**************************************************************************************************************************************************************************************************** MOTIFSIM - Motif Similarity Detection Tool Version 1.0 **************************************************************************************************************************************************************************************************** Please, consult user manual for using this tool. **************************************************************************************************************************************************************************************************** INPUT **************************************************************************************************************************************************************************************************** Number of files: 2 Number of best matches: 10 Similarity cutoff: >= 0.75 Number of threads: 1 Input Files and Motif Counts File Name File Type Count of Motifs Dataset # W-ChIPMotifs_DM230.txt PSSM 11 1 RSAT_peak-motifs_DM230.txt TRANSFAC-like 10 2 **************************************************************************************************************************************************************************************************** RESULTS **************************************************************************************************************************************************************************************************** ****************************************************************** Top 10 Significant Motifs - Global Matching (Highest to Lowest) ****************************************************************** Dataset # 1 Motif ID 1 Motif Name TFW1 Original Motif 0 0.082495 0.917505 0 0.0744467 0.217304 0.197183 0.511066 0 0.897384 0.102616 0 0.0503018 0.102616 0.847082 0 0 0.949698 0.0503018 0 0 0.0523139 0.947686 0 Reverse Complement Motif 0 0.947686 0.0523139 0 0 0.0503018 0.949698 0 0.0503018 0.847082 0.102616 0 0 0.102616 0.897384 0 0.511066 0.217304 0.197183 0.0744467 0 0.917505 0.082495 0 *************************************************************** Best Matches for Top Significant Motif ID 1 (Highest to Lowest) *************************************************************** Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 sSGTCACGTGACSs Original Motif Original Motif Backward 7 6 0.0375102 Original Motif 0.0555556 0.388889 0.388889 0.166667 0 0.277778 0.722222 0 0.0555556 0.111111 0.833333 0 0.111111 0 0.0555556 0.833333 0 0.888889 0.111111 0 1 0 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.0555556 0.944444 0 0 0 0 1 0 0.111111 0.888889 0 0.833333 0.0555556 0 0.111111 0 0.833333 0.111111 0.0555556 0 0.722222 0.277778 0 0.166667 0.388889 0.388889 0.0555556 Reverse Complement Motif 0.166667 0.388889 0.388889 0.0555556 0 0.277778 0.722222 0 0 0.111111 0.833333 0.0555556 0.111111 0.0555556 0 0.833333 0 0.888889 0.111111 0 1 0 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.0555556 0.944444 0 0 0 0 1 0 0.111111 0.888889 0 0.833333 0 0.0555556 0.111111 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0 0.722222 0.277778 0 0.0555556 0.388889 0.388889 0.166667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 csGCCCCGCCCCsc Original Motif Original Motif Forward 3 6 0.0539 Original Motif 0.179104 0.492537 0.164179 0.164179 0.223881 0.402985 0.283582 0.0895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0746269 0 0.895522 0.0895522 0.0149254 0 0.925373 0.0149254 0.0597015 0.0298507 0.970149 0 0 0 0.970149 0.0298507 0 0.0447761 0 0.940299 0.0149254 0 0.955224 0.0149254 0.0298507 0.0298507 0.955224 0.0149254 0 0.0298507 0.925373 0.0149254 0.0298507 0.119403 0.820896 0.0149254 0.0447761 0.104478 0.328358 0.373134 0.19403 0.179104 0.358209 0.223881 0.238806 Reverse Complement Motif 0.179104 0.223881 0.358209 0.238806 0.104478 0.373134 0.328358 0.19403 0.119403 0.0149254 0.820896 0.0447761 0.0298507 0.0149254 0.925373 0.0298507 0.0298507 0.0149254 0.955224 0 0 0.0149254 0.955224 0.0298507 0.0447761 0.940299 0 0.0149254 0 0.0298507 0.970149 0 0.0298507 0 0.970149 0 0 0.0149254 0.925373 0.0597015 0 0.0895522 0.895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0149254 0.0746269 0.223881 0.283582 0.402985 0.0895522 0.179104 0.164179 0.492537 0.164179 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 14 cccGCCCCGCCCCsb Reverse Complement Original Motif Backward 3 6 0.0558733 Original Motif 0.148936 0.425532 0.234043 0.191489 0.106383 0.553191 0.170213 0.170213 0.106383 0.659574 0.148936 0.0851064 0.0425532 0 0.851064 0.106383 0 0.93617 0.0638298 0 0 0.87234 0.0425532 0.0851064 0 1 0 0 0 0.957447 0.0425532 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.0425532 0.93617 0.0212766 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0.0638298 0.914894 0.0212766 0 0.0638298 0.297872 0.404255 0.234043 0.148936 0.319149 0.255319 0.276596 Reverse Complement Motif 0.148936 0.255319 0.319149 0.276596 0.0638298 0.404255 0.297872 0.234043 0.0638298 0.0212766 0.914894 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0.0425532 0.0212766 0.93617 0 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0 0.0425532 0.957447 0 0 0 1 0 0 0.0425532 0.87234 0.0851064 0 0.0638298 0.93617 0 0.0425532 0.851064 0 0.106383 0.106383 0.148936 0.659574 0.0851064 0.106383 0.170213 0.553191 0.170213 0.148936 0.234043 0.425532 0.191489 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 kcACCTGCAgc Original Motif Reverse Complement Forward 1 6 0.0980422 Original Motif 0.153846 0.230769 0.307692 0.307692 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0.153846 0.230769 0.461538 0.153846 0.153846 0.615385 0.153846 0.0769231 Reverse Complement Motif 0.153846 0.153846 0.615385 0.0769231 0.153846 0.461538 0.230769 0.153846 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0.153846 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 0.307692 0.230769 0.307692 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 dhACATTCTkh Original Motif Reverse Complement Forward 8 4 1.09467 Original Motif 0.333333 0 0.333333 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0.666667 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 Reverse Complement Motif 0.333333 0.333333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 1 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 1 Motif ID 3 Motif Name TFW3 Original Motif 0.02 0.92 0.05 0.01 0 0.03 0.96 0.01 0 0.17 0.83 0 0 0.99 0 0.01 0 0.27 0.21 0.52 0.03 0.3 0.37 0.3 0 0.95 0.05 0 0.02 0.13 0.8 0.05 0 0.88 0.12 0 0.01 0.22 0.76 0.01 Reverse Complement Motif 0.01 0.76 0.22 0.01 0 0.12 0.88 0 0.02 0.8 0.13 0.05 0 0.05 0.95 0 0.03 0.37 0.3 0.3 0.52 0.27 0.21 0 0 0 0.99 0.01 0 0.83 0.17 0 0 0.96 0.03 0.01 0.02 0.05 0.92 0.01 *************************************************************** Best Matches for Top Significant Motif ID 3 (Highest to Lowest) *************************************************************** Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 csGCCCCGCCCCsc Original Motif Original Motif Forward 1 10 0.0718771 Original Motif 0.179104 0.492537 0.164179 0.164179 0.223881 0.402985 0.283582 0.0895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0746269 0 0.895522 0.0895522 0.0149254 0 0.925373 0.0149254 0.0597015 0.0298507 0.970149 0 0 0 0.970149 0.0298507 0 0.0447761 0 0.940299 0.0149254 0 0.955224 0.0149254 0.0298507 0.0298507 0.955224 0.0149254 0 0.0298507 0.925373 0.0149254 0.0298507 0.119403 0.820896 0.0149254 0.0447761 0.104478 0.328358 0.373134 0.19403 0.179104 0.358209 0.223881 0.238806 Reverse Complement Motif 0.179104 0.223881 0.358209 0.238806 0.104478 0.373134 0.328358 0.19403 0.119403 0.0149254 0.820896 0.0447761 0.0298507 0.0149254 0.925373 0.0298507 0.0298507 0.0149254 0.955224 0 0 0.0149254 0.955224 0.0298507 0.0447761 0.940299 0 0.0149254 0 0.0298507 0.970149 0 0.0298507 0 0.970149 0 0 0.0149254 0.925373 0.0597015 0 0.0895522 0.895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0149254 0.0746269 0.223881 0.283582 0.402985 0.0895522 0.179104 0.164179 0.492537 0.164179 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 14 cccGCCCCGCCCCsb Original Motif Original Motif Backward 5 10 0.0719604 Original Motif 0.148936 0.425532 0.234043 0.191489 0.106383 0.553191 0.170213 0.170213 0.106383 0.659574 0.148936 0.0851064 0.0425532 0 0.851064 0.106383 0 0.93617 0.0638298 0 0 0.87234 0.0425532 0.0851064 0 1 0 0 0 0.957447 0.0425532 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.0425532 0.93617 0.0212766 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0.0638298 0.914894 0.0212766 0 0.0638298 0.297872 0.404255 0.234043 0.148936 0.319149 0.255319 0.276596 Reverse Complement Motif 0.148936 0.255319 0.319149 0.276596 0.0638298 0.404255 0.297872 0.234043 0.0638298 0.0212766 0.914894 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0.0425532 0.0212766 0.93617 0 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0 0.0425532 0.957447 0 0 0 1 0 0 0.0425532 0.87234 0.0851064 0 0.0638298 0.93617 0 0.0425532 0.851064 0 0.106383 0.106383 0.148936 0.659574 0.0851064 0.106383 0.170213 0.553191 0.170213 0.148936 0.234043 0.425532 0.191489 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 sSGTCACGTGACSs Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 10 0.0895189 Original Motif 0.0555556 0.388889 0.388889 0.166667 0 0.277778 0.722222 0 0.0555556 0.111111 0.833333 0 0.111111 0 0.0555556 0.833333 0 0.888889 0.111111 0 1 0 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.0555556 0.944444 0 0 0 0 1 0 0.111111 0.888889 0 0.833333 0.0555556 0 0.111111 0 0.833333 0.111111 0.0555556 0 0.722222 0.277778 0 0.166667 0.388889 0.388889 0.0555556 Reverse Complement Motif 0.166667 0.388889 0.388889 0.0555556 0 0.277778 0.722222 0 0 0.111111 0.833333 0.0555556 0.111111 0.0555556 0 0.833333 0 0.888889 0.111111 0 1 0 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.0555556 0.944444 0 0 0 0 1 0 0.111111 0.888889 0 0.833333 0 0.0555556 0.111111 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0 0.722222 0.277778 0 0.0555556 0.388889 0.388889 0.166667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 kcACCTGCAgc Reverse Complement Original Motif Forward 4 8 1.10343 Original Motif 0.153846 0.230769 0.307692 0.307692 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0.153846 0.230769 0.461538 0.153846 0.153846 0.615385 0.153846 0.0769231 Reverse Complement Motif 0.153846 0.153846 0.615385 0.0769231 0.153846 0.461538 0.230769 0.153846 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0.153846 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 0.307692 0.230769 0.307692 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 15 kCAGCCAATmr Reverse Complement Original Motif Backward 5 7 1.57732 Original Motif 0.235294 0.176471 0.294118 0.294118 0.117647 0.705882 0.176471 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0.352941 0.352941 0.235294 0.0588235 0.352941 0.176471 0.411765 0.0588235 Reverse Complement Motif 0.352941 0.411765 0.176471 0.0588235 0.0588235 0.352941 0.235294 0.352941 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.117647 0.176471 0.705882 0 0.235294 0.294118 0.176471 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 17 Motif Name wwAAATAATAtw Original Motif 0.37037 0.166667 0.12963 0.333333 0.333333 0.166667 0.203704 0.296296 0.740741 0.0185185 0.0555556 0.185185 0.740741 0.0555556 0.037037 0.166667 0.888889 0.0185185 0.0185185 0.0740741 0.037037 0 0 0.962963 0.833333 0.037037 0.0185185 0.111111 0.796296 0.0185185 0.037037 0.148148 0.0740741 0.0555556 0.0185185 0.851852 0.925926 0.0555556 0.0185185 0 0.240741 0.166667 0.166667 0.425926 0.37037 0.12963 0.148148 0.351852 Reverse Complement Motif 0.351852 0.12963 0.148148 0.37037 0.425926 0.166667 0.166667 0.240741 0 0.0555556 0.0185185 0.925926 0.851852 0.0555556 0.0185185 0.0740741 0.148148 0.0185185 0.037037 0.796296 0.111111 0.037037 0.0185185 0.833333 0.962963 0 0 0.037037 0.0740741 0.0185185 0.0185185 0.888889 0.166667 0.0555556 0.037037 0.740741 0.185185 0.0185185 0.0555556 0.740741 0.296296 0.166667 0.203704 0.333333 0.333333 0.166667 0.12963 0.37037 *************************************************************** Best Matches for Top Significant Motif ID 17 (Highest to Lowest) *************************************************************** Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 7 TFM1 Original Motif Reverse Complement Backward 1 12 0.0565705 Original Motif 0.384615 0.0769231 0 0.538462 0.25641 0 0 0.74359 0.0769231 0.153846 0.333333 0.435897 0.230769 0 0 0.769231 0 0.25641 0 0.74359 0 0 0.0769231 0.923077 0.025641 0.0769231 0.25641 0.641026 0 0.128205 0.230769 0.641026 0.333333 0.230769 0.205128 0.230769 0.282051 0.179487 0 0.538462 0.0512821 0.128205 0 0.820513 0.128205 0 0 0.871795 0.25641 0.025641 0.179487 0.538462 0.102564 0 0 0.897436 0.128205 0 0.102564 0.769231 0.128205 0.025641 0.205128 0.641026 0.102564 0.333333 0.25641 0.307692 0.25641 0.102564 0 0.641026 Reverse Complement Motif 0.641026 0.102564 0 0.25641 0.102564 0.25641 0.333333 0.307692 0.641026 0.025641 0.205128 0.128205 0.769231 0 0.102564 0.128205 0.897436 0 0 0.102564 0.538462 0.025641 0.179487 0.25641 0.871795 0 0 0.128205 0.820513 0.128205 0 0.0512821 0.538462 0.179487 0 0.282051 0.230769 0.230769 0.205128 0.333333 0.641026 0.128205 0.230769 0 0.641026 0.0769231 0.25641 0.025641 0.923077 0 0.0769231 0 0.74359 0.25641 0 0 0.769231 0 0 0.230769 0.435897 0.153846 0.333333 0.0769231 0.74359 0 0 0.25641 0.538462 0.0769231 0 0.384615 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 TFM11 Original Motif Original Motif Forward 3 12 0.0575935 Original Motif 0.294118 0.235294 0.117647 0.352941 0.382353 0.205882 0.205882 0.205882 0.529412 0 0.117647 0.352941 0.235294 0.294118 0.323529 0.147059 1 0 0 0 0.941176 0 0 0.0588235 0.764706 0 0.0294118 0.205882 0.382353 0.235294 0.176471 0.205882 0.735294 0 0.0588235 0.205882 0.735294 0.0294118 0.117647 0.117647 0.676471 0 0.0882353 0.235294 0.529412 0.117647 0.205882 0.147059 0.705882 0.176471 0.117647 0 0.441176 0.352941 0.147059 0.0588235 0.941176 0.0588235 0 0 0.852941 0 0.147059 0 0.676471 0.0882353 0 0.235294 0.529412 0.323529 0.117647 0.0294118 0.470588 0.176471 0 0.352941 0.411765 0 0.147059 0.441176 0.5 0.0882353 0.147059 0.264706 0.294118 0.205882 0.0882353 0.411765 0.205882 0.235294 0.264706 0.294118 0.470588 0 0.117647 0.411765 0.617647 0.176471 0.205882 0 Reverse Complement Motif 0 0.176471 0.205882 0.617647 0.411765 0 0.117647 0.470588 0.294118 0.235294 0.264706 0.205882 0.411765 0.205882 0.0882353 0.294118 0.264706 0.0882353 0.147059 0.5 0.441176 0 0.147059 0.411765 0.352941 0.176471 0 0.470588 0.0294118 0.323529 0.117647 0.529412 0.235294 0.0882353 0 0.676471 0 0 0.147059 0.852941 0 0.0588235 0 0.941176 0.0588235 0.352941 0.147059 0.441176 0 0.176471 0.117647 0.705882 0.147059 0.117647 0.205882 0.529412 0.235294 0 0.0882353 0.676471 0.117647 0.0294118 0.117647 0.735294 0.205882 0 0.0588235 0.735294 0.205882 0.235294 0.176471 0.382353 0.205882 0 0.0294118 0.764706 0.0588235 0 0 0.941176 0 0 0 1 0.235294 0.323529 0.294118 0.147059 0.352941 0 0.117647 0.529412 0.205882 0.205882 0.205882 0.382353 0.352941 0.235294 0.117647 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 10 TFM13 Reverse Complement Original Motif Backward 1 12 0.0712963 Original Motif 0.666667 0.133333 0 0.2 0.0666667 0.2 0 0.733333 0.2 0 0.333333 0.466667 0.666667 0 0 0.333333 0.666667 0 0 0.333333 0.6 0 0 0.4 0.333333 0 0 0.666667 0 0.0666667 0 0.933333 0.133333 0.266667 0 0.6 0.266667 0 0 0.733333 0.466667 0 0.466667 0.0666667 0.6 0.333333 0 0.0666667 0.8 0.2 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.133333 0.2 0.2 0.466667 0.8 0 0.2 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 0.4 0.333333 0 0.266667 0.2 0 0 0.8 0.6 0 0 0.4 Reverse Complement Motif 0.4 0 0 0.6 0.8 0 0 0.2 0.266667 0.333333 0 0.4 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0 0 0.2 0.8 0.466667 0.2 0.2 0.133333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.2 0 0.8 0.0666667 0.333333 0 0.6 0.0666667 0 0.466667 0.466667 0.733333 0 0 0.266667 0.6 0.266667 0 0.133333 0.933333 0.0666667 0 0 0.666667 0 0 0.333333 0.4 0 0 0.6 0.333333 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.666667 0.466667 0 0.333333 0.2 0.733333 0.2 0 0.0666667 0.2 0.133333 0 0.666667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 8 TFM3 Original Motif Reverse Complement Forward 7 12 0.0733516 Original Motif 0.454545 0 0 0.545455 0.5 0 0 0.5 0.318182 0.181818 0.0909091 0.409091 0 0 0.136364 0.863636 0.318182 0 0 0.681818 0.0454545 0 0.272727 0.681818 0.272727 0.0454545 0.0909091 0.590909 0.272727 0.0909091 0 0.636364 0.0454545 0.818182 0 0.136364 0.727273 0 0 0.272727 0.0909091 0.318182 0.227273 0.363636 0.863636 0.0454545 0 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0909091 0 0.5 0.0909091 0.0909091 0.318182 0.136364 0.227273 0 0.636364 0.227273 0 0 0.772727 0.363636 0.0909091 0 0.545455 0.772727 0.181818 0.0454545 0 Reverse Complement Motif 0 0.181818 0.0454545 0.772727 0.545455 0.0909091 0 0.363636 0.772727 0 0 0.227273 0.636364 0.227273 0 0.136364 0.318182 0.0909091 0.0909091 0.5 0 0.0909091 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0454545 0 0.863636 0.363636 0.318182 0.227273 0.0909091 0.272727 0 0 0.727273 0.0454545 0 0.818182 0.136364 0.636364 0.0909091 0 0.272727 0.590909 0.0454545 0.0909091 0.272727 0.681818 0 0.272727 0.0454545 0.681818 0 0 0.318182 0.863636 0 0.136364 0 0.409091 0.181818 0.0909091 0.318182 0.5 0 0 0.5 0.545455 0 0 0.454545 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 TFM12 Reverse Complement Reverse Complement Backward 16 5 3.59569 Original Motif 0 1 0 0 0.19 0.4 0 0.41 0 0.52 0.19 0.29 0.11 0.61 0.1 0.18 0.18 0.29 0.33 0.2 0 0.38 0.35 0.27 0 0.82 0 0.18 0.18 0.39 0 0.43 0 0.53 0 0.47 0 0.47 0.15 0.38 0 0.24 0.24 0.52 0 0.87 0 0.13 0.05 0.68 0 0.27 0.18 0.38 0.1 0.34 0 0.62 0.22 0.16 0 0.66 0.09 0.25 0.2 0.15 0.13 0.52 0.04 0.46 0.16 0.34 0.06 0.53 0.03 0.38 0.05 0.57 0.04 0.34 Reverse Complement Motif 0.05 0.04 0.57 0.34 0.06 0.03 0.53 0.38 0.04 0.16 0.46 0.34 0.52 0.15 0.13 0.2 0 0.09 0.66 0.25 0 0.22 0.62 0.16 0.18 0.1 0.38 0.34 0.05 0 0.68 0.27 0 0 0.87 0.13 0.52 0.24 0.24 0 0 0.15 0.47 0.38 0 0 0.53 0.47 0.43 0.39 0 0.18 0 0 0.82 0.18 0 0.35 0.38 0.27 0.18 0.33 0.29 0.2 0.11 0.1 0.61 0.18 0 0.19 0.52 0.29 0.41 0.4 0 0.19 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 13 Motif Name tkAAATAATAtw Original Motif 0.233333 0.2 0.166667 0.4 0.233333 0.133333 0.266667 0.366667 0.733333 0.0333333 0.0333333 0.2 0.866667 0.0333333 0.0333333 0.0666667 0.833333 0 0.0333333 0.133333 0.166667 0 0 0.833333 0.866667 0.0666667 0 0.0666667 0.8 0.0333333 0.0333333 0.133333 0 0 0 1 0.966667 0.0333333 0 0 0.166667 0.2 0.133333 0.5 0.4 0.1 0.1 0.4 Reverse Complement Motif 0.4 0.1 0.1 0.4 0.5 0.2 0.133333 0.166667 0 0.0333333 0 0.966667 1 0 0 0 0.133333 0.0333333 0.0333333 0.8 0.0666667 0.0666667 0 0.866667 0.833333 0 0 0.166667 0.133333 0 0.0333333 0.833333 0.0666667 0.0333333 0.0333333 0.866667 0.2 0.0333333 0.0333333 0.733333 0.366667 0.133333 0.266667 0.233333 0.4 0.2 0.166667 0.233333 *************************************************************** Best Matches for Top Significant Motif ID 13 (Highest to Lowest) *************************************************************** Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 TFM11 Reverse Complement Reverse Complement Backward 3 12 0.0590505 Original Motif 0.294118 0.235294 0.117647 0.352941 0.382353 0.205882 0.205882 0.205882 0.529412 0 0.117647 0.352941 0.235294 0.294118 0.323529 0.147059 1 0 0 0 0.941176 0 0 0.0588235 0.764706 0 0.0294118 0.205882 0.382353 0.235294 0.176471 0.205882 0.735294 0 0.0588235 0.205882 0.735294 0.0294118 0.117647 0.117647 0.676471 0 0.0882353 0.235294 0.529412 0.117647 0.205882 0.147059 0.705882 0.176471 0.117647 0 0.441176 0.352941 0.147059 0.0588235 0.941176 0.0588235 0 0 0.852941 0 0.147059 0 0.676471 0.0882353 0 0.235294 0.529412 0.323529 0.117647 0.0294118 0.470588 0.176471 0 0.352941 0.411765 0 0.147059 0.441176 0.5 0.0882353 0.147059 0.264706 0.294118 0.205882 0.0882353 0.411765 0.205882 0.235294 0.264706 0.294118 0.470588 0 0.117647 0.411765 0.617647 0.176471 0.205882 0 Reverse Complement Motif 0 0.176471 0.205882 0.617647 0.411765 0 0.117647 0.470588 0.294118 0.235294 0.264706 0.205882 0.411765 0.205882 0.0882353 0.294118 0.264706 0.0882353 0.147059 0.5 0.441176 0 0.147059 0.411765 0.352941 0.176471 0 0.470588 0.0294118 0.323529 0.117647 0.529412 0.235294 0.0882353 0 0.676471 0 0 0.147059 0.852941 0 0.0588235 0 0.941176 0.0588235 0.352941 0.147059 0.441176 0 0.176471 0.117647 0.705882 0.147059 0.117647 0.205882 0.529412 0.235294 0 0.0882353 0.676471 0.117647 0.0294118 0.117647 0.735294 0.205882 0 0.0588235 0.735294 0.205882 0.235294 0.176471 0.382353 0.205882 0 0.0294118 0.764706 0.0588235 0 0 0.941176 0 0 0 1 0.235294 0.323529 0.294118 0.147059 0.352941 0 0.117647 0.529412 0.205882 0.205882 0.205882 0.382353 0.352941 0.235294 0.117647 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 7 TFM1 Reverse Complement Original Motif Backward 7 12 0.0637702 Original Motif 0.384615 0.0769231 0 0.538462 0.25641 0 0 0.74359 0.0769231 0.153846 0.333333 0.435897 0.230769 0 0 0.769231 0 0.25641 0 0.74359 0 0 0.0769231 0.923077 0.025641 0.0769231 0.25641 0.641026 0 0.128205 0.230769 0.641026 0.333333 0.230769 0.205128 0.230769 0.282051 0.179487 0 0.538462 0.0512821 0.128205 0 0.820513 0.128205 0 0 0.871795 0.25641 0.025641 0.179487 0.538462 0.102564 0 0 0.897436 0.128205 0 0.102564 0.769231 0.128205 0.025641 0.205128 0.641026 0.102564 0.333333 0.25641 0.307692 0.25641 0.102564 0 0.641026 Reverse Complement Motif 0.641026 0.102564 0 0.25641 0.102564 0.25641 0.333333 0.307692 0.641026 0.025641 0.205128 0.128205 0.769231 0 0.102564 0.128205 0.897436 0 0 0.102564 0.538462 0.025641 0.179487 0.25641 0.871795 0 0 0.128205 0.820513 0.128205 0 0.0512821 0.538462 0.179487 0 0.282051 0.230769 0.230769 0.205128 0.333333 0.641026 0.128205 0.230769 0 0.641026 0.0769231 0.25641 0.025641 0.923077 0 0.0769231 0 0.74359 0.25641 0 0 0.769231 0 0 0.230769 0.435897 0.153846 0.333333 0.0769231 0.74359 0 0 0.25641 0.538462 0.0769231 0 0.384615 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 10 TFM13 Reverse Complement Original Motif Forward 9 12 0.0704475 Original Motif 0.666667 0.133333 0 0.2 0.0666667 0.2 0 0.733333 0.2 0 0.333333 0.466667 0.666667 0 0 0.333333 0.666667 0 0 0.333333 0.6 0 0 0.4 0.333333 0 0 0.666667 0 0.0666667 0 0.933333 0.133333 0.266667 0 0.6 0.266667 0 0 0.733333 0.466667 0 0.466667 0.0666667 0.6 0.333333 0 0.0666667 0.8 0.2 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.133333 0.2 0.2 0.466667 0.8 0 0.2 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 0.4 0.333333 0 0.266667 0.2 0 0 0.8 0.6 0 0 0.4 Reverse Complement Motif 0.4 0 0 0.6 0.8 0 0 0.2 0.266667 0.333333 0 0.4 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0 0 0.2 0.8 0.466667 0.2 0.2 0.133333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.2 0 0.8 0.0666667 0.333333 0 0.6 0.0666667 0 0.466667 0.466667 0.733333 0 0 0.266667 0.6 0.266667 0 0.133333 0.933333 0.0666667 0 0 0.666667 0 0 0.333333 0.4 0 0 0.6 0.333333 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.666667 0.466667 0 0.333333 0.2 0.733333 0.2 0 0.0666667 0.2 0.133333 0 0.666667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 8 TFM3 Original Motif Reverse Complement Forward 7 12 0.0763819 Original Motif 0.454545 0 0 0.545455 0.5 0 0 0.5 0.318182 0.181818 0.0909091 0.409091 0 0 0.136364 0.863636 0.318182 0 0 0.681818 0.0454545 0 0.272727 0.681818 0.272727 0.0454545 0.0909091 0.590909 0.272727 0.0909091 0 0.636364 0.0454545 0.818182 0 0.136364 0.727273 0 0 0.272727 0.0909091 0.318182 0.227273 0.363636 0.863636 0.0454545 0 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0909091 0 0.5 0.0909091 0.0909091 0.318182 0.136364 0.227273 0 0.636364 0.227273 0 0 0.772727 0.363636 0.0909091 0 0.545455 0.772727 0.181818 0.0454545 0 Reverse Complement Motif 0 0.181818 0.0454545 0.772727 0.545455 0.0909091 0 0.363636 0.772727 0 0 0.227273 0.636364 0.227273 0 0.136364 0.318182 0.0909091 0.0909091 0.5 0 0.0909091 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0454545 0 0.863636 0.363636 0.318182 0.227273 0.0909091 0.272727 0 0 0.727273 0.0454545 0 0.818182 0.136364 0.636364 0.0909091 0 0.272727 0.590909 0.0454545 0.0909091 0.272727 0.681818 0 0.272727 0.0454545 0.681818 0 0 0.318182 0.863636 0 0.136364 0 0.409091 0.181818 0.0909091 0.318182 0.5 0 0 0.5 0.545455 0 0 0.454545 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 TFM12 Reverse Complement Reverse Complement Backward 16 5 3.59273 Original Motif 0 1 0 0 0.19 0.4 0 0.41 0 0.52 0.19 0.29 0.11 0.61 0.1 0.18 0.18 0.29 0.33 0.2 0 0.38 0.35 0.27 0 0.82 0 0.18 0.18 0.39 0 0.43 0 0.53 0 0.47 0 0.47 0.15 0.38 0 0.24 0.24 0.52 0 0.87 0 0.13 0.05 0.68 0 0.27 0.18 0.38 0.1 0.34 0 0.62 0.22 0.16 0 0.66 0.09 0.25 0.2 0.15 0.13 0.52 0.04 0.46 0.16 0.34 0.06 0.53 0.03 0.38 0.05 0.57 0.04 0.34 Reverse Complement Motif 0.05 0.04 0.57 0.34 0.06 0.03 0.53 0.38 0.04 0.16 0.46 0.34 0.52 0.15 0.13 0.2 0 0.09 0.66 0.25 0 0.22 0.62 0.16 0.18 0.1 0.38 0.34 0.05 0 0.68 0.27 0 0 0.87 0.13 0.52 0.24 0.24 0 0 0.15 0.47 0.38 0 0 0.53 0.47 0.43 0.39 0 0.18 0 0 0.82 0.18 0 0.35 0.38 0.27 0.18 0.33 0.29 0.2 0.11 0.1 0.61 0.18 0 0.19 0.52 0.29 0.41 0.4 0 0.19 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 1 Motif ID 2 Motif Name TFW2 Original Motif 0.0058309 0.364431 0.41691 0.212828 0.0816327 0.816327 0.0991254 0.00291545 0.00291545 0.0670554 0.921283 0.00874636 0.0058309 0.883382 0.107872 0.00291545 0 0.0962099 0.860058 0.0437318 0.00291545 0.906706 0.0787172 0.0116618 0.0437318 0.0758017 0.825073 0.0553936 0 0.125364 0.87172 0.00291545 Reverse Complement Motif 0 0.87172 0.125364 0.00291545 0.0437318 0.825073 0.0758017 0.0553936 0.00291545 0.0787172 0.906706 0.0116618 0 0.860058 0.0962099 0.0437318 0.0058309 0.107872 0.883382 0.00291545 0.00291545 0.921283 0.0670554 0.00874636 0.0816327 0.0991254 0.816327 0.00291545 0.0058309 0.41691 0.364431 0.212828 *************************************************************** Best Matches for Top Significant Motif ID 2 (Highest to Lowest) *************************************************************** Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 csGCCCCGCCCCsc Original Motif Reverse Complement Forward 2 8 0.0456233 Original Motif 0.179104 0.492537 0.164179 0.164179 0.223881 0.402985 0.283582 0.0895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0746269 0 0.895522 0.0895522 0.0149254 0 0.925373 0.0149254 0.0597015 0.0298507 0.970149 0 0 0 0.970149 0.0298507 0 0.0447761 0 0.940299 0.0149254 0 0.955224 0.0149254 0.0298507 0.0298507 0.955224 0.0149254 0 0.0298507 0.925373 0.0149254 0.0298507 0.119403 0.820896 0.0149254 0.0447761 0.104478 0.328358 0.373134 0.19403 0.179104 0.358209 0.223881 0.238806 Reverse Complement Motif 0.179104 0.223881 0.358209 0.238806 0.104478 0.373134 0.328358 0.19403 0.119403 0.0149254 0.820896 0.0447761 0.0298507 0.0149254 0.925373 0.0298507 0.0298507 0.0149254 0.955224 0 0 0.0149254 0.955224 0.0298507 0.0447761 0.940299 0 0.0149254 0 0.0298507 0.970149 0 0.0298507 0 0.970149 0 0 0.0149254 0.925373 0.0597015 0 0.0895522 0.895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0149254 0.0746269 0.223881 0.283582 0.402985 0.0895522 0.179104 0.164179 0.492537 0.164179 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 14 cccGCCCCGCCCCsb Original Motif Reverse Complement Backward 7 8 0.045686 Original Motif 0.148936 0.425532 0.234043 0.191489 0.106383 0.553191 0.170213 0.170213 0.106383 0.659574 0.148936 0.0851064 0.0425532 0 0.851064 0.106383 0 0.93617 0.0638298 0 0 0.87234 0.0425532 0.0851064 0 1 0 0 0 0.957447 0.0425532 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.0425532 0.93617 0.0212766 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0.0638298 0.914894 0.0212766 0 0.0638298 0.297872 0.404255 0.234043 0.148936 0.319149 0.255319 0.276596 Reverse Complement Motif 0.148936 0.255319 0.319149 0.276596 0.0638298 0.404255 0.297872 0.234043 0.0638298 0.0212766 0.914894 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0.0425532 0.0212766 0.93617 0 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0 0.0425532 0.957447 0 0 0 1 0 0 0.0425532 0.87234 0.0851064 0 0.0638298 0.93617 0 0.0425532 0.851064 0 0.106383 0.106383 0.148936 0.659574 0.0851064 0.106383 0.170213 0.553191 0.170213 0.148936 0.234043 0.425532 0.191489 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 sSGTCACGTGACSs Original Motif Original Motif Forward 4 8 0.0988223 Original Motif 0.0555556 0.388889 0.388889 0.166667 0 0.277778 0.722222 0 0.0555556 0.111111 0.833333 0 0.111111 0 0.0555556 0.833333 0 0.888889 0.111111 0 1 0 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.0555556 0.944444 0 0 0 0 1 0 0.111111 0.888889 0 0.833333 0.0555556 0 0.111111 0 0.833333 0.111111 0.0555556 0 0.722222 0.277778 0 0.166667 0.388889 0.388889 0.0555556 Reverse Complement Motif 0.166667 0.388889 0.388889 0.0555556 0 0.277778 0.722222 0 0 0.111111 0.833333 0.0555556 0.111111 0.0555556 0 0.833333 0 0.888889 0.111111 0 1 0 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.0555556 0.944444 0 0 0 0 1 0 0.111111 0.888889 0 0.833333 0 0.0555556 0.111111 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0 0.722222 0.277778 0 0.0555556 0.388889 0.388889 0.166667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 kcACCTGCAgc Original Motif Reverse Complement Backward 8 4 2.08456 Original Motif 0.153846 0.230769 0.307692 0.307692 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0.153846 0.230769 0.461538 0.153846 0.153846 0.615385 0.153846 0.0769231 Reverse Complement Motif 0.153846 0.153846 0.615385 0.0769231 0.153846 0.461538 0.230769 0.153846 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0.153846 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 0.307692 0.230769 0.307692 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 15 kCAGCCAATmr Reverse Complement Reverse Complement Forward 8 4 2.0901 Original Motif 0.235294 0.176471 0.294118 0.294118 0.117647 0.705882 0.176471 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0.352941 0.352941 0.235294 0.0588235 0.352941 0.176471 0.411765 0.0588235 Reverse Complement Motif 0.352941 0.411765 0.176471 0.0588235 0.0588235 0.352941 0.235294 0.352941 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.117647 0.176471 0.705882 0 0.235294 0.294118 0.176471 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 21 Motif Name wbgTAAATAww Original Motif 0.285714 0.142857 0.178571 0.392857 0.214286 0.285714 0.25 0.25 0.142857 0.0714286 0.678571 0.107143 0 0 0 1 0.928571 0 0.0357143 0.0357143 0.821429 0.107143 0.0357143 0.0357143 0.821429 0 0.178571 0 0 0.0714286 0 0.928571 0.928571 0.0357143 0.0357143 0 0.285714 0.214286 0.142857 0.357143 0.392857 0.178571 0.178571 0.25 Reverse Complement Motif 0.25 0.178571 0.178571 0.392857 0.357143 0.214286 0.142857 0.285714 0 0.0357143 0.0357143 0.928571 0.928571 0.0714286 0 0 0 0 0.178571 0.821429 0.0357143 0.107143 0.0357143 0.821429 0.0357143 0 0.0357143 0.928571 1 0 0 0 0.142857 0.678571 0.0714286 0.107143 0.214286 0.25 0.285714 0.25 0.392857 0.142857 0.178571 0.285714 *************************************************************** Best Matches for Top Significant Motif ID 21 (Highest to Lowest) *************************************************************** Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 TFM11 Reverse Complement Reverse Complement Forward 15 11 0.0192768 Original Motif 0.294118 0.235294 0.117647 0.352941 0.382353 0.205882 0.205882 0.205882 0.529412 0 0.117647 0.352941 0.235294 0.294118 0.323529 0.147059 1 0 0 0 0.941176 0 0 0.0588235 0.764706 0 0.0294118 0.205882 0.382353 0.235294 0.176471 0.205882 0.735294 0 0.0588235 0.205882 0.735294 0.0294118 0.117647 0.117647 0.676471 0 0.0882353 0.235294 0.529412 0.117647 0.205882 0.147059 0.705882 0.176471 0.117647 0 0.441176 0.352941 0.147059 0.0588235 0.941176 0.0588235 0 0 0.852941 0 0.147059 0 0.676471 0.0882353 0 0.235294 0.529412 0.323529 0.117647 0.0294118 0.470588 0.176471 0 0.352941 0.411765 0 0.147059 0.441176 0.5 0.0882353 0.147059 0.264706 0.294118 0.205882 0.0882353 0.411765 0.205882 0.235294 0.264706 0.294118 0.470588 0 0.117647 0.411765 0.617647 0.176471 0.205882 0 Reverse Complement Motif 0 0.176471 0.205882 0.617647 0.411765 0 0.117647 0.470588 0.294118 0.235294 0.264706 0.205882 0.411765 0.205882 0.0882353 0.294118 0.264706 0.0882353 0.147059 0.5 0.441176 0 0.147059 0.411765 0.352941 0.176471 0 0.470588 0.0294118 0.323529 0.117647 0.529412 0.235294 0.0882353 0 0.676471 0 0 0.147059 0.852941 0 0.0588235 0 0.941176 0.0588235 0.352941 0.147059 0.441176 0 0.176471 0.117647 0.705882 0.147059 0.117647 0.205882 0.529412 0.235294 0 0.0882353 0.676471 0.117647 0.0294118 0.117647 0.735294 0.205882 0 0.0588235 0.735294 0.205882 0.235294 0.176471 0.382353 0.205882 0 0.0294118 0.764706 0.0588235 0 0 0.941176 0 0 0 1 0.235294 0.323529 0.294118 0.147059 0.352941 0 0.117647 0.529412 0.205882 0.205882 0.205882 0.382353 0.352941 0.235294 0.117647 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 7 TFM1 Reverse Complement Original Motif Forward 1 11 0.0283217 Original Motif 0.384615 0.0769231 0 0.538462 0.25641 0 0 0.74359 0.0769231 0.153846 0.333333 0.435897 0.230769 0 0 0.769231 0 0.25641 0 0.74359 0 0 0.0769231 0.923077 0.025641 0.0769231 0.25641 0.641026 0 0.128205 0.230769 0.641026 0.333333 0.230769 0.205128 0.230769 0.282051 0.179487 0 0.538462 0.0512821 0.128205 0 0.820513 0.128205 0 0 0.871795 0.25641 0.025641 0.179487 0.538462 0.102564 0 0 0.897436 0.128205 0 0.102564 0.769231 0.128205 0.025641 0.205128 0.641026 0.102564 0.333333 0.25641 0.307692 0.25641 0.102564 0 0.641026 Reverse Complement Motif 0.641026 0.102564 0 0.25641 0.102564 0.25641 0.333333 0.307692 0.641026 0.025641 0.205128 0.128205 0.769231 0 0.102564 0.128205 0.897436 0 0 0.102564 0.538462 0.025641 0.179487 0.25641 0.871795 0 0 0.128205 0.820513 0.128205 0 0.0512821 0.538462 0.179487 0 0.282051 0.230769 0.230769 0.205128 0.333333 0.641026 0.128205 0.230769 0 0.641026 0.0769231 0.25641 0.025641 0.923077 0 0.0769231 0 0.74359 0.25641 0 0 0.769231 0 0 0.230769 0.435897 0.153846 0.333333 0.0769231 0.74359 0 0 0.25641 0.538462 0.0769231 0 0.384615 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 8 TFM3 Reverse Complement Original Motif Forward 7 11 0.0308097 Original Motif 0.454545 0 0 0.545455 0.5 0 0 0.5 0.318182 0.181818 0.0909091 0.409091 0 0 0.136364 0.863636 0.318182 0 0 0.681818 0.0454545 0 0.272727 0.681818 0.272727 0.0454545 0.0909091 0.590909 0.272727 0.0909091 0 0.636364 0.0454545 0.818182 0 0.136364 0.727273 0 0 0.272727 0.0909091 0.318182 0.227273 0.363636 0.863636 0.0454545 0 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0909091 0 0.5 0.0909091 0.0909091 0.318182 0.136364 0.227273 0 0.636364 0.227273 0 0 0.772727 0.363636 0.0909091 0 0.545455 0.772727 0.181818 0.0454545 0 Reverse Complement Motif 0 0.181818 0.0454545 0.772727 0.545455 0.0909091 0 0.363636 0.772727 0 0 0.227273 0.636364 0.227273 0 0.136364 0.318182 0.0909091 0.0909091 0.5 0 0.0909091 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0454545 0 0.863636 0.363636 0.318182 0.227273 0.0909091 0.272727 0 0 0.727273 0.0454545 0 0.818182 0.136364 0.636364 0.0909091 0 0.272727 0.590909 0.0454545 0.0909091 0.272727 0.681818 0 0.272727 0.0454545 0.681818 0 0 0.318182 0.863636 0 0.136364 0 0.409091 0.181818 0.0909091 0.318182 0.5 0 0 0.5 0.545455 0 0 0.454545 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 10 TFM13 Original Motif Original Motif Forward 8 11 0.0333874 Original Motif 0.666667 0.133333 0 0.2 0.0666667 0.2 0 0.733333 0.2 0 0.333333 0.466667 0.666667 0 0 0.333333 0.666667 0 0 0.333333 0.6 0 0 0.4 0.333333 0 0 0.666667 0 0.0666667 0 0.933333 0.133333 0.266667 0 0.6 0.266667 0 0 0.733333 0.466667 0 0.466667 0.0666667 0.6 0.333333 0 0.0666667 0.8 0.2 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.133333 0.2 0.2 0.466667 0.8 0 0.2 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 0.4 0.333333 0 0.266667 0.2 0 0 0.8 0.6 0 0 0.4 Reverse Complement Motif 0.4 0 0 0.6 0.8 0 0 0.2 0.266667 0.333333 0 0.4 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0 0 0.2 0.8 0.466667 0.2 0.2 0.133333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.2 0 0.8 0.0666667 0.333333 0 0.6 0.0666667 0 0.466667 0.466667 0.733333 0 0 0.266667 0.6 0.266667 0 0.133333 0.933333 0.0666667 0 0 0.666667 0 0 0.333333 0.4 0 0 0.6 0.333333 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.666667 0.466667 0 0.333333 0.2 0.733333 0.2 0 0.0666667 0.2 0.133333 0 0.666667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 TFM12 Reverse Complement Reverse Complement Backward 14 7 2.0544 Original Motif 0 1 0 0 0.19 0.4 0 0.41 0 0.52 0.19 0.29 0.11 0.61 0.1 0.18 0.18 0.29 0.33 0.2 0 0.38 0.35 0.27 0 0.82 0 0.18 0.18 0.39 0 0.43 0 0.53 0 0.47 0 0.47 0.15 0.38 0 0.24 0.24 0.52 0 0.87 0 0.13 0.05 0.68 0 0.27 0.18 0.38 0.1 0.34 0 0.62 0.22 0.16 0 0.66 0.09 0.25 0.2 0.15 0.13 0.52 0.04 0.46 0.16 0.34 0.06 0.53 0.03 0.38 0.05 0.57 0.04 0.34 Reverse Complement Motif 0.05 0.04 0.57 0.34 0.06 0.03 0.53 0.38 0.04 0.16 0.46 0.34 0.52 0.15 0.13 0.2 0 0.09 0.66 0.25 0 0.22 0.62 0.16 0.18 0.1 0.38 0.34 0.05 0 0.68 0.27 0 0 0.87 0.13 0.52 0.24 0.24 0 0 0.15 0.47 0.38 0 0 0.53 0.47 0.43 0.39 0 0.18 0 0 0.82 0.18 0 0.35 0.38 0.27 0.18 0.33 0.29 0.2 0.11 0.1 0.61 0.18 0 0.19 0.52 0.29 0.41 0.4 0 0.19 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 6 TFM2 Reverse Complement Reverse Complement Backward 12 5 3.05714 Original Motif 0.404762 0.047619 0.547619 0 0.238095 0.119048 0.642857 0 0.607143 0.0714286 0.321429 0 0.190476 0 0.797619 0.0119048 0.22619 0 0.738095 0.0357143 0.738095 0 0.238095 0.0238095 0.261905 0.142857 0.595238 0 0.345238 0.0714286 0.583333 0 0.547619 0 0.452381 0 0.0119048 0 0.988095 0 0.0119048 0.309524 0.678571 0 0.357143 0.261905 0.190476 0.190476 0.309524 0 0.690476 0 0.25 0.0952381 0.654762 0 0.309524 0.047619 0.392857 0.25 0.0357143 0.0952381 0.857143 0.0119048 Reverse Complement Motif 0.0357143 0.857143 0.0952381 0.0119048 0.309524 0.392857 0.047619 0.25 0.25 0.654762 0.0952381 0 0.309524 0.690476 0 0 0.190476 0.261905 0.190476 0.357143 0.0119048 0.678571 0.309524 0 0.0119048 0.988095 0 0 0 0 0.452381 0.547619 0.345238 0.583333 0.0714286 0 0.261905 0.595238 0.142857 0 0.0238095 0 0.238095 0.738095 0.22619 0.738095 0 0.0357143 0.190476 0.797619 0 0.0119048 0 0.0714286 0.321429 0.607143 0.238095 0.642857 0.119048 0 0.404762 0.547619 0.047619 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 4 TFF1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 9 4 3.54896 Original Motif 0.180952 0.533333 0.142857 0.142857 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.0190476 0.047619 0.914286 0.0190476 0.4 0.333333 0.219048 0.047619 0.0285714 0.047619 0.885714 0.0380952 0.0380952 0.895238 0.00952381 0.0571429 0.133333 0.733333 0.0666667 0.0666667 0.0380952 0.0380952 0.87619 0.047619 0.12381 0.752381 0.114286 0.00952381 0.314286 0.190476 0.390476 0.104762 0.12381 0.0285714 0.771429 0.0761905 0.0571429 0.904762 0.0285714 0.00952381 Reverse Complement Motif 0.0571429 0.0285714 0.904762 0.00952381 0.12381 0.771429 0.0285714 0.0761905 0.314286 0.390476 0.190476 0.104762 0.12381 0.114286 0.752381 0.00952381 0.0380952 0.87619 0.0380952 0.047619 0.133333 0.0666667 0.733333 0.0666667 0.0380952 0.00952381 0.895238 0.0571429 0.0285714 0.885714 0.047619 0.0380952 0.047619 0.333333 0.219048 0.4 0.0190476 0.914286 0.047619 0.0190476 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.180952 0.142857 0.533333 0.142857 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 19 Motif Name wsTACwGTAsw Original Motif 0.277778 0.222222 0.166667 0.333333 0.166667 0.444444 0.277778 0.111111 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0.5 0 0 0.5 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0.111111 0.277778 0.444444 0.166667 0.333333 0.166667 0.222222 0.277778 Reverse Complement Motif 0.277778 0.166667 0.222222 0.333333 0.111111 0.444444 0.277778 0.166667 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0.5 0 0 0.5 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0.166667 0.277778 0.444444 0.111111 0.333333 0.222222 0.166667 0.277778 *************************************************************** Best Matches for Top Significant Motif ID 19 (Highest to Lowest) *************************************************************** Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 8 TFM3 Reverse Complement Original Motif Backward 5 11 0.0413797 Original Motif 0.454545 0 0 0.545455 0.5 0 0 0.5 0.318182 0.181818 0.0909091 0.409091 0 0 0.136364 0.863636 0.318182 0 0 0.681818 0.0454545 0 0.272727 0.681818 0.272727 0.0454545 0.0909091 0.590909 0.272727 0.0909091 0 0.636364 0.0454545 0.818182 0 0.136364 0.727273 0 0 0.272727 0.0909091 0.318182 0.227273 0.363636 0.863636 0.0454545 0 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0909091 0 0.5 0.0909091 0.0909091 0.318182 0.136364 0.227273 0 0.636364 0.227273 0 0 0.772727 0.363636 0.0909091 0 0.545455 0.772727 0.181818 0.0454545 0 Reverse Complement Motif 0 0.181818 0.0454545 0.772727 0.545455 0.0909091 0 0.363636 0.772727 0 0 0.227273 0.636364 0.227273 0 0.136364 0.318182 0.0909091 0.0909091 0.5 0 0.0909091 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0454545 0 0.863636 0.363636 0.318182 0.227273 0.0909091 0.272727 0 0 0.727273 0.0454545 0 0.818182 0.136364 0.636364 0.0909091 0 0.272727 0.590909 0.0454545 0.0909091 0.272727 0.681818 0 0.272727 0.0454545 0.681818 0 0 0.318182 0.863636 0 0.136364 0 0.409091 0.181818 0.0909091 0.318182 0.5 0 0 0.5 0.545455 0 0 0.454545 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 10 TFM13 Original Motif Reverse Complement Backward 3 11 0.0445707 Original Motif 0.666667 0.133333 0 0.2 0.0666667 0.2 0 0.733333 0.2 0 0.333333 0.466667 0.666667 0 0 0.333333 0.666667 0 0 0.333333 0.6 0 0 0.4 0.333333 0 0 0.666667 0 0.0666667 0 0.933333 0.133333 0.266667 0 0.6 0.266667 0 0 0.733333 0.466667 0 0.466667 0.0666667 0.6 0.333333 0 0.0666667 0.8 0.2 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.133333 0.2 0.2 0.466667 0.8 0 0.2 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 0.4 0.333333 0 0.266667 0.2 0 0 0.8 0.6 0 0 0.4 Reverse Complement Motif 0.4 0 0 0.6 0.8 0 0 0.2 0.266667 0.333333 0 0.4 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0 0 0.2 0.8 0.466667 0.2 0.2 0.133333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.2 0 0.8 0.0666667 0.333333 0 0.6 0.0666667 0 0.466667 0.466667 0.733333 0 0 0.266667 0.6 0.266667 0 0.133333 0.933333 0.0666667 0 0 0.666667 0 0 0.333333 0.4 0 0 0.6 0.333333 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.666667 0.466667 0 0.333333 0.2 0.733333 0.2 0 0.0666667 0.2 0.133333 0 0.666667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 TFM11 Reverse Complement Original Motif Backward 12 11 0.0472742 Original Motif 0.294118 0.235294 0.117647 0.352941 0.382353 0.205882 0.205882 0.205882 0.529412 0 0.117647 0.352941 0.235294 0.294118 0.323529 0.147059 1 0 0 0 0.941176 0 0 0.0588235 0.764706 0 0.0294118 0.205882 0.382353 0.235294 0.176471 0.205882 0.735294 0 0.0588235 0.205882 0.735294 0.0294118 0.117647 0.117647 0.676471 0 0.0882353 0.235294 0.529412 0.117647 0.205882 0.147059 0.705882 0.176471 0.117647 0 0.441176 0.352941 0.147059 0.0588235 0.941176 0.0588235 0 0 0.852941 0 0.147059 0 0.676471 0.0882353 0 0.235294 0.529412 0.323529 0.117647 0.0294118 0.470588 0.176471 0 0.352941 0.411765 0 0.147059 0.441176 0.5 0.0882353 0.147059 0.264706 0.294118 0.205882 0.0882353 0.411765 0.205882 0.235294 0.264706 0.294118 0.470588 0 0.117647 0.411765 0.617647 0.176471 0.205882 0 Reverse Complement Motif 0 0.176471 0.205882 0.617647 0.411765 0 0.117647 0.470588 0.294118 0.235294 0.264706 0.205882 0.411765 0.205882 0.0882353 0.294118 0.264706 0.0882353 0.147059 0.5 0.441176 0 0.147059 0.411765 0.352941 0.176471 0 0.470588 0.0294118 0.323529 0.117647 0.529412 0.235294 0.0882353 0 0.676471 0 0 0.147059 0.852941 0 0.0588235 0 0.941176 0.0588235 0.352941 0.147059 0.441176 0 0.176471 0.117647 0.705882 0.147059 0.117647 0.205882 0.529412 0.235294 0 0.0882353 0.676471 0.117647 0.0294118 0.117647 0.735294 0.205882 0 0.0588235 0.735294 0.205882 0.235294 0.176471 0.382353 0.205882 0 0.0294118 0.764706 0.0588235 0 0 0.941176 0 0 0 1 0.235294 0.323529 0.294118 0.147059 0.352941 0 0.117647 0.529412 0.205882 0.205882 0.205882 0.382353 0.352941 0.235294 0.117647 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 7 TFM1 Reverse Complement Original Motif Forward 10 9 1.04742 Original Motif 0.384615 0.0769231 0 0.538462 0.25641 0 0 0.74359 0.0769231 0.153846 0.333333 0.435897 0.230769 0 0 0.769231 0 0.25641 0 0.74359 0 0 0.0769231 0.923077 0.025641 0.0769231 0.25641 0.641026 0 0.128205 0.230769 0.641026 0.333333 0.230769 0.205128 0.230769 0.282051 0.179487 0 0.538462 0.0512821 0.128205 0 0.820513 0.128205 0 0 0.871795 0.25641 0.025641 0.179487 0.538462 0.102564 0 0 0.897436 0.128205 0 0.102564 0.769231 0.128205 0.025641 0.205128 0.641026 0.102564 0.333333 0.25641 0.307692 0.25641 0.102564 0 0.641026 Reverse Complement Motif 0.641026 0.102564 0 0.25641 0.102564 0.25641 0.333333 0.307692 0.641026 0.025641 0.205128 0.128205 0.769231 0 0.102564 0.128205 0.897436 0 0 0.102564 0.538462 0.025641 0.179487 0.25641 0.871795 0 0 0.128205 0.820513 0.128205 0 0.0512821 0.538462 0.179487 0 0.282051 0.230769 0.230769 0.205128 0.333333 0.641026 0.128205 0.230769 0 0.641026 0.0769231 0.25641 0.025641 0.923077 0 0.0769231 0 0.74359 0.25641 0 0 0.769231 0 0 0.230769 0.435897 0.153846 0.333333 0.0769231 0.74359 0 0 0.25641 0.538462 0.0769231 0 0.384615 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 TFM12 Reverse Complement Original Motif Backward 15 6 2.54736 Original Motif 0 1 0 0 0.19 0.4 0 0.41 0 0.52 0.19 0.29 0.11 0.61 0.1 0.18 0.18 0.29 0.33 0.2 0 0.38 0.35 0.27 0 0.82 0 0.18 0.18 0.39 0 0.43 0 0.53 0 0.47 0 0.47 0.15 0.38 0 0.24 0.24 0.52 0 0.87 0 0.13 0.05 0.68 0 0.27 0.18 0.38 0.1 0.34 0 0.62 0.22 0.16 0 0.66 0.09 0.25 0.2 0.15 0.13 0.52 0.04 0.46 0.16 0.34 0.06 0.53 0.03 0.38 0.05 0.57 0.04 0.34 Reverse Complement Motif 0.05 0.04 0.57 0.34 0.06 0.03 0.53 0.38 0.04 0.16 0.46 0.34 0.52 0.15 0.13 0.2 0 0.09 0.66 0.25 0 0.22 0.62 0.16 0.18 0.1 0.38 0.34 0.05 0 0.68 0.27 0 0 0.87 0.13 0.52 0.24 0.24 0 0 0.15 0.47 0.38 0 0 0.53 0.47 0.43 0.39 0 0.18 0 0 0.82 0.18 0 0.35 0.38 0.27 0.18 0.33 0.29 0.2 0.11 0.1 0.61 0.18 0 0.19 0.52 0.29 0.41 0.4 0 0.19 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 5 TFF11 Reverse Complement Original Motif Forward 10 5 3.04599 Original Motif 0.0761905 0.0857143 0.819048 0.0190476 0.0761905 0.0666667 0.780952 0.0761905 0.438095 0.32381 0.180952 0.0571429 0.12381 0.180952 0.657143 0.0380952 0.0952381 0.0761905 0.790476 0.0380952 0.371429 0.104762 0.485714 0.0380952 0.0190476 0.0380952 0.914286 0.0285714 0.0190476 0.0952381 0.885714 0 0.0571429 0.866667 0.0666667 0.00952381 0.00952381 0.00952381 0.980952 0 0.047619 0.104762 0.838095 0.00952381 0.333333 0.161905 0.409524 0.0952381 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.114286 0.580952 0.266667 0.0380952 Reverse Complement Motif 0.114286 0.266667 0.580952 0.0380952 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.333333 0.409524 0.161905 0.0952381 0.047619 0.838095 0.104762 0.00952381 0.00952381 0.980952 0.00952381 0 0.0571429 0.0666667 0.866667 0.00952381 0.0190476 0.885714 0.0952381 0 0.0190476 0.914286 0.0380952 0.0285714 0.371429 0.485714 0.104762 0.0380952 0.0952381 0.790476 0.0761905 0.0380952 0.12381 0.657143 0.180952 0.0380952 0.0571429 0.32381 0.180952 0.438095 0.0761905 0.780952 0.0666667 0.0761905 0.0761905 0.819048 0.0857143 0.0190476 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 6 TFM2 Reverse Complement Original Motif Forward 12 5 3.04861 Original Motif 0.404762 0.047619 0.547619 0 0.238095 0.119048 0.642857 0 0.607143 0.0714286 0.321429 0 0.190476 0 0.797619 0.0119048 0.22619 0 0.738095 0.0357143 0.738095 0 0.238095 0.0238095 0.261905 0.142857 0.595238 0 0.345238 0.0714286 0.583333 0 0.547619 0 0.452381 0 0.0119048 0 0.988095 0 0.0119048 0.309524 0.678571 0 0.357143 0.261905 0.190476 0.190476 0.309524 0 0.690476 0 0.25 0.0952381 0.654762 0 0.309524 0.047619 0.392857 0.25 0.0357143 0.0952381 0.857143 0.0119048 Reverse Complement Motif 0.0357143 0.857143 0.0952381 0.0119048 0.309524 0.392857 0.047619 0.25 0.25 0.654762 0.0952381 0 0.309524 0.690476 0 0 0.190476 0.261905 0.190476 0.357143 0.0119048 0.678571 0.309524 0 0.0119048 0.988095 0 0 0 0 0.452381 0.547619 0.345238 0.583333 0.0714286 0 0.261905 0.595238 0.142857 0 0.0238095 0 0.238095 0.738095 0.22619 0.738095 0 0.0357143 0.190476 0.797619 0 0.0119048 0 0.0714286 0.321429 0.607143 0.238095 0.642857 0.119048 0 0.404762 0.547619 0.047619 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 16 Motif Name kcACCTGCAgc Original Motif 0.153846 0.230769 0.307692 0.307692 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0.153846 0.230769 0.461538 0.153846 0.153846 0.615385 0.153846 0.0769231 Reverse Complement Motif 0.153846 0.153846 0.615385 0.0769231 0.153846 0.461538 0.230769 0.153846 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0.153846 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 0.307692 0.230769 0.307692 *************************************************************** Best Matches for Top Significant Motif ID 16 (Highest to Lowest) *************************************************************** Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 5 TFF11 Reverse Complement Original Motif Backward 4 11 0.0312321 Original Motif 0.0761905 0.0857143 0.819048 0.0190476 0.0761905 0.0666667 0.780952 0.0761905 0.438095 0.32381 0.180952 0.0571429 0.12381 0.180952 0.657143 0.0380952 0.0952381 0.0761905 0.790476 0.0380952 0.371429 0.104762 0.485714 0.0380952 0.0190476 0.0380952 0.914286 0.0285714 0.0190476 0.0952381 0.885714 0 0.0571429 0.866667 0.0666667 0.00952381 0.00952381 0.00952381 0.980952 0 0.047619 0.104762 0.838095 0.00952381 0.333333 0.161905 0.409524 0.0952381 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.114286 0.580952 0.266667 0.0380952 Reverse Complement Motif 0.114286 0.266667 0.580952 0.0380952 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.333333 0.409524 0.161905 0.0952381 0.047619 0.838095 0.104762 0.00952381 0.00952381 0.980952 0.00952381 0 0.0571429 0.0666667 0.866667 0.00952381 0.0190476 0.885714 0.0952381 0 0.0190476 0.914286 0.0380952 0.0285714 0.371429 0.485714 0.104762 0.0380952 0.0952381 0.790476 0.0761905 0.0380952 0.12381 0.657143 0.180952 0.0380952 0.0571429 0.32381 0.180952 0.438095 0.0761905 0.780952 0.0666667 0.0761905 0.0761905 0.819048 0.0857143 0.0190476 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 TFM12 Reverse Complement Reverse Complement Backward 6 11 0.0444938 Original Motif 0 1 0 0 0.19 0.4 0 0.41 0 0.52 0.19 0.29 0.11 0.61 0.1 0.18 0.18 0.29 0.33 0.2 0 0.38 0.35 0.27 0 0.82 0 0.18 0.18 0.39 0 0.43 0 0.53 0 0.47 0 0.47 0.15 0.38 0 0.24 0.24 0.52 0 0.87 0 0.13 0.05 0.68 0 0.27 0.18 0.38 0.1 0.34 0 0.62 0.22 0.16 0 0.66 0.09 0.25 0.2 0.15 0.13 0.52 0.04 0.46 0.16 0.34 0.06 0.53 0.03 0.38 0.05 0.57 0.04 0.34 Reverse Complement Motif 0.05 0.04 0.57 0.34 0.06 0.03 0.53 0.38 0.04 0.16 0.46 0.34 0.52 0.15 0.13 0.2 0 0.09 0.66 0.25 0 0.22 0.62 0.16 0.18 0.1 0.38 0.34 0.05 0 0.68 0.27 0 0 0.87 0.13 0.52 0.24 0.24 0 0 0.15 0.47 0.38 0 0 0.53 0.47 0.43 0.39 0 0.18 0 0 0.82 0.18 0 0.35 0.38 0.27 0.18 0.33 0.29 0.2 0.11 0.1 0.61 0.18 0 0.19 0.52 0.29 0.41 0.4 0 0.19 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 6 TFM2 Reverse Complement Original Motif Backward 7 10 0.538471 Original Motif 0.404762 0.047619 0.547619 0 0.238095 0.119048 0.642857 0 0.607143 0.0714286 0.321429 0 0.190476 0 0.797619 0.0119048 0.22619 0 0.738095 0.0357143 0.738095 0 0.238095 0.0238095 0.261905 0.142857 0.595238 0 0.345238 0.0714286 0.583333 0 0.547619 0 0.452381 0 0.0119048 0 0.988095 0 0.0119048 0.309524 0.678571 0 0.357143 0.261905 0.190476 0.190476 0.309524 0 0.690476 0 0.25 0.0952381 0.654762 0 0.309524 0.047619 0.392857 0.25 0.0357143 0.0952381 0.857143 0.0119048 Reverse Complement Motif 0.0357143 0.857143 0.0952381 0.0119048 0.309524 0.392857 0.047619 0.25 0.25 0.654762 0.0952381 0 0.309524 0.690476 0 0 0.190476 0.261905 0.190476 0.357143 0.0119048 0.678571 0.309524 0 0.0119048 0.988095 0 0 0 0 0.452381 0.547619 0.345238 0.583333 0.0714286 0 0.261905 0.595238 0.142857 0 0.0238095 0 0.238095 0.738095 0.22619 0.738095 0 0.0357143 0.190476 0.797619 0 0.0119048 0 0.0714286 0.321429 0.607143 0.238095 0.642857 0.119048 0 0.404762 0.547619 0.047619 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 4 TFF1 Original Motif Reverse Complement Forward 5 8 1.54364 Original Motif 0.180952 0.533333 0.142857 0.142857 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.0190476 0.047619 0.914286 0.0190476 0.4 0.333333 0.219048 0.047619 0.0285714 0.047619 0.885714 0.0380952 0.0380952 0.895238 0.00952381 0.0571429 0.133333 0.733333 0.0666667 0.0666667 0.0380952 0.0380952 0.87619 0.047619 0.12381 0.752381 0.114286 0.00952381 0.314286 0.190476 0.390476 0.104762 0.12381 0.0285714 0.771429 0.0761905 0.0571429 0.904762 0.0285714 0.00952381 Reverse Complement Motif 0.0571429 0.0285714 0.904762 0.00952381 0.12381 0.771429 0.0285714 0.0761905 0.314286 0.390476 0.190476 0.104762 0.12381 0.114286 0.752381 0.00952381 0.0380952 0.87619 0.0380952 0.047619 0.133333 0.0666667 0.733333 0.0666667 0.0380952 0.00952381 0.895238 0.0571429 0.0285714 0.885714 0.047619 0.0380952 0.047619 0.333333 0.219048 0.4 0.0190476 0.914286 0.047619 0.0190476 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.180952 0.142857 0.533333 0.142857 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 3 TFW3 Reverse Complement Original Motif Backward 3 8 1.5466 Original Motif 0.02 0.92 0.05 0.01 0 0.03 0.96 0.01 0 0.17 0.83 0 0 0.99 0 0.01 0 0.27 0.21 0.52 0.03 0.3 0.37 0.3 0 0.95 0.05 0 0.02 0.13 0.8 0.05 0 0.88 0.12 0 0.01 0.22 0.76 0.01 Reverse Complement Motif 0.01 0.76 0.22 0.01 0 0.12 0.88 0 0.02 0.8 0.13 0.05 0 0.05 0.95 0 0.03 0.37 0.3 0.3 0.52 0.27 0.21 0 0 0 0.99 0.01 0 0.83 0.17 0 0 0.96 0.03 0.01 0.02 0.05 0.92 0.01 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 1 TFW1 Reverse Complement Original Motif Backward 1 6 2.54121 Original Motif 0 0.082495 0.917505 0 0.0744467 0.217304 0.197183 0.511066 0 0.897384 0.102616 0 0.0503018 0.102616 0.847082 0 0 0.949698 0.0503018 0 0 0.0523139 0.947686 0 Reverse Complement Motif 0 0.947686 0.0523139 0 0 0.0503018 0.949698 0 0.0503018 0.847082 0.102616 0 0 0.102616 0.897384 0 0.511066 0.217304 0.197183 0.0744467 0 0.917505 0.082495 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 2 TFW2 Original Motif Reverse Complement Forward 5 4 3.53211 Original Motif 0.0058309 0.364431 0.41691 0.212828 0.0816327 0.816327 0.0991254 0.00291545 0.00291545 0.0670554 0.921283 0.00874636 0.0058309 0.883382 0.107872 0.00291545 0 0.0962099 0.860058 0.0437318 0.00291545 0.906706 0.0787172 0.0116618 0.0437318 0.0758017 0.825073 0.0553936 0 0.125364 0.87172 0.00291545 Reverse Complement Motif 0 0.87172 0.125364 0.00291545 0.0437318 0.825073 0.0758017 0.0553936 0.00291545 0.0787172 0.906706 0.0116618 0 0.860058 0.0962099 0.0437318 0.0058309 0.107872 0.883382 0.00291545 0.00291545 0.921283 0.0670554 0.00874636 0.0816327 0.0991254 0.816327 0.00291545 0.0058309 0.41691 0.364431 0.212828 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 TFM11 Reverse Complement Reverse Complement Backward 22 4 3.53789 Original Motif 0.294118 0.235294 0.117647 0.352941 0.382353 0.205882 0.205882 0.205882 0.529412 0 0.117647 0.352941 0.235294 0.294118 0.323529 0.147059 1 0 0 0 0.941176 0 0 0.0588235 0.764706 0 0.0294118 0.205882 0.382353 0.235294 0.176471 0.205882 0.735294 0 0.0588235 0.205882 0.735294 0.0294118 0.117647 0.117647 0.676471 0 0.0882353 0.235294 0.529412 0.117647 0.205882 0.147059 0.705882 0.176471 0.117647 0 0.441176 0.352941 0.147059 0.0588235 0.941176 0.0588235 0 0 0.852941 0 0.147059 0 0.676471 0.0882353 0 0.235294 0.529412 0.323529 0.117647 0.0294118 0.470588 0.176471 0 0.352941 0.411765 0 0.147059 0.441176 0.5 0.0882353 0.147059 0.264706 0.294118 0.205882 0.0882353 0.411765 0.205882 0.235294 0.264706 0.294118 0.470588 0 0.117647 0.411765 0.617647 0.176471 0.205882 0 Reverse Complement Motif 0 0.176471 0.205882 0.617647 0.411765 0 0.117647 0.470588 0.294118 0.235294 0.264706 0.205882 0.411765 0.205882 0.0882353 0.294118 0.264706 0.0882353 0.147059 0.5 0.441176 0 0.147059 0.411765 0.352941 0.176471 0 0.470588 0.0294118 0.323529 0.117647 0.529412 0.235294 0.0882353 0 0.676471 0 0 0.147059 0.852941 0 0.0588235 0 0.941176 0.0588235 0.352941 0.147059 0.441176 0 0.176471 0.117647 0.705882 0.147059 0.117647 0.205882 0.529412 0.235294 0 0.0882353 0.676471 0.117647 0.0294118 0.117647 0.735294 0.205882 0 0.0588235 0.735294 0.205882 0.235294 0.176471 0.382353 0.205882 0 0.0294118 0.764706 0.0588235 0 0 0.941176 0 0 0 1 0.235294 0.323529 0.294118 0.147059 0.352941 0 0.117647 0.529412 0.205882 0.205882 0.205882 0.382353 0.352941 0.235294 0.117647 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 1 Motif ID 4 Motif Name TFF1 Original Motif 0.180952 0.533333 0.142857 0.142857 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.0190476 0.047619 0.914286 0.0190476 0.4 0.333333 0.219048 0.047619 0.0285714 0.047619 0.885714 0.0380952 0.0380952 0.895238 0.00952381 0.0571429 0.133333 0.733333 0.0666667 0.0666667 0.0380952 0.0380952 0.87619 0.047619 0.12381 0.752381 0.114286 0.00952381 0.314286 0.190476 0.390476 0.104762 0.12381 0.0285714 0.771429 0.0761905 0.0571429 0.904762 0.0285714 0.00952381 Reverse Complement Motif 0.0571429 0.0285714 0.904762 0.00952381 0.12381 0.771429 0.0285714 0.0761905 0.314286 0.390476 0.190476 0.104762 0.12381 0.114286 0.752381 0.00952381 0.0380952 0.87619 0.0380952 0.047619 0.133333 0.0666667 0.733333 0.0666667 0.0380952 0.00952381 0.895238 0.0571429 0.0285714 0.885714 0.047619 0.0380952 0.047619 0.333333 0.219048 0.4 0.0190476 0.914286 0.047619 0.0190476 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.180952 0.142857 0.533333 0.142857 *************************************************************** Best Matches for Top Significant Motif ID 4 (Highest to Lowest) *************************************************************** Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 csGCCCCGCCCCsc Original Motif Original Motif Backward 3 12 0.0542674 Original Motif 0.179104 0.492537 0.164179 0.164179 0.223881 0.402985 0.283582 0.0895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0746269 0 0.895522 0.0895522 0.0149254 0 0.925373 0.0149254 0.0597015 0.0298507 0.970149 0 0 0 0.970149 0.0298507 0 0.0447761 0 0.940299 0.0149254 0 0.955224 0.0149254 0.0298507 0.0298507 0.955224 0.0149254 0 0.0298507 0.925373 0.0149254 0.0298507 0.119403 0.820896 0.0149254 0.0447761 0.104478 0.328358 0.373134 0.19403 0.179104 0.358209 0.223881 0.238806 Reverse Complement Motif 0.179104 0.223881 0.358209 0.238806 0.104478 0.373134 0.328358 0.19403 0.119403 0.0149254 0.820896 0.0447761 0.0298507 0.0149254 0.925373 0.0298507 0.0298507 0.0149254 0.955224 0 0 0.0149254 0.955224 0.0298507 0.0447761 0.940299 0 0.0149254 0 0.0298507 0.970149 0 0.0298507 0 0.970149 0 0 0.0149254 0.925373 0.0597015 0 0.0895522 0.895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0149254 0.0746269 0.223881 0.283582 0.402985 0.0895522 0.179104 0.164179 0.492537 0.164179 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 14 cccGCCCCGCCCCsb Reverse Complement Original Motif Backward 1 12 0.0548371 Original Motif 0.148936 0.425532 0.234043 0.191489 0.106383 0.553191 0.170213 0.170213 0.106383 0.659574 0.148936 0.0851064 0.0425532 0 0.851064 0.106383 0 0.93617 0.0638298 0 0 0.87234 0.0425532 0.0851064 0 1 0 0 0 0.957447 0.0425532 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.0425532 0.93617 0.0212766 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0.0638298 0.914894 0.0212766 0 0.0638298 0.297872 0.404255 0.234043 0.148936 0.319149 0.255319 0.276596 Reverse Complement Motif 0.148936 0.255319 0.319149 0.276596 0.0638298 0.404255 0.297872 0.234043 0.0638298 0.0212766 0.914894 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0.0425532 0.0212766 0.93617 0 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0 0.0425532 0.957447 0 0 0 1 0 0 0.0425532 0.87234 0.0851064 0 0.0638298 0.93617 0 0.0425532 0.851064 0 0.106383 0.106383 0.148936 0.659574 0.0851064 0.106383 0.170213 0.553191 0.170213 0.148936 0.234043 0.425532 0.191489 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 sSGTCACGTGACSs Reverse Complement Original Motif Backward 1 12 0.0777862 Original Motif 0.0555556 0.388889 0.388889 0.166667 0 0.277778 0.722222 0 0.0555556 0.111111 0.833333 0 0.111111 0 0.0555556 0.833333 0 0.888889 0.111111 0 1 0 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.0555556 0.944444 0 0 0 0 1 0 0.111111 0.888889 0 0.833333 0.0555556 0 0.111111 0 0.833333 0.111111 0.0555556 0 0.722222 0.277778 0 0.166667 0.388889 0.388889 0.0555556 Reverse Complement Motif 0.166667 0.388889 0.388889 0.0555556 0 0.277778 0.722222 0 0 0.111111 0.833333 0.0555556 0.111111 0.0555556 0 0.833333 0 0.888889 0.111111 0 1 0 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.0555556 0.944444 0 0 0 0 1 0 0.111111 0.888889 0 0.833333 0 0.0555556 0.111111 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0 0.722222 0.277778 0 0.0555556 0.388889 0.388889 0.166667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 kcACCTGCAgc Original Motif Reverse Complement Backward 4 8 2.08028 Original Motif 0.153846 0.230769 0.307692 0.307692 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0.153846 0.230769 0.461538 0.153846 0.153846 0.615385 0.153846 0.0769231 Reverse Complement Motif 0.153846 0.153846 0.615385 0.0769231 0.153846 0.461538 0.230769 0.153846 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0.153846 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 0.307692 0.230769 0.307692 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 15 kCAGCCAATmr Original Motif Original Motif Backward 7 5 3.54126 Original Motif 0.235294 0.176471 0.294118 0.294118 0.117647 0.705882 0.176471 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0.352941 0.352941 0.235294 0.0588235 0.352941 0.176471 0.411765 0.0588235 Reverse Complement Motif 0.352941 0.411765 0.176471 0.0588235 0.0588235 0.352941 0.235294 0.352941 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.117647 0.176471 0.705882 0 0.235294 0.294118 0.176471 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 dhACATTCTkh Reverse Complement Reverse Complement Forward 8 4 4.07107 Original Motif 0.333333 0 0.333333 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0.666667 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 Reverse Complement Motif 0.333333 0.333333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 1 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 wbgTAAATAww Reverse Complement Reverse Complement Forward 8 4 4.0742 Original Motif 0.285714 0.142857 0.178571 0.392857 0.214286 0.285714 0.25 0.25 0.142857 0.0714286 0.678571 0.107143 0 0 0 1 0.928571 0 0.0357143 0.0357143 0.821429 0.107143 0.0357143 0.0357143 0.821429 0 0.178571 0 0 0.0714286 0 0.928571 0.928571 0.0357143 0.0357143 0 0.285714 0.214286 0.142857 0.357143 0.392857 0.178571 0.178571 0.25 Reverse Complement Motif 0.25 0.178571 0.178571 0.392857 0.357143 0.214286 0.142857 0.285714 0 0.0357143 0.0357143 0.928571 0.928571 0.0714286 0 0 0 0 0.178571 0.821429 0.0357143 0.107143 0.0357143 0.821429 0.0357143 0 0.0357143 0.928571 1 0 0 0 0.142857 0.678571 0.0714286 0.107143 0.214286 0.25 0.285714 0.25 0.392857 0.142857 0.178571 0.285714 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 20 Motif Name dhACATTCTkh Original Motif 0.333333 0 0.333333 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0.666667 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 Reverse Complement Motif 0.333333 0.333333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 1 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 *************************************************************** Best Matches for Top Significant Motif ID 20 (Highest to Lowest) *************************************************************** Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 8 TFM3 Reverse Complement Original Motif Forward 1 11 0.00522383 Original Motif 0.454545 0 0 0.545455 0.5 0 0 0.5 0.318182 0.181818 0.0909091 0.409091 0 0 0.136364 0.863636 0.318182 0 0 0.681818 0.0454545 0 0.272727 0.681818 0.272727 0.0454545 0.0909091 0.590909 0.272727 0.0909091 0 0.636364 0.0454545 0.818182 0 0.136364 0.727273 0 0 0.272727 0.0909091 0.318182 0.227273 0.363636 0.863636 0.0454545 0 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0909091 0 0.5 0.0909091 0.0909091 0.318182 0.136364 0.227273 0 0.636364 0.227273 0 0 0.772727 0.363636 0.0909091 0 0.545455 0.772727 0.181818 0.0454545 0 Reverse Complement Motif 0 0.181818 0.0454545 0.772727 0.545455 0.0909091 0 0.363636 0.772727 0 0 0.227273 0.636364 0.227273 0 0.136364 0.318182 0.0909091 0.0909091 0.5 0 0.0909091 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0454545 0 0.863636 0.363636 0.318182 0.227273 0.0909091 0.272727 0 0 0.727273 0.0454545 0 0.818182 0.136364 0.636364 0.0909091 0 0.272727 0.590909 0.0454545 0.0909091 0.272727 0.681818 0 0.272727 0.0454545 0.681818 0 0 0.318182 0.863636 0 0.136364 0 0.409091 0.181818 0.0909091 0.318182 0.5 0 0 0.5 0.545455 0 0 0.454545 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 TFM11 Reverse Complement Original Motif Backward 11 11 0.014258 Original Motif 0.294118 0.235294 0.117647 0.352941 0.382353 0.205882 0.205882 0.205882 0.529412 0 0.117647 0.352941 0.235294 0.294118 0.323529 0.147059 1 0 0 0 0.941176 0 0 0.0588235 0.764706 0 0.0294118 0.205882 0.382353 0.235294 0.176471 0.205882 0.735294 0 0.0588235 0.205882 0.735294 0.0294118 0.117647 0.117647 0.676471 0 0.0882353 0.235294 0.529412 0.117647 0.205882 0.147059 0.705882 0.176471 0.117647 0 0.441176 0.352941 0.147059 0.0588235 0.941176 0.0588235 0 0 0.852941 0 0.147059 0 0.676471 0.0882353 0 0.235294 0.529412 0.323529 0.117647 0.0294118 0.470588 0.176471 0 0.352941 0.411765 0 0.147059 0.441176 0.5 0.0882353 0.147059 0.264706 0.294118 0.205882 0.0882353 0.411765 0.205882 0.235294 0.264706 0.294118 0.470588 0 0.117647 0.411765 0.617647 0.176471 0.205882 0 Reverse Complement Motif 0 0.176471 0.205882 0.617647 0.411765 0 0.117647 0.470588 0.294118 0.235294 0.264706 0.205882 0.411765 0.205882 0.0882353 0.294118 0.264706 0.0882353 0.147059 0.5 0.441176 0 0.147059 0.411765 0.352941 0.176471 0 0.470588 0.0294118 0.323529 0.117647 0.529412 0.235294 0.0882353 0 0.676471 0 0 0.147059 0.852941 0 0.0588235 0 0.941176 0.0588235 0.352941 0.147059 0.441176 0 0.176471 0.117647 0.705882 0.147059 0.117647 0.205882 0.529412 0.235294 0 0.0882353 0.676471 0.117647 0.0294118 0.117647 0.735294 0.205882 0 0.0588235 0.735294 0.205882 0.235294 0.176471 0.382353 0.205882 0 0.0294118 0.764706 0.0588235 0 0 0.941176 0 0 0 1 0.235294 0.323529 0.294118 0.147059 0.352941 0 0.117647 0.529412 0.205882 0.205882 0.205882 0.382353 0.352941 0.235294 0.117647 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 10 TFM13 Original Motif Original Motif Backward 9 11 0.0192045 Original Motif 0.666667 0.133333 0 0.2 0.0666667 0.2 0 0.733333 0.2 0 0.333333 0.466667 0.666667 0 0 0.333333 0.666667 0 0 0.333333 0.6 0 0 0.4 0.333333 0 0 0.666667 0 0.0666667 0 0.933333 0.133333 0.266667 0 0.6 0.266667 0 0 0.733333 0.466667 0 0.466667 0.0666667 0.6 0.333333 0 0.0666667 0.8 0.2 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.133333 0.2 0.2 0.466667 0.8 0 0.2 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 0.4 0.333333 0 0.266667 0.2 0 0 0.8 0.6 0 0 0.4 Reverse Complement Motif 0.4 0 0 0.6 0.8 0 0 0.2 0.266667 0.333333 0 0.4 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0 0 0.2 0.8 0.466667 0.2 0.2 0.133333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.2 0 0.8 0.0666667 0.333333 0 0.6 0.0666667 0 0.466667 0.466667 0.733333 0 0 0.266667 0.6 0.266667 0 0.133333 0.933333 0.0666667 0 0 0.666667 0 0 0.333333 0.4 0 0 0.6 0.333333 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.666667 0.466667 0 0.333333 0.2 0.733333 0.2 0 0.0666667 0.2 0.133333 0 0.666667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 7 TFM1 Reverse Complement Reverse Complement Forward 9 10 0.519904 Original Motif 0.384615 0.0769231 0 0.538462 0.25641 0 0 0.74359 0.0769231 0.153846 0.333333 0.435897 0.230769 0 0 0.769231 0 0.25641 0 0.74359 0 0 0.0769231 0.923077 0.025641 0.0769231 0.25641 0.641026 0 0.128205 0.230769 0.641026 0.333333 0.230769 0.205128 0.230769 0.282051 0.179487 0 0.538462 0.0512821 0.128205 0 0.820513 0.128205 0 0 0.871795 0.25641 0.025641 0.179487 0.538462 0.102564 0 0 0.897436 0.128205 0 0.102564 0.769231 0.128205 0.025641 0.205128 0.641026 0.102564 0.333333 0.25641 0.307692 0.25641 0.102564 0 0.641026 Reverse Complement Motif 0.641026 0.102564 0 0.25641 0.102564 0.25641 0.333333 0.307692 0.641026 0.025641 0.205128 0.128205 0.769231 0 0.102564 0.128205 0.897436 0 0 0.102564 0.538462 0.025641 0.179487 0.25641 0.871795 0 0 0.128205 0.820513 0.128205 0 0.0512821 0.538462 0.179487 0 0.282051 0.230769 0.230769 0.205128 0.333333 0.641026 0.128205 0.230769 0 0.641026 0.0769231 0.25641 0.025641 0.923077 0 0.0769231 0 0.74359 0.25641 0 0 0.769231 0 0 0.230769 0.435897 0.153846 0.333333 0.0769231 0.74359 0 0 0.25641 0.538462 0.0769231 0 0.384615 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 TFM12 Original Motif Original Motif Backward 17 4 3.5 Original Motif 0 1 0 0 0.19 0.4 0 0.41 0 0.52 0.19 0.29 0.11 0.61 0.1 0.18 0.18 0.29 0.33 0.2 0 0.38 0.35 0.27 0 0.82 0 0.18 0.18 0.39 0 0.43 0 0.53 0 0.47 0 0.47 0.15 0.38 0 0.24 0.24 0.52 0 0.87 0 0.13 0.05 0.68 0 0.27 0.18 0.38 0.1 0.34 0 0.62 0.22 0.16 0 0.66 0.09 0.25 0.2 0.15 0.13 0.52 0.04 0.46 0.16 0.34 0.06 0.53 0.03 0.38 0.05 0.57 0.04 0.34 Reverse Complement Motif 0.05 0.04 0.57 0.34 0.06 0.03 0.53 0.38 0.04 0.16 0.46 0.34 0.52 0.15 0.13 0.2 0 0.09 0.66 0.25 0 0.22 0.62 0.16 0.18 0.1 0.38 0.34 0.05 0 0.68 0.27 0 0 0.87 0.13 0.52 0.24 0.24 0 0 0.15 0.47 0.38 0 0 0.53 0.47 0.43 0.39 0 0.18 0 0 0.82 0.18 0 0.35 0.38 0.27 0.18 0.33 0.29 0.2 0.11 0.1 0.61 0.18 0 0.19 0.52 0.29 0.41 0.4 0 0.19 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 4 TFF1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 9 4 3.51958 Original Motif 0.180952 0.533333 0.142857 0.142857 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.0190476 0.047619 0.914286 0.0190476 0.4 0.333333 0.219048 0.047619 0.0285714 0.047619 0.885714 0.0380952 0.0380952 0.895238 0.00952381 0.0571429 0.133333 0.733333 0.0666667 0.0666667 0.0380952 0.0380952 0.87619 0.047619 0.12381 0.752381 0.114286 0.00952381 0.314286 0.190476 0.390476 0.104762 0.12381 0.0285714 0.771429 0.0761905 0.0571429 0.904762 0.0285714 0.00952381 Reverse Complement Motif 0.0571429 0.0285714 0.904762 0.00952381 0.12381 0.771429 0.0285714 0.0761905 0.314286 0.390476 0.190476 0.104762 0.12381 0.114286 0.752381 0.00952381 0.0380952 0.87619 0.0380952 0.047619 0.133333 0.0666667 0.733333 0.0666667 0.0380952 0.00952381 0.895238 0.0571429 0.0285714 0.885714 0.047619 0.0380952 0.047619 0.333333 0.219048 0.4 0.0190476 0.914286 0.047619 0.0190476 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.180952 0.142857 0.533333 0.142857 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 1 TFW1 Original Motif Reverse Complement Backward 3 4 3.52299 Original Motif 0 0.082495 0.917505 0 0.0744467 0.217304 0.197183 0.511066 0 0.897384 0.102616 0 0.0503018 0.102616 0.847082 0 0 0.949698 0.0503018 0 0 0.0523139 0.947686 0 Reverse Complement Motif 0 0.947686 0.0523139 0 0 0.0503018 0.949698 0 0.0503018 0.847082 0.102616 0 0 0.102616 0.897384 0 0.511066 0.217304 0.197183 0.0744467 0 0.917505 0.082495 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 5 TFF11 Original Motif Reverse Complement Backward 11 4 3.52554 Original Motif 0.0761905 0.0857143 0.819048 0.0190476 0.0761905 0.0666667 0.780952 0.0761905 0.438095 0.32381 0.180952 0.0571429 0.12381 0.180952 0.657143 0.0380952 0.0952381 0.0761905 0.790476 0.0380952 0.371429 0.104762 0.485714 0.0380952 0.0190476 0.0380952 0.914286 0.0285714 0.0190476 0.0952381 0.885714 0 0.0571429 0.866667 0.0666667 0.00952381 0.00952381 0.00952381 0.980952 0 0.047619 0.104762 0.838095 0.00952381 0.333333 0.161905 0.409524 0.0952381 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.114286 0.580952 0.266667 0.0380952 Reverse Complement Motif 0.114286 0.266667 0.580952 0.0380952 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.333333 0.409524 0.161905 0.0952381 0.047619 0.838095 0.104762 0.00952381 0.00952381 0.980952 0.00952381 0 0.0571429 0.0666667 0.866667 0.00952381 0.0190476 0.885714 0.0952381 0 0.0190476 0.914286 0.0380952 0.0285714 0.371429 0.485714 0.104762 0.0380952 0.0952381 0.790476 0.0761905 0.0380952 0.12381 0.657143 0.180952 0.0380952 0.0571429 0.32381 0.180952 0.438095 0.0761905 0.780952 0.0666667 0.0761905 0.0761905 0.819048 0.0857143 0.0190476 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- **************************************************************************************************************************************************************************************************** **************************************************************** Significant Motifs - Global and Local Matching (Highest to Lowest) **************************************************************** Dataset # 1 Motif ID 1 Motif Name TFW1 Original Motif 0 0.082495 0.917505 0 0.0744467 0.217304 0.197183 0.511066 0 0.897384 0.102616 0 0.0503018 0.102616 0.847082 0 0 0.949698 0.0503018 0 0 0.0523139 0.947686 0 Reverse Complement Motif 0 0.947686 0.0523139 0 0 0.0503018 0.949698 0 0.0503018 0.847082 0.102616 0 0 0.102616 0.897384 0 0.511066 0.217304 0.197183 0.0744467 0 0.917505 0.082495 0 ******************************************************************* Best Matches for Significant Motif ID 1 (Highest to Lowest) ******************************************************************* Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 3 TFW3 Original Motif Original Motif Backward 1 6 0.0350356 Original Motif 0.02 0.92 0.05 0.01 0 0.03 0.96 0.01 0 0.17 0.83 0 0 0.99 0 0.01 0 0.27 0.21 0.52 0.03 0.3 0.37 0.3 0 0.95 0.05 0 0.02 0.13 0.8 0.05 0 0.88 0.12 0 0.01 0.22 0.76 0.01 Reverse Complement Motif 0.01 0.76 0.22 0.01 0 0.12 0.88 0 0.02 0.8 0.13 0.05 0 0.05 0.95 0 0.03 0.37 0.3 0.3 0.52 0.27 0.21 0 0 0 0.99 0.01 0 0.83 0.17 0 0 0.96 0.03 0.01 0.02 0.05 0.92 0.01 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 sSGTCACGTGACSs Original Motif Original Motif Forward 3 6 0.0375102 Original Motif 0.0555556 0.388889 0.388889 0.166667 0 0.277778 0.722222 0 0.0555556 0.111111 0.833333 0 0.111111 0 0.0555556 0.833333 0 0.888889 0.111111 0 1 0 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.0555556 0.944444 0 0 0 0 1 0 0.111111 0.888889 0 0.833333 0.0555556 0 0.111111 0 0.833333 0.111111 0.0555556 0 0.722222 0.277778 0 0.166667 0.388889 0.388889 0.0555556 Reverse Complement Motif 0.166667 0.388889 0.388889 0.0555556 0 0.277778 0.722222 0 0 0.111111 0.833333 0.0555556 0.111111 0.0555556 0 0.833333 0 0.888889 0.111111 0 1 0 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.0555556 0.944444 0 0 0 0 1 0 0.111111 0.888889 0 0.833333 0 0.0555556 0.111111 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0 0.722222 0.277778 0 0.0555556 0.388889 0.388889 0.166667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 5 TFF11 Reverse Complement Reverse Complement Backward 5 6 0.0381641 Original Motif 0.0761905 0.0857143 0.819048 0.0190476 0.0761905 0.0666667 0.780952 0.0761905 0.438095 0.32381 0.180952 0.0571429 0.12381 0.180952 0.657143 0.0380952 0.0952381 0.0761905 0.790476 0.0380952 0.371429 0.104762 0.485714 0.0380952 0.0190476 0.0380952 0.914286 0.0285714 0.0190476 0.0952381 0.885714 0 0.0571429 0.866667 0.0666667 0.00952381 0.00952381 0.00952381 0.980952 0 0.047619 0.104762 0.838095 0.00952381 0.333333 0.161905 0.409524 0.0952381 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.114286 0.580952 0.266667 0.0380952 Reverse Complement Motif 0.114286 0.266667 0.580952 0.0380952 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.333333 0.409524 0.161905 0.0952381 0.047619 0.838095 0.104762 0.00952381 0.00952381 0.980952 0.00952381 0 0.0571429 0.0666667 0.866667 0.00952381 0.0190476 0.885714 0.0952381 0 0.0190476 0.914286 0.0380952 0.0285714 0.371429 0.485714 0.104762 0.0380952 0.0952381 0.790476 0.0761905 0.0380952 0.12381 0.657143 0.180952 0.0380952 0.0571429 0.32381 0.180952 0.438095 0.0761905 0.780952 0.0666667 0.0761905 0.0761905 0.819048 0.0857143 0.0190476 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 4 TFF1 Reverse Complement Original Motif Forward 7 6 0.0431161 Original Motif 0.180952 0.533333 0.142857 0.142857 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.0190476 0.047619 0.914286 0.0190476 0.4 0.333333 0.219048 0.047619 0.0285714 0.047619 0.885714 0.0380952 0.0380952 0.895238 0.00952381 0.0571429 0.133333 0.733333 0.0666667 0.0666667 0.0380952 0.0380952 0.87619 0.047619 0.12381 0.752381 0.114286 0.00952381 0.314286 0.190476 0.390476 0.104762 0.12381 0.0285714 0.771429 0.0761905 0.0571429 0.904762 0.0285714 0.00952381 Reverse Complement Motif 0.0571429 0.0285714 0.904762 0.00952381 0.12381 0.771429 0.0285714 0.0761905 0.314286 0.390476 0.190476 0.104762 0.12381 0.114286 0.752381 0.00952381 0.0380952 0.87619 0.0380952 0.047619 0.133333 0.0666667 0.733333 0.0666667 0.0380952 0.00952381 0.895238 0.0571429 0.0285714 0.885714 0.047619 0.0380952 0.047619 0.333333 0.219048 0.4 0.0190476 0.914286 0.047619 0.0190476 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.180952 0.142857 0.533333 0.142857 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 2 TFW2 Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 6 0.052047 Original Motif 0.0058309 0.364431 0.41691 0.212828 0.0816327 0.816327 0.0991254 0.00291545 0.00291545 0.0670554 0.921283 0.00874636 0.0058309 0.883382 0.107872 0.00291545 0 0.0962099 0.860058 0.0437318 0.00291545 0.906706 0.0787172 0.0116618 0.0437318 0.0758017 0.825073 0.0553936 0 0.125364 0.87172 0.00291545 Reverse Complement Motif 0 0.87172 0.125364 0.00291545 0.0437318 0.825073 0.0758017 0.0553936 0.00291545 0.0787172 0.906706 0.0116618 0 0.860058 0.0962099 0.0437318 0.0058309 0.107872 0.883382 0.00291545 0.00291545 0.921283 0.0670554 0.00874636 0.0816327 0.0991254 0.816327 0.00291545 0.0058309 0.41691 0.364431 0.212828 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 csGCCCCGCCCCsc Original Motif Original Motif Backward 7 6 0.0539 Original Motif 0.179104 0.492537 0.164179 0.164179 0.223881 0.402985 0.283582 0.0895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0746269 0 0.895522 0.0895522 0.0149254 0 0.925373 0.0149254 0.0597015 0.0298507 0.970149 0 0 0 0.970149 0.0298507 0 0.0447761 0 0.940299 0.0149254 0 0.955224 0.0149254 0.0298507 0.0298507 0.955224 0.0149254 0 0.0298507 0.925373 0.0149254 0.0298507 0.119403 0.820896 0.0149254 0.0447761 0.104478 0.328358 0.373134 0.19403 0.179104 0.358209 0.223881 0.238806 Reverse Complement Motif 0.179104 0.223881 0.358209 0.238806 0.104478 0.373134 0.328358 0.19403 0.119403 0.0149254 0.820896 0.0447761 0.0298507 0.0149254 0.925373 0.0298507 0.0298507 0.0149254 0.955224 0 0 0.0149254 0.955224 0.0298507 0.0447761 0.940299 0 0.0149254 0 0.0298507 0.970149 0 0.0298507 0 0.970149 0 0 0.0149254 0.925373 0.0597015 0 0.0895522 0.895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0149254 0.0746269 0.223881 0.283582 0.402985 0.0895522 0.179104 0.164179 0.492537 0.164179 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 14 cccGCCCCGCCCCsb Reverse Complement Original Motif Backward 3 6 0.0558733 Original Motif 0.148936 0.425532 0.234043 0.191489 0.106383 0.553191 0.170213 0.170213 0.106383 0.659574 0.148936 0.0851064 0.0425532 0 0.851064 0.106383 0 0.93617 0.0638298 0 0 0.87234 0.0425532 0.0851064 0 1 0 0 0 0.957447 0.0425532 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.0425532 0.93617 0.0212766 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0.0638298 0.914894 0.0212766 0 0.0638298 0.297872 0.404255 0.234043 0.148936 0.319149 0.255319 0.276596 Reverse Complement Motif 0.148936 0.255319 0.319149 0.276596 0.0638298 0.404255 0.297872 0.234043 0.0638298 0.0212766 0.914894 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0.0425532 0.0212766 0.93617 0 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0 0.0425532 0.957447 0 0 0 1 0 0 0.0425532 0.87234 0.0851064 0 0.0638298 0.93617 0 0.0425532 0.851064 0 0.106383 0.106383 0.148936 0.659574 0.0851064 0.106383 0.170213 0.553191 0.170213 0.148936 0.234043 0.425532 0.191489 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 6 TFM2 Reverse Complement Reverse Complement Forward 7 6 0.0877631 Original Motif 0.404762 0.047619 0.547619 0 0.238095 0.119048 0.642857 0 0.607143 0.0714286 0.321429 0 0.190476 0 0.797619 0.0119048 0.22619 0 0.738095 0.0357143 0.738095 0 0.238095 0.0238095 0.261905 0.142857 0.595238 0 0.345238 0.0714286 0.583333 0 0.547619 0 0.452381 0 0.0119048 0 0.988095 0 0.0119048 0.309524 0.678571 0 0.357143 0.261905 0.190476 0.190476 0.309524 0 0.690476 0 0.25 0.0952381 0.654762 0 0.309524 0.047619 0.392857 0.25 0.0357143 0.0952381 0.857143 0.0119048 Reverse Complement Motif 0.0357143 0.857143 0.0952381 0.0119048 0.309524 0.392857 0.047619 0.25 0.25 0.654762 0.0952381 0 0.309524 0.690476 0 0 0.190476 0.261905 0.190476 0.357143 0.0119048 0.678571 0.309524 0 0.0119048 0.988095 0 0 0 0 0.452381 0.547619 0.345238 0.583333 0.0714286 0 0.261905 0.595238 0.142857 0 0.0238095 0 0.238095 0.738095 0.22619 0.738095 0 0.0357143 0.190476 0.797619 0 0.0119048 0 0.0714286 0.321429 0.607143 0.238095 0.642857 0.119048 0 0.404762 0.547619 0.047619 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 TFM12 Original Motif Reverse Complement Backward 7 6 0.089121 Original Motif 0 1 0 0 0.19 0.4 0 0.41 0 0.52 0.19 0.29 0.11 0.61 0.1 0.18 0.18 0.29 0.33 0.2 0 0.38 0.35 0.27 0 0.82 0 0.18 0.18 0.39 0 0.43 0 0.53 0 0.47 0 0.47 0.15 0.38 0 0.24 0.24 0.52 0 0.87 0 0.13 0.05 0.68 0 0.27 0.18 0.38 0.1 0.34 0 0.62 0.22 0.16 0 0.66 0.09 0.25 0.2 0.15 0.13 0.52 0.04 0.46 0.16 0.34 0.06 0.53 0.03 0.38 0.05 0.57 0.04 0.34 Reverse Complement Motif 0.05 0.04 0.57 0.34 0.06 0.03 0.53 0.38 0.04 0.16 0.46 0.34 0.52 0.15 0.13 0.2 0 0.09 0.66 0.25 0 0.22 0.62 0.16 0.18 0.1 0.38 0.34 0.05 0 0.68 0.27 0 0 0.87 0.13 0.52 0.24 0.24 0 0 0.15 0.47 0.38 0 0 0.53 0.47 0.43 0.39 0 0.18 0 0 0.82 0.18 0 0.35 0.38 0.27 0.18 0.33 0.29 0.2 0.11 0.1 0.61 0.18 0 0.19 0.52 0.29 0.41 0.4 0 0.19 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 kcACCTGCAgc Reverse Complement Original Motif Forward 6 6 0.0980422 Original Motif 0.153846 0.230769 0.307692 0.307692 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0.153846 0.230769 0.461538 0.153846 0.153846 0.615385 0.153846 0.0769231 Reverse Complement Motif 0.153846 0.153846 0.615385 0.0769231 0.153846 0.461538 0.230769 0.153846 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0.153846 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 0.307692 0.230769 0.307692 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 dhACATTCTkh Original Motif Reverse Complement Forward 8 4 1.09467 Original Motif 0.333333 0 0.333333 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0.666667 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 Reverse Complement Motif 0.333333 0.333333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 1 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 16 Motif Name kcACCTGCAgc Original Motif 0.153846 0.230769 0.307692 0.307692 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0.153846 0.230769 0.461538 0.153846 0.153846 0.615385 0.153846 0.0769231 Reverse Complement Motif 0.153846 0.153846 0.615385 0.0769231 0.153846 0.461538 0.230769 0.153846 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0.153846 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 0.307692 0.230769 0.307692 ******************************************************************* Best Matches for Significant Motif ID 16 (Highest to Lowest) ******************************************************************* Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 wsTACwGTAsw Original Motif Reverse Complement Backward 1 11 0.0182895 Original Motif 0.277778 0.222222 0.166667 0.333333 0.166667 0.444444 0.277778 0.111111 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0.5 0 0 0.5 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0.111111 0.277778 0.444444 0.166667 0.333333 0.166667 0.222222 0.277778 Reverse Complement Motif 0.277778 0.166667 0.222222 0.333333 0.111111 0.444444 0.277778 0.166667 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0.5 0 0 0.5 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0.166667 0.277778 0.444444 0.111111 0.333333 0.222222 0.166667 0.277778 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 dhACATTCTkh Original Motif Original Motif Backward 1 11 0.0221745 Original Motif 0.333333 0 0.333333 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0.666667 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 Reverse Complement Motif 0.333333 0.333333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 1 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 sSGTCACGTGACSs Original Motif Original Motif Forward 4 11 0.0280991 Original Motif 0.0555556 0.388889 0.388889 0.166667 0 0.277778 0.722222 0 0.0555556 0.111111 0.833333 0 0.111111 0 0.0555556 0.833333 0 0.888889 0.111111 0 1 0 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.0555556 0.944444 0 0 0 0 1 0 0.111111 0.888889 0 0.833333 0.0555556 0 0.111111 0 0.833333 0.111111 0.0555556 0 0.722222 0.277778 0 0.166667 0.388889 0.388889 0.0555556 Reverse Complement Motif 0.166667 0.388889 0.388889 0.0555556 0 0.277778 0.722222 0 0 0.111111 0.833333 0.0555556 0.111111 0.0555556 0 0.833333 0 0.888889 0.111111 0 1 0 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.0555556 0.944444 0 0 0 0 1 0 0.111111 0.888889 0 0.833333 0 0.0555556 0.111111 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0 0.722222 0.277778 0 0.0555556 0.388889 0.388889 0.166667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 5 TFF11 Reverse Complement Original Motif Forward 1 11 0.0312321 Original Motif 0.0761905 0.0857143 0.819048 0.0190476 0.0761905 0.0666667 0.780952 0.0761905 0.438095 0.32381 0.180952 0.0571429 0.12381 0.180952 0.657143 0.0380952 0.0952381 0.0761905 0.790476 0.0380952 0.371429 0.104762 0.485714 0.0380952 0.0190476 0.0380952 0.914286 0.0285714 0.0190476 0.0952381 0.885714 0 0.0571429 0.866667 0.0666667 0.00952381 0.00952381 0.00952381 0.980952 0 0.047619 0.104762 0.838095 0.00952381 0.333333 0.161905 0.409524 0.0952381 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.114286 0.580952 0.266667 0.0380952 Reverse Complement Motif 0.114286 0.266667 0.580952 0.0380952 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.333333 0.409524 0.161905 0.0952381 0.047619 0.838095 0.104762 0.00952381 0.00952381 0.980952 0.00952381 0 0.0571429 0.0666667 0.866667 0.00952381 0.0190476 0.885714 0.0952381 0 0.0190476 0.914286 0.0380952 0.0285714 0.371429 0.485714 0.104762 0.0380952 0.0952381 0.790476 0.0761905 0.0380952 0.12381 0.657143 0.180952 0.0380952 0.0571429 0.32381 0.180952 0.438095 0.0761905 0.780952 0.0666667 0.0761905 0.0761905 0.819048 0.0857143 0.0190476 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 csGCCCCGCCCCsc Original Motif Original Motif Backward 3 11 0.0370129 Original Motif 0.179104 0.492537 0.164179 0.164179 0.223881 0.402985 0.283582 0.0895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0746269 0 0.895522 0.0895522 0.0149254 0 0.925373 0.0149254 0.0597015 0.0298507 0.970149 0 0 0 0.970149 0.0298507 0 0.0447761 0 0.940299 0.0149254 0 0.955224 0.0149254 0.0298507 0.0298507 0.955224 0.0149254 0 0.0298507 0.925373 0.0149254 0.0298507 0.119403 0.820896 0.0149254 0.0447761 0.104478 0.328358 0.373134 0.19403 0.179104 0.358209 0.223881 0.238806 Reverse Complement Motif 0.179104 0.223881 0.358209 0.238806 0.104478 0.373134 0.328358 0.19403 0.119403 0.0149254 0.820896 0.0447761 0.0298507 0.0149254 0.925373 0.0298507 0.0298507 0.0149254 0.955224 0 0 0.0149254 0.955224 0.0298507 0.0447761 0.940299 0 0.0149254 0 0.0298507 0.970149 0 0.0298507 0 0.970149 0 0 0.0149254 0.925373 0.0597015 0 0.0895522 0.895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0149254 0.0746269 0.223881 0.283582 0.402985 0.0895522 0.179104 0.164179 0.492537 0.164179 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 15 kCAGCCAATmr Reverse Complement Original Motif Backward 1 11 0.0407197 Original Motif 0.235294 0.176471 0.294118 0.294118 0.117647 0.705882 0.176471 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0.352941 0.352941 0.235294 0.0588235 0.352941 0.176471 0.411765 0.0588235 Reverse Complement Motif 0.352941 0.411765 0.176471 0.0588235 0.0588235 0.352941 0.235294 0.352941 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.117647 0.176471 0.705882 0 0.235294 0.294118 0.176471 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 14 cccGCCCCGCCCCsb Original Motif Original Motif Backward 3 11 0.0429055 Original Motif 0.148936 0.425532 0.234043 0.191489 0.106383 0.553191 0.170213 0.170213 0.106383 0.659574 0.148936 0.0851064 0.0425532 0 0.851064 0.106383 0 0.93617 0.0638298 0 0 0.87234 0.0425532 0.0851064 0 1 0 0 0 0.957447 0.0425532 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.0425532 0.93617 0.0212766 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0.0638298 0.914894 0.0212766 0 0.0638298 0.297872 0.404255 0.234043 0.148936 0.319149 0.255319 0.276596 Reverse Complement Motif 0.148936 0.255319 0.319149 0.276596 0.0638298 0.404255 0.297872 0.234043 0.0638298 0.0212766 0.914894 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0.0425532 0.0212766 0.93617 0 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0 0.0425532 0.957447 0 0 0 1 0 0 0.0425532 0.87234 0.0851064 0 0.0638298 0.93617 0 0.0425532 0.851064 0 0.106383 0.106383 0.148936 0.659574 0.0851064 0.106383 0.170213 0.553191 0.170213 0.148936 0.234043 0.425532 0.191489 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 TFM12 Reverse Complement Reverse Complement Backward 6 11 0.0444938 Original Motif 0 1 0 0 0.19 0.4 0 0.41 0 0.52 0.19 0.29 0.11 0.61 0.1 0.18 0.18 0.29 0.33 0.2 0 0.38 0.35 0.27 0 0.82 0 0.18 0.18 0.39 0 0.43 0 0.53 0 0.47 0 0.47 0.15 0.38 0 0.24 0.24 0.52 0 0.87 0 0.13 0.05 0.68 0 0.27 0.18 0.38 0.1 0.34 0 0.62 0.22 0.16 0 0.66 0.09 0.25 0.2 0.15 0.13 0.52 0.04 0.46 0.16 0.34 0.06 0.53 0.03 0.38 0.05 0.57 0.04 0.34 Reverse Complement Motif 0.05 0.04 0.57 0.34 0.06 0.03 0.53 0.38 0.04 0.16 0.46 0.34 0.52 0.15 0.13 0.2 0 0.09 0.66 0.25 0 0.22 0.62 0.16 0.18 0.1 0.38 0.34 0.05 0 0.68 0.27 0 0 0.87 0.13 0.52 0.24 0.24 0 0 0.15 0.47 0.38 0 0 0.53 0.47 0.43 0.39 0 0.18 0 0 0.82 0.18 0 0.35 0.38 0.27 0.18 0.33 0.29 0.2 0.11 0.1 0.61 0.18 0 0.19 0.52 0.29 0.41 0.4 0 0.19 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 6 TFM2 Reverse Complement Original Motif Backward 7 10 0.538471 Original Motif 0.404762 0.047619 0.547619 0 0.238095 0.119048 0.642857 0 0.607143 0.0714286 0.321429 0 0.190476 0 0.797619 0.0119048 0.22619 0 0.738095 0.0357143 0.738095 0 0.238095 0.0238095 0.261905 0.142857 0.595238 0 0.345238 0.0714286 0.583333 0 0.547619 0 0.452381 0 0.0119048 0 0.988095 0 0.0119048 0.309524 0.678571 0 0.357143 0.261905 0.190476 0.190476 0.309524 0 0.690476 0 0.25 0.0952381 0.654762 0 0.309524 0.047619 0.392857 0.25 0.0357143 0.0952381 0.857143 0.0119048 Reverse Complement Motif 0.0357143 0.857143 0.0952381 0.0119048 0.309524 0.392857 0.047619 0.25 0.25 0.654762 0.0952381 0 0.309524 0.690476 0 0 0.190476 0.261905 0.190476 0.357143 0.0119048 0.678571 0.309524 0 0.0119048 0.988095 0 0 0 0 0.452381 0.547619 0.345238 0.583333 0.0714286 0 0.261905 0.595238 0.142857 0 0.0238095 0 0.238095 0.738095 0.22619 0.738095 0 0.0357143 0.190476 0.797619 0 0.0119048 0 0.0714286 0.321429 0.607143 0.238095 0.642857 0.119048 0 0.404762 0.547619 0.047619 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 4 TFF1 Original Motif Reverse Complement Forward 5 8 1.54364 Original Motif 0.180952 0.533333 0.142857 0.142857 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.0190476 0.047619 0.914286 0.0190476 0.4 0.333333 0.219048 0.047619 0.0285714 0.047619 0.885714 0.0380952 0.0380952 0.895238 0.00952381 0.0571429 0.133333 0.733333 0.0666667 0.0666667 0.0380952 0.0380952 0.87619 0.047619 0.12381 0.752381 0.114286 0.00952381 0.314286 0.190476 0.390476 0.104762 0.12381 0.0285714 0.771429 0.0761905 0.0571429 0.904762 0.0285714 0.00952381 Reverse Complement Motif 0.0571429 0.0285714 0.904762 0.00952381 0.12381 0.771429 0.0285714 0.0761905 0.314286 0.390476 0.190476 0.104762 0.12381 0.114286 0.752381 0.00952381 0.0380952 0.87619 0.0380952 0.047619 0.133333 0.0666667 0.733333 0.0666667 0.0380952 0.00952381 0.895238 0.0571429 0.0285714 0.885714 0.047619 0.0380952 0.047619 0.333333 0.219048 0.4 0.0190476 0.914286 0.047619 0.0190476 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.180952 0.142857 0.533333 0.142857 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 1 Motif ID 2 Motif Name TFW2 Original Motif 0.0058309 0.364431 0.41691 0.212828 0.0816327 0.816327 0.0991254 0.00291545 0.00291545 0.0670554 0.921283 0.00874636 0.0058309 0.883382 0.107872 0.00291545 0 0.0962099 0.860058 0.0437318 0.00291545 0.906706 0.0787172 0.0116618 0.0437318 0.0758017 0.825073 0.0553936 0 0.125364 0.87172 0.00291545 Reverse Complement Motif 0 0.87172 0.125364 0.00291545 0.0437318 0.825073 0.0758017 0.0553936 0.00291545 0.0787172 0.906706 0.0116618 0 0.860058 0.0962099 0.0437318 0.0058309 0.107872 0.883382 0.00291545 0.00291545 0.921283 0.0670554 0.00874636 0.0816327 0.0991254 0.816327 0.00291545 0.0058309 0.41691 0.364431 0.212828 ******************************************************************* Best Matches for Significant Motif ID 2 (Highest to Lowest) ******************************************************************* Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 csGCCCCGCCCCsc Original Motif Reverse Complement Backward 6 8 0.0456233 Original Motif 0.179104 0.492537 0.164179 0.164179 0.223881 0.402985 0.283582 0.0895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0746269 0 0.895522 0.0895522 0.0149254 0 0.925373 0.0149254 0.0597015 0.0298507 0.970149 0 0 0 0.970149 0.0298507 0 0.0447761 0 0.940299 0.0149254 0 0.955224 0.0149254 0.0298507 0.0298507 0.955224 0.0149254 0 0.0298507 0.925373 0.0149254 0.0298507 0.119403 0.820896 0.0149254 0.0447761 0.104478 0.328358 0.373134 0.19403 0.179104 0.358209 0.223881 0.238806 Reverse Complement Motif 0.179104 0.223881 0.358209 0.238806 0.104478 0.373134 0.328358 0.19403 0.119403 0.0149254 0.820896 0.0447761 0.0298507 0.0149254 0.925373 0.0298507 0.0298507 0.0149254 0.955224 0 0 0.0149254 0.955224 0.0298507 0.0447761 0.940299 0 0.0149254 0 0.0298507 0.970149 0 0.0298507 0 0.970149 0 0 0.0149254 0.925373 0.0597015 0 0.0895522 0.895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0149254 0.0746269 0.223881 0.283582 0.402985 0.0895522 0.179104 0.164179 0.492537 0.164179 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 14 cccGCCCCGCCCCsb Reverse Complement Original Motif Backward 2 8 0.045686 Original Motif 0.148936 0.425532 0.234043 0.191489 0.106383 0.553191 0.170213 0.170213 0.106383 0.659574 0.148936 0.0851064 0.0425532 0 0.851064 0.106383 0 0.93617 0.0638298 0 0 0.87234 0.0425532 0.0851064 0 1 0 0 0 0.957447 0.0425532 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.0425532 0.93617 0.0212766 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0.0638298 0.914894 0.0212766 0 0.0638298 0.297872 0.404255 0.234043 0.148936 0.319149 0.255319 0.276596 Reverse Complement Motif 0.148936 0.255319 0.319149 0.276596 0.0638298 0.404255 0.297872 0.234043 0.0638298 0.0212766 0.914894 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0.0425532 0.0212766 0.93617 0 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0 0.0425532 0.957447 0 0 0 1 0 0 0.0425532 0.87234 0.0851064 0 0.0638298 0.93617 0 0.0425532 0.851064 0 0.106383 0.106383 0.148936 0.659574 0.0851064 0.106383 0.170213 0.553191 0.170213 0.148936 0.234043 0.425532 0.191489 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 5 TFF11 Original Motif Original Motif Forward 4 8 0.0583967 Original Motif 0.0761905 0.0857143 0.819048 0.0190476 0.0761905 0.0666667 0.780952 0.0761905 0.438095 0.32381 0.180952 0.0571429 0.12381 0.180952 0.657143 0.0380952 0.0952381 0.0761905 0.790476 0.0380952 0.371429 0.104762 0.485714 0.0380952 0.0190476 0.0380952 0.914286 0.0285714 0.0190476 0.0952381 0.885714 0 0.0571429 0.866667 0.0666667 0.00952381 0.00952381 0.00952381 0.980952 0 0.047619 0.104762 0.838095 0.00952381 0.333333 0.161905 0.409524 0.0952381 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.114286 0.580952 0.266667 0.0380952 Reverse Complement Motif 0.114286 0.266667 0.580952 0.0380952 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.333333 0.409524 0.161905 0.0952381 0.047619 0.838095 0.104762 0.00952381 0.00952381 0.980952 0.00952381 0 0.0571429 0.0666667 0.866667 0.00952381 0.0190476 0.885714 0.0952381 0 0.0190476 0.914286 0.0380952 0.0285714 0.371429 0.485714 0.104762 0.0380952 0.0952381 0.790476 0.0761905 0.0380952 0.12381 0.657143 0.180952 0.0380952 0.0571429 0.32381 0.180952 0.438095 0.0761905 0.780952 0.0666667 0.0761905 0.0761905 0.819048 0.0857143 0.0190476 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 4 TFF1 Original Motif Original Motif Backward 5 8 0.060966 Original Motif 0.180952 0.533333 0.142857 0.142857 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.0190476 0.047619 0.914286 0.0190476 0.4 0.333333 0.219048 0.047619 0.0285714 0.047619 0.885714 0.0380952 0.0380952 0.895238 0.00952381 0.0571429 0.133333 0.733333 0.0666667 0.0666667 0.0380952 0.0380952 0.87619 0.047619 0.12381 0.752381 0.114286 0.00952381 0.314286 0.190476 0.390476 0.104762 0.12381 0.0285714 0.771429 0.0761905 0.0571429 0.904762 0.0285714 0.00952381 Reverse Complement Motif 0.0571429 0.0285714 0.904762 0.00952381 0.12381 0.771429 0.0285714 0.0761905 0.314286 0.390476 0.190476 0.104762 0.12381 0.114286 0.752381 0.00952381 0.0380952 0.87619 0.0380952 0.047619 0.133333 0.0666667 0.733333 0.0666667 0.0380952 0.00952381 0.895238 0.0571429 0.0285714 0.885714 0.047619 0.0380952 0.047619 0.333333 0.219048 0.4 0.0190476 0.914286 0.047619 0.0190476 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.180952 0.142857 0.533333 0.142857 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 3 TFW3 Original Motif Reverse Complement Forward 3 8 0.0906073 Original Motif 0.02 0.92 0.05 0.01 0 0.03 0.96 0.01 0 0.17 0.83 0 0 0.99 0 0.01 0 0.27 0.21 0.52 0.03 0.3 0.37 0.3 0 0.95 0.05 0 0.02 0.13 0.8 0.05 0 0.88 0.12 0 0.01 0.22 0.76 0.01 Reverse Complement Motif 0.01 0.76 0.22 0.01 0 0.12 0.88 0 0.02 0.8 0.13 0.05 0 0.05 0.95 0 0.03 0.37 0.3 0.3 0.52 0.27 0.21 0 0 0 0.99 0.01 0 0.83 0.17 0 0 0.96 0.03 0.01 0.02 0.05 0.92 0.01 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 6 TFM2 Reverse Complement Reverse Complement Backward 6 8 0.0910301 Original Motif 0.404762 0.047619 0.547619 0 0.238095 0.119048 0.642857 0 0.607143 0.0714286 0.321429 0 0.190476 0 0.797619 0.0119048 0.22619 0 0.738095 0.0357143 0.738095 0 0.238095 0.0238095 0.261905 0.142857 0.595238 0 0.345238 0.0714286 0.583333 0 0.547619 0 0.452381 0 0.0119048 0 0.988095 0 0.0119048 0.309524 0.678571 0 0.357143 0.261905 0.190476 0.190476 0.309524 0 0.690476 0 0.25 0.0952381 0.654762 0 0.309524 0.047619 0.392857 0.25 0.0357143 0.0952381 0.857143 0.0119048 Reverse Complement Motif 0.0357143 0.857143 0.0952381 0.0119048 0.309524 0.392857 0.047619 0.25 0.25 0.654762 0.0952381 0 0.309524 0.690476 0 0 0.190476 0.261905 0.190476 0.357143 0.0119048 0.678571 0.309524 0 0.0119048 0.988095 0 0 0 0 0.452381 0.547619 0.345238 0.583333 0.0714286 0 0.261905 0.595238 0.142857 0 0.0238095 0 0.238095 0.738095 0.22619 0.738095 0 0.0357143 0.190476 0.797619 0 0.0119048 0 0.0714286 0.321429 0.607143 0.238095 0.642857 0.119048 0 0.404762 0.547619 0.047619 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 TFM12 Original Motif Reverse Complement Backward 4 8 0.094473 Original Motif 0 1 0 0 0.19 0.4 0 0.41 0 0.52 0.19 0.29 0.11 0.61 0.1 0.18 0.18 0.29 0.33 0.2 0 0.38 0.35 0.27 0 0.82 0 0.18 0.18 0.39 0 0.43 0 0.53 0 0.47 0 0.47 0.15 0.38 0 0.24 0.24 0.52 0 0.87 0 0.13 0.05 0.68 0 0.27 0.18 0.38 0.1 0.34 0 0.62 0.22 0.16 0 0.66 0.09 0.25 0.2 0.15 0.13 0.52 0.04 0.46 0.16 0.34 0.06 0.53 0.03 0.38 0.05 0.57 0.04 0.34 Reverse Complement Motif 0.05 0.04 0.57 0.34 0.06 0.03 0.53 0.38 0.04 0.16 0.46 0.34 0.52 0.15 0.13 0.2 0 0.09 0.66 0.25 0 0.22 0.62 0.16 0.18 0.1 0.38 0.34 0.05 0 0.68 0.27 0 0 0.87 0.13 0.52 0.24 0.24 0 0 0.15 0.47 0.38 0 0 0.53 0.47 0.43 0.39 0 0.18 0 0 0.82 0.18 0 0.35 0.38 0.27 0.18 0.33 0.29 0.2 0.11 0.1 0.61 0.18 0 0.19 0.52 0.29 0.41 0.4 0 0.19 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 sSGTCACGTGACSs Original Motif Original Motif Backward 4 8 0.0988223 Original Motif 0.0555556 0.388889 0.388889 0.166667 0 0.277778 0.722222 0 0.0555556 0.111111 0.833333 0 0.111111 0 0.0555556 0.833333 0 0.888889 0.111111 0 1 0 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.0555556 0.944444 0 0 0 0 1 0 0.111111 0.888889 0 0.833333 0.0555556 0 0.111111 0 0.833333 0.111111 0.0555556 0 0.722222 0.277778 0 0.166667 0.388889 0.388889 0.0555556 Reverse Complement Motif 0.166667 0.388889 0.388889 0.0555556 0 0.277778 0.722222 0 0 0.111111 0.833333 0.0555556 0.111111 0.0555556 0 0.833333 0 0.888889 0.111111 0 1 0 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.0555556 0.944444 0 0 0 0 1 0 0.111111 0.888889 0 0.833333 0 0.0555556 0.111111 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0 0.722222 0.277778 0 0.0555556 0.388889 0.388889 0.166667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 1 TFW1 Original Motif Original Motif Forward 2 5 1.5088 Original Motif 0 0.082495 0.917505 0 0.0744467 0.217304 0.197183 0.511066 0 0.897384 0.102616 0 0.0503018 0.102616 0.847082 0 0 0.949698 0.0503018 0 0 0.0523139 0.947686 0 Reverse Complement Motif 0 0.947686 0.0523139 0 0 0.0503018 0.949698 0 0.0503018 0.847082 0.102616 0 0 0.102616 0.897384 0 0.511066 0.217304 0.197183 0.0744467 0 0.917505 0.082495 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 kcACCTGCAgc Original Motif Reverse Complement Backward 8 4 2.08456 Original Motif 0.153846 0.230769 0.307692 0.307692 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0.153846 0.230769 0.461538 0.153846 0.153846 0.615385 0.153846 0.0769231 Reverse Complement Motif 0.153846 0.153846 0.615385 0.0769231 0.153846 0.461538 0.230769 0.153846 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0.153846 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 0.307692 0.230769 0.307692 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 1 Motif ID 3 Motif Name TFW3 Original Motif 0.02 0.92 0.05 0.01 0 0.03 0.96 0.01 0 0.17 0.83 0 0 0.99 0 0.01 0 0.27 0.21 0.52 0.03 0.3 0.37 0.3 0 0.95 0.05 0 0.02 0.13 0.8 0.05 0 0.88 0.12 0 0.01 0.22 0.76 0.01 Reverse Complement Motif 0.01 0.76 0.22 0.01 0 0.12 0.88 0 0.02 0.8 0.13 0.05 0 0.05 0.95 0 0.03 0.37 0.3 0.3 0.52 0.27 0.21 0 0 0 0.99 0.01 0 0.83 0.17 0 0 0.96 0.03 0.01 0.02 0.05 0.92 0.01 ******************************************************************* Best Matches for Significant Motif ID 3 (Highest to Lowest) ******************************************************************* Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 4 TFF1 Original Motif Original Motif Backward 3 10 0.0623879 Original Motif 0.180952 0.533333 0.142857 0.142857 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.0190476 0.047619 0.914286 0.0190476 0.4 0.333333 0.219048 0.047619 0.0285714 0.047619 0.885714 0.0380952 0.0380952 0.895238 0.00952381 0.0571429 0.133333 0.733333 0.0666667 0.0666667 0.0380952 0.0380952 0.87619 0.047619 0.12381 0.752381 0.114286 0.00952381 0.314286 0.190476 0.390476 0.104762 0.12381 0.0285714 0.771429 0.0761905 0.0571429 0.904762 0.0285714 0.00952381 Reverse Complement Motif 0.0571429 0.0285714 0.904762 0.00952381 0.12381 0.771429 0.0285714 0.0761905 0.314286 0.390476 0.190476 0.104762 0.12381 0.114286 0.752381 0.00952381 0.0380952 0.87619 0.0380952 0.047619 0.133333 0.0666667 0.733333 0.0666667 0.0380952 0.00952381 0.895238 0.0571429 0.0285714 0.885714 0.047619 0.0380952 0.047619 0.333333 0.219048 0.4 0.0190476 0.914286 0.047619 0.0190476 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.180952 0.142857 0.533333 0.142857 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 5 TFF11 Reverse Complement Original Motif Backward 5 10 0.0645308 Original Motif 0.0761905 0.0857143 0.819048 0.0190476 0.0761905 0.0666667 0.780952 0.0761905 0.438095 0.32381 0.180952 0.0571429 0.12381 0.180952 0.657143 0.0380952 0.0952381 0.0761905 0.790476 0.0380952 0.371429 0.104762 0.485714 0.0380952 0.0190476 0.0380952 0.914286 0.0285714 0.0190476 0.0952381 0.885714 0 0.0571429 0.866667 0.0666667 0.00952381 0.00952381 0.00952381 0.980952 0 0.047619 0.104762 0.838095 0.00952381 0.333333 0.161905 0.409524 0.0952381 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.114286 0.580952 0.266667 0.0380952 Reverse Complement Motif 0.114286 0.266667 0.580952 0.0380952 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.333333 0.409524 0.161905 0.0952381 0.047619 0.838095 0.104762 0.00952381 0.00952381 0.980952 0.00952381 0 0.0571429 0.0666667 0.866667 0.00952381 0.0190476 0.885714 0.0952381 0 0.0190476 0.914286 0.0380952 0.0285714 0.371429 0.485714 0.104762 0.0380952 0.0952381 0.790476 0.0761905 0.0380952 0.12381 0.657143 0.180952 0.0380952 0.0571429 0.32381 0.180952 0.438095 0.0761905 0.780952 0.0666667 0.0761905 0.0761905 0.819048 0.0857143 0.0190476 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 csGCCCCGCCCCsc Original Motif Original Motif Backward 5 10 0.0718771 Original Motif 0.179104 0.492537 0.164179 0.164179 0.223881 0.402985 0.283582 0.0895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0746269 0 0.895522 0.0895522 0.0149254 0 0.925373 0.0149254 0.0597015 0.0298507 0.970149 0 0 0 0.970149 0.0298507 0 0.0447761 0 0.940299 0.0149254 0 0.955224 0.0149254 0.0298507 0.0298507 0.955224 0.0149254 0 0.0298507 0.925373 0.0149254 0.0298507 0.119403 0.820896 0.0149254 0.0447761 0.104478 0.328358 0.373134 0.19403 0.179104 0.358209 0.223881 0.238806 Reverse Complement Motif 0.179104 0.223881 0.358209 0.238806 0.104478 0.373134 0.328358 0.19403 0.119403 0.0149254 0.820896 0.0447761 0.0298507 0.0149254 0.925373 0.0298507 0.0298507 0.0149254 0.955224 0 0 0.0149254 0.955224 0.0298507 0.0447761 0.940299 0 0.0149254 0 0.0298507 0.970149 0 0.0298507 0 0.970149 0 0 0.0149254 0.925373 0.0597015 0 0.0895522 0.895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0149254 0.0746269 0.223881 0.283582 0.402985 0.0895522 0.179104 0.164179 0.492537 0.164179 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 14 cccGCCCCGCCCCsb Original Motif Original Motif Forward 2 10 0.0719604 Original Motif 0.148936 0.425532 0.234043 0.191489 0.106383 0.553191 0.170213 0.170213 0.106383 0.659574 0.148936 0.0851064 0.0425532 0 0.851064 0.106383 0 0.93617 0.0638298 0 0 0.87234 0.0425532 0.0851064 0 1 0 0 0 0.957447 0.0425532 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.0425532 0.93617 0.0212766 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0.0638298 0.914894 0.0212766 0 0.0638298 0.297872 0.404255 0.234043 0.148936 0.319149 0.255319 0.276596 Reverse Complement Motif 0.148936 0.255319 0.319149 0.276596 0.0638298 0.404255 0.297872 0.234043 0.0638298 0.0212766 0.914894 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0.0425532 0.0212766 0.93617 0 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0 0.0425532 0.957447 0 0 0 1 0 0 0.0425532 0.87234 0.0851064 0 0.0638298 0.93617 0 0.0425532 0.851064 0 0.106383 0.106383 0.148936 0.659574 0.0851064 0.106383 0.170213 0.553191 0.170213 0.148936 0.234043 0.425532 0.191489 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 TFM12 Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 10 0.0767689 Original Motif 0 1 0 0 0.19 0.4 0 0.41 0 0.52 0.19 0.29 0.11 0.61 0.1 0.18 0.18 0.29 0.33 0.2 0 0.38 0.35 0.27 0 0.82 0 0.18 0.18 0.39 0 0.43 0 0.53 0 0.47 0 0.47 0.15 0.38 0 0.24 0.24 0.52 0 0.87 0 0.13 0.05 0.68 0 0.27 0.18 0.38 0.1 0.34 0 0.62 0.22 0.16 0 0.66 0.09 0.25 0.2 0.15 0.13 0.52 0.04 0.46 0.16 0.34 0.06 0.53 0.03 0.38 0.05 0.57 0.04 0.34 Reverse Complement Motif 0.05 0.04 0.57 0.34 0.06 0.03 0.53 0.38 0.04 0.16 0.46 0.34 0.52 0.15 0.13 0.2 0 0.09 0.66 0.25 0 0.22 0.62 0.16 0.18 0.1 0.38 0.34 0.05 0 0.68 0.27 0 0 0.87 0.13 0.52 0.24 0.24 0 0 0.15 0.47 0.38 0 0 0.53 0.47 0.43 0.39 0 0.18 0 0 0.82 0.18 0 0.35 0.38 0.27 0.18 0.33 0.29 0.2 0.11 0.1 0.61 0.18 0 0.19 0.52 0.29 0.41 0.4 0 0.19 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 6 TFM2 Original Motif Reverse Complement Forward 1 10 0.0814831 Original Motif 0.404762 0.047619 0.547619 0 0.238095 0.119048 0.642857 0 0.607143 0.0714286 0.321429 0 0.190476 0 0.797619 0.0119048 0.22619 0 0.738095 0.0357143 0.738095 0 0.238095 0.0238095 0.261905 0.142857 0.595238 0 0.345238 0.0714286 0.583333 0 0.547619 0 0.452381 0 0.0119048 0 0.988095 0 0.0119048 0.309524 0.678571 0 0.357143 0.261905 0.190476 0.190476 0.309524 0 0.690476 0 0.25 0.0952381 0.654762 0 0.309524 0.047619 0.392857 0.25 0.0357143 0.0952381 0.857143 0.0119048 Reverse Complement Motif 0.0357143 0.857143 0.0952381 0.0119048 0.309524 0.392857 0.047619 0.25 0.25 0.654762 0.0952381 0 0.309524 0.690476 0 0 0.190476 0.261905 0.190476 0.357143 0.0119048 0.678571 0.309524 0 0.0119048 0.988095 0 0 0 0 0.452381 0.547619 0.345238 0.583333 0.0714286 0 0.261905 0.595238 0.142857 0 0.0238095 0 0.238095 0.738095 0.22619 0.738095 0 0.0357143 0.190476 0.797619 0 0.0119048 0 0.0714286 0.321429 0.607143 0.238095 0.642857 0.119048 0 0.404762 0.547619 0.047619 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 sSGTCACGTGACSs Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 10 0.0895189 Original Motif 0.0555556 0.388889 0.388889 0.166667 0 0.277778 0.722222 0 0.0555556 0.111111 0.833333 0 0.111111 0 0.0555556 0.833333 0 0.888889 0.111111 0 1 0 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.0555556 0.944444 0 0 0 0 1 0 0.111111 0.888889 0 0.833333 0.0555556 0 0.111111 0 0.833333 0.111111 0.0555556 0 0.722222 0.277778 0 0.166667 0.388889 0.388889 0.0555556 Reverse Complement Motif 0.166667 0.388889 0.388889 0.0555556 0 0.277778 0.722222 0 0 0.111111 0.833333 0.0555556 0.111111 0.0555556 0 0.833333 0 0.888889 0.111111 0 1 0 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.0555556 0.944444 0 0 0 0 1 0 0.111111 0.888889 0 0.833333 0 0.0555556 0.111111 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0 0.722222 0.277778 0 0.0555556 0.388889 0.388889 0.166667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 2 TFW2 Original Motif Reverse Complement Backward 1 8 1.09499 Original Motif 0.0058309 0.364431 0.41691 0.212828 0.0816327 0.816327 0.0991254 0.00291545 0.00291545 0.0670554 0.921283 0.00874636 0.0058309 0.883382 0.107872 0.00291545 0 0.0962099 0.860058 0.0437318 0.00291545 0.906706 0.0787172 0.0116618 0.0437318 0.0758017 0.825073 0.0553936 0 0.125364 0.87172 0.00291545 Reverse Complement Motif 0 0.87172 0.125364 0.00291545 0.0437318 0.825073 0.0758017 0.0553936 0.00291545 0.0787172 0.906706 0.0116618 0 0.860058 0.0962099 0.0437318 0.0058309 0.107872 0.883382 0.00291545 0.00291545 0.921283 0.0670554 0.00874636 0.0816327 0.0991254 0.816327 0.00291545 0.0058309 0.41691 0.364431 0.212828 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 kcACCTGCAgc Reverse Complement Original Motif Forward 4 8 1.10343 Original Motif 0.153846 0.230769 0.307692 0.307692 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0.153846 0.230769 0.461538 0.153846 0.153846 0.615385 0.153846 0.0769231 Reverse Complement Motif 0.153846 0.153846 0.615385 0.0769231 0.153846 0.461538 0.230769 0.153846 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0.153846 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 0.307692 0.230769 0.307692 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 15 kCAGCCAATmr Reverse Complement Original Motif Backward 5 7 1.57732 Original Motif 0.235294 0.176471 0.294118 0.294118 0.117647 0.705882 0.176471 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0.352941 0.352941 0.235294 0.0588235 0.352941 0.176471 0.411765 0.0588235 Reverse Complement Motif 0.352941 0.411765 0.176471 0.0588235 0.0588235 0.352941 0.235294 0.352941 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.117647 0.176471 0.705882 0 0.235294 0.294118 0.176471 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 19 Motif Name wsTACwGTAsw Original Motif 0.277778 0.222222 0.166667 0.333333 0.166667 0.444444 0.277778 0.111111 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0.5 0 0 0.5 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0.111111 0.277778 0.444444 0.166667 0.333333 0.166667 0.222222 0.277778 Reverse Complement Motif 0.277778 0.166667 0.222222 0.333333 0.111111 0.444444 0.277778 0.166667 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0.5 0 0 0.5 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0.166667 0.277778 0.444444 0.111111 0.333333 0.222222 0.166667 0.277778 ******************************************************************* Best Matches for Significant Motif ID 19 (Highest to Lowest) ******************************************************************* Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 kcACCTGCAgc Original Motif Reverse Complement Backward 1 11 0.0199592 Original Motif 0.153846 0.230769 0.307692 0.307692 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0.153846 0.230769 0.461538 0.153846 0.153846 0.615385 0.153846 0.0769231 Reverse Complement Motif 0.153846 0.153846 0.615385 0.0769231 0.153846 0.461538 0.230769 0.153846 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0.153846 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 0.307692 0.230769 0.307692 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 17 wwAAATAATAtw Original Motif Reverse Complement Backward 1 11 0.0309343 Original Motif 0.37037 0.166667 0.12963 0.333333 0.333333 0.166667 0.203704 0.296296 0.740741 0.0185185 0.0555556 0.185185 0.740741 0.0555556 0.037037 0.166667 0.888889 0.0185185 0.0185185 0.0740741 0.037037 0 0 0.962963 0.833333 0.037037 0.0185185 0.111111 0.796296 0.0185185 0.037037 0.148148 0.0740741 0.0555556 0.0185185 0.851852 0.925926 0.0555556 0.0185185 0 0.240741 0.166667 0.166667 0.425926 0.37037 0.12963 0.148148 0.351852 Reverse Complement Motif 0.351852 0.12963 0.148148 0.37037 0.425926 0.166667 0.166667 0.240741 0 0.0555556 0.0185185 0.925926 0.851852 0.0555556 0.0185185 0.0740741 0.148148 0.0185185 0.037037 0.796296 0.111111 0.037037 0.0185185 0.833333 0.962963 0 0 0.037037 0.0740741 0.0185185 0.0185185 0.888889 0.166667 0.0555556 0.037037 0.740741 0.185185 0.0185185 0.0555556 0.740741 0.296296 0.166667 0.203704 0.333333 0.333333 0.166667 0.12963 0.37037 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 13 tkAAATAATAtw Reverse Complement Original Motif Forward 1 11 0.0337121 Original Motif 0.233333 0.2 0.166667 0.4 0.233333 0.133333 0.266667 0.366667 0.733333 0.0333333 0.0333333 0.2 0.866667 0.0333333 0.0333333 0.0666667 0.833333 0 0.0333333 0.133333 0.166667 0 0 0.833333 0.866667 0.0666667 0 0.0666667 0.8 0.0333333 0.0333333 0.133333 0 0 0 1 0.966667 0.0333333 0 0 0.166667 0.2 0.133333 0.5 0.4 0.1 0.1 0.4 Reverse Complement Motif 0.4 0.1 0.1 0.4 0.5 0.2 0.133333 0.166667 0 0.0333333 0 0.966667 1 0 0 0 0.133333 0.0333333 0.0333333 0.8 0.0666667 0.0666667 0 0.866667 0.833333 0 0 0.166667 0.133333 0 0.0333333 0.833333 0.0666667 0.0333333 0.0333333 0.866667 0.2 0.0333333 0.0333333 0.733333 0.366667 0.133333 0.266667 0.233333 0.4 0.2 0.166667 0.233333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 wbgTAAATAww Reverse Complement Original Motif Forward 1 11 0.037518 Original Motif 0.285714 0.142857 0.178571 0.392857 0.214286 0.285714 0.25 0.25 0.142857 0.0714286 0.678571 0.107143 0 0 0 1 0.928571 0 0.0357143 0.0357143 0.821429 0.107143 0.0357143 0.0357143 0.821429 0 0.178571 0 0 0.0714286 0 0.928571 0.928571 0.0357143 0.0357143 0 0.285714 0.214286 0.142857 0.357143 0.392857 0.178571 0.178571 0.25 Reverse Complement Motif 0.25 0.178571 0.178571 0.392857 0.357143 0.214286 0.142857 0.285714 0 0.0357143 0.0357143 0.928571 0.928571 0.0714286 0 0 0 0 0.178571 0.821429 0.0357143 0.107143 0.0357143 0.821429 0.0357143 0 0.0357143 0.928571 1 0 0 0 0.142857 0.678571 0.0714286 0.107143 0.214286 0.25 0.285714 0.25 0.392857 0.142857 0.178571 0.285714 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 8 TFM3 Reverse Complement Original Motif Forward 4 11 0.0413797 Original Motif 0.454545 0 0 0.545455 0.5 0 0 0.5 0.318182 0.181818 0.0909091 0.409091 0 0 0.136364 0.863636 0.318182 0 0 0.681818 0.0454545 0 0.272727 0.681818 0.272727 0.0454545 0.0909091 0.590909 0.272727 0.0909091 0 0.636364 0.0454545 0.818182 0 0.136364 0.727273 0 0 0.272727 0.0909091 0.318182 0.227273 0.363636 0.863636 0.0454545 0 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0909091 0 0.5 0.0909091 0.0909091 0.318182 0.136364 0.227273 0 0.636364 0.227273 0 0 0.772727 0.363636 0.0909091 0 0.545455 0.772727 0.181818 0.0454545 0 Reverse Complement Motif 0 0.181818 0.0454545 0.772727 0.545455 0.0909091 0 0.363636 0.772727 0 0 0.227273 0.636364 0.227273 0 0.136364 0.318182 0.0909091 0.0909091 0.5 0 0.0909091 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0454545 0 0.863636 0.363636 0.318182 0.227273 0.0909091 0.272727 0 0 0.727273 0.0454545 0 0.818182 0.136364 0.636364 0.0909091 0 0.272727 0.590909 0.0454545 0.0909091 0.272727 0.681818 0 0.272727 0.0454545 0.681818 0 0 0.318182 0.863636 0 0.136364 0 0.409091 0.181818 0.0909091 0.318182 0.5 0 0 0.5 0.545455 0 0 0.454545 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 10 TFM13 Original Motif Reverse Complement Backward 3 11 0.0445707 Original Motif 0.666667 0.133333 0 0.2 0.0666667 0.2 0 0.733333 0.2 0 0.333333 0.466667 0.666667 0 0 0.333333 0.666667 0 0 0.333333 0.6 0 0 0.4 0.333333 0 0 0.666667 0 0.0666667 0 0.933333 0.133333 0.266667 0 0.6 0.266667 0 0 0.733333 0.466667 0 0.466667 0.0666667 0.6 0.333333 0 0.0666667 0.8 0.2 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.133333 0.2 0.2 0.466667 0.8 0 0.2 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 0.4 0.333333 0 0.266667 0.2 0 0 0.8 0.6 0 0 0.4 Reverse Complement Motif 0.4 0 0 0.6 0.8 0 0 0.2 0.266667 0.333333 0 0.4 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0 0 0.2 0.8 0.466667 0.2 0.2 0.133333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.2 0 0.8 0.0666667 0.333333 0 0.6 0.0666667 0 0.466667 0.466667 0.733333 0 0 0.266667 0.6 0.266667 0 0.133333 0.933333 0.0666667 0 0 0.666667 0 0 0.333333 0.4 0 0 0.6 0.333333 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.666667 0.466667 0 0.333333 0.2 0.733333 0.2 0 0.0666667 0.2 0.133333 0 0.666667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 TFM11 Reverse Complement Original Motif Forward 4 11 0.0472742 Original Motif 0.294118 0.235294 0.117647 0.352941 0.382353 0.205882 0.205882 0.205882 0.529412 0 0.117647 0.352941 0.235294 0.294118 0.323529 0.147059 1 0 0 0 0.941176 0 0 0.0588235 0.764706 0 0.0294118 0.205882 0.382353 0.235294 0.176471 0.205882 0.735294 0 0.0588235 0.205882 0.735294 0.0294118 0.117647 0.117647 0.676471 0 0.0882353 0.235294 0.529412 0.117647 0.205882 0.147059 0.705882 0.176471 0.117647 0 0.441176 0.352941 0.147059 0.0588235 0.941176 0.0588235 0 0 0.852941 0 0.147059 0 0.676471 0.0882353 0 0.235294 0.529412 0.323529 0.117647 0.0294118 0.470588 0.176471 0 0.352941 0.411765 0 0.147059 0.441176 0.5 0.0882353 0.147059 0.264706 0.294118 0.205882 0.0882353 0.411765 0.205882 0.235294 0.264706 0.294118 0.470588 0 0.117647 0.411765 0.617647 0.176471 0.205882 0 Reverse Complement Motif 0 0.176471 0.205882 0.617647 0.411765 0 0.117647 0.470588 0.294118 0.235294 0.264706 0.205882 0.411765 0.205882 0.0882353 0.294118 0.264706 0.0882353 0.147059 0.5 0.441176 0 0.147059 0.411765 0.352941 0.176471 0 0.470588 0.0294118 0.323529 0.117647 0.529412 0.235294 0.0882353 0 0.676471 0 0 0.147059 0.852941 0 0.0588235 0 0.941176 0.0588235 0.352941 0.147059 0.441176 0 0.176471 0.117647 0.705882 0.147059 0.117647 0.205882 0.529412 0.235294 0 0.0882353 0.676471 0.117647 0.0294118 0.117647 0.735294 0.205882 0 0.0588235 0.735294 0.205882 0.235294 0.176471 0.382353 0.205882 0 0.0294118 0.764706 0.0588235 0 0 0.941176 0 0 0 1 0.235294 0.323529 0.294118 0.147059 0.352941 0 0.117647 0.529412 0.205882 0.205882 0.205882 0.382353 0.352941 0.235294 0.117647 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 dhACATTCTkh Original Motif Reverse Complement Forward 2 10 0.544444 Original Motif 0.333333 0 0.333333 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0.666667 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 Reverse Complement Motif 0.333333 0.333333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 1 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 7 TFM1 Reverse Complement Original Motif Forward 10 9 1.04742 Original Motif 0.384615 0.0769231 0 0.538462 0.25641 0 0 0.74359 0.0769231 0.153846 0.333333 0.435897 0.230769 0 0 0.769231 0 0.25641 0 0.74359 0 0 0.0769231 0.923077 0.025641 0.0769231 0.25641 0.641026 0 0.128205 0.230769 0.641026 0.333333 0.230769 0.205128 0.230769 0.282051 0.179487 0 0.538462 0.0512821 0.128205 0 0.820513 0.128205 0 0 0.871795 0.25641 0.025641 0.179487 0.538462 0.102564 0 0 0.897436 0.128205 0 0.102564 0.769231 0.128205 0.025641 0.205128 0.641026 0.102564 0.333333 0.25641 0.307692 0.25641 0.102564 0 0.641026 Reverse Complement Motif 0.641026 0.102564 0 0.25641 0.102564 0.25641 0.333333 0.307692 0.641026 0.025641 0.205128 0.128205 0.769231 0 0.102564 0.128205 0.897436 0 0 0.102564 0.538462 0.025641 0.179487 0.25641 0.871795 0 0 0.128205 0.820513 0.128205 0 0.0512821 0.538462 0.179487 0 0.282051 0.230769 0.230769 0.205128 0.333333 0.641026 0.128205 0.230769 0 0.641026 0.0769231 0.25641 0.025641 0.923077 0 0.0769231 0 0.74359 0.25641 0 0 0.769231 0 0 0.230769 0.435897 0.153846 0.333333 0.0769231 0.74359 0 0 0.25641 0.538462 0.0769231 0 0.384615 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 TFM12 Reverse Complement Original Motif Backward 15 6 2.54736 Original Motif 0 1 0 0 0.19 0.4 0 0.41 0 0.52 0.19 0.29 0.11 0.61 0.1 0.18 0.18 0.29 0.33 0.2 0 0.38 0.35 0.27 0 0.82 0 0.18 0.18 0.39 0 0.43 0 0.53 0 0.47 0 0.47 0.15 0.38 0 0.24 0.24 0.52 0 0.87 0 0.13 0.05 0.68 0 0.27 0.18 0.38 0.1 0.34 0 0.62 0.22 0.16 0 0.66 0.09 0.25 0.2 0.15 0.13 0.52 0.04 0.46 0.16 0.34 0.06 0.53 0.03 0.38 0.05 0.57 0.04 0.34 Reverse Complement Motif 0.05 0.04 0.57 0.34 0.06 0.03 0.53 0.38 0.04 0.16 0.46 0.34 0.52 0.15 0.13 0.2 0 0.09 0.66 0.25 0 0.22 0.62 0.16 0.18 0.1 0.38 0.34 0.05 0 0.68 0.27 0 0 0.87 0.13 0.52 0.24 0.24 0 0 0.15 0.47 0.38 0 0 0.53 0.47 0.43 0.39 0 0.18 0 0 0.82 0.18 0 0.35 0.38 0.27 0.18 0.33 0.29 0.2 0.11 0.1 0.61 0.18 0 0.19 0.52 0.29 0.41 0.4 0 0.19 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 20 Motif Name dhACATTCTkh Original Motif 0.333333 0 0.333333 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0.666667 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 Reverse Complement Motif 0.333333 0.333333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 1 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 ******************************************************************* Best Matches for Significant Motif ID 20 (Highest to Lowest) ******************************************************************* Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 8 TFM3 Reverse Complement Original Motif Backward 8 11 0.00522383 Original Motif 0.454545 0 0 0.545455 0.5 0 0 0.5 0.318182 0.181818 0.0909091 0.409091 0 0 0.136364 0.863636 0.318182 0 0 0.681818 0.0454545 0 0.272727 0.681818 0.272727 0.0454545 0.0909091 0.590909 0.272727 0.0909091 0 0.636364 0.0454545 0.818182 0 0.136364 0.727273 0 0 0.272727 0.0909091 0.318182 0.227273 0.363636 0.863636 0.0454545 0 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0909091 0 0.5 0.0909091 0.0909091 0.318182 0.136364 0.227273 0 0.636364 0.227273 0 0 0.772727 0.363636 0.0909091 0 0.545455 0.772727 0.181818 0.0454545 0 Reverse Complement Motif 0 0.181818 0.0454545 0.772727 0.545455 0.0909091 0 0.363636 0.772727 0 0 0.227273 0.636364 0.227273 0 0.136364 0.318182 0.0909091 0.0909091 0.5 0 0.0909091 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0454545 0 0.863636 0.363636 0.318182 0.227273 0.0909091 0.272727 0 0 0.727273 0.0454545 0 0.818182 0.136364 0.636364 0.0909091 0 0.272727 0.590909 0.0454545 0.0909091 0.272727 0.681818 0 0.272727 0.0454545 0.681818 0 0 0.318182 0.863636 0 0.136364 0 0.409091 0.181818 0.0909091 0.318182 0.5 0 0 0.5 0.545455 0 0 0.454545 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 kcACCTGCAgc Original Motif Original Motif Backward 1 11 0.00731643 Original Motif 0.153846 0.230769 0.307692 0.307692 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0.153846 0.230769 0.461538 0.153846 0.153846 0.615385 0.153846 0.0769231 Reverse Complement Motif 0.153846 0.153846 0.615385 0.0769231 0.153846 0.461538 0.230769 0.153846 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0.153846 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 0.307692 0.230769 0.307692 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 17 wwAAATAATAtw Reverse Complement Reverse Complement Forward 2 11 0.0127231 Original Motif 0.37037 0.166667 0.12963 0.333333 0.333333 0.166667 0.203704 0.296296 0.740741 0.0185185 0.0555556 0.185185 0.740741 0.0555556 0.037037 0.166667 0.888889 0.0185185 0.0185185 0.0740741 0.037037 0 0 0.962963 0.833333 0.037037 0.0185185 0.111111 0.796296 0.0185185 0.037037 0.148148 0.0740741 0.0555556 0.0185185 0.851852 0.925926 0.0555556 0.0185185 0 0.240741 0.166667 0.166667 0.425926 0.37037 0.12963 0.148148 0.351852 Reverse Complement Motif 0.351852 0.12963 0.148148 0.37037 0.425926 0.166667 0.166667 0.240741 0 0.0555556 0.0185185 0.925926 0.851852 0.0555556 0.0185185 0.0740741 0.148148 0.0185185 0.037037 0.796296 0.111111 0.037037 0.0185185 0.833333 0.962963 0 0 0.037037 0.0740741 0.0185185 0.0185185 0.888889 0.166667 0.0555556 0.037037 0.740741 0.185185 0.0185185 0.0555556 0.740741 0.296296 0.166667 0.203704 0.333333 0.333333 0.166667 0.12963 0.37037 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 TFM11 Reverse Complement Original Motif Forward 5 11 0.014258 Original Motif 0.294118 0.235294 0.117647 0.352941 0.382353 0.205882 0.205882 0.205882 0.529412 0 0.117647 0.352941 0.235294 0.294118 0.323529 0.147059 1 0 0 0 0.941176 0 0 0.0588235 0.764706 0 0.0294118 0.205882 0.382353 0.235294 0.176471 0.205882 0.735294 0 0.0588235 0.205882 0.735294 0.0294118 0.117647 0.117647 0.676471 0 0.0882353 0.235294 0.529412 0.117647 0.205882 0.147059 0.705882 0.176471 0.117647 0 0.441176 0.352941 0.147059 0.0588235 0.941176 0.0588235 0 0 0.852941 0 0.147059 0 0.676471 0.0882353 0 0.235294 0.529412 0.323529 0.117647 0.0294118 0.470588 0.176471 0 0.352941 0.411765 0 0.147059 0.441176 0.5 0.0882353 0.147059 0.264706 0.294118 0.205882 0.0882353 0.411765 0.205882 0.235294 0.264706 0.294118 0.470588 0 0.117647 0.411765 0.617647 0.176471 0.205882 0 Reverse Complement Motif 0 0.176471 0.205882 0.617647 0.411765 0 0.117647 0.470588 0.294118 0.235294 0.264706 0.205882 0.411765 0.205882 0.0882353 0.294118 0.264706 0.0882353 0.147059 0.5 0.441176 0 0.147059 0.411765 0.352941 0.176471 0 0.470588 0.0294118 0.323529 0.117647 0.529412 0.235294 0.0882353 0 0.676471 0 0 0.147059 0.852941 0 0.0588235 0 0.941176 0.0588235 0.352941 0.147059 0.441176 0 0.176471 0.117647 0.705882 0.147059 0.117647 0.205882 0.529412 0.235294 0 0.0882353 0.676471 0.117647 0.0294118 0.117647 0.735294 0.205882 0 0.0588235 0.735294 0.205882 0.235294 0.176471 0.382353 0.205882 0 0.0294118 0.764706 0.0588235 0 0 0.941176 0 0 0 1 0.235294 0.323529 0.294118 0.147059 0.352941 0 0.117647 0.529412 0.205882 0.205882 0.205882 0.382353 0.352941 0.235294 0.117647 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 10 TFM13 Original Motif Original Motif Forward 2 11 0.0192045 Original Motif 0.666667 0.133333 0 0.2 0.0666667 0.2 0 0.733333 0.2 0 0.333333 0.466667 0.666667 0 0 0.333333 0.666667 0 0 0.333333 0.6 0 0 0.4 0.333333 0 0 0.666667 0 0.0666667 0 0.933333 0.133333 0.266667 0 0.6 0.266667 0 0 0.733333 0.466667 0 0.466667 0.0666667 0.6 0.333333 0 0.0666667 0.8 0.2 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.133333 0.2 0.2 0.466667 0.8 0 0.2 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 0.4 0.333333 0 0.266667 0.2 0 0 0.8 0.6 0 0 0.4 Reverse Complement Motif 0.4 0 0 0.6 0.8 0 0 0.2 0.266667 0.333333 0 0.4 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0 0 0.2 0.8 0.466667 0.2 0.2 0.133333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.2 0 0.8 0.0666667 0.333333 0 0.6 0.0666667 0 0.466667 0.466667 0.733333 0 0 0.266667 0.6 0.266667 0 0.133333 0.933333 0.0666667 0 0 0.666667 0 0 0.333333 0.4 0 0 0.6 0.333333 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.666667 0.466667 0 0.333333 0.2 0.733333 0.2 0 0.0666667 0.2 0.133333 0 0.666667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 13 tkAAATAATAtw Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 11 0.0199621 Original Motif 0.233333 0.2 0.166667 0.4 0.233333 0.133333 0.266667 0.366667 0.733333 0.0333333 0.0333333 0.2 0.866667 0.0333333 0.0333333 0.0666667 0.833333 0 0.0333333 0.133333 0.166667 0 0 0.833333 0.866667 0.0666667 0 0.0666667 0.8 0.0333333 0.0333333 0.133333 0 0 0 1 0.966667 0.0333333 0 0 0.166667 0.2 0.133333 0.5 0.4 0.1 0.1 0.4 Reverse Complement Motif 0.4 0.1 0.1 0.4 0.5 0.2 0.133333 0.166667 0 0.0333333 0 0.966667 1 0 0 0 0.133333 0.0333333 0.0333333 0.8 0.0666667 0.0666667 0 0.866667 0.833333 0 0 0.166667 0.133333 0 0.0333333 0.833333 0.0666667 0.0333333 0.0333333 0.866667 0.2 0.0333333 0.0333333 0.733333 0.366667 0.133333 0.266667 0.233333 0.4 0.2 0.166667 0.233333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 15 kCAGCCAATmr Original Motif Reverse Complement Forward 1 11 0.0247304 Original Motif 0.235294 0.176471 0.294118 0.294118 0.117647 0.705882 0.176471 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0.352941 0.352941 0.235294 0.0588235 0.352941 0.176471 0.411765 0.0588235 Reverse Complement Motif 0.352941 0.411765 0.176471 0.0588235 0.0588235 0.352941 0.235294 0.352941 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.117647 0.176471 0.705882 0 0.235294 0.294118 0.176471 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 7 TFM1 Reverse Complement Reverse Complement Forward 9 10 0.519904 Original Motif 0.384615 0.0769231 0 0.538462 0.25641 0 0 0.74359 0.0769231 0.153846 0.333333 0.435897 0.230769 0 0 0.769231 0 0.25641 0 0.74359 0 0 0.0769231 0.923077 0.025641 0.0769231 0.25641 0.641026 0 0.128205 0.230769 0.641026 0.333333 0.230769 0.205128 0.230769 0.282051 0.179487 0 0.538462 0.0512821 0.128205 0 0.820513 0.128205 0 0 0.871795 0.25641 0.025641 0.179487 0.538462 0.102564 0 0 0.897436 0.128205 0 0.102564 0.769231 0.128205 0.025641 0.205128 0.641026 0.102564 0.333333 0.25641 0.307692 0.25641 0.102564 0 0.641026 Reverse Complement Motif 0.641026 0.102564 0 0.25641 0.102564 0.25641 0.333333 0.307692 0.641026 0.025641 0.205128 0.128205 0.769231 0 0.102564 0.128205 0.897436 0 0 0.102564 0.538462 0.025641 0.179487 0.25641 0.871795 0 0 0.128205 0.820513 0.128205 0 0.0512821 0.538462 0.179487 0 0.282051 0.230769 0.230769 0.205128 0.333333 0.641026 0.128205 0.230769 0 0.641026 0.0769231 0.25641 0.025641 0.923077 0 0.0769231 0 0.74359 0.25641 0 0 0.769231 0 0 0.230769 0.435897 0.153846 0.333333 0.0769231 0.74359 0 0 0.25641 0.538462 0.0769231 0 0.384615 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 wsTACwGTAsw Original Motif Reverse Complement Backward 2 10 0.527917 Original Motif 0.277778 0.222222 0.166667 0.333333 0.166667 0.444444 0.277778 0.111111 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0.5 0 0 0.5 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0.111111 0.277778 0.444444 0.166667 0.333333 0.166667 0.222222 0.277778 Reverse Complement Motif 0.277778 0.166667 0.222222 0.333333 0.111111 0.444444 0.277778 0.166667 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0.5 0 0 0.5 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0.166667 0.277778 0.444444 0.111111 0.333333 0.222222 0.166667 0.277778 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 TFM12 Original Motif Original Motif Backward 17 4 3.5 Original Motif 0 1 0 0 0.19 0.4 0 0.41 0 0.52 0.19 0.29 0.11 0.61 0.1 0.18 0.18 0.29 0.33 0.2 0 0.38 0.35 0.27 0 0.82 0 0.18 0.18 0.39 0 0.43 0 0.53 0 0.47 0 0.47 0.15 0.38 0 0.24 0.24 0.52 0 0.87 0 0.13 0.05 0.68 0 0.27 0.18 0.38 0.1 0.34 0 0.62 0.22 0.16 0 0.66 0.09 0.25 0.2 0.15 0.13 0.52 0.04 0.46 0.16 0.34 0.06 0.53 0.03 0.38 0.05 0.57 0.04 0.34 Reverse Complement Motif 0.05 0.04 0.57 0.34 0.06 0.03 0.53 0.38 0.04 0.16 0.46 0.34 0.52 0.15 0.13 0.2 0 0.09 0.66 0.25 0 0.22 0.62 0.16 0.18 0.1 0.38 0.34 0.05 0 0.68 0.27 0 0 0.87 0.13 0.52 0.24 0.24 0 0 0.15 0.47 0.38 0 0 0.53 0.47 0.43 0.39 0 0.18 0 0 0.82 0.18 0 0.35 0.38 0.27 0.18 0.33 0.29 0.2 0.11 0.1 0.61 0.18 0 0.19 0.52 0.29 0.41 0.4 0 0.19 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 21 Motif Name wbgTAAATAww Original Motif 0.285714 0.142857 0.178571 0.392857 0.214286 0.285714 0.25 0.25 0.142857 0.0714286 0.678571 0.107143 0 0 0 1 0.928571 0 0.0357143 0.0357143 0.821429 0.107143 0.0357143 0.0357143 0.821429 0 0.178571 0 0 0.0714286 0 0.928571 0.928571 0.0357143 0.0357143 0 0.285714 0.214286 0.142857 0.357143 0.392857 0.178571 0.178571 0.25 Reverse Complement Motif 0.25 0.178571 0.178571 0.392857 0.357143 0.214286 0.142857 0.285714 0 0.0357143 0.0357143 0.928571 0.928571 0.0714286 0 0 0 0 0.178571 0.821429 0.0357143 0.107143 0.0357143 0.821429 0.0357143 0 0.0357143 0.928571 1 0 0 0 0.142857 0.678571 0.0714286 0.107143 0.214286 0.25 0.285714 0.25 0.392857 0.142857 0.178571 0.285714 ******************************************************************* Best Matches for Significant Motif ID 21 (Highest to Lowest) ******************************************************************* Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 13 tkAAATAATAtw Original Motif Original Motif Forward 2 11 0.0162338 Original Motif 0.233333 0.2 0.166667 0.4 0.233333 0.133333 0.266667 0.366667 0.733333 0.0333333 0.0333333 0.2 0.866667 0.0333333 0.0333333 0.0666667 0.833333 0 0.0333333 0.133333 0.166667 0 0 0.833333 0.866667 0.0666667 0 0.0666667 0.8 0.0333333 0.0333333 0.133333 0 0 0 1 0.966667 0.0333333 0 0 0.166667 0.2 0.133333 0.5 0.4 0.1 0.1 0.4 Reverse Complement Motif 0.4 0.1 0.1 0.4 0.5 0.2 0.133333 0.166667 0 0.0333333 0 0.966667 1 0 0 0 0.133333 0.0333333 0.0333333 0.8 0.0666667 0.0666667 0 0.866667 0.833333 0 0 0.166667 0.133333 0 0.0333333 0.833333 0.0666667 0.0333333 0.0333333 0.866667 0.2 0.0333333 0.0333333 0.733333 0.366667 0.133333 0.266667 0.233333 0.4 0.2 0.166667 0.233333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 17 wwAAATAATAtw Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 11 0.0164863 Original Motif 0.37037 0.166667 0.12963 0.333333 0.333333 0.166667 0.203704 0.296296 0.740741 0.0185185 0.0555556 0.185185 0.740741 0.0555556 0.037037 0.166667 0.888889 0.0185185 0.0185185 0.0740741 0.037037 0 0 0.962963 0.833333 0.037037 0.0185185 0.111111 0.796296 0.0185185 0.037037 0.148148 0.0740741 0.0555556 0.0185185 0.851852 0.925926 0.0555556 0.0185185 0 0.240741 0.166667 0.166667 0.425926 0.37037 0.12963 0.148148 0.351852 Reverse Complement Motif 0.351852 0.12963 0.148148 0.37037 0.425926 0.166667 0.166667 0.240741 0 0.0555556 0.0185185 0.925926 0.851852 0.0555556 0.0185185 0.0740741 0.148148 0.0185185 0.037037 0.796296 0.111111 0.037037 0.0185185 0.833333 0.962963 0 0 0.037037 0.0740741 0.0185185 0.0185185 0.888889 0.166667 0.0555556 0.037037 0.740741 0.185185 0.0185185 0.0555556 0.740741 0.296296 0.166667 0.203704 0.333333 0.333333 0.166667 0.12963 0.37037 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 TFM11 Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 11 0.0192768 Original Motif 0.294118 0.235294 0.117647 0.352941 0.382353 0.205882 0.205882 0.205882 0.529412 0 0.117647 0.352941 0.235294 0.294118 0.323529 0.147059 1 0 0 0 0.941176 0 0 0.0588235 0.764706 0 0.0294118 0.205882 0.382353 0.235294 0.176471 0.205882 0.735294 0 0.0588235 0.205882 0.735294 0.0294118 0.117647 0.117647 0.676471 0 0.0882353 0.235294 0.529412 0.117647 0.205882 0.147059 0.705882 0.176471 0.117647 0 0.441176 0.352941 0.147059 0.0588235 0.941176 0.0588235 0 0 0.852941 0 0.147059 0 0.676471 0.0882353 0 0.235294 0.529412 0.323529 0.117647 0.0294118 0.470588 0.176471 0 0.352941 0.411765 0 0.147059 0.441176 0.5 0.0882353 0.147059 0.264706 0.294118 0.205882 0.0882353 0.411765 0.205882 0.235294 0.264706 0.294118 0.470588 0 0.117647 0.411765 0.617647 0.176471 0.205882 0 Reverse Complement Motif 0 0.176471 0.205882 0.617647 0.411765 0 0.117647 0.470588 0.294118 0.235294 0.264706 0.205882 0.411765 0.205882 0.0882353 0.294118 0.264706 0.0882353 0.147059 0.5 0.441176 0 0.147059 0.411765 0.352941 0.176471 0 0.470588 0.0294118 0.323529 0.117647 0.529412 0.235294 0.0882353 0 0.676471 0 0 0.147059 0.852941 0 0.0588235 0 0.941176 0.0588235 0.352941 0.147059 0.441176 0 0.176471 0.117647 0.705882 0.147059 0.117647 0.205882 0.529412 0.235294 0 0.0882353 0.676471 0.117647 0.0294118 0.117647 0.735294 0.205882 0 0.0588235 0.735294 0.205882 0.235294 0.176471 0.382353 0.205882 0 0.0294118 0.764706 0.0588235 0 0 0.941176 0 0 0 1 0.235294 0.323529 0.294118 0.147059 0.352941 0 0.117647 0.529412 0.205882 0.205882 0.205882 0.382353 0.352941 0.235294 0.117647 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 7 TFM1 Reverse Complement Original Motif Forward 1 11 0.0283217 Original Motif 0.384615 0.0769231 0 0.538462 0.25641 0 0 0.74359 0.0769231 0.153846 0.333333 0.435897 0.230769 0 0 0.769231 0 0.25641 0 0.74359 0 0 0.0769231 0.923077 0.025641 0.0769231 0.25641 0.641026 0 0.128205 0.230769 0.641026 0.333333 0.230769 0.205128 0.230769 0.282051 0.179487 0 0.538462 0.0512821 0.128205 0 0.820513 0.128205 0 0 0.871795 0.25641 0.025641 0.179487 0.538462 0.102564 0 0 0.897436 0.128205 0 0.102564 0.769231 0.128205 0.025641 0.205128 0.641026 0.102564 0.333333 0.25641 0.307692 0.25641 0.102564 0 0.641026 Reverse Complement Motif 0.641026 0.102564 0 0.25641 0.102564 0.25641 0.333333 0.307692 0.641026 0.025641 0.205128 0.128205 0.769231 0 0.102564 0.128205 0.897436 0 0 0.102564 0.538462 0.025641 0.179487 0.25641 0.871795 0 0 0.128205 0.820513 0.128205 0 0.0512821 0.538462 0.179487 0 0.282051 0.230769 0.230769 0.205128 0.333333 0.641026 0.128205 0.230769 0 0.641026 0.0769231 0.25641 0.025641 0.923077 0 0.0769231 0 0.74359 0.25641 0 0 0.769231 0 0 0.230769 0.435897 0.153846 0.333333 0.0769231 0.74359 0 0 0.25641 0.538462 0.0769231 0 0.384615 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 8 TFM3 Reverse Complement Original Motif Backward 2 11 0.0308097 Original Motif 0.454545 0 0 0.545455 0.5 0 0 0.5 0.318182 0.181818 0.0909091 0.409091 0 0 0.136364 0.863636 0.318182 0 0 0.681818 0.0454545 0 0.272727 0.681818 0.272727 0.0454545 0.0909091 0.590909 0.272727 0.0909091 0 0.636364 0.0454545 0.818182 0 0.136364 0.727273 0 0 0.272727 0.0909091 0.318182 0.227273 0.363636 0.863636 0.0454545 0 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0909091 0 0.5 0.0909091 0.0909091 0.318182 0.136364 0.227273 0 0.636364 0.227273 0 0 0.772727 0.363636 0.0909091 0 0.545455 0.772727 0.181818 0.0454545 0 Reverse Complement Motif 0 0.181818 0.0454545 0.772727 0.545455 0.0909091 0 0.363636 0.772727 0 0 0.227273 0.636364 0.227273 0 0.136364 0.318182 0.0909091 0.0909091 0.5 0 0.0909091 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0454545 0 0.863636 0.363636 0.318182 0.227273 0.0909091 0.272727 0 0 0.727273 0.0454545 0 0.818182 0.136364 0.636364 0.0909091 0 0.272727 0.590909 0.0454545 0.0909091 0.272727 0.681818 0 0.272727 0.0454545 0.681818 0 0 0.318182 0.863636 0 0.136364 0 0.409091 0.181818 0.0909091 0.318182 0.5 0 0 0.5 0.545455 0 0 0.454545 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 10 TFM13 Original Motif Original Motif Forward 8 11 0.0333874 Original Motif 0.666667 0.133333 0 0.2 0.0666667 0.2 0 0.733333 0.2 0 0.333333 0.466667 0.666667 0 0 0.333333 0.666667 0 0 0.333333 0.6 0 0 0.4 0.333333 0 0 0.666667 0 0.0666667 0 0.933333 0.133333 0.266667 0 0.6 0.266667 0 0 0.733333 0.466667 0 0.466667 0.0666667 0.6 0.333333 0 0.0666667 0.8 0.2 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.133333 0.2 0.2 0.466667 0.8 0 0.2 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 0.4 0.333333 0 0.266667 0.2 0 0 0.8 0.6 0 0 0.4 Reverse Complement Motif 0.4 0 0 0.6 0.8 0 0 0.2 0.266667 0.333333 0 0.4 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0 0 0.2 0.8 0.466667 0.2 0.2 0.133333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.2 0 0.8 0.0666667 0.333333 0 0.6 0.0666667 0 0.466667 0.466667 0.733333 0 0 0.266667 0.6 0.266667 0 0.133333 0.933333 0.0666667 0 0 0.666667 0 0 0.333333 0.4 0 0 0.6 0.333333 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.666667 0.466667 0 0.333333 0.2 0.733333 0.2 0 0.0666667 0.2 0.133333 0 0.666667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 wsTACwGTAsw Reverse Complement Original Motif Backward 1 11 0.0472403 Original Motif 0.277778 0.222222 0.166667 0.333333 0.166667 0.444444 0.277778 0.111111 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0.5 0 0 0.5 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0.111111 0.277778 0.444444 0.166667 0.333333 0.166667 0.222222 0.277778 Reverse Complement Motif 0.277778 0.166667 0.222222 0.333333 0.111111 0.444444 0.277778 0.166667 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0.5 0 0 0.5 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0.166667 0.277778 0.444444 0.111111 0.333333 0.222222 0.166667 0.277778 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 15 kCAGCCAATmr Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 10 0.554132 Original Motif 0.235294 0.176471 0.294118 0.294118 0.117647 0.705882 0.176471 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0.352941 0.352941 0.235294 0.0588235 0.352941 0.176471 0.411765 0.0588235 Reverse Complement Motif 0.352941 0.411765 0.176471 0.0588235 0.0588235 0.352941 0.235294 0.352941 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.117647 0.176471 0.705882 0 0.235294 0.294118 0.176471 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 TFM12 Reverse Complement Reverse Complement Backward 14 7 2.0544 Original Motif 0 1 0 0 0.19 0.4 0 0.41 0 0.52 0.19 0.29 0.11 0.61 0.1 0.18 0.18 0.29 0.33 0.2 0 0.38 0.35 0.27 0 0.82 0 0.18 0.18 0.39 0 0.43 0 0.53 0 0.47 0 0.47 0.15 0.38 0 0.24 0.24 0.52 0 0.87 0 0.13 0.05 0.68 0 0.27 0.18 0.38 0.1 0.34 0 0.62 0.22 0.16 0 0.66 0.09 0.25 0.2 0.15 0.13 0.52 0.04 0.46 0.16 0.34 0.06 0.53 0.03 0.38 0.05 0.57 0.04 0.34 Reverse Complement Motif 0.05 0.04 0.57 0.34 0.06 0.03 0.53 0.38 0.04 0.16 0.46 0.34 0.52 0.15 0.13 0.2 0 0.09 0.66 0.25 0 0.22 0.62 0.16 0.18 0.1 0.38 0.34 0.05 0 0.68 0.27 0 0 0.87 0.13 0.52 0.24 0.24 0 0 0.15 0.47 0.38 0 0 0.53 0.47 0.43 0.39 0 0.18 0 0 0.82 0.18 0 0.35 0.38 0.27 0.18 0.33 0.29 0.2 0.11 0.1 0.61 0.18 0 0.19 0.52 0.29 0.41 0.4 0 0.19 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 6 TFM2 Reverse Complement Reverse Complement Backward 12 5 3.05714 Original Motif 0.404762 0.047619 0.547619 0 0.238095 0.119048 0.642857 0 0.607143 0.0714286 0.321429 0 0.190476 0 0.797619 0.0119048 0.22619 0 0.738095 0.0357143 0.738095 0 0.238095 0.0238095 0.261905 0.142857 0.595238 0 0.345238 0.0714286 0.583333 0 0.547619 0 0.452381 0 0.0119048 0 0.988095 0 0.0119048 0.309524 0.678571 0 0.357143 0.261905 0.190476 0.190476 0.309524 0 0.690476 0 0.25 0.0952381 0.654762 0 0.309524 0.047619 0.392857 0.25 0.0357143 0.0952381 0.857143 0.0119048 Reverse Complement Motif 0.0357143 0.857143 0.0952381 0.0119048 0.309524 0.392857 0.047619 0.25 0.25 0.654762 0.0952381 0 0.309524 0.690476 0 0 0.190476 0.261905 0.190476 0.357143 0.0119048 0.678571 0.309524 0 0.0119048 0.988095 0 0 0 0 0.452381 0.547619 0.345238 0.583333 0.0714286 0 0.261905 0.595238 0.142857 0 0.0238095 0 0.238095 0.738095 0.22619 0.738095 0 0.0357143 0.190476 0.797619 0 0.0119048 0 0.0714286 0.321429 0.607143 0.238095 0.642857 0.119048 0 0.404762 0.547619 0.047619 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 17 Motif Name wwAAATAATAtw Original Motif 0.37037 0.166667 0.12963 0.333333 0.333333 0.166667 0.203704 0.296296 0.740741 0.0185185 0.0555556 0.185185 0.740741 0.0555556 0.037037 0.166667 0.888889 0.0185185 0.0185185 0.0740741 0.037037 0 0 0.962963 0.833333 0.037037 0.0185185 0.111111 0.796296 0.0185185 0.037037 0.148148 0.0740741 0.0555556 0.0185185 0.851852 0.925926 0.0555556 0.0185185 0 0.240741 0.166667 0.166667 0.425926 0.37037 0.12963 0.148148 0.351852 Reverse Complement Motif 0.351852 0.12963 0.148148 0.37037 0.425926 0.166667 0.166667 0.240741 0 0.0555556 0.0185185 0.925926 0.851852 0.0555556 0.0185185 0.0740741 0.148148 0.0185185 0.037037 0.796296 0.111111 0.037037 0.0185185 0.833333 0.962963 0 0 0.037037 0.0740741 0.0185185 0.0185185 0.888889 0.166667 0.0555556 0.037037 0.740741 0.185185 0.0185185 0.0555556 0.740741 0.296296 0.166667 0.203704 0.333333 0.333333 0.166667 0.12963 0.37037 ******************************************************************* Best Matches for Significant Motif ID 17 (Highest to Lowest) ******************************************************************* Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 13 tkAAATAATAtw Original Motif Original Motif Backward 1 12 0 Original Motif 0.233333 0.2 0.166667 0.4 0.233333 0.133333 0.266667 0.366667 0.733333 0.0333333 0.0333333 0.2 0.866667 0.0333333 0.0333333 0.0666667 0.833333 0 0.0333333 0.133333 0.166667 0 0 0.833333 0.866667 0.0666667 0 0.0666667 0.8 0.0333333 0.0333333 0.133333 0 0 0 1 0.966667 0.0333333 0 0 0.166667 0.2 0.133333 0.5 0.4 0.1 0.1 0.4 Reverse Complement Motif 0.4 0.1 0.1 0.4 0.5 0.2 0.133333 0.166667 0 0.0333333 0 0.966667 1 0 0 0 0.133333 0.0333333 0.0333333 0.8 0.0666667 0.0666667 0 0.866667 0.833333 0 0 0.166667 0.133333 0 0.0333333 0.833333 0.0666667 0.0333333 0.0333333 0.866667 0.2 0.0333333 0.0333333 0.733333 0.366667 0.133333 0.266667 0.233333 0.4 0.2 0.166667 0.233333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 7 TFM1 Original Motif Reverse Complement Backward 1 12 0.0565705 Original Motif 0.384615 0.0769231 0 0.538462 0.25641 0 0 0.74359 0.0769231 0.153846 0.333333 0.435897 0.230769 0 0 0.769231 0 0.25641 0 0.74359 0 0 0.0769231 0.923077 0.025641 0.0769231 0.25641 0.641026 0 0.128205 0.230769 0.641026 0.333333 0.230769 0.205128 0.230769 0.282051 0.179487 0 0.538462 0.0512821 0.128205 0 0.820513 0.128205 0 0 0.871795 0.25641 0.025641 0.179487 0.538462 0.102564 0 0 0.897436 0.128205 0 0.102564 0.769231 0.128205 0.025641 0.205128 0.641026 0.102564 0.333333 0.25641 0.307692 0.25641 0.102564 0 0.641026 Reverse Complement Motif 0.641026 0.102564 0 0.25641 0.102564 0.25641 0.333333 0.307692 0.641026 0.025641 0.205128 0.128205 0.769231 0 0.102564 0.128205 0.897436 0 0 0.102564 0.538462 0.025641 0.179487 0.25641 0.871795 0 0 0.128205 0.820513 0.128205 0 0.0512821 0.538462 0.179487 0 0.282051 0.230769 0.230769 0.205128 0.333333 0.641026 0.128205 0.230769 0 0.641026 0.0769231 0.25641 0.025641 0.923077 0 0.0769231 0 0.74359 0.25641 0 0 0.769231 0 0 0.230769 0.435897 0.153846 0.333333 0.0769231 0.74359 0 0 0.25641 0.538462 0.0769231 0 0.384615 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 TFM11 Original Motif Original Motif Forward 3 12 0.0575935 Original Motif 0.294118 0.235294 0.117647 0.352941 0.382353 0.205882 0.205882 0.205882 0.529412 0 0.117647 0.352941 0.235294 0.294118 0.323529 0.147059 1 0 0 0 0.941176 0 0 0.0588235 0.764706 0 0.0294118 0.205882 0.382353 0.235294 0.176471 0.205882 0.735294 0 0.0588235 0.205882 0.735294 0.0294118 0.117647 0.117647 0.676471 0 0.0882353 0.235294 0.529412 0.117647 0.205882 0.147059 0.705882 0.176471 0.117647 0 0.441176 0.352941 0.147059 0.0588235 0.941176 0.0588235 0 0 0.852941 0 0.147059 0 0.676471 0.0882353 0 0.235294 0.529412 0.323529 0.117647 0.0294118 0.470588 0.176471 0 0.352941 0.411765 0 0.147059 0.441176 0.5 0.0882353 0.147059 0.264706 0.294118 0.205882 0.0882353 0.411765 0.205882 0.235294 0.264706 0.294118 0.470588 0 0.117647 0.411765 0.617647 0.176471 0.205882 0 Reverse Complement Motif 0 0.176471 0.205882 0.617647 0.411765 0 0.117647 0.470588 0.294118 0.235294 0.264706 0.205882 0.411765 0.205882 0.0882353 0.294118 0.264706 0.0882353 0.147059 0.5 0.441176 0 0.147059 0.411765 0.352941 0.176471 0 0.470588 0.0294118 0.323529 0.117647 0.529412 0.235294 0.0882353 0 0.676471 0 0 0.147059 0.852941 0 0.0588235 0 0.941176 0.0588235 0.352941 0.147059 0.441176 0 0.176471 0.117647 0.705882 0.147059 0.117647 0.205882 0.529412 0.235294 0 0.0882353 0.676471 0.117647 0.0294118 0.117647 0.735294 0.205882 0 0.0588235 0.735294 0.205882 0.235294 0.176471 0.382353 0.205882 0 0.0294118 0.764706 0.0588235 0 0 0.941176 0 0 0 1 0.235294 0.323529 0.294118 0.147059 0.352941 0 0.117647 0.529412 0.205882 0.205882 0.205882 0.382353 0.352941 0.235294 0.117647 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 10 TFM13 Original Motif Reverse Complement Backward 9 12 0.0712963 Original Motif 0.666667 0.133333 0 0.2 0.0666667 0.2 0 0.733333 0.2 0 0.333333 0.466667 0.666667 0 0 0.333333 0.666667 0 0 0.333333 0.6 0 0 0.4 0.333333 0 0 0.666667 0 0.0666667 0 0.933333 0.133333 0.266667 0 0.6 0.266667 0 0 0.733333 0.466667 0 0.466667 0.0666667 0.6 0.333333 0 0.0666667 0.8 0.2 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.133333 0.2 0.2 0.466667 0.8 0 0.2 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 0.4 0.333333 0 0.266667 0.2 0 0 0.8 0.6 0 0 0.4 Reverse Complement Motif 0.4 0 0 0.6 0.8 0 0 0.2 0.266667 0.333333 0 0.4 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0 0 0.2 0.8 0.466667 0.2 0.2 0.133333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.2 0 0.8 0.0666667 0.333333 0 0.6 0.0666667 0 0.466667 0.466667 0.733333 0 0 0.266667 0.6 0.266667 0 0.133333 0.933333 0.0666667 0 0 0.666667 0 0 0.333333 0.4 0 0 0.6 0.333333 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.666667 0.466667 0 0.333333 0.2 0.733333 0.2 0 0.0666667 0.2 0.133333 0 0.666667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 8 TFM3 Original Motif Reverse Complement Forward 7 12 0.0733516 Original Motif 0.454545 0 0 0.545455 0.5 0 0 0.5 0.318182 0.181818 0.0909091 0.409091 0 0 0.136364 0.863636 0.318182 0 0 0.681818 0.0454545 0 0.272727 0.681818 0.272727 0.0454545 0.0909091 0.590909 0.272727 0.0909091 0 0.636364 0.0454545 0.818182 0 0.136364 0.727273 0 0 0.272727 0.0909091 0.318182 0.227273 0.363636 0.863636 0.0454545 0 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0909091 0 0.5 0.0909091 0.0909091 0.318182 0.136364 0.227273 0 0.636364 0.227273 0 0 0.772727 0.363636 0.0909091 0 0.545455 0.772727 0.181818 0.0454545 0 Reverse Complement Motif 0 0.181818 0.0454545 0.772727 0.545455 0.0909091 0 0.363636 0.772727 0 0 0.227273 0.636364 0.227273 0 0.136364 0.318182 0.0909091 0.0909091 0.5 0 0.0909091 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0454545 0 0.863636 0.363636 0.318182 0.227273 0.0909091 0.272727 0 0 0.727273 0.0454545 0 0.818182 0.136364 0.636364 0.0909091 0 0.272727 0.590909 0.0454545 0.0909091 0.272727 0.681818 0 0.272727 0.0454545 0.681818 0 0 0.318182 0.863636 0 0.136364 0 0.409091 0.181818 0.0909091 0.318182 0.5 0 0 0.5 0.545455 0 0 0.454545 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 wbgTAAATAww Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 11 0.560545 Original Motif 0.285714 0.142857 0.178571 0.392857 0.214286 0.285714 0.25 0.25 0.142857 0.0714286 0.678571 0.107143 0 0 0 1 0.928571 0 0.0357143 0.0357143 0.821429 0.107143 0.0357143 0.0357143 0.821429 0 0.178571 0 0 0.0714286 0 0.928571 0.928571 0.0357143 0.0357143 0 0.285714 0.214286 0.142857 0.357143 0.392857 0.178571 0.178571 0.25 Reverse Complement Motif 0.25 0.178571 0.178571 0.392857 0.357143 0.214286 0.142857 0.285714 0 0.0357143 0.0357143 0.928571 0.928571 0.0714286 0 0 0 0 0.178571 0.821429 0.0357143 0.107143 0.0357143 0.821429 0.0357143 0 0.0357143 0.928571 1 0 0 0 0.142857 0.678571 0.0714286 0.107143 0.214286 0.25 0.285714 0.25 0.392857 0.142857 0.178571 0.285714 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 dhACATTCTkh Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 11 0.583032 Original Motif 0.333333 0 0.333333 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0.666667 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 Reverse Complement Motif 0.333333 0.333333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 1 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 wsTACwGTAsw Original Motif Reverse Complement Backward 1 11 0.584715 Original Motif 0.277778 0.222222 0.166667 0.333333 0.166667 0.444444 0.277778 0.111111 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0.5 0 0 0.5 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0.111111 0.277778 0.444444 0.166667 0.333333 0.166667 0.222222 0.277778 Reverse Complement Motif 0.277778 0.166667 0.222222 0.333333 0.111111 0.444444 0.277778 0.166667 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0.5 0 0 0.5 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0.166667 0.277778 0.444444 0.111111 0.333333 0.222222 0.166667 0.277778 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 15 kCAGCCAATmr Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 11 0.59598 Original Motif 0.235294 0.176471 0.294118 0.294118 0.117647 0.705882 0.176471 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0.352941 0.352941 0.235294 0.0588235 0.352941 0.176471 0.411765 0.0588235 Reverse Complement Motif 0.352941 0.411765 0.176471 0.0588235 0.0588235 0.352941 0.235294 0.352941 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.117647 0.176471 0.705882 0 0.235294 0.294118 0.176471 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 TFM12 Reverse Complement Reverse Complement Backward 16 5 3.59569 Original Motif 0 1 0 0 0.19 0.4 0 0.41 0 0.52 0.19 0.29 0.11 0.61 0.1 0.18 0.18 0.29 0.33 0.2 0 0.38 0.35 0.27 0 0.82 0 0.18 0.18 0.39 0 0.43 0 0.53 0 0.47 0 0.47 0.15 0.38 0 0.24 0.24 0.52 0 0.87 0 0.13 0.05 0.68 0 0.27 0.18 0.38 0.1 0.34 0 0.62 0.22 0.16 0 0.66 0.09 0.25 0.2 0.15 0.13 0.52 0.04 0.46 0.16 0.34 0.06 0.53 0.03 0.38 0.05 0.57 0.04 0.34 Reverse Complement Motif 0.05 0.04 0.57 0.34 0.06 0.03 0.53 0.38 0.04 0.16 0.46 0.34 0.52 0.15 0.13 0.2 0 0.09 0.66 0.25 0 0.22 0.62 0.16 0.18 0.1 0.38 0.34 0.05 0 0.68 0.27 0 0 0.87 0.13 0.52 0.24 0.24 0 0 0.15 0.47 0.38 0 0 0.53 0.47 0.43 0.39 0 0.18 0 0 0.82 0.18 0 0.35 0.38 0.27 0.18 0.33 0.29 0.2 0.11 0.1 0.61 0.18 0 0.19 0.52 0.29 0.41 0.4 0 0.19 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 13 Motif Name tkAAATAATAtw Original Motif 0.233333 0.2 0.166667 0.4 0.233333 0.133333 0.266667 0.366667 0.733333 0.0333333 0.0333333 0.2 0.866667 0.0333333 0.0333333 0.0666667 0.833333 0 0.0333333 0.133333 0.166667 0 0 0.833333 0.866667 0.0666667 0 0.0666667 0.8 0.0333333 0.0333333 0.133333 0 0 0 1 0.966667 0.0333333 0 0 0.166667 0.2 0.133333 0.5 0.4 0.1 0.1 0.4 Reverse Complement Motif 0.4 0.1 0.1 0.4 0.5 0.2 0.133333 0.166667 0 0.0333333 0 0.966667 1 0 0 0 0.133333 0.0333333 0.0333333 0.8 0.0666667 0.0666667 0 0.866667 0.833333 0 0 0.166667 0.133333 0 0.0333333 0.833333 0.0666667 0.0333333 0.0333333 0.866667 0.2 0.0333333 0.0333333 0.733333 0.366667 0.133333 0.266667 0.233333 0.4 0.2 0.166667 0.233333 ******************************************************************* Best Matches for Significant Motif ID 13 (Highest to Lowest) ******************************************************************* Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 17 wwAAATAATAtw Original Motif Original Motif Backward 1 12 0 Original Motif 0.37037 0.166667 0.12963 0.333333 0.333333 0.166667 0.203704 0.296296 0.740741 0.0185185 0.0555556 0.185185 0.740741 0.0555556 0.037037 0.166667 0.888889 0.0185185 0.0185185 0.0740741 0.037037 0 0 0.962963 0.833333 0.037037 0.0185185 0.111111 0.796296 0.0185185 0.037037 0.148148 0.0740741 0.0555556 0.0185185 0.851852 0.925926 0.0555556 0.0185185 0 0.240741 0.166667 0.166667 0.425926 0.37037 0.12963 0.148148 0.351852 Reverse Complement Motif 0.351852 0.12963 0.148148 0.37037 0.425926 0.166667 0.166667 0.240741 0 0.0555556 0.0185185 0.925926 0.851852 0.0555556 0.0185185 0.0740741 0.148148 0.0185185 0.037037 0.796296 0.111111 0.037037 0.0185185 0.833333 0.962963 0 0 0.037037 0.0740741 0.0185185 0.0185185 0.888889 0.166667 0.0555556 0.037037 0.740741 0.185185 0.0185185 0.0555556 0.740741 0.296296 0.166667 0.203704 0.333333 0.333333 0.166667 0.12963 0.37037 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 TFM11 Reverse Complement Reverse Complement Forward 12 12 0.0590505 Original Motif 0.294118 0.235294 0.117647 0.352941 0.382353 0.205882 0.205882 0.205882 0.529412 0 0.117647 0.352941 0.235294 0.294118 0.323529 0.147059 1 0 0 0 0.941176 0 0 0.0588235 0.764706 0 0.0294118 0.205882 0.382353 0.235294 0.176471 0.205882 0.735294 0 0.0588235 0.205882 0.735294 0.0294118 0.117647 0.117647 0.676471 0 0.0882353 0.235294 0.529412 0.117647 0.205882 0.147059 0.705882 0.176471 0.117647 0 0.441176 0.352941 0.147059 0.0588235 0.941176 0.0588235 0 0 0.852941 0 0.147059 0 0.676471 0.0882353 0 0.235294 0.529412 0.323529 0.117647 0.0294118 0.470588 0.176471 0 0.352941 0.411765 0 0.147059 0.441176 0.5 0.0882353 0.147059 0.264706 0.294118 0.205882 0.0882353 0.411765 0.205882 0.235294 0.264706 0.294118 0.470588 0 0.117647 0.411765 0.617647 0.176471 0.205882 0 Reverse Complement Motif 0 0.176471 0.205882 0.617647 0.411765 0 0.117647 0.470588 0.294118 0.235294 0.264706 0.205882 0.411765 0.205882 0.0882353 0.294118 0.264706 0.0882353 0.147059 0.5 0.441176 0 0.147059 0.411765 0.352941 0.176471 0 0.470588 0.0294118 0.323529 0.117647 0.529412 0.235294 0.0882353 0 0.676471 0 0 0.147059 0.852941 0 0.0588235 0 0.941176 0.0588235 0.352941 0.147059 0.441176 0 0.176471 0.117647 0.705882 0.147059 0.117647 0.205882 0.529412 0.235294 0 0.0882353 0.676471 0.117647 0.0294118 0.117647 0.735294 0.205882 0 0.0588235 0.735294 0.205882 0.235294 0.176471 0.382353 0.205882 0 0.0294118 0.764706 0.0588235 0 0 0.941176 0 0 0 1 0.235294 0.323529 0.294118 0.147059 0.352941 0 0.117647 0.529412 0.205882 0.205882 0.205882 0.382353 0.352941 0.235294 0.117647 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 7 TFM1 Reverse Complement Original Motif Backward 7 12 0.0637702 Original Motif 0.384615 0.0769231 0 0.538462 0.25641 0 0 0.74359 0.0769231 0.153846 0.333333 0.435897 0.230769 0 0 0.769231 0 0.25641 0 0.74359 0 0 0.0769231 0.923077 0.025641 0.0769231 0.25641 0.641026 0 0.128205 0.230769 0.641026 0.333333 0.230769 0.205128 0.230769 0.282051 0.179487 0 0.538462 0.0512821 0.128205 0 0.820513 0.128205 0 0 0.871795 0.25641 0.025641 0.179487 0.538462 0.102564 0 0 0.897436 0.128205 0 0.102564 0.769231 0.128205 0.025641 0.205128 0.641026 0.102564 0.333333 0.25641 0.307692 0.25641 0.102564 0 0.641026 Reverse Complement Motif 0.641026 0.102564 0 0.25641 0.102564 0.25641 0.333333 0.307692 0.641026 0.025641 0.205128 0.128205 0.769231 0 0.102564 0.128205 0.897436 0 0 0.102564 0.538462 0.025641 0.179487 0.25641 0.871795 0 0 0.128205 0.820513 0.128205 0 0.0512821 0.538462 0.179487 0 0.282051 0.230769 0.230769 0.205128 0.333333 0.641026 0.128205 0.230769 0 0.641026 0.0769231 0.25641 0.025641 0.923077 0 0.0769231 0 0.74359 0.25641 0 0 0.769231 0 0 0.230769 0.435897 0.153846 0.333333 0.0769231 0.74359 0 0 0.25641 0.538462 0.0769231 0 0.384615 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 10 TFM13 Original Motif Reverse Complement Backward 9 12 0.0704475 Original Motif 0.666667 0.133333 0 0.2 0.0666667 0.2 0 0.733333 0.2 0 0.333333 0.466667 0.666667 0 0 0.333333 0.666667 0 0 0.333333 0.6 0 0 0.4 0.333333 0 0 0.666667 0 0.0666667 0 0.933333 0.133333 0.266667 0 0.6 0.266667 0 0 0.733333 0.466667 0 0.466667 0.0666667 0.6 0.333333 0 0.0666667 0.8 0.2 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.133333 0.2 0.2 0.466667 0.8 0 0.2 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 0.4 0.333333 0 0.266667 0.2 0 0 0.8 0.6 0 0 0.4 Reverse Complement Motif 0.4 0 0 0.6 0.8 0 0 0.2 0.266667 0.333333 0 0.4 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0 0 0.2 0.8 0.466667 0.2 0.2 0.133333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.2 0 0.8 0.0666667 0.333333 0 0.6 0.0666667 0 0.466667 0.466667 0.733333 0 0 0.266667 0.6 0.266667 0 0.133333 0.933333 0.0666667 0 0 0.666667 0 0 0.333333 0.4 0 0 0.6 0.333333 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.666667 0.466667 0 0.333333 0.2 0.733333 0.2 0 0.0666667 0.2 0.133333 0 0.666667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 8 TFM3 Original Motif Reverse Complement Forward 7 12 0.0763819 Original Motif 0.454545 0 0 0.545455 0.5 0 0 0.5 0.318182 0.181818 0.0909091 0.409091 0 0 0.136364 0.863636 0.318182 0 0 0.681818 0.0454545 0 0.272727 0.681818 0.272727 0.0454545 0.0909091 0.590909 0.272727 0.0909091 0 0.636364 0.0454545 0.818182 0 0.136364 0.727273 0 0 0.272727 0.0909091 0.318182 0.227273 0.363636 0.863636 0.0454545 0 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0909091 0 0.5 0.0909091 0.0909091 0.318182 0.136364 0.227273 0 0.636364 0.227273 0 0 0.772727 0.363636 0.0909091 0 0.545455 0.772727 0.181818 0.0454545 0 Reverse Complement Motif 0 0.181818 0.0454545 0.772727 0.545455 0.0909091 0 0.363636 0.772727 0 0 0.227273 0.636364 0.227273 0 0.136364 0.318182 0.0909091 0.0909091 0.5 0 0.0909091 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0454545 0 0.863636 0.363636 0.318182 0.227273 0.0909091 0.272727 0 0 0.727273 0.0454545 0 0.818182 0.136364 0.636364 0.0909091 0 0.272727 0.590909 0.0454545 0.0909091 0.272727 0.681818 0 0.272727 0.0454545 0.681818 0 0 0.318182 0.863636 0 0.136364 0 0.409091 0.181818 0.0909091 0.318182 0.5 0 0 0.5 0.545455 0 0 0.454545 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 wbgTAAATAww Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 11 0.560292 Original Motif 0.285714 0.142857 0.178571 0.392857 0.214286 0.285714 0.25 0.25 0.142857 0.0714286 0.678571 0.107143 0 0 0 1 0.928571 0 0.0357143 0.0357143 0.821429 0.107143 0.0357143 0.0357143 0.821429 0 0.178571 0 0 0.0714286 0 0.928571 0.928571 0.0357143 0.0357143 0 0.285714 0.214286 0.142857 0.357143 0.392857 0.178571 0.178571 0.25 Reverse Complement Motif 0.25 0.178571 0.178571 0.392857 0.357143 0.214286 0.142857 0.285714 0 0.0357143 0.0357143 0.928571 0.928571 0.0714286 0 0 0 0 0.178571 0.821429 0.0357143 0.107143 0.0357143 0.821429 0.0357143 0 0.0357143 0.928571 1 0 0 0 0.142857 0.678571 0.0714286 0.107143 0.214286 0.25 0.285714 0.25 0.392857 0.142857 0.178571 0.285714 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 wsTACwGTAsw Reverse Complement Original Motif Forward 1 11 0.587493 Original Motif 0.277778 0.222222 0.166667 0.333333 0.166667 0.444444 0.277778 0.111111 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0.5 0 0 0.5 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0.111111 0.277778 0.444444 0.166667 0.333333 0.166667 0.222222 0.277778 Reverse Complement Motif 0.277778 0.166667 0.222222 0.333333 0.111111 0.444444 0.277778 0.166667 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0.5 0 0 0.5 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0.166667 0.277778 0.444444 0.111111 0.333333 0.222222 0.166667 0.277778 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 dhACATTCTkh Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 11 0.590271 Original Motif 0.333333 0 0.333333 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0.666667 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 Reverse Complement Motif 0.333333 0.333333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 1 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 15 kCAGCCAATmr Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 11 0.592142 Original Motif 0.235294 0.176471 0.294118 0.294118 0.117647 0.705882 0.176471 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0.352941 0.352941 0.235294 0.0588235 0.352941 0.176471 0.411765 0.0588235 Reverse Complement Motif 0.352941 0.411765 0.176471 0.0588235 0.0588235 0.352941 0.235294 0.352941 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.117647 0.176471 0.705882 0 0.235294 0.294118 0.176471 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 TFM12 Reverse Complement Reverse Complement Backward 16 5 3.59273 Original Motif 0 1 0 0 0.19 0.4 0 0.41 0 0.52 0.19 0.29 0.11 0.61 0.1 0.18 0.18 0.29 0.33 0.2 0 0.38 0.35 0.27 0 0.82 0 0.18 0.18 0.39 0 0.43 0 0.53 0 0.47 0 0.47 0.15 0.38 0 0.24 0.24 0.52 0 0.87 0 0.13 0.05 0.68 0 0.27 0.18 0.38 0.1 0.34 0 0.62 0.22 0.16 0 0.66 0.09 0.25 0.2 0.15 0.13 0.52 0.04 0.46 0.16 0.34 0.06 0.53 0.03 0.38 0.05 0.57 0.04 0.34 Reverse Complement Motif 0.05 0.04 0.57 0.34 0.06 0.03 0.53 0.38 0.04 0.16 0.46 0.34 0.52 0.15 0.13 0.2 0 0.09 0.66 0.25 0 0.22 0.62 0.16 0.18 0.1 0.38 0.34 0.05 0 0.68 0.27 0 0 0.87 0.13 0.52 0.24 0.24 0 0 0.15 0.47 0.38 0 0 0.53 0.47 0.43 0.39 0 0.18 0 0 0.82 0.18 0 0.35 0.38 0.27 0.18 0.33 0.29 0.2 0.11 0.1 0.61 0.18 0 0.19 0.52 0.29 0.41 0.4 0 0.19 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 15 Motif Name kCAGCCAATmr Original Motif 0.235294 0.176471 0.294118 0.294118 0.117647 0.705882 0.176471 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0.352941 0.352941 0.235294 0.0588235 0.352941 0.176471 0.411765 0.0588235 Reverse Complement Motif 0.352941 0.411765 0.176471 0.0588235 0.0588235 0.352941 0.235294 0.352941 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.117647 0.176471 0.705882 0 0.235294 0.294118 0.176471 0.294118 ******************************************************************* Best Matches for Significant Motif ID 15 (Highest to Lowest) ******************************************************************* Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 13 tkAAATAATAtw Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 11 0.0320614 Original Motif 0.233333 0.2 0.166667 0.4 0.233333 0.133333 0.266667 0.366667 0.733333 0.0333333 0.0333333 0.2 0.866667 0.0333333 0.0333333 0.0666667 0.833333 0 0.0333333 0.133333 0.166667 0 0 0.833333 0.866667 0.0666667 0 0.0666667 0.8 0.0333333 0.0333333 0.133333 0 0 0 1 0.966667 0.0333333 0 0 0.166667 0.2 0.133333 0.5 0.4 0.1 0.1 0.4 Reverse Complement Motif 0.4 0.1 0.1 0.4 0.5 0.2 0.133333 0.166667 0 0.0333333 0 0.966667 1 0 0 0 0.133333 0.0333333 0.0333333 0.8 0.0666667 0.0666667 0 0.866667 0.833333 0 0 0.166667 0.133333 0 0.0333333 0.833333 0.0666667 0.0333333 0.0333333 0.866667 0.2 0.0333333 0.0333333 0.733333 0.366667 0.133333 0.266667 0.233333 0.4 0.2 0.166667 0.233333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 dhACATTCTkh Original Motif Reverse Complement Backward 1 11 0.034958 Original Motif 0.333333 0 0.333333 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0.666667 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 Reverse Complement Motif 0.333333 0.333333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 1 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 17 wwAAATAATAtw Reverse Complement Reverse Complement Forward 2 11 0.0358988 Original Motif 0.37037 0.166667 0.12963 0.333333 0.333333 0.166667 0.203704 0.296296 0.740741 0.0185185 0.0555556 0.185185 0.740741 0.0555556 0.037037 0.166667 0.888889 0.0185185 0.0185185 0.0740741 0.037037 0 0 0.962963 0.833333 0.037037 0.0185185 0.111111 0.796296 0.0185185 0.037037 0.148148 0.0740741 0.0555556 0.0185185 0.851852 0.925926 0.0555556 0.0185185 0 0.240741 0.166667 0.166667 0.425926 0.37037 0.12963 0.148148 0.351852 Reverse Complement Motif 0.351852 0.12963 0.148148 0.37037 0.425926 0.166667 0.166667 0.240741 0 0.0555556 0.0185185 0.925926 0.851852 0.0555556 0.0185185 0.0740741 0.148148 0.0185185 0.037037 0.796296 0.111111 0.037037 0.0185185 0.833333 0.962963 0 0 0.037037 0.0740741 0.0185185 0.0185185 0.888889 0.166667 0.0555556 0.037037 0.740741 0.185185 0.0185185 0.0555556 0.740741 0.296296 0.166667 0.203704 0.333333 0.333333 0.166667 0.12963 0.37037 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 kcACCTGCAgc Reverse Complement Original Motif Backward 1 11 0.0360892 Original Motif 0.153846 0.230769 0.307692 0.307692 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0.153846 0.230769 0.461538 0.153846 0.153846 0.615385 0.153846 0.0769231 Reverse Complement Motif 0.153846 0.153846 0.615385 0.0769231 0.153846 0.461538 0.230769 0.153846 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0.153846 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 0.307692 0.230769 0.307692 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 5 TFF11 Reverse Complement Original Motif Backward 2 11 0.0376063 Original Motif 0.0761905 0.0857143 0.819048 0.0190476 0.0761905 0.0666667 0.780952 0.0761905 0.438095 0.32381 0.180952 0.0571429 0.12381 0.180952 0.657143 0.0380952 0.0952381 0.0761905 0.790476 0.0380952 0.371429 0.104762 0.485714 0.0380952 0.0190476 0.0380952 0.914286 0.0285714 0.0190476 0.0952381 0.885714 0 0.0571429 0.866667 0.0666667 0.00952381 0.00952381 0.00952381 0.980952 0 0.047619 0.104762 0.838095 0.00952381 0.333333 0.161905 0.409524 0.0952381 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.114286 0.580952 0.266667 0.0380952 Reverse Complement Motif 0.114286 0.266667 0.580952 0.0380952 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.333333 0.409524 0.161905 0.0952381 0.047619 0.838095 0.104762 0.00952381 0.00952381 0.980952 0.00952381 0 0.0571429 0.0666667 0.866667 0.00952381 0.0190476 0.885714 0.0952381 0 0.0190476 0.914286 0.0380952 0.0285714 0.371429 0.485714 0.104762 0.0380952 0.0952381 0.790476 0.0761905 0.0380952 0.12381 0.657143 0.180952 0.0380952 0.0571429 0.32381 0.180952 0.438095 0.0761905 0.780952 0.0666667 0.0761905 0.0761905 0.819048 0.0857143 0.0190476 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 TFM11 Original Motif Original Motif Backward 7 11 0.0396371 Original Motif 0.294118 0.235294 0.117647 0.352941 0.382353 0.205882 0.205882 0.205882 0.529412 0 0.117647 0.352941 0.235294 0.294118 0.323529 0.147059 1 0 0 0 0.941176 0 0 0.0588235 0.764706 0 0.0294118 0.205882 0.382353 0.235294 0.176471 0.205882 0.735294 0 0.0588235 0.205882 0.735294 0.0294118 0.117647 0.117647 0.676471 0 0.0882353 0.235294 0.529412 0.117647 0.205882 0.147059 0.705882 0.176471 0.117647 0 0.441176 0.352941 0.147059 0.0588235 0.941176 0.0588235 0 0 0.852941 0 0.147059 0 0.676471 0.0882353 0 0.235294 0.529412 0.323529 0.117647 0.0294118 0.470588 0.176471 0 0.352941 0.411765 0 0.147059 0.441176 0.5 0.0882353 0.147059 0.264706 0.294118 0.205882 0.0882353 0.411765 0.205882 0.235294 0.264706 0.294118 0.470588 0 0.117647 0.411765 0.617647 0.176471 0.205882 0 Reverse Complement Motif 0 0.176471 0.205882 0.617647 0.411765 0 0.117647 0.470588 0.294118 0.235294 0.264706 0.205882 0.411765 0.205882 0.0882353 0.294118 0.264706 0.0882353 0.147059 0.5 0.441176 0 0.147059 0.411765 0.352941 0.176471 0 0.470588 0.0294118 0.323529 0.117647 0.529412 0.235294 0.0882353 0 0.676471 0 0 0.147059 0.852941 0 0.0588235 0 0.941176 0.0588235 0.352941 0.147059 0.441176 0 0.176471 0.117647 0.705882 0.147059 0.117647 0.205882 0.529412 0.235294 0 0.0882353 0.676471 0.117647 0.0294118 0.117647 0.735294 0.205882 0 0.0588235 0.735294 0.205882 0.235294 0.176471 0.382353 0.205882 0 0.0294118 0.764706 0.0588235 0 0 0.941176 0 0 0 1 0.235294 0.323529 0.294118 0.147059 0.352941 0 0.117647 0.529412 0.205882 0.205882 0.205882 0.382353 0.352941 0.235294 0.117647 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 wbgTAAATAww Reverse Complement Reverse Complement Forward 2 10 0.538109 Original Motif 0.285714 0.142857 0.178571 0.392857 0.214286 0.285714 0.25 0.25 0.142857 0.0714286 0.678571 0.107143 0 0 0 1 0.928571 0 0.0357143 0.0357143 0.821429 0.107143 0.0357143 0.0357143 0.821429 0 0.178571 0 0 0.0714286 0 0.928571 0.928571 0.0357143 0.0357143 0 0.285714 0.214286 0.142857 0.357143 0.392857 0.178571 0.178571 0.25 Reverse Complement Motif 0.25 0.178571 0.178571 0.392857 0.357143 0.214286 0.142857 0.285714 0 0.0357143 0.0357143 0.928571 0.928571 0.0714286 0 0 0 0 0.178571 0.821429 0.0357143 0.107143 0.0357143 0.821429 0.0357143 0 0.0357143 0.928571 1 0 0 0 0.142857 0.678571 0.0714286 0.107143 0.214286 0.25 0.285714 0.25 0.392857 0.142857 0.178571 0.285714 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 3 TFW3 Reverse Complement Original Motif Forward 4 7 2.01586 Original Motif 0.02 0.92 0.05 0.01 0 0.03 0.96 0.01 0 0.17 0.83 0 0 0.99 0 0.01 0 0.27 0.21 0.52 0.03 0.3 0.37 0.3 0 0.95 0.05 0 0.02 0.13 0.8 0.05 0 0.88 0.12 0 0.01 0.22 0.76 0.01 Reverse Complement Motif 0.01 0.76 0.22 0.01 0 0.12 0.88 0 0.02 0.8 0.13 0.05 0 0.05 0.95 0 0.03 0.37 0.3 0.3 0.52 0.27 0.21 0 0 0 0.99 0.01 0 0.83 0.17 0 0 0.96 0.03 0.01 0.02 0.05 0.92 0.01 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 6 TFM2 Reverse Complement Original Motif Forward 11 6 2.5389 Original Motif 0.404762 0.047619 0.547619 0 0.238095 0.119048 0.642857 0 0.607143 0.0714286 0.321429 0 0.190476 0 0.797619 0.0119048 0.22619 0 0.738095 0.0357143 0.738095 0 0.238095 0.0238095 0.261905 0.142857 0.595238 0 0.345238 0.0714286 0.583333 0 0.547619 0 0.452381 0 0.0119048 0 0.988095 0 0.0119048 0.309524 0.678571 0 0.357143 0.261905 0.190476 0.190476 0.309524 0 0.690476 0 0.25 0.0952381 0.654762 0 0.309524 0.047619 0.392857 0.25 0.0357143 0.0952381 0.857143 0.0119048 Reverse Complement Motif 0.0357143 0.857143 0.0952381 0.0119048 0.309524 0.392857 0.047619 0.25 0.25 0.654762 0.0952381 0 0.309524 0.690476 0 0 0.190476 0.261905 0.190476 0.357143 0.0119048 0.678571 0.309524 0 0.0119048 0.988095 0 0 0 0 0.452381 0.547619 0.345238 0.583333 0.0714286 0 0.261905 0.595238 0.142857 0 0.0238095 0 0.238095 0.738095 0.22619 0.738095 0 0.0357143 0.190476 0.797619 0 0.0119048 0 0.0714286 0.321429 0.607143 0.238095 0.642857 0.119048 0 0.404762 0.547619 0.047619 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 4 TFF1 Original Motif Original Motif Forward 8 5 3 Original Motif 0.180952 0.533333 0.142857 0.142857 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.0190476 0.047619 0.914286 0.0190476 0.4 0.333333 0.219048 0.047619 0.0285714 0.047619 0.885714 0.0380952 0.0380952 0.895238 0.00952381 0.0571429 0.133333 0.733333 0.0666667 0.0666667 0.0380952 0.0380952 0.87619 0.047619 0.12381 0.752381 0.114286 0.00952381 0.314286 0.190476 0.390476 0.104762 0.12381 0.0285714 0.771429 0.0761905 0.0571429 0.904762 0.0285714 0.00952381 Reverse Complement Motif 0.0571429 0.0285714 0.904762 0.00952381 0.12381 0.771429 0.0285714 0.0761905 0.314286 0.390476 0.190476 0.104762 0.12381 0.114286 0.752381 0.00952381 0.0380952 0.87619 0.0380952 0.047619 0.133333 0.0666667 0.733333 0.0666667 0.0380952 0.00952381 0.895238 0.0571429 0.0285714 0.885714 0.047619 0.0380952 0.047619 0.333333 0.219048 0.4 0.0190476 0.914286 0.047619 0.0190476 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.180952 0.142857 0.533333 0.142857 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- **************************************************************************************************************************************************************************************************** ********************************************************************** Best Matches for Each Motif (Highest to Lowest) ***************************************************************************** Dataset # 1 Motif ID 1 Motif Name TFW1 Original Motif 0 0.082495 0.917505 0 0.0744467 0.217304 0.197183 0.511066 0 0.897384 0.102616 0 0.0503018 0.102616 0.847082 0 0 0.949698 0.0503018 0 0 0.0523139 0.947686 0 Reserve Complement Motif 0 0.947686 0.0523139 0 0 0.0503018 0.949698 0 0.0503018 0.847082 0.102616 0 0 0.102616 0.897384 0 0.511066 0.217304 0.197183 0.0744467 0 0.917505 0.082495 0 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 1 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 3 TFW3 Original Motif Original Motif Backward 1 6 0.0350356 Original Motif 0.02 0.92 0.05 0.01 0 0.03 0.96 0.01 0 0.17 0.83 0 0 0.99 0 0.01 0 0.27 0.21 0.52 0.03 0.3 0.37 0.3 0 0.95 0.05 0 0.02 0.13 0.8 0.05 0 0.88 0.12 0 0.01 0.22 0.76 0.01 Reverse Complement Motif 0.01 0.76 0.22 0.01 0 0.12 0.88 0 0.02 0.8 0.13 0.05 0 0.05 0.95 0 0.03 0.37 0.3 0.3 0.52 0.27 0.21 0 0 0 0.99 0.01 0 0.83 0.17 0 0 0.96 0.03 0.01 0.02 0.05 0.92 0.01 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 sSGTCACGTGACSs Original Motif Original Motif Forward 3 6 0.0375102 Original Motif 0.0555556 0.388889 0.388889 0.166667 0 0.277778 0.722222 0 0.0555556 0.111111 0.833333 0 0.111111 0 0.0555556 0.833333 0 0.888889 0.111111 0 1 0 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.0555556 0.944444 0 0 0 0 1 0 0.111111 0.888889 0 0.833333 0.0555556 0 0.111111 0 0.833333 0.111111 0.0555556 0 0.722222 0.277778 0 0.166667 0.388889 0.388889 0.0555556 Reverse Complement Motif 0.166667 0.388889 0.388889 0.0555556 0 0.277778 0.722222 0 0 0.111111 0.833333 0.0555556 0.111111 0.0555556 0 0.833333 0 0.888889 0.111111 0 1 0 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.0555556 0.944444 0 0 0 0 1 0 0.111111 0.888889 0 0.833333 0 0.0555556 0.111111 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0 0.722222 0.277778 0 0.0555556 0.388889 0.388889 0.166667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 5 TFF11 Reverse Complement Reverse Complement Backward 5 6 0.0381641 Original Motif 0.0761905 0.0857143 0.819048 0.0190476 0.0761905 0.0666667 0.780952 0.0761905 0.438095 0.32381 0.180952 0.0571429 0.12381 0.180952 0.657143 0.0380952 0.0952381 0.0761905 0.790476 0.0380952 0.371429 0.104762 0.485714 0.0380952 0.0190476 0.0380952 0.914286 0.0285714 0.0190476 0.0952381 0.885714 0 0.0571429 0.866667 0.0666667 0.00952381 0.00952381 0.00952381 0.980952 0 0.047619 0.104762 0.838095 0.00952381 0.333333 0.161905 0.409524 0.0952381 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.114286 0.580952 0.266667 0.0380952 Reverse Complement Motif 0.114286 0.266667 0.580952 0.0380952 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.333333 0.409524 0.161905 0.0952381 0.047619 0.838095 0.104762 0.00952381 0.00952381 0.980952 0.00952381 0 0.0571429 0.0666667 0.866667 0.00952381 0.0190476 0.885714 0.0952381 0 0.0190476 0.914286 0.0380952 0.0285714 0.371429 0.485714 0.104762 0.0380952 0.0952381 0.790476 0.0761905 0.0380952 0.12381 0.657143 0.180952 0.0380952 0.0571429 0.32381 0.180952 0.438095 0.0761905 0.780952 0.0666667 0.0761905 0.0761905 0.819048 0.0857143 0.0190476 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 4 TFF1 Reverse Complement Original Motif Forward 7 6 0.0431161 Original Motif 0.180952 0.533333 0.142857 0.142857 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.0190476 0.047619 0.914286 0.0190476 0.4 0.333333 0.219048 0.047619 0.0285714 0.047619 0.885714 0.0380952 0.0380952 0.895238 0.00952381 0.0571429 0.133333 0.733333 0.0666667 0.0666667 0.0380952 0.0380952 0.87619 0.047619 0.12381 0.752381 0.114286 0.00952381 0.314286 0.190476 0.390476 0.104762 0.12381 0.0285714 0.771429 0.0761905 0.0571429 0.904762 0.0285714 0.00952381 Reverse Complement Motif 0.0571429 0.0285714 0.904762 0.00952381 0.12381 0.771429 0.0285714 0.0761905 0.314286 0.390476 0.190476 0.104762 0.12381 0.114286 0.752381 0.00952381 0.0380952 0.87619 0.0380952 0.047619 0.133333 0.0666667 0.733333 0.0666667 0.0380952 0.00952381 0.895238 0.0571429 0.0285714 0.885714 0.047619 0.0380952 0.047619 0.333333 0.219048 0.4 0.0190476 0.914286 0.047619 0.0190476 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.180952 0.142857 0.533333 0.142857 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 2 TFW2 Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 6 0.052047 Original Motif 0.0058309 0.364431 0.41691 0.212828 0.0816327 0.816327 0.0991254 0.00291545 0.00291545 0.0670554 0.921283 0.00874636 0.0058309 0.883382 0.107872 0.00291545 0 0.0962099 0.860058 0.0437318 0.00291545 0.906706 0.0787172 0.0116618 0.0437318 0.0758017 0.825073 0.0553936 0 0.125364 0.87172 0.00291545 Reverse Complement Motif 0 0.87172 0.125364 0.00291545 0.0437318 0.825073 0.0758017 0.0553936 0.00291545 0.0787172 0.906706 0.0116618 0 0.860058 0.0962099 0.0437318 0.0058309 0.107872 0.883382 0.00291545 0.00291545 0.921283 0.0670554 0.00874636 0.0816327 0.0991254 0.816327 0.00291545 0.0058309 0.41691 0.364431 0.212828 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 csGCCCCGCCCCsc Original Motif Original Motif Backward 7 6 0.0539 Original Motif 0.179104 0.492537 0.164179 0.164179 0.223881 0.402985 0.283582 0.0895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0746269 0 0.895522 0.0895522 0.0149254 0 0.925373 0.0149254 0.0597015 0.0298507 0.970149 0 0 0 0.970149 0.0298507 0 0.0447761 0 0.940299 0.0149254 0 0.955224 0.0149254 0.0298507 0.0298507 0.955224 0.0149254 0 0.0298507 0.925373 0.0149254 0.0298507 0.119403 0.820896 0.0149254 0.0447761 0.104478 0.328358 0.373134 0.19403 0.179104 0.358209 0.223881 0.238806 Reverse Complement Motif 0.179104 0.223881 0.358209 0.238806 0.104478 0.373134 0.328358 0.19403 0.119403 0.0149254 0.820896 0.0447761 0.0298507 0.0149254 0.925373 0.0298507 0.0298507 0.0149254 0.955224 0 0 0.0149254 0.955224 0.0298507 0.0447761 0.940299 0 0.0149254 0 0.0298507 0.970149 0 0.0298507 0 0.970149 0 0 0.0149254 0.925373 0.0597015 0 0.0895522 0.895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0149254 0.0746269 0.223881 0.283582 0.402985 0.0895522 0.179104 0.164179 0.492537 0.164179 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 14 cccGCCCCGCCCCsb Reverse Complement Original Motif Backward 3 6 0.0558733 Original Motif 0.148936 0.425532 0.234043 0.191489 0.106383 0.553191 0.170213 0.170213 0.106383 0.659574 0.148936 0.0851064 0.0425532 0 0.851064 0.106383 0 0.93617 0.0638298 0 0 0.87234 0.0425532 0.0851064 0 1 0 0 0 0.957447 0.0425532 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.0425532 0.93617 0.0212766 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0.0638298 0.914894 0.0212766 0 0.0638298 0.297872 0.404255 0.234043 0.148936 0.319149 0.255319 0.276596 Reverse Complement Motif 0.148936 0.255319 0.319149 0.276596 0.0638298 0.404255 0.297872 0.234043 0.0638298 0.0212766 0.914894 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0.0425532 0.0212766 0.93617 0 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0 0.0425532 0.957447 0 0 0 1 0 0 0.0425532 0.87234 0.0851064 0 0.0638298 0.93617 0 0.0425532 0.851064 0 0.106383 0.106383 0.148936 0.659574 0.0851064 0.106383 0.170213 0.553191 0.170213 0.148936 0.234043 0.425532 0.191489 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 6 TFM2 Reverse Complement Reverse Complement Forward 7 6 0.0877631 Original Motif 0.404762 0.047619 0.547619 0 0.238095 0.119048 0.642857 0 0.607143 0.0714286 0.321429 0 0.190476 0 0.797619 0.0119048 0.22619 0 0.738095 0.0357143 0.738095 0 0.238095 0.0238095 0.261905 0.142857 0.595238 0 0.345238 0.0714286 0.583333 0 0.547619 0 0.452381 0 0.0119048 0 0.988095 0 0.0119048 0.309524 0.678571 0 0.357143 0.261905 0.190476 0.190476 0.309524 0 0.690476 0 0.25 0.0952381 0.654762 0 0.309524 0.047619 0.392857 0.25 0.0357143 0.0952381 0.857143 0.0119048 Reverse Complement Motif 0.0357143 0.857143 0.0952381 0.0119048 0.309524 0.392857 0.047619 0.25 0.25 0.654762 0.0952381 0 0.309524 0.690476 0 0 0.190476 0.261905 0.190476 0.357143 0.0119048 0.678571 0.309524 0 0.0119048 0.988095 0 0 0 0 0.452381 0.547619 0.345238 0.583333 0.0714286 0 0.261905 0.595238 0.142857 0 0.0238095 0 0.238095 0.738095 0.22619 0.738095 0 0.0357143 0.190476 0.797619 0 0.0119048 0 0.0714286 0.321429 0.607143 0.238095 0.642857 0.119048 0 0.404762 0.547619 0.047619 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 TFM12 Original Motif Reverse Complement Backward 7 6 0.089121 Original Motif 0 1 0 0 0.19 0.4 0 0.41 0 0.52 0.19 0.29 0.11 0.61 0.1 0.18 0.18 0.29 0.33 0.2 0 0.38 0.35 0.27 0 0.82 0 0.18 0.18 0.39 0 0.43 0 0.53 0 0.47 0 0.47 0.15 0.38 0 0.24 0.24 0.52 0 0.87 0 0.13 0.05 0.68 0 0.27 0.18 0.38 0.1 0.34 0 0.62 0.22 0.16 0 0.66 0.09 0.25 0.2 0.15 0.13 0.52 0.04 0.46 0.16 0.34 0.06 0.53 0.03 0.38 0.05 0.57 0.04 0.34 Reverse Complement Motif 0.05 0.04 0.57 0.34 0.06 0.03 0.53 0.38 0.04 0.16 0.46 0.34 0.52 0.15 0.13 0.2 0 0.09 0.66 0.25 0 0.22 0.62 0.16 0.18 0.1 0.38 0.34 0.05 0 0.68 0.27 0 0 0.87 0.13 0.52 0.24 0.24 0 0 0.15 0.47 0.38 0 0 0.53 0.47 0.43 0.39 0 0.18 0 0 0.82 0.18 0 0.35 0.38 0.27 0.18 0.33 0.29 0.2 0.11 0.1 0.61 0.18 0 0.19 0.52 0.29 0.41 0.4 0 0.19 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 kcACCTGCAgc Reverse Complement Original Motif Forward 6 6 0.0980422 Original Motif 0.153846 0.230769 0.307692 0.307692 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0.153846 0.230769 0.461538 0.153846 0.153846 0.615385 0.153846 0.0769231 Reverse Complement Motif 0.153846 0.153846 0.615385 0.0769231 0.153846 0.461538 0.230769 0.153846 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0.153846 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 0.307692 0.230769 0.307692 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 dhACATTCTkh Original Motif Reverse Complement Forward 8 4 1.09467 Original Motif 0.333333 0 0.333333 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0.666667 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 Reverse Complement Motif 0.333333 0.333333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 1 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 1 Motif ID 2 Motif Name TFW2 Original Motif 0.0058309 0.364431 0.41691 0.212828 0.0816327 0.816327 0.0991254 0.00291545 0.00291545 0.0670554 0.921283 0.00874636 0.0058309 0.883382 0.107872 0.00291545 0 0.0962099 0.860058 0.0437318 0.00291545 0.906706 0.0787172 0.0116618 0.0437318 0.0758017 0.825073 0.0553936 0 0.125364 0.87172 0.00291545 Reserve Complement Motif 0 0.87172 0.125364 0.00291545 0.0437318 0.825073 0.0758017 0.0553936 0.00291545 0.0787172 0.906706 0.0116618 0 0.860058 0.0962099 0.0437318 0.0058309 0.107872 0.883382 0.00291545 0.00291545 0.921283 0.0670554 0.00874636 0.0816327 0.0991254 0.816327 0.00291545 0.0058309 0.41691 0.364431 0.212828 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 2 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 csGCCCCGCCCCsc Original Motif Reverse Complement Backward 6 8 0.0456233 Original Motif 0.179104 0.492537 0.164179 0.164179 0.223881 0.402985 0.283582 0.0895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0746269 0 0.895522 0.0895522 0.0149254 0 0.925373 0.0149254 0.0597015 0.0298507 0.970149 0 0 0 0.970149 0.0298507 0 0.0447761 0 0.940299 0.0149254 0 0.955224 0.0149254 0.0298507 0.0298507 0.955224 0.0149254 0 0.0298507 0.925373 0.0149254 0.0298507 0.119403 0.820896 0.0149254 0.0447761 0.104478 0.328358 0.373134 0.19403 0.179104 0.358209 0.223881 0.238806 Reverse Complement Motif 0.179104 0.223881 0.358209 0.238806 0.104478 0.373134 0.328358 0.19403 0.119403 0.0149254 0.820896 0.0447761 0.0298507 0.0149254 0.925373 0.0298507 0.0298507 0.0149254 0.955224 0 0 0.0149254 0.955224 0.0298507 0.0447761 0.940299 0 0.0149254 0 0.0298507 0.970149 0 0.0298507 0 0.970149 0 0 0.0149254 0.925373 0.0597015 0 0.0895522 0.895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0149254 0.0746269 0.223881 0.283582 0.402985 0.0895522 0.179104 0.164179 0.492537 0.164179 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 14 cccGCCCCGCCCCsb Reverse Complement Original Motif Backward 2 8 0.045686 Original Motif 0.148936 0.425532 0.234043 0.191489 0.106383 0.553191 0.170213 0.170213 0.106383 0.659574 0.148936 0.0851064 0.0425532 0 0.851064 0.106383 0 0.93617 0.0638298 0 0 0.87234 0.0425532 0.0851064 0 1 0 0 0 0.957447 0.0425532 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.0425532 0.93617 0.0212766 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0.0638298 0.914894 0.0212766 0 0.0638298 0.297872 0.404255 0.234043 0.148936 0.319149 0.255319 0.276596 Reverse Complement Motif 0.148936 0.255319 0.319149 0.276596 0.0638298 0.404255 0.297872 0.234043 0.0638298 0.0212766 0.914894 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0.0425532 0.0212766 0.93617 0 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0 0.0425532 0.957447 0 0 0 1 0 0 0.0425532 0.87234 0.0851064 0 0.0638298 0.93617 0 0.0425532 0.851064 0 0.106383 0.106383 0.148936 0.659574 0.0851064 0.106383 0.170213 0.553191 0.170213 0.148936 0.234043 0.425532 0.191489 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 5 TFF11 Original Motif Original Motif Forward 4 8 0.0583967 Original Motif 0.0761905 0.0857143 0.819048 0.0190476 0.0761905 0.0666667 0.780952 0.0761905 0.438095 0.32381 0.180952 0.0571429 0.12381 0.180952 0.657143 0.0380952 0.0952381 0.0761905 0.790476 0.0380952 0.371429 0.104762 0.485714 0.0380952 0.0190476 0.0380952 0.914286 0.0285714 0.0190476 0.0952381 0.885714 0 0.0571429 0.866667 0.0666667 0.00952381 0.00952381 0.00952381 0.980952 0 0.047619 0.104762 0.838095 0.00952381 0.333333 0.161905 0.409524 0.0952381 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.114286 0.580952 0.266667 0.0380952 Reverse Complement Motif 0.114286 0.266667 0.580952 0.0380952 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.333333 0.409524 0.161905 0.0952381 0.047619 0.838095 0.104762 0.00952381 0.00952381 0.980952 0.00952381 0 0.0571429 0.0666667 0.866667 0.00952381 0.0190476 0.885714 0.0952381 0 0.0190476 0.914286 0.0380952 0.0285714 0.371429 0.485714 0.104762 0.0380952 0.0952381 0.790476 0.0761905 0.0380952 0.12381 0.657143 0.180952 0.0380952 0.0571429 0.32381 0.180952 0.438095 0.0761905 0.780952 0.0666667 0.0761905 0.0761905 0.819048 0.0857143 0.0190476 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 4 TFF1 Original Motif Original Motif Backward 5 8 0.060966 Original Motif 0.180952 0.533333 0.142857 0.142857 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.0190476 0.047619 0.914286 0.0190476 0.4 0.333333 0.219048 0.047619 0.0285714 0.047619 0.885714 0.0380952 0.0380952 0.895238 0.00952381 0.0571429 0.133333 0.733333 0.0666667 0.0666667 0.0380952 0.0380952 0.87619 0.047619 0.12381 0.752381 0.114286 0.00952381 0.314286 0.190476 0.390476 0.104762 0.12381 0.0285714 0.771429 0.0761905 0.0571429 0.904762 0.0285714 0.00952381 Reverse Complement Motif 0.0571429 0.0285714 0.904762 0.00952381 0.12381 0.771429 0.0285714 0.0761905 0.314286 0.390476 0.190476 0.104762 0.12381 0.114286 0.752381 0.00952381 0.0380952 0.87619 0.0380952 0.047619 0.133333 0.0666667 0.733333 0.0666667 0.0380952 0.00952381 0.895238 0.0571429 0.0285714 0.885714 0.047619 0.0380952 0.047619 0.333333 0.219048 0.4 0.0190476 0.914286 0.047619 0.0190476 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.180952 0.142857 0.533333 0.142857 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 3 TFW3 Original Motif Reverse Complement Forward 3 8 0.0906073 Original Motif 0.02 0.92 0.05 0.01 0 0.03 0.96 0.01 0 0.17 0.83 0 0 0.99 0 0.01 0 0.27 0.21 0.52 0.03 0.3 0.37 0.3 0 0.95 0.05 0 0.02 0.13 0.8 0.05 0 0.88 0.12 0 0.01 0.22 0.76 0.01 Reverse Complement Motif 0.01 0.76 0.22 0.01 0 0.12 0.88 0 0.02 0.8 0.13 0.05 0 0.05 0.95 0 0.03 0.37 0.3 0.3 0.52 0.27 0.21 0 0 0 0.99 0.01 0 0.83 0.17 0 0 0.96 0.03 0.01 0.02 0.05 0.92 0.01 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 6 TFM2 Reverse Complement Reverse Complement Backward 6 8 0.0910301 Original Motif 0.404762 0.047619 0.547619 0 0.238095 0.119048 0.642857 0 0.607143 0.0714286 0.321429 0 0.190476 0 0.797619 0.0119048 0.22619 0 0.738095 0.0357143 0.738095 0 0.238095 0.0238095 0.261905 0.142857 0.595238 0 0.345238 0.0714286 0.583333 0 0.547619 0 0.452381 0 0.0119048 0 0.988095 0 0.0119048 0.309524 0.678571 0 0.357143 0.261905 0.190476 0.190476 0.309524 0 0.690476 0 0.25 0.0952381 0.654762 0 0.309524 0.047619 0.392857 0.25 0.0357143 0.0952381 0.857143 0.0119048 Reverse Complement Motif 0.0357143 0.857143 0.0952381 0.0119048 0.309524 0.392857 0.047619 0.25 0.25 0.654762 0.0952381 0 0.309524 0.690476 0 0 0.190476 0.261905 0.190476 0.357143 0.0119048 0.678571 0.309524 0 0.0119048 0.988095 0 0 0 0 0.452381 0.547619 0.345238 0.583333 0.0714286 0 0.261905 0.595238 0.142857 0 0.0238095 0 0.238095 0.738095 0.22619 0.738095 0 0.0357143 0.190476 0.797619 0 0.0119048 0 0.0714286 0.321429 0.607143 0.238095 0.642857 0.119048 0 0.404762 0.547619 0.047619 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 TFM12 Original Motif Reverse Complement Backward 4 8 0.094473 Original Motif 0 1 0 0 0.19 0.4 0 0.41 0 0.52 0.19 0.29 0.11 0.61 0.1 0.18 0.18 0.29 0.33 0.2 0 0.38 0.35 0.27 0 0.82 0 0.18 0.18 0.39 0 0.43 0 0.53 0 0.47 0 0.47 0.15 0.38 0 0.24 0.24 0.52 0 0.87 0 0.13 0.05 0.68 0 0.27 0.18 0.38 0.1 0.34 0 0.62 0.22 0.16 0 0.66 0.09 0.25 0.2 0.15 0.13 0.52 0.04 0.46 0.16 0.34 0.06 0.53 0.03 0.38 0.05 0.57 0.04 0.34 Reverse Complement Motif 0.05 0.04 0.57 0.34 0.06 0.03 0.53 0.38 0.04 0.16 0.46 0.34 0.52 0.15 0.13 0.2 0 0.09 0.66 0.25 0 0.22 0.62 0.16 0.18 0.1 0.38 0.34 0.05 0 0.68 0.27 0 0 0.87 0.13 0.52 0.24 0.24 0 0 0.15 0.47 0.38 0 0 0.53 0.47 0.43 0.39 0 0.18 0 0 0.82 0.18 0 0.35 0.38 0.27 0.18 0.33 0.29 0.2 0.11 0.1 0.61 0.18 0 0.19 0.52 0.29 0.41 0.4 0 0.19 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 sSGTCACGTGACSs Original Motif Original Motif Backward 4 8 0.0988223 Original Motif 0.0555556 0.388889 0.388889 0.166667 0 0.277778 0.722222 0 0.0555556 0.111111 0.833333 0 0.111111 0 0.0555556 0.833333 0 0.888889 0.111111 0 1 0 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.0555556 0.944444 0 0 0 0 1 0 0.111111 0.888889 0 0.833333 0.0555556 0 0.111111 0 0.833333 0.111111 0.0555556 0 0.722222 0.277778 0 0.166667 0.388889 0.388889 0.0555556 Reverse Complement Motif 0.166667 0.388889 0.388889 0.0555556 0 0.277778 0.722222 0 0 0.111111 0.833333 0.0555556 0.111111 0.0555556 0 0.833333 0 0.888889 0.111111 0 1 0 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.0555556 0.944444 0 0 0 0 1 0 0.111111 0.888889 0 0.833333 0 0.0555556 0.111111 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0 0.722222 0.277778 0 0.0555556 0.388889 0.388889 0.166667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 1 TFW1 Original Motif Original Motif Forward 2 5 1.5088 Original Motif 0 0.082495 0.917505 0 0.0744467 0.217304 0.197183 0.511066 0 0.897384 0.102616 0 0.0503018 0.102616 0.847082 0 0 0.949698 0.0503018 0 0 0.0523139 0.947686 0 Reverse Complement Motif 0 0.947686 0.0523139 0 0 0.0503018 0.949698 0 0.0503018 0.847082 0.102616 0 0 0.102616 0.897384 0 0.511066 0.217304 0.197183 0.0744467 0 0.917505 0.082495 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 kcACCTGCAgc Original Motif Reverse Complement Backward 8 4 2.08456 Original Motif 0.153846 0.230769 0.307692 0.307692 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0.153846 0.230769 0.461538 0.153846 0.153846 0.615385 0.153846 0.0769231 Reverse Complement Motif 0.153846 0.153846 0.615385 0.0769231 0.153846 0.461538 0.230769 0.153846 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0.153846 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 0.307692 0.230769 0.307692 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 1 Motif ID 3 Motif Name TFW3 Original Motif 0.02 0.92 0.05 0.01 0 0.03 0.96 0.01 0 0.17 0.83 0 0 0.99 0 0.01 0 0.27 0.21 0.52 0.03 0.3 0.37 0.3 0 0.95 0.05 0 0.02 0.13 0.8 0.05 0 0.88 0.12 0 0.01 0.22 0.76 0.01 Reserve Complement Motif 0.01 0.76 0.22 0.01 0 0.12 0.88 0 0.02 0.8 0.13 0.05 0 0.05 0.95 0 0.03 0.37 0.3 0.3 0.52 0.27 0.21 0 0 0 0.99 0.01 0 0.83 0.17 0 0 0.96 0.03 0.01 0.02 0.05 0.92 0.01 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 3 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 4 TFF1 Original Motif Original Motif Backward 3 10 0.0623879 Original Motif 0.180952 0.533333 0.142857 0.142857 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.0190476 0.047619 0.914286 0.0190476 0.4 0.333333 0.219048 0.047619 0.0285714 0.047619 0.885714 0.0380952 0.0380952 0.895238 0.00952381 0.0571429 0.133333 0.733333 0.0666667 0.0666667 0.0380952 0.0380952 0.87619 0.047619 0.12381 0.752381 0.114286 0.00952381 0.314286 0.190476 0.390476 0.104762 0.12381 0.0285714 0.771429 0.0761905 0.0571429 0.904762 0.0285714 0.00952381 Reverse Complement Motif 0.0571429 0.0285714 0.904762 0.00952381 0.12381 0.771429 0.0285714 0.0761905 0.314286 0.390476 0.190476 0.104762 0.12381 0.114286 0.752381 0.00952381 0.0380952 0.87619 0.0380952 0.047619 0.133333 0.0666667 0.733333 0.0666667 0.0380952 0.00952381 0.895238 0.0571429 0.0285714 0.885714 0.047619 0.0380952 0.047619 0.333333 0.219048 0.4 0.0190476 0.914286 0.047619 0.0190476 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.180952 0.142857 0.533333 0.142857 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 5 TFF11 Reverse Complement Original Motif Backward 5 10 0.0645308 Original Motif 0.0761905 0.0857143 0.819048 0.0190476 0.0761905 0.0666667 0.780952 0.0761905 0.438095 0.32381 0.180952 0.0571429 0.12381 0.180952 0.657143 0.0380952 0.0952381 0.0761905 0.790476 0.0380952 0.371429 0.104762 0.485714 0.0380952 0.0190476 0.0380952 0.914286 0.0285714 0.0190476 0.0952381 0.885714 0 0.0571429 0.866667 0.0666667 0.00952381 0.00952381 0.00952381 0.980952 0 0.047619 0.104762 0.838095 0.00952381 0.333333 0.161905 0.409524 0.0952381 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.114286 0.580952 0.266667 0.0380952 Reverse Complement Motif 0.114286 0.266667 0.580952 0.0380952 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.333333 0.409524 0.161905 0.0952381 0.047619 0.838095 0.104762 0.00952381 0.00952381 0.980952 0.00952381 0 0.0571429 0.0666667 0.866667 0.00952381 0.0190476 0.885714 0.0952381 0 0.0190476 0.914286 0.0380952 0.0285714 0.371429 0.485714 0.104762 0.0380952 0.0952381 0.790476 0.0761905 0.0380952 0.12381 0.657143 0.180952 0.0380952 0.0571429 0.32381 0.180952 0.438095 0.0761905 0.780952 0.0666667 0.0761905 0.0761905 0.819048 0.0857143 0.0190476 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 csGCCCCGCCCCsc Original Motif Original Motif Backward 5 10 0.0718771 Original Motif 0.179104 0.492537 0.164179 0.164179 0.223881 0.402985 0.283582 0.0895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0746269 0 0.895522 0.0895522 0.0149254 0 0.925373 0.0149254 0.0597015 0.0298507 0.970149 0 0 0 0.970149 0.0298507 0 0.0447761 0 0.940299 0.0149254 0 0.955224 0.0149254 0.0298507 0.0298507 0.955224 0.0149254 0 0.0298507 0.925373 0.0149254 0.0298507 0.119403 0.820896 0.0149254 0.0447761 0.104478 0.328358 0.373134 0.19403 0.179104 0.358209 0.223881 0.238806 Reverse Complement Motif 0.179104 0.223881 0.358209 0.238806 0.104478 0.373134 0.328358 0.19403 0.119403 0.0149254 0.820896 0.0447761 0.0298507 0.0149254 0.925373 0.0298507 0.0298507 0.0149254 0.955224 0 0 0.0149254 0.955224 0.0298507 0.0447761 0.940299 0 0.0149254 0 0.0298507 0.970149 0 0.0298507 0 0.970149 0 0 0.0149254 0.925373 0.0597015 0 0.0895522 0.895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0149254 0.0746269 0.223881 0.283582 0.402985 0.0895522 0.179104 0.164179 0.492537 0.164179 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 14 cccGCCCCGCCCCsb Original Motif Original Motif Forward 2 10 0.0719604 Original Motif 0.148936 0.425532 0.234043 0.191489 0.106383 0.553191 0.170213 0.170213 0.106383 0.659574 0.148936 0.0851064 0.0425532 0 0.851064 0.106383 0 0.93617 0.0638298 0 0 0.87234 0.0425532 0.0851064 0 1 0 0 0 0.957447 0.0425532 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.0425532 0.93617 0.0212766 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0.0638298 0.914894 0.0212766 0 0.0638298 0.297872 0.404255 0.234043 0.148936 0.319149 0.255319 0.276596 Reverse Complement Motif 0.148936 0.255319 0.319149 0.276596 0.0638298 0.404255 0.297872 0.234043 0.0638298 0.0212766 0.914894 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0.0425532 0.0212766 0.93617 0 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0 0.0425532 0.957447 0 0 0 1 0 0 0.0425532 0.87234 0.0851064 0 0.0638298 0.93617 0 0.0425532 0.851064 0 0.106383 0.106383 0.148936 0.659574 0.0851064 0.106383 0.170213 0.553191 0.170213 0.148936 0.234043 0.425532 0.191489 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 TFM12 Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 10 0.0767689 Original Motif 0 1 0 0 0.19 0.4 0 0.41 0 0.52 0.19 0.29 0.11 0.61 0.1 0.18 0.18 0.29 0.33 0.2 0 0.38 0.35 0.27 0 0.82 0 0.18 0.18 0.39 0 0.43 0 0.53 0 0.47 0 0.47 0.15 0.38 0 0.24 0.24 0.52 0 0.87 0 0.13 0.05 0.68 0 0.27 0.18 0.38 0.1 0.34 0 0.62 0.22 0.16 0 0.66 0.09 0.25 0.2 0.15 0.13 0.52 0.04 0.46 0.16 0.34 0.06 0.53 0.03 0.38 0.05 0.57 0.04 0.34 Reverse Complement Motif 0.05 0.04 0.57 0.34 0.06 0.03 0.53 0.38 0.04 0.16 0.46 0.34 0.52 0.15 0.13 0.2 0 0.09 0.66 0.25 0 0.22 0.62 0.16 0.18 0.1 0.38 0.34 0.05 0 0.68 0.27 0 0 0.87 0.13 0.52 0.24 0.24 0 0 0.15 0.47 0.38 0 0 0.53 0.47 0.43 0.39 0 0.18 0 0 0.82 0.18 0 0.35 0.38 0.27 0.18 0.33 0.29 0.2 0.11 0.1 0.61 0.18 0 0.19 0.52 0.29 0.41 0.4 0 0.19 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 6 TFM2 Original Motif Reverse Complement Forward 1 10 0.0814831 Original Motif 0.404762 0.047619 0.547619 0 0.238095 0.119048 0.642857 0 0.607143 0.0714286 0.321429 0 0.190476 0 0.797619 0.0119048 0.22619 0 0.738095 0.0357143 0.738095 0 0.238095 0.0238095 0.261905 0.142857 0.595238 0 0.345238 0.0714286 0.583333 0 0.547619 0 0.452381 0 0.0119048 0 0.988095 0 0.0119048 0.309524 0.678571 0 0.357143 0.261905 0.190476 0.190476 0.309524 0 0.690476 0 0.25 0.0952381 0.654762 0 0.309524 0.047619 0.392857 0.25 0.0357143 0.0952381 0.857143 0.0119048 Reverse Complement Motif 0.0357143 0.857143 0.0952381 0.0119048 0.309524 0.392857 0.047619 0.25 0.25 0.654762 0.0952381 0 0.309524 0.690476 0 0 0.190476 0.261905 0.190476 0.357143 0.0119048 0.678571 0.309524 0 0.0119048 0.988095 0 0 0 0 0.452381 0.547619 0.345238 0.583333 0.0714286 0 0.261905 0.595238 0.142857 0 0.0238095 0 0.238095 0.738095 0.22619 0.738095 0 0.0357143 0.190476 0.797619 0 0.0119048 0 0.0714286 0.321429 0.607143 0.238095 0.642857 0.119048 0 0.404762 0.547619 0.047619 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 sSGTCACGTGACSs Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 10 0.0895189 Original Motif 0.0555556 0.388889 0.388889 0.166667 0 0.277778 0.722222 0 0.0555556 0.111111 0.833333 0 0.111111 0 0.0555556 0.833333 0 0.888889 0.111111 0 1 0 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.0555556 0.944444 0 0 0 0 1 0 0.111111 0.888889 0 0.833333 0.0555556 0 0.111111 0 0.833333 0.111111 0.0555556 0 0.722222 0.277778 0 0.166667 0.388889 0.388889 0.0555556 Reverse Complement Motif 0.166667 0.388889 0.388889 0.0555556 0 0.277778 0.722222 0 0 0.111111 0.833333 0.0555556 0.111111 0.0555556 0 0.833333 0 0.888889 0.111111 0 1 0 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.0555556 0.944444 0 0 0 0 1 0 0.111111 0.888889 0 0.833333 0 0.0555556 0.111111 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0 0.722222 0.277778 0 0.0555556 0.388889 0.388889 0.166667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 2 TFW2 Original Motif Reverse Complement Backward 1 8 1.09499 Original Motif 0.0058309 0.364431 0.41691 0.212828 0.0816327 0.816327 0.0991254 0.00291545 0.00291545 0.0670554 0.921283 0.00874636 0.0058309 0.883382 0.107872 0.00291545 0 0.0962099 0.860058 0.0437318 0.00291545 0.906706 0.0787172 0.0116618 0.0437318 0.0758017 0.825073 0.0553936 0 0.125364 0.87172 0.00291545 Reverse Complement Motif 0 0.87172 0.125364 0.00291545 0.0437318 0.825073 0.0758017 0.0553936 0.00291545 0.0787172 0.906706 0.0116618 0 0.860058 0.0962099 0.0437318 0.0058309 0.107872 0.883382 0.00291545 0.00291545 0.921283 0.0670554 0.00874636 0.0816327 0.0991254 0.816327 0.00291545 0.0058309 0.41691 0.364431 0.212828 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 kcACCTGCAgc Reverse Complement Original Motif Forward 4 8 1.10343 Original Motif 0.153846 0.230769 0.307692 0.307692 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0.153846 0.230769 0.461538 0.153846 0.153846 0.615385 0.153846 0.0769231 Reverse Complement Motif 0.153846 0.153846 0.615385 0.0769231 0.153846 0.461538 0.230769 0.153846 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0.153846 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 0.307692 0.230769 0.307692 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 15 kCAGCCAATmr Reverse Complement Original Motif Backward 5 7 1.57732 Original Motif 0.235294 0.176471 0.294118 0.294118 0.117647 0.705882 0.176471 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0.352941 0.352941 0.235294 0.0588235 0.352941 0.176471 0.411765 0.0588235 Reverse Complement Motif 0.352941 0.411765 0.176471 0.0588235 0.0588235 0.352941 0.235294 0.352941 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.117647 0.176471 0.705882 0 0.235294 0.294118 0.176471 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 1 Motif ID 4 Motif Name TFF1 Original Motif 0.180952 0.533333 0.142857 0.142857 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.0190476 0.047619 0.914286 0.0190476 0.4 0.333333 0.219048 0.047619 0.0285714 0.047619 0.885714 0.0380952 0.0380952 0.895238 0.00952381 0.0571429 0.133333 0.733333 0.0666667 0.0666667 0.0380952 0.0380952 0.87619 0.047619 0.12381 0.752381 0.114286 0.00952381 0.314286 0.190476 0.390476 0.104762 0.12381 0.0285714 0.771429 0.0761905 0.0571429 0.904762 0.0285714 0.00952381 Reserve Complement Motif 0.0571429 0.0285714 0.904762 0.00952381 0.12381 0.771429 0.0285714 0.0761905 0.314286 0.390476 0.190476 0.104762 0.12381 0.114286 0.752381 0.00952381 0.0380952 0.87619 0.0380952 0.047619 0.133333 0.0666667 0.733333 0.0666667 0.0380952 0.00952381 0.895238 0.0571429 0.0285714 0.885714 0.047619 0.0380952 0.047619 0.333333 0.219048 0.4 0.0190476 0.914286 0.047619 0.0190476 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.180952 0.142857 0.533333 0.142857 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 4 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 5 TFF11 Original Motif Original Motif Backward 1 12 0.0292081 Original Motif 0.0761905 0.0857143 0.819048 0.0190476 0.0761905 0.0666667 0.780952 0.0761905 0.438095 0.32381 0.180952 0.0571429 0.12381 0.180952 0.657143 0.0380952 0.0952381 0.0761905 0.790476 0.0380952 0.371429 0.104762 0.485714 0.0380952 0.0190476 0.0380952 0.914286 0.0285714 0.0190476 0.0952381 0.885714 0 0.0571429 0.866667 0.0666667 0.00952381 0.00952381 0.00952381 0.980952 0 0.047619 0.104762 0.838095 0.00952381 0.333333 0.161905 0.409524 0.0952381 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.114286 0.580952 0.266667 0.0380952 Reverse Complement Motif 0.114286 0.266667 0.580952 0.0380952 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.333333 0.409524 0.161905 0.0952381 0.047619 0.838095 0.104762 0.00952381 0.00952381 0.980952 0.00952381 0 0.0571429 0.0666667 0.866667 0.00952381 0.0190476 0.885714 0.0952381 0 0.0190476 0.914286 0.0380952 0.0285714 0.371429 0.485714 0.104762 0.0380952 0.0952381 0.790476 0.0761905 0.0380952 0.12381 0.657143 0.180952 0.0380952 0.0571429 0.32381 0.180952 0.438095 0.0761905 0.780952 0.0666667 0.0761905 0.0761905 0.819048 0.0857143 0.0190476 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 csGCCCCGCCCCsc Original Motif Original Motif Backward 3 12 0.0542674 Original Motif 0.179104 0.492537 0.164179 0.164179 0.223881 0.402985 0.283582 0.0895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0746269 0 0.895522 0.0895522 0.0149254 0 0.925373 0.0149254 0.0597015 0.0298507 0.970149 0 0 0 0.970149 0.0298507 0 0.0447761 0 0.940299 0.0149254 0 0.955224 0.0149254 0.0298507 0.0298507 0.955224 0.0149254 0 0.0298507 0.925373 0.0149254 0.0298507 0.119403 0.820896 0.0149254 0.0447761 0.104478 0.328358 0.373134 0.19403 0.179104 0.358209 0.223881 0.238806 Reverse Complement Motif 0.179104 0.223881 0.358209 0.238806 0.104478 0.373134 0.328358 0.19403 0.119403 0.0149254 0.820896 0.0447761 0.0298507 0.0149254 0.925373 0.0298507 0.0298507 0.0149254 0.955224 0 0 0.0149254 0.955224 0.0298507 0.0447761 0.940299 0 0.0149254 0 0.0298507 0.970149 0 0.0298507 0 0.970149 0 0 0.0149254 0.925373 0.0597015 0 0.0895522 0.895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0149254 0.0746269 0.223881 0.283582 0.402985 0.0895522 0.179104 0.164179 0.492537 0.164179 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 TFM12 Original Motif Reverse Complement Backward 3 12 0.0543272 Original Motif 0 1 0 0 0.19 0.4 0 0.41 0 0.52 0.19 0.29 0.11 0.61 0.1 0.18 0.18 0.29 0.33 0.2 0 0.38 0.35 0.27 0 0.82 0 0.18 0.18 0.39 0 0.43 0 0.53 0 0.47 0 0.47 0.15 0.38 0 0.24 0.24 0.52 0 0.87 0 0.13 0.05 0.68 0 0.27 0.18 0.38 0.1 0.34 0 0.62 0.22 0.16 0 0.66 0.09 0.25 0.2 0.15 0.13 0.52 0.04 0.46 0.16 0.34 0.06 0.53 0.03 0.38 0.05 0.57 0.04 0.34 Reverse Complement Motif 0.05 0.04 0.57 0.34 0.06 0.03 0.53 0.38 0.04 0.16 0.46 0.34 0.52 0.15 0.13 0.2 0 0.09 0.66 0.25 0 0.22 0.62 0.16 0.18 0.1 0.38 0.34 0.05 0 0.68 0.27 0 0 0.87 0.13 0.52 0.24 0.24 0 0 0.15 0.47 0.38 0 0 0.53 0.47 0.43 0.39 0 0.18 0 0 0.82 0.18 0 0.35 0.38 0.27 0.18 0.33 0.29 0.2 0.11 0.1 0.61 0.18 0 0.19 0.52 0.29 0.41 0.4 0 0.19 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 14 cccGCCCCGCCCCsb Reverse Complement Original Motif Forward 4 12 0.0548371 Original Motif 0.148936 0.425532 0.234043 0.191489 0.106383 0.553191 0.170213 0.170213 0.106383 0.659574 0.148936 0.0851064 0.0425532 0 0.851064 0.106383 0 0.93617 0.0638298 0 0 0.87234 0.0425532 0.0851064 0 1 0 0 0 0.957447 0.0425532 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.0425532 0.93617 0.0212766 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0.0638298 0.914894 0.0212766 0 0.0638298 0.297872 0.404255 0.234043 0.148936 0.319149 0.255319 0.276596 Reverse Complement Motif 0.148936 0.255319 0.319149 0.276596 0.0638298 0.404255 0.297872 0.234043 0.0638298 0.0212766 0.914894 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0.0425532 0.0212766 0.93617 0 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0 0.0425532 0.957447 0 0 0 1 0 0 0.0425532 0.87234 0.0851064 0 0.0638298 0.93617 0 0.0425532 0.851064 0 0.106383 0.106383 0.148936 0.659574 0.0851064 0.106383 0.170213 0.553191 0.170213 0.148936 0.234043 0.425532 0.191489 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 6 TFM2 Reverse Complement Reverse Complement Forward 3 12 0.0594165 Original Motif 0.404762 0.047619 0.547619 0 0.238095 0.119048 0.642857 0 0.607143 0.0714286 0.321429 0 0.190476 0 0.797619 0.0119048 0.22619 0 0.738095 0.0357143 0.738095 0 0.238095 0.0238095 0.261905 0.142857 0.595238 0 0.345238 0.0714286 0.583333 0 0.547619 0 0.452381 0 0.0119048 0 0.988095 0 0.0119048 0.309524 0.678571 0 0.357143 0.261905 0.190476 0.190476 0.309524 0 0.690476 0 0.25 0.0952381 0.654762 0 0.309524 0.047619 0.392857 0.25 0.0357143 0.0952381 0.857143 0.0119048 Reverse Complement Motif 0.0357143 0.857143 0.0952381 0.0119048 0.309524 0.392857 0.047619 0.25 0.25 0.654762 0.0952381 0 0.309524 0.690476 0 0 0.190476 0.261905 0.190476 0.357143 0.0119048 0.678571 0.309524 0 0.0119048 0.988095 0 0 0 0 0.452381 0.547619 0.345238 0.583333 0.0714286 0 0.261905 0.595238 0.142857 0 0.0238095 0 0.238095 0.738095 0.22619 0.738095 0 0.0357143 0.190476 0.797619 0 0.0119048 0 0.0714286 0.321429 0.607143 0.238095 0.642857 0.119048 0 0.404762 0.547619 0.047619 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 sSGTCACGTGACSs Reverse Complement Original Motif Backward 1 12 0.0777862 Original Motif 0.0555556 0.388889 0.388889 0.166667 0 0.277778 0.722222 0 0.0555556 0.111111 0.833333 0 0.111111 0 0.0555556 0.833333 0 0.888889 0.111111 0 1 0 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.0555556 0.944444 0 0 0 0 1 0 0.111111 0.888889 0 0.833333 0.0555556 0 0.111111 0 0.833333 0.111111 0.0555556 0 0.722222 0.277778 0 0.166667 0.388889 0.388889 0.0555556 Reverse Complement Motif 0.166667 0.388889 0.388889 0.0555556 0 0.277778 0.722222 0 0 0.111111 0.833333 0.0555556 0.111111 0.0555556 0 0.833333 0 0.888889 0.111111 0 1 0 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.0555556 0.944444 0 0 0 0 1 0 0.111111 0.888889 0 0.833333 0 0.0555556 0.111111 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0 0.722222 0.277778 0 0.0555556 0.388889 0.388889 0.166667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 3 TFW3 Original Motif Original Motif Forward 1 10 1.04219 Original Motif 0.02 0.92 0.05 0.01 0 0.03 0.96 0.01 0 0.17 0.83 0 0 0.99 0 0.01 0 0.27 0.21 0.52 0.03 0.3 0.37 0.3 0 0.95 0.05 0 0.02 0.13 0.8 0.05 0 0.88 0.12 0 0.01 0.22 0.76 0.01 Reverse Complement Motif 0.01 0.76 0.22 0.01 0 0.12 0.88 0 0.02 0.8 0.13 0.05 0 0.05 0.95 0 0.03 0.37 0.3 0.3 0.52 0.27 0.21 0 0 0 0.99 0.01 0 0.83 0.17 0 0 0.96 0.03 0.01 0.02 0.05 0.92 0.01 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 2 TFW2 Original Motif Original Motif Forward 1 8 2.04515 Original Motif 0.0058309 0.364431 0.41691 0.212828 0.0816327 0.816327 0.0991254 0.00291545 0.00291545 0.0670554 0.921283 0.00874636 0.0058309 0.883382 0.107872 0.00291545 0 0.0962099 0.860058 0.0437318 0.00291545 0.906706 0.0787172 0.0116618 0.0437318 0.0758017 0.825073 0.0553936 0 0.125364 0.87172 0.00291545 Reverse Complement Motif 0 0.87172 0.125364 0.00291545 0.0437318 0.825073 0.0758017 0.0553936 0.00291545 0.0787172 0.906706 0.0116618 0 0.860058 0.0962099 0.0437318 0.0058309 0.107872 0.883382 0.00291545 0.00291545 0.921283 0.0670554 0.00874636 0.0816327 0.0991254 0.816327 0.00291545 0.0058309 0.41691 0.364431 0.212828 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 kcACCTGCAgc Original Motif Reverse Complement Backward 4 8 2.08028 Original Motif 0.153846 0.230769 0.307692 0.307692 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0.153846 0.230769 0.461538 0.153846 0.153846 0.615385 0.153846 0.0769231 Reverse Complement Motif 0.153846 0.153846 0.615385 0.0769231 0.153846 0.461538 0.230769 0.153846 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0.153846 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 0.307692 0.230769 0.307692 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 1 TFW1 Reverse Complement Original Motif Backward 1 6 3.02292 Original Motif 0 0.082495 0.917505 0 0.0744467 0.217304 0.197183 0.511066 0 0.897384 0.102616 0 0.0503018 0.102616 0.847082 0 0 0.949698 0.0503018 0 0 0.0523139 0.947686 0 Reverse Complement Motif 0 0.947686 0.0523139 0 0 0.0503018 0.949698 0 0.0503018 0.847082 0.102616 0 0 0.102616 0.897384 0 0.511066 0.217304 0.197183 0.0744467 0 0.917505 0.082495 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 1 Motif ID 5 Motif Name TFF11 Original Motif 0.0761905 0.0857143 0.819048 0.0190476 0.0761905 0.0666667 0.780952 0.0761905 0.438095 0.32381 0.180952 0.0571429 0.12381 0.180952 0.657143 0.0380952 0.0952381 0.0761905 0.790476 0.0380952 0.371429 0.104762 0.485714 0.0380952 0.0190476 0.0380952 0.914286 0.0285714 0.0190476 0.0952381 0.885714 0 0.0571429 0.866667 0.0666667 0.00952381 0.00952381 0.00952381 0.980952 0 0.047619 0.104762 0.838095 0.00952381 0.333333 0.161905 0.409524 0.0952381 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.114286 0.580952 0.266667 0.0380952 Reserve Complement Motif 0.114286 0.266667 0.580952 0.0380952 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.333333 0.409524 0.161905 0.0952381 0.047619 0.838095 0.104762 0.00952381 0.00952381 0.980952 0.00952381 0 0.0571429 0.0666667 0.866667 0.00952381 0.0190476 0.885714 0.0952381 0 0.0190476 0.914286 0.0380952 0.0285714 0.371429 0.485714 0.104762 0.0380952 0.0952381 0.790476 0.0761905 0.0380952 0.12381 0.657143 0.180952 0.0380952 0.0571429 0.32381 0.180952 0.438095 0.0761905 0.780952 0.0666667 0.0761905 0.0761905 0.819048 0.0857143 0.0190476 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 5 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 6 TFM2 Original Motif Original Motif Forward 1 14 0.033716 Original Motif 0.404762 0.047619 0.547619 0 0.238095 0.119048 0.642857 0 0.607143 0.0714286 0.321429 0 0.190476 0 0.797619 0.0119048 0.22619 0 0.738095 0.0357143 0.738095 0 0.238095 0.0238095 0.261905 0.142857 0.595238 0 0.345238 0.0714286 0.583333 0 0.547619 0 0.452381 0 0.0119048 0 0.988095 0 0.0119048 0.309524 0.678571 0 0.357143 0.261905 0.190476 0.190476 0.309524 0 0.690476 0 0.25 0.0952381 0.654762 0 0.309524 0.047619 0.392857 0.25 0.0357143 0.0952381 0.857143 0.0119048 Reverse Complement Motif 0.0357143 0.857143 0.0952381 0.0119048 0.309524 0.392857 0.047619 0.25 0.25 0.654762 0.0952381 0 0.309524 0.690476 0 0 0.190476 0.261905 0.190476 0.357143 0.0119048 0.678571 0.309524 0 0.0119048 0.988095 0 0 0 0 0.452381 0.547619 0.345238 0.583333 0.0714286 0 0.261905 0.595238 0.142857 0 0.0238095 0 0.238095 0.738095 0.22619 0.738095 0 0.0357143 0.190476 0.797619 0 0.0119048 0 0.0714286 0.321429 0.607143 0.238095 0.642857 0.119048 0 0.404762 0.547619 0.047619 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 TFM12 Reverse Complement Original Motif Backward 2 14 0.0386905 Original Motif 0 1 0 0 0.19 0.4 0 0.41 0 0.52 0.19 0.29 0.11 0.61 0.1 0.18 0.18 0.29 0.33 0.2 0 0.38 0.35 0.27 0 0.82 0 0.18 0.18 0.39 0 0.43 0 0.53 0 0.47 0 0.47 0.15 0.38 0 0.24 0.24 0.52 0 0.87 0 0.13 0.05 0.68 0 0.27 0.18 0.38 0.1 0.34 0 0.62 0.22 0.16 0 0.66 0.09 0.25 0.2 0.15 0.13 0.52 0.04 0.46 0.16 0.34 0.06 0.53 0.03 0.38 0.05 0.57 0.04 0.34 Reverse Complement Motif 0.05 0.04 0.57 0.34 0.06 0.03 0.53 0.38 0.04 0.16 0.46 0.34 0.52 0.15 0.13 0.2 0 0.09 0.66 0.25 0 0.22 0.62 0.16 0.18 0.1 0.38 0.34 0.05 0 0.68 0.27 0 0 0.87 0.13 0.52 0.24 0.24 0 0 0.15 0.47 0.38 0 0 0.53 0.47 0.43 0.39 0 0.18 0 0 0.82 0.18 0 0.35 0.38 0.27 0.18 0.33 0.29 0.2 0.11 0.1 0.61 0.18 0 0.19 0.52 0.29 0.41 0.4 0 0.19 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 14 cccGCCCCGCCCCsb Reverse Complement Original Motif Forward 1 14 0.0548198 Original Motif 0.148936 0.425532 0.234043 0.191489 0.106383 0.553191 0.170213 0.170213 0.106383 0.659574 0.148936 0.0851064 0.0425532 0 0.851064 0.106383 0 0.93617 0.0638298 0 0 0.87234 0.0425532 0.0851064 0 1 0 0 0 0.957447 0.0425532 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.0425532 0.93617 0.0212766 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0.0638298 0.914894 0.0212766 0 0.0638298 0.297872 0.404255 0.234043 0.148936 0.319149 0.255319 0.276596 Reverse Complement Motif 0.148936 0.255319 0.319149 0.276596 0.0638298 0.404255 0.297872 0.234043 0.0638298 0.0212766 0.914894 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0.0425532 0.0212766 0.93617 0 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0 0.0425532 0.957447 0 0 0 1 0 0 0.0425532 0.87234 0.0851064 0 0.0638298 0.93617 0 0.0425532 0.851064 0 0.106383 0.106383 0.148936 0.659574 0.0851064 0.106383 0.170213 0.553191 0.170213 0.148936 0.234043 0.425532 0.191489 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 csGCCCCGCCCCsc Reverse Complement Original Motif Backward 1 14 0.0652173 Original Motif 0.179104 0.492537 0.164179 0.164179 0.223881 0.402985 0.283582 0.0895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0746269 0 0.895522 0.0895522 0.0149254 0 0.925373 0.0149254 0.0597015 0.0298507 0.970149 0 0 0 0.970149 0.0298507 0 0.0447761 0 0.940299 0.0149254 0 0.955224 0.0149254 0.0298507 0.0298507 0.955224 0.0149254 0 0.0298507 0.925373 0.0149254 0.0298507 0.119403 0.820896 0.0149254 0.0447761 0.104478 0.328358 0.373134 0.19403 0.179104 0.358209 0.223881 0.238806 Reverse Complement Motif 0.179104 0.223881 0.358209 0.238806 0.104478 0.373134 0.328358 0.19403 0.119403 0.0149254 0.820896 0.0447761 0.0298507 0.0149254 0.925373 0.0298507 0.0298507 0.0149254 0.955224 0 0 0.0149254 0.955224 0.0298507 0.0447761 0.940299 0 0.0149254 0 0.0298507 0.970149 0 0.0298507 0 0.970149 0 0 0.0149254 0.925373 0.0597015 0 0.0895522 0.895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0149254 0.0746269 0.223881 0.283582 0.402985 0.0895522 0.179104 0.164179 0.492537 0.164179 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 4 TFF1 Original Motif Original Motif Backward 1 12 1.02659 Original Motif 0.180952 0.533333 0.142857 0.142857 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.0190476 0.047619 0.914286 0.0190476 0.4 0.333333 0.219048 0.047619 0.0285714 0.047619 0.885714 0.0380952 0.0380952 0.895238 0.00952381 0.0571429 0.133333 0.733333 0.0666667 0.0666667 0.0380952 0.0380952 0.87619 0.047619 0.12381 0.752381 0.114286 0.00952381 0.314286 0.190476 0.390476 0.104762 0.12381 0.0285714 0.771429 0.0761905 0.0571429 0.904762 0.0285714 0.00952381 Reverse Complement Motif 0.0571429 0.0285714 0.904762 0.00952381 0.12381 0.771429 0.0285714 0.0761905 0.314286 0.390476 0.190476 0.104762 0.12381 0.114286 0.752381 0.00952381 0.0380952 0.87619 0.0380952 0.047619 0.133333 0.0666667 0.733333 0.0666667 0.0380952 0.00952381 0.895238 0.0571429 0.0285714 0.885714 0.047619 0.0380952 0.047619 0.333333 0.219048 0.4 0.0190476 0.914286 0.047619 0.0190476 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.180952 0.142857 0.533333 0.142857 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 sSGTCACGTGACSs Reverse Complement Reverse Complement Forward 3 12 1.07325 Original Motif 0.0555556 0.388889 0.388889 0.166667 0 0.277778 0.722222 0 0.0555556 0.111111 0.833333 0 0.111111 0 0.0555556 0.833333 0 0.888889 0.111111 0 1 0 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.0555556 0.944444 0 0 0 0 1 0 0.111111 0.888889 0 0.833333 0.0555556 0 0.111111 0 0.833333 0.111111 0.0555556 0 0.722222 0.277778 0 0.166667 0.388889 0.388889 0.0555556 Reverse Complement Motif 0.166667 0.388889 0.388889 0.0555556 0 0.277778 0.722222 0 0 0.111111 0.833333 0.0555556 0.111111 0.0555556 0 0.833333 0 0.888889 0.111111 0 1 0 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.0555556 0.944444 0 0 0 0 1 0 0.111111 0.888889 0 0.833333 0 0.0555556 0.111111 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0 0.722222 0.277778 0 0.0555556 0.388889 0.388889 0.166667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 kcACCTGCAgc Reverse Complement Original Motif Forward 1 11 1.56524 Original Motif 0.153846 0.230769 0.307692 0.307692 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0.153846 0.230769 0.461538 0.153846 0.153846 0.615385 0.153846 0.0769231 Reverse Complement Motif 0.153846 0.153846 0.615385 0.0769231 0.153846 0.461538 0.230769 0.153846 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0.153846 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 0.307692 0.230769 0.307692 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 3 TFW3 Reverse Complement Original Motif Forward 1 10 2.04171 Original Motif 0.02 0.92 0.05 0.01 0 0.03 0.96 0.01 0 0.17 0.83 0 0 0.99 0 0.01 0 0.27 0.21 0.52 0.03 0.3 0.37 0.3 0 0.95 0.05 0 0.02 0.13 0.8 0.05 0 0.88 0.12 0 0.01 0.22 0.76 0.01 Reverse Complement Motif 0.01 0.76 0.22 0.01 0 0.12 0.88 0 0.02 0.8 0.13 0.05 0 0.05 0.95 0 0.03 0.37 0.3 0.3 0.52 0.27 0.21 0 0 0 0.99 0.01 0 0.83 0.17 0 0 0.96 0.03 0.01 0.02 0.05 0.92 0.01 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 2 TFW2 Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 8 3.06679 Original Motif 0.0058309 0.364431 0.41691 0.212828 0.0816327 0.816327 0.0991254 0.00291545 0.00291545 0.0670554 0.921283 0.00874636 0.0058309 0.883382 0.107872 0.00291545 0 0.0962099 0.860058 0.0437318 0.00291545 0.906706 0.0787172 0.0116618 0.0437318 0.0758017 0.825073 0.0553936 0 0.125364 0.87172 0.00291545 Reverse Complement Motif 0 0.87172 0.125364 0.00291545 0.0437318 0.825073 0.0758017 0.0553936 0.00291545 0.0787172 0.906706 0.0116618 0 0.860058 0.0962099 0.0437318 0.0058309 0.107872 0.883382 0.00291545 0.00291545 0.921283 0.0670554 0.00874636 0.0816327 0.0991254 0.816327 0.00291545 0.0058309 0.41691 0.364431 0.212828 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 1 TFW1 Original Motif Reverse Complement Forward 1 6 4.05705 Original Motif 0 0.082495 0.917505 0 0.0744467 0.217304 0.197183 0.511066 0 0.897384 0.102616 0 0.0503018 0.102616 0.847082 0 0 0.949698 0.0503018 0 0 0.0523139 0.947686 0 Reverse Complement Motif 0 0.947686 0.0523139 0 0 0.0503018 0.949698 0 0.0503018 0.847082 0.102616 0 0 0.102616 0.897384 0 0.511066 0.217304 0.197183 0.0744467 0 0.917505 0.082495 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 1 Motif ID 6 Motif Name TFM2 Original Motif 0.404762 0.047619 0.547619 0 0.238095 0.119048 0.642857 0 0.607143 0.0714286 0.321429 0 0.190476 0 0.797619 0.0119048 0.22619 0 0.738095 0.0357143 0.738095 0 0.238095 0.0238095 0.261905 0.142857 0.595238 0 0.345238 0.0714286 0.583333 0 0.547619 0 0.452381 0 0.0119048 0 0.988095 0 0.0119048 0.309524 0.678571 0 0.357143 0.261905 0.190476 0.190476 0.309524 0 0.690476 0 0.25 0.0952381 0.654762 0 0.309524 0.047619 0.392857 0.25 0.0357143 0.0952381 0.857143 0.0119048 Reserve Complement Motif 0.0357143 0.857143 0.0952381 0.0119048 0.309524 0.392857 0.047619 0.25 0.25 0.654762 0.0952381 0 0.309524 0.690476 0 0 0.190476 0.261905 0.190476 0.357143 0.0119048 0.678571 0.309524 0 0.0119048 0.988095 0 0 0 0 0.452381 0.547619 0.345238 0.583333 0.0714286 0 0.261905 0.595238 0.142857 0 0.0238095 0 0.238095 0.738095 0.22619 0.738095 0 0.0357143 0.190476 0.797619 0 0.0119048 0 0.0714286 0.321429 0.607143 0.238095 0.642857 0.119048 0 0.404762 0.547619 0.047619 0 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 6 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 TFM12 Reverse Complement Original Motif Backward 5 16 0.0331473 Original Motif 0 1 0 0 0.19 0.4 0 0.41 0 0.52 0.19 0.29 0.11 0.61 0.1 0.18 0.18 0.29 0.33 0.2 0 0.38 0.35 0.27 0 0.82 0 0.18 0.18 0.39 0 0.43 0 0.53 0 0.47 0 0.47 0.15 0.38 0 0.24 0.24 0.52 0 0.87 0 0.13 0.05 0.68 0 0.27 0.18 0.38 0.1 0.34 0 0.62 0.22 0.16 0 0.66 0.09 0.25 0.2 0.15 0.13 0.52 0.04 0.46 0.16 0.34 0.06 0.53 0.03 0.38 0.05 0.57 0.04 0.34 Reverse Complement Motif 0.05 0.04 0.57 0.34 0.06 0.03 0.53 0.38 0.04 0.16 0.46 0.34 0.52 0.15 0.13 0.2 0 0.09 0.66 0.25 0 0.22 0.62 0.16 0.18 0.1 0.38 0.34 0.05 0 0.68 0.27 0 0 0.87 0.13 0.52 0.24 0.24 0 0 0.15 0.47 0.38 0 0 0.53 0.47 0.43 0.39 0 0.18 0 0 0.82 0.18 0 0.35 0.38 0.27 0.18 0.33 0.29 0.2 0.11 0.1 0.61 0.18 0 0.19 0.52 0.29 0.41 0.4 0 0.19 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 TFM11 Original Motif Original Motif Forward 8 16 0.0794752 Original Motif 0.294118 0.235294 0.117647 0.352941 0.382353 0.205882 0.205882 0.205882 0.529412 0 0.117647 0.352941 0.235294 0.294118 0.323529 0.147059 1 0 0 0 0.941176 0 0 0.0588235 0.764706 0 0.0294118 0.205882 0.382353 0.235294 0.176471 0.205882 0.735294 0 0.0588235 0.205882 0.735294 0.0294118 0.117647 0.117647 0.676471 0 0.0882353 0.235294 0.529412 0.117647 0.205882 0.147059 0.705882 0.176471 0.117647 0 0.441176 0.352941 0.147059 0.0588235 0.941176 0.0588235 0 0 0.852941 0 0.147059 0 0.676471 0.0882353 0 0.235294 0.529412 0.323529 0.117647 0.0294118 0.470588 0.176471 0 0.352941 0.411765 0 0.147059 0.441176 0.5 0.0882353 0.147059 0.264706 0.294118 0.205882 0.0882353 0.411765 0.205882 0.235294 0.264706 0.294118 0.470588 0 0.117647 0.411765 0.617647 0.176471 0.205882 0 Reverse Complement Motif 0 0.176471 0.205882 0.617647 0.411765 0 0.117647 0.470588 0.294118 0.235294 0.264706 0.205882 0.411765 0.205882 0.0882353 0.294118 0.264706 0.0882353 0.147059 0.5 0.441176 0 0.147059 0.411765 0.352941 0.176471 0 0.470588 0.0294118 0.323529 0.117647 0.529412 0.235294 0.0882353 0 0.676471 0 0 0.147059 0.852941 0 0.0588235 0 0.941176 0.0588235 0.352941 0.147059 0.441176 0 0.176471 0.117647 0.705882 0.147059 0.117647 0.205882 0.529412 0.235294 0 0.0882353 0.676471 0.117647 0.0294118 0.117647 0.735294 0.205882 0 0.0588235 0.735294 0.205882 0.235294 0.176471 0.382353 0.205882 0 0.0294118 0.764706 0.0588235 0 0 0.941176 0 0 0 1 0.235294 0.323529 0.294118 0.147059 0.352941 0 0.117647 0.529412 0.205882 0.205882 0.205882 0.382353 0.352941 0.235294 0.117647 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 14 cccGCCCCGCCCCsb Original Motif Reverse Complement Forward 1 15 0.558405 Original Motif 0.148936 0.425532 0.234043 0.191489 0.106383 0.553191 0.170213 0.170213 0.106383 0.659574 0.148936 0.0851064 0.0425532 0 0.851064 0.106383 0 0.93617 0.0638298 0 0 0.87234 0.0425532 0.0851064 0 1 0 0 0 0.957447 0.0425532 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.0425532 0.93617 0.0212766 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0.0638298 0.914894 0.0212766 0 0.0638298 0.297872 0.404255 0.234043 0.148936 0.319149 0.255319 0.276596 Reverse Complement Motif 0.148936 0.255319 0.319149 0.276596 0.0638298 0.404255 0.297872 0.234043 0.0638298 0.0212766 0.914894 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0.0425532 0.0212766 0.93617 0 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0 0.0425532 0.957447 0 0 0 1 0 0 0.0425532 0.87234 0.0851064 0 0.0638298 0.93617 0 0.0425532 0.851064 0 0.106383 0.106383 0.148936 0.659574 0.0851064 0.106383 0.170213 0.553191 0.170213 0.148936 0.234043 0.425532 0.191489 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 5 TFF11 Original Motif Original Motif Forward 1 14 1.03372 Original Motif 0.0761905 0.0857143 0.819048 0.0190476 0.0761905 0.0666667 0.780952 0.0761905 0.438095 0.32381 0.180952 0.0571429 0.12381 0.180952 0.657143 0.0380952 0.0952381 0.0761905 0.790476 0.0380952 0.371429 0.104762 0.485714 0.0380952 0.0190476 0.0380952 0.914286 0.0285714 0.0190476 0.0952381 0.885714 0 0.0571429 0.866667 0.0666667 0.00952381 0.00952381 0.00952381 0.980952 0 0.047619 0.104762 0.838095 0.00952381 0.333333 0.161905 0.409524 0.0952381 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.114286 0.580952 0.266667 0.0380952 Reverse Complement Motif 0.114286 0.266667 0.580952 0.0380952 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.333333 0.409524 0.161905 0.0952381 0.047619 0.838095 0.104762 0.00952381 0.00952381 0.980952 0.00952381 0 0.0571429 0.0666667 0.866667 0.00952381 0.0190476 0.885714 0.0952381 0 0.0190476 0.914286 0.0380952 0.0285714 0.371429 0.485714 0.104762 0.0380952 0.0952381 0.790476 0.0761905 0.0380952 0.12381 0.657143 0.180952 0.0380952 0.0571429 0.32381 0.180952 0.438095 0.0761905 0.780952 0.0666667 0.0761905 0.0761905 0.819048 0.0857143 0.0190476 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 csGCCCCGCCCCsc Original Motif Reverse Complement Forward 1 14 1.05955 Original Motif 0.179104 0.492537 0.164179 0.164179 0.223881 0.402985 0.283582 0.0895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0746269 0 0.895522 0.0895522 0.0149254 0 0.925373 0.0149254 0.0597015 0.0298507 0.970149 0 0 0 0.970149 0.0298507 0 0.0447761 0 0.940299 0.0149254 0 0.955224 0.0149254 0.0298507 0.0298507 0.955224 0.0149254 0 0.0298507 0.925373 0.0149254 0.0298507 0.119403 0.820896 0.0149254 0.0447761 0.104478 0.328358 0.373134 0.19403 0.179104 0.358209 0.223881 0.238806 Reverse Complement Motif 0.179104 0.223881 0.358209 0.238806 0.104478 0.373134 0.328358 0.19403 0.119403 0.0149254 0.820896 0.0447761 0.0298507 0.0149254 0.925373 0.0298507 0.0298507 0.0149254 0.955224 0 0 0.0149254 0.955224 0.0298507 0.0447761 0.940299 0 0.0149254 0 0.0298507 0.970149 0 0.0298507 0 0.970149 0 0 0.0149254 0.925373 0.0597015 0 0.0895522 0.895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0149254 0.0746269 0.223881 0.283582 0.402985 0.0895522 0.179104 0.164179 0.492537 0.164179 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 4 TFF1 Original Motif Reverse Complement Forward 1 12 2.07381 Original Motif 0.180952 0.533333 0.142857 0.142857 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.0190476 0.047619 0.914286 0.0190476 0.4 0.333333 0.219048 0.047619 0.0285714 0.047619 0.885714 0.0380952 0.0380952 0.895238 0.00952381 0.0571429 0.133333 0.733333 0.0666667 0.0666667 0.0380952 0.0380952 0.87619 0.047619 0.12381 0.752381 0.114286 0.00952381 0.314286 0.190476 0.390476 0.104762 0.12381 0.0285714 0.771429 0.0761905 0.0571429 0.904762 0.0285714 0.00952381 Reverse Complement Motif 0.0571429 0.0285714 0.904762 0.00952381 0.12381 0.771429 0.0285714 0.0761905 0.314286 0.390476 0.190476 0.104762 0.12381 0.114286 0.752381 0.00952381 0.0380952 0.87619 0.0380952 0.047619 0.133333 0.0666667 0.733333 0.0666667 0.0380952 0.00952381 0.895238 0.0571429 0.0285714 0.885714 0.047619 0.0380952 0.047619 0.333333 0.219048 0.4 0.0190476 0.914286 0.047619 0.0190476 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.180952 0.142857 0.533333 0.142857 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 3 TFW3 Original Motif Reverse Complement Forward 1 10 3.05867 Original Motif 0.02 0.92 0.05 0.01 0 0.03 0.96 0.01 0 0.17 0.83 0 0 0.99 0 0.01 0 0.27 0.21 0.52 0.03 0.3 0.37 0.3 0 0.95 0.05 0 0.02 0.13 0.8 0.05 0 0.88 0.12 0 0.01 0.22 0.76 0.01 Reverse Complement Motif 0.01 0.76 0.22 0.01 0 0.12 0.88 0 0.02 0.8 0.13 0.05 0 0.05 0.95 0 0.03 0.37 0.3 0.3 0.52 0.27 0.21 0 0 0 0.99 0.01 0 0.83 0.17 0 0 0.96 0.03 0.01 0.02 0.05 0.92 0.01 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 kcACCTGCAgc Reverse Complement Original Motif Forward 2 10 3.07248 Original Motif 0.153846 0.230769 0.307692 0.307692 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0.153846 0.230769 0.461538 0.153846 0.153846 0.615385 0.153846 0.0769231 Reverse Complement Motif 0.153846 0.153846 0.615385 0.0769231 0.153846 0.461538 0.230769 0.153846 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0.153846 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 0.307692 0.230769 0.307692 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 7 TFM1 Original Motif Reverse Complement Forward 10 9 3.57029 Original Motif 0.384615 0.0769231 0 0.538462 0.25641 0 0 0.74359 0.0769231 0.153846 0.333333 0.435897 0.230769 0 0 0.769231 0 0.25641 0 0.74359 0 0 0.0769231 0.923077 0.025641 0.0769231 0.25641 0.641026 0 0.128205 0.230769 0.641026 0.333333 0.230769 0.205128 0.230769 0.282051 0.179487 0 0.538462 0.0512821 0.128205 0 0.820513 0.128205 0 0 0.871795 0.25641 0.025641 0.179487 0.538462 0.102564 0 0 0.897436 0.128205 0 0.102564 0.769231 0.128205 0.025641 0.205128 0.641026 0.102564 0.333333 0.25641 0.307692 0.25641 0.102564 0 0.641026 Reverse Complement Motif 0.641026 0.102564 0 0.25641 0.102564 0.25641 0.333333 0.307692 0.641026 0.025641 0.205128 0.128205 0.769231 0 0.102564 0.128205 0.897436 0 0 0.102564 0.538462 0.025641 0.179487 0.25641 0.871795 0 0 0.128205 0.820513 0.128205 0 0.0512821 0.538462 0.179487 0 0.282051 0.230769 0.230769 0.205128 0.333333 0.641026 0.128205 0.230769 0 0.641026 0.0769231 0.25641 0.025641 0.923077 0 0.0769231 0 0.74359 0.25641 0 0 0.769231 0 0 0.230769 0.435897 0.153846 0.333333 0.0769231 0.74359 0 0 0.25641 0.538462 0.0769231 0 0.384615 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 8 TFM3 Original Motif Reverse Complement Forward 10 9 3.57686 Original Motif 0.454545 0 0 0.545455 0.5 0 0 0.5 0.318182 0.181818 0.0909091 0.409091 0 0 0.136364 0.863636 0.318182 0 0 0.681818 0.0454545 0 0.272727 0.681818 0.272727 0.0454545 0.0909091 0.590909 0.272727 0.0909091 0 0.636364 0.0454545 0.818182 0 0.136364 0.727273 0 0 0.272727 0.0909091 0.318182 0.227273 0.363636 0.863636 0.0454545 0 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0909091 0 0.5 0.0909091 0.0909091 0.318182 0.136364 0.227273 0 0.636364 0.227273 0 0 0.772727 0.363636 0.0909091 0 0.545455 0.772727 0.181818 0.0454545 0 Reverse Complement Motif 0 0.181818 0.0454545 0.772727 0.545455 0.0909091 0 0.363636 0.772727 0 0 0.227273 0.636364 0.227273 0 0.136364 0.318182 0.0909091 0.0909091 0.5 0 0.0909091 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0454545 0 0.863636 0.363636 0.318182 0.227273 0.0909091 0.272727 0 0 0.727273 0.0454545 0 0.818182 0.136364 0.636364 0.0909091 0 0.272727 0.590909 0.0454545 0.0909091 0.272727 0.681818 0 0.272727 0.0454545 0.681818 0 0 0.318182 0.863636 0 0.136364 0 0.409091 0.181818 0.0909091 0.318182 0.5 0 0 0.5 0.545455 0 0 0.454545 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 1 Motif ID 7 Motif Name TFM1 Original Motif 0.384615 0.0769231 0 0.538462 0.25641 0 0 0.74359 0.0769231 0.153846 0.333333 0.435897 0.230769 0 0 0.769231 0 0.25641 0 0.74359 0 0 0.0769231 0.923077 0.025641 0.0769231 0.25641 0.641026 0 0.128205 0.230769 0.641026 0.333333 0.230769 0.205128 0.230769 0.282051 0.179487 0 0.538462 0.0512821 0.128205 0 0.820513 0.128205 0 0 0.871795 0.25641 0.025641 0.179487 0.538462 0.102564 0 0 0.897436 0.128205 0 0.102564 0.769231 0.128205 0.025641 0.205128 0.641026 0.102564 0.333333 0.25641 0.307692 0.25641 0.102564 0 0.641026 Reserve Complement Motif 0.641026 0.102564 0 0.25641 0.102564 0.25641 0.333333 0.307692 0.641026 0.025641 0.205128 0.128205 0.769231 0 0.102564 0.128205 0.897436 0 0 0.102564 0.538462 0.025641 0.179487 0.25641 0.871795 0 0 0.128205 0.820513 0.128205 0 0.0512821 0.538462 0.179487 0 0.282051 0.230769 0.230769 0.205128 0.333333 0.641026 0.128205 0.230769 0 0.641026 0.0769231 0.25641 0.025641 0.923077 0 0.0769231 0 0.74359 0.25641 0 0 0.769231 0 0 0.230769 0.435897 0.153846 0.333333 0.0769231 0.74359 0 0 0.25641 0.538462 0.0769231 0 0.384615 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 7 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 TFM11 Reverse Complement Original Motif Backward 6 18 0 Original Motif 0.294118 0.235294 0.117647 0.352941 0.382353 0.205882 0.205882 0.205882 0.529412 0 0.117647 0.352941 0.235294 0.294118 0.323529 0.147059 1 0 0 0 0.941176 0 0 0.0588235 0.764706 0 0.0294118 0.205882 0.382353 0.235294 0.176471 0.205882 0.735294 0 0.0588235 0.205882 0.735294 0.0294118 0.117647 0.117647 0.676471 0 0.0882353 0.235294 0.529412 0.117647 0.205882 0.147059 0.705882 0.176471 0.117647 0 0.441176 0.352941 0.147059 0.0588235 0.941176 0.0588235 0 0 0.852941 0 0.147059 0 0.676471 0.0882353 0 0.235294 0.529412 0.323529 0.117647 0.0294118 0.470588 0.176471 0 0.352941 0.411765 0 0.147059 0.441176 0.5 0.0882353 0.147059 0.264706 0.294118 0.205882 0.0882353 0.411765 0.205882 0.235294 0.264706 0.294118 0.470588 0 0.117647 0.411765 0.617647 0.176471 0.205882 0 Reverse Complement Motif 0 0.176471 0.205882 0.617647 0.411765 0 0.117647 0.470588 0.294118 0.235294 0.264706 0.205882 0.411765 0.205882 0.0882353 0.294118 0.264706 0.0882353 0.147059 0.5 0.441176 0 0.147059 0.411765 0.352941 0.176471 0 0.470588 0.0294118 0.323529 0.117647 0.529412 0.235294 0.0882353 0 0.676471 0 0 0.147059 0.852941 0 0.0588235 0 0.941176 0.0588235 0.352941 0.147059 0.441176 0 0.176471 0.117647 0.705882 0.147059 0.117647 0.205882 0.529412 0.235294 0 0.0882353 0.676471 0.117647 0.0294118 0.117647 0.735294 0.205882 0 0.0588235 0.735294 0.205882 0.235294 0.176471 0.382353 0.205882 0 0.0294118 0.764706 0.0588235 0 0 0.941176 0 0 0 1 0.235294 0.323529 0.294118 0.147059 0.352941 0 0.117647 0.529412 0.205882 0.205882 0.205882 0.382353 0.352941 0.235294 0.117647 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 10 TFM13 Reverse Complement Original Motif Backward 3 18 0.0364672 Original Motif 0.666667 0.133333 0 0.2 0.0666667 0.2 0 0.733333 0.2 0 0.333333 0.466667 0.666667 0 0 0.333333 0.666667 0 0 0.333333 0.6 0 0 0.4 0.333333 0 0 0.666667 0 0.0666667 0 0.933333 0.133333 0.266667 0 0.6 0.266667 0 0 0.733333 0.466667 0 0.466667 0.0666667 0.6 0.333333 0 0.0666667 0.8 0.2 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.133333 0.2 0.2 0.466667 0.8 0 0.2 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 0.4 0.333333 0 0.266667 0.2 0 0 0.8 0.6 0 0 0.4 Reverse Complement Motif 0.4 0 0 0.6 0.8 0 0 0.2 0.266667 0.333333 0 0.4 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0 0 0.2 0.8 0.466667 0.2 0.2 0.133333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.2 0 0.8 0.0666667 0.333333 0 0.6 0.0666667 0 0.466667 0.466667 0.733333 0 0 0.266667 0.6 0.266667 0 0.133333 0.933333 0.0666667 0 0 0.666667 0 0 0.333333 0.4 0 0 0.6 0.333333 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.666667 0.466667 0 0.333333 0.2 0.733333 0.2 0 0.0666667 0.2 0.133333 0 0.666667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 8 TFM3 Original Motif Original Motif Forward 1 18 0.0456974 Original Motif 0.454545 0 0 0.545455 0.5 0 0 0.5 0.318182 0.181818 0.0909091 0.409091 0 0 0.136364 0.863636 0.318182 0 0 0.681818 0.0454545 0 0.272727 0.681818 0.272727 0.0454545 0.0909091 0.590909 0.272727 0.0909091 0 0.636364 0.0454545 0.818182 0 0.136364 0.727273 0 0 0.272727 0.0909091 0.318182 0.227273 0.363636 0.863636 0.0454545 0 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0909091 0 0.5 0.0909091 0.0909091 0.318182 0.136364 0.227273 0 0.636364 0.227273 0 0 0.772727 0.363636 0.0909091 0 0.545455 0.772727 0.181818 0.0454545 0 Reverse Complement Motif 0 0.181818 0.0454545 0.772727 0.545455 0.0909091 0 0.363636 0.772727 0 0 0.227273 0.636364 0.227273 0 0.136364 0.318182 0.0909091 0.0909091 0.5 0 0.0909091 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0454545 0 0.863636 0.363636 0.318182 0.227273 0.0909091 0.272727 0 0 0.727273 0.0454545 0 0.818182 0.136364 0.636364 0.0909091 0 0.272727 0.590909 0.0454545 0.0909091 0.272727 0.681818 0 0.272727 0.0454545 0.681818 0 0 0.318182 0.863636 0 0.136364 0 0.409091 0.181818 0.0909091 0.318182 0.5 0 0 0.5 0.545455 0 0 0.454545 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 TFM12 Original Motif Original Motif Forward 4 17 0.572783 Original Motif 0 1 0 0 0.19 0.4 0 0.41 0 0.52 0.19 0.29 0.11 0.61 0.1 0.18 0.18 0.29 0.33 0.2 0 0.38 0.35 0.27 0 0.82 0 0.18 0.18 0.39 0 0.43 0 0.53 0 0.47 0 0.47 0.15 0.38 0 0.24 0.24 0.52 0 0.87 0 0.13 0.05 0.68 0 0.27 0.18 0.38 0.1 0.34 0 0.62 0.22 0.16 0 0.66 0.09 0.25 0.2 0.15 0.13 0.52 0.04 0.46 0.16 0.34 0.06 0.53 0.03 0.38 0.05 0.57 0.04 0.34 Reverse Complement Motif 0.05 0.04 0.57 0.34 0.06 0.03 0.53 0.38 0.04 0.16 0.46 0.34 0.52 0.15 0.13 0.2 0 0.09 0.66 0.25 0 0.22 0.62 0.16 0.18 0.1 0.38 0.34 0.05 0 0.68 0.27 0 0 0.87 0.13 0.52 0.24 0.24 0 0 0.15 0.47 0.38 0 0 0.53 0.47 0.43 0.39 0 0.18 0 0 0.82 0.18 0 0.35 0.38 0.27 0.18 0.33 0.29 0.2 0.11 0.1 0.61 0.18 0 0.19 0.52 0.29 0.41 0.4 0 0.19 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 17 wwAAATAATAtw Original Motif Reverse Complement Backward 1 12 3.0279 Original Motif 0.37037 0.166667 0.12963 0.333333 0.333333 0.166667 0.203704 0.296296 0.740741 0.0185185 0.0555556 0.185185 0.740741 0.0555556 0.037037 0.166667 0.888889 0.0185185 0.0185185 0.0740741 0.037037 0 0 0.962963 0.833333 0.037037 0.0185185 0.111111 0.796296 0.0185185 0.037037 0.148148 0.0740741 0.0555556 0.0185185 0.851852 0.925926 0.0555556 0.0185185 0 0.240741 0.166667 0.166667 0.425926 0.37037 0.12963 0.148148 0.351852 Reverse Complement Motif 0.351852 0.12963 0.148148 0.37037 0.425926 0.166667 0.166667 0.240741 0 0.0555556 0.0185185 0.925926 0.851852 0.0555556 0.0185185 0.0740741 0.148148 0.0185185 0.037037 0.796296 0.111111 0.037037 0.0185185 0.833333 0.962963 0 0 0.037037 0.0740741 0.0185185 0.0185185 0.888889 0.166667 0.0555556 0.037037 0.740741 0.185185 0.0185185 0.0555556 0.740741 0.296296 0.166667 0.203704 0.333333 0.333333 0.166667 0.12963 0.37037 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 13 tkAAATAATAtw Reverse Complement Original Motif Forward 1 12 3.0351 Original Motif 0.233333 0.2 0.166667 0.4 0.233333 0.133333 0.266667 0.366667 0.733333 0.0333333 0.0333333 0.2 0.866667 0.0333333 0.0333333 0.0666667 0.833333 0 0.0333333 0.133333 0.166667 0 0 0.833333 0.866667 0.0666667 0 0.0666667 0.8 0.0333333 0.0333333 0.133333 0 0 0 1 0.966667 0.0333333 0 0 0.166667 0.2 0.133333 0.5 0.4 0.1 0.1 0.4 Reverse Complement Motif 0.4 0.1 0.1 0.4 0.5 0.2 0.133333 0.166667 0 0.0333333 0 0.966667 1 0 0 0 0.133333 0.0333333 0.0333333 0.8 0.0666667 0.0666667 0 0.866667 0.833333 0 0 0.166667 0.133333 0 0.0333333 0.833333 0.0666667 0.0333333 0.0333333 0.866667 0.2 0.0333333 0.0333333 0.733333 0.366667 0.133333 0.266667 0.233333 0.4 0.2 0.166667 0.233333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 wbgTAAATAww Reverse Complement Original Motif Forward 1 11 3.54371 Original Motif 0.285714 0.142857 0.178571 0.392857 0.214286 0.285714 0.25 0.25 0.142857 0.0714286 0.678571 0.107143 0 0 0 1 0.928571 0 0.0357143 0.0357143 0.821429 0.107143 0.0357143 0.0357143 0.821429 0 0.178571 0 0 0.0714286 0 0.928571 0.928571 0.0357143 0.0357143 0 0.285714 0.214286 0.142857 0.357143 0.392857 0.178571 0.178571 0.25 Reverse Complement Motif 0.25 0.178571 0.178571 0.392857 0.357143 0.214286 0.142857 0.285714 0 0.0357143 0.0357143 0.928571 0.928571 0.0714286 0 0 0 0 0.178571 0.821429 0.0357143 0.107143 0.0357143 0.821429 0.0357143 0 0.0357143 0.928571 1 0 0 0 0.142857 0.678571 0.0714286 0.107143 0.214286 0.25 0.285714 0.25 0.392857 0.142857 0.178571 0.285714 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 dhACATTCTkh Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 10 4.06154 Original Motif 0.333333 0 0.333333 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0.666667 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 Reverse Complement Motif 0.333333 0.333333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 1 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 6 TFM2 Original Motif Reverse Complement Backward 8 9 4.56306 Original Motif 0.404762 0.047619 0.547619 0 0.238095 0.119048 0.642857 0 0.607143 0.0714286 0.321429 0 0.190476 0 0.797619 0.0119048 0.22619 0 0.738095 0.0357143 0.738095 0 0.238095 0.0238095 0.261905 0.142857 0.595238 0 0.345238 0.0714286 0.583333 0 0.547619 0 0.452381 0 0.0119048 0 0.988095 0 0.0119048 0.309524 0.678571 0 0.357143 0.261905 0.190476 0.190476 0.309524 0 0.690476 0 0.25 0.0952381 0.654762 0 0.309524 0.047619 0.392857 0.25 0.0357143 0.0952381 0.857143 0.0119048 Reverse Complement Motif 0.0357143 0.857143 0.0952381 0.0119048 0.309524 0.392857 0.047619 0.25 0.25 0.654762 0.0952381 0 0.309524 0.690476 0 0 0.190476 0.261905 0.190476 0.357143 0.0119048 0.678571 0.309524 0 0.0119048 0.988095 0 0 0 0 0.452381 0.547619 0.345238 0.583333 0.0714286 0 0.261905 0.595238 0.142857 0 0.0238095 0 0.238095 0.738095 0.22619 0.738095 0 0.0357143 0.190476 0.797619 0 0.0119048 0 0.0714286 0.321429 0.607143 0.238095 0.642857 0.119048 0 0.404762 0.547619 0.047619 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 wsTACwGTAsw Reverse Complement Original Motif Backward 3 9 4.57253 Original Motif 0.277778 0.222222 0.166667 0.333333 0.166667 0.444444 0.277778 0.111111 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0.5 0 0 0.5 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0.111111 0.277778 0.444444 0.166667 0.333333 0.166667 0.222222 0.277778 Reverse Complement Motif 0.277778 0.166667 0.222222 0.333333 0.111111 0.444444 0.277778 0.166667 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0.5 0 0 0.5 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0.166667 0.277778 0.444444 0.111111 0.333333 0.222222 0.166667 0.277778 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 1 Motif ID 8 Motif Name TFM3 Original Motif 0.454545 0 0 0.545455 0.5 0 0 0.5 0.318182 0.181818 0.0909091 0.409091 0 0 0.136364 0.863636 0.318182 0 0 0.681818 0.0454545 0 0.272727 0.681818 0.272727 0.0454545 0.0909091 0.590909 0.272727 0.0909091 0 0.636364 0.0454545 0.818182 0 0.136364 0.727273 0 0 0.272727 0.0909091 0.318182 0.227273 0.363636 0.863636 0.0454545 0 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0909091 0 0.5 0.0909091 0.0909091 0.318182 0.136364 0.227273 0 0.636364 0.227273 0 0 0.772727 0.363636 0.0909091 0 0.545455 0.772727 0.181818 0.0454545 0 Reserve Complement Motif 0 0.181818 0.0454545 0.772727 0.545455 0.0909091 0 0.363636 0.772727 0 0 0.227273 0.636364 0.227273 0 0.136364 0.318182 0.0909091 0.0909091 0.5 0 0.0909091 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0454545 0 0.863636 0.363636 0.318182 0.227273 0.0909091 0.272727 0 0 0.727273 0.0454545 0 0.818182 0.136364 0.636364 0.0909091 0 0.272727 0.590909 0.0454545 0.0909091 0.272727 0.681818 0 0.272727 0.0454545 0.681818 0 0 0.318182 0.863636 0 0.136364 0 0.409091 0.181818 0.0909091 0.318182 0.5 0 0 0.5 0.545455 0 0 0.454545 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 8 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 10 TFM13 Reverse Complement Original Motif Forward 2 18 0.00833981 Original Motif 0.666667 0.133333 0 0.2 0.0666667 0.2 0 0.733333 0.2 0 0.333333 0.466667 0.666667 0 0 0.333333 0.666667 0 0 0.333333 0.6 0 0 0.4 0.333333 0 0 0.666667 0 0.0666667 0 0.933333 0.133333 0.266667 0 0.6 0.266667 0 0 0.733333 0.466667 0 0.466667 0.0666667 0.6 0.333333 0 0.0666667 0.8 0.2 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.133333 0.2 0.2 0.466667 0.8 0 0.2 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 0.4 0.333333 0 0.266667 0.2 0 0 0.8 0.6 0 0 0.4 Reverse Complement Motif 0.4 0 0 0.6 0.8 0 0 0.2 0.266667 0.333333 0 0.4 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0 0 0.2 0.8 0.466667 0.2 0.2 0.133333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.2 0 0.8 0.0666667 0.333333 0 0.6 0.0666667 0 0.466667 0.466667 0.733333 0 0 0.266667 0.6 0.266667 0 0.133333 0.933333 0.0666667 0 0 0.666667 0 0 0.333333 0.4 0 0 0.6 0.333333 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.666667 0.466667 0 0.333333 0.2 0.733333 0.2 0 0.0666667 0.2 0.133333 0 0.666667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 TFM11 Original Motif Reverse Complement Backward 4 18 0.0346965 Original Motif 0.294118 0.235294 0.117647 0.352941 0.382353 0.205882 0.205882 0.205882 0.529412 0 0.117647 0.352941 0.235294 0.294118 0.323529 0.147059 1 0 0 0 0.941176 0 0 0.0588235 0.764706 0 0.0294118 0.205882 0.382353 0.235294 0.176471 0.205882 0.735294 0 0.0588235 0.205882 0.735294 0.0294118 0.117647 0.117647 0.676471 0 0.0882353 0.235294 0.529412 0.117647 0.205882 0.147059 0.705882 0.176471 0.117647 0 0.441176 0.352941 0.147059 0.0588235 0.941176 0.0588235 0 0 0.852941 0 0.147059 0 0.676471 0.0882353 0 0.235294 0.529412 0.323529 0.117647 0.0294118 0.470588 0.176471 0 0.352941 0.411765 0 0.147059 0.441176 0.5 0.0882353 0.147059 0.264706 0.294118 0.205882 0.0882353 0.411765 0.205882 0.235294 0.264706 0.294118 0.470588 0 0.117647 0.411765 0.617647 0.176471 0.205882 0 Reverse Complement Motif 0 0.176471 0.205882 0.617647 0.411765 0 0.117647 0.470588 0.294118 0.235294 0.264706 0.205882 0.411765 0.205882 0.0882353 0.294118 0.264706 0.0882353 0.147059 0.5 0.441176 0 0.147059 0.411765 0.352941 0.176471 0 0.470588 0.0294118 0.323529 0.117647 0.529412 0.235294 0.0882353 0 0.676471 0 0 0.147059 0.852941 0 0.0588235 0 0.941176 0.0588235 0.352941 0.147059 0.441176 0 0.176471 0.117647 0.705882 0.147059 0.117647 0.205882 0.529412 0.235294 0 0.0882353 0.676471 0.117647 0.0294118 0.117647 0.735294 0.205882 0 0.0588235 0.735294 0.205882 0.235294 0.176471 0.382353 0.205882 0 0.0294118 0.764706 0.0588235 0 0 0.941176 0 0 0 1 0.235294 0.323529 0.294118 0.147059 0.352941 0 0.117647 0.529412 0.205882 0.205882 0.205882 0.382353 0.352941 0.235294 0.117647 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 7 TFM1 Original Motif Original Motif Backward 1 18 0.0376845 Original Motif 0.384615 0.0769231 0 0.538462 0.25641 0 0 0.74359 0.0769231 0.153846 0.333333 0.435897 0.230769 0 0 0.769231 0 0.25641 0 0.74359 0 0 0.0769231 0.923077 0.025641 0.0769231 0.25641 0.641026 0 0.128205 0.230769 0.641026 0.333333 0.230769 0.205128 0.230769 0.282051 0.179487 0 0.538462 0.0512821 0.128205 0 0.820513 0.128205 0 0 0.871795 0.25641 0.025641 0.179487 0.538462 0.102564 0 0 0.897436 0.128205 0 0.102564 0.769231 0.128205 0.025641 0.205128 0.641026 0.102564 0.333333 0.25641 0.307692 0.25641 0.102564 0 0.641026 Reverse Complement Motif 0.641026 0.102564 0 0.25641 0.102564 0.25641 0.333333 0.307692 0.641026 0.025641 0.205128 0.128205 0.769231 0 0.102564 0.128205 0.897436 0 0 0.102564 0.538462 0.025641 0.179487 0.25641 0.871795 0 0 0.128205 0.820513 0.128205 0 0.0512821 0.538462 0.179487 0 0.282051 0.230769 0.230769 0.205128 0.333333 0.641026 0.128205 0.230769 0 0.641026 0.0769231 0.25641 0.025641 0.923077 0 0.0769231 0 0.74359 0.25641 0 0 0.769231 0 0 0.230769 0.435897 0.153846 0.333333 0.0769231 0.74359 0 0 0.25641 0.538462 0.0769231 0 0.384615 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 17 wwAAATAATAtw Original Motif Reverse Complement Backward 1 12 3.03666 Original Motif 0.37037 0.166667 0.12963 0.333333 0.333333 0.166667 0.203704 0.296296 0.740741 0.0185185 0.0555556 0.185185 0.740741 0.0555556 0.037037 0.166667 0.888889 0.0185185 0.0185185 0.0740741 0.037037 0 0 0.962963 0.833333 0.037037 0.0185185 0.111111 0.796296 0.0185185 0.037037 0.148148 0.0740741 0.0555556 0.0185185 0.851852 0.925926 0.0555556 0.0185185 0 0.240741 0.166667 0.166667 0.425926 0.37037 0.12963 0.148148 0.351852 Reverse Complement Motif 0.351852 0.12963 0.148148 0.37037 0.425926 0.166667 0.166667 0.240741 0 0.0555556 0.0185185 0.925926 0.851852 0.0555556 0.0185185 0.0740741 0.148148 0.0185185 0.037037 0.796296 0.111111 0.037037 0.0185185 0.833333 0.962963 0 0 0.037037 0.0740741 0.0185185 0.0185185 0.888889 0.166667 0.0555556 0.037037 0.740741 0.185185 0.0185185 0.0555556 0.740741 0.296296 0.166667 0.203704 0.333333 0.333333 0.166667 0.12963 0.37037 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 13 tkAAATAATAtw Original Motif Reverse Complement Backward 1 12 3.0397 Original Motif 0.233333 0.2 0.166667 0.4 0.233333 0.133333 0.266667 0.366667 0.733333 0.0333333 0.0333333 0.2 0.866667 0.0333333 0.0333333 0.0666667 0.833333 0 0.0333333 0.133333 0.166667 0 0 0.833333 0.866667 0.0666667 0 0.0666667 0.8 0.0333333 0.0333333 0.133333 0 0 0 1 0.966667 0.0333333 0 0 0.166667 0.2 0.133333 0.5 0.4 0.1 0.1 0.4 Reverse Complement Motif 0.4 0.1 0.1 0.4 0.5 0.2 0.133333 0.166667 0 0.0333333 0 0.966667 1 0 0 0 0.133333 0.0333333 0.0333333 0.8 0.0666667 0.0666667 0 0.866667 0.833333 0 0 0.166667 0.133333 0 0.0333333 0.833333 0.0666667 0.0333333 0.0333333 0.866667 0.2 0.0333333 0.0333333 0.733333 0.366667 0.133333 0.266667 0.233333 0.4 0.2 0.166667 0.233333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 dhACATTCTkh Reverse Complement Original Motif Forward 1 11 3.53885 Original Motif 0.333333 0 0.333333 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0.666667 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 Reverse Complement Motif 0.333333 0.333333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 1 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 wbgTAAATAww Original Motif Original Motif Backward 1 11 3.54165 Original Motif 0.285714 0.142857 0.178571 0.392857 0.214286 0.285714 0.25 0.25 0.142857 0.0714286 0.678571 0.107143 0 0 0 1 0.928571 0 0.0357143 0.0357143 0.821429 0.107143 0.0357143 0.0357143 0.821429 0 0.178571 0 0 0.0714286 0 0.928571 0.928571 0.0357143 0.0357143 0 0.285714 0.214286 0.142857 0.357143 0.392857 0.178571 0.178571 0.25 Reverse Complement Motif 0.25 0.178571 0.178571 0.392857 0.357143 0.214286 0.142857 0.285714 0 0.0357143 0.0357143 0.928571 0.928571 0.0714286 0 0 0 0 0.178571 0.821429 0.0357143 0.107143 0.0357143 0.821429 0.0357143 0 0.0357143 0.928571 1 0 0 0 0.142857 0.678571 0.0714286 0.107143 0.214286 0.25 0.285714 0.25 0.392857 0.142857 0.178571 0.285714 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 6 TFM2 Original Motif Reverse Complement Backward 8 9 4.56162 Original Motif 0.404762 0.047619 0.547619 0 0.238095 0.119048 0.642857 0 0.607143 0.0714286 0.321429 0 0.190476 0 0.797619 0.0119048 0.22619 0 0.738095 0.0357143 0.738095 0 0.238095 0.0238095 0.261905 0.142857 0.595238 0 0.345238 0.0714286 0.583333 0 0.547619 0 0.452381 0 0.0119048 0 0.988095 0 0.0119048 0.309524 0.678571 0 0.357143 0.261905 0.190476 0.190476 0.309524 0 0.690476 0 0.25 0.0952381 0.654762 0 0.309524 0.047619 0.392857 0.25 0.0357143 0.0952381 0.857143 0.0119048 Reverse Complement Motif 0.0357143 0.857143 0.0952381 0.0119048 0.309524 0.392857 0.047619 0.25 0.25 0.654762 0.0952381 0 0.309524 0.690476 0 0 0.190476 0.261905 0.190476 0.357143 0.0119048 0.678571 0.309524 0 0.0119048 0.988095 0 0 0 0 0.452381 0.547619 0.345238 0.583333 0.0714286 0 0.261905 0.595238 0.142857 0 0.0238095 0 0.238095 0.738095 0.22619 0.738095 0 0.0357143 0.190476 0.797619 0 0.0119048 0 0.0714286 0.321429 0.607143 0.238095 0.642857 0.119048 0 0.404762 0.547619 0.047619 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 wsTACwGTAsw Reverse Complement Original Motif Backward 5 7 5.56444 Original Motif 0.277778 0.222222 0.166667 0.333333 0.166667 0.444444 0.277778 0.111111 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0.5 0 0 0.5 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0.111111 0.277778 0.444444 0.166667 0.333333 0.166667 0.222222 0.277778 Reverse Complement Motif 0.277778 0.166667 0.222222 0.333333 0.111111 0.444444 0.277778 0.166667 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0.5 0 0 0.5 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0.166667 0.277778 0.444444 0.111111 0.333333 0.222222 0.166667 0.277778 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 TFM12 Original Motif Original Motif Forward 17 4 7.05747 Original Motif 0 1 0 0 0.19 0.4 0 0.41 0 0.52 0.19 0.29 0.11 0.61 0.1 0.18 0.18 0.29 0.33 0.2 0 0.38 0.35 0.27 0 0.82 0 0.18 0.18 0.39 0 0.43 0 0.53 0 0.47 0 0.47 0.15 0.38 0 0.24 0.24 0.52 0 0.87 0 0.13 0.05 0.68 0 0.27 0.18 0.38 0.1 0.34 0 0.62 0.22 0.16 0 0.66 0.09 0.25 0.2 0.15 0.13 0.52 0.04 0.46 0.16 0.34 0.06 0.53 0.03 0.38 0.05 0.57 0.04 0.34 Reverse Complement Motif 0.05 0.04 0.57 0.34 0.06 0.03 0.53 0.38 0.04 0.16 0.46 0.34 0.52 0.15 0.13 0.2 0 0.09 0.66 0.25 0 0.22 0.62 0.16 0.18 0.1 0.38 0.34 0.05 0 0.68 0.27 0 0 0.87 0.13 0.52 0.24 0.24 0 0 0.15 0.47 0.38 0 0 0.53 0.47 0.43 0.39 0 0.18 0 0 0.82 0.18 0 0.35 0.38 0.27 0.18 0.33 0.29 0.2 0.11 0.1 0.61 0.18 0 0.19 0.52 0.29 0.41 0.4 0 0.19 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 1 Motif ID 9 Motif Name TFM12 Original Motif 0 1 0 0 0.19 0.4 0 0.41 0 0.52 0.19 0.29 0.11 0.61 0.1 0.18 0.18 0.29 0.33 0.2 0 0.38 0.35 0.27 0 0.82 0 0.18 0.18 0.39 0 0.43 0 0.53 0 0.47 0 0.47 0.15 0.38 0 0.24 0.24 0.52 0 0.87 0 0.13 0.05 0.68 0 0.27 0.18 0.38 0.1 0.34 0 0.62 0.22 0.16 0 0.66 0.09 0.25 0.2 0.15 0.13 0.52 0.04 0.46 0.16 0.34 0.06 0.53 0.03 0.38 0.05 0.57 0.04 0.34 Reserve Complement Motif 0.05 0.04 0.57 0.34 0.06 0.03 0.53 0.38 0.04 0.16 0.46 0.34 0.52 0.15 0.13 0.2 0 0.09 0.66 0.25 0 0.22 0.62 0.16 0.18 0.1 0.38 0.34 0.05 0 0.68 0.27 0 0 0.87 0.13 0.52 0.24 0.24 0 0 0.15 0.47 0.38 0 0 0.53 0.47 0.43 0.39 0 0.18 0 0 0.82 0.18 0 0.35 0.38 0.27 0.18 0.33 0.29 0.2 0.11 0.1 0.61 0.18 0 0.19 0.52 0.29 0.41 0.4 0 0.19 0 0 1 0 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 9 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 TFM11 Original Motif Reverse Complement Forward 1 20 0.0550447 Original Motif 0.294118 0.235294 0.117647 0.352941 0.382353 0.205882 0.205882 0.205882 0.529412 0 0.117647 0.352941 0.235294 0.294118 0.323529 0.147059 1 0 0 0 0.941176 0 0 0.0588235 0.764706 0 0.0294118 0.205882 0.382353 0.235294 0.176471 0.205882 0.735294 0 0.0588235 0.205882 0.735294 0.0294118 0.117647 0.117647 0.676471 0 0.0882353 0.235294 0.529412 0.117647 0.205882 0.147059 0.705882 0.176471 0.117647 0 0.441176 0.352941 0.147059 0.0588235 0.941176 0.0588235 0 0 0.852941 0 0.147059 0 0.676471 0.0882353 0 0.235294 0.529412 0.323529 0.117647 0.0294118 0.470588 0.176471 0 0.352941 0.411765 0 0.147059 0.441176 0.5 0.0882353 0.147059 0.264706 0.294118 0.205882 0.0882353 0.411765 0.205882 0.235294 0.264706 0.294118 0.470588 0 0.117647 0.411765 0.617647 0.176471 0.205882 0 Reverse Complement Motif 0 0.176471 0.205882 0.617647 0.411765 0 0.117647 0.470588 0.294118 0.235294 0.264706 0.205882 0.411765 0.205882 0.0882353 0.294118 0.264706 0.0882353 0.147059 0.5 0.441176 0 0.147059 0.411765 0.352941 0.176471 0 0.470588 0.0294118 0.323529 0.117647 0.529412 0.235294 0.0882353 0 0.676471 0 0 0.147059 0.852941 0 0.0588235 0 0.941176 0.0588235 0.352941 0.147059 0.441176 0 0.176471 0.117647 0.705882 0.147059 0.117647 0.205882 0.529412 0.235294 0 0.0882353 0.676471 0.117647 0.0294118 0.117647 0.735294 0.205882 0 0.0588235 0.735294 0.205882 0.235294 0.176471 0.382353 0.205882 0 0.0294118 0.764706 0.0588235 0 0 0.941176 0 0 0 1 0.235294 0.323529 0.294118 0.147059 0.352941 0 0.117647 0.529412 0.205882 0.205882 0.205882 0.382353 0.352941 0.235294 0.117647 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 7 TFM1 Original Motif Original Motif Backward 2 17 1.56027 Original Motif 0.384615 0.0769231 0 0.538462 0.25641 0 0 0.74359 0.0769231 0.153846 0.333333 0.435897 0.230769 0 0 0.769231 0 0.25641 0 0.74359 0 0 0.0769231 0.923077 0.025641 0.0769231 0.25641 0.641026 0 0.128205 0.230769 0.641026 0.333333 0.230769 0.205128 0.230769 0.282051 0.179487 0 0.538462 0.0512821 0.128205 0 0.820513 0.128205 0 0 0.871795 0.25641 0.025641 0.179487 0.538462 0.102564 0 0 0.897436 0.128205 0 0.102564 0.769231 0.128205 0.025641 0.205128 0.641026 0.102564 0.333333 0.25641 0.307692 0.25641 0.102564 0 0.641026 Reverse Complement Motif 0.641026 0.102564 0 0.25641 0.102564 0.25641 0.333333 0.307692 0.641026 0.025641 0.205128 0.128205 0.769231 0 0.102564 0.128205 0.897436 0 0 0.102564 0.538462 0.025641 0.179487 0.25641 0.871795 0 0 0.128205 0.820513 0.128205 0 0.0512821 0.538462 0.179487 0 0.282051 0.230769 0.230769 0.205128 0.333333 0.641026 0.128205 0.230769 0 0.641026 0.0769231 0.25641 0.025641 0.923077 0 0.0769231 0 0.74359 0.25641 0 0 0.769231 0 0 0.230769 0.435897 0.153846 0.333333 0.0769231 0.74359 0 0 0.25641 0.538462 0.0769231 0 0.384615 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 6 TFM2 Reverse Complement Original Motif Forward 1 16 2.0134 Original Motif 0.404762 0.047619 0.547619 0 0.238095 0.119048 0.642857 0 0.607143 0.0714286 0.321429 0 0.190476 0 0.797619 0.0119048 0.22619 0 0.738095 0.0357143 0.738095 0 0.238095 0.0238095 0.261905 0.142857 0.595238 0 0.345238 0.0714286 0.583333 0 0.547619 0 0.452381 0 0.0119048 0 0.988095 0 0.0119048 0.309524 0.678571 0 0.357143 0.261905 0.190476 0.190476 0.309524 0 0.690476 0 0.25 0.0952381 0.654762 0 0.309524 0.047619 0.392857 0.25 0.0357143 0.0952381 0.857143 0.0119048 Reverse Complement Motif 0.0357143 0.857143 0.0952381 0.0119048 0.309524 0.392857 0.047619 0.25 0.25 0.654762 0.0952381 0 0.309524 0.690476 0 0 0.190476 0.261905 0.190476 0.357143 0.0119048 0.678571 0.309524 0 0.0119048 0.988095 0 0 0 0 0.452381 0.547619 0.345238 0.583333 0.0714286 0 0.261905 0.595238 0.142857 0 0.0238095 0 0.238095 0.738095 0.22619 0.738095 0 0.0357143 0.190476 0.797619 0 0.0119048 0 0.0714286 0.321429 0.607143 0.238095 0.642857 0.119048 0 0.404762 0.547619 0.047619 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 14 cccGCCCCGCCCCsb Original Motif Original Motif Backward 1 15 2.54994 Original Motif 0.148936 0.425532 0.234043 0.191489 0.106383 0.553191 0.170213 0.170213 0.106383 0.659574 0.148936 0.0851064 0.0425532 0 0.851064 0.106383 0 0.93617 0.0638298 0 0 0.87234 0.0425532 0.0851064 0 1 0 0 0 0.957447 0.0425532 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.0425532 0.93617 0.0212766 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0.0638298 0.914894 0.0212766 0 0.0638298 0.297872 0.404255 0.234043 0.148936 0.319149 0.255319 0.276596 Reverse Complement Motif 0.148936 0.255319 0.319149 0.276596 0.0638298 0.404255 0.297872 0.234043 0.0638298 0.0212766 0.914894 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0.0425532 0.0212766 0.93617 0 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0 0.0425532 0.957447 0 0 0 1 0 0 0.0425532 0.87234 0.0851064 0 0.0638298 0.93617 0 0.0425532 0.851064 0 0.106383 0.106383 0.148936 0.659574 0.0851064 0.106383 0.170213 0.553191 0.170213 0.148936 0.234043 0.425532 0.191489 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 csGCCCCGCCCCsc Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 14 3.04796 Original Motif 0.179104 0.492537 0.164179 0.164179 0.223881 0.402985 0.283582 0.0895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0746269 0 0.895522 0.0895522 0.0149254 0 0.925373 0.0149254 0.0597015 0.0298507 0.970149 0 0 0 0.970149 0.0298507 0 0.0447761 0 0.940299 0.0149254 0 0.955224 0.0149254 0.0298507 0.0298507 0.955224 0.0149254 0 0.0298507 0.925373 0.0149254 0.0298507 0.119403 0.820896 0.0149254 0.0447761 0.104478 0.328358 0.373134 0.19403 0.179104 0.358209 0.223881 0.238806 Reverse Complement Motif 0.179104 0.223881 0.358209 0.238806 0.104478 0.373134 0.328358 0.19403 0.119403 0.0149254 0.820896 0.0447761 0.0298507 0.0149254 0.925373 0.0298507 0.0298507 0.0149254 0.955224 0 0 0.0149254 0.955224 0.0298507 0.0447761 0.940299 0 0.0149254 0 0.0298507 0.970149 0 0.0298507 0 0.970149 0 0 0.0149254 0.925373 0.0597015 0 0.0895522 0.895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0149254 0.0746269 0.223881 0.283582 0.402985 0.0895522 0.179104 0.164179 0.492537 0.164179 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 5 TFF11 Reverse Complement Original Motif Forward 1 14 3.05193 Original Motif 0.0761905 0.0857143 0.819048 0.0190476 0.0761905 0.0666667 0.780952 0.0761905 0.438095 0.32381 0.180952 0.0571429 0.12381 0.180952 0.657143 0.0380952 0.0952381 0.0761905 0.790476 0.0380952 0.371429 0.104762 0.485714 0.0380952 0.0190476 0.0380952 0.914286 0.0285714 0.0190476 0.0952381 0.885714 0 0.0571429 0.866667 0.0666667 0.00952381 0.00952381 0.00952381 0.980952 0 0.047619 0.104762 0.838095 0.00952381 0.333333 0.161905 0.409524 0.0952381 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.114286 0.580952 0.266667 0.0380952 Reverse Complement Motif 0.114286 0.266667 0.580952 0.0380952 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.333333 0.409524 0.161905 0.0952381 0.047619 0.838095 0.104762 0.00952381 0.00952381 0.980952 0.00952381 0 0.0571429 0.0666667 0.866667 0.00952381 0.0190476 0.885714 0.0952381 0 0.0190476 0.914286 0.0380952 0.0285714 0.371429 0.485714 0.104762 0.0380952 0.0952381 0.790476 0.0761905 0.0380952 0.12381 0.657143 0.180952 0.0380952 0.0571429 0.32381 0.180952 0.438095 0.0761905 0.780952 0.0666667 0.0761905 0.0761905 0.819048 0.0857143 0.0190476 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 4 TFF1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 12 4.05708 Original Motif 0.180952 0.533333 0.142857 0.142857 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.0190476 0.047619 0.914286 0.0190476 0.4 0.333333 0.219048 0.047619 0.0285714 0.047619 0.885714 0.0380952 0.0380952 0.895238 0.00952381 0.0571429 0.133333 0.733333 0.0666667 0.0666667 0.0380952 0.0380952 0.87619 0.047619 0.12381 0.752381 0.114286 0.00952381 0.314286 0.190476 0.390476 0.104762 0.12381 0.0285714 0.771429 0.0761905 0.0571429 0.904762 0.0285714 0.00952381 Reverse Complement Motif 0.0571429 0.0285714 0.904762 0.00952381 0.12381 0.771429 0.0285714 0.0761905 0.314286 0.390476 0.190476 0.104762 0.12381 0.114286 0.752381 0.00952381 0.0380952 0.87619 0.0380952 0.047619 0.133333 0.0666667 0.733333 0.0666667 0.0380952 0.00952381 0.895238 0.0571429 0.0285714 0.885714 0.047619 0.0380952 0.047619 0.333333 0.219048 0.4 0.0190476 0.914286 0.047619 0.0190476 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.180952 0.142857 0.533333 0.142857 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 3 TFW3 Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 10 5.03421 Original Motif 0.02 0.92 0.05 0.01 0 0.03 0.96 0.01 0 0.17 0.83 0 0 0.99 0 0.01 0 0.27 0.21 0.52 0.03 0.3 0.37 0.3 0 0.95 0.05 0 0.02 0.13 0.8 0.05 0 0.88 0.12 0 0.01 0.22 0.76 0.01 Reverse Complement Motif 0.01 0.76 0.22 0.01 0 0.12 0.88 0 0.02 0.8 0.13 0.05 0 0.05 0.95 0 0.03 0.37 0.3 0.3 0.52 0.27 0.21 0 0 0 0.99 0.01 0 0.83 0.17 0 0 0.96 0.03 0.01 0.02 0.05 0.92 0.01 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 10 TFM13 Original Motif Reverse Complement Backward 11 10 5.05237 Original Motif 0.666667 0.133333 0 0.2 0.0666667 0.2 0 0.733333 0.2 0 0.333333 0.466667 0.666667 0 0 0.333333 0.666667 0 0 0.333333 0.6 0 0 0.4 0.333333 0 0 0.666667 0 0.0666667 0 0.933333 0.133333 0.266667 0 0.6 0.266667 0 0 0.733333 0.466667 0 0.466667 0.0666667 0.6 0.333333 0 0.0666667 0.8 0.2 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.133333 0.2 0.2 0.466667 0.8 0 0.2 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 0.4 0.333333 0 0.266667 0.2 0 0 0.8 0.6 0 0 0.4 Reverse Complement Motif 0.4 0 0 0.6 0.8 0 0 0.2 0.266667 0.333333 0 0.4 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0 0 0.2 0.8 0.466667 0.2 0.2 0.133333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.2 0 0.8 0.0666667 0.333333 0 0.6 0.0666667 0 0.466667 0.466667 0.733333 0 0 0.266667 0.6 0.266667 0 0.133333 0.933333 0.0666667 0 0 0.666667 0 0 0.333333 0.4 0 0 0.6 0.333333 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.666667 0.466667 0 0.333333 0.2 0.733333 0.2 0 0.0666667 0.2 0.133333 0 0.666667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 2 TFW2 Original Motif Reverse Complement Forward 1 8 6.06074 Original Motif 0.0058309 0.364431 0.41691 0.212828 0.0816327 0.816327 0.0991254 0.00291545 0.00291545 0.0670554 0.921283 0.00874636 0.0058309 0.883382 0.107872 0.00291545 0 0.0962099 0.860058 0.0437318 0.00291545 0.906706 0.0787172 0.0116618 0.0437318 0.0758017 0.825073 0.0553936 0 0.125364 0.87172 0.00291545 Reverse Complement Motif 0 0.87172 0.125364 0.00291545 0.0437318 0.825073 0.0758017 0.0553936 0.00291545 0.0787172 0.906706 0.0116618 0 0.860058 0.0962099 0.0437318 0.0058309 0.107872 0.883382 0.00291545 0.00291545 0.921283 0.0670554 0.00874636 0.0816327 0.0991254 0.816327 0.00291545 0.0058309 0.41691 0.364431 0.212828 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 1 Motif ID 10 Motif Name TFM13 Original Motif 0.666667 0.133333 0 0.2 0.0666667 0.2 0 0.733333 0.2 0 0.333333 0.466667 0.666667 0 0 0.333333 0.666667 0 0 0.333333 0.6 0 0 0.4 0.333333 0 0 0.666667 0 0.0666667 0 0.933333 0.133333 0.266667 0 0.6 0.266667 0 0 0.733333 0.466667 0 0.466667 0.0666667 0.6 0.333333 0 0.0666667 0.8 0.2 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.133333 0.2 0.2 0.466667 0.8 0 0.2 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 0.4 0.333333 0 0.266667 0.2 0 0 0.8 0.6 0 0 0.4 Reserve Complement Motif 0.4 0 0 0.6 0.8 0 0 0.2 0.266667 0.333333 0 0.4 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0 0 0.2 0.8 0.466667 0.2 0.2 0.133333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.2 0 0.8 0.0666667 0.333333 0 0.6 0.0666667 0 0.466667 0.466667 0.733333 0 0 0.266667 0.6 0.266667 0 0.133333 0.933333 0.0666667 0 0 0.666667 0 0 0.333333 0.4 0 0 0.6 0.333333 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.666667 0.466667 0 0.333333 0.2 0.733333 0.2 0 0.0666667 0.2 0.133333 0 0.666667 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 10 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 TFM11 Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 20 0.0352451 Original Motif 0.294118 0.235294 0.117647 0.352941 0.382353 0.205882 0.205882 0.205882 0.529412 0 0.117647 0.352941 0.235294 0.294118 0.323529 0.147059 1 0 0 0 0.941176 0 0 0.0588235 0.764706 0 0.0294118 0.205882 0.382353 0.235294 0.176471 0.205882 0.735294 0 0.0588235 0.205882 0.735294 0.0294118 0.117647 0.117647 0.676471 0 0.0882353 0.235294 0.529412 0.117647 0.205882 0.147059 0.705882 0.176471 0.117647 0 0.441176 0.352941 0.147059 0.0588235 0.941176 0.0588235 0 0 0.852941 0 0.147059 0 0.676471 0.0882353 0 0.235294 0.529412 0.323529 0.117647 0.0294118 0.470588 0.176471 0 0.352941 0.411765 0 0.147059 0.441176 0.5 0.0882353 0.147059 0.264706 0.294118 0.205882 0.0882353 0.411765 0.205882 0.235294 0.264706 0.294118 0.470588 0 0.117647 0.411765 0.617647 0.176471 0.205882 0 Reverse Complement Motif 0 0.176471 0.205882 0.617647 0.411765 0 0.117647 0.470588 0.294118 0.235294 0.264706 0.205882 0.411765 0.205882 0.0882353 0.294118 0.264706 0.0882353 0.147059 0.5 0.441176 0 0.147059 0.411765 0.352941 0.176471 0 0.470588 0.0294118 0.323529 0.117647 0.529412 0.235294 0.0882353 0 0.676471 0 0 0.147059 0.852941 0 0.0588235 0 0.941176 0.0588235 0.352941 0.147059 0.441176 0 0.176471 0.117647 0.705882 0.147059 0.117647 0.205882 0.529412 0.235294 0 0.0882353 0.676471 0.117647 0.0294118 0.117647 0.735294 0.205882 0 0.0588235 0.735294 0.205882 0.235294 0.176471 0.382353 0.205882 0 0.0294118 0.764706 0.0588235 0 0 0.941176 0 0 0 1 0.235294 0.323529 0.294118 0.147059 0.352941 0 0.117647 0.529412 0.205882 0.205882 0.205882 0.382353 0.352941 0.235294 0.117647 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 8 TFM3 Original Motif Reverse Complement Forward 1 18 1.02254 Original Motif 0.454545 0 0 0.545455 0.5 0 0 0.5 0.318182 0.181818 0.0909091 0.409091 0 0 0.136364 0.863636 0.318182 0 0 0.681818 0.0454545 0 0.272727 0.681818 0.272727 0.0454545 0.0909091 0.590909 0.272727 0.0909091 0 0.636364 0.0454545 0.818182 0 0.136364 0.727273 0 0 0.272727 0.0909091 0.318182 0.227273 0.363636 0.863636 0.0454545 0 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0909091 0 0.5 0.0909091 0.0909091 0.318182 0.136364 0.227273 0 0.636364 0.227273 0 0 0.772727 0.363636 0.0909091 0 0.545455 0.772727 0.181818 0.0454545 0 Reverse Complement Motif 0 0.181818 0.0454545 0.772727 0.545455 0.0909091 0 0.363636 0.772727 0 0 0.227273 0.636364 0.227273 0 0.136364 0.318182 0.0909091 0.0909091 0.5 0 0.0909091 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0454545 0 0.863636 0.363636 0.318182 0.227273 0.0909091 0.272727 0 0 0.727273 0.0454545 0 0.818182 0.136364 0.636364 0.0909091 0 0.272727 0.590909 0.0454545 0.0909091 0.272727 0.681818 0 0.272727 0.0454545 0.681818 0 0 0.318182 0.863636 0 0.136364 0 0.409091 0.181818 0.0909091 0.318182 0.5 0 0 0.5 0.545455 0 0 0.454545 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 7 TFM1 Reverse Complement Original Motif Forward 1 18 1.02868 Original Motif 0.384615 0.0769231 0 0.538462 0.25641 0 0 0.74359 0.0769231 0.153846 0.333333 0.435897 0.230769 0 0 0.769231 0 0.25641 0 0.74359 0 0 0.0769231 0.923077 0.025641 0.0769231 0.25641 0.641026 0 0.128205 0.230769 0.641026 0.333333 0.230769 0.205128 0.230769 0.282051 0.179487 0 0.538462 0.0512821 0.128205 0 0.820513 0.128205 0 0 0.871795 0.25641 0.025641 0.179487 0.538462 0.102564 0 0 0.897436 0.128205 0 0.102564 0.769231 0.128205 0.025641 0.205128 0.641026 0.102564 0.333333 0.25641 0.307692 0.25641 0.102564 0 0.641026 Reverse Complement Motif 0.641026 0.102564 0 0.25641 0.102564 0.25641 0.333333 0.307692 0.641026 0.025641 0.205128 0.128205 0.769231 0 0.102564 0.128205 0.897436 0 0 0.102564 0.538462 0.025641 0.179487 0.25641 0.871795 0 0 0.128205 0.820513 0.128205 0 0.0512821 0.538462 0.179487 0 0.282051 0.230769 0.230769 0.205128 0.333333 0.641026 0.128205 0.230769 0 0.641026 0.0769231 0.25641 0.025641 0.923077 0 0.0769231 0 0.74359 0.25641 0 0 0.769231 0 0 0.230769 0.435897 0.153846 0.333333 0.0769231 0.74359 0 0 0.25641 0.538462 0.0769231 0 0.384615 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 13 tkAAATAATAtw Reverse Complement Original Motif Backward 1 12 4.03399 Original Motif 0.233333 0.2 0.166667 0.4 0.233333 0.133333 0.266667 0.366667 0.733333 0.0333333 0.0333333 0.2 0.866667 0.0333333 0.0333333 0.0666667 0.833333 0 0.0333333 0.133333 0.166667 0 0 0.833333 0.866667 0.0666667 0 0.0666667 0.8 0.0333333 0.0333333 0.133333 0 0 0 1 0.966667 0.0333333 0 0 0.166667 0.2 0.133333 0.5 0.4 0.1 0.1 0.4 Reverse Complement Motif 0.4 0.1 0.1 0.4 0.5 0.2 0.133333 0.166667 0 0.0333333 0 0.966667 1 0 0 0 0.133333 0.0333333 0.0333333 0.8 0.0666667 0.0666667 0 0.866667 0.833333 0 0 0.166667 0.133333 0 0.0333333 0.833333 0.0666667 0.0333333 0.0333333 0.866667 0.2 0.0333333 0.0333333 0.733333 0.366667 0.133333 0.266667 0.233333 0.4 0.2 0.166667 0.233333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 17 wwAAATAATAtw Original Motif Reverse Complement Forward 1 12 4.03484 Original Motif 0.37037 0.166667 0.12963 0.333333 0.333333 0.166667 0.203704 0.296296 0.740741 0.0185185 0.0555556 0.185185 0.740741 0.0555556 0.037037 0.166667 0.888889 0.0185185 0.0185185 0.0740741 0.037037 0 0 0.962963 0.833333 0.037037 0.0185185 0.111111 0.796296 0.0185185 0.037037 0.148148 0.0740741 0.0555556 0.0185185 0.851852 0.925926 0.0555556 0.0185185 0 0.240741 0.166667 0.166667 0.425926 0.37037 0.12963 0.148148 0.351852 Reverse Complement Motif 0.351852 0.12963 0.148148 0.37037 0.425926 0.166667 0.166667 0.240741 0 0.0555556 0.0185185 0.925926 0.851852 0.0555556 0.0185185 0.0740741 0.148148 0.0185185 0.037037 0.796296 0.111111 0.037037 0.0185185 0.833333 0.962963 0 0 0.037037 0.0740741 0.0185185 0.0185185 0.888889 0.166667 0.0555556 0.037037 0.740741 0.185185 0.0185185 0.0555556 0.740741 0.296296 0.166667 0.203704 0.333333 0.333333 0.166667 0.12963 0.37037 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 wbgTAAATAww Original Motif Original Motif Forward 1 11 4.55116 Original Motif 0.285714 0.142857 0.178571 0.392857 0.214286 0.285714 0.25 0.25 0.142857 0.0714286 0.678571 0.107143 0 0 0 1 0.928571 0 0.0357143 0.0357143 0.821429 0.107143 0.0357143 0.0357143 0.821429 0 0.178571 0 0 0.0714286 0 0.928571 0.928571 0.0357143 0.0357143 0 0.285714 0.214286 0.142857 0.357143 0.392857 0.178571 0.178571 0.25 Reverse Complement Motif 0.25 0.178571 0.178571 0.392857 0.357143 0.214286 0.142857 0.285714 0 0.0357143 0.0357143 0.928571 0.928571 0.0714286 0 0 0 0 0.178571 0.821429 0.0357143 0.107143 0.0357143 0.821429 0.0357143 0 0.0357143 0.928571 1 0 0 0 0.142857 0.678571 0.0714286 0.107143 0.214286 0.25 0.285714 0.25 0.392857 0.142857 0.178571 0.285714 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 TFM12 Original Motif Reverse Complement Forward 11 10 5.0571 Original Motif 0 1 0 0 0.19 0.4 0 0.41 0 0.52 0.19 0.29 0.11 0.61 0.1 0.18 0.18 0.29 0.33 0.2 0 0.38 0.35 0.27 0 0.82 0 0.18 0.18 0.39 0 0.43 0 0.53 0 0.47 0 0.47 0.15 0.38 0 0.24 0.24 0.52 0 0.87 0 0.13 0.05 0.68 0 0.27 0.18 0.38 0.1 0.34 0 0.62 0.22 0.16 0 0.66 0.09 0.25 0.2 0.15 0.13 0.52 0.04 0.46 0.16 0.34 0.06 0.53 0.03 0.38 0.05 0.57 0.04 0.34 Reverse Complement Motif 0.05 0.04 0.57 0.34 0.06 0.03 0.53 0.38 0.04 0.16 0.46 0.34 0.52 0.15 0.13 0.2 0 0.09 0.66 0.25 0 0.22 0.62 0.16 0.18 0.1 0.38 0.34 0.05 0 0.68 0.27 0 0 0.87 0.13 0.52 0.24 0.24 0 0 0.15 0.47 0.38 0 0 0.53 0.47 0.43 0.39 0 0.18 0 0 0.82 0.18 0 0.35 0.38 0.27 0.18 0.33 0.29 0.2 0.11 0.1 0.61 0.18 0 0.19 0.52 0.29 0.41 0.4 0 0.19 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 dhACATTCTkh Original Motif Original Motif Backward 5 7 6.55998 Original Motif 0.333333 0 0.333333 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0.666667 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 Reverse Complement Motif 0.333333 0.333333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 1 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 15 kCAGCCAATmr Original Motif Reverse Complement Backward 7 5 7.55485 Original Motif 0.235294 0.176471 0.294118 0.294118 0.117647 0.705882 0.176471 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0.352941 0.352941 0.235294 0.0588235 0.352941 0.176471 0.411765 0.0588235 Reverse Complement Motif 0.352941 0.411765 0.176471 0.0588235 0.0588235 0.352941 0.235294 0.352941 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.117647 0.176471 0.705882 0 0.235294 0.294118 0.176471 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 wsTACwGTAsw Original Motif Original Motif Backward 8 4 8.01732 Original Motif 0.277778 0.222222 0.166667 0.333333 0.166667 0.444444 0.277778 0.111111 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0.5 0 0 0.5 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0.111111 0.277778 0.444444 0.166667 0.333333 0.166667 0.222222 0.277778 Reverse Complement Motif 0.277778 0.166667 0.222222 0.333333 0.111111 0.444444 0.277778 0.166667 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0.5 0 0 0.5 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0.166667 0.277778 0.444444 0.111111 0.333333 0.222222 0.166667 0.277778 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 1 Motif ID 11 Motif Name TFM11 Original Motif 0.294118 0.235294 0.117647 0.352941 0.382353 0.205882 0.205882 0.205882 0.529412 0 0.117647 0.352941 0.235294 0.294118 0.323529 0.147059 1 0 0 0 0.941176 0 0 0.0588235 0.764706 0 0.0294118 0.205882 0.382353 0.235294 0.176471 0.205882 0.735294 0 0.0588235 0.205882 0.735294 0.0294118 0.117647 0.117647 0.676471 0 0.0882353 0.235294 0.529412 0.117647 0.205882 0.147059 0.705882 0.176471 0.117647 0 0.441176 0.352941 0.147059 0.0588235 0.941176 0.0588235 0 0 0.852941 0 0.147059 0 0.676471 0.0882353 0 0.235294 0.529412 0.323529 0.117647 0.0294118 0.470588 0.176471 0 0.352941 0.411765 0 0.147059 0.441176 0.5 0.0882353 0.147059 0.264706 0.294118 0.205882 0.0882353 0.411765 0.205882 0.235294 0.264706 0.294118 0.470588 0 0.117647 0.411765 0.617647 0.176471 0.205882 0 Reserve Complement Motif 0 0.176471 0.205882 0.617647 0.411765 0 0.117647 0.470588 0.294118 0.235294 0.264706 0.205882 0.411765 0.205882 0.0882353 0.294118 0.264706 0.0882353 0.147059 0.5 0.441176 0 0.147059 0.411765 0.352941 0.176471 0 0.470588 0.0294118 0.323529 0.117647 0.529412 0.235294 0.0882353 0 0.676471 0 0 0.147059 0.852941 0 0.0588235 0 0.941176 0.0588235 0.352941 0.147059 0.441176 0 0.176471 0.117647 0.705882 0.147059 0.117647 0.205882 0.529412 0.235294 0 0.0882353 0.676471 0.117647 0.0294118 0.117647 0.735294 0.205882 0 0.0588235 0.735294 0.205882 0.235294 0.176471 0.382353 0.205882 0 0.0294118 0.764706 0.0588235 0 0 0.941176 0 0 0 1 0.235294 0.323529 0.294118 0.147059 0.352941 0 0.117647 0.529412 0.205882 0.205882 0.205882 0.382353 0.352941 0.235294 0.117647 0.294118 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 11 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 10 TFM13 Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 20 0.0486765 Original Motif 0.666667 0.133333 0 0.2 0.0666667 0.2 0 0.733333 0.2 0 0.333333 0.466667 0.666667 0 0 0.333333 0.666667 0 0 0.333333 0.6 0 0 0.4 0.333333 0 0 0.666667 0 0.0666667 0 0.933333 0.133333 0.266667 0 0.6 0.266667 0 0 0.733333 0.466667 0 0.466667 0.0666667 0.6 0.333333 0 0.0666667 0.8 0.2 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.133333 0.2 0.2 0.466667 0.8 0 0.2 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 0.4 0.333333 0 0.266667 0.2 0 0 0.8 0.6 0 0 0.4 Reverse Complement Motif 0.4 0 0 0.6 0.8 0 0 0.2 0.266667 0.333333 0 0.4 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0 0 0.2 0.8 0.466667 0.2 0.2 0.133333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.2 0 0.8 0.0666667 0.333333 0 0.6 0.0666667 0 0.466667 0.466667 0.733333 0 0 0.266667 0.6 0.266667 0 0.133333 0.933333 0.0666667 0 0 0.666667 0 0 0.333333 0.4 0 0 0.6 0.333333 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.666667 0.466667 0 0.333333 0.2 0.733333 0.2 0 0.0666667 0.2 0.133333 0 0.666667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 TFM12 Original Motif Reverse Complement Forward 1 20 0.0693284 Original Motif 0 1 0 0 0.19 0.4 0 0.41 0 0.52 0.19 0.29 0.11 0.61 0.1 0.18 0.18 0.29 0.33 0.2 0 0.38 0.35 0.27 0 0.82 0 0.18 0.18 0.39 0 0.43 0 0.53 0 0.47 0 0.47 0.15 0.38 0 0.24 0.24 0.52 0 0.87 0 0.13 0.05 0.68 0 0.27 0.18 0.38 0.1 0.34 0 0.62 0.22 0.16 0 0.66 0.09 0.25 0.2 0.15 0.13 0.52 0.04 0.46 0.16 0.34 0.06 0.53 0.03 0.38 0.05 0.57 0.04 0.34 Reverse Complement Motif 0.05 0.04 0.57 0.34 0.06 0.03 0.53 0.38 0.04 0.16 0.46 0.34 0.52 0.15 0.13 0.2 0 0.09 0.66 0.25 0 0.22 0.62 0.16 0.18 0.1 0.38 0.34 0.05 0 0.68 0.27 0 0 0.87 0.13 0.52 0.24 0.24 0 0 0.15 0.47 0.38 0 0 0.53 0.47 0.43 0.39 0 0.18 0 0 0.82 0.18 0 0.35 0.38 0.27 0.18 0.33 0.29 0.2 0.11 0.1 0.61 0.18 0 0.19 0.52 0.29 0.41 0.4 0 0.19 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 7 TFM1 Original Motif Reverse Complement Backward 1 18 1.0232 Original Motif 0.384615 0.0769231 0 0.538462 0.25641 0 0 0.74359 0.0769231 0.153846 0.333333 0.435897 0.230769 0 0 0.769231 0 0.25641 0 0.74359 0 0 0.0769231 0.923077 0.025641 0.0769231 0.25641 0.641026 0 0.128205 0.230769 0.641026 0.333333 0.230769 0.205128 0.230769 0.282051 0.179487 0 0.538462 0.0512821 0.128205 0 0.820513 0.128205 0 0 0.871795 0.25641 0.025641 0.179487 0.538462 0.102564 0 0 0.897436 0.128205 0 0.102564 0.769231 0.128205 0.025641 0.205128 0.641026 0.102564 0.333333 0.25641 0.307692 0.25641 0.102564 0 0.641026 Reverse Complement Motif 0.641026 0.102564 0 0.25641 0.102564 0.25641 0.333333 0.307692 0.641026 0.025641 0.205128 0.128205 0.769231 0 0.102564 0.128205 0.897436 0 0 0.102564 0.538462 0.025641 0.179487 0.25641 0.871795 0 0 0.128205 0.820513 0.128205 0 0.0512821 0.538462 0.179487 0 0.282051 0.230769 0.230769 0.205128 0.333333 0.641026 0.128205 0.230769 0 0.641026 0.0769231 0.25641 0.025641 0.923077 0 0.0769231 0 0.74359 0.25641 0 0 0.769231 0 0 0.230769 0.435897 0.153846 0.333333 0.0769231 0.74359 0 0 0.25641 0.538462 0.0769231 0 0.384615 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 8 TFM3 Reverse Complement Original Motif Forward 1 18 1.05388 Original Motif 0.454545 0 0 0.545455 0.5 0 0 0.5 0.318182 0.181818 0.0909091 0.409091 0 0 0.136364 0.863636 0.318182 0 0 0.681818 0.0454545 0 0.272727 0.681818 0.272727 0.0454545 0.0909091 0.590909 0.272727 0.0909091 0 0.636364 0.0454545 0.818182 0 0.136364 0.727273 0 0 0.272727 0.0909091 0.318182 0.227273 0.363636 0.863636 0.0454545 0 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0909091 0 0.5 0.0909091 0.0909091 0.318182 0.136364 0.227273 0 0.636364 0.227273 0 0 0.772727 0.363636 0.0909091 0 0.545455 0.772727 0.181818 0.0454545 0 Reverse Complement Motif 0 0.181818 0.0454545 0.772727 0.545455 0.0909091 0 0.363636 0.772727 0 0 0.227273 0.636364 0.227273 0 0.136364 0.318182 0.0909091 0.0909091 0.5 0 0.0909091 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0454545 0 0.863636 0.363636 0.318182 0.227273 0.0909091 0.272727 0 0 0.727273 0.0454545 0 0.818182 0.136364 0.636364 0.0909091 0 0.272727 0.590909 0.0454545 0.0909091 0.272727 0.681818 0 0.272727 0.0454545 0.681818 0 0 0.318182 0.863636 0 0.136364 0 0.409091 0.181818 0.0909091 0.318182 0.5 0 0 0.5 0.545455 0 0 0.454545 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 17 wwAAATAATAtw Original Motif Original Motif Forward 1 12 4.03464 Original Motif 0.37037 0.166667 0.12963 0.333333 0.333333 0.166667 0.203704 0.296296 0.740741 0.0185185 0.0555556 0.185185 0.740741 0.0555556 0.037037 0.166667 0.888889 0.0185185 0.0185185 0.0740741 0.037037 0 0 0.962963 0.833333 0.037037 0.0185185 0.111111 0.796296 0.0185185 0.037037 0.148148 0.0740741 0.0555556 0.0185185 0.851852 0.925926 0.0555556 0.0185185 0 0.240741 0.166667 0.166667 0.425926 0.37037 0.12963 0.148148 0.351852 Reverse Complement Motif 0.351852 0.12963 0.148148 0.37037 0.425926 0.166667 0.166667 0.240741 0 0.0555556 0.0185185 0.925926 0.851852 0.0555556 0.0185185 0.0740741 0.148148 0.0185185 0.037037 0.796296 0.111111 0.037037 0.0185185 0.833333 0.962963 0 0 0.037037 0.0740741 0.0185185 0.0185185 0.888889 0.166667 0.0555556 0.037037 0.740741 0.185185 0.0185185 0.0555556 0.740741 0.296296 0.166667 0.203704 0.333333 0.333333 0.166667 0.12963 0.37037 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 13 tkAAATAATAtw Original Motif Original Motif Forward 1 12 4.04436 Original Motif 0.233333 0.2 0.166667 0.4 0.233333 0.133333 0.266667 0.366667 0.733333 0.0333333 0.0333333 0.2 0.866667 0.0333333 0.0333333 0.0666667 0.833333 0 0.0333333 0.133333 0.166667 0 0 0.833333 0.866667 0.0666667 0 0.0666667 0.8 0.0333333 0.0333333 0.133333 0 0 0 1 0.966667 0.0333333 0 0 0.166667 0.2 0.133333 0.5 0.4 0.1 0.1 0.4 Reverse Complement Motif 0.4 0.1 0.1 0.4 0.5 0.2 0.133333 0.166667 0 0.0333333 0 0.966667 1 0 0 0 0.133333 0.0333333 0.0333333 0.8 0.0666667 0.0666667 0 0.866667 0.833333 0 0 0.166667 0.133333 0 0.0333333 0.833333 0.0666667 0.0333333 0.0333333 0.866667 0.2 0.0333333 0.0333333 0.733333 0.366667 0.133333 0.266667 0.233333 0.4 0.2 0.166667 0.233333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 wbgTAAATAww Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 11 4.53643 Original Motif 0.285714 0.142857 0.178571 0.392857 0.214286 0.285714 0.25 0.25 0.142857 0.0714286 0.678571 0.107143 0 0 0 1 0.928571 0 0.0357143 0.0357143 0.821429 0.107143 0.0357143 0.0357143 0.821429 0 0.178571 0 0 0.0714286 0 0.928571 0.928571 0.0357143 0.0357143 0 0.285714 0.214286 0.142857 0.357143 0.392857 0.178571 0.178571 0.25 Reverse Complement Motif 0.25 0.178571 0.178571 0.392857 0.357143 0.214286 0.142857 0.285714 0 0.0357143 0.0357143 0.928571 0.928571 0.0714286 0 0 0 0 0.178571 0.821429 0.0357143 0.107143 0.0357143 0.821429 0.0357143 0 0.0357143 0.928571 1 0 0 0 0.142857 0.678571 0.0714286 0.107143 0.214286 0.25 0.285714 0.25 0.392857 0.142857 0.178571 0.285714 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 dhACATTCTkh Reverse Complement Original Motif Backward 1 11 4.56457 Original Motif 0.333333 0 0.333333 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0.666667 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 Reverse Complement Motif 0.333333 0.333333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 1 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 6 TFM2 Original Motif Original Motif Backward 10 7 6.57279 Original Motif 0.404762 0.047619 0.547619 0 0.238095 0.119048 0.642857 0 0.607143 0.0714286 0.321429 0 0.190476 0 0.797619 0.0119048 0.22619 0 0.738095 0.0357143 0.738095 0 0.238095 0.0238095 0.261905 0.142857 0.595238 0 0.345238 0.0714286 0.583333 0 0.547619 0 0.452381 0 0.0119048 0 0.988095 0 0.0119048 0.309524 0.678571 0 0.357143 0.261905 0.190476 0.190476 0.309524 0 0.690476 0 0.25 0.0952381 0.654762 0 0.309524 0.047619 0.392857 0.25 0.0357143 0.0952381 0.857143 0.0119048 Reverse Complement Motif 0.0357143 0.857143 0.0952381 0.0119048 0.309524 0.392857 0.047619 0.25 0.25 0.654762 0.0952381 0 0.309524 0.690476 0 0 0.190476 0.261905 0.190476 0.357143 0.0119048 0.678571 0.309524 0 0.0119048 0.988095 0 0 0 0 0.452381 0.547619 0.345238 0.583333 0.0714286 0 0.261905 0.595238 0.142857 0 0.0238095 0 0.238095 0.738095 0.22619 0.738095 0 0.0357143 0.190476 0.797619 0 0.0119048 0 0.0714286 0.321429 0.607143 0.238095 0.642857 0.119048 0 0.404762 0.547619 0.047619 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 wsTACwGTAsw Reverse Complement Reverse Complement Forward 8 4 8.03096 Original Motif 0.277778 0.222222 0.166667 0.333333 0.166667 0.444444 0.277778 0.111111 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0.5 0 0 0.5 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0.111111 0.277778 0.444444 0.166667 0.333333 0.166667 0.222222 0.277778 Reverse Complement Motif 0.277778 0.166667 0.222222 0.333333 0.111111 0.444444 0.277778 0.166667 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0.5 0 0 0.5 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0.166667 0.277778 0.444444 0.111111 0.333333 0.222222 0.166667 0.277778 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 12 Motif Name csGCCCCGCCCCsc Original Motif 0.179104 0.492537 0.164179 0.164179 0.223881 0.402985 0.283582 0.0895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0746269 0 0.895522 0.0895522 0.0149254 0 0.925373 0.0149254 0.0597015 0.0298507 0.970149 0 0 0 0.970149 0.0298507 0 0.0447761 0 0.940299 0.0149254 0 0.955224 0.0149254 0.0298507 0.0298507 0.955224 0.0149254 0 0.0298507 0.925373 0.0149254 0.0298507 0.119403 0.820896 0.0149254 0.0447761 0.104478 0.328358 0.373134 0.19403 0.179104 0.358209 0.223881 0.238806 Reserve Complement Motif 0.179104 0.223881 0.358209 0.238806 0.104478 0.373134 0.328358 0.19403 0.119403 0.0149254 0.820896 0.0447761 0.0298507 0.0149254 0.925373 0.0298507 0.0298507 0.0149254 0.955224 0 0 0.0149254 0.955224 0.0298507 0.0447761 0.940299 0 0.0149254 0 0.0298507 0.970149 0 0.0298507 0 0.970149 0 0 0.0149254 0.925373 0.0597015 0 0.0895522 0.895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0149254 0.0746269 0.223881 0.283582 0.402985 0.0895522 0.179104 0.164179 0.492537 0.164179 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 12 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 14 cccGCCCCGCCCCsb Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 14 0 Original Motif 0.148936 0.425532 0.234043 0.191489 0.106383 0.553191 0.170213 0.170213 0.106383 0.659574 0.148936 0.0851064 0.0425532 0 0.851064 0.106383 0 0.93617 0.0638298 0 0 0.87234 0.0425532 0.0851064 0 1 0 0 0 0.957447 0.0425532 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.0425532 0.93617 0.0212766 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0.0638298 0.914894 0.0212766 0 0.0638298 0.297872 0.404255 0.234043 0.148936 0.319149 0.255319 0.276596 Reverse Complement Motif 0.148936 0.255319 0.319149 0.276596 0.0638298 0.404255 0.297872 0.234043 0.0638298 0.0212766 0.914894 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0.0425532 0.0212766 0.93617 0 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0 0.0425532 0.957447 0 0 0 1 0 0 0.0425532 0.87234 0.0851064 0 0.0638298 0.93617 0 0.0425532 0.851064 0 0.106383 0.106383 0.148936 0.659574 0.0851064 0.106383 0.170213 0.553191 0.170213 0.148936 0.234043 0.425532 0.191489 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 TFM12 Original Motif Original Motif Backward 4 14 0.0777991 Original Motif 0 1 0 0 0.19 0.4 0 0.41 0 0.52 0.19 0.29 0.11 0.61 0.1 0.18 0.18 0.29 0.33 0.2 0 0.38 0.35 0.27 0 0.82 0 0.18 0.18 0.39 0 0.43 0 0.53 0 0.47 0 0.47 0.15 0.38 0 0.24 0.24 0.52 0 0.87 0 0.13 0.05 0.68 0 0.27 0.18 0.38 0.1 0.34 0 0.62 0.22 0.16 0 0.66 0.09 0.25 0.2 0.15 0.13 0.52 0.04 0.46 0.16 0.34 0.06 0.53 0.03 0.38 0.05 0.57 0.04 0.34 Reverse Complement Motif 0.05 0.04 0.57 0.34 0.06 0.03 0.53 0.38 0.04 0.16 0.46 0.34 0.52 0.15 0.13 0.2 0 0.09 0.66 0.25 0 0.22 0.62 0.16 0.18 0.1 0.38 0.34 0.05 0 0.68 0.27 0 0 0.87 0.13 0.52 0.24 0.24 0 0 0.15 0.47 0.38 0 0 0.53 0.47 0.43 0.39 0 0.18 0 0 0.82 0.18 0 0.35 0.38 0.27 0.18 0.33 0.29 0.2 0.11 0.1 0.61 0.18 0 0.19 0.52 0.29 0.41 0.4 0 0.19 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 6 TFM2 Original Motif Reverse Complement Forward 1 14 0.0880609 Original Motif 0.404762 0.047619 0.547619 0 0.238095 0.119048 0.642857 0 0.607143 0.0714286 0.321429 0 0.190476 0 0.797619 0.0119048 0.22619 0 0.738095 0.0357143 0.738095 0 0.238095 0.0238095 0.261905 0.142857 0.595238 0 0.345238 0.0714286 0.583333 0 0.547619 0 0.452381 0 0.0119048 0 0.988095 0 0.0119048 0.309524 0.678571 0 0.357143 0.261905 0.190476 0.190476 0.309524 0 0.690476 0 0.25 0.0952381 0.654762 0 0.309524 0.047619 0.392857 0.25 0.0357143 0.0952381 0.857143 0.0119048 Reverse Complement Motif 0.0357143 0.857143 0.0952381 0.0119048 0.309524 0.392857 0.047619 0.25 0.25 0.654762 0.0952381 0 0.309524 0.690476 0 0 0.190476 0.261905 0.190476 0.357143 0.0119048 0.678571 0.309524 0 0.0119048 0.988095 0 0 0 0 0.452381 0.547619 0.345238 0.583333 0.0714286 0 0.261905 0.595238 0.142857 0 0.0238095 0 0.238095 0.738095 0.22619 0.738095 0 0.0357143 0.190476 0.797619 0 0.0119048 0 0.0714286 0.321429 0.607143 0.238095 0.642857 0.119048 0 0.404762 0.547619 0.047619 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 5 TFF11 Reverse Complement Original Motif Backward 1 14 0.0937271 Original Motif 0.0761905 0.0857143 0.819048 0.0190476 0.0761905 0.0666667 0.780952 0.0761905 0.438095 0.32381 0.180952 0.0571429 0.12381 0.180952 0.657143 0.0380952 0.0952381 0.0761905 0.790476 0.0380952 0.371429 0.104762 0.485714 0.0380952 0.0190476 0.0380952 0.914286 0.0285714 0.0190476 0.0952381 0.885714 0 0.0571429 0.866667 0.0666667 0.00952381 0.00952381 0.00952381 0.980952 0 0.047619 0.104762 0.838095 0.00952381 0.333333 0.161905 0.409524 0.0952381 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.114286 0.580952 0.266667 0.0380952 Reverse Complement Motif 0.114286 0.266667 0.580952 0.0380952 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.333333 0.409524 0.161905 0.0952381 0.047619 0.838095 0.104762 0.00952381 0.00952381 0.980952 0.00952381 0 0.0571429 0.0666667 0.866667 0.00952381 0.0190476 0.885714 0.0952381 0 0.0190476 0.914286 0.0380952 0.0285714 0.371429 0.485714 0.104762 0.0380952 0.0952381 0.790476 0.0761905 0.0380952 0.12381 0.657143 0.180952 0.0380952 0.0571429 0.32381 0.180952 0.438095 0.0761905 0.780952 0.0666667 0.0761905 0.0761905 0.819048 0.0857143 0.0190476 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 sSGTCACGTGACSs Original Motif Reverse Complement Forward 1 14 0.0971132 Original Motif 0.0555556 0.388889 0.388889 0.166667 0 0.277778 0.722222 0 0.0555556 0.111111 0.833333 0 0.111111 0 0.0555556 0.833333 0 0.888889 0.111111 0 1 0 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.0555556 0.944444 0 0 0 0 1 0 0.111111 0.888889 0 0.833333 0.0555556 0 0.111111 0 0.833333 0.111111 0.0555556 0 0.722222 0.277778 0 0.166667 0.388889 0.388889 0.0555556 Reverse Complement Motif 0.166667 0.388889 0.388889 0.0555556 0 0.277778 0.722222 0 0 0.111111 0.833333 0.0555556 0.111111 0.0555556 0 0.833333 0 0.888889 0.111111 0 1 0 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.0555556 0.944444 0 0 0 0 1 0 0.111111 0.888889 0 0.833333 0 0.0555556 0.111111 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0 0.722222 0.277778 0 0.0555556 0.388889 0.388889 0.166667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 4 TFF1 Original Motif Original Motif Forward 1 12 1.08016 Original Motif 0.180952 0.533333 0.142857 0.142857 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.0190476 0.047619 0.914286 0.0190476 0.4 0.333333 0.219048 0.047619 0.0285714 0.047619 0.885714 0.0380952 0.0380952 0.895238 0.00952381 0.0571429 0.133333 0.733333 0.0666667 0.0666667 0.0380952 0.0380952 0.87619 0.047619 0.12381 0.752381 0.114286 0.00952381 0.314286 0.190476 0.390476 0.104762 0.12381 0.0285714 0.771429 0.0761905 0.0571429 0.904762 0.0285714 0.00952381 Reverse Complement Motif 0.0571429 0.0285714 0.904762 0.00952381 0.12381 0.771429 0.0285714 0.0761905 0.314286 0.390476 0.190476 0.104762 0.12381 0.114286 0.752381 0.00952381 0.0380952 0.87619 0.0380952 0.047619 0.133333 0.0666667 0.733333 0.0666667 0.0380952 0.00952381 0.895238 0.0571429 0.0285714 0.885714 0.047619 0.0380952 0.047619 0.333333 0.219048 0.4 0.0190476 0.914286 0.047619 0.0190476 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.180952 0.142857 0.533333 0.142857 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 3 TFW3 Original Motif Original Motif Forward 1 10 2.07757 Original Motif 0.02 0.92 0.05 0.01 0 0.03 0.96 0.01 0 0.17 0.83 0 0 0.99 0 0.01 0 0.27 0.21 0.52 0.03 0.3 0.37 0.3 0 0.95 0.05 0 0.02 0.13 0.8 0.05 0 0.88 0.12 0 0.01 0.22 0.76 0.01 Reverse Complement Motif 0.01 0.76 0.22 0.01 0 0.12 0.88 0 0.02 0.8 0.13 0.05 0 0.05 0.95 0 0.03 0.37 0.3 0.3 0.52 0.27 0.21 0 0 0 0.99 0.01 0 0.83 0.17 0 0 0.96 0.03 0.01 0.02 0.05 0.92 0.01 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 2 TFW2 Original Motif Original Motif Forward 1 8 3.07109 Original Motif 0.0058309 0.364431 0.41691 0.212828 0.0816327 0.816327 0.0991254 0.00291545 0.00291545 0.0670554 0.921283 0.00874636 0.0058309 0.883382 0.107872 0.00291545 0 0.0962099 0.860058 0.0437318 0.00291545 0.906706 0.0787172 0.0116618 0.0437318 0.0758017 0.825073 0.0553936 0 0.125364 0.87172 0.00291545 Reverse Complement Motif 0 0.87172 0.125364 0.00291545 0.0437318 0.825073 0.0758017 0.0553936 0.00291545 0.0787172 0.906706 0.0116618 0 0.860058 0.0962099 0.0437318 0.0058309 0.107872 0.883382 0.00291545 0.00291545 0.921283 0.0670554 0.00874636 0.0816327 0.0991254 0.816327 0.00291545 0.0058309 0.41691 0.364431 0.212828 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 1 TFW1 Original Motif Reverse Complement Forward 1 6 4.10276 Original Motif 0 0.082495 0.917505 0 0.0744467 0.217304 0.197183 0.511066 0 0.897384 0.102616 0 0.0503018 0.102616 0.847082 0 0 0.949698 0.0503018 0 0 0.0523139 0.947686 0 Reverse Complement Motif 0 0.947686 0.0523139 0 0 0.0503018 0.949698 0 0.0503018 0.847082 0.102616 0 0 0.102616 0.897384 0 0.511066 0.217304 0.197183 0.0744467 0 0.917505 0.082495 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 TFM11 Original Motif Reverse Complement Forward 22 4 5.10677 Original Motif 0.294118 0.235294 0.117647 0.352941 0.382353 0.205882 0.205882 0.205882 0.529412 0 0.117647 0.352941 0.235294 0.294118 0.323529 0.147059 1 0 0 0 0.941176 0 0 0.0588235 0.764706 0 0.0294118 0.205882 0.382353 0.235294 0.176471 0.205882 0.735294 0 0.0588235 0.205882 0.735294 0.0294118 0.117647 0.117647 0.676471 0 0.0882353 0.235294 0.529412 0.117647 0.205882 0.147059 0.705882 0.176471 0.117647 0 0.441176 0.352941 0.147059 0.0588235 0.941176 0.0588235 0 0 0.852941 0 0.147059 0 0.676471 0.0882353 0 0.235294 0.529412 0.323529 0.117647 0.0294118 0.470588 0.176471 0 0.352941 0.411765 0 0.147059 0.441176 0.5 0.0882353 0.147059 0.264706 0.294118 0.205882 0.0882353 0.411765 0.205882 0.235294 0.264706 0.294118 0.470588 0 0.117647 0.411765 0.617647 0.176471 0.205882 0 Reverse Complement Motif 0 0.176471 0.205882 0.617647 0.411765 0 0.117647 0.470588 0.294118 0.235294 0.264706 0.205882 0.411765 0.205882 0.0882353 0.294118 0.264706 0.0882353 0.147059 0.5 0.441176 0 0.147059 0.411765 0.352941 0.176471 0 0.470588 0.0294118 0.323529 0.117647 0.529412 0.235294 0.0882353 0 0.676471 0 0 0.147059 0.852941 0 0.0588235 0 0.941176 0.0588235 0.352941 0.147059 0.441176 0 0.176471 0.117647 0.705882 0.147059 0.117647 0.205882 0.529412 0.235294 0 0.0882353 0.676471 0.117647 0.0294118 0.117647 0.735294 0.205882 0 0.0588235 0.735294 0.205882 0.235294 0.176471 0.382353 0.205882 0 0.0294118 0.764706 0.0588235 0 0 0.941176 0 0 0 1 0.235294 0.323529 0.294118 0.147059 0.352941 0 0.117647 0.529412 0.205882 0.205882 0.205882 0.382353 0.352941 0.235294 0.117647 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 13 Motif Name tkAAATAATAtw Original Motif 0.233333 0.2 0.166667 0.4 0.233333 0.133333 0.266667 0.366667 0.733333 0.0333333 0.0333333 0.2 0.866667 0.0333333 0.0333333 0.0666667 0.833333 0 0.0333333 0.133333 0.166667 0 0 0.833333 0.866667 0.0666667 0 0.0666667 0.8 0.0333333 0.0333333 0.133333 0 0 0 1 0.966667 0.0333333 0 0 0.166667 0.2 0.133333 0.5 0.4 0.1 0.1 0.4 Reserve Complement Motif 0.4 0.1 0.1 0.4 0.5 0.2 0.133333 0.166667 0 0.0333333 0 0.966667 1 0 0 0 0.133333 0.0333333 0.0333333 0.8 0.0666667 0.0666667 0 0.866667 0.833333 0 0 0.166667 0.133333 0 0.0333333 0.833333 0.0666667 0.0333333 0.0333333 0.866667 0.2 0.0333333 0.0333333 0.733333 0.366667 0.133333 0.266667 0.233333 0.4 0.2 0.166667 0.233333 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 13 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 17 wwAAATAATAtw Original Motif Original Motif Backward 1 12 0 Original Motif 0.37037 0.166667 0.12963 0.333333 0.333333 0.166667 0.203704 0.296296 0.740741 0.0185185 0.0555556 0.185185 0.740741 0.0555556 0.037037 0.166667 0.888889 0.0185185 0.0185185 0.0740741 0.037037 0 0 0.962963 0.833333 0.037037 0.0185185 0.111111 0.796296 0.0185185 0.037037 0.148148 0.0740741 0.0555556 0.0185185 0.851852 0.925926 0.0555556 0.0185185 0 0.240741 0.166667 0.166667 0.425926 0.37037 0.12963 0.148148 0.351852 Reverse Complement Motif 0.351852 0.12963 0.148148 0.37037 0.425926 0.166667 0.166667 0.240741 0 0.0555556 0.0185185 0.925926 0.851852 0.0555556 0.0185185 0.0740741 0.148148 0.0185185 0.037037 0.796296 0.111111 0.037037 0.0185185 0.833333 0.962963 0 0 0.037037 0.0740741 0.0185185 0.0185185 0.888889 0.166667 0.0555556 0.037037 0.740741 0.185185 0.0185185 0.0555556 0.740741 0.296296 0.166667 0.203704 0.333333 0.333333 0.166667 0.12963 0.37037 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 TFM11 Reverse Complement Reverse Complement Forward 12 12 0.0590505 Original Motif 0.294118 0.235294 0.117647 0.352941 0.382353 0.205882 0.205882 0.205882 0.529412 0 0.117647 0.352941 0.235294 0.294118 0.323529 0.147059 1 0 0 0 0.941176 0 0 0.0588235 0.764706 0 0.0294118 0.205882 0.382353 0.235294 0.176471 0.205882 0.735294 0 0.0588235 0.205882 0.735294 0.0294118 0.117647 0.117647 0.676471 0 0.0882353 0.235294 0.529412 0.117647 0.205882 0.147059 0.705882 0.176471 0.117647 0 0.441176 0.352941 0.147059 0.0588235 0.941176 0.0588235 0 0 0.852941 0 0.147059 0 0.676471 0.0882353 0 0.235294 0.529412 0.323529 0.117647 0.0294118 0.470588 0.176471 0 0.352941 0.411765 0 0.147059 0.441176 0.5 0.0882353 0.147059 0.264706 0.294118 0.205882 0.0882353 0.411765 0.205882 0.235294 0.264706 0.294118 0.470588 0 0.117647 0.411765 0.617647 0.176471 0.205882 0 Reverse Complement Motif 0 0.176471 0.205882 0.617647 0.411765 0 0.117647 0.470588 0.294118 0.235294 0.264706 0.205882 0.411765 0.205882 0.0882353 0.294118 0.264706 0.0882353 0.147059 0.5 0.441176 0 0.147059 0.411765 0.352941 0.176471 0 0.470588 0.0294118 0.323529 0.117647 0.529412 0.235294 0.0882353 0 0.676471 0 0 0.147059 0.852941 0 0.0588235 0 0.941176 0.0588235 0.352941 0.147059 0.441176 0 0.176471 0.117647 0.705882 0.147059 0.117647 0.205882 0.529412 0.235294 0 0.0882353 0.676471 0.117647 0.0294118 0.117647 0.735294 0.205882 0 0.0588235 0.735294 0.205882 0.235294 0.176471 0.382353 0.205882 0 0.0294118 0.764706 0.0588235 0 0 0.941176 0 0 0 1 0.235294 0.323529 0.294118 0.147059 0.352941 0 0.117647 0.529412 0.205882 0.205882 0.205882 0.382353 0.352941 0.235294 0.117647 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 7 TFM1 Reverse Complement Original Motif Backward 7 12 0.0637702 Original Motif 0.384615 0.0769231 0 0.538462 0.25641 0 0 0.74359 0.0769231 0.153846 0.333333 0.435897 0.230769 0 0 0.769231 0 0.25641 0 0.74359 0 0 0.0769231 0.923077 0.025641 0.0769231 0.25641 0.641026 0 0.128205 0.230769 0.641026 0.333333 0.230769 0.205128 0.230769 0.282051 0.179487 0 0.538462 0.0512821 0.128205 0 0.820513 0.128205 0 0 0.871795 0.25641 0.025641 0.179487 0.538462 0.102564 0 0 0.897436 0.128205 0 0.102564 0.769231 0.128205 0.025641 0.205128 0.641026 0.102564 0.333333 0.25641 0.307692 0.25641 0.102564 0 0.641026 Reverse Complement Motif 0.641026 0.102564 0 0.25641 0.102564 0.25641 0.333333 0.307692 0.641026 0.025641 0.205128 0.128205 0.769231 0 0.102564 0.128205 0.897436 0 0 0.102564 0.538462 0.025641 0.179487 0.25641 0.871795 0 0 0.128205 0.820513 0.128205 0 0.0512821 0.538462 0.179487 0 0.282051 0.230769 0.230769 0.205128 0.333333 0.641026 0.128205 0.230769 0 0.641026 0.0769231 0.25641 0.025641 0.923077 0 0.0769231 0 0.74359 0.25641 0 0 0.769231 0 0 0.230769 0.435897 0.153846 0.333333 0.0769231 0.74359 0 0 0.25641 0.538462 0.0769231 0 0.384615 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 10 TFM13 Original Motif Reverse Complement Backward 9 12 0.0704475 Original Motif 0.666667 0.133333 0 0.2 0.0666667 0.2 0 0.733333 0.2 0 0.333333 0.466667 0.666667 0 0 0.333333 0.666667 0 0 0.333333 0.6 0 0 0.4 0.333333 0 0 0.666667 0 0.0666667 0 0.933333 0.133333 0.266667 0 0.6 0.266667 0 0 0.733333 0.466667 0 0.466667 0.0666667 0.6 0.333333 0 0.0666667 0.8 0.2 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.133333 0.2 0.2 0.466667 0.8 0 0.2 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 0.4 0.333333 0 0.266667 0.2 0 0 0.8 0.6 0 0 0.4 Reverse Complement Motif 0.4 0 0 0.6 0.8 0 0 0.2 0.266667 0.333333 0 0.4 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0 0 0.2 0.8 0.466667 0.2 0.2 0.133333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.2 0 0.8 0.0666667 0.333333 0 0.6 0.0666667 0 0.466667 0.466667 0.733333 0 0 0.266667 0.6 0.266667 0 0.133333 0.933333 0.0666667 0 0 0.666667 0 0 0.333333 0.4 0 0 0.6 0.333333 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.666667 0.466667 0 0.333333 0.2 0.733333 0.2 0 0.0666667 0.2 0.133333 0 0.666667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 8 TFM3 Original Motif Reverse Complement Forward 7 12 0.0763819 Original Motif 0.454545 0 0 0.545455 0.5 0 0 0.5 0.318182 0.181818 0.0909091 0.409091 0 0 0.136364 0.863636 0.318182 0 0 0.681818 0.0454545 0 0.272727 0.681818 0.272727 0.0454545 0.0909091 0.590909 0.272727 0.0909091 0 0.636364 0.0454545 0.818182 0 0.136364 0.727273 0 0 0.272727 0.0909091 0.318182 0.227273 0.363636 0.863636 0.0454545 0 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0909091 0 0.5 0.0909091 0.0909091 0.318182 0.136364 0.227273 0 0.636364 0.227273 0 0 0.772727 0.363636 0.0909091 0 0.545455 0.772727 0.181818 0.0454545 0 Reverse Complement Motif 0 0.181818 0.0454545 0.772727 0.545455 0.0909091 0 0.363636 0.772727 0 0 0.227273 0.636364 0.227273 0 0.136364 0.318182 0.0909091 0.0909091 0.5 0 0.0909091 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0454545 0 0.863636 0.363636 0.318182 0.227273 0.0909091 0.272727 0 0 0.727273 0.0454545 0 0.818182 0.136364 0.636364 0.0909091 0 0.272727 0.590909 0.0454545 0.0909091 0.272727 0.681818 0 0.272727 0.0454545 0.681818 0 0 0.318182 0.863636 0 0.136364 0 0.409091 0.181818 0.0909091 0.318182 0.5 0 0 0.5 0.545455 0 0 0.454545 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 wbgTAAATAww Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 11 0.560292 Original Motif 0.285714 0.142857 0.178571 0.392857 0.214286 0.285714 0.25 0.25 0.142857 0.0714286 0.678571 0.107143 0 0 0 1 0.928571 0 0.0357143 0.0357143 0.821429 0.107143 0.0357143 0.0357143 0.821429 0 0.178571 0 0 0.0714286 0 0.928571 0.928571 0.0357143 0.0357143 0 0.285714 0.214286 0.142857 0.357143 0.392857 0.178571 0.178571 0.25 Reverse Complement Motif 0.25 0.178571 0.178571 0.392857 0.357143 0.214286 0.142857 0.285714 0 0.0357143 0.0357143 0.928571 0.928571 0.0714286 0 0 0 0 0.178571 0.821429 0.0357143 0.107143 0.0357143 0.821429 0.0357143 0 0.0357143 0.928571 1 0 0 0 0.142857 0.678571 0.0714286 0.107143 0.214286 0.25 0.285714 0.25 0.392857 0.142857 0.178571 0.285714 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 wsTACwGTAsw Reverse Complement Original Motif Forward 1 11 0.587493 Original Motif 0.277778 0.222222 0.166667 0.333333 0.166667 0.444444 0.277778 0.111111 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0.5 0 0 0.5 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0.111111 0.277778 0.444444 0.166667 0.333333 0.166667 0.222222 0.277778 Reverse Complement Motif 0.277778 0.166667 0.222222 0.333333 0.111111 0.444444 0.277778 0.166667 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0.5 0 0 0.5 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0.166667 0.277778 0.444444 0.111111 0.333333 0.222222 0.166667 0.277778 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 dhACATTCTkh Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 11 0.590271 Original Motif 0.333333 0 0.333333 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0.666667 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 Reverse Complement Motif 0.333333 0.333333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 1 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 15 kCAGCCAATmr Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 11 0.592142 Original Motif 0.235294 0.176471 0.294118 0.294118 0.117647 0.705882 0.176471 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0.352941 0.352941 0.235294 0.0588235 0.352941 0.176471 0.411765 0.0588235 Reverse Complement Motif 0.352941 0.411765 0.176471 0.0588235 0.0588235 0.352941 0.235294 0.352941 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.117647 0.176471 0.705882 0 0.235294 0.294118 0.176471 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 TFM12 Reverse Complement Reverse Complement Backward 16 5 3.59273 Original Motif 0 1 0 0 0.19 0.4 0 0.41 0 0.52 0.19 0.29 0.11 0.61 0.1 0.18 0.18 0.29 0.33 0.2 0 0.38 0.35 0.27 0 0.82 0 0.18 0.18 0.39 0 0.43 0 0.53 0 0.47 0 0.47 0.15 0.38 0 0.24 0.24 0.52 0 0.87 0 0.13 0.05 0.68 0 0.27 0.18 0.38 0.1 0.34 0 0.62 0.22 0.16 0 0.66 0.09 0.25 0.2 0.15 0.13 0.52 0.04 0.46 0.16 0.34 0.06 0.53 0.03 0.38 0.05 0.57 0.04 0.34 Reverse Complement Motif 0.05 0.04 0.57 0.34 0.06 0.03 0.53 0.38 0.04 0.16 0.46 0.34 0.52 0.15 0.13 0.2 0 0.09 0.66 0.25 0 0.22 0.62 0.16 0.18 0.1 0.38 0.34 0.05 0 0.68 0.27 0 0 0.87 0.13 0.52 0.24 0.24 0 0 0.15 0.47 0.38 0 0 0.53 0.47 0.43 0.39 0 0.18 0 0 0.82 0.18 0 0.35 0.38 0.27 0.18 0.33 0.29 0.2 0.11 0.1 0.61 0.18 0 0.19 0.52 0.29 0.41 0.4 0 0.19 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 14 Motif Name cccGCCCCGCCCCsb Original Motif 0.148936 0.425532 0.234043 0.191489 0.106383 0.553191 0.170213 0.170213 0.106383 0.659574 0.148936 0.0851064 0.0425532 0 0.851064 0.106383 0 0.93617 0.0638298 0 0 0.87234 0.0425532 0.0851064 0 1 0 0 0 0.957447 0.0425532 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.0425532 0.93617 0.0212766 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0.0638298 0.914894 0.0212766 0 0.0638298 0.297872 0.404255 0.234043 0.148936 0.319149 0.255319 0.276596 Reserve Complement Motif 0.148936 0.255319 0.319149 0.276596 0.0638298 0.404255 0.297872 0.234043 0.0638298 0.0212766 0.914894 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0.0425532 0.0212766 0.93617 0 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0 0.0425532 0.957447 0 0 0 1 0 0 0.0425532 0.87234 0.0851064 0 0.0638298 0.93617 0 0.0425532 0.851064 0 0.106383 0.106383 0.148936 0.659574 0.0851064 0.106383 0.170213 0.553191 0.170213 0.148936 0.234043 0.425532 0.191489 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 14 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 TFM12 Original Motif Original Motif Forward 3 15 0.0773345 Original Motif 0 1 0 0 0.19 0.4 0 0.41 0 0.52 0.19 0.29 0.11 0.61 0.1 0.18 0.18 0.29 0.33 0.2 0 0.38 0.35 0.27 0 0.82 0 0.18 0.18 0.39 0 0.43 0 0.53 0 0.47 0 0.47 0.15 0.38 0 0.24 0.24 0.52 0 0.87 0 0.13 0.05 0.68 0 0.27 0.18 0.38 0.1 0.34 0 0.62 0.22 0.16 0 0.66 0.09 0.25 0.2 0.15 0.13 0.52 0.04 0.46 0.16 0.34 0.06 0.53 0.03 0.38 0.05 0.57 0.04 0.34 Reverse Complement Motif 0.05 0.04 0.57 0.34 0.06 0.03 0.53 0.38 0.04 0.16 0.46 0.34 0.52 0.15 0.13 0.2 0 0.09 0.66 0.25 0 0.22 0.62 0.16 0.18 0.1 0.38 0.34 0.05 0 0.68 0.27 0 0 0.87 0.13 0.52 0.24 0.24 0 0 0.15 0.47 0.38 0 0 0.53 0.47 0.43 0.39 0 0.18 0 0 0.82 0.18 0 0.35 0.38 0.27 0.18 0.33 0.29 0.2 0.11 0.1 0.61 0.18 0 0.19 0.52 0.29 0.41 0.4 0 0.19 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 6 TFM2 Original Motif Reverse Complement Backward 2 15 0.0869149 Original Motif 0.404762 0.047619 0.547619 0 0.238095 0.119048 0.642857 0 0.607143 0.0714286 0.321429 0 0.190476 0 0.797619 0.0119048 0.22619 0 0.738095 0.0357143 0.738095 0 0.238095 0.0238095 0.261905 0.142857 0.595238 0 0.345238 0.0714286 0.583333 0 0.547619 0 0.452381 0 0.0119048 0 0.988095 0 0.0119048 0.309524 0.678571 0 0.357143 0.261905 0.190476 0.190476 0.309524 0 0.690476 0 0.25 0.0952381 0.654762 0 0.309524 0.047619 0.392857 0.25 0.0357143 0.0952381 0.857143 0.0119048 Reverse Complement Motif 0.0357143 0.857143 0.0952381 0.0119048 0.309524 0.392857 0.047619 0.25 0.25 0.654762 0.0952381 0 0.309524 0.690476 0 0 0.190476 0.261905 0.190476 0.357143 0.0119048 0.678571 0.309524 0 0.0119048 0.988095 0 0 0 0 0.452381 0.547619 0.345238 0.583333 0.0714286 0 0.261905 0.595238 0.142857 0 0.0238095 0 0.238095 0.738095 0.22619 0.738095 0 0.0357143 0.190476 0.797619 0 0.0119048 0 0.0714286 0.321429 0.607143 0.238095 0.642857 0.119048 0 0.404762 0.547619 0.047619 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 csGCCCCGCCCCsc Original Motif Original Motif Backward 1 14 0.5 Original Motif 0.179104 0.492537 0.164179 0.164179 0.223881 0.402985 0.283582 0.0895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0746269 0 0.895522 0.0895522 0.0149254 0 0.925373 0.0149254 0.0597015 0.0298507 0.970149 0 0 0 0.970149 0.0298507 0 0.0447761 0 0.940299 0.0149254 0 0.955224 0.0149254 0.0298507 0.0298507 0.955224 0.0149254 0 0.0298507 0.925373 0.0149254 0.0298507 0.119403 0.820896 0.0149254 0.0447761 0.104478 0.328358 0.373134 0.19403 0.179104 0.358209 0.223881 0.238806 Reverse Complement Motif 0.179104 0.223881 0.358209 0.238806 0.104478 0.373134 0.328358 0.19403 0.119403 0.0149254 0.820896 0.0447761 0.0298507 0.0149254 0.925373 0.0298507 0.0298507 0.0149254 0.955224 0 0 0.0149254 0.955224 0.0298507 0.0447761 0.940299 0 0.0149254 0 0.0298507 0.970149 0 0.0298507 0 0.970149 0 0 0.0149254 0.925373 0.0597015 0 0.0895522 0.895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0149254 0.0746269 0.223881 0.283582 0.402985 0.0895522 0.179104 0.164179 0.492537 0.164179 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 5 TFF11 Reverse Complement Original Motif Forward 1 14 0.58333 Original Motif 0.0761905 0.0857143 0.819048 0.0190476 0.0761905 0.0666667 0.780952 0.0761905 0.438095 0.32381 0.180952 0.0571429 0.12381 0.180952 0.657143 0.0380952 0.0952381 0.0761905 0.790476 0.0380952 0.371429 0.104762 0.485714 0.0380952 0.0190476 0.0380952 0.914286 0.0285714 0.0190476 0.0952381 0.885714 0 0.0571429 0.866667 0.0666667 0.00952381 0.00952381 0.00952381 0.980952 0 0.047619 0.104762 0.838095 0.00952381 0.333333 0.161905 0.409524 0.0952381 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.114286 0.580952 0.266667 0.0380952 Reverse Complement Motif 0.114286 0.266667 0.580952 0.0380952 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.333333 0.409524 0.161905 0.0952381 0.047619 0.838095 0.104762 0.00952381 0.00952381 0.980952 0.00952381 0 0.0571429 0.0666667 0.866667 0.00952381 0.0190476 0.885714 0.0952381 0 0.0190476 0.914286 0.0380952 0.0285714 0.371429 0.485714 0.104762 0.0380952 0.0952381 0.790476 0.0761905 0.0380952 0.12381 0.657143 0.180952 0.0380952 0.0571429 0.32381 0.180952 0.438095 0.0761905 0.780952 0.0666667 0.0761905 0.0761905 0.819048 0.0857143 0.0190476 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 sSGTCACGTGACSs Reverse Complement Original Motif Forward 1 14 0.601399 Original Motif 0.0555556 0.388889 0.388889 0.166667 0 0.277778 0.722222 0 0.0555556 0.111111 0.833333 0 0.111111 0 0.0555556 0.833333 0 0.888889 0.111111 0 1 0 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.0555556 0.944444 0 0 0 0 1 0 0.111111 0.888889 0 0.833333 0.0555556 0 0.111111 0 0.833333 0.111111 0.0555556 0 0.722222 0.277778 0 0.166667 0.388889 0.388889 0.0555556 Reverse Complement Motif 0.166667 0.388889 0.388889 0.0555556 0 0.277778 0.722222 0 0 0.111111 0.833333 0.0555556 0.111111 0.0555556 0 0.833333 0 0.888889 0.111111 0 1 0 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.0555556 0.944444 0 0 0 0 1 0 0.111111 0.888889 0 0.833333 0 0.0555556 0.111111 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0 0.722222 0.277778 0 0.0555556 0.388889 0.388889 0.166667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 4 TFF1 Reverse Complement Original Motif Backward 1 12 1.58073 Original Motif 0.180952 0.533333 0.142857 0.142857 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.0190476 0.047619 0.914286 0.0190476 0.4 0.333333 0.219048 0.047619 0.0285714 0.047619 0.885714 0.0380952 0.0380952 0.895238 0.00952381 0.0571429 0.133333 0.733333 0.0666667 0.0666667 0.0380952 0.0380952 0.87619 0.047619 0.12381 0.752381 0.114286 0.00952381 0.314286 0.190476 0.390476 0.104762 0.12381 0.0285714 0.771429 0.0761905 0.0571429 0.904762 0.0285714 0.00952381 Reverse Complement Motif 0.0571429 0.0285714 0.904762 0.00952381 0.12381 0.771429 0.0285714 0.0761905 0.314286 0.390476 0.190476 0.104762 0.12381 0.114286 0.752381 0.00952381 0.0380952 0.87619 0.0380952 0.047619 0.133333 0.0666667 0.733333 0.0666667 0.0380952 0.00952381 0.895238 0.0571429 0.0285714 0.885714 0.047619 0.0380952 0.047619 0.333333 0.219048 0.4 0.0190476 0.914286 0.047619 0.0190476 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.180952 0.142857 0.533333 0.142857 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 3 TFW3 Reverse Complement Original Motif Backward 1 10 2.6085 Original Motif 0.02 0.92 0.05 0.01 0 0.03 0.96 0.01 0 0.17 0.83 0 0 0.99 0 0.01 0 0.27 0.21 0.52 0.03 0.3 0.37 0.3 0 0.95 0.05 0 0.02 0.13 0.8 0.05 0 0.88 0.12 0 0.01 0.22 0.76 0.01 Reverse Complement Motif 0.01 0.76 0.22 0.01 0 0.12 0.88 0 0.02 0.8 0.13 0.05 0 0.05 0.95 0 0.03 0.37 0.3 0.3 0.52 0.27 0.21 0 0 0 0.99 0.01 0 0.83 0.17 0 0 0.96 0.03 0.01 0.02 0.05 0.92 0.01 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 2 TFW2 Original Motif Reverse Complement Forward 1 8 3.595 Original Motif 0.0058309 0.364431 0.41691 0.212828 0.0816327 0.816327 0.0991254 0.00291545 0.00291545 0.0670554 0.921283 0.00874636 0.0058309 0.883382 0.107872 0.00291545 0 0.0962099 0.860058 0.0437318 0.00291545 0.906706 0.0787172 0.0116618 0.0437318 0.0758017 0.825073 0.0553936 0 0.125364 0.87172 0.00291545 Reverse Complement Motif 0 0.87172 0.125364 0.00291545 0.0437318 0.825073 0.0758017 0.0553936 0.00291545 0.0787172 0.906706 0.0116618 0 0.860058 0.0962099 0.0437318 0.0058309 0.107872 0.883382 0.00291545 0.00291545 0.921283 0.0670554 0.00874636 0.0816327 0.0991254 0.816327 0.00291545 0.0058309 0.41691 0.364431 0.212828 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 1 TFW1 Original Motif Original Motif Forward 1 6 4.58105 Original Motif 0 0.082495 0.917505 0 0.0744467 0.217304 0.197183 0.511066 0 0.897384 0.102616 0 0.0503018 0.102616 0.847082 0 0 0.949698 0.0503018 0 0 0.0523139 0.947686 0 Reverse Complement Motif 0 0.947686 0.0523139 0 0 0.0503018 0.949698 0 0.0503018 0.847082 0.102616 0 0 0.102616 0.897384 0 0.511066 0.217304 0.197183 0.0744467 0 0.917505 0.082495 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 TFM11 Original Motif Reverse Complement Backward 22 4 5.59832 Original Motif 0.294118 0.235294 0.117647 0.352941 0.382353 0.205882 0.205882 0.205882 0.529412 0 0.117647 0.352941 0.235294 0.294118 0.323529 0.147059 1 0 0 0 0.941176 0 0 0.0588235 0.764706 0 0.0294118 0.205882 0.382353 0.235294 0.176471 0.205882 0.735294 0 0.0588235 0.205882 0.735294 0.0294118 0.117647 0.117647 0.676471 0 0.0882353 0.235294 0.529412 0.117647 0.205882 0.147059 0.705882 0.176471 0.117647 0 0.441176 0.352941 0.147059 0.0588235 0.941176 0.0588235 0 0 0.852941 0 0.147059 0 0.676471 0.0882353 0 0.235294 0.529412 0.323529 0.117647 0.0294118 0.470588 0.176471 0 0.352941 0.411765 0 0.147059 0.441176 0.5 0.0882353 0.147059 0.264706 0.294118 0.205882 0.0882353 0.411765 0.205882 0.235294 0.264706 0.294118 0.470588 0 0.117647 0.411765 0.617647 0.176471 0.205882 0 Reverse Complement Motif 0 0.176471 0.205882 0.617647 0.411765 0 0.117647 0.470588 0.294118 0.235294 0.264706 0.205882 0.411765 0.205882 0.0882353 0.294118 0.264706 0.0882353 0.147059 0.5 0.441176 0 0.147059 0.411765 0.352941 0.176471 0 0.470588 0.0294118 0.323529 0.117647 0.529412 0.235294 0.0882353 0 0.676471 0 0 0.147059 0.852941 0 0.0588235 0 0.941176 0.0588235 0.352941 0.147059 0.441176 0 0.176471 0.117647 0.705882 0.147059 0.117647 0.205882 0.529412 0.235294 0 0.0882353 0.676471 0.117647 0.0294118 0.117647 0.735294 0.205882 0 0.0588235 0.735294 0.205882 0.235294 0.176471 0.382353 0.205882 0 0.0294118 0.764706 0.0588235 0 0 0.941176 0 0 0 1 0.235294 0.323529 0.294118 0.147059 0.352941 0 0.117647 0.529412 0.205882 0.205882 0.205882 0.382353 0.352941 0.235294 0.117647 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 15 Motif Name kCAGCCAATmr Original Motif 0.235294 0.176471 0.294118 0.294118 0.117647 0.705882 0.176471 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0.352941 0.352941 0.235294 0.0588235 0.352941 0.176471 0.411765 0.0588235 Reserve Complement Motif 0.352941 0.411765 0.176471 0.0588235 0.0588235 0.352941 0.235294 0.352941 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.117647 0.176471 0.705882 0 0.235294 0.294118 0.176471 0.294118 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 15 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 13 tkAAATAATAtw Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 11 0.0320614 Original Motif 0.233333 0.2 0.166667 0.4 0.233333 0.133333 0.266667 0.366667 0.733333 0.0333333 0.0333333 0.2 0.866667 0.0333333 0.0333333 0.0666667 0.833333 0 0.0333333 0.133333 0.166667 0 0 0.833333 0.866667 0.0666667 0 0.0666667 0.8 0.0333333 0.0333333 0.133333 0 0 0 1 0.966667 0.0333333 0 0 0.166667 0.2 0.133333 0.5 0.4 0.1 0.1 0.4 Reverse Complement Motif 0.4 0.1 0.1 0.4 0.5 0.2 0.133333 0.166667 0 0.0333333 0 0.966667 1 0 0 0 0.133333 0.0333333 0.0333333 0.8 0.0666667 0.0666667 0 0.866667 0.833333 0 0 0.166667 0.133333 0 0.0333333 0.833333 0.0666667 0.0333333 0.0333333 0.866667 0.2 0.0333333 0.0333333 0.733333 0.366667 0.133333 0.266667 0.233333 0.4 0.2 0.166667 0.233333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 dhACATTCTkh Original Motif Reverse Complement Backward 1 11 0.034958 Original Motif 0.333333 0 0.333333 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0.666667 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 Reverse Complement Motif 0.333333 0.333333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 1 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 17 wwAAATAATAtw Reverse Complement Reverse Complement Forward 2 11 0.0358988 Original Motif 0.37037 0.166667 0.12963 0.333333 0.333333 0.166667 0.203704 0.296296 0.740741 0.0185185 0.0555556 0.185185 0.740741 0.0555556 0.037037 0.166667 0.888889 0.0185185 0.0185185 0.0740741 0.037037 0 0 0.962963 0.833333 0.037037 0.0185185 0.111111 0.796296 0.0185185 0.037037 0.148148 0.0740741 0.0555556 0.0185185 0.851852 0.925926 0.0555556 0.0185185 0 0.240741 0.166667 0.166667 0.425926 0.37037 0.12963 0.148148 0.351852 Reverse Complement Motif 0.351852 0.12963 0.148148 0.37037 0.425926 0.166667 0.166667 0.240741 0 0.0555556 0.0185185 0.925926 0.851852 0.0555556 0.0185185 0.0740741 0.148148 0.0185185 0.037037 0.796296 0.111111 0.037037 0.0185185 0.833333 0.962963 0 0 0.037037 0.0740741 0.0185185 0.0185185 0.888889 0.166667 0.0555556 0.037037 0.740741 0.185185 0.0185185 0.0555556 0.740741 0.296296 0.166667 0.203704 0.333333 0.333333 0.166667 0.12963 0.37037 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 kcACCTGCAgc Reverse Complement Original Motif Backward 1 11 0.0360892 Original Motif 0.153846 0.230769 0.307692 0.307692 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0.153846 0.230769 0.461538 0.153846 0.153846 0.615385 0.153846 0.0769231 Reverse Complement Motif 0.153846 0.153846 0.615385 0.0769231 0.153846 0.461538 0.230769 0.153846 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0.153846 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 0.307692 0.230769 0.307692 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 5 TFF11 Reverse Complement Original Motif Backward 2 11 0.0376063 Original Motif 0.0761905 0.0857143 0.819048 0.0190476 0.0761905 0.0666667 0.780952 0.0761905 0.438095 0.32381 0.180952 0.0571429 0.12381 0.180952 0.657143 0.0380952 0.0952381 0.0761905 0.790476 0.0380952 0.371429 0.104762 0.485714 0.0380952 0.0190476 0.0380952 0.914286 0.0285714 0.0190476 0.0952381 0.885714 0 0.0571429 0.866667 0.0666667 0.00952381 0.00952381 0.00952381 0.980952 0 0.047619 0.104762 0.838095 0.00952381 0.333333 0.161905 0.409524 0.0952381 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.114286 0.580952 0.266667 0.0380952 Reverse Complement Motif 0.114286 0.266667 0.580952 0.0380952 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.333333 0.409524 0.161905 0.0952381 0.047619 0.838095 0.104762 0.00952381 0.00952381 0.980952 0.00952381 0 0.0571429 0.0666667 0.866667 0.00952381 0.0190476 0.885714 0.0952381 0 0.0190476 0.914286 0.0380952 0.0285714 0.371429 0.485714 0.104762 0.0380952 0.0952381 0.790476 0.0761905 0.0380952 0.12381 0.657143 0.180952 0.0380952 0.0571429 0.32381 0.180952 0.438095 0.0761905 0.780952 0.0666667 0.0761905 0.0761905 0.819048 0.0857143 0.0190476 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 TFM11 Original Motif Original Motif Backward 7 11 0.0396371 Original Motif 0.294118 0.235294 0.117647 0.352941 0.382353 0.205882 0.205882 0.205882 0.529412 0 0.117647 0.352941 0.235294 0.294118 0.323529 0.147059 1 0 0 0 0.941176 0 0 0.0588235 0.764706 0 0.0294118 0.205882 0.382353 0.235294 0.176471 0.205882 0.735294 0 0.0588235 0.205882 0.735294 0.0294118 0.117647 0.117647 0.676471 0 0.0882353 0.235294 0.529412 0.117647 0.205882 0.147059 0.705882 0.176471 0.117647 0 0.441176 0.352941 0.147059 0.0588235 0.941176 0.0588235 0 0 0.852941 0 0.147059 0 0.676471 0.0882353 0 0.235294 0.529412 0.323529 0.117647 0.0294118 0.470588 0.176471 0 0.352941 0.411765 0 0.147059 0.441176 0.5 0.0882353 0.147059 0.264706 0.294118 0.205882 0.0882353 0.411765 0.205882 0.235294 0.264706 0.294118 0.470588 0 0.117647 0.411765 0.617647 0.176471 0.205882 0 Reverse Complement Motif 0 0.176471 0.205882 0.617647 0.411765 0 0.117647 0.470588 0.294118 0.235294 0.264706 0.205882 0.411765 0.205882 0.0882353 0.294118 0.264706 0.0882353 0.147059 0.5 0.441176 0 0.147059 0.411765 0.352941 0.176471 0 0.470588 0.0294118 0.323529 0.117647 0.529412 0.235294 0.0882353 0 0.676471 0 0 0.147059 0.852941 0 0.0588235 0 0.941176 0.0588235 0.352941 0.147059 0.441176 0 0.176471 0.117647 0.705882 0.147059 0.117647 0.205882 0.529412 0.235294 0 0.0882353 0.676471 0.117647 0.0294118 0.117647 0.735294 0.205882 0 0.0588235 0.735294 0.205882 0.235294 0.176471 0.382353 0.205882 0 0.0294118 0.764706 0.0588235 0 0 0.941176 0 0 0 1 0.235294 0.323529 0.294118 0.147059 0.352941 0 0.117647 0.529412 0.205882 0.205882 0.205882 0.382353 0.352941 0.235294 0.117647 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 wbgTAAATAww Reverse Complement Reverse Complement Forward 2 10 0.538109 Original Motif 0.285714 0.142857 0.178571 0.392857 0.214286 0.285714 0.25 0.25 0.142857 0.0714286 0.678571 0.107143 0 0 0 1 0.928571 0 0.0357143 0.0357143 0.821429 0.107143 0.0357143 0.0357143 0.821429 0 0.178571 0 0 0.0714286 0 0.928571 0.928571 0.0357143 0.0357143 0 0.285714 0.214286 0.142857 0.357143 0.392857 0.178571 0.178571 0.25 Reverse Complement Motif 0.25 0.178571 0.178571 0.392857 0.357143 0.214286 0.142857 0.285714 0 0.0357143 0.0357143 0.928571 0.928571 0.0714286 0 0 0 0 0.178571 0.821429 0.0357143 0.107143 0.0357143 0.821429 0.0357143 0 0.0357143 0.928571 1 0 0 0 0.142857 0.678571 0.0714286 0.107143 0.214286 0.25 0.285714 0.25 0.392857 0.142857 0.178571 0.285714 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 3 TFW3 Reverse Complement Original Motif Forward 4 7 2.01586 Original Motif 0.02 0.92 0.05 0.01 0 0.03 0.96 0.01 0 0.17 0.83 0 0 0.99 0 0.01 0 0.27 0.21 0.52 0.03 0.3 0.37 0.3 0 0.95 0.05 0 0.02 0.13 0.8 0.05 0 0.88 0.12 0 0.01 0.22 0.76 0.01 Reverse Complement Motif 0.01 0.76 0.22 0.01 0 0.12 0.88 0 0.02 0.8 0.13 0.05 0 0.05 0.95 0 0.03 0.37 0.3 0.3 0.52 0.27 0.21 0 0 0 0.99 0.01 0 0.83 0.17 0 0 0.96 0.03 0.01 0.02 0.05 0.92 0.01 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 6 TFM2 Reverse Complement Original Motif Forward 11 6 2.5389 Original Motif 0.404762 0.047619 0.547619 0 0.238095 0.119048 0.642857 0 0.607143 0.0714286 0.321429 0 0.190476 0 0.797619 0.0119048 0.22619 0 0.738095 0.0357143 0.738095 0 0.238095 0.0238095 0.261905 0.142857 0.595238 0 0.345238 0.0714286 0.583333 0 0.547619 0 0.452381 0 0.0119048 0 0.988095 0 0.0119048 0.309524 0.678571 0 0.357143 0.261905 0.190476 0.190476 0.309524 0 0.690476 0 0.25 0.0952381 0.654762 0 0.309524 0.047619 0.392857 0.25 0.0357143 0.0952381 0.857143 0.0119048 Reverse Complement Motif 0.0357143 0.857143 0.0952381 0.0119048 0.309524 0.392857 0.047619 0.25 0.25 0.654762 0.0952381 0 0.309524 0.690476 0 0 0.190476 0.261905 0.190476 0.357143 0.0119048 0.678571 0.309524 0 0.0119048 0.988095 0 0 0 0 0.452381 0.547619 0.345238 0.583333 0.0714286 0 0.261905 0.595238 0.142857 0 0.0238095 0 0.238095 0.738095 0.22619 0.738095 0 0.0357143 0.190476 0.797619 0 0.0119048 0 0.0714286 0.321429 0.607143 0.238095 0.642857 0.119048 0 0.404762 0.547619 0.047619 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 4 TFF1 Original Motif Original Motif Forward 8 5 3 Original Motif 0.180952 0.533333 0.142857 0.142857 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.0190476 0.047619 0.914286 0.0190476 0.4 0.333333 0.219048 0.047619 0.0285714 0.047619 0.885714 0.0380952 0.0380952 0.895238 0.00952381 0.0571429 0.133333 0.733333 0.0666667 0.0666667 0.0380952 0.0380952 0.87619 0.047619 0.12381 0.752381 0.114286 0.00952381 0.314286 0.190476 0.390476 0.104762 0.12381 0.0285714 0.771429 0.0761905 0.0571429 0.904762 0.0285714 0.00952381 Reverse Complement Motif 0.0571429 0.0285714 0.904762 0.00952381 0.12381 0.771429 0.0285714 0.0761905 0.314286 0.390476 0.190476 0.104762 0.12381 0.114286 0.752381 0.00952381 0.0380952 0.87619 0.0380952 0.047619 0.133333 0.0666667 0.733333 0.0666667 0.0380952 0.00952381 0.895238 0.0571429 0.0285714 0.885714 0.047619 0.0380952 0.047619 0.333333 0.219048 0.4 0.0190476 0.914286 0.047619 0.0190476 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.180952 0.142857 0.533333 0.142857 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 16 Motif Name kcACCTGCAgc Original Motif 0.153846 0.230769 0.307692 0.307692 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0.153846 0.230769 0.461538 0.153846 0.153846 0.615385 0.153846 0.0769231 Reserve Complement Motif 0.153846 0.153846 0.615385 0.0769231 0.153846 0.461538 0.230769 0.153846 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0.153846 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 0.307692 0.230769 0.307692 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 16 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 wsTACwGTAsw Original Motif Reverse Complement Backward 1 11 0.0182895 Original Motif 0.277778 0.222222 0.166667 0.333333 0.166667 0.444444 0.277778 0.111111 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0.5 0 0 0.5 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0.111111 0.277778 0.444444 0.166667 0.333333 0.166667 0.222222 0.277778 Reverse Complement Motif 0.277778 0.166667 0.222222 0.333333 0.111111 0.444444 0.277778 0.166667 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0.5 0 0 0.5 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0.166667 0.277778 0.444444 0.111111 0.333333 0.222222 0.166667 0.277778 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 dhACATTCTkh Original Motif Original Motif Backward 1 11 0.0221745 Original Motif 0.333333 0 0.333333 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0.666667 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 Reverse Complement Motif 0.333333 0.333333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 1 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 sSGTCACGTGACSs Original Motif Original Motif Forward 4 11 0.0280991 Original Motif 0.0555556 0.388889 0.388889 0.166667 0 0.277778 0.722222 0 0.0555556 0.111111 0.833333 0 0.111111 0 0.0555556 0.833333 0 0.888889 0.111111 0 1 0 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.0555556 0.944444 0 0 0 0 1 0 0.111111 0.888889 0 0.833333 0.0555556 0 0.111111 0 0.833333 0.111111 0.0555556 0 0.722222 0.277778 0 0.166667 0.388889 0.388889 0.0555556 Reverse Complement Motif 0.166667 0.388889 0.388889 0.0555556 0 0.277778 0.722222 0 0 0.111111 0.833333 0.0555556 0.111111 0.0555556 0 0.833333 0 0.888889 0.111111 0 1 0 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.0555556 0.944444 0 0 0 0 1 0 0.111111 0.888889 0 0.833333 0 0.0555556 0.111111 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0 0.722222 0.277778 0 0.0555556 0.388889 0.388889 0.166667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 5 TFF11 Reverse Complement Original Motif Forward 1 11 0.0312321 Original Motif 0.0761905 0.0857143 0.819048 0.0190476 0.0761905 0.0666667 0.780952 0.0761905 0.438095 0.32381 0.180952 0.0571429 0.12381 0.180952 0.657143 0.0380952 0.0952381 0.0761905 0.790476 0.0380952 0.371429 0.104762 0.485714 0.0380952 0.0190476 0.0380952 0.914286 0.0285714 0.0190476 0.0952381 0.885714 0 0.0571429 0.866667 0.0666667 0.00952381 0.00952381 0.00952381 0.980952 0 0.047619 0.104762 0.838095 0.00952381 0.333333 0.161905 0.409524 0.0952381 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.114286 0.580952 0.266667 0.0380952 Reverse Complement Motif 0.114286 0.266667 0.580952 0.0380952 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.333333 0.409524 0.161905 0.0952381 0.047619 0.838095 0.104762 0.00952381 0.00952381 0.980952 0.00952381 0 0.0571429 0.0666667 0.866667 0.00952381 0.0190476 0.885714 0.0952381 0 0.0190476 0.914286 0.0380952 0.0285714 0.371429 0.485714 0.104762 0.0380952 0.0952381 0.790476 0.0761905 0.0380952 0.12381 0.657143 0.180952 0.0380952 0.0571429 0.32381 0.180952 0.438095 0.0761905 0.780952 0.0666667 0.0761905 0.0761905 0.819048 0.0857143 0.0190476 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 csGCCCCGCCCCsc Original Motif Original Motif Backward 3 11 0.0370129 Original Motif 0.179104 0.492537 0.164179 0.164179 0.223881 0.402985 0.283582 0.0895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0746269 0 0.895522 0.0895522 0.0149254 0 0.925373 0.0149254 0.0597015 0.0298507 0.970149 0 0 0 0.970149 0.0298507 0 0.0447761 0 0.940299 0.0149254 0 0.955224 0.0149254 0.0298507 0.0298507 0.955224 0.0149254 0 0.0298507 0.925373 0.0149254 0.0298507 0.119403 0.820896 0.0149254 0.0447761 0.104478 0.328358 0.373134 0.19403 0.179104 0.358209 0.223881 0.238806 Reverse Complement Motif 0.179104 0.223881 0.358209 0.238806 0.104478 0.373134 0.328358 0.19403 0.119403 0.0149254 0.820896 0.0447761 0.0298507 0.0149254 0.925373 0.0298507 0.0298507 0.0149254 0.955224 0 0 0.0149254 0.955224 0.0298507 0.0447761 0.940299 0 0.0149254 0 0.0298507 0.970149 0 0.0298507 0 0.970149 0 0 0.0149254 0.925373 0.0597015 0 0.0895522 0.895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0149254 0.0746269 0.223881 0.283582 0.402985 0.0895522 0.179104 0.164179 0.492537 0.164179 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 15 kCAGCCAATmr Reverse Complement Original Motif Backward 1 11 0.0407197 Original Motif 0.235294 0.176471 0.294118 0.294118 0.117647 0.705882 0.176471 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0.352941 0.352941 0.235294 0.0588235 0.352941 0.176471 0.411765 0.0588235 Reverse Complement Motif 0.352941 0.411765 0.176471 0.0588235 0.0588235 0.352941 0.235294 0.352941 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.117647 0.176471 0.705882 0 0.235294 0.294118 0.176471 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 14 cccGCCCCGCCCCsb Original Motif Original Motif Backward 3 11 0.0429055 Original Motif 0.148936 0.425532 0.234043 0.191489 0.106383 0.553191 0.170213 0.170213 0.106383 0.659574 0.148936 0.0851064 0.0425532 0 0.851064 0.106383 0 0.93617 0.0638298 0 0 0.87234 0.0425532 0.0851064 0 1 0 0 0 0.957447 0.0425532 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.0425532 0.93617 0.0212766 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0.0638298 0.914894 0.0212766 0 0.0638298 0.297872 0.404255 0.234043 0.148936 0.319149 0.255319 0.276596 Reverse Complement Motif 0.148936 0.255319 0.319149 0.276596 0.0638298 0.404255 0.297872 0.234043 0.0638298 0.0212766 0.914894 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0.0425532 0.0212766 0.93617 0 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0 0.0425532 0.957447 0 0 0 1 0 0 0.0425532 0.87234 0.0851064 0 0.0638298 0.93617 0 0.0425532 0.851064 0 0.106383 0.106383 0.148936 0.659574 0.0851064 0.106383 0.170213 0.553191 0.170213 0.148936 0.234043 0.425532 0.191489 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 TFM12 Reverse Complement Reverse Complement Backward 6 11 0.0444938 Original Motif 0 1 0 0 0.19 0.4 0 0.41 0 0.52 0.19 0.29 0.11 0.61 0.1 0.18 0.18 0.29 0.33 0.2 0 0.38 0.35 0.27 0 0.82 0 0.18 0.18 0.39 0 0.43 0 0.53 0 0.47 0 0.47 0.15 0.38 0 0.24 0.24 0.52 0 0.87 0 0.13 0.05 0.68 0 0.27 0.18 0.38 0.1 0.34 0 0.62 0.22 0.16 0 0.66 0.09 0.25 0.2 0.15 0.13 0.52 0.04 0.46 0.16 0.34 0.06 0.53 0.03 0.38 0.05 0.57 0.04 0.34 Reverse Complement Motif 0.05 0.04 0.57 0.34 0.06 0.03 0.53 0.38 0.04 0.16 0.46 0.34 0.52 0.15 0.13 0.2 0 0.09 0.66 0.25 0 0.22 0.62 0.16 0.18 0.1 0.38 0.34 0.05 0 0.68 0.27 0 0 0.87 0.13 0.52 0.24 0.24 0 0 0.15 0.47 0.38 0 0 0.53 0.47 0.43 0.39 0 0.18 0 0 0.82 0.18 0 0.35 0.38 0.27 0.18 0.33 0.29 0.2 0.11 0.1 0.61 0.18 0 0.19 0.52 0.29 0.41 0.4 0 0.19 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 6 TFM2 Reverse Complement Original Motif Backward 7 10 0.538471 Original Motif 0.404762 0.047619 0.547619 0 0.238095 0.119048 0.642857 0 0.607143 0.0714286 0.321429 0 0.190476 0 0.797619 0.0119048 0.22619 0 0.738095 0.0357143 0.738095 0 0.238095 0.0238095 0.261905 0.142857 0.595238 0 0.345238 0.0714286 0.583333 0 0.547619 0 0.452381 0 0.0119048 0 0.988095 0 0.0119048 0.309524 0.678571 0 0.357143 0.261905 0.190476 0.190476 0.309524 0 0.690476 0 0.25 0.0952381 0.654762 0 0.309524 0.047619 0.392857 0.25 0.0357143 0.0952381 0.857143 0.0119048 Reverse Complement Motif 0.0357143 0.857143 0.0952381 0.0119048 0.309524 0.392857 0.047619 0.25 0.25 0.654762 0.0952381 0 0.309524 0.690476 0 0 0.190476 0.261905 0.190476 0.357143 0.0119048 0.678571 0.309524 0 0.0119048 0.988095 0 0 0 0 0.452381 0.547619 0.345238 0.583333 0.0714286 0 0.261905 0.595238 0.142857 0 0.0238095 0 0.238095 0.738095 0.22619 0.738095 0 0.0357143 0.190476 0.797619 0 0.0119048 0 0.0714286 0.321429 0.607143 0.238095 0.642857 0.119048 0 0.404762 0.547619 0.047619 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 4 TFF1 Original Motif Reverse Complement Forward 5 8 1.54364 Original Motif 0.180952 0.533333 0.142857 0.142857 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.0190476 0.047619 0.914286 0.0190476 0.4 0.333333 0.219048 0.047619 0.0285714 0.047619 0.885714 0.0380952 0.0380952 0.895238 0.00952381 0.0571429 0.133333 0.733333 0.0666667 0.0666667 0.0380952 0.0380952 0.87619 0.047619 0.12381 0.752381 0.114286 0.00952381 0.314286 0.190476 0.390476 0.104762 0.12381 0.0285714 0.771429 0.0761905 0.0571429 0.904762 0.0285714 0.00952381 Reverse Complement Motif 0.0571429 0.0285714 0.904762 0.00952381 0.12381 0.771429 0.0285714 0.0761905 0.314286 0.390476 0.190476 0.104762 0.12381 0.114286 0.752381 0.00952381 0.0380952 0.87619 0.0380952 0.047619 0.133333 0.0666667 0.733333 0.0666667 0.0380952 0.00952381 0.895238 0.0571429 0.0285714 0.885714 0.047619 0.0380952 0.047619 0.333333 0.219048 0.4 0.0190476 0.914286 0.047619 0.0190476 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.180952 0.142857 0.533333 0.142857 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 17 Motif Name wwAAATAATAtw Original Motif 0.37037 0.166667 0.12963 0.333333 0.333333 0.166667 0.203704 0.296296 0.740741 0.0185185 0.0555556 0.185185 0.740741 0.0555556 0.037037 0.166667 0.888889 0.0185185 0.0185185 0.0740741 0.037037 0 0 0.962963 0.833333 0.037037 0.0185185 0.111111 0.796296 0.0185185 0.037037 0.148148 0.0740741 0.0555556 0.0185185 0.851852 0.925926 0.0555556 0.0185185 0 0.240741 0.166667 0.166667 0.425926 0.37037 0.12963 0.148148 0.351852 Reserve Complement Motif 0.351852 0.12963 0.148148 0.37037 0.425926 0.166667 0.166667 0.240741 0 0.0555556 0.0185185 0.925926 0.851852 0.0555556 0.0185185 0.0740741 0.148148 0.0185185 0.037037 0.796296 0.111111 0.037037 0.0185185 0.833333 0.962963 0 0 0.037037 0.0740741 0.0185185 0.0185185 0.888889 0.166667 0.0555556 0.037037 0.740741 0.185185 0.0185185 0.0555556 0.740741 0.296296 0.166667 0.203704 0.333333 0.333333 0.166667 0.12963 0.37037 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 17 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 13 tkAAATAATAtw Original Motif Original Motif Backward 1 12 0 Original Motif 0.233333 0.2 0.166667 0.4 0.233333 0.133333 0.266667 0.366667 0.733333 0.0333333 0.0333333 0.2 0.866667 0.0333333 0.0333333 0.0666667 0.833333 0 0.0333333 0.133333 0.166667 0 0 0.833333 0.866667 0.0666667 0 0.0666667 0.8 0.0333333 0.0333333 0.133333 0 0 0 1 0.966667 0.0333333 0 0 0.166667 0.2 0.133333 0.5 0.4 0.1 0.1 0.4 Reverse Complement Motif 0.4 0.1 0.1 0.4 0.5 0.2 0.133333 0.166667 0 0.0333333 0 0.966667 1 0 0 0 0.133333 0.0333333 0.0333333 0.8 0.0666667 0.0666667 0 0.866667 0.833333 0 0 0.166667 0.133333 0 0.0333333 0.833333 0.0666667 0.0333333 0.0333333 0.866667 0.2 0.0333333 0.0333333 0.733333 0.366667 0.133333 0.266667 0.233333 0.4 0.2 0.166667 0.233333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 7 TFM1 Original Motif Reverse Complement Backward 1 12 0.0565705 Original Motif 0.384615 0.0769231 0 0.538462 0.25641 0 0 0.74359 0.0769231 0.153846 0.333333 0.435897 0.230769 0 0 0.769231 0 0.25641 0 0.74359 0 0 0.0769231 0.923077 0.025641 0.0769231 0.25641 0.641026 0 0.128205 0.230769 0.641026 0.333333 0.230769 0.205128 0.230769 0.282051 0.179487 0 0.538462 0.0512821 0.128205 0 0.820513 0.128205 0 0 0.871795 0.25641 0.025641 0.179487 0.538462 0.102564 0 0 0.897436 0.128205 0 0.102564 0.769231 0.128205 0.025641 0.205128 0.641026 0.102564 0.333333 0.25641 0.307692 0.25641 0.102564 0 0.641026 Reverse Complement Motif 0.641026 0.102564 0 0.25641 0.102564 0.25641 0.333333 0.307692 0.641026 0.025641 0.205128 0.128205 0.769231 0 0.102564 0.128205 0.897436 0 0 0.102564 0.538462 0.025641 0.179487 0.25641 0.871795 0 0 0.128205 0.820513 0.128205 0 0.0512821 0.538462 0.179487 0 0.282051 0.230769 0.230769 0.205128 0.333333 0.641026 0.128205 0.230769 0 0.641026 0.0769231 0.25641 0.025641 0.923077 0 0.0769231 0 0.74359 0.25641 0 0 0.769231 0 0 0.230769 0.435897 0.153846 0.333333 0.0769231 0.74359 0 0 0.25641 0.538462 0.0769231 0 0.384615 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 TFM11 Original Motif Original Motif Forward 3 12 0.0575935 Original Motif 0.294118 0.235294 0.117647 0.352941 0.382353 0.205882 0.205882 0.205882 0.529412 0 0.117647 0.352941 0.235294 0.294118 0.323529 0.147059 1 0 0 0 0.941176 0 0 0.0588235 0.764706 0 0.0294118 0.205882 0.382353 0.235294 0.176471 0.205882 0.735294 0 0.0588235 0.205882 0.735294 0.0294118 0.117647 0.117647 0.676471 0 0.0882353 0.235294 0.529412 0.117647 0.205882 0.147059 0.705882 0.176471 0.117647 0 0.441176 0.352941 0.147059 0.0588235 0.941176 0.0588235 0 0 0.852941 0 0.147059 0 0.676471 0.0882353 0 0.235294 0.529412 0.323529 0.117647 0.0294118 0.470588 0.176471 0 0.352941 0.411765 0 0.147059 0.441176 0.5 0.0882353 0.147059 0.264706 0.294118 0.205882 0.0882353 0.411765 0.205882 0.235294 0.264706 0.294118 0.470588 0 0.117647 0.411765 0.617647 0.176471 0.205882 0 Reverse Complement Motif 0 0.176471 0.205882 0.617647 0.411765 0 0.117647 0.470588 0.294118 0.235294 0.264706 0.205882 0.411765 0.205882 0.0882353 0.294118 0.264706 0.0882353 0.147059 0.5 0.441176 0 0.147059 0.411765 0.352941 0.176471 0 0.470588 0.0294118 0.323529 0.117647 0.529412 0.235294 0.0882353 0 0.676471 0 0 0.147059 0.852941 0 0.0588235 0 0.941176 0.0588235 0.352941 0.147059 0.441176 0 0.176471 0.117647 0.705882 0.147059 0.117647 0.205882 0.529412 0.235294 0 0.0882353 0.676471 0.117647 0.0294118 0.117647 0.735294 0.205882 0 0.0588235 0.735294 0.205882 0.235294 0.176471 0.382353 0.205882 0 0.0294118 0.764706 0.0588235 0 0 0.941176 0 0 0 1 0.235294 0.323529 0.294118 0.147059 0.352941 0 0.117647 0.529412 0.205882 0.205882 0.205882 0.382353 0.352941 0.235294 0.117647 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 10 TFM13 Original Motif Reverse Complement Backward 9 12 0.0712963 Original Motif 0.666667 0.133333 0 0.2 0.0666667 0.2 0 0.733333 0.2 0 0.333333 0.466667 0.666667 0 0 0.333333 0.666667 0 0 0.333333 0.6 0 0 0.4 0.333333 0 0 0.666667 0 0.0666667 0 0.933333 0.133333 0.266667 0 0.6 0.266667 0 0 0.733333 0.466667 0 0.466667 0.0666667 0.6 0.333333 0 0.0666667 0.8 0.2 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.133333 0.2 0.2 0.466667 0.8 0 0.2 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 0.4 0.333333 0 0.266667 0.2 0 0 0.8 0.6 0 0 0.4 Reverse Complement Motif 0.4 0 0 0.6 0.8 0 0 0.2 0.266667 0.333333 0 0.4 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0 0 0.2 0.8 0.466667 0.2 0.2 0.133333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.2 0 0.8 0.0666667 0.333333 0 0.6 0.0666667 0 0.466667 0.466667 0.733333 0 0 0.266667 0.6 0.266667 0 0.133333 0.933333 0.0666667 0 0 0.666667 0 0 0.333333 0.4 0 0 0.6 0.333333 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.666667 0.466667 0 0.333333 0.2 0.733333 0.2 0 0.0666667 0.2 0.133333 0 0.666667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 8 TFM3 Original Motif Reverse Complement Forward 7 12 0.0733516 Original Motif 0.454545 0 0 0.545455 0.5 0 0 0.5 0.318182 0.181818 0.0909091 0.409091 0 0 0.136364 0.863636 0.318182 0 0 0.681818 0.0454545 0 0.272727 0.681818 0.272727 0.0454545 0.0909091 0.590909 0.272727 0.0909091 0 0.636364 0.0454545 0.818182 0 0.136364 0.727273 0 0 0.272727 0.0909091 0.318182 0.227273 0.363636 0.863636 0.0454545 0 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0909091 0 0.5 0.0909091 0.0909091 0.318182 0.136364 0.227273 0 0.636364 0.227273 0 0 0.772727 0.363636 0.0909091 0 0.545455 0.772727 0.181818 0.0454545 0 Reverse Complement Motif 0 0.181818 0.0454545 0.772727 0.545455 0.0909091 0 0.363636 0.772727 0 0 0.227273 0.636364 0.227273 0 0.136364 0.318182 0.0909091 0.0909091 0.5 0 0.0909091 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0454545 0 0.863636 0.363636 0.318182 0.227273 0.0909091 0.272727 0 0 0.727273 0.0454545 0 0.818182 0.136364 0.636364 0.0909091 0 0.272727 0.590909 0.0454545 0.0909091 0.272727 0.681818 0 0.272727 0.0454545 0.681818 0 0 0.318182 0.863636 0 0.136364 0 0.409091 0.181818 0.0909091 0.318182 0.5 0 0 0.5 0.545455 0 0 0.454545 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 wbgTAAATAww Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 11 0.560545 Original Motif 0.285714 0.142857 0.178571 0.392857 0.214286 0.285714 0.25 0.25 0.142857 0.0714286 0.678571 0.107143 0 0 0 1 0.928571 0 0.0357143 0.0357143 0.821429 0.107143 0.0357143 0.0357143 0.821429 0 0.178571 0 0 0.0714286 0 0.928571 0.928571 0.0357143 0.0357143 0 0.285714 0.214286 0.142857 0.357143 0.392857 0.178571 0.178571 0.25 Reverse Complement Motif 0.25 0.178571 0.178571 0.392857 0.357143 0.214286 0.142857 0.285714 0 0.0357143 0.0357143 0.928571 0.928571 0.0714286 0 0 0 0 0.178571 0.821429 0.0357143 0.107143 0.0357143 0.821429 0.0357143 0 0.0357143 0.928571 1 0 0 0 0.142857 0.678571 0.0714286 0.107143 0.214286 0.25 0.285714 0.25 0.392857 0.142857 0.178571 0.285714 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 dhACATTCTkh Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 11 0.583032 Original Motif 0.333333 0 0.333333 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0.666667 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 Reverse Complement Motif 0.333333 0.333333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 1 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 wsTACwGTAsw Original Motif Reverse Complement Backward 1 11 0.584715 Original Motif 0.277778 0.222222 0.166667 0.333333 0.166667 0.444444 0.277778 0.111111 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0.5 0 0 0.5 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0.111111 0.277778 0.444444 0.166667 0.333333 0.166667 0.222222 0.277778 Reverse Complement Motif 0.277778 0.166667 0.222222 0.333333 0.111111 0.444444 0.277778 0.166667 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0.5 0 0 0.5 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0.166667 0.277778 0.444444 0.111111 0.333333 0.222222 0.166667 0.277778 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 15 kCAGCCAATmr Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 11 0.59598 Original Motif 0.235294 0.176471 0.294118 0.294118 0.117647 0.705882 0.176471 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0.352941 0.352941 0.235294 0.0588235 0.352941 0.176471 0.411765 0.0588235 Reverse Complement Motif 0.352941 0.411765 0.176471 0.0588235 0.0588235 0.352941 0.235294 0.352941 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.117647 0.176471 0.705882 0 0.235294 0.294118 0.176471 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 TFM12 Reverse Complement Reverse Complement Backward 16 5 3.59569 Original Motif 0 1 0 0 0.19 0.4 0 0.41 0 0.52 0.19 0.29 0.11 0.61 0.1 0.18 0.18 0.29 0.33 0.2 0 0.38 0.35 0.27 0 0.82 0 0.18 0.18 0.39 0 0.43 0 0.53 0 0.47 0 0.47 0.15 0.38 0 0.24 0.24 0.52 0 0.87 0 0.13 0.05 0.68 0 0.27 0.18 0.38 0.1 0.34 0 0.62 0.22 0.16 0 0.66 0.09 0.25 0.2 0.15 0.13 0.52 0.04 0.46 0.16 0.34 0.06 0.53 0.03 0.38 0.05 0.57 0.04 0.34 Reverse Complement Motif 0.05 0.04 0.57 0.34 0.06 0.03 0.53 0.38 0.04 0.16 0.46 0.34 0.52 0.15 0.13 0.2 0 0.09 0.66 0.25 0 0.22 0.62 0.16 0.18 0.1 0.38 0.34 0.05 0 0.68 0.27 0 0 0.87 0.13 0.52 0.24 0.24 0 0 0.15 0.47 0.38 0 0 0.53 0.47 0.43 0.39 0 0.18 0 0 0.82 0.18 0 0.35 0.38 0.27 0.18 0.33 0.29 0.2 0.11 0.1 0.61 0.18 0 0.19 0.52 0.29 0.41 0.4 0 0.19 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 18 Motif Name sSGTCACGTGACSs Original Motif 0.0555556 0.388889 0.388889 0.166667 0 0.277778 0.722222 0 0.0555556 0.111111 0.833333 0 0.111111 0 0.0555556 0.833333 0 0.888889 0.111111 0 1 0 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.0555556 0.944444 0 0 0 0 1 0 0.111111 0.888889 0 0.833333 0.0555556 0 0.111111 0 0.833333 0.111111 0.0555556 0 0.722222 0.277778 0 0.166667 0.388889 0.388889 0.0555556 Reserve Complement Motif 0.166667 0.388889 0.388889 0.0555556 0 0.277778 0.722222 0 0 0.111111 0.833333 0.0555556 0.111111 0.0555556 0 0.833333 0 0.888889 0.111111 0 1 0 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.0555556 0.944444 0 0 0 0 1 0 0.111111 0.888889 0 0.833333 0 0.0555556 0.111111 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0 0.722222 0.277778 0 0.0555556 0.388889 0.388889 0.166667 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 18 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 csGCCCCGCCCCsc Original Motif Reverse Complement Forward 1 14 0.0539097 Original Motif 0.179104 0.492537 0.164179 0.164179 0.223881 0.402985 0.283582 0.0895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0746269 0 0.895522 0.0895522 0.0149254 0 0.925373 0.0149254 0.0597015 0.0298507 0.970149 0 0 0 0.970149 0.0298507 0 0.0447761 0 0.940299 0.0149254 0 0.955224 0.0149254 0.0298507 0.0298507 0.955224 0.0149254 0 0.0298507 0.925373 0.0149254 0.0298507 0.119403 0.820896 0.0149254 0.0447761 0.104478 0.328358 0.373134 0.19403 0.179104 0.358209 0.223881 0.238806 Reverse Complement Motif 0.179104 0.223881 0.358209 0.238806 0.104478 0.373134 0.328358 0.19403 0.119403 0.0149254 0.820896 0.0447761 0.0298507 0.0149254 0.925373 0.0298507 0.0298507 0.0149254 0.955224 0 0 0.0149254 0.955224 0.0298507 0.0447761 0.940299 0 0.0149254 0 0.0298507 0.970149 0 0.0298507 0 0.970149 0 0 0.0149254 0.925373 0.0597015 0 0.0895522 0.895522 0.0149254 0.0149254 0.895522 0.0149254 0.0746269 0.223881 0.283582 0.402985 0.0895522 0.179104 0.164179 0.492537 0.164179 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 14 cccGCCCCGCCCCsb Reverse Complement Original Motif Backward 2 14 0.0581955 Original Motif 0.148936 0.425532 0.234043 0.191489 0.106383 0.553191 0.170213 0.170213 0.106383 0.659574 0.148936 0.0851064 0.0425532 0 0.851064 0.106383 0 0.93617 0.0638298 0 0 0.87234 0.0425532 0.0851064 0 1 0 0 0 0.957447 0.0425532 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.0425532 0.93617 0.0212766 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0.0638298 0.914894 0.0212766 0 0.0638298 0.297872 0.404255 0.234043 0.148936 0.319149 0.255319 0.276596 Reverse Complement Motif 0.148936 0.255319 0.319149 0.276596 0.0638298 0.404255 0.297872 0.234043 0.0638298 0.0212766 0.914894 0 0.0212766 0.0212766 0.957447 0 0.0425532 0.0212766 0.93617 0 0 0.0212766 0.957447 0.0212766 0.0212766 0.957447 0.0212766 0 0 0.0425532 0.957447 0 0 0 1 0 0 0.0425532 0.87234 0.0851064 0 0.0638298 0.93617 0 0.0425532 0.851064 0 0.106383 0.106383 0.148936 0.659574 0.0851064 0.106383 0.170213 0.553191 0.170213 0.148936 0.234043 0.425532 0.191489 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 5 TFF11 Reverse Complement Reverse Complement Backward 3 12 1.05855 Original Motif 0.0761905 0.0857143 0.819048 0.0190476 0.0761905 0.0666667 0.780952 0.0761905 0.438095 0.32381 0.180952 0.0571429 0.12381 0.180952 0.657143 0.0380952 0.0952381 0.0761905 0.790476 0.0380952 0.371429 0.104762 0.485714 0.0380952 0.0190476 0.0380952 0.914286 0.0285714 0.0190476 0.0952381 0.885714 0 0.0571429 0.866667 0.0666667 0.00952381 0.00952381 0.00952381 0.980952 0 0.047619 0.104762 0.838095 0.00952381 0.333333 0.161905 0.409524 0.0952381 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.114286 0.580952 0.266667 0.0380952 Reverse Complement Motif 0.114286 0.266667 0.580952 0.0380952 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.333333 0.409524 0.161905 0.0952381 0.047619 0.838095 0.104762 0.00952381 0.00952381 0.980952 0.00952381 0 0.0571429 0.0666667 0.866667 0.00952381 0.0190476 0.885714 0.0952381 0 0.0190476 0.914286 0.0380952 0.0285714 0.371429 0.485714 0.104762 0.0380952 0.0952381 0.790476 0.0761905 0.0380952 0.12381 0.657143 0.180952 0.0380952 0.0571429 0.32381 0.180952 0.438095 0.0761905 0.780952 0.0666667 0.0761905 0.0761905 0.819048 0.0857143 0.0190476 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 4 TFF1 Reverse Complement Original Motif Backward 1 12 1.06047 Original Motif 0.180952 0.533333 0.142857 0.142857 0.0190476 0.00952381 0.952381 0.0190476 0.0190476 0.047619 0.914286 0.0190476 0.4 0.333333 0.219048 0.047619 0.0285714 0.047619 0.885714 0.0380952 0.0380952 0.895238 0.00952381 0.0571429 0.133333 0.733333 0.0666667 0.0666667 0.0380952 0.0380952 0.87619 0.047619 0.12381 0.752381 0.114286 0.00952381 0.314286 0.190476 0.390476 0.104762 0.12381 0.0285714 0.771429 0.0761905 0.0571429 0.904762 0.0285714 0.00952381 Reverse Complement Motif 0.0571429 0.0285714 0.904762 0.00952381 0.12381 0.771429 0.0285714 0.0761905 0.314286 0.390476 0.190476 0.104762 0.12381 0.114286 0.752381 0.00952381 0.0380952 0.87619 0.0380952 0.047619 0.133333 0.0666667 0.733333 0.0666667 0.0380952 0.00952381 0.895238 0.0571429 0.0285714 0.885714 0.047619 0.0380952 0.047619 0.333333 0.219048 0.4 0.0190476 0.914286 0.047619 0.0190476 0.0190476 0.952381 0.00952381 0.0190476 0.180952 0.142857 0.533333 0.142857 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 kcACCTGCAgc Original Motif Original Motif Backward 1 11 1.54742 Original Motif 0.153846 0.230769 0.307692 0.307692 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0.153846 0.230769 0.461538 0.153846 0.153846 0.615385 0.153846 0.0769231 Reverse Complement Motif 0.153846 0.153846 0.615385 0.0769231 0.153846 0.461538 0.230769 0.153846 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0.153846 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 0.307692 0.230769 0.307692 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 3 TFW3 Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 10 2.05201 Original Motif 0.02 0.92 0.05 0.01 0 0.03 0.96 0.01 0 0.17 0.83 0 0 0.99 0 0.01 0 0.27 0.21 0.52 0.03 0.3 0.37 0.3 0 0.95 0.05 0 0.02 0.13 0.8 0.05 0 0.88 0.12 0 0.01 0.22 0.76 0.01 Reverse Complement Motif 0.01 0.76 0.22 0.01 0 0.12 0.88 0 0.02 0.8 0.13 0.05 0 0.05 0.95 0 0.03 0.37 0.3 0.3 0.52 0.27 0.21 0 0 0 0.99 0.01 0 0.83 0.17 0 0 0.96 0.03 0.01 0.02 0.05 0.92 0.01 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 TFM12 Reverse Complement Original Motif Backward 14 7 3.55896 Original Motif 0 1 0 0 0.19 0.4 0 0.41 0 0.52 0.19 0.29 0.11 0.61 0.1 0.18 0.18 0.29 0.33 0.2 0 0.38 0.35 0.27 0 0.82 0 0.18 0.18 0.39 0 0.43 0 0.53 0 0.47 0 0.47 0.15 0.38 0 0.24 0.24 0.52 0 0.87 0 0.13 0.05 0.68 0 0.27 0.18 0.38 0.1 0.34 0 0.62 0.22 0.16 0 0.66 0.09 0.25 0.2 0.15 0.13 0.52 0.04 0.46 0.16 0.34 0.06 0.53 0.03 0.38 0.05 0.57 0.04 0.34 Reverse Complement Motif 0.05 0.04 0.57 0.34 0.06 0.03 0.53 0.38 0.04 0.16 0.46 0.34 0.52 0.15 0.13 0.2 0 0.09 0.66 0.25 0 0.22 0.62 0.16 0.18 0.1 0.38 0.34 0.05 0 0.68 0.27 0 0 0.87 0.13 0.52 0.24 0.24 0 0 0.15 0.47 0.38 0 0 0.53 0.47 0.43 0.39 0 0.18 0 0 0.82 0.18 0 0.35 0.38 0.27 0.18 0.33 0.29 0.2 0.11 0.1 0.61 0.18 0 0.19 0.52 0.29 0.41 0.4 0 0.19 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 1 TFW1 Original Motif Original Motif Backward 2 5 4.54286 Original Motif 0 0.082495 0.917505 0 0.0744467 0.217304 0.197183 0.511066 0 0.897384 0.102616 0 0.0503018 0.102616 0.847082 0 0 0.949698 0.0503018 0 0 0.0523139 0.947686 0 Reverse Complement Motif 0 0.947686 0.0523139 0 0 0.0503018 0.949698 0 0.0503018 0.847082 0.102616 0 0 0.102616 0.897384 0 0.511066 0.217304 0.197183 0.0744467 0 0.917505 0.082495 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 6 TFM2 Reverse Complement Reverse Complement Backward 12 5 4.549 Original Motif 0.404762 0.047619 0.547619 0 0.238095 0.119048 0.642857 0 0.607143 0.0714286 0.321429 0 0.190476 0 0.797619 0.0119048 0.22619 0 0.738095 0.0357143 0.738095 0 0.238095 0.0238095 0.261905 0.142857 0.595238 0 0.345238 0.0714286 0.583333 0 0.547619 0 0.452381 0 0.0119048 0 0.988095 0 0.0119048 0.309524 0.678571 0 0.357143 0.261905 0.190476 0.190476 0.309524 0 0.690476 0 0.25 0.0952381 0.654762 0 0.309524 0.047619 0.392857 0.25 0.0357143 0.0952381 0.857143 0.0119048 Reverse Complement Motif 0.0357143 0.857143 0.0952381 0.0119048 0.309524 0.392857 0.047619 0.25 0.25 0.654762 0.0952381 0 0.309524 0.690476 0 0 0.190476 0.261905 0.190476 0.357143 0.0119048 0.678571 0.309524 0 0.0119048 0.988095 0 0 0 0 0.452381 0.547619 0.345238 0.583333 0.0714286 0 0.261905 0.595238 0.142857 0 0.0238095 0 0.238095 0.738095 0.22619 0.738095 0 0.0357143 0.190476 0.797619 0 0.0119048 0 0.0714286 0.321429 0.607143 0.238095 0.642857 0.119048 0 0.404762 0.547619 0.047619 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 2 TFW2 Reverse Complement Original Motif Forward 5 4 5.06029 Original Motif 0.0058309 0.364431 0.41691 0.212828 0.0816327 0.816327 0.0991254 0.00291545 0.00291545 0.0670554 0.921283 0.00874636 0.0058309 0.883382 0.107872 0.00291545 0 0.0962099 0.860058 0.0437318 0.00291545 0.906706 0.0787172 0.0116618 0.0437318 0.0758017 0.825073 0.0553936 0 0.125364 0.87172 0.00291545 Reverse Complement Motif 0 0.87172 0.125364 0.00291545 0.0437318 0.825073 0.0758017 0.0553936 0.00291545 0.0787172 0.906706 0.0116618 0 0.860058 0.0962099 0.0437318 0.0058309 0.107872 0.883382 0.00291545 0.00291545 0.921283 0.0670554 0.00874636 0.0816327 0.0991254 0.816327 0.00291545 0.0058309 0.41691 0.364431 0.212828 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 19 Motif Name wsTACwGTAsw Original Motif 0.277778 0.222222 0.166667 0.333333 0.166667 0.444444 0.277778 0.111111 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0.5 0 0 0.5 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0.111111 0.277778 0.444444 0.166667 0.333333 0.166667 0.222222 0.277778 Reserve Complement Motif 0.277778 0.166667 0.222222 0.333333 0.111111 0.444444 0.277778 0.166667 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0.5 0 0 0.5 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0.166667 0.277778 0.444444 0.111111 0.333333 0.222222 0.166667 0.277778 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 19 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 kcACCTGCAgc Original Motif Reverse Complement Backward 1 11 0.0199592 Original Motif 0.153846 0.230769 0.307692 0.307692 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0.153846 0.230769 0.461538 0.153846 0.153846 0.615385 0.153846 0.0769231 Reverse Complement Motif 0.153846 0.153846 0.615385 0.0769231 0.153846 0.461538 0.230769 0.153846 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0.153846 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 0.307692 0.230769 0.307692 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 17 wwAAATAATAtw Original Motif Reverse Complement Backward 1 11 0.0309343 Original Motif 0.37037 0.166667 0.12963 0.333333 0.333333 0.166667 0.203704 0.296296 0.740741 0.0185185 0.0555556 0.185185 0.740741 0.0555556 0.037037 0.166667 0.888889 0.0185185 0.0185185 0.0740741 0.037037 0 0 0.962963 0.833333 0.037037 0.0185185 0.111111 0.796296 0.0185185 0.037037 0.148148 0.0740741 0.0555556 0.0185185 0.851852 0.925926 0.0555556 0.0185185 0 0.240741 0.166667 0.166667 0.425926 0.37037 0.12963 0.148148 0.351852 Reverse Complement Motif 0.351852 0.12963 0.148148 0.37037 0.425926 0.166667 0.166667 0.240741 0 0.0555556 0.0185185 0.925926 0.851852 0.0555556 0.0185185 0.0740741 0.148148 0.0185185 0.037037 0.796296 0.111111 0.037037 0.0185185 0.833333 0.962963 0 0 0.037037 0.0740741 0.0185185 0.0185185 0.888889 0.166667 0.0555556 0.037037 0.740741 0.185185 0.0185185 0.0555556 0.740741 0.296296 0.166667 0.203704 0.333333 0.333333 0.166667 0.12963 0.37037 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 13 tkAAATAATAtw Reverse Complement Original Motif Forward 1 11 0.0337121 Original Motif 0.233333 0.2 0.166667 0.4 0.233333 0.133333 0.266667 0.366667 0.733333 0.0333333 0.0333333 0.2 0.866667 0.0333333 0.0333333 0.0666667 0.833333 0 0.0333333 0.133333 0.166667 0 0 0.833333 0.866667 0.0666667 0 0.0666667 0.8 0.0333333 0.0333333 0.133333 0 0 0 1 0.966667 0.0333333 0 0 0.166667 0.2 0.133333 0.5 0.4 0.1 0.1 0.4 Reverse Complement Motif 0.4 0.1 0.1 0.4 0.5 0.2 0.133333 0.166667 0 0.0333333 0 0.966667 1 0 0 0 0.133333 0.0333333 0.0333333 0.8 0.0666667 0.0666667 0 0.866667 0.833333 0 0 0.166667 0.133333 0 0.0333333 0.833333 0.0666667 0.0333333 0.0333333 0.866667 0.2 0.0333333 0.0333333 0.733333 0.366667 0.133333 0.266667 0.233333 0.4 0.2 0.166667 0.233333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 wbgTAAATAww Reverse Complement Original Motif Forward 1 11 0.037518 Original Motif 0.285714 0.142857 0.178571 0.392857 0.214286 0.285714 0.25 0.25 0.142857 0.0714286 0.678571 0.107143 0 0 0 1 0.928571 0 0.0357143 0.0357143 0.821429 0.107143 0.0357143 0.0357143 0.821429 0 0.178571 0 0 0.0714286 0 0.928571 0.928571 0.0357143 0.0357143 0 0.285714 0.214286 0.142857 0.357143 0.392857 0.178571 0.178571 0.25 Reverse Complement Motif 0.25 0.178571 0.178571 0.392857 0.357143 0.214286 0.142857 0.285714 0 0.0357143 0.0357143 0.928571 0.928571 0.0714286 0 0 0 0 0.178571 0.821429 0.0357143 0.107143 0.0357143 0.821429 0.0357143 0 0.0357143 0.928571 1 0 0 0 0.142857 0.678571 0.0714286 0.107143 0.214286 0.25 0.285714 0.25 0.392857 0.142857 0.178571 0.285714 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 8 TFM3 Reverse Complement Original Motif Forward 4 11 0.0413797 Original Motif 0.454545 0 0 0.545455 0.5 0 0 0.5 0.318182 0.181818 0.0909091 0.409091 0 0 0.136364 0.863636 0.318182 0 0 0.681818 0.0454545 0 0.272727 0.681818 0.272727 0.0454545 0.0909091 0.590909 0.272727 0.0909091 0 0.636364 0.0454545 0.818182 0 0.136364 0.727273 0 0 0.272727 0.0909091 0.318182 0.227273 0.363636 0.863636 0.0454545 0 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0909091 0 0.5 0.0909091 0.0909091 0.318182 0.136364 0.227273 0 0.636364 0.227273 0 0 0.772727 0.363636 0.0909091 0 0.545455 0.772727 0.181818 0.0454545 0 Reverse Complement Motif 0 0.181818 0.0454545 0.772727 0.545455 0.0909091 0 0.363636 0.772727 0 0 0.227273 0.636364 0.227273 0 0.136364 0.318182 0.0909091 0.0909091 0.5 0 0.0909091 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0454545 0 0.863636 0.363636 0.318182 0.227273 0.0909091 0.272727 0 0 0.727273 0.0454545 0 0.818182 0.136364 0.636364 0.0909091 0 0.272727 0.590909 0.0454545 0.0909091 0.272727 0.681818 0 0.272727 0.0454545 0.681818 0 0 0.318182 0.863636 0 0.136364 0 0.409091 0.181818 0.0909091 0.318182 0.5 0 0 0.5 0.545455 0 0 0.454545 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 10 TFM13 Original Motif Reverse Complement Backward 3 11 0.0445707 Original Motif 0.666667 0.133333 0 0.2 0.0666667 0.2 0 0.733333 0.2 0 0.333333 0.466667 0.666667 0 0 0.333333 0.666667 0 0 0.333333 0.6 0 0 0.4 0.333333 0 0 0.666667 0 0.0666667 0 0.933333 0.133333 0.266667 0 0.6 0.266667 0 0 0.733333 0.466667 0 0.466667 0.0666667 0.6 0.333333 0 0.0666667 0.8 0.2 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.133333 0.2 0.2 0.466667 0.8 0 0.2 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 0.4 0.333333 0 0.266667 0.2 0 0 0.8 0.6 0 0 0.4 Reverse Complement Motif 0.4 0 0 0.6 0.8 0 0 0.2 0.266667 0.333333 0 0.4 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0 0 0.2 0.8 0.466667 0.2 0.2 0.133333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.2 0 0.8 0.0666667 0.333333 0 0.6 0.0666667 0 0.466667 0.466667 0.733333 0 0 0.266667 0.6 0.266667 0 0.133333 0.933333 0.0666667 0 0 0.666667 0 0 0.333333 0.4 0 0 0.6 0.333333 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.666667 0.466667 0 0.333333 0.2 0.733333 0.2 0 0.0666667 0.2 0.133333 0 0.666667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 TFM11 Reverse Complement Original Motif Forward 4 11 0.0472742 Original Motif 0.294118 0.235294 0.117647 0.352941 0.382353 0.205882 0.205882 0.205882 0.529412 0 0.117647 0.352941 0.235294 0.294118 0.323529 0.147059 1 0 0 0 0.941176 0 0 0.0588235 0.764706 0 0.0294118 0.205882 0.382353 0.235294 0.176471 0.205882 0.735294 0 0.0588235 0.205882 0.735294 0.0294118 0.117647 0.117647 0.676471 0 0.0882353 0.235294 0.529412 0.117647 0.205882 0.147059 0.705882 0.176471 0.117647 0 0.441176 0.352941 0.147059 0.0588235 0.941176 0.0588235 0 0 0.852941 0 0.147059 0 0.676471 0.0882353 0 0.235294 0.529412 0.323529 0.117647 0.0294118 0.470588 0.176471 0 0.352941 0.411765 0 0.147059 0.441176 0.5 0.0882353 0.147059 0.264706 0.294118 0.205882 0.0882353 0.411765 0.205882 0.235294 0.264706 0.294118 0.470588 0 0.117647 0.411765 0.617647 0.176471 0.205882 0 Reverse Complement Motif 0 0.176471 0.205882 0.617647 0.411765 0 0.117647 0.470588 0.294118 0.235294 0.264706 0.205882 0.411765 0.205882 0.0882353 0.294118 0.264706 0.0882353 0.147059 0.5 0.441176 0 0.147059 0.411765 0.352941 0.176471 0 0.470588 0.0294118 0.323529 0.117647 0.529412 0.235294 0.0882353 0 0.676471 0 0 0.147059 0.852941 0 0.0588235 0 0.941176 0.0588235 0.352941 0.147059 0.441176 0 0.176471 0.117647 0.705882 0.147059 0.117647 0.205882 0.529412 0.235294 0 0.0882353 0.676471 0.117647 0.0294118 0.117647 0.735294 0.205882 0 0.0588235 0.735294 0.205882 0.235294 0.176471 0.382353 0.205882 0 0.0294118 0.764706 0.0588235 0 0 0.941176 0 0 0 1 0.235294 0.323529 0.294118 0.147059 0.352941 0 0.117647 0.529412 0.205882 0.205882 0.205882 0.382353 0.352941 0.235294 0.117647 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 dhACATTCTkh Original Motif Reverse Complement Forward 2 10 0.544444 Original Motif 0.333333 0 0.333333 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0.666667 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 Reverse Complement Motif 0.333333 0.333333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 1 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 7 TFM1 Reverse Complement Original Motif Forward 10 9 1.04742 Original Motif 0.384615 0.0769231 0 0.538462 0.25641 0 0 0.74359 0.0769231 0.153846 0.333333 0.435897 0.230769 0 0 0.769231 0 0.25641 0 0.74359 0 0 0.0769231 0.923077 0.025641 0.0769231 0.25641 0.641026 0 0.128205 0.230769 0.641026 0.333333 0.230769 0.205128 0.230769 0.282051 0.179487 0 0.538462 0.0512821 0.128205 0 0.820513 0.128205 0 0 0.871795 0.25641 0.025641 0.179487 0.538462 0.102564 0 0 0.897436 0.128205 0 0.102564 0.769231 0.128205 0.025641 0.205128 0.641026 0.102564 0.333333 0.25641 0.307692 0.25641 0.102564 0 0.641026 Reverse Complement Motif 0.641026 0.102564 0 0.25641 0.102564 0.25641 0.333333 0.307692 0.641026 0.025641 0.205128 0.128205 0.769231 0 0.102564 0.128205 0.897436 0 0 0.102564 0.538462 0.025641 0.179487 0.25641 0.871795 0 0 0.128205 0.820513 0.128205 0 0.0512821 0.538462 0.179487 0 0.282051 0.230769 0.230769 0.205128 0.333333 0.641026 0.128205 0.230769 0 0.641026 0.0769231 0.25641 0.025641 0.923077 0 0.0769231 0 0.74359 0.25641 0 0 0.769231 0 0 0.230769 0.435897 0.153846 0.333333 0.0769231 0.74359 0 0 0.25641 0.538462 0.0769231 0 0.384615 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 TFM12 Reverse Complement Original Motif Backward 15 6 2.54736 Original Motif 0 1 0 0 0.19 0.4 0 0.41 0 0.52 0.19 0.29 0.11 0.61 0.1 0.18 0.18 0.29 0.33 0.2 0 0.38 0.35 0.27 0 0.82 0 0.18 0.18 0.39 0 0.43 0 0.53 0 0.47 0 0.47 0.15 0.38 0 0.24 0.24 0.52 0 0.87 0 0.13 0.05 0.68 0 0.27 0.18 0.38 0.1 0.34 0 0.62 0.22 0.16 0 0.66 0.09 0.25 0.2 0.15 0.13 0.52 0.04 0.46 0.16 0.34 0.06 0.53 0.03 0.38 0.05 0.57 0.04 0.34 Reverse Complement Motif 0.05 0.04 0.57 0.34 0.06 0.03 0.53 0.38 0.04 0.16 0.46 0.34 0.52 0.15 0.13 0.2 0 0.09 0.66 0.25 0 0.22 0.62 0.16 0.18 0.1 0.38 0.34 0.05 0 0.68 0.27 0 0 0.87 0.13 0.52 0.24 0.24 0 0 0.15 0.47 0.38 0 0 0.53 0.47 0.43 0.39 0 0.18 0 0 0.82 0.18 0 0.35 0.38 0.27 0.18 0.33 0.29 0.2 0.11 0.1 0.61 0.18 0 0.19 0.52 0.29 0.41 0.4 0 0.19 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 20 Motif Name dhACATTCTkh Original Motif 0.333333 0 0.333333 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0.666667 0.333333 0.333333 0.333333 0 0.333333 Reserve Complement Motif 0.333333 0.333333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 1 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 0 0.333333 0.333333 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 20 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 8 TFM3 Reverse Complement Original Motif Backward 8 11 0.00522383 Original Motif 0.454545 0 0 0.545455 0.5 0 0 0.5 0.318182 0.181818 0.0909091 0.409091 0 0 0.136364 0.863636 0.318182 0 0 0.681818 0.0454545 0 0.272727 0.681818 0.272727 0.0454545 0.0909091 0.590909 0.272727 0.0909091 0 0.636364 0.0454545 0.818182 0 0.136364 0.727273 0 0 0.272727 0.0909091 0.318182 0.227273 0.363636 0.863636 0.0454545 0 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0909091 0 0.5 0.0909091 0.0909091 0.318182 0.136364 0.227273 0 0.636364 0.227273 0 0 0.772727 0.363636 0.0909091 0 0.545455 0.772727 0.181818 0.0454545 0 Reverse Complement Motif 0 0.181818 0.0454545 0.772727 0.545455 0.0909091 0 0.363636 0.772727 0 0 0.227273 0.636364 0.227273 0 0.136364 0.318182 0.0909091 0.0909091 0.5 0 0.0909091 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0454545 0 0.863636 0.363636 0.318182 0.227273 0.0909091 0.272727 0 0 0.727273 0.0454545 0 0.818182 0.136364 0.636364 0.0909091 0 0.272727 0.590909 0.0454545 0.0909091 0.272727 0.681818 0 0.272727 0.0454545 0.681818 0 0 0.318182 0.863636 0 0.136364 0 0.409091 0.181818 0.0909091 0.318182 0.5 0 0 0.5 0.545455 0 0 0.454545 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 kcACCTGCAgc Original Motif Original Motif Backward 1 11 0.00731643 Original Motif 0.153846 0.230769 0.307692 0.307692 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0.153846 0.230769 0.461538 0.153846 0.153846 0.615385 0.153846 0.0769231 Reverse Complement Motif 0.153846 0.153846 0.615385 0.0769231 0.153846 0.461538 0.230769 0.153846 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0.153846 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 0.307692 0.230769 0.307692 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 17 wwAAATAATAtw Reverse Complement Reverse Complement Forward 2 11 0.0127231 Original Motif 0.37037 0.166667 0.12963 0.333333 0.333333 0.166667 0.203704 0.296296 0.740741 0.0185185 0.0555556 0.185185 0.740741 0.0555556 0.037037 0.166667 0.888889 0.0185185 0.0185185 0.0740741 0.037037 0 0 0.962963 0.833333 0.037037 0.0185185 0.111111 0.796296 0.0185185 0.037037 0.148148 0.0740741 0.0555556 0.0185185 0.851852 0.925926 0.0555556 0.0185185 0 0.240741 0.166667 0.166667 0.425926 0.37037 0.12963 0.148148 0.351852 Reverse Complement Motif 0.351852 0.12963 0.148148 0.37037 0.425926 0.166667 0.166667 0.240741 0 0.0555556 0.0185185 0.925926 0.851852 0.0555556 0.0185185 0.0740741 0.148148 0.0185185 0.037037 0.796296 0.111111 0.037037 0.0185185 0.833333 0.962963 0 0 0.037037 0.0740741 0.0185185 0.0185185 0.888889 0.166667 0.0555556 0.037037 0.740741 0.185185 0.0185185 0.0555556 0.740741 0.296296 0.166667 0.203704 0.333333 0.333333 0.166667 0.12963 0.37037 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 TFM11 Reverse Complement Original Motif Forward 5 11 0.014258 Original Motif 0.294118 0.235294 0.117647 0.352941 0.382353 0.205882 0.205882 0.205882 0.529412 0 0.117647 0.352941 0.235294 0.294118 0.323529 0.147059 1 0 0 0 0.941176 0 0 0.0588235 0.764706 0 0.0294118 0.205882 0.382353 0.235294 0.176471 0.205882 0.735294 0 0.0588235 0.205882 0.735294 0.0294118 0.117647 0.117647 0.676471 0 0.0882353 0.235294 0.529412 0.117647 0.205882 0.147059 0.705882 0.176471 0.117647 0 0.441176 0.352941 0.147059 0.0588235 0.941176 0.0588235 0 0 0.852941 0 0.147059 0 0.676471 0.0882353 0 0.235294 0.529412 0.323529 0.117647 0.0294118 0.470588 0.176471 0 0.352941 0.411765 0 0.147059 0.441176 0.5 0.0882353 0.147059 0.264706 0.294118 0.205882 0.0882353 0.411765 0.205882 0.235294 0.264706 0.294118 0.470588 0 0.117647 0.411765 0.617647 0.176471 0.205882 0 Reverse Complement Motif 0 0.176471 0.205882 0.617647 0.411765 0 0.117647 0.470588 0.294118 0.235294 0.264706 0.205882 0.411765 0.205882 0.0882353 0.294118 0.264706 0.0882353 0.147059 0.5 0.441176 0 0.147059 0.411765 0.352941 0.176471 0 0.470588 0.0294118 0.323529 0.117647 0.529412 0.235294 0.0882353 0 0.676471 0 0 0.147059 0.852941 0 0.0588235 0 0.941176 0.0588235 0.352941 0.147059 0.441176 0 0.176471 0.117647 0.705882 0.147059 0.117647 0.205882 0.529412 0.235294 0 0.0882353 0.676471 0.117647 0.0294118 0.117647 0.735294 0.205882 0 0.0588235 0.735294 0.205882 0.235294 0.176471 0.382353 0.205882 0 0.0294118 0.764706 0.0588235 0 0 0.941176 0 0 0 1 0.235294 0.323529 0.294118 0.147059 0.352941 0 0.117647 0.529412 0.205882 0.205882 0.205882 0.382353 0.352941 0.235294 0.117647 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 10 TFM13 Original Motif Original Motif Forward 2 11 0.0192045 Original Motif 0.666667 0.133333 0 0.2 0.0666667 0.2 0 0.733333 0.2 0 0.333333 0.466667 0.666667 0 0 0.333333 0.666667 0 0 0.333333 0.6 0 0 0.4 0.333333 0 0 0.666667 0 0.0666667 0 0.933333 0.133333 0.266667 0 0.6 0.266667 0 0 0.733333 0.466667 0 0.466667 0.0666667 0.6 0.333333 0 0.0666667 0.8 0.2 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.133333 0.2 0.2 0.466667 0.8 0 0.2 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 0.4 0.333333 0 0.266667 0.2 0 0 0.8 0.6 0 0 0.4 Reverse Complement Motif 0.4 0 0 0.6 0.8 0 0 0.2 0.266667 0.333333 0 0.4 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0 0 0.2 0.8 0.466667 0.2 0.2 0.133333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.2 0 0.8 0.0666667 0.333333 0 0.6 0.0666667 0 0.466667 0.466667 0.733333 0 0 0.266667 0.6 0.266667 0 0.133333 0.933333 0.0666667 0 0 0.666667 0 0 0.333333 0.4 0 0 0.6 0.333333 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.666667 0.466667 0 0.333333 0.2 0.733333 0.2 0 0.0666667 0.2 0.133333 0 0.666667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 13 tkAAATAATAtw Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 11 0.0199621 Original Motif 0.233333 0.2 0.166667 0.4 0.233333 0.133333 0.266667 0.366667 0.733333 0.0333333 0.0333333 0.2 0.866667 0.0333333 0.0333333 0.0666667 0.833333 0 0.0333333 0.133333 0.166667 0 0 0.833333 0.866667 0.0666667 0 0.0666667 0.8 0.0333333 0.0333333 0.133333 0 0 0 1 0.966667 0.0333333 0 0 0.166667 0.2 0.133333 0.5 0.4 0.1 0.1 0.4 Reverse Complement Motif 0.4 0.1 0.1 0.4 0.5 0.2 0.133333 0.166667 0 0.0333333 0 0.966667 1 0 0 0 0.133333 0.0333333 0.0333333 0.8 0.0666667 0.0666667 0 0.866667 0.833333 0 0 0.166667 0.133333 0 0.0333333 0.833333 0.0666667 0.0333333 0.0333333 0.866667 0.2 0.0333333 0.0333333 0.733333 0.366667 0.133333 0.266667 0.233333 0.4 0.2 0.166667 0.233333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 15 kCAGCCAATmr Original Motif Reverse Complement Forward 1 11 0.0247304 Original Motif 0.235294 0.176471 0.294118 0.294118 0.117647 0.705882 0.176471 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0.352941 0.352941 0.235294 0.0588235 0.352941 0.176471 0.411765 0.0588235 Reverse Complement Motif 0.352941 0.411765 0.176471 0.0588235 0.0588235 0.352941 0.235294 0.352941 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.117647 0.176471 0.705882 0 0.235294 0.294118 0.176471 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 7 TFM1 Reverse Complement Reverse Complement Forward 9 10 0.519904 Original Motif 0.384615 0.0769231 0 0.538462 0.25641 0 0 0.74359 0.0769231 0.153846 0.333333 0.435897 0.230769 0 0 0.769231 0 0.25641 0 0.74359 0 0 0.0769231 0.923077 0.025641 0.0769231 0.25641 0.641026 0 0.128205 0.230769 0.641026 0.333333 0.230769 0.205128 0.230769 0.282051 0.179487 0 0.538462 0.0512821 0.128205 0 0.820513 0.128205 0 0 0.871795 0.25641 0.025641 0.179487 0.538462 0.102564 0 0 0.897436 0.128205 0 0.102564 0.769231 0.128205 0.025641 0.205128 0.641026 0.102564 0.333333 0.25641 0.307692 0.25641 0.102564 0 0.641026 Reverse Complement Motif 0.641026 0.102564 0 0.25641 0.102564 0.25641 0.333333 0.307692 0.641026 0.025641 0.205128 0.128205 0.769231 0 0.102564 0.128205 0.897436 0 0 0.102564 0.538462 0.025641 0.179487 0.25641 0.871795 0 0 0.128205 0.820513 0.128205 0 0.0512821 0.538462 0.179487 0 0.282051 0.230769 0.230769 0.205128 0.333333 0.641026 0.128205 0.230769 0 0.641026 0.0769231 0.25641 0.025641 0.923077 0 0.0769231 0 0.74359 0.25641 0 0 0.769231 0 0 0.230769 0.435897 0.153846 0.333333 0.0769231 0.74359 0 0 0.25641 0.538462 0.0769231 0 0.384615 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 wsTACwGTAsw Original Motif Reverse Complement Backward 2 10 0.527917 Original Motif 0.277778 0.222222 0.166667 0.333333 0.166667 0.444444 0.277778 0.111111 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0.5 0 0 0.5 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0.111111 0.277778 0.444444 0.166667 0.333333 0.166667 0.222222 0.277778 Reverse Complement Motif 0.277778 0.166667 0.222222 0.333333 0.111111 0.444444 0.277778 0.166667 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0.5 0 0 0.5 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0.166667 0.277778 0.444444 0.111111 0.333333 0.222222 0.166667 0.277778 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 TFM12 Original Motif Original Motif Backward 17 4 3.5 Original Motif 0 1 0 0 0.19 0.4 0 0.41 0 0.52 0.19 0.29 0.11 0.61 0.1 0.18 0.18 0.29 0.33 0.2 0 0.38 0.35 0.27 0 0.82 0 0.18 0.18 0.39 0 0.43 0 0.53 0 0.47 0 0.47 0.15 0.38 0 0.24 0.24 0.52 0 0.87 0 0.13 0.05 0.68 0 0.27 0.18 0.38 0.1 0.34 0 0.62 0.22 0.16 0 0.66 0.09 0.25 0.2 0.15 0.13 0.52 0.04 0.46 0.16 0.34 0.06 0.53 0.03 0.38 0.05 0.57 0.04 0.34 Reverse Complement Motif 0.05 0.04 0.57 0.34 0.06 0.03 0.53 0.38 0.04 0.16 0.46 0.34 0.52 0.15 0.13 0.2 0 0.09 0.66 0.25 0 0.22 0.62 0.16 0.18 0.1 0.38 0.34 0.05 0 0.68 0.27 0 0 0.87 0.13 0.52 0.24 0.24 0 0 0.15 0.47 0.38 0 0 0.53 0.47 0.43 0.39 0 0.18 0 0 0.82 0.18 0 0.35 0.38 0.27 0.18 0.33 0.29 0.2 0.11 0.1 0.61 0.18 0 0.19 0.52 0.29 0.41 0.4 0 0.19 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 21 Motif Name wbgTAAATAww Original Motif 0.285714 0.142857 0.178571 0.392857 0.214286 0.285714 0.25 0.25 0.142857 0.0714286 0.678571 0.107143 0 0 0 1 0.928571 0 0.0357143 0.0357143 0.821429 0.107143 0.0357143 0.0357143 0.821429 0 0.178571 0 0 0.0714286 0 0.928571 0.928571 0.0357143 0.0357143 0 0.285714 0.214286 0.142857 0.357143 0.392857 0.178571 0.178571 0.25 Reserve Complement Motif 0.25 0.178571 0.178571 0.392857 0.357143 0.214286 0.142857 0.285714 0 0.0357143 0.0357143 0.928571 0.928571 0.0714286 0 0 0 0 0.178571 0.821429 0.0357143 0.107143 0.0357143 0.821429 0.0357143 0 0.0357143 0.928571 1 0 0 0 0.142857 0.678571 0.0714286 0.107143 0.214286 0.25 0.285714 0.25 0.392857 0.142857 0.178571 0.285714 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 21 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 13 tkAAATAATAtw Original Motif Original Motif Forward 2 11 0.0162338 Original Motif 0.233333 0.2 0.166667 0.4 0.233333 0.133333 0.266667 0.366667 0.733333 0.0333333 0.0333333 0.2 0.866667 0.0333333 0.0333333 0.0666667 0.833333 0 0.0333333 0.133333 0.166667 0 0 0.833333 0.866667 0.0666667 0 0.0666667 0.8 0.0333333 0.0333333 0.133333 0 0 0 1 0.966667 0.0333333 0 0 0.166667 0.2 0.133333 0.5 0.4 0.1 0.1 0.4 Reverse Complement Motif 0.4 0.1 0.1 0.4 0.5 0.2 0.133333 0.166667 0 0.0333333 0 0.966667 1 0 0 0 0.133333 0.0333333 0.0333333 0.8 0.0666667 0.0666667 0 0.866667 0.833333 0 0 0.166667 0.133333 0 0.0333333 0.833333 0.0666667 0.0333333 0.0333333 0.866667 0.2 0.0333333 0.0333333 0.733333 0.366667 0.133333 0.266667 0.233333 0.4 0.2 0.166667 0.233333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 17 wwAAATAATAtw Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 11 0.0164863 Original Motif 0.37037 0.166667 0.12963 0.333333 0.333333 0.166667 0.203704 0.296296 0.740741 0.0185185 0.0555556 0.185185 0.740741 0.0555556 0.037037 0.166667 0.888889 0.0185185 0.0185185 0.0740741 0.037037 0 0 0.962963 0.833333 0.037037 0.0185185 0.111111 0.796296 0.0185185 0.037037 0.148148 0.0740741 0.0555556 0.0185185 0.851852 0.925926 0.0555556 0.0185185 0 0.240741 0.166667 0.166667 0.425926 0.37037 0.12963 0.148148 0.351852 Reverse Complement Motif 0.351852 0.12963 0.148148 0.37037 0.425926 0.166667 0.166667 0.240741 0 0.0555556 0.0185185 0.925926 0.851852 0.0555556 0.0185185 0.0740741 0.148148 0.0185185 0.037037 0.796296 0.111111 0.037037 0.0185185 0.833333 0.962963 0 0 0.037037 0.0740741 0.0185185 0.0185185 0.888889 0.166667 0.0555556 0.037037 0.740741 0.185185 0.0185185 0.0555556 0.740741 0.296296 0.166667 0.203704 0.333333 0.333333 0.166667 0.12963 0.37037 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 TFM11 Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 11 0.0192768 Original Motif 0.294118 0.235294 0.117647 0.352941 0.382353 0.205882 0.205882 0.205882 0.529412 0 0.117647 0.352941 0.235294 0.294118 0.323529 0.147059 1 0 0 0 0.941176 0 0 0.0588235 0.764706 0 0.0294118 0.205882 0.382353 0.235294 0.176471 0.205882 0.735294 0 0.0588235 0.205882 0.735294 0.0294118 0.117647 0.117647 0.676471 0 0.0882353 0.235294 0.529412 0.117647 0.205882 0.147059 0.705882 0.176471 0.117647 0 0.441176 0.352941 0.147059 0.0588235 0.941176 0.0588235 0 0 0.852941 0 0.147059 0 0.676471 0.0882353 0 0.235294 0.529412 0.323529 0.117647 0.0294118 0.470588 0.176471 0 0.352941 0.411765 0 0.147059 0.441176 0.5 0.0882353 0.147059 0.264706 0.294118 0.205882 0.0882353 0.411765 0.205882 0.235294 0.264706 0.294118 0.470588 0 0.117647 0.411765 0.617647 0.176471 0.205882 0 Reverse Complement Motif 0 0.176471 0.205882 0.617647 0.411765 0 0.117647 0.470588 0.294118 0.235294 0.264706 0.205882 0.411765 0.205882 0.0882353 0.294118 0.264706 0.0882353 0.147059 0.5 0.441176 0 0.147059 0.411765 0.352941 0.176471 0 0.470588 0.0294118 0.323529 0.117647 0.529412 0.235294 0.0882353 0 0.676471 0 0 0.147059 0.852941 0 0.0588235 0 0.941176 0.0588235 0.352941 0.147059 0.441176 0 0.176471 0.117647 0.705882 0.147059 0.117647 0.205882 0.529412 0.235294 0 0.0882353 0.676471 0.117647 0.0294118 0.117647 0.735294 0.205882 0 0.0588235 0.735294 0.205882 0.235294 0.176471 0.382353 0.205882 0 0.0294118 0.764706 0.0588235 0 0 0.941176 0 0 0 1 0.235294 0.323529 0.294118 0.147059 0.352941 0 0.117647 0.529412 0.205882 0.205882 0.205882 0.382353 0.352941 0.235294 0.117647 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 7 TFM1 Reverse Complement Original Motif Forward 1 11 0.0283217 Original Motif 0.384615 0.0769231 0 0.538462 0.25641 0 0 0.74359 0.0769231 0.153846 0.333333 0.435897 0.230769 0 0 0.769231 0 0.25641 0 0.74359 0 0 0.0769231 0.923077 0.025641 0.0769231 0.25641 0.641026 0 0.128205 0.230769 0.641026 0.333333 0.230769 0.205128 0.230769 0.282051 0.179487 0 0.538462 0.0512821 0.128205 0 0.820513 0.128205 0 0 0.871795 0.25641 0.025641 0.179487 0.538462 0.102564 0 0 0.897436 0.128205 0 0.102564 0.769231 0.128205 0.025641 0.205128 0.641026 0.102564 0.333333 0.25641 0.307692 0.25641 0.102564 0 0.641026 Reverse Complement Motif 0.641026 0.102564 0 0.25641 0.102564 0.25641 0.333333 0.307692 0.641026 0.025641 0.205128 0.128205 0.769231 0 0.102564 0.128205 0.897436 0 0 0.102564 0.538462 0.025641 0.179487 0.25641 0.871795 0 0 0.128205 0.820513 0.128205 0 0.0512821 0.538462 0.179487 0 0.282051 0.230769 0.230769 0.205128 0.333333 0.641026 0.128205 0.230769 0 0.641026 0.0769231 0.25641 0.025641 0.923077 0 0.0769231 0 0.74359 0.25641 0 0 0.769231 0 0 0.230769 0.435897 0.153846 0.333333 0.0769231 0.74359 0 0 0.25641 0.538462 0.0769231 0 0.384615 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 8 TFM3 Reverse Complement Original Motif Backward 2 11 0.0308097 Original Motif 0.454545 0 0 0.545455 0.5 0 0 0.5 0.318182 0.181818 0.0909091 0.409091 0 0 0.136364 0.863636 0.318182 0 0 0.681818 0.0454545 0 0.272727 0.681818 0.272727 0.0454545 0.0909091 0.590909 0.272727 0.0909091 0 0.636364 0.0454545 0.818182 0 0.136364 0.727273 0 0 0.272727 0.0909091 0.318182 0.227273 0.363636 0.863636 0.0454545 0 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0909091 0 0.5 0.0909091 0.0909091 0.318182 0.136364 0.227273 0 0.636364 0.227273 0 0 0.772727 0.363636 0.0909091 0 0.545455 0.772727 0.181818 0.0454545 0 Reverse Complement Motif 0 0.181818 0.0454545 0.772727 0.545455 0.0909091 0 0.363636 0.772727 0 0 0.227273 0.636364 0.227273 0 0.136364 0.318182 0.0909091 0.0909091 0.5 0 0.0909091 0.0909091 0.818182 0.0909091 0.0454545 0 0.863636 0.363636 0.318182 0.227273 0.0909091 0.272727 0 0 0.727273 0.0454545 0 0.818182 0.136364 0.636364 0.0909091 0 0.272727 0.590909 0.0454545 0.0909091 0.272727 0.681818 0 0.272727 0.0454545 0.681818 0 0 0.318182 0.863636 0 0.136364 0 0.409091 0.181818 0.0909091 0.318182 0.5 0 0 0.5 0.545455 0 0 0.454545 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 10 TFM13 Original Motif Original Motif Forward 8 11 0.0333874 Original Motif 0.666667 0.133333 0 0.2 0.0666667 0.2 0 0.733333 0.2 0 0.333333 0.466667 0.666667 0 0 0.333333 0.666667 0 0 0.333333 0.6 0 0 0.4 0.333333 0 0 0.666667 0 0.0666667 0 0.933333 0.133333 0.266667 0 0.6 0.266667 0 0 0.733333 0.466667 0 0.466667 0.0666667 0.6 0.333333 0 0.0666667 0.8 0.2 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.133333 0.2 0.2 0.466667 0.8 0 0.2 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 0.4 0.333333 0 0.266667 0.2 0 0 0.8 0.6 0 0 0.4 Reverse Complement Motif 0.4 0 0 0.6 0.8 0 0 0.2 0.266667 0.333333 0 0.4 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0 0 0.2 0.8 0.466667 0.2 0.2 0.133333 0 0.333333 0 0.666667 0 0.2 0 0.8 0.0666667 0.333333 0 0.6 0.0666667 0 0.466667 0.466667 0.733333 0 0 0.266667 0.6 0.266667 0 0.133333 0.933333 0.0666667 0 0 0.666667 0 0 0.333333 0.4 0 0 0.6 0.333333 0 0 0.666667 0.333333 0 0 0.666667 0.466667 0 0.333333 0.2 0.733333 0.2 0 0.0666667 0.2 0.133333 0 0.666667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 wsTACwGTAsw Reverse Complement Original Motif Backward 1 11 0.0472403 Original Motif 0.277778 0.222222 0.166667 0.333333 0.166667 0.444444 0.277778 0.111111 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0.5 0 0 0.5 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0.111111 0.277778 0.444444 0.166667 0.333333 0.166667 0.222222 0.277778 Reverse Complement Motif 0.277778 0.166667 0.222222 0.333333 0.111111 0.444444 0.277778 0.166667 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 0 0 0.5 0 0 0.5 0 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0.166667 0.277778 0.444444 0.111111 0.333333 0.222222 0.166667 0.277778 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 15 kCAGCCAATmr Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 10 0.554132 Original Motif 0.235294 0.176471 0.294118 0.294118 0.117647 0.705882 0.176471 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0.352941 0.352941 0.235294 0.0588235 0.352941 0.176471 0.411765 0.0588235 Reverse Complement Motif 0.352941 0.411765 0.176471 0.0588235 0.0588235 0.352941 0.235294 0.352941 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.117647 0.176471 0.705882 0 0.235294 0.294118 0.176471 0.294118 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 TFM12 Reverse Complement Reverse Complement Backward 14 7 2.0544 Original Motif 0 1 0 0 0.19 0.4 0 0.41 0 0.52 0.19 0.29 0.11 0.61 0.1 0.18 0.18 0.29 0.33 0.2 0 0.38 0.35 0.27 0 0.82 0 0.18 0.18 0.39 0 0.43 0 0.53 0 0.47 0 0.47 0.15 0.38 0 0.24 0.24 0.52 0 0.87 0 0.13 0.05 0.68 0 0.27 0.18 0.38 0.1 0.34 0 0.62 0.22 0.16 0 0.66 0.09 0.25 0.2 0.15 0.13 0.52 0.04 0.46 0.16 0.34 0.06 0.53 0.03 0.38 0.05 0.57 0.04 0.34 Reverse Complement Motif 0.05 0.04 0.57 0.34 0.06 0.03 0.53 0.38 0.04 0.16 0.46 0.34 0.52 0.15 0.13 0.2 0 0.09 0.66 0.25 0 0.22 0.62 0.16 0.18 0.1 0.38 0.34 0.05 0 0.68 0.27 0 0 0.87 0.13 0.52 0.24 0.24 0 0 0.15 0.47 0.38 0 0 0.53 0.47 0.43 0.39 0 0.18 0 0 0.82 0.18 0 0.35 0.38 0.27 0.18 0.33 0.29 0.2 0.11 0.1 0.61 0.18 0 0.19 0.52 0.29 0.41 0.4 0 0.19 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 6 TFM2 Reverse Complement Reverse Complement Backward 12 5 3.05714 Original Motif 0.404762 0.047619 0.547619 0 0.238095 0.119048 0.642857 0 0.607143 0.0714286 0.321429 0 0.190476 0 0.797619 0.0119048 0.22619 0 0.738095 0.0357143 0.738095 0 0.238095 0.0238095 0.261905 0.142857 0.595238 0 0.345238 0.0714286 0.583333 0 0.547619 0 0.452381 0 0.0119048 0 0.988095 0 0.0119048 0.309524 0.678571 0 0.357143 0.261905 0.190476 0.190476 0.309524 0 0.690476 0 0.25 0.0952381 0.654762 0 0.309524 0.047619 0.392857 0.25 0.0357143 0.0952381 0.857143 0.0119048 Reverse Complement Motif 0.0357143 0.857143 0.0952381 0.0119048 0.309524 0.392857 0.047619 0.25 0.25 0.654762 0.0952381 0 0.309524 0.690476 0 0 0.190476 0.261905 0.190476 0.357143 0.0119048 0.678571 0.309524 0 0.0119048 0.988095 0 0 0 0 0.452381 0.547619 0.345238 0.583333 0.0714286 0 0.261905 0.595238 0.142857 0 0.0238095 0 0.238095 0.738095 0.22619 0.738095 0 0.0357143 0.190476 0.797619 0 0.0119048 0 0.0714286 0.321429 0.607143 0.238095 0.642857 0.119048 0 0.404762 0.547619 0.047619 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Results created by MOTIFSIM on 01-01-2015 16:56:34 Runtime: 1.31913 seconds. MOTIFSIM is written by Ngoc Tam L. Tran.