**************************************************************************************************************************************************************************************************** MOTIFSIM - Motif Similarity Detection Tool Version 1.0 **************************************************************************************************************************************************************************************************** Please, consult user manual for using this tool. **************************************************************************************************************************************************************************************************** INPUT **************************************************************************************************************************************************************************************************** Number of files: 2 Number of best matches: 10 Similarity cutoff: >= 0.75 Number of threads: 1 Input Files and Motif Counts File Name File Type Count of Motifs Dataset # MEME-CHIP_DM721.txt MEME output 11 1 PScanChIP_DM721.txt Jaspar 37 2 **************************************************************************************************************************************************************************************************** RESULTS **************************************************************************************************************************************************************************************************** ****************************************************************** Top 10 Significant Motifs - Global Matching (Highest to Lowest) ****************************************************************** Dataset # 1 Motif ID 4 Motif Name Motif 4 Original Motif 0 1 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0.265176 0 0.734824 0 0 1 0 0 0.591054 0 0.408946 Reverse Complement Motif 0 0 0.591054 0.408946 0 1 0 0 0.734824 0.265176 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 *************************************************************** Best Matches for Top Significant Motif ID 4 (Highest to Lowest) *************************************************************** Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 43 NR1H2RXRA Reverse Complement Original Motif Backward 7 6 0.012269 Original Motif 0.68 0.2 0 0.12 0.68 0.04 0.2 0.08 0.8 0 0.2 0 0 0 1 0 0 0 0.96 0.04 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.96 0 0 0.04 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.8 0.04 0.08 0.08 0 0.6 0.24 0.16 Reverse Complement Motif 0 0.24 0.6 0.16 0.08 0.04 0.08 0.8 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.04 0 0 0.96 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0.96 0 0.04 0 1 0 0 0 0 0.2 0.8 0.08 0.04 0.2 0.68 0.12 0.2 0 0.68 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 PPARGRXRA Reverse Complement Original Motif Backward 5 6 0.0140102 Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reverse Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 22 NR2F1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 5 6 0.0186793 Original Motif 0 0 0.153846 0.846154 0.0769231 0 0.923077 0 0.923077 0 0.0769231 0 0.461538 0.538462 0 0 0 1 0 0 0 0.230769 0 0.769231 0 0.153846 0 0.846154 0.0769231 0 0 0.923077 0.153846 0 0.846154 0 0.461538 0.307692 0.230769 0 0.461538 0.384615 0.0769231 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.230769 0.461538 0 0.307692 0 0.230769 0.230769 0.538462 Reverse Complement Motif 0.538462 0.230769 0.230769 0 0.230769 0 0.461538 0.307692 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.384615 0.0769231 0.461538 0 0.307692 0.230769 0.461538 0.153846 0.846154 0 0 0.923077 0 0 0.0769231 0.846154 0.153846 0 0 0.769231 0.230769 0 0 0 0 1 0 0.461538 0 0.538462 0 0 0 0.0769231 0.923077 0.0769231 0.923077 0 0 0.846154 0 0.153846 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 34 HNF4A Reverse Complement Original Motif Backward 5 6 0.020602 Original Motif 0.41791 0.104478 0.402985 0.0746269 0.0298507 0.0298507 0.835821 0.104478 0.179104 0.0597015 0.522388 0.238806 0.0746269 0.343284 0.298507 0.283582 0.0447761 0.761194 0.0597015 0.134328 0.880597 0.0149254 0.0447761 0.0597015 0.791045 0.0298507 0.149254 0.0298507 0.835821 0.0149254 0.119403 0.0298507 0.0597015 0.0597015 0.865672 0.0149254 0.0895522 0.0298507 0.492537 0.38806 0.0447761 0.328358 0.164179 0.462687 0.0597015 0.731343 0.0746269 0.134328 0.626866 0.104478 0.149254 0.119403 Reverse Complement Motif 0.119403 0.104478 0.149254 0.626866 0.0597015 0.0746269 0.731343 0.134328 0.462687 0.328358 0.164179 0.0447761 0.0895522 0.492537 0.0298507 0.38806 0.0597015 0.865672 0.0597015 0.0149254 0.0298507 0.0149254 0.119403 0.835821 0.0298507 0.0298507 0.149254 0.791045 0.0597015 0.0149254 0.0447761 0.880597 0.0447761 0.0597015 0.761194 0.134328 0.0746269 0.298507 0.343284 0.283582 0.179104 0.522388 0.0597015 0.238806 0.0298507 0.835821 0.0298507 0.104478 0.0746269 0.104478 0.402985 0.41791 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 37 MIZF Original Motif Original Motif Backward 1 6 0.0221665 Original Motif 0.1 0.3 0.25 0.35 0.65 0.05 0 0.3 1 0 0 0 0.1 0.85 0.05 0 0 0 0.95 0.05 0 0.05 0 0.95 0 0.95 0 0.05 0 0.9 0.1 0 0 0 0.95 0.05 0.1 0.65 0.05 0.2 Reverse Complement Motif 0.1 0.05 0.65 0.2 0 0.95 0 0.05 0 0.1 0.9 0 0 0 0.95 0.05 0.95 0.05 0 0 0 0.95 0 0.05 0.1 0.05 0.85 0 0 0 0 1 0.3 0.05 0 0.65 0.35 0.3 0.25 0.1 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 35 INSM1 Reverse Complement Original Motif Backward 5 6 0.0255256 Original Motif 0.0416667 0 0.166667 0.791667 0 0 0.833333 0.166667 0 0.333333 0.125 0.541667 0.25 0.625 0 0.125 0.666667 0 0 0.333333 0 0 1 0 0 0.0416667 0.958333 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.0833333 0.666667 0.25 0.125 0.666667 0 0.208333 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.125 0 0.666667 0.208333 0 0.666667 0.0833333 0.25 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 1 0 0 0.333333 0 0 0.666667 0.25 0 0.625 0.125 0.541667 0.333333 0.125 0 0 0.833333 0 0.166667 0.791667 0 0.166667 0.0416667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 SP1 Original Motif Original Motif Backward 5 6 0.0349642 Original Motif 0 0.914286 0.0285714 0.0571429 0 0.857143 0.0285714 0.114286 0 1 0 0 0.114286 0.771429 0 0.114286 0.0571429 0.142857 0.428571 0.371429 0 0.8 0.0285714 0.171429 0.0285714 0.885714 0 0.0857143 0 0.685714 0.0857143 0.228571 0.171429 0.714286 0 0.114286 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.0857143 Reverse Complement Motif 0.0857143 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.171429 0 0.714286 0.114286 0 0.0857143 0.685714 0.228571 0.0285714 0 0.885714 0.0857143 0 0.0285714 0.8 0.171429 0.0571429 0.428571 0.142857 0.371429 0.114286 0 0.771429 0.114286 0 0 1 0 0 0.0285714 0.857143 0.114286 0 0.0285714 0.914286 0.0571429 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 REST Original Motif Reverse Complement Forward 3 6 0.0376108 Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reverse Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 Zfx Reverse Complement Original Motif Backward 6 6 0.0448449 Original Motif 0.105042 0.371849 0.37605 0.147059 0.125786 0.356394 0.360587 0.157233 0.190377 0.3159 0.416318 0.0774059 0.150313 0.102296 0.622129 0.125261 0.02079 0.617464 0.299376 0.0623701 0.012474 0.752599 0.004158 0.230769 0.0623701 0.259875 0.378378 0.299376 0.397089 0.320166 0.251559 0.031185 0.018711 0.004158 0.975052 0.002079 0 0.00623701 0.991684 0.002079 0.002079 0.997921 0 0 0 0.997921 0 0.002079 0 0.004158 0 0.995842 0.174636 0.253638 0.455301 0.116424 Reverse Complement Motif 0.174636 0.455301 0.253638 0.116424 0.995842 0.004158 0 0 0 0 0.997921 0.002079 0.002079 0 0.997921 0 0 0.991684 0.00623701 0.002079 0.018711 0.975052 0.004158 0.002079 0.031185 0.320166 0.251559 0.397089 0.0623701 0.378378 0.259875 0.299376 0.012474 0.004158 0.752599 0.230769 0.02079 0.299376 0.617464 0.0623701 0.150313 0.622129 0.102296 0.125261 0.190377 0.416318 0.3159 0.0774059 0.125786 0.360587 0.356394 0.157233 0.105042 0.37605 0.371849 0.147059 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 29 ESR1 Reverse Complement Reverse Complement Forward 4 6 0.0454269 Original Motif 0.261242 0.256959 0.329764 0.152034 0.228632 0.17094 0.350427 0.25 0.136752 0.369658 0.318376 0.175214 0.176596 0.487234 0.138298 0.197872 0.285106 0.493617 0.1 0.121277 0.651163 0.0591966 0.188161 0.10148 0.0759494 0.0168776 0.816456 0.0907173 0.04 0.0378947 0.884211 0.0378947 0.0694737 0.0863158 0.191579 0.652632 0.00842105 0.829474 0.111579 0.0505263 0.837895 0.0273684 0.0568421 0.0778947 0.122105 0.526316 0.225263 0.126316 0.132632 0.581053 0.111579 0.174737 0.134737 0.543158 0.204211 0.117895 0.0673684 0.04 0.0168421 0.875789 0.0442105 0.0463158 0.896842 0.0126316 0.642105 0.223158 0.0652632 0.0694737 0.0210526 0.917895 0.0252632 0.0357895 0.124211 0.743158 0.00421053 0.128421 0.0547368 0.347368 0.0463158 0.551579 Reverse Complement Motif 0.551579 0.347368 0.0463158 0.0547368 0.124211 0.00421053 0.743158 0.128421 0.0210526 0.0252632 0.917895 0.0357895 0.0694737 0.223158 0.0652632 0.642105 0.0442105 0.896842 0.0463158 0.0126316 0.875789 0.04 0.0168421 0.0673684 0.134737 0.204211 0.543158 0.117895 0.132632 0.111579 0.581053 0.174737 0.122105 0.225263 0.526316 0.126316 0.0778947 0.0273684 0.0568421 0.837895 0.00842105 0.111579 0.829474 0.0505263 0.652632 0.0863158 0.191579 0.0694737 0.04 0.884211 0.0378947 0.0378947 0.0759494 0.816456 0.0168776 0.0907173 0.10148 0.0591966 0.188161 0.651163 0.285106 0.1 0.493617 0.121277 0.176596 0.138298 0.487234 0.197872 0.136752 0.318376 0.369658 0.175214 0.228632 0.350427 0.17094 0.25 0.261242 0.329764 0.256959 0.152034 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 1 Motif ID 5 Motif Name Motif 5 Original Motif 1 0 0 0 0 0 0 1 0.165712 0 0.39748 0.436808 0 0 0 1 0.436426 0.563574 0 0 Reverse Complement Motif 0.436426 0 0.563574 0 1 0 0 0 0.436808 0 0.39748 0.165712 1 0 0 0 0 0 0 1 *************************************************************** Best Matches for Top Significant Motif ID 5 (Highest to Lowest) *************************************************************** Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 10 5 0.0256083 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 44 NR4A2 Reverse Complement Original Motif Backward 4 5 0.0276382 Original Motif 0.615385 0.0769231 0.230769 0.0769231 0.928571 0 0.0714286 0 0 0 0.928571 0.0714286 0.214286 0 0.785714 0 0.142857 0.142857 0 0.714286 0 0.928571 0 0.0714286 1 0 0 0 0.230769 0.615385 0.153846 0 Reverse Complement Motif 0.230769 0.153846 0.615385 0 0 0 0 1 0 0 0.928571 0.0714286 0.714286 0.142857 0 0.142857 0.214286 0.785714 0 0 0 0.928571 0 0.0714286 0 0 0.0714286 0.928571 0.0769231 0.0769231 0.230769 0.615385 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 22 NR2F1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 3 5 0.0279129 Original Motif 0 0 0.153846 0.846154 0.0769231 0 0.923077 0 0.923077 0 0.0769231 0 0.461538 0.538462 0 0 0 1 0 0 0 0.230769 0 0.769231 0 0.153846 0 0.846154 0.0769231 0 0 0.923077 0.153846 0 0.846154 0 0.461538 0.307692 0.230769 0 0.461538 0.384615 0.0769231 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.230769 0.461538 0 0.307692 0 0.230769 0.230769 0.538462 Reverse Complement Motif 0.538462 0.230769 0.230769 0 0.230769 0 0.461538 0.307692 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.384615 0.0769231 0.461538 0 0.307692 0.230769 0.461538 0.153846 0.846154 0 0 0.923077 0 0 0.0769231 0.846154 0.153846 0 0 0.769231 0.230769 0 0 0 0 1 0 0.461538 0 0.538462 0 0 0 0.0769231 0.923077 0.0769231 0.923077 0 0 0.846154 0 0.153846 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 43 NR1H2RXRA Original Motif Original Motif Backward 4 5 0.0292478 Original Motif 0.68 0.2 0 0.12 0.68 0.04 0.2 0.08 0.8 0 0.2 0 0 0 1 0 0 0 0.96 0.04 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.96 0 0 0.04 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.8 0.04 0.08 0.08 0 0.6 0.24 0.16 Reverse Complement Motif 0 0.24 0.6 0.16 0.08 0.04 0.08 0.8 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.04 0 0 0.96 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0.96 0 0.04 0 1 0 0 0 0 0.2 0.8 0.08 0.04 0.2 0.68 0.12 0.2 0 0.68 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 37 MIZF Original Motif Original Motif Backward 4 5 0.0292478 Original Motif 0.1 0.3 0.25 0.35 0.65 0.05 0 0.3 1 0 0 0 0.1 0.85 0.05 0 0 0 0.95 0.05 0 0.05 0 0.95 0 0.95 0 0.05 0 0.9 0.1 0 0 0 0.95 0.05 0.1 0.65 0.05 0.2 Reverse Complement Motif 0.1 0.05 0.65 0.2 0 0.95 0 0.05 0 0.1 0.9 0 0 0 0.95 0.05 0.95 0.05 0 0 0 0.95 0 0.05 0.1 0.05 0.85 0 0 0 0 1 0.3 0.05 0 0.65 0.35 0.3 0.25 0.1 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 PPARGRXRA Original Motif Reverse Complement Forward 5 5 0.0305369 Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reverse Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 REST Original Motif Reverse Complement Forward 5 5 0.0315454 Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reverse Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 47 RXRRAR_DR5 Original Motif Original Motif Forward 1 5 0.0335956 Original Motif 0.521739 0 0.478261 0 0 0 1 0 0.0434783 0 0.565217 0.391304 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.782609 0.130435 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.173913 0.304348 0.217391 0.304348 0.217391 0.347826 0.391304 0.0434783 0.217391 0.173913 0.478261 0.130435 0.565217 0.0434783 0.304348 0.0869565 0.217391 0.26087 0.521739 0 0.73913 0.130435 0.130435 0 0.0434783 0.0434783 0.869565 0.0434783 0 0.0434783 0.695652 0.26087 0.0869565 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0434783 0.73913 0.130435 0.0869565 0.913043 0 0.0434783 0.0434783 Reverse Complement Motif 0.0434783 0 0.0434783 0.913043 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0869565 0.73913 0.0434783 0.130435 0.0869565 0 0.695652 0.0434783 0.26087 0.0434783 0.869565 0.0434783 0.0434783 0 0.130435 0.130435 0.73913 0.217391 0.521739 0.26087 0 0.0869565 0.0434783 0.304348 0.565217 0.217391 0.478261 0.173913 0.130435 0.217391 0.391304 0.347826 0.0434783 0.173913 0.217391 0.304348 0.304348 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.130435 0.782609 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.0434783 0.565217 0 0.391304 0 1 0 0 0 0 0.478261 0.521739 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 46 RORA_1 Reverse Complement Original Motif Backward 3 5 0.0336052 Original Motif 0.6 0.04 0.08 0.28 0.36 0.04 0 0.6 0.24 0.48 0.16 0.12 0.44 0.08 0.2 0.28 0.84 0 0.16 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 Reverse Complement Motif 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0.16 0.84 0.28 0.08 0.2 0.44 0.24 0.16 0.48 0.12 0.6 0.04 0 0.36 0.28 0.04 0.08 0.6 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 34 HNF4A Original Motif Original Motif Backward 2 5 0.0367105 Original Motif 0.41791 0.104478 0.402985 0.0746269 0.0298507 0.0298507 0.835821 0.104478 0.179104 0.0597015 0.522388 0.238806 0.0746269 0.343284 0.298507 0.283582 0.0447761 0.761194 0.0597015 0.134328 0.880597 0.0149254 0.0447761 0.0597015 0.791045 0.0298507 0.149254 0.0298507 0.835821 0.0149254 0.119403 0.0298507 0.0597015 0.0597015 0.865672 0.0149254 0.0895522 0.0298507 0.492537 0.38806 0.0447761 0.328358 0.164179 0.462687 0.0597015 0.731343 0.0746269 0.134328 0.626866 0.104478 0.149254 0.119403 Reverse Complement Motif 0.119403 0.104478 0.149254 0.626866 0.0597015 0.0746269 0.731343 0.134328 0.462687 0.328358 0.164179 0.0447761 0.0895522 0.492537 0.0298507 0.38806 0.0597015 0.865672 0.0597015 0.0149254 0.0298507 0.0149254 0.119403 0.835821 0.0298507 0.0298507 0.149254 0.791045 0.0597015 0.0149254 0.0447761 0.880597 0.0447761 0.0597015 0.761194 0.134328 0.0746269 0.298507 0.343284 0.283582 0.179104 0.522388 0.0597015 0.238806 0.0298507 0.835821 0.0298507 0.104478 0.0746269 0.104478 0.402985 0.41791 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 1 Motif ID 6 Motif Name Motif 6 Original Motif 0 1 0 0 0.594366 0.405634 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0.63662 0 0.36338 0 0 0 1 0 0 1 0 0 Reverse Complement Motif 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0.36338 0.63662 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0.405634 0 0.594366 0 0 1 0 *************************************************************** Best Matches for Top Significant Motif ID 6 (Highest to Lowest) *************************************************************** Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 REST Reverse Complement Reverse Complement Forward 13 7 0.0205607 Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reverse Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 37 MIZF Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 7 0.0322623 Original Motif 0.1 0.3 0.25 0.35 0.65 0.05 0 0.3 1 0 0 0 0.1 0.85 0.05 0 0 0 0.95 0.05 0 0.05 0 0.95 0 0.95 0 0.05 0 0.9 0.1 0 0 0 0.95 0.05 0.1 0.65 0.05 0.2 Reverse Complement Motif 0.1 0.05 0.65 0.2 0 0.95 0 0.05 0 0.1 0.9 0 0 0 0.95 0.05 0.95 0.05 0 0 0 0.95 0 0.05 0.1 0.05 0.85 0 0 0 0 1 0.3 0.05 0 0.65 0.35 0.3 0.25 0.1 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 Zfx Original Motif Original Motif Backward 4 7 0.038091 Original Motif 0.105042 0.371849 0.37605 0.147059 0.125786 0.356394 0.360587 0.157233 0.190377 0.3159 0.416318 0.0774059 0.150313 0.102296 0.622129 0.125261 0.02079 0.617464 0.299376 0.0623701 0.012474 0.752599 0.004158 0.230769 0.0623701 0.259875 0.378378 0.299376 0.397089 0.320166 0.251559 0.031185 0.018711 0.004158 0.975052 0.002079 0 0.00623701 0.991684 0.002079 0.002079 0.997921 0 0 0 0.997921 0 0.002079 0 0.004158 0 0.995842 0.174636 0.253638 0.455301 0.116424 Reverse Complement Motif 0.174636 0.455301 0.253638 0.116424 0.995842 0.004158 0 0 0 0 0.997921 0.002079 0.002079 0 0.997921 0 0 0.991684 0.00623701 0.002079 0.018711 0.975052 0.004158 0.002079 0.031185 0.320166 0.251559 0.397089 0.0623701 0.378378 0.259875 0.299376 0.012474 0.004158 0.752599 0.230769 0.02079 0.299376 0.617464 0.0623701 0.150313 0.622129 0.102296 0.125261 0.190377 0.416318 0.3159 0.0774059 0.125786 0.360587 0.356394 0.157233 0.105042 0.37605 0.371849 0.147059 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 15 TFAP2A Original Motif Reverse Complement Forward 3 7 0.0393168 Original Motif 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.118919 0.383784 0.248649 0.248649 0.102703 0.308108 0.32973 0.259459 0.297297 0.237838 0.362162 0.102703 0.286486 0.162162 0.491892 0.0594595 0.102703 0.0864865 0.740541 0.0702703 0.0486486 0.421622 0.427027 0.102703 Reverse Complement Motif 0.0486486 0.427027 0.421622 0.102703 0.102703 0.740541 0.0864865 0.0702703 0.286486 0.491892 0.162162 0.0594595 0.297297 0.362162 0.237838 0.102703 0.102703 0.32973 0.308108 0.259459 0.118919 0.248649 0.383784 0.248649 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 45 Pax5 Reverse Complement Reverse Complement Backward 7 7 0.0448462 Original Motif 0.333333 0.0833333 0.333333 0.25 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 0.25 0.25 0.166667 0.0833333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.583333 0.166667 0.0833333 0.166667 0.166667 0.416667 0.25 0.166667 0 0.25 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.666667 0.0833333 0.5 0.0833333 0.25 0.166667 0.5 0 0.166667 0.333333 0 0 1 0 0.166667 0.666667 0.0833333 0.0833333 0.25 0 0.75 0 0.0833333 0 0.333333 0.583333 0.5 0.0833333 0.416667 0 0.416667 0.0833333 0.416667 0.0833333 0.166667 0.833333 0 0 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.166667 0 0.833333 0 0.0833333 0.0833333 0.416667 0.416667 0 0.0833333 0.416667 0.5 0.583333 0 0.333333 0.0833333 0.25 0.75 0 0 0.166667 0.0833333 0.666667 0.0833333 0 1 0 0 0.333333 0 0.166667 0.5 0.166667 0.0833333 0.25 0.5 0.0833333 0.666667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.25 0.166667 0 0.166667 0.25 0.416667 0.166667 0.166667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.416667 0.166667 0.333333 0.166667 0.25 0.25 0.333333 0.333333 0.666667 0 0 0.25 0.0833333 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 28 Egr1 Reverse Complement Original Motif Forward 4 7 0.0453576 Original Motif 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0.133333 0.0666667 0.8 0 0 0.866667 0 0.133333 0 0 1 0 0 0 0.2 0.8 0.2 0 0.8 0 0.0666667 0 0.933333 0 0 0 1 0 0.133333 0.666667 0 0.2 0 0 1 0 0.0666667 0 0.466667 0.466667 Reverse Complement Motif 0.0666667 0.466667 0 0.466667 0 1 0 0 0.133333 0 0.666667 0.2 0 1 0 0 0.0666667 0.933333 0 0 0.2 0.8 0 0 0.8 0 0.2 0 0 1 0 0 0 0 0.866667 0.133333 0.133333 0.8 0.0666667 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 36 Klf4 Original Motif Reverse Complement Forward 2 7 0.0476958 Original Motif 0.338561 0.0186808 0.235701 0.407057 0.0202765 0.00207373 0.976267 0.00138249 0.00322284 0.00299263 0.990792 0.00299263 0.00322061 0.00828157 0.984817 0.0036807 0.0636928 0.441941 0.00252932 0.491837 0.00506446 0.00345304 0.983656 0.00782689 0.00967073 0.0184204 0.501727 0.470182 0.0608716 0.0106064 0.8997 0.0288218 0.0283999 0.0300162 0.874856 0.0667282 0.0587419 0.660962 0.0647549 0.215541 Reverse Complement Motif 0.0587419 0.0647549 0.660962 0.215541 0.0283999 0.874856 0.0300162 0.0667282 0.0608716 0.8997 0.0106064 0.0288218 0.00967073 0.501727 0.0184204 0.470182 0.00506446 0.983656 0.00345304 0.00782689 0.491837 0.441941 0.00252932 0.0636928 0.00322061 0.984817 0.00828157 0.0036807 0.00322284 0.990792 0.00299263 0.00299263 0.0202765 0.976267 0.00207373 0.00138249 0.407057 0.0186808 0.235701 0.338561 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 SP1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 4 7 0.0490991 Original Motif 0 0.914286 0.0285714 0.0571429 0 0.857143 0.0285714 0.114286 0 1 0 0 0.114286 0.771429 0 0.114286 0.0571429 0.142857 0.428571 0.371429 0 0.8 0.0285714 0.171429 0.0285714 0.885714 0 0.0857143 0 0.685714 0.0857143 0.228571 0.171429 0.714286 0 0.114286 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.0857143 Reverse Complement Motif 0.0857143 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.171429 0 0.714286 0.114286 0 0.0857143 0.685714 0.228571 0.0285714 0 0.885714 0.0857143 0 0.0285714 0.8 0.171429 0.0571429 0.428571 0.142857 0.371429 0.114286 0 0.771429 0.114286 0 0 1 0 0 0.0285714 0.857143 0.114286 0 0.0285714 0.914286 0.0571429 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Reverse Complement Reverse Complement Forward 6 7 0.0498726 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 35 INSM1 Original Motif Reverse Complement Forward 4 7 0.0511926 Original Motif 0.0416667 0 0.166667 0.791667 0 0 0.833333 0.166667 0 0.333333 0.125 0.541667 0.25 0.625 0 0.125 0.666667 0 0 0.333333 0 0 1 0 0 0.0416667 0.958333 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.0833333 0.666667 0.25 0.125 0.666667 0 0.208333 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.125 0 0.666667 0.208333 0 0.666667 0.0833333 0.25 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 1 0 0 0.333333 0 0 0.666667 0.25 0 0.625 0.125 0.541667 0.333333 0.125 0 0 0.833333 0 0.166667 0.791667 0 0.166667 0.0416667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 1 Motif ID 8 Motif Name Motif 8 Original Motif 0 1 0 0 0 0.306358 0 0.693642 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 Reverse Complement Motif 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.693642 0.306358 0 0 0 0 1 0 *************************************************************** Best Matches for Top Significant Motif ID 8 (Highest to Lowest) *************************************************************** Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 REST Reverse Complement Reverse Complement Forward 8 6 0.0392549 Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reverse Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 23 MZF1_1-4 Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 6 0.0416319 Original Motif 0.15 0.25 0.2 0.4 0 0 0.95 0.05 0.1 0 0.9 0 0 0 0.95 0.05 0 0 1 0 0.9 0 0.1 0 Reverse Complement Motif 0 0 0.1 0.9 0 1 0 0 0 0.95 0 0.05 0.1 0.9 0 0 0 0.95 0 0.05 0.4 0.25 0.2 0.15 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Original Motif Reverse Complement Backward 1 6 0.0509122 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 35 INSM1 Original Motif Original Motif Forward 4 6 0.0557857 Original Motif 0.0416667 0 0.166667 0.791667 0 0 0.833333 0.166667 0 0.333333 0.125 0.541667 0.25 0.625 0 0.125 0.666667 0 0 0.333333 0 0 1 0 0 0.0416667 0.958333 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.0833333 0.666667 0.25 0.125 0.666667 0 0.208333 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.125 0 0.666667 0.208333 0 0.666667 0.0833333 0.25 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 1 0 0 0.333333 0 0 0.666667 0.25 0 0.625 0.125 0.541667 0.333333 0.125 0 0 0.833333 0 0.166667 0.791667 0 0.166667 0.0416667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 13 Zfp423 Reverse Complement Reverse Complement Backward 7 6 0.0624145 Original Motif 0.212121 0.121212 0.666667 0 0 0.484848 0.515152 0 0.484848 0.515152 0 0 0.515152 0.484848 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.030303 0.515152 0 0.454545 0.727273 0 0 0.272727 0.393939 0 0.484848 0.121212 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.515152 0.484848 0 0 0.484848 0.515152 0 0.242424 0.484848 0.272727 0.333333 0.666667 0 0 Reverse Complement Motif 0.333333 0 0.666667 0 0 0.484848 0.242424 0.272727 0.515152 0 0.484848 0 0 0.515152 0 0.484848 0 1 0 0 0 1 0 0 0.393939 0.484848 0 0.121212 0.272727 0 0 0.727273 0.030303 0 0.515152 0.454545 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.484848 0 0.515152 0.484848 0 0.515152 0 0 0.515152 0.484848 0 0.212121 0.666667 0.121212 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 43 NR1H2RXRA Reverse Complement Original Motif Forward 6 6 0.0650784 Original Motif 0.68 0.2 0 0.12 0.68 0.04 0.2 0.08 0.8 0 0.2 0 0 0 1 0 0 0 0.96 0.04 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.96 0 0 0.04 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.8 0.04 0.08 0.08 0 0.6 0.24 0.16 Reverse Complement Motif 0 0.24 0.6 0.16 0.08 0.04 0.08 0.8 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.04 0 0 0.96 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0.96 0 0.04 0 1 0 0 0 0 0.2 0.8 0.08 0.04 0.2 0.68 0.12 0.2 0 0.68 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 48 Tcfcp2l1 Original Motif Reverse Complement Forward 1 6 0.0663804 Original Motif 0.00196754 0.92548 0.0627152 0.00983768 0.069973 0.807513 0.00540142 0.117113 0.594508 0.00514832 0.275803 0.12454 0.0058838 0.0237803 0.967149 0.00318706 0.175477 0.33627 0.0256975 0.462555 0.0983847 0.28928 0.0621635 0.550171 0.173924 0.39726 0.151174 0.277642 0.357213 0.224939 0.252323 0.165526 0.63154 0.0696822 0.190954 0.107824 0.394421 0.0513824 0.310497 0.2437 0.00366928 0.933219 0.0547945 0.00831703 0.0617193 0.812148 0.00293902 0.123194 0.536555 0.00736016 0.305937 0.150147 0.0120393 0.0289926 0.954791 0.0041769 Reverse Complement Motif 0.0120393 0.954791 0.0289926 0.0041769 0.150147 0.00736016 0.305937 0.536555 0.0617193 0.00293902 0.812148 0.123194 0.00366928 0.0547945 0.933219 0.00831703 0.2437 0.0513824 0.310497 0.394421 0.107824 0.0696822 0.190954 0.63154 0.165526 0.224939 0.252323 0.357213 0.173924 0.151174 0.39726 0.277642 0.550171 0.28928 0.0621635 0.0983847 0.462555 0.33627 0.0256975 0.175477 0.0058838 0.967149 0.0237803 0.00318706 0.12454 0.00514832 0.275803 0.594508 0.069973 0.00540142 0.807513 0.117113 0.00196754 0.0627152 0.92548 0.00983768 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 28 Egr1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 4 6 0.0678562 Original Motif 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0.133333 0.0666667 0.8 0 0 0.866667 0 0.133333 0 0 1 0 0 0 0.2 0.8 0.2 0 0.8 0 0.0666667 0 0.933333 0 0 0 1 0 0.133333 0.666667 0 0.2 0 0 1 0 0.0666667 0 0.466667 0.466667 Reverse Complement Motif 0.0666667 0.466667 0 0.466667 0 1 0 0 0.133333 0 0.666667 0.2 0 1 0 0 0.0666667 0.933333 0 0 0.2 0.8 0 0 0.8 0 0.2 0 0 1 0 0 0 0 0.866667 0.133333 0.133333 0.8 0.0666667 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 24 Ar Reverse Complement Original Motif Backward 3 6 0.0714107 Original Motif 0.375 0.291667 0.0833333 0.25 0.375 0.0833333 0.125 0.416667 0.458333 0.125 0.125 0.291667 0.666667 0.0416667 0.291667 0 0 0 0.916667 0.0833333 0.5 0.25 0.0416667 0.208333 0.875 0.0833333 0 0.0416667 0 1 0 0 0.625 0 0.333333 0.0416667 0.166667 0.375 0.0833333 0.375 0.208333 0.458333 0.0833333 0.25 0.25 0.375 0.375 0 0.125 0.208333 0.0416667 0.625 0 0 1 0 0.166667 0 0 0.833333 0.458333 0.208333 0.0416667 0.291667 0.0416667 0.916667 0.0416667 0 0.125 0.666667 0.0416667 0.166667 0.25 0.291667 0.208333 0.25 0.25 0.208333 0.375 0.166667 0.416667 0.458333 0 0.125 0.208333 0.458333 0.25 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.208333 0.25 0.458333 0.0833333 0.416667 0 0.458333 0.125 0.25 0.375 0.208333 0.166667 0.25 0.208333 0.291667 0.25 0.125 0.0416667 0.666667 0.166667 0.0416667 0.0416667 0.916667 0 0.291667 0.208333 0.0416667 0.458333 0.833333 0 0 0.166667 0 1 0 0 0.625 0.208333 0.0416667 0.125 0.25 0.375 0.375 0 0.208333 0.0833333 0.458333 0.25 0.166667 0.0833333 0.375 0.375 0.0416667 0 0.333333 0.625 0 0 1 0 0.0416667 0.0833333 0 0.875 0.208333 0.25 0.0416667 0.5 0 0.916667 0 0.0833333 0 0.0416667 0.291667 0.666667 0.291667 0.125 0.125 0.458333 0.416667 0.0833333 0.125 0.375 0.25 0.291667 0.0833333 0.375 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 Zfx Original Motif Original Motif Backward 4 6 0.0718041 Original Motif 0.105042 0.371849 0.37605 0.147059 0.125786 0.356394 0.360587 0.157233 0.190377 0.3159 0.416318 0.0774059 0.150313 0.102296 0.622129 0.125261 0.02079 0.617464 0.299376 0.0623701 0.012474 0.752599 0.004158 0.230769 0.0623701 0.259875 0.378378 0.299376 0.397089 0.320166 0.251559 0.031185 0.018711 0.004158 0.975052 0.002079 0 0.00623701 0.991684 0.002079 0.002079 0.997921 0 0 0 0.997921 0 0.002079 0 0.004158 0 0.995842 0.174636 0.253638 0.455301 0.116424 Reverse Complement Motif 0.174636 0.455301 0.253638 0.116424 0.995842 0.004158 0 0 0 0 0.997921 0.002079 0.002079 0 0.997921 0 0 0.991684 0.00623701 0.002079 0.018711 0.975052 0.004158 0.002079 0.031185 0.320166 0.251559 0.397089 0.0623701 0.378378 0.259875 0.299376 0.012474 0.004158 0.752599 0.230769 0.02079 0.299376 0.617464 0.0623701 0.150313 0.622129 0.102296 0.125261 0.190377 0.416318 0.3159 0.0774059 0.125786 0.360587 0.356394 0.157233 0.105042 0.37605 0.371849 0.147059 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 1 Motif ID 2 Motif Name Motif 2 Original Motif 1 0 0 0 0.483355 0.516645 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0.832898 0 0.167102 0 Reverse Complement Motif 0 0 0.167102 0.832898 0 0 1 0 0 0 0 1 0.483355 0 0.516645 0 0 0 0 1 *************************************************************** Best Matches for Top Significant Motif ID 2 (Highest to Lowest) *************************************************************** Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Original Motif Original Motif Backward 11 5 0.0243918 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 24 Ar Original Motif Original Motif Backward 14 5 0.0429088 Original Motif 0.375 0.291667 0.0833333 0.25 0.375 0.0833333 0.125 0.416667 0.458333 0.125 0.125 0.291667 0.666667 0.0416667 0.291667 0 0 0 0.916667 0.0833333 0.5 0.25 0.0416667 0.208333 0.875 0.0833333 0 0.0416667 0 1 0 0 0.625 0 0.333333 0.0416667 0.166667 0.375 0.0833333 0.375 0.208333 0.458333 0.0833333 0.25 0.25 0.375 0.375 0 0.125 0.208333 0.0416667 0.625 0 0 1 0 0.166667 0 0 0.833333 0.458333 0.208333 0.0416667 0.291667 0.0416667 0.916667 0.0416667 0 0.125 0.666667 0.0416667 0.166667 0.25 0.291667 0.208333 0.25 0.25 0.208333 0.375 0.166667 0.416667 0.458333 0 0.125 0.208333 0.458333 0.25 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.208333 0.25 0.458333 0.0833333 0.416667 0 0.458333 0.125 0.25 0.375 0.208333 0.166667 0.25 0.208333 0.291667 0.25 0.125 0.0416667 0.666667 0.166667 0.0416667 0.0416667 0.916667 0 0.291667 0.208333 0.0416667 0.458333 0.833333 0 0 0.166667 0 1 0 0 0.625 0.208333 0.0416667 0.125 0.25 0.375 0.375 0 0.208333 0.0833333 0.458333 0.25 0.166667 0.0833333 0.375 0.375 0.0416667 0 0.333333 0.625 0 0 1 0 0.0416667 0.0833333 0 0.875 0.208333 0.25 0.0416667 0.5 0 0.916667 0 0.0833333 0 0.0416667 0.291667 0.666667 0.291667 0.125 0.125 0.458333 0.416667 0.0833333 0.125 0.375 0.25 0.291667 0.0833333 0.375 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 PPARGRXRA Reverse Complement Reverse Complement Backward 6 5 0.0595073 Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reverse Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 26 ArntAhr Reverse Complement Original Motif Backward 2 5 0.0600161 Original Motif 0.125 0.333333 0.0833333 0.458333 0 0 0.958333 0.0416667 0 0.958333 0 0.0416667 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 0 1 0 0 1 0 Reverse Complement Motif 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0.958333 0 0.0416667 0 0 0.958333 0.0416667 0 0.958333 0 0.0416667 0.458333 0.333333 0.0833333 0.125 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 45 Pax5 Original Motif Reverse Complement Forward 6 5 0.0620995 Original Motif 0.333333 0.0833333 0.333333 0.25 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 0.25 0.25 0.166667 0.0833333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.583333 0.166667 0.0833333 0.166667 0.166667 0.416667 0.25 0.166667 0 0.25 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.666667 0.0833333 0.5 0.0833333 0.25 0.166667 0.5 0 0.166667 0.333333 0 0 1 0 0.166667 0.666667 0.0833333 0.0833333 0.25 0 0.75 0 0.0833333 0 0.333333 0.583333 0.5 0.0833333 0.416667 0 0.416667 0.0833333 0.416667 0.0833333 0.166667 0.833333 0 0 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.166667 0 0.833333 0 0.0833333 0.0833333 0.416667 0.416667 0 0.0833333 0.416667 0.5 0.583333 0 0.333333 0.0833333 0.25 0.75 0 0 0.166667 0.0833333 0.666667 0.0833333 0 1 0 0 0.333333 0 0.166667 0.5 0.166667 0.0833333 0.25 0.5 0.0833333 0.666667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.25 0.166667 0 0.166667 0.25 0.416667 0.166667 0.166667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.416667 0.166667 0.333333 0.166667 0.25 0.25 0.333333 0.333333 0.666667 0 0 0.25 0.0833333 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 22 NR2F1 Original Motif Reverse Complement Backward 4 5 0.0650242 Original Motif 0 0 0.153846 0.846154 0.0769231 0 0.923077 0 0.923077 0 0.0769231 0 0.461538 0.538462 0 0 0 1 0 0 0 0.230769 0 0.769231 0 0.153846 0 0.846154 0.0769231 0 0 0.923077 0.153846 0 0.846154 0 0.461538 0.307692 0.230769 0 0.461538 0.384615 0.0769231 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.230769 0.461538 0 0.307692 0 0.230769 0.230769 0.538462 Reverse Complement Motif 0.538462 0.230769 0.230769 0 0.230769 0 0.461538 0.307692 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.384615 0.0769231 0.461538 0 0.307692 0.230769 0.461538 0.153846 0.846154 0 0 0.923077 0 0 0.0769231 0.846154 0.153846 0 0 0.769231 0.230769 0 0 0 0 1 0 0.461538 0 0.538462 0 0 0 0.0769231 0.923077 0.0769231 0.923077 0 0 0.846154 0 0.153846 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 35 INSM1 Original Motif Reverse Complement Forward 8 5 0.0670984 Original Motif 0.0416667 0 0.166667 0.791667 0 0 0.833333 0.166667 0 0.333333 0.125 0.541667 0.25 0.625 0 0.125 0.666667 0 0 0.333333 0 0 1 0 0 0.0416667 0.958333 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.0833333 0.666667 0.25 0.125 0.666667 0 0.208333 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.125 0 0.666667 0.208333 0 0.666667 0.0833333 0.25 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 1 0 0 0.333333 0 0 0.666667 0.25 0 0.625 0.125 0.541667 0.333333 0.125 0 0 0.833333 0 0.166667 0.791667 0 0.166667 0.0416667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 33 HIF1AARNT Original Motif Reverse Complement Backward 4 5 0.0700905 Original Motif 0.259615 0.269231 0.471154 0 0.0961538 0.278846 0.326923 0.298077 0.75 0.0192308 0.221154 0.00961538 0 0.990385 0 0.00961538 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.173077 0.490385 0.192308 0.144231 Reverse Complement Motif 0.173077 0.192308 0.490385 0.144231 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0.990385 0.00961538 0.00961538 0.0192308 0.221154 0.75 0.0961538 0.326923 0.278846 0.298077 0.259615 0.471154 0.269231 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 38 Myc Original Motif Original Motif Forward 2 5 0.0708148 Original Motif 0.295154 0.422907 0.15859 0.123348 0.14978 0.23348 0.572687 0.0440529 0.0352423 0.964758 0 0 0.955947 0.0176211 0.0220264 0.00440529 0 0.933921 0.0132159 0.0528634 0.0837004 0.00881057 0.898678 0.00881057 0.0396476 0.193833 0 0.76652 0 0.00881057 0.951542 0.0396476 0 0.0748899 0.806167 0.118943 0.198238 0.471366 0.105727 0.22467 Reverse Complement Motif 0.198238 0.105727 0.471366 0.22467 0 0.806167 0.0748899 0.118943 0 0.951542 0.00881057 0.0396476 0.76652 0.193833 0 0.0396476 0.0837004 0.898678 0.00881057 0.00881057 0 0.0132159 0.933921 0.0528634 0.00440529 0.0176211 0.0220264 0.955947 0.0352423 0 0.964758 0 0.14978 0.572687 0.23348 0.0440529 0.295154 0.15859 0.422907 0.123348 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 34 HNF4A Reverse Complement Reverse Complement Backward 4 5 0.071574 Original Motif 0.41791 0.104478 0.402985 0.0746269 0.0298507 0.0298507 0.835821 0.104478 0.179104 0.0597015 0.522388 0.238806 0.0746269 0.343284 0.298507 0.283582 0.0447761 0.761194 0.0597015 0.134328 0.880597 0.0149254 0.0447761 0.0597015 0.791045 0.0298507 0.149254 0.0298507 0.835821 0.0149254 0.119403 0.0298507 0.0597015 0.0597015 0.865672 0.0149254 0.0895522 0.0298507 0.492537 0.38806 0.0447761 0.328358 0.164179 0.462687 0.0597015 0.731343 0.0746269 0.134328 0.626866 0.104478 0.149254 0.119403 Reverse Complement Motif 0.119403 0.104478 0.149254 0.626866 0.0597015 0.0746269 0.731343 0.134328 0.462687 0.328358 0.164179 0.0447761 0.0895522 0.492537 0.0298507 0.38806 0.0597015 0.865672 0.0597015 0.0149254 0.0298507 0.0149254 0.119403 0.835821 0.0298507 0.0298507 0.149254 0.791045 0.0597015 0.0149254 0.0447761 0.880597 0.0447761 0.0597015 0.761194 0.134328 0.0746269 0.298507 0.343284 0.283582 0.179104 0.522388 0.0597015 0.238806 0.0298507 0.835821 0.0298507 0.104478 0.0746269 0.104478 0.402985 0.41791 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 1 Motif ID 3 Motif Name Motif 3 Original Motif 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0.472754 0.527246 0 0 1 0 0 0.496318 0 0 0.503682 0 0 1 0 0 0 1 0 Reverse Complement Motif 0 1 0 0 0 1 0 0 0.503682 0 0 0.496318 0 0 1 0 0 0.527246 0.472754 0 0 1 0 0 0 0 0 1 *************************************************************** Best Matches for Top Significant Motif ID 3 (Highest to Lowest) *************************************************************** Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 32 EWSR1-FLI1 Original Motif Original Motif Forward 8 7 0.0395671 Original Motif 0 0 1 0 0.0190476 0 0.980952 0 0.990476 0 0.00952381 0 0.990476 0 0.00952381 0 0.00952381 0 0.990476 0 0.0190476 0 0.971429 0.00952381 0.980952 0 0.0190476 0 0.971429 0 0.0285714 0 0 0 0.990476 0.00952381 0 0.0190476 0.980952 0 0.942857 0.0380952 0.0190476 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0.0190476 0.980952 0 0.952381 0.0285714 0 0.0190476 0.971429 0 0.0190476 0.00952381 0.047619 0 0.92381 0.0285714 0.0285714 0.0285714 0.92381 0.0190476 Reverse Complement Motif 0.0285714 0.92381 0.0285714 0.0190476 0.047619 0.92381 0 0.0285714 0.00952381 0 0.0190476 0.971429 0.0190476 0.0285714 0 0.952381 0 0.980952 0.0190476 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0.0380952 0.0190476 0.942857 0 0.980952 0.0190476 0 0 0.990476 0 0.00952381 0 0 0.0285714 0.971429 0 0 0.0190476 0.980952 0.0190476 0.971429 0 0.00952381 0.00952381 0.990476 0 0 0 0 0.00952381 0.990476 0 0 0.00952381 0.990476 0.0190476 0.980952 0 0 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 35 INSM1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 7 0.0494688 Original Motif 0.0416667 0 0.166667 0.791667 0 0 0.833333 0.166667 0 0.333333 0.125 0.541667 0.25 0.625 0 0.125 0.666667 0 0 0.333333 0 0 1 0 0 0.0416667 0.958333 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.0833333 0.666667 0.25 0.125 0.666667 0 0.208333 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.125 0 0.666667 0.208333 0 0.666667 0.0833333 0.25 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 1 0 0 0.333333 0 0 0.666667 0.25 0 0.625 0.125 0.541667 0.333333 0.125 0 0 0.833333 0 0.166667 0.791667 0 0.166667 0.0416667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 48 Tcfcp2l1 Reverse Complement Original Motif Forward 1 7 0.0669354 Original Motif 0.00196754 0.92548 0.0627152 0.00983768 0.069973 0.807513 0.00540142 0.117113 0.594508 0.00514832 0.275803 0.12454 0.0058838 0.0237803 0.967149 0.00318706 0.175477 0.33627 0.0256975 0.462555 0.0983847 0.28928 0.0621635 0.550171 0.173924 0.39726 0.151174 0.277642 0.357213 0.224939 0.252323 0.165526 0.63154 0.0696822 0.190954 0.107824 0.394421 0.0513824 0.310497 0.2437 0.00366928 0.933219 0.0547945 0.00831703 0.0617193 0.812148 0.00293902 0.123194 0.536555 0.00736016 0.305937 0.150147 0.0120393 0.0289926 0.954791 0.0041769 Reverse Complement Motif 0.0120393 0.954791 0.0289926 0.0041769 0.150147 0.00736016 0.305937 0.536555 0.0617193 0.00293902 0.812148 0.123194 0.00366928 0.0547945 0.933219 0.00831703 0.2437 0.0513824 0.310497 0.394421 0.107824 0.0696822 0.190954 0.63154 0.165526 0.224939 0.252323 0.357213 0.173924 0.151174 0.39726 0.277642 0.550171 0.28928 0.0621635 0.0983847 0.462555 0.33627 0.0256975 0.175477 0.0058838 0.967149 0.0237803 0.00318706 0.12454 0.00514832 0.275803 0.594508 0.069973 0.00540142 0.807513 0.117113 0.00196754 0.0627152 0.92548 0.00983768 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 REST Original Motif Original Motif Backward 9 7 0.0693747 Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reverse Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 SP1 Reverse Complement Original Motif Backward 3 7 0.0695377 Original Motif 0 0.914286 0.0285714 0.0571429 0 0.857143 0.0285714 0.114286 0 1 0 0 0.114286 0.771429 0 0.114286 0.0571429 0.142857 0.428571 0.371429 0 0.8 0.0285714 0.171429 0.0285714 0.885714 0 0.0857143 0 0.685714 0.0857143 0.228571 0.171429 0.714286 0 0.114286 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.0857143 Reverse Complement Motif 0.0857143 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.171429 0 0.714286 0.114286 0 0.0857143 0.685714 0.228571 0.0285714 0 0.885714 0.0857143 0 0.0285714 0.8 0.171429 0.0571429 0.428571 0.142857 0.371429 0.114286 0 0.771429 0.114286 0 0 1 0 0 0.0285714 0.857143 0.114286 0 0.0285714 0.914286 0.0571429 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 Zfx Reverse Complement Original Motif Backward 2 7 0.0720685 Original Motif 0.105042 0.371849 0.37605 0.147059 0.125786 0.356394 0.360587 0.157233 0.190377 0.3159 0.416318 0.0774059 0.150313 0.102296 0.622129 0.125261 0.02079 0.617464 0.299376 0.0623701 0.012474 0.752599 0.004158 0.230769 0.0623701 0.259875 0.378378 0.299376 0.397089 0.320166 0.251559 0.031185 0.018711 0.004158 0.975052 0.002079 0 0.00623701 0.991684 0.002079 0.002079 0.997921 0 0 0 0.997921 0 0.002079 0 0.004158 0 0.995842 0.174636 0.253638 0.455301 0.116424 Reverse Complement Motif 0.174636 0.455301 0.253638 0.116424 0.995842 0.004158 0 0 0 0 0.997921 0.002079 0.002079 0 0.997921 0 0 0.991684 0.00623701 0.002079 0.018711 0.975052 0.004158 0.002079 0.031185 0.320166 0.251559 0.397089 0.0623701 0.378378 0.259875 0.299376 0.012474 0.004158 0.752599 0.230769 0.02079 0.299376 0.617464 0.0623701 0.150313 0.622129 0.102296 0.125261 0.190377 0.416318 0.3159 0.0774059 0.125786 0.360587 0.356394 0.157233 0.105042 0.37605 0.371849 0.147059 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 29 ESR1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 7 0.0771405 Original Motif 0.261242 0.256959 0.329764 0.152034 0.228632 0.17094 0.350427 0.25 0.136752 0.369658 0.318376 0.175214 0.176596 0.487234 0.138298 0.197872 0.285106 0.493617 0.1 0.121277 0.651163 0.0591966 0.188161 0.10148 0.0759494 0.0168776 0.816456 0.0907173 0.04 0.0378947 0.884211 0.0378947 0.0694737 0.0863158 0.191579 0.652632 0.00842105 0.829474 0.111579 0.0505263 0.837895 0.0273684 0.0568421 0.0778947 0.122105 0.526316 0.225263 0.126316 0.132632 0.581053 0.111579 0.174737 0.134737 0.543158 0.204211 0.117895 0.0673684 0.04 0.0168421 0.875789 0.0442105 0.0463158 0.896842 0.0126316 0.642105 0.223158 0.0652632 0.0694737 0.0210526 0.917895 0.0252632 0.0357895 0.124211 0.743158 0.00421053 0.128421 0.0547368 0.347368 0.0463158 0.551579 Reverse Complement Motif 0.551579 0.347368 0.0463158 0.0547368 0.124211 0.00421053 0.743158 0.128421 0.0210526 0.0252632 0.917895 0.0357895 0.0694737 0.223158 0.0652632 0.642105 0.0442105 0.896842 0.0463158 0.0126316 0.875789 0.04 0.0168421 0.0673684 0.134737 0.204211 0.543158 0.117895 0.132632 0.111579 0.581053 0.174737 0.122105 0.225263 0.526316 0.126316 0.0778947 0.0273684 0.0568421 0.837895 0.00842105 0.111579 0.829474 0.0505263 0.652632 0.0863158 0.191579 0.0694737 0.04 0.884211 0.0378947 0.0378947 0.0759494 0.816456 0.0168776 0.0907173 0.10148 0.0591966 0.188161 0.651163 0.285106 0.1 0.493617 0.121277 0.176596 0.138298 0.487234 0.197872 0.136752 0.318376 0.369658 0.175214 0.228632 0.350427 0.17094 0.25 0.261242 0.329764 0.256959 0.152034 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 46 RORA_1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 7 0.0772276 Original Motif 0.6 0.04 0.08 0.28 0.36 0.04 0 0.6 0.24 0.48 0.16 0.12 0.44 0.08 0.2 0.28 0.84 0 0.16 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 Reverse Complement Motif 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0.16 0.84 0.28 0.08 0.2 0.44 0.24 0.16 0.48 0.12 0.6 0.04 0 0.36 0.28 0.04 0.08 0.6 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 36 Klf4 Original Motif Original Motif Forward 1 7 0.0798994 Original Motif 0.338561 0.0186808 0.235701 0.407057 0.0202765 0.00207373 0.976267 0.00138249 0.00322284 0.00299263 0.990792 0.00299263 0.00322061 0.00828157 0.984817 0.0036807 0.0636928 0.441941 0.00252932 0.491837 0.00506446 0.00345304 0.983656 0.00782689 0.00967073 0.0184204 0.501727 0.470182 0.0608716 0.0106064 0.8997 0.0288218 0.0283999 0.0300162 0.874856 0.0667282 0.0587419 0.660962 0.0647549 0.215541 Reverse Complement Motif 0.0587419 0.0647549 0.660962 0.215541 0.0283999 0.874856 0.0300162 0.0667282 0.0608716 0.8997 0.0106064 0.0288218 0.00967073 0.501727 0.0184204 0.470182 0.00506446 0.983656 0.00345304 0.00782689 0.491837 0.441941 0.00252932 0.0636928 0.00322061 0.984817 0.00828157 0.0036807 0.00322284 0.990792 0.00299263 0.00299263 0.0202765 0.976267 0.00207373 0.00138249 0.407057 0.0186808 0.235701 0.338561 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 39 MYCMAX Original Motif Original Motif Backward 5 7 0.0839075 Original Motif 0.333333 0.047619 0.428571 0.190476 0.714286 0.047619 0.190476 0.047619 0.0952381 0.428571 0.428571 0.047619 0.047619 0.952381 0 0 1 0 0 0 0 0.952381 0 0.047619 0.047619 0 0.952381 0 0 0.047619 0 0.952381 0 0 1 0 0.047619 0.047619 0.857143 0.047619 0.142857 0.238095 0 0.619048 Reverse Complement Motif 0.619048 0.238095 0 0.142857 0.047619 0.857143 0.047619 0.047619 0 1 0 0 0.952381 0.047619 0 0 0.047619 0.952381 0 0 0 0 0.952381 0.047619 0 0 0 1 0.047619 0 0.952381 0 0.0952381 0.428571 0.428571 0.047619 0.047619 0.047619 0.190476 0.714286 0.333333 0.428571 0.047619 0.190476 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 1 Motif ID 1 Motif Name Motif 1 Original Motif 0.577889 0 0.422111 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.419095 0 0.580905 0 Reverse Complement Motif 0.419095 0.580905 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0.422111 0.577889 *************************************************************** Best Matches for Top Significant Motif ID 1 (Highest to Lowest) *************************************************************** Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 32 EWSR1-FLI1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 12 6 0.0146511 Original Motif 0 0 1 0 0.0190476 0 0.980952 0 0.990476 0 0.00952381 0 0.990476 0 0.00952381 0 0.00952381 0 0.990476 0 0.0190476 0 0.971429 0.00952381 0.980952 0 0.0190476 0 0.971429 0 0.0285714 0 0 0 0.990476 0.00952381 0 0.0190476 0.980952 0 0.942857 0.0380952 0.0190476 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0.0190476 0.980952 0 0.952381 0.0285714 0 0.0190476 0.971429 0 0.0190476 0.00952381 0.047619 0 0.92381 0.0285714 0.0285714 0.0285714 0.92381 0.0190476 Reverse Complement Motif 0.0285714 0.92381 0.0285714 0.0190476 0.047619 0.92381 0 0.0285714 0.00952381 0 0.0190476 0.971429 0.0190476 0.0285714 0 0.952381 0 0.980952 0.0190476 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0.0380952 0.0190476 0.942857 0 0.980952 0.0190476 0 0 0.990476 0 0.00952381 0 0 0.0285714 0.971429 0 0 0.0190476 0.980952 0.0190476 0.971429 0 0.00952381 0.00952381 0.990476 0 0 0 0 0.00952381 0.990476 0 0 0.00952381 0.990476 0.0190476 0.980952 0 0 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 37 MIZF Reverse Complement Original Motif Backward 2 6 0.0608243 Original Motif 0.1 0.3 0.25 0.35 0.65 0.05 0 0.3 1 0 0 0 0.1 0.85 0.05 0 0 0 0.95 0.05 0 0.05 0 0.95 0 0.95 0 0.05 0 0.9 0.1 0 0 0 0.95 0.05 0.1 0.65 0.05 0.2 Reverse Complement Motif 0.1 0.05 0.65 0.2 0 0.95 0 0.05 0 0.1 0.9 0 0 0 0.95 0.05 0.95 0.05 0 0 0 0.95 0 0.05 0.1 0.05 0.85 0 0 0 0 1 0.3 0.05 0 0.65 0.35 0.3 0.25 0.1 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 41 MZF1_5-13 Original Motif Original Motif Backward 1 6 0.0753789 Original Motif 0.0625 0.25 0.4375 0.25 0.125 0 0.4375 0.4375 0.9375 0.0625 0 0 0 0 0.6875 0.3125 0 0 0.9375 0.0625 0 0.125 0.875 0 0 0 0.875 0.125 0.1875 0.0625 0.5 0.25 0.625 0 0.25 0.125 0.5 0.125 0.25 0.125 Reverse Complement Motif 0.125 0.125 0.25 0.5 0.125 0 0.25 0.625 0.1875 0.5 0.0625 0.25 0 0.875 0 0.125 0 0.875 0.125 0 0 0.9375 0 0.0625 0 0.6875 0 0.3125 0 0.0625 0 0.9375 0.125 0.4375 0 0.4375 0.0625 0.4375 0.25 0.25 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 42 NFKB1 Original Motif Reverse Complement Forward 2 6 0.0757695 Original Motif 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0.111111 0 0.888889 0 0.611111 0.0555556 0.333333 0 0.277778 0 0.111111 0.611111 0 0.277778 0.111111 0.611111 0 0.722222 0 0.277778 0 0.944444 0 0.0555556 0 1 0 0 0.0555556 0.833333 0.0555556 0.0555556 Reverse Complement Motif 0.0555556 0.0555556 0.833333 0.0555556 0 0 1 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.722222 0.277778 0.611111 0.277778 0.111111 0 0.611111 0 0.111111 0.277778 0 0.0555556 0.333333 0.611111 0.111111 0.888889 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 PPARGRXRA Original Motif Original Motif Forward 4 6 0.0800484 Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reverse Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 REST Original Motif Original Motif Forward 11 6 0.0829223 Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reverse Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 35 INSM1 Original Motif Original Motif Forward 7 6 0.0832926 Original Motif 0.0416667 0 0.166667 0.791667 0 0 0.833333 0.166667 0 0.333333 0.125 0.541667 0.25 0.625 0 0.125 0.666667 0 0 0.333333 0 0 1 0 0 0.0416667 0.958333 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.0833333 0.666667 0.25 0.125 0.666667 0 0.208333 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.125 0 0.666667 0.208333 0 0.666667 0.0833333 0.25 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 1 0 0 0.333333 0 0 0.666667 0.25 0 0.625 0.125 0.541667 0.333333 0.125 0 0 0.833333 0 0.166667 0.791667 0 0.166667 0.0416667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Original Motif Reverse Complement Backward 11 6 0.0835516 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 24 Ar Original Motif Original Motif Forward 4 6 0.0836451 Original Motif 0.375 0.291667 0.0833333 0.25 0.375 0.0833333 0.125 0.416667 0.458333 0.125 0.125 0.291667 0.666667 0.0416667 0.291667 0 0 0 0.916667 0.0833333 0.5 0.25 0.0416667 0.208333 0.875 0.0833333 0 0.0416667 0 1 0 0 0.625 0 0.333333 0.0416667 0.166667 0.375 0.0833333 0.375 0.208333 0.458333 0.0833333 0.25 0.25 0.375 0.375 0 0.125 0.208333 0.0416667 0.625 0 0 1 0 0.166667 0 0 0.833333 0.458333 0.208333 0.0416667 0.291667 0.0416667 0.916667 0.0416667 0 0.125 0.666667 0.0416667 0.166667 0.25 0.291667 0.208333 0.25 0.25 0.208333 0.375 0.166667 0.416667 0.458333 0 0.125 0.208333 0.458333 0.25 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.208333 0.25 0.458333 0.0833333 0.416667 0 0.458333 0.125 0.25 0.375 0.208333 0.166667 0.25 0.208333 0.291667 0.25 0.125 0.0416667 0.666667 0.166667 0.0416667 0.0416667 0.916667 0 0.291667 0.208333 0.0416667 0.458333 0.833333 0 0 0.166667 0 1 0 0 0.625 0.208333 0.0416667 0.125 0.25 0.375 0.375 0 0.208333 0.0833333 0.458333 0.25 0.166667 0.0833333 0.375 0.375 0.0416667 0 0.333333 0.625 0 0 1 0 0.0416667 0.0833333 0 0.875 0.208333 0.25 0.0416667 0.5 0 0.916667 0 0.0833333 0 0.0416667 0.291667 0.666667 0.291667 0.125 0.125 0.458333 0.416667 0.0833333 0.125 0.375 0.25 0.291667 0.0833333 0.375 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 27 E2F1 Original Motif Reverse Complement Forward 3 6 0.0842331 Original Motif 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0.4 0.6 0 0 0.2 0.8 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0.9 0.1 0 Reverse Complement Motif 0 0.1 0.9 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0.8 0.2 0 0 0.6 0.4 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 13 Zfp423 Original Motif Reverse Complement Forward 9 6 0.0850287 Original Motif 0.212121 0.121212 0.666667 0 0 0.484848 0.515152 0 0.484848 0.515152 0 0 0.515152 0.484848 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.030303 0.515152 0 0.454545 0.727273 0 0 0.272727 0.393939 0 0.484848 0.121212 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.515152 0.484848 0 0 0.484848 0.515152 0 0.242424 0.484848 0.272727 0.333333 0.666667 0 0 Reverse Complement Motif 0.333333 0 0.666667 0 0 0.484848 0.242424 0.272727 0.515152 0 0.484848 0 0 0.515152 0 0.484848 0 1 0 0 0 1 0 0 0.393939 0.484848 0 0.121212 0.272727 0 0 0.727273 0.030303 0 0.515152 0.454545 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.484848 0 0.515152 0.484848 0 0.515152 0 0 0.515152 0.484848 0 0.212121 0.666667 0.121212 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 1 Motif ID 7 Motif Name Motif 7 Original Motif 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.474359 0 0.525641 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 Reverse Complement Motif 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0.474359 0.525641 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 *************************************************************** Best Matches for Top Significant Motif ID 7 (Highest to Lowest) *************************************************************** Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 SP1 Original Motif Original Motif Backward 2 8 0.0423611 Original Motif 0 0.914286 0.0285714 0.0571429 0 0.857143 0.0285714 0.114286 0 1 0 0 0.114286 0.771429 0 0.114286 0.0571429 0.142857 0.428571 0.371429 0 0.8 0.0285714 0.171429 0.0285714 0.885714 0 0.0857143 0 0.685714 0.0857143 0.228571 0.171429 0.714286 0 0.114286 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.0857143 Reverse Complement Motif 0.0857143 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.171429 0 0.714286 0.114286 0 0.0857143 0.685714 0.228571 0.0285714 0 0.885714 0.0857143 0 0.0285714 0.8 0.171429 0.0571429 0.428571 0.142857 0.371429 0.114286 0 0.771429 0.114286 0 0 1 0 0 0.0285714 0.857143 0.114286 0 0.0285714 0.914286 0.0571429 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 36 Klf4 Reverse Complement Original Motif Backward 3 8 0.0461644 Original Motif 0.338561 0.0186808 0.235701 0.407057 0.0202765 0.00207373 0.976267 0.00138249 0.00322284 0.00299263 0.990792 0.00299263 0.00322061 0.00828157 0.984817 0.0036807 0.0636928 0.441941 0.00252932 0.491837 0.00506446 0.00345304 0.983656 0.00782689 0.00967073 0.0184204 0.501727 0.470182 0.0608716 0.0106064 0.8997 0.0288218 0.0283999 0.0300162 0.874856 0.0667282 0.0587419 0.660962 0.0647549 0.215541 Reverse Complement Motif 0.0587419 0.0647549 0.660962 0.215541 0.0283999 0.874856 0.0300162 0.0667282 0.0608716 0.8997 0.0106064 0.0288218 0.00967073 0.501727 0.0184204 0.470182 0.00506446 0.983656 0.00345304 0.00782689 0.491837 0.441941 0.00252932 0.0636928 0.00322061 0.984817 0.00828157 0.0036807 0.00322284 0.990792 0.00299263 0.00299263 0.0202765 0.976267 0.00207373 0.00138249 0.407057 0.0186808 0.235701 0.338561 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 28 Egr1 Original Motif Reverse Complement Backward 1 8 0.0650374 Original Motif 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0.133333 0.0666667 0.8 0 0 0.866667 0 0.133333 0 0 1 0 0 0 0.2 0.8 0.2 0 0.8 0 0.0666667 0 0.933333 0 0 0 1 0 0.133333 0.666667 0 0.2 0 0 1 0 0.0666667 0 0.466667 0.466667 Reverse Complement Motif 0.0666667 0.466667 0 0.466667 0 1 0 0 0.133333 0 0.666667 0.2 0 1 0 0 0.0666667 0.933333 0 0 0.2 0.8 0 0 0.8 0 0.2 0 0 1 0 0 0 0 0.866667 0.133333 0.133333 0.8 0.0666667 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Original Motif Original Motif Forward 7 8 0.076401 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 42 NFKB1 Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 8 0.0893429 Original Motif 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0.111111 0 0.888889 0 0.611111 0.0555556 0.333333 0 0.277778 0 0.111111 0.611111 0 0.277778 0.111111 0.611111 0 0.722222 0 0.277778 0 0.944444 0 0.0555556 0 1 0 0 0.0555556 0.833333 0.0555556 0.0555556 Reverse Complement Motif 0.0555556 0.0555556 0.833333 0.0555556 0 0 1 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.722222 0.277778 0.611111 0.277778 0.111111 0 0.611111 0 0.111111 0.277778 0 0.0555556 0.333333 0.611111 0.111111 0.888889 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 35 INSM1 Reverse Complement Original Motif Backward 5 8 0.0936832 Original Motif 0.0416667 0 0.166667 0.791667 0 0 0.833333 0.166667 0 0.333333 0.125 0.541667 0.25 0.625 0 0.125 0.666667 0 0 0.333333 0 0 1 0 0 0.0416667 0.958333 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.0833333 0.666667 0.25 0.125 0.666667 0 0.208333 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.125 0 0.666667 0.208333 0 0.666667 0.0833333 0.25 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 1 0 0 0.333333 0 0 0.666667 0.25 0 0.625 0.125 0.541667 0.333333 0.125 0 0 0.833333 0 0.166667 0.791667 0 0.166667 0.0416667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 32 EWSR1-FLI1 Reverse Complement Original Motif Forward 7 8 0.0950969 Original Motif 0 0 1 0 0.0190476 0 0.980952 0 0.990476 0 0.00952381 0 0.990476 0 0.00952381 0 0.00952381 0 0.990476 0 0.0190476 0 0.971429 0.00952381 0.980952 0 0.0190476 0 0.971429 0 0.0285714 0 0 0 0.990476 0.00952381 0 0.0190476 0.980952 0 0.942857 0.0380952 0.0190476 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0.0190476 0.980952 0 0.952381 0.0285714 0 0.0190476 0.971429 0 0.0190476 0.00952381 0.047619 0 0.92381 0.0285714 0.0285714 0.0285714 0.92381 0.0190476 Reverse Complement Motif 0.0285714 0.92381 0.0285714 0.0190476 0.047619 0.92381 0 0.0285714 0.00952381 0 0.0190476 0.971429 0.0190476 0.0285714 0 0.952381 0 0.980952 0.0190476 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0.0380952 0.0190476 0.942857 0 0.980952 0.0190476 0 0 0.990476 0 0.00952381 0 0 0.0285714 0.971429 0 0 0.0190476 0.980952 0.0190476 0.971429 0 0.00952381 0.00952381 0.990476 0 0 0 0 0.00952381 0.990476 0 0 0.00952381 0.990476 0.0190476 0.980952 0 0 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 PLAG1 Original Motif Reverse Complement Backward 1 8 0.0998932 Original Motif 0 0 1 0 0.166667 0 0.777778 0.0555556 0 0 1 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0.777778 0.222222 0 0 0.833333 0.0555556 0.111111 0.222222 0.555556 0.0555556 0.166667 0.666667 0 0 0.333333 0.611111 0.277778 0.111111 0 0.111111 0 0.777778 0.111111 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.888889 0.111111 0.111111 0 0.888889 0 Reverse Complement Motif 0.111111 0.888889 0 0 0 0.888889 0 0.111111 0 1 0 0 0 1 0 0 0.111111 0.777778 0 0.111111 0 0.277778 0.111111 0.611111 0.333333 0 0 0.666667 0.222222 0.0555556 0.555556 0.166667 0 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0.222222 0.777778 0 0 0.944444 0 0.0555556 0 1 0 0 0.166667 0.777778 0 0.0555556 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 Zfx Original Motif Original Motif Backward 3 8 0.10221 Original Motif 0.105042 0.371849 0.37605 0.147059 0.125786 0.356394 0.360587 0.157233 0.190377 0.3159 0.416318 0.0774059 0.150313 0.102296 0.622129 0.125261 0.02079 0.617464 0.299376 0.0623701 0.012474 0.752599 0.004158 0.230769 0.0623701 0.259875 0.378378 0.299376 0.397089 0.320166 0.251559 0.031185 0.018711 0.004158 0.975052 0.002079 0 0.00623701 0.991684 0.002079 0.002079 0.997921 0 0 0 0.997921 0 0.002079 0 0.004158 0 0.995842 0.174636 0.253638 0.455301 0.116424 Reverse Complement Motif 0.174636 0.455301 0.253638 0.116424 0.995842 0.004158 0 0 0 0 0.997921 0.002079 0.002079 0 0.997921 0 0 0.991684 0.00623701 0.002079 0.018711 0.975052 0.004158 0.002079 0.031185 0.320166 0.251559 0.397089 0.0623701 0.378378 0.259875 0.299376 0.012474 0.004158 0.752599 0.230769 0.02079 0.299376 0.617464 0.0623701 0.150313 0.622129 0.102296 0.125261 0.190377 0.416318 0.3159 0.0774059 0.125786 0.360587 0.356394 0.157233 0.105042 0.37605 0.371849 0.147059 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 45 Pax5 Reverse Complement Original Motif Backward 5 8 0.102497 Original Motif 0.333333 0.0833333 0.333333 0.25 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 0.25 0.25 0.166667 0.0833333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.583333 0.166667 0.0833333 0.166667 0.166667 0.416667 0.25 0.166667 0 0.25 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.666667 0.0833333 0.5 0.0833333 0.25 0.166667 0.5 0 0.166667 0.333333 0 0 1 0 0.166667 0.666667 0.0833333 0.0833333 0.25 0 0.75 0 0.0833333 0 0.333333 0.583333 0.5 0.0833333 0.416667 0 0.416667 0.0833333 0.416667 0.0833333 0.166667 0.833333 0 0 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.166667 0 0.833333 0 0.0833333 0.0833333 0.416667 0.416667 0 0.0833333 0.416667 0.5 0.583333 0 0.333333 0.0833333 0.25 0.75 0 0 0.166667 0.0833333 0.666667 0.0833333 0 1 0 0 0.333333 0 0.166667 0.5 0.166667 0.0833333 0.25 0.5 0.0833333 0.666667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.25 0.166667 0 0.166667 0.25 0.416667 0.166667 0.166667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.416667 0.166667 0.333333 0.166667 0.25 0.25 0.333333 0.333333 0.666667 0 0 0.25 0.0833333 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 26 Motif Name ArntAhr Original Motif 0.125 0.333333 0.0833333 0.458333 0 0 0.958333 0.0416667 0 0.958333 0 0.0416667 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 0 1 0 0 1 0 Reverse Complement Motif 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0.958333 0 0.0416667 0 0 0.958333 0.0416667 0 0.958333 0 0.0416667 0.458333 0.333333 0.0833333 0.125 *************************************************************** Best Matches for Top Significant Motif ID 26 (Highest to Lowest) *************************************************************** Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 Motif 11 Reverse Complement Original Motif Backward 7 6 0.0308396 Original Motif 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0.636364 0 0.363636 0.727273 0 0.272727 0 0.181818 0.818182 0 0 1 0 0 0 0 0.909091 0 0.090909 1 0 0 0 0 0.909091 0 0.090909 0.909091 0 0 0.090909 0 1 0 0 0.818182 0 0 0.181818 0 0.909091 0 0.090909 0.909091 0 0 0.090909 Reverse Complement Motif 0.090909 0 0 0.909091 0 0 0.909091 0.090909 0.181818 0 0 0.818182 0 0 1 0 0.090909 0 0 0.909091 0 0 0.909091 0.090909 0 0 0 1 0 0 0.909091 0.090909 0 0 0 1 0.181818 0 0.818182 0 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0 1 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 Motif 9 Reverse Complement Original Motif Forward 9 6 0.0350575 Original Motif 0.034483 0.931034 0.034483 0 1 0 0 0 0 0.827586 0.172414 0 0.862069 0 0 0.137931 0.103448 0.862069 0 0.034483 0.793103 0.034483 0.103448 0.068966 0.241379 0.413793 0.275862 0.068966 0.655172 0 0.344828 0 0 0.827586 0.172414 0 0.965517 0 0.034483 0 0 0.965517 0.034483 0 0.931034 0 0 0.068966 0.068966 0.931034 0 0 0.965517 0.034483 0 0 Reverse Complement Motif 0 0.034483 0 0.965517 0.068966 0 0.931034 0 0.068966 0 0 0.931034 0 0.034483 0.965517 0 0 0 0.034483 0.965517 0 0.172414 0.827586 0 0 0 0.344828 0.655172 0.241379 0.275862 0.413793 0.068966 0.068966 0.034483 0.103448 0.793103 0.103448 0 0.862069 0.034483 0.137931 0 0 0.862069 0 0.172414 0.827586 0 0 0 0 1 0.034483 0.034483 0.931034 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 7 Motif 7 Original Motif Reverse Complement Forward 1 6 0.0586538 Original Motif 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.474359 0 0.525641 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 Reverse Complement Motif 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0.474359 0.525641 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 3 Motif 3 Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 6 0.0884818 Original Motif 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0.472754 0.527246 0 0 1 0 0 0.496318 0 0 0.503682 0 0 1 0 0 0 1 0 Reverse Complement Motif 0 1 0 0 0 1 0 0 0.503682 0 0 0.496318 0 0 1 0 0 0.527246 0.472754 0 0 1 0 0 0 0 0 1 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 2 Motif 2 Reverse Complement Original Motif Forward 1 5 0.563057 Original Motif 1 0 0 0 0.483355 0.516645 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0.832898 0 0.167102 0 Reverse Complement Motif 0 0 0.167102 0.832898 0 0 1 0 0 0 0 1 0.483355 0 0.516645 0 0 0 0 1 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 6 Motif 6 Original Motif Reverse Complement Backward 3 5 0.572774 Original Motif 0 1 0 0 0.594366 0.405634 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0.63662 0 0.36338 0 0 0 1 0 0 1 0 0 Reverse Complement Motif 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0.36338 0.63662 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0.405634 0 0.594366 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 8 Motif 8 Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 5 0.581904 Original Motif 0 1 0 0 0 0.306358 0 0.693642 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 Reverse Complement Motif 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.693642 0.306358 0 0 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 4 Motif 4 Original Motif Reverse Complement Backward 3 4 1.06919 Original Motif 0 1 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0.265176 0 0.734824 0 0 1 0 0 0.591054 0 0.408946 Reverse Complement Motif 0 0 0.591054 0.408946 0 1 0 0 0.734824 0.265176 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 33 Motif Name HIF1AARNT Original Motif 0.259615 0.269231 0.471154 0 0.0961538 0.278846 0.326923 0.298077 0.75 0.0192308 0.221154 0.00961538 0 0.990385 0 0.00961538 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.173077 0.490385 0.192308 0.144231 Reverse Complement Motif 0.173077 0.192308 0.490385 0.144231 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0.990385 0.00961538 0.00961538 0.0192308 0.221154 0.75 0.0961538 0.326923 0.278846 0.298077 0.259615 0.471154 0.269231 0 *************************************************************** Best Matches for Top Significant Motif ID 33 (Highest to Lowest) *************************************************************** Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 Motif 9 Reverse Complement Original Motif Backward 2 8 0.0745994 Original Motif 0.034483 0.931034 0.034483 0 1 0 0 0 0 0.827586 0.172414 0 0.862069 0 0 0.137931 0.103448 0.862069 0 0.034483 0.793103 0.034483 0.103448 0.068966 0.241379 0.413793 0.275862 0.068966 0.655172 0 0.344828 0 0 0.827586 0.172414 0 0.965517 0 0.034483 0 0 0.965517 0.034483 0 0.931034 0 0 0.068966 0.068966 0.931034 0 0 0.965517 0.034483 0 0 Reverse Complement Motif 0 0.034483 0 0.965517 0.068966 0 0.931034 0 0.068966 0 0 0.931034 0 0.034483 0.965517 0 0 0 0.034483 0.965517 0 0.172414 0.827586 0 0 0 0.344828 0.655172 0.241379 0.275862 0.413793 0.068966 0.068966 0.034483 0.103448 0.793103 0.103448 0 0.862069 0.034483 0.137931 0 0 0.862069 0 0.172414 0.827586 0 0 0 0 1 0.034483 0.034483 0.931034 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 Motif 11 Reverse Complement Original Motif Backward 4 8 0.0850889 Original Motif 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0.636364 0 0.363636 0.727273 0 0.272727 0 0.181818 0.818182 0 0 1 0 0 0 0 0.909091 0 0.090909 1 0 0 0 0 0.909091 0 0.090909 0.909091 0 0 0.090909 0 1 0 0 0.818182 0 0 0.181818 0 0.909091 0 0.090909 0.909091 0 0 0.090909 Reverse Complement Motif 0.090909 0 0 0.909091 0 0 0.909091 0.090909 0.181818 0 0 0.818182 0 0 1 0 0.090909 0 0 0.909091 0 0 0.909091 0.090909 0 0 0 1 0 0 0.909091 0.090909 0 0 0 1 0.181818 0 0.818182 0 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0 1 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 7 Motif 7 Reverse Complement Original Motif Forward 2 7 0.588622 Original Motif 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.474359 0 0.525641 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 Reverse Complement Motif 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0.474359 0.525641 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 3 Motif 3 Reverse Complement Original Motif Backward 3 5 1.55675 Original Motif 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0.472754 0.527246 0 0 1 0 0 0.496318 0 0 0.503682 0 0 1 0 0 0 1 0 Reverse Complement Motif 0 1 0 0 0 1 0 0 0.503682 0 0 0.496318 0 0 1 0 0 0.527246 0.472754 0 0 1 0 0 0 0 0 1 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 2 Motif 2 Original Motif Reverse Complement Forward 1 5 1.57238 Original Motif 1 0 0 0 0.483355 0.516645 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0.832898 0 0.167102 0 Reverse Complement Motif 0 0 0.167102 0.832898 0 0 1 0 0 0 0 1 0.483355 0 0.516645 0 0 0 0 1 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- **************************************************************************************************************************************************************************************************** **************************************************************** Significant Motifs - Global and Local Matching (Highest to Lowest) **************************************************************** Dataset # 2 Motif ID 14 Motif Name ZEB1 Original Motif 0.0243902 0.829268 0.0243902 0.121951 0.926829 0 0.0487805 0.0243902 0 0.97561 0.0243902 0 0 0.926829 0.0731707 0 0 0.0243902 0 0.97561 0.243902 0.0243902 0.390244 0.341463 Reverse Complement Motif 0.243902 0.390244 0.0243902 0.341463 0.97561 0.0243902 0 0 0 0.0731707 0.926829 0 0 0.0243902 0.97561 0 0.0243902 0 0.0487805 0.926829 0.0243902 0.0243902 0.829268 0.121951 ******************************************************************* Best Matches for Significant Motif ID 14 (Highest to Lowest) ******************************************************************* Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 46 RORA_1 Original Motif Reverse Complement Forward 2 6 0.0141289 Original Motif 0.6 0.04 0.08 0.28 0.36 0.04 0 0.6 0.24 0.48 0.16 0.12 0.44 0.08 0.2 0.28 0.84 0 0.16 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 Reverse Complement Motif 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0.16 0.84 0.28 0.08 0.2 0.44 0.24 0.16 0.48 0.12 0.6 0.04 0 0.36 0.28 0.04 0.08 0.6 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 REST Reverse Complement Reverse Complement Forward 11 6 0.0143133 Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reverse Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 31 Esrrb Original Motif Reverse Complement Forward 1 6 0.0207244 Original Motif 0.2 0.8 0 0 0.95 0 0.05 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 Reverse Complement Motif 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0.05 0.95 0.2 0 0.8 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 25 Arnt Original Motif Reverse Complement Forward 1 6 0.0207244 Original Motif 0.2 0.8 0 0 0.95 0 0.05 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 Reverse Complement Motif 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0.05 0.95 0.2 0 0.8 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 43 NR1H2RXRA Original Motif Reverse Complement Backward 2 6 0.0232753 Original Motif 0.68 0.2 0 0.12 0.68 0.04 0.2 0.08 0.8 0 0.2 0 0 0 1 0 0 0 0.96 0.04 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.96 0 0 0.04 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.8 0.04 0.08 0.08 0 0.6 0.24 0.16 Reverse Complement Motif 0 0.24 0.6 0.16 0.08 0.04 0.08 0.8 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.04 0 0 0.96 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0.96 0 0.04 0 1 0 0 0 0 0.2 0.8 0.08 0.04 0.2 0.68 0.12 0.2 0 0.68 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 33 HIF1AARNT Original Motif Reverse Complement Forward 2 6 0.0237889 Original Motif 0.259615 0.269231 0.471154 0 0.0961538 0.278846 0.326923 0.298077 0.75 0.0192308 0.221154 0.00961538 0 0.990385 0 0.00961538 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.173077 0.490385 0.192308 0.144231 Reverse Complement Motif 0.173077 0.192308 0.490385 0.144231 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0.990385 0.00961538 0.00961538 0.0192308 0.221154 0.75 0.0961538 0.326923 0.278846 0.298077 0.259615 0.471154 0.269231 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 35 INSM1 Reverse Complement Original Motif Forward 4 6 0.0262123 Original Motif 0.0416667 0 0.166667 0.791667 0 0 0.833333 0.166667 0 0.333333 0.125 0.541667 0.25 0.625 0 0.125 0.666667 0 0 0.333333 0 0 1 0 0 0.0416667 0.958333 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.0833333 0.666667 0.25 0.125 0.666667 0 0.208333 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.125 0 0.666667 0.208333 0 0.666667 0.0833333 0.25 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 1 0 0 0.333333 0 0 0.666667 0.25 0 0.625 0.125 0.541667 0.333333 0.125 0 0 0.833333 0 0.166667 0.791667 0 0.166667 0.0416667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 PPARGRXRA Original Motif Reverse Complement Forward 2 6 0.0264837 Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reverse Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 39 MYCMAX Original Motif Reverse Complement Forward 3 6 0.0269744 Original Motif 0.333333 0.047619 0.428571 0.190476 0.714286 0.047619 0.190476 0.047619 0.0952381 0.428571 0.428571 0.047619 0.047619 0.952381 0 0 1 0 0 0 0 0.952381 0 0.047619 0.047619 0 0.952381 0 0 0.047619 0 0.952381 0 0 1 0 0.047619 0.047619 0.857143 0.047619 0.142857 0.238095 0 0.619048 Reverse Complement Motif 0.619048 0.238095 0 0.142857 0.047619 0.857143 0.047619 0.047619 0 1 0 0 0.952381 0.047619 0 0 0.047619 0.952381 0 0 0 0 0.952381 0.047619 0 0 0 1 0.047619 0 0.952381 0 0.0952381 0.428571 0.428571 0.047619 0.047619 0.047619 0.190476 0.714286 0.333333 0.428571 0.047619 0.190476 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 44 NR4A2 Original Motif Reverse Complement Backward 1 6 0.0288897 Original Motif 0.615385 0.0769231 0.230769 0.0769231 0.928571 0 0.0714286 0 0 0 0.928571 0.0714286 0.214286 0 0.785714 0 0.142857 0.142857 0 0.714286 0 0.928571 0 0.0714286 1 0 0 0 0.230769 0.615385 0.153846 0 Reverse Complement Motif 0.230769 0.153846 0.615385 0 0 0 0 1 0 0 0.928571 0.0714286 0.714286 0.142857 0 0.142857 0.214286 0.785714 0 0 0 0.928571 0 0.0714286 0 0 0.0714286 0.928571 0.0769231 0.0769231 0.230769 0.615385 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 1 Motif ID 4 Motif Name Motif 4 Original Motif 0 1 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0.265176 0 0.734824 0 0 1 0 0 0.591054 0 0.408946 Reverse Complement Motif 0 0 0.591054 0.408946 0 1 0 0 0.734824 0.265176 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 ******************************************************************* Best Matches for Significant Motif ID 4 (Highest to Lowest) ******************************************************************* Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 43 NR1H2RXRA Reverse Complement Original Motif Backward 7 6 0.012269 Original Motif 0.68 0.2 0 0.12 0.68 0.04 0.2 0.08 0.8 0 0.2 0 0 0 1 0 0 0 0.96 0.04 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.96 0 0 0.04 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.8 0.04 0.08 0.08 0 0.6 0.24 0.16 Reverse Complement Motif 0 0.24 0.6 0.16 0.08 0.04 0.08 0.8 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.04 0 0 0.96 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0.96 0 0.04 0 1 0 0 0 0 0.2 0.8 0.08 0.04 0.2 0.68 0.12 0.2 0 0.68 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 PPARGRXRA Reverse Complement Original Motif Forward 6 6 0.0140102 Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reverse Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 22 NR2F1 Reverse Complement Reverse Complement Forward 5 6 0.0186793 Original Motif 0 0 0.153846 0.846154 0.0769231 0 0.923077 0 0.923077 0 0.0769231 0 0.461538 0.538462 0 0 0 1 0 0 0 0.230769 0 0.769231 0 0.153846 0 0.846154 0.0769231 0 0 0.923077 0.153846 0 0.846154 0 0.461538 0.307692 0.230769 0 0.461538 0.384615 0.0769231 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.230769 0.461538 0 0.307692 0 0.230769 0.230769 0.538462 Reverse Complement Motif 0.538462 0.230769 0.230769 0 0.230769 0 0.461538 0.307692 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.384615 0.0769231 0.461538 0 0.307692 0.230769 0.461538 0.153846 0.846154 0 0 0.923077 0 0 0.0769231 0.846154 0.153846 0 0 0.769231 0.230769 0 0 0 0 1 0 0.461538 0 0.538462 0 0 0 0.0769231 0.923077 0.0769231 0.923077 0 0 0.846154 0 0.153846 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 34 HNF4A Reverse Complement Original Motif Forward 4 6 0.020602 Original Motif 0.41791 0.104478 0.402985 0.0746269 0.0298507 0.0298507 0.835821 0.104478 0.179104 0.0597015 0.522388 0.238806 0.0746269 0.343284 0.298507 0.283582 0.0447761 0.761194 0.0597015 0.134328 0.880597 0.0149254 0.0447761 0.0597015 0.791045 0.0298507 0.149254 0.0298507 0.835821 0.0149254 0.119403 0.0298507 0.0597015 0.0597015 0.865672 0.0149254 0.0895522 0.0298507 0.492537 0.38806 0.0447761 0.328358 0.164179 0.462687 0.0597015 0.731343 0.0746269 0.134328 0.626866 0.104478 0.149254 0.119403 Reverse Complement Motif 0.119403 0.104478 0.149254 0.626866 0.0597015 0.0746269 0.731343 0.134328 0.462687 0.328358 0.164179 0.0447761 0.0895522 0.492537 0.0298507 0.38806 0.0597015 0.865672 0.0597015 0.0149254 0.0298507 0.0149254 0.119403 0.835821 0.0298507 0.0298507 0.149254 0.791045 0.0597015 0.0149254 0.0447761 0.880597 0.0447761 0.0597015 0.761194 0.134328 0.0746269 0.298507 0.343284 0.283582 0.179104 0.522388 0.0597015 0.238806 0.0298507 0.835821 0.0298507 0.104478 0.0746269 0.104478 0.402985 0.41791 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 37 MIZF Original Motif Original Motif Backward 1 6 0.0221665 Original Motif 0.1 0.3 0.25 0.35 0.65 0.05 0 0.3 1 0 0 0 0.1 0.85 0.05 0 0 0 0.95 0.05 0 0.05 0 0.95 0 0.95 0 0.05 0 0.9 0.1 0 0 0 0.95 0.05 0.1 0.65 0.05 0.2 Reverse Complement Motif 0.1 0.05 0.65 0.2 0 0.95 0 0.05 0 0.1 0.9 0 0 0 0.95 0.05 0.95 0.05 0 0 0 0.95 0 0.05 0.1 0.05 0.85 0 0 0 0 1 0.3 0.05 0 0.65 0.35 0.3 0.25 0.1 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 35 INSM1 Reverse Complement Original Motif Forward 3 6 0.0255256 Original Motif 0.0416667 0 0.166667 0.791667 0 0 0.833333 0.166667 0 0.333333 0.125 0.541667 0.25 0.625 0 0.125 0.666667 0 0 0.333333 0 0 1 0 0 0.0416667 0.958333 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.0833333 0.666667 0.25 0.125 0.666667 0 0.208333 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.125 0 0.666667 0.208333 0 0.666667 0.0833333 0.25 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 1 0 0 0.333333 0 0 0.666667 0.25 0 0.625 0.125 0.541667 0.333333 0.125 0 0 0.833333 0 0.166667 0.791667 0 0.166667 0.0416667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 SP1 Original Motif Original Motif Forward 1 6 0.0349642 Original Motif 0 0.914286 0.0285714 0.0571429 0 0.857143 0.0285714 0.114286 0 1 0 0 0.114286 0.771429 0 0.114286 0.0571429 0.142857 0.428571 0.371429 0 0.8 0.0285714 0.171429 0.0285714 0.885714 0 0.0857143 0 0.685714 0.0857143 0.228571 0.171429 0.714286 0 0.114286 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.0857143 Reverse Complement Motif 0.0857143 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.171429 0 0.714286 0.114286 0 0.0857143 0.685714 0.228571 0.0285714 0 0.885714 0.0857143 0 0.0285714 0.8 0.171429 0.0571429 0.428571 0.142857 0.371429 0.114286 0 0.771429 0.114286 0 0 1 0 0 0.0285714 0.857143 0.114286 0 0.0285714 0.914286 0.0571429 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 REST Original Motif Reverse Complement Forward 3 6 0.0376108 Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reverse Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 8 Motif 8 Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 6 0.0446026 Original Motif 0 1 0 0 0 0.306358 0 0.693642 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 Reverse Complement Motif 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.693642 0.306358 0 0 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 Zfx Reverse Complement Original Motif Backward 6 6 0.0448449 Original Motif 0.105042 0.371849 0.37605 0.147059 0.125786 0.356394 0.360587 0.157233 0.190377 0.3159 0.416318 0.0774059 0.150313 0.102296 0.622129 0.125261 0.02079 0.617464 0.299376 0.0623701 0.012474 0.752599 0.004158 0.230769 0.0623701 0.259875 0.378378 0.299376 0.397089 0.320166 0.251559 0.031185 0.018711 0.004158 0.975052 0.002079 0 0.00623701 0.991684 0.002079 0.002079 0.997921 0 0 0 0.997921 0 0.002079 0 0.004158 0 0.995842 0.174636 0.253638 0.455301 0.116424 Reverse Complement Motif 0.174636 0.455301 0.253638 0.116424 0.995842 0.004158 0 0 0 0 0.997921 0.002079 0.002079 0 0.997921 0 0 0.991684 0.00623701 0.002079 0.018711 0.975052 0.004158 0.002079 0.031185 0.320166 0.251559 0.397089 0.0623701 0.378378 0.259875 0.299376 0.012474 0.004158 0.752599 0.230769 0.02079 0.299376 0.617464 0.0623701 0.150313 0.622129 0.102296 0.125261 0.190377 0.416318 0.3159 0.0774059 0.125786 0.360587 0.356394 0.157233 0.105042 0.37605 0.371849 0.147059 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 1 Motif ID 5 Motif Name Motif 5 Original Motif 1 0 0 0 0 0 0 1 0.165712 0 0.39748 0.436808 0 0 0 1 0.436426 0.563574 0 0 Reverse Complement Motif 0.436426 0 0.563574 0 1 0 0 0 0.436808 0 0.39748 0.165712 1 0 0 0 0 0 0 1 ******************************************************************* Best Matches for Significant Motif ID 5 (Highest to Lowest) ******************************************************************* Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 10 5 0.0256083 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 10 Motif 10 Reverse Complement Reverse Complement Backward 9 5 0.0260117 Original Motif 0.169492 0 0 0.830508 0.169492 0.033898 0.372881 0.423729 0.152542 0 0.305085 0.542373 0.20339 0 0 0.79661 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0.20339 0.576271 0.220339 0.271186 0.135593 0.0508471 0.542374 0.016949 0.152542 0.033898 0.796611 0.016949 0 0.101695 0.881356 0.084746 0 0.135593 0.779661 0.050847 0 0.067797 0.881356 0 0.169492 0.152542 0.677966 0 0 0.169492 0.830508 Reverse Complement Motif 0.830508 0 0.169492 0 0.677966 0.169492 0.152542 0 0.881356 0 0.067797 0.050847 0.779661 0 0.135593 0.084746 0.881356 0 0.101695 0.016949 0.796611 0.152542 0.033898 0.016949 0.542374 0.135593 0.0508471 0.271186 0 0.576271 0.20339 0.220339 1 0 0 0 1 0 0 0 0.79661 0 0 0.20339 0.542373 0 0.305085 0.152542 0.423729 0.033898 0.372881 0.169492 0.830508 0 0 0.169492 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 44 NR4A2 Reverse Complement Original Motif Backward 4 5 0.0276382 Original Motif 0.615385 0.0769231 0.230769 0.0769231 0.928571 0 0.0714286 0 0 0 0.928571 0.0714286 0.214286 0 0.785714 0 0.142857 0.142857 0 0.714286 0 0.928571 0 0.0714286 1 0 0 0 0.230769 0.615385 0.153846 0 Reverse Complement Motif 0.230769 0.153846 0.615385 0 0 0 0 1 0 0 0.928571 0.0714286 0.714286 0.142857 0 0.142857 0.214286 0.785714 0 0 0 0.928571 0 0.0714286 0 0 0.0714286 0.928571 0.0769231 0.0769231 0.230769 0.615385 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 22 NR2F1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 3 5 0.0279129 Original Motif 0 0 0.153846 0.846154 0.0769231 0 0.923077 0 0.923077 0 0.0769231 0 0.461538 0.538462 0 0 0 1 0 0 0 0.230769 0 0.769231 0 0.153846 0 0.846154 0.0769231 0 0 0.923077 0.153846 0 0.846154 0 0.461538 0.307692 0.230769 0 0.461538 0.384615 0.0769231 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.230769 0.461538 0 0.307692 0 0.230769 0.230769 0.538462 Reverse Complement Motif 0.538462 0.230769 0.230769 0 0.230769 0 0.461538 0.307692 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.384615 0.0769231 0.461538 0 0.307692 0.230769 0.461538 0.153846 0.846154 0 0 0.923077 0 0 0.0769231 0.846154 0.153846 0 0 0.769231 0.230769 0 0 0 0 1 0 0.461538 0 0.538462 0 0 0 0.0769231 0.923077 0.0769231 0.923077 0 0 0.846154 0 0.153846 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 43 NR1H2RXRA Original Motif Original Motif Forward 10 5 0.0292478 Original Motif 0.68 0.2 0 0.12 0.68 0.04 0.2 0.08 0.8 0 0.2 0 0 0 1 0 0 0 0.96 0.04 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.96 0 0 0.04 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.8 0.04 0.08 0.08 0 0.6 0.24 0.16 Reverse Complement Motif 0 0.24 0.6 0.16 0.08 0.04 0.08 0.8 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.04 0 0 0.96 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0.96 0 0.04 0 1 0 0 0 0 0.2 0.8 0.08 0.04 0.2 0.68 0.12 0.2 0 0.68 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 37 MIZF Original Motif Original Motif Backward 4 5 0.0292478 Original Motif 0.1 0.3 0.25 0.35 0.65 0.05 0 0.3 1 0 0 0 0.1 0.85 0.05 0 0 0 0.95 0.05 0 0.05 0 0.95 0 0.95 0 0.05 0 0.9 0.1 0 0 0 0.95 0.05 0.1 0.65 0.05 0.2 Reverse Complement Motif 0.1 0.05 0.65 0.2 0 0.95 0 0.05 0 0.1 0.9 0 0 0 0.95 0.05 0.95 0.05 0 0 0 0.95 0 0.05 0.1 0.05 0.85 0 0 0 0 1 0.3 0.05 0 0.65 0.35 0.3 0.25 0.1 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 PPARGRXRA Original Motif Reverse Complement Forward 5 5 0.0305369 Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reverse Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 REST Original Motif Reverse Complement Forward 5 5 0.0315454 Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reverse Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 47 RXRRAR_DR5 Original Motif Original Motif Forward 1 5 0.0335956 Original Motif 0.521739 0 0.478261 0 0 0 1 0 0.0434783 0 0.565217 0.391304 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.782609 0.130435 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.173913 0.304348 0.217391 0.304348 0.217391 0.347826 0.391304 0.0434783 0.217391 0.173913 0.478261 0.130435 0.565217 0.0434783 0.304348 0.0869565 0.217391 0.26087 0.521739 0 0.73913 0.130435 0.130435 0 0.0434783 0.0434783 0.869565 0.0434783 0 0.0434783 0.695652 0.26087 0.0869565 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0434783 0.73913 0.130435 0.0869565 0.913043 0 0.0434783 0.0434783 Reverse Complement Motif 0.0434783 0 0.0434783 0.913043 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0869565 0.73913 0.0434783 0.130435 0.0869565 0 0.695652 0.0434783 0.26087 0.0434783 0.869565 0.0434783 0.0434783 0 0.130435 0.130435 0.73913 0.217391 0.521739 0.26087 0 0.0869565 0.0434783 0.304348 0.565217 0.217391 0.478261 0.173913 0.130435 0.217391 0.391304 0.347826 0.0434783 0.173913 0.217391 0.304348 0.304348 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.130435 0.782609 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.0434783 0.565217 0 0.391304 0 1 0 0 0 0 0.478261 0.521739 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 46 RORA_1 Reverse Complement Original Motif Forward 4 5 0.0336052 Original Motif 0.6 0.04 0.08 0.28 0.36 0.04 0 0.6 0.24 0.48 0.16 0.12 0.44 0.08 0.2 0.28 0.84 0 0.16 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 Reverse Complement Motif 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0.16 0.84 0.28 0.08 0.2 0.44 0.24 0.16 0.48 0.12 0.6 0.04 0 0.36 0.28 0.04 0.08 0.6 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 26 Motif Name ArntAhr Original Motif 0.125 0.333333 0.0833333 0.458333 0 0 0.958333 0.0416667 0 0.958333 0 0.0416667 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 0 1 0 0 1 0 Reverse Complement Motif 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0.958333 0 0.0416667 0 0 0.958333 0.0416667 0 0.958333 0 0.0416667 0.458333 0.333333 0.0833333 0.125 ******************************************************************* Best Matches for Significant Motif ID 26 (Highest to Lowest) ******************************************************************* Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 28 Egr1 Original Motif Original Motif Backward 6 6 0 Original Motif 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0.133333 0.0666667 0.8 0 0 0.866667 0 0.133333 0 0 1 0 0 0 0.2 0.8 0.2 0 0.8 0 0.0666667 0 0.933333 0 0 0 1 0 0.133333 0.666667 0 0.2 0 0 1 0 0.0666667 0 0.466667 0.466667 Reverse Complement Motif 0.0666667 0.466667 0 0.466667 0 1 0 0 0.133333 0 0.666667 0.2 0 1 0 0 0.0666667 0.933333 0 0 0.2 0.8 0 0 0.8 0 0.2 0 0 1 0 0 0 0 0.866667 0.133333 0.133333 0.8 0.0666667 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 33 HIF1AARNT Original Motif Original Motif Backward 2 6 0.0112447 Original Motif 0.259615 0.269231 0.471154 0 0.0961538 0.278846 0.326923 0.298077 0.75 0.0192308 0.221154 0.00961538 0 0.990385 0 0.00961538 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.173077 0.490385 0.192308 0.144231 Reverse Complement Motif 0.173077 0.192308 0.490385 0.144231 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0.990385 0.00961538 0.00961538 0.0192308 0.221154 0.75 0.0961538 0.326923 0.278846 0.298077 0.259615 0.471154 0.269231 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 Motif 11 Reverse Complement Original Motif Backward 7 6 0.0308396 Original Motif 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0.636364 0 0.363636 0.727273 0 0.272727 0 0.181818 0.818182 0 0 1 0 0 0 0 0.909091 0 0.090909 1 0 0 0 0 0.909091 0 0.090909 0.909091 0 0 0.090909 0 1 0 0 0.818182 0 0 0.181818 0 0.909091 0 0.090909 0.909091 0 0 0.090909 Reverse Complement Motif 0.090909 0 0 0.909091 0 0 0.909091 0.090909 0.181818 0 0 0.818182 0 0 1 0 0.090909 0 0 0.909091 0 0 0.909091 0.090909 0 0 0 1 0 0 0.909091 0.090909 0 0 0 1 0.181818 0 0.818182 0 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0 1 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 25 Arnt Original Motif Original Motif Forward 1 6 0.0315972 Original Motif 0.2 0.8 0 0 0.95 0 0.05 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 Reverse Complement Motif 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0.05 0.95 0.2 0 0.8 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 31 Esrrb Original Motif Original Motif Backward 1 6 0.0315972 Original Motif 0.2 0.8 0 0 0.95 0 0.05 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 Reverse Complement Motif 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0.05 0.95 0.2 0 0.8 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 Motif 9 Reverse Complement Original Motif Backward 1 6 0.0350575 Original Motif 0.034483 0.931034 0.034483 0 1 0 0 0 0 0.827586 0.172414 0 0.862069 0 0 0.137931 0.103448 0.862069 0 0.034483 0.793103 0.034483 0.103448 0.068966 0.241379 0.413793 0.275862 0.068966 0.655172 0 0.344828 0 0 0.827586 0.172414 0 0.965517 0 0.034483 0 0 0.965517 0.034483 0 0.931034 0 0 0.068966 0.068966 0.931034 0 0 0.965517 0.034483 0 0 Reverse Complement Motif 0 0.034483 0 0.965517 0.068966 0 0.931034 0 0.068966 0 0 0.931034 0 0.034483 0.965517 0 0 0 0.034483 0.965517 0 0.172414 0.827586 0 0 0 0.344828 0.655172 0.241379 0.275862 0.413793 0.068966 0.068966 0.034483 0.103448 0.793103 0.103448 0 0.862069 0.034483 0.137931 0 0 0.862069 0 0.172414 0.827586 0 0 0 0 1 0.034483 0.034483 0.931034 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 39 MYCMAX Original Motif Original Motif Backward 3 6 0.0376488 Original Motif 0.333333 0.047619 0.428571 0.190476 0.714286 0.047619 0.190476 0.047619 0.0952381 0.428571 0.428571 0.047619 0.047619 0.952381 0 0 1 0 0 0 0 0.952381 0 0.047619 0.047619 0 0.952381 0 0 0.047619 0 0.952381 0 0 1 0 0.047619 0.047619 0.857143 0.047619 0.142857 0.238095 0 0.619048 Reverse Complement Motif 0.619048 0.238095 0 0.142857 0.047619 0.857143 0.047619 0.047619 0 1 0 0 0.952381 0.047619 0 0 0.047619 0.952381 0 0 0 0 0.952381 0.047619 0 0 0 1 0.047619 0 0.952381 0 0.0952381 0.428571 0.428571 0.047619 0.047619 0.047619 0.190476 0.714286 0.333333 0.428571 0.047619 0.190476 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 40 Mycn Original Motif Reverse Complement Forward 3 6 0.0377949 Original Motif 0.349315 0.363014 0.143836 0.143836 0.0890411 0.388128 0.447489 0.0753425 0.0159817 0.984018 0 0 0.945205 0 0.0410959 0.0136986 0 0.961187 0.0182648 0.0205479 0.0707763 0.00228311 0.924658 0.00228311 0.0547945 0.221461 0.00456621 0.719178 0 0 0.938356 0.0616438 0.0616438 0.111872 0.739726 0.086758 0.139269 0.605023 0.0913242 0.164384 Reverse Complement Motif 0.139269 0.0913242 0.605023 0.164384 0.0616438 0.739726 0.111872 0.086758 0 0.938356 0 0.0616438 0.719178 0.221461 0.00456621 0.0547945 0.0707763 0.924658 0.00228311 0.00228311 0 0.0182648 0.961187 0.0205479 0.0136986 0 0.0410959 0.945205 0.0159817 0 0.984018 0 0.0890411 0.447489 0.388128 0.0753425 0.349315 0.143836 0.363014 0.143836 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 38 Myc Original Motif Reverse Complement Backward 3 6 0.0399214 Original Motif 0.295154 0.422907 0.15859 0.123348 0.14978 0.23348 0.572687 0.0440529 0.0352423 0.964758 0 0 0.955947 0.0176211 0.0220264 0.00440529 0 0.933921 0.0132159 0.0528634 0.0837004 0.00881057 0.898678 0.00881057 0.0396476 0.193833 0 0.76652 0 0.00881057 0.951542 0.0396476 0 0.0748899 0.806167 0.118943 0.198238 0.471366 0.105727 0.22467 Reverse Complement Motif 0.198238 0.105727 0.471366 0.22467 0 0.806167 0.0748899 0.118943 0 0.951542 0.00881057 0.0396476 0.76652 0.193833 0 0.0396476 0.0837004 0.898678 0.00881057 0.00881057 0 0.0132159 0.933921 0.0528634 0.00440529 0.0176211 0.0220264 0.955947 0.0352423 0 0.964758 0 0.14978 0.572687 0.23348 0.0440529 0.295154 0.15859 0.422907 0.123348 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Original Motif Reverse Complement Forward 9 6 0.0433081 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 1 Motif ID 6 Motif Name Motif 6 Original Motif 0 1 0 0 0.594366 0.405634 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0.63662 0 0.36338 0 0 0 1 0 0 1 0 0 Reverse Complement Motif 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0.36338 0.63662 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0.405634 0 0.594366 0 0 1 0 ******************************************************************* Best Matches for Significant Motif ID 6 (Highest to Lowest) ******************************************************************* Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 REST Original Motif Original Motif Forward 3 7 0.0205607 Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reverse Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 37 MIZF Reverse Complement Reverse Complement Backward 4 7 0.0322623 Original Motif 0.1 0.3 0.25 0.35 0.65 0.05 0 0.3 1 0 0 0 0.1 0.85 0.05 0 0 0 0.95 0.05 0 0.05 0 0.95 0 0.95 0 0.05 0 0.9 0.1 0 0 0 0.95 0.05 0.1 0.65 0.05 0.2 Reverse Complement Motif 0.1 0.05 0.65 0.2 0 0.95 0 0.05 0 0.1 0.9 0 0 0 0.95 0.05 0.95 0.05 0 0 0 0.95 0 0.05 0.1 0.05 0.85 0 0 0 0 1 0.3 0.05 0 0.65 0.35 0.3 0.25 0.1 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 Zfx Original Motif Original Motif Forward 5 7 0.038091 Original Motif 0.105042 0.371849 0.37605 0.147059 0.125786 0.356394 0.360587 0.157233 0.190377 0.3159 0.416318 0.0774059 0.150313 0.102296 0.622129 0.125261 0.02079 0.617464 0.299376 0.0623701 0.012474 0.752599 0.004158 0.230769 0.0623701 0.259875 0.378378 0.299376 0.397089 0.320166 0.251559 0.031185 0.018711 0.004158 0.975052 0.002079 0 0.00623701 0.991684 0.002079 0.002079 0.997921 0 0 0 0.997921 0 0.002079 0 0.004158 0 0.995842 0.174636 0.253638 0.455301 0.116424 Reverse Complement Motif 0.174636 0.455301 0.253638 0.116424 0.995842 0.004158 0 0 0 0 0.997921 0.002079 0.002079 0 0.997921 0 0 0.991684 0.00623701 0.002079 0.018711 0.975052 0.004158 0.002079 0.031185 0.320166 0.251559 0.397089 0.0623701 0.378378 0.259875 0.299376 0.012474 0.004158 0.752599 0.230769 0.02079 0.299376 0.617464 0.0623701 0.150313 0.622129 0.102296 0.125261 0.190377 0.416318 0.3159 0.0774059 0.125786 0.360587 0.356394 0.157233 0.105042 0.37605 0.371849 0.147059 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 15 TFAP2A Original Motif Reverse Complement Forward 3 7 0.0393168 Original Motif 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.118919 0.383784 0.248649 0.248649 0.102703 0.308108 0.32973 0.259459 0.297297 0.237838 0.362162 0.102703 0.286486 0.162162 0.491892 0.0594595 0.102703 0.0864865 0.740541 0.0702703 0.0486486 0.421622 0.427027 0.102703 Reverse Complement Motif 0.0486486 0.427027 0.421622 0.102703 0.102703 0.740541 0.0864865 0.0702703 0.286486 0.491892 0.162162 0.0594595 0.297297 0.362162 0.237838 0.102703 0.102703 0.32973 0.308108 0.259459 0.118919 0.248649 0.383784 0.248649 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 7 Motif 7 Original Motif Original Motif Forward 2 7 0.0443244 Original Motif 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.474359 0 0.525641 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 Reverse Complement Motif 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0.474359 0.525641 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 45 Pax5 Reverse Complement Reverse Complement Forward 8 7 0.0448462 Original Motif 0.333333 0.0833333 0.333333 0.25 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 0.25 0.25 0.166667 0.0833333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.583333 0.166667 0.0833333 0.166667 0.166667 0.416667 0.25 0.166667 0 0.25 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.666667 0.0833333 0.5 0.0833333 0.25 0.166667 0.5 0 0.166667 0.333333 0 0 1 0 0.166667 0.666667 0.0833333 0.0833333 0.25 0 0.75 0 0.0833333 0 0.333333 0.583333 0.5 0.0833333 0.416667 0 0.416667 0.0833333 0.416667 0.0833333 0.166667 0.833333 0 0 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.166667 0 0.833333 0 0.0833333 0.0833333 0.416667 0.416667 0 0.0833333 0.416667 0.5 0.583333 0 0.333333 0.0833333 0.25 0.75 0 0 0.166667 0.0833333 0.666667 0.0833333 0 1 0 0 0.333333 0 0.166667 0.5 0.166667 0.0833333 0.25 0.5 0.0833333 0.666667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.25 0.166667 0 0.166667 0.25 0.416667 0.166667 0.166667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.416667 0.166667 0.333333 0.166667 0.25 0.25 0.333333 0.333333 0.666667 0 0 0.25 0.0833333 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 28 Egr1 Reverse Complement Original Motif Backward 2 7 0.0453576 Original Motif 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0.133333 0.0666667 0.8 0 0 0.866667 0 0.133333 0 0 1 0 0 0 0.2 0.8 0.2 0 0.8 0 0.0666667 0 0.933333 0 0 0 1 0 0.133333 0.666667 0 0.2 0 0 1 0 0.0666667 0 0.466667 0.466667 Reverse Complement Motif 0.0666667 0.466667 0 0.466667 0 1 0 0 0.133333 0 0.666667 0.2 0 1 0 0 0.0666667 0.933333 0 0 0.2 0.8 0 0 0.8 0 0.2 0 0 1 0 0 0 0 0.866667 0.133333 0.133333 0.8 0.0666667 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 36 Klf4 Original Motif Reverse Complement Backward 3 7 0.0476958 Original Motif 0.338561 0.0186808 0.235701 0.407057 0.0202765 0.00207373 0.976267 0.00138249 0.00322284 0.00299263 0.990792 0.00299263 0.00322061 0.00828157 0.984817 0.0036807 0.0636928 0.441941 0.00252932 0.491837 0.00506446 0.00345304 0.983656 0.00782689 0.00967073 0.0184204 0.501727 0.470182 0.0608716 0.0106064 0.8997 0.0288218 0.0283999 0.0300162 0.874856 0.0667282 0.0587419 0.660962 0.0647549 0.215541 Reverse Complement Motif 0.0587419 0.0647549 0.660962 0.215541 0.0283999 0.874856 0.0300162 0.0667282 0.0608716 0.8997 0.0106064 0.0288218 0.00967073 0.501727 0.0184204 0.470182 0.00506446 0.983656 0.00345304 0.00782689 0.491837 0.441941 0.00252932 0.0636928 0.00322061 0.984817 0.00828157 0.0036807 0.00322284 0.990792 0.00299263 0.00299263 0.0202765 0.976267 0.00207373 0.00138249 0.407057 0.0186808 0.235701 0.338561 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 SP1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 4 7 0.0490991 Original Motif 0 0.914286 0.0285714 0.0571429 0 0.857143 0.0285714 0.114286 0 1 0 0 0.114286 0.771429 0 0.114286 0.0571429 0.142857 0.428571 0.371429 0 0.8 0.0285714 0.171429 0.0285714 0.885714 0 0.0857143 0 0.685714 0.0857143 0.228571 0.171429 0.714286 0 0.114286 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.0857143 Reverse Complement Motif 0.0857143 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.171429 0 0.714286 0.114286 0 0.0857143 0.685714 0.228571 0.0285714 0 0.885714 0.0857143 0 0.0285714 0.8 0.171429 0.0571429 0.428571 0.142857 0.371429 0.114286 0 0.771429 0.114286 0 0 1 0 0 0.0285714 0.857143 0.114286 0 0.0285714 0.914286 0.0571429 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Reverse Complement Reverse Complement Forward 6 7 0.0498726 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 1 Motif ID 2 Motif Name Motif 2 Original Motif 1 0 0 0 0.483355 0.516645 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0.832898 0 0.167102 0 Reverse Complement Motif 0 0 0.167102 0.832898 0 0 1 0 0 0 0 1 0.483355 0 0.516645 0 0 0 0 1 ******************************************************************* Best Matches for Significant Motif ID 2 (Highest to Lowest) ******************************************************************* Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 Motif 11 Original Motif Original Motif Backward 5 5 0 Original Motif 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0.636364 0 0.363636 0.727273 0 0.272727 0 0.181818 0.818182 0 0 1 0 0 0 0 0.909091 0 0.090909 1 0 0 0 0 0.909091 0 0.090909 0.909091 0 0 0.090909 0 1 0 0 0.818182 0 0 0.181818 0 0.909091 0 0.090909 0.909091 0 0 0.090909 Reverse Complement Motif 0.090909 0 0 0.909091 0 0 0.909091 0.090909 0.181818 0 0 0.818182 0 0 1 0 0.090909 0 0 0.909091 0 0 0.909091 0.090909 0 0 0 1 0 0 0.909091 0.090909 0 0 0 1 0.181818 0 0.818182 0 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0 1 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 Motif 9 Reverse Complement Reverse Complement Backward 10 5 0.0040753 Original Motif 0.034483 0.931034 0.034483 0 1 0 0 0 0 0.827586 0.172414 0 0.862069 0 0 0.137931 0.103448 0.862069 0 0.034483 0.793103 0.034483 0.103448 0.068966 0.241379 0.413793 0.275862 0.068966 0.655172 0 0.344828 0 0 0.827586 0.172414 0 0.965517 0 0.034483 0 0 0.965517 0.034483 0 0.931034 0 0 0.068966 0.068966 0.931034 0 0 0.965517 0.034483 0 0 Reverse Complement Motif 0 0.034483 0 0.965517 0.068966 0 0.931034 0 0.068966 0 0 0.931034 0 0.034483 0.965517 0 0 0 0.034483 0.965517 0 0.172414 0.827586 0 0 0 0.344828 0.655172 0.241379 0.275862 0.413793 0.068966 0.068966 0.034483 0.103448 0.793103 0.103448 0 0.862069 0.034483 0.137931 0 0 0.862069 0 0.172414 0.827586 0 0 0 0 1 0.034483 0.034483 0.931034 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Original Motif Original Motif Forward 6 5 0.0243918 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 10 Motif 10 Original Motif Reverse Complement Backward 6 5 0.0394919 Original Motif 0.169492 0 0 0.830508 0.169492 0.033898 0.372881 0.423729 0.152542 0 0.305085 0.542373 0.20339 0 0 0.79661 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0.20339 0.576271 0.220339 0.271186 0.135593 0.0508471 0.542374 0.016949 0.152542 0.033898 0.796611 0.016949 0 0.101695 0.881356 0.084746 0 0.135593 0.779661 0.050847 0 0.067797 0.881356 0 0.169492 0.152542 0.677966 0 0 0.169492 0.830508 Reverse Complement Motif 0.830508 0 0.169492 0 0.677966 0.169492 0.152542 0 0.881356 0 0.067797 0.050847 0.779661 0 0.135593 0.084746 0.881356 0 0.101695 0.016949 0.796611 0.152542 0.033898 0.016949 0.542374 0.135593 0.0508471 0.271186 0 0.576271 0.20339 0.220339 1 0 0 0 1 0 0 0 0.79661 0 0 0.20339 0.542373 0 0.305085 0.152542 0.423729 0.033898 0.372881 0.169492 0.830508 0 0 0.169492 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 24 Ar Original Motif Original Motif Backward 14 5 0.0429088 Original Motif 0.375 0.291667 0.0833333 0.25 0.375 0.0833333 0.125 0.416667 0.458333 0.125 0.125 0.291667 0.666667 0.0416667 0.291667 0 0 0 0.916667 0.0833333 0.5 0.25 0.0416667 0.208333 0.875 0.0833333 0 0.0416667 0 1 0 0 0.625 0 0.333333 0.0416667 0.166667 0.375 0.0833333 0.375 0.208333 0.458333 0.0833333 0.25 0.25 0.375 0.375 0 0.125 0.208333 0.0416667 0.625 0 0 1 0 0.166667 0 0 0.833333 0.458333 0.208333 0.0416667 0.291667 0.0416667 0.916667 0.0416667 0 0.125 0.666667 0.0416667 0.166667 0.25 0.291667 0.208333 0.25 0.25 0.208333 0.375 0.166667 0.416667 0.458333 0 0.125 0.208333 0.458333 0.25 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.208333 0.25 0.458333 0.0833333 0.416667 0 0.458333 0.125 0.25 0.375 0.208333 0.166667 0.25 0.208333 0.291667 0.25 0.125 0.0416667 0.666667 0.166667 0.0416667 0.0416667 0.916667 0 0.291667 0.208333 0.0416667 0.458333 0.833333 0 0 0.166667 0 1 0 0 0.625 0.208333 0.0416667 0.125 0.25 0.375 0.375 0 0.208333 0.0833333 0.458333 0.25 0.166667 0.0833333 0.375 0.375 0.0416667 0 0.333333 0.625 0 0 1 0 0.0416667 0.0833333 0 0.875 0.208333 0.25 0.0416667 0.5 0 0.916667 0 0.0833333 0 0.0416667 0.291667 0.666667 0.291667 0.125 0.125 0.458333 0.416667 0.0833333 0.125 0.375 0.25 0.291667 0.0833333 0.375 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 PPARGRXRA Reverse Complement Reverse Complement Backward 6 5 0.0595073 Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reverse Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 26 ArntAhr Reverse Complement Original Motif Backward 2 5 0.0600161 Original Motif 0.125 0.333333 0.0833333 0.458333 0 0 0.958333 0.0416667 0 0.958333 0 0.0416667 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 0 1 0 0 1 0 Reverse Complement Motif 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0.958333 0 0.0416667 0 0 0.958333 0.0416667 0 0.958333 0 0.0416667 0.458333 0.333333 0.0833333 0.125 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 45 Pax5 Original Motif Reverse Complement Backward 11 5 0.0620995 Original Motif 0.333333 0.0833333 0.333333 0.25 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 0.25 0.25 0.166667 0.0833333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.583333 0.166667 0.0833333 0.166667 0.166667 0.416667 0.25 0.166667 0 0.25 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.666667 0.0833333 0.5 0.0833333 0.25 0.166667 0.5 0 0.166667 0.333333 0 0 1 0 0.166667 0.666667 0.0833333 0.0833333 0.25 0 0.75 0 0.0833333 0 0.333333 0.583333 0.5 0.0833333 0.416667 0 0.416667 0.0833333 0.416667 0.0833333 0.166667 0.833333 0 0 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.166667 0 0.833333 0 0.0833333 0.0833333 0.416667 0.416667 0 0.0833333 0.416667 0.5 0.583333 0 0.333333 0.0833333 0.25 0.75 0 0 0.166667 0.0833333 0.666667 0.0833333 0 1 0 0 0.333333 0 0.166667 0.5 0.166667 0.0833333 0.25 0.5 0.0833333 0.666667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.25 0.166667 0 0.166667 0.25 0.416667 0.166667 0.166667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.416667 0.166667 0.333333 0.166667 0.25 0.25 0.333333 0.333333 0.666667 0 0 0.25 0.0833333 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 22 NR2F1 Original Motif Reverse Complement Forward 7 5 0.0650242 Original Motif 0 0 0.153846 0.846154 0.0769231 0 0.923077 0 0.923077 0 0.0769231 0 0.461538 0.538462 0 0 0 1 0 0 0 0.230769 0 0.769231 0 0.153846 0 0.846154 0.0769231 0 0 0.923077 0.153846 0 0.846154 0 0.461538 0.307692 0.230769 0 0.461538 0.384615 0.0769231 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.230769 0.461538 0 0.307692 0 0.230769 0.230769 0.538462 Reverse Complement Motif 0.538462 0.230769 0.230769 0 0.230769 0 0.461538 0.307692 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.384615 0.0769231 0.461538 0 0.307692 0.230769 0.461538 0.153846 0.846154 0 0 0.923077 0 0 0.0769231 0.846154 0.153846 0 0 0.769231 0.230769 0 0 0 0 1 0 0.461538 0 0.538462 0 0 0 0.0769231 0.923077 0.0769231 0.923077 0 0 0.846154 0 0.153846 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 35 INSM1 Reverse Complement Original Motif Forward 1 5 0.0670984 Original Motif 0.0416667 0 0.166667 0.791667 0 0 0.833333 0.166667 0 0.333333 0.125 0.541667 0.25 0.625 0 0.125 0.666667 0 0 0.333333 0 0 1 0 0 0.0416667 0.958333 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.0833333 0.666667 0.25 0.125 0.666667 0 0.208333 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.125 0 0.666667 0.208333 0 0.666667 0.0833333 0.25 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 1 0 0 0.333333 0 0 0.666667 0.25 0 0.625 0.125 0.541667 0.333333 0.125 0 0 0.833333 0 0.166667 0.791667 0 0.166667 0.0416667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 23 Motif Name MZF1_1-4 Original Motif 0.15 0.25 0.2 0.4 0 0 0.95 0.05 0.1 0 0.9 0 0 0 0.95 0.05 0 0 1 0 0.9 0 0.1 0 Reverse Complement Motif 0 0 0.1 0.9 0 1 0 0 0 0.95 0 0.05 0.1 0.9 0 0 0 0.95 0 0.05 0.4 0.25 0.2 0.15 ******************************************************************* Best Matches for Significant Motif ID 23 (Highest to Lowest) ******************************************************************* Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 35 INSM1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 5 6 0.0276389 Original Motif 0.0416667 0 0.166667 0.791667 0 0 0.833333 0.166667 0 0.333333 0.125 0.541667 0.25 0.625 0 0.125 0.666667 0 0 0.333333 0 0 1 0 0 0.0416667 0.958333 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.0833333 0.666667 0.25 0.125 0.666667 0 0.208333 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.125 0 0.666667 0.208333 0 0.666667 0.0833333 0.25 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 1 0 0 0.333333 0 0 0.666667 0.25 0 0.625 0.125 0.541667 0.333333 0.125 0 0 0.833333 0 0.166667 0.791667 0 0.166667 0.0416667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 41 MZF1_5-13 Original Motif Original Motif Backward 2 6 0.0314583 Original Motif 0.0625 0.25 0.4375 0.25 0.125 0 0.4375 0.4375 0.9375 0.0625 0 0 0 0 0.6875 0.3125 0 0 0.9375 0.0625 0 0.125 0.875 0 0 0 0.875 0.125 0.1875 0.0625 0.5 0.25 0.625 0 0.25 0.125 0.5 0.125 0.25 0.125 Reverse Complement Motif 0.125 0.125 0.25 0.5 0.125 0 0.25 0.625 0.1875 0.5 0.0625 0.25 0 0.875 0 0.125 0 0.875 0.125 0 0 0.9375 0 0.0625 0 0.6875 0 0.3125 0 0.0625 0 0.9375 0.125 0.4375 0 0.4375 0.0625 0.4375 0.25 0.25 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 36 Klf4 Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 6 0.0406514 Original Motif 0.338561 0.0186808 0.235701 0.407057 0.0202765 0.00207373 0.976267 0.00138249 0.00322284 0.00299263 0.990792 0.00299263 0.00322061 0.00828157 0.984817 0.0036807 0.0636928 0.441941 0.00252932 0.491837 0.00506446 0.00345304 0.983656 0.00782689 0.00967073 0.0184204 0.501727 0.470182 0.0608716 0.0106064 0.8997 0.0288218 0.0283999 0.0300162 0.874856 0.0667282 0.0587419 0.660962 0.0647549 0.215541 Reverse Complement Motif 0.0587419 0.0647549 0.660962 0.215541 0.0283999 0.874856 0.0300162 0.0667282 0.0608716 0.8997 0.0106064 0.0288218 0.00967073 0.501727 0.0184204 0.470182 0.00506446 0.983656 0.00345304 0.00782689 0.491837 0.441941 0.00252932 0.0636928 0.00322061 0.984817 0.00828157 0.0036807 0.00322284 0.990792 0.00299263 0.00299263 0.0202765 0.976267 0.00207373 0.00138249 0.407057 0.0186808 0.235701 0.338561 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 PLAG1 Original Motif Original Motif Backward 1 6 0.0412963 Original Motif 0 0 1 0 0.166667 0 0.777778 0.0555556 0 0 1 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0.777778 0.222222 0 0 0.833333 0.0555556 0.111111 0.222222 0.555556 0.0555556 0.166667 0.666667 0 0 0.333333 0.611111 0.277778 0.111111 0 0.111111 0 0.777778 0.111111 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.888889 0.111111 0.111111 0 0.888889 0 Reverse Complement Motif 0.111111 0.888889 0 0 0 0.888889 0 0.111111 0 1 0 0 0 1 0 0 0.111111 0.777778 0 0.111111 0 0.277778 0.111111 0.611111 0.333333 0 0 0.666667 0.222222 0.0555556 0.555556 0.166667 0 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0.222222 0.777778 0 0 0.944444 0 0.0555556 0 1 0 0 0.166667 0.777778 0 0.0555556 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 8 Motif 8 Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 6 0.0426517 Original Motif 0 1 0 0 0 0.306358 0 0.693642 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 Reverse Complement Motif 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.693642 0.306358 0 0 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 SP1 Original Motif Reverse Complement Forward 5 6 0.0464881 Original Motif 0 0.914286 0.0285714 0.0571429 0 0.857143 0.0285714 0.114286 0 1 0 0 0.114286 0.771429 0 0.114286 0.0571429 0.142857 0.428571 0.371429 0 0.8 0.0285714 0.171429 0.0285714 0.885714 0 0.0857143 0 0.685714 0.0857143 0.228571 0.171429 0.714286 0 0.114286 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.0857143 Reverse Complement Motif 0.0857143 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.171429 0 0.714286 0.114286 0 0.0857143 0.685714 0.228571 0.0285714 0 0.885714 0.0857143 0 0.0285714 0.8 0.171429 0.0571429 0.428571 0.142857 0.371429 0.114286 0 0.771429 0.114286 0 0 1 0 0 0.0285714 0.857143 0.114286 0 0.0285714 0.914286 0.0571429 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Reverse Complement Original Motif Backward 11 6 0.0493561 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 42 NFKB1 Reverse Complement Original Motif Forward 6 6 0.0521759 Original Motif 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0.111111 0 0.888889 0 0.611111 0.0555556 0.333333 0 0.277778 0 0.111111 0.611111 0 0.277778 0.111111 0.611111 0 0.722222 0 0.277778 0 0.944444 0 0.0555556 0 1 0 0 0.0555556 0.833333 0.0555556 0.0555556 Reverse Complement Motif 0.0555556 0.0555556 0.833333 0.0555556 0 0 1 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.722222 0.277778 0.611111 0.277778 0.111111 0 0.611111 0 0.111111 0.277778 0 0.0555556 0.333333 0.611111 0.111111 0.888889 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 REST Reverse Complement Reverse Complement Forward 6 6 0.0581528 Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reverse Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 24 Ar Reverse Complement Original Motif Forward 15 6 0.0585417 Original Motif 0.375 0.291667 0.0833333 0.25 0.375 0.0833333 0.125 0.416667 0.458333 0.125 0.125 0.291667 0.666667 0.0416667 0.291667 0 0 0 0.916667 0.0833333 0.5 0.25 0.0416667 0.208333 0.875 0.0833333 0 0.0416667 0 1 0 0 0.625 0 0.333333 0.0416667 0.166667 0.375 0.0833333 0.375 0.208333 0.458333 0.0833333 0.25 0.25 0.375 0.375 0 0.125 0.208333 0.0416667 0.625 0 0 1 0 0.166667 0 0 0.833333 0.458333 0.208333 0.0416667 0.291667 0.0416667 0.916667 0.0416667 0 0.125 0.666667 0.0416667 0.166667 0.25 0.291667 0.208333 0.25 0.25 0.208333 0.375 0.166667 0.416667 0.458333 0 0.125 0.208333 0.458333 0.25 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.208333 0.25 0.458333 0.0833333 0.416667 0 0.458333 0.125 0.25 0.375 0.208333 0.166667 0.25 0.208333 0.291667 0.25 0.125 0.0416667 0.666667 0.166667 0.0416667 0.0416667 0.916667 0 0.291667 0.208333 0.0416667 0.458333 0.833333 0 0 0.166667 0 1 0 0 0.625 0.208333 0.0416667 0.125 0.25 0.375 0.375 0 0.208333 0.0833333 0.458333 0.25 0.166667 0.0833333 0.375 0.375 0.0416667 0 0.333333 0.625 0 0 1 0 0.0416667 0.0833333 0 0.875 0.208333 0.25 0.0416667 0.5 0 0.916667 0 0.0833333 0 0.0416667 0.291667 0.666667 0.291667 0.125 0.125 0.458333 0.416667 0.0833333 0.125 0.375 0.25 0.291667 0.0833333 0.375 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 44 Motif Name NR4A2 Original Motif 0.615385 0.0769231 0.230769 0.0769231 0.928571 0 0.0714286 0 0 0 0.928571 0.0714286 0.214286 0 0.785714 0 0.142857 0.142857 0 0.714286 0 0.928571 0 0.0714286 1 0 0 0 0.230769 0.615385 0.153846 0 Reverse Complement Motif 0.230769 0.153846 0.615385 0 0 0 0 1 0 0 0.928571 0.0714286 0.714286 0.142857 0 0.142857 0.214286 0.785714 0 0 0 0.928571 0 0.0714286 0 0 0.0714286 0.928571 0.0769231 0.0769231 0.230769 0.615385 ******************************************************************* Best Matches for Significant Motif ID 44 (Highest to Lowest) ******************************************************************* Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 43 NR1H2RXRA Original Motif Original Motif Backward 9 8 0.0167759 Original Motif 0.68 0.2 0 0.12 0.68 0.04 0.2 0.08 0.8 0 0.2 0 0 0 1 0 0 0 0.96 0.04 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.96 0 0 0.04 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.8 0.04 0.08 0.08 0 0.6 0.24 0.16 Reverse Complement Motif 0 0.24 0.6 0.16 0.08 0.04 0.08 0.8 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.04 0 0 0.96 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0.96 0 0.04 0 1 0 0 0 0 0.2 0.8 0.08 0.04 0.2 0.68 0.12 0.2 0 0.68 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 29 ESR1 Original Motif Original Motif Forward 5 8 0.0195235 Original Motif 0.261242 0.256959 0.329764 0.152034 0.228632 0.17094 0.350427 0.25 0.136752 0.369658 0.318376 0.175214 0.176596 0.487234 0.138298 0.197872 0.285106 0.493617 0.1 0.121277 0.651163 0.0591966 0.188161 0.10148 0.0759494 0.0168776 0.816456 0.0907173 0.04 0.0378947 0.884211 0.0378947 0.0694737 0.0863158 0.191579 0.652632 0.00842105 0.829474 0.111579 0.0505263 0.837895 0.0273684 0.0568421 0.0778947 0.122105 0.526316 0.225263 0.126316 0.132632 0.581053 0.111579 0.174737 0.134737 0.543158 0.204211 0.117895 0.0673684 0.04 0.0168421 0.875789 0.0442105 0.0463158 0.896842 0.0126316 0.642105 0.223158 0.0652632 0.0694737 0.0210526 0.917895 0.0252632 0.0357895 0.124211 0.743158 0.00421053 0.128421 0.0547368 0.347368 0.0463158 0.551579 Reverse Complement Motif 0.551579 0.347368 0.0463158 0.0547368 0.124211 0.00421053 0.743158 0.128421 0.0210526 0.0252632 0.917895 0.0357895 0.0694737 0.223158 0.0652632 0.642105 0.0442105 0.896842 0.0463158 0.0126316 0.875789 0.04 0.0168421 0.0673684 0.134737 0.204211 0.543158 0.117895 0.132632 0.111579 0.581053 0.174737 0.122105 0.225263 0.526316 0.126316 0.0778947 0.0273684 0.0568421 0.837895 0.00842105 0.111579 0.829474 0.0505263 0.652632 0.0863158 0.191579 0.0694737 0.04 0.884211 0.0378947 0.0378947 0.0759494 0.816456 0.0168776 0.0907173 0.10148 0.0591966 0.188161 0.651163 0.285106 0.1 0.493617 0.121277 0.176596 0.138298 0.487234 0.197872 0.136752 0.318376 0.369658 0.175214 0.228632 0.350427 0.17094 0.25 0.261242 0.329764 0.256959 0.152034 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 30 ESR2 Original Motif Original Motif Backward 10 8 0.0198372 Original Motif 0.218487 0.45098 0.176471 0.154062 0.442577 0.142857 0.114846 0.29972 0.521008 0.0420168 0.431373 0.00560224 0.0756303 0 0.770308 0.154062 0.0504202 0.0560224 0.893557 0 0.0364146 0.0532213 0.092437 0.817927 0 1 0 0 0.943978 0.00280112 0 0.0532213 0.137255 0.344538 0.316527 0.201681 0.179272 0.176471 0.417367 0.226891 0.145658 0.170868 0.411765 0.271709 0.0588235 0.092437 0.0672269 0.781513 0.176471 0.070028 0.742297 0.0112045 0.498599 0.277311 0.0532213 0.170868 0.0952381 0.7507 0.00560224 0.148459 0.128852 0.809524 0 0.0616246 0.0756303 0.252101 0 0.672269 0.168067 0.263305 0.380952 0.187675 Reverse Complement Motif 0.168067 0.380952 0.263305 0.187675 0.672269 0.252101 0 0.0756303 0.128852 0 0.809524 0.0616246 0.0952381 0.00560224 0.7507 0.148459 0.170868 0.277311 0.0532213 0.498599 0.176471 0.742297 0.070028 0.0112045 0.781513 0.092437 0.0672269 0.0588235 0.145658 0.411765 0.170868 0.271709 0.179272 0.417367 0.176471 0.226891 0.137255 0.316527 0.344538 0.201681 0.0532213 0.00280112 0 0.943978 0 0 1 0 0.817927 0.0532213 0.092437 0.0364146 0.0504202 0.893557 0.0560224 0 0.0756303 0.770308 0 0.154062 0.00560224 0.0420168 0.431373 0.521008 0.29972 0.142857 0.114846 0.442577 0.218487 0.176471 0.45098 0.154062 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 24 Ar Reverse Complement Reverse Complement Backward 3 8 0.0487608 Original Motif 0.375 0.291667 0.0833333 0.25 0.375 0.0833333 0.125 0.416667 0.458333 0.125 0.125 0.291667 0.666667 0.0416667 0.291667 0 0 0 0.916667 0.0833333 0.5 0.25 0.0416667 0.208333 0.875 0.0833333 0 0.0416667 0 1 0 0 0.625 0 0.333333 0.0416667 0.166667 0.375 0.0833333 0.375 0.208333 0.458333 0.0833333 0.25 0.25 0.375 0.375 0 0.125 0.208333 0.0416667 0.625 0 0 1 0 0.166667 0 0 0.833333 0.458333 0.208333 0.0416667 0.291667 0.0416667 0.916667 0.0416667 0 0.125 0.666667 0.0416667 0.166667 0.25 0.291667 0.208333 0.25 0.25 0.208333 0.375 0.166667 0.416667 0.458333 0 0.125 0.208333 0.458333 0.25 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.208333 0.25 0.458333 0.0833333 0.416667 0 0.458333 0.125 0.25 0.375 0.208333 0.166667 0.25 0.208333 0.291667 0.25 0.125 0.0416667 0.666667 0.166667 0.0416667 0.0416667 0.916667 0 0.291667 0.208333 0.0416667 0.458333 0.833333 0 0 0.166667 0 1 0 0 0.625 0.208333 0.0416667 0.125 0.25 0.375 0.375 0 0.208333 0.0833333 0.458333 0.25 0.166667 0.0833333 0.375 0.375 0.0416667 0 0.333333 0.625 0 0 1 0 0.0416667 0.0833333 0 0.875 0.208333 0.25 0.0416667 0.5 0 0.916667 0 0.0833333 0 0.0416667 0.291667 0.666667 0.291667 0.125 0.125 0.458333 0.416667 0.0833333 0.125 0.375 0.25 0.291667 0.0833333 0.375 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 PPARGRXRA Original Motif Original Motif Forward 2 8 0.0495607 Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reverse Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 22 NR2F1 Original Motif Reverse Complement Forward 7 8 0.0564874 Original Motif 0 0 0.153846 0.846154 0.0769231 0 0.923077 0 0.923077 0 0.0769231 0 0.461538 0.538462 0 0 0 1 0 0 0 0.230769 0 0.769231 0 0.153846 0 0.846154 0.0769231 0 0 0.923077 0.153846 0 0.846154 0 0.461538 0.307692 0.230769 0 0.461538 0.384615 0.0769231 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.230769 0.461538 0 0.307692 0 0.230769 0.230769 0.538462 Reverse Complement Motif 0.538462 0.230769 0.230769 0 0.230769 0 0.461538 0.307692 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.384615 0.0769231 0.461538 0 0.307692 0.230769 0.461538 0.153846 0.846154 0 0 0.923077 0 0 0.0769231 0.846154 0.153846 0 0 0.769231 0.230769 0 0 0 0 1 0 0.461538 0 0.538462 0 0 0 0.0769231 0.923077 0.0769231 0.923077 0 0 0.846154 0 0.153846 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 REST Reverse Complement Reverse Complement Backward 10 8 0.0594649 Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reverse Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 Zfx Reverse Complement Original Motif Backward 7 8 0.0631514 Original Motif 0.105042 0.371849 0.37605 0.147059 0.125786 0.356394 0.360587 0.157233 0.190377 0.3159 0.416318 0.0774059 0.150313 0.102296 0.622129 0.125261 0.02079 0.617464 0.299376 0.0623701 0.012474 0.752599 0.004158 0.230769 0.0623701 0.259875 0.378378 0.299376 0.397089 0.320166 0.251559 0.031185 0.018711 0.004158 0.975052 0.002079 0 0.00623701 0.991684 0.002079 0.002079 0.997921 0 0 0 0.997921 0 0.002079 0 0.004158 0 0.995842 0.174636 0.253638 0.455301 0.116424 Reverse Complement Motif 0.174636 0.455301 0.253638 0.116424 0.995842 0.004158 0 0 0 0 0.997921 0.002079 0.002079 0 0.997921 0 0 0.991684 0.00623701 0.002079 0.018711 0.975052 0.004158 0.002079 0.031185 0.320166 0.251559 0.397089 0.0623701 0.378378 0.259875 0.299376 0.012474 0.004158 0.752599 0.230769 0.02079 0.299376 0.617464 0.0623701 0.150313 0.622129 0.102296 0.125261 0.190377 0.416318 0.3159 0.0774059 0.125786 0.360587 0.356394 0.157233 0.105042 0.37605 0.371849 0.147059 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 4 8 0.0720656 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 48 Tcfcp2l1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 8 0.0740998 Original Motif 0.00196754 0.92548 0.0627152 0.00983768 0.069973 0.807513 0.00540142 0.117113 0.594508 0.00514832 0.275803 0.12454 0.0058838 0.0237803 0.967149 0.00318706 0.175477 0.33627 0.0256975 0.462555 0.0983847 0.28928 0.0621635 0.550171 0.173924 0.39726 0.151174 0.277642 0.357213 0.224939 0.252323 0.165526 0.63154 0.0696822 0.190954 0.107824 0.394421 0.0513824 0.310497 0.2437 0.00366928 0.933219 0.0547945 0.00831703 0.0617193 0.812148 0.00293902 0.123194 0.536555 0.00736016 0.305937 0.150147 0.0120393 0.0289926 0.954791 0.0041769 Reverse Complement Motif 0.0120393 0.954791 0.0289926 0.0041769 0.150147 0.00736016 0.305937 0.536555 0.0617193 0.00293902 0.812148 0.123194 0.00366928 0.0547945 0.933219 0.00831703 0.2437 0.0513824 0.310497 0.394421 0.107824 0.0696822 0.190954 0.63154 0.165526 0.224939 0.252323 0.357213 0.173924 0.151174 0.39726 0.277642 0.550171 0.28928 0.0621635 0.0983847 0.462555 0.33627 0.0256975 0.175477 0.0058838 0.967149 0.0237803 0.00318706 0.12454 0.00514832 0.275803 0.594508 0.069973 0.00540142 0.807513 0.117113 0.00196754 0.0627152 0.92548 0.00983768 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 15 Motif Name TFAP2A Original Motif 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.118919 0.383784 0.248649 0.248649 0.102703 0.308108 0.32973 0.259459 0.297297 0.237838 0.362162 0.102703 0.286486 0.162162 0.491892 0.0594595 0.102703 0.0864865 0.740541 0.0702703 0.0486486 0.421622 0.427027 0.102703 Reverse Complement Motif 0.0486486 0.427027 0.421622 0.102703 0.102703 0.740541 0.0864865 0.0702703 0.286486 0.491892 0.162162 0.0594595 0.297297 0.362162 0.237838 0.102703 0.102703 0.32973 0.308108 0.259459 0.118919 0.248649 0.383784 0.248649 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 ******************************************************************* Best Matches for Significant Motif ID 15 (Highest to Lowest) ******************************************************************* Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 Zfx Reverse Complement Original Motif Backward 3 9 0.0131247 Original Motif 0.105042 0.371849 0.37605 0.147059 0.125786 0.356394 0.360587 0.157233 0.190377 0.3159 0.416318 0.0774059 0.150313 0.102296 0.622129 0.125261 0.02079 0.617464 0.299376 0.0623701 0.012474 0.752599 0.004158 0.230769 0.0623701 0.259875 0.378378 0.299376 0.397089 0.320166 0.251559 0.031185 0.018711 0.004158 0.975052 0.002079 0 0.00623701 0.991684 0.002079 0.002079 0.997921 0 0 0 0.997921 0 0.002079 0 0.004158 0 0.995842 0.174636 0.253638 0.455301 0.116424 Reverse Complement Motif 0.174636 0.455301 0.253638 0.116424 0.995842 0.004158 0 0 0 0 0.997921 0.002079 0.002079 0 0.997921 0 0 0.991684 0.00623701 0.002079 0.018711 0.975052 0.004158 0.002079 0.031185 0.320166 0.251559 0.397089 0.0623701 0.378378 0.259875 0.299376 0.012474 0.004158 0.752599 0.230769 0.02079 0.299376 0.617464 0.0623701 0.150313 0.622129 0.102296 0.125261 0.190377 0.416318 0.3159 0.0774059 0.125786 0.360587 0.356394 0.157233 0.105042 0.37605 0.371849 0.147059 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 PLAG1 Original Motif Original Motif Forward 4 9 0.0414588 Original Motif 0 0 1 0 0.166667 0 0.777778 0.0555556 0 0 1 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0.777778 0.222222 0 0 0.833333 0.0555556 0.111111 0.222222 0.555556 0.0555556 0.166667 0.666667 0 0 0.333333 0.611111 0.277778 0.111111 0 0.111111 0 0.777778 0.111111 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.888889 0.111111 0.111111 0 0.888889 0 Reverse Complement Motif 0.111111 0.888889 0 0 0 0.888889 0 0.111111 0 1 0 0 0 1 0 0 0.111111 0.777778 0 0.111111 0 0.277778 0.111111 0.611111 0.333333 0 0 0.666667 0.222222 0.0555556 0.555556 0.166667 0 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0.222222 0.777778 0 0 0.944444 0 0.0555556 0 1 0 0 0.166667 0.777778 0 0.0555556 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 13 Zfp423 Reverse Complement Reverse Complement Backward 4 9 0.0438157 Original Motif 0.212121 0.121212 0.666667 0 0 0.484848 0.515152 0 0.484848 0.515152 0 0 0.515152 0.484848 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.030303 0.515152 0 0.454545 0.727273 0 0 0.272727 0.393939 0 0.484848 0.121212 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.515152 0.484848 0 0 0.484848 0.515152 0 0.242424 0.484848 0.272727 0.333333 0.666667 0 0 Reverse Complement Motif 0.333333 0 0.666667 0 0 0.484848 0.242424 0.272727 0.515152 0 0.484848 0 0 0.515152 0 0.484848 0 1 0 0 0 1 0 0 0.393939 0.484848 0 0.121212 0.272727 0 0 0.727273 0.030303 0 0.515152 0.454545 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.484848 0 0.515152 0.484848 0 0.515152 0 0 0.515152 0.484848 0 0.212121 0.666667 0.121212 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 29 ESR1 Original Motif Reverse Complement Backward 2 9 0.0450672 Original Motif 0.261242 0.256959 0.329764 0.152034 0.228632 0.17094 0.350427 0.25 0.136752 0.369658 0.318376 0.175214 0.176596 0.487234 0.138298 0.197872 0.285106 0.493617 0.1 0.121277 0.651163 0.0591966 0.188161 0.10148 0.0759494 0.0168776 0.816456 0.0907173 0.04 0.0378947 0.884211 0.0378947 0.0694737 0.0863158 0.191579 0.652632 0.00842105 0.829474 0.111579 0.0505263 0.837895 0.0273684 0.0568421 0.0778947 0.122105 0.526316 0.225263 0.126316 0.132632 0.581053 0.111579 0.174737 0.134737 0.543158 0.204211 0.117895 0.0673684 0.04 0.0168421 0.875789 0.0442105 0.0463158 0.896842 0.0126316 0.642105 0.223158 0.0652632 0.0694737 0.0210526 0.917895 0.0252632 0.0357895 0.124211 0.743158 0.00421053 0.128421 0.0547368 0.347368 0.0463158 0.551579 Reverse Complement Motif 0.551579 0.347368 0.0463158 0.0547368 0.124211 0.00421053 0.743158 0.128421 0.0210526 0.0252632 0.917895 0.0357895 0.0694737 0.223158 0.0652632 0.642105 0.0442105 0.896842 0.0463158 0.0126316 0.875789 0.04 0.0168421 0.0673684 0.134737 0.204211 0.543158 0.117895 0.132632 0.111579 0.581053 0.174737 0.122105 0.225263 0.526316 0.126316 0.0778947 0.0273684 0.0568421 0.837895 0.00842105 0.111579 0.829474 0.0505263 0.652632 0.0863158 0.191579 0.0694737 0.04 0.884211 0.0378947 0.0378947 0.0759494 0.816456 0.0168776 0.0907173 0.10148 0.0591966 0.188161 0.651163 0.285106 0.1 0.493617 0.121277 0.176596 0.138298 0.487234 0.197872 0.136752 0.318376 0.369658 0.175214 0.228632 0.350427 0.17094 0.25 0.261242 0.329764 0.256959 0.152034 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 30 ESR2 Reverse Complement Reverse Complement Forward 6 9 0.0531668 Original Motif 0.218487 0.45098 0.176471 0.154062 0.442577 0.142857 0.114846 0.29972 0.521008 0.0420168 0.431373 0.00560224 0.0756303 0 0.770308 0.154062 0.0504202 0.0560224 0.893557 0 0.0364146 0.0532213 0.092437 0.817927 0 1 0 0 0.943978 0.00280112 0 0.0532213 0.137255 0.344538 0.316527 0.201681 0.179272 0.176471 0.417367 0.226891 0.145658 0.170868 0.411765 0.271709 0.0588235 0.092437 0.0672269 0.781513 0.176471 0.070028 0.742297 0.0112045 0.498599 0.277311 0.0532213 0.170868 0.0952381 0.7507 0.00560224 0.148459 0.128852 0.809524 0 0.0616246 0.0756303 0.252101 0 0.672269 0.168067 0.263305 0.380952 0.187675 Reverse Complement Motif 0.168067 0.380952 0.263305 0.187675 0.672269 0.252101 0 0.0756303 0.128852 0 0.809524 0.0616246 0.0952381 0.00560224 0.7507 0.148459 0.170868 0.277311 0.0532213 0.498599 0.176471 0.742297 0.070028 0.0112045 0.781513 0.092437 0.0672269 0.0588235 0.145658 0.411765 0.170868 0.271709 0.179272 0.417367 0.176471 0.226891 0.137255 0.316527 0.344538 0.201681 0.0532213 0.00280112 0 0.943978 0 0 1 0 0.817927 0.0532213 0.092437 0.0364146 0.0504202 0.893557 0.0560224 0 0.0756303 0.770308 0 0.154062 0.00560224 0.0420168 0.431373 0.521008 0.29972 0.142857 0.114846 0.442577 0.218487 0.176471 0.45098 0.154062 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 40 Mycn Reverse Complement Original Motif Forward 2 9 0.0550803 Original Motif 0.349315 0.363014 0.143836 0.143836 0.0890411 0.388128 0.447489 0.0753425 0.0159817 0.984018 0 0 0.945205 0 0.0410959 0.0136986 0 0.961187 0.0182648 0.0205479 0.0707763 0.00228311 0.924658 0.00228311 0.0547945 0.221461 0.00456621 0.719178 0 0 0.938356 0.0616438 0.0616438 0.111872 0.739726 0.086758 0.139269 0.605023 0.0913242 0.164384 Reverse Complement Motif 0.139269 0.0913242 0.605023 0.164384 0.0616438 0.739726 0.111872 0.086758 0 0.938356 0 0.0616438 0.719178 0.221461 0.00456621 0.0547945 0.0707763 0.924658 0.00228311 0.00228311 0 0.0182648 0.961187 0.0205479 0.0136986 0 0.0410959 0.945205 0.0159817 0 0.984018 0 0.0890411 0.447489 0.388128 0.0753425 0.349315 0.143836 0.363014 0.143836 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 45 Pax5 Original Motif Reverse Complement Backward 5 9 0.0581255 Original Motif 0.333333 0.0833333 0.333333 0.25 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 0.25 0.25 0.166667 0.0833333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.583333 0.166667 0.0833333 0.166667 0.166667 0.416667 0.25 0.166667 0 0.25 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.666667 0.0833333 0.5 0.0833333 0.25 0.166667 0.5 0 0.166667 0.333333 0 0 1 0 0.166667 0.666667 0.0833333 0.0833333 0.25 0 0.75 0 0.0833333 0 0.333333 0.583333 0.5 0.0833333 0.416667 0 0.416667 0.0833333 0.416667 0.0833333 0.166667 0.833333 0 0 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.166667 0 0.833333 0 0.0833333 0.0833333 0.416667 0.416667 0 0.0833333 0.416667 0.5 0.583333 0 0.333333 0.0833333 0.25 0.75 0 0 0.166667 0.0833333 0.666667 0.0833333 0 1 0 0 0.333333 0 0.166667 0.5 0.166667 0.0833333 0.25 0.5 0.0833333 0.666667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.25 0.166667 0 0.166667 0.25 0.416667 0.166667 0.166667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.416667 0.166667 0.333333 0.166667 0.25 0.25 0.333333 0.333333 0.666667 0 0 0.25 0.0833333 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 47 RXRRAR_DR5 Original Motif Original Motif Forward 3 9 0.0606062 Original Motif 0.521739 0 0.478261 0 0 0 1 0 0.0434783 0 0.565217 0.391304 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.782609 0.130435 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.173913 0.304348 0.217391 0.304348 0.217391 0.347826 0.391304 0.0434783 0.217391 0.173913 0.478261 0.130435 0.565217 0.0434783 0.304348 0.0869565 0.217391 0.26087 0.521739 0 0.73913 0.130435 0.130435 0 0.0434783 0.0434783 0.869565 0.0434783 0 0.0434783 0.695652 0.26087 0.0869565 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0434783 0.73913 0.130435 0.0869565 0.913043 0 0.0434783 0.0434783 Reverse Complement Motif 0.0434783 0 0.0434783 0.913043 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0869565 0.73913 0.0434783 0.130435 0.0869565 0 0.695652 0.0434783 0.26087 0.0434783 0.869565 0.0434783 0.0434783 0 0.130435 0.130435 0.73913 0.217391 0.521739 0.26087 0 0.0869565 0.0434783 0.304348 0.565217 0.217391 0.478261 0.173913 0.130435 0.217391 0.391304 0.347826 0.0434783 0.173913 0.217391 0.304348 0.304348 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.130435 0.782609 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.0434783 0.565217 0 0.391304 0 1 0 0 0 0 0.478261 0.521739 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 38 Myc Reverse Complement Original Motif Backward 1 9 0.0613455 Original Motif 0.295154 0.422907 0.15859 0.123348 0.14978 0.23348 0.572687 0.0440529 0.0352423 0.964758 0 0 0.955947 0.0176211 0.0220264 0.00440529 0 0.933921 0.0132159 0.0528634 0.0837004 0.00881057 0.898678 0.00881057 0.0396476 0.193833 0 0.76652 0 0.00881057 0.951542 0.0396476 0 0.0748899 0.806167 0.118943 0.198238 0.471366 0.105727 0.22467 Reverse Complement Motif 0.198238 0.105727 0.471366 0.22467 0 0.806167 0.0748899 0.118943 0 0.951542 0.00881057 0.0396476 0.76652 0.193833 0 0.0396476 0.0837004 0.898678 0.00881057 0.00881057 0 0.0132159 0.933921 0.0528634 0.00440529 0.0176211 0.0220264 0.955947 0.0352423 0 0.964758 0 0.14978 0.572687 0.23348 0.0440529 0.295154 0.15859 0.422907 0.123348 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 48 Tcfcp2l1 Original Motif Original Motif Backward 3 9 0.0631412 Original Motif 0.00196754 0.92548 0.0627152 0.00983768 0.069973 0.807513 0.00540142 0.117113 0.594508 0.00514832 0.275803 0.12454 0.0058838 0.0237803 0.967149 0.00318706 0.175477 0.33627 0.0256975 0.462555 0.0983847 0.28928 0.0621635 0.550171 0.173924 0.39726 0.151174 0.277642 0.357213 0.224939 0.252323 0.165526 0.63154 0.0696822 0.190954 0.107824 0.394421 0.0513824 0.310497 0.2437 0.00366928 0.933219 0.0547945 0.00831703 0.0617193 0.812148 0.00293902 0.123194 0.536555 0.00736016 0.305937 0.150147 0.0120393 0.0289926 0.954791 0.0041769 Reverse Complement Motif 0.0120393 0.954791 0.0289926 0.0041769 0.150147 0.00736016 0.305937 0.536555 0.0617193 0.00293902 0.812148 0.123194 0.00366928 0.0547945 0.933219 0.00831703 0.2437 0.0513824 0.310497 0.394421 0.107824 0.0696822 0.190954 0.63154 0.165526 0.224939 0.252323 0.357213 0.173924 0.151174 0.39726 0.277642 0.550171 0.28928 0.0621635 0.0983847 0.462555 0.33627 0.0256975 0.175477 0.0058838 0.967149 0.0237803 0.00318706 0.12454 0.00514832 0.275803 0.594508 0.069973 0.00540142 0.807513 0.117113 0.00196754 0.0627152 0.92548 0.00983768 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 31 Motif Name Esrrb Original Motif 0.2 0.8 0 0 0.95 0 0.05 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 Reverse Complement Motif 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0.05 0.95 0.2 0 0.8 0 ******************************************************************* Best Matches for Significant Motif ID 31 (Highest to Lowest) ******************************************************************* Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 25 Arnt Original Motif Original Motif Forward 1 6 0 Original Motif 0.2 0.8 0 0 0.95 0 0.05 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 Reverse Complement Motif 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0.05 0.95 0.2 0 0.8 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 39 MYCMAX Reverse Complement Reverse Complement Backward 4 6 0.0143849 Original Motif 0.333333 0.047619 0.428571 0.190476 0.714286 0.047619 0.190476 0.047619 0.0952381 0.428571 0.428571 0.047619 0.047619 0.952381 0 0 1 0 0 0 0 0.952381 0 0.047619 0.047619 0 0.952381 0 0 0.047619 0 0.952381 0 0 1 0 0.047619 0.047619 0.857143 0.047619 0.142857 0.238095 0 0.619048 Reverse Complement Motif 0.619048 0.238095 0 0.142857 0.047619 0.857143 0.047619 0.047619 0 1 0 0 0.952381 0.047619 0 0 0.047619 0.952381 0 0 0 0 0.952381 0.047619 0 0 0 1 0.047619 0 0.952381 0 0.0952381 0.428571 0.428571 0.047619 0.047619 0.047619 0.190476 0.714286 0.333333 0.428571 0.047619 0.190476 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 38 Myc Original Motif Original Motif Backward 3 6 0.0267529 Original Motif 0.295154 0.422907 0.15859 0.123348 0.14978 0.23348 0.572687 0.0440529 0.0352423 0.964758 0 0 0.955947 0.0176211 0.0220264 0.00440529 0 0.933921 0.0132159 0.0528634 0.0837004 0.00881057 0.898678 0.00881057 0.0396476 0.193833 0 0.76652 0 0.00881057 0.951542 0.0396476 0 0.0748899 0.806167 0.118943 0.198238 0.471366 0.105727 0.22467 Reverse Complement Motif 0.198238 0.105727 0.471366 0.22467 0 0.806167 0.0748899 0.118943 0 0.951542 0.00881057 0.0396476 0.76652 0.193833 0 0.0396476 0.0837004 0.898678 0.00881057 0.00881057 0 0.0132159 0.933921 0.0528634 0.00440529 0.0176211 0.0220264 0.955947 0.0352423 0 0.964758 0 0.14978 0.572687 0.23348 0.0440529 0.295154 0.15859 0.422907 0.123348 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 40 Mycn Original Motif Original Motif Forward 3 6 0.0272641 Original Motif 0.349315 0.363014 0.143836 0.143836 0.0890411 0.388128 0.447489 0.0753425 0.0159817 0.984018 0 0 0.945205 0 0.0410959 0.0136986 0 0.961187 0.0182648 0.0205479 0.0707763 0.00228311 0.924658 0.00228311 0.0547945 0.221461 0.00456621 0.719178 0 0 0.938356 0.0616438 0.0616438 0.111872 0.739726 0.086758 0.139269 0.605023 0.0913242 0.164384 Reverse Complement Motif 0.139269 0.0913242 0.605023 0.164384 0.0616438 0.739726 0.111872 0.086758 0 0.938356 0 0.0616438 0.719178 0.221461 0.00456621 0.0547945 0.0707763 0.924658 0.00228311 0.00228311 0 0.0182648 0.961187 0.0205479 0.0136986 0 0.0410959 0.945205 0.0159817 0 0.984018 0 0.0890411 0.447489 0.388128 0.0753425 0.349315 0.143836 0.363014 0.143836 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 33 HIF1AARNT Original Motif Original Motif Forward 2 6 0.0347756 Original Motif 0.259615 0.269231 0.471154 0 0.0961538 0.278846 0.326923 0.298077 0.75 0.0192308 0.221154 0.00961538 0 0.990385 0 0.00961538 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.173077 0.490385 0.192308 0.144231 Reverse Complement Motif 0.173077 0.192308 0.490385 0.144231 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0.990385 0.00961538 0.00961538 0.0192308 0.221154 0.75 0.0961538 0.326923 0.278846 0.298077 0.259615 0.471154 0.269231 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 26 ArntAhr Original Motif Original Motif Backward 1 6 0.065625 Original Motif 0.125 0.333333 0.0833333 0.458333 0 0 0.958333 0.0416667 0 0.958333 0 0.0416667 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 0 1 0 0 1 0 Reverse Complement Motif 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0.958333 0 0.0416667 0 0 0.958333 0.0416667 0 0.958333 0 0.0416667 0.458333 0.333333 0.0833333 0.125 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 14 ZEB1 Original Motif Reverse Complement Forward 1 6 0.0689533 Original Motif 0.0243902 0.829268 0.0243902 0.121951 0.926829 0 0.0487805 0.0243902 0 0.97561 0.0243902 0 0 0.926829 0.0731707 0 0 0.0243902 0 0.97561 0.243902 0.0243902 0.390244 0.341463 Reverse Complement Motif 0.243902 0.390244 0.0243902 0.341463 0.97561 0.0243902 0 0 0 0.0731707 0.926829 0 0 0.0243902 0.97561 0 0.0243902 0 0.0487805 0.926829 0.0243902 0.0243902 0.829268 0.121951 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 28 Egr1 Original Motif Original Motif Backward 6 6 0.0784722 Original Motif 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0.133333 0.0666667 0.8 0 0 0.866667 0 0.133333 0 0 1 0 0 0 0.2 0.8 0.2 0 0.8 0 0.0666667 0 0.933333 0 0 0 1 0 0.133333 0.666667 0 0.2 0 0 1 0 0.0666667 0 0.466667 0.466667 Reverse Complement Motif 0.0666667 0.466667 0 0.466667 0 1 0 0 0.133333 0 0.666667 0.2 0 1 0 0 0.0666667 0.933333 0 0 0.2 0.8 0 0 0.8 0 0.2 0 0 1 0 0 0 0 0.866667 0.133333 0.133333 0.8 0.0666667 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 37 MIZF Original Motif Original Motif Forward 2 6 0.0854167 Original Motif 0.1 0.3 0.25 0.35 0.65 0.05 0 0.3 1 0 0 0 0.1 0.85 0.05 0 0 0 0.95 0.05 0 0.05 0 0.95 0 0.95 0 0.05 0 0.9 0.1 0 0 0 0.95 0.05 0.1 0.65 0.05 0.2 Reverse Complement Motif 0.1 0.05 0.65 0.2 0 0.95 0 0.05 0 0.1 0.9 0 0 0 0.95 0.05 0.95 0.05 0 0 0 0.95 0 0.05 0.1 0.05 0.85 0 0 0 0 1 0.3 0.05 0 0.65 0.35 0.3 0.25 0.1 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 PLAG1 Original Motif Original Motif Backward 3 6 0.105093 Original Motif 0 0 1 0 0.166667 0 0.777778 0.0555556 0 0 1 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0.777778 0.222222 0 0 0.833333 0.0555556 0.111111 0.222222 0.555556 0.0555556 0.166667 0.666667 0 0 0.333333 0.611111 0.277778 0.111111 0 0.111111 0 0.777778 0.111111 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.888889 0.111111 0.111111 0 0.888889 0 Reverse Complement Motif 0.111111 0.888889 0 0 0 0.888889 0 0.111111 0 1 0 0 0 1 0 0 0.111111 0.777778 0 0.111111 0 0.277778 0.111111 0.611111 0.333333 0 0 0.666667 0.222222 0.0555556 0.555556 0.166667 0 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0.222222 0.777778 0 0 0.944444 0 0.0555556 0 1 0 0 0.166667 0.777778 0 0.0555556 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- **************************************************************************************************************************************************************************************************** ********************************************************************** Best Matches for Each Motif (Highest to Lowest) ***************************************************************************** Dataset # 1 Motif ID 1 Motif Name Motif 1 Original Motif 0.577889 0 0.422111 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.419095 0 0.580905 0 Reserve Complement Motif 0.419095 0.580905 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0.422111 0.577889 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 1 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 32 EWSR1-FLI1 Original Motif Original Motif Forward 12 6 0.0146511 Original Motif 0 0 1 0 0.0190476 0 0.980952 0 0.990476 0 0.00952381 0 0.990476 0 0.00952381 0 0.00952381 0 0.990476 0 0.0190476 0 0.971429 0.00952381 0.980952 0 0.0190476 0 0.971429 0 0.0285714 0 0 0 0.990476 0.00952381 0 0.0190476 0.980952 0 0.942857 0.0380952 0.0190476 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0.0190476 0.980952 0 0.952381 0.0285714 0 0.0190476 0.971429 0 0.0190476 0.00952381 0.047619 0 0.92381 0.0285714 0.0285714 0.0285714 0.92381 0.0190476 Reverse Complement Motif 0.0285714 0.92381 0.0285714 0.0190476 0.047619 0.92381 0 0.0285714 0.00952381 0 0.0190476 0.971429 0.0190476 0.0285714 0 0.952381 0 0.980952 0.0190476 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0.0380952 0.0190476 0.942857 0 0.980952 0.0190476 0 0 0.990476 0 0.00952381 0 0 0.0285714 0.971429 0 0 0.0190476 0.980952 0.0190476 0.971429 0 0.00952381 0.00952381 0.990476 0 0 0 0 0.00952381 0.990476 0 0 0.00952381 0.990476 0.0190476 0.980952 0 0 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 37 MIZF Reverse Complement Original Motif Backward 2 6 0.0608243 Original Motif 0.1 0.3 0.25 0.35 0.65 0.05 0 0.3 1 0 0 0 0.1 0.85 0.05 0 0 0 0.95 0.05 0 0.05 0 0.95 0 0.95 0 0.05 0 0.9 0.1 0 0 0 0.95 0.05 0.1 0.65 0.05 0.2 Reverse Complement Motif 0.1 0.05 0.65 0.2 0 0.95 0 0.05 0 0.1 0.9 0 0 0 0.95 0.05 0.95 0.05 0 0 0 0.95 0 0.05 0.1 0.05 0.85 0 0 0 0 1 0.3 0.05 0 0.65 0.35 0.3 0.25 0.1 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 41 MZF1_5-13 Original Motif Original Motif Backward 1 6 0.0753789 Original Motif 0.0625 0.25 0.4375 0.25 0.125 0 0.4375 0.4375 0.9375 0.0625 0 0 0 0 0.6875 0.3125 0 0 0.9375 0.0625 0 0.125 0.875 0 0 0 0.875 0.125 0.1875 0.0625 0.5 0.25 0.625 0 0.25 0.125 0.5 0.125 0.25 0.125 Reverse Complement Motif 0.125 0.125 0.25 0.5 0.125 0 0.25 0.625 0.1875 0.5 0.0625 0.25 0 0.875 0 0.125 0 0.875 0.125 0 0 0.9375 0 0.0625 0 0.6875 0 0.3125 0 0.0625 0 0.9375 0.125 0.4375 0 0.4375 0.0625 0.4375 0.25 0.25 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 42 NFKB1 Original Motif Reverse Complement Forward 2 6 0.0757695 Original Motif 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0.111111 0 0.888889 0 0.611111 0.0555556 0.333333 0 0.277778 0 0.111111 0.611111 0 0.277778 0.111111 0.611111 0 0.722222 0 0.277778 0 0.944444 0 0.0555556 0 1 0 0 0.0555556 0.833333 0.0555556 0.0555556 Reverse Complement Motif 0.0555556 0.0555556 0.833333 0.0555556 0 0 1 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.722222 0.277778 0.611111 0.277778 0.111111 0 0.611111 0 0.111111 0.277778 0 0.0555556 0.333333 0.611111 0.111111 0.888889 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 PPARGRXRA Original Motif Original Motif Forward 4 6 0.0800484 Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reverse Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 7 Motif 7 Original Motif Reverse Complement Forward 2 6 0.0827261 Original Motif 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.474359 0 0.525641 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 Reverse Complement Motif 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0.474359 0.525641 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 REST Original Motif Original Motif Forward 11 6 0.0829223 Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reverse Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 35 INSM1 Original Motif Original Motif Forward 7 6 0.0832926 Original Motif 0.0416667 0 0.166667 0.791667 0 0 0.833333 0.166667 0 0.333333 0.125 0.541667 0.25 0.625 0 0.125 0.666667 0 0 0.333333 0 0 1 0 0 0.0416667 0.958333 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.0833333 0.666667 0.25 0.125 0.666667 0 0.208333 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.125 0 0.666667 0.208333 0 0.666667 0.0833333 0.25 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 1 0 0 0.333333 0 0 0.666667 0.25 0 0.625 0.125 0.541667 0.333333 0.125 0 0 0.833333 0 0.166667 0.791667 0 0.166667 0.0416667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Original Motif Reverse Complement Forward 5 6 0.0835516 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 24 Ar Original Motif Original Motif Backward 14 6 0.0836451 Original Motif 0.375 0.291667 0.0833333 0.25 0.375 0.0833333 0.125 0.416667 0.458333 0.125 0.125 0.291667 0.666667 0.0416667 0.291667 0 0 0 0.916667 0.0833333 0.5 0.25 0.0416667 0.208333 0.875 0.0833333 0 0.0416667 0 1 0 0 0.625 0 0.333333 0.0416667 0.166667 0.375 0.0833333 0.375 0.208333 0.458333 0.0833333 0.25 0.25 0.375 0.375 0 0.125 0.208333 0.0416667 0.625 0 0 1 0 0.166667 0 0 0.833333 0.458333 0.208333 0.0416667 0.291667 0.0416667 0.916667 0.0416667 0 0.125 0.666667 0.0416667 0.166667 0.25 0.291667 0.208333 0.25 0.25 0.208333 0.375 0.166667 0.416667 0.458333 0 0.125 0.208333 0.458333 0.25 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.208333 0.25 0.458333 0.0833333 0.416667 0 0.458333 0.125 0.25 0.375 0.208333 0.166667 0.25 0.208333 0.291667 0.25 0.125 0.0416667 0.666667 0.166667 0.0416667 0.0416667 0.916667 0 0.291667 0.208333 0.0416667 0.458333 0.833333 0 0 0.166667 0 1 0 0 0.625 0.208333 0.0416667 0.125 0.25 0.375 0.375 0 0.208333 0.0833333 0.458333 0.25 0.166667 0.0833333 0.375 0.375 0.0416667 0 0.333333 0.625 0 0 1 0 0.0416667 0.0833333 0 0.875 0.208333 0.25 0.0416667 0.5 0 0.916667 0 0.0833333 0 0.0416667 0.291667 0.666667 0.291667 0.125 0.125 0.458333 0.416667 0.0833333 0.125 0.375 0.25 0.291667 0.0833333 0.375 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 27 E2F1 Original Motif Reverse Complement Forward 3 6 0.0842331 Original Motif 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0.4 0.6 0 0 0.2 0.8 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0.9 0.1 0 Reverse Complement Motif 0 0.1 0.9 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0.8 0.2 0 0 0.6 0.4 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 1 Motif ID 2 Motif Name Motif 2 Original Motif 1 0 0 0 0.483355 0.516645 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0.832898 0 0.167102 0 Reserve Complement Motif 0 0 0.167102 0.832898 0 0 1 0 0 0 0 1 0.483355 0 0.516645 0 0 0 0 1 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 2 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 Motif 11 Original Motif Original Motif Backward 5 5 0 Original Motif 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0.636364 0 0.363636 0.727273 0 0.272727 0 0.181818 0.818182 0 0 1 0 0 0 0 0.909091 0 0.090909 1 0 0 0 0 0.909091 0 0.090909 0.909091 0 0 0.090909 0 1 0 0 0.818182 0 0 0.181818 0 0.909091 0 0.090909 0.909091 0 0 0.090909 Reverse Complement Motif 0.090909 0 0 0.909091 0 0 0.909091 0.090909 0.181818 0 0 0.818182 0 0 1 0 0.090909 0 0 0.909091 0 0 0.909091 0.090909 0 0 0 1 0 0 0.909091 0.090909 0 0 0 1 0.181818 0 0.818182 0 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0 1 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 Motif 9 Reverse Complement Reverse Complement Backward 10 5 0.0040753 Original Motif 0.034483 0.931034 0.034483 0 1 0 0 0 0 0.827586 0.172414 0 0.862069 0 0 0.137931 0.103448 0.862069 0 0.034483 0.793103 0.034483 0.103448 0.068966 0.241379 0.413793 0.275862 0.068966 0.655172 0 0.344828 0 0 0.827586 0.172414 0 0.965517 0 0.034483 0 0 0.965517 0.034483 0 0.931034 0 0 0.068966 0.068966 0.931034 0 0 0.965517 0.034483 0 0 Reverse Complement Motif 0 0.034483 0 0.965517 0.068966 0 0.931034 0 0.068966 0 0 0.931034 0 0.034483 0.965517 0 0 0 0.034483 0.965517 0 0.172414 0.827586 0 0 0 0.344828 0.655172 0.241379 0.275862 0.413793 0.068966 0.068966 0.034483 0.103448 0.793103 0.103448 0 0.862069 0.034483 0.137931 0 0 0.862069 0 0.172414 0.827586 0 0 0 0 1 0.034483 0.034483 0.931034 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Original Motif Original Motif Forward 6 5 0.0243918 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 10 Motif 10 Original Motif Reverse Complement Backward 6 5 0.0394919 Original Motif 0.169492 0 0 0.830508 0.169492 0.033898 0.372881 0.423729 0.152542 0 0.305085 0.542373 0.20339 0 0 0.79661 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0.20339 0.576271 0.220339 0.271186 0.135593 0.0508471 0.542374 0.016949 0.152542 0.033898 0.796611 0.016949 0 0.101695 0.881356 0.084746 0 0.135593 0.779661 0.050847 0 0.067797 0.881356 0 0.169492 0.152542 0.677966 0 0 0.169492 0.830508 Reverse Complement Motif 0.830508 0 0.169492 0 0.677966 0.169492 0.152542 0 0.881356 0 0.067797 0.050847 0.779661 0 0.135593 0.084746 0.881356 0 0.101695 0.016949 0.796611 0.152542 0.033898 0.016949 0.542374 0.135593 0.0508471 0.271186 0 0.576271 0.20339 0.220339 1 0 0 0 1 0 0 0 0.79661 0 0 0.20339 0.542373 0 0.305085 0.152542 0.423729 0.033898 0.372881 0.169492 0.830508 0 0 0.169492 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 24 Ar Original Motif Original Motif Backward 14 5 0.0429088 Original Motif 0.375 0.291667 0.0833333 0.25 0.375 0.0833333 0.125 0.416667 0.458333 0.125 0.125 0.291667 0.666667 0.0416667 0.291667 0 0 0 0.916667 0.0833333 0.5 0.25 0.0416667 0.208333 0.875 0.0833333 0 0.0416667 0 1 0 0 0.625 0 0.333333 0.0416667 0.166667 0.375 0.0833333 0.375 0.208333 0.458333 0.0833333 0.25 0.25 0.375 0.375 0 0.125 0.208333 0.0416667 0.625 0 0 1 0 0.166667 0 0 0.833333 0.458333 0.208333 0.0416667 0.291667 0.0416667 0.916667 0.0416667 0 0.125 0.666667 0.0416667 0.166667 0.25 0.291667 0.208333 0.25 0.25 0.208333 0.375 0.166667 0.416667 0.458333 0 0.125 0.208333 0.458333 0.25 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.208333 0.25 0.458333 0.0833333 0.416667 0 0.458333 0.125 0.25 0.375 0.208333 0.166667 0.25 0.208333 0.291667 0.25 0.125 0.0416667 0.666667 0.166667 0.0416667 0.0416667 0.916667 0 0.291667 0.208333 0.0416667 0.458333 0.833333 0 0 0.166667 0 1 0 0 0.625 0.208333 0.0416667 0.125 0.25 0.375 0.375 0 0.208333 0.0833333 0.458333 0.25 0.166667 0.0833333 0.375 0.375 0.0416667 0 0.333333 0.625 0 0 1 0 0.0416667 0.0833333 0 0.875 0.208333 0.25 0.0416667 0.5 0 0.916667 0 0.0833333 0 0.0416667 0.291667 0.666667 0.291667 0.125 0.125 0.458333 0.416667 0.0833333 0.125 0.375 0.25 0.291667 0.0833333 0.375 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 PPARGRXRA Reverse Complement Reverse Complement Backward 6 5 0.0595073 Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reverse Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 26 ArntAhr Reverse Complement Original Motif Backward 2 5 0.0600161 Original Motif 0.125 0.333333 0.0833333 0.458333 0 0 0.958333 0.0416667 0 0.958333 0 0.0416667 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 0 1 0 0 1 0 Reverse Complement Motif 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0.958333 0 0.0416667 0 0 0.958333 0.0416667 0 0.958333 0 0.0416667 0.458333 0.333333 0.0833333 0.125 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 45 Pax5 Original Motif Reverse Complement Backward 11 5 0.0620995 Original Motif 0.333333 0.0833333 0.333333 0.25 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 0.25 0.25 0.166667 0.0833333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.583333 0.166667 0.0833333 0.166667 0.166667 0.416667 0.25 0.166667 0 0.25 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.666667 0.0833333 0.5 0.0833333 0.25 0.166667 0.5 0 0.166667 0.333333 0 0 1 0 0.166667 0.666667 0.0833333 0.0833333 0.25 0 0.75 0 0.0833333 0 0.333333 0.583333 0.5 0.0833333 0.416667 0 0.416667 0.0833333 0.416667 0.0833333 0.166667 0.833333 0 0 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.166667 0 0.833333 0 0.0833333 0.0833333 0.416667 0.416667 0 0.0833333 0.416667 0.5 0.583333 0 0.333333 0.0833333 0.25 0.75 0 0 0.166667 0.0833333 0.666667 0.0833333 0 1 0 0 0.333333 0 0.166667 0.5 0.166667 0.0833333 0.25 0.5 0.0833333 0.666667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.25 0.166667 0 0.166667 0.25 0.416667 0.166667 0.166667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.416667 0.166667 0.333333 0.166667 0.25 0.25 0.333333 0.333333 0.666667 0 0 0.25 0.0833333 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 22 NR2F1 Original Motif Reverse Complement Forward 7 5 0.0650242 Original Motif 0 0 0.153846 0.846154 0.0769231 0 0.923077 0 0.923077 0 0.0769231 0 0.461538 0.538462 0 0 0 1 0 0 0 0.230769 0 0.769231 0 0.153846 0 0.846154 0.0769231 0 0 0.923077 0.153846 0 0.846154 0 0.461538 0.307692 0.230769 0 0.461538 0.384615 0.0769231 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.230769 0.461538 0 0.307692 0 0.230769 0.230769 0.538462 Reverse Complement Motif 0.538462 0.230769 0.230769 0 0.230769 0 0.461538 0.307692 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.384615 0.0769231 0.461538 0 0.307692 0.230769 0.461538 0.153846 0.846154 0 0 0.923077 0 0 0.0769231 0.846154 0.153846 0 0 0.769231 0.230769 0 0 0 0 1 0 0.461538 0 0.538462 0 0 0 0.0769231 0.923077 0.0769231 0.923077 0 0 0.846154 0 0.153846 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 35 INSM1 Reverse Complement Original Motif Forward 1 5 0.0670984 Original Motif 0.0416667 0 0.166667 0.791667 0 0 0.833333 0.166667 0 0.333333 0.125 0.541667 0.25 0.625 0 0.125 0.666667 0 0 0.333333 0 0 1 0 0 0.0416667 0.958333 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.0833333 0.666667 0.25 0.125 0.666667 0 0.208333 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.125 0 0.666667 0.208333 0 0.666667 0.0833333 0.25 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 1 0 0 0.333333 0 0 0.666667 0.25 0 0.625 0.125 0.541667 0.333333 0.125 0 0 0.833333 0 0.166667 0.791667 0 0.166667 0.0416667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 1 Motif ID 3 Motif Name Motif 3 Original Motif 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0.472754 0.527246 0 0 1 0 0 0.496318 0 0 0.503682 0 0 1 0 0 0 1 0 Reserve Complement Motif 0 1 0 0 0 1 0 0 0.503682 0 0 0.496318 0 0 1 0 0 0.527246 0.472754 0 0 1 0 0 0 0 0 1 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 3 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 32 EWSR1-FLI1 Original Motif Original Motif Backward 5 7 0.0395671 Original Motif 0 0 1 0 0.0190476 0 0.980952 0 0.990476 0 0.00952381 0 0.990476 0 0.00952381 0 0.00952381 0 0.990476 0 0.0190476 0 0.971429 0.00952381 0.980952 0 0.0190476 0 0.971429 0 0.0285714 0 0 0 0.990476 0.00952381 0 0.0190476 0.980952 0 0.942857 0.0380952 0.0190476 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0.0190476 0.980952 0 0.952381 0.0285714 0 0.0190476 0.971429 0 0.0190476 0.00952381 0.047619 0 0.92381 0.0285714 0.0285714 0.0285714 0.92381 0.0190476 Reverse Complement Motif 0.0285714 0.92381 0.0285714 0.0190476 0.047619 0.92381 0 0.0285714 0.00952381 0 0.0190476 0.971429 0.0190476 0.0285714 0 0.952381 0 0.980952 0.0190476 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0.0380952 0.0190476 0.942857 0 0.980952 0.0190476 0 0 0.990476 0 0.00952381 0 0 0.0285714 0.971429 0 0 0.0190476 0.980952 0.0190476 0.971429 0 0.00952381 0.00952381 0.990476 0 0 0 0 0.00952381 0.990476 0 0 0.00952381 0.990476 0.0190476 0.980952 0 0 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 35 INSM1 Original Motif Original Motif Forward 1 7 0.0494688 Original Motif 0.0416667 0 0.166667 0.791667 0 0 0.833333 0.166667 0 0.333333 0.125 0.541667 0.25 0.625 0 0.125 0.666667 0 0 0.333333 0 0 1 0 0 0.0416667 0.958333 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.0833333 0.666667 0.25 0.125 0.666667 0 0.208333 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.125 0 0.666667 0.208333 0 0.666667 0.0833333 0.25 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 1 0 0 0.333333 0 0 0.666667 0.25 0 0.625 0.125 0.541667 0.333333 0.125 0 0 0.833333 0 0.166667 0.791667 0 0.166667 0.0416667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 48 Tcfcp2l1 Reverse Complement Original Motif Forward 1 7 0.0669354 Original Motif 0.00196754 0.92548 0.0627152 0.00983768 0.069973 0.807513 0.00540142 0.117113 0.594508 0.00514832 0.275803 0.12454 0.0058838 0.0237803 0.967149 0.00318706 0.175477 0.33627 0.0256975 0.462555 0.0983847 0.28928 0.0621635 0.550171 0.173924 0.39726 0.151174 0.277642 0.357213 0.224939 0.252323 0.165526 0.63154 0.0696822 0.190954 0.107824 0.394421 0.0513824 0.310497 0.2437 0.00366928 0.933219 0.0547945 0.00831703 0.0617193 0.812148 0.00293902 0.123194 0.536555 0.00736016 0.305937 0.150147 0.0120393 0.0289926 0.954791 0.0041769 Reverse Complement Motif 0.0120393 0.954791 0.0289926 0.0041769 0.150147 0.00736016 0.305937 0.536555 0.0617193 0.00293902 0.812148 0.123194 0.00366928 0.0547945 0.933219 0.00831703 0.2437 0.0513824 0.310497 0.394421 0.107824 0.0696822 0.190954 0.63154 0.165526 0.224939 0.252323 0.357213 0.173924 0.151174 0.39726 0.277642 0.550171 0.28928 0.0621635 0.0983847 0.462555 0.33627 0.0256975 0.175477 0.0058838 0.967149 0.0237803 0.00318706 0.12454 0.00514832 0.275803 0.594508 0.069973 0.00540142 0.807513 0.117113 0.00196754 0.0627152 0.92548 0.00983768 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 REST Original Motif Original Motif Backward 9 7 0.0693747 Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reverse Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 SP1 Reverse Complement Original Motif Backward 3 7 0.0695377 Original Motif 0 0.914286 0.0285714 0.0571429 0 0.857143 0.0285714 0.114286 0 1 0 0 0.114286 0.771429 0 0.114286 0.0571429 0.142857 0.428571 0.371429 0 0.8 0.0285714 0.171429 0.0285714 0.885714 0 0.0857143 0 0.685714 0.0857143 0.228571 0.171429 0.714286 0 0.114286 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.0857143 Reverse Complement Motif 0.0857143 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.171429 0 0.714286 0.114286 0 0.0857143 0.685714 0.228571 0.0285714 0 0.885714 0.0857143 0 0.0285714 0.8 0.171429 0.0571429 0.428571 0.142857 0.371429 0.114286 0 0.771429 0.114286 0 0 1 0 0 0.0285714 0.857143 0.114286 0 0.0285714 0.914286 0.0571429 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 Zfx Reverse Complement Original Motif Forward 7 7 0.0720685 Original Motif 0.105042 0.371849 0.37605 0.147059 0.125786 0.356394 0.360587 0.157233 0.190377 0.3159 0.416318 0.0774059 0.150313 0.102296 0.622129 0.125261 0.02079 0.617464 0.299376 0.0623701 0.012474 0.752599 0.004158 0.230769 0.0623701 0.259875 0.378378 0.299376 0.397089 0.320166 0.251559 0.031185 0.018711 0.004158 0.975052 0.002079 0 0.00623701 0.991684 0.002079 0.002079 0.997921 0 0 0 0.997921 0 0.002079 0 0.004158 0 0.995842 0.174636 0.253638 0.455301 0.116424 Reverse Complement Motif 0.174636 0.455301 0.253638 0.116424 0.995842 0.004158 0 0 0 0 0.997921 0.002079 0.002079 0 0.997921 0 0 0.991684 0.00623701 0.002079 0.018711 0.975052 0.004158 0.002079 0.031185 0.320166 0.251559 0.397089 0.0623701 0.378378 0.259875 0.299376 0.012474 0.004158 0.752599 0.230769 0.02079 0.299376 0.617464 0.0623701 0.150313 0.622129 0.102296 0.125261 0.190377 0.416318 0.3159 0.0774059 0.125786 0.360587 0.356394 0.157233 0.105042 0.37605 0.371849 0.147059 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 7 Motif 7 Original Motif Reverse Complement Backward 1 7 0.0742342 Original Motif 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.474359 0 0.525641 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 Reverse Complement Motif 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0.474359 0.525641 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 29 ESR1 Reverse Complement Reverse Complement Forward 13 7 0.0771405 Original Motif 0.261242 0.256959 0.329764 0.152034 0.228632 0.17094 0.350427 0.25 0.136752 0.369658 0.318376 0.175214 0.176596 0.487234 0.138298 0.197872 0.285106 0.493617 0.1 0.121277 0.651163 0.0591966 0.188161 0.10148 0.0759494 0.0168776 0.816456 0.0907173 0.04 0.0378947 0.884211 0.0378947 0.0694737 0.0863158 0.191579 0.652632 0.00842105 0.829474 0.111579 0.0505263 0.837895 0.0273684 0.0568421 0.0778947 0.122105 0.526316 0.225263 0.126316 0.132632 0.581053 0.111579 0.174737 0.134737 0.543158 0.204211 0.117895 0.0673684 0.04 0.0168421 0.875789 0.0442105 0.0463158 0.896842 0.0126316 0.642105 0.223158 0.0652632 0.0694737 0.0210526 0.917895 0.0252632 0.0357895 0.124211 0.743158 0.00421053 0.128421 0.0547368 0.347368 0.0463158 0.551579 Reverse Complement Motif 0.551579 0.347368 0.0463158 0.0547368 0.124211 0.00421053 0.743158 0.128421 0.0210526 0.0252632 0.917895 0.0357895 0.0694737 0.223158 0.0652632 0.642105 0.0442105 0.896842 0.0463158 0.0126316 0.875789 0.04 0.0168421 0.0673684 0.134737 0.204211 0.543158 0.117895 0.132632 0.111579 0.581053 0.174737 0.122105 0.225263 0.526316 0.126316 0.0778947 0.0273684 0.0568421 0.837895 0.00842105 0.111579 0.829474 0.0505263 0.652632 0.0863158 0.191579 0.0694737 0.04 0.884211 0.0378947 0.0378947 0.0759494 0.816456 0.0168776 0.0907173 0.10148 0.0591966 0.188161 0.651163 0.285106 0.1 0.493617 0.121277 0.176596 0.138298 0.487234 0.197872 0.136752 0.318376 0.369658 0.175214 0.228632 0.350427 0.17094 0.25 0.261242 0.329764 0.256959 0.152034 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 46 RORA_1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 7 0.0772276 Original Motif 0.6 0.04 0.08 0.28 0.36 0.04 0 0.6 0.24 0.48 0.16 0.12 0.44 0.08 0.2 0.28 0.84 0 0.16 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 Reverse Complement Motif 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0.16 0.84 0.28 0.08 0.2 0.44 0.24 0.16 0.48 0.12 0.6 0.04 0 0.36 0.28 0.04 0.08 0.6 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 36 Klf4 Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 7 0.0798994 Original Motif 0.338561 0.0186808 0.235701 0.407057 0.0202765 0.00207373 0.976267 0.00138249 0.00322284 0.00299263 0.990792 0.00299263 0.00322061 0.00828157 0.984817 0.0036807 0.0636928 0.441941 0.00252932 0.491837 0.00506446 0.00345304 0.983656 0.00782689 0.00967073 0.0184204 0.501727 0.470182 0.0608716 0.0106064 0.8997 0.0288218 0.0283999 0.0300162 0.874856 0.0667282 0.0587419 0.660962 0.0647549 0.215541 Reverse Complement Motif 0.0587419 0.0647549 0.660962 0.215541 0.0283999 0.874856 0.0300162 0.0667282 0.0608716 0.8997 0.0106064 0.0288218 0.00967073 0.501727 0.0184204 0.470182 0.00506446 0.983656 0.00345304 0.00782689 0.491837 0.441941 0.00252932 0.0636928 0.00322061 0.984817 0.00828157 0.0036807 0.00322284 0.990792 0.00299263 0.00299263 0.0202765 0.976267 0.00207373 0.00138249 0.407057 0.0186808 0.235701 0.338561 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 1 Motif ID 4 Motif Name Motif 4 Original Motif 0 1 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0.265176 0 0.734824 0 0 1 0 0 0.591054 0 0.408946 Reserve Complement Motif 0 0 0.591054 0.408946 0 1 0 0 0.734824 0.265176 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 1 0 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 4 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 43 NR1H2RXRA Reverse Complement Original Motif Backward 7 6 0.012269 Original Motif 0.68 0.2 0 0.12 0.68 0.04 0.2 0.08 0.8 0 0.2 0 0 0 1 0 0 0 0.96 0.04 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.96 0 0 0.04 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.8 0.04 0.08 0.08 0 0.6 0.24 0.16 Reverse Complement Motif 0 0.24 0.6 0.16 0.08 0.04 0.08 0.8 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.04 0 0 0.96 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0.96 0 0.04 0 1 0 0 0 0 0.2 0.8 0.08 0.04 0.2 0.68 0.12 0.2 0 0.68 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 PPARGRXRA Reverse Complement Original Motif Forward 6 6 0.0140102 Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reverse Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 22 NR2F1 Reverse Complement Reverse Complement Forward 5 6 0.0186793 Original Motif 0 0 0.153846 0.846154 0.0769231 0 0.923077 0 0.923077 0 0.0769231 0 0.461538 0.538462 0 0 0 1 0 0 0 0.230769 0 0.769231 0 0.153846 0 0.846154 0.0769231 0 0 0.923077 0.153846 0 0.846154 0 0.461538 0.307692 0.230769 0 0.461538 0.384615 0.0769231 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.230769 0.461538 0 0.307692 0 0.230769 0.230769 0.538462 Reverse Complement Motif 0.538462 0.230769 0.230769 0 0.230769 0 0.461538 0.307692 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.384615 0.0769231 0.461538 0 0.307692 0.230769 0.461538 0.153846 0.846154 0 0 0.923077 0 0 0.0769231 0.846154 0.153846 0 0 0.769231 0.230769 0 0 0 0 1 0 0.461538 0 0.538462 0 0 0 0.0769231 0.923077 0.0769231 0.923077 0 0 0.846154 0 0.153846 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 34 HNF4A Reverse Complement Original Motif Forward 4 6 0.020602 Original Motif 0.41791 0.104478 0.402985 0.0746269 0.0298507 0.0298507 0.835821 0.104478 0.179104 0.0597015 0.522388 0.238806 0.0746269 0.343284 0.298507 0.283582 0.0447761 0.761194 0.0597015 0.134328 0.880597 0.0149254 0.0447761 0.0597015 0.791045 0.0298507 0.149254 0.0298507 0.835821 0.0149254 0.119403 0.0298507 0.0597015 0.0597015 0.865672 0.0149254 0.0895522 0.0298507 0.492537 0.38806 0.0447761 0.328358 0.164179 0.462687 0.0597015 0.731343 0.0746269 0.134328 0.626866 0.104478 0.149254 0.119403 Reverse Complement Motif 0.119403 0.104478 0.149254 0.626866 0.0597015 0.0746269 0.731343 0.134328 0.462687 0.328358 0.164179 0.0447761 0.0895522 0.492537 0.0298507 0.38806 0.0597015 0.865672 0.0597015 0.0149254 0.0298507 0.0149254 0.119403 0.835821 0.0298507 0.0298507 0.149254 0.791045 0.0597015 0.0149254 0.0447761 0.880597 0.0447761 0.0597015 0.761194 0.134328 0.0746269 0.298507 0.343284 0.283582 0.179104 0.522388 0.0597015 0.238806 0.0298507 0.835821 0.0298507 0.104478 0.0746269 0.104478 0.402985 0.41791 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 37 MIZF Original Motif Original Motif Backward 1 6 0.0221665 Original Motif 0.1 0.3 0.25 0.35 0.65 0.05 0 0.3 1 0 0 0 0.1 0.85 0.05 0 0 0 0.95 0.05 0 0.05 0 0.95 0 0.95 0 0.05 0 0.9 0.1 0 0 0 0.95 0.05 0.1 0.65 0.05 0.2 Reverse Complement Motif 0.1 0.05 0.65 0.2 0 0.95 0 0.05 0 0.1 0.9 0 0 0 0.95 0.05 0.95 0.05 0 0 0 0.95 0 0.05 0.1 0.05 0.85 0 0 0 0 1 0.3 0.05 0 0.65 0.35 0.3 0.25 0.1 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 35 INSM1 Reverse Complement Original Motif Forward 3 6 0.0255256 Original Motif 0.0416667 0 0.166667 0.791667 0 0 0.833333 0.166667 0 0.333333 0.125 0.541667 0.25 0.625 0 0.125 0.666667 0 0 0.333333 0 0 1 0 0 0.0416667 0.958333 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.0833333 0.666667 0.25 0.125 0.666667 0 0.208333 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.125 0 0.666667 0.208333 0 0.666667 0.0833333 0.25 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 1 0 0 0.333333 0 0 0.666667 0.25 0 0.625 0.125 0.541667 0.333333 0.125 0 0 0.833333 0 0.166667 0.791667 0 0.166667 0.0416667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 SP1 Original Motif Original Motif Forward 1 6 0.0349642 Original Motif 0 0.914286 0.0285714 0.0571429 0 0.857143 0.0285714 0.114286 0 1 0 0 0.114286 0.771429 0 0.114286 0.0571429 0.142857 0.428571 0.371429 0 0.8 0.0285714 0.171429 0.0285714 0.885714 0 0.0857143 0 0.685714 0.0857143 0.228571 0.171429 0.714286 0 0.114286 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.0857143 Reverse Complement Motif 0.0857143 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.171429 0 0.714286 0.114286 0 0.0857143 0.685714 0.228571 0.0285714 0 0.885714 0.0857143 0 0.0285714 0.8 0.171429 0.0571429 0.428571 0.142857 0.371429 0.114286 0 0.771429 0.114286 0 0 1 0 0 0.0285714 0.857143 0.114286 0 0.0285714 0.914286 0.0571429 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 REST Original Motif Reverse Complement Forward 3 6 0.0376108 Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reverse Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 8 Motif 8 Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 6 0.0446026 Original Motif 0 1 0 0 0 0.306358 0 0.693642 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 Reverse Complement Motif 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.693642 0.306358 0 0 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 Zfx Reverse Complement Original Motif Backward 6 6 0.0448449 Original Motif 0.105042 0.371849 0.37605 0.147059 0.125786 0.356394 0.360587 0.157233 0.190377 0.3159 0.416318 0.0774059 0.150313 0.102296 0.622129 0.125261 0.02079 0.617464 0.299376 0.0623701 0.012474 0.752599 0.004158 0.230769 0.0623701 0.259875 0.378378 0.299376 0.397089 0.320166 0.251559 0.031185 0.018711 0.004158 0.975052 0.002079 0 0.00623701 0.991684 0.002079 0.002079 0.997921 0 0 0 0.997921 0 0.002079 0 0.004158 0 0.995842 0.174636 0.253638 0.455301 0.116424 Reverse Complement Motif 0.174636 0.455301 0.253638 0.116424 0.995842 0.004158 0 0 0 0 0.997921 0.002079 0.002079 0 0.997921 0 0 0.991684 0.00623701 0.002079 0.018711 0.975052 0.004158 0.002079 0.031185 0.320166 0.251559 0.397089 0.0623701 0.378378 0.259875 0.299376 0.012474 0.004158 0.752599 0.230769 0.02079 0.299376 0.617464 0.0623701 0.150313 0.622129 0.102296 0.125261 0.190377 0.416318 0.3159 0.0774059 0.125786 0.360587 0.356394 0.157233 0.105042 0.37605 0.371849 0.147059 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 1 Motif ID 5 Motif Name Motif 5 Original Motif 1 0 0 0 0 0 0 1 0.165712 0 0.39748 0.436808 0 0 0 1 0.436426 0.563574 0 0 Reserve Complement Motif 0.436426 0 0.563574 0 1 0 0 0 0.436808 0 0.39748 0.165712 1 0 0 0 0 0 0 1 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 5 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 10 5 0.0256083 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 10 Motif 10 Reverse Complement Reverse Complement Backward 9 5 0.0260117 Original Motif 0.169492 0 0 0.830508 0.169492 0.033898 0.372881 0.423729 0.152542 0 0.305085 0.542373 0.20339 0 0 0.79661 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0.20339 0.576271 0.220339 0.271186 0.135593 0.0508471 0.542374 0.016949 0.152542 0.033898 0.796611 0.016949 0 0.101695 0.881356 0.084746 0 0.135593 0.779661 0.050847 0 0.067797 0.881356 0 0.169492 0.152542 0.677966 0 0 0.169492 0.830508 Reverse Complement Motif 0.830508 0 0.169492 0 0.677966 0.169492 0.152542 0 0.881356 0 0.067797 0.050847 0.779661 0 0.135593 0.084746 0.881356 0 0.101695 0.016949 0.796611 0.152542 0.033898 0.016949 0.542374 0.135593 0.0508471 0.271186 0 0.576271 0.20339 0.220339 1 0 0 0 1 0 0 0 0.79661 0 0 0.20339 0.542373 0 0.305085 0.152542 0.423729 0.033898 0.372881 0.169492 0.830508 0 0 0.169492 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 44 NR4A2 Reverse Complement Original Motif Backward 4 5 0.0276382 Original Motif 0.615385 0.0769231 0.230769 0.0769231 0.928571 0 0.0714286 0 0 0 0.928571 0.0714286 0.214286 0 0.785714 0 0.142857 0.142857 0 0.714286 0 0.928571 0 0.0714286 1 0 0 0 0.230769 0.615385 0.153846 0 Reverse Complement Motif 0.230769 0.153846 0.615385 0 0 0 0 1 0 0 0.928571 0.0714286 0.714286 0.142857 0 0.142857 0.214286 0.785714 0 0 0 0.928571 0 0.0714286 0 0 0.0714286 0.928571 0.0769231 0.0769231 0.230769 0.615385 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 22 NR2F1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 3 5 0.0279129 Original Motif 0 0 0.153846 0.846154 0.0769231 0 0.923077 0 0.923077 0 0.0769231 0 0.461538 0.538462 0 0 0 1 0 0 0 0.230769 0 0.769231 0 0.153846 0 0.846154 0.0769231 0 0 0.923077 0.153846 0 0.846154 0 0.461538 0.307692 0.230769 0 0.461538 0.384615 0.0769231 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.230769 0.461538 0 0.307692 0 0.230769 0.230769 0.538462 Reverse Complement Motif 0.538462 0.230769 0.230769 0 0.230769 0 0.461538 0.307692 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.384615 0.0769231 0.461538 0 0.307692 0.230769 0.461538 0.153846 0.846154 0 0 0.923077 0 0 0.0769231 0.846154 0.153846 0 0 0.769231 0.230769 0 0 0 0 1 0 0.461538 0 0.538462 0 0 0 0.0769231 0.923077 0.0769231 0.923077 0 0 0.846154 0 0.153846 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 43 NR1H2RXRA Original Motif Original Motif Forward 10 5 0.0292478 Original Motif 0.68 0.2 0 0.12 0.68 0.04 0.2 0.08 0.8 0 0.2 0 0 0 1 0 0 0 0.96 0.04 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.96 0 0 0.04 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.8 0.04 0.08 0.08 0 0.6 0.24 0.16 Reverse Complement Motif 0 0.24 0.6 0.16 0.08 0.04 0.08 0.8 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.04 0 0 0.96 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0.96 0 0.04 0 1 0 0 0 0 0.2 0.8 0.08 0.04 0.2 0.68 0.12 0.2 0 0.68 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 37 MIZF Original Motif Original Motif Backward 4 5 0.0292478 Original Motif 0.1 0.3 0.25 0.35 0.65 0.05 0 0.3 1 0 0 0 0.1 0.85 0.05 0 0 0 0.95 0.05 0 0.05 0 0.95 0 0.95 0 0.05 0 0.9 0.1 0 0 0 0.95 0.05 0.1 0.65 0.05 0.2 Reverse Complement Motif 0.1 0.05 0.65 0.2 0 0.95 0 0.05 0 0.1 0.9 0 0 0 0.95 0.05 0.95 0.05 0 0 0 0.95 0 0.05 0.1 0.05 0.85 0 0 0 0 1 0.3 0.05 0 0.65 0.35 0.3 0.25 0.1 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 PPARGRXRA Original Motif Reverse Complement Forward 5 5 0.0305369 Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reverse Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 REST Original Motif Reverse Complement Forward 5 5 0.0315454 Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reverse Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 47 RXRRAR_DR5 Original Motif Original Motif Forward 1 5 0.0335956 Original Motif 0.521739 0 0.478261 0 0 0 1 0 0.0434783 0 0.565217 0.391304 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.782609 0.130435 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.173913 0.304348 0.217391 0.304348 0.217391 0.347826 0.391304 0.0434783 0.217391 0.173913 0.478261 0.130435 0.565217 0.0434783 0.304348 0.0869565 0.217391 0.26087 0.521739 0 0.73913 0.130435 0.130435 0 0.0434783 0.0434783 0.869565 0.0434783 0 0.0434783 0.695652 0.26087 0.0869565 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0434783 0.73913 0.130435 0.0869565 0.913043 0 0.0434783 0.0434783 Reverse Complement Motif 0.0434783 0 0.0434783 0.913043 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0869565 0.73913 0.0434783 0.130435 0.0869565 0 0.695652 0.0434783 0.26087 0.0434783 0.869565 0.0434783 0.0434783 0 0.130435 0.130435 0.73913 0.217391 0.521739 0.26087 0 0.0869565 0.0434783 0.304348 0.565217 0.217391 0.478261 0.173913 0.130435 0.217391 0.391304 0.347826 0.0434783 0.173913 0.217391 0.304348 0.304348 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.130435 0.782609 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.0434783 0.565217 0 0.391304 0 1 0 0 0 0 0.478261 0.521739 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 46 RORA_1 Reverse Complement Original Motif Forward 4 5 0.0336052 Original Motif 0.6 0.04 0.08 0.28 0.36 0.04 0 0.6 0.24 0.48 0.16 0.12 0.44 0.08 0.2 0.28 0.84 0 0.16 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 Reverse Complement Motif 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0.16 0.84 0.28 0.08 0.2 0.44 0.24 0.16 0.48 0.12 0.6 0.04 0 0.36 0.28 0.04 0.08 0.6 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 1 Motif ID 6 Motif Name Motif 6 Original Motif 0 1 0 0 0.594366 0.405634 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0.63662 0 0.36338 0 0 0 1 0 0 1 0 0 Reserve Complement Motif 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0.36338 0.63662 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0.405634 0 0.594366 0 0 1 0 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 6 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 REST Original Motif Original Motif Forward 3 7 0.0205607 Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reverse Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 37 MIZF Reverse Complement Reverse Complement Backward 4 7 0.0322623 Original Motif 0.1 0.3 0.25 0.35 0.65 0.05 0 0.3 1 0 0 0 0.1 0.85 0.05 0 0 0 0.95 0.05 0 0.05 0 0.95 0 0.95 0 0.05 0 0.9 0.1 0 0 0 0.95 0.05 0.1 0.65 0.05 0.2 Reverse Complement Motif 0.1 0.05 0.65 0.2 0 0.95 0 0.05 0 0.1 0.9 0 0 0 0.95 0.05 0.95 0.05 0 0 0 0.95 0 0.05 0.1 0.05 0.85 0 0 0 0 1 0.3 0.05 0 0.65 0.35 0.3 0.25 0.1 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 Zfx Original Motif Original Motif Forward 5 7 0.038091 Original Motif 0.105042 0.371849 0.37605 0.147059 0.125786 0.356394 0.360587 0.157233 0.190377 0.3159 0.416318 0.0774059 0.150313 0.102296 0.622129 0.125261 0.02079 0.617464 0.299376 0.0623701 0.012474 0.752599 0.004158 0.230769 0.0623701 0.259875 0.378378 0.299376 0.397089 0.320166 0.251559 0.031185 0.018711 0.004158 0.975052 0.002079 0 0.00623701 0.991684 0.002079 0.002079 0.997921 0 0 0 0.997921 0 0.002079 0 0.004158 0 0.995842 0.174636 0.253638 0.455301 0.116424 Reverse Complement Motif 0.174636 0.455301 0.253638 0.116424 0.995842 0.004158 0 0 0 0 0.997921 0.002079 0.002079 0 0.997921 0 0 0.991684 0.00623701 0.002079 0.018711 0.975052 0.004158 0.002079 0.031185 0.320166 0.251559 0.397089 0.0623701 0.378378 0.259875 0.299376 0.012474 0.004158 0.752599 0.230769 0.02079 0.299376 0.617464 0.0623701 0.150313 0.622129 0.102296 0.125261 0.190377 0.416318 0.3159 0.0774059 0.125786 0.360587 0.356394 0.157233 0.105042 0.37605 0.371849 0.147059 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 15 TFAP2A Original Motif Reverse Complement Forward 3 7 0.0393168 Original Motif 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.118919 0.383784 0.248649 0.248649 0.102703 0.308108 0.32973 0.259459 0.297297 0.237838 0.362162 0.102703 0.286486 0.162162 0.491892 0.0594595 0.102703 0.0864865 0.740541 0.0702703 0.0486486 0.421622 0.427027 0.102703 Reverse Complement Motif 0.0486486 0.427027 0.421622 0.102703 0.102703 0.740541 0.0864865 0.0702703 0.286486 0.491892 0.162162 0.0594595 0.297297 0.362162 0.237838 0.102703 0.102703 0.32973 0.308108 0.259459 0.118919 0.248649 0.383784 0.248649 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 7 Motif 7 Original Motif Original Motif Forward 2 7 0.0443244 Original Motif 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.474359 0 0.525641 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 Reverse Complement Motif 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0.474359 0.525641 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 45 Pax5 Reverse Complement Reverse Complement Forward 8 7 0.0448462 Original Motif 0.333333 0.0833333 0.333333 0.25 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 0.25 0.25 0.166667 0.0833333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.583333 0.166667 0.0833333 0.166667 0.166667 0.416667 0.25 0.166667 0 0.25 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.666667 0.0833333 0.5 0.0833333 0.25 0.166667 0.5 0 0.166667 0.333333 0 0 1 0 0.166667 0.666667 0.0833333 0.0833333 0.25 0 0.75 0 0.0833333 0 0.333333 0.583333 0.5 0.0833333 0.416667 0 0.416667 0.0833333 0.416667 0.0833333 0.166667 0.833333 0 0 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.166667 0 0.833333 0 0.0833333 0.0833333 0.416667 0.416667 0 0.0833333 0.416667 0.5 0.583333 0 0.333333 0.0833333 0.25 0.75 0 0 0.166667 0.0833333 0.666667 0.0833333 0 1 0 0 0.333333 0 0.166667 0.5 0.166667 0.0833333 0.25 0.5 0.0833333 0.666667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.25 0.166667 0 0.166667 0.25 0.416667 0.166667 0.166667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.416667 0.166667 0.333333 0.166667 0.25 0.25 0.333333 0.333333 0.666667 0 0 0.25 0.0833333 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 28 Egr1 Reverse Complement Original Motif Backward 2 7 0.0453576 Original Motif 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0.133333 0.0666667 0.8 0 0 0.866667 0 0.133333 0 0 1 0 0 0 0.2 0.8 0.2 0 0.8 0 0.0666667 0 0.933333 0 0 0 1 0 0.133333 0.666667 0 0.2 0 0 1 0 0.0666667 0 0.466667 0.466667 Reverse Complement Motif 0.0666667 0.466667 0 0.466667 0 1 0 0 0.133333 0 0.666667 0.2 0 1 0 0 0.0666667 0.933333 0 0 0.2 0.8 0 0 0.8 0 0.2 0 0 1 0 0 0 0 0.866667 0.133333 0.133333 0.8 0.0666667 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 36 Klf4 Original Motif Reverse Complement Backward 3 7 0.0476958 Original Motif 0.338561 0.0186808 0.235701 0.407057 0.0202765 0.00207373 0.976267 0.00138249 0.00322284 0.00299263 0.990792 0.00299263 0.00322061 0.00828157 0.984817 0.0036807 0.0636928 0.441941 0.00252932 0.491837 0.00506446 0.00345304 0.983656 0.00782689 0.00967073 0.0184204 0.501727 0.470182 0.0608716 0.0106064 0.8997 0.0288218 0.0283999 0.0300162 0.874856 0.0667282 0.0587419 0.660962 0.0647549 0.215541 Reverse Complement Motif 0.0587419 0.0647549 0.660962 0.215541 0.0283999 0.874856 0.0300162 0.0667282 0.0608716 0.8997 0.0106064 0.0288218 0.00967073 0.501727 0.0184204 0.470182 0.00506446 0.983656 0.00345304 0.00782689 0.491837 0.441941 0.00252932 0.0636928 0.00322061 0.984817 0.00828157 0.0036807 0.00322284 0.990792 0.00299263 0.00299263 0.0202765 0.976267 0.00207373 0.00138249 0.407057 0.0186808 0.235701 0.338561 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 SP1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 4 7 0.0490991 Original Motif 0 0.914286 0.0285714 0.0571429 0 0.857143 0.0285714 0.114286 0 1 0 0 0.114286 0.771429 0 0.114286 0.0571429 0.142857 0.428571 0.371429 0 0.8 0.0285714 0.171429 0.0285714 0.885714 0 0.0857143 0 0.685714 0.0857143 0.228571 0.171429 0.714286 0 0.114286 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.0857143 Reverse Complement Motif 0.0857143 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.171429 0 0.714286 0.114286 0 0.0857143 0.685714 0.228571 0.0285714 0 0.885714 0.0857143 0 0.0285714 0.8 0.171429 0.0571429 0.428571 0.142857 0.371429 0.114286 0 0.771429 0.114286 0 0 1 0 0 0.0285714 0.857143 0.114286 0 0.0285714 0.914286 0.0571429 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Reverse Complement Reverse Complement Forward 6 7 0.0498726 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 1 Motif ID 7 Motif Name Motif 7 Original Motif 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.474359 0 0.525641 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 Reserve Complement Motif 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0.474359 0.525641 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 7 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 SP1 Original Motif Original Motif Backward 2 8 0.0423611 Original Motif 0 0.914286 0.0285714 0.0571429 0 0.857143 0.0285714 0.114286 0 1 0 0 0.114286 0.771429 0 0.114286 0.0571429 0.142857 0.428571 0.371429 0 0.8 0.0285714 0.171429 0.0285714 0.885714 0 0.0857143 0 0.685714 0.0857143 0.228571 0.171429 0.714286 0 0.114286 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.0857143 Reverse Complement Motif 0.0857143 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.171429 0 0.714286 0.114286 0 0.0857143 0.685714 0.228571 0.0285714 0 0.885714 0.0857143 0 0.0285714 0.8 0.171429 0.0571429 0.428571 0.142857 0.371429 0.114286 0 0.771429 0.114286 0 0 1 0 0 0.0285714 0.857143 0.114286 0 0.0285714 0.914286 0.0571429 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 36 Klf4 Reverse Complement Original Motif Backward 3 8 0.0461644 Original Motif 0.338561 0.0186808 0.235701 0.407057 0.0202765 0.00207373 0.976267 0.00138249 0.00322284 0.00299263 0.990792 0.00299263 0.00322061 0.00828157 0.984817 0.0036807 0.0636928 0.441941 0.00252932 0.491837 0.00506446 0.00345304 0.983656 0.00782689 0.00967073 0.0184204 0.501727 0.470182 0.0608716 0.0106064 0.8997 0.0288218 0.0283999 0.0300162 0.874856 0.0667282 0.0587419 0.660962 0.0647549 0.215541 Reverse Complement Motif 0.0587419 0.0647549 0.660962 0.215541 0.0283999 0.874856 0.0300162 0.0667282 0.0608716 0.8997 0.0106064 0.0288218 0.00967073 0.501727 0.0184204 0.470182 0.00506446 0.983656 0.00345304 0.00782689 0.491837 0.441941 0.00252932 0.0636928 0.00322061 0.984817 0.00828157 0.0036807 0.00322284 0.990792 0.00299263 0.00299263 0.0202765 0.976267 0.00207373 0.00138249 0.407057 0.0186808 0.235701 0.338561 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 28 Egr1 Original Motif Reverse Complement Backward 1 8 0.0650374 Original Motif 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0.133333 0.0666667 0.8 0 0 0.866667 0 0.133333 0 0 1 0 0 0 0.2 0.8 0.2 0 0.8 0 0.0666667 0 0.933333 0 0 0 1 0 0.133333 0.666667 0 0.2 0 0 1 0 0.0666667 0 0.466667 0.466667 Reverse Complement Motif 0.0666667 0.466667 0 0.466667 0 1 0 0 0.133333 0 0.666667 0.2 0 1 0 0 0.0666667 0.933333 0 0 0.2 0.8 0 0 0.8 0 0.2 0 0 1 0 0 0 0 0.866667 0.133333 0.133333 0.8 0.0666667 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Original Motif Original Motif Backward 7 8 0.076401 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 42 NFKB1 Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 8 0.0893429 Original Motif 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0.111111 0 0.888889 0 0.611111 0.0555556 0.333333 0 0.277778 0 0.111111 0.611111 0 0.277778 0.111111 0.611111 0 0.722222 0 0.277778 0 0.944444 0 0.0555556 0 1 0 0 0.0555556 0.833333 0.0555556 0.0555556 Reverse Complement Motif 0.0555556 0.0555556 0.833333 0.0555556 0 0 1 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.722222 0.277778 0.611111 0.277778 0.111111 0 0.611111 0 0.111111 0.277778 0 0.0555556 0.333333 0.611111 0.111111 0.888889 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 35 INSM1 Reverse Complement Original Motif Forward 1 8 0.0936832 Original Motif 0.0416667 0 0.166667 0.791667 0 0 0.833333 0.166667 0 0.333333 0.125 0.541667 0.25 0.625 0 0.125 0.666667 0 0 0.333333 0 0 1 0 0 0.0416667 0.958333 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.0833333 0.666667 0.25 0.125 0.666667 0 0.208333 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.125 0 0.666667 0.208333 0 0.666667 0.0833333 0.25 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 1 0 0 0.333333 0 0 0.666667 0.25 0 0.625 0.125 0.541667 0.333333 0.125 0 0 0.833333 0 0.166667 0.791667 0 0.166667 0.0416667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 32 EWSR1-FLI1 Reverse Complement Original Motif Forward 7 8 0.0950969 Original Motif 0 0 1 0 0.0190476 0 0.980952 0 0.990476 0 0.00952381 0 0.990476 0 0.00952381 0 0.00952381 0 0.990476 0 0.0190476 0 0.971429 0.00952381 0.980952 0 0.0190476 0 0.971429 0 0.0285714 0 0 0 0.990476 0.00952381 0 0.0190476 0.980952 0 0.942857 0.0380952 0.0190476 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0.0190476 0.980952 0 0.952381 0.0285714 0 0.0190476 0.971429 0 0.0190476 0.00952381 0.047619 0 0.92381 0.0285714 0.0285714 0.0285714 0.92381 0.0190476 Reverse Complement Motif 0.0285714 0.92381 0.0285714 0.0190476 0.047619 0.92381 0 0.0285714 0.00952381 0 0.0190476 0.971429 0.0190476 0.0285714 0 0.952381 0 0.980952 0.0190476 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0.0380952 0.0190476 0.942857 0 0.980952 0.0190476 0 0 0.990476 0 0.00952381 0 0 0.0285714 0.971429 0 0 0.0190476 0.980952 0.0190476 0.971429 0 0.00952381 0.00952381 0.990476 0 0 0 0 0.00952381 0.990476 0 0 0.00952381 0.990476 0.0190476 0.980952 0 0 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 PLAG1 Reverse Complement Original Motif Forward 1 8 0.0998932 Original Motif 0 0 1 0 0.166667 0 0.777778 0.0555556 0 0 1 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0.777778 0.222222 0 0 0.833333 0.0555556 0.111111 0.222222 0.555556 0.0555556 0.166667 0.666667 0 0 0.333333 0.611111 0.277778 0.111111 0 0.111111 0 0.777778 0.111111 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.888889 0.111111 0.111111 0 0.888889 0 Reverse Complement Motif 0.111111 0.888889 0 0 0 0.888889 0 0.111111 0 1 0 0 0 1 0 0 0.111111 0.777778 0 0.111111 0 0.277778 0.111111 0.611111 0.333333 0 0 0.666667 0.222222 0.0555556 0.555556 0.166667 0 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0.222222 0.777778 0 0 0.944444 0 0.0555556 0 1 0 0 0.166667 0.777778 0 0.0555556 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 Zfx Original Motif Original Motif Backward 3 8 0.10221 Original Motif 0.105042 0.371849 0.37605 0.147059 0.125786 0.356394 0.360587 0.157233 0.190377 0.3159 0.416318 0.0774059 0.150313 0.102296 0.622129 0.125261 0.02079 0.617464 0.299376 0.0623701 0.012474 0.752599 0.004158 0.230769 0.0623701 0.259875 0.378378 0.299376 0.397089 0.320166 0.251559 0.031185 0.018711 0.004158 0.975052 0.002079 0 0.00623701 0.991684 0.002079 0.002079 0.997921 0 0 0 0.997921 0 0.002079 0 0.004158 0 0.995842 0.174636 0.253638 0.455301 0.116424 Reverse Complement Motif 0.174636 0.455301 0.253638 0.116424 0.995842 0.004158 0 0 0 0 0.997921 0.002079 0.002079 0 0.997921 0 0 0.991684 0.00623701 0.002079 0.018711 0.975052 0.004158 0.002079 0.031185 0.320166 0.251559 0.397089 0.0623701 0.378378 0.259875 0.299376 0.012474 0.004158 0.752599 0.230769 0.02079 0.299376 0.617464 0.0623701 0.150313 0.622129 0.102296 0.125261 0.190377 0.416318 0.3159 0.0774059 0.125786 0.360587 0.356394 0.157233 0.105042 0.37605 0.371849 0.147059 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 45 Pax5 Reverse Complement Original Motif Forward 9 8 0.102497 Original Motif 0.333333 0.0833333 0.333333 0.25 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 0.25 0.25 0.166667 0.0833333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.583333 0.166667 0.0833333 0.166667 0.166667 0.416667 0.25 0.166667 0 0.25 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.666667 0.0833333 0.5 0.0833333 0.25 0.166667 0.5 0 0.166667 0.333333 0 0 1 0 0.166667 0.666667 0.0833333 0.0833333 0.25 0 0.75 0 0.0833333 0 0.333333 0.583333 0.5 0.0833333 0.416667 0 0.416667 0.0833333 0.416667 0.0833333 0.166667 0.833333 0 0 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.166667 0 0.833333 0 0.0833333 0.0833333 0.416667 0.416667 0 0.0833333 0.416667 0.5 0.583333 0 0.333333 0.0833333 0.25 0.75 0 0 0.166667 0.0833333 0.666667 0.0833333 0 1 0 0 0.333333 0 0.166667 0.5 0.166667 0.0833333 0.25 0.5 0.0833333 0.666667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.25 0.166667 0 0.166667 0.25 0.416667 0.166667 0.166667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.416667 0.166667 0.333333 0.166667 0.25 0.25 0.333333 0.333333 0.666667 0 0 0.25 0.0833333 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 1 Motif ID 8 Motif Name Motif 8 Original Motif 0 1 0 0 0 0.306358 0 0.693642 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 Reserve Complement Motif 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.693642 0.306358 0 0 0 0 1 0 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 8 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 REST Reverse Complement Reverse Complement Forward 8 6 0.0392549 Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reverse Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 23 MZF1_1-4 Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 6 0.0416319 Original Motif 0.15 0.25 0.2 0.4 0 0 0.95 0.05 0.1 0 0.9 0 0 0 0.95 0.05 0 0 1 0 0.9 0 0.1 0 Reverse Complement Motif 0 0 0.1 0.9 0 1 0 0 0 0.95 0 0.05 0.1 0.9 0 0 0 0.95 0 0.05 0.4 0.25 0.2 0.15 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Original Motif Reverse Complement Backward 1 6 0.0509122 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 35 INSM1 Original Motif Original Motif Forward 4 6 0.0557857 Original Motif 0.0416667 0 0.166667 0.791667 0 0 0.833333 0.166667 0 0.333333 0.125 0.541667 0.25 0.625 0 0.125 0.666667 0 0 0.333333 0 0 1 0 0 0.0416667 0.958333 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.0833333 0.666667 0.25 0.125 0.666667 0 0.208333 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.125 0 0.666667 0.208333 0 0.666667 0.0833333 0.25 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 1 0 0 0.333333 0 0 0.666667 0.25 0 0.625 0.125 0.541667 0.333333 0.125 0 0 0.833333 0 0.166667 0.791667 0 0.166667 0.0416667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 13 Zfp423 Reverse Complement Reverse Complement Backward 7 6 0.0624145 Original Motif 0.212121 0.121212 0.666667 0 0 0.484848 0.515152 0 0.484848 0.515152 0 0 0.515152 0.484848 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.030303 0.515152 0 0.454545 0.727273 0 0 0.272727 0.393939 0 0.484848 0.121212 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.515152 0.484848 0 0 0.484848 0.515152 0 0.242424 0.484848 0.272727 0.333333 0.666667 0 0 Reverse Complement Motif 0.333333 0 0.666667 0 0 0.484848 0.242424 0.272727 0.515152 0 0.484848 0 0 0.515152 0 0.484848 0 1 0 0 0 1 0 0 0.393939 0.484848 0 0.121212 0.272727 0 0 0.727273 0.030303 0 0.515152 0.454545 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.484848 0 0.515152 0.484848 0 0.515152 0 0 0.515152 0.484848 0 0.212121 0.666667 0.121212 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 43 NR1H2RXRA Reverse Complement Original Motif Forward 6 6 0.0650784 Original Motif 0.68 0.2 0 0.12 0.68 0.04 0.2 0.08 0.8 0 0.2 0 0 0 1 0 0 0 0.96 0.04 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.96 0 0 0.04 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.8 0.04 0.08 0.08 0 0.6 0.24 0.16 Reverse Complement Motif 0 0.24 0.6 0.16 0.08 0.04 0.08 0.8 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.04 0 0 0.96 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0.96 0 0.04 0 1 0 0 0 0 0.2 0.8 0.08 0.04 0.2 0.68 0.12 0.2 0 0.68 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 48 Tcfcp2l1 Original Motif Reverse Complement Backward 9 6 0.0663804 Original Motif 0.00196754 0.92548 0.0627152 0.00983768 0.069973 0.807513 0.00540142 0.117113 0.594508 0.00514832 0.275803 0.12454 0.0058838 0.0237803 0.967149 0.00318706 0.175477 0.33627 0.0256975 0.462555 0.0983847 0.28928 0.0621635 0.550171 0.173924 0.39726 0.151174 0.277642 0.357213 0.224939 0.252323 0.165526 0.63154 0.0696822 0.190954 0.107824 0.394421 0.0513824 0.310497 0.2437 0.00366928 0.933219 0.0547945 0.00831703 0.0617193 0.812148 0.00293902 0.123194 0.536555 0.00736016 0.305937 0.150147 0.0120393 0.0289926 0.954791 0.0041769 Reverse Complement Motif 0.0120393 0.954791 0.0289926 0.0041769 0.150147 0.00736016 0.305937 0.536555 0.0617193 0.00293902 0.812148 0.123194 0.00366928 0.0547945 0.933219 0.00831703 0.2437 0.0513824 0.310497 0.394421 0.107824 0.0696822 0.190954 0.63154 0.165526 0.224939 0.252323 0.357213 0.173924 0.151174 0.39726 0.277642 0.550171 0.28928 0.0621635 0.0983847 0.462555 0.33627 0.0256975 0.175477 0.0058838 0.967149 0.0237803 0.00318706 0.12454 0.00514832 0.275803 0.594508 0.069973 0.00540142 0.807513 0.117113 0.00196754 0.0627152 0.92548 0.00983768 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 28 Egr1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 4 6 0.0678562 Original Motif 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0.133333 0.0666667 0.8 0 0 0.866667 0 0.133333 0 0 1 0 0 0 0.2 0.8 0.2 0 0.8 0 0.0666667 0 0.933333 0 0 0 1 0 0.133333 0.666667 0 0.2 0 0 1 0 0.0666667 0 0.466667 0.466667 Reverse Complement Motif 0.0666667 0.466667 0 0.466667 0 1 0 0 0.133333 0 0.666667 0.2 0 1 0 0 0.0666667 0.933333 0 0 0.2 0.8 0 0 0.8 0 0.2 0 0 1 0 0 0 0 0.866667 0.133333 0.133333 0.8 0.0666667 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 24 Ar Reverse Complement Original Motif Backward 3 6 0.0714107 Original Motif 0.375 0.291667 0.0833333 0.25 0.375 0.0833333 0.125 0.416667 0.458333 0.125 0.125 0.291667 0.666667 0.0416667 0.291667 0 0 0 0.916667 0.0833333 0.5 0.25 0.0416667 0.208333 0.875 0.0833333 0 0.0416667 0 1 0 0 0.625 0 0.333333 0.0416667 0.166667 0.375 0.0833333 0.375 0.208333 0.458333 0.0833333 0.25 0.25 0.375 0.375 0 0.125 0.208333 0.0416667 0.625 0 0 1 0 0.166667 0 0 0.833333 0.458333 0.208333 0.0416667 0.291667 0.0416667 0.916667 0.0416667 0 0.125 0.666667 0.0416667 0.166667 0.25 0.291667 0.208333 0.25 0.25 0.208333 0.375 0.166667 0.416667 0.458333 0 0.125 0.208333 0.458333 0.25 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.208333 0.25 0.458333 0.0833333 0.416667 0 0.458333 0.125 0.25 0.375 0.208333 0.166667 0.25 0.208333 0.291667 0.25 0.125 0.0416667 0.666667 0.166667 0.0416667 0.0416667 0.916667 0 0.291667 0.208333 0.0416667 0.458333 0.833333 0 0 0.166667 0 1 0 0 0.625 0.208333 0.0416667 0.125 0.25 0.375 0.375 0 0.208333 0.0833333 0.458333 0.25 0.166667 0.0833333 0.375 0.375 0.0416667 0 0.333333 0.625 0 0 1 0 0.0416667 0.0833333 0 0.875 0.208333 0.25 0.0416667 0.5 0 0.916667 0 0.0833333 0 0.0416667 0.291667 0.666667 0.291667 0.125 0.125 0.458333 0.416667 0.0833333 0.125 0.375 0.25 0.291667 0.0833333 0.375 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 Zfx Original Motif Original Motif Backward 4 6 0.0718041 Original Motif 0.105042 0.371849 0.37605 0.147059 0.125786 0.356394 0.360587 0.157233 0.190377 0.3159 0.416318 0.0774059 0.150313 0.102296 0.622129 0.125261 0.02079 0.617464 0.299376 0.0623701 0.012474 0.752599 0.004158 0.230769 0.0623701 0.259875 0.378378 0.299376 0.397089 0.320166 0.251559 0.031185 0.018711 0.004158 0.975052 0.002079 0 0.00623701 0.991684 0.002079 0.002079 0.997921 0 0 0 0.997921 0 0.002079 0 0.004158 0 0.995842 0.174636 0.253638 0.455301 0.116424 Reverse Complement Motif 0.174636 0.455301 0.253638 0.116424 0.995842 0.004158 0 0 0 0 0.997921 0.002079 0.002079 0 0.997921 0 0 0.991684 0.00623701 0.002079 0.018711 0.975052 0.004158 0.002079 0.031185 0.320166 0.251559 0.397089 0.0623701 0.378378 0.259875 0.299376 0.012474 0.004158 0.752599 0.230769 0.02079 0.299376 0.617464 0.0623701 0.150313 0.622129 0.102296 0.125261 0.190377 0.416318 0.3159 0.0774059 0.125786 0.360587 0.356394 0.157233 0.105042 0.37605 0.371849 0.147059 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 1 Motif ID 9 Motif Name Motif 9 Original Motif 0.034483 0.931034 0.034483 0 1 0 0 0 0 0.827586 0.172414 0 0.862069 0 0 0.137931 0.103448 0.862069 0 0.034483 0.793103 0.034483 0.103448 0.068966 0.241379 0.413793 0.275862 0.068966 0.655172 0 0.344828 0 0 0.827586 0.172414 0 0.965517 0 0.034483 0 0 0.965517 0.034483 0 0.931034 0 0 0.068966 0.068966 0.931034 0 0 0.965517 0.034483 0 0 Reserve Complement Motif 0 0.034483 0 0.965517 0.068966 0 0.931034 0 0.068966 0 0 0.931034 0 0.034483 0.965517 0 0 0 0.034483 0.965517 0 0.172414 0.827586 0 0 0 0.344828 0.655172 0.241379 0.275862 0.413793 0.068966 0.068966 0.034483 0.103448 0.793103 0.103448 0 0.862069 0.034483 0.137931 0 0 0.862069 0 0.172414 0.827586 0 0 0 0 1 0.034483 0.034483 0.931034 0 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 9 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 Motif 11 Original Motif Original Motif Backward 1 14 0.0170175 Original Motif 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0.636364 0 0.363636 0.727273 0 0.272727 0 0.181818 0.818182 0 0 1 0 0 0 0 0.909091 0 0.090909 1 0 0 0 0 0.909091 0 0.090909 0.909091 0 0 0.090909 0 1 0 0 0.818182 0 0 0.181818 0 0.909091 0 0.090909 0.909091 0 0 0.090909 Reverse Complement Motif 0.090909 0 0 0.909091 0 0 0.909091 0.090909 0.181818 0 0 0.818182 0 0 1 0 0.090909 0 0 0.909091 0 0 0.909091 0.090909 0 0 0 1 0 0 0.909091 0.090909 0 0 0 1 0.181818 0 0.818182 0 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0 1 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Original Motif Original Motif Backward 3 14 0.0868786 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 10 Motif 10 Reverse Complement Original Motif Forward 2 13 0.578949 Original Motif 0.169492 0 0 0.830508 0.169492 0.033898 0.372881 0.423729 0.152542 0 0.305085 0.542373 0.20339 0 0 0.79661 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0.20339 0.576271 0.220339 0.271186 0.135593 0.0508471 0.542374 0.016949 0.152542 0.033898 0.796611 0.016949 0 0.101695 0.881356 0.084746 0 0.135593 0.779661 0.050847 0 0.067797 0.881356 0 0.169492 0.152542 0.677966 0 0 0.169492 0.830508 Reverse Complement Motif 0.830508 0 0.169492 0 0.677966 0.169492 0.152542 0 0.881356 0 0.067797 0.050847 0.779661 0 0.135593 0.084746 0.881356 0 0.101695 0.016949 0.796611 0.152542 0.033898 0.016949 0.542374 0.135593 0.0508471 0.271186 0 0.576271 0.20339 0.220339 1 0 0 0 1 0 0 0 0.79661 0 0 0.20339 0.542373 0 0.305085 0.152542 0.423729 0.033898 0.372881 0.169492 0.830508 0 0 0.169492 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 17 RXRAVDR Original Motif Reverse Complement Forward 3 13 0.593978 Original Motif 0.3 0 0.7 0 0 0 1 0 0 0 0.9 0.1 0 0 0 1 0 0.9 0 0.1 0.9 0 0.1 0 0.4 0.2 0 0.4 0.2 0.4 0.2 0.2 0.2 0 0.8 0 0.5 0 0.5 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0.1 0 0 0.9 0 0.9 0 0.1 0.7 0.1 0.2 0 Reverse Complement Motif 0 0.1 0.2 0.7 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0 0.1 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0 0.2 0.2 0.4 0.2 0.4 0.2 0 0.4 0 0 0.1 0.9 0 0 0.9 0.1 1 0 0 0 0 0.9 0 0.1 0 1 0 0 0.3 0.7 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 24 Ar Original Motif Reverse Complement Backward 11 12 1.09291 Original Motif 0.375 0.291667 0.0833333 0.25 0.375 0.0833333 0.125 0.416667 0.458333 0.125 0.125 0.291667 0.666667 0.0416667 0.291667 0 0 0 0.916667 0.0833333 0.5 0.25 0.0416667 0.208333 0.875 0.0833333 0 0.0416667 0 1 0 0 0.625 0 0.333333 0.0416667 0.166667 0.375 0.0833333 0.375 0.208333 0.458333 0.0833333 0.25 0.25 0.375 0.375 0 0.125 0.208333 0.0416667 0.625 0 0 1 0 0.166667 0 0 0.833333 0.458333 0.208333 0.0416667 0.291667 0.0416667 0.916667 0.0416667 0 0.125 0.666667 0.0416667 0.166667 0.25 0.291667 0.208333 0.25 0.25 0.208333 0.375 0.166667 0.416667 0.458333 0 0.125 0.208333 0.458333 0.25 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.208333 0.25 0.458333 0.0833333 0.416667 0 0.458333 0.125 0.25 0.375 0.208333 0.166667 0.25 0.208333 0.291667 0.25 0.125 0.0416667 0.666667 0.166667 0.0416667 0.0416667 0.916667 0 0.291667 0.208333 0.0416667 0.458333 0.833333 0 0 0.166667 0 1 0 0 0.625 0.208333 0.0416667 0.125 0.25 0.375 0.375 0 0.208333 0.0833333 0.458333 0.25 0.166667 0.0833333 0.375 0.375 0.0416667 0 0.333333 0.625 0 0 1 0 0.0416667 0.0833333 0 0.875 0.208333 0.25 0.0416667 0.5 0 0.916667 0 0.0833333 0 0.0416667 0.291667 0.666667 0.291667 0.125 0.125 0.458333 0.416667 0.0833333 0.125 0.375 0.25 0.291667 0.0833333 0.375 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 28 Egr1 Reverse Complement Original Motif Forward 1 11 1.57424 Original Motif 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0.133333 0.0666667 0.8 0 0 0.866667 0 0.133333 0 0 1 0 0 0 0.2 0.8 0.2 0 0.8 0 0.0666667 0 0.933333 0 0 0 1 0 0.133333 0.666667 0 0.2 0 0 1 0 0.0666667 0 0.466667 0.466667 Reverse Complement Motif 0.0666667 0.466667 0 0.466667 0 1 0 0 0.133333 0 0.666667 0.2 0 1 0 0 0.0666667 0.933333 0 0 0.2 0.8 0 0 0.8 0 0.2 0 0 1 0 0 0 0 0.866667 0.133333 0.133333 0.8 0.0666667 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 29 ESR1 Original Motif Original Motif Forward 10 11 1.58704 Original Motif 0.261242 0.256959 0.329764 0.152034 0.228632 0.17094 0.350427 0.25 0.136752 0.369658 0.318376 0.175214 0.176596 0.487234 0.138298 0.197872 0.285106 0.493617 0.1 0.121277 0.651163 0.0591966 0.188161 0.10148 0.0759494 0.0168776 0.816456 0.0907173 0.04 0.0378947 0.884211 0.0378947 0.0694737 0.0863158 0.191579 0.652632 0.00842105 0.829474 0.111579 0.0505263 0.837895 0.0273684 0.0568421 0.0778947 0.122105 0.526316 0.225263 0.126316 0.132632 0.581053 0.111579 0.174737 0.134737 0.543158 0.204211 0.117895 0.0673684 0.04 0.0168421 0.875789 0.0442105 0.0463158 0.896842 0.0126316 0.642105 0.223158 0.0652632 0.0694737 0.0210526 0.917895 0.0252632 0.0357895 0.124211 0.743158 0.00421053 0.128421 0.0547368 0.347368 0.0463158 0.551579 Reverse Complement Motif 0.551579 0.347368 0.0463158 0.0547368 0.124211 0.00421053 0.743158 0.128421 0.0210526 0.0252632 0.917895 0.0357895 0.0694737 0.223158 0.0652632 0.642105 0.0442105 0.896842 0.0463158 0.0126316 0.875789 0.04 0.0168421 0.0673684 0.134737 0.204211 0.543158 0.117895 0.132632 0.111579 0.581053 0.174737 0.122105 0.225263 0.526316 0.126316 0.0778947 0.0273684 0.0568421 0.837895 0.00842105 0.111579 0.829474 0.0505263 0.652632 0.0863158 0.191579 0.0694737 0.04 0.884211 0.0378947 0.0378947 0.0759494 0.816456 0.0168776 0.0907173 0.10148 0.0591966 0.188161 0.651163 0.285106 0.1 0.493617 0.121277 0.176596 0.138298 0.487234 0.197872 0.136752 0.318376 0.369658 0.175214 0.228632 0.350427 0.17094 0.25 0.261242 0.329764 0.256959 0.152034 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 35 INSM1 Original Motif Reverse Complement Forward 3 10 2.08086 Original Motif 0.0416667 0 0.166667 0.791667 0 0 0.833333 0.166667 0 0.333333 0.125 0.541667 0.25 0.625 0 0.125 0.666667 0 0 0.333333 0 0 1 0 0 0.0416667 0.958333 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.0833333 0.666667 0.25 0.125 0.666667 0 0.208333 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.125 0 0.666667 0.208333 0 0.666667 0.0833333 0.25 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 1 0 0 0.333333 0 0 0.666667 0.25 0 0.625 0.125 0.541667 0.333333 0.125 0 0 0.833333 0 0.166667 0.791667 0 0.166667 0.0416667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 36 Klf4 Reverse Complement Original Motif Forward 1 10 2.0884 Original Motif 0.338561 0.0186808 0.235701 0.407057 0.0202765 0.00207373 0.976267 0.00138249 0.00322284 0.00299263 0.990792 0.00299263 0.00322061 0.00828157 0.984817 0.0036807 0.0636928 0.441941 0.00252932 0.491837 0.00506446 0.00345304 0.983656 0.00782689 0.00967073 0.0184204 0.501727 0.470182 0.0608716 0.0106064 0.8997 0.0288218 0.0283999 0.0300162 0.874856 0.0667282 0.0587419 0.660962 0.0647549 0.215541 Reverse Complement Motif 0.0587419 0.0647549 0.660962 0.215541 0.0283999 0.874856 0.0300162 0.0667282 0.0608716 0.8997 0.0106064 0.0288218 0.00967073 0.501727 0.0184204 0.470182 0.00506446 0.983656 0.00345304 0.00782689 0.491837 0.441941 0.00252932 0.0636928 0.00322061 0.984817 0.00828157 0.0036807 0.00322284 0.990792 0.00299263 0.00299263 0.0202765 0.976267 0.00207373 0.00138249 0.407057 0.0186808 0.235701 0.338561 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 34 HNF4A Reverse Complement Reverse Complement Forward 4 10 2.09226 Original Motif 0.41791 0.104478 0.402985 0.0746269 0.0298507 0.0298507 0.835821 0.104478 0.179104 0.0597015 0.522388 0.238806 0.0746269 0.343284 0.298507 0.283582 0.0447761 0.761194 0.0597015 0.134328 0.880597 0.0149254 0.0447761 0.0597015 0.791045 0.0298507 0.149254 0.0298507 0.835821 0.0149254 0.119403 0.0298507 0.0597015 0.0597015 0.865672 0.0149254 0.0895522 0.0298507 0.492537 0.38806 0.0447761 0.328358 0.164179 0.462687 0.0597015 0.731343 0.0746269 0.134328 0.626866 0.104478 0.149254 0.119403 Reverse Complement Motif 0.119403 0.104478 0.149254 0.626866 0.0597015 0.0746269 0.731343 0.134328 0.462687 0.328358 0.164179 0.0447761 0.0895522 0.492537 0.0298507 0.38806 0.0597015 0.865672 0.0597015 0.0149254 0.0298507 0.0149254 0.119403 0.835821 0.0298507 0.0298507 0.149254 0.791045 0.0597015 0.0149254 0.0447761 0.880597 0.0447761 0.0597015 0.761194 0.134328 0.0746269 0.298507 0.343284 0.283582 0.179104 0.522388 0.0597015 0.238806 0.0298507 0.835821 0.0298507 0.104478 0.0746269 0.104478 0.402985 0.41791 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 1 Motif ID 10 Motif Name Motif 10 Original Motif 0.169492 0 0 0.830508 0.169492 0.033898 0.372881 0.423729 0.152542 0 0.305085 0.542373 0.20339 0 0 0.79661 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0.20339 0.576271 0.220339 0.271186 0.135593 0.0508471 0.542374 0.016949 0.152542 0.033898 0.796611 0.016949 0 0.101695 0.881356 0.084746 0 0.135593 0.779661 0.050847 0 0.067797 0.881356 0 0.169492 0.152542 0.677966 0 0 0.169492 0.830508 Reserve Complement Motif 0.830508 0 0.169492 0 0.677966 0.169492 0.152542 0 0.881356 0 0.067797 0.050847 0.779661 0 0.135593 0.084746 0.881356 0 0.101695 0.016949 0.796611 0.152542 0.033898 0.016949 0.542374 0.135593 0.0508471 0.271186 0 0.576271 0.20339 0.220339 1 0 0 0 1 0 0 0 0.79661 0 0 0.20339 0.542373 0 0.305085 0.152542 0.423729 0.033898 0.372881 0.169492 0.830508 0 0 0.169492 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 10 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 32 EWSR1-FLI1 Reverse Complement Original Motif Backward 3 14 0.0424269 Original Motif 0 0 1 0 0.0190476 0 0.980952 0 0.990476 0 0.00952381 0 0.990476 0 0.00952381 0 0.00952381 0 0.990476 0 0.0190476 0 0.971429 0.00952381 0.980952 0 0.0190476 0 0.971429 0 0.0285714 0 0 0 0.990476 0.00952381 0 0.0190476 0.980952 0 0.942857 0.0380952 0.0190476 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0.0190476 0.980952 0 0.952381 0.0285714 0 0.0190476 0.971429 0 0.0190476 0.00952381 0.047619 0 0.92381 0.0285714 0.0285714 0.0285714 0.92381 0.0190476 Reverse Complement Motif 0.0285714 0.92381 0.0285714 0.0190476 0.047619 0.92381 0 0.0285714 0.00952381 0 0.0190476 0.971429 0.0190476 0.0285714 0 0.952381 0 0.980952 0.0190476 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0.0380952 0.0190476 0.942857 0 0.980952 0.0190476 0 0 0.990476 0 0.00952381 0 0 0.0285714 0.971429 0 0 0.0190476 0.980952 0.0190476 0.971429 0 0.00952381 0.00952381 0.990476 0 0 0 0 0.00952381 0.990476 0 0 0.00952381 0.990476 0.0190476 0.980952 0 0 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 Motif 9 Reverse Complement Original Motif Backward 2 13 0.529035 Original Motif 0.034483 0.931034 0.034483 0 1 0 0 0 0 0.827586 0.172414 0 0.862069 0 0 0.137931 0.103448 0.862069 0 0.034483 0.793103 0.034483 0.103448 0.068966 0.241379 0.413793 0.275862 0.068966 0.655172 0 0.344828 0 0 0.827586 0.172414 0 0.965517 0 0.034483 0 0 0.965517 0.034483 0 0.931034 0 0 0.068966 0.068966 0.931034 0 0 0.965517 0.034483 0 0 Reverse Complement Motif 0 0.034483 0 0.965517 0.068966 0 0.931034 0 0.068966 0 0 0.931034 0 0.034483 0.965517 0 0 0 0.034483 0.965517 0 0.172414 0.827586 0 0 0 0.344828 0.655172 0.241379 0.275862 0.413793 0.068966 0.068966 0.034483 0.103448 0.793103 0.103448 0 0.862069 0.034483 0.137931 0 0 0.862069 0 0.172414 0.827586 0 0 0 0 1 0.034483 0.034483 0.931034 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 Motif 11 Original Motif Reverse Complement Backward 2 13 0.531594 Original Motif 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0.636364 0 0.363636 0.727273 0 0.272727 0 0.181818 0.818182 0 0 1 0 0 0 0 0.909091 0 0.090909 1 0 0 0 0 0.909091 0 0.090909 0.909091 0 0 0.090909 0 1 0 0 0.818182 0 0 0.181818 0 0.909091 0 0.090909 0.909091 0 0 0.090909 Reverse Complement Motif 0.090909 0 0 0.909091 0 0 0.909091 0.090909 0.181818 0 0 0.818182 0 0 1 0 0.090909 0 0 0.909091 0 0 0.909091 0.090909 0 0 0 1 0 0 0.909091 0.090909 0 0 0 1 0.181818 0 0.818182 0 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0 1 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 43 NR1H2RXRA Reverse Complement Original Motif Backward 5 13 0.535643 Original Motif 0.68 0.2 0 0.12 0.68 0.04 0.2 0.08 0.8 0 0.2 0 0 0 1 0 0 0 0.96 0.04 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.96 0 0 0.04 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.8 0.04 0.08 0.08 0 0.6 0.24 0.16 Reverse Complement Motif 0 0.24 0.6 0.16 0.08 0.04 0.08 0.8 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.04 0 0 0.96 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0.96 0 0.04 0 1 0 0 0 0 0.2 0.8 0.08 0.04 0.2 0.68 0.12 0.2 0 0.68 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 PPARGRXRA Reverse Complement Original Motif Backward 3 13 0.543043 Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reverse Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 24 Ar Original Motif Reverse Complement Forward 10 13 0.544053 Original Motif 0.375 0.291667 0.0833333 0.25 0.375 0.0833333 0.125 0.416667 0.458333 0.125 0.125 0.291667 0.666667 0.0416667 0.291667 0 0 0 0.916667 0.0833333 0.5 0.25 0.0416667 0.208333 0.875 0.0833333 0 0.0416667 0 1 0 0 0.625 0 0.333333 0.0416667 0.166667 0.375 0.0833333 0.375 0.208333 0.458333 0.0833333 0.25 0.25 0.375 0.375 0 0.125 0.208333 0.0416667 0.625 0 0 1 0 0.166667 0 0 0.833333 0.458333 0.208333 0.0416667 0.291667 0.0416667 0.916667 0.0416667 0 0.125 0.666667 0.0416667 0.166667 0.25 0.291667 0.208333 0.25 0.25 0.208333 0.375 0.166667 0.416667 0.458333 0 0.125 0.208333 0.458333 0.25 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.208333 0.25 0.458333 0.0833333 0.416667 0 0.458333 0.125 0.25 0.375 0.208333 0.166667 0.25 0.208333 0.291667 0.25 0.125 0.0416667 0.666667 0.166667 0.0416667 0.0416667 0.916667 0 0.291667 0.208333 0.0416667 0.458333 0.833333 0 0 0.166667 0 1 0 0 0.625 0.208333 0.0416667 0.125 0.25 0.375 0.375 0 0.208333 0.0833333 0.458333 0.25 0.166667 0.0833333 0.375 0.375 0.0416667 0 0.333333 0.625 0 0 1 0 0.0416667 0.0833333 0 0.875 0.208333 0.25 0.0416667 0.5 0 0.916667 0 0.0833333 0 0.0416667 0.291667 0.666667 0.291667 0.125 0.125 0.458333 0.416667 0.0833333 0.125 0.375 0.25 0.291667 0.0833333 0.375 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 22 NR2F1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 3 12 1.04059 Original Motif 0 0 0.153846 0.846154 0.0769231 0 0.923077 0 0.923077 0 0.0769231 0 0.461538 0.538462 0 0 0 1 0 0 0 0.230769 0 0.769231 0 0.153846 0 0.846154 0.0769231 0 0 0.923077 0.153846 0 0.846154 0 0.461538 0.307692 0.230769 0 0.461538 0.384615 0.0769231 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.230769 0.461538 0 0.307692 0 0.230769 0.230769 0.538462 Reverse Complement Motif 0.538462 0.230769 0.230769 0 0.230769 0 0.461538 0.307692 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.384615 0.0769231 0.461538 0 0.307692 0.230769 0.461538 0.153846 0.846154 0 0 0.923077 0 0 0.0769231 0.846154 0.153846 0 0 0.769231 0.230769 0 0 0 0 1 0 0.461538 0 0.538462 0 0 0 0.0769231 0.923077 0.0769231 0.923077 0 0 0.846154 0 0.153846 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 34 HNF4A Reverse Complement Original Motif Backward 3 11 1.53429 Original Motif 0.41791 0.104478 0.402985 0.0746269 0.0298507 0.0298507 0.835821 0.104478 0.179104 0.0597015 0.522388 0.238806 0.0746269 0.343284 0.298507 0.283582 0.0447761 0.761194 0.0597015 0.134328 0.880597 0.0149254 0.0447761 0.0597015 0.791045 0.0298507 0.149254 0.0298507 0.835821 0.0149254 0.119403 0.0298507 0.0597015 0.0597015 0.865672 0.0149254 0.0895522 0.0298507 0.492537 0.38806 0.0447761 0.328358 0.164179 0.462687 0.0597015 0.731343 0.0746269 0.134328 0.626866 0.104478 0.149254 0.119403 Reverse Complement Motif 0.119403 0.104478 0.149254 0.626866 0.0597015 0.0746269 0.731343 0.134328 0.462687 0.328358 0.164179 0.0447761 0.0895522 0.492537 0.0298507 0.38806 0.0597015 0.865672 0.0597015 0.0149254 0.0298507 0.0149254 0.119403 0.835821 0.0298507 0.0298507 0.149254 0.791045 0.0597015 0.0149254 0.0447761 0.880597 0.0447761 0.0597015 0.761194 0.134328 0.0746269 0.298507 0.343284 0.283582 0.179104 0.522388 0.0597015 0.238806 0.0298507 0.835821 0.0298507 0.104478 0.0746269 0.104478 0.402985 0.41791 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 45 Pax5 Reverse Complement Original Motif Backward 10 11 1.54022 Original Motif 0.333333 0.0833333 0.333333 0.25 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 0.25 0.25 0.166667 0.0833333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.583333 0.166667 0.0833333 0.166667 0.166667 0.416667 0.25 0.166667 0 0.25 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.666667 0.0833333 0.5 0.0833333 0.25 0.166667 0.5 0 0.166667 0.333333 0 0 1 0 0.166667 0.666667 0.0833333 0.0833333 0.25 0 0.75 0 0.0833333 0 0.333333 0.583333 0.5 0.0833333 0.416667 0 0.416667 0.0833333 0.416667 0.0833333 0.166667 0.833333 0 0 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.166667 0 0.833333 0 0.0833333 0.0833333 0.416667 0.416667 0 0.0833333 0.416667 0.5 0.583333 0 0.333333 0.0833333 0.25 0.75 0 0 0.166667 0.0833333 0.666667 0.0833333 0 1 0 0 0.333333 0 0.166667 0.5 0.166667 0.0833333 0.25 0.5 0.0833333 0.666667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.25 0.166667 0 0.166667 0.25 0.416667 0.166667 0.166667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.416667 0.166667 0.333333 0.166667 0.25 0.25 0.333333 0.333333 0.666667 0 0 0.25 0.0833333 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Reverse Complement Original Motif Backward 11 10 2.0484 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 1 Motif ID 11 Motif Name Motif 11 Original Motif 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0.636364 0 0.363636 0.727273 0 0.272727 0 0.181818 0.818182 0 0 1 0 0 0 0 0.909091 0 0.090909 1 0 0 0 0 0.909091 0 0.090909 0.909091 0 0 0.090909 0 1 0 0 0.818182 0 0 0.181818 0 0.909091 0 0.090909 0.909091 0 0 0.090909 Reserve Complement Motif 0.090909 0 0 0.909091 0 0 0.909091 0.090909 0.181818 0 0 0.818182 0 0 1 0 0.090909 0 0 0.909091 0 0 0.909091 0.090909 0 0 0 1 0 0 0.909091 0.090909 0 0 0 1 0.181818 0 0.818182 0 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0 1 0 0 1 0 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 11 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 Motif 9 Original Motif Original Motif Forward 1 14 0.0170175 Original Motif 0.034483 0.931034 0.034483 0 1 0 0 0 0 0.827586 0.172414 0 0.862069 0 0 0.137931 0.103448 0.862069 0 0.034483 0.793103 0.034483 0.103448 0.068966 0.241379 0.413793 0.275862 0.068966 0.655172 0 0.344828 0 0 0.827586 0.172414 0 0.965517 0 0.034483 0 0 0.965517 0.034483 0 0.931034 0 0 0.068966 0.068966 0.931034 0 0 0.965517 0.034483 0 0 Reverse Complement Motif 0 0.034483 0 0.965517 0.068966 0 0.931034 0 0.068966 0 0 0.931034 0 0.034483 0.965517 0 0 0 0.034483 0.965517 0 0.172414 0.827586 0 0 0 0.344828 0.655172 0.241379 0.275862 0.413793 0.068966 0.068966 0.034483 0.103448 0.793103 0.103448 0 0.862069 0.034483 0.137931 0 0 0.862069 0 0.172414 0.827586 0 0 0 0 1 0.034483 0.034483 0.931034 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Original Motif Original Motif Forward 5 14 0.0837439 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 10 Motif 10 Original Motif Reverse Complement Forward 2 13 0.581509 Original Motif 0.169492 0 0 0.830508 0.169492 0.033898 0.372881 0.423729 0.152542 0 0.305085 0.542373 0.20339 0 0 0.79661 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0.20339 0.576271 0.220339 0.271186 0.135593 0.0508471 0.542374 0.016949 0.152542 0.033898 0.796611 0.016949 0 0.101695 0.881356 0.084746 0 0.135593 0.779661 0.050847 0 0.067797 0.881356 0 0.169492 0.152542 0.677966 0 0 0.169492 0.830508 Reverse Complement Motif 0.830508 0 0.169492 0 0.677966 0.169492 0.152542 0 0.881356 0 0.067797 0.050847 0.779661 0 0.135593 0.084746 0.881356 0 0.101695 0.016949 0.796611 0.152542 0.033898 0.016949 0.542374 0.135593 0.0508471 0.271186 0 0.576271 0.20339 0.220339 1 0 0 0 1 0 0 0 0.79661 0 0 0.20339 0.542373 0 0.305085 0.152542 0.423729 0.033898 0.372881 0.169492 0.830508 0 0 0.169492 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 35 INSM1 Reverse Complement Original Motif Backward 1 12 1.09362 Original Motif 0.0416667 0 0.166667 0.791667 0 0 0.833333 0.166667 0 0.333333 0.125 0.541667 0.25 0.625 0 0.125 0.666667 0 0 0.333333 0 0 1 0 0 0.0416667 0.958333 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.0833333 0.666667 0.25 0.125 0.666667 0 0.208333 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.125 0 0.666667 0.208333 0 0.666667 0.0833333 0.25 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 1 0 0 0.333333 0 0 0.666667 0.25 0 0.625 0.125 0.541667 0.333333 0.125 0 0 0.833333 0 0.166667 0.791667 0 0.166667 0.0416667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 28 Egr1 Reverse Complement Original Motif Forward 1 11 1.56977 Original Motif 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0.133333 0.0666667 0.8 0 0 0.866667 0 0.133333 0 0 1 0 0 0 0.2 0.8 0.2 0 0.8 0 0.0666667 0 0.933333 0 0 0 1 0 0.133333 0.666667 0 0.2 0 0 1 0 0.0666667 0 0.466667 0.466667 Reverse Complement Motif 0.0666667 0.466667 0 0.466667 0 1 0 0 0.133333 0 0.666667 0.2 0 1 0 0 0.0666667 0.933333 0 0 0.2 0.8 0 0 0.8 0 0.2 0 0 1 0 0 0 0 0.866667 0.133333 0.133333 0.8 0.0666667 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 29 ESR1 Original Motif Original Motif Forward 10 11 1.59795 Original Motif 0.261242 0.256959 0.329764 0.152034 0.228632 0.17094 0.350427 0.25 0.136752 0.369658 0.318376 0.175214 0.176596 0.487234 0.138298 0.197872 0.285106 0.493617 0.1 0.121277 0.651163 0.0591966 0.188161 0.10148 0.0759494 0.0168776 0.816456 0.0907173 0.04 0.0378947 0.884211 0.0378947 0.0694737 0.0863158 0.191579 0.652632 0.00842105 0.829474 0.111579 0.0505263 0.837895 0.0273684 0.0568421 0.0778947 0.122105 0.526316 0.225263 0.126316 0.132632 0.581053 0.111579 0.174737 0.134737 0.543158 0.204211 0.117895 0.0673684 0.04 0.0168421 0.875789 0.0442105 0.0463158 0.896842 0.0126316 0.642105 0.223158 0.0652632 0.0694737 0.0210526 0.917895 0.0252632 0.0357895 0.124211 0.743158 0.00421053 0.128421 0.0547368 0.347368 0.0463158 0.551579 Reverse Complement Motif 0.551579 0.347368 0.0463158 0.0547368 0.124211 0.00421053 0.743158 0.128421 0.0210526 0.0252632 0.917895 0.0357895 0.0694737 0.223158 0.0652632 0.642105 0.0442105 0.896842 0.0463158 0.0126316 0.875789 0.04 0.0168421 0.0673684 0.134737 0.204211 0.543158 0.117895 0.132632 0.111579 0.581053 0.174737 0.122105 0.225263 0.526316 0.126316 0.0778947 0.0273684 0.0568421 0.837895 0.00842105 0.111579 0.829474 0.0505263 0.652632 0.0863158 0.191579 0.0694737 0.04 0.884211 0.0378947 0.0378947 0.0759494 0.816456 0.0168776 0.0907173 0.10148 0.0591966 0.188161 0.651163 0.285106 0.1 0.493617 0.121277 0.176596 0.138298 0.487234 0.197872 0.136752 0.318376 0.369658 0.175214 0.228632 0.350427 0.17094 0.25 0.261242 0.329764 0.256959 0.152034 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 36 Klf4 Reverse Complement Original Motif Forward 1 10 2.08683 Original Motif 0.338561 0.0186808 0.235701 0.407057 0.0202765 0.00207373 0.976267 0.00138249 0.00322284 0.00299263 0.990792 0.00299263 0.00322061 0.00828157 0.984817 0.0036807 0.0636928 0.441941 0.00252932 0.491837 0.00506446 0.00345304 0.983656 0.00782689 0.00967073 0.0184204 0.501727 0.470182 0.0608716 0.0106064 0.8997 0.0288218 0.0283999 0.0300162 0.874856 0.0667282 0.0587419 0.660962 0.0647549 0.215541 Reverse Complement Motif 0.0587419 0.0647549 0.660962 0.215541 0.0283999 0.874856 0.0300162 0.0667282 0.0608716 0.8997 0.0106064 0.0288218 0.00967073 0.501727 0.0184204 0.470182 0.00506446 0.983656 0.00345304 0.00782689 0.491837 0.441941 0.00252932 0.0636928 0.00322061 0.984817 0.00828157 0.0036807 0.00322284 0.990792 0.00299263 0.00299263 0.0202765 0.976267 0.00207373 0.00138249 0.407057 0.0186808 0.235701 0.338561 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 SP1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 9 2.59204 Original Motif 0 0.914286 0.0285714 0.0571429 0 0.857143 0.0285714 0.114286 0 1 0 0 0.114286 0.771429 0 0.114286 0.0571429 0.142857 0.428571 0.371429 0 0.8 0.0285714 0.171429 0.0285714 0.885714 0 0.0857143 0 0.685714 0.0857143 0.228571 0.171429 0.714286 0 0.114286 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.0857143 Reverse Complement Motif 0.0857143 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.171429 0 0.714286 0.114286 0 0.0857143 0.685714 0.228571 0.0285714 0 0.885714 0.0857143 0 0.0285714 0.8 0.171429 0.0571429 0.428571 0.142857 0.371429 0.114286 0 0.771429 0.114286 0 0 1 0 0 0.0285714 0.857143 0.114286 0 0.0285714 0.914286 0.0571429 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 7 Motif 7 Original Motif Original Motif Backward 1 8 3.09205 Original Motif 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.474359 0 0.525641 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 Reverse Complement Motif 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0.474359 0.525641 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 33 HIF1AARNT Reverse Complement Original Motif Backward 2 7 3.58699 Original Motif 0.259615 0.269231 0.471154 0 0.0961538 0.278846 0.326923 0.298077 0.75 0.0192308 0.221154 0.00961538 0 0.990385 0 0.00961538 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.173077 0.490385 0.192308 0.144231 Reverse Complement Motif 0.173077 0.192308 0.490385 0.144231 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0.990385 0.00961538 0.00961538 0.0192308 0.221154 0.75 0.0961538 0.326923 0.278846 0.298077 0.259615 0.471154 0.269231 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 12 Motif Name Zfx Original Motif 0.105042 0.371849 0.37605 0.147059 0.125786 0.356394 0.360587 0.157233 0.190377 0.3159 0.416318 0.0774059 0.150313 0.102296 0.622129 0.125261 0.02079 0.617464 0.299376 0.0623701 0.012474 0.752599 0.004158 0.230769 0.0623701 0.259875 0.378378 0.299376 0.397089 0.320166 0.251559 0.031185 0.018711 0.004158 0.975052 0.002079 0 0.00623701 0.991684 0.002079 0.002079 0.997921 0 0 0 0.997921 0 0.002079 0 0.004158 0 0.995842 0.174636 0.253638 0.455301 0.116424 Reserve Complement Motif 0.174636 0.455301 0.253638 0.116424 0.995842 0.004158 0 0 0 0 0.997921 0.002079 0.002079 0 0.997921 0 0 0.991684 0.00623701 0.002079 0.018711 0.975052 0.004158 0.002079 0.031185 0.320166 0.251559 0.397089 0.0623701 0.378378 0.259875 0.299376 0.012474 0.004158 0.752599 0.230769 0.02079 0.299376 0.617464 0.0623701 0.150313 0.622129 0.102296 0.125261 0.190377 0.416318 0.3159 0.0774059 0.125786 0.360587 0.356394 0.157233 0.105042 0.37605 0.371849 0.147059 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 12 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 45 Pax5 Original Motif Original Motif Forward 3 14 0.0611182 Original Motif 0.333333 0.0833333 0.333333 0.25 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 0.25 0.25 0.166667 0.0833333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.583333 0.166667 0.0833333 0.166667 0.166667 0.416667 0.25 0.166667 0 0.25 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.666667 0.0833333 0.5 0.0833333 0.25 0.166667 0.5 0 0.166667 0.333333 0 0 1 0 0.166667 0.666667 0.0833333 0.0833333 0.25 0 0.75 0 0.0833333 0 0.333333 0.583333 0.5 0.0833333 0.416667 0 0.416667 0.0833333 0.416667 0.0833333 0.166667 0.833333 0 0 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.166667 0 0.833333 0 0.0833333 0.0833333 0.416667 0.416667 0 0.0833333 0.416667 0.5 0.583333 0 0.333333 0.0833333 0.25 0.75 0 0 0.166667 0.0833333 0.666667 0.0833333 0 1 0 0 0.333333 0 0.166667 0.5 0.166667 0.0833333 0.25 0.5 0.0833333 0.666667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.25 0.166667 0 0.166667 0.25 0.416667 0.166667 0.166667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.416667 0.166667 0.333333 0.166667 0.25 0.25 0.333333 0.333333 0.666667 0 0 0.25 0.0833333 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 30 ESR2 Original Motif Reverse Complement Forward 4 14 0.0635714 Original Motif 0.218487 0.45098 0.176471 0.154062 0.442577 0.142857 0.114846 0.29972 0.521008 0.0420168 0.431373 0.00560224 0.0756303 0 0.770308 0.154062 0.0504202 0.0560224 0.893557 0 0.0364146 0.0532213 0.092437 0.817927 0 1 0 0 0.943978 0.00280112 0 0.0532213 0.137255 0.344538 0.316527 0.201681 0.179272 0.176471 0.417367 0.226891 0.145658 0.170868 0.411765 0.271709 0.0588235 0.092437 0.0672269 0.781513 0.176471 0.070028 0.742297 0.0112045 0.498599 0.277311 0.0532213 0.170868 0.0952381 0.7507 0.00560224 0.148459 0.128852 0.809524 0 0.0616246 0.0756303 0.252101 0 0.672269 0.168067 0.263305 0.380952 0.187675 Reverse Complement Motif 0.168067 0.380952 0.263305 0.187675 0.672269 0.252101 0 0.0756303 0.128852 0 0.809524 0.0616246 0.0952381 0.00560224 0.7507 0.148459 0.170868 0.277311 0.0532213 0.498599 0.176471 0.742297 0.070028 0.0112045 0.781513 0.092437 0.0672269 0.0588235 0.145658 0.411765 0.170868 0.271709 0.179272 0.417367 0.176471 0.226891 0.137255 0.316527 0.344538 0.201681 0.0532213 0.00280112 0 0.943978 0 0 1 0 0.817927 0.0532213 0.092437 0.0364146 0.0504202 0.893557 0.0560224 0 0.0756303 0.770308 0 0.154062 0.00560224 0.0420168 0.431373 0.521008 0.29972 0.142857 0.114846 0.442577 0.218487 0.176471 0.45098 0.154062 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 29 ESR1 Original Motif Reverse Complement Backward 5 14 0.0722733 Original Motif 0.261242 0.256959 0.329764 0.152034 0.228632 0.17094 0.350427 0.25 0.136752 0.369658 0.318376 0.175214 0.176596 0.487234 0.138298 0.197872 0.285106 0.493617 0.1 0.121277 0.651163 0.0591966 0.188161 0.10148 0.0759494 0.0168776 0.816456 0.0907173 0.04 0.0378947 0.884211 0.0378947 0.0694737 0.0863158 0.191579 0.652632 0.00842105 0.829474 0.111579 0.0505263 0.837895 0.0273684 0.0568421 0.0778947 0.122105 0.526316 0.225263 0.126316 0.132632 0.581053 0.111579 0.174737 0.134737 0.543158 0.204211 0.117895 0.0673684 0.04 0.0168421 0.875789 0.0442105 0.0463158 0.896842 0.0126316 0.642105 0.223158 0.0652632 0.0694737 0.0210526 0.917895 0.0252632 0.0357895 0.124211 0.743158 0.00421053 0.128421 0.0547368 0.347368 0.0463158 0.551579 Reverse Complement Motif 0.551579 0.347368 0.0463158 0.0547368 0.124211 0.00421053 0.743158 0.128421 0.0210526 0.0252632 0.917895 0.0357895 0.0694737 0.223158 0.0652632 0.642105 0.0442105 0.896842 0.0463158 0.0126316 0.875789 0.04 0.0168421 0.0673684 0.134737 0.204211 0.543158 0.117895 0.132632 0.111579 0.581053 0.174737 0.122105 0.225263 0.526316 0.126316 0.0778947 0.0273684 0.0568421 0.837895 0.00842105 0.111579 0.829474 0.0505263 0.652632 0.0863158 0.191579 0.0694737 0.04 0.884211 0.0378947 0.0378947 0.0759494 0.816456 0.0168776 0.0907173 0.10148 0.0591966 0.188161 0.651163 0.285106 0.1 0.493617 0.121277 0.176596 0.138298 0.487234 0.197872 0.136752 0.318376 0.369658 0.175214 0.228632 0.350427 0.17094 0.25 0.261242 0.329764 0.256959 0.152034 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 48 Tcfcp2l1 Original Motif Original Motif Backward 1 14 0.0732898 Original Motif 0.00196754 0.92548 0.0627152 0.00983768 0.069973 0.807513 0.00540142 0.117113 0.594508 0.00514832 0.275803 0.12454 0.0058838 0.0237803 0.967149 0.00318706 0.175477 0.33627 0.0256975 0.462555 0.0983847 0.28928 0.0621635 0.550171 0.173924 0.39726 0.151174 0.277642 0.357213 0.224939 0.252323 0.165526 0.63154 0.0696822 0.190954 0.107824 0.394421 0.0513824 0.310497 0.2437 0.00366928 0.933219 0.0547945 0.00831703 0.0617193 0.812148 0.00293902 0.123194 0.536555 0.00736016 0.305937 0.150147 0.0120393 0.0289926 0.954791 0.0041769 Reverse Complement Motif 0.0120393 0.954791 0.0289926 0.0041769 0.150147 0.00736016 0.305937 0.536555 0.0617193 0.00293902 0.812148 0.123194 0.00366928 0.0547945 0.933219 0.00831703 0.2437 0.0513824 0.310497 0.394421 0.107824 0.0696822 0.190954 0.63154 0.165526 0.224939 0.252323 0.357213 0.173924 0.151174 0.39726 0.277642 0.550171 0.28928 0.0621635 0.0983847 0.462555 0.33627 0.0256975 0.175477 0.0058838 0.967149 0.0237803 0.00318706 0.12454 0.00514832 0.275803 0.594508 0.069973 0.00540142 0.807513 0.117113 0.00196754 0.0627152 0.92548 0.00983768 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 13 Zfp423 Reverse Complement Reverse Complement Forward 2 14 0.0747812 Original Motif 0.212121 0.121212 0.666667 0 0 0.484848 0.515152 0 0.484848 0.515152 0 0 0.515152 0.484848 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.030303 0.515152 0 0.454545 0.727273 0 0 0.272727 0.393939 0 0.484848 0.121212 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.515152 0.484848 0 0 0.484848 0.515152 0 0.242424 0.484848 0.272727 0.333333 0.666667 0 0 Reverse Complement Motif 0.333333 0 0.666667 0 0 0.484848 0.242424 0.272727 0.515152 0 0.484848 0 0 0.515152 0 0.484848 0 1 0 0 0 1 0 0 0.393939 0.484848 0 0.121212 0.272727 0 0 0.727273 0.030303 0 0.515152 0.454545 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.484848 0 0.515152 0.484848 0 0.515152 0 0 0.515152 0.484848 0 0.212121 0.666667 0.121212 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 PLAG1 Original Motif Reverse Complement Forward 1 14 0.0796879 Original Motif 0 0 1 0 0.166667 0 0.777778 0.0555556 0 0 1 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0.777778 0.222222 0 0 0.833333 0.0555556 0.111111 0.222222 0.555556 0.0555556 0.166667 0.666667 0 0 0.333333 0.611111 0.277778 0.111111 0 0.111111 0 0.777778 0.111111 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.888889 0.111111 0.111111 0 0.888889 0 Reverse Complement Motif 0.111111 0.888889 0 0 0 0.888889 0 0.111111 0 1 0 0 0 1 0 0 0.111111 0.777778 0 0.111111 0 0.277778 0.111111 0.611111 0.333333 0 0 0.666667 0.222222 0.0555556 0.555556 0.166667 0 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0.222222 0.777778 0 0 0.944444 0 0.0555556 0 1 0 0 0.166667 0.777778 0 0.0555556 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 REST Reverse Complement Reverse Complement Forward 5 14 0.0812253 Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reverse Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 24 Ar Reverse Complement Original Motif Backward 4 14 0.0832838 Original Motif 0.375 0.291667 0.0833333 0.25 0.375 0.0833333 0.125 0.416667 0.458333 0.125 0.125 0.291667 0.666667 0.0416667 0.291667 0 0 0 0.916667 0.0833333 0.5 0.25 0.0416667 0.208333 0.875 0.0833333 0 0.0416667 0 1 0 0 0.625 0 0.333333 0.0416667 0.166667 0.375 0.0833333 0.375 0.208333 0.458333 0.0833333 0.25 0.25 0.375 0.375 0 0.125 0.208333 0.0416667 0.625 0 0 1 0 0.166667 0 0 0.833333 0.458333 0.208333 0.0416667 0.291667 0.0416667 0.916667 0.0416667 0 0.125 0.666667 0.0416667 0.166667 0.25 0.291667 0.208333 0.25 0.25 0.208333 0.375 0.166667 0.416667 0.458333 0 0.125 0.208333 0.458333 0.25 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.208333 0.25 0.458333 0.0833333 0.416667 0 0.458333 0.125 0.25 0.375 0.208333 0.166667 0.25 0.208333 0.291667 0.25 0.125 0.0416667 0.666667 0.166667 0.0416667 0.0416667 0.916667 0 0.291667 0.208333 0.0416667 0.458333 0.833333 0 0 0.166667 0 1 0 0 0.625 0.208333 0.0416667 0.125 0.25 0.375 0.375 0 0.208333 0.0833333 0.458333 0.25 0.166667 0.0833333 0.375 0.375 0.0416667 0 0.333333 0.625 0 0 1 0 0.0416667 0.0833333 0 0.875 0.208333 0.25 0.0416667 0.5 0 0.916667 0 0.0833333 0 0.0416667 0.291667 0.666667 0.291667 0.125 0.125 0.458333 0.416667 0.0833333 0.125 0.375 0.25 0.291667 0.0833333 0.375 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 PPARGRXRA Original Motif Reverse Complement Forward 1 14 0.0836605 Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reverse Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 47 RXRRAR_DR5 Original Motif Reverse Complement Forward 5 13 0.570818 Original Motif 0.521739 0 0.478261 0 0 0 1 0 0.0434783 0 0.565217 0.391304 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.782609 0.130435 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.173913 0.304348 0.217391 0.304348 0.217391 0.347826 0.391304 0.0434783 0.217391 0.173913 0.478261 0.130435 0.565217 0.0434783 0.304348 0.0869565 0.217391 0.26087 0.521739 0 0.73913 0.130435 0.130435 0 0.0434783 0.0434783 0.869565 0.0434783 0 0.0434783 0.695652 0.26087 0.0869565 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0434783 0.73913 0.130435 0.0869565 0.913043 0 0.0434783 0.0434783 Reverse Complement Motif 0.0434783 0 0.0434783 0.913043 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0869565 0.73913 0.0434783 0.130435 0.0869565 0 0.695652 0.0434783 0.26087 0.0434783 0.869565 0.0434783 0.0434783 0 0.130435 0.130435 0.73913 0.217391 0.521739 0.26087 0 0.0869565 0.0434783 0.304348 0.565217 0.217391 0.478261 0.173913 0.130435 0.217391 0.391304 0.347826 0.0434783 0.173913 0.217391 0.304348 0.304348 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.130435 0.782609 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.0434783 0.565217 0 0.391304 0 1 0 0 0 0 0.478261 0.521739 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 13 Motif Name Zfp423 Original Motif 0.212121 0.121212 0.666667 0 0 0.484848 0.515152 0 0.484848 0.515152 0 0 0.515152 0.484848 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.030303 0.515152 0 0.454545 0.727273 0 0 0.272727 0.393939 0 0.484848 0.121212 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.515152 0.484848 0 0 0.484848 0.515152 0 0.242424 0.484848 0.272727 0.333333 0.666667 0 0 Reserve Complement Motif 0.333333 0 0.666667 0 0 0.484848 0.242424 0.272727 0.515152 0 0.484848 0 0 0.515152 0 0.484848 0 1 0 0 0 1 0 0 0.393939 0.484848 0 0.121212 0.272727 0 0 0.727273 0.030303 0 0.515152 0.454545 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.484848 0 0.515152 0.484848 0 0.515152 0 0 0.515152 0.484848 0 0.212121 0.666667 0.121212 0 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 13 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 24 Ar Original Motif Original Motif Forward 4 15 0.0400042 Original Motif 0.375 0.291667 0.0833333 0.25 0.375 0.0833333 0.125 0.416667 0.458333 0.125 0.125 0.291667 0.666667 0.0416667 0.291667 0 0 0 0.916667 0.0833333 0.5 0.25 0.0416667 0.208333 0.875 0.0833333 0 0.0416667 0 1 0 0 0.625 0 0.333333 0.0416667 0.166667 0.375 0.0833333 0.375 0.208333 0.458333 0.0833333 0.25 0.25 0.375 0.375 0 0.125 0.208333 0.0416667 0.625 0 0 1 0 0.166667 0 0 0.833333 0.458333 0.208333 0.0416667 0.291667 0.0416667 0.916667 0.0416667 0 0.125 0.666667 0.0416667 0.166667 0.25 0.291667 0.208333 0.25 0.25 0.208333 0.375 0.166667 0.416667 0.458333 0 0.125 0.208333 0.458333 0.25 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.208333 0.25 0.458333 0.0833333 0.416667 0 0.458333 0.125 0.25 0.375 0.208333 0.166667 0.25 0.208333 0.291667 0.25 0.125 0.0416667 0.666667 0.166667 0.0416667 0.0416667 0.916667 0 0.291667 0.208333 0.0416667 0.458333 0.833333 0 0 0.166667 0 1 0 0 0.625 0.208333 0.0416667 0.125 0.25 0.375 0.375 0 0.208333 0.0833333 0.458333 0.25 0.166667 0.0833333 0.375 0.375 0.0416667 0 0.333333 0.625 0 0 1 0 0.0416667 0.0833333 0 0.875 0.208333 0.25 0.0416667 0.5 0 0.916667 0 0.0833333 0 0.0416667 0.291667 0.666667 0.291667 0.125 0.125 0.458333 0.416667 0.0833333 0.125 0.375 0.25 0.291667 0.0833333 0.375 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 45 Pax5 Original Motif Original Motif Forward 3 15 0.0400673 Original Motif 0.333333 0.0833333 0.333333 0.25 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 0.25 0.25 0.166667 0.0833333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.583333 0.166667 0.0833333 0.166667 0.166667 0.416667 0.25 0.166667 0 0.25 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.666667 0.0833333 0.5 0.0833333 0.25 0.166667 0.5 0 0.166667 0.333333 0 0 1 0 0.166667 0.666667 0.0833333 0.0833333 0.25 0 0.75 0 0.0833333 0 0.333333 0.583333 0.5 0.0833333 0.416667 0 0.416667 0.0833333 0.416667 0.0833333 0.166667 0.833333 0 0 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.166667 0 0.833333 0 0.0833333 0.0833333 0.416667 0.416667 0 0.0833333 0.416667 0.5 0.583333 0 0.333333 0.0833333 0.25 0.75 0 0 0.166667 0.0833333 0.666667 0.0833333 0 1 0 0 0.333333 0 0.166667 0.5 0.166667 0.0833333 0.25 0.5 0.0833333 0.666667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.25 0.166667 0 0.166667 0.25 0.416667 0.166667 0.166667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.416667 0.166667 0.333333 0.166667 0.25 0.25 0.333333 0.333333 0.666667 0 0 0.25 0.0833333 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 REST Reverse Complement Original Motif Backward 4 15 0.0410001 Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reverse Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 17 RXRAVDR Reverse Complement Original Motif Backward 1 15 0.0465067 Original Motif 0.3 0 0.7 0 0 0 1 0 0 0 0.9 0.1 0 0 0 1 0 0.9 0 0.1 0.9 0 0.1 0 0.4 0.2 0 0.4 0.2 0.4 0.2 0.2 0.2 0 0.8 0 0.5 0 0.5 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0.1 0 0 0.9 0 0.9 0 0.1 0.7 0.1 0.2 0 Reverse Complement Motif 0 0.1 0.2 0.7 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0 0.1 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0 0.2 0.2 0.4 0.2 0.4 0.2 0 0.4 0 0 0.1 0.9 0 0 0.9 0.1 1 0 0 0 0 0.9 0 0.1 0 1 0 0 0.3 0.7 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 PLAG1 Original Motif Original Motif Forward 1 14 0.527928 Original Motif 0 0 1 0 0.166667 0 0.777778 0.0555556 0 0 1 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0.777778 0.222222 0 0 0.833333 0.0555556 0.111111 0.222222 0.555556 0.0555556 0.166667 0.666667 0 0 0.333333 0.611111 0.277778 0.111111 0 0.111111 0 0.777778 0.111111 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.888889 0.111111 0.111111 0 0.888889 0 Reverse Complement Motif 0.111111 0.888889 0 0 0 0.888889 0 0.111111 0 1 0 0 0 1 0 0 0.111111 0.777778 0 0.111111 0 0.277778 0.111111 0.611111 0.333333 0 0 0.666667 0.222222 0.0555556 0.555556 0.166667 0 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0.222222 0.777778 0 0 0.944444 0 0.0555556 0 1 0 0 0.166667 0.777778 0 0.0555556 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 Zfx Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 14 0.53991 Original Motif 0.105042 0.371849 0.37605 0.147059 0.125786 0.356394 0.360587 0.157233 0.190377 0.3159 0.416318 0.0774059 0.150313 0.102296 0.622129 0.125261 0.02079 0.617464 0.299376 0.0623701 0.012474 0.752599 0.004158 0.230769 0.0623701 0.259875 0.378378 0.299376 0.397089 0.320166 0.251559 0.031185 0.018711 0.004158 0.975052 0.002079 0 0.00623701 0.991684 0.002079 0.002079 0.997921 0 0 0 0.997921 0 0.002079 0 0.004158 0 0.995842 0.174636 0.253638 0.455301 0.116424 Reverse Complement Motif 0.174636 0.455301 0.253638 0.116424 0.995842 0.004158 0 0 0 0 0.997921 0.002079 0.002079 0 0.997921 0 0 0.991684 0.00623701 0.002079 0.018711 0.975052 0.004158 0.002079 0.031185 0.320166 0.251559 0.397089 0.0623701 0.378378 0.259875 0.299376 0.012474 0.004158 0.752599 0.230769 0.02079 0.299376 0.617464 0.0623701 0.150313 0.622129 0.102296 0.125261 0.190377 0.416318 0.3159 0.0774059 0.125786 0.360587 0.356394 0.157233 0.105042 0.37605 0.371849 0.147059 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 29 ESR1 Reverse Complement Original Motif Backward 8 13 1.03254 Original Motif 0.261242 0.256959 0.329764 0.152034 0.228632 0.17094 0.350427 0.25 0.136752 0.369658 0.318376 0.175214 0.176596 0.487234 0.138298 0.197872 0.285106 0.493617 0.1 0.121277 0.651163 0.0591966 0.188161 0.10148 0.0759494 0.0168776 0.816456 0.0907173 0.04 0.0378947 0.884211 0.0378947 0.0694737 0.0863158 0.191579 0.652632 0.00842105 0.829474 0.111579 0.0505263 0.837895 0.0273684 0.0568421 0.0778947 0.122105 0.526316 0.225263 0.126316 0.132632 0.581053 0.111579 0.174737 0.134737 0.543158 0.204211 0.117895 0.0673684 0.04 0.0168421 0.875789 0.0442105 0.0463158 0.896842 0.0126316 0.642105 0.223158 0.0652632 0.0694737 0.0210526 0.917895 0.0252632 0.0357895 0.124211 0.743158 0.00421053 0.128421 0.0547368 0.347368 0.0463158 0.551579 Reverse Complement Motif 0.551579 0.347368 0.0463158 0.0547368 0.124211 0.00421053 0.743158 0.128421 0.0210526 0.0252632 0.917895 0.0357895 0.0694737 0.223158 0.0652632 0.642105 0.0442105 0.896842 0.0463158 0.0126316 0.875789 0.04 0.0168421 0.0673684 0.134737 0.204211 0.543158 0.117895 0.132632 0.111579 0.581053 0.174737 0.122105 0.225263 0.526316 0.126316 0.0778947 0.0273684 0.0568421 0.837895 0.00842105 0.111579 0.829474 0.0505263 0.652632 0.0863158 0.191579 0.0694737 0.04 0.884211 0.0378947 0.0378947 0.0759494 0.816456 0.0168776 0.0907173 0.10148 0.0591966 0.188161 0.651163 0.285106 0.1 0.493617 0.121277 0.176596 0.138298 0.487234 0.197872 0.136752 0.318376 0.369658 0.175214 0.228632 0.350427 0.17094 0.25 0.261242 0.329764 0.256959 0.152034 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Reverse Complement Reverse Complement Forward 8 13 1.04952 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 35 INSM1 Original Motif Original Motif Backward 1 12 1.54193 Original Motif 0.0416667 0 0.166667 0.791667 0 0 0.833333 0.166667 0 0.333333 0.125 0.541667 0.25 0.625 0 0.125 0.666667 0 0 0.333333 0 0 1 0 0 0.0416667 0.958333 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.0833333 0.666667 0.25 0.125 0.666667 0 0.208333 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.125 0 0.666667 0.208333 0 0.666667 0.0833333 0.25 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 1 0 0 0.333333 0 0 0.666667 0.25 0 0.625 0.125 0.541667 0.333333 0.125 0 0 0.833333 0 0.166667 0.791667 0 0.166667 0.0416667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 48 Tcfcp2l1 Reverse Complement Reverse Complement Forward 4 11 2.04218 Original Motif 0.00196754 0.92548 0.0627152 0.00983768 0.069973 0.807513 0.00540142 0.117113 0.594508 0.00514832 0.275803 0.12454 0.0058838 0.0237803 0.967149 0.00318706 0.175477 0.33627 0.0256975 0.462555 0.0983847 0.28928 0.0621635 0.550171 0.173924 0.39726 0.151174 0.277642 0.357213 0.224939 0.252323 0.165526 0.63154 0.0696822 0.190954 0.107824 0.394421 0.0513824 0.310497 0.2437 0.00366928 0.933219 0.0547945 0.00831703 0.0617193 0.812148 0.00293902 0.123194 0.536555 0.00736016 0.305937 0.150147 0.0120393 0.0289926 0.954791 0.0041769 Reverse Complement Motif 0.0120393 0.954791 0.0289926 0.0041769 0.150147 0.00736016 0.305937 0.536555 0.0617193 0.00293902 0.812148 0.123194 0.00366928 0.0547945 0.933219 0.00831703 0.2437 0.0513824 0.310497 0.394421 0.107824 0.0696822 0.190954 0.63154 0.165526 0.224939 0.252323 0.357213 0.173924 0.151174 0.39726 0.277642 0.550171 0.28928 0.0621635 0.0983847 0.462555 0.33627 0.0256975 0.175477 0.0058838 0.967149 0.0237803 0.00318706 0.12454 0.00514832 0.275803 0.594508 0.069973 0.00540142 0.807513 0.117113 0.00196754 0.0627152 0.92548 0.00983768 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 14 Motif Name ZEB1 Original Motif 0.0243902 0.829268 0.0243902 0.121951 0.926829 0 0.0487805 0.0243902 0 0.97561 0.0243902 0 0 0.926829 0.0731707 0 0 0.0243902 0 0.97561 0.243902 0.0243902 0.390244 0.341463 Reserve Complement Motif 0.243902 0.390244 0.0243902 0.341463 0.97561 0.0243902 0 0 0 0.0731707 0.926829 0 0 0.0243902 0.97561 0 0.0243902 0 0.0487805 0.926829 0.0243902 0.0243902 0.829268 0.121951 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 14 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 46 RORA_1 Original Motif Reverse Complement Forward 2 6 0.0141289 Original Motif 0.6 0.04 0.08 0.28 0.36 0.04 0 0.6 0.24 0.48 0.16 0.12 0.44 0.08 0.2 0.28 0.84 0 0.16 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 Reverse Complement Motif 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0.16 0.84 0.28 0.08 0.2 0.44 0.24 0.16 0.48 0.12 0.6 0.04 0 0.36 0.28 0.04 0.08 0.6 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 REST Reverse Complement Reverse Complement Forward 11 6 0.0143133 Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reverse Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 31 Esrrb Original Motif Reverse Complement Forward 1 6 0.0207244 Original Motif 0.2 0.8 0 0 0.95 0 0.05 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 Reverse Complement Motif 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0.05 0.95 0.2 0 0.8 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 25 Arnt Original Motif Reverse Complement Forward 1 6 0.0207244 Original Motif 0.2 0.8 0 0 0.95 0 0.05 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 Reverse Complement Motif 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0.05 0.95 0.2 0 0.8 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 43 NR1H2RXRA Original Motif Reverse Complement Backward 2 6 0.0232753 Original Motif 0.68 0.2 0 0.12 0.68 0.04 0.2 0.08 0.8 0 0.2 0 0 0 1 0 0 0 0.96 0.04 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.96 0 0 0.04 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.8 0.04 0.08 0.08 0 0.6 0.24 0.16 Reverse Complement Motif 0 0.24 0.6 0.16 0.08 0.04 0.08 0.8 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.04 0 0 0.96 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0.96 0 0.04 0 1 0 0 0 0 0.2 0.8 0.08 0.04 0.2 0.68 0.12 0.2 0 0.68 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 33 HIF1AARNT Original Motif Reverse Complement Forward 2 6 0.0237889 Original Motif 0.259615 0.269231 0.471154 0 0.0961538 0.278846 0.326923 0.298077 0.75 0.0192308 0.221154 0.00961538 0 0.990385 0 0.00961538 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.173077 0.490385 0.192308 0.144231 Reverse Complement Motif 0.173077 0.192308 0.490385 0.144231 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0.990385 0.00961538 0.00961538 0.0192308 0.221154 0.75 0.0961538 0.326923 0.278846 0.298077 0.259615 0.471154 0.269231 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 35 INSM1 Reverse Complement Original Motif Forward 4 6 0.0262123 Original Motif 0.0416667 0 0.166667 0.791667 0 0 0.833333 0.166667 0 0.333333 0.125 0.541667 0.25 0.625 0 0.125 0.666667 0 0 0.333333 0 0 1 0 0 0.0416667 0.958333 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.0833333 0.666667 0.25 0.125 0.666667 0 0.208333 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.125 0 0.666667 0.208333 0 0.666667 0.0833333 0.25 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 1 0 0 0.333333 0 0 0.666667 0.25 0 0.625 0.125 0.541667 0.333333 0.125 0 0 0.833333 0 0.166667 0.791667 0 0.166667 0.0416667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 PPARGRXRA Original Motif Reverse Complement Forward 2 6 0.0264837 Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reverse Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 39 MYCMAX Original Motif Reverse Complement Forward 3 6 0.0269744 Original Motif 0.333333 0.047619 0.428571 0.190476 0.714286 0.047619 0.190476 0.047619 0.0952381 0.428571 0.428571 0.047619 0.047619 0.952381 0 0 1 0 0 0 0 0.952381 0 0.047619 0.047619 0 0.952381 0 0 0.047619 0 0.952381 0 0 1 0 0.047619 0.047619 0.857143 0.047619 0.142857 0.238095 0 0.619048 Reverse Complement Motif 0.619048 0.238095 0 0.142857 0.047619 0.857143 0.047619 0.047619 0 1 0 0 0.952381 0.047619 0 0 0.047619 0.952381 0 0 0 0 0.952381 0.047619 0 0 0 1 0.047619 0 0.952381 0 0.0952381 0.428571 0.428571 0.047619 0.047619 0.047619 0.190476 0.714286 0.333333 0.428571 0.047619 0.190476 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 44 NR4A2 Original Motif Reverse Complement Backward 1 6 0.0288897 Original Motif 0.615385 0.0769231 0.230769 0.0769231 0.928571 0 0.0714286 0 0 0 0.928571 0.0714286 0.214286 0 0.785714 0 0.142857 0.142857 0 0.714286 0 0.928571 0 0.0714286 1 0 0 0 0.230769 0.615385 0.153846 0 Reverse Complement Motif 0.230769 0.153846 0.615385 0 0 0 0 1 0 0 0.928571 0.0714286 0.714286 0.142857 0 0.142857 0.214286 0.785714 0 0 0 0.928571 0 0.0714286 0 0 0.0714286 0.928571 0.0769231 0.0769231 0.230769 0.615385 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 15 Motif Name TFAP2A Original Motif 0 0 1 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.118919 0.383784 0.248649 0.248649 0.102703 0.308108 0.32973 0.259459 0.297297 0.237838 0.362162 0.102703 0.286486 0.162162 0.491892 0.0594595 0.102703 0.0864865 0.740541 0.0702703 0.0486486 0.421622 0.427027 0.102703 Reserve Complement Motif 0.0486486 0.427027 0.421622 0.102703 0.102703 0.740541 0.0864865 0.0702703 0.286486 0.491892 0.162162 0.0594595 0.297297 0.362162 0.237838 0.102703 0.102703 0.32973 0.308108 0.259459 0.118919 0.248649 0.383784 0.248649 0 0 1 0 0 0 1 0 0 1 0 0 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 15 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 Zfx Reverse Complement Original Motif Backward 3 9 0.0131247 Original Motif 0.105042 0.371849 0.37605 0.147059 0.125786 0.356394 0.360587 0.157233 0.190377 0.3159 0.416318 0.0774059 0.150313 0.102296 0.622129 0.125261 0.02079 0.617464 0.299376 0.0623701 0.012474 0.752599 0.004158 0.230769 0.0623701 0.259875 0.378378 0.299376 0.397089 0.320166 0.251559 0.031185 0.018711 0.004158 0.975052 0.002079 0 0.00623701 0.991684 0.002079 0.002079 0.997921 0 0 0 0.997921 0 0.002079 0 0.004158 0 0.995842 0.174636 0.253638 0.455301 0.116424 Reverse Complement Motif 0.174636 0.455301 0.253638 0.116424 0.995842 0.004158 0 0 0 0 0.997921 0.002079 0.002079 0 0.997921 0 0 0.991684 0.00623701 0.002079 0.018711 0.975052 0.004158 0.002079 0.031185 0.320166 0.251559 0.397089 0.0623701 0.378378 0.259875 0.299376 0.012474 0.004158 0.752599 0.230769 0.02079 0.299376 0.617464 0.0623701 0.150313 0.622129 0.102296 0.125261 0.190377 0.416318 0.3159 0.0774059 0.125786 0.360587 0.356394 0.157233 0.105042 0.37605 0.371849 0.147059 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 PLAG1 Original Motif Original Motif Forward 4 9 0.0414588 Original Motif 0 0 1 0 0.166667 0 0.777778 0.0555556 0 0 1 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0.777778 0.222222 0 0 0.833333 0.0555556 0.111111 0.222222 0.555556 0.0555556 0.166667 0.666667 0 0 0.333333 0.611111 0.277778 0.111111 0 0.111111 0 0.777778 0.111111 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.888889 0.111111 0.111111 0 0.888889 0 Reverse Complement Motif 0.111111 0.888889 0 0 0 0.888889 0 0.111111 0 1 0 0 0 1 0 0 0.111111 0.777778 0 0.111111 0 0.277778 0.111111 0.611111 0.333333 0 0 0.666667 0.222222 0.0555556 0.555556 0.166667 0 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0.222222 0.777778 0 0 0.944444 0 0.0555556 0 1 0 0 0.166667 0.777778 0 0.0555556 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 13 Zfp423 Reverse Complement Reverse Complement Backward 4 9 0.0438157 Original Motif 0.212121 0.121212 0.666667 0 0 0.484848 0.515152 0 0.484848 0.515152 0 0 0.515152 0.484848 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.030303 0.515152 0 0.454545 0.727273 0 0 0.272727 0.393939 0 0.484848 0.121212 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.515152 0.484848 0 0 0.484848 0.515152 0 0.242424 0.484848 0.272727 0.333333 0.666667 0 0 Reverse Complement Motif 0.333333 0 0.666667 0 0 0.484848 0.242424 0.272727 0.515152 0 0.484848 0 0 0.515152 0 0.484848 0 1 0 0 0 1 0 0 0.393939 0.484848 0 0.121212 0.272727 0 0 0.727273 0.030303 0 0.515152 0.454545 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.484848 0 0.515152 0.484848 0 0.515152 0 0 0.515152 0.484848 0 0.212121 0.666667 0.121212 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 29 ESR1 Original Motif Reverse Complement Backward 2 9 0.0450672 Original Motif 0.261242 0.256959 0.329764 0.152034 0.228632 0.17094 0.350427 0.25 0.136752 0.369658 0.318376 0.175214 0.176596 0.487234 0.138298 0.197872 0.285106 0.493617 0.1 0.121277 0.651163 0.0591966 0.188161 0.10148 0.0759494 0.0168776 0.816456 0.0907173 0.04 0.0378947 0.884211 0.0378947 0.0694737 0.0863158 0.191579 0.652632 0.00842105 0.829474 0.111579 0.0505263 0.837895 0.0273684 0.0568421 0.0778947 0.122105 0.526316 0.225263 0.126316 0.132632 0.581053 0.111579 0.174737 0.134737 0.543158 0.204211 0.117895 0.0673684 0.04 0.0168421 0.875789 0.0442105 0.0463158 0.896842 0.0126316 0.642105 0.223158 0.0652632 0.0694737 0.0210526 0.917895 0.0252632 0.0357895 0.124211 0.743158 0.00421053 0.128421 0.0547368 0.347368 0.0463158 0.551579 Reverse Complement Motif 0.551579 0.347368 0.0463158 0.0547368 0.124211 0.00421053 0.743158 0.128421 0.0210526 0.0252632 0.917895 0.0357895 0.0694737 0.223158 0.0652632 0.642105 0.0442105 0.896842 0.0463158 0.0126316 0.875789 0.04 0.0168421 0.0673684 0.134737 0.204211 0.543158 0.117895 0.132632 0.111579 0.581053 0.174737 0.122105 0.225263 0.526316 0.126316 0.0778947 0.0273684 0.0568421 0.837895 0.00842105 0.111579 0.829474 0.0505263 0.652632 0.0863158 0.191579 0.0694737 0.04 0.884211 0.0378947 0.0378947 0.0759494 0.816456 0.0168776 0.0907173 0.10148 0.0591966 0.188161 0.651163 0.285106 0.1 0.493617 0.121277 0.176596 0.138298 0.487234 0.197872 0.136752 0.318376 0.369658 0.175214 0.228632 0.350427 0.17094 0.25 0.261242 0.329764 0.256959 0.152034 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 30 ESR2 Reverse Complement Reverse Complement Forward 6 9 0.0531668 Original Motif 0.218487 0.45098 0.176471 0.154062 0.442577 0.142857 0.114846 0.29972 0.521008 0.0420168 0.431373 0.00560224 0.0756303 0 0.770308 0.154062 0.0504202 0.0560224 0.893557 0 0.0364146 0.0532213 0.092437 0.817927 0 1 0 0 0.943978 0.00280112 0 0.0532213 0.137255 0.344538 0.316527 0.201681 0.179272 0.176471 0.417367 0.226891 0.145658 0.170868 0.411765 0.271709 0.0588235 0.092437 0.0672269 0.781513 0.176471 0.070028 0.742297 0.0112045 0.498599 0.277311 0.0532213 0.170868 0.0952381 0.7507 0.00560224 0.148459 0.128852 0.809524 0 0.0616246 0.0756303 0.252101 0 0.672269 0.168067 0.263305 0.380952 0.187675 Reverse Complement Motif 0.168067 0.380952 0.263305 0.187675 0.672269 0.252101 0 0.0756303 0.128852 0 0.809524 0.0616246 0.0952381 0.00560224 0.7507 0.148459 0.170868 0.277311 0.0532213 0.498599 0.176471 0.742297 0.070028 0.0112045 0.781513 0.092437 0.0672269 0.0588235 0.145658 0.411765 0.170868 0.271709 0.179272 0.417367 0.176471 0.226891 0.137255 0.316527 0.344538 0.201681 0.0532213 0.00280112 0 0.943978 0 0 1 0 0.817927 0.0532213 0.092437 0.0364146 0.0504202 0.893557 0.0560224 0 0.0756303 0.770308 0 0.154062 0.00560224 0.0420168 0.431373 0.521008 0.29972 0.142857 0.114846 0.442577 0.218487 0.176471 0.45098 0.154062 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 40 Mycn Reverse Complement Original Motif Forward 2 9 0.0550803 Original Motif 0.349315 0.363014 0.143836 0.143836 0.0890411 0.388128 0.447489 0.0753425 0.0159817 0.984018 0 0 0.945205 0 0.0410959 0.0136986 0 0.961187 0.0182648 0.0205479 0.0707763 0.00228311 0.924658 0.00228311 0.0547945 0.221461 0.00456621 0.719178 0 0 0.938356 0.0616438 0.0616438 0.111872 0.739726 0.086758 0.139269 0.605023 0.0913242 0.164384 Reverse Complement Motif 0.139269 0.0913242 0.605023 0.164384 0.0616438 0.739726 0.111872 0.086758 0 0.938356 0 0.0616438 0.719178 0.221461 0.00456621 0.0547945 0.0707763 0.924658 0.00228311 0.00228311 0 0.0182648 0.961187 0.0205479 0.0136986 0 0.0410959 0.945205 0.0159817 0 0.984018 0 0.0890411 0.447489 0.388128 0.0753425 0.349315 0.143836 0.363014 0.143836 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 45 Pax5 Original Motif Reverse Complement Backward 5 9 0.0581255 Original Motif 0.333333 0.0833333 0.333333 0.25 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 0.25 0.25 0.166667 0.0833333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.583333 0.166667 0.0833333 0.166667 0.166667 0.416667 0.25 0.166667 0 0.25 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.666667 0.0833333 0.5 0.0833333 0.25 0.166667 0.5 0 0.166667 0.333333 0 0 1 0 0.166667 0.666667 0.0833333 0.0833333 0.25 0 0.75 0 0.0833333 0 0.333333 0.583333 0.5 0.0833333 0.416667 0 0.416667 0.0833333 0.416667 0.0833333 0.166667 0.833333 0 0 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.166667 0 0.833333 0 0.0833333 0.0833333 0.416667 0.416667 0 0.0833333 0.416667 0.5 0.583333 0 0.333333 0.0833333 0.25 0.75 0 0 0.166667 0.0833333 0.666667 0.0833333 0 1 0 0 0.333333 0 0.166667 0.5 0.166667 0.0833333 0.25 0.5 0.0833333 0.666667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.25 0.166667 0 0.166667 0.25 0.416667 0.166667 0.166667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.416667 0.166667 0.333333 0.166667 0.25 0.25 0.333333 0.333333 0.666667 0 0 0.25 0.0833333 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 47 RXRRAR_DR5 Original Motif Original Motif Forward 3 9 0.0606062 Original Motif 0.521739 0 0.478261 0 0 0 1 0 0.0434783 0 0.565217 0.391304 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.782609 0.130435 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.173913 0.304348 0.217391 0.304348 0.217391 0.347826 0.391304 0.0434783 0.217391 0.173913 0.478261 0.130435 0.565217 0.0434783 0.304348 0.0869565 0.217391 0.26087 0.521739 0 0.73913 0.130435 0.130435 0 0.0434783 0.0434783 0.869565 0.0434783 0 0.0434783 0.695652 0.26087 0.0869565 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0434783 0.73913 0.130435 0.0869565 0.913043 0 0.0434783 0.0434783 Reverse Complement Motif 0.0434783 0 0.0434783 0.913043 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0869565 0.73913 0.0434783 0.130435 0.0869565 0 0.695652 0.0434783 0.26087 0.0434783 0.869565 0.0434783 0.0434783 0 0.130435 0.130435 0.73913 0.217391 0.521739 0.26087 0 0.0869565 0.0434783 0.304348 0.565217 0.217391 0.478261 0.173913 0.130435 0.217391 0.391304 0.347826 0.0434783 0.173913 0.217391 0.304348 0.304348 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.130435 0.782609 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.0434783 0.565217 0 0.391304 0 1 0 0 0 0 0.478261 0.521739 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 38 Myc Reverse Complement Original Motif Backward 1 9 0.0613455 Original Motif 0.295154 0.422907 0.15859 0.123348 0.14978 0.23348 0.572687 0.0440529 0.0352423 0.964758 0 0 0.955947 0.0176211 0.0220264 0.00440529 0 0.933921 0.0132159 0.0528634 0.0837004 0.00881057 0.898678 0.00881057 0.0396476 0.193833 0 0.76652 0 0.00881057 0.951542 0.0396476 0 0.0748899 0.806167 0.118943 0.198238 0.471366 0.105727 0.22467 Reverse Complement Motif 0.198238 0.105727 0.471366 0.22467 0 0.806167 0.0748899 0.118943 0 0.951542 0.00881057 0.0396476 0.76652 0.193833 0 0.0396476 0.0837004 0.898678 0.00881057 0.00881057 0 0.0132159 0.933921 0.0528634 0.00440529 0.0176211 0.0220264 0.955947 0.0352423 0 0.964758 0 0.14978 0.572687 0.23348 0.0440529 0.295154 0.15859 0.422907 0.123348 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 48 Tcfcp2l1 Original Motif Original Motif Backward 3 9 0.0631412 Original Motif 0.00196754 0.92548 0.0627152 0.00983768 0.069973 0.807513 0.00540142 0.117113 0.594508 0.00514832 0.275803 0.12454 0.0058838 0.0237803 0.967149 0.00318706 0.175477 0.33627 0.0256975 0.462555 0.0983847 0.28928 0.0621635 0.550171 0.173924 0.39726 0.151174 0.277642 0.357213 0.224939 0.252323 0.165526 0.63154 0.0696822 0.190954 0.107824 0.394421 0.0513824 0.310497 0.2437 0.00366928 0.933219 0.0547945 0.00831703 0.0617193 0.812148 0.00293902 0.123194 0.536555 0.00736016 0.305937 0.150147 0.0120393 0.0289926 0.954791 0.0041769 Reverse Complement Motif 0.0120393 0.954791 0.0289926 0.0041769 0.150147 0.00736016 0.305937 0.536555 0.0617193 0.00293902 0.812148 0.123194 0.00366928 0.0547945 0.933219 0.00831703 0.2437 0.0513824 0.310497 0.394421 0.107824 0.0696822 0.190954 0.63154 0.165526 0.224939 0.252323 0.357213 0.173924 0.151174 0.39726 0.277642 0.550171 0.28928 0.0621635 0.0983847 0.462555 0.33627 0.0256975 0.175477 0.0058838 0.967149 0.0237803 0.00318706 0.12454 0.00514832 0.275803 0.594508 0.069973 0.00540142 0.807513 0.117113 0.00196754 0.0627152 0.92548 0.00983768 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 16 Motif Name SP1 Original Motif 0 0.914286 0.0285714 0.0571429 0 0.857143 0.0285714 0.114286 0 1 0 0 0.114286 0.771429 0 0.114286 0.0571429 0.142857 0.428571 0.371429 0 0.8 0.0285714 0.171429 0.0285714 0.885714 0 0.0857143 0 0.685714 0.0857143 0.228571 0.171429 0.714286 0 0.114286 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.0857143 Reserve Complement Motif 0.0857143 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.171429 0 0.714286 0.114286 0 0.0857143 0.685714 0.228571 0.0285714 0 0.885714 0.0857143 0 0.0285714 0.8 0.171429 0.0571429 0.428571 0.142857 0.371429 0.114286 0 0.771429 0.114286 0 0 1 0 0 0.0285714 0.857143 0.114286 0 0.0285714 0.914286 0.0571429 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 16 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Reverse Complement Reverse Complement Forward 2 10 0.0646465 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 Zfx Reverse Complement Original Motif Forward 5 10 0.0664832 Original Motif 0.105042 0.371849 0.37605 0.147059 0.125786 0.356394 0.360587 0.157233 0.190377 0.3159 0.416318 0.0774059 0.150313 0.102296 0.622129 0.125261 0.02079 0.617464 0.299376 0.0623701 0.012474 0.752599 0.004158 0.230769 0.0623701 0.259875 0.378378 0.299376 0.397089 0.320166 0.251559 0.031185 0.018711 0.004158 0.975052 0.002079 0 0.00623701 0.991684 0.002079 0.002079 0.997921 0 0 0 0.997921 0 0.002079 0 0.004158 0 0.995842 0.174636 0.253638 0.455301 0.116424 Reverse Complement Motif 0.174636 0.455301 0.253638 0.116424 0.995842 0.004158 0 0 0 0 0.997921 0.002079 0.002079 0 0.997921 0 0 0.991684 0.00623701 0.002079 0.018711 0.975052 0.004158 0.002079 0.031185 0.320166 0.251559 0.397089 0.0623701 0.378378 0.259875 0.299376 0.012474 0.004158 0.752599 0.230769 0.02079 0.299376 0.617464 0.0623701 0.150313 0.622129 0.102296 0.125261 0.190377 0.416318 0.3159 0.0774059 0.125786 0.360587 0.356394 0.157233 0.105042 0.37605 0.371849 0.147059 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 PLAG1 Original Motif Reverse Complement Backward 4 10 0.0725 Original Motif 0 0 1 0 0.166667 0 0.777778 0.0555556 0 0 1 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0.777778 0.222222 0 0 0.833333 0.0555556 0.111111 0.222222 0.555556 0.0555556 0.166667 0.666667 0 0 0.333333 0.611111 0.277778 0.111111 0 0.111111 0 0.777778 0.111111 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.888889 0.111111 0.111111 0 0.888889 0 Reverse Complement Motif 0.111111 0.888889 0 0 0 0.888889 0 0.111111 0 1 0 0 0 1 0 0 0.111111 0.777778 0 0.111111 0 0.277778 0.111111 0.611111 0.333333 0 0 0.666667 0.222222 0.0555556 0.555556 0.166667 0 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0.222222 0.777778 0 0 0.944444 0 0.0555556 0 1 0 0 0.166667 0.777778 0 0.0555556 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 PPARGRXRA Original Motif Reverse Complement Forward 3 10 0.0731995 Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reverse Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 36 Klf4 Original Motif Reverse Complement Backward 1 10 0.0761191 Original Motif 0.338561 0.0186808 0.235701 0.407057 0.0202765 0.00207373 0.976267 0.00138249 0.00322284 0.00299263 0.990792 0.00299263 0.00322061 0.00828157 0.984817 0.0036807 0.0636928 0.441941 0.00252932 0.491837 0.00506446 0.00345304 0.983656 0.00782689 0.00967073 0.0184204 0.501727 0.470182 0.0608716 0.0106064 0.8997 0.0288218 0.0283999 0.0300162 0.874856 0.0667282 0.0587419 0.660962 0.0647549 0.215541 Reverse Complement Motif 0.0587419 0.0647549 0.660962 0.215541 0.0283999 0.874856 0.0300162 0.0667282 0.0608716 0.8997 0.0106064 0.0288218 0.00967073 0.501727 0.0184204 0.470182 0.00506446 0.983656 0.00345304 0.00782689 0.491837 0.441941 0.00252932 0.0636928 0.00322061 0.984817 0.00828157 0.0036807 0.00322284 0.990792 0.00299263 0.00299263 0.0202765 0.976267 0.00207373 0.00138249 0.407057 0.0186808 0.235701 0.338561 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 28 Egr1 Reverse Complement Original Motif Backward 2 10 0.0798413 Original Motif 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0.133333 0.0666667 0.8 0 0 0.866667 0 0.133333 0 0 1 0 0 0 0.2 0.8 0.2 0 0.8 0 0.0666667 0 0.933333 0 0 0 1 0 0.133333 0.666667 0 0.2 0 0 1 0 0.0666667 0 0.466667 0.466667 Reverse Complement Motif 0.0666667 0.466667 0 0.466667 0 1 0 0 0.133333 0 0.666667 0.2 0 1 0 0 0.0666667 0.933333 0 0 0.2 0.8 0 0 0.8 0 0.2 0 0 1 0 0 0 0 0.866667 0.133333 0.133333 0.8 0.0666667 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 45 Pax5 Reverse Complement Original Motif Backward 4 10 0.0846627 Original Motif 0.333333 0.0833333 0.333333 0.25 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 0.25 0.25 0.166667 0.0833333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.583333 0.166667 0.0833333 0.166667 0.166667 0.416667 0.25 0.166667 0 0.25 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.666667 0.0833333 0.5 0.0833333 0.25 0.166667 0.5 0 0.166667 0.333333 0 0 1 0 0.166667 0.666667 0.0833333 0.0833333 0.25 0 0.75 0 0.0833333 0 0.333333 0.583333 0.5 0.0833333 0.416667 0 0.416667 0.0833333 0.416667 0.0833333 0.166667 0.833333 0 0 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.166667 0 0.833333 0 0.0833333 0.0833333 0.416667 0.416667 0 0.0833333 0.416667 0.5 0.583333 0 0.333333 0.0833333 0.25 0.75 0 0 0.166667 0.0833333 0.666667 0.0833333 0 1 0 0 0.333333 0 0.166667 0.5 0.166667 0.0833333 0.25 0.5 0.0833333 0.666667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.25 0.166667 0 0.166667 0.25 0.416667 0.166667 0.166667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.416667 0.166667 0.333333 0.166667 0.25 0.25 0.333333 0.333333 0.666667 0 0 0.25 0.0833333 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 41 MZF1_5-13 Reverse Complement Original Motif Backward 1 10 0.0884127 Original Motif 0.0625 0.25 0.4375 0.25 0.125 0 0.4375 0.4375 0.9375 0.0625 0 0 0 0 0.6875 0.3125 0 0 0.9375 0.0625 0 0.125 0.875 0 0 0 0.875 0.125 0.1875 0.0625 0.5 0.25 0.625 0 0.25 0.125 0.5 0.125 0.25 0.125 Reverse Complement Motif 0.125 0.125 0.25 0.5 0.125 0 0.25 0.625 0.1875 0.5 0.0625 0.25 0 0.875 0 0.125 0 0.875 0.125 0 0 0.9375 0 0.0625 0 0.6875 0 0.3125 0 0.0625 0 0.9375 0.125 0.4375 0 0.4375 0.0625 0.4375 0.25 0.25 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 35 INSM1 Reverse Complement Original Motif Backward 3 10 0.089127 Original Motif 0.0416667 0 0.166667 0.791667 0 0 0.833333 0.166667 0 0.333333 0.125 0.541667 0.25 0.625 0 0.125 0.666667 0 0 0.333333 0 0 1 0 0 0.0416667 0.958333 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.0833333 0.666667 0.25 0.125 0.666667 0 0.208333 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.125 0 0.666667 0.208333 0 0.666667 0.0833333 0.25 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 1 0 0 0.333333 0 0 0.666667 0.25 0 0.625 0.125 0.541667 0.333333 0.125 0 0 0.833333 0 0.166667 0.791667 0 0.166667 0.0416667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 32 EWSR1-FLI1 Original Motif Reverse Complement Forward 4 10 0.0893651 Original Motif 0 0 1 0 0.0190476 0 0.980952 0 0.990476 0 0.00952381 0 0.990476 0 0.00952381 0 0.00952381 0 0.990476 0 0.0190476 0 0.971429 0.00952381 0.980952 0 0.0190476 0 0.971429 0 0.0285714 0 0 0 0.990476 0.00952381 0 0.0190476 0.980952 0 0.942857 0.0380952 0.0190476 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0.0190476 0.980952 0 0.952381 0.0285714 0 0.0190476 0.971429 0 0.0190476 0.00952381 0.047619 0 0.92381 0.0285714 0.0285714 0.0285714 0.92381 0.0190476 Reverse Complement Motif 0.0285714 0.92381 0.0285714 0.0190476 0.047619 0.92381 0 0.0285714 0.00952381 0 0.0190476 0.971429 0.0190476 0.0285714 0 0.952381 0 0.980952 0.0190476 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0.0380952 0.0190476 0.942857 0 0.980952 0.0190476 0 0 0.990476 0 0.00952381 0 0 0.0285714 0.971429 0 0 0.0190476 0.980952 0.0190476 0.971429 0 0.00952381 0.00952381 0.990476 0 0 0 0 0.00952381 0.990476 0 0 0.00952381 0.990476 0.0190476 0.980952 0 0 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 17 Motif Name RXRAVDR Original Motif 0.3 0 0.7 0 0 0 1 0 0 0 0.9 0.1 0 0 0 1 0 0.9 0 0.1 0.9 0 0.1 0 0.4 0.2 0 0.4 0.2 0.4 0.2 0.2 0.2 0 0.8 0 0.5 0 0.5 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0.1 0 0 0.9 0 0.9 0 0.1 0.7 0.1 0.2 0 Reserve Complement Motif 0 0.1 0.2 0.7 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0 0.1 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0 0.2 0.2 0.4 0.2 0.4 0.2 0 0.4 0 0 0.1 0.9 0 0 0.9 0.1 1 0 0 0 0 0.9 0 0.1 0 1 0 0 0.3 0.7 0 0 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 17 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 24 Ar Reverse Complement Original Motif Forward 4 15 0.0566667 Original Motif 0.375 0.291667 0.0833333 0.25 0.375 0.0833333 0.125 0.416667 0.458333 0.125 0.125 0.291667 0.666667 0.0416667 0.291667 0 0 0 0.916667 0.0833333 0.5 0.25 0.0416667 0.208333 0.875 0.0833333 0 0.0416667 0 1 0 0 0.625 0 0.333333 0.0416667 0.166667 0.375 0.0833333 0.375 0.208333 0.458333 0.0833333 0.25 0.25 0.375 0.375 0 0.125 0.208333 0.0416667 0.625 0 0 1 0 0.166667 0 0 0.833333 0.458333 0.208333 0.0416667 0.291667 0.0416667 0.916667 0.0416667 0 0.125 0.666667 0.0416667 0.166667 0.25 0.291667 0.208333 0.25 0.25 0.208333 0.375 0.166667 0.416667 0.458333 0 0.125 0.208333 0.458333 0.25 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.208333 0.25 0.458333 0.0833333 0.416667 0 0.458333 0.125 0.25 0.375 0.208333 0.166667 0.25 0.208333 0.291667 0.25 0.125 0.0416667 0.666667 0.166667 0.0416667 0.0416667 0.916667 0 0.291667 0.208333 0.0416667 0.458333 0.833333 0 0 0.166667 0 1 0 0 0.625 0.208333 0.0416667 0.125 0.25 0.375 0.375 0 0.208333 0.0833333 0.458333 0.25 0.166667 0.0833333 0.375 0.375 0.0416667 0 0.333333 0.625 0 0 1 0 0.0416667 0.0833333 0 0.875 0.208333 0.25 0.0416667 0.5 0 0.916667 0 0.0833333 0 0.0416667 0.291667 0.666667 0.291667 0.125 0.125 0.458333 0.416667 0.0833333 0.125 0.375 0.25 0.291667 0.0833333 0.375 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 30 ESR2 Original Motif Original Motif Backward 2 15 0.0617507 Original Motif 0.218487 0.45098 0.176471 0.154062 0.442577 0.142857 0.114846 0.29972 0.521008 0.0420168 0.431373 0.00560224 0.0756303 0 0.770308 0.154062 0.0504202 0.0560224 0.893557 0 0.0364146 0.0532213 0.092437 0.817927 0 1 0 0 0.943978 0.00280112 0 0.0532213 0.137255 0.344538 0.316527 0.201681 0.179272 0.176471 0.417367 0.226891 0.145658 0.170868 0.411765 0.271709 0.0588235 0.092437 0.0672269 0.781513 0.176471 0.070028 0.742297 0.0112045 0.498599 0.277311 0.0532213 0.170868 0.0952381 0.7507 0.00560224 0.148459 0.128852 0.809524 0 0.0616246 0.0756303 0.252101 0 0.672269 0.168067 0.263305 0.380952 0.187675 Reverse Complement Motif 0.168067 0.380952 0.263305 0.187675 0.672269 0.252101 0 0.0756303 0.128852 0 0.809524 0.0616246 0.0952381 0.00560224 0.7507 0.148459 0.170868 0.277311 0.0532213 0.498599 0.176471 0.742297 0.070028 0.0112045 0.781513 0.092437 0.0672269 0.0588235 0.145658 0.411765 0.170868 0.271709 0.179272 0.417367 0.176471 0.226891 0.137255 0.316527 0.344538 0.201681 0.0532213 0.00280112 0 0.943978 0 0 1 0 0.817927 0.0532213 0.092437 0.0364146 0.0504202 0.893557 0.0560224 0 0.0756303 0.770308 0 0.154062 0.00560224 0.0420168 0.431373 0.521008 0.29972 0.142857 0.114846 0.442577 0.218487 0.176471 0.45098 0.154062 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 47 RXRRAR_DR5 Original Motif Original Motif Backward 3 15 0.062029 Original Motif 0.521739 0 0.478261 0 0 0 1 0 0.0434783 0 0.565217 0.391304 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.782609 0.130435 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.173913 0.304348 0.217391 0.304348 0.217391 0.347826 0.391304 0.0434783 0.217391 0.173913 0.478261 0.130435 0.565217 0.0434783 0.304348 0.0869565 0.217391 0.26087 0.521739 0 0.73913 0.130435 0.130435 0 0.0434783 0.0434783 0.869565 0.0434783 0 0.0434783 0.695652 0.26087 0.0869565 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0434783 0.73913 0.130435 0.0869565 0.913043 0 0.0434783 0.0434783 Reverse Complement Motif 0.0434783 0 0.0434783 0.913043 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0869565 0.73913 0.0434783 0.130435 0.0869565 0 0.695652 0.0434783 0.26087 0.0434783 0.869565 0.0434783 0.0434783 0 0.130435 0.130435 0.73913 0.217391 0.521739 0.26087 0 0.0869565 0.0434783 0.304348 0.565217 0.217391 0.478261 0.173913 0.130435 0.217391 0.391304 0.347826 0.0434783 0.173913 0.217391 0.304348 0.304348 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.130435 0.782609 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.0434783 0.565217 0 0.391304 0 1 0 0 0 0 0.478261 0.521739 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 29 ESR1 Reverse Complement Original Motif Backward 1 15 0.0714525 Original Motif 0.261242 0.256959 0.329764 0.152034 0.228632 0.17094 0.350427 0.25 0.136752 0.369658 0.318376 0.175214 0.176596 0.487234 0.138298 0.197872 0.285106 0.493617 0.1 0.121277 0.651163 0.0591966 0.188161 0.10148 0.0759494 0.0168776 0.816456 0.0907173 0.04 0.0378947 0.884211 0.0378947 0.0694737 0.0863158 0.191579 0.652632 0.00842105 0.829474 0.111579 0.0505263 0.837895 0.0273684 0.0568421 0.0778947 0.122105 0.526316 0.225263 0.126316 0.132632 0.581053 0.111579 0.174737 0.134737 0.543158 0.204211 0.117895 0.0673684 0.04 0.0168421 0.875789 0.0442105 0.0463158 0.896842 0.0126316 0.642105 0.223158 0.0652632 0.0694737 0.0210526 0.917895 0.0252632 0.0357895 0.124211 0.743158 0.00421053 0.128421 0.0547368 0.347368 0.0463158 0.551579 Reverse Complement Motif 0.551579 0.347368 0.0463158 0.0547368 0.124211 0.00421053 0.743158 0.128421 0.0210526 0.0252632 0.917895 0.0357895 0.0694737 0.223158 0.0652632 0.642105 0.0442105 0.896842 0.0463158 0.0126316 0.875789 0.04 0.0168421 0.0673684 0.134737 0.204211 0.543158 0.117895 0.132632 0.111579 0.581053 0.174737 0.122105 0.225263 0.526316 0.126316 0.0778947 0.0273684 0.0568421 0.837895 0.00842105 0.111579 0.829474 0.0505263 0.652632 0.0863158 0.191579 0.0694737 0.04 0.884211 0.0378947 0.0378947 0.0759494 0.816456 0.0168776 0.0907173 0.10148 0.0591966 0.188161 0.651163 0.285106 0.1 0.493617 0.121277 0.176596 0.138298 0.487234 0.197872 0.136752 0.318376 0.369658 0.175214 0.228632 0.350427 0.17094 0.25 0.261242 0.329764 0.256959 0.152034 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 13 Zfp423 Reverse Complement Original Motif Forward 1 15 0.0849495 Original Motif 0.212121 0.121212 0.666667 0 0 0.484848 0.515152 0 0.484848 0.515152 0 0 0.515152 0.484848 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.030303 0.515152 0 0.454545 0.727273 0 0 0.272727 0.393939 0 0.484848 0.121212 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.515152 0.484848 0 0 0.484848 0.515152 0 0.242424 0.484848 0.272727 0.333333 0.666667 0 0 Reverse Complement Motif 0.333333 0 0.666667 0 0 0.484848 0.242424 0.272727 0.515152 0 0.484848 0 0 0.515152 0 0.484848 0 1 0 0 0 1 0 0 0.393939 0.484848 0 0.121212 0.272727 0 0 0.727273 0.030303 0 0.515152 0.454545 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.484848 0 0.515152 0.484848 0 0.515152 0 0 0.515152 0.484848 0 0.212121 0.666667 0.121212 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 43 NR1H2RXRA Original Motif Original Motif Backward 1 15 0.0866667 Original Motif 0.68 0.2 0 0.12 0.68 0.04 0.2 0.08 0.8 0 0.2 0 0 0 1 0 0 0 0.96 0.04 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.96 0 0 0.04 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.8 0.04 0.08 0.08 0 0.6 0.24 0.16 Reverse Complement Motif 0 0.24 0.6 0.16 0.08 0.04 0.08 0.8 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.04 0 0 0.96 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0.96 0 0.04 0 1 0 0 0 0 0.2 0.8 0.08 0.04 0.2 0.68 0.12 0.2 0 0.68 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 PLAG1 Original Motif Original Motif Forward 2 13 1.06201 Original Motif 0 0 1 0 0.166667 0 0.777778 0.0555556 0 0 1 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0.777778 0.222222 0 0 0.833333 0.0555556 0.111111 0.222222 0.555556 0.0555556 0.166667 0.666667 0 0 0.333333 0.611111 0.277778 0.111111 0 0.111111 0 0.777778 0.111111 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.888889 0.111111 0.111111 0 0.888889 0 Reverse Complement Motif 0.111111 0.888889 0 0 0 0.888889 0 0.111111 0 1 0 0 0 1 0 0 0.111111 0.777778 0 0.111111 0 0.277778 0.111111 0.611111 0.333333 0 0 0.666667 0.222222 0.0555556 0.555556 0.166667 0 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0.222222 0.777778 0 0 0.944444 0 0.0555556 0 1 0 0 0.166667 0.777778 0 0.0555556 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 PPARGRXRA Original Motif Original Motif Forward 3 13 1.07837 Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reverse Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 34 HNF4A Original Motif Original Motif Forward 1 13 1.0801 Original Motif 0.41791 0.104478 0.402985 0.0746269 0.0298507 0.0298507 0.835821 0.104478 0.179104 0.0597015 0.522388 0.238806 0.0746269 0.343284 0.298507 0.283582 0.0447761 0.761194 0.0597015 0.134328 0.880597 0.0149254 0.0447761 0.0597015 0.791045 0.0298507 0.149254 0.0298507 0.835821 0.0149254 0.119403 0.0298507 0.0597015 0.0597015 0.865672 0.0149254 0.0895522 0.0298507 0.492537 0.38806 0.0447761 0.328358 0.164179 0.462687 0.0597015 0.731343 0.0746269 0.134328 0.626866 0.104478 0.149254 0.119403 Reverse Complement Motif 0.119403 0.104478 0.149254 0.626866 0.0597015 0.0746269 0.731343 0.134328 0.462687 0.328358 0.164179 0.0447761 0.0895522 0.492537 0.0298507 0.38806 0.0597015 0.865672 0.0597015 0.0149254 0.0298507 0.0149254 0.119403 0.835821 0.0298507 0.0298507 0.149254 0.791045 0.0597015 0.0149254 0.0447761 0.880597 0.0447761 0.0597015 0.761194 0.134328 0.0746269 0.298507 0.343284 0.283582 0.179104 0.522388 0.0597015 0.238806 0.0298507 0.835821 0.0298507 0.104478 0.0746269 0.104478 0.402985 0.41791 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 22 NR2F1 Original Motif Reverse Complement Forward 2 13 1.08482 Original Motif 0 0 0.153846 0.846154 0.0769231 0 0.923077 0 0.923077 0 0.0769231 0 0.461538 0.538462 0 0 0 1 0 0 0 0.230769 0 0.769231 0 0.153846 0 0.846154 0.0769231 0 0 0.923077 0.153846 0 0.846154 0 0.461538 0.307692 0.230769 0 0.461538 0.384615 0.0769231 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.230769 0.461538 0 0.307692 0 0.230769 0.230769 0.538462 Reverse Complement Motif 0.538462 0.230769 0.230769 0 0.230769 0 0.461538 0.307692 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.384615 0.0769231 0.461538 0 0.307692 0.230769 0.461538 0.153846 0.846154 0 0 0.923077 0 0 0.0769231 0.846154 0.153846 0 0 0.769231 0.230769 0 0 0 0 1 0 0.461538 0 0.538462 0 0 0 0.0769231 0.923077 0.0769231 0.923077 0 0 0.846154 0 0.153846 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 18 Motif Name RREB1 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reserve Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 18 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 29 ESR1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 19 0.0874679 Original Motif 0.261242 0.256959 0.329764 0.152034 0.228632 0.17094 0.350427 0.25 0.136752 0.369658 0.318376 0.175214 0.176596 0.487234 0.138298 0.197872 0.285106 0.493617 0.1 0.121277 0.651163 0.0591966 0.188161 0.10148 0.0759494 0.0168776 0.816456 0.0907173 0.04 0.0378947 0.884211 0.0378947 0.0694737 0.0863158 0.191579 0.652632 0.00842105 0.829474 0.111579 0.0505263 0.837895 0.0273684 0.0568421 0.0778947 0.122105 0.526316 0.225263 0.126316 0.132632 0.581053 0.111579 0.174737 0.134737 0.543158 0.204211 0.117895 0.0673684 0.04 0.0168421 0.875789 0.0442105 0.0463158 0.896842 0.0126316 0.642105 0.223158 0.0652632 0.0694737 0.0210526 0.917895 0.0252632 0.0357895 0.124211 0.743158 0.00421053 0.128421 0.0547368 0.347368 0.0463158 0.551579 Reverse Complement Motif 0.551579 0.347368 0.0463158 0.0547368 0.124211 0.00421053 0.743158 0.128421 0.0210526 0.0252632 0.917895 0.0357895 0.0694737 0.223158 0.0652632 0.642105 0.0442105 0.896842 0.0463158 0.0126316 0.875789 0.04 0.0168421 0.0673684 0.134737 0.204211 0.543158 0.117895 0.132632 0.111579 0.581053 0.174737 0.122105 0.225263 0.526316 0.126316 0.0778947 0.0273684 0.0568421 0.837895 0.00842105 0.111579 0.829474 0.0505263 0.652632 0.0863158 0.191579 0.0694737 0.04 0.884211 0.0378947 0.0378947 0.0759494 0.816456 0.0168776 0.0907173 0.10148 0.0591966 0.188161 0.651163 0.285106 0.1 0.493617 0.121277 0.176596 0.138298 0.487234 0.197872 0.136752 0.318376 0.369658 0.175214 0.228632 0.350427 0.17094 0.25 0.261242 0.329764 0.256959 0.152034 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 24 Ar Original Motif Original Motif Backward 4 19 0.0927532 Original Motif 0.375 0.291667 0.0833333 0.25 0.375 0.0833333 0.125 0.416667 0.458333 0.125 0.125 0.291667 0.666667 0.0416667 0.291667 0 0 0 0.916667 0.0833333 0.5 0.25 0.0416667 0.208333 0.875 0.0833333 0 0.0416667 0 1 0 0 0.625 0 0.333333 0.0416667 0.166667 0.375 0.0833333 0.375 0.208333 0.458333 0.0833333 0.25 0.25 0.375 0.375 0 0.125 0.208333 0.0416667 0.625 0 0 1 0 0.166667 0 0 0.833333 0.458333 0.208333 0.0416667 0.291667 0.0416667 0.916667 0.0416667 0 0.125 0.666667 0.0416667 0.166667 0.25 0.291667 0.208333 0.25 0.25 0.208333 0.375 0.166667 0.416667 0.458333 0 0.125 0.208333 0.458333 0.25 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.208333 0.25 0.458333 0.0833333 0.416667 0 0.458333 0.125 0.25 0.375 0.208333 0.166667 0.25 0.208333 0.291667 0.25 0.125 0.0416667 0.666667 0.166667 0.0416667 0.0416667 0.916667 0 0.291667 0.208333 0.0416667 0.458333 0.833333 0 0 0.166667 0 1 0 0 0.625 0.208333 0.0416667 0.125 0.25 0.375 0.375 0 0.208333 0.0833333 0.458333 0.25 0.166667 0.0833333 0.375 0.375 0.0416667 0 0.333333 0.625 0 0 1 0 0.0416667 0.0833333 0 0.875 0.208333 0.25 0.0416667 0.5 0 0.916667 0 0.0833333 0 0.0416667 0.291667 0.666667 0.291667 0.125 0.125 0.458333 0.416667 0.0833333 0.125 0.375 0.25 0.291667 0.0833333 0.375 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 30 ESR2 Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 18 0.593122 Original Motif 0.218487 0.45098 0.176471 0.154062 0.442577 0.142857 0.114846 0.29972 0.521008 0.0420168 0.431373 0.00560224 0.0756303 0 0.770308 0.154062 0.0504202 0.0560224 0.893557 0 0.0364146 0.0532213 0.092437 0.817927 0 1 0 0 0.943978 0.00280112 0 0.0532213 0.137255 0.344538 0.316527 0.201681 0.179272 0.176471 0.417367 0.226891 0.145658 0.170868 0.411765 0.271709 0.0588235 0.092437 0.0672269 0.781513 0.176471 0.070028 0.742297 0.0112045 0.498599 0.277311 0.0532213 0.170868 0.0952381 0.7507 0.00560224 0.148459 0.128852 0.809524 0 0.0616246 0.0756303 0.252101 0 0.672269 0.168067 0.263305 0.380952 0.187675 Reverse Complement Motif 0.168067 0.380952 0.263305 0.187675 0.672269 0.252101 0 0.0756303 0.128852 0 0.809524 0.0616246 0.0952381 0.00560224 0.7507 0.148459 0.170868 0.277311 0.0532213 0.498599 0.176471 0.742297 0.070028 0.0112045 0.781513 0.092437 0.0672269 0.0588235 0.145658 0.411765 0.170868 0.271709 0.179272 0.417367 0.176471 0.226891 0.137255 0.316527 0.344538 0.201681 0.0532213 0.00280112 0 0.943978 0 0 1 0 0.817927 0.0532213 0.092437 0.0364146 0.0504202 0.893557 0.0560224 0 0.0756303 0.770308 0 0.154062 0.00560224 0.0420168 0.431373 0.521008 0.29972 0.142857 0.114846 0.442577 0.218487 0.176471 0.45098 0.154062 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 45 Pax5 Reverse Complement Original Motif Backward 4 17 1.09431 Original Motif 0.333333 0.0833333 0.333333 0.25 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 0.25 0.25 0.166667 0.0833333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.583333 0.166667 0.0833333 0.166667 0.166667 0.416667 0.25 0.166667 0 0.25 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.666667 0.0833333 0.5 0.0833333 0.25 0.166667 0.5 0 0.166667 0.333333 0 0 1 0 0.166667 0.666667 0.0833333 0.0833333 0.25 0 0.75 0 0.0833333 0 0.333333 0.583333 0.5 0.0833333 0.416667 0 0.416667 0.0833333 0.416667 0.0833333 0.166667 0.833333 0 0 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.166667 0 0.833333 0 0.0833333 0.0833333 0.416667 0.416667 0 0.0833333 0.416667 0.5 0.583333 0 0.333333 0.0833333 0.25 0.75 0 0 0.166667 0.0833333 0.666667 0.0833333 0 1 0 0 0.333333 0 0.166667 0.5 0.166667 0.0833333 0.25 0.5 0.0833333 0.666667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.25 0.166667 0 0.166667 0.25 0.416667 0.166667 0.166667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.416667 0.166667 0.333333 0.166667 0.25 0.25 0.333333 0.333333 0.666667 0 0 0.25 0.0833333 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 PLAG1 Original Motif Reverse Complement Forward 1 14 2.5804 Original Motif 0 0 1 0 0.166667 0 0.777778 0.0555556 0 0 1 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0.777778 0.222222 0 0 0.833333 0.0555556 0.111111 0.222222 0.555556 0.0555556 0.166667 0.666667 0 0 0.333333 0.611111 0.277778 0.111111 0 0.111111 0 0.777778 0.111111 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.888889 0.111111 0.111111 0 0.888889 0 Reverse Complement Motif 0.111111 0.888889 0 0 0 0.888889 0 0.111111 0 1 0 0 0 1 0 0 0.111111 0.777778 0 0.111111 0 0.277778 0.111111 0.611111 0.333333 0 0 0.666667 0.222222 0.0555556 0.555556 0.166667 0 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0.222222 0.777778 0 0 0.944444 0 0.0555556 0 1 0 0 0.166667 0.777778 0 0.0555556 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 Motif 9 Original Motif Original Motif Backward 1 14 2.58596 Original Motif 0.034483 0.931034 0.034483 0 1 0 0 0 0 0.827586 0.172414 0 0.862069 0 0 0.137931 0.103448 0.862069 0 0.034483 0.793103 0.034483 0.103448 0.068966 0.241379 0.413793 0.275862 0.068966 0.655172 0 0.344828 0 0 0.827586 0.172414 0 0.965517 0 0.034483 0 0 0.965517 0.034483 0 0.931034 0 0 0.068966 0.068966 0.931034 0 0 0.965517 0.034483 0 0 Reverse Complement Motif 0 0.034483 0 0.965517 0.068966 0 0.931034 0 0.068966 0 0 0.931034 0 0.034483 0.965517 0 0 0 0.034483 0.965517 0 0.172414 0.827586 0 0 0 0.344828 0.655172 0.241379 0.275862 0.413793 0.068966 0.068966 0.034483 0.103448 0.793103 0.103448 0 0.862069 0.034483 0.137931 0 0 0.862069 0 0.172414 0.827586 0 0 0 0 1 0.034483 0.034483 0.931034 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 Motif 11 Original Motif Original Motif Backward 1 14 2.59077 Original Motif 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0.636364 0 0.363636 0.727273 0 0.272727 0 0.181818 0.818182 0 0 1 0 0 0 0 0.909091 0 0.090909 1 0 0 0 0 0.909091 0 0.090909 0.909091 0 0 0.090909 0 1 0 0 0.818182 0 0 0.181818 0 0.909091 0 0.090909 0.909091 0 0 0.090909 Reverse Complement Motif 0.090909 0 0 0.909091 0 0 0.909091 0.090909 0.181818 0 0 0.818182 0 0 1 0 0.090909 0 0 0.909091 0 0 0.909091 0.090909 0 0 0 1 0 0 0.909091 0.090909 0 0 0 1 0.181818 0 0.818182 0 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0 1 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 47 RXRRAR_DR5 Reverse Complement Original Motif Forward 5 13 3.07964 Original Motif 0.521739 0 0.478261 0 0 0 1 0 0.0434783 0 0.565217 0.391304 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.782609 0.130435 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.173913 0.304348 0.217391 0.304348 0.217391 0.347826 0.391304 0.0434783 0.217391 0.173913 0.478261 0.130435 0.565217 0.0434783 0.304348 0.0869565 0.217391 0.26087 0.521739 0 0.73913 0.130435 0.130435 0 0.0434783 0.0434783 0.869565 0.0434783 0 0.0434783 0.695652 0.26087 0.0869565 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0434783 0.73913 0.130435 0.0869565 0.913043 0 0.0434783 0.0434783 Reverse Complement Motif 0.0434783 0 0.0434783 0.913043 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0869565 0.73913 0.0434783 0.130435 0.0869565 0 0.695652 0.0434783 0.26087 0.0434783 0.869565 0.0434783 0.0434783 0 0.130435 0.130435 0.73913 0.217391 0.521739 0.26087 0 0.0869565 0.0434783 0.304348 0.565217 0.217391 0.478261 0.173913 0.130435 0.217391 0.391304 0.347826 0.0434783 0.173913 0.217391 0.304348 0.304348 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.130435 0.782609 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.0434783 0.565217 0 0.391304 0 1 0 0 0 0 0.478261 0.521739 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 PPARGRXRA Reverse Complement Original Motif Forward 3 13 3.08033 Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reverse Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 48 Tcfcp2l1 Original Motif Original Motif Backward 2 13 3.08771 Original Motif 0.00196754 0.92548 0.0627152 0.00983768 0.069973 0.807513 0.00540142 0.117113 0.594508 0.00514832 0.275803 0.12454 0.0058838 0.0237803 0.967149 0.00318706 0.175477 0.33627 0.0256975 0.462555 0.0983847 0.28928 0.0621635 0.550171 0.173924 0.39726 0.151174 0.277642 0.357213 0.224939 0.252323 0.165526 0.63154 0.0696822 0.190954 0.107824 0.394421 0.0513824 0.310497 0.2437 0.00366928 0.933219 0.0547945 0.00831703 0.0617193 0.812148 0.00293902 0.123194 0.536555 0.00736016 0.305937 0.150147 0.0120393 0.0289926 0.954791 0.0041769 Reverse Complement Motif 0.0120393 0.954791 0.0289926 0.0041769 0.150147 0.00736016 0.305937 0.536555 0.0617193 0.00293902 0.812148 0.123194 0.00366928 0.0547945 0.933219 0.00831703 0.2437 0.0513824 0.310497 0.394421 0.107824 0.0696822 0.190954 0.63154 0.165526 0.224939 0.252323 0.357213 0.173924 0.151174 0.39726 0.277642 0.550171 0.28928 0.0621635 0.0983847 0.462555 0.33627 0.0256975 0.175477 0.0058838 0.967149 0.0237803 0.00318706 0.12454 0.00514832 0.275803 0.594508 0.069973 0.00540142 0.807513 0.117113 0.00196754 0.0627152 0.92548 0.00983768 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 19 Motif Name REST Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reserve Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 19 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 24 Ar Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 21 0.0685835 Original Motif 0.375 0.291667 0.0833333 0.25 0.375 0.0833333 0.125 0.416667 0.458333 0.125 0.125 0.291667 0.666667 0.0416667 0.291667 0 0 0 0.916667 0.0833333 0.5 0.25 0.0416667 0.208333 0.875 0.0833333 0 0.0416667 0 1 0 0 0.625 0 0.333333 0.0416667 0.166667 0.375 0.0833333 0.375 0.208333 0.458333 0.0833333 0.25 0.25 0.375 0.375 0 0.125 0.208333 0.0416667 0.625 0 0 1 0 0.166667 0 0 0.833333 0.458333 0.208333 0.0416667 0.291667 0.0416667 0.916667 0.0416667 0 0.125 0.666667 0.0416667 0.166667 0.25 0.291667 0.208333 0.25 0.25 0.208333 0.375 0.166667 0.416667 0.458333 0 0.125 0.208333 0.458333 0.25 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.208333 0.25 0.458333 0.0833333 0.416667 0 0.458333 0.125 0.25 0.375 0.208333 0.166667 0.25 0.208333 0.291667 0.25 0.125 0.0416667 0.666667 0.166667 0.0416667 0.0416667 0.916667 0 0.291667 0.208333 0.0416667 0.458333 0.833333 0 0 0.166667 0 1 0 0 0.625 0.208333 0.0416667 0.125 0.25 0.375 0.375 0 0.208333 0.0833333 0.458333 0.25 0.166667 0.0833333 0.375 0.375 0.0416667 0 0.333333 0.625 0 0 1 0 0.0416667 0.0833333 0 0.875 0.208333 0.25 0.0416667 0.5 0 0.916667 0 0.0833333 0 0.0416667 0.291667 0.666667 0.291667 0.125 0.125 0.458333 0.416667 0.0833333 0.125 0.375 0.25 0.291667 0.0833333 0.375 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 45 Pax5 Reverse Complement Reverse Complement Forward 3 18 1.577 Original Motif 0.333333 0.0833333 0.333333 0.25 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 0.25 0.25 0.166667 0.0833333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.583333 0.166667 0.0833333 0.166667 0.166667 0.416667 0.25 0.166667 0 0.25 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.666667 0.0833333 0.5 0.0833333 0.25 0.166667 0.5 0 0.166667 0.333333 0 0 1 0 0.166667 0.666667 0.0833333 0.0833333 0.25 0 0.75 0 0.0833333 0 0.333333 0.583333 0.5 0.0833333 0.416667 0 0.416667 0.0833333 0.416667 0.0833333 0.166667 0.833333 0 0 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.166667 0 0.833333 0 0.0833333 0.0833333 0.416667 0.416667 0 0.0833333 0.416667 0.5 0.583333 0 0.333333 0.0833333 0.25 0.75 0 0 0.166667 0.0833333 0.666667 0.0833333 0 1 0 0 0.333333 0 0.166667 0.5 0.166667 0.0833333 0.25 0.5 0.0833333 0.666667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.25 0.166667 0 0.166667 0.25 0.416667 0.166667 0.166667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.416667 0.166667 0.333333 0.166667 0.25 0.25 0.333333 0.333333 0.666667 0 0 0.25 0.0833333 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 29 ESR1 Original Motif Original Motif Backward 5 16 2.56863 Original Motif 0.261242 0.256959 0.329764 0.152034 0.228632 0.17094 0.350427 0.25 0.136752 0.369658 0.318376 0.175214 0.176596 0.487234 0.138298 0.197872 0.285106 0.493617 0.1 0.121277 0.651163 0.0591966 0.188161 0.10148 0.0759494 0.0168776 0.816456 0.0907173 0.04 0.0378947 0.884211 0.0378947 0.0694737 0.0863158 0.191579 0.652632 0.00842105 0.829474 0.111579 0.0505263 0.837895 0.0273684 0.0568421 0.0778947 0.122105 0.526316 0.225263 0.126316 0.132632 0.581053 0.111579 0.174737 0.134737 0.543158 0.204211 0.117895 0.0673684 0.04 0.0168421 0.875789 0.0442105 0.0463158 0.896842 0.0126316 0.642105 0.223158 0.0652632 0.0694737 0.0210526 0.917895 0.0252632 0.0357895 0.124211 0.743158 0.00421053 0.128421 0.0547368 0.347368 0.0463158 0.551579 Reverse Complement Motif 0.551579 0.347368 0.0463158 0.0547368 0.124211 0.00421053 0.743158 0.128421 0.0210526 0.0252632 0.917895 0.0357895 0.0694737 0.223158 0.0652632 0.642105 0.0442105 0.896842 0.0463158 0.0126316 0.875789 0.04 0.0168421 0.0673684 0.134737 0.204211 0.543158 0.117895 0.132632 0.111579 0.581053 0.174737 0.122105 0.225263 0.526316 0.126316 0.0778947 0.0273684 0.0568421 0.837895 0.00842105 0.111579 0.829474 0.0505263 0.652632 0.0863158 0.191579 0.0694737 0.04 0.884211 0.0378947 0.0378947 0.0759494 0.816456 0.0168776 0.0907173 0.10148 0.0591966 0.188161 0.651163 0.285106 0.1 0.493617 0.121277 0.176596 0.138298 0.487234 0.197872 0.136752 0.318376 0.369658 0.175214 0.228632 0.350427 0.17094 0.25 0.261242 0.329764 0.256959 0.152034 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 30 ESR2 Reverse Complement Reverse Complement Forward 6 13 4.05754 Original Motif 0.218487 0.45098 0.176471 0.154062 0.442577 0.142857 0.114846 0.29972 0.521008 0.0420168 0.431373 0.00560224 0.0756303 0 0.770308 0.154062 0.0504202 0.0560224 0.893557 0 0.0364146 0.0532213 0.092437 0.817927 0 1 0 0 0.943978 0.00280112 0 0.0532213 0.137255 0.344538 0.316527 0.201681 0.179272 0.176471 0.417367 0.226891 0.145658 0.170868 0.411765 0.271709 0.0588235 0.092437 0.0672269 0.781513 0.176471 0.070028 0.742297 0.0112045 0.498599 0.277311 0.0532213 0.170868 0.0952381 0.7507 0.00560224 0.148459 0.128852 0.809524 0 0.0616246 0.0756303 0.252101 0 0.672269 0.168067 0.263305 0.380952 0.187675 Reverse Complement Motif 0.168067 0.380952 0.263305 0.187675 0.672269 0.252101 0 0.0756303 0.128852 0 0.809524 0.0616246 0.0952381 0.00560224 0.7507 0.148459 0.170868 0.277311 0.0532213 0.498599 0.176471 0.742297 0.070028 0.0112045 0.781513 0.092437 0.0672269 0.0588235 0.145658 0.411765 0.170868 0.271709 0.179272 0.417367 0.176471 0.226891 0.137255 0.316527 0.344538 0.201681 0.0532213 0.00280112 0 0.943978 0 0 1 0 0.817927 0.0532213 0.092437 0.0364146 0.0504202 0.893557 0.0560224 0 0.0756303 0.770308 0 0.154062 0.00560224 0.0420168 0.431373 0.521008 0.29972 0.142857 0.114846 0.442577 0.218487 0.176471 0.45098 0.154062 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 34 HNF4A Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 13 4.06973 Original Motif 0.41791 0.104478 0.402985 0.0746269 0.0298507 0.0298507 0.835821 0.104478 0.179104 0.0597015 0.522388 0.238806 0.0746269 0.343284 0.298507 0.283582 0.0447761 0.761194 0.0597015 0.134328 0.880597 0.0149254 0.0447761 0.0597015 0.791045 0.0298507 0.149254 0.0298507 0.835821 0.0149254 0.119403 0.0298507 0.0597015 0.0597015 0.865672 0.0149254 0.0895522 0.0298507 0.492537 0.38806 0.0447761 0.328358 0.164179 0.462687 0.0597015 0.731343 0.0746269 0.134328 0.626866 0.104478 0.149254 0.119403 Reverse Complement Motif 0.119403 0.104478 0.149254 0.626866 0.0597015 0.0746269 0.731343 0.134328 0.462687 0.328358 0.164179 0.0447761 0.0895522 0.492537 0.0298507 0.38806 0.0597015 0.865672 0.0597015 0.0149254 0.0298507 0.0149254 0.119403 0.835821 0.0298507 0.0298507 0.149254 0.791045 0.0597015 0.0149254 0.0447761 0.880597 0.0447761 0.0597015 0.761194 0.134328 0.0746269 0.298507 0.343284 0.283582 0.179104 0.522388 0.0597015 0.238806 0.0298507 0.835821 0.0298507 0.104478 0.0746269 0.104478 0.402985 0.41791 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 PPARGRXRA Original Motif Original Motif Backward 3 13 4.07172 Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reverse Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 48 Tcfcp2l1 Reverse Complement Original Motif Forward 3 12 4.57098 Original Motif 0.00196754 0.92548 0.0627152 0.00983768 0.069973 0.807513 0.00540142 0.117113 0.594508 0.00514832 0.275803 0.12454 0.0058838 0.0237803 0.967149 0.00318706 0.175477 0.33627 0.0256975 0.462555 0.0983847 0.28928 0.0621635 0.550171 0.173924 0.39726 0.151174 0.277642 0.357213 0.224939 0.252323 0.165526 0.63154 0.0696822 0.190954 0.107824 0.394421 0.0513824 0.310497 0.2437 0.00366928 0.933219 0.0547945 0.00831703 0.0617193 0.812148 0.00293902 0.123194 0.536555 0.00736016 0.305937 0.150147 0.0120393 0.0289926 0.954791 0.0041769 Reverse Complement Motif 0.0120393 0.954791 0.0289926 0.0041769 0.150147 0.00736016 0.305937 0.536555 0.0617193 0.00293902 0.812148 0.123194 0.00366928 0.0547945 0.933219 0.00831703 0.2437 0.0513824 0.310497 0.394421 0.107824 0.0696822 0.190954 0.63154 0.165526 0.224939 0.252323 0.357213 0.173924 0.151174 0.39726 0.277642 0.550171 0.28928 0.0621635 0.0983847 0.462555 0.33627 0.0256975 0.175477 0.0058838 0.967149 0.0237803 0.00318706 0.12454 0.00514832 0.275803 0.594508 0.069973 0.00540142 0.807513 0.117113 0.00196754 0.0627152 0.92548 0.00983768 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 Zfx Reverse Complement Original Motif Backward 3 12 4.57482 Original Motif 0.105042 0.371849 0.37605 0.147059 0.125786 0.356394 0.360587 0.157233 0.190377 0.3159 0.416318 0.0774059 0.150313 0.102296 0.622129 0.125261 0.02079 0.617464 0.299376 0.0623701 0.012474 0.752599 0.004158 0.230769 0.0623701 0.259875 0.378378 0.299376 0.397089 0.320166 0.251559 0.031185 0.018711 0.004158 0.975052 0.002079 0 0.00623701 0.991684 0.002079 0.002079 0.997921 0 0 0 0.997921 0 0.002079 0 0.004158 0 0.995842 0.174636 0.253638 0.455301 0.116424 Reverse Complement Motif 0.174636 0.455301 0.253638 0.116424 0.995842 0.004158 0 0 0 0 0.997921 0.002079 0.002079 0 0.997921 0 0 0.991684 0.00623701 0.002079 0.018711 0.975052 0.004158 0.002079 0.031185 0.320166 0.251559 0.397089 0.0623701 0.378378 0.259875 0.299376 0.012474 0.004158 0.752599 0.230769 0.02079 0.299376 0.617464 0.0623701 0.150313 0.622129 0.102296 0.125261 0.190377 0.416318 0.3159 0.0774059 0.125786 0.360587 0.356394 0.157233 0.105042 0.37605 0.371849 0.147059 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 17 RXRAVDR Reverse Complement Reverse Complement Forward 5 11 5.05758 Original Motif 0.3 0 0.7 0 0 0 1 0 0 0 0.9 0.1 0 0 0 1 0 0.9 0 0.1 0.9 0 0.1 0 0.4 0.2 0 0.4 0.2 0.4 0.2 0.2 0.2 0 0.8 0 0.5 0 0.5 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0.1 0 0 0.9 0 0.9 0 0.1 0.7 0.1 0.2 0 Reverse Complement Motif 0 0.1 0.2 0.7 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0 0.1 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0 0.2 0.2 0.4 0.2 0.4 0.2 0 0.4 0 0 0.1 0.9 0 0 0.9 0.1 1 0 0 0 0 0.9 0 0.1 0 1 0 0 0.3 0.7 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 47 RXRRAR_DR5 Reverse Complement Reverse Complement Forward 7 11 5.05947 Original Motif 0.521739 0 0.478261 0 0 0 1 0 0.0434783 0 0.565217 0.391304 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.782609 0.130435 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.173913 0.304348 0.217391 0.304348 0.217391 0.347826 0.391304 0.0434783 0.217391 0.173913 0.478261 0.130435 0.565217 0.0434783 0.304348 0.0869565 0.217391 0.26087 0.521739 0 0.73913 0.130435 0.130435 0 0.0434783 0.0434783 0.869565 0.0434783 0 0.0434783 0.695652 0.26087 0.0869565 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0434783 0.73913 0.130435 0.0869565 0.913043 0 0.0434783 0.0434783 Reverse Complement Motif 0.0434783 0 0.0434783 0.913043 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0869565 0.73913 0.0434783 0.130435 0.0869565 0 0.695652 0.0434783 0.26087 0.0434783 0.869565 0.0434783 0.0434783 0 0.130435 0.130435 0.73913 0.217391 0.521739 0.26087 0 0.0869565 0.0434783 0.304348 0.565217 0.217391 0.478261 0.173913 0.130435 0.217391 0.391304 0.347826 0.0434783 0.173913 0.217391 0.304348 0.304348 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.130435 0.782609 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.0434783 0.565217 0 0.391304 0 1 0 0 0 0 0.478261 0.521739 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 20 Motif Name PPARGRXRA Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reserve Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 20 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 43 NR1H2RXRA Original Motif Original Motif Backward 3 15 0.0442974 Original Motif 0.68 0.2 0 0.12 0.68 0.04 0.2 0.08 0.8 0 0.2 0 0 0 1 0 0 0 0.96 0.04 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.96 0 0 0.04 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.8 0.04 0.08 0.08 0 0.6 0.24 0.16 Reverse Complement Motif 0 0.24 0.6 0.16 0.08 0.04 0.08 0.8 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.04 0 0 0.96 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0.96 0 0.04 0 1 0 0 0 0 0.2 0.8 0.08 0.04 0.2 0.68 0.12 0.2 0 0.68 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 47 RXRRAR_DR5 Original Motif Original Motif Backward 1 15 0.0500583 Original Motif 0.521739 0 0.478261 0 0 0 1 0 0.0434783 0 0.565217 0.391304 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.782609 0.130435 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.173913 0.304348 0.217391 0.304348 0.217391 0.347826 0.391304 0.0434783 0.217391 0.173913 0.478261 0.130435 0.565217 0.0434783 0.304348 0.0869565 0.217391 0.26087 0.521739 0 0.73913 0.130435 0.130435 0 0.0434783 0.0434783 0.869565 0.0434783 0 0.0434783 0.695652 0.26087 0.0869565 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0434783 0.73913 0.130435 0.0869565 0.913043 0 0.0434783 0.0434783 Reverse Complement Motif 0.0434783 0 0.0434783 0.913043 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0869565 0.73913 0.0434783 0.130435 0.0869565 0 0.695652 0.0434783 0.26087 0.0434783 0.869565 0.0434783 0.0434783 0 0.130435 0.130435 0.73913 0.217391 0.521739 0.26087 0 0.0869565 0.0434783 0.304348 0.565217 0.217391 0.478261 0.173913 0.130435 0.217391 0.391304 0.347826 0.0434783 0.173913 0.217391 0.304348 0.304348 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.130435 0.782609 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.0434783 0.565217 0 0.391304 0 1 0 0 0 0 0.478261 0.521739 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 30 ESR2 Original Motif Original Motif Backward 4 15 0.0602408 Original Motif 0.218487 0.45098 0.176471 0.154062 0.442577 0.142857 0.114846 0.29972 0.521008 0.0420168 0.431373 0.00560224 0.0756303 0 0.770308 0.154062 0.0504202 0.0560224 0.893557 0 0.0364146 0.0532213 0.092437 0.817927 0 1 0 0 0.943978 0.00280112 0 0.0532213 0.137255 0.344538 0.316527 0.201681 0.179272 0.176471 0.417367 0.226891 0.145658 0.170868 0.411765 0.271709 0.0588235 0.092437 0.0672269 0.781513 0.176471 0.070028 0.742297 0.0112045 0.498599 0.277311 0.0532213 0.170868 0.0952381 0.7507 0.00560224 0.148459 0.128852 0.809524 0 0.0616246 0.0756303 0.252101 0 0.672269 0.168067 0.263305 0.380952 0.187675 Reverse Complement Motif 0.168067 0.380952 0.263305 0.187675 0.672269 0.252101 0 0.0756303 0.128852 0 0.809524 0.0616246 0.0952381 0.00560224 0.7507 0.148459 0.170868 0.277311 0.0532213 0.498599 0.176471 0.742297 0.070028 0.0112045 0.781513 0.092437 0.0672269 0.0588235 0.145658 0.411765 0.170868 0.271709 0.179272 0.417367 0.176471 0.226891 0.137255 0.316527 0.344538 0.201681 0.0532213 0.00280112 0 0.943978 0 0 1 0 0.817927 0.0532213 0.092437 0.0364146 0.0504202 0.893557 0.0560224 0 0.0756303 0.770308 0 0.154062 0.00560224 0.0420168 0.431373 0.521008 0.29972 0.142857 0.114846 0.442577 0.218487 0.176471 0.45098 0.154062 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 24 Ar Reverse Complement Original Motif Backward 1 15 0.0714981 Original Motif 0.375 0.291667 0.0833333 0.25 0.375 0.0833333 0.125 0.416667 0.458333 0.125 0.125 0.291667 0.666667 0.0416667 0.291667 0 0 0 0.916667 0.0833333 0.5 0.25 0.0416667 0.208333 0.875 0.0833333 0 0.0416667 0 1 0 0 0.625 0 0.333333 0.0416667 0.166667 0.375 0.0833333 0.375 0.208333 0.458333 0.0833333 0.25 0.25 0.375 0.375 0 0.125 0.208333 0.0416667 0.625 0 0 1 0 0.166667 0 0 0.833333 0.458333 0.208333 0.0416667 0.291667 0.0416667 0.916667 0.0416667 0 0.125 0.666667 0.0416667 0.166667 0.25 0.291667 0.208333 0.25 0.25 0.208333 0.375 0.166667 0.416667 0.458333 0 0.125 0.208333 0.458333 0.25 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.208333 0.25 0.458333 0.0833333 0.416667 0 0.458333 0.125 0.25 0.375 0.208333 0.166667 0.25 0.208333 0.291667 0.25 0.125 0.0416667 0.666667 0.166667 0.0416667 0.0416667 0.916667 0 0.291667 0.208333 0.0416667 0.458333 0.833333 0 0 0.166667 0 1 0 0 0.625 0.208333 0.0416667 0.125 0.25 0.375 0.375 0 0.208333 0.0833333 0.458333 0.25 0.166667 0.0833333 0.375 0.375 0.0416667 0 0.333333 0.625 0 0 1 0 0.0416667 0.0833333 0 0.875 0.208333 0.25 0.0416667 0.5 0 0.916667 0 0.0833333 0 0.0416667 0.291667 0.666667 0.291667 0.125 0.125 0.458333 0.416667 0.0833333 0.125 0.375 0.25 0.291667 0.0833333 0.375 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 45 Pax5 Reverse Complement Reverse Complement Backward 3 15 0.0720255 Original Motif 0.333333 0.0833333 0.333333 0.25 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 0.25 0.25 0.166667 0.0833333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.583333 0.166667 0.0833333 0.166667 0.166667 0.416667 0.25 0.166667 0 0.25 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.666667 0.0833333 0.5 0.0833333 0.25 0.166667 0.5 0 0.166667 0.333333 0 0 1 0 0.166667 0.666667 0.0833333 0.0833333 0.25 0 0.75 0 0.0833333 0 0.333333 0.583333 0.5 0.0833333 0.416667 0 0.416667 0.0833333 0.416667 0.0833333 0.166667 0.833333 0 0 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.166667 0 0.833333 0 0.0833333 0.0833333 0.416667 0.416667 0 0.0833333 0.416667 0.5 0.583333 0 0.333333 0.0833333 0.25 0.75 0 0 0.166667 0.0833333 0.666667 0.0833333 0 1 0 0 0.333333 0 0.166667 0.5 0.166667 0.0833333 0.25 0.5 0.0833333 0.666667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.25 0.166667 0 0.166667 0.25 0.416667 0.166667 0.166667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.416667 0.166667 0.333333 0.166667 0.25 0.25 0.333333 0.333333 0.666667 0 0 0.25 0.0833333 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 29 ESR1 Original Motif Original Motif Backward 3 15 0.0723092 Original Motif 0.261242 0.256959 0.329764 0.152034 0.228632 0.17094 0.350427 0.25 0.136752 0.369658 0.318376 0.175214 0.176596 0.487234 0.138298 0.197872 0.285106 0.493617 0.1 0.121277 0.651163 0.0591966 0.188161 0.10148 0.0759494 0.0168776 0.816456 0.0907173 0.04 0.0378947 0.884211 0.0378947 0.0694737 0.0863158 0.191579 0.652632 0.00842105 0.829474 0.111579 0.0505263 0.837895 0.0273684 0.0568421 0.0778947 0.122105 0.526316 0.225263 0.126316 0.132632 0.581053 0.111579 0.174737 0.134737 0.543158 0.204211 0.117895 0.0673684 0.04 0.0168421 0.875789 0.0442105 0.0463158 0.896842 0.0126316 0.642105 0.223158 0.0652632 0.0694737 0.0210526 0.917895 0.0252632 0.0357895 0.124211 0.743158 0.00421053 0.128421 0.0547368 0.347368 0.0463158 0.551579 Reverse Complement Motif 0.551579 0.347368 0.0463158 0.0547368 0.124211 0.00421053 0.743158 0.128421 0.0210526 0.0252632 0.917895 0.0357895 0.0694737 0.223158 0.0652632 0.642105 0.0442105 0.896842 0.0463158 0.0126316 0.875789 0.04 0.0168421 0.0673684 0.134737 0.204211 0.543158 0.117895 0.132632 0.111579 0.581053 0.174737 0.122105 0.225263 0.526316 0.126316 0.0778947 0.0273684 0.0568421 0.837895 0.00842105 0.111579 0.829474 0.0505263 0.652632 0.0863158 0.191579 0.0694737 0.04 0.884211 0.0378947 0.0378947 0.0759494 0.816456 0.0168776 0.0907173 0.10148 0.0591966 0.188161 0.651163 0.285106 0.1 0.493617 0.121277 0.176596 0.138298 0.487234 0.197872 0.136752 0.318376 0.369658 0.175214 0.228632 0.350427 0.17094 0.25 0.261242 0.329764 0.256959 0.152034 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Reverse Complement Original Motif Forward 2 15 0.0755648 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 REST Original Motif Original Motif Forward 2 15 0.0796159 Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reverse Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 22 NR2F1 Reverse Complement Original Motif Forward 1 14 0.536521 Original Motif 0 0 0.153846 0.846154 0.0769231 0 0.923077 0 0.923077 0 0.0769231 0 0.461538 0.538462 0 0 0 1 0 0 0 0.230769 0 0.769231 0 0.153846 0 0.846154 0.0769231 0 0 0.923077 0.153846 0 0.846154 0 0.461538 0.307692 0.230769 0 0.461538 0.384615 0.0769231 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.230769 0.461538 0 0.307692 0 0.230769 0.230769 0.538462 Reverse Complement Motif 0.538462 0.230769 0.230769 0 0.230769 0 0.461538 0.307692 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.384615 0.0769231 0.461538 0 0.307692 0.230769 0.461538 0.153846 0.846154 0 0 0.923077 0 0 0.0769231 0.846154 0.153846 0 0 0.769231 0.230769 0 0 0 0 1 0 0.461538 0 0.538462 0 0 0 0.0769231 0.923077 0.0769231 0.923077 0 0 0.846154 0 0.153846 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 PLAG1 Original Motif Original Motif Backward 1 14 0.575248 Original Motif 0 0 1 0 0.166667 0 0.777778 0.0555556 0 0 1 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0.777778 0.222222 0 0 0.833333 0.0555556 0.111111 0.222222 0.555556 0.0555556 0.166667 0.666667 0 0 0.333333 0.611111 0.277778 0.111111 0 0.111111 0 0.777778 0.111111 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.888889 0.111111 0.111111 0 0.888889 0 Reverse Complement Motif 0.111111 0.888889 0 0 0 0.888889 0 0.111111 0 1 0 0 0 1 0 0 0.111111 0.777778 0 0.111111 0 0.277778 0.111111 0.611111 0.333333 0 0 0.666667 0.222222 0.0555556 0.555556 0.166667 0 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0.222222 0.777778 0 0 0.944444 0 0.0555556 0 1 0 0 0.166667 0.777778 0 0.0555556 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 21 Motif Name PLAG1 Original Motif 0 0 1 0 0.166667 0 0.777778 0.0555556 0 0 1 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0.777778 0.222222 0 0 0.833333 0.0555556 0.111111 0.222222 0.555556 0.0555556 0.166667 0.666667 0 0 0.333333 0.611111 0.277778 0.111111 0 0.111111 0 0.777778 0.111111 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.888889 0.111111 0.111111 0 0.888889 0 Reserve Complement Motif 0.111111 0.888889 0 0 0 0.888889 0 0.111111 0 1 0 0 0 1 0 0 0.111111 0.777778 0 0.111111 0 0.277778 0.111111 0.611111 0.333333 0 0 0.666667 0.222222 0.0555556 0.555556 0.166667 0 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0.222222 0.777778 0 0 0.944444 0 0.0555556 0 1 0 0 0.166667 0.777778 0 0.0555556 0 1 0 0 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 21 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 13 Zfp423 Original Motif Original Motif Forward 1 14 0.0944264 Original Motif 0.212121 0.121212 0.666667 0 0 0.484848 0.515152 0 0.484848 0.515152 0 0 0.515152 0.484848 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.030303 0.515152 0 0.454545 0.727273 0 0 0.272727 0.393939 0 0.484848 0.121212 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.515152 0.484848 0 0 0.484848 0.515152 0 0.242424 0.484848 0.272727 0.333333 0.666667 0 0 Reverse Complement Motif 0.333333 0 0.666667 0 0 0.484848 0.242424 0.272727 0.515152 0 0.484848 0 0 0.515152 0 0.484848 0 1 0 0 0 1 0 0 0.393939 0.484848 0 0.121212 0.272727 0 0 0.727273 0.030303 0 0.515152 0.454545 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.484848 0 0.515152 0.484848 0 0.515152 0 0 0.515152 0.484848 0 0.212121 0.666667 0.121212 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Original Motif Reverse Complement Forward 1 14 0.102814 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 PPARGRXRA Original Motif Original Motif Forward 2 14 0.107206 Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reverse Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 Zfx Original Motif Reverse Complement Forward 1 14 0.111315 Original Motif 0.105042 0.371849 0.37605 0.147059 0.125786 0.356394 0.360587 0.157233 0.190377 0.3159 0.416318 0.0774059 0.150313 0.102296 0.622129 0.125261 0.02079 0.617464 0.299376 0.0623701 0.012474 0.752599 0.004158 0.230769 0.0623701 0.259875 0.378378 0.299376 0.397089 0.320166 0.251559 0.031185 0.018711 0.004158 0.975052 0.002079 0 0.00623701 0.991684 0.002079 0.002079 0.997921 0 0 0 0.997921 0 0.002079 0 0.004158 0 0.995842 0.174636 0.253638 0.455301 0.116424 Reverse Complement Motif 0.174636 0.455301 0.253638 0.116424 0.995842 0.004158 0 0 0 0 0.997921 0.002079 0.002079 0 0.997921 0 0 0.991684 0.00623701 0.002079 0.018711 0.975052 0.004158 0.002079 0.031185 0.320166 0.251559 0.397089 0.0623701 0.378378 0.259875 0.299376 0.012474 0.004158 0.752599 0.230769 0.02079 0.299376 0.617464 0.0623701 0.150313 0.622129 0.102296 0.125261 0.190377 0.416318 0.3159 0.0774059 0.125786 0.360587 0.356394 0.157233 0.105042 0.37605 0.371849 0.147059 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 48 Tcfcp2l1 Reverse Complement Original Motif Backward 1 14 0.115151 Original Motif 0.00196754 0.92548 0.0627152 0.00983768 0.069973 0.807513 0.00540142 0.117113 0.594508 0.00514832 0.275803 0.12454 0.0058838 0.0237803 0.967149 0.00318706 0.175477 0.33627 0.0256975 0.462555 0.0983847 0.28928 0.0621635 0.550171 0.173924 0.39726 0.151174 0.277642 0.357213 0.224939 0.252323 0.165526 0.63154 0.0696822 0.190954 0.107824 0.394421 0.0513824 0.310497 0.2437 0.00366928 0.933219 0.0547945 0.00831703 0.0617193 0.812148 0.00293902 0.123194 0.536555 0.00736016 0.305937 0.150147 0.0120393 0.0289926 0.954791 0.0041769 Reverse Complement Motif 0.0120393 0.954791 0.0289926 0.0041769 0.150147 0.00736016 0.305937 0.536555 0.0617193 0.00293902 0.812148 0.123194 0.00366928 0.0547945 0.933219 0.00831703 0.2437 0.0513824 0.310497 0.394421 0.107824 0.0696822 0.190954 0.63154 0.165526 0.224939 0.252323 0.357213 0.173924 0.151174 0.39726 0.277642 0.550171 0.28928 0.0621635 0.0983847 0.462555 0.33627 0.0256975 0.175477 0.0058838 0.967149 0.0237803 0.00318706 0.12454 0.00514832 0.275803 0.594508 0.069973 0.00540142 0.807513 0.117113 0.00196754 0.0627152 0.92548 0.00983768 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 47 RXRRAR_DR5 Original Motif Original Motif Backward 4 14 0.116287 Original Motif 0.521739 0 0.478261 0 0 0 1 0 0.0434783 0 0.565217 0.391304 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.782609 0.130435 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.173913 0.304348 0.217391 0.304348 0.217391 0.347826 0.391304 0.0434783 0.217391 0.173913 0.478261 0.130435 0.565217 0.0434783 0.304348 0.0869565 0.217391 0.26087 0.521739 0 0.73913 0.130435 0.130435 0 0.0434783 0.0434783 0.869565 0.0434783 0 0.0434783 0.695652 0.26087 0.0869565 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0434783 0.73913 0.130435 0.0869565 0.913043 0 0.0434783 0.0434783 Reverse Complement Motif 0.0434783 0 0.0434783 0.913043 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0869565 0.73913 0.0434783 0.130435 0.0869565 0 0.695652 0.0434783 0.26087 0.0434783 0.869565 0.0434783 0.0434783 0 0.130435 0.130435 0.73913 0.217391 0.521739 0.26087 0 0.0869565 0.0434783 0.304348 0.565217 0.217391 0.478261 0.173913 0.130435 0.217391 0.391304 0.347826 0.0434783 0.173913 0.217391 0.304348 0.304348 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.130435 0.782609 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.0434783 0.565217 0 0.391304 0 1 0 0 0 0 0.478261 0.521739 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 45 Pax5 Original Motif Original Motif Backward 7 14 0.117063 Original Motif 0.333333 0.0833333 0.333333 0.25 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 0.25 0.25 0.166667 0.0833333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.583333 0.166667 0.0833333 0.166667 0.166667 0.416667 0.25 0.166667 0 0.25 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.666667 0.0833333 0.5 0.0833333 0.25 0.166667 0.5 0 0.166667 0.333333 0 0 1 0 0.166667 0.666667 0.0833333 0.0833333 0.25 0 0.75 0 0.0833333 0 0.333333 0.583333 0.5 0.0833333 0.416667 0 0.416667 0.0833333 0.416667 0.0833333 0.166667 0.833333 0 0 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.166667 0 0.833333 0 0.0833333 0.0833333 0.416667 0.416667 0 0.0833333 0.416667 0.5 0.583333 0 0.333333 0.0833333 0.25 0.75 0 0 0.166667 0.0833333 0.666667 0.0833333 0 1 0 0 0.333333 0 0.166667 0.5 0.166667 0.0833333 0.25 0.5 0.0833333 0.666667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.25 0.166667 0 0.166667 0.25 0.416667 0.166667 0.166667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.416667 0.166667 0.333333 0.166667 0.25 0.25 0.333333 0.333333 0.666667 0 0 0.25 0.0833333 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 17 RXRAVDR Original Motif Original Motif Backward 3 13 0.590064 Original Motif 0.3 0 0.7 0 0 0 1 0 0 0 0.9 0.1 0 0 0 1 0 0.9 0 0.1 0.9 0 0.1 0 0.4 0.2 0 0.4 0.2 0.4 0.2 0.2 0.2 0 0.8 0 0.5 0 0.5 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0.1 0 0 0.9 0 0.9 0 0.1 0.7 0.1 0.2 0 Reverse Complement Motif 0 0.1 0.2 0.7 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0 0.1 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0 0.2 0.2 0.4 0.2 0.4 0.2 0 0.4 0 0 0.1 0.9 0 0 0.9 0.1 1 0 0 0 0 0.9 0 0.1 0 1 0 0 0.3 0.7 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 34 HNF4A Original Motif Original Motif Backward 1 13 0.603385 Original Motif 0.41791 0.104478 0.402985 0.0746269 0.0298507 0.0298507 0.835821 0.104478 0.179104 0.0597015 0.522388 0.238806 0.0746269 0.343284 0.298507 0.283582 0.0447761 0.761194 0.0597015 0.134328 0.880597 0.0149254 0.0447761 0.0597015 0.791045 0.0298507 0.149254 0.0298507 0.835821 0.0149254 0.119403 0.0298507 0.0597015 0.0597015 0.865672 0.0149254 0.0895522 0.0298507 0.492537 0.38806 0.0447761 0.328358 0.164179 0.462687 0.0597015 0.731343 0.0746269 0.134328 0.626866 0.104478 0.149254 0.119403 Reverse Complement Motif 0.119403 0.104478 0.149254 0.626866 0.0597015 0.0746269 0.731343 0.134328 0.462687 0.328358 0.164179 0.0447761 0.0895522 0.492537 0.0298507 0.38806 0.0597015 0.865672 0.0597015 0.0149254 0.0298507 0.0149254 0.119403 0.835821 0.0298507 0.0298507 0.149254 0.791045 0.0597015 0.0149254 0.0447761 0.880597 0.0447761 0.0597015 0.761194 0.134328 0.0746269 0.298507 0.343284 0.283582 0.179104 0.522388 0.0597015 0.238806 0.0298507 0.835821 0.0298507 0.104478 0.0746269 0.104478 0.402985 0.41791 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 22 NR2F1 Original Motif Reverse Complement Backward 2 13 0.613207 Original Motif 0 0 0.153846 0.846154 0.0769231 0 0.923077 0 0.923077 0 0.0769231 0 0.461538 0.538462 0 0 0 1 0 0 0 0.230769 0 0.769231 0 0.153846 0 0.846154 0.0769231 0 0 0.923077 0.153846 0 0.846154 0 0.461538 0.307692 0.230769 0 0.461538 0.384615 0.0769231 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.230769 0.461538 0 0.307692 0 0.230769 0.230769 0.538462 Reverse Complement Motif 0.538462 0.230769 0.230769 0 0.230769 0 0.461538 0.307692 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.384615 0.0769231 0.461538 0 0.307692 0.230769 0.461538 0.153846 0.846154 0 0 0.923077 0 0 0.0769231 0.846154 0.153846 0 0 0.769231 0.230769 0 0 0 0 1 0 0.461538 0 0.538462 0 0 0 0.0769231 0.923077 0.0769231 0.923077 0 0 0.846154 0 0.153846 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 22 Motif Name NR2F1 Original Motif 0 0 0.153846 0.846154 0.0769231 0 0.923077 0 0.923077 0 0.0769231 0 0.461538 0.538462 0 0 0 1 0 0 0 0.230769 0 0.769231 0 0.153846 0 0.846154 0.0769231 0 0 0.923077 0.153846 0 0.846154 0 0.461538 0.307692 0.230769 0 0.461538 0.384615 0.0769231 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.230769 0.461538 0 0.307692 0 0.230769 0.230769 0.538462 Reserve Complement Motif 0.538462 0.230769 0.230769 0 0.230769 0 0.461538 0.307692 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.384615 0.0769231 0.461538 0 0.307692 0.230769 0.461538 0.153846 0.846154 0 0 0.923077 0 0 0.0769231 0.846154 0.153846 0 0 0.769231 0.230769 0 0 0 0 1 0 0.461538 0 0.538462 0 0 0 0.0769231 0.923077 0.0769231 0.923077 0 0 0.846154 0 0.153846 0 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 22 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 43 NR1H2RXRA Original Motif Reverse Complement Backward 2 14 0.0174588 Original Motif 0.68 0.2 0 0.12 0.68 0.04 0.2 0.08 0.8 0 0.2 0 0 0 1 0 0 0 0.96 0.04 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.96 0 0 0.04 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.8 0.04 0.08 0.08 0 0.6 0.24 0.16 Reverse Complement Motif 0 0.24 0.6 0.16 0.08 0.04 0.08 0.8 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.04 0 0 0.96 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0.96 0 0.04 0 1 0 0 0 0 0.2 0.8 0.08 0.04 0.2 0.68 0.12 0.2 0 0.68 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 PPARGRXRA Reverse Complement Original Motif Backward 2 14 0.0278283 Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reverse Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 47 RXRRAR_DR5 Reverse Complement Original Motif Backward 1 14 0.0625328 Original Motif 0.521739 0 0.478261 0 0 0 1 0 0.0434783 0 0.565217 0.391304 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.782609 0.130435 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.173913 0.304348 0.217391 0.304348 0.217391 0.347826 0.391304 0.0434783 0.217391 0.173913 0.478261 0.130435 0.565217 0.0434783 0.304348 0.0869565 0.217391 0.26087 0.521739 0 0.73913 0.130435 0.130435 0 0.0434783 0.0434783 0.869565 0.0434783 0 0.0434783 0.695652 0.26087 0.0869565 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0434783 0.73913 0.130435 0.0869565 0.913043 0 0.0434783 0.0434783 Reverse Complement Motif 0.0434783 0 0.0434783 0.913043 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0869565 0.73913 0.0434783 0.130435 0.0869565 0 0.695652 0.0434783 0.26087 0.0434783 0.869565 0.0434783 0.0434783 0 0.130435 0.130435 0.73913 0.217391 0.521739 0.26087 0 0.0869565 0.0434783 0.304348 0.565217 0.217391 0.478261 0.173913 0.130435 0.217391 0.391304 0.347826 0.0434783 0.173913 0.217391 0.304348 0.304348 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.130435 0.782609 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.0434783 0.565217 0 0.391304 0 1 0 0 0 0 0.478261 0.521739 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 30 ESR2 Original Motif Reverse Complement Forward 4 14 0.0710475 Original Motif 0.218487 0.45098 0.176471 0.154062 0.442577 0.142857 0.114846 0.29972 0.521008 0.0420168 0.431373 0.00560224 0.0756303 0 0.770308 0.154062 0.0504202 0.0560224 0.893557 0 0.0364146 0.0532213 0.092437 0.817927 0 1 0 0 0.943978 0.00280112 0 0.0532213 0.137255 0.344538 0.316527 0.201681 0.179272 0.176471 0.417367 0.226891 0.145658 0.170868 0.411765 0.271709 0.0588235 0.092437 0.0672269 0.781513 0.176471 0.070028 0.742297 0.0112045 0.498599 0.277311 0.0532213 0.170868 0.0952381 0.7507 0.00560224 0.148459 0.128852 0.809524 0 0.0616246 0.0756303 0.252101 0 0.672269 0.168067 0.263305 0.380952 0.187675 Reverse Complement Motif 0.168067 0.380952 0.263305 0.187675 0.672269 0.252101 0 0.0756303 0.128852 0 0.809524 0.0616246 0.0952381 0.00560224 0.7507 0.148459 0.170868 0.277311 0.0532213 0.498599 0.176471 0.742297 0.070028 0.0112045 0.781513 0.092437 0.0672269 0.0588235 0.145658 0.411765 0.170868 0.271709 0.179272 0.417367 0.176471 0.226891 0.137255 0.316527 0.344538 0.201681 0.0532213 0.00280112 0 0.943978 0 0 1 0 0.817927 0.0532213 0.092437 0.0364146 0.0504202 0.893557 0.0560224 0 0.0756303 0.770308 0 0.154062 0.00560224 0.0420168 0.431373 0.521008 0.29972 0.142857 0.114846 0.442577 0.218487 0.176471 0.45098 0.154062 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 REST Original Motif Reverse Complement Backward 6 14 0.071796 Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reverse Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 45 Pax5 Original Motif Reverse Complement Backward 3 14 0.0741987 Original Motif 0.333333 0.0833333 0.333333 0.25 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 0.25 0.25 0.166667 0.0833333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.583333 0.166667 0.0833333 0.166667 0.166667 0.416667 0.25 0.166667 0 0.25 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.666667 0.0833333 0.5 0.0833333 0.25 0.166667 0.5 0 0.166667 0.333333 0 0 1 0 0.166667 0.666667 0.0833333 0.0833333 0.25 0 0.75 0 0.0833333 0 0.333333 0.583333 0.5 0.0833333 0.416667 0 0.416667 0.0833333 0.416667 0.0833333 0.166667 0.833333 0 0 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.166667 0 0.833333 0 0.0833333 0.0833333 0.416667 0.416667 0 0.0833333 0.416667 0.5 0.583333 0 0.333333 0.0833333 0.25 0.75 0 0 0.166667 0.0833333 0.666667 0.0833333 0 1 0 0 0.333333 0 0.166667 0.5 0.166667 0.0833333 0.25 0.5 0.0833333 0.666667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.25 0.166667 0 0.166667 0.25 0.416667 0.166667 0.166667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.416667 0.166667 0.333333 0.166667 0.25 0.25 0.333333 0.333333 0.666667 0 0 0.25 0.0833333 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 34 HNF4A Reverse Complement Original Motif Backward 1 13 0.514048 Original Motif 0.41791 0.104478 0.402985 0.0746269 0.0298507 0.0298507 0.835821 0.104478 0.179104 0.0597015 0.522388 0.238806 0.0746269 0.343284 0.298507 0.283582 0.0447761 0.761194 0.0597015 0.134328 0.880597 0.0149254 0.0447761 0.0597015 0.791045 0.0298507 0.149254 0.0298507 0.835821 0.0149254 0.119403 0.0298507 0.0597015 0.0597015 0.865672 0.0149254 0.0895522 0.0298507 0.492537 0.38806 0.0447761 0.328358 0.164179 0.462687 0.0597015 0.731343 0.0746269 0.134328 0.626866 0.104478 0.149254 0.119403 Reverse Complement Motif 0.119403 0.104478 0.149254 0.626866 0.0597015 0.0746269 0.731343 0.134328 0.462687 0.328358 0.164179 0.0447761 0.0895522 0.492537 0.0298507 0.38806 0.0597015 0.865672 0.0597015 0.0149254 0.0298507 0.0149254 0.119403 0.835821 0.0298507 0.0298507 0.149254 0.791045 0.0597015 0.0149254 0.0447761 0.880597 0.0447761 0.0597015 0.761194 0.134328 0.0746269 0.298507 0.343284 0.283582 0.179104 0.522388 0.0597015 0.238806 0.0298507 0.835821 0.0298507 0.104478 0.0746269 0.104478 0.402985 0.41791 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 Zfx Reverse Complement Original Motif Forward 2 13 0.568042 Original Motif 0.105042 0.371849 0.37605 0.147059 0.125786 0.356394 0.360587 0.157233 0.190377 0.3159 0.416318 0.0774059 0.150313 0.102296 0.622129 0.125261 0.02079 0.617464 0.299376 0.0623701 0.012474 0.752599 0.004158 0.230769 0.0623701 0.259875 0.378378 0.299376 0.397089 0.320166 0.251559 0.031185 0.018711 0.004158 0.975052 0.002079 0 0.00623701 0.991684 0.002079 0.002079 0.997921 0 0 0 0.997921 0 0.002079 0 0.004158 0 0.995842 0.174636 0.253638 0.455301 0.116424 Reverse Complement Motif 0.174636 0.455301 0.253638 0.116424 0.995842 0.004158 0 0 0 0 0.997921 0.002079 0.002079 0 0.997921 0 0 0.991684 0.00623701 0.002079 0.018711 0.975052 0.004158 0.002079 0.031185 0.320166 0.251559 0.397089 0.0623701 0.378378 0.259875 0.299376 0.012474 0.004158 0.752599 0.230769 0.02079 0.299376 0.617464 0.0623701 0.150313 0.622129 0.102296 0.125261 0.190377 0.416318 0.3159 0.0774059 0.125786 0.360587 0.356394 0.157233 0.105042 0.37605 0.371849 0.147059 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 29 ESR1 Original Motif Original Motif Forward 8 13 0.569869 Original Motif 0.261242 0.256959 0.329764 0.152034 0.228632 0.17094 0.350427 0.25 0.136752 0.369658 0.318376 0.175214 0.176596 0.487234 0.138298 0.197872 0.285106 0.493617 0.1 0.121277 0.651163 0.0591966 0.188161 0.10148 0.0759494 0.0168776 0.816456 0.0907173 0.04 0.0378947 0.884211 0.0378947 0.0694737 0.0863158 0.191579 0.652632 0.00842105 0.829474 0.111579 0.0505263 0.837895 0.0273684 0.0568421 0.0778947 0.122105 0.526316 0.225263 0.126316 0.132632 0.581053 0.111579 0.174737 0.134737 0.543158 0.204211 0.117895 0.0673684 0.04 0.0168421 0.875789 0.0442105 0.0463158 0.896842 0.0126316 0.642105 0.223158 0.0652632 0.0694737 0.0210526 0.917895 0.0252632 0.0357895 0.124211 0.743158 0.00421053 0.128421 0.0547368 0.347368 0.0463158 0.551579 Reverse Complement Motif 0.551579 0.347368 0.0463158 0.0547368 0.124211 0.00421053 0.743158 0.128421 0.0210526 0.0252632 0.917895 0.0357895 0.0694737 0.223158 0.0652632 0.642105 0.0442105 0.896842 0.0463158 0.0126316 0.875789 0.04 0.0168421 0.0673684 0.134737 0.204211 0.543158 0.117895 0.132632 0.111579 0.581053 0.174737 0.122105 0.225263 0.526316 0.126316 0.0778947 0.0273684 0.0568421 0.837895 0.00842105 0.111579 0.829474 0.0505263 0.652632 0.0863158 0.191579 0.0694737 0.04 0.884211 0.0378947 0.0378947 0.0759494 0.816456 0.0168776 0.0907173 0.10148 0.0591966 0.188161 0.651163 0.285106 0.1 0.493617 0.121277 0.176596 0.138298 0.487234 0.197872 0.136752 0.318376 0.369658 0.175214 0.228632 0.350427 0.17094 0.25 0.261242 0.329764 0.256959 0.152034 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 17 RXRAVDR Original Motif Reverse Complement Backward 3 13 0.572226 Original Motif 0.3 0 0.7 0 0 0 1 0 0 0 0.9 0.1 0 0 0 1 0 0.9 0 0.1 0.9 0 0.1 0 0.4 0.2 0 0.4 0.2 0.4 0.2 0.2 0.2 0 0.8 0 0.5 0 0.5 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0.1 0 0 0.9 0 0.9 0 0.1 0.7 0.1 0.2 0 Reverse Complement Motif 0 0.1 0.2 0.7 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0 0.1 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0 0.2 0.2 0.4 0.2 0.4 0.2 0 0.4 0 0 0.1 0.9 0 0 0.9 0.1 1 0 0 0 0 0.9 0 0.1 0 1 0 0 0.3 0.7 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 23 Motif Name MZF1_1-4 Original Motif 0.15 0.25 0.2 0.4 0 0 0.95 0.05 0.1 0 0.9 0 0 0 0.95 0.05 0 0 1 0 0.9 0 0.1 0 Reserve Complement Motif 0 0 0.1 0.9 0 1 0 0 0 0.95 0 0.05 0.1 0.9 0 0 0 0.95 0 0.05 0.4 0.25 0.2 0.15 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 23 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 35 INSM1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 5 6 0.0276389 Original Motif 0.0416667 0 0.166667 0.791667 0 0 0.833333 0.166667 0 0.333333 0.125 0.541667 0.25 0.625 0 0.125 0.666667 0 0 0.333333 0 0 1 0 0 0.0416667 0.958333 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.0833333 0.666667 0.25 0.125 0.666667 0 0.208333 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.125 0 0.666667 0.208333 0 0.666667 0.0833333 0.25 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 1 0 0 0.333333 0 0 0.666667 0.25 0 0.625 0.125 0.541667 0.333333 0.125 0 0 0.833333 0 0.166667 0.791667 0 0.166667 0.0416667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 41 MZF1_5-13 Original Motif Original Motif Backward 2 6 0.0314583 Original Motif 0.0625 0.25 0.4375 0.25 0.125 0 0.4375 0.4375 0.9375 0.0625 0 0 0 0 0.6875 0.3125 0 0 0.9375 0.0625 0 0.125 0.875 0 0 0 0.875 0.125 0.1875 0.0625 0.5 0.25 0.625 0 0.25 0.125 0.5 0.125 0.25 0.125 Reverse Complement Motif 0.125 0.125 0.25 0.5 0.125 0 0.25 0.625 0.1875 0.5 0.0625 0.25 0 0.875 0 0.125 0 0.875 0.125 0 0 0.9375 0 0.0625 0 0.6875 0 0.3125 0 0.0625 0 0.9375 0.125 0.4375 0 0.4375 0.0625 0.4375 0.25 0.25 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 36 Klf4 Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 6 0.0406514 Original Motif 0.338561 0.0186808 0.235701 0.407057 0.0202765 0.00207373 0.976267 0.00138249 0.00322284 0.00299263 0.990792 0.00299263 0.00322061 0.00828157 0.984817 0.0036807 0.0636928 0.441941 0.00252932 0.491837 0.00506446 0.00345304 0.983656 0.00782689 0.00967073 0.0184204 0.501727 0.470182 0.0608716 0.0106064 0.8997 0.0288218 0.0283999 0.0300162 0.874856 0.0667282 0.0587419 0.660962 0.0647549 0.215541 Reverse Complement Motif 0.0587419 0.0647549 0.660962 0.215541 0.0283999 0.874856 0.0300162 0.0667282 0.0608716 0.8997 0.0106064 0.0288218 0.00967073 0.501727 0.0184204 0.470182 0.00506446 0.983656 0.00345304 0.00782689 0.491837 0.441941 0.00252932 0.0636928 0.00322061 0.984817 0.00828157 0.0036807 0.00322284 0.990792 0.00299263 0.00299263 0.0202765 0.976267 0.00207373 0.00138249 0.407057 0.0186808 0.235701 0.338561 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 PLAG1 Original Motif Original Motif Backward 1 6 0.0412963 Original Motif 0 0 1 0 0.166667 0 0.777778 0.0555556 0 0 1 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0.777778 0.222222 0 0 0.833333 0.0555556 0.111111 0.222222 0.555556 0.0555556 0.166667 0.666667 0 0 0.333333 0.611111 0.277778 0.111111 0 0.111111 0 0.777778 0.111111 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.888889 0.111111 0.111111 0 0.888889 0 Reverse Complement Motif 0.111111 0.888889 0 0 0 0.888889 0 0.111111 0 1 0 0 0 1 0 0 0.111111 0.777778 0 0.111111 0 0.277778 0.111111 0.611111 0.333333 0 0 0.666667 0.222222 0.0555556 0.555556 0.166667 0 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0.222222 0.777778 0 0 0.944444 0 0.0555556 0 1 0 0 0.166667 0.777778 0 0.0555556 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 8 Motif 8 Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 6 0.0426517 Original Motif 0 1 0 0 0 0.306358 0 0.693642 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 Reverse Complement Motif 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.693642 0.306358 0 0 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 SP1 Original Motif Reverse Complement Forward 5 6 0.0464881 Original Motif 0 0.914286 0.0285714 0.0571429 0 0.857143 0.0285714 0.114286 0 1 0 0 0.114286 0.771429 0 0.114286 0.0571429 0.142857 0.428571 0.371429 0 0.8 0.0285714 0.171429 0.0285714 0.885714 0 0.0857143 0 0.685714 0.0857143 0.228571 0.171429 0.714286 0 0.114286 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.0857143 Reverse Complement Motif 0.0857143 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.171429 0 0.714286 0.114286 0 0.0857143 0.685714 0.228571 0.0285714 0 0.885714 0.0857143 0 0.0285714 0.8 0.171429 0.0571429 0.428571 0.142857 0.371429 0.114286 0 0.771429 0.114286 0 0 1 0 0 0.0285714 0.857143 0.114286 0 0.0285714 0.914286 0.0571429 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Reverse Complement Original Motif Backward 11 6 0.0493561 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 42 NFKB1 Reverse Complement Original Motif Forward 6 6 0.0521759 Original Motif 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0.111111 0 0.888889 0 0.611111 0.0555556 0.333333 0 0.277778 0 0.111111 0.611111 0 0.277778 0.111111 0.611111 0 0.722222 0 0.277778 0 0.944444 0 0.0555556 0 1 0 0 0.0555556 0.833333 0.0555556 0.0555556 Reverse Complement Motif 0.0555556 0.0555556 0.833333 0.0555556 0 0 1 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.722222 0.277778 0.611111 0.277778 0.111111 0 0.611111 0 0.111111 0.277778 0 0.0555556 0.333333 0.611111 0.111111 0.888889 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 REST Reverse Complement Reverse Complement Forward 6 6 0.0581528 Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reverse Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 24 Ar Reverse Complement Original Motif Forward 15 6 0.0585417 Original Motif 0.375 0.291667 0.0833333 0.25 0.375 0.0833333 0.125 0.416667 0.458333 0.125 0.125 0.291667 0.666667 0.0416667 0.291667 0 0 0 0.916667 0.0833333 0.5 0.25 0.0416667 0.208333 0.875 0.0833333 0 0.0416667 0 1 0 0 0.625 0 0.333333 0.0416667 0.166667 0.375 0.0833333 0.375 0.208333 0.458333 0.0833333 0.25 0.25 0.375 0.375 0 0.125 0.208333 0.0416667 0.625 0 0 1 0 0.166667 0 0 0.833333 0.458333 0.208333 0.0416667 0.291667 0.0416667 0.916667 0.0416667 0 0.125 0.666667 0.0416667 0.166667 0.25 0.291667 0.208333 0.25 0.25 0.208333 0.375 0.166667 0.416667 0.458333 0 0.125 0.208333 0.458333 0.25 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.208333 0.25 0.458333 0.0833333 0.416667 0 0.458333 0.125 0.25 0.375 0.208333 0.166667 0.25 0.208333 0.291667 0.25 0.125 0.0416667 0.666667 0.166667 0.0416667 0.0416667 0.916667 0 0.291667 0.208333 0.0416667 0.458333 0.833333 0 0 0.166667 0 1 0 0 0.625 0.208333 0.0416667 0.125 0.25 0.375 0.375 0 0.208333 0.0833333 0.458333 0.25 0.166667 0.0833333 0.375 0.375 0.0416667 0 0.333333 0.625 0 0 1 0 0.0416667 0.0833333 0 0.875 0.208333 0.25 0.0416667 0.5 0 0.916667 0 0.0833333 0 0.0416667 0.291667 0.666667 0.291667 0.125 0.125 0.458333 0.416667 0.0833333 0.125 0.375 0.25 0.291667 0.0833333 0.375 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 24 Motif Name Ar Original Motif 0.375 0.291667 0.0833333 0.25 0.375 0.0833333 0.125 0.416667 0.458333 0.125 0.125 0.291667 0.666667 0.0416667 0.291667 0 0 0 0.916667 0.0833333 0.5 0.25 0.0416667 0.208333 0.875 0.0833333 0 0.0416667 0 1 0 0 0.625 0 0.333333 0.0416667 0.166667 0.375 0.0833333 0.375 0.208333 0.458333 0.0833333 0.25 0.25 0.375 0.375 0 0.125 0.208333 0.0416667 0.625 0 0 1 0 0.166667 0 0 0.833333 0.458333 0.208333 0.0416667 0.291667 0.0416667 0.916667 0.0416667 0 0.125 0.666667 0.0416667 0.166667 0.25 0.291667 0.208333 0.25 0.25 0.208333 0.375 0.166667 0.416667 0.458333 0 0.125 0.208333 0.458333 0.25 0.0833333 Reserve Complement Motif 0.208333 0.25 0.458333 0.0833333 0.416667 0 0.458333 0.125 0.25 0.375 0.208333 0.166667 0.25 0.208333 0.291667 0.25 0.125 0.0416667 0.666667 0.166667 0.0416667 0.0416667 0.916667 0 0.291667 0.208333 0.0416667 0.458333 0.833333 0 0 0.166667 0 1 0 0 0.625 0.208333 0.0416667 0.125 0.25 0.375 0.375 0 0.208333 0.0833333 0.458333 0.25 0.166667 0.0833333 0.375 0.375 0.0416667 0 0.333333 0.625 0 0 1 0 0.0416667 0.0833333 0 0.875 0.208333 0.25 0.0416667 0.5 0 0.916667 0 0.0833333 0 0.0416667 0.291667 0.666667 0.291667 0.125 0.125 0.458333 0.416667 0.0833333 0.125 0.375 0.25 0.291667 0.0833333 0.375 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 24 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 REST Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 21 0.0696331 Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reverse Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 45 Pax5 Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 20 0.564914 Original Motif 0.333333 0.0833333 0.333333 0.25 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 0.25 0.25 0.166667 0.0833333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.583333 0.166667 0.0833333 0.166667 0.166667 0.416667 0.25 0.166667 0 0.25 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.666667 0.0833333 0.5 0.0833333 0.25 0.166667 0.5 0 0.166667 0.333333 0 0 1 0 0.166667 0.666667 0.0833333 0.0833333 0.25 0 0.75 0 0.0833333 0 0.333333 0.583333 0.5 0.0833333 0.416667 0 0.416667 0.0833333 0.416667 0.0833333 0.166667 0.833333 0 0 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.166667 0 0.833333 0 0.0833333 0.0833333 0.416667 0.416667 0 0.0833333 0.416667 0.5 0.583333 0 0.333333 0.0833333 0.25 0.75 0 0 0.166667 0.0833333 0.666667 0.0833333 0 1 0 0 0.333333 0 0.166667 0.5 0.166667 0.0833333 0.25 0.5 0.0833333 0.666667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.25 0.166667 0 0.166667 0.25 0.416667 0.166667 0.166667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.416667 0.166667 0.333333 0.166667 0.25 0.25 0.333333 0.333333 0.666667 0 0 0.25 0.0833333 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 29 ESR1 Reverse Complement Original Motif Forward 2 19 1.05195 Original Motif 0.261242 0.256959 0.329764 0.152034 0.228632 0.17094 0.350427 0.25 0.136752 0.369658 0.318376 0.175214 0.176596 0.487234 0.138298 0.197872 0.285106 0.493617 0.1 0.121277 0.651163 0.0591966 0.188161 0.10148 0.0759494 0.0168776 0.816456 0.0907173 0.04 0.0378947 0.884211 0.0378947 0.0694737 0.0863158 0.191579 0.652632 0.00842105 0.829474 0.111579 0.0505263 0.837895 0.0273684 0.0568421 0.0778947 0.122105 0.526316 0.225263 0.126316 0.132632 0.581053 0.111579 0.174737 0.134737 0.543158 0.204211 0.117895 0.0673684 0.04 0.0168421 0.875789 0.0442105 0.0463158 0.896842 0.0126316 0.642105 0.223158 0.0652632 0.0694737 0.0210526 0.917895 0.0252632 0.0357895 0.124211 0.743158 0.00421053 0.128421 0.0547368 0.347368 0.0463158 0.551579 Reverse Complement Motif 0.551579 0.347368 0.0463158 0.0547368 0.124211 0.00421053 0.743158 0.128421 0.0210526 0.0252632 0.917895 0.0357895 0.0694737 0.223158 0.0652632 0.642105 0.0442105 0.896842 0.0463158 0.0126316 0.875789 0.04 0.0168421 0.0673684 0.134737 0.204211 0.543158 0.117895 0.132632 0.111579 0.581053 0.174737 0.122105 0.225263 0.526316 0.126316 0.0778947 0.0273684 0.0568421 0.837895 0.00842105 0.111579 0.829474 0.0505263 0.652632 0.0863158 0.191579 0.0694737 0.04 0.884211 0.0378947 0.0378947 0.0759494 0.816456 0.0168776 0.0907173 0.10148 0.0591966 0.188161 0.651163 0.285106 0.1 0.493617 0.121277 0.176596 0.138298 0.487234 0.197872 0.136752 0.318376 0.369658 0.175214 0.228632 0.350427 0.17094 0.25 0.261242 0.329764 0.256959 0.152034 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Original Motif Original Motif Forward 2 19 1.07661 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 PPARGRXRA Reverse Complement Original Motif Backward 1 15 3.0649 Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reverse Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 30 ESR2 Reverse Complement Original Motif Backward 5 14 3.57597 Original Motif 0.218487 0.45098 0.176471 0.154062 0.442577 0.142857 0.114846 0.29972 0.521008 0.0420168 0.431373 0.00560224 0.0756303 0 0.770308 0.154062 0.0504202 0.0560224 0.893557 0 0.0364146 0.0532213 0.092437 0.817927 0 1 0 0 0.943978 0.00280112 0 0.0532213 0.137255 0.344538 0.316527 0.201681 0.179272 0.176471 0.417367 0.226891 0.145658 0.170868 0.411765 0.271709 0.0588235 0.092437 0.0672269 0.781513 0.176471 0.070028 0.742297 0.0112045 0.498599 0.277311 0.0532213 0.170868 0.0952381 0.7507 0.00560224 0.148459 0.128852 0.809524 0 0.0616246 0.0756303 0.252101 0 0.672269 0.168067 0.263305 0.380952 0.187675 Reverse Complement Motif 0.168067 0.380952 0.263305 0.187675 0.672269 0.252101 0 0.0756303 0.128852 0 0.809524 0.0616246 0.0952381 0.00560224 0.7507 0.148459 0.170868 0.277311 0.0532213 0.498599 0.176471 0.742297 0.070028 0.0112045 0.781513 0.092437 0.0672269 0.0588235 0.145658 0.411765 0.170868 0.271709 0.179272 0.417367 0.176471 0.226891 0.137255 0.316527 0.344538 0.201681 0.0532213 0.00280112 0 0.943978 0 0 1 0 0.817927 0.0532213 0.092437 0.0364146 0.0504202 0.893557 0.0560224 0 0.0756303 0.770308 0 0.154062 0.00560224 0.0420168 0.431373 0.521008 0.29972 0.142857 0.114846 0.442577 0.218487 0.176471 0.45098 0.154062 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 34 HNF4A Original Motif Reverse Complement Backward 1 13 4.07506 Original Motif 0.41791 0.104478 0.402985 0.0746269 0.0298507 0.0298507 0.835821 0.104478 0.179104 0.0597015 0.522388 0.238806 0.0746269 0.343284 0.298507 0.283582 0.0447761 0.761194 0.0597015 0.134328 0.880597 0.0149254 0.0447761 0.0597015 0.791045 0.0298507 0.149254 0.0298507 0.835821 0.0149254 0.119403 0.0298507 0.0597015 0.0597015 0.865672 0.0149254 0.0895522 0.0298507 0.492537 0.38806 0.0447761 0.328358 0.164179 0.462687 0.0597015 0.731343 0.0746269 0.134328 0.626866 0.104478 0.149254 0.119403 Reverse Complement Motif 0.119403 0.104478 0.149254 0.626866 0.0597015 0.0746269 0.731343 0.134328 0.462687 0.328358 0.164179 0.0447761 0.0895522 0.492537 0.0298507 0.38806 0.0597015 0.865672 0.0597015 0.0149254 0.0298507 0.0149254 0.119403 0.835821 0.0298507 0.0298507 0.149254 0.791045 0.0597015 0.0149254 0.0447761 0.880597 0.0447761 0.0597015 0.761194 0.134328 0.0746269 0.298507 0.343284 0.283582 0.179104 0.522388 0.0597015 0.238806 0.0298507 0.835821 0.0298507 0.104478 0.0746269 0.104478 0.402985 0.41791 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 10 Motif 10 Original Motif Reverse Complement Backward 2 13 4.07511 Original Motif 0.169492 0 0 0.830508 0.169492 0.033898 0.372881 0.423729 0.152542 0 0.305085 0.542373 0.20339 0 0 0.79661 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0.20339 0.576271 0.220339 0.271186 0.135593 0.0508471 0.542374 0.016949 0.152542 0.033898 0.796611 0.016949 0 0.101695 0.881356 0.084746 0 0.135593 0.779661 0.050847 0 0.067797 0.881356 0 0.169492 0.152542 0.677966 0 0 0.169492 0.830508 Reverse Complement Motif 0.830508 0 0.169492 0 0.677966 0.169492 0.152542 0 0.881356 0 0.067797 0.050847 0.779661 0 0.135593 0.084746 0.881356 0 0.101695 0.016949 0.796611 0.152542 0.033898 0.016949 0.542374 0.135593 0.0508471 0.271186 0 0.576271 0.20339 0.220339 1 0 0 0 1 0 0 0 0.79661 0 0 0.20339 0.542373 0 0.305085 0.152542 0.423729 0.033898 0.372881 0.169492 0.830508 0 0 0.169492 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 48 Tcfcp2l1 Reverse Complement Reverse Complement Forward 2 13 4.0791 Original Motif 0.00196754 0.92548 0.0627152 0.00983768 0.069973 0.807513 0.00540142 0.117113 0.594508 0.00514832 0.275803 0.12454 0.0058838 0.0237803 0.967149 0.00318706 0.175477 0.33627 0.0256975 0.462555 0.0983847 0.28928 0.0621635 0.550171 0.173924 0.39726 0.151174 0.277642 0.357213 0.224939 0.252323 0.165526 0.63154 0.0696822 0.190954 0.107824 0.394421 0.0513824 0.310497 0.2437 0.00366928 0.933219 0.0547945 0.00831703 0.0617193 0.812148 0.00293902 0.123194 0.536555 0.00736016 0.305937 0.150147 0.0120393 0.0289926 0.954791 0.0041769 Reverse Complement Motif 0.0120393 0.954791 0.0289926 0.0041769 0.150147 0.00736016 0.305937 0.536555 0.0617193 0.00293902 0.812148 0.123194 0.00366928 0.0547945 0.933219 0.00831703 0.2437 0.0513824 0.310497 0.394421 0.107824 0.0696822 0.190954 0.63154 0.165526 0.224939 0.252323 0.357213 0.173924 0.151174 0.39726 0.277642 0.550171 0.28928 0.0621635 0.0983847 0.462555 0.33627 0.0256975 0.175477 0.0058838 0.967149 0.0237803 0.00318706 0.12454 0.00514832 0.275803 0.594508 0.069973 0.00540142 0.807513 0.117113 0.00196754 0.0627152 0.92548 0.00983768 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 Motif 9 Original Motif Reverse Complement Forward 3 12 4.57405 Original Motif 0.034483 0.931034 0.034483 0 1 0 0 0 0 0.827586 0.172414 0 0.862069 0 0 0.137931 0.103448 0.862069 0 0.034483 0.793103 0.034483 0.103448 0.068966 0.241379 0.413793 0.275862 0.068966 0.655172 0 0.344828 0 0 0.827586 0.172414 0 0.965517 0 0.034483 0 0 0.965517 0.034483 0 0.931034 0 0 0.068966 0.068966 0.931034 0 0 0.965517 0.034483 0 0 Reverse Complement Motif 0 0.034483 0 0.965517 0.068966 0 0.931034 0 0.068966 0 0 0.931034 0 0.034483 0.965517 0 0 0 0.034483 0.965517 0 0.172414 0.827586 0 0 0 0.344828 0.655172 0.241379 0.275862 0.413793 0.068966 0.068966 0.034483 0.103448 0.793103 0.103448 0 0.862069 0.034483 0.137931 0 0 0.862069 0 0.172414 0.827586 0 0 0 0 1 0.034483 0.034483 0.931034 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 25 Motif Name Arnt Original Motif 0.2 0.8 0 0 0.95 0 0.05 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 Reserve Complement Motif 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0.05 0.95 0.2 0 0.8 0 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 25 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 31 Esrrb Original Motif Original Motif Forward 1 6 0 Original Motif 0.2 0.8 0 0 0.95 0 0.05 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 Reverse Complement Motif 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0.05 0.95 0.2 0 0.8 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 39 MYCMAX Reverse Complement Reverse Complement Backward 4 6 0.0143849 Original Motif 0.333333 0.047619 0.428571 0.190476 0.714286 0.047619 0.190476 0.047619 0.0952381 0.428571 0.428571 0.047619 0.047619 0.952381 0 0 1 0 0 0 0 0.952381 0 0.047619 0.047619 0 0.952381 0 0 0.047619 0 0.952381 0 0 1 0 0.047619 0.047619 0.857143 0.047619 0.142857 0.238095 0 0.619048 Reverse Complement Motif 0.619048 0.238095 0 0.142857 0.047619 0.857143 0.047619 0.047619 0 1 0 0 0.952381 0.047619 0 0 0.047619 0.952381 0 0 0 0 0.952381 0.047619 0 0 0 1 0.047619 0 0.952381 0 0.0952381 0.428571 0.428571 0.047619 0.047619 0.047619 0.190476 0.714286 0.333333 0.428571 0.047619 0.190476 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 38 Myc Original Motif Original Motif Backward 3 6 0.0267529 Original Motif 0.295154 0.422907 0.15859 0.123348 0.14978 0.23348 0.572687 0.0440529 0.0352423 0.964758 0 0 0.955947 0.0176211 0.0220264 0.00440529 0 0.933921 0.0132159 0.0528634 0.0837004 0.00881057 0.898678 0.00881057 0.0396476 0.193833 0 0.76652 0 0.00881057 0.951542 0.0396476 0 0.0748899 0.806167 0.118943 0.198238 0.471366 0.105727 0.22467 Reverse Complement Motif 0.198238 0.105727 0.471366 0.22467 0 0.806167 0.0748899 0.118943 0 0.951542 0.00881057 0.0396476 0.76652 0.193833 0 0.0396476 0.0837004 0.898678 0.00881057 0.00881057 0 0.0132159 0.933921 0.0528634 0.00440529 0.0176211 0.0220264 0.955947 0.0352423 0 0.964758 0 0.14978 0.572687 0.23348 0.0440529 0.295154 0.15859 0.422907 0.123348 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 40 Mycn Original Motif Original Motif Forward 3 6 0.0272641 Original Motif 0.349315 0.363014 0.143836 0.143836 0.0890411 0.388128 0.447489 0.0753425 0.0159817 0.984018 0 0 0.945205 0 0.0410959 0.0136986 0 0.961187 0.0182648 0.0205479 0.0707763 0.00228311 0.924658 0.00228311 0.0547945 0.221461 0.00456621 0.719178 0 0 0.938356 0.0616438 0.0616438 0.111872 0.739726 0.086758 0.139269 0.605023 0.0913242 0.164384 Reverse Complement Motif 0.139269 0.0913242 0.605023 0.164384 0.0616438 0.739726 0.111872 0.086758 0 0.938356 0 0.0616438 0.719178 0.221461 0.00456621 0.0547945 0.0707763 0.924658 0.00228311 0.00228311 0 0.0182648 0.961187 0.0205479 0.0136986 0 0.0410959 0.945205 0.0159817 0 0.984018 0 0.0890411 0.447489 0.388128 0.0753425 0.349315 0.143836 0.363014 0.143836 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 33 HIF1AARNT Original Motif Original Motif Backward 2 6 0.0347756 Original Motif 0.259615 0.269231 0.471154 0 0.0961538 0.278846 0.326923 0.298077 0.75 0.0192308 0.221154 0.00961538 0 0.990385 0 0.00961538 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.173077 0.490385 0.192308 0.144231 Reverse Complement Motif 0.173077 0.192308 0.490385 0.144231 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0.990385 0.00961538 0.00961538 0.0192308 0.221154 0.75 0.0961538 0.326923 0.278846 0.298077 0.259615 0.471154 0.269231 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 26 ArntAhr Original Motif Original Motif Backward 1 6 0.065625 Original Motif 0.125 0.333333 0.0833333 0.458333 0 0 0.958333 0.0416667 0 0.958333 0 0.0416667 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 0 1 0 0 1 0 Reverse Complement Motif 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0.958333 0 0.0416667 0 0 0.958333 0.0416667 0 0.958333 0 0.0416667 0.458333 0.333333 0.0833333 0.125 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 14 ZEB1 Original Motif Reverse Complement Backward 1 6 0.0689533 Original Motif 0.0243902 0.829268 0.0243902 0.121951 0.926829 0 0.0487805 0.0243902 0 0.97561 0.0243902 0 0 0.926829 0.0731707 0 0 0.0243902 0 0.97561 0.243902 0.0243902 0.390244 0.341463 Reverse Complement Motif 0.243902 0.390244 0.0243902 0.341463 0.97561 0.0243902 0 0 0 0.0731707 0.926829 0 0 0.0243902 0.97561 0 0.0243902 0 0.0487805 0.926829 0.0243902 0.0243902 0.829268 0.121951 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 28 Egr1 Original Motif Original Motif Backward 6 6 0.0784722 Original Motif 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0.133333 0.0666667 0.8 0 0 0.866667 0 0.133333 0 0 1 0 0 0 0.2 0.8 0.2 0 0.8 0 0.0666667 0 0.933333 0 0 0 1 0 0.133333 0.666667 0 0.2 0 0 1 0 0.0666667 0 0.466667 0.466667 Reverse Complement Motif 0.0666667 0.466667 0 0.466667 0 1 0 0 0.133333 0 0.666667 0.2 0 1 0 0 0.0666667 0.933333 0 0 0.2 0.8 0 0 0.8 0 0.2 0 0 1 0 0 0 0 0.866667 0.133333 0.133333 0.8 0.0666667 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 37 MIZF Original Motif Original Motif Forward 2 6 0.0854167 Original Motif 0.1 0.3 0.25 0.35 0.65 0.05 0 0.3 1 0 0 0 0.1 0.85 0.05 0 0 0 0.95 0.05 0 0.05 0 0.95 0 0.95 0 0.05 0 0.9 0.1 0 0 0 0.95 0.05 0.1 0.65 0.05 0.2 Reverse Complement Motif 0.1 0.05 0.65 0.2 0 0.95 0 0.05 0 0.1 0.9 0 0 0 0.95 0.05 0.95 0.05 0 0 0 0.95 0 0.05 0.1 0.05 0.85 0 0 0 0 1 0.3 0.05 0 0.65 0.35 0.3 0.25 0.1 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 PLAG1 Original Motif Original Motif Backward 3 6 0.105093 Original Motif 0 0 1 0 0.166667 0 0.777778 0.0555556 0 0 1 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0.777778 0.222222 0 0 0.833333 0.0555556 0.111111 0.222222 0.555556 0.0555556 0.166667 0.666667 0 0 0.333333 0.611111 0.277778 0.111111 0 0.111111 0 0.777778 0.111111 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.888889 0.111111 0.111111 0 0.888889 0 Reverse Complement Motif 0.111111 0.888889 0 0 0 0.888889 0 0.111111 0 1 0 0 0 1 0 0 0.111111 0.777778 0 0.111111 0 0.277778 0.111111 0.611111 0.333333 0 0 0.666667 0.222222 0.0555556 0.555556 0.166667 0 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0.222222 0.777778 0 0 0.944444 0 0.0555556 0 1 0 0 0.166667 0.777778 0 0.0555556 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 26 Motif Name ArntAhr Original Motif 0.125 0.333333 0.0833333 0.458333 0 0 0.958333 0.0416667 0 0.958333 0 0.0416667 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 0 1 0 0 1 0 Reserve Complement Motif 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0.958333 0 0.0416667 0 0 0.958333 0.0416667 0 0.958333 0 0.0416667 0.458333 0.333333 0.0833333 0.125 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 26 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 28 Egr1 Original Motif Original Motif Backward 6 6 0 Original Motif 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0.133333 0.0666667 0.8 0 0 0.866667 0 0.133333 0 0 1 0 0 0 0.2 0.8 0.2 0 0.8 0 0.0666667 0 0.933333 0 0 0 1 0 0.133333 0.666667 0 0.2 0 0 1 0 0.0666667 0 0.466667 0.466667 Reverse Complement Motif 0.0666667 0.466667 0 0.466667 0 1 0 0 0.133333 0 0.666667 0.2 0 1 0 0 0.0666667 0.933333 0 0 0.2 0.8 0 0 0.8 0 0.2 0 0 1 0 0 0 0 0.866667 0.133333 0.133333 0.8 0.0666667 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 33 HIF1AARNT Original Motif Original Motif Backward 2 6 0.0112447 Original Motif 0.259615 0.269231 0.471154 0 0.0961538 0.278846 0.326923 0.298077 0.75 0.0192308 0.221154 0.00961538 0 0.990385 0 0.00961538 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.173077 0.490385 0.192308 0.144231 Reverse Complement Motif 0.173077 0.192308 0.490385 0.144231 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0.990385 0.00961538 0.00961538 0.0192308 0.221154 0.75 0.0961538 0.326923 0.278846 0.298077 0.259615 0.471154 0.269231 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 Motif 11 Reverse Complement Original Motif Backward 7 6 0.0308396 Original Motif 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0.636364 0 0.363636 0.727273 0 0.272727 0 0.181818 0.818182 0 0 1 0 0 0 0 0.909091 0 0.090909 1 0 0 0 0 0.909091 0 0.090909 0.909091 0 0 0.090909 0 1 0 0 0.818182 0 0 0.181818 0 0.909091 0 0.090909 0.909091 0 0 0.090909 Reverse Complement Motif 0.090909 0 0 0.909091 0 0 0.909091 0.090909 0.181818 0 0 0.818182 0 0 1 0 0.090909 0 0 0.909091 0 0 0.909091 0.090909 0 0 0 1 0 0 0.909091 0.090909 0 0 0 1 0.181818 0 0.818182 0 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0 1 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 25 Arnt Original Motif Original Motif Forward 1 6 0.0315972 Original Motif 0.2 0.8 0 0 0.95 0 0.05 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 Reverse Complement Motif 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0.05 0.95 0.2 0 0.8 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 31 Esrrb Original Motif Original Motif Backward 1 6 0.0315972 Original Motif 0.2 0.8 0 0 0.95 0 0.05 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 Reverse Complement Motif 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0.05 0.95 0.2 0 0.8 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 Motif 9 Reverse Complement Original Motif Backward 1 6 0.0350575 Original Motif 0.034483 0.931034 0.034483 0 1 0 0 0 0 0.827586 0.172414 0 0.862069 0 0 0.137931 0.103448 0.862069 0 0.034483 0.793103 0.034483 0.103448 0.068966 0.241379 0.413793 0.275862 0.068966 0.655172 0 0.344828 0 0 0.827586 0.172414 0 0.965517 0 0.034483 0 0 0.965517 0.034483 0 0.931034 0 0 0.068966 0.068966 0.931034 0 0 0.965517 0.034483 0 0 Reverse Complement Motif 0 0.034483 0 0.965517 0.068966 0 0.931034 0 0.068966 0 0 0.931034 0 0.034483 0.965517 0 0 0 0.034483 0.965517 0 0.172414 0.827586 0 0 0 0.344828 0.655172 0.241379 0.275862 0.413793 0.068966 0.068966 0.034483 0.103448 0.793103 0.103448 0 0.862069 0.034483 0.137931 0 0 0.862069 0 0.172414 0.827586 0 0 0 0 1 0.034483 0.034483 0.931034 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 39 MYCMAX Original Motif Original Motif Backward 3 6 0.0376488 Original Motif 0.333333 0.047619 0.428571 0.190476 0.714286 0.047619 0.190476 0.047619 0.0952381 0.428571 0.428571 0.047619 0.047619 0.952381 0 0 1 0 0 0 0 0.952381 0 0.047619 0.047619 0 0.952381 0 0 0.047619 0 0.952381 0 0 1 0 0.047619 0.047619 0.857143 0.047619 0.142857 0.238095 0 0.619048 Reverse Complement Motif 0.619048 0.238095 0 0.142857 0.047619 0.857143 0.047619 0.047619 0 1 0 0 0.952381 0.047619 0 0 0.047619 0.952381 0 0 0 0 0.952381 0.047619 0 0 0 1 0.047619 0 0.952381 0 0.0952381 0.428571 0.428571 0.047619 0.047619 0.047619 0.190476 0.714286 0.333333 0.428571 0.047619 0.190476 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 40 Mycn Original Motif Reverse Complement Forward 3 6 0.0377949 Original Motif 0.349315 0.363014 0.143836 0.143836 0.0890411 0.388128 0.447489 0.0753425 0.0159817 0.984018 0 0 0.945205 0 0.0410959 0.0136986 0 0.961187 0.0182648 0.0205479 0.0707763 0.00228311 0.924658 0.00228311 0.0547945 0.221461 0.00456621 0.719178 0 0 0.938356 0.0616438 0.0616438 0.111872 0.739726 0.086758 0.139269 0.605023 0.0913242 0.164384 Reverse Complement Motif 0.139269 0.0913242 0.605023 0.164384 0.0616438 0.739726 0.111872 0.086758 0 0.938356 0 0.0616438 0.719178 0.221461 0.00456621 0.0547945 0.0707763 0.924658 0.00228311 0.00228311 0 0.0182648 0.961187 0.0205479 0.0136986 0 0.0410959 0.945205 0.0159817 0 0.984018 0 0.0890411 0.447489 0.388128 0.0753425 0.349315 0.143836 0.363014 0.143836 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 38 Myc Original Motif Reverse Complement Backward 3 6 0.0399214 Original Motif 0.295154 0.422907 0.15859 0.123348 0.14978 0.23348 0.572687 0.0440529 0.0352423 0.964758 0 0 0.955947 0.0176211 0.0220264 0.00440529 0 0.933921 0.0132159 0.0528634 0.0837004 0.00881057 0.898678 0.00881057 0.0396476 0.193833 0 0.76652 0 0.00881057 0.951542 0.0396476 0 0.0748899 0.806167 0.118943 0.198238 0.471366 0.105727 0.22467 Reverse Complement Motif 0.198238 0.105727 0.471366 0.22467 0 0.806167 0.0748899 0.118943 0 0.951542 0.00881057 0.0396476 0.76652 0.193833 0 0.0396476 0.0837004 0.898678 0.00881057 0.00881057 0 0.0132159 0.933921 0.0528634 0.00440529 0.0176211 0.0220264 0.955947 0.0352423 0 0.964758 0 0.14978 0.572687 0.23348 0.0440529 0.295154 0.15859 0.422907 0.123348 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Original Motif Reverse Complement Forward 9 6 0.0433081 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 27 Motif Name E2F1 Original Motif 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0.4 0.6 0 0 0.2 0.8 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0.9 0.1 0 Reserve Complement Motif 0 0.1 0.9 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0.8 0.2 0 0 0.6 0.4 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 27 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 PLAG1 Original Motif Reverse Complement Backward 6 8 0.0255644 Original Motif 0 0 1 0 0.166667 0 0.777778 0.0555556 0 0 1 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0.777778 0.222222 0 0 0.833333 0.0555556 0.111111 0.222222 0.555556 0.0555556 0.166667 0.666667 0 0 0.333333 0.611111 0.277778 0.111111 0 0.111111 0 0.777778 0.111111 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.888889 0.111111 0.111111 0 0.888889 0 Reverse Complement Motif 0.111111 0.888889 0 0 0 0.888889 0 0.111111 0 1 0 0 0 1 0 0 0.111111 0.777778 0 0.111111 0 0.277778 0.111111 0.611111 0.333333 0 0 0.666667 0.222222 0.0555556 0.555556 0.166667 0 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0.222222 0.777778 0 0 0.944444 0 0.0555556 0 1 0 0 0.166667 0.777778 0 0.0555556 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 PPARGRXRA Original Motif Reverse Complement Backward 6 8 0.0280436 Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reverse Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 34 HNF4A Reverse Complement Original Motif Backward 6 8 0.0283733 Original Motif 0.41791 0.104478 0.402985 0.0746269 0.0298507 0.0298507 0.835821 0.104478 0.179104 0.0597015 0.522388 0.238806 0.0746269 0.343284 0.298507 0.283582 0.0447761 0.761194 0.0597015 0.134328 0.880597 0.0149254 0.0447761 0.0597015 0.791045 0.0298507 0.149254 0.0298507 0.835821 0.0149254 0.119403 0.0298507 0.0597015 0.0597015 0.865672 0.0149254 0.0895522 0.0298507 0.492537 0.38806 0.0447761 0.328358 0.164179 0.462687 0.0597015 0.731343 0.0746269 0.134328 0.626866 0.104478 0.149254 0.119403 Reverse Complement Motif 0.119403 0.104478 0.149254 0.626866 0.0597015 0.0746269 0.731343 0.134328 0.462687 0.328358 0.164179 0.0447761 0.0895522 0.492537 0.0298507 0.38806 0.0597015 0.865672 0.0597015 0.0149254 0.0298507 0.0149254 0.119403 0.835821 0.0298507 0.0298507 0.149254 0.791045 0.0597015 0.0149254 0.0447761 0.880597 0.0447761 0.0597015 0.761194 0.134328 0.0746269 0.298507 0.343284 0.283582 0.179104 0.522388 0.0597015 0.238806 0.0298507 0.835821 0.0298507 0.104478 0.0746269 0.104478 0.402985 0.41791 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 43 NR1H2RXRA Reverse Complement Original Motif Forward 3 8 0.0298005 Original Motif 0.68 0.2 0 0.12 0.68 0.04 0.2 0.08 0.8 0 0.2 0 0 0 1 0 0 0 0.96 0.04 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.96 0 0 0.04 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.8 0.04 0.08 0.08 0 0.6 0.24 0.16 Reverse Complement Motif 0 0.24 0.6 0.16 0.08 0.04 0.08 0.8 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.04 0 0 0.96 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0.96 0 0.04 0 1 0 0 0 0 0.2 0.8 0.08 0.04 0.2 0.68 0.12 0.2 0 0.68 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 22 NR2F1 Original Motif Original Motif Backward 2 8 0.0369159 Original Motif 0 0 0.153846 0.846154 0.0769231 0 0.923077 0 0.923077 0 0.0769231 0 0.461538 0.538462 0 0 0 1 0 0 0 0.230769 0 0.769231 0 0.153846 0 0.846154 0.0769231 0 0 0.923077 0.153846 0 0.846154 0 0.461538 0.307692 0.230769 0 0.461538 0.384615 0.0769231 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.230769 0.461538 0 0.307692 0 0.230769 0.230769 0.538462 Reverse Complement Motif 0.538462 0.230769 0.230769 0 0.230769 0 0.461538 0.307692 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.384615 0.0769231 0.461538 0 0.307692 0.230769 0.461538 0.153846 0.846154 0 0 0.923077 0 0 0.0769231 0.846154 0.153846 0 0 0.769231 0.230769 0 0 0 0 1 0 0.461538 0 0.538462 0 0 0 0.0769231 0.923077 0.0769231 0.923077 0 0 0.846154 0 0.153846 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 13 Zfp423 Reverse Complement Original Motif Forward 7 8 0.0423573 Original Motif 0.212121 0.121212 0.666667 0 0 0.484848 0.515152 0 0.484848 0.515152 0 0 0.515152 0.484848 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.030303 0.515152 0 0.454545 0.727273 0 0 0.272727 0.393939 0 0.484848 0.121212 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.515152 0.484848 0 0 0.484848 0.515152 0 0.242424 0.484848 0.272727 0.333333 0.666667 0 0 Reverse Complement Motif 0.333333 0 0.666667 0 0 0.484848 0.242424 0.272727 0.515152 0 0.484848 0 0 0.515152 0 0.484848 0 1 0 0 0 1 0 0 0.393939 0.484848 0 0.121212 0.272727 0 0 0.727273 0.030303 0 0.515152 0.454545 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.484848 0 0.515152 0.484848 0 0.515152 0 0 0.515152 0.484848 0 0.212121 0.666667 0.121212 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 28 Egr1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 4 8 0.0470922 Original Motif 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0.133333 0.0666667 0.8 0 0 0.866667 0 0.133333 0 0 1 0 0 0 0.2 0.8 0.2 0 0.8 0 0.0666667 0 0.933333 0 0 0 1 0 0.133333 0.666667 0 0.2 0 0 1 0 0.0666667 0 0.466667 0.466667 Reverse Complement Motif 0.0666667 0.466667 0 0.466667 0 1 0 0 0.133333 0 0.666667 0.2 0 1 0 0 0.0666667 0.933333 0 0 0.2 0.8 0 0 0.8 0 0.2 0 0 1 0 0 0 0 0.866667 0.133333 0.133333 0.8 0.0666667 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 10 Motif 10 Original Motif Original Motif Forward 4 8 0.0486459 Original Motif 0.169492 0 0 0.830508 0.169492 0.033898 0.372881 0.423729 0.152542 0 0.305085 0.542373 0.20339 0 0 0.79661 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0.20339 0.576271 0.220339 0.271186 0.135593 0.0508471 0.542374 0.016949 0.152542 0.033898 0.796611 0.016949 0 0.101695 0.881356 0.084746 0 0.135593 0.779661 0.050847 0 0.067797 0.881356 0 0.169492 0.152542 0.677966 0 0 0.169492 0.830508 Reverse Complement Motif 0.830508 0 0.169492 0 0.677966 0.169492 0.152542 0 0.881356 0 0.067797 0.050847 0.779661 0 0.135593 0.084746 0.881356 0 0.101695 0.016949 0.796611 0.152542 0.033898 0.016949 0.542374 0.135593 0.0508471 0.271186 0 0.576271 0.20339 0.220339 1 0 0 0 1 0 0 0 0.79661 0 0 0.20339 0.542373 0 0.305085 0.152542 0.423729 0.033898 0.372881 0.169492 0.830508 0 0 0.169492 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Original Motif Reverse Complement Forward 1 8 0.0497437 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 1 Motif 1 Original Motif Reverse Complement Backward 1 6 1.03392 Original Motif 0.577889 0 0.422111 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.419095 0 0.580905 0 Reverse Complement Motif 0.419095 0.580905 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0.422111 0.577889 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 28 Motif Name Egr1 Original Motif 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0.133333 0.0666667 0.8 0 0 0.866667 0 0.133333 0 0 1 0 0 0 0.2 0.8 0.2 0 0.8 0 0.0666667 0 0.933333 0 0 0 1 0 0.133333 0.666667 0 0.2 0 0 1 0 0.0666667 0 0.466667 0.466667 Reserve Complement Motif 0.0666667 0.466667 0 0.466667 0 1 0 0 0.133333 0 0.666667 0.2 0 1 0 0 0.0666667 0.933333 0 0 0.2 0.8 0 0 0.8 0 0.2 0 0 1 0 0 0 0 0.866667 0.133333 0.133333 0.8 0.0666667 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 28 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Original Motif Reverse Complement Backward 3 11 0.0550907 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 Motif 11 Reverse Complement Original Motif Forward 1 11 0.062391 Original Motif 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0.636364 0 0.363636 0.727273 0 0.272727 0 0.181818 0.818182 0 0 1 0 0 0 0 0.909091 0 0.090909 1 0 0 0 0 0.909091 0 0.090909 0.909091 0 0 0.090909 0 1 0 0 0.818182 0 0 0.181818 0 0.909091 0 0.090909 0.909091 0 0 0.090909 Reverse Complement Motif 0.090909 0 0 0.909091 0 0 0.909091 0.090909 0.181818 0 0 0.818182 0 0 1 0 0.090909 0 0 0.909091 0 0 0.909091 0.090909 0 0 0 1 0 0 0.909091 0.090909 0 0 0 1 0.181818 0 0.818182 0 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0 1 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 Motif 9 Reverse Complement Original Motif Backward 4 11 0.0668604 Original Motif 0.034483 0.931034 0.034483 0 1 0 0 0 0 0.827586 0.172414 0 0.862069 0 0 0.137931 0.103448 0.862069 0 0.034483 0.793103 0.034483 0.103448 0.068966 0.241379 0.413793 0.275862 0.068966 0.655172 0 0.344828 0 0 0.827586 0.172414 0 0.965517 0 0.034483 0 0 0.965517 0.034483 0 0.931034 0 0 0.068966 0.068966 0.931034 0 0 0.965517 0.034483 0 0 Reverse Complement Motif 0 0.034483 0 0.965517 0.068966 0 0.931034 0 0.068966 0 0 0.931034 0 0.034483 0.965517 0 0 0 0.034483 0.965517 0 0.172414 0.827586 0 0 0 0.344828 0.655172 0.241379 0.275862 0.413793 0.068966 0.068966 0.034483 0.103448 0.793103 0.103448 0 0.862069 0.034483 0.137931 0 0 0.862069 0 0.172414 0.827586 0 0 0 0 1 0.034483 0.034483 0.931034 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 13 Zfp423 Reverse Complement Original Motif Backward 2 11 0.0673496 Original Motif 0.212121 0.121212 0.666667 0 0 0.484848 0.515152 0 0.484848 0.515152 0 0 0.515152 0.484848 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.030303 0.515152 0 0.454545 0.727273 0 0 0.272727 0.393939 0 0.484848 0.121212 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.515152 0.484848 0 0 0.484848 0.515152 0 0.242424 0.484848 0.272727 0.333333 0.666667 0 0 Reverse Complement Motif 0.333333 0 0.666667 0 0 0.484848 0.242424 0.272727 0.515152 0 0.484848 0 0 0.515152 0 0.484848 0 1 0 0 0 1 0 0 0.393939 0.484848 0 0.121212 0.272727 0 0 0.727273 0.030303 0 0.515152 0.454545 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.484848 0 0.515152 0.484848 0 0.515152 0 0 0.515152 0.484848 0 0.212121 0.666667 0.121212 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 Zfx Original Motif Original Motif Forward 3 11 0.0764878 Original Motif 0.105042 0.371849 0.37605 0.147059 0.125786 0.356394 0.360587 0.157233 0.190377 0.3159 0.416318 0.0774059 0.150313 0.102296 0.622129 0.125261 0.02079 0.617464 0.299376 0.0623701 0.012474 0.752599 0.004158 0.230769 0.0623701 0.259875 0.378378 0.299376 0.397089 0.320166 0.251559 0.031185 0.018711 0.004158 0.975052 0.002079 0 0.00623701 0.991684 0.002079 0.002079 0.997921 0 0 0 0.997921 0 0.002079 0 0.004158 0 0.995842 0.174636 0.253638 0.455301 0.116424 Reverse Complement Motif 0.174636 0.455301 0.253638 0.116424 0.995842 0.004158 0 0 0 0 0.997921 0.002079 0.002079 0 0.997921 0 0 0.991684 0.00623701 0.002079 0.018711 0.975052 0.004158 0.002079 0.031185 0.320166 0.251559 0.397089 0.0623701 0.378378 0.259875 0.299376 0.012474 0.004158 0.752599 0.230769 0.02079 0.299376 0.617464 0.0623701 0.150313 0.622129 0.102296 0.125261 0.190377 0.416318 0.3159 0.0774059 0.125786 0.360587 0.356394 0.157233 0.105042 0.37605 0.371849 0.147059 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 45 Pax5 Original Motif Original Motif Backward 6 11 0.0765783 Original Motif 0.333333 0.0833333 0.333333 0.25 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 0.25 0.25 0.166667 0.0833333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.583333 0.166667 0.0833333 0.166667 0.166667 0.416667 0.25 0.166667 0 0.25 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.666667 0.0833333 0.5 0.0833333 0.25 0.166667 0.5 0 0.166667 0.333333 0 0 1 0 0.166667 0.666667 0.0833333 0.0833333 0.25 0 0.75 0 0.0833333 0 0.333333 0.583333 0.5 0.0833333 0.416667 0 0.416667 0.0833333 0.416667 0.0833333 0.166667 0.833333 0 0 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.166667 0 0.833333 0 0.0833333 0.0833333 0.416667 0.416667 0 0.0833333 0.416667 0.5 0.583333 0 0.333333 0.0833333 0.25 0.75 0 0 0.166667 0.0833333 0.666667 0.0833333 0 1 0 0 0.333333 0 0.166667 0.5 0.166667 0.0833333 0.25 0.5 0.0833333 0.666667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.25 0.166667 0 0.166667 0.25 0.416667 0.166667 0.166667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.416667 0.166667 0.333333 0.166667 0.25 0.25 0.333333 0.333333 0.666667 0 0 0.25 0.0833333 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 35 INSM1 Original Motif Original Motif Forward 1 11 0.0830177 Original Motif 0.0416667 0 0.166667 0.791667 0 0 0.833333 0.166667 0 0.333333 0.125 0.541667 0.25 0.625 0 0.125 0.666667 0 0 0.333333 0 0 1 0 0 0.0416667 0.958333 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.0833333 0.666667 0.25 0.125 0.666667 0 0.208333 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.125 0 0.666667 0.208333 0 0.666667 0.0833333 0.25 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 1 0 0 0.333333 0 0 0.666667 0.25 0 0.625 0.125 0.541667 0.333333 0.125 0 0 0.833333 0 0.166667 0.791667 0 0.166667 0.0416667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 34 HNF4A Original Motif Reverse Complement Forward 3 11 0.0857144 Original Motif 0.41791 0.104478 0.402985 0.0746269 0.0298507 0.0298507 0.835821 0.104478 0.179104 0.0597015 0.522388 0.238806 0.0746269 0.343284 0.298507 0.283582 0.0447761 0.761194 0.0597015 0.134328 0.880597 0.0149254 0.0447761 0.0597015 0.791045 0.0298507 0.149254 0.0298507 0.835821 0.0149254 0.119403 0.0298507 0.0597015 0.0597015 0.865672 0.0149254 0.0895522 0.0298507 0.492537 0.38806 0.0447761 0.328358 0.164179 0.462687 0.0597015 0.731343 0.0746269 0.134328 0.626866 0.104478 0.149254 0.119403 Reverse Complement Motif 0.119403 0.104478 0.149254 0.626866 0.0597015 0.0746269 0.731343 0.134328 0.462687 0.328358 0.164179 0.0447761 0.0895522 0.492537 0.0298507 0.38806 0.0597015 0.865672 0.0597015 0.0149254 0.0298507 0.0149254 0.119403 0.835821 0.0298507 0.0298507 0.149254 0.791045 0.0597015 0.0149254 0.0447761 0.880597 0.0447761 0.0597015 0.761194 0.134328 0.0746269 0.298507 0.343284 0.283582 0.179104 0.522388 0.0597015 0.238806 0.0298507 0.835821 0.0298507 0.104478 0.0746269 0.104478 0.402985 0.41791 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 SP1 Reverse Complement Original Motif Forward 1 10 0.572401 Original Motif 0 0.914286 0.0285714 0.0571429 0 0.857143 0.0285714 0.114286 0 1 0 0 0.114286 0.771429 0 0.114286 0.0571429 0.142857 0.428571 0.371429 0 0.8 0.0285714 0.171429 0.0285714 0.885714 0 0.0857143 0 0.685714 0.0857143 0.228571 0.171429 0.714286 0 0.114286 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.0857143 Reverse Complement Motif 0.0857143 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.171429 0 0.714286 0.114286 0 0.0857143 0.685714 0.228571 0.0285714 0 0.885714 0.0857143 0 0.0285714 0.8 0.171429 0.0571429 0.428571 0.142857 0.371429 0.114286 0 0.771429 0.114286 0 0 1 0 0 0.0285714 0.857143 0.114286 0 0.0285714 0.914286 0.0571429 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 36 Klf4 Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 10 0.580823 Original Motif 0.338561 0.0186808 0.235701 0.407057 0.0202765 0.00207373 0.976267 0.00138249 0.00322284 0.00299263 0.990792 0.00299263 0.00322061 0.00828157 0.984817 0.0036807 0.0636928 0.441941 0.00252932 0.491837 0.00506446 0.00345304 0.983656 0.00782689 0.00967073 0.0184204 0.501727 0.470182 0.0608716 0.0106064 0.8997 0.0288218 0.0283999 0.0300162 0.874856 0.0667282 0.0587419 0.660962 0.0647549 0.215541 Reverse Complement Motif 0.0587419 0.0647549 0.660962 0.215541 0.0283999 0.874856 0.0300162 0.0667282 0.0608716 0.8997 0.0106064 0.0288218 0.00967073 0.501727 0.0184204 0.470182 0.00506446 0.983656 0.00345304 0.00782689 0.491837 0.441941 0.00252932 0.0636928 0.00322061 0.984817 0.00828157 0.0036807 0.00322284 0.990792 0.00299263 0.00299263 0.0202765 0.976267 0.00207373 0.00138249 0.407057 0.0186808 0.235701 0.338561 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 29 Motif Name ESR1 Original Motif 0.261242 0.256959 0.329764 0.152034 0.228632 0.17094 0.350427 0.25 0.136752 0.369658 0.318376 0.175214 0.176596 0.487234 0.138298 0.197872 0.285106 0.493617 0.1 0.121277 0.651163 0.0591966 0.188161 0.10148 0.0759494 0.0168776 0.816456 0.0907173 0.04 0.0378947 0.884211 0.0378947 0.0694737 0.0863158 0.191579 0.652632 0.00842105 0.829474 0.111579 0.0505263 0.837895 0.0273684 0.0568421 0.0778947 0.122105 0.526316 0.225263 0.126316 0.132632 0.581053 0.111579 0.174737 0.134737 0.543158 0.204211 0.117895 0.0673684 0.04 0.0168421 0.875789 0.0442105 0.0463158 0.896842 0.0126316 0.642105 0.223158 0.0652632 0.0694737 0.0210526 0.917895 0.0252632 0.0357895 0.124211 0.743158 0.00421053 0.128421 0.0547368 0.347368 0.0463158 0.551579 Reserve Complement Motif 0.551579 0.347368 0.0463158 0.0547368 0.124211 0.00421053 0.743158 0.128421 0.0210526 0.0252632 0.917895 0.0357895 0.0694737 0.223158 0.0652632 0.642105 0.0442105 0.896842 0.0463158 0.0126316 0.875789 0.04 0.0168421 0.0673684 0.134737 0.204211 0.543158 0.117895 0.132632 0.111579 0.581053 0.174737 0.122105 0.225263 0.526316 0.126316 0.0778947 0.0273684 0.0568421 0.837895 0.00842105 0.111579 0.829474 0.0505263 0.652632 0.0863158 0.191579 0.0694737 0.04 0.884211 0.0378947 0.0378947 0.0759494 0.816456 0.0168776 0.0907173 0.10148 0.0591966 0.188161 0.651163 0.285106 0.1 0.493617 0.121277 0.176596 0.138298 0.487234 0.197872 0.136752 0.318376 0.369658 0.175214 0.228632 0.350427 0.17094 0.25 0.261242 0.329764 0.256959 0.152034 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 29 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 45 Pax5 Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 20 0.0624908 Original Motif 0.333333 0.0833333 0.333333 0.25 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 0.25 0.25 0.166667 0.0833333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.583333 0.166667 0.0833333 0.166667 0.166667 0.416667 0.25 0.166667 0 0.25 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.666667 0.0833333 0.5 0.0833333 0.25 0.166667 0.5 0 0.166667 0.333333 0 0 1 0 0.166667 0.666667 0.0833333 0.0833333 0.25 0 0.75 0 0.0833333 0 0.333333 0.583333 0.5 0.0833333 0.416667 0 0.416667 0.0833333 0.416667 0.0833333 0.166667 0.833333 0 0 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.166667 0 0.833333 0 0.0833333 0.0833333 0.416667 0.416667 0 0.0833333 0.416667 0.5 0.583333 0 0.333333 0.0833333 0.25 0.75 0 0 0.166667 0.0833333 0.666667 0.0833333 0 1 0 0 0.333333 0 0.166667 0.5 0.166667 0.0833333 0.25 0.5 0.0833333 0.666667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.25 0.166667 0 0.166667 0.25 0.416667 0.166667 0.166667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.416667 0.166667 0.333333 0.166667 0.25 0.25 0.333333 0.333333 0.666667 0 0 0.25 0.0833333 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 24 Ar Reverse Complement Original Motif Backward 4 19 0.556363 Original Motif 0.375 0.291667 0.0833333 0.25 0.375 0.0833333 0.125 0.416667 0.458333 0.125 0.125 0.291667 0.666667 0.0416667 0.291667 0 0 0 0.916667 0.0833333 0.5 0.25 0.0416667 0.208333 0.875 0.0833333 0 0.0416667 0 1 0 0 0.625 0 0.333333 0.0416667 0.166667 0.375 0.0833333 0.375 0.208333 0.458333 0.0833333 0.25 0.25 0.375 0.375 0 0.125 0.208333 0.0416667 0.625 0 0 1 0 0.166667 0 0 0.833333 0.458333 0.208333 0.0416667 0.291667 0.0416667 0.916667 0.0416667 0 0.125 0.666667 0.0416667 0.166667 0.25 0.291667 0.208333 0.25 0.25 0.208333 0.375 0.166667 0.416667 0.458333 0 0.125 0.208333 0.458333 0.25 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.208333 0.25 0.458333 0.0833333 0.416667 0 0.458333 0.125 0.25 0.375 0.208333 0.166667 0.25 0.208333 0.291667 0.25 0.125 0.0416667 0.666667 0.166667 0.0416667 0.0416667 0.916667 0 0.291667 0.208333 0.0416667 0.458333 0.833333 0 0 0.166667 0 1 0 0 0.625 0.208333 0.0416667 0.125 0.25 0.375 0.375 0 0.208333 0.0833333 0.458333 0.25 0.166667 0.0833333 0.375 0.375 0.0416667 0 0.333333 0.625 0 0 1 0 0.0416667 0.0833333 0 0.875 0.208333 0.25 0.0416667 0.5 0 0.916667 0 0.0833333 0 0.0416667 0.291667 0.666667 0.291667 0.125 0.125 0.458333 0.416667 0.0833333 0.125 0.375 0.25 0.291667 0.0833333 0.375 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Reverse Complement Reverse Complement Forward 2 19 0.575732 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 30 ESR2 Original Motif Original Motif Backward 2 17 1.50287 Original Motif 0.218487 0.45098 0.176471 0.154062 0.442577 0.142857 0.114846 0.29972 0.521008 0.0420168 0.431373 0.00560224 0.0756303 0 0.770308 0.154062 0.0504202 0.0560224 0.893557 0 0.0364146 0.0532213 0.092437 0.817927 0 1 0 0 0.943978 0.00280112 0 0.0532213 0.137255 0.344538 0.316527 0.201681 0.179272 0.176471 0.417367 0.226891 0.145658 0.170868 0.411765 0.271709 0.0588235 0.092437 0.0672269 0.781513 0.176471 0.070028 0.742297 0.0112045 0.498599 0.277311 0.0532213 0.170868 0.0952381 0.7507 0.00560224 0.148459 0.128852 0.809524 0 0.0616246 0.0756303 0.252101 0 0.672269 0.168067 0.263305 0.380952 0.187675 Reverse Complement Motif 0.168067 0.380952 0.263305 0.187675 0.672269 0.252101 0 0.0756303 0.128852 0 0.809524 0.0616246 0.0952381 0.00560224 0.7507 0.148459 0.170868 0.277311 0.0532213 0.498599 0.176471 0.742297 0.070028 0.0112045 0.781513 0.092437 0.0672269 0.0588235 0.145658 0.411765 0.170868 0.271709 0.179272 0.417367 0.176471 0.226891 0.137255 0.316527 0.344538 0.201681 0.0532213 0.00280112 0 0.943978 0 0 1 0 0.817927 0.0532213 0.092437 0.0364146 0.0504202 0.893557 0.0560224 0 0.0756303 0.770308 0 0.154062 0.00560224 0.0420168 0.431373 0.521008 0.29972 0.142857 0.114846 0.442577 0.218487 0.176471 0.45098 0.154062 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 47 RXRRAR_DR5 Original Motif Reverse Complement Backward 1 17 1.55839 Original Motif 0.521739 0 0.478261 0 0 0 1 0 0.0434783 0 0.565217 0.391304 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.782609 0.130435 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.173913 0.304348 0.217391 0.304348 0.217391 0.347826 0.391304 0.0434783 0.217391 0.173913 0.478261 0.130435 0.565217 0.0434783 0.304348 0.0869565 0.217391 0.26087 0.521739 0 0.73913 0.130435 0.130435 0 0.0434783 0.0434783 0.869565 0.0434783 0 0.0434783 0.695652 0.26087 0.0869565 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0434783 0.73913 0.130435 0.0869565 0.913043 0 0.0434783 0.0434783 Reverse Complement Motif 0.0434783 0 0.0434783 0.913043 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0869565 0.73913 0.0434783 0.130435 0.0869565 0 0.695652 0.0434783 0.26087 0.0434783 0.869565 0.0434783 0.0434783 0 0.130435 0.130435 0.73913 0.217391 0.521739 0.26087 0 0.0869565 0.0434783 0.304348 0.565217 0.217391 0.478261 0.173913 0.130435 0.217391 0.391304 0.347826 0.0434783 0.173913 0.217391 0.304348 0.304348 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.130435 0.782609 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.0434783 0.565217 0 0.391304 0 1 0 0 0 0 0.478261 0.521739 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 REST Original Motif Original Motif Forward 6 16 2.07409 Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reverse Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 17 RXRAVDR Reverse Complement Original Motif Backward 1 15 2.56536 Original Motif 0.3 0 0.7 0 0 0 1 0 0 0 0.9 0.1 0 0 0 1 0 0.9 0 0.1 0.9 0 0.1 0 0.4 0.2 0 0.4 0.2 0.4 0.2 0.2 0.2 0 0.8 0 0.5 0 0.5 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0.1 0 0 0.9 0 0.9 0 0.1 0.7 0.1 0.2 0 Reverse Complement Motif 0 0.1 0.2 0.7 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0 0.1 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0 0.2 0.2 0.4 0.2 0.4 0.2 0 0.4 0 0 0.1 0.9 0 0 0.9 0.1 1 0 0 0 0 0.9 0 0.1 0 1 0 0 0.3 0.7 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 PPARGRXRA Original Motif Reverse Complement Backward 2 14 3.07055 Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reverse Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 Zfx Reverse Complement Reverse Complement Forward 2 13 3.56429 Original Motif 0.105042 0.371849 0.37605 0.147059 0.125786 0.356394 0.360587 0.157233 0.190377 0.3159 0.416318 0.0774059 0.150313 0.102296 0.622129 0.125261 0.02079 0.617464 0.299376 0.0623701 0.012474 0.752599 0.004158 0.230769 0.0623701 0.259875 0.378378 0.299376 0.397089 0.320166 0.251559 0.031185 0.018711 0.004158 0.975052 0.002079 0 0.00623701 0.991684 0.002079 0.002079 0.997921 0 0 0 0.997921 0 0.002079 0 0.004158 0 0.995842 0.174636 0.253638 0.455301 0.116424 Reverse Complement Motif 0.174636 0.455301 0.253638 0.116424 0.995842 0.004158 0 0 0 0 0.997921 0.002079 0.002079 0 0.997921 0 0 0.991684 0.00623701 0.002079 0.018711 0.975052 0.004158 0.002079 0.031185 0.320166 0.251559 0.397089 0.0623701 0.378378 0.259875 0.299376 0.012474 0.004158 0.752599 0.230769 0.02079 0.299376 0.617464 0.0623701 0.150313 0.622129 0.102296 0.125261 0.190377 0.416318 0.3159 0.0774059 0.125786 0.360587 0.356394 0.157233 0.105042 0.37605 0.371849 0.147059 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 13 Zfp423 Reverse Complement Original Motif Forward 3 13 3.56489 Original Motif 0.212121 0.121212 0.666667 0 0 0.484848 0.515152 0 0.484848 0.515152 0 0 0.515152 0.484848 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.030303 0.515152 0 0.454545 0.727273 0 0 0.272727 0.393939 0 0.484848 0.121212 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.515152 0.484848 0 0 0.484848 0.515152 0 0.242424 0.484848 0.272727 0.333333 0.666667 0 0 Reverse Complement Motif 0.333333 0 0.666667 0 0 0.484848 0.242424 0.272727 0.515152 0 0.484848 0 0 0.515152 0 0.484848 0 1 0 0 0 1 0 0 0.393939 0.484848 0 0.121212 0.272727 0 0 0.727273 0.030303 0 0.515152 0.454545 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.484848 0 0.515152 0.484848 0 0.515152 0 0 0.515152 0.484848 0 0.212121 0.666667 0.121212 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 30 Motif Name ESR2 Original Motif 0.218487 0.45098 0.176471 0.154062 0.442577 0.142857 0.114846 0.29972 0.521008 0.0420168 0.431373 0.00560224 0.0756303 0 0.770308 0.154062 0.0504202 0.0560224 0.893557 0 0.0364146 0.0532213 0.092437 0.817927 0 1 0 0 0.943978 0.00280112 0 0.0532213 0.137255 0.344538 0.316527 0.201681 0.179272 0.176471 0.417367 0.226891 0.145658 0.170868 0.411765 0.271709 0.0588235 0.092437 0.0672269 0.781513 0.176471 0.070028 0.742297 0.0112045 0.498599 0.277311 0.0532213 0.170868 0.0952381 0.7507 0.00560224 0.148459 0.128852 0.809524 0 0.0616246 0.0756303 0.252101 0 0.672269 0.168067 0.263305 0.380952 0.187675 Reserve Complement Motif 0.168067 0.380952 0.263305 0.187675 0.672269 0.252101 0 0.0756303 0.128852 0 0.809524 0.0616246 0.0952381 0.00560224 0.7507 0.148459 0.170868 0.277311 0.0532213 0.498599 0.176471 0.742297 0.070028 0.0112045 0.781513 0.092437 0.0672269 0.0588235 0.145658 0.411765 0.170868 0.271709 0.179272 0.417367 0.176471 0.226891 0.137255 0.316527 0.344538 0.201681 0.0532213 0.00280112 0 0.943978 0 0 1 0 0.817927 0.0532213 0.092437 0.0364146 0.0504202 0.893557 0.0560224 0 0.0756303 0.770308 0 0.154062 0.00560224 0.0420168 0.431373 0.521008 0.29972 0.142857 0.114846 0.442577 0.218487 0.176471 0.45098 0.154062 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 30 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 24 Ar Reverse Complement Original Motif Forward 3 18 0.0488603 Original Motif 0.375 0.291667 0.0833333 0.25 0.375 0.0833333 0.125 0.416667 0.458333 0.125 0.125 0.291667 0.666667 0.0416667 0.291667 0 0 0 0.916667 0.0833333 0.5 0.25 0.0416667 0.208333 0.875 0.0833333 0 0.0416667 0 1 0 0 0.625 0 0.333333 0.0416667 0.166667 0.375 0.0833333 0.375 0.208333 0.458333 0.0833333 0.25 0.25 0.375 0.375 0 0.125 0.208333 0.0416667 0.625 0 0 1 0 0.166667 0 0 0.833333 0.458333 0.208333 0.0416667 0.291667 0.0416667 0.916667 0.0416667 0 0.125 0.666667 0.0416667 0.166667 0.25 0.291667 0.208333 0.25 0.25 0.208333 0.375 0.166667 0.416667 0.458333 0 0.125 0.208333 0.458333 0.25 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.208333 0.25 0.458333 0.0833333 0.416667 0 0.458333 0.125 0.25 0.375 0.208333 0.166667 0.25 0.208333 0.291667 0.25 0.125 0.0416667 0.666667 0.166667 0.0416667 0.0416667 0.916667 0 0.291667 0.208333 0.0416667 0.458333 0.833333 0 0 0.166667 0 1 0 0 0.625 0.208333 0.0416667 0.125 0.25 0.375 0.375 0 0.208333 0.0833333 0.458333 0.25 0.166667 0.0833333 0.375 0.375 0.0416667 0 0.333333 0.625 0 0 1 0 0.0416667 0.0833333 0 0.875 0.208333 0.25 0.0416667 0.5 0 0.916667 0 0.0833333 0 0.0416667 0.291667 0.666667 0.291667 0.125 0.125 0.458333 0.416667 0.0833333 0.125 0.375 0.25 0.291667 0.0833333 0.375 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 45 Pax5 Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 18 0.0851144 Original Motif 0.333333 0.0833333 0.333333 0.25 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 0.25 0.25 0.166667 0.0833333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.583333 0.166667 0.0833333 0.166667 0.166667 0.416667 0.25 0.166667 0 0.25 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.666667 0.0833333 0.5 0.0833333 0.25 0.166667 0.5 0 0.166667 0.333333 0 0 1 0 0.166667 0.666667 0.0833333 0.0833333 0.25 0 0.75 0 0.0833333 0 0.333333 0.583333 0.5 0.0833333 0.416667 0 0.416667 0.0833333 0.416667 0.0833333 0.166667 0.833333 0 0 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.166667 0 0.833333 0 0.0833333 0.0833333 0.416667 0.416667 0 0.0833333 0.416667 0.5 0.583333 0 0.333333 0.0833333 0.25 0.75 0 0 0.166667 0.0833333 0.666667 0.0833333 0 1 0 0 0.333333 0 0.166667 0.5 0.166667 0.0833333 0.25 0.5 0.0833333 0.666667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.25 0.166667 0 0.166667 0.25 0.416667 0.166667 0.166667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.416667 0.166667 0.333333 0.166667 0.25 0.25 0.333333 0.333333 0.666667 0 0 0.25 0.0833333 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 18 0.0903249 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 REST Original Motif Reverse Complement Backward 3 18 0.0916961 Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reverse Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 29 ESR1 Original Motif Original Motif Forward 4 17 0.511812 Original Motif 0.261242 0.256959 0.329764 0.152034 0.228632 0.17094 0.350427 0.25 0.136752 0.369658 0.318376 0.175214 0.176596 0.487234 0.138298 0.197872 0.285106 0.493617 0.1 0.121277 0.651163 0.0591966 0.188161 0.10148 0.0759494 0.0168776 0.816456 0.0907173 0.04 0.0378947 0.884211 0.0378947 0.0694737 0.0863158 0.191579 0.652632 0.00842105 0.829474 0.111579 0.0505263 0.837895 0.0273684 0.0568421 0.0778947 0.122105 0.526316 0.225263 0.126316 0.132632 0.581053 0.111579 0.174737 0.134737 0.543158 0.204211 0.117895 0.0673684 0.04 0.0168421 0.875789 0.0442105 0.0463158 0.896842 0.0126316 0.642105 0.223158 0.0652632 0.0694737 0.0210526 0.917895 0.0252632 0.0357895 0.124211 0.743158 0.00421053 0.128421 0.0547368 0.347368 0.0463158 0.551579 Reverse Complement Motif 0.551579 0.347368 0.0463158 0.0547368 0.124211 0.00421053 0.743158 0.128421 0.0210526 0.0252632 0.917895 0.0357895 0.0694737 0.223158 0.0652632 0.642105 0.0442105 0.896842 0.0463158 0.0126316 0.875789 0.04 0.0168421 0.0673684 0.134737 0.204211 0.543158 0.117895 0.132632 0.111579 0.581053 0.174737 0.122105 0.225263 0.526316 0.126316 0.0778947 0.0273684 0.0568421 0.837895 0.00842105 0.111579 0.829474 0.0505263 0.652632 0.0863158 0.191579 0.0694737 0.04 0.884211 0.0378947 0.0378947 0.0759494 0.816456 0.0168776 0.0907173 0.10148 0.0591966 0.188161 0.651163 0.285106 0.1 0.493617 0.121277 0.176596 0.138298 0.487234 0.197872 0.136752 0.318376 0.369658 0.175214 0.228632 0.350427 0.17094 0.25 0.261242 0.329764 0.256959 0.152034 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 47 RXRRAR_DR5 Reverse Complement Original Motif Backward 1 17 0.570972 Original Motif 0.521739 0 0.478261 0 0 0 1 0 0.0434783 0 0.565217 0.391304 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.782609 0.130435 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.173913 0.304348 0.217391 0.304348 0.217391 0.347826 0.391304 0.0434783 0.217391 0.173913 0.478261 0.130435 0.565217 0.0434783 0.304348 0.0869565 0.217391 0.26087 0.521739 0 0.73913 0.130435 0.130435 0 0.0434783 0.0434783 0.869565 0.0434783 0 0.0434783 0.695652 0.26087 0.0869565 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0434783 0.73913 0.130435 0.0869565 0.913043 0 0.0434783 0.0434783 Reverse Complement Motif 0.0434783 0 0.0434783 0.913043 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0869565 0.73913 0.0434783 0.130435 0.0869565 0 0.695652 0.0434783 0.26087 0.0434783 0.869565 0.0434783 0.0434783 0 0.130435 0.130435 0.73913 0.217391 0.521739 0.26087 0 0.0869565 0.0434783 0.304348 0.565217 0.217391 0.478261 0.173913 0.130435 0.217391 0.391304 0.347826 0.0434783 0.173913 0.217391 0.304348 0.304348 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.130435 0.782609 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.0434783 0.565217 0 0.391304 0 1 0 0 0 0 0.478261 0.521739 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 PPARGRXRA Original Motif Original Motif Forward 1 15 1.56699 Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reverse Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 Zfx Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 14 2.07891 Original Motif 0.105042 0.371849 0.37605 0.147059 0.125786 0.356394 0.360587 0.157233 0.190377 0.3159 0.416318 0.0774059 0.150313 0.102296 0.622129 0.125261 0.02079 0.617464 0.299376 0.0623701 0.012474 0.752599 0.004158 0.230769 0.0623701 0.259875 0.378378 0.299376 0.397089 0.320166 0.251559 0.031185 0.018711 0.004158 0.975052 0.002079 0 0.00623701 0.991684 0.002079 0.002079 0.997921 0 0 0 0.997921 0 0.002079 0 0.004158 0 0.995842 0.174636 0.253638 0.455301 0.116424 Reverse Complement Motif 0.174636 0.455301 0.253638 0.116424 0.995842 0.004158 0 0 0 0 0.997921 0.002079 0.002079 0 0.997921 0 0 0.991684 0.00623701 0.002079 0.018711 0.975052 0.004158 0.002079 0.031185 0.320166 0.251559 0.397089 0.0623701 0.378378 0.259875 0.299376 0.012474 0.004158 0.752599 0.230769 0.02079 0.299376 0.617464 0.0623701 0.150313 0.622129 0.102296 0.125261 0.190377 0.416318 0.3159 0.0774059 0.125786 0.360587 0.356394 0.157233 0.105042 0.37605 0.371849 0.147059 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 22 NR2F1 Original Motif Original Motif Backward 1 14 2.08921 Original Motif 0 0 0.153846 0.846154 0.0769231 0 0.923077 0 0.923077 0 0.0769231 0 0.461538 0.538462 0 0 0 1 0 0 0 0.230769 0 0.769231 0 0.153846 0 0.846154 0.0769231 0 0 0.923077 0.153846 0 0.846154 0 0.461538 0.307692 0.230769 0 0.461538 0.384615 0.0769231 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.230769 0.461538 0 0.307692 0 0.230769 0.230769 0.538462 Reverse Complement Motif 0.538462 0.230769 0.230769 0 0.230769 0 0.461538 0.307692 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.384615 0.0769231 0.461538 0 0.307692 0.230769 0.461538 0.153846 0.846154 0 0 0.923077 0 0 0.0769231 0.846154 0.153846 0 0 0.769231 0.230769 0 0 0 0 1 0 0.461538 0 0.538462 0 0 0 0.0769231 0.923077 0.0769231 0.923077 0 0 0.846154 0 0.153846 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 48 Tcfcp2l1 Reverse Complement Original Motif Backward 1 14 2.09109 Original Motif 0.00196754 0.92548 0.0627152 0.00983768 0.069973 0.807513 0.00540142 0.117113 0.594508 0.00514832 0.275803 0.12454 0.0058838 0.0237803 0.967149 0.00318706 0.175477 0.33627 0.0256975 0.462555 0.0983847 0.28928 0.0621635 0.550171 0.173924 0.39726 0.151174 0.277642 0.357213 0.224939 0.252323 0.165526 0.63154 0.0696822 0.190954 0.107824 0.394421 0.0513824 0.310497 0.2437 0.00366928 0.933219 0.0547945 0.00831703 0.0617193 0.812148 0.00293902 0.123194 0.536555 0.00736016 0.305937 0.150147 0.0120393 0.0289926 0.954791 0.0041769 Reverse Complement Motif 0.0120393 0.954791 0.0289926 0.0041769 0.150147 0.00736016 0.305937 0.536555 0.0617193 0.00293902 0.812148 0.123194 0.00366928 0.0547945 0.933219 0.00831703 0.2437 0.0513824 0.310497 0.394421 0.107824 0.0696822 0.190954 0.63154 0.165526 0.224939 0.252323 0.357213 0.173924 0.151174 0.39726 0.277642 0.550171 0.28928 0.0621635 0.0983847 0.462555 0.33627 0.0256975 0.175477 0.0058838 0.967149 0.0237803 0.00318706 0.12454 0.00514832 0.275803 0.594508 0.069973 0.00540142 0.807513 0.117113 0.00196754 0.0627152 0.92548 0.00983768 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 31 Motif Name Esrrb Original Motif 0.2 0.8 0 0 0.95 0 0.05 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 Reserve Complement Motif 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0.05 0.95 0.2 0 0.8 0 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 31 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 25 Arnt Original Motif Original Motif Forward 1 6 0 Original Motif 0.2 0.8 0 0 0.95 0 0.05 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 Reverse Complement Motif 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0.05 0.95 0.2 0 0.8 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 39 MYCMAX Reverse Complement Reverse Complement Backward 4 6 0.0143849 Original Motif 0.333333 0.047619 0.428571 0.190476 0.714286 0.047619 0.190476 0.047619 0.0952381 0.428571 0.428571 0.047619 0.047619 0.952381 0 0 1 0 0 0 0 0.952381 0 0.047619 0.047619 0 0.952381 0 0 0.047619 0 0.952381 0 0 1 0 0.047619 0.047619 0.857143 0.047619 0.142857 0.238095 0 0.619048 Reverse Complement Motif 0.619048 0.238095 0 0.142857 0.047619 0.857143 0.047619 0.047619 0 1 0 0 0.952381 0.047619 0 0 0.047619 0.952381 0 0 0 0 0.952381 0.047619 0 0 0 1 0.047619 0 0.952381 0 0.0952381 0.428571 0.428571 0.047619 0.047619 0.047619 0.190476 0.714286 0.333333 0.428571 0.047619 0.190476 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 38 Myc Original Motif Original Motif Backward 3 6 0.0267529 Original Motif 0.295154 0.422907 0.15859 0.123348 0.14978 0.23348 0.572687 0.0440529 0.0352423 0.964758 0 0 0.955947 0.0176211 0.0220264 0.00440529 0 0.933921 0.0132159 0.0528634 0.0837004 0.00881057 0.898678 0.00881057 0.0396476 0.193833 0 0.76652 0 0.00881057 0.951542 0.0396476 0 0.0748899 0.806167 0.118943 0.198238 0.471366 0.105727 0.22467 Reverse Complement Motif 0.198238 0.105727 0.471366 0.22467 0 0.806167 0.0748899 0.118943 0 0.951542 0.00881057 0.0396476 0.76652 0.193833 0 0.0396476 0.0837004 0.898678 0.00881057 0.00881057 0 0.0132159 0.933921 0.0528634 0.00440529 0.0176211 0.0220264 0.955947 0.0352423 0 0.964758 0 0.14978 0.572687 0.23348 0.0440529 0.295154 0.15859 0.422907 0.123348 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 40 Mycn Original Motif Original Motif Forward 3 6 0.0272641 Original Motif 0.349315 0.363014 0.143836 0.143836 0.0890411 0.388128 0.447489 0.0753425 0.0159817 0.984018 0 0 0.945205 0 0.0410959 0.0136986 0 0.961187 0.0182648 0.0205479 0.0707763 0.00228311 0.924658 0.00228311 0.0547945 0.221461 0.00456621 0.719178 0 0 0.938356 0.0616438 0.0616438 0.111872 0.739726 0.086758 0.139269 0.605023 0.0913242 0.164384 Reverse Complement Motif 0.139269 0.0913242 0.605023 0.164384 0.0616438 0.739726 0.111872 0.086758 0 0.938356 0 0.0616438 0.719178 0.221461 0.00456621 0.0547945 0.0707763 0.924658 0.00228311 0.00228311 0 0.0182648 0.961187 0.0205479 0.0136986 0 0.0410959 0.945205 0.0159817 0 0.984018 0 0.0890411 0.447489 0.388128 0.0753425 0.349315 0.143836 0.363014 0.143836 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 33 HIF1AARNT Original Motif Original Motif Forward 2 6 0.0347756 Original Motif 0.259615 0.269231 0.471154 0 0.0961538 0.278846 0.326923 0.298077 0.75 0.0192308 0.221154 0.00961538 0 0.990385 0 0.00961538 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.173077 0.490385 0.192308 0.144231 Reverse Complement Motif 0.173077 0.192308 0.490385 0.144231 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0.990385 0.00961538 0.00961538 0.0192308 0.221154 0.75 0.0961538 0.326923 0.278846 0.298077 0.259615 0.471154 0.269231 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 26 ArntAhr Original Motif Original Motif Backward 1 6 0.065625 Original Motif 0.125 0.333333 0.0833333 0.458333 0 0 0.958333 0.0416667 0 0.958333 0 0.0416667 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 0 1 0 0 1 0 Reverse Complement Motif 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0.958333 0 0.0416667 0 0 0.958333 0.0416667 0 0.958333 0 0.0416667 0.458333 0.333333 0.0833333 0.125 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 14 ZEB1 Original Motif Reverse Complement Forward 1 6 0.0689533 Original Motif 0.0243902 0.829268 0.0243902 0.121951 0.926829 0 0.0487805 0.0243902 0 0.97561 0.0243902 0 0 0.926829 0.0731707 0 0 0.0243902 0 0.97561 0.243902 0.0243902 0.390244 0.341463 Reverse Complement Motif 0.243902 0.390244 0.0243902 0.341463 0.97561 0.0243902 0 0 0 0.0731707 0.926829 0 0 0.0243902 0.97561 0 0.0243902 0 0.0487805 0.926829 0.0243902 0.0243902 0.829268 0.121951 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 28 Egr1 Original Motif Original Motif Backward 6 6 0.0784722 Original Motif 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0.133333 0.0666667 0.8 0 0 0.866667 0 0.133333 0 0 1 0 0 0 0.2 0.8 0.2 0 0.8 0 0.0666667 0 0.933333 0 0 0 1 0 0.133333 0.666667 0 0.2 0 0 1 0 0.0666667 0 0.466667 0.466667 Reverse Complement Motif 0.0666667 0.466667 0 0.466667 0 1 0 0 0.133333 0 0.666667 0.2 0 1 0 0 0.0666667 0.933333 0 0 0.2 0.8 0 0 0.8 0 0.2 0 0 1 0 0 0 0 0.866667 0.133333 0.133333 0.8 0.0666667 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 37 MIZF Original Motif Original Motif Forward 2 6 0.0854167 Original Motif 0.1 0.3 0.25 0.35 0.65 0.05 0 0.3 1 0 0 0 0.1 0.85 0.05 0 0 0 0.95 0.05 0 0.05 0 0.95 0 0.95 0 0.05 0 0.9 0.1 0 0 0 0.95 0.05 0.1 0.65 0.05 0.2 Reverse Complement Motif 0.1 0.05 0.65 0.2 0 0.95 0 0.05 0 0.1 0.9 0 0 0 0.95 0.05 0.95 0.05 0 0 0 0.95 0 0.05 0.1 0.05 0.85 0 0 0 0 1 0.3 0.05 0 0.65 0.35 0.3 0.25 0.1 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 PLAG1 Original Motif Original Motif Backward 3 6 0.105093 Original Motif 0 0 1 0 0.166667 0 0.777778 0.0555556 0 0 1 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0.777778 0.222222 0 0 0.833333 0.0555556 0.111111 0.222222 0.555556 0.0555556 0.166667 0.666667 0 0 0.333333 0.611111 0.277778 0.111111 0 0.111111 0 0.777778 0.111111 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.888889 0.111111 0.111111 0 0.888889 0 Reverse Complement Motif 0.111111 0.888889 0 0 0 0.888889 0 0.111111 0 1 0 0 0 1 0 0 0.111111 0.777778 0 0.111111 0 0.277778 0.111111 0.611111 0.333333 0 0 0.666667 0.222222 0.0555556 0.555556 0.166667 0 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0.222222 0.777778 0 0 0.944444 0 0.0555556 0 1 0 0 0.166667 0.777778 0 0.0555556 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 32 Motif Name EWSR1-FLI1 Original Motif 0 0 1 0 0.0190476 0 0.980952 0 0.990476 0 0.00952381 0 0.990476 0 0.00952381 0 0.00952381 0 0.990476 0 0.0190476 0 0.971429 0.00952381 0.980952 0 0.0190476 0 0.971429 0 0.0285714 0 0 0 0.990476 0.00952381 0 0.0190476 0.980952 0 0.942857 0.0380952 0.0190476 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0.0190476 0.980952 0 0.952381 0.0285714 0 0.0190476 0.971429 0 0.0190476 0.00952381 0.047619 0 0.92381 0.0285714 0.0285714 0.0285714 0.92381 0.0190476 Reserve Complement Motif 0.0285714 0.92381 0.0285714 0.0190476 0.047619 0.92381 0 0.0285714 0.00952381 0 0.0190476 0.971429 0.0190476 0.0285714 0 0.952381 0 0.980952 0.0190476 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0.0380952 0.0190476 0.942857 0 0.980952 0.0190476 0 0 0.990476 0 0.00952381 0 0 0.0285714 0.971429 0 0 0.0190476 0.980952 0.0190476 0.971429 0 0.00952381 0.00952381 0.990476 0 0 0 0 0.00952381 0.990476 0 0 0.00952381 0.990476 0.0190476 0.980952 0 0 0 1 0 0 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 32 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 43 NR1H2RXRA Original Motif Original Motif Backward 6 12 1.09472 Original Motif 0.68 0.2 0 0.12 0.68 0.04 0.2 0.08 0.8 0 0.2 0 0 0 1 0 0 0 0.96 0.04 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.96 0 0 0.04 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.8 0.04 0.08 0.08 0 0.6 0.24 0.16 Reverse Complement Motif 0 0.24 0.6 0.16 0.08 0.04 0.08 0.8 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.04 0 0 0.96 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0.96 0 0.04 0 1 0 0 0 0 0.2 0.8 0.08 0.04 0.2 0.68 0.12 0.2 0 0.68 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 10 Motif 10 Reverse Complement Original Motif Backward 3 12 1.1007 Original Motif 0.169492 0 0 0.830508 0.169492 0.033898 0.372881 0.423729 0.152542 0 0.305085 0.542373 0.20339 0 0 0.79661 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0.20339 0.576271 0.220339 0.271186 0.135593 0.0508471 0.542374 0.016949 0.152542 0.033898 0.796611 0.016949 0 0.101695 0.881356 0.084746 0 0.135593 0.779661 0.050847 0 0.067797 0.881356 0 0.169492 0.152542 0.677966 0 0 0.169492 0.830508 Reverse Complement Motif 0.830508 0 0.169492 0 0.677966 0.169492 0.152542 0 0.881356 0 0.067797 0.050847 0.779661 0 0.135593 0.084746 0.881356 0 0.101695 0.016949 0.796611 0.152542 0.033898 0.016949 0.542374 0.135593 0.0508471 0.271186 0 0.576271 0.20339 0.220339 1 0 0 0 1 0 0 0 0.79661 0 0 0.20339 0.542373 0 0.305085 0.152542 0.423729 0.033898 0.372881 0.169492 0.830508 0 0 0.169492 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Reverse Complement Original Motif Backward 11 10 2.09833 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 SP1 Original Motif Reverse Complement Forward 2 9 2.58264 Original Motif 0 0.914286 0.0285714 0.0571429 0 0.857143 0.0285714 0.114286 0 1 0 0 0.114286 0.771429 0 0.114286 0.0571429 0.142857 0.428571 0.371429 0 0.8 0.0285714 0.171429 0.0285714 0.885714 0 0.0857143 0 0.685714 0.0857143 0.228571 0.171429 0.714286 0 0.114286 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.0857143 Reverse Complement Motif 0.0857143 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.171429 0 0.714286 0.114286 0 0.0857143 0.685714 0.228571 0.0285714 0 0.885714 0.0857143 0 0.0285714 0.8 0.171429 0.0571429 0.428571 0.142857 0.371429 0.114286 0 0.771429 0.114286 0 0 1 0 0 0.0285714 0.857143 0.114286 0 0.0285714 0.914286 0.0571429 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 37 MIZF Reverse Complement Original Motif Backward 3 8 3.0896 Original Motif 0.1 0.3 0.25 0.35 0.65 0.05 0 0.3 1 0 0 0 0.1 0.85 0.05 0 0 0 0.95 0.05 0 0.05 0 0.95 0 0.95 0 0.05 0 0.9 0.1 0 0 0 0.95 0.05 0.1 0.65 0.05 0.2 Reverse Complement Motif 0.1 0.05 0.65 0.2 0 0.95 0 0.05 0 0.1 0.9 0 0 0 0.95 0.05 0.95 0.05 0 0 0 0.95 0 0.05 0.1 0.05 0.85 0 0 0 0 1 0.3 0.05 0 0.65 0.35 0.3 0.25 0.1 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 7 Motif 7 Reverse Complement Original Motif Backward 1 8 3.09107 Original Motif 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.474359 0 0.525641 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 Reverse Complement Motif 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0.474359 0.525641 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 29 ESR1 Original Motif Reverse Complement Forward 13 8 3.09836 Original Motif 0.261242 0.256959 0.329764 0.152034 0.228632 0.17094 0.350427 0.25 0.136752 0.369658 0.318376 0.175214 0.176596 0.487234 0.138298 0.197872 0.285106 0.493617 0.1 0.121277 0.651163 0.0591966 0.188161 0.10148 0.0759494 0.0168776 0.816456 0.0907173 0.04 0.0378947 0.884211 0.0378947 0.0694737 0.0863158 0.191579 0.652632 0.00842105 0.829474 0.111579 0.0505263 0.837895 0.0273684 0.0568421 0.0778947 0.122105 0.526316 0.225263 0.126316 0.132632 0.581053 0.111579 0.174737 0.134737 0.543158 0.204211 0.117895 0.0673684 0.04 0.0168421 0.875789 0.0442105 0.0463158 0.896842 0.0126316 0.642105 0.223158 0.0652632 0.0694737 0.0210526 0.917895 0.0252632 0.0357895 0.124211 0.743158 0.00421053 0.128421 0.0547368 0.347368 0.0463158 0.551579 Reverse Complement Motif 0.551579 0.347368 0.0463158 0.0547368 0.124211 0.00421053 0.743158 0.128421 0.0210526 0.0252632 0.917895 0.0357895 0.0694737 0.223158 0.0652632 0.642105 0.0442105 0.896842 0.0463158 0.0126316 0.875789 0.04 0.0168421 0.0673684 0.134737 0.204211 0.543158 0.117895 0.132632 0.111579 0.581053 0.174737 0.122105 0.225263 0.526316 0.126316 0.0778947 0.0273684 0.0568421 0.837895 0.00842105 0.111579 0.829474 0.0505263 0.652632 0.0863158 0.191579 0.0694737 0.04 0.884211 0.0378947 0.0378947 0.0759494 0.816456 0.0168776 0.0907173 0.10148 0.0591966 0.188161 0.651163 0.285106 0.1 0.493617 0.121277 0.176596 0.138298 0.487234 0.197872 0.136752 0.318376 0.369658 0.175214 0.228632 0.350427 0.17094 0.25 0.261242 0.329764 0.256959 0.152034 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 36 Klf4 Original Motif Original Motif Backward 3 8 3.10206 Original Motif 0.338561 0.0186808 0.235701 0.407057 0.0202765 0.00207373 0.976267 0.00138249 0.00322284 0.00299263 0.990792 0.00299263 0.00322061 0.00828157 0.984817 0.0036807 0.0636928 0.441941 0.00252932 0.491837 0.00506446 0.00345304 0.983656 0.00782689 0.00967073 0.0184204 0.501727 0.470182 0.0608716 0.0106064 0.8997 0.0288218 0.0283999 0.0300162 0.874856 0.0667282 0.0587419 0.660962 0.0647549 0.215541 Reverse Complement Motif 0.0587419 0.0647549 0.660962 0.215541 0.0283999 0.874856 0.0300162 0.0667282 0.0608716 0.8997 0.0106064 0.0288218 0.00967073 0.501727 0.0184204 0.470182 0.00506446 0.983656 0.00345304 0.00782689 0.491837 0.441941 0.00252932 0.0636928 0.00322061 0.984817 0.00828157 0.0036807 0.00322284 0.990792 0.00299263 0.00299263 0.0202765 0.976267 0.00207373 0.00138249 0.407057 0.0186808 0.235701 0.338561 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 3 Motif 3 Original Motif Original Motif Backward 1 7 3.55161 Original Motif 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0.472754 0.527246 0 0 1 0 0 0.496318 0 0 0.503682 0 0 1 0 0 0 1 0 Reverse Complement Motif 0 1 0 0 0 1 0 0 0.503682 0 0 0.496318 0 0 1 0 0 0.527246 0.472754 0 0 1 0 0 0 0 0 1 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 46 RORA_1 Reverse Complement Reverse Complement Forward 4 7 3.58428 Original Motif 0.6 0.04 0.08 0.28 0.36 0.04 0 0.6 0.24 0.48 0.16 0.12 0.44 0.08 0.2 0.28 0.84 0 0.16 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 Reverse Complement Motif 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0.16 0.84 0.28 0.08 0.2 0.44 0.24 0.16 0.48 0.12 0.6 0.04 0 0.36 0.28 0.04 0.08 0.6 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 33 Motif Name HIF1AARNT Original Motif 0.259615 0.269231 0.471154 0 0.0961538 0.278846 0.326923 0.298077 0.75 0.0192308 0.221154 0.00961538 0 0.990385 0 0.00961538 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.173077 0.490385 0.192308 0.144231 Reserve Complement Motif 0.173077 0.192308 0.490385 0.144231 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0.990385 0.00961538 0.00961538 0.0192308 0.221154 0.75 0.0961538 0.326923 0.278846 0.298077 0.259615 0.471154 0.269231 0 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 33 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 40 Mycn Original Motif Reverse Complement Backward 2 8 0.0228069 Original Motif 0.349315 0.363014 0.143836 0.143836 0.0890411 0.388128 0.447489 0.0753425 0.0159817 0.984018 0 0 0.945205 0 0.0410959 0.0136986 0 0.961187 0.0182648 0.0205479 0.0707763 0.00228311 0.924658 0.00228311 0.0547945 0.221461 0.00456621 0.719178 0 0 0.938356 0.0616438 0.0616438 0.111872 0.739726 0.086758 0.139269 0.605023 0.0913242 0.164384 Reverse Complement Motif 0.139269 0.0913242 0.605023 0.164384 0.0616438 0.739726 0.111872 0.086758 0 0.938356 0 0.0616438 0.719178 0.221461 0.00456621 0.0547945 0.0707763 0.924658 0.00228311 0.00228311 0 0.0182648 0.961187 0.0205479 0.0136986 0 0.0410959 0.945205 0.0159817 0 0.984018 0 0.0890411 0.447489 0.388128 0.0753425 0.349315 0.143836 0.363014 0.143836 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 38 Myc Original Motif Reverse Complement Backward 2 8 0.0249459 Original Motif 0.295154 0.422907 0.15859 0.123348 0.14978 0.23348 0.572687 0.0440529 0.0352423 0.964758 0 0 0.955947 0.0176211 0.0220264 0.00440529 0 0.933921 0.0132159 0.0528634 0.0837004 0.00881057 0.898678 0.00881057 0.0396476 0.193833 0 0.76652 0 0.00881057 0.951542 0.0396476 0 0.0748899 0.806167 0.118943 0.198238 0.471366 0.105727 0.22467 Reverse Complement Motif 0.198238 0.105727 0.471366 0.22467 0 0.806167 0.0748899 0.118943 0 0.951542 0.00881057 0.0396476 0.76652 0.193833 0 0.0396476 0.0837004 0.898678 0.00881057 0.00881057 0 0.0132159 0.933921 0.0528634 0.00440529 0.0176211 0.0220264 0.955947 0.0352423 0 0.964758 0 0.14978 0.572687 0.23348 0.0440529 0.295154 0.15859 0.422907 0.123348 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 39 MYCMAX Reverse Complement Reverse Complement Forward 2 8 0.0254922 Original Motif 0.333333 0.047619 0.428571 0.190476 0.714286 0.047619 0.190476 0.047619 0.0952381 0.428571 0.428571 0.047619 0.047619 0.952381 0 0 1 0 0 0 0 0.952381 0 0.047619 0.047619 0 0.952381 0 0 0.047619 0 0.952381 0 0 1 0 0.047619 0.047619 0.857143 0.047619 0.142857 0.238095 0 0.619048 Reverse Complement Motif 0.619048 0.238095 0 0.142857 0.047619 0.857143 0.047619 0.047619 0 1 0 0 0.952381 0.047619 0 0 0.047619 0.952381 0 0 0 0 0.952381 0.047619 0 0 0 1 0.047619 0 0.952381 0 0.0952381 0.428571 0.428571 0.047619 0.047619 0.047619 0.190476 0.714286 0.333333 0.428571 0.047619 0.190476 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 37 MIZF Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 8 0.0482171 Original Motif 0.1 0.3 0.25 0.35 0.65 0.05 0 0.3 1 0 0 0 0.1 0.85 0.05 0 0 0 0.95 0.05 0 0.05 0 0.95 0 0.95 0 0.05 0 0.9 0.1 0 0 0 0.95 0.05 0.1 0.65 0.05 0.2 Reverse Complement Motif 0.1 0.05 0.65 0.2 0 0.95 0 0.05 0 0.1 0.9 0 0 0 0.95 0.05 0.95 0.05 0 0 0 0.95 0 0.05 0.1 0.05 0.85 0 0 0 0 1 0.3 0.05 0 0.65 0.35 0.3 0.25 0.1 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 24 Ar Original Motif Reverse Complement Forward 5 8 0.0533654 Original Motif 0.375 0.291667 0.0833333 0.25 0.375 0.0833333 0.125 0.416667 0.458333 0.125 0.125 0.291667 0.666667 0.0416667 0.291667 0 0 0 0.916667 0.0833333 0.5 0.25 0.0416667 0.208333 0.875 0.0833333 0 0.0416667 0 1 0 0 0.625 0 0.333333 0.0416667 0.166667 0.375 0.0833333 0.375 0.208333 0.458333 0.0833333 0.25 0.25 0.375 0.375 0 0.125 0.208333 0.0416667 0.625 0 0 1 0 0.166667 0 0 0.833333 0.458333 0.208333 0.0416667 0.291667 0.0416667 0.916667 0.0416667 0 0.125 0.666667 0.0416667 0.166667 0.25 0.291667 0.208333 0.25 0.25 0.208333 0.375 0.166667 0.416667 0.458333 0 0.125 0.208333 0.458333 0.25 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.208333 0.25 0.458333 0.0833333 0.416667 0 0.458333 0.125 0.25 0.375 0.208333 0.166667 0.25 0.208333 0.291667 0.25 0.125 0.0416667 0.666667 0.166667 0.0416667 0.0416667 0.916667 0 0.291667 0.208333 0.0416667 0.458333 0.833333 0 0 0.166667 0 1 0 0 0.625 0.208333 0.0416667 0.125 0.25 0.375 0.375 0 0.208333 0.0833333 0.458333 0.25 0.166667 0.0833333 0.375 0.375 0.0416667 0 0.333333 0.625 0 0 1 0 0.0416667 0.0833333 0 0.875 0.208333 0.25 0.0416667 0.5 0 0.916667 0 0.0833333 0 0.0416667 0.291667 0.666667 0.291667 0.125 0.125 0.458333 0.416667 0.0833333 0.125 0.375 0.25 0.291667 0.0833333 0.375 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 45 Pax5 Reverse Complement Reverse Complement Backward 8 8 0.0661859 Original Motif 0.333333 0.0833333 0.333333 0.25 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 0.25 0.25 0.166667 0.0833333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.583333 0.166667 0.0833333 0.166667 0.166667 0.416667 0.25 0.166667 0 0.25 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.666667 0.0833333 0.5 0.0833333 0.25 0.166667 0.5 0 0.166667 0.333333 0 0 1 0 0.166667 0.666667 0.0833333 0.0833333 0.25 0 0.75 0 0.0833333 0 0.333333 0.583333 0.5 0.0833333 0.416667 0 0.416667 0.0833333 0.416667 0.0833333 0.166667 0.833333 0 0 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.166667 0 0.833333 0 0.0833333 0.0833333 0.416667 0.416667 0 0.0833333 0.416667 0.5 0.583333 0 0.333333 0.0833333 0.25 0.75 0 0 0.166667 0.0833333 0.666667 0.0833333 0 1 0 0 0.333333 0 0.166667 0.5 0.166667 0.0833333 0.25 0.5 0.0833333 0.666667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.25 0.166667 0 0.166667 0.25 0.416667 0.166667 0.166667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.416667 0.166667 0.333333 0.166667 0.25 0.25 0.333333 0.333333 0.666667 0 0 0.25 0.0833333 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Reverse Complement Original Motif Forward 6 8 0.0666776 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 41 MZF1_5-13 Original Motif Original Motif Backward 3 8 0.0703926 Original Motif 0.0625 0.25 0.4375 0.25 0.125 0 0.4375 0.4375 0.9375 0.0625 0 0 0 0 0.6875 0.3125 0 0 0.9375 0.0625 0 0.125 0.875 0 0 0 0.875 0.125 0.1875 0.0625 0.5 0.25 0.625 0 0.25 0.125 0.5 0.125 0.25 0.125 Reverse Complement Motif 0.125 0.125 0.25 0.5 0.125 0 0.25 0.625 0.1875 0.5 0.0625 0.25 0 0.875 0 0.125 0 0.875 0.125 0 0 0.9375 0 0.0625 0 0.6875 0 0.3125 0 0.0625 0 0.9375 0.125 0.4375 0 0.4375 0.0625 0.4375 0.25 0.25 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 30 ESR2 Original Motif Reverse Complement Forward 6 8 0.0716055 Original Motif 0.218487 0.45098 0.176471 0.154062 0.442577 0.142857 0.114846 0.29972 0.521008 0.0420168 0.431373 0.00560224 0.0756303 0 0.770308 0.154062 0.0504202 0.0560224 0.893557 0 0.0364146 0.0532213 0.092437 0.817927 0 1 0 0 0.943978 0.00280112 0 0.0532213 0.137255 0.344538 0.316527 0.201681 0.179272 0.176471 0.417367 0.226891 0.145658 0.170868 0.411765 0.271709 0.0588235 0.092437 0.0672269 0.781513 0.176471 0.070028 0.742297 0.0112045 0.498599 0.277311 0.0532213 0.170868 0.0952381 0.7507 0.00560224 0.148459 0.128852 0.809524 0 0.0616246 0.0756303 0.252101 0 0.672269 0.168067 0.263305 0.380952 0.187675 Reverse Complement Motif 0.168067 0.380952 0.263305 0.187675 0.672269 0.252101 0 0.0756303 0.128852 0 0.809524 0.0616246 0.0952381 0.00560224 0.7507 0.148459 0.170868 0.277311 0.0532213 0.498599 0.176471 0.742297 0.070028 0.0112045 0.781513 0.092437 0.0672269 0.0588235 0.145658 0.411765 0.170868 0.271709 0.179272 0.417367 0.176471 0.226891 0.137255 0.316527 0.344538 0.201681 0.0532213 0.00280112 0 0.943978 0 0 1 0 0.817927 0.0532213 0.092437 0.0364146 0.0504202 0.893557 0.0560224 0 0.0756303 0.770308 0 0.154062 0.00560224 0.0420168 0.431373 0.521008 0.29972 0.142857 0.114846 0.442577 0.218487 0.176471 0.45098 0.154062 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 47 RXRRAR_DR5 Original Motif Reverse Complement Backward 4 8 0.0726789 Original Motif 0.521739 0 0.478261 0 0 0 1 0 0.0434783 0 0.565217 0.391304 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.782609 0.130435 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.173913 0.304348 0.217391 0.304348 0.217391 0.347826 0.391304 0.0434783 0.217391 0.173913 0.478261 0.130435 0.565217 0.0434783 0.304348 0.0869565 0.217391 0.26087 0.521739 0 0.73913 0.130435 0.130435 0 0.0434783 0.0434783 0.869565 0.0434783 0 0.0434783 0.695652 0.26087 0.0869565 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0434783 0.73913 0.130435 0.0869565 0.913043 0 0.0434783 0.0434783 Reverse Complement Motif 0.0434783 0 0.0434783 0.913043 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0869565 0.73913 0.0434783 0.130435 0.0869565 0 0.695652 0.0434783 0.26087 0.0434783 0.869565 0.0434783 0.0434783 0 0.130435 0.130435 0.73913 0.217391 0.521739 0.26087 0 0.0869565 0.0434783 0.304348 0.565217 0.217391 0.478261 0.173913 0.130435 0.217391 0.391304 0.347826 0.0434783 0.173913 0.217391 0.304348 0.304348 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.130435 0.782609 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.0434783 0.565217 0 0.391304 0 1 0 0 0 0 0.478261 0.521739 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 34 Motif Name HNF4A Original Motif 0.41791 0.104478 0.402985 0.0746269 0.0298507 0.0298507 0.835821 0.104478 0.179104 0.0597015 0.522388 0.238806 0.0746269 0.343284 0.298507 0.283582 0.0447761 0.761194 0.0597015 0.134328 0.880597 0.0149254 0.0447761 0.0597015 0.791045 0.0298507 0.149254 0.0298507 0.835821 0.0149254 0.119403 0.0298507 0.0597015 0.0597015 0.865672 0.0149254 0.0895522 0.0298507 0.492537 0.38806 0.0447761 0.328358 0.164179 0.462687 0.0597015 0.731343 0.0746269 0.134328 0.626866 0.104478 0.149254 0.119403 Reserve Complement Motif 0.119403 0.104478 0.149254 0.626866 0.0597015 0.0746269 0.731343 0.134328 0.462687 0.328358 0.164179 0.0447761 0.0895522 0.492537 0.0298507 0.38806 0.0597015 0.865672 0.0597015 0.0149254 0.0298507 0.0149254 0.119403 0.835821 0.0298507 0.0298507 0.149254 0.791045 0.0597015 0.0149254 0.0447761 0.880597 0.0447761 0.0597015 0.761194 0.134328 0.0746269 0.298507 0.343284 0.283582 0.179104 0.522388 0.0597015 0.238806 0.0298507 0.835821 0.0298507 0.104478 0.0746269 0.104478 0.402985 0.41791 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 34 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 PPARGRXRA Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 13 0 Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reverse Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 22 NR2F1 Reverse Complement Original Motif Backward 1 13 0.0227413 Original Motif 0 0 0.153846 0.846154 0.0769231 0 0.923077 0 0.923077 0 0.0769231 0 0.461538 0.538462 0 0 0 1 0 0 0 0.230769 0 0.769231 0 0.153846 0 0.846154 0.0769231 0 0 0.923077 0.153846 0 0.846154 0 0.461538 0.307692 0.230769 0 0.461538 0.384615 0.0769231 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.230769 0.461538 0 0.307692 0 0.230769 0.230769 0.538462 Reverse Complement Motif 0.538462 0.230769 0.230769 0 0.230769 0 0.461538 0.307692 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.384615 0.0769231 0.461538 0 0.307692 0.230769 0.461538 0.153846 0.846154 0 0 0.923077 0 0 0.0769231 0.846154 0.153846 0 0 0.769231 0.230769 0 0 0 0 1 0 0.461538 0 0.538462 0 0 0 0.0769231 0.923077 0.0769231 0.923077 0 0 0.846154 0 0.153846 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 43 NR1H2RXRA Original Motif Original Motif Forward 3 13 0.0423023 Original Motif 0.68 0.2 0 0.12 0.68 0.04 0.2 0.08 0.8 0 0.2 0 0 0 1 0 0 0 0.96 0.04 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.96 0 0 0.04 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.8 0.04 0.08 0.08 0 0.6 0.24 0.16 Reverse Complement Motif 0 0.24 0.6 0.16 0.08 0.04 0.08 0.8 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.04 0 0 0.96 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0.96 0 0.04 0 1 0 0 0 0 0.2 0.8 0.08 0.04 0.2 0.68 0.12 0.2 0 0.68 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 47 RXRRAR_DR5 Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 13 0.048852 Original Motif 0.521739 0 0.478261 0 0 0 1 0 0.0434783 0 0.565217 0.391304 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.782609 0.130435 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.173913 0.304348 0.217391 0.304348 0.217391 0.347826 0.391304 0.0434783 0.217391 0.173913 0.478261 0.130435 0.565217 0.0434783 0.304348 0.0869565 0.217391 0.26087 0.521739 0 0.73913 0.130435 0.130435 0 0.0434783 0.0434783 0.869565 0.0434783 0 0.0434783 0.695652 0.26087 0.0869565 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0434783 0.73913 0.130435 0.0869565 0.913043 0 0.0434783 0.0434783 Reverse Complement Motif 0.0434783 0 0.0434783 0.913043 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0869565 0.73913 0.0434783 0.130435 0.0869565 0 0.695652 0.0434783 0.26087 0.0434783 0.869565 0.0434783 0.0434783 0 0.130435 0.130435 0.73913 0.217391 0.521739 0.26087 0 0.0869565 0.0434783 0.304348 0.565217 0.217391 0.478261 0.173913 0.130435 0.217391 0.391304 0.347826 0.0434783 0.173913 0.217391 0.304348 0.304348 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.130435 0.782609 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.0434783 0.565217 0 0.391304 0 1 0 0 0 0 0.478261 0.521739 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 45 Pax5 Original Motif Reverse Complement Forward 8 13 0.063924 Original Motif 0.333333 0.0833333 0.333333 0.25 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 0.25 0.25 0.166667 0.0833333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.583333 0.166667 0.0833333 0.166667 0.166667 0.416667 0.25 0.166667 0 0.25 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.666667 0.0833333 0.5 0.0833333 0.25 0.166667 0.5 0 0.166667 0.333333 0 0 1 0 0.166667 0.666667 0.0833333 0.0833333 0.25 0 0.75 0 0.0833333 0 0.333333 0.583333 0.5 0.0833333 0.416667 0 0.416667 0.0833333 0.416667 0.0833333 0.166667 0.833333 0 0 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.166667 0 0.833333 0 0.0833333 0.0833333 0.416667 0.416667 0 0.0833333 0.416667 0.5 0.583333 0 0.333333 0.0833333 0.25 0.75 0 0 0.166667 0.0833333 0.666667 0.0833333 0 1 0 0 0.333333 0 0.166667 0.5 0.166667 0.0833333 0.25 0.5 0.0833333 0.666667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.25 0.166667 0 0.166667 0.25 0.416667 0.166667 0.166667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.416667 0.166667 0.333333 0.166667 0.25 0.25 0.333333 0.333333 0.666667 0 0 0.25 0.0833333 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 30 ESR2 Original Motif Original Motif Backward 4 13 0.0671615 Original Motif 0.218487 0.45098 0.176471 0.154062 0.442577 0.142857 0.114846 0.29972 0.521008 0.0420168 0.431373 0.00560224 0.0756303 0 0.770308 0.154062 0.0504202 0.0560224 0.893557 0 0.0364146 0.0532213 0.092437 0.817927 0 1 0 0 0.943978 0.00280112 0 0.0532213 0.137255 0.344538 0.316527 0.201681 0.179272 0.176471 0.417367 0.226891 0.145658 0.170868 0.411765 0.271709 0.0588235 0.092437 0.0672269 0.781513 0.176471 0.070028 0.742297 0.0112045 0.498599 0.277311 0.0532213 0.170868 0.0952381 0.7507 0.00560224 0.148459 0.128852 0.809524 0 0.0616246 0.0756303 0.252101 0 0.672269 0.168067 0.263305 0.380952 0.187675 Reverse Complement Motif 0.168067 0.380952 0.263305 0.187675 0.672269 0.252101 0 0.0756303 0.128852 0 0.809524 0.0616246 0.0952381 0.00560224 0.7507 0.148459 0.170868 0.277311 0.0532213 0.498599 0.176471 0.742297 0.070028 0.0112045 0.781513 0.092437 0.0672269 0.0588235 0.145658 0.411765 0.170868 0.271709 0.179272 0.417367 0.176471 0.226891 0.137255 0.316527 0.344538 0.201681 0.0532213 0.00280112 0 0.943978 0 0 1 0 0.817927 0.0532213 0.092437 0.0364146 0.0504202 0.893557 0.0560224 0 0.0756303 0.770308 0 0.154062 0.00560224 0.0420168 0.431373 0.521008 0.29972 0.142857 0.114846 0.442577 0.218487 0.176471 0.45098 0.154062 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 24 Ar Reverse Complement Reverse Complement Forward 7 13 0.067775 Original Motif 0.375 0.291667 0.0833333 0.25 0.375 0.0833333 0.125 0.416667 0.458333 0.125 0.125 0.291667 0.666667 0.0416667 0.291667 0 0 0 0.916667 0.0833333 0.5 0.25 0.0416667 0.208333 0.875 0.0833333 0 0.0416667 0 1 0 0 0.625 0 0.333333 0.0416667 0.166667 0.375 0.0833333 0.375 0.208333 0.458333 0.0833333 0.25 0.25 0.375 0.375 0 0.125 0.208333 0.0416667 0.625 0 0 1 0 0.166667 0 0 0.833333 0.458333 0.208333 0.0416667 0.291667 0.0416667 0.916667 0.0416667 0 0.125 0.666667 0.0416667 0.166667 0.25 0.291667 0.208333 0.25 0.25 0.208333 0.375 0.166667 0.416667 0.458333 0 0.125 0.208333 0.458333 0.25 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.208333 0.25 0.458333 0.0833333 0.416667 0 0.458333 0.125 0.25 0.375 0.208333 0.166667 0.25 0.208333 0.291667 0.25 0.125 0.0416667 0.666667 0.166667 0.0416667 0.0416667 0.916667 0 0.291667 0.208333 0.0416667 0.458333 0.833333 0 0 0.166667 0 1 0 0 0.625 0.208333 0.0416667 0.125 0.25 0.375 0.375 0 0.208333 0.0833333 0.458333 0.25 0.166667 0.0833333 0.375 0.375 0.0416667 0 0.333333 0.625 0 0 1 0 0.0416667 0.0833333 0 0.875 0.208333 0.25 0.0416667 0.5 0 0.916667 0 0.0833333 0 0.0416667 0.291667 0.666667 0.291667 0.125 0.125 0.458333 0.416667 0.0833333 0.125 0.375 0.25 0.291667 0.0833333 0.375 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 29 ESR1 Reverse Complement Original Motif Backward 8 13 0.0711137 Original Motif 0.261242 0.256959 0.329764 0.152034 0.228632 0.17094 0.350427 0.25 0.136752 0.369658 0.318376 0.175214 0.176596 0.487234 0.138298 0.197872 0.285106 0.493617 0.1 0.121277 0.651163 0.0591966 0.188161 0.10148 0.0759494 0.0168776 0.816456 0.0907173 0.04 0.0378947 0.884211 0.0378947 0.0694737 0.0863158 0.191579 0.652632 0.00842105 0.829474 0.111579 0.0505263 0.837895 0.0273684 0.0568421 0.0778947 0.122105 0.526316 0.225263 0.126316 0.132632 0.581053 0.111579 0.174737 0.134737 0.543158 0.204211 0.117895 0.0673684 0.04 0.0168421 0.875789 0.0442105 0.0463158 0.896842 0.0126316 0.642105 0.223158 0.0652632 0.0694737 0.0210526 0.917895 0.0252632 0.0357895 0.124211 0.743158 0.00421053 0.128421 0.0547368 0.347368 0.0463158 0.551579 Reverse Complement Motif 0.551579 0.347368 0.0463158 0.0547368 0.124211 0.00421053 0.743158 0.128421 0.0210526 0.0252632 0.917895 0.0357895 0.0694737 0.223158 0.0652632 0.642105 0.0442105 0.896842 0.0463158 0.0126316 0.875789 0.04 0.0168421 0.0673684 0.134737 0.204211 0.543158 0.117895 0.132632 0.111579 0.581053 0.174737 0.122105 0.225263 0.526316 0.126316 0.0778947 0.0273684 0.0568421 0.837895 0.00842105 0.111579 0.829474 0.0505263 0.652632 0.0863158 0.191579 0.0694737 0.04 0.884211 0.0378947 0.0378947 0.0759494 0.816456 0.0168776 0.0907173 0.10148 0.0591966 0.188161 0.651163 0.285106 0.1 0.493617 0.121277 0.176596 0.138298 0.487234 0.197872 0.136752 0.318376 0.369658 0.175214 0.228632 0.350427 0.17094 0.25 0.261242 0.329764 0.256959 0.152034 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 PLAG1 Original Motif Original Motif Backward 1 13 0.0714266 Original Motif 0 0 1 0 0.166667 0 0.777778 0.0555556 0 0 1 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0.777778 0.222222 0 0 0.833333 0.0555556 0.111111 0.222222 0.555556 0.0555556 0.166667 0.666667 0 0 0.333333 0.611111 0.277778 0.111111 0 0.111111 0 0.777778 0.111111 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.888889 0.111111 0.111111 0 0.888889 0 Reverse Complement Motif 0.111111 0.888889 0 0 0 0.888889 0 0.111111 0 1 0 0 0 1 0 0 0.111111 0.777778 0 0.111111 0 0.277778 0.111111 0.611111 0.333333 0 0 0.666667 0.222222 0.0555556 0.555556 0.166667 0 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0.222222 0.777778 0 0 0.944444 0 0.0555556 0 1 0 0 0.166667 0.777778 0 0.0555556 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 REST Reverse Complement Reverse Complement Forward 6 13 0.0741922 Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reverse Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 35 Motif Name INSM1 Original Motif 0.0416667 0 0.166667 0.791667 0 0 0.833333 0.166667 0 0.333333 0.125 0.541667 0.25 0.625 0 0.125 0.666667 0 0 0.333333 0 0 1 0 0 0.0416667 0.958333 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.0833333 0.666667 0.25 0.125 0.666667 0 0.208333 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reserve Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.125 0 0.666667 0.208333 0 0.666667 0.0833333 0.25 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 1 0 0 0.333333 0 0 0.666667 0.25 0 0.625 0.125 0.541667 0.333333 0.125 0 0 0.833333 0 0.166667 0.791667 0 0.166667 0.0416667 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 35 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 PPARGRXRA Original Motif Original Motif Backward 1 12 0.0472454 Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reverse Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Original Motif Reverse Complement Forward 9 12 0.0499162 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 13 Zfp423 Reverse Complement Reverse Complement Forward 2 12 0.0538619 Original Motif 0.212121 0.121212 0.666667 0 0 0.484848 0.515152 0 0.484848 0.515152 0 0 0.515152 0.484848 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.030303 0.515152 0 0.454545 0.727273 0 0 0.272727 0.393939 0 0.484848 0.121212 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.515152 0.484848 0 0 0.484848 0.515152 0 0.242424 0.484848 0.272727 0.333333 0.666667 0 0 Reverse Complement Motif 0.333333 0 0.666667 0 0 0.484848 0.242424 0.272727 0.515152 0 0.484848 0 0 0.515152 0 0.484848 0 1 0 0 0 1 0 0 0.393939 0.484848 0 0.121212 0.272727 0 0 0.727273 0.030303 0 0.515152 0.454545 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.484848 0 0.515152 0.484848 0 0.515152 0 0 0.515152 0.484848 0 0.212121 0.666667 0.121212 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 34 HNF4A Original Motif Original Motif Forward 2 12 0.0551858 Original Motif 0.41791 0.104478 0.402985 0.0746269 0.0298507 0.0298507 0.835821 0.104478 0.179104 0.0597015 0.522388 0.238806 0.0746269 0.343284 0.298507 0.283582 0.0447761 0.761194 0.0597015 0.134328 0.880597 0.0149254 0.0447761 0.0597015 0.791045 0.0298507 0.149254 0.0298507 0.835821 0.0149254 0.119403 0.0298507 0.0597015 0.0597015 0.865672 0.0149254 0.0895522 0.0298507 0.492537 0.38806 0.0447761 0.328358 0.164179 0.462687 0.0597015 0.731343 0.0746269 0.134328 0.626866 0.104478 0.149254 0.119403 Reverse Complement Motif 0.119403 0.104478 0.149254 0.626866 0.0597015 0.0746269 0.731343 0.134328 0.462687 0.328358 0.164179 0.0447761 0.0895522 0.492537 0.0298507 0.38806 0.0597015 0.865672 0.0597015 0.0149254 0.0298507 0.0149254 0.119403 0.835821 0.0298507 0.0298507 0.149254 0.791045 0.0597015 0.0149254 0.0447761 0.880597 0.0447761 0.0597015 0.761194 0.134328 0.0746269 0.298507 0.343284 0.283582 0.179104 0.522388 0.0597015 0.238806 0.0298507 0.835821 0.0298507 0.104478 0.0746269 0.104478 0.402985 0.41791 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 29 ESR1 Original Motif Original Motif Forward 2 12 0.0630846 Original Motif 0.261242 0.256959 0.329764 0.152034 0.228632 0.17094 0.350427 0.25 0.136752 0.369658 0.318376 0.175214 0.176596 0.487234 0.138298 0.197872 0.285106 0.493617 0.1 0.121277 0.651163 0.0591966 0.188161 0.10148 0.0759494 0.0168776 0.816456 0.0907173 0.04 0.0378947 0.884211 0.0378947 0.0694737 0.0863158 0.191579 0.652632 0.00842105 0.829474 0.111579 0.0505263 0.837895 0.0273684 0.0568421 0.0778947 0.122105 0.526316 0.225263 0.126316 0.132632 0.581053 0.111579 0.174737 0.134737 0.543158 0.204211 0.117895 0.0673684 0.04 0.0168421 0.875789 0.0442105 0.0463158 0.896842 0.0126316 0.642105 0.223158 0.0652632 0.0694737 0.0210526 0.917895 0.0252632 0.0357895 0.124211 0.743158 0.00421053 0.128421 0.0547368 0.347368 0.0463158 0.551579 Reverse Complement Motif 0.551579 0.347368 0.0463158 0.0547368 0.124211 0.00421053 0.743158 0.128421 0.0210526 0.0252632 0.917895 0.0357895 0.0694737 0.223158 0.0652632 0.642105 0.0442105 0.896842 0.0463158 0.0126316 0.875789 0.04 0.0168421 0.0673684 0.134737 0.204211 0.543158 0.117895 0.132632 0.111579 0.581053 0.174737 0.122105 0.225263 0.526316 0.126316 0.0778947 0.0273684 0.0568421 0.837895 0.00842105 0.111579 0.829474 0.0505263 0.652632 0.0863158 0.191579 0.0694737 0.04 0.884211 0.0378947 0.0378947 0.0759494 0.816456 0.0168776 0.0907173 0.10148 0.0591966 0.188161 0.651163 0.285106 0.1 0.493617 0.121277 0.176596 0.138298 0.487234 0.197872 0.136752 0.318376 0.369658 0.175214 0.228632 0.350427 0.17094 0.25 0.261242 0.329764 0.256959 0.152034 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 45 Pax5 Original Motif Original Motif Backward 4 12 0.0679087 Original Motif 0.333333 0.0833333 0.333333 0.25 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 0.25 0.25 0.166667 0.0833333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.583333 0.166667 0.0833333 0.166667 0.166667 0.416667 0.25 0.166667 0 0.25 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.666667 0.0833333 0.5 0.0833333 0.25 0.166667 0.5 0 0.166667 0.333333 0 0 1 0 0.166667 0.666667 0.0833333 0.0833333 0.25 0 0.75 0 0.0833333 0 0.333333 0.583333 0.5 0.0833333 0.416667 0 0.416667 0.0833333 0.416667 0.0833333 0.166667 0.833333 0 0 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.166667 0 0.833333 0 0.0833333 0.0833333 0.416667 0.416667 0 0.0833333 0.416667 0.5 0.583333 0 0.333333 0.0833333 0.25 0.75 0 0 0.166667 0.0833333 0.666667 0.0833333 0 1 0 0 0.333333 0 0.166667 0.5 0.166667 0.0833333 0.25 0.5 0.0833333 0.666667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.25 0.166667 0 0.166667 0.25 0.416667 0.166667 0.166667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.416667 0.166667 0.333333 0.166667 0.25 0.25 0.333333 0.333333 0.666667 0 0 0.25 0.0833333 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 Zfx Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 12 0.069037 Original Motif 0.105042 0.371849 0.37605 0.147059 0.125786 0.356394 0.360587 0.157233 0.190377 0.3159 0.416318 0.0774059 0.150313 0.102296 0.622129 0.125261 0.02079 0.617464 0.299376 0.0623701 0.012474 0.752599 0.004158 0.230769 0.0623701 0.259875 0.378378 0.299376 0.397089 0.320166 0.251559 0.031185 0.018711 0.004158 0.975052 0.002079 0 0.00623701 0.991684 0.002079 0.002079 0.997921 0 0 0 0.997921 0 0.002079 0 0.004158 0 0.995842 0.174636 0.253638 0.455301 0.116424 Reverse Complement Motif 0.174636 0.455301 0.253638 0.116424 0.995842 0.004158 0 0 0 0 0.997921 0.002079 0.002079 0 0.997921 0 0 0.991684 0.00623701 0.002079 0.018711 0.975052 0.004158 0.002079 0.031185 0.320166 0.251559 0.397089 0.0623701 0.378378 0.259875 0.299376 0.012474 0.004158 0.752599 0.230769 0.02079 0.299376 0.617464 0.0623701 0.150313 0.622129 0.102296 0.125261 0.190377 0.416318 0.3159 0.0774059 0.125786 0.360587 0.356394 0.157233 0.105042 0.37605 0.371849 0.147059 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 Motif 11 Reverse Complement Original Motif Backward 1 12 0.0692502 Original Motif 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0.636364 0 0.363636 0.727273 0 0.272727 0 0.181818 0.818182 0 0 1 0 0 0 0 0.909091 0 0.090909 1 0 0 0 0 0.909091 0 0.090909 0.909091 0 0 0.090909 0 1 0 0 0.818182 0 0 0.181818 0 0.909091 0 0.090909 0.909091 0 0 0.090909 Reverse Complement Motif 0.090909 0 0 0.909091 0 0 0.909091 0.090909 0.181818 0 0 0.818182 0 0 1 0 0.090909 0 0 0.909091 0 0 0.909091 0.090909 0 0 0 1 0 0 0.909091 0.090909 0 0 0 1 0.181818 0 0.818182 0 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0 1 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 43 NR1H2RXRA Original Motif Original Motif Backward 3 12 0.0696795 Original Motif 0.68 0.2 0 0.12 0.68 0.04 0.2 0.08 0.8 0 0.2 0 0 0 1 0 0 0 0.96 0.04 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.96 0 0 0.04 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.8 0.04 0.08 0.08 0 0.6 0.24 0.16 Reverse Complement Motif 0 0.24 0.6 0.16 0.08 0.04 0.08 0.8 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.04 0 0 0.96 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0.96 0 0.04 0 1 0 0 0 0 0.2 0.8 0.08 0.04 0.2 0.68 0.12 0.2 0 0.68 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 22 NR2F1 Reverse Complement Original Motif Forward 3 12 0.0705128 Original Motif 0 0 0.153846 0.846154 0.0769231 0 0.923077 0 0.923077 0 0.0769231 0 0.461538 0.538462 0 0 0 1 0 0 0 0.230769 0 0.769231 0 0.153846 0 0.846154 0.0769231 0 0 0.923077 0.153846 0 0.846154 0 0.461538 0.307692 0.230769 0 0.461538 0.384615 0.0769231 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.230769 0.461538 0 0.307692 0 0.230769 0.230769 0.538462 Reverse Complement Motif 0.538462 0.230769 0.230769 0 0.230769 0 0.461538 0.307692 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.384615 0.0769231 0.461538 0 0.307692 0.230769 0.461538 0.153846 0.846154 0 0 0.923077 0 0 0.0769231 0.846154 0.153846 0 0 0.769231 0.230769 0 0 0 0 1 0 0.461538 0 0.538462 0 0 0 0.0769231 0.923077 0.0769231 0.923077 0 0 0.846154 0 0.153846 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 36 Motif Name Klf4 Original Motif 0.338561 0.0186808 0.235701 0.407057 0.0202765 0.00207373 0.976267 0.00138249 0.00322284 0.00299263 0.990792 0.00299263 0.00322061 0.00828157 0.984817 0.0036807 0.0636928 0.441941 0.00252932 0.491837 0.00506446 0.00345304 0.983656 0.00782689 0.00967073 0.0184204 0.501727 0.470182 0.0608716 0.0106064 0.8997 0.0288218 0.0283999 0.0300162 0.874856 0.0667282 0.0587419 0.660962 0.0647549 0.215541 Reserve Complement Motif 0.0587419 0.0647549 0.660962 0.215541 0.0283999 0.874856 0.0300162 0.0667282 0.0608716 0.8997 0.0106064 0.0288218 0.00967073 0.501727 0.0184204 0.470182 0.00506446 0.983656 0.00345304 0.00782689 0.491837 0.441941 0.00252932 0.0636928 0.00322061 0.984817 0.00828157 0.0036807 0.00322284 0.990792 0.00299263 0.00299263 0.0202765 0.976267 0.00207373 0.00138249 0.407057 0.0186808 0.235701 0.338561 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 36 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Original Motif Reverse Complement Forward 11 10 0.065355 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 Zfx Reverse Complement Original Motif Forward 2 10 0.0734166 Original Motif 0.105042 0.371849 0.37605 0.147059 0.125786 0.356394 0.360587 0.157233 0.190377 0.3159 0.416318 0.0774059 0.150313 0.102296 0.622129 0.125261 0.02079 0.617464 0.299376 0.0623701 0.012474 0.752599 0.004158 0.230769 0.0623701 0.259875 0.378378 0.299376 0.397089 0.320166 0.251559 0.031185 0.018711 0.004158 0.975052 0.002079 0 0.00623701 0.991684 0.002079 0.002079 0.997921 0 0 0 0.997921 0 0.002079 0 0.004158 0 0.995842 0.174636 0.253638 0.455301 0.116424 Reverse Complement Motif 0.174636 0.455301 0.253638 0.116424 0.995842 0.004158 0 0 0 0 0.997921 0.002079 0.002079 0 0.997921 0 0 0.991684 0.00623701 0.002079 0.018711 0.975052 0.004158 0.002079 0.031185 0.320166 0.251559 0.397089 0.0623701 0.378378 0.259875 0.299376 0.012474 0.004158 0.752599 0.230769 0.02079 0.299376 0.617464 0.0623701 0.150313 0.622129 0.102296 0.125261 0.190377 0.416318 0.3159 0.0774059 0.125786 0.360587 0.356394 0.157233 0.105042 0.37605 0.371849 0.147059 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 SP1 Original Motif Reverse Complement Backward 1 10 0.0773711 Original Motif 0 0.914286 0.0285714 0.0571429 0 0.857143 0.0285714 0.114286 0 1 0 0 0.114286 0.771429 0 0.114286 0.0571429 0.142857 0.428571 0.371429 0 0.8 0.0285714 0.171429 0.0285714 0.885714 0 0.0857143 0 0.685714 0.0857143 0.228571 0.171429 0.714286 0 0.114286 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.0857143 Reverse Complement Motif 0.0857143 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.171429 0 0.714286 0.114286 0 0.0857143 0.685714 0.228571 0.0285714 0 0.885714 0.0857143 0 0.0285714 0.8 0.171429 0.0571429 0.428571 0.142857 0.371429 0.114286 0 0.771429 0.114286 0 0 1 0 0 0.0285714 0.857143 0.114286 0 0.0285714 0.914286 0.0571429 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 11 Motif 11 Reverse Complement Original Motif Backward 3 10 0.0781179 Original Motif 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0.636364 0 0.363636 0.727273 0 0.272727 0 0.181818 0.818182 0 0 1 0 0 0 0 0.909091 0 0.090909 1 0 0 0 0 0.909091 0 0.090909 0.909091 0 0 0.090909 0 1 0 0 0.818182 0 0 0.181818 0 0.909091 0 0.090909 0.909091 0 0 0.090909 Reverse Complement Motif 0.090909 0 0 0.909091 0 0 0.909091 0.090909 0.181818 0 0 0.818182 0 0 1 0 0.090909 0 0 0.909091 0 0 0.909091 0.090909 0 0 0 1 0 0 0.909091 0.090909 0 0 0 1 0.181818 0 0.818182 0 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0 1 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 35 INSM1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 10 0.0785684 Original Motif 0.0416667 0 0.166667 0.791667 0 0 0.833333 0.166667 0 0.333333 0.125 0.541667 0.25 0.625 0 0.125 0.666667 0 0 0.333333 0 0 1 0 0 0.0416667 0.958333 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.0833333 0.666667 0.25 0.125 0.666667 0 0.208333 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.125 0 0.666667 0.208333 0 0.666667 0.0833333 0.25 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 1 0 0 0.333333 0 0 0.666667 0.25 0 0.625 0.125 0.541667 0.333333 0.125 0 0 0.833333 0 0.166667 0.791667 0 0.166667 0.0416667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 38 Myc Original Motif Original Motif Backward 1 10 0.0797423 Original Motif 0.295154 0.422907 0.15859 0.123348 0.14978 0.23348 0.572687 0.0440529 0.0352423 0.964758 0 0 0.955947 0.0176211 0.0220264 0.00440529 0 0.933921 0.0132159 0.0528634 0.0837004 0.00881057 0.898678 0.00881057 0.0396476 0.193833 0 0.76652 0 0.00881057 0.951542 0.0396476 0 0.0748899 0.806167 0.118943 0.198238 0.471366 0.105727 0.22467 Reverse Complement Motif 0.198238 0.105727 0.471366 0.22467 0 0.806167 0.0748899 0.118943 0 0.951542 0.00881057 0.0396476 0.76652 0.193833 0 0.0396476 0.0837004 0.898678 0.00881057 0.00881057 0 0.0132159 0.933921 0.0528634 0.00440529 0.0176211 0.0220264 0.955947 0.0352423 0 0.964758 0 0.14978 0.572687 0.23348 0.0440529 0.295154 0.15859 0.422907 0.123348 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 45 Pax5 Original Motif Original Motif Backward 3 10 0.0806175 Original Motif 0.333333 0.0833333 0.333333 0.25 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 0.25 0.25 0.166667 0.0833333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.583333 0.166667 0.0833333 0.166667 0.166667 0.416667 0.25 0.166667 0 0.25 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.666667 0.0833333 0.5 0.0833333 0.25 0.166667 0.5 0 0.166667 0.333333 0 0 1 0 0.166667 0.666667 0.0833333 0.0833333 0.25 0 0.75 0 0.0833333 0 0.333333 0.583333 0.5 0.0833333 0.416667 0 0.416667 0.0833333 0.416667 0.0833333 0.166667 0.833333 0 0 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.166667 0 0.833333 0 0.0833333 0.0833333 0.416667 0.416667 0 0.0833333 0.416667 0.5 0.583333 0 0.333333 0.0833333 0.25 0.75 0 0 0.166667 0.0833333 0.666667 0.0833333 0 1 0 0 0.333333 0 0.166667 0.5 0.166667 0.0833333 0.25 0.5 0.0833333 0.666667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.25 0.166667 0 0.166667 0.25 0.416667 0.166667 0.166667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.416667 0.166667 0.333333 0.166667 0.25 0.25 0.333333 0.333333 0.666667 0 0 0.25 0.0833333 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 40 Mycn Original Motif Original Motif Forward 1 10 0.080695 Original Motif 0.349315 0.363014 0.143836 0.143836 0.0890411 0.388128 0.447489 0.0753425 0.0159817 0.984018 0 0 0.945205 0 0.0410959 0.0136986 0 0.961187 0.0182648 0.0205479 0.0707763 0.00228311 0.924658 0.00228311 0.0547945 0.221461 0.00456621 0.719178 0 0 0.938356 0.0616438 0.0616438 0.111872 0.739726 0.086758 0.139269 0.605023 0.0913242 0.164384 Reverse Complement Motif 0.139269 0.0913242 0.605023 0.164384 0.0616438 0.739726 0.111872 0.086758 0 0.938356 0 0.0616438 0.719178 0.221461 0.00456621 0.0547945 0.0707763 0.924658 0.00228311 0.00228311 0 0.0182648 0.961187 0.0205479 0.0136986 0 0.0410959 0.945205 0.0159817 0 0.984018 0 0.0890411 0.447489 0.388128 0.0753425 0.349315 0.143836 0.363014 0.143836 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 48 Tcfcp2l1 Reverse Complement Original Motif Backward 2 10 0.0807235 Original Motif 0.00196754 0.92548 0.0627152 0.00983768 0.069973 0.807513 0.00540142 0.117113 0.594508 0.00514832 0.275803 0.12454 0.0058838 0.0237803 0.967149 0.00318706 0.175477 0.33627 0.0256975 0.462555 0.0983847 0.28928 0.0621635 0.550171 0.173924 0.39726 0.151174 0.277642 0.357213 0.224939 0.252323 0.165526 0.63154 0.0696822 0.190954 0.107824 0.394421 0.0513824 0.310497 0.2437 0.00366928 0.933219 0.0547945 0.00831703 0.0617193 0.812148 0.00293902 0.123194 0.536555 0.00736016 0.305937 0.150147 0.0120393 0.0289926 0.954791 0.0041769 Reverse Complement Motif 0.0120393 0.954791 0.0289926 0.0041769 0.150147 0.00736016 0.305937 0.536555 0.0617193 0.00293902 0.812148 0.123194 0.00366928 0.0547945 0.933219 0.00831703 0.2437 0.0513824 0.310497 0.394421 0.107824 0.0696822 0.190954 0.63154 0.165526 0.224939 0.252323 0.357213 0.173924 0.151174 0.39726 0.277642 0.550171 0.28928 0.0621635 0.0983847 0.462555 0.33627 0.0256975 0.175477 0.0058838 0.967149 0.0237803 0.00318706 0.12454 0.00514832 0.275803 0.594508 0.069973 0.00540142 0.807513 0.117113 0.00196754 0.0627152 0.92548 0.00983768 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 28 Egr1 Original Motif Original Motif Forward 1 10 0.089515 Original Motif 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0.133333 0.0666667 0.8 0 0 0.866667 0 0.133333 0 0 1 0 0 0 0.2 0.8 0.2 0 0.8 0 0.0666667 0 0.933333 0 0 0 1 0 0.133333 0.666667 0 0.2 0 0 1 0 0.0666667 0 0.466667 0.466667 Reverse Complement Motif 0.0666667 0.466667 0 0.466667 0 1 0 0 0.133333 0 0.666667 0.2 0 1 0 0 0.0666667 0.933333 0 0 0.2 0.8 0 0 0.8 0 0.2 0 0 1 0 0 0 0 0.866667 0.133333 0.133333 0.8 0.0666667 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 37 Motif Name MIZF Original Motif 0.1 0.3 0.25 0.35 0.65 0.05 0 0.3 1 0 0 0 0.1 0.85 0.05 0 0 0 0.95 0.05 0 0.05 0 0.95 0 0.95 0 0.05 0 0.9 0.1 0 0 0 0.95 0.05 0.1 0.65 0.05 0.2 Reserve Complement Motif 0.1 0.05 0.65 0.2 0 0.95 0 0.05 0 0.1 0.9 0 0 0 0.95 0.05 0.95 0.05 0 0 0 0.95 0 0.05 0.1 0.05 0.85 0 0 0 0 1 0.3 0.05 0 0.65 0.35 0.3 0.25 0.1 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 37 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 39 MYCMAX Original Motif Reverse Complement Forward 2 10 0.0390724 Original Motif 0.333333 0.047619 0.428571 0.190476 0.714286 0.047619 0.190476 0.047619 0.0952381 0.428571 0.428571 0.047619 0.047619 0.952381 0 0 1 0 0 0 0 0.952381 0 0.047619 0.047619 0 0.952381 0 0 0.047619 0 0.952381 0 0 1 0 0.047619 0.047619 0.857143 0.047619 0.142857 0.238095 0 0.619048 Reverse Complement Motif 0.619048 0.238095 0 0.142857 0.047619 0.857143 0.047619 0.047619 0 1 0 0 0.952381 0.047619 0 0 0.047619 0.952381 0 0 0 0 0.952381 0.047619 0 0 0 1 0.047619 0 0.952381 0 0.0952381 0.428571 0.428571 0.047619 0.047619 0.047619 0.190476 0.714286 0.333333 0.428571 0.047619 0.190476 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 30 ESR2 Reverse Complement Reverse Complement Forward 9 10 0.0399477 Original Motif 0.218487 0.45098 0.176471 0.154062 0.442577 0.142857 0.114846 0.29972 0.521008 0.0420168 0.431373 0.00560224 0.0756303 0 0.770308 0.154062 0.0504202 0.0560224 0.893557 0 0.0364146 0.0532213 0.092437 0.817927 0 1 0 0 0.943978 0.00280112 0 0.0532213 0.137255 0.344538 0.316527 0.201681 0.179272 0.176471 0.417367 0.226891 0.145658 0.170868 0.411765 0.271709 0.0588235 0.092437 0.0672269 0.781513 0.176471 0.070028 0.742297 0.0112045 0.498599 0.277311 0.0532213 0.170868 0.0952381 0.7507 0.00560224 0.148459 0.128852 0.809524 0 0.0616246 0.0756303 0.252101 0 0.672269 0.168067 0.263305 0.380952 0.187675 Reverse Complement Motif 0.168067 0.380952 0.263305 0.187675 0.672269 0.252101 0 0.0756303 0.128852 0 0.809524 0.0616246 0.0952381 0.00560224 0.7507 0.148459 0.170868 0.277311 0.0532213 0.498599 0.176471 0.742297 0.070028 0.0112045 0.781513 0.092437 0.0672269 0.0588235 0.145658 0.411765 0.170868 0.271709 0.179272 0.417367 0.176471 0.226891 0.137255 0.316527 0.344538 0.201681 0.0532213 0.00280112 0 0.943978 0 0 1 0 0.817927 0.0532213 0.092437 0.0364146 0.0504202 0.893557 0.0560224 0 0.0756303 0.770308 0 0.154062 0.00560224 0.0420168 0.431373 0.521008 0.29972 0.142857 0.114846 0.442577 0.218487 0.176471 0.45098 0.154062 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 29 ESR1 Original Motif Original Motif Forward 4 10 0.0408267 Original Motif 0.261242 0.256959 0.329764 0.152034 0.228632 0.17094 0.350427 0.25 0.136752 0.369658 0.318376 0.175214 0.176596 0.487234 0.138298 0.197872 0.285106 0.493617 0.1 0.121277 0.651163 0.0591966 0.188161 0.10148 0.0759494 0.0168776 0.816456 0.0907173 0.04 0.0378947 0.884211 0.0378947 0.0694737 0.0863158 0.191579 0.652632 0.00842105 0.829474 0.111579 0.0505263 0.837895 0.0273684 0.0568421 0.0778947 0.122105 0.526316 0.225263 0.126316 0.132632 0.581053 0.111579 0.174737 0.134737 0.543158 0.204211 0.117895 0.0673684 0.04 0.0168421 0.875789 0.0442105 0.0463158 0.896842 0.0126316 0.642105 0.223158 0.0652632 0.0694737 0.0210526 0.917895 0.0252632 0.0357895 0.124211 0.743158 0.00421053 0.128421 0.0547368 0.347368 0.0463158 0.551579 Reverse Complement Motif 0.551579 0.347368 0.0463158 0.0547368 0.124211 0.00421053 0.743158 0.128421 0.0210526 0.0252632 0.917895 0.0357895 0.0694737 0.223158 0.0652632 0.642105 0.0442105 0.896842 0.0463158 0.0126316 0.875789 0.04 0.0168421 0.0673684 0.134737 0.204211 0.543158 0.117895 0.132632 0.111579 0.581053 0.174737 0.122105 0.225263 0.526316 0.126316 0.0778947 0.0273684 0.0568421 0.837895 0.00842105 0.111579 0.829474 0.0505263 0.652632 0.0863158 0.191579 0.0694737 0.04 0.884211 0.0378947 0.0378947 0.0759494 0.816456 0.0168776 0.0907173 0.10148 0.0591966 0.188161 0.651163 0.285106 0.1 0.493617 0.121277 0.176596 0.138298 0.487234 0.197872 0.136752 0.318376 0.369658 0.175214 0.228632 0.350427 0.17094 0.25 0.261242 0.329764 0.256959 0.152034 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 24 Ar Original Motif Original Motif Forward 10 10 0.0432688 Original Motif 0.375 0.291667 0.0833333 0.25 0.375 0.0833333 0.125 0.416667 0.458333 0.125 0.125 0.291667 0.666667 0.0416667 0.291667 0 0 0 0.916667 0.0833333 0.5 0.25 0.0416667 0.208333 0.875 0.0833333 0 0.0416667 0 1 0 0 0.625 0 0.333333 0.0416667 0.166667 0.375 0.0833333 0.375 0.208333 0.458333 0.0833333 0.25 0.25 0.375 0.375 0 0.125 0.208333 0.0416667 0.625 0 0 1 0 0.166667 0 0 0.833333 0.458333 0.208333 0.0416667 0.291667 0.0416667 0.916667 0.0416667 0 0.125 0.666667 0.0416667 0.166667 0.25 0.291667 0.208333 0.25 0.25 0.208333 0.375 0.166667 0.416667 0.458333 0 0.125 0.208333 0.458333 0.25 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.208333 0.25 0.458333 0.0833333 0.416667 0 0.458333 0.125 0.25 0.375 0.208333 0.166667 0.25 0.208333 0.291667 0.25 0.125 0.0416667 0.666667 0.166667 0.0416667 0.0416667 0.916667 0 0.291667 0.208333 0.0416667 0.458333 0.833333 0 0 0.166667 0 1 0 0 0.625 0.208333 0.0416667 0.125 0.25 0.375 0.375 0 0.208333 0.0833333 0.458333 0.25 0.166667 0.0833333 0.375 0.375 0.0416667 0 0.333333 0.625 0 0 1 0 0.0416667 0.0833333 0 0.875 0.208333 0.25 0.0416667 0.5 0 0.916667 0 0.0833333 0 0.0416667 0.291667 0.666667 0.291667 0.125 0.125 0.458333 0.416667 0.0833333 0.125 0.375 0.25 0.291667 0.0833333 0.375 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 43 NR1H2RXRA Original Motif Original Motif Backward 1 10 0.0439771 Original Motif 0.68 0.2 0 0.12 0.68 0.04 0.2 0.08 0.8 0 0.2 0 0 0 1 0 0 0 0.96 0.04 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.96 0 0 0.04 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.8 0.04 0.08 0.08 0 0.6 0.24 0.16 Reverse Complement Motif 0 0.24 0.6 0.16 0.08 0.04 0.08 0.8 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.04 0 0 0.96 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0.96 0 0.04 0 1 0 0 0 0 0.2 0.8 0.08 0.04 0.2 0.68 0.12 0.2 0 0.68 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 REST Original Motif Reverse Complement Backward 3 10 0.0501848 Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reverse Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 45 Pax5 Reverse Complement Reverse Complement Forward 2 10 0.0576438 Original Motif 0.333333 0.0833333 0.333333 0.25 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 0.25 0.25 0.166667 0.0833333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.583333 0.166667 0.0833333 0.166667 0.166667 0.416667 0.25 0.166667 0 0.25 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.666667 0.0833333 0.5 0.0833333 0.25 0.166667 0.5 0 0.166667 0.333333 0 0 1 0 0.166667 0.666667 0.0833333 0.0833333 0.25 0 0.75 0 0.0833333 0 0.333333 0.583333 0.5 0.0833333 0.416667 0 0.416667 0.0833333 0.416667 0.0833333 0.166667 0.833333 0 0 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.166667 0 0.833333 0 0.0833333 0.0833333 0.416667 0.416667 0 0.0833333 0.416667 0.5 0.583333 0 0.333333 0.0833333 0.25 0.75 0 0 0.166667 0.0833333 0.666667 0.0833333 0 1 0 0 0.333333 0 0.166667 0.5 0.166667 0.0833333 0.25 0.5 0.0833333 0.666667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.25 0.166667 0 0.166667 0.25 0.416667 0.166667 0.166667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.416667 0.166667 0.333333 0.166667 0.25 0.25 0.333333 0.333333 0.666667 0 0 0.25 0.0833333 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 38 Myc Original Motif Reverse Complement Forward 2 9 0.535015 Original Motif 0.295154 0.422907 0.15859 0.123348 0.14978 0.23348 0.572687 0.0440529 0.0352423 0.964758 0 0 0.955947 0.0176211 0.0220264 0.00440529 0 0.933921 0.0132159 0.0528634 0.0837004 0.00881057 0.898678 0.00881057 0.0396476 0.193833 0 0.76652 0 0.00881057 0.951542 0.0396476 0 0.0748899 0.806167 0.118943 0.198238 0.471366 0.105727 0.22467 Reverse Complement Motif 0.198238 0.105727 0.471366 0.22467 0 0.806167 0.0748899 0.118943 0 0.951542 0.00881057 0.0396476 0.76652 0.193833 0 0.0396476 0.0837004 0.898678 0.00881057 0.00881057 0 0.0132159 0.933921 0.0528634 0.00440529 0.0176211 0.0220264 0.955947 0.0352423 0 0.964758 0 0.14978 0.572687 0.23348 0.0440529 0.295154 0.15859 0.422907 0.123348 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 28 Egr1 Original Motif Original Motif Backward 3 9 0.537968 Original Motif 0.2 0.266667 0.0666667 0.466667 0.133333 0.0666667 0.8 0 0 0.866667 0 0.133333 0 0 1 0 0 0 0.2 0.8 0.2 0 0.8 0 0.0666667 0 0.933333 0 0 0 1 0 0.133333 0.666667 0 0.2 0 0 1 0 0.0666667 0 0.466667 0.466667 Reverse Complement Motif 0.0666667 0.466667 0 0.466667 0 1 0 0 0.133333 0 0.666667 0.2 0 1 0 0 0.0666667 0.933333 0 0 0.2 0.8 0 0 0.8 0 0.2 0 0 1 0 0 0 0 0.866667 0.133333 0.133333 0.8 0.0666667 0 0.466667 0.266667 0.0666667 0.2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 40 Mycn Original Motif Reverse Complement Forward 2 9 0.540549 Original Motif 0.349315 0.363014 0.143836 0.143836 0.0890411 0.388128 0.447489 0.0753425 0.0159817 0.984018 0 0 0.945205 0 0.0410959 0.0136986 0 0.961187 0.0182648 0.0205479 0.0707763 0.00228311 0.924658 0.00228311 0.0547945 0.221461 0.00456621 0.719178 0 0 0.938356 0.0616438 0.0616438 0.111872 0.739726 0.086758 0.139269 0.605023 0.0913242 0.164384 Reverse Complement Motif 0.139269 0.0913242 0.605023 0.164384 0.0616438 0.739726 0.111872 0.086758 0 0.938356 0 0.0616438 0.719178 0.221461 0.00456621 0.0547945 0.0707763 0.924658 0.00228311 0.00228311 0 0.0182648 0.961187 0.0205479 0.0136986 0 0.0410959 0.945205 0.0159817 0 0.984018 0 0.0890411 0.447489 0.388128 0.0753425 0.349315 0.143836 0.363014 0.143836 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 38 Motif Name Myc Original Motif 0.295154 0.422907 0.15859 0.123348 0.14978 0.23348 0.572687 0.0440529 0.0352423 0.964758 0 0 0.955947 0.0176211 0.0220264 0.00440529 0 0.933921 0.0132159 0.0528634 0.0837004 0.00881057 0.898678 0.00881057 0.0396476 0.193833 0 0.76652 0 0.00881057 0.951542 0.0396476 0 0.0748899 0.806167 0.118943 0.198238 0.471366 0.105727 0.22467 Reserve Complement Motif 0.198238 0.105727 0.471366 0.22467 0 0.806167 0.0748899 0.118943 0 0.951542 0.00881057 0.0396476 0.76652 0.193833 0 0.0396476 0.0837004 0.898678 0.00881057 0.00881057 0 0.0132159 0.933921 0.0528634 0.00440529 0.0176211 0.0220264 0.955947 0.0352423 0 0.964758 0 0.14978 0.572687 0.23348 0.0440529 0.295154 0.15859 0.422907 0.123348 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 38 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 40 Mycn Original Motif Original Motif Forward 1 10 0 Original Motif 0.349315 0.363014 0.143836 0.143836 0.0890411 0.388128 0.447489 0.0753425 0.0159817 0.984018 0 0 0.945205 0 0.0410959 0.0136986 0 0.961187 0.0182648 0.0205479 0.0707763 0.00228311 0.924658 0.00228311 0.0547945 0.221461 0.00456621 0.719178 0 0 0.938356 0.0616438 0.0616438 0.111872 0.739726 0.086758 0.139269 0.605023 0.0913242 0.164384 Reverse Complement Motif 0.139269 0.0913242 0.605023 0.164384 0.0616438 0.739726 0.111872 0.086758 0 0.938356 0 0.0616438 0.719178 0.221461 0.00456621 0.0547945 0.0707763 0.924658 0.00228311 0.00228311 0 0.0182648 0.961187 0.0205479 0.0136986 0 0.0410959 0.945205 0.0159817 0 0.984018 0 0.0890411 0.447489 0.388128 0.0753425 0.349315 0.143836 0.363014 0.143836 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 39 MYCMAX Original Motif Original Motif Backward 1 10 0.0209359 Original Motif 0.333333 0.047619 0.428571 0.190476 0.714286 0.047619 0.190476 0.047619 0.0952381 0.428571 0.428571 0.047619 0.047619 0.952381 0 0 1 0 0 0 0 0.952381 0 0.047619 0.047619 0 0.952381 0 0 0.047619 0 0.952381 0 0 1 0 0.047619 0.047619 0.857143 0.047619 0.142857 0.238095 0 0.619048 Reverse Complement Motif 0.619048 0.238095 0 0.142857 0.047619 0.857143 0.047619 0.047619 0 1 0 0 0.952381 0.047619 0 0 0.047619 0.952381 0 0 0 0 0.952381 0.047619 0 0 0 1 0.047619 0 0.952381 0 0.0952381 0.428571 0.428571 0.047619 0.047619 0.047619 0.190476 0.714286 0.333333 0.428571 0.047619 0.190476 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 35 INSM1 Reverse Complement Reverse Complement Forward 2 10 0.0844808 Original Motif 0.0416667 0 0.166667 0.791667 0 0 0.833333 0.166667 0 0.333333 0.125 0.541667 0.25 0.625 0 0.125 0.666667 0 0 0.333333 0 0 1 0 0 0.0416667 0.958333 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.0833333 0.666667 0.25 0.125 0.666667 0 0.208333 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.125 0 0.666667 0.208333 0 0.666667 0.0833333 0.25 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 1 0 0 0.333333 0 0 0.666667 0.25 0 0.625 0.125 0.541667 0.333333 0.125 0 0 0.833333 0 0.166667 0.791667 0 0.166667 0.0416667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 36 Klf4 Original Motif Original Motif Forward 1 10 0.0883745 Original Motif 0.338561 0.0186808 0.235701 0.407057 0.0202765 0.00207373 0.976267 0.00138249 0.00322284 0.00299263 0.990792 0.00299263 0.00322061 0.00828157 0.984817 0.0036807 0.0636928 0.441941 0.00252932 0.491837 0.00506446 0.00345304 0.983656 0.00782689 0.00967073 0.0184204 0.501727 0.470182 0.0608716 0.0106064 0.8997 0.0288218 0.0283999 0.0300162 0.874856 0.0667282 0.0587419 0.660962 0.0647549 0.215541 Reverse Complement Motif 0.0587419 0.0647549 0.660962 0.215541 0.0283999 0.874856 0.0300162 0.0667282 0.0608716 0.8997 0.0106064 0.0288218 0.00967073 0.501727 0.0184204 0.470182 0.00506446 0.983656 0.00345304 0.00782689 0.491837 0.441941 0.00252932 0.0636928 0.00322061 0.984817 0.00828157 0.0036807 0.00322284 0.990792 0.00299263 0.00299263 0.0202765 0.976267 0.00207373 0.00138249 0.407057 0.0186808 0.235701 0.338561 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 Zfx Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 10 0.0925451 Original Motif 0.105042 0.371849 0.37605 0.147059 0.125786 0.356394 0.360587 0.157233 0.190377 0.3159 0.416318 0.0774059 0.150313 0.102296 0.622129 0.125261 0.02079 0.617464 0.299376 0.0623701 0.012474 0.752599 0.004158 0.230769 0.0623701 0.259875 0.378378 0.299376 0.397089 0.320166 0.251559 0.031185 0.018711 0.004158 0.975052 0.002079 0 0.00623701 0.991684 0.002079 0.002079 0.997921 0 0 0 0.997921 0 0.002079 0 0.004158 0 0.995842 0.174636 0.253638 0.455301 0.116424 Reverse Complement Motif 0.174636 0.455301 0.253638 0.116424 0.995842 0.004158 0 0 0 0 0.997921 0.002079 0.002079 0 0.997921 0 0 0.991684 0.00623701 0.002079 0.018711 0.975052 0.004158 0.002079 0.031185 0.320166 0.251559 0.397089 0.0623701 0.378378 0.259875 0.299376 0.012474 0.004158 0.752599 0.230769 0.02079 0.299376 0.617464 0.0623701 0.150313 0.622129 0.102296 0.125261 0.190377 0.416318 0.3159 0.0774059 0.125786 0.360587 0.356394 0.157233 0.105042 0.37605 0.371849 0.147059 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 PLAG1 Original Motif Reverse Complement Forward 5 10 0.0930375 Original Motif 0 0 1 0 0.166667 0 0.777778 0.0555556 0 0 1 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0.777778 0.222222 0 0 0.833333 0.0555556 0.111111 0.222222 0.555556 0.0555556 0.166667 0.666667 0 0 0.333333 0.611111 0.277778 0.111111 0 0.111111 0 0.777778 0.111111 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.888889 0.111111 0.111111 0 0.888889 0 Reverse Complement Motif 0.111111 0.888889 0 0 0 0.888889 0 0.111111 0 1 0 0 0 1 0 0 0.111111 0.777778 0 0.111111 0 0.277778 0.111111 0.611111 0.333333 0 0 0.666667 0.222222 0.0555556 0.555556 0.166667 0 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0.222222 0.777778 0 0 0.944444 0 0.0555556 0 1 0 0 0.166667 0.777778 0 0.0555556 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 13 Zfp423 Reverse Complement Reverse Complement Backward 3 10 0.0930519 Original Motif 0.212121 0.121212 0.666667 0 0 0.484848 0.515152 0 0.484848 0.515152 0 0 0.515152 0.484848 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.030303 0.515152 0 0.454545 0.727273 0 0 0.272727 0.393939 0 0.484848 0.121212 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.515152 0.484848 0 0 0.484848 0.515152 0 0.242424 0.484848 0.272727 0.333333 0.666667 0 0 Reverse Complement Motif 0.333333 0 0.666667 0 0 0.484848 0.242424 0.272727 0.515152 0 0.484848 0 0 0.515152 0 0.484848 0 1 0 0 0 1 0 0 0.393939 0.484848 0 0.121212 0.272727 0 0 0.727273 0.030303 0 0.515152 0.454545 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.484848 0 0.515152 0.484848 0 0.515152 0 0 0.515152 0.484848 0 0.212121 0.666667 0.121212 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 34 HNF4A Original Motif Reverse Complement Forward 4 10 0.0934488 Original Motif 0.41791 0.104478 0.402985 0.0746269 0.0298507 0.0298507 0.835821 0.104478 0.179104 0.0597015 0.522388 0.238806 0.0746269 0.343284 0.298507 0.283582 0.0447761 0.761194 0.0597015 0.134328 0.880597 0.0149254 0.0447761 0.0597015 0.791045 0.0298507 0.149254 0.0298507 0.835821 0.0149254 0.119403 0.0298507 0.0597015 0.0597015 0.865672 0.0149254 0.0895522 0.0298507 0.492537 0.38806 0.0447761 0.328358 0.164179 0.462687 0.0597015 0.731343 0.0746269 0.134328 0.626866 0.104478 0.149254 0.119403 Reverse Complement Motif 0.119403 0.104478 0.149254 0.626866 0.0597015 0.0746269 0.731343 0.134328 0.462687 0.328358 0.164179 0.0447761 0.0895522 0.492537 0.0298507 0.38806 0.0597015 0.865672 0.0597015 0.0149254 0.0298507 0.0149254 0.119403 0.835821 0.0298507 0.0298507 0.149254 0.791045 0.0597015 0.0149254 0.0447761 0.880597 0.0447761 0.0597015 0.761194 0.134328 0.0746269 0.298507 0.343284 0.283582 0.179104 0.522388 0.0597015 0.238806 0.0298507 0.835821 0.0298507 0.104478 0.0746269 0.104478 0.402985 0.41791 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 29 ESR1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 3 10 0.0940438 Original Motif 0.261242 0.256959 0.329764 0.152034 0.228632 0.17094 0.350427 0.25 0.136752 0.369658 0.318376 0.175214 0.176596 0.487234 0.138298 0.197872 0.285106 0.493617 0.1 0.121277 0.651163 0.0591966 0.188161 0.10148 0.0759494 0.0168776 0.816456 0.0907173 0.04 0.0378947 0.884211 0.0378947 0.0694737 0.0863158 0.191579 0.652632 0.00842105 0.829474 0.111579 0.0505263 0.837895 0.0273684 0.0568421 0.0778947 0.122105 0.526316 0.225263 0.126316 0.132632 0.581053 0.111579 0.174737 0.134737 0.543158 0.204211 0.117895 0.0673684 0.04 0.0168421 0.875789 0.0442105 0.0463158 0.896842 0.0126316 0.642105 0.223158 0.0652632 0.0694737 0.0210526 0.917895 0.0252632 0.0357895 0.124211 0.743158 0.00421053 0.128421 0.0547368 0.347368 0.0463158 0.551579 Reverse Complement Motif 0.551579 0.347368 0.0463158 0.0547368 0.124211 0.00421053 0.743158 0.128421 0.0210526 0.0252632 0.917895 0.0357895 0.0694737 0.223158 0.0652632 0.642105 0.0442105 0.896842 0.0463158 0.0126316 0.875789 0.04 0.0168421 0.0673684 0.134737 0.204211 0.543158 0.117895 0.132632 0.111579 0.581053 0.174737 0.122105 0.225263 0.526316 0.126316 0.0778947 0.0273684 0.0568421 0.837895 0.00842105 0.111579 0.829474 0.0505263 0.652632 0.0863158 0.191579 0.0694737 0.04 0.884211 0.0378947 0.0378947 0.0759494 0.816456 0.0168776 0.0907173 0.10148 0.0591966 0.188161 0.651163 0.285106 0.1 0.493617 0.121277 0.176596 0.138298 0.487234 0.197872 0.136752 0.318376 0.369658 0.175214 0.228632 0.350427 0.17094 0.25 0.261242 0.329764 0.256959 0.152034 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 24 Ar Reverse Complement Original Motif Forward 7 10 0.0966137 Original Motif 0.375 0.291667 0.0833333 0.25 0.375 0.0833333 0.125 0.416667 0.458333 0.125 0.125 0.291667 0.666667 0.0416667 0.291667 0 0 0 0.916667 0.0833333 0.5 0.25 0.0416667 0.208333 0.875 0.0833333 0 0.0416667 0 1 0 0 0.625 0 0.333333 0.0416667 0.166667 0.375 0.0833333 0.375 0.208333 0.458333 0.0833333 0.25 0.25 0.375 0.375 0 0.125 0.208333 0.0416667 0.625 0 0 1 0 0.166667 0 0 0.833333 0.458333 0.208333 0.0416667 0.291667 0.0416667 0.916667 0.0416667 0 0.125 0.666667 0.0416667 0.166667 0.25 0.291667 0.208333 0.25 0.25 0.208333 0.375 0.166667 0.416667 0.458333 0 0.125 0.208333 0.458333 0.25 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.208333 0.25 0.458333 0.0833333 0.416667 0 0.458333 0.125 0.25 0.375 0.208333 0.166667 0.25 0.208333 0.291667 0.25 0.125 0.0416667 0.666667 0.166667 0.0416667 0.0416667 0.916667 0 0.291667 0.208333 0.0416667 0.458333 0.833333 0 0 0.166667 0 1 0 0 0.625 0.208333 0.0416667 0.125 0.25 0.375 0.375 0 0.208333 0.0833333 0.458333 0.25 0.166667 0.0833333 0.375 0.375 0.0416667 0 0.333333 0.625 0 0 1 0 0.0416667 0.0833333 0 0.875 0.208333 0.25 0.0416667 0.5 0 0.916667 0 0.0833333 0 0.0416667 0.291667 0.666667 0.291667 0.125 0.125 0.458333 0.416667 0.0833333 0.125 0.375 0.25 0.291667 0.0833333 0.375 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 39 Motif Name MYCMAX Original Motif 0.333333 0.047619 0.428571 0.190476 0.714286 0.047619 0.190476 0.047619 0.0952381 0.428571 0.428571 0.047619 0.047619 0.952381 0 0 1 0 0 0 0 0.952381 0 0.047619 0.047619 0 0.952381 0 0 0.047619 0 0.952381 0 0 1 0 0.047619 0.047619 0.857143 0.047619 0.142857 0.238095 0 0.619048 Reserve Complement Motif 0.619048 0.238095 0 0.142857 0.047619 0.857143 0.047619 0.047619 0 1 0 0 0.952381 0.047619 0 0 0.047619 0.952381 0 0 0 0 0.952381 0.047619 0 0 0 1 0.047619 0 0.952381 0 0.0952381 0.428571 0.428571 0.047619 0.047619 0.047619 0.190476 0.714286 0.333333 0.428571 0.047619 0.190476 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 39 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Reverse Complement Original Motif Forward 4 11 0.0862644 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 24 Ar Original Motif Original Motif Forward 3 11 0.0877525 Original Motif 0.375 0.291667 0.0833333 0.25 0.375 0.0833333 0.125 0.416667 0.458333 0.125 0.125 0.291667 0.666667 0.0416667 0.291667 0 0 0 0.916667 0.0833333 0.5 0.25 0.0416667 0.208333 0.875 0.0833333 0 0.0416667 0 1 0 0 0.625 0 0.333333 0.0416667 0.166667 0.375 0.0833333 0.375 0.208333 0.458333 0.0833333 0.25 0.25 0.375 0.375 0 0.125 0.208333 0.0416667 0.625 0 0 1 0 0.166667 0 0 0.833333 0.458333 0.208333 0.0416667 0.291667 0.0416667 0.916667 0.0416667 0 0.125 0.666667 0.0416667 0.166667 0.25 0.291667 0.208333 0.25 0.25 0.208333 0.375 0.166667 0.416667 0.458333 0 0.125 0.208333 0.458333 0.25 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.208333 0.25 0.458333 0.0833333 0.416667 0 0.458333 0.125 0.25 0.375 0.208333 0.166667 0.25 0.208333 0.291667 0.25 0.125 0.0416667 0.666667 0.166667 0.0416667 0.0416667 0.916667 0 0.291667 0.208333 0.0416667 0.458333 0.833333 0 0 0.166667 0 1 0 0 0.625 0.208333 0.0416667 0.125 0.25 0.375 0.375 0 0.208333 0.0833333 0.458333 0.25 0.166667 0.0833333 0.375 0.375 0.0416667 0 0.333333 0.625 0 0 1 0 0.0416667 0.0833333 0 0.875 0.208333 0.25 0.0416667 0.5 0 0.916667 0 0.0833333 0 0.0416667 0.291667 0.666667 0.291667 0.125 0.125 0.458333 0.416667 0.0833333 0.125 0.375 0.25 0.291667 0.0833333 0.375 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 13 Zfp423 Reverse Complement Original Motif Forward 2 11 0.0933483 Original Motif 0.212121 0.121212 0.666667 0 0 0.484848 0.515152 0 0.484848 0.515152 0 0 0.515152 0.484848 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.030303 0.515152 0 0.454545 0.727273 0 0 0.272727 0.393939 0 0.484848 0.121212 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.515152 0.484848 0 0 0.484848 0.515152 0 0.242424 0.484848 0.272727 0.333333 0.666667 0 0 Reverse Complement Motif 0.333333 0 0.666667 0 0 0.484848 0.242424 0.272727 0.515152 0 0.484848 0 0 0.515152 0 0.484848 0 1 0 0 0 1 0 0 0.393939 0.484848 0 0.121212 0.272727 0 0 0.727273 0.030303 0 0.515152 0.454545 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.484848 0 0.515152 0.484848 0 0.515152 0 0 0.515152 0.484848 0 0.212121 0.666667 0.121212 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 PLAG1 Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 11 0.10358 Original Motif 0 0 1 0 0.166667 0 0.777778 0.0555556 0 0 1 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0.777778 0.222222 0 0 0.833333 0.0555556 0.111111 0.222222 0.555556 0.0555556 0.166667 0.666667 0 0 0.333333 0.611111 0.277778 0.111111 0 0.111111 0 0.777778 0.111111 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.888889 0.111111 0.111111 0 0.888889 0 Reverse Complement Motif 0.111111 0.888889 0 0 0 0.888889 0 0.111111 0 1 0 0 0 1 0 0 0.111111 0.777778 0 0.111111 0 0.277778 0.111111 0.611111 0.333333 0 0 0.666667 0.222222 0.0555556 0.555556 0.166667 0 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0.222222 0.777778 0 0 0.944444 0 0.0555556 0 1 0 0 0.166667 0.777778 0 0.0555556 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 35 INSM1 Original Motif Original Motif Forward 1 11 0.104527 Original Motif 0.0416667 0 0.166667 0.791667 0 0 0.833333 0.166667 0 0.333333 0.125 0.541667 0.25 0.625 0 0.125 0.666667 0 0 0.333333 0 0 1 0 0 0.0416667 0.958333 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.0833333 0.666667 0.25 0.125 0.666667 0 0.208333 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.125 0 0.666667 0.208333 0 0.666667 0.0833333 0.25 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 1 0 0 0.333333 0 0 0.666667 0.25 0 0.625 0.125 0.541667 0.333333 0.125 0 0 0.833333 0 0.166667 0.791667 0 0.166667 0.0416667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 REST Reverse Complement Reverse Complement Forward 9 11 0.105174 Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reverse Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 30 ESR2 Original Motif Original Motif Forward 4 11 0.105681 Original Motif 0.218487 0.45098 0.176471 0.154062 0.442577 0.142857 0.114846 0.29972 0.521008 0.0420168 0.431373 0.00560224 0.0756303 0 0.770308 0.154062 0.0504202 0.0560224 0.893557 0 0.0364146 0.0532213 0.092437 0.817927 0 1 0 0 0.943978 0.00280112 0 0.0532213 0.137255 0.344538 0.316527 0.201681 0.179272 0.176471 0.417367 0.226891 0.145658 0.170868 0.411765 0.271709 0.0588235 0.092437 0.0672269 0.781513 0.176471 0.070028 0.742297 0.0112045 0.498599 0.277311 0.0532213 0.170868 0.0952381 0.7507 0.00560224 0.148459 0.128852 0.809524 0 0.0616246 0.0756303 0.252101 0 0.672269 0.168067 0.263305 0.380952 0.187675 Reverse Complement Motif 0.168067 0.380952 0.263305 0.187675 0.672269 0.252101 0 0.0756303 0.128852 0 0.809524 0.0616246 0.0952381 0.00560224 0.7507 0.148459 0.170868 0.277311 0.0532213 0.498599 0.176471 0.742297 0.070028 0.0112045 0.781513 0.092437 0.0672269 0.0588235 0.145658 0.411765 0.170868 0.271709 0.179272 0.417367 0.176471 0.226891 0.137255 0.316527 0.344538 0.201681 0.0532213 0.00280112 0 0.943978 0 0 1 0 0.817927 0.0532213 0.092437 0.0364146 0.0504202 0.893557 0.0560224 0 0.0756303 0.770308 0 0.154062 0.00560224 0.0420168 0.431373 0.521008 0.29972 0.142857 0.114846 0.442577 0.218487 0.176471 0.45098 0.154062 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 29 ESR1 Reverse Complement Reverse Complement Forward 9 11 0.107782 Original Motif 0.261242 0.256959 0.329764 0.152034 0.228632 0.17094 0.350427 0.25 0.136752 0.369658 0.318376 0.175214 0.176596 0.487234 0.138298 0.197872 0.285106 0.493617 0.1 0.121277 0.651163 0.0591966 0.188161 0.10148 0.0759494 0.0168776 0.816456 0.0907173 0.04 0.0378947 0.884211 0.0378947 0.0694737 0.0863158 0.191579 0.652632 0.00842105 0.829474 0.111579 0.0505263 0.837895 0.0273684 0.0568421 0.0778947 0.122105 0.526316 0.225263 0.126316 0.132632 0.581053 0.111579 0.174737 0.134737 0.543158 0.204211 0.117895 0.0673684 0.04 0.0168421 0.875789 0.0442105 0.0463158 0.896842 0.0126316 0.642105 0.223158 0.0652632 0.0694737 0.0210526 0.917895 0.0252632 0.0357895 0.124211 0.743158 0.00421053 0.128421 0.0547368 0.347368 0.0463158 0.551579 Reverse Complement Motif 0.551579 0.347368 0.0463158 0.0547368 0.124211 0.00421053 0.743158 0.128421 0.0210526 0.0252632 0.917895 0.0357895 0.0694737 0.223158 0.0652632 0.642105 0.0442105 0.896842 0.0463158 0.0126316 0.875789 0.04 0.0168421 0.0673684 0.134737 0.204211 0.543158 0.117895 0.132632 0.111579 0.581053 0.174737 0.122105 0.225263 0.526316 0.126316 0.0778947 0.0273684 0.0568421 0.837895 0.00842105 0.111579 0.829474 0.0505263 0.652632 0.0863158 0.191579 0.0694737 0.04 0.884211 0.0378947 0.0378947 0.0759494 0.816456 0.0168776 0.0907173 0.10148 0.0591966 0.188161 0.651163 0.285106 0.1 0.493617 0.121277 0.176596 0.138298 0.487234 0.197872 0.136752 0.318376 0.369658 0.175214 0.228632 0.350427 0.17094 0.25 0.261242 0.329764 0.256959 0.152034 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 47 RXRRAR_DR5 Reverse Complement Reverse Complement Forward 3 11 0.108615 Original Motif 0.521739 0 0.478261 0 0 0 1 0 0.0434783 0 0.565217 0.391304 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.782609 0.130435 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.173913 0.304348 0.217391 0.304348 0.217391 0.347826 0.391304 0.0434783 0.217391 0.173913 0.478261 0.130435 0.565217 0.0434783 0.304348 0.0869565 0.217391 0.26087 0.521739 0 0.73913 0.130435 0.130435 0 0.0434783 0.0434783 0.869565 0.0434783 0 0.0434783 0.695652 0.26087 0.0869565 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0434783 0.73913 0.130435 0.0869565 0.913043 0 0.0434783 0.0434783 Reverse Complement Motif 0.0434783 0 0.0434783 0.913043 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0869565 0.73913 0.0434783 0.130435 0.0869565 0 0.695652 0.0434783 0.26087 0.0434783 0.869565 0.0434783 0.0434783 0 0.130435 0.130435 0.73913 0.217391 0.521739 0.26087 0 0.0869565 0.0434783 0.304348 0.565217 0.217391 0.478261 0.173913 0.130435 0.217391 0.391304 0.347826 0.0434783 0.173913 0.217391 0.304348 0.304348 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.130435 0.782609 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.0434783 0.565217 0 0.391304 0 1 0 0 0 0 0.478261 0.521739 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 Zfx Original Motif Original Motif Forward 1 11 0.110189 Original Motif 0.105042 0.371849 0.37605 0.147059 0.125786 0.356394 0.360587 0.157233 0.190377 0.3159 0.416318 0.0774059 0.150313 0.102296 0.622129 0.125261 0.02079 0.617464 0.299376 0.0623701 0.012474 0.752599 0.004158 0.230769 0.0623701 0.259875 0.378378 0.299376 0.397089 0.320166 0.251559 0.031185 0.018711 0.004158 0.975052 0.002079 0 0.00623701 0.991684 0.002079 0.002079 0.997921 0 0 0 0.997921 0 0.002079 0 0.004158 0 0.995842 0.174636 0.253638 0.455301 0.116424 Reverse Complement Motif 0.174636 0.455301 0.253638 0.116424 0.995842 0.004158 0 0 0 0 0.997921 0.002079 0.002079 0 0.997921 0 0 0.991684 0.00623701 0.002079 0.018711 0.975052 0.004158 0.002079 0.031185 0.320166 0.251559 0.397089 0.0623701 0.378378 0.259875 0.299376 0.012474 0.004158 0.752599 0.230769 0.02079 0.299376 0.617464 0.0623701 0.150313 0.622129 0.102296 0.125261 0.190377 0.416318 0.3159 0.0774059 0.125786 0.360587 0.356394 0.157233 0.105042 0.37605 0.371849 0.147059 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 40 Motif Name Mycn Original Motif 0.349315 0.363014 0.143836 0.143836 0.0890411 0.388128 0.447489 0.0753425 0.0159817 0.984018 0 0 0.945205 0 0.0410959 0.0136986 0 0.961187 0.0182648 0.0205479 0.0707763 0.00228311 0.924658 0.00228311 0.0547945 0.221461 0.00456621 0.719178 0 0 0.938356 0.0616438 0.0616438 0.111872 0.739726 0.086758 0.139269 0.605023 0.0913242 0.164384 Reserve Complement Motif 0.139269 0.0913242 0.605023 0.164384 0.0616438 0.739726 0.111872 0.086758 0 0.938356 0 0.0616438 0.719178 0.221461 0.00456621 0.0547945 0.0707763 0.924658 0.00228311 0.00228311 0 0.0182648 0.961187 0.0205479 0.0136986 0 0.0410959 0.945205 0.0159817 0 0.984018 0 0.0890411 0.447489 0.388128 0.0753425 0.349315 0.143836 0.363014 0.143836 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 40 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 38 Myc Original Motif Original Motif Backward 1 10 0 Original Motif 0.295154 0.422907 0.15859 0.123348 0.14978 0.23348 0.572687 0.0440529 0.0352423 0.964758 0 0 0.955947 0.0176211 0.0220264 0.00440529 0 0.933921 0.0132159 0.0528634 0.0837004 0.00881057 0.898678 0.00881057 0.0396476 0.193833 0 0.76652 0 0.00881057 0.951542 0.0396476 0 0.0748899 0.806167 0.118943 0.198238 0.471366 0.105727 0.22467 Reverse Complement Motif 0.198238 0.105727 0.471366 0.22467 0 0.806167 0.0748899 0.118943 0 0.951542 0.00881057 0.0396476 0.76652 0.193833 0 0.0396476 0.0837004 0.898678 0.00881057 0.00881057 0 0.0132159 0.933921 0.0528634 0.00440529 0.0176211 0.0220264 0.955947 0.0352423 0 0.964758 0 0.14978 0.572687 0.23348 0.0440529 0.295154 0.15859 0.422907 0.123348 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 39 MYCMAX Original Motif Original Motif Backward 1 10 0.0200467 Original Motif 0.333333 0.047619 0.428571 0.190476 0.714286 0.047619 0.190476 0.047619 0.0952381 0.428571 0.428571 0.047619 0.047619 0.952381 0 0 1 0 0 0 0 0.952381 0 0.047619 0.047619 0 0.952381 0 0 0.047619 0 0.952381 0 0 1 0 0.047619 0.047619 0.857143 0.047619 0.142857 0.238095 0 0.619048 Reverse Complement Motif 0.619048 0.238095 0 0.142857 0.047619 0.857143 0.047619 0.047619 0 1 0 0 0.952381 0.047619 0 0 0.047619 0.952381 0 0 0 0 0.952381 0.047619 0 0 0 1 0.047619 0 0.952381 0 0.0952381 0.428571 0.428571 0.047619 0.047619 0.047619 0.190476 0.714286 0.333333 0.428571 0.047619 0.190476 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 35 INSM1 Reverse Complement Reverse Complement Forward 2 10 0.0834824 Original Motif 0.0416667 0 0.166667 0.791667 0 0 0.833333 0.166667 0 0.333333 0.125 0.541667 0.25 0.625 0 0.125 0.666667 0 0 0.333333 0 0 1 0 0 0.0416667 0.958333 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.0833333 0.666667 0.25 0.125 0.666667 0 0.208333 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.125 0 0.666667 0.208333 0 0.666667 0.0833333 0.25 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 1 0 0 0.333333 0 0 0.666667 0.25 0 0.625 0.125 0.541667 0.333333 0.125 0 0 0.833333 0 0.166667 0.791667 0 0.166667 0.0416667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 36 Klf4 Original Motif Original Motif Backward 1 10 0.0893272 Original Motif 0.338561 0.0186808 0.235701 0.407057 0.0202765 0.00207373 0.976267 0.00138249 0.00322284 0.00299263 0.990792 0.00299263 0.00322061 0.00828157 0.984817 0.0036807 0.0636928 0.441941 0.00252932 0.491837 0.00506446 0.00345304 0.983656 0.00782689 0.00967073 0.0184204 0.501727 0.470182 0.0608716 0.0106064 0.8997 0.0288218 0.0283999 0.0300162 0.874856 0.0667282 0.0587419 0.660962 0.0647549 0.215541 Reverse Complement Motif 0.0587419 0.0647549 0.660962 0.215541 0.0283999 0.874856 0.0300162 0.0667282 0.0608716 0.8997 0.0106064 0.0288218 0.00967073 0.501727 0.0184204 0.470182 0.00506446 0.983656 0.00345304 0.00782689 0.491837 0.441941 0.00252932 0.0636928 0.00322061 0.984817 0.00828157 0.0036807 0.00322284 0.990792 0.00299263 0.00299263 0.0202765 0.976267 0.00207373 0.00138249 0.407057 0.0186808 0.235701 0.338561 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 29 ESR1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 3 10 0.089863 Original Motif 0.261242 0.256959 0.329764 0.152034 0.228632 0.17094 0.350427 0.25 0.136752 0.369658 0.318376 0.175214 0.176596 0.487234 0.138298 0.197872 0.285106 0.493617 0.1 0.121277 0.651163 0.0591966 0.188161 0.10148 0.0759494 0.0168776 0.816456 0.0907173 0.04 0.0378947 0.884211 0.0378947 0.0694737 0.0863158 0.191579 0.652632 0.00842105 0.829474 0.111579 0.0505263 0.837895 0.0273684 0.0568421 0.0778947 0.122105 0.526316 0.225263 0.126316 0.132632 0.581053 0.111579 0.174737 0.134737 0.543158 0.204211 0.117895 0.0673684 0.04 0.0168421 0.875789 0.0442105 0.0463158 0.896842 0.0126316 0.642105 0.223158 0.0652632 0.0694737 0.0210526 0.917895 0.0252632 0.0357895 0.124211 0.743158 0.00421053 0.128421 0.0547368 0.347368 0.0463158 0.551579 Reverse Complement Motif 0.551579 0.347368 0.0463158 0.0547368 0.124211 0.00421053 0.743158 0.128421 0.0210526 0.0252632 0.917895 0.0357895 0.0694737 0.223158 0.0652632 0.642105 0.0442105 0.896842 0.0463158 0.0126316 0.875789 0.04 0.0168421 0.0673684 0.134737 0.204211 0.543158 0.117895 0.132632 0.111579 0.581053 0.174737 0.122105 0.225263 0.526316 0.126316 0.0778947 0.0273684 0.0568421 0.837895 0.00842105 0.111579 0.829474 0.0505263 0.652632 0.0863158 0.191579 0.0694737 0.04 0.884211 0.0378947 0.0378947 0.0759494 0.816456 0.0168776 0.0907173 0.10148 0.0591966 0.188161 0.651163 0.285106 0.1 0.493617 0.121277 0.176596 0.138298 0.487234 0.197872 0.136752 0.318376 0.369658 0.175214 0.228632 0.350427 0.17094 0.25 0.261242 0.329764 0.256959 0.152034 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 Zfx Reverse Complement Reverse Complement Forward 4 10 0.0899944 Original Motif 0.105042 0.371849 0.37605 0.147059 0.125786 0.356394 0.360587 0.157233 0.190377 0.3159 0.416318 0.0774059 0.150313 0.102296 0.622129 0.125261 0.02079 0.617464 0.299376 0.0623701 0.012474 0.752599 0.004158 0.230769 0.0623701 0.259875 0.378378 0.299376 0.397089 0.320166 0.251559 0.031185 0.018711 0.004158 0.975052 0.002079 0 0.00623701 0.991684 0.002079 0.002079 0.997921 0 0 0 0.997921 0 0.002079 0 0.004158 0 0.995842 0.174636 0.253638 0.455301 0.116424 Reverse Complement Motif 0.174636 0.455301 0.253638 0.116424 0.995842 0.004158 0 0 0 0 0.997921 0.002079 0.002079 0 0.997921 0 0 0.991684 0.00623701 0.002079 0.018711 0.975052 0.004158 0.002079 0.031185 0.320166 0.251559 0.397089 0.0623701 0.378378 0.259875 0.299376 0.012474 0.004158 0.752599 0.230769 0.02079 0.299376 0.617464 0.0623701 0.150313 0.622129 0.102296 0.125261 0.190377 0.416318 0.3159 0.0774059 0.125786 0.360587 0.356394 0.157233 0.105042 0.37605 0.371849 0.147059 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 PLAG1 Original Motif Reverse Complement Backward 1 10 0.0921439 Original Motif 0 0 1 0 0.166667 0 0.777778 0.0555556 0 0 1 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0.777778 0.222222 0 0 0.833333 0.0555556 0.111111 0.222222 0.555556 0.0555556 0.166667 0.666667 0 0 0.333333 0.611111 0.277778 0.111111 0 0.111111 0 0.777778 0.111111 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.888889 0.111111 0.111111 0 0.888889 0 Reverse Complement Motif 0.111111 0.888889 0 0 0 0.888889 0 0.111111 0 1 0 0 0 1 0 0 0.111111 0.777778 0 0.111111 0 0.277778 0.111111 0.611111 0.333333 0 0 0.666667 0.222222 0.0555556 0.555556 0.166667 0 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0.222222 0.777778 0 0 0.944444 0 0.0555556 0 1 0 0 0.166667 0.777778 0 0.0555556 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 34 HNF4A Reverse Complement Reverse Complement Forward 2 10 0.0947124 Original Motif 0.41791 0.104478 0.402985 0.0746269 0.0298507 0.0298507 0.835821 0.104478 0.179104 0.0597015 0.522388 0.238806 0.0746269 0.343284 0.298507 0.283582 0.0447761 0.761194 0.0597015 0.134328 0.880597 0.0149254 0.0447761 0.0597015 0.791045 0.0298507 0.149254 0.0298507 0.835821 0.0149254 0.119403 0.0298507 0.0597015 0.0597015 0.865672 0.0149254 0.0895522 0.0298507 0.492537 0.38806 0.0447761 0.328358 0.164179 0.462687 0.0597015 0.731343 0.0746269 0.134328 0.626866 0.104478 0.149254 0.119403 Reverse Complement Motif 0.119403 0.104478 0.149254 0.626866 0.0597015 0.0746269 0.731343 0.134328 0.462687 0.328358 0.164179 0.0447761 0.0895522 0.492537 0.0298507 0.38806 0.0597015 0.865672 0.0597015 0.0149254 0.0298507 0.0149254 0.119403 0.835821 0.0298507 0.0298507 0.149254 0.791045 0.0597015 0.0149254 0.0447761 0.880597 0.0447761 0.0597015 0.761194 0.134328 0.0746269 0.298507 0.343284 0.283582 0.179104 0.522388 0.0597015 0.238806 0.0298507 0.835821 0.0298507 0.104478 0.0746269 0.104478 0.402985 0.41791 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 PPARGRXRA Reverse Complement Reverse Complement Forward 2 10 0.0954444 Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reverse Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 30 ESR2 Original Motif Original Motif Forward 5 10 0.0964708 Original Motif 0.218487 0.45098 0.176471 0.154062 0.442577 0.142857 0.114846 0.29972 0.521008 0.0420168 0.431373 0.00560224 0.0756303 0 0.770308 0.154062 0.0504202 0.0560224 0.893557 0 0.0364146 0.0532213 0.092437 0.817927 0 1 0 0 0.943978 0.00280112 0 0.0532213 0.137255 0.344538 0.316527 0.201681 0.179272 0.176471 0.417367 0.226891 0.145658 0.170868 0.411765 0.271709 0.0588235 0.092437 0.0672269 0.781513 0.176471 0.070028 0.742297 0.0112045 0.498599 0.277311 0.0532213 0.170868 0.0952381 0.7507 0.00560224 0.148459 0.128852 0.809524 0 0.0616246 0.0756303 0.252101 0 0.672269 0.168067 0.263305 0.380952 0.187675 Reverse Complement Motif 0.168067 0.380952 0.263305 0.187675 0.672269 0.252101 0 0.0756303 0.128852 0 0.809524 0.0616246 0.0952381 0.00560224 0.7507 0.148459 0.170868 0.277311 0.0532213 0.498599 0.176471 0.742297 0.070028 0.0112045 0.781513 0.092437 0.0672269 0.0588235 0.145658 0.411765 0.170868 0.271709 0.179272 0.417367 0.176471 0.226891 0.137255 0.316527 0.344538 0.201681 0.0532213 0.00280112 0 0.943978 0 0 1 0 0.817927 0.0532213 0.092437 0.0364146 0.0504202 0.893557 0.0560224 0 0.0756303 0.770308 0 0.154062 0.00560224 0.0420168 0.431373 0.521008 0.29972 0.142857 0.114846 0.442577 0.218487 0.176471 0.45098 0.154062 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 41 Motif Name MZF1_5-13 Original Motif 0.0625 0.25 0.4375 0.25 0.125 0 0.4375 0.4375 0.9375 0.0625 0 0 0 0 0.6875 0.3125 0 0 0.9375 0.0625 0 0.125 0.875 0 0 0 0.875 0.125 0.1875 0.0625 0.5 0.25 0.625 0 0.25 0.125 0.5 0.125 0.25 0.125 Reserve Complement Motif 0.125 0.125 0.25 0.5 0.125 0 0.25 0.625 0.1875 0.5 0.0625 0.25 0 0.875 0 0.125 0 0.875 0.125 0 0 0.9375 0 0.0625 0 0.6875 0 0.3125 0 0.0625 0 0.9375 0.125 0.4375 0 0.4375 0.0625 0.4375 0.25 0.25 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 41 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 35 INSM1 Original Motif Original Motif Backward 1 10 0.0360532 Original Motif 0.0416667 0 0.166667 0.791667 0 0 0.833333 0.166667 0 0.333333 0.125 0.541667 0.25 0.625 0 0.125 0.666667 0 0 0.333333 0 0 1 0 0 0.0416667 0.958333 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.0833333 0.666667 0.25 0.125 0.666667 0 0.208333 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.125 0 0.666667 0.208333 0 0.666667 0.0833333 0.25 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.958333 0.0416667 0 0 1 0 0 0.333333 0 0 0.666667 0.25 0 0.625 0.125 0.541667 0.333333 0.125 0 0 0.833333 0 0.166667 0.791667 0 0.166667 0.0416667 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 45 Pax5 Original Motif Original Motif Backward 4 10 0.0428241 Original Motif 0.333333 0.0833333 0.333333 0.25 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 0.25 0.25 0.166667 0.0833333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.583333 0.166667 0.0833333 0.166667 0.166667 0.416667 0.25 0.166667 0 0.25 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.666667 0.0833333 0.5 0.0833333 0.25 0.166667 0.5 0 0.166667 0.333333 0 0 1 0 0.166667 0.666667 0.0833333 0.0833333 0.25 0 0.75 0 0.0833333 0 0.333333 0.583333 0.5 0.0833333 0.416667 0 0.416667 0.0833333 0.416667 0.0833333 0.166667 0.833333 0 0 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.166667 0 0.833333 0 0.0833333 0.0833333 0.416667 0.416667 0 0.0833333 0.416667 0.5 0.583333 0 0.333333 0.0833333 0.25 0.75 0 0 0.166667 0.0833333 0.666667 0.0833333 0 1 0 0 0.333333 0 0.166667 0.5 0.166667 0.0833333 0.25 0.5 0.0833333 0.666667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.25 0.166667 0 0.166667 0.25 0.416667 0.166667 0.166667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.416667 0.166667 0.333333 0.166667 0.25 0.25 0.333333 0.333333 0.666667 0 0 0.25 0.0833333 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 PPARGRXRA Original Motif Original Motif Forward 1 10 0.0470779 Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reverse Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 13 Zfp423 Original Motif Original Motif Backward 1 10 0.0524832 Original Motif 0.212121 0.121212 0.666667 0 0 0.484848 0.515152 0 0.484848 0.515152 0 0 0.515152 0.484848 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.030303 0.515152 0 0.454545 0.727273 0 0 0.272727 0.393939 0 0.484848 0.121212 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.515152 0.484848 0 0 0.484848 0.515152 0 0.242424 0.484848 0.272727 0.333333 0.666667 0 0 Reverse Complement Motif 0.333333 0 0.666667 0 0 0.484848 0.242424 0.272727 0.515152 0 0.484848 0 0 0.515152 0 0.484848 0 1 0 0 0 1 0 0 0.393939 0.484848 0 0.121212 0.272727 0 0 0.727273 0.030303 0 0.515152 0.454545 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.484848 0 0.515152 0.484848 0 0.515152 0 0 0.515152 0.484848 0 0.212121 0.666667 0.121212 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Reverse Complement Original Motif Forward 2 10 0.0548506 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 34 HNF4A Reverse Complement Reverse Complement Backward 4 10 0.0568244 Original Motif 0.41791 0.104478 0.402985 0.0746269 0.0298507 0.0298507 0.835821 0.104478 0.179104 0.0597015 0.522388 0.238806 0.0746269 0.343284 0.298507 0.283582 0.0447761 0.761194 0.0597015 0.134328 0.880597 0.0149254 0.0447761 0.0597015 0.791045 0.0298507 0.149254 0.0298507 0.835821 0.0149254 0.119403 0.0298507 0.0597015 0.0597015 0.865672 0.0149254 0.0895522 0.0298507 0.492537 0.38806 0.0447761 0.328358 0.164179 0.462687 0.0597015 0.731343 0.0746269 0.134328 0.626866 0.104478 0.149254 0.119403 Reverse Complement Motif 0.119403 0.104478 0.149254 0.626866 0.0597015 0.0746269 0.731343 0.134328 0.462687 0.328358 0.164179 0.0447761 0.0895522 0.492537 0.0298507 0.38806 0.0597015 0.865672 0.0597015 0.0149254 0.0298507 0.0149254 0.119403 0.835821 0.0298507 0.0298507 0.149254 0.791045 0.0597015 0.0149254 0.0447761 0.880597 0.0447761 0.0597015 0.761194 0.134328 0.0746269 0.298507 0.343284 0.283582 0.179104 0.522388 0.0597015 0.238806 0.0298507 0.835821 0.0298507 0.104478 0.0746269 0.104478 0.402985 0.41791 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 47 RXRRAR_DR5 Reverse Complement Reverse Complement Backward 8 10 0.0581547 Original Motif 0.521739 0 0.478261 0 0 0 1 0 0.0434783 0 0.565217 0.391304 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.782609 0.130435 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.173913 0.304348 0.217391 0.304348 0.217391 0.347826 0.391304 0.0434783 0.217391 0.173913 0.478261 0.130435 0.565217 0.0434783 0.304348 0.0869565 0.217391 0.26087 0.521739 0 0.73913 0.130435 0.130435 0 0.0434783 0.0434783 0.869565 0.0434783 0 0.0434783 0.695652 0.26087 0.0869565 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0434783 0.73913 0.130435 0.0869565 0.913043 0 0.0434783 0.0434783 Reverse Complement Motif 0.0434783 0 0.0434783 0.913043 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0869565 0.73913 0.0434783 0.130435 0.0869565 0 0.695652 0.0434783 0.26087 0.0434783 0.869565 0.0434783 0.0434783 0 0.130435 0.130435 0.73913 0.217391 0.521739 0.26087 0 0.0869565 0.0434783 0.304348 0.565217 0.217391 0.478261 0.173913 0.130435 0.217391 0.391304 0.347826 0.0434783 0.173913 0.217391 0.304348 0.304348 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.130435 0.782609 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.0434783 0.565217 0 0.391304 0 1 0 0 0 0 0.478261 0.521739 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 24 Ar Original Motif Reverse Complement Forward 13 10 0.0610532 Original Motif 0.375 0.291667 0.0833333 0.25 0.375 0.0833333 0.125 0.416667 0.458333 0.125 0.125 0.291667 0.666667 0.0416667 0.291667 0 0 0 0.916667 0.0833333 0.5 0.25 0.0416667 0.208333 0.875 0.0833333 0 0.0416667 0 1 0 0 0.625 0 0.333333 0.0416667 0.166667 0.375 0.0833333 0.375 0.208333 0.458333 0.0833333 0.25 0.25 0.375 0.375 0 0.125 0.208333 0.0416667 0.625 0 0 1 0 0.166667 0 0 0.833333 0.458333 0.208333 0.0416667 0.291667 0.0416667 0.916667 0.0416667 0 0.125 0.666667 0.0416667 0.166667 0.25 0.291667 0.208333 0.25 0.25 0.208333 0.375 0.166667 0.416667 0.458333 0 0.125 0.208333 0.458333 0.25 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.208333 0.25 0.458333 0.0833333 0.416667 0 0.458333 0.125 0.25 0.375 0.208333 0.166667 0.25 0.208333 0.291667 0.25 0.125 0.0416667 0.666667 0.166667 0.0416667 0.0416667 0.916667 0 0.291667 0.208333 0.0416667 0.458333 0.833333 0 0 0.166667 0 1 0 0 0.625 0.208333 0.0416667 0.125 0.25 0.375 0.375 0 0.208333 0.0833333 0.458333 0.25 0.166667 0.0833333 0.375 0.375 0.0416667 0 0.333333 0.625 0 0 1 0 0.0416667 0.0833333 0 0.875 0.208333 0.25 0.0416667 0.5 0 0.916667 0 0.0833333 0 0.0416667 0.291667 0.666667 0.291667 0.125 0.125 0.458333 0.416667 0.0833333 0.125 0.375 0.25 0.291667 0.0833333 0.375 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 29 ESR1 Original Motif Original Motif Backward 9 10 0.0642057 Original Motif 0.261242 0.256959 0.329764 0.152034 0.228632 0.17094 0.350427 0.25 0.136752 0.369658 0.318376 0.175214 0.176596 0.487234 0.138298 0.197872 0.285106 0.493617 0.1 0.121277 0.651163 0.0591966 0.188161 0.10148 0.0759494 0.0168776 0.816456 0.0907173 0.04 0.0378947 0.884211 0.0378947 0.0694737 0.0863158 0.191579 0.652632 0.00842105 0.829474 0.111579 0.0505263 0.837895 0.0273684 0.0568421 0.0778947 0.122105 0.526316 0.225263 0.126316 0.132632 0.581053 0.111579 0.174737 0.134737 0.543158 0.204211 0.117895 0.0673684 0.04 0.0168421 0.875789 0.0442105 0.0463158 0.896842 0.0126316 0.642105 0.223158 0.0652632 0.0694737 0.0210526 0.917895 0.0252632 0.0357895 0.124211 0.743158 0.00421053 0.128421 0.0547368 0.347368 0.0463158 0.551579 Reverse Complement Motif 0.551579 0.347368 0.0463158 0.0547368 0.124211 0.00421053 0.743158 0.128421 0.0210526 0.0252632 0.917895 0.0357895 0.0694737 0.223158 0.0652632 0.642105 0.0442105 0.896842 0.0463158 0.0126316 0.875789 0.04 0.0168421 0.0673684 0.134737 0.204211 0.543158 0.117895 0.132632 0.111579 0.581053 0.174737 0.122105 0.225263 0.526316 0.126316 0.0778947 0.0273684 0.0568421 0.837895 0.00842105 0.111579 0.829474 0.0505263 0.652632 0.0863158 0.191579 0.0694737 0.04 0.884211 0.0378947 0.0378947 0.0759494 0.816456 0.0168776 0.0907173 0.10148 0.0591966 0.188161 0.651163 0.285106 0.1 0.493617 0.121277 0.176596 0.138298 0.487234 0.197872 0.136752 0.318376 0.369658 0.175214 0.228632 0.350427 0.17094 0.25 0.261242 0.329764 0.256959 0.152034 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 SP1 Reverse Complement Original Motif Backward 1 10 0.0692824 Original Motif 0 0.914286 0.0285714 0.0571429 0 0.857143 0.0285714 0.114286 0 1 0 0 0.114286 0.771429 0 0.114286 0.0571429 0.142857 0.428571 0.371429 0 0.8 0.0285714 0.171429 0.0285714 0.885714 0 0.0857143 0 0.685714 0.0857143 0.228571 0.171429 0.714286 0 0.114286 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.0857143 Reverse Complement Motif 0.0857143 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.171429 0 0.714286 0.114286 0 0.0857143 0.685714 0.228571 0.0285714 0 0.885714 0.0857143 0 0.0285714 0.8 0.171429 0.0571429 0.428571 0.142857 0.371429 0.114286 0 0.771429 0.114286 0 0 1 0 0 0.0285714 0.857143 0.114286 0 0.0285714 0.914286 0.0571429 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 42 Motif Name NFKB1 Original Motif 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0.111111 0 0.888889 0 0.611111 0.0555556 0.333333 0 0.277778 0 0.111111 0.611111 0 0.277778 0.111111 0.611111 0 0.722222 0 0.277778 0 0.944444 0 0.0555556 0 1 0 0 0.0555556 0.833333 0.0555556 0.0555556 Reserve Complement Motif 0.0555556 0.0555556 0.833333 0.0555556 0 0 1 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0 0.722222 0.277778 0.611111 0.277778 0.111111 0 0.611111 0 0.111111 0.277778 0 0.0555556 0.333333 0.611111 0.111111 0.888889 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 42 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 48 Tcfcp2l1 Original Motif Reverse Complement Backward 4 11 0.103405 Original Motif 0.00196754 0.92548 0.0627152 0.00983768 0.069973 0.807513 0.00540142 0.117113 0.594508 0.00514832 0.275803 0.12454 0.0058838 0.0237803 0.967149 0.00318706 0.175477 0.33627 0.0256975 0.462555 0.0983847 0.28928 0.0621635 0.550171 0.173924 0.39726 0.151174 0.277642 0.357213 0.224939 0.252323 0.165526 0.63154 0.0696822 0.190954 0.107824 0.394421 0.0513824 0.310497 0.2437 0.00366928 0.933219 0.0547945 0.00831703 0.0617193 0.812148 0.00293902 0.123194 0.536555 0.00736016 0.305937 0.150147 0.0120393 0.0289926 0.954791 0.0041769 Reverse Complement Motif 0.0120393 0.954791 0.0289926 0.0041769 0.150147 0.00736016 0.305937 0.536555 0.0617193 0.00293902 0.812148 0.123194 0.00366928 0.0547945 0.933219 0.00831703 0.2437 0.0513824 0.310497 0.394421 0.107824 0.0696822 0.190954 0.63154 0.165526 0.224939 0.252323 0.357213 0.173924 0.151174 0.39726 0.277642 0.550171 0.28928 0.0621635 0.0983847 0.462555 0.33627 0.0256975 0.175477 0.0058838 0.967149 0.0237803 0.00318706 0.12454 0.00514832 0.275803 0.594508 0.069973 0.00540142 0.807513 0.117113 0.00196754 0.0627152 0.92548 0.00983768 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 REST Reverse Complement Original Motif Forward 1 11 0.112926 Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reverse Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 45 Pax5 Reverse Complement Reverse Complement Backward 9 11 0.116162 Original Motif 0.333333 0.0833333 0.333333 0.25 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 0.25 0.25 0.166667 0.0833333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.583333 0.166667 0.0833333 0.166667 0.166667 0.416667 0.25 0.166667 0 0.25 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.666667 0.0833333 0.5 0.0833333 0.25 0.166667 0.5 0 0.166667 0.333333 0 0 1 0 0.166667 0.666667 0.0833333 0.0833333 0.25 0 0.75 0 0.0833333 0 0.333333 0.583333 0.5 0.0833333 0.416667 0 0.416667 0.0833333 0.416667 0.0833333 0.166667 0.833333 0 0 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.166667 0 0.833333 0 0.0833333 0.0833333 0.416667 0.416667 0 0.0833333 0.416667 0.5 0.583333 0 0.333333 0.0833333 0.25 0.75 0 0 0.166667 0.0833333 0.666667 0.0833333 0 1 0 0 0.333333 0 0.166667 0.5 0.166667 0.0833333 0.25 0.5 0.0833333 0.666667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.25 0.166667 0 0.166667 0.25 0.416667 0.166667 0.166667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.416667 0.166667 0.333333 0.166667 0.25 0.25 0.333333 0.333333 0.666667 0 0 0.25 0.0833333 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Reverse Complement Original Motif Backward 5 11 0.117826 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 36 Klf4 Original Motif Reverse Complement Forward 1 10 0.616368 Original Motif 0.338561 0.0186808 0.235701 0.407057 0.0202765 0.00207373 0.976267 0.00138249 0.00322284 0.00299263 0.990792 0.00299263 0.00322061 0.00828157 0.984817 0.0036807 0.0636928 0.441941 0.00252932 0.491837 0.00506446 0.00345304 0.983656 0.00782689 0.00967073 0.0184204 0.501727 0.470182 0.0608716 0.0106064 0.8997 0.0288218 0.0283999 0.0300162 0.874856 0.0667282 0.0587419 0.660962 0.0647549 0.215541 Reverse Complement Motif 0.0587419 0.0647549 0.660962 0.215541 0.0283999 0.874856 0.0300162 0.0667282 0.0608716 0.8997 0.0106064 0.0288218 0.00967073 0.501727 0.0184204 0.470182 0.00506446 0.983656 0.00345304 0.00782689 0.491837 0.441941 0.00252932 0.0636928 0.00322061 0.984817 0.00828157 0.0036807 0.00322284 0.990792 0.00299263 0.00299263 0.0202765 0.976267 0.00207373 0.00138249 0.407057 0.0186808 0.235701 0.338561 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 PLAG1 Original Motif Original Motif Backward 6 9 1.11497 Original Motif 0 0 1 0 0.166667 0 0.777778 0.0555556 0 0 1 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0.777778 0.222222 0 0 0.833333 0.0555556 0.111111 0.222222 0.555556 0.0555556 0.166667 0.666667 0 0 0.333333 0.611111 0.277778 0.111111 0 0.111111 0 0.777778 0.111111 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.888889 0.111111 0.111111 0 0.888889 0 Reverse Complement Motif 0.111111 0.888889 0 0 0 0.888889 0 0.111111 0 1 0 0 0 1 0 0 0.111111 0.777778 0 0.111111 0 0.277778 0.111111 0.611111 0.333333 0 0 0.666667 0.222222 0.0555556 0.555556 0.166667 0 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0.222222 0.777778 0 0 0.944444 0 0.0555556 0 1 0 0 0.166667 0.777778 0 0.0555556 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 16 SP1 Original Motif Reverse Complement Backward 2 9 1.11585 Original Motif 0 0.914286 0.0285714 0.0571429 0 0.857143 0.0285714 0.114286 0 1 0 0 0.114286 0.771429 0 0.114286 0.0571429 0.142857 0.428571 0.371429 0 0.8 0.0285714 0.171429 0.0285714 0.885714 0 0.0857143 0 0.685714 0.0857143 0.228571 0.171429 0.714286 0 0.114286 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.0857143 Reverse Complement Motif 0.0857143 0.0857143 0.742857 0.0857143 0.171429 0 0.714286 0.114286 0 0.0857143 0.685714 0.228571 0.0285714 0 0.885714 0.0857143 0 0.0285714 0.8 0.171429 0.0571429 0.428571 0.142857 0.371429 0.114286 0 0.771429 0.114286 0 0 1 0 0 0.0285714 0.857143 0.114286 0 0.0285714 0.914286 0.0571429 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 7 Motif 7 Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 8 1.59629 Original Motif 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.474359 0 0.525641 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 Reverse Complement Motif 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0.474359 0.525641 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 13 Zfp423 Original Motif Original Motif Forward 8 8 1.59848 Original Motif 0.212121 0.121212 0.666667 0 0 0.484848 0.515152 0 0.484848 0.515152 0 0 0.515152 0.484848 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.030303 0.515152 0 0.454545 0.727273 0 0 0.272727 0.393939 0 0.484848 0.121212 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.515152 0.484848 0 0 0.484848 0.515152 0 0.242424 0.484848 0.272727 0.333333 0.666667 0 0 Reverse Complement Motif 0.333333 0 0.666667 0 0 0.484848 0.242424 0.272727 0.515152 0 0.484848 0 0 0.515152 0 0.484848 0 1 0 0 0 1 0 0 0.393939 0.484848 0 0.121212 0.272727 0 0 0.727273 0.030303 0 0.515152 0.454545 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0.484848 0 0.515152 0.484848 0 0.515152 0 0 0.515152 0.484848 0 0.212121 0.666667 0.121212 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 41 MZF1_5-13 Reverse Complement Original Motif Backward 3 8 1.61306 Original Motif 0.0625 0.25 0.4375 0.25 0.125 0 0.4375 0.4375 0.9375 0.0625 0 0 0 0 0.6875 0.3125 0 0 0.9375 0.0625 0 0.125 0.875 0 0 0 0.875 0.125 0.1875 0.0625 0.5 0.25 0.625 0 0.25 0.125 0.5 0.125 0.25 0.125 Reverse Complement Motif 0.125 0.125 0.25 0.5 0.125 0 0.25 0.625 0.1875 0.5 0.0625 0.25 0 0.875 0 0.125 0 0.875 0.125 0 0 0.9375 0 0.0625 0 0.6875 0 0.3125 0 0.0625 0 0.9375 0.125 0.4375 0 0.4375 0.0625 0.4375 0.25 0.25 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 43 Motif Name NR1H2RXRA Original Motif 0.68 0.2 0 0.12 0.68 0.04 0.2 0.08 0.8 0 0.2 0 0 0 1 0 0 0 0.96 0.04 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.96 0 0 0.04 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.8 0.04 0.08 0.08 0 0.6 0.24 0.16 Reserve Complement Motif 0 0.24 0.6 0.16 0.08 0.04 0.08 0.8 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.04 0 0 0.96 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0.96 0 0.04 0 1 0 0 0 0 0.2 0.8 0.08 0.04 0.2 0.68 0.12 0.2 0 0.68 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 43 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 REST Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 17 0.0911991 Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reverse Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 PPARGRXRA Original Motif Original Motif Forward 1 15 1.05945 Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reverse Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 17 RXRAVDR Original Motif Original Motif Backward 1 15 1.09792 Original Motif 0.3 0 0.7 0 0 0 1 0 0 0 0.9 0.1 0 0 0 1 0 0.9 0 0.1 0.9 0 0.1 0 0.4 0.2 0 0.4 0.2 0.4 0.2 0.2 0.2 0 0.8 0 0.5 0 0.5 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0.1 0 0 0.9 0 0.9 0 0.1 0.7 0.1 0.2 0 Reverse Complement Motif 0 0.1 0.2 0.7 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0 0.1 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0 0.2 0.2 0.4 0.2 0.4 0.2 0 0.4 0 0 0.1 0.9 0 0 0.9 0.1 1 0 0 0 0 0.9 0 0.1 0 1 0 0 0.3 0.7 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 29 ESR1 Original Motif Original Motif Backward 8 13 2.08514 Original Motif 0.261242 0.256959 0.329764 0.152034 0.228632 0.17094 0.350427 0.25 0.136752 0.369658 0.318376 0.175214 0.176596 0.487234 0.138298 0.197872 0.285106 0.493617 0.1 0.121277 0.651163 0.0591966 0.188161 0.10148 0.0759494 0.0168776 0.816456 0.0907173 0.04 0.0378947 0.884211 0.0378947 0.0694737 0.0863158 0.191579 0.652632 0.00842105 0.829474 0.111579 0.0505263 0.837895 0.0273684 0.0568421 0.0778947 0.122105 0.526316 0.225263 0.126316 0.132632 0.581053 0.111579 0.174737 0.134737 0.543158 0.204211 0.117895 0.0673684 0.04 0.0168421 0.875789 0.0442105 0.0463158 0.896842 0.0126316 0.642105 0.223158 0.0652632 0.0694737 0.0210526 0.917895 0.0252632 0.0357895 0.124211 0.743158 0.00421053 0.128421 0.0547368 0.347368 0.0463158 0.551579 Reverse Complement Motif 0.551579 0.347368 0.0463158 0.0547368 0.124211 0.00421053 0.743158 0.128421 0.0210526 0.0252632 0.917895 0.0357895 0.0694737 0.223158 0.0652632 0.642105 0.0442105 0.896842 0.0463158 0.0126316 0.875789 0.04 0.0168421 0.0673684 0.134737 0.204211 0.543158 0.117895 0.132632 0.111579 0.581053 0.174737 0.122105 0.225263 0.526316 0.126316 0.0778947 0.0273684 0.0568421 0.837895 0.00842105 0.111579 0.829474 0.0505263 0.652632 0.0863158 0.191579 0.0694737 0.04 0.884211 0.0378947 0.0378947 0.0759494 0.816456 0.0168776 0.0907173 0.10148 0.0591966 0.188161 0.651163 0.285106 0.1 0.493617 0.121277 0.176596 0.138298 0.487234 0.197872 0.136752 0.318376 0.369658 0.175214 0.228632 0.350427 0.17094 0.25 0.261242 0.329764 0.256959 0.152034 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 10 Motif 10 Reverse Complement Original Motif Forward 2 13 2.08845 Original Motif 0.169492 0 0 0.830508 0.169492 0.033898 0.372881 0.423729 0.152542 0 0.305085 0.542373 0.20339 0 0 0.79661 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0.20339 0.576271 0.220339 0.271186 0.135593 0.0508471 0.542374 0.016949 0.152542 0.033898 0.796611 0.016949 0 0.101695 0.881356 0.084746 0 0.135593 0.779661 0.050847 0 0.067797 0.881356 0 0.169492 0.152542 0.677966 0 0 0.169492 0.830508 Reverse Complement Motif 0.830508 0 0.169492 0 0.677966 0.169492 0.152542 0 0.881356 0 0.067797 0.050847 0.779661 0 0.135593 0.084746 0.881356 0 0.101695 0.016949 0.796611 0.152542 0.033898 0.016949 0.542374 0.135593 0.0508471 0.271186 0 0.576271 0.20339 0.220339 1 0 0 0 1 0 0 0 0.79661 0 0 0.20339 0.542373 0 0.305085 0.152542 0.423729 0.033898 0.372881 0.169492 0.830508 0 0 0.169492 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 32 EWSR1-FLI1 Original Motif Original Motif Forward 7 12 2.59335 Original Motif 0 0 1 0 0.0190476 0 0.980952 0 0.990476 0 0.00952381 0 0.990476 0 0.00952381 0 0.00952381 0 0.990476 0 0.0190476 0 0.971429 0.00952381 0.980952 0 0.0190476 0 0.971429 0 0.0285714 0 0 0 0.990476 0.00952381 0 0.0190476 0.980952 0 0.942857 0.0380952 0.0190476 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0.0190476 0.980952 0 0.952381 0.0285714 0 0.0190476 0.971429 0 0.0190476 0.00952381 0.047619 0 0.92381 0.0285714 0.0285714 0.0285714 0.92381 0.0190476 Reverse Complement Motif 0.0285714 0.92381 0.0285714 0.0190476 0.047619 0.92381 0 0.0285714 0.00952381 0 0.0190476 0.971429 0.0190476 0.0285714 0 0.952381 0 0.980952 0.0190476 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0.0380952 0.0190476 0.942857 0 0.980952 0.0190476 0 0 0.990476 0 0.00952381 0 0 0.0285714 0.971429 0 0 0.0190476 0.980952 0.0190476 0.971429 0 0.00952381 0.00952381 0.990476 0 0 0 0 0.00952381 0.990476 0 0 0.00952381 0.990476 0.0190476 0.980952 0 0 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 24 Ar Reverse Complement Reverse Complement Forward 12 11 3.09595 Original Motif 0.375 0.291667 0.0833333 0.25 0.375 0.0833333 0.125 0.416667 0.458333 0.125 0.125 0.291667 0.666667 0.0416667 0.291667 0 0 0 0.916667 0.0833333 0.5 0.25 0.0416667 0.208333 0.875 0.0833333 0 0.0416667 0 1 0 0 0.625 0 0.333333 0.0416667 0.166667 0.375 0.0833333 0.375 0.208333 0.458333 0.0833333 0.25 0.25 0.375 0.375 0 0.125 0.208333 0.0416667 0.625 0 0 1 0 0.166667 0 0 0.833333 0.458333 0.208333 0.0416667 0.291667 0.0416667 0.916667 0.0416667 0 0.125 0.666667 0.0416667 0.166667 0.25 0.291667 0.208333 0.25 0.25 0.208333 0.375 0.166667 0.416667 0.458333 0 0.125 0.208333 0.458333 0.25 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.208333 0.25 0.458333 0.0833333 0.416667 0 0.458333 0.125 0.25 0.375 0.208333 0.166667 0.25 0.208333 0.291667 0.25 0.125 0.0416667 0.666667 0.166667 0.0416667 0.0416667 0.916667 0 0.291667 0.208333 0.0416667 0.458333 0.833333 0 0 0.166667 0 1 0 0 0.625 0.208333 0.0416667 0.125 0.25 0.375 0.375 0 0.208333 0.0833333 0.458333 0.25 0.166667 0.0833333 0.375 0.375 0.0416667 0 0.333333 0.625 0 0 1 0 0.0416667 0.0833333 0 0.875 0.208333 0.25 0.0416667 0.5 0 0.916667 0 0.0833333 0 0.0416667 0.291667 0.666667 0.291667 0.125 0.125 0.458333 0.416667 0.0833333 0.125 0.375 0.25 0.291667 0.0833333 0.375 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 30 ESR2 Reverse Complement Reverse Complement Forward 9 10 3.56221 Original Motif 0.218487 0.45098 0.176471 0.154062 0.442577 0.142857 0.114846 0.29972 0.521008 0.0420168 0.431373 0.00560224 0.0756303 0 0.770308 0.154062 0.0504202 0.0560224 0.893557 0 0.0364146 0.0532213 0.092437 0.817927 0 1 0 0 0.943978 0.00280112 0 0.0532213 0.137255 0.344538 0.316527 0.201681 0.179272 0.176471 0.417367 0.226891 0.145658 0.170868 0.411765 0.271709 0.0588235 0.092437 0.0672269 0.781513 0.176471 0.070028 0.742297 0.0112045 0.498599 0.277311 0.0532213 0.170868 0.0952381 0.7507 0.00560224 0.148459 0.128852 0.809524 0 0.0616246 0.0756303 0.252101 0 0.672269 0.168067 0.263305 0.380952 0.187675 Reverse Complement Motif 0.168067 0.380952 0.263305 0.187675 0.672269 0.252101 0 0.0756303 0.128852 0 0.809524 0.0616246 0.0952381 0.00560224 0.7507 0.148459 0.170868 0.277311 0.0532213 0.498599 0.176471 0.742297 0.070028 0.0112045 0.781513 0.092437 0.0672269 0.0588235 0.145658 0.411765 0.170868 0.271709 0.179272 0.417367 0.176471 0.226891 0.137255 0.316527 0.344538 0.201681 0.0532213 0.00280112 0 0.943978 0 0 1 0 0.817927 0.0532213 0.092437 0.0364146 0.0504202 0.893557 0.0560224 0 0.0756303 0.770308 0 0.154062 0.00560224 0.0420168 0.431373 0.521008 0.29972 0.142857 0.114846 0.442577 0.218487 0.176471 0.45098 0.154062 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 37 MIZF Original Motif Original Motif Backward 1 10 3.5855 Original Motif 0.1 0.3 0.25 0.35 0.65 0.05 0 0.3 1 0 0 0 0.1 0.85 0.05 0 0 0 0.95 0.05 0 0.05 0 0.95 0 0.95 0 0.05 0 0.9 0.1 0 0 0 0.95 0.05 0.1 0.65 0.05 0.2 Reverse Complement Motif 0.1 0.05 0.65 0.2 0 0.95 0 0.05 0 0.1 0.9 0 0 0 0.95 0.05 0.95 0.05 0 0 0 0.95 0 0.05 0.1 0.05 0.85 0 0 0 0 1 0.3 0.05 0 0.65 0.35 0.3 0.25 0.1 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 1 9 Motif 9 Original Motif Original Motif Forward 5 10 3.59839 Original Motif 0.034483 0.931034 0.034483 0 1 0 0 0 0 0.827586 0.172414 0 0.862069 0 0 0.137931 0.103448 0.862069 0 0.034483 0.793103 0.034483 0.103448 0.068966 0.241379 0.413793 0.275862 0.068966 0.655172 0 0.344828 0 0 0.827586 0.172414 0 0.965517 0 0.034483 0 0 0.965517 0.034483 0 0.931034 0 0 0.068966 0.068966 0.931034 0 0 0.965517 0.034483 0 0 Reverse Complement Motif 0 0.034483 0 0.965517 0.068966 0 0.931034 0 0.068966 0 0 0.931034 0 0.034483 0.965517 0 0 0 0.034483 0.965517 0 0.172414 0.827586 0 0 0 0.344828 0.655172 0.241379 0.275862 0.413793 0.068966 0.068966 0.034483 0.103448 0.793103 0.103448 0 0.862069 0.034483 0.137931 0 0 0.862069 0 0.172414 0.827586 0 0 0 0 1 0.034483 0.034483 0.931034 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 44 Motif Name NR4A2 Original Motif 0.615385 0.0769231 0.230769 0.0769231 0.928571 0 0.0714286 0 0 0 0.928571 0.0714286 0.214286 0 0.785714 0 0.142857 0.142857 0 0.714286 0 0.928571 0 0.0714286 1 0 0 0 0.230769 0.615385 0.153846 0 Reserve Complement Motif 0.230769 0.153846 0.615385 0 0 0 0 1 0 0 0.928571 0.0714286 0.714286 0.142857 0 0.142857 0.214286 0.785714 0 0 0 0.928571 0 0.0714286 0 0 0.0714286 0.928571 0.0769231 0.0769231 0.230769 0.615385 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 44 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 43 NR1H2RXRA Original Motif Original Motif Backward 9 8 0.0167759 Original Motif 0.68 0.2 0 0.12 0.68 0.04 0.2 0.08 0.8 0 0.2 0 0 0 1 0 0 0 0.96 0.04 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.96 0 0 0.04 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.8 0.04 0.08 0.08 0 0.6 0.24 0.16 Reverse Complement Motif 0 0.24 0.6 0.16 0.08 0.04 0.08 0.8 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.04 0 0 0.96 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0.96 0 0.04 0 1 0 0 0 0 0.2 0.8 0.08 0.04 0.2 0.68 0.12 0.2 0 0.68 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 29 ESR1 Original Motif Original Motif Forward 5 8 0.0195235 Original Motif 0.261242 0.256959 0.329764 0.152034 0.228632 0.17094 0.350427 0.25 0.136752 0.369658 0.318376 0.175214 0.176596 0.487234 0.138298 0.197872 0.285106 0.493617 0.1 0.121277 0.651163 0.0591966 0.188161 0.10148 0.0759494 0.0168776 0.816456 0.0907173 0.04 0.0378947 0.884211 0.0378947 0.0694737 0.0863158 0.191579 0.652632 0.00842105 0.829474 0.111579 0.0505263 0.837895 0.0273684 0.0568421 0.0778947 0.122105 0.526316 0.225263 0.126316 0.132632 0.581053 0.111579 0.174737 0.134737 0.543158 0.204211 0.117895 0.0673684 0.04 0.0168421 0.875789 0.0442105 0.0463158 0.896842 0.0126316 0.642105 0.223158 0.0652632 0.0694737 0.0210526 0.917895 0.0252632 0.0357895 0.124211 0.743158 0.00421053 0.128421 0.0547368 0.347368 0.0463158 0.551579 Reverse Complement Motif 0.551579 0.347368 0.0463158 0.0547368 0.124211 0.00421053 0.743158 0.128421 0.0210526 0.0252632 0.917895 0.0357895 0.0694737 0.223158 0.0652632 0.642105 0.0442105 0.896842 0.0463158 0.0126316 0.875789 0.04 0.0168421 0.0673684 0.134737 0.204211 0.543158 0.117895 0.132632 0.111579 0.581053 0.174737 0.122105 0.225263 0.526316 0.126316 0.0778947 0.0273684 0.0568421 0.837895 0.00842105 0.111579 0.829474 0.0505263 0.652632 0.0863158 0.191579 0.0694737 0.04 0.884211 0.0378947 0.0378947 0.0759494 0.816456 0.0168776 0.0907173 0.10148 0.0591966 0.188161 0.651163 0.285106 0.1 0.493617 0.121277 0.176596 0.138298 0.487234 0.197872 0.136752 0.318376 0.369658 0.175214 0.228632 0.350427 0.17094 0.25 0.261242 0.329764 0.256959 0.152034 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 30 ESR2 Original Motif Original Motif Backward 10 8 0.0198372 Original Motif 0.218487 0.45098 0.176471 0.154062 0.442577 0.142857 0.114846 0.29972 0.521008 0.0420168 0.431373 0.00560224 0.0756303 0 0.770308 0.154062 0.0504202 0.0560224 0.893557 0 0.0364146 0.0532213 0.092437 0.817927 0 1 0 0 0.943978 0.00280112 0 0.0532213 0.137255 0.344538 0.316527 0.201681 0.179272 0.176471 0.417367 0.226891 0.145658 0.170868 0.411765 0.271709 0.0588235 0.092437 0.0672269 0.781513 0.176471 0.070028 0.742297 0.0112045 0.498599 0.277311 0.0532213 0.170868 0.0952381 0.7507 0.00560224 0.148459 0.128852 0.809524 0 0.0616246 0.0756303 0.252101 0 0.672269 0.168067 0.263305 0.380952 0.187675 Reverse Complement Motif 0.168067 0.380952 0.263305 0.187675 0.672269 0.252101 0 0.0756303 0.128852 0 0.809524 0.0616246 0.0952381 0.00560224 0.7507 0.148459 0.170868 0.277311 0.0532213 0.498599 0.176471 0.742297 0.070028 0.0112045 0.781513 0.092437 0.0672269 0.0588235 0.145658 0.411765 0.170868 0.271709 0.179272 0.417367 0.176471 0.226891 0.137255 0.316527 0.344538 0.201681 0.0532213 0.00280112 0 0.943978 0 0 1 0 0.817927 0.0532213 0.092437 0.0364146 0.0504202 0.893557 0.0560224 0 0.0756303 0.770308 0 0.154062 0.00560224 0.0420168 0.431373 0.521008 0.29972 0.142857 0.114846 0.442577 0.218487 0.176471 0.45098 0.154062 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 24 Ar Reverse Complement Reverse Complement Backward 3 8 0.0487608 Original Motif 0.375 0.291667 0.0833333 0.25 0.375 0.0833333 0.125 0.416667 0.458333 0.125 0.125 0.291667 0.666667 0.0416667 0.291667 0 0 0 0.916667 0.0833333 0.5 0.25 0.0416667 0.208333 0.875 0.0833333 0 0.0416667 0 1 0 0 0.625 0 0.333333 0.0416667 0.166667 0.375 0.0833333 0.375 0.208333 0.458333 0.0833333 0.25 0.25 0.375 0.375 0 0.125 0.208333 0.0416667 0.625 0 0 1 0 0.166667 0 0 0.833333 0.458333 0.208333 0.0416667 0.291667 0.0416667 0.916667 0.0416667 0 0.125 0.666667 0.0416667 0.166667 0.25 0.291667 0.208333 0.25 0.25 0.208333 0.375 0.166667 0.416667 0.458333 0 0.125 0.208333 0.458333 0.25 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.208333 0.25 0.458333 0.0833333 0.416667 0 0.458333 0.125 0.25 0.375 0.208333 0.166667 0.25 0.208333 0.291667 0.25 0.125 0.0416667 0.666667 0.166667 0.0416667 0.0416667 0.916667 0 0.291667 0.208333 0.0416667 0.458333 0.833333 0 0 0.166667 0 1 0 0 0.625 0.208333 0.0416667 0.125 0.25 0.375 0.375 0 0.208333 0.0833333 0.458333 0.25 0.166667 0.0833333 0.375 0.375 0.0416667 0 0.333333 0.625 0 0 1 0 0.0416667 0.0833333 0 0.875 0.208333 0.25 0.0416667 0.5 0 0.916667 0 0.0833333 0 0.0416667 0.291667 0.666667 0.291667 0.125 0.125 0.458333 0.416667 0.0833333 0.125 0.375 0.25 0.291667 0.0833333 0.375 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 PPARGRXRA Original Motif Original Motif Forward 2 8 0.0495607 Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reverse Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 22 NR2F1 Original Motif Reverse Complement Forward 7 8 0.0564874 Original Motif 0 0 0.153846 0.846154 0.0769231 0 0.923077 0 0.923077 0 0.0769231 0 0.461538 0.538462 0 0 0 1 0 0 0 0.230769 0 0.769231 0 0.153846 0 0.846154 0.0769231 0 0 0.923077 0.153846 0 0.846154 0 0.461538 0.307692 0.230769 0 0.461538 0.384615 0.0769231 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.230769 0.461538 0 0.307692 0 0.230769 0.230769 0.538462 Reverse Complement Motif 0.538462 0.230769 0.230769 0 0.230769 0 0.461538 0.307692 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.384615 0.0769231 0.461538 0 0.307692 0.230769 0.461538 0.153846 0.846154 0 0 0.923077 0 0 0.0769231 0.846154 0.153846 0 0 0.769231 0.230769 0 0 0 0 1 0 0.461538 0 0.538462 0 0 0 0.0769231 0.923077 0.0769231 0.923077 0 0 0.846154 0 0.153846 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 REST Reverse Complement Reverse Complement Backward 10 8 0.0594649 Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reverse Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 Zfx Reverse Complement Original Motif Backward 7 8 0.0631514 Original Motif 0.105042 0.371849 0.37605 0.147059 0.125786 0.356394 0.360587 0.157233 0.190377 0.3159 0.416318 0.0774059 0.150313 0.102296 0.622129 0.125261 0.02079 0.617464 0.299376 0.0623701 0.012474 0.752599 0.004158 0.230769 0.0623701 0.259875 0.378378 0.299376 0.397089 0.320166 0.251559 0.031185 0.018711 0.004158 0.975052 0.002079 0 0.00623701 0.991684 0.002079 0.002079 0.997921 0 0 0 0.997921 0 0.002079 0 0.004158 0 0.995842 0.174636 0.253638 0.455301 0.116424 Reverse Complement Motif 0.174636 0.455301 0.253638 0.116424 0.995842 0.004158 0 0 0 0 0.997921 0.002079 0.002079 0 0.997921 0 0 0.991684 0.00623701 0.002079 0.018711 0.975052 0.004158 0.002079 0.031185 0.320166 0.251559 0.397089 0.0623701 0.378378 0.259875 0.299376 0.012474 0.004158 0.752599 0.230769 0.02079 0.299376 0.617464 0.0623701 0.150313 0.622129 0.102296 0.125261 0.190377 0.416318 0.3159 0.0774059 0.125786 0.360587 0.356394 0.157233 0.105042 0.37605 0.371849 0.147059 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 4 8 0.0720656 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 48 Tcfcp2l1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 8 0.0740998 Original Motif 0.00196754 0.92548 0.0627152 0.00983768 0.069973 0.807513 0.00540142 0.117113 0.594508 0.00514832 0.275803 0.12454 0.0058838 0.0237803 0.967149 0.00318706 0.175477 0.33627 0.0256975 0.462555 0.0983847 0.28928 0.0621635 0.550171 0.173924 0.39726 0.151174 0.277642 0.357213 0.224939 0.252323 0.165526 0.63154 0.0696822 0.190954 0.107824 0.394421 0.0513824 0.310497 0.2437 0.00366928 0.933219 0.0547945 0.00831703 0.0617193 0.812148 0.00293902 0.123194 0.536555 0.00736016 0.305937 0.150147 0.0120393 0.0289926 0.954791 0.0041769 Reverse Complement Motif 0.0120393 0.954791 0.0289926 0.0041769 0.150147 0.00736016 0.305937 0.536555 0.0617193 0.00293902 0.812148 0.123194 0.00366928 0.0547945 0.933219 0.00831703 0.2437 0.0513824 0.310497 0.394421 0.107824 0.0696822 0.190954 0.63154 0.165526 0.224939 0.252323 0.357213 0.173924 0.151174 0.39726 0.277642 0.550171 0.28928 0.0621635 0.0983847 0.462555 0.33627 0.0256975 0.175477 0.0058838 0.967149 0.0237803 0.00318706 0.12454 0.00514832 0.275803 0.594508 0.069973 0.00540142 0.807513 0.117113 0.00196754 0.0627152 0.92548 0.00983768 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 45 Motif Name Pax5 Original Motif 0.333333 0.0833333 0.333333 0.25 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 0.25 0.25 0.166667 0.0833333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.583333 0.166667 0.0833333 0.166667 0.166667 0.416667 0.25 0.166667 0 0.25 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.666667 0.0833333 0.5 0.0833333 0.25 0.166667 0.5 0 0.166667 0.333333 0 0 1 0 0.166667 0.666667 0.0833333 0.0833333 0.25 0 0.75 0 0.0833333 0 0.333333 0.583333 0.5 0.0833333 0.416667 0 0.416667 0.0833333 0.416667 0.0833333 0.166667 0.833333 0 0 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reserve Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.166667 0 0.833333 0 0.0833333 0.0833333 0.416667 0.416667 0 0.0833333 0.416667 0.5 0.583333 0 0.333333 0.0833333 0.25 0.75 0 0 0.166667 0.0833333 0.666667 0.0833333 0 1 0 0 0.333333 0 0.166667 0.5 0.166667 0.0833333 0.25 0.5 0.0833333 0.666667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.25 0.166667 0 0.166667 0.25 0.416667 0.166667 0.166667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.416667 0.166667 0.333333 0.166667 0.25 0.25 0.333333 0.333333 0.666667 0 0 0.25 0.0833333 0.333333 0.333333 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 45 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 29 ESR1 Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 20 0.0382347 Original Motif 0.261242 0.256959 0.329764 0.152034 0.228632 0.17094 0.350427 0.25 0.136752 0.369658 0.318376 0.175214 0.176596 0.487234 0.138298 0.197872 0.285106 0.493617 0.1 0.121277 0.651163 0.0591966 0.188161 0.10148 0.0759494 0.0168776 0.816456 0.0907173 0.04 0.0378947 0.884211 0.0378947 0.0694737 0.0863158 0.191579 0.652632 0.00842105 0.829474 0.111579 0.0505263 0.837895 0.0273684 0.0568421 0.0778947 0.122105 0.526316 0.225263 0.126316 0.132632 0.581053 0.111579 0.174737 0.134737 0.543158 0.204211 0.117895 0.0673684 0.04 0.0168421 0.875789 0.0442105 0.0463158 0.896842 0.0126316 0.642105 0.223158 0.0652632 0.0694737 0.0210526 0.917895 0.0252632 0.0357895 0.124211 0.743158 0.00421053 0.128421 0.0547368 0.347368 0.0463158 0.551579 Reverse Complement Motif 0.551579 0.347368 0.0463158 0.0547368 0.124211 0.00421053 0.743158 0.128421 0.0210526 0.0252632 0.917895 0.0357895 0.0694737 0.223158 0.0652632 0.642105 0.0442105 0.896842 0.0463158 0.0126316 0.875789 0.04 0.0168421 0.0673684 0.134737 0.204211 0.543158 0.117895 0.132632 0.111579 0.581053 0.174737 0.122105 0.225263 0.526316 0.126316 0.0778947 0.0273684 0.0568421 0.837895 0.00842105 0.111579 0.829474 0.0505263 0.652632 0.0863158 0.191579 0.0694737 0.04 0.884211 0.0378947 0.0378947 0.0759494 0.816456 0.0168776 0.0907173 0.10148 0.0591966 0.188161 0.651163 0.285106 0.1 0.493617 0.121277 0.176596 0.138298 0.487234 0.197872 0.136752 0.318376 0.369658 0.175214 0.228632 0.350427 0.17094 0.25 0.261242 0.329764 0.256959 0.152034 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 24 Ar Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 20 0.0450685 Original Motif 0.375 0.291667 0.0833333 0.25 0.375 0.0833333 0.125 0.416667 0.458333 0.125 0.125 0.291667 0.666667 0.0416667 0.291667 0 0 0 0.916667 0.0833333 0.5 0.25 0.0416667 0.208333 0.875 0.0833333 0 0.0416667 0 1 0 0 0.625 0 0.333333 0.0416667 0.166667 0.375 0.0833333 0.375 0.208333 0.458333 0.0833333 0.25 0.25 0.375 0.375 0 0.125 0.208333 0.0416667 0.625 0 0 1 0 0.166667 0 0 0.833333 0.458333 0.208333 0.0416667 0.291667 0.0416667 0.916667 0.0416667 0 0.125 0.666667 0.0416667 0.166667 0.25 0.291667 0.208333 0.25 0.25 0.208333 0.375 0.166667 0.416667 0.458333 0 0.125 0.208333 0.458333 0.25 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.208333 0.25 0.458333 0.0833333 0.416667 0 0.458333 0.125 0.25 0.375 0.208333 0.166667 0.25 0.208333 0.291667 0.25 0.125 0.0416667 0.666667 0.166667 0.0416667 0.0416667 0.916667 0 0.291667 0.208333 0.0416667 0.458333 0.833333 0 0 0.166667 0 1 0 0 0.625 0.208333 0.0416667 0.125 0.25 0.375 0.375 0 0.208333 0.0833333 0.458333 0.25 0.166667 0.0833333 0.375 0.375 0.0416667 0 0.333333 0.625 0 0 1 0 0.0416667 0.0833333 0 0.875 0.208333 0.25 0.0416667 0.5 0 0.916667 0 0.0833333 0 0.0416667 0.291667 0.666667 0.291667 0.125 0.125 0.458333 0.416667 0.0833333 0.125 0.375 0.25 0.291667 0.0833333 0.375 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 30 ESR2 Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 18 1.05192 Original Motif 0.218487 0.45098 0.176471 0.154062 0.442577 0.142857 0.114846 0.29972 0.521008 0.0420168 0.431373 0.00560224 0.0756303 0 0.770308 0.154062 0.0504202 0.0560224 0.893557 0 0.0364146 0.0532213 0.092437 0.817927 0 1 0 0 0.943978 0.00280112 0 0.0532213 0.137255 0.344538 0.316527 0.201681 0.179272 0.176471 0.417367 0.226891 0.145658 0.170868 0.411765 0.271709 0.0588235 0.092437 0.0672269 0.781513 0.176471 0.070028 0.742297 0.0112045 0.498599 0.277311 0.0532213 0.170868 0.0952381 0.7507 0.00560224 0.148459 0.128852 0.809524 0 0.0616246 0.0756303 0.252101 0 0.672269 0.168067 0.263305 0.380952 0.187675 Reverse Complement Motif 0.168067 0.380952 0.263305 0.187675 0.672269 0.252101 0 0.0756303 0.128852 0 0.809524 0.0616246 0.0952381 0.00560224 0.7507 0.148459 0.170868 0.277311 0.0532213 0.498599 0.176471 0.742297 0.070028 0.0112045 0.781513 0.092437 0.0672269 0.0588235 0.145658 0.411765 0.170868 0.271709 0.179272 0.417367 0.176471 0.226891 0.137255 0.316527 0.344538 0.201681 0.0532213 0.00280112 0 0.943978 0 0 1 0 0.817927 0.0532213 0.092437 0.0364146 0.0504202 0.893557 0.0560224 0 0.0756303 0.770308 0 0.154062 0.00560224 0.0420168 0.431373 0.521008 0.29972 0.142857 0.114846 0.442577 0.218487 0.176471 0.45098 0.154062 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 REST Reverse Complement Reverse Complement Backward 4 18 1.0582 Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reverse Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 47 RXRRAR_DR5 Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 17 1.53818 Original Motif 0.521739 0 0.478261 0 0 0 1 0 0.0434783 0 0.565217 0.391304 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.782609 0.130435 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.173913 0.304348 0.217391 0.304348 0.217391 0.347826 0.391304 0.0434783 0.217391 0.173913 0.478261 0.130435 0.565217 0.0434783 0.304348 0.0869565 0.217391 0.26087 0.521739 0 0.73913 0.130435 0.130435 0 0.0434783 0.0434783 0.869565 0.0434783 0 0.0434783 0.695652 0.26087 0.0869565 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0434783 0.73913 0.130435 0.0869565 0.913043 0 0.0434783 0.0434783 Reverse Complement Motif 0.0434783 0 0.0434783 0.913043 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0869565 0.73913 0.0434783 0.130435 0.0869565 0 0.695652 0.0434783 0.26087 0.0434783 0.869565 0.0434783 0.0434783 0 0.130435 0.130435 0.73913 0.217391 0.521739 0.26087 0 0.0869565 0.0434783 0.304348 0.565217 0.217391 0.478261 0.173913 0.130435 0.217391 0.391304 0.347826 0.0434783 0.173913 0.217391 0.304348 0.304348 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.130435 0.782609 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.0434783 0.565217 0 0.391304 0 1 0 0 0 0 0.478261 0.521739 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Reverse Complement Original Motif Forward 4 17 1.55831 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 PPARGRXRA Original Motif Reverse Complement Backward 1 15 2.55126 Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reverse Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 PLAG1 Original Motif Original Motif Forward 1 14 3.05866 Original Motif 0 0 1 0 0.166667 0 0.777778 0.0555556 0 0 1 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0.777778 0.222222 0 0 0.833333 0.0555556 0.111111 0.222222 0.555556 0.0555556 0.166667 0.666667 0 0 0.333333 0.611111 0.277778 0.111111 0 0.111111 0 0.777778 0.111111 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.888889 0.111111 0.111111 0 0.888889 0 Reverse Complement Motif 0.111111 0.888889 0 0 0 0.888889 0 0.111111 0 1 0 0 0 1 0 0 0.111111 0.777778 0 0.111111 0 0.277778 0.111111 0.611111 0.333333 0 0 0.666667 0.222222 0.0555556 0.555556 0.166667 0 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0.222222 0.777778 0 0 0.944444 0 0.0555556 0 1 0 0 0.166667 0.777778 0 0.0555556 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 22 NR2F1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 14 3.05897 Original Motif 0 0 0.153846 0.846154 0.0769231 0 0.923077 0 0.923077 0 0.0769231 0 0.461538 0.538462 0 0 0 1 0 0 0 0.230769 0 0.769231 0 0.153846 0 0.846154 0.0769231 0 0 0.923077 0.153846 0 0.846154 0 0.461538 0.307692 0.230769 0 0.461538 0.384615 0.0769231 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.230769 0.461538 0 0.307692 0 0.230769 0.230769 0.538462 Reverse Complement Motif 0.538462 0.230769 0.230769 0 0.230769 0 0.461538 0.307692 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.384615 0.0769231 0.461538 0 0.307692 0.230769 0.461538 0.153846 0.846154 0 0 0.923077 0 0 0.0769231 0.846154 0.153846 0 0 0.769231 0.230769 0 0 0 0 1 0 0.461538 0 0.538462 0 0 0 0.0769231 0.923077 0.0769231 0.923077 0 0 0.846154 0 0.153846 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 34 HNF4A Original Motif Reverse Complement Backward 1 13 3.53748 Original Motif 0.41791 0.104478 0.402985 0.0746269 0.0298507 0.0298507 0.835821 0.104478 0.179104 0.0597015 0.522388 0.238806 0.0746269 0.343284 0.298507 0.283582 0.0447761 0.761194 0.0597015 0.134328 0.880597 0.0149254 0.0447761 0.0597015 0.791045 0.0298507 0.149254 0.0298507 0.835821 0.0149254 0.119403 0.0298507 0.0597015 0.0597015 0.865672 0.0149254 0.0895522 0.0298507 0.492537 0.38806 0.0447761 0.328358 0.164179 0.462687 0.0597015 0.731343 0.0746269 0.134328 0.626866 0.104478 0.149254 0.119403 Reverse Complement Motif 0.119403 0.104478 0.149254 0.626866 0.0597015 0.0746269 0.731343 0.134328 0.462687 0.328358 0.164179 0.0447761 0.0895522 0.492537 0.0298507 0.38806 0.0597015 0.865672 0.0597015 0.0149254 0.0298507 0.0149254 0.119403 0.835821 0.0298507 0.0298507 0.149254 0.791045 0.0597015 0.0149254 0.0447761 0.880597 0.0447761 0.0597015 0.761194 0.134328 0.0746269 0.298507 0.343284 0.283582 0.179104 0.522388 0.0597015 0.238806 0.0298507 0.835821 0.0298507 0.104478 0.0746269 0.104478 0.402985 0.41791 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 46 Motif Name RORA_1 Original Motif 0.6 0.04 0.08 0.28 0.36 0.04 0 0.6 0.24 0.48 0.16 0.12 0.44 0.08 0.2 0.28 0.84 0 0.16 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 Reserve Complement Motif 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0.16 0.84 0.28 0.08 0.2 0.44 0.24 0.16 0.48 0.12 0.6 0.04 0 0.36 0.28 0.04 0.08 0.6 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 46 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 29 ESR1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 10 0.0417851 Original Motif 0.261242 0.256959 0.329764 0.152034 0.228632 0.17094 0.350427 0.25 0.136752 0.369658 0.318376 0.175214 0.176596 0.487234 0.138298 0.197872 0.285106 0.493617 0.1 0.121277 0.651163 0.0591966 0.188161 0.10148 0.0759494 0.0168776 0.816456 0.0907173 0.04 0.0378947 0.884211 0.0378947 0.0694737 0.0863158 0.191579 0.652632 0.00842105 0.829474 0.111579 0.0505263 0.837895 0.0273684 0.0568421 0.0778947 0.122105 0.526316 0.225263 0.126316 0.132632 0.581053 0.111579 0.174737 0.134737 0.543158 0.204211 0.117895 0.0673684 0.04 0.0168421 0.875789 0.0442105 0.0463158 0.896842 0.0126316 0.642105 0.223158 0.0652632 0.0694737 0.0210526 0.917895 0.0252632 0.0357895 0.124211 0.743158 0.00421053 0.128421 0.0547368 0.347368 0.0463158 0.551579 Reverse Complement Motif 0.551579 0.347368 0.0463158 0.0547368 0.124211 0.00421053 0.743158 0.128421 0.0210526 0.0252632 0.917895 0.0357895 0.0694737 0.223158 0.0652632 0.642105 0.0442105 0.896842 0.0463158 0.0126316 0.875789 0.04 0.0168421 0.0673684 0.134737 0.204211 0.543158 0.117895 0.132632 0.111579 0.581053 0.174737 0.122105 0.225263 0.526316 0.126316 0.0778947 0.0273684 0.0568421 0.837895 0.00842105 0.111579 0.829474 0.0505263 0.652632 0.0863158 0.191579 0.0694737 0.04 0.884211 0.0378947 0.0378947 0.0759494 0.816456 0.0168776 0.0907173 0.10148 0.0591966 0.188161 0.651163 0.285106 0.1 0.493617 0.121277 0.176596 0.138298 0.487234 0.197872 0.136752 0.318376 0.369658 0.175214 0.228632 0.350427 0.17094 0.25 0.261242 0.329764 0.256959 0.152034 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 17 RXRAVDR Original Motif Original Motif Forward 6 10 0.05325 Original Motif 0.3 0 0.7 0 0 0 1 0 0 0 0.9 0.1 0 0 0 1 0 0.9 0 0.1 0.9 0 0.1 0 0.4 0.2 0 0.4 0.2 0.4 0.2 0.2 0.2 0 0.8 0 0.5 0 0.5 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0.1 0 0 0.9 0 0.9 0 0.1 0.7 0.1 0.2 0 Reverse Complement Motif 0 0.1 0.2 0.7 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0 0.1 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0 0.2 0.2 0.4 0.2 0.4 0.2 0 0.4 0 0 0.1 0.9 0 0 0.9 0.1 1 0 0 0 0 0.9 0 0.1 0 1 0 0 0.3 0.7 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 43 NR1H2RXRA Original Motif Original Motif Backward 3 10 0.05425 Original Motif 0.68 0.2 0 0.12 0.68 0.04 0.2 0.08 0.8 0 0.2 0 0 0 1 0 0 0 0.96 0.04 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.96 0 0 0.04 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0.8 0.04 0.08 0.08 0 0.6 0.24 0.16 Reverse Complement Motif 0 0.24 0.6 0.16 0.08 0.04 0.08 0.8 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0.04 0 0 0.96 0 0 0 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0.96 0 0.04 0 1 0 0 0 0 0.2 0.8 0.08 0.04 0.2 0.68 0.12 0.2 0 0.68 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 47 RXRRAR_DR5 Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 10 0.0600761 Original Motif 0.521739 0 0.478261 0 0 0 1 0 0.0434783 0 0.565217 0.391304 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.782609 0.130435 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.173913 0.304348 0.217391 0.304348 0.217391 0.347826 0.391304 0.0434783 0.217391 0.173913 0.478261 0.130435 0.565217 0.0434783 0.304348 0.0869565 0.217391 0.26087 0.521739 0 0.73913 0.130435 0.130435 0 0.0434783 0.0434783 0.869565 0.0434783 0 0.0434783 0.695652 0.26087 0.0869565 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0434783 0.73913 0.130435 0.0869565 0.913043 0 0.0434783 0.0434783 Reverse Complement Motif 0.0434783 0 0.0434783 0.913043 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0869565 0.73913 0.0434783 0.130435 0.0869565 0 0.695652 0.0434783 0.26087 0.0434783 0.869565 0.0434783 0.0434783 0 0.130435 0.130435 0.73913 0.217391 0.521739 0.26087 0 0.0869565 0.0434783 0.304348 0.565217 0.217391 0.478261 0.173913 0.130435 0.217391 0.391304 0.347826 0.0434783 0.173913 0.217391 0.304348 0.304348 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.130435 0.782609 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.0434783 0.565217 0 0.391304 0 1 0 0 0 0 0.478261 0.521739 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 22 NR2F1 Reverse Complement Original Motif Forward 5 10 0.0654808 Original Motif 0 0 0.153846 0.846154 0.0769231 0 0.923077 0 0.923077 0 0.0769231 0 0.461538 0.538462 0 0 0 1 0 0 0 0.230769 0 0.769231 0 0.153846 0 0.846154 0.0769231 0 0 0.923077 0.153846 0 0.846154 0 0.461538 0.307692 0.230769 0 0.461538 0.384615 0.0769231 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.230769 0.461538 0 0.307692 0 0.230769 0.230769 0.538462 Reverse Complement Motif 0.538462 0.230769 0.230769 0 0.230769 0 0.461538 0.307692 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.384615 0.0769231 0.461538 0 0.307692 0.230769 0.461538 0.153846 0.846154 0 0 0.923077 0 0 0.0769231 0.846154 0.153846 0 0 0.769231 0.230769 0 0 0 0 1 0 0.461538 0 0.538462 0 0 0 0.0769231 0.923077 0.0769231 0.923077 0 0 0.846154 0 0.153846 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 PPARGRXRA Original Motif Original Motif Forward 6 10 0.06668 Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reverse Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 REST Original Motif Original Motif Backward 6 10 0.0755608 Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reverse Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 34 HNF4A Original Motif Original Motif Forward 4 10 0.0803396 Original Motif 0.41791 0.104478 0.402985 0.0746269 0.0298507 0.0298507 0.835821 0.104478 0.179104 0.0597015 0.522388 0.238806 0.0746269 0.343284 0.298507 0.283582 0.0447761 0.761194 0.0597015 0.134328 0.880597 0.0149254 0.0447761 0.0597015 0.791045 0.0298507 0.149254 0.0298507 0.835821 0.0149254 0.119403 0.0298507 0.0597015 0.0597015 0.865672 0.0149254 0.0895522 0.0298507 0.492537 0.38806 0.0447761 0.328358 0.164179 0.462687 0.0597015 0.731343 0.0746269 0.134328 0.626866 0.104478 0.149254 0.119403 Reverse Complement Motif 0.119403 0.104478 0.149254 0.626866 0.0597015 0.0746269 0.731343 0.134328 0.462687 0.328358 0.164179 0.0447761 0.0895522 0.492537 0.0298507 0.38806 0.0597015 0.865672 0.0597015 0.0149254 0.0298507 0.0149254 0.119403 0.835821 0.0298507 0.0298507 0.149254 0.791045 0.0597015 0.0149254 0.0447761 0.880597 0.0447761 0.0597015 0.761194 0.134328 0.0746269 0.298507 0.343284 0.283582 0.179104 0.522388 0.0597015 0.238806 0.0298507 0.835821 0.0298507 0.104478 0.0746269 0.104478 0.402985 0.41791 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 24 Ar Original Motif Reverse Complement Forward 13 10 0.0814167 Original Motif 0.375 0.291667 0.0833333 0.25 0.375 0.0833333 0.125 0.416667 0.458333 0.125 0.125 0.291667 0.666667 0.0416667 0.291667 0 0 0 0.916667 0.0833333 0.5 0.25 0.0416667 0.208333 0.875 0.0833333 0 0.0416667 0 1 0 0 0.625 0 0.333333 0.0416667 0.166667 0.375 0.0833333 0.375 0.208333 0.458333 0.0833333 0.25 0.25 0.375 0.375 0 0.125 0.208333 0.0416667 0.625 0 0 1 0 0.166667 0 0 0.833333 0.458333 0.208333 0.0416667 0.291667 0.0416667 0.916667 0.0416667 0 0.125 0.666667 0.0416667 0.166667 0.25 0.291667 0.208333 0.25 0.25 0.208333 0.375 0.166667 0.416667 0.458333 0 0.125 0.208333 0.458333 0.25 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.208333 0.25 0.458333 0.0833333 0.416667 0 0.458333 0.125 0.25 0.375 0.208333 0.166667 0.25 0.208333 0.291667 0.25 0.125 0.0416667 0.666667 0.166667 0.0416667 0.0416667 0.916667 0 0.291667 0.208333 0.0416667 0.458333 0.833333 0 0 0.166667 0 1 0 0 0.625 0.208333 0.0416667 0.125 0.25 0.375 0.375 0 0.208333 0.0833333 0.458333 0.25 0.166667 0.0833333 0.375 0.375 0.0416667 0 0.333333 0.625 0 0 1 0 0.0416667 0.0833333 0 0.875 0.208333 0.25 0.0416667 0.5 0 0.916667 0 0.0833333 0 0.0416667 0.291667 0.666667 0.291667 0.125 0.125 0.458333 0.416667 0.0833333 0.125 0.375 0.25 0.291667 0.0833333 0.375 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Reverse Complement Original Motif Forward 4 10 0.0901591 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 47 Motif Name RXRRAR_DR5 Original Motif 0.521739 0 0.478261 0 0 0 1 0 0.0434783 0 0.565217 0.391304 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.782609 0.130435 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.173913 0.304348 0.217391 0.304348 0.217391 0.347826 0.391304 0.0434783 0.217391 0.173913 0.478261 0.130435 0.565217 0.0434783 0.304348 0.0869565 0.217391 0.26087 0.521739 0 0.73913 0.130435 0.130435 0 0.0434783 0.0434783 0.869565 0.0434783 0 0.0434783 0.695652 0.26087 0.0869565 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0434783 0.73913 0.130435 0.0869565 0.913043 0 0.0434783 0.0434783 Reserve Complement Motif 0.0434783 0 0.0434783 0.913043 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0869565 0.73913 0.0434783 0.130435 0.0869565 0 0.695652 0.0434783 0.26087 0.0434783 0.869565 0.0434783 0.0434783 0 0.130435 0.130435 0.73913 0.217391 0.521739 0.26087 0 0.0869565 0.0434783 0.304348 0.565217 0.217391 0.478261 0.173913 0.130435 0.217391 0.391304 0.347826 0.0434783 0.173913 0.217391 0.304348 0.304348 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.130435 0.782609 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.0434783 0.565217 0 0.391304 0 1 0 0 0 0 0.478261 0.521739 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 47 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 29 ESR1 Original Motif Reverse Complement Backward 1 17 0.0554256 Original Motif 0.261242 0.256959 0.329764 0.152034 0.228632 0.17094 0.350427 0.25 0.136752 0.369658 0.318376 0.175214 0.176596 0.487234 0.138298 0.197872 0.285106 0.493617 0.1 0.121277 0.651163 0.0591966 0.188161 0.10148 0.0759494 0.0168776 0.816456 0.0907173 0.04 0.0378947 0.884211 0.0378947 0.0694737 0.0863158 0.191579 0.652632 0.00842105 0.829474 0.111579 0.0505263 0.837895 0.0273684 0.0568421 0.0778947 0.122105 0.526316 0.225263 0.126316 0.132632 0.581053 0.111579 0.174737 0.134737 0.543158 0.204211 0.117895 0.0673684 0.04 0.0168421 0.875789 0.0442105 0.0463158 0.896842 0.0126316 0.642105 0.223158 0.0652632 0.0694737 0.0210526 0.917895 0.0252632 0.0357895 0.124211 0.743158 0.00421053 0.128421 0.0547368 0.347368 0.0463158 0.551579 Reverse Complement Motif 0.551579 0.347368 0.0463158 0.0547368 0.124211 0.00421053 0.743158 0.128421 0.0210526 0.0252632 0.917895 0.0357895 0.0694737 0.223158 0.0652632 0.642105 0.0442105 0.896842 0.0463158 0.0126316 0.875789 0.04 0.0168421 0.0673684 0.134737 0.204211 0.543158 0.117895 0.132632 0.111579 0.581053 0.174737 0.122105 0.225263 0.526316 0.126316 0.0778947 0.0273684 0.0568421 0.837895 0.00842105 0.111579 0.829474 0.0505263 0.652632 0.0863158 0.191579 0.0694737 0.04 0.884211 0.0378947 0.0378947 0.0759494 0.816456 0.0168776 0.0907173 0.10148 0.0591966 0.188161 0.651163 0.285106 0.1 0.493617 0.121277 0.176596 0.138298 0.487234 0.197872 0.136752 0.318376 0.369658 0.175214 0.228632 0.350427 0.17094 0.25 0.261242 0.329764 0.256959 0.152034 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 30 ESR2 Reverse Complement Original Motif Backward 1 17 0.0590677 Original Motif 0.218487 0.45098 0.176471 0.154062 0.442577 0.142857 0.114846 0.29972 0.521008 0.0420168 0.431373 0.00560224 0.0756303 0 0.770308 0.154062 0.0504202 0.0560224 0.893557 0 0.0364146 0.0532213 0.092437 0.817927 0 1 0 0 0.943978 0.00280112 0 0.0532213 0.137255 0.344538 0.316527 0.201681 0.179272 0.176471 0.417367 0.226891 0.145658 0.170868 0.411765 0.271709 0.0588235 0.092437 0.0672269 0.781513 0.176471 0.070028 0.742297 0.0112045 0.498599 0.277311 0.0532213 0.170868 0.0952381 0.7507 0.00560224 0.148459 0.128852 0.809524 0 0.0616246 0.0756303 0.252101 0 0.672269 0.168067 0.263305 0.380952 0.187675 Reverse Complement Motif 0.168067 0.380952 0.263305 0.187675 0.672269 0.252101 0 0.0756303 0.128852 0 0.809524 0.0616246 0.0952381 0.00560224 0.7507 0.148459 0.170868 0.277311 0.0532213 0.498599 0.176471 0.742297 0.070028 0.0112045 0.781513 0.092437 0.0672269 0.0588235 0.145658 0.411765 0.170868 0.271709 0.179272 0.417367 0.176471 0.226891 0.137255 0.316527 0.344538 0.201681 0.0532213 0.00280112 0 0.943978 0 0 1 0 0.817927 0.0532213 0.092437 0.0364146 0.0504202 0.893557 0.0560224 0 0.0756303 0.770308 0 0.154062 0.00560224 0.0420168 0.431373 0.521008 0.29972 0.142857 0.114846 0.442577 0.218487 0.176471 0.45098 0.154062 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 45 Pax5 Reverse Complement Reverse Complement Forward 4 17 0.0594693 Original Motif 0.333333 0.0833333 0.333333 0.25 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 0.25 0.25 0.166667 0.0833333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.583333 0.166667 0.0833333 0.166667 0.166667 0.416667 0.25 0.166667 0 0.25 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.666667 0.0833333 0.5 0.0833333 0.25 0.166667 0.5 0 0.166667 0.333333 0 0 1 0 0.166667 0.666667 0.0833333 0.0833333 0.25 0 0.75 0 0.0833333 0 0.333333 0.583333 0.5 0.0833333 0.416667 0 0.416667 0.0833333 0.416667 0.0833333 0.166667 0.833333 0 0 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.166667 0 0.833333 0 0.0833333 0.0833333 0.416667 0.416667 0 0.0833333 0.416667 0.5 0.583333 0 0.333333 0.0833333 0.25 0.75 0 0 0.166667 0.0833333 0.666667 0.0833333 0 1 0 0 0.333333 0 0.166667 0.5 0.166667 0.0833333 0.25 0.5 0.0833333 0.666667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.25 0.166667 0 0.166667 0.25 0.416667 0.166667 0.166667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.416667 0.166667 0.333333 0.166667 0.25 0.25 0.333333 0.333333 0.666667 0 0 0.25 0.0833333 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 24 Ar Reverse Complement Original Motif Forward 5 17 0.0751876 Original Motif 0.375 0.291667 0.0833333 0.25 0.375 0.0833333 0.125 0.416667 0.458333 0.125 0.125 0.291667 0.666667 0.0416667 0.291667 0 0 0 0.916667 0.0833333 0.5 0.25 0.0416667 0.208333 0.875 0.0833333 0 0.0416667 0 1 0 0 0.625 0 0.333333 0.0416667 0.166667 0.375 0.0833333 0.375 0.208333 0.458333 0.0833333 0.25 0.25 0.375 0.375 0 0.125 0.208333 0.0416667 0.625 0 0 1 0 0.166667 0 0 0.833333 0.458333 0.208333 0.0416667 0.291667 0.0416667 0.916667 0.0416667 0 0.125 0.666667 0.0416667 0.166667 0.25 0.291667 0.208333 0.25 0.25 0.208333 0.375 0.166667 0.416667 0.458333 0 0.125 0.208333 0.458333 0.25 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.208333 0.25 0.458333 0.0833333 0.416667 0 0.458333 0.125 0.25 0.375 0.208333 0.166667 0.25 0.208333 0.291667 0.25 0.125 0.0416667 0.666667 0.166667 0.0416667 0.0416667 0.916667 0 0.291667 0.208333 0.0416667 0.458333 0.833333 0 0 0.166667 0 1 0 0 0.625 0.208333 0.0416667 0.125 0.25 0.375 0.375 0 0.208333 0.0833333 0.458333 0.25 0.166667 0.0833333 0.375 0.375 0.0416667 0 0.333333 0.625 0 0 1 0 0.0416667 0.0833333 0 0.875 0.208333 0.25 0.0416667 0.5 0 0.916667 0 0.0833333 0 0.0416667 0.291667 0.666667 0.291667 0.125 0.125 0.458333 0.416667 0.0833333 0.125 0.375 0.25 0.291667 0.0833333 0.375 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 PPARGRXRA Original Motif Original Motif Backward 1 15 1.0449 Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reverse Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 17 RXRAVDR Original Motif Original Motif Forward 1 15 1.05297 Original Motif 0.3 0 0.7 0 0 0 1 0 0 0 0.9 0.1 0 0 0 1 0 0.9 0 0.1 0.9 0 0.1 0 0.4 0.2 0 0.4 0.2 0.4 0.2 0.2 0.2 0 0.8 0 0.5 0 0.5 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0.1 0 0 0.9 0 0.9 0 0.1 0.7 0.1 0.2 0 Reverse Complement Motif 0 0.1 0.2 0.7 0 0 0.9 0.1 0.9 0 0 0.1 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0.5 0.5 0.2 0.8 0 0 0.2 0.2 0.4 0.2 0.4 0.2 0 0.4 0 0 0.1 0.9 0 0 0.9 0.1 1 0 0 0 0 0.9 0 0.1 0 1 0 0 0.3 0.7 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 22 NR2F1 Reverse Complement Original Motif Backward 1 14 1.56607 Original Motif 0 0 0.153846 0.846154 0.0769231 0 0.923077 0 0.923077 0 0.0769231 0 0.461538 0.538462 0 0 0 1 0 0 0 0.230769 0 0.769231 0 0.153846 0 0.846154 0.0769231 0 0 0.923077 0.153846 0 0.846154 0 0.461538 0.307692 0.230769 0 0.461538 0.384615 0.0769231 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.230769 0.461538 0 0.307692 0 0.230769 0.230769 0.538462 Reverse Complement Motif 0.538462 0.230769 0.230769 0 0.230769 0 0.461538 0.307692 0.0769231 0.0769231 0.769231 0.0769231 0.0769231 0.384615 0.0769231 0.461538 0 0.307692 0.230769 0.461538 0.153846 0.846154 0 0 0.923077 0 0 0.0769231 0.846154 0.153846 0 0 0.769231 0.230769 0 0 0 0 1 0 0.461538 0 0.538462 0 0 0 0.0769231 0.923077 0.0769231 0.923077 0 0 0.846154 0 0.153846 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 PLAG1 Original Motif Original Motif Forward 1 14 1.57917 Original Motif 0 0 1 0 0.166667 0 0.777778 0.0555556 0 0 1 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0.777778 0.222222 0 0 0.833333 0.0555556 0.111111 0.222222 0.555556 0.0555556 0.166667 0.666667 0 0 0.333333 0.611111 0.277778 0.111111 0 0.111111 0 0.777778 0.111111 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.888889 0.111111 0.111111 0 0.888889 0 Reverse Complement Motif 0.111111 0.888889 0 0 0 0.888889 0 0.111111 0 1 0 0 0 1 0 0 0.111111 0.777778 0 0.111111 0 0.277778 0.111111 0.611111 0.333333 0 0 0.666667 0.222222 0.0555556 0.555556 0.166667 0 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0.222222 0.777778 0 0 0.944444 0 0.0555556 0 1 0 0 0.166667 0.777778 0 0.0555556 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 34 HNF4A Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 13 2.0437 Original Motif 0.41791 0.104478 0.402985 0.0746269 0.0298507 0.0298507 0.835821 0.104478 0.179104 0.0597015 0.522388 0.238806 0.0746269 0.343284 0.298507 0.283582 0.0447761 0.761194 0.0597015 0.134328 0.880597 0.0149254 0.0447761 0.0597015 0.791045 0.0298507 0.149254 0.0298507 0.835821 0.0149254 0.119403 0.0298507 0.0597015 0.0597015 0.865672 0.0149254 0.0895522 0.0298507 0.492537 0.38806 0.0447761 0.328358 0.164179 0.462687 0.0597015 0.731343 0.0746269 0.134328 0.626866 0.104478 0.149254 0.119403 Reverse Complement Motif 0.119403 0.104478 0.149254 0.626866 0.0597015 0.0746269 0.731343 0.134328 0.462687 0.328358 0.164179 0.0447761 0.0895522 0.492537 0.0298507 0.38806 0.0597015 0.865672 0.0597015 0.0149254 0.0298507 0.0149254 0.119403 0.835821 0.0298507 0.0298507 0.149254 0.791045 0.0597015 0.0149254 0.0447761 0.880597 0.0447761 0.0597015 0.761194 0.134328 0.0746269 0.298507 0.343284 0.283582 0.179104 0.522388 0.0597015 0.238806 0.0298507 0.835821 0.0298507 0.104478 0.0746269 0.104478 0.402985 0.41791 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Reverse Complement Original Motif Backward 8 13 2.06494 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # 2 Motif ID 48 Motif Name Tcfcp2l1 Original Motif 0.00196754 0.92548 0.0627152 0.00983768 0.069973 0.807513 0.00540142 0.117113 0.594508 0.00514832 0.275803 0.12454 0.0058838 0.0237803 0.967149 0.00318706 0.175477 0.33627 0.0256975 0.462555 0.0983847 0.28928 0.0621635 0.550171 0.173924 0.39726 0.151174 0.277642 0.357213 0.224939 0.252323 0.165526 0.63154 0.0696822 0.190954 0.107824 0.394421 0.0513824 0.310497 0.2437 0.00366928 0.933219 0.0547945 0.00831703 0.0617193 0.812148 0.00293902 0.123194 0.536555 0.00736016 0.305937 0.150147 0.0120393 0.0289926 0.954791 0.0041769 Reserve Complement Motif 0.0120393 0.954791 0.0289926 0.0041769 0.150147 0.00736016 0.305937 0.536555 0.0617193 0.00293902 0.812148 0.123194 0.00366928 0.0547945 0.933219 0.00831703 0.2437 0.0513824 0.310497 0.394421 0.107824 0.0696822 0.190954 0.63154 0.165526 0.224939 0.252323 0.357213 0.173924 0.151174 0.39726 0.277642 0.550171 0.28928 0.0621635 0.0983847 0.462555 0.33627 0.0256975 0.175477 0.0058838 0.967149 0.0237803 0.00318706 0.12454 0.00514832 0.275803 0.594508 0.069973 0.00540142 0.807513 0.117113 0.00196754 0.0627152 0.92548 0.00983768 ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 48 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 24 Ar Original Motif Original Motif Backward 3 14 0.0679942 Original Motif 0.375 0.291667 0.0833333 0.25 0.375 0.0833333 0.125 0.416667 0.458333 0.125 0.125 0.291667 0.666667 0.0416667 0.291667 0 0 0 0.916667 0.0833333 0.5 0.25 0.0416667 0.208333 0.875 0.0833333 0 0.0416667 0 1 0 0 0.625 0 0.333333 0.0416667 0.166667 0.375 0.0833333 0.375 0.208333 0.458333 0.0833333 0.25 0.25 0.375 0.375 0 0.125 0.208333 0.0416667 0.625 0 0 1 0 0.166667 0 0 0.833333 0.458333 0.208333 0.0416667 0.291667 0.0416667 0.916667 0.0416667 0 0.125 0.666667 0.0416667 0.166667 0.25 0.291667 0.208333 0.25 0.25 0.208333 0.375 0.166667 0.416667 0.458333 0 0.125 0.208333 0.458333 0.25 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.208333 0.25 0.458333 0.0833333 0.416667 0 0.458333 0.125 0.25 0.375 0.208333 0.166667 0.25 0.208333 0.291667 0.25 0.125 0.0416667 0.666667 0.166667 0.0416667 0.0416667 0.916667 0 0.291667 0.208333 0.0416667 0.458333 0.833333 0 0 0.166667 0 1 0 0 0.625 0.208333 0.0416667 0.125 0.25 0.375 0.375 0 0.208333 0.0833333 0.458333 0.25 0.166667 0.0833333 0.375 0.375 0.0416667 0 0.333333 0.625 0 0 1 0 0.0416667 0.0833333 0 0.875 0.208333 0.25 0.0416667 0.5 0 0.916667 0 0.0833333 0 0.0416667 0.291667 0.666667 0.291667 0.125 0.125 0.458333 0.416667 0.0833333 0.125 0.375 0.25 0.291667 0.0833333 0.375 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 29 ESR1 Original Motif Reverse Complement Backward 4 14 0.0713928 Original Motif 0.261242 0.256959 0.329764 0.152034 0.228632 0.17094 0.350427 0.25 0.136752 0.369658 0.318376 0.175214 0.176596 0.487234 0.138298 0.197872 0.285106 0.493617 0.1 0.121277 0.651163 0.0591966 0.188161 0.10148 0.0759494 0.0168776 0.816456 0.0907173 0.04 0.0378947 0.884211 0.0378947 0.0694737 0.0863158 0.191579 0.652632 0.00842105 0.829474 0.111579 0.0505263 0.837895 0.0273684 0.0568421 0.0778947 0.122105 0.526316 0.225263 0.126316 0.132632 0.581053 0.111579 0.174737 0.134737 0.543158 0.204211 0.117895 0.0673684 0.04 0.0168421 0.875789 0.0442105 0.0463158 0.896842 0.0126316 0.642105 0.223158 0.0652632 0.0694737 0.0210526 0.917895 0.0252632 0.0357895 0.124211 0.743158 0.00421053 0.128421 0.0547368 0.347368 0.0463158 0.551579 Reverse Complement Motif 0.551579 0.347368 0.0463158 0.0547368 0.124211 0.00421053 0.743158 0.128421 0.0210526 0.0252632 0.917895 0.0357895 0.0694737 0.223158 0.0652632 0.642105 0.0442105 0.896842 0.0463158 0.0126316 0.875789 0.04 0.0168421 0.0673684 0.134737 0.204211 0.543158 0.117895 0.132632 0.111579 0.581053 0.174737 0.122105 0.225263 0.526316 0.126316 0.0778947 0.0273684 0.0568421 0.837895 0.00842105 0.111579 0.829474 0.0505263 0.652632 0.0863158 0.191579 0.0694737 0.04 0.884211 0.0378947 0.0378947 0.0759494 0.816456 0.0168776 0.0907173 0.10148 0.0591966 0.188161 0.651163 0.285106 0.1 0.493617 0.121277 0.176596 0.138298 0.487234 0.197872 0.136752 0.318376 0.369658 0.175214 0.228632 0.350427 0.17094 0.25 0.261242 0.329764 0.256959 0.152034 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 12 Zfx Original Motif Original Motif Backward 1 14 0.0714852 Original Motif 0.105042 0.371849 0.37605 0.147059 0.125786 0.356394 0.360587 0.157233 0.190377 0.3159 0.416318 0.0774059 0.150313 0.102296 0.622129 0.125261 0.02079 0.617464 0.299376 0.0623701 0.012474 0.752599 0.004158 0.230769 0.0623701 0.259875 0.378378 0.299376 0.397089 0.320166 0.251559 0.031185 0.018711 0.004158 0.975052 0.002079 0 0.00623701 0.991684 0.002079 0.002079 0.997921 0 0 0 0.997921 0 0.002079 0 0.004158 0 0.995842 0.174636 0.253638 0.455301 0.116424 Reverse Complement Motif 0.174636 0.455301 0.253638 0.116424 0.995842 0.004158 0 0 0 0 0.997921 0.002079 0.002079 0 0.997921 0 0 0.991684 0.00623701 0.002079 0.018711 0.975052 0.004158 0.002079 0.031185 0.320166 0.251559 0.397089 0.0623701 0.378378 0.259875 0.299376 0.012474 0.004158 0.752599 0.230769 0.02079 0.299376 0.617464 0.0623701 0.150313 0.622129 0.102296 0.125261 0.190377 0.416318 0.3159 0.0774059 0.125786 0.360587 0.356394 0.157233 0.105042 0.37605 0.371849 0.147059 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 18 RREB1 Reverse Complement Reverse Complement Forward 6 14 0.0777364 Original Motif 0.272727 0.727273 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0 1 0 0 0.636364 0.363636 0 0 0.818182 0.181818 0 0 0.727273 0.272727 0 0 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0 1 0 0 1 0 0 0 0.363636 0.636364 0 0 0.0909091 0.909091 0 0 0.272727 0.727273 0 0 0.363636 0.545455 0.0909091 0 0.181818 0.818182 0 0 0.363636 0.454545 0 0.181818 0.363636 0.454545 0.0909091 0.0909091 0.363636 0.545455 0 0.0909091 0.0909091 0.636364 0.272727 0 0.363636 0.363636 0.181818 0.0909091 Reverse Complement Motif 0.0909091 0.363636 0.181818 0.363636 0.0909091 0.272727 0.636364 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0.363636 0.0909091 0.454545 0.0909091 0.363636 0 0.454545 0.181818 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0.0909091 0.545455 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.363636 0 0.636364 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0.363636 0 0.545455 0.0909091 0 0.272727 0 0.727273 0 0.181818 0 0.818182 0 0.363636 0 0.636364 0 0 1 0 0.272727 0 0.727273 0 0.0909091 0 0.909091 0 0.272727 0 0.727273 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 21 PLAG1 Reverse Complement Original Motif Forward 1 14 0.0817193 Original Motif 0 0 1 0 0.166667 0 0.777778 0.0555556 0 0 1 0 0 0 0.944444 0.0555556 0 0.777778 0.222222 0 0 0.833333 0.0555556 0.111111 0.222222 0.555556 0.0555556 0.166667 0.666667 0 0 0.333333 0.611111 0.277778 0.111111 0 0.111111 0 0.777778 0.111111 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0.888889 0.111111 0.111111 0 0.888889 0 Reverse Complement Motif 0.111111 0.888889 0 0 0 0.888889 0 0.111111 0 1 0 0 0 1 0 0 0.111111 0.777778 0 0.111111 0 0.277778 0.111111 0.611111 0.333333 0 0 0.666667 0.222222 0.0555556 0.555556 0.166667 0 0.0555556 0.833333 0.111111 0 0.222222 0.777778 0 0 0.944444 0 0.0555556 0 1 0 0 0.166667 0.777778 0 0.0555556 0 1 0 0 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 30 ESR2 Reverse Complement Original Motif Backward 1 14 0.0828703 Original Motif 0.218487 0.45098 0.176471 0.154062 0.442577 0.142857 0.114846 0.29972 0.521008 0.0420168 0.431373 0.00560224 0.0756303 0 0.770308 0.154062 0.0504202 0.0560224 0.893557 0 0.0364146 0.0532213 0.092437 0.817927 0 1 0 0 0.943978 0.00280112 0 0.0532213 0.137255 0.344538 0.316527 0.201681 0.179272 0.176471 0.417367 0.226891 0.145658 0.170868 0.411765 0.271709 0.0588235 0.092437 0.0672269 0.781513 0.176471 0.070028 0.742297 0.0112045 0.498599 0.277311 0.0532213 0.170868 0.0952381 0.7507 0.00560224 0.148459 0.128852 0.809524 0 0.0616246 0.0756303 0.252101 0 0.672269 0.168067 0.263305 0.380952 0.187675 Reverse Complement Motif 0.168067 0.380952 0.263305 0.187675 0.672269 0.252101 0 0.0756303 0.128852 0 0.809524 0.0616246 0.0952381 0.00560224 0.7507 0.148459 0.170868 0.277311 0.0532213 0.498599 0.176471 0.742297 0.070028 0.0112045 0.781513 0.092437 0.0672269 0.0588235 0.145658 0.411765 0.170868 0.271709 0.179272 0.417367 0.176471 0.226891 0.137255 0.316527 0.344538 0.201681 0.0532213 0.00280112 0 0.943978 0 0 1 0 0.817927 0.0532213 0.092437 0.0364146 0.0504202 0.893557 0.0560224 0 0.0756303 0.770308 0 0.154062 0.00560224 0.0420168 0.431373 0.521008 0.29972 0.142857 0.114846 0.442577 0.218487 0.176471 0.45098 0.154062 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 20 PPARGRXRA Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 14 0.0829929 Original Motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.0267442 0.427907 0.0918605 0.116144 0.00348432 0.779326 0.101045 0.161253 0.0174014 0.781903 0.0394432 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.0822711 0.633835 0.207416 0.0764774 0.949015 0.0243337 0.0173812 0.00926999 0.604867 0.0556199 0.312862 0.0266512 0.825231 0.00578704 0.158565 0.0104167 0.0950174 0.0023175 0.88876 0.013905 0.0475087 0.0104287 0.803013 0.13905 0.0254925 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.12645 0.784223 0.0672854 0.0545244 0.0939675 Reverse Complement Motif 0.0939675 0.0672854 0.0545244 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.12645 0.555041 0.114716 0.304751 0.0254925 0.0475087 0.803013 0.0104287 0.13905 0.0950174 0.88876 0.0023175 0.013905 0.0104167 0.00578704 0.158565 0.825231 0.0266512 0.0556199 0.312862 0.604867 0.00926999 0.0243337 0.0173812 0.949015 0.0822711 0.207416 0.633835 0.0764774 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.0174014 0.0394432 0.116144 0.779326 0.00348432 0.101045 0.0918605 0.0267442 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 45 Pax5 Reverse Complement Original Motif Forward 8 13 0.575635 Original Motif 0.333333 0.0833333 0.333333 0.25 0.333333 0 0.666667 0 0.333333 0.25 0.25 0.166667 0.0833333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.583333 0.166667 0.0833333 0.166667 0.166667 0.416667 0.25 0.166667 0 0.25 0.166667 0.583333 0.0833333 0.166667 0.666667 0.0833333 0.5 0.0833333 0.25 0.166667 0.5 0 0.166667 0.333333 0 0 1 0 0.166667 0.666667 0.0833333 0.0833333 0.25 0 0.75 0 0.0833333 0 0.333333 0.583333 0.5 0.0833333 0.416667 0 0.416667 0.0833333 0.416667 0.0833333 0.166667 0.833333 0 0 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.416667 0 0.5 0.0833333 Reverse Complement Motif 0.416667 0.5 0 0.0833333 0.166667 0.416667 0.416667 0 0.166667 0 0.833333 0 0.0833333 0.0833333 0.416667 0.416667 0 0.0833333 0.416667 0.5 0.583333 0 0.333333 0.0833333 0.25 0.75 0 0 0.166667 0.0833333 0.666667 0.0833333 0 1 0 0 0.333333 0 0.166667 0.5 0.166667 0.0833333 0.25 0.5 0.0833333 0.666667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.25 0.166667 0 0.166667 0.25 0.416667 0.166667 0.166667 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.583333 0.166667 0.0833333 0.416667 0.166667 0.333333 0.166667 0.25 0.25 0.333333 0.333333 0.666667 0 0 0.25 0.0833333 0.333333 0.333333 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 47 RXRRAR_DR5 Reverse Complement Original Motif Forward 5 13 0.578477 Original Motif 0.521739 0 0.478261 0 0 0 1 0 0.0434783 0 0.565217 0.391304 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.782609 0.130435 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.173913 0.304348 0.217391 0.304348 0.217391 0.347826 0.391304 0.0434783 0.217391 0.173913 0.478261 0.130435 0.565217 0.0434783 0.304348 0.0869565 0.217391 0.26087 0.521739 0 0.73913 0.130435 0.130435 0 0.0434783 0.0434783 0.869565 0.0434783 0 0.0434783 0.695652 0.26087 0.0869565 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0434783 0.73913 0.130435 0.0869565 0.913043 0 0.0434783 0.0434783 Reverse Complement Motif 0.0434783 0 0.0434783 0.913043 0.0434783 0.130435 0.73913 0.0869565 0.73913 0.0434783 0.130435 0.0869565 0 0.695652 0.0434783 0.26087 0.0434783 0.869565 0.0434783 0.0434783 0 0.130435 0.130435 0.73913 0.217391 0.521739 0.26087 0 0.0869565 0.0434783 0.304348 0.565217 0.217391 0.478261 0.173913 0.130435 0.217391 0.391304 0.347826 0.0434783 0.173913 0.217391 0.304348 0.304348 0 0 0.0434783 0.956522 0 0.130435 0.782609 0.0869565 0.956522 0 0.0434783 0 0.0434783 0.565217 0 0.391304 0 1 0 0 0 0 0.478261 0.521739 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset # Motif ID Motif Name Matching Format of First Motif Matching Format of Second Motif Direction Position # # of Overlap Similarity Score 2 19 REST Reverse Complement Original Motif Backward 10 12 1.07716 Original Motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.52797 0.0363181 0.168441 0.0914214 0.70382 0.0475892 0.855354 0.0313087 0.0657483 0.906367 0.0187266 0.0586767 0.0162297 0.021197 0.0274314 0.945137 0.00623441 0.0760125 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.00435866 0.00747198 0.00747198 0.001868 0.987547 0.00747198 0.00311333 0.0217933 0.922167 0.0124533 0.0435866 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.0773067 0.552369 0.0243142 0.00436409 0.966958 0.00436409 0.0124688 0.00311721 0.983167 0.00124688 0.877105 0.069869 0.0212102 0.0318153 0.008125 0.8 0.145625 0.04625 0.98375 0.005625 0.004375 0.00625 0.0263488 0.00815558 0.959849 0.00564617 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.0194724 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.0786164 0.112579 0.700629 0.0232704 0.163522 Reverse Complement Motif 0.112579 0.0232704 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.0786164 0.229899 0.432161 0.0194724 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.0263488 0.959849 0.00815558 0.00564617 0.00625 0.005625 0.004375 0.98375 0.008125 0.145625 0.8 0.04625 0.0318153 0.069869 0.0212102 0.877105 0.0124688 0.983167 0.00311721 0.00124688 0.0243142 0.966958 0.00436409 0.00436409 0.552369 0.233791 0.0773067 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.0217933 0.0124533 0.922167 0.0435866 0.001868 0.00747198 0.987547 0.00311333 0.00747198 0.00435866 0.00747198 0.980697 0.0760125 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.0274314 0.00623441 0.0162297 0.0187266 0.0586767 0.906367 0.0475892 0.0313087 0.855354 0.0657483 0.70382 0.168441 0.0914214 0.0363181 0.52797 0.109365 0.230044 0.132621 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Results created by MOTIFSIM on 01-01-2015 17:13:16 Runtime: 4.3991 seconds. MOTIFSIM is written by Ngoc Tam L. Tran.