**************************************************************************************************************************************************************************************************** MOTIFSIM - Motif Similarity Detection Tool Version 2.1 **************************************************************************************************************************************************************************************************** INPUT **************************************************************************************************************************************************************************************************** Input Parameters Number of files: 1 Number of top significant motifs: 10 Number of best matches: 5 Similarity cutoff: >= 0.75 Matching motif database: UniProbe Mus Musculus Phylogenetic tree: Yes Combined similar motifs: Yes Output file type: All Output file format: All Input files and motif counts File name Count of motifs Dataset # CisFinder_DM721_Cluster.txt 153 1 **************************************************************************************************************************************************************************************************** RESULTS **************************************************************************************************************************************************************************************************** ********************************************************************** Best Matches in Database for Each Motif (Highest to Lowest) ***************************************************************** Dataset #: 1 Motif ID: 1 Motif name: C001 Original motif 0.450000 0.050000 0.020000 0.480000 0.450000 0.040000 0.040000 0.470000 0.574257 0.089109 0.039604 0.297030 0.750000 0.090000 0.040000 0.120000 0.811881 0.049505 0.039604 0.099010 0.770000 0.030000 0.040000 0.160000 0.742574 0.029703 0.029703 0.198020 0.790000 0.030000 0.020000 0.160000 0.620000 0.020000 0.030000 0.330000 0.500000 0.020000 0.030000 0.450000 0.600000 0.060000 0.040000 0.300000 0.870000 0.060000 0.040000 0.030000 0.920000 0.040000 0.020000 0.020000 0.919192 0.040404 0.020202 0.020202 0.797980 0.060606 0.060606 0.080808 0.520000 0.070000 0.050000 0.360000 0.742574 0.108911 0.029703 0.118812 0.910000 0.040000 0.020000 0.030000 0.930000 0.030000 0.020000 0.020000 0.840000 0.060000 0.040000 0.060000 0.606061 0.070707 0.030303 0.292929 0.504950 0.049505 0.029703 0.415842 0.610000 0.050000 0.030000 0.310000 0.720000 0.240000 0.030000 0.010000 0.848485 0.111111 0.020202 0.020202 0.760000 0.130000 0.030000 0.080000 0.700000 0.160000 0.090000 0.050000 0.350000 0.290000 0.060000 0.300000 0.510000 0.040000 0.030000 0.420000 0.350000 0.150000 0.050000 0.450000 Consensus sequence: WWWAAAAAWWAAAAAWAAAAAWWAAAAHWW Reserve complement motif 0.450000 0.150000 0.050000 0.350000 0.420000 0.040000 0.030000 0.510000 0.300000 0.290000 0.060000 0.350000 0.050000 0.160000 0.090000 0.700000 0.080000 0.130000 0.030000 0.760000 0.020202 0.111111 0.020202 0.848485 0.010000 0.240000 0.030000 0.720000 0.310000 0.050000 0.030000 0.610000 0.415842 0.049505 0.029703 0.504950 0.292929 0.070707 0.030303 0.606061 0.060000 0.060000 0.040000 0.840000 0.020000 0.030000 0.020000 0.930000 0.030000 0.040000 0.020000 0.910000 0.118812 0.108911 0.029703 0.742574 0.360000 0.070000 0.050000 0.520000 0.080808 0.060606 0.060606 0.797980 0.020202 0.040404 0.020202 0.919192 0.020000 0.040000 0.020000 0.920000 0.030000 0.060000 0.040000 0.870000 0.300000 0.060000 0.040000 0.600000 0.450000 0.020000 0.030000 0.500000 0.330000 0.020000 0.030000 0.620000 0.160000 0.030000 0.020000 0.790000 0.198020 0.029703 0.029703 0.742574 0.160000 0.030000 0.040000 0.770000 0.099010 0.049505 0.039604 0.811881 0.120000 0.090000 0.040000 0.750000 0.297030 0.089109 0.039604 0.574257 0.470000 0.040000 0.040000 0.450000 0.480000 0.050000 0.020000 0.450000 Consensus sequence: WWHTTTTWWTTTTTWTTTTTWWTTTTTWWW ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 1 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00528 Foxm1_primary Original Motif Original Motif Backward 3 23 0.084647 Species: Mus musculus Original motif 0.402634 0.249702 0.143705 0.203959 0.709619 0.108953 0.130781 0.050647 0.334232 0.077498 0.228818 0.359452 0.131721 0.094794 0.234481 0.539005 0.170102 0.237609 0.252464 0.339824 0.244961 0.347304 0.228129 0.179606 0.612141 0.132244 0.180110 0.075504 0.472236 0.042388 0.234419 0.250957 0.125213 0.007413 0.849788 0.017587 0.702068 0.064216 0.141992 0.091724 0.008657 0.038238 0.002959 0.950145 0.007170 0.002244 0.986824 0.003763 0.002862 0.979956 0.000711 0.016471 0.971196 0.001954 0.011441 0.015409 0.105575 0.031482 0.022836 0.840107 0.031534 0.736742 0.032785 0.198939 0.479153 0.347558 0.031799 0.141490 0.056405 0.123140 0.023989 0.796466 0.111194 0.195344 0.501360 0.192102 0.376359 0.416820 0.072818 0.134004 0.225111 0.249460 0.306563 0.218866 0.405251 0.168478 0.108618 0.317653 0.165386 0.191749 0.268604 0.374261 Consensus sequence: HADTBVADGATGCATCMTGMVHB Reverse complement motif 0.374261 0.191749 0.268604 0.165386 0.317653 0.168478 0.108618 0.405251 0.225111 0.306563 0.249460 0.218866 0.376359 0.072818 0.416820 0.134004 0.111194 0.501360 0.195344 0.192102 0.796466 0.123140 0.023989 0.056405 0.141490 0.347558 0.031799 0.479153 0.031534 0.032785 0.736742 0.198939 0.840107 0.031482 0.022836 0.105575 0.015409 0.001954 0.011441 0.971196 0.002862 0.000711 0.979956 0.016471 0.007170 0.986824 0.002244 0.003763 0.950145 0.038238 0.002959 0.008657 0.091724 0.064216 0.141992 0.702068 0.125213 0.849788 0.007413 0.017587 0.250957 0.042388 0.234419 0.472236 0.075504 0.132244 0.180110 0.612141 0.244961 0.228129 0.347304 0.179606 0.339824 0.237609 0.252464 0.170102 0.539005 0.094794 0.234481 0.131721 0.359452 0.077498 0.228818 0.334232 0.050647 0.108953 0.130781 0.709619 0.203959 0.249702 0.143705 0.402634 Consensus sequence: VHVRCAYGATGCATCDTVVADTH Alignment: -------HADTBVADGATGCATCMTGMVHB WWWAAAAAWWAAAAAWAAAAAWWAAAAHWW-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_primary Original Motif Original Motif Backward 2 22 0.561689 Species: Mus musculus Original motif 0.360997 0.300272 0.115555 0.223177 0.309749 0.228429 0.166233 0.295589 0.149419 0.176868 0.240155 0.433558 0.379704 0.095791 0.276373 0.248133 0.394549 0.174184 0.130641 0.300626 0.443749 0.070776 0.211081 0.274393 0.364301 0.074356 0.370406 0.190936 0.791976 0.038475 0.093390 0.076159 0.963721 0.001826 0.002456 0.031997 0.004516 0.954596 0.008092 0.032796 0.981080 0.002062 0.002161 0.014697 0.986185 0.001846 0.006976 0.004992 0.059567 0.003649 0.002189 0.934595 0.495328 0.024257 0.240450 0.239965 0.305027 0.094878 0.526069 0.074025 0.418442 0.196237 0.158323 0.226998 0.336713 0.220452 0.191155 0.251680 0.192296 0.300342 0.169047 0.338315 0.240387 0.144634 0.128513 0.486465 0.290763 0.271259 0.116600 0.321377 0.224825 0.296233 0.229255 0.249687 0.493240 0.171285 0.075148 0.260326 Consensus sequence: HHBDHDDAACAATDRHHHHHBW Reverse complement motif 0.260326 0.171285 0.075148 0.493240 0.224825 0.229255 0.296233 0.249687 0.321377 0.271259 0.116600 0.290763 0.486465 0.144634 0.128513 0.240387 0.338315 0.300342 0.169047 0.192296 0.251680 0.220452 0.191155 0.336713 0.226998 0.196237 0.158323 0.418442 0.305027 0.526069 0.094878 0.074025 0.239965 0.024257 0.240450 0.495328 0.934595 0.003649 0.002189 0.059567 0.004992 0.001846 0.006976 0.986185 0.014697 0.002062 0.002161 0.981080 0.004516 0.008092 0.954596 0.032796 0.031997 0.001826 0.002456 0.963721 0.076159 0.038475 0.093390 0.791976 0.364301 0.370406 0.074356 0.190936 0.274393 0.070776 0.211081 0.443749 0.300626 0.174184 0.130641 0.394549 0.248133 0.095791 0.276373 0.379704 0.433558 0.176868 0.240155 0.149419 0.295589 0.228429 0.166233 0.309749 0.223177 0.300272 0.115555 0.360997 Consensus sequence: WBHHHHHMDATTGTTHDHDVHH Alignment: --------HHBDHDDAACAATDRHHHHHBW WWWAAAAAWWAAAAAWAAAAAWWAAAAHWW- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00032 Gata3_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 6 22 0.566383 Species: Mus musculus Original motif 0.151572 0.262753 0.258275 0.327401 0.221834 0.113385 0.275380 0.389400 0.297769 0.136928 0.134678 0.430625 0.270099 0.110415 0.271106 0.348380 0.265471 0.090253 0.223340 0.420936 0.616582 0.090091 0.171960 0.121367 0.197318 0.107541 0.406904 0.288237 0.798258 0.046950 0.001406 0.153385 0.003195 0.002516 0.989707 0.004582 0.991503 0.002748 0.002617 0.003132 0.005015 0.002764 0.003026 0.989195 0.948394 0.008932 0.001344 0.041330 0.973109 0.004100 0.004081 0.018710 0.040365 0.113905 0.828185 0.017545 0.736608 0.130524 0.113464 0.019404 0.415921 0.106101 0.316613 0.161365 0.376582 0.170927 0.155572 0.296919 0.137731 0.197151 0.211055 0.454064 0.324853 0.122747 0.246107 0.306293 0.462490 0.207311 0.159392 0.170807 0.380420 0.188972 0.311990 0.118618 0.222178 0.157873 0.380486 0.239463 Consensus sequence: BDHDDADAGATAAGADHBDHVD Reverse complement motif 0.222178 0.380486 0.157873 0.239463 0.118618 0.188972 0.311990 0.380420 0.170807 0.207311 0.159392 0.462490 0.306293 0.122747 0.246107 0.324853 0.454064 0.197151 0.211055 0.137731 0.296919 0.170927 0.155572 0.376582 0.161365 0.106101 0.316613 0.415921 0.019404 0.130524 0.113464 0.736608 0.040365 0.828185 0.113905 0.017545 0.018710 0.004100 0.004081 0.973109 0.041330 0.008932 0.001344 0.948394 0.989195 0.002764 0.003026 0.005015 0.003132 0.002748 0.002617 0.991503 0.003195 0.989707 0.002516 0.004582 0.153385 0.046950 0.001406 0.798258 0.197318 0.406904 0.107541 0.288237 0.121367 0.090091 0.171960 0.616582 0.420936 0.090253 0.223340 0.265471 0.348380 0.110415 0.271106 0.270099 0.430625 0.136928 0.134678 0.297769 0.389400 0.113385 0.275380 0.221834 0.327401 0.262753 0.258275 0.151572 Consensus sequence: HBHDVHDTCTTATCTHTDDHDV Alignment: --------HBHDVHDTCTTATCTHTDDHDV WWHTTTTWWTTTTTWTTTTTWWTTTTTWWW----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00032 Gata3_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 7 22 0.575767 Species: Mus musculus Original motif 0.177641 0.319872 0.115137 0.387350 0.136644 0.182137 0.205873 0.475347 0.254263 0.244280 0.165207 0.336250 0.240415 0.207557 0.237497 0.314530 0.271041 0.214702 0.364395 0.149863 0.095475 0.320104 0.191738 0.392682 0.500902 0.142722 0.026556 0.329820 0.051221 0.023698 0.897245 0.027836 0.922410 0.027509 0.024058 0.026023 0.030735 0.070903 0.024248 0.874114 0.242120 0.231992 0.225143 0.300745 0.106956 0.220471 0.283490 0.389083 0.152079 0.165830 0.135066 0.547025 0.839205 0.051581 0.060119 0.049095 0.041204 0.069147 0.070830 0.818819 0.051861 0.848177 0.027599 0.072363 0.383793 0.016807 0.397470 0.201931 0.381899 0.215846 0.255908 0.146347 0.094792 0.358651 0.280905 0.265652 0.296132 0.181545 0.178433 0.343890 0.301997 0.254722 0.108566 0.334714 0.349481 0.270693 0.137507 0.242319 Consensus sequence: HBHDVBWGATHBTATCRVBHHH Reverse complement motif 0.242319 0.270693 0.137507 0.349481 0.334714 0.254722 0.108566 0.301997 0.343890 0.181545 0.178433 0.296132 0.094792 0.280905 0.358651 0.265652 0.146347 0.215846 0.255908 0.381899 0.383793 0.397470 0.016807 0.201931 0.051861 0.027599 0.848177 0.072363 0.818819 0.069147 0.070830 0.041204 0.049095 0.051581 0.060119 0.839205 0.547025 0.165830 0.135066 0.152079 0.389083 0.220471 0.283490 0.106956 0.300745 0.231992 0.225143 0.242120 0.874114 0.070903 0.024248 0.030735 0.026023 0.027509 0.024058 0.922410 0.051221 0.897245 0.023698 0.027836 0.329820 0.142722 0.026556 0.500902 0.392682 0.320104 0.191738 0.095475 0.271041 0.364395 0.214702 0.149863 0.314530 0.207557 0.237497 0.240415 0.336250 0.244280 0.165207 0.254263 0.475347 0.182137 0.205873 0.136644 0.387350 0.319872 0.115137 0.177641 Consensus sequence: HHHBBMGATAVHATCWVVDHVH Alignment: HBHDVBWGATHBTATCRVBHHH-------- ------WWWAAAAAWWAAAAAWAAAAAWWAAAAHWW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 6 22 0.578275 Species: Mus musculus Original motif 0.067627 0.131333 0.654425 0.146615 0.156488 0.114442 0.145630 0.583441 0.206450 0.265630 0.358017 0.169903 0.090729 0.460713 0.274712 0.173847 0.285994 0.099998 0.154485 0.459523 0.635908 0.184787 0.072982 0.106323 0.748421 0.039204 0.092605 0.119769 0.081342 0.061327 0.044532 0.812799 0.143120 0.043879 0.024216 0.788785 0.247544 0.092102 0.621453 0.038901 0.295531 0.036295 0.027594 0.640580 0.194561 0.305468 0.339916 0.160055 0.175038 0.193568 0.101212 0.530182 0.145226 0.167488 0.559871 0.127415 0.271501 0.237429 0.206701 0.284369 0.216834 0.109191 0.569605 0.104370 0.182624 0.177160 0.300475 0.339742 0.331737 0.198645 0.265137 0.204482 0.230155 0.359365 0.183450 0.227029 0.056581 0.067297 0.463052 0.413070 0.198891 0.324626 0.304424 0.172059 0.181968 0.287547 0.202419 0.328066 Consensus sequence: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB Reverse complement motif 0.328066 0.287547 0.202419 0.181968 0.198891 0.304424 0.324626 0.172059 0.056581 0.463052 0.067297 0.413070 0.230155 0.183450 0.359365 0.227029 0.204482 0.198645 0.265137 0.331737 0.339742 0.177160 0.300475 0.182624 0.216834 0.569605 0.109191 0.104370 0.284369 0.237429 0.206701 0.271501 0.145226 0.559871 0.167488 0.127415 0.530182 0.193568 0.101212 0.175038 0.194561 0.339916 0.305468 0.160055 0.640580 0.036295 0.027594 0.295531 0.247544 0.621453 0.092102 0.038901 0.788785 0.043879 0.024216 0.143120 0.812799 0.061327 0.044532 0.081342 0.119769 0.039204 0.092605 0.748421 0.106323 0.184787 0.072982 0.635908 0.459523 0.099998 0.154485 0.285994 0.090729 0.274712 0.460713 0.173847 0.206450 0.358017 0.265630 0.169903 0.583441 0.114442 0.145630 0.156488 0.067627 0.654425 0.131333 0.146615 Consensus sequence: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC Alignment: --------VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC WWHTTTTWWTTTTTWTTTTTWWTTTTTWWW----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 2 Motif name: C002 Original motif 0.138614 0.227723 0.069307 0.564356 0.570000 0.060000 0.240000 0.130000 0.040404 0.505051 0.030303 0.424242 0.530000 0.020000 0.430000 0.020000 0.030000 0.580000 0.020000 0.370000 0.717172 0.020202 0.232323 0.030303 0.030000 0.720000 0.020000 0.230000 0.870000 0.020000 0.080000 0.030000 0.029703 0.752475 0.019802 0.198020 0.929293 0.010101 0.050505 0.010101 0.019802 0.811881 0.029703 0.138614 0.910891 0.019802 0.049505 0.019802 0.030000 0.800000 0.040000 0.130000 0.920792 0.019802 0.029703 0.029703 0.029703 0.841584 0.029703 0.099010 0.930000 0.020000 0.020000 0.030000 0.030000 0.670000 0.030000 0.270000 0.535354 0.010101 0.444444 0.010101 0.030000 0.620000 0.020000 0.330000 0.880000 0.050000 0.030000 0.040000 0.030000 0.560000 0.020000 0.390000 0.525253 0.010101 0.444444 0.020202 0.030000 0.450000 0.030000 0.490000 Consensus sequence: TAYRYACACACACACACRYAYRY Reserve complement motif 0.490000 0.450000 0.030000 0.030000 0.020202 0.010101 0.444444 0.525253 0.030000 0.020000 0.560000 0.390000 0.040000 0.050000 0.030000 0.880000 0.030000 0.020000 0.620000 0.330000 0.010101 0.010101 0.444444 0.535354 0.030000 0.030000 0.670000 0.270000 0.030000 0.020000 0.020000 0.930000 0.029703 0.029703 0.841584 0.099010 0.029703 0.019802 0.029703 0.920792 0.030000 0.040000 0.800000 0.130000 0.019802 0.019802 0.049505 0.910891 0.019802 0.029703 0.811881 0.138614 0.010101 0.010101 0.050505 0.929293 0.029703 0.019802 0.752475 0.198020 0.030000 0.020000 0.080000 0.870000 0.030000 0.020000 0.720000 0.230000 0.030303 0.020202 0.232323 0.717172 0.030000 0.020000 0.580000 0.370000 0.020000 0.020000 0.430000 0.530000 0.040404 0.030303 0.505051 0.424242 0.130000 0.060000 0.240000 0.570000 0.564356 0.227723 0.069307 0.138614 Consensus sequence: MKKTKKGTGTGTGTGTGTKKKTA ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 2 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 23 0.058996 Species: Mus musculus Original motif 0.404007 0.395873 0.173319 0.026801 0.305977 0.215534 0.215359 0.263130 0.370148 0.250957 0.113088 0.265808 0.324336 0.229498 0.174679 0.271487 0.263563 0.137896 0.079217 0.519324 0.265762 0.222582 0.082555 0.429102 0.206721 0.288405 0.017851 0.487023 0.164361 0.236500 0.061051 0.538088 0.593344 0.348446 0.050304 0.007906 0.031328 0.947050 0.007032 0.014590 0.010428 0.956605 0.029142 0.003825 0.459636 0.207616 0.155368 0.177380 0.014573 0.964608 0.012209 0.008610 0.066291 0.918196 0.008729 0.006784 0.019488 0.866774 0.018897 0.094841 0.767405 0.104198 0.029234 0.099164 0.052494 0.772531 0.039832 0.135142 0.296085 0.243498 0.350935 0.109482 0.518843 0.226659 0.124784 0.129714 0.647901 0.019721 0.159901 0.172477 0.113912 0.231511 0.214864 0.439713 0.223117 0.310596 0.293328 0.172959 0.185557 0.487662 0.136321 0.190459 Consensus sequence: MHHHWHYTMCCHCCCACVAABVH Reverse complement motif 0.185557 0.136321 0.487662 0.190459 0.223117 0.293328 0.310596 0.172959 0.439713 0.231511 0.214864 0.113912 0.172477 0.019721 0.159901 0.647901 0.129714 0.226659 0.124784 0.518843 0.296085 0.350935 0.243498 0.109482 0.052494 0.039832 0.772531 0.135142 0.099164 0.104198 0.029234 0.767405 0.019488 0.018897 0.866774 0.094841 0.066291 0.008729 0.918196 0.006784 0.014573 0.012209 0.964608 0.008610 0.177380 0.207616 0.155368 0.459636 0.010428 0.029142 0.956605 0.003825 0.031328 0.007032 0.947050 0.014590 0.007906 0.348446 0.050304 0.593344 0.538088 0.236500 0.061051 0.164361 0.487023 0.288405 0.017851 0.206721 0.429102 0.222582 0.082555 0.265762 0.519324 0.137896 0.079217 0.263563 0.271487 0.229498 0.174679 0.324336 0.265808 0.250957 0.113088 0.370148 0.263130 0.215534 0.215359 0.305977 0.026801 0.395873 0.173319 0.404007 Consensus sequence: DVVTTVGTGGGHGGYAMHWHHHY Alignment: MHHHWHYTMCCHCCCACVAABVH TAYRYACACACACACACRYAYRY ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00050 Bhlhb2_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 1 23 0.067872 Species: Mus musculus Original motif 0.120938 0.344851 0.124072 0.410138 0.220931 0.169844 0.422396 0.186829 0.127752 0.260812 0.103811 0.507625 0.140641 0.405473 0.287668 0.166218 0.296957 0.155579 0.301094 0.246370 0.219647 0.287193 0.154072 0.339087 0.049294 0.026059 0.121789 0.802859 0.520042 0.289284 0.173423 0.017251 0.049190 0.943472 0.004308 0.003030 0.902609 0.006767 0.074770 0.015854 0.003221 0.971329 0.005512 0.019937 0.019937 0.005512 0.971329 0.003221 0.015854 0.074770 0.006767 0.902609 0.003030 0.004308 0.943472 0.049190 0.003497 0.088920 0.685942 0.221641 0.802859 0.121789 0.026059 0.049294 0.334544 0.155170 0.275193 0.235092 0.275957 0.132104 0.454982 0.136957 0.134097 0.254352 0.422940 0.188611 0.396163 0.432784 0.051281 0.119772 0.276474 0.115627 0.419844 0.188056 0.160759 0.088061 0.649863 0.101318 0.203314 0.166595 0.106821 0.523270 Consensus sequence: YDYBDHTMCACGTGGADDBMDGT Reverse complement motif 0.523270 0.166595 0.106821 0.203314 0.160759 0.649863 0.088061 0.101318 0.276474 0.419844 0.115627 0.188056 0.396163 0.051281 0.432784 0.119772 0.134097 0.422940 0.254352 0.188611 0.275957 0.454982 0.132104 0.136957 0.235092 0.155170 0.275193 0.334544 0.049294 0.121789 0.026059 0.802859 0.003497 0.685942 0.088920 0.221641 0.003030 0.943472 0.004308 0.049190 0.902609 0.074770 0.006767 0.015854 0.019937 0.971329 0.005512 0.003221 0.003221 0.005512 0.971329 0.019937 0.015854 0.006767 0.074770 0.902609 0.049190 0.004308 0.943472 0.003030 0.017251 0.289284 0.173423 0.520042 0.802859 0.026059 0.121789 0.049294 0.339087 0.287193 0.154072 0.219647 0.296957 0.301094 0.155579 0.246370 0.140641 0.287668 0.405473 0.166218 0.507625 0.260812 0.103811 0.127752 0.220931 0.422396 0.169844 0.186829 0.410138 0.344851 0.124072 0.120938 Consensus sequence: ACHRBHDTCCACGTGYAHHBMHM Alignment: YDYBDHTMCACGTGGADDBMDGT TAYRYACACACACACACRYAYRY ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_primaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 23 0.073922 Species: Mus musculus Original motif 0.183797 0.268049 0.330111 0.218043 0.127599 0.330310 0.243614 0.298477 0.143199 0.188046 0.268593 0.400162 0.214690 0.205230 0.247090 0.332990 0.294688 0.299104 0.327152 0.079056 0.221909 0.193223 0.480155 0.104712 0.444072 0.068239 0.481838 0.005852 0.006182 0.015429 0.901278 0.077111 0.766535 0.111138 0.121632 0.000696 0.014848 0.973961 0.000298 0.010893 0.001807 0.992200 0.002669 0.003324 0.795344 0.140510 0.018576 0.045571 0.006990 0.988200 0.002510 0.002299 0.154898 0.842296 0.000998 0.001808 0.029577 0.919262 0.006935 0.044226 0.677987 0.032075 0.185065 0.104874 0.195132 0.364580 0.319321 0.120967 0.225412 0.115034 0.612849 0.046705 0.548628 0.058900 0.162857 0.229616 0.112531 0.340331 0.165910 0.381227 0.073029 0.303078 0.363896 0.259997 0.561485 0.260567 0.092979 0.084969 0.132283 0.457691 0.140159 0.269867 Consensus sequence: BBBDVVRGACCACCCAVGABBAB Reverse complement motif 0.132283 0.140159 0.457691 0.269867 0.084969 0.260567 0.092979 0.561485 0.073029 0.363896 0.303078 0.259997 0.381227 0.340331 0.165910 0.112531 0.229616 0.058900 0.162857 0.548628 0.225412 0.612849 0.115034 0.046705 0.195132 0.319321 0.364580 0.120967 0.104874 0.032075 0.185065 0.677987 0.029577 0.006935 0.919262 0.044226 0.154898 0.000998 0.842296 0.001808 0.006990 0.002510 0.988200 0.002299 0.045571 0.140510 0.018576 0.795344 0.001807 0.002669 0.992200 0.003324 0.014848 0.000298 0.973961 0.010893 0.000696 0.111138 0.121632 0.766535 0.006182 0.901278 0.015429 0.077111 0.444072 0.481838 0.068239 0.005852 0.221909 0.480155 0.193223 0.104712 0.294688 0.327152 0.299104 0.079056 0.332990 0.205230 0.247090 0.214690 0.400162 0.188046 0.268593 0.143199 0.127599 0.243614 0.330310 0.298477 0.183797 0.330111 0.268049 0.218043 Consensus sequence: BTBVTCVTGGGTGGTCMVVDVBB Alignment: BBBDVVRGACCACCCAVGABBAB TAYRYACACACACACACRYAYRY ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_primaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 23 0.077586 Species: Mus musculus Original motif 0.137831 0.118922 0.394177 0.349070 0.190108 0.163633 0.138507 0.507753 0.346002 0.332315 0.228621 0.093063 0.113254 0.287554 0.373285 0.225908 0.272578 0.125402 0.328963 0.273057 0.333973 0.115165 0.194267 0.356595 0.381054 0.086215 0.501679 0.031052 0.002232 0.007405 0.966087 0.024276 0.834741 0.112115 0.052053 0.001091 0.009034 0.983239 0.000766 0.006960 0.002054 0.988103 0.003138 0.006705 0.805772 0.171299 0.008415 0.014515 0.020076 0.976846 0.000894 0.002183 0.079914 0.917273 0.001179 0.001634 0.013983 0.950545 0.004205 0.031267 0.789407 0.039441 0.108645 0.062507 0.055453 0.161271 0.595249 0.188028 0.333424 0.128169 0.373270 0.165136 0.536103 0.109520 0.062980 0.291397 0.346477 0.090909 0.279533 0.283081 0.045892 0.190183 0.584314 0.179611 0.088294 0.406148 0.251647 0.253912 0.202467 0.447159 0.162802 0.187571 Consensus sequence: DTVBDDRGACCACCCAGDWDGBH Reverse complement motif 0.202467 0.162802 0.447159 0.187571 0.088294 0.251647 0.406148 0.253912 0.045892 0.584314 0.190183 0.179611 0.283081 0.090909 0.279533 0.346477 0.291397 0.109520 0.062980 0.536103 0.333424 0.373270 0.128169 0.165136 0.055453 0.595249 0.161271 0.188028 0.062507 0.039441 0.108645 0.789407 0.013983 0.004205 0.950545 0.031267 0.079914 0.001179 0.917273 0.001634 0.020076 0.000894 0.976846 0.002183 0.014515 0.171299 0.008415 0.805772 0.002054 0.003138 0.988103 0.006705 0.009034 0.000766 0.983239 0.006960 0.001091 0.112115 0.052053 0.834741 0.002232 0.966087 0.007405 0.024276 0.381054 0.501679 0.086215 0.031052 0.356595 0.115165 0.194267 0.333973 0.272578 0.328963 0.125402 0.273057 0.113254 0.373285 0.287554 0.225908 0.093063 0.332315 0.228621 0.346002 0.507753 0.163633 0.138507 0.190108 0.137831 0.394177 0.118922 0.349070 Consensus sequence: DBCDWHCTGGGTGGTCMDHBBAH Alignment: DTVBDDRGACCACCCAGDWDGBH TAYRYACACACACACACRYAYRY ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 2 22 0.559380 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: -HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB MKKTKKGTGTGTGTGTGTKKKTA- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 3 Motif name: C003 Original motif 0.128713 0.089109 0.742574 0.039604 0.060000 0.440000 0.410000 0.090000 0.212121 0.676768 0.010101 0.101010 0.020000 0.500000 0.020000 0.460000 0.010000 0.900000 0.010000 0.080000 0.170000 0.320000 0.150000 0.360000 0.040404 0.444444 0.323232 0.191919 0.010000 0.660000 0.100000 0.230000 0.010000 0.820000 0.020000 0.150000 0.060000 0.330000 0.060000 0.550000 0.240000 0.190000 0.410000 0.160000 0.010000 0.700000 0.040000 0.250000 0.020000 0.770000 0.010000 0.200000 0.069307 0.504950 0.108911 0.316832 0.050505 0.575758 0.171717 0.202020 0.050000 0.570000 0.180000 0.200000 0.020202 0.747475 0.070707 0.161616 0.010000 0.810000 0.020000 0.160000 0.010101 0.898990 0.020202 0.070707 0.040000 0.790000 0.070000 0.100000 0.120000 0.380000 0.390000 0.110000 0.080000 0.510000 0.340000 0.070000 0.030000 0.830000 0.050000 0.090000 0.020000 0.840000 0.020000 0.120000 0.010101 0.858586 0.010101 0.121212 0.050505 0.797980 0.020202 0.131313 0.188119 0.504950 0.247525 0.059406 0.110000 0.470000 0.370000 0.050000 0.050000 0.500000 0.430000 0.020000 0.020000 0.880000 0.030000 0.070000 Consensus sequence: GSCYCHSCCYVCCYCCCCCCSSCCCCCSSC Reserve complement motif 0.020000 0.030000 0.880000 0.070000 0.050000 0.430000 0.500000 0.020000 0.110000 0.370000 0.470000 0.050000 0.188119 0.247525 0.504950 0.059406 0.050505 0.020202 0.797980 0.131313 0.010101 0.010101 0.858586 0.121212 0.020000 0.020000 0.840000 0.120000 0.030000 0.050000 0.830000 0.090000 0.080000 0.340000 0.510000 0.070000 0.120000 0.390000 0.380000 0.110000 0.040000 0.070000 0.790000 0.100000 0.010101 0.020202 0.898990 0.070707 0.010000 0.020000 0.810000 0.160000 0.020202 0.070707 0.747475 0.161616 0.050000 0.180000 0.570000 0.200000 0.050505 0.171717 0.575758 0.202020 0.069307 0.108911 0.504950 0.316832 0.020000 0.010000 0.770000 0.200000 0.010000 0.040000 0.700000 0.250000 0.240000 0.410000 0.190000 0.160000 0.550000 0.330000 0.060000 0.060000 0.010000 0.020000 0.820000 0.150000 0.010000 0.100000 0.660000 0.230000 0.040404 0.323232 0.444444 0.191919 0.360000 0.320000 0.150000 0.170000 0.010000 0.010000 0.900000 0.080000 0.020000 0.020000 0.500000 0.460000 0.212121 0.010101 0.676768 0.101010 0.060000 0.410000 0.440000 0.090000 0.128713 0.742574 0.089109 0.039604 Consensus sequence: GSSGGGGGSSGGGGGGKGGVMGGSHGKGSC ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 3 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 2 23 0.050442 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: -------VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH GSCYCHSCCYVCCYCCCCCCSSCCCCCSSC- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 3 23 0.050817 Species: Mus musculus Original motif 0.404007 0.395873 0.173319 0.026801 0.305977 0.215534 0.215359 0.263130 0.370148 0.250957 0.113088 0.265808 0.324336 0.229498 0.174679 0.271487 0.263563 0.137896 0.079217 0.519324 0.265762 0.222582 0.082555 0.429102 0.206721 0.288405 0.017851 0.487023 0.164361 0.236500 0.061051 0.538088 0.593344 0.348446 0.050304 0.007906 0.031328 0.947050 0.007032 0.014590 0.010428 0.956605 0.029142 0.003825 0.459636 0.207616 0.155368 0.177380 0.014573 0.964608 0.012209 0.008610 0.066291 0.918196 0.008729 0.006784 0.019488 0.866774 0.018897 0.094841 0.767405 0.104198 0.029234 0.099164 0.052494 0.772531 0.039832 0.135142 0.296085 0.243498 0.350935 0.109482 0.518843 0.226659 0.124784 0.129714 0.647901 0.019721 0.159901 0.172477 0.113912 0.231511 0.214864 0.439713 0.223117 0.310596 0.293328 0.172959 0.185557 0.487662 0.136321 0.190459 Consensus sequence: MHHHWHYTMCCHCCCACVAABVH Reverse complement motif 0.185557 0.136321 0.487662 0.190459 0.223117 0.293328 0.310596 0.172959 0.439713 0.231511 0.214864 0.113912 0.172477 0.019721 0.159901 0.647901 0.129714 0.226659 0.124784 0.518843 0.296085 0.350935 0.243498 0.109482 0.052494 0.039832 0.772531 0.135142 0.099164 0.104198 0.029234 0.767405 0.019488 0.018897 0.866774 0.094841 0.066291 0.008729 0.918196 0.006784 0.014573 0.012209 0.964608 0.008610 0.177380 0.207616 0.155368 0.459636 0.010428 0.029142 0.956605 0.003825 0.031328 0.007032 0.947050 0.014590 0.007906 0.348446 0.050304 0.593344 0.538088 0.236500 0.061051 0.164361 0.487023 0.288405 0.017851 0.206721 0.429102 0.222582 0.082555 0.265762 0.519324 0.137896 0.079217 0.263563 0.271487 0.229498 0.174679 0.324336 0.265808 0.250957 0.113088 0.370148 0.263130 0.215534 0.215359 0.305977 0.026801 0.395873 0.173319 0.404007 Consensus sequence: DVVTTVGTGGGHGGYAMHWHHHY Alignment: -------MHHHWHYTMCCHCCCACVAABVH GSCYCHSCCYVCCYCCCCCCSSCCCCCSSC-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 2 23 0.051826 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH------- -GSSGGGGGSSGGGGGGKGGVMGGSHGKGSC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00400 Zif268 Original Motif Original Motif Backward 1 23 0.053060 Species: Mus musculus Original motif 0.104824 0.412716 0.254506 0.227955 0.644922 0.065476 0.140479 0.149122 0.201205 0.166164 0.347131 0.285501 0.360606 0.256316 0.150766 0.232313 0.199831 0.240681 0.279350 0.280137 0.234308 0.204076 0.321306 0.240310 0.274112 0.462435 0.111425 0.152028 0.067070 0.717501 0.073934 0.141496 0.106745 0.084442 0.658566 0.150247 0.025128 0.967053 0.003585 0.004234 0.006412 0.982989 0.003227 0.007371 0.009588 0.877620 0.002571 0.110221 0.621521 0.355443 0.015669 0.007366 0.002600 0.980275 0.004191 0.012934 0.118773 0.026658 0.783843 0.070725 0.022358 0.822101 0.024684 0.130857 0.713212 0.080912 0.128793 0.077084 0.166568 0.250955 0.107934 0.474544 0.225040 0.222494 0.163301 0.389166 0.268976 0.223206 0.265314 0.242504 0.137052 0.229058 0.148439 0.485451 0.135819 0.304550 0.141994 0.417637 0.272440 0.319501 0.230580 0.177478 Consensus sequence: BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV Reverse complement motif 0.272440 0.230580 0.319501 0.177478 0.417637 0.304550 0.141994 0.135819 0.485451 0.229058 0.148439 0.137052 0.242504 0.223206 0.265314 0.268976 0.389166 0.222494 0.163301 0.225040 0.474544 0.250955 0.107934 0.166568 0.077084 0.080912 0.128793 0.713212 0.022358 0.024684 0.822101 0.130857 0.118773 0.783843 0.026658 0.070725 0.002600 0.004191 0.980275 0.012934 0.007366 0.355443 0.015669 0.621521 0.009588 0.002571 0.877620 0.110221 0.006412 0.003227 0.982989 0.007371 0.025128 0.003585 0.967053 0.004234 0.106745 0.658566 0.084442 0.150247 0.067070 0.073934 0.717501 0.141496 0.274112 0.111425 0.462435 0.152028 0.234308 0.321306 0.204076 0.240310 0.280137 0.240681 0.279350 0.199831 0.232313 0.256316 0.150766 0.360606 0.201205 0.347131 0.166164 0.285501 0.149122 0.065476 0.140479 0.644922 0.104824 0.254506 0.412716 0.227955 Consensus sequence: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB Alignment: -------BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV GSCYCHSCCYVCCYCCCCCCSSCCCCCSSC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_primaryReverse Complement Reverse Complement Backward 6 23 0.059163 Species: Mus musculus Original motif 0.183797 0.268049 0.330111 0.218043 0.127599 0.330310 0.243614 0.298477 0.143199 0.188046 0.268593 0.400162 0.214690 0.205230 0.247090 0.332990 0.294688 0.299104 0.327152 0.079056 0.221909 0.193223 0.480155 0.104712 0.444072 0.068239 0.481838 0.005852 0.006182 0.015429 0.901278 0.077111 0.766535 0.111138 0.121632 0.000696 0.014848 0.973961 0.000298 0.010893 0.001807 0.992200 0.002669 0.003324 0.795344 0.140510 0.018576 0.045571 0.006990 0.988200 0.002510 0.002299 0.154898 0.842296 0.000998 0.001808 0.029577 0.919262 0.006935 0.044226 0.677987 0.032075 0.185065 0.104874 0.195132 0.364580 0.319321 0.120967 0.225412 0.115034 0.612849 0.046705 0.548628 0.058900 0.162857 0.229616 0.112531 0.340331 0.165910 0.381227 0.073029 0.303078 0.363896 0.259997 0.561485 0.260567 0.092979 0.084969 0.132283 0.457691 0.140159 0.269867 Consensus sequence: BBBDVVRGACCACCCAVGABBAB Reverse complement motif 0.132283 0.140159 0.457691 0.269867 0.084969 0.260567 0.092979 0.561485 0.073029 0.363896 0.303078 0.259997 0.381227 0.340331 0.165910 0.112531 0.229616 0.058900 0.162857 0.548628 0.225412 0.612849 0.115034 0.046705 0.195132 0.319321 0.364580 0.120967 0.104874 0.032075 0.185065 0.677987 0.029577 0.006935 0.919262 0.044226 0.154898 0.000998 0.842296 0.001808 0.006990 0.002510 0.988200 0.002299 0.045571 0.140510 0.018576 0.795344 0.001807 0.002669 0.992200 0.003324 0.014848 0.000298 0.973961 0.010893 0.000696 0.111138 0.121632 0.766535 0.006182 0.901278 0.015429 0.077111 0.444072 0.481838 0.068239 0.005852 0.221909 0.480155 0.193223 0.104712 0.294688 0.327152 0.299104 0.079056 0.332990 0.205230 0.247090 0.214690 0.400162 0.188046 0.268593 0.143199 0.127599 0.243614 0.330310 0.298477 0.183797 0.330111 0.268049 0.218043 Consensus sequence: BTBVTCVTGGGTGGTCMVVDVBB Alignment: -------BTBVTCVTGGGTGGTCMVVDVBB GSSGGGGGSSGGGGGGKGGVMGGSHGKGSC----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 4 Motif name: C004 Original motif 0.029703 0.465347 0.465347 0.039604 0.060000 0.460000 0.450000 0.030000 0.020202 0.515152 0.414141 0.050505 0.020000 0.540000 0.400000 0.040000 0.010101 0.575758 0.383838 0.030303 0.010000 0.670000 0.300000 0.020000 0.030000 0.600000 0.340000 0.030000 0.030303 0.444444 0.494949 0.030303 0.020202 0.595960 0.363636 0.020202 0.040000 0.590000 0.310000 0.060000 0.020202 0.515152 0.404040 0.060606 0.010000 0.740000 0.230000 0.020000 0.029703 0.712871 0.217822 0.039604 0.040000 0.440000 0.490000 0.030000 0.020000 0.600000 0.360000 0.020000 0.020202 0.595960 0.363636 0.020202 0.020202 0.484848 0.464646 0.030303 0.010000 0.790000 0.180000 0.020000 0.020000 0.710000 0.180000 0.090000 0.050505 0.373737 0.444444 0.131313 0.020000 0.660000 0.300000 0.020000 0.019802 0.603960 0.336634 0.039604 0.030000 0.460000 0.480000 0.030000 0.020000 0.600000 0.350000 0.030000 0.020202 0.575758 0.333333 0.070707 0.040000 0.450000 0.480000 0.030000 0.039604 0.425743 0.495050 0.039604 Consensus sequence: SSSSSCSSSSSCCSSSSCCSCSSSSSS Reserve complement motif 0.039604 0.495050 0.425743 0.039604 0.040000 0.480000 0.450000 0.030000 0.020202 0.333333 0.575758 0.070707 0.020000 0.350000 0.600000 0.030000 0.030000 0.480000 0.460000 0.030000 0.019802 0.336634 0.603960 0.039604 0.020000 0.300000 0.660000 0.020000 0.050505 0.444444 0.373737 0.131313 0.020000 0.180000 0.710000 0.090000 0.010000 0.180000 0.790000 0.020000 0.020202 0.464646 0.484848 0.030303 0.020202 0.363636 0.595960 0.020202 0.020000 0.360000 0.600000 0.020000 0.040000 0.490000 0.440000 0.030000 0.029703 0.217822 0.712871 0.039604 0.010000 0.230000 0.740000 0.020000 0.020202 0.404040 0.515152 0.060606 0.040000 0.310000 0.590000 0.060000 0.020202 0.363636 0.595960 0.020202 0.030303 0.494949 0.444444 0.030303 0.030000 0.340000 0.600000 0.030000 0.010000 0.300000 0.670000 0.020000 0.010101 0.383838 0.575758 0.030303 0.020000 0.400000 0.540000 0.040000 0.020202 0.414141 0.515152 0.050505 0.060000 0.450000 0.460000 0.030000 0.029703 0.465347 0.465347 0.039604 Consensus sequence: SSSSSSGSGGSSSSGGSSSSSGSSSSS ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 4 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 2 23 0.037887 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV---- -SSSSSSGSGGSSSSGGSSSSSGSSSSS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 5 23 0.042097 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: ----HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB SSSSSCSSSSSCCSSSSCCSCSSSSSS---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00400 Zif268 Reverse Complement Reverse Complement Forward 3 23 0.042858 Species: Mus musculus Original motif 0.104824 0.412716 0.254506 0.227955 0.644922 0.065476 0.140479 0.149122 0.201205 0.166164 0.347131 0.285501 0.360606 0.256316 0.150766 0.232313 0.199831 0.240681 0.279350 0.280137 0.234308 0.204076 0.321306 0.240310 0.274112 0.462435 0.111425 0.152028 0.067070 0.717501 0.073934 0.141496 0.106745 0.084442 0.658566 0.150247 0.025128 0.967053 0.003585 0.004234 0.006412 0.982989 0.003227 0.007371 0.009588 0.877620 0.002571 0.110221 0.621521 0.355443 0.015669 0.007366 0.002600 0.980275 0.004191 0.012934 0.118773 0.026658 0.783843 0.070725 0.022358 0.822101 0.024684 0.130857 0.713212 0.080912 0.128793 0.077084 0.166568 0.250955 0.107934 0.474544 0.225040 0.222494 0.163301 0.389166 0.268976 0.223206 0.265314 0.242504 0.137052 0.229058 0.148439 0.485451 0.135819 0.304550 0.141994 0.417637 0.272440 0.319501 0.230580 0.177478 Consensus sequence: BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV Reverse complement motif 0.272440 0.230580 0.319501 0.177478 0.417637 0.304550 0.141994 0.135819 0.485451 0.229058 0.148439 0.137052 0.242504 0.223206 0.265314 0.268976 0.389166 0.222494 0.163301 0.225040 0.474544 0.250955 0.107934 0.166568 0.077084 0.080912 0.128793 0.713212 0.022358 0.024684 0.822101 0.130857 0.118773 0.783843 0.026658 0.070725 0.002600 0.004191 0.980275 0.012934 0.007366 0.355443 0.015669 0.621521 0.009588 0.002571 0.877620 0.110221 0.006412 0.003227 0.982989 0.007371 0.025128 0.003585 0.967053 0.004234 0.106745 0.658566 0.084442 0.150247 0.067070 0.073934 0.717501 0.141496 0.274112 0.111425 0.462435 0.152028 0.234308 0.321306 0.204076 0.240310 0.280137 0.240681 0.279350 0.199831 0.232313 0.256316 0.150766 0.360606 0.201205 0.347131 0.166164 0.285501 0.149122 0.065476 0.140479 0.644922 0.104824 0.254506 0.412716 0.227955 Consensus sequence: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB Alignment: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB---- --SSSSSSGSGGSSSSGGSSSSSGSSSSS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_primaryReverse Complement Reverse Complement Forward 3 23 0.046732 Species: Mus musculus Original motif 0.183797 0.268049 0.330111 0.218043 0.127599 0.330310 0.243614 0.298477 0.143199 0.188046 0.268593 0.400162 0.214690 0.205230 0.247090 0.332990 0.294688 0.299104 0.327152 0.079056 0.221909 0.193223 0.480155 0.104712 0.444072 0.068239 0.481838 0.005852 0.006182 0.015429 0.901278 0.077111 0.766535 0.111138 0.121632 0.000696 0.014848 0.973961 0.000298 0.010893 0.001807 0.992200 0.002669 0.003324 0.795344 0.140510 0.018576 0.045571 0.006990 0.988200 0.002510 0.002299 0.154898 0.842296 0.000998 0.001808 0.029577 0.919262 0.006935 0.044226 0.677987 0.032075 0.185065 0.104874 0.195132 0.364580 0.319321 0.120967 0.225412 0.115034 0.612849 0.046705 0.548628 0.058900 0.162857 0.229616 0.112531 0.340331 0.165910 0.381227 0.073029 0.303078 0.363896 0.259997 0.561485 0.260567 0.092979 0.084969 0.132283 0.457691 0.140159 0.269867 Consensus sequence: BBBDVVRGACCACCCAVGABBAB Reverse complement motif 0.132283 0.140159 0.457691 0.269867 0.084969 0.260567 0.092979 0.561485 0.073029 0.363896 0.303078 0.259997 0.381227 0.340331 0.165910 0.112531 0.229616 0.058900 0.162857 0.548628 0.225412 0.612849 0.115034 0.046705 0.195132 0.319321 0.364580 0.120967 0.104874 0.032075 0.185065 0.677987 0.029577 0.006935 0.919262 0.044226 0.154898 0.000998 0.842296 0.001808 0.006990 0.002510 0.988200 0.002299 0.045571 0.140510 0.018576 0.795344 0.001807 0.002669 0.992200 0.003324 0.014848 0.000298 0.973961 0.010893 0.000696 0.111138 0.121632 0.766535 0.006182 0.901278 0.015429 0.077111 0.444072 0.481838 0.068239 0.005852 0.221909 0.480155 0.193223 0.104712 0.294688 0.327152 0.299104 0.079056 0.332990 0.205230 0.247090 0.214690 0.400162 0.188046 0.268593 0.143199 0.127599 0.243614 0.330310 0.298477 0.183797 0.330111 0.268049 0.218043 Consensus sequence: BTBVTCVTGGGTGGTCMVVDVBB Alignment: BTBVTCVTGGGTGGTCMVVDVBB---- --SSSSSSGSGGSSSSGGSSSSSGSSSSS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v015681_primaryOriginal Motif Original Motif Backward 4 23 0.048642 Species: Mus musculus Original motif 0.641428 0.180211 0.044767 0.133594 0.171696 0.262981 0.334148 0.231174 0.129726 0.322735 0.243462 0.304077 0.165713 0.175735 0.256108 0.402445 0.146090 0.171890 0.412753 0.269266 0.212837 0.439192 0.280990 0.066980 0.251088 0.275516 0.374380 0.099015 0.575438 0.079656 0.338201 0.006704 0.005634 0.003422 0.972597 0.018348 0.890447 0.077034 0.031851 0.000668 0.007128 0.986862 0.000496 0.005515 0.001445 0.991564 0.001925 0.005066 0.738761 0.190157 0.026399 0.044684 0.013384 0.983783 0.000896 0.001937 0.068077 0.929549 0.000773 0.001602 0.040830 0.933742 0.005283 0.020145 0.730274 0.029225 0.145689 0.094812 0.165032 0.572838 0.162001 0.100129 0.383584 0.129942 0.429497 0.056977 0.455959 0.071959 0.208204 0.263878 0.134271 0.262985 0.222626 0.380117 0.071193 0.346594 0.346081 0.236132 0.445661 0.405278 0.053901 0.095160 Consensus sequence: ABBBBVVRGACCACCCACRDBBM Reverse complement motif 0.095160 0.405278 0.053901 0.445661 0.071193 0.346081 0.346594 0.236132 0.380117 0.262985 0.222626 0.134271 0.263878 0.071959 0.208204 0.455959 0.383584 0.429497 0.129942 0.056977 0.165032 0.162001 0.572838 0.100129 0.094812 0.029225 0.145689 0.730274 0.040830 0.005283 0.933742 0.020145 0.068077 0.000773 0.929549 0.001602 0.013384 0.000896 0.983783 0.001937 0.044684 0.190157 0.026399 0.738761 0.001445 0.001925 0.991564 0.005066 0.007128 0.000496 0.986862 0.005515 0.000668 0.077034 0.031851 0.890447 0.005634 0.972597 0.003422 0.018348 0.006704 0.079656 0.338201 0.575438 0.251088 0.374380 0.275516 0.099015 0.212837 0.280990 0.439192 0.066980 0.146090 0.412753 0.171890 0.269266 0.402445 0.175735 0.256108 0.165713 0.129726 0.243462 0.322735 0.304077 0.171696 0.334148 0.262981 0.231174 0.133594 0.180211 0.044767 0.641428 Consensus sequence: YBVDMGTGGGTGGTCKVVBVBBT Alignment: ----ABBBBVVRGACCACCCACRDBBM SSSSSCSSSSSCCSSSSCCSCSSSSSS--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 5 Motif name: C005 Original motif 0.060000 0.250000 0.040000 0.650000 0.160000 0.540000 0.070000 0.230000 0.050000 0.040000 0.050000 0.860000 0.049505 0.029703 0.900990 0.019802 0.050505 0.040404 0.131313 0.777778 0.920000 0.010000 0.050000 0.020000 0.029703 0.019802 0.930693 0.019802 0.480000 0.350000 0.090000 0.080000 0.020000 0.890000 0.040000 0.050000 0.040404 0.909091 0.020202 0.030303 0.840000 0.020000 0.020000 0.120000 0.030000 0.020000 0.930000 0.020000 0.020202 0.040404 0.919192 0.020202 0.020000 0.930000 0.030000 0.020000 0.030000 0.030000 0.020000 0.920000 0.100000 0.020000 0.840000 0.040000 0.070000 0.050000 0.810000 0.070000 0.040404 0.828283 0.090909 0.040404 0.020000 0.860000 0.020000 0.100000 0.089109 0.059406 0.019802 0.831683 0.079208 0.514851 0.118812 0.287129 0.168317 0.049505 0.683168 0.099010 0.470000 0.030000 0.100000 0.400000 Consensus sequence: TCTGTAGMCCAGGCTGGCCTYGW Reserve complement motif 0.400000 0.030000 0.100000 0.470000 0.168317 0.683168 0.049505 0.099010 0.079208 0.118812 0.514851 0.287129 0.831683 0.059406 0.019802 0.089109 0.020000 0.020000 0.860000 0.100000 0.040404 0.090909 0.828283 0.040404 0.070000 0.810000 0.050000 0.070000 0.100000 0.840000 0.020000 0.040000 0.920000 0.030000 0.020000 0.030000 0.020000 0.030000 0.930000 0.020000 0.020202 0.919192 0.040404 0.020202 0.030000 0.930000 0.020000 0.020000 0.120000 0.020000 0.020000 0.840000 0.040404 0.020202 0.909091 0.030303 0.020000 0.040000 0.890000 0.050000 0.080000 0.350000 0.090000 0.480000 0.029703 0.930693 0.019802 0.019802 0.020000 0.010000 0.050000 0.920000 0.777778 0.040404 0.131313 0.050505 0.049505 0.900990 0.029703 0.019802 0.860000 0.040000 0.050000 0.050000 0.160000 0.070000 0.540000 0.230000 0.650000 0.250000 0.040000 0.060000 Consensus sequence: WCKAGGCCAGCCTGGYCTACAGA ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 5 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 1 23 0.062066 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB TCTGTAGMCCAGGCTGGCCTYGW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_primaryOriginal Motif Original Motif Backward 2 22 0.553936 Species: Mus musculus Original motif 0.137831 0.118922 0.394177 0.349070 0.190108 0.163633 0.138507 0.507753 0.346002 0.332315 0.228621 0.093063 0.113254 0.287554 0.373285 0.225908 0.272578 0.125402 0.328963 0.273057 0.333973 0.115165 0.194267 0.356595 0.381054 0.086215 0.501679 0.031052 0.002232 0.007405 0.966087 0.024276 0.834741 0.112115 0.052053 0.001091 0.009034 0.983239 0.000766 0.006960 0.002054 0.988103 0.003138 0.006705 0.805772 0.171299 0.008415 0.014515 0.020076 0.976846 0.000894 0.002183 0.079914 0.917273 0.001179 0.001634 0.013983 0.950545 0.004205 0.031267 0.789407 0.039441 0.108645 0.062507 0.055453 0.161271 0.595249 0.188028 0.333424 0.128169 0.373270 0.165136 0.536103 0.109520 0.062980 0.291397 0.346477 0.090909 0.279533 0.283081 0.045892 0.190183 0.584314 0.179611 0.088294 0.406148 0.251647 0.253912 0.202467 0.447159 0.162802 0.187571 Consensus sequence: DTVBDDRGACCACCCAGDWDGBH Reverse complement motif 0.202467 0.162802 0.447159 0.187571 0.088294 0.251647 0.406148 0.253912 0.045892 0.584314 0.190183 0.179611 0.283081 0.090909 0.279533 0.346477 0.291397 0.109520 0.062980 0.536103 0.333424 0.373270 0.128169 0.165136 0.055453 0.595249 0.161271 0.188028 0.062507 0.039441 0.108645 0.789407 0.013983 0.004205 0.950545 0.031267 0.079914 0.001179 0.917273 0.001634 0.020076 0.000894 0.976846 0.002183 0.014515 0.171299 0.008415 0.805772 0.002054 0.003138 0.988103 0.006705 0.009034 0.000766 0.983239 0.006960 0.001091 0.112115 0.052053 0.834741 0.002232 0.966087 0.007405 0.024276 0.381054 0.501679 0.086215 0.031052 0.356595 0.115165 0.194267 0.333973 0.272578 0.328963 0.125402 0.273057 0.113254 0.373285 0.287554 0.225908 0.093063 0.332315 0.228621 0.346002 0.507753 0.163633 0.138507 0.190108 0.137831 0.394177 0.118922 0.349070 Consensus sequence: DBCDWHCTGGGTGGTCMDHBBAH Alignment: -DTVBDDRGACCACCCAGDWDGBH TCTGTAGMCCAGGCTGGCCTYGW- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_primaryOriginal Motif Original Motif Backward 2 22 0.556669 Species: Mus musculus Original motif 0.183797 0.268049 0.330111 0.218043 0.127599 0.330310 0.243614 0.298477 0.143199 0.188046 0.268593 0.400162 0.214690 0.205230 0.247090 0.332990 0.294688 0.299104 0.327152 0.079056 0.221909 0.193223 0.480155 0.104712 0.444072 0.068239 0.481838 0.005852 0.006182 0.015429 0.901278 0.077111 0.766535 0.111138 0.121632 0.000696 0.014848 0.973961 0.000298 0.010893 0.001807 0.992200 0.002669 0.003324 0.795344 0.140510 0.018576 0.045571 0.006990 0.988200 0.002510 0.002299 0.154898 0.842296 0.000998 0.001808 0.029577 0.919262 0.006935 0.044226 0.677987 0.032075 0.185065 0.104874 0.195132 0.364580 0.319321 0.120967 0.225412 0.115034 0.612849 0.046705 0.548628 0.058900 0.162857 0.229616 0.112531 0.340331 0.165910 0.381227 0.073029 0.303078 0.363896 0.259997 0.561485 0.260567 0.092979 0.084969 0.132283 0.457691 0.140159 0.269867 Consensus sequence: BBBDVVRGACCACCCAVGABBAB Reverse complement motif 0.132283 0.140159 0.457691 0.269867 0.084969 0.260567 0.092979 0.561485 0.073029 0.363896 0.303078 0.259997 0.381227 0.340331 0.165910 0.112531 0.229616 0.058900 0.162857 0.548628 0.225412 0.612849 0.115034 0.046705 0.195132 0.319321 0.364580 0.120967 0.104874 0.032075 0.185065 0.677987 0.029577 0.006935 0.919262 0.044226 0.154898 0.000998 0.842296 0.001808 0.006990 0.002510 0.988200 0.002299 0.045571 0.140510 0.018576 0.795344 0.001807 0.002669 0.992200 0.003324 0.014848 0.000298 0.973961 0.010893 0.000696 0.111138 0.121632 0.766535 0.006182 0.901278 0.015429 0.077111 0.444072 0.481838 0.068239 0.005852 0.221909 0.480155 0.193223 0.104712 0.294688 0.327152 0.299104 0.079056 0.332990 0.205230 0.247090 0.214690 0.400162 0.188046 0.268593 0.143199 0.127599 0.243614 0.330310 0.298477 0.183797 0.330111 0.268049 0.218043 Consensus sequence: BTBVTCVTGGGTGGTCMVVDVBB Alignment: -BBBDVVRGACCACCCAVGABBAB TCTGTAGMCCAGGCTGGCCTYGW- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_primaryReverse Complement Original Motif Forward 2 22 0.558490 Species: Mus musculus Original motif 0.204923 0.208846 0.365383 0.220848 0.294304 0.300143 0.167287 0.238266 0.109711 0.619514 0.117379 0.153396 0.178979 0.378580 0.230177 0.212264 0.159594 0.542602 0.118178 0.179627 0.125206 0.430074 0.151826 0.292894 0.097692 0.709845 0.116956 0.075506 0.148292 0.565912 0.037632 0.248164 0.077951 0.034190 0.855503 0.032356 0.001657 0.001061 0.971877 0.025405 0.001926 0.001084 0.991712 0.005278 0.033031 0.012001 0.057796 0.897171 0.002723 0.002647 0.993348 0.001281 0.003261 0.000963 0.987199 0.008577 0.000611 0.090925 0.074857 0.833608 0.015299 0.978878 0.004949 0.000874 0.013368 0.600902 0.033485 0.352245 0.231949 0.149575 0.118804 0.499672 0.267580 0.186002 0.371242 0.175176 0.264884 0.223483 0.110082 0.401551 0.221365 0.170121 0.179559 0.428955 0.112997 0.692930 0.139981 0.054092 0.460305 0.207883 0.155111 0.176702 Consensus sequence: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH Reverse complement motif 0.176702 0.207883 0.155111 0.460305 0.112997 0.139981 0.692930 0.054092 0.428955 0.170121 0.179559 0.221365 0.401551 0.223483 0.110082 0.264884 0.267580 0.371242 0.186002 0.175176 0.499672 0.149575 0.118804 0.231949 0.013368 0.033485 0.600902 0.352245 0.015299 0.004949 0.978878 0.000874 0.833608 0.090925 0.074857 0.000611 0.003261 0.987199 0.000963 0.008577 0.002723 0.993348 0.002647 0.001281 0.897171 0.012001 0.057796 0.033031 0.001926 0.991712 0.001084 0.005278 0.001657 0.971877 0.001061 0.025405 0.077951 0.855503 0.034190 0.032356 0.148292 0.037632 0.565912 0.248164 0.097692 0.116956 0.709845 0.075506 0.125206 0.151826 0.430074 0.292894 0.159594 0.118178 0.542602 0.179627 0.178979 0.230177 0.378580 0.212264 0.109711 0.117379 0.619514 0.153396 0.294304 0.167287 0.300143 0.238266 0.204923 0.365383 0.208846 0.220848 Consensus sequence: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB Alignment: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB- -WCKAGGCCAGCCTGGYCTACAGA ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00528 Foxm1_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 1 22 0.565440 Species: Mus musculus Original motif 0.399785 0.446658 0.111435 0.042122 0.535175 0.103991 0.089706 0.271128 0.078171 0.387987 0.375083 0.158759 0.309001 0.519142 0.070618 0.101239 0.201844 0.255818 0.323149 0.219190 0.534101 0.109845 0.235026 0.121028 0.656038 0.037473 0.261484 0.045006 0.315713 0.164290 0.471815 0.048182 0.651960 0.009412 0.328237 0.010391 0.937365 0.017313 0.007516 0.037807 0.019983 0.044238 0.012387 0.923392 0.061195 0.021485 0.881645 0.035675 0.017521 0.952998 0.013139 0.016342 0.254160 0.029735 0.493023 0.223082 0.239200 0.593324 0.114503 0.052973 0.610822 0.071539 0.099169 0.218470 0.166610 0.389712 0.204400 0.239278 0.227752 0.361626 0.178497 0.232125 0.537030 0.182466 0.026035 0.254470 0.235902 0.151006 0.043788 0.569304 0.081851 0.250397 0.590059 0.077693 0.340417 0.189613 0.272075 0.197895 Consensus sequence: MWSMBAARRATGCDCABHATGD Reverse complement motif 0.197895 0.189613 0.272075 0.340417 0.081851 0.590059 0.250397 0.077693 0.569304 0.151006 0.043788 0.235902 0.254470 0.182466 0.026035 0.537030 0.227752 0.178497 0.361626 0.232125 0.166610 0.204400 0.389712 0.239278 0.218470 0.071539 0.099169 0.610822 0.239200 0.114503 0.593324 0.052973 0.254160 0.493023 0.029735 0.223082 0.017521 0.013139 0.952998 0.016342 0.061195 0.881645 0.021485 0.035675 0.923392 0.044238 0.012387 0.019983 0.037807 0.017313 0.007516 0.937365 0.010391 0.009412 0.328237 0.651960 0.315713 0.471815 0.164290 0.048182 0.045006 0.037473 0.261484 0.656038 0.121028 0.109845 0.235026 0.534101 0.201844 0.323149 0.255818 0.219190 0.309001 0.070618 0.519142 0.101239 0.078171 0.375083 0.387987 0.158759 0.271128 0.103991 0.089706 0.535175 0.399785 0.111435 0.446658 0.042122 Consensus sequence: DCATDBTGHGCATKMTTBRSWR Alignment: DCATDBTGHGCATKMTTBRSWR- WCKAGGCCAGCCTGGYCTACAGA ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 6 Motif name: C006 Original motif 0.040000 0.440000 0.470000 0.050000 0.494949 0.010101 0.020202 0.474747 0.030000 0.620000 0.300000 0.050000 0.767677 0.020202 0.030303 0.181818 0.020000 0.850000 0.050000 0.080000 0.950000 0.010000 0.020000 0.020000 0.010000 0.850000 0.050000 0.090000 0.929293 0.010101 0.010101 0.050505 0.020000 0.610000 0.350000 0.020000 0.640000 0.010000 0.020000 0.330000 0.020000 0.800000 0.140000 0.040000 0.940000 0.010000 0.020000 0.030000 0.030000 0.880000 0.020000 0.070000 0.919192 0.030303 0.010101 0.040404 0.030000 0.760000 0.150000 0.060000 0.630000 0.030000 0.020000 0.320000 0.030303 0.484848 0.454545 0.030303 0.494949 0.020202 0.020202 0.464646 Consensus sequence: SWCACACASWCACACWSW Reserve complement motif 0.464646 0.020202 0.020202 0.494949 0.030303 0.454545 0.484848 0.030303 0.320000 0.030000 0.020000 0.630000 0.030000 0.150000 0.760000 0.060000 0.040404 0.030303 0.010101 0.919192 0.030000 0.020000 0.880000 0.070000 0.030000 0.010000 0.020000 0.940000 0.020000 0.140000 0.800000 0.040000 0.330000 0.010000 0.020000 0.640000 0.020000 0.350000 0.610000 0.020000 0.050505 0.010101 0.010101 0.929293 0.010000 0.050000 0.850000 0.090000 0.020000 0.010000 0.020000 0.950000 0.020000 0.050000 0.850000 0.080000 0.181818 0.020202 0.030303 0.767677 0.030000 0.300000 0.620000 0.050000 0.474747 0.010101 0.020202 0.494949 0.040000 0.470000 0.440000 0.050000 Consensus sequence: WSWGTGTGWSTGTGTGWS ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 6 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 3 18 0.036166 Species: Mus musculus Original motif 0.067627 0.131333 0.654425 0.146615 0.156488 0.114442 0.145630 0.583441 0.206450 0.265630 0.358017 0.169903 0.090729 0.460713 0.274712 0.173847 0.285994 0.099998 0.154485 0.459523 0.635908 0.184787 0.072982 0.106323 0.748421 0.039204 0.092605 0.119769 0.081342 0.061327 0.044532 0.812799 0.143120 0.043879 0.024216 0.788785 0.247544 0.092102 0.621453 0.038901 0.295531 0.036295 0.027594 0.640580 0.194561 0.305468 0.339916 0.160055 0.175038 0.193568 0.101212 0.530182 0.145226 0.167488 0.559871 0.127415 0.271501 0.237429 0.206701 0.284369 0.216834 0.109191 0.569605 0.104370 0.182624 0.177160 0.300475 0.339742 0.331737 0.198645 0.265137 0.204482 0.230155 0.359365 0.183450 0.227029 0.056581 0.067297 0.463052 0.413070 0.198891 0.324626 0.304424 0.172059 0.181968 0.287547 0.202419 0.328066 Consensus sequence: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB Reverse complement motif 0.328066 0.287547 0.202419 0.181968 0.198891 0.304424 0.324626 0.172059 0.056581 0.463052 0.067297 0.413070 0.230155 0.183450 0.359365 0.227029 0.204482 0.198645 0.265137 0.331737 0.339742 0.177160 0.300475 0.182624 0.216834 0.569605 0.109191 0.104370 0.284369 0.237429 0.206701 0.271501 0.145226 0.559871 0.167488 0.127415 0.530182 0.193568 0.101212 0.175038 0.194561 0.339916 0.305468 0.160055 0.640580 0.036295 0.027594 0.295531 0.247544 0.621453 0.092102 0.038901 0.788785 0.043879 0.024216 0.143120 0.812799 0.061327 0.044532 0.081342 0.119769 0.039204 0.092605 0.748421 0.106323 0.184787 0.072982 0.635908 0.459523 0.099998 0.154485 0.285994 0.090729 0.274712 0.460713 0.173847 0.206450 0.358017 0.265630 0.169903 0.583441 0.114442 0.145630 0.156488 0.067627 0.654425 0.131333 0.146615 Consensus sequence: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC Alignment: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC --SWCACACASWCACACWSW-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00400 Zif268 Original Motif Original Motif Backward 3 18 0.040655 Species: Mus musculus Original motif 0.104824 0.412716 0.254506 0.227955 0.644922 0.065476 0.140479 0.149122 0.201205 0.166164 0.347131 0.285501 0.360606 0.256316 0.150766 0.232313 0.199831 0.240681 0.279350 0.280137 0.234308 0.204076 0.321306 0.240310 0.274112 0.462435 0.111425 0.152028 0.067070 0.717501 0.073934 0.141496 0.106745 0.084442 0.658566 0.150247 0.025128 0.967053 0.003585 0.004234 0.006412 0.982989 0.003227 0.007371 0.009588 0.877620 0.002571 0.110221 0.621521 0.355443 0.015669 0.007366 0.002600 0.980275 0.004191 0.012934 0.118773 0.026658 0.783843 0.070725 0.022358 0.822101 0.024684 0.130857 0.713212 0.080912 0.128793 0.077084 0.166568 0.250955 0.107934 0.474544 0.225040 0.222494 0.163301 0.389166 0.268976 0.223206 0.265314 0.242504 0.137052 0.229058 0.148439 0.485451 0.135819 0.304550 0.141994 0.417637 0.272440 0.319501 0.230580 0.177478 Consensus sequence: BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV Reverse complement motif 0.272440 0.230580 0.319501 0.177478 0.417637 0.304550 0.141994 0.135819 0.485451 0.229058 0.148439 0.137052 0.242504 0.223206 0.265314 0.268976 0.389166 0.222494 0.163301 0.225040 0.474544 0.250955 0.107934 0.166568 0.077084 0.080912 0.128793 0.713212 0.022358 0.024684 0.822101 0.130857 0.118773 0.783843 0.026658 0.070725 0.002600 0.004191 0.980275 0.012934 0.007366 0.355443 0.015669 0.621521 0.009588 0.002571 0.877620 0.110221 0.006412 0.003227 0.982989 0.007371 0.025128 0.003585 0.967053 0.004234 0.106745 0.658566 0.084442 0.150247 0.067070 0.073934 0.717501 0.141496 0.274112 0.111425 0.462435 0.152028 0.234308 0.321306 0.204076 0.240310 0.280137 0.240681 0.279350 0.199831 0.232313 0.256316 0.150766 0.360606 0.201205 0.347131 0.166164 0.285501 0.149122 0.065476 0.140479 0.644922 0.104824 0.254506 0.412716 0.227955 Consensus sequence: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB Alignment: BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV ---SWCACACASWCACACWSW-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 2 18 0.040868 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH -SWCACACASWCACACWSW---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 1 18 0.042186 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB WSWGTGTGWSTGTGTGWS----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00098 Rfx3_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 4 18 0.042743 Species: Mus musculus Original motif 0.314514 0.275352 0.257617 0.152518 0.126939 0.598294 0.130576 0.144192 0.102265 0.155334 0.177957 0.564445 0.129288 0.282678 0.326990 0.261044 0.318166 0.227823 0.175681 0.278330 0.109019 0.380838 0.278328 0.231815 0.226145 0.289206 0.291300 0.193348 0.035863 0.844339 0.072582 0.047216 0.223793 0.187244 0.088092 0.500871 0.039800 0.029681 0.026201 0.904317 0.298298 0.032147 0.654746 0.014809 0.014729 0.022023 0.944826 0.018422 0.485114 0.004925 0.013785 0.496176 0.035708 0.020381 0.240804 0.703108 0.951152 0.012738 0.017886 0.018224 0.023713 0.944394 0.009538 0.022355 0.291067 0.385205 0.232388 0.091339 0.340334 0.199588 0.311526 0.148552 0.198713 0.472138 0.178319 0.150830 0.321155 0.269932 0.311301 0.097612 0.412646 0.195252 0.231950 0.160152 0.297134 0.180928 0.250400 0.271538 0.151169 0.305386 0.358574 0.184871 Consensus sequence: VCTBHBVCTTGGWTACVVVVVDB Reverse complement motif 0.151169 0.358574 0.305386 0.184871 0.271538 0.180928 0.250400 0.297134 0.160152 0.195252 0.231950 0.412646 0.097612 0.269932 0.311301 0.321155 0.198713 0.178319 0.472138 0.150830 0.148552 0.199588 0.311526 0.340334 0.291067 0.232388 0.385205 0.091339 0.023713 0.009538 0.944394 0.022355 0.018224 0.012738 0.017886 0.951152 0.703108 0.020381 0.240804 0.035708 0.496176 0.004925 0.013785 0.485114 0.014729 0.944826 0.022023 0.018422 0.298298 0.654746 0.032147 0.014809 0.904317 0.029681 0.026201 0.039800 0.500871 0.187244 0.088092 0.223793 0.035863 0.072582 0.844339 0.047216 0.226145 0.291300 0.289206 0.193348 0.109019 0.278328 0.380838 0.231815 0.278330 0.227823 0.175681 0.318166 0.129288 0.326990 0.282678 0.261044 0.564445 0.155334 0.177957 0.102265 0.126939 0.130576 0.598294 0.144192 0.152518 0.275352 0.257617 0.314514 Consensus sequence: BDBBVBVGTAWCCAAGVBHBAGB Alignment: VCTBHBVCTTGGWTACVVVVVDB ---SWCACACASWCACACWSW-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 7 Motif name: C007 Original motif 0.080000 0.040000 0.450000 0.430000 0.099010 0.237624 0.039604 0.623762 0.138614 0.198020 0.059406 0.603960 0.060000 0.480000 0.330000 0.130000 0.079208 0.049505 0.069307 0.801980 0.060606 0.030303 0.888889 0.020202 0.888889 0.010101 0.090909 0.010101 0.040404 0.020202 0.929293 0.010101 0.020202 0.070707 0.050505 0.858586 0.010000 0.090000 0.030000 0.870000 0.030000 0.870000 0.030000 0.070000 0.290000 0.400000 0.240000 0.070000 0.920000 0.020000 0.030000 0.030000 0.070707 0.010101 0.898990 0.020202 0.030303 0.020202 0.929293 0.020202 0.424242 0.424242 0.050505 0.101010 0.040000 0.890000 0.020000 0.050000 0.910000 0.020000 0.030000 0.040000 0.080000 0.030000 0.850000 0.040000 0.030000 0.850000 0.040000 0.080000 0.040000 0.870000 0.030000 0.060000 0.250000 0.150000 0.060000 0.540000 0.010000 0.480000 0.460000 0.050000 Consensus sequence: KTTSTGAGTTCVAGGMCAGCCTS Reserve complement motif 0.010000 0.460000 0.480000 0.050000 0.540000 0.150000 0.060000 0.250000 0.040000 0.030000 0.870000 0.060000 0.030000 0.040000 0.850000 0.080000 0.080000 0.850000 0.030000 0.040000 0.040000 0.020000 0.030000 0.910000 0.040000 0.020000 0.890000 0.050000 0.101010 0.424242 0.050505 0.424242 0.030303 0.929293 0.020202 0.020202 0.070707 0.898990 0.010101 0.020202 0.030000 0.020000 0.030000 0.920000 0.290000 0.240000 0.400000 0.070000 0.030000 0.030000 0.870000 0.070000 0.870000 0.090000 0.030000 0.010000 0.858586 0.070707 0.050505 0.020202 0.040404 0.929293 0.020202 0.010101 0.010101 0.010101 0.090909 0.888889 0.060606 0.888889 0.030303 0.020202 0.801980 0.049505 0.069307 0.079208 0.060000 0.330000 0.480000 0.130000 0.603960 0.198020 0.059406 0.138614 0.623762 0.237624 0.039604 0.099010 0.080000 0.450000 0.040000 0.430000 Consensus sequence: SAGGCTGYCCTVGAACTCASAAY ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 7 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 2 22 0.064291 Species: Mus musculus Original motif 0.067627 0.131333 0.654425 0.146615 0.156488 0.114442 0.145630 0.583441 0.206450 0.265630 0.358017 0.169903 0.090729 0.460713 0.274712 0.173847 0.285994 0.099998 0.154485 0.459523 0.635908 0.184787 0.072982 0.106323 0.748421 0.039204 0.092605 0.119769 0.081342 0.061327 0.044532 0.812799 0.143120 0.043879 0.024216 0.788785 0.247544 0.092102 0.621453 0.038901 0.295531 0.036295 0.027594 0.640580 0.194561 0.305468 0.339916 0.160055 0.175038 0.193568 0.101212 0.530182 0.145226 0.167488 0.559871 0.127415 0.271501 0.237429 0.206701 0.284369 0.216834 0.109191 0.569605 0.104370 0.182624 0.177160 0.300475 0.339742 0.331737 0.198645 0.265137 0.204482 0.230155 0.359365 0.183450 0.227029 0.056581 0.067297 0.463052 0.413070 0.198891 0.324626 0.304424 0.172059 0.181968 0.287547 0.202419 0.328066 Consensus sequence: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB Reverse complement motif 0.328066 0.287547 0.202419 0.181968 0.198891 0.304424 0.324626 0.172059 0.056581 0.463052 0.067297 0.413070 0.230155 0.183450 0.359365 0.227029 0.204482 0.198645 0.265137 0.331737 0.339742 0.177160 0.300475 0.182624 0.216834 0.569605 0.109191 0.104370 0.284369 0.237429 0.206701 0.271501 0.145226 0.559871 0.167488 0.127415 0.530182 0.193568 0.101212 0.175038 0.194561 0.339916 0.305468 0.160055 0.640580 0.036295 0.027594 0.295531 0.247544 0.621453 0.092102 0.038901 0.788785 0.043879 0.024216 0.143120 0.812799 0.061327 0.044532 0.081342 0.119769 0.039204 0.092605 0.748421 0.106323 0.184787 0.072982 0.635908 0.459523 0.099998 0.154485 0.285994 0.090729 0.274712 0.460713 0.173847 0.206450 0.358017 0.265630 0.169903 0.583441 0.114442 0.145630 0.156488 0.067627 0.654425 0.131333 0.146615 Consensus sequence: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC Alignment: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC- -SAGGCTGYCCTVGAACTCASAAY ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00098 Rfx3_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 2 22 0.066480 Species: Mus musculus Original motif 0.314514 0.275352 0.257617 0.152518 0.126939 0.598294 0.130576 0.144192 0.102265 0.155334 0.177957 0.564445 0.129288 0.282678 0.326990 0.261044 0.318166 0.227823 0.175681 0.278330 0.109019 0.380838 0.278328 0.231815 0.226145 0.289206 0.291300 0.193348 0.035863 0.844339 0.072582 0.047216 0.223793 0.187244 0.088092 0.500871 0.039800 0.029681 0.026201 0.904317 0.298298 0.032147 0.654746 0.014809 0.014729 0.022023 0.944826 0.018422 0.485114 0.004925 0.013785 0.496176 0.035708 0.020381 0.240804 0.703108 0.951152 0.012738 0.017886 0.018224 0.023713 0.944394 0.009538 0.022355 0.291067 0.385205 0.232388 0.091339 0.340334 0.199588 0.311526 0.148552 0.198713 0.472138 0.178319 0.150830 0.321155 0.269932 0.311301 0.097612 0.412646 0.195252 0.231950 0.160152 0.297134 0.180928 0.250400 0.271538 0.151169 0.305386 0.358574 0.184871 Consensus sequence: VCTBHBVCTTGGWTACVVVVVDB Reverse complement motif 0.151169 0.358574 0.305386 0.184871 0.271538 0.180928 0.250400 0.297134 0.160152 0.195252 0.231950 0.412646 0.097612 0.269932 0.311301 0.321155 0.198713 0.178319 0.472138 0.150830 0.148552 0.199588 0.311526 0.340334 0.291067 0.232388 0.385205 0.091339 0.023713 0.009538 0.944394 0.022355 0.018224 0.012738 0.017886 0.951152 0.703108 0.020381 0.240804 0.035708 0.496176 0.004925 0.013785 0.485114 0.014729 0.944826 0.022023 0.018422 0.298298 0.654746 0.032147 0.014809 0.904317 0.029681 0.026201 0.039800 0.500871 0.187244 0.088092 0.223793 0.035863 0.072582 0.844339 0.047216 0.226145 0.291300 0.289206 0.193348 0.109019 0.278328 0.380838 0.231815 0.278330 0.227823 0.175681 0.318166 0.129288 0.326990 0.282678 0.261044 0.564445 0.155334 0.177957 0.102265 0.126939 0.130576 0.598294 0.144192 0.152518 0.275352 0.257617 0.314514 Consensus sequence: BDBBVBVGTAWCCAAGVBHBAGB Alignment: -VCTBHBVCTTGGWTACVVVVVDB KTTSTGAGTTCVAGGMCAGCCTS- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00098 Rfx3_primary Reverse Complement Original Motif Backward 2 22 0.067297 Species: Mus musculus Original motif 0.218345 0.231533 0.152528 0.397594 0.264604 0.126115 0.320860 0.288421 0.117304 0.186844 0.172946 0.522906 0.111929 0.277908 0.409084 0.201079 0.343319 0.311376 0.123612 0.221692 0.193354 0.374280 0.157338 0.275028 0.166348 0.578991 0.130872 0.123789 0.006937 0.931183 0.046809 0.015072 0.255581 0.289587 0.125513 0.329319 0.002582 0.012615 0.002782 0.982021 0.850584 0.007973 0.140639 0.000803 0.037792 0.002285 0.957277 0.002646 0.009414 0.921481 0.001636 0.067469 0.943403 0.000980 0.042401 0.013216 0.991166 0.002931 0.003540 0.002364 0.003651 0.987110 0.001106 0.008133 0.208873 0.369705 0.319129 0.102292 0.322535 0.186617 0.374187 0.116660 0.326738 0.179486 0.226374 0.267402 0.299697 0.185329 0.133025 0.381949 0.300824 0.266836 0.096437 0.335904 0.418443 0.191068 0.127183 0.263306 0.386727 0.204062 0.126050 0.283161 Consensus sequence: HDTBHHCCHTAGCAACVVDHHHH Reverse complement motif 0.283161 0.204062 0.126050 0.386727 0.263306 0.191068 0.127183 0.418443 0.335904 0.266836 0.096437 0.300824 0.381949 0.185329 0.133025 0.299697 0.267402 0.179486 0.226374 0.326738 0.322535 0.374187 0.186617 0.116660 0.208873 0.319129 0.369705 0.102292 0.003651 0.001106 0.987110 0.008133 0.002364 0.002931 0.003540 0.991166 0.013216 0.000980 0.042401 0.943403 0.009414 0.001636 0.921481 0.067469 0.037792 0.957277 0.002285 0.002646 0.000803 0.007973 0.140639 0.850584 0.982021 0.012615 0.002782 0.002582 0.329319 0.289587 0.125513 0.255581 0.006937 0.046809 0.931183 0.015072 0.166348 0.130872 0.578991 0.123789 0.193354 0.157338 0.374280 0.275028 0.221692 0.311376 0.123612 0.343319 0.111929 0.409084 0.277908 0.201079 0.522906 0.186844 0.172946 0.117304 0.264604 0.320860 0.126115 0.288421 0.397594 0.231533 0.152528 0.218345 Consensus sequence: HHHHDVVGTTGCTAHGGDHBAHH Alignment: -HDTBHHCCHTAGCAACVVDHHHH SAGGCTGYCCTVGAACTCASAAY- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 2 22 0.070728 Species: Mus musculus Original motif 0.404007 0.395873 0.173319 0.026801 0.305977 0.215534 0.215359 0.263130 0.370148 0.250957 0.113088 0.265808 0.324336 0.229498 0.174679 0.271487 0.263563 0.137896 0.079217 0.519324 0.265762 0.222582 0.082555 0.429102 0.206721 0.288405 0.017851 0.487023 0.164361 0.236500 0.061051 0.538088 0.593344 0.348446 0.050304 0.007906 0.031328 0.947050 0.007032 0.014590 0.010428 0.956605 0.029142 0.003825 0.459636 0.207616 0.155368 0.177380 0.014573 0.964608 0.012209 0.008610 0.066291 0.918196 0.008729 0.006784 0.019488 0.866774 0.018897 0.094841 0.767405 0.104198 0.029234 0.099164 0.052494 0.772531 0.039832 0.135142 0.296085 0.243498 0.350935 0.109482 0.518843 0.226659 0.124784 0.129714 0.647901 0.019721 0.159901 0.172477 0.113912 0.231511 0.214864 0.439713 0.223117 0.310596 0.293328 0.172959 0.185557 0.487662 0.136321 0.190459 Consensus sequence: MHHHWHYTMCCHCCCACVAABVH Reverse complement motif 0.185557 0.136321 0.487662 0.190459 0.223117 0.293328 0.310596 0.172959 0.439713 0.231511 0.214864 0.113912 0.172477 0.019721 0.159901 0.647901 0.129714 0.226659 0.124784 0.518843 0.296085 0.350935 0.243498 0.109482 0.052494 0.039832 0.772531 0.135142 0.099164 0.104198 0.029234 0.767405 0.019488 0.018897 0.866774 0.094841 0.066291 0.008729 0.918196 0.006784 0.014573 0.012209 0.964608 0.008610 0.177380 0.207616 0.155368 0.459636 0.010428 0.029142 0.956605 0.003825 0.031328 0.007032 0.947050 0.014590 0.007906 0.348446 0.050304 0.593344 0.538088 0.236500 0.061051 0.164361 0.487023 0.288405 0.017851 0.206721 0.429102 0.222582 0.082555 0.265762 0.519324 0.137896 0.079217 0.263563 0.271487 0.229498 0.174679 0.324336 0.265808 0.250957 0.113088 0.370148 0.263130 0.215534 0.215359 0.305977 0.026801 0.395873 0.173319 0.404007 Consensus sequence: DVVTTVGTGGGHGGYAMHWHHHY Alignment: -DVVTTVGTGGGHGGYAMHWHHHY KTTSTGAGTTCVAGGMCAGCCTS- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v015681_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 3 21 0.562337 Species: Mus musculus Original motif 0.214165 0.143436 0.372522 0.269876 0.314445 0.406003 0.160351 0.119201 0.137147 0.092924 0.042921 0.727007 0.044121 0.072843 0.051741 0.831295 0.261292 0.324124 0.298498 0.116086 0.258125 0.323243 0.263362 0.155271 0.204557 0.589399 0.107153 0.098891 0.371021 0.244027 0.291102 0.093849 0.096327 0.572718 0.011797 0.319159 0.027282 0.046183 0.844519 0.082016 0.018921 0.012887 0.915917 0.052275 0.364793 0.166722 0.084229 0.384256 0.028216 0.011233 0.951056 0.009495 0.054974 0.004738 0.890377 0.049911 0.006802 0.312915 0.134247 0.546036 0.241289 0.628210 0.104788 0.025713 0.237863 0.302807 0.213018 0.246311 0.349399 0.203220 0.086635 0.360746 0.386634 0.144693 0.246895 0.221779 0.425101 0.354676 0.093374 0.126849 0.060272 0.391320 0.104905 0.443503 0.162090 0.190233 0.227433 0.420244 Consensus sequence: DVTTVVCVYGGHGGYCHHDMYB Reverse complement motif 0.420244 0.190233 0.227433 0.162090 0.443503 0.391320 0.104905 0.060272 0.126849 0.354676 0.093374 0.425101 0.221779 0.144693 0.246895 0.386634 0.360746 0.203220 0.086635 0.349399 0.237863 0.213018 0.302807 0.246311 0.241289 0.104788 0.628210 0.025713 0.546036 0.312915 0.134247 0.006802 0.054974 0.890377 0.004738 0.049911 0.028216 0.951056 0.011233 0.009495 0.384256 0.166722 0.084229 0.364793 0.018921 0.915917 0.012887 0.052275 0.027282 0.844519 0.046183 0.082016 0.096327 0.011797 0.572718 0.319159 0.093849 0.244027 0.291102 0.371021 0.204557 0.107153 0.589399 0.098891 0.258125 0.263362 0.323243 0.155271 0.261292 0.298498 0.324124 0.116086 0.831295 0.072843 0.051741 0.044121 0.727007 0.092924 0.042921 0.137147 0.314445 0.160351 0.406003 0.119201 0.214165 0.372522 0.143436 0.269876 Consensus sequence: VMYDHDGMCCHCCKBGVVAAVH Alignment: VMYDHDGMCCHCCKBGVVAAVH-- --SAGGCTGYCCTVGAACTCASAAY ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 8 Motif name: C008 Original motif 0.030303 0.393939 0.484848 0.090909 0.030000 0.490000 0.450000 0.030000 0.010000 0.930000 0.030000 0.030000 0.020202 0.929293 0.010101 0.040404 0.040000 0.530000 0.340000 0.090000 0.070000 0.400000 0.390000 0.140000 0.020000 0.790000 0.110000 0.080000 0.020000 0.880000 0.020000 0.080000 0.029703 0.841584 0.019802 0.108911 0.050000 0.810000 0.020000 0.120000 0.108911 0.435644 0.366337 0.089109 0.059406 0.455446 0.415842 0.069307 0.020000 0.910000 0.040000 0.030000 0.030303 0.919192 0.010101 0.040404 0.020000 0.470000 0.490000 0.020000 0.080000 0.420000 0.480000 0.020000 Consensus sequence: SSCCSSCCCCSSCCSS Reserve complement motif 0.080000 0.480000 0.420000 0.020000 0.020000 0.490000 0.470000 0.020000 0.030303 0.010101 0.919192 0.040404 0.020000 0.040000 0.910000 0.030000 0.059406 0.415842 0.455446 0.069307 0.108911 0.366337 0.435644 0.089109 0.050000 0.020000 0.810000 0.120000 0.029703 0.019802 0.841584 0.108911 0.020000 0.020000 0.880000 0.080000 0.020000 0.110000 0.790000 0.080000 0.070000 0.390000 0.400000 0.140000 0.040000 0.340000 0.530000 0.090000 0.020202 0.010101 0.929293 0.040404 0.010000 0.030000 0.930000 0.030000 0.030000 0.450000 0.490000 0.030000 0.030303 0.484848 0.393939 0.090909 Consensus sequence: SSGGSSGGGGSSGGSS ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 8 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00022 Zfp740_primaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 16 0.035318 Species: Mus musculus Original motif 0.136946 0.396508 0.135309 0.331236 0.185528 0.417538 0.215409 0.181525 0.171276 0.341901 0.172832 0.313991 0.145641 0.590572 0.146376 0.117412 0.138035 0.660416 0.114016 0.087533 0.222728 0.750532 0.007528 0.019212 0.024633 0.963314 0.001894 0.010159 0.009557 0.979956 0.000642 0.009844 0.010416 0.977424 0.000541 0.011619 0.026401 0.956740 0.001544 0.015314 0.195502 0.755959 0.011060 0.037480 0.491291 0.364785 0.025613 0.118311 0.305153 0.398160 0.071680 0.225008 0.253497 0.232647 0.213246 0.300610 0.156964 0.297876 0.144683 0.400477 0.179549 0.292514 0.319462 0.208475 Consensus sequence: HVBCCCCCCCCMHHHB Reverse complement motif 0.179549 0.319462 0.292514 0.208475 0.400477 0.297876 0.144683 0.156964 0.300610 0.232647 0.213246 0.253497 0.305153 0.071680 0.398160 0.225008 0.118311 0.364785 0.025613 0.491291 0.195502 0.011060 0.755959 0.037480 0.026401 0.001544 0.956740 0.015314 0.010416 0.000541 0.977424 0.011619 0.009557 0.000642 0.979956 0.009844 0.024633 0.001894 0.963314 0.010159 0.222728 0.007528 0.750532 0.019212 0.138035 0.114016 0.660416 0.087533 0.145641 0.146376 0.590572 0.117412 0.171276 0.172832 0.341901 0.313991 0.185528 0.215409 0.417538 0.181525 0.136946 0.135309 0.396508 0.331236 Consensus sequence: BHHDYGGGGGGGGBVD Alignment: HVBCCCCCCCCMHHHB SSCCSSCCCCSSCCSS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 3 16 0.035321 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH --SSCCSSCCCCSSCCSS---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 8 16 0.041649 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV -------SSGGSSGGGGSSGGSS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 8 16 0.042735 Species: Mus musculus Original motif 0.404007 0.395873 0.173319 0.026801 0.305977 0.215534 0.215359 0.263130 0.370148 0.250957 0.113088 0.265808 0.324336 0.229498 0.174679 0.271487 0.263563 0.137896 0.079217 0.519324 0.265762 0.222582 0.082555 0.429102 0.206721 0.288405 0.017851 0.487023 0.164361 0.236500 0.061051 0.538088 0.593344 0.348446 0.050304 0.007906 0.031328 0.947050 0.007032 0.014590 0.010428 0.956605 0.029142 0.003825 0.459636 0.207616 0.155368 0.177380 0.014573 0.964608 0.012209 0.008610 0.066291 0.918196 0.008729 0.006784 0.019488 0.866774 0.018897 0.094841 0.767405 0.104198 0.029234 0.099164 0.052494 0.772531 0.039832 0.135142 0.296085 0.243498 0.350935 0.109482 0.518843 0.226659 0.124784 0.129714 0.647901 0.019721 0.159901 0.172477 0.113912 0.231511 0.214864 0.439713 0.223117 0.310596 0.293328 0.172959 0.185557 0.487662 0.136321 0.190459 Consensus sequence: MHHHWHYTMCCHCCCACVAABVH Reverse complement motif 0.185557 0.136321 0.487662 0.190459 0.223117 0.293328 0.310596 0.172959 0.439713 0.231511 0.214864 0.113912 0.172477 0.019721 0.159901 0.647901 0.129714 0.226659 0.124784 0.518843 0.296085 0.350935 0.243498 0.109482 0.052494 0.039832 0.772531 0.135142 0.099164 0.104198 0.029234 0.767405 0.019488 0.018897 0.866774 0.094841 0.066291 0.008729 0.918196 0.006784 0.014573 0.012209 0.964608 0.008610 0.177380 0.207616 0.155368 0.459636 0.010428 0.029142 0.956605 0.003825 0.031328 0.007032 0.947050 0.014590 0.007906 0.348446 0.050304 0.593344 0.538088 0.236500 0.061051 0.164361 0.487023 0.288405 0.017851 0.206721 0.429102 0.222582 0.082555 0.265762 0.519324 0.137896 0.079217 0.263563 0.271487 0.229498 0.174679 0.324336 0.265808 0.250957 0.113088 0.370148 0.263130 0.215534 0.215359 0.305977 0.026801 0.395873 0.173319 0.404007 Consensus sequence: DVVTTVGTGGGHGGYAMHWHHHY Alignment: DVVTTVGTGGGHGGYAMHWHHHY SSGGSSGGGGSSGGSS------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 2 16 0.042859 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB -SSGGSSGGGGSSGGSS------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 9 Motif name: C009 Original motif 0.580000 0.040000 0.280000 0.100000 0.069307 0.326733 0.316832 0.287129 0.260000 0.020000 0.660000 0.060000 0.020000 0.900000 0.040000 0.040000 0.010000 0.930000 0.010000 0.050000 0.020202 0.020202 0.020202 0.939394 0.049505 0.039604 0.188119 0.722772 0.060000 0.040000 0.060000 0.840000 0.890000 0.040000 0.060000 0.010000 0.909091 0.020202 0.030303 0.040404 0.020000 0.060000 0.030000 0.890000 0.010101 0.919192 0.020202 0.050505 0.040000 0.880000 0.020000 0.060000 0.030000 0.880000 0.020000 0.070000 0.949495 0.010101 0.020202 0.020202 0.030000 0.010000 0.940000 0.020000 0.040000 0.890000 0.040000 0.030000 0.881188 0.039604 0.029703 0.049505 0.070000 0.840000 0.020000 0.070000 0.060000 0.080000 0.030000 0.830000 0.151515 0.272727 0.111111 0.464646 0.373737 0.080808 0.464646 0.080808 Consensus sequence: ABGCCTTTAATCCCAGCACTHR Reserve complement motif 0.373737 0.464646 0.080808 0.080808 0.464646 0.272727 0.111111 0.151515 0.830000 0.080000 0.030000 0.060000 0.070000 0.020000 0.840000 0.070000 0.049505 0.039604 0.029703 0.881188 0.040000 0.040000 0.890000 0.030000 0.030000 0.940000 0.010000 0.020000 0.020202 0.010101 0.020202 0.949495 0.030000 0.020000 0.880000 0.070000 0.040000 0.020000 0.880000 0.060000 0.010101 0.020202 0.919192 0.050505 0.890000 0.060000 0.030000 0.020000 0.040404 0.020202 0.030303 0.909091 0.010000 0.040000 0.060000 0.890000 0.840000 0.040000 0.060000 0.060000 0.722772 0.039604 0.188119 0.049505 0.939394 0.020202 0.020202 0.020202 0.010000 0.010000 0.930000 0.050000 0.020000 0.040000 0.900000 0.040000 0.260000 0.660000 0.020000 0.060000 0.069307 0.316832 0.326733 0.287129 0.100000 0.040000 0.280000 0.580000 Consensus sequence: MHAGTGCTGGGATTAAAGGCBT ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 9 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 1 22 0.066488 Species: Mus musculus Original motif 0.404007 0.395873 0.173319 0.026801 0.305977 0.215534 0.215359 0.263130 0.370148 0.250957 0.113088 0.265808 0.324336 0.229498 0.174679 0.271487 0.263563 0.137896 0.079217 0.519324 0.265762 0.222582 0.082555 0.429102 0.206721 0.288405 0.017851 0.487023 0.164361 0.236500 0.061051 0.538088 0.593344 0.348446 0.050304 0.007906 0.031328 0.947050 0.007032 0.014590 0.010428 0.956605 0.029142 0.003825 0.459636 0.207616 0.155368 0.177380 0.014573 0.964608 0.012209 0.008610 0.066291 0.918196 0.008729 0.006784 0.019488 0.866774 0.018897 0.094841 0.767405 0.104198 0.029234 0.099164 0.052494 0.772531 0.039832 0.135142 0.296085 0.243498 0.350935 0.109482 0.518843 0.226659 0.124784 0.129714 0.647901 0.019721 0.159901 0.172477 0.113912 0.231511 0.214864 0.439713 0.223117 0.310596 0.293328 0.172959 0.185557 0.487662 0.136321 0.190459 Consensus sequence: MHHHWHYTMCCHCCCACVAABVH Reverse complement motif 0.185557 0.136321 0.487662 0.190459 0.223117 0.293328 0.310596 0.172959 0.439713 0.231511 0.214864 0.113912 0.172477 0.019721 0.159901 0.647901 0.129714 0.226659 0.124784 0.518843 0.296085 0.350935 0.243498 0.109482 0.052494 0.039832 0.772531 0.135142 0.099164 0.104198 0.029234 0.767405 0.019488 0.018897 0.866774 0.094841 0.066291 0.008729 0.918196 0.006784 0.014573 0.012209 0.964608 0.008610 0.177380 0.207616 0.155368 0.459636 0.010428 0.029142 0.956605 0.003825 0.031328 0.007032 0.947050 0.014590 0.007906 0.348446 0.050304 0.593344 0.538088 0.236500 0.061051 0.164361 0.487023 0.288405 0.017851 0.206721 0.429102 0.222582 0.082555 0.265762 0.519324 0.137896 0.079217 0.263563 0.271487 0.229498 0.174679 0.324336 0.265808 0.250957 0.113088 0.370148 0.263130 0.215534 0.215359 0.305977 0.026801 0.395873 0.173319 0.404007 Consensus sequence: DVVTTVGTGGGHGGYAMHWHHHY Alignment: DVVTTVGTGGGHGGYAMHWHHHY MHAGTGCTGGGATTAAAGGCBT- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00032 Gata3_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 2 21 0.563210 Species: Mus musculus Original motif 0.177641 0.319872 0.115137 0.387350 0.136644 0.182137 0.205873 0.475347 0.254263 0.244280 0.165207 0.336250 0.240415 0.207557 0.237497 0.314530 0.271041 0.214702 0.364395 0.149863 0.095475 0.320104 0.191738 0.392682 0.500902 0.142722 0.026556 0.329820 0.051221 0.023698 0.897245 0.027836 0.922410 0.027509 0.024058 0.026023 0.030735 0.070903 0.024248 0.874114 0.242120 0.231992 0.225143 0.300745 0.106956 0.220471 0.283490 0.389083 0.152079 0.165830 0.135066 0.547025 0.839205 0.051581 0.060119 0.049095 0.041204 0.069147 0.070830 0.818819 0.051861 0.848177 0.027599 0.072363 0.383793 0.016807 0.397470 0.201931 0.381899 0.215846 0.255908 0.146347 0.094792 0.358651 0.280905 0.265652 0.296132 0.181545 0.178433 0.343890 0.301997 0.254722 0.108566 0.334714 0.349481 0.270693 0.137507 0.242319 Consensus sequence: HBHDVBWGATHBTATCRVBHHH Reverse complement motif 0.242319 0.270693 0.137507 0.349481 0.334714 0.254722 0.108566 0.301997 0.343890 0.181545 0.178433 0.296132 0.094792 0.280905 0.358651 0.265652 0.146347 0.215846 0.255908 0.381899 0.383793 0.397470 0.016807 0.201931 0.051861 0.027599 0.848177 0.072363 0.818819 0.069147 0.070830 0.041204 0.049095 0.051581 0.060119 0.839205 0.547025 0.165830 0.135066 0.152079 0.389083 0.220471 0.283490 0.106956 0.300745 0.231992 0.225143 0.242120 0.874114 0.070903 0.024248 0.030735 0.026023 0.027509 0.024058 0.922410 0.051221 0.897245 0.023698 0.027836 0.329820 0.142722 0.026556 0.500902 0.392682 0.320104 0.191738 0.095475 0.271041 0.364395 0.214702 0.149863 0.314530 0.207557 0.237497 0.240415 0.336250 0.244280 0.165207 0.254263 0.475347 0.182137 0.205873 0.136644 0.387350 0.319872 0.115137 0.177641 Consensus sequence: HHHBBMGATAVHATCWVVDHVH Alignment: HBHDVBWGATHBTATCRVBHHH- -ABGCCTTTAATCCCAGCACTHR ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00400 Zif268 Original Motif Original Motif Backward 3 21 0.565627 Species: Mus musculus Original motif 0.104824 0.412716 0.254506 0.227955 0.644922 0.065476 0.140479 0.149122 0.201205 0.166164 0.347131 0.285501 0.360606 0.256316 0.150766 0.232313 0.199831 0.240681 0.279350 0.280137 0.234308 0.204076 0.321306 0.240310 0.274112 0.462435 0.111425 0.152028 0.067070 0.717501 0.073934 0.141496 0.106745 0.084442 0.658566 0.150247 0.025128 0.967053 0.003585 0.004234 0.006412 0.982989 0.003227 0.007371 0.009588 0.877620 0.002571 0.110221 0.621521 0.355443 0.015669 0.007366 0.002600 0.980275 0.004191 0.012934 0.118773 0.026658 0.783843 0.070725 0.022358 0.822101 0.024684 0.130857 0.713212 0.080912 0.128793 0.077084 0.166568 0.250955 0.107934 0.474544 0.225040 0.222494 0.163301 0.389166 0.268976 0.223206 0.265314 0.242504 0.137052 0.229058 0.148439 0.485451 0.135819 0.304550 0.141994 0.417637 0.272440 0.319501 0.230580 0.177478 Consensus sequence: BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV Reverse complement motif 0.272440 0.230580 0.319501 0.177478 0.417637 0.304550 0.141994 0.135819 0.485451 0.229058 0.148439 0.137052 0.242504 0.223206 0.265314 0.268976 0.389166 0.222494 0.163301 0.225040 0.474544 0.250955 0.107934 0.166568 0.077084 0.080912 0.128793 0.713212 0.022358 0.024684 0.822101 0.130857 0.118773 0.783843 0.026658 0.070725 0.002600 0.004191 0.980275 0.012934 0.007366 0.355443 0.015669 0.621521 0.009588 0.002571 0.877620 0.110221 0.006412 0.003227 0.982989 0.007371 0.025128 0.003585 0.967053 0.004234 0.106745 0.658566 0.084442 0.150247 0.067070 0.073934 0.717501 0.141496 0.274112 0.111425 0.462435 0.152028 0.234308 0.321306 0.204076 0.240310 0.280137 0.240681 0.279350 0.199831 0.232313 0.256316 0.150766 0.360606 0.201205 0.347131 0.166164 0.285501 0.149122 0.065476 0.140479 0.644922 0.104824 0.254506 0.412716 0.227955 Consensus sequence: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB Alignment: -BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV ABGCCTTTAATCCCAGCACTHR-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v015681_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 2 21 0.567020 Species: Mus musculus Original motif 0.331499 0.188505 0.182841 0.297156 0.328961 0.213025 0.273530 0.184484 0.197213 0.129292 0.524914 0.148581 0.274491 0.226406 0.312118 0.186986 0.103231 0.393726 0.364988 0.138055 0.552594 0.166422 0.186262 0.094722 0.157618 0.064773 0.616497 0.161112 0.139166 0.176098 0.621185 0.063551 0.748420 0.062398 0.012447 0.176735 0.116584 0.009438 0.860326 0.013653 0.005030 0.003646 0.974877 0.016447 0.055257 0.007181 0.921760 0.015802 0.032748 0.058249 0.052709 0.856293 0.105606 0.872231 0.014370 0.007793 0.019480 0.497379 0.125899 0.357242 0.478582 0.269713 0.061464 0.190242 0.253985 0.287006 0.201320 0.257689 0.319384 0.210231 0.175842 0.294543 0.222123 0.287802 0.201294 0.288782 0.139951 0.376041 0.081133 0.402875 0.213450 0.343835 0.383676 0.059039 0.322294 0.355918 0.148062 0.173725 Consensus sequence: HVGVSAGGAGGGTCYHHHHYVH Reverse complement motif 0.322294 0.148062 0.355918 0.173725 0.213450 0.383676 0.343835 0.059039 0.402875 0.376041 0.081133 0.139951 0.288782 0.287802 0.201294 0.222123 0.294543 0.210231 0.175842 0.319384 0.253985 0.201320 0.287006 0.257689 0.190242 0.269713 0.061464 0.478582 0.019480 0.125899 0.497379 0.357242 0.105606 0.014370 0.872231 0.007793 0.856293 0.058249 0.052709 0.032748 0.055257 0.921760 0.007181 0.015802 0.005030 0.974877 0.003646 0.016447 0.116584 0.860326 0.009438 0.013653 0.176735 0.062398 0.012447 0.748420 0.139166 0.621185 0.176098 0.063551 0.157618 0.616497 0.064773 0.161112 0.094722 0.166422 0.186262 0.552594 0.103231 0.364988 0.393726 0.138055 0.274491 0.312118 0.226406 0.186986 0.197213 0.524914 0.129292 0.148581 0.184484 0.213025 0.273530 0.328961 0.297156 0.188505 0.182841 0.331499 Consensus sequence: DVMHHDHKGACCCTCCTSVCBH Alignment: HVGVSAGGAGGGTCYHHHHYVH- -ABGCCTTTAATCCCAGCACTHR ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00098 Rfx3_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 4 20 1.064315 Species: Mus musculus Original motif 0.314514 0.275352 0.257617 0.152518 0.126939 0.598294 0.130576 0.144192 0.102265 0.155334 0.177957 0.564445 0.129288 0.282678 0.326990 0.261044 0.318166 0.227823 0.175681 0.278330 0.109019 0.380838 0.278328 0.231815 0.226145 0.289206 0.291300 0.193348 0.035863 0.844339 0.072582 0.047216 0.223793 0.187244 0.088092 0.500871 0.039800 0.029681 0.026201 0.904317 0.298298 0.032147 0.654746 0.014809 0.014729 0.022023 0.944826 0.018422 0.485114 0.004925 0.013785 0.496176 0.035708 0.020381 0.240804 0.703108 0.951152 0.012738 0.017886 0.018224 0.023713 0.944394 0.009538 0.022355 0.291067 0.385205 0.232388 0.091339 0.340334 0.199588 0.311526 0.148552 0.198713 0.472138 0.178319 0.150830 0.321155 0.269932 0.311301 0.097612 0.412646 0.195252 0.231950 0.160152 0.297134 0.180928 0.250400 0.271538 0.151169 0.305386 0.358574 0.184871 Consensus sequence: VCTBHBVCTTGGWTACVVVVVDB Reverse complement motif 0.151169 0.358574 0.305386 0.184871 0.271538 0.180928 0.250400 0.297134 0.160152 0.195252 0.231950 0.412646 0.097612 0.269932 0.311301 0.321155 0.198713 0.178319 0.472138 0.150830 0.148552 0.199588 0.311526 0.340334 0.291067 0.232388 0.385205 0.091339 0.023713 0.009538 0.944394 0.022355 0.018224 0.012738 0.017886 0.951152 0.703108 0.020381 0.240804 0.035708 0.496176 0.004925 0.013785 0.485114 0.014729 0.944826 0.022023 0.018422 0.298298 0.654746 0.032147 0.014809 0.904317 0.029681 0.026201 0.039800 0.500871 0.187244 0.088092 0.223793 0.035863 0.072582 0.844339 0.047216 0.226145 0.291300 0.289206 0.193348 0.109019 0.278328 0.380838 0.231815 0.278330 0.227823 0.175681 0.318166 0.129288 0.326990 0.282678 0.261044 0.564445 0.155334 0.177957 0.102265 0.126939 0.130576 0.598294 0.144192 0.152518 0.275352 0.257617 0.314514 Consensus sequence: BDBBVBVGTAWCCAAGVBHBAGB Alignment: --BDBBVBVGTAWCCAAGVBHBAGB MHAGTGCTGGGATTAAAGGCBT--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 10 Motif name: C010 Original motif 0.350000 0.110000 0.060000 0.480000 0.400000 0.050000 0.050000 0.500000 0.444444 0.161616 0.040404 0.353535 0.660000 0.280000 0.030000 0.030000 0.680000 0.290000 0.020000 0.010000 0.800000 0.170000 0.020000 0.010000 0.693069 0.227723 0.019802 0.059406 0.336634 0.108911 0.019802 0.534653 0.424242 0.060606 0.020202 0.494949 0.830000 0.020000 0.040000 0.110000 0.891089 0.019802 0.029703 0.059406 0.860000 0.050000 0.040000 0.050000 0.640000 0.260000 0.050000 0.050000 0.870000 0.090000 0.020000 0.020000 0.920000 0.030000 0.030000 0.020000 0.868687 0.040404 0.050505 0.040404 0.510000 0.230000 0.050000 0.210000 0.770000 0.190000 0.020000 0.020000 0.730000 0.130000 0.020000 0.120000 0.520000 0.020000 0.050000 0.410000 0.400000 0.080000 0.050000 0.470000 Consensus sequence: WWWAAAAWWAAAAAAAAAAWW Reserve complement motif 0.470000 0.080000 0.050000 0.400000 0.410000 0.020000 0.050000 0.520000 0.120000 0.130000 0.020000 0.730000 0.020000 0.190000 0.020000 0.770000 0.210000 0.230000 0.050000 0.510000 0.040404 0.040404 0.050505 0.868687 0.020000 0.030000 0.030000 0.920000 0.020000 0.090000 0.020000 0.870000 0.050000 0.260000 0.050000 0.640000 0.050000 0.050000 0.040000 0.860000 0.059406 0.019802 0.029703 0.891089 0.110000 0.020000 0.040000 0.830000 0.494949 0.060606 0.020202 0.424242 0.534653 0.108911 0.019802 0.336634 0.059406 0.227723 0.019802 0.693069 0.010000 0.170000 0.020000 0.800000 0.010000 0.290000 0.020000 0.680000 0.030000 0.280000 0.030000 0.660000 0.353535 0.161616 0.040404 0.444444 0.500000 0.050000 0.050000 0.400000 0.480000 0.110000 0.060000 0.350000 Consensus sequence: WWTTTTTTTTTTWWTTTTWWW ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 10 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00032 Gata3_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 21 0.052806 Species: Mus musculus Original motif 0.151572 0.262753 0.258275 0.327401 0.221834 0.113385 0.275380 0.389400 0.297769 0.136928 0.134678 0.430625 0.270099 0.110415 0.271106 0.348380 0.265471 0.090253 0.223340 0.420936 0.616582 0.090091 0.171960 0.121367 0.197318 0.107541 0.406904 0.288237 0.798258 0.046950 0.001406 0.153385 0.003195 0.002516 0.989707 0.004582 0.991503 0.002748 0.002617 0.003132 0.005015 0.002764 0.003026 0.989195 0.948394 0.008932 0.001344 0.041330 0.973109 0.004100 0.004081 0.018710 0.040365 0.113905 0.828185 0.017545 0.736608 0.130524 0.113464 0.019404 0.415921 0.106101 0.316613 0.161365 0.376582 0.170927 0.155572 0.296919 0.137731 0.197151 0.211055 0.454064 0.324853 0.122747 0.246107 0.306293 0.462490 0.207311 0.159392 0.170807 0.380420 0.188972 0.311990 0.118618 0.222178 0.157873 0.380486 0.239463 Consensus sequence: BDHDDADAGATAAGADHBDHVD Reverse complement motif 0.222178 0.380486 0.157873 0.239463 0.118618 0.188972 0.311990 0.380420 0.170807 0.207311 0.159392 0.462490 0.306293 0.122747 0.246107 0.324853 0.454064 0.197151 0.211055 0.137731 0.296919 0.170927 0.155572 0.376582 0.161365 0.106101 0.316613 0.415921 0.019404 0.130524 0.113464 0.736608 0.040365 0.828185 0.113905 0.017545 0.018710 0.004100 0.004081 0.973109 0.041330 0.008932 0.001344 0.948394 0.989195 0.002764 0.003026 0.005015 0.003132 0.002748 0.002617 0.991503 0.003195 0.989707 0.002516 0.004582 0.153385 0.046950 0.001406 0.798258 0.197318 0.406904 0.107541 0.288237 0.121367 0.090091 0.171960 0.616582 0.420936 0.090253 0.223340 0.265471 0.348380 0.110415 0.271106 0.270099 0.430625 0.136928 0.134678 0.297769 0.389400 0.113385 0.275380 0.221834 0.327401 0.262753 0.258275 0.151572 Consensus sequence: HBHDVHDTCTTATCTHTDDHDV Alignment: HBHDVHDTCTTATCTHTDDHDV WWTTTTTTTTTTWWTTTTWWW- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_primary Original Motif Original Motif Backward 1 21 0.058627 Species: Mus musculus Original motif 0.360997 0.300272 0.115555 0.223177 0.309749 0.228429 0.166233 0.295589 0.149419 0.176868 0.240155 0.433558 0.379704 0.095791 0.276373 0.248133 0.394549 0.174184 0.130641 0.300626 0.443749 0.070776 0.211081 0.274393 0.364301 0.074356 0.370406 0.190936 0.791976 0.038475 0.093390 0.076159 0.963721 0.001826 0.002456 0.031997 0.004516 0.954596 0.008092 0.032796 0.981080 0.002062 0.002161 0.014697 0.986185 0.001846 0.006976 0.004992 0.059567 0.003649 0.002189 0.934595 0.495328 0.024257 0.240450 0.239965 0.305027 0.094878 0.526069 0.074025 0.418442 0.196237 0.158323 0.226998 0.336713 0.220452 0.191155 0.251680 0.192296 0.300342 0.169047 0.338315 0.240387 0.144634 0.128513 0.486465 0.290763 0.271259 0.116600 0.321377 0.224825 0.296233 0.229255 0.249687 0.493240 0.171285 0.075148 0.260326 Consensus sequence: HHBDHDDAACAATDRHHHHHBW Reverse complement motif 0.260326 0.171285 0.075148 0.493240 0.224825 0.229255 0.296233 0.249687 0.321377 0.271259 0.116600 0.290763 0.486465 0.144634 0.128513 0.240387 0.338315 0.300342 0.169047 0.192296 0.251680 0.220452 0.191155 0.336713 0.226998 0.196237 0.158323 0.418442 0.305027 0.526069 0.094878 0.074025 0.239965 0.024257 0.240450 0.495328 0.934595 0.003649 0.002189 0.059567 0.004992 0.001846 0.006976 0.986185 0.014697 0.002062 0.002161 0.981080 0.004516 0.008092 0.954596 0.032796 0.031997 0.001826 0.002456 0.963721 0.076159 0.038475 0.093390 0.791976 0.364301 0.370406 0.074356 0.190936 0.274393 0.070776 0.211081 0.443749 0.300626 0.174184 0.130641 0.394549 0.248133 0.095791 0.276373 0.379704 0.433558 0.176868 0.240155 0.149419 0.295589 0.228429 0.166233 0.309749 0.223177 0.300272 0.115555 0.360997 Consensus sequence: WBHHHHHMDATTGTTHDHDVHH Alignment: HHBDHDDAACAATDRHHHHHBW -WWWAAAAWWAAAAAAAAAAWW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00032 Gata3_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 1 21 0.060671 Species: Mus musculus Original motif 0.177641 0.319872 0.115137 0.387350 0.136644 0.182137 0.205873 0.475347 0.254263 0.244280 0.165207 0.336250 0.240415 0.207557 0.237497 0.314530 0.271041 0.214702 0.364395 0.149863 0.095475 0.320104 0.191738 0.392682 0.500902 0.142722 0.026556 0.329820 0.051221 0.023698 0.897245 0.027836 0.922410 0.027509 0.024058 0.026023 0.030735 0.070903 0.024248 0.874114 0.242120 0.231992 0.225143 0.300745 0.106956 0.220471 0.283490 0.389083 0.152079 0.165830 0.135066 0.547025 0.839205 0.051581 0.060119 0.049095 0.041204 0.069147 0.070830 0.818819 0.051861 0.848177 0.027599 0.072363 0.383793 0.016807 0.397470 0.201931 0.381899 0.215846 0.255908 0.146347 0.094792 0.358651 0.280905 0.265652 0.296132 0.181545 0.178433 0.343890 0.301997 0.254722 0.108566 0.334714 0.349481 0.270693 0.137507 0.242319 Consensus sequence: HBHDVBWGATHBTATCRVBHHH Reverse complement motif 0.242319 0.270693 0.137507 0.349481 0.334714 0.254722 0.108566 0.301997 0.343890 0.181545 0.178433 0.296132 0.094792 0.280905 0.358651 0.265652 0.146347 0.215846 0.255908 0.381899 0.383793 0.397470 0.016807 0.201931 0.051861 0.027599 0.848177 0.072363 0.818819 0.069147 0.070830 0.041204 0.049095 0.051581 0.060119 0.839205 0.547025 0.165830 0.135066 0.152079 0.389083 0.220471 0.283490 0.106956 0.300745 0.231992 0.225143 0.242120 0.874114 0.070903 0.024248 0.030735 0.026023 0.027509 0.024058 0.922410 0.051221 0.897245 0.023698 0.027836 0.329820 0.142722 0.026556 0.500902 0.392682 0.320104 0.191738 0.095475 0.271041 0.364395 0.214702 0.149863 0.314530 0.207557 0.237497 0.240415 0.336250 0.244280 0.165207 0.254263 0.475347 0.182137 0.205873 0.136644 0.387350 0.319872 0.115137 0.177641 Consensus sequence: HHHBBMGATAVHATCWVVDHVH Alignment: HHHBBMGATAVHATCWVVDHVH -WWWAAAAWWAAAAAAAAAAWW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 1 21 0.061742 Species: Mus musculus Original motif 0.067627 0.131333 0.654425 0.146615 0.156488 0.114442 0.145630 0.583441 0.206450 0.265630 0.358017 0.169903 0.090729 0.460713 0.274712 0.173847 0.285994 0.099998 0.154485 0.459523 0.635908 0.184787 0.072982 0.106323 0.748421 0.039204 0.092605 0.119769 0.081342 0.061327 0.044532 0.812799 0.143120 0.043879 0.024216 0.788785 0.247544 0.092102 0.621453 0.038901 0.295531 0.036295 0.027594 0.640580 0.194561 0.305468 0.339916 0.160055 0.175038 0.193568 0.101212 0.530182 0.145226 0.167488 0.559871 0.127415 0.271501 0.237429 0.206701 0.284369 0.216834 0.109191 0.569605 0.104370 0.182624 0.177160 0.300475 0.339742 0.331737 0.198645 0.265137 0.204482 0.230155 0.359365 0.183450 0.227029 0.056581 0.067297 0.463052 0.413070 0.198891 0.324626 0.304424 0.172059 0.181968 0.287547 0.202419 0.328066 Consensus sequence: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB Reverse complement motif 0.328066 0.287547 0.202419 0.181968 0.198891 0.304424 0.324626 0.172059 0.056581 0.463052 0.067297 0.413070 0.230155 0.183450 0.359365 0.227029 0.204482 0.198645 0.265137 0.331737 0.339742 0.177160 0.300475 0.182624 0.216834 0.569605 0.109191 0.104370 0.284369 0.237429 0.206701 0.271501 0.145226 0.559871 0.167488 0.127415 0.530182 0.193568 0.101212 0.175038 0.194561 0.339916 0.305468 0.160055 0.640580 0.036295 0.027594 0.295531 0.247544 0.621453 0.092102 0.038901 0.788785 0.043879 0.024216 0.143120 0.812799 0.061327 0.044532 0.081342 0.119769 0.039204 0.092605 0.748421 0.106323 0.184787 0.072982 0.635908 0.459523 0.099998 0.154485 0.285994 0.090729 0.274712 0.460713 0.173847 0.206450 0.358017 0.265630 0.169903 0.583441 0.114442 0.145630 0.156488 0.067627 0.654425 0.131333 0.146615 Consensus sequence: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC Alignment: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC WWWAAAAWWAAAAAAAAAAWW- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00098 Rfx3_primary Original Motif Original Motif Forward 1 21 0.065491 Species: Mus musculus Original motif 0.218345 0.231533 0.152528 0.397594 0.264604 0.126115 0.320860 0.288421 0.117304 0.186844 0.172946 0.522906 0.111929 0.277908 0.409084 0.201079 0.343319 0.311376 0.123612 0.221692 0.193354 0.374280 0.157338 0.275028 0.166348 0.578991 0.130872 0.123789 0.006937 0.931183 0.046809 0.015072 0.255581 0.289587 0.125513 0.329319 0.002582 0.012615 0.002782 0.982021 0.850584 0.007973 0.140639 0.000803 0.037792 0.002285 0.957277 0.002646 0.009414 0.921481 0.001636 0.067469 0.943403 0.000980 0.042401 0.013216 0.991166 0.002931 0.003540 0.002364 0.003651 0.987110 0.001106 0.008133 0.208873 0.369705 0.319129 0.102292 0.322535 0.186617 0.374187 0.116660 0.326738 0.179486 0.226374 0.267402 0.299697 0.185329 0.133025 0.381949 0.300824 0.266836 0.096437 0.335904 0.418443 0.191068 0.127183 0.263306 0.386727 0.204062 0.126050 0.283161 Consensus sequence: HDTBHHCCHTAGCAACVVDHHHH Reverse complement motif 0.283161 0.204062 0.126050 0.386727 0.263306 0.191068 0.127183 0.418443 0.335904 0.266836 0.096437 0.300824 0.381949 0.185329 0.133025 0.299697 0.267402 0.179486 0.226374 0.326738 0.322535 0.374187 0.186617 0.116660 0.208873 0.319129 0.369705 0.102292 0.003651 0.001106 0.987110 0.008133 0.002364 0.002931 0.003540 0.991166 0.013216 0.000980 0.042401 0.943403 0.009414 0.001636 0.921481 0.067469 0.037792 0.957277 0.002285 0.002646 0.000803 0.007973 0.140639 0.850584 0.982021 0.012615 0.002782 0.002582 0.329319 0.289587 0.125513 0.255581 0.006937 0.046809 0.931183 0.015072 0.166348 0.130872 0.578991 0.123789 0.193354 0.157338 0.374280 0.275028 0.221692 0.311376 0.123612 0.343319 0.111929 0.409084 0.277908 0.201079 0.522906 0.186844 0.172946 0.117304 0.264604 0.320860 0.126115 0.288421 0.397594 0.231533 0.152528 0.218345 Consensus sequence: HHHHDVVGTTGCTAHGGDHBAHH Alignment: HDTBHHCCHTAGCAACVVDHHHH WWWAAAAWWAAAAAAAAAAWW-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 11 Motif name: C011 Original motif 0.029703 0.029703 0.455446 0.485149 0.465347 0.475248 0.049505 0.009901 0.100000 0.080000 0.770000 0.050000 0.790000 0.050000 0.130000 0.030000 0.110000 0.170000 0.710000 0.010000 0.770000 0.010000 0.190000 0.030000 0.019802 0.029703 0.445545 0.504950 0.460000 0.470000 0.060000 0.010000 0.089109 0.158416 0.742574 0.009901 0.880000 0.010000 0.090000 0.020000 0.100000 0.130000 0.760000 0.010000 0.730000 0.020000 0.230000 0.020000 0.050000 0.120000 0.630000 0.200000 0.780000 0.120000 0.080000 0.020000 0.060000 0.150000 0.780000 0.010000 0.851485 0.009901 0.118812 0.019802 0.029703 0.049505 0.386139 0.534653 0.445545 0.485149 0.049505 0.019802 Consensus sequence: KMGAGAKMGAGAGAGAKM Reserve complement motif 0.445545 0.049505 0.485149 0.019802 0.534653 0.049505 0.386139 0.029703 0.019802 0.009901 0.118812 0.851485 0.060000 0.780000 0.150000 0.010000 0.020000 0.120000 0.080000 0.780000 0.050000 0.630000 0.120000 0.200000 0.020000 0.020000 0.230000 0.730000 0.100000 0.760000 0.130000 0.010000 0.020000 0.010000 0.090000 0.880000 0.089109 0.742574 0.158416 0.009901 0.460000 0.060000 0.470000 0.010000 0.504950 0.029703 0.445545 0.019802 0.030000 0.010000 0.190000 0.770000 0.110000 0.710000 0.170000 0.010000 0.030000 0.050000 0.130000 0.790000 0.100000 0.770000 0.080000 0.050000 0.465347 0.049505 0.475248 0.009901 0.485149 0.029703 0.455446 0.029703 Consensus sequence: RRTCTCTCTCRRTCTCRR ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 11 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 2 18 0.040481 Species: Mus musculus Original motif 0.067627 0.131333 0.654425 0.146615 0.156488 0.114442 0.145630 0.583441 0.206450 0.265630 0.358017 0.169903 0.090729 0.460713 0.274712 0.173847 0.285994 0.099998 0.154485 0.459523 0.635908 0.184787 0.072982 0.106323 0.748421 0.039204 0.092605 0.119769 0.081342 0.061327 0.044532 0.812799 0.143120 0.043879 0.024216 0.788785 0.247544 0.092102 0.621453 0.038901 0.295531 0.036295 0.027594 0.640580 0.194561 0.305468 0.339916 0.160055 0.175038 0.193568 0.101212 0.530182 0.145226 0.167488 0.559871 0.127415 0.271501 0.237429 0.206701 0.284369 0.216834 0.109191 0.569605 0.104370 0.182624 0.177160 0.300475 0.339742 0.331737 0.198645 0.265137 0.204482 0.230155 0.359365 0.183450 0.227029 0.056581 0.067297 0.463052 0.413070 0.198891 0.324626 0.304424 0.172059 0.181968 0.287547 0.202419 0.328066 Consensus sequence: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB Reverse complement motif 0.328066 0.287547 0.202419 0.181968 0.198891 0.304424 0.324626 0.172059 0.056581 0.463052 0.067297 0.413070 0.230155 0.183450 0.359365 0.227029 0.204482 0.198645 0.265137 0.331737 0.339742 0.177160 0.300475 0.182624 0.216834 0.569605 0.109191 0.104370 0.284369 0.237429 0.206701 0.271501 0.145226 0.559871 0.167488 0.127415 0.530182 0.193568 0.101212 0.175038 0.194561 0.339916 0.305468 0.160055 0.640580 0.036295 0.027594 0.295531 0.247544 0.621453 0.092102 0.038901 0.788785 0.043879 0.024216 0.143120 0.812799 0.061327 0.044532 0.081342 0.119769 0.039204 0.092605 0.748421 0.106323 0.184787 0.072982 0.635908 0.459523 0.099998 0.154485 0.285994 0.090729 0.274712 0.460713 0.173847 0.206450 0.358017 0.265630 0.169903 0.583441 0.114442 0.145630 0.156488 0.067627 0.654425 0.131333 0.146615 Consensus sequence: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC Alignment: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC ---RRTCTCTCTCRRTCTCRR- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 2 18 0.047123 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH ----RRTCTCTCTCRRTCTCRR- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00098 Rfx3_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 1 18 0.047474 Species: Mus musculus Original motif 0.314514 0.275352 0.257617 0.152518 0.126939 0.598294 0.130576 0.144192 0.102265 0.155334 0.177957 0.564445 0.129288 0.282678 0.326990 0.261044 0.318166 0.227823 0.175681 0.278330 0.109019 0.380838 0.278328 0.231815 0.226145 0.289206 0.291300 0.193348 0.035863 0.844339 0.072582 0.047216 0.223793 0.187244 0.088092 0.500871 0.039800 0.029681 0.026201 0.904317 0.298298 0.032147 0.654746 0.014809 0.014729 0.022023 0.944826 0.018422 0.485114 0.004925 0.013785 0.496176 0.035708 0.020381 0.240804 0.703108 0.951152 0.012738 0.017886 0.018224 0.023713 0.944394 0.009538 0.022355 0.291067 0.385205 0.232388 0.091339 0.340334 0.199588 0.311526 0.148552 0.198713 0.472138 0.178319 0.150830 0.321155 0.269932 0.311301 0.097612 0.412646 0.195252 0.231950 0.160152 0.297134 0.180928 0.250400 0.271538 0.151169 0.305386 0.358574 0.184871 Consensus sequence: VCTBHBVCTTGGWTACVVVVVDB Reverse complement motif 0.151169 0.358574 0.305386 0.184871 0.271538 0.180928 0.250400 0.297134 0.160152 0.195252 0.231950 0.412646 0.097612 0.269932 0.311301 0.321155 0.198713 0.178319 0.472138 0.150830 0.148552 0.199588 0.311526 0.340334 0.291067 0.232388 0.385205 0.091339 0.023713 0.009538 0.944394 0.022355 0.018224 0.012738 0.017886 0.951152 0.703108 0.020381 0.240804 0.035708 0.496176 0.004925 0.013785 0.485114 0.014729 0.944826 0.022023 0.018422 0.298298 0.654746 0.032147 0.014809 0.904317 0.029681 0.026201 0.039800 0.500871 0.187244 0.088092 0.223793 0.035863 0.072582 0.844339 0.047216 0.226145 0.291300 0.289206 0.193348 0.109019 0.278328 0.380838 0.231815 0.278330 0.227823 0.175681 0.318166 0.129288 0.326990 0.282678 0.261044 0.564445 0.155334 0.177957 0.102265 0.126939 0.130576 0.598294 0.144192 0.152518 0.275352 0.257617 0.314514 Consensus sequence: BDBBVBVGTAWCCAAGVBHBAGB Alignment: BDBBVBVGTAWCCAAGVBHBAGB RRTCTCTCTCRRTCTCRR----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 3 18 0.047585 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK --KMGAGAKMGAGAGAGAKM-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 4 18 0.050002 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV ---KMGAGAKMGAGAGAGAKM-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 12 Motif name: C012 Original motif 0.435644 0.445545 0.079208 0.039604 0.029703 0.069307 0.415842 0.485149 0.630000 0.130000 0.200000 0.040000 0.090000 0.110000 0.760000 0.040000 0.770000 0.010000 0.190000 0.030000 0.049505 0.108911 0.801980 0.039604 0.460000 0.430000 0.100000 0.010000 0.010000 0.060000 0.440000 0.490000 0.772277 0.009901 0.178218 0.039604 0.060606 0.161616 0.767677 0.010101 0.820000 0.010000 0.140000 0.030000 0.080000 0.120000 0.780000 0.020000 0.620000 0.210000 0.140000 0.030000 0.050000 0.160000 0.570000 0.220000 0.860000 0.030000 0.100000 0.010000 0.100000 0.110000 0.780000 0.010000 0.660000 0.200000 0.130000 0.010000 0.040404 0.060606 0.404040 0.494949 0.475248 0.396040 0.099010 0.029703 Consensus sequence: MKAGAGMKAGAGAGAGAKM Reserve complement motif 0.029703 0.396040 0.099010 0.475248 0.494949 0.060606 0.404040 0.040404 0.010000 0.200000 0.130000 0.660000 0.100000 0.780000 0.110000 0.010000 0.010000 0.030000 0.100000 0.860000 0.050000 0.570000 0.160000 0.220000 0.030000 0.210000 0.140000 0.620000 0.080000 0.780000 0.120000 0.020000 0.030000 0.010000 0.140000 0.820000 0.060606 0.767677 0.161616 0.010101 0.039604 0.009901 0.178218 0.772277 0.490000 0.060000 0.440000 0.010000 0.010000 0.430000 0.100000 0.460000 0.049505 0.801980 0.108911 0.039604 0.030000 0.010000 0.190000 0.770000 0.090000 0.760000 0.110000 0.040000 0.040000 0.130000 0.200000 0.630000 0.485149 0.069307 0.415842 0.029703 0.435644 0.079208 0.445545 0.039604 Consensus sequence: YRTCTCTCTCTRYCTCTRR ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 12 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 2 19 0.041974 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK -MKAGAGMKAGAGAGAGAKM-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00032 Gata3_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 4 19 0.044641 Species: Mus musculus Original motif 0.151572 0.262753 0.258275 0.327401 0.221834 0.113385 0.275380 0.389400 0.297769 0.136928 0.134678 0.430625 0.270099 0.110415 0.271106 0.348380 0.265471 0.090253 0.223340 0.420936 0.616582 0.090091 0.171960 0.121367 0.197318 0.107541 0.406904 0.288237 0.798258 0.046950 0.001406 0.153385 0.003195 0.002516 0.989707 0.004582 0.991503 0.002748 0.002617 0.003132 0.005015 0.002764 0.003026 0.989195 0.948394 0.008932 0.001344 0.041330 0.973109 0.004100 0.004081 0.018710 0.040365 0.113905 0.828185 0.017545 0.736608 0.130524 0.113464 0.019404 0.415921 0.106101 0.316613 0.161365 0.376582 0.170927 0.155572 0.296919 0.137731 0.197151 0.211055 0.454064 0.324853 0.122747 0.246107 0.306293 0.462490 0.207311 0.159392 0.170807 0.380420 0.188972 0.311990 0.118618 0.222178 0.157873 0.380486 0.239463 Consensus sequence: BDHDDADAGATAAGADHBDHVD Reverse complement motif 0.222178 0.380486 0.157873 0.239463 0.118618 0.188972 0.311990 0.380420 0.170807 0.207311 0.159392 0.462490 0.306293 0.122747 0.246107 0.324853 0.454064 0.197151 0.211055 0.137731 0.296919 0.170927 0.155572 0.376582 0.161365 0.106101 0.316613 0.415921 0.019404 0.130524 0.113464 0.736608 0.040365 0.828185 0.113905 0.017545 0.018710 0.004100 0.004081 0.973109 0.041330 0.008932 0.001344 0.948394 0.989195 0.002764 0.003026 0.005015 0.003132 0.002748 0.002617 0.991503 0.003195 0.989707 0.002516 0.004582 0.153385 0.046950 0.001406 0.798258 0.197318 0.406904 0.107541 0.288237 0.121367 0.090091 0.171960 0.616582 0.420936 0.090253 0.223340 0.265471 0.348380 0.110415 0.271106 0.270099 0.430625 0.136928 0.134678 0.297769 0.389400 0.113385 0.275380 0.221834 0.327401 0.262753 0.258275 0.151572 Consensus sequence: HBHDVHDTCTTATCTHTDDHDV Alignment: HBHDVHDTCTTATCTHTDDHDV YRTCTCTCTCTRYCTCTRR--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 3 19 0.045570 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB --MKAGAGMKAGAGAGAGAKM-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00400 Zif268 Original Motif Reverse Complement Backward 3 19 0.050295 Species: Mus musculus Original motif 0.104824 0.412716 0.254506 0.227955 0.644922 0.065476 0.140479 0.149122 0.201205 0.166164 0.347131 0.285501 0.360606 0.256316 0.150766 0.232313 0.199831 0.240681 0.279350 0.280137 0.234308 0.204076 0.321306 0.240310 0.274112 0.462435 0.111425 0.152028 0.067070 0.717501 0.073934 0.141496 0.106745 0.084442 0.658566 0.150247 0.025128 0.967053 0.003585 0.004234 0.006412 0.982989 0.003227 0.007371 0.009588 0.877620 0.002571 0.110221 0.621521 0.355443 0.015669 0.007366 0.002600 0.980275 0.004191 0.012934 0.118773 0.026658 0.783843 0.070725 0.022358 0.822101 0.024684 0.130857 0.713212 0.080912 0.128793 0.077084 0.166568 0.250955 0.107934 0.474544 0.225040 0.222494 0.163301 0.389166 0.268976 0.223206 0.265314 0.242504 0.137052 0.229058 0.148439 0.485451 0.135819 0.304550 0.141994 0.417637 0.272440 0.319501 0.230580 0.177478 Consensus sequence: BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV Reverse complement motif 0.272440 0.230580 0.319501 0.177478 0.417637 0.304550 0.141994 0.135819 0.485451 0.229058 0.148439 0.137052 0.242504 0.223206 0.265314 0.268976 0.389166 0.222494 0.163301 0.225040 0.474544 0.250955 0.107934 0.166568 0.077084 0.080912 0.128793 0.713212 0.022358 0.024684 0.822101 0.130857 0.118773 0.783843 0.026658 0.070725 0.002600 0.004191 0.980275 0.012934 0.007366 0.355443 0.015669 0.621521 0.009588 0.002571 0.877620 0.110221 0.006412 0.003227 0.982989 0.007371 0.025128 0.003585 0.967053 0.004234 0.106745 0.658566 0.084442 0.150247 0.067070 0.073934 0.717501 0.141496 0.274112 0.111425 0.462435 0.152028 0.234308 0.321306 0.204076 0.240310 0.280137 0.240681 0.279350 0.199831 0.232313 0.256316 0.150766 0.360606 0.201205 0.347131 0.166164 0.285501 0.149122 0.065476 0.140479 0.644922 0.104824 0.254506 0.412716 0.227955 Consensus sequence: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB Alignment: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB --MKAGAGMKAGAGAGAGAKM-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 3 19 0.051037 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV --MKAGAGMKAGAGAGAGAKM-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 13 Motif name: C013 Original motif 0.470000 0.020000 0.120000 0.390000 0.131313 0.494949 0.252525 0.121212 0.090909 0.818182 0.010101 0.080808 0.020000 0.030000 0.010000 0.940000 0.089109 0.029703 0.752475 0.128713 0.060000 0.020000 0.900000 0.020000 0.881188 0.039604 0.049505 0.029703 0.810000 0.030000 0.110000 0.050000 0.030000 0.870000 0.040000 0.060000 0.019802 0.029703 0.019802 0.930693 0.020000 0.930000 0.030000 0.020000 0.920792 0.019802 0.019802 0.039604 0.030000 0.850000 0.090000 0.030000 0.080000 0.030000 0.040000 0.850000 0.138614 0.475248 0.118812 0.267327 0.050000 0.020000 0.030000 0.900000 0.020000 0.030000 0.940000 0.010000 0.040000 0.100000 0.020000 0.840000 0.960000 0.020000 0.010000 0.010000 0.060000 0.020000 0.900000 0.020000 0.790000 0.130000 0.030000 0.050000 0.050000 0.760000 0.080000 0.110000 0.108911 0.811881 0.019802 0.059406 0.930000 0.010000 0.030000 0.030000 0.060000 0.030000 0.880000 0.030000 0.080000 0.020000 0.840000 0.060000 0.480000 0.420000 0.010000 0.090000 Consensus sequence: WVCTGGAACTCACTHTGTAGACCAGGM Reserve complement motif 0.090000 0.420000 0.010000 0.480000 0.080000 0.840000 0.020000 0.060000 0.060000 0.880000 0.030000 0.030000 0.030000 0.010000 0.030000 0.930000 0.108911 0.019802 0.811881 0.059406 0.050000 0.080000 0.760000 0.110000 0.050000 0.130000 0.030000 0.790000 0.060000 0.900000 0.020000 0.020000 0.010000 0.020000 0.010000 0.960000 0.840000 0.100000 0.020000 0.040000 0.020000 0.940000 0.030000 0.010000 0.900000 0.020000 0.030000 0.050000 0.138614 0.118812 0.475248 0.267327 0.850000 0.030000 0.040000 0.080000 0.030000 0.090000 0.850000 0.030000 0.039604 0.019802 0.019802 0.920792 0.020000 0.030000 0.930000 0.020000 0.930693 0.029703 0.019802 0.019802 0.030000 0.040000 0.870000 0.060000 0.050000 0.030000 0.110000 0.810000 0.029703 0.039604 0.049505 0.881188 0.060000 0.900000 0.020000 0.020000 0.089109 0.752475 0.029703 0.128713 0.940000 0.030000 0.010000 0.020000 0.090909 0.010101 0.818182 0.080808 0.131313 0.252525 0.494949 0.121212 0.390000 0.020000 0.120000 0.470000 Consensus sequence: YCCTGGTCTACADAGTGAGTTCCAGVW ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 13 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00528 Foxm1_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 6 22 0.045656 Species: Mus musculus Original motif 0.399785 0.446658 0.111435 0.042122 0.535175 0.103991 0.089706 0.271128 0.078171 0.387987 0.375083 0.158759 0.309001 0.519142 0.070618 0.101239 0.201844 0.255818 0.323149 0.219190 0.534101 0.109845 0.235026 0.121028 0.656038 0.037473 0.261484 0.045006 0.315713 0.164290 0.471815 0.048182 0.651960 0.009412 0.328237 0.010391 0.937365 0.017313 0.007516 0.037807 0.019983 0.044238 0.012387 0.923392 0.061195 0.021485 0.881645 0.035675 0.017521 0.952998 0.013139 0.016342 0.254160 0.029735 0.493023 0.223082 0.239200 0.593324 0.114503 0.052973 0.610822 0.071539 0.099169 0.218470 0.166610 0.389712 0.204400 0.239278 0.227752 0.361626 0.178497 0.232125 0.537030 0.182466 0.026035 0.254470 0.235902 0.151006 0.043788 0.569304 0.081851 0.250397 0.590059 0.077693 0.340417 0.189613 0.272075 0.197895 Consensus sequence: MWSMBAARRATGCDCABHATGD Reverse complement motif 0.197895 0.189613 0.272075 0.340417 0.081851 0.590059 0.250397 0.077693 0.569304 0.151006 0.043788 0.235902 0.254470 0.182466 0.026035 0.537030 0.227752 0.178497 0.361626 0.232125 0.166610 0.204400 0.389712 0.239278 0.218470 0.071539 0.099169 0.610822 0.239200 0.114503 0.593324 0.052973 0.254160 0.493023 0.029735 0.223082 0.017521 0.013139 0.952998 0.016342 0.061195 0.881645 0.021485 0.035675 0.923392 0.044238 0.012387 0.019983 0.037807 0.017313 0.007516 0.937365 0.010391 0.009412 0.328237 0.651960 0.315713 0.471815 0.164290 0.048182 0.045006 0.037473 0.261484 0.656038 0.121028 0.109845 0.235026 0.534101 0.201844 0.323149 0.255818 0.219190 0.309001 0.070618 0.519142 0.101239 0.078171 0.375083 0.387987 0.158759 0.271128 0.103991 0.089706 0.535175 0.399785 0.111435 0.446658 0.042122 Consensus sequence: DCATDBTGHGCATKMTTBRSWR Alignment: -----MWSMBAARRATGCDCABHATGD WVCTGGAACTCACTHTGTAGACCAGGM----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 6 22 0.050311 Species: Mus musculus Original motif 0.067627 0.131333 0.654425 0.146615 0.156488 0.114442 0.145630 0.583441 0.206450 0.265630 0.358017 0.169903 0.090729 0.460713 0.274712 0.173847 0.285994 0.099998 0.154485 0.459523 0.635908 0.184787 0.072982 0.106323 0.748421 0.039204 0.092605 0.119769 0.081342 0.061327 0.044532 0.812799 0.143120 0.043879 0.024216 0.788785 0.247544 0.092102 0.621453 0.038901 0.295531 0.036295 0.027594 0.640580 0.194561 0.305468 0.339916 0.160055 0.175038 0.193568 0.101212 0.530182 0.145226 0.167488 0.559871 0.127415 0.271501 0.237429 0.206701 0.284369 0.216834 0.109191 0.569605 0.104370 0.182624 0.177160 0.300475 0.339742 0.331737 0.198645 0.265137 0.204482 0.230155 0.359365 0.183450 0.227029 0.056581 0.067297 0.463052 0.413070 0.198891 0.324626 0.304424 0.172059 0.181968 0.287547 0.202419 0.328066 Consensus sequence: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB Reverse complement motif 0.328066 0.287547 0.202419 0.181968 0.198891 0.304424 0.324626 0.172059 0.056581 0.463052 0.067297 0.413070 0.230155 0.183450 0.359365 0.227029 0.204482 0.198645 0.265137 0.331737 0.339742 0.177160 0.300475 0.182624 0.216834 0.569605 0.109191 0.104370 0.284369 0.237429 0.206701 0.271501 0.145226 0.559871 0.167488 0.127415 0.530182 0.193568 0.101212 0.175038 0.194561 0.339916 0.305468 0.160055 0.640580 0.036295 0.027594 0.295531 0.247544 0.621453 0.092102 0.038901 0.788785 0.043879 0.024216 0.143120 0.812799 0.061327 0.044532 0.081342 0.119769 0.039204 0.092605 0.748421 0.106323 0.184787 0.072982 0.635908 0.459523 0.099998 0.154485 0.285994 0.090729 0.274712 0.460713 0.173847 0.206450 0.358017 0.265630 0.169903 0.583441 0.114442 0.145630 0.156488 0.067627 0.654425 0.131333 0.146615 Consensus sequence: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC Alignment: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC----- -----YCCTGGTCTACADAGTGAGTTCCAGVW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00526 Foxn1_primary Original Motif Original Motif Backward 6 22 0.051843 Species: Mus musculus Original motif 0.456612 0.057181 0.078281 0.407926 0.460529 0.185506 0.083106 0.270859 0.445717 0.179510 0.239355 0.135417 0.116339 0.145186 0.275331 0.463144 0.239398 0.142078 0.480004 0.138520 0.355157 0.217877 0.284296 0.142670 0.318602 0.444835 0.153321 0.083243 0.609569 0.055866 0.280349 0.054216 0.062297 0.769824 0.027844 0.140035 0.151868 0.019245 0.803188 0.025699 0.011842 0.952534 0.017959 0.017665 0.017665 0.017959 0.952534 0.011842 0.025699 0.803188 0.019245 0.151868 0.140035 0.027844 0.769824 0.062297 0.054216 0.280349 0.055866 0.609569 0.013084 0.624655 0.177956 0.184305 0.287647 0.183527 0.295753 0.233074 0.042309 0.345931 0.198458 0.413301 0.338138 0.266033 0.045367 0.350462 0.302850 0.155320 0.074662 0.467168 0.240926 0.068901 0.283055 0.407118 0.409954 0.183157 0.154186 0.252704 Consensus sequence: WHVBVVMACGCGCGTCDYHWDH Reverse complement motif 0.252704 0.183157 0.154186 0.409954 0.407118 0.068901 0.283055 0.240926 0.467168 0.155320 0.074662 0.302850 0.350462 0.266033 0.045367 0.338138 0.413301 0.345931 0.198458 0.042309 0.287647 0.295753 0.183527 0.233074 0.013084 0.177956 0.624655 0.184305 0.609569 0.280349 0.055866 0.054216 0.140035 0.769824 0.027844 0.062297 0.025699 0.019245 0.803188 0.151868 0.017665 0.952534 0.017959 0.011842 0.011842 0.017959 0.952534 0.017665 0.151868 0.803188 0.019245 0.025699 0.062297 0.027844 0.769824 0.140035 0.054216 0.055866 0.280349 0.609569 0.318602 0.153321 0.444835 0.083243 0.142670 0.217877 0.284296 0.355157 0.239398 0.480004 0.142078 0.138520 0.463144 0.145186 0.275331 0.116339 0.135417 0.179510 0.239355 0.445717 0.270859 0.185506 0.083106 0.460529 0.407926 0.057181 0.078281 0.456612 Consensus sequence: HDWHMHGACGCGCGTRBVVBHW Alignment: -----WHVBVVMACGCGCGTCDYHWDH WVCTGGAACTCACTHTGTAGACCAGGM----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_primaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 7 21 0.546981 Species: Mus musculus Original motif 0.204923 0.208846 0.365383 0.220848 0.294304 0.300143 0.167287 0.238266 0.109711 0.619514 0.117379 0.153396 0.178979 0.378580 0.230177 0.212264 0.159594 0.542602 0.118178 0.179627 0.125206 0.430074 0.151826 0.292894 0.097692 0.709845 0.116956 0.075506 0.148292 0.565912 0.037632 0.248164 0.077951 0.034190 0.855503 0.032356 0.001657 0.001061 0.971877 0.025405 0.001926 0.001084 0.991712 0.005278 0.033031 0.012001 0.057796 0.897171 0.002723 0.002647 0.993348 0.001281 0.003261 0.000963 0.987199 0.008577 0.000611 0.090925 0.074857 0.833608 0.015299 0.978878 0.004949 0.000874 0.013368 0.600902 0.033485 0.352245 0.231949 0.149575 0.118804 0.499672 0.267580 0.186002 0.371242 0.175176 0.264884 0.223483 0.110082 0.401551 0.221365 0.170121 0.179559 0.428955 0.112997 0.692930 0.139981 0.054092 0.460305 0.207883 0.155111 0.176702 Consensus sequence: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH Reverse complement motif 0.176702 0.207883 0.155111 0.460305 0.112997 0.139981 0.692930 0.054092 0.428955 0.170121 0.179559 0.221365 0.401551 0.223483 0.110082 0.264884 0.267580 0.371242 0.186002 0.175176 0.499672 0.149575 0.118804 0.231949 0.013368 0.033485 0.600902 0.352245 0.015299 0.004949 0.978878 0.000874 0.833608 0.090925 0.074857 0.000611 0.003261 0.987199 0.000963 0.008577 0.002723 0.993348 0.002647 0.001281 0.897171 0.012001 0.057796 0.033031 0.001926 0.991712 0.001084 0.005278 0.001657 0.971877 0.001061 0.025405 0.077951 0.855503 0.034190 0.032356 0.148292 0.037632 0.565912 0.248164 0.097692 0.116956 0.709845 0.075506 0.125206 0.151826 0.430074 0.292894 0.159594 0.118178 0.542602 0.179627 0.178979 0.230177 0.378580 0.212264 0.109711 0.117379 0.619514 0.153396 0.294304 0.167287 0.300143 0.238266 0.204923 0.365383 0.208846 0.220848 Consensus sequence: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB Alignment: ------BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH WVCTGGAACTCACTHTGTAGACCAGGM------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_primaryReverse Complement Reverse Complement Backward 3 21 0.549369 Species: Mus musculus Original motif 0.183797 0.268049 0.330111 0.218043 0.127599 0.330310 0.243614 0.298477 0.143199 0.188046 0.268593 0.400162 0.214690 0.205230 0.247090 0.332990 0.294688 0.299104 0.327152 0.079056 0.221909 0.193223 0.480155 0.104712 0.444072 0.068239 0.481838 0.005852 0.006182 0.015429 0.901278 0.077111 0.766535 0.111138 0.121632 0.000696 0.014848 0.973961 0.000298 0.010893 0.001807 0.992200 0.002669 0.003324 0.795344 0.140510 0.018576 0.045571 0.006990 0.988200 0.002510 0.002299 0.154898 0.842296 0.000998 0.001808 0.029577 0.919262 0.006935 0.044226 0.677987 0.032075 0.185065 0.104874 0.195132 0.364580 0.319321 0.120967 0.225412 0.115034 0.612849 0.046705 0.548628 0.058900 0.162857 0.229616 0.112531 0.340331 0.165910 0.381227 0.073029 0.303078 0.363896 0.259997 0.561485 0.260567 0.092979 0.084969 0.132283 0.457691 0.140159 0.269867 Consensus sequence: BBBDVVRGACCACCCAVGABBAB Reverse complement motif 0.132283 0.140159 0.457691 0.269867 0.084969 0.260567 0.092979 0.561485 0.073029 0.363896 0.303078 0.259997 0.381227 0.340331 0.165910 0.112531 0.229616 0.058900 0.162857 0.548628 0.225412 0.612849 0.115034 0.046705 0.195132 0.319321 0.364580 0.120967 0.104874 0.032075 0.185065 0.677987 0.029577 0.006935 0.919262 0.044226 0.154898 0.000998 0.842296 0.001808 0.006990 0.002510 0.988200 0.002299 0.045571 0.140510 0.018576 0.795344 0.001807 0.002669 0.992200 0.003324 0.014848 0.000298 0.973961 0.010893 0.000696 0.111138 0.121632 0.766535 0.006182 0.901278 0.015429 0.077111 0.444072 0.481838 0.068239 0.005852 0.221909 0.480155 0.193223 0.104712 0.294688 0.327152 0.299104 0.079056 0.332990 0.205230 0.247090 0.214690 0.400162 0.188046 0.268593 0.143199 0.127599 0.243614 0.330310 0.298477 0.183797 0.330111 0.268049 0.218043 Consensus sequence: BTBVTCVTGGGTGGTCMVVDVBB Alignment: ------BTBVTCVTGGGTGGTCMVVDVBB YCCTGGTCTACADAGTGAGTTCCAGVW-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 14 Motif name: C014 Original motif 0.019802 0.623762 0.029703 0.326733 0.108911 0.445545 0.366337 0.079208 0.140000 0.090000 0.610000 0.160000 0.131313 0.030303 0.828283 0.010101 0.929293 0.010101 0.050505 0.010101 0.090000 0.010000 0.890000 0.010000 0.181818 0.030303 0.707071 0.080808 0.060000 0.720000 0.170000 0.050000 0.750000 0.010000 0.070000 0.170000 0.040404 0.010101 0.939394 0.010101 0.656566 0.020202 0.303030 0.020202 0.101010 0.040404 0.838384 0.020202 0.178218 0.049505 0.742574 0.029703 0.070000 0.780000 0.090000 0.060000 0.500000 0.450000 0.030000 0.020000 0.040000 0.340000 0.530000 0.090000 Consensus sequence: YSGGAGGCAGAGGCMS Reserve complement motif 0.040000 0.530000 0.340000 0.090000 0.020000 0.450000 0.030000 0.500000 0.070000 0.090000 0.780000 0.060000 0.178218 0.742574 0.049505 0.029703 0.101010 0.838384 0.040404 0.020202 0.020202 0.020202 0.303030 0.656566 0.040404 0.939394 0.010101 0.010101 0.170000 0.010000 0.070000 0.750000 0.060000 0.170000 0.720000 0.050000 0.181818 0.707071 0.030303 0.080808 0.090000 0.890000 0.010000 0.010000 0.010101 0.010101 0.050505 0.929293 0.131313 0.828283 0.030303 0.010101 0.140000 0.610000 0.090000 0.160000 0.108911 0.366337 0.445545 0.079208 0.019802 0.029703 0.623762 0.326733 Consensus sequence: SYGCCTCTGCCTCCSK ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 14 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00527 Foxn4_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 3 16 0.033136 Species: Mus musculus Original motif 0.298336 0.418632 0.208054 0.074978 0.289907 0.015608 0.457100 0.237385 0.273583 0.077889 0.107860 0.540668 0.184954 0.161611 0.384390 0.269045 0.521826 0.156340 0.089019 0.232815 0.356716 0.131104 0.394857 0.117323 0.266669 0.108765 0.505273 0.119293 0.020778 0.047199 0.919524 0.012500 0.948536 0.018775 0.008113 0.024576 0.010822 0.964042 0.014701 0.010434 0.007428 0.019505 0.966351 0.006717 0.010025 0.975678 0.008648 0.005649 0.043796 0.120935 0.742979 0.092289 0.008252 0.250704 0.541132 0.199913 0.474428 0.044681 0.134430 0.346461 0.146597 0.421317 0.143166 0.288920 0.020540 0.181479 0.553811 0.244170 0.129612 0.173360 0.535219 0.161808 0.506084 0.158156 0.130983 0.204776 0.054872 0.103043 0.545792 0.296293 0.389882 0.171037 0.164162 0.274918 0.225861 0.314031 0.288872 0.171237 Consensus sequence: VDWDARRGACGCGGWHGGAKHV Reverse complement motif 0.225861 0.288872 0.314031 0.171237 0.274918 0.171037 0.164162 0.389882 0.054872 0.545792 0.103043 0.296293 0.204776 0.158156 0.130983 0.506084 0.129612 0.535219 0.173360 0.161808 0.020540 0.553811 0.181479 0.244170 0.146597 0.143166 0.421317 0.288920 0.346461 0.044681 0.134430 0.474428 0.008252 0.541132 0.250704 0.199913 0.043796 0.742979 0.120935 0.092289 0.010025 0.008648 0.975678 0.005649 0.007428 0.966351 0.019505 0.006717 0.010822 0.014701 0.964042 0.010434 0.024576 0.018775 0.008113 0.948536 0.020778 0.919524 0.047199 0.012500 0.266669 0.505273 0.108765 0.119293 0.356716 0.394857 0.131104 0.117323 0.232815 0.156340 0.089019 0.521826 0.184954 0.384390 0.161611 0.269045 0.540668 0.077889 0.107860 0.273583 0.289907 0.457100 0.015608 0.237385 0.298336 0.208054 0.418632 0.074978 Consensus sequence: VHYTCCDWCCGCGTCMMTHWHV Alignment: VHYTCCDWCCGCGTCMMTHWHV --SYGCCTCTGCCTCCSK---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00068 Eomes_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 1 16 0.034812 Species: Mus musculus Original motif 0.253642 0.252604 0.298295 0.195458 0.112892 0.341342 0.341061 0.204704 0.297430 0.215095 0.343350 0.144125 0.241098 0.129378 0.421448 0.208076 0.894201 0.007299 0.061032 0.037468 0.052259 0.054303 0.856609 0.036829 0.005074 0.015048 0.966734 0.013144 0.003258 0.061529 0.002368 0.932845 0.017531 0.005025 0.973155 0.004289 0.116022 0.030172 0.047139 0.806667 0.027749 0.602513 0.009946 0.359792 0.018763 0.048982 0.794648 0.137608 0.177116 0.459591 0.284833 0.078460 0.121483 0.491485 0.148745 0.238287 0.152590 0.245835 0.214717 0.386857 0.221040 0.320773 0.249918 0.208270 Consensus sequence: VBVDAGGTGTYGVBBV Reverse complement motif 0.221040 0.249918 0.320773 0.208270 0.386857 0.245835 0.214717 0.152590 0.121483 0.148745 0.491485 0.238287 0.177116 0.284833 0.459591 0.078460 0.018763 0.794648 0.048982 0.137608 0.027749 0.009946 0.602513 0.359792 0.806667 0.030172 0.047139 0.116022 0.017531 0.973155 0.005025 0.004289 0.932845 0.061529 0.002368 0.003258 0.005074 0.966734 0.015048 0.013144 0.052259 0.856609 0.054303 0.036829 0.037468 0.007299 0.061032 0.894201 0.241098 0.421448 0.129378 0.208076 0.297430 0.343350 0.215095 0.144125 0.112892 0.341061 0.341342 0.204704 0.253642 0.298295 0.252604 0.195458 Consensus sequence: VVBVCKACACCTHVBV Alignment: VVBVCKACACCTHVBV SYGCCTCTGCCTCCSK ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v015681_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 7 16 0.034835 Species: Mus musculus Original motif 0.331499 0.188505 0.182841 0.297156 0.328961 0.213025 0.273530 0.184484 0.197213 0.129292 0.524914 0.148581 0.274491 0.226406 0.312118 0.186986 0.103231 0.393726 0.364988 0.138055 0.552594 0.166422 0.186262 0.094722 0.157618 0.064773 0.616497 0.161112 0.139166 0.176098 0.621185 0.063551 0.748420 0.062398 0.012447 0.176735 0.116584 0.009438 0.860326 0.013653 0.005030 0.003646 0.974877 0.016447 0.055257 0.007181 0.921760 0.015802 0.032748 0.058249 0.052709 0.856293 0.105606 0.872231 0.014370 0.007793 0.019480 0.497379 0.125899 0.357242 0.478582 0.269713 0.061464 0.190242 0.253985 0.287006 0.201320 0.257689 0.319384 0.210231 0.175842 0.294543 0.222123 0.287802 0.201294 0.288782 0.139951 0.376041 0.081133 0.402875 0.213450 0.343835 0.383676 0.059039 0.322294 0.355918 0.148062 0.173725 Consensus sequence: HVGVSAGGAGGGTCYHHHHYVH Reverse complement motif 0.322294 0.148062 0.355918 0.173725 0.213450 0.383676 0.343835 0.059039 0.402875 0.376041 0.081133 0.139951 0.288782 0.287802 0.201294 0.222123 0.294543 0.210231 0.175842 0.319384 0.253985 0.201320 0.287006 0.257689 0.190242 0.269713 0.061464 0.478582 0.019480 0.125899 0.497379 0.357242 0.105606 0.014370 0.872231 0.007793 0.856293 0.058249 0.052709 0.032748 0.055257 0.921760 0.007181 0.015802 0.005030 0.974877 0.003646 0.016447 0.116584 0.860326 0.009438 0.013653 0.176735 0.062398 0.012447 0.748420 0.139166 0.621185 0.176098 0.063551 0.157618 0.616497 0.064773 0.161112 0.094722 0.166422 0.186262 0.552594 0.103231 0.364988 0.393726 0.138055 0.274491 0.312118 0.226406 0.186986 0.197213 0.524914 0.129292 0.148581 0.184484 0.213025 0.273530 0.328961 0.297156 0.188505 0.182841 0.331499 Consensus sequence: DVMHHDHKGACCCTCCTSVCBH Alignment: HVGVSAGGAGGGTCYHHHHYVH YSGGAGGCAGAGGCMS------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00002 Sp4_primary Reverse Complement Original Motif Forward 2 16 0.034915 Species: Mus musculus Original motif 0.155386 0.223380 0.374454 0.246780 0.247106 0.159582 0.345111 0.248201 0.238889 0.258354 0.165304 0.337454 0.255612 0.489586 0.051621 0.203182 0.450100 0.545383 0.001071 0.003447 0.003704 0.991007 0.002456 0.002833 0.035504 0.001814 0.928129 0.034553 0.001494 0.991406 0.003414 0.003686 0.003045 0.990628 0.005182 0.001145 0.000990 0.963237 0.001215 0.034557 0.148016 0.838396 0.000666 0.012922 0.014261 0.905847 0.007200 0.072692 0.083394 0.270068 0.058368 0.588170 0.149141 0.286783 0.142802 0.421274 0.204851 0.347195 0.253356 0.194597 0.184442 0.299908 0.194408 0.321242 0.125793 0.380109 0.245318 0.248780 Consensus sequence: BDHHMCGCCCCCTHVBB Reverse complement motif 0.125793 0.245318 0.380109 0.248780 0.321242 0.299908 0.194408 0.184442 0.204851 0.253356 0.347195 0.194597 0.421274 0.286783 0.142802 0.149141 0.588170 0.270068 0.058368 0.083394 0.014261 0.007200 0.905847 0.072692 0.148016 0.000666 0.838396 0.012922 0.000990 0.001215 0.963237 0.034557 0.003045 0.005182 0.990628 0.001145 0.001494 0.003414 0.991406 0.003686 0.035504 0.928129 0.001814 0.034553 0.003704 0.002456 0.991007 0.002833 0.450100 0.001071 0.545383 0.003447 0.255612 0.051621 0.489586 0.203182 0.337454 0.258354 0.165304 0.238889 0.247106 0.345111 0.159582 0.248201 0.155386 0.374454 0.223380 0.246780 Consensus sequence: BVVHAGGGGGCGRDHHB Alignment: BDHHMCGCCCCCTHVBB -SYGCCTCTGCCTCCSK ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00031 Zbtb3_primary Reverse Complement Original Motif Backward 1 16 0.035075 Species: Mus musculus Original motif 0.401190 0.144405 0.268531 0.185874 0.430224 0.168519 0.221247 0.180011 0.172575 0.268499 0.274136 0.284789 0.150971 0.297110 0.290868 0.261051 0.133421 0.282842 0.434718 0.149019 0.042798 0.941105 0.001785 0.014312 0.890788 0.002551 0.103316 0.003345 0.001887 0.951368 0.043722 0.003023 0.011633 0.002218 0.002269 0.983880 0.003597 0.003728 0.984819 0.007856 0.002946 0.903520 0.072457 0.021077 0.908487 0.057072 0.018256 0.016185 0.076237 0.329864 0.228896 0.365003 0.144926 0.162981 0.177370 0.514722 0.124970 0.327876 0.295814 0.251341 0.144592 0.313887 0.301912 0.239609 0.108463 0.241747 0.350296 0.299494 Consensus sequence: DDBBBCACTGCABTBBB Reverse complement motif 0.108463 0.350296 0.241747 0.299494 0.144592 0.301912 0.313887 0.239609 0.124970 0.295814 0.327876 0.251341 0.514722 0.162981 0.177370 0.144926 0.365003 0.329864 0.228896 0.076237 0.016185 0.057072 0.018256 0.908487 0.002946 0.072457 0.903520 0.021077 0.003597 0.984819 0.003728 0.007856 0.983880 0.002218 0.002269 0.011633 0.001887 0.043722 0.951368 0.003023 0.003345 0.002551 0.103316 0.890788 0.042798 0.001785 0.941105 0.014312 0.133421 0.434718 0.282842 0.149019 0.150971 0.290868 0.297110 0.261051 0.284789 0.268499 0.274136 0.172575 0.180011 0.168519 0.221247 0.430224 0.185874 0.144405 0.268531 0.401190 Consensus sequence: BBBAVTGCAGTGBBVDD Alignment: BBBAVTGCAGTGBBVDD -SYGCCTCTGCCTCCSK ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 15 Motif name: C015 Original motif 0.270000 0.140000 0.180000 0.410000 0.277228 0.445545 0.207921 0.069307 0.772277 0.079208 0.138614 0.009901 0.040000 0.040000 0.880000 0.040000 0.010101 0.898990 0.060606 0.030303 0.020202 0.929293 0.010101 0.040404 0.580000 0.060000 0.040000 0.320000 0.130000 0.020000 0.490000 0.360000 0.180000 0.010000 0.780000 0.030000 0.070000 0.040000 0.620000 0.270000 0.020202 0.949495 0.010101 0.020202 0.030000 0.100000 0.030000 0.840000 0.828283 0.050505 0.090909 0.030303 0.020000 0.870000 0.030000 0.080000 0.740000 0.200000 0.020000 0.040000 0.220000 0.330000 0.320000 0.130000 0.950000 0.010000 0.010000 0.030000 0.030000 0.010000 0.950000 0.010000 0.170000 0.580000 0.020000 0.230000 0.111111 0.010101 0.393939 0.484848 Consensus sequence: DVAGCCWKGGCTACAVAGCK Reserve complement motif 0.484848 0.010101 0.393939 0.111111 0.170000 0.020000 0.580000 0.230000 0.030000 0.950000 0.010000 0.010000 0.030000 0.010000 0.010000 0.950000 0.220000 0.320000 0.330000 0.130000 0.040000 0.200000 0.020000 0.740000 0.020000 0.030000 0.870000 0.080000 0.030303 0.050505 0.090909 0.828283 0.840000 0.100000 0.030000 0.030000 0.020202 0.010101 0.949495 0.020202 0.070000 0.620000 0.040000 0.270000 0.180000 0.780000 0.010000 0.030000 0.130000 0.490000 0.020000 0.360000 0.320000 0.060000 0.040000 0.580000 0.020202 0.010101 0.929293 0.040404 0.010101 0.060606 0.898990 0.030303 0.040000 0.880000 0.040000 0.040000 0.009901 0.079208 0.138614 0.772277 0.277228 0.207921 0.445545 0.069307 0.410000 0.140000 0.180000 0.270000 Consensus sequence: RGCTVTGTAGCCYWGGCTVD ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 15 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00098 Rfx3_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 2 20 0.048654 Species: Mus musculus Original motif 0.314514 0.275352 0.257617 0.152518 0.126939 0.598294 0.130576 0.144192 0.102265 0.155334 0.177957 0.564445 0.129288 0.282678 0.326990 0.261044 0.318166 0.227823 0.175681 0.278330 0.109019 0.380838 0.278328 0.231815 0.226145 0.289206 0.291300 0.193348 0.035863 0.844339 0.072582 0.047216 0.223793 0.187244 0.088092 0.500871 0.039800 0.029681 0.026201 0.904317 0.298298 0.032147 0.654746 0.014809 0.014729 0.022023 0.944826 0.018422 0.485114 0.004925 0.013785 0.496176 0.035708 0.020381 0.240804 0.703108 0.951152 0.012738 0.017886 0.018224 0.023713 0.944394 0.009538 0.022355 0.291067 0.385205 0.232388 0.091339 0.340334 0.199588 0.311526 0.148552 0.198713 0.472138 0.178319 0.150830 0.321155 0.269932 0.311301 0.097612 0.412646 0.195252 0.231950 0.160152 0.297134 0.180928 0.250400 0.271538 0.151169 0.305386 0.358574 0.184871 Consensus sequence: VCTBHBVCTTGGWTACVVVVVDB Reverse complement motif 0.151169 0.358574 0.305386 0.184871 0.271538 0.180928 0.250400 0.297134 0.160152 0.195252 0.231950 0.412646 0.097612 0.269932 0.311301 0.321155 0.198713 0.178319 0.472138 0.150830 0.148552 0.199588 0.311526 0.340334 0.291067 0.232388 0.385205 0.091339 0.023713 0.009538 0.944394 0.022355 0.018224 0.012738 0.017886 0.951152 0.703108 0.020381 0.240804 0.035708 0.496176 0.004925 0.013785 0.485114 0.014729 0.944826 0.022023 0.018422 0.298298 0.654746 0.032147 0.014809 0.904317 0.029681 0.026201 0.039800 0.500871 0.187244 0.088092 0.223793 0.035863 0.072582 0.844339 0.047216 0.226145 0.291300 0.289206 0.193348 0.109019 0.278328 0.380838 0.231815 0.278330 0.227823 0.175681 0.318166 0.129288 0.326990 0.282678 0.261044 0.564445 0.155334 0.177957 0.102265 0.126939 0.130576 0.598294 0.144192 0.152518 0.275352 0.257617 0.314514 Consensus sequence: BDBBVBVGTAWCCAAGVBHBAGB Alignment: VCTBHBVCTTGGWTACVVVVVDB --DVAGCCWKGGCTACAVAGCK- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00098 Rfx3_primary Original Motif Original Motif Forward 3 20 0.053615 Species: Mus musculus Original motif 0.218345 0.231533 0.152528 0.397594 0.264604 0.126115 0.320860 0.288421 0.117304 0.186844 0.172946 0.522906 0.111929 0.277908 0.409084 0.201079 0.343319 0.311376 0.123612 0.221692 0.193354 0.374280 0.157338 0.275028 0.166348 0.578991 0.130872 0.123789 0.006937 0.931183 0.046809 0.015072 0.255581 0.289587 0.125513 0.329319 0.002582 0.012615 0.002782 0.982021 0.850584 0.007973 0.140639 0.000803 0.037792 0.002285 0.957277 0.002646 0.009414 0.921481 0.001636 0.067469 0.943403 0.000980 0.042401 0.013216 0.991166 0.002931 0.003540 0.002364 0.003651 0.987110 0.001106 0.008133 0.208873 0.369705 0.319129 0.102292 0.322535 0.186617 0.374187 0.116660 0.326738 0.179486 0.226374 0.267402 0.299697 0.185329 0.133025 0.381949 0.300824 0.266836 0.096437 0.335904 0.418443 0.191068 0.127183 0.263306 0.386727 0.204062 0.126050 0.283161 Consensus sequence: HDTBHHCCHTAGCAACVVDHHHH Reverse complement motif 0.283161 0.204062 0.126050 0.386727 0.263306 0.191068 0.127183 0.418443 0.335904 0.266836 0.096437 0.300824 0.381949 0.185329 0.133025 0.299697 0.267402 0.179486 0.226374 0.326738 0.322535 0.374187 0.186617 0.116660 0.208873 0.319129 0.369705 0.102292 0.003651 0.001106 0.987110 0.008133 0.002364 0.002931 0.003540 0.991166 0.013216 0.000980 0.042401 0.943403 0.009414 0.001636 0.921481 0.067469 0.037792 0.957277 0.002285 0.002646 0.000803 0.007973 0.140639 0.850584 0.982021 0.012615 0.002782 0.002582 0.329319 0.289587 0.125513 0.255581 0.006937 0.046809 0.931183 0.015072 0.166348 0.130872 0.578991 0.123789 0.193354 0.157338 0.374280 0.275028 0.221692 0.311376 0.123612 0.343319 0.111929 0.409084 0.277908 0.201079 0.522906 0.186844 0.172946 0.117304 0.264604 0.320860 0.126115 0.288421 0.397594 0.231533 0.152528 0.218345 Consensus sequence: HHHHDVVGTTGCTAHGGDHBAHH Alignment: HDTBHHCCHTAGCAACVVDHHHH --DVAGCCWKGGCTACAVAGCK- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 2 20 0.062432 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH -RGCTVTGTAGCCYWGGCTVD-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v015681_primaryReverse Complement Reverse Complement Forward 3 20 0.063585 Species: Mus musculus Original motif 0.472795 0.179227 0.091251 0.256726 0.036521 0.159743 0.204840 0.598896 0.164582 0.312805 0.221324 0.301289 0.237069 0.249050 0.293048 0.220833 0.401949 0.225181 0.229401 0.143469 0.161422 0.494334 0.252207 0.092036 0.252940 0.177721 0.369400 0.199939 0.119630 0.024651 0.849920 0.005798 0.000962 0.002398 0.990616 0.006023 0.937852 0.027016 0.034535 0.000597 0.008963 0.987756 0.000629 0.002652 0.001584 0.992898 0.002349 0.003169 0.956822 0.027342 0.002484 0.013352 0.009873 0.987759 0.000988 0.001381 0.016397 0.980856 0.000369 0.002378 0.081761 0.758555 0.038572 0.121112 0.371713 0.091838 0.448027 0.088423 0.111617 0.121913 0.683885 0.082585 0.334562 0.102916 0.436488 0.126034 0.210362 0.101261 0.238339 0.450037 0.169041 0.271583 0.320799 0.238576 0.140316 0.049885 0.735236 0.074563 Consensus sequence: HTBVVVDGGACCACCCRGRDBG Reverse complement motif 0.140316 0.735236 0.049885 0.074563 0.169041 0.320799 0.271583 0.238576 0.450037 0.101261 0.238339 0.210362 0.334562 0.436488 0.102916 0.126034 0.111617 0.683885 0.121913 0.082585 0.371713 0.448027 0.091838 0.088423 0.081761 0.038572 0.758555 0.121112 0.016397 0.000369 0.980856 0.002378 0.009873 0.000988 0.987759 0.001381 0.013352 0.027342 0.002484 0.956822 0.001584 0.002349 0.992898 0.003169 0.008963 0.000629 0.987756 0.002652 0.000597 0.027016 0.034535 0.937852 0.000962 0.990616 0.002398 0.006023 0.119630 0.849920 0.024651 0.005798 0.252940 0.369400 0.177721 0.199939 0.161422 0.252207 0.494334 0.092036 0.143469 0.225181 0.229401 0.401949 0.237069 0.293048 0.249050 0.220833 0.164582 0.221324 0.312805 0.301289 0.598896 0.159743 0.204840 0.036521 0.256726 0.179227 0.091251 0.472795 Consensus sequence: CBDMCMGGGTGGTCCHVBVBAH Alignment: CBDMCMGGGTGGTCCHVBVBAH --RGCTVTGTAGCCYWGGCTVD ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_primaryReverse Complement Reverse Complement Forward 3 20 0.064076 Species: Mus musculus Original motif 0.180868 0.321661 0.134642 0.362829 0.232215 0.134289 0.315356 0.318141 0.065068 0.093681 0.569842 0.271408 0.370822 0.229680 0.154738 0.244759 0.323039 0.182873 0.173588 0.320500 0.175039 0.266898 0.276080 0.281984 0.412669 0.147730 0.146326 0.293275 0.325953 0.028805 0.629596 0.015646 0.003017 0.001766 0.979711 0.015507 0.888973 0.040666 0.069420 0.000941 0.017309 0.979155 0.000899 0.002637 0.001732 0.988816 0.004856 0.004596 0.889763 0.078125 0.010384 0.021729 0.007566 0.987081 0.001421 0.003932 0.027797 0.966593 0.000878 0.004731 0.025816 0.867003 0.065749 0.041433 0.220658 0.075256 0.582904 0.121182 0.088946 0.283695 0.565345 0.062015 0.328012 0.241332 0.305901 0.124755 0.307302 0.137589 0.375928 0.179181 0.298752 0.231470 0.315255 0.154524 0.094565 0.142901 0.705696 0.056838 Consensus sequence: HDGHHBHRGACCACCCGSVDVG Reverse complement motif 0.094565 0.705696 0.142901 0.056838 0.298752 0.315255 0.231470 0.154524 0.307302 0.375928 0.137589 0.179181 0.124755 0.241332 0.305901 0.328012 0.088946 0.565345 0.283695 0.062015 0.220658 0.582904 0.075256 0.121182 0.025816 0.065749 0.867003 0.041433 0.027797 0.000878 0.966593 0.004731 0.007566 0.001421 0.987081 0.003932 0.021729 0.078125 0.010384 0.889763 0.001732 0.004856 0.988816 0.004596 0.017309 0.000899 0.979155 0.002637 0.000941 0.040666 0.069420 0.888973 0.003017 0.979711 0.001766 0.015507 0.325953 0.629596 0.028805 0.015646 0.293275 0.147730 0.146326 0.412669 0.281984 0.266898 0.276080 0.175039 0.320500 0.182873 0.173588 0.323039 0.244759 0.229680 0.154738 0.370822 0.065068 0.569842 0.093681 0.271408 0.318141 0.134289 0.315356 0.232215 0.362829 0.321661 0.134642 0.180868 Consensus sequence: CVHBSCGGGTGGTCMHVHHCDH Alignment: CVHBSCGGGTGGTCMHVHHCDH --RGCTVTGTAGCCYWGGCTVD ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 16 Motif name: C016 Original motif 0.240000 0.260000 0.060000 0.440000 0.450000 0.050000 0.020000 0.480000 0.717172 0.202020 0.030303 0.050505 0.732673 0.178218 0.059406 0.029703 0.415842 0.217822 0.019802 0.346535 0.880000 0.040000 0.020000 0.060000 0.720000 0.120000 0.010000 0.150000 0.712871 0.079208 0.148515 0.059406 0.250000 0.470000 0.010000 0.270000 0.520000 0.010000 0.020000 0.450000 0.720000 0.240000 0.020000 0.020000 0.920000 0.040000 0.030000 0.010000 0.500000 0.430000 0.050000 0.020000 0.920000 0.050000 0.010000 0.020000 0.504950 0.009901 0.019802 0.465347 0.740000 0.030000 0.150000 0.080000 0.460000 0.380000 0.040000 0.120000 0.919192 0.040404 0.010101 0.030303 0.670000 0.070000 0.030000 0.230000 0.490000 0.040000 0.200000 0.270000 0.390000 0.140000 0.020000 0.450000 Consensus sequence: HWAAWAAAHWAAMAWAMAAWW Reserve complement motif 0.450000 0.140000 0.020000 0.390000 0.270000 0.040000 0.200000 0.490000 0.230000 0.070000 0.030000 0.670000 0.030303 0.040404 0.010101 0.919192 0.120000 0.380000 0.040000 0.460000 0.080000 0.030000 0.150000 0.740000 0.465347 0.009901 0.019802 0.504950 0.020000 0.050000 0.010000 0.920000 0.020000 0.430000 0.050000 0.500000 0.010000 0.040000 0.030000 0.920000 0.020000 0.240000 0.020000 0.720000 0.450000 0.010000 0.020000 0.520000 0.250000 0.010000 0.470000 0.270000 0.059406 0.079208 0.148515 0.712871 0.150000 0.120000 0.010000 0.720000 0.060000 0.040000 0.020000 0.880000 0.346535 0.217822 0.019802 0.415842 0.029703 0.178218 0.059406 0.732673 0.050505 0.202020 0.030303 0.717172 0.480000 0.050000 0.020000 0.450000 0.440000 0.260000 0.060000 0.240000 Consensus sequence: WWTTYTWTYTTWDTTTWTTWH ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 16 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_primary Original Motif Original Motif Backward 1 21 0.044569 Species: Mus musculus Original motif 0.360997 0.300272 0.115555 0.223177 0.309749 0.228429 0.166233 0.295589 0.149419 0.176868 0.240155 0.433558 0.379704 0.095791 0.276373 0.248133 0.394549 0.174184 0.130641 0.300626 0.443749 0.070776 0.211081 0.274393 0.364301 0.074356 0.370406 0.190936 0.791976 0.038475 0.093390 0.076159 0.963721 0.001826 0.002456 0.031997 0.004516 0.954596 0.008092 0.032796 0.981080 0.002062 0.002161 0.014697 0.986185 0.001846 0.006976 0.004992 0.059567 0.003649 0.002189 0.934595 0.495328 0.024257 0.240450 0.239965 0.305027 0.094878 0.526069 0.074025 0.418442 0.196237 0.158323 0.226998 0.336713 0.220452 0.191155 0.251680 0.192296 0.300342 0.169047 0.338315 0.240387 0.144634 0.128513 0.486465 0.290763 0.271259 0.116600 0.321377 0.224825 0.296233 0.229255 0.249687 0.493240 0.171285 0.075148 0.260326 Consensus sequence: HHBDHDDAACAATDRHHHHHBW Reverse complement motif 0.260326 0.171285 0.075148 0.493240 0.224825 0.229255 0.296233 0.249687 0.321377 0.271259 0.116600 0.290763 0.486465 0.144634 0.128513 0.240387 0.338315 0.300342 0.169047 0.192296 0.251680 0.220452 0.191155 0.336713 0.226998 0.196237 0.158323 0.418442 0.305027 0.526069 0.094878 0.074025 0.239965 0.024257 0.240450 0.495328 0.934595 0.003649 0.002189 0.059567 0.004992 0.001846 0.006976 0.986185 0.014697 0.002062 0.002161 0.981080 0.004516 0.008092 0.954596 0.032796 0.031997 0.001826 0.002456 0.963721 0.076159 0.038475 0.093390 0.791976 0.364301 0.370406 0.074356 0.190936 0.274393 0.070776 0.211081 0.443749 0.300626 0.174184 0.130641 0.394549 0.248133 0.095791 0.276373 0.379704 0.433558 0.176868 0.240155 0.149419 0.295589 0.228429 0.166233 0.309749 0.223177 0.300272 0.115555 0.360997 Consensus sequence: WBHHHHHMDATTGTTHDHDVHH Alignment: HHBDHDDAACAATDRHHHHHBW -HWAAWAAAHWAAMAWAMAAWW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00032 Gata3_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 21 0.047280 Species: Mus musculus Original motif 0.151572 0.262753 0.258275 0.327401 0.221834 0.113385 0.275380 0.389400 0.297769 0.136928 0.134678 0.430625 0.270099 0.110415 0.271106 0.348380 0.265471 0.090253 0.223340 0.420936 0.616582 0.090091 0.171960 0.121367 0.197318 0.107541 0.406904 0.288237 0.798258 0.046950 0.001406 0.153385 0.003195 0.002516 0.989707 0.004582 0.991503 0.002748 0.002617 0.003132 0.005015 0.002764 0.003026 0.989195 0.948394 0.008932 0.001344 0.041330 0.973109 0.004100 0.004081 0.018710 0.040365 0.113905 0.828185 0.017545 0.736608 0.130524 0.113464 0.019404 0.415921 0.106101 0.316613 0.161365 0.376582 0.170927 0.155572 0.296919 0.137731 0.197151 0.211055 0.454064 0.324853 0.122747 0.246107 0.306293 0.462490 0.207311 0.159392 0.170807 0.380420 0.188972 0.311990 0.118618 0.222178 0.157873 0.380486 0.239463 Consensus sequence: BDHDDADAGATAAGADHBDHVD Reverse complement motif 0.222178 0.380486 0.157873 0.239463 0.118618 0.188972 0.311990 0.380420 0.170807 0.207311 0.159392 0.462490 0.306293 0.122747 0.246107 0.324853 0.454064 0.197151 0.211055 0.137731 0.296919 0.170927 0.155572 0.376582 0.161365 0.106101 0.316613 0.415921 0.019404 0.130524 0.113464 0.736608 0.040365 0.828185 0.113905 0.017545 0.018710 0.004100 0.004081 0.973109 0.041330 0.008932 0.001344 0.948394 0.989195 0.002764 0.003026 0.005015 0.003132 0.002748 0.002617 0.991503 0.003195 0.989707 0.002516 0.004582 0.153385 0.046950 0.001406 0.798258 0.197318 0.406904 0.107541 0.288237 0.121367 0.090091 0.171960 0.616582 0.420936 0.090253 0.223340 0.265471 0.348380 0.110415 0.271106 0.270099 0.430625 0.136928 0.134678 0.297769 0.389400 0.113385 0.275380 0.221834 0.327401 0.262753 0.258275 0.151572 Consensus sequence: HBHDVHDTCTTATCTHTDDHDV Alignment: HBHDVHDTCTTATCTHTDDHDV WWTTYTWTYTTWDTTTWTTWH- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00032 Gata3_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 1 21 0.051899 Species: Mus musculus Original motif 0.177641 0.319872 0.115137 0.387350 0.136644 0.182137 0.205873 0.475347 0.254263 0.244280 0.165207 0.336250 0.240415 0.207557 0.237497 0.314530 0.271041 0.214702 0.364395 0.149863 0.095475 0.320104 0.191738 0.392682 0.500902 0.142722 0.026556 0.329820 0.051221 0.023698 0.897245 0.027836 0.922410 0.027509 0.024058 0.026023 0.030735 0.070903 0.024248 0.874114 0.242120 0.231992 0.225143 0.300745 0.106956 0.220471 0.283490 0.389083 0.152079 0.165830 0.135066 0.547025 0.839205 0.051581 0.060119 0.049095 0.041204 0.069147 0.070830 0.818819 0.051861 0.848177 0.027599 0.072363 0.383793 0.016807 0.397470 0.201931 0.381899 0.215846 0.255908 0.146347 0.094792 0.358651 0.280905 0.265652 0.296132 0.181545 0.178433 0.343890 0.301997 0.254722 0.108566 0.334714 0.349481 0.270693 0.137507 0.242319 Consensus sequence: HBHDVBWGATHBTATCRVBHHH Reverse complement motif 0.242319 0.270693 0.137507 0.349481 0.334714 0.254722 0.108566 0.301997 0.343890 0.181545 0.178433 0.296132 0.094792 0.280905 0.358651 0.265652 0.146347 0.215846 0.255908 0.381899 0.383793 0.397470 0.016807 0.201931 0.051861 0.027599 0.848177 0.072363 0.818819 0.069147 0.070830 0.041204 0.049095 0.051581 0.060119 0.839205 0.547025 0.165830 0.135066 0.152079 0.389083 0.220471 0.283490 0.106956 0.300745 0.231992 0.225143 0.242120 0.874114 0.070903 0.024248 0.030735 0.026023 0.027509 0.024058 0.922410 0.051221 0.897245 0.023698 0.027836 0.329820 0.142722 0.026556 0.500902 0.392682 0.320104 0.191738 0.095475 0.271041 0.364395 0.214702 0.149863 0.314530 0.207557 0.237497 0.240415 0.336250 0.244280 0.165207 0.254263 0.475347 0.182137 0.205873 0.136644 0.387350 0.319872 0.115137 0.177641 Consensus sequence: HHHBBMGATAVHATCWVVDHVH Alignment: HBHDVBWGATHBTATCRVBHHH -HWAAWAAAHWAAMAWAMAAWW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 2 21 0.052355 Species: Mus musculus Original motif 0.067627 0.131333 0.654425 0.146615 0.156488 0.114442 0.145630 0.583441 0.206450 0.265630 0.358017 0.169903 0.090729 0.460713 0.274712 0.173847 0.285994 0.099998 0.154485 0.459523 0.635908 0.184787 0.072982 0.106323 0.748421 0.039204 0.092605 0.119769 0.081342 0.061327 0.044532 0.812799 0.143120 0.043879 0.024216 0.788785 0.247544 0.092102 0.621453 0.038901 0.295531 0.036295 0.027594 0.640580 0.194561 0.305468 0.339916 0.160055 0.175038 0.193568 0.101212 0.530182 0.145226 0.167488 0.559871 0.127415 0.271501 0.237429 0.206701 0.284369 0.216834 0.109191 0.569605 0.104370 0.182624 0.177160 0.300475 0.339742 0.331737 0.198645 0.265137 0.204482 0.230155 0.359365 0.183450 0.227029 0.056581 0.067297 0.463052 0.413070 0.198891 0.324626 0.304424 0.172059 0.181968 0.287547 0.202419 0.328066 Consensus sequence: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB Reverse complement motif 0.328066 0.287547 0.202419 0.181968 0.198891 0.304424 0.324626 0.172059 0.056581 0.463052 0.067297 0.413070 0.230155 0.183450 0.359365 0.227029 0.204482 0.198645 0.265137 0.331737 0.339742 0.177160 0.300475 0.182624 0.216834 0.569605 0.109191 0.104370 0.284369 0.237429 0.206701 0.271501 0.145226 0.559871 0.167488 0.127415 0.530182 0.193568 0.101212 0.175038 0.194561 0.339916 0.305468 0.160055 0.640580 0.036295 0.027594 0.295531 0.247544 0.621453 0.092102 0.038901 0.788785 0.043879 0.024216 0.143120 0.812799 0.061327 0.044532 0.081342 0.119769 0.039204 0.092605 0.748421 0.106323 0.184787 0.072982 0.635908 0.459523 0.099998 0.154485 0.285994 0.090729 0.274712 0.460713 0.173847 0.206450 0.358017 0.265630 0.169903 0.583441 0.114442 0.145630 0.156488 0.067627 0.654425 0.131333 0.146615 Consensus sequence: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC Alignment: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC HWAAWAAAHWAAMAWAMAAWW- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 2 21 0.059977 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH -HWAAWAAAHWAAMAWAMAAWW- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 17 Motif name: C017 Original motif 0.445545 0.029703 0.029703 0.495050 0.010000 0.470000 0.490000 0.030000 0.565657 0.010101 0.030303 0.393939 0.080000 0.240000 0.670000 0.010000 0.727273 0.010101 0.252525 0.010101 0.070000 0.120000 0.800000 0.010000 0.780000 0.020000 0.160000 0.040000 0.020202 0.353535 0.616162 0.010101 0.630000 0.010000 0.020000 0.340000 0.020202 0.333333 0.636364 0.010101 0.820000 0.010000 0.050000 0.120000 0.090909 0.161616 0.737374 0.010101 0.820000 0.010000 0.130000 0.040000 0.070707 0.202020 0.717172 0.010101 0.790000 0.020000 0.110000 0.080000 0.030000 0.420000 0.530000 0.020000 0.470000 0.020000 0.020000 0.490000 0.030000 0.460000 0.480000 0.030000 Consensus sequence: WSWGAGASWSAGAGASWS Reserve complement motif 0.030000 0.480000 0.460000 0.030000 0.490000 0.020000 0.020000 0.470000 0.030000 0.530000 0.420000 0.020000 0.080000 0.020000 0.110000 0.790000 0.070707 0.717172 0.202020 0.010101 0.040000 0.010000 0.130000 0.820000 0.090909 0.737374 0.161616 0.010101 0.120000 0.010000 0.050000 0.820000 0.020202 0.636364 0.333333 0.010101 0.340000 0.010000 0.020000 0.630000 0.020202 0.616162 0.353535 0.010101 0.040000 0.020000 0.160000 0.780000 0.070000 0.800000 0.120000 0.010000 0.010101 0.010101 0.252525 0.727273 0.080000 0.670000 0.240000 0.010000 0.393939 0.010101 0.030303 0.565657 0.010000 0.490000 0.470000 0.030000 0.495050 0.029703 0.029703 0.445545 Consensus sequence: SWSTCTCTSWSTCTCWSW ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 17 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00527 Foxn4_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 3 18 0.037009 Species: Mus musculus Original motif 0.298336 0.418632 0.208054 0.074978 0.289907 0.015608 0.457100 0.237385 0.273583 0.077889 0.107860 0.540668 0.184954 0.161611 0.384390 0.269045 0.521826 0.156340 0.089019 0.232815 0.356716 0.131104 0.394857 0.117323 0.266669 0.108765 0.505273 0.119293 0.020778 0.047199 0.919524 0.012500 0.948536 0.018775 0.008113 0.024576 0.010822 0.964042 0.014701 0.010434 0.007428 0.019505 0.966351 0.006717 0.010025 0.975678 0.008648 0.005649 0.043796 0.120935 0.742979 0.092289 0.008252 0.250704 0.541132 0.199913 0.474428 0.044681 0.134430 0.346461 0.146597 0.421317 0.143166 0.288920 0.020540 0.181479 0.553811 0.244170 0.129612 0.173360 0.535219 0.161808 0.506084 0.158156 0.130983 0.204776 0.054872 0.103043 0.545792 0.296293 0.389882 0.171037 0.164162 0.274918 0.225861 0.314031 0.288872 0.171237 Consensus sequence: VDWDARRGACGCGGWHGGAKHV Reverse complement motif 0.225861 0.288872 0.314031 0.171237 0.274918 0.171037 0.164162 0.389882 0.054872 0.545792 0.103043 0.296293 0.204776 0.158156 0.130983 0.506084 0.129612 0.535219 0.173360 0.161808 0.020540 0.553811 0.181479 0.244170 0.146597 0.143166 0.421317 0.288920 0.346461 0.044681 0.134430 0.474428 0.008252 0.541132 0.250704 0.199913 0.043796 0.742979 0.120935 0.092289 0.010025 0.008648 0.975678 0.005649 0.007428 0.966351 0.019505 0.006717 0.010822 0.014701 0.964042 0.010434 0.024576 0.018775 0.008113 0.948536 0.020778 0.919524 0.047199 0.012500 0.266669 0.505273 0.108765 0.119293 0.356716 0.394857 0.131104 0.117323 0.232815 0.156340 0.089019 0.521826 0.184954 0.384390 0.161611 0.269045 0.540668 0.077889 0.107860 0.273583 0.289907 0.457100 0.015608 0.237385 0.298336 0.208054 0.418632 0.074978 Consensus sequence: VHYTCCDWCCGCGTCMMTHWHV Alignment: VDWDARRGACGCGGWHGGAKHV --WSWGAGASWSAGAGASWS-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 3 18 0.039915 Species: Mus musculus Original motif 0.067627 0.131333 0.654425 0.146615 0.156488 0.114442 0.145630 0.583441 0.206450 0.265630 0.358017 0.169903 0.090729 0.460713 0.274712 0.173847 0.285994 0.099998 0.154485 0.459523 0.635908 0.184787 0.072982 0.106323 0.748421 0.039204 0.092605 0.119769 0.081342 0.061327 0.044532 0.812799 0.143120 0.043879 0.024216 0.788785 0.247544 0.092102 0.621453 0.038901 0.295531 0.036295 0.027594 0.640580 0.194561 0.305468 0.339916 0.160055 0.175038 0.193568 0.101212 0.530182 0.145226 0.167488 0.559871 0.127415 0.271501 0.237429 0.206701 0.284369 0.216834 0.109191 0.569605 0.104370 0.182624 0.177160 0.300475 0.339742 0.331737 0.198645 0.265137 0.204482 0.230155 0.359365 0.183450 0.227029 0.056581 0.067297 0.463052 0.413070 0.198891 0.324626 0.304424 0.172059 0.181968 0.287547 0.202419 0.328066 Consensus sequence: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB Reverse complement motif 0.328066 0.287547 0.202419 0.181968 0.198891 0.304424 0.324626 0.172059 0.056581 0.463052 0.067297 0.413070 0.230155 0.183450 0.359365 0.227029 0.204482 0.198645 0.265137 0.331737 0.339742 0.177160 0.300475 0.182624 0.216834 0.569605 0.109191 0.104370 0.284369 0.237429 0.206701 0.271501 0.145226 0.559871 0.167488 0.127415 0.530182 0.193568 0.101212 0.175038 0.194561 0.339916 0.305468 0.160055 0.640580 0.036295 0.027594 0.295531 0.247544 0.621453 0.092102 0.038901 0.788785 0.043879 0.024216 0.143120 0.812799 0.061327 0.044532 0.081342 0.119769 0.039204 0.092605 0.748421 0.106323 0.184787 0.072982 0.635908 0.459523 0.099998 0.154485 0.285994 0.090729 0.274712 0.460713 0.173847 0.206450 0.358017 0.265630 0.169903 0.583441 0.114442 0.145630 0.156488 0.067627 0.654425 0.131333 0.146615 Consensus sequence: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC Alignment: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC --SWSTCTCTSWSTCTCWSW-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 6 18 0.042264 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB WSWGAGASWSAGAGASWS----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 5 18 0.042586 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV ----WSWGAGASWSAGAGASWS- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00098 Rfx3_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 4 18 0.043939 Species: Mus musculus Original motif 0.314514 0.275352 0.257617 0.152518 0.126939 0.598294 0.130576 0.144192 0.102265 0.155334 0.177957 0.564445 0.129288 0.282678 0.326990 0.261044 0.318166 0.227823 0.175681 0.278330 0.109019 0.380838 0.278328 0.231815 0.226145 0.289206 0.291300 0.193348 0.035863 0.844339 0.072582 0.047216 0.223793 0.187244 0.088092 0.500871 0.039800 0.029681 0.026201 0.904317 0.298298 0.032147 0.654746 0.014809 0.014729 0.022023 0.944826 0.018422 0.485114 0.004925 0.013785 0.496176 0.035708 0.020381 0.240804 0.703108 0.951152 0.012738 0.017886 0.018224 0.023713 0.944394 0.009538 0.022355 0.291067 0.385205 0.232388 0.091339 0.340334 0.199588 0.311526 0.148552 0.198713 0.472138 0.178319 0.150830 0.321155 0.269932 0.311301 0.097612 0.412646 0.195252 0.231950 0.160152 0.297134 0.180928 0.250400 0.271538 0.151169 0.305386 0.358574 0.184871 Consensus sequence: VCTBHBVCTTGGWTACVVVVVDB Reverse complement motif 0.151169 0.358574 0.305386 0.184871 0.271538 0.180928 0.250400 0.297134 0.160152 0.195252 0.231950 0.412646 0.097612 0.269932 0.311301 0.321155 0.198713 0.178319 0.472138 0.150830 0.148552 0.199588 0.311526 0.340334 0.291067 0.232388 0.385205 0.091339 0.023713 0.009538 0.944394 0.022355 0.018224 0.012738 0.017886 0.951152 0.703108 0.020381 0.240804 0.035708 0.496176 0.004925 0.013785 0.485114 0.014729 0.944826 0.022023 0.018422 0.298298 0.654746 0.032147 0.014809 0.904317 0.029681 0.026201 0.039800 0.500871 0.187244 0.088092 0.223793 0.035863 0.072582 0.844339 0.047216 0.226145 0.291300 0.289206 0.193348 0.109019 0.278328 0.380838 0.231815 0.278330 0.227823 0.175681 0.318166 0.129288 0.326990 0.282678 0.261044 0.564445 0.155334 0.177957 0.102265 0.126939 0.130576 0.598294 0.144192 0.152518 0.275352 0.257617 0.314514 Consensus sequence: BDBBVBVGTAWCCAAGVBHBAGB Alignment: BDBBVBVGTAWCCAAGVBHBAGB --WSWGAGASWSAGAGASWS--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 18 Motif name: C018 Original motif 0.504950 0.019802 0.227723 0.247525 0.762376 0.138614 0.049505 0.049505 0.620000 0.320000 0.050000 0.010000 0.140000 0.340000 0.020000 0.500000 0.881188 0.059406 0.049505 0.009901 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.841584 0.138614 0.009901 0.009901 0.584158 0.227723 0.108911 0.079208 0.610000 0.010000 0.280000 0.100000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.292929 0.252525 0.010101 0.444444 0.564356 0.079208 0.188119 0.168317 Consensus sequence: AAMYAAAAAAAHA Reserve complement motif 0.168317 0.079208 0.188119 0.564356 0.444444 0.252525 0.010101 0.292929 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.100000 0.010000 0.280000 0.610000 0.079208 0.227723 0.108911 0.584158 0.009901 0.138614 0.009901 0.841584 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.009901 0.059406 0.049505 0.881188 0.500000 0.340000 0.020000 0.140000 0.010000 0.320000 0.050000 0.620000 0.049505 0.138614 0.049505 0.762376 0.247525 0.019802 0.227723 0.504950 Consensus sequence: THTTTTTTTMYTT ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 18 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00028 Tcfap2e_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 13 0.014539 Species: Mus musculus Original motif 0.248591 0.214386 0.166769 0.370254 0.416041 0.167262 0.218682 0.198015 0.195301 0.542527 0.153042 0.109129 0.240156 0.185228 0.255545 0.319071 0.195809 0.247688 0.280778 0.275725 0.271555 0.129776 0.497286 0.101382 0.738080 0.057879 0.078760 0.125281 0.728876 0.074205 0.092737 0.104182 0.694380 0.084957 0.159476 0.061186 0.665572 0.111592 0.131546 0.091289 0.782384 0.059680 0.047525 0.110411 0.769981 0.105692 0.056467 0.067860 0.402932 0.087712 0.172674 0.336682 0.409485 0.160886 0.229779 0.199850 Consensus sequence: HDCDBRAAAAAADD Reverse complement motif 0.199850 0.160886 0.229779 0.409485 0.336682 0.087712 0.172674 0.402932 0.067860 0.105692 0.056467 0.769981 0.110411 0.059680 0.047525 0.782384 0.091289 0.111592 0.131546 0.665572 0.061186 0.084957 0.159476 0.694380 0.104182 0.074205 0.092737 0.728876 0.125281 0.057879 0.078760 0.738080 0.271555 0.497286 0.129776 0.101382 0.195809 0.280778 0.247688 0.275725 0.319071 0.185228 0.255545 0.240156 0.195301 0.153042 0.542527 0.109129 0.198015 0.167262 0.218682 0.416041 0.370254 0.214386 0.166769 0.248591 Consensus sequence: DDTTTTTTMBDGDH Alignment: HDCDBRAAAAAADD -AAMYAAAAAAAHA ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00077 Srf_secondary Original Motif Original Motif Backward 1 13 0.016692 Species: Mus musculus Original motif 0.162968 0.284828 0.440984 0.111220 0.151392 0.200635 0.205316 0.442657 0.267215 0.083669 0.192498 0.456618 0.332771 0.180711 0.200027 0.286491 0.509370 0.102954 0.242569 0.145107 0.666262 0.077309 0.154466 0.101962 0.737968 0.113335 0.100401 0.048296 0.658878 0.141580 0.134033 0.065510 0.766115 0.094051 0.069763 0.070072 0.755621 0.088491 0.044802 0.111086 0.749083 0.135917 0.047510 0.067490 0.663231 0.176795 0.028134 0.131839 0.553358 0.277659 0.038655 0.130328 0.392578 0.314083 0.209844 0.083495 0.198462 0.237132 0.239466 0.324940 0.275121 0.210087 0.194779 0.320013 0.287748 0.277395 0.142704 0.292154 Consensus sequence: VBDDAAAAAAAAMVBHH Reverse complement motif 0.292154 0.277395 0.142704 0.287748 0.320013 0.210087 0.194779 0.275121 0.324940 0.237132 0.239466 0.198462 0.083495 0.314083 0.209844 0.392578 0.130328 0.277659 0.038655 0.553358 0.131839 0.176795 0.028134 0.663231 0.067490 0.135917 0.047510 0.749083 0.111086 0.088491 0.044802 0.755621 0.070072 0.094051 0.069763 0.766115 0.065510 0.141580 0.134033 0.658878 0.048296 0.113335 0.100401 0.737968 0.101962 0.077309 0.154466 0.666262 0.145107 0.102954 0.242569 0.509370 0.286491 0.180711 0.200027 0.332771 0.456618 0.083669 0.192498 0.267215 0.442657 0.200635 0.205316 0.151392 0.162968 0.440984 0.284828 0.111220 Consensus sequence: HHVBYTTTTTTTTDDVV Alignment: VBDDAAAAAAAAMVBHH ----AAMYAAAAAAAHA ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00061 Foxl1_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 3 13 0.019263 Species: Mus musculus Original motif 0.560226 0.121586 0.083231 0.234957 0.318077 0.149137 0.179955 0.352831 0.482497 0.118420 0.173594 0.225488 0.200166 0.160901 0.191493 0.447440 0.033691 0.569719 0.018901 0.377690 0.638020 0.166545 0.021254 0.174181 0.573953 0.105729 0.009308 0.311010 0.890518 0.053364 0.013424 0.042694 0.910758 0.028166 0.032648 0.028428 0.013358 0.738707 0.023981 0.223953 0.911783 0.018754 0.031898 0.037564 0.702891 0.068940 0.076823 0.151346 0.445507 0.320769 0.057216 0.176507 0.587798 0.129586 0.140592 0.142024 0.258981 0.330939 0.167334 0.242747 0.362022 0.333796 0.145861 0.158320 Consensus sequence: ADDDYAWAACAAMAHH Reverse complement motif 0.158320 0.333796 0.145861 0.362022 0.258981 0.167334 0.330939 0.242747 0.142024 0.129586 0.140592 0.587798 0.176507 0.320769 0.057216 0.445507 0.151346 0.068940 0.076823 0.702891 0.037564 0.018754 0.031898 0.911783 0.013358 0.023981 0.738707 0.223953 0.028428 0.028166 0.032648 0.910758 0.042694 0.053364 0.013424 0.890518 0.311010 0.105729 0.009308 0.573953 0.174181 0.166545 0.021254 0.638020 0.033691 0.018901 0.569719 0.377690 0.447440 0.160901 0.191493 0.200166 0.225488 0.118420 0.173594 0.482497 0.352831 0.149137 0.179955 0.318077 0.234957 0.121586 0.083231 0.560226 Consensus sequence: HDTYTTGTTWTKDDDT Alignment: ADDDYAWAACAAMAHH -AAMYAAAAAAAHA-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00134 Hoxb13 Original Motif Original Motif Forward 2 13 0.020451 Species: Mus musculus Original motif 0.376100 0.272625 0.202253 0.149021 0.479072 0.116315 0.274952 0.129661 0.297412 0.328646 0.182054 0.191889 0.052067 0.771717 0.088083 0.088133 0.018222 0.666056 0.006952 0.308770 0.755568 0.122362 0.001339 0.120731 0.915413 0.001023 0.052340 0.031225 0.002612 0.028396 0.000695 0.968297 0.831092 0.001851 0.005615 0.161442 0.927869 0.001839 0.001169 0.069123 0.967747 0.009603 0.002871 0.019778 0.843186 0.073812 0.055868 0.027134 0.371084 0.143031 0.086222 0.399662 0.264976 0.212885 0.118960 0.403179 0.215633 0.345186 0.105518 0.333663 0.221910 0.297212 0.329310 0.151568 Consensus sequence: VRHCCAATAAAAWHHV Reverse complement motif 0.221910 0.329310 0.297212 0.151568 0.215633 0.105518 0.345186 0.333663 0.403179 0.212885 0.118960 0.264976 0.399662 0.143031 0.086222 0.371084 0.027134 0.073812 0.055868 0.843186 0.019778 0.009603 0.002871 0.967747 0.069123 0.001839 0.001169 0.927869 0.161442 0.001851 0.005615 0.831092 0.968297 0.028396 0.000695 0.002612 0.031225 0.001023 0.052340 0.915413 0.120731 0.122362 0.001339 0.755568 0.018222 0.006952 0.666056 0.308770 0.052067 0.088083 0.771717 0.088133 0.297412 0.182054 0.328646 0.191889 0.129661 0.116315 0.274952 0.479072 0.149021 0.272625 0.202253 0.376100 Consensus sequence: VDHWTTTTATTGGDKB Alignment: VRHCCAATAAAAWHHV -AAMYAAAAAAAHA-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00041 Foxj1_primary Original Motif Original Motif Forward 2 13 0.021737 Species: Mus musculus Original motif 0.446042 0.209997 0.124191 0.219770 0.271534 0.218131 0.245258 0.265077 0.368646 0.184693 0.168482 0.278180 0.348384 0.034204 0.583335 0.034077 0.040365 0.085618 0.013162 0.860855 0.824790 0.156631 0.004063 0.014515 0.835134 0.069381 0.003505 0.091980 0.967572 0.009280 0.006259 0.016890 0.009507 0.909577 0.004492 0.076424 0.947956 0.006994 0.008177 0.036873 0.599204 0.170666 0.065622 0.164508 0.708795 0.035865 0.070557 0.184782 0.303191 0.287145 0.184748 0.224917 0.285550 0.184167 0.248662 0.281621 0.235315 0.210836 0.254428 0.299421 0.220038 0.158539 0.286552 0.334871 Consensus sequence: HDHRTAAACAAAHDDD Reverse complement motif 0.334871 0.158539 0.286552 0.220038 0.299421 0.210836 0.254428 0.235315 0.281621 0.184167 0.248662 0.285550 0.224917 0.287145 0.184748 0.303191 0.184782 0.035865 0.070557 0.708795 0.164508 0.170666 0.065622 0.599204 0.036873 0.006994 0.008177 0.947956 0.009507 0.004492 0.909577 0.076424 0.016890 0.009280 0.006259 0.967572 0.091980 0.069381 0.003505 0.835134 0.014515 0.156631 0.004063 0.824790 0.860855 0.085618 0.013162 0.040365 0.348384 0.583335 0.034204 0.034077 0.278180 0.184693 0.168482 0.368646 0.265077 0.218131 0.245258 0.271534 0.219770 0.209997 0.124191 0.446042 Consensus sequence: DDDHTTTGTTTAMHDH Alignment: HDHRTAAACAAAHDDD -AAMYAAAAAAAHA-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 19 Motif name: C019 Original motif 0.420000 0.460000 0.080000 0.040000 0.430000 0.050000 0.070000 0.450000 0.040000 0.310000 0.120000 0.530000 0.020000 0.910000 0.030000 0.040000 0.060000 0.780000 0.010000 0.150000 0.090000 0.710000 0.080000 0.120000 0.840000 0.040000 0.070000 0.050000 0.010101 0.010101 0.969697 0.010101 0.040000 0.800000 0.150000 0.010000 0.900000 0.040000 0.040000 0.020000 0.020000 0.920000 0.030000 0.030000 0.010101 0.080808 0.020202 0.888889 0.040000 0.210000 0.220000 0.530000 0.180000 0.040000 0.710000 0.070000 0.050000 0.030000 0.900000 0.020000 0.130000 0.070000 0.780000 0.020000 0.890000 0.010000 0.030000 0.070000 0.120000 0.020000 0.850000 0.010000 0.060606 0.070707 0.848485 0.020202 0.029703 0.683168 0.158416 0.128713 0.610000 0.030000 0.210000 0.150000 0.108911 0.009901 0.871287 0.009901 Consensus sequence: MWYCCCAGCACTTGGGAGGCAG Reserve complement motif 0.108911 0.871287 0.009901 0.009901 0.150000 0.030000 0.210000 0.610000 0.029703 0.158416 0.683168 0.128713 0.060606 0.848485 0.070707 0.020202 0.120000 0.850000 0.020000 0.010000 0.070000 0.010000 0.030000 0.890000 0.130000 0.780000 0.070000 0.020000 0.050000 0.900000 0.030000 0.020000 0.180000 0.710000 0.040000 0.070000 0.530000 0.210000 0.220000 0.040000 0.888889 0.080808 0.020202 0.010101 0.020000 0.030000 0.920000 0.030000 0.020000 0.040000 0.040000 0.900000 0.040000 0.150000 0.800000 0.010000 0.010101 0.969697 0.010101 0.010101 0.050000 0.040000 0.070000 0.840000 0.090000 0.080000 0.710000 0.120000 0.060000 0.010000 0.780000 0.150000 0.020000 0.030000 0.910000 0.040000 0.530000 0.310000 0.120000 0.040000 0.450000 0.050000 0.070000 0.430000 0.420000 0.080000 0.460000 0.040000 Consensus sequence: CTGCCTCCCAAGTGCTGGGMWR ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 19 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00050 Bhlhb2_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 1 22 0.041956 Species: Mus musculus Original motif 0.120938 0.344851 0.124072 0.410138 0.220931 0.169844 0.422396 0.186829 0.127752 0.260812 0.103811 0.507625 0.140641 0.405473 0.287668 0.166218 0.296957 0.155579 0.301094 0.246370 0.219647 0.287193 0.154072 0.339087 0.049294 0.026059 0.121789 0.802859 0.520042 0.289284 0.173423 0.017251 0.049190 0.943472 0.004308 0.003030 0.902609 0.006767 0.074770 0.015854 0.003221 0.971329 0.005512 0.019937 0.019937 0.005512 0.971329 0.003221 0.015854 0.074770 0.006767 0.902609 0.003030 0.004308 0.943472 0.049190 0.003497 0.088920 0.685942 0.221641 0.802859 0.121789 0.026059 0.049294 0.334544 0.155170 0.275193 0.235092 0.275957 0.132104 0.454982 0.136957 0.134097 0.254352 0.422940 0.188611 0.396163 0.432784 0.051281 0.119772 0.276474 0.115627 0.419844 0.188056 0.160759 0.088061 0.649863 0.101318 0.203314 0.166595 0.106821 0.523270 Consensus sequence: YDYBDHTMCACGTGGADDBMDGT Reverse complement motif 0.523270 0.166595 0.106821 0.203314 0.160759 0.649863 0.088061 0.101318 0.276474 0.419844 0.115627 0.188056 0.396163 0.051281 0.432784 0.119772 0.134097 0.422940 0.254352 0.188611 0.275957 0.454982 0.132104 0.136957 0.235092 0.155170 0.275193 0.334544 0.049294 0.121789 0.026059 0.802859 0.003497 0.685942 0.088920 0.221641 0.003030 0.943472 0.004308 0.049190 0.902609 0.074770 0.006767 0.015854 0.019937 0.971329 0.005512 0.003221 0.003221 0.005512 0.971329 0.019937 0.015854 0.006767 0.074770 0.902609 0.049190 0.004308 0.943472 0.003030 0.017251 0.289284 0.173423 0.520042 0.802859 0.026059 0.121789 0.049294 0.339087 0.287193 0.154072 0.219647 0.296957 0.301094 0.155579 0.246370 0.140641 0.287668 0.405473 0.166218 0.507625 0.260812 0.103811 0.127752 0.220931 0.422396 0.169844 0.186829 0.410138 0.344851 0.124072 0.120938 Consensus sequence: ACHRBHDTCCACGTGYAHHBMHM Alignment: YDYBDHTMCACGTGGADDBMDGT MWYCCCAGCACTTGGGAGGCAG- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 1 22 0.044193 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV CTGCCTCCCAAGTGCTGGGMWR- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 1 22 0.055206 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH MWYCCCAGCACTTGGGAGGCAG ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v015681_primaryOriginal Motif Original Motif Forward 1 22 0.059682 Species: Mus musculus Original motif 0.472795 0.179227 0.091251 0.256726 0.036521 0.159743 0.204840 0.598896 0.164582 0.312805 0.221324 0.301289 0.237069 0.249050 0.293048 0.220833 0.401949 0.225181 0.229401 0.143469 0.161422 0.494334 0.252207 0.092036 0.252940 0.177721 0.369400 0.199939 0.119630 0.024651 0.849920 0.005798 0.000962 0.002398 0.990616 0.006023 0.937852 0.027016 0.034535 0.000597 0.008963 0.987756 0.000629 0.002652 0.001584 0.992898 0.002349 0.003169 0.956822 0.027342 0.002484 0.013352 0.009873 0.987759 0.000988 0.001381 0.016397 0.980856 0.000369 0.002378 0.081761 0.758555 0.038572 0.121112 0.371713 0.091838 0.448027 0.088423 0.111617 0.121913 0.683885 0.082585 0.334562 0.102916 0.436488 0.126034 0.210362 0.101261 0.238339 0.450037 0.169041 0.271583 0.320799 0.238576 0.140316 0.049885 0.735236 0.074563 Consensus sequence: HTBVVVDGGACCACCCRGRDBG Reverse complement motif 0.140316 0.735236 0.049885 0.074563 0.169041 0.320799 0.271583 0.238576 0.450037 0.101261 0.238339 0.210362 0.334562 0.436488 0.102916 0.126034 0.111617 0.683885 0.121913 0.082585 0.371713 0.448027 0.091838 0.088423 0.081761 0.038572 0.758555 0.121112 0.016397 0.000369 0.980856 0.002378 0.009873 0.000988 0.987759 0.001381 0.013352 0.027342 0.002484 0.956822 0.001584 0.002349 0.992898 0.003169 0.008963 0.000629 0.987756 0.002652 0.000597 0.027016 0.034535 0.937852 0.000962 0.990616 0.002398 0.006023 0.119630 0.849920 0.024651 0.005798 0.252940 0.369400 0.177721 0.199939 0.161422 0.252207 0.494334 0.092036 0.143469 0.225181 0.229401 0.401949 0.237069 0.293048 0.249050 0.220833 0.164582 0.221324 0.312805 0.301289 0.598896 0.159743 0.204840 0.036521 0.256726 0.179227 0.091251 0.472795 Consensus sequence: CBDMCMGGGTGGTCCHVBVBAH Alignment: HTBVVVDGGACCACCCRGRDBG MWYCCCAGCACTTGGGAGGCAG ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00050 Bhlhb2_primaryReverse Complement Reverse Complement Forward 1 22 0.059940 Species: Mus musculus Original motif 0.347837 0.112349 0.403713 0.136102 0.298329 0.175329 0.324534 0.201809 0.421791 0.222553 0.113615 0.242041 0.387506 0.130670 0.161435 0.320389 0.197183 0.244864 0.304611 0.253342 0.345884 0.188786 0.278290 0.187041 0.228203 0.142148 0.408269 0.221381 0.037126 0.006772 0.231775 0.724328 0.055214 0.942800 0.001192 0.000794 0.974119 0.004466 0.015535 0.005880 0.000300 0.958145 0.007498 0.034056 0.034056 0.007498 0.958145 0.000300 0.005880 0.015535 0.004466 0.974119 0.000794 0.001192 0.942800 0.055214 0.724328 0.231775 0.006772 0.037126 0.015720 0.466476 0.315208 0.202596 0.173670 0.355170 0.210710 0.260449 0.407419 0.261539 0.134430 0.196612 0.351478 0.209698 0.262426 0.176399 0.207869 0.284582 0.198951 0.308598 0.434482 0.113724 0.184408 0.267386 0.211144 0.363745 0.173978 0.251133 Consensus sequence: RDHDBVDTCACGTGASBHVHDH Reverse complement motif 0.211144 0.173978 0.363745 0.251133 0.267386 0.113724 0.184408 0.434482 0.308598 0.284582 0.198951 0.207869 0.176399 0.209698 0.262426 0.351478 0.196612 0.261539 0.134430 0.407419 0.173670 0.210710 0.355170 0.260449 0.015720 0.315208 0.466476 0.202596 0.037126 0.231775 0.006772 0.724328 0.000794 0.942800 0.001192 0.055214 0.974119 0.015535 0.004466 0.005880 0.034056 0.958145 0.007498 0.000300 0.000300 0.007498 0.958145 0.034056 0.005880 0.004466 0.015535 0.974119 0.055214 0.001192 0.942800 0.000794 0.724328 0.006772 0.231775 0.037126 0.228203 0.408269 0.142148 0.221381 0.187041 0.188786 0.278290 0.345884 0.197183 0.304611 0.244864 0.253342 0.320389 0.130670 0.161435 0.387506 0.242041 0.222553 0.113615 0.421791 0.298329 0.324534 0.175329 0.201809 0.347837 0.403713 0.112349 0.136102 Consensus sequence: DDHBHBSTCACGTGAHBBDHHM Alignment: DDHBHBSTCACGTGAHBBDHHM CTGCCTCCCAAGTGCTGGGMWR ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 20 Motif name: C020 Original motif 0.039604 0.366337 0.376238 0.217822 0.010000 0.450000 0.510000 0.030000 0.020000 0.800000 0.050000 0.130000 0.330000 0.230000 0.370000 0.070000 0.010000 0.940000 0.020000 0.030000 0.050000 0.840000 0.040000 0.070000 0.099010 0.366337 0.504950 0.029703 0.020000 0.950000 0.020000 0.010000 0.030303 0.949495 0.010101 0.010101 0.227723 0.485149 0.158416 0.128713 0.030000 0.880000 0.030000 0.060000 0.009901 0.485149 0.405941 0.099010 0.090000 0.650000 0.210000 0.050000 0.060000 0.880000 0.010000 0.050000 0.030000 0.890000 0.020000 0.060000 0.510000 0.180000 0.180000 0.130000 0.030000 0.760000 0.190000 0.020000 0.039604 0.514851 0.277228 0.168317 Consensus sequence: BSCVCCSCCVCSCCCACS Reserve complement motif 0.039604 0.277228 0.514851 0.168317 0.030000 0.190000 0.760000 0.020000 0.130000 0.180000 0.180000 0.510000 0.030000 0.020000 0.890000 0.060000 0.060000 0.010000 0.880000 0.050000 0.090000 0.210000 0.650000 0.050000 0.009901 0.405941 0.485149 0.099010 0.030000 0.030000 0.880000 0.060000 0.227723 0.158416 0.485149 0.128713 0.030303 0.010101 0.949495 0.010101 0.020000 0.020000 0.950000 0.010000 0.099010 0.504950 0.366337 0.029703 0.050000 0.040000 0.840000 0.070000 0.010000 0.020000 0.940000 0.030000 0.330000 0.370000 0.230000 0.070000 0.020000 0.050000 0.800000 0.130000 0.010000 0.510000 0.450000 0.030000 0.039604 0.376238 0.366337 0.217822 Consensus sequence: SGTGGGSGVGGSGGVGSB ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 20 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 1 18 0.035017 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK SGTGGGSGVGGSGGVGSB---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 5 18 0.041284 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB -SGTGGGSGVGGSGGVGSB---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00400 Zif268 Original Motif Original Motif Forward 3 18 0.041506 Species: Mus musculus Original motif 0.104824 0.412716 0.254506 0.227955 0.644922 0.065476 0.140479 0.149122 0.201205 0.166164 0.347131 0.285501 0.360606 0.256316 0.150766 0.232313 0.199831 0.240681 0.279350 0.280137 0.234308 0.204076 0.321306 0.240310 0.274112 0.462435 0.111425 0.152028 0.067070 0.717501 0.073934 0.141496 0.106745 0.084442 0.658566 0.150247 0.025128 0.967053 0.003585 0.004234 0.006412 0.982989 0.003227 0.007371 0.009588 0.877620 0.002571 0.110221 0.621521 0.355443 0.015669 0.007366 0.002600 0.980275 0.004191 0.012934 0.118773 0.026658 0.783843 0.070725 0.022358 0.822101 0.024684 0.130857 0.713212 0.080912 0.128793 0.077084 0.166568 0.250955 0.107934 0.474544 0.225040 0.222494 0.163301 0.389166 0.268976 0.223206 0.265314 0.242504 0.137052 0.229058 0.148439 0.485451 0.135819 0.304550 0.141994 0.417637 0.272440 0.319501 0.230580 0.177478 Consensus sequence: BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV Reverse complement motif 0.272440 0.230580 0.319501 0.177478 0.417637 0.304550 0.141994 0.135819 0.485451 0.229058 0.148439 0.137052 0.242504 0.223206 0.265314 0.268976 0.389166 0.222494 0.163301 0.225040 0.474544 0.250955 0.107934 0.166568 0.077084 0.080912 0.128793 0.713212 0.022358 0.024684 0.822101 0.130857 0.118773 0.783843 0.026658 0.070725 0.002600 0.004191 0.980275 0.012934 0.007366 0.355443 0.015669 0.621521 0.009588 0.002571 0.877620 0.110221 0.006412 0.003227 0.982989 0.007371 0.025128 0.003585 0.967053 0.004234 0.106745 0.658566 0.084442 0.150247 0.067070 0.073934 0.717501 0.141496 0.274112 0.111425 0.462435 0.152028 0.234308 0.321306 0.204076 0.240310 0.280137 0.240681 0.279350 0.199831 0.232313 0.256316 0.150766 0.360606 0.201205 0.347131 0.166164 0.285501 0.149122 0.065476 0.140479 0.644922 0.104824 0.254506 0.412716 0.227955 Consensus sequence: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB Alignment: BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV --BSCVCCSCCVCSCCCACS--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 5 18 0.043893 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH -BSCVCCSCCVCSCCCACS---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 6 18 0.047525 Species: Mus musculus Original motif 0.404007 0.395873 0.173319 0.026801 0.305977 0.215534 0.215359 0.263130 0.370148 0.250957 0.113088 0.265808 0.324336 0.229498 0.174679 0.271487 0.263563 0.137896 0.079217 0.519324 0.265762 0.222582 0.082555 0.429102 0.206721 0.288405 0.017851 0.487023 0.164361 0.236500 0.061051 0.538088 0.593344 0.348446 0.050304 0.007906 0.031328 0.947050 0.007032 0.014590 0.010428 0.956605 0.029142 0.003825 0.459636 0.207616 0.155368 0.177380 0.014573 0.964608 0.012209 0.008610 0.066291 0.918196 0.008729 0.006784 0.019488 0.866774 0.018897 0.094841 0.767405 0.104198 0.029234 0.099164 0.052494 0.772531 0.039832 0.135142 0.296085 0.243498 0.350935 0.109482 0.518843 0.226659 0.124784 0.129714 0.647901 0.019721 0.159901 0.172477 0.113912 0.231511 0.214864 0.439713 0.223117 0.310596 0.293328 0.172959 0.185557 0.487662 0.136321 0.190459 Consensus sequence: MHHHWHYTMCCHCCCACVAABVH Reverse complement motif 0.185557 0.136321 0.487662 0.190459 0.223117 0.293328 0.310596 0.172959 0.439713 0.231511 0.214864 0.113912 0.172477 0.019721 0.159901 0.647901 0.129714 0.226659 0.124784 0.518843 0.296085 0.350935 0.243498 0.109482 0.052494 0.039832 0.772531 0.135142 0.099164 0.104198 0.029234 0.767405 0.019488 0.018897 0.866774 0.094841 0.066291 0.008729 0.918196 0.006784 0.014573 0.012209 0.964608 0.008610 0.177380 0.207616 0.155368 0.459636 0.010428 0.029142 0.956605 0.003825 0.031328 0.007032 0.947050 0.014590 0.007906 0.348446 0.050304 0.593344 0.538088 0.236500 0.061051 0.164361 0.487023 0.288405 0.017851 0.206721 0.429102 0.222582 0.082555 0.265762 0.519324 0.137896 0.079217 0.263563 0.271487 0.229498 0.174679 0.324336 0.265808 0.250957 0.113088 0.370148 0.263130 0.215534 0.215359 0.305977 0.026801 0.395873 0.173319 0.404007 Consensus sequence: DVVTTVGTGGGHGGYAMHWHHHY Alignment: MHHHWHYTMCCHCCCACVAABVH BSCVCCSCCVCSCCCACS----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 21 Motif name: C021 Original motif 0.470000 0.450000 0.060000 0.020000 0.010000 0.060000 0.430000 0.500000 0.910891 0.009901 0.069307 0.009901 0.141414 0.232323 0.616162 0.010101 0.485149 0.435644 0.069307 0.009901 0.190000 0.350000 0.400000 0.060000 0.950000 0.010000 0.030000 0.010000 0.040000 0.230000 0.720000 0.010000 0.821782 0.049505 0.099010 0.029703 0.010101 0.050505 0.404040 0.535354 0.900000 0.010000 0.080000 0.010000 0.070000 0.150000 0.770000 0.010000 0.470000 0.460000 0.060000 0.010000 0.050000 0.040000 0.410000 0.500000 Consensus sequence: MKAGMVAGAKAGMK Reserve complement motif 0.500000 0.040000 0.410000 0.050000 0.010000 0.460000 0.060000 0.470000 0.070000 0.770000 0.150000 0.010000 0.010000 0.010000 0.080000 0.900000 0.535354 0.050505 0.404040 0.010101 0.029703 0.049505 0.099010 0.821782 0.040000 0.720000 0.230000 0.010000 0.010000 0.010000 0.030000 0.950000 0.190000 0.400000 0.350000 0.060000 0.009901 0.435644 0.069307 0.485149 0.141414 0.616162 0.232323 0.010101 0.009901 0.009901 0.069307 0.910891 0.500000 0.060000 0.430000 0.010000 0.020000 0.450000 0.060000 0.470000 Consensus sequence: RYCTRTCTVYCTRY ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 21 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00101 Sox12_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 1 14 0.026939 Species: Mus musculus Original motif 0.378898 0.318901 0.205859 0.096341 0.352524 0.321236 0.224504 0.101736 0.323551 0.182056 0.210897 0.283496 0.135539 0.325230 0.208031 0.331200 0.663106 0.055471 0.154459 0.126963 0.051748 0.292567 0.537307 0.118378 0.886489 0.042361 0.035742 0.035408 0.043647 0.688744 0.094358 0.173252 0.882052 0.039818 0.018899 0.059231 0.864171 0.036011 0.068363 0.031455 0.790158 0.046868 0.041594 0.121379 0.087447 0.143905 0.707798 0.060849 0.295919 0.132479 0.485703 0.085899 0.653156 0.133004 0.110012 0.103828 0.351764 0.131771 0.217730 0.298736 0.203977 0.196773 0.099958 0.499292 Consensus sequence: VVDBASACAAAGRADH Reverse complement motif 0.499292 0.196773 0.099958 0.203977 0.298736 0.131771 0.217730 0.351764 0.103828 0.133004 0.110012 0.653156 0.295919 0.485703 0.132479 0.085899 0.087447 0.707798 0.143905 0.060849 0.121379 0.046868 0.041594 0.790158 0.031455 0.036011 0.068363 0.864171 0.059231 0.039818 0.018899 0.882052 0.043647 0.094358 0.688744 0.173252 0.035408 0.042361 0.035742 0.886489 0.051748 0.537307 0.292567 0.118378 0.126963 0.055471 0.154459 0.663106 0.331200 0.325230 0.208031 0.135539 0.283496 0.182056 0.210897 0.323551 0.101736 0.321236 0.224504 0.352524 0.096341 0.318901 0.205859 0.378898 Consensus sequence: HDTMCTTTGTSTVDBB Alignment: HDTMCTTTGTSTVDBB --RYCTRTCTVYCTRY ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score >UP00011 Irf6_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 1 14 0.033149 Species: Mus musculus Original motif 0.326255 0.256976 0.231005 0.185764 0.145621 0.315489 0.266193 0.272698 0.138750 0.396937 0.205185 0.259127 0.534194 0.121488 0.084178 0.260140 0.201823 0.589398 0.086624 0.122154 0.031428 0.023221 0.066048 0.879303 0.022389 0.889379 0.049165 0.039067 0.042252 0.295983 0.085234 0.576531 0.022905 0.915187 0.021569 0.040339 0.117305 0.061052 0.716358 0.105285 0.205873 0.113582 0.609303 0.071242 0.110208 0.084907 0.274228 0.530658 0.233550 0.385055 0.150708 0.230687 0.333806 0.136131 0.311600 0.218463 0.216423 0.309361 0.281145 0.193072 Consensus sequence: VBBACTCYCGGKHDV Reverse complement motif 0.216423 0.281145 0.309361 0.193072 0.218463 0.136131 0.311600 0.333806 0.233550 0.150708 0.385055 0.230687 0.530658 0.084907 0.274228 0.110208 0.205873 0.609303 0.113582 0.071242 0.117305 0.716358 0.061052 0.105285 0.022905 0.021569 0.915187 0.040339 0.576531 0.295983 0.085234 0.042252 0.022389 0.049165 0.889379 0.039067 0.879303 0.023221 0.066048 0.031428 0.201823 0.086624 0.589398 0.122154 0.260140 0.121488 0.084178 0.534194 0.138750 0.205185 0.396937 0.259127 0.145621 0.266193 0.315489 0.272698 0.185764 0.256976 0.231005 0.326255 Consensus sequence: VDDRCCGMGAGTBBB Alignment: VBBACTCYCGGKHDV -MKAGMVAGAKAGMK ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00040 Irf5_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 2 14 0.034198 Species: Mus musculus Original motif 0.160739 0.237732 0.225630 0.375899 0.231003 0.186804 0.122026 0.460167 0.282260 0.197034 0.288737 0.231969 0.746029 0.055630 0.083427 0.114914 0.169536 0.340063 0.148794 0.341606 0.086576 0.827589 0.034986 0.050849 0.021280 0.012938 0.955490 0.010292 0.930476 0.013781 0.047798 0.007945 0.002126 0.038171 0.948134 0.011570 0.959483 0.009871 0.015462 0.015184 0.495380 0.028946 0.408360 0.067314 0.145964 0.186198 0.031072 0.636767 0.200379 0.206354 0.151807 0.441460 0.171996 0.390086 0.220850 0.217068 0.208281 0.322628 0.291771 0.177321 Consensus sequence: BHDAHCGAGARTHBV Reverse complement motif 0.208281 0.291771 0.322628 0.177321 0.171996 0.220850 0.390086 0.217068 0.441460 0.206354 0.151807 0.200379 0.636767 0.186198 0.031072 0.145964 0.067314 0.028946 0.408360 0.495380 0.015184 0.009871 0.015462 0.959483 0.002126 0.948134 0.038171 0.011570 0.007945 0.013781 0.047798 0.930476 0.021280 0.955490 0.012938 0.010292 0.086576 0.034986 0.827589 0.050849 0.341606 0.340063 0.148794 0.169536 0.114914 0.055630 0.083427 0.746029 0.282260 0.288737 0.197034 0.231969 0.460167 0.186804 0.122026 0.231003 0.375899 0.237732 0.225630 0.160739 Consensus sequence: VBHAKTCTCGHTHHV Alignment: BHDAHCGAGARTHBV -MKAGMVAGAKAGMK ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00046 Tcfe2a_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 1 14 0.035961 Species: Mus musculus Original motif 0.296417 0.247522 0.206749 0.249312 0.410113 0.201959 0.303149 0.084779 0.267313 0.132645 0.452057 0.147985 0.187929 0.136827 0.427628 0.247616 0.198671 0.425254 0.234160 0.141915 0.029244 0.953929 0.004092 0.012734 0.954570 0.014314 0.018695 0.012421 0.010025 0.055055 0.845504 0.089415 0.874802 0.040849 0.069178 0.015172 0.015084 0.010551 0.008736 0.965628 0.012981 0.007192 0.965036 0.014791 0.037724 0.016891 0.495632 0.449753 0.021685 0.438927 0.056118 0.483270 0.209872 0.365671 0.139706 0.284751 0.151815 0.336912 0.289382 0.221891 0.152995 0.262354 0.416434 0.168217 0.227567 0.187603 0.447892 0.136938 Consensus sequence: HVDDVCAGATGKYHBBV Reverse complement motif 0.227567 0.447892 0.187603 0.136938 0.152995 0.416434 0.262354 0.168217 0.151815 0.289382 0.336912 0.221891 0.209872 0.139706 0.365671 0.284751 0.483270 0.438927 0.056118 0.021685 0.037724 0.495632 0.016891 0.449753 0.012981 0.965036 0.007192 0.014791 0.965628 0.010551 0.008736 0.015084 0.015172 0.040849 0.069178 0.874802 0.010025 0.845504 0.055055 0.089415 0.012421 0.014314 0.018695 0.954570 0.029244 0.004092 0.953929 0.012734 0.198671 0.234160 0.425254 0.141915 0.187929 0.427628 0.136827 0.247616 0.267313 0.452057 0.132645 0.147985 0.084779 0.201959 0.303149 0.410113 0.249312 0.247522 0.206749 0.296417 Consensus sequence: VBBDMYCATCTGVHHBH Alignment: HVDDVCAGATGKYHBBV MKAGMVAGAKAGMK--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00042 Gm397_second Reverse Complement Reverse Complement Forward 3 14 0.036816 Species: Mus musculus Original motif 0.360404 0.193218 0.248888 0.197490 0.286498 0.224597 0.426555 0.062349 0.347032 0.440548 0.033161 0.179259 0.337062 0.193658 0.385751 0.083529 0.108793 0.005723 0.878300 0.007184 0.015151 0.973406 0.009324 0.002118 0.972117 0.003915 0.019783 0.004185 0.010144 0.980912 0.003106 0.005839 0.974864 0.007532 0.015914 0.001691 0.012441 0.939195 0.029256 0.019108 0.759620 0.106164 0.073819 0.060397 0.157234 0.818234 0.007449 0.017083 0.050076 0.063608 0.505171 0.381144 0.131903 0.538163 0.124608 0.205325 0.367623 0.286526 0.240931 0.104919 0.357798 0.317606 0.097711 0.226885 Consensus sequence: DVMVGCACACACKCVH Reverse complement motif 0.226885 0.317606 0.097711 0.357798 0.104919 0.286526 0.240931 0.367623 0.131903 0.124608 0.538163 0.205325 0.050076 0.505171 0.063608 0.381144 0.157234 0.007449 0.818234 0.017083 0.060397 0.106164 0.073819 0.759620 0.012441 0.029256 0.939195 0.019108 0.001691 0.007532 0.015914 0.974864 0.010144 0.003106 0.980912 0.005839 0.004185 0.003915 0.019783 0.972117 0.015151 0.009324 0.973406 0.002118 0.108793 0.878300 0.005723 0.007184 0.337062 0.385751 0.193658 0.083529 0.347032 0.033161 0.440548 0.179259 0.286498 0.426555 0.224597 0.062349 0.197490 0.193218 0.248888 0.360404 Consensus sequence: HBGYGTGTGTGCVRVD Alignment: HBGYGTGTGTGCVRVD --RYCTRTCTVYCTRY ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 22 Motif name: C022 Original motif 0.020000 0.300000 0.330000 0.350000 0.070000 0.220000 0.570000 0.140000 0.030303 0.626263 0.030303 0.313131 0.020202 0.646465 0.020202 0.313131 0.030000 0.420000 0.020000 0.530000 0.010101 0.767677 0.050505 0.171717 0.190000 0.370000 0.220000 0.220000 0.049505 0.227723 0.693069 0.029703 0.040000 0.570000 0.310000 0.080000 0.100000 0.550000 0.240000 0.110000 0.010000 0.570000 0.110000 0.310000 0.010000 0.900000 0.020000 0.070000 0.010000 0.830000 0.020000 0.140000 0.070000 0.720000 0.020000 0.190000 0.170000 0.490000 0.290000 0.050000 0.330000 0.410000 0.170000 0.090000 0.080000 0.510000 0.400000 0.010000 Consensus sequence: BGCCYCBGSCYCCCSVS Reserve complement motif 0.080000 0.400000 0.510000 0.010000 0.330000 0.170000 0.410000 0.090000 0.170000 0.290000 0.490000 0.050000 0.070000 0.020000 0.720000 0.190000 0.010000 0.020000 0.830000 0.140000 0.010000 0.020000 0.900000 0.070000 0.010000 0.110000 0.570000 0.310000 0.100000 0.240000 0.550000 0.110000 0.040000 0.310000 0.570000 0.080000 0.049505 0.693069 0.227723 0.029703 0.190000 0.220000 0.370000 0.220000 0.010101 0.050505 0.767677 0.171717 0.530000 0.420000 0.020000 0.030000 0.020202 0.020202 0.646465 0.313131 0.030303 0.030303 0.626263 0.313131 0.070000 0.570000 0.220000 0.140000 0.350000 0.300000 0.330000 0.020000 Consensus sequence: SVSGGGKGSCBGMGGCV ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 22 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 6 17 0.035206 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH BGCCYCBGSCYCCCSVS----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00033 Zfp410_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 17 0.038437 Species: Mus musculus Original motif 0.162979 0.284781 0.237433 0.314807 0.182449 0.447584 0.069464 0.300502 0.298973 0.261014 0.213211 0.226802 0.136039 0.433062 0.144274 0.286625 0.180084 0.395933 0.158565 0.265418 0.069354 0.748510 0.068898 0.113238 0.060485 0.717828 0.075333 0.146354 0.023280 0.071762 0.645500 0.259457 0.166896 0.749762 0.062730 0.020612 0.050401 0.775248 0.089072 0.085279 0.103847 0.767557 0.068804 0.059791 0.064815 0.748318 0.114588 0.072280 0.340921 0.071942 0.242981 0.344157 0.301967 0.263512 0.165927 0.268594 0.479800 0.222955 0.118441 0.178803 0.229469 0.283621 0.143099 0.343811 0.261733 0.180191 0.169905 0.388170 Consensus sequence: BHHBHCCGCCCCDHHHH Reverse complement motif 0.388170 0.180191 0.169905 0.261733 0.343811 0.283621 0.143099 0.229469 0.178803 0.222955 0.118441 0.479800 0.268594 0.263512 0.165927 0.301967 0.344157 0.071942 0.242981 0.340921 0.064815 0.114588 0.748318 0.072280 0.103847 0.068804 0.767557 0.059791 0.050401 0.089072 0.775248 0.085279 0.166896 0.062730 0.749762 0.020612 0.023280 0.645500 0.071762 0.259457 0.060485 0.075333 0.717828 0.146354 0.069354 0.068898 0.748510 0.113238 0.180084 0.158565 0.395933 0.265418 0.136039 0.144274 0.433062 0.286625 0.226802 0.261014 0.213211 0.298973 0.182449 0.069464 0.447584 0.300502 0.314807 0.284781 0.237433 0.162979 Consensus sequence: HHHHDGGGGCGGDBHDV Alignment: BHHBHCCGCCCCDHHHH BGCCYCBGSCYCCCSVS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 7 17 0.039482 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB ------SVSGGGKGSCBGMGGCV ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00002 Sp4_primary Original Motif Original Motif Forward 1 17 0.047050 Species: Mus musculus Original motif 0.155386 0.223380 0.374454 0.246780 0.247106 0.159582 0.345111 0.248201 0.238889 0.258354 0.165304 0.337454 0.255612 0.489586 0.051621 0.203182 0.450100 0.545383 0.001071 0.003447 0.003704 0.991007 0.002456 0.002833 0.035504 0.001814 0.928129 0.034553 0.001494 0.991406 0.003414 0.003686 0.003045 0.990628 0.005182 0.001145 0.000990 0.963237 0.001215 0.034557 0.148016 0.838396 0.000666 0.012922 0.014261 0.905847 0.007200 0.072692 0.083394 0.270068 0.058368 0.588170 0.149141 0.286783 0.142802 0.421274 0.204851 0.347195 0.253356 0.194597 0.184442 0.299908 0.194408 0.321242 0.125793 0.380109 0.245318 0.248780 Consensus sequence: BDHHMCGCCCCCTHVBB Reverse complement motif 0.125793 0.245318 0.380109 0.248780 0.321242 0.299908 0.194408 0.184442 0.204851 0.253356 0.347195 0.194597 0.421274 0.286783 0.142802 0.149141 0.588170 0.270068 0.058368 0.083394 0.014261 0.007200 0.905847 0.072692 0.148016 0.000666 0.838396 0.012922 0.000990 0.001215 0.963237 0.034557 0.003045 0.005182 0.990628 0.001145 0.001494 0.003414 0.991406 0.003686 0.035504 0.928129 0.001814 0.034553 0.003704 0.002456 0.991007 0.002833 0.450100 0.001071 0.545383 0.003447 0.255612 0.051621 0.489586 0.203182 0.337454 0.258354 0.165304 0.238889 0.247106 0.345111 0.159582 0.248201 0.155386 0.374454 0.223380 0.246780 Consensus sequence: BVVHAGGGGGCGRDHHB Alignment: BDHHMCGCCCCCTHVBB BGCCYCBGSCYCCCSVS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 7 17 0.047783 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV ------SVSGGGKGSCBGMGGCV ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 23 Motif name: C023 Original motif 0.009901 0.485149 0.445545 0.059406 0.009901 0.485149 0.445545 0.059406 0.009901 0.782178 0.079208 0.128713 0.178218 0.584158 0.118812 0.118812 0.010000 0.520000 0.430000 0.040000 0.019802 0.613861 0.158416 0.207921 0.168317 0.415842 0.247525 0.168317 0.240000 0.460000 0.100000 0.200000 0.140000 0.580000 0.020000 0.260000 0.020000 0.510000 0.460000 0.010000 0.188119 0.584158 0.148515 0.079208 0.148515 0.752475 0.089109 0.009901 0.059406 0.524752 0.405941 0.009901 0.079208 0.485149 0.425743 0.009901 Consensus sequence: SSCCSCBHCSCCSS Reserve complement motif 0.079208 0.425743 0.485149 0.009901 0.059406 0.405941 0.524752 0.009901 0.148515 0.089109 0.752475 0.009901 0.188119 0.148515 0.584158 0.079208 0.020000 0.460000 0.510000 0.010000 0.140000 0.020000 0.580000 0.260000 0.240000 0.100000 0.460000 0.200000 0.168317 0.247525 0.415842 0.168317 0.019802 0.158416 0.613861 0.207921 0.010000 0.430000 0.520000 0.040000 0.178218 0.118812 0.584158 0.118812 0.009901 0.079208 0.782178 0.128713 0.009901 0.445545 0.485149 0.059406 0.009901 0.445545 0.485149 0.059406 Consensus sequence: SSGGSGDBGSGGSS ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 23 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 4 14 0.023367 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH ---SSCCSCBHCSCCSS----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00099 Ascl2_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 1 14 0.030831 Species: Mus musculus Original motif 0.114462 0.345602 0.289353 0.250583 0.192593 0.250844 0.116250 0.440313 0.338838 0.304929 0.195843 0.160390 0.312051 0.115094 0.162465 0.410390 0.143975 0.600492 0.123348 0.132185 0.078751 0.715072 0.135182 0.070995 0.146191 0.685571 0.069799 0.098439 0.137287 0.646078 0.126428 0.090207 0.335099 0.092260 0.371510 0.201131 0.033090 0.631176 0.074278 0.261456 0.117516 0.619336 0.100946 0.162202 0.114769 0.627362 0.089839 0.168031 0.195787 0.252057 0.220803 0.331353 0.415355 0.120731 0.281372 0.182542 0.111178 0.217079 0.245769 0.425974 0.191517 0.296952 0.153370 0.358162 Consensus sequence: BHVDCCCCDCCCBDBH Reverse complement motif 0.358162 0.296952 0.153370 0.191517 0.425974 0.217079 0.245769 0.111178 0.182542 0.120731 0.281372 0.415355 0.331353 0.252057 0.220803 0.195787 0.114769 0.089839 0.627362 0.168031 0.117516 0.100946 0.619336 0.162202 0.033090 0.074278 0.631176 0.261456 0.335099 0.371510 0.092260 0.201131 0.137287 0.126428 0.646078 0.090207 0.146191 0.069799 0.685571 0.098439 0.078751 0.135182 0.715072 0.070995 0.143975 0.123348 0.600492 0.132185 0.410390 0.115094 0.162465 0.312051 0.160390 0.304929 0.195843 0.338838 0.440313 0.250844 0.116250 0.192593 0.114462 0.289353 0.345602 0.250583 Consensus sequence: HVDVGGGHGGGGDBHB Alignment: HVDVGGGHGGGGDBHB SSGGSGDBGSGGSS-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00013 Gabpa_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 3 14 0.032196 Species: Mus musculus Original motif 0.233133 0.551828 0.139009 0.076030 0.100085 0.525562 0.101688 0.272665 0.252996 0.198121 0.299171 0.249711 0.141471 0.195290 0.234560 0.428679 0.160993 0.442765 0.082653 0.313590 0.307890 0.127950 0.071713 0.492448 0.093453 0.148935 0.080288 0.677324 0.083535 0.634212 0.074652 0.207601 0.098119 0.639328 0.099957 0.162596 0.067430 0.451776 0.357188 0.123606 0.286259 0.466975 0.063013 0.183753 0.203211 0.422637 0.133368 0.240783 0.111206 0.315595 0.192833 0.380366 0.199462 0.324652 0.305491 0.170395 0.347919 0.292387 0.230724 0.128970 0.254648 0.294196 0.194942 0.256214 Consensus sequence: CYDBYWTCCSMHBVVH Reverse complement motif 0.254648 0.194942 0.294196 0.256214 0.128970 0.292387 0.230724 0.347919 0.199462 0.305491 0.324652 0.170395 0.380366 0.315595 0.192833 0.111206 0.203211 0.133368 0.422637 0.240783 0.286259 0.063013 0.466975 0.183753 0.067430 0.357188 0.451776 0.123606 0.098119 0.099957 0.639328 0.162596 0.083535 0.074652 0.634212 0.207601 0.677324 0.148935 0.080288 0.093453 0.492448 0.127950 0.071713 0.307890 0.160993 0.082653 0.442765 0.313590 0.428679 0.195290 0.234560 0.141471 0.252996 0.299171 0.198121 0.249711 0.100085 0.101688 0.525562 0.272665 0.233133 0.139009 0.551828 0.076030 Consensus sequence: DBVVDRSGGAWKVHKG Alignment: DBVVDRSGGAWKVHKG --SSGGSGDBGSGGSS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00021 Zfp281_primaryReverse Complement Reverse Complement Backward 1 14 0.032274 Species: Mus musculus Original motif 0.201535 0.165213 0.201324 0.431929 0.136153 0.443451 0.179132 0.241264 0.263149 0.555137 0.067983 0.113731 0.142183 0.737634 0.045722 0.074461 0.044982 0.884112 0.045356 0.025549 0.246434 0.590578 0.022655 0.140333 0.123049 0.591257 0.033072 0.252622 0.018153 0.944742 0.010254 0.026851 0.035459 0.953844 0.003988 0.006709 0.020000 0.954344 0.005966 0.019690 0.015299 0.964390 0.006755 0.013557 0.028565 0.936152 0.011660 0.023623 0.300127 0.517309 0.029700 0.152863 0.159063 0.513443 0.051834 0.275660 0.158172 0.647055 0.133256 0.061516 Consensus sequence: DBCCCCCCCCCCMYC Reverse complement motif 0.158172 0.133256 0.647055 0.061516 0.159063 0.051834 0.513443 0.275660 0.300127 0.029700 0.517309 0.152863 0.028565 0.011660 0.936152 0.023623 0.015299 0.006755 0.964390 0.013557 0.020000 0.005966 0.954344 0.019690 0.035459 0.003988 0.953844 0.006709 0.018153 0.010254 0.944742 0.026851 0.123049 0.033072 0.591257 0.252622 0.246434 0.022655 0.590578 0.140333 0.044982 0.045356 0.884112 0.025549 0.142183 0.045722 0.737634 0.074461 0.263149 0.067983 0.555137 0.113731 0.136153 0.179132 0.443451 0.241264 0.431929 0.165213 0.201324 0.201535 Consensus sequence: GKRGGGGGGGGGGBD Alignment: GKRGGGGGGGGGGBD -SSGGSGDBGSGGSS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 3 14 0.032454 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH -------SSCCSCBHCSCCSS-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 24 Motif name: C024 Original motif 0.230000 0.250000 0.010000 0.510000 0.470000 0.040000 0.230000 0.260000 0.690000 0.250000 0.020000 0.040000 0.720000 0.250000 0.020000 0.010000 0.130000 0.370000 0.100000 0.400000 0.554455 0.009901 0.287129 0.148515 0.514851 0.009901 0.009901 0.465347 0.801980 0.148515 0.039604 0.009901 0.732673 0.158416 0.099010 0.009901 0.881188 0.099010 0.009901 0.009901 0.871287 0.009901 0.009901 0.108911 0.490000 0.010000 0.010000 0.490000 0.160000 0.320000 0.010000 0.510000 0.490000 0.040000 0.260000 0.210000 0.760000 0.210000 0.010000 0.020000 0.851485 0.118812 0.019802 0.009901 0.252525 0.252525 0.040404 0.454545 0.560000 0.090000 0.190000 0.160000 Consensus sequence: TDAAYRWAAAAWYDAAHA Reserve complement motif 0.160000 0.090000 0.190000 0.560000 0.454545 0.252525 0.040404 0.252525 0.009901 0.118812 0.019802 0.851485 0.020000 0.210000 0.010000 0.760000 0.210000 0.040000 0.260000 0.490000 0.510000 0.320000 0.010000 0.160000 0.490000 0.010000 0.010000 0.490000 0.108911 0.009901 0.009901 0.871287 0.009901 0.099010 0.009901 0.881188 0.009901 0.158416 0.099010 0.732673 0.009901 0.148515 0.039604 0.801980 0.465347 0.009901 0.009901 0.514851 0.148515 0.009901 0.287129 0.554455 0.400000 0.370000 0.100000 0.130000 0.010000 0.250000 0.020000 0.720000 0.040000 0.250000 0.020000 0.690000 0.260000 0.040000 0.230000 0.470000 0.510000 0.250000 0.010000 0.230000 Consensus sequence: THTTDMWTTTTWKMTTDA ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 24 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 3 18 0.041090 Species: Mus musculus Original motif 0.360997 0.300272 0.115555 0.223177 0.309749 0.228429 0.166233 0.295589 0.149419 0.176868 0.240155 0.433558 0.379704 0.095791 0.276373 0.248133 0.394549 0.174184 0.130641 0.300626 0.443749 0.070776 0.211081 0.274393 0.364301 0.074356 0.370406 0.190936 0.791976 0.038475 0.093390 0.076159 0.963721 0.001826 0.002456 0.031997 0.004516 0.954596 0.008092 0.032796 0.981080 0.002062 0.002161 0.014697 0.986185 0.001846 0.006976 0.004992 0.059567 0.003649 0.002189 0.934595 0.495328 0.024257 0.240450 0.239965 0.305027 0.094878 0.526069 0.074025 0.418442 0.196237 0.158323 0.226998 0.336713 0.220452 0.191155 0.251680 0.192296 0.300342 0.169047 0.338315 0.240387 0.144634 0.128513 0.486465 0.290763 0.271259 0.116600 0.321377 0.224825 0.296233 0.229255 0.249687 0.493240 0.171285 0.075148 0.260326 Consensus sequence: HHBDHDDAACAATDRHHHHHBW Reverse complement motif 0.260326 0.171285 0.075148 0.493240 0.224825 0.229255 0.296233 0.249687 0.321377 0.271259 0.116600 0.290763 0.486465 0.144634 0.128513 0.240387 0.338315 0.300342 0.169047 0.192296 0.251680 0.220452 0.191155 0.336713 0.226998 0.196237 0.158323 0.418442 0.305027 0.526069 0.094878 0.074025 0.239965 0.024257 0.240450 0.495328 0.934595 0.003649 0.002189 0.059567 0.004992 0.001846 0.006976 0.986185 0.014697 0.002062 0.002161 0.981080 0.004516 0.008092 0.954596 0.032796 0.031997 0.001826 0.002456 0.963721 0.076159 0.038475 0.093390 0.791976 0.364301 0.370406 0.074356 0.190936 0.274393 0.070776 0.211081 0.443749 0.300626 0.174184 0.130641 0.394549 0.248133 0.095791 0.276373 0.379704 0.433558 0.176868 0.240155 0.149419 0.295589 0.228429 0.166233 0.309749 0.223177 0.300272 0.115555 0.360997 Consensus sequence: WBHHHHHMDATTGTTHDHDVHH Alignment: WBHHHHHMDATTGTTHDHDVHH --THTTDMWTTTTWKMTTDA-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 5 18 0.044148 Species: Mus musculus Original motif 0.067627 0.131333 0.654425 0.146615 0.156488 0.114442 0.145630 0.583441 0.206450 0.265630 0.358017 0.169903 0.090729 0.460713 0.274712 0.173847 0.285994 0.099998 0.154485 0.459523 0.635908 0.184787 0.072982 0.106323 0.748421 0.039204 0.092605 0.119769 0.081342 0.061327 0.044532 0.812799 0.143120 0.043879 0.024216 0.788785 0.247544 0.092102 0.621453 0.038901 0.295531 0.036295 0.027594 0.640580 0.194561 0.305468 0.339916 0.160055 0.175038 0.193568 0.101212 0.530182 0.145226 0.167488 0.559871 0.127415 0.271501 0.237429 0.206701 0.284369 0.216834 0.109191 0.569605 0.104370 0.182624 0.177160 0.300475 0.339742 0.331737 0.198645 0.265137 0.204482 0.230155 0.359365 0.183450 0.227029 0.056581 0.067297 0.463052 0.413070 0.198891 0.324626 0.304424 0.172059 0.181968 0.287547 0.202419 0.328066 Consensus sequence: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB Reverse complement motif 0.328066 0.287547 0.202419 0.181968 0.198891 0.304424 0.324626 0.172059 0.056581 0.463052 0.067297 0.413070 0.230155 0.183450 0.359365 0.227029 0.204482 0.198645 0.265137 0.331737 0.339742 0.177160 0.300475 0.182624 0.216834 0.569605 0.109191 0.104370 0.284369 0.237429 0.206701 0.271501 0.145226 0.559871 0.167488 0.127415 0.530182 0.193568 0.101212 0.175038 0.194561 0.339916 0.305468 0.160055 0.640580 0.036295 0.027594 0.295531 0.247544 0.621453 0.092102 0.038901 0.788785 0.043879 0.024216 0.143120 0.812799 0.061327 0.044532 0.081342 0.119769 0.039204 0.092605 0.748421 0.106323 0.184787 0.072982 0.635908 0.459523 0.099998 0.154485 0.285994 0.090729 0.274712 0.460713 0.173847 0.206450 0.358017 0.265630 0.169903 0.583441 0.114442 0.145630 0.156488 0.067627 0.654425 0.131333 0.146615 Consensus sequence: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC Alignment: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC ----TDAAYRWAAAAWYDAAHA ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00032 Gata3_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 18 0.050819 Species: Mus musculus Original motif 0.151572 0.262753 0.258275 0.327401 0.221834 0.113385 0.275380 0.389400 0.297769 0.136928 0.134678 0.430625 0.270099 0.110415 0.271106 0.348380 0.265471 0.090253 0.223340 0.420936 0.616582 0.090091 0.171960 0.121367 0.197318 0.107541 0.406904 0.288237 0.798258 0.046950 0.001406 0.153385 0.003195 0.002516 0.989707 0.004582 0.991503 0.002748 0.002617 0.003132 0.005015 0.002764 0.003026 0.989195 0.948394 0.008932 0.001344 0.041330 0.973109 0.004100 0.004081 0.018710 0.040365 0.113905 0.828185 0.017545 0.736608 0.130524 0.113464 0.019404 0.415921 0.106101 0.316613 0.161365 0.376582 0.170927 0.155572 0.296919 0.137731 0.197151 0.211055 0.454064 0.324853 0.122747 0.246107 0.306293 0.462490 0.207311 0.159392 0.170807 0.380420 0.188972 0.311990 0.118618 0.222178 0.157873 0.380486 0.239463 Consensus sequence: BDHDDADAGATAAGADHBDHVD Reverse complement motif 0.222178 0.380486 0.157873 0.239463 0.118618 0.188972 0.311990 0.380420 0.170807 0.207311 0.159392 0.462490 0.306293 0.122747 0.246107 0.324853 0.454064 0.197151 0.211055 0.137731 0.296919 0.170927 0.155572 0.376582 0.161365 0.106101 0.316613 0.415921 0.019404 0.130524 0.113464 0.736608 0.040365 0.828185 0.113905 0.017545 0.018710 0.004100 0.004081 0.973109 0.041330 0.008932 0.001344 0.948394 0.989195 0.002764 0.003026 0.005015 0.003132 0.002748 0.002617 0.991503 0.003195 0.989707 0.002516 0.004582 0.153385 0.046950 0.001406 0.798258 0.197318 0.406904 0.107541 0.288237 0.121367 0.090091 0.171960 0.616582 0.420936 0.090253 0.223340 0.265471 0.348380 0.110415 0.271106 0.270099 0.430625 0.136928 0.134678 0.297769 0.389400 0.113385 0.275380 0.221834 0.327401 0.262753 0.258275 0.151572 Consensus sequence: HBHDVHDTCTTATCTHTDDHDV Alignment: HBHDVHDTCTTATCTHTDDHDV THTTDMWTTTTWKMTTDA---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00032 Gata3_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 3 18 0.054699 Species: Mus musculus Original motif 0.177641 0.319872 0.115137 0.387350 0.136644 0.182137 0.205873 0.475347 0.254263 0.244280 0.165207 0.336250 0.240415 0.207557 0.237497 0.314530 0.271041 0.214702 0.364395 0.149863 0.095475 0.320104 0.191738 0.392682 0.500902 0.142722 0.026556 0.329820 0.051221 0.023698 0.897245 0.027836 0.922410 0.027509 0.024058 0.026023 0.030735 0.070903 0.024248 0.874114 0.242120 0.231992 0.225143 0.300745 0.106956 0.220471 0.283490 0.389083 0.152079 0.165830 0.135066 0.547025 0.839205 0.051581 0.060119 0.049095 0.041204 0.069147 0.070830 0.818819 0.051861 0.848177 0.027599 0.072363 0.383793 0.016807 0.397470 0.201931 0.381899 0.215846 0.255908 0.146347 0.094792 0.358651 0.280905 0.265652 0.296132 0.181545 0.178433 0.343890 0.301997 0.254722 0.108566 0.334714 0.349481 0.270693 0.137507 0.242319 Consensus sequence: HBHDVBWGATHBTATCRVBHHH Reverse complement motif 0.242319 0.270693 0.137507 0.349481 0.334714 0.254722 0.108566 0.301997 0.343890 0.181545 0.178433 0.296132 0.094792 0.280905 0.358651 0.265652 0.146347 0.215846 0.255908 0.381899 0.383793 0.397470 0.016807 0.201931 0.051861 0.027599 0.848177 0.072363 0.818819 0.069147 0.070830 0.041204 0.049095 0.051581 0.060119 0.839205 0.547025 0.165830 0.135066 0.152079 0.389083 0.220471 0.283490 0.106956 0.300745 0.231992 0.225143 0.242120 0.874114 0.070903 0.024248 0.030735 0.026023 0.027509 0.024058 0.922410 0.051221 0.897245 0.023698 0.027836 0.329820 0.142722 0.026556 0.500902 0.392682 0.320104 0.191738 0.095475 0.271041 0.364395 0.214702 0.149863 0.314530 0.207557 0.237497 0.240415 0.336250 0.244280 0.165207 0.254263 0.475347 0.182137 0.205873 0.136644 0.387350 0.319872 0.115137 0.177641 Consensus sequence: HHHBBMGATAVHATCWVVDHVH Alignment: HHHBBMGATAVHATCWVVDHVH --TDAAYRWAAAAWYDAAHA-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00528 Foxm1_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 1 18 0.055300 Species: Mus musculus Original motif 0.399785 0.446658 0.111435 0.042122 0.535175 0.103991 0.089706 0.271128 0.078171 0.387987 0.375083 0.158759 0.309001 0.519142 0.070618 0.101239 0.201844 0.255818 0.323149 0.219190 0.534101 0.109845 0.235026 0.121028 0.656038 0.037473 0.261484 0.045006 0.315713 0.164290 0.471815 0.048182 0.651960 0.009412 0.328237 0.010391 0.937365 0.017313 0.007516 0.037807 0.019983 0.044238 0.012387 0.923392 0.061195 0.021485 0.881645 0.035675 0.017521 0.952998 0.013139 0.016342 0.254160 0.029735 0.493023 0.223082 0.239200 0.593324 0.114503 0.052973 0.610822 0.071539 0.099169 0.218470 0.166610 0.389712 0.204400 0.239278 0.227752 0.361626 0.178497 0.232125 0.537030 0.182466 0.026035 0.254470 0.235902 0.151006 0.043788 0.569304 0.081851 0.250397 0.590059 0.077693 0.340417 0.189613 0.272075 0.197895 Consensus sequence: MWSMBAARRATGCDCABHATGD Reverse complement motif 0.197895 0.189613 0.272075 0.340417 0.081851 0.590059 0.250397 0.077693 0.569304 0.151006 0.043788 0.235902 0.254470 0.182466 0.026035 0.537030 0.227752 0.178497 0.361626 0.232125 0.166610 0.204400 0.389712 0.239278 0.218470 0.071539 0.099169 0.610822 0.239200 0.114503 0.593324 0.052973 0.254160 0.493023 0.029735 0.223082 0.017521 0.013139 0.952998 0.016342 0.061195 0.881645 0.021485 0.035675 0.923392 0.044238 0.012387 0.019983 0.037807 0.017313 0.007516 0.937365 0.010391 0.009412 0.328237 0.651960 0.315713 0.471815 0.164290 0.048182 0.045006 0.037473 0.261484 0.656038 0.121028 0.109845 0.235026 0.534101 0.201844 0.323149 0.255818 0.219190 0.309001 0.070618 0.519142 0.101239 0.078171 0.375083 0.387987 0.158759 0.271128 0.103991 0.089706 0.535175 0.399785 0.111435 0.446658 0.042122 Consensus sequence: DCATDBTGHGCATKMTTBRSWR Alignment: MWSMBAARRATGCDCABHATGD TDAAYRWAAAAWYDAAHA---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 25 Motif name: C025 Original motif 0.029703 0.029703 0.455446 0.485149 0.465347 0.495050 0.029703 0.009901 0.039604 0.069307 0.772277 0.118812 0.780000 0.010000 0.200000 0.010000 0.009901 0.009901 0.455446 0.524752 0.693069 0.009901 0.247525 0.049505 0.070000 0.180000 0.740000 0.010000 0.841584 0.009901 0.138614 0.009901 0.188119 0.207921 0.574257 0.029703 0.475248 0.485149 0.029703 0.009901 0.151515 0.161616 0.676768 0.010101 0.871287 0.009901 0.108911 0.009901 0.019802 0.019802 0.465347 0.495050 0.455446 0.495050 0.039604 0.009901 Consensus sequence: KMGAKAGAGMGAKM Reserve complement motif 0.455446 0.039604 0.495050 0.009901 0.495050 0.019802 0.465347 0.019802 0.009901 0.009901 0.108911 0.871287 0.151515 0.676768 0.161616 0.010101 0.475248 0.029703 0.485149 0.009901 0.188119 0.574257 0.207921 0.029703 0.009901 0.009901 0.138614 0.841584 0.070000 0.740000 0.180000 0.010000 0.049505 0.009901 0.247525 0.693069 0.524752 0.009901 0.455446 0.009901 0.010000 0.010000 0.200000 0.780000 0.039604 0.772277 0.069307 0.118812 0.465347 0.029703 0.495050 0.009901 0.485149 0.029703 0.455446 0.029703 Consensus sequence: RRTCRCTCTRTCRR ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 25 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00080 Gata5_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 4 14 0.036512 Species: Mus musculus Original motif 0.296956 0.225759 0.366964 0.110320 0.363955 0.287909 0.178199 0.169937 0.167366 0.353513 0.235266 0.243855 0.362045 0.255289 0.159993 0.222674 0.280070 0.083717 0.491243 0.144971 0.856104 0.068327 0.034504 0.041065 0.063256 0.017187 0.849623 0.069934 0.916053 0.035900 0.039485 0.008562 0.025896 0.011964 0.054314 0.907826 0.827706 0.129092 0.013351 0.029850 0.048301 0.029514 0.118868 0.803318 0.069245 0.824881 0.022797 0.083077 0.508319 0.034384 0.109239 0.348058 0.228736 0.146771 0.436716 0.187777 0.183599 0.289339 0.157455 0.369607 0.174967 0.268426 0.275078 0.281528 0.136843 0.155950 0.346111 0.361096 Consensus sequence: VVBHRAGATATCWDHBB Reverse complement motif 0.361096 0.155950 0.346111 0.136843 0.281528 0.268426 0.275078 0.174967 0.369607 0.289339 0.157455 0.183599 0.228736 0.436716 0.146771 0.187777 0.348058 0.034384 0.109239 0.508319 0.069245 0.022797 0.824881 0.083077 0.803318 0.029514 0.118868 0.048301 0.029850 0.129092 0.013351 0.827706 0.907826 0.011964 0.054314 0.025896 0.008562 0.035900 0.039485 0.916053 0.063256 0.849623 0.017187 0.069934 0.041065 0.068327 0.034504 0.856104 0.280070 0.491243 0.083717 0.144971 0.222674 0.255289 0.159993 0.362045 0.167366 0.235266 0.353513 0.243855 0.169937 0.287909 0.178199 0.363955 0.296956 0.366964 0.225759 0.110320 Consensus sequence: VVHHWGATATCTMHBBV Alignment: VVBHRAGATATCWDHBB RRTCRCTCTRTCRR--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 4 14 0.037763 Species: Mus musculus Original motif 0.067627 0.131333 0.654425 0.146615 0.156488 0.114442 0.145630 0.583441 0.206450 0.265630 0.358017 0.169903 0.090729 0.460713 0.274712 0.173847 0.285994 0.099998 0.154485 0.459523 0.635908 0.184787 0.072982 0.106323 0.748421 0.039204 0.092605 0.119769 0.081342 0.061327 0.044532 0.812799 0.143120 0.043879 0.024216 0.788785 0.247544 0.092102 0.621453 0.038901 0.295531 0.036295 0.027594 0.640580 0.194561 0.305468 0.339916 0.160055 0.175038 0.193568 0.101212 0.530182 0.145226 0.167488 0.559871 0.127415 0.271501 0.237429 0.206701 0.284369 0.216834 0.109191 0.569605 0.104370 0.182624 0.177160 0.300475 0.339742 0.331737 0.198645 0.265137 0.204482 0.230155 0.359365 0.183450 0.227029 0.056581 0.067297 0.463052 0.413070 0.198891 0.324626 0.304424 0.172059 0.181968 0.287547 0.202419 0.328066 Consensus sequence: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB Reverse complement motif 0.328066 0.287547 0.202419 0.181968 0.198891 0.304424 0.324626 0.172059 0.056581 0.463052 0.067297 0.413070 0.230155 0.183450 0.359365 0.227029 0.204482 0.198645 0.265137 0.331737 0.339742 0.177160 0.300475 0.182624 0.216834 0.569605 0.109191 0.104370 0.284369 0.237429 0.206701 0.271501 0.145226 0.559871 0.167488 0.127415 0.530182 0.193568 0.101212 0.175038 0.194561 0.339916 0.305468 0.160055 0.640580 0.036295 0.027594 0.295531 0.247544 0.621453 0.092102 0.038901 0.788785 0.043879 0.024216 0.143120 0.812799 0.061327 0.044532 0.081342 0.119769 0.039204 0.092605 0.748421 0.106323 0.184787 0.072982 0.635908 0.459523 0.099998 0.154485 0.285994 0.090729 0.274712 0.460713 0.173847 0.206450 0.358017 0.265630 0.169903 0.583441 0.114442 0.145630 0.156488 0.067627 0.654425 0.131333 0.146615 Consensus sequence: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC Alignment: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC -----RRTCRCTCTRTCRR--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00098 Rfx3_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 10 14 0.038424 Species: Mus musculus Original motif 0.314514 0.275352 0.257617 0.152518 0.126939 0.598294 0.130576 0.144192 0.102265 0.155334 0.177957 0.564445 0.129288 0.282678 0.326990 0.261044 0.318166 0.227823 0.175681 0.278330 0.109019 0.380838 0.278328 0.231815 0.226145 0.289206 0.291300 0.193348 0.035863 0.844339 0.072582 0.047216 0.223793 0.187244 0.088092 0.500871 0.039800 0.029681 0.026201 0.904317 0.298298 0.032147 0.654746 0.014809 0.014729 0.022023 0.944826 0.018422 0.485114 0.004925 0.013785 0.496176 0.035708 0.020381 0.240804 0.703108 0.951152 0.012738 0.017886 0.018224 0.023713 0.944394 0.009538 0.022355 0.291067 0.385205 0.232388 0.091339 0.340334 0.199588 0.311526 0.148552 0.198713 0.472138 0.178319 0.150830 0.321155 0.269932 0.311301 0.097612 0.412646 0.195252 0.231950 0.160152 0.297134 0.180928 0.250400 0.271538 0.151169 0.305386 0.358574 0.184871 Consensus sequence: VCTBHBVCTTGGWTACVVVVVDB Reverse complement motif 0.151169 0.358574 0.305386 0.184871 0.271538 0.180928 0.250400 0.297134 0.160152 0.195252 0.231950 0.412646 0.097612 0.269932 0.311301 0.321155 0.198713 0.178319 0.472138 0.150830 0.148552 0.199588 0.311526 0.340334 0.291067 0.232388 0.385205 0.091339 0.023713 0.009538 0.944394 0.022355 0.018224 0.012738 0.017886 0.951152 0.703108 0.020381 0.240804 0.035708 0.496176 0.004925 0.013785 0.485114 0.014729 0.944826 0.022023 0.018422 0.298298 0.654746 0.032147 0.014809 0.904317 0.029681 0.026201 0.039800 0.500871 0.187244 0.088092 0.223793 0.035863 0.072582 0.844339 0.047216 0.226145 0.291300 0.289206 0.193348 0.109019 0.278328 0.380838 0.231815 0.278330 0.227823 0.175681 0.318166 0.129288 0.326990 0.282678 0.261044 0.564445 0.155334 0.177957 0.102265 0.126939 0.130576 0.598294 0.144192 0.152518 0.275352 0.257617 0.314514 Consensus sequence: BDBBVBVGTAWCCAAGVBHBAGB Alignment: VCTBHBVCTTGGWTACVVVVVDB ---------KMGAKAGAGMGAKM ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00100 Gata6_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 4 14 0.039470 Species: Mus musculus Original motif 0.096037 0.078720 0.658871 0.166372 0.099473 0.472200 0.272164 0.156163 0.148727 0.227078 0.409637 0.214558 0.280787 0.217654 0.322181 0.179378 0.108784 0.723506 0.080970 0.086739 0.058171 0.044102 0.818270 0.079457 0.681346 0.227586 0.064501 0.026567 0.026226 0.007471 0.070040 0.896263 0.896263 0.070040 0.007471 0.026226 0.026567 0.064501 0.227586 0.681346 0.079457 0.818270 0.044102 0.058171 0.086739 0.080970 0.723506 0.108784 0.081853 0.508631 0.267911 0.141606 0.438599 0.302967 0.195554 0.062881 0.091413 0.182315 0.581418 0.144854 0.142535 0.490840 0.073803 0.292822 0.254673 0.169951 0.289664 0.285713 Consensus sequence: GBBVCGATATCGSVGYD Reverse complement motif 0.254673 0.289664 0.169951 0.285713 0.142535 0.073803 0.490840 0.292822 0.091413 0.581418 0.182315 0.144854 0.062881 0.302967 0.195554 0.438599 0.081853 0.267911 0.508631 0.141606 0.086739 0.723506 0.080970 0.108784 0.079457 0.044102 0.818270 0.058171 0.681346 0.064501 0.227586 0.026567 0.026226 0.070040 0.007471 0.896263 0.896263 0.007471 0.070040 0.026226 0.026567 0.227586 0.064501 0.681346 0.058171 0.818270 0.044102 0.079457 0.108784 0.080970 0.723506 0.086739 0.280787 0.322181 0.217654 0.179378 0.148727 0.409637 0.227078 0.214558 0.099473 0.272164 0.472200 0.156163 0.096037 0.658871 0.078720 0.166372 Consensus sequence: HKCBSCGATATCGVBBC Alignment: HKCBSCGATATCGVBBC RRTCRCTCTRTCRR--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00040 Irf5_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 1 14 0.040538 Species: Mus musculus Original motif 0.160739 0.237732 0.225630 0.375899 0.231003 0.186804 0.122026 0.460167 0.282260 0.197034 0.288737 0.231969 0.746029 0.055630 0.083427 0.114914 0.169536 0.340063 0.148794 0.341606 0.086576 0.827589 0.034986 0.050849 0.021280 0.012938 0.955490 0.010292 0.930476 0.013781 0.047798 0.007945 0.002126 0.038171 0.948134 0.011570 0.959483 0.009871 0.015462 0.015184 0.495380 0.028946 0.408360 0.067314 0.145964 0.186198 0.031072 0.636767 0.200379 0.206354 0.151807 0.441460 0.171996 0.390086 0.220850 0.217068 0.208281 0.322628 0.291771 0.177321 Consensus sequence: BHDAHCGAGARTHBV Reverse complement motif 0.208281 0.291771 0.322628 0.177321 0.171996 0.220850 0.390086 0.217068 0.441460 0.206354 0.151807 0.200379 0.636767 0.186198 0.031072 0.145964 0.067314 0.028946 0.408360 0.495380 0.015184 0.009871 0.015462 0.959483 0.002126 0.948134 0.038171 0.011570 0.007945 0.013781 0.047798 0.930476 0.021280 0.955490 0.012938 0.010292 0.086576 0.034986 0.827589 0.050849 0.341606 0.340063 0.148794 0.169536 0.114914 0.055630 0.083427 0.746029 0.282260 0.288737 0.197034 0.231969 0.460167 0.186804 0.122026 0.231003 0.375899 0.237732 0.225630 0.160739 Consensus sequence: VBHAKTCTCGHTHHV Alignment: BHDAHCGAGARTHBV KMGAKAGAGMGAKM- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 26 Motif name: C026 Original motif 0.029703 0.039604 0.435644 0.495050 0.460000 0.470000 0.050000 0.020000 0.148515 0.148515 0.693069 0.009901 0.710000 0.010000 0.270000 0.010000 0.099010 0.099010 0.792079 0.009901 0.722772 0.029703 0.188119 0.059406 0.009901 0.019802 0.445545 0.524752 0.455446 0.485149 0.049505 0.009901 0.009901 0.029703 0.445545 0.514851 0.465347 0.485149 0.039604 0.009901 0.138614 0.138614 0.712871 0.009901 0.841584 0.009901 0.138614 0.009901 0.118812 0.108911 0.762376 0.009901 0.760000 0.010000 0.190000 0.040000 0.030000 0.040000 0.430000 0.500000 0.450000 0.470000 0.060000 0.020000 Consensus sequence: KMGAGAKMKMGAGAKM Reserve complement motif 0.450000 0.060000 0.470000 0.020000 0.500000 0.040000 0.430000 0.030000 0.040000 0.010000 0.190000 0.760000 0.118812 0.762376 0.108911 0.009901 0.009901 0.009901 0.138614 0.841584 0.138614 0.712871 0.138614 0.009901 0.465347 0.039604 0.485149 0.009901 0.514851 0.029703 0.445545 0.009901 0.455446 0.049505 0.485149 0.009901 0.524752 0.019802 0.445545 0.009901 0.059406 0.029703 0.188119 0.722772 0.099010 0.792079 0.099010 0.009901 0.010000 0.010000 0.270000 0.710000 0.148515 0.693069 0.148515 0.009901 0.460000 0.050000 0.470000 0.020000 0.495050 0.039604 0.435644 0.029703 Consensus sequence: RRTCTCRRRRTCTCRR ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 26 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00095 Zfp691_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 1 16 0.045464 Species: Mus musculus Original motif 0.236868 0.155338 0.295091 0.312703 0.522782 0.133021 0.177386 0.166812 0.192915 0.374870 0.221406 0.210809 0.146546 0.199196 0.418035 0.236223 0.454326 0.095049 0.151770 0.298855 0.027956 0.023096 0.878335 0.070614 0.916030 0.020358 0.039894 0.023717 0.010595 0.938036 0.039415 0.011954 0.007271 0.014948 0.007990 0.969792 0.014291 0.964878 0.011126 0.009705 0.154586 0.759294 0.050151 0.035969 0.051021 0.268239 0.053410 0.627330 0.158293 0.386843 0.113152 0.341713 0.281766 0.184139 0.187916 0.346179 0.292444 0.267259 0.241323 0.198974 0.425732 0.262331 0.149076 0.162861 0.205385 0.384164 0.267912 0.142538 Consensus sequence: DABBWGACTCCTHDVHV Reverse complement motif 0.205385 0.267912 0.384164 0.142538 0.162861 0.262331 0.149076 0.425732 0.198974 0.267259 0.241323 0.292444 0.346179 0.184139 0.187916 0.281766 0.158293 0.113152 0.386843 0.341713 0.627330 0.268239 0.053410 0.051021 0.154586 0.050151 0.759294 0.035969 0.014291 0.011126 0.964878 0.009705 0.969792 0.014948 0.007990 0.007271 0.010595 0.039415 0.938036 0.011954 0.023717 0.020358 0.039894 0.916030 0.027956 0.878335 0.023096 0.070614 0.298855 0.095049 0.151770 0.454326 0.146546 0.418035 0.199196 0.236223 0.192915 0.221406 0.374870 0.210809 0.166812 0.133021 0.177386 0.522782 0.312703 0.155338 0.295091 0.236868 Consensus sequence: VHBDDAGGAGTCWBBTD Alignment: VHBDDAGGAGTCWBBTD RRTCTCRRRRTCTCRR- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00037 Zfp105_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 2 16 0.045982 Species: Mus musculus Original motif 0.266678 0.210793 0.270357 0.252172 0.060513 0.387388 0.139940 0.412159 0.129835 0.094669 0.581455 0.194041 0.222891 0.216518 0.374389 0.186202 0.051470 0.183173 0.261264 0.504093 0.033295 0.098623 0.075218 0.792864 0.159222 0.757734 0.066213 0.016831 0.909619 0.041577 0.030716 0.018087 0.790897 0.139370 0.044203 0.025531 0.016549 0.121838 0.111434 0.750178 0.747907 0.043147 0.179106 0.029840 0.696917 0.099750 0.098316 0.105017 0.132206 0.270741 0.232896 0.364158 0.140809 0.132229 0.164933 0.562029 0.054822 0.313780 0.179755 0.451644 0.144402 0.139143 0.255283 0.461171 0.263219 0.160957 0.382446 0.193379 Consensus sequence: DYGVKTCAATAABTYDD Reverse complement motif 0.263219 0.382446 0.160957 0.193379 0.461171 0.139143 0.255283 0.144402 0.451644 0.313780 0.179755 0.054822 0.562029 0.132229 0.164933 0.140809 0.364158 0.270741 0.232896 0.132206 0.105017 0.099750 0.098316 0.696917 0.029840 0.043147 0.179106 0.747907 0.750178 0.121838 0.111434 0.016549 0.025531 0.139370 0.044203 0.790897 0.018087 0.041577 0.030716 0.909619 0.159222 0.066213 0.757734 0.016831 0.792864 0.098623 0.075218 0.033295 0.504093 0.183173 0.261264 0.051470 0.222891 0.374389 0.216518 0.186202 0.129835 0.581455 0.094669 0.194041 0.412159 0.387388 0.139940 0.060513 0.266678 0.270357 0.210793 0.252172 Consensus sequence: HDMAVTTATTGARVCMH Alignment: HDMAVTTATTGARVCMH KMGAGAKMKMGAGAKM- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00098 Rfx3_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 7 16 0.047003 Species: Mus musculus Original motif 0.314514 0.275352 0.257617 0.152518 0.126939 0.598294 0.130576 0.144192 0.102265 0.155334 0.177957 0.564445 0.129288 0.282678 0.326990 0.261044 0.318166 0.227823 0.175681 0.278330 0.109019 0.380838 0.278328 0.231815 0.226145 0.289206 0.291300 0.193348 0.035863 0.844339 0.072582 0.047216 0.223793 0.187244 0.088092 0.500871 0.039800 0.029681 0.026201 0.904317 0.298298 0.032147 0.654746 0.014809 0.014729 0.022023 0.944826 0.018422 0.485114 0.004925 0.013785 0.496176 0.035708 0.020381 0.240804 0.703108 0.951152 0.012738 0.017886 0.018224 0.023713 0.944394 0.009538 0.022355 0.291067 0.385205 0.232388 0.091339 0.340334 0.199588 0.311526 0.148552 0.198713 0.472138 0.178319 0.150830 0.321155 0.269932 0.311301 0.097612 0.412646 0.195252 0.231950 0.160152 0.297134 0.180928 0.250400 0.271538 0.151169 0.305386 0.358574 0.184871 Consensus sequence: VCTBHBVCTTGGWTACVVVVVDB Reverse complement motif 0.151169 0.358574 0.305386 0.184871 0.271538 0.180928 0.250400 0.297134 0.160152 0.195252 0.231950 0.412646 0.097612 0.269932 0.311301 0.321155 0.198713 0.178319 0.472138 0.150830 0.148552 0.199588 0.311526 0.340334 0.291067 0.232388 0.385205 0.091339 0.023713 0.009538 0.944394 0.022355 0.018224 0.012738 0.017886 0.951152 0.703108 0.020381 0.240804 0.035708 0.496176 0.004925 0.013785 0.485114 0.014729 0.944826 0.022023 0.018422 0.298298 0.654746 0.032147 0.014809 0.904317 0.029681 0.026201 0.039800 0.500871 0.187244 0.088092 0.223793 0.035863 0.072582 0.844339 0.047216 0.226145 0.291300 0.289206 0.193348 0.109019 0.278328 0.380838 0.231815 0.278330 0.227823 0.175681 0.318166 0.129288 0.326990 0.282678 0.261044 0.564445 0.155334 0.177957 0.102265 0.126939 0.130576 0.598294 0.144192 0.152518 0.275352 0.257617 0.314514 Consensus sequence: BDBBVBVGTAWCCAAGVBHBAGB Alignment: BDBBVBVGTAWCCAAGVBHBAGB ------RRTCTCRRRRTCTCRR- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00100 Gata6_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 1 16 0.047248 Species: Mus musculus Original motif 0.096037 0.078720 0.658871 0.166372 0.099473 0.472200 0.272164 0.156163 0.148727 0.227078 0.409637 0.214558 0.280787 0.217654 0.322181 0.179378 0.108784 0.723506 0.080970 0.086739 0.058171 0.044102 0.818270 0.079457 0.681346 0.227586 0.064501 0.026567 0.026226 0.007471 0.070040 0.896263 0.896263 0.070040 0.007471 0.026226 0.026567 0.064501 0.227586 0.681346 0.079457 0.818270 0.044102 0.058171 0.086739 0.080970 0.723506 0.108784 0.081853 0.508631 0.267911 0.141606 0.438599 0.302967 0.195554 0.062881 0.091413 0.182315 0.581418 0.144854 0.142535 0.490840 0.073803 0.292822 0.254673 0.169951 0.289664 0.285713 Consensus sequence: GBBVCGATATCGSVGYD Reverse complement motif 0.254673 0.289664 0.169951 0.285713 0.142535 0.073803 0.490840 0.292822 0.091413 0.581418 0.182315 0.144854 0.062881 0.302967 0.195554 0.438599 0.081853 0.267911 0.508631 0.141606 0.086739 0.723506 0.080970 0.108784 0.079457 0.044102 0.818270 0.058171 0.681346 0.064501 0.227586 0.026567 0.026226 0.070040 0.007471 0.896263 0.896263 0.007471 0.070040 0.026226 0.026567 0.227586 0.064501 0.681346 0.058171 0.818270 0.044102 0.079457 0.108784 0.080970 0.723506 0.086739 0.280787 0.322181 0.217654 0.179378 0.148727 0.409637 0.227078 0.214558 0.099473 0.272164 0.472200 0.156163 0.096037 0.658871 0.078720 0.166372 Consensus sequence: HKCBSCGATATCGVBBC Alignment: HKCBSCGATATCGVBBC RRTCTCRRRRTCTCRR- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00080 Gata5_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 2 16 0.048958 Species: Mus musculus Original motif 0.296956 0.225759 0.366964 0.110320 0.363955 0.287909 0.178199 0.169937 0.167366 0.353513 0.235266 0.243855 0.362045 0.255289 0.159993 0.222674 0.280070 0.083717 0.491243 0.144971 0.856104 0.068327 0.034504 0.041065 0.063256 0.017187 0.849623 0.069934 0.916053 0.035900 0.039485 0.008562 0.025896 0.011964 0.054314 0.907826 0.827706 0.129092 0.013351 0.029850 0.048301 0.029514 0.118868 0.803318 0.069245 0.824881 0.022797 0.083077 0.508319 0.034384 0.109239 0.348058 0.228736 0.146771 0.436716 0.187777 0.183599 0.289339 0.157455 0.369607 0.174967 0.268426 0.275078 0.281528 0.136843 0.155950 0.346111 0.361096 Consensus sequence: VVBHRAGATATCWDHBB Reverse complement motif 0.361096 0.155950 0.346111 0.136843 0.281528 0.268426 0.275078 0.174967 0.369607 0.289339 0.157455 0.183599 0.228736 0.436716 0.146771 0.187777 0.348058 0.034384 0.109239 0.508319 0.069245 0.022797 0.824881 0.083077 0.803318 0.029514 0.118868 0.048301 0.029850 0.129092 0.013351 0.827706 0.907826 0.011964 0.054314 0.025896 0.008562 0.035900 0.039485 0.916053 0.063256 0.849623 0.017187 0.069934 0.041065 0.068327 0.034504 0.856104 0.280070 0.491243 0.083717 0.144971 0.222674 0.255289 0.159993 0.362045 0.167366 0.235266 0.353513 0.243855 0.169937 0.287909 0.178199 0.363955 0.296956 0.366964 0.225759 0.110320 Consensus sequence: VVHHWGATATCTMHBBV Alignment: VVHHWGATATCTMHBBV -KMGAGAKMKMGAGAKM ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 27 Motif name: C027 Original motif 0.460000 0.340000 0.010000 0.190000 0.504950 0.009901 0.425743 0.059406 0.280000 0.690000 0.020000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.267327 0.039604 0.584158 0.108911 0.445545 0.009901 0.455446 0.089109 0.030303 0.070707 0.888889 0.010101 0.910000 0.020000 0.030000 0.040000 0.800000 0.030000 0.150000 0.020000 0.890000 0.030000 0.020000 0.060000 0.010000 0.900000 0.030000 0.060000 0.030000 0.870000 0.010000 0.090000 0.020000 0.900000 0.010000 0.070000 0.070000 0.030000 0.010000 0.890000 0.040000 0.020000 0.860000 0.080000 0.100000 0.140000 0.050000 0.710000 0.020000 0.940000 0.020000 0.020000 0.030303 0.131313 0.010101 0.828283 0.029703 0.564356 0.019802 0.386139 0.320000 0.080000 0.360000 0.240000 0.470000 0.010000 0.110000 0.410000 Consensus sequence: MRCAGRGAAACCCTGTCTYDW Reserve complement motif 0.410000 0.010000 0.110000 0.470000 0.320000 0.360000 0.080000 0.240000 0.029703 0.019802 0.564356 0.386139 0.828283 0.131313 0.010101 0.030303 0.020000 0.020000 0.940000 0.020000 0.710000 0.140000 0.050000 0.100000 0.040000 0.860000 0.020000 0.080000 0.890000 0.030000 0.010000 0.070000 0.020000 0.010000 0.900000 0.070000 0.030000 0.010000 0.870000 0.090000 0.010000 0.030000 0.900000 0.060000 0.060000 0.030000 0.020000 0.890000 0.020000 0.030000 0.150000 0.800000 0.040000 0.020000 0.030000 0.910000 0.030303 0.888889 0.070707 0.010101 0.445545 0.455446 0.009901 0.089109 0.267327 0.584158 0.039604 0.108911 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.280000 0.020000 0.690000 0.010000 0.059406 0.009901 0.425743 0.504950 0.190000 0.340000 0.010000 0.460000 Consensus sequence: WHKAGACAGGGTTTCMCTGKY ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 27 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 2 21 0.037937 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB -WHKAGACAGGGTTTCMCTGKY- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_primaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 3 21 0.042825 Species: Mus musculus Original motif 0.204923 0.208846 0.365383 0.220848 0.294304 0.300143 0.167287 0.238266 0.109711 0.619514 0.117379 0.153396 0.178979 0.378580 0.230177 0.212264 0.159594 0.542602 0.118178 0.179627 0.125206 0.430074 0.151826 0.292894 0.097692 0.709845 0.116956 0.075506 0.148292 0.565912 0.037632 0.248164 0.077951 0.034190 0.855503 0.032356 0.001657 0.001061 0.971877 0.025405 0.001926 0.001084 0.991712 0.005278 0.033031 0.012001 0.057796 0.897171 0.002723 0.002647 0.993348 0.001281 0.003261 0.000963 0.987199 0.008577 0.000611 0.090925 0.074857 0.833608 0.015299 0.978878 0.004949 0.000874 0.013368 0.600902 0.033485 0.352245 0.231949 0.149575 0.118804 0.499672 0.267580 0.186002 0.371242 0.175176 0.264884 0.223483 0.110082 0.401551 0.221365 0.170121 0.179559 0.428955 0.112997 0.692930 0.139981 0.054092 0.460305 0.207883 0.155111 0.176702 Consensus sequence: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH Reverse complement motif 0.176702 0.207883 0.155111 0.460305 0.112997 0.139981 0.692930 0.054092 0.428955 0.170121 0.179559 0.221365 0.401551 0.223483 0.110082 0.264884 0.267580 0.371242 0.186002 0.175176 0.499672 0.149575 0.118804 0.231949 0.013368 0.033485 0.600902 0.352245 0.015299 0.004949 0.978878 0.000874 0.833608 0.090925 0.074857 0.000611 0.003261 0.987199 0.000963 0.008577 0.002723 0.993348 0.002647 0.001281 0.897171 0.012001 0.057796 0.033031 0.001926 0.991712 0.001084 0.005278 0.001657 0.971877 0.001061 0.025405 0.077951 0.855503 0.034190 0.032356 0.148292 0.037632 0.565912 0.248164 0.097692 0.116956 0.709845 0.075506 0.125206 0.151826 0.430074 0.292894 0.159594 0.118178 0.542602 0.179627 0.178979 0.230177 0.378580 0.212264 0.109711 0.117379 0.619514 0.153396 0.294304 0.167287 0.300143 0.238266 0.204923 0.365383 0.208846 0.220848 Consensus sequence: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB Alignment: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB --MRCAGRGAAACCCTGTCTYDW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00098 Rfx3_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 2 21 0.043222 Species: Mus musculus Original motif 0.314514 0.275352 0.257617 0.152518 0.126939 0.598294 0.130576 0.144192 0.102265 0.155334 0.177957 0.564445 0.129288 0.282678 0.326990 0.261044 0.318166 0.227823 0.175681 0.278330 0.109019 0.380838 0.278328 0.231815 0.226145 0.289206 0.291300 0.193348 0.035863 0.844339 0.072582 0.047216 0.223793 0.187244 0.088092 0.500871 0.039800 0.029681 0.026201 0.904317 0.298298 0.032147 0.654746 0.014809 0.014729 0.022023 0.944826 0.018422 0.485114 0.004925 0.013785 0.496176 0.035708 0.020381 0.240804 0.703108 0.951152 0.012738 0.017886 0.018224 0.023713 0.944394 0.009538 0.022355 0.291067 0.385205 0.232388 0.091339 0.340334 0.199588 0.311526 0.148552 0.198713 0.472138 0.178319 0.150830 0.321155 0.269932 0.311301 0.097612 0.412646 0.195252 0.231950 0.160152 0.297134 0.180928 0.250400 0.271538 0.151169 0.305386 0.358574 0.184871 Consensus sequence: VCTBHBVCTTGGWTACVVVVVDB Reverse complement motif 0.151169 0.358574 0.305386 0.184871 0.271538 0.180928 0.250400 0.297134 0.160152 0.195252 0.231950 0.412646 0.097612 0.269932 0.311301 0.321155 0.198713 0.178319 0.472138 0.150830 0.148552 0.199588 0.311526 0.340334 0.291067 0.232388 0.385205 0.091339 0.023713 0.009538 0.944394 0.022355 0.018224 0.012738 0.017886 0.951152 0.703108 0.020381 0.240804 0.035708 0.496176 0.004925 0.013785 0.485114 0.014729 0.944826 0.022023 0.018422 0.298298 0.654746 0.032147 0.014809 0.904317 0.029681 0.026201 0.039800 0.500871 0.187244 0.088092 0.223793 0.035863 0.072582 0.844339 0.047216 0.226145 0.291300 0.289206 0.193348 0.109019 0.278328 0.380838 0.231815 0.278330 0.227823 0.175681 0.318166 0.129288 0.326990 0.282678 0.261044 0.564445 0.155334 0.177957 0.102265 0.126939 0.130576 0.598294 0.144192 0.152518 0.275352 0.257617 0.314514 Consensus sequence: BDBBVBVGTAWCCAAGVBHBAGB Alignment: VCTBHBVCTTGGWTACVVVVVDB -WHKAGACAGGGTTTCMCTGKY- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v015681_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 1 21 0.045419 Species: Mus musculus Original motif 0.331499 0.188505 0.182841 0.297156 0.328961 0.213025 0.273530 0.184484 0.197213 0.129292 0.524914 0.148581 0.274491 0.226406 0.312118 0.186986 0.103231 0.393726 0.364988 0.138055 0.552594 0.166422 0.186262 0.094722 0.157618 0.064773 0.616497 0.161112 0.139166 0.176098 0.621185 0.063551 0.748420 0.062398 0.012447 0.176735 0.116584 0.009438 0.860326 0.013653 0.005030 0.003646 0.974877 0.016447 0.055257 0.007181 0.921760 0.015802 0.032748 0.058249 0.052709 0.856293 0.105606 0.872231 0.014370 0.007793 0.019480 0.497379 0.125899 0.357242 0.478582 0.269713 0.061464 0.190242 0.253985 0.287006 0.201320 0.257689 0.319384 0.210231 0.175842 0.294543 0.222123 0.287802 0.201294 0.288782 0.139951 0.376041 0.081133 0.402875 0.213450 0.343835 0.383676 0.059039 0.322294 0.355918 0.148062 0.173725 Consensus sequence: HVGVSAGGAGGGTCYHHHHYVH Reverse complement motif 0.322294 0.148062 0.355918 0.173725 0.213450 0.383676 0.343835 0.059039 0.402875 0.376041 0.081133 0.139951 0.288782 0.287802 0.201294 0.222123 0.294543 0.210231 0.175842 0.319384 0.253985 0.201320 0.287006 0.257689 0.190242 0.269713 0.061464 0.478582 0.019480 0.125899 0.497379 0.357242 0.105606 0.014370 0.872231 0.007793 0.856293 0.058249 0.052709 0.032748 0.055257 0.921760 0.007181 0.015802 0.005030 0.974877 0.003646 0.016447 0.116584 0.860326 0.009438 0.013653 0.176735 0.062398 0.012447 0.748420 0.139166 0.621185 0.176098 0.063551 0.157618 0.616497 0.064773 0.161112 0.094722 0.166422 0.186262 0.552594 0.103231 0.364988 0.393726 0.138055 0.274491 0.312118 0.226406 0.186986 0.197213 0.524914 0.129292 0.148581 0.184484 0.213025 0.273530 0.328961 0.297156 0.188505 0.182841 0.331499 Consensus sequence: DVMHHDHKGACCCTCCTSVCBH Alignment: DVMHHDHKGACCCTCCTSVCBH MRCAGRGAAACCCTGTCTYDW- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00032 Gata3_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 2 21 0.049119 Species: Mus musculus Original motif 0.177641 0.319872 0.115137 0.387350 0.136644 0.182137 0.205873 0.475347 0.254263 0.244280 0.165207 0.336250 0.240415 0.207557 0.237497 0.314530 0.271041 0.214702 0.364395 0.149863 0.095475 0.320104 0.191738 0.392682 0.500902 0.142722 0.026556 0.329820 0.051221 0.023698 0.897245 0.027836 0.922410 0.027509 0.024058 0.026023 0.030735 0.070903 0.024248 0.874114 0.242120 0.231992 0.225143 0.300745 0.106956 0.220471 0.283490 0.389083 0.152079 0.165830 0.135066 0.547025 0.839205 0.051581 0.060119 0.049095 0.041204 0.069147 0.070830 0.818819 0.051861 0.848177 0.027599 0.072363 0.383793 0.016807 0.397470 0.201931 0.381899 0.215846 0.255908 0.146347 0.094792 0.358651 0.280905 0.265652 0.296132 0.181545 0.178433 0.343890 0.301997 0.254722 0.108566 0.334714 0.349481 0.270693 0.137507 0.242319 Consensus sequence: HBHDVBWGATHBTATCRVBHHH Reverse complement motif 0.242319 0.270693 0.137507 0.349481 0.334714 0.254722 0.108566 0.301997 0.343890 0.181545 0.178433 0.296132 0.094792 0.280905 0.358651 0.265652 0.146347 0.215846 0.255908 0.381899 0.383793 0.397470 0.016807 0.201931 0.051861 0.027599 0.848177 0.072363 0.818819 0.069147 0.070830 0.041204 0.049095 0.051581 0.060119 0.839205 0.547025 0.165830 0.135066 0.152079 0.389083 0.220471 0.283490 0.106956 0.300745 0.231992 0.225143 0.242120 0.874114 0.070903 0.024248 0.030735 0.026023 0.027509 0.024058 0.922410 0.051221 0.897245 0.023698 0.027836 0.329820 0.142722 0.026556 0.500902 0.392682 0.320104 0.191738 0.095475 0.271041 0.364395 0.214702 0.149863 0.314530 0.207557 0.237497 0.240415 0.336250 0.244280 0.165207 0.254263 0.475347 0.182137 0.205873 0.136644 0.387350 0.319872 0.115137 0.177641 Consensus sequence: HHHBBMGATAVHATCWVVDHVH Alignment: HBHDVBWGATHBTATCRVBHHH -WHKAGACAGGGTTTCMCTGKY ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 28 Motif name: C028 Original motif 0.079208 0.495050 0.217822 0.207921 0.240000 0.430000 0.320000 0.010000 0.108911 0.198020 0.683168 0.009901 0.940000 0.010000 0.040000 0.010000 0.069307 0.336634 0.425743 0.168317 0.141414 0.464646 0.303030 0.090909 0.019802 0.633663 0.306931 0.039604 0.930000 0.010000 0.010000 0.050000 0.060000 0.450000 0.480000 0.010000 0.940594 0.009901 0.029703 0.019802 0.029703 0.267327 0.663366 0.039604 0.250000 0.490000 0.240000 0.020000 0.020000 0.620000 0.350000 0.010000 0.871287 0.029703 0.009901 0.089109 0.049505 0.267327 0.455446 0.227723 0.303030 0.252525 0.393939 0.050505 Consensus sequence: BVGASSCASAGVSABV Reserve complement motif 0.303030 0.393939 0.252525 0.050505 0.049505 0.455446 0.267327 0.227723 0.089109 0.029703 0.009901 0.871287 0.020000 0.350000 0.620000 0.010000 0.250000 0.240000 0.490000 0.020000 0.029703 0.663366 0.267327 0.039604 0.019802 0.009901 0.029703 0.940594 0.060000 0.480000 0.450000 0.010000 0.050000 0.010000 0.010000 0.930000 0.019802 0.306931 0.633663 0.039604 0.141414 0.303030 0.464646 0.090909 0.069307 0.425743 0.336634 0.168317 0.010000 0.010000 0.040000 0.940000 0.108911 0.683168 0.198020 0.009901 0.240000 0.320000 0.430000 0.010000 0.079208 0.217822 0.495050 0.207921 Consensus sequence: VBTSVCTSTGSSTCVB ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 28 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00000 Smad3_primary Original Motif Original Motif Backward 2 16 0.035172 Species: Mus musculus Original motif 0.282316 0.413385 0.114930 0.189369 0.341654 0.135011 0.267943 0.255392 0.399523 0.173081 0.168845 0.258551 0.365086 0.196360 0.211856 0.226699 0.243321 0.177839 0.224206 0.354635 0.029873 0.808479 0.036309 0.125339 0.004945 0.815465 0.040635 0.138955 0.934557 0.058944 0.005027 0.001471 0.005099 0.003998 0.986148 0.004755 0.969304 0.020594 0.001929 0.008173 0.008189 0.984816 0.004199 0.002795 0.669579 0.012182 0.282153 0.036085 0.130511 0.171241 0.334041 0.364207 0.198982 0.289660 0.252392 0.258966 0.423172 0.190978 0.164411 0.221440 0.213519 0.287388 0.294414 0.204679 0.371956 0.285061 0.150191 0.192792 Consensus sequence: HDHDDCCAGACABBHVH Reverse complement motif 0.192792 0.285061 0.150191 0.371956 0.213519 0.294414 0.287388 0.204679 0.221440 0.190978 0.164411 0.423172 0.198982 0.252392 0.289660 0.258966 0.364207 0.171241 0.334041 0.130511 0.036085 0.012182 0.282153 0.669579 0.008189 0.004199 0.984816 0.002795 0.008173 0.020594 0.001929 0.969304 0.005099 0.986148 0.003998 0.004755 0.001471 0.058944 0.005027 0.934557 0.004945 0.040635 0.815465 0.138955 0.029873 0.036309 0.808479 0.125339 0.354635 0.177839 0.224206 0.243321 0.226699 0.196360 0.211856 0.365086 0.258551 0.173081 0.168845 0.399523 0.255392 0.135011 0.267943 0.341654 0.282316 0.114930 0.413385 0.189369 Consensus sequence: HVHBVTGTCTGGDDHDD Alignment: HDHDDCCAGACABBHVH BVGASSCASAGVSABV- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 4 16 0.039357 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH ---BVGASSCASAGVSABV--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00013 Gabpa_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 1 16 0.039791 Species: Mus musculus Original motif 0.233133 0.551828 0.139009 0.076030 0.100085 0.525562 0.101688 0.272665 0.252996 0.198121 0.299171 0.249711 0.141471 0.195290 0.234560 0.428679 0.160993 0.442765 0.082653 0.313590 0.307890 0.127950 0.071713 0.492448 0.093453 0.148935 0.080288 0.677324 0.083535 0.634212 0.074652 0.207601 0.098119 0.639328 0.099957 0.162596 0.067430 0.451776 0.357188 0.123606 0.286259 0.466975 0.063013 0.183753 0.203211 0.422637 0.133368 0.240783 0.111206 0.315595 0.192833 0.380366 0.199462 0.324652 0.305491 0.170395 0.347919 0.292387 0.230724 0.128970 0.254648 0.294196 0.194942 0.256214 Consensus sequence: CYDBYWTCCSMHBVVH Reverse complement motif 0.254648 0.194942 0.294196 0.256214 0.128970 0.292387 0.230724 0.347919 0.199462 0.305491 0.324652 0.170395 0.380366 0.315595 0.192833 0.111206 0.203211 0.133368 0.422637 0.240783 0.286259 0.063013 0.466975 0.183753 0.067430 0.357188 0.451776 0.123606 0.098119 0.099957 0.639328 0.162596 0.083535 0.074652 0.634212 0.207601 0.677324 0.148935 0.080288 0.093453 0.492448 0.127950 0.071713 0.307890 0.160993 0.082653 0.442765 0.313590 0.428679 0.195290 0.234560 0.141471 0.252996 0.299171 0.198121 0.249711 0.100085 0.101688 0.525562 0.272665 0.233133 0.139009 0.551828 0.076030 Consensus sequence: DBVVDRSGGAWKVHKG Alignment: CYDBYWTCCSMHBVVH VBTSVCTSTGSSTCVB ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00011 Irf6_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 2 16 0.039989 Species: Mus musculus Original motif 0.256714 0.363080 0.149403 0.230804 0.312941 0.135162 0.190389 0.361507 0.255033 0.128823 0.354898 0.261246 0.667588 0.053933 0.205778 0.072701 0.199950 0.339707 0.114445 0.345899 0.029853 0.908514 0.006383 0.055250 0.019621 0.002231 0.976266 0.001882 0.983875 0.005320 0.008639 0.002166 0.698671 0.002741 0.006725 0.291864 0.990097 0.003609 0.003047 0.003247 0.008905 0.975208 0.011495 0.004392 0.022092 0.611448 0.018828 0.347632 0.538109 0.125313 0.241515 0.095063 0.456841 0.205124 0.177213 0.160822 0.372926 0.189134 0.195747 0.242193 0.217155 0.198027 0.300393 0.284425 0.277630 0.187849 0.237049 0.297472 Consensus sequence: HDDAHCGAAACYAVDDD Reverse complement motif 0.297472 0.187849 0.237049 0.277630 0.217155 0.300393 0.198027 0.284425 0.242193 0.189134 0.195747 0.372926 0.160822 0.205124 0.177213 0.456841 0.095063 0.125313 0.241515 0.538109 0.022092 0.018828 0.611448 0.347632 0.008905 0.011495 0.975208 0.004392 0.003247 0.003609 0.003047 0.990097 0.291864 0.002741 0.006725 0.698671 0.002166 0.005320 0.008639 0.983875 0.019621 0.976266 0.002231 0.001882 0.029853 0.006383 0.908514 0.055250 0.345899 0.339707 0.114445 0.199950 0.072701 0.053933 0.205778 0.667588 0.255033 0.354898 0.128823 0.261246 0.361507 0.135162 0.190389 0.312941 0.256714 0.149403 0.363080 0.230804 Consensus sequence: DHDBTKGTTTCGHTHDD Alignment: DHDBTKGTTTCGHTHDD -VBTSVCTSTGSSTCVB ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 5 16 0.040818 Species: Mus musculus Original motif 0.067627 0.131333 0.654425 0.146615 0.156488 0.114442 0.145630 0.583441 0.206450 0.265630 0.358017 0.169903 0.090729 0.460713 0.274712 0.173847 0.285994 0.099998 0.154485 0.459523 0.635908 0.184787 0.072982 0.106323 0.748421 0.039204 0.092605 0.119769 0.081342 0.061327 0.044532 0.812799 0.143120 0.043879 0.024216 0.788785 0.247544 0.092102 0.621453 0.038901 0.295531 0.036295 0.027594 0.640580 0.194561 0.305468 0.339916 0.160055 0.175038 0.193568 0.101212 0.530182 0.145226 0.167488 0.559871 0.127415 0.271501 0.237429 0.206701 0.284369 0.216834 0.109191 0.569605 0.104370 0.182624 0.177160 0.300475 0.339742 0.331737 0.198645 0.265137 0.204482 0.230155 0.359365 0.183450 0.227029 0.056581 0.067297 0.463052 0.413070 0.198891 0.324626 0.304424 0.172059 0.181968 0.287547 0.202419 0.328066 Consensus sequence: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB Reverse complement motif 0.328066 0.287547 0.202419 0.181968 0.198891 0.304424 0.324626 0.172059 0.056581 0.463052 0.067297 0.413070 0.230155 0.183450 0.359365 0.227029 0.204482 0.198645 0.265137 0.331737 0.339742 0.177160 0.300475 0.182624 0.216834 0.569605 0.109191 0.104370 0.284369 0.237429 0.206701 0.271501 0.145226 0.559871 0.167488 0.127415 0.530182 0.193568 0.101212 0.175038 0.194561 0.339916 0.305468 0.160055 0.640580 0.036295 0.027594 0.295531 0.247544 0.621453 0.092102 0.038901 0.788785 0.043879 0.024216 0.143120 0.812799 0.061327 0.044532 0.081342 0.119769 0.039204 0.092605 0.748421 0.106323 0.184787 0.072982 0.635908 0.459523 0.099998 0.154485 0.285994 0.090729 0.274712 0.460713 0.173847 0.206450 0.358017 0.265630 0.169903 0.583441 0.114442 0.145630 0.156488 0.067627 0.654425 0.131333 0.146615 Consensus sequence: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC Alignment: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB --VBTSVCTSTGSSTCVB---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 29 Motif name: C029 Original motif 0.831683 0.019802 0.128713 0.019802 0.760000 0.010000 0.200000 0.030000 0.370000 0.080000 0.100000 0.450000 0.380000 0.120000 0.080000 0.420000 0.410000 0.080000 0.130000 0.380000 0.792079 0.128713 0.069307 0.009901 0.940000 0.010000 0.040000 0.010000 0.880000 0.010000 0.080000 0.030000 0.880000 0.030000 0.080000 0.010000 0.434343 0.151515 0.020202 0.393939 0.410000 0.030000 0.140000 0.420000 0.340000 0.060000 0.150000 0.450000 0.831683 0.019802 0.138614 0.009901 0.750000 0.020000 0.220000 0.010000 Consensus sequence: AAWWWAAAAWWWAA Reserve complement motif 0.010000 0.020000 0.220000 0.750000 0.009901 0.019802 0.138614 0.831683 0.450000 0.060000 0.150000 0.340000 0.420000 0.030000 0.140000 0.410000 0.393939 0.151515 0.020202 0.434343 0.010000 0.030000 0.080000 0.880000 0.030000 0.010000 0.080000 0.880000 0.010000 0.010000 0.040000 0.940000 0.009901 0.128713 0.069307 0.792079 0.380000 0.080000 0.130000 0.410000 0.420000 0.120000 0.080000 0.380000 0.450000 0.080000 0.100000 0.370000 0.030000 0.010000 0.200000 0.760000 0.019802 0.019802 0.128713 0.831683 Consensus sequence: TTWWWTTTTWWWTT ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 29 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00121 Hoxd10 Reverse Complement Reverse Complement Backward 4 14 0.038747 Species: Mus musculus Original motif 0.405345 0.293266 0.220907 0.080482 0.398063 0.099034 0.333525 0.169378 0.049753 0.190411 0.336789 0.423048 0.243698 0.226261 0.324346 0.205696 0.030873 0.549741 0.008321 0.411065 0.714225 0.228092 0.020960 0.036723 0.833992 0.010944 0.021918 0.133146 0.008898 0.026169 0.008341 0.956591 0.811684 0.004889 0.004751 0.178676 0.952107 0.004322 0.004587 0.038984 0.925365 0.008360 0.006811 0.059464 0.850659 0.058250 0.065237 0.025855 0.193369 0.242985 0.049515 0.514131 0.266774 0.080601 0.239781 0.412844 0.335522 0.125500 0.188170 0.350809 0.407171 0.120540 0.187300 0.284989 0.281181 0.242348 0.160247 0.316224 Consensus sequence: VDKVYAATAAAATDDDH Reverse complement motif 0.316224 0.242348 0.160247 0.281181 0.284989 0.120540 0.187300 0.407171 0.350809 0.125500 0.188170 0.335522 0.412844 0.080601 0.239781 0.266774 0.514131 0.242985 0.049515 0.193369 0.025855 0.058250 0.065237 0.850659 0.059464 0.008360 0.006811 0.925365 0.038984 0.004322 0.004587 0.952107 0.178676 0.004889 0.004751 0.811684 0.956591 0.026169 0.008341 0.008898 0.133146 0.010944 0.021918 0.833992 0.036723 0.228092 0.020960 0.714225 0.030873 0.008321 0.549741 0.411065 0.243698 0.324346 0.226261 0.205696 0.423048 0.190411 0.336789 0.049753 0.169378 0.099034 0.333525 0.398063 0.080482 0.293266 0.220907 0.405345 Consensus sequence: HDDDATTTTATTKVRDB Alignment: HDDDATTTTATTKVRDB TTWWWTTTTWWWTT--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00090 Elf3_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 4 14 0.041495 Species: Mus musculus Original motif 0.155083 0.152982 0.490906 0.201030 0.123195 0.312681 0.220770 0.343354 0.110252 0.131358 0.153983 0.604406 0.216489 0.490160 0.101348 0.192003 0.396130 0.292429 0.103252 0.208189 0.634770 0.070898 0.070668 0.223664 0.667102 0.099915 0.067576 0.165407 0.625495 0.095579 0.039353 0.239573 0.717478 0.093228 0.024737 0.164558 0.729965 0.048628 0.024557 0.196850 0.670909 0.118718 0.043692 0.166681 0.689441 0.050145 0.038829 0.221584 0.506735 0.159498 0.095635 0.238132 0.406093 0.298915 0.149902 0.145090 0.193913 0.282078 0.096706 0.427303 0.272324 0.154790 0.262469 0.310417 0.224484 0.458724 0.060144 0.256647 Consensus sequence: DBTHHAAAAAAAAVHDH Reverse complement motif 0.224484 0.060144 0.458724 0.256647 0.310417 0.154790 0.262469 0.272324 0.427303 0.282078 0.096706 0.193913 0.145090 0.298915 0.149902 0.406093 0.238132 0.159498 0.095635 0.506735 0.221584 0.050145 0.038829 0.689441 0.166681 0.118718 0.043692 0.670909 0.196850 0.048628 0.024557 0.729965 0.164558 0.093228 0.024737 0.717478 0.239573 0.095579 0.039353 0.625495 0.165407 0.099915 0.067576 0.667102 0.223664 0.070898 0.070668 0.634770 0.208189 0.292429 0.103252 0.396130 0.216489 0.101348 0.490160 0.192003 0.604406 0.131358 0.153983 0.110252 0.343354 0.312681 0.220770 0.123195 0.155083 0.490906 0.152982 0.201030 Consensus sequence: DDHBTTTTTTTTHDAVH Alignment: DDHBTTTTTTTTHDAVH TTWWWTTTTWWWTT--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00077 Srf_secondary Original Motif Original Motif Backward 1 14 0.041504 Species: Mus musculus Original motif 0.162968 0.284828 0.440984 0.111220 0.151392 0.200635 0.205316 0.442657 0.267215 0.083669 0.192498 0.456618 0.332771 0.180711 0.200027 0.286491 0.509370 0.102954 0.242569 0.145107 0.666262 0.077309 0.154466 0.101962 0.737968 0.113335 0.100401 0.048296 0.658878 0.141580 0.134033 0.065510 0.766115 0.094051 0.069763 0.070072 0.755621 0.088491 0.044802 0.111086 0.749083 0.135917 0.047510 0.067490 0.663231 0.176795 0.028134 0.131839 0.553358 0.277659 0.038655 0.130328 0.392578 0.314083 0.209844 0.083495 0.198462 0.237132 0.239466 0.324940 0.275121 0.210087 0.194779 0.320013 0.287748 0.277395 0.142704 0.292154 Consensus sequence: VBDDAAAAAAAAMVBHH Reverse complement motif 0.292154 0.277395 0.142704 0.287748 0.320013 0.210087 0.194779 0.275121 0.324940 0.237132 0.239466 0.198462 0.083495 0.314083 0.209844 0.392578 0.130328 0.277659 0.038655 0.553358 0.131839 0.176795 0.028134 0.663231 0.067490 0.135917 0.047510 0.749083 0.111086 0.088491 0.044802 0.755621 0.070072 0.094051 0.069763 0.766115 0.065510 0.141580 0.134033 0.658878 0.048296 0.113335 0.100401 0.737968 0.101962 0.077309 0.154466 0.666262 0.145107 0.102954 0.242569 0.509370 0.286491 0.180711 0.200027 0.332771 0.456618 0.083669 0.192498 0.267215 0.442657 0.200635 0.205316 0.151392 0.162968 0.440984 0.284828 0.111220 Consensus sequence: HHVBYTTTTTTTTDDVV Alignment: VBDDAAAAAAAAMVBHH ---AAWWWAAAAWWWAA ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00061 Foxl1_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 3 14 0.043485 Species: Mus musculus Original motif 0.560226 0.121586 0.083231 0.234957 0.318077 0.149137 0.179955 0.352831 0.482497 0.118420 0.173594 0.225488 0.200166 0.160901 0.191493 0.447440 0.033691 0.569719 0.018901 0.377690 0.638020 0.166545 0.021254 0.174181 0.573953 0.105729 0.009308 0.311010 0.890518 0.053364 0.013424 0.042694 0.910758 0.028166 0.032648 0.028428 0.013358 0.738707 0.023981 0.223953 0.911783 0.018754 0.031898 0.037564 0.702891 0.068940 0.076823 0.151346 0.445507 0.320769 0.057216 0.176507 0.587798 0.129586 0.140592 0.142024 0.258981 0.330939 0.167334 0.242747 0.362022 0.333796 0.145861 0.158320 Consensus sequence: ADDDYAWAACAAMAHH Reverse complement motif 0.158320 0.333796 0.145861 0.362022 0.258981 0.167334 0.330939 0.242747 0.142024 0.129586 0.140592 0.587798 0.176507 0.320769 0.057216 0.445507 0.151346 0.068940 0.076823 0.702891 0.037564 0.018754 0.031898 0.911783 0.013358 0.023981 0.738707 0.223953 0.028428 0.028166 0.032648 0.910758 0.042694 0.053364 0.013424 0.890518 0.311010 0.105729 0.009308 0.573953 0.174181 0.166545 0.021254 0.638020 0.033691 0.018901 0.569719 0.377690 0.447440 0.160901 0.191493 0.200166 0.225488 0.118420 0.173594 0.482497 0.352831 0.149137 0.179955 0.318077 0.234957 0.121586 0.083231 0.560226 Consensus sequence: HDTYTTGTTWTKDDDT Alignment: ADDDYAWAACAAMAHH AAWWWAAAAWWWAA-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00255 Dbx1 Original Motif Original Motif Forward 2 14 0.045306 Species: Mus musculus Original motif 0.193358 0.228955 0.160692 0.416995 0.611960 0.068099 0.048494 0.271446 0.459770 0.057385 0.307824 0.175021 0.226103 0.127408 0.101076 0.545413 0.241226 0.228640 0.067165 0.462969 0.621421 0.137382 0.078412 0.162785 0.737972 0.031899 0.051833 0.178295 0.110802 0.098497 0.073668 0.717033 0.129567 0.110629 0.036048 0.723756 0.729342 0.031636 0.088480 0.150541 0.540257 0.104927 0.048065 0.306750 0.195987 0.148698 0.098709 0.556606 0.587529 0.072583 0.170635 0.169252 0.497416 0.161804 0.219409 0.121371 0.278831 0.114362 0.139037 0.467771 0.297462 0.189119 0.187754 0.325665 0.397268 0.140582 0.287428 0.174722 Consensus sequence: HARTHAATTAWTAVDHD Reverse complement motif 0.174722 0.140582 0.287428 0.397268 0.325665 0.189119 0.187754 0.297462 0.467771 0.114362 0.139037 0.278831 0.121371 0.161804 0.219409 0.497416 0.169252 0.072583 0.170635 0.587529 0.556606 0.148698 0.098709 0.195987 0.306750 0.104927 0.048065 0.540257 0.150541 0.031636 0.088480 0.729342 0.723756 0.110629 0.036048 0.129567 0.717033 0.098497 0.073668 0.110802 0.178295 0.031899 0.051833 0.737972 0.162785 0.137382 0.078412 0.621421 0.462969 0.228640 0.067165 0.241226 0.545413 0.127408 0.101076 0.226103 0.175021 0.057385 0.307824 0.459770 0.271446 0.068099 0.048494 0.611960 0.416995 0.228955 0.160692 0.193358 Consensus sequence: DHDBTAWTAATTHAKTH Alignment: HARTHAATTAWTAVDHD -AAWWWAAAAWWWAA-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 30 Motif name: C030 Original motif 0.420000 0.090000 0.060000 0.430000 0.210000 0.340000 0.020000 0.430000 0.740000 0.230000 0.020000 0.010000 0.680000 0.210000 0.100000 0.010000 0.560000 0.210000 0.050000 0.180000 0.540000 0.010000 0.250000 0.200000 0.670000 0.110000 0.120000 0.100000 0.540000 0.390000 0.040000 0.030000 0.820000 0.160000 0.010000 0.010000 0.676768 0.262626 0.050505 0.010101 0.600000 0.280000 0.030000 0.090000 0.555556 0.010101 0.181818 0.252525 0.676768 0.161616 0.050505 0.111111 0.650000 0.280000 0.020000 0.050000 0.762376 0.168317 0.019802 0.049505 0.850000 0.030000 0.070000 0.050000 0.330000 0.160000 0.010000 0.500000 0.540000 0.230000 0.100000 0.130000 0.450000 0.380000 0.090000 0.080000 Consensus sequence: WYAAAAAMAAAAAAAAWAM Reserve complement motif 0.080000 0.380000 0.090000 0.450000 0.130000 0.230000 0.100000 0.540000 0.500000 0.160000 0.010000 0.330000 0.050000 0.030000 0.070000 0.850000 0.049505 0.168317 0.019802 0.762376 0.050000 0.280000 0.020000 0.650000 0.111111 0.161616 0.050505 0.676768 0.252525 0.010101 0.181818 0.555556 0.090000 0.280000 0.030000 0.600000 0.010101 0.262626 0.050505 0.676768 0.010000 0.160000 0.010000 0.820000 0.030000 0.390000 0.040000 0.540000 0.100000 0.110000 0.120000 0.670000 0.200000 0.010000 0.250000 0.540000 0.180000 0.210000 0.050000 0.560000 0.010000 0.210000 0.100000 0.680000 0.010000 0.230000 0.020000 0.740000 0.430000 0.340000 0.020000 0.210000 0.430000 0.090000 0.060000 0.420000 Consensus sequence: YTWTTTTTTTTYTTTTTMW ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 30 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_primary Original Motif Original Motif Backward 2 19 0.036929 Species: Mus musculus Original motif 0.360997 0.300272 0.115555 0.223177 0.309749 0.228429 0.166233 0.295589 0.149419 0.176868 0.240155 0.433558 0.379704 0.095791 0.276373 0.248133 0.394549 0.174184 0.130641 0.300626 0.443749 0.070776 0.211081 0.274393 0.364301 0.074356 0.370406 0.190936 0.791976 0.038475 0.093390 0.076159 0.963721 0.001826 0.002456 0.031997 0.004516 0.954596 0.008092 0.032796 0.981080 0.002062 0.002161 0.014697 0.986185 0.001846 0.006976 0.004992 0.059567 0.003649 0.002189 0.934595 0.495328 0.024257 0.240450 0.239965 0.305027 0.094878 0.526069 0.074025 0.418442 0.196237 0.158323 0.226998 0.336713 0.220452 0.191155 0.251680 0.192296 0.300342 0.169047 0.338315 0.240387 0.144634 0.128513 0.486465 0.290763 0.271259 0.116600 0.321377 0.224825 0.296233 0.229255 0.249687 0.493240 0.171285 0.075148 0.260326 Consensus sequence: HHBDHDDAACAATDRHHHHHBW Reverse complement motif 0.260326 0.171285 0.075148 0.493240 0.224825 0.229255 0.296233 0.249687 0.321377 0.271259 0.116600 0.290763 0.486465 0.144634 0.128513 0.240387 0.338315 0.300342 0.169047 0.192296 0.251680 0.220452 0.191155 0.336713 0.226998 0.196237 0.158323 0.418442 0.305027 0.526069 0.094878 0.074025 0.239965 0.024257 0.240450 0.495328 0.934595 0.003649 0.002189 0.059567 0.004992 0.001846 0.006976 0.986185 0.014697 0.002062 0.002161 0.981080 0.004516 0.008092 0.954596 0.032796 0.031997 0.001826 0.002456 0.963721 0.076159 0.038475 0.093390 0.791976 0.364301 0.370406 0.074356 0.190936 0.274393 0.070776 0.211081 0.443749 0.300626 0.174184 0.130641 0.394549 0.248133 0.095791 0.276373 0.379704 0.433558 0.176868 0.240155 0.149419 0.295589 0.228429 0.166233 0.309749 0.223177 0.300272 0.115555 0.360997 Consensus sequence: WBHHHHHMDATTGTTHDHDVHH Alignment: HHBDHDDAACAATDRHHHHHBW --WYAAAAAMAAAAAAAAWAM- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 4 19 0.039952 Species: Mus musculus Original motif 0.067627 0.131333 0.654425 0.146615 0.156488 0.114442 0.145630 0.583441 0.206450 0.265630 0.358017 0.169903 0.090729 0.460713 0.274712 0.173847 0.285994 0.099998 0.154485 0.459523 0.635908 0.184787 0.072982 0.106323 0.748421 0.039204 0.092605 0.119769 0.081342 0.061327 0.044532 0.812799 0.143120 0.043879 0.024216 0.788785 0.247544 0.092102 0.621453 0.038901 0.295531 0.036295 0.027594 0.640580 0.194561 0.305468 0.339916 0.160055 0.175038 0.193568 0.101212 0.530182 0.145226 0.167488 0.559871 0.127415 0.271501 0.237429 0.206701 0.284369 0.216834 0.109191 0.569605 0.104370 0.182624 0.177160 0.300475 0.339742 0.331737 0.198645 0.265137 0.204482 0.230155 0.359365 0.183450 0.227029 0.056581 0.067297 0.463052 0.413070 0.198891 0.324626 0.304424 0.172059 0.181968 0.287547 0.202419 0.328066 Consensus sequence: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB Reverse complement motif 0.328066 0.287547 0.202419 0.181968 0.198891 0.304424 0.324626 0.172059 0.056581 0.463052 0.067297 0.413070 0.230155 0.183450 0.359365 0.227029 0.204482 0.198645 0.265137 0.331737 0.339742 0.177160 0.300475 0.182624 0.216834 0.569605 0.109191 0.104370 0.284369 0.237429 0.206701 0.271501 0.145226 0.559871 0.167488 0.127415 0.530182 0.193568 0.101212 0.175038 0.194561 0.339916 0.305468 0.160055 0.640580 0.036295 0.027594 0.295531 0.247544 0.621453 0.092102 0.038901 0.788785 0.043879 0.024216 0.143120 0.812799 0.061327 0.044532 0.081342 0.119769 0.039204 0.092605 0.748421 0.106323 0.184787 0.072982 0.635908 0.459523 0.099998 0.154485 0.285994 0.090729 0.274712 0.460713 0.173847 0.206450 0.358017 0.265630 0.169903 0.583441 0.114442 0.145630 0.156488 0.067627 0.654425 0.131333 0.146615 Consensus sequence: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC Alignment: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB ---YTWTTTTTTTTYTTTTTMW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00032 Gata3_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 3 19 0.043173 Species: Mus musculus Original motif 0.151572 0.262753 0.258275 0.327401 0.221834 0.113385 0.275380 0.389400 0.297769 0.136928 0.134678 0.430625 0.270099 0.110415 0.271106 0.348380 0.265471 0.090253 0.223340 0.420936 0.616582 0.090091 0.171960 0.121367 0.197318 0.107541 0.406904 0.288237 0.798258 0.046950 0.001406 0.153385 0.003195 0.002516 0.989707 0.004582 0.991503 0.002748 0.002617 0.003132 0.005015 0.002764 0.003026 0.989195 0.948394 0.008932 0.001344 0.041330 0.973109 0.004100 0.004081 0.018710 0.040365 0.113905 0.828185 0.017545 0.736608 0.130524 0.113464 0.019404 0.415921 0.106101 0.316613 0.161365 0.376582 0.170927 0.155572 0.296919 0.137731 0.197151 0.211055 0.454064 0.324853 0.122747 0.246107 0.306293 0.462490 0.207311 0.159392 0.170807 0.380420 0.188972 0.311990 0.118618 0.222178 0.157873 0.380486 0.239463 Consensus sequence: BDHDDADAGATAAGADHBDHVD Reverse complement motif 0.222178 0.380486 0.157873 0.239463 0.118618 0.188972 0.311990 0.380420 0.170807 0.207311 0.159392 0.462490 0.306293 0.122747 0.246107 0.324853 0.454064 0.197151 0.211055 0.137731 0.296919 0.170927 0.155572 0.376582 0.161365 0.106101 0.316613 0.415921 0.019404 0.130524 0.113464 0.736608 0.040365 0.828185 0.113905 0.017545 0.018710 0.004100 0.004081 0.973109 0.041330 0.008932 0.001344 0.948394 0.989195 0.002764 0.003026 0.005015 0.003132 0.002748 0.002617 0.991503 0.003195 0.989707 0.002516 0.004582 0.153385 0.046950 0.001406 0.798258 0.197318 0.406904 0.107541 0.288237 0.121367 0.090091 0.171960 0.616582 0.420936 0.090253 0.223340 0.265471 0.348380 0.110415 0.271106 0.270099 0.430625 0.136928 0.134678 0.297769 0.389400 0.113385 0.275380 0.221834 0.327401 0.262753 0.258275 0.151572 Consensus sequence: HBHDVHDTCTTATCTHTDDHDV Alignment: HBHDVHDTCTTATCTHTDDHDV --YTWTTTTTTTTYTTTTTMW- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00032 Gata3_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 1 19 0.050366 Species: Mus musculus Original motif 0.177641 0.319872 0.115137 0.387350 0.136644 0.182137 0.205873 0.475347 0.254263 0.244280 0.165207 0.336250 0.240415 0.207557 0.237497 0.314530 0.271041 0.214702 0.364395 0.149863 0.095475 0.320104 0.191738 0.392682 0.500902 0.142722 0.026556 0.329820 0.051221 0.023698 0.897245 0.027836 0.922410 0.027509 0.024058 0.026023 0.030735 0.070903 0.024248 0.874114 0.242120 0.231992 0.225143 0.300745 0.106956 0.220471 0.283490 0.389083 0.152079 0.165830 0.135066 0.547025 0.839205 0.051581 0.060119 0.049095 0.041204 0.069147 0.070830 0.818819 0.051861 0.848177 0.027599 0.072363 0.383793 0.016807 0.397470 0.201931 0.381899 0.215846 0.255908 0.146347 0.094792 0.358651 0.280905 0.265652 0.296132 0.181545 0.178433 0.343890 0.301997 0.254722 0.108566 0.334714 0.349481 0.270693 0.137507 0.242319 Consensus sequence: HBHDVBWGATHBTATCRVBHHH Reverse complement motif 0.242319 0.270693 0.137507 0.349481 0.334714 0.254722 0.108566 0.301997 0.343890 0.181545 0.178433 0.296132 0.094792 0.280905 0.358651 0.265652 0.146347 0.215846 0.255908 0.381899 0.383793 0.397470 0.016807 0.201931 0.051861 0.027599 0.848177 0.072363 0.818819 0.069147 0.070830 0.041204 0.049095 0.051581 0.060119 0.839205 0.547025 0.165830 0.135066 0.152079 0.389083 0.220471 0.283490 0.106956 0.300745 0.231992 0.225143 0.242120 0.874114 0.070903 0.024248 0.030735 0.026023 0.027509 0.024058 0.922410 0.051221 0.897245 0.023698 0.027836 0.329820 0.142722 0.026556 0.500902 0.392682 0.320104 0.191738 0.095475 0.271041 0.364395 0.214702 0.149863 0.314530 0.207557 0.237497 0.240415 0.336250 0.244280 0.165207 0.254263 0.475347 0.182137 0.205873 0.136644 0.387350 0.319872 0.115137 0.177641 Consensus sequence: HHHBBMGATAVHATCWVVDHVH Alignment: HHHBBMGATAVHATCWVVDHVH ---WYAAAAAMAAAAAAAAWAM ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 3 19 0.050713 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH --WYAAAAAMAAAAAAAAWAM-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 31 Motif name: C031 Original motif 0.393939 0.131313 0.030303 0.444444 0.330000 0.220000 0.060000 0.390000 0.900000 0.070000 0.010000 0.020000 0.910000 0.050000 0.010000 0.030000 0.868687 0.101010 0.020202 0.010101 0.580000 0.320000 0.040000 0.060000 0.520000 0.010000 0.280000 0.190000 0.570000 0.010000 0.080000 0.340000 0.500000 0.010000 0.010000 0.480000 0.160000 0.280000 0.010000 0.550000 0.670000 0.190000 0.010000 0.130000 0.740000 0.200000 0.020000 0.040000 0.787879 0.111111 0.090909 0.010101 0.560000 0.360000 0.020000 0.060000 0.640000 0.200000 0.060000 0.100000 0.390000 0.090000 0.150000 0.370000 0.504950 0.059406 0.089109 0.346535 Consensus sequence: WHAAAMRWWYAAAMAWW Reserve complement motif 0.346535 0.059406 0.089109 0.504950 0.370000 0.090000 0.150000 0.390000 0.100000 0.200000 0.060000 0.640000 0.060000 0.360000 0.020000 0.560000 0.010101 0.111111 0.090909 0.787879 0.040000 0.200000 0.020000 0.740000 0.130000 0.190000 0.010000 0.670000 0.550000 0.280000 0.010000 0.160000 0.480000 0.010000 0.010000 0.500000 0.340000 0.010000 0.080000 0.570000 0.190000 0.010000 0.280000 0.520000 0.060000 0.320000 0.040000 0.580000 0.010101 0.101010 0.020202 0.868687 0.030000 0.050000 0.010000 0.910000 0.020000 0.070000 0.010000 0.900000 0.390000 0.220000 0.060000 0.330000 0.444444 0.131313 0.030303 0.393939 Consensus sequence: WWTYTTTMWWKYTTTHW ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 31 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00077 Srf_secondary Original Motif Original Motif Forward 1 17 0.045883 Species: Mus musculus Original motif 0.162968 0.284828 0.440984 0.111220 0.151392 0.200635 0.205316 0.442657 0.267215 0.083669 0.192498 0.456618 0.332771 0.180711 0.200027 0.286491 0.509370 0.102954 0.242569 0.145107 0.666262 0.077309 0.154466 0.101962 0.737968 0.113335 0.100401 0.048296 0.658878 0.141580 0.134033 0.065510 0.766115 0.094051 0.069763 0.070072 0.755621 0.088491 0.044802 0.111086 0.749083 0.135917 0.047510 0.067490 0.663231 0.176795 0.028134 0.131839 0.553358 0.277659 0.038655 0.130328 0.392578 0.314083 0.209844 0.083495 0.198462 0.237132 0.239466 0.324940 0.275121 0.210087 0.194779 0.320013 0.287748 0.277395 0.142704 0.292154 Consensus sequence: VBDDAAAAAAAAMVBHH Reverse complement motif 0.292154 0.277395 0.142704 0.287748 0.320013 0.210087 0.194779 0.275121 0.324940 0.237132 0.239466 0.198462 0.083495 0.314083 0.209844 0.392578 0.130328 0.277659 0.038655 0.553358 0.131839 0.176795 0.028134 0.663231 0.067490 0.135917 0.047510 0.749083 0.111086 0.088491 0.044802 0.755621 0.070072 0.094051 0.069763 0.766115 0.065510 0.141580 0.134033 0.658878 0.048296 0.113335 0.100401 0.737968 0.101962 0.077309 0.154466 0.666262 0.145107 0.102954 0.242569 0.509370 0.286491 0.180711 0.200027 0.332771 0.456618 0.083669 0.192498 0.267215 0.442657 0.200635 0.205316 0.151392 0.162968 0.440984 0.284828 0.111220 Consensus sequence: HHVBYTTTTTTTTDDVV Alignment: VBDDAAAAAAAAMVBHH WHAAAMRWWYAAAMAWW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00090 Elf3_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 1 17 0.048819 Species: Mus musculus Original motif 0.155083 0.152982 0.490906 0.201030 0.123195 0.312681 0.220770 0.343354 0.110252 0.131358 0.153983 0.604406 0.216489 0.490160 0.101348 0.192003 0.396130 0.292429 0.103252 0.208189 0.634770 0.070898 0.070668 0.223664 0.667102 0.099915 0.067576 0.165407 0.625495 0.095579 0.039353 0.239573 0.717478 0.093228 0.024737 0.164558 0.729965 0.048628 0.024557 0.196850 0.670909 0.118718 0.043692 0.166681 0.689441 0.050145 0.038829 0.221584 0.506735 0.159498 0.095635 0.238132 0.406093 0.298915 0.149902 0.145090 0.193913 0.282078 0.096706 0.427303 0.272324 0.154790 0.262469 0.310417 0.224484 0.458724 0.060144 0.256647 Consensus sequence: DBTHHAAAAAAAAVHDH Reverse complement motif 0.224484 0.060144 0.458724 0.256647 0.310417 0.154790 0.262469 0.272324 0.427303 0.282078 0.096706 0.193913 0.145090 0.298915 0.149902 0.406093 0.238132 0.159498 0.095635 0.506735 0.221584 0.050145 0.038829 0.689441 0.166681 0.118718 0.043692 0.670909 0.196850 0.048628 0.024557 0.729965 0.164558 0.093228 0.024737 0.717478 0.239573 0.095579 0.039353 0.625495 0.165407 0.099915 0.067576 0.667102 0.223664 0.070898 0.070668 0.634770 0.208189 0.292429 0.103252 0.396130 0.216489 0.101348 0.490160 0.192003 0.604406 0.131358 0.153983 0.110252 0.343354 0.312681 0.220770 0.123195 0.155083 0.490906 0.152982 0.201030 Consensus sequence: DDHBTTTTTTTTHDAVH Alignment: DDHBTTTTTTTTHDAVH WWTYTTTMWWKYTTTHW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 6 17 0.050140 Species: Mus musculus Original motif 0.360997 0.300272 0.115555 0.223177 0.309749 0.228429 0.166233 0.295589 0.149419 0.176868 0.240155 0.433558 0.379704 0.095791 0.276373 0.248133 0.394549 0.174184 0.130641 0.300626 0.443749 0.070776 0.211081 0.274393 0.364301 0.074356 0.370406 0.190936 0.791976 0.038475 0.093390 0.076159 0.963721 0.001826 0.002456 0.031997 0.004516 0.954596 0.008092 0.032796 0.981080 0.002062 0.002161 0.014697 0.986185 0.001846 0.006976 0.004992 0.059567 0.003649 0.002189 0.934595 0.495328 0.024257 0.240450 0.239965 0.305027 0.094878 0.526069 0.074025 0.418442 0.196237 0.158323 0.226998 0.336713 0.220452 0.191155 0.251680 0.192296 0.300342 0.169047 0.338315 0.240387 0.144634 0.128513 0.486465 0.290763 0.271259 0.116600 0.321377 0.224825 0.296233 0.229255 0.249687 0.493240 0.171285 0.075148 0.260326 Consensus sequence: HHBDHDDAACAATDRHHHHHBW Reverse complement motif 0.260326 0.171285 0.075148 0.493240 0.224825 0.229255 0.296233 0.249687 0.321377 0.271259 0.116600 0.290763 0.486465 0.144634 0.128513 0.240387 0.338315 0.300342 0.169047 0.192296 0.251680 0.220452 0.191155 0.336713 0.226998 0.196237 0.158323 0.418442 0.305027 0.526069 0.094878 0.074025 0.239965 0.024257 0.240450 0.495328 0.934595 0.003649 0.002189 0.059567 0.004992 0.001846 0.006976 0.986185 0.014697 0.002062 0.002161 0.981080 0.004516 0.008092 0.954596 0.032796 0.031997 0.001826 0.002456 0.963721 0.076159 0.038475 0.093390 0.791976 0.364301 0.370406 0.074356 0.190936 0.274393 0.070776 0.211081 0.443749 0.300626 0.174184 0.130641 0.394549 0.248133 0.095791 0.276373 0.379704 0.433558 0.176868 0.240155 0.149419 0.295589 0.228429 0.166233 0.309749 0.223177 0.300272 0.115555 0.360997 Consensus sequence: WBHHHHHMDATTGTTHDHDVHH Alignment: WBHHHHHMDATTGTTHDHDVHH WWTYTTTMWWKYTTTHW----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00255 Dbx1 Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 17 0.053948 Species: Mus musculus Original motif 0.193358 0.228955 0.160692 0.416995 0.611960 0.068099 0.048494 0.271446 0.459770 0.057385 0.307824 0.175021 0.226103 0.127408 0.101076 0.545413 0.241226 0.228640 0.067165 0.462969 0.621421 0.137382 0.078412 0.162785 0.737972 0.031899 0.051833 0.178295 0.110802 0.098497 0.073668 0.717033 0.129567 0.110629 0.036048 0.723756 0.729342 0.031636 0.088480 0.150541 0.540257 0.104927 0.048065 0.306750 0.195987 0.148698 0.098709 0.556606 0.587529 0.072583 0.170635 0.169252 0.497416 0.161804 0.219409 0.121371 0.278831 0.114362 0.139037 0.467771 0.297462 0.189119 0.187754 0.325665 0.397268 0.140582 0.287428 0.174722 Consensus sequence: HARTHAATTAWTAVDHD Reverse complement motif 0.174722 0.140582 0.287428 0.397268 0.325665 0.189119 0.187754 0.297462 0.467771 0.114362 0.139037 0.278831 0.121371 0.161804 0.219409 0.497416 0.169252 0.072583 0.170635 0.587529 0.556606 0.148698 0.098709 0.195987 0.306750 0.104927 0.048065 0.540257 0.150541 0.031636 0.088480 0.729342 0.723756 0.110629 0.036048 0.129567 0.717033 0.098497 0.073668 0.110802 0.178295 0.031899 0.051833 0.737972 0.162785 0.137382 0.078412 0.621421 0.462969 0.228640 0.067165 0.241226 0.545413 0.127408 0.101076 0.226103 0.175021 0.057385 0.307824 0.459770 0.271446 0.068099 0.048494 0.611960 0.416995 0.228955 0.160692 0.193358 Consensus sequence: DHDBTAWTAATTHAKTH Alignment: DHDBTAWTAATTHAKTH WWTYTTTMWWKYTTTHW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00078 Arid3a_primaryReverse Complement Reverse Complement Forward 1 17 0.054529 Species: Mus musculus Original motif 0.179646 0.266649 0.382823 0.170882 0.210101 0.218431 0.353260 0.218209 0.182980 0.213084 0.340966 0.262971 0.218158 0.203798 0.187600 0.390444 0.087071 0.110887 0.082136 0.719907 0.043529 0.095870 0.045570 0.815030 0.695645 0.010408 0.181644 0.112302 0.886232 0.003541 0.004701 0.105526 0.105526 0.004701 0.003541 0.886232 0.112302 0.181644 0.010408 0.695645 0.815030 0.045570 0.095870 0.043529 0.719907 0.082136 0.110887 0.087071 0.598597 0.045843 0.085320 0.270240 0.469818 0.282557 0.057345 0.190280 0.233954 0.229161 0.190290 0.346595 0.267839 0.231747 0.133766 0.366648 0.240560 0.300738 0.201112 0.257590 Consensus sequence: VBBHTTAATTAAAMHHH Reverse complement motif 0.240560 0.201112 0.300738 0.257590 0.366648 0.231747 0.133766 0.267839 0.346595 0.229161 0.190290 0.233954 0.190280 0.282557 0.057345 0.469818 0.270240 0.045843 0.085320 0.598597 0.087071 0.082136 0.110887 0.719907 0.043529 0.045570 0.095870 0.815030 0.695645 0.181644 0.010408 0.112302 0.886232 0.004701 0.003541 0.105526 0.105526 0.003541 0.004701 0.886232 0.112302 0.010408 0.181644 0.695645 0.815030 0.095870 0.045570 0.043529 0.719907 0.110887 0.082136 0.087071 0.390444 0.203798 0.187600 0.218158 0.182980 0.340966 0.213084 0.262971 0.210101 0.353260 0.218431 0.218209 0.179646 0.382823 0.266649 0.170882 Consensus sequence: DHHYTTTAATTAAHBBV Alignment: DHHYTTTAATTAAHBBV WWTYTTTMWWKYTTTHW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 32 Motif name: C032 Original motif 0.217822 0.217822 0.079208 0.485149 0.480000 0.030000 0.110000 0.380000 0.920000 0.060000 0.010000 0.010000 0.960000 0.020000 0.010000 0.010000 0.390000 0.030000 0.010000 0.570000 0.100000 0.320000 0.010000 0.570000 0.350000 0.090000 0.190000 0.370000 0.920000 0.060000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.821782 0.138614 0.029703 0.009901 0.510000 0.380000 0.080000 0.030000 0.356436 0.128713 0.089109 0.425743 0.455446 0.009901 0.455446 0.079208 0.490000 0.010000 0.030000 0.470000 0.880000 0.010000 0.060000 0.050000 0.550000 0.310000 0.090000 0.050000 0.310000 0.160000 0.080000 0.450000 0.470000 0.020000 0.300000 0.210000 Consensus sequence: HWAAWYDAAAMWRWAMWR Reserve complement motif 0.210000 0.020000 0.300000 0.470000 0.450000 0.160000 0.080000 0.310000 0.050000 0.310000 0.090000 0.550000 0.050000 0.010000 0.060000 0.880000 0.470000 0.010000 0.030000 0.490000 0.079208 0.009901 0.455446 0.455446 0.425743 0.128713 0.089109 0.356436 0.030000 0.380000 0.080000 0.510000 0.009901 0.138614 0.029703 0.821782 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.060000 0.010000 0.920000 0.370000 0.090000 0.190000 0.350000 0.570000 0.320000 0.010000 0.100000 0.570000 0.030000 0.010000 0.390000 0.010000 0.020000 0.010000 0.960000 0.010000 0.060000 0.010000 0.920000 0.380000 0.030000 0.110000 0.480000 0.485149 0.217822 0.079208 0.217822 Consensus sequence: KWYTWKWYTTTDMWTTWH ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 32 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 4 18 0.046142 Species: Mus musculus Original motif 0.360997 0.300272 0.115555 0.223177 0.309749 0.228429 0.166233 0.295589 0.149419 0.176868 0.240155 0.433558 0.379704 0.095791 0.276373 0.248133 0.394549 0.174184 0.130641 0.300626 0.443749 0.070776 0.211081 0.274393 0.364301 0.074356 0.370406 0.190936 0.791976 0.038475 0.093390 0.076159 0.963721 0.001826 0.002456 0.031997 0.004516 0.954596 0.008092 0.032796 0.981080 0.002062 0.002161 0.014697 0.986185 0.001846 0.006976 0.004992 0.059567 0.003649 0.002189 0.934595 0.495328 0.024257 0.240450 0.239965 0.305027 0.094878 0.526069 0.074025 0.418442 0.196237 0.158323 0.226998 0.336713 0.220452 0.191155 0.251680 0.192296 0.300342 0.169047 0.338315 0.240387 0.144634 0.128513 0.486465 0.290763 0.271259 0.116600 0.321377 0.224825 0.296233 0.229255 0.249687 0.493240 0.171285 0.075148 0.260326 Consensus sequence: HHBDHDDAACAATDRHHHHHBW Reverse complement motif 0.260326 0.171285 0.075148 0.493240 0.224825 0.229255 0.296233 0.249687 0.321377 0.271259 0.116600 0.290763 0.486465 0.144634 0.128513 0.240387 0.338315 0.300342 0.169047 0.192296 0.251680 0.220452 0.191155 0.336713 0.226998 0.196237 0.158323 0.418442 0.305027 0.526069 0.094878 0.074025 0.239965 0.024257 0.240450 0.495328 0.934595 0.003649 0.002189 0.059567 0.004992 0.001846 0.006976 0.986185 0.014697 0.002062 0.002161 0.981080 0.004516 0.008092 0.954596 0.032796 0.031997 0.001826 0.002456 0.963721 0.076159 0.038475 0.093390 0.791976 0.364301 0.370406 0.074356 0.190936 0.274393 0.070776 0.211081 0.443749 0.300626 0.174184 0.130641 0.394549 0.248133 0.095791 0.276373 0.379704 0.433558 0.176868 0.240155 0.149419 0.295589 0.228429 0.166233 0.309749 0.223177 0.300272 0.115555 0.360997 Consensus sequence: WBHHHHHMDATTGTTHDHDVHH Alignment: WBHHHHHMDATTGTTHDHDVHH ---KWYTWKWYTTTDMWTTWH- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 2 18 0.050828 Species: Mus musculus Original motif 0.067627 0.131333 0.654425 0.146615 0.156488 0.114442 0.145630 0.583441 0.206450 0.265630 0.358017 0.169903 0.090729 0.460713 0.274712 0.173847 0.285994 0.099998 0.154485 0.459523 0.635908 0.184787 0.072982 0.106323 0.748421 0.039204 0.092605 0.119769 0.081342 0.061327 0.044532 0.812799 0.143120 0.043879 0.024216 0.788785 0.247544 0.092102 0.621453 0.038901 0.295531 0.036295 0.027594 0.640580 0.194561 0.305468 0.339916 0.160055 0.175038 0.193568 0.101212 0.530182 0.145226 0.167488 0.559871 0.127415 0.271501 0.237429 0.206701 0.284369 0.216834 0.109191 0.569605 0.104370 0.182624 0.177160 0.300475 0.339742 0.331737 0.198645 0.265137 0.204482 0.230155 0.359365 0.183450 0.227029 0.056581 0.067297 0.463052 0.413070 0.198891 0.324626 0.304424 0.172059 0.181968 0.287547 0.202419 0.328066 Consensus sequence: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB Reverse complement motif 0.328066 0.287547 0.202419 0.181968 0.198891 0.304424 0.324626 0.172059 0.056581 0.463052 0.067297 0.413070 0.230155 0.183450 0.359365 0.227029 0.204482 0.198645 0.265137 0.331737 0.339742 0.177160 0.300475 0.182624 0.216834 0.569605 0.109191 0.104370 0.284369 0.237429 0.206701 0.271501 0.145226 0.559871 0.167488 0.127415 0.530182 0.193568 0.101212 0.175038 0.194561 0.339916 0.305468 0.160055 0.640580 0.036295 0.027594 0.295531 0.247544 0.621453 0.092102 0.038901 0.788785 0.043879 0.024216 0.143120 0.812799 0.061327 0.044532 0.081342 0.119769 0.039204 0.092605 0.748421 0.106323 0.184787 0.072982 0.635908 0.459523 0.099998 0.154485 0.285994 0.090729 0.274712 0.460713 0.173847 0.206450 0.358017 0.265630 0.169903 0.583441 0.114442 0.145630 0.156488 0.067627 0.654425 0.131333 0.146615 Consensus sequence: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC Alignment: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB ---HWAAWYDAAAMWRWAMWR- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00032 Gata3_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 2 18 0.051698 Species: Mus musculus Original motif 0.151572 0.262753 0.258275 0.327401 0.221834 0.113385 0.275380 0.389400 0.297769 0.136928 0.134678 0.430625 0.270099 0.110415 0.271106 0.348380 0.265471 0.090253 0.223340 0.420936 0.616582 0.090091 0.171960 0.121367 0.197318 0.107541 0.406904 0.288237 0.798258 0.046950 0.001406 0.153385 0.003195 0.002516 0.989707 0.004582 0.991503 0.002748 0.002617 0.003132 0.005015 0.002764 0.003026 0.989195 0.948394 0.008932 0.001344 0.041330 0.973109 0.004100 0.004081 0.018710 0.040365 0.113905 0.828185 0.017545 0.736608 0.130524 0.113464 0.019404 0.415921 0.106101 0.316613 0.161365 0.376582 0.170927 0.155572 0.296919 0.137731 0.197151 0.211055 0.454064 0.324853 0.122747 0.246107 0.306293 0.462490 0.207311 0.159392 0.170807 0.380420 0.188972 0.311990 0.118618 0.222178 0.157873 0.380486 0.239463 Consensus sequence: BDHDDADAGATAAGADHBDHVD Reverse complement motif 0.222178 0.380486 0.157873 0.239463 0.118618 0.188972 0.311990 0.380420 0.170807 0.207311 0.159392 0.462490 0.306293 0.122747 0.246107 0.324853 0.454064 0.197151 0.211055 0.137731 0.296919 0.170927 0.155572 0.376582 0.161365 0.106101 0.316613 0.415921 0.019404 0.130524 0.113464 0.736608 0.040365 0.828185 0.113905 0.017545 0.018710 0.004100 0.004081 0.973109 0.041330 0.008932 0.001344 0.948394 0.989195 0.002764 0.003026 0.005015 0.003132 0.002748 0.002617 0.991503 0.003195 0.989707 0.002516 0.004582 0.153385 0.046950 0.001406 0.798258 0.197318 0.406904 0.107541 0.288237 0.121367 0.090091 0.171960 0.616582 0.420936 0.090253 0.223340 0.265471 0.348380 0.110415 0.271106 0.270099 0.430625 0.136928 0.134678 0.297769 0.389400 0.113385 0.275380 0.221834 0.327401 0.262753 0.258275 0.151572 Consensus sequence: HBHDVHDTCTTATCTHTDDHDV Alignment: HBHDVHDTCTTATCTHTDDHDV -KWYTWKWYTTTDMWTTWH--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00032 Gata3_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 1 18 0.051702 Species: Mus musculus Original motif 0.177641 0.319872 0.115137 0.387350 0.136644 0.182137 0.205873 0.475347 0.254263 0.244280 0.165207 0.336250 0.240415 0.207557 0.237497 0.314530 0.271041 0.214702 0.364395 0.149863 0.095475 0.320104 0.191738 0.392682 0.500902 0.142722 0.026556 0.329820 0.051221 0.023698 0.897245 0.027836 0.922410 0.027509 0.024058 0.026023 0.030735 0.070903 0.024248 0.874114 0.242120 0.231992 0.225143 0.300745 0.106956 0.220471 0.283490 0.389083 0.152079 0.165830 0.135066 0.547025 0.839205 0.051581 0.060119 0.049095 0.041204 0.069147 0.070830 0.818819 0.051861 0.848177 0.027599 0.072363 0.383793 0.016807 0.397470 0.201931 0.381899 0.215846 0.255908 0.146347 0.094792 0.358651 0.280905 0.265652 0.296132 0.181545 0.178433 0.343890 0.301997 0.254722 0.108566 0.334714 0.349481 0.270693 0.137507 0.242319 Consensus sequence: HBHDVBWGATHBTATCRVBHHH Reverse complement motif 0.242319 0.270693 0.137507 0.349481 0.334714 0.254722 0.108566 0.301997 0.343890 0.181545 0.178433 0.296132 0.094792 0.280905 0.358651 0.265652 0.146347 0.215846 0.255908 0.381899 0.383793 0.397470 0.016807 0.201931 0.051861 0.027599 0.848177 0.072363 0.818819 0.069147 0.070830 0.041204 0.049095 0.051581 0.060119 0.839205 0.547025 0.165830 0.135066 0.152079 0.389083 0.220471 0.283490 0.106956 0.300745 0.231992 0.225143 0.242120 0.874114 0.070903 0.024248 0.030735 0.026023 0.027509 0.024058 0.922410 0.051221 0.897245 0.023698 0.027836 0.329820 0.142722 0.026556 0.500902 0.392682 0.320104 0.191738 0.095475 0.271041 0.364395 0.214702 0.149863 0.314530 0.207557 0.237497 0.240415 0.336250 0.244280 0.165207 0.254263 0.475347 0.182137 0.205873 0.136644 0.387350 0.319872 0.115137 0.177641 Consensus sequence: HHHBBMGATAVHATCWVVDHVH Alignment: HBHDVBWGATHBTATCRVBHHH ----HWAAWYDAAAMWRWAMWR ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00050 Bhlhb2_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 4 18 0.066743 Species: Mus musculus Original motif 0.120938 0.344851 0.124072 0.410138 0.220931 0.169844 0.422396 0.186829 0.127752 0.260812 0.103811 0.507625 0.140641 0.405473 0.287668 0.166218 0.296957 0.155579 0.301094 0.246370 0.219647 0.287193 0.154072 0.339087 0.049294 0.026059 0.121789 0.802859 0.520042 0.289284 0.173423 0.017251 0.049190 0.943472 0.004308 0.003030 0.902609 0.006767 0.074770 0.015854 0.003221 0.971329 0.005512 0.019937 0.019937 0.005512 0.971329 0.003221 0.015854 0.074770 0.006767 0.902609 0.003030 0.004308 0.943472 0.049190 0.003497 0.088920 0.685942 0.221641 0.802859 0.121789 0.026059 0.049294 0.334544 0.155170 0.275193 0.235092 0.275957 0.132104 0.454982 0.136957 0.134097 0.254352 0.422940 0.188611 0.396163 0.432784 0.051281 0.119772 0.276474 0.115627 0.419844 0.188056 0.160759 0.088061 0.649863 0.101318 0.203314 0.166595 0.106821 0.523270 Consensus sequence: YDYBDHTMCACGTGGADDBMDGT Reverse complement motif 0.523270 0.166595 0.106821 0.203314 0.160759 0.649863 0.088061 0.101318 0.276474 0.419844 0.115627 0.188056 0.396163 0.051281 0.432784 0.119772 0.134097 0.422940 0.254352 0.188611 0.275957 0.454982 0.132104 0.136957 0.235092 0.155170 0.275193 0.334544 0.049294 0.121789 0.026059 0.802859 0.003497 0.685942 0.088920 0.221641 0.003030 0.943472 0.004308 0.049190 0.902609 0.074770 0.006767 0.015854 0.019937 0.971329 0.005512 0.003221 0.003221 0.005512 0.971329 0.019937 0.015854 0.006767 0.074770 0.902609 0.049190 0.004308 0.943472 0.003030 0.017251 0.289284 0.173423 0.520042 0.802859 0.026059 0.121789 0.049294 0.339087 0.287193 0.154072 0.219647 0.296957 0.301094 0.155579 0.246370 0.140641 0.287668 0.405473 0.166218 0.507625 0.260812 0.103811 0.127752 0.220931 0.422396 0.169844 0.186829 0.410138 0.344851 0.124072 0.120938 Consensus sequence: ACHRBHDTCCACGTGYAHHBMHM Alignment: ACHRBHDTCCACGTGYAHHBMHM --HWAAWYDAAAMWRWAMWR--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 33 Motif name: C033 Original motif 0.400000 0.100000 0.020000 0.480000 0.270000 0.220000 0.010000 0.500000 0.950000 0.030000 0.010000 0.010000 0.821782 0.138614 0.019802 0.019802 0.410000 0.060000 0.010000 0.520000 0.060000 0.410000 0.010000 0.520000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.831683 0.148515 0.009901 0.009901 0.881188 0.089109 0.019802 0.009901 0.470000 0.410000 0.060000 0.060000 0.540000 0.010000 0.410000 0.040000 0.564356 0.029703 0.029703 0.376238 0.930000 0.010000 0.010000 0.050000 0.640000 0.270000 0.070000 0.020000 0.574257 0.019802 0.217822 0.188119 0.534653 0.049505 0.059406 0.356436 Consensus sequence: WWAAWYAAAMRWAAAW Reserve complement motif 0.356436 0.049505 0.059406 0.534653 0.188119 0.019802 0.217822 0.574257 0.020000 0.270000 0.070000 0.640000 0.050000 0.010000 0.010000 0.930000 0.376238 0.029703 0.029703 0.564356 0.040000 0.010000 0.410000 0.540000 0.060000 0.410000 0.060000 0.470000 0.009901 0.089109 0.019802 0.881188 0.009901 0.148515 0.009901 0.831683 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.520000 0.410000 0.010000 0.060000 0.520000 0.060000 0.010000 0.410000 0.019802 0.138614 0.019802 0.821782 0.010000 0.030000 0.010000 0.950000 0.500000 0.220000 0.010000 0.270000 0.480000 0.100000 0.020000 0.400000 Consensus sequence: WTTTWKYTTTMWTTWW ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 33 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00061 Foxl1_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 16 0.022622 Species: Mus musculus Original motif 0.323208 0.152915 0.185111 0.338766 0.428132 0.056109 0.099487 0.416272 0.659386 0.039965 0.035805 0.264843 0.647143 0.049206 0.078984 0.224667 0.208834 0.076592 0.071631 0.642943 0.341077 0.003865 0.649511 0.005547 0.016627 0.001866 0.001715 0.979792 0.952319 0.045294 0.000870 0.001516 0.988834 0.004620 0.000720 0.005826 0.989346 0.001005 0.006467 0.003182 0.001093 0.784230 0.001235 0.213442 0.991209 0.002017 0.001737 0.005037 0.801581 0.037084 0.023060 0.138274 0.528554 0.089350 0.107501 0.274595 0.208802 0.268646 0.368022 0.154530 0.280218 0.221367 0.340497 0.157918 0.146611 0.250725 0.293524 0.309140 Consensus sequence: DWAATRTAAACAAWVVB Reverse complement motif 0.309140 0.250725 0.293524 0.146611 0.280218 0.340497 0.221367 0.157918 0.208802 0.368022 0.268646 0.154530 0.274595 0.089350 0.107501 0.528554 0.138274 0.037084 0.023060 0.801581 0.005037 0.002017 0.001737 0.991209 0.001093 0.001235 0.784230 0.213442 0.003182 0.001005 0.006467 0.989346 0.005826 0.004620 0.000720 0.988834 0.001516 0.045294 0.000870 0.952319 0.979792 0.001866 0.001715 0.016627 0.341077 0.649511 0.003865 0.005547 0.642943 0.076592 0.071631 0.208834 0.224667 0.049206 0.078984 0.647143 0.264843 0.039965 0.035805 0.659386 0.416272 0.056109 0.099487 0.428132 0.338766 0.152915 0.185111 0.323208 Consensus sequence: VVVWTTGTTTAMATTWD Alignment: VVVWTTGTTTAMATTWD -WTTTWKYTTTMWTTWW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00073 Foxa2_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 2 16 0.026239 Species: Mus musculus Original motif 0.335487 0.205062 0.128957 0.330494 0.411635 0.179625 0.175701 0.233038 0.412976 0.128602 0.091890 0.366532 0.608396 0.079002 0.107142 0.205460 0.433474 0.035203 0.153143 0.378180 0.087552 0.005003 0.894586 0.012858 0.004459 0.038951 0.001109 0.955481 0.924470 0.068560 0.001165 0.005805 0.920483 0.070039 0.001674 0.007805 0.988335 0.001902 0.003155 0.006608 0.001527 0.656726 0.002699 0.339047 0.987505 0.001810 0.004336 0.006349 0.719584 0.065184 0.050384 0.164848 0.535389 0.099997 0.102849 0.261764 0.245215 0.272017 0.301499 0.181269 0.306107 0.209040 0.248687 0.236166 0.223744 0.278668 0.251931 0.245657 Consensus sequence: HHWAWGTAAAYAAAVDB Reverse complement motif 0.223744 0.251931 0.278668 0.245657 0.236166 0.209040 0.248687 0.306107 0.245215 0.301499 0.272017 0.181269 0.261764 0.099997 0.102849 0.535389 0.164848 0.065184 0.050384 0.719584 0.006349 0.001810 0.004336 0.987505 0.001527 0.002699 0.656726 0.339047 0.006608 0.001902 0.003155 0.988335 0.007805 0.070039 0.001674 0.920483 0.005805 0.068560 0.001165 0.924470 0.955481 0.038951 0.001109 0.004459 0.087552 0.894586 0.005003 0.012858 0.378180 0.035203 0.153143 0.433474 0.205460 0.079002 0.107142 0.608396 0.366532 0.128602 0.091890 0.412976 0.233038 0.179625 0.175701 0.411635 0.330494 0.205062 0.128957 0.335487 Consensus sequence: BDVTTTKTTTACWTWHH Alignment: BDVTTTKTTTACWTWHH -WTTTWKYTTTMWTTWW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00025 Foxk1_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 2 16 0.028732 Species: Mus musculus Original motif 0.338172 0.192194 0.207817 0.261817 0.407924 0.117261 0.278236 0.196580 0.595570 0.070480 0.119221 0.214729 0.710845 0.038748 0.052600 0.197807 0.124647 0.116138 0.178053 0.581162 0.201602 0.005514 0.792110 0.000774 0.024590 0.004193 0.001331 0.969886 0.919465 0.077871 0.000760 0.001904 0.972342 0.010395 0.000580 0.016683 0.991045 0.001495 0.003585 0.003875 0.001358 0.885197 0.000980 0.112465 0.990318 0.001846 0.002968 0.004867 0.804563 0.063147 0.023496 0.108795 0.564824 0.087976 0.102865 0.244336 0.269947 0.300278 0.285008 0.144767 0.337905 0.220102 0.253694 0.188299 0.153781 0.274135 0.318343 0.253741 Consensus sequence: DDAATGTAAACAAAVVB Reverse complement motif 0.153781 0.318343 0.274135 0.253741 0.188299 0.220102 0.253694 0.337905 0.269947 0.285008 0.300278 0.144767 0.244336 0.087976 0.102865 0.564824 0.108795 0.063147 0.023496 0.804563 0.004867 0.001846 0.002968 0.990318 0.001358 0.000980 0.885197 0.112465 0.003875 0.001495 0.003585 0.991045 0.016683 0.010395 0.000580 0.972342 0.001904 0.077871 0.000760 0.919465 0.969886 0.004193 0.001331 0.024590 0.201602 0.792110 0.005514 0.000774 0.581162 0.116138 0.178053 0.124647 0.197807 0.038748 0.052600 0.710845 0.214729 0.070480 0.119221 0.595570 0.196580 0.117261 0.278236 0.407924 0.261817 0.192194 0.207817 0.338172 Consensus sequence: BBVTTTGTTTACATTDD Alignment: BBVTTTGTTTACATTDD -WTTTWKYTTTMWTTWW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00061 Foxl1_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 16 0.029684 Species: Mus musculus Original motif 0.560226 0.121586 0.083231 0.234957 0.318077 0.149137 0.179955 0.352831 0.482497 0.118420 0.173594 0.225488 0.200166 0.160901 0.191493 0.447440 0.033691 0.569719 0.018901 0.377690 0.638020 0.166545 0.021254 0.174181 0.573953 0.105729 0.009308 0.311010 0.890518 0.053364 0.013424 0.042694 0.910758 0.028166 0.032648 0.028428 0.013358 0.738707 0.023981 0.223953 0.911783 0.018754 0.031898 0.037564 0.702891 0.068940 0.076823 0.151346 0.445507 0.320769 0.057216 0.176507 0.587798 0.129586 0.140592 0.142024 0.258981 0.330939 0.167334 0.242747 0.362022 0.333796 0.145861 0.158320 Consensus sequence: ADDDYAWAACAAMAHH Reverse complement motif 0.158320 0.333796 0.145861 0.362022 0.258981 0.167334 0.330939 0.242747 0.142024 0.129586 0.140592 0.587798 0.176507 0.320769 0.057216 0.445507 0.151346 0.068940 0.076823 0.702891 0.037564 0.018754 0.031898 0.911783 0.013358 0.023981 0.738707 0.223953 0.028428 0.028166 0.032648 0.910758 0.042694 0.053364 0.013424 0.890518 0.311010 0.105729 0.009308 0.573953 0.174181 0.166545 0.021254 0.638020 0.033691 0.018901 0.569719 0.377690 0.447440 0.160901 0.191493 0.200166 0.225488 0.118420 0.173594 0.482497 0.352831 0.149137 0.179955 0.318077 0.234957 0.121586 0.083231 0.560226 Consensus sequence: HDTYTTGTTWTKDDDT Alignment: ADDDYAWAACAAMAHH WWAAWYAAAMRWAAAW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00077 Srf_secondary Original Motif Original Motif Backward 1 16 0.030050 Species: Mus musculus Original motif 0.162968 0.284828 0.440984 0.111220 0.151392 0.200635 0.205316 0.442657 0.267215 0.083669 0.192498 0.456618 0.332771 0.180711 0.200027 0.286491 0.509370 0.102954 0.242569 0.145107 0.666262 0.077309 0.154466 0.101962 0.737968 0.113335 0.100401 0.048296 0.658878 0.141580 0.134033 0.065510 0.766115 0.094051 0.069763 0.070072 0.755621 0.088491 0.044802 0.111086 0.749083 0.135917 0.047510 0.067490 0.663231 0.176795 0.028134 0.131839 0.553358 0.277659 0.038655 0.130328 0.392578 0.314083 0.209844 0.083495 0.198462 0.237132 0.239466 0.324940 0.275121 0.210087 0.194779 0.320013 0.287748 0.277395 0.142704 0.292154 Consensus sequence: VBDDAAAAAAAAMVBHH Reverse complement motif 0.292154 0.277395 0.142704 0.287748 0.320013 0.210087 0.194779 0.275121 0.324940 0.237132 0.239466 0.198462 0.083495 0.314083 0.209844 0.392578 0.130328 0.277659 0.038655 0.553358 0.131839 0.176795 0.028134 0.663231 0.067490 0.135917 0.047510 0.749083 0.111086 0.088491 0.044802 0.755621 0.070072 0.094051 0.069763 0.766115 0.065510 0.141580 0.134033 0.658878 0.048296 0.113335 0.100401 0.737968 0.101962 0.077309 0.154466 0.666262 0.145107 0.102954 0.242569 0.509370 0.286491 0.180711 0.200027 0.332771 0.456618 0.083669 0.192498 0.267215 0.442657 0.200635 0.205316 0.151392 0.162968 0.440984 0.284828 0.111220 Consensus sequence: HHVBYTTTTTTTTDDVV Alignment: VBDDAAAAAAAAMVBHH -WWAAWYAAAMRWAAAW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 34 Motif name: C034 Original motif 0.050000 0.460000 0.440000 0.050000 0.019802 0.881188 0.019802 0.079208 0.643564 0.019802 0.079208 0.257426 0.030000 0.850000 0.110000 0.010000 0.070707 0.111111 0.010101 0.808081 0.080000 0.180000 0.520000 0.220000 0.050000 0.500000 0.410000 0.040000 0.230000 0.010000 0.750000 0.010000 0.138614 0.019802 0.821782 0.019802 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.080000 0.050000 0.860000 0.010000 0.060000 0.360000 0.470000 0.110000 0.270000 0.530000 0.160000 0.040000 0.850000 0.010000 0.120000 0.020000 0.020000 0.010000 0.960000 0.010000 0.770000 0.050000 0.110000 0.070000 0.108911 0.059406 0.821782 0.009901 0.029703 0.495050 0.425743 0.049505 Consensus sequence: SCACTGSGGAGSMAGAGS Reserve complement motif 0.029703 0.425743 0.495050 0.049505 0.108911 0.821782 0.059406 0.009901 0.070000 0.050000 0.110000 0.770000 0.020000 0.960000 0.010000 0.010000 0.020000 0.010000 0.120000 0.850000 0.270000 0.160000 0.530000 0.040000 0.060000 0.470000 0.360000 0.110000 0.080000 0.860000 0.050000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.138614 0.821782 0.019802 0.019802 0.230000 0.750000 0.010000 0.010000 0.050000 0.410000 0.500000 0.040000 0.080000 0.520000 0.180000 0.220000 0.808081 0.111111 0.010101 0.070707 0.030000 0.110000 0.850000 0.010000 0.257426 0.019802 0.079208 0.643564 0.019802 0.019802 0.881188 0.079208 0.050000 0.440000 0.460000 0.050000 Consensus sequence: SCTCTRSCTCCSCAGTGS ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 34 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 3 18 0.043462 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB ---SCACTGSGGAGSMAGAGS-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 3 18 0.046877 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH --SCTCTRSCTCCSCAGTGS-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00400 Zif268 Reverse Complement Original Motif Backward 3 18 0.048667 Species: Mus musculus Original motif 0.104824 0.412716 0.254506 0.227955 0.644922 0.065476 0.140479 0.149122 0.201205 0.166164 0.347131 0.285501 0.360606 0.256316 0.150766 0.232313 0.199831 0.240681 0.279350 0.280137 0.234308 0.204076 0.321306 0.240310 0.274112 0.462435 0.111425 0.152028 0.067070 0.717501 0.073934 0.141496 0.106745 0.084442 0.658566 0.150247 0.025128 0.967053 0.003585 0.004234 0.006412 0.982989 0.003227 0.007371 0.009588 0.877620 0.002571 0.110221 0.621521 0.355443 0.015669 0.007366 0.002600 0.980275 0.004191 0.012934 0.118773 0.026658 0.783843 0.070725 0.022358 0.822101 0.024684 0.130857 0.713212 0.080912 0.128793 0.077084 0.166568 0.250955 0.107934 0.474544 0.225040 0.222494 0.163301 0.389166 0.268976 0.223206 0.265314 0.242504 0.137052 0.229058 0.148439 0.485451 0.135819 0.304550 0.141994 0.417637 0.272440 0.319501 0.230580 0.177478 Consensus sequence: BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV Reverse complement motif 0.272440 0.230580 0.319501 0.177478 0.417637 0.304550 0.141994 0.135819 0.485451 0.229058 0.148439 0.137052 0.242504 0.223206 0.265314 0.268976 0.389166 0.222494 0.163301 0.225040 0.474544 0.250955 0.107934 0.166568 0.077084 0.080912 0.128793 0.713212 0.022358 0.024684 0.822101 0.130857 0.118773 0.783843 0.026658 0.070725 0.002600 0.004191 0.980275 0.012934 0.007366 0.355443 0.015669 0.621521 0.009588 0.002571 0.877620 0.110221 0.006412 0.003227 0.982989 0.007371 0.025128 0.003585 0.967053 0.004234 0.106745 0.658566 0.084442 0.150247 0.067070 0.073934 0.717501 0.141496 0.274112 0.111425 0.462435 0.152028 0.234308 0.321306 0.204076 0.240310 0.280137 0.240681 0.279350 0.199831 0.232313 0.256316 0.150766 0.360606 0.201205 0.347131 0.166164 0.285501 0.149122 0.065476 0.140479 0.644922 0.104824 0.254506 0.412716 0.227955 Consensus sequence: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB Alignment: BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV ---SCTCTRSCTCCSCAGTGS-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 4 18 0.050063 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH --SCTCTRSCTCCSCAGTGS--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00098 Rfx3_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 1 18 0.052223 Species: Mus musculus Original motif 0.314514 0.275352 0.257617 0.152518 0.126939 0.598294 0.130576 0.144192 0.102265 0.155334 0.177957 0.564445 0.129288 0.282678 0.326990 0.261044 0.318166 0.227823 0.175681 0.278330 0.109019 0.380838 0.278328 0.231815 0.226145 0.289206 0.291300 0.193348 0.035863 0.844339 0.072582 0.047216 0.223793 0.187244 0.088092 0.500871 0.039800 0.029681 0.026201 0.904317 0.298298 0.032147 0.654746 0.014809 0.014729 0.022023 0.944826 0.018422 0.485114 0.004925 0.013785 0.496176 0.035708 0.020381 0.240804 0.703108 0.951152 0.012738 0.017886 0.018224 0.023713 0.944394 0.009538 0.022355 0.291067 0.385205 0.232388 0.091339 0.340334 0.199588 0.311526 0.148552 0.198713 0.472138 0.178319 0.150830 0.321155 0.269932 0.311301 0.097612 0.412646 0.195252 0.231950 0.160152 0.297134 0.180928 0.250400 0.271538 0.151169 0.305386 0.358574 0.184871 Consensus sequence: VCTBHBVCTTGGWTACVVVVVDB Reverse complement motif 0.151169 0.358574 0.305386 0.184871 0.271538 0.180928 0.250400 0.297134 0.160152 0.195252 0.231950 0.412646 0.097612 0.269932 0.311301 0.321155 0.198713 0.178319 0.472138 0.150830 0.148552 0.199588 0.311526 0.340334 0.291067 0.232388 0.385205 0.091339 0.023713 0.009538 0.944394 0.022355 0.018224 0.012738 0.017886 0.951152 0.703108 0.020381 0.240804 0.035708 0.496176 0.004925 0.013785 0.485114 0.014729 0.944826 0.022023 0.018422 0.298298 0.654746 0.032147 0.014809 0.904317 0.029681 0.026201 0.039800 0.500871 0.187244 0.088092 0.223793 0.035863 0.072582 0.844339 0.047216 0.226145 0.291300 0.289206 0.193348 0.109019 0.278328 0.380838 0.231815 0.278330 0.227823 0.175681 0.318166 0.129288 0.326990 0.282678 0.261044 0.564445 0.155334 0.177957 0.102265 0.126939 0.130576 0.598294 0.144192 0.152518 0.275352 0.257617 0.314514 Consensus sequence: BDBBVBVGTAWCCAAGVBHBAGB Alignment: VCTBHBVCTTGGWTACVVVVVDB -----SCTCTRSCTCCSCAGTGS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 35 Motif name: C035 Original motif 0.514851 0.049505 0.079208 0.356436 0.454545 0.070707 0.151515 0.323232 0.603960 0.019802 0.178218 0.198020 0.040000 0.830000 0.030000 0.100000 0.040000 0.710000 0.010000 0.240000 0.020202 0.595960 0.080808 0.303030 0.090000 0.010000 0.370000 0.530000 0.070000 0.010000 0.900000 0.020000 0.040000 0.040000 0.020000 0.900000 0.010000 0.940000 0.010000 0.040000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.474747 0.414141 0.010101 0.101010 0.310000 0.050000 0.600000 0.040000 0.810000 0.010000 0.160000 0.020000 0.880000 0.020000 0.070000 0.030000 0.930000 0.020000 0.020000 0.030000 0.390000 0.180000 0.040000 0.390000 0.366337 0.089109 0.009901 0.534653 Consensus sequence: WWACCYKGTCTMRAAAWW Reserve complement motif 0.534653 0.089109 0.009901 0.366337 0.390000 0.180000 0.040000 0.390000 0.030000 0.020000 0.020000 0.930000 0.030000 0.020000 0.070000 0.880000 0.020000 0.010000 0.160000 0.810000 0.310000 0.600000 0.050000 0.040000 0.101010 0.414141 0.010101 0.474747 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.940000 0.040000 0.900000 0.040000 0.020000 0.040000 0.070000 0.900000 0.010000 0.020000 0.530000 0.010000 0.370000 0.090000 0.020202 0.080808 0.595960 0.303030 0.040000 0.010000 0.710000 0.240000 0.040000 0.030000 0.830000 0.100000 0.198020 0.019802 0.178218 0.603960 0.323232 0.070707 0.151515 0.454545 0.356436 0.049505 0.079208 0.514851 Consensus sequence: WWTTTMYAGACRKGGTWW ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 35 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00032 Gata3_primary Original Motif Reverse Complement Forward 5 18 0.042469 Species: Mus musculus Original motif 0.151572 0.262753 0.258275 0.327401 0.221834 0.113385 0.275380 0.389400 0.297769 0.136928 0.134678 0.430625 0.270099 0.110415 0.271106 0.348380 0.265471 0.090253 0.223340 0.420936 0.616582 0.090091 0.171960 0.121367 0.197318 0.107541 0.406904 0.288237 0.798258 0.046950 0.001406 0.153385 0.003195 0.002516 0.989707 0.004582 0.991503 0.002748 0.002617 0.003132 0.005015 0.002764 0.003026 0.989195 0.948394 0.008932 0.001344 0.041330 0.973109 0.004100 0.004081 0.018710 0.040365 0.113905 0.828185 0.017545 0.736608 0.130524 0.113464 0.019404 0.415921 0.106101 0.316613 0.161365 0.376582 0.170927 0.155572 0.296919 0.137731 0.197151 0.211055 0.454064 0.324853 0.122747 0.246107 0.306293 0.462490 0.207311 0.159392 0.170807 0.380420 0.188972 0.311990 0.118618 0.222178 0.157873 0.380486 0.239463 Consensus sequence: BDHDDADAGATAAGADHBDHVD Reverse complement motif 0.222178 0.380486 0.157873 0.239463 0.118618 0.188972 0.311990 0.380420 0.170807 0.207311 0.159392 0.462490 0.306293 0.122747 0.246107 0.324853 0.454064 0.197151 0.211055 0.137731 0.296919 0.170927 0.155572 0.376582 0.161365 0.106101 0.316613 0.415921 0.019404 0.130524 0.113464 0.736608 0.040365 0.828185 0.113905 0.017545 0.018710 0.004100 0.004081 0.973109 0.041330 0.008932 0.001344 0.948394 0.989195 0.002764 0.003026 0.005015 0.003132 0.002748 0.002617 0.991503 0.003195 0.989707 0.002516 0.004582 0.153385 0.046950 0.001406 0.798258 0.197318 0.406904 0.107541 0.288237 0.121367 0.090091 0.171960 0.616582 0.420936 0.090253 0.223340 0.265471 0.348380 0.110415 0.271106 0.270099 0.430625 0.136928 0.134678 0.297769 0.389400 0.113385 0.275380 0.221834 0.327401 0.262753 0.258275 0.151572 Consensus sequence: HBHDVHDTCTTATCTHTDDHDV Alignment: HBHDVHDTCTTATCTHTDDHDV ----WWACCYKGTCTMRAAAWW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 4 18 0.052935 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH ---WWTTTMYAGACRKGGTWW-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00050 Bhlhb2_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 6 18 0.053018 Species: Mus musculus Original motif 0.120938 0.344851 0.124072 0.410138 0.220931 0.169844 0.422396 0.186829 0.127752 0.260812 0.103811 0.507625 0.140641 0.405473 0.287668 0.166218 0.296957 0.155579 0.301094 0.246370 0.219647 0.287193 0.154072 0.339087 0.049294 0.026059 0.121789 0.802859 0.520042 0.289284 0.173423 0.017251 0.049190 0.943472 0.004308 0.003030 0.902609 0.006767 0.074770 0.015854 0.003221 0.971329 0.005512 0.019937 0.019937 0.005512 0.971329 0.003221 0.015854 0.074770 0.006767 0.902609 0.003030 0.004308 0.943472 0.049190 0.003497 0.088920 0.685942 0.221641 0.802859 0.121789 0.026059 0.049294 0.334544 0.155170 0.275193 0.235092 0.275957 0.132104 0.454982 0.136957 0.134097 0.254352 0.422940 0.188611 0.396163 0.432784 0.051281 0.119772 0.276474 0.115627 0.419844 0.188056 0.160759 0.088061 0.649863 0.101318 0.203314 0.166595 0.106821 0.523270 Consensus sequence: YDYBDHTMCACGTGGADDBMDGT Reverse complement motif 0.523270 0.166595 0.106821 0.203314 0.160759 0.649863 0.088061 0.101318 0.276474 0.419844 0.115627 0.188056 0.396163 0.051281 0.432784 0.119772 0.134097 0.422940 0.254352 0.188611 0.275957 0.454982 0.132104 0.136957 0.235092 0.155170 0.275193 0.334544 0.049294 0.121789 0.026059 0.802859 0.003497 0.685942 0.088920 0.221641 0.003030 0.943472 0.004308 0.049190 0.902609 0.074770 0.006767 0.015854 0.019937 0.971329 0.005512 0.003221 0.003221 0.005512 0.971329 0.019937 0.015854 0.006767 0.074770 0.902609 0.049190 0.004308 0.943472 0.003030 0.017251 0.289284 0.173423 0.520042 0.802859 0.026059 0.121789 0.049294 0.339087 0.287193 0.154072 0.219647 0.296957 0.301094 0.155579 0.246370 0.140641 0.287668 0.405473 0.166218 0.507625 0.260812 0.103811 0.127752 0.220931 0.422396 0.169844 0.186829 0.410138 0.344851 0.124072 0.120938 Consensus sequence: ACHRBHDTCCACGTGYAHHBMHM Alignment: YDYBDHTMCACGTGGADDBMDGT WWTTTMYAGACRKGGTWW----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00098 Rfx3_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 1 18 0.057202 Species: Mus musculus Original motif 0.314514 0.275352 0.257617 0.152518 0.126939 0.598294 0.130576 0.144192 0.102265 0.155334 0.177957 0.564445 0.129288 0.282678 0.326990 0.261044 0.318166 0.227823 0.175681 0.278330 0.109019 0.380838 0.278328 0.231815 0.226145 0.289206 0.291300 0.193348 0.035863 0.844339 0.072582 0.047216 0.223793 0.187244 0.088092 0.500871 0.039800 0.029681 0.026201 0.904317 0.298298 0.032147 0.654746 0.014809 0.014729 0.022023 0.944826 0.018422 0.485114 0.004925 0.013785 0.496176 0.035708 0.020381 0.240804 0.703108 0.951152 0.012738 0.017886 0.018224 0.023713 0.944394 0.009538 0.022355 0.291067 0.385205 0.232388 0.091339 0.340334 0.199588 0.311526 0.148552 0.198713 0.472138 0.178319 0.150830 0.321155 0.269932 0.311301 0.097612 0.412646 0.195252 0.231950 0.160152 0.297134 0.180928 0.250400 0.271538 0.151169 0.305386 0.358574 0.184871 Consensus sequence: VCTBHBVCTTGGWTACVVVVVDB Reverse complement motif 0.151169 0.358574 0.305386 0.184871 0.271538 0.180928 0.250400 0.297134 0.160152 0.195252 0.231950 0.412646 0.097612 0.269932 0.311301 0.321155 0.198713 0.178319 0.472138 0.150830 0.148552 0.199588 0.311526 0.340334 0.291067 0.232388 0.385205 0.091339 0.023713 0.009538 0.944394 0.022355 0.018224 0.012738 0.017886 0.951152 0.703108 0.020381 0.240804 0.035708 0.496176 0.004925 0.013785 0.485114 0.014729 0.944826 0.022023 0.018422 0.298298 0.654746 0.032147 0.014809 0.904317 0.029681 0.026201 0.039800 0.500871 0.187244 0.088092 0.223793 0.035863 0.072582 0.844339 0.047216 0.226145 0.291300 0.289206 0.193348 0.109019 0.278328 0.380838 0.231815 0.278330 0.227823 0.175681 0.318166 0.129288 0.326990 0.282678 0.261044 0.564445 0.155334 0.177957 0.102265 0.126939 0.130576 0.598294 0.144192 0.152518 0.275352 0.257617 0.314514 Consensus sequence: BDBBVBVGTAWCCAAGVBHBAGB Alignment: VCTBHBVCTTGGWTACVVVVVDB WWACCYKGTCTMRAAAWW----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00400 Zif268 Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 18 0.057488 Species: Mus musculus Original motif 0.104824 0.412716 0.254506 0.227955 0.644922 0.065476 0.140479 0.149122 0.201205 0.166164 0.347131 0.285501 0.360606 0.256316 0.150766 0.232313 0.199831 0.240681 0.279350 0.280137 0.234308 0.204076 0.321306 0.240310 0.274112 0.462435 0.111425 0.152028 0.067070 0.717501 0.073934 0.141496 0.106745 0.084442 0.658566 0.150247 0.025128 0.967053 0.003585 0.004234 0.006412 0.982989 0.003227 0.007371 0.009588 0.877620 0.002571 0.110221 0.621521 0.355443 0.015669 0.007366 0.002600 0.980275 0.004191 0.012934 0.118773 0.026658 0.783843 0.070725 0.022358 0.822101 0.024684 0.130857 0.713212 0.080912 0.128793 0.077084 0.166568 0.250955 0.107934 0.474544 0.225040 0.222494 0.163301 0.389166 0.268976 0.223206 0.265314 0.242504 0.137052 0.229058 0.148439 0.485451 0.135819 0.304550 0.141994 0.417637 0.272440 0.319501 0.230580 0.177478 Consensus sequence: BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV Reverse complement motif 0.272440 0.230580 0.319501 0.177478 0.417637 0.304550 0.141994 0.135819 0.485451 0.229058 0.148439 0.137052 0.242504 0.223206 0.265314 0.268976 0.389166 0.222494 0.163301 0.225040 0.474544 0.250955 0.107934 0.166568 0.077084 0.080912 0.128793 0.713212 0.022358 0.024684 0.822101 0.130857 0.118773 0.783843 0.026658 0.070725 0.002600 0.004191 0.980275 0.012934 0.007366 0.355443 0.015669 0.621521 0.009588 0.002571 0.877620 0.110221 0.006412 0.003227 0.982989 0.007371 0.025128 0.003585 0.967053 0.004234 0.106745 0.658566 0.084442 0.150247 0.067070 0.073934 0.717501 0.141496 0.274112 0.111425 0.462435 0.152028 0.234308 0.321306 0.204076 0.240310 0.280137 0.240681 0.279350 0.199831 0.232313 0.256316 0.150766 0.360606 0.201205 0.347131 0.166164 0.285501 0.149122 0.065476 0.140479 0.644922 0.104824 0.254506 0.412716 0.227955 Consensus sequence: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB Alignment: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB ----WWTTTMYAGACRKGGTWW- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 36 Motif name: C036 Original motif 0.455446 0.455446 0.049505 0.039604 0.009901 0.029703 0.455446 0.504950 0.710000 0.010000 0.250000 0.030000 0.138614 0.148515 0.683168 0.029703 0.455446 0.495050 0.039604 0.009901 0.009901 0.049505 0.445545 0.495050 0.465347 0.485149 0.039604 0.009901 0.130000 0.220000 0.630000 0.020000 0.693069 0.009901 0.247525 0.049505 0.148515 0.168317 0.673267 0.009901 0.510000 0.050000 0.250000 0.190000 0.009901 0.019802 0.465347 0.504950 0.455446 0.475248 0.059406 0.009901 0.009901 0.039604 0.445545 0.504950 0.780000 0.010000 0.170000 0.040000 0.210000 0.110000 0.670000 0.010000 0.445545 0.504950 0.039604 0.009901 0.030000 0.060000 0.430000 0.480000 Consensus sequence: MKAGMKMGAGAKMKAGMK Reserve complement motif 0.480000 0.060000 0.430000 0.030000 0.445545 0.039604 0.504950 0.009901 0.210000 0.670000 0.110000 0.010000 0.040000 0.010000 0.170000 0.780000 0.504950 0.039604 0.445545 0.009901 0.455446 0.059406 0.475248 0.009901 0.504950 0.019802 0.465347 0.009901 0.190000 0.050000 0.250000 0.510000 0.148515 0.673267 0.168317 0.009901 0.049505 0.009901 0.247525 0.693069 0.130000 0.630000 0.220000 0.020000 0.465347 0.039604 0.485149 0.009901 0.495050 0.049505 0.445545 0.009901 0.455446 0.039604 0.495050 0.009901 0.138614 0.683168 0.148515 0.029703 0.030000 0.010000 0.250000 0.710000 0.504950 0.029703 0.455446 0.009901 0.039604 0.455446 0.049505 0.455446 Consensus sequence: RRCTRRRTCTCRRRCTRY ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 36 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 1 18 0.042603 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK ----RRCTRRRTCTCRRRCTRY ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 5 18 0.045483 Species: Mus musculus Original motif 0.067627 0.131333 0.654425 0.146615 0.156488 0.114442 0.145630 0.583441 0.206450 0.265630 0.358017 0.169903 0.090729 0.460713 0.274712 0.173847 0.285994 0.099998 0.154485 0.459523 0.635908 0.184787 0.072982 0.106323 0.748421 0.039204 0.092605 0.119769 0.081342 0.061327 0.044532 0.812799 0.143120 0.043879 0.024216 0.788785 0.247544 0.092102 0.621453 0.038901 0.295531 0.036295 0.027594 0.640580 0.194561 0.305468 0.339916 0.160055 0.175038 0.193568 0.101212 0.530182 0.145226 0.167488 0.559871 0.127415 0.271501 0.237429 0.206701 0.284369 0.216834 0.109191 0.569605 0.104370 0.182624 0.177160 0.300475 0.339742 0.331737 0.198645 0.265137 0.204482 0.230155 0.359365 0.183450 0.227029 0.056581 0.067297 0.463052 0.413070 0.198891 0.324626 0.304424 0.172059 0.181968 0.287547 0.202419 0.328066 Consensus sequence: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB Reverse complement motif 0.328066 0.287547 0.202419 0.181968 0.198891 0.304424 0.324626 0.172059 0.056581 0.463052 0.067297 0.413070 0.230155 0.183450 0.359365 0.227029 0.204482 0.198645 0.265137 0.331737 0.339742 0.177160 0.300475 0.182624 0.216834 0.569605 0.109191 0.104370 0.284369 0.237429 0.206701 0.271501 0.145226 0.559871 0.167488 0.127415 0.530182 0.193568 0.101212 0.175038 0.194561 0.339916 0.305468 0.160055 0.640580 0.036295 0.027594 0.295531 0.247544 0.621453 0.092102 0.038901 0.788785 0.043879 0.024216 0.143120 0.812799 0.061327 0.044532 0.081342 0.119769 0.039204 0.092605 0.748421 0.106323 0.184787 0.072982 0.635908 0.459523 0.099998 0.154485 0.285994 0.090729 0.274712 0.460713 0.173847 0.206450 0.358017 0.265630 0.169903 0.583441 0.114442 0.145630 0.156488 0.067627 0.654425 0.131333 0.146615 Consensus sequence: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC Alignment: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB ----RRCTRRRTCTCRRRCTRY ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00526 Foxn1_primary Reverse Complement Original Motif Forward 1 18 0.047366 Species: Mus musculus Original motif 0.456612 0.057181 0.078281 0.407926 0.460529 0.185506 0.083106 0.270859 0.445717 0.179510 0.239355 0.135417 0.116339 0.145186 0.275331 0.463144 0.239398 0.142078 0.480004 0.138520 0.355157 0.217877 0.284296 0.142670 0.318602 0.444835 0.153321 0.083243 0.609569 0.055866 0.280349 0.054216 0.062297 0.769824 0.027844 0.140035 0.151868 0.019245 0.803188 0.025699 0.011842 0.952534 0.017959 0.017665 0.017665 0.017959 0.952534 0.011842 0.025699 0.803188 0.019245 0.151868 0.140035 0.027844 0.769824 0.062297 0.054216 0.280349 0.055866 0.609569 0.013084 0.624655 0.177956 0.184305 0.287647 0.183527 0.295753 0.233074 0.042309 0.345931 0.198458 0.413301 0.338138 0.266033 0.045367 0.350462 0.302850 0.155320 0.074662 0.467168 0.240926 0.068901 0.283055 0.407118 0.409954 0.183157 0.154186 0.252704 Consensus sequence: WHVBVVMACGCGCGTCDYHWDH Reverse complement motif 0.252704 0.183157 0.154186 0.409954 0.407118 0.068901 0.283055 0.240926 0.467168 0.155320 0.074662 0.302850 0.350462 0.266033 0.045367 0.338138 0.413301 0.345931 0.198458 0.042309 0.287647 0.295753 0.183527 0.233074 0.013084 0.177956 0.624655 0.184305 0.609569 0.280349 0.055866 0.054216 0.140035 0.769824 0.027844 0.062297 0.025699 0.019245 0.803188 0.151868 0.017665 0.952534 0.017959 0.011842 0.011842 0.017959 0.952534 0.017665 0.151868 0.803188 0.019245 0.025699 0.062297 0.027844 0.769824 0.140035 0.054216 0.055866 0.280349 0.609569 0.318602 0.153321 0.444835 0.083243 0.142670 0.217877 0.284296 0.355157 0.239398 0.480004 0.142078 0.138520 0.463144 0.145186 0.275331 0.116339 0.135417 0.179510 0.239355 0.445717 0.270859 0.185506 0.083106 0.460529 0.407926 0.057181 0.078281 0.456612 Consensus sequence: HDWHMHGACGCGCGTRBVVBHW Alignment: WHVBVVMACGCGCGTCDYHWDH RRCTRRRTCTCRRRCTRY---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 3 18 0.048097 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB --MKAGMKMGAGAKMKAGMK--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00527 Foxn4_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 4 18 0.049390 Species: Mus musculus Original motif 0.298336 0.418632 0.208054 0.074978 0.289907 0.015608 0.457100 0.237385 0.273583 0.077889 0.107860 0.540668 0.184954 0.161611 0.384390 0.269045 0.521826 0.156340 0.089019 0.232815 0.356716 0.131104 0.394857 0.117323 0.266669 0.108765 0.505273 0.119293 0.020778 0.047199 0.919524 0.012500 0.948536 0.018775 0.008113 0.024576 0.010822 0.964042 0.014701 0.010434 0.007428 0.019505 0.966351 0.006717 0.010025 0.975678 0.008648 0.005649 0.043796 0.120935 0.742979 0.092289 0.008252 0.250704 0.541132 0.199913 0.474428 0.044681 0.134430 0.346461 0.146597 0.421317 0.143166 0.288920 0.020540 0.181479 0.553811 0.244170 0.129612 0.173360 0.535219 0.161808 0.506084 0.158156 0.130983 0.204776 0.054872 0.103043 0.545792 0.296293 0.389882 0.171037 0.164162 0.274918 0.225861 0.314031 0.288872 0.171237 Consensus sequence: VDWDARRGACGCGGWHGGAKHV Reverse complement motif 0.225861 0.288872 0.314031 0.171237 0.274918 0.171037 0.164162 0.389882 0.054872 0.545792 0.103043 0.296293 0.204776 0.158156 0.130983 0.506084 0.129612 0.535219 0.173360 0.161808 0.020540 0.553811 0.181479 0.244170 0.146597 0.143166 0.421317 0.288920 0.346461 0.044681 0.134430 0.474428 0.008252 0.541132 0.250704 0.199913 0.043796 0.742979 0.120935 0.092289 0.010025 0.008648 0.975678 0.005649 0.007428 0.966351 0.019505 0.006717 0.010822 0.014701 0.964042 0.010434 0.024576 0.018775 0.008113 0.948536 0.020778 0.919524 0.047199 0.012500 0.266669 0.505273 0.108765 0.119293 0.356716 0.394857 0.131104 0.117323 0.232815 0.156340 0.089019 0.521826 0.184954 0.384390 0.161611 0.269045 0.540668 0.077889 0.107860 0.273583 0.289907 0.457100 0.015608 0.237385 0.298336 0.208054 0.418632 0.074978 Consensus sequence: VHYTCCDWCCGCGTCMMTHWHV Alignment: VDWDARRGACGCGGWHGGAKHV -RRCTRRRTCTCRRRCTRY--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 37 Motif name: C037 Original motif 0.009901 0.336634 0.524752 0.128713 0.280000 0.210000 0.400000 0.110000 0.039604 0.831683 0.019802 0.108911 0.138614 0.792079 0.009901 0.059406 0.227723 0.188119 0.544554 0.039604 0.020000 0.400000 0.340000 0.240000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.424242 0.393939 0.090909 0.090909 0.040404 0.929293 0.010101 0.020202 0.280000 0.680000 0.010000 0.030000 0.200000 0.280000 0.510000 0.010000 0.030000 0.470000 0.210000 0.290000 0.010000 0.950000 0.030000 0.010000 0.524752 0.336634 0.029703 0.108911 0.010000 0.730000 0.130000 0.130000 0.120000 0.820000 0.050000 0.010000 0.217822 0.237624 0.465347 0.079208 0.050000 0.440000 0.300000 0.210000 Consensus sequence: SVCCGBCMCCSYCMCCVB Reserve complement motif 0.050000 0.300000 0.440000 0.210000 0.217822 0.465347 0.237624 0.079208 0.120000 0.050000 0.820000 0.010000 0.010000 0.130000 0.730000 0.130000 0.108911 0.336634 0.029703 0.524752 0.010000 0.030000 0.950000 0.010000 0.030000 0.210000 0.470000 0.290000 0.200000 0.510000 0.280000 0.010000 0.280000 0.010000 0.680000 0.030000 0.040404 0.010101 0.929293 0.020202 0.090909 0.393939 0.090909 0.424242 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.020000 0.340000 0.400000 0.240000 0.227723 0.544554 0.188119 0.039604 0.138614 0.009901 0.792079 0.059406 0.039604 0.019802 0.831683 0.108911 0.280000 0.400000 0.210000 0.110000 0.009901 0.524752 0.336634 0.128713 Consensus sequence: BVGGYGKSGGYGBCGGVS ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 37 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 2 18 0.026592 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK -BVGGYGKSGGYGBCGGVS--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 3 18 0.036312 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB --BVGGYGKSGGYGBCGGVS--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 3 18 0.037650 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH ---SVCCGBCMCCSYCMCCVB-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00400 Zif268 Reverse Complement Reverse Complement Forward 5 18 0.040963 Species: Mus musculus Original motif 0.104824 0.412716 0.254506 0.227955 0.644922 0.065476 0.140479 0.149122 0.201205 0.166164 0.347131 0.285501 0.360606 0.256316 0.150766 0.232313 0.199831 0.240681 0.279350 0.280137 0.234308 0.204076 0.321306 0.240310 0.274112 0.462435 0.111425 0.152028 0.067070 0.717501 0.073934 0.141496 0.106745 0.084442 0.658566 0.150247 0.025128 0.967053 0.003585 0.004234 0.006412 0.982989 0.003227 0.007371 0.009588 0.877620 0.002571 0.110221 0.621521 0.355443 0.015669 0.007366 0.002600 0.980275 0.004191 0.012934 0.118773 0.026658 0.783843 0.070725 0.022358 0.822101 0.024684 0.130857 0.713212 0.080912 0.128793 0.077084 0.166568 0.250955 0.107934 0.474544 0.225040 0.222494 0.163301 0.389166 0.268976 0.223206 0.265314 0.242504 0.137052 0.229058 0.148439 0.485451 0.135819 0.304550 0.141994 0.417637 0.272440 0.319501 0.230580 0.177478 Consensus sequence: BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV Reverse complement motif 0.272440 0.230580 0.319501 0.177478 0.417637 0.304550 0.141994 0.135819 0.485451 0.229058 0.148439 0.137052 0.242504 0.223206 0.265314 0.268976 0.389166 0.222494 0.163301 0.225040 0.474544 0.250955 0.107934 0.166568 0.077084 0.080912 0.128793 0.713212 0.022358 0.024684 0.822101 0.130857 0.118773 0.783843 0.026658 0.070725 0.002600 0.004191 0.980275 0.012934 0.007366 0.355443 0.015669 0.621521 0.009588 0.002571 0.877620 0.110221 0.006412 0.003227 0.982989 0.007371 0.025128 0.003585 0.967053 0.004234 0.106745 0.658566 0.084442 0.150247 0.067070 0.073934 0.717501 0.141496 0.274112 0.111425 0.462435 0.152028 0.234308 0.321306 0.204076 0.240310 0.280137 0.240681 0.279350 0.199831 0.232313 0.256316 0.150766 0.360606 0.201205 0.347131 0.166164 0.285501 0.149122 0.065476 0.140479 0.644922 0.104824 0.254506 0.412716 0.227955 Consensus sequence: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB Alignment: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB ----BVGGYGKSGGYGBCGGVS- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v015681_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 1 18 0.045486 Species: Mus musculus Original motif 0.214165 0.143436 0.372522 0.269876 0.314445 0.406003 0.160351 0.119201 0.137147 0.092924 0.042921 0.727007 0.044121 0.072843 0.051741 0.831295 0.261292 0.324124 0.298498 0.116086 0.258125 0.323243 0.263362 0.155271 0.204557 0.589399 0.107153 0.098891 0.371021 0.244027 0.291102 0.093849 0.096327 0.572718 0.011797 0.319159 0.027282 0.046183 0.844519 0.082016 0.018921 0.012887 0.915917 0.052275 0.364793 0.166722 0.084229 0.384256 0.028216 0.011233 0.951056 0.009495 0.054974 0.004738 0.890377 0.049911 0.006802 0.312915 0.134247 0.546036 0.241289 0.628210 0.104788 0.025713 0.237863 0.302807 0.213018 0.246311 0.349399 0.203220 0.086635 0.360746 0.386634 0.144693 0.246895 0.221779 0.425101 0.354676 0.093374 0.126849 0.060272 0.391320 0.104905 0.443503 0.162090 0.190233 0.227433 0.420244 Consensus sequence: DVTTVVCVYGGHGGYCHHDMYB Reverse complement motif 0.420244 0.190233 0.227433 0.162090 0.443503 0.391320 0.104905 0.060272 0.126849 0.354676 0.093374 0.425101 0.221779 0.144693 0.246895 0.386634 0.360746 0.203220 0.086635 0.349399 0.237863 0.213018 0.302807 0.246311 0.241289 0.104788 0.628210 0.025713 0.546036 0.312915 0.134247 0.006802 0.054974 0.890377 0.004738 0.049911 0.028216 0.951056 0.011233 0.009495 0.384256 0.166722 0.084229 0.364793 0.018921 0.915917 0.012887 0.052275 0.027282 0.844519 0.046183 0.082016 0.096327 0.011797 0.572718 0.319159 0.093849 0.244027 0.291102 0.371021 0.204557 0.107153 0.589399 0.098891 0.258125 0.263362 0.323243 0.155271 0.261292 0.298498 0.324124 0.116086 0.831295 0.072843 0.051741 0.044121 0.727007 0.092924 0.042921 0.137147 0.314445 0.160351 0.406003 0.119201 0.214165 0.372522 0.143436 0.269876 Consensus sequence: VMYDHDGMCCHCCKBGVVAAVH Alignment: VMYDHDGMCCHCCKBGVVAAVH ----BVGGYGKSGGYGBCGGVS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 38 Motif name: C038 Original motif 0.504950 0.029703 0.435644 0.029703 0.550000 0.070000 0.320000 0.060000 0.560000 0.030000 0.400000 0.010000 0.797980 0.131313 0.040404 0.030303 0.020000 0.040000 0.010000 0.930000 0.010000 0.940000 0.020000 0.030000 0.020000 0.750000 0.030000 0.200000 0.454545 0.050505 0.282828 0.212121 0.070000 0.460000 0.440000 0.030000 0.040404 0.898990 0.030303 0.030303 0.030000 0.020000 0.020000 0.930000 0.010000 0.050000 0.880000 0.060000 0.010000 0.950000 0.010000 0.030000 0.010000 0.840000 0.020000 0.130000 0.020000 0.060000 0.010000 0.910000 0.020000 0.580000 0.070000 0.330000 0.180000 0.090000 0.040000 0.690000 Consensus sequence: RRRATCCDSCTGCCTYT Reserve complement motif 0.690000 0.090000 0.040000 0.180000 0.020000 0.070000 0.580000 0.330000 0.910000 0.060000 0.010000 0.020000 0.010000 0.020000 0.840000 0.130000 0.010000 0.010000 0.950000 0.030000 0.010000 0.880000 0.050000 0.060000 0.930000 0.020000 0.020000 0.030000 0.040404 0.030303 0.898990 0.030303 0.070000 0.440000 0.460000 0.030000 0.212121 0.050505 0.282828 0.454545 0.020000 0.030000 0.750000 0.200000 0.010000 0.020000 0.940000 0.030000 0.930000 0.040000 0.010000 0.020000 0.030303 0.131313 0.040404 0.797980 0.010000 0.030000 0.400000 0.560000 0.060000 0.070000 0.320000 0.550000 0.029703 0.029703 0.435644 0.504950 Consensus sequence: AKAGGCAGSDGGATKKK ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 38 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00528 Foxm1_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 17 0.033289 Species: Mus musculus Original motif 0.402634 0.249702 0.143705 0.203959 0.709619 0.108953 0.130781 0.050647 0.334232 0.077498 0.228818 0.359452 0.131721 0.094794 0.234481 0.539005 0.170102 0.237609 0.252464 0.339824 0.244961 0.347304 0.228129 0.179606 0.612141 0.132244 0.180110 0.075504 0.472236 0.042388 0.234419 0.250957 0.125213 0.007413 0.849788 0.017587 0.702068 0.064216 0.141992 0.091724 0.008657 0.038238 0.002959 0.950145 0.007170 0.002244 0.986824 0.003763 0.002862 0.979956 0.000711 0.016471 0.971196 0.001954 0.011441 0.015409 0.105575 0.031482 0.022836 0.840107 0.031534 0.736742 0.032785 0.198939 0.479153 0.347558 0.031799 0.141490 0.056405 0.123140 0.023989 0.796466 0.111194 0.195344 0.501360 0.192102 0.376359 0.416820 0.072818 0.134004 0.225111 0.249460 0.306563 0.218866 0.405251 0.168478 0.108618 0.317653 0.165386 0.191749 0.268604 0.374261 Consensus sequence: HADTBVADGATGCATCMTGMVHB Reverse complement motif 0.374261 0.191749 0.268604 0.165386 0.317653 0.168478 0.108618 0.405251 0.225111 0.306563 0.249460 0.218866 0.376359 0.072818 0.416820 0.134004 0.111194 0.501360 0.195344 0.192102 0.796466 0.123140 0.023989 0.056405 0.141490 0.347558 0.031799 0.479153 0.031534 0.032785 0.736742 0.198939 0.840107 0.031482 0.022836 0.105575 0.015409 0.001954 0.011441 0.971196 0.002862 0.000711 0.979956 0.016471 0.007170 0.986824 0.002244 0.003763 0.950145 0.038238 0.002959 0.008657 0.091724 0.064216 0.141992 0.702068 0.125213 0.849788 0.007413 0.017587 0.250957 0.042388 0.234419 0.472236 0.075504 0.132244 0.180110 0.612141 0.244961 0.228129 0.347304 0.179606 0.339824 0.237609 0.252464 0.170102 0.539005 0.094794 0.234481 0.131721 0.359452 0.077498 0.228818 0.334232 0.050647 0.108953 0.130781 0.709619 0.203959 0.249702 0.143705 0.402634 Consensus sequence: VHVRCAYGATGCATCDTVVADTH Alignment: VHVRCAYGATGCATCDTVVADTH ------AKAGGCAGSDGGATKKK ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00022 Zfp740_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 1 17 0.041598 Species: Mus musculus Original motif 0.398967 0.071604 0.323957 0.205472 0.457709 0.058192 0.267218 0.216881 0.393346 0.032365 0.329533 0.244756 0.119528 0.091191 0.190078 0.599202 0.273933 0.123548 0.073075 0.529444 0.068935 0.812883 0.015245 0.102937 0.029664 0.907790 0.024804 0.037742 0.020725 0.933422 0.016796 0.029057 0.015086 0.948448 0.018030 0.018436 0.015628 0.884941 0.061172 0.038259 0.067508 0.744063 0.107305 0.081125 0.108097 0.140614 0.650174 0.101115 0.065696 0.247239 0.506149 0.180916 0.395005 0.077185 0.345914 0.181895 0.527081 0.093650 0.281853 0.097416 0.289378 0.245159 0.348803 0.116660 0.147136 0.260117 0.145993 0.446754 Consensus sequence: DDDTWCCCCCCGGDRVH Reverse complement motif 0.446754 0.260117 0.145993 0.147136 0.289378 0.348803 0.245159 0.116660 0.097416 0.093650 0.281853 0.527081 0.181895 0.077185 0.345914 0.395005 0.065696 0.506149 0.247239 0.180916 0.108097 0.650174 0.140614 0.101115 0.067508 0.107305 0.744063 0.081125 0.015628 0.061172 0.884941 0.038259 0.015086 0.018030 0.948448 0.018436 0.020725 0.016796 0.933422 0.029057 0.029664 0.024804 0.907790 0.037742 0.068935 0.015245 0.812883 0.102937 0.529444 0.123548 0.073075 0.273933 0.599202 0.091191 0.190078 0.119528 0.244756 0.032365 0.329533 0.393346 0.216881 0.058192 0.267218 0.457709 0.205472 0.071604 0.323957 0.398967 Consensus sequence: HVKDCCGGGGGGWADDD Alignment: HVKDCCGGGGGGWADDD AKAGGCAGSDGGATKKK ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00046 Tcfe2a_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 1 17 0.046783 Species: Mus musculus Original motif 0.296417 0.247522 0.206749 0.249312 0.410113 0.201959 0.303149 0.084779 0.267313 0.132645 0.452057 0.147985 0.187929 0.136827 0.427628 0.247616 0.198671 0.425254 0.234160 0.141915 0.029244 0.953929 0.004092 0.012734 0.954570 0.014314 0.018695 0.012421 0.010025 0.055055 0.845504 0.089415 0.874802 0.040849 0.069178 0.015172 0.015084 0.010551 0.008736 0.965628 0.012981 0.007192 0.965036 0.014791 0.037724 0.016891 0.495632 0.449753 0.021685 0.438927 0.056118 0.483270 0.209872 0.365671 0.139706 0.284751 0.151815 0.336912 0.289382 0.221891 0.152995 0.262354 0.416434 0.168217 0.227567 0.187603 0.447892 0.136938 Consensus sequence: HVDDVCAGATGKYHBBV Reverse complement motif 0.227567 0.447892 0.187603 0.136938 0.152995 0.416434 0.262354 0.168217 0.151815 0.289382 0.336912 0.221891 0.209872 0.139706 0.365671 0.284751 0.483270 0.438927 0.056118 0.021685 0.037724 0.495632 0.016891 0.449753 0.012981 0.965036 0.007192 0.014791 0.965628 0.010551 0.008736 0.015084 0.015172 0.040849 0.069178 0.874802 0.010025 0.845504 0.055055 0.089415 0.012421 0.014314 0.018695 0.954570 0.029244 0.004092 0.953929 0.012734 0.198671 0.234160 0.425254 0.141915 0.187929 0.427628 0.136827 0.247616 0.267313 0.452057 0.132645 0.147985 0.084779 0.201959 0.303149 0.410113 0.249312 0.247522 0.206749 0.296417 Consensus sequence: VBBDMYCATCTGVHHBH Alignment: HVDDVCAGATGKYHBBV AKAGGCAGSDGGATKKK ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00050 Bhlhb2_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 4 17 0.047608 Species: Mus musculus Original motif 0.120938 0.344851 0.124072 0.410138 0.220931 0.169844 0.422396 0.186829 0.127752 0.260812 0.103811 0.507625 0.140641 0.405473 0.287668 0.166218 0.296957 0.155579 0.301094 0.246370 0.219647 0.287193 0.154072 0.339087 0.049294 0.026059 0.121789 0.802859 0.520042 0.289284 0.173423 0.017251 0.049190 0.943472 0.004308 0.003030 0.902609 0.006767 0.074770 0.015854 0.003221 0.971329 0.005512 0.019937 0.019937 0.005512 0.971329 0.003221 0.015854 0.074770 0.006767 0.902609 0.003030 0.004308 0.943472 0.049190 0.003497 0.088920 0.685942 0.221641 0.802859 0.121789 0.026059 0.049294 0.334544 0.155170 0.275193 0.235092 0.275957 0.132104 0.454982 0.136957 0.134097 0.254352 0.422940 0.188611 0.396163 0.432784 0.051281 0.119772 0.276474 0.115627 0.419844 0.188056 0.160759 0.088061 0.649863 0.101318 0.203314 0.166595 0.106821 0.523270 Consensus sequence: YDYBDHTMCACGTGGADDBMDGT Reverse complement motif 0.523270 0.166595 0.106821 0.203314 0.160759 0.649863 0.088061 0.101318 0.276474 0.419844 0.115627 0.188056 0.396163 0.051281 0.432784 0.119772 0.134097 0.422940 0.254352 0.188611 0.275957 0.454982 0.132104 0.136957 0.235092 0.155170 0.275193 0.334544 0.049294 0.121789 0.026059 0.802859 0.003497 0.685942 0.088920 0.221641 0.003030 0.943472 0.004308 0.049190 0.902609 0.074770 0.006767 0.015854 0.019937 0.971329 0.005512 0.003221 0.003221 0.005512 0.971329 0.019937 0.015854 0.006767 0.074770 0.902609 0.049190 0.004308 0.943472 0.003030 0.017251 0.289284 0.173423 0.520042 0.802859 0.026059 0.121789 0.049294 0.339087 0.287193 0.154072 0.219647 0.296957 0.301094 0.155579 0.246370 0.140641 0.287668 0.405473 0.166218 0.507625 0.260812 0.103811 0.127752 0.220931 0.422396 0.169844 0.186829 0.410138 0.344851 0.124072 0.120938 Consensus sequence: ACHRBHDTCCACGTGYAHHBMHM Alignment: ACHRBHDTCCACGTGYAHHBMHM ---RRRATCCDSCTGCCTYT--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00526 Foxn1_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 2 17 0.048267 Species: Mus musculus Original motif 0.477863 0.106306 0.184102 0.231729 0.304951 0.149020 0.361418 0.184612 0.548996 0.056128 0.348902 0.045974 0.385727 0.477782 0.086218 0.050273 0.409556 0.232265 0.173851 0.184328 0.174550 0.312880 0.307123 0.205448 0.850398 0.047204 0.041665 0.060734 0.141234 0.548534 0.142230 0.168002 0.059462 0.026354 0.892948 0.021236 0.053714 0.870297 0.028935 0.047055 0.086273 0.069147 0.805284 0.039296 0.033781 0.573881 0.034115 0.358223 0.035191 0.079663 0.824970 0.060176 0.051830 0.862631 0.019359 0.066180 0.178685 0.015738 0.762485 0.043092 0.058988 0.042615 0.017608 0.880789 0.202382 0.173360 0.284095 0.340163 0.098493 0.234651 0.506524 0.160333 0.109087 0.336204 0.250510 0.304198 0.130945 0.250843 0.177122 0.441090 0.353830 0.138838 0.162784 0.344548 0.114290 0.417163 0.160662 0.307885 Consensus sequence: DDRMHBACGCGYGCGTDGBBDB Reverse complement motif 0.114290 0.160662 0.417163 0.307885 0.344548 0.138838 0.162784 0.353830 0.441090 0.250843 0.177122 0.130945 0.109087 0.250510 0.336204 0.304198 0.098493 0.506524 0.234651 0.160333 0.340163 0.173360 0.284095 0.202382 0.880789 0.042615 0.017608 0.058988 0.178685 0.762485 0.015738 0.043092 0.051830 0.019359 0.862631 0.066180 0.035191 0.824970 0.079663 0.060176 0.033781 0.034115 0.573881 0.358223 0.086273 0.805284 0.069147 0.039296 0.053714 0.028935 0.870297 0.047055 0.059462 0.892948 0.026354 0.021236 0.141234 0.142230 0.548534 0.168002 0.060734 0.047204 0.041665 0.850398 0.174550 0.307123 0.312880 0.205448 0.184328 0.232265 0.173851 0.409556 0.385727 0.086218 0.477782 0.050273 0.045974 0.056128 0.348902 0.548996 0.304951 0.361418 0.149020 0.184612 0.231729 0.106306 0.184102 0.477863 Consensus sequence: BDVBCDACGCKCGCGTBHRKHD Alignment: DDRMHBACGCGYGCGTDGBBDB -RRRATCCDSCTGCCTYT---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 39 Motif name: C039 Original motif 0.059406 0.396040 0.475248 0.069307 0.330000 0.430000 0.220000 0.020000 0.811881 0.009901 0.158416 0.019802 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.310000 0.020000 0.480000 0.190000 0.180000 0.300000 0.500000 0.020000 0.089109 0.782178 0.099010 0.029703 0.930000 0.010000 0.050000 0.010000 0.030000 0.010000 0.950000 0.010000 0.020000 0.570000 0.360000 0.050000 0.010000 0.510000 0.280000 0.200000 0.210000 0.470000 0.010000 0.310000 0.178218 0.009901 0.742574 0.069307 0.089109 0.009901 0.861386 0.039604 0.060000 0.190000 0.410000 0.340000 0.108911 0.504950 0.376238 0.009901 Consensus sequence: SMAGRSCAGSSYGGBS Reserve complement motif 0.108911 0.376238 0.504950 0.009901 0.060000 0.410000 0.190000 0.340000 0.089109 0.861386 0.009901 0.039604 0.178218 0.742574 0.009901 0.069307 0.210000 0.010000 0.470000 0.310000 0.010000 0.280000 0.510000 0.200000 0.020000 0.360000 0.570000 0.050000 0.030000 0.950000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.050000 0.930000 0.089109 0.099010 0.782178 0.029703 0.180000 0.500000 0.300000 0.020000 0.310000 0.480000 0.020000 0.190000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.019802 0.009901 0.158416 0.811881 0.330000 0.220000 0.430000 0.020000 0.059406 0.475248 0.396040 0.069307 Consensus sequence: SBCCKSSCTGSMCTRS ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 39 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v015681_primaryOriginal Motif Original Motif Forward 6 16 0.038116 Species: Mus musculus Original motif 0.472795 0.179227 0.091251 0.256726 0.036521 0.159743 0.204840 0.598896 0.164582 0.312805 0.221324 0.301289 0.237069 0.249050 0.293048 0.220833 0.401949 0.225181 0.229401 0.143469 0.161422 0.494334 0.252207 0.092036 0.252940 0.177721 0.369400 0.199939 0.119630 0.024651 0.849920 0.005798 0.000962 0.002398 0.990616 0.006023 0.937852 0.027016 0.034535 0.000597 0.008963 0.987756 0.000629 0.002652 0.001584 0.992898 0.002349 0.003169 0.956822 0.027342 0.002484 0.013352 0.009873 0.987759 0.000988 0.001381 0.016397 0.980856 0.000369 0.002378 0.081761 0.758555 0.038572 0.121112 0.371713 0.091838 0.448027 0.088423 0.111617 0.121913 0.683885 0.082585 0.334562 0.102916 0.436488 0.126034 0.210362 0.101261 0.238339 0.450037 0.169041 0.271583 0.320799 0.238576 0.140316 0.049885 0.735236 0.074563 Consensus sequence: HTBVVVDGGACCACCCRGRDBG Reverse complement motif 0.140316 0.735236 0.049885 0.074563 0.169041 0.320799 0.271583 0.238576 0.450037 0.101261 0.238339 0.210362 0.334562 0.436488 0.102916 0.126034 0.111617 0.683885 0.121913 0.082585 0.371713 0.448027 0.091838 0.088423 0.081761 0.038572 0.758555 0.121112 0.016397 0.000369 0.980856 0.002378 0.009873 0.000988 0.987759 0.001381 0.013352 0.027342 0.002484 0.956822 0.001584 0.002349 0.992898 0.003169 0.008963 0.000629 0.987756 0.002652 0.000597 0.027016 0.034535 0.937852 0.000962 0.990616 0.002398 0.006023 0.119630 0.849920 0.024651 0.005798 0.252940 0.369400 0.177721 0.199939 0.161422 0.252207 0.494334 0.092036 0.143469 0.225181 0.229401 0.401949 0.237069 0.293048 0.249050 0.220833 0.164582 0.221324 0.312805 0.301289 0.598896 0.159743 0.204840 0.036521 0.256726 0.179227 0.091251 0.472795 Consensus sequence: CBDMCMGGGTGGTCCHVBVBAH Alignment: HTBVVVDGGACCACCCRGRDBG -----SMAGRSCAGSSYGGBS- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_primaryReverse Complement Original Motif Forward 4 16 0.040692 Species: Mus musculus Original motif 0.204923 0.208846 0.365383 0.220848 0.294304 0.300143 0.167287 0.238266 0.109711 0.619514 0.117379 0.153396 0.178979 0.378580 0.230177 0.212264 0.159594 0.542602 0.118178 0.179627 0.125206 0.430074 0.151826 0.292894 0.097692 0.709845 0.116956 0.075506 0.148292 0.565912 0.037632 0.248164 0.077951 0.034190 0.855503 0.032356 0.001657 0.001061 0.971877 0.025405 0.001926 0.001084 0.991712 0.005278 0.033031 0.012001 0.057796 0.897171 0.002723 0.002647 0.993348 0.001281 0.003261 0.000963 0.987199 0.008577 0.000611 0.090925 0.074857 0.833608 0.015299 0.978878 0.004949 0.000874 0.013368 0.600902 0.033485 0.352245 0.231949 0.149575 0.118804 0.499672 0.267580 0.186002 0.371242 0.175176 0.264884 0.223483 0.110082 0.401551 0.221365 0.170121 0.179559 0.428955 0.112997 0.692930 0.139981 0.054092 0.460305 0.207883 0.155111 0.176702 Consensus sequence: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH Reverse complement motif 0.176702 0.207883 0.155111 0.460305 0.112997 0.139981 0.692930 0.054092 0.428955 0.170121 0.179559 0.221365 0.401551 0.223483 0.110082 0.264884 0.267580 0.371242 0.186002 0.175176 0.499672 0.149575 0.118804 0.231949 0.013368 0.033485 0.600902 0.352245 0.015299 0.004949 0.978878 0.000874 0.833608 0.090925 0.074857 0.000611 0.003261 0.987199 0.000963 0.008577 0.002723 0.993348 0.002647 0.001281 0.897171 0.012001 0.057796 0.033031 0.001926 0.991712 0.001084 0.005278 0.001657 0.971877 0.001061 0.025405 0.077951 0.855503 0.034190 0.032356 0.148292 0.037632 0.565912 0.248164 0.097692 0.116956 0.709845 0.075506 0.125206 0.151826 0.430074 0.292894 0.159594 0.118178 0.542602 0.179627 0.178979 0.230177 0.378580 0.212264 0.109711 0.117379 0.619514 0.153396 0.294304 0.167287 0.300143 0.238266 0.204923 0.365383 0.208846 0.220848 Consensus sequence: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB Alignment: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH ---SBCCKSSCTGSMCTRS---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00000 Smad3_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 16 0.041681 Species: Mus musculus Original motif 0.282316 0.413385 0.114930 0.189369 0.341654 0.135011 0.267943 0.255392 0.399523 0.173081 0.168845 0.258551 0.365086 0.196360 0.211856 0.226699 0.243321 0.177839 0.224206 0.354635 0.029873 0.808479 0.036309 0.125339 0.004945 0.815465 0.040635 0.138955 0.934557 0.058944 0.005027 0.001471 0.005099 0.003998 0.986148 0.004755 0.969304 0.020594 0.001929 0.008173 0.008189 0.984816 0.004199 0.002795 0.669579 0.012182 0.282153 0.036085 0.130511 0.171241 0.334041 0.364207 0.198982 0.289660 0.252392 0.258966 0.423172 0.190978 0.164411 0.221440 0.213519 0.287388 0.294414 0.204679 0.371956 0.285061 0.150191 0.192792 Consensus sequence: HDHDDCCAGACABBHVH Reverse complement motif 0.192792 0.285061 0.150191 0.371956 0.213519 0.294414 0.287388 0.204679 0.221440 0.190978 0.164411 0.423172 0.198982 0.252392 0.289660 0.258966 0.364207 0.171241 0.334041 0.130511 0.036085 0.012182 0.282153 0.669579 0.008189 0.004199 0.984816 0.002795 0.008173 0.020594 0.001929 0.969304 0.005099 0.986148 0.003998 0.004755 0.001471 0.058944 0.005027 0.934557 0.004945 0.040635 0.815465 0.138955 0.029873 0.036309 0.808479 0.125339 0.354635 0.177839 0.224206 0.243321 0.226699 0.196360 0.211856 0.365086 0.258551 0.173081 0.168845 0.399523 0.255392 0.135011 0.267943 0.341654 0.282316 0.114930 0.413385 0.189369 Consensus sequence: HVHBVTGTCTGGDDHDD Alignment: HVHBVTGTCTGGDDHDD -SBCCKSSCTGSMCTRS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_primaryOriginal Motif Original Motif Backward 2 16 0.041797 Species: Mus musculus Original motif 0.180868 0.321661 0.134642 0.362829 0.232215 0.134289 0.315356 0.318141 0.065068 0.093681 0.569842 0.271408 0.370822 0.229680 0.154738 0.244759 0.323039 0.182873 0.173588 0.320500 0.175039 0.266898 0.276080 0.281984 0.412669 0.147730 0.146326 0.293275 0.325953 0.028805 0.629596 0.015646 0.003017 0.001766 0.979711 0.015507 0.888973 0.040666 0.069420 0.000941 0.017309 0.979155 0.000899 0.002637 0.001732 0.988816 0.004856 0.004596 0.889763 0.078125 0.010384 0.021729 0.007566 0.987081 0.001421 0.003932 0.027797 0.966593 0.000878 0.004731 0.025816 0.867003 0.065749 0.041433 0.220658 0.075256 0.582904 0.121182 0.088946 0.283695 0.565345 0.062015 0.328012 0.241332 0.305901 0.124755 0.307302 0.137589 0.375928 0.179181 0.298752 0.231470 0.315255 0.154524 0.094565 0.142901 0.705696 0.056838 Consensus sequence: HDGHHBHRGACCACCCGSVDVG Reverse complement motif 0.094565 0.705696 0.142901 0.056838 0.298752 0.315255 0.231470 0.154524 0.307302 0.375928 0.137589 0.179181 0.124755 0.241332 0.305901 0.328012 0.088946 0.565345 0.283695 0.062015 0.220658 0.582904 0.075256 0.121182 0.025816 0.065749 0.867003 0.041433 0.027797 0.000878 0.966593 0.004731 0.007566 0.001421 0.987081 0.003932 0.021729 0.078125 0.010384 0.889763 0.001732 0.004856 0.988816 0.004596 0.017309 0.000899 0.979155 0.002637 0.000941 0.040666 0.069420 0.888973 0.003017 0.979711 0.001766 0.015507 0.325953 0.629596 0.028805 0.015646 0.293275 0.147730 0.146326 0.412669 0.281984 0.266898 0.276080 0.175039 0.320500 0.182873 0.173588 0.323039 0.244759 0.229680 0.154738 0.370822 0.065068 0.569842 0.093681 0.271408 0.318141 0.134289 0.315356 0.232215 0.362829 0.321661 0.134642 0.180868 Consensus sequence: CVHBSCGGGTGGTCMHVHHCDH Alignment: HDGHHBHRGACCACCCGSVDVG -----SMAGRSCAGSSYGGBS- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v015681_primaryReverse Complement Reverse Complement Backward 6 16 0.042498 Species: Mus musculus Original motif 0.641428 0.180211 0.044767 0.133594 0.171696 0.262981 0.334148 0.231174 0.129726 0.322735 0.243462 0.304077 0.165713 0.175735 0.256108 0.402445 0.146090 0.171890 0.412753 0.269266 0.212837 0.439192 0.280990 0.066980 0.251088 0.275516 0.374380 0.099015 0.575438 0.079656 0.338201 0.006704 0.005634 0.003422 0.972597 0.018348 0.890447 0.077034 0.031851 0.000668 0.007128 0.986862 0.000496 0.005515 0.001445 0.991564 0.001925 0.005066 0.738761 0.190157 0.026399 0.044684 0.013384 0.983783 0.000896 0.001937 0.068077 0.929549 0.000773 0.001602 0.040830 0.933742 0.005283 0.020145 0.730274 0.029225 0.145689 0.094812 0.165032 0.572838 0.162001 0.100129 0.383584 0.129942 0.429497 0.056977 0.455959 0.071959 0.208204 0.263878 0.134271 0.262985 0.222626 0.380117 0.071193 0.346594 0.346081 0.236132 0.445661 0.405278 0.053901 0.095160 Consensus sequence: ABBBBVVRGACCACCCACRDBBM Reverse complement motif 0.095160 0.405278 0.053901 0.445661 0.071193 0.346081 0.346594 0.236132 0.380117 0.262985 0.222626 0.134271 0.263878 0.071959 0.208204 0.455959 0.383584 0.429497 0.129942 0.056977 0.165032 0.162001 0.572838 0.100129 0.094812 0.029225 0.145689 0.730274 0.040830 0.005283 0.933742 0.020145 0.068077 0.000773 0.929549 0.001602 0.013384 0.000896 0.983783 0.001937 0.044684 0.190157 0.026399 0.738761 0.001445 0.001925 0.991564 0.005066 0.007128 0.000496 0.986862 0.005515 0.000668 0.077034 0.031851 0.890447 0.005634 0.972597 0.003422 0.018348 0.006704 0.079656 0.338201 0.575438 0.251088 0.374380 0.275516 0.099015 0.212837 0.280990 0.439192 0.066980 0.146090 0.412753 0.171890 0.269266 0.402445 0.175735 0.256108 0.165713 0.129726 0.243462 0.322735 0.304077 0.171696 0.334148 0.262981 0.231174 0.133594 0.180211 0.044767 0.641428 Consensus sequence: YBVDMGTGGGTGGTCKVVBVBBT Alignment: YBVDMGTGGGTGGTCKVVBVBBT --SBCCKSSCTGSMCTRS----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 40 Motif name: C040 Original motif 0.340000 0.050000 0.480000 0.130000 0.060000 0.570000 0.300000 0.070000 0.040000 0.010000 0.040000 0.910000 0.040000 0.010000 0.940000 0.010000 0.663366 0.029703 0.217822 0.089109 0.070000 0.400000 0.450000 0.080000 0.020000 0.420000 0.010000 0.550000 0.080808 0.050505 0.020202 0.848485 0.029703 0.900990 0.019802 0.049505 0.515152 0.363636 0.111111 0.010101 0.910000 0.020000 0.040000 0.030000 0.504950 0.009901 0.455446 0.029703 0.030000 0.490000 0.430000 0.050000 0.180000 0.290000 0.010000 0.520000 0.030000 0.920000 0.010000 0.040000 0.680000 0.190000 0.010000 0.120000 0.101010 0.212121 0.656566 0.030303 0.060000 0.520000 0.080000 0.340000 Consensus sequence: RSTGASYTCMARSYCAGY Reserve complement motif 0.060000 0.080000 0.520000 0.340000 0.101010 0.656566 0.212121 0.030303 0.120000 0.190000 0.010000 0.680000 0.030000 0.010000 0.920000 0.040000 0.520000 0.290000 0.010000 0.180000 0.030000 0.430000 0.490000 0.050000 0.029703 0.009901 0.455446 0.504950 0.030000 0.020000 0.040000 0.910000 0.010101 0.363636 0.111111 0.515152 0.029703 0.019802 0.900990 0.049505 0.848485 0.050505 0.020202 0.080808 0.550000 0.420000 0.010000 0.020000 0.070000 0.450000 0.400000 0.080000 0.089109 0.029703 0.217822 0.663366 0.040000 0.940000 0.010000 0.010000 0.910000 0.010000 0.040000 0.040000 0.060000 0.300000 0.570000 0.070000 0.340000 0.480000 0.050000 0.130000 Consensus sequence: KCTGMSKTYGAMSTCASM ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 40 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 5 18 0.042685 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH RSTGASYTCMARSYCAGY---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 1 18 0.044311 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB -----KCTGMSKTYGAMSTCASM ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_primaryOriginal Motif Original Motif Forward 5 18 0.045032 Species: Mus musculus Original motif 0.137831 0.118922 0.394177 0.349070 0.190108 0.163633 0.138507 0.507753 0.346002 0.332315 0.228621 0.093063 0.113254 0.287554 0.373285 0.225908 0.272578 0.125402 0.328963 0.273057 0.333973 0.115165 0.194267 0.356595 0.381054 0.086215 0.501679 0.031052 0.002232 0.007405 0.966087 0.024276 0.834741 0.112115 0.052053 0.001091 0.009034 0.983239 0.000766 0.006960 0.002054 0.988103 0.003138 0.006705 0.805772 0.171299 0.008415 0.014515 0.020076 0.976846 0.000894 0.002183 0.079914 0.917273 0.001179 0.001634 0.013983 0.950545 0.004205 0.031267 0.789407 0.039441 0.108645 0.062507 0.055453 0.161271 0.595249 0.188028 0.333424 0.128169 0.373270 0.165136 0.536103 0.109520 0.062980 0.291397 0.346477 0.090909 0.279533 0.283081 0.045892 0.190183 0.584314 0.179611 0.088294 0.406148 0.251647 0.253912 0.202467 0.447159 0.162802 0.187571 Consensus sequence: DTVBDDRGACCACCCAGDWDGBH Reverse complement motif 0.202467 0.162802 0.447159 0.187571 0.088294 0.251647 0.406148 0.253912 0.045892 0.584314 0.190183 0.179611 0.283081 0.090909 0.279533 0.346477 0.291397 0.109520 0.062980 0.536103 0.333424 0.373270 0.128169 0.165136 0.055453 0.595249 0.161271 0.188028 0.062507 0.039441 0.108645 0.789407 0.013983 0.004205 0.950545 0.031267 0.079914 0.001179 0.917273 0.001634 0.020076 0.000894 0.976846 0.002183 0.014515 0.171299 0.008415 0.805772 0.002054 0.003138 0.988103 0.006705 0.009034 0.000766 0.983239 0.006960 0.001091 0.112115 0.052053 0.834741 0.002232 0.966087 0.007405 0.024276 0.381054 0.501679 0.086215 0.031052 0.356595 0.115165 0.194267 0.333973 0.272578 0.328963 0.125402 0.273057 0.113254 0.373285 0.287554 0.225908 0.093063 0.332315 0.228621 0.346002 0.507753 0.163633 0.138507 0.190108 0.137831 0.394177 0.118922 0.349070 Consensus sequence: DBCDWHCTGGGTGGTCMDHBBAH Alignment: DTVBDDRGACCACCCAGDWDGBH ----RSTGASYTCMARSYCAGY- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00050 Bhlhb2_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 6 18 0.045566 Species: Mus musculus Original motif 0.120938 0.344851 0.124072 0.410138 0.220931 0.169844 0.422396 0.186829 0.127752 0.260812 0.103811 0.507625 0.140641 0.405473 0.287668 0.166218 0.296957 0.155579 0.301094 0.246370 0.219647 0.287193 0.154072 0.339087 0.049294 0.026059 0.121789 0.802859 0.520042 0.289284 0.173423 0.017251 0.049190 0.943472 0.004308 0.003030 0.902609 0.006767 0.074770 0.015854 0.003221 0.971329 0.005512 0.019937 0.019937 0.005512 0.971329 0.003221 0.015854 0.074770 0.006767 0.902609 0.003030 0.004308 0.943472 0.049190 0.003497 0.088920 0.685942 0.221641 0.802859 0.121789 0.026059 0.049294 0.334544 0.155170 0.275193 0.235092 0.275957 0.132104 0.454982 0.136957 0.134097 0.254352 0.422940 0.188611 0.396163 0.432784 0.051281 0.119772 0.276474 0.115627 0.419844 0.188056 0.160759 0.088061 0.649863 0.101318 0.203314 0.166595 0.106821 0.523270 Consensus sequence: YDYBDHTMCACGTGGADDBMDGT Reverse complement motif 0.523270 0.166595 0.106821 0.203314 0.160759 0.649863 0.088061 0.101318 0.276474 0.419844 0.115627 0.188056 0.396163 0.051281 0.432784 0.119772 0.134097 0.422940 0.254352 0.188611 0.275957 0.454982 0.132104 0.136957 0.235092 0.155170 0.275193 0.334544 0.049294 0.121789 0.026059 0.802859 0.003497 0.685942 0.088920 0.221641 0.003030 0.943472 0.004308 0.049190 0.902609 0.074770 0.006767 0.015854 0.019937 0.971329 0.005512 0.003221 0.003221 0.005512 0.971329 0.019937 0.015854 0.006767 0.074770 0.902609 0.049190 0.004308 0.943472 0.003030 0.017251 0.289284 0.173423 0.520042 0.802859 0.026059 0.121789 0.049294 0.339087 0.287193 0.154072 0.219647 0.296957 0.301094 0.155579 0.246370 0.140641 0.287668 0.405473 0.166218 0.507625 0.260812 0.103811 0.127752 0.220931 0.422396 0.169844 0.186829 0.410138 0.344851 0.124072 0.120938 Consensus sequence: ACHRBHDTCCACGTGYAHHBMHM Alignment: ACHRBHDTCCACGTGYAHHBMHM KCTGMSKTYGAMSTCASM----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 3 18 0.045778 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH ---RSTGASYTCMARSYCAGY-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 41 Motif name: C041 Original motif 0.070000 0.590000 0.290000 0.050000 0.120000 0.480000 0.390000 0.010000 0.050000 0.020000 0.860000 0.070000 0.770000 0.030000 0.160000 0.040000 0.140000 0.010000 0.840000 0.010000 0.090000 0.020000 0.870000 0.020000 0.010000 0.790000 0.020000 0.180000 0.440000 0.490000 0.020000 0.050000 0.080808 0.030303 0.555556 0.333333 0.700000 0.030000 0.260000 0.010000 0.030000 0.010000 0.950000 0.010000 0.030000 0.030000 0.920000 0.020000 0.090909 0.696970 0.191919 0.020202 0.600000 0.280000 0.040000 0.080000 0.010000 0.440000 0.540000 0.010000 0.130000 0.340000 0.500000 0.030000 Consensus sequence: CSGAGGCMKAGGCASS Reserve complement motif 0.130000 0.500000 0.340000 0.030000 0.010000 0.540000 0.440000 0.010000 0.080000 0.280000 0.040000 0.600000 0.090909 0.191919 0.696970 0.020202 0.030000 0.920000 0.030000 0.020000 0.030000 0.950000 0.010000 0.010000 0.010000 0.030000 0.260000 0.700000 0.080808 0.555556 0.030303 0.333333 0.440000 0.020000 0.490000 0.050000 0.010000 0.020000 0.790000 0.180000 0.090000 0.870000 0.020000 0.020000 0.140000 0.840000 0.010000 0.010000 0.040000 0.030000 0.160000 0.770000 0.050000 0.860000 0.020000 0.070000 0.120000 0.390000 0.480000 0.010000 0.070000 0.290000 0.590000 0.050000 Consensus sequence: SSTGCCTYRGCCTCSG ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 41 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00098 Rfx3_primary Reverse Complement Original Motif Forward 3 16 0.029747 Species: Mus musculus Original motif 0.218345 0.231533 0.152528 0.397594 0.264604 0.126115 0.320860 0.288421 0.117304 0.186844 0.172946 0.522906 0.111929 0.277908 0.409084 0.201079 0.343319 0.311376 0.123612 0.221692 0.193354 0.374280 0.157338 0.275028 0.166348 0.578991 0.130872 0.123789 0.006937 0.931183 0.046809 0.015072 0.255581 0.289587 0.125513 0.329319 0.002582 0.012615 0.002782 0.982021 0.850584 0.007973 0.140639 0.000803 0.037792 0.002285 0.957277 0.002646 0.009414 0.921481 0.001636 0.067469 0.943403 0.000980 0.042401 0.013216 0.991166 0.002931 0.003540 0.002364 0.003651 0.987110 0.001106 0.008133 0.208873 0.369705 0.319129 0.102292 0.322535 0.186617 0.374187 0.116660 0.326738 0.179486 0.226374 0.267402 0.299697 0.185329 0.133025 0.381949 0.300824 0.266836 0.096437 0.335904 0.418443 0.191068 0.127183 0.263306 0.386727 0.204062 0.126050 0.283161 Consensus sequence: HDTBHHCCHTAGCAACVVDHHHH Reverse complement motif 0.283161 0.204062 0.126050 0.386727 0.263306 0.191068 0.127183 0.418443 0.335904 0.266836 0.096437 0.300824 0.381949 0.185329 0.133025 0.299697 0.267402 0.179486 0.226374 0.326738 0.322535 0.374187 0.186617 0.116660 0.208873 0.319129 0.369705 0.102292 0.003651 0.001106 0.987110 0.008133 0.002364 0.002931 0.003540 0.991166 0.013216 0.000980 0.042401 0.943403 0.009414 0.001636 0.921481 0.067469 0.037792 0.957277 0.002285 0.002646 0.000803 0.007973 0.140639 0.850584 0.982021 0.012615 0.002782 0.002582 0.329319 0.289587 0.125513 0.255581 0.006937 0.046809 0.931183 0.015072 0.166348 0.130872 0.578991 0.123789 0.193354 0.157338 0.374280 0.275028 0.221692 0.311376 0.123612 0.343319 0.111929 0.409084 0.277908 0.201079 0.522906 0.186844 0.172946 0.117304 0.264604 0.320860 0.126115 0.288421 0.397594 0.231533 0.152528 0.218345 Consensus sequence: HHHHDVVGTTGCTAHGGDHBAHH Alignment: HDTBHHCCHTAGCAACVVDHHHH --SSTGCCTYRGCCTCSG----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00527 Foxn4_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 2 16 0.030833 Species: Mus musculus Original motif 0.298336 0.418632 0.208054 0.074978 0.289907 0.015608 0.457100 0.237385 0.273583 0.077889 0.107860 0.540668 0.184954 0.161611 0.384390 0.269045 0.521826 0.156340 0.089019 0.232815 0.356716 0.131104 0.394857 0.117323 0.266669 0.108765 0.505273 0.119293 0.020778 0.047199 0.919524 0.012500 0.948536 0.018775 0.008113 0.024576 0.010822 0.964042 0.014701 0.010434 0.007428 0.019505 0.966351 0.006717 0.010025 0.975678 0.008648 0.005649 0.043796 0.120935 0.742979 0.092289 0.008252 0.250704 0.541132 0.199913 0.474428 0.044681 0.134430 0.346461 0.146597 0.421317 0.143166 0.288920 0.020540 0.181479 0.553811 0.244170 0.129612 0.173360 0.535219 0.161808 0.506084 0.158156 0.130983 0.204776 0.054872 0.103043 0.545792 0.296293 0.389882 0.171037 0.164162 0.274918 0.225861 0.314031 0.288872 0.171237 Consensus sequence: VDWDARRGACGCGGWHGGAKHV Reverse complement motif 0.225861 0.288872 0.314031 0.171237 0.274918 0.171037 0.164162 0.389882 0.054872 0.545792 0.103043 0.296293 0.204776 0.158156 0.130983 0.506084 0.129612 0.535219 0.173360 0.161808 0.020540 0.553811 0.181479 0.244170 0.146597 0.143166 0.421317 0.288920 0.346461 0.044681 0.134430 0.474428 0.008252 0.541132 0.250704 0.199913 0.043796 0.742979 0.120935 0.092289 0.010025 0.008648 0.975678 0.005649 0.007428 0.966351 0.019505 0.006717 0.010822 0.014701 0.964042 0.010434 0.024576 0.018775 0.008113 0.948536 0.020778 0.919524 0.047199 0.012500 0.266669 0.505273 0.108765 0.119293 0.356716 0.394857 0.131104 0.117323 0.232815 0.156340 0.089019 0.521826 0.184954 0.384390 0.161611 0.269045 0.540668 0.077889 0.107860 0.273583 0.289907 0.457100 0.015608 0.237385 0.298336 0.208054 0.418632 0.074978 Consensus sequence: VHYTCCDWCCGCGTCMMTHWHV Alignment: VHYTCCDWCCGCGTCMMTHWHV -SSTGCCTYRGCCTCSG----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00527 Foxn4_primary Reverse Complement Original Motif Backward 6 16 0.031755 Species: Mus musculus Original motif 0.397468 0.109792 0.196359 0.296381 0.102928 0.480888 0.250249 0.165936 0.141925 0.173586 0.377365 0.307124 0.337385 0.368225 0.188518 0.105872 0.354789 0.067393 0.345343 0.232475 0.299392 0.109745 0.215552 0.375311 0.242937 0.170264 0.189245 0.397554 0.461680 0.013180 0.358677 0.166463 0.067089 0.063048 0.008045 0.861819 0.431756 0.128671 0.436022 0.003551 0.006559 0.001814 0.988272 0.003355 0.012929 0.983600 0.001468 0.002003 0.018768 0.000766 0.976433 0.004033 0.003776 0.005554 0.002991 0.987679 0.002737 0.981589 0.009028 0.006646 0.126509 0.273800 0.413161 0.186530 0.100613 0.337225 0.212034 0.350128 0.123741 0.284683 0.060914 0.530661 0.204454 0.143533 0.100462 0.551551 0.202290 0.482197 0.148368 0.167145 0.191625 0.101330 0.607860 0.099185 0.507546 0.086532 0.219554 0.186368 Consensus sequence: DBBVDDDRTRGCGTCBBYTHGA Reverse complement motif 0.186368 0.086532 0.219554 0.507546 0.191625 0.607860 0.101330 0.099185 0.202290 0.148368 0.482197 0.167145 0.551551 0.143533 0.100462 0.204454 0.530661 0.284683 0.060914 0.123741 0.350128 0.337225 0.212034 0.100613 0.126509 0.413161 0.273800 0.186530 0.002737 0.009028 0.981589 0.006646 0.987679 0.005554 0.002991 0.003776 0.018768 0.976433 0.000766 0.004033 0.012929 0.001468 0.983600 0.002003 0.006559 0.988272 0.001814 0.003355 0.431756 0.436022 0.128671 0.003551 0.861819 0.063048 0.008045 0.067089 0.166463 0.013180 0.358677 0.461680 0.397554 0.170264 0.189245 0.242937 0.375311 0.109745 0.215552 0.299392 0.232475 0.067393 0.345343 0.354789 0.337385 0.188518 0.368225 0.105872 0.141925 0.377365 0.173586 0.307124 0.102928 0.250249 0.480888 0.165936 0.296381 0.109792 0.196359 0.397468 Consensus sequence: TCDAMVBGACGCMAKDDDVBBD Alignment: DBBVDDDRTRGCGTCBBYTHGA -SSTGCCTYRGCCTCSG----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00093 Klf7_primary Original Motif Reverse Complement Backward 1 16 0.031774 Species: Mus musculus Original motif 0.204514 0.198353 0.171218 0.425915 0.167188 0.296785 0.246082 0.289946 0.267330 0.148001 0.398674 0.185994 0.549386 0.060167 0.337100 0.053347 0.050746 0.900013 0.022169 0.027073 0.037905 0.920332 0.008360 0.033403 0.410356 0.566702 0.016267 0.006675 0.009526 0.982354 0.001060 0.007060 0.204292 0.001084 0.748567 0.046056 0.003955 0.988490 0.002821 0.004735 0.004264 0.988826 0.004311 0.002598 0.002758 0.929549 0.001244 0.066448 0.260332 0.421683 0.024720 0.293265 0.184798 0.247697 0.085237 0.482268 0.347537 0.197344 0.139961 0.315159 0.255281 0.166620 0.242297 0.335802 Consensus sequence: HBDRCCMCGCCCHHHD Reverse complement motif 0.335802 0.166620 0.242297 0.255281 0.315159 0.197344 0.139961 0.347537 0.482268 0.247697 0.085237 0.184798 0.260332 0.024720 0.421683 0.293265 0.002758 0.001244 0.929549 0.066448 0.004264 0.004311 0.988826 0.002598 0.003955 0.002821 0.988490 0.004735 0.204292 0.748567 0.001084 0.046056 0.009526 0.001060 0.982354 0.007060 0.410356 0.016267 0.566702 0.006675 0.037905 0.008360 0.920332 0.033403 0.050746 0.022169 0.900013 0.027073 0.053347 0.060167 0.337100 0.549386 0.267330 0.398674 0.148001 0.185994 0.167188 0.246082 0.296785 0.289946 0.425915 0.198353 0.171218 0.204514 Consensus sequence: DHHDGGGCGRGGKHBH Alignment: DHHDGGGCGRGGKHBH CSGAGGCMKAGGCASS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00099 Ascl2_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 1 16 0.032164 Species: Mus musculus Original motif 0.114462 0.345602 0.289353 0.250583 0.192593 0.250844 0.116250 0.440313 0.338838 0.304929 0.195843 0.160390 0.312051 0.115094 0.162465 0.410390 0.143975 0.600492 0.123348 0.132185 0.078751 0.715072 0.135182 0.070995 0.146191 0.685571 0.069799 0.098439 0.137287 0.646078 0.126428 0.090207 0.335099 0.092260 0.371510 0.201131 0.033090 0.631176 0.074278 0.261456 0.117516 0.619336 0.100946 0.162202 0.114769 0.627362 0.089839 0.168031 0.195787 0.252057 0.220803 0.331353 0.415355 0.120731 0.281372 0.182542 0.111178 0.217079 0.245769 0.425974 0.191517 0.296952 0.153370 0.358162 Consensus sequence: BHVDCCCCDCCCBDBH Reverse complement motif 0.358162 0.296952 0.153370 0.191517 0.425974 0.217079 0.245769 0.111178 0.182542 0.120731 0.281372 0.415355 0.331353 0.252057 0.220803 0.195787 0.114769 0.089839 0.627362 0.168031 0.117516 0.100946 0.619336 0.162202 0.033090 0.074278 0.631176 0.261456 0.335099 0.371510 0.092260 0.201131 0.137287 0.126428 0.646078 0.090207 0.146191 0.069799 0.685571 0.098439 0.078751 0.135182 0.715072 0.070995 0.143975 0.123348 0.600492 0.132185 0.410390 0.115094 0.162465 0.312051 0.160390 0.304929 0.195843 0.338838 0.440313 0.250844 0.116250 0.192593 0.114462 0.289353 0.345602 0.250583 Consensus sequence: HVDVGGGHGGGGDBHB Alignment: BHVDCCCCDCCCBDBH CSGAGGCMKAGGCASS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 42 Motif name: C042 Original motif 0.455446 0.009901 0.049505 0.485149 0.190000 0.030000 0.690000 0.090000 0.170000 0.020000 0.100000 0.710000 0.010000 0.960000 0.010000 0.020000 0.020000 0.750000 0.010000 0.220000 0.029703 0.039604 0.455446 0.475248 0.524752 0.019802 0.435644 0.019802 0.030000 0.010000 0.950000 0.010000 0.920000 0.050000 0.020000 0.010000 0.850000 0.020000 0.120000 0.010000 0.010000 0.960000 0.010000 0.020000 0.040000 0.450000 0.010000 0.500000 0.460000 0.480000 0.030000 0.030000 0.670000 0.030000 0.260000 0.040000 0.020000 0.910000 0.050000 0.020000 0.180000 0.020000 0.020000 0.780000 0.060606 0.717172 0.030303 0.191919 0.495050 0.049505 0.049505 0.405941 Consensus sequence: WGTCCKRGAACYMACTCW Reserve complement motif 0.405941 0.049505 0.049505 0.495050 0.060606 0.030303 0.717172 0.191919 0.780000 0.020000 0.020000 0.180000 0.020000 0.050000 0.910000 0.020000 0.040000 0.030000 0.260000 0.670000 0.460000 0.030000 0.480000 0.030000 0.500000 0.450000 0.010000 0.040000 0.010000 0.010000 0.960000 0.020000 0.010000 0.020000 0.120000 0.850000 0.010000 0.050000 0.020000 0.920000 0.030000 0.950000 0.010000 0.010000 0.019802 0.019802 0.435644 0.524752 0.475248 0.039604 0.455446 0.029703 0.020000 0.010000 0.750000 0.220000 0.010000 0.010000 0.960000 0.020000 0.710000 0.020000 0.100000 0.170000 0.190000 0.690000 0.030000 0.090000 0.485149 0.009901 0.049505 0.455446 Consensus sequence: WGAGTRMGTTCKRGGACW ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 42 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v015681_primaryReverse Complement Reverse Complement Forward 5 18 0.026618 Species: Mus musculus Original motif 0.641428 0.180211 0.044767 0.133594 0.171696 0.262981 0.334148 0.231174 0.129726 0.322735 0.243462 0.304077 0.165713 0.175735 0.256108 0.402445 0.146090 0.171890 0.412753 0.269266 0.212837 0.439192 0.280990 0.066980 0.251088 0.275516 0.374380 0.099015 0.575438 0.079656 0.338201 0.006704 0.005634 0.003422 0.972597 0.018348 0.890447 0.077034 0.031851 0.000668 0.007128 0.986862 0.000496 0.005515 0.001445 0.991564 0.001925 0.005066 0.738761 0.190157 0.026399 0.044684 0.013384 0.983783 0.000896 0.001937 0.068077 0.929549 0.000773 0.001602 0.040830 0.933742 0.005283 0.020145 0.730274 0.029225 0.145689 0.094812 0.165032 0.572838 0.162001 0.100129 0.383584 0.129942 0.429497 0.056977 0.455959 0.071959 0.208204 0.263878 0.134271 0.262985 0.222626 0.380117 0.071193 0.346594 0.346081 0.236132 0.445661 0.405278 0.053901 0.095160 Consensus sequence: ABBBBVVRGACCACCCACRDBBM Reverse complement motif 0.095160 0.405278 0.053901 0.445661 0.071193 0.346081 0.346594 0.236132 0.380117 0.262985 0.222626 0.134271 0.263878 0.071959 0.208204 0.455959 0.383584 0.429497 0.129942 0.056977 0.165032 0.162001 0.572838 0.100129 0.094812 0.029225 0.145689 0.730274 0.040830 0.005283 0.933742 0.020145 0.068077 0.000773 0.929549 0.001602 0.013384 0.000896 0.983783 0.001937 0.044684 0.190157 0.026399 0.738761 0.001445 0.001925 0.991564 0.005066 0.007128 0.000496 0.986862 0.005515 0.000668 0.077034 0.031851 0.890447 0.005634 0.972597 0.003422 0.018348 0.006704 0.079656 0.338201 0.575438 0.251088 0.374380 0.275516 0.099015 0.212837 0.280990 0.439192 0.066980 0.146090 0.412753 0.171890 0.269266 0.402445 0.175735 0.256108 0.165713 0.129726 0.243462 0.322735 0.304077 0.171696 0.334148 0.262981 0.231174 0.133594 0.180211 0.044767 0.641428 Consensus sequence: YBVDMGTGGGTGGTCKVVBVBBT Alignment: YBVDMGTGGGTGGTCKVVBVBBT ----WGAGTRMGTTCKRGGACW- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00098 Rfx3_primary Original Motif Original Motif Forward 5 18 0.033003 Species: Mus musculus Original motif 0.218345 0.231533 0.152528 0.397594 0.264604 0.126115 0.320860 0.288421 0.117304 0.186844 0.172946 0.522906 0.111929 0.277908 0.409084 0.201079 0.343319 0.311376 0.123612 0.221692 0.193354 0.374280 0.157338 0.275028 0.166348 0.578991 0.130872 0.123789 0.006937 0.931183 0.046809 0.015072 0.255581 0.289587 0.125513 0.329319 0.002582 0.012615 0.002782 0.982021 0.850584 0.007973 0.140639 0.000803 0.037792 0.002285 0.957277 0.002646 0.009414 0.921481 0.001636 0.067469 0.943403 0.000980 0.042401 0.013216 0.991166 0.002931 0.003540 0.002364 0.003651 0.987110 0.001106 0.008133 0.208873 0.369705 0.319129 0.102292 0.322535 0.186617 0.374187 0.116660 0.326738 0.179486 0.226374 0.267402 0.299697 0.185329 0.133025 0.381949 0.300824 0.266836 0.096437 0.335904 0.418443 0.191068 0.127183 0.263306 0.386727 0.204062 0.126050 0.283161 Consensus sequence: HDTBHHCCHTAGCAACVVDHHHH Reverse complement motif 0.283161 0.204062 0.126050 0.386727 0.263306 0.191068 0.127183 0.418443 0.335904 0.266836 0.096437 0.300824 0.381949 0.185329 0.133025 0.299697 0.267402 0.179486 0.226374 0.326738 0.322535 0.374187 0.186617 0.116660 0.208873 0.319129 0.369705 0.102292 0.003651 0.001106 0.987110 0.008133 0.002364 0.002931 0.003540 0.991166 0.013216 0.000980 0.042401 0.943403 0.009414 0.001636 0.921481 0.067469 0.037792 0.957277 0.002285 0.002646 0.000803 0.007973 0.140639 0.850584 0.982021 0.012615 0.002782 0.002582 0.329319 0.289587 0.125513 0.255581 0.006937 0.046809 0.931183 0.015072 0.166348 0.130872 0.578991 0.123789 0.193354 0.157338 0.374280 0.275028 0.221692 0.311376 0.123612 0.343319 0.111929 0.409084 0.277908 0.201079 0.522906 0.186844 0.172946 0.117304 0.264604 0.320860 0.126115 0.288421 0.397594 0.231533 0.152528 0.218345 Consensus sequence: HHHHDVVGTTGCTAHGGDHBAHH Alignment: HDTBHHCCHTAGCAACVVDHHHH ----WGTCCKRGAACYMACTCW- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 5 18 0.034170 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH -WGTCCKRGAACYMACTCW---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 5 18 0.034787 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV ----WGAGTRMGTTCKRGGACW- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00098 Rfx3_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 5 18 0.035399 Species: Mus musculus Original motif 0.314514 0.275352 0.257617 0.152518 0.126939 0.598294 0.130576 0.144192 0.102265 0.155334 0.177957 0.564445 0.129288 0.282678 0.326990 0.261044 0.318166 0.227823 0.175681 0.278330 0.109019 0.380838 0.278328 0.231815 0.226145 0.289206 0.291300 0.193348 0.035863 0.844339 0.072582 0.047216 0.223793 0.187244 0.088092 0.500871 0.039800 0.029681 0.026201 0.904317 0.298298 0.032147 0.654746 0.014809 0.014729 0.022023 0.944826 0.018422 0.485114 0.004925 0.013785 0.496176 0.035708 0.020381 0.240804 0.703108 0.951152 0.012738 0.017886 0.018224 0.023713 0.944394 0.009538 0.022355 0.291067 0.385205 0.232388 0.091339 0.340334 0.199588 0.311526 0.148552 0.198713 0.472138 0.178319 0.150830 0.321155 0.269932 0.311301 0.097612 0.412646 0.195252 0.231950 0.160152 0.297134 0.180928 0.250400 0.271538 0.151169 0.305386 0.358574 0.184871 Consensus sequence: VCTBHBVCTTGGWTACVVVVVDB Reverse complement motif 0.151169 0.358574 0.305386 0.184871 0.271538 0.180928 0.250400 0.297134 0.160152 0.195252 0.231950 0.412646 0.097612 0.269932 0.311301 0.321155 0.198713 0.178319 0.472138 0.150830 0.148552 0.199588 0.311526 0.340334 0.291067 0.232388 0.385205 0.091339 0.023713 0.009538 0.944394 0.022355 0.018224 0.012738 0.017886 0.951152 0.703108 0.020381 0.240804 0.035708 0.496176 0.004925 0.013785 0.485114 0.014729 0.944826 0.022023 0.018422 0.298298 0.654746 0.032147 0.014809 0.904317 0.029681 0.026201 0.039800 0.500871 0.187244 0.088092 0.223793 0.035863 0.072582 0.844339 0.047216 0.226145 0.291300 0.289206 0.193348 0.109019 0.278328 0.380838 0.231815 0.278330 0.227823 0.175681 0.318166 0.129288 0.326990 0.282678 0.261044 0.564445 0.155334 0.177957 0.102265 0.126939 0.130576 0.598294 0.144192 0.152518 0.275352 0.257617 0.314514 Consensus sequence: BDBBVBVGTAWCCAAGVBHBAGB Alignment: VCTBHBVCTTGGWTACVVVVVDB ----WGTCCKRGAACYMACTCW- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 43 Motif name: C043 Original motif 0.530000 0.050000 0.080000 0.340000 0.510000 0.170000 0.020000 0.300000 0.740000 0.010000 0.230000 0.020000 0.800000 0.010000 0.160000 0.030000 0.530000 0.130000 0.030000 0.310000 0.545455 0.161616 0.030303 0.262626 0.720000 0.020000 0.230000 0.030000 0.740000 0.030000 0.220000 0.010000 0.888889 0.020202 0.080808 0.010101 0.810000 0.020000 0.150000 0.020000 0.560000 0.040000 0.250000 0.150000 0.270000 0.150000 0.500000 0.080000 0.710000 0.040000 0.240000 0.010000 0.890000 0.020000 0.080000 0.010000 0.260000 0.030000 0.180000 0.530000 0.400000 0.090000 0.110000 0.400000 Consensus sequence: WWAAWAAAAAARAATW Reserve complement motif 0.400000 0.090000 0.110000 0.400000 0.530000 0.030000 0.180000 0.260000 0.010000 0.020000 0.080000 0.890000 0.010000 0.040000 0.240000 0.710000 0.270000 0.500000 0.150000 0.080000 0.150000 0.040000 0.250000 0.560000 0.020000 0.020000 0.150000 0.810000 0.010101 0.020202 0.080808 0.888889 0.010000 0.030000 0.220000 0.740000 0.030000 0.020000 0.230000 0.720000 0.262626 0.161616 0.030303 0.545455 0.310000 0.130000 0.030000 0.530000 0.030000 0.010000 0.160000 0.800000 0.020000 0.010000 0.230000 0.740000 0.300000 0.170000 0.020000 0.510000 0.340000 0.050000 0.080000 0.530000 Consensus sequence: WATTMTTTTTTWTTWW ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 43 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00077 Srf_secondary Original Motif Original Motif Forward 2 16 0.023240 Species: Mus musculus Original motif 0.162968 0.284828 0.440984 0.111220 0.151392 0.200635 0.205316 0.442657 0.267215 0.083669 0.192498 0.456618 0.332771 0.180711 0.200027 0.286491 0.509370 0.102954 0.242569 0.145107 0.666262 0.077309 0.154466 0.101962 0.737968 0.113335 0.100401 0.048296 0.658878 0.141580 0.134033 0.065510 0.766115 0.094051 0.069763 0.070072 0.755621 0.088491 0.044802 0.111086 0.749083 0.135917 0.047510 0.067490 0.663231 0.176795 0.028134 0.131839 0.553358 0.277659 0.038655 0.130328 0.392578 0.314083 0.209844 0.083495 0.198462 0.237132 0.239466 0.324940 0.275121 0.210087 0.194779 0.320013 0.287748 0.277395 0.142704 0.292154 Consensus sequence: VBDDAAAAAAAAMVBHH Reverse complement motif 0.292154 0.277395 0.142704 0.287748 0.320013 0.210087 0.194779 0.275121 0.324940 0.237132 0.239466 0.198462 0.083495 0.314083 0.209844 0.392578 0.130328 0.277659 0.038655 0.553358 0.131839 0.176795 0.028134 0.663231 0.067490 0.135917 0.047510 0.749083 0.111086 0.088491 0.044802 0.755621 0.070072 0.094051 0.069763 0.766115 0.065510 0.141580 0.134033 0.658878 0.048296 0.113335 0.100401 0.737968 0.101962 0.077309 0.154466 0.666262 0.145107 0.102954 0.242569 0.509370 0.286491 0.180711 0.200027 0.332771 0.456618 0.083669 0.192498 0.267215 0.442657 0.200635 0.205316 0.151392 0.162968 0.440984 0.284828 0.111220 Consensus sequence: HHVBYTTTTTTTTDDVV Alignment: VBDDAAAAAAAAMVBHH -WWAAWAAAAAARAATW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00054 Tcf7_primary Original Motif Original Motif Backward 1 16 0.028869 Species: Mus musculus Original motif 0.170811 0.196976 0.220503 0.411710 0.337231 0.228482 0.140137 0.294150 0.299312 0.173780 0.143426 0.383481 0.603957 0.053557 0.128214 0.214271 0.036338 0.377925 0.534647 0.051091 0.725865 0.010314 0.008501 0.255320 0.067855 0.007849 0.004559 0.919737 0.049387 0.815496 0.098330 0.036787 0.960514 0.005036 0.005137 0.029313 0.960631 0.004550 0.018815 0.016004 0.935245 0.005169 0.023866 0.035720 0.159760 0.060340 0.761341 0.018559 0.228534 0.153897 0.523052 0.094517 0.557984 0.123512 0.254154 0.064350 0.490252 0.211976 0.124557 0.173215 0.310463 0.250279 0.132612 0.306646 0.332720 0.248937 0.120633 0.297711 Consensus sequence: BHHASATCAAAGGAHHH Reverse complement motif 0.297711 0.248937 0.120633 0.332720 0.306646 0.250279 0.132612 0.310463 0.173215 0.211976 0.124557 0.490252 0.064350 0.123512 0.254154 0.557984 0.228534 0.523052 0.153897 0.094517 0.159760 0.761341 0.060340 0.018559 0.035720 0.005169 0.023866 0.935245 0.016004 0.004550 0.018815 0.960631 0.029313 0.005036 0.005137 0.960514 0.049387 0.098330 0.815496 0.036787 0.919737 0.007849 0.004559 0.067855 0.255320 0.010314 0.008501 0.725865 0.036338 0.534647 0.377925 0.051091 0.214271 0.053557 0.128214 0.603957 0.383481 0.173780 0.143426 0.299312 0.294150 0.228482 0.140137 0.337231 0.411710 0.196976 0.220503 0.170811 Consensus sequence: HHHTCCTTTGATSTHHV Alignment: BHHASATCAAAGGAHHH -WWAAWAAAAAARAATW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00255 Dbx1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 16 0.029681 Species: Mus musculus Original motif 0.193358 0.228955 0.160692 0.416995 0.611960 0.068099 0.048494 0.271446 0.459770 0.057385 0.307824 0.175021 0.226103 0.127408 0.101076 0.545413 0.241226 0.228640 0.067165 0.462969 0.621421 0.137382 0.078412 0.162785 0.737972 0.031899 0.051833 0.178295 0.110802 0.098497 0.073668 0.717033 0.129567 0.110629 0.036048 0.723756 0.729342 0.031636 0.088480 0.150541 0.540257 0.104927 0.048065 0.306750 0.195987 0.148698 0.098709 0.556606 0.587529 0.072583 0.170635 0.169252 0.497416 0.161804 0.219409 0.121371 0.278831 0.114362 0.139037 0.467771 0.297462 0.189119 0.187754 0.325665 0.397268 0.140582 0.287428 0.174722 Consensus sequence: HARTHAATTAWTAVDHD Reverse complement motif 0.174722 0.140582 0.287428 0.397268 0.325665 0.189119 0.187754 0.297462 0.467771 0.114362 0.139037 0.278831 0.121371 0.161804 0.219409 0.497416 0.169252 0.072583 0.170635 0.587529 0.556606 0.148698 0.098709 0.195987 0.306750 0.104927 0.048065 0.540257 0.150541 0.031636 0.088480 0.729342 0.723756 0.110629 0.036048 0.129567 0.717033 0.098497 0.073668 0.110802 0.178295 0.031899 0.051833 0.737972 0.162785 0.137382 0.078412 0.621421 0.462969 0.228640 0.067165 0.241226 0.545413 0.127408 0.101076 0.226103 0.175021 0.057385 0.307824 0.459770 0.271446 0.068099 0.048494 0.611960 0.416995 0.228955 0.160692 0.193358 Consensus sequence: DHDBTAWTAATTHAKTH Alignment: DHDBTAWTAATTHAKTH -WATTMTTTTTTWTTWW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00051 Sox8_primary Reverse Complement Original Motif Forward 2 16 0.032083 Species: Mus musculus Original motif 0.244952 0.197659 0.278014 0.279374 0.244434 0.136006 0.278446 0.341114 0.512025 0.129954 0.139069 0.218951 0.190001 0.086232 0.125500 0.598267 0.154692 0.325860 0.193904 0.325544 0.384624 0.130540 0.035110 0.449726 0.945021 0.006713 0.011975 0.036291 0.008386 0.026630 0.004166 0.960817 0.020908 0.005554 0.009294 0.964244 0.149285 0.038995 0.806085 0.005635 0.110990 0.007155 0.007797 0.874058 0.087283 0.099671 0.059611 0.753435 0.250662 0.432576 0.082152 0.234610 0.251277 0.174578 0.147771 0.426374 0.205121 0.137656 0.296366 0.360857 0.316796 0.152457 0.164403 0.366344 0.475864 0.128717 0.153551 0.241867 Consensus sequence: DDATBWATTGTTHHDDD Reverse complement motif 0.241867 0.128717 0.153551 0.475864 0.366344 0.152457 0.164403 0.316796 0.360857 0.137656 0.296366 0.205121 0.426374 0.174578 0.147771 0.251277 0.250662 0.082152 0.432576 0.234610 0.753435 0.099671 0.059611 0.087283 0.874058 0.007155 0.007797 0.110990 0.149285 0.806085 0.038995 0.005635 0.964244 0.005554 0.009294 0.020908 0.960817 0.026630 0.004166 0.008386 0.036291 0.006713 0.011975 0.945021 0.449726 0.130540 0.035110 0.384624 0.154692 0.193904 0.325860 0.325544 0.598267 0.086232 0.125500 0.190001 0.218951 0.129954 0.139069 0.512025 0.341114 0.136006 0.278446 0.244434 0.279374 0.197659 0.278014 0.244952 Consensus sequence: DDDHDAACAATWBATDD Alignment: DDATBWATTGTTHHDDD -WATTMTTTTTTWTTWW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00061 Foxl1_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 1 16 0.032702 Species: Mus musculus Original motif 0.560226 0.121586 0.083231 0.234957 0.318077 0.149137 0.179955 0.352831 0.482497 0.118420 0.173594 0.225488 0.200166 0.160901 0.191493 0.447440 0.033691 0.569719 0.018901 0.377690 0.638020 0.166545 0.021254 0.174181 0.573953 0.105729 0.009308 0.311010 0.890518 0.053364 0.013424 0.042694 0.910758 0.028166 0.032648 0.028428 0.013358 0.738707 0.023981 0.223953 0.911783 0.018754 0.031898 0.037564 0.702891 0.068940 0.076823 0.151346 0.445507 0.320769 0.057216 0.176507 0.587798 0.129586 0.140592 0.142024 0.258981 0.330939 0.167334 0.242747 0.362022 0.333796 0.145861 0.158320 Consensus sequence: ADDDYAWAACAAMAHH Reverse complement motif 0.158320 0.333796 0.145861 0.362022 0.258981 0.167334 0.330939 0.242747 0.142024 0.129586 0.140592 0.587798 0.176507 0.320769 0.057216 0.445507 0.151346 0.068940 0.076823 0.702891 0.037564 0.018754 0.031898 0.911783 0.013358 0.023981 0.738707 0.223953 0.028428 0.028166 0.032648 0.910758 0.042694 0.053364 0.013424 0.890518 0.311010 0.105729 0.009308 0.573953 0.174181 0.166545 0.021254 0.638020 0.033691 0.018901 0.569719 0.377690 0.447440 0.160901 0.191493 0.200166 0.225488 0.118420 0.173594 0.482497 0.352831 0.149137 0.179955 0.318077 0.234957 0.121586 0.083231 0.560226 Consensus sequence: HDTYTTGTTWTKDDDT Alignment: HDTYTTGTTWTKDDDT WATTMTTTTTTWTTWW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 44 Motif name: C044 Original motif 0.060000 0.300000 0.430000 0.210000 0.252525 0.484848 0.232323 0.030303 0.782178 0.019802 0.099010 0.099010 0.029703 0.039604 0.920792 0.009901 0.801980 0.009901 0.158416 0.029703 0.010000 0.180000 0.780000 0.030000 0.060000 0.130000 0.650000 0.160000 0.130000 0.610000 0.250000 0.010000 0.940000 0.010000 0.010000 0.040000 0.110000 0.010000 0.870000 0.010000 0.390000 0.010000 0.580000 0.020000 0.191919 0.464646 0.242424 0.101010 0.180000 0.520000 0.280000 0.020000 0.108911 0.079208 0.801980 0.009901 0.780000 0.010000 0.150000 0.060000 0.019802 0.148515 0.029703 0.801980 0.070000 0.210000 0.430000 0.290000 Consensus sequence: BVAGAGGCAGRVSGATB Reserve complement motif 0.070000 0.430000 0.210000 0.290000 0.801980 0.148515 0.029703 0.019802 0.060000 0.010000 0.150000 0.780000 0.108911 0.801980 0.079208 0.009901 0.180000 0.280000 0.520000 0.020000 0.191919 0.242424 0.464646 0.101010 0.390000 0.580000 0.010000 0.020000 0.110000 0.870000 0.010000 0.010000 0.040000 0.010000 0.010000 0.940000 0.130000 0.250000 0.610000 0.010000 0.060000 0.650000 0.130000 0.160000 0.010000 0.780000 0.180000 0.030000 0.029703 0.009901 0.158416 0.801980 0.029703 0.920792 0.039604 0.009901 0.099010 0.019802 0.099010 0.782178 0.252525 0.232323 0.484848 0.030303 0.060000 0.430000 0.300000 0.210000 Consensus sequence: BATCSVMCTGCCTCTVB ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 44 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00527 Foxn4_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 2 17 0.043872 Species: Mus musculus Original motif 0.298336 0.418632 0.208054 0.074978 0.289907 0.015608 0.457100 0.237385 0.273583 0.077889 0.107860 0.540668 0.184954 0.161611 0.384390 0.269045 0.521826 0.156340 0.089019 0.232815 0.356716 0.131104 0.394857 0.117323 0.266669 0.108765 0.505273 0.119293 0.020778 0.047199 0.919524 0.012500 0.948536 0.018775 0.008113 0.024576 0.010822 0.964042 0.014701 0.010434 0.007428 0.019505 0.966351 0.006717 0.010025 0.975678 0.008648 0.005649 0.043796 0.120935 0.742979 0.092289 0.008252 0.250704 0.541132 0.199913 0.474428 0.044681 0.134430 0.346461 0.146597 0.421317 0.143166 0.288920 0.020540 0.181479 0.553811 0.244170 0.129612 0.173360 0.535219 0.161808 0.506084 0.158156 0.130983 0.204776 0.054872 0.103043 0.545792 0.296293 0.389882 0.171037 0.164162 0.274918 0.225861 0.314031 0.288872 0.171237 Consensus sequence: VDWDARRGACGCGGWHGGAKHV Reverse complement motif 0.225861 0.288872 0.314031 0.171237 0.274918 0.171037 0.164162 0.389882 0.054872 0.545792 0.103043 0.296293 0.204776 0.158156 0.130983 0.506084 0.129612 0.535219 0.173360 0.161808 0.020540 0.553811 0.181479 0.244170 0.146597 0.143166 0.421317 0.288920 0.346461 0.044681 0.134430 0.474428 0.008252 0.541132 0.250704 0.199913 0.043796 0.742979 0.120935 0.092289 0.010025 0.008648 0.975678 0.005649 0.007428 0.966351 0.019505 0.006717 0.010822 0.014701 0.964042 0.010434 0.024576 0.018775 0.008113 0.948536 0.020778 0.919524 0.047199 0.012500 0.266669 0.505273 0.108765 0.119293 0.356716 0.394857 0.131104 0.117323 0.232815 0.156340 0.089019 0.521826 0.184954 0.384390 0.161611 0.269045 0.540668 0.077889 0.107860 0.273583 0.289907 0.457100 0.015608 0.237385 0.298336 0.208054 0.418632 0.074978 Consensus sequence: VHYTCCDWCCGCGTCMMTHWHV Alignment: VDWDARRGACGCGGWHGGAKHV ----BVAGAGGCAGRVSGATB- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v015681_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 2 17 0.046578 Species: Mus musculus Original motif 0.214165 0.143436 0.372522 0.269876 0.314445 0.406003 0.160351 0.119201 0.137147 0.092924 0.042921 0.727007 0.044121 0.072843 0.051741 0.831295 0.261292 0.324124 0.298498 0.116086 0.258125 0.323243 0.263362 0.155271 0.204557 0.589399 0.107153 0.098891 0.371021 0.244027 0.291102 0.093849 0.096327 0.572718 0.011797 0.319159 0.027282 0.046183 0.844519 0.082016 0.018921 0.012887 0.915917 0.052275 0.364793 0.166722 0.084229 0.384256 0.028216 0.011233 0.951056 0.009495 0.054974 0.004738 0.890377 0.049911 0.006802 0.312915 0.134247 0.546036 0.241289 0.628210 0.104788 0.025713 0.237863 0.302807 0.213018 0.246311 0.349399 0.203220 0.086635 0.360746 0.386634 0.144693 0.246895 0.221779 0.425101 0.354676 0.093374 0.126849 0.060272 0.391320 0.104905 0.443503 0.162090 0.190233 0.227433 0.420244 Consensus sequence: DVTTVVCVYGGHGGYCHHDMYB Reverse complement motif 0.420244 0.190233 0.227433 0.162090 0.443503 0.391320 0.104905 0.060272 0.126849 0.354676 0.093374 0.425101 0.221779 0.144693 0.246895 0.386634 0.360746 0.203220 0.086635 0.349399 0.237863 0.213018 0.302807 0.246311 0.241289 0.104788 0.628210 0.025713 0.546036 0.312915 0.134247 0.006802 0.054974 0.890377 0.004738 0.049911 0.028216 0.951056 0.011233 0.009495 0.384256 0.166722 0.084229 0.364793 0.018921 0.915917 0.012887 0.052275 0.027282 0.844519 0.046183 0.082016 0.096327 0.011797 0.572718 0.319159 0.093849 0.244027 0.291102 0.371021 0.204557 0.107153 0.589399 0.098891 0.258125 0.263362 0.323243 0.155271 0.261292 0.298498 0.324124 0.116086 0.831295 0.072843 0.051741 0.044121 0.727007 0.092924 0.042921 0.137147 0.314445 0.160351 0.406003 0.119201 0.214165 0.372522 0.143436 0.269876 Consensus sequence: VMYDHDGMCCHCCKBGVVAAVH Alignment: VMYDHDGMCCHCCKBGVVAAVH -BATCSVMCTGCCTCTVB---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00031 Zbtb3_primary Reverse Complement Original Motif Forward 1 17 0.046833 Species: Mus musculus Original motif 0.401190 0.144405 0.268531 0.185874 0.430224 0.168519 0.221247 0.180011 0.172575 0.268499 0.274136 0.284789 0.150971 0.297110 0.290868 0.261051 0.133421 0.282842 0.434718 0.149019 0.042798 0.941105 0.001785 0.014312 0.890788 0.002551 0.103316 0.003345 0.001887 0.951368 0.043722 0.003023 0.011633 0.002218 0.002269 0.983880 0.003597 0.003728 0.984819 0.007856 0.002946 0.903520 0.072457 0.021077 0.908487 0.057072 0.018256 0.016185 0.076237 0.329864 0.228896 0.365003 0.144926 0.162981 0.177370 0.514722 0.124970 0.327876 0.295814 0.251341 0.144592 0.313887 0.301912 0.239609 0.108463 0.241747 0.350296 0.299494 Consensus sequence: DDBBBCACTGCABTBBB Reverse complement motif 0.108463 0.350296 0.241747 0.299494 0.144592 0.301912 0.313887 0.239609 0.124970 0.295814 0.327876 0.251341 0.514722 0.162981 0.177370 0.144926 0.365003 0.329864 0.228896 0.076237 0.016185 0.057072 0.018256 0.908487 0.002946 0.072457 0.903520 0.021077 0.003597 0.984819 0.003728 0.007856 0.983880 0.002218 0.002269 0.011633 0.001887 0.043722 0.951368 0.003023 0.003345 0.002551 0.103316 0.890788 0.042798 0.001785 0.941105 0.014312 0.133421 0.434718 0.282842 0.149019 0.150971 0.290868 0.297110 0.261051 0.284789 0.268499 0.274136 0.172575 0.180011 0.168519 0.221247 0.430224 0.185874 0.144405 0.268531 0.401190 Consensus sequence: BBBAVTGCAGTGBBVDD Alignment: DDBBBCACTGCABTBBB BATCSVMCTGCCTCTVB ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00527 Foxn4_primary Original Motif Reverse Complement Forward 5 17 0.049551 Species: Mus musculus Original motif 0.397468 0.109792 0.196359 0.296381 0.102928 0.480888 0.250249 0.165936 0.141925 0.173586 0.377365 0.307124 0.337385 0.368225 0.188518 0.105872 0.354789 0.067393 0.345343 0.232475 0.299392 0.109745 0.215552 0.375311 0.242937 0.170264 0.189245 0.397554 0.461680 0.013180 0.358677 0.166463 0.067089 0.063048 0.008045 0.861819 0.431756 0.128671 0.436022 0.003551 0.006559 0.001814 0.988272 0.003355 0.012929 0.983600 0.001468 0.002003 0.018768 0.000766 0.976433 0.004033 0.003776 0.005554 0.002991 0.987679 0.002737 0.981589 0.009028 0.006646 0.126509 0.273800 0.413161 0.186530 0.100613 0.337225 0.212034 0.350128 0.123741 0.284683 0.060914 0.530661 0.204454 0.143533 0.100462 0.551551 0.202290 0.482197 0.148368 0.167145 0.191625 0.101330 0.607860 0.099185 0.507546 0.086532 0.219554 0.186368 Consensus sequence: DBBVDDDRTRGCGTCBBYTHGA Reverse complement motif 0.186368 0.086532 0.219554 0.507546 0.191625 0.607860 0.101330 0.099185 0.202290 0.148368 0.482197 0.167145 0.551551 0.143533 0.100462 0.204454 0.530661 0.284683 0.060914 0.123741 0.350128 0.337225 0.212034 0.100613 0.126509 0.413161 0.273800 0.186530 0.002737 0.009028 0.981589 0.006646 0.987679 0.005554 0.002991 0.003776 0.018768 0.976433 0.000766 0.004033 0.012929 0.001468 0.983600 0.002003 0.006559 0.988272 0.001814 0.003355 0.431756 0.436022 0.128671 0.003551 0.861819 0.063048 0.008045 0.067089 0.166463 0.013180 0.358677 0.461680 0.397554 0.170264 0.189245 0.242937 0.375311 0.109745 0.215552 0.299392 0.232475 0.067393 0.345343 0.354789 0.337385 0.188518 0.368225 0.105872 0.141925 0.377365 0.173586 0.307124 0.102928 0.250249 0.480888 0.165936 0.296381 0.109792 0.196359 0.397468 Consensus sequence: TCDAMVBGACGCMAKDDDVBBD Alignment: TCDAMVBGACGCMAKDDDVBBD ----BVAGAGGCAGRVSGATB- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00095 Zfp691_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 1 17 0.049611 Species: Mus musculus Original motif 0.236868 0.155338 0.295091 0.312703 0.522782 0.133021 0.177386 0.166812 0.192915 0.374870 0.221406 0.210809 0.146546 0.199196 0.418035 0.236223 0.454326 0.095049 0.151770 0.298855 0.027956 0.023096 0.878335 0.070614 0.916030 0.020358 0.039894 0.023717 0.010595 0.938036 0.039415 0.011954 0.007271 0.014948 0.007990 0.969792 0.014291 0.964878 0.011126 0.009705 0.154586 0.759294 0.050151 0.035969 0.051021 0.268239 0.053410 0.627330 0.158293 0.386843 0.113152 0.341713 0.281766 0.184139 0.187916 0.346179 0.292444 0.267259 0.241323 0.198974 0.425732 0.262331 0.149076 0.162861 0.205385 0.384164 0.267912 0.142538 Consensus sequence: DABBWGACTCCTHDVHV Reverse complement motif 0.205385 0.267912 0.384164 0.142538 0.162861 0.262331 0.149076 0.425732 0.198974 0.267259 0.241323 0.292444 0.346179 0.184139 0.187916 0.281766 0.158293 0.113152 0.386843 0.341713 0.627330 0.268239 0.053410 0.051021 0.154586 0.050151 0.759294 0.035969 0.014291 0.011126 0.964878 0.009705 0.969792 0.014948 0.007990 0.007271 0.010595 0.039415 0.938036 0.011954 0.023717 0.020358 0.039894 0.916030 0.027956 0.878335 0.023096 0.070614 0.298855 0.095049 0.151770 0.454326 0.146546 0.418035 0.199196 0.236223 0.192915 0.221406 0.374870 0.210809 0.166812 0.133021 0.177386 0.522782 0.312703 0.155338 0.295091 0.236868 Consensus sequence: VHBDDAGGAGTCWBBTD Alignment: DABBWGACTCCTHDVHV BATCSVMCTGCCTCTVB ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 45 Motif name: C045 Original motif 0.420000 0.170000 0.400000 0.010000 0.010000 0.480000 0.030000 0.480000 0.660000 0.010000 0.290000 0.040000 0.069307 0.128713 0.732673 0.069307 0.386139 0.465347 0.069307 0.079208 0.110000 0.600000 0.010000 0.280000 0.360000 0.430000 0.010000 0.200000 0.200000 0.010000 0.430000 0.360000 0.280000 0.010000 0.600000 0.110000 0.079208 0.069307 0.465347 0.386139 0.069307 0.732673 0.128713 0.069307 0.040000 0.290000 0.010000 0.660000 0.480000 0.030000 0.480000 0.010000 0.010000 0.400000 0.170000 0.420000 Consensus sequence: RYAGMCMKGKCTRY Reserve complement motif 0.420000 0.400000 0.170000 0.010000 0.010000 0.030000 0.480000 0.480000 0.660000 0.290000 0.010000 0.040000 0.069307 0.128713 0.732673 0.069307 0.079208 0.465347 0.069307 0.386139 0.280000 0.600000 0.010000 0.110000 0.200000 0.430000 0.010000 0.360000 0.360000 0.010000 0.430000 0.200000 0.110000 0.010000 0.600000 0.280000 0.386139 0.069307 0.465347 0.079208 0.069307 0.732673 0.128713 0.069307 0.040000 0.010000 0.290000 0.660000 0.010000 0.030000 0.480000 0.480000 0.010000 0.170000 0.400000 0.420000 Consensus sequence: MKAGYCYRGRCTKK ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 45 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 2 14 0.030356 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK -RYAGMCMKGKCTRY------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00086 Irf3_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 1 14 0.035551 Species: Mus musculus Original motif 0.236565 0.149020 0.414811 0.199604 0.197737 0.139048 0.436764 0.226451 0.598309 0.089963 0.124245 0.187483 0.212136 0.055296 0.648272 0.084296 0.747144 0.027184 0.047789 0.177884 0.766825 0.051238 0.039008 0.142929 0.479462 0.085743 0.175517 0.259279 0.064625 0.107366 0.753079 0.074929 0.058034 0.074096 0.820937 0.046934 0.270072 0.088714 0.217158 0.424057 0.063867 0.384543 0.418514 0.133076 0.047352 0.597210 0.167770 0.187669 0.266737 0.150063 0.382264 0.200936 0.381079 0.204427 0.218492 0.196003 Consensus sequence: DDAGAADGGDSCDV Reverse complement motif 0.196003 0.204427 0.218492 0.381079 0.266737 0.382264 0.150063 0.200936 0.047352 0.167770 0.597210 0.187669 0.063867 0.418514 0.384543 0.133076 0.424057 0.088714 0.217158 0.270072 0.058034 0.820937 0.074096 0.046934 0.064625 0.753079 0.107366 0.074929 0.259279 0.085743 0.175517 0.479462 0.142929 0.051238 0.039008 0.766825 0.177884 0.027184 0.047789 0.747144 0.212136 0.648272 0.055296 0.084296 0.187483 0.089963 0.124245 0.598309 0.197737 0.436764 0.139048 0.226451 0.236565 0.414811 0.149020 0.199604 Consensus sequence: BHGSDCCDTTCTHH Alignment: DDAGAADGGDSCDV RYAGMCMKGKCTRY ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00099 Ascl2_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 2 14 0.039161 Species: Mus musculus Original motif 0.114462 0.345602 0.289353 0.250583 0.192593 0.250844 0.116250 0.440313 0.338838 0.304929 0.195843 0.160390 0.312051 0.115094 0.162465 0.410390 0.143975 0.600492 0.123348 0.132185 0.078751 0.715072 0.135182 0.070995 0.146191 0.685571 0.069799 0.098439 0.137287 0.646078 0.126428 0.090207 0.335099 0.092260 0.371510 0.201131 0.033090 0.631176 0.074278 0.261456 0.117516 0.619336 0.100946 0.162202 0.114769 0.627362 0.089839 0.168031 0.195787 0.252057 0.220803 0.331353 0.415355 0.120731 0.281372 0.182542 0.111178 0.217079 0.245769 0.425974 0.191517 0.296952 0.153370 0.358162 Consensus sequence: BHVDCCCCDCCCBDBH Reverse complement motif 0.358162 0.296952 0.153370 0.191517 0.425974 0.217079 0.245769 0.111178 0.182542 0.120731 0.281372 0.415355 0.331353 0.252057 0.220803 0.195787 0.114769 0.089839 0.627362 0.168031 0.117516 0.100946 0.619336 0.162202 0.033090 0.074278 0.631176 0.261456 0.335099 0.371510 0.092260 0.201131 0.137287 0.126428 0.646078 0.090207 0.146191 0.069799 0.685571 0.098439 0.078751 0.135182 0.715072 0.070995 0.143975 0.123348 0.600492 0.132185 0.410390 0.115094 0.162465 0.312051 0.160390 0.304929 0.195843 0.338838 0.440313 0.250844 0.116250 0.192593 0.114462 0.289353 0.345602 0.250583 Consensus sequence: HVDVGGGHGGGGDBHB Alignment: HVDVGGGHGGGGDBHB -MKAGYCYRGRCTKK- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00084 Gmeb1_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 14 0.039909 Species: Mus musculus Original motif 0.166569 0.264627 0.345569 0.223235 0.335599 0.314451 0.153336 0.196615 0.105350 0.231839 0.348018 0.314793 0.131274 0.215623 0.291288 0.361815 0.125570 0.072341 0.404848 0.397242 0.049879 0.039110 0.325167 0.585844 0.705098 0.009202 0.284757 0.000943 0.003535 0.986983 0.004275 0.005207 0.005207 0.004275 0.986983 0.003535 0.000943 0.284757 0.009202 0.705098 0.585844 0.325167 0.039110 0.049879 0.397242 0.404848 0.072341 0.125570 0.206857 0.234555 0.371731 0.186857 0.435957 0.145115 0.181033 0.237896 0.176104 0.260127 0.230770 0.333000 0.272102 0.213365 0.312032 0.202501 0.237402 0.250982 0.266977 0.244639 Consensus sequence: BHBBKKACGTMMVDBVB Reverse complement motif 0.237402 0.266977 0.250982 0.244639 0.272102 0.312032 0.213365 0.202501 0.333000 0.260127 0.230770 0.176104 0.237896 0.145115 0.181033 0.435957 0.206857 0.371731 0.234555 0.186857 0.397242 0.072341 0.404848 0.125570 0.049879 0.325167 0.039110 0.585844 0.705098 0.284757 0.009202 0.000943 0.005207 0.986983 0.004275 0.003535 0.003535 0.004275 0.986983 0.005207 0.000943 0.009202 0.284757 0.705098 0.585844 0.039110 0.325167 0.049879 0.125570 0.404848 0.072341 0.397242 0.361815 0.215623 0.291288 0.131274 0.105350 0.348018 0.231839 0.314793 0.196615 0.314451 0.153336 0.335599 0.166569 0.345569 0.264627 0.223235 Consensus sequence: BVVDVRYACGTRYVBHB Alignment: BVVDVRYACGTRYVBHB --MKAGYCYRGRCTKK- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 7 14 0.040692 Species: Mus musculus Original motif 0.067627 0.131333 0.654425 0.146615 0.156488 0.114442 0.145630 0.583441 0.206450 0.265630 0.358017 0.169903 0.090729 0.460713 0.274712 0.173847 0.285994 0.099998 0.154485 0.459523 0.635908 0.184787 0.072982 0.106323 0.748421 0.039204 0.092605 0.119769 0.081342 0.061327 0.044532 0.812799 0.143120 0.043879 0.024216 0.788785 0.247544 0.092102 0.621453 0.038901 0.295531 0.036295 0.027594 0.640580 0.194561 0.305468 0.339916 0.160055 0.175038 0.193568 0.101212 0.530182 0.145226 0.167488 0.559871 0.127415 0.271501 0.237429 0.206701 0.284369 0.216834 0.109191 0.569605 0.104370 0.182624 0.177160 0.300475 0.339742 0.331737 0.198645 0.265137 0.204482 0.230155 0.359365 0.183450 0.227029 0.056581 0.067297 0.463052 0.413070 0.198891 0.324626 0.304424 0.172059 0.181968 0.287547 0.202419 0.328066 Consensus sequence: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB Reverse complement motif 0.328066 0.287547 0.202419 0.181968 0.198891 0.304424 0.324626 0.172059 0.056581 0.463052 0.067297 0.413070 0.230155 0.183450 0.359365 0.227029 0.204482 0.198645 0.265137 0.331737 0.339742 0.177160 0.300475 0.182624 0.216834 0.569605 0.109191 0.104370 0.284369 0.237429 0.206701 0.271501 0.145226 0.559871 0.167488 0.127415 0.530182 0.193568 0.101212 0.175038 0.194561 0.339916 0.305468 0.160055 0.640580 0.036295 0.027594 0.295531 0.247544 0.621453 0.092102 0.038901 0.788785 0.043879 0.024216 0.143120 0.812799 0.061327 0.044532 0.081342 0.119769 0.039204 0.092605 0.748421 0.106323 0.184787 0.072982 0.635908 0.459523 0.099998 0.154485 0.285994 0.090729 0.274712 0.460713 0.173847 0.206450 0.358017 0.265630 0.169903 0.583441 0.114442 0.145630 0.156488 0.067627 0.654425 0.131333 0.146615 Consensus sequence: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC Alignment: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB ------MKAGYCYRGRCTKK-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 46 Motif name: C046 Original motif 0.080000 0.040000 0.480000 0.400000 0.060606 0.484848 0.444444 0.010101 0.120000 0.010000 0.010000 0.860000 0.030000 0.010000 0.910000 0.050000 0.110000 0.050000 0.490000 0.350000 0.020000 0.960000 0.010000 0.010000 0.040000 0.910000 0.010000 0.040000 0.039604 0.257426 0.029703 0.673267 0.600000 0.050000 0.320000 0.030000 0.030000 0.010000 0.940000 0.020000 0.860000 0.040000 0.090000 0.010000 0.880000 0.040000 0.070000 0.010000 0.020000 0.940000 0.030000 0.010000 0.330000 0.010000 0.020000 0.640000 0.010000 0.460000 0.460000 0.070000 0.495050 0.475248 0.019802 0.009901 Consensus sequence: KSTGKCCTRGAACWSM Reserve complement motif 0.009901 0.475248 0.019802 0.495050 0.010000 0.460000 0.460000 0.070000 0.640000 0.010000 0.020000 0.330000 0.020000 0.030000 0.940000 0.010000 0.010000 0.040000 0.070000 0.880000 0.010000 0.040000 0.090000 0.860000 0.030000 0.940000 0.010000 0.020000 0.030000 0.050000 0.320000 0.600000 0.673267 0.257426 0.029703 0.039604 0.040000 0.010000 0.910000 0.040000 0.020000 0.010000 0.960000 0.010000 0.110000 0.490000 0.050000 0.350000 0.030000 0.910000 0.010000 0.050000 0.860000 0.010000 0.010000 0.120000 0.060606 0.444444 0.484848 0.010101 0.080000 0.480000 0.040000 0.400000 Consensus sequence: YSWGTTCKAGGYCASY ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 46 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00043 Bcl6b_primary Original Motif Original Motif Backward 1 16 0.033819 Species: Mus musculus Original motif 0.346550 0.082299 0.202982 0.368169 0.169328 0.599178 0.046508 0.184986 0.085619 0.105820 0.059390 0.749172 0.128756 0.084682 0.076780 0.709782 0.032381 0.009923 0.016477 0.941220 0.013184 0.868651 0.009399 0.108766 0.018397 0.104497 0.450474 0.426632 0.800902 0.010911 0.015982 0.172205 0.141166 0.055397 0.762379 0.041059 0.073467 0.021239 0.811630 0.093665 0.878497 0.015031 0.044964 0.061509 0.875924 0.027013 0.013780 0.083283 0.205684 0.213313 0.040936 0.540067 0.244336 0.228277 0.168227 0.359160 0.208971 0.304437 0.148473 0.338119 0.201607 0.294079 0.334889 0.169425 Consensus sequence: DCTTTCKAGGAATHHV Reverse complement motif 0.201607 0.334889 0.294079 0.169425 0.338119 0.304437 0.148473 0.208971 0.359160 0.228277 0.168227 0.244336 0.540067 0.213313 0.040936 0.205684 0.083283 0.027013 0.013780 0.875924 0.061509 0.015031 0.044964 0.878497 0.073467 0.811630 0.021239 0.093665 0.141166 0.762379 0.055397 0.041059 0.172205 0.010911 0.015982 0.800902 0.018397 0.450474 0.104497 0.426632 0.013184 0.009399 0.868651 0.108766 0.941220 0.009923 0.016477 0.032381 0.709782 0.084682 0.076780 0.128756 0.749172 0.105820 0.059390 0.085619 0.169328 0.046508 0.599178 0.184986 0.368169 0.082299 0.202982 0.346550 Consensus sequence: VHHATTCCTYGAAAGD Alignment: DCTTTCKAGGAATHHV KSTGKCCTRGAACWSM ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00414 Ets1 Original Motif Original Motif Forward 1 16 0.038301 Species: Mus musculus Original motif 0.185517 0.352264 0.234781 0.227438 0.267475 0.153636 0.374632 0.204257 0.209599 0.165342 0.278644 0.346414 0.223668 0.129204 0.369628 0.277501 0.215373 0.320617 0.160255 0.303754 0.836593 0.030586 0.105229 0.027592 0.018622 0.916166 0.063271 0.001942 0.137490 0.857089 0.004870 0.000551 0.002748 0.001698 0.993222 0.002332 0.003309 0.001651 0.993223 0.001817 0.990419 0.000878 0.002565 0.006138 0.815068 0.016317 0.001274 0.167342 0.373416 0.011725 0.613373 0.001487 0.124276 0.194676 0.025016 0.656033 0.359192 0.227478 0.212937 0.200393 0.314691 0.211253 0.233074 0.240981 0.285894 0.131047 0.225562 0.357496 Consensus sequence: BDDDHACCGGAARTVDD Reverse complement motif 0.357496 0.131047 0.225562 0.285894 0.240981 0.211253 0.233074 0.314691 0.200393 0.227478 0.212937 0.359192 0.656033 0.194676 0.025016 0.124276 0.373416 0.613373 0.011725 0.001487 0.167342 0.016317 0.001274 0.815068 0.006138 0.000878 0.002565 0.990419 0.003309 0.993223 0.001651 0.001817 0.002748 0.993222 0.001698 0.002332 0.137490 0.004870 0.857089 0.000551 0.018622 0.063271 0.916166 0.001942 0.027592 0.030586 0.105229 0.836593 0.215373 0.160255 0.320617 0.303754 0.223668 0.369628 0.129204 0.277501 0.346414 0.165342 0.278644 0.209599 0.267475 0.374632 0.153636 0.204257 0.185517 0.234781 0.352264 0.227438 Consensus sequence: DDBAMTTCCGGTDHDHB Alignment: BDDDHACCGGAARTVDD KSTGKCCTRGAACWSM- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 5 16 0.042817 Species: Mus musculus Original motif 0.404007 0.395873 0.173319 0.026801 0.305977 0.215534 0.215359 0.263130 0.370148 0.250957 0.113088 0.265808 0.324336 0.229498 0.174679 0.271487 0.263563 0.137896 0.079217 0.519324 0.265762 0.222582 0.082555 0.429102 0.206721 0.288405 0.017851 0.487023 0.164361 0.236500 0.061051 0.538088 0.593344 0.348446 0.050304 0.007906 0.031328 0.947050 0.007032 0.014590 0.010428 0.956605 0.029142 0.003825 0.459636 0.207616 0.155368 0.177380 0.014573 0.964608 0.012209 0.008610 0.066291 0.918196 0.008729 0.006784 0.019488 0.866774 0.018897 0.094841 0.767405 0.104198 0.029234 0.099164 0.052494 0.772531 0.039832 0.135142 0.296085 0.243498 0.350935 0.109482 0.518843 0.226659 0.124784 0.129714 0.647901 0.019721 0.159901 0.172477 0.113912 0.231511 0.214864 0.439713 0.223117 0.310596 0.293328 0.172959 0.185557 0.487662 0.136321 0.190459 Consensus sequence: MHHHWHYTMCCHCCCACVAABVH Reverse complement motif 0.185557 0.136321 0.487662 0.190459 0.223117 0.293328 0.310596 0.172959 0.439713 0.231511 0.214864 0.113912 0.172477 0.019721 0.159901 0.647901 0.129714 0.226659 0.124784 0.518843 0.296085 0.350935 0.243498 0.109482 0.052494 0.039832 0.772531 0.135142 0.099164 0.104198 0.029234 0.767405 0.019488 0.018897 0.866774 0.094841 0.066291 0.008729 0.918196 0.006784 0.014573 0.012209 0.964608 0.008610 0.177380 0.207616 0.155368 0.459636 0.010428 0.029142 0.956605 0.003825 0.031328 0.007032 0.947050 0.014590 0.007906 0.348446 0.050304 0.593344 0.538088 0.236500 0.061051 0.164361 0.487023 0.288405 0.017851 0.206721 0.429102 0.222582 0.082555 0.265762 0.519324 0.137896 0.079217 0.263563 0.271487 0.229498 0.174679 0.324336 0.265808 0.250957 0.113088 0.370148 0.263130 0.215534 0.215359 0.305977 0.026801 0.395873 0.173319 0.404007 Consensus sequence: DVVTTVGTGGGHGGYAMHWHHHY Alignment: DVVTTVGTGGGHGGYAMHWHHHY ---YSWGTTCKAGGYCASY---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00400 Zif268 Reverse Complement Reverse Complement Backward 6 16 0.043672 Species: Mus musculus Original motif 0.104824 0.412716 0.254506 0.227955 0.644922 0.065476 0.140479 0.149122 0.201205 0.166164 0.347131 0.285501 0.360606 0.256316 0.150766 0.232313 0.199831 0.240681 0.279350 0.280137 0.234308 0.204076 0.321306 0.240310 0.274112 0.462435 0.111425 0.152028 0.067070 0.717501 0.073934 0.141496 0.106745 0.084442 0.658566 0.150247 0.025128 0.967053 0.003585 0.004234 0.006412 0.982989 0.003227 0.007371 0.009588 0.877620 0.002571 0.110221 0.621521 0.355443 0.015669 0.007366 0.002600 0.980275 0.004191 0.012934 0.118773 0.026658 0.783843 0.070725 0.022358 0.822101 0.024684 0.130857 0.713212 0.080912 0.128793 0.077084 0.166568 0.250955 0.107934 0.474544 0.225040 0.222494 0.163301 0.389166 0.268976 0.223206 0.265314 0.242504 0.137052 0.229058 0.148439 0.485451 0.135819 0.304550 0.141994 0.417637 0.272440 0.319501 0.230580 0.177478 Consensus sequence: BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV Reverse complement motif 0.272440 0.230580 0.319501 0.177478 0.417637 0.304550 0.141994 0.135819 0.485451 0.229058 0.148439 0.137052 0.242504 0.223206 0.265314 0.268976 0.389166 0.222494 0.163301 0.225040 0.474544 0.250955 0.107934 0.166568 0.077084 0.080912 0.128793 0.713212 0.022358 0.024684 0.822101 0.130857 0.118773 0.783843 0.026658 0.070725 0.002600 0.004191 0.980275 0.012934 0.007366 0.355443 0.015669 0.621521 0.009588 0.002571 0.877620 0.110221 0.006412 0.003227 0.982989 0.007371 0.025128 0.003585 0.967053 0.004234 0.106745 0.658566 0.084442 0.150247 0.067070 0.073934 0.717501 0.141496 0.274112 0.111425 0.462435 0.152028 0.234308 0.321306 0.204076 0.240310 0.280137 0.240681 0.279350 0.199831 0.232313 0.256316 0.150766 0.360606 0.201205 0.347131 0.166164 0.285501 0.149122 0.065476 0.140479 0.644922 0.104824 0.254506 0.412716 0.227955 Consensus sequence: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB Alignment: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB --YSWGTTCKAGGYCASY----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00213 Hoxa9 Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 16 0.044122 Species: Mus musculus Original motif 0.386110 0.122124 0.336396 0.155370 0.214951 0.503652 0.200027 0.081370 0.227199 0.070231 0.558705 0.143864 0.087364 0.155173 0.659970 0.097493 0.088468 0.597073 0.010847 0.303611 0.237567 0.630916 0.020446 0.111071 0.883692 0.003551 0.103622 0.009135 0.022994 0.004161 0.003712 0.969134 0.630635 0.007085 0.003697 0.358584 0.954551 0.003419 0.003818 0.038212 0.932582 0.012322 0.005304 0.049792 0.758713 0.022612 0.031347 0.187327 0.320450 0.163437 0.062031 0.454082 0.174953 0.127720 0.167458 0.529870 0.511837 0.131729 0.146649 0.209785 0.382191 0.090904 0.276475 0.250430 0.383323 0.080173 0.111038 0.425465 Consensus sequence: DCGGYCATWAAAWTADW Reverse complement motif 0.425465 0.080173 0.111038 0.383323 0.250430 0.090904 0.276475 0.382191 0.209785 0.131729 0.146649 0.511837 0.529870 0.127720 0.167458 0.174953 0.454082 0.163437 0.062031 0.320450 0.187327 0.022612 0.031347 0.758713 0.049792 0.012322 0.005304 0.932582 0.038212 0.003419 0.003818 0.954551 0.358584 0.007085 0.003697 0.630635 0.969134 0.004161 0.003712 0.022994 0.009135 0.003551 0.103622 0.883692 0.237567 0.020446 0.630916 0.111071 0.088468 0.010847 0.597073 0.303611 0.087364 0.659970 0.155173 0.097493 0.227199 0.558705 0.070231 0.143864 0.214951 0.200027 0.503652 0.081370 0.155370 0.122124 0.336396 0.386110 Consensus sequence: WDTAWTTTWATGKCCGD Alignment: WDTAWTTTWATGKCCGD -YSWGTTCKAGGYCASY ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 47 Motif name: C047 Original motif 0.070000 0.010000 0.010000 0.910000 0.040000 0.500000 0.440000 0.020000 0.060606 0.020202 0.828283 0.090909 0.939394 0.020202 0.030303 0.010101 0.880000 0.060000 0.040000 0.020000 0.470000 0.450000 0.030000 0.050000 0.140000 0.020000 0.270000 0.570000 0.020000 0.960000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.890000 0.070000 0.030000 0.040000 0.010000 0.010000 0.940000 0.520000 0.300000 0.050000 0.130000 0.049505 0.019802 0.425743 0.504950 0.020000 0.050000 0.800000 0.130000 0.010000 0.030000 0.020000 0.940000 0.797980 0.171717 0.020202 0.010101 0.049505 0.455446 0.475248 0.019802 0.930000 0.020000 0.010000 0.040000 Consensus sequence: TSGAAMTCACTMKGTASA Reserve complement motif 0.040000 0.020000 0.010000 0.930000 0.049505 0.475248 0.455446 0.019802 0.010101 0.171717 0.020202 0.797980 0.940000 0.030000 0.020000 0.010000 0.020000 0.800000 0.050000 0.130000 0.504950 0.019802 0.425743 0.049505 0.130000 0.300000 0.050000 0.520000 0.940000 0.010000 0.010000 0.040000 0.010000 0.070000 0.890000 0.030000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.020000 0.010000 0.960000 0.010000 0.570000 0.020000 0.270000 0.140000 0.050000 0.450000 0.030000 0.470000 0.020000 0.060000 0.040000 0.880000 0.010101 0.020202 0.030303 0.939394 0.060606 0.828283 0.020202 0.090909 0.040000 0.440000 0.500000 0.020000 0.910000 0.010000 0.010000 0.070000 Consensus sequence: TSTACRYAGTGAYTTCSA ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 47 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00528 Foxm1_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 4 18 0.036996 Species: Mus musculus Original motif 0.399785 0.446658 0.111435 0.042122 0.535175 0.103991 0.089706 0.271128 0.078171 0.387987 0.375083 0.158759 0.309001 0.519142 0.070618 0.101239 0.201844 0.255818 0.323149 0.219190 0.534101 0.109845 0.235026 0.121028 0.656038 0.037473 0.261484 0.045006 0.315713 0.164290 0.471815 0.048182 0.651960 0.009412 0.328237 0.010391 0.937365 0.017313 0.007516 0.037807 0.019983 0.044238 0.012387 0.923392 0.061195 0.021485 0.881645 0.035675 0.017521 0.952998 0.013139 0.016342 0.254160 0.029735 0.493023 0.223082 0.239200 0.593324 0.114503 0.052973 0.610822 0.071539 0.099169 0.218470 0.166610 0.389712 0.204400 0.239278 0.227752 0.361626 0.178497 0.232125 0.537030 0.182466 0.026035 0.254470 0.235902 0.151006 0.043788 0.569304 0.081851 0.250397 0.590059 0.077693 0.340417 0.189613 0.272075 0.197895 Consensus sequence: MWSMBAARRATGCDCABHATGD Reverse complement motif 0.197895 0.189613 0.272075 0.340417 0.081851 0.590059 0.250397 0.077693 0.569304 0.151006 0.043788 0.235902 0.254470 0.182466 0.026035 0.537030 0.227752 0.178497 0.361626 0.232125 0.166610 0.204400 0.389712 0.239278 0.218470 0.071539 0.099169 0.610822 0.239200 0.114503 0.593324 0.052973 0.254160 0.493023 0.029735 0.223082 0.017521 0.013139 0.952998 0.016342 0.061195 0.881645 0.021485 0.035675 0.923392 0.044238 0.012387 0.019983 0.037807 0.017313 0.007516 0.937365 0.010391 0.009412 0.328237 0.651960 0.315713 0.471815 0.164290 0.048182 0.045006 0.037473 0.261484 0.656038 0.121028 0.109845 0.235026 0.534101 0.201844 0.323149 0.255818 0.219190 0.309001 0.070618 0.519142 0.101239 0.078171 0.375083 0.387987 0.158759 0.271128 0.103991 0.089706 0.535175 0.399785 0.111435 0.446658 0.042122 Consensus sequence: DCATDBTGHGCATKMTTBRSWR Alignment: DCATDBTGHGCATKMTTBRSWR ---TSGAAMTCACTMKGTASA- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00527 Foxn4_primary Reverse Complement Original Motif Backward 1 18 0.045149 Species: Mus musculus Original motif 0.397468 0.109792 0.196359 0.296381 0.102928 0.480888 0.250249 0.165936 0.141925 0.173586 0.377365 0.307124 0.337385 0.368225 0.188518 0.105872 0.354789 0.067393 0.345343 0.232475 0.299392 0.109745 0.215552 0.375311 0.242937 0.170264 0.189245 0.397554 0.461680 0.013180 0.358677 0.166463 0.067089 0.063048 0.008045 0.861819 0.431756 0.128671 0.436022 0.003551 0.006559 0.001814 0.988272 0.003355 0.012929 0.983600 0.001468 0.002003 0.018768 0.000766 0.976433 0.004033 0.003776 0.005554 0.002991 0.987679 0.002737 0.981589 0.009028 0.006646 0.126509 0.273800 0.413161 0.186530 0.100613 0.337225 0.212034 0.350128 0.123741 0.284683 0.060914 0.530661 0.204454 0.143533 0.100462 0.551551 0.202290 0.482197 0.148368 0.167145 0.191625 0.101330 0.607860 0.099185 0.507546 0.086532 0.219554 0.186368 Consensus sequence: DBBVDDDRTRGCGTCBBYTHGA Reverse complement motif 0.186368 0.086532 0.219554 0.507546 0.191625 0.607860 0.101330 0.099185 0.202290 0.148368 0.482197 0.167145 0.551551 0.143533 0.100462 0.204454 0.530661 0.284683 0.060914 0.123741 0.350128 0.337225 0.212034 0.100613 0.126509 0.413161 0.273800 0.186530 0.002737 0.009028 0.981589 0.006646 0.987679 0.005554 0.002991 0.003776 0.018768 0.976433 0.000766 0.004033 0.012929 0.001468 0.983600 0.002003 0.006559 0.988272 0.001814 0.003355 0.431756 0.436022 0.128671 0.003551 0.861819 0.063048 0.008045 0.067089 0.166463 0.013180 0.358677 0.461680 0.397554 0.170264 0.189245 0.242937 0.375311 0.109745 0.215552 0.299392 0.232475 0.067393 0.345343 0.354789 0.337385 0.188518 0.368225 0.105872 0.141925 0.377365 0.173586 0.307124 0.102928 0.250249 0.480888 0.165936 0.296381 0.109792 0.196359 0.397468 Consensus sequence: TCDAMVBGACGCMAKDDDVBBD Alignment: TCDAMVBGACGCMAKDDDVBBD ----TSTACRYAGTGAYTTCSA ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 3 18 0.046771 Species: Mus musculus Original motif 0.067627 0.131333 0.654425 0.146615 0.156488 0.114442 0.145630 0.583441 0.206450 0.265630 0.358017 0.169903 0.090729 0.460713 0.274712 0.173847 0.285994 0.099998 0.154485 0.459523 0.635908 0.184787 0.072982 0.106323 0.748421 0.039204 0.092605 0.119769 0.081342 0.061327 0.044532 0.812799 0.143120 0.043879 0.024216 0.788785 0.247544 0.092102 0.621453 0.038901 0.295531 0.036295 0.027594 0.640580 0.194561 0.305468 0.339916 0.160055 0.175038 0.193568 0.101212 0.530182 0.145226 0.167488 0.559871 0.127415 0.271501 0.237429 0.206701 0.284369 0.216834 0.109191 0.569605 0.104370 0.182624 0.177160 0.300475 0.339742 0.331737 0.198645 0.265137 0.204482 0.230155 0.359365 0.183450 0.227029 0.056581 0.067297 0.463052 0.413070 0.198891 0.324626 0.304424 0.172059 0.181968 0.287547 0.202419 0.328066 Consensus sequence: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB Reverse complement motif 0.328066 0.287547 0.202419 0.181968 0.198891 0.304424 0.324626 0.172059 0.056581 0.463052 0.067297 0.413070 0.230155 0.183450 0.359365 0.227029 0.204482 0.198645 0.265137 0.331737 0.339742 0.177160 0.300475 0.182624 0.216834 0.569605 0.109191 0.104370 0.284369 0.237429 0.206701 0.271501 0.145226 0.559871 0.167488 0.127415 0.530182 0.193568 0.101212 0.175038 0.194561 0.339916 0.305468 0.160055 0.640580 0.036295 0.027594 0.295531 0.247544 0.621453 0.092102 0.038901 0.788785 0.043879 0.024216 0.143120 0.812799 0.061327 0.044532 0.081342 0.119769 0.039204 0.092605 0.748421 0.106323 0.184787 0.072982 0.635908 0.459523 0.099998 0.154485 0.285994 0.090729 0.274712 0.460713 0.173847 0.206450 0.358017 0.265630 0.169903 0.583441 0.114442 0.145630 0.156488 0.067627 0.654425 0.131333 0.146615 Consensus sequence: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC Alignment: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC --TSTACRYAGTGAYTTCSA-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v015681_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 3 18 0.047063 Species: Mus musculus Original motif 0.214165 0.143436 0.372522 0.269876 0.314445 0.406003 0.160351 0.119201 0.137147 0.092924 0.042921 0.727007 0.044121 0.072843 0.051741 0.831295 0.261292 0.324124 0.298498 0.116086 0.258125 0.323243 0.263362 0.155271 0.204557 0.589399 0.107153 0.098891 0.371021 0.244027 0.291102 0.093849 0.096327 0.572718 0.011797 0.319159 0.027282 0.046183 0.844519 0.082016 0.018921 0.012887 0.915917 0.052275 0.364793 0.166722 0.084229 0.384256 0.028216 0.011233 0.951056 0.009495 0.054974 0.004738 0.890377 0.049911 0.006802 0.312915 0.134247 0.546036 0.241289 0.628210 0.104788 0.025713 0.237863 0.302807 0.213018 0.246311 0.349399 0.203220 0.086635 0.360746 0.386634 0.144693 0.246895 0.221779 0.425101 0.354676 0.093374 0.126849 0.060272 0.391320 0.104905 0.443503 0.162090 0.190233 0.227433 0.420244 Consensus sequence: DVTTVVCVYGGHGGYCHHDMYB Reverse complement motif 0.420244 0.190233 0.227433 0.162090 0.443503 0.391320 0.104905 0.060272 0.126849 0.354676 0.093374 0.425101 0.221779 0.144693 0.246895 0.386634 0.360746 0.203220 0.086635 0.349399 0.237863 0.213018 0.302807 0.246311 0.241289 0.104788 0.628210 0.025713 0.546036 0.312915 0.134247 0.006802 0.054974 0.890377 0.004738 0.049911 0.028216 0.951056 0.011233 0.009495 0.384256 0.166722 0.084229 0.364793 0.018921 0.915917 0.012887 0.052275 0.027282 0.844519 0.046183 0.082016 0.096327 0.011797 0.572718 0.319159 0.093849 0.244027 0.291102 0.371021 0.204557 0.107153 0.589399 0.098891 0.258125 0.263362 0.323243 0.155271 0.261292 0.298498 0.324124 0.116086 0.831295 0.072843 0.051741 0.044121 0.727007 0.092924 0.042921 0.137147 0.314445 0.160351 0.406003 0.119201 0.214165 0.372522 0.143436 0.269876 Consensus sequence: VMYDHDGMCCHCCKBGVVAAVH Alignment: DVTTVVCVYGGHGGYCHHDMYB --TSTACRYAGTGAYTTCSA-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00098 Rfx3_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 6 18 0.047979 Species: Mus musculus Original motif 0.314514 0.275352 0.257617 0.152518 0.126939 0.598294 0.130576 0.144192 0.102265 0.155334 0.177957 0.564445 0.129288 0.282678 0.326990 0.261044 0.318166 0.227823 0.175681 0.278330 0.109019 0.380838 0.278328 0.231815 0.226145 0.289206 0.291300 0.193348 0.035863 0.844339 0.072582 0.047216 0.223793 0.187244 0.088092 0.500871 0.039800 0.029681 0.026201 0.904317 0.298298 0.032147 0.654746 0.014809 0.014729 0.022023 0.944826 0.018422 0.485114 0.004925 0.013785 0.496176 0.035708 0.020381 0.240804 0.703108 0.951152 0.012738 0.017886 0.018224 0.023713 0.944394 0.009538 0.022355 0.291067 0.385205 0.232388 0.091339 0.340334 0.199588 0.311526 0.148552 0.198713 0.472138 0.178319 0.150830 0.321155 0.269932 0.311301 0.097612 0.412646 0.195252 0.231950 0.160152 0.297134 0.180928 0.250400 0.271538 0.151169 0.305386 0.358574 0.184871 Consensus sequence: VCTBHBVCTTGGWTACVVVVVDB Reverse complement motif 0.151169 0.358574 0.305386 0.184871 0.271538 0.180928 0.250400 0.297134 0.160152 0.195252 0.231950 0.412646 0.097612 0.269932 0.311301 0.321155 0.198713 0.178319 0.472138 0.150830 0.148552 0.199588 0.311526 0.340334 0.291067 0.232388 0.385205 0.091339 0.023713 0.009538 0.944394 0.022355 0.018224 0.012738 0.017886 0.951152 0.703108 0.020381 0.240804 0.035708 0.496176 0.004925 0.013785 0.485114 0.014729 0.944826 0.022023 0.018422 0.298298 0.654746 0.032147 0.014809 0.904317 0.029681 0.026201 0.039800 0.500871 0.187244 0.088092 0.223793 0.035863 0.072582 0.844339 0.047216 0.226145 0.291300 0.289206 0.193348 0.109019 0.278328 0.380838 0.231815 0.278330 0.227823 0.175681 0.318166 0.129288 0.326990 0.282678 0.261044 0.564445 0.155334 0.177957 0.102265 0.126939 0.130576 0.598294 0.144192 0.152518 0.275352 0.257617 0.314514 Consensus sequence: BDBBVBVGTAWCCAAGVBHBAGB Alignment: BDBBVBVGTAWCCAAGVBHBAGB -----TSGAAMTCACTMKGTASA ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 48 Motif name: C048 Original motif 0.030000 0.440000 0.460000 0.070000 0.010000 0.150000 0.830000 0.010000 0.710000 0.090000 0.150000 0.050000 0.050000 0.010000 0.930000 0.010000 0.020000 0.060000 0.910000 0.010000 0.020000 0.850000 0.020000 0.110000 0.380000 0.020000 0.040000 0.560000 0.009901 0.495050 0.485149 0.009901 0.560000 0.010000 0.020000 0.410000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.020000 0.950000 0.020000 0.108911 0.603960 0.277228 0.009901 0.680000 0.030000 0.200000 0.090000 0.020000 0.040000 0.930000 0.010000 0.100000 0.400000 0.410000 0.090000 0.080000 0.560000 0.220000 0.140000 Consensus sequence: SGAGGCWSWGGCAGSC Reserve complement motif 0.080000 0.220000 0.560000 0.140000 0.100000 0.410000 0.400000 0.090000 0.020000 0.930000 0.040000 0.010000 0.090000 0.030000 0.200000 0.680000 0.108911 0.277228 0.603960 0.009901 0.010000 0.950000 0.020000 0.020000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.410000 0.010000 0.020000 0.560000 0.009901 0.485149 0.495050 0.009901 0.560000 0.020000 0.040000 0.380000 0.020000 0.020000 0.850000 0.110000 0.020000 0.910000 0.060000 0.010000 0.050000 0.930000 0.010000 0.010000 0.050000 0.090000 0.150000 0.710000 0.010000 0.830000 0.150000 0.010000 0.030000 0.460000 0.440000 0.070000 Consensus sequence: GSCTGCCWSWGCCTCS ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 48 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00527 Foxn4_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 7 16 0.023702 Species: Mus musculus Original motif 0.298336 0.418632 0.208054 0.074978 0.289907 0.015608 0.457100 0.237385 0.273583 0.077889 0.107860 0.540668 0.184954 0.161611 0.384390 0.269045 0.521826 0.156340 0.089019 0.232815 0.356716 0.131104 0.394857 0.117323 0.266669 0.108765 0.505273 0.119293 0.020778 0.047199 0.919524 0.012500 0.948536 0.018775 0.008113 0.024576 0.010822 0.964042 0.014701 0.010434 0.007428 0.019505 0.966351 0.006717 0.010025 0.975678 0.008648 0.005649 0.043796 0.120935 0.742979 0.092289 0.008252 0.250704 0.541132 0.199913 0.474428 0.044681 0.134430 0.346461 0.146597 0.421317 0.143166 0.288920 0.020540 0.181479 0.553811 0.244170 0.129612 0.173360 0.535219 0.161808 0.506084 0.158156 0.130983 0.204776 0.054872 0.103043 0.545792 0.296293 0.389882 0.171037 0.164162 0.274918 0.225861 0.314031 0.288872 0.171237 Consensus sequence: VDWDARRGACGCGGWHGGAKHV Reverse complement motif 0.225861 0.288872 0.314031 0.171237 0.274918 0.171037 0.164162 0.389882 0.054872 0.545792 0.103043 0.296293 0.204776 0.158156 0.130983 0.506084 0.129612 0.535219 0.173360 0.161808 0.020540 0.553811 0.181479 0.244170 0.146597 0.143166 0.421317 0.288920 0.346461 0.044681 0.134430 0.474428 0.008252 0.541132 0.250704 0.199913 0.043796 0.742979 0.120935 0.092289 0.010025 0.008648 0.975678 0.005649 0.007428 0.966351 0.019505 0.006717 0.010822 0.014701 0.964042 0.010434 0.024576 0.018775 0.008113 0.948536 0.020778 0.919524 0.047199 0.012500 0.266669 0.505273 0.108765 0.119293 0.356716 0.394857 0.131104 0.117323 0.232815 0.156340 0.089019 0.521826 0.184954 0.384390 0.161611 0.269045 0.540668 0.077889 0.107860 0.273583 0.289907 0.457100 0.015608 0.237385 0.298336 0.208054 0.418632 0.074978 Consensus sequence: VHYTCCDWCCGCGTCMMTHWHV Alignment: VDWDARRGACGCGGWHGGAKHV ------SGAGGCWSWGGCAGSC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v015681_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 1 16 0.032717 Species: Mus musculus Original motif 0.331499 0.188505 0.182841 0.297156 0.328961 0.213025 0.273530 0.184484 0.197213 0.129292 0.524914 0.148581 0.274491 0.226406 0.312118 0.186986 0.103231 0.393726 0.364988 0.138055 0.552594 0.166422 0.186262 0.094722 0.157618 0.064773 0.616497 0.161112 0.139166 0.176098 0.621185 0.063551 0.748420 0.062398 0.012447 0.176735 0.116584 0.009438 0.860326 0.013653 0.005030 0.003646 0.974877 0.016447 0.055257 0.007181 0.921760 0.015802 0.032748 0.058249 0.052709 0.856293 0.105606 0.872231 0.014370 0.007793 0.019480 0.497379 0.125899 0.357242 0.478582 0.269713 0.061464 0.190242 0.253985 0.287006 0.201320 0.257689 0.319384 0.210231 0.175842 0.294543 0.222123 0.287802 0.201294 0.288782 0.139951 0.376041 0.081133 0.402875 0.213450 0.343835 0.383676 0.059039 0.322294 0.355918 0.148062 0.173725 Consensus sequence: HVGVSAGGAGGGTCYHHHHYVH Reverse complement motif 0.322294 0.148062 0.355918 0.173725 0.213450 0.383676 0.343835 0.059039 0.402875 0.376041 0.081133 0.139951 0.288782 0.287802 0.201294 0.222123 0.294543 0.210231 0.175842 0.319384 0.253985 0.201320 0.287006 0.257689 0.190242 0.269713 0.061464 0.478582 0.019480 0.125899 0.497379 0.357242 0.105606 0.014370 0.872231 0.007793 0.856293 0.058249 0.052709 0.032748 0.055257 0.921760 0.007181 0.015802 0.005030 0.974877 0.003646 0.016447 0.116584 0.860326 0.009438 0.013653 0.176735 0.062398 0.012447 0.748420 0.139166 0.621185 0.176098 0.063551 0.157618 0.616497 0.064773 0.161112 0.094722 0.166422 0.186262 0.552594 0.103231 0.364988 0.393726 0.138055 0.274491 0.312118 0.226406 0.186986 0.197213 0.524914 0.129292 0.148581 0.184484 0.213025 0.273530 0.328961 0.297156 0.188505 0.182841 0.331499 Consensus sequence: DVMHHDHKGACCCTCCTSVCBH Alignment: DVMHHDHKGACCCTCCTSVCBH GSCTGCCWSWGCCTCS------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00400 Zif268 Original Motif Reverse Complement Backward 5 16 0.034796 Species: Mus musculus Original motif 0.104824 0.412716 0.254506 0.227955 0.644922 0.065476 0.140479 0.149122 0.201205 0.166164 0.347131 0.285501 0.360606 0.256316 0.150766 0.232313 0.199831 0.240681 0.279350 0.280137 0.234308 0.204076 0.321306 0.240310 0.274112 0.462435 0.111425 0.152028 0.067070 0.717501 0.073934 0.141496 0.106745 0.084442 0.658566 0.150247 0.025128 0.967053 0.003585 0.004234 0.006412 0.982989 0.003227 0.007371 0.009588 0.877620 0.002571 0.110221 0.621521 0.355443 0.015669 0.007366 0.002600 0.980275 0.004191 0.012934 0.118773 0.026658 0.783843 0.070725 0.022358 0.822101 0.024684 0.130857 0.713212 0.080912 0.128793 0.077084 0.166568 0.250955 0.107934 0.474544 0.225040 0.222494 0.163301 0.389166 0.268976 0.223206 0.265314 0.242504 0.137052 0.229058 0.148439 0.485451 0.135819 0.304550 0.141994 0.417637 0.272440 0.319501 0.230580 0.177478 Consensus sequence: BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV Reverse complement motif 0.272440 0.230580 0.319501 0.177478 0.417637 0.304550 0.141994 0.135819 0.485451 0.229058 0.148439 0.137052 0.242504 0.223206 0.265314 0.268976 0.389166 0.222494 0.163301 0.225040 0.474544 0.250955 0.107934 0.166568 0.077084 0.080912 0.128793 0.713212 0.022358 0.024684 0.822101 0.130857 0.118773 0.783843 0.026658 0.070725 0.002600 0.004191 0.980275 0.012934 0.007366 0.355443 0.015669 0.621521 0.009588 0.002571 0.877620 0.110221 0.006412 0.003227 0.982989 0.007371 0.025128 0.003585 0.967053 0.004234 0.106745 0.658566 0.084442 0.150247 0.067070 0.073934 0.717501 0.141496 0.274112 0.111425 0.462435 0.152028 0.234308 0.321306 0.204076 0.240310 0.280137 0.240681 0.279350 0.199831 0.232313 0.256316 0.150766 0.360606 0.201205 0.347131 0.166164 0.285501 0.149122 0.065476 0.140479 0.644922 0.104824 0.254506 0.412716 0.227955 Consensus sequence: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB Alignment: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB ---SGAGGCWSWGGCAGSC---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 4 16 0.036242 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH ---GSCTGCCWSWGCCTCS--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00098 Rfx3_primary Reverse Complement Original Motif Forward 2 16 0.039340 Species: Mus musculus Original motif 0.218345 0.231533 0.152528 0.397594 0.264604 0.126115 0.320860 0.288421 0.117304 0.186844 0.172946 0.522906 0.111929 0.277908 0.409084 0.201079 0.343319 0.311376 0.123612 0.221692 0.193354 0.374280 0.157338 0.275028 0.166348 0.578991 0.130872 0.123789 0.006937 0.931183 0.046809 0.015072 0.255581 0.289587 0.125513 0.329319 0.002582 0.012615 0.002782 0.982021 0.850584 0.007973 0.140639 0.000803 0.037792 0.002285 0.957277 0.002646 0.009414 0.921481 0.001636 0.067469 0.943403 0.000980 0.042401 0.013216 0.991166 0.002931 0.003540 0.002364 0.003651 0.987110 0.001106 0.008133 0.208873 0.369705 0.319129 0.102292 0.322535 0.186617 0.374187 0.116660 0.326738 0.179486 0.226374 0.267402 0.299697 0.185329 0.133025 0.381949 0.300824 0.266836 0.096437 0.335904 0.418443 0.191068 0.127183 0.263306 0.386727 0.204062 0.126050 0.283161 Consensus sequence: HDTBHHCCHTAGCAACVVDHHHH Reverse complement motif 0.283161 0.204062 0.126050 0.386727 0.263306 0.191068 0.127183 0.418443 0.335904 0.266836 0.096437 0.300824 0.381949 0.185329 0.133025 0.299697 0.267402 0.179486 0.226374 0.326738 0.322535 0.374187 0.186617 0.116660 0.208873 0.319129 0.369705 0.102292 0.003651 0.001106 0.987110 0.008133 0.002364 0.002931 0.003540 0.991166 0.013216 0.000980 0.042401 0.943403 0.009414 0.001636 0.921481 0.067469 0.037792 0.957277 0.002285 0.002646 0.000803 0.007973 0.140639 0.850584 0.982021 0.012615 0.002782 0.002582 0.329319 0.289587 0.125513 0.255581 0.006937 0.046809 0.931183 0.015072 0.166348 0.130872 0.578991 0.123789 0.193354 0.157338 0.374280 0.275028 0.221692 0.311376 0.123612 0.343319 0.111929 0.409084 0.277908 0.201079 0.522906 0.186844 0.172946 0.117304 0.264604 0.320860 0.126115 0.288421 0.397594 0.231533 0.152528 0.218345 Consensus sequence: HHHHDVVGTTGCTAHGGDHBAHH Alignment: HDTBHHCCHTAGCAACVVDHHHH -GSCTGCCWSWGCCTCS------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 49 Motif name: C049 Original motif 0.534653 0.019802 0.108911 0.336634 0.564356 0.069307 0.089109 0.277228 0.570000 0.030000 0.010000 0.390000 0.484848 0.090909 0.040404 0.383838 0.700000 0.020000 0.090000 0.190000 0.950000 0.010000 0.020000 0.020000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.950000 0.010000 0.010000 0.030000 0.010000 0.170000 0.020000 0.800000 0.860000 0.010000 0.120000 0.010000 0.666667 0.010101 0.020202 0.303030 0.475248 0.049505 0.009901 0.465347 0.168317 0.059406 0.049505 0.722772 Consensus sequence: WAWWAAAATAAWT Reserve complement motif 0.722772 0.059406 0.049505 0.168317 0.465347 0.049505 0.009901 0.475248 0.303030 0.010101 0.020202 0.666667 0.010000 0.010000 0.120000 0.860000 0.800000 0.170000 0.020000 0.010000 0.030000 0.010000 0.010000 0.950000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.020000 0.010000 0.020000 0.950000 0.190000 0.020000 0.090000 0.700000 0.383838 0.090909 0.040404 0.484848 0.390000 0.030000 0.010000 0.570000 0.277228 0.069307 0.089109 0.564356 0.336634 0.019802 0.108911 0.534653 Consensus sequence: AWTTATTTTWWTW ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 49 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00061 Foxl1_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 2 13 0.023502 Species: Mus musculus Original motif 0.560226 0.121586 0.083231 0.234957 0.318077 0.149137 0.179955 0.352831 0.482497 0.118420 0.173594 0.225488 0.200166 0.160901 0.191493 0.447440 0.033691 0.569719 0.018901 0.377690 0.638020 0.166545 0.021254 0.174181 0.573953 0.105729 0.009308 0.311010 0.890518 0.053364 0.013424 0.042694 0.910758 0.028166 0.032648 0.028428 0.013358 0.738707 0.023981 0.223953 0.911783 0.018754 0.031898 0.037564 0.702891 0.068940 0.076823 0.151346 0.445507 0.320769 0.057216 0.176507 0.587798 0.129586 0.140592 0.142024 0.258981 0.330939 0.167334 0.242747 0.362022 0.333796 0.145861 0.158320 Consensus sequence: ADDDYAWAACAAMAHH Reverse complement motif 0.158320 0.333796 0.145861 0.362022 0.258981 0.167334 0.330939 0.242747 0.142024 0.129586 0.140592 0.587798 0.176507 0.320769 0.057216 0.445507 0.151346 0.068940 0.076823 0.702891 0.037564 0.018754 0.031898 0.911783 0.013358 0.023981 0.738707 0.223953 0.028428 0.028166 0.032648 0.910758 0.042694 0.053364 0.013424 0.890518 0.311010 0.105729 0.009308 0.573953 0.174181 0.166545 0.021254 0.638020 0.033691 0.018901 0.569719 0.377690 0.447440 0.160901 0.191493 0.200166 0.225488 0.118420 0.173594 0.482497 0.352831 0.149137 0.179955 0.318077 0.234957 0.121586 0.083231 0.560226 Consensus sequence: HDTYTTGTTWTKDDDT Alignment: ADDDYAWAACAAMAHH -WAWWAAAATAAWT-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00073 Foxa2_primary Original Motif Original Motif Forward 3 13 0.025123 Species: Mus musculus Original motif 0.335487 0.205062 0.128957 0.330494 0.411635 0.179625 0.175701 0.233038 0.412976 0.128602 0.091890 0.366532 0.608396 0.079002 0.107142 0.205460 0.433474 0.035203 0.153143 0.378180 0.087552 0.005003 0.894586 0.012858 0.004459 0.038951 0.001109 0.955481 0.924470 0.068560 0.001165 0.005805 0.920483 0.070039 0.001674 0.007805 0.988335 0.001902 0.003155 0.006608 0.001527 0.656726 0.002699 0.339047 0.987505 0.001810 0.004336 0.006349 0.719584 0.065184 0.050384 0.164848 0.535389 0.099997 0.102849 0.261764 0.245215 0.272017 0.301499 0.181269 0.306107 0.209040 0.248687 0.236166 0.223744 0.278668 0.251931 0.245657 Consensus sequence: HHWAWGTAAAYAAAVDB Reverse complement motif 0.223744 0.251931 0.278668 0.245657 0.236166 0.209040 0.248687 0.306107 0.245215 0.301499 0.272017 0.181269 0.261764 0.099997 0.102849 0.535389 0.164848 0.065184 0.050384 0.719584 0.006349 0.001810 0.004336 0.987505 0.001527 0.002699 0.656726 0.339047 0.006608 0.001902 0.003155 0.988335 0.007805 0.070039 0.001674 0.920483 0.005805 0.068560 0.001165 0.924470 0.955481 0.038951 0.001109 0.004459 0.087552 0.894586 0.005003 0.012858 0.378180 0.035203 0.153143 0.433474 0.205460 0.079002 0.107142 0.608396 0.366532 0.128602 0.091890 0.412976 0.233038 0.179625 0.175701 0.411635 0.330494 0.205062 0.128957 0.335487 Consensus sequence: BDVTTTKTTTACWTWHH Alignment: HHWAWGTAAAYAAAVDB --WAWWAAAATAAWT-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00121 Hoxd10 Reverse Complement Reverse Complement Backward 5 13 0.026993 Species: Mus musculus Original motif 0.405345 0.293266 0.220907 0.080482 0.398063 0.099034 0.333525 0.169378 0.049753 0.190411 0.336789 0.423048 0.243698 0.226261 0.324346 0.205696 0.030873 0.549741 0.008321 0.411065 0.714225 0.228092 0.020960 0.036723 0.833992 0.010944 0.021918 0.133146 0.008898 0.026169 0.008341 0.956591 0.811684 0.004889 0.004751 0.178676 0.952107 0.004322 0.004587 0.038984 0.925365 0.008360 0.006811 0.059464 0.850659 0.058250 0.065237 0.025855 0.193369 0.242985 0.049515 0.514131 0.266774 0.080601 0.239781 0.412844 0.335522 0.125500 0.188170 0.350809 0.407171 0.120540 0.187300 0.284989 0.281181 0.242348 0.160247 0.316224 Consensus sequence: VDKVYAATAAAATDDDH Reverse complement motif 0.316224 0.242348 0.160247 0.281181 0.284989 0.120540 0.187300 0.407171 0.350809 0.125500 0.188170 0.335522 0.412844 0.080601 0.239781 0.266774 0.514131 0.242985 0.049515 0.193369 0.025855 0.058250 0.065237 0.850659 0.059464 0.008360 0.006811 0.925365 0.038984 0.004322 0.004587 0.952107 0.178676 0.004889 0.004751 0.811684 0.956591 0.026169 0.008341 0.008898 0.133146 0.010944 0.021918 0.833992 0.036723 0.228092 0.020960 0.714225 0.030873 0.008321 0.549741 0.411065 0.243698 0.324346 0.226261 0.205696 0.423048 0.190411 0.336789 0.049753 0.169378 0.099034 0.333525 0.398063 0.080482 0.293266 0.220907 0.405345 Consensus sequence: HDDDATTTTATTKVRDB Alignment: HDDDATTTTATTKVRDB AWTTATTTTWWTW---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00061 Foxl1_primary Original Motif Original Motif Forward 3 13 0.027063 Species: Mus musculus Original motif 0.323208 0.152915 0.185111 0.338766 0.428132 0.056109 0.099487 0.416272 0.659386 0.039965 0.035805 0.264843 0.647143 0.049206 0.078984 0.224667 0.208834 0.076592 0.071631 0.642943 0.341077 0.003865 0.649511 0.005547 0.016627 0.001866 0.001715 0.979792 0.952319 0.045294 0.000870 0.001516 0.988834 0.004620 0.000720 0.005826 0.989346 0.001005 0.006467 0.003182 0.001093 0.784230 0.001235 0.213442 0.991209 0.002017 0.001737 0.005037 0.801581 0.037084 0.023060 0.138274 0.528554 0.089350 0.107501 0.274595 0.208802 0.268646 0.368022 0.154530 0.280218 0.221367 0.340497 0.157918 0.146611 0.250725 0.293524 0.309140 Consensus sequence: DWAATRTAAACAAWVVB Reverse complement motif 0.309140 0.250725 0.293524 0.146611 0.280218 0.340497 0.221367 0.157918 0.208802 0.368022 0.268646 0.154530 0.274595 0.089350 0.107501 0.528554 0.138274 0.037084 0.023060 0.801581 0.005037 0.002017 0.001737 0.991209 0.001093 0.001235 0.784230 0.213442 0.003182 0.001005 0.006467 0.989346 0.005826 0.004620 0.000720 0.988834 0.001516 0.045294 0.000870 0.952319 0.979792 0.001866 0.001715 0.016627 0.341077 0.649511 0.003865 0.005547 0.642943 0.076592 0.071631 0.208834 0.224667 0.049206 0.078984 0.647143 0.264843 0.039965 0.035805 0.659386 0.416272 0.056109 0.099487 0.428132 0.338766 0.152915 0.185111 0.323208 Consensus sequence: VVVWTTGTTTAMATTWD Alignment: DWAATRTAAACAAWVVB --WAWWAAAATAAWT-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00037 Zfp105_primaryReverse Complement Reverse Complement Forward 2 13 0.029016 Species: Mus musculus Original motif 0.363104 0.182807 0.145232 0.308856 0.419707 0.133742 0.222546 0.224005 0.164481 0.418263 0.052397 0.364858 0.715575 0.117639 0.064914 0.101872 0.883836 0.026985 0.032584 0.056596 0.558797 0.151280 0.033120 0.256803 0.267037 0.403488 0.026746 0.302729 0.939762 0.013627 0.034579 0.012032 0.897072 0.009878 0.035642 0.057408 0.305904 0.516040 0.055311 0.122746 0.880940 0.027958 0.048350 0.042752 0.710082 0.052464 0.040250 0.197204 0.246712 0.125155 0.318627 0.309506 0.429749 0.181755 0.176892 0.211603 0.339643 0.097216 0.355250 0.207891 Consensus sequence: HDYAAAHAAMAADHD Reverse complement motif 0.339643 0.355250 0.097216 0.207891 0.211603 0.181755 0.176892 0.429749 0.246712 0.318627 0.125155 0.309506 0.197204 0.052464 0.040250 0.710082 0.042752 0.027958 0.048350 0.880940 0.305904 0.055311 0.516040 0.122746 0.057408 0.009878 0.035642 0.897072 0.012032 0.013627 0.034579 0.939762 0.267037 0.026746 0.403488 0.302729 0.256803 0.151280 0.033120 0.558797 0.056596 0.026985 0.032584 0.883836 0.101872 0.117639 0.064914 0.715575 0.164481 0.052397 0.418263 0.364858 0.224005 0.133742 0.222546 0.419707 0.308856 0.182807 0.145232 0.363104 Consensus sequence: HHHTTRTTDTTTKDH Alignment: HHHTTRTTDTTTKDH -AWTTATTTTWWTW- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 50 Motif name: C050 Original motif 0.009901 0.693069 0.118812 0.178218 0.160000 0.210000 0.270000 0.360000 0.079208 0.188119 0.722772 0.009901 0.009901 0.821782 0.089109 0.079208 0.200000 0.620000 0.020000 0.160000 0.059406 0.108911 0.356436 0.475248 0.010000 0.950000 0.030000 0.010000 0.120000 0.310000 0.090000 0.480000 0.010000 0.350000 0.600000 0.040000 0.020000 0.820000 0.010000 0.150000 0.121212 0.767677 0.010101 0.101010 0.191919 0.010101 0.050505 0.747475 0.010000 0.680000 0.190000 0.120000 0.010000 0.590000 0.020000 0.380000 0.465347 0.336634 0.128713 0.069307 0.250000 0.070000 0.670000 0.010000 Consensus sequence: CBGCCKCYSCCTCYMG Reserve complement motif 0.250000 0.670000 0.070000 0.010000 0.069307 0.336634 0.128713 0.465347 0.010000 0.020000 0.590000 0.380000 0.010000 0.190000 0.680000 0.120000 0.747475 0.010101 0.050505 0.191919 0.121212 0.010101 0.767677 0.101010 0.020000 0.010000 0.820000 0.150000 0.010000 0.600000 0.350000 0.040000 0.480000 0.310000 0.090000 0.120000 0.010000 0.030000 0.950000 0.010000 0.475248 0.108911 0.356436 0.059406 0.200000 0.020000 0.620000 0.160000 0.009901 0.089109 0.821782 0.079208 0.079208 0.722772 0.188119 0.009901 0.360000 0.210000 0.270000 0.160000 0.009901 0.118812 0.693069 0.178218 Consensus sequence: CYKGAGGSMGRGGCVG ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 50 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 6 16 0.027486 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH -----CBGCCKCYSCCTCYMG- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00527 Foxn4_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 3 16 0.029426 Species: Mus musculus Original motif 0.298336 0.418632 0.208054 0.074978 0.289907 0.015608 0.457100 0.237385 0.273583 0.077889 0.107860 0.540668 0.184954 0.161611 0.384390 0.269045 0.521826 0.156340 0.089019 0.232815 0.356716 0.131104 0.394857 0.117323 0.266669 0.108765 0.505273 0.119293 0.020778 0.047199 0.919524 0.012500 0.948536 0.018775 0.008113 0.024576 0.010822 0.964042 0.014701 0.010434 0.007428 0.019505 0.966351 0.006717 0.010025 0.975678 0.008648 0.005649 0.043796 0.120935 0.742979 0.092289 0.008252 0.250704 0.541132 0.199913 0.474428 0.044681 0.134430 0.346461 0.146597 0.421317 0.143166 0.288920 0.020540 0.181479 0.553811 0.244170 0.129612 0.173360 0.535219 0.161808 0.506084 0.158156 0.130983 0.204776 0.054872 0.103043 0.545792 0.296293 0.389882 0.171037 0.164162 0.274918 0.225861 0.314031 0.288872 0.171237 Consensus sequence: VDWDARRGACGCGGWHGGAKHV Reverse complement motif 0.225861 0.288872 0.314031 0.171237 0.274918 0.171037 0.164162 0.389882 0.054872 0.545792 0.103043 0.296293 0.204776 0.158156 0.130983 0.506084 0.129612 0.535219 0.173360 0.161808 0.020540 0.553811 0.181479 0.244170 0.146597 0.143166 0.421317 0.288920 0.346461 0.044681 0.134430 0.474428 0.008252 0.541132 0.250704 0.199913 0.043796 0.742979 0.120935 0.092289 0.010025 0.008648 0.975678 0.005649 0.007428 0.966351 0.019505 0.006717 0.010822 0.014701 0.964042 0.010434 0.024576 0.018775 0.008113 0.948536 0.020778 0.919524 0.047199 0.012500 0.266669 0.505273 0.108765 0.119293 0.356716 0.394857 0.131104 0.117323 0.232815 0.156340 0.089019 0.521826 0.184954 0.384390 0.161611 0.269045 0.540668 0.077889 0.107860 0.273583 0.289907 0.457100 0.015608 0.237385 0.298336 0.208054 0.418632 0.074978 Consensus sequence: VHYTCCDWCCGCGTCMMTHWHV Alignment: VHYTCCDWCCGCGTCMMTHWHV --CBGCCKCYSCCTCYMG---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00022 Zfp740_primaryReverse Complement Reverse Complement Forward 1 16 0.029578 Species: Mus musculus Original motif 0.136946 0.396508 0.135309 0.331236 0.185528 0.417538 0.215409 0.181525 0.171276 0.341901 0.172832 0.313991 0.145641 0.590572 0.146376 0.117412 0.138035 0.660416 0.114016 0.087533 0.222728 0.750532 0.007528 0.019212 0.024633 0.963314 0.001894 0.010159 0.009557 0.979956 0.000642 0.009844 0.010416 0.977424 0.000541 0.011619 0.026401 0.956740 0.001544 0.015314 0.195502 0.755959 0.011060 0.037480 0.491291 0.364785 0.025613 0.118311 0.305153 0.398160 0.071680 0.225008 0.253497 0.232647 0.213246 0.300610 0.156964 0.297876 0.144683 0.400477 0.179549 0.292514 0.319462 0.208475 Consensus sequence: HVBCCCCCCCCMHHHB Reverse complement motif 0.179549 0.319462 0.292514 0.208475 0.400477 0.297876 0.144683 0.156964 0.300610 0.232647 0.213246 0.253497 0.305153 0.071680 0.398160 0.225008 0.118311 0.364785 0.025613 0.491291 0.195502 0.011060 0.755959 0.037480 0.026401 0.001544 0.956740 0.015314 0.010416 0.000541 0.977424 0.011619 0.009557 0.000642 0.979956 0.009844 0.024633 0.001894 0.963314 0.010159 0.222728 0.007528 0.750532 0.019212 0.138035 0.114016 0.660416 0.087533 0.145641 0.146376 0.590572 0.117412 0.171276 0.172832 0.341901 0.313991 0.185528 0.215409 0.417538 0.181525 0.136946 0.135309 0.396508 0.331236 Consensus sequence: BHHDYGGGGGGGGBVD Alignment: BHHDYGGGGGGGGBVD CYKGAGGSMGRGGCVG ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00099 Ascl2_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 1 16 0.031553 Species: Mus musculus Original motif 0.114462 0.345602 0.289353 0.250583 0.192593 0.250844 0.116250 0.440313 0.338838 0.304929 0.195843 0.160390 0.312051 0.115094 0.162465 0.410390 0.143975 0.600492 0.123348 0.132185 0.078751 0.715072 0.135182 0.070995 0.146191 0.685571 0.069799 0.098439 0.137287 0.646078 0.126428 0.090207 0.335099 0.092260 0.371510 0.201131 0.033090 0.631176 0.074278 0.261456 0.117516 0.619336 0.100946 0.162202 0.114769 0.627362 0.089839 0.168031 0.195787 0.252057 0.220803 0.331353 0.415355 0.120731 0.281372 0.182542 0.111178 0.217079 0.245769 0.425974 0.191517 0.296952 0.153370 0.358162 Consensus sequence: BHVDCCCCDCCCBDBH Reverse complement motif 0.358162 0.296952 0.153370 0.191517 0.425974 0.217079 0.245769 0.111178 0.182542 0.120731 0.281372 0.415355 0.331353 0.252057 0.220803 0.195787 0.114769 0.089839 0.627362 0.168031 0.117516 0.100946 0.619336 0.162202 0.033090 0.074278 0.631176 0.261456 0.335099 0.371510 0.092260 0.201131 0.137287 0.126428 0.646078 0.090207 0.146191 0.069799 0.685571 0.098439 0.078751 0.135182 0.715072 0.070995 0.143975 0.123348 0.600492 0.132185 0.410390 0.115094 0.162465 0.312051 0.160390 0.304929 0.195843 0.338838 0.440313 0.250844 0.116250 0.192593 0.114462 0.289353 0.345602 0.250583 Consensus sequence: HVDVGGGHGGGGDBHB Alignment: HVDVGGGHGGGGDBHB CYKGAGGSMGRGGCVG ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 3 16 0.032239 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH -----CBGCCKCYSCCTCYMG-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 51 Motif name: C051 Original motif 0.020000 0.370000 0.600000 0.010000 0.188119 0.099010 0.673267 0.039604 0.128713 0.732673 0.009901 0.128713 0.099010 0.881188 0.009901 0.009901 0.207921 0.732673 0.019802 0.039604 0.010000 0.900000 0.010000 0.080000 0.138614 0.841584 0.009901 0.009901 0.480000 0.150000 0.120000 0.250000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.019802 0.594059 0.128713 0.257426 0.020000 0.550000 0.370000 0.060000 Consensus sequence: SGCCCCCHCCCS Reserve complement motif 0.020000 0.370000 0.550000 0.060000 0.019802 0.128713 0.594059 0.257426 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.250000 0.150000 0.120000 0.480000 0.138614 0.009901 0.841584 0.009901 0.010000 0.010000 0.900000 0.080000 0.207921 0.019802 0.732673 0.039604 0.099010 0.009901 0.881188 0.009901 0.128713 0.009901 0.732673 0.128713 0.188119 0.673267 0.099010 0.039604 0.020000 0.600000 0.370000 0.010000 Consensus sequence: SGGGHGGGGGCS ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 51 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00021 Zfp281_primaryOriginal Motif Original Motif Backward 3 12 0.009358 Species: Mus musculus Original motif 0.201535 0.165213 0.201324 0.431929 0.136153 0.443451 0.179132 0.241264 0.263149 0.555137 0.067983 0.113731 0.142183 0.737634 0.045722 0.074461 0.044982 0.884112 0.045356 0.025549 0.246434 0.590578 0.022655 0.140333 0.123049 0.591257 0.033072 0.252622 0.018153 0.944742 0.010254 0.026851 0.035459 0.953844 0.003988 0.006709 0.020000 0.954344 0.005966 0.019690 0.015299 0.964390 0.006755 0.013557 0.028565 0.936152 0.011660 0.023623 0.300127 0.517309 0.029700 0.152863 0.159063 0.513443 0.051834 0.275660 0.158172 0.647055 0.133256 0.061516 Consensus sequence: DBCCCCCCCCCCMYC Reverse complement motif 0.158172 0.133256 0.647055 0.061516 0.159063 0.051834 0.513443 0.275660 0.300127 0.029700 0.517309 0.152863 0.028565 0.011660 0.936152 0.023623 0.015299 0.006755 0.964390 0.013557 0.020000 0.005966 0.954344 0.019690 0.035459 0.003988 0.953844 0.006709 0.018153 0.010254 0.944742 0.026851 0.123049 0.033072 0.591257 0.252622 0.246434 0.022655 0.590578 0.140333 0.044982 0.045356 0.884112 0.025549 0.142183 0.045722 0.737634 0.074461 0.263149 0.067983 0.555137 0.113731 0.136153 0.179132 0.443451 0.241264 0.431929 0.165213 0.201324 0.201535 Consensus sequence: GKRGGGGGGGGGGBD Alignment: DBCCCCCCCCCCMYC -SGCCCCCHCCCS-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00093 Klf7_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 12 0.012254 Species: Mus musculus Original motif 0.204514 0.198353 0.171218 0.425915 0.167188 0.296785 0.246082 0.289946 0.267330 0.148001 0.398674 0.185994 0.549386 0.060167 0.337100 0.053347 0.050746 0.900013 0.022169 0.027073 0.037905 0.920332 0.008360 0.033403 0.410356 0.566702 0.016267 0.006675 0.009526 0.982354 0.001060 0.007060 0.204292 0.001084 0.748567 0.046056 0.003955 0.988490 0.002821 0.004735 0.004264 0.988826 0.004311 0.002598 0.002758 0.929549 0.001244 0.066448 0.260332 0.421683 0.024720 0.293265 0.184798 0.247697 0.085237 0.482268 0.347537 0.197344 0.139961 0.315159 0.255281 0.166620 0.242297 0.335802 Consensus sequence: HBDRCCMCGCCCHHHD Reverse complement motif 0.335802 0.166620 0.242297 0.255281 0.315159 0.197344 0.139961 0.347537 0.482268 0.247697 0.085237 0.184798 0.260332 0.024720 0.421683 0.293265 0.002758 0.001244 0.929549 0.066448 0.004264 0.004311 0.988826 0.002598 0.003955 0.002821 0.988490 0.004735 0.204292 0.748567 0.001084 0.046056 0.009526 0.001060 0.982354 0.007060 0.410356 0.016267 0.566702 0.006675 0.037905 0.008360 0.920332 0.033403 0.050746 0.022169 0.900013 0.027073 0.053347 0.060167 0.337100 0.549386 0.267330 0.398674 0.148001 0.185994 0.167188 0.246082 0.296785 0.289946 0.425915 0.198353 0.171218 0.204514 Consensus sequence: DHHDGGGCGRGGKHBH Alignment: DHHDGGGCGRGGKHBH ---SGGGHGGGGGCS- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00022 Zfp740_primaryOriginal Motif Original Motif Backward 4 12 0.014522 Species: Mus musculus Original motif 0.136946 0.396508 0.135309 0.331236 0.185528 0.417538 0.215409 0.181525 0.171276 0.341901 0.172832 0.313991 0.145641 0.590572 0.146376 0.117412 0.138035 0.660416 0.114016 0.087533 0.222728 0.750532 0.007528 0.019212 0.024633 0.963314 0.001894 0.010159 0.009557 0.979956 0.000642 0.009844 0.010416 0.977424 0.000541 0.011619 0.026401 0.956740 0.001544 0.015314 0.195502 0.755959 0.011060 0.037480 0.491291 0.364785 0.025613 0.118311 0.305153 0.398160 0.071680 0.225008 0.253497 0.232647 0.213246 0.300610 0.156964 0.297876 0.144683 0.400477 0.179549 0.292514 0.319462 0.208475 Consensus sequence: HVBCCCCCCCCMHHHB Reverse complement motif 0.179549 0.319462 0.292514 0.208475 0.400477 0.297876 0.144683 0.156964 0.300610 0.232647 0.213246 0.253497 0.305153 0.071680 0.398160 0.225008 0.118311 0.364785 0.025613 0.491291 0.195502 0.011060 0.755959 0.037480 0.026401 0.001544 0.956740 0.015314 0.010416 0.000541 0.977424 0.011619 0.009557 0.000642 0.979956 0.009844 0.024633 0.001894 0.963314 0.010159 0.222728 0.007528 0.750532 0.019212 0.138035 0.114016 0.660416 0.087533 0.145641 0.146376 0.590572 0.117412 0.171276 0.172832 0.341901 0.313991 0.185528 0.215409 0.417538 0.181525 0.136946 0.135309 0.396508 0.331236 Consensus sequence: BHHDYGGGGGGGGBVD Alignment: HVBCCCCCCCCMHHHB -SGCCCCCHCCCS--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 4 12 0.014562 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH ---SGCCCCCHCCCS------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 9 12 0.022696 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH ---SGCCCCCHCCCS-------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 52 Motif name: C052 Original motif 0.049505 0.079208 0.772277 0.099010 0.710000 0.010000 0.270000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010101 0.232323 0.171717 0.585859 0.010101 0.262626 0.252525 0.474747 0.207921 0.198020 0.455446 0.138614 0.140000 0.400000 0.450000 0.010000 0.851485 0.089109 0.049505 0.009901 0.128713 0.009901 0.851485 0.009901 0.059406 0.138614 0.792079 0.009901 0.099010 0.524752 0.168317 0.207921 0.460000 0.300000 0.230000 0.010000 0.544554 0.227723 0.207921 0.019802 0.020000 0.010000 0.960000 0.010000 0.250000 0.450000 0.260000 0.040000 0.099010 0.762376 0.108911 0.029703 Consensus sequence: GAGTBVSAGGCMAGVC Reserve complement motif 0.099010 0.108911 0.762376 0.029703 0.250000 0.260000 0.450000 0.040000 0.020000 0.960000 0.010000 0.010000 0.019802 0.227723 0.207921 0.544554 0.010000 0.300000 0.230000 0.460000 0.099010 0.168317 0.524752 0.207921 0.059406 0.792079 0.138614 0.009901 0.128713 0.851485 0.009901 0.009901 0.009901 0.089109 0.049505 0.851485 0.140000 0.450000 0.400000 0.010000 0.207921 0.455446 0.198020 0.138614 0.474747 0.262626 0.252525 0.010101 0.585859 0.232323 0.171717 0.010101 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.270000 0.710000 0.049505 0.772277 0.079208 0.099010 Consensus sequence: GVCTYGCCTSVVACTC ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 52 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 5 16 0.042340 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK ----GAGTBVSAGGCMAGVC-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 6 16 0.047746 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH --GVCTYGCCTSVVACTC----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00064 Sox18_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 16 0.049012 Species: Mus musculus Original motif 0.233450 0.135591 0.449351 0.181608 0.164159 0.195257 0.355715 0.284869 0.366008 0.174902 0.291705 0.167384 0.111204 0.386494 0.313802 0.188500 0.037772 0.262983 0.150189 0.549056 0.361570 0.040331 0.452937 0.145162 0.644867 0.179214 0.074070 0.101849 0.847543 0.023693 0.066894 0.061870 0.061870 0.066894 0.023693 0.847543 0.101849 0.074070 0.179214 0.644867 0.145162 0.452937 0.040331 0.361570 0.549056 0.150189 0.262983 0.037772 0.256653 0.170745 0.197091 0.375512 0.288178 0.121185 0.335592 0.255044 0.284270 0.341602 0.127009 0.247119 0.288580 0.309961 0.222765 0.178693 Consensus sequence: DBVBTRAATTYADDHV Reverse complement motif 0.288580 0.222765 0.309961 0.178693 0.284270 0.127009 0.341602 0.247119 0.288178 0.335592 0.121185 0.255044 0.375512 0.170745 0.197091 0.256653 0.037772 0.150189 0.262983 0.549056 0.145162 0.040331 0.452937 0.361570 0.644867 0.074070 0.179214 0.101849 0.847543 0.066894 0.023693 0.061870 0.061870 0.023693 0.066894 0.847543 0.101849 0.179214 0.074070 0.644867 0.361570 0.452937 0.040331 0.145162 0.549056 0.262983 0.150189 0.037772 0.111204 0.313802 0.386494 0.188500 0.167384 0.174902 0.291705 0.366008 0.164159 0.355715 0.195257 0.284869 0.233450 0.449351 0.135591 0.181608 Consensus sequence: VDHDTKAATTMABBBH Alignment: DBVBTRAATTYADDHV GAGTBVSAGGCMAGVC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00400 Zif268 Reverse Complement Original Motif Backward 8 16 0.049953 Species: Mus musculus Original motif 0.104824 0.412716 0.254506 0.227955 0.644922 0.065476 0.140479 0.149122 0.201205 0.166164 0.347131 0.285501 0.360606 0.256316 0.150766 0.232313 0.199831 0.240681 0.279350 0.280137 0.234308 0.204076 0.321306 0.240310 0.274112 0.462435 0.111425 0.152028 0.067070 0.717501 0.073934 0.141496 0.106745 0.084442 0.658566 0.150247 0.025128 0.967053 0.003585 0.004234 0.006412 0.982989 0.003227 0.007371 0.009588 0.877620 0.002571 0.110221 0.621521 0.355443 0.015669 0.007366 0.002600 0.980275 0.004191 0.012934 0.118773 0.026658 0.783843 0.070725 0.022358 0.822101 0.024684 0.130857 0.713212 0.080912 0.128793 0.077084 0.166568 0.250955 0.107934 0.474544 0.225040 0.222494 0.163301 0.389166 0.268976 0.223206 0.265314 0.242504 0.137052 0.229058 0.148439 0.485451 0.135819 0.304550 0.141994 0.417637 0.272440 0.319501 0.230580 0.177478 Consensus sequence: BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV Reverse complement motif 0.272440 0.230580 0.319501 0.177478 0.417637 0.304550 0.141994 0.135819 0.485451 0.229058 0.148439 0.137052 0.242504 0.223206 0.265314 0.268976 0.389166 0.222494 0.163301 0.225040 0.474544 0.250955 0.107934 0.166568 0.077084 0.080912 0.128793 0.713212 0.022358 0.024684 0.822101 0.130857 0.118773 0.783843 0.026658 0.070725 0.002600 0.004191 0.980275 0.012934 0.007366 0.355443 0.015669 0.621521 0.009588 0.002571 0.877620 0.110221 0.006412 0.003227 0.982989 0.007371 0.025128 0.003585 0.967053 0.004234 0.106745 0.658566 0.084442 0.150247 0.067070 0.073934 0.717501 0.141496 0.274112 0.111425 0.462435 0.152028 0.234308 0.321306 0.204076 0.240310 0.280137 0.240681 0.279350 0.199831 0.232313 0.256316 0.150766 0.360606 0.201205 0.347131 0.166164 0.285501 0.149122 0.065476 0.140479 0.644922 0.104824 0.254506 0.412716 0.227955 Consensus sequence: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB Alignment: BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV GVCTYGCCTSVVACTC------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 1 16 0.053502 Species: Mus musculus Original motif 0.404007 0.395873 0.173319 0.026801 0.305977 0.215534 0.215359 0.263130 0.370148 0.250957 0.113088 0.265808 0.324336 0.229498 0.174679 0.271487 0.263563 0.137896 0.079217 0.519324 0.265762 0.222582 0.082555 0.429102 0.206721 0.288405 0.017851 0.487023 0.164361 0.236500 0.061051 0.538088 0.593344 0.348446 0.050304 0.007906 0.031328 0.947050 0.007032 0.014590 0.010428 0.956605 0.029142 0.003825 0.459636 0.207616 0.155368 0.177380 0.014573 0.964608 0.012209 0.008610 0.066291 0.918196 0.008729 0.006784 0.019488 0.866774 0.018897 0.094841 0.767405 0.104198 0.029234 0.099164 0.052494 0.772531 0.039832 0.135142 0.296085 0.243498 0.350935 0.109482 0.518843 0.226659 0.124784 0.129714 0.647901 0.019721 0.159901 0.172477 0.113912 0.231511 0.214864 0.439713 0.223117 0.310596 0.293328 0.172959 0.185557 0.487662 0.136321 0.190459 Consensus sequence: MHHHWHYTMCCHCCCACVAABVH Reverse complement motif 0.185557 0.136321 0.487662 0.190459 0.223117 0.293328 0.310596 0.172959 0.439713 0.231511 0.214864 0.113912 0.172477 0.019721 0.159901 0.647901 0.129714 0.226659 0.124784 0.518843 0.296085 0.350935 0.243498 0.109482 0.052494 0.039832 0.772531 0.135142 0.099164 0.104198 0.029234 0.767405 0.019488 0.018897 0.866774 0.094841 0.066291 0.008729 0.918196 0.006784 0.014573 0.012209 0.964608 0.008610 0.177380 0.207616 0.155368 0.459636 0.010428 0.029142 0.956605 0.003825 0.031328 0.007032 0.947050 0.014590 0.007906 0.348446 0.050304 0.593344 0.538088 0.236500 0.061051 0.164361 0.487023 0.288405 0.017851 0.206721 0.429102 0.222582 0.082555 0.265762 0.519324 0.137896 0.079217 0.263563 0.271487 0.229498 0.174679 0.324336 0.265808 0.250957 0.113088 0.370148 0.263130 0.215534 0.215359 0.305977 0.026801 0.395873 0.173319 0.404007 Consensus sequence: DVVTTVGTGGGHGGYAMHWHHHY Alignment: MHHHWHYTMCCHCCCACVAABVH GAGTBVSAGGCMAGVC------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 53 Motif name: C053 Original motif 0.410000 0.190000 0.390000 0.010000 0.470000 0.290000 0.020000 0.220000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.020202 0.939394 0.020202 0.020202 0.465347 0.009901 0.405941 0.118812 0.020000 0.140000 0.710000 0.130000 0.850000 0.020000 0.070000 0.060000 0.010101 0.030303 0.949495 0.010101 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.940000 0.020000 0.030000 0.010000 0.702970 0.128713 0.148515 0.019802 0.110000 0.360000 0.010000 0.520000 0.039604 0.891089 0.019802 0.049505 0.130000 0.580000 0.010000 0.280000 0.217822 0.009901 0.039604 0.732673 0.020000 0.030000 0.790000 0.160000 0.170000 0.030000 0.290000 0.510000 0.039604 0.405941 0.059406 0.495050 Consensus sequence: RMACRGAGAAAYCCTGKY Reserve complement motif 0.495050 0.405941 0.059406 0.039604 0.510000 0.030000 0.290000 0.170000 0.020000 0.790000 0.030000 0.160000 0.732673 0.009901 0.039604 0.217822 0.130000 0.010000 0.580000 0.280000 0.039604 0.019802 0.891089 0.049505 0.520000 0.360000 0.010000 0.110000 0.019802 0.128713 0.148515 0.702970 0.010000 0.020000 0.030000 0.940000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010101 0.949495 0.030303 0.010101 0.060000 0.020000 0.070000 0.850000 0.020000 0.710000 0.140000 0.130000 0.118812 0.009901 0.405941 0.465347 0.020202 0.020202 0.939394 0.020202 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.220000 0.290000 0.020000 0.470000 0.010000 0.190000 0.390000 0.410000 Consensus sequence: MRCAGGMTTTCTCKGTYK ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 53 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_primaryReverse Complement Reverse Complement Backward 4 18 0.038823 Species: Mus musculus Original motif 0.204923 0.208846 0.365383 0.220848 0.294304 0.300143 0.167287 0.238266 0.109711 0.619514 0.117379 0.153396 0.178979 0.378580 0.230177 0.212264 0.159594 0.542602 0.118178 0.179627 0.125206 0.430074 0.151826 0.292894 0.097692 0.709845 0.116956 0.075506 0.148292 0.565912 0.037632 0.248164 0.077951 0.034190 0.855503 0.032356 0.001657 0.001061 0.971877 0.025405 0.001926 0.001084 0.991712 0.005278 0.033031 0.012001 0.057796 0.897171 0.002723 0.002647 0.993348 0.001281 0.003261 0.000963 0.987199 0.008577 0.000611 0.090925 0.074857 0.833608 0.015299 0.978878 0.004949 0.000874 0.013368 0.600902 0.033485 0.352245 0.231949 0.149575 0.118804 0.499672 0.267580 0.186002 0.371242 0.175176 0.264884 0.223483 0.110082 0.401551 0.221365 0.170121 0.179559 0.428955 0.112997 0.692930 0.139981 0.054092 0.460305 0.207883 0.155111 0.176702 Consensus sequence: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH Reverse complement motif 0.176702 0.207883 0.155111 0.460305 0.112997 0.139981 0.692930 0.054092 0.428955 0.170121 0.179559 0.221365 0.401551 0.223483 0.110082 0.264884 0.267580 0.371242 0.186002 0.175176 0.499672 0.149575 0.118804 0.231949 0.013368 0.033485 0.600902 0.352245 0.015299 0.004949 0.978878 0.000874 0.833608 0.090925 0.074857 0.000611 0.003261 0.987199 0.000963 0.008577 0.002723 0.993348 0.002647 0.001281 0.897171 0.012001 0.057796 0.033031 0.001926 0.991712 0.001084 0.005278 0.001657 0.971877 0.001061 0.025405 0.077951 0.855503 0.034190 0.032356 0.148292 0.037632 0.565912 0.248164 0.097692 0.116956 0.709845 0.075506 0.125206 0.151826 0.430074 0.292894 0.159594 0.118178 0.542602 0.179627 0.178979 0.230177 0.378580 0.212264 0.109711 0.117379 0.619514 0.153396 0.294304 0.167287 0.300143 0.238266 0.204923 0.365383 0.208846 0.220848 Consensus sequence: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB Alignment: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB --MRCAGGMTTTCTCKGTYK--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00098 Rfx3_primary Original Motif Original Motif Backward 2 18 0.041044 Species: Mus musculus Original motif 0.218345 0.231533 0.152528 0.397594 0.264604 0.126115 0.320860 0.288421 0.117304 0.186844 0.172946 0.522906 0.111929 0.277908 0.409084 0.201079 0.343319 0.311376 0.123612 0.221692 0.193354 0.374280 0.157338 0.275028 0.166348 0.578991 0.130872 0.123789 0.006937 0.931183 0.046809 0.015072 0.255581 0.289587 0.125513 0.329319 0.002582 0.012615 0.002782 0.982021 0.850584 0.007973 0.140639 0.000803 0.037792 0.002285 0.957277 0.002646 0.009414 0.921481 0.001636 0.067469 0.943403 0.000980 0.042401 0.013216 0.991166 0.002931 0.003540 0.002364 0.003651 0.987110 0.001106 0.008133 0.208873 0.369705 0.319129 0.102292 0.322535 0.186617 0.374187 0.116660 0.326738 0.179486 0.226374 0.267402 0.299697 0.185329 0.133025 0.381949 0.300824 0.266836 0.096437 0.335904 0.418443 0.191068 0.127183 0.263306 0.386727 0.204062 0.126050 0.283161 Consensus sequence: HDTBHHCCHTAGCAACVVDHHHH Reverse complement motif 0.283161 0.204062 0.126050 0.386727 0.263306 0.191068 0.127183 0.418443 0.335904 0.266836 0.096437 0.300824 0.381949 0.185329 0.133025 0.299697 0.267402 0.179486 0.226374 0.326738 0.322535 0.374187 0.186617 0.116660 0.208873 0.319129 0.369705 0.102292 0.003651 0.001106 0.987110 0.008133 0.002364 0.002931 0.003540 0.991166 0.013216 0.000980 0.042401 0.943403 0.009414 0.001636 0.921481 0.067469 0.037792 0.957277 0.002285 0.002646 0.000803 0.007973 0.140639 0.850584 0.982021 0.012615 0.002782 0.002582 0.329319 0.289587 0.125513 0.255581 0.006937 0.046809 0.931183 0.015072 0.166348 0.130872 0.578991 0.123789 0.193354 0.157338 0.374280 0.275028 0.221692 0.311376 0.123612 0.343319 0.111929 0.409084 0.277908 0.201079 0.522906 0.186844 0.172946 0.117304 0.264604 0.320860 0.126115 0.288421 0.397594 0.231533 0.152528 0.218345 Consensus sequence: HHHHDVVGTTGCTAHGGDHBAHH Alignment: HDTBHHCCHTAGCAACVVDHHHH ----RMACRGAGAAAYCCTGKY- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00526 Foxn1_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 4 18 0.041334 Species: Mus musculus Original motif 0.477863 0.106306 0.184102 0.231729 0.304951 0.149020 0.361418 0.184612 0.548996 0.056128 0.348902 0.045974 0.385727 0.477782 0.086218 0.050273 0.409556 0.232265 0.173851 0.184328 0.174550 0.312880 0.307123 0.205448 0.850398 0.047204 0.041665 0.060734 0.141234 0.548534 0.142230 0.168002 0.059462 0.026354 0.892948 0.021236 0.053714 0.870297 0.028935 0.047055 0.086273 0.069147 0.805284 0.039296 0.033781 0.573881 0.034115 0.358223 0.035191 0.079663 0.824970 0.060176 0.051830 0.862631 0.019359 0.066180 0.178685 0.015738 0.762485 0.043092 0.058988 0.042615 0.017608 0.880789 0.202382 0.173360 0.284095 0.340163 0.098493 0.234651 0.506524 0.160333 0.109087 0.336204 0.250510 0.304198 0.130945 0.250843 0.177122 0.441090 0.353830 0.138838 0.162784 0.344548 0.114290 0.417163 0.160662 0.307885 Consensus sequence: DDRMHBACGCGYGCGTDGBBDB Reverse complement motif 0.114290 0.160662 0.417163 0.307885 0.344548 0.138838 0.162784 0.353830 0.441090 0.250843 0.177122 0.130945 0.109087 0.250510 0.336204 0.304198 0.098493 0.506524 0.234651 0.160333 0.340163 0.173360 0.284095 0.202382 0.880789 0.042615 0.017608 0.058988 0.178685 0.762485 0.015738 0.043092 0.051830 0.019359 0.862631 0.066180 0.035191 0.824970 0.079663 0.060176 0.033781 0.034115 0.573881 0.358223 0.086273 0.805284 0.069147 0.039296 0.053714 0.028935 0.870297 0.047055 0.059462 0.892948 0.026354 0.021236 0.141234 0.142230 0.548534 0.168002 0.060734 0.047204 0.041665 0.850398 0.174550 0.307123 0.312880 0.205448 0.184328 0.232265 0.173851 0.409556 0.385727 0.086218 0.477782 0.050273 0.045974 0.056128 0.348902 0.548996 0.304951 0.361418 0.149020 0.184612 0.231729 0.106306 0.184102 0.477863 Consensus sequence: BDVBCDACGCKCGCGTBHRKHD Alignment: DDRMHBACGCGYGCGTDGBBDB ---MRCAGGMTTTCTCKGTYK- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00098 Rfx3_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 1 18 0.044041 Species: Mus musculus Original motif 0.314514 0.275352 0.257617 0.152518 0.126939 0.598294 0.130576 0.144192 0.102265 0.155334 0.177957 0.564445 0.129288 0.282678 0.326990 0.261044 0.318166 0.227823 0.175681 0.278330 0.109019 0.380838 0.278328 0.231815 0.226145 0.289206 0.291300 0.193348 0.035863 0.844339 0.072582 0.047216 0.223793 0.187244 0.088092 0.500871 0.039800 0.029681 0.026201 0.904317 0.298298 0.032147 0.654746 0.014809 0.014729 0.022023 0.944826 0.018422 0.485114 0.004925 0.013785 0.496176 0.035708 0.020381 0.240804 0.703108 0.951152 0.012738 0.017886 0.018224 0.023713 0.944394 0.009538 0.022355 0.291067 0.385205 0.232388 0.091339 0.340334 0.199588 0.311526 0.148552 0.198713 0.472138 0.178319 0.150830 0.321155 0.269932 0.311301 0.097612 0.412646 0.195252 0.231950 0.160152 0.297134 0.180928 0.250400 0.271538 0.151169 0.305386 0.358574 0.184871 Consensus sequence: VCTBHBVCTTGGWTACVVVVVDB Reverse complement motif 0.151169 0.358574 0.305386 0.184871 0.271538 0.180928 0.250400 0.297134 0.160152 0.195252 0.231950 0.412646 0.097612 0.269932 0.311301 0.321155 0.198713 0.178319 0.472138 0.150830 0.148552 0.199588 0.311526 0.340334 0.291067 0.232388 0.385205 0.091339 0.023713 0.009538 0.944394 0.022355 0.018224 0.012738 0.017886 0.951152 0.703108 0.020381 0.240804 0.035708 0.496176 0.004925 0.013785 0.485114 0.014729 0.944826 0.022023 0.018422 0.298298 0.654746 0.032147 0.014809 0.904317 0.029681 0.026201 0.039800 0.500871 0.187244 0.088092 0.223793 0.035863 0.072582 0.844339 0.047216 0.226145 0.291300 0.289206 0.193348 0.109019 0.278328 0.380838 0.231815 0.278330 0.227823 0.175681 0.318166 0.129288 0.326990 0.282678 0.261044 0.564445 0.155334 0.177957 0.102265 0.126939 0.130576 0.598294 0.144192 0.152518 0.275352 0.257617 0.314514 Consensus sequence: BDBBVBVGTAWCCAAGVBHBAGB Alignment: VCTBHBVCTTGGWTACVVVVVDB RMACRGAGAAAYCCTGKY----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v015681_primaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 4 18 0.044251 Species: Mus musculus Original motif 0.472795 0.179227 0.091251 0.256726 0.036521 0.159743 0.204840 0.598896 0.164582 0.312805 0.221324 0.301289 0.237069 0.249050 0.293048 0.220833 0.401949 0.225181 0.229401 0.143469 0.161422 0.494334 0.252207 0.092036 0.252940 0.177721 0.369400 0.199939 0.119630 0.024651 0.849920 0.005798 0.000962 0.002398 0.990616 0.006023 0.937852 0.027016 0.034535 0.000597 0.008963 0.987756 0.000629 0.002652 0.001584 0.992898 0.002349 0.003169 0.956822 0.027342 0.002484 0.013352 0.009873 0.987759 0.000988 0.001381 0.016397 0.980856 0.000369 0.002378 0.081761 0.758555 0.038572 0.121112 0.371713 0.091838 0.448027 0.088423 0.111617 0.121913 0.683885 0.082585 0.334562 0.102916 0.436488 0.126034 0.210362 0.101261 0.238339 0.450037 0.169041 0.271583 0.320799 0.238576 0.140316 0.049885 0.735236 0.074563 Consensus sequence: HTBVVVDGGACCACCCRGRDBG Reverse complement motif 0.140316 0.735236 0.049885 0.074563 0.169041 0.320799 0.271583 0.238576 0.450037 0.101261 0.238339 0.210362 0.334562 0.436488 0.102916 0.126034 0.111617 0.683885 0.121913 0.082585 0.371713 0.448027 0.091838 0.088423 0.081761 0.038572 0.758555 0.121112 0.016397 0.000369 0.980856 0.002378 0.009873 0.000988 0.987759 0.001381 0.013352 0.027342 0.002484 0.956822 0.001584 0.002349 0.992898 0.003169 0.008963 0.000629 0.987756 0.002652 0.000597 0.027016 0.034535 0.937852 0.000962 0.990616 0.002398 0.006023 0.119630 0.849920 0.024651 0.005798 0.252940 0.369400 0.177721 0.199939 0.161422 0.252207 0.494334 0.092036 0.143469 0.225181 0.229401 0.401949 0.237069 0.293048 0.249050 0.220833 0.164582 0.221324 0.312805 0.301289 0.598896 0.159743 0.204840 0.036521 0.256726 0.179227 0.091251 0.472795 Consensus sequence: CBDMCMGGGTGGTCCHVBVBAH Alignment: CBDMCMGGGTGGTCCHVBVBAH -RMACRGAGAAAYCCTGKY--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 54 Motif name: C054 Original motif 0.009901 0.514851 0.455446 0.019802 0.020000 0.530000 0.380000 0.070000 0.010000 0.960000 0.010000 0.020000 0.168317 0.712871 0.009901 0.108911 0.250000 0.040000 0.480000 0.230000 0.128713 0.693069 0.039604 0.138614 0.148515 0.792079 0.009901 0.049505 0.138614 0.831683 0.019802 0.009901 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.140000 0.580000 0.010000 0.270000 0.198020 0.524752 0.168317 0.108911 0.140000 0.680000 0.170000 0.010000 0.110000 0.370000 0.470000 0.050000 0.009901 0.386139 0.534653 0.069307 Consensus sequence: SSCCDCCCCCCCSS Reserve complement motif 0.009901 0.534653 0.386139 0.069307 0.110000 0.470000 0.370000 0.050000 0.140000 0.170000 0.680000 0.010000 0.198020 0.168317 0.524752 0.108911 0.140000 0.010000 0.580000 0.270000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.138614 0.019802 0.831683 0.009901 0.148515 0.009901 0.792079 0.049505 0.128713 0.039604 0.693069 0.138614 0.250000 0.480000 0.040000 0.230000 0.168317 0.009901 0.712871 0.108911 0.010000 0.010000 0.960000 0.020000 0.020000 0.380000 0.530000 0.070000 0.009901 0.455446 0.514851 0.019802 Consensus sequence: SSGGGGGGGHGGSS ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 54 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00043 Bcl6b_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 3 14 0.016212 Species: Mus musculus Original motif 0.316572 0.278382 0.152556 0.252490 0.167141 0.257034 0.259894 0.315931 0.175523 0.325956 0.259996 0.238525 0.165052 0.385677 0.239449 0.209822 0.069489 0.782718 0.072454 0.075339 0.049943 0.800636 0.031988 0.117433 0.223382 0.060306 0.552691 0.163621 0.072944 0.818252 0.034406 0.074398 0.070535 0.845127 0.062712 0.021626 0.031035 0.859354 0.055424 0.054187 0.063668 0.798503 0.067274 0.070554 0.348488 0.030697 0.197179 0.423636 0.307220 0.256470 0.181009 0.255301 0.460933 0.285057 0.090258 0.163752 0.315798 0.228431 0.171135 0.284637 0.374527 0.268328 0.198810 0.158335 Consensus sequence: HBBBCCGCCCCWHHHV Reverse complement motif 0.158335 0.268328 0.198810 0.374527 0.284637 0.228431 0.171135 0.315798 0.163752 0.285057 0.090258 0.460933 0.255301 0.256470 0.181009 0.307220 0.423636 0.030697 0.197179 0.348488 0.063668 0.067274 0.798503 0.070554 0.031035 0.055424 0.859354 0.054187 0.070535 0.062712 0.845127 0.021626 0.072944 0.034406 0.818252 0.074398 0.223382 0.552691 0.060306 0.163621 0.049943 0.031988 0.800636 0.117433 0.069489 0.072454 0.782718 0.075339 0.165052 0.239449 0.385677 0.209822 0.175523 0.259996 0.325956 0.238525 0.315931 0.257034 0.259894 0.167141 0.252490 0.278382 0.152556 0.316572 Consensus sequence: BHHHWGGGGCGGBBVH Alignment: HBBBCCGCCCCWHHHV --SSCCDCCCCCCCSS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 4 14 0.018565 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH ---SSCCDCCCCCCCSS----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00021 Zfp281_primaryOriginal Motif Original Motif Forward 2 14 0.020141 Species: Mus musculus Original motif 0.201535 0.165213 0.201324 0.431929 0.136153 0.443451 0.179132 0.241264 0.263149 0.555137 0.067983 0.113731 0.142183 0.737634 0.045722 0.074461 0.044982 0.884112 0.045356 0.025549 0.246434 0.590578 0.022655 0.140333 0.123049 0.591257 0.033072 0.252622 0.018153 0.944742 0.010254 0.026851 0.035459 0.953844 0.003988 0.006709 0.020000 0.954344 0.005966 0.019690 0.015299 0.964390 0.006755 0.013557 0.028565 0.936152 0.011660 0.023623 0.300127 0.517309 0.029700 0.152863 0.159063 0.513443 0.051834 0.275660 0.158172 0.647055 0.133256 0.061516 Consensus sequence: DBCCCCCCCCCCMYC Reverse complement motif 0.158172 0.133256 0.647055 0.061516 0.159063 0.051834 0.513443 0.275660 0.300127 0.029700 0.517309 0.152863 0.028565 0.011660 0.936152 0.023623 0.015299 0.006755 0.964390 0.013557 0.020000 0.005966 0.954344 0.019690 0.035459 0.003988 0.953844 0.006709 0.018153 0.010254 0.944742 0.026851 0.123049 0.033072 0.591257 0.252622 0.246434 0.022655 0.590578 0.140333 0.044982 0.045356 0.884112 0.025549 0.142183 0.045722 0.737634 0.074461 0.263149 0.067983 0.555137 0.113731 0.136153 0.179132 0.443451 0.241264 0.431929 0.165213 0.201324 0.201535 Consensus sequence: GKRGGGGGGGGGGBD Alignment: DBCCCCCCCCCCMYC -SSCCDCCCCCCCSS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00033 Zfp410_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 1 14 0.022195 Species: Mus musculus Original motif 0.162979 0.284781 0.237433 0.314807 0.182449 0.447584 0.069464 0.300502 0.298973 0.261014 0.213211 0.226802 0.136039 0.433062 0.144274 0.286625 0.180084 0.395933 0.158565 0.265418 0.069354 0.748510 0.068898 0.113238 0.060485 0.717828 0.075333 0.146354 0.023280 0.071762 0.645500 0.259457 0.166896 0.749762 0.062730 0.020612 0.050401 0.775248 0.089072 0.085279 0.103847 0.767557 0.068804 0.059791 0.064815 0.748318 0.114588 0.072280 0.340921 0.071942 0.242981 0.344157 0.301967 0.263512 0.165927 0.268594 0.479800 0.222955 0.118441 0.178803 0.229469 0.283621 0.143099 0.343811 0.261733 0.180191 0.169905 0.388170 Consensus sequence: BHHBHCCGCCCCDHHHH Reverse complement motif 0.388170 0.180191 0.169905 0.261733 0.343811 0.283621 0.143099 0.229469 0.178803 0.222955 0.118441 0.479800 0.268594 0.263512 0.165927 0.301967 0.344157 0.071942 0.242981 0.340921 0.064815 0.114588 0.748318 0.072280 0.103847 0.068804 0.767557 0.059791 0.050401 0.089072 0.775248 0.085279 0.166896 0.062730 0.749762 0.020612 0.023280 0.645500 0.071762 0.259457 0.060485 0.075333 0.717828 0.146354 0.069354 0.068898 0.748510 0.113238 0.180084 0.158565 0.395933 0.265418 0.136039 0.144274 0.433062 0.286625 0.226802 0.261014 0.213211 0.298973 0.182449 0.069464 0.447584 0.300502 0.314807 0.284781 0.237433 0.162979 Consensus sequence: HHHHDGGGGCGGDBHDV Alignment: HHHHDGGGGCGGDBHDV SSGGGGGGGHGGSS--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00022 Zfp740_primaryOriginal Motif Original Motif Backward 2 14 0.026521 Species: Mus musculus Original motif 0.136946 0.396508 0.135309 0.331236 0.185528 0.417538 0.215409 0.181525 0.171276 0.341901 0.172832 0.313991 0.145641 0.590572 0.146376 0.117412 0.138035 0.660416 0.114016 0.087533 0.222728 0.750532 0.007528 0.019212 0.024633 0.963314 0.001894 0.010159 0.009557 0.979956 0.000642 0.009844 0.010416 0.977424 0.000541 0.011619 0.026401 0.956740 0.001544 0.015314 0.195502 0.755959 0.011060 0.037480 0.491291 0.364785 0.025613 0.118311 0.305153 0.398160 0.071680 0.225008 0.253497 0.232647 0.213246 0.300610 0.156964 0.297876 0.144683 0.400477 0.179549 0.292514 0.319462 0.208475 Consensus sequence: HVBCCCCCCCCMHHHB Reverse complement motif 0.179549 0.319462 0.292514 0.208475 0.400477 0.297876 0.144683 0.156964 0.300610 0.232647 0.213246 0.253497 0.305153 0.071680 0.398160 0.225008 0.118311 0.364785 0.025613 0.491291 0.195502 0.011060 0.755959 0.037480 0.026401 0.001544 0.956740 0.015314 0.010416 0.000541 0.977424 0.011619 0.009557 0.000642 0.979956 0.009844 0.024633 0.001894 0.963314 0.010159 0.222728 0.007528 0.750532 0.019212 0.138035 0.114016 0.660416 0.087533 0.145641 0.146376 0.590572 0.117412 0.171276 0.172832 0.341901 0.313991 0.185528 0.215409 0.417538 0.181525 0.136946 0.135309 0.396508 0.331236 Consensus sequence: BHHDYGGGGGGGGBVD Alignment: HVBCCCCCCCCMHHHB -SSCCDCCCCCCCSS- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 55 Motif name: C055 Original motif 0.445545 0.455446 0.059406 0.039604 0.029703 0.039604 0.435644 0.495050 0.690000 0.010000 0.240000 0.060000 0.168317 0.108911 0.712871 0.009901 0.680000 0.010000 0.220000 0.090000 0.148515 0.059406 0.762376 0.029703 0.455446 0.475248 0.059406 0.009901 0.009901 0.039604 0.455446 0.495050 0.460000 0.480000 0.040000 0.020000 0.019802 0.039604 0.445545 0.495050 0.732673 0.009901 0.178218 0.079208 0.070000 0.150000 0.770000 0.010000 0.750000 0.010000 0.230000 0.010000 0.188119 0.148515 0.643564 0.019802 0.455446 0.455446 0.079208 0.009901 0.040000 0.050000 0.430000 0.480000 Consensus sequence: MKAGAGMKMKAGAGMK Reserve complement motif 0.480000 0.050000 0.430000 0.040000 0.009901 0.455446 0.079208 0.455446 0.188119 0.643564 0.148515 0.019802 0.010000 0.010000 0.230000 0.750000 0.070000 0.770000 0.150000 0.010000 0.079208 0.009901 0.178218 0.732673 0.495050 0.039604 0.445545 0.019802 0.460000 0.040000 0.480000 0.020000 0.495050 0.039604 0.455446 0.009901 0.455446 0.059406 0.475248 0.009901 0.148515 0.762376 0.059406 0.029703 0.090000 0.010000 0.220000 0.680000 0.168317 0.712871 0.108911 0.009901 0.060000 0.010000 0.240000 0.690000 0.495050 0.039604 0.435644 0.029703 0.445545 0.059406 0.455446 0.039604 Consensus sequence: RYCTCTRRRRCTCTRR ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 55 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00101 Sox12_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 16 0.039204 Species: Mus musculus Original motif 0.378898 0.318901 0.205859 0.096341 0.352524 0.321236 0.224504 0.101736 0.323551 0.182056 0.210897 0.283496 0.135539 0.325230 0.208031 0.331200 0.663106 0.055471 0.154459 0.126963 0.051748 0.292567 0.537307 0.118378 0.886489 0.042361 0.035742 0.035408 0.043647 0.688744 0.094358 0.173252 0.882052 0.039818 0.018899 0.059231 0.864171 0.036011 0.068363 0.031455 0.790158 0.046868 0.041594 0.121379 0.087447 0.143905 0.707798 0.060849 0.295919 0.132479 0.485703 0.085899 0.653156 0.133004 0.110012 0.103828 0.351764 0.131771 0.217730 0.298736 0.203977 0.196773 0.099958 0.499292 Consensus sequence: VVDBASACAAAGRADH Reverse complement motif 0.499292 0.196773 0.099958 0.203977 0.298736 0.131771 0.217730 0.351764 0.103828 0.133004 0.110012 0.653156 0.295919 0.485703 0.132479 0.085899 0.087447 0.707798 0.143905 0.060849 0.121379 0.046868 0.041594 0.790158 0.031455 0.036011 0.068363 0.864171 0.059231 0.039818 0.018899 0.882052 0.043647 0.094358 0.688744 0.173252 0.035408 0.042361 0.035742 0.886489 0.051748 0.537307 0.292567 0.118378 0.126963 0.055471 0.154459 0.663106 0.331200 0.325230 0.208031 0.135539 0.283496 0.182056 0.210897 0.323551 0.101736 0.321236 0.224504 0.352524 0.096341 0.318901 0.205859 0.378898 Consensus sequence: HDTMCTTTGTSTVDBB Alignment: VVDBASACAAAGRADH MKAGAGMKMKAGAGMK ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00080 Gata5_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 2 16 0.039874 Species: Mus musculus Original motif 0.296956 0.225759 0.366964 0.110320 0.363955 0.287909 0.178199 0.169937 0.167366 0.353513 0.235266 0.243855 0.362045 0.255289 0.159993 0.222674 0.280070 0.083717 0.491243 0.144971 0.856104 0.068327 0.034504 0.041065 0.063256 0.017187 0.849623 0.069934 0.916053 0.035900 0.039485 0.008562 0.025896 0.011964 0.054314 0.907826 0.827706 0.129092 0.013351 0.029850 0.048301 0.029514 0.118868 0.803318 0.069245 0.824881 0.022797 0.083077 0.508319 0.034384 0.109239 0.348058 0.228736 0.146771 0.436716 0.187777 0.183599 0.289339 0.157455 0.369607 0.174967 0.268426 0.275078 0.281528 0.136843 0.155950 0.346111 0.361096 Consensus sequence: VVBHRAGATATCWDHBB Reverse complement motif 0.361096 0.155950 0.346111 0.136843 0.281528 0.268426 0.275078 0.174967 0.369607 0.289339 0.157455 0.183599 0.228736 0.436716 0.146771 0.187777 0.348058 0.034384 0.109239 0.508319 0.069245 0.022797 0.824881 0.083077 0.803318 0.029514 0.118868 0.048301 0.029850 0.129092 0.013351 0.827706 0.907826 0.011964 0.054314 0.025896 0.008562 0.035900 0.039485 0.916053 0.063256 0.849623 0.017187 0.069934 0.041065 0.068327 0.034504 0.856104 0.280070 0.491243 0.083717 0.144971 0.222674 0.255289 0.159993 0.362045 0.167366 0.235266 0.353513 0.243855 0.169937 0.287909 0.178199 0.363955 0.296956 0.366964 0.225759 0.110320 Consensus sequence: VVHHWGATATCTMHBBV Alignment: VVBHRAGATATCWDHBB -MKAGAGMKMKAGAGMK ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00019 Zbtb12_primaryReverse Complement Reverse Complement Backward 1 16 0.042792 Species: Mus musculus Original motif 0.163348 0.349811 0.273573 0.213268 0.212612 0.211975 0.220400 0.355012 0.325879 0.220972 0.186720 0.266430 0.510632 0.041115 0.419323 0.028930 0.067550 0.203499 0.411224 0.317727 0.023546 0.002038 0.972278 0.002138 0.017818 0.006841 0.006478 0.968864 0.019791 0.001443 0.009338 0.969428 0.003084 0.992130 0.002654 0.002131 0.001031 0.039768 0.003588 0.955613 0.980811 0.006260 0.008964 0.003965 0.013624 0.002796 0.979716 0.003863 0.841198 0.016422 0.129217 0.013163 0.169265 0.145424 0.085753 0.599558 0.068235 0.584950 0.065758 0.281057 0.378189 0.252218 0.209355 0.160238 0.167389 0.305726 0.229730 0.297156 Consensus sequence: BDHRBGTTCTAGATCVB Reverse complement motif 0.167389 0.229730 0.305726 0.297156 0.160238 0.252218 0.209355 0.378189 0.068235 0.065758 0.584950 0.281057 0.599558 0.145424 0.085753 0.169265 0.013163 0.016422 0.129217 0.841198 0.013624 0.979716 0.002796 0.003863 0.003965 0.006260 0.008964 0.980811 0.955613 0.039768 0.003588 0.001031 0.003084 0.002654 0.992130 0.002131 0.969428 0.001443 0.009338 0.019791 0.968864 0.006841 0.006478 0.017818 0.023546 0.972278 0.002038 0.002138 0.067550 0.411224 0.203499 0.317727 0.028930 0.041115 0.419323 0.510632 0.266430 0.220972 0.186720 0.325879 0.355012 0.211975 0.220400 0.212612 0.163348 0.273573 0.349811 0.213268 Consensus sequence: BBGATCTAGAACBKHDB Alignment: BBGATCTAGAACBKHDB -RYCTCTRRRRCTCTRR ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00075 Sox15_primary Original Motif Original Motif Backward 1 16 0.043318 Species: Mus musculus Original motif 0.287334 0.139055 0.124297 0.449314 0.278683 0.214056 0.278266 0.228994 0.196938 0.172103 0.339663 0.291296 0.343773 0.089222 0.198442 0.368564 0.217683 0.069371 0.485495 0.227451 0.795638 0.049144 0.086842 0.068377 0.932914 0.008887 0.006817 0.051381 0.018504 0.893128 0.012624 0.075744 0.960471 0.008180 0.009943 0.021405 0.966816 0.008885 0.008787 0.015512 0.086103 0.016953 0.005969 0.890975 0.475989 0.013028 0.097844 0.413139 0.304890 0.097952 0.464158 0.133000 0.458453 0.118585 0.307695 0.115267 0.205225 0.241082 0.224896 0.328798 0.328081 0.178970 0.116466 0.376483 0.188001 0.185031 0.192398 0.434571 Consensus sequence: HDDDDAACAATWRRBHD Reverse complement motif 0.434571 0.185031 0.192398 0.188001 0.376483 0.178970 0.116466 0.328081 0.328798 0.241082 0.224896 0.205225 0.115267 0.118585 0.307695 0.458453 0.304890 0.464158 0.097952 0.133000 0.413139 0.013028 0.097844 0.475989 0.890975 0.016953 0.005969 0.086103 0.015512 0.008885 0.008787 0.966816 0.021405 0.008180 0.009943 0.960471 0.018504 0.012624 0.893128 0.075744 0.051381 0.008887 0.006817 0.932914 0.068377 0.049144 0.086842 0.795638 0.217683 0.485495 0.069371 0.227451 0.368564 0.089222 0.198442 0.343773 0.196938 0.339663 0.172103 0.291296 0.228994 0.214056 0.278266 0.278683 0.449314 0.139055 0.124297 0.287334 Consensus sequence: DHVKMWATTGTTHDHDH Alignment: HDDDDAACAATWRRBHD -MKAGAGMKMKAGAGMK ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 8 16 0.045428 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH -------RYCTCTRRRRCTCTRR ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 56 Motif name: C056 Original motif 0.530000 0.040000 0.240000 0.190000 0.445545 0.009901 0.079208 0.465347 0.440000 0.400000 0.030000 0.130000 0.910000 0.070000 0.010000 0.010000 0.750000 0.220000 0.010000 0.020000 0.851485 0.039604 0.099010 0.009901 0.079208 0.425743 0.009901 0.485149 0.500000 0.020000 0.040000 0.440000 0.524752 0.009901 0.376238 0.089109 0.742574 0.148515 0.039604 0.069307 0.620000 0.320000 0.040000 0.020000 0.841584 0.138614 0.009901 0.009901 0.730000 0.010000 0.170000 0.090000 0.550000 0.040000 0.010000 0.400000 0.250000 0.250000 0.040000 0.460000 Consensus sequence: AWMAAAYWRAMAAWH Reserve complement motif 0.460000 0.250000 0.040000 0.250000 0.400000 0.040000 0.010000 0.550000 0.090000 0.010000 0.170000 0.730000 0.009901 0.138614 0.009901 0.841584 0.020000 0.320000 0.040000 0.620000 0.069307 0.148515 0.039604 0.742574 0.089109 0.009901 0.376238 0.524752 0.440000 0.020000 0.040000 0.500000 0.485149 0.425743 0.009901 0.079208 0.009901 0.039604 0.099010 0.851485 0.020000 0.220000 0.010000 0.750000 0.010000 0.070000 0.010000 0.910000 0.130000 0.400000 0.030000 0.440000 0.465347 0.009901 0.079208 0.445545 0.190000 0.040000 0.240000 0.530000 Consensus sequence: HWTTYTKWMTTTYWT ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 56 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00077 Srf_secondary Original Motif Original Motif Forward 2 15 0.021358 Species: Mus musculus Original motif 0.162968 0.284828 0.440984 0.111220 0.151392 0.200635 0.205316 0.442657 0.267215 0.083669 0.192498 0.456618 0.332771 0.180711 0.200027 0.286491 0.509370 0.102954 0.242569 0.145107 0.666262 0.077309 0.154466 0.101962 0.737968 0.113335 0.100401 0.048296 0.658878 0.141580 0.134033 0.065510 0.766115 0.094051 0.069763 0.070072 0.755621 0.088491 0.044802 0.111086 0.749083 0.135917 0.047510 0.067490 0.663231 0.176795 0.028134 0.131839 0.553358 0.277659 0.038655 0.130328 0.392578 0.314083 0.209844 0.083495 0.198462 0.237132 0.239466 0.324940 0.275121 0.210087 0.194779 0.320013 0.287748 0.277395 0.142704 0.292154 Consensus sequence: VBDDAAAAAAAAMVBHH Reverse complement motif 0.292154 0.277395 0.142704 0.287748 0.320013 0.210087 0.194779 0.275121 0.324940 0.237132 0.239466 0.198462 0.083495 0.314083 0.209844 0.392578 0.130328 0.277659 0.038655 0.553358 0.131839 0.176795 0.028134 0.663231 0.067490 0.135917 0.047510 0.749083 0.111086 0.088491 0.044802 0.755621 0.070072 0.094051 0.069763 0.766115 0.065510 0.141580 0.134033 0.658878 0.048296 0.113335 0.100401 0.737968 0.101962 0.077309 0.154466 0.666262 0.145107 0.102954 0.242569 0.509370 0.286491 0.180711 0.200027 0.332771 0.456618 0.083669 0.192498 0.267215 0.442657 0.200635 0.205316 0.151392 0.162968 0.440984 0.284828 0.111220 Consensus sequence: HHVBYTTTTTTTTDDVV Alignment: VBDDAAAAAAAAMVBHH -AWMAAAYWRAMAAWH- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00037 Zfp105_primaryOriginal Motif Original Motif Forward 1 15 0.025185 Species: Mus musculus Original motif 0.363104 0.182807 0.145232 0.308856 0.419707 0.133742 0.222546 0.224005 0.164481 0.418263 0.052397 0.364858 0.715575 0.117639 0.064914 0.101872 0.883836 0.026985 0.032584 0.056596 0.558797 0.151280 0.033120 0.256803 0.267037 0.403488 0.026746 0.302729 0.939762 0.013627 0.034579 0.012032 0.897072 0.009878 0.035642 0.057408 0.305904 0.516040 0.055311 0.122746 0.880940 0.027958 0.048350 0.042752 0.710082 0.052464 0.040250 0.197204 0.246712 0.125155 0.318627 0.309506 0.429749 0.181755 0.176892 0.211603 0.339643 0.097216 0.355250 0.207891 Consensus sequence: HDYAAAHAAMAADHD Reverse complement motif 0.339643 0.355250 0.097216 0.207891 0.211603 0.181755 0.176892 0.429749 0.246712 0.318627 0.125155 0.309506 0.197204 0.052464 0.040250 0.710082 0.042752 0.027958 0.048350 0.880940 0.305904 0.055311 0.516040 0.122746 0.057408 0.009878 0.035642 0.897072 0.012032 0.013627 0.034579 0.939762 0.267037 0.026746 0.403488 0.302729 0.256803 0.151280 0.033120 0.558797 0.056596 0.026985 0.032584 0.883836 0.101872 0.117639 0.064914 0.715575 0.164481 0.052397 0.418263 0.364858 0.224005 0.133742 0.222546 0.419707 0.308856 0.182807 0.145232 0.363104 Consensus sequence: HHHTTRTTDTTTKDH Alignment: HDYAAAHAAMAADHD AWMAAAYWRAMAAWH ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00090 Elf3_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 2 15 0.027499 Species: Mus musculus Original motif 0.155083 0.152982 0.490906 0.201030 0.123195 0.312681 0.220770 0.343354 0.110252 0.131358 0.153983 0.604406 0.216489 0.490160 0.101348 0.192003 0.396130 0.292429 0.103252 0.208189 0.634770 0.070898 0.070668 0.223664 0.667102 0.099915 0.067576 0.165407 0.625495 0.095579 0.039353 0.239573 0.717478 0.093228 0.024737 0.164558 0.729965 0.048628 0.024557 0.196850 0.670909 0.118718 0.043692 0.166681 0.689441 0.050145 0.038829 0.221584 0.506735 0.159498 0.095635 0.238132 0.406093 0.298915 0.149902 0.145090 0.193913 0.282078 0.096706 0.427303 0.272324 0.154790 0.262469 0.310417 0.224484 0.458724 0.060144 0.256647 Consensus sequence: DBTHHAAAAAAAAVHDH Reverse complement motif 0.224484 0.060144 0.458724 0.256647 0.310417 0.154790 0.262469 0.272324 0.427303 0.282078 0.096706 0.193913 0.145090 0.298915 0.149902 0.406093 0.238132 0.159498 0.095635 0.506735 0.221584 0.050145 0.038829 0.689441 0.166681 0.118718 0.043692 0.670909 0.196850 0.048628 0.024557 0.729965 0.164558 0.093228 0.024737 0.717478 0.239573 0.095579 0.039353 0.625495 0.165407 0.099915 0.067576 0.667102 0.223664 0.070898 0.070668 0.634770 0.208189 0.292429 0.103252 0.396130 0.216489 0.101348 0.490160 0.192003 0.604406 0.131358 0.153983 0.110252 0.343354 0.312681 0.220770 0.123195 0.155083 0.490906 0.152982 0.201030 Consensus sequence: DDHBTTTTTTTTHDAVH Alignment: DBTHHAAAAAAAAVHDH -AWMAAAYWRAMAAWH- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00255 Dbx1 Original Motif Original Motif Backward 2 15 0.027785 Species: Mus musculus Original motif 0.193358 0.228955 0.160692 0.416995 0.611960 0.068099 0.048494 0.271446 0.459770 0.057385 0.307824 0.175021 0.226103 0.127408 0.101076 0.545413 0.241226 0.228640 0.067165 0.462969 0.621421 0.137382 0.078412 0.162785 0.737972 0.031899 0.051833 0.178295 0.110802 0.098497 0.073668 0.717033 0.129567 0.110629 0.036048 0.723756 0.729342 0.031636 0.088480 0.150541 0.540257 0.104927 0.048065 0.306750 0.195987 0.148698 0.098709 0.556606 0.587529 0.072583 0.170635 0.169252 0.497416 0.161804 0.219409 0.121371 0.278831 0.114362 0.139037 0.467771 0.297462 0.189119 0.187754 0.325665 0.397268 0.140582 0.287428 0.174722 Consensus sequence: HARTHAATTAWTAVDHD Reverse complement motif 0.174722 0.140582 0.287428 0.397268 0.325665 0.189119 0.187754 0.297462 0.467771 0.114362 0.139037 0.278831 0.121371 0.161804 0.219409 0.497416 0.169252 0.072583 0.170635 0.587529 0.556606 0.148698 0.098709 0.195987 0.306750 0.104927 0.048065 0.540257 0.150541 0.031636 0.088480 0.729342 0.723756 0.110629 0.036048 0.129567 0.717033 0.098497 0.073668 0.110802 0.178295 0.031899 0.051833 0.737972 0.162785 0.137382 0.078412 0.621421 0.462969 0.228640 0.067165 0.241226 0.545413 0.127408 0.101076 0.226103 0.175021 0.057385 0.307824 0.459770 0.271446 0.068099 0.048494 0.611960 0.416995 0.228955 0.160692 0.193358 Consensus sequence: DHDBTAWTAATTHAKTH Alignment: HARTHAATTAWTAVDHD -AWMAAAYWRAMAAWH- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00121 Hoxd10 Reverse Complement Reverse Complement Forward 2 15 0.029260 Species: Mus musculus Original motif 0.405345 0.293266 0.220907 0.080482 0.398063 0.099034 0.333525 0.169378 0.049753 0.190411 0.336789 0.423048 0.243698 0.226261 0.324346 0.205696 0.030873 0.549741 0.008321 0.411065 0.714225 0.228092 0.020960 0.036723 0.833992 0.010944 0.021918 0.133146 0.008898 0.026169 0.008341 0.956591 0.811684 0.004889 0.004751 0.178676 0.952107 0.004322 0.004587 0.038984 0.925365 0.008360 0.006811 0.059464 0.850659 0.058250 0.065237 0.025855 0.193369 0.242985 0.049515 0.514131 0.266774 0.080601 0.239781 0.412844 0.335522 0.125500 0.188170 0.350809 0.407171 0.120540 0.187300 0.284989 0.281181 0.242348 0.160247 0.316224 Consensus sequence: VDKVYAATAAAATDDDH Reverse complement motif 0.316224 0.242348 0.160247 0.281181 0.284989 0.120540 0.187300 0.407171 0.350809 0.125500 0.188170 0.335522 0.412844 0.080601 0.239781 0.266774 0.514131 0.242985 0.049515 0.193369 0.025855 0.058250 0.065237 0.850659 0.059464 0.008360 0.006811 0.925365 0.038984 0.004322 0.004587 0.952107 0.178676 0.004889 0.004751 0.811684 0.956591 0.026169 0.008341 0.008898 0.133146 0.010944 0.021918 0.833992 0.036723 0.228092 0.020960 0.714225 0.030873 0.008321 0.549741 0.411065 0.243698 0.324346 0.226261 0.205696 0.423048 0.190411 0.336789 0.049753 0.169378 0.099034 0.333525 0.398063 0.080482 0.293266 0.220907 0.405345 Consensus sequence: HDDDATTTTATTKVRDB Alignment: HDDDATTTTATTKVRDB -HWTTYTKWMTTTYWT- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 57 Motif name: C057 Original motif 0.520000 0.070000 0.060000 0.350000 0.510000 0.010000 0.290000 0.190000 0.590000 0.310000 0.010000 0.090000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.514851 0.039604 0.277228 0.168317 0.220000 0.300000 0.010000 0.470000 0.910000 0.050000 0.020000 0.020000 0.858586 0.070707 0.050505 0.020202 0.560000 0.380000 0.020000 0.040000 0.900000 0.060000 0.010000 0.030000 0.530000 0.010000 0.340000 0.120000 0.207921 0.336634 0.019802 0.435644 0.666667 0.292929 0.030303 0.010101 0.860000 0.100000 0.030000 0.010000 0.405941 0.485149 0.049505 0.059406 0.700000 0.170000 0.020000 0.110000 0.510000 0.010000 0.220000 0.260000 0.303030 0.252525 0.050505 0.393939 Consensus sequence: WRMARYAAMARYAAMAWH Reserve complement motif 0.393939 0.252525 0.050505 0.303030 0.260000 0.010000 0.220000 0.510000 0.110000 0.170000 0.020000 0.700000 0.405941 0.049505 0.485149 0.059406 0.010000 0.100000 0.030000 0.860000 0.010101 0.292929 0.030303 0.666667 0.435644 0.336634 0.019802 0.207921 0.120000 0.010000 0.340000 0.530000 0.030000 0.060000 0.010000 0.900000 0.040000 0.380000 0.020000 0.560000 0.020202 0.070707 0.050505 0.858586 0.020000 0.050000 0.020000 0.910000 0.470000 0.300000 0.010000 0.220000 0.168317 0.039604 0.277228 0.514851 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.090000 0.310000 0.010000 0.590000 0.190000 0.010000 0.290000 0.510000 0.350000 0.070000 0.060000 0.520000 Consensus sequence: HWTRTTMKTYTTMKTYKW ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 57 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_primary Original Motif Original Motif Forward 2 18 0.038148 Species: Mus musculus Original motif 0.360997 0.300272 0.115555 0.223177 0.309749 0.228429 0.166233 0.295589 0.149419 0.176868 0.240155 0.433558 0.379704 0.095791 0.276373 0.248133 0.394549 0.174184 0.130641 0.300626 0.443749 0.070776 0.211081 0.274393 0.364301 0.074356 0.370406 0.190936 0.791976 0.038475 0.093390 0.076159 0.963721 0.001826 0.002456 0.031997 0.004516 0.954596 0.008092 0.032796 0.981080 0.002062 0.002161 0.014697 0.986185 0.001846 0.006976 0.004992 0.059567 0.003649 0.002189 0.934595 0.495328 0.024257 0.240450 0.239965 0.305027 0.094878 0.526069 0.074025 0.418442 0.196237 0.158323 0.226998 0.336713 0.220452 0.191155 0.251680 0.192296 0.300342 0.169047 0.338315 0.240387 0.144634 0.128513 0.486465 0.290763 0.271259 0.116600 0.321377 0.224825 0.296233 0.229255 0.249687 0.493240 0.171285 0.075148 0.260326 Consensus sequence: HHBDHDDAACAATDRHHHHHBW Reverse complement motif 0.260326 0.171285 0.075148 0.493240 0.224825 0.229255 0.296233 0.249687 0.321377 0.271259 0.116600 0.290763 0.486465 0.144634 0.128513 0.240387 0.338315 0.300342 0.169047 0.192296 0.251680 0.220452 0.191155 0.336713 0.226998 0.196237 0.158323 0.418442 0.305027 0.526069 0.094878 0.074025 0.239965 0.024257 0.240450 0.495328 0.934595 0.003649 0.002189 0.059567 0.004992 0.001846 0.006976 0.986185 0.014697 0.002062 0.002161 0.981080 0.004516 0.008092 0.954596 0.032796 0.031997 0.001826 0.002456 0.963721 0.076159 0.038475 0.093390 0.791976 0.364301 0.370406 0.074356 0.190936 0.274393 0.070776 0.211081 0.443749 0.300626 0.174184 0.130641 0.394549 0.248133 0.095791 0.276373 0.379704 0.433558 0.176868 0.240155 0.149419 0.295589 0.228429 0.166233 0.309749 0.223177 0.300272 0.115555 0.360997 Consensus sequence: WBHHHHHMDATTGTTHDHDVHH Alignment: HHBDHDDAACAATDRHHHHHBW -WRMARYAAMARYAAMAWH--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 1 18 0.052401 Species: Mus musculus Original motif 0.067627 0.131333 0.654425 0.146615 0.156488 0.114442 0.145630 0.583441 0.206450 0.265630 0.358017 0.169903 0.090729 0.460713 0.274712 0.173847 0.285994 0.099998 0.154485 0.459523 0.635908 0.184787 0.072982 0.106323 0.748421 0.039204 0.092605 0.119769 0.081342 0.061327 0.044532 0.812799 0.143120 0.043879 0.024216 0.788785 0.247544 0.092102 0.621453 0.038901 0.295531 0.036295 0.027594 0.640580 0.194561 0.305468 0.339916 0.160055 0.175038 0.193568 0.101212 0.530182 0.145226 0.167488 0.559871 0.127415 0.271501 0.237429 0.206701 0.284369 0.216834 0.109191 0.569605 0.104370 0.182624 0.177160 0.300475 0.339742 0.331737 0.198645 0.265137 0.204482 0.230155 0.359365 0.183450 0.227029 0.056581 0.067297 0.463052 0.413070 0.198891 0.324626 0.304424 0.172059 0.181968 0.287547 0.202419 0.328066 Consensus sequence: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB Reverse complement motif 0.328066 0.287547 0.202419 0.181968 0.198891 0.304424 0.324626 0.172059 0.056581 0.463052 0.067297 0.413070 0.230155 0.183450 0.359365 0.227029 0.204482 0.198645 0.265137 0.331737 0.339742 0.177160 0.300475 0.182624 0.216834 0.569605 0.109191 0.104370 0.284369 0.237429 0.206701 0.271501 0.145226 0.559871 0.167488 0.127415 0.530182 0.193568 0.101212 0.175038 0.194561 0.339916 0.305468 0.160055 0.640580 0.036295 0.027594 0.295531 0.247544 0.621453 0.092102 0.038901 0.788785 0.043879 0.024216 0.143120 0.812799 0.061327 0.044532 0.081342 0.119769 0.039204 0.092605 0.748421 0.106323 0.184787 0.072982 0.635908 0.459523 0.099998 0.154485 0.285994 0.090729 0.274712 0.460713 0.173847 0.206450 0.358017 0.265630 0.169903 0.583441 0.114442 0.145630 0.156488 0.067627 0.654425 0.131333 0.146615 Consensus sequence: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC Alignment: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC ----WRMARYAAMARYAAMAWH ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00528 Foxm1_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 3 18 0.054082 Species: Mus musculus Original motif 0.399785 0.446658 0.111435 0.042122 0.535175 0.103991 0.089706 0.271128 0.078171 0.387987 0.375083 0.158759 0.309001 0.519142 0.070618 0.101239 0.201844 0.255818 0.323149 0.219190 0.534101 0.109845 0.235026 0.121028 0.656038 0.037473 0.261484 0.045006 0.315713 0.164290 0.471815 0.048182 0.651960 0.009412 0.328237 0.010391 0.937365 0.017313 0.007516 0.037807 0.019983 0.044238 0.012387 0.923392 0.061195 0.021485 0.881645 0.035675 0.017521 0.952998 0.013139 0.016342 0.254160 0.029735 0.493023 0.223082 0.239200 0.593324 0.114503 0.052973 0.610822 0.071539 0.099169 0.218470 0.166610 0.389712 0.204400 0.239278 0.227752 0.361626 0.178497 0.232125 0.537030 0.182466 0.026035 0.254470 0.235902 0.151006 0.043788 0.569304 0.081851 0.250397 0.590059 0.077693 0.340417 0.189613 0.272075 0.197895 Consensus sequence: MWSMBAARRATGCDCABHATGD Reverse complement motif 0.197895 0.189613 0.272075 0.340417 0.081851 0.590059 0.250397 0.077693 0.569304 0.151006 0.043788 0.235902 0.254470 0.182466 0.026035 0.537030 0.227752 0.178497 0.361626 0.232125 0.166610 0.204400 0.389712 0.239278 0.218470 0.071539 0.099169 0.610822 0.239200 0.114503 0.593324 0.052973 0.254160 0.493023 0.029735 0.223082 0.017521 0.013139 0.952998 0.016342 0.061195 0.881645 0.021485 0.035675 0.923392 0.044238 0.012387 0.019983 0.037807 0.017313 0.007516 0.937365 0.010391 0.009412 0.328237 0.651960 0.315713 0.471815 0.164290 0.048182 0.045006 0.037473 0.261484 0.656038 0.121028 0.109845 0.235026 0.534101 0.201844 0.323149 0.255818 0.219190 0.309001 0.070618 0.519142 0.101239 0.078171 0.375083 0.387987 0.158759 0.271128 0.103991 0.089706 0.535175 0.399785 0.111435 0.446658 0.042122 Consensus sequence: DCATDBTGHGCATKMTTBRSWR Alignment: DCATDBTGHGCATKMTTBRSWR --HWTRTTMKTYTTMKTYKW-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00032 Gata3_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 3 18 0.054240 Species: Mus musculus Original motif 0.151572 0.262753 0.258275 0.327401 0.221834 0.113385 0.275380 0.389400 0.297769 0.136928 0.134678 0.430625 0.270099 0.110415 0.271106 0.348380 0.265471 0.090253 0.223340 0.420936 0.616582 0.090091 0.171960 0.121367 0.197318 0.107541 0.406904 0.288237 0.798258 0.046950 0.001406 0.153385 0.003195 0.002516 0.989707 0.004582 0.991503 0.002748 0.002617 0.003132 0.005015 0.002764 0.003026 0.989195 0.948394 0.008932 0.001344 0.041330 0.973109 0.004100 0.004081 0.018710 0.040365 0.113905 0.828185 0.017545 0.736608 0.130524 0.113464 0.019404 0.415921 0.106101 0.316613 0.161365 0.376582 0.170927 0.155572 0.296919 0.137731 0.197151 0.211055 0.454064 0.324853 0.122747 0.246107 0.306293 0.462490 0.207311 0.159392 0.170807 0.380420 0.188972 0.311990 0.118618 0.222178 0.157873 0.380486 0.239463 Consensus sequence: BDHDDADAGATAAGADHBDHVD Reverse complement motif 0.222178 0.380486 0.157873 0.239463 0.118618 0.188972 0.311990 0.380420 0.170807 0.207311 0.159392 0.462490 0.306293 0.122747 0.246107 0.324853 0.454064 0.197151 0.211055 0.137731 0.296919 0.170927 0.155572 0.376582 0.161365 0.106101 0.316613 0.415921 0.019404 0.130524 0.113464 0.736608 0.040365 0.828185 0.113905 0.017545 0.018710 0.004100 0.004081 0.973109 0.041330 0.008932 0.001344 0.948394 0.989195 0.002764 0.003026 0.005015 0.003132 0.002748 0.002617 0.991503 0.003195 0.989707 0.002516 0.004582 0.153385 0.046950 0.001406 0.798258 0.197318 0.406904 0.107541 0.288237 0.121367 0.090091 0.171960 0.616582 0.420936 0.090253 0.223340 0.265471 0.348380 0.110415 0.271106 0.270099 0.430625 0.136928 0.134678 0.297769 0.389400 0.113385 0.275380 0.221834 0.327401 0.262753 0.258275 0.151572 Consensus sequence: HBHDVHDTCTTATCTHTDDHDV Alignment: HBHDVHDTCTTATCTHTDDHDV --HWTRTTMKTYTTMKTYKW-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00032 Gata3_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 4 18 0.055231 Species: Mus musculus Original motif 0.177641 0.319872 0.115137 0.387350 0.136644 0.182137 0.205873 0.475347 0.254263 0.244280 0.165207 0.336250 0.240415 0.207557 0.237497 0.314530 0.271041 0.214702 0.364395 0.149863 0.095475 0.320104 0.191738 0.392682 0.500902 0.142722 0.026556 0.329820 0.051221 0.023698 0.897245 0.027836 0.922410 0.027509 0.024058 0.026023 0.030735 0.070903 0.024248 0.874114 0.242120 0.231992 0.225143 0.300745 0.106956 0.220471 0.283490 0.389083 0.152079 0.165830 0.135066 0.547025 0.839205 0.051581 0.060119 0.049095 0.041204 0.069147 0.070830 0.818819 0.051861 0.848177 0.027599 0.072363 0.383793 0.016807 0.397470 0.201931 0.381899 0.215846 0.255908 0.146347 0.094792 0.358651 0.280905 0.265652 0.296132 0.181545 0.178433 0.343890 0.301997 0.254722 0.108566 0.334714 0.349481 0.270693 0.137507 0.242319 Consensus sequence: HBHDVBWGATHBTATCRVBHHH Reverse complement motif 0.242319 0.270693 0.137507 0.349481 0.334714 0.254722 0.108566 0.301997 0.343890 0.181545 0.178433 0.296132 0.094792 0.280905 0.358651 0.265652 0.146347 0.215846 0.255908 0.381899 0.383793 0.397470 0.016807 0.201931 0.051861 0.027599 0.848177 0.072363 0.818819 0.069147 0.070830 0.041204 0.049095 0.051581 0.060119 0.839205 0.547025 0.165830 0.135066 0.152079 0.389083 0.220471 0.283490 0.106956 0.300745 0.231992 0.225143 0.242120 0.874114 0.070903 0.024248 0.030735 0.026023 0.027509 0.024058 0.922410 0.051221 0.897245 0.023698 0.027836 0.329820 0.142722 0.026556 0.500902 0.392682 0.320104 0.191738 0.095475 0.271041 0.364395 0.214702 0.149863 0.314530 0.207557 0.237497 0.240415 0.336250 0.244280 0.165207 0.254263 0.475347 0.182137 0.205873 0.136644 0.387350 0.319872 0.115137 0.177641 Consensus sequence: HHHBBMGATAVHATCWVVDHVH Alignment: HHHBBMGATAVHATCWVVDHVH ---WRMARYAAMARYAAMAWH- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 58 Motif name: C058 Original motif 0.010000 0.820000 0.010000 0.160000 0.030000 0.420000 0.120000 0.430000 0.010000 0.770000 0.070000 0.150000 0.010000 0.850000 0.010000 0.130000 0.040000 0.290000 0.410000 0.260000 0.130000 0.590000 0.250000 0.030000 0.010101 0.494949 0.474747 0.020202 0.079208 0.277228 0.584158 0.059406 0.262626 0.414141 0.313131 0.010101 0.010000 0.810000 0.010000 0.170000 0.059406 0.435644 0.009901 0.495050 0.010000 0.600000 0.140000 0.250000 0.030000 0.760000 0.020000 0.190000 0.060000 0.220000 0.330000 0.390000 0.200000 0.540000 0.250000 0.010000 Consensus sequence: CYCCBCSGVCYCCBC Reserve complement motif 0.200000 0.250000 0.540000 0.010000 0.390000 0.220000 0.330000 0.060000 0.030000 0.020000 0.760000 0.190000 0.010000 0.140000 0.600000 0.250000 0.495050 0.435644 0.009901 0.059406 0.010000 0.010000 0.810000 0.170000 0.262626 0.313131 0.414141 0.010101 0.079208 0.584158 0.277228 0.059406 0.010101 0.474747 0.494949 0.020202 0.130000 0.250000 0.590000 0.030000 0.040000 0.410000 0.290000 0.260000 0.010000 0.010000 0.850000 0.130000 0.010000 0.070000 0.770000 0.150000 0.430000 0.420000 0.120000 0.030000 0.010000 0.010000 0.820000 0.160000 Consensus sequence: GVGGMGVCSGBGGMG ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 58 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 7 15 0.024651 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK -GVGGMGVCSGBGGMG------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00036 Myf6_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 1 15 0.026651 Species: Mus musculus Original motif 0.345146 0.261059 0.273931 0.119863 0.222137 0.272923 0.332024 0.172916 0.269602 0.278951 0.245221 0.206225 0.485406 0.144018 0.294421 0.076155 0.577731 0.270563 0.078955 0.072752 0.070027 0.750816 0.062819 0.116339 0.685018 0.105175 0.137110 0.072697 0.162574 0.071041 0.638464 0.127921 0.343240 0.389633 0.206226 0.060900 0.080169 0.790323 0.114211 0.015297 0.167035 0.201642 0.462780 0.168543 0.114383 0.664317 0.166143 0.055157 0.392143 0.114475 0.340085 0.153298 0.208147 0.577473 0.142694 0.071686 0.168632 0.563135 0.066181 0.202052 Consensus sequence: VVVRACAGVCBCDCC Reverse complement motif 0.168632 0.066181 0.563135 0.202052 0.208147 0.142694 0.577473 0.071686 0.153298 0.114475 0.340085 0.392143 0.114383 0.166143 0.664317 0.055157 0.167035 0.462780 0.201642 0.168543 0.080169 0.114211 0.790323 0.015297 0.343240 0.206226 0.389633 0.060900 0.162574 0.638464 0.071041 0.127921 0.072697 0.105175 0.137110 0.685018 0.070027 0.062819 0.750816 0.116339 0.072752 0.270563 0.078955 0.577731 0.076155 0.144018 0.294421 0.485406 0.269602 0.245221 0.278951 0.206225 0.222137 0.332024 0.272923 0.172916 0.119863 0.261059 0.273931 0.345146 Consensus sequence: GGDGBGVCTGTKVVB Alignment: GGDGBGVCTGTKVVB GVGGMGVCSGBGGMG ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00033 Zfp410_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 1 15 0.029628 Species: Mus musculus Original motif 0.162979 0.284781 0.237433 0.314807 0.182449 0.447584 0.069464 0.300502 0.298973 0.261014 0.213211 0.226802 0.136039 0.433062 0.144274 0.286625 0.180084 0.395933 0.158565 0.265418 0.069354 0.748510 0.068898 0.113238 0.060485 0.717828 0.075333 0.146354 0.023280 0.071762 0.645500 0.259457 0.166896 0.749762 0.062730 0.020612 0.050401 0.775248 0.089072 0.085279 0.103847 0.767557 0.068804 0.059791 0.064815 0.748318 0.114588 0.072280 0.340921 0.071942 0.242981 0.344157 0.301967 0.263512 0.165927 0.268594 0.479800 0.222955 0.118441 0.178803 0.229469 0.283621 0.143099 0.343811 0.261733 0.180191 0.169905 0.388170 Consensus sequence: BHHBHCCGCCCCDHHHH Reverse complement motif 0.388170 0.180191 0.169905 0.261733 0.343811 0.283621 0.143099 0.229469 0.178803 0.222955 0.118441 0.479800 0.268594 0.263512 0.165927 0.301967 0.344157 0.071942 0.242981 0.340921 0.064815 0.114588 0.748318 0.072280 0.103847 0.068804 0.767557 0.059791 0.050401 0.089072 0.775248 0.085279 0.166896 0.062730 0.749762 0.020612 0.023280 0.645500 0.071762 0.259457 0.060485 0.075333 0.717828 0.146354 0.069354 0.068898 0.748510 0.113238 0.180084 0.158565 0.395933 0.265418 0.136039 0.144274 0.433062 0.286625 0.226802 0.261014 0.213211 0.298973 0.182449 0.069464 0.447584 0.300502 0.314807 0.284781 0.237433 0.162979 Consensus sequence: HHHHDGGGGCGGDBHDV Alignment: BHHBHCCGCCCCDHHHH CYCCBCSGVCYCCBC-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00002 Sp4_primary Original Motif Original Motif Backward 1 15 0.030957 Species: Mus musculus Original motif 0.155386 0.223380 0.374454 0.246780 0.247106 0.159582 0.345111 0.248201 0.238889 0.258354 0.165304 0.337454 0.255612 0.489586 0.051621 0.203182 0.450100 0.545383 0.001071 0.003447 0.003704 0.991007 0.002456 0.002833 0.035504 0.001814 0.928129 0.034553 0.001494 0.991406 0.003414 0.003686 0.003045 0.990628 0.005182 0.001145 0.000990 0.963237 0.001215 0.034557 0.148016 0.838396 0.000666 0.012922 0.014261 0.905847 0.007200 0.072692 0.083394 0.270068 0.058368 0.588170 0.149141 0.286783 0.142802 0.421274 0.204851 0.347195 0.253356 0.194597 0.184442 0.299908 0.194408 0.321242 0.125793 0.380109 0.245318 0.248780 Consensus sequence: BDHHMCGCCCCCTHVBB Reverse complement motif 0.125793 0.245318 0.380109 0.248780 0.321242 0.299908 0.194408 0.184442 0.204851 0.253356 0.347195 0.194597 0.421274 0.286783 0.142802 0.149141 0.588170 0.270068 0.058368 0.083394 0.014261 0.007200 0.905847 0.072692 0.148016 0.000666 0.838396 0.012922 0.000990 0.001215 0.963237 0.034557 0.003045 0.005182 0.990628 0.001145 0.001494 0.003414 0.991406 0.003686 0.035504 0.928129 0.001814 0.034553 0.003704 0.002456 0.991007 0.002833 0.450100 0.001071 0.545383 0.003447 0.255612 0.051621 0.489586 0.203182 0.337454 0.258354 0.165304 0.238889 0.247106 0.345111 0.159582 0.248201 0.155386 0.374454 0.223380 0.246780 Consensus sequence: BVVHAGGGGGCGRDHHB Alignment: BDHHMCGCCCCCTHVBB --CYCCBCSGVCYCCBC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00099 Ascl2_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 1 15 0.033197 Species: Mus musculus Original motif 0.114462 0.345602 0.289353 0.250583 0.192593 0.250844 0.116250 0.440313 0.338838 0.304929 0.195843 0.160390 0.312051 0.115094 0.162465 0.410390 0.143975 0.600492 0.123348 0.132185 0.078751 0.715072 0.135182 0.070995 0.146191 0.685571 0.069799 0.098439 0.137287 0.646078 0.126428 0.090207 0.335099 0.092260 0.371510 0.201131 0.033090 0.631176 0.074278 0.261456 0.117516 0.619336 0.100946 0.162202 0.114769 0.627362 0.089839 0.168031 0.195787 0.252057 0.220803 0.331353 0.415355 0.120731 0.281372 0.182542 0.111178 0.217079 0.245769 0.425974 0.191517 0.296952 0.153370 0.358162 Consensus sequence: BHVDCCCCDCCCBDBH Reverse complement motif 0.358162 0.296952 0.153370 0.191517 0.425974 0.217079 0.245769 0.111178 0.182542 0.120731 0.281372 0.415355 0.331353 0.252057 0.220803 0.195787 0.114769 0.089839 0.627362 0.168031 0.117516 0.100946 0.619336 0.162202 0.033090 0.074278 0.631176 0.261456 0.335099 0.371510 0.092260 0.201131 0.137287 0.126428 0.646078 0.090207 0.146191 0.069799 0.685571 0.098439 0.078751 0.135182 0.715072 0.070995 0.143975 0.123348 0.600492 0.132185 0.410390 0.115094 0.162465 0.312051 0.160390 0.304929 0.195843 0.338838 0.440313 0.250844 0.116250 0.192593 0.114462 0.289353 0.345602 0.250583 Consensus sequence: HVDVGGGHGGGGDBHB Alignment: BHVDCCCCDCCCBDBH CYCCBCSGVCYCCBC- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 59 Motif name: C059 Original motif 0.079208 0.495050 0.316832 0.108911 0.070000 0.540000 0.060000 0.330000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.060000 0.920000 0.010000 0.010000 0.330000 0.140000 0.250000 0.280000 0.128713 0.554455 0.247525 0.069307 0.010000 0.720000 0.260000 0.010000 0.178218 0.524752 0.069307 0.227723 0.198020 0.653465 0.009901 0.138614 0.227723 0.653465 0.009901 0.108911 0.340000 0.100000 0.550000 0.010000 0.100000 0.270000 0.620000 0.010000 Consensus sequence: SYCCDCCCCCRG Reserve complement motif 0.100000 0.620000 0.270000 0.010000 0.340000 0.550000 0.100000 0.010000 0.227723 0.009901 0.653465 0.108911 0.198020 0.009901 0.653465 0.138614 0.178218 0.069307 0.524752 0.227723 0.010000 0.260000 0.720000 0.010000 0.128713 0.247525 0.554455 0.069307 0.280000 0.140000 0.250000 0.330000 0.060000 0.010000 0.920000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.070000 0.060000 0.540000 0.330000 0.079208 0.316832 0.495050 0.108911 Consensus sequence: CMGGGGGDGGKS ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 59 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 5 12 0.019733 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH ------SYCCDCCCCCRG---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00033 Zfp410_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 3 12 0.022426 Species: Mus musculus Original motif 0.162979 0.284781 0.237433 0.314807 0.182449 0.447584 0.069464 0.300502 0.298973 0.261014 0.213211 0.226802 0.136039 0.433062 0.144274 0.286625 0.180084 0.395933 0.158565 0.265418 0.069354 0.748510 0.068898 0.113238 0.060485 0.717828 0.075333 0.146354 0.023280 0.071762 0.645500 0.259457 0.166896 0.749762 0.062730 0.020612 0.050401 0.775248 0.089072 0.085279 0.103847 0.767557 0.068804 0.059791 0.064815 0.748318 0.114588 0.072280 0.340921 0.071942 0.242981 0.344157 0.301967 0.263512 0.165927 0.268594 0.479800 0.222955 0.118441 0.178803 0.229469 0.283621 0.143099 0.343811 0.261733 0.180191 0.169905 0.388170 Consensus sequence: BHHBHCCGCCCCDHHHH Reverse complement motif 0.388170 0.180191 0.169905 0.261733 0.343811 0.283621 0.143099 0.229469 0.178803 0.222955 0.118441 0.479800 0.268594 0.263512 0.165927 0.301967 0.344157 0.071942 0.242981 0.340921 0.064815 0.114588 0.748318 0.072280 0.103847 0.068804 0.767557 0.059791 0.050401 0.089072 0.775248 0.085279 0.166896 0.062730 0.749762 0.020612 0.023280 0.645500 0.071762 0.259457 0.060485 0.075333 0.717828 0.146354 0.069354 0.068898 0.748510 0.113238 0.180084 0.158565 0.395933 0.265418 0.136039 0.144274 0.433062 0.286625 0.226802 0.261014 0.213211 0.298973 0.182449 0.069464 0.447584 0.300502 0.314807 0.284781 0.237433 0.162979 Consensus sequence: HHHHDGGGGCGGDBHDV Alignment: HHHHDGGGGCGGDBHDV --CMGGGGGDGGKS--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00099 Ascl2_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 5 12 0.023168 Species: Mus musculus Original motif 0.114462 0.345602 0.289353 0.250583 0.192593 0.250844 0.116250 0.440313 0.338838 0.304929 0.195843 0.160390 0.312051 0.115094 0.162465 0.410390 0.143975 0.600492 0.123348 0.132185 0.078751 0.715072 0.135182 0.070995 0.146191 0.685571 0.069799 0.098439 0.137287 0.646078 0.126428 0.090207 0.335099 0.092260 0.371510 0.201131 0.033090 0.631176 0.074278 0.261456 0.117516 0.619336 0.100946 0.162202 0.114769 0.627362 0.089839 0.168031 0.195787 0.252057 0.220803 0.331353 0.415355 0.120731 0.281372 0.182542 0.111178 0.217079 0.245769 0.425974 0.191517 0.296952 0.153370 0.358162 Consensus sequence: BHVDCCCCDCCCBDBH Reverse complement motif 0.358162 0.296952 0.153370 0.191517 0.425974 0.217079 0.245769 0.111178 0.182542 0.120731 0.281372 0.415355 0.331353 0.252057 0.220803 0.195787 0.114769 0.089839 0.627362 0.168031 0.117516 0.100946 0.619336 0.162202 0.033090 0.074278 0.631176 0.261456 0.335099 0.371510 0.092260 0.201131 0.137287 0.126428 0.646078 0.090207 0.146191 0.069799 0.685571 0.098439 0.078751 0.135182 0.715072 0.070995 0.143975 0.123348 0.600492 0.132185 0.410390 0.115094 0.162465 0.312051 0.160390 0.304929 0.195843 0.338838 0.440313 0.250844 0.116250 0.192593 0.114462 0.289353 0.345602 0.250583 Consensus sequence: HVDVGGGHGGGGDBHB Alignment: HVDVGGGHGGGGDBHB CMGGGGGDGGKS---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00043 Bcl6b_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 3 12 0.023387 Species: Mus musculus Original motif 0.316572 0.278382 0.152556 0.252490 0.167141 0.257034 0.259894 0.315931 0.175523 0.325956 0.259996 0.238525 0.165052 0.385677 0.239449 0.209822 0.069489 0.782718 0.072454 0.075339 0.049943 0.800636 0.031988 0.117433 0.223382 0.060306 0.552691 0.163621 0.072944 0.818252 0.034406 0.074398 0.070535 0.845127 0.062712 0.021626 0.031035 0.859354 0.055424 0.054187 0.063668 0.798503 0.067274 0.070554 0.348488 0.030697 0.197179 0.423636 0.307220 0.256470 0.181009 0.255301 0.460933 0.285057 0.090258 0.163752 0.315798 0.228431 0.171135 0.284637 0.374527 0.268328 0.198810 0.158335 Consensus sequence: HBBBCCGCCCCWHHHV Reverse complement motif 0.158335 0.268328 0.198810 0.374527 0.284637 0.228431 0.171135 0.315798 0.163752 0.285057 0.090258 0.460933 0.255301 0.256470 0.181009 0.307220 0.423636 0.030697 0.197179 0.348488 0.063668 0.067274 0.798503 0.070554 0.031035 0.055424 0.859354 0.054187 0.070535 0.062712 0.845127 0.021626 0.072944 0.034406 0.818252 0.074398 0.223382 0.552691 0.060306 0.163621 0.049943 0.031988 0.800636 0.117433 0.069489 0.072454 0.782718 0.075339 0.165052 0.239449 0.385677 0.209822 0.175523 0.259996 0.325956 0.238525 0.315931 0.257034 0.259894 0.167141 0.252490 0.278382 0.152556 0.316572 Consensus sequence: BHHHWGGGGCGGBBVH Alignment: BHHHWGGGGCGGBBVH --CMGGGGGDGGKS-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 7 12 0.024621 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV -----CMGGGGGDGGKS------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 60 Motif name: C060 Original motif 0.020000 0.420000 0.530000 0.030000 0.530000 0.430000 0.010000 0.030000 0.099010 0.009901 0.841584 0.049505 0.148515 0.079208 0.752475 0.019802 0.010000 0.810000 0.170000 0.010000 0.742574 0.029703 0.108911 0.118812 0.009901 0.039604 0.504950 0.445545 0.495050 0.475248 0.009901 0.019802 0.090000 0.010000 0.890000 0.010000 0.059406 0.089109 0.821782 0.029703 0.010000 0.900000 0.080000 0.010000 0.782178 0.089109 0.039604 0.089109 0.059406 0.009901 0.495050 0.435644 0.128713 0.465347 0.366337 0.039604 Consensus sequence: SMGGCAKMGGCAKS Reserve complement motif 0.128713 0.366337 0.465347 0.039604 0.059406 0.495050 0.009901 0.435644 0.089109 0.089109 0.039604 0.782178 0.010000 0.080000 0.900000 0.010000 0.059406 0.821782 0.089109 0.029703 0.090000 0.890000 0.010000 0.010000 0.019802 0.475248 0.009901 0.495050 0.009901 0.504950 0.039604 0.445545 0.118812 0.029703 0.108911 0.742574 0.010000 0.170000 0.810000 0.010000 0.148515 0.752475 0.079208 0.019802 0.099010 0.841584 0.009901 0.049505 0.030000 0.430000 0.010000 0.530000 0.020000 0.530000 0.420000 0.030000 Consensus sequence: SYTGCCYYTGCCYS ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 60 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00010 Tcfap2b_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 2 14 0.030925 Species: Mus musculus Original motif 0.325895 0.099601 0.286848 0.287657 0.177095 0.035123 0.260876 0.526906 0.344850 0.211117 0.015725 0.428308 0.128363 0.059965 0.777560 0.034112 0.048072 0.881624 0.024842 0.045462 0.072628 0.872650 0.011271 0.043451 0.057165 0.162157 0.347719 0.432959 0.015437 0.448405 0.428425 0.107733 0.446877 0.336374 0.099940 0.116809 0.090955 0.023004 0.848240 0.037801 0.040151 0.015072 0.901303 0.043473 0.087378 0.817019 0.027876 0.067727 0.532482 0.021469 0.266773 0.179276 0.325017 0.271661 0.138860 0.264463 0.203625 0.179490 0.143885 0.473001 Consensus sequence: DTWGCCKSMGGCRHH Reverse complement motif 0.473001 0.179490 0.143885 0.203625 0.264463 0.271661 0.138860 0.325017 0.179276 0.021469 0.266773 0.532482 0.087378 0.027876 0.817019 0.067727 0.040151 0.901303 0.015072 0.043473 0.090955 0.848240 0.023004 0.037801 0.116809 0.336374 0.099940 0.446877 0.015437 0.428425 0.448405 0.107733 0.432959 0.162157 0.347719 0.057165 0.072628 0.011271 0.872650 0.043451 0.048072 0.024842 0.881624 0.045462 0.128363 0.777560 0.059965 0.034112 0.428308 0.211117 0.015725 0.344850 0.526906 0.035123 0.260876 0.177095 0.287657 0.099601 0.286848 0.325895 Consensus sequence: HHKGCCYSRGGCWAD Alignment: HHKGCCYSRGGCWAD SYTGCCYYTGCCYS- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00079 Esrra_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 4 14 0.034966 Species: Mus musculus Original motif 0.212524 0.177958 0.293723 0.315796 0.420838 0.283140 0.144938 0.151084 0.198119 0.196347 0.260353 0.345181 0.117752 0.282184 0.137207 0.462857 0.070125 0.781439 0.138093 0.010344 0.965989 0.000956 0.023828 0.009227 0.977263 0.003066 0.019255 0.000416 0.007404 0.000267 0.938934 0.053395 0.007147 0.000287 0.983377 0.009190 0.039608 0.000730 0.040682 0.918981 0.000685 0.905345 0.021930 0.072040 0.800961 0.001126 0.195791 0.002121 0.245039 0.241263 0.038084 0.475614 0.265397 0.238316 0.304963 0.191325 0.203742 0.286208 0.231002 0.279048 0.194132 0.188854 0.346693 0.270322 0.310711 0.263840 0.184317 0.241132 Consensus sequence: DHDBCAAGGTCAHVBDH Reverse complement motif 0.241132 0.263840 0.184317 0.310711 0.194132 0.346693 0.188854 0.270322 0.203742 0.231002 0.286208 0.279048 0.265397 0.304963 0.238316 0.191325 0.475614 0.241263 0.038084 0.245039 0.002121 0.001126 0.195791 0.800961 0.000685 0.021930 0.905345 0.072040 0.918981 0.000730 0.040682 0.039608 0.007147 0.983377 0.000287 0.009190 0.007404 0.938934 0.000267 0.053395 0.000416 0.003066 0.019255 0.977263 0.009227 0.000956 0.023828 0.965989 0.070125 0.138093 0.781439 0.010344 0.462857 0.282184 0.137207 0.117752 0.345181 0.196347 0.260353 0.198119 0.151084 0.283140 0.144938 0.420838 0.315796 0.177958 0.293723 0.212524 Consensus sequence: HHBVHTGACCTTGVDHD Alignment: HHBVHTGACCTTGVDHD ---SYTGCCYYTGCCYS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v015681_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 6 14 0.040673 Species: Mus musculus Original motif 0.331499 0.188505 0.182841 0.297156 0.328961 0.213025 0.273530 0.184484 0.197213 0.129292 0.524914 0.148581 0.274491 0.226406 0.312118 0.186986 0.103231 0.393726 0.364988 0.138055 0.552594 0.166422 0.186262 0.094722 0.157618 0.064773 0.616497 0.161112 0.139166 0.176098 0.621185 0.063551 0.748420 0.062398 0.012447 0.176735 0.116584 0.009438 0.860326 0.013653 0.005030 0.003646 0.974877 0.016447 0.055257 0.007181 0.921760 0.015802 0.032748 0.058249 0.052709 0.856293 0.105606 0.872231 0.014370 0.007793 0.019480 0.497379 0.125899 0.357242 0.478582 0.269713 0.061464 0.190242 0.253985 0.287006 0.201320 0.257689 0.319384 0.210231 0.175842 0.294543 0.222123 0.287802 0.201294 0.288782 0.139951 0.376041 0.081133 0.402875 0.213450 0.343835 0.383676 0.059039 0.322294 0.355918 0.148062 0.173725 Consensus sequence: HVGVSAGGAGGGTCYHHHHYVH Reverse complement motif 0.322294 0.148062 0.355918 0.173725 0.213450 0.383676 0.343835 0.059039 0.402875 0.376041 0.081133 0.139951 0.288782 0.287802 0.201294 0.222123 0.294543 0.210231 0.175842 0.319384 0.253985 0.201320 0.287006 0.257689 0.190242 0.269713 0.061464 0.478582 0.019480 0.125899 0.497379 0.357242 0.105606 0.014370 0.872231 0.007793 0.856293 0.058249 0.052709 0.032748 0.055257 0.921760 0.007181 0.015802 0.005030 0.974877 0.003646 0.016447 0.116584 0.860326 0.009438 0.013653 0.176735 0.062398 0.012447 0.748420 0.139166 0.621185 0.176098 0.063551 0.157618 0.616497 0.064773 0.161112 0.094722 0.166422 0.186262 0.552594 0.103231 0.364988 0.393726 0.138055 0.274491 0.312118 0.226406 0.186986 0.197213 0.524914 0.129292 0.148581 0.184484 0.213025 0.273530 0.328961 0.297156 0.188505 0.182841 0.331499 Consensus sequence: DVMHHDHKGACCCTCCTSVCBH Alignment: DVMHHDHKGACCCTCCTSVCBH -----SYTGCCYYTGCCYS--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00028 Tcfap2e_primaryReverse Complement Reverse Complement Forward 1 14 0.041946 Species: Mus musculus Original motif 0.369517 0.172742 0.163174 0.294567 0.260541 0.211816 0.194359 0.333284 0.292862 0.281323 0.073013 0.352801 0.011777 0.272676 0.697188 0.018359 0.005160 0.983588 0.005917 0.005335 0.002256 0.960488 0.005733 0.031524 0.003735 0.283214 0.123762 0.589290 0.024383 0.379981 0.542999 0.052638 0.589290 0.123762 0.283214 0.003735 0.031524 0.005733 0.960488 0.002256 0.005335 0.005917 0.983588 0.005160 0.018359 0.697188 0.272676 0.011777 0.328286 0.093173 0.334133 0.244408 0.563777 0.145250 0.140240 0.150733 0.263206 0.222321 0.242153 0.272320 Consensus sequence: HHHGCCTSAGGCDAD Reverse complement motif 0.272320 0.222321 0.242153 0.263206 0.150733 0.145250 0.140240 0.563777 0.328286 0.334133 0.093173 0.244408 0.018359 0.272676 0.697188 0.011777 0.005335 0.983588 0.005917 0.005160 0.031524 0.960488 0.005733 0.002256 0.003735 0.123762 0.283214 0.589290 0.024383 0.542999 0.379981 0.052638 0.589290 0.283214 0.123762 0.003735 0.002256 0.005733 0.960488 0.031524 0.005160 0.005917 0.983588 0.005335 0.011777 0.697188 0.272676 0.018359 0.352801 0.281323 0.073013 0.292862 0.333284 0.211816 0.194359 0.260541 0.294567 0.172742 0.163174 0.369517 Consensus sequence: DTHGCCTSAGGCHHH Alignment: DTHGCCTSAGGCHHH SYTGCCYYTGCCYS- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00099 Ascl2_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 1 14 0.043659 Species: Mus musculus Original motif 0.114462 0.345602 0.289353 0.250583 0.192593 0.250844 0.116250 0.440313 0.338838 0.304929 0.195843 0.160390 0.312051 0.115094 0.162465 0.410390 0.143975 0.600492 0.123348 0.132185 0.078751 0.715072 0.135182 0.070995 0.146191 0.685571 0.069799 0.098439 0.137287 0.646078 0.126428 0.090207 0.335099 0.092260 0.371510 0.201131 0.033090 0.631176 0.074278 0.261456 0.117516 0.619336 0.100946 0.162202 0.114769 0.627362 0.089839 0.168031 0.195787 0.252057 0.220803 0.331353 0.415355 0.120731 0.281372 0.182542 0.111178 0.217079 0.245769 0.425974 0.191517 0.296952 0.153370 0.358162 Consensus sequence: BHVDCCCCDCCCBDBH Reverse complement motif 0.358162 0.296952 0.153370 0.191517 0.425974 0.217079 0.245769 0.111178 0.182542 0.120731 0.281372 0.415355 0.331353 0.252057 0.220803 0.195787 0.114769 0.089839 0.627362 0.168031 0.117516 0.100946 0.619336 0.162202 0.033090 0.074278 0.631176 0.261456 0.335099 0.371510 0.092260 0.201131 0.137287 0.126428 0.646078 0.090207 0.146191 0.069799 0.685571 0.098439 0.078751 0.135182 0.715072 0.070995 0.143975 0.123348 0.600492 0.132185 0.410390 0.115094 0.162465 0.312051 0.160390 0.304929 0.195843 0.338838 0.440313 0.250844 0.116250 0.192593 0.114462 0.289353 0.345602 0.250583 Consensus sequence: HVDVGGGHGGGGDBHB Alignment: BHVDCCCCDCCCBDBH SYTGCCYYTGCCYS-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 61 Motif name: C061 Original motif 0.590000 0.330000 0.040000 0.040000 0.287129 0.148515 0.554455 0.009901 0.010000 0.010000 0.890000 0.090000 0.360000 0.590000 0.040000 0.010000 0.320000 0.630000 0.010000 0.040000 0.161616 0.161616 0.404040 0.272727 0.653465 0.118812 0.207921 0.019802 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.280000 0.700000 0.010000 0.010000 0.890000 0.090000 0.010000 0.290000 0.400000 0.080000 0.230000 0.010000 0.010000 0.740000 0.240000 0.010000 0.050000 0.930000 0.010000 0.168317 0.603960 0.188119 0.039604 0.099010 0.504950 0.168317 0.227723 0.059406 0.019802 0.336634 0.584158 Consensus sequence: MRGMMBAGGCHGGCCK Reserve complement motif 0.584158 0.019802 0.336634 0.059406 0.099010 0.168317 0.504950 0.227723 0.168317 0.188119 0.603960 0.039604 0.010000 0.930000 0.050000 0.010000 0.010000 0.740000 0.010000 0.240000 0.290000 0.080000 0.400000 0.230000 0.010000 0.090000 0.890000 0.010000 0.010000 0.700000 0.280000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.019802 0.118812 0.207921 0.653465 0.161616 0.404040 0.161616 0.272727 0.320000 0.010000 0.630000 0.040000 0.360000 0.040000 0.590000 0.010000 0.010000 0.890000 0.010000 0.090000 0.287129 0.554455 0.148515 0.009901 0.040000 0.330000 0.040000 0.590000 Consensus sequence: RGGCCDGCCTBRRCMY ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 61 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00526 Foxn1_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 1 16 0.035498 Species: Mus musculus Original motif 0.477863 0.106306 0.184102 0.231729 0.304951 0.149020 0.361418 0.184612 0.548996 0.056128 0.348902 0.045974 0.385727 0.477782 0.086218 0.050273 0.409556 0.232265 0.173851 0.184328 0.174550 0.312880 0.307123 0.205448 0.850398 0.047204 0.041665 0.060734 0.141234 0.548534 0.142230 0.168002 0.059462 0.026354 0.892948 0.021236 0.053714 0.870297 0.028935 0.047055 0.086273 0.069147 0.805284 0.039296 0.033781 0.573881 0.034115 0.358223 0.035191 0.079663 0.824970 0.060176 0.051830 0.862631 0.019359 0.066180 0.178685 0.015738 0.762485 0.043092 0.058988 0.042615 0.017608 0.880789 0.202382 0.173360 0.284095 0.340163 0.098493 0.234651 0.506524 0.160333 0.109087 0.336204 0.250510 0.304198 0.130945 0.250843 0.177122 0.441090 0.353830 0.138838 0.162784 0.344548 0.114290 0.417163 0.160662 0.307885 Consensus sequence: DDRMHBACGCGYGCGTDGBBDB Reverse complement motif 0.114290 0.160662 0.417163 0.307885 0.344548 0.138838 0.162784 0.353830 0.441090 0.250843 0.177122 0.130945 0.109087 0.250510 0.336204 0.304198 0.098493 0.506524 0.234651 0.160333 0.340163 0.173360 0.284095 0.202382 0.880789 0.042615 0.017608 0.058988 0.178685 0.762485 0.015738 0.043092 0.051830 0.019359 0.862631 0.066180 0.035191 0.824970 0.079663 0.060176 0.033781 0.034115 0.573881 0.358223 0.086273 0.805284 0.069147 0.039296 0.053714 0.028935 0.870297 0.047055 0.059462 0.892948 0.026354 0.021236 0.141234 0.142230 0.548534 0.168002 0.060734 0.047204 0.041665 0.850398 0.174550 0.307123 0.312880 0.205448 0.184328 0.232265 0.173851 0.409556 0.385727 0.086218 0.477782 0.050273 0.045974 0.056128 0.348902 0.548996 0.304951 0.361418 0.149020 0.184612 0.231729 0.106306 0.184102 0.477863 Consensus sequence: BDVBCDACGCKCGCGTBHRKHD Alignment: DDRMHBACGCGYGCGTDGBBDB MRGMMBAGGCHGGCCK------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 6 16 0.037160 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH -----RGGCCDGCCTBRRCMY-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_primaryReverse Complement Original Motif Backward 2 16 0.039719 Species: Mus musculus Original motif 0.183797 0.268049 0.330111 0.218043 0.127599 0.330310 0.243614 0.298477 0.143199 0.188046 0.268593 0.400162 0.214690 0.205230 0.247090 0.332990 0.294688 0.299104 0.327152 0.079056 0.221909 0.193223 0.480155 0.104712 0.444072 0.068239 0.481838 0.005852 0.006182 0.015429 0.901278 0.077111 0.766535 0.111138 0.121632 0.000696 0.014848 0.973961 0.000298 0.010893 0.001807 0.992200 0.002669 0.003324 0.795344 0.140510 0.018576 0.045571 0.006990 0.988200 0.002510 0.002299 0.154898 0.842296 0.000998 0.001808 0.029577 0.919262 0.006935 0.044226 0.677987 0.032075 0.185065 0.104874 0.195132 0.364580 0.319321 0.120967 0.225412 0.115034 0.612849 0.046705 0.548628 0.058900 0.162857 0.229616 0.112531 0.340331 0.165910 0.381227 0.073029 0.303078 0.363896 0.259997 0.561485 0.260567 0.092979 0.084969 0.132283 0.457691 0.140159 0.269867 Consensus sequence: BBBDVVRGACCACCCAVGABBAB Reverse complement motif 0.132283 0.140159 0.457691 0.269867 0.084969 0.260567 0.092979 0.561485 0.073029 0.363896 0.303078 0.259997 0.381227 0.340331 0.165910 0.112531 0.229616 0.058900 0.162857 0.548628 0.225412 0.612849 0.115034 0.046705 0.195132 0.319321 0.364580 0.120967 0.104874 0.032075 0.185065 0.677987 0.029577 0.006935 0.919262 0.044226 0.154898 0.000998 0.842296 0.001808 0.006990 0.002510 0.988200 0.002299 0.045571 0.140510 0.018576 0.795344 0.001807 0.002669 0.992200 0.003324 0.014848 0.000298 0.973961 0.010893 0.000696 0.111138 0.121632 0.766535 0.006182 0.901278 0.015429 0.077111 0.444072 0.481838 0.068239 0.005852 0.221909 0.480155 0.193223 0.104712 0.294688 0.327152 0.299104 0.079056 0.332990 0.205230 0.247090 0.214690 0.400162 0.188046 0.268593 0.143199 0.127599 0.243614 0.330310 0.298477 0.183797 0.330111 0.268049 0.218043 Consensus sequence: BTBVTCVTGGGTGGTCMVVDVBB Alignment: BBBDVVRGACCACCCAVGABBAB ------RGGCCDGCCTBRRCMY- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v015681_primaryReverse Complement Original Motif Forward 8 16 0.041005 Species: Mus musculus Original motif 0.641428 0.180211 0.044767 0.133594 0.171696 0.262981 0.334148 0.231174 0.129726 0.322735 0.243462 0.304077 0.165713 0.175735 0.256108 0.402445 0.146090 0.171890 0.412753 0.269266 0.212837 0.439192 0.280990 0.066980 0.251088 0.275516 0.374380 0.099015 0.575438 0.079656 0.338201 0.006704 0.005634 0.003422 0.972597 0.018348 0.890447 0.077034 0.031851 0.000668 0.007128 0.986862 0.000496 0.005515 0.001445 0.991564 0.001925 0.005066 0.738761 0.190157 0.026399 0.044684 0.013384 0.983783 0.000896 0.001937 0.068077 0.929549 0.000773 0.001602 0.040830 0.933742 0.005283 0.020145 0.730274 0.029225 0.145689 0.094812 0.165032 0.572838 0.162001 0.100129 0.383584 0.129942 0.429497 0.056977 0.455959 0.071959 0.208204 0.263878 0.134271 0.262985 0.222626 0.380117 0.071193 0.346594 0.346081 0.236132 0.445661 0.405278 0.053901 0.095160 Consensus sequence: ABBBBVVRGACCACCCACRDBBM Reverse complement motif 0.095160 0.405278 0.053901 0.445661 0.071193 0.346081 0.346594 0.236132 0.380117 0.262985 0.222626 0.134271 0.263878 0.071959 0.208204 0.455959 0.383584 0.429497 0.129942 0.056977 0.165032 0.162001 0.572838 0.100129 0.094812 0.029225 0.145689 0.730274 0.040830 0.005283 0.933742 0.020145 0.068077 0.000773 0.929549 0.001602 0.013384 0.000896 0.983783 0.001937 0.044684 0.190157 0.026399 0.738761 0.001445 0.001925 0.991564 0.005066 0.007128 0.000496 0.986862 0.005515 0.000668 0.077034 0.031851 0.890447 0.005634 0.972597 0.003422 0.018348 0.006704 0.079656 0.338201 0.575438 0.251088 0.374380 0.275516 0.099015 0.212837 0.280990 0.439192 0.066980 0.146090 0.412753 0.171890 0.269266 0.402445 0.175735 0.256108 0.165713 0.129726 0.243462 0.322735 0.304077 0.171696 0.334148 0.262981 0.231174 0.133594 0.180211 0.044767 0.641428 Consensus sequence: YBVDMGTGGGTGGTCKVVBVBBT Alignment: ABBBBVVRGACCACCCACRDBBM -------RGGCCDGCCTBRRCMY ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00527 Foxn4_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 2 16 0.041662 Species: Mus musculus Original motif 0.298336 0.418632 0.208054 0.074978 0.289907 0.015608 0.457100 0.237385 0.273583 0.077889 0.107860 0.540668 0.184954 0.161611 0.384390 0.269045 0.521826 0.156340 0.089019 0.232815 0.356716 0.131104 0.394857 0.117323 0.266669 0.108765 0.505273 0.119293 0.020778 0.047199 0.919524 0.012500 0.948536 0.018775 0.008113 0.024576 0.010822 0.964042 0.014701 0.010434 0.007428 0.019505 0.966351 0.006717 0.010025 0.975678 0.008648 0.005649 0.043796 0.120935 0.742979 0.092289 0.008252 0.250704 0.541132 0.199913 0.474428 0.044681 0.134430 0.346461 0.146597 0.421317 0.143166 0.288920 0.020540 0.181479 0.553811 0.244170 0.129612 0.173360 0.535219 0.161808 0.506084 0.158156 0.130983 0.204776 0.054872 0.103043 0.545792 0.296293 0.389882 0.171037 0.164162 0.274918 0.225861 0.314031 0.288872 0.171237 Consensus sequence: VDWDARRGACGCGGWHGGAKHV Reverse complement motif 0.225861 0.288872 0.314031 0.171237 0.274918 0.171037 0.164162 0.389882 0.054872 0.545792 0.103043 0.296293 0.204776 0.158156 0.130983 0.506084 0.129612 0.535219 0.173360 0.161808 0.020540 0.553811 0.181479 0.244170 0.146597 0.143166 0.421317 0.288920 0.346461 0.044681 0.134430 0.474428 0.008252 0.541132 0.250704 0.199913 0.043796 0.742979 0.120935 0.092289 0.010025 0.008648 0.975678 0.005649 0.007428 0.966351 0.019505 0.006717 0.010822 0.014701 0.964042 0.010434 0.024576 0.018775 0.008113 0.948536 0.020778 0.919524 0.047199 0.012500 0.266669 0.505273 0.108765 0.119293 0.356716 0.394857 0.131104 0.117323 0.232815 0.156340 0.089019 0.521826 0.184954 0.384390 0.161611 0.269045 0.540668 0.077889 0.107860 0.273583 0.289907 0.457100 0.015608 0.237385 0.298336 0.208054 0.418632 0.074978 Consensus sequence: VHYTCCDWCCGCGTCMMTHWHV Alignment: VDWDARRGACGCGGWHGGAKHV -----MRGMMBAGGCHGGCCK- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 62 Motif name: C062 Original motif 0.540000 0.040000 0.030000 0.390000 0.505051 0.010101 0.060606 0.424242 0.797980 0.010101 0.121212 0.070707 0.570000 0.310000 0.030000 0.090000 0.900990 0.009901 0.019802 0.069307 0.500000 0.010000 0.050000 0.440000 0.540000 0.010000 0.410000 0.040000 0.330000 0.510000 0.120000 0.040000 0.959596 0.010101 0.010101 0.020202 0.400000 0.530000 0.030000 0.040000 0.800000 0.030000 0.160000 0.010000 0.040000 0.460000 0.010000 0.490000 0.474747 0.020202 0.010101 0.494949 0.737374 0.121212 0.010101 0.131313 0.910000 0.050000 0.020000 0.020000 0.360000 0.370000 0.010000 0.260000 0.430000 0.080000 0.020000 0.470000 0.410000 0.090000 0.020000 0.480000 Consensus sequence: WWAMAWRMAMAYWAAHWW Reserve complement motif 0.480000 0.090000 0.020000 0.410000 0.470000 0.080000 0.020000 0.430000 0.360000 0.010000 0.370000 0.260000 0.020000 0.050000 0.020000 0.910000 0.131313 0.121212 0.010101 0.737374 0.494949 0.020202 0.010101 0.474747 0.490000 0.460000 0.010000 0.040000 0.010000 0.030000 0.160000 0.800000 0.400000 0.030000 0.530000 0.040000 0.020202 0.010101 0.010101 0.959596 0.330000 0.120000 0.510000 0.040000 0.040000 0.010000 0.410000 0.540000 0.440000 0.010000 0.050000 0.500000 0.069307 0.009901 0.019802 0.900990 0.090000 0.310000 0.030000 0.570000 0.070707 0.010101 0.121212 0.797980 0.424242 0.010101 0.060606 0.505051 0.390000 0.040000 0.030000 0.540000 Consensus sequence: WWDTTWMTRTRKWTYTWW ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 62 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 4 18 0.049610 Species: Mus musculus Original motif 0.360997 0.300272 0.115555 0.223177 0.309749 0.228429 0.166233 0.295589 0.149419 0.176868 0.240155 0.433558 0.379704 0.095791 0.276373 0.248133 0.394549 0.174184 0.130641 0.300626 0.443749 0.070776 0.211081 0.274393 0.364301 0.074356 0.370406 0.190936 0.791976 0.038475 0.093390 0.076159 0.963721 0.001826 0.002456 0.031997 0.004516 0.954596 0.008092 0.032796 0.981080 0.002062 0.002161 0.014697 0.986185 0.001846 0.006976 0.004992 0.059567 0.003649 0.002189 0.934595 0.495328 0.024257 0.240450 0.239965 0.305027 0.094878 0.526069 0.074025 0.418442 0.196237 0.158323 0.226998 0.336713 0.220452 0.191155 0.251680 0.192296 0.300342 0.169047 0.338315 0.240387 0.144634 0.128513 0.486465 0.290763 0.271259 0.116600 0.321377 0.224825 0.296233 0.229255 0.249687 0.493240 0.171285 0.075148 0.260326 Consensus sequence: HHBDHDDAACAATDRHHHHHBW Reverse complement motif 0.260326 0.171285 0.075148 0.493240 0.224825 0.229255 0.296233 0.249687 0.321377 0.271259 0.116600 0.290763 0.486465 0.144634 0.128513 0.240387 0.338315 0.300342 0.169047 0.192296 0.251680 0.220452 0.191155 0.336713 0.226998 0.196237 0.158323 0.418442 0.305027 0.526069 0.094878 0.074025 0.239965 0.024257 0.240450 0.495328 0.934595 0.003649 0.002189 0.059567 0.004992 0.001846 0.006976 0.986185 0.014697 0.002062 0.002161 0.981080 0.004516 0.008092 0.954596 0.032796 0.031997 0.001826 0.002456 0.963721 0.076159 0.038475 0.093390 0.791976 0.364301 0.370406 0.074356 0.190936 0.274393 0.070776 0.211081 0.443749 0.300626 0.174184 0.130641 0.394549 0.248133 0.095791 0.276373 0.379704 0.433558 0.176868 0.240155 0.149419 0.295589 0.228429 0.166233 0.309749 0.223177 0.300272 0.115555 0.360997 Consensus sequence: WBHHHHHMDATTGTTHDHDVHH Alignment: WBHHHHHMDATTGTTHDHDVHH -WWDTTWMTRTRKWTYTWW--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00032 Gata3_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 4 18 0.061849 Species: Mus musculus Original motif 0.151572 0.262753 0.258275 0.327401 0.221834 0.113385 0.275380 0.389400 0.297769 0.136928 0.134678 0.430625 0.270099 0.110415 0.271106 0.348380 0.265471 0.090253 0.223340 0.420936 0.616582 0.090091 0.171960 0.121367 0.197318 0.107541 0.406904 0.288237 0.798258 0.046950 0.001406 0.153385 0.003195 0.002516 0.989707 0.004582 0.991503 0.002748 0.002617 0.003132 0.005015 0.002764 0.003026 0.989195 0.948394 0.008932 0.001344 0.041330 0.973109 0.004100 0.004081 0.018710 0.040365 0.113905 0.828185 0.017545 0.736608 0.130524 0.113464 0.019404 0.415921 0.106101 0.316613 0.161365 0.376582 0.170927 0.155572 0.296919 0.137731 0.197151 0.211055 0.454064 0.324853 0.122747 0.246107 0.306293 0.462490 0.207311 0.159392 0.170807 0.380420 0.188972 0.311990 0.118618 0.222178 0.157873 0.380486 0.239463 Consensus sequence: BDHDDADAGATAAGADHBDHVD Reverse complement motif 0.222178 0.380486 0.157873 0.239463 0.118618 0.188972 0.311990 0.380420 0.170807 0.207311 0.159392 0.462490 0.306293 0.122747 0.246107 0.324853 0.454064 0.197151 0.211055 0.137731 0.296919 0.170927 0.155572 0.376582 0.161365 0.106101 0.316613 0.415921 0.019404 0.130524 0.113464 0.736608 0.040365 0.828185 0.113905 0.017545 0.018710 0.004100 0.004081 0.973109 0.041330 0.008932 0.001344 0.948394 0.989195 0.002764 0.003026 0.005015 0.003132 0.002748 0.002617 0.991503 0.003195 0.989707 0.002516 0.004582 0.153385 0.046950 0.001406 0.798258 0.197318 0.406904 0.107541 0.288237 0.121367 0.090091 0.171960 0.616582 0.420936 0.090253 0.223340 0.265471 0.348380 0.110415 0.271106 0.270099 0.430625 0.136928 0.134678 0.297769 0.389400 0.113385 0.275380 0.221834 0.327401 0.262753 0.258275 0.151572 Consensus sequence: HBHDVHDTCTTATCTHTDDHDV Alignment: HBHDVHDTCTTATCTHTDDHDV ---WWDTTWMTRTRKWTYTWW- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00528 Foxm1_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 4 18 0.061870 Species: Mus musculus Original motif 0.399785 0.446658 0.111435 0.042122 0.535175 0.103991 0.089706 0.271128 0.078171 0.387987 0.375083 0.158759 0.309001 0.519142 0.070618 0.101239 0.201844 0.255818 0.323149 0.219190 0.534101 0.109845 0.235026 0.121028 0.656038 0.037473 0.261484 0.045006 0.315713 0.164290 0.471815 0.048182 0.651960 0.009412 0.328237 0.010391 0.937365 0.017313 0.007516 0.037807 0.019983 0.044238 0.012387 0.923392 0.061195 0.021485 0.881645 0.035675 0.017521 0.952998 0.013139 0.016342 0.254160 0.029735 0.493023 0.223082 0.239200 0.593324 0.114503 0.052973 0.610822 0.071539 0.099169 0.218470 0.166610 0.389712 0.204400 0.239278 0.227752 0.361626 0.178497 0.232125 0.537030 0.182466 0.026035 0.254470 0.235902 0.151006 0.043788 0.569304 0.081851 0.250397 0.590059 0.077693 0.340417 0.189613 0.272075 0.197895 Consensus sequence: MWSMBAARRATGCDCABHATGD Reverse complement motif 0.197895 0.189613 0.272075 0.340417 0.081851 0.590059 0.250397 0.077693 0.569304 0.151006 0.043788 0.235902 0.254470 0.182466 0.026035 0.537030 0.227752 0.178497 0.361626 0.232125 0.166610 0.204400 0.389712 0.239278 0.218470 0.071539 0.099169 0.610822 0.239200 0.114503 0.593324 0.052973 0.254160 0.493023 0.029735 0.223082 0.017521 0.013139 0.952998 0.016342 0.061195 0.881645 0.021485 0.035675 0.923392 0.044238 0.012387 0.019983 0.037807 0.017313 0.007516 0.937365 0.010391 0.009412 0.328237 0.651960 0.315713 0.471815 0.164290 0.048182 0.045006 0.037473 0.261484 0.656038 0.121028 0.109845 0.235026 0.534101 0.201844 0.323149 0.255818 0.219190 0.309001 0.070618 0.519142 0.101239 0.078171 0.375083 0.387987 0.158759 0.271128 0.103991 0.089706 0.535175 0.399785 0.111435 0.446658 0.042122 Consensus sequence: DCATDBTGHGCATKMTTBRSWR Alignment: MWSMBAARRATGCDCABHATGD -WWAMAWRMAMAYWAAHWW--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 4 18 0.062603 Species: Mus musculus Original motif 0.067627 0.131333 0.654425 0.146615 0.156488 0.114442 0.145630 0.583441 0.206450 0.265630 0.358017 0.169903 0.090729 0.460713 0.274712 0.173847 0.285994 0.099998 0.154485 0.459523 0.635908 0.184787 0.072982 0.106323 0.748421 0.039204 0.092605 0.119769 0.081342 0.061327 0.044532 0.812799 0.143120 0.043879 0.024216 0.788785 0.247544 0.092102 0.621453 0.038901 0.295531 0.036295 0.027594 0.640580 0.194561 0.305468 0.339916 0.160055 0.175038 0.193568 0.101212 0.530182 0.145226 0.167488 0.559871 0.127415 0.271501 0.237429 0.206701 0.284369 0.216834 0.109191 0.569605 0.104370 0.182624 0.177160 0.300475 0.339742 0.331737 0.198645 0.265137 0.204482 0.230155 0.359365 0.183450 0.227029 0.056581 0.067297 0.463052 0.413070 0.198891 0.324626 0.304424 0.172059 0.181968 0.287547 0.202419 0.328066 Consensus sequence: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB Reverse complement motif 0.328066 0.287547 0.202419 0.181968 0.198891 0.304424 0.324626 0.172059 0.056581 0.463052 0.067297 0.413070 0.230155 0.183450 0.359365 0.227029 0.204482 0.198645 0.265137 0.331737 0.339742 0.177160 0.300475 0.182624 0.216834 0.569605 0.109191 0.104370 0.284369 0.237429 0.206701 0.271501 0.145226 0.559871 0.167488 0.127415 0.530182 0.193568 0.101212 0.175038 0.194561 0.339916 0.305468 0.160055 0.640580 0.036295 0.027594 0.295531 0.247544 0.621453 0.092102 0.038901 0.788785 0.043879 0.024216 0.143120 0.812799 0.061327 0.044532 0.081342 0.119769 0.039204 0.092605 0.748421 0.106323 0.184787 0.072982 0.635908 0.459523 0.099998 0.154485 0.285994 0.090729 0.274712 0.460713 0.173847 0.206450 0.358017 0.265630 0.169903 0.583441 0.114442 0.145630 0.156488 0.067627 0.654425 0.131333 0.146615 Consensus sequence: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC Alignment: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC ---WWAMAWRMAMAYWAAHWW- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00032 Gata3_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 2 18 0.065917 Species: Mus musculus Original motif 0.177641 0.319872 0.115137 0.387350 0.136644 0.182137 0.205873 0.475347 0.254263 0.244280 0.165207 0.336250 0.240415 0.207557 0.237497 0.314530 0.271041 0.214702 0.364395 0.149863 0.095475 0.320104 0.191738 0.392682 0.500902 0.142722 0.026556 0.329820 0.051221 0.023698 0.897245 0.027836 0.922410 0.027509 0.024058 0.026023 0.030735 0.070903 0.024248 0.874114 0.242120 0.231992 0.225143 0.300745 0.106956 0.220471 0.283490 0.389083 0.152079 0.165830 0.135066 0.547025 0.839205 0.051581 0.060119 0.049095 0.041204 0.069147 0.070830 0.818819 0.051861 0.848177 0.027599 0.072363 0.383793 0.016807 0.397470 0.201931 0.381899 0.215846 0.255908 0.146347 0.094792 0.358651 0.280905 0.265652 0.296132 0.181545 0.178433 0.343890 0.301997 0.254722 0.108566 0.334714 0.349481 0.270693 0.137507 0.242319 Consensus sequence: HBHDVBWGATHBTATCRVBHHH Reverse complement motif 0.242319 0.270693 0.137507 0.349481 0.334714 0.254722 0.108566 0.301997 0.343890 0.181545 0.178433 0.296132 0.094792 0.280905 0.358651 0.265652 0.146347 0.215846 0.255908 0.381899 0.383793 0.397470 0.016807 0.201931 0.051861 0.027599 0.848177 0.072363 0.818819 0.069147 0.070830 0.041204 0.049095 0.051581 0.060119 0.839205 0.547025 0.165830 0.135066 0.152079 0.389083 0.220471 0.283490 0.106956 0.300745 0.231992 0.225143 0.242120 0.874114 0.070903 0.024248 0.030735 0.026023 0.027509 0.024058 0.922410 0.051221 0.897245 0.023698 0.027836 0.329820 0.142722 0.026556 0.500902 0.392682 0.320104 0.191738 0.095475 0.271041 0.364395 0.214702 0.149863 0.314530 0.207557 0.237497 0.240415 0.336250 0.244280 0.165207 0.254263 0.475347 0.182137 0.205873 0.136644 0.387350 0.319872 0.115137 0.177641 Consensus sequence: HHHBBMGATAVHATCWVVDHVH Alignment: HHHBBMGATAVHATCWVVDHVH ---WWAMAWRMAMAYWAAHWW- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 63 Motif name: C063 Original motif 0.504950 0.287129 0.019802 0.188119 0.623762 0.059406 0.247525 0.069307 0.710000 0.010000 0.210000 0.070000 0.188119 0.039604 0.326733 0.445545 0.500000 0.290000 0.010000 0.200000 0.500000 0.040000 0.010000 0.450000 0.653465 0.009901 0.188119 0.148515 0.750000 0.150000 0.090000 0.010000 0.690000 0.060000 0.240000 0.010000 0.940000 0.010000 0.010000 0.040000 0.520000 0.010000 0.020000 0.450000 0.180000 0.020000 0.330000 0.470000 0.440000 0.310000 0.060000 0.190000 0.720000 0.060000 0.210000 0.010000 0.683168 0.069307 0.178218 0.069307 Consensus sequence: MAAKMWAAAAWKHAA Reserve complement motif 0.069307 0.069307 0.178218 0.683168 0.010000 0.060000 0.210000 0.720000 0.190000 0.310000 0.060000 0.440000 0.470000 0.020000 0.330000 0.180000 0.450000 0.010000 0.020000 0.520000 0.040000 0.010000 0.010000 0.940000 0.010000 0.060000 0.240000 0.690000 0.010000 0.150000 0.090000 0.750000 0.148515 0.009901 0.188119 0.653465 0.450000 0.040000 0.010000 0.500000 0.200000 0.290000 0.010000 0.500000 0.445545 0.039604 0.326733 0.188119 0.070000 0.010000 0.210000 0.710000 0.069307 0.059406 0.247525 0.623762 0.188119 0.287129 0.019802 0.504950 Consensus sequence: TTHRWTTTTWYRTTY ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 63 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00061 Foxl1_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 1 15 0.034446 Species: Mus musculus Original motif 0.560226 0.121586 0.083231 0.234957 0.318077 0.149137 0.179955 0.352831 0.482497 0.118420 0.173594 0.225488 0.200166 0.160901 0.191493 0.447440 0.033691 0.569719 0.018901 0.377690 0.638020 0.166545 0.021254 0.174181 0.573953 0.105729 0.009308 0.311010 0.890518 0.053364 0.013424 0.042694 0.910758 0.028166 0.032648 0.028428 0.013358 0.738707 0.023981 0.223953 0.911783 0.018754 0.031898 0.037564 0.702891 0.068940 0.076823 0.151346 0.445507 0.320769 0.057216 0.176507 0.587798 0.129586 0.140592 0.142024 0.258981 0.330939 0.167334 0.242747 0.362022 0.333796 0.145861 0.158320 Consensus sequence: ADDDYAWAACAAMAHH Reverse complement motif 0.158320 0.333796 0.145861 0.362022 0.258981 0.167334 0.330939 0.242747 0.142024 0.129586 0.140592 0.587798 0.176507 0.320769 0.057216 0.445507 0.151346 0.068940 0.076823 0.702891 0.037564 0.018754 0.031898 0.911783 0.013358 0.023981 0.738707 0.223953 0.028428 0.028166 0.032648 0.910758 0.042694 0.053364 0.013424 0.890518 0.311010 0.105729 0.009308 0.573953 0.174181 0.166545 0.021254 0.638020 0.033691 0.018901 0.569719 0.377690 0.447440 0.160901 0.191493 0.200166 0.225488 0.118420 0.173594 0.482497 0.352831 0.149137 0.179955 0.318077 0.234957 0.121586 0.083231 0.560226 Consensus sequence: HDTYTTGTTWTKDDDT Alignment: HDTYTTGTTWTKDDDT TTHRWTTTTWYRTTY- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00039 Foxj3_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 1 15 0.034515 Species: Mus musculus Original motif 0.317700 0.247432 0.215783 0.219085 0.352303 0.162638 0.230006 0.255053 0.168554 0.301758 0.264712 0.264975 0.529943 0.098389 0.260344 0.111324 0.205868 0.388676 0.197345 0.208111 0.033261 0.853848 0.009029 0.103862 0.673657 0.279649 0.037915 0.008779 0.496326 0.243318 0.006446 0.253910 0.913038 0.037006 0.017077 0.032879 0.948910 0.014865 0.012562 0.023664 0.010919 0.862142 0.009524 0.117414 0.955604 0.012514 0.012289 0.019594 0.409400 0.131244 0.138666 0.320691 0.465036 0.133548 0.065727 0.335688 0.212413 0.103583 0.412294 0.271710 0.182538 0.310768 0.349143 0.157550 0.294233 0.219194 0.238798 0.247776 Consensus sequence: HDBAHCAWAACADWDVD Reverse complement motif 0.247776 0.219194 0.238798 0.294233 0.182538 0.349143 0.310768 0.157550 0.212413 0.412294 0.103583 0.271710 0.335688 0.133548 0.065727 0.465036 0.320691 0.131244 0.138666 0.409400 0.019594 0.012514 0.012289 0.955604 0.010919 0.009524 0.862142 0.117414 0.023664 0.014865 0.012562 0.948910 0.032879 0.037006 0.017077 0.913038 0.253910 0.243318 0.006446 0.496326 0.008779 0.279649 0.037915 0.673657 0.033261 0.009029 0.853848 0.103862 0.205868 0.197345 0.388676 0.208111 0.111324 0.098389 0.260344 0.529943 0.168554 0.264712 0.301758 0.264975 0.255053 0.162638 0.230006 0.352303 0.219085 0.247432 0.215783 0.317700 Consensus sequence: DVHWDTGTTWTGDTBDH Alignment: DVHWDTGTTWTGDTBDH TTHRWTTTTWYRTTY-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00090 Elf3_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 1 15 0.035554 Species: Mus musculus Original motif 0.155083 0.152982 0.490906 0.201030 0.123195 0.312681 0.220770 0.343354 0.110252 0.131358 0.153983 0.604406 0.216489 0.490160 0.101348 0.192003 0.396130 0.292429 0.103252 0.208189 0.634770 0.070898 0.070668 0.223664 0.667102 0.099915 0.067576 0.165407 0.625495 0.095579 0.039353 0.239573 0.717478 0.093228 0.024737 0.164558 0.729965 0.048628 0.024557 0.196850 0.670909 0.118718 0.043692 0.166681 0.689441 0.050145 0.038829 0.221584 0.506735 0.159498 0.095635 0.238132 0.406093 0.298915 0.149902 0.145090 0.193913 0.282078 0.096706 0.427303 0.272324 0.154790 0.262469 0.310417 0.224484 0.458724 0.060144 0.256647 Consensus sequence: DBTHHAAAAAAAAVHDH Reverse complement motif 0.224484 0.060144 0.458724 0.256647 0.310417 0.154790 0.262469 0.272324 0.427303 0.282078 0.096706 0.193913 0.145090 0.298915 0.149902 0.406093 0.238132 0.159498 0.095635 0.506735 0.221584 0.050145 0.038829 0.689441 0.166681 0.118718 0.043692 0.670909 0.196850 0.048628 0.024557 0.729965 0.164558 0.093228 0.024737 0.717478 0.239573 0.095579 0.039353 0.625495 0.165407 0.099915 0.067576 0.667102 0.223664 0.070898 0.070668 0.634770 0.208189 0.292429 0.103252 0.396130 0.216489 0.101348 0.490160 0.192003 0.604406 0.131358 0.153983 0.110252 0.343354 0.312681 0.220770 0.123195 0.155083 0.490906 0.152982 0.201030 Consensus sequence: DDHBTTTTTTTTHDAVH Alignment: DDHBTTTTTTTTHDAVH --TTHRWTTTTWYRTTY ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00255 Dbx1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 15 0.035689 Species: Mus musculus Original motif 0.193358 0.228955 0.160692 0.416995 0.611960 0.068099 0.048494 0.271446 0.459770 0.057385 0.307824 0.175021 0.226103 0.127408 0.101076 0.545413 0.241226 0.228640 0.067165 0.462969 0.621421 0.137382 0.078412 0.162785 0.737972 0.031899 0.051833 0.178295 0.110802 0.098497 0.073668 0.717033 0.129567 0.110629 0.036048 0.723756 0.729342 0.031636 0.088480 0.150541 0.540257 0.104927 0.048065 0.306750 0.195987 0.148698 0.098709 0.556606 0.587529 0.072583 0.170635 0.169252 0.497416 0.161804 0.219409 0.121371 0.278831 0.114362 0.139037 0.467771 0.297462 0.189119 0.187754 0.325665 0.397268 0.140582 0.287428 0.174722 Consensus sequence: HARTHAATTAWTAVDHD Reverse complement motif 0.174722 0.140582 0.287428 0.397268 0.325665 0.189119 0.187754 0.297462 0.467771 0.114362 0.139037 0.278831 0.121371 0.161804 0.219409 0.497416 0.169252 0.072583 0.170635 0.587529 0.556606 0.148698 0.098709 0.195987 0.306750 0.104927 0.048065 0.540257 0.150541 0.031636 0.088480 0.729342 0.723756 0.110629 0.036048 0.129567 0.717033 0.098497 0.073668 0.110802 0.178295 0.031899 0.051833 0.737972 0.162785 0.137382 0.078412 0.621421 0.462969 0.228640 0.067165 0.241226 0.545413 0.127408 0.101076 0.226103 0.175021 0.057385 0.307824 0.459770 0.271446 0.068099 0.048494 0.611960 0.416995 0.228955 0.160692 0.193358 Consensus sequence: DHDBTAWTAATTHAKTH Alignment: DHDBTAWTAATTHAKTH --TTHRWTTTTWYRTTY ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00213 Hoxa9 Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 15 0.036730 Species: Mus musculus Original motif 0.386110 0.122124 0.336396 0.155370 0.214951 0.503652 0.200027 0.081370 0.227199 0.070231 0.558705 0.143864 0.087364 0.155173 0.659970 0.097493 0.088468 0.597073 0.010847 0.303611 0.237567 0.630916 0.020446 0.111071 0.883692 0.003551 0.103622 0.009135 0.022994 0.004161 0.003712 0.969134 0.630635 0.007085 0.003697 0.358584 0.954551 0.003419 0.003818 0.038212 0.932582 0.012322 0.005304 0.049792 0.758713 0.022612 0.031347 0.187327 0.320450 0.163437 0.062031 0.454082 0.174953 0.127720 0.167458 0.529870 0.511837 0.131729 0.146649 0.209785 0.382191 0.090904 0.276475 0.250430 0.383323 0.080173 0.111038 0.425465 Consensus sequence: DCGGYCATWAAAWTADW Reverse complement motif 0.425465 0.080173 0.111038 0.383323 0.250430 0.090904 0.276475 0.382191 0.209785 0.131729 0.146649 0.511837 0.529870 0.127720 0.167458 0.174953 0.454082 0.163437 0.062031 0.320450 0.187327 0.022612 0.031347 0.758713 0.049792 0.012322 0.005304 0.932582 0.038212 0.003419 0.003818 0.954551 0.358584 0.007085 0.003697 0.630635 0.969134 0.004161 0.003712 0.022994 0.009135 0.003551 0.103622 0.883692 0.237567 0.020446 0.630916 0.111071 0.088468 0.010847 0.597073 0.303611 0.087364 0.659970 0.155173 0.097493 0.227199 0.558705 0.070231 0.143864 0.214951 0.200027 0.503652 0.081370 0.155370 0.122124 0.336396 0.386110 Consensus sequence: WDTAWTTTWATGKCCGD Alignment: WDTAWTTTWATGKCCGD TTHRWTTTTWYRTTY-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 64 Motif name: C064 Original motif 0.272727 0.010101 0.272727 0.444444 0.510000 0.250000 0.010000 0.230000 0.643564 0.069307 0.178218 0.108911 0.670000 0.010000 0.310000 0.010000 0.128713 0.039604 0.405941 0.425743 0.620000 0.110000 0.250000 0.020000 0.940000 0.010000 0.040000 0.010000 0.871287 0.009901 0.009901 0.108911 0.623762 0.227723 0.089109 0.059406 0.530000 0.320000 0.010000 0.140000 0.920000 0.060000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.210000 0.010000 0.340000 0.440000 Consensus sequence: DAAAKAAAAMAAK Reserve complement motif 0.440000 0.010000 0.340000 0.210000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.060000 0.010000 0.920000 0.140000 0.320000 0.010000 0.530000 0.059406 0.227723 0.089109 0.623762 0.108911 0.009901 0.009901 0.871287 0.010000 0.010000 0.040000 0.940000 0.020000 0.110000 0.250000 0.620000 0.425743 0.039604 0.405941 0.128713 0.010000 0.010000 0.310000 0.670000 0.108911 0.069307 0.178218 0.643564 0.230000 0.250000 0.010000 0.510000 0.444444 0.010101 0.272727 0.272727 Consensus sequence: RTTYTTTTRTTTD ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 64 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00077 Srf_secondary Reverse Complement Reverse Complement Forward 3 13 0.017516 Species: Mus musculus Original motif 0.162968 0.284828 0.440984 0.111220 0.151392 0.200635 0.205316 0.442657 0.267215 0.083669 0.192498 0.456618 0.332771 0.180711 0.200027 0.286491 0.509370 0.102954 0.242569 0.145107 0.666262 0.077309 0.154466 0.101962 0.737968 0.113335 0.100401 0.048296 0.658878 0.141580 0.134033 0.065510 0.766115 0.094051 0.069763 0.070072 0.755621 0.088491 0.044802 0.111086 0.749083 0.135917 0.047510 0.067490 0.663231 0.176795 0.028134 0.131839 0.553358 0.277659 0.038655 0.130328 0.392578 0.314083 0.209844 0.083495 0.198462 0.237132 0.239466 0.324940 0.275121 0.210087 0.194779 0.320013 0.287748 0.277395 0.142704 0.292154 Consensus sequence: VBDDAAAAAAAAMVBHH Reverse complement motif 0.292154 0.277395 0.142704 0.287748 0.320013 0.210087 0.194779 0.275121 0.324940 0.237132 0.239466 0.198462 0.083495 0.314083 0.209844 0.392578 0.130328 0.277659 0.038655 0.553358 0.131839 0.176795 0.028134 0.663231 0.067490 0.135917 0.047510 0.749083 0.111086 0.088491 0.044802 0.755621 0.070072 0.094051 0.069763 0.766115 0.065510 0.141580 0.134033 0.658878 0.048296 0.113335 0.100401 0.737968 0.101962 0.077309 0.154466 0.666262 0.145107 0.102954 0.242569 0.509370 0.286491 0.180711 0.200027 0.332771 0.456618 0.083669 0.192498 0.267215 0.442657 0.200635 0.205316 0.151392 0.162968 0.440984 0.284828 0.111220 Consensus sequence: HHVBYTTTTTTTTDDVV Alignment: HHVBYTTTTTTTTDDVV --RTTYTTTTRTTTD-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00028 Tcfap2e_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 1 13 0.021009 Species: Mus musculus Original motif 0.248591 0.214386 0.166769 0.370254 0.416041 0.167262 0.218682 0.198015 0.195301 0.542527 0.153042 0.109129 0.240156 0.185228 0.255545 0.319071 0.195809 0.247688 0.280778 0.275725 0.271555 0.129776 0.497286 0.101382 0.738080 0.057879 0.078760 0.125281 0.728876 0.074205 0.092737 0.104182 0.694380 0.084957 0.159476 0.061186 0.665572 0.111592 0.131546 0.091289 0.782384 0.059680 0.047525 0.110411 0.769981 0.105692 0.056467 0.067860 0.402932 0.087712 0.172674 0.336682 0.409485 0.160886 0.229779 0.199850 Consensus sequence: HDCDBRAAAAAADD Reverse complement motif 0.199850 0.160886 0.229779 0.409485 0.336682 0.087712 0.172674 0.402932 0.067860 0.105692 0.056467 0.769981 0.110411 0.059680 0.047525 0.782384 0.091289 0.111592 0.131546 0.665572 0.061186 0.084957 0.159476 0.694380 0.104182 0.074205 0.092737 0.728876 0.125281 0.057879 0.078760 0.738080 0.271555 0.497286 0.129776 0.101382 0.195809 0.280778 0.247688 0.275725 0.319071 0.185228 0.255545 0.240156 0.195301 0.153042 0.542527 0.109129 0.198015 0.167262 0.218682 0.416041 0.370254 0.214386 0.166769 0.248591 Consensus sequence: DDTTTTTTMBDGDH Alignment: HDCDBRAAAAAADD DAAAKAAAAMAAK- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00025 Foxk1_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 1 13 0.030589 Species: Mus musculus Original motif 0.240753 0.425595 0.141281 0.192371 0.367715 0.247224 0.117353 0.267708 0.489169 0.220343 0.113844 0.176644 0.742256 0.042809 0.146704 0.068231 0.078936 0.546144 0.032328 0.342592 0.588419 0.293580 0.082117 0.035885 0.913924 0.026256 0.050778 0.009042 0.009007 0.565680 0.010683 0.414630 0.947562 0.020878 0.018821 0.012739 0.901384 0.021519 0.030204 0.046893 0.077157 0.797900 0.026432 0.098511 0.824314 0.040128 0.051910 0.083648 0.254436 0.342235 0.143789 0.259539 0.319400 0.338163 0.129746 0.212691 0.231014 0.260719 0.169042 0.339225 Consensus sequence: HHHAYAAYAACAHHH Reverse complement motif 0.339225 0.260719 0.169042 0.231014 0.319400 0.129746 0.338163 0.212691 0.254436 0.143789 0.342235 0.259539 0.083648 0.040128 0.051910 0.824314 0.077157 0.026432 0.797900 0.098511 0.046893 0.021519 0.030204 0.901384 0.012739 0.020878 0.018821 0.947562 0.009007 0.010683 0.565680 0.414630 0.009042 0.026256 0.050778 0.913924 0.035885 0.293580 0.082117 0.588419 0.078936 0.032328 0.546144 0.342592 0.068231 0.042809 0.146704 0.742256 0.176644 0.220343 0.113844 0.489169 0.267708 0.247224 0.117353 0.367715 0.240753 0.141281 0.425595 0.192371 Consensus sequence: HDDTGTTKTTKTHHD Alignment: HDDTGTTKTTKTHHD --RTTYTTTTRTTTD ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00090 Elf3_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 4 13 0.032231 Species: Mus musculus Original motif 0.155083 0.152982 0.490906 0.201030 0.123195 0.312681 0.220770 0.343354 0.110252 0.131358 0.153983 0.604406 0.216489 0.490160 0.101348 0.192003 0.396130 0.292429 0.103252 0.208189 0.634770 0.070898 0.070668 0.223664 0.667102 0.099915 0.067576 0.165407 0.625495 0.095579 0.039353 0.239573 0.717478 0.093228 0.024737 0.164558 0.729965 0.048628 0.024557 0.196850 0.670909 0.118718 0.043692 0.166681 0.689441 0.050145 0.038829 0.221584 0.506735 0.159498 0.095635 0.238132 0.406093 0.298915 0.149902 0.145090 0.193913 0.282078 0.096706 0.427303 0.272324 0.154790 0.262469 0.310417 0.224484 0.458724 0.060144 0.256647 Consensus sequence: DBTHHAAAAAAAAVHDH Reverse complement motif 0.224484 0.060144 0.458724 0.256647 0.310417 0.154790 0.262469 0.272324 0.427303 0.282078 0.096706 0.193913 0.145090 0.298915 0.149902 0.406093 0.238132 0.159498 0.095635 0.506735 0.221584 0.050145 0.038829 0.689441 0.166681 0.118718 0.043692 0.670909 0.196850 0.048628 0.024557 0.729965 0.164558 0.093228 0.024737 0.717478 0.239573 0.095579 0.039353 0.625495 0.165407 0.099915 0.067576 0.667102 0.223664 0.070898 0.070668 0.634770 0.208189 0.292429 0.103252 0.396130 0.216489 0.101348 0.490160 0.192003 0.604406 0.131358 0.153983 0.110252 0.343354 0.312681 0.220770 0.123195 0.155083 0.490906 0.152982 0.201030 Consensus sequence: DDHBTTTTTTTTHDAVH Alignment: DDHBTTTTTTTTHDAVH -RTTYTTTTRTTTD--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00180 Hoxd13 Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 13 0.032652 Species: Mus musculus Original motif 0.279189 0.316791 0.190404 0.213616 0.297705 0.175638 0.191020 0.335637 0.333485 0.203858 0.174034 0.288623 0.046444 0.540349 0.083237 0.329969 0.016780 0.648667 0.003870 0.330682 0.679959 0.116873 0.002745 0.200422 0.936496 0.002013 0.026876 0.034615 0.004741 0.008734 0.003861 0.982665 0.904624 0.000869 0.005345 0.089162 0.967883 0.002295 0.001003 0.028819 0.980087 0.004768 0.002887 0.012258 0.898523 0.041633 0.022776 0.037069 0.246903 0.292446 0.069240 0.391411 0.192528 0.300908 0.105655 0.400908 0.247610 0.343317 0.190760 0.218313 0.246702 0.253595 0.176298 0.323404 Consensus sequence: HDHYYAATAAAAHHHH Reverse complement motif 0.323404 0.253595 0.176298 0.246702 0.247610 0.190760 0.343317 0.218313 0.400908 0.300908 0.105655 0.192528 0.391411 0.292446 0.069240 0.246903 0.037069 0.041633 0.022776 0.898523 0.012258 0.004768 0.002887 0.980087 0.028819 0.002295 0.001003 0.967883 0.089162 0.000869 0.005345 0.904624 0.982665 0.008734 0.003861 0.004741 0.034615 0.002013 0.026876 0.936496 0.200422 0.116873 0.002745 0.679959 0.016780 0.003870 0.648667 0.330682 0.046444 0.083237 0.540349 0.329969 0.288623 0.203858 0.174034 0.333485 0.335637 0.175638 0.191020 0.297705 0.279189 0.190404 0.316791 0.213616 Consensus sequence: HDHHTTTTATTKKHDD Alignment: HDHHTTTTATTKKHDD ---RTTYTTTTRTTTD ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 65 Motif name: C065 Original motif 0.435644 0.504950 0.049505 0.009901 0.070000 0.560000 0.330000 0.040000 0.030000 0.010000 0.010000 0.950000 0.009901 0.148515 0.831683 0.009901 0.841584 0.009901 0.138614 0.009901 0.118812 0.138614 0.693069 0.049505 0.450000 0.050000 0.020000 0.480000 0.079208 0.059406 0.009901 0.851485 0.070000 0.910000 0.010000 0.010000 0.400000 0.550000 0.040000 0.010000 0.920000 0.010000 0.010000 0.060000 0.089109 0.336634 0.534653 0.039604 0.049505 0.029703 0.495050 0.425743 Consensus sequence: MSTGAGWTCMASK Reserve complement motif 0.049505 0.495050 0.029703 0.425743 0.089109 0.534653 0.336634 0.039604 0.060000 0.010000 0.010000 0.920000 0.400000 0.040000 0.550000 0.010000 0.070000 0.010000 0.910000 0.010000 0.851485 0.059406 0.009901 0.079208 0.480000 0.050000 0.020000 0.450000 0.118812 0.693069 0.138614 0.049505 0.009901 0.009901 0.138614 0.841584 0.009901 0.831683 0.148515 0.009901 0.950000 0.010000 0.010000 0.030000 0.070000 0.330000 0.560000 0.040000 0.435644 0.049505 0.504950 0.009901 Consensus sequence: YSTRGAWCTCASR ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 65 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00080 Gata5_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 3 13 0.014418 Species: Mus musculus Original motif 0.296956 0.225759 0.366964 0.110320 0.363955 0.287909 0.178199 0.169937 0.167366 0.353513 0.235266 0.243855 0.362045 0.255289 0.159993 0.222674 0.280070 0.083717 0.491243 0.144971 0.856104 0.068327 0.034504 0.041065 0.063256 0.017187 0.849623 0.069934 0.916053 0.035900 0.039485 0.008562 0.025896 0.011964 0.054314 0.907826 0.827706 0.129092 0.013351 0.029850 0.048301 0.029514 0.118868 0.803318 0.069245 0.824881 0.022797 0.083077 0.508319 0.034384 0.109239 0.348058 0.228736 0.146771 0.436716 0.187777 0.183599 0.289339 0.157455 0.369607 0.174967 0.268426 0.275078 0.281528 0.136843 0.155950 0.346111 0.361096 Consensus sequence: VVBHRAGATATCWDHBB Reverse complement motif 0.361096 0.155950 0.346111 0.136843 0.281528 0.268426 0.275078 0.174967 0.369607 0.289339 0.157455 0.183599 0.228736 0.436716 0.146771 0.187777 0.348058 0.034384 0.109239 0.508319 0.069245 0.022797 0.824881 0.083077 0.803318 0.029514 0.118868 0.048301 0.029850 0.129092 0.013351 0.827706 0.907826 0.011964 0.054314 0.025896 0.008562 0.035900 0.039485 0.916053 0.063256 0.849623 0.017187 0.069934 0.041065 0.068327 0.034504 0.856104 0.280070 0.491243 0.083717 0.144971 0.222674 0.255289 0.159993 0.362045 0.167366 0.235266 0.353513 0.243855 0.169937 0.287909 0.178199 0.363955 0.296956 0.366964 0.225759 0.110320 Consensus sequence: VVHHWGATATCTMHBBV Alignment: VVHHWGATATCTMHBBV --MSTGAGWTCMASK-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00148 Hdx Reverse Complement Original Motif Backward 4 13 0.016022 Species: Mus musculus Original motif 0.311640 0.203273 0.213311 0.271776 0.341055 0.177799 0.257310 0.223836 0.047573 0.089551 0.516163 0.346713 0.195776 0.119326 0.352322 0.332576 0.295379 0.306027 0.157574 0.241020 0.213770 0.018770 0.724927 0.042533 0.702123 0.228608 0.050137 0.019133 0.826735 0.011735 0.061646 0.099884 0.920071 0.005458 0.026253 0.048218 0.018655 0.024240 0.028915 0.928190 0.029929 0.896758 0.043300 0.030013 0.864548 0.044943 0.013744 0.076766 0.177175 0.216931 0.155519 0.450375 0.228403 0.325164 0.203649 0.242785 0.140135 0.298665 0.306153 0.255047 0.338324 0.345500 0.057864 0.258313 0.402538 0.228867 0.191777 0.176818 Consensus sequence: DDKDHGAAATCAHHBHV Reverse complement motif 0.176818 0.228867 0.191777 0.402538 0.338324 0.057864 0.345500 0.258313 0.140135 0.306153 0.298665 0.255047 0.228403 0.203649 0.325164 0.242785 0.450375 0.216931 0.155519 0.177175 0.076766 0.044943 0.013744 0.864548 0.029929 0.043300 0.896758 0.030013 0.928190 0.024240 0.028915 0.018655 0.048218 0.005458 0.026253 0.920071 0.099884 0.011735 0.061646 0.826735 0.019133 0.228608 0.050137 0.702123 0.213770 0.724927 0.018770 0.042533 0.295379 0.157574 0.306027 0.241020 0.195776 0.352322 0.119326 0.332576 0.047573 0.516163 0.089551 0.346713 0.223836 0.177799 0.257310 0.341055 0.271776 0.203273 0.213311 0.311640 Consensus sequence: BDBDHTGATTTCDHYDD Alignment: DDKDHGAAATCAHHBHV -YSTRGAWCTCASR--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00066 Hnf4a_primary Original Motif Original Motif Forward 3 13 0.018819 Species: Mus musculus Original motif 0.223704 0.280688 0.251889 0.243719 0.198683 0.190981 0.267970 0.342366 0.150012 0.319579 0.206063 0.324347 0.274896 0.302572 0.238597 0.183935 0.438853 0.331148 0.021186 0.208812 0.133937 0.027342 0.832490 0.006231 0.141462 0.002336 0.854359 0.001843 0.003464 0.000753 0.987433 0.008349 0.004388 0.000692 0.884494 0.110426 0.003808 0.001605 0.016793 0.977794 0.001992 0.976605 0.003739 0.017664 0.881237 0.089981 0.026017 0.002764 0.735041 0.106592 0.083260 0.075107 0.164419 0.315518 0.181031 0.339032 0.228285 0.176364 0.157583 0.437768 0.233407 0.193567 0.327076 0.245951 0.320479 0.312566 0.195701 0.171254 Consensus sequence: BDBVMGGGGTCAABHDV Reverse complement motif 0.171254 0.312566 0.195701 0.320479 0.233407 0.327076 0.193567 0.245951 0.437768 0.176364 0.157583 0.228285 0.339032 0.315518 0.181031 0.164419 0.075107 0.106592 0.083260 0.735041 0.002764 0.089981 0.026017 0.881237 0.001992 0.003739 0.976605 0.017664 0.977794 0.001605 0.016793 0.003808 0.004388 0.884494 0.000692 0.110426 0.003464 0.987433 0.000753 0.008349 0.141462 0.854359 0.002336 0.001843 0.133937 0.832490 0.027342 0.006231 0.208812 0.331148 0.021186 0.438853 0.274896 0.238597 0.302572 0.183935 0.324347 0.319579 0.206063 0.150012 0.342366 0.190981 0.267970 0.198683 0.223704 0.251889 0.280688 0.243719 Consensus sequence: BHHVTTGACCCCYVVDB Alignment: BDBVMGGGGTCAABHDV --MSTGAGWTCMASK-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00020 Atf1_primary Original Motif Reverse Complement Forward 3 13 0.022458 Species: Mus musculus Original motif 0.381335 0.135129 0.244887 0.238648 0.139538 0.419619 0.195665 0.245178 0.158070 0.098493 0.409974 0.333462 0.472756 0.096594 0.388246 0.042403 0.008868 0.028811 0.005332 0.956990 0.014102 0.014269 0.863476 0.108153 0.962594 0.004653 0.011816 0.020937 0.003091 0.949099 0.003165 0.044646 0.044646 0.003165 0.949099 0.003091 0.020937 0.011816 0.004653 0.962594 0.108153 0.863476 0.014269 0.014102 0.956990 0.005332 0.028811 0.008868 0.049761 0.357863 0.144826 0.447550 0.225769 0.448432 0.142340 0.183460 0.264766 0.097627 0.493031 0.144576 0.352319 0.180279 0.236767 0.230635 Consensus sequence: DBDRTGACGTCAYHRD Reverse complement motif 0.230635 0.180279 0.236767 0.352319 0.264766 0.493031 0.097627 0.144576 0.225769 0.142340 0.448432 0.183460 0.447550 0.357863 0.144826 0.049761 0.008868 0.005332 0.028811 0.956990 0.108153 0.014269 0.863476 0.014102 0.962594 0.011816 0.004653 0.020937 0.044646 0.949099 0.003165 0.003091 0.003091 0.003165 0.949099 0.044646 0.020937 0.004653 0.011816 0.962594 0.014102 0.863476 0.014269 0.108153 0.956990 0.028811 0.005332 0.008868 0.042403 0.096594 0.388246 0.472756 0.158070 0.409974 0.098493 0.333462 0.139538 0.195665 0.419619 0.245178 0.238648 0.135129 0.244887 0.381335 Consensus sequence: DMDMTGACGTCAKHBD Alignment: DMDMTGACGTCAKHBD --MSTGAGWTCMASK- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00054 Tcf7_primary Reverse Complement Original Motif Backward 5 13 0.023228 Species: Mus musculus Original motif 0.170811 0.196976 0.220503 0.411710 0.337231 0.228482 0.140137 0.294150 0.299312 0.173780 0.143426 0.383481 0.603957 0.053557 0.128214 0.214271 0.036338 0.377925 0.534647 0.051091 0.725865 0.010314 0.008501 0.255320 0.067855 0.007849 0.004559 0.919737 0.049387 0.815496 0.098330 0.036787 0.960514 0.005036 0.005137 0.029313 0.960631 0.004550 0.018815 0.016004 0.935245 0.005169 0.023866 0.035720 0.159760 0.060340 0.761341 0.018559 0.228534 0.153897 0.523052 0.094517 0.557984 0.123512 0.254154 0.064350 0.490252 0.211976 0.124557 0.173215 0.310463 0.250279 0.132612 0.306646 0.332720 0.248937 0.120633 0.297711 Consensus sequence: BHHASATCAAAGGAHHH Reverse complement motif 0.297711 0.248937 0.120633 0.332720 0.306646 0.250279 0.132612 0.310463 0.173215 0.211976 0.124557 0.490252 0.064350 0.123512 0.254154 0.557984 0.228534 0.523052 0.153897 0.094517 0.159760 0.761341 0.060340 0.018559 0.035720 0.005169 0.023866 0.935245 0.016004 0.004550 0.018815 0.960631 0.029313 0.005036 0.005137 0.960514 0.049387 0.098330 0.815496 0.036787 0.919737 0.007849 0.004559 0.067855 0.255320 0.010314 0.008501 0.725865 0.036338 0.534647 0.377925 0.051091 0.214271 0.053557 0.128214 0.603957 0.383481 0.173780 0.143426 0.299312 0.294150 0.228482 0.140137 0.337231 0.411710 0.196976 0.220503 0.170811 Consensus sequence: HHHTCCTTTGATSTHHV Alignment: BHHASATCAAAGGAHHH YSTRGAWCTCASR---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 66 Motif name: C066 Original motif 0.340000 0.460000 0.070000 0.130000 0.720000 0.010000 0.230000 0.040000 0.390000 0.460000 0.070000 0.080000 0.080000 0.210000 0.070000 0.640000 0.010000 0.890000 0.010000 0.090000 0.010000 0.720000 0.010000 0.260000 0.188119 0.504950 0.138614 0.168317 0.490000 0.470000 0.010000 0.030000 0.039604 0.524752 0.425743 0.009901 0.010000 0.010000 0.430000 0.550000 0.150000 0.150000 0.600000 0.100000 0.009901 0.851485 0.009901 0.128713 0.009901 0.881188 0.009901 0.099010 0.009901 0.118812 0.009901 0.861386 0.010000 0.910000 0.060000 0.020000 0.010000 0.240000 0.010000 0.740000 0.010000 0.090000 0.520000 0.380000 Consensus sequence: MAMTCCCMSKGCCTCTK Reserve complement motif 0.010000 0.520000 0.090000 0.380000 0.740000 0.240000 0.010000 0.010000 0.010000 0.060000 0.910000 0.020000 0.861386 0.118812 0.009901 0.009901 0.009901 0.009901 0.881188 0.099010 0.009901 0.009901 0.851485 0.128713 0.150000 0.600000 0.150000 0.100000 0.550000 0.010000 0.430000 0.010000 0.039604 0.425743 0.524752 0.009901 0.030000 0.470000 0.010000 0.490000 0.188119 0.138614 0.504950 0.168317 0.010000 0.010000 0.720000 0.260000 0.010000 0.010000 0.890000 0.090000 0.640000 0.210000 0.070000 0.080000 0.390000 0.070000 0.460000 0.080000 0.040000 0.010000 0.230000 0.720000 0.340000 0.070000 0.460000 0.130000 Consensus sequence: YAGAGGCRSYGGGARTR ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 66 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00527 Foxn4_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 6 17 0.038080 Species: Mus musculus Original motif 0.298336 0.418632 0.208054 0.074978 0.289907 0.015608 0.457100 0.237385 0.273583 0.077889 0.107860 0.540668 0.184954 0.161611 0.384390 0.269045 0.521826 0.156340 0.089019 0.232815 0.356716 0.131104 0.394857 0.117323 0.266669 0.108765 0.505273 0.119293 0.020778 0.047199 0.919524 0.012500 0.948536 0.018775 0.008113 0.024576 0.010822 0.964042 0.014701 0.010434 0.007428 0.019505 0.966351 0.006717 0.010025 0.975678 0.008648 0.005649 0.043796 0.120935 0.742979 0.092289 0.008252 0.250704 0.541132 0.199913 0.474428 0.044681 0.134430 0.346461 0.146597 0.421317 0.143166 0.288920 0.020540 0.181479 0.553811 0.244170 0.129612 0.173360 0.535219 0.161808 0.506084 0.158156 0.130983 0.204776 0.054872 0.103043 0.545792 0.296293 0.389882 0.171037 0.164162 0.274918 0.225861 0.314031 0.288872 0.171237 Consensus sequence: VDWDARRGACGCGGWHGGAKHV Reverse complement motif 0.225861 0.288872 0.314031 0.171237 0.274918 0.171037 0.164162 0.389882 0.054872 0.545792 0.103043 0.296293 0.204776 0.158156 0.130983 0.506084 0.129612 0.535219 0.173360 0.161808 0.020540 0.553811 0.181479 0.244170 0.146597 0.143166 0.421317 0.288920 0.346461 0.044681 0.134430 0.474428 0.008252 0.541132 0.250704 0.199913 0.043796 0.742979 0.120935 0.092289 0.010025 0.008648 0.975678 0.005649 0.007428 0.966351 0.019505 0.006717 0.010822 0.014701 0.964042 0.010434 0.024576 0.018775 0.008113 0.948536 0.020778 0.919524 0.047199 0.012500 0.266669 0.505273 0.108765 0.119293 0.356716 0.394857 0.131104 0.117323 0.232815 0.156340 0.089019 0.521826 0.184954 0.384390 0.161611 0.269045 0.540668 0.077889 0.107860 0.273583 0.289907 0.457100 0.015608 0.237385 0.298336 0.208054 0.418632 0.074978 Consensus sequence: VHYTCCDWCCGCGTCMMTHWHV Alignment: VDWDARRGACGCGGWHGGAKHV -----YAGAGGCRSYGGGARTR ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 4 17 0.049922 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB ---YAGAGGCRSYGGGARTR--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00033 Zfp410_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 1 17 0.051056 Species: Mus musculus Original motif 0.162979 0.284781 0.237433 0.314807 0.182449 0.447584 0.069464 0.300502 0.298973 0.261014 0.213211 0.226802 0.136039 0.433062 0.144274 0.286625 0.180084 0.395933 0.158565 0.265418 0.069354 0.748510 0.068898 0.113238 0.060485 0.717828 0.075333 0.146354 0.023280 0.071762 0.645500 0.259457 0.166896 0.749762 0.062730 0.020612 0.050401 0.775248 0.089072 0.085279 0.103847 0.767557 0.068804 0.059791 0.064815 0.748318 0.114588 0.072280 0.340921 0.071942 0.242981 0.344157 0.301967 0.263512 0.165927 0.268594 0.479800 0.222955 0.118441 0.178803 0.229469 0.283621 0.143099 0.343811 0.261733 0.180191 0.169905 0.388170 Consensus sequence: BHHBHCCGCCCCDHHHH Reverse complement motif 0.388170 0.180191 0.169905 0.261733 0.343811 0.283621 0.143099 0.229469 0.178803 0.222955 0.118441 0.479800 0.268594 0.263512 0.165927 0.301967 0.344157 0.071942 0.242981 0.340921 0.064815 0.114588 0.748318 0.072280 0.103847 0.068804 0.767557 0.059791 0.050401 0.089072 0.775248 0.085279 0.166896 0.062730 0.749762 0.020612 0.023280 0.645500 0.071762 0.259457 0.060485 0.075333 0.717828 0.146354 0.069354 0.068898 0.748510 0.113238 0.180084 0.158565 0.395933 0.265418 0.136039 0.144274 0.433062 0.286625 0.226802 0.261014 0.213211 0.298973 0.182449 0.069464 0.447584 0.300502 0.314807 0.284781 0.237433 0.162979 Consensus sequence: HHHHDGGGGCGGDBHDV Alignment: HHHHDGGGGCGGDBHDV YAGAGGCRSYGGGARTR ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 4 17 0.051710 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV ---YAGAGGCRSYGGGARTR--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 3 17 0.052221 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK --YAGAGGCRSYGGGARTR--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 67 Motif name: C067 Original motif 0.510000 0.170000 0.010000 0.310000 0.270000 0.010000 0.250000 0.470000 0.860000 0.010000 0.020000 0.110000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.524752 0.227723 0.049505 0.198020 0.623762 0.227723 0.099010 0.049505 0.841584 0.019802 0.108911 0.029703 0.851485 0.009901 0.128713 0.009901 0.570000 0.050000 0.300000 0.080000 0.170000 0.040000 0.340000 0.450000 0.574257 0.207921 0.207921 0.009901 0.730000 0.020000 0.240000 0.010000 0.585859 0.151515 0.010101 0.252525 0.280000 0.010000 0.250000 0.460000 Consensus sequence: WDAAAAAARKAAAD Reserve complement motif 0.460000 0.010000 0.250000 0.280000 0.252525 0.151515 0.010101 0.585859 0.010000 0.020000 0.240000 0.730000 0.009901 0.207921 0.207921 0.574257 0.450000 0.040000 0.340000 0.170000 0.080000 0.050000 0.300000 0.570000 0.009901 0.009901 0.128713 0.851485 0.029703 0.019802 0.108911 0.841584 0.049505 0.227723 0.099010 0.623762 0.198020 0.227723 0.049505 0.524752 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.110000 0.010000 0.020000 0.860000 0.470000 0.010000 0.250000 0.270000 0.310000 0.170000 0.010000 0.510000 Consensus sequence: DTTTRKTTTTTTDW ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 67 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00077 Srf_secondary Original Motif Original Motif Backward 1 14 0.023278 Species: Mus musculus Original motif 0.162968 0.284828 0.440984 0.111220 0.151392 0.200635 0.205316 0.442657 0.267215 0.083669 0.192498 0.456618 0.332771 0.180711 0.200027 0.286491 0.509370 0.102954 0.242569 0.145107 0.666262 0.077309 0.154466 0.101962 0.737968 0.113335 0.100401 0.048296 0.658878 0.141580 0.134033 0.065510 0.766115 0.094051 0.069763 0.070072 0.755621 0.088491 0.044802 0.111086 0.749083 0.135917 0.047510 0.067490 0.663231 0.176795 0.028134 0.131839 0.553358 0.277659 0.038655 0.130328 0.392578 0.314083 0.209844 0.083495 0.198462 0.237132 0.239466 0.324940 0.275121 0.210087 0.194779 0.320013 0.287748 0.277395 0.142704 0.292154 Consensus sequence: VBDDAAAAAAAAMVBHH Reverse complement motif 0.292154 0.277395 0.142704 0.287748 0.320013 0.210087 0.194779 0.275121 0.324940 0.237132 0.239466 0.198462 0.083495 0.314083 0.209844 0.392578 0.130328 0.277659 0.038655 0.553358 0.131839 0.176795 0.028134 0.663231 0.067490 0.135917 0.047510 0.749083 0.111086 0.088491 0.044802 0.755621 0.070072 0.094051 0.069763 0.766115 0.065510 0.141580 0.134033 0.658878 0.048296 0.113335 0.100401 0.737968 0.101962 0.077309 0.154466 0.666262 0.145107 0.102954 0.242569 0.509370 0.286491 0.180711 0.200027 0.332771 0.456618 0.083669 0.192498 0.267215 0.442657 0.200635 0.205316 0.151392 0.162968 0.440984 0.284828 0.111220 Consensus sequence: HHVBYTTTTTTTTDDVV Alignment: VBDDAAAAAAAAMVBHH ---WDAAAAAARKAAAD ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00037 Zfp105_primaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 14 0.026372 Species: Mus musculus Original motif 0.363104 0.182807 0.145232 0.308856 0.419707 0.133742 0.222546 0.224005 0.164481 0.418263 0.052397 0.364858 0.715575 0.117639 0.064914 0.101872 0.883836 0.026985 0.032584 0.056596 0.558797 0.151280 0.033120 0.256803 0.267037 0.403488 0.026746 0.302729 0.939762 0.013627 0.034579 0.012032 0.897072 0.009878 0.035642 0.057408 0.305904 0.516040 0.055311 0.122746 0.880940 0.027958 0.048350 0.042752 0.710082 0.052464 0.040250 0.197204 0.246712 0.125155 0.318627 0.309506 0.429749 0.181755 0.176892 0.211603 0.339643 0.097216 0.355250 0.207891 Consensus sequence: HDYAAAHAAMAADHD Reverse complement motif 0.339643 0.355250 0.097216 0.207891 0.211603 0.181755 0.176892 0.429749 0.246712 0.318627 0.125155 0.309506 0.197204 0.052464 0.040250 0.710082 0.042752 0.027958 0.048350 0.880940 0.305904 0.055311 0.516040 0.122746 0.057408 0.009878 0.035642 0.897072 0.012032 0.013627 0.034579 0.939762 0.267037 0.026746 0.403488 0.302729 0.256803 0.151280 0.033120 0.558797 0.056596 0.026985 0.032584 0.883836 0.101872 0.117639 0.064914 0.715575 0.164481 0.052397 0.418263 0.364858 0.224005 0.133742 0.222546 0.419707 0.308856 0.182807 0.145232 0.363104 Consensus sequence: HHHTTRTTDTTTKDH Alignment: HDYAAAHAAMAADHD -WDAAAAAARKAAAD ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00014 Sox17_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 2 14 0.030154 Species: Mus musculus Original motif 0.384811 0.284700 0.175936 0.154553 0.309402 0.148547 0.182807 0.359244 0.481080 0.063522 0.236227 0.219171 0.767683 0.076339 0.078689 0.077290 0.721907 0.020423 0.021208 0.236461 0.015843 0.855728 0.037803 0.090627 0.946041 0.014076 0.006202 0.033681 0.968744 0.003602 0.010784 0.016871 0.019919 0.012714 0.005072 0.962296 0.184775 0.020594 0.079338 0.715293 0.391691 0.169606 0.345342 0.093361 0.686419 0.086126 0.077592 0.149862 0.416935 0.101839 0.062848 0.418379 0.272943 0.305787 0.124571 0.296700 0.388624 0.124150 0.177104 0.310122 Consensus sequence: VDDAACAATTVAWHD Reverse complement motif 0.310122 0.124150 0.177104 0.388624 0.272943 0.124571 0.305787 0.296700 0.418379 0.101839 0.062848 0.416935 0.149862 0.086126 0.077592 0.686419 0.093361 0.169606 0.345342 0.391691 0.715293 0.020594 0.079338 0.184775 0.962296 0.012714 0.005072 0.019919 0.016871 0.003602 0.010784 0.968744 0.033681 0.014076 0.006202 0.946041 0.015843 0.037803 0.855728 0.090627 0.236461 0.020423 0.021208 0.721907 0.077290 0.076339 0.078689 0.767683 0.219171 0.063522 0.236227 0.481080 0.359244 0.148547 0.182807 0.309402 0.154553 0.284700 0.175936 0.384811 Consensus sequence: DDWTBAATTGTTDDB Alignment: DDWTBAATTGTTDDB -DTTTRKTTTTTTDW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00062 Sox4_primary Original Motif Original Motif Forward 4 14 0.030750 Species: Mus musculus Original motif 0.427843 0.231210 0.119424 0.221523 0.196506 0.239531 0.304906 0.259057 0.302488 0.156922 0.290190 0.250401 0.433872 0.149126 0.196496 0.220506 0.258426 0.076511 0.475100 0.189963 0.841714 0.046453 0.099915 0.011918 0.983853 0.001612 0.001362 0.013174 0.003460 0.982032 0.005728 0.008780 0.989743 0.002253 0.002020 0.005984 0.990761 0.003397 0.002843 0.003000 0.770864 0.003540 0.001549 0.224048 0.235342 0.002598 0.757383 0.004677 0.371426 0.089574 0.529959 0.009040 0.480804 0.196949 0.240413 0.081833 0.187158 0.355102 0.216599 0.241142 0.248006 0.232182 0.157452 0.362360 0.403367 0.177684 0.164649 0.254300 Consensus sequence: HBDDDAACAAAGRVBHH Reverse complement motif 0.254300 0.177684 0.164649 0.403367 0.362360 0.232182 0.157452 0.248006 0.187158 0.216599 0.355102 0.241142 0.081833 0.196949 0.240413 0.480804 0.371426 0.529959 0.089574 0.009040 0.235342 0.757383 0.002598 0.004677 0.224048 0.003540 0.001549 0.770864 0.003000 0.003397 0.002843 0.990761 0.005984 0.002253 0.002020 0.989743 0.003460 0.005728 0.982032 0.008780 0.013174 0.001612 0.001362 0.983853 0.011918 0.046453 0.099915 0.841714 0.258426 0.475100 0.076511 0.189963 0.220506 0.149126 0.196496 0.433872 0.250401 0.156922 0.290190 0.302488 0.196506 0.304906 0.239531 0.259057 0.221523 0.231210 0.119424 0.427843 Consensus sequence: HHBBMCTTTGTTHDDBH Alignment: HBDDDAACAAAGRVBHH ---WDAAAAAARKAAAD ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00030 Sox11_primary Original Motif Original Motif Forward 4 14 0.031296 Species: Mus musculus Original motif 0.351812 0.238467 0.143954 0.265768 0.195246 0.235838 0.281473 0.287443 0.349478 0.172616 0.210739 0.267167 0.484061 0.110438 0.173131 0.232370 0.276692 0.070713 0.479604 0.172991 0.859124 0.044167 0.083951 0.012758 0.975608 0.002029 0.002285 0.020079 0.006422 0.978485 0.007124 0.007969 0.987489 0.003025 0.002868 0.006617 0.987739 0.005463 0.002730 0.004067 0.693013 0.004067 0.002445 0.300475 0.189100 0.003677 0.801408 0.005814 0.352090 0.072517 0.567737 0.007656 0.542316 0.176545 0.192768 0.088371 0.196382 0.304176 0.205985 0.293457 0.289415 0.201358 0.182937 0.326290 0.385801 0.216362 0.152363 0.245475 Consensus sequence: HBDDRAACAAAGRABHH Reverse complement motif 0.245475 0.216362 0.152363 0.385801 0.326290 0.201358 0.182937 0.289415 0.196382 0.205985 0.304176 0.293457 0.088371 0.176545 0.192768 0.542316 0.352090 0.567737 0.072517 0.007656 0.189100 0.801408 0.003677 0.005814 0.300475 0.004067 0.002445 0.693013 0.004067 0.005463 0.002730 0.987739 0.006617 0.003025 0.002868 0.987489 0.006422 0.007124 0.978485 0.007969 0.020079 0.002029 0.002285 0.975608 0.012758 0.044167 0.083951 0.859124 0.276692 0.479604 0.070713 0.172991 0.232370 0.110438 0.173131 0.484061 0.267167 0.172616 0.210739 0.349478 0.287443 0.235838 0.281473 0.195246 0.265768 0.238467 0.143954 0.351812 Consensus sequence: HHBTMCTTTGTTMDDVH Alignment: HBDDRAACAAAGRABHH ---WDAAAAAARKAAAD ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 68 Motif name: C068 Original motif 0.090909 0.252525 0.282828 0.373737 0.188119 0.029703 0.742574 0.039604 0.039604 0.653465 0.079208 0.227723 0.108911 0.534653 0.039604 0.316832 0.010000 0.040000 0.540000 0.410000 0.009901 0.851485 0.009901 0.128713 0.240000 0.170000 0.030000 0.560000 0.010000 0.250000 0.610000 0.130000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.510000 0.430000 0.010000 0.050000 0.010000 0.190000 0.130000 0.670000 0.010000 0.930000 0.030000 0.030000 0.049505 0.841584 0.009901 0.099010 0.475248 0.316832 0.158416 0.049505 Consensus sequence: BGCYKCTGCMTCCM Reserve complement motif 0.049505 0.316832 0.158416 0.475248 0.049505 0.009901 0.841584 0.099010 0.010000 0.030000 0.930000 0.030000 0.670000 0.190000 0.130000 0.010000 0.050000 0.430000 0.010000 0.510000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.610000 0.250000 0.130000 0.560000 0.170000 0.030000 0.240000 0.009901 0.009901 0.851485 0.128713 0.010000 0.540000 0.040000 0.410000 0.108911 0.039604 0.534653 0.316832 0.039604 0.079208 0.653465 0.227723 0.188119 0.742574 0.029703 0.039604 0.373737 0.252525 0.282828 0.090909 Consensus sequence: YGGAYGCAGYKGCV ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 68 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00527 Foxn4_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 4 14 0.024207 Species: Mus musculus Original motif 0.298336 0.418632 0.208054 0.074978 0.289907 0.015608 0.457100 0.237385 0.273583 0.077889 0.107860 0.540668 0.184954 0.161611 0.384390 0.269045 0.521826 0.156340 0.089019 0.232815 0.356716 0.131104 0.394857 0.117323 0.266669 0.108765 0.505273 0.119293 0.020778 0.047199 0.919524 0.012500 0.948536 0.018775 0.008113 0.024576 0.010822 0.964042 0.014701 0.010434 0.007428 0.019505 0.966351 0.006717 0.010025 0.975678 0.008648 0.005649 0.043796 0.120935 0.742979 0.092289 0.008252 0.250704 0.541132 0.199913 0.474428 0.044681 0.134430 0.346461 0.146597 0.421317 0.143166 0.288920 0.020540 0.181479 0.553811 0.244170 0.129612 0.173360 0.535219 0.161808 0.506084 0.158156 0.130983 0.204776 0.054872 0.103043 0.545792 0.296293 0.389882 0.171037 0.164162 0.274918 0.225861 0.314031 0.288872 0.171237 Consensus sequence: VDWDARRGACGCGGWHGGAKHV Reverse complement motif 0.225861 0.288872 0.314031 0.171237 0.274918 0.171037 0.164162 0.389882 0.054872 0.545792 0.103043 0.296293 0.204776 0.158156 0.130983 0.506084 0.129612 0.535219 0.173360 0.161808 0.020540 0.553811 0.181479 0.244170 0.146597 0.143166 0.421317 0.288920 0.346461 0.044681 0.134430 0.474428 0.008252 0.541132 0.250704 0.199913 0.043796 0.742979 0.120935 0.092289 0.010025 0.008648 0.975678 0.005649 0.007428 0.966351 0.019505 0.006717 0.010822 0.014701 0.964042 0.010434 0.024576 0.018775 0.008113 0.948536 0.020778 0.919524 0.047199 0.012500 0.266669 0.505273 0.108765 0.119293 0.356716 0.394857 0.131104 0.117323 0.232815 0.156340 0.089019 0.521826 0.184954 0.384390 0.161611 0.269045 0.540668 0.077889 0.107860 0.273583 0.289907 0.457100 0.015608 0.237385 0.298336 0.208054 0.418632 0.074978 Consensus sequence: VHYTCCDWCCGCGTCMMTHWHV Alignment: VHYTCCDWCCGCGTCMMTHWHV ---BGCYKCTGCMTCCM----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 4 14 0.025810 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH ---BGCYKCTGCMTCCM----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00031 Zbtb3_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 2 14 0.029473 Species: Mus musculus Original motif 0.401190 0.144405 0.268531 0.185874 0.430224 0.168519 0.221247 0.180011 0.172575 0.268499 0.274136 0.284789 0.150971 0.297110 0.290868 0.261051 0.133421 0.282842 0.434718 0.149019 0.042798 0.941105 0.001785 0.014312 0.890788 0.002551 0.103316 0.003345 0.001887 0.951368 0.043722 0.003023 0.011633 0.002218 0.002269 0.983880 0.003597 0.003728 0.984819 0.007856 0.002946 0.903520 0.072457 0.021077 0.908487 0.057072 0.018256 0.016185 0.076237 0.329864 0.228896 0.365003 0.144926 0.162981 0.177370 0.514722 0.124970 0.327876 0.295814 0.251341 0.144592 0.313887 0.301912 0.239609 0.108463 0.241747 0.350296 0.299494 Consensus sequence: DDBBBCACTGCABTBBB Reverse complement motif 0.108463 0.350296 0.241747 0.299494 0.144592 0.301912 0.313887 0.239609 0.124970 0.295814 0.327876 0.251341 0.514722 0.162981 0.177370 0.144926 0.365003 0.329864 0.228896 0.076237 0.016185 0.057072 0.018256 0.908487 0.002946 0.072457 0.903520 0.021077 0.003597 0.984819 0.003728 0.007856 0.983880 0.002218 0.002269 0.011633 0.001887 0.043722 0.951368 0.003023 0.003345 0.002551 0.103316 0.890788 0.042798 0.001785 0.941105 0.014312 0.133421 0.434718 0.282842 0.149019 0.150971 0.290868 0.297110 0.261051 0.284789 0.268499 0.274136 0.172575 0.180011 0.168519 0.221247 0.430224 0.185874 0.144405 0.268531 0.401190 Consensus sequence: BBBAVTGCAGTGBBVDD Alignment: BBBAVTGCAGTGBBVDD -YGGAYGCAGYKGCV-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 10 14 0.029717 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH BGCYKCTGCMTCCM--------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00033 Zfp410_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 1 14 0.030051 Species: Mus musculus Original motif 0.162979 0.284781 0.237433 0.314807 0.182449 0.447584 0.069464 0.300502 0.298973 0.261014 0.213211 0.226802 0.136039 0.433062 0.144274 0.286625 0.180084 0.395933 0.158565 0.265418 0.069354 0.748510 0.068898 0.113238 0.060485 0.717828 0.075333 0.146354 0.023280 0.071762 0.645500 0.259457 0.166896 0.749762 0.062730 0.020612 0.050401 0.775248 0.089072 0.085279 0.103847 0.767557 0.068804 0.059791 0.064815 0.748318 0.114588 0.072280 0.340921 0.071942 0.242981 0.344157 0.301967 0.263512 0.165927 0.268594 0.479800 0.222955 0.118441 0.178803 0.229469 0.283621 0.143099 0.343811 0.261733 0.180191 0.169905 0.388170 Consensus sequence: BHHBHCCGCCCCDHHHH Reverse complement motif 0.388170 0.180191 0.169905 0.261733 0.343811 0.283621 0.143099 0.229469 0.178803 0.222955 0.118441 0.479800 0.268594 0.263512 0.165927 0.301967 0.344157 0.071942 0.242981 0.340921 0.064815 0.114588 0.748318 0.072280 0.103847 0.068804 0.767557 0.059791 0.050401 0.089072 0.775248 0.085279 0.166896 0.062730 0.749762 0.020612 0.023280 0.645500 0.071762 0.259457 0.060485 0.075333 0.717828 0.146354 0.069354 0.068898 0.748510 0.113238 0.180084 0.158565 0.395933 0.265418 0.136039 0.144274 0.433062 0.286625 0.226802 0.261014 0.213211 0.298973 0.182449 0.069464 0.447584 0.300502 0.314807 0.284781 0.237433 0.162979 Consensus sequence: HHHHDGGGGCGGDBHDV Alignment: BHHBHCCGCCCCDHHHH BGCYKCTGCMTCCM--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 69 Motif name: C069 Original motif 0.514851 0.049505 0.247525 0.188119 0.290000 0.250000 0.020000 0.440000 0.890000 0.040000 0.030000 0.040000 0.890000 0.040000 0.050000 0.020000 0.623762 0.326733 0.039604 0.009901 0.900000 0.080000 0.010000 0.010000 0.720000 0.010000 0.180000 0.090000 0.210000 0.320000 0.020000 0.450000 0.616162 0.010101 0.050505 0.323232 0.490000 0.110000 0.200000 0.200000 0.190000 0.330000 0.010000 0.470000 0.830000 0.010000 0.130000 0.030000 0.710000 0.200000 0.070000 0.020000 0.570000 0.350000 0.070000 0.010000 0.930000 0.020000 0.010000 0.040000 0.640000 0.020000 0.210000 0.130000 0.290000 0.260000 0.020000 0.430000 0.460000 0.100000 0.220000 0.220000 Consensus sequence: AHAAMAAYWDYAAMAAHD Reserve complement motif 0.220000 0.100000 0.220000 0.460000 0.430000 0.260000 0.020000 0.290000 0.130000 0.020000 0.210000 0.640000 0.040000 0.020000 0.010000 0.930000 0.010000 0.350000 0.070000 0.570000 0.020000 0.200000 0.070000 0.710000 0.030000 0.010000 0.130000 0.830000 0.470000 0.330000 0.010000 0.190000 0.200000 0.110000 0.200000 0.490000 0.323232 0.010101 0.050505 0.616162 0.450000 0.320000 0.020000 0.210000 0.090000 0.010000 0.180000 0.720000 0.010000 0.080000 0.010000 0.900000 0.009901 0.326733 0.039604 0.623762 0.020000 0.040000 0.050000 0.890000 0.040000 0.040000 0.030000 0.890000 0.440000 0.250000 0.020000 0.290000 0.188119 0.049505 0.247525 0.514851 Consensus sequence: DHTTYTTMDWMTTYTTHT ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 69 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_primary Original Motif Original Motif Backward 3 18 0.054724 Species: Mus musculus Original motif 0.360997 0.300272 0.115555 0.223177 0.309749 0.228429 0.166233 0.295589 0.149419 0.176868 0.240155 0.433558 0.379704 0.095791 0.276373 0.248133 0.394549 0.174184 0.130641 0.300626 0.443749 0.070776 0.211081 0.274393 0.364301 0.074356 0.370406 0.190936 0.791976 0.038475 0.093390 0.076159 0.963721 0.001826 0.002456 0.031997 0.004516 0.954596 0.008092 0.032796 0.981080 0.002062 0.002161 0.014697 0.986185 0.001846 0.006976 0.004992 0.059567 0.003649 0.002189 0.934595 0.495328 0.024257 0.240450 0.239965 0.305027 0.094878 0.526069 0.074025 0.418442 0.196237 0.158323 0.226998 0.336713 0.220452 0.191155 0.251680 0.192296 0.300342 0.169047 0.338315 0.240387 0.144634 0.128513 0.486465 0.290763 0.271259 0.116600 0.321377 0.224825 0.296233 0.229255 0.249687 0.493240 0.171285 0.075148 0.260326 Consensus sequence: HHBDHDDAACAATDRHHHHHBW Reverse complement motif 0.260326 0.171285 0.075148 0.493240 0.224825 0.229255 0.296233 0.249687 0.321377 0.271259 0.116600 0.290763 0.486465 0.144634 0.128513 0.240387 0.338315 0.300342 0.169047 0.192296 0.251680 0.220452 0.191155 0.336713 0.226998 0.196237 0.158323 0.418442 0.305027 0.526069 0.094878 0.074025 0.239965 0.024257 0.240450 0.495328 0.934595 0.003649 0.002189 0.059567 0.004992 0.001846 0.006976 0.986185 0.014697 0.002062 0.002161 0.981080 0.004516 0.008092 0.954596 0.032796 0.031997 0.001826 0.002456 0.963721 0.076159 0.038475 0.093390 0.791976 0.364301 0.370406 0.074356 0.190936 0.274393 0.070776 0.211081 0.443749 0.300626 0.174184 0.130641 0.394549 0.248133 0.095791 0.276373 0.379704 0.433558 0.176868 0.240155 0.149419 0.295589 0.228429 0.166233 0.309749 0.223177 0.300272 0.115555 0.360997 Consensus sequence: WBHHHHHMDATTGTTHDHDVHH Alignment: HHBDHDDAACAATDRHHHHHBW --AHAAMAAYWDYAAMAAHD-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00032 Gata3_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 4 18 0.055623 Species: Mus musculus Original motif 0.151572 0.262753 0.258275 0.327401 0.221834 0.113385 0.275380 0.389400 0.297769 0.136928 0.134678 0.430625 0.270099 0.110415 0.271106 0.348380 0.265471 0.090253 0.223340 0.420936 0.616582 0.090091 0.171960 0.121367 0.197318 0.107541 0.406904 0.288237 0.798258 0.046950 0.001406 0.153385 0.003195 0.002516 0.989707 0.004582 0.991503 0.002748 0.002617 0.003132 0.005015 0.002764 0.003026 0.989195 0.948394 0.008932 0.001344 0.041330 0.973109 0.004100 0.004081 0.018710 0.040365 0.113905 0.828185 0.017545 0.736608 0.130524 0.113464 0.019404 0.415921 0.106101 0.316613 0.161365 0.376582 0.170927 0.155572 0.296919 0.137731 0.197151 0.211055 0.454064 0.324853 0.122747 0.246107 0.306293 0.462490 0.207311 0.159392 0.170807 0.380420 0.188972 0.311990 0.118618 0.222178 0.157873 0.380486 0.239463 Consensus sequence: BDHDDADAGATAAGADHBDHVD Reverse complement motif 0.222178 0.380486 0.157873 0.239463 0.118618 0.188972 0.311990 0.380420 0.170807 0.207311 0.159392 0.462490 0.306293 0.122747 0.246107 0.324853 0.454064 0.197151 0.211055 0.137731 0.296919 0.170927 0.155572 0.376582 0.161365 0.106101 0.316613 0.415921 0.019404 0.130524 0.113464 0.736608 0.040365 0.828185 0.113905 0.017545 0.018710 0.004100 0.004081 0.973109 0.041330 0.008932 0.001344 0.948394 0.989195 0.002764 0.003026 0.005015 0.003132 0.002748 0.002617 0.991503 0.003195 0.989707 0.002516 0.004582 0.153385 0.046950 0.001406 0.798258 0.197318 0.406904 0.107541 0.288237 0.121367 0.090091 0.171960 0.616582 0.420936 0.090253 0.223340 0.265471 0.348380 0.110415 0.271106 0.270099 0.430625 0.136928 0.134678 0.297769 0.389400 0.113385 0.275380 0.221834 0.327401 0.262753 0.258275 0.151572 Consensus sequence: HBHDVHDTCTTATCTHTDDHDV Alignment: HBHDVHDTCTTATCTHTDDHDV -DHTTYTTMDWMTTYTTHT--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 1 18 0.056443 Species: Mus musculus Original motif 0.067627 0.131333 0.654425 0.146615 0.156488 0.114442 0.145630 0.583441 0.206450 0.265630 0.358017 0.169903 0.090729 0.460713 0.274712 0.173847 0.285994 0.099998 0.154485 0.459523 0.635908 0.184787 0.072982 0.106323 0.748421 0.039204 0.092605 0.119769 0.081342 0.061327 0.044532 0.812799 0.143120 0.043879 0.024216 0.788785 0.247544 0.092102 0.621453 0.038901 0.295531 0.036295 0.027594 0.640580 0.194561 0.305468 0.339916 0.160055 0.175038 0.193568 0.101212 0.530182 0.145226 0.167488 0.559871 0.127415 0.271501 0.237429 0.206701 0.284369 0.216834 0.109191 0.569605 0.104370 0.182624 0.177160 0.300475 0.339742 0.331737 0.198645 0.265137 0.204482 0.230155 0.359365 0.183450 0.227029 0.056581 0.067297 0.463052 0.413070 0.198891 0.324626 0.304424 0.172059 0.181968 0.287547 0.202419 0.328066 Consensus sequence: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB Reverse complement motif 0.328066 0.287547 0.202419 0.181968 0.198891 0.304424 0.324626 0.172059 0.056581 0.463052 0.067297 0.413070 0.230155 0.183450 0.359365 0.227029 0.204482 0.198645 0.265137 0.331737 0.339742 0.177160 0.300475 0.182624 0.216834 0.569605 0.109191 0.104370 0.284369 0.237429 0.206701 0.271501 0.145226 0.559871 0.167488 0.127415 0.530182 0.193568 0.101212 0.175038 0.194561 0.339916 0.305468 0.160055 0.640580 0.036295 0.027594 0.295531 0.247544 0.621453 0.092102 0.038901 0.788785 0.043879 0.024216 0.143120 0.812799 0.061327 0.044532 0.081342 0.119769 0.039204 0.092605 0.748421 0.106323 0.184787 0.072982 0.635908 0.459523 0.099998 0.154485 0.285994 0.090729 0.274712 0.460713 0.173847 0.206450 0.358017 0.265630 0.169903 0.583441 0.114442 0.145630 0.156488 0.067627 0.654425 0.131333 0.146615 Consensus sequence: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC Alignment: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC AHAAMAAYWDYAAMAAHD---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00032 Gata3_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 4 18 0.058939 Species: Mus musculus Original motif 0.177641 0.319872 0.115137 0.387350 0.136644 0.182137 0.205873 0.475347 0.254263 0.244280 0.165207 0.336250 0.240415 0.207557 0.237497 0.314530 0.271041 0.214702 0.364395 0.149863 0.095475 0.320104 0.191738 0.392682 0.500902 0.142722 0.026556 0.329820 0.051221 0.023698 0.897245 0.027836 0.922410 0.027509 0.024058 0.026023 0.030735 0.070903 0.024248 0.874114 0.242120 0.231992 0.225143 0.300745 0.106956 0.220471 0.283490 0.389083 0.152079 0.165830 0.135066 0.547025 0.839205 0.051581 0.060119 0.049095 0.041204 0.069147 0.070830 0.818819 0.051861 0.848177 0.027599 0.072363 0.383793 0.016807 0.397470 0.201931 0.381899 0.215846 0.255908 0.146347 0.094792 0.358651 0.280905 0.265652 0.296132 0.181545 0.178433 0.343890 0.301997 0.254722 0.108566 0.334714 0.349481 0.270693 0.137507 0.242319 Consensus sequence: HBHDVBWGATHBTATCRVBHHH Reverse complement motif 0.242319 0.270693 0.137507 0.349481 0.334714 0.254722 0.108566 0.301997 0.343890 0.181545 0.178433 0.296132 0.094792 0.280905 0.358651 0.265652 0.146347 0.215846 0.255908 0.381899 0.383793 0.397470 0.016807 0.201931 0.051861 0.027599 0.848177 0.072363 0.818819 0.069147 0.070830 0.041204 0.049095 0.051581 0.060119 0.839205 0.547025 0.165830 0.135066 0.152079 0.389083 0.220471 0.283490 0.106956 0.300745 0.231992 0.225143 0.242120 0.874114 0.070903 0.024248 0.030735 0.026023 0.027509 0.024058 0.922410 0.051221 0.897245 0.023698 0.027836 0.329820 0.142722 0.026556 0.500902 0.392682 0.320104 0.191738 0.095475 0.271041 0.364395 0.214702 0.149863 0.314530 0.207557 0.237497 0.240415 0.336250 0.244280 0.165207 0.254263 0.475347 0.182137 0.205873 0.136644 0.387350 0.319872 0.115137 0.177641 Consensus sequence: HHHBBMGATAVHATCWVVDHVH Alignment: HHHBBMGATAVHATCWVVDHVH -AHAAMAAYWDYAAMAAHD--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00528 Foxm1_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 4 18 0.064465 Species: Mus musculus Original motif 0.399785 0.446658 0.111435 0.042122 0.535175 0.103991 0.089706 0.271128 0.078171 0.387987 0.375083 0.158759 0.309001 0.519142 0.070618 0.101239 0.201844 0.255818 0.323149 0.219190 0.534101 0.109845 0.235026 0.121028 0.656038 0.037473 0.261484 0.045006 0.315713 0.164290 0.471815 0.048182 0.651960 0.009412 0.328237 0.010391 0.937365 0.017313 0.007516 0.037807 0.019983 0.044238 0.012387 0.923392 0.061195 0.021485 0.881645 0.035675 0.017521 0.952998 0.013139 0.016342 0.254160 0.029735 0.493023 0.223082 0.239200 0.593324 0.114503 0.052973 0.610822 0.071539 0.099169 0.218470 0.166610 0.389712 0.204400 0.239278 0.227752 0.361626 0.178497 0.232125 0.537030 0.182466 0.026035 0.254470 0.235902 0.151006 0.043788 0.569304 0.081851 0.250397 0.590059 0.077693 0.340417 0.189613 0.272075 0.197895 Consensus sequence: MWSMBAARRATGCDCABHATGD Reverse complement motif 0.197895 0.189613 0.272075 0.340417 0.081851 0.590059 0.250397 0.077693 0.569304 0.151006 0.043788 0.235902 0.254470 0.182466 0.026035 0.537030 0.227752 0.178497 0.361626 0.232125 0.166610 0.204400 0.389712 0.239278 0.218470 0.071539 0.099169 0.610822 0.239200 0.114503 0.593324 0.052973 0.254160 0.493023 0.029735 0.223082 0.017521 0.013139 0.952998 0.016342 0.061195 0.881645 0.021485 0.035675 0.923392 0.044238 0.012387 0.019983 0.037807 0.017313 0.007516 0.937365 0.010391 0.009412 0.328237 0.651960 0.315713 0.471815 0.164290 0.048182 0.045006 0.037473 0.261484 0.656038 0.121028 0.109845 0.235026 0.534101 0.201844 0.323149 0.255818 0.219190 0.309001 0.070618 0.519142 0.101239 0.078171 0.375083 0.387987 0.158759 0.271128 0.103991 0.089706 0.535175 0.399785 0.111435 0.446658 0.042122 Consensus sequence: DCATDBTGHGCATKMTTBRSWR Alignment: DCATDBTGHGCATKMTTBRSWR -DHTTYTTMDWMTTYTTHT--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 70 Motif name: C070 Original motif 0.079208 0.227723 0.514851 0.178218 0.160000 0.330000 0.420000 0.090000 0.180000 0.020000 0.790000 0.010000 0.540000 0.180000 0.240000 0.040000 0.080000 0.330000 0.330000 0.260000 0.760000 0.010000 0.200000 0.030000 0.100000 0.290000 0.600000 0.010000 0.960000 0.020000 0.010000 0.010000 0.242424 0.292929 0.454545 0.010101 0.850000 0.060000 0.060000 0.030000 0.030000 0.230000 0.730000 0.010000 0.760000 0.010000 0.220000 0.010000 0.150000 0.380000 0.410000 0.060000 0.360000 0.250000 0.350000 0.040000 0.060000 0.170000 0.360000 0.410000 Consensus sequence: GVGABAGAVAGASVK Reserve complement motif 0.410000 0.170000 0.360000 0.060000 0.040000 0.250000 0.350000 0.360000 0.150000 0.410000 0.380000 0.060000 0.010000 0.010000 0.220000 0.760000 0.030000 0.730000 0.230000 0.010000 0.030000 0.060000 0.060000 0.850000 0.242424 0.454545 0.292929 0.010101 0.010000 0.020000 0.010000 0.960000 0.100000 0.600000 0.290000 0.010000 0.030000 0.010000 0.200000 0.760000 0.080000 0.330000 0.330000 0.260000 0.040000 0.180000 0.240000 0.540000 0.180000 0.790000 0.020000 0.010000 0.160000 0.420000 0.330000 0.090000 0.079208 0.514851 0.227723 0.178218 Consensus sequence: RBSTCTVTCTBTCVC ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 70 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score >UP00011 Irf6_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 1 15 0.037164 Species: Mus musculus Original motif 0.326255 0.256976 0.231005 0.185764 0.145621 0.315489 0.266193 0.272698 0.138750 0.396937 0.205185 0.259127 0.534194 0.121488 0.084178 0.260140 0.201823 0.589398 0.086624 0.122154 0.031428 0.023221 0.066048 0.879303 0.022389 0.889379 0.049165 0.039067 0.042252 0.295983 0.085234 0.576531 0.022905 0.915187 0.021569 0.040339 0.117305 0.061052 0.716358 0.105285 0.205873 0.113582 0.609303 0.071242 0.110208 0.084907 0.274228 0.530658 0.233550 0.385055 0.150708 0.230687 0.333806 0.136131 0.311600 0.218463 0.216423 0.309361 0.281145 0.193072 Consensus sequence: VBBACTCYCGGKHDV Reverse complement motif 0.216423 0.281145 0.309361 0.193072 0.218463 0.136131 0.311600 0.333806 0.233550 0.150708 0.385055 0.230687 0.530658 0.084907 0.274228 0.110208 0.205873 0.609303 0.113582 0.071242 0.117305 0.716358 0.061052 0.105285 0.022905 0.021569 0.915187 0.040339 0.576531 0.295983 0.085234 0.042252 0.022389 0.049165 0.889379 0.039067 0.879303 0.023221 0.066048 0.031428 0.201823 0.086624 0.589398 0.122154 0.260140 0.121488 0.084178 0.534194 0.138750 0.205185 0.396937 0.259127 0.145621 0.266193 0.315489 0.272698 0.185764 0.256976 0.231005 0.326255 Consensus sequence: VDDRCCGMGAGTBBB Alignment: VBBACTCYCGGKHDV RBSTCTVTCTBTCVC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00101 Sox12_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 15 0.039418 Species: Mus musculus Original motif 0.378898 0.318901 0.205859 0.096341 0.352524 0.321236 0.224504 0.101736 0.323551 0.182056 0.210897 0.283496 0.135539 0.325230 0.208031 0.331200 0.663106 0.055471 0.154459 0.126963 0.051748 0.292567 0.537307 0.118378 0.886489 0.042361 0.035742 0.035408 0.043647 0.688744 0.094358 0.173252 0.882052 0.039818 0.018899 0.059231 0.864171 0.036011 0.068363 0.031455 0.790158 0.046868 0.041594 0.121379 0.087447 0.143905 0.707798 0.060849 0.295919 0.132479 0.485703 0.085899 0.653156 0.133004 0.110012 0.103828 0.351764 0.131771 0.217730 0.298736 0.203977 0.196773 0.099958 0.499292 Consensus sequence: VVDBASACAAAGRADH Reverse complement motif 0.499292 0.196773 0.099958 0.203977 0.298736 0.131771 0.217730 0.351764 0.103828 0.133004 0.110012 0.653156 0.295919 0.485703 0.132479 0.085899 0.087447 0.707798 0.143905 0.060849 0.121379 0.046868 0.041594 0.790158 0.031455 0.036011 0.068363 0.864171 0.059231 0.039818 0.018899 0.882052 0.043647 0.094358 0.688744 0.173252 0.035408 0.042361 0.035742 0.886489 0.051748 0.537307 0.292567 0.118378 0.126963 0.055471 0.154459 0.663106 0.331200 0.325230 0.208031 0.135539 0.283496 0.182056 0.210897 0.323551 0.101736 0.321236 0.224504 0.352524 0.096341 0.318901 0.205859 0.378898 Consensus sequence: HDTMCTTTGTSTVDBB Alignment: VVDBASACAAAGRADH -GVGABAGAVAGASVK ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00018 Irf4_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 1 15 0.045211 Species: Mus musculus Original motif 0.288101 0.247588 0.287461 0.176850 0.187625 0.276525 0.352820 0.183030 0.175230 0.300094 0.203295 0.321380 0.564519 0.107594 0.098018 0.229869 0.150412 0.310868 0.054960 0.483760 0.034907 0.015505 0.034843 0.914745 0.041776 0.885897 0.032309 0.040017 0.046210 0.168474 0.066613 0.718702 0.031764 0.913321 0.024478 0.030437 0.191755 0.029057 0.754998 0.024190 0.206291 0.097100 0.623727 0.072881 0.311511 0.037435 0.173101 0.477953 0.205101 0.316738 0.081628 0.396533 0.243888 0.196473 0.292453 0.267186 0.167980 0.404608 0.259107 0.168305 Consensus sequence: VVBAYTCTCGGWHDB Reverse complement motif 0.167980 0.259107 0.404608 0.168305 0.243888 0.292453 0.196473 0.267186 0.396533 0.316738 0.081628 0.205101 0.477953 0.037435 0.173101 0.311511 0.206291 0.623727 0.097100 0.072881 0.191755 0.754998 0.029057 0.024190 0.031764 0.024478 0.913321 0.030437 0.718702 0.168474 0.066613 0.046210 0.041776 0.032309 0.885897 0.040017 0.914745 0.015505 0.034843 0.034907 0.483760 0.310868 0.054960 0.150412 0.229869 0.107594 0.098018 0.564519 0.321380 0.300094 0.203295 0.175230 0.187625 0.352820 0.276525 0.183030 0.176850 0.247588 0.287461 0.288101 Consensus sequence: BHHWCCGAGAMTVVB Alignment: VVBAYTCTCGGWHDB RBSTCTVTCTBTCVC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00077 Srf_secondary Original Motif Original Motif Forward 1 15 0.048045 Species: Mus musculus Original motif 0.162968 0.284828 0.440984 0.111220 0.151392 0.200635 0.205316 0.442657 0.267215 0.083669 0.192498 0.456618 0.332771 0.180711 0.200027 0.286491 0.509370 0.102954 0.242569 0.145107 0.666262 0.077309 0.154466 0.101962 0.737968 0.113335 0.100401 0.048296 0.658878 0.141580 0.134033 0.065510 0.766115 0.094051 0.069763 0.070072 0.755621 0.088491 0.044802 0.111086 0.749083 0.135917 0.047510 0.067490 0.663231 0.176795 0.028134 0.131839 0.553358 0.277659 0.038655 0.130328 0.392578 0.314083 0.209844 0.083495 0.198462 0.237132 0.239466 0.324940 0.275121 0.210087 0.194779 0.320013 0.287748 0.277395 0.142704 0.292154 Consensus sequence: VBDDAAAAAAAAMVBHH Reverse complement motif 0.292154 0.277395 0.142704 0.287748 0.320013 0.210087 0.194779 0.275121 0.324940 0.237132 0.239466 0.198462 0.083495 0.314083 0.209844 0.392578 0.130328 0.277659 0.038655 0.553358 0.131839 0.176795 0.028134 0.663231 0.067490 0.135917 0.047510 0.749083 0.111086 0.088491 0.044802 0.755621 0.070072 0.094051 0.069763 0.766115 0.065510 0.141580 0.134033 0.658878 0.048296 0.113335 0.100401 0.737968 0.101962 0.077309 0.154466 0.666262 0.145107 0.102954 0.242569 0.509370 0.286491 0.180711 0.200027 0.332771 0.456618 0.083669 0.192498 0.267215 0.442657 0.200635 0.205316 0.151392 0.162968 0.440984 0.284828 0.111220 Consensus sequence: HHVBYTTTTTTTTDDVV Alignment: VBDDAAAAAAAAMVBHH GVGABAGAVAGASVK-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00000 Smad3_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 3 15 0.048611 Species: Mus musculus Original motif 0.282316 0.413385 0.114930 0.189369 0.341654 0.135011 0.267943 0.255392 0.399523 0.173081 0.168845 0.258551 0.365086 0.196360 0.211856 0.226699 0.243321 0.177839 0.224206 0.354635 0.029873 0.808479 0.036309 0.125339 0.004945 0.815465 0.040635 0.138955 0.934557 0.058944 0.005027 0.001471 0.005099 0.003998 0.986148 0.004755 0.969304 0.020594 0.001929 0.008173 0.008189 0.984816 0.004199 0.002795 0.669579 0.012182 0.282153 0.036085 0.130511 0.171241 0.334041 0.364207 0.198982 0.289660 0.252392 0.258966 0.423172 0.190978 0.164411 0.221440 0.213519 0.287388 0.294414 0.204679 0.371956 0.285061 0.150191 0.192792 Consensus sequence: HDHDDCCAGACABBHVH Reverse complement motif 0.192792 0.285061 0.150191 0.371956 0.213519 0.294414 0.287388 0.204679 0.221440 0.190978 0.164411 0.423172 0.198982 0.252392 0.289660 0.258966 0.364207 0.171241 0.334041 0.130511 0.036085 0.012182 0.282153 0.669579 0.008189 0.004199 0.984816 0.002795 0.008173 0.020594 0.001929 0.969304 0.005099 0.986148 0.003998 0.004755 0.001471 0.058944 0.005027 0.934557 0.004945 0.040635 0.815465 0.138955 0.029873 0.036309 0.808479 0.125339 0.354635 0.177839 0.224206 0.243321 0.226699 0.196360 0.211856 0.365086 0.258551 0.173081 0.168845 0.399523 0.255392 0.135011 0.267943 0.341654 0.282316 0.114930 0.413385 0.189369 Consensus sequence: HVHBVTGTCTGGDDHDD Alignment: HVHBVTGTCTGGDDHDD --RBSTCTVTCTBTCVC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 71 Motif name: C071 Original motif 0.010000 0.430000 0.500000 0.060000 0.202020 0.282828 0.363636 0.151515 0.207921 0.742574 0.039604 0.009901 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.633663 0.188119 0.118812 0.059406 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.440000 0.540000 0.010000 0.180000 0.370000 0.310000 0.140000 0.010000 0.490000 0.490000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.650000 0.140000 0.010000 0.200000 0.010000 0.940000 0.040000 0.010000 0.190000 0.760000 0.010000 0.040000 0.141414 0.313131 0.343434 0.202020 0.010000 0.380000 0.600000 0.010000 Consensus sequence: SVCCACSVSCACCBS Reserve complement motif 0.010000 0.600000 0.380000 0.010000 0.141414 0.343434 0.313131 0.202020 0.190000 0.010000 0.760000 0.040000 0.010000 0.040000 0.940000 0.010000 0.200000 0.140000 0.010000 0.650000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.490000 0.490000 0.010000 0.180000 0.310000 0.370000 0.140000 0.010000 0.540000 0.440000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.059406 0.188119 0.118812 0.633663 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.207921 0.039604 0.742574 0.009901 0.202020 0.363636 0.282828 0.151515 0.010000 0.500000 0.430000 0.060000 Consensus sequence: SBGGTGSVSGTGGVS ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 71 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00022 Zfp740_primaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 15 0.020552 Species: Mus musculus Original motif 0.136946 0.396508 0.135309 0.331236 0.185528 0.417538 0.215409 0.181525 0.171276 0.341901 0.172832 0.313991 0.145641 0.590572 0.146376 0.117412 0.138035 0.660416 0.114016 0.087533 0.222728 0.750532 0.007528 0.019212 0.024633 0.963314 0.001894 0.010159 0.009557 0.979956 0.000642 0.009844 0.010416 0.977424 0.000541 0.011619 0.026401 0.956740 0.001544 0.015314 0.195502 0.755959 0.011060 0.037480 0.491291 0.364785 0.025613 0.118311 0.305153 0.398160 0.071680 0.225008 0.253497 0.232647 0.213246 0.300610 0.156964 0.297876 0.144683 0.400477 0.179549 0.292514 0.319462 0.208475 Consensus sequence: HVBCCCCCCCCMHHHB Reverse complement motif 0.179549 0.319462 0.292514 0.208475 0.400477 0.297876 0.144683 0.156964 0.300610 0.232647 0.213246 0.253497 0.305153 0.071680 0.398160 0.225008 0.118311 0.364785 0.025613 0.491291 0.195502 0.011060 0.755959 0.037480 0.026401 0.001544 0.956740 0.015314 0.010416 0.000541 0.977424 0.011619 0.009557 0.000642 0.979956 0.009844 0.024633 0.001894 0.963314 0.010159 0.222728 0.007528 0.750532 0.019212 0.138035 0.114016 0.660416 0.087533 0.145641 0.146376 0.590572 0.117412 0.171276 0.172832 0.341901 0.313991 0.185528 0.215409 0.417538 0.181525 0.136946 0.135309 0.396508 0.331236 Consensus sequence: BHHDYGGGGGGGGBVD Alignment: HVBCCCCCCCCMHHHB -SVCCACSVSCACCBS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00002 Sp4_primary Original Motif Original Motif Backward 3 15 0.020698 Species: Mus musculus Original motif 0.155386 0.223380 0.374454 0.246780 0.247106 0.159582 0.345111 0.248201 0.238889 0.258354 0.165304 0.337454 0.255612 0.489586 0.051621 0.203182 0.450100 0.545383 0.001071 0.003447 0.003704 0.991007 0.002456 0.002833 0.035504 0.001814 0.928129 0.034553 0.001494 0.991406 0.003414 0.003686 0.003045 0.990628 0.005182 0.001145 0.000990 0.963237 0.001215 0.034557 0.148016 0.838396 0.000666 0.012922 0.014261 0.905847 0.007200 0.072692 0.083394 0.270068 0.058368 0.588170 0.149141 0.286783 0.142802 0.421274 0.204851 0.347195 0.253356 0.194597 0.184442 0.299908 0.194408 0.321242 0.125793 0.380109 0.245318 0.248780 Consensus sequence: BDHHMCGCCCCCTHVBB Reverse complement motif 0.125793 0.245318 0.380109 0.248780 0.321242 0.299908 0.194408 0.184442 0.204851 0.253356 0.347195 0.194597 0.421274 0.286783 0.142802 0.149141 0.588170 0.270068 0.058368 0.083394 0.014261 0.007200 0.905847 0.072692 0.148016 0.000666 0.838396 0.012922 0.000990 0.001215 0.963237 0.034557 0.003045 0.005182 0.990628 0.001145 0.001494 0.003414 0.991406 0.003686 0.035504 0.928129 0.001814 0.034553 0.003704 0.002456 0.991007 0.002833 0.450100 0.001071 0.545383 0.003447 0.255612 0.051621 0.489586 0.203182 0.337454 0.258354 0.165304 0.238889 0.247106 0.345111 0.159582 0.248201 0.155386 0.374454 0.223380 0.246780 Consensus sequence: BVVHAGGGGGCGRDHHB Alignment: BDHHMCGCCCCCTHVBB SVCCACSVSCACCBS-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 2 15 0.021119 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK -SBGGTGSVSGTGGVS------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 3 15 0.022472 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH ------SVCCACSVSCACCBS-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 7 15 0.025011 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH ------SVCCACSVSCACCBS-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 72 Motif name: C072 Original motif 0.150000 0.470000 0.300000 0.080000 0.480000 0.110000 0.110000 0.300000 0.700000 0.010000 0.250000 0.040000 0.030000 0.010000 0.950000 0.010000 0.009901 0.792079 0.178218 0.019802 0.108911 0.722772 0.009901 0.158416 0.130000 0.340000 0.410000 0.120000 0.240000 0.010000 0.390000 0.360000 0.010000 0.010000 0.940000 0.040000 0.019802 0.069307 0.891089 0.019802 0.039604 0.742574 0.207921 0.009901 0.435644 0.069307 0.059406 0.435644 Consensus sequence: SWAGCCVDGGCW Reserve complement motif 0.435644 0.069307 0.059406 0.435644 0.039604 0.207921 0.742574 0.009901 0.019802 0.891089 0.069307 0.019802 0.010000 0.940000 0.010000 0.040000 0.240000 0.390000 0.010000 0.360000 0.130000 0.410000 0.340000 0.120000 0.108911 0.009901 0.722772 0.158416 0.009901 0.178218 0.792079 0.019802 0.030000 0.950000 0.010000 0.010000 0.040000 0.010000 0.250000 0.700000 0.300000 0.110000 0.110000 0.480000 0.150000 0.300000 0.470000 0.080000 Consensus sequence: WGCCHVGGCTWS ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 72 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00010 Tcfap2b_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 2 12 0.005589 Species: Mus musculus Original motif 0.325895 0.099601 0.286848 0.287657 0.177095 0.035123 0.260876 0.526906 0.344850 0.211117 0.015725 0.428308 0.128363 0.059965 0.777560 0.034112 0.048072 0.881624 0.024842 0.045462 0.072628 0.872650 0.011271 0.043451 0.057165 0.162157 0.347719 0.432959 0.015437 0.448405 0.428425 0.107733 0.446877 0.336374 0.099940 0.116809 0.090955 0.023004 0.848240 0.037801 0.040151 0.015072 0.901303 0.043473 0.087378 0.817019 0.027876 0.067727 0.532482 0.021469 0.266773 0.179276 0.325017 0.271661 0.138860 0.264463 0.203625 0.179490 0.143885 0.473001 Consensus sequence: DTWGCCKSMGGCRHH Reverse complement motif 0.473001 0.179490 0.143885 0.203625 0.264463 0.271661 0.138860 0.325017 0.179276 0.021469 0.266773 0.532482 0.087378 0.027876 0.817019 0.067727 0.040151 0.901303 0.015072 0.043473 0.090955 0.848240 0.023004 0.037801 0.116809 0.336374 0.099940 0.446877 0.015437 0.428425 0.448405 0.107733 0.432959 0.162157 0.347719 0.057165 0.072628 0.011271 0.872650 0.043451 0.048072 0.024842 0.881624 0.045462 0.128363 0.777560 0.059965 0.034112 0.428308 0.211117 0.015725 0.344850 0.526906 0.035123 0.260876 0.177095 0.287657 0.099601 0.286848 0.325895 Consensus sequence: HHKGCCYSRGGCWAD Alignment: HHKGCCYSRGGCWAD -SWAGCCVDGGCW-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00002 Sp4_secondary Original Motif Original Motif Forward 2 12 0.007435 Species: Mus musculus Original motif 0.146334 0.312326 0.244281 0.297060 0.493155 0.092609 0.162506 0.251729 0.503593 0.059863 0.077561 0.358984 0.763321 0.015264 0.213114 0.008301 0.012415 0.025932 0.945502 0.016151 0.006713 0.015221 0.950098 0.027968 0.062415 0.834303 0.054500 0.048782 0.011010 0.020677 0.928821 0.039493 0.012785 0.024162 0.145822 0.817231 0.133595 0.033962 0.787876 0.044567 0.140697 0.180481 0.428253 0.250570 0.036281 0.806412 0.033510 0.123797 0.157910 0.408607 0.122427 0.311055 0.292185 0.260017 0.197515 0.250283 0.251107 0.124480 0.359447 0.264967 Consensus sequence: BDWAGGCGTGBCHHD Reverse complement motif 0.251107 0.359447 0.124480 0.264967 0.250283 0.260017 0.197515 0.292185 0.157910 0.122427 0.408607 0.311055 0.036281 0.033510 0.806412 0.123797 0.140697 0.428253 0.180481 0.250570 0.133595 0.787876 0.033962 0.044567 0.817231 0.024162 0.145822 0.012785 0.011010 0.928821 0.020677 0.039493 0.062415 0.054500 0.834303 0.048782 0.006713 0.950098 0.015221 0.027968 0.012415 0.945502 0.025932 0.016151 0.008301 0.015264 0.213114 0.763321 0.358984 0.059863 0.077561 0.503593 0.251729 0.092609 0.162506 0.493155 0.146334 0.244281 0.312326 0.297060 Consensus sequence: HHDGBCACGCCTWDB Alignment: BDWAGGCGTGBCHHD -SWAGCCVDGGCW-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00028 Tcfap2e_primaryOriginal Motif Original Motif Forward 2 12 0.014154 Species: Mus musculus Original motif 0.369517 0.172742 0.163174 0.294567 0.260541 0.211816 0.194359 0.333284 0.292862 0.281323 0.073013 0.352801 0.011777 0.272676 0.697188 0.018359 0.005160 0.983588 0.005917 0.005335 0.002256 0.960488 0.005733 0.031524 0.003735 0.283214 0.123762 0.589290 0.024383 0.379981 0.542999 0.052638 0.589290 0.123762 0.283214 0.003735 0.031524 0.005733 0.960488 0.002256 0.005335 0.005917 0.983588 0.005160 0.018359 0.697188 0.272676 0.011777 0.328286 0.093173 0.334133 0.244408 0.563777 0.145250 0.140240 0.150733 0.263206 0.222321 0.242153 0.272320 Consensus sequence: HHHGCCTSAGGCDAD Reverse complement motif 0.272320 0.222321 0.242153 0.263206 0.150733 0.145250 0.140240 0.563777 0.328286 0.334133 0.093173 0.244408 0.018359 0.272676 0.697188 0.011777 0.005335 0.983588 0.005917 0.005160 0.031524 0.960488 0.005733 0.002256 0.003735 0.123762 0.283214 0.589290 0.024383 0.542999 0.379981 0.052638 0.589290 0.283214 0.123762 0.003735 0.002256 0.005733 0.960488 0.031524 0.005160 0.005917 0.983588 0.005335 0.011777 0.697188 0.272676 0.018359 0.352801 0.281323 0.073013 0.292862 0.333284 0.211816 0.194359 0.260541 0.294567 0.172742 0.163174 0.369517 Consensus sequence: DTHGCCTSAGGCHHH Alignment: HHHGCCTSAGGCDAD -SWAGCCVDGGCW-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00087 Tcfap2c_primaryReverse Complement Original Motif Forward 3 12 0.018758 Species: Mus musculus Original motif 0.453894 0.104785 0.095366 0.345954 0.232091 0.189298 0.180541 0.398071 0.233238 0.261214 0.065556 0.439992 0.012319 0.459636 0.511133 0.016912 0.008159 0.984661 0.002866 0.004314 0.001420 0.885962 0.001808 0.110810 0.005689 0.345363 0.111901 0.537046 0.035614 0.353586 0.534122 0.076679 0.537046 0.111901 0.345363 0.005689 0.110810 0.001808 0.885962 0.001420 0.004314 0.002866 0.984661 0.008159 0.016912 0.511133 0.459636 0.012319 0.313235 0.097541 0.435018 0.154206 0.570019 0.140594 0.123600 0.165788 0.326417 0.176576 0.220289 0.276718 Consensus sequence: WHHSCCYSRGGSDAD Reverse complement motif 0.276718 0.176576 0.220289 0.326417 0.165788 0.140594 0.123600 0.570019 0.313235 0.435018 0.097541 0.154206 0.016912 0.459636 0.511133 0.012319 0.004314 0.984661 0.002866 0.008159 0.110810 0.885962 0.001808 0.001420 0.005689 0.111901 0.345363 0.537046 0.035614 0.534122 0.353586 0.076679 0.537046 0.345363 0.111901 0.005689 0.001420 0.001808 0.885962 0.110810 0.008159 0.002866 0.984661 0.004314 0.012319 0.511133 0.459636 0.016912 0.439992 0.261214 0.065556 0.233238 0.398071 0.189298 0.180541 0.232091 0.345954 0.104785 0.095366 0.453894 Consensus sequence: DTHSCCKSMGGSHHW Alignment: WHHSCCYSRGGSDAD --WGCCHVGGCTWS- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 2 12 0.018770 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK -SWAGCCVDGGCW--------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 73 Motif name: C073 Original motif 0.009901 0.465347 0.059406 0.465347 0.540000 0.400000 0.050000 0.010000 0.520000 0.020000 0.160000 0.300000 0.010000 0.080000 0.900000 0.010000 0.040000 0.410000 0.450000 0.100000 0.336634 0.554455 0.049505 0.059406 0.120000 0.450000 0.020000 0.410000 0.801980 0.049505 0.138614 0.009901 0.050000 0.010000 0.930000 0.010000 0.029703 0.693069 0.099010 0.178218 0.070000 0.910000 0.010000 0.010000 0.465347 0.009901 0.435644 0.089109 0.090000 0.040000 0.570000 0.300000 0.069307 0.405941 0.485149 0.039604 0.040000 0.010000 0.580000 0.370000 0.069307 0.821782 0.049505 0.059406 0.010000 0.070000 0.300000 0.620000 0.480000 0.110000 0.400000 0.010000 Consensus sequence: YMWGSMYAGCCRKSKCTR Reserve complement motif 0.010000 0.110000 0.400000 0.480000 0.620000 0.070000 0.300000 0.010000 0.069307 0.049505 0.821782 0.059406 0.040000 0.580000 0.010000 0.370000 0.069307 0.485149 0.405941 0.039604 0.090000 0.570000 0.040000 0.300000 0.089109 0.009901 0.435644 0.465347 0.070000 0.010000 0.910000 0.010000 0.029703 0.099010 0.693069 0.178218 0.050000 0.930000 0.010000 0.010000 0.009901 0.049505 0.138614 0.801980 0.120000 0.020000 0.450000 0.410000 0.336634 0.049505 0.554455 0.059406 0.040000 0.450000 0.410000 0.100000 0.010000 0.900000 0.080000 0.010000 0.300000 0.020000 0.160000 0.520000 0.010000 0.400000 0.050000 0.540000 0.009901 0.059406 0.465347 0.465347 Consensus sequence: KAGYSYKGGCTKRSCWYK ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 73 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_primaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 5 18 0.027117 Species: Mus musculus Original motif 0.204923 0.208846 0.365383 0.220848 0.294304 0.300143 0.167287 0.238266 0.109711 0.619514 0.117379 0.153396 0.178979 0.378580 0.230177 0.212264 0.159594 0.542602 0.118178 0.179627 0.125206 0.430074 0.151826 0.292894 0.097692 0.709845 0.116956 0.075506 0.148292 0.565912 0.037632 0.248164 0.077951 0.034190 0.855503 0.032356 0.001657 0.001061 0.971877 0.025405 0.001926 0.001084 0.991712 0.005278 0.033031 0.012001 0.057796 0.897171 0.002723 0.002647 0.993348 0.001281 0.003261 0.000963 0.987199 0.008577 0.000611 0.090925 0.074857 0.833608 0.015299 0.978878 0.004949 0.000874 0.013368 0.600902 0.033485 0.352245 0.231949 0.149575 0.118804 0.499672 0.267580 0.186002 0.371242 0.175176 0.264884 0.223483 0.110082 0.401551 0.221365 0.170121 0.179559 0.428955 0.112997 0.692930 0.139981 0.054092 0.460305 0.207883 0.155111 0.176702 Consensus sequence: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH Reverse complement motif 0.176702 0.207883 0.155111 0.460305 0.112997 0.139981 0.692930 0.054092 0.428955 0.170121 0.179559 0.221365 0.401551 0.223483 0.110082 0.264884 0.267580 0.371242 0.186002 0.175176 0.499672 0.149575 0.118804 0.231949 0.013368 0.033485 0.600902 0.352245 0.015299 0.004949 0.978878 0.000874 0.833608 0.090925 0.074857 0.000611 0.003261 0.987199 0.000963 0.008577 0.002723 0.993348 0.002647 0.001281 0.897171 0.012001 0.057796 0.033031 0.001926 0.991712 0.001084 0.005278 0.001657 0.971877 0.001061 0.025405 0.077951 0.855503 0.034190 0.032356 0.148292 0.037632 0.565912 0.248164 0.097692 0.116956 0.709845 0.075506 0.125206 0.151826 0.430074 0.292894 0.159594 0.118178 0.542602 0.179627 0.178979 0.230177 0.378580 0.212264 0.109711 0.117379 0.619514 0.153396 0.294304 0.167287 0.300143 0.238266 0.204923 0.365383 0.208846 0.220848 Consensus sequence: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB Alignment: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB ----YMWGSMYAGCCRKSKCTR- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00400 Zif268 Reverse Complement Reverse Complement Forward 6 18 0.028067 Species: Mus musculus Original motif 0.104824 0.412716 0.254506 0.227955 0.644922 0.065476 0.140479 0.149122 0.201205 0.166164 0.347131 0.285501 0.360606 0.256316 0.150766 0.232313 0.199831 0.240681 0.279350 0.280137 0.234308 0.204076 0.321306 0.240310 0.274112 0.462435 0.111425 0.152028 0.067070 0.717501 0.073934 0.141496 0.106745 0.084442 0.658566 0.150247 0.025128 0.967053 0.003585 0.004234 0.006412 0.982989 0.003227 0.007371 0.009588 0.877620 0.002571 0.110221 0.621521 0.355443 0.015669 0.007366 0.002600 0.980275 0.004191 0.012934 0.118773 0.026658 0.783843 0.070725 0.022358 0.822101 0.024684 0.130857 0.713212 0.080912 0.128793 0.077084 0.166568 0.250955 0.107934 0.474544 0.225040 0.222494 0.163301 0.389166 0.268976 0.223206 0.265314 0.242504 0.137052 0.229058 0.148439 0.485451 0.135819 0.304550 0.141994 0.417637 0.272440 0.319501 0.230580 0.177478 Consensus sequence: BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV Reverse complement motif 0.272440 0.230580 0.319501 0.177478 0.417637 0.304550 0.141994 0.135819 0.485451 0.229058 0.148439 0.137052 0.242504 0.223206 0.265314 0.268976 0.389166 0.222494 0.163301 0.225040 0.474544 0.250955 0.107934 0.166568 0.077084 0.080912 0.128793 0.713212 0.022358 0.024684 0.822101 0.130857 0.118773 0.783843 0.026658 0.070725 0.002600 0.004191 0.980275 0.012934 0.007366 0.355443 0.015669 0.621521 0.009588 0.002571 0.877620 0.110221 0.006412 0.003227 0.982989 0.007371 0.025128 0.003585 0.967053 0.004234 0.106745 0.658566 0.084442 0.150247 0.067070 0.073934 0.717501 0.141496 0.274112 0.111425 0.462435 0.152028 0.234308 0.321306 0.204076 0.240310 0.280137 0.240681 0.279350 0.199831 0.232313 0.256316 0.150766 0.360606 0.201205 0.347131 0.166164 0.285501 0.149122 0.065476 0.140479 0.644922 0.104824 0.254506 0.412716 0.227955 Consensus sequence: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB Alignment: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB -----KAGYSYKGGCTKRSCWYK ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 3 18 0.028438 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH ---YMWGSMYAGCCRKSKCTR-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 3 18 0.031398 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK --KAGYSYKGGCTKRSCWYK-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_primaryOriginal Motif Original Motif Backward 2 18 0.032852 Species: Mus musculus Original motif 0.183797 0.268049 0.330111 0.218043 0.127599 0.330310 0.243614 0.298477 0.143199 0.188046 0.268593 0.400162 0.214690 0.205230 0.247090 0.332990 0.294688 0.299104 0.327152 0.079056 0.221909 0.193223 0.480155 0.104712 0.444072 0.068239 0.481838 0.005852 0.006182 0.015429 0.901278 0.077111 0.766535 0.111138 0.121632 0.000696 0.014848 0.973961 0.000298 0.010893 0.001807 0.992200 0.002669 0.003324 0.795344 0.140510 0.018576 0.045571 0.006990 0.988200 0.002510 0.002299 0.154898 0.842296 0.000998 0.001808 0.029577 0.919262 0.006935 0.044226 0.677987 0.032075 0.185065 0.104874 0.195132 0.364580 0.319321 0.120967 0.225412 0.115034 0.612849 0.046705 0.548628 0.058900 0.162857 0.229616 0.112531 0.340331 0.165910 0.381227 0.073029 0.303078 0.363896 0.259997 0.561485 0.260567 0.092979 0.084969 0.132283 0.457691 0.140159 0.269867 Consensus sequence: BBBDVVRGACCACCCAVGABBAB Reverse complement motif 0.132283 0.140159 0.457691 0.269867 0.084969 0.260567 0.092979 0.561485 0.073029 0.363896 0.303078 0.259997 0.381227 0.340331 0.165910 0.112531 0.229616 0.058900 0.162857 0.548628 0.225412 0.612849 0.115034 0.046705 0.195132 0.319321 0.364580 0.120967 0.104874 0.032075 0.185065 0.677987 0.029577 0.006935 0.919262 0.044226 0.154898 0.000998 0.842296 0.001808 0.006990 0.002510 0.988200 0.002299 0.045571 0.140510 0.018576 0.795344 0.001807 0.002669 0.992200 0.003324 0.014848 0.000298 0.973961 0.010893 0.000696 0.111138 0.121632 0.766535 0.006182 0.901278 0.015429 0.077111 0.444072 0.481838 0.068239 0.005852 0.221909 0.480155 0.193223 0.104712 0.294688 0.327152 0.299104 0.079056 0.332990 0.205230 0.247090 0.214690 0.400162 0.188046 0.268593 0.143199 0.127599 0.243614 0.330310 0.298477 0.183797 0.330111 0.268049 0.218043 Consensus sequence: BTBVTCVTGGGTGGTCMVVDVBB Alignment: BBBDVVRGACCACCCAVGABBAB ----YMWGSMYAGCCRKSKCTR- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 74 Motif name: C074 Original motif 0.280000 0.600000 0.070000 0.050000 0.200000 0.550000 0.230000 0.020000 0.840000 0.040000 0.070000 0.050000 0.020000 0.010000 0.950000 0.020000 0.010000 0.200000 0.780000 0.010000 0.030000 0.940000 0.020000 0.010000 0.435644 0.009901 0.009901 0.544554 0.306931 0.009901 0.633663 0.049505 0.030000 0.010000 0.950000 0.010000 0.080000 0.660000 0.240000 0.020000 0.050000 0.560000 0.320000 0.070000 0.030000 0.030000 0.440000 0.500000 0.030000 0.310000 0.480000 0.180000 Consensus sequence: CCAGGCWGGCSKS Reserve complement motif 0.030000 0.480000 0.310000 0.180000 0.500000 0.030000 0.440000 0.030000 0.050000 0.320000 0.560000 0.070000 0.080000 0.240000 0.660000 0.020000 0.030000 0.950000 0.010000 0.010000 0.306931 0.633663 0.009901 0.049505 0.544554 0.009901 0.009901 0.435644 0.030000 0.020000 0.940000 0.010000 0.010000 0.780000 0.200000 0.010000 0.020000 0.950000 0.010000 0.020000 0.050000 0.040000 0.070000 0.840000 0.200000 0.230000 0.550000 0.020000 0.280000 0.070000 0.600000 0.050000 Consensus sequence: SRSGCCWGCCTGG ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 74 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_primaryReverse Complement Original Motif Forward 6 13 0.025772 Species: Mus musculus Original motif 0.183797 0.268049 0.330111 0.218043 0.127599 0.330310 0.243614 0.298477 0.143199 0.188046 0.268593 0.400162 0.214690 0.205230 0.247090 0.332990 0.294688 0.299104 0.327152 0.079056 0.221909 0.193223 0.480155 0.104712 0.444072 0.068239 0.481838 0.005852 0.006182 0.015429 0.901278 0.077111 0.766535 0.111138 0.121632 0.000696 0.014848 0.973961 0.000298 0.010893 0.001807 0.992200 0.002669 0.003324 0.795344 0.140510 0.018576 0.045571 0.006990 0.988200 0.002510 0.002299 0.154898 0.842296 0.000998 0.001808 0.029577 0.919262 0.006935 0.044226 0.677987 0.032075 0.185065 0.104874 0.195132 0.364580 0.319321 0.120967 0.225412 0.115034 0.612849 0.046705 0.548628 0.058900 0.162857 0.229616 0.112531 0.340331 0.165910 0.381227 0.073029 0.303078 0.363896 0.259997 0.561485 0.260567 0.092979 0.084969 0.132283 0.457691 0.140159 0.269867 Consensus sequence: BBBDVVRGACCACCCAVGABBAB Reverse complement motif 0.132283 0.140159 0.457691 0.269867 0.084969 0.260567 0.092979 0.561485 0.073029 0.363896 0.303078 0.259997 0.381227 0.340331 0.165910 0.112531 0.229616 0.058900 0.162857 0.548628 0.225412 0.612849 0.115034 0.046705 0.195132 0.319321 0.364580 0.120967 0.104874 0.032075 0.185065 0.677987 0.029577 0.006935 0.919262 0.044226 0.154898 0.000998 0.842296 0.001808 0.006990 0.002510 0.988200 0.002299 0.045571 0.140510 0.018576 0.795344 0.001807 0.002669 0.992200 0.003324 0.014848 0.000298 0.973961 0.010893 0.000696 0.111138 0.121632 0.766535 0.006182 0.901278 0.015429 0.077111 0.444072 0.481838 0.068239 0.005852 0.221909 0.480155 0.193223 0.104712 0.294688 0.327152 0.299104 0.079056 0.332990 0.205230 0.247090 0.214690 0.400162 0.188046 0.268593 0.143199 0.127599 0.243614 0.330310 0.298477 0.183797 0.330111 0.268049 0.218043 Consensus sequence: BTBVTCVTGGGTGGTCMVVDVBB Alignment: BBBDVVRGACCACCCAVGABBAB -----SRSGCCWGCCTGG----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00526 Foxn1_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 5 13 0.027065 Species: Mus musculus Original motif 0.477863 0.106306 0.184102 0.231729 0.304951 0.149020 0.361418 0.184612 0.548996 0.056128 0.348902 0.045974 0.385727 0.477782 0.086218 0.050273 0.409556 0.232265 0.173851 0.184328 0.174550 0.312880 0.307123 0.205448 0.850398 0.047204 0.041665 0.060734 0.141234 0.548534 0.142230 0.168002 0.059462 0.026354 0.892948 0.021236 0.053714 0.870297 0.028935 0.047055 0.086273 0.069147 0.805284 0.039296 0.033781 0.573881 0.034115 0.358223 0.035191 0.079663 0.824970 0.060176 0.051830 0.862631 0.019359 0.066180 0.178685 0.015738 0.762485 0.043092 0.058988 0.042615 0.017608 0.880789 0.202382 0.173360 0.284095 0.340163 0.098493 0.234651 0.506524 0.160333 0.109087 0.336204 0.250510 0.304198 0.130945 0.250843 0.177122 0.441090 0.353830 0.138838 0.162784 0.344548 0.114290 0.417163 0.160662 0.307885 Consensus sequence: DDRMHBACGCGYGCGTDGBBDB Reverse complement motif 0.114290 0.160662 0.417163 0.307885 0.344548 0.138838 0.162784 0.353830 0.441090 0.250843 0.177122 0.130945 0.109087 0.250510 0.336204 0.304198 0.098493 0.506524 0.234651 0.160333 0.340163 0.173360 0.284095 0.202382 0.880789 0.042615 0.017608 0.058988 0.178685 0.762485 0.015738 0.043092 0.051830 0.019359 0.862631 0.066180 0.035191 0.824970 0.079663 0.060176 0.033781 0.034115 0.573881 0.358223 0.086273 0.805284 0.069147 0.039296 0.053714 0.028935 0.870297 0.047055 0.059462 0.892948 0.026354 0.021236 0.141234 0.142230 0.548534 0.168002 0.060734 0.047204 0.041665 0.850398 0.174550 0.307123 0.312880 0.205448 0.184328 0.232265 0.173851 0.409556 0.385727 0.086218 0.477782 0.050273 0.045974 0.056128 0.348902 0.548996 0.304951 0.361418 0.149020 0.184612 0.231729 0.106306 0.184102 0.477863 Consensus sequence: BDVBCDACGCKCGCGTBHRKHD Alignment: DDRMHBACGCGYGCGTDGBBDB -----SRSGCCWGCCTGG---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00000 Smad3_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 2 13 0.028328 Species: Mus musculus Original motif 0.150668 0.131779 0.245665 0.471887 0.316817 0.287314 0.150829 0.245040 0.256473 0.409066 0.109700 0.224761 0.210646 0.220222 0.345010 0.224122 0.166679 0.508939 0.081676 0.242705 0.049351 0.759380 0.088489 0.102780 0.047598 0.785546 0.121957 0.044898 0.004606 0.944933 0.034696 0.015764 0.040252 0.050652 0.890382 0.018713 0.003038 0.913699 0.022449 0.060814 0.028672 0.941477 0.012276 0.017575 0.635243 0.139731 0.110495 0.114531 0.240016 0.385948 0.182848 0.191188 0.210430 0.274127 0.085171 0.430272 0.088118 0.454598 0.208989 0.248295 0.181269 0.265028 0.149023 0.404680 0.101070 0.252682 0.368542 0.277706 Consensus sequence: DHHBCCCCGCCAHHBHB Reverse complement motif 0.101070 0.368542 0.252682 0.277706 0.404680 0.265028 0.149023 0.181269 0.088118 0.208989 0.454598 0.248295 0.430272 0.274127 0.085171 0.210430 0.240016 0.182848 0.385948 0.191188 0.114531 0.139731 0.110495 0.635243 0.028672 0.012276 0.941477 0.017575 0.003038 0.022449 0.913699 0.060814 0.040252 0.890382 0.050652 0.018713 0.004606 0.034696 0.944933 0.015764 0.047598 0.121957 0.785546 0.044898 0.049351 0.088489 0.759380 0.102780 0.166679 0.081676 0.508939 0.242705 0.210646 0.345010 0.220222 0.224122 0.256473 0.109700 0.409066 0.224761 0.245040 0.287314 0.150829 0.316817 0.471887 0.131779 0.245665 0.150668 Consensus sequence: BHBHDTGGCGGGGBDHD Alignment: BHBHDTGGCGGGGBDHD ---CCAGGCWGGCSKS- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00002 Sp4_secondary Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 13 0.031324 Species: Mus musculus Original motif 0.146334 0.312326 0.244281 0.297060 0.493155 0.092609 0.162506 0.251729 0.503593 0.059863 0.077561 0.358984 0.763321 0.015264 0.213114 0.008301 0.012415 0.025932 0.945502 0.016151 0.006713 0.015221 0.950098 0.027968 0.062415 0.834303 0.054500 0.048782 0.011010 0.020677 0.928821 0.039493 0.012785 0.024162 0.145822 0.817231 0.133595 0.033962 0.787876 0.044567 0.140697 0.180481 0.428253 0.250570 0.036281 0.806412 0.033510 0.123797 0.157910 0.408607 0.122427 0.311055 0.292185 0.260017 0.197515 0.250283 0.251107 0.124480 0.359447 0.264967 Consensus sequence: BDWAGGCGTGBCHHD Reverse complement motif 0.251107 0.359447 0.124480 0.264967 0.250283 0.260017 0.197515 0.292185 0.157910 0.122427 0.408607 0.311055 0.036281 0.033510 0.806412 0.123797 0.140697 0.428253 0.180481 0.250570 0.133595 0.787876 0.033962 0.044567 0.817231 0.024162 0.145822 0.012785 0.011010 0.928821 0.020677 0.039493 0.062415 0.054500 0.834303 0.048782 0.006713 0.950098 0.015221 0.027968 0.012415 0.945502 0.025932 0.016151 0.008301 0.015264 0.213114 0.763321 0.358984 0.059863 0.077561 0.503593 0.251729 0.092609 0.162506 0.493155 0.146334 0.244281 0.312326 0.297060 Consensus sequence: HHDGBCACGCCTWDB Alignment: HHDGBCACGCCTWDB -SRSGCCWGCCTGG- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 5 13 0.032757 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB ------CCAGGCWGGCSKS---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 75 Motif name: C075 Original motif 0.460000 0.300000 0.030000 0.210000 0.240000 0.030000 0.690000 0.040000 0.040000 0.220000 0.710000 0.030000 0.010000 0.870000 0.110000 0.010000 0.880000 0.010000 0.010000 0.100000 0.060000 0.010000 0.920000 0.010000 0.630000 0.330000 0.030000 0.010000 0.009901 0.455446 0.504950 0.029703 0.120000 0.100000 0.710000 0.070000 0.010000 0.950000 0.030000 0.010000 0.880000 0.020000 0.020000 0.080000 0.050000 0.010000 0.930000 0.010000 0.130000 0.340000 0.510000 0.020000 0.050000 0.670000 0.110000 0.170000 0.140000 0.020000 0.440000 0.400000 Consensus sequence: MGGCAGMSGCAGSCK Reserve complement motif 0.140000 0.440000 0.020000 0.400000 0.050000 0.110000 0.670000 0.170000 0.130000 0.510000 0.340000 0.020000 0.050000 0.930000 0.010000 0.010000 0.080000 0.020000 0.020000 0.880000 0.010000 0.030000 0.950000 0.010000 0.120000 0.710000 0.100000 0.070000 0.009901 0.504950 0.455446 0.029703 0.010000 0.330000 0.030000 0.630000 0.060000 0.920000 0.010000 0.010000 0.100000 0.010000 0.010000 0.880000 0.010000 0.110000 0.870000 0.010000 0.040000 0.710000 0.220000 0.030000 0.240000 0.690000 0.030000 0.040000 0.210000 0.300000 0.030000 0.460000 Consensus sequence: YGSCTGCSYCTGCCY ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 75 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00099 Ascl2_primary Original Motif Original Motif Forward 3 15 0.034357 Species: Mus musculus Original motif 0.168852 0.325948 0.188604 0.316596 0.150343 0.193286 0.241301 0.415069 0.091518 0.482905 0.122928 0.302648 0.472493 0.198776 0.225796 0.102935 0.294513 0.179919 0.447250 0.078318 0.014660 0.972080 0.005591 0.007668 0.954848 0.008107 0.008474 0.028571 0.006076 0.178912 0.760021 0.054991 0.052082 0.817415 0.124797 0.005707 0.019342 0.010406 0.008905 0.961347 0.005455 0.008073 0.977684 0.008788 0.042946 0.715551 0.087020 0.154483 0.116888 0.241739 0.170073 0.471300 0.315931 0.324343 0.291451 0.068274 0.199164 0.366921 0.163690 0.270226 0.218561 0.211076 0.187732 0.382631 0.145317 0.139808 0.389262 0.325614 Consensus sequence: BBYVVCAGCTGCBVHHD Reverse complement motif 0.145317 0.389262 0.139808 0.325614 0.382631 0.211076 0.187732 0.218561 0.199164 0.163690 0.366921 0.270226 0.315931 0.291451 0.324343 0.068274 0.471300 0.241739 0.170073 0.116888 0.042946 0.087020 0.715551 0.154483 0.005455 0.977684 0.008073 0.008788 0.961347 0.010406 0.008905 0.019342 0.052082 0.124797 0.817415 0.005707 0.006076 0.760021 0.178912 0.054991 0.028571 0.008107 0.008474 0.954848 0.014660 0.005591 0.972080 0.007668 0.294513 0.447250 0.179919 0.078318 0.102935 0.198776 0.225796 0.472493 0.091518 0.122928 0.482905 0.302648 0.415069 0.193286 0.241301 0.150343 0.168852 0.188604 0.325948 0.316596 Consensus sequence: HHDVVGCAGCTGVBKVB Alignment: BBYVVCAGCTGCBVHHD --MGGCAGMSGCAGSCK ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00043 Bcl6b_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 2 15 0.035297 Species: Mus musculus Original motif 0.316572 0.278382 0.152556 0.252490 0.167141 0.257034 0.259894 0.315931 0.175523 0.325956 0.259996 0.238525 0.165052 0.385677 0.239449 0.209822 0.069489 0.782718 0.072454 0.075339 0.049943 0.800636 0.031988 0.117433 0.223382 0.060306 0.552691 0.163621 0.072944 0.818252 0.034406 0.074398 0.070535 0.845127 0.062712 0.021626 0.031035 0.859354 0.055424 0.054187 0.063668 0.798503 0.067274 0.070554 0.348488 0.030697 0.197179 0.423636 0.307220 0.256470 0.181009 0.255301 0.460933 0.285057 0.090258 0.163752 0.315798 0.228431 0.171135 0.284637 0.374527 0.268328 0.198810 0.158335 Consensus sequence: HBBBCCGCCCCWHHHV Reverse complement motif 0.158335 0.268328 0.198810 0.374527 0.284637 0.228431 0.171135 0.315798 0.163752 0.285057 0.090258 0.460933 0.255301 0.256470 0.181009 0.307220 0.423636 0.030697 0.197179 0.348488 0.063668 0.067274 0.798503 0.070554 0.031035 0.055424 0.859354 0.054187 0.070535 0.062712 0.845127 0.021626 0.072944 0.034406 0.818252 0.074398 0.223382 0.552691 0.060306 0.163621 0.049943 0.031988 0.800636 0.117433 0.069489 0.072454 0.782718 0.075339 0.165052 0.239449 0.385677 0.209822 0.175523 0.259996 0.325956 0.238525 0.315931 0.257034 0.259894 0.167141 0.252490 0.278382 0.152556 0.316572 Consensus sequence: BHHHWGGGGCGGBBVH Alignment: HBBBCCGCCCCWHHHV -YGSCTGCSYCTGCCY ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00079 Esrra_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 15 0.036392 Species: Mus musculus Original motif 0.212524 0.177958 0.293723 0.315796 0.420838 0.283140 0.144938 0.151084 0.198119 0.196347 0.260353 0.345181 0.117752 0.282184 0.137207 0.462857 0.070125 0.781439 0.138093 0.010344 0.965989 0.000956 0.023828 0.009227 0.977263 0.003066 0.019255 0.000416 0.007404 0.000267 0.938934 0.053395 0.007147 0.000287 0.983377 0.009190 0.039608 0.000730 0.040682 0.918981 0.000685 0.905345 0.021930 0.072040 0.800961 0.001126 0.195791 0.002121 0.245039 0.241263 0.038084 0.475614 0.265397 0.238316 0.304963 0.191325 0.203742 0.286208 0.231002 0.279048 0.194132 0.188854 0.346693 0.270322 0.310711 0.263840 0.184317 0.241132 Consensus sequence: DHDBCAAGGTCAHVBDH Reverse complement motif 0.241132 0.263840 0.184317 0.310711 0.194132 0.346693 0.188854 0.270322 0.203742 0.231002 0.286208 0.279048 0.265397 0.304963 0.238316 0.191325 0.475614 0.241263 0.038084 0.245039 0.002121 0.001126 0.195791 0.800961 0.000685 0.021930 0.905345 0.072040 0.918981 0.000730 0.040682 0.039608 0.007147 0.983377 0.000287 0.009190 0.007404 0.938934 0.000267 0.053395 0.000416 0.003066 0.019255 0.977263 0.009227 0.000956 0.023828 0.965989 0.070125 0.138093 0.781439 0.010344 0.462857 0.282184 0.137207 0.117752 0.345181 0.196347 0.260353 0.198119 0.151084 0.283140 0.144938 0.420838 0.315796 0.177958 0.293723 0.212524 Consensus sequence: HHBVHTGACCTTGVDHD Alignment: HHBVHTGACCTTGVDHD -YGSCTGCSYCTGCCY- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00033 Zfp410_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 3 15 0.036959 Species: Mus musculus Original motif 0.162979 0.284781 0.237433 0.314807 0.182449 0.447584 0.069464 0.300502 0.298973 0.261014 0.213211 0.226802 0.136039 0.433062 0.144274 0.286625 0.180084 0.395933 0.158565 0.265418 0.069354 0.748510 0.068898 0.113238 0.060485 0.717828 0.075333 0.146354 0.023280 0.071762 0.645500 0.259457 0.166896 0.749762 0.062730 0.020612 0.050401 0.775248 0.089072 0.085279 0.103847 0.767557 0.068804 0.059791 0.064815 0.748318 0.114588 0.072280 0.340921 0.071942 0.242981 0.344157 0.301967 0.263512 0.165927 0.268594 0.479800 0.222955 0.118441 0.178803 0.229469 0.283621 0.143099 0.343811 0.261733 0.180191 0.169905 0.388170 Consensus sequence: BHHBHCCGCCCCDHHHH Reverse complement motif 0.388170 0.180191 0.169905 0.261733 0.343811 0.283621 0.143099 0.229469 0.178803 0.222955 0.118441 0.479800 0.268594 0.263512 0.165927 0.301967 0.344157 0.071942 0.242981 0.340921 0.064815 0.114588 0.748318 0.072280 0.103847 0.068804 0.767557 0.059791 0.050401 0.089072 0.775248 0.085279 0.166896 0.062730 0.749762 0.020612 0.023280 0.645500 0.071762 0.259457 0.060485 0.075333 0.717828 0.146354 0.069354 0.068898 0.748510 0.113238 0.180084 0.158565 0.395933 0.265418 0.136039 0.144274 0.433062 0.286625 0.226802 0.261014 0.213211 0.298973 0.182449 0.069464 0.447584 0.300502 0.314807 0.284781 0.237433 0.162979 Consensus sequence: HHHHDGGGGCGGDBHDV Alignment: BHHBHCCGCCCCDHHHH --YGSCTGCSYCTGCCY ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00526 Foxn1_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 1 15 0.038102 Species: Mus musculus Original motif 0.477863 0.106306 0.184102 0.231729 0.304951 0.149020 0.361418 0.184612 0.548996 0.056128 0.348902 0.045974 0.385727 0.477782 0.086218 0.050273 0.409556 0.232265 0.173851 0.184328 0.174550 0.312880 0.307123 0.205448 0.850398 0.047204 0.041665 0.060734 0.141234 0.548534 0.142230 0.168002 0.059462 0.026354 0.892948 0.021236 0.053714 0.870297 0.028935 0.047055 0.086273 0.069147 0.805284 0.039296 0.033781 0.573881 0.034115 0.358223 0.035191 0.079663 0.824970 0.060176 0.051830 0.862631 0.019359 0.066180 0.178685 0.015738 0.762485 0.043092 0.058988 0.042615 0.017608 0.880789 0.202382 0.173360 0.284095 0.340163 0.098493 0.234651 0.506524 0.160333 0.109087 0.336204 0.250510 0.304198 0.130945 0.250843 0.177122 0.441090 0.353830 0.138838 0.162784 0.344548 0.114290 0.417163 0.160662 0.307885 Consensus sequence: DDRMHBACGCGYGCGTDGBBDB Reverse complement motif 0.114290 0.160662 0.417163 0.307885 0.344548 0.138838 0.162784 0.353830 0.441090 0.250843 0.177122 0.130945 0.109087 0.250510 0.336204 0.304198 0.098493 0.506524 0.234651 0.160333 0.340163 0.173360 0.284095 0.202382 0.880789 0.042615 0.017608 0.058988 0.178685 0.762485 0.015738 0.043092 0.051830 0.019359 0.862631 0.066180 0.035191 0.824970 0.079663 0.060176 0.033781 0.034115 0.573881 0.358223 0.086273 0.805284 0.069147 0.039296 0.053714 0.028935 0.870297 0.047055 0.059462 0.892948 0.026354 0.021236 0.141234 0.142230 0.548534 0.168002 0.060734 0.047204 0.041665 0.850398 0.174550 0.307123 0.312880 0.205448 0.184328 0.232265 0.173851 0.409556 0.385727 0.086218 0.477782 0.050273 0.045974 0.056128 0.348902 0.548996 0.304951 0.361418 0.149020 0.184612 0.231729 0.106306 0.184102 0.477863 Consensus sequence: BDVBCDACGCKCGCGTBHRKHD Alignment: DDRMHBACGCGYGCGTDGBBDB MGGCAGMSGCAGSCK------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 76 Motif name: C076 Original motif 0.574257 0.138614 0.188119 0.099010 0.090000 0.390000 0.490000 0.030000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.089109 0.188119 0.108911 0.613861 0.435644 0.009901 0.475248 0.079208 0.079208 0.792079 0.118812 0.009901 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.020000 0.240000 0.730000 0.009901 0.811881 0.059406 0.118812 0.069307 0.495050 0.009901 0.425743 0.069307 0.247525 0.465347 0.217822 0.039604 0.841584 0.009901 0.108911 0.099010 0.386139 0.445545 0.069307 0.108911 0.237624 0.207921 0.445545 Consensus sequence: ASCTRCCTCYBCSB Reserve complement motif 0.445545 0.237624 0.207921 0.108911 0.099010 0.445545 0.386139 0.069307 0.039604 0.009901 0.841584 0.108911 0.069307 0.465347 0.247525 0.217822 0.069307 0.009901 0.495050 0.425743 0.009901 0.059406 0.811881 0.118812 0.730000 0.020000 0.240000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.079208 0.118812 0.792079 0.009901 0.435644 0.475248 0.009901 0.079208 0.613861 0.188119 0.108911 0.089109 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.090000 0.490000 0.390000 0.030000 0.099010 0.138614 0.188119 0.574257 Consensus sequence: VSGBKGAGGMAGST ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 76 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00043 Bcl6b_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 1 14 0.026676 Species: Mus musculus Original motif 0.316572 0.278382 0.152556 0.252490 0.167141 0.257034 0.259894 0.315931 0.175523 0.325956 0.259996 0.238525 0.165052 0.385677 0.239449 0.209822 0.069489 0.782718 0.072454 0.075339 0.049943 0.800636 0.031988 0.117433 0.223382 0.060306 0.552691 0.163621 0.072944 0.818252 0.034406 0.074398 0.070535 0.845127 0.062712 0.021626 0.031035 0.859354 0.055424 0.054187 0.063668 0.798503 0.067274 0.070554 0.348488 0.030697 0.197179 0.423636 0.307220 0.256470 0.181009 0.255301 0.460933 0.285057 0.090258 0.163752 0.315798 0.228431 0.171135 0.284637 0.374527 0.268328 0.198810 0.158335 Consensus sequence: HBBBCCGCCCCWHHHV Reverse complement motif 0.158335 0.268328 0.198810 0.374527 0.284637 0.228431 0.171135 0.315798 0.163752 0.285057 0.090258 0.460933 0.255301 0.256470 0.181009 0.307220 0.423636 0.030697 0.197179 0.348488 0.063668 0.067274 0.798503 0.070554 0.031035 0.055424 0.859354 0.054187 0.070535 0.062712 0.845127 0.021626 0.072944 0.034406 0.818252 0.074398 0.223382 0.552691 0.060306 0.163621 0.049943 0.031988 0.800636 0.117433 0.069489 0.072454 0.782718 0.075339 0.165052 0.239449 0.385677 0.209822 0.175523 0.259996 0.325956 0.238525 0.315931 0.257034 0.259894 0.167141 0.252490 0.278382 0.152556 0.316572 Consensus sequence: BHHHWGGGGCGGBBVH Alignment: BHHHWGGGGCGGBBVH VSGBKGAGGMAGST-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00033 Zfp410_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 4 14 0.027267 Species: Mus musculus Original motif 0.162979 0.284781 0.237433 0.314807 0.182449 0.447584 0.069464 0.300502 0.298973 0.261014 0.213211 0.226802 0.136039 0.433062 0.144274 0.286625 0.180084 0.395933 0.158565 0.265418 0.069354 0.748510 0.068898 0.113238 0.060485 0.717828 0.075333 0.146354 0.023280 0.071762 0.645500 0.259457 0.166896 0.749762 0.062730 0.020612 0.050401 0.775248 0.089072 0.085279 0.103847 0.767557 0.068804 0.059791 0.064815 0.748318 0.114588 0.072280 0.340921 0.071942 0.242981 0.344157 0.301967 0.263512 0.165927 0.268594 0.479800 0.222955 0.118441 0.178803 0.229469 0.283621 0.143099 0.343811 0.261733 0.180191 0.169905 0.388170 Consensus sequence: BHHBHCCGCCCCDHHHH Reverse complement motif 0.388170 0.180191 0.169905 0.261733 0.343811 0.283621 0.143099 0.229469 0.178803 0.222955 0.118441 0.479800 0.268594 0.263512 0.165927 0.301967 0.344157 0.071942 0.242981 0.340921 0.064815 0.114588 0.748318 0.072280 0.103847 0.068804 0.767557 0.059791 0.050401 0.089072 0.775248 0.085279 0.166896 0.062730 0.749762 0.020612 0.023280 0.645500 0.071762 0.259457 0.060485 0.075333 0.717828 0.146354 0.069354 0.068898 0.748510 0.113238 0.180084 0.158565 0.395933 0.265418 0.136039 0.144274 0.433062 0.286625 0.226802 0.261014 0.213211 0.298973 0.182449 0.069464 0.447584 0.300502 0.314807 0.284781 0.237433 0.162979 Consensus sequence: HHHHDGGGGCGGDBHDV Alignment: HHHHDGGGGCGGDBHDV VSGBKGAGGMAGST--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00013 Gabpa_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 1 14 0.030213 Species: Mus musculus Original motif 0.233133 0.551828 0.139009 0.076030 0.100085 0.525562 0.101688 0.272665 0.252996 0.198121 0.299171 0.249711 0.141471 0.195290 0.234560 0.428679 0.160993 0.442765 0.082653 0.313590 0.307890 0.127950 0.071713 0.492448 0.093453 0.148935 0.080288 0.677324 0.083535 0.634212 0.074652 0.207601 0.098119 0.639328 0.099957 0.162596 0.067430 0.451776 0.357188 0.123606 0.286259 0.466975 0.063013 0.183753 0.203211 0.422637 0.133368 0.240783 0.111206 0.315595 0.192833 0.380366 0.199462 0.324652 0.305491 0.170395 0.347919 0.292387 0.230724 0.128970 0.254648 0.294196 0.194942 0.256214 Consensus sequence: CYDBYWTCCSMHBVVH Reverse complement motif 0.254648 0.194942 0.294196 0.256214 0.128970 0.292387 0.230724 0.347919 0.199462 0.305491 0.324652 0.170395 0.380366 0.315595 0.192833 0.111206 0.203211 0.133368 0.422637 0.240783 0.286259 0.063013 0.466975 0.183753 0.067430 0.357188 0.451776 0.123606 0.098119 0.099957 0.639328 0.162596 0.083535 0.074652 0.634212 0.207601 0.677324 0.148935 0.080288 0.093453 0.492448 0.127950 0.071713 0.307890 0.160993 0.082653 0.442765 0.313590 0.428679 0.195290 0.234560 0.141471 0.252996 0.299171 0.198121 0.249711 0.100085 0.101688 0.525562 0.272665 0.233133 0.139009 0.551828 0.076030 Consensus sequence: DBVVDRSGGAWKVHKG Alignment: DBVVDRSGGAWKVHKG VSGBKGAGGMAGST-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00022 Zfp740_primaryReverse Complement Reverse Complement Backward 2 14 0.032802 Species: Mus musculus Original motif 0.136946 0.396508 0.135309 0.331236 0.185528 0.417538 0.215409 0.181525 0.171276 0.341901 0.172832 0.313991 0.145641 0.590572 0.146376 0.117412 0.138035 0.660416 0.114016 0.087533 0.222728 0.750532 0.007528 0.019212 0.024633 0.963314 0.001894 0.010159 0.009557 0.979956 0.000642 0.009844 0.010416 0.977424 0.000541 0.011619 0.026401 0.956740 0.001544 0.015314 0.195502 0.755959 0.011060 0.037480 0.491291 0.364785 0.025613 0.118311 0.305153 0.398160 0.071680 0.225008 0.253497 0.232647 0.213246 0.300610 0.156964 0.297876 0.144683 0.400477 0.179549 0.292514 0.319462 0.208475 Consensus sequence: HVBCCCCCCCCMHHHB Reverse complement motif 0.179549 0.319462 0.292514 0.208475 0.400477 0.297876 0.144683 0.156964 0.300610 0.232647 0.213246 0.253497 0.305153 0.071680 0.398160 0.225008 0.118311 0.364785 0.025613 0.491291 0.195502 0.011060 0.755959 0.037480 0.026401 0.001544 0.956740 0.015314 0.010416 0.000541 0.977424 0.011619 0.009557 0.000642 0.979956 0.009844 0.024633 0.001894 0.963314 0.010159 0.222728 0.007528 0.750532 0.019212 0.138035 0.114016 0.660416 0.087533 0.145641 0.146376 0.590572 0.117412 0.171276 0.172832 0.341901 0.313991 0.185528 0.215409 0.417538 0.181525 0.136946 0.135309 0.396508 0.331236 Consensus sequence: BHHDYGGGGGGGGBVD Alignment: BHHDYGGGGGGGGBVD -VSGBKGAGGMAGST- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00022 Zfp740_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 4 14 0.033052 Species: Mus musculus Original motif 0.398967 0.071604 0.323957 0.205472 0.457709 0.058192 0.267218 0.216881 0.393346 0.032365 0.329533 0.244756 0.119528 0.091191 0.190078 0.599202 0.273933 0.123548 0.073075 0.529444 0.068935 0.812883 0.015245 0.102937 0.029664 0.907790 0.024804 0.037742 0.020725 0.933422 0.016796 0.029057 0.015086 0.948448 0.018030 0.018436 0.015628 0.884941 0.061172 0.038259 0.067508 0.744063 0.107305 0.081125 0.108097 0.140614 0.650174 0.101115 0.065696 0.247239 0.506149 0.180916 0.395005 0.077185 0.345914 0.181895 0.527081 0.093650 0.281853 0.097416 0.289378 0.245159 0.348803 0.116660 0.147136 0.260117 0.145993 0.446754 Consensus sequence: DDDTWCCCCCCGGDRVH Reverse complement motif 0.446754 0.260117 0.145993 0.147136 0.289378 0.348803 0.245159 0.116660 0.097416 0.093650 0.281853 0.527081 0.181895 0.077185 0.345914 0.395005 0.065696 0.506149 0.247239 0.180916 0.108097 0.650174 0.140614 0.101115 0.067508 0.107305 0.744063 0.081125 0.015628 0.061172 0.884941 0.038259 0.015086 0.018030 0.948448 0.018436 0.020725 0.016796 0.933422 0.029057 0.029664 0.024804 0.907790 0.037742 0.068935 0.015245 0.812883 0.102937 0.529444 0.123548 0.073075 0.273933 0.599202 0.091191 0.190078 0.119528 0.244756 0.032365 0.329533 0.393346 0.216881 0.058192 0.267218 0.457709 0.205472 0.071604 0.323957 0.398967 Consensus sequence: HVKDCCGGGGGGWADDD Alignment: HVKDCCGGGGGGWADDD ---VSGBKGAGGMAGST ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 77 Motif name: C077 Original motif 0.160000 0.300000 0.520000 0.020000 0.118812 0.138614 0.475248 0.267327 0.050505 0.545455 0.131313 0.272727 0.170000 0.570000 0.030000 0.230000 0.207921 0.594059 0.029703 0.168317 0.150000 0.730000 0.010000 0.110000 0.190000 0.160000 0.640000 0.010000 0.108911 0.257426 0.623762 0.009901 0.019802 0.445545 0.524752 0.009901 0.010000 0.580000 0.320000 0.090000 0.010000 0.560000 0.170000 0.260000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.080000 0.840000 0.040000 0.040000 0.090000 0.610000 0.250000 0.050000 0.100000 0.820000 0.030000 0.050000 0.060000 0.500000 0.240000 0.200000 Consensus sequence: SBCCCCGGSSCCCCCB Reserve complement motif 0.060000 0.240000 0.500000 0.200000 0.100000 0.030000 0.820000 0.050000 0.090000 0.250000 0.610000 0.050000 0.080000 0.040000 0.840000 0.040000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.170000 0.560000 0.260000 0.010000 0.320000 0.580000 0.090000 0.019802 0.524752 0.445545 0.009901 0.108911 0.623762 0.257426 0.009901 0.190000 0.640000 0.160000 0.010000 0.150000 0.010000 0.730000 0.110000 0.207921 0.029703 0.594059 0.168317 0.170000 0.030000 0.570000 0.230000 0.050505 0.131313 0.545455 0.272727 0.118812 0.475248 0.138614 0.267327 0.160000 0.520000 0.300000 0.020000 Consensus sequence: BGGGGGSSCCGGGGBS ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 77 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00002 Sp4_primary Original Motif Original Motif Backward 2 16 0.048075 Species: Mus musculus Original motif 0.155386 0.223380 0.374454 0.246780 0.247106 0.159582 0.345111 0.248201 0.238889 0.258354 0.165304 0.337454 0.255612 0.489586 0.051621 0.203182 0.450100 0.545383 0.001071 0.003447 0.003704 0.991007 0.002456 0.002833 0.035504 0.001814 0.928129 0.034553 0.001494 0.991406 0.003414 0.003686 0.003045 0.990628 0.005182 0.001145 0.000990 0.963237 0.001215 0.034557 0.148016 0.838396 0.000666 0.012922 0.014261 0.905847 0.007200 0.072692 0.083394 0.270068 0.058368 0.588170 0.149141 0.286783 0.142802 0.421274 0.204851 0.347195 0.253356 0.194597 0.184442 0.299908 0.194408 0.321242 0.125793 0.380109 0.245318 0.248780 Consensus sequence: BDHHMCGCCCCCTHVBB Reverse complement motif 0.125793 0.245318 0.380109 0.248780 0.321242 0.299908 0.194408 0.184442 0.204851 0.253356 0.347195 0.194597 0.421274 0.286783 0.142802 0.149141 0.588170 0.270068 0.058368 0.083394 0.014261 0.007200 0.905847 0.072692 0.148016 0.000666 0.838396 0.012922 0.000990 0.001215 0.963237 0.034557 0.003045 0.005182 0.990628 0.001145 0.001494 0.003414 0.991406 0.003686 0.035504 0.928129 0.001814 0.034553 0.003704 0.002456 0.991007 0.002833 0.450100 0.001071 0.545383 0.003447 0.255612 0.051621 0.489586 0.203182 0.337454 0.258354 0.165304 0.238889 0.247106 0.345111 0.159582 0.248201 0.155386 0.374454 0.223380 0.246780 Consensus sequence: BVVHAGGGGGCGRDHHB Alignment: BDHHMCGCCCCCTHVBB SBCCCCGGSSCCCCCB- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 1 16 0.048440 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH -------BGGGGGSSCCGGGGBS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 1 16 0.049048 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH SBCCCCGGSSCCCCCB------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00033 Zfp410_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 1 16 0.053518 Species: Mus musculus Original motif 0.162979 0.284781 0.237433 0.314807 0.182449 0.447584 0.069464 0.300502 0.298973 0.261014 0.213211 0.226802 0.136039 0.433062 0.144274 0.286625 0.180084 0.395933 0.158565 0.265418 0.069354 0.748510 0.068898 0.113238 0.060485 0.717828 0.075333 0.146354 0.023280 0.071762 0.645500 0.259457 0.166896 0.749762 0.062730 0.020612 0.050401 0.775248 0.089072 0.085279 0.103847 0.767557 0.068804 0.059791 0.064815 0.748318 0.114588 0.072280 0.340921 0.071942 0.242981 0.344157 0.301967 0.263512 0.165927 0.268594 0.479800 0.222955 0.118441 0.178803 0.229469 0.283621 0.143099 0.343811 0.261733 0.180191 0.169905 0.388170 Consensus sequence: BHHBHCCGCCCCDHHHH Reverse complement motif 0.388170 0.180191 0.169905 0.261733 0.343811 0.283621 0.143099 0.229469 0.178803 0.222955 0.118441 0.479800 0.268594 0.263512 0.165927 0.301967 0.344157 0.071942 0.242981 0.340921 0.064815 0.114588 0.748318 0.072280 0.103847 0.068804 0.767557 0.059791 0.050401 0.089072 0.775248 0.085279 0.166896 0.062730 0.749762 0.020612 0.023280 0.645500 0.071762 0.259457 0.060485 0.075333 0.717828 0.146354 0.069354 0.068898 0.748510 0.113238 0.180084 0.158565 0.395933 0.265418 0.136039 0.144274 0.433062 0.286625 0.226802 0.261014 0.213211 0.298973 0.182449 0.069464 0.447584 0.300502 0.314807 0.284781 0.237433 0.162979 Consensus sequence: HHHHDGGGGCGGDBHDV Alignment: HHHHDGGGGCGGDBHDV -BGGGGGSSCCGGGGBS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00527 Foxn4_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 1 16 0.054309 Species: Mus musculus Original motif 0.298336 0.418632 0.208054 0.074978 0.289907 0.015608 0.457100 0.237385 0.273583 0.077889 0.107860 0.540668 0.184954 0.161611 0.384390 0.269045 0.521826 0.156340 0.089019 0.232815 0.356716 0.131104 0.394857 0.117323 0.266669 0.108765 0.505273 0.119293 0.020778 0.047199 0.919524 0.012500 0.948536 0.018775 0.008113 0.024576 0.010822 0.964042 0.014701 0.010434 0.007428 0.019505 0.966351 0.006717 0.010025 0.975678 0.008648 0.005649 0.043796 0.120935 0.742979 0.092289 0.008252 0.250704 0.541132 0.199913 0.474428 0.044681 0.134430 0.346461 0.146597 0.421317 0.143166 0.288920 0.020540 0.181479 0.553811 0.244170 0.129612 0.173360 0.535219 0.161808 0.506084 0.158156 0.130983 0.204776 0.054872 0.103043 0.545792 0.296293 0.389882 0.171037 0.164162 0.274918 0.225861 0.314031 0.288872 0.171237 Consensus sequence: VDWDARRGACGCGGWHGGAKHV Reverse complement motif 0.225861 0.288872 0.314031 0.171237 0.274918 0.171037 0.164162 0.389882 0.054872 0.545792 0.103043 0.296293 0.204776 0.158156 0.130983 0.506084 0.129612 0.535219 0.173360 0.161808 0.020540 0.553811 0.181479 0.244170 0.146597 0.143166 0.421317 0.288920 0.346461 0.044681 0.134430 0.474428 0.008252 0.541132 0.250704 0.199913 0.043796 0.742979 0.120935 0.092289 0.010025 0.008648 0.975678 0.005649 0.007428 0.966351 0.019505 0.006717 0.010822 0.014701 0.964042 0.010434 0.024576 0.018775 0.008113 0.948536 0.020778 0.919524 0.047199 0.012500 0.266669 0.505273 0.108765 0.119293 0.356716 0.394857 0.131104 0.117323 0.232815 0.156340 0.089019 0.521826 0.184954 0.384390 0.161611 0.269045 0.540668 0.077889 0.107860 0.273583 0.289907 0.457100 0.015608 0.237385 0.298336 0.208054 0.418632 0.074978 Consensus sequence: VHYTCCDWCCGCGTCMMTHWHV Alignment: VDWDARRGACGCGGWHGGAKHV SBCCCCGGSSCCCCCB------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 78 Motif name: C078 Original motif 0.030000 0.310000 0.160000 0.500000 0.480000 0.190000 0.320000 0.010000 0.080000 0.290000 0.620000 0.010000 0.710000 0.010000 0.270000 0.010000 0.029703 0.326733 0.118812 0.524752 0.820000 0.010000 0.160000 0.010000 0.010000 0.070000 0.910000 0.010000 0.722772 0.049505 0.207921 0.019802 0.181818 0.191919 0.616162 0.010101 0.510000 0.170000 0.310000 0.010000 0.009901 0.158416 0.821782 0.009901 0.831683 0.009901 0.069307 0.089109 0.009901 0.316832 0.138614 0.534653 0.465347 0.207921 0.287129 0.039604 Consensus sequence: YRGAYAGAGRGAYR Reserve complement motif 0.039604 0.207921 0.287129 0.465347 0.534653 0.316832 0.138614 0.009901 0.089109 0.009901 0.069307 0.831683 0.009901 0.821782 0.158416 0.009901 0.010000 0.170000 0.310000 0.510000 0.181818 0.616162 0.191919 0.010101 0.019802 0.049505 0.207921 0.722772 0.010000 0.910000 0.070000 0.010000 0.010000 0.010000 0.160000 0.820000 0.524752 0.326733 0.118812 0.029703 0.010000 0.010000 0.270000 0.710000 0.080000 0.620000 0.290000 0.010000 0.010000 0.190000 0.320000 0.480000 0.500000 0.310000 0.160000 0.030000 Consensus sequence: KMTCKCTCTMTCKM ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 78 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score >UP00011 Irf6_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 1 14 0.028962 Species: Mus musculus Original motif 0.326255 0.256976 0.231005 0.185764 0.145621 0.315489 0.266193 0.272698 0.138750 0.396937 0.205185 0.259127 0.534194 0.121488 0.084178 0.260140 0.201823 0.589398 0.086624 0.122154 0.031428 0.023221 0.066048 0.879303 0.022389 0.889379 0.049165 0.039067 0.042252 0.295983 0.085234 0.576531 0.022905 0.915187 0.021569 0.040339 0.117305 0.061052 0.716358 0.105285 0.205873 0.113582 0.609303 0.071242 0.110208 0.084907 0.274228 0.530658 0.233550 0.385055 0.150708 0.230687 0.333806 0.136131 0.311600 0.218463 0.216423 0.309361 0.281145 0.193072 Consensus sequence: VBBACTCYCGGKHDV Reverse complement motif 0.216423 0.281145 0.309361 0.193072 0.218463 0.136131 0.311600 0.333806 0.233550 0.150708 0.385055 0.230687 0.530658 0.084907 0.274228 0.110208 0.205873 0.609303 0.113582 0.071242 0.117305 0.716358 0.061052 0.105285 0.022905 0.021569 0.915187 0.040339 0.576531 0.295983 0.085234 0.042252 0.022389 0.049165 0.889379 0.039067 0.879303 0.023221 0.066048 0.031428 0.201823 0.086624 0.589398 0.122154 0.260140 0.121488 0.084178 0.534194 0.138750 0.205185 0.396937 0.259127 0.145621 0.266193 0.315489 0.272698 0.185764 0.256976 0.231005 0.326255 Consensus sequence: VDDRCCGMGAGTBBB Alignment: VDDRCCGMGAGTBBB -KMTCKCTCTMTCKM ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00007 Egr1_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 1 14 0.033484 Species: Mus musculus Original motif 0.182057 0.230014 0.276532 0.311397 0.122004 0.156883 0.366166 0.354947 0.209446 0.335433 0.185677 0.269444 0.140035 0.276547 0.302466 0.280952 0.124879 0.019371 0.809895 0.045854 0.647807 0.117014 0.183956 0.051224 0.021434 0.011745 0.954633 0.012188 0.017853 0.009441 0.315429 0.657277 0.166123 0.008326 0.807215 0.018337 0.022775 0.008972 0.947283 0.020970 0.038795 0.033592 0.781209 0.146405 0.728916 0.032888 0.088836 0.149360 0.197826 0.427858 0.055755 0.318561 0.264938 0.196184 0.092516 0.446362 0.267969 0.195624 0.318766 0.217641 0.225006 0.250404 0.267265 0.257324 Consensus sequence: BBHBGAGTGGGAHHDB Reverse complement motif 0.225006 0.267265 0.250404 0.257324 0.267969 0.318766 0.195624 0.217641 0.446362 0.196184 0.092516 0.264938 0.197826 0.055755 0.427858 0.318561 0.149360 0.032888 0.088836 0.728916 0.038795 0.781209 0.033592 0.146405 0.022775 0.947283 0.008972 0.020970 0.166123 0.807215 0.008326 0.018337 0.657277 0.009441 0.315429 0.017853 0.021434 0.954633 0.011745 0.012188 0.051224 0.117014 0.183956 0.647807 0.124879 0.809895 0.019371 0.045854 0.140035 0.302466 0.276547 0.280952 0.209446 0.185677 0.335433 0.269444 0.122004 0.366166 0.156883 0.354947 0.311397 0.230014 0.276532 0.182057 Consensus sequence: BHHDTCCCACTCBDBV Alignment: BHHDTCCCACTCBDBV --KMTCKCTCTMTCKM ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00040 Irf5_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 1 14 0.033929 Species: Mus musculus Original motif 0.160739 0.237732 0.225630 0.375899 0.231003 0.186804 0.122026 0.460167 0.282260 0.197034 0.288737 0.231969 0.746029 0.055630 0.083427 0.114914 0.169536 0.340063 0.148794 0.341606 0.086576 0.827589 0.034986 0.050849 0.021280 0.012938 0.955490 0.010292 0.930476 0.013781 0.047798 0.007945 0.002126 0.038171 0.948134 0.011570 0.959483 0.009871 0.015462 0.015184 0.495380 0.028946 0.408360 0.067314 0.145964 0.186198 0.031072 0.636767 0.200379 0.206354 0.151807 0.441460 0.171996 0.390086 0.220850 0.217068 0.208281 0.322628 0.291771 0.177321 Consensus sequence: BHDAHCGAGARTHBV Reverse complement motif 0.208281 0.291771 0.322628 0.177321 0.171996 0.220850 0.390086 0.217068 0.441460 0.206354 0.151807 0.200379 0.636767 0.186198 0.031072 0.145964 0.067314 0.028946 0.408360 0.495380 0.015184 0.009871 0.015462 0.959483 0.002126 0.948134 0.038171 0.011570 0.007945 0.013781 0.047798 0.930476 0.021280 0.955490 0.012938 0.010292 0.086576 0.034986 0.827589 0.050849 0.341606 0.340063 0.148794 0.169536 0.114914 0.055630 0.083427 0.746029 0.282260 0.288737 0.197034 0.231969 0.460167 0.186804 0.122026 0.231003 0.375899 0.237732 0.225630 0.160739 Consensus sequence: VBHAKTCTCGHTHHV Alignment: BHDAHCGAGARTHBV YRGAYAGAGRGAYR- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00078 Arid3a_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 2 14 0.035249 Species: Mus musculus Original motif 0.308020 0.276347 0.161615 0.254018 0.248646 0.301261 0.219934 0.230159 0.256412 0.342954 0.245072 0.155562 0.272754 0.338198 0.328556 0.060492 0.373995 0.152484 0.388888 0.084633 0.072916 0.189056 0.158990 0.579039 0.811964 0.071447 0.101263 0.015326 0.040888 0.172829 0.100771 0.685513 0.178536 0.579508 0.209023 0.032934 0.502338 0.073826 0.252643 0.171194 0.348504 0.097030 0.274747 0.279718 0.437867 0.210964 0.247804 0.103365 0.248429 0.088640 0.177088 0.485843 0.215645 0.320917 0.122076 0.341362 0.198295 0.099966 0.334817 0.366922 Consensus sequence: HHVVRTATCRDVDHD Reverse complement motif 0.366922 0.099966 0.334817 0.198295 0.341362 0.320917 0.122076 0.215645 0.485843 0.088640 0.177088 0.248429 0.103365 0.210964 0.247804 0.437867 0.279718 0.097030 0.274747 0.348504 0.171194 0.073826 0.252643 0.502338 0.178536 0.209023 0.579508 0.032934 0.685513 0.172829 0.100771 0.040888 0.015326 0.071447 0.101263 0.811964 0.579039 0.189056 0.158990 0.072916 0.373995 0.388888 0.152484 0.084633 0.272754 0.328556 0.338198 0.060492 0.256412 0.245072 0.342954 0.155562 0.248646 0.219934 0.301261 0.230159 0.254018 0.276347 0.161615 0.308020 Consensus sequence: DHDBDKGATAMVVDH Alignment: HHVVRTATCRDVDHD -YRGAYAGAGRGAYR ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 8 14 0.039215 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK -------YRGAYAGAGRGAYR- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 79 Motif name: C079 Original motif 0.530000 0.240000 0.010000 0.220000 0.272727 0.060606 0.272727 0.393939 0.752475 0.019802 0.188119 0.039604 0.762376 0.009901 0.138614 0.089109 0.524752 0.247525 0.019802 0.207921 0.170000 0.010000 0.360000 0.460000 0.530000 0.020000 0.010000 0.440000 0.752475 0.118812 0.118812 0.009901 0.660000 0.010000 0.300000 0.030000 0.780000 0.150000 0.060000 0.010000 0.742574 0.019802 0.128713 0.108911 0.524752 0.009901 0.009901 0.455446 0.610000 0.240000 0.010000 0.140000 0.090000 0.040000 0.410000 0.460000 0.702970 0.069307 0.207921 0.019802 0.650000 0.010000 0.330000 0.010000 0.530000 0.170000 0.010000 0.290000 Consensus sequence: ADAAAKWAAAAWAKARW Reserve complement motif 0.290000 0.170000 0.010000 0.530000 0.010000 0.010000 0.330000 0.650000 0.019802 0.069307 0.207921 0.702970 0.460000 0.040000 0.410000 0.090000 0.140000 0.240000 0.010000 0.610000 0.455446 0.009901 0.009901 0.524752 0.108911 0.019802 0.128713 0.742574 0.010000 0.150000 0.060000 0.780000 0.030000 0.010000 0.300000 0.660000 0.009901 0.118812 0.118812 0.752475 0.440000 0.020000 0.010000 0.530000 0.460000 0.010000 0.360000 0.170000 0.207921 0.247525 0.019802 0.524752 0.089109 0.009901 0.138614 0.762376 0.039604 0.019802 0.188119 0.752475 0.393939 0.060606 0.272727 0.272727 0.220000 0.240000 0.010000 0.530000 Consensus sequence: WKTRTWTTTTWRTTTDT ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 79 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00077 Srf_secondary Original Motif Original Motif Backward 1 17 0.026537 Species: Mus musculus Original motif 0.162968 0.284828 0.440984 0.111220 0.151392 0.200635 0.205316 0.442657 0.267215 0.083669 0.192498 0.456618 0.332771 0.180711 0.200027 0.286491 0.509370 0.102954 0.242569 0.145107 0.666262 0.077309 0.154466 0.101962 0.737968 0.113335 0.100401 0.048296 0.658878 0.141580 0.134033 0.065510 0.766115 0.094051 0.069763 0.070072 0.755621 0.088491 0.044802 0.111086 0.749083 0.135917 0.047510 0.067490 0.663231 0.176795 0.028134 0.131839 0.553358 0.277659 0.038655 0.130328 0.392578 0.314083 0.209844 0.083495 0.198462 0.237132 0.239466 0.324940 0.275121 0.210087 0.194779 0.320013 0.287748 0.277395 0.142704 0.292154 Consensus sequence: VBDDAAAAAAAAMVBHH Reverse complement motif 0.292154 0.277395 0.142704 0.287748 0.320013 0.210087 0.194779 0.275121 0.324940 0.237132 0.239466 0.198462 0.083495 0.314083 0.209844 0.392578 0.130328 0.277659 0.038655 0.553358 0.131839 0.176795 0.028134 0.663231 0.067490 0.135917 0.047510 0.749083 0.111086 0.088491 0.044802 0.755621 0.070072 0.094051 0.069763 0.766115 0.065510 0.141580 0.134033 0.658878 0.048296 0.113335 0.100401 0.737968 0.101962 0.077309 0.154466 0.666262 0.145107 0.102954 0.242569 0.509370 0.286491 0.180711 0.200027 0.332771 0.456618 0.083669 0.192498 0.267215 0.442657 0.200635 0.205316 0.151392 0.162968 0.440984 0.284828 0.111220 Consensus sequence: HHVBYTTTTTTTTDDVV Alignment: VBDDAAAAAAAAMVBHH ADAAAKWAAAAWAKARW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 17 0.031944 Species: Mus musculus Original motif 0.360997 0.300272 0.115555 0.223177 0.309749 0.228429 0.166233 0.295589 0.149419 0.176868 0.240155 0.433558 0.379704 0.095791 0.276373 0.248133 0.394549 0.174184 0.130641 0.300626 0.443749 0.070776 0.211081 0.274393 0.364301 0.074356 0.370406 0.190936 0.791976 0.038475 0.093390 0.076159 0.963721 0.001826 0.002456 0.031997 0.004516 0.954596 0.008092 0.032796 0.981080 0.002062 0.002161 0.014697 0.986185 0.001846 0.006976 0.004992 0.059567 0.003649 0.002189 0.934595 0.495328 0.024257 0.240450 0.239965 0.305027 0.094878 0.526069 0.074025 0.418442 0.196237 0.158323 0.226998 0.336713 0.220452 0.191155 0.251680 0.192296 0.300342 0.169047 0.338315 0.240387 0.144634 0.128513 0.486465 0.290763 0.271259 0.116600 0.321377 0.224825 0.296233 0.229255 0.249687 0.493240 0.171285 0.075148 0.260326 Consensus sequence: HHBDHDDAACAATDRHHHHHBW Reverse complement motif 0.260326 0.171285 0.075148 0.493240 0.224825 0.229255 0.296233 0.249687 0.321377 0.271259 0.116600 0.290763 0.486465 0.144634 0.128513 0.240387 0.338315 0.300342 0.169047 0.192296 0.251680 0.220452 0.191155 0.336713 0.226998 0.196237 0.158323 0.418442 0.305027 0.526069 0.094878 0.074025 0.239965 0.024257 0.240450 0.495328 0.934595 0.003649 0.002189 0.059567 0.004992 0.001846 0.006976 0.986185 0.014697 0.002062 0.002161 0.981080 0.004516 0.008092 0.954596 0.032796 0.031997 0.001826 0.002456 0.963721 0.076159 0.038475 0.093390 0.791976 0.364301 0.370406 0.074356 0.190936 0.274393 0.070776 0.211081 0.443749 0.300626 0.174184 0.130641 0.394549 0.248133 0.095791 0.276373 0.379704 0.433558 0.176868 0.240155 0.149419 0.295589 0.228429 0.166233 0.309749 0.223177 0.300272 0.115555 0.360997 Consensus sequence: WBHHHHHMDATTGTTHDHDVHH Alignment: WBHHHHHMDATTGTTHDHDVHH ----WKTRTWTTTTWRTTTDT- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00090 Elf3_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 17 0.035925 Species: Mus musculus Original motif 0.155083 0.152982 0.490906 0.201030 0.123195 0.312681 0.220770 0.343354 0.110252 0.131358 0.153983 0.604406 0.216489 0.490160 0.101348 0.192003 0.396130 0.292429 0.103252 0.208189 0.634770 0.070898 0.070668 0.223664 0.667102 0.099915 0.067576 0.165407 0.625495 0.095579 0.039353 0.239573 0.717478 0.093228 0.024737 0.164558 0.729965 0.048628 0.024557 0.196850 0.670909 0.118718 0.043692 0.166681 0.689441 0.050145 0.038829 0.221584 0.506735 0.159498 0.095635 0.238132 0.406093 0.298915 0.149902 0.145090 0.193913 0.282078 0.096706 0.427303 0.272324 0.154790 0.262469 0.310417 0.224484 0.458724 0.060144 0.256647 Consensus sequence: DBTHHAAAAAAAAVHDH Reverse complement motif 0.224484 0.060144 0.458724 0.256647 0.310417 0.154790 0.262469 0.272324 0.427303 0.282078 0.096706 0.193913 0.145090 0.298915 0.149902 0.406093 0.238132 0.159498 0.095635 0.506735 0.221584 0.050145 0.038829 0.689441 0.166681 0.118718 0.043692 0.670909 0.196850 0.048628 0.024557 0.729965 0.164558 0.093228 0.024737 0.717478 0.239573 0.095579 0.039353 0.625495 0.165407 0.099915 0.067576 0.667102 0.223664 0.070898 0.070668 0.634770 0.208189 0.292429 0.103252 0.396130 0.216489 0.101348 0.490160 0.192003 0.604406 0.131358 0.153983 0.110252 0.343354 0.312681 0.220770 0.123195 0.155083 0.490906 0.152982 0.201030 Consensus sequence: DDHBTTTTTTTTHDAVH Alignment: DBTHHAAAAAAAAVHDH ADAAAKWAAAAWAKARW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00032 Gata3_primary Original Motif Original Motif Backward 1 17 0.036697 Species: Mus musculus Original motif 0.151572 0.262753 0.258275 0.327401 0.221834 0.113385 0.275380 0.389400 0.297769 0.136928 0.134678 0.430625 0.270099 0.110415 0.271106 0.348380 0.265471 0.090253 0.223340 0.420936 0.616582 0.090091 0.171960 0.121367 0.197318 0.107541 0.406904 0.288237 0.798258 0.046950 0.001406 0.153385 0.003195 0.002516 0.989707 0.004582 0.991503 0.002748 0.002617 0.003132 0.005015 0.002764 0.003026 0.989195 0.948394 0.008932 0.001344 0.041330 0.973109 0.004100 0.004081 0.018710 0.040365 0.113905 0.828185 0.017545 0.736608 0.130524 0.113464 0.019404 0.415921 0.106101 0.316613 0.161365 0.376582 0.170927 0.155572 0.296919 0.137731 0.197151 0.211055 0.454064 0.324853 0.122747 0.246107 0.306293 0.462490 0.207311 0.159392 0.170807 0.380420 0.188972 0.311990 0.118618 0.222178 0.157873 0.380486 0.239463 Consensus sequence: BDHDDADAGATAAGADHBDHVD Reverse complement motif 0.222178 0.380486 0.157873 0.239463 0.118618 0.188972 0.311990 0.380420 0.170807 0.207311 0.159392 0.462490 0.306293 0.122747 0.246107 0.324853 0.454064 0.197151 0.211055 0.137731 0.296919 0.170927 0.155572 0.376582 0.161365 0.106101 0.316613 0.415921 0.019404 0.130524 0.113464 0.736608 0.040365 0.828185 0.113905 0.017545 0.018710 0.004100 0.004081 0.973109 0.041330 0.008932 0.001344 0.948394 0.989195 0.002764 0.003026 0.005015 0.003132 0.002748 0.002617 0.991503 0.003195 0.989707 0.002516 0.004582 0.153385 0.046950 0.001406 0.798258 0.197318 0.406904 0.107541 0.288237 0.121367 0.090091 0.171960 0.616582 0.420936 0.090253 0.223340 0.265471 0.348380 0.110415 0.271106 0.270099 0.430625 0.136928 0.134678 0.297769 0.389400 0.113385 0.275380 0.221834 0.327401 0.262753 0.258275 0.151572 Consensus sequence: HBHDVHDTCTTATCTHTDDHDV Alignment: BDHDDADAGATAAGADHBDHVD -----ADAAAKWAAAAWAKARW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00025 Foxk1_primary Original Motif Original Motif Backward 1 17 0.038111 Species: Mus musculus Original motif 0.338172 0.192194 0.207817 0.261817 0.407924 0.117261 0.278236 0.196580 0.595570 0.070480 0.119221 0.214729 0.710845 0.038748 0.052600 0.197807 0.124647 0.116138 0.178053 0.581162 0.201602 0.005514 0.792110 0.000774 0.024590 0.004193 0.001331 0.969886 0.919465 0.077871 0.000760 0.001904 0.972342 0.010395 0.000580 0.016683 0.991045 0.001495 0.003585 0.003875 0.001358 0.885197 0.000980 0.112465 0.990318 0.001846 0.002968 0.004867 0.804563 0.063147 0.023496 0.108795 0.564824 0.087976 0.102865 0.244336 0.269947 0.300278 0.285008 0.144767 0.337905 0.220102 0.253694 0.188299 0.153781 0.274135 0.318343 0.253741 Consensus sequence: DDAATGTAAACAAAVVB Reverse complement motif 0.153781 0.318343 0.274135 0.253741 0.188299 0.220102 0.253694 0.337905 0.269947 0.285008 0.300278 0.144767 0.244336 0.087976 0.102865 0.564824 0.108795 0.063147 0.023496 0.804563 0.004867 0.001846 0.002968 0.990318 0.001358 0.000980 0.885197 0.112465 0.003875 0.001495 0.003585 0.991045 0.016683 0.010395 0.000580 0.972342 0.001904 0.077871 0.000760 0.919465 0.969886 0.004193 0.001331 0.024590 0.201602 0.792110 0.005514 0.000774 0.581162 0.116138 0.178053 0.124647 0.197807 0.038748 0.052600 0.710845 0.214729 0.070480 0.119221 0.595570 0.196580 0.117261 0.278236 0.407924 0.261817 0.192194 0.207817 0.338172 Consensus sequence: BBVTTTGTTTACATTDD Alignment: DDAATGTAAACAAAVVB ADAAAKWAAAAWAKARW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 80 Motif name: C080 Original motif 0.560000 0.040000 0.070000 0.330000 0.550000 0.010000 0.030000 0.410000 0.750000 0.060000 0.010000 0.180000 0.623762 0.128713 0.168317 0.079208 0.430000 0.160000 0.260000 0.150000 0.851485 0.009901 0.049505 0.089109 0.640000 0.300000 0.010000 0.050000 0.534653 0.405941 0.049505 0.009901 0.356436 0.465347 0.089109 0.089109 0.190000 0.320000 0.140000 0.350000 0.670000 0.310000 0.010000 0.010000 0.890000 0.090000 0.010000 0.010000 0.465347 0.079208 0.009901 0.445545 0.480000 0.050000 0.030000 0.440000 Consensus sequence: WWAAVAAMMHAAWW Reserve complement motif 0.440000 0.050000 0.030000 0.480000 0.445545 0.079208 0.009901 0.465347 0.010000 0.090000 0.010000 0.890000 0.010000 0.310000 0.010000 0.670000 0.350000 0.320000 0.140000 0.190000 0.356436 0.089109 0.465347 0.089109 0.009901 0.405941 0.049505 0.534653 0.050000 0.300000 0.010000 0.640000 0.089109 0.009901 0.049505 0.851485 0.150000 0.160000 0.260000 0.430000 0.079208 0.128713 0.168317 0.623762 0.180000 0.060000 0.010000 0.750000 0.410000 0.010000 0.030000 0.550000 0.330000 0.040000 0.070000 0.560000 Consensus sequence: WWTTHRYTTBTTWW ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 80 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00077 Srf_secondary Original Motif Original Motif Backward 1 14 0.024539 Species: Mus musculus Original motif 0.162968 0.284828 0.440984 0.111220 0.151392 0.200635 0.205316 0.442657 0.267215 0.083669 0.192498 0.456618 0.332771 0.180711 0.200027 0.286491 0.509370 0.102954 0.242569 0.145107 0.666262 0.077309 0.154466 0.101962 0.737968 0.113335 0.100401 0.048296 0.658878 0.141580 0.134033 0.065510 0.766115 0.094051 0.069763 0.070072 0.755621 0.088491 0.044802 0.111086 0.749083 0.135917 0.047510 0.067490 0.663231 0.176795 0.028134 0.131839 0.553358 0.277659 0.038655 0.130328 0.392578 0.314083 0.209844 0.083495 0.198462 0.237132 0.239466 0.324940 0.275121 0.210087 0.194779 0.320013 0.287748 0.277395 0.142704 0.292154 Consensus sequence: VBDDAAAAAAAAMVBHH Reverse complement motif 0.292154 0.277395 0.142704 0.287748 0.320013 0.210087 0.194779 0.275121 0.324940 0.237132 0.239466 0.198462 0.083495 0.314083 0.209844 0.392578 0.130328 0.277659 0.038655 0.553358 0.131839 0.176795 0.028134 0.663231 0.067490 0.135917 0.047510 0.749083 0.111086 0.088491 0.044802 0.755621 0.070072 0.094051 0.069763 0.766115 0.065510 0.141580 0.134033 0.658878 0.048296 0.113335 0.100401 0.737968 0.101962 0.077309 0.154466 0.666262 0.145107 0.102954 0.242569 0.509370 0.286491 0.180711 0.200027 0.332771 0.456618 0.083669 0.192498 0.267215 0.442657 0.200635 0.205316 0.151392 0.162968 0.440984 0.284828 0.111220 Consensus sequence: HHVBYTTTTTTTTDDVV Alignment: VBDDAAAAAAAAMVBHH ---WWAAVAAMMHAAWW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00170 Isl2 Reverse Complement Reverse Complement Forward 2 14 0.034192 Species: Mus musculus Original motif 0.380653 0.464278 0.069710 0.085358 0.372741 0.252485 0.094893 0.279881 0.400406 0.346871 0.119279 0.133444 0.582825 0.148558 0.126868 0.141748 0.743019 0.117598 0.049691 0.089692 0.055277 0.296642 0.093515 0.554566 0.016892 0.507616 0.007671 0.467820 0.599279 0.361703 0.019061 0.019957 0.705284 0.282581 0.005323 0.006811 0.013750 0.013079 0.004736 0.968435 0.013264 0.013804 0.004612 0.968319 0.933004 0.004447 0.005179 0.057370 0.656051 0.041577 0.212432 0.089940 0.145543 0.109863 0.307597 0.436997 0.323514 0.098571 0.137254 0.440660 0.204784 0.284909 0.075638 0.434669 Consensus sequence: MHHAAYYMATTAADWH Reverse complement motif 0.434669 0.284909 0.075638 0.204784 0.440660 0.098571 0.137254 0.323514 0.436997 0.109863 0.307597 0.145543 0.089940 0.041577 0.212432 0.656051 0.057370 0.004447 0.005179 0.933004 0.968319 0.013804 0.004612 0.013264 0.968435 0.013079 0.004736 0.013750 0.006811 0.282581 0.005323 0.705284 0.019957 0.361703 0.019061 0.599279 0.016892 0.007671 0.507616 0.467820 0.554566 0.296642 0.093515 0.055277 0.089692 0.117598 0.049691 0.743019 0.141748 0.148558 0.126868 0.582825 0.133444 0.346871 0.119279 0.400406 0.279881 0.252485 0.094893 0.372741 0.380653 0.069710 0.464278 0.085358 Consensus sequence: HWDTTAATYKMTTHHR Alignment: HWDTTAATYKMTTHHR -WWTTHRYTTBTTWW- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00090 Elf3_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 14 0.034963 Species: Mus musculus Original motif 0.155083 0.152982 0.490906 0.201030 0.123195 0.312681 0.220770 0.343354 0.110252 0.131358 0.153983 0.604406 0.216489 0.490160 0.101348 0.192003 0.396130 0.292429 0.103252 0.208189 0.634770 0.070898 0.070668 0.223664 0.667102 0.099915 0.067576 0.165407 0.625495 0.095579 0.039353 0.239573 0.717478 0.093228 0.024737 0.164558 0.729965 0.048628 0.024557 0.196850 0.670909 0.118718 0.043692 0.166681 0.689441 0.050145 0.038829 0.221584 0.506735 0.159498 0.095635 0.238132 0.406093 0.298915 0.149902 0.145090 0.193913 0.282078 0.096706 0.427303 0.272324 0.154790 0.262469 0.310417 0.224484 0.458724 0.060144 0.256647 Consensus sequence: DBTHHAAAAAAAAVHDH Reverse complement motif 0.224484 0.060144 0.458724 0.256647 0.310417 0.154790 0.262469 0.272324 0.427303 0.282078 0.096706 0.193913 0.145090 0.298915 0.149902 0.406093 0.238132 0.159498 0.095635 0.506735 0.221584 0.050145 0.038829 0.689441 0.166681 0.118718 0.043692 0.670909 0.196850 0.048628 0.024557 0.729965 0.164558 0.093228 0.024737 0.717478 0.239573 0.095579 0.039353 0.625495 0.165407 0.099915 0.067576 0.667102 0.223664 0.070898 0.070668 0.634770 0.208189 0.292429 0.103252 0.396130 0.216489 0.101348 0.490160 0.192003 0.604406 0.131358 0.153983 0.110252 0.343354 0.312681 0.220770 0.123195 0.155083 0.490906 0.152982 0.201030 Consensus sequence: DDHBTTTTTTTTHDAVH Alignment: DBTHHAAAAAAAAVHDH ---WWAAVAAMMHAAWW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00061 Foxl1_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 1 14 0.036263 Species: Mus musculus Original motif 0.560226 0.121586 0.083231 0.234957 0.318077 0.149137 0.179955 0.352831 0.482497 0.118420 0.173594 0.225488 0.200166 0.160901 0.191493 0.447440 0.033691 0.569719 0.018901 0.377690 0.638020 0.166545 0.021254 0.174181 0.573953 0.105729 0.009308 0.311010 0.890518 0.053364 0.013424 0.042694 0.910758 0.028166 0.032648 0.028428 0.013358 0.738707 0.023981 0.223953 0.911783 0.018754 0.031898 0.037564 0.702891 0.068940 0.076823 0.151346 0.445507 0.320769 0.057216 0.176507 0.587798 0.129586 0.140592 0.142024 0.258981 0.330939 0.167334 0.242747 0.362022 0.333796 0.145861 0.158320 Consensus sequence: ADDDYAWAACAAMAHH Reverse complement motif 0.158320 0.333796 0.145861 0.362022 0.258981 0.167334 0.330939 0.242747 0.142024 0.129586 0.140592 0.587798 0.176507 0.320769 0.057216 0.445507 0.151346 0.068940 0.076823 0.702891 0.037564 0.018754 0.031898 0.911783 0.013358 0.023981 0.738707 0.223953 0.028428 0.028166 0.032648 0.910758 0.042694 0.053364 0.013424 0.890518 0.311010 0.105729 0.009308 0.573953 0.174181 0.166545 0.021254 0.638020 0.033691 0.018901 0.569719 0.377690 0.447440 0.160901 0.191493 0.200166 0.225488 0.118420 0.173594 0.482497 0.352831 0.149137 0.179955 0.318077 0.234957 0.121586 0.083231 0.560226 Consensus sequence: HDTYTTGTTWTKDDDT Alignment: ADDDYAWAACAAMAHH WWAAVAAMMHAAWW-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00037 Zfp105_primaryOriginal Motif Original Motif Forward 1 14 0.038040 Species: Mus musculus Original motif 0.363104 0.182807 0.145232 0.308856 0.419707 0.133742 0.222546 0.224005 0.164481 0.418263 0.052397 0.364858 0.715575 0.117639 0.064914 0.101872 0.883836 0.026985 0.032584 0.056596 0.558797 0.151280 0.033120 0.256803 0.267037 0.403488 0.026746 0.302729 0.939762 0.013627 0.034579 0.012032 0.897072 0.009878 0.035642 0.057408 0.305904 0.516040 0.055311 0.122746 0.880940 0.027958 0.048350 0.042752 0.710082 0.052464 0.040250 0.197204 0.246712 0.125155 0.318627 0.309506 0.429749 0.181755 0.176892 0.211603 0.339643 0.097216 0.355250 0.207891 Consensus sequence: HDYAAAHAAMAADHD Reverse complement motif 0.339643 0.355250 0.097216 0.207891 0.211603 0.181755 0.176892 0.429749 0.246712 0.318627 0.125155 0.309506 0.197204 0.052464 0.040250 0.710082 0.042752 0.027958 0.048350 0.880940 0.305904 0.055311 0.516040 0.122746 0.057408 0.009878 0.035642 0.897072 0.012032 0.013627 0.034579 0.939762 0.267037 0.026746 0.403488 0.302729 0.256803 0.151280 0.033120 0.558797 0.056596 0.026985 0.032584 0.883836 0.101872 0.117639 0.064914 0.715575 0.164481 0.052397 0.418263 0.364858 0.224005 0.133742 0.222546 0.419707 0.308856 0.182807 0.145232 0.363104 Consensus sequence: HHHTTRTTDTTTKDH Alignment: HDYAAAHAAMAADHD WWAAVAAMMHAAWW- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 81 Motif name: C081 Original motif 0.110000 0.480000 0.270000 0.140000 0.039604 0.811881 0.009901 0.138614 0.010000 0.920000 0.010000 0.060000 0.090000 0.400000 0.480000 0.030000 0.313131 0.282828 0.151515 0.252525 0.128713 0.792079 0.069307 0.009901 0.210000 0.770000 0.010000 0.010000 0.010000 0.800000 0.010000 0.180000 0.090000 0.500000 0.400000 0.010000 0.099010 0.792079 0.099010 0.009901 0.480000 0.320000 0.030000 0.170000 0.099010 0.247525 0.633663 0.019802 Consensus sequence: BCCSHCCCSCMG Reserve complement motif 0.099010 0.633663 0.247525 0.019802 0.170000 0.320000 0.030000 0.480000 0.099010 0.099010 0.792079 0.009901 0.090000 0.400000 0.500000 0.010000 0.010000 0.010000 0.800000 0.180000 0.210000 0.010000 0.770000 0.010000 0.128713 0.069307 0.792079 0.009901 0.252525 0.282828 0.151515 0.313131 0.090000 0.480000 0.400000 0.030000 0.010000 0.010000 0.920000 0.060000 0.039604 0.009901 0.811881 0.138614 0.110000 0.270000 0.480000 0.140000 Consensus sequence: CYGSGGGHSGGB ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 81 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00021 Zfp281_primaryOriginal Motif Original Motif Forward 3 12 0.013343 Species: Mus musculus Original motif 0.201535 0.165213 0.201324 0.431929 0.136153 0.443451 0.179132 0.241264 0.263149 0.555137 0.067983 0.113731 0.142183 0.737634 0.045722 0.074461 0.044982 0.884112 0.045356 0.025549 0.246434 0.590578 0.022655 0.140333 0.123049 0.591257 0.033072 0.252622 0.018153 0.944742 0.010254 0.026851 0.035459 0.953844 0.003988 0.006709 0.020000 0.954344 0.005966 0.019690 0.015299 0.964390 0.006755 0.013557 0.028565 0.936152 0.011660 0.023623 0.300127 0.517309 0.029700 0.152863 0.159063 0.513443 0.051834 0.275660 0.158172 0.647055 0.133256 0.061516 Consensus sequence: DBCCCCCCCCCCMYC Reverse complement motif 0.158172 0.133256 0.647055 0.061516 0.159063 0.051834 0.513443 0.275660 0.300127 0.029700 0.517309 0.152863 0.028565 0.011660 0.936152 0.023623 0.015299 0.006755 0.964390 0.013557 0.020000 0.005966 0.954344 0.019690 0.035459 0.003988 0.953844 0.006709 0.018153 0.010254 0.944742 0.026851 0.123049 0.033072 0.591257 0.252622 0.246434 0.022655 0.590578 0.140333 0.044982 0.045356 0.884112 0.025549 0.142183 0.045722 0.737634 0.074461 0.263149 0.067983 0.555137 0.113731 0.136153 0.179132 0.443451 0.241264 0.431929 0.165213 0.201324 0.201535 Consensus sequence: GKRGGGGGGGGGGBD Alignment: DBCCCCCCCCCCMYC --BCCSHCCCSCMG- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00043 Bcl6b_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 2 12 0.017312 Species: Mus musculus Original motif 0.316572 0.278382 0.152556 0.252490 0.167141 0.257034 0.259894 0.315931 0.175523 0.325956 0.259996 0.238525 0.165052 0.385677 0.239449 0.209822 0.069489 0.782718 0.072454 0.075339 0.049943 0.800636 0.031988 0.117433 0.223382 0.060306 0.552691 0.163621 0.072944 0.818252 0.034406 0.074398 0.070535 0.845127 0.062712 0.021626 0.031035 0.859354 0.055424 0.054187 0.063668 0.798503 0.067274 0.070554 0.348488 0.030697 0.197179 0.423636 0.307220 0.256470 0.181009 0.255301 0.460933 0.285057 0.090258 0.163752 0.315798 0.228431 0.171135 0.284637 0.374527 0.268328 0.198810 0.158335 Consensus sequence: HBBBCCGCCCCWHHHV Reverse complement motif 0.158335 0.268328 0.198810 0.374527 0.284637 0.228431 0.171135 0.315798 0.163752 0.285057 0.090258 0.460933 0.255301 0.256470 0.181009 0.307220 0.423636 0.030697 0.197179 0.348488 0.063668 0.067274 0.798503 0.070554 0.031035 0.055424 0.859354 0.054187 0.070535 0.062712 0.845127 0.021626 0.072944 0.034406 0.818252 0.074398 0.223382 0.552691 0.060306 0.163621 0.049943 0.031988 0.800636 0.117433 0.069489 0.072454 0.782718 0.075339 0.165052 0.239449 0.385677 0.209822 0.175523 0.259996 0.325956 0.238525 0.315931 0.257034 0.259894 0.167141 0.252490 0.278382 0.152556 0.316572 Consensus sequence: BHHHWGGGGCGGBBVH Alignment: HBBBCCGCCCCWHHHV ---BCCSHCCCSCMG- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00033 Zfp410_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 2 12 0.019329 Species: Mus musculus Original motif 0.162979 0.284781 0.237433 0.314807 0.182449 0.447584 0.069464 0.300502 0.298973 0.261014 0.213211 0.226802 0.136039 0.433062 0.144274 0.286625 0.180084 0.395933 0.158565 0.265418 0.069354 0.748510 0.068898 0.113238 0.060485 0.717828 0.075333 0.146354 0.023280 0.071762 0.645500 0.259457 0.166896 0.749762 0.062730 0.020612 0.050401 0.775248 0.089072 0.085279 0.103847 0.767557 0.068804 0.059791 0.064815 0.748318 0.114588 0.072280 0.340921 0.071942 0.242981 0.344157 0.301967 0.263512 0.165927 0.268594 0.479800 0.222955 0.118441 0.178803 0.229469 0.283621 0.143099 0.343811 0.261733 0.180191 0.169905 0.388170 Consensus sequence: BHHBHCCGCCCCDHHHH Reverse complement motif 0.388170 0.180191 0.169905 0.261733 0.343811 0.283621 0.143099 0.229469 0.178803 0.222955 0.118441 0.479800 0.268594 0.263512 0.165927 0.301967 0.344157 0.071942 0.242981 0.340921 0.064815 0.114588 0.748318 0.072280 0.103847 0.068804 0.767557 0.059791 0.050401 0.089072 0.775248 0.085279 0.166896 0.062730 0.749762 0.020612 0.023280 0.645500 0.071762 0.259457 0.060485 0.075333 0.717828 0.146354 0.069354 0.068898 0.748510 0.113238 0.180084 0.158565 0.395933 0.265418 0.136039 0.144274 0.433062 0.286625 0.226802 0.261014 0.213211 0.298973 0.182449 0.069464 0.447584 0.300502 0.314807 0.284781 0.237433 0.162979 Consensus sequence: HHHHDGGGGCGGDBHDV Alignment: BHHBHCCGCCCCDHHHH ----BCCSHCCCSCMG- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00022 Zfp740_primaryOriginal Motif Original Motif Forward 2 12 0.021428 Species: Mus musculus Original motif 0.136946 0.396508 0.135309 0.331236 0.185528 0.417538 0.215409 0.181525 0.171276 0.341901 0.172832 0.313991 0.145641 0.590572 0.146376 0.117412 0.138035 0.660416 0.114016 0.087533 0.222728 0.750532 0.007528 0.019212 0.024633 0.963314 0.001894 0.010159 0.009557 0.979956 0.000642 0.009844 0.010416 0.977424 0.000541 0.011619 0.026401 0.956740 0.001544 0.015314 0.195502 0.755959 0.011060 0.037480 0.491291 0.364785 0.025613 0.118311 0.305153 0.398160 0.071680 0.225008 0.253497 0.232647 0.213246 0.300610 0.156964 0.297876 0.144683 0.400477 0.179549 0.292514 0.319462 0.208475 Consensus sequence: HVBCCCCCCCCMHHHB Reverse complement motif 0.179549 0.319462 0.292514 0.208475 0.400477 0.297876 0.144683 0.156964 0.300610 0.232647 0.213246 0.253497 0.305153 0.071680 0.398160 0.225008 0.118311 0.364785 0.025613 0.491291 0.195502 0.011060 0.755959 0.037480 0.026401 0.001544 0.956740 0.015314 0.010416 0.000541 0.977424 0.011619 0.009557 0.000642 0.979956 0.009844 0.024633 0.001894 0.963314 0.010159 0.222728 0.007528 0.750532 0.019212 0.138035 0.114016 0.660416 0.087533 0.145641 0.146376 0.590572 0.117412 0.171276 0.172832 0.341901 0.313991 0.185528 0.215409 0.417538 0.181525 0.136946 0.135309 0.396508 0.331236 Consensus sequence: BHHDYGGGGGGGGBVD Alignment: HVBCCCCCCCCMHHHB -BCCSHCCCSCMG--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 7 12 0.023016 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK ----CYGSGGGHSGGB------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 82 Motif name: C082 Original motif 0.475248 0.009901 0.049505 0.465347 0.141414 0.020202 0.424242 0.414141 0.712871 0.009901 0.217822 0.059406 0.600000 0.100000 0.290000 0.010000 0.750000 0.010000 0.170000 0.070000 0.320000 0.030000 0.600000 0.050000 0.680000 0.150000 0.120000 0.050000 0.811881 0.148515 0.029703 0.009901 0.940000 0.010000 0.010000 0.040000 0.570000 0.040000 0.370000 0.020000 0.570000 0.270000 0.110000 0.050000 0.590000 0.180000 0.010000 0.220000 0.554455 0.059406 0.019802 0.366337 Consensus sequence: WKAAARAAARAAW Reserve complement motif 0.366337 0.059406 0.019802 0.554455 0.220000 0.180000 0.010000 0.590000 0.050000 0.270000 0.110000 0.570000 0.020000 0.040000 0.370000 0.570000 0.040000 0.010000 0.010000 0.940000 0.009901 0.148515 0.029703 0.811881 0.050000 0.150000 0.120000 0.680000 0.320000 0.600000 0.030000 0.050000 0.070000 0.010000 0.170000 0.750000 0.010000 0.100000 0.290000 0.600000 0.059406 0.009901 0.217822 0.712871 0.141414 0.424242 0.020202 0.414141 0.465347 0.009901 0.049505 0.475248 Consensus sequence: WTTKTTTMTTTYW ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 82 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00077 Srf_secondary Original Motif Original Motif Forward 3 13 0.010570 Species: Mus musculus Original motif 0.162968 0.284828 0.440984 0.111220 0.151392 0.200635 0.205316 0.442657 0.267215 0.083669 0.192498 0.456618 0.332771 0.180711 0.200027 0.286491 0.509370 0.102954 0.242569 0.145107 0.666262 0.077309 0.154466 0.101962 0.737968 0.113335 0.100401 0.048296 0.658878 0.141580 0.134033 0.065510 0.766115 0.094051 0.069763 0.070072 0.755621 0.088491 0.044802 0.111086 0.749083 0.135917 0.047510 0.067490 0.663231 0.176795 0.028134 0.131839 0.553358 0.277659 0.038655 0.130328 0.392578 0.314083 0.209844 0.083495 0.198462 0.237132 0.239466 0.324940 0.275121 0.210087 0.194779 0.320013 0.287748 0.277395 0.142704 0.292154 Consensus sequence: VBDDAAAAAAAAMVBHH Reverse complement motif 0.292154 0.277395 0.142704 0.287748 0.320013 0.210087 0.194779 0.275121 0.324940 0.237132 0.239466 0.198462 0.083495 0.314083 0.209844 0.392578 0.130328 0.277659 0.038655 0.553358 0.131839 0.176795 0.028134 0.663231 0.067490 0.135917 0.047510 0.749083 0.111086 0.088491 0.044802 0.755621 0.070072 0.094051 0.069763 0.766115 0.065510 0.141580 0.134033 0.658878 0.048296 0.113335 0.100401 0.737968 0.101962 0.077309 0.154466 0.666262 0.145107 0.102954 0.242569 0.509370 0.286491 0.180711 0.200027 0.332771 0.456618 0.083669 0.192498 0.267215 0.442657 0.200635 0.205316 0.151392 0.162968 0.440984 0.284828 0.111220 Consensus sequence: HHVBYTTTTTTTTDDVV Alignment: VBDDAAAAAAAAMVBHH --WKAAARAAARAAW-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00028 Tcfap2e_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 1 13 0.021784 Species: Mus musculus Original motif 0.248591 0.214386 0.166769 0.370254 0.416041 0.167262 0.218682 0.198015 0.195301 0.542527 0.153042 0.109129 0.240156 0.185228 0.255545 0.319071 0.195809 0.247688 0.280778 0.275725 0.271555 0.129776 0.497286 0.101382 0.738080 0.057879 0.078760 0.125281 0.728876 0.074205 0.092737 0.104182 0.694380 0.084957 0.159476 0.061186 0.665572 0.111592 0.131546 0.091289 0.782384 0.059680 0.047525 0.110411 0.769981 0.105692 0.056467 0.067860 0.402932 0.087712 0.172674 0.336682 0.409485 0.160886 0.229779 0.199850 Consensus sequence: HDCDBRAAAAAADD Reverse complement motif 0.199850 0.160886 0.229779 0.409485 0.336682 0.087712 0.172674 0.402932 0.067860 0.105692 0.056467 0.769981 0.110411 0.059680 0.047525 0.782384 0.091289 0.111592 0.131546 0.665572 0.061186 0.084957 0.159476 0.694380 0.104182 0.074205 0.092737 0.728876 0.125281 0.057879 0.078760 0.738080 0.271555 0.497286 0.129776 0.101382 0.195809 0.280778 0.247688 0.275725 0.319071 0.185228 0.255545 0.240156 0.195301 0.153042 0.542527 0.109129 0.198015 0.167262 0.218682 0.416041 0.370254 0.214386 0.166769 0.248591 Consensus sequence: DDTTTTTTMBDGDH Alignment: DDTTTTTTMBDGDH -WTTKTTTMTTTYW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00037 Zfp105_primaryReverse Complement Reverse Complement Backward 1 13 0.023499 Species: Mus musculus Original motif 0.363104 0.182807 0.145232 0.308856 0.419707 0.133742 0.222546 0.224005 0.164481 0.418263 0.052397 0.364858 0.715575 0.117639 0.064914 0.101872 0.883836 0.026985 0.032584 0.056596 0.558797 0.151280 0.033120 0.256803 0.267037 0.403488 0.026746 0.302729 0.939762 0.013627 0.034579 0.012032 0.897072 0.009878 0.035642 0.057408 0.305904 0.516040 0.055311 0.122746 0.880940 0.027958 0.048350 0.042752 0.710082 0.052464 0.040250 0.197204 0.246712 0.125155 0.318627 0.309506 0.429749 0.181755 0.176892 0.211603 0.339643 0.097216 0.355250 0.207891 Consensus sequence: HDYAAAHAAMAADHD Reverse complement motif 0.339643 0.355250 0.097216 0.207891 0.211603 0.181755 0.176892 0.429749 0.246712 0.318627 0.125155 0.309506 0.197204 0.052464 0.040250 0.710082 0.042752 0.027958 0.048350 0.880940 0.305904 0.055311 0.516040 0.122746 0.057408 0.009878 0.035642 0.897072 0.012032 0.013627 0.034579 0.939762 0.267037 0.026746 0.403488 0.302729 0.256803 0.151280 0.033120 0.558797 0.056596 0.026985 0.032584 0.883836 0.101872 0.117639 0.064914 0.715575 0.164481 0.052397 0.418263 0.364858 0.224005 0.133742 0.222546 0.419707 0.308856 0.182807 0.145232 0.363104 Consensus sequence: HHHTTRTTDTTTKDH Alignment: HHHTTRTTDTTTKDH --WTTKTTTMTTTYW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00090 Elf3_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 4 13 0.026568 Species: Mus musculus Original motif 0.155083 0.152982 0.490906 0.201030 0.123195 0.312681 0.220770 0.343354 0.110252 0.131358 0.153983 0.604406 0.216489 0.490160 0.101348 0.192003 0.396130 0.292429 0.103252 0.208189 0.634770 0.070898 0.070668 0.223664 0.667102 0.099915 0.067576 0.165407 0.625495 0.095579 0.039353 0.239573 0.717478 0.093228 0.024737 0.164558 0.729965 0.048628 0.024557 0.196850 0.670909 0.118718 0.043692 0.166681 0.689441 0.050145 0.038829 0.221584 0.506735 0.159498 0.095635 0.238132 0.406093 0.298915 0.149902 0.145090 0.193913 0.282078 0.096706 0.427303 0.272324 0.154790 0.262469 0.310417 0.224484 0.458724 0.060144 0.256647 Consensus sequence: DBTHHAAAAAAAAVHDH Reverse complement motif 0.224484 0.060144 0.458724 0.256647 0.310417 0.154790 0.262469 0.272324 0.427303 0.282078 0.096706 0.193913 0.145090 0.298915 0.149902 0.406093 0.238132 0.159498 0.095635 0.506735 0.221584 0.050145 0.038829 0.689441 0.166681 0.118718 0.043692 0.670909 0.196850 0.048628 0.024557 0.729965 0.164558 0.093228 0.024737 0.717478 0.239573 0.095579 0.039353 0.625495 0.165407 0.099915 0.067576 0.667102 0.223664 0.070898 0.070668 0.634770 0.208189 0.292429 0.103252 0.396130 0.216489 0.101348 0.490160 0.192003 0.604406 0.131358 0.153983 0.110252 0.343354 0.312681 0.220770 0.123195 0.155083 0.490906 0.152982 0.201030 Consensus sequence: DDHBTTTTTTTTHDAVH Alignment: DDHBTTTTTTTTHDAVH -WTTKTTTMTTTYW--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00097 Mtf1_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 1 13 0.026725 Species: Mus musculus Original motif 0.492974 0.180918 0.148012 0.178096 0.368251 0.203899 0.207777 0.220074 0.507882 0.155465 0.113772 0.222882 0.123798 0.114285 0.153584 0.608334 0.587677 0.127243 0.066116 0.218964 0.403397 0.150410 0.140817 0.305376 0.186086 0.147802 0.466164 0.199948 0.681097 0.135011 0.082959 0.100934 0.717748 0.075425 0.052584 0.154243 0.649784 0.103313 0.082872 0.164031 0.424054 0.187232 0.138687 0.250027 0.583515 0.181222 0.122887 0.112376 0.353266 0.175583 0.217918 0.253234 0.312794 0.344669 0.278065 0.064473 Consensus sequence: HDATAHDAAAHADV Reverse complement motif 0.312794 0.278065 0.344669 0.064473 0.253234 0.175583 0.217918 0.353266 0.112376 0.181222 0.122887 0.583515 0.250027 0.187232 0.138687 0.424054 0.164031 0.103313 0.082872 0.649784 0.154243 0.075425 0.052584 0.717748 0.100934 0.135011 0.082959 0.681097 0.186086 0.466164 0.147802 0.199948 0.305376 0.150410 0.140817 0.403397 0.218964 0.127243 0.066116 0.587677 0.608334 0.114285 0.153584 0.123798 0.222882 0.155465 0.113772 0.507882 0.220074 0.203899 0.207777 0.368251 0.178096 0.180918 0.148012 0.492974 Consensus sequence: VDTHTTTHHTATDH Alignment: VDTHTTTHHTATDH WTTKTTTMTTTYW- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 83 Motif name: C083 Original motif 0.010000 0.670000 0.040000 0.280000 0.170000 0.050000 0.300000 0.480000 0.070000 0.240000 0.400000 0.290000 0.009901 0.801980 0.099010 0.089109 0.010000 0.900000 0.010000 0.080000 0.039604 0.207921 0.128713 0.623762 0.009901 0.485149 0.425743 0.079208 0.009901 0.465347 0.079208 0.445545 0.410000 0.100000 0.470000 0.020000 0.029703 0.485149 0.475248 0.009901 0.009901 0.712871 0.039604 0.237624 0.039604 0.108911 0.009901 0.841584 0.010000 0.610000 0.290000 0.090000 0.366337 0.514851 0.009901 0.108911 0.420000 0.400000 0.070000 0.110000 0.280000 0.050000 0.640000 0.030000 Consensus sequence: CKBCCTSYRSCTCMMG Reserve complement motif 0.280000 0.640000 0.050000 0.030000 0.110000 0.400000 0.070000 0.420000 0.366337 0.009901 0.514851 0.108911 0.010000 0.290000 0.610000 0.090000 0.841584 0.108911 0.009901 0.039604 0.009901 0.039604 0.712871 0.237624 0.029703 0.475248 0.485149 0.009901 0.410000 0.470000 0.100000 0.020000 0.009901 0.079208 0.465347 0.445545 0.009901 0.425743 0.485149 0.079208 0.623762 0.207921 0.128713 0.039604 0.010000 0.010000 0.900000 0.080000 0.009901 0.099010 0.801980 0.089109 0.070000 0.400000 0.240000 0.290000 0.480000 0.050000 0.300000 0.170000 0.010000 0.040000 0.670000 0.280000 Consensus sequence: CYRGAGSMKSAGGBRG ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 83 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00527 Foxn4_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 5 16 0.026961 Species: Mus musculus Original motif 0.298336 0.418632 0.208054 0.074978 0.289907 0.015608 0.457100 0.237385 0.273583 0.077889 0.107860 0.540668 0.184954 0.161611 0.384390 0.269045 0.521826 0.156340 0.089019 0.232815 0.356716 0.131104 0.394857 0.117323 0.266669 0.108765 0.505273 0.119293 0.020778 0.047199 0.919524 0.012500 0.948536 0.018775 0.008113 0.024576 0.010822 0.964042 0.014701 0.010434 0.007428 0.019505 0.966351 0.006717 0.010025 0.975678 0.008648 0.005649 0.043796 0.120935 0.742979 0.092289 0.008252 0.250704 0.541132 0.199913 0.474428 0.044681 0.134430 0.346461 0.146597 0.421317 0.143166 0.288920 0.020540 0.181479 0.553811 0.244170 0.129612 0.173360 0.535219 0.161808 0.506084 0.158156 0.130983 0.204776 0.054872 0.103043 0.545792 0.296293 0.389882 0.171037 0.164162 0.274918 0.225861 0.314031 0.288872 0.171237 Consensus sequence: VDWDARRGACGCGGWHGGAKHV Reverse complement motif 0.225861 0.288872 0.314031 0.171237 0.274918 0.171037 0.164162 0.389882 0.054872 0.545792 0.103043 0.296293 0.204776 0.158156 0.130983 0.506084 0.129612 0.535219 0.173360 0.161808 0.020540 0.553811 0.181479 0.244170 0.146597 0.143166 0.421317 0.288920 0.346461 0.044681 0.134430 0.474428 0.008252 0.541132 0.250704 0.199913 0.043796 0.742979 0.120935 0.092289 0.010025 0.008648 0.975678 0.005649 0.007428 0.966351 0.019505 0.006717 0.010822 0.014701 0.964042 0.010434 0.024576 0.018775 0.008113 0.948536 0.020778 0.919524 0.047199 0.012500 0.266669 0.505273 0.108765 0.119293 0.356716 0.394857 0.131104 0.117323 0.232815 0.156340 0.089019 0.521826 0.184954 0.384390 0.161611 0.269045 0.540668 0.077889 0.107860 0.273583 0.289907 0.457100 0.015608 0.237385 0.298336 0.208054 0.418632 0.074978 Consensus sequence: VHYTCCDWCCGCGTCMMTHWHV Alignment: VHYTCCDWCCGCGTCMMTHWHV --CKBCCTSYRSCTCMMG---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00043 Bcl6b_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 16 0.033647 Species: Mus musculus Original motif 0.316572 0.278382 0.152556 0.252490 0.167141 0.257034 0.259894 0.315931 0.175523 0.325956 0.259996 0.238525 0.165052 0.385677 0.239449 0.209822 0.069489 0.782718 0.072454 0.075339 0.049943 0.800636 0.031988 0.117433 0.223382 0.060306 0.552691 0.163621 0.072944 0.818252 0.034406 0.074398 0.070535 0.845127 0.062712 0.021626 0.031035 0.859354 0.055424 0.054187 0.063668 0.798503 0.067274 0.070554 0.348488 0.030697 0.197179 0.423636 0.307220 0.256470 0.181009 0.255301 0.460933 0.285057 0.090258 0.163752 0.315798 0.228431 0.171135 0.284637 0.374527 0.268328 0.198810 0.158335 Consensus sequence: HBBBCCGCCCCWHHHV Reverse complement motif 0.158335 0.268328 0.198810 0.374527 0.284637 0.228431 0.171135 0.315798 0.163752 0.285057 0.090258 0.460933 0.255301 0.256470 0.181009 0.307220 0.423636 0.030697 0.197179 0.348488 0.063668 0.067274 0.798503 0.070554 0.031035 0.055424 0.859354 0.054187 0.070535 0.062712 0.845127 0.021626 0.072944 0.034406 0.818252 0.074398 0.223382 0.552691 0.060306 0.163621 0.049943 0.031988 0.800636 0.117433 0.069489 0.072454 0.782718 0.075339 0.165052 0.239449 0.385677 0.209822 0.175523 0.259996 0.325956 0.238525 0.315931 0.257034 0.259894 0.167141 0.252490 0.278382 0.152556 0.316572 Consensus sequence: BHHHWGGGGCGGBBVH Alignment: HBBBCCGCCCCWHHHV CKBCCTSYRSCTCMMG ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 6 16 0.035189 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH -CKBCCTSYRSCTCMMG----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00099 Ascl2_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 1 16 0.035551 Species: Mus musculus Original motif 0.114462 0.345602 0.289353 0.250583 0.192593 0.250844 0.116250 0.440313 0.338838 0.304929 0.195843 0.160390 0.312051 0.115094 0.162465 0.410390 0.143975 0.600492 0.123348 0.132185 0.078751 0.715072 0.135182 0.070995 0.146191 0.685571 0.069799 0.098439 0.137287 0.646078 0.126428 0.090207 0.335099 0.092260 0.371510 0.201131 0.033090 0.631176 0.074278 0.261456 0.117516 0.619336 0.100946 0.162202 0.114769 0.627362 0.089839 0.168031 0.195787 0.252057 0.220803 0.331353 0.415355 0.120731 0.281372 0.182542 0.111178 0.217079 0.245769 0.425974 0.191517 0.296952 0.153370 0.358162 Consensus sequence: BHVDCCCCDCCCBDBH Reverse complement motif 0.358162 0.296952 0.153370 0.191517 0.425974 0.217079 0.245769 0.111178 0.182542 0.120731 0.281372 0.415355 0.331353 0.252057 0.220803 0.195787 0.114769 0.089839 0.627362 0.168031 0.117516 0.100946 0.619336 0.162202 0.033090 0.074278 0.631176 0.261456 0.335099 0.371510 0.092260 0.201131 0.137287 0.126428 0.646078 0.090207 0.146191 0.069799 0.685571 0.098439 0.078751 0.135182 0.715072 0.070995 0.143975 0.123348 0.600492 0.132185 0.410390 0.115094 0.162465 0.312051 0.160390 0.304929 0.195843 0.338838 0.440313 0.250844 0.116250 0.192593 0.114462 0.289353 0.345602 0.250583 Consensus sequence: HVDVGGGHGGGGDBHB Alignment: HVDVGGGHGGGGDBHB CYRGAGSMKSAGGBRG ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00033 Zfp410_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 16 0.035682 Species: Mus musculus Original motif 0.162979 0.284781 0.237433 0.314807 0.182449 0.447584 0.069464 0.300502 0.298973 0.261014 0.213211 0.226802 0.136039 0.433062 0.144274 0.286625 0.180084 0.395933 0.158565 0.265418 0.069354 0.748510 0.068898 0.113238 0.060485 0.717828 0.075333 0.146354 0.023280 0.071762 0.645500 0.259457 0.166896 0.749762 0.062730 0.020612 0.050401 0.775248 0.089072 0.085279 0.103847 0.767557 0.068804 0.059791 0.064815 0.748318 0.114588 0.072280 0.340921 0.071942 0.242981 0.344157 0.301967 0.263512 0.165927 0.268594 0.479800 0.222955 0.118441 0.178803 0.229469 0.283621 0.143099 0.343811 0.261733 0.180191 0.169905 0.388170 Consensus sequence: BHHBHCCGCCCCDHHHH Reverse complement motif 0.388170 0.180191 0.169905 0.261733 0.343811 0.283621 0.143099 0.229469 0.178803 0.222955 0.118441 0.479800 0.268594 0.263512 0.165927 0.301967 0.344157 0.071942 0.242981 0.340921 0.064815 0.114588 0.748318 0.072280 0.103847 0.068804 0.767557 0.059791 0.050401 0.089072 0.775248 0.085279 0.166896 0.062730 0.749762 0.020612 0.023280 0.645500 0.071762 0.259457 0.060485 0.075333 0.717828 0.146354 0.069354 0.068898 0.748510 0.113238 0.180084 0.158565 0.395933 0.265418 0.136039 0.144274 0.433062 0.286625 0.226802 0.261014 0.213211 0.298973 0.182449 0.069464 0.447584 0.300502 0.314807 0.284781 0.237433 0.162979 Consensus sequence: HHHHDGGGGCGGDBHDV Alignment: BHHBHCCGCCCCDHHHH -CKBCCTSYRSCTCMMG ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 84 Motif name: C084 Original motif 0.190000 0.310000 0.490000 0.010000 0.010000 0.920000 0.010000 0.060000 0.128713 0.168317 0.069307 0.633663 0.009901 0.138614 0.841584 0.009901 0.009901 0.712871 0.148515 0.128713 0.330000 0.490000 0.050000 0.130000 0.110000 0.040000 0.530000 0.320000 0.009901 0.851485 0.009901 0.128713 0.151515 0.151515 0.010101 0.686869 0.010000 0.190000 0.770000 0.030000 0.009901 0.841584 0.009901 0.138614 0.140000 0.440000 0.290000 0.130000 0.100000 0.230000 0.300000 0.370000 Consensus sequence: SCTGCMKCTGCVB Reserve complement motif 0.370000 0.230000 0.300000 0.100000 0.140000 0.290000 0.440000 0.130000 0.009901 0.009901 0.841584 0.138614 0.010000 0.770000 0.190000 0.030000 0.686869 0.151515 0.010101 0.151515 0.009901 0.009901 0.851485 0.128713 0.110000 0.530000 0.040000 0.320000 0.330000 0.050000 0.490000 0.130000 0.009901 0.148515 0.712871 0.128713 0.009901 0.841584 0.138614 0.009901 0.633663 0.168317 0.069307 0.128713 0.010000 0.010000 0.920000 0.060000 0.190000 0.490000 0.310000 0.010000 Consensus sequence: VVGCAGYRGCAGS ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 84 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00099 Ascl2_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 4 13 0.022977 Species: Mus musculus Original motif 0.168852 0.325948 0.188604 0.316596 0.150343 0.193286 0.241301 0.415069 0.091518 0.482905 0.122928 0.302648 0.472493 0.198776 0.225796 0.102935 0.294513 0.179919 0.447250 0.078318 0.014660 0.972080 0.005591 0.007668 0.954848 0.008107 0.008474 0.028571 0.006076 0.178912 0.760021 0.054991 0.052082 0.817415 0.124797 0.005707 0.019342 0.010406 0.008905 0.961347 0.005455 0.008073 0.977684 0.008788 0.042946 0.715551 0.087020 0.154483 0.116888 0.241739 0.170073 0.471300 0.315931 0.324343 0.291451 0.068274 0.199164 0.366921 0.163690 0.270226 0.218561 0.211076 0.187732 0.382631 0.145317 0.139808 0.389262 0.325614 Consensus sequence: BBYVVCAGCTGCBVHHD Reverse complement motif 0.145317 0.389262 0.139808 0.325614 0.382631 0.211076 0.187732 0.218561 0.199164 0.163690 0.366921 0.270226 0.315931 0.291451 0.324343 0.068274 0.471300 0.241739 0.170073 0.116888 0.042946 0.087020 0.715551 0.154483 0.005455 0.977684 0.008073 0.008788 0.961347 0.010406 0.008905 0.019342 0.052082 0.124797 0.817415 0.005707 0.006076 0.760021 0.178912 0.054991 0.028571 0.008107 0.008474 0.954848 0.014660 0.005591 0.972080 0.007668 0.294513 0.447250 0.179919 0.078318 0.102935 0.198776 0.225796 0.472493 0.091518 0.122928 0.482905 0.302648 0.415069 0.193286 0.241301 0.150343 0.168852 0.188604 0.325948 0.316596 Consensus sequence: HHDVVGCAGCTGVBKVB Alignment: HHDVVGCAGCTGVBKVB ---VVGCAGYRGCAGS- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00036 Myf6_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 1 13 0.025672 Species: Mus musculus Original motif 0.345146 0.261059 0.273931 0.119863 0.222137 0.272923 0.332024 0.172916 0.269602 0.278951 0.245221 0.206225 0.485406 0.144018 0.294421 0.076155 0.577731 0.270563 0.078955 0.072752 0.070027 0.750816 0.062819 0.116339 0.685018 0.105175 0.137110 0.072697 0.162574 0.071041 0.638464 0.127921 0.343240 0.389633 0.206226 0.060900 0.080169 0.790323 0.114211 0.015297 0.167035 0.201642 0.462780 0.168543 0.114383 0.664317 0.166143 0.055157 0.392143 0.114475 0.340085 0.153298 0.208147 0.577473 0.142694 0.071686 0.168632 0.563135 0.066181 0.202052 Consensus sequence: VVVRACAGVCBCDCC Reverse complement motif 0.168632 0.066181 0.563135 0.202052 0.208147 0.142694 0.577473 0.071686 0.153298 0.114475 0.340085 0.392143 0.114383 0.166143 0.664317 0.055157 0.167035 0.462780 0.201642 0.168543 0.080169 0.114211 0.790323 0.015297 0.343240 0.206226 0.389633 0.060900 0.162574 0.638464 0.071041 0.127921 0.072697 0.105175 0.137110 0.685018 0.070027 0.062819 0.750816 0.116339 0.072752 0.270563 0.078955 0.577731 0.076155 0.144018 0.294421 0.485406 0.269602 0.245221 0.278951 0.206225 0.222137 0.332024 0.272923 0.172916 0.119863 0.261059 0.273931 0.345146 Consensus sequence: GGDGBGVCTGTKVVB Alignment: VVVRACAGVCBCDCC SCTGCMKCTGCVB-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00013 Gabpa_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 1 13 0.031027 Species: Mus musculus Original motif 0.233133 0.551828 0.139009 0.076030 0.100085 0.525562 0.101688 0.272665 0.252996 0.198121 0.299171 0.249711 0.141471 0.195290 0.234560 0.428679 0.160993 0.442765 0.082653 0.313590 0.307890 0.127950 0.071713 0.492448 0.093453 0.148935 0.080288 0.677324 0.083535 0.634212 0.074652 0.207601 0.098119 0.639328 0.099957 0.162596 0.067430 0.451776 0.357188 0.123606 0.286259 0.466975 0.063013 0.183753 0.203211 0.422637 0.133368 0.240783 0.111206 0.315595 0.192833 0.380366 0.199462 0.324652 0.305491 0.170395 0.347919 0.292387 0.230724 0.128970 0.254648 0.294196 0.194942 0.256214 Consensus sequence: CYDBYWTCCSMHBVVH Reverse complement motif 0.254648 0.194942 0.294196 0.256214 0.128970 0.292387 0.230724 0.347919 0.199462 0.305491 0.324652 0.170395 0.380366 0.315595 0.192833 0.111206 0.203211 0.133368 0.422637 0.240783 0.286259 0.063013 0.466975 0.183753 0.067430 0.357188 0.451776 0.123606 0.098119 0.099957 0.639328 0.162596 0.083535 0.074652 0.634212 0.207601 0.677324 0.148935 0.080288 0.093453 0.492448 0.127950 0.071713 0.307890 0.160993 0.082653 0.442765 0.313590 0.428679 0.195290 0.234560 0.141471 0.252996 0.299171 0.198121 0.249711 0.100085 0.101688 0.525562 0.272665 0.233133 0.139009 0.551828 0.076030 Consensus sequence: DBVVDRSGGAWKVHKG Alignment: CYDBYWTCCSMHBVVH SCTGCMKCTGCVB--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00033 Zfp410_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 5 13 0.032538 Species: Mus musculus Original motif 0.162979 0.284781 0.237433 0.314807 0.182449 0.447584 0.069464 0.300502 0.298973 0.261014 0.213211 0.226802 0.136039 0.433062 0.144274 0.286625 0.180084 0.395933 0.158565 0.265418 0.069354 0.748510 0.068898 0.113238 0.060485 0.717828 0.075333 0.146354 0.023280 0.071762 0.645500 0.259457 0.166896 0.749762 0.062730 0.020612 0.050401 0.775248 0.089072 0.085279 0.103847 0.767557 0.068804 0.059791 0.064815 0.748318 0.114588 0.072280 0.340921 0.071942 0.242981 0.344157 0.301967 0.263512 0.165927 0.268594 0.479800 0.222955 0.118441 0.178803 0.229469 0.283621 0.143099 0.343811 0.261733 0.180191 0.169905 0.388170 Consensus sequence: BHHBHCCGCCCCDHHHH Reverse complement motif 0.388170 0.180191 0.169905 0.261733 0.343811 0.283621 0.143099 0.229469 0.178803 0.222955 0.118441 0.479800 0.268594 0.263512 0.165927 0.301967 0.344157 0.071942 0.242981 0.340921 0.064815 0.114588 0.748318 0.072280 0.103847 0.068804 0.767557 0.059791 0.050401 0.089072 0.775248 0.085279 0.166896 0.062730 0.749762 0.020612 0.023280 0.645500 0.071762 0.259457 0.060485 0.075333 0.717828 0.146354 0.069354 0.068898 0.748510 0.113238 0.180084 0.158565 0.395933 0.265418 0.136039 0.144274 0.433062 0.286625 0.226802 0.261014 0.213211 0.298973 0.182449 0.069464 0.447584 0.300502 0.314807 0.284781 0.237433 0.162979 Consensus sequence: HHHHDGGGGCGGDBHDV Alignment: BHHBHCCGCCCCDHHHH ----SCTGCMKCTGCVB ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00102 Zic1_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 1 13 0.034871 Species: Mus musculus Original motif 0.161683 0.405114 0.171743 0.261460 0.259478 0.357988 0.146793 0.235741 0.371334 0.026439 0.283598 0.318630 0.092229 0.883389 0.018758 0.005623 0.419591 0.169874 0.253266 0.157270 0.002985 0.976375 0.002722 0.017918 0.909381 0.021357 0.013299 0.055963 0.039418 0.007014 0.948302 0.005266 0.001711 0.845894 0.005756 0.146640 0.803792 0.003049 0.148687 0.044472 0.015314 0.017153 0.680239 0.287294 0.003793 0.011414 0.937403 0.047390 0.431916 0.266291 0.144154 0.157638 0.269331 0.239338 0.366817 0.124513 0.395873 0.103980 0.214796 0.285351 Consensus sequence: BHDCVCAGCAGGHVD Reverse complement motif 0.285351 0.103980 0.214796 0.395873 0.269331 0.366817 0.239338 0.124513 0.157638 0.266291 0.144154 0.431916 0.003793 0.937403 0.011414 0.047390 0.015314 0.680239 0.017153 0.287294 0.044472 0.003049 0.148687 0.803792 0.001711 0.005756 0.845894 0.146640 0.039418 0.948302 0.007014 0.005266 0.055963 0.021357 0.013299 0.909381 0.002985 0.002722 0.976375 0.017918 0.157270 0.169874 0.253266 0.419591 0.092229 0.018758 0.883389 0.005623 0.318630 0.026439 0.283598 0.371334 0.259478 0.146793 0.357988 0.235741 0.161683 0.171743 0.405114 0.261460 Consensus sequence: DVHCCTGCTGBGDDB Alignment: BHDCVCAGCAGGHVD --VVGCAGYRGCAGS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 85 Motif name: C085 Original motif 0.210000 0.460000 0.290000 0.040000 0.059406 0.524752 0.405941 0.009901 0.190000 0.010000 0.790000 0.010000 0.440000 0.150000 0.400000 0.010000 0.009901 0.455446 0.495050 0.039604 0.090000 0.160000 0.430000 0.320000 0.242424 0.414141 0.171717 0.171717 0.740000 0.010000 0.240000 0.010000 0.178218 0.118812 0.693069 0.009901 0.790000 0.010000 0.190000 0.010000 0.370000 0.010000 0.610000 0.010000 0.190000 0.110000 0.400000 0.300000 0.220000 0.490000 0.210000 0.080000 0.190000 0.510000 0.290000 0.010000 0.050000 0.020000 0.920000 0.010000 0.480000 0.080000 0.430000 0.010000 0.010000 0.450000 0.470000 0.070000 Consensus sequence: VSGRSBHAGARDVSGRS Reserve complement motif 0.010000 0.470000 0.450000 0.070000 0.010000 0.080000 0.430000 0.480000 0.050000 0.920000 0.020000 0.010000 0.190000 0.290000 0.510000 0.010000 0.220000 0.210000 0.490000 0.080000 0.190000 0.400000 0.110000 0.300000 0.370000 0.610000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.190000 0.790000 0.178218 0.693069 0.118812 0.009901 0.010000 0.010000 0.240000 0.740000 0.242424 0.171717 0.414141 0.171717 0.090000 0.430000 0.160000 0.320000 0.009901 0.495050 0.455446 0.039604 0.010000 0.150000 0.400000 0.440000 0.190000 0.790000 0.010000 0.010000 0.059406 0.405941 0.524752 0.009901 0.210000 0.290000 0.460000 0.040000 Consensus sequence: SKCSVHMTCTDBSKCSV ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 85 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 5 17 0.034598 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH ----SKCSVHMTCTDBSKCSV- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00099 Ascl2_primary Reverse Complement Original Motif Backward 1 17 0.036848 Species: Mus musculus Original motif 0.168852 0.325948 0.188604 0.316596 0.150343 0.193286 0.241301 0.415069 0.091518 0.482905 0.122928 0.302648 0.472493 0.198776 0.225796 0.102935 0.294513 0.179919 0.447250 0.078318 0.014660 0.972080 0.005591 0.007668 0.954848 0.008107 0.008474 0.028571 0.006076 0.178912 0.760021 0.054991 0.052082 0.817415 0.124797 0.005707 0.019342 0.010406 0.008905 0.961347 0.005455 0.008073 0.977684 0.008788 0.042946 0.715551 0.087020 0.154483 0.116888 0.241739 0.170073 0.471300 0.315931 0.324343 0.291451 0.068274 0.199164 0.366921 0.163690 0.270226 0.218561 0.211076 0.187732 0.382631 0.145317 0.139808 0.389262 0.325614 Consensus sequence: BBYVVCAGCTGCBVHHD Reverse complement motif 0.145317 0.389262 0.139808 0.325614 0.382631 0.211076 0.187732 0.218561 0.199164 0.163690 0.366921 0.270226 0.315931 0.291451 0.324343 0.068274 0.471300 0.241739 0.170073 0.116888 0.042946 0.087020 0.715551 0.154483 0.005455 0.977684 0.008073 0.008788 0.961347 0.010406 0.008905 0.019342 0.052082 0.124797 0.817415 0.005707 0.006076 0.760021 0.178912 0.054991 0.028571 0.008107 0.008474 0.954848 0.014660 0.005591 0.972080 0.007668 0.294513 0.447250 0.179919 0.078318 0.102935 0.198776 0.225796 0.472493 0.091518 0.122928 0.482905 0.302648 0.415069 0.193286 0.241301 0.150343 0.168852 0.188604 0.325948 0.316596 Consensus sequence: HHDVVGCAGCTGVBKVB Alignment: BBYVVCAGCTGCBVHHD SKCSVHMTCTDBSKCSV ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 1 17 0.038764 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV ------VSGRSBHAGARDVSGRS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 3 17 0.039469 Species: Mus musculus Original motif 0.067627 0.131333 0.654425 0.146615 0.156488 0.114442 0.145630 0.583441 0.206450 0.265630 0.358017 0.169903 0.090729 0.460713 0.274712 0.173847 0.285994 0.099998 0.154485 0.459523 0.635908 0.184787 0.072982 0.106323 0.748421 0.039204 0.092605 0.119769 0.081342 0.061327 0.044532 0.812799 0.143120 0.043879 0.024216 0.788785 0.247544 0.092102 0.621453 0.038901 0.295531 0.036295 0.027594 0.640580 0.194561 0.305468 0.339916 0.160055 0.175038 0.193568 0.101212 0.530182 0.145226 0.167488 0.559871 0.127415 0.271501 0.237429 0.206701 0.284369 0.216834 0.109191 0.569605 0.104370 0.182624 0.177160 0.300475 0.339742 0.331737 0.198645 0.265137 0.204482 0.230155 0.359365 0.183450 0.227029 0.056581 0.067297 0.463052 0.413070 0.198891 0.324626 0.304424 0.172059 0.181968 0.287547 0.202419 0.328066 Consensus sequence: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB Reverse complement motif 0.328066 0.287547 0.202419 0.181968 0.198891 0.304424 0.324626 0.172059 0.056581 0.463052 0.067297 0.413070 0.230155 0.183450 0.359365 0.227029 0.204482 0.198645 0.265137 0.331737 0.339742 0.177160 0.300475 0.182624 0.216834 0.569605 0.109191 0.104370 0.284369 0.237429 0.206701 0.271501 0.145226 0.559871 0.167488 0.127415 0.530182 0.193568 0.101212 0.175038 0.194561 0.339916 0.305468 0.160055 0.640580 0.036295 0.027594 0.295531 0.247544 0.621453 0.092102 0.038901 0.788785 0.043879 0.024216 0.143120 0.812799 0.061327 0.044532 0.081342 0.119769 0.039204 0.092605 0.748421 0.106323 0.184787 0.072982 0.635908 0.459523 0.099998 0.154485 0.285994 0.090729 0.274712 0.460713 0.173847 0.206450 0.358017 0.265630 0.169903 0.583441 0.114442 0.145630 0.156488 0.067627 0.654425 0.131333 0.146615 Consensus sequence: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC Alignment: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB ---SKCSVHMTCTDBSKCSV-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00016 Sry_secondary Original Motif Original Motif Backward 1 17 0.040319 Species: Mus musculus Original motif 0.219740 0.291283 0.118755 0.370223 0.242432 0.282700 0.205912 0.268956 0.327415 0.133992 0.255532 0.283060 0.263415 0.304333 0.213668 0.218583 0.259356 0.177510 0.294274 0.268860 0.315458 0.184947 0.444440 0.055155 0.572256 0.199521 0.180616 0.047606 0.881847 0.020818 0.032731 0.064603 0.028134 0.863210 0.052977 0.055679 0.921133 0.023179 0.036360 0.019328 0.913642 0.029557 0.028830 0.027972 0.131537 0.035078 0.033568 0.799817 0.412204 0.069669 0.279439 0.238689 0.247458 0.179342 0.390493 0.182707 0.282951 0.233824 0.324889 0.158336 0.176058 0.325159 0.163416 0.335366 0.172201 0.210000 0.453746 0.164053 Consensus sequence: HHDHDRAACAATDDVHV Reverse complement motif 0.172201 0.453746 0.210000 0.164053 0.335366 0.325159 0.163416 0.176058 0.282951 0.324889 0.233824 0.158336 0.247458 0.390493 0.179342 0.182707 0.238689 0.069669 0.279439 0.412204 0.799817 0.035078 0.033568 0.131537 0.027972 0.029557 0.028830 0.913642 0.019328 0.023179 0.036360 0.921133 0.028134 0.052977 0.863210 0.055679 0.064603 0.020818 0.032731 0.881847 0.047606 0.199521 0.180616 0.572256 0.315458 0.444440 0.184947 0.055155 0.259356 0.294274 0.177510 0.268860 0.263415 0.213668 0.304333 0.218583 0.283060 0.133992 0.255532 0.327415 0.242432 0.205912 0.282700 0.268956 0.370223 0.291283 0.118755 0.219740 Consensus sequence: VHVHDATTGTTMHDDDH Alignment: HHDHDRAACAATDDVHV VSGRSBHAGARDVSGRS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 86 Motif name: C086 Original motif 0.030000 0.720000 0.020000 0.230000 0.090000 0.480000 0.340000 0.090000 0.200000 0.010000 0.760000 0.030000 0.010000 0.280000 0.700000 0.010000 0.660000 0.030000 0.200000 0.110000 0.180000 0.010000 0.800000 0.010000 0.010000 0.070000 0.410000 0.510000 0.010000 0.890000 0.010000 0.090000 0.420000 0.130000 0.060000 0.390000 0.080000 0.030000 0.880000 0.010000 0.504950 0.455446 0.029703 0.009901 0.148515 0.009901 0.831683 0.009901 0.099010 0.009901 0.881188 0.009901 0.190000 0.500000 0.300000 0.010000 0.544554 0.128713 0.247525 0.079208 0.009901 0.376238 0.475248 0.138614 0.260000 0.040000 0.640000 0.060000 Consensus sequence: CSGGAGKCWGMGGSASG Reserve complement motif 0.260000 0.640000 0.040000 0.060000 0.009901 0.475248 0.376238 0.138614 0.079208 0.128713 0.247525 0.544554 0.190000 0.300000 0.500000 0.010000 0.099010 0.881188 0.009901 0.009901 0.148515 0.831683 0.009901 0.009901 0.009901 0.455446 0.029703 0.504950 0.080000 0.880000 0.030000 0.010000 0.390000 0.130000 0.060000 0.420000 0.010000 0.010000 0.890000 0.090000 0.510000 0.070000 0.410000 0.010000 0.180000 0.800000 0.010000 0.010000 0.110000 0.030000 0.200000 0.660000 0.010000 0.700000 0.280000 0.010000 0.200000 0.760000 0.010000 0.030000 0.090000 0.340000 0.480000 0.090000 0.030000 0.020000 0.720000 0.230000 Consensus sequence: CSTSCCYCWGRCTCCSG ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 86 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 5 17 0.043299 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH ----CSTSCCYCWGRCTCCSG-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 5 17 0.045617 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK -CSGGAGKCWGMGGSASG---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 5 17 0.046080 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH ----CSTSCCYCWGRCTCCSG-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00527 Foxn4_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 2 17 0.052654 Species: Mus musculus Original motif 0.298336 0.418632 0.208054 0.074978 0.289907 0.015608 0.457100 0.237385 0.273583 0.077889 0.107860 0.540668 0.184954 0.161611 0.384390 0.269045 0.521826 0.156340 0.089019 0.232815 0.356716 0.131104 0.394857 0.117323 0.266669 0.108765 0.505273 0.119293 0.020778 0.047199 0.919524 0.012500 0.948536 0.018775 0.008113 0.024576 0.010822 0.964042 0.014701 0.010434 0.007428 0.019505 0.966351 0.006717 0.010025 0.975678 0.008648 0.005649 0.043796 0.120935 0.742979 0.092289 0.008252 0.250704 0.541132 0.199913 0.474428 0.044681 0.134430 0.346461 0.146597 0.421317 0.143166 0.288920 0.020540 0.181479 0.553811 0.244170 0.129612 0.173360 0.535219 0.161808 0.506084 0.158156 0.130983 0.204776 0.054872 0.103043 0.545792 0.296293 0.389882 0.171037 0.164162 0.274918 0.225861 0.314031 0.288872 0.171237 Consensus sequence: VDWDARRGACGCGGWHGGAKHV Reverse complement motif 0.225861 0.288872 0.314031 0.171237 0.274918 0.171037 0.164162 0.389882 0.054872 0.545792 0.103043 0.296293 0.204776 0.158156 0.130983 0.506084 0.129612 0.535219 0.173360 0.161808 0.020540 0.553811 0.181479 0.244170 0.146597 0.143166 0.421317 0.288920 0.346461 0.044681 0.134430 0.474428 0.008252 0.541132 0.250704 0.199913 0.043796 0.742979 0.120935 0.092289 0.010025 0.008648 0.975678 0.005649 0.007428 0.966351 0.019505 0.006717 0.010822 0.014701 0.964042 0.010434 0.024576 0.018775 0.008113 0.948536 0.020778 0.919524 0.047199 0.012500 0.266669 0.505273 0.108765 0.119293 0.356716 0.394857 0.131104 0.117323 0.232815 0.156340 0.089019 0.521826 0.184954 0.384390 0.161611 0.269045 0.540668 0.077889 0.107860 0.273583 0.289907 0.457100 0.015608 0.237385 0.298336 0.208054 0.418632 0.074978 Consensus sequence: VHYTCCDWCCGCGTCMMTHWHV Alignment: VDWDARRGACGCGGWHGGAKHV ----CSGGAGKCWGMGGSASG- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00098 Rfx3_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 3 17 0.053037 Species: Mus musculus Original motif 0.314514 0.275352 0.257617 0.152518 0.126939 0.598294 0.130576 0.144192 0.102265 0.155334 0.177957 0.564445 0.129288 0.282678 0.326990 0.261044 0.318166 0.227823 0.175681 0.278330 0.109019 0.380838 0.278328 0.231815 0.226145 0.289206 0.291300 0.193348 0.035863 0.844339 0.072582 0.047216 0.223793 0.187244 0.088092 0.500871 0.039800 0.029681 0.026201 0.904317 0.298298 0.032147 0.654746 0.014809 0.014729 0.022023 0.944826 0.018422 0.485114 0.004925 0.013785 0.496176 0.035708 0.020381 0.240804 0.703108 0.951152 0.012738 0.017886 0.018224 0.023713 0.944394 0.009538 0.022355 0.291067 0.385205 0.232388 0.091339 0.340334 0.199588 0.311526 0.148552 0.198713 0.472138 0.178319 0.150830 0.321155 0.269932 0.311301 0.097612 0.412646 0.195252 0.231950 0.160152 0.297134 0.180928 0.250400 0.271538 0.151169 0.305386 0.358574 0.184871 Consensus sequence: VCTBHBVCTTGGWTACVVVVVDB Reverse complement motif 0.151169 0.358574 0.305386 0.184871 0.271538 0.180928 0.250400 0.297134 0.160152 0.195252 0.231950 0.412646 0.097612 0.269932 0.311301 0.321155 0.198713 0.178319 0.472138 0.150830 0.148552 0.199588 0.311526 0.340334 0.291067 0.232388 0.385205 0.091339 0.023713 0.009538 0.944394 0.022355 0.018224 0.012738 0.017886 0.951152 0.703108 0.020381 0.240804 0.035708 0.496176 0.004925 0.013785 0.485114 0.014729 0.944826 0.022023 0.018422 0.298298 0.654746 0.032147 0.014809 0.904317 0.029681 0.026201 0.039800 0.500871 0.187244 0.088092 0.223793 0.035863 0.072582 0.844339 0.047216 0.226145 0.291300 0.289206 0.193348 0.109019 0.278328 0.380838 0.231815 0.278330 0.227823 0.175681 0.318166 0.129288 0.326990 0.282678 0.261044 0.564445 0.155334 0.177957 0.102265 0.126939 0.130576 0.598294 0.144192 0.152518 0.275352 0.257617 0.314514 Consensus sequence: BDBBVBVGTAWCCAAGVBHBAGB Alignment: BDBBVBVGTAWCCAAGVBHBAGB ----CSGGAGKCWGMGGSASG-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 87 Motif name: C087 Original motif 0.495050 0.029703 0.009901 0.465347 0.504950 0.009901 0.465347 0.019802 0.029703 0.118812 0.841584 0.009901 0.574257 0.207921 0.118812 0.099010 0.010000 0.960000 0.020000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.514851 0.039604 0.435644 0.009901 0.009901 0.475248 0.495050 0.019802 0.029703 0.504950 0.455446 0.009901 0.049505 0.465347 0.009901 0.475248 0.040000 0.010000 0.010000 0.940000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.009901 0.079208 0.841584 0.069307 0.069307 0.851485 0.019802 0.059406 0.039604 0.485149 0.009901 0.465347 0.425743 0.039604 0.009901 0.524752 Consensus sequence: WRGACCRSSYTGGCYW Reserve complement motif 0.524752 0.039604 0.009901 0.425743 0.039604 0.009901 0.485149 0.465347 0.069307 0.019802 0.851485 0.059406 0.009901 0.841584 0.079208 0.069307 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.940000 0.010000 0.010000 0.040000 0.475248 0.465347 0.009901 0.049505 0.029703 0.455446 0.504950 0.009901 0.009901 0.495050 0.475248 0.019802 0.009901 0.039604 0.435644 0.514851 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.020000 0.960000 0.010000 0.099010 0.207921 0.118812 0.574257 0.029703 0.841584 0.118812 0.009901 0.019802 0.009901 0.465347 0.504950 0.465347 0.029703 0.009901 0.495050 Consensus sequence: WKGCCAMSSKGGTCKW ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 87 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v015681_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 3 16 0.024051 Species: Mus musculus Original motif 0.214165 0.143436 0.372522 0.269876 0.314445 0.406003 0.160351 0.119201 0.137147 0.092924 0.042921 0.727007 0.044121 0.072843 0.051741 0.831295 0.261292 0.324124 0.298498 0.116086 0.258125 0.323243 0.263362 0.155271 0.204557 0.589399 0.107153 0.098891 0.371021 0.244027 0.291102 0.093849 0.096327 0.572718 0.011797 0.319159 0.027282 0.046183 0.844519 0.082016 0.018921 0.012887 0.915917 0.052275 0.364793 0.166722 0.084229 0.384256 0.028216 0.011233 0.951056 0.009495 0.054974 0.004738 0.890377 0.049911 0.006802 0.312915 0.134247 0.546036 0.241289 0.628210 0.104788 0.025713 0.237863 0.302807 0.213018 0.246311 0.349399 0.203220 0.086635 0.360746 0.386634 0.144693 0.246895 0.221779 0.425101 0.354676 0.093374 0.126849 0.060272 0.391320 0.104905 0.443503 0.162090 0.190233 0.227433 0.420244 Consensus sequence: DVTTVVCVYGGHGGYCHHDMYB Reverse complement motif 0.420244 0.190233 0.227433 0.162090 0.443503 0.391320 0.104905 0.060272 0.126849 0.354676 0.093374 0.425101 0.221779 0.144693 0.246895 0.386634 0.360746 0.203220 0.086635 0.349399 0.237863 0.213018 0.302807 0.246311 0.241289 0.104788 0.628210 0.025713 0.546036 0.312915 0.134247 0.006802 0.054974 0.890377 0.004738 0.049911 0.028216 0.951056 0.011233 0.009495 0.384256 0.166722 0.084229 0.364793 0.018921 0.915917 0.012887 0.052275 0.027282 0.844519 0.046183 0.082016 0.096327 0.011797 0.572718 0.319159 0.093849 0.244027 0.291102 0.371021 0.204557 0.107153 0.589399 0.098891 0.258125 0.263362 0.323243 0.155271 0.261292 0.298498 0.324124 0.116086 0.831295 0.072843 0.051741 0.044121 0.727007 0.092924 0.042921 0.137147 0.314445 0.160351 0.406003 0.119201 0.214165 0.372522 0.143436 0.269876 Consensus sequence: VMYDHDGMCCHCCKBGVVAAVH Alignment: DVTTVVCVYGGHGGYCHHDMYB --WKGCCAMSSKGGTCKW---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 6 16 0.027308 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH -----WKGCCAMSSKGGTCKW-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v015681_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 1 16 0.029994 Species: Mus musculus Original motif 0.331499 0.188505 0.182841 0.297156 0.328961 0.213025 0.273530 0.184484 0.197213 0.129292 0.524914 0.148581 0.274491 0.226406 0.312118 0.186986 0.103231 0.393726 0.364988 0.138055 0.552594 0.166422 0.186262 0.094722 0.157618 0.064773 0.616497 0.161112 0.139166 0.176098 0.621185 0.063551 0.748420 0.062398 0.012447 0.176735 0.116584 0.009438 0.860326 0.013653 0.005030 0.003646 0.974877 0.016447 0.055257 0.007181 0.921760 0.015802 0.032748 0.058249 0.052709 0.856293 0.105606 0.872231 0.014370 0.007793 0.019480 0.497379 0.125899 0.357242 0.478582 0.269713 0.061464 0.190242 0.253985 0.287006 0.201320 0.257689 0.319384 0.210231 0.175842 0.294543 0.222123 0.287802 0.201294 0.288782 0.139951 0.376041 0.081133 0.402875 0.213450 0.343835 0.383676 0.059039 0.322294 0.355918 0.148062 0.173725 Consensus sequence: HVGVSAGGAGGGTCYHHHHYVH Reverse complement motif 0.322294 0.148062 0.355918 0.173725 0.213450 0.383676 0.343835 0.059039 0.402875 0.376041 0.081133 0.139951 0.288782 0.287802 0.201294 0.222123 0.294543 0.210231 0.175842 0.319384 0.253985 0.201320 0.287006 0.257689 0.190242 0.269713 0.061464 0.478582 0.019480 0.125899 0.497379 0.357242 0.105606 0.014370 0.872231 0.007793 0.856293 0.058249 0.052709 0.032748 0.055257 0.921760 0.007181 0.015802 0.005030 0.974877 0.003646 0.016447 0.116584 0.860326 0.009438 0.013653 0.176735 0.062398 0.012447 0.748420 0.139166 0.621185 0.176098 0.063551 0.157618 0.616497 0.064773 0.161112 0.094722 0.166422 0.186262 0.552594 0.103231 0.364988 0.393726 0.138055 0.274491 0.312118 0.226406 0.186986 0.197213 0.524914 0.129292 0.148581 0.184484 0.213025 0.273530 0.328961 0.297156 0.188505 0.182841 0.331499 Consensus sequence: DVMHHDHKGACCCTCCTSVCBH Alignment: HVGVSAGGAGGGTCYHHHHYVH ------WRGACCRSSYTGGCYW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_primaryOriginal Motif Original Motif Forward 6 16 0.031629 Species: Mus musculus Original motif 0.183797 0.268049 0.330111 0.218043 0.127599 0.330310 0.243614 0.298477 0.143199 0.188046 0.268593 0.400162 0.214690 0.205230 0.247090 0.332990 0.294688 0.299104 0.327152 0.079056 0.221909 0.193223 0.480155 0.104712 0.444072 0.068239 0.481838 0.005852 0.006182 0.015429 0.901278 0.077111 0.766535 0.111138 0.121632 0.000696 0.014848 0.973961 0.000298 0.010893 0.001807 0.992200 0.002669 0.003324 0.795344 0.140510 0.018576 0.045571 0.006990 0.988200 0.002510 0.002299 0.154898 0.842296 0.000998 0.001808 0.029577 0.919262 0.006935 0.044226 0.677987 0.032075 0.185065 0.104874 0.195132 0.364580 0.319321 0.120967 0.225412 0.115034 0.612849 0.046705 0.548628 0.058900 0.162857 0.229616 0.112531 0.340331 0.165910 0.381227 0.073029 0.303078 0.363896 0.259997 0.561485 0.260567 0.092979 0.084969 0.132283 0.457691 0.140159 0.269867 Consensus sequence: BBBDVVRGACCACCCAVGABBAB Reverse complement motif 0.132283 0.140159 0.457691 0.269867 0.084969 0.260567 0.092979 0.561485 0.073029 0.363896 0.303078 0.259997 0.381227 0.340331 0.165910 0.112531 0.229616 0.058900 0.162857 0.548628 0.225412 0.612849 0.115034 0.046705 0.195132 0.319321 0.364580 0.120967 0.104874 0.032075 0.185065 0.677987 0.029577 0.006935 0.919262 0.044226 0.154898 0.000998 0.842296 0.001808 0.006990 0.002510 0.988200 0.002299 0.045571 0.140510 0.018576 0.795344 0.001807 0.002669 0.992200 0.003324 0.014848 0.000298 0.973961 0.010893 0.000696 0.111138 0.121632 0.766535 0.006182 0.901278 0.015429 0.077111 0.444072 0.481838 0.068239 0.005852 0.221909 0.480155 0.193223 0.104712 0.294688 0.327152 0.299104 0.079056 0.332990 0.205230 0.247090 0.214690 0.400162 0.188046 0.268593 0.143199 0.127599 0.243614 0.330310 0.298477 0.183797 0.330111 0.268049 0.218043 Consensus sequence: BTBVTCVTGGGTGGTCMVVDVBB Alignment: BBBDVVRGACCACCCAVGABBAB -----WRGACCRSSYTGGCYW-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_primaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 6 16 0.031888 Species: Mus musculus Original motif 0.204923 0.208846 0.365383 0.220848 0.294304 0.300143 0.167287 0.238266 0.109711 0.619514 0.117379 0.153396 0.178979 0.378580 0.230177 0.212264 0.159594 0.542602 0.118178 0.179627 0.125206 0.430074 0.151826 0.292894 0.097692 0.709845 0.116956 0.075506 0.148292 0.565912 0.037632 0.248164 0.077951 0.034190 0.855503 0.032356 0.001657 0.001061 0.971877 0.025405 0.001926 0.001084 0.991712 0.005278 0.033031 0.012001 0.057796 0.897171 0.002723 0.002647 0.993348 0.001281 0.003261 0.000963 0.987199 0.008577 0.000611 0.090925 0.074857 0.833608 0.015299 0.978878 0.004949 0.000874 0.013368 0.600902 0.033485 0.352245 0.231949 0.149575 0.118804 0.499672 0.267580 0.186002 0.371242 0.175176 0.264884 0.223483 0.110082 0.401551 0.221365 0.170121 0.179559 0.428955 0.112997 0.692930 0.139981 0.054092 0.460305 0.207883 0.155111 0.176702 Consensus sequence: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH Reverse complement motif 0.176702 0.207883 0.155111 0.460305 0.112997 0.139981 0.692930 0.054092 0.428955 0.170121 0.179559 0.221365 0.401551 0.223483 0.110082 0.264884 0.267580 0.371242 0.186002 0.175176 0.499672 0.149575 0.118804 0.231949 0.013368 0.033485 0.600902 0.352245 0.015299 0.004949 0.978878 0.000874 0.833608 0.090925 0.074857 0.000611 0.003261 0.987199 0.000963 0.008577 0.002723 0.993348 0.002647 0.001281 0.897171 0.012001 0.057796 0.033031 0.001926 0.991712 0.001084 0.005278 0.001657 0.971877 0.001061 0.025405 0.077951 0.855503 0.034190 0.032356 0.148292 0.037632 0.565912 0.248164 0.097692 0.116956 0.709845 0.075506 0.125206 0.151826 0.430074 0.292894 0.159594 0.118178 0.542602 0.179627 0.178979 0.230177 0.378580 0.212264 0.109711 0.117379 0.619514 0.153396 0.294304 0.167287 0.300143 0.238266 0.204923 0.365383 0.208846 0.220848 Consensus sequence: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB Alignment: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB -----WRGACCRSSYTGGCYW-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 88 Motif name: C088 Original motif 0.019802 0.425743 0.504950 0.049505 0.069307 0.009901 0.465347 0.455446 0.060000 0.920000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.009901 0.821782 0.158416 0.009901 0.060000 0.010000 0.010000 0.920000 0.010000 0.750000 0.030000 0.210000 0.480000 0.070000 0.030000 0.420000 0.150000 0.070000 0.700000 0.080000 0.090000 0.010000 0.010000 0.890000 0.960000 0.010000 0.010000 0.020000 0.099010 0.009901 0.881188 0.009901 0.720000 0.140000 0.080000 0.060000 0.470000 0.450000 0.010000 0.070000 0.090000 0.410000 0.470000 0.030000 Consensus sequence: SKCACTCWGTAGAMS Reserve complement motif 0.090000 0.470000 0.410000 0.030000 0.070000 0.450000 0.010000 0.470000 0.060000 0.140000 0.080000 0.720000 0.099010 0.881188 0.009901 0.009901 0.020000 0.010000 0.010000 0.960000 0.890000 0.010000 0.010000 0.090000 0.150000 0.700000 0.070000 0.080000 0.420000 0.070000 0.030000 0.480000 0.010000 0.030000 0.750000 0.210000 0.920000 0.010000 0.010000 0.060000 0.009901 0.158416 0.821782 0.009901 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.060000 0.010000 0.920000 0.010000 0.069307 0.465347 0.009901 0.455446 0.019802 0.504950 0.425743 0.049505 Consensus sequence: SYTCTACWGAGTGYS ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 88 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00201 Emx2 Reverse Complement Original Motif Backward 2 15 0.028571 Species: Mus musculus Original motif 0.484575 0.083418 0.052338 0.379669 0.260773 0.336233 0.332641 0.070352 0.276126 0.368417 0.241198 0.114259 0.377205 0.196394 0.327727 0.098673 0.025781 0.682867 0.059474 0.231877 0.015583 0.035769 0.000782 0.947865 0.884975 0.111429 0.001139 0.002457 0.979922 0.008742 0.000744 0.010591 0.010591 0.000744 0.008742 0.979922 0.002457 0.001139 0.111429 0.884975 0.947865 0.000782 0.035769 0.015583 0.231877 0.059474 0.682867 0.025781 0.024452 0.386115 0.050019 0.539414 0.116898 0.151177 0.484611 0.247313 0.140854 0.245359 0.501926 0.111862 0.273412 0.258193 0.206804 0.261592 0.175252 0.318601 0.225006 0.281142 Consensus sequence: WVVVCTAATTAGYBGHB Reverse complement motif 0.175252 0.225006 0.318601 0.281142 0.261592 0.258193 0.206804 0.273412 0.140854 0.501926 0.245359 0.111862 0.116898 0.484611 0.151177 0.247313 0.539414 0.386115 0.050019 0.024452 0.231877 0.682867 0.059474 0.025781 0.015583 0.000782 0.035769 0.947865 0.884975 0.001139 0.111429 0.002457 0.979922 0.000744 0.008742 0.010591 0.010591 0.008742 0.000744 0.979922 0.002457 0.111429 0.001139 0.884975 0.947865 0.035769 0.000782 0.015583 0.025781 0.059474 0.682867 0.231877 0.098673 0.196394 0.327727 0.377205 0.276126 0.241198 0.368417 0.114259 0.260773 0.332641 0.336233 0.070352 0.379669 0.083418 0.052338 0.484575 Consensus sequence: BHCBMCTAATTAGBVVW Alignment: WVVVCTAATTAGYBGHB -SYTCTACWGAGTGYS- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00123 Hlxb9 Reverse Complement Original Motif Forward 1 15 0.030681 Species: Mus musculus Original motif 0.124726 0.237945 0.372005 0.265324 0.136341 0.210540 0.300319 0.352800 0.563722 0.246698 0.172306 0.017274 0.105666 0.392788 0.383230 0.118316 0.008158 0.083543 0.000664 0.907635 0.971699 0.020631 0.004197 0.003472 0.984998 0.003454 0.005204 0.006344 0.006344 0.005204 0.003454 0.984998 0.003472 0.004197 0.020631 0.971699 0.907635 0.000664 0.083543 0.008158 0.075595 0.162864 0.680211 0.081330 0.017274 0.172306 0.246698 0.563722 0.168421 0.090333 0.590199 0.151047 0.226279 0.273018 0.333611 0.167092 0.251897 0.348912 0.112360 0.286831 0.291867 0.301340 0.336444 0.070349 Consensus sequence: BBASTAATTAGTGVHV Reverse complement motif 0.291867 0.336444 0.301340 0.070349 0.251897 0.112360 0.348912 0.286831 0.226279 0.333611 0.273018 0.167092 0.168421 0.590199 0.090333 0.151047 0.563722 0.172306 0.246698 0.017274 0.075595 0.680211 0.162864 0.081330 0.008158 0.000664 0.083543 0.907635 0.971699 0.004197 0.020631 0.003472 0.984998 0.005204 0.003454 0.006344 0.006344 0.003454 0.005204 0.984998 0.003472 0.020631 0.004197 0.971699 0.907635 0.083543 0.000664 0.008158 0.105666 0.383230 0.392788 0.118316 0.017274 0.246698 0.172306 0.563722 0.352800 0.210540 0.300319 0.136341 0.124726 0.372005 0.237945 0.265324 Consensus sequence: VDVCACTAATTASTVB Alignment: BBASTAATTAGTGVHV SYTCTACWGAGTGYS- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00162 Evx1 Reverse Complement Original Motif Backward 2 15 0.031937 Species: Mus musculus Original motif 0.467091 0.055966 0.031451 0.445491 0.297969 0.254547 0.334132 0.113352 0.355907 0.217782 0.210827 0.215484 0.469306 0.146281 0.256669 0.127745 0.050402 0.656647 0.178799 0.114152 0.008515 0.033204 0.000966 0.957315 0.853083 0.143369 0.002996 0.000552 0.987472 0.005323 0.004604 0.002601 0.002601 0.004604 0.005323 0.987472 0.000552 0.002996 0.143369 0.853083 0.957315 0.000966 0.033204 0.008515 0.114152 0.178799 0.656647 0.050402 0.027244 0.439870 0.055293 0.477592 0.165329 0.200182 0.457936 0.176553 0.200531 0.245309 0.380414 0.173747 0.360118 0.164432 0.174125 0.301325 0.239572 0.358371 0.238530 0.163528 Consensus sequence: WVHVCTAATTAGYBVDV Reverse complement motif 0.239572 0.238530 0.358371 0.163528 0.301325 0.164432 0.174125 0.360118 0.200531 0.380414 0.245309 0.173747 0.165329 0.457936 0.200182 0.176553 0.477592 0.439870 0.055293 0.027244 0.114152 0.656647 0.178799 0.050402 0.008515 0.000966 0.033204 0.957315 0.853083 0.002996 0.143369 0.000552 0.987472 0.004604 0.005323 0.002601 0.002601 0.005323 0.004604 0.987472 0.000552 0.143369 0.002996 0.853083 0.957315 0.033204 0.000966 0.008515 0.050402 0.178799 0.656647 0.114152 0.127745 0.146281 0.256669 0.469306 0.215484 0.217782 0.210827 0.355907 0.297969 0.334132 0.254547 0.113352 0.445491 0.055966 0.031451 0.467091 Consensus sequence: VDVBMCTAATTAGBHVW Alignment: WVHVCTAATTAGYBVDV -SYTCTACWGAGTGYS- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00132 Evx2 Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 15 0.032030 Species: Mus musculus Original motif 0.206898 0.304756 0.229326 0.259021 0.396007 0.330131 0.192964 0.080898 0.138551 0.564168 0.090166 0.207116 0.286745 0.524514 0.088046 0.100694 0.152216 0.070150 0.760833 0.016800 0.024267 0.824098 0.120321 0.031313 0.004888 0.017616 0.000443 0.977053 0.948687 0.044377 0.006226 0.000709 0.991749 0.001631 0.003522 0.003099 0.002129 0.002760 0.003047 0.992064 0.001023 0.007073 0.052989 0.938915 0.925976 0.000749 0.071651 0.001624 0.021003 0.158227 0.761241 0.059529 0.043697 0.530850 0.230935 0.194518 0.124744 0.184486 0.400596 0.290174 0.092689 0.146902 0.377415 0.382993 0.340077 0.102340 0.057203 0.500380 Consensus sequence: BVCMGCTAATTAGCBKW Reverse complement motif 0.500380 0.102340 0.057203 0.340077 0.382993 0.146902 0.377415 0.092689 0.124744 0.400596 0.184486 0.290174 0.043697 0.230935 0.530850 0.194518 0.021003 0.761241 0.158227 0.059529 0.001624 0.000749 0.071651 0.925976 0.938915 0.007073 0.052989 0.001023 0.992064 0.002760 0.003047 0.002129 0.003099 0.001631 0.003522 0.991749 0.000709 0.044377 0.006226 0.948687 0.977053 0.017616 0.000443 0.004888 0.024267 0.120321 0.824098 0.031313 0.152216 0.760833 0.070150 0.016800 0.286745 0.088046 0.524514 0.100694 0.138551 0.090166 0.564168 0.207116 0.080898 0.330131 0.192964 0.396007 0.206898 0.229326 0.304756 0.259021 Consensus sequence: WRBGCTAATTAGCRGBB Alignment: WRBGCTAATTAGCRGBB -SYTCTACWGAGTGYS- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00116 Rhox6 Reverse Complement Original Motif Forward 2 15 0.032222 Species: Mus musculus Original motif 0.360624 0.052745 0.050511 0.536120 0.313286 0.209809 0.395358 0.081547 0.236253 0.426218 0.145895 0.191635 0.277450 0.393062 0.182036 0.147452 0.080392 0.361677 0.039443 0.518488 0.030736 0.025359 0.014986 0.928919 0.861156 0.054995 0.013538 0.070311 0.934728 0.027904 0.034233 0.003136 0.003136 0.034233 0.027904 0.934728 0.070311 0.013538 0.054995 0.861156 0.928919 0.014986 0.025359 0.030736 0.518488 0.039443 0.361677 0.080392 0.065979 0.224320 0.121030 0.588671 0.078630 0.234912 0.420487 0.265971 0.103547 0.400488 0.392739 0.103225 0.252475 0.235031 0.240995 0.271499 0.214482 0.344839 0.137535 0.303144 Consensus sequence: WVHVYTAATTARTBSDH Reverse complement motif 0.214482 0.137535 0.344839 0.303144 0.271499 0.235031 0.240995 0.252475 0.103547 0.392739 0.400488 0.103225 0.078630 0.420487 0.234912 0.265971 0.588671 0.224320 0.121030 0.065979 0.080392 0.039443 0.361677 0.518488 0.030736 0.014986 0.025359 0.928919 0.861156 0.013538 0.054995 0.070311 0.934728 0.034233 0.027904 0.003136 0.003136 0.027904 0.034233 0.934728 0.070311 0.054995 0.013538 0.861156 0.928919 0.025359 0.014986 0.030736 0.518488 0.361677 0.039443 0.080392 0.277450 0.182036 0.393062 0.147452 0.236253 0.145895 0.426218 0.191635 0.313286 0.395358 0.209809 0.081547 0.536120 0.052745 0.050511 0.360624 Consensus sequence: DDSBAKTAATTAMVDVW Alignment: WVHVYTAATTARTBSDH -SYTCTACWGAGTGYS- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 89 Motif name: C089 Original motif 0.020000 0.560000 0.010000 0.410000 0.050000 0.020000 0.450000 0.480000 0.070000 0.900000 0.020000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.910000 0.010000 0.070000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.440000 0.350000 0.010000 0.200000 0.040000 0.510000 0.040000 0.410000 0.380000 0.070000 0.530000 0.020000 0.200000 0.080000 0.250000 0.470000 0.841584 0.009901 0.009901 0.138614 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.450000 0.090000 0.420000 0.040000 0.010000 0.920000 0.010000 0.060000 0.465347 0.495050 0.009901 0.029703 0.420000 0.030000 0.470000 0.080000 Consensus sequence: YKCACTMYRDAGRCMR Reserve complement motif 0.420000 0.470000 0.030000 0.080000 0.465347 0.009901 0.495050 0.029703 0.010000 0.010000 0.920000 0.060000 0.040000 0.090000 0.420000 0.450000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.138614 0.009901 0.009901 0.841584 0.470000 0.080000 0.250000 0.200000 0.380000 0.530000 0.070000 0.020000 0.040000 0.040000 0.510000 0.410000 0.200000 0.350000 0.010000 0.440000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.910000 0.070000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.070000 0.020000 0.900000 0.010000 0.480000 0.020000 0.450000 0.050000 0.020000 0.010000 0.560000 0.410000 Consensus sequence: MRGKCTDMKYAGTGRK ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 89 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00132 Evx2 Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 16 0.041275 Species: Mus musculus Original motif 0.206898 0.304756 0.229326 0.259021 0.396007 0.330131 0.192964 0.080898 0.138551 0.564168 0.090166 0.207116 0.286745 0.524514 0.088046 0.100694 0.152216 0.070150 0.760833 0.016800 0.024267 0.824098 0.120321 0.031313 0.004888 0.017616 0.000443 0.977053 0.948687 0.044377 0.006226 0.000709 0.991749 0.001631 0.003522 0.003099 0.002129 0.002760 0.003047 0.992064 0.001023 0.007073 0.052989 0.938915 0.925976 0.000749 0.071651 0.001624 0.021003 0.158227 0.761241 0.059529 0.043697 0.530850 0.230935 0.194518 0.124744 0.184486 0.400596 0.290174 0.092689 0.146902 0.377415 0.382993 0.340077 0.102340 0.057203 0.500380 Consensus sequence: BVCMGCTAATTAGCBKW Reverse complement motif 0.500380 0.102340 0.057203 0.340077 0.382993 0.146902 0.377415 0.092689 0.124744 0.400596 0.184486 0.290174 0.043697 0.230935 0.530850 0.194518 0.021003 0.761241 0.158227 0.059529 0.001624 0.000749 0.071651 0.925976 0.938915 0.007073 0.052989 0.001023 0.992064 0.002760 0.003047 0.002129 0.003099 0.001631 0.003522 0.991749 0.000709 0.044377 0.006226 0.948687 0.977053 0.017616 0.000443 0.004888 0.024267 0.120321 0.824098 0.031313 0.152216 0.760833 0.070150 0.016800 0.286745 0.088046 0.524514 0.100694 0.138551 0.090166 0.564168 0.207116 0.080898 0.330131 0.192964 0.396007 0.206898 0.229326 0.304756 0.259021 Consensus sequence: WRBGCTAATTAGCRGBB Alignment: WRBGCTAATTAGCRGBB MRGKCTDMKYAGTGRK- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00131 Gbx2 Reverse Complement Reverse Complement Forward 2 16 0.042450 Species: Mus musculus Original motif 0.386212 0.050100 0.264286 0.299401 0.238250 0.271019 0.290093 0.200638 0.244981 0.382115 0.195542 0.177362 0.408943 0.090757 0.420316 0.079984 0.043824 0.844120 0.061224 0.050832 0.003925 0.194171 0.000796 0.801108 0.980854 0.013004 0.004250 0.001892 0.986820 0.005116 0.002834 0.005231 0.005231 0.002834 0.005116 0.986820 0.001892 0.004250 0.013004 0.980854 0.801108 0.000796 0.194171 0.003925 0.050832 0.061224 0.844120 0.043824 0.042136 0.437110 0.103694 0.417060 0.157043 0.278774 0.439499 0.124684 0.389315 0.112948 0.303336 0.194401 0.111205 0.229990 0.249727 0.409078 0.152439 0.132904 0.226965 0.487693 Consensus sequence: DVVRCTAATTAGYVDBD Reverse complement motif 0.487693 0.132904 0.226965 0.152439 0.409078 0.229990 0.249727 0.111205 0.194401 0.112948 0.303336 0.389315 0.157043 0.439499 0.278774 0.124684 0.042136 0.103694 0.437110 0.417060 0.050832 0.844120 0.061224 0.043824 0.003925 0.000796 0.194171 0.801108 0.980854 0.004250 0.013004 0.001892 0.986820 0.002834 0.005116 0.005231 0.005231 0.005116 0.002834 0.986820 0.001892 0.013004 0.004250 0.980854 0.801108 0.194171 0.000796 0.003925 0.043824 0.061224 0.844120 0.050832 0.408943 0.420316 0.090757 0.079984 0.244981 0.195542 0.382115 0.177362 0.238250 0.290093 0.271019 0.200638 0.299401 0.050100 0.264286 0.386212 Consensus sequence: DVDVKCTAATTAGMVVD Alignment: DVDVKCTAATTAGMVVD -MRGKCTDMKYAGTGRK ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00201 Emx2 Reverse Complement Original Motif Backward 2 16 0.043962 Species: Mus musculus Original motif 0.484575 0.083418 0.052338 0.379669 0.260773 0.336233 0.332641 0.070352 0.276126 0.368417 0.241198 0.114259 0.377205 0.196394 0.327727 0.098673 0.025781 0.682867 0.059474 0.231877 0.015583 0.035769 0.000782 0.947865 0.884975 0.111429 0.001139 0.002457 0.979922 0.008742 0.000744 0.010591 0.010591 0.000744 0.008742 0.979922 0.002457 0.001139 0.111429 0.884975 0.947865 0.000782 0.035769 0.015583 0.231877 0.059474 0.682867 0.025781 0.024452 0.386115 0.050019 0.539414 0.116898 0.151177 0.484611 0.247313 0.140854 0.245359 0.501926 0.111862 0.273412 0.258193 0.206804 0.261592 0.175252 0.318601 0.225006 0.281142 Consensus sequence: WVVVCTAATTAGYBGHB Reverse complement motif 0.175252 0.225006 0.318601 0.281142 0.261592 0.258193 0.206804 0.273412 0.140854 0.501926 0.245359 0.111862 0.116898 0.484611 0.151177 0.247313 0.539414 0.386115 0.050019 0.024452 0.231877 0.682867 0.059474 0.025781 0.015583 0.000782 0.035769 0.947865 0.884975 0.001139 0.111429 0.002457 0.979922 0.000744 0.008742 0.010591 0.010591 0.008742 0.000744 0.979922 0.002457 0.111429 0.001139 0.884975 0.947865 0.035769 0.000782 0.015583 0.025781 0.059474 0.682867 0.231877 0.098673 0.196394 0.327727 0.377205 0.276126 0.241198 0.368417 0.114259 0.260773 0.332641 0.336233 0.070352 0.379669 0.083418 0.052338 0.484575 Consensus sequence: BHCBMCTAATTAGBVVW Alignment: WVVVCTAATTAGYBGHB MRGKCTDMKYAGTGRK- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00184 Lhx8 Reverse Complement Original Motif Forward 1 16 0.045466 Species: Mus musculus Original motif 0.381182 0.203863 0.138419 0.276536 0.273032 0.443086 0.157555 0.126328 0.332245 0.358200 0.167187 0.142367 0.288841 0.389156 0.252732 0.069272 0.059714 0.852529 0.049374 0.038383 0.005876 0.170371 0.000610 0.823143 0.857806 0.014120 0.127763 0.000311 0.983730 0.004111 0.010338 0.001820 0.001820 0.010338 0.004111 0.983730 0.000311 0.127763 0.014120 0.857806 0.823143 0.000610 0.170371 0.005876 0.038383 0.049374 0.852529 0.059714 0.022729 0.729173 0.090200 0.157898 0.139768 0.120744 0.492473 0.247016 0.148964 0.118692 0.499320 0.233024 0.076316 0.185770 0.195892 0.542022 0.181038 0.136132 0.512805 0.170024 Consensus sequence: HVVVCTAATTAGCDDTG Reverse complement motif 0.181038 0.512805 0.136132 0.170024 0.542022 0.185770 0.195892 0.076316 0.148964 0.499320 0.118692 0.233024 0.139768 0.492473 0.120744 0.247016 0.022729 0.090200 0.729173 0.157898 0.038383 0.852529 0.049374 0.059714 0.005876 0.000610 0.170371 0.823143 0.857806 0.127763 0.014120 0.000311 0.983730 0.010338 0.004111 0.001820 0.001820 0.004111 0.010338 0.983730 0.000311 0.014120 0.127763 0.857806 0.823143 0.170371 0.000610 0.005876 0.059714 0.049374 0.852529 0.038383 0.288841 0.252732 0.389156 0.069272 0.332245 0.167187 0.358200 0.142367 0.273032 0.157555 0.443086 0.126328 0.276536 0.203863 0.138419 0.381182 Consensus sequence: CAHHGCTAATTAGVVVH Alignment: CAHHGCTAATTAGVVVH MRGKCTDMKYAGTGRK- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00084 Gmeb1_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 1 16 0.046154 Species: Mus musculus Original motif 0.171801 0.139045 0.265726 0.423428 0.146597 0.118316 0.577770 0.157317 0.247220 0.191958 0.432935 0.127887 0.119277 0.232191 0.394786 0.253747 0.227546 0.664338 0.016991 0.091125 0.271290 0.146819 0.518707 0.063184 0.693351 0.120942 0.066863 0.118844 0.041459 0.895990 0.042253 0.020298 0.020298 0.042253 0.895990 0.041459 0.118844 0.066863 0.120942 0.693351 0.063184 0.518707 0.146819 0.271290 0.091125 0.016991 0.664338 0.227546 0.122589 0.186959 0.078274 0.612178 0.103039 0.274719 0.113320 0.508922 0.375945 0.289040 0.127861 0.207153 0.429989 0.189120 0.110127 0.270765 Consensus sequence: DGVBCRACGTYGTYHH Reverse complement motif 0.270765 0.189120 0.110127 0.429989 0.207153 0.289040 0.127861 0.375945 0.508922 0.274719 0.113320 0.103039 0.612178 0.186959 0.078274 0.122589 0.091125 0.664338 0.016991 0.227546 0.063184 0.146819 0.518707 0.271290 0.693351 0.066863 0.120942 0.118844 0.020298 0.895990 0.042253 0.041459 0.041459 0.042253 0.895990 0.020298 0.118844 0.120942 0.066863 0.693351 0.271290 0.518707 0.146819 0.063184 0.227546 0.016991 0.664338 0.091125 0.119277 0.394786 0.232191 0.253747 0.247220 0.432935 0.191958 0.127887 0.146597 0.577770 0.118316 0.157317 0.423428 0.139045 0.265726 0.171801 Consensus sequence: HHMACKACGTMGBVCD Alignment: DGVBCRACGTYGTYHH YKCACTMYRDAGRCMR ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 90 Motif name: C090 Original motif 0.510000 0.050000 0.050000 0.390000 0.620000 0.140000 0.010000 0.230000 0.702970 0.009901 0.138614 0.148515 0.330000 0.080000 0.160000 0.430000 0.430000 0.160000 0.010000 0.400000 0.851485 0.128713 0.009901 0.009901 0.683168 0.039604 0.079208 0.198020 0.821782 0.148515 0.019802 0.009901 0.405941 0.108911 0.227723 0.257426 0.460000 0.010000 0.160000 0.370000 0.460000 0.070000 0.070000 0.400000 0.560000 0.100000 0.010000 0.330000 0.732673 0.009901 0.059406 0.198020 0.297030 0.079208 0.128713 0.495050 Consensus sequence: WAAWWAAADWWWAW Reserve complement motif 0.495050 0.079208 0.128713 0.297030 0.198020 0.009901 0.059406 0.732673 0.330000 0.100000 0.010000 0.560000 0.400000 0.070000 0.070000 0.460000 0.370000 0.010000 0.160000 0.460000 0.257426 0.108911 0.227723 0.405941 0.009901 0.148515 0.019802 0.821782 0.198020 0.039604 0.079208 0.683168 0.009901 0.128713 0.009901 0.851485 0.400000 0.160000 0.010000 0.430000 0.430000 0.080000 0.160000 0.330000 0.148515 0.009901 0.138614 0.702970 0.230000 0.140000 0.010000 0.620000 0.390000 0.050000 0.050000 0.510000 Consensus sequence: WTWWWDTTTWWTTW ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 90 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00090 Elf3_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 1 14 0.039347 Species: Mus musculus Original motif 0.155083 0.152982 0.490906 0.201030 0.123195 0.312681 0.220770 0.343354 0.110252 0.131358 0.153983 0.604406 0.216489 0.490160 0.101348 0.192003 0.396130 0.292429 0.103252 0.208189 0.634770 0.070898 0.070668 0.223664 0.667102 0.099915 0.067576 0.165407 0.625495 0.095579 0.039353 0.239573 0.717478 0.093228 0.024737 0.164558 0.729965 0.048628 0.024557 0.196850 0.670909 0.118718 0.043692 0.166681 0.689441 0.050145 0.038829 0.221584 0.506735 0.159498 0.095635 0.238132 0.406093 0.298915 0.149902 0.145090 0.193913 0.282078 0.096706 0.427303 0.272324 0.154790 0.262469 0.310417 0.224484 0.458724 0.060144 0.256647 Consensus sequence: DBTHHAAAAAAAAVHDH Reverse complement motif 0.224484 0.060144 0.458724 0.256647 0.310417 0.154790 0.262469 0.272324 0.427303 0.282078 0.096706 0.193913 0.145090 0.298915 0.149902 0.406093 0.238132 0.159498 0.095635 0.506735 0.221584 0.050145 0.038829 0.689441 0.166681 0.118718 0.043692 0.670909 0.196850 0.048628 0.024557 0.729965 0.164558 0.093228 0.024737 0.717478 0.239573 0.095579 0.039353 0.625495 0.165407 0.099915 0.067576 0.667102 0.223664 0.070898 0.070668 0.634770 0.208189 0.292429 0.103252 0.396130 0.216489 0.101348 0.490160 0.192003 0.604406 0.131358 0.153983 0.110252 0.343354 0.312681 0.220770 0.123195 0.155083 0.490906 0.152982 0.201030 Consensus sequence: DDHBTTTTTTTTHDAVH Alignment: DDHBTTTTTTTTHDAVH WTWWWDTTTWWTTW--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00255 Dbx1 Original Motif Original Motif Forward 1 14 0.039649 Species: Mus musculus Original motif 0.193358 0.228955 0.160692 0.416995 0.611960 0.068099 0.048494 0.271446 0.459770 0.057385 0.307824 0.175021 0.226103 0.127408 0.101076 0.545413 0.241226 0.228640 0.067165 0.462969 0.621421 0.137382 0.078412 0.162785 0.737972 0.031899 0.051833 0.178295 0.110802 0.098497 0.073668 0.717033 0.129567 0.110629 0.036048 0.723756 0.729342 0.031636 0.088480 0.150541 0.540257 0.104927 0.048065 0.306750 0.195987 0.148698 0.098709 0.556606 0.587529 0.072583 0.170635 0.169252 0.497416 0.161804 0.219409 0.121371 0.278831 0.114362 0.139037 0.467771 0.297462 0.189119 0.187754 0.325665 0.397268 0.140582 0.287428 0.174722 Consensus sequence: HARTHAATTAWTAVDHD Reverse complement motif 0.174722 0.140582 0.287428 0.397268 0.325665 0.189119 0.187754 0.297462 0.467771 0.114362 0.139037 0.278831 0.121371 0.161804 0.219409 0.497416 0.169252 0.072583 0.170635 0.587529 0.556606 0.148698 0.098709 0.195987 0.306750 0.104927 0.048065 0.540257 0.150541 0.031636 0.088480 0.729342 0.723756 0.110629 0.036048 0.129567 0.717033 0.098497 0.073668 0.110802 0.178295 0.031899 0.051833 0.737972 0.162785 0.137382 0.078412 0.621421 0.462969 0.228640 0.067165 0.241226 0.545413 0.127408 0.101076 0.226103 0.175021 0.057385 0.307824 0.459770 0.271446 0.068099 0.048494 0.611960 0.416995 0.228955 0.160692 0.193358 Consensus sequence: DHDBTAWTAATTHAKTH Alignment: HARTHAATTAWTAVDHD WAAWWAAADWWWAW--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00077 Srf_secondary Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 14 0.039664 Species: Mus musculus Original motif 0.162968 0.284828 0.440984 0.111220 0.151392 0.200635 0.205316 0.442657 0.267215 0.083669 0.192498 0.456618 0.332771 0.180711 0.200027 0.286491 0.509370 0.102954 0.242569 0.145107 0.666262 0.077309 0.154466 0.101962 0.737968 0.113335 0.100401 0.048296 0.658878 0.141580 0.134033 0.065510 0.766115 0.094051 0.069763 0.070072 0.755621 0.088491 0.044802 0.111086 0.749083 0.135917 0.047510 0.067490 0.663231 0.176795 0.028134 0.131839 0.553358 0.277659 0.038655 0.130328 0.392578 0.314083 0.209844 0.083495 0.198462 0.237132 0.239466 0.324940 0.275121 0.210087 0.194779 0.320013 0.287748 0.277395 0.142704 0.292154 Consensus sequence: VBDDAAAAAAAAMVBHH Reverse complement motif 0.292154 0.277395 0.142704 0.287748 0.320013 0.210087 0.194779 0.275121 0.324940 0.237132 0.239466 0.198462 0.083495 0.314083 0.209844 0.392578 0.130328 0.277659 0.038655 0.553358 0.131839 0.176795 0.028134 0.663231 0.067490 0.135917 0.047510 0.749083 0.111086 0.088491 0.044802 0.755621 0.070072 0.094051 0.069763 0.766115 0.065510 0.141580 0.134033 0.658878 0.048296 0.113335 0.100401 0.737968 0.101962 0.077309 0.154466 0.666262 0.145107 0.102954 0.242569 0.509370 0.286491 0.180711 0.200027 0.332771 0.456618 0.083669 0.192498 0.267215 0.442657 0.200635 0.205316 0.151392 0.162968 0.440984 0.284828 0.111220 Consensus sequence: HHVBYTTTTTTTTDDVV Alignment: HHVBYTTTTTTTTDDVV WTWWWDTTTWWTTW--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00097 Mtf1_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 1 14 0.043291 Species: Mus musculus Original motif 0.492974 0.180918 0.148012 0.178096 0.368251 0.203899 0.207777 0.220074 0.507882 0.155465 0.113772 0.222882 0.123798 0.114285 0.153584 0.608334 0.587677 0.127243 0.066116 0.218964 0.403397 0.150410 0.140817 0.305376 0.186086 0.147802 0.466164 0.199948 0.681097 0.135011 0.082959 0.100934 0.717748 0.075425 0.052584 0.154243 0.649784 0.103313 0.082872 0.164031 0.424054 0.187232 0.138687 0.250027 0.583515 0.181222 0.122887 0.112376 0.353266 0.175583 0.217918 0.253234 0.312794 0.344669 0.278065 0.064473 Consensus sequence: HDATAHDAAAHADV Reverse complement motif 0.312794 0.278065 0.344669 0.064473 0.253234 0.175583 0.217918 0.353266 0.112376 0.181222 0.122887 0.583515 0.250027 0.187232 0.138687 0.424054 0.164031 0.103313 0.082872 0.649784 0.154243 0.075425 0.052584 0.717748 0.100934 0.135011 0.082959 0.681097 0.186086 0.466164 0.147802 0.199948 0.305376 0.150410 0.140817 0.403397 0.218964 0.127243 0.066116 0.587677 0.608334 0.114285 0.153584 0.123798 0.222882 0.155465 0.113772 0.507882 0.220074 0.203899 0.207777 0.368251 0.178096 0.180918 0.148012 0.492974 Consensus sequence: VDTHTTTHHTATDH Alignment: VDTHTTTHHTATDH WTWWWDTTTWWTTW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00061 Foxl1_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 2 14 0.046411 Species: Mus musculus Original motif 0.560226 0.121586 0.083231 0.234957 0.318077 0.149137 0.179955 0.352831 0.482497 0.118420 0.173594 0.225488 0.200166 0.160901 0.191493 0.447440 0.033691 0.569719 0.018901 0.377690 0.638020 0.166545 0.021254 0.174181 0.573953 0.105729 0.009308 0.311010 0.890518 0.053364 0.013424 0.042694 0.910758 0.028166 0.032648 0.028428 0.013358 0.738707 0.023981 0.223953 0.911783 0.018754 0.031898 0.037564 0.702891 0.068940 0.076823 0.151346 0.445507 0.320769 0.057216 0.176507 0.587798 0.129586 0.140592 0.142024 0.258981 0.330939 0.167334 0.242747 0.362022 0.333796 0.145861 0.158320 Consensus sequence: ADDDYAWAACAAMAHH Reverse complement motif 0.158320 0.333796 0.145861 0.362022 0.258981 0.167334 0.330939 0.242747 0.142024 0.129586 0.140592 0.587798 0.176507 0.320769 0.057216 0.445507 0.151346 0.068940 0.076823 0.702891 0.037564 0.018754 0.031898 0.911783 0.013358 0.023981 0.738707 0.223953 0.028428 0.028166 0.032648 0.910758 0.042694 0.053364 0.013424 0.890518 0.311010 0.105729 0.009308 0.573953 0.174181 0.166545 0.021254 0.638020 0.033691 0.018901 0.569719 0.377690 0.447440 0.160901 0.191493 0.200166 0.225488 0.118420 0.173594 0.482497 0.352831 0.149137 0.179955 0.318077 0.234957 0.121586 0.083231 0.560226 Consensus sequence: HDTYTTGTTWTKDDDT Alignment: HDTYTTGTTWTKDDDT -WTWWWDTTTWWTTW- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 91 Motif name: C091 Original motif 0.049505 0.009901 0.514851 0.425743 0.524752 0.425743 0.039604 0.009901 0.810000 0.010000 0.010000 0.170000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.760000 0.010000 0.220000 0.650000 0.030000 0.220000 0.100000 0.465347 0.465347 0.009901 0.059406 0.019802 0.029703 0.425743 0.524752 0.070000 0.310000 0.010000 0.610000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.930000 0.050000 0.010000 0.080000 0.010000 0.900000 0.920000 0.060000 0.010000 0.010000 0.059406 0.009901 0.455446 0.475248 0.495050 0.435644 0.029703 0.039604 Consensus sequence: KMACTCAMKYTGTAKM Reserve complement motif 0.039604 0.435644 0.029703 0.495050 0.475248 0.009901 0.455446 0.059406 0.010000 0.060000 0.010000 0.920000 0.900000 0.080000 0.010000 0.010000 0.010000 0.930000 0.010000 0.050000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.610000 0.310000 0.010000 0.070000 0.524752 0.029703 0.425743 0.019802 0.059406 0.465347 0.009901 0.465347 0.100000 0.030000 0.220000 0.650000 0.010000 0.010000 0.760000 0.220000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.170000 0.010000 0.010000 0.810000 0.009901 0.425743 0.039604 0.524752 0.049505 0.514851 0.009901 0.425743 Consensus sequence: YRTACAMRYTGAGTYY ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 91 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00050 Bhlhb2_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 4 16 0.027180 Species: Mus musculus Original motif 0.120938 0.344851 0.124072 0.410138 0.220931 0.169844 0.422396 0.186829 0.127752 0.260812 0.103811 0.507625 0.140641 0.405473 0.287668 0.166218 0.296957 0.155579 0.301094 0.246370 0.219647 0.287193 0.154072 0.339087 0.049294 0.026059 0.121789 0.802859 0.520042 0.289284 0.173423 0.017251 0.049190 0.943472 0.004308 0.003030 0.902609 0.006767 0.074770 0.015854 0.003221 0.971329 0.005512 0.019937 0.019937 0.005512 0.971329 0.003221 0.015854 0.074770 0.006767 0.902609 0.003030 0.004308 0.943472 0.049190 0.003497 0.088920 0.685942 0.221641 0.802859 0.121789 0.026059 0.049294 0.334544 0.155170 0.275193 0.235092 0.275957 0.132104 0.454982 0.136957 0.134097 0.254352 0.422940 0.188611 0.396163 0.432784 0.051281 0.119772 0.276474 0.115627 0.419844 0.188056 0.160759 0.088061 0.649863 0.101318 0.203314 0.166595 0.106821 0.523270 Consensus sequence: YDYBDHTMCACGTGGADDBMDGT Reverse complement motif 0.523270 0.166595 0.106821 0.203314 0.160759 0.649863 0.088061 0.101318 0.276474 0.419844 0.115627 0.188056 0.396163 0.051281 0.432784 0.119772 0.134097 0.422940 0.254352 0.188611 0.275957 0.454982 0.132104 0.136957 0.235092 0.155170 0.275193 0.334544 0.049294 0.121789 0.026059 0.802859 0.003497 0.685942 0.088920 0.221641 0.003030 0.943472 0.004308 0.049190 0.902609 0.074770 0.006767 0.015854 0.019937 0.971329 0.005512 0.003221 0.003221 0.005512 0.971329 0.019937 0.015854 0.006767 0.074770 0.902609 0.049190 0.004308 0.943472 0.003030 0.017251 0.289284 0.173423 0.520042 0.802859 0.026059 0.121789 0.049294 0.339087 0.287193 0.154072 0.219647 0.296957 0.301094 0.155579 0.246370 0.140641 0.287668 0.405473 0.166218 0.507625 0.260812 0.103811 0.127752 0.220931 0.422396 0.169844 0.186829 0.410138 0.344851 0.124072 0.120938 Consensus sequence: ACHRBHDTCCACGTGYAHHBMHM Alignment: YDYBDHTMCACGTGGADDBMDGT ----YRTACAMRYTGAGTYY--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v015681_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 1 16 0.033393 Species: Mus musculus Original motif 0.214165 0.143436 0.372522 0.269876 0.314445 0.406003 0.160351 0.119201 0.137147 0.092924 0.042921 0.727007 0.044121 0.072843 0.051741 0.831295 0.261292 0.324124 0.298498 0.116086 0.258125 0.323243 0.263362 0.155271 0.204557 0.589399 0.107153 0.098891 0.371021 0.244027 0.291102 0.093849 0.096327 0.572718 0.011797 0.319159 0.027282 0.046183 0.844519 0.082016 0.018921 0.012887 0.915917 0.052275 0.364793 0.166722 0.084229 0.384256 0.028216 0.011233 0.951056 0.009495 0.054974 0.004738 0.890377 0.049911 0.006802 0.312915 0.134247 0.546036 0.241289 0.628210 0.104788 0.025713 0.237863 0.302807 0.213018 0.246311 0.349399 0.203220 0.086635 0.360746 0.386634 0.144693 0.246895 0.221779 0.425101 0.354676 0.093374 0.126849 0.060272 0.391320 0.104905 0.443503 0.162090 0.190233 0.227433 0.420244 Consensus sequence: DVTTVVCVYGGHGGYCHHDMYB Reverse complement motif 0.420244 0.190233 0.227433 0.162090 0.443503 0.391320 0.104905 0.060272 0.126849 0.354676 0.093374 0.425101 0.221779 0.144693 0.246895 0.386634 0.360746 0.203220 0.086635 0.349399 0.237863 0.213018 0.302807 0.246311 0.241289 0.104788 0.628210 0.025713 0.546036 0.312915 0.134247 0.006802 0.054974 0.890377 0.004738 0.049911 0.028216 0.951056 0.011233 0.009495 0.384256 0.166722 0.084229 0.364793 0.018921 0.915917 0.012887 0.052275 0.027282 0.844519 0.046183 0.082016 0.096327 0.011797 0.572718 0.319159 0.093849 0.244027 0.291102 0.371021 0.204557 0.107153 0.589399 0.098891 0.258125 0.263362 0.323243 0.155271 0.261292 0.298498 0.324124 0.116086 0.831295 0.072843 0.051741 0.044121 0.727007 0.092924 0.042921 0.137147 0.314445 0.160351 0.406003 0.119201 0.214165 0.372522 0.143436 0.269876 Consensus sequence: VMYDHDGMCCHCCKBGVVAAVH Alignment: VMYDHDGMCCHCCKBGVVAAVH YRTACAMRYTGAGTYY------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00528 Foxm1_primary Original Motif Original Motif Forward 1 16 0.034728 Species: Mus musculus Original motif 0.402634 0.249702 0.143705 0.203959 0.709619 0.108953 0.130781 0.050647 0.334232 0.077498 0.228818 0.359452 0.131721 0.094794 0.234481 0.539005 0.170102 0.237609 0.252464 0.339824 0.244961 0.347304 0.228129 0.179606 0.612141 0.132244 0.180110 0.075504 0.472236 0.042388 0.234419 0.250957 0.125213 0.007413 0.849788 0.017587 0.702068 0.064216 0.141992 0.091724 0.008657 0.038238 0.002959 0.950145 0.007170 0.002244 0.986824 0.003763 0.002862 0.979956 0.000711 0.016471 0.971196 0.001954 0.011441 0.015409 0.105575 0.031482 0.022836 0.840107 0.031534 0.736742 0.032785 0.198939 0.479153 0.347558 0.031799 0.141490 0.056405 0.123140 0.023989 0.796466 0.111194 0.195344 0.501360 0.192102 0.376359 0.416820 0.072818 0.134004 0.225111 0.249460 0.306563 0.218866 0.405251 0.168478 0.108618 0.317653 0.165386 0.191749 0.268604 0.374261 Consensus sequence: HADTBVADGATGCATCMTGMVHB Reverse complement motif 0.374261 0.191749 0.268604 0.165386 0.317653 0.168478 0.108618 0.405251 0.225111 0.306563 0.249460 0.218866 0.376359 0.072818 0.416820 0.134004 0.111194 0.501360 0.195344 0.192102 0.796466 0.123140 0.023989 0.056405 0.141490 0.347558 0.031799 0.479153 0.031534 0.032785 0.736742 0.198939 0.840107 0.031482 0.022836 0.105575 0.015409 0.001954 0.011441 0.971196 0.002862 0.000711 0.979956 0.016471 0.007170 0.986824 0.002244 0.003763 0.950145 0.038238 0.002959 0.008657 0.091724 0.064216 0.141992 0.702068 0.125213 0.849788 0.007413 0.017587 0.250957 0.042388 0.234419 0.472236 0.075504 0.132244 0.180110 0.612141 0.244961 0.228129 0.347304 0.179606 0.339824 0.237609 0.252464 0.170102 0.539005 0.094794 0.234481 0.131721 0.359452 0.077498 0.228818 0.334232 0.050647 0.108953 0.130781 0.709619 0.203959 0.249702 0.143705 0.402634 Consensus sequence: VHVRCAYGATGCATCDTVVADTH Alignment: HADTBVADGATGCATCMTGMVHB KMACTCAMKYTGTAKM------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 5 16 0.037005 Species: Mus musculus Original motif 0.067627 0.131333 0.654425 0.146615 0.156488 0.114442 0.145630 0.583441 0.206450 0.265630 0.358017 0.169903 0.090729 0.460713 0.274712 0.173847 0.285994 0.099998 0.154485 0.459523 0.635908 0.184787 0.072982 0.106323 0.748421 0.039204 0.092605 0.119769 0.081342 0.061327 0.044532 0.812799 0.143120 0.043879 0.024216 0.788785 0.247544 0.092102 0.621453 0.038901 0.295531 0.036295 0.027594 0.640580 0.194561 0.305468 0.339916 0.160055 0.175038 0.193568 0.101212 0.530182 0.145226 0.167488 0.559871 0.127415 0.271501 0.237429 0.206701 0.284369 0.216834 0.109191 0.569605 0.104370 0.182624 0.177160 0.300475 0.339742 0.331737 0.198645 0.265137 0.204482 0.230155 0.359365 0.183450 0.227029 0.056581 0.067297 0.463052 0.413070 0.198891 0.324626 0.304424 0.172059 0.181968 0.287547 0.202419 0.328066 Consensus sequence: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB Reverse complement motif 0.328066 0.287547 0.202419 0.181968 0.198891 0.304424 0.324626 0.172059 0.056581 0.463052 0.067297 0.413070 0.230155 0.183450 0.359365 0.227029 0.204482 0.198645 0.265137 0.331737 0.339742 0.177160 0.300475 0.182624 0.216834 0.569605 0.109191 0.104370 0.284369 0.237429 0.206701 0.271501 0.145226 0.559871 0.167488 0.127415 0.530182 0.193568 0.101212 0.175038 0.194561 0.339916 0.305468 0.160055 0.640580 0.036295 0.027594 0.295531 0.247544 0.621453 0.092102 0.038901 0.788785 0.043879 0.024216 0.143120 0.812799 0.061327 0.044532 0.081342 0.119769 0.039204 0.092605 0.748421 0.106323 0.184787 0.072982 0.635908 0.459523 0.099998 0.154485 0.285994 0.090729 0.274712 0.460713 0.173847 0.206450 0.358017 0.265630 0.169903 0.583441 0.114442 0.145630 0.156488 0.067627 0.654425 0.131333 0.146615 Consensus sequence: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC Alignment: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC --YRTACAMRYTGAGTYY---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00165 Titf1 Original Motif Reverse Complement Backward 1 16 0.038690 Species: Mus musculus Original motif 0.142834 0.324493 0.147276 0.385397 0.404842 0.233186 0.227659 0.134313 0.677580 0.044952 0.178774 0.098695 0.137761 0.202622 0.469728 0.189889 0.069301 0.825888 0.093549 0.011262 0.003882 0.876858 0.000966 0.118295 0.904355 0.015154 0.001043 0.079449 0.018912 0.977464 0.001207 0.002417 0.003517 0.004393 0.002428 0.989662 0.007151 0.162279 0.000584 0.829986 0.192074 0.120883 0.670840 0.016203 0.881358 0.002039 0.013253 0.103349 0.450016 0.333144 0.184121 0.032719 0.342018 0.321148 0.066945 0.269889 0.209486 0.122118 0.046367 0.622029 0.174564 0.145894 0.048004 0.631539 Consensus sequence: BVABCCACTTGAMHTT Reverse complement motif 0.631539 0.145894 0.048004 0.174564 0.622029 0.122118 0.046367 0.209486 0.269889 0.321148 0.066945 0.342018 0.032719 0.333144 0.184121 0.450016 0.103349 0.002039 0.013253 0.881358 0.192074 0.670840 0.120883 0.016203 0.829986 0.162279 0.000584 0.007151 0.989662 0.004393 0.002428 0.003517 0.018912 0.001207 0.977464 0.002417 0.079449 0.015154 0.001043 0.904355 0.003882 0.000966 0.876858 0.118295 0.069301 0.093549 0.825888 0.011262 0.137761 0.469728 0.202622 0.189889 0.098695 0.044952 0.178774 0.677580 0.134313 0.233186 0.227659 0.404842 0.385397 0.324493 0.147276 0.142834 Consensus sequence: AAHYTCAAGTGGBTBV Alignment: BVABCCACTTGAMHTT KMACTCAMKYTGTAKM ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 92 Motif name: C092 Original motif 0.440000 0.050000 0.500000 0.010000 0.019802 0.465347 0.039604 0.475248 0.030000 0.940000 0.020000 0.010000 0.900000 0.010000 0.010000 0.080000 0.237624 0.079208 0.673267 0.009901 0.530000 0.010000 0.450000 0.010000 0.090000 0.360000 0.490000 0.060000 0.050000 0.010000 0.010000 0.930000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.148515 0.009901 0.792079 0.049505 0.029703 0.772277 0.108911 0.089109 0.040000 0.460000 0.470000 0.030000 0.020000 0.460000 0.050000 0.470000 0.020000 0.710000 0.030000 0.240000 0.060000 0.300000 0.630000 0.010000 0.683168 0.059406 0.198020 0.059406 0.470000 0.060000 0.460000 0.010000 0.050000 0.500000 0.030000 0.420000 Consensus sequence: RYCAGRSTGGCSYCGARY Reserve complement motif 0.050000 0.030000 0.500000 0.420000 0.010000 0.060000 0.460000 0.470000 0.059406 0.059406 0.198020 0.683168 0.060000 0.630000 0.300000 0.010000 0.020000 0.030000 0.710000 0.240000 0.470000 0.460000 0.050000 0.020000 0.040000 0.470000 0.460000 0.030000 0.029703 0.108911 0.772277 0.089109 0.148515 0.792079 0.009901 0.049505 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.930000 0.010000 0.010000 0.050000 0.090000 0.490000 0.360000 0.060000 0.010000 0.010000 0.450000 0.530000 0.237624 0.673267 0.079208 0.009901 0.080000 0.010000 0.010000 0.900000 0.030000 0.020000 0.940000 0.010000 0.475248 0.465347 0.039604 0.019802 0.440000 0.500000 0.050000 0.010000 Consensus sequence: KKTCGMSGCCASKCTGMM ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 92 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 18 0.033654 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB -----RYCAGRSTGGCSYCGARY ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v015681_primaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 3 18 0.040633 Species: Mus musculus Original motif 0.472795 0.179227 0.091251 0.256726 0.036521 0.159743 0.204840 0.598896 0.164582 0.312805 0.221324 0.301289 0.237069 0.249050 0.293048 0.220833 0.401949 0.225181 0.229401 0.143469 0.161422 0.494334 0.252207 0.092036 0.252940 0.177721 0.369400 0.199939 0.119630 0.024651 0.849920 0.005798 0.000962 0.002398 0.990616 0.006023 0.937852 0.027016 0.034535 0.000597 0.008963 0.987756 0.000629 0.002652 0.001584 0.992898 0.002349 0.003169 0.956822 0.027342 0.002484 0.013352 0.009873 0.987759 0.000988 0.001381 0.016397 0.980856 0.000369 0.002378 0.081761 0.758555 0.038572 0.121112 0.371713 0.091838 0.448027 0.088423 0.111617 0.121913 0.683885 0.082585 0.334562 0.102916 0.436488 0.126034 0.210362 0.101261 0.238339 0.450037 0.169041 0.271583 0.320799 0.238576 0.140316 0.049885 0.735236 0.074563 Consensus sequence: HTBVVVDGGACCACCCRGRDBG Reverse complement motif 0.140316 0.735236 0.049885 0.074563 0.169041 0.320799 0.271583 0.238576 0.450037 0.101261 0.238339 0.210362 0.334562 0.436488 0.102916 0.126034 0.111617 0.683885 0.121913 0.082585 0.371713 0.448027 0.091838 0.088423 0.081761 0.038572 0.758555 0.121112 0.016397 0.000369 0.980856 0.002378 0.009873 0.000988 0.987759 0.001381 0.013352 0.027342 0.002484 0.956822 0.001584 0.002349 0.992898 0.003169 0.008963 0.000629 0.987756 0.002652 0.000597 0.027016 0.034535 0.937852 0.000962 0.990616 0.002398 0.006023 0.119630 0.849920 0.024651 0.005798 0.252940 0.369400 0.177721 0.199939 0.161422 0.252207 0.494334 0.092036 0.143469 0.225181 0.229401 0.401949 0.237069 0.293048 0.249050 0.220833 0.164582 0.221324 0.312805 0.301289 0.598896 0.159743 0.204840 0.036521 0.256726 0.179227 0.091251 0.472795 Consensus sequence: CBDMCMGGGTGGTCCHVBVBAH Alignment: CBDMCMGGGTGGTCCHVBVBAH --RYCAGRSTGGCSYCGARY-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 5 18 0.043653 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK ----RYCAGRSTGGCSYCGARY ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_primaryOriginal Motif Original Motif Backward 2 18 0.045999 Species: Mus musculus Original motif 0.204923 0.208846 0.365383 0.220848 0.294304 0.300143 0.167287 0.238266 0.109711 0.619514 0.117379 0.153396 0.178979 0.378580 0.230177 0.212264 0.159594 0.542602 0.118178 0.179627 0.125206 0.430074 0.151826 0.292894 0.097692 0.709845 0.116956 0.075506 0.148292 0.565912 0.037632 0.248164 0.077951 0.034190 0.855503 0.032356 0.001657 0.001061 0.971877 0.025405 0.001926 0.001084 0.991712 0.005278 0.033031 0.012001 0.057796 0.897171 0.002723 0.002647 0.993348 0.001281 0.003261 0.000963 0.987199 0.008577 0.000611 0.090925 0.074857 0.833608 0.015299 0.978878 0.004949 0.000874 0.013368 0.600902 0.033485 0.352245 0.231949 0.149575 0.118804 0.499672 0.267580 0.186002 0.371242 0.175176 0.264884 0.223483 0.110082 0.401551 0.221365 0.170121 0.179559 0.428955 0.112997 0.692930 0.139981 0.054092 0.460305 0.207883 0.155111 0.176702 Consensus sequence: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH Reverse complement motif 0.176702 0.207883 0.155111 0.460305 0.112997 0.139981 0.692930 0.054092 0.428955 0.170121 0.179559 0.221365 0.401551 0.223483 0.110082 0.264884 0.267580 0.371242 0.186002 0.175176 0.499672 0.149575 0.118804 0.231949 0.013368 0.033485 0.600902 0.352245 0.015299 0.004949 0.978878 0.000874 0.833608 0.090925 0.074857 0.000611 0.003261 0.987199 0.000963 0.008577 0.002723 0.993348 0.002647 0.001281 0.897171 0.012001 0.057796 0.033031 0.001926 0.991712 0.001084 0.005278 0.001657 0.971877 0.001061 0.025405 0.077951 0.855503 0.034190 0.032356 0.148292 0.037632 0.565912 0.248164 0.097692 0.116956 0.709845 0.075506 0.125206 0.151826 0.430074 0.292894 0.159594 0.118178 0.542602 0.179627 0.178979 0.230177 0.378580 0.212264 0.109711 0.117379 0.619514 0.153396 0.294304 0.167287 0.300143 0.238266 0.204923 0.365383 0.208846 0.220848 Consensus sequence: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB Alignment: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH ----RYCAGRSTGGCSYCGARY- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_primaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 5 18 0.047687 Species: Mus musculus Original motif 0.183797 0.268049 0.330111 0.218043 0.127599 0.330310 0.243614 0.298477 0.143199 0.188046 0.268593 0.400162 0.214690 0.205230 0.247090 0.332990 0.294688 0.299104 0.327152 0.079056 0.221909 0.193223 0.480155 0.104712 0.444072 0.068239 0.481838 0.005852 0.006182 0.015429 0.901278 0.077111 0.766535 0.111138 0.121632 0.000696 0.014848 0.973961 0.000298 0.010893 0.001807 0.992200 0.002669 0.003324 0.795344 0.140510 0.018576 0.045571 0.006990 0.988200 0.002510 0.002299 0.154898 0.842296 0.000998 0.001808 0.029577 0.919262 0.006935 0.044226 0.677987 0.032075 0.185065 0.104874 0.195132 0.364580 0.319321 0.120967 0.225412 0.115034 0.612849 0.046705 0.548628 0.058900 0.162857 0.229616 0.112531 0.340331 0.165910 0.381227 0.073029 0.303078 0.363896 0.259997 0.561485 0.260567 0.092979 0.084969 0.132283 0.457691 0.140159 0.269867 Consensus sequence: BBBDVVRGACCACCCAVGABBAB Reverse complement motif 0.132283 0.140159 0.457691 0.269867 0.084969 0.260567 0.092979 0.561485 0.073029 0.363896 0.303078 0.259997 0.381227 0.340331 0.165910 0.112531 0.229616 0.058900 0.162857 0.548628 0.225412 0.612849 0.115034 0.046705 0.195132 0.319321 0.364580 0.120967 0.104874 0.032075 0.185065 0.677987 0.029577 0.006935 0.919262 0.044226 0.154898 0.000998 0.842296 0.001808 0.006990 0.002510 0.988200 0.002299 0.045571 0.140510 0.018576 0.795344 0.001807 0.002669 0.992200 0.003324 0.014848 0.000298 0.973961 0.010893 0.000696 0.111138 0.121632 0.766535 0.006182 0.901278 0.015429 0.077111 0.444072 0.481838 0.068239 0.005852 0.221909 0.480155 0.193223 0.104712 0.294688 0.327152 0.299104 0.079056 0.332990 0.205230 0.247090 0.214690 0.400162 0.188046 0.268593 0.143199 0.127599 0.243614 0.330310 0.298477 0.183797 0.330111 0.268049 0.218043 Consensus sequence: BTBVTCVTGGGTGGTCMVVDVBB Alignment: BTBVTCVTGGGTGGTCMVVDVBB ----RYCAGRSTGGCSYCGARY- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 93 Motif name: C093 Original motif 0.851485 0.049505 0.089109 0.009901 0.019802 0.049505 0.465347 0.465347 0.010000 0.650000 0.250000 0.090000 0.010000 0.740000 0.010000 0.240000 0.595960 0.080808 0.181818 0.141414 0.009901 0.524752 0.455446 0.009901 0.480000 0.420000 0.080000 0.020000 0.190000 0.240000 0.260000 0.310000 0.010000 0.390000 0.580000 0.020000 0.010000 0.910000 0.070000 0.010000 0.010000 0.910000 0.010000 0.070000 0.009901 0.049505 0.534653 0.405941 0.020000 0.580000 0.380000 0.020000 0.158416 0.178218 0.128713 0.534653 0.080000 0.180000 0.730000 0.010000 0.010000 0.940000 0.010000 0.040000 0.366337 0.475248 0.079208 0.079208 0.009901 0.148515 0.089109 0.752475 Consensus sequence: AKCCASMBSCCKSTGCMT Reserve complement motif 0.752475 0.148515 0.089109 0.009901 0.366337 0.079208 0.475248 0.079208 0.010000 0.010000 0.940000 0.040000 0.080000 0.730000 0.180000 0.010000 0.534653 0.178218 0.128713 0.158416 0.020000 0.380000 0.580000 0.020000 0.009901 0.534653 0.049505 0.405941 0.010000 0.010000 0.910000 0.070000 0.010000 0.070000 0.910000 0.010000 0.010000 0.580000 0.390000 0.020000 0.310000 0.240000 0.260000 0.190000 0.020000 0.420000 0.080000 0.480000 0.009901 0.455446 0.524752 0.009901 0.141414 0.080808 0.181818 0.595960 0.010000 0.010000 0.740000 0.240000 0.010000 0.250000 0.650000 0.090000 0.019802 0.465347 0.049505 0.465347 0.009901 0.049505 0.089109 0.851485 Consensus sequence: ARGCASYGGSVYSTGGYT ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 93 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00400 Zif268 Original Motif Original Motif Forward 1 18 0.038926 Species: Mus musculus Original motif 0.104824 0.412716 0.254506 0.227955 0.644922 0.065476 0.140479 0.149122 0.201205 0.166164 0.347131 0.285501 0.360606 0.256316 0.150766 0.232313 0.199831 0.240681 0.279350 0.280137 0.234308 0.204076 0.321306 0.240310 0.274112 0.462435 0.111425 0.152028 0.067070 0.717501 0.073934 0.141496 0.106745 0.084442 0.658566 0.150247 0.025128 0.967053 0.003585 0.004234 0.006412 0.982989 0.003227 0.007371 0.009588 0.877620 0.002571 0.110221 0.621521 0.355443 0.015669 0.007366 0.002600 0.980275 0.004191 0.012934 0.118773 0.026658 0.783843 0.070725 0.022358 0.822101 0.024684 0.130857 0.713212 0.080912 0.128793 0.077084 0.166568 0.250955 0.107934 0.474544 0.225040 0.222494 0.163301 0.389166 0.268976 0.223206 0.265314 0.242504 0.137052 0.229058 0.148439 0.485451 0.135819 0.304550 0.141994 0.417637 0.272440 0.319501 0.230580 0.177478 Consensus sequence: BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV Reverse complement motif 0.272440 0.230580 0.319501 0.177478 0.417637 0.304550 0.141994 0.135819 0.485451 0.229058 0.148439 0.137052 0.242504 0.223206 0.265314 0.268976 0.389166 0.222494 0.163301 0.225040 0.474544 0.250955 0.107934 0.166568 0.077084 0.080912 0.128793 0.713212 0.022358 0.024684 0.822101 0.130857 0.118773 0.783843 0.026658 0.070725 0.002600 0.004191 0.980275 0.012934 0.007366 0.355443 0.015669 0.621521 0.009588 0.002571 0.877620 0.110221 0.006412 0.003227 0.982989 0.007371 0.025128 0.003585 0.967053 0.004234 0.106745 0.658566 0.084442 0.150247 0.067070 0.073934 0.717501 0.141496 0.274112 0.111425 0.462435 0.152028 0.234308 0.321306 0.204076 0.240310 0.280137 0.240681 0.279350 0.199831 0.232313 0.256316 0.150766 0.360606 0.201205 0.347131 0.166164 0.285501 0.149122 0.065476 0.140479 0.644922 0.104824 0.254506 0.412716 0.227955 Consensus sequence: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB Alignment: BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV AKCCASMBSCCKSTGCMT----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 4 18 0.040994 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH ---AKCCASMBSCCKSTGCMT-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 3 18 0.044287 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH --AKCCASMBSCCKSTGCMT-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00526 Foxn1_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 1 18 0.044682 Species: Mus musculus Original motif 0.477863 0.106306 0.184102 0.231729 0.304951 0.149020 0.361418 0.184612 0.548996 0.056128 0.348902 0.045974 0.385727 0.477782 0.086218 0.050273 0.409556 0.232265 0.173851 0.184328 0.174550 0.312880 0.307123 0.205448 0.850398 0.047204 0.041665 0.060734 0.141234 0.548534 0.142230 0.168002 0.059462 0.026354 0.892948 0.021236 0.053714 0.870297 0.028935 0.047055 0.086273 0.069147 0.805284 0.039296 0.033781 0.573881 0.034115 0.358223 0.035191 0.079663 0.824970 0.060176 0.051830 0.862631 0.019359 0.066180 0.178685 0.015738 0.762485 0.043092 0.058988 0.042615 0.017608 0.880789 0.202382 0.173360 0.284095 0.340163 0.098493 0.234651 0.506524 0.160333 0.109087 0.336204 0.250510 0.304198 0.130945 0.250843 0.177122 0.441090 0.353830 0.138838 0.162784 0.344548 0.114290 0.417163 0.160662 0.307885 Consensus sequence: DDRMHBACGCGYGCGTDGBBDB Reverse complement motif 0.114290 0.160662 0.417163 0.307885 0.344548 0.138838 0.162784 0.353830 0.441090 0.250843 0.177122 0.130945 0.109087 0.250510 0.336204 0.304198 0.098493 0.506524 0.234651 0.160333 0.340163 0.173360 0.284095 0.202382 0.880789 0.042615 0.017608 0.058988 0.178685 0.762485 0.015738 0.043092 0.051830 0.019359 0.862631 0.066180 0.035191 0.824970 0.079663 0.060176 0.033781 0.034115 0.573881 0.358223 0.086273 0.805284 0.069147 0.039296 0.053714 0.028935 0.870297 0.047055 0.059462 0.892948 0.026354 0.021236 0.141234 0.142230 0.548534 0.168002 0.060734 0.047204 0.041665 0.850398 0.174550 0.307123 0.312880 0.205448 0.184328 0.232265 0.173851 0.409556 0.385727 0.086218 0.477782 0.050273 0.045974 0.056128 0.348902 0.548996 0.304951 0.361418 0.149020 0.184612 0.231729 0.106306 0.184102 0.477863 Consensus sequence: BDVBCDACGCKCGCGTBHRKHD Alignment: DDRMHBACGCGYGCGTDGBBDB ARGCASYGGSVYSTGGYT---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00526 Foxn1_primary Reverse Complement Original Motif Backward 2 18 0.046342 Species: Mus musculus Original motif 0.456612 0.057181 0.078281 0.407926 0.460529 0.185506 0.083106 0.270859 0.445717 0.179510 0.239355 0.135417 0.116339 0.145186 0.275331 0.463144 0.239398 0.142078 0.480004 0.138520 0.355157 0.217877 0.284296 0.142670 0.318602 0.444835 0.153321 0.083243 0.609569 0.055866 0.280349 0.054216 0.062297 0.769824 0.027844 0.140035 0.151868 0.019245 0.803188 0.025699 0.011842 0.952534 0.017959 0.017665 0.017665 0.017959 0.952534 0.011842 0.025699 0.803188 0.019245 0.151868 0.140035 0.027844 0.769824 0.062297 0.054216 0.280349 0.055866 0.609569 0.013084 0.624655 0.177956 0.184305 0.287647 0.183527 0.295753 0.233074 0.042309 0.345931 0.198458 0.413301 0.338138 0.266033 0.045367 0.350462 0.302850 0.155320 0.074662 0.467168 0.240926 0.068901 0.283055 0.407118 0.409954 0.183157 0.154186 0.252704 Consensus sequence: WHVBVVMACGCGCGTCDYHWDH Reverse complement motif 0.252704 0.183157 0.154186 0.409954 0.407118 0.068901 0.283055 0.240926 0.467168 0.155320 0.074662 0.302850 0.350462 0.266033 0.045367 0.338138 0.413301 0.345931 0.198458 0.042309 0.287647 0.295753 0.183527 0.233074 0.013084 0.177956 0.624655 0.184305 0.609569 0.280349 0.055866 0.054216 0.140035 0.769824 0.027844 0.062297 0.025699 0.019245 0.803188 0.151868 0.017665 0.952534 0.017959 0.011842 0.011842 0.017959 0.952534 0.017665 0.151868 0.803188 0.019245 0.025699 0.062297 0.027844 0.769824 0.140035 0.054216 0.055866 0.280349 0.609569 0.318602 0.153321 0.444835 0.083243 0.142670 0.217877 0.284296 0.355157 0.239398 0.480004 0.142078 0.138520 0.463144 0.145186 0.275331 0.116339 0.135417 0.179510 0.239355 0.445717 0.270859 0.185506 0.083106 0.460529 0.407926 0.057181 0.078281 0.456612 Consensus sequence: HDWHMHGACGCGCGTRBVVBHW Alignment: WHVBVVMACGCGCGTCDYHWDH ---ARGCASYGGSVYSTGGYT- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 94 Motif name: C094 Original motif 0.010000 0.430000 0.370000 0.190000 0.050000 0.370000 0.510000 0.070000 0.300000 0.450000 0.100000 0.150000 0.019802 0.871287 0.099010 0.009901 0.210000 0.760000 0.010000 0.020000 0.089109 0.881188 0.009901 0.019802 0.009901 0.465347 0.445545 0.079208 0.180000 0.250000 0.550000 0.020000 0.290000 0.580000 0.110000 0.020000 0.010000 0.720000 0.260000 0.010000 0.069307 0.772277 0.009901 0.148515 0.020000 0.770000 0.010000 0.200000 0.069307 0.356436 0.475248 0.099010 0.079208 0.237624 0.603960 0.079208 Consensus sequence: SSHCCCSGCCCCSG Reserve complement motif 0.079208 0.603960 0.237624 0.079208 0.069307 0.475248 0.356436 0.099010 0.020000 0.010000 0.770000 0.200000 0.069307 0.009901 0.772277 0.148515 0.010000 0.260000 0.720000 0.010000 0.290000 0.110000 0.580000 0.020000 0.180000 0.550000 0.250000 0.020000 0.009901 0.445545 0.465347 0.079208 0.089109 0.009901 0.881188 0.019802 0.210000 0.010000 0.760000 0.020000 0.019802 0.099010 0.871287 0.009901 0.300000 0.100000 0.450000 0.150000 0.050000 0.510000 0.370000 0.070000 0.010000 0.370000 0.430000 0.190000 Consensus sequence: CSGGGGCSGGGDSS ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 94 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00033 Zfp410_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 4 14 0.017083 Species: Mus musculus Original motif 0.162979 0.284781 0.237433 0.314807 0.182449 0.447584 0.069464 0.300502 0.298973 0.261014 0.213211 0.226802 0.136039 0.433062 0.144274 0.286625 0.180084 0.395933 0.158565 0.265418 0.069354 0.748510 0.068898 0.113238 0.060485 0.717828 0.075333 0.146354 0.023280 0.071762 0.645500 0.259457 0.166896 0.749762 0.062730 0.020612 0.050401 0.775248 0.089072 0.085279 0.103847 0.767557 0.068804 0.059791 0.064815 0.748318 0.114588 0.072280 0.340921 0.071942 0.242981 0.344157 0.301967 0.263512 0.165927 0.268594 0.479800 0.222955 0.118441 0.178803 0.229469 0.283621 0.143099 0.343811 0.261733 0.180191 0.169905 0.388170 Consensus sequence: BHHBHCCGCCCCDHHHH Reverse complement motif 0.388170 0.180191 0.169905 0.261733 0.343811 0.283621 0.143099 0.229469 0.178803 0.222955 0.118441 0.479800 0.268594 0.263512 0.165927 0.301967 0.344157 0.071942 0.242981 0.340921 0.064815 0.114588 0.748318 0.072280 0.103847 0.068804 0.767557 0.059791 0.050401 0.089072 0.775248 0.085279 0.166896 0.062730 0.749762 0.020612 0.023280 0.645500 0.071762 0.259457 0.060485 0.075333 0.717828 0.146354 0.069354 0.068898 0.748510 0.113238 0.180084 0.158565 0.395933 0.265418 0.136039 0.144274 0.433062 0.286625 0.226802 0.261014 0.213211 0.298973 0.182449 0.069464 0.447584 0.300502 0.314807 0.284781 0.237433 0.162979 Consensus sequence: HHHHDGGGGCGGDBHDV Alignment: BHHBHCCGCCCCDHHHH SSHCCCSGCCCCSG--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 4 14 0.020341 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH ---SSHCCCSGCCCCSG----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00099 Ascl2_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 2 14 0.022934 Species: Mus musculus Original motif 0.114462 0.345602 0.289353 0.250583 0.192593 0.250844 0.116250 0.440313 0.338838 0.304929 0.195843 0.160390 0.312051 0.115094 0.162465 0.410390 0.143975 0.600492 0.123348 0.132185 0.078751 0.715072 0.135182 0.070995 0.146191 0.685571 0.069799 0.098439 0.137287 0.646078 0.126428 0.090207 0.335099 0.092260 0.371510 0.201131 0.033090 0.631176 0.074278 0.261456 0.117516 0.619336 0.100946 0.162202 0.114769 0.627362 0.089839 0.168031 0.195787 0.252057 0.220803 0.331353 0.415355 0.120731 0.281372 0.182542 0.111178 0.217079 0.245769 0.425974 0.191517 0.296952 0.153370 0.358162 Consensus sequence: BHVDCCCCDCCCBDBH Reverse complement motif 0.358162 0.296952 0.153370 0.191517 0.425974 0.217079 0.245769 0.111178 0.182542 0.120731 0.281372 0.415355 0.331353 0.252057 0.220803 0.195787 0.114769 0.089839 0.627362 0.168031 0.117516 0.100946 0.619336 0.162202 0.033090 0.074278 0.631176 0.261456 0.335099 0.371510 0.092260 0.201131 0.137287 0.126428 0.646078 0.090207 0.146191 0.069799 0.685571 0.098439 0.078751 0.135182 0.715072 0.070995 0.143975 0.123348 0.600492 0.132185 0.410390 0.115094 0.162465 0.312051 0.160390 0.304929 0.195843 0.338838 0.440313 0.250844 0.116250 0.192593 0.114462 0.289353 0.345602 0.250583 Consensus sequence: HVDVGGGHGGGGDBHB Alignment: HVDVGGGHGGGGDBHB -CSGGGGCSGGGDSS- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00093 Klf7_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 14 0.023919 Species: Mus musculus Original motif 0.204514 0.198353 0.171218 0.425915 0.167188 0.296785 0.246082 0.289946 0.267330 0.148001 0.398674 0.185994 0.549386 0.060167 0.337100 0.053347 0.050746 0.900013 0.022169 0.027073 0.037905 0.920332 0.008360 0.033403 0.410356 0.566702 0.016267 0.006675 0.009526 0.982354 0.001060 0.007060 0.204292 0.001084 0.748567 0.046056 0.003955 0.988490 0.002821 0.004735 0.004264 0.988826 0.004311 0.002598 0.002758 0.929549 0.001244 0.066448 0.260332 0.421683 0.024720 0.293265 0.184798 0.247697 0.085237 0.482268 0.347537 0.197344 0.139961 0.315159 0.255281 0.166620 0.242297 0.335802 Consensus sequence: HBDRCCMCGCCCHHHD Reverse complement motif 0.335802 0.166620 0.242297 0.255281 0.315159 0.197344 0.139961 0.347537 0.482268 0.247697 0.085237 0.184798 0.260332 0.024720 0.421683 0.293265 0.002758 0.001244 0.929549 0.066448 0.004264 0.004311 0.988826 0.002598 0.003955 0.002821 0.988490 0.004735 0.204292 0.748567 0.001084 0.046056 0.009526 0.001060 0.982354 0.007060 0.410356 0.016267 0.566702 0.006675 0.037905 0.008360 0.920332 0.033403 0.050746 0.022169 0.900013 0.027073 0.053347 0.060167 0.337100 0.549386 0.267330 0.398674 0.148001 0.185994 0.167188 0.246082 0.296785 0.289946 0.425915 0.198353 0.171218 0.204514 Consensus sequence: DHHDGGGCGRGGKHBH Alignment: DHHDGGGCGRGGKHBH -CSGGGGCSGGGDSS- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00022 Zfp740_primaryOriginal Motif Original Motif Forward 2 14 0.024560 Species: Mus musculus Original motif 0.136946 0.396508 0.135309 0.331236 0.185528 0.417538 0.215409 0.181525 0.171276 0.341901 0.172832 0.313991 0.145641 0.590572 0.146376 0.117412 0.138035 0.660416 0.114016 0.087533 0.222728 0.750532 0.007528 0.019212 0.024633 0.963314 0.001894 0.010159 0.009557 0.979956 0.000642 0.009844 0.010416 0.977424 0.000541 0.011619 0.026401 0.956740 0.001544 0.015314 0.195502 0.755959 0.011060 0.037480 0.491291 0.364785 0.025613 0.118311 0.305153 0.398160 0.071680 0.225008 0.253497 0.232647 0.213246 0.300610 0.156964 0.297876 0.144683 0.400477 0.179549 0.292514 0.319462 0.208475 Consensus sequence: HVBCCCCCCCCMHHHB Reverse complement motif 0.179549 0.319462 0.292514 0.208475 0.400477 0.297876 0.144683 0.156964 0.300610 0.232647 0.213246 0.253497 0.305153 0.071680 0.398160 0.225008 0.118311 0.364785 0.025613 0.491291 0.195502 0.011060 0.755959 0.037480 0.026401 0.001544 0.956740 0.015314 0.010416 0.000541 0.977424 0.011619 0.009557 0.000642 0.979956 0.009844 0.024633 0.001894 0.963314 0.010159 0.222728 0.007528 0.750532 0.019212 0.138035 0.114016 0.660416 0.087533 0.145641 0.146376 0.590572 0.117412 0.171276 0.172832 0.341901 0.313991 0.185528 0.215409 0.417538 0.181525 0.136946 0.135309 0.396508 0.331236 Consensus sequence: BHHDYGGGGGGGGBVD Alignment: HVBCCCCCCCCMHHHB -SSHCCCSGCCCCSG- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 95 Motif name: C095 Original motif 0.019802 0.049505 0.485149 0.445545 0.059406 0.742574 0.049505 0.148515 0.040000 0.910000 0.040000 0.010000 0.960000 0.010000 0.010000 0.020000 0.009901 0.059406 0.495050 0.435644 0.480000 0.430000 0.080000 0.010000 0.029703 0.455446 0.504950 0.009901 0.090000 0.010000 0.010000 0.890000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.099010 0.059406 0.831683 0.009901 0.110000 0.260000 0.110000 0.520000 0.039604 0.495050 0.455446 0.009901 0.019802 0.029703 0.495050 0.455446 0.470000 0.460000 0.040000 0.030000 0.039604 0.801980 0.108911 0.049505 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.158416 0.089109 0.673267 0.079208 0.430000 0.460000 0.020000 0.090000 Consensus sequence: KCCAKMSTGGTSKMCAGM Reserve complement motif 0.430000 0.020000 0.460000 0.090000 0.158416 0.673267 0.089109 0.079208 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.039604 0.108911 0.801980 0.049505 0.030000 0.460000 0.040000 0.470000 0.019802 0.495050 0.029703 0.455446 0.039604 0.455446 0.495050 0.009901 0.520000 0.260000 0.110000 0.110000 0.099010 0.831683 0.059406 0.009901 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.890000 0.010000 0.010000 0.090000 0.029703 0.504950 0.455446 0.009901 0.010000 0.430000 0.080000 0.480000 0.009901 0.495050 0.059406 0.435644 0.020000 0.010000 0.010000 0.960000 0.040000 0.040000 0.910000 0.010000 0.059406 0.049505 0.742574 0.148515 0.019802 0.485149 0.049505 0.445545 Consensus sequence: RCTGYYSACCASYYTGGY ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 95 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v015681_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 1 18 0.027863 Species: Mus musculus Original motif 0.214165 0.143436 0.372522 0.269876 0.314445 0.406003 0.160351 0.119201 0.137147 0.092924 0.042921 0.727007 0.044121 0.072843 0.051741 0.831295 0.261292 0.324124 0.298498 0.116086 0.258125 0.323243 0.263362 0.155271 0.204557 0.589399 0.107153 0.098891 0.371021 0.244027 0.291102 0.093849 0.096327 0.572718 0.011797 0.319159 0.027282 0.046183 0.844519 0.082016 0.018921 0.012887 0.915917 0.052275 0.364793 0.166722 0.084229 0.384256 0.028216 0.011233 0.951056 0.009495 0.054974 0.004738 0.890377 0.049911 0.006802 0.312915 0.134247 0.546036 0.241289 0.628210 0.104788 0.025713 0.237863 0.302807 0.213018 0.246311 0.349399 0.203220 0.086635 0.360746 0.386634 0.144693 0.246895 0.221779 0.425101 0.354676 0.093374 0.126849 0.060272 0.391320 0.104905 0.443503 0.162090 0.190233 0.227433 0.420244 Consensus sequence: DVTTVVCVYGGHGGYCHHDMYB Reverse complement motif 0.420244 0.190233 0.227433 0.162090 0.443503 0.391320 0.104905 0.060272 0.126849 0.354676 0.093374 0.425101 0.221779 0.144693 0.246895 0.386634 0.360746 0.203220 0.086635 0.349399 0.237863 0.213018 0.302807 0.246311 0.241289 0.104788 0.628210 0.025713 0.546036 0.312915 0.134247 0.006802 0.054974 0.890377 0.004738 0.049911 0.028216 0.951056 0.011233 0.009495 0.384256 0.166722 0.084229 0.364793 0.018921 0.915917 0.012887 0.052275 0.027282 0.844519 0.046183 0.082016 0.096327 0.011797 0.572718 0.319159 0.093849 0.244027 0.291102 0.371021 0.204557 0.107153 0.589399 0.098891 0.258125 0.263362 0.323243 0.155271 0.261292 0.298498 0.324124 0.116086 0.831295 0.072843 0.051741 0.044121 0.727007 0.092924 0.042921 0.137147 0.314445 0.160351 0.406003 0.119201 0.214165 0.372522 0.143436 0.269876 Consensus sequence: VMYDHDGMCCHCCKBGVVAAVH Alignment: VMYDHDGMCCHCCKBGVVAAVH RCTGYYSACCASYYTGGY---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 1 18 0.028167 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK RCTGYYSACCASYYTGGY---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 2 18 0.033095 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH ----RCTGYYSACCASYYTGGY- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 6 18 0.036897 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV -----KCCAKMSTGGTSKMCAGM ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_primaryReverse Complement Reverse Complement Backward 5 18 0.037936 Species: Mus musculus Original motif 0.204923 0.208846 0.365383 0.220848 0.294304 0.300143 0.167287 0.238266 0.109711 0.619514 0.117379 0.153396 0.178979 0.378580 0.230177 0.212264 0.159594 0.542602 0.118178 0.179627 0.125206 0.430074 0.151826 0.292894 0.097692 0.709845 0.116956 0.075506 0.148292 0.565912 0.037632 0.248164 0.077951 0.034190 0.855503 0.032356 0.001657 0.001061 0.971877 0.025405 0.001926 0.001084 0.991712 0.005278 0.033031 0.012001 0.057796 0.897171 0.002723 0.002647 0.993348 0.001281 0.003261 0.000963 0.987199 0.008577 0.000611 0.090925 0.074857 0.833608 0.015299 0.978878 0.004949 0.000874 0.013368 0.600902 0.033485 0.352245 0.231949 0.149575 0.118804 0.499672 0.267580 0.186002 0.371242 0.175176 0.264884 0.223483 0.110082 0.401551 0.221365 0.170121 0.179559 0.428955 0.112997 0.692930 0.139981 0.054092 0.460305 0.207883 0.155111 0.176702 Consensus sequence: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH Reverse complement motif 0.176702 0.207883 0.155111 0.460305 0.112997 0.139981 0.692930 0.054092 0.428955 0.170121 0.179559 0.221365 0.401551 0.223483 0.110082 0.264884 0.267580 0.371242 0.186002 0.175176 0.499672 0.149575 0.118804 0.231949 0.013368 0.033485 0.600902 0.352245 0.015299 0.004949 0.978878 0.000874 0.833608 0.090925 0.074857 0.000611 0.003261 0.987199 0.000963 0.008577 0.002723 0.993348 0.002647 0.001281 0.897171 0.012001 0.057796 0.033031 0.001926 0.991712 0.001084 0.005278 0.001657 0.971877 0.001061 0.025405 0.077951 0.855503 0.034190 0.032356 0.148292 0.037632 0.565912 0.248164 0.097692 0.116956 0.709845 0.075506 0.125206 0.151826 0.430074 0.292894 0.159594 0.118178 0.542602 0.179627 0.178979 0.230177 0.378580 0.212264 0.109711 0.117379 0.619514 0.153396 0.294304 0.167287 0.300143 0.238266 0.204923 0.365383 0.208846 0.220848 Consensus sequence: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB Alignment: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB -RCTGYYSACCASYYTGGY---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 96 Motif name: C096 Original motif 0.495050 0.445545 0.049505 0.009901 0.524752 0.009901 0.445545 0.019802 0.330000 0.520000 0.060000 0.090000 0.010000 0.760000 0.010000 0.220000 0.350000 0.570000 0.030000 0.050000 0.170000 0.410000 0.030000 0.390000 0.089109 0.069307 0.673267 0.168317 0.010000 0.340000 0.640000 0.010000 0.070000 0.910000 0.010000 0.010000 0.010000 0.320000 0.040000 0.630000 0.445545 0.009901 0.455446 0.089109 0.090000 0.010000 0.610000 0.290000 0.250000 0.510000 0.210000 0.030000 0.100000 0.670000 0.010000 0.220000 0.010000 0.540000 0.010000 0.440000 0.010000 0.110000 0.330000 0.550000 Consensus sequence: MRMCMYGSCYRGCCYK Reserve complement motif 0.550000 0.110000 0.330000 0.010000 0.010000 0.010000 0.540000 0.440000 0.100000 0.010000 0.670000 0.220000 0.250000 0.210000 0.510000 0.030000 0.090000 0.610000 0.010000 0.290000 0.445545 0.455446 0.009901 0.089109 0.630000 0.320000 0.040000 0.010000 0.070000 0.010000 0.910000 0.010000 0.010000 0.640000 0.340000 0.010000 0.089109 0.673267 0.069307 0.168317 0.170000 0.030000 0.410000 0.390000 0.350000 0.030000 0.570000 0.050000 0.010000 0.010000 0.760000 0.220000 0.330000 0.060000 0.520000 0.090000 0.019802 0.009901 0.445545 0.524752 0.009901 0.445545 0.049505 0.495050 Consensus sequence: RKGGCMMGSCKRGRKY ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 96 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_primaryReverse Complement Reverse Complement Backward 3 16 0.034661 Species: Mus musculus Original motif 0.204923 0.208846 0.365383 0.220848 0.294304 0.300143 0.167287 0.238266 0.109711 0.619514 0.117379 0.153396 0.178979 0.378580 0.230177 0.212264 0.159594 0.542602 0.118178 0.179627 0.125206 0.430074 0.151826 0.292894 0.097692 0.709845 0.116956 0.075506 0.148292 0.565912 0.037632 0.248164 0.077951 0.034190 0.855503 0.032356 0.001657 0.001061 0.971877 0.025405 0.001926 0.001084 0.991712 0.005278 0.033031 0.012001 0.057796 0.897171 0.002723 0.002647 0.993348 0.001281 0.003261 0.000963 0.987199 0.008577 0.000611 0.090925 0.074857 0.833608 0.015299 0.978878 0.004949 0.000874 0.013368 0.600902 0.033485 0.352245 0.231949 0.149575 0.118804 0.499672 0.267580 0.186002 0.371242 0.175176 0.264884 0.223483 0.110082 0.401551 0.221365 0.170121 0.179559 0.428955 0.112997 0.692930 0.139981 0.054092 0.460305 0.207883 0.155111 0.176702 Consensus sequence: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH Reverse complement motif 0.176702 0.207883 0.155111 0.460305 0.112997 0.139981 0.692930 0.054092 0.428955 0.170121 0.179559 0.221365 0.401551 0.223483 0.110082 0.264884 0.267580 0.371242 0.186002 0.175176 0.499672 0.149575 0.118804 0.231949 0.013368 0.033485 0.600902 0.352245 0.015299 0.004949 0.978878 0.000874 0.833608 0.090925 0.074857 0.000611 0.003261 0.987199 0.000963 0.008577 0.002723 0.993348 0.002647 0.001281 0.897171 0.012001 0.057796 0.033031 0.001926 0.991712 0.001084 0.005278 0.001657 0.971877 0.001061 0.025405 0.077951 0.855503 0.034190 0.032356 0.148292 0.037632 0.565912 0.248164 0.097692 0.116956 0.709845 0.075506 0.125206 0.151826 0.430074 0.292894 0.159594 0.118178 0.542602 0.179627 0.178979 0.230177 0.378580 0.212264 0.109711 0.117379 0.619514 0.153396 0.294304 0.167287 0.300143 0.238266 0.204923 0.365383 0.208846 0.220848 Consensus sequence: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB Alignment: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB -----RKGGCMMGSCKRGRKY-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00033 Zfp410_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 16 0.035631 Species: Mus musculus Original motif 0.162979 0.284781 0.237433 0.314807 0.182449 0.447584 0.069464 0.300502 0.298973 0.261014 0.213211 0.226802 0.136039 0.433062 0.144274 0.286625 0.180084 0.395933 0.158565 0.265418 0.069354 0.748510 0.068898 0.113238 0.060485 0.717828 0.075333 0.146354 0.023280 0.071762 0.645500 0.259457 0.166896 0.749762 0.062730 0.020612 0.050401 0.775248 0.089072 0.085279 0.103847 0.767557 0.068804 0.059791 0.064815 0.748318 0.114588 0.072280 0.340921 0.071942 0.242981 0.344157 0.301967 0.263512 0.165927 0.268594 0.479800 0.222955 0.118441 0.178803 0.229469 0.283621 0.143099 0.343811 0.261733 0.180191 0.169905 0.388170 Consensus sequence: BHHBHCCGCCCCDHHHH Reverse complement motif 0.388170 0.180191 0.169905 0.261733 0.343811 0.283621 0.143099 0.229469 0.178803 0.222955 0.118441 0.479800 0.268594 0.263512 0.165927 0.301967 0.344157 0.071942 0.242981 0.340921 0.064815 0.114588 0.748318 0.072280 0.103847 0.068804 0.767557 0.059791 0.050401 0.089072 0.775248 0.085279 0.166896 0.062730 0.749762 0.020612 0.023280 0.645500 0.071762 0.259457 0.060485 0.075333 0.717828 0.146354 0.069354 0.068898 0.748510 0.113238 0.180084 0.158565 0.395933 0.265418 0.136039 0.144274 0.433062 0.286625 0.226802 0.261014 0.213211 0.298973 0.182449 0.069464 0.447584 0.300502 0.314807 0.284781 0.237433 0.162979 Consensus sequence: HHHHDGGGGCGGDBHDV Alignment: BHHBHCCGCCCCDHHHH -MRMCMYGSCYRGCCYK ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 5 16 0.037990 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK --MRMCMYGSCYRGCCYK---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00000 Smad3_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 2 16 0.040763 Species: Mus musculus Original motif 0.150668 0.131779 0.245665 0.471887 0.316817 0.287314 0.150829 0.245040 0.256473 0.409066 0.109700 0.224761 0.210646 0.220222 0.345010 0.224122 0.166679 0.508939 0.081676 0.242705 0.049351 0.759380 0.088489 0.102780 0.047598 0.785546 0.121957 0.044898 0.004606 0.944933 0.034696 0.015764 0.040252 0.050652 0.890382 0.018713 0.003038 0.913699 0.022449 0.060814 0.028672 0.941477 0.012276 0.017575 0.635243 0.139731 0.110495 0.114531 0.240016 0.385948 0.182848 0.191188 0.210430 0.274127 0.085171 0.430272 0.088118 0.454598 0.208989 0.248295 0.181269 0.265028 0.149023 0.404680 0.101070 0.252682 0.368542 0.277706 Consensus sequence: DHHBCCCCGCCAHHBHB Reverse complement motif 0.101070 0.368542 0.252682 0.277706 0.404680 0.265028 0.149023 0.181269 0.088118 0.208989 0.454598 0.248295 0.430272 0.274127 0.085171 0.210430 0.240016 0.182848 0.385948 0.191188 0.114531 0.139731 0.110495 0.635243 0.028672 0.012276 0.941477 0.017575 0.003038 0.022449 0.913699 0.060814 0.040252 0.890382 0.050652 0.018713 0.004606 0.034696 0.944933 0.015764 0.047598 0.121957 0.785546 0.044898 0.049351 0.088489 0.759380 0.102780 0.166679 0.081676 0.508939 0.242705 0.210646 0.345010 0.220222 0.224122 0.256473 0.109700 0.409066 0.224761 0.245040 0.287314 0.150829 0.316817 0.471887 0.131779 0.245665 0.150668 Consensus sequence: BHBHDTGGCGGGGBDHD Alignment: DHHBCCCCGCCAHHBHB -MRMCMYGSCYRGCCYK ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00022 Zfp740_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 1 16 0.041607 Species: Mus musculus Original motif 0.398967 0.071604 0.323957 0.205472 0.457709 0.058192 0.267218 0.216881 0.393346 0.032365 0.329533 0.244756 0.119528 0.091191 0.190078 0.599202 0.273933 0.123548 0.073075 0.529444 0.068935 0.812883 0.015245 0.102937 0.029664 0.907790 0.024804 0.037742 0.020725 0.933422 0.016796 0.029057 0.015086 0.948448 0.018030 0.018436 0.015628 0.884941 0.061172 0.038259 0.067508 0.744063 0.107305 0.081125 0.108097 0.140614 0.650174 0.101115 0.065696 0.247239 0.506149 0.180916 0.395005 0.077185 0.345914 0.181895 0.527081 0.093650 0.281853 0.097416 0.289378 0.245159 0.348803 0.116660 0.147136 0.260117 0.145993 0.446754 Consensus sequence: DDDTWCCCCCCGGDRVH Reverse complement motif 0.446754 0.260117 0.145993 0.147136 0.289378 0.348803 0.245159 0.116660 0.097416 0.093650 0.281853 0.527081 0.181895 0.077185 0.345914 0.395005 0.065696 0.506149 0.247239 0.180916 0.108097 0.650174 0.140614 0.101115 0.067508 0.107305 0.744063 0.081125 0.015628 0.061172 0.884941 0.038259 0.015086 0.018030 0.948448 0.018436 0.020725 0.016796 0.933422 0.029057 0.029664 0.024804 0.907790 0.037742 0.068935 0.015245 0.812883 0.102937 0.529444 0.123548 0.073075 0.273933 0.599202 0.091191 0.190078 0.119528 0.244756 0.032365 0.329533 0.393346 0.216881 0.058192 0.267218 0.457709 0.205472 0.071604 0.323957 0.398967 Consensus sequence: HVKDCCGGGGGGWADDD Alignment: DDDTWCCCCCCGGDRVH -RKGGCMMGSCKRGRKY ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 97 Motif name: C097 Original motif 0.400000 0.040000 0.100000 0.460000 0.168317 0.396040 0.227723 0.207921 0.800000 0.180000 0.010000 0.010000 0.782178 0.118812 0.089109 0.009901 0.100000 0.410000 0.370000 0.120000 0.470000 0.060000 0.010000 0.460000 0.495050 0.009901 0.069307 0.425743 0.770000 0.210000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.900000 0.010000 0.010000 0.080000 0.732673 0.158416 0.079208 0.029703 0.450000 0.040000 0.010000 0.500000 0.504950 0.009901 0.009901 0.475248 0.150000 0.400000 0.390000 0.060000 0.683168 0.217822 0.089109 0.009901 0.660000 0.120000 0.210000 0.010000 0.250000 0.250000 0.360000 0.140000 0.440000 0.130000 0.060000 0.370000 Consensus sequence: WBAASWWAAAAWWSAAVW Reserve complement motif 0.370000 0.130000 0.060000 0.440000 0.250000 0.360000 0.250000 0.140000 0.010000 0.120000 0.210000 0.660000 0.009901 0.217822 0.089109 0.683168 0.150000 0.390000 0.400000 0.060000 0.475248 0.009901 0.009901 0.504950 0.500000 0.040000 0.010000 0.450000 0.029703 0.158416 0.079208 0.732673 0.080000 0.010000 0.010000 0.900000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.210000 0.010000 0.770000 0.425743 0.009901 0.069307 0.495050 0.460000 0.060000 0.010000 0.470000 0.100000 0.370000 0.410000 0.120000 0.009901 0.118812 0.089109 0.782178 0.010000 0.180000 0.010000 0.800000 0.168317 0.227723 0.396040 0.207921 0.460000 0.040000 0.100000 0.400000 Consensus sequence: WVTTSWWTTTTWWSTTBW ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 97 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 18 0.032986 Species: Mus musculus Original motif 0.360997 0.300272 0.115555 0.223177 0.309749 0.228429 0.166233 0.295589 0.149419 0.176868 0.240155 0.433558 0.379704 0.095791 0.276373 0.248133 0.394549 0.174184 0.130641 0.300626 0.443749 0.070776 0.211081 0.274393 0.364301 0.074356 0.370406 0.190936 0.791976 0.038475 0.093390 0.076159 0.963721 0.001826 0.002456 0.031997 0.004516 0.954596 0.008092 0.032796 0.981080 0.002062 0.002161 0.014697 0.986185 0.001846 0.006976 0.004992 0.059567 0.003649 0.002189 0.934595 0.495328 0.024257 0.240450 0.239965 0.305027 0.094878 0.526069 0.074025 0.418442 0.196237 0.158323 0.226998 0.336713 0.220452 0.191155 0.251680 0.192296 0.300342 0.169047 0.338315 0.240387 0.144634 0.128513 0.486465 0.290763 0.271259 0.116600 0.321377 0.224825 0.296233 0.229255 0.249687 0.493240 0.171285 0.075148 0.260326 Consensus sequence: HHBDHDDAACAATDRHHHHHBW Reverse complement motif 0.260326 0.171285 0.075148 0.493240 0.224825 0.229255 0.296233 0.249687 0.321377 0.271259 0.116600 0.290763 0.486465 0.144634 0.128513 0.240387 0.338315 0.300342 0.169047 0.192296 0.251680 0.220452 0.191155 0.336713 0.226998 0.196237 0.158323 0.418442 0.305027 0.526069 0.094878 0.074025 0.239965 0.024257 0.240450 0.495328 0.934595 0.003649 0.002189 0.059567 0.004992 0.001846 0.006976 0.986185 0.014697 0.002062 0.002161 0.981080 0.004516 0.008092 0.954596 0.032796 0.031997 0.001826 0.002456 0.963721 0.076159 0.038475 0.093390 0.791976 0.364301 0.370406 0.074356 0.190936 0.274393 0.070776 0.211081 0.443749 0.300626 0.174184 0.130641 0.394549 0.248133 0.095791 0.276373 0.379704 0.433558 0.176868 0.240155 0.149419 0.295589 0.228429 0.166233 0.309749 0.223177 0.300272 0.115555 0.360997 Consensus sequence: WBHHHHHMDATTGTTHDHDVHH Alignment: WBHHHHHMDATTGTTHDHDVHH ---WVTTSWWTTTTWWSTTBW- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00032 Gata3_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 5 18 0.039525 Species: Mus musculus Original motif 0.151572 0.262753 0.258275 0.327401 0.221834 0.113385 0.275380 0.389400 0.297769 0.136928 0.134678 0.430625 0.270099 0.110415 0.271106 0.348380 0.265471 0.090253 0.223340 0.420936 0.616582 0.090091 0.171960 0.121367 0.197318 0.107541 0.406904 0.288237 0.798258 0.046950 0.001406 0.153385 0.003195 0.002516 0.989707 0.004582 0.991503 0.002748 0.002617 0.003132 0.005015 0.002764 0.003026 0.989195 0.948394 0.008932 0.001344 0.041330 0.973109 0.004100 0.004081 0.018710 0.040365 0.113905 0.828185 0.017545 0.736608 0.130524 0.113464 0.019404 0.415921 0.106101 0.316613 0.161365 0.376582 0.170927 0.155572 0.296919 0.137731 0.197151 0.211055 0.454064 0.324853 0.122747 0.246107 0.306293 0.462490 0.207311 0.159392 0.170807 0.380420 0.188972 0.311990 0.118618 0.222178 0.157873 0.380486 0.239463 Consensus sequence: BDHDDADAGATAAGADHBDHVD Reverse complement motif 0.222178 0.380486 0.157873 0.239463 0.118618 0.188972 0.311990 0.380420 0.170807 0.207311 0.159392 0.462490 0.306293 0.122747 0.246107 0.324853 0.454064 0.197151 0.211055 0.137731 0.296919 0.170927 0.155572 0.376582 0.161365 0.106101 0.316613 0.415921 0.019404 0.130524 0.113464 0.736608 0.040365 0.828185 0.113905 0.017545 0.018710 0.004100 0.004081 0.973109 0.041330 0.008932 0.001344 0.948394 0.989195 0.002764 0.003026 0.005015 0.003132 0.002748 0.002617 0.991503 0.003195 0.989707 0.002516 0.004582 0.153385 0.046950 0.001406 0.798258 0.197318 0.406904 0.107541 0.288237 0.121367 0.090091 0.171960 0.616582 0.420936 0.090253 0.223340 0.265471 0.348380 0.110415 0.271106 0.270099 0.430625 0.136928 0.134678 0.297769 0.389400 0.113385 0.275380 0.221834 0.327401 0.262753 0.258275 0.151572 Consensus sequence: HBHDVHDTCTTATCTHTDDHDV Alignment: HBHDVHDTCTTATCTHTDDHDV WVTTSWWTTTTWWSTTBW---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00032 Gata3_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 1 18 0.048336 Species: Mus musculus Original motif 0.177641 0.319872 0.115137 0.387350 0.136644 0.182137 0.205873 0.475347 0.254263 0.244280 0.165207 0.336250 0.240415 0.207557 0.237497 0.314530 0.271041 0.214702 0.364395 0.149863 0.095475 0.320104 0.191738 0.392682 0.500902 0.142722 0.026556 0.329820 0.051221 0.023698 0.897245 0.027836 0.922410 0.027509 0.024058 0.026023 0.030735 0.070903 0.024248 0.874114 0.242120 0.231992 0.225143 0.300745 0.106956 0.220471 0.283490 0.389083 0.152079 0.165830 0.135066 0.547025 0.839205 0.051581 0.060119 0.049095 0.041204 0.069147 0.070830 0.818819 0.051861 0.848177 0.027599 0.072363 0.383793 0.016807 0.397470 0.201931 0.381899 0.215846 0.255908 0.146347 0.094792 0.358651 0.280905 0.265652 0.296132 0.181545 0.178433 0.343890 0.301997 0.254722 0.108566 0.334714 0.349481 0.270693 0.137507 0.242319 Consensus sequence: HBHDVBWGATHBTATCRVBHHH Reverse complement motif 0.242319 0.270693 0.137507 0.349481 0.334714 0.254722 0.108566 0.301997 0.343890 0.181545 0.178433 0.296132 0.094792 0.280905 0.358651 0.265652 0.146347 0.215846 0.255908 0.381899 0.383793 0.397470 0.016807 0.201931 0.051861 0.027599 0.848177 0.072363 0.818819 0.069147 0.070830 0.041204 0.049095 0.051581 0.060119 0.839205 0.547025 0.165830 0.135066 0.152079 0.389083 0.220471 0.283490 0.106956 0.300745 0.231992 0.225143 0.242120 0.874114 0.070903 0.024248 0.030735 0.026023 0.027509 0.024058 0.922410 0.051221 0.897245 0.023698 0.027836 0.329820 0.142722 0.026556 0.500902 0.392682 0.320104 0.191738 0.095475 0.271041 0.364395 0.214702 0.149863 0.314530 0.207557 0.237497 0.240415 0.336250 0.244280 0.165207 0.254263 0.475347 0.182137 0.205873 0.136644 0.387350 0.319872 0.115137 0.177641 Consensus sequence: HHHBBMGATAVHATCWVVDHVH Alignment: HHHBBMGATAVHATCWVVDHVH ----WBAASWWAAAAWWSAAVW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 5 18 0.048893 Species: Mus musculus Original motif 0.067627 0.131333 0.654425 0.146615 0.156488 0.114442 0.145630 0.583441 0.206450 0.265630 0.358017 0.169903 0.090729 0.460713 0.274712 0.173847 0.285994 0.099998 0.154485 0.459523 0.635908 0.184787 0.072982 0.106323 0.748421 0.039204 0.092605 0.119769 0.081342 0.061327 0.044532 0.812799 0.143120 0.043879 0.024216 0.788785 0.247544 0.092102 0.621453 0.038901 0.295531 0.036295 0.027594 0.640580 0.194561 0.305468 0.339916 0.160055 0.175038 0.193568 0.101212 0.530182 0.145226 0.167488 0.559871 0.127415 0.271501 0.237429 0.206701 0.284369 0.216834 0.109191 0.569605 0.104370 0.182624 0.177160 0.300475 0.339742 0.331737 0.198645 0.265137 0.204482 0.230155 0.359365 0.183450 0.227029 0.056581 0.067297 0.463052 0.413070 0.198891 0.324626 0.304424 0.172059 0.181968 0.287547 0.202419 0.328066 Consensus sequence: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB Reverse complement motif 0.328066 0.287547 0.202419 0.181968 0.198891 0.304424 0.324626 0.172059 0.056581 0.463052 0.067297 0.413070 0.230155 0.183450 0.359365 0.227029 0.204482 0.198645 0.265137 0.331737 0.339742 0.177160 0.300475 0.182624 0.216834 0.569605 0.109191 0.104370 0.284369 0.237429 0.206701 0.271501 0.145226 0.559871 0.167488 0.127415 0.530182 0.193568 0.101212 0.175038 0.194561 0.339916 0.305468 0.160055 0.640580 0.036295 0.027594 0.295531 0.247544 0.621453 0.092102 0.038901 0.788785 0.043879 0.024216 0.143120 0.812799 0.061327 0.044532 0.081342 0.119769 0.039204 0.092605 0.748421 0.106323 0.184787 0.072982 0.635908 0.459523 0.099998 0.154485 0.285994 0.090729 0.274712 0.460713 0.173847 0.206450 0.358017 0.265630 0.169903 0.583441 0.114442 0.145630 0.156488 0.067627 0.654425 0.131333 0.146615 Consensus sequence: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC Alignment: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC ----WBAASWWAAAAWWSAAVW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00528 Foxm1_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 2 18 0.054921 Species: Mus musculus Original motif 0.399785 0.446658 0.111435 0.042122 0.535175 0.103991 0.089706 0.271128 0.078171 0.387987 0.375083 0.158759 0.309001 0.519142 0.070618 0.101239 0.201844 0.255818 0.323149 0.219190 0.534101 0.109845 0.235026 0.121028 0.656038 0.037473 0.261484 0.045006 0.315713 0.164290 0.471815 0.048182 0.651960 0.009412 0.328237 0.010391 0.937365 0.017313 0.007516 0.037807 0.019983 0.044238 0.012387 0.923392 0.061195 0.021485 0.881645 0.035675 0.017521 0.952998 0.013139 0.016342 0.254160 0.029735 0.493023 0.223082 0.239200 0.593324 0.114503 0.052973 0.610822 0.071539 0.099169 0.218470 0.166610 0.389712 0.204400 0.239278 0.227752 0.361626 0.178497 0.232125 0.537030 0.182466 0.026035 0.254470 0.235902 0.151006 0.043788 0.569304 0.081851 0.250397 0.590059 0.077693 0.340417 0.189613 0.272075 0.197895 Consensus sequence: MWSMBAARRATGCDCABHATGD Reverse complement motif 0.197895 0.189613 0.272075 0.340417 0.081851 0.590059 0.250397 0.077693 0.569304 0.151006 0.043788 0.235902 0.254470 0.182466 0.026035 0.537030 0.227752 0.178497 0.361626 0.232125 0.166610 0.204400 0.389712 0.239278 0.218470 0.071539 0.099169 0.610822 0.239200 0.114503 0.593324 0.052973 0.254160 0.493023 0.029735 0.223082 0.017521 0.013139 0.952998 0.016342 0.061195 0.881645 0.021485 0.035675 0.923392 0.044238 0.012387 0.019983 0.037807 0.017313 0.007516 0.937365 0.010391 0.009412 0.328237 0.651960 0.315713 0.471815 0.164290 0.048182 0.045006 0.037473 0.261484 0.656038 0.121028 0.109845 0.235026 0.534101 0.201844 0.323149 0.255818 0.219190 0.309001 0.070618 0.519142 0.101239 0.078171 0.375083 0.387987 0.158759 0.271128 0.103991 0.089706 0.535175 0.399785 0.111435 0.446658 0.042122 Consensus sequence: DCATDBTGHGCATKMTTBRSWR Alignment: MWSMBAARRATGCDCABHATGD -WBAASWWAAAAWWSAAVW--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 98 Motif name: C098 Original motif 0.560000 0.010000 0.180000 0.250000 0.534653 0.059406 0.138614 0.267327 0.720000 0.110000 0.010000 0.160000 0.752475 0.138614 0.059406 0.049505 0.410000 0.100000 0.010000 0.480000 0.500000 0.020000 0.180000 0.300000 0.780000 0.200000 0.010000 0.010000 0.540000 0.440000 0.010000 0.010000 0.830000 0.150000 0.010000 0.010000 0.610000 0.270000 0.070000 0.050000 0.350000 0.210000 0.010000 0.430000 0.480000 0.050000 0.140000 0.330000 0.792079 0.128713 0.069307 0.009901 0.650000 0.230000 0.110000 0.010000 0.356436 0.089109 0.049505 0.504950 0.247525 0.217822 0.059406 0.475248 Consensus sequence: AAAAWWAMAAWWAAWH Reserve complement motif 0.475248 0.217822 0.059406 0.247525 0.504950 0.089109 0.049505 0.356436 0.010000 0.230000 0.110000 0.650000 0.009901 0.128713 0.069307 0.792079 0.330000 0.050000 0.140000 0.480000 0.430000 0.210000 0.010000 0.350000 0.050000 0.270000 0.070000 0.610000 0.010000 0.150000 0.010000 0.830000 0.010000 0.440000 0.010000 0.540000 0.010000 0.200000 0.010000 0.780000 0.300000 0.020000 0.180000 0.500000 0.480000 0.100000 0.010000 0.410000 0.049505 0.138614 0.059406 0.752475 0.160000 0.110000 0.010000 0.720000 0.267327 0.059406 0.138614 0.534653 0.250000 0.010000 0.180000 0.560000 Consensus sequence: HWTTWWTTYTWWTTTT ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 98 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00077 Srf_secondary Original Motif Original Motif Backward 1 16 0.038656 Species: Mus musculus Original motif 0.162968 0.284828 0.440984 0.111220 0.151392 0.200635 0.205316 0.442657 0.267215 0.083669 0.192498 0.456618 0.332771 0.180711 0.200027 0.286491 0.509370 0.102954 0.242569 0.145107 0.666262 0.077309 0.154466 0.101962 0.737968 0.113335 0.100401 0.048296 0.658878 0.141580 0.134033 0.065510 0.766115 0.094051 0.069763 0.070072 0.755621 0.088491 0.044802 0.111086 0.749083 0.135917 0.047510 0.067490 0.663231 0.176795 0.028134 0.131839 0.553358 0.277659 0.038655 0.130328 0.392578 0.314083 0.209844 0.083495 0.198462 0.237132 0.239466 0.324940 0.275121 0.210087 0.194779 0.320013 0.287748 0.277395 0.142704 0.292154 Consensus sequence: VBDDAAAAAAAAMVBHH Reverse complement motif 0.292154 0.277395 0.142704 0.287748 0.320013 0.210087 0.194779 0.275121 0.324940 0.237132 0.239466 0.198462 0.083495 0.314083 0.209844 0.392578 0.130328 0.277659 0.038655 0.553358 0.131839 0.176795 0.028134 0.663231 0.067490 0.135917 0.047510 0.749083 0.111086 0.088491 0.044802 0.755621 0.070072 0.094051 0.069763 0.766115 0.065510 0.141580 0.134033 0.658878 0.048296 0.113335 0.100401 0.737968 0.101962 0.077309 0.154466 0.666262 0.145107 0.102954 0.242569 0.509370 0.286491 0.180711 0.200027 0.332771 0.456618 0.083669 0.192498 0.267215 0.442657 0.200635 0.205316 0.151392 0.162968 0.440984 0.284828 0.111220 Consensus sequence: HHVBYTTTTTTTTDDVV Alignment: VBDDAAAAAAAAMVBHH -AAAAWWAMAAWWAAWH ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00051 Sox8_primary Original Motif Reverse Complement Forward 1 16 0.041004 Species: Mus musculus Original motif 0.244952 0.197659 0.278014 0.279374 0.244434 0.136006 0.278446 0.341114 0.512025 0.129954 0.139069 0.218951 0.190001 0.086232 0.125500 0.598267 0.154692 0.325860 0.193904 0.325544 0.384624 0.130540 0.035110 0.449726 0.945021 0.006713 0.011975 0.036291 0.008386 0.026630 0.004166 0.960817 0.020908 0.005554 0.009294 0.964244 0.149285 0.038995 0.806085 0.005635 0.110990 0.007155 0.007797 0.874058 0.087283 0.099671 0.059611 0.753435 0.250662 0.432576 0.082152 0.234610 0.251277 0.174578 0.147771 0.426374 0.205121 0.137656 0.296366 0.360857 0.316796 0.152457 0.164403 0.366344 0.475864 0.128717 0.153551 0.241867 Consensus sequence: DDATBWATTGTTHHDDD Reverse complement motif 0.241867 0.128717 0.153551 0.475864 0.366344 0.152457 0.164403 0.316796 0.360857 0.137656 0.296366 0.205121 0.426374 0.174578 0.147771 0.251277 0.250662 0.082152 0.432576 0.234610 0.753435 0.099671 0.059611 0.087283 0.874058 0.007155 0.007797 0.110990 0.149285 0.806085 0.038995 0.005635 0.964244 0.005554 0.009294 0.020908 0.960817 0.026630 0.004166 0.008386 0.036291 0.006713 0.011975 0.945021 0.449726 0.130540 0.035110 0.384624 0.154692 0.193904 0.325860 0.325544 0.598267 0.086232 0.125500 0.190001 0.218951 0.129954 0.139069 0.512025 0.341114 0.136006 0.278446 0.244434 0.279374 0.197659 0.278014 0.244952 Consensus sequence: DDDHDAACAATWBATDD Alignment: DDDHDAACAATWBATDD AAAAWWAMAAWWAAWH- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00090 Elf3_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 1 16 0.041978 Species: Mus musculus Original motif 0.155083 0.152982 0.490906 0.201030 0.123195 0.312681 0.220770 0.343354 0.110252 0.131358 0.153983 0.604406 0.216489 0.490160 0.101348 0.192003 0.396130 0.292429 0.103252 0.208189 0.634770 0.070898 0.070668 0.223664 0.667102 0.099915 0.067576 0.165407 0.625495 0.095579 0.039353 0.239573 0.717478 0.093228 0.024737 0.164558 0.729965 0.048628 0.024557 0.196850 0.670909 0.118718 0.043692 0.166681 0.689441 0.050145 0.038829 0.221584 0.506735 0.159498 0.095635 0.238132 0.406093 0.298915 0.149902 0.145090 0.193913 0.282078 0.096706 0.427303 0.272324 0.154790 0.262469 0.310417 0.224484 0.458724 0.060144 0.256647 Consensus sequence: DBTHHAAAAAAAAVHDH Reverse complement motif 0.224484 0.060144 0.458724 0.256647 0.310417 0.154790 0.262469 0.272324 0.427303 0.282078 0.096706 0.193913 0.145090 0.298915 0.149902 0.406093 0.238132 0.159498 0.095635 0.506735 0.221584 0.050145 0.038829 0.689441 0.166681 0.118718 0.043692 0.670909 0.196850 0.048628 0.024557 0.729965 0.164558 0.093228 0.024737 0.717478 0.239573 0.095579 0.039353 0.625495 0.165407 0.099915 0.067576 0.667102 0.223664 0.070898 0.070668 0.634770 0.208189 0.292429 0.103252 0.396130 0.216489 0.101348 0.490160 0.192003 0.604406 0.131358 0.153983 0.110252 0.343354 0.312681 0.220770 0.123195 0.155083 0.490906 0.152982 0.201030 Consensus sequence: DDHBTTTTTTTTHDAVH Alignment: DBTHHAAAAAAAAVHDH AAAAWWAMAAWWAAWH- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00255 Dbx1 Original Motif Original Motif Forward 1 16 0.041991 Species: Mus musculus Original motif 0.193358 0.228955 0.160692 0.416995 0.611960 0.068099 0.048494 0.271446 0.459770 0.057385 0.307824 0.175021 0.226103 0.127408 0.101076 0.545413 0.241226 0.228640 0.067165 0.462969 0.621421 0.137382 0.078412 0.162785 0.737972 0.031899 0.051833 0.178295 0.110802 0.098497 0.073668 0.717033 0.129567 0.110629 0.036048 0.723756 0.729342 0.031636 0.088480 0.150541 0.540257 0.104927 0.048065 0.306750 0.195987 0.148698 0.098709 0.556606 0.587529 0.072583 0.170635 0.169252 0.497416 0.161804 0.219409 0.121371 0.278831 0.114362 0.139037 0.467771 0.297462 0.189119 0.187754 0.325665 0.397268 0.140582 0.287428 0.174722 Consensus sequence: HARTHAATTAWTAVDHD Reverse complement motif 0.174722 0.140582 0.287428 0.397268 0.325665 0.189119 0.187754 0.297462 0.467771 0.114362 0.139037 0.278831 0.121371 0.161804 0.219409 0.497416 0.169252 0.072583 0.170635 0.587529 0.556606 0.148698 0.098709 0.195987 0.306750 0.104927 0.048065 0.540257 0.150541 0.031636 0.088480 0.729342 0.723756 0.110629 0.036048 0.129567 0.717033 0.098497 0.073668 0.110802 0.178295 0.031899 0.051833 0.737972 0.162785 0.137382 0.078412 0.621421 0.462969 0.228640 0.067165 0.241226 0.545413 0.127408 0.101076 0.226103 0.175021 0.057385 0.307824 0.459770 0.271446 0.068099 0.048494 0.611960 0.416995 0.228955 0.160692 0.193358 Consensus sequence: DHDBTAWTAATTHAKTH Alignment: HARTHAATTAWTAVDHD AAAAWWAMAAWWAAWH- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_primary Original Motif Original Motif Backward 5 16 0.043025 Species: Mus musculus Original motif 0.360997 0.300272 0.115555 0.223177 0.309749 0.228429 0.166233 0.295589 0.149419 0.176868 0.240155 0.433558 0.379704 0.095791 0.276373 0.248133 0.394549 0.174184 0.130641 0.300626 0.443749 0.070776 0.211081 0.274393 0.364301 0.074356 0.370406 0.190936 0.791976 0.038475 0.093390 0.076159 0.963721 0.001826 0.002456 0.031997 0.004516 0.954596 0.008092 0.032796 0.981080 0.002062 0.002161 0.014697 0.986185 0.001846 0.006976 0.004992 0.059567 0.003649 0.002189 0.934595 0.495328 0.024257 0.240450 0.239965 0.305027 0.094878 0.526069 0.074025 0.418442 0.196237 0.158323 0.226998 0.336713 0.220452 0.191155 0.251680 0.192296 0.300342 0.169047 0.338315 0.240387 0.144634 0.128513 0.486465 0.290763 0.271259 0.116600 0.321377 0.224825 0.296233 0.229255 0.249687 0.493240 0.171285 0.075148 0.260326 Consensus sequence: HHBDHDDAACAATDRHHHHHBW Reverse complement motif 0.260326 0.171285 0.075148 0.493240 0.224825 0.229255 0.296233 0.249687 0.321377 0.271259 0.116600 0.290763 0.486465 0.144634 0.128513 0.240387 0.338315 0.300342 0.169047 0.192296 0.251680 0.220452 0.191155 0.336713 0.226998 0.196237 0.158323 0.418442 0.305027 0.526069 0.094878 0.074025 0.239965 0.024257 0.240450 0.495328 0.934595 0.003649 0.002189 0.059567 0.004992 0.001846 0.006976 0.986185 0.014697 0.002062 0.002161 0.981080 0.004516 0.008092 0.954596 0.032796 0.031997 0.001826 0.002456 0.963721 0.076159 0.038475 0.093390 0.791976 0.364301 0.370406 0.074356 0.190936 0.274393 0.070776 0.211081 0.443749 0.300626 0.174184 0.130641 0.394549 0.248133 0.095791 0.276373 0.379704 0.433558 0.176868 0.240155 0.149419 0.295589 0.228429 0.166233 0.309749 0.223177 0.300272 0.115555 0.360997 Consensus sequence: WBHHHHHMDATTGTTHDHDVHH Alignment: HHBDHDDAACAATDRHHHHHBW --AAAAWWAMAAWWAAWH---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 99 Motif name: C099 Original motif 0.455446 0.495050 0.009901 0.039604 0.009901 0.495050 0.009901 0.485149 0.059406 0.851485 0.009901 0.079208 0.009901 0.851485 0.009901 0.128713 0.009901 0.861386 0.009901 0.118812 0.445545 0.376238 0.059406 0.118812 0.250000 0.010000 0.670000 0.070000 0.160000 0.780000 0.050000 0.010000 0.871287 0.108911 0.009901 0.009901 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.020000 0.720000 0.010000 0.250000 0.138614 0.059406 0.306931 0.495050 0.099010 0.039604 0.801980 0.059406 0.010000 0.150000 0.770000 0.070000 0.930000 0.040000 0.020000 0.010000 0.485149 0.029703 0.465347 0.019802 0.039604 0.039604 0.415842 0.504950 Consensus sequence: MYCCCMGCACTCKGGARK Reserve complement motif 0.504950 0.039604 0.415842 0.039604 0.019802 0.029703 0.465347 0.485149 0.010000 0.040000 0.020000 0.930000 0.010000 0.770000 0.150000 0.070000 0.099010 0.801980 0.039604 0.059406 0.495050 0.059406 0.306931 0.138614 0.020000 0.010000 0.720000 0.250000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.009901 0.108911 0.009901 0.871287 0.160000 0.050000 0.780000 0.010000 0.250000 0.670000 0.010000 0.070000 0.118812 0.376238 0.059406 0.445545 0.009901 0.009901 0.861386 0.118812 0.009901 0.009901 0.851485 0.128713 0.059406 0.009901 0.851485 0.079208 0.009901 0.009901 0.495050 0.485149 0.455446 0.009901 0.495050 0.039604 Consensus sequence: RKTCCRGAGTGCYGGGKR ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 99 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 4 18 0.031866 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV ---RKTCCRGAGTGCYGGGKR-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 18 0.036621 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH ----MYCCCMGCACTCKGGARK ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00526 Foxn1_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 3 18 0.040491 Species: Mus musculus Original motif 0.477863 0.106306 0.184102 0.231729 0.304951 0.149020 0.361418 0.184612 0.548996 0.056128 0.348902 0.045974 0.385727 0.477782 0.086218 0.050273 0.409556 0.232265 0.173851 0.184328 0.174550 0.312880 0.307123 0.205448 0.850398 0.047204 0.041665 0.060734 0.141234 0.548534 0.142230 0.168002 0.059462 0.026354 0.892948 0.021236 0.053714 0.870297 0.028935 0.047055 0.086273 0.069147 0.805284 0.039296 0.033781 0.573881 0.034115 0.358223 0.035191 0.079663 0.824970 0.060176 0.051830 0.862631 0.019359 0.066180 0.178685 0.015738 0.762485 0.043092 0.058988 0.042615 0.017608 0.880789 0.202382 0.173360 0.284095 0.340163 0.098493 0.234651 0.506524 0.160333 0.109087 0.336204 0.250510 0.304198 0.130945 0.250843 0.177122 0.441090 0.353830 0.138838 0.162784 0.344548 0.114290 0.417163 0.160662 0.307885 Consensus sequence: DDRMHBACGCGYGCGTDGBBDB Reverse complement motif 0.114290 0.160662 0.417163 0.307885 0.344548 0.138838 0.162784 0.353830 0.441090 0.250843 0.177122 0.130945 0.109087 0.250510 0.336204 0.304198 0.098493 0.506524 0.234651 0.160333 0.340163 0.173360 0.284095 0.202382 0.880789 0.042615 0.017608 0.058988 0.178685 0.762485 0.015738 0.043092 0.051830 0.019359 0.862631 0.066180 0.035191 0.824970 0.079663 0.060176 0.033781 0.034115 0.573881 0.358223 0.086273 0.805284 0.069147 0.039296 0.053714 0.028935 0.870297 0.047055 0.059462 0.892948 0.026354 0.021236 0.141234 0.142230 0.548534 0.168002 0.060734 0.047204 0.041665 0.850398 0.174550 0.307123 0.312880 0.205448 0.184328 0.232265 0.173851 0.409556 0.385727 0.086218 0.477782 0.050273 0.045974 0.056128 0.348902 0.548996 0.304951 0.361418 0.149020 0.184612 0.231729 0.106306 0.184102 0.477863 Consensus sequence: BDVBCDACGCKCGCGTBHRKHD Alignment: BDVBCDACGCKCGCGTBHRKHD --MYCCCMGCACTCKGGARK-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 4 18 0.043860 Species: Mus musculus Original motif 0.404007 0.395873 0.173319 0.026801 0.305977 0.215534 0.215359 0.263130 0.370148 0.250957 0.113088 0.265808 0.324336 0.229498 0.174679 0.271487 0.263563 0.137896 0.079217 0.519324 0.265762 0.222582 0.082555 0.429102 0.206721 0.288405 0.017851 0.487023 0.164361 0.236500 0.061051 0.538088 0.593344 0.348446 0.050304 0.007906 0.031328 0.947050 0.007032 0.014590 0.010428 0.956605 0.029142 0.003825 0.459636 0.207616 0.155368 0.177380 0.014573 0.964608 0.012209 0.008610 0.066291 0.918196 0.008729 0.006784 0.019488 0.866774 0.018897 0.094841 0.767405 0.104198 0.029234 0.099164 0.052494 0.772531 0.039832 0.135142 0.296085 0.243498 0.350935 0.109482 0.518843 0.226659 0.124784 0.129714 0.647901 0.019721 0.159901 0.172477 0.113912 0.231511 0.214864 0.439713 0.223117 0.310596 0.293328 0.172959 0.185557 0.487662 0.136321 0.190459 Consensus sequence: MHHHWHYTMCCHCCCACVAABVH Reverse complement motif 0.185557 0.136321 0.487662 0.190459 0.223117 0.293328 0.310596 0.172959 0.439713 0.231511 0.214864 0.113912 0.172477 0.019721 0.159901 0.647901 0.129714 0.226659 0.124784 0.518843 0.296085 0.350935 0.243498 0.109482 0.052494 0.039832 0.772531 0.135142 0.099164 0.104198 0.029234 0.767405 0.019488 0.018897 0.866774 0.094841 0.066291 0.008729 0.918196 0.006784 0.014573 0.012209 0.964608 0.008610 0.177380 0.207616 0.155368 0.459636 0.010428 0.029142 0.956605 0.003825 0.031328 0.007032 0.947050 0.014590 0.007906 0.348446 0.050304 0.593344 0.538088 0.236500 0.061051 0.164361 0.487023 0.288405 0.017851 0.206721 0.429102 0.222582 0.082555 0.265762 0.519324 0.137896 0.079217 0.263563 0.271487 0.229498 0.174679 0.324336 0.265808 0.250957 0.113088 0.370148 0.263130 0.215534 0.215359 0.305977 0.026801 0.395873 0.173319 0.404007 Consensus sequence: DVVTTVGTGGGHGGYAMHWHHHY Alignment: MHHHWHYTMCCHCCCACVAABVH ---MYCCCMGCACTCKGGARK-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 3 18 0.044350 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB ---RKTCCRGAGTGCYGGGKR-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 100 Motif name: C100 Original motif 0.530000 0.070000 0.010000 0.390000 0.390000 0.150000 0.150000 0.310000 0.560000 0.010000 0.020000 0.410000 0.009901 0.861386 0.009901 0.118812 0.070000 0.380000 0.510000 0.040000 0.009901 0.881188 0.009901 0.099010 0.080000 0.010000 0.010000 0.900000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.009901 0.118812 0.039604 0.831683 0.029703 0.465347 0.415842 0.089109 0.019802 0.029703 0.118812 0.831683 0.010000 0.940000 0.010000 0.040000 0.260000 0.250000 0.140000 0.350000 0.504950 0.009901 0.019802 0.465347 Consensus sequence: WDWCSCTGTSTCHW Reserve complement motif 0.465347 0.009901 0.019802 0.504950 0.350000 0.250000 0.140000 0.260000 0.010000 0.010000 0.940000 0.040000 0.831683 0.029703 0.118812 0.019802 0.029703 0.415842 0.465347 0.089109 0.831683 0.118812 0.039604 0.009901 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.900000 0.010000 0.010000 0.080000 0.009901 0.009901 0.881188 0.099010 0.070000 0.510000 0.380000 0.040000 0.009901 0.009901 0.861386 0.118812 0.410000 0.010000 0.020000 0.560000 0.310000 0.150000 0.150000 0.390000 0.390000 0.070000 0.010000 0.530000 Consensus sequence: WHGASACAGSGWDW ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 100 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00031 Zbtb3_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 2 14 0.021135 Species: Mus musculus Original motif 0.110412 0.519910 0.162398 0.207280 0.470593 0.172893 0.115202 0.241311 0.467126 0.160175 0.227365 0.145334 0.196112 0.169855 0.079068 0.554965 0.198275 0.671393 0.026094 0.104237 0.793465 0.046739 0.110258 0.049538 0.058204 0.867549 0.045603 0.028645 0.079471 0.027484 0.025248 0.867797 0.032277 0.065893 0.827417 0.074413 0.080553 0.119144 0.585050 0.215253 0.105106 0.470208 0.170921 0.253765 0.690158 0.033925 0.171121 0.104796 0.299543 0.155890 0.362586 0.181981 0.343375 0.213360 0.180067 0.263198 0.364819 0.149053 0.181128 0.305000 0.247818 0.143948 0.217882 0.390352 Consensus sequence: CHVTCACTGGBADHDD Reverse complement motif 0.390352 0.143948 0.217882 0.247818 0.305000 0.149053 0.181128 0.364819 0.263198 0.213360 0.180067 0.343375 0.299543 0.362586 0.155890 0.181981 0.104796 0.033925 0.171121 0.690158 0.105106 0.170921 0.470208 0.253765 0.080553 0.585050 0.119144 0.215253 0.032277 0.827417 0.065893 0.074413 0.867797 0.027484 0.025248 0.079471 0.058204 0.045603 0.867549 0.028645 0.049538 0.046739 0.110258 0.793465 0.198275 0.026094 0.671393 0.104237 0.554965 0.169855 0.079068 0.196112 0.145334 0.160175 0.227365 0.467126 0.241311 0.172893 0.115202 0.470593 0.110412 0.162398 0.519910 0.207280 Consensus sequence: DDHHTBCCAGTGABHG Alignment: CHVTCACTGGBADHDD -WDWCSCTGTSTCHW- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00101 Sox12_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 2 14 0.025539 Species: Mus musculus Original motif 0.378898 0.318901 0.205859 0.096341 0.352524 0.321236 0.224504 0.101736 0.323551 0.182056 0.210897 0.283496 0.135539 0.325230 0.208031 0.331200 0.663106 0.055471 0.154459 0.126963 0.051748 0.292567 0.537307 0.118378 0.886489 0.042361 0.035742 0.035408 0.043647 0.688744 0.094358 0.173252 0.882052 0.039818 0.018899 0.059231 0.864171 0.036011 0.068363 0.031455 0.790158 0.046868 0.041594 0.121379 0.087447 0.143905 0.707798 0.060849 0.295919 0.132479 0.485703 0.085899 0.653156 0.133004 0.110012 0.103828 0.351764 0.131771 0.217730 0.298736 0.203977 0.196773 0.099958 0.499292 Consensus sequence: VVDBASACAAAGRADH Reverse complement motif 0.499292 0.196773 0.099958 0.203977 0.298736 0.131771 0.217730 0.351764 0.103828 0.133004 0.110012 0.653156 0.295919 0.485703 0.132479 0.085899 0.087447 0.707798 0.143905 0.060849 0.121379 0.046868 0.041594 0.790158 0.031455 0.036011 0.068363 0.864171 0.059231 0.039818 0.018899 0.882052 0.043647 0.094358 0.688744 0.173252 0.035408 0.042361 0.035742 0.886489 0.051748 0.537307 0.292567 0.118378 0.126963 0.055471 0.154459 0.663106 0.331200 0.325230 0.208031 0.135539 0.283496 0.182056 0.210897 0.323551 0.101736 0.321236 0.224504 0.352524 0.096341 0.318901 0.205859 0.378898 Consensus sequence: HDTMCTTTGTSTVDBB Alignment: HDTMCTTTGTSTVDBB -WDWCSCTGTSTCHW- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00210 Mrg2 Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 14 0.026359 Species: Mus musculus Original motif 0.451361 0.129344 0.139593 0.279702 0.590642 0.061045 0.179638 0.168676 0.264848 0.211505 0.252514 0.271134 0.108876 0.280056 0.299987 0.311081 0.771098 0.021050 0.148609 0.059244 0.030292 0.505912 0.423702 0.040094 0.053400 0.869563 0.021964 0.055073 0.001749 0.029333 0.000487 0.968430 0.007267 0.000536 0.989450 0.002747 0.031237 0.006659 0.000558 0.961545 0.001520 0.992342 0.001637 0.004501 0.976582 0.004910 0.010811 0.007697 0.640869 0.062002 0.032830 0.264299 0.318843 0.128253 0.123096 0.429808 0.432137 0.269895 0.155457 0.142512 0.247124 0.427480 0.147164 0.178233 Consensus sequence: DADBASCTGTCAAHVH Reverse complement motif 0.247124 0.147164 0.427480 0.178233 0.142512 0.269895 0.155457 0.432137 0.429808 0.128253 0.123096 0.318843 0.264299 0.062002 0.032830 0.640869 0.007697 0.004910 0.010811 0.976582 0.001520 0.001637 0.992342 0.004501 0.961545 0.006659 0.000558 0.031237 0.007267 0.989450 0.000536 0.002747 0.968430 0.029333 0.000487 0.001749 0.053400 0.021964 0.869563 0.055073 0.030292 0.423702 0.505912 0.040094 0.059244 0.021050 0.148609 0.771098 0.311081 0.280056 0.299987 0.108876 0.271134 0.211505 0.252514 0.264848 0.168676 0.061045 0.179638 0.590642 0.279702 0.129344 0.139593 0.451361 Consensus sequence: DBHTTGACAGSTVDTD Alignment: DBHTTGACAGSTVDTD -WHGASACAGSGWDW- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00098 Rfx3_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 10 14 0.031614 Species: Mus musculus Original motif 0.314514 0.275352 0.257617 0.152518 0.126939 0.598294 0.130576 0.144192 0.102265 0.155334 0.177957 0.564445 0.129288 0.282678 0.326990 0.261044 0.318166 0.227823 0.175681 0.278330 0.109019 0.380838 0.278328 0.231815 0.226145 0.289206 0.291300 0.193348 0.035863 0.844339 0.072582 0.047216 0.223793 0.187244 0.088092 0.500871 0.039800 0.029681 0.026201 0.904317 0.298298 0.032147 0.654746 0.014809 0.014729 0.022023 0.944826 0.018422 0.485114 0.004925 0.013785 0.496176 0.035708 0.020381 0.240804 0.703108 0.951152 0.012738 0.017886 0.018224 0.023713 0.944394 0.009538 0.022355 0.291067 0.385205 0.232388 0.091339 0.340334 0.199588 0.311526 0.148552 0.198713 0.472138 0.178319 0.150830 0.321155 0.269932 0.311301 0.097612 0.412646 0.195252 0.231950 0.160152 0.297134 0.180928 0.250400 0.271538 0.151169 0.305386 0.358574 0.184871 Consensus sequence: VCTBHBVCTTGGWTACVVVVVDB Reverse complement motif 0.151169 0.358574 0.305386 0.184871 0.271538 0.180928 0.250400 0.297134 0.160152 0.195252 0.231950 0.412646 0.097612 0.269932 0.311301 0.321155 0.198713 0.178319 0.472138 0.150830 0.148552 0.199588 0.311526 0.340334 0.291067 0.232388 0.385205 0.091339 0.023713 0.009538 0.944394 0.022355 0.018224 0.012738 0.017886 0.951152 0.703108 0.020381 0.240804 0.035708 0.496176 0.004925 0.013785 0.485114 0.014729 0.944826 0.022023 0.018422 0.298298 0.654746 0.032147 0.014809 0.904317 0.029681 0.026201 0.039800 0.500871 0.187244 0.088092 0.223793 0.035863 0.072582 0.844339 0.047216 0.226145 0.291300 0.289206 0.193348 0.109019 0.278328 0.380838 0.231815 0.278330 0.227823 0.175681 0.318166 0.129288 0.326990 0.282678 0.261044 0.564445 0.155334 0.177957 0.102265 0.126939 0.130576 0.598294 0.144192 0.152518 0.275352 0.257617 0.314514 Consensus sequence: BDBBVBVGTAWCCAAGVBHBAGB Alignment: VCTBHBVCTTGGWTACVVVVVDB ---------WHGASACAGSGWDW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00186 Meis1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 14 0.031657 Species: Mus musculus Original motif 0.432115 0.114994 0.130835 0.322056 0.508081 0.060822 0.214256 0.216841 0.225875 0.276028 0.280982 0.217115 0.092373 0.286687 0.360933 0.260007 0.947172 0.005937 0.028595 0.018297 0.027829 0.439935 0.505051 0.027185 0.023801 0.963424 0.008205 0.004571 0.001548 0.018215 0.000406 0.979831 0.008422 0.001124 0.989007 0.001446 0.025343 0.004094 0.000241 0.970323 0.001451 0.992789 0.002037 0.003724 0.991202 0.001638 0.003159 0.004002 0.695910 0.022145 0.013657 0.268288 0.357895 0.090931 0.093796 0.457378 0.453163 0.204395 0.181067 0.161376 0.200615 0.393437 0.171398 0.234551 Consensus sequence: WAVBASCTGTCAAWVH Reverse complement motif 0.200615 0.171398 0.393437 0.234551 0.161376 0.204395 0.181067 0.453163 0.457378 0.090931 0.093796 0.357895 0.268288 0.022145 0.013657 0.695910 0.004002 0.001638 0.003159 0.991202 0.001451 0.002037 0.992789 0.003724 0.970323 0.004094 0.000241 0.025343 0.008422 0.989007 0.001124 0.001446 0.979831 0.018215 0.000406 0.001548 0.023801 0.008205 0.963424 0.004571 0.027829 0.505051 0.439935 0.027185 0.018297 0.005937 0.028595 0.947172 0.092373 0.360933 0.286687 0.260007 0.225875 0.280982 0.276028 0.217115 0.216841 0.060822 0.214256 0.508081 0.322056 0.114994 0.130835 0.432115 Consensus sequence: DBWTTGACAGSTBVTW Alignment: DBWTTGACAGSTBVTW -WHGASACAGSGWDW- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 101 Motif name: C101 Original motif 0.009901 0.534653 0.059406 0.396040 0.128713 0.089109 0.019802 0.762376 0.010000 0.290000 0.560000 0.140000 0.019802 0.801980 0.069307 0.108911 0.010000 0.960000 0.010000 0.020000 0.020000 0.200000 0.020000 0.760000 0.030000 0.530000 0.430000 0.010000 0.100000 0.110000 0.400000 0.390000 0.029703 0.465347 0.495050 0.009901 0.300000 0.450000 0.150000 0.100000 0.009901 0.445545 0.485149 0.059406 0.010000 0.020000 0.040000 0.930000 0.010000 0.610000 0.300000 0.080000 0.138614 0.772277 0.009901 0.079208 0.090000 0.620000 0.010000 0.280000 0.722772 0.089109 0.089109 0.099010 0.400000 0.070000 0.470000 0.060000 Consensus sequence: YTSCCTSKSVSTCCCAR Reserve complement motif 0.400000 0.470000 0.070000 0.060000 0.099010 0.089109 0.089109 0.722772 0.090000 0.010000 0.620000 0.280000 0.138614 0.009901 0.772277 0.079208 0.010000 0.300000 0.610000 0.080000 0.930000 0.020000 0.040000 0.010000 0.009901 0.485149 0.445545 0.059406 0.300000 0.150000 0.450000 0.100000 0.029703 0.495050 0.465347 0.009901 0.100000 0.400000 0.110000 0.390000 0.030000 0.430000 0.530000 0.010000 0.760000 0.200000 0.020000 0.020000 0.010000 0.010000 0.960000 0.020000 0.019802 0.069307 0.801980 0.108911 0.010000 0.560000 0.290000 0.140000 0.762376 0.089109 0.019802 0.128713 0.009901 0.059406 0.534653 0.396040 Consensus sequence: MTGGGASVSYSAGGSAK ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 101 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00527 Foxn4_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 3 17 0.037977 Species: Mus musculus Original motif 0.298336 0.418632 0.208054 0.074978 0.289907 0.015608 0.457100 0.237385 0.273583 0.077889 0.107860 0.540668 0.184954 0.161611 0.384390 0.269045 0.521826 0.156340 0.089019 0.232815 0.356716 0.131104 0.394857 0.117323 0.266669 0.108765 0.505273 0.119293 0.020778 0.047199 0.919524 0.012500 0.948536 0.018775 0.008113 0.024576 0.010822 0.964042 0.014701 0.010434 0.007428 0.019505 0.966351 0.006717 0.010025 0.975678 0.008648 0.005649 0.043796 0.120935 0.742979 0.092289 0.008252 0.250704 0.541132 0.199913 0.474428 0.044681 0.134430 0.346461 0.146597 0.421317 0.143166 0.288920 0.020540 0.181479 0.553811 0.244170 0.129612 0.173360 0.535219 0.161808 0.506084 0.158156 0.130983 0.204776 0.054872 0.103043 0.545792 0.296293 0.389882 0.171037 0.164162 0.274918 0.225861 0.314031 0.288872 0.171237 Consensus sequence: VDWDARRGACGCGGWHGGAKHV Reverse complement motif 0.225861 0.288872 0.314031 0.171237 0.274918 0.171037 0.164162 0.389882 0.054872 0.545792 0.103043 0.296293 0.204776 0.158156 0.130983 0.506084 0.129612 0.535219 0.173360 0.161808 0.020540 0.553811 0.181479 0.244170 0.146597 0.143166 0.421317 0.288920 0.346461 0.044681 0.134430 0.474428 0.008252 0.541132 0.250704 0.199913 0.043796 0.742979 0.120935 0.092289 0.010025 0.008648 0.975678 0.005649 0.007428 0.966351 0.019505 0.006717 0.010822 0.014701 0.964042 0.010434 0.024576 0.018775 0.008113 0.948536 0.020778 0.919524 0.047199 0.012500 0.266669 0.505273 0.108765 0.119293 0.356716 0.394857 0.131104 0.117323 0.232815 0.156340 0.089019 0.521826 0.184954 0.384390 0.161611 0.269045 0.540668 0.077889 0.107860 0.273583 0.289907 0.457100 0.015608 0.237385 0.298336 0.208054 0.418632 0.074978 Consensus sequence: VHYTCCDWCCGCGTCMMTHWHV Alignment: VDWDARRGACGCGGWHGGAKHV ---MTGGGASVSYSAGGSAK-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 6 17 0.043481 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB -MTGGGASVSYSAGGSAK----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 17 0.044679 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH -----YTSCCTSKSVSTCCCAR ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v015681_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 4 17 0.044745 Species: Mus musculus Original motif 0.214165 0.143436 0.372522 0.269876 0.314445 0.406003 0.160351 0.119201 0.137147 0.092924 0.042921 0.727007 0.044121 0.072843 0.051741 0.831295 0.261292 0.324124 0.298498 0.116086 0.258125 0.323243 0.263362 0.155271 0.204557 0.589399 0.107153 0.098891 0.371021 0.244027 0.291102 0.093849 0.096327 0.572718 0.011797 0.319159 0.027282 0.046183 0.844519 0.082016 0.018921 0.012887 0.915917 0.052275 0.364793 0.166722 0.084229 0.384256 0.028216 0.011233 0.951056 0.009495 0.054974 0.004738 0.890377 0.049911 0.006802 0.312915 0.134247 0.546036 0.241289 0.628210 0.104788 0.025713 0.237863 0.302807 0.213018 0.246311 0.349399 0.203220 0.086635 0.360746 0.386634 0.144693 0.246895 0.221779 0.425101 0.354676 0.093374 0.126849 0.060272 0.391320 0.104905 0.443503 0.162090 0.190233 0.227433 0.420244 Consensus sequence: DVTTVVCVYGGHGGYCHHDMYB Reverse complement motif 0.420244 0.190233 0.227433 0.162090 0.443503 0.391320 0.104905 0.060272 0.126849 0.354676 0.093374 0.425101 0.221779 0.144693 0.246895 0.386634 0.360746 0.203220 0.086635 0.349399 0.237863 0.213018 0.302807 0.246311 0.241289 0.104788 0.628210 0.025713 0.546036 0.312915 0.134247 0.006802 0.054974 0.890377 0.004738 0.049911 0.028216 0.951056 0.011233 0.009495 0.384256 0.166722 0.084229 0.364793 0.018921 0.915917 0.012887 0.052275 0.027282 0.844519 0.046183 0.082016 0.096327 0.011797 0.572718 0.319159 0.093849 0.244027 0.291102 0.371021 0.204557 0.107153 0.589399 0.098891 0.258125 0.263362 0.323243 0.155271 0.261292 0.298498 0.324124 0.116086 0.831295 0.072843 0.051741 0.044121 0.727007 0.092924 0.042921 0.137147 0.314445 0.160351 0.406003 0.119201 0.214165 0.372522 0.143436 0.269876 Consensus sequence: VMYDHDGMCCHCCKBGVVAAVH Alignment: DVTTVVCVYGGHGGYCHHDMYB --YTSCCTSKSVSTCCCAR--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00400 Zif268 Reverse Complement Original Motif Forward 2 17 0.046494 Species: Mus musculus Original motif 0.104824 0.412716 0.254506 0.227955 0.644922 0.065476 0.140479 0.149122 0.201205 0.166164 0.347131 0.285501 0.360606 0.256316 0.150766 0.232313 0.199831 0.240681 0.279350 0.280137 0.234308 0.204076 0.321306 0.240310 0.274112 0.462435 0.111425 0.152028 0.067070 0.717501 0.073934 0.141496 0.106745 0.084442 0.658566 0.150247 0.025128 0.967053 0.003585 0.004234 0.006412 0.982989 0.003227 0.007371 0.009588 0.877620 0.002571 0.110221 0.621521 0.355443 0.015669 0.007366 0.002600 0.980275 0.004191 0.012934 0.118773 0.026658 0.783843 0.070725 0.022358 0.822101 0.024684 0.130857 0.713212 0.080912 0.128793 0.077084 0.166568 0.250955 0.107934 0.474544 0.225040 0.222494 0.163301 0.389166 0.268976 0.223206 0.265314 0.242504 0.137052 0.229058 0.148439 0.485451 0.135819 0.304550 0.141994 0.417637 0.272440 0.319501 0.230580 0.177478 Consensus sequence: BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV Reverse complement motif 0.272440 0.230580 0.319501 0.177478 0.417637 0.304550 0.141994 0.135819 0.485451 0.229058 0.148439 0.137052 0.242504 0.223206 0.265314 0.268976 0.389166 0.222494 0.163301 0.225040 0.474544 0.250955 0.107934 0.166568 0.077084 0.080912 0.128793 0.713212 0.022358 0.024684 0.822101 0.130857 0.118773 0.783843 0.026658 0.070725 0.002600 0.004191 0.980275 0.012934 0.007366 0.355443 0.015669 0.621521 0.009588 0.002571 0.877620 0.110221 0.006412 0.003227 0.982989 0.007371 0.025128 0.003585 0.967053 0.004234 0.106745 0.658566 0.084442 0.150247 0.067070 0.073934 0.717501 0.141496 0.274112 0.111425 0.462435 0.152028 0.234308 0.321306 0.204076 0.240310 0.280137 0.240681 0.279350 0.199831 0.232313 0.256316 0.150766 0.360606 0.201205 0.347131 0.166164 0.285501 0.149122 0.065476 0.140479 0.644922 0.104824 0.254506 0.412716 0.227955 Consensus sequence: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB Alignment: BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV -MTGGGASVSYSAGGSAK----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 102 Motif name: C102 Original motif 0.050000 0.410000 0.370000 0.170000 0.040000 0.940000 0.010000 0.010000 0.430000 0.390000 0.010000 0.170000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.198020 0.702970 0.009901 0.089109 0.100000 0.420000 0.470000 0.010000 0.148515 0.405941 0.435644 0.009901 0.009901 0.415842 0.495050 0.079208 0.350000 0.370000 0.230000 0.050000 0.030000 0.910000 0.030000 0.030000 0.030000 0.950000 0.010000 0.010000 0.326733 0.544554 0.009901 0.118812 0.150000 0.310000 0.510000 0.030000 0.090000 0.350000 0.500000 0.060000 Consensus sequence: SCMCCSSSVCCMSS Reserve complement motif 0.090000 0.500000 0.350000 0.060000 0.150000 0.510000 0.310000 0.030000 0.326733 0.009901 0.544554 0.118812 0.030000 0.010000 0.950000 0.010000 0.030000 0.030000 0.910000 0.030000 0.350000 0.230000 0.370000 0.050000 0.009901 0.495050 0.415842 0.079208 0.148515 0.435644 0.405941 0.009901 0.100000 0.470000 0.420000 0.010000 0.198020 0.009901 0.702970 0.089109 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.170000 0.390000 0.010000 0.430000 0.040000 0.010000 0.940000 0.010000 0.050000 0.370000 0.410000 0.170000 Consensus sequence: SSRGGVSSSGGYGS ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 102 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00021 Zfp281_primaryOriginal Motif Original Motif Forward 2 14 0.010999 Species: Mus musculus Original motif 0.201535 0.165213 0.201324 0.431929 0.136153 0.443451 0.179132 0.241264 0.263149 0.555137 0.067983 0.113731 0.142183 0.737634 0.045722 0.074461 0.044982 0.884112 0.045356 0.025549 0.246434 0.590578 0.022655 0.140333 0.123049 0.591257 0.033072 0.252622 0.018153 0.944742 0.010254 0.026851 0.035459 0.953844 0.003988 0.006709 0.020000 0.954344 0.005966 0.019690 0.015299 0.964390 0.006755 0.013557 0.028565 0.936152 0.011660 0.023623 0.300127 0.517309 0.029700 0.152863 0.159063 0.513443 0.051834 0.275660 0.158172 0.647055 0.133256 0.061516 Consensus sequence: DBCCCCCCCCCCMYC Reverse complement motif 0.158172 0.133256 0.647055 0.061516 0.159063 0.051834 0.513443 0.275660 0.300127 0.029700 0.517309 0.152863 0.028565 0.011660 0.936152 0.023623 0.015299 0.006755 0.964390 0.013557 0.020000 0.005966 0.954344 0.019690 0.035459 0.003988 0.953844 0.006709 0.018153 0.010254 0.944742 0.026851 0.123049 0.033072 0.591257 0.252622 0.246434 0.022655 0.590578 0.140333 0.044982 0.045356 0.884112 0.025549 0.142183 0.045722 0.737634 0.074461 0.263149 0.067983 0.555137 0.113731 0.136153 0.179132 0.443451 0.241264 0.431929 0.165213 0.201324 0.201535 Consensus sequence: GKRGGGGGGGGGGBD Alignment: DBCCCCCCCCCCMYC -SCMCCSSSVCCMSS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 7 14 0.020435 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH --SCMCCSSSVCCMSS------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v015681_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 1 14 0.021407 Species: Mus musculus Original motif 0.214165 0.143436 0.372522 0.269876 0.314445 0.406003 0.160351 0.119201 0.137147 0.092924 0.042921 0.727007 0.044121 0.072843 0.051741 0.831295 0.261292 0.324124 0.298498 0.116086 0.258125 0.323243 0.263362 0.155271 0.204557 0.589399 0.107153 0.098891 0.371021 0.244027 0.291102 0.093849 0.096327 0.572718 0.011797 0.319159 0.027282 0.046183 0.844519 0.082016 0.018921 0.012887 0.915917 0.052275 0.364793 0.166722 0.084229 0.384256 0.028216 0.011233 0.951056 0.009495 0.054974 0.004738 0.890377 0.049911 0.006802 0.312915 0.134247 0.546036 0.241289 0.628210 0.104788 0.025713 0.237863 0.302807 0.213018 0.246311 0.349399 0.203220 0.086635 0.360746 0.386634 0.144693 0.246895 0.221779 0.425101 0.354676 0.093374 0.126849 0.060272 0.391320 0.104905 0.443503 0.162090 0.190233 0.227433 0.420244 Consensus sequence: DVTTVVCVYGGHGGYCHHDMYB Reverse complement motif 0.420244 0.190233 0.227433 0.162090 0.443503 0.391320 0.104905 0.060272 0.126849 0.354676 0.093374 0.425101 0.221779 0.144693 0.246895 0.386634 0.360746 0.203220 0.086635 0.349399 0.237863 0.213018 0.302807 0.246311 0.241289 0.104788 0.628210 0.025713 0.546036 0.312915 0.134247 0.006802 0.054974 0.890377 0.004738 0.049911 0.028216 0.951056 0.011233 0.009495 0.384256 0.166722 0.084229 0.364793 0.018921 0.915917 0.012887 0.052275 0.027282 0.844519 0.046183 0.082016 0.096327 0.011797 0.572718 0.319159 0.093849 0.244027 0.291102 0.371021 0.204557 0.107153 0.589399 0.098891 0.258125 0.263362 0.323243 0.155271 0.261292 0.298498 0.324124 0.116086 0.831295 0.072843 0.051741 0.044121 0.727007 0.092924 0.042921 0.137147 0.314445 0.160351 0.406003 0.119201 0.214165 0.372522 0.143436 0.269876 Consensus sequence: VMYDHDGMCCHCCKBGVVAAVH Alignment: VMYDHDGMCCHCCKBGVVAAVH --------SCMCCSSSVCCMSS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 2 14 0.023683 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH --------SCMCCSSSVCCMSS- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00022 Zfp740_primaryOriginal Motif Original Motif Forward 1 14 0.024744 Species: Mus musculus Original motif 0.136946 0.396508 0.135309 0.331236 0.185528 0.417538 0.215409 0.181525 0.171276 0.341901 0.172832 0.313991 0.145641 0.590572 0.146376 0.117412 0.138035 0.660416 0.114016 0.087533 0.222728 0.750532 0.007528 0.019212 0.024633 0.963314 0.001894 0.010159 0.009557 0.979956 0.000642 0.009844 0.010416 0.977424 0.000541 0.011619 0.026401 0.956740 0.001544 0.015314 0.195502 0.755959 0.011060 0.037480 0.491291 0.364785 0.025613 0.118311 0.305153 0.398160 0.071680 0.225008 0.253497 0.232647 0.213246 0.300610 0.156964 0.297876 0.144683 0.400477 0.179549 0.292514 0.319462 0.208475 Consensus sequence: HVBCCCCCCCCMHHHB Reverse complement motif 0.179549 0.319462 0.292514 0.208475 0.400477 0.297876 0.144683 0.156964 0.300610 0.232647 0.213246 0.253497 0.305153 0.071680 0.398160 0.225008 0.118311 0.364785 0.025613 0.491291 0.195502 0.011060 0.755959 0.037480 0.026401 0.001544 0.956740 0.015314 0.010416 0.000541 0.977424 0.011619 0.009557 0.000642 0.979956 0.009844 0.024633 0.001894 0.963314 0.010159 0.222728 0.007528 0.750532 0.019212 0.138035 0.114016 0.660416 0.087533 0.145641 0.146376 0.590572 0.117412 0.171276 0.172832 0.341901 0.313991 0.185528 0.215409 0.417538 0.181525 0.136946 0.135309 0.396508 0.331236 Consensus sequence: BHHDYGGGGGGGGBVD Alignment: HVBCCCCCCCCMHHHB SCMCCSSSVCCMSS-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 103 Motif name: C103 Original motif 0.430000 0.050000 0.440000 0.080000 0.450000 0.060000 0.420000 0.070000 0.820000 0.010000 0.010000 0.160000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.470000 0.050000 0.450000 0.030000 0.550000 0.270000 0.170000 0.010000 0.742574 0.009901 0.108911 0.138614 0.010000 0.810000 0.170000 0.010000 0.148515 0.831683 0.009901 0.009901 0.029703 0.425743 0.069307 0.475248 0.128713 0.009901 0.029703 0.831683 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.070000 0.430000 0.040000 0.460000 0.080000 0.440000 0.020000 0.460000 Consensus sequence: RRAGRAACCYTGYY Reserve complement motif 0.460000 0.440000 0.020000 0.080000 0.460000 0.430000 0.040000 0.070000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.831683 0.009901 0.029703 0.128713 0.475248 0.425743 0.069307 0.029703 0.148515 0.009901 0.831683 0.009901 0.010000 0.170000 0.810000 0.010000 0.138614 0.009901 0.108911 0.742574 0.010000 0.270000 0.170000 0.550000 0.030000 0.050000 0.450000 0.470000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.160000 0.010000 0.010000 0.820000 0.070000 0.060000 0.420000 0.450000 0.430000 0.440000 0.050000 0.080000 Consensus sequence: MMCAMGGTTKCTKM ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 103 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00098 Rfx3_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 9 14 0.038712 Species: Mus musculus Original motif 0.218345 0.231533 0.152528 0.397594 0.264604 0.126115 0.320860 0.288421 0.117304 0.186844 0.172946 0.522906 0.111929 0.277908 0.409084 0.201079 0.343319 0.311376 0.123612 0.221692 0.193354 0.374280 0.157338 0.275028 0.166348 0.578991 0.130872 0.123789 0.006937 0.931183 0.046809 0.015072 0.255581 0.289587 0.125513 0.329319 0.002582 0.012615 0.002782 0.982021 0.850584 0.007973 0.140639 0.000803 0.037792 0.002285 0.957277 0.002646 0.009414 0.921481 0.001636 0.067469 0.943403 0.000980 0.042401 0.013216 0.991166 0.002931 0.003540 0.002364 0.003651 0.987110 0.001106 0.008133 0.208873 0.369705 0.319129 0.102292 0.322535 0.186617 0.374187 0.116660 0.326738 0.179486 0.226374 0.267402 0.299697 0.185329 0.133025 0.381949 0.300824 0.266836 0.096437 0.335904 0.418443 0.191068 0.127183 0.263306 0.386727 0.204062 0.126050 0.283161 Consensus sequence: HDTBHHCCHTAGCAACVVDHHHH Reverse complement motif 0.283161 0.204062 0.126050 0.386727 0.263306 0.191068 0.127183 0.418443 0.335904 0.266836 0.096437 0.300824 0.381949 0.185329 0.133025 0.299697 0.267402 0.179486 0.226374 0.326738 0.322535 0.374187 0.186617 0.116660 0.208873 0.319129 0.369705 0.102292 0.003651 0.001106 0.987110 0.008133 0.002364 0.002931 0.003540 0.991166 0.013216 0.000980 0.042401 0.943403 0.009414 0.001636 0.921481 0.067469 0.037792 0.957277 0.002285 0.002646 0.000803 0.007973 0.140639 0.850584 0.982021 0.012615 0.002782 0.002582 0.329319 0.289587 0.125513 0.255581 0.006937 0.046809 0.931183 0.015072 0.166348 0.130872 0.578991 0.123789 0.193354 0.157338 0.374280 0.275028 0.221692 0.311376 0.123612 0.343319 0.111929 0.409084 0.277908 0.201079 0.522906 0.186844 0.172946 0.117304 0.264604 0.320860 0.126115 0.288421 0.397594 0.231533 0.152528 0.218345 Consensus sequence: HHHHDVVGTTGCTAHGGDHBAHH Alignment: HHHHDVVGTTGCTAHGGDHBAHH -MMCAMGGTTKCTKM-------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00036 Myf6_primary Original Motif Original Motif Forward 1 14 0.040530 Species: Mus musculus Original motif 0.249543 0.203739 0.394131 0.152587 0.349361 0.204136 0.321767 0.124736 0.386930 0.174655 0.250284 0.188131 0.173937 0.233501 0.412360 0.180201 0.663624 0.037653 0.264216 0.034507 0.717265 0.040761 0.206656 0.035318 0.004176 0.985948 0.003219 0.006657 0.967612 0.005543 0.008604 0.018241 0.080781 0.089857 0.746009 0.083354 0.019831 0.270961 0.409808 0.299401 0.019877 0.026996 0.014022 0.939105 0.005169 0.007980 0.978334 0.008518 0.115710 0.200514 0.226485 0.457291 0.032392 0.527196 0.128372 0.312041 0.202049 0.384912 0.106488 0.306551 0.181994 0.192975 0.425582 0.199448 Consensus sequence: VVDBAACAGBTGBYHB Reverse complement motif 0.181994 0.425582 0.192975 0.199448 0.202049 0.106488 0.384912 0.306551 0.032392 0.128372 0.527196 0.312041 0.457291 0.200514 0.226485 0.115710 0.005169 0.978334 0.007980 0.008518 0.939105 0.026996 0.014022 0.019877 0.019831 0.409808 0.270961 0.299401 0.080781 0.746009 0.089857 0.083354 0.018241 0.005543 0.008604 0.967612 0.004176 0.003219 0.985948 0.006657 0.035318 0.040761 0.206656 0.717265 0.034507 0.037653 0.264216 0.663624 0.173937 0.412360 0.233501 0.180201 0.188131 0.174655 0.250284 0.386930 0.124736 0.204136 0.321767 0.349361 0.249543 0.394131 0.203739 0.152587 Consensus sequence: BDKVCABCTGTTBDBV Alignment: VVDBAACAGBTGBYHB RRAGRAACCYTGYY-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00098 Rfx3_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 5 14 0.040791 Species: Mus musculus Original motif 0.314514 0.275352 0.257617 0.152518 0.126939 0.598294 0.130576 0.144192 0.102265 0.155334 0.177957 0.564445 0.129288 0.282678 0.326990 0.261044 0.318166 0.227823 0.175681 0.278330 0.109019 0.380838 0.278328 0.231815 0.226145 0.289206 0.291300 0.193348 0.035863 0.844339 0.072582 0.047216 0.223793 0.187244 0.088092 0.500871 0.039800 0.029681 0.026201 0.904317 0.298298 0.032147 0.654746 0.014809 0.014729 0.022023 0.944826 0.018422 0.485114 0.004925 0.013785 0.496176 0.035708 0.020381 0.240804 0.703108 0.951152 0.012738 0.017886 0.018224 0.023713 0.944394 0.009538 0.022355 0.291067 0.385205 0.232388 0.091339 0.340334 0.199588 0.311526 0.148552 0.198713 0.472138 0.178319 0.150830 0.321155 0.269932 0.311301 0.097612 0.412646 0.195252 0.231950 0.160152 0.297134 0.180928 0.250400 0.271538 0.151169 0.305386 0.358574 0.184871 Consensus sequence: VCTBHBVCTTGGWTACVVVVVDB Reverse complement motif 0.151169 0.358574 0.305386 0.184871 0.271538 0.180928 0.250400 0.297134 0.160152 0.195252 0.231950 0.412646 0.097612 0.269932 0.311301 0.321155 0.198713 0.178319 0.472138 0.150830 0.148552 0.199588 0.311526 0.340334 0.291067 0.232388 0.385205 0.091339 0.023713 0.009538 0.944394 0.022355 0.018224 0.012738 0.017886 0.951152 0.703108 0.020381 0.240804 0.035708 0.496176 0.004925 0.013785 0.485114 0.014729 0.944826 0.022023 0.018422 0.298298 0.654746 0.032147 0.014809 0.904317 0.029681 0.026201 0.039800 0.500871 0.187244 0.088092 0.223793 0.035863 0.072582 0.844339 0.047216 0.226145 0.291300 0.289206 0.193348 0.109019 0.278328 0.380838 0.231815 0.278330 0.227823 0.175681 0.318166 0.129288 0.326990 0.282678 0.261044 0.564445 0.155334 0.177957 0.102265 0.126939 0.130576 0.598294 0.144192 0.152518 0.275352 0.257617 0.314514 Consensus sequence: BDBBVBVGTAWCCAAGVBHBAGB Alignment: BDBBVBVGTAWCCAAGVBHBAGB ----RRAGRAACCYTGYY----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00056 Rfx4_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 1 14 0.041466 Species: Mus musculus Original motif 0.241055 0.181590 0.146782 0.430573 0.334692 0.284570 0.183858 0.196880 0.149993 0.369289 0.267268 0.213450 0.022041 0.923939 0.029272 0.024748 0.270991 0.387582 0.133916 0.207510 0.064065 0.026889 0.060947 0.848098 0.502352 0.014409 0.481032 0.002206 0.004704 0.003480 0.984761 0.007055 0.362619 0.002225 0.004187 0.630969 0.008959 0.011532 0.043287 0.936222 0.952238 0.009996 0.017571 0.020195 0.008741 0.976874 0.006479 0.007906 0.219429 0.353879 0.330699 0.095994 0.234527 0.265601 0.292784 0.207089 0.296592 0.268334 0.216930 0.218144 Consensus sequence: HHBCHTRGWTACVVH Reverse complement motif 0.218144 0.268334 0.216930 0.296592 0.234527 0.292784 0.265601 0.207089 0.219429 0.330699 0.353879 0.095994 0.008741 0.006479 0.976874 0.007906 0.020195 0.009996 0.017571 0.952238 0.936222 0.011532 0.043287 0.008959 0.630969 0.002225 0.004187 0.362619 0.004704 0.984761 0.003480 0.007055 0.002206 0.014409 0.481032 0.502352 0.848098 0.026889 0.060947 0.064065 0.270991 0.133916 0.387582 0.207510 0.022041 0.029272 0.923939 0.024748 0.149993 0.267268 0.369289 0.213450 0.196880 0.284570 0.183858 0.334692 0.430573 0.181590 0.146782 0.241055 Consensus sequence: HVVGTAWCKADGBHH Alignment: HVVGTAWCKADGBHH -MMCAMGGTTKCTKM ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00526 Foxn1_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 6 14 0.042102 Species: Mus musculus Original motif 0.477863 0.106306 0.184102 0.231729 0.304951 0.149020 0.361418 0.184612 0.548996 0.056128 0.348902 0.045974 0.385727 0.477782 0.086218 0.050273 0.409556 0.232265 0.173851 0.184328 0.174550 0.312880 0.307123 0.205448 0.850398 0.047204 0.041665 0.060734 0.141234 0.548534 0.142230 0.168002 0.059462 0.026354 0.892948 0.021236 0.053714 0.870297 0.028935 0.047055 0.086273 0.069147 0.805284 0.039296 0.033781 0.573881 0.034115 0.358223 0.035191 0.079663 0.824970 0.060176 0.051830 0.862631 0.019359 0.066180 0.178685 0.015738 0.762485 0.043092 0.058988 0.042615 0.017608 0.880789 0.202382 0.173360 0.284095 0.340163 0.098493 0.234651 0.506524 0.160333 0.109087 0.336204 0.250510 0.304198 0.130945 0.250843 0.177122 0.441090 0.353830 0.138838 0.162784 0.344548 0.114290 0.417163 0.160662 0.307885 Consensus sequence: DDRMHBACGCGYGCGTDGBBDB Reverse complement motif 0.114290 0.160662 0.417163 0.307885 0.344548 0.138838 0.162784 0.353830 0.441090 0.250843 0.177122 0.130945 0.109087 0.250510 0.336204 0.304198 0.098493 0.506524 0.234651 0.160333 0.340163 0.173360 0.284095 0.202382 0.880789 0.042615 0.017608 0.058988 0.178685 0.762485 0.015738 0.043092 0.051830 0.019359 0.862631 0.066180 0.035191 0.824970 0.079663 0.060176 0.033781 0.034115 0.573881 0.358223 0.086273 0.805284 0.069147 0.039296 0.053714 0.028935 0.870297 0.047055 0.059462 0.892948 0.026354 0.021236 0.141234 0.142230 0.548534 0.168002 0.060734 0.047204 0.041665 0.850398 0.174550 0.307123 0.312880 0.205448 0.184328 0.232265 0.173851 0.409556 0.385727 0.086218 0.477782 0.050273 0.045974 0.056128 0.348902 0.548996 0.304951 0.361418 0.149020 0.184612 0.231729 0.106306 0.184102 0.477863 Consensus sequence: BDVBCDACGCKCGCGTBHRKHD Alignment: DDRMHBACGCGYGCGTDGBBDB ---MMCAMGGTTKCTKM----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 104 Motif name: C104 Original motif 0.060000 0.410000 0.520000 0.010000 0.069307 0.386139 0.524752 0.019802 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.198020 0.524752 0.138614 0.138614 0.110000 0.510000 0.080000 0.300000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.180000 0.640000 0.130000 0.050000 0.079208 0.841584 0.009901 0.069307 0.227723 0.544554 0.009901 0.217822 0.277228 0.138614 0.445545 0.138614 0.160000 0.700000 0.130000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.540000 0.440000 0.010000 0.040000 0.570000 0.370000 0.020000 Consensus sequence: SSCCYCCCCDCCSS Reserve complement motif 0.040000 0.370000 0.570000 0.020000 0.010000 0.440000 0.540000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.160000 0.130000 0.700000 0.010000 0.277228 0.445545 0.138614 0.138614 0.227723 0.009901 0.544554 0.217822 0.079208 0.009901 0.841584 0.069307 0.180000 0.130000 0.640000 0.050000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.110000 0.080000 0.510000 0.300000 0.198020 0.138614 0.524752 0.138614 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.069307 0.524752 0.386139 0.019802 0.060000 0.520000 0.410000 0.010000 Consensus sequence: SSGGHGGGGKGGSS ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 104 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 5 14 0.021266 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH ----SSCCYCCCCDCCSS---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00022 Zfp740_primaryReverse Complement Reverse Complement Forward 1 14 0.024109 Species: Mus musculus Original motif 0.136946 0.396508 0.135309 0.331236 0.185528 0.417538 0.215409 0.181525 0.171276 0.341901 0.172832 0.313991 0.145641 0.590572 0.146376 0.117412 0.138035 0.660416 0.114016 0.087533 0.222728 0.750532 0.007528 0.019212 0.024633 0.963314 0.001894 0.010159 0.009557 0.979956 0.000642 0.009844 0.010416 0.977424 0.000541 0.011619 0.026401 0.956740 0.001544 0.015314 0.195502 0.755959 0.011060 0.037480 0.491291 0.364785 0.025613 0.118311 0.305153 0.398160 0.071680 0.225008 0.253497 0.232647 0.213246 0.300610 0.156964 0.297876 0.144683 0.400477 0.179549 0.292514 0.319462 0.208475 Consensus sequence: HVBCCCCCCCCMHHHB Reverse complement motif 0.179549 0.319462 0.292514 0.208475 0.400477 0.297876 0.144683 0.156964 0.300610 0.232647 0.213246 0.253497 0.305153 0.071680 0.398160 0.225008 0.118311 0.364785 0.025613 0.491291 0.195502 0.011060 0.755959 0.037480 0.026401 0.001544 0.956740 0.015314 0.010416 0.000541 0.977424 0.011619 0.009557 0.000642 0.979956 0.009844 0.024633 0.001894 0.963314 0.010159 0.222728 0.007528 0.750532 0.019212 0.138035 0.114016 0.660416 0.087533 0.145641 0.146376 0.590572 0.117412 0.171276 0.172832 0.341901 0.313991 0.185528 0.215409 0.417538 0.181525 0.136946 0.135309 0.396508 0.331236 Consensus sequence: BHHDYGGGGGGGGBVD Alignment: BHHDYGGGGGGGGBVD SSGGHGGGGKGGSS-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00021 Zfp281_primaryOriginal Motif Original Motif Backward 2 14 0.026142 Species: Mus musculus Original motif 0.201535 0.165213 0.201324 0.431929 0.136153 0.443451 0.179132 0.241264 0.263149 0.555137 0.067983 0.113731 0.142183 0.737634 0.045722 0.074461 0.044982 0.884112 0.045356 0.025549 0.246434 0.590578 0.022655 0.140333 0.123049 0.591257 0.033072 0.252622 0.018153 0.944742 0.010254 0.026851 0.035459 0.953844 0.003988 0.006709 0.020000 0.954344 0.005966 0.019690 0.015299 0.964390 0.006755 0.013557 0.028565 0.936152 0.011660 0.023623 0.300127 0.517309 0.029700 0.152863 0.159063 0.513443 0.051834 0.275660 0.158172 0.647055 0.133256 0.061516 Consensus sequence: DBCCCCCCCCCCMYC Reverse complement motif 0.158172 0.133256 0.647055 0.061516 0.159063 0.051834 0.513443 0.275660 0.300127 0.029700 0.517309 0.152863 0.028565 0.011660 0.936152 0.023623 0.015299 0.006755 0.964390 0.013557 0.020000 0.005966 0.954344 0.019690 0.035459 0.003988 0.953844 0.006709 0.018153 0.010254 0.944742 0.026851 0.123049 0.033072 0.591257 0.252622 0.246434 0.022655 0.590578 0.140333 0.044982 0.045356 0.884112 0.025549 0.142183 0.045722 0.737634 0.074461 0.263149 0.067983 0.555137 0.113731 0.136153 0.179132 0.443451 0.241264 0.431929 0.165213 0.201324 0.201535 Consensus sequence: GKRGGGGGGGGGGBD Alignment: DBCCCCCCCCCCMYC SSCCYCCCCDCCSS- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00043 Bcl6b_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 3 14 0.026456 Species: Mus musculus Original motif 0.316572 0.278382 0.152556 0.252490 0.167141 0.257034 0.259894 0.315931 0.175523 0.325956 0.259996 0.238525 0.165052 0.385677 0.239449 0.209822 0.069489 0.782718 0.072454 0.075339 0.049943 0.800636 0.031988 0.117433 0.223382 0.060306 0.552691 0.163621 0.072944 0.818252 0.034406 0.074398 0.070535 0.845127 0.062712 0.021626 0.031035 0.859354 0.055424 0.054187 0.063668 0.798503 0.067274 0.070554 0.348488 0.030697 0.197179 0.423636 0.307220 0.256470 0.181009 0.255301 0.460933 0.285057 0.090258 0.163752 0.315798 0.228431 0.171135 0.284637 0.374527 0.268328 0.198810 0.158335 Consensus sequence: HBBBCCGCCCCWHHHV Reverse complement motif 0.158335 0.268328 0.198810 0.374527 0.284637 0.228431 0.171135 0.315798 0.163752 0.285057 0.090258 0.460933 0.255301 0.256470 0.181009 0.307220 0.423636 0.030697 0.197179 0.348488 0.063668 0.067274 0.798503 0.070554 0.031035 0.055424 0.859354 0.054187 0.070535 0.062712 0.845127 0.021626 0.072944 0.034406 0.818252 0.074398 0.223382 0.552691 0.060306 0.163621 0.049943 0.031988 0.800636 0.117433 0.069489 0.072454 0.782718 0.075339 0.165052 0.239449 0.385677 0.209822 0.175523 0.259996 0.325956 0.238525 0.315931 0.257034 0.259894 0.167141 0.252490 0.278382 0.152556 0.316572 Consensus sequence: BHHHWGGGGCGGBBVH Alignment: HBBBCCGCCCCWHHHV --SSCCYCCCCDCCSS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 8 14 0.027575 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH -------SSCCYCCCCDCCSS-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 105 Motif name: C105 Original motif 0.009901 0.138614 0.039604 0.811881 0.019802 0.158416 0.623762 0.198020 0.009901 0.702970 0.158416 0.128713 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.069307 0.069307 0.306931 0.554455 0.320000 0.530000 0.140000 0.010000 0.100000 0.400000 0.170000 0.330000 0.010000 0.540000 0.350000 0.100000 0.059406 0.811881 0.118812 0.009901 0.010000 0.770000 0.010000 0.210000 0.009901 0.089109 0.465347 0.435644 0.360000 0.430000 0.130000 0.080000 0.010000 0.680000 0.190000 0.120000 0.019802 0.722772 0.009901 0.247525 0.237624 0.495050 0.148515 0.118812 0.772277 0.108911 0.079208 0.039604 Consensus sequence: TGCCKMBSCCKMCCVA Reserve complement motif 0.039604 0.108911 0.079208 0.772277 0.237624 0.148515 0.495050 0.118812 0.019802 0.009901 0.722772 0.247525 0.010000 0.190000 0.680000 0.120000 0.360000 0.130000 0.430000 0.080000 0.009901 0.465347 0.089109 0.435644 0.010000 0.010000 0.770000 0.210000 0.059406 0.118812 0.811881 0.009901 0.010000 0.350000 0.540000 0.100000 0.100000 0.170000 0.400000 0.330000 0.320000 0.140000 0.530000 0.010000 0.554455 0.069307 0.306931 0.069307 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.009901 0.158416 0.702970 0.128713 0.019802 0.623762 0.158416 0.198020 0.811881 0.138614 0.039604 0.009901 Consensus sequence: TVGGRYGGSBRRGGCA ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 105 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 2 16 0.039868 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB -TVGGRYGGSBRRGGCA------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 3 16 0.041306 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK --TVGGRYGGSBRRGGCA---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 2 16 0.044591 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV ------TVGGRYGGSBRRGGCA- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00400 Zif268 Original Motif Original Motif Forward 2 16 0.047943 Species: Mus musculus Original motif 0.104824 0.412716 0.254506 0.227955 0.644922 0.065476 0.140479 0.149122 0.201205 0.166164 0.347131 0.285501 0.360606 0.256316 0.150766 0.232313 0.199831 0.240681 0.279350 0.280137 0.234308 0.204076 0.321306 0.240310 0.274112 0.462435 0.111425 0.152028 0.067070 0.717501 0.073934 0.141496 0.106745 0.084442 0.658566 0.150247 0.025128 0.967053 0.003585 0.004234 0.006412 0.982989 0.003227 0.007371 0.009588 0.877620 0.002571 0.110221 0.621521 0.355443 0.015669 0.007366 0.002600 0.980275 0.004191 0.012934 0.118773 0.026658 0.783843 0.070725 0.022358 0.822101 0.024684 0.130857 0.713212 0.080912 0.128793 0.077084 0.166568 0.250955 0.107934 0.474544 0.225040 0.222494 0.163301 0.389166 0.268976 0.223206 0.265314 0.242504 0.137052 0.229058 0.148439 0.485451 0.135819 0.304550 0.141994 0.417637 0.272440 0.319501 0.230580 0.177478 Consensus sequence: BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV Reverse complement motif 0.272440 0.230580 0.319501 0.177478 0.417637 0.304550 0.141994 0.135819 0.485451 0.229058 0.148439 0.137052 0.242504 0.223206 0.265314 0.268976 0.389166 0.222494 0.163301 0.225040 0.474544 0.250955 0.107934 0.166568 0.077084 0.080912 0.128793 0.713212 0.022358 0.024684 0.822101 0.130857 0.118773 0.783843 0.026658 0.070725 0.002600 0.004191 0.980275 0.012934 0.007366 0.355443 0.015669 0.621521 0.009588 0.002571 0.877620 0.110221 0.006412 0.003227 0.982989 0.007371 0.025128 0.003585 0.967053 0.004234 0.106745 0.658566 0.084442 0.150247 0.067070 0.073934 0.717501 0.141496 0.274112 0.111425 0.462435 0.152028 0.234308 0.321306 0.204076 0.240310 0.280137 0.240681 0.279350 0.199831 0.232313 0.256316 0.150766 0.360606 0.201205 0.347131 0.166164 0.285501 0.149122 0.065476 0.140479 0.644922 0.104824 0.254506 0.412716 0.227955 Consensus sequence: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB Alignment: BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV -TGCCKMBSCCKMCCVA------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00000 Smad3_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 2 16 0.048432 Species: Mus musculus Original motif 0.150668 0.131779 0.245665 0.471887 0.316817 0.287314 0.150829 0.245040 0.256473 0.409066 0.109700 0.224761 0.210646 0.220222 0.345010 0.224122 0.166679 0.508939 0.081676 0.242705 0.049351 0.759380 0.088489 0.102780 0.047598 0.785546 0.121957 0.044898 0.004606 0.944933 0.034696 0.015764 0.040252 0.050652 0.890382 0.018713 0.003038 0.913699 0.022449 0.060814 0.028672 0.941477 0.012276 0.017575 0.635243 0.139731 0.110495 0.114531 0.240016 0.385948 0.182848 0.191188 0.210430 0.274127 0.085171 0.430272 0.088118 0.454598 0.208989 0.248295 0.181269 0.265028 0.149023 0.404680 0.101070 0.252682 0.368542 0.277706 Consensus sequence: DHHBCCCCGCCAHHBHB Reverse complement motif 0.101070 0.368542 0.252682 0.277706 0.404680 0.265028 0.149023 0.181269 0.088118 0.208989 0.454598 0.248295 0.430272 0.274127 0.085171 0.210430 0.240016 0.182848 0.385948 0.191188 0.114531 0.139731 0.110495 0.635243 0.028672 0.012276 0.941477 0.017575 0.003038 0.022449 0.913699 0.060814 0.040252 0.890382 0.050652 0.018713 0.004606 0.034696 0.944933 0.015764 0.047598 0.121957 0.785546 0.044898 0.049351 0.088489 0.759380 0.102780 0.166679 0.081676 0.508939 0.242705 0.210646 0.345010 0.220222 0.224122 0.256473 0.109700 0.409066 0.224761 0.245040 0.287314 0.150829 0.316817 0.471887 0.131779 0.245665 0.150668 Consensus sequence: BHBHDTGGCGGGGBDHD Alignment: BHBHDTGGCGGGGBDHD TVGGRYGGSBRRGGCA- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 106 Motif name: C106 Original motif 0.470000 0.460000 0.030000 0.040000 0.029703 0.514851 0.445545 0.009901 0.099010 0.009901 0.881188 0.009901 0.010000 0.910000 0.070000 0.010000 0.732673 0.009901 0.148515 0.108911 0.128713 0.069307 0.792079 0.009901 0.495050 0.039604 0.019802 0.445545 0.190000 0.010000 0.790000 0.010000 0.069307 0.178218 0.722772 0.029703 0.010000 0.940000 0.040000 0.010000 0.683168 0.108911 0.168317 0.039604 0.030000 0.390000 0.570000 0.010000 0.099010 0.099010 0.366337 0.435644 Consensus sequence: MSGCAGWGGCASK Reserve complement motif 0.435644 0.099010 0.366337 0.099010 0.030000 0.570000 0.390000 0.010000 0.039604 0.108911 0.168317 0.683168 0.010000 0.040000 0.940000 0.010000 0.069307 0.722772 0.178218 0.029703 0.190000 0.790000 0.010000 0.010000 0.445545 0.039604 0.019802 0.495050 0.128713 0.792079 0.069307 0.009901 0.108911 0.009901 0.148515 0.732673 0.010000 0.070000 0.910000 0.010000 0.099010 0.881188 0.009901 0.009901 0.029703 0.445545 0.514851 0.009901 0.040000 0.460000 0.030000 0.470000 Consensus sequence: RSTGCCWCTGCSY ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 106 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00031 Zbtb3_primary Reverse Complement Original Motif Forward 1 13 0.022116 Species: Mus musculus Original motif 0.401190 0.144405 0.268531 0.185874 0.430224 0.168519 0.221247 0.180011 0.172575 0.268499 0.274136 0.284789 0.150971 0.297110 0.290868 0.261051 0.133421 0.282842 0.434718 0.149019 0.042798 0.941105 0.001785 0.014312 0.890788 0.002551 0.103316 0.003345 0.001887 0.951368 0.043722 0.003023 0.011633 0.002218 0.002269 0.983880 0.003597 0.003728 0.984819 0.007856 0.002946 0.903520 0.072457 0.021077 0.908487 0.057072 0.018256 0.016185 0.076237 0.329864 0.228896 0.365003 0.144926 0.162981 0.177370 0.514722 0.124970 0.327876 0.295814 0.251341 0.144592 0.313887 0.301912 0.239609 0.108463 0.241747 0.350296 0.299494 Consensus sequence: DDBBBCACTGCABTBBB Reverse complement motif 0.108463 0.350296 0.241747 0.299494 0.144592 0.301912 0.313887 0.239609 0.124970 0.295814 0.327876 0.251341 0.514722 0.162981 0.177370 0.144926 0.365003 0.329864 0.228896 0.076237 0.016185 0.057072 0.018256 0.908487 0.002946 0.072457 0.903520 0.021077 0.003597 0.984819 0.003728 0.007856 0.983880 0.002218 0.002269 0.011633 0.001887 0.043722 0.951368 0.003023 0.003345 0.002551 0.103316 0.890788 0.042798 0.001785 0.941105 0.014312 0.133421 0.434718 0.282842 0.149019 0.150971 0.290868 0.297110 0.261051 0.284789 0.268499 0.274136 0.172575 0.180011 0.168519 0.221247 0.430224 0.185874 0.144405 0.268531 0.401190 Consensus sequence: BBBAVTGCAGTGBBVDD Alignment: BBBAVTGCAGTGBBVDD RSTGCCWCTGCSY---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00010 Tcfap2b_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 3 13 0.026668 Species: Mus musculus Original motif 0.325895 0.099601 0.286848 0.287657 0.177095 0.035123 0.260876 0.526906 0.344850 0.211117 0.015725 0.428308 0.128363 0.059965 0.777560 0.034112 0.048072 0.881624 0.024842 0.045462 0.072628 0.872650 0.011271 0.043451 0.057165 0.162157 0.347719 0.432959 0.015437 0.448405 0.428425 0.107733 0.446877 0.336374 0.099940 0.116809 0.090955 0.023004 0.848240 0.037801 0.040151 0.015072 0.901303 0.043473 0.087378 0.817019 0.027876 0.067727 0.532482 0.021469 0.266773 0.179276 0.325017 0.271661 0.138860 0.264463 0.203625 0.179490 0.143885 0.473001 Consensus sequence: DTWGCCKSMGGCRHH Reverse complement motif 0.473001 0.179490 0.143885 0.203625 0.264463 0.271661 0.138860 0.325017 0.179276 0.021469 0.266773 0.532482 0.087378 0.027876 0.817019 0.067727 0.040151 0.901303 0.015072 0.043473 0.090955 0.848240 0.023004 0.037801 0.116809 0.336374 0.099940 0.446877 0.015437 0.428425 0.448405 0.107733 0.432959 0.162157 0.347719 0.057165 0.072628 0.011271 0.872650 0.043451 0.048072 0.024842 0.881624 0.045462 0.128363 0.777560 0.059965 0.034112 0.428308 0.211117 0.015725 0.344850 0.526906 0.035123 0.260876 0.177095 0.287657 0.099601 0.286848 0.325895 Consensus sequence: HHKGCCYSRGGCWAD Alignment: HHKGCCYSRGGCWAD RSTGCCWCTGCSY-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00527 Foxn4_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 2 13 0.027361 Species: Mus musculus Original motif 0.298336 0.418632 0.208054 0.074978 0.289907 0.015608 0.457100 0.237385 0.273583 0.077889 0.107860 0.540668 0.184954 0.161611 0.384390 0.269045 0.521826 0.156340 0.089019 0.232815 0.356716 0.131104 0.394857 0.117323 0.266669 0.108765 0.505273 0.119293 0.020778 0.047199 0.919524 0.012500 0.948536 0.018775 0.008113 0.024576 0.010822 0.964042 0.014701 0.010434 0.007428 0.019505 0.966351 0.006717 0.010025 0.975678 0.008648 0.005649 0.043796 0.120935 0.742979 0.092289 0.008252 0.250704 0.541132 0.199913 0.474428 0.044681 0.134430 0.346461 0.146597 0.421317 0.143166 0.288920 0.020540 0.181479 0.553811 0.244170 0.129612 0.173360 0.535219 0.161808 0.506084 0.158156 0.130983 0.204776 0.054872 0.103043 0.545792 0.296293 0.389882 0.171037 0.164162 0.274918 0.225861 0.314031 0.288872 0.171237 Consensus sequence: VDWDARRGACGCGGWHGGAKHV Reverse complement motif 0.225861 0.288872 0.314031 0.171237 0.274918 0.171037 0.164162 0.389882 0.054872 0.545792 0.103043 0.296293 0.204776 0.158156 0.130983 0.506084 0.129612 0.535219 0.173360 0.161808 0.020540 0.553811 0.181479 0.244170 0.146597 0.143166 0.421317 0.288920 0.346461 0.044681 0.134430 0.474428 0.008252 0.541132 0.250704 0.199913 0.043796 0.742979 0.120935 0.092289 0.010025 0.008648 0.975678 0.005649 0.007428 0.966351 0.019505 0.006717 0.010822 0.014701 0.964042 0.010434 0.024576 0.018775 0.008113 0.948536 0.020778 0.919524 0.047199 0.012500 0.266669 0.505273 0.108765 0.119293 0.356716 0.394857 0.131104 0.117323 0.232815 0.156340 0.089019 0.521826 0.184954 0.384390 0.161611 0.269045 0.540668 0.077889 0.107860 0.273583 0.289907 0.457100 0.015608 0.237385 0.298336 0.208054 0.418632 0.074978 Consensus sequence: VHYTCCDWCCGCGTCMMTHWHV Alignment: VDWDARRGACGCGGWHGGAKHV --------MSGCAGWGGCASK- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00031 Zbtb3_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 3 13 0.028269 Species: Mus musculus Original motif 0.110412 0.519910 0.162398 0.207280 0.470593 0.172893 0.115202 0.241311 0.467126 0.160175 0.227365 0.145334 0.196112 0.169855 0.079068 0.554965 0.198275 0.671393 0.026094 0.104237 0.793465 0.046739 0.110258 0.049538 0.058204 0.867549 0.045603 0.028645 0.079471 0.027484 0.025248 0.867797 0.032277 0.065893 0.827417 0.074413 0.080553 0.119144 0.585050 0.215253 0.105106 0.470208 0.170921 0.253765 0.690158 0.033925 0.171121 0.104796 0.299543 0.155890 0.362586 0.181981 0.343375 0.213360 0.180067 0.263198 0.364819 0.149053 0.181128 0.305000 0.247818 0.143948 0.217882 0.390352 Consensus sequence: CHVTCACTGGBADHDD Reverse complement motif 0.390352 0.143948 0.217882 0.247818 0.305000 0.149053 0.181128 0.364819 0.263198 0.213360 0.180067 0.343375 0.299543 0.362586 0.155890 0.181981 0.104796 0.033925 0.171121 0.690158 0.105106 0.170921 0.470208 0.253765 0.080553 0.585050 0.119144 0.215253 0.032277 0.827417 0.065893 0.074413 0.867797 0.027484 0.025248 0.079471 0.058204 0.045603 0.867549 0.028645 0.049538 0.046739 0.110258 0.793465 0.198275 0.026094 0.671393 0.104237 0.554965 0.169855 0.079068 0.196112 0.145334 0.160175 0.227365 0.467126 0.241311 0.172893 0.115202 0.470593 0.110412 0.162398 0.519910 0.207280 Consensus sequence: DDHHTBCCAGTGABHG Alignment: DDHHTBCCAGTGABHG --RSTGCCWCTGCSY- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00036 Myf6_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 3 13 0.028902 Species: Mus musculus Original motif 0.345146 0.261059 0.273931 0.119863 0.222137 0.272923 0.332024 0.172916 0.269602 0.278951 0.245221 0.206225 0.485406 0.144018 0.294421 0.076155 0.577731 0.270563 0.078955 0.072752 0.070027 0.750816 0.062819 0.116339 0.685018 0.105175 0.137110 0.072697 0.162574 0.071041 0.638464 0.127921 0.343240 0.389633 0.206226 0.060900 0.080169 0.790323 0.114211 0.015297 0.167035 0.201642 0.462780 0.168543 0.114383 0.664317 0.166143 0.055157 0.392143 0.114475 0.340085 0.153298 0.208147 0.577473 0.142694 0.071686 0.168632 0.563135 0.066181 0.202052 Consensus sequence: VVVRACAGVCBCDCC Reverse complement motif 0.168632 0.066181 0.563135 0.202052 0.208147 0.142694 0.577473 0.071686 0.153298 0.114475 0.340085 0.392143 0.114383 0.166143 0.664317 0.055157 0.167035 0.462780 0.201642 0.168543 0.080169 0.114211 0.790323 0.015297 0.343240 0.206226 0.389633 0.060900 0.162574 0.638464 0.071041 0.127921 0.072697 0.105175 0.137110 0.685018 0.070027 0.062819 0.750816 0.116339 0.072752 0.270563 0.078955 0.577731 0.076155 0.144018 0.294421 0.485406 0.269602 0.245221 0.278951 0.206225 0.222137 0.332024 0.272923 0.172916 0.119863 0.261059 0.273931 0.345146 Consensus sequence: GGDGBGVCTGTKVVB Alignment: GGDGBGVCTGTKVVB RSTGCCWCTGCSY-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 107 Motif name: C107 Original motif 0.009901 0.801980 0.158416 0.029703 0.326733 0.277228 0.138614 0.257426 0.138614 0.415842 0.158416 0.287129 0.121212 0.303030 0.252525 0.323232 0.010000 0.890000 0.090000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.040000 0.220000 0.170000 0.570000 0.010000 0.270000 0.220000 0.500000 0.217822 0.237624 0.247525 0.297030 0.550000 0.260000 0.180000 0.010000 0.565657 0.252525 0.171717 0.010101 0.010000 0.400000 0.310000 0.280000 0.010000 0.750000 0.210000 0.030000 0.010000 0.960000 0.010000 0.020000 0.010000 0.930000 0.010000 0.050000 0.350000 0.110000 0.310000 0.230000 0.100000 0.190000 0.660000 0.050000 Consensus sequence: CHBBCCTYBAABCCCDG Reserve complement motif 0.100000 0.660000 0.190000 0.050000 0.230000 0.110000 0.310000 0.350000 0.010000 0.010000 0.930000 0.050000 0.010000 0.010000 0.960000 0.020000 0.010000 0.210000 0.750000 0.030000 0.010000 0.310000 0.400000 0.280000 0.010101 0.252525 0.171717 0.565657 0.010000 0.260000 0.180000 0.550000 0.297030 0.237624 0.247525 0.217822 0.500000 0.270000 0.220000 0.010000 0.570000 0.220000 0.170000 0.040000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.090000 0.890000 0.010000 0.323232 0.303030 0.252525 0.121212 0.138614 0.158416 0.415842 0.287129 0.257426 0.277228 0.138614 0.326733 0.009901 0.158416 0.801980 0.029703 Consensus sequence: CDGGGBTTVMAGGVBHG ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 107 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 5 17 0.058088 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK -CDGGGBTTVMAGGVBHG---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 1 17 0.058416 Species: Mus musculus Original motif 0.404007 0.395873 0.173319 0.026801 0.305977 0.215534 0.215359 0.263130 0.370148 0.250957 0.113088 0.265808 0.324336 0.229498 0.174679 0.271487 0.263563 0.137896 0.079217 0.519324 0.265762 0.222582 0.082555 0.429102 0.206721 0.288405 0.017851 0.487023 0.164361 0.236500 0.061051 0.538088 0.593344 0.348446 0.050304 0.007906 0.031328 0.947050 0.007032 0.014590 0.010428 0.956605 0.029142 0.003825 0.459636 0.207616 0.155368 0.177380 0.014573 0.964608 0.012209 0.008610 0.066291 0.918196 0.008729 0.006784 0.019488 0.866774 0.018897 0.094841 0.767405 0.104198 0.029234 0.099164 0.052494 0.772531 0.039832 0.135142 0.296085 0.243498 0.350935 0.109482 0.518843 0.226659 0.124784 0.129714 0.647901 0.019721 0.159901 0.172477 0.113912 0.231511 0.214864 0.439713 0.223117 0.310596 0.293328 0.172959 0.185557 0.487662 0.136321 0.190459 Consensus sequence: MHHHWHYTMCCHCCCACVAABVH Reverse complement motif 0.185557 0.136321 0.487662 0.190459 0.223117 0.293328 0.310596 0.172959 0.439713 0.231511 0.214864 0.113912 0.172477 0.019721 0.159901 0.647901 0.129714 0.226659 0.124784 0.518843 0.296085 0.350935 0.243498 0.109482 0.052494 0.039832 0.772531 0.135142 0.099164 0.104198 0.029234 0.767405 0.019488 0.018897 0.866774 0.094841 0.066291 0.008729 0.918196 0.006784 0.014573 0.012209 0.964608 0.008610 0.177380 0.207616 0.155368 0.459636 0.010428 0.029142 0.956605 0.003825 0.031328 0.007032 0.947050 0.014590 0.007906 0.348446 0.050304 0.593344 0.538088 0.236500 0.061051 0.164361 0.487023 0.288405 0.017851 0.206721 0.429102 0.222582 0.082555 0.265762 0.519324 0.137896 0.079217 0.263563 0.271487 0.229498 0.174679 0.324336 0.265808 0.250957 0.113088 0.370148 0.263130 0.215534 0.215359 0.305977 0.026801 0.395873 0.173319 0.404007 Consensus sequence: DVVTTVGTGGGHGGYAMHWHHHY Alignment: MHHHWHYTMCCHCCCACVAABVH CHBBCCTYBAABCCCDG------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00098 Rfx3_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 5 17 0.060476 Species: Mus musculus Original motif 0.314514 0.275352 0.257617 0.152518 0.126939 0.598294 0.130576 0.144192 0.102265 0.155334 0.177957 0.564445 0.129288 0.282678 0.326990 0.261044 0.318166 0.227823 0.175681 0.278330 0.109019 0.380838 0.278328 0.231815 0.226145 0.289206 0.291300 0.193348 0.035863 0.844339 0.072582 0.047216 0.223793 0.187244 0.088092 0.500871 0.039800 0.029681 0.026201 0.904317 0.298298 0.032147 0.654746 0.014809 0.014729 0.022023 0.944826 0.018422 0.485114 0.004925 0.013785 0.496176 0.035708 0.020381 0.240804 0.703108 0.951152 0.012738 0.017886 0.018224 0.023713 0.944394 0.009538 0.022355 0.291067 0.385205 0.232388 0.091339 0.340334 0.199588 0.311526 0.148552 0.198713 0.472138 0.178319 0.150830 0.321155 0.269932 0.311301 0.097612 0.412646 0.195252 0.231950 0.160152 0.297134 0.180928 0.250400 0.271538 0.151169 0.305386 0.358574 0.184871 Consensus sequence: VCTBHBVCTTGGWTACVVVVVDB Reverse complement motif 0.151169 0.358574 0.305386 0.184871 0.271538 0.180928 0.250400 0.297134 0.160152 0.195252 0.231950 0.412646 0.097612 0.269932 0.311301 0.321155 0.198713 0.178319 0.472138 0.150830 0.148552 0.199588 0.311526 0.340334 0.291067 0.232388 0.385205 0.091339 0.023713 0.009538 0.944394 0.022355 0.018224 0.012738 0.017886 0.951152 0.703108 0.020381 0.240804 0.035708 0.496176 0.004925 0.013785 0.485114 0.014729 0.944826 0.022023 0.018422 0.298298 0.654746 0.032147 0.014809 0.904317 0.029681 0.026201 0.039800 0.500871 0.187244 0.088092 0.223793 0.035863 0.072582 0.844339 0.047216 0.226145 0.291300 0.289206 0.193348 0.109019 0.278328 0.380838 0.231815 0.278330 0.227823 0.175681 0.318166 0.129288 0.326990 0.282678 0.261044 0.564445 0.155334 0.177957 0.102265 0.126939 0.130576 0.598294 0.144192 0.152518 0.275352 0.257617 0.314514 Consensus sequence: BDBBVBVGTAWCCAAGVBHBAGB Alignment: VCTBHBVCTTGGWTACVVVVVDB --CHBBCCTYBAABCCCDG---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 3 17 0.061864 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH ----CHBBCCTYBAABCCCDG-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 5 17 0.066908 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH ----CHBBCCTYBAABCCCDG-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 108 Motif name: C108 Original motif 0.490000 0.160000 0.340000 0.010000 0.040404 0.303030 0.383838 0.272727 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.030000 0.720000 0.220000 0.030000 0.534653 0.049505 0.009901 0.405941 0.100000 0.200000 0.690000 0.010000 0.851485 0.009901 0.039604 0.099010 0.009901 0.455446 0.524752 0.009901 0.712871 0.148515 0.108911 0.029703 0.336634 0.029703 0.118812 0.514851 0.801980 0.128713 0.059406 0.009901 0.059406 0.524752 0.386139 0.029703 0.272727 0.444444 0.272727 0.010101 0.009901 0.316832 0.138614 0.534653 Consensus sequence: RBACWGASAWASVY Reserve complement motif 0.534653 0.316832 0.138614 0.009901 0.272727 0.272727 0.444444 0.010101 0.059406 0.386139 0.524752 0.029703 0.009901 0.128713 0.059406 0.801980 0.514851 0.029703 0.118812 0.336634 0.029703 0.148515 0.108911 0.712871 0.009901 0.524752 0.455446 0.009901 0.099010 0.009901 0.039604 0.851485 0.100000 0.690000 0.200000 0.010000 0.405941 0.049505 0.009901 0.534653 0.030000 0.220000 0.720000 0.030000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.040404 0.383838 0.303030 0.272727 0.010000 0.160000 0.340000 0.490000 Consensus sequence: MVSTWTSTCWGTBK ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 108 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00101 Sox12_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 1 14 0.026317 Species: Mus musculus Original motif 0.378898 0.318901 0.205859 0.096341 0.352524 0.321236 0.224504 0.101736 0.323551 0.182056 0.210897 0.283496 0.135539 0.325230 0.208031 0.331200 0.663106 0.055471 0.154459 0.126963 0.051748 0.292567 0.537307 0.118378 0.886489 0.042361 0.035742 0.035408 0.043647 0.688744 0.094358 0.173252 0.882052 0.039818 0.018899 0.059231 0.864171 0.036011 0.068363 0.031455 0.790158 0.046868 0.041594 0.121379 0.087447 0.143905 0.707798 0.060849 0.295919 0.132479 0.485703 0.085899 0.653156 0.133004 0.110012 0.103828 0.351764 0.131771 0.217730 0.298736 0.203977 0.196773 0.099958 0.499292 Consensus sequence: VVDBASACAAAGRADH Reverse complement motif 0.499292 0.196773 0.099958 0.203977 0.298736 0.131771 0.217730 0.351764 0.103828 0.133004 0.110012 0.653156 0.295919 0.485703 0.132479 0.085899 0.087447 0.707798 0.143905 0.060849 0.121379 0.046868 0.041594 0.790158 0.031455 0.036011 0.068363 0.864171 0.059231 0.039818 0.018899 0.882052 0.043647 0.094358 0.688744 0.173252 0.035408 0.042361 0.035742 0.886489 0.051748 0.537307 0.292567 0.118378 0.126963 0.055471 0.154459 0.663106 0.331200 0.325230 0.208031 0.135539 0.283496 0.182056 0.210897 0.323551 0.101736 0.321236 0.224504 0.352524 0.096341 0.318901 0.205859 0.378898 Consensus sequence: HDTMCTTTGTSTVDBB Alignment: HDTMCTTTGTSTVDBB --MVSTWTSTCWGTBK ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00018 Irf4_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 1 14 0.031560 Species: Mus musculus Original motif 0.288101 0.247588 0.287461 0.176850 0.187625 0.276525 0.352820 0.183030 0.175230 0.300094 0.203295 0.321380 0.564519 0.107594 0.098018 0.229869 0.150412 0.310868 0.054960 0.483760 0.034907 0.015505 0.034843 0.914745 0.041776 0.885897 0.032309 0.040017 0.046210 0.168474 0.066613 0.718702 0.031764 0.913321 0.024478 0.030437 0.191755 0.029057 0.754998 0.024190 0.206291 0.097100 0.623727 0.072881 0.311511 0.037435 0.173101 0.477953 0.205101 0.316738 0.081628 0.396533 0.243888 0.196473 0.292453 0.267186 0.167980 0.404608 0.259107 0.168305 Consensus sequence: VVBAYTCTCGGWHDB Reverse complement motif 0.167980 0.259107 0.404608 0.168305 0.243888 0.292453 0.196473 0.267186 0.396533 0.316738 0.081628 0.205101 0.477953 0.037435 0.173101 0.311511 0.206291 0.623727 0.097100 0.072881 0.191755 0.754998 0.029057 0.024190 0.031764 0.024478 0.913321 0.030437 0.718702 0.168474 0.066613 0.046210 0.041776 0.032309 0.885897 0.040017 0.914745 0.015505 0.034843 0.034907 0.483760 0.310868 0.054960 0.150412 0.229869 0.107594 0.098018 0.564519 0.321380 0.300094 0.203295 0.175230 0.187625 0.352820 0.276525 0.183030 0.176850 0.247588 0.287461 0.288101 Consensus sequence: BHHWCCGAGAMTVVB Alignment: VVBAYTCTCGGWHDB MVSTWTSTCWGTBK- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score >UP00011 Irf6_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 1 14 0.032056 Species: Mus musculus Original motif 0.326255 0.256976 0.231005 0.185764 0.145621 0.315489 0.266193 0.272698 0.138750 0.396937 0.205185 0.259127 0.534194 0.121488 0.084178 0.260140 0.201823 0.589398 0.086624 0.122154 0.031428 0.023221 0.066048 0.879303 0.022389 0.889379 0.049165 0.039067 0.042252 0.295983 0.085234 0.576531 0.022905 0.915187 0.021569 0.040339 0.117305 0.061052 0.716358 0.105285 0.205873 0.113582 0.609303 0.071242 0.110208 0.084907 0.274228 0.530658 0.233550 0.385055 0.150708 0.230687 0.333806 0.136131 0.311600 0.218463 0.216423 0.309361 0.281145 0.193072 Consensus sequence: VBBACTCYCGGKHDV Reverse complement motif 0.216423 0.281145 0.309361 0.193072 0.218463 0.136131 0.311600 0.333806 0.233550 0.150708 0.385055 0.230687 0.530658 0.084907 0.274228 0.110208 0.205873 0.609303 0.113582 0.071242 0.117305 0.716358 0.061052 0.105285 0.022905 0.021569 0.915187 0.040339 0.576531 0.295983 0.085234 0.042252 0.022389 0.049165 0.889379 0.039067 0.879303 0.023221 0.066048 0.031428 0.201823 0.086624 0.589398 0.122154 0.260140 0.121488 0.084178 0.534194 0.138750 0.205185 0.396937 0.259127 0.145621 0.266193 0.315489 0.272698 0.185764 0.256976 0.231005 0.326255 Consensus sequence: VDDRCCGMGAGTBBB Alignment: VDDRCCGMGAGTBBB -RBACWGASAWASVY ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00073 Foxa2_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 14 0.034866 Species: Mus musculus Original motif 0.337264 0.231140 0.283651 0.147945 0.347118 0.236817 0.257338 0.158726 0.431380 0.126811 0.187071 0.254738 0.585753 0.089587 0.164350 0.160310 0.590169 0.225841 0.088487 0.095503 0.091374 0.098551 0.099596 0.710479 0.790999 0.060485 0.081771 0.066745 0.738945 0.032660 0.093144 0.135251 0.071350 0.719067 0.064337 0.145246 0.820757 0.079130 0.029431 0.070682 0.603611 0.145951 0.097449 0.152989 0.530021 0.143634 0.190469 0.135877 0.231297 0.288099 0.276056 0.204548 0.202920 0.232513 0.431635 0.132933 0.198379 0.292889 0.308599 0.200133 Consensus sequence: VVDAATAACAAAVVB Reverse complement motif 0.198379 0.308599 0.292889 0.200133 0.202920 0.431635 0.232513 0.132933 0.231297 0.276056 0.288099 0.204548 0.135877 0.143634 0.190469 0.530021 0.152989 0.145951 0.097449 0.603611 0.070682 0.079130 0.029431 0.820757 0.071350 0.064337 0.719067 0.145246 0.135251 0.032660 0.093144 0.738945 0.066745 0.060485 0.081771 0.790999 0.710479 0.098551 0.099596 0.091374 0.095503 0.225841 0.088487 0.590169 0.160310 0.089587 0.164350 0.585753 0.254738 0.126811 0.187071 0.431380 0.158726 0.236817 0.257338 0.347118 0.147945 0.231140 0.283651 0.337264 Consensus sequence: BVVTTTGTTATTDBB Alignment: VVDAATAACAAAVVB -RBACWGASAWASVY ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00000 Smad3_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 4 14 0.035279 Species: Mus musculus Original motif 0.282316 0.413385 0.114930 0.189369 0.341654 0.135011 0.267943 0.255392 0.399523 0.173081 0.168845 0.258551 0.365086 0.196360 0.211856 0.226699 0.243321 0.177839 0.224206 0.354635 0.029873 0.808479 0.036309 0.125339 0.004945 0.815465 0.040635 0.138955 0.934557 0.058944 0.005027 0.001471 0.005099 0.003998 0.986148 0.004755 0.969304 0.020594 0.001929 0.008173 0.008189 0.984816 0.004199 0.002795 0.669579 0.012182 0.282153 0.036085 0.130511 0.171241 0.334041 0.364207 0.198982 0.289660 0.252392 0.258966 0.423172 0.190978 0.164411 0.221440 0.213519 0.287388 0.294414 0.204679 0.371956 0.285061 0.150191 0.192792 Consensus sequence: HDHDDCCAGACABBHVH Reverse complement motif 0.192792 0.285061 0.150191 0.371956 0.213519 0.294414 0.287388 0.204679 0.221440 0.190978 0.164411 0.423172 0.198982 0.252392 0.289660 0.258966 0.364207 0.171241 0.334041 0.130511 0.036085 0.012182 0.282153 0.669579 0.008189 0.004199 0.984816 0.002795 0.008173 0.020594 0.001929 0.969304 0.005099 0.986148 0.003998 0.004755 0.001471 0.058944 0.005027 0.934557 0.004945 0.040635 0.815465 0.138955 0.029873 0.036309 0.808479 0.125339 0.354635 0.177839 0.224206 0.243321 0.226699 0.196360 0.211856 0.365086 0.258551 0.173081 0.168845 0.399523 0.255392 0.135011 0.267943 0.341654 0.282316 0.114930 0.413385 0.189369 Consensus sequence: HVHBVTGTCTGGDDHDD Alignment: HVHBVTGTCTGGDDHDD MVSTWTSTCWGTBK--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 109 Motif name: C109 Original motif 0.520000 0.160000 0.310000 0.010000 0.485149 0.495050 0.009901 0.009901 0.009901 0.881188 0.099010 0.009901 0.504950 0.039604 0.019802 0.435644 0.060000 0.470000 0.430000 0.040000 0.089109 0.158416 0.702970 0.049505 0.009901 0.851485 0.079208 0.059406 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.050000 0.010000 0.930000 0.010000 0.009901 0.475248 0.485149 0.029703 0.020000 0.800000 0.160000 0.020000 0.010000 0.810000 0.010000 0.170000 0.069307 0.009901 0.445545 0.475248 0.040000 0.330000 0.160000 0.470000 Consensus sequence: RMCWSGCTGSCCKY Reserve complement motif 0.470000 0.330000 0.160000 0.040000 0.475248 0.009901 0.445545 0.069307 0.010000 0.010000 0.810000 0.170000 0.020000 0.160000 0.800000 0.020000 0.009901 0.485149 0.475248 0.029703 0.050000 0.930000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.009901 0.079208 0.851485 0.059406 0.089109 0.702970 0.158416 0.049505 0.060000 0.430000 0.470000 0.040000 0.435644 0.039604 0.019802 0.504950 0.009901 0.099010 0.881188 0.009901 0.485149 0.009901 0.495050 0.009901 0.010000 0.160000 0.310000 0.520000 Consensus sequence: MRGGSCAGCSWGRK ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 109 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00006 Zic3_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 2 14 0.023228 Species: Mus musculus Original motif 0.225537 0.223459 0.280507 0.270498 0.332396 0.181810 0.207290 0.278505 0.309873 0.017922 0.386135 0.286070 0.101947 0.871607 0.020267 0.006179 0.541366 0.089100 0.242170 0.127364 0.003307 0.969997 0.002414 0.024283 0.903286 0.021590 0.015872 0.059253 0.039887 0.009732 0.945083 0.005298 0.001704 0.827209 0.006276 0.164810 0.723052 0.003102 0.221051 0.052795 0.011758 0.024398 0.560633 0.403211 0.003656 0.012952 0.939586 0.043807 0.477846 0.270399 0.113113 0.138642 0.225706 0.298505 0.258523 0.217266 0.365251 0.191780 0.197411 0.245557 Consensus sequence: DDDCACAGCAKGHVD Reverse complement motif 0.245557 0.191780 0.197411 0.365251 0.225706 0.258523 0.298505 0.217266 0.138642 0.270399 0.113113 0.477846 0.003656 0.939586 0.012952 0.043807 0.011758 0.560633 0.024398 0.403211 0.052795 0.003102 0.221051 0.723052 0.001704 0.006276 0.827209 0.164810 0.039887 0.945083 0.009732 0.005298 0.059253 0.021590 0.015872 0.903286 0.003307 0.002414 0.969997 0.024283 0.127364 0.089100 0.242170 0.541366 0.101947 0.020267 0.871607 0.006179 0.309873 0.386135 0.017922 0.286070 0.278505 0.181810 0.207290 0.332396 0.225537 0.280507 0.223459 0.270498 Consensus sequence: DVHCYTGCTGTGHDH Alignment: DDDCACAGCAKGHVD MRGGSCAGCSWGRK- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 6 14 0.023267 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH ----MRGGSCAGCSWGRK----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00046 Tcfe2a_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 4 14 0.023398 Species: Mus musculus Original motif 0.296417 0.247522 0.206749 0.249312 0.410113 0.201959 0.303149 0.084779 0.267313 0.132645 0.452057 0.147985 0.187929 0.136827 0.427628 0.247616 0.198671 0.425254 0.234160 0.141915 0.029244 0.953929 0.004092 0.012734 0.954570 0.014314 0.018695 0.012421 0.010025 0.055055 0.845504 0.089415 0.874802 0.040849 0.069178 0.015172 0.015084 0.010551 0.008736 0.965628 0.012981 0.007192 0.965036 0.014791 0.037724 0.016891 0.495632 0.449753 0.021685 0.438927 0.056118 0.483270 0.209872 0.365671 0.139706 0.284751 0.151815 0.336912 0.289382 0.221891 0.152995 0.262354 0.416434 0.168217 0.227567 0.187603 0.447892 0.136938 Consensus sequence: HVDDVCAGATGKYHBBV Reverse complement motif 0.227567 0.447892 0.187603 0.136938 0.152995 0.416434 0.262354 0.168217 0.151815 0.289382 0.336912 0.221891 0.209872 0.139706 0.365671 0.284751 0.483270 0.438927 0.056118 0.021685 0.037724 0.495632 0.016891 0.449753 0.012981 0.965036 0.007192 0.014791 0.965628 0.010551 0.008736 0.015084 0.015172 0.040849 0.069178 0.874802 0.010025 0.845504 0.055055 0.089415 0.012421 0.014314 0.018695 0.954570 0.029244 0.004092 0.953929 0.012734 0.198671 0.234160 0.425254 0.141915 0.187929 0.427628 0.136827 0.247616 0.267313 0.452057 0.132645 0.147985 0.084779 0.201959 0.303149 0.410113 0.249312 0.247522 0.206749 0.296417 Consensus sequence: VBBDMYCATCTGVHHBH Alignment: VBBDMYCATCTGVHHBH ---RMCWSGCTGSCCKY ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v015681_primaryReverse Complement Original Motif Backward 3 14 0.024354 Species: Mus musculus Original motif 0.472795 0.179227 0.091251 0.256726 0.036521 0.159743 0.204840 0.598896 0.164582 0.312805 0.221324 0.301289 0.237069 0.249050 0.293048 0.220833 0.401949 0.225181 0.229401 0.143469 0.161422 0.494334 0.252207 0.092036 0.252940 0.177721 0.369400 0.199939 0.119630 0.024651 0.849920 0.005798 0.000962 0.002398 0.990616 0.006023 0.937852 0.027016 0.034535 0.000597 0.008963 0.987756 0.000629 0.002652 0.001584 0.992898 0.002349 0.003169 0.956822 0.027342 0.002484 0.013352 0.009873 0.987759 0.000988 0.001381 0.016397 0.980856 0.000369 0.002378 0.081761 0.758555 0.038572 0.121112 0.371713 0.091838 0.448027 0.088423 0.111617 0.121913 0.683885 0.082585 0.334562 0.102916 0.436488 0.126034 0.210362 0.101261 0.238339 0.450037 0.169041 0.271583 0.320799 0.238576 0.140316 0.049885 0.735236 0.074563 Consensus sequence: HTBVVVDGGACCACCCRGRDBG Reverse complement motif 0.140316 0.735236 0.049885 0.074563 0.169041 0.320799 0.271583 0.238576 0.450037 0.101261 0.238339 0.210362 0.334562 0.436488 0.102916 0.126034 0.111617 0.683885 0.121913 0.082585 0.371713 0.448027 0.091838 0.088423 0.081761 0.038572 0.758555 0.121112 0.016397 0.000369 0.980856 0.002378 0.009873 0.000988 0.987759 0.001381 0.013352 0.027342 0.002484 0.956822 0.001584 0.002349 0.992898 0.003169 0.008963 0.000629 0.987756 0.002652 0.000597 0.027016 0.034535 0.937852 0.000962 0.990616 0.002398 0.006023 0.119630 0.849920 0.024651 0.005798 0.252940 0.369400 0.177721 0.199939 0.161422 0.252207 0.494334 0.092036 0.143469 0.225181 0.229401 0.401949 0.237069 0.293048 0.249050 0.220833 0.164582 0.221324 0.312805 0.301289 0.598896 0.159743 0.204840 0.036521 0.256726 0.179227 0.091251 0.472795 Consensus sequence: CBDMCMGGGTGGTCCHVBVBAH Alignment: HTBVVVDGGACCACCCRGRDBG ------MRGGSCAGCSWGRK-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00057 Zic2_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 2 14 0.024667 Species: Mus musculus Original motif 0.201522 0.336845 0.183740 0.277892 0.238705 0.354378 0.165332 0.241585 0.350858 0.031427 0.308482 0.309233 0.104423 0.870794 0.018676 0.006107 0.313246 0.259944 0.277570 0.149241 0.003590 0.973377 0.002520 0.020513 0.899716 0.025489 0.015458 0.059336 0.049224 0.006415 0.938214 0.006147 0.002021 0.859631 0.007903 0.130445 0.772818 0.002659 0.187334 0.037190 0.008456 0.015170 0.594695 0.381679 0.004118 0.009188 0.961506 0.025188 0.367151 0.230955 0.204475 0.197419 0.267508 0.193660 0.430070 0.108762 0.444449 0.099127 0.212182 0.244241 Consensus sequence: HHDCVCAGCAKGVVD Reverse complement motif 0.244241 0.099127 0.212182 0.444449 0.267508 0.430070 0.193660 0.108762 0.197419 0.230955 0.204475 0.367151 0.004118 0.961506 0.009188 0.025188 0.008456 0.594695 0.015170 0.381679 0.037190 0.002659 0.187334 0.772818 0.002021 0.007903 0.859631 0.130445 0.049224 0.938214 0.006415 0.006147 0.059336 0.025489 0.015458 0.899716 0.003590 0.002520 0.973377 0.020513 0.149241 0.259944 0.277570 0.313246 0.104423 0.018676 0.870794 0.006107 0.309233 0.031427 0.308482 0.350858 0.238705 0.165332 0.354378 0.241585 0.201522 0.183740 0.336845 0.277892 Consensus sequence: DVBCYTGCTGBGDDD Alignment: HHDCVCAGCAKGVVD MRGGSCAGCSWGRK- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 110 Motif name: C110 Original motif 0.090000 0.390000 0.120000 0.400000 0.040000 0.450000 0.060000 0.450000 0.009901 0.831683 0.009901 0.148515 0.010000 0.060000 0.010000 0.920000 0.050000 0.100000 0.490000 0.360000 0.060000 0.010000 0.010000 0.920000 0.009901 0.831683 0.009901 0.148515 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.009901 0.752475 0.049505 0.188119 0.320000 0.470000 0.100000 0.110000 0.881188 0.019802 0.089109 0.009901 0.801980 0.099010 0.039604 0.059406 0.540000 0.010000 0.360000 0.090000 0.410000 0.120000 0.370000 0.100000 Consensus sequence: YYCTKTCTCMAARR Reserve complement motif 0.100000 0.120000 0.370000 0.410000 0.090000 0.010000 0.360000 0.540000 0.059406 0.099010 0.039604 0.801980 0.009901 0.019802 0.089109 0.881188 0.320000 0.100000 0.470000 0.110000 0.009901 0.049505 0.752475 0.188119 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.009901 0.009901 0.831683 0.148515 0.920000 0.010000 0.010000 0.060000 0.050000 0.490000 0.100000 0.360000 0.920000 0.060000 0.010000 0.010000 0.009901 0.009901 0.831683 0.148515 0.040000 0.060000 0.450000 0.450000 0.400000 0.390000 0.120000 0.090000 Consensus sequence: KKTTRGAGAYAGKM ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 110 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00032 Gata3_primary Reverse Complement Original Motif Forward 2 14 0.030626 Species: Mus musculus Original motif 0.151572 0.262753 0.258275 0.327401 0.221834 0.113385 0.275380 0.389400 0.297769 0.136928 0.134678 0.430625 0.270099 0.110415 0.271106 0.348380 0.265471 0.090253 0.223340 0.420936 0.616582 0.090091 0.171960 0.121367 0.197318 0.107541 0.406904 0.288237 0.798258 0.046950 0.001406 0.153385 0.003195 0.002516 0.989707 0.004582 0.991503 0.002748 0.002617 0.003132 0.005015 0.002764 0.003026 0.989195 0.948394 0.008932 0.001344 0.041330 0.973109 0.004100 0.004081 0.018710 0.040365 0.113905 0.828185 0.017545 0.736608 0.130524 0.113464 0.019404 0.415921 0.106101 0.316613 0.161365 0.376582 0.170927 0.155572 0.296919 0.137731 0.197151 0.211055 0.454064 0.324853 0.122747 0.246107 0.306293 0.462490 0.207311 0.159392 0.170807 0.380420 0.188972 0.311990 0.118618 0.222178 0.157873 0.380486 0.239463 Consensus sequence: BDHDDADAGATAAGADHBDHVD Reverse complement motif 0.222178 0.380486 0.157873 0.239463 0.118618 0.188972 0.311990 0.380420 0.170807 0.207311 0.159392 0.462490 0.306293 0.122747 0.246107 0.324853 0.454064 0.197151 0.211055 0.137731 0.296919 0.170927 0.155572 0.376582 0.161365 0.106101 0.316613 0.415921 0.019404 0.130524 0.113464 0.736608 0.040365 0.828185 0.113905 0.017545 0.018710 0.004100 0.004081 0.973109 0.041330 0.008932 0.001344 0.948394 0.989195 0.002764 0.003026 0.005015 0.003132 0.002748 0.002617 0.991503 0.003195 0.989707 0.002516 0.004582 0.153385 0.046950 0.001406 0.798258 0.197318 0.406904 0.107541 0.288237 0.121367 0.090091 0.171960 0.616582 0.420936 0.090253 0.223340 0.265471 0.348380 0.110415 0.271106 0.270099 0.430625 0.136928 0.134678 0.297769 0.389400 0.113385 0.275380 0.221834 0.327401 0.262753 0.258275 0.151572 Consensus sequence: HBHDVHDTCTTATCTHTDDHDV Alignment: BDHDDADAGATAAGADHBDHVD -KKTTRGAGAYAGKM------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00043 Bcl6b_primary Original Motif Reverse Complement Backward 2 14 0.032867 Species: Mus musculus Original motif 0.346550 0.082299 0.202982 0.368169 0.169328 0.599178 0.046508 0.184986 0.085619 0.105820 0.059390 0.749172 0.128756 0.084682 0.076780 0.709782 0.032381 0.009923 0.016477 0.941220 0.013184 0.868651 0.009399 0.108766 0.018397 0.104497 0.450474 0.426632 0.800902 0.010911 0.015982 0.172205 0.141166 0.055397 0.762379 0.041059 0.073467 0.021239 0.811630 0.093665 0.878497 0.015031 0.044964 0.061509 0.875924 0.027013 0.013780 0.083283 0.205684 0.213313 0.040936 0.540067 0.244336 0.228277 0.168227 0.359160 0.208971 0.304437 0.148473 0.338119 0.201607 0.294079 0.334889 0.169425 Consensus sequence: DCTTTCKAGGAATHHV Reverse complement motif 0.201607 0.334889 0.294079 0.169425 0.338119 0.304437 0.148473 0.208971 0.359160 0.228277 0.168227 0.244336 0.540067 0.213313 0.040936 0.205684 0.083283 0.027013 0.013780 0.875924 0.061509 0.015031 0.044964 0.878497 0.073467 0.811630 0.021239 0.093665 0.141166 0.762379 0.055397 0.041059 0.172205 0.010911 0.015982 0.800902 0.018397 0.450474 0.104497 0.426632 0.013184 0.009399 0.868651 0.108766 0.941220 0.009923 0.016477 0.032381 0.709782 0.084682 0.076780 0.128756 0.749172 0.105820 0.059390 0.085619 0.169328 0.046508 0.599178 0.184986 0.368169 0.082299 0.202982 0.346550 Consensus sequence: VHHATTCCTYGAAAGD Alignment: VHHATTCCTYGAAAGD -YYCTKTCTCMAARR- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00076 Rfxdc2_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 3 14 0.036236 Species: Mus musculus Original motif 0.120124 0.369052 0.280026 0.230798 0.153013 0.175278 0.321983 0.349726 0.426573 0.206846 0.272112 0.094469 0.067213 0.665712 0.165815 0.101259 0.213424 0.152912 0.229260 0.404404 0.042427 0.193675 0.034144 0.729754 0.359927 0.038767 0.588911 0.012395 0.015079 0.017884 0.948607 0.018430 0.699438 0.007004 0.014579 0.278979 0.017282 0.022228 0.369181 0.591308 0.948823 0.011471 0.018805 0.020901 0.016175 0.947649 0.007710 0.028466 0.114584 0.334989 0.511562 0.038865 0.219114 0.247229 0.396478 0.137179 0.308087 0.178171 0.248356 0.265386 0.479300 0.125168 0.134837 0.260696 0.323493 0.230502 0.108189 0.337815 Consensus sequence: BBVCDTRGAKACSVDDH Reverse complement motif 0.337815 0.230502 0.108189 0.323493 0.260696 0.125168 0.134837 0.479300 0.265386 0.178171 0.248356 0.308087 0.219114 0.396478 0.247229 0.137179 0.114584 0.511562 0.334989 0.038865 0.016175 0.007710 0.947649 0.028466 0.020901 0.011471 0.018805 0.948823 0.591308 0.022228 0.369181 0.017282 0.278979 0.007004 0.014579 0.699438 0.015079 0.948607 0.017884 0.018430 0.359927 0.588911 0.038767 0.012395 0.729754 0.193675 0.034144 0.042427 0.404404 0.152912 0.229260 0.213424 0.067213 0.165815 0.665712 0.101259 0.094469 0.206846 0.272112 0.426573 0.349726 0.175278 0.321983 0.153013 0.120124 0.280026 0.369052 0.230798 Consensus sequence: HDDVSGTRTCMADGBVB Alignment: BBVCDTRGAKACSVDDH --KKTTRGAGAYAGKM- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00101 Sox12_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 3 14 0.039677 Species: Mus musculus Original motif 0.378898 0.318901 0.205859 0.096341 0.352524 0.321236 0.224504 0.101736 0.323551 0.182056 0.210897 0.283496 0.135539 0.325230 0.208031 0.331200 0.663106 0.055471 0.154459 0.126963 0.051748 0.292567 0.537307 0.118378 0.886489 0.042361 0.035742 0.035408 0.043647 0.688744 0.094358 0.173252 0.882052 0.039818 0.018899 0.059231 0.864171 0.036011 0.068363 0.031455 0.790158 0.046868 0.041594 0.121379 0.087447 0.143905 0.707798 0.060849 0.295919 0.132479 0.485703 0.085899 0.653156 0.133004 0.110012 0.103828 0.351764 0.131771 0.217730 0.298736 0.203977 0.196773 0.099958 0.499292 Consensus sequence: VVDBASACAAAGRADH Reverse complement motif 0.499292 0.196773 0.099958 0.203977 0.298736 0.131771 0.217730 0.351764 0.103828 0.133004 0.110012 0.653156 0.295919 0.485703 0.132479 0.085899 0.087447 0.707798 0.143905 0.060849 0.121379 0.046868 0.041594 0.790158 0.031455 0.036011 0.068363 0.864171 0.059231 0.039818 0.018899 0.882052 0.043647 0.094358 0.688744 0.173252 0.035408 0.042361 0.035742 0.886489 0.051748 0.537307 0.292567 0.118378 0.126963 0.055471 0.154459 0.663106 0.331200 0.325230 0.208031 0.135539 0.283496 0.182056 0.210897 0.323551 0.101736 0.321236 0.224504 0.352524 0.096341 0.318901 0.205859 0.378898 Consensus sequence: HDTMCTTTGTSTVDBB Alignment: HDTMCTTTGTSTVDBB --YYCTKTCTCMAARR ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00032 Gata3_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 1 14 0.039681 Species: Mus musculus Original motif 0.177641 0.319872 0.115137 0.387350 0.136644 0.182137 0.205873 0.475347 0.254263 0.244280 0.165207 0.336250 0.240415 0.207557 0.237497 0.314530 0.271041 0.214702 0.364395 0.149863 0.095475 0.320104 0.191738 0.392682 0.500902 0.142722 0.026556 0.329820 0.051221 0.023698 0.897245 0.027836 0.922410 0.027509 0.024058 0.026023 0.030735 0.070903 0.024248 0.874114 0.242120 0.231992 0.225143 0.300745 0.106956 0.220471 0.283490 0.389083 0.152079 0.165830 0.135066 0.547025 0.839205 0.051581 0.060119 0.049095 0.041204 0.069147 0.070830 0.818819 0.051861 0.848177 0.027599 0.072363 0.383793 0.016807 0.397470 0.201931 0.381899 0.215846 0.255908 0.146347 0.094792 0.358651 0.280905 0.265652 0.296132 0.181545 0.178433 0.343890 0.301997 0.254722 0.108566 0.334714 0.349481 0.270693 0.137507 0.242319 Consensus sequence: HBHDVBWGATHBTATCRVBHHH Reverse complement motif 0.242319 0.270693 0.137507 0.349481 0.334714 0.254722 0.108566 0.301997 0.343890 0.181545 0.178433 0.296132 0.094792 0.280905 0.358651 0.265652 0.146347 0.215846 0.255908 0.381899 0.383793 0.397470 0.016807 0.201931 0.051861 0.027599 0.848177 0.072363 0.818819 0.069147 0.070830 0.041204 0.049095 0.051581 0.060119 0.839205 0.547025 0.165830 0.135066 0.152079 0.389083 0.220471 0.283490 0.106956 0.300745 0.231992 0.225143 0.242120 0.874114 0.070903 0.024248 0.030735 0.026023 0.027509 0.024058 0.922410 0.051221 0.897245 0.023698 0.027836 0.329820 0.142722 0.026556 0.500902 0.392682 0.320104 0.191738 0.095475 0.271041 0.364395 0.214702 0.149863 0.314530 0.207557 0.237497 0.240415 0.336250 0.244280 0.165207 0.254263 0.475347 0.182137 0.205873 0.136644 0.387350 0.319872 0.115137 0.177641 Consensus sequence: HHHBBMGATAVHATCWVVDHVH Alignment: HBHDVBWGATHBTATCRVBHHH KKTTRGAGAYAGKM-------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 111 Motif name: C111 Original motif 0.180000 0.030000 0.260000 0.530000 0.069307 0.267327 0.445545 0.217822 0.613861 0.108911 0.128713 0.148515 0.158416 0.069307 0.207921 0.564356 0.500000 0.090000 0.070000 0.340000 0.010000 0.410000 0.010000 0.570000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.050000 0.930000 0.010000 0.772277 0.049505 0.009901 0.168317 0.504950 0.009901 0.475248 0.009901 0.440000 0.020000 0.120000 0.420000 0.039604 0.079208 0.009901 0.871287 0.010000 0.680000 0.030000 0.280000 0.180000 0.460000 0.320000 0.040000 0.530000 0.330000 0.010000 0.130000 Consensus sequence: TBATWYCTGARWTCSM Reserve complement motif 0.130000 0.330000 0.010000 0.530000 0.180000 0.320000 0.460000 0.040000 0.010000 0.030000 0.680000 0.280000 0.871287 0.079208 0.009901 0.039604 0.420000 0.020000 0.120000 0.440000 0.009901 0.009901 0.475248 0.504950 0.168317 0.049505 0.009901 0.772277 0.010000 0.930000 0.050000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.570000 0.410000 0.010000 0.010000 0.340000 0.090000 0.070000 0.500000 0.564356 0.069307 0.207921 0.158416 0.148515 0.108911 0.128713 0.613861 0.069307 0.445545 0.267327 0.217822 0.530000 0.030000 0.260000 0.180000 Consensus sequence: YSGAWKTCAGMWATBA ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 111 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00045 Mafb_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 16 0.038214 Species: Mus musculus Original motif 0.420301 0.182299 0.161481 0.235919 0.593201 0.055751 0.202477 0.148571 0.653364 0.017008 0.054630 0.274998 0.339176 0.102943 0.050258 0.507622 0.171557 0.078698 0.267471 0.482273 0.044703 0.033212 0.003920 0.918165 0.010333 0.004451 0.972441 0.012775 0.034026 0.949298 0.004788 0.011889 0.016078 0.008878 0.004007 0.971037 0.020331 0.004077 0.929676 0.045916 0.975739 0.007450 0.005991 0.010819 0.012733 0.887375 0.018700 0.081192 0.259981 0.111885 0.243051 0.385083 0.327677 0.149969 0.094895 0.427459 0.541721 0.105923 0.242224 0.110132 0.258689 0.068305 0.493226 0.179779 0.306041 0.306854 0.168308 0.218798 Consensus sequence: HAAWDTGCTGACDWARH Reverse complement motif 0.306041 0.168308 0.306854 0.218798 0.258689 0.493226 0.068305 0.179779 0.110132 0.105923 0.242224 0.541721 0.427459 0.149969 0.094895 0.327677 0.385083 0.111885 0.243051 0.259981 0.012733 0.018700 0.887375 0.081192 0.010819 0.007450 0.005991 0.975739 0.020331 0.929676 0.004077 0.045916 0.971037 0.008878 0.004007 0.016078 0.034026 0.004788 0.949298 0.011889 0.010333 0.972441 0.004451 0.012775 0.918165 0.033212 0.003920 0.044703 0.482273 0.078698 0.267471 0.171557 0.507622 0.102943 0.050258 0.339176 0.274998 0.017008 0.054630 0.653364 0.148571 0.055751 0.202477 0.593201 0.235919 0.182299 0.161481 0.420301 Consensus sequence: DMTWDGTCAGCADWTTH Alignment: DMTWDGTCAGCADWTTH YSGAWKTCAGMWATBA- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00410 Elk1 Original Motif Original Motif Backward 2 16 0.043652 Species: Mus musculus Original motif 0.430685 0.247184 0.200279 0.121853 0.170474 0.344859 0.320328 0.164339 0.289040 0.209865 0.151683 0.349412 0.153609 0.191266 0.230615 0.424510 0.717152 0.035619 0.128912 0.118318 0.015844 0.931939 0.044019 0.008198 0.074710 0.923143 0.001579 0.000568 0.005662 0.001876 0.991367 0.001095 0.002915 0.001618 0.993221 0.002246 0.986317 0.000532 0.001970 0.011180 0.891841 0.003746 0.000912 0.103501 0.077493 0.231881 0.682573 0.008053 0.012287 0.247896 0.024535 0.715282 0.291287 0.134464 0.256360 0.317889 0.223530 0.285605 0.253558 0.237306 0.373509 0.307981 0.133817 0.184693 0.294043 0.208400 0.267829 0.229728 Consensus sequence: VVHBACCGGAAGTDBHD Reverse complement motif 0.229728 0.208400 0.267829 0.294043 0.184693 0.307981 0.133817 0.373509 0.223530 0.253558 0.285605 0.237306 0.317889 0.134464 0.256360 0.291287 0.715282 0.247896 0.024535 0.012287 0.077493 0.682573 0.231881 0.008053 0.103501 0.003746 0.000912 0.891841 0.011180 0.000532 0.001970 0.986317 0.002915 0.993221 0.001618 0.002246 0.005662 0.991367 0.001876 0.001095 0.074710 0.001579 0.923143 0.000568 0.015844 0.044019 0.931939 0.008198 0.118318 0.035619 0.128912 0.717152 0.424510 0.191266 0.230615 0.153609 0.349412 0.209865 0.151683 0.289040 0.170474 0.320328 0.344859 0.164339 0.121853 0.247184 0.200279 0.430685 Consensus sequence: DHBDACTTCCGGTVHVB Alignment: VVHBACCGGAAGTDBHD TBATWYCTGARWTCSM- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00013 Gabpa_primary Original Motif Original Motif Backward 2 16 0.043927 Species: Mus musculus Original motif 0.347579 0.362501 0.122567 0.167353 0.291516 0.289483 0.243331 0.175670 0.444682 0.202283 0.117720 0.235315 0.286823 0.160493 0.154998 0.397686 0.777207 0.031168 0.138668 0.052958 0.020187 0.935458 0.041166 0.003190 0.044954 0.947416 0.006517 0.001112 0.004962 0.002315 0.991007 0.001716 0.002572 0.002766 0.992355 0.002307 0.989037 0.001723 0.001769 0.007471 0.898665 0.004213 0.001115 0.096007 0.219936 0.020606 0.754552 0.004906 0.021686 0.134459 0.014432 0.829423 0.197325 0.176901 0.362465 0.263309 0.245978 0.264865 0.197336 0.291821 0.323340 0.203013 0.195793 0.277854 0.279355 0.250354 0.250472 0.219819 Consensus sequence: HVHHACCGGAAGTDHHV Reverse complement motif 0.219819 0.250354 0.250472 0.279355 0.277854 0.203013 0.195793 0.323340 0.291821 0.264865 0.197336 0.245978 0.197325 0.362465 0.176901 0.263309 0.829423 0.134459 0.014432 0.021686 0.219936 0.754552 0.020606 0.004906 0.096007 0.004213 0.001115 0.898665 0.007471 0.001723 0.001769 0.989037 0.002572 0.992355 0.002766 0.002307 0.004962 0.991007 0.002315 0.001716 0.044954 0.006517 0.947416 0.001112 0.020187 0.041166 0.935458 0.003190 0.052958 0.031168 0.138668 0.777207 0.397686 0.160493 0.154998 0.286823 0.235315 0.202283 0.117720 0.444682 0.175670 0.289483 0.243331 0.291516 0.347579 0.122567 0.362501 0.167353 Consensus sequence: BHHHACTTCCGGTHHBD Alignment: HVHHACCGGAAGTDHHV TBATWYCTGARWTCSM- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00032 Gata3_primary Reverse Complement Original Motif Forward 5 16 0.048574 Species: Mus musculus Original motif 0.151572 0.262753 0.258275 0.327401 0.221834 0.113385 0.275380 0.389400 0.297769 0.136928 0.134678 0.430625 0.270099 0.110415 0.271106 0.348380 0.265471 0.090253 0.223340 0.420936 0.616582 0.090091 0.171960 0.121367 0.197318 0.107541 0.406904 0.288237 0.798258 0.046950 0.001406 0.153385 0.003195 0.002516 0.989707 0.004582 0.991503 0.002748 0.002617 0.003132 0.005015 0.002764 0.003026 0.989195 0.948394 0.008932 0.001344 0.041330 0.973109 0.004100 0.004081 0.018710 0.040365 0.113905 0.828185 0.017545 0.736608 0.130524 0.113464 0.019404 0.415921 0.106101 0.316613 0.161365 0.376582 0.170927 0.155572 0.296919 0.137731 0.197151 0.211055 0.454064 0.324853 0.122747 0.246107 0.306293 0.462490 0.207311 0.159392 0.170807 0.380420 0.188972 0.311990 0.118618 0.222178 0.157873 0.380486 0.239463 Consensus sequence: BDHDDADAGATAAGADHBDHVD Reverse complement motif 0.222178 0.380486 0.157873 0.239463 0.118618 0.188972 0.311990 0.380420 0.170807 0.207311 0.159392 0.462490 0.306293 0.122747 0.246107 0.324853 0.454064 0.197151 0.211055 0.137731 0.296919 0.170927 0.155572 0.376582 0.161365 0.106101 0.316613 0.415921 0.019404 0.130524 0.113464 0.736608 0.040365 0.828185 0.113905 0.017545 0.018710 0.004100 0.004081 0.973109 0.041330 0.008932 0.001344 0.948394 0.989195 0.002764 0.003026 0.005015 0.003132 0.002748 0.002617 0.991503 0.003195 0.989707 0.002516 0.004582 0.153385 0.046950 0.001406 0.798258 0.197318 0.406904 0.107541 0.288237 0.121367 0.090091 0.171960 0.616582 0.420936 0.090253 0.223340 0.265471 0.348380 0.110415 0.271106 0.270099 0.430625 0.136928 0.134678 0.297769 0.389400 0.113385 0.275380 0.221834 0.327401 0.262753 0.258275 0.151572 Consensus sequence: HBHDVHDTCTTATCTHTDDHDV Alignment: BDHDDADAGATAAGADHBDHVD ----YSGAWKTCAGMWATBA-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00193 Rhox11_1765.2 Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 16 0.048696 Species: Mus musculus Original motif 0.538735 0.129821 0.147336 0.184107 0.331267 0.275123 0.227609 0.166001 0.174654 0.113319 0.383610 0.328417 0.296734 0.281670 0.230068 0.191527 0.128222 0.561296 0.062928 0.247554 0.027028 0.014676 0.949335 0.008962 0.087209 0.761581 0.147964 0.003246 0.006796 0.000741 0.006037 0.986427 0.039496 0.000533 0.943453 0.016517 0.005541 0.005164 0.002805 0.986489 0.561957 0.002761 0.004207 0.431075 0.780197 0.037155 0.031222 0.151425 0.518642 0.104220 0.012670 0.364468 0.314451 0.111366 0.333508 0.240676 0.236936 0.357992 0.280813 0.124259 0.314846 0.163774 0.426195 0.095185 0.408340 0.134111 0.102987 0.354562 Consensus sequence: AVDVCGCTGTWAWDVVW Reverse complement motif 0.354562 0.134111 0.102987 0.408340 0.314846 0.426195 0.163774 0.095185 0.236936 0.280813 0.357992 0.124259 0.314451 0.333508 0.111366 0.240676 0.364468 0.104220 0.012670 0.518642 0.151425 0.037155 0.031222 0.780197 0.431075 0.002761 0.004207 0.561957 0.986489 0.005164 0.002805 0.005541 0.039496 0.943453 0.000533 0.016517 0.986427 0.000741 0.006037 0.006796 0.087209 0.147964 0.761581 0.003246 0.027028 0.949335 0.014676 0.008962 0.128222 0.062928 0.561296 0.247554 0.191527 0.281670 0.230068 0.296734 0.174654 0.383610 0.113319 0.328417 0.166001 0.275123 0.227609 0.331267 0.184107 0.129821 0.147336 0.538735 Consensus sequence: WVVHWTWACAGCGBHBT Alignment: WVVHWTWACAGCGBHBT -YSGAWKTCAGMWATBA ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 112 Motif name: C112 Original motif 0.009901 0.881188 0.009901 0.099010 0.040000 0.940000 0.010000 0.010000 0.168317 0.455446 0.168317 0.207921 0.010000 0.960000 0.020000 0.010000 0.010000 0.550000 0.130000 0.310000 0.080000 0.520000 0.380000 0.020000 0.009901 0.495050 0.485149 0.009901 0.010000 0.380000 0.570000 0.040000 0.270000 0.060000 0.660000 0.010000 0.069307 0.772277 0.069307 0.089109 0.217822 0.702970 0.009901 0.069307 0.210000 0.570000 0.080000 0.140000 0.250000 0.670000 0.020000 0.060000 0.090000 0.310000 0.590000 0.010000 0.180000 0.290000 0.510000 0.020000 Consensus sequence: CCBCYSSSGCCCCSS Reserve complement motif 0.180000 0.510000 0.290000 0.020000 0.090000 0.590000 0.310000 0.010000 0.250000 0.020000 0.670000 0.060000 0.210000 0.080000 0.570000 0.140000 0.217822 0.009901 0.702970 0.069307 0.069307 0.069307 0.772277 0.089109 0.270000 0.660000 0.060000 0.010000 0.010000 0.570000 0.380000 0.040000 0.009901 0.485149 0.495050 0.009901 0.080000 0.380000 0.520000 0.020000 0.010000 0.130000 0.550000 0.310000 0.010000 0.020000 0.960000 0.010000 0.168317 0.168317 0.455446 0.207921 0.040000 0.010000 0.940000 0.010000 0.009901 0.009901 0.881188 0.099010 Consensus sequence: SSGGGGCSSSKGBGG ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 112 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 9 15 0.036812 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB SSGGGGCSSSKGBGG-------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 3 15 0.038423 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH --CCBCYSSSGCCCCSS----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00033 Zfp410_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 1 15 0.043048 Species: Mus musculus Original motif 0.162979 0.284781 0.237433 0.314807 0.182449 0.447584 0.069464 0.300502 0.298973 0.261014 0.213211 0.226802 0.136039 0.433062 0.144274 0.286625 0.180084 0.395933 0.158565 0.265418 0.069354 0.748510 0.068898 0.113238 0.060485 0.717828 0.075333 0.146354 0.023280 0.071762 0.645500 0.259457 0.166896 0.749762 0.062730 0.020612 0.050401 0.775248 0.089072 0.085279 0.103847 0.767557 0.068804 0.059791 0.064815 0.748318 0.114588 0.072280 0.340921 0.071942 0.242981 0.344157 0.301967 0.263512 0.165927 0.268594 0.479800 0.222955 0.118441 0.178803 0.229469 0.283621 0.143099 0.343811 0.261733 0.180191 0.169905 0.388170 Consensus sequence: BHHBHCCGCCCCDHHHH Reverse complement motif 0.388170 0.180191 0.169905 0.261733 0.343811 0.283621 0.143099 0.229469 0.178803 0.222955 0.118441 0.479800 0.268594 0.263512 0.165927 0.301967 0.344157 0.071942 0.242981 0.340921 0.064815 0.114588 0.748318 0.072280 0.103847 0.068804 0.767557 0.059791 0.050401 0.089072 0.775248 0.085279 0.166896 0.062730 0.749762 0.020612 0.023280 0.645500 0.071762 0.259457 0.060485 0.075333 0.717828 0.146354 0.069354 0.068898 0.748510 0.113238 0.180084 0.158565 0.395933 0.265418 0.136039 0.144274 0.433062 0.286625 0.226802 0.261014 0.213211 0.298973 0.182449 0.069464 0.447584 0.300502 0.314807 0.284781 0.237433 0.162979 Consensus sequence: HHHHDGGGGCGGDBHDV Alignment: HHHHDGGGGCGGDBHDV --SSGGGGCSSSKGBGG ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00099 Ascl2_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 2 15 0.045006 Species: Mus musculus Original motif 0.114462 0.345602 0.289353 0.250583 0.192593 0.250844 0.116250 0.440313 0.338838 0.304929 0.195843 0.160390 0.312051 0.115094 0.162465 0.410390 0.143975 0.600492 0.123348 0.132185 0.078751 0.715072 0.135182 0.070995 0.146191 0.685571 0.069799 0.098439 0.137287 0.646078 0.126428 0.090207 0.335099 0.092260 0.371510 0.201131 0.033090 0.631176 0.074278 0.261456 0.117516 0.619336 0.100946 0.162202 0.114769 0.627362 0.089839 0.168031 0.195787 0.252057 0.220803 0.331353 0.415355 0.120731 0.281372 0.182542 0.111178 0.217079 0.245769 0.425974 0.191517 0.296952 0.153370 0.358162 Consensus sequence: BHVDCCCCDCCCBDBH Reverse complement motif 0.358162 0.296952 0.153370 0.191517 0.425974 0.217079 0.245769 0.111178 0.182542 0.120731 0.281372 0.415355 0.331353 0.252057 0.220803 0.195787 0.114769 0.089839 0.627362 0.168031 0.117516 0.100946 0.619336 0.162202 0.033090 0.074278 0.631176 0.261456 0.335099 0.371510 0.092260 0.201131 0.137287 0.126428 0.646078 0.090207 0.146191 0.069799 0.685571 0.098439 0.078751 0.135182 0.715072 0.070995 0.143975 0.123348 0.600492 0.132185 0.410390 0.115094 0.162465 0.312051 0.160390 0.304929 0.195843 0.338838 0.440313 0.250844 0.116250 0.192593 0.114462 0.289353 0.345602 0.250583 Consensus sequence: HVDVGGGHGGGGDBHB Alignment: BHVDCCCCDCCCBDBH CCBCYSSSGCCCCSS- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00022 Zfp740_primaryOriginal Motif Original Motif Forward 1 15 0.046008 Species: Mus musculus Original motif 0.136946 0.396508 0.135309 0.331236 0.185528 0.417538 0.215409 0.181525 0.171276 0.341901 0.172832 0.313991 0.145641 0.590572 0.146376 0.117412 0.138035 0.660416 0.114016 0.087533 0.222728 0.750532 0.007528 0.019212 0.024633 0.963314 0.001894 0.010159 0.009557 0.979956 0.000642 0.009844 0.010416 0.977424 0.000541 0.011619 0.026401 0.956740 0.001544 0.015314 0.195502 0.755959 0.011060 0.037480 0.491291 0.364785 0.025613 0.118311 0.305153 0.398160 0.071680 0.225008 0.253497 0.232647 0.213246 0.300610 0.156964 0.297876 0.144683 0.400477 0.179549 0.292514 0.319462 0.208475 Consensus sequence: HVBCCCCCCCCMHHHB Reverse complement motif 0.179549 0.319462 0.292514 0.208475 0.400477 0.297876 0.144683 0.156964 0.300610 0.232647 0.213246 0.253497 0.305153 0.071680 0.398160 0.225008 0.118311 0.364785 0.025613 0.491291 0.195502 0.011060 0.755959 0.037480 0.026401 0.001544 0.956740 0.015314 0.010416 0.000541 0.977424 0.011619 0.009557 0.000642 0.979956 0.009844 0.024633 0.001894 0.963314 0.010159 0.222728 0.007528 0.750532 0.019212 0.138035 0.114016 0.660416 0.087533 0.145641 0.146376 0.590572 0.117412 0.171276 0.172832 0.341901 0.313991 0.185528 0.215409 0.417538 0.181525 0.136946 0.135309 0.396508 0.331236 Consensus sequence: BHHDYGGGGGGGGBVD Alignment: HVBCCCCCCCCMHHHB CCBCYSSSGCCCCSS- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 113 Motif name: C113 Original motif 0.039604 0.811881 0.138614 0.009901 0.170000 0.420000 0.150000 0.260000 0.009901 0.851485 0.039604 0.099010 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.070000 0.560000 0.320000 0.050000 0.010000 0.630000 0.090000 0.270000 0.069307 0.495050 0.425743 0.009901 0.260000 0.260000 0.470000 0.010000 0.070000 0.370000 0.540000 0.020000 0.099010 0.722772 0.039604 0.138614 0.171717 0.616162 0.010101 0.202020 0.161616 0.666667 0.010101 0.161616 0.191919 0.606061 0.010101 0.191919 Consensus sequence: CHCCSCSVSCCCC Reserve complement motif 0.191919 0.010101 0.606061 0.191919 0.161616 0.010101 0.666667 0.161616 0.171717 0.010101 0.616162 0.202020 0.099010 0.039604 0.722772 0.138614 0.070000 0.540000 0.370000 0.020000 0.260000 0.470000 0.260000 0.010000 0.069307 0.425743 0.495050 0.009901 0.010000 0.090000 0.630000 0.270000 0.070000 0.320000 0.560000 0.050000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.009901 0.039604 0.851485 0.099010 0.170000 0.150000 0.420000 0.260000 0.039604 0.138614 0.811881 0.009901 Consensus sequence: GGGGSVSGSGGDG ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 113 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00021 Zfp281_primaryOriginal Motif Original Motif Backward 2 13 0.031790 Species: Mus musculus Original motif 0.201535 0.165213 0.201324 0.431929 0.136153 0.443451 0.179132 0.241264 0.263149 0.555137 0.067983 0.113731 0.142183 0.737634 0.045722 0.074461 0.044982 0.884112 0.045356 0.025549 0.246434 0.590578 0.022655 0.140333 0.123049 0.591257 0.033072 0.252622 0.018153 0.944742 0.010254 0.026851 0.035459 0.953844 0.003988 0.006709 0.020000 0.954344 0.005966 0.019690 0.015299 0.964390 0.006755 0.013557 0.028565 0.936152 0.011660 0.023623 0.300127 0.517309 0.029700 0.152863 0.159063 0.513443 0.051834 0.275660 0.158172 0.647055 0.133256 0.061516 Consensus sequence: DBCCCCCCCCCCMYC Reverse complement motif 0.158172 0.133256 0.647055 0.061516 0.159063 0.051834 0.513443 0.275660 0.300127 0.029700 0.517309 0.152863 0.028565 0.011660 0.936152 0.023623 0.015299 0.006755 0.964390 0.013557 0.020000 0.005966 0.954344 0.019690 0.035459 0.003988 0.953844 0.006709 0.018153 0.010254 0.944742 0.026851 0.123049 0.033072 0.591257 0.252622 0.246434 0.022655 0.590578 0.140333 0.044982 0.045356 0.884112 0.025549 0.142183 0.045722 0.737634 0.074461 0.263149 0.067983 0.555137 0.113731 0.136153 0.179132 0.443451 0.241264 0.431929 0.165213 0.201324 0.201535 Consensus sequence: GKRGGGGGGGGGGBD Alignment: DBCCCCCCCCCCMYC -CHCCSCSVSCCCC- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 2 13 0.038443 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB -GGGGSVSGSGGDG--------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 1 13 0.038686 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK GGGGSVSGSGGDG--------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 11 13 0.038793 Species: Mus musculus Original motif 0.404007 0.395873 0.173319 0.026801 0.305977 0.215534 0.215359 0.263130 0.370148 0.250957 0.113088 0.265808 0.324336 0.229498 0.174679 0.271487 0.263563 0.137896 0.079217 0.519324 0.265762 0.222582 0.082555 0.429102 0.206721 0.288405 0.017851 0.487023 0.164361 0.236500 0.061051 0.538088 0.593344 0.348446 0.050304 0.007906 0.031328 0.947050 0.007032 0.014590 0.010428 0.956605 0.029142 0.003825 0.459636 0.207616 0.155368 0.177380 0.014573 0.964608 0.012209 0.008610 0.066291 0.918196 0.008729 0.006784 0.019488 0.866774 0.018897 0.094841 0.767405 0.104198 0.029234 0.099164 0.052494 0.772531 0.039832 0.135142 0.296085 0.243498 0.350935 0.109482 0.518843 0.226659 0.124784 0.129714 0.647901 0.019721 0.159901 0.172477 0.113912 0.231511 0.214864 0.439713 0.223117 0.310596 0.293328 0.172959 0.185557 0.487662 0.136321 0.190459 Consensus sequence: MHHHWHYTMCCHCCCACVAABVH Reverse complement motif 0.185557 0.136321 0.487662 0.190459 0.223117 0.293328 0.310596 0.172959 0.439713 0.231511 0.214864 0.113912 0.172477 0.019721 0.159901 0.647901 0.129714 0.226659 0.124784 0.518843 0.296085 0.350935 0.243498 0.109482 0.052494 0.039832 0.772531 0.135142 0.099164 0.104198 0.029234 0.767405 0.019488 0.018897 0.866774 0.094841 0.066291 0.008729 0.918196 0.006784 0.014573 0.012209 0.964608 0.008610 0.177380 0.207616 0.155368 0.459636 0.010428 0.029142 0.956605 0.003825 0.031328 0.007032 0.947050 0.014590 0.007906 0.348446 0.050304 0.593344 0.538088 0.236500 0.061051 0.164361 0.487023 0.288405 0.017851 0.206721 0.429102 0.222582 0.082555 0.265762 0.519324 0.137896 0.079217 0.263563 0.271487 0.229498 0.174679 0.324336 0.265808 0.250957 0.113088 0.370148 0.263130 0.215534 0.215359 0.305977 0.026801 0.395873 0.173319 0.404007 Consensus sequence: DVVTTVGTGGGHGGYAMHWHHHY Alignment: DVVTTVGTGGGHGGYAMHWHHHY GGGGSVSGSGGDG---------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00022 Zfp740_primaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 13 0.042401 Species: Mus musculus Original motif 0.136946 0.396508 0.135309 0.331236 0.185528 0.417538 0.215409 0.181525 0.171276 0.341901 0.172832 0.313991 0.145641 0.590572 0.146376 0.117412 0.138035 0.660416 0.114016 0.087533 0.222728 0.750532 0.007528 0.019212 0.024633 0.963314 0.001894 0.010159 0.009557 0.979956 0.000642 0.009844 0.010416 0.977424 0.000541 0.011619 0.026401 0.956740 0.001544 0.015314 0.195502 0.755959 0.011060 0.037480 0.491291 0.364785 0.025613 0.118311 0.305153 0.398160 0.071680 0.225008 0.253497 0.232647 0.213246 0.300610 0.156964 0.297876 0.144683 0.400477 0.179549 0.292514 0.319462 0.208475 Consensus sequence: HVBCCCCCCCCMHHHB Reverse complement motif 0.179549 0.319462 0.292514 0.208475 0.400477 0.297876 0.144683 0.156964 0.300610 0.232647 0.213246 0.253497 0.305153 0.071680 0.398160 0.225008 0.118311 0.364785 0.025613 0.491291 0.195502 0.011060 0.755959 0.037480 0.026401 0.001544 0.956740 0.015314 0.010416 0.000541 0.977424 0.011619 0.009557 0.000642 0.979956 0.009844 0.024633 0.001894 0.963314 0.010159 0.222728 0.007528 0.750532 0.019212 0.138035 0.114016 0.660416 0.087533 0.145641 0.146376 0.590572 0.117412 0.171276 0.172832 0.341901 0.313991 0.185528 0.215409 0.417538 0.181525 0.136946 0.135309 0.396508 0.331236 Consensus sequence: BHHDYGGGGGGGGBVD Alignment: HVBCCCCCCCCMHHHB ---CHCCSCSVSCCCC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 114 Motif name: C114 Original motif 0.050000 0.290000 0.480000 0.180000 0.580000 0.010000 0.390000 0.020000 0.750000 0.010000 0.230000 0.010000 0.410000 0.010000 0.570000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.138614 0.801980 0.009901 0.049505 0.445545 0.455446 0.009901 0.089109 0.069307 0.009901 0.425743 0.495050 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.080000 0.140000 0.140000 0.640000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.009901 0.396040 0.059406 0.534653 0.140000 0.480000 0.330000 0.050000 Consensus sequence: SRARCCMKGTCTYS Reserve complement motif 0.140000 0.330000 0.480000 0.050000 0.534653 0.396040 0.059406 0.009901 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.640000 0.140000 0.140000 0.080000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.495050 0.009901 0.425743 0.069307 0.445545 0.009901 0.455446 0.089109 0.138614 0.009901 0.801980 0.049505 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.410000 0.570000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.230000 0.750000 0.020000 0.010000 0.390000 0.580000 0.050000 0.480000 0.290000 0.180000 Consensus sequence: SMAGACRRGGMTKS ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 114 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00082 Zfp187_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 1 14 0.021968 Species: Mus musculus Original motif 0.173063 0.169680 0.440836 0.216421 0.353277 0.179996 0.249403 0.217325 0.307337 0.038055 0.616380 0.038228 0.316636 0.564670 0.023732 0.094962 0.015484 0.923764 0.019439 0.041313 0.011243 0.956300 0.009443 0.023014 0.062273 0.107531 0.010739 0.819456 0.126670 0.201521 0.192005 0.479803 0.093090 0.045924 0.835792 0.025194 0.020165 0.015483 0.009567 0.954786 0.010873 0.672448 0.004559 0.312121 0.018002 0.846860 0.017605 0.117533 0.335703 0.408170 0.104095 0.152031 0.150308 0.362296 0.067408 0.419988 0.286490 0.242211 0.176532 0.294767 0.265022 0.249655 0.272219 0.213104 Consensus sequence: DDGMCCTBGTCCHYHV Reverse complement motif 0.265022 0.272219 0.249655 0.213104 0.294767 0.242211 0.176532 0.286490 0.419988 0.362296 0.067408 0.150308 0.335703 0.104095 0.408170 0.152031 0.018002 0.017605 0.846860 0.117533 0.010873 0.004559 0.672448 0.312121 0.954786 0.015483 0.009567 0.020165 0.093090 0.835792 0.045924 0.025194 0.479803 0.201521 0.192005 0.126670 0.819456 0.107531 0.010739 0.062273 0.011243 0.009443 0.956300 0.023014 0.015484 0.019439 0.923764 0.041313 0.316636 0.023732 0.564670 0.094962 0.307337 0.616380 0.038055 0.038228 0.217325 0.179996 0.249403 0.353277 0.173063 0.440836 0.169680 0.216421 Consensus sequence: VHMDGGACVAGGRCDH Alignment: DDGMCCTBGTCCHYHV SRARCCMKGTCTYS-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00002 Sp4_secondary Reverse Complement Original Motif Forward 2 14 0.032033 Species: Mus musculus Original motif 0.146334 0.312326 0.244281 0.297060 0.493155 0.092609 0.162506 0.251729 0.503593 0.059863 0.077561 0.358984 0.763321 0.015264 0.213114 0.008301 0.012415 0.025932 0.945502 0.016151 0.006713 0.015221 0.950098 0.027968 0.062415 0.834303 0.054500 0.048782 0.011010 0.020677 0.928821 0.039493 0.012785 0.024162 0.145822 0.817231 0.133595 0.033962 0.787876 0.044567 0.140697 0.180481 0.428253 0.250570 0.036281 0.806412 0.033510 0.123797 0.157910 0.408607 0.122427 0.311055 0.292185 0.260017 0.197515 0.250283 0.251107 0.124480 0.359447 0.264967 Consensus sequence: BDWAGGCGTGBCHHD Reverse complement motif 0.251107 0.359447 0.124480 0.264967 0.250283 0.260017 0.197515 0.292185 0.157910 0.122427 0.408607 0.311055 0.036281 0.033510 0.806412 0.123797 0.140697 0.428253 0.180481 0.250570 0.133595 0.787876 0.033962 0.044567 0.817231 0.024162 0.145822 0.012785 0.011010 0.928821 0.020677 0.039493 0.062415 0.054500 0.834303 0.048782 0.006713 0.950098 0.015221 0.027968 0.012415 0.945502 0.025932 0.016151 0.008301 0.015264 0.213114 0.763321 0.358984 0.059863 0.077561 0.503593 0.251729 0.092609 0.162506 0.493155 0.146334 0.244281 0.312326 0.297060 Consensus sequence: HHDGBCACGCCTWDB Alignment: BDWAGGCGTGBCHHD -SMAGACRRGGMTKS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00093 Klf7_primary Original Motif Original Motif Backward 3 14 0.032045 Species: Mus musculus Original motif 0.204514 0.198353 0.171218 0.425915 0.167188 0.296785 0.246082 0.289946 0.267330 0.148001 0.398674 0.185994 0.549386 0.060167 0.337100 0.053347 0.050746 0.900013 0.022169 0.027073 0.037905 0.920332 0.008360 0.033403 0.410356 0.566702 0.016267 0.006675 0.009526 0.982354 0.001060 0.007060 0.204292 0.001084 0.748567 0.046056 0.003955 0.988490 0.002821 0.004735 0.004264 0.988826 0.004311 0.002598 0.002758 0.929549 0.001244 0.066448 0.260332 0.421683 0.024720 0.293265 0.184798 0.247697 0.085237 0.482268 0.347537 0.197344 0.139961 0.315159 0.255281 0.166620 0.242297 0.335802 Consensus sequence: HBDRCCMCGCCCHHHD Reverse complement motif 0.335802 0.166620 0.242297 0.255281 0.315159 0.197344 0.139961 0.347537 0.482268 0.247697 0.085237 0.184798 0.260332 0.024720 0.421683 0.293265 0.002758 0.001244 0.929549 0.066448 0.004264 0.004311 0.988826 0.002598 0.003955 0.002821 0.988490 0.004735 0.204292 0.748567 0.001084 0.046056 0.009526 0.001060 0.982354 0.007060 0.410356 0.016267 0.566702 0.006675 0.037905 0.008360 0.920332 0.033403 0.050746 0.022169 0.900013 0.027073 0.053347 0.060167 0.337100 0.549386 0.267330 0.398674 0.148001 0.185994 0.167188 0.246082 0.296785 0.289946 0.425915 0.198353 0.171218 0.204514 Consensus sequence: DHHDGGGCGRGGKHBH Alignment: HBDRCCMCGCCCHHHD SRARCCMKGTCTYS-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00007 Egr1_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 2 14 0.033857 Species: Mus musculus Original motif 0.182057 0.230014 0.276532 0.311397 0.122004 0.156883 0.366166 0.354947 0.209446 0.335433 0.185677 0.269444 0.140035 0.276547 0.302466 0.280952 0.124879 0.019371 0.809895 0.045854 0.647807 0.117014 0.183956 0.051224 0.021434 0.011745 0.954633 0.012188 0.017853 0.009441 0.315429 0.657277 0.166123 0.008326 0.807215 0.018337 0.022775 0.008972 0.947283 0.020970 0.038795 0.033592 0.781209 0.146405 0.728916 0.032888 0.088836 0.149360 0.197826 0.427858 0.055755 0.318561 0.264938 0.196184 0.092516 0.446362 0.267969 0.195624 0.318766 0.217641 0.225006 0.250404 0.267265 0.257324 Consensus sequence: BBHBGAGTGGGAHHDB Reverse complement motif 0.225006 0.267265 0.250404 0.257324 0.267969 0.318766 0.195624 0.217641 0.446362 0.196184 0.092516 0.264938 0.197826 0.055755 0.427858 0.318561 0.149360 0.032888 0.088836 0.728916 0.038795 0.781209 0.033592 0.146405 0.022775 0.947283 0.008972 0.020970 0.166123 0.807215 0.008326 0.018337 0.657277 0.009441 0.315429 0.017853 0.021434 0.954633 0.011745 0.012188 0.051224 0.117014 0.183956 0.647807 0.124879 0.809895 0.019371 0.045854 0.140035 0.302466 0.276547 0.280952 0.209446 0.185677 0.335433 0.269444 0.122004 0.366166 0.156883 0.354947 0.311397 0.230014 0.276532 0.182057 Consensus sequence: BHHDTCCCACTCBDBV Alignment: BBHBGAGTGGGAHHDB -SMAGACRRGGMTKS- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00009 Nr2f2_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 3 14 0.035046 Species: Mus musculus Original motif 0.195749 0.435700 0.196915 0.171636 0.131070 0.131912 0.417834 0.319184 0.238959 0.441529 0.174973 0.144539 0.187749 0.189727 0.405849 0.216675 0.006751 0.541370 0.182092 0.269787 0.005388 0.590608 0.339869 0.064135 0.088153 0.004666 0.902351 0.004830 0.002459 0.004278 0.982637 0.010626 0.003618 0.002504 0.985275 0.008602 0.003325 0.004017 0.009244 0.983414 0.002547 0.972864 0.005345 0.019244 0.940260 0.002927 0.053632 0.003181 0.222459 0.390569 0.251497 0.135475 0.151824 0.258444 0.332866 0.256865 0.175811 0.290583 0.232086 0.301520 0.356690 0.198973 0.136050 0.308287 Consensus sequence: VBVBCSGGGTCAVBBH Reverse complement motif 0.308287 0.198973 0.136050 0.356690 0.301520 0.290583 0.232086 0.175811 0.151824 0.332866 0.258444 0.256865 0.222459 0.251497 0.390569 0.135475 0.003181 0.002927 0.053632 0.940260 0.002547 0.005345 0.972864 0.019244 0.983414 0.004017 0.009244 0.003325 0.003618 0.985275 0.002504 0.008602 0.002459 0.982637 0.004278 0.010626 0.088153 0.902351 0.004666 0.004830 0.005388 0.339869 0.590608 0.064135 0.006751 0.182092 0.541370 0.269787 0.187749 0.405849 0.189727 0.216675 0.238959 0.174973 0.441529 0.144539 0.131070 0.417834 0.131912 0.319184 0.195749 0.196915 0.435700 0.171636 Consensus sequence: HVBVTGACCCSGBVBV Alignment: VBVBCSGGGTCAVBBH SRARCCMKGTCTYS-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 115 Motif name: C115 Original motif 0.410000 0.370000 0.070000 0.150000 0.280000 0.120000 0.150000 0.450000 0.640000 0.010000 0.340000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.128713 0.009901 0.366337 0.495050 0.030000 0.070000 0.890000 0.010000 0.020000 0.480000 0.480000 0.020000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.128713 0.009901 0.831683 0.029703 0.138614 0.009901 0.841584 0.009901 0.009901 0.198020 0.742574 0.049505 0.445545 0.207921 0.148515 0.198020 0.190000 0.010000 0.340000 0.460000 Consensus sequence: MDRGKGSTGGGHK Reserve complement motif 0.460000 0.010000 0.340000 0.190000 0.198020 0.207921 0.148515 0.445545 0.009901 0.742574 0.198020 0.049505 0.138614 0.841584 0.009901 0.009901 0.128713 0.831683 0.009901 0.029703 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.020000 0.480000 0.480000 0.020000 0.030000 0.890000 0.070000 0.010000 0.495050 0.009901 0.366337 0.128713 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.340000 0.640000 0.450000 0.120000 0.150000 0.280000 0.150000 0.370000 0.070000 0.410000 Consensus sequence: RHCCCASCRCKDY ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 115 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00099 Ascl2_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 3 13 0.010704 Species: Mus musculus Original motif 0.114462 0.345602 0.289353 0.250583 0.192593 0.250844 0.116250 0.440313 0.338838 0.304929 0.195843 0.160390 0.312051 0.115094 0.162465 0.410390 0.143975 0.600492 0.123348 0.132185 0.078751 0.715072 0.135182 0.070995 0.146191 0.685571 0.069799 0.098439 0.137287 0.646078 0.126428 0.090207 0.335099 0.092260 0.371510 0.201131 0.033090 0.631176 0.074278 0.261456 0.117516 0.619336 0.100946 0.162202 0.114769 0.627362 0.089839 0.168031 0.195787 0.252057 0.220803 0.331353 0.415355 0.120731 0.281372 0.182542 0.111178 0.217079 0.245769 0.425974 0.191517 0.296952 0.153370 0.358162 Consensus sequence: BHVDCCCCDCCCBDBH Reverse complement motif 0.358162 0.296952 0.153370 0.191517 0.425974 0.217079 0.245769 0.111178 0.182542 0.120731 0.281372 0.415355 0.331353 0.252057 0.220803 0.195787 0.114769 0.089839 0.627362 0.168031 0.117516 0.100946 0.619336 0.162202 0.033090 0.074278 0.631176 0.261456 0.335099 0.371510 0.092260 0.201131 0.137287 0.126428 0.646078 0.090207 0.146191 0.069799 0.685571 0.098439 0.078751 0.135182 0.715072 0.070995 0.143975 0.123348 0.600492 0.132185 0.410390 0.115094 0.162465 0.312051 0.160390 0.304929 0.195843 0.338838 0.440313 0.250844 0.116250 0.192593 0.114462 0.289353 0.345602 0.250583 Consensus sequence: HVDVGGGHGGGGDBHB Alignment: HVDVGGGHGGGGDBHB -MDRGKGSTGGGHK-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00043 Bcl6b_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 2 13 0.011942 Species: Mus musculus Original motif 0.316572 0.278382 0.152556 0.252490 0.167141 0.257034 0.259894 0.315931 0.175523 0.325956 0.259996 0.238525 0.165052 0.385677 0.239449 0.209822 0.069489 0.782718 0.072454 0.075339 0.049943 0.800636 0.031988 0.117433 0.223382 0.060306 0.552691 0.163621 0.072944 0.818252 0.034406 0.074398 0.070535 0.845127 0.062712 0.021626 0.031035 0.859354 0.055424 0.054187 0.063668 0.798503 0.067274 0.070554 0.348488 0.030697 0.197179 0.423636 0.307220 0.256470 0.181009 0.255301 0.460933 0.285057 0.090258 0.163752 0.315798 0.228431 0.171135 0.284637 0.374527 0.268328 0.198810 0.158335 Consensus sequence: HBBBCCGCCCCWHHHV Reverse complement motif 0.158335 0.268328 0.198810 0.374527 0.284637 0.228431 0.171135 0.315798 0.163752 0.285057 0.090258 0.460933 0.255301 0.256470 0.181009 0.307220 0.423636 0.030697 0.197179 0.348488 0.063668 0.067274 0.798503 0.070554 0.031035 0.055424 0.859354 0.054187 0.070535 0.062712 0.845127 0.021626 0.072944 0.034406 0.818252 0.074398 0.223382 0.552691 0.060306 0.163621 0.049943 0.031988 0.800636 0.117433 0.069489 0.072454 0.782718 0.075339 0.165052 0.239449 0.385677 0.209822 0.175523 0.259996 0.325956 0.238525 0.315931 0.257034 0.259894 0.167141 0.252490 0.278382 0.152556 0.316572 Consensus sequence: BHHHWGGGGCGGBBVH Alignment: BHHHWGGGGCGGBBVH --MDRGKGSTGGGHK- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00000 Smad3_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 2 13 0.014271 Species: Mus musculus Original motif 0.150668 0.131779 0.245665 0.471887 0.316817 0.287314 0.150829 0.245040 0.256473 0.409066 0.109700 0.224761 0.210646 0.220222 0.345010 0.224122 0.166679 0.508939 0.081676 0.242705 0.049351 0.759380 0.088489 0.102780 0.047598 0.785546 0.121957 0.044898 0.004606 0.944933 0.034696 0.015764 0.040252 0.050652 0.890382 0.018713 0.003038 0.913699 0.022449 0.060814 0.028672 0.941477 0.012276 0.017575 0.635243 0.139731 0.110495 0.114531 0.240016 0.385948 0.182848 0.191188 0.210430 0.274127 0.085171 0.430272 0.088118 0.454598 0.208989 0.248295 0.181269 0.265028 0.149023 0.404680 0.101070 0.252682 0.368542 0.277706 Consensus sequence: DHHBCCCCGCCAHHBHB Reverse complement motif 0.101070 0.368542 0.252682 0.277706 0.404680 0.265028 0.149023 0.181269 0.088118 0.208989 0.454598 0.248295 0.430272 0.274127 0.085171 0.210430 0.240016 0.182848 0.385948 0.191188 0.114531 0.139731 0.110495 0.635243 0.028672 0.012276 0.941477 0.017575 0.003038 0.022449 0.913699 0.060814 0.040252 0.890382 0.050652 0.018713 0.004606 0.034696 0.944933 0.015764 0.047598 0.121957 0.785546 0.044898 0.049351 0.088489 0.759380 0.102780 0.166679 0.081676 0.508939 0.242705 0.210646 0.345010 0.220222 0.224122 0.256473 0.109700 0.409066 0.224761 0.245040 0.287314 0.150829 0.316817 0.471887 0.131779 0.245665 0.150668 Consensus sequence: BHBHDTGGCGGGGBDHD Alignment: DHHBCCCCGCCAHHBHB ---RHCCCASCRCKDY- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00033 Zfp410_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 3 13 0.014570 Species: Mus musculus Original motif 0.162979 0.284781 0.237433 0.314807 0.182449 0.447584 0.069464 0.300502 0.298973 0.261014 0.213211 0.226802 0.136039 0.433062 0.144274 0.286625 0.180084 0.395933 0.158565 0.265418 0.069354 0.748510 0.068898 0.113238 0.060485 0.717828 0.075333 0.146354 0.023280 0.071762 0.645500 0.259457 0.166896 0.749762 0.062730 0.020612 0.050401 0.775248 0.089072 0.085279 0.103847 0.767557 0.068804 0.059791 0.064815 0.748318 0.114588 0.072280 0.340921 0.071942 0.242981 0.344157 0.301967 0.263512 0.165927 0.268594 0.479800 0.222955 0.118441 0.178803 0.229469 0.283621 0.143099 0.343811 0.261733 0.180191 0.169905 0.388170 Consensus sequence: BHHBHCCGCCCCDHHHH Reverse complement motif 0.388170 0.180191 0.169905 0.261733 0.343811 0.283621 0.143099 0.229469 0.178803 0.222955 0.118441 0.479800 0.268594 0.263512 0.165927 0.301967 0.344157 0.071942 0.242981 0.340921 0.064815 0.114588 0.748318 0.072280 0.103847 0.068804 0.767557 0.059791 0.050401 0.089072 0.775248 0.085279 0.166896 0.062730 0.749762 0.020612 0.023280 0.645500 0.071762 0.259457 0.060485 0.075333 0.717828 0.146354 0.069354 0.068898 0.748510 0.113238 0.180084 0.158565 0.395933 0.265418 0.136039 0.144274 0.433062 0.286625 0.226802 0.261014 0.213211 0.298973 0.182449 0.069464 0.447584 0.300502 0.314807 0.284781 0.237433 0.162979 Consensus sequence: HHHHDGGGGCGGDBHDV Alignment: HHHHDGGGGCGGDBHDV --MDRGKGSTGGGHK-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00002 Sp4_secondary Original Motif Original Motif Backward 2 13 0.020060 Species: Mus musculus Original motif 0.146334 0.312326 0.244281 0.297060 0.493155 0.092609 0.162506 0.251729 0.503593 0.059863 0.077561 0.358984 0.763321 0.015264 0.213114 0.008301 0.012415 0.025932 0.945502 0.016151 0.006713 0.015221 0.950098 0.027968 0.062415 0.834303 0.054500 0.048782 0.011010 0.020677 0.928821 0.039493 0.012785 0.024162 0.145822 0.817231 0.133595 0.033962 0.787876 0.044567 0.140697 0.180481 0.428253 0.250570 0.036281 0.806412 0.033510 0.123797 0.157910 0.408607 0.122427 0.311055 0.292185 0.260017 0.197515 0.250283 0.251107 0.124480 0.359447 0.264967 Consensus sequence: BDWAGGCGTGBCHHD Reverse complement motif 0.251107 0.359447 0.124480 0.264967 0.250283 0.260017 0.197515 0.292185 0.157910 0.122427 0.408607 0.311055 0.036281 0.033510 0.806412 0.123797 0.140697 0.428253 0.180481 0.250570 0.133595 0.787876 0.033962 0.044567 0.817231 0.024162 0.145822 0.012785 0.011010 0.928821 0.020677 0.039493 0.062415 0.054500 0.834303 0.048782 0.006713 0.950098 0.015221 0.027968 0.012415 0.945502 0.025932 0.016151 0.008301 0.015264 0.213114 0.763321 0.358984 0.059863 0.077561 0.503593 0.251729 0.092609 0.162506 0.493155 0.146334 0.244281 0.312326 0.297060 Consensus sequence: HHDGBCACGCCTWDB Alignment: BDWAGGCGTGBCHHD -MDRGKGSTGGGHK- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 116 Motif name: C116 Original motif 0.430000 0.120000 0.010000 0.440000 0.480000 0.020000 0.090000 0.410000 0.400000 0.460000 0.020000 0.120000 0.820000 0.010000 0.010000 0.160000 0.440000 0.090000 0.010000 0.460000 0.623762 0.108911 0.217822 0.049505 0.009901 0.772277 0.099010 0.118812 0.940000 0.040000 0.010000 0.010000 0.118812 0.673267 0.079208 0.128713 0.470000 0.070000 0.010000 0.450000 0.320000 0.620000 0.010000 0.050000 0.920000 0.060000 0.010000 0.010000 0.430000 0.090000 0.020000 0.460000 0.504950 0.009901 0.089109 0.396040 Consensus sequence: WWMAWACACWMAWW Reserve complement motif 0.396040 0.009901 0.089109 0.504950 0.460000 0.090000 0.020000 0.430000 0.010000 0.060000 0.010000 0.920000 0.320000 0.010000 0.620000 0.050000 0.450000 0.070000 0.010000 0.470000 0.118812 0.079208 0.673267 0.128713 0.010000 0.040000 0.010000 0.940000 0.009901 0.099010 0.772277 0.118812 0.049505 0.108911 0.217822 0.623762 0.460000 0.090000 0.010000 0.440000 0.160000 0.010000 0.010000 0.820000 0.400000 0.020000 0.460000 0.120000 0.410000 0.020000 0.090000 0.480000 0.440000 0.120000 0.010000 0.430000 Consensus sequence: WWTRWGTGTWTRWW ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 116 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00055 Hbp1_primary Original Motif Reverse Complement Forward 1 14 0.024260 Species: Mus musculus Original motif 0.348694 0.177225 0.158977 0.315104 0.241477 0.301470 0.225252 0.231801 0.299530 0.177310 0.188699 0.334462 0.413829 0.141414 0.102784 0.341973 0.032644 0.017968 0.004577 0.944811 0.021091 0.330699 0.642563 0.005647 0.969224 0.001914 0.005956 0.022906 0.969063 0.003485 0.003398 0.024054 0.013104 0.003523 0.002842 0.980532 0.005485 0.020244 0.932599 0.041672 0.757494 0.002617 0.231695 0.008193 0.865658 0.039206 0.073039 0.022097 0.110535 0.114879 0.043620 0.730965 0.186322 0.154540 0.442471 0.216667 0.366490 0.152622 0.256688 0.224200 0.216146 0.261309 0.238703 0.283842 Consensus sequence: HHDWTSAATGAATDDB Reverse complement motif 0.283842 0.261309 0.238703 0.216146 0.224200 0.152622 0.256688 0.366490 0.186322 0.442471 0.154540 0.216667 0.730965 0.114879 0.043620 0.110535 0.022097 0.039206 0.073039 0.865658 0.008193 0.002617 0.231695 0.757494 0.005485 0.932599 0.020244 0.041672 0.980532 0.003523 0.002842 0.013104 0.024054 0.003485 0.003398 0.969063 0.022906 0.001914 0.005956 0.969224 0.021091 0.642563 0.330699 0.005647 0.944811 0.017968 0.004577 0.032644 0.341973 0.141414 0.102784 0.413829 0.334462 0.177310 0.188699 0.299530 0.241477 0.225252 0.301470 0.231801 0.315104 0.177225 0.158977 0.348694 Consensus sequence: VDHATTCATTSAWDDH Alignment: HHDWTSAATGAATDDB WWMAWACACWMAWW-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00061 Foxl1_primary Original Motif Original Motif Forward 1 14 0.026290 Species: Mus musculus Original motif 0.323208 0.152915 0.185111 0.338766 0.428132 0.056109 0.099487 0.416272 0.659386 0.039965 0.035805 0.264843 0.647143 0.049206 0.078984 0.224667 0.208834 0.076592 0.071631 0.642943 0.341077 0.003865 0.649511 0.005547 0.016627 0.001866 0.001715 0.979792 0.952319 0.045294 0.000870 0.001516 0.988834 0.004620 0.000720 0.005826 0.989346 0.001005 0.006467 0.003182 0.001093 0.784230 0.001235 0.213442 0.991209 0.002017 0.001737 0.005037 0.801581 0.037084 0.023060 0.138274 0.528554 0.089350 0.107501 0.274595 0.208802 0.268646 0.368022 0.154530 0.280218 0.221367 0.340497 0.157918 0.146611 0.250725 0.293524 0.309140 Consensus sequence: DWAATRTAAACAAWVVB Reverse complement motif 0.309140 0.250725 0.293524 0.146611 0.280218 0.340497 0.221367 0.157918 0.208802 0.368022 0.268646 0.154530 0.274595 0.089350 0.107501 0.528554 0.138274 0.037084 0.023060 0.801581 0.005037 0.002017 0.001737 0.991209 0.001093 0.001235 0.784230 0.213442 0.003182 0.001005 0.006467 0.989346 0.005826 0.004620 0.000720 0.988834 0.001516 0.045294 0.000870 0.952319 0.979792 0.001866 0.001715 0.016627 0.341077 0.649511 0.003865 0.005547 0.642943 0.076592 0.071631 0.208834 0.224667 0.049206 0.078984 0.647143 0.264843 0.039965 0.035805 0.659386 0.416272 0.056109 0.099487 0.428132 0.338766 0.152915 0.185111 0.323208 Consensus sequence: VVVWTTGTTTAMATTWD Alignment: DWAATRTAAACAAWVVB WWMAWACACWMAWW--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 7 14 0.026772 Species: Mus musculus Original motif 0.067627 0.131333 0.654425 0.146615 0.156488 0.114442 0.145630 0.583441 0.206450 0.265630 0.358017 0.169903 0.090729 0.460713 0.274712 0.173847 0.285994 0.099998 0.154485 0.459523 0.635908 0.184787 0.072982 0.106323 0.748421 0.039204 0.092605 0.119769 0.081342 0.061327 0.044532 0.812799 0.143120 0.043879 0.024216 0.788785 0.247544 0.092102 0.621453 0.038901 0.295531 0.036295 0.027594 0.640580 0.194561 0.305468 0.339916 0.160055 0.175038 0.193568 0.101212 0.530182 0.145226 0.167488 0.559871 0.127415 0.271501 0.237429 0.206701 0.284369 0.216834 0.109191 0.569605 0.104370 0.182624 0.177160 0.300475 0.339742 0.331737 0.198645 0.265137 0.204482 0.230155 0.359365 0.183450 0.227029 0.056581 0.067297 0.463052 0.413070 0.198891 0.324626 0.304424 0.172059 0.181968 0.287547 0.202419 0.328066 Consensus sequence: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB Reverse complement motif 0.328066 0.287547 0.202419 0.181968 0.198891 0.304424 0.324626 0.172059 0.056581 0.463052 0.067297 0.413070 0.230155 0.183450 0.359365 0.227029 0.204482 0.198645 0.265137 0.331737 0.339742 0.177160 0.300475 0.182624 0.216834 0.569605 0.109191 0.104370 0.284369 0.237429 0.206701 0.271501 0.145226 0.559871 0.167488 0.127415 0.530182 0.193568 0.101212 0.175038 0.194561 0.339916 0.305468 0.160055 0.640580 0.036295 0.027594 0.295531 0.247544 0.621453 0.092102 0.038901 0.788785 0.043879 0.024216 0.143120 0.812799 0.061327 0.044532 0.081342 0.119769 0.039204 0.092605 0.748421 0.106323 0.184787 0.072982 0.635908 0.459523 0.099998 0.154485 0.285994 0.090729 0.274712 0.460713 0.173847 0.206450 0.358017 0.265630 0.169903 0.583441 0.114442 0.145630 0.156488 0.067627 0.654425 0.131333 0.146615 Consensus sequence: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC Alignment: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB ------WWTRWGTGTWTRWW-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00228 Bapx1 Reverse Complement Reverse Complement Forward 4 14 0.027012 Species: Mus musculus Original motif 0.301697 0.347856 0.239075 0.111372 0.364458 0.225587 0.074842 0.335112 0.228472 0.141747 0.139010 0.490770 0.559532 0.164793 0.197557 0.078118 0.506611 0.130882 0.113226 0.249281 0.054222 0.680706 0.257913 0.007160 0.001978 0.899030 0.000622 0.098369 0.950561 0.002121 0.000888 0.046429 0.037529 0.960534 0.000660 0.001278 0.001571 0.005538 0.001403 0.991487 0.001274 0.052527 0.000520 0.945679 0.926306 0.006886 0.003823 0.062985 0.638246 0.038639 0.145042 0.178072 0.266452 0.337698 0.283972 0.111878 0.307019 0.250170 0.243307 0.199504 0.550380 0.190997 0.122920 0.135703 0.187982 0.330356 0.168897 0.312765 Consensus sequence: VHHAACCACTTAAVVAH Reverse complement motif 0.187982 0.168897 0.330356 0.312765 0.135703 0.190997 0.122920 0.550380 0.199504 0.250170 0.243307 0.307019 0.266452 0.283972 0.337698 0.111878 0.178072 0.038639 0.145042 0.638246 0.062985 0.006886 0.003823 0.926306 0.945679 0.052527 0.000520 0.001274 0.991487 0.005538 0.001403 0.001571 0.037529 0.000660 0.960534 0.001278 0.046429 0.002121 0.000888 0.950561 0.001978 0.000622 0.899030 0.098369 0.054222 0.257913 0.680706 0.007160 0.249281 0.130882 0.113226 0.506611 0.078118 0.164793 0.197557 0.559532 0.490770 0.141747 0.139010 0.228472 0.335112 0.225587 0.074842 0.364458 0.301697 0.239075 0.347856 0.111372 Consensus sequence: DTBVTTAAGTGGTTHHV Alignment: DTBVTTAAGTGGTTHHV ---WWTRWGTGTWTRWW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00037 Zfp105_primaryOriginal Motif Original Motif Forward 1 14 0.027164 Species: Mus musculus Original motif 0.363104 0.182807 0.145232 0.308856 0.419707 0.133742 0.222546 0.224005 0.164481 0.418263 0.052397 0.364858 0.715575 0.117639 0.064914 0.101872 0.883836 0.026985 0.032584 0.056596 0.558797 0.151280 0.033120 0.256803 0.267037 0.403488 0.026746 0.302729 0.939762 0.013627 0.034579 0.012032 0.897072 0.009878 0.035642 0.057408 0.305904 0.516040 0.055311 0.122746 0.880940 0.027958 0.048350 0.042752 0.710082 0.052464 0.040250 0.197204 0.246712 0.125155 0.318627 0.309506 0.429749 0.181755 0.176892 0.211603 0.339643 0.097216 0.355250 0.207891 Consensus sequence: HDYAAAHAAMAADHD Reverse complement motif 0.339643 0.355250 0.097216 0.207891 0.211603 0.181755 0.176892 0.429749 0.246712 0.318627 0.125155 0.309506 0.197204 0.052464 0.040250 0.710082 0.042752 0.027958 0.048350 0.880940 0.305904 0.055311 0.516040 0.122746 0.057408 0.009878 0.035642 0.897072 0.012032 0.013627 0.034579 0.939762 0.267037 0.026746 0.403488 0.302729 0.256803 0.151280 0.033120 0.558797 0.056596 0.026985 0.032584 0.883836 0.101872 0.117639 0.064914 0.715575 0.164481 0.052397 0.418263 0.364858 0.224005 0.133742 0.222546 0.419707 0.308856 0.182807 0.145232 0.363104 Consensus sequence: HHHTTRTTDTTTKDH Alignment: HDYAAAHAAMAADHD WWMAWACACWMAWW- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 117 Motif name: C117 Original motif 0.079208 0.801980 0.039604 0.079208 0.504950 0.415842 0.029703 0.049505 0.010000 0.960000 0.010000 0.020000 0.524752 0.019802 0.009901 0.445545 0.425743 0.128713 0.425743 0.019802 0.050000 0.290000 0.510000 0.150000 0.010000 0.890000 0.090000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.009901 0.089109 0.752475 0.148515 0.009901 0.495050 0.099010 0.396040 0.009901 0.782178 0.138614 0.069307 0.029703 0.742574 0.009901 0.217822 0.080000 0.080000 0.420000 0.420000 0.089109 0.069307 0.762376 0.079208 Consensus sequence: CMCWRSCTGYCCKG Reserve complement motif 0.089109 0.762376 0.069307 0.079208 0.080000 0.420000 0.080000 0.420000 0.029703 0.009901 0.742574 0.217822 0.009901 0.138614 0.782178 0.069307 0.009901 0.099010 0.495050 0.396040 0.009901 0.752475 0.089109 0.148515 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.090000 0.890000 0.010000 0.050000 0.510000 0.290000 0.150000 0.019802 0.128713 0.425743 0.425743 0.445545 0.019802 0.009901 0.524752 0.010000 0.010000 0.960000 0.020000 0.049505 0.415842 0.029703 0.504950 0.079208 0.039604 0.801980 0.079208 Consensus sequence: CYGGKCAGSKWGYG ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 117 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00031 Zbtb3_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 1 14 0.023372 Species: Mus musculus Original motif 0.110412 0.519910 0.162398 0.207280 0.470593 0.172893 0.115202 0.241311 0.467126 0.160175 0.227365 0.145334 0.196112 0.169855 0.079068 0.554965 0.198275 0.671393 0.026094 0.104237 0.793465 0.046739 0.110258 0.049538 0.058204 0.867549 0.045603 0.028645 0.079471 0.027484 0.025248 0.867797 0.032277 0.065893 0.827417 0.074413 0.080553 0.119144 0.585050 0.215253 0.105106 0.470208 0.170921 0.253765 0.690158 0.033925 0.171121 0.104796 0.299543 0.155890 0.362586 0.181981 0.343375 0.213360 0.180067 0.263198 0.364819 0.149053 0.181128 0.305000 0.247818 0.143948 0.217882 0.390352 Consensus sequence: CHVTCACTGGBADHDD Reverse complement motif 0.390352 0.143948 0.217882 0.247818 0.305000 0.149053 0.181128 0.364819 0.263198 0.213360 0.180067 0.343375 0.299543 0.362586 0.155890 0.181981 0.104796 0.033925 0.171121 0.690158 0.105106 0.170921 0.470208 0.253765 0.080553 0.585050 0.119144 0.215253 0.032277 0.827417 0.065893 0.074413 0.867797 0.027484 0.025248 0.079471 0.058204 0.045603 0.867549 0.028645 0.049538 0.046739 0.110258 0.793465 0.198275 0.026094 0.671393 0.104237 0.554965 0.169855 0.079068 0.196112 0.145334 0.160175 0.227365 0.467126 0.241311 0.172893 0.115202 0.470593 0.110412 0.162398 0.519910 0.207280 Consensus sequence: DDHHTBCCAGTGABHG Alignment: DDHHTBCCAGTGABHG --CYGGKCAGSKWGYG ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00092 Myb_secondary Reverse Complement Reverse Complement Forward 2 14 0.023872 Species: Mus musculus Original motif 0.205499 0.277575 0.259453 0.257473 0.195121 0.188791 0.391777 0.224311 0.514704 0.191753 0.122477 0.171066 0.063609 0.633099 0.088173 0.215120 0.125737 0.620566 0.012681 0.241016 0.985342 0.002529 0.005984 0.006145 0.986092 0.007796 0.003341 0.002771 0.004947 0.985867 0.004474 0.004712 0.023351 0.140013 0.015937 0.820699 0.020749 0.006802 0.969227 0.003223 0.150942 0.638406 0.020813 0.189838 0.030781 0.907267 0.014632 0.047320 0.502947 0.055027 0.326515 0.115511 0.204781 0.281209 0.218985 0.295024 0.191705 0.247567 0.338912 0.221816 0.224641 0.309544 0.218985 0.246831 Consensus sequence: BDACCAACTGCCRBBH Reverse complement motif 0.224641 0.218985 0.309544 0.246831 0.191705 0.338912 0.247567 0.221816 0.295024 0.281209 0.218985 0.204781 0.115511 0.055027 0.326515 0.502947 0.030781 0.014632 0.907267 0.047320 0.150942 0.020813 0.638406 0.189838 0.020749 0.969227 0.006802 0.003223 0.820699 0.140013 0.015937 0.023351 0.004947 0.004474 0.985867 0.004712 0.002771 0.007796 0.003341 0.986092 0.006145 0.002529 0.005984 0.985342 0.125737 0.012681 0.620566 0.241016 0.063609 0.088173 0.633099 0.215120 0.171066 0.191753 0.122477 0.514704 0.195121 0.391777 0.188791 0.224311 0.205499 0.259453 0.277575 0.257473 Consensus sequence: DBVKGGCAGTTGGTHB Alignment: DBVKGGCAGTTGGTHB -CYGGKCAGSKWGYG- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00057 Zic2_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 2 14 0.025025 Species: Mus musculus Original motif 0.201522 0.336845 0.183740 0.277892 0.238705 0.354378 0.165332 0.241585 0.350858 0.031427 0.308482 0.309233 0.104423 0.870794 0.018676 0.006107 0.313246 0.259944 0.277570 0.149241 0.003590 0.973377 0.002520 0.020513 0.899716 0.025489 0.015458 0.059336 0.049224 0.006415 0.938214 0.006147 0.002021 0.859631 0.007903 0.130445 0.772818 0.002659 0.187334 0.037190 0.008456 0.015170 0.594695 0.381679 0.004118 0.009188 0.961506 0.025188 0.367151 0.230955 0.204475 0.197419 0.267508 0.193660 0.430070 0.108762 0.444449 0.099127 0.212182 0.244241 Consensus sequence: HHDCVCAGCAKGVVD Reverse complement motif 0.244241 0.099127 0.212182 0.444449 0.267508 0.430070 0.193660 0.108762 0.197419 0.230955 0.204475 0.367151 0.004118 0.961506 0.009188 0.025188 0.008456 0.594695 0.015170 0.381679 0.037190 0.002659 0.187334 0.772818 0.002021 0.007903 0.859631 0.130445 0.049224 0.938214 0.006415 0.006147 0.059336 0.025489 0.015458 0.899716 0.003590 0.002520 0.973377 0.020513 0.149241 0.259944 0.277570 0.313246 0.104423 0.018676 0.870794 0.006107 0.309233 0.031427 0.308482 0.350858 0.238705 0.165332 0.354378 0.241585 0.201522 0.183740 0.336845 0.277892 Consensus sequence: DVBCYTGCTGBGDDD Alignment: HHDCVCAGCAKGVVD CYGGKCAGSKWGYG- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00081 Mybl1_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 1 14 0.026271 Species: Mus musculus Original motif 0.205989 0.268359 0.263479 0.262174 0.149858 0.330201 0.339741 0.180201 0.440045 0.213697 0.179742 0.166516 0.055722 0.767204 0.049077 0.127997 0.060389 0.768239 0.011175 0.160197 0.980265 0.008906 0.004964 0.005865 0.976251 0.015501 0.004122 0.004126 0.006449 0.982888 0.005200 0.005463 0.025776 0.139679 0.048415 0.786131 0.009775 0.008352 0.975178 0.006695 0.187590 0.568007 0.036604 0.207799 0.108890 0.808175 0.017705 0.065231 0.242101 0.097932 0.555551 0.104417 0.281058 0.212523 0.104136 0.402283 0.150908 0.188201 0.411156 0.249734 Consensus sequence: BBVCCAACTGCCGHB Reverse complement motif 0.150908 0.411156 0.188201 0.249734 0.402283 0.212523 0.104136 0.281058 0.242101 0.555551 0.097932 0.104417 0.108890 0.017705 0.808175 0.065231 0.187590 0.036604 0.568007 0.207799 0.009775 0.975178 0.008352 0.006695 0.786131 0.139679 0.048415 0.025776 0.006449 0.005200 0.982888 0.005463 0.004126 0.015501 0.004122 0.976251 0.005865 0.008906 0.004964 0.980265 0.060389 0.011175 0.768239 0.160197 0.055722 0.049077 0.767204 0.127997 0.166516 0.213697 0.179742 0.440045 0.149858 0.339741 0.330201 0.180201 0.205989 0.263479 0.268359 0.262174 Consensus sequence: BHCGGCAGTTGGBBB Alignment: BHCGGCAGTTGGBBB CYGGKCAGSKWGYG- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00006 Zic3_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 2 14 0.027466 Species: Mus musculus Original motif 0.225537 0.223459 0.280507 0.270498 0.332396 0.181810 0.207290 0.278505 0.309873 0.017922 0.386135 0.286070 0.101947 0.871607 0.020267 0.006179 0.541366 0.089100 0.242170 0.127364 0.003307 0.969997 0.002414 0.024283 0.903286 0.021590 0.015872 0.059253 0.039887 0.009732 0.945083 0.005298 0.001704 0.827209 0.006276 0.164810 0.723052 0.003102 0.221051 0.052795 0.011758 0.024398 0.560633 0.403211 0.003656 0.012952 0.939586 0.043807 0.477846 0.270399 0.113113 0.138642 0.225706 0.298505 0.258523 0.217266 0.365251 0.191780 0.197411 0.245557 Consensus sequence: DDDCACAGCAKGHVD Reverse complement motif 0.245557 0.191780 0.197411 0.365251 0.225706 0.258523 0.298505 0.217266 0.138642 0.270399 0.113113 0.477846 0.003656 0.939586 0.012952 0.043807 0.011758 0.560633 0.024398 0.403211 0.052795 0.003102 0.221051 0.723052 0.001704 0.006276 0.827209 0.164810 0.039887 0.945083 0.009732 0.005298 0.059253 0.021590 0.015872 0.903286 0.003307 0.002414 0.969997 0.024283 0.127364 0.089100 0.242170 0.541366 0.101947 0.020267 0.871607 0.006179 0.309873 0.386135 0.017922 0.286070 0.278505 0.181810 0.207290 0.332396 0.225537 0.280507 0.223459 0.270498 Consensus sequence: DVHCYTGCTGTGHDH Alignment: DVHCYTGCTGTGHDH -CMCWRSCTGYCCKG ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 118 Motif name: C118 Original motif 0.178218 0.039604 0.722772 0.059406 0.500000 0.360000 0.120000 0.020000 0.009901 0.891089 0.029703 0.069307 0.099010 0.069307 0.009901 0.821782 0.010000 0.080000 0.900000 0.010000 0.009901 0.851485 0.009901 0.128713 0.009901 0.485149 0.495050 0.009901 0.465347 0.019802 0.059406 0.455446 0.019802 0.485149 0.485149 0.009901 0.079208 0.168317 0.039604 0.712871 0.010000 0.240000 0.740000 0.010000 0.009901 0.831683 0.069307 0.089109 0.039604 0.732673 0.009901 0.217822 0.118812 0.009901 0.396040 0.475248 0.009901 0.663366 0.188119 0.138614 Consensus sequence: GMCTGCSWSTGCCKC Reserve complement motif 0.009901 0.188119 0.663366 0.138614 0.475248 0.009901 0.396040 0.118812 0.039604 0.009901 0.732673 0.217822 0.009901 0.069307 0.831683 0.089109 0.010000 0.740000 0.240000 0.010000 0.712871 0.168317 0.039604 0.079208 0.019802 0.485149 0.485149 0.009901 0.455446 0.019802 0.059406 0.465347 0.009901 0.495050 0.485149 0.009901 0.009901 0.009901 0.851485 0.128713 0.010000 0.900000 0.080000 0.010000 0.821782 0.069307 0.009901 0.099010 0.009901 0.029703 0.891089 0.069307 0.020000 0.360000 0.120000 0.500000 0.178218 0.722772 0.039604 0.059406 Consensus sequence: GRGGCASWSGCAGYC ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 118 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00400 Zif268 Original Motif Reverse Complement Backward 6 15 0.043954 Species: Mus musculus Original motif 0.104824 0.412716 0.254506 0.227955 0.644922 0.065476 0.140479 0.149122 0.201205 0.166164 0.347131 0.285501 0.360606 0.256316 0.150766 0.232313 0.199831 0.240681 0.279350 0.280137 0.234308 0.204076 0.321306 0.240310 0.274112 0.462435 0.111425 0.152028 0.067070 0.717501 0.073934 0.141496 0.106745 0.084442 0.658566 0.150247 0.025128 0.967053 0.003585 0.004234 0.006412 0.982989 0.003227 0.007371 0.009588 0.877620 0.002571 0.110221 0.621521 0.355443 0.015669 0.007366 0.002600 0.980275 0.004191 0.012934 0.118773 0.026658 0.783843 0.070725 0.022358 0.822101 0.024684 0.130857 0.713212 0.080912 0.128793 0.077084 0.166568 0.250955 0.107934 0.474544 0.225040 0.222494 0.163301 0.389166 0.268976 0.223206 0.265314 0.242504 0.137052 0.229058 0.148439 0.485451 0.135819 0.304550 0.141994 0.417637 0.272440 0.319501 0.230580 0.177478 Consensus sequence: BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV Reverse complement motif 0.272440 0.230580 0.319501 0.177478 0.417637 0.304550 0.141994 0.135819 0.485451 0.229058 0.148439 0.137052 0.242504 0.223206 0.265314 0.268976 0.389166 0.222494 0.163301 0.225040 0.474544 0.250955 0.107934 0.166568 0.077084 0.080912 0.128793 0.713212 0.022358 0.024684 0.822101 0.130857 0.118773 0.783843 0.026658 0.070725 0.002600 0.004191 0.980275 0.012934 0.007366 0.355443 0.015669 0.621521 0.009588 0.002571 0.877620 0.110221 0.006412 0.003227 0.982989 0.007371 0.025128 0.003585 0.967053 0.004234 0.106745 0.658566 0.084442 0.150247 0.067070 0.073934 0.717501 0.141496 0.274112 0.111425 0.462435 0.152028 0.234308 0.321306 0.204076 0.240310 0.280137 0.240681 0.279350 0.199831 0.232313 0.256316 0.150766 0.360606 0.201205 0.347131 0.166164 0.285501 0.149122 0.065476 0.140479 0.644922 0.104824 0.254506 0.412716 0.227955 Consensus sequence: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB Alignment: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB ---GMCTGCSWSTGCCKC----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00527 Foxn4_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 8 15 0.044643 Species: Mus musculus Original motif 0.298336 0.418632 0.208054 0.074978 0.289907 0.015608 0.457100 0.237385 0.273583 0.077889 0.107860 0.540668 0.184954 0.161611 0.384390 0.269045 0.521826 0.156340 0.089019 0.232815 0.356716 0.131104 0.394857 0.117323 0.266669 0.108765 0.505273 0.119293 0.020778 0.047199 0.919524 0.012500 0.948536 0.018775 0.008113 0.024576 0.010822 0.964042 0.014701 0.010434 0.007428 0.019505 0.966351 0.006717 0.010025 0.975678 0.008648 0.005649 0.043796 0.120935 0.742979 0.092289 0.008252 0.250704 0.541132 0.199913 0.474428 0.044681 0.134430 0.346461 0.146597 0.421317 0.143166 0.288920 0.020540 0.181479 0.553811 0.244170 0.129612 0.173360 0.535219 0.161808 0.506084 0.158156 0.130983 0.204776 0.054872 0.103043 0.545792 0.296293 0.389882 0.171037 0.164162 0.274918 0.225861 0.314031 0.288872 0.171237 Consensus sequence: VDWDARRGACGCGGWHGGAKHV Reverse complement motif 0.225861 0.288872 0.314031 0.171237 0.274918 0.171037 0.164162 0.389882 0.054872 0.545792 0.103043 0.296293 0.204776 0.158156 0.130983 0.506084 0.129612 0.535219 0.173360 0.161808 0.020540 0.553811 0.181479 0.244170 0.146597 0.143166 0.421317 0.288920 0.346461 0.044681 0.134430 0.474428 0.008252 0.541132 0.250704 0.199913 0.043796 0.742979 0.120935 0.092289 0.010025 0.008648 0.975678 0.005649 0.007428 0.966351 0.019505 0.006717 0.010822 0.014701 0.964042 0.010434 0.024576 0.018775 0.008113 0.948536 0.020778 0.919524 0.047199 0.012500 0.266669 0.505273 0.108765 0.119293 0.356716 0.394857 0.131104 0.117323 0.232815 0.156340 0.089019 0.521826 0.184954 0.384390 0.161611 0.269045 0.540668 0.077889 0.107860 0.273583 0.289907 0.457100 0.015608 0.237385 0.298336 0.208054 0.418632 0.074978 Consensus sequence: VHYTCCDWCCGCGTCMMTHWHV Alignment: VHYTCCDWCCGCGTCMMTHWHV GMCTGCSWSTGCCKC------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00031 Zbtb3_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 1 15 0.045173 Species: Mus musculus Original motif 0.110412 0.519910 0.162398 0.207280 0.470593 0.172893 0.115202 0.241311 0.467126 0.160175 0.227365 0.145334 0.196112 0.169855 0.079068 0.554965 0.198275 0.671393 0.026094 0.104237 0.793465 0.046739 0.110258 0.049538 0.058204 0.867549 0.045603 0.028645 0.079471 0.027484 0.025248 0.867797 0.032277 0.065893 0.827417 0.074413 0.080553 0.119144 0.585050 0.215253 0.105106 0.470208 0.170921 0.253765 0.690158 0.033925 0.171121 0.104796 0.299543 0.155890 0.362586 0.181981 0.343375 0.213360 0.180067 0.263198 0.364819 0.149053 0.181128 0.305000 0.247818 0.143948 0.217882 0.390352 Consensus sequence: CHVTCACTGGBADHDD Reverse complement motif 0.390352 0.143948 0.217882 0.247818 0.305000 0.149053 0.181128 0.364819 0.263198 0.213360 0.180067 0.343375 0.299543 0.362586 0.155890 0.181981 0.104796 0.033925 0.171121 0.690158 0.105106 0.170921 0.470208 0.253765 0.080553 0.585050 0.119144 0.215253 0.032277 0.827417 0.065893 0.074413 0.867797 0.027484 0.025248 0.079471 0.058204 0.045603 0.867549 0.028645 0.049538 0.046739 0.110258 0.793465 0.198275 0.026094 0.671393 0.104237 0.554965 0.169855 0.079068 0.196112 0.145334 0.160175 0.227365 0.467126 0.241311 0.172893 0.115202 0.470593 0.110412 0.162398 0.519910 0.207280 Consensus sequence: DDHHTBCCAGTGABHG Alignment: CHVTCACTGGBADHDD -GMCTGCSWSTGCCKC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 4 15 0.045801 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH ---GMCTGCSWSTGCCKC----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00414 Ets1 Reverse Complement Original Motif Backward 3 15 0.050142 Species: Mus musculus Original motif 0.185517 0.352264 0.234781 0.227438 0.267475 0.153636 0.374632 0.204257 0.209599 0.165342 0.278644 0.346414 0.223668 0.129204 0.369628 0.277501 0.215373 0.320617 0.160255 0.303754 0.836593 0.030586 0.105229 0.027592 0.018622 0.916166 0.063271 0.001942 0.137490 0.857089 0.004870 0.000551 0.002748 0.001698 0.993222 0.002332 0.003309 0.001651 0.993223 0.001817 0.990419 0.000878 0.002565 0.006138 0.815068 0.016317 0.001274 0.167342 0.373416 0.011725 0.613373 0.001487 0.124276 0.194676 0.025016 0.656033 0.359192 0.227478 0.212937 0.200393 0.314691 0.211253 0.233074 0.240981 0.285894 0.131047 0.225562 0.357496 Consensus sequence: BDDDHACCGGAARTVDD Reverse complement motif 0.357496 0.131047 0.225562 0.285894 0.240981 0.211253 0.233074 0.314691 0.200393 0.227478 0.212937 0.359192 0.656033 0.194676 0.025016 0.124276 0.373416 0.613373 0.011725 0.001487 0.167342 0.016317 0.001274 0.815068 0.006138 0.000878 0.002565 0.990419 0.003309 0.993223 0.001651 0.001817 0.002748 0.993222 0.001698 0.002332 0.137490 0.004870 0.857089 0.000551 0.018622 0.063271 0.916166 0.001942 0.027592 0.030586 0.105229 0.836593 0.215373 0.160255 0.320617 0.303754 0.223668 0.369628 0.129204 0.277501 0.346414 0.165342 0.278644 0.209599 0.267475 0.374632 0.153636 0.204257 0.185517 0.234781 0.352264 0.227438 Consensus sequence: DDBAMTTCCGGTDHDHB Alignment: BDDDHACCGGAARTVDD GRGGCASWSGCAGYC-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 119 Motif name: C119 Original motif 0.050000 0.460000 0.430000 0.060000 0.475248 0.009901 0.059406 0.455446 0.524752 0.009901 0.396040 0.069307 0.128713 0.009901 0.029703 0.831683 0.030000 0.470000 0.050000 0.450000 0.158416 0.821782 0.009901 0.009901 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.060000 0.920000 0.010000 0.386139 0.049505 0.524752 0.039604 0.636364 0.191919 0.010101 0.161616 0.010000 0.890000 0.010000 0.090000 0.390000 0.040000 0.010000 0.560000 0.070000 0.420000 0.470000 0.040000 Consensus sequence: SWRTYCCAGRACWS Reserve complement motif 0.070000 0.470000 0.420000 0.040000 0.560000 0.040000 0.010000 0.390000 0.010000 0.010000 0.890000 0.090000 0.161616 0.191919 0.010101 0.636364 0.386139 0.524752 0.049505 0.039604 0.010000 0.920000 0.060000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.158416 0.009901 0.821782 0.009901 0.030000 0.050000 0.470000 0.450000 0.831683 0.009901 0.029703 0.128713 0.069307 0.009901 0.396040 0.524752 0.455446 0.009901 0.059406 0.475248 0.050000 0.430000 0.460000 0.060000 Consensus sequence: SWGTMCTGGKAKWS ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 119 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00031 Zbtb3_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 2 14 0.028875 Species: Mus musculus Original motif 0.110412 0.519910 0.162398 0.207280 0.470593 0.172893 0.115202 0.241311 0.467126 0.160175 0.227365 0.145334 0.196112 0.169855 0.079068 0.554965 0.198275 0.671393 0.026094 0.104237 0.793465 0.046739 0.110258 0.049538 0.058204 0.867549 0.045603 0.028645 0.079471 0.027484 0.025248 0.867797 0.032277 0.065893 0.827417 0.074413 0.080553 0.119144 0.585050 0.215253 0.105106 0.470208 0.170921 0.253765 0.690158 0.033925 0.171121 0.104796 0.299543 0.155890 0.362586 0.181981 0.343375 0.213360 0.180067 0.263198 0.364819 0.149053 0.181128 0.305000 0.247818 0.143948 0.217882 0.390352 Consensus sequence: CHVTCACTGGBADHDD Reverse complement motif 0.390352 0.143948 0.217882 0.247818 0.305000 0.149053 0.181128 0.364819 0.263198 0.213360 0.180067 0.343375 0.299543 0.362586 0.155890 0.181981 0.104796 0.033925 0.171121 0.690158 0.105106 0.170921 0.470208 0.253765 0.080553 0.585050 0.119144 0.215253 0.032277 0.827417 0.065893 0.074413 0.867797 0.027484 0.025248 0.079471 0.058204 0.045603 0.867549 0.028645 0.049538 0.046739 0.110258 0.793465 0.198275 0.026094 0.671393 0.104237 0.554965 0.169855 0.079068 0.196112 0.145334 0.160175 0.227365 0.467126 0.241311 0.172893 0.115202 0.470593 0.110412 0.162398 0.519910 0.207280 Consensus sequence: DDHHTBCCAGTGABHG Alignment: CHVTCACTGGBADHDD -SWGTMCTGGKAKWS- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00040 Irf5_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 2 14 0.029427 Species: Mus musculus Original motif 0.160739 0.237732 0.225630 0.375899 0.231003 0.186804 0.122026 0.460167 0.282260 0.197034 0.288737 0.231969 0.746029 0.055630 0.083427 0.114914 0.169536 0.340063 0.148794 0.341606 0.086576 0.827589 0.034986 0.050849 0.021280 0.012938 0.955490 0.010292 0.930476 0.013781 0.047798 0.007945 0.002126 0.038171 0.948134 0.011570 0.959483 0.009871 0.015462 0.015184 0.495380 0.028946 0.408360 0.067314 0.145964 0.186198 0.031072 0.636767 0.200379 0.206354 0.151807 0.441460 0.171996 0.390086 0.220850 0.217068 0.208281 0.322628 0.291771 0.177321 Consensus sequence: BHDAHCGAGARTHBV Reverse complement motif 0.208281 0.291771 0.322628 0.177321 0.171996 0.220850 0.390086 0.217068 0.441460 0.206354 0.151807 0.200379 0.636767 0.186198 0.031072 0.145964 0.067314 0.028946 0.408360 0.495380 0.015184 0.009871 0.015462 0.959483 0.002126 0.948134 0.038171 0.011570 0.007945 0.013781 0.047798 0.930476 0.021280 0.955490 0.012938 0.010292 0.086576 0.034986 0.827589 0.050849 0.341606 0.340063 0.148794 0.169536 0.114914 0.055630 0.083427 0.746029 0.282260 0.288737 0.197034 0.231969 0.460167 0.186804 0.122026 0.231003 0.375899 0.237732 0.225630 0.160739 Consensus sequence: VBHAKTCTCGHTHHV Alignment: BHDAHCGAGARTHBV SWRTYCCAGRACWS- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00019 Zbtb12_primaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 14 0.031753 Species: Mus musculus Original motif 0.163348 0.349811 0.273573 0.213268 0.212612 0.211975 0.220400 0.355012 0.325879 0.220972 0.186720 0.266430 0.510632 0.041115 0.419323 0.028930 0.067550 0.203499 0.411224 0.317727 0.023546 0.002038 0.972278 0.002138 0.017818 0.006841 0.006478 0.968864 0.019791 0.001443 0.009338 0.969428 0.003084 0.992130 0.002654 0.002131 0.001031 0.039768 0.003588 0.955613 0.980811 0.006260 0.008964 0.003965 0.013624 0.002796 0.979716 0.003863 0.841198 0.016422 0.129217 0.013163 0.169265 0.145424 0.085753 0.599558 0.068235 0.584950 0.065758 0.281057 0.378189 0.252218 0.209355 0.160238 0.167389 0.305726 0.229730 0.297156 Consensus sequence: BDHRBGTTCTAGATCVB Reverse complement motif 0.167389 0.229730 0.305726 0.297156 0.160238 0.252218 0.209355 0.378189 0.068235 0.065758 0.584950 0.281057 0.599558 0.145424 0.085753 0.169265 0.013163 0.016422 0.129217 0.841198 0.013624 0.979716 0.002796 0.003863 0.003965 0.006260 0.008964 0.980811 0.955613 0.039768 0.003588 0.001031 0.003084 0.002654 0.992130 0.002131 0.969428 0.001443 0.009338 0.019791 0.968864 0.006841 0.006478 0.017818 0.023546 0.972278 0.002038 0.002138 0.067550 0.411224 0.203499 0.317727 0.028930 0.041115 0.419323 0.510632 0.266430 0.220972 0.186720 0.325879 0.355012 0.211975 0.220400 0.212612 0.163348 0.273573 0.349811 0.213268 Consensus sequence: BBGATCTAGAACBKHDB Alignment: BDHRBGTTCTAGATCVB ---SWRTYCCAGRACWS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00018 Irf4_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 2 14 0.032311 Species: Mus musculus Original motif 0.288101 0.247588 0.287461 0.176850 0.187625 0.276525 0.352820 0.183030 0.175230 0.300094 0.203295 0.321380 0.564519 0.107594 0.098018 0.229869 0.150412 0.310868 0.054960 0.483760 0.034907 0.015505 0.034843 0.914745 0.041776 0.885897 0.032309 0.040017 0.046210 0.168474 0.066613 0.718702 0.031764 0.913321 0.024478 0.030437 0.191755 0.029057 0.754998 0.024190 0.206291 0.097100 0.623727 0.072881 0.311511 0.037435 0.173101 0.477953 0.205101 0.316738 0.081628 0.396533 0.243888 0.196473 0.292453 0.267186 0.167980 0.404608 0.259107 0.168305 Consensus sequence: VVBAYTCTCGGWHDB Reverse complement motif 0.167980 0.259107 0.404608 0.168305 0.243888 0.292453 0.196473 0.267186 0.396533 0.316738 0.081628 0.205101 0.477953 0.037435 0.173101 0.311511 0.206291 0.623727 0.097100 0.072881 0.191755 0.754998 0.029057 0.024190 0.031764 0.024478 0.913321 0.030437 0.718702 0.168474 0.066613 0.046210 0.041776 0.032309 0.885897 0.040017 0.914745 0.015505 0.034843 0.034907 0.483760 0.310868 0.054960 0.150412 0.229869 0.107594 0.098018 0.564519 0.321380 0.300094 0.203295 0.175230 0.187625 0.352820 0.276525 0.183030 0.176850 0.247588 0.287461 0.288101 Consensus sequence: BHHWCCGAGAMTVVB Alignment: BHHWCCGAGAMTVVB SWRTYCCAGRACWS- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00203 Pknox1 Original Motif Reverse Complement Backward 2 14 0.032863 Species: Mus musculus Original motif 0.436259 0.086706 0.169714 0.307321 0.433826 0.063296 0.358082 0.144795 0.324190 0.284651 0.208786 0.182372 0.054648 0.285295 0.518967 0.141090 0.922874 0.012239 0.042656 0.022231 0.036668 0.581917 0.338993 0.042422 0.021599 0.968542 0.006920 0.002939 0.001846 0.026071 0.000271 0.971812 0.007232 0.000773 0.989645 0.002350 0.019103 0.005771 0.000209 0.974917 0.001535 0.989111 0.000852 0.008502 0.989698 0.000915 0.004907 0.004480 0.679114 0.077050 0.037931 0.205904 0.330007 0.110122 0.067993 0.491878 0.286458 0.421726 0.186579 0.105236 0.199258 0.473968 0.173008 0.153766 Consensus sequence: DRVSASCTGTCAAWVV Reverse complement motif 0.199258 0.173008 0.473968 0.153766 0.286458 0.186579 0.421726 0.105236 0.491878 0.110122 0.067993 0.330007 0.205904 0.077050 0.037931 0.679114 0.004480 0.000915 0.004907 0.989698 0.001535 0.000852 0.989111 0.008502 0.974917 0.005771 0.000209 0.019103 0.007232 0.989645 0.000773 0.002350 0.971812 0.026071 0.000271 0.001846 0.021599 0.006920 0.968542 0.002939 0.036668 0.338993 0.581917 0.042422 0.022231 0.012239 0.042656 0.922874 0.054648 0.518967 0.285295 0.141090 0.182372 0.284651 0.208786 0.324190 0.144795 0.063296 0.358082 0.433826 0.307321 0.086706 0.169714 0.436259 Consensus sequence: VVWTTGACAGSTSBKD Alignment: VVWTTGACAGSTSBKD -SWRTYCCAGRACWS- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 120 Motif name: C120 Original motif 0.178218 0.128713 0.019802 0.673267 0.190000 0.010000 0.790000 0.010000 0.820000 0.010000 0.010000 0.160000 0.650000 0.010000 0.330000 0.010000 0.613861 0.237624 0.079208 0.069307 0.010000 0.780000 0.010000 0.200000 0.465347 0.376238 0.009901 0.148515 0.070000 0.430000 0.430000 0.070000 0.148515 0.009901 0.376238 0.465347 0.200000 0.010000 0.780000 0.010000 0.069307 0.079208 0.237624 0.613861 0.010000 0.330000 0.010000 0.650000 0.160000 0.010000 0.010000 0.820000 0.010000 0.790000 0.010000 0.190000 0.673267 0.019802 0.128713 0.178218 Consensus sequence: TGARACMSKGTYTCA Reserve complement motif 0.178218 0.019802 0.128713 0.673267 0.010000 0.010000 0.790000 0.190000 0.820000 0.010000 0.010000 0.160000 0.650000 0.330000 0.010000 0.010000 0.613861 0.079208 0.237624 0.069307 0.200000 0.780000 0.010000 0.010000 0.465347 0.009901 0.376238 0.148515 0.070000 0.430000 0.430000 0.070000 0.148515 0.376238 0.009901 0.465347 0.010000 0.010000 0.780000 0.200000 0.069307 0.237624 0.079208 0.613861 0.010000 0.010000 0.330000 0.650000 0.160000 0.010000 0.010000 0.820000 0.190000 0.790000 0.010000 0.010000 0.673267 0.128713 0.019802 0.178218 Consensus sequence: TGAMACRSYGTKTCA ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 120 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00098 Rfx3_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 7 15 0.045693 Species: Mus musculus Original motif 0.314514 0.275352 0.257617 0.152518 0.126939 0.598294 0.130576 0.144192 0.102265 0.155334 0.177957 0.564445 0.129288 0.282678 0.326990 0.261044 0.318166 0.227823 0.175681 0.278330 0.109019 0.380838 0.278328 0.231815 0.226145 0.289206 0.291300 0.193348 0.035863 0.844339 0.072582 0.047216 0.223793 0.187244 0.088092 0.500871 0.039800 0.029681 0.026201 0.904317 0.298298 0.032147 0.654746 0.014809 0.014729 0.022023 0.944826 0.018422 0.485114 0.004925 0.013785 0.496176 0.035708 0.020381 0.240804 0.703108 0.951152 0.012738 0.017886 0.018224 0.023713 0.944394 0.009538 0.022355 0.291067 0.385205 0.232388 0.091339 0.340334 0.199588 0.311526 0.148552 0.198713 0.472138 0.178319 0.150830 0.321155 0.269932 0.311301 0.097612 0.412646 0.195252 0.231950 0.160152 0.297134 0.180928 0.250400 0.271538 0.151169 0.305386 0.358574 0.184871 Consensus sequence: VCTBHBVCTTGGWTACVVVVVDB Reverse complement motif 0.151169 0.358574 0.305386 0.184871 0.271538 0.180928 0.250400 0.297134 0.160152 0.195252 0.231950 0.412646 0.097612 0.269932 0.311301 0.321155 0.198713 0.178319 0.472138 0.150830 0.148552 0.199588 0.311526 0.340334 0.291067 0.232388 0.385205 0.091339 0.023713 0.009538 0.944394 0.022355 0.018224 0.012738 0.017886 0.951152 0.703108 0.020381 0.240804 0.035708 0.496176 0.004925 0.013785 0.485114 0.014729 0.944826 0.022023 0.018422 0.298298 0.654746 0.032147 0.014809 0.904317 0.029681 0.026201 0.039800 0.500871 0.187244 0.088092 0.223793 0.035863 0.072582 0.844339 0.047216 0.226145 0.291300 0.289206 0.193348 0.109019 0.278328 0.380838 0.231815 0.278330 0.227823 0.175681 0.318166 0.129288 0.326990 0.282678 0.261044 0.564445 0.155334 0.177957 0.102265 0.126939 0.130576 0.598294 0.144192 0.152518 0.275352 0.257617 0.314514 Consensus sequence: BDBBVBVGTAWCCAAGVBHBAGB Alignment: BDBBVBVGTAWCCAAGVBHBAGB ------TGARACMSKGTYTCA-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00036 Myf6_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 1 15 0.049534 Species: Mus musculus Original motif 0.345146 0.261059 0.273931 0.119863 0.222137 0.272923 0.332024 0.172916 0.269602 0.278951 0.245221 0.206225 0.485406 0.144018 0.294421 0.076155 0.577731 0.270563 0.078955 0.072752 0.070027 0.750816 0.062819 0.116339 0.685018 0.105175 0.137110 0.072697 0.162574 0.071041 0.638464 0.127921 0.343240 0.389633 0.206226 0.060900 0.080169 0.790323 0.114211 0.015297 0.167035 0.201642 0.462780 0.168543 0.114383 0.664317 0.166143 0.055157 0.392143 0.114475 0.340085 0.153298 0.208147 0.577473 0.142694 0.071686 0.168632 0.563135 0.066181 0.202052 Consensus sequence: VVVRACAGVCBCDCC Reverse complement motif 0.168632 0.066181 0.563135 0.202052 0.208147 0.142694 0.577473 0.071686 0.153298 0.114475 0.340085 0.392143 0.114383 0.166143 0.664317 0.055157 0.167035 0.462780 0.201642 0.168543 0.080169 0.114211 0.790323 0.015297 0.343240 0.206226 0.389633 0.060900 0.162574 0.638464 0.071041 0.127921 0.072697 0.105175 0.137110 0.685018 0.070027 0.062819 0.750816 0.116339 0.072752 0.270563 0.078955 0.577731 0.076155 0.144018 0.294421 0.485406 0.269602 0.245221 0.278951 0.206225 0.222137 0.332024 0.272923 0.172916 0.119863 0.261059 0.273931 0.345146 Consensus sequence: GGDGBGVCTGTKVVB Alignment: GGDGBGVCTGTKVVB TGAMACRSYGTKTCA ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v015681_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 5 15 0.050342 Species: Mus musculus Original motif 0.214165 0.143436 0.372522 0.269876 0.314445 0.406003 0.160351 0.119201 0.137147 0.092924 0.042921 0.727007 0.044121 0.072843 0.051741 0.831295 0.261292 0.324124 0.298498 0.116086 0.258125 0.323243 0.263362 0.155271 0.204557 0.589399 0.107153 0.098891 0.371021 0.244027 0.291102 0.093849 0.096327 0.572718 0.011797 0.319159 0.027282 0.046183 0.844519 0.082016 0.018921 0.012887 0.915917 0.052275 0.364793 0.166722 0.084229 0.384256 0.028216 0.011233 0.951056 0.009495 0.054974 0.004738 0.890377 0.049911 0.006802 0.312915 0.134247 0.546036 0.241289 0.628210 0.104788 0.025713 0.237863 0.302807 0.213018 0.246311 0.349399 0.203220 0.086635 0.360746 0.386634 0.144693 0.246895 0.221779 0.425101 0.354676 0.093374 0.126849 0.060272 0.391320 0.104905 0.443503 0.162090 0.190233 0.227433 0.420244 Consensus sequence: DVTTVVCVYGGHGGYCHHDMYB Reverse complement motif 0.420244 0.190233 0.227433 0.162090 0.443503 0.391320 0.104905 0.060272 0.126849 0.354676 0.093374 0.425101 0.221779 0.144693 0.246895 0.386634 0.360746 0.203220 0.086635 0.349399 0.237863 0.213018 0.302807 0.246311 0.241289 0.104788 0.628210 0.025713 0.546036 0.312915 0.134247 0.006802 0.054974 0.890377 0.004738 0.049911 0.028216 0.951056 0.011233 0.009495 0.384256 0.166722 0.084229 0.364793 0.018921 0.915917 0.012887 0.052275 0.027282 0.844519 0.046183 0.082016 0.096327 0.011797 0.572718 0.319159 0.093849 0.244027 0.291102 0.371021 0.204557 0.107153 0.589399 0.098891 0.258125 0.263362 0.323243 0.155271 0.261292 0.298498 0.324124 0.116086 0.831295 0.072843 0.051741 0.044121 0.727007 0.092924 0.042921 0.137147 0.314445 0.160351 0.406003 0.119201 0.214165 0.372522 0.143436 0.269876 Consensus sequence: VMYDHDGMCCHCCKBGVVAAVH Alignment: VMYDHDGMCCHCCKBGVVAAVH ----TGAMACRSYGTKTCA--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 7 15 0.052516 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH ------TGARACMSKGTYTCA- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00059 Arid5a_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 15 0.053982 Species: Mus musculus Original motif 0.171818 0.301056 0.272984 0.254142 0.302396 0.167176 0.303664 0.226765 0.143418 0.268925 0.092516 0.495141 0.279634 0.190554 0.254922 0.274891 0.282522 0.364494 0.178654 0.174330 0.671808 0.058029 0.059648 0.210515 0.834274 0.073299 0.052756 0.039670 0.037426 0.054162 0.097288 0.811124 0.781687 0.119873 0.059536 0.038903 0.094411 0.739418 0.148946 0.017225 0.121496 0.182464 0.688059 0.007982 0.531845 0.058513 0.264994 0.144647 0.406274 0.102159 0.285681 0.205886 0.434643 0.139452 0.187267 0.238638 0.151869 0.281521 0.246110 0.320500 0.351314 0.200542 0.276809 0.171335 0.442449 0.213939 0.210895 0.132717 Consensus sequence: BDYDVAATACGADDBVV Reverse complement motif 0.132717 0.213939 0.210895 0.442449 0.171335 0.200542 0.276809 0.351314 0.320500 0.281521 0.246110 0.151869 0.238638 0.139452 0.187267 0.434643 0.205886 0.102159 0.285681 0.406274 0.144647 0.058513 0.264994 0.531845 0.121496 0.688059 0.182464 0.007982 0.094411 0.148946 0.739418 0.017225 0.038903 0.119873 0.059536 0.781687 0.811124 0.054162 0.097288 0.037426 0.039670 0.073299 0.052756 0.834274 0.210515 0.058029 0.059648 0.671808 0.282522 0.178654 0.364494 0.174330 0.274891 0.190554 0.254922 0.279634 0.495141 0.268925 0.092516 0.143418 0.302396 0.303664 0.167176 0.226765 0.171818 0.272984 0.301056 0.254142 Consensus sequence: BBVDDTCGTATTVDMHB Alignment: BDYDVAATACGADDBVV --TGARACMSKGTYTCA ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 121 Motif name: C121 Original motif 0.420000 0.420000 0.110000 0.050000 0.425743 0.029703 0.435644 0.108911 0.100000 0.610000 0.100000 0.190000 0.010000 0.920000 0.010000 0.060000 0.009901 0.841584 0.009901 0.138614 0.010000 0.020000 0.010000 0.960000 0.485149 0.099010 0.405941 0.009901 0.060000 0.060000 0.870000 0.010000 0.059406 0.821782 0.069307 0.049505 0.009901 0.415842 0.118812 0.455446 0.010000 0.460000 0.390000 0.140000 0.010000 0.290000 0.100000 0.600000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.910000 0.010000 0.070000 0.040000 0.480000 0.010000 0.470000 0.010000 0.160000 0.400000 0.430000 Consensus sequence: MRCCCTRGCYSTCCYK Reserve complement motif 0.430000 0.160000 0.400000 0.010000 0.040000 0.010000 0.480000 0.470000 0.010000 0.010000 0.910000 0.070000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.600000 0.290000 0.100000 0.010000 0.010000 0.390000 0.460000 0.140000 0.455446 0.415842 0.118812 0.009901 0.059406 0.069307 0.821782 0.049505 0.060000 0.870000 0.060000 0.010000 0.009901 0.099010 0.405941 0.485149 0.960000 0.020000 0.010000 0.010000 0.009901 0.009901 0.841584 0.138614 0.010000 0.010000 0.920000 0.060000 0.100000 0.100000 0.610000 0.190000 0.425743 0.435644 0.029703 0.108911 0.050000 0.420000 0.110000 0.420000 Consensus sequence: RKGGASMGCKAGGGMY ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 121 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00526 Foxn1_primary Reverse Complement Original Motif Backward 5 16 0.043279 Species: Mus musculus Original motif 0.456612 0.057181 0.078281 0.407926 0.460529 0.185506 0.083106 0.270859 0.445717 0.179510 0.239355 0.135417 0.116339 0.145186 0.275331 0.463144 0.239398 0.142078 0.480004 0.138520 0.355157 0.217877 0.284296 0.142670 0.318602 0.444835 0.153321 0.083243 0.609569 0.055866 0.280349 0.054216 0.062297 0.769824 0.027844 0.140035 0.151868 0.019245 0.803188 0.025699 0.011842 0.952534 0.017959 0.017665 0.017665 0.017959 0.952534 0.011842 0.025699 0.803188 0.019245 0.151868 0.140035 0.027844 0.769824 0.062297 0.054216 0.280349 0.055866 0.609569 0.013084 0.624655 0.177956 0.184305 0.287647 0.183527 0.295753 0.233074 0.042309 0.345931 0.198458 0.413301 0.338138 0.266033 0.045367 0.350462 0.302850 0.155320 0.074662 0.467168 0.240926 0.068901 0.283055 0.407118 0.409954 0.183157 0.154186 0.252704 Consensus sequence: WHVBVVMACGCGCGTCDYHWDH Reverse complement motif 0.252704 0.183157 0.154186 0.409954 0.407118 0.068901 0.283055 0.240926 0.467168 0.155320 0.074662 0.302850 0.350462 0.266033 0.045367 0.338138 0.413301 0.345931 0.198458 0.042309 0.287647 0.295753 0.183527 0.233074 0.013084 0.177956 0.624655 0.184305 0.609569 0.280349 0.055866 0.054216 0.140035 0.769824 0.027844 0.062297 0.025699 0.019245 0.803188 0.151868 0.017665 0.952534 0.017959 0.011842 0.011842 0.017959 0.952534 0.017665 0.151868 0.803188 0.019245 0.025699 0.062297 0.027844 0.769824 0.140035 0.054216 0.055866 0.280349 0.609569 0.318602 0.153321 0.444835 0.083243 0.142670 0.217877 0.284296 0.355157 0.239398 0.480004 0.142078 0.138520 0.463144 0.145186 0.275331 0.116339 0.135417 0.179510 0.239355 0.445717 0.270859 0.185506 0.083106 0.460529 0.407926 0.057181 0.078281 0.456612 Consensus sequence: HDWHMHGACGCGCGTRBVVBHW Alignment: WHVBVVMACGCGCGTCDYHWDH --RKGGASMGCKAGGGMY---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 1 16 0.043535 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK ------RKGGASMGCKAGGGMY ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v015681_primaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 2 16 0.043859 Species: Mus musculus Original motif 0.472795 0.179227 0.091251 0.256726 0.036521 0.159743 0.204840 0.598896 0.164582 0.312805 0.221324 0.301289 0.237069 0.249050 0.293048 0.220833 0.401949 0.225181 0.229401 0.143469 0.161422 0.494334 0.252207 0.092036 0.252940 0.177721 0.369400 0.199939 0.119630 0.024651 0.849920 0.005798 0.000962 0.002398 0.990616 0.006023 0.937852 0.027016 0.034535 0.000597 0.008963 0.987756 0.000629 0.002652 0.001584 0.992898 0.002349 0.003169 0.956822 0.027342 0.002484 0.013352 0.009873 0.987759 0.000988 0.001381 0.016397 0.980856 0.000369 0.002378 0.081761 0.758555 0.038572 0.121112 0.371713 0.091838 0.448027 0.088423 0.111617 0.121913 0.683885 0.082585 0.334562 0.102916 0.436488 0.126034 0.210362 0.101261 0.238339 0.450037 0.169041 0.271583 0.320799 0.238576 0.140316 0.049885 0.735236 0.074563 Consensus sequence: HTBVVVDGGACCACCCRGRDBG Reverse complement motif 0.140316 0.735236 0.049885 0.074563 0.169041 0.320799 0.271583 0.238576 0.450037 0.101261 0.238339 0.210362 0.334562 0.436488 0.102916 0.126034 0.111617 0.683885 0.121913 0.082585 0.371713 0.448027 0.091838 0.088423 0.081761 0.038572 0.758555 0.121112 0.016397 0.000369 0.980856 0.002378 0.009873 0.000988 0.987759 0.001381 0.013352 0.027342 0.002484 0.956822 0.001584 0.002349 0.992898 0.003169 0.008963 0.000629 0.987756 0.002652 0.000597 0.027016 0.034535 0.937852 0.000962 0.990616 0.002398 0.006023 0.119630 0.849920 0.024651 0.005798 0.252940 0.369400 0.177721 0.199939 0.161422 0.252207 0.494334 0.092036 0.143469 0.225181 0.229401 0.401949 0.237069 0.293048 0.249050 0.220833 0.164582 0.221324 0.312805 0.301289 0.598896 0.159743 0.204840 0.036521 0.256726 0.179227 0.091251 0.472795 Consensus sequence: CBDMCMGGGTGGTCCHVBVBAH Alignment: CBDMCMGGGTGGTCCHVBVBAH -MRCCCTRGCYSTCCYK----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_primaryOriginal Motif Original Motif Backward 5 16 0.045046 Species: Mus musculus Original motif 0.204923 0.208846 0.365383 0.220848 0.294304 0.300143 0.167287 0.238266 0.109711 0.619514 0.117379 0.153396 0.178979 0.378580 0.230177 0.212264 0.159594 0.542602 0.118178 0.179627 0.125206 0.430074 0.151826 0.292894 0.097692 0.709845 0.116956 0.075506 0.148292 0.565912 0.037632 0.248164 0.077951 0.034190 0.855503 0.032356 0.001657 0.001061 0.971877 0.025405 0.001926 0.001084 0.991712 0.005278 0.033031 0.012001 0.057796 0.897171 0.002723 0.002647 0.993348 0.001281 0.003261 0.000963 0.987199 0.008577 0.000611 0.090925 0.074857 0.833608 0.015299 0.978878 0.004949 0.000874 0.013368 0.600902 0.033485 0.352245 0.231949 0.149575 0.118804 0.499672 0.267580 0.186002 0.371242 0.175176 0.264884 0.223483 0.110082 0.401551 0.221365 0.170121 0.179559 0.428955 0.112997 0.692930 0.139981 0.054092 0.460305 0.207883 0.155111 0.176702 Consensus sequence: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH Reverse complement motif 0.176702 0.207883 0.155111 0.460305 0.112997 0.139981 0.692930 0.054092 0.428955 0.170121 0.179559 0.221365 0.401551 0.223483 0.110082 0.264884 0.267580 0.371242 0.186002 0.175176 0.499672 0.149575 0.118804 0.231949 0.013368 0.033485 0.600902 0.352245 0.015299 0.004949 0.978878 0.000874 0.833608 0.090925 0.074857 0.000611 0.003261 0.987199 0.000963 0.008577 0.002723 0.993348 0.002647 0.001281 0.897171 0.012001 0.057796 0.033031 0.001926 0.991712 0.001084 0.005278 0.001657 0.971877 0.001061 0.025405 0.077951 0.855503 0.034190 0.032356 0.148292 0.037632 0.565912 0.248164 0.097692 0.116956 0.709845 0.075506 0.125206 0.151826 0.430074 0.292894 0.159594 0.118178 0.542602 0.179627 0.178979 0.230177 0.378580 0.212264 0.109711 0.117379 0.619514 0.153396 0.294304 0.167287 0.300143 0.238266 0.204923 0.365383 0.208846 0.220848 Consensus sequence: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB Alignment: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH ---MRCCCTRGCYSTCCYK---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 1 16 0.045155 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH -------RKGGASMGCKAGGGMY ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 122 Motif name: C122 Original motif 0.009901 0.445545 0.148515 0.396040 0.792079 0.069307 0.128713 0.009901 0.009901 0.059406 0.801980 0.128713 0.029703 0.702970 0.089109 0.178218 0.010000 0.930000 0.010000 0.050000 0.010000 0.820000 0.010000 0.160000 0.475248 0.019802 0.108911 0.396040 0.010000 0.080000 0.900000 0.010000 0.050000 0.460000 0.430000 0.060000 0.049505 0.821782 0.118812 0.009901 0.440000 0.080000 0.080000 0.400000 0.039604 0.455446 0.495050 0.009901 0.020000 0.320000 0.310000 0.350000 0.010000 0.930000 0.050000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.039604 0.148515 0.049505 0.762376 0.405941 0.138614 0.445545 0.009901 Consensus sequence: YAGCCCWGSCWSBCCTR Reserve complement motif 0.405941 0.445545 0.138614 0.009901 0.762376 0.148515 0.049505 0.039604 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.050000 0.930000 0.010000 0.350000 0.320000 0.310000 0.020000 0.039604 0.495050 0.455446 0.009901 0.400000 0.080000 0.080000 0.440000 0.049505 0.118812 0.821782 0.009901 0.050000 0.430000 0.460000 0.060000 0.010000 0.900000 0.080000 0.010000 0.396040 0.019802 0.108911 0.475248 0.010000 0.010000 0.820000 0.160000 0.010000 0.010000 0.930000 0.050000 0.029703 0.089109 0.702970 0.178218 0.009901 0.801980 0.059406 0.128713 0.009901 0.069307 0.128713 0.792079 0.009901 0.148515 0.445545 0.396040 Consensus sequence: MAGGVSWGSCWGGGCTK ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 122 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00400 Zif268 Reverse Complement Reverse Complement Backward 7 17 0.037400 Species: Mus musculus Original motif 0.104824 0.412716 0.254506 0.227955 0.644922 0.065476 0.140479 0.149122 0.201205 0.166164 0.347131 0.285501 0.360606 0.256316 0.150766 0.232313 0.199831 0.240681 0.279350 0.280137 0.234308 0.204076 0.321306 0.240310 0.274112 0.462435 0.111425 0.152028 0.067070 0.717501 0.073934 0.141496 0.106745 0.084442 0.658566 0.150247 0.025128 0.967053 0.003585 0.004234 0.006412 0.982989 0.003227 0.007371 0.009588 0.877620 0.002571 0.110221 0.621521 0.355443 0.015669 0.007366 0.002600 0.980275 0.004191 0.012934 0.118773 0.026658 0.783843 0.070725 0.022358 0.822101 0.024684 0.130857 0.713212 0.080912 0.128793 0.077084 0.166568 0.250955 0.107934 0.474544 0.225040 0.222494 0.163301 0.389166 0.268976 0.223206 0.265314 0.242504 0.137052 0.229058 0.148439 0.485451 0.135819 0.304550 0.141994 0.417637 0.272440 0.319501 0.230580 0.177478 Consensus sequence: BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV Reverse complement motif 0.272440 0.230580 0.319501 0.177478 0.417637 0.304550 0.141994 0.135819 0.485451 0.229058 0.148439 0.137052 0.242504 0.223206 0.265314 0.268976 0.389166 0.222494 0.163301 0.225040 0.474544 0.250955 0.107934 0.166568 0.077084 0.080912 0.128793 0.713212 0.022358 0.024684 0.822101 0.130857 0.118773 0.783843 0.026658 0.070725 0.002600 0.004191 0.980275 0.012934 0.007366 0.355443 0.015669 0.621521 0.009588 0.002571 0.877620 0.110221 0.006412 0.003227 0.982989 0.007371 0.025128 0.003585 0.967053 0.004234 0.106745 0.658566 0.084442 0.150247 0.067070 0.073934 0.717501 0.141496 0.274112 0.111425 0.462435 0.152028 0.234308 0.321306 0.204076 0.240310 0.280137 0.240681 0.279350 0.199831 0.232313 0.256316 0.150766 0.360606 0.201205 0.347131 0.166164 0.285501 0.149122 0.065476 0.140479 0.644922 0.104824 0.254506 0.412716 0.227955 Consensus sequence: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB Alignment: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB MAGGVSWGSCWGGGCTK------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 3 17 0.043118 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH ----YAGCCCWGSCWSBCCTR-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v015681_primaryReverse Complement Reverse Complement Backward 7 17 0.044555 Species: Mus musculus Original motif 0.641428 0.180211 0.044767 0.133594 0.171696 0.262981 0.334148 0.231174 0.129726 0.322735 0.243462 0.304077 0.165713 0.175735 0.256108 0.402445 0.146090 0.171890 0.412753 0.269266 0.212837 0.439192 0.280990 0.066980 0.251088 0.275516 0.374380 0.099015 0.575438 0.079656 0.338201 0.006704 0.005634 0.003422 0.972597 0.018348 0.890447 0.077034 0.031851 0.000668 0.007128 0.986862 0.000496 0.005515 0.001445 0.991564 0.001925 0.005066 0.738761 0.190157 0.026399 0.044684 0.013384 0.983783 0.000896 0.001937 0.068077 0.929549 0.000773 0.001602 0.040830 0.933742 0.005283 0.020145 0.730274 0.029225 0.145689 0.094812 0.165032 0.572838 0.162001 0.100129 0.383584 0.129942 0.429497 0.056977 0.455959 0.071959 0.208204 0.263878 0.134271 0.262985 0.222626 0.380117 0.071193 0.346594 0.346081 0.236132 0.445661 0.405278 0.053901 0.095160 Consensus sequence: ABBBBVVRGACCACCCACRDBBM Reverse complement motif 0.095160 0.405278 0.053901 0.445661 0.071193 0.346081 0.346594 0.236132 0.380117 0.262985 0.222626 0.134271 0.263878 0.071959 0.208204 0.455959 0.383584 0.429497 0.129942 0.056977 0.165032 0.162001 0.572838 0.100129 0.094812 0.029225 0.145689 0.730274 0.040830 0.005283 0.933742 0.020145 0.068077 0.000773 0.929549 0.001602 0.013384 0.000896 0.983783 0.001937 0.044684 0.190157 0.026399 0.738761 0.001445 0.001925 0.991564 0.005066 0.007128 0.000496 0.986862 0.005515 0.000668 0.077034 0.031851 0.890447 0.005634 0.972597 0.003422 0.018348 0.006704 0.079656 0.338201 0.575438 0.251088 0.374380 0.275516 0.099015 0.212837 0.280990 0.439192 0.066980 0.146090 0.412753 0.171890 0.269266 0.402445 0.175735 0.256108 0.165713 0.129726 0.243462 0.322735 0.304077 0.171696 0.334148 0.262981 0.231174 0.133594 0.180211 0.044767 0.641428 Consensus sequence: YBVDMGTGGGTGGTCKVVBVBBT Alignment: YBVDMGTGGGTGGTCKVVBVBBT MAGGVSWGSCWGGGCTK------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 6 17 0.045957 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK -----MAGGVSWGSCWGGGCTK ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_primaryOriginal Motif Original Motif Forward 3 17 0.047328 Species: Mus musculus Original motif 0.204923 0.208846 0.365383 0.220848 0.294304 0.300143 0.167287 0.238266 0.109711 0.619514 0.117379 0.153396 0.178979 0.378580 0.230177 0.212264 0.159594 0.542602 0.118178 0.179627 0.125206 0.430074 0.151826 0.292894 0.097692 0.709845 0.116956 0.075506 0.148292 0.565912 0.037632 0.248164 0.077951 0.034190 0.855503 0.032356 0.001657 0.001061 0.971877 0.025405 0.001926 0.001084 0.991712 0.005278 0.033031 0.012001 0.057796 0.897171 0.002723 0.002647 0.993348 0.001281 0.003261 0.000963 0.987199 0.008577 0.000611 0.090925 0.074857 0.833608 0.015299 0.978878 0.004949 0.000874 0.013368 0.600902 0.033485 0.352245 0.231949 0.149575 0.118804 0.499672 0.267580 0.186002 0.371242 0.175176 0.264884 0.223483 0.110082 0.401551 0.221365 0.170121 0.179559 0.428955 0.112997 0.692930 0.139981 0.054092 0.460305 0.207883 0.155111 0.176702 Consensus sequence: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH Reverse complement motif 0.176702 0.207883 0.155111 0.460305 0.112997 0.139981 0.692930 0.054092 0.428955 0.170121 0.179559 0.221365 0.401551 0.223483 0.110082 0.264884 0.267580 0.371242 0.186002 0.175176 0.499672 0.149575 0.118804 0.231949 0.013368 0.033485 0.600902 0.352245 0.015299 0.004949 0.978878 0.000874 0.833608 0.090925 0.074857 0.000611 0.003261 0.987199 0.000963 0.008577 0.002723 0.993348 0.002647 0.001281 0.897171 0.012001 0.057796 0.033031 0.001926 0.991712 0.001084 0.005278 0.001657 0.971877 0.001061 0.025405 0.077951 0.855503 0.034190 0.032356 0.148292 0.037632 0.565912 0.248164 0.097692 0.116956 0.709845 0.075506 0.125206 0.151826 0.430074 0.292894 0.159594 0.118178 0.542602 0.179627 0.178979 0.230177 0.378580 0.212264 0.109711 0.117379 0.619514 0.153396 0.294304 0.167287 0.300143 0.238266 0.204923 0.365383 0.208846 0.220848 Consensus sequence: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB Alignment: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH --YAGCCCWGSCWSBCCTR---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 123 Motif name: C123 Original motif 0.128713 0.019802 0.792079 0.059406 0.900000 0.010000 0.020000 0.070000 0.790000 0.010000 0.010000 0.190000 0.260000 0.500000 0.010000 0.230000 0.310000 0.010000 0.010000 0.670000 0.050000 0.880000 0.010000 0.060000 0.410000 0.030000 0.060000 0.500000 0.060000 0.030000 0.840000 0.070000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.871287 0.009901 0.108911 0.009901 0.686869 0.151515 0.151515 0.010101 0.039604 0.069307 0.089109 0.801980 0.100000 0.720000 0.030000 0.150000 Consensus sequence: GAAMTCWGAAATC Reserve complement motif 0.100000 0.030000 0.720000 0.150000 0.801980 0.069307 0.089109 0.039604 0.010101 0.151515 0.151515 0.686869 0.009901 0.009901 0.108911 0.871287 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.060000 0.840000 0.030000 0.070000 0.500000 0.030000 0.060000 0.410000 0.050000 0.010000 0.880000 0.060000 0.670000 0.010000 0.010000 0.310000 0.260000 0.010000 0.500000 0.230000 0.190000 0.010000 0.010000 0.790000 0.070000 0.010000 0.020000 0.900000 0.128713 0.792079 0.019802 0.059406 Consensus sequence: GATTTCWGARTTC ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 123 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00015 Ehf_secondary Reverse Complement Original Motif Forward 4 13 0.039739 Species: Mus musculus Original motif 0.307205 0.034440 0.106635 0.551720 0.363403 0.109044 0.178564 0.348988 0.296409 0.241179 0.359666 0.102746 0.239304 0.113815 0.274725 0.372156 0.742404 0.063158 0.121573 0.072864 0.160692 0.233592 0.260062 0.345653 0.073999 0.014007 0.012486 0.899508 0.074874 0.014298 0.009907 0.900921 0.022623 0.925966 0.008378 0.043033 0.027723 0.921907 0.020088 0.030282 0.029405 0.074965 0.595500 0.300130 0.776422 0.083024 0.041124 0.099429 0.270188 0.158044 0.134940 0.436827 0.070564 0.545506 0.345463 0.038467 0.316962 0.128938 0.151826 0.402274 0.327940 0.106122 0.104097 0.461841 Consensus sequence: WDVDABTTCCKAHSDW Reverse complement motif 0.461841 0.106122 0.104097 0.327940 0.402274 0.128938 0.151826 0.316962 0.070564 0.345463 0.545506 0.038467 0.436827 0.158044 0.134940 0.270188 0.099429 0.083024 0.041124 0.776422 0.029405 0.595500 0.074965 0.300130 0.027723 0.020088 0.921907 0.030282 0.022623 0.008378 0.925966 0.043033 0.900921 0.014298 0.009907 0.074874 0.899508 0.014007 0.012486 0.073999 0.345653 0.233592 0.260062 0.160692 0.072864 0.063158 0.121573 0.742404 0.372156 0.113815 0.274725 0.239304 0.296409 0.359666 0.241179 0.102746 0.348988 0.109044 0.178564 0.363403 0.551720 0.034440 0.106635 0.307205 Consensus sequence: WDSHTYGGAAVTDVDW Alignment: WDVDABTTCCKAHSDW ---GATTTCWGARTTC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00409 Elf5 Original Motif Original Motif Forward 1 13 0.041152 Species: Mus musculus Original motif 0.179167 0.229135 0.279326 0.312372 0.421239 0.102900 0.145609 0.330252 0.791978 0.009721 0.028951 0.169350 0.237609 0.375543 0.161526 0.225321 0.145845 0.325411 0.516045 0.012699 0.431007 0.516333 0.051679 0.000982 0.005750 0.001408 0.990928 0.001915 0.002025 0.001886 0.992021 0.004068 0.986405 0.001705 0.001039 0.010851 0.950652 0.003619 0.000482 0.045248 0.165221 0.013897 0.819076 0.001805 0.032042 0.049374 0.014632 0.903953 0.285325 0.108010 0.127373 0.479292 0.366131 0.141246 0.290661 0.201963 Consensus sequence: BWAHSMGGAAGTWD Reverse complement motif 0.201963 0.141246 0.290661 0.366131 0.479292 0.108010 0.127373 0.285325 0.903953 0.049374 0.014632 0.032042 0.165221 0.819076 0.013897 0.001805 0.045248 0.003619 0.000482 0.950652 0.010851 0.001705 0.001039 0.986405 0.002025 0.992021 0.001886 0.004068 0.005750 0.990928 0.001408 0.001915 0.431007 0.051679 0.516333 0.000982 0.145845 0.516045 0.325411 0.012699 0.237609 0.161526 0.375543 0.225321 0.169350 0.009721 0.028951 0.791978 0.330252 0.102900 0.145609 0.421239 0.312372 0.229135 0.279326 0.179167 Consensus sequence: DWACTTCCRSDTWV Alignment: BWAHSMGGAAGTWD GAAMTCWGAAATC- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00015 Ehf_primary Original Motif Original Motif Forward 2 13 0.041718 Species: Mus musculus Original motif 0.327238 0.304037 0.232174 0.136551 0.198306 0.222758 0.316421 0.262515 0.252373 0.217079 0.267210 0.263337 0.633781 0.039800 0.036914 0.289504 0.160405 0.384709 0.220671 0.234215 0.134205 0.590541 0.266074 0.009179 0.210933 0.755978 0.030378 0.002710 0.011856 0.001472 0.984138 0.002533 0.003235 0.001605 0.989465 0.005695 0.984189 0.002418 0.002842 0.010551 0.884492 0.002651 0.002095 0.110762 0.249047 0.054607 0.690939 0.005407 0.124602 0.154669 0.047597 0.673132 0.375217 0.110561 0.230374 0.283848 0.402951 0.186789 0.219551 0.190710 Consensus sequence: VBDABCCGGAAGTDD Reverse complement motif 0.190710 0.186789 0.219551 0.402951 0.283848 0.110561 0.230374 0.375217 0.673132 0.154669 0.047597 0.124602 0.249047 0.690939 0.054607 0.005407 0.110762 0.002651 0.002095 0.884492 0.010551 0.002418 0.002842 0.984189 0.003235 0.989465 0.001605 0.005695 0.011856 0.984138 0.001472 0.002533 0.210933 0.030378 0.755978 0.002710 0.134205 0.266074 0.590541 0.009179 0.160405 0.220671 0.384709 0.234215 0.289504 0.039800 0.036914 0.633781 0.252373 0.267210 0.217079 0.263337 0.198306 0.316421 0.222758 0.262515 0.136551 0.304037 0.232174 0.327238 Consensus sequence: DDACTTCCGGBTHBB Alignment: VBDABCCGGAAGTDD -GAAMTCWGAAATC- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00413 Elf4 Reverse Complement Original Motif Forward 4 13 0.041802 Species: Mus musculus Original motif 0.349744 0.139466 0.209326 0.301464 0.080478 0.359482 0.307083 0.252956 0.145756 0.213763 0.350557 0.289924 0.317307 0.199359 0.096089 0.387245 0.868576 0.009724 0.088821 0.032878 0.001975 0.827004 0.014159 0.156862 0.045494 0.000985 0.001907 0.951615 0.011012 0.001203 0.002186 0.985599 0.002743 0.992908 0.002226 0.002123 0.001498 0.990840 0.001556 0.006106 0.000951 0.005138 0.880591 0.113319 0.003127 0.107962 0.867980 0.020930 0.156602 0.055355 0.396563 0.391480 0.421246 0.049379 0.084495 0.444880 0.223879 0.068063 0.203809 0.504249 0.144100 0.323579 0.131544 0.400777 Consensus sequence: DBBHACTTCCGGKWTH Reverse complement motif 0.400777 0.323579 0.131544 0.144100 0.504249 0.068063 0.203809 0.223879 0.444880 0.049379 0.084495 0.421246 0.156602 0.396563 0.055355 0.391480 0.003127 0.867980 0.107962 0.020930 0.000951 0.880591 0.005138 0.113319 0.001498 0.001556 0.990840 0.006106 0.002743 0.002226 0.992908 0.002123 0.985599 0.001203 0.002186 0.011012 0.951615 0.000985 0.001907 0.045494 0.001975 0.014159 0.827004 0.156862 0.032878 0.009724 0.088821 0.868576 0.387245 0.199359 0.096089 0.317307 0.145756 0.350557 0.213763 0.289924 0.080478 0.307083 0.359482 0.252956 0.301464 0.139466 0.209326 0.349744 Consensus sequence: HAWYCCGGAAGTHBBD Alignment: DBBHACTTCCGGKWTH ---GATTTCWGARTTC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00418 Etv6 Original Motif Reverse Complement Backward 5 13 0.041862 Species: Mus musculus Original motif 0.354972 0.069107 0.299350 0.276571 0.209701 0.408003 0.227382 0.154914 0.284336 0.375266 0.162604 0.177794 0.176569 0.181438 0.342172 0.299820 0.106551 0.204378 0.060299 0.628772 0.884088 0.003252 0.103113 0.009546 0.001110 0.704391 0.006294 0.288205 0.014992 0.000892 0.001401 0.982714 0.004842 0.001887 0.002470 0.990801 0.002724 0.992864 0.002206 0.002206 0.001792 0.991200 0.001615 0.005393 0.005151 0.010157 0.940259 0.044433 0.017780 0.199839 0.761921 0.020459 0.230834 0.269936 0.119652 0.379577 0.233019 0.093692 0.034743 0.638546 0.194739 0.181763 0.175340 0.448159 0.145452 0.293709 0.335917 0.224922 Consensus sequence: DVHBTACTTCCGGHTHB Reverse complement motif 0.145452 0.335917 0.293709 0.224922 0.448159 0.181763 0.175340 0.194739 0.638546 0.093692 0.034743 0.233019 0.379577 0.269936 0.119652 0.230834 0.017780 0.761921 0.199839 0.020459 0.005151 0.940259 0.010157 0.044433 0.001792 0.001615 0.991200 0.005393 0.002724 0.002206 0.992864 0.002206 0.990801 0.001887 0.002470 0.004842 0.982714 0.000892 0.001401 0.014992 0.001110 0.006294 0.704391 0.288205 0.009546 0.003252 0.103113 0.884088 0.628772 0.204378 0.060299 0.106551 0.176569 0.342172 0.181438 0.299820 0.284336 0.162604 0.375266 0.177794 0.209701 0.227382 0.408003 0.154914 0.276571 0.069107 0.299350 0.354972 Consensus sequence: BHAHCCGGAAGTABDVD Alignment: BHAHCCGGAAGTABDVD GAAMTCWGAAATC---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 124 Motif name: C124 Original motif 0.430000 0.040000 0.070000 0.460000 0.030000 0.350000 0.460000 0.160000 0.610000 0.220000 0.110000 0.060000 0.010000 0.910000 0.070000 0.010000 0.080000 0.440000 0.470000 0.010000 0.420000 0.020000 0.550000 0.010000 0.120000 0.440000 0.420000 0.020000 0.039604 0.178218 0.762376 0.019802 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.020000 0.010000 0.010000 0.960000 0.010000 0.010000 0.940000 0.040000 0.030000 0.460000 0.480000 0.030000 0.009901 0.485149 0.029703 0.475248 0.029703 0.465347 0.415842 0.089109 0.010000 0.080000 0.010000 0.900000 0.010000 0.710000 0.010000 0.270000 0.200000 0.440000 0.350000 0.010000 0.445545 0.039604 0.069307 0.445545 Consensus sequence: WSACSRSGCTGSYSTCSW Reserve complement motif 0.445545 0.039604 0.069307 0.445545 0.200000 0.350000 0.440000 0.010000 0.010000 0.010000 0.710000 0.270000 0.900000 0.080000 0.010000 0.010000 0.029703 0.415842 0.465347 0.089109 0.009901 0.029703 0.485149 0.475248 0.030000 0.480000 0.460000 0.030000 0.010000 0.940000 0.010000 0.040000 0.960000 0.010000 0.010000 0.020000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.039604 0.762376 0.178218 0.019802 0.120000 0.420000 0.440000 0.020000 0.420000 0.550000 0.020000 0.010000 0.080000 0.470000 0.440000 0.010000 0.010000 0.070000 0.910000 0.010000 0.060000 0.220000 0.110000 0.610000 0.030000 0.460000 0.350000 0.160000 0.460000 0.040000 0.070000 0.430000 Consensus sequence: WSGASKSCAGCSMSGTSW ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 124 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 4 18 0.032921 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH --WSGASKSCAGCSMSGTSW--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00528 Foxm1_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 4 18 0.032945 Species: Mus musculus Original motif 0.399785 0.446658 0.111435 0.042122 0.535175 0.103991 0.089706 0.271128 0.078171 0.387987 0.375083 0.158759 0.309001 0.519142 0.070618 0.101239 0.201844 0.255818 0.323149 0.219190 0.534101 0.109845 0.235026 0.121028 0.656038 0.037473 0.261484 0.045006 0.315713 0.164290 0.471815 0.048182 0.651960 0.009412 0.328237 0.010391 0.937365 0.017313 0.007516 0.037807 0.019983 0.044238 0.012387 0.923392 0.061195 0.021485 0.881645 0.035675 0.017521 0.952998 0.013139 0.016342 0.254160 0.029735 0.493023 0.223082 0.239200 0.593324 0.114503 0.052973 0.610822 0.071539 0.099169 0.218470 0.166610 0.389712 0.204400 0.239278 0.227752 0.361626 0.178497 0.232125 0.537030 0.182466 0.026035 0.254470 0.235902 0.151006 0.043788 0.569304 0.081851 0.250397 0.590059 0.077693 0.340417 0.189613 0.272075 0.197895 Consensus sequence: MWSMBAARRATGCDCABHATGD Reverse complement motif 0.197895 0.189613 0.272075 0.340417 0.081851 0.590059 0.250397 0.077693 0.569304 0.151006 0.043788 0.235902 0.254470 0.182466 0.026035 0.537030 0.227752 0.178497 0.361626 0.232125 0.166610 0.204400 0.389712 0.239278 0.218470 0.071539 0.099169 0.610822 0.239200 0.114503 0.593324 0.052973 0.254160 0.493023 0.029735 0.223082 0.017521 0.013139 0.952998 0.016342 0.061195 0.881645 0.021485 0.035675 0.923392 0.044238 0.012387 0.019983 0.037807 0.017313 0.007516 0.937365 0.010391 0.009412 0.328237 0.651960 0.315713 0.471815 0.164290 0.048182 0.045006 0.037473 0.261484 0.656038 0.121028 0.109845 0.235026 0.534101 0.201844 0.323149 0.255818 0.219190 0.309001 0.070618 0.519142 0.101239 0.078171 0.375083 0.387987 0.158759 0.271128 0.103991 0.089706 0.535175 0.399785 0.111435 0.446658 0.042122 Consensus sequence: DCATDBTGHGCATKMTTBRSWR Alignment: MWSMBAARRATGCDCABHATGD -WSACSRSGCTGSYSTCSW--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00526 Foxn1_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 4 18 0.035174 Species: Mus musculus Original motif 0.477863 0.106306 0.184102 0.231729 0.304951 0.149020 0.361418 0.184612 0.548996 0.056128 0.348902 0.045974 0.385727 0.477782 0.086218 0.050273 0.409556 0.232265 0.173851 0.184328 0.174550 0.312880 0.307123 0.205448 0.850398 0.047204 0.041665 0.060734 0.141234 0.548534 0.142230 0.168002 0.059462 0.026354 0.892948 0.021236 0.053714 0.870297 0.028935 0.047055 0.086273 0.069147 0.805284 0.039296 0.033781 0.573881 0.034115 0.358223 0.035191 0.079663 0.824970 0.060176 0.051830 0.862631 0.019359 0.066180 0.178685 0.015738 0.762485 0.043092 0.058988 0.042615 0.017608 0.880789 0.202382 0.173360 0.284095 0.340163 0.098493 0.234651 0.506524 0.160333 0.109087 0.336204 0.250510 0.304198 0.130945 0.250843 0.177122 0.441090 0.353830 0.138838 0.162784 0.344548 0.114290 0.417163 0.160662 0.307885 Consensus sequence: DDRMHBACGCGYGCGTDGBBDB Reverse complement motif 0.114290 0.160662 0.417163 0.307885 0.344548 0.138838 0.162784 0.353830 0.441090 0.250843 0.177122 0.130945 0.109087 0.250510 0.336204 0.304198 0.098493 0.506524 0.234651 0.160333 0.340163 0.173360 0.284095 0.202382 0.880789 0.042615 0.017608 0.058988 0.178685 0.762485 0.015738 0.043092 0.051830 0.019359 0.862631 0.066180 0.035191 0.824970 0.079663 0.060176 0.033781 0.034115 0.573881 0.358223 0.086273 0.805284 0.069147 0.039296 0.053714 0.028935 0.870297 0.047055 0.059462 0.892948 0.026354 0.021236 0.141234 0.142230 0.548534 0.168002 0.060734 0.047204 0.041665 0.850398 0.174550 0.307123 0.312880 0.205448 0.184328 0.232265 0.173851 0.409556 0.385727 0.086218 0.477782 0.050273 0.045974 0.056128 0.348902 0.548996 0.304951 0.361418 0.149020 0.184612 0.231729 0.106306 0.184102 0.477863 Consensus sequence: BDVBCDACGCKCGCGTBHRKHD Alignment: BDVBCDACGCKCGCGTBHRKHD -WSACSRSGCTGSYSTCSW--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 3 18 0.036252 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH --WSGASKSCAGCSMSGTSW-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00526 Foxn1_primary Original Motif Original Motif Backward 3 18 0.037852 Species: Mus musculus Original motif 0.456612 0.057181 0.078281 0.407926 0.460529 0.185506 0.083106 0.270859 0.445717 0.179510 0.239355 0.135417 0.116339 0.145186 0.275331 0.463144 0.239398 0.142078 0.480004 0.138520 0.355157 0.217877 0.284296 0.142670 0.318602 0.444835 0.153321 0.083243 0.609569 0.055866 0.280349 0.054216 0.062297 0.769824 0.027844 0.140035 0.151868 0.019245 0.803188 0.025699 0.011842 0.952534 0.017959 0.017665 0.017665 0.017959 0.952534 0.011842 0.025699 0.803188 0.019245 0.151868 0.140035 0.027844 0.769824 0.062297 0.054216 0.280349 0.055866 0.609569 0.013084 0.624655 0.177956 0.184305 0.287647 0.183527 0.295753 0.233074 0.042309 0.345931 0.198458 0.413301 0.338138 0.266033 0.045367 0.350462 0.302850 0.155320 0.074662 0.467168 0.240926 0.068901 0.283055 0.407118 0.409954 0.183157 0.154186 0.252704 Consensus sequence: WHVBVVMACGCGCGTCDYHWDH Reverse complement motif 0.252704 0.183157 0.154186 0.409954 0.407118 0.068901 0.283055 0.240926 0.467168 0.155320 0.074662 0.302850 0.350462 0.266033 0.045367 0.338138 0.413301 0.345931 0.198458 0.042309 0.287647 0.295753 0.183527 0.233074 0.013084 0.177956 0.624655 0.184305 0.609569 0.280349 0.055866 0.054216 0.140035 0.769824 0.027844 0.062297 0.025699 0.019245 0.803188 0.151868 0.017665 0.952534 0.017959 0.011842 0.011842 0.017959 0.952534 0.017665 0.151868 0.803188 0.019245 0.025699 0.062297 0.027844 0.769824 0.140035 0.054216 0.055866 0.280349 0.609569 0.318602 0.153321 0.444835 0.083243 0.142670 0.217877 0.284296 0.355157 0.239398 0.480004 0.142078 0.138520 0.463144 0.145186 0.275331 0.116339 0.135417 0.179510 0.239355 0.445717 0.270859 0.185506 0.083106 0.460529 0.407926 0.057181 0.078281 0.456612 Consensus sequence: HDWHMHGACGCGCGTRBVVBHW Alignment: WHVBVVMACGCGCGTCDYHWDH --WSACSRSGCTGSYSTCSW-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 125 Motif name: C125 Original motif 0.140000 0.470000 0.350000 0.040000 0.089109 0.079208 0.396040 0.435644 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.009901 0.504950 0.336634 0.148515 0.504950 0.138614 0.009901 0.346535 0.020000 0.430000 0.060000 0.490000 0.920000 0.010000 0.010000 0.060000 0.070000 0.380000 0.540000 0.010000 0.792079 0.009901 0.079208 0.118812 0.120000 0.260000 0.610000 0.010000 0.430000 0.160000 0.400000 0.010000 0.326733 0.069307 0.099010 0.504950 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.080000 0.550000 0.360000 0.010000 0.500000 0.380000 0.060000 0.060000 0.010000 0.420000 0.380000 0.190000 Consensus sequence: SKASWYASAGRWASMS Reserve complement motif 0.010000 0.380000 0.420000 0.190000 0.060000 0.380000 0.060000 0.500000 0.080000 0.360000 0.550000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.504950 0.069307 0.099010 0.326733 0.010000 0.160000 0.400000 0.430000 0.120000 0.610000 0.260000 0.010000 0.118812 0.009901 0.079208 0.792079 0.070000 0.540000 0.380000 0.010000 0.060000 0.010000 0.010000 0.920000 0.490000 0.430000 0.060000 0.020000 0.346535 0.138614 0.009901 0.504950 0.009901 0.336634 0.504950 0.148515 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.435644 0.079208 0.396040 0.089109 0.140000 0.350000 0.470000 0.040000 Consensus sequence: SYSTWKCTSTMWSTRS ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 125 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 6 16 0.030466 Species: Mus musculus Original motif 0.067627 0.131333 0.654425 0.146615 0.156488 0.114442 0.145630 0.583441 0.206450 0.265630 0.358017 0.169903 0.090729 0.460713 0.274712 0.173847 0.285994 0.099998 0.154485 0.459523 0.635908 0.184787 0.072982 0.106323 0.748421 0.039204 0.092605 0.119769 0.081342 0.061327 0.044532 0.812799 0.143120 0.043879 0.024216 0.788785 0.247544 0.092102 0.621453 0.038901 0.295531 0.036295 0.027594 0.640580 0.194561 0.305468 0.339916 0.160055 0.175038 0.193568 0.101212 0.530182 0.145226 0.167488 0.559871 0.127415 0.271501 0.237429 0.206701 0.284369 0.216834 0.109191 0.569605 0.104370 0.182624 0.177160 0.300475 0.339742 0.331737 0.198645 0.265137 0.204482 0.230155 0.359365 0.183450 0.227029 0.056581 0.067297 0.463052 0.413070 0.198891 0.324626 0.304424 0.172059 0.181968 0.287547 0.202419 0.328066 Consensus sequence: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB Reverse complement motif 0.328066 0.287547 0.202419 0.181968 0.198891 0.304424 0.324626 0.172059 0.056581 0.463052 0.067297 0.413070 0.230155 0.183450 0.359365 0.227029 0.204482 0.198645 0.265137 0.331737 0.339742 0.177160 0.300475 0.182624 0.216834 0.569605 0.109191 0.104370 0.284369 0.237429 0.206701 0.271501 0.145226 0.559871 0.167488 0.127415 0.530182 0.193568 0.101212 0.175038 0.194561 0.339916 0.305468 0.160055 0.640580 0.036295 0.027594 0.295531 0.247544 0.621453 0.092102 0.038901 0.788785 0.043879 0.024216 0.143120 0.812799 0.061327 0.044532 0.081342 0.119769 0.039204 0.092605 0.748421 0.106323 0.184787 0.072982 0.635908 0.459523 0.099998 0.154485 0.285994 0.090729 0.274712 0.460713 0.173847 0.206450 0.358017 0.265630 0.169903 0.583441 0.114442 0.145630 0.156488 0.067627 0.654425 0.131333 0.146615 Consensus sequence: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC Alignment: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB -SYSTWKCTSTMWSTRS----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00122 Tgif1 Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 16 0.033763 Species: Mus musculus Original motif 0.272977 0.158875 0.284742 0.283406 0.550609 0.124110 0.169608 0.155673 0.114568 0.207160 0.282464 0.395807 0.560868 0.052907 0.053508 0.332716 0.336500 0.068048 0.114050 0.481403 0.007736 0.003722 0.000495 0.988048 0.004489 0.000729 0.992211 0.002571 0.956618 0.000414 0.000890 0.042078 0.004381 0.990925 0.000538 0.004156 0.982797 0.000366 0.015539 0.001298 0.016760 0.002980 0.969991 0.010269 0.036013 0.725983 0.200022 0.037982 0.064755 0.104386 0.133891 0.696968 0.199404 0.263520 0.410228 0.126848 0.222648 0.351390 0.272575 0.153387 0.087778 0.206043 0.395671 0.310507 0.319643 0.144216 0.196041 0.340100 Consensus sequence: DABWWTGACAGCTVVBD Reverse complement motif 0.340100 0.144216 0.196041 0.319643 0.087778 0.395671 0.206043 0.310507 0.222648 0.272575 0.351390 0.153387 0.199404 0.410228 0.263520 0.126848 0.696968 0.104386 0.133891 0.064755 0.036013 0.200022 0.725983 0.037982 0.016760 0.969991 0.002980 0.010269 0.001298 0.000366 0.015539 0.982797 0.004381 0.000538 0.990925 0.004156 0.042078 0.000414 0.000890 0.956618 0.004489 0.992211 0.000729 0.002571 0.988048 0.003722 0.000495 0.007736 0.481403 0.068048 0.114050 0.336500 0.332716 0.052907 0.053508 0.560868 0.395807 0.207160 0.282464 0.114568 0.155673 0.124110 0.169608 0.550609 0.272977 0.284742 0.158875 0.283406 Consensus sequence: DBVVAGCTGTCAWWVTH Alignment: DBVVAGCTGTCAWWVTH SYSTWKCTSTMWSTRS- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00014 Sox17_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 1 16 0.034204 Species: Mus musculus Original motif 0.216056 0.230834 0.399857 0.153253 0.321065 0.233860 0.135741 0.309334 0.166479 0.321423 0.209463 0.302635 0.185647 0.499038 0.152355 0.162961 0.416451 0.221510 0.168645 0.193395 0.070777 0.581761 0.126392 0.221070 0.764583 0.085635 0.031993 0.117789 0.035294 0.112638 0.038664 0.813404 0.153178 0.046321 0.056161 0.744340 0.076540 0.825062 0.055409 0.042989 0.764357 0.060365 0.119861 0.055417 0.130143 0.178946 0.153266 0.537644 0.402684 0.154010 0.357674 0.085632 0.189784 0.349553 0.176965 0.283698 0.475181 0.145276 0.256449 0.123094 0.472286 0.151639 0.172736 0.203339 0.215278 0.186804 0.213020 0.384898 Consensus sequence: VHBHHCATTCATRHVDD Reverse complement motif 0.384898 0.186804 0.213020 0.215278 0.203339 0.151639 0.172736 0.472286 0.123094 0.145276 0.256449 0.475181 0.189784 0.176965 0.349553 0.283698 0.085632 0.154010 0.357674 0.402684 0.537644 0.178946 0.153266 0.130143 0.055417 0.060365 0.119861 0.764357 0.076540 0.055409 0.825062 0.042989 0.744340 0.046321 0.056161 0.153178 0.813404 0.112638 0.038664 0.035294 0.117789 0.085635 0.031993 0.764583 0.070777 0.126392 0.581761 0.221070 0.193395 0.221510 0.168645 0.416451 0.185647 0.152355 0.499038 0.162961 0.166479 0.209463 0.321423 0.302635 0.309334 0.233860 0.135741 0.321065 0.216056 0.399857 0.230834 0.153253 Consensus sequence: DDBDKATGAATGHDBHV Alignment: VHBHHCATTCATRHVDD SKASWYASAGRWASMS- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00077 Srf_secondary Original Motif Original Motif Forward 1 16 0.034641 Species: Mus musculus Original motif 0.162968 0.284828 0.440984 0.111220 0.151392 0.200635 0.205316 0.442657 0.267215 0.083669 0.192498 0.456618 0.332771 0.180711 0.200027 0.286491 0.509370 0.102954 0.242569 0.145107 0.666262 0.077309 0.154466 0.101962 0.737968 0.113335 0.100401 0.048296 0.658878 0.141580 0.134033 0.065510 0.766115 0.094051 0.069763 0.070072 0.755621 0.088491 0.044802 0.111086 0.749083 0.135917 0.047510 0.067490 0.663231 0.176795 0.028134 0.131839 0.553358 0.277659 0.038655 0.130328 0.392578 0.314083 0.209844 0.083495 0.198462 0.237132 0.239466 0.324940 0.275121 0.210087 0.194779 0.320013 0.287748 0.277395 0.142704 0.292154 Consensus sequence: VBDDAAAAAAAAMVBHH Reverse complement motif 0.292154 0.277395 0.142704 0.287748 0.320013 0.210087 0.194779 0.275121 0.324940 0.237132 0.239466 0.198462 0.083495 0.314083 0.209844 0.392578 0.130328 0.277659 0.038655 0.553358 0.131839 0.176795 0.028134 0.663231 0.067490 0.135917 0.047510 0.749083 0.111086 0.088491 0.044802 0.755621 0.070072 0.094051 0.069763 0.766115 0.065510 0.141580 0.134033 0.658878 0.048296 0.113335 0.100401 0.737968 0.101962 0.077309 0.154466 0.666262 0.145107 0.102954 0.242569 0.509370 0.286491 0.180711 0.200027 0.332771 0.456618 0.083669 0.192498 0.267215 0.442657 0.200635 0.205316 0.151392 0.162968 0.440984 0.284828 0.111220 Consensus sequence: HHVBYTTTTTTTTDDVV Alignment: VBDDAAAAAAAAMVBHH SKASWYASAGRWASMS- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00084 Gmeb1_primary Original Motif Reverse Complement Backward 1 16 0.035911 Species: Mus musculus Original motif 0.166569 0.264627 0.345569 0.223235 0.335599 0.314451 0.153336 0.196615 0.105350 0.231839 0.348018 0.314793 0.131274 0.215623 0.291288 0.361815 0.125570 0.072341 0.404848 0.397242 0.049879 0.039110 0.325167 0.585844 0.705098 0.009202 0.284757 0.000943 0.003535 0.986983 0.004275 0.005207 0.005207 0.004275 0.986983 0.003535 0.000943 0.284757 0.009202 0.705098 0.585844 0.325167 0.039110 0.049879 0.397242 0.404848 0.072341 0.125570 0.206857 0.234555 0.371731 0.186857 0.435957 0.145115 0.181033 0.237896 0.176104 0.260127 0.230770 0.333000 0.272102 0.213365 0.312032 0.202501 0.237402 0.250982 0.266977 0.244639 Consensus sequence: BHBBKKACGTMMVDBVB Reverse complement motif 0.237402 0.266977 0.250982 0.244639 0.272102 0.312032 0.213365 0.202501 0.333000 0.260127 0.230770 0.176104 0.237896 0.145115 0.181033 0.435957 0.206857 0.371731 0.234555 0.186857 0.397242 0.072341 0.404848 0.125570 0.049879 0.325167 0.039110 0.585844 0.705098 0.284757 0.009202 0.000943 0.005207 0.986983 0.004275 0.003535 0.003535 0.004275 0.986983 0.005207 0.000943 0.009202 0.284757 0.705098 0.585844 0.039110 0.325167 0.049879 0.125570 0.404848 0.072341 0.397242 0.361815 0.215623 0.291288 0.131274 0.105350 0.348018 0.231839 0.314793 0.196615 0.314451 0.153336 0.335599 0.166569 0.345569 0.264627 0.223235 Consensus sequence: BVVDVRYACGTRYVBHB Alignment: BHBBKKACGTMMVDBVB -SKASWYASAGRWASMS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 126 Motif name: C126 Original motif 0.009901 0.386139 0.465347 0.138614 0.410000 0.170000 0.340000 0.080000 0.560000 0.010000 0.010000 0.420000 0.099010 0.009901 0.881188 0.009901 0.300000 0.140000 0.530000 0.030000 0.128713 0.732673 0.049505 0.089109 0.020000 0.490000 0.450000 0.040000 0.540000 0.400000 0.050000 0.010000 0.010000 0.050000 0.480000 0.460000 0.070000 0.460000 0.460000 0.010000 0.009901 0.851485 0.128713 0.009901 0.009901 0.009901 0.099010 0.881188 0.069307 0.128713 0.693069 0.108911 0.099010 0.009901 0.881188 0.009901 0.040000 0.310000 0.200000 0.450000 0.140000 0.470000 0.320000 0.070000 Consensus sequence: SVWGRCSMKSCTGGYS Reserve complement motif 0.140000 0.320000 0.470000 0.070000 0.450000 0.310000 0.200000 0.040000 0.099010 0.881188 0.009901 0.009901 0.069307 0.693069 0.128713 0.108911 0.881188 0.009901 0.099010 0.009901 0.009901 0.128713 0.851485 0.009901 0.070000 0.460000 0.460000 0.010000 0.010000 0.480000 0.050000 0.460000 0.010000 0.400000 0.050000 0.540000 0.020000 0.450000 0.490000 0.040000 0.128713 0.049505 0.732673 0.089109 0.300000 0.530000 0.140000 0.030000 0.099010 0.881188 0.009901 0.009901 0.420000 0.010000 0.010000 0.560000 0.080000 0.170000 0.340000 0.410000 0.009901 0.465347 0.386139 0.138614 Consensus sequence: SMCCAGSYYSGMCWBS ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 126 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 1 16 0.024631 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH SVWGRCSMKSCTGGYS------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 2 16 0.025748 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH ------SMCCAGSYYSGMCWBS- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v015681_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 3 16 0.027917 Species: Mus musculus Original motif 0.214165 0.143436 0.372522 0.269876 0.314445 0.406003 0.160351 0.119201 0.137147 0.092924 0.042921 0.727007 0.044121 0.072843 0.051741 0.831295 0.261292 0.324124 0.298498 0.116086 0.258125 0.323243 0.263362 0.155271 0.204557 0.589399 0.107153 0.098891 0.371021 0.244027 0.291102 0.093849 0.096327 0.572718 0.011797 0.319159 0.027282 0.046183 0.844519 0.082016 0.018921 0.012887 0.915917 0.052275 0.364793 0.166722 0.084229 0.384256 0.028216 0.011233 0.951056 0.009495 0.054974 0.004738 0.890377 0.049911 0.006802 0.312915 0.134247 0.546036 0.241289 0.628210 0.104788 0.025713 0.237863 0.302807 0.213018 0.246311 0.349399 0.203220 0.086635 0.360746 0.386634 0.144693 0.246895 0.221779 0.425101 0.354676 0.093374 0.126849 0.060272 0.391320 0.104905 0.443503 0.162090 0.190233 0.227433 0.420244 Consensus sequence: DVTTVVCVYGGHGGYCHHDMYB Reverse complement motif 0.420244 0.190233 0.227433 0.162090 0.443503 0.391320 0.104905 0.060272 0.126849 0.354676 0.093374 0.425101 0.221779 0.144693 0.246895 0.386634 0.360746 0.203220 0.086635 0.349399 0.237863 0.213018 0.302807 0.246311 0.241289 0.104788 0.628210 0.025713 0.546036 0.312915 0.134247 0.006802 0.054974 0.890377 0.004738 0.049911 0.028216 0.951056 0.011233 0.009495 0.384256 0.166722 0.084229 0.364793 0.018921 0.915917 0.012887 0.052275 0.027282 0.844519 0.046183 0.082016 0.096327 0.011797 0.572718 0.319159 0.093849 0.244027 0.291102 0.371021 0.204557 0.107153 0.589399 0.098891 0.258125 0.263362 0.323243 0.155271 0.261292 0.298498 0.324124 0.116086 0.831295 0.072843 0.051741 0.044121 0.727007 0.092924 0.042921 0.137147 0.314445 0.160351 0.406003 0.119201 0.214165 0.372522 0.143436 0.269876 Consensus sequence: VMYDHDGMCCHCCKBGVVAAVH Alignment: VMYDHDGMCCHCCKBGVVAAVH --SVWGRCSMKSCTGGYS---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v015681_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 6 16 0.030717 Species: Mus musculus Original motif 0.331499 0.188505 0.182841 0.297156 0.328961 0.213025 0.273530 0.184484 0.197213 0.129292 0.524914 0.148581 0.274491 0.226406 0.312118 0.186986 0.103231 0.393726 0.364988 0.138055 0.552594 0.166422 0.186262 0.094722 0.157618 0.064773 0.616497 0.161112 0.139166 0.176098 0.621185 0.063551 0.748420 0.062398 0.012447 0.176735 0.116584 0.009438 0.860326 0.013653 0.005030 0.003646 0.974877 0.016447 0.055257 0.007181 0.921760 0.015802 0.032748 0.058249 0.052709 0.856293 0.105606 0.872231 0.014370 0.007793 0.019480 0.497379 0.125899 0.357242 0.478582 0.269713 0.061464 0.190242 0.253985 0.287006 0.201320 0.257689 0.319384 0.210231 0.175842 0.294543 0.222123 0.287802 0.201294 0.288782 0.139951 0.376041 0.081133 0.402875 0.213450 0.343835 0.383676 0.059039 0.322294 0.355918 0.148062 0.173725 Consensus sequence: HVGVSAGGAGGGTCYHHHHYVH Reverse complement motif 0.322294 0.148062 0.355918 0.173725 0.213450 0.383676 0.343835 0.059039 0.402875 0.376041 0.081133 0.139951 0.288782 0.287802 0.201294 0.222123 0.294543 0.210231 0.175842 0.319384 0.253985 0.201320 0.287006 0.257689 0.190242 0.269713 0.061464 0.478582 0.019480 0.125899 0.497379 0.357242 0.105606 0.014370 0.872231 0.007793 0.856293 0.058249 0.052709 0.032748 0.055257 0.921760 0.007181 0.015802 0.005030 0.974877 0.003646 0.016447 0.116584 0.860326 0.009438 0.013653 0.176735 0.062398 0.012447 0.748420 0.139166 0.621185 0.176098 0.063551 0.157618 0.616497 0.064773 0.161112 0.094722 0.166422 0.186262 0.552594 0.103231 0.364988 0.393726 0.138055 0.274491 0.312118 0.226406 0.186986 0.197213 0.524914 0.129292 0.148581 0.184484 0.213025 0.273530 0.328961 0.297156 0.188505 0.182841 0.331499 Consensus sequence: DVMHHDHKGACCCTCCTSVCBH Alignment: DVMHHDHKGACCCTCCTSVCBH -----SVWGRCSMKSCTGGYS- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_primaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 4 16 0.032917 Species: Mus musculus Original motif 0.204923 0.208846 0.365383 0.220848 0.294304 0.300143 0.167287 0.238266 0.109711 0.619514 0.117379 0.153396 0.178979 0.378580 0.230177 0.212264 0.159594 0.542602 0.118178 0.179627 0.125206 0.430074 0.151826 0.292894 0.097692 0.709845 0.116956 0.075506 0.148292 0.565912 0.037632 0.248164 0.077951 0.034190 0.855503 0.032356 0.001657 0.001061 0.971877 0.025405 0.001926 0.001084 0.991712 0.005278 0.033031 0.012001 0.057796 0.897171 0.002723 0.002647 0.993348 0.001281 0.003261 0.000963 0.987199 0.008577 0.000611 0.090925 0.074857 0.833608 0.015299 0.978878 0.004949 0.000874 0.013368 0.600902 0.033485 0.352245 0.231949 0.149575 0.118804 0.499672 0.267580 0.186002 0.371242 0.175176 0.264884 0.223483 0.110082 0.401551 0.221365 0.170121 0.179559 0.428955 0.112997 0.692930 0.139981 0.054092 0.460305 0.207883 0.155111 0.176702 Consensus sequence: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH Reverse complement motif 0.176702 0.207883 0.155111 0.460305 0.112997 0.139981 0.692930 0.054092 0.428955 0.170121 0.179559 0.221365 0.401551 0.223483 0.110082 0.264884 0.267580 0.371242 0.186002 0.175176 0.499672 0.149575 0.118804 0.231949 0.013368 0.033485 0.600902 0.352245 0.015299 0.004949 0.978878 0.000874 0.833608 0.090925 0.074857 0.000611 0.003261 0.987199 0.000963 0.008577 0.002723 0.993348 0.002647 0.001281 0.897171 0.012001 0.057796 0.033031 0.001926 0.991712 0.001084 0.005278 0.001657 0.971877 0.001061 0.025405 0.077951 0.855503 0.034190 0.032356 0.148292 0.037632 0.565912 0.248164 0.097692 0.116956 0.709845 0.075506 0.125206 0.151826 0.430074 0.292894 0.159594 0.118178 0.542602 0.179627 0.178979 0.230177 0.378580 0.212264 0.109711 0.117379 0.619514 0.153396 0.294304 0.167287 0.300143 0.238266 0.204923 0.365383 0.208846 0.220848 Consensus sequence: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB Alignment: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB ----SVWGRCSMKSCTGGYS--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 127 Motif name: C127 Original motif 0.099010 0.693069 0.029703 0.178218 0.120000 0.060000 0.400000 0.420000 0.010000 0.820000 0.010000 0.160000 0.020000 0.870000 0.010000 0.100000 0.010000 0.420000 0.010000 0.560000 0.020000 0.290000 0.170000 0.520000 0.029703 0.138614 0.089109 0.742574 0.320000 0.250000 0.140000 0.290000 0.792079 0.009901 0.138614 0.059406 0.010000 0.200000 0.010000 0.780000 0.010000 0.720000 0.010000 0.260000 0.010000 0.740000 0.010000 0.240000 0.010000 0.680000 0.010000 0.300000 0.534653 0.326733 0.009901 0.128713 0.188119 0.089109 0.693069 0.029703 Consensus sequence: CKCCYYTHATCCCMG Reserve complement motif 0.188119 0.693069 0.089109 0.029703 0.128713 0.326733 0.009901 0.534653 0.010000 0.010000 0.680000 0.300000 0.010000 0.010000 0.740000 0.240000 0.010000 0.010000 0.720000 0.260000 0.780000 0.200000 0.010000 0.010000 0.059406 0.009901 0.138614 0.792079 0.290000 0.250000 0.140000 0.320000 0.742574 0.138614 0.089109 0.029703 0.520000 0.290000 0.170000 0.020000 0.560000 0.420000 0.010000 0.010000 0.020000 0.010000 0.870000 0.100000 0.010000 0.010000 0.820000 0.160000 0.420000 0.060000 0.400000 0.120000 0.099010 0.029703 0.693069 0.178218 Consensus sequence: CYGGGATHAMMGGRG ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 127 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00219 Cutl1_3494.1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 15 0.032061 Species: Mus musculus Original motif 0.592353 0.064229 0.272635 0.070783 0.108549 0.536240 0.218803 0.136408 0.156379 0.513220 0.118324 0.212077 0.233257 0.154485 0.518141 0.094117 0.285357 0.186274 0.422798 0.105572 0.131793 0.162240 0.089519 0.616448 0.084407 0.071794 0.012238 0.831561 0.294613 0.014641 0.666617 0.024128 0.963648 0.005910 0.017368 0.013073 0.020306 0.007870 0.006055 0.965770 0.060081 0.605587 0.016357 0.317975 0.800615 0.056800 0.007221 0.135365 0.307425 0.354719 0.110635 0.227221 0.129991 0.476432 0.296042 0.097535 0.353920 0.081566 0.154208 0.410306 0.131003 0.287241 0.305199 0.276557 0.407263 0.103473 0.297376 0.191887 Consensus sequence: ACCGVTTGATYAHSWBD Reverse complement motif 0.191887 0.103473 0.297376 0.407263 0.131003 0.305199 0.287241 0.276557 0.410306 0.081566 0.154208 0.353920 0.129991 0.296042 0.476432 0.097535 0.307425 0.110635 0.354719 0.227221 0.135365 0.056800 0.007221 0.800615 0.060081 0.016357 0.605587 0.317975 0.965770 0.007870 0.006055 0.020306 0.013073 0.005910 0.017368 0.963648 0.294613 0.666617 0.014641 0.024128 0.831561 0.071794 0.012238 0.084407 0.616448 0.162240 0.089519 0.131793 0.285357 0.422798 0.186274 0.105572 0.233257 0.518141 0.154485 0.094117 0.156379 0.118324 0.513220 0.212077 0.108549 0.218803 0.536240 0.136408 0.070783 0.064229 0.272635 0.592353 Consensus sequence: DBWSDTKATCAAVCGGT Alignment: DBWSDTKATCAAVCGGT --CYGGGATHAMMGGRG ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00067 Lef1_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 15 0.033839 Species: Mus musculus Original motif 0.281920 0.214207 0.278077 0.225796 0.325566 0.151435 0.298797 0.224202 0.290253 0.145824 0.243443 0.320480 0.069286 0.404645 0.141614 0.384454 0.070044 0.621448 0.142647 0.165862 0.007295 0.907657 0.038110 0.046938 0.015587 0.018273 0.000658 0.965482 0.005527 0.005886 0.001905 0.986682 0.024512 0.001189 0.001344 0.972955 0.007384 0.025221 0.952270 0.015125 0.966438 0.000630 0.002693 0.030239 0.082252 0.001173 0.001495 0.915080 0.030255 0.677155 0.275323 0.017267 0.199467 0.118815 0.056814 0.624905 0.345445 0.169597 0.216831 0.268127 0.278106 0.150864 0.173693 0.397336 0.251834 0.339733 0.219703 0.188730 Consensus sequence: DDDYCCTTTGATCTDDV Reverse complement motif 0.251834 0.219703 0.339733 0.188730 0.397336 0.150864 0.173693 0.278106 0.268127 0.169597 0.216831 0.345445 0.624905 0.118815 0.056814 0.199467 0.030255 0.275323 0.677155 0.017267 0.915080 0.001173 0.001495 0.082252 0.030239 0.000630 0.002693 0.966438 0.007384 0.952270 0.025221 0.015125 0.972955 0.001189 0.001344 0.024512 0.986682 0.005886 0.001905 0.005527 0.965482 0.018273 0.000658 0.015587 0.007295 0.038110 0.907657 0.046938 0.070044 0.142647 0.621448 0.165862 0.069286 0.141614 0.404645 0.384454 0.320480 0.145824 0.243443 0.290253 0.224202 0.151435 0.298797 0.325566 0.225796 0.214207 0.278077 0.281920 Consensus sequence: VDDAGATCAAAGGKDDD Alignment: VDDAGATCAAAGGKDDD CYGGGATHAMMGGRG-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00014 Sox17_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 3 15 0.034507 Species: Mus musculus Original motif 0.216056 0.230834 0.399857 0.153253 0.321065 0.233860 0.135741 0.309334 0.166479 0.321423 0.209463 0.302635 0.185647 0.499038 0.152355 0.162961 0.416451 0.221510 0.168645 0.193395 0.070777 0.581761 0.126392 0.221070 0.764583 0.085635 0.031993 0.117789 0.035294 0.112638 0.038664 0.813404 0.153178 0.046321 0.056161 0.744340 0.076540 0.825062 0.055409 0.042989 0.764357 0.060365 0.119861 0.055417 0.130143 0.178946 0.153266 0.537644 0.402684 0.154010 0.357674 0.085632 0.189784 0.349553 0.176965 0.283698 0.475181 0.145276 0.256449 0.123094 0.472286 0.151639 0.172736 0.203339 0.215278 0.186804 0.213020 0.384898 Consensus sequence: VHBHHCATTCATRHVDD Reverse complement motif 0.384898 0.186804 0.213020 0.215278 0.203339 0.151639 0.172736 0.472286 0.123094 0.145276 0.256449 0.475181 0.189784 0.176965 0.349553 0.283698 0.085632 0.154010 0.357674 0.402684 0.537644 0.178946 0.153266 0.130143 0.055417 0.060365 0.119861 0.764357 0.076540 0.055409 0.825062 0.042989 0.744340 0.046321 0.056161 0.153178 0.813404 0.112638 0.038664 0.035294 0.117789 0.085635 0.031993 0.764583 0.070777 0.126392 0.581761 0.221070 0.193395 0.221510 0.168645 0.416451 0.185647 0.152355 0.499038 0.162961 0.166479 0.209463 0.321423 0.302635 0.309334 0.233860 0.135741 0.321065 0.216056 0.399857 0.230834 0.153253 Consensus sequence: DDBDKATGAATGHDBHV Alignment: DDBDKATGAATGHDBHV CYGGGATHAMMGGRG-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00058 Tcf3_primary Reverse Complement Original Motif Forward 1 15 0.034546 Species: Mus musculus Original motif 0.185864 0.201179 0.183663 0.429294 0.371100 0.233868 0.122934 0.272098 0.249563 0.171285 0.128851 0.450301 0.582940 0.043382 0.129099 0.244578 0.041400 0.395349 0.497087 0.066163 0.759123 0.009670 0.005936 0.225270 0.056579 0.008662 0.003986 0.930772 0.043968 0.865783 0.056001 0.034249 0.962748 0.003731 0.003265 0.030256 0.971318 0.003542 0.012299 0.012841 0.937558 0.003991 0.020195 0.038256 0.125931 0.057976 0.798081 0.018012 0.209401 0.172342 0.483980 0.134277 0.485703 0.129227 0.309936 0.075134 0.397027 0.195902 0.152395 0.254676 0.311636 0.231510 0.157732 0.299122 0.320965 0.206031 0.164299 0.308705 Consensus sequence: HHHASATCAAAGVRHHH Reverse complement motif 0.308705 0.206031 0.164299 0.320965 0.299122 0.231510 0.157732 0.311636 0.254676 0.195902 0.152395 0.397027 0.075134 0.129227 0.309936 0.485703 0.209401 0.483980 0.172342 0.134277 0.125931 0.798081 0.057976 0.018012 0.038256 0.003991 0.020195 0.937558 0.012841 0.003542 0.012299 0.971318 0.030256 0.003731 0.003265 0.962748 0.043968 0.056001 0.865783 0.034249 0.930772 0.008662 0.003986 0.056579 0.225270 0.009670 0.005936 0.759123 0.041400 0.497087 0.395349 0.066163 0.244578 0.043382 0.129099 0.582940 0.450301 0.171285 0.128851 0.249563 0.272098 0.233868 0.122934 0.371100 0.429294 0.201179 0.183663 0.185864 Consensus sequence: HHHKVCTTTGATSTHHH Alignment: HHHKVCTTTGATSTHHH CYGGGATHAMMGGRG-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00083 Tcf7l2_primaryReverse Complement Reverse Complement Backward 3 15 0.034898 Species: Mus musculus Original motif 0.285725 0.187143 0.254855 0.272277 0.276264 0.157893 0.258178 0.307665 0.238788 0.161120 0.254018 0.346074 0.076041 0.333901 0.150903 0.439156 0.093376 0.526578 0.180529 0.199517 0.010827 0.880320 0.034150 0.074703 0.016546 0.023834 0.000940 0.958680 0.007166 0.008215 0.001941 0.982678 0.029634 0.001363 0.001379 0.967625 0.010872 0.031751 0.926186 0.031190 0.949407 0.000760 0.002581 0.047253 0.109203 0.001362 0.002094 0.887341 0.044198 0.567994 0.353059 0.034749 0.222623 0.142360 0.041281 0.593736 0.358872 0.167597 0.220534 0.252997 0.233072 0.141480 0.230985 0.394463 0.350703 0.243129 0.233961 0.172207 Consensus sequence: DDDYCCTTTGATSTDDV Reverse complement motif 0.172207 0.243129 0.233961 0.350703 0.394463 0.141480 0.230985 0.233072 0.252997 0.167597 0.220534 0.358872 0.593736 0.142360 0.041281 0.222623 0.044198 0.353059 0.567994 0.034749 0.887341 0.001362 0.002094 0.109203 0.047253 0.000760 0.002581 0.949407 0.010872 0.926186 0.031751 0.031190 0.967625 0.001363 0.001379 0.029634 0.982678 0.008215 0.001941 0.007166 0.958680 0.023834 0.000940 0.016546 0.010827 0.034150 0.880320 0.074703 0.093376 0.180529 0.526578 0.199517 0.439156 0.333901 0.150903 0.076041 0.346074 0.161120 0.254018 0.238788 0.307665 0.157893 0.258178 0.276264 0.272277 0.187143 0.254855 0.285725 Consensus sequence: BDDASATCAAAGGMDDD Alignment: BDDASATCAAAGGMDDD CYGGGATHAMMGGRG-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 128 Motif name: C128 Original motif 0.079208 0.306931 0.495050 0.118812 0.009901 0.415842 0.089109 0.485149 0.010000 0.900000 0.080000 0.010000 0.118812 0.009901 0.009901 0.861386 0.060000 0.450000 0.460000 0.030000 0.560000 0.020000 0.410000 0.010000 0.090000 0.460000 0.440000 0.010000 0.089109 0.009901 0.108911 0.792079 0.010000 0.010000 0.900000 0.080000 0.059406 0.079208 0.108911 0.752475 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.009901 0.514851 0.465347 0.009901 0.009901 0.465347 0.029703 0.495050 0.009901 0.465347 0.455446 0.069307 0.009901 0.069307 0.851485 0.069307 0.650000 0.110000 0.020000 0.220000 0.550000 0.060000 0.380000 0.010000 0.050000 0.450000 0.440000 0.060000 Consensus sequence: SYCTSRSTGTCSYSGARS Reserve complement motif 0.050000 0.440000 0.450000 0.060000 0.010000 0.060000 0.380000 0.550000 0.220000 0.110000 0.020000 0.650000 0.009901 0.851485 0.069307 0.069307 0.009901 0.455446 0.465347 0.069307 0.495050 0.465347 0.029703 0.009901 0.009901 0.465347 0.514851 0.009901 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.752475 0.079208 0.108911 0.059406 0.010000 0.900000 0.010000 0.080000 0.792079 0.009901 0.108911 0.089109 0.090000 0.440000 0.460000 0.010000 0.010000 0.020000 0.410000 0.560000 0.060000 0.460000 0.450000 0.030000 0.861386 0.009901 0.009901 0.118812 0.010000 0.080000 0.900000 0.010000 0.485149 0.415842 0.089109 0.009901 0.079208 0.495050 0.306931 0.118812 Consensus sequence: SKTCSMSGACASKSAGMS ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 128 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 18 0.034504 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB -----SYCTSRSTGTCSYSGARS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 1 18 0.035599 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK ----SYCTSRSTGTCSYSGARS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00098 Rfx3_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 6 18 0.040905 Species: Mus musculus Original motif 0.314514 0.275352 0.257617 0.152518 0.126939 0.598294 0.130576 0.144192 0.102265 0.155334 0.177957 0.564445 0.129288 0.282678 0.326990 0.261044 0.318166 0.227823 0.175681 0.278330 0.109019 0.380838 0.278328 0.231815 0.226145 0.289206 0.291300 0.193348 0.035863 0.844339 0.072582 0.047216 0.223793 0.187244 0.088092 0.500871 0.039800 0.029681 0.026201 0.904317 0.298298 0.032147 0.654746 0.014809 0.014729 0.022023 0.944826 0.018422 0.485114 0.004925 0.013785 0.496176 0.035708 0.020381 0.240804 0.703108 0.951152 0.012738 0.017886 0.018224 0.023713 0.944394 0.009538 0.022355 0.291067 0.385205 0.232388 0.091339 0.340334 0.199588 0.311526 0.148552 0.198713 0.472138 0.178319 0.150830 0.321155 0.269932 0.311301 0.097612 0.412646 0.195252 0.231950 0.160152 0.297134 0.180928 0.250400 0.271538 0.151169 0.305386 0.358574 0.184871 Consensus sequence: VCTBHBVCTTGGWTACVVVVVDB Reverse complement motif 0.151169 0.358574 0.305386 0.184871 0.271538 0.180928 0.250400 0.297134 0.160152 0.195252 0.231950 0.412646 0.097612 0.269932 0.311301 0.321155 0.198713 0.178319 0.472138 0.150830 0.148552 0.199588 0.311526 0.340334 0.291067 0.232388 0.385205 0.091339 0.023713 0.009538 0.944394 0.022355 0.018224 0.012738 0.017886 0.951152 0.703108 0.020381 0.240804 0.035708 0.496176 0.004925 0.013785 0.485114 0.014729 0.944826 0.022023 0.018422 0.298298 0.654746 0.032147 0.014809 0.904317 0.029681 0.026201 0.039800 0.500871 0.187244 0.088092 0.223793 0.035863 0.072582 0.844339 0.047216 0.226145 0.291300 0.289206 0.193348 0.109019 0.278328 0.380838 0.231815 0.278330 0.227823 0.175681 0.318166 0.129288 0.326990 0.282678 0.261044 0.564445 0.155334 0.177957 0.102265 0.126939 0.130576 0.598294 0.144192 0.152518 0.275352 0.257617 0.314514 Consensus sequence: BDBBVBVGTAWCCAAGVBHBAGB Alignment: VCTBHBVCTTGGWTACVVVVVDB -----SYCTSRSTGTCSYSGARS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 6 18 0.041604 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV -----SYCTSRSTGTCSYSGARS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00527 Foxn4_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 1 18 0.043668 Species: Mus musculus Original motif 0.298336 0.418632 0.208054 0.074978 0.289907 0.015608 0.457100 0.237385 0.273583 0.077889 0.107860 0.540668 0.184954 0.161611 0.384390 0.269045 0.521826 0.156340 0.089019 0.232815 0.356716 0.131104 0.394857 0.117323 0.266669 0.108765 0.505273 0.119293 0.020778 0.047199 0.919524 0.012500 0.948536 0.018775 0.008113 0.024576 0.010822 0.964042 0.014701 0.010434 0.007428 0.019505 0.966351 0.006717 0.010025 0.975678 0.008648 0.005649 0.043796 0.120935 0.742979 0.092289 0.008252 0.250704 0.541132 0.199913 0.474428 0.044681 0.134430 0.346461 0.146597 0.421317 0.143166 0.288920 0.020540 0.181479 0.553811 0.244170 0.129612 0.173360 0.535219 0.161808 0.506084 0.158156 0.130983 0.204776 0.054872 0.103043 0.545792 0.296293 0.389882 0.171037 0.164162 0.274918 0.225861 0.314031 0.288872 0.171237 Consensus sequence: VDWDARRGACGCGGWHGGAKHV Reverse complement motif 0.225861 0.288872 0.314031 0.171237 0.274918 0.171037 0.164162 0.389882 0.054872 0.545792 0.103043 0.296293 0.204776 0.158156 0.130983 0.506084 0.129612 0.535219 0.173360 0.161808 0.020540 0.553811 0.181479 0.244170 0.146597 0.143166 0.421317 0.288920 0.346461 0.044681 0.134430 0.474428 0.008252 0.541132 0.250704 0.199913 0.043796 0.742979 0.120935 0.092289 0.010025 0.008648 0.975678 0.005649 0.007428 0.966351 0.019505 0.006717 0.010822 0.014701 0.964042 0.010434 0.024576 0.018775 0.008113 0.948536 0.020778 0.919524 0.047199 0.012500 0.266669 0.505273 0.108765 0.119293 0.356716 0.394857 0.131104 0.117323 0.232815 0.156340 0.089019 0.521826 0.184954 0.384390 0.161611 0.269045 0.540668 0.077889 0.107860 0.273583 0.289907 0.457100 0.015608 0.237385 0.298336 0.208054 0.418632 0.074978 Consensus sequence: VHYTCCDWCCGCGTCMMTHWHV Alignment: VDWDARRGACGCGGWHGGAKHV SKTCSMSGACASKSAGMS---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 129 Motif name: C129 Original motif 0.029703 0.039604 0.465347 0.465347 0.069307 0.009901 0.445545 0.475248 0.060000 0.010000 0.920000 0.010000 0.010000 0.940000 0.040000 0.010000 0.128713 0.009901 0.009901 0.851485 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.390000 0.010000 0.590000 0.455446 0.009901 0.495050 0.039604 0.009901 0.504950 0.009901 0.475248 0.600000 0.010000 0.380000 0.010000 0.050000 0.010000 0.930000 0.010000 0.861386 0.009901 0.009901 0.118812 0.138614 0.009901 0.841584 0.009901 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.376238 0.485149 0.049505 0.089109 0.475248 0.495050 0.009901 0.019802 Consensus sequence: KKGCTAYRYRGAGAMM Reserve complement motif 0.475248 0.009901 0.495050 0.019802 0.376238 0.049505 0.485149 0.089109 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.138614 0.841584 0.009901 0.009901 0.118812 0.009901 0.009901 0.861386 0.050000 0.930000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.380000 0.600000 0.009901 0.009901 0.504950 0.475248 0.455446 0.495050 0.009901 0.039604 0.590000 0.390000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.851485 0.009901 0.009901 0.128713 0.010000 0.040000 0.940000 0.010000 0.060000 0.920000 0.010000 0.010000 0.475248 0.009901 0.445545 0.069307 0.029703 0.465347 0.039604 0.465347 Consensus sequence: RRTCTCKKMMTAGCRY ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 129 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00131 Gbx2 Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 16 0.019589 Species: Mus musculus Original motif 0.386212 0.050100 0.264286 0.299401 0.238250 0.271019 0.290093 0.200638 0.244981 0.382115 0.195542 0.177362 0.408943 0.090757 0.420316 0.079984 0.043824 0.844120 0.061224 0.050832 0.003925 0.194171 0.000796 0.801108 0.980854 0.013004 0.004250 0.001892 0.986820 0.005116 0.002834 0.005231 0.005231 0.002834 0.005116 0.986820 0.001892 0.004250 0.013004 0.980854 0.801108 0.000796 0.194171 0.003925 0.050832 0.061224 0.844120 0.043824 0.042136 0.437110 0.103694 0.417060 0.157043 0.278774 0.439499 0.124684 0.389315 0.112948 0.303336 0.194401 0.111205 0.229990 0.249727 0.409078 0.152439 0.132904 0.226965 0.487693 Consensus sequence: DVVRCTAATTAGYVDBD Reverse complement motif 0.487693 0.132904 0.226965 0.152439 0.409078 0.229990 0.249727 0.111205 0.194401 0.112948 0.303336 0.389315 0.157043 0.439499 0.278774 0.124684 0.042136 0.103694 0.437110 0.417060 0.050832 0.844120 0.061224 0.043824 0.003925 0.000796 0.194171 0.801108 0.980854 0.004250 0.013004 0.001892 0.986820 0.002834 0.005116 0.005231 0.005231 0.005116 0.002834 0.986820 0.001892 0.013004 0.004250 0.980854 0.801108 0.194171 0.000796 0.003925 0.043824 0.061224 0.844120 0.050832 0.408943 0.420316 0.090757 0.079984 0.244981 0.195542 0.382115 0.177362 0.238250 0.290093 0.271019 0.200638 0.299401 0.050100 0.264286 0.386212 Consensus sequence: DVDVKCTAATTAGMVVD Alignment: DVDVKCTAATTAGMVVD RRTCTCKKMMTAGCRY- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00136 Prrx2 Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 16 0.032870 Species: Mus musculus Original motif 0.577686 0.042459 0.124219 0.255636 0.324126 0.261479 0.246042 0.168353 0.407054 0.283628 0.110890 0.198428 0.276434 0.087523 0.555195 0.080849 0.024204 0.699069 0.012673 0.264055 0.003869 0.118299 0.000746 0.877086 0.987417 0.004615 0.005301 0.002668 0.985222 0.001872 0.007585 0.005321 0.005321 0.007585 0.001872 0.985222 0.002668 0.005301 0.004615 0.987417 0.877086 0.000746 0.118299 0.003869 0.264055 0.012673 0.699069 0.024204 0.026875 0.542803 0.035189 0.395132 0.181326 0.172452 0.411693 0.234529 0.441167 0.147383 0.255789 0.155661 0.423686 0.147908 0.175008 0.253399 0.296960 0.202032 0.264113 0.236895 Consensus sequence: AVHGCTAATTAGYDDDD Reverse complement motif 0.236895 0.202032 0.264113 0.296960 0.253399 0.147908 0.175008 0.423686 0.155661 0.147383 0.255789 0.441167 0.181326 0.411693 0.172452 0.234529 0.026875 0.035189 0.542803 0.395132 0.264055 0.699069 0.012673 0.024204 0.003869 0.000746 0.118299 0.877086 0.987417 0.005301 0.004615 0.002668 0.985222 0.007585 0.001872 0.005321 0.005321 0.001872 0.007585 0.985222 0.002668 0.004615 0.005301 0.987417 0.877086 0.118299 0.000746 0.003869 0.024204 0.012673 0.699069 0.264055 0.276434 0.555195 0.087523 0.080849 0.198428 0.283628 0.110890 0.407054 0.168353 0.261479 0.246042 0.324126 0.255636 0.042459 0.124219 0.577686 Consensus sequence: DDDHKCTAATTAGCHBT Alignment: DDDHKCTAATTAGCHBT RRTCTCKKMMTAGCRY- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00132 Evx2 Reverse Complement Original Motif Backward 2 16 0.035618 Species: Mus musculus Original motif 0.206898 0.304756 0.229326 0.259021 0.396007 0.330131 0.192964 0.080898 0.138551 0.564168 0.090166 0.207116 0.286745 0.524514 0.088046 0.100694 0.152216 0.070150 0.760833 0.016800 0.024267 0.824098 0.120321 0.031313 0.004888 0.017616 0.000443 0.977053 0.948687 0.044377 0.006226 0.000709 0.991749 0.001631 0.003522 0.003099 0.002129 0.002760 0.003047 0.992064 0.001023 0.007073 0.052989 0.938915 0.925976 0.000749 0.071651 0.001624 0.021003 0.158227 0.761241 0.059529 0.043697 0.530850 0.230935 0.194518 0.124744 0.184486 0.400596 0.290174 0.092689 0.146902 0.377415 0.382993 0.340077 0.102340 0.057203 0.500380 Consensus sequence: BVCMGCTAATTAGCBKW Reverse complement motif 0.500380 0.102340 0.057203 0.340077 0.382993 0.146902 0.377415 0.092689 0.124744 0.400596 0.184486 0.290174 0.043697 0.230935 0.530850 0.194518 0.021003 0.761241 0.158227 0.059529 0.001624 0.000749 0.071651 0.925976 0.938915 0.007073 0.052989 0.001023 0.992064 0.002760 0.003047 0.002129 0.003099 0.001631 0.003522 0.991749 0.000709 0.044377 0.006226 0.948687 0.977053 0.017616 0.000443 0.004888 0.024267 0.120321 0.824098 0.031313 0.152216 0.760833 0.070150 0.016800 0.286745 0.088046 0.524514 0.100694 0.138551 0.090166 0.564168 0.207116 0.080898 0.330131 0.192964 0.396007 0.206898 0.229326 0.304756 0.259021 Consensus sequence: WRBGCTAATTAGCRGBB Alignment: BVCMGCTAATTAGCBKW RRTCTCKKMMTAGCRY- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00211 Pou3f3 Original Motif Reverse Complement Backward 1 16 0.036059 Species: Mus musculus Original motif 0.402059 0.183334 0.129995 0.284612 0.637165 0.097294 0.089284 0.176258 0.307269 0.160096 0.305393 0.227242 0.342471 0.102992 0.265291 0.289246 0.091600 0.100833 0.033581 0.773986 0.798635 0.078572 0.026801 0.095992 0.006820 0.052860 0.002012 0.938308 0.017076 0.003624 0.947530 0.031771 0.086932 0.905749 0.001612 0.005708 0.983215 0.002160 0.010700 0.003925 0.030968 0.005240 0.011437 0.952355 0.893793 0.010310 0.013393 0.082504 0.666055 0.063676 0.007180 0.263089 0.170333 0.094919 0.231056 0.503693 0.342691 0.132989 0.269857 0.254463 0.371397 0.117426 0.241987 0.269189 0.598148 0.065635 0.098090 0.238127 Consensus sequence: HADDTATGCATAATDDA Reverse complement motif 0.238127 0.065635 0.098090 0.598148 0.269189 0.117426 0.241987 0.371397 0.254463 0.132989 0.269857 0.342691 0.503693 0.094919 0.231056 0.170333 0.263089 0.063676 0.007180 0.666055 0.082504 0.010310 0.013393 0.893793 0.952355 0.005240 0.011437 0.030968 0.003925 0.002160 0.010700 0.983215 0.086932 0.001612 0.905749 0.005708 0.017076 0.947530 0.003624 0.031771 0.938308 0.052860 0.002012 0.006820 0.095992 0.078572 0.026801 0.798635 0.773986 0.100833 0.033581 0.091600 0.289246 0.102992 0.265291 0.342471 0.227242 0.160096 0.305393 0.307269 0.176258 0.097294 0.089284 0.637165 0.284612 0.183334 0.129995 0.402059 Consensus sequence: TDDATTATGCATADDTH Alignment: HADDTATGCATAATDDA -KKGCTAYRYRGAGAMM ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00178 Og2x Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 16 0.036562 Species: Mus musculus Original motif 0.174171 0.504501 0.196117 0.125211 0.128219 0.175644 0.540933 0.155203 0.233647 0.284872 0.248986 0.232496 0.311282 0.225783 0.359527 0.103408 0.016893 0.577590 0.028682 0.376835 0.016189 0.331462 0.001787 0.650563 0.917887 0.005921 0.068383 0.007810 0.959721 0.002908 0.006671 0.030699 0.030699 0.006671 0.002908 0.959721 0.007810 0.068383 0.005921 0.917887 0.650563 0.001787 0.331462 0.016189 0.376835 0.028682 0.577590 0.016893 0.141811 0.163292 0.393792 0.301105 0.295356 0.194120 0.163084 0.347440 0.443721 0.156430 0.160598 0.239252 0.228972 0.294652 0.166053 0.310324 0.152483 0.405996 0.251527 0.189994 Consensus sequence: CGVVYYAATTRRBHDHB Reverse complement motif 0.152483 0.251527 0.405996 0.189994 0.310324 0.294652 0.166053 0.228972 0.239252 0.156430 0.160598 0.443721 0.347440 0.194120 0.163084 0.295356 0.141811 0.393792 0.163292 0.301105 0.376835 0.577590 0.028682 0.016893 0.016189 0.001787 0.331462 0.650563 0.917887 0.068383 0.005921 0.007810 0.959721 0.006671 0.002908 0.030699 0.030699 0.002908 0.006671 0.959721 0.007810 0.005921 0.068383 0.917887 0.650563 0.331462 0.001787 0.016189 0.016893 0.028682 0.577590 0.376835 0.311282 0.359527 0.225783 0.103408 0.233647 0.248986 0.284872 0.232496 0.128219 0.540933 0.175644 0.155203 0.174171 0.196117 0.504501 0.125211 Consensus sequence: BHDHBMKAATTMKVVCG Alignment: BHDHBMKAATTMKVVCG RRTCTCKKMMTAGCRY- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 130 Motif name: C130 Original motif 0.009901 0.059406 0.079208 0.851485 0.009901 0.049505 0.524752 0.415842 0.010000 0.960000 0.010000 0.020000 0.089109 0.831683 0.009901 0.069307 0.520000 0.020000 0.060000 0.400000 0.040000 0.010000 0.940000 0.010000 0.009901 0.118812 0.861386 0.009901 0.370000 0.300000 0.320000 0.010000 0.039604 0.782178 0.099010 0.079208 0.520000 0.020000 0.030000 0.430000 0.108911 0.168317 0.653465 0.069307 0.010000 0.810000 0.170000 0.010000 0.415842 0.534653 0.019802 0.029703 0.841584 0.009901 0.128713 0.019802 Consensus sequence: TKCCWGGVCWGCMA Reserve complement motif 0.019802 0.009901 0.128713 0.841584 0.415842 0.019802 0.534653 0.029703 0.010000 0.170000 0.810000 0.010000 0.108911 0.653465 0.168317 0.069307 0.430000 0.020000 0.030000 0.520000 0.039604 0.099010 0.782178 0.079208 0.010000 0.300000 0.320000 0.370000 0.009901 0.861386 0.118812 0.009901 0.040000 0.940000 0.010000 0.010000 0.400000 0.020000 0.060000 0.520000 0.089109 0.009901 0.831683 0.069307 0.010000 0.010000 0.960000 0.020000 0.009901 0.524752 0.049505 0.415842 0.851485 0.059406 0.079208 0.009901 Consensus sequence: TRGCWGBCCWGGYA ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 130 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 9 14 0.041760 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH -TKCCWGGVCWGCMA-------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00400 Zif268 Original Motif Reverse Complement Backward 4 14 0.043853 Species: Mus musculus Original motif 0.104824 0.412716 0.254506 0.227955 0.644922 0.065476 0.140479 0.149122 0.201205 0.166164 0.347131 0.285501 0.360606 0.256316 0.150766 0.232313 0.199831 0.240681 0.279350 0.280137 0.234308 0.204076 0.321306 0.240310 0.274112 0.462435 0.111425 0.152028 0.067070 0.717501 0.073934 0.141496 0.106745 0.084442 0.658566 0.150247 0.025128 0.967053 0.003585 0.004234 0.006412 0.982989 0.003227 0.007371 0.009588 0.877620 0.002571 0.110221 0.621521 0.355443 0.015669 0.007366 0.002600 0.980275 0.004191 0.012934 0.118773 0.026658 0.783843 0.070725 0.022358 0.822101 0.024684 0.130857 0.713212 0.080912 0.128793 0.077084 0.166568 0.250955 0.107934 0.474544 0.225040 0.222494 0.163301 0.389166 0.268976 0.223206 0.265314 0.242504 0.137052 0.229058 0.148439 0.485451 0.135819 0.304550 0.141994 0.417637 0.272440 0.319501 0.230580 0.177478 Consensus sequence: BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV Reverse complement motif 0.272440 0.230580 0.319501 0.177478 0.417637 0.304550 0.141994 0.135819 0.485451 0.229058 0.148439 0.137052 0.242504 0.223206 0.265314 0.268976 0.389166 0.222494 0.163301 0.225040 0.474544 0.250955 0.107934 0.166568 0.077084 0.080912 0.128793 0.713212 0.022358 0.024684 0.822101 0.130857 0.118773 0.783843 0.026658 0.070725 0.002600 0.004191 0.980275 0.012934 0.007366 0.355443 0.015669 0.621521 0.009588 0.002571 0.877620 0.110221 0.006412 0.003227 0.982989 0.007371 0.025128 0.003585 0.967053 0.004234 0.106745 0.658566 0.084442 0.150247 0.067070 0.073934 0.717501 0.141496 0.274112 0.111425 0.462435 0.152028 0.234308 0.321306 0.204076 0.240310 0.280137 0.240681 0.279350 0.199831 0.232313 0.256316 0.150766 0.360606 0.201205 0.347131 0.166164 0.285501 0.149122 0.065476 0.140479 0.644922 0.104824 0.254506 0.412716 0.227955 Consensus sequence: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB Alignment: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB ------TKCCWGGVCWGCMA--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00098 Rfx3_primary Reverse Complement Original Motif Forward 1 14 0.044921 Species: Mus musculus Original motif 0.218345 0.231533 0.152528 0.397594 0.264604 0.126115 0.320860 0.288421 0.117304 0.186844 0.172946 0.522906 0.111929 0.277908 0.409084 0.201079 0.343319 0.311376 0.123612 0.221692 0.193354 0.374280 0.157338 0.275028 0.166348 0.578991 0.130872 0.123789 0.006937 0.931183 0.046809 0.015072 0.255581 0.289587 0.125513 0.329319 0.002582 0.012615 0.002782 0.982021 0.850584 0.007973 0.140639 0.000803 0.037792 0.002285 0.957277 0.002646 0.009414 0.921481 0.001636 0.067469 0.943403 0.000980 0.042401 0.013216 0.991166 0.002931 0.003540 0.002364 0.003651 0.987110 0.001106 0.008133 0.208873 0.369705 0.319129 0.102292 0.322535 0.186617 0.374187 0.116660 0.326738 0.179486 0.226374 0.267402 0.299697 0.185329 0.133025 0.381949 0.300824 0.266836 0.096437 0.335904 0.418443 0.191068 0.127183 0.263306 0.386727 0.204062 0.126050 0.283161 Consensus sequence: HDTBHHCCHTAGCAACVVDHHHH Reverse complement motif 0.283161 0.204062 0.126050 0.386727 0.263306 0.191068 0.127183 0.418443 0.335904 0.266836 0.096437 0.300824 0.381949 0.185329 0.133025 0.299697 0.267402 0.179486 0.226374 0.326738 0.322535 0.374187 0.186617 0.116660 0.208873 0.319129 0.369705 0.102292 0.003651 0.001106 0.987110 0.008133 0.002364 0.002931 0.003540 0.991166 0.013216 0.000980 0.042401 0.943403 0.009414 0.001636 0.921481 0.067469 0.037792 0.957277 0.002285 0.002646 0.000803 0.007973 0.140639 0.850584 0.982021 0.012615 0.002782 0.002582 0.329319 0.289587 0.125513 0.255581 0.006937 0.046809 0.931183 0.015072 0.166348 0.130872 0.578991 0.123789 0.193354 0.157338 0.374280 0.275028 0.221692 0.311376 0.123612 0.343319 0.111929 0.409084 0.277908 0.201079 0.522906 0.186844 0.172946 0.117304 0.264604 0.320860 0.126115 0.288421 0.397594 0.231533 0.152528 0.218345 Consensus sequence: HHHHDVVGTTGCTAHGGDHBAHH Alignment: HHHHDVVGTTGCTAHGGDHBAHH TRGCWGBCCWGGYA--------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 2 14 0.046337 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK -------TKCCWGGVCWGCMA- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v015681_primaryReverse Complement Reverse Complement Forward 7 14 0.047289 Species: Mus musculus Original motif 0.641428 0.180211 0.044767 0.133594 0.171696 0.262981 0.334148 0.231174 0.129726 0.322735 0.243462 0.304077 0.165713 0.175735 0.256108 0.402445 0.146090 0.171890 0.412753 0.269266 0.212837 0.439192 0.280990 0.066980 0.251088 0.275516 0.374380 0.099015 0.575438 0.079656 0.338201 0.006704 0.005634 0.003422 0.972597 0.018348 0.890447 0.077034 0.031851 0.000668 0.007128 0.986862 0.000496 0.005515 0.001445 0.991564 0.001925 0.005066 0.738761 0.190157 0.026399 0.044684 0.013384 0.983783 0.000896 0.001937 0.068077 0.929549 0.000773 0.001602 0.040830 0.933742 0.005283 0.020145 0.730274 0.029225 0.145689 0.094812 0.165032 0.572838 0.162001 0.100129 0.383584 0.129942 0.429497 0.056977 0.455959 0.071959 0.208204 0.263878 0.134271 0.262985 0.222626 0.380117 0.071193 0.346594 0.346081 0.236132 0.445661 0.405278 0.053901 0.095160 Consensus sequence: ABBBBVVRGACCACCCACRDBBM Reverse complement motif 0.095160 0.405278 0.053901 0.445661 0.071193 0.346081 0.346594 0.236132 0.380117 0.262985 0.222626 0.134271 0.263878 0.071959 0.208204 0.455959 0.383584 0.429497 0.129942 0.056977 0.165032 0.162001 0.572838 0.100129 0.094812 0.029225 0.145689 0.730274 0.040830 0.005283 0.933742 0.020145 0.068077 0.000773 0.929549 0.001602 0.013384 0.000896 0.983783 0.001937 0.044684 0.190157 0.026399 0.738761 0.001445 0.001925 0.991564 0.005066 0.007128 0.000496 0.986862 0.005515 0.000668 0.077034 0.031851 0.890447 0.005634 0.972597 0.003422 0.018348 0.006704 0.079656 0.338201 0.575438 0.251088 0.374380 0.275516 0.099015 0.212837 0.280990 0.439192 0.066980 0.146090 0.412753 0.171890 0.269266 0.402445 0.175735 0.256108 0.165713 0.129726 0.243462 0.322735 0.304077 0.171696 0.334148 0.262981 0.231174 0.133594 0.180211 0.044767 0.641428 Consensus sequence: YBVDMGTGGGTGGTCKVVBVBBT Alignment: YBVDMGTGGGTGGTCKVVBVBBT ------TRGCWGBCCWGGYA--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 131 Motif name: C131 Original motif 0.430000 0.070000 0.040000 0.460000 0.350000 0.010000 0.040000 0.600000 0.811881 0.009901 0.158416 0.019802 0.680000 0.110000 0.150000 0.060000 0.404040 0.090909 0.252525 0.252525 0.960000 0.010000 0.010000 0.020000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.620000 0.040000 0.330000 0.010000 0.460000 0.150000 0.260000 0.130000 0.290000 0.210000 0.140000 0.360000 0.890000 0.010000 0.080000 0.020000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.480000 0.010000 0.090000 0.420000 0.495050 0.059406 0.099010 0.346535 Consensus sequence: WWAADAARVHAAWW Reserve complement motif 0.346535 0.059406 0.099010 0.495050 0.420000 0.010000 0.090000 0.480000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.020000 0.010000 0.080000 0.890000 0.360000 0.210000 0.140000 0.290000 0.130000 0.150000 0.260000 0.460000 0.010000 0.040000 0.330000 0.620000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.020000 0.010000 0.010000 0.960000 0.252525 0.090909 0.252525 0.404040 0.060000 0.110000 0.150000 0.680000 0.019802 0.009901 0.158416 0.811881 0.600000 0.010000 0.040000 0.350000 0.460000 0.070000 0.040000 0.430000 Consensus sequence: WWTTHBKTTDTTWW ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 131 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00077 Srf_secondary Original Motif Original Motif Backward 2 14 0.025672 Species: Mus musculus Original motif 0.162968 0.284828 0.440984 0.111220 0.151392 0.200635 0.205316 0.442657 0.267215 0.083669 0.192498 0.456618 0.332771 0.180711 0.200027 0.286491 0.509370 0.102954 0.242569 0.145107 0.666262 0.077309 0.154466 0.101962 0.737968 0.113335 0.100401 0.048296 0.658878 0.141580 0.134033 0.065510 0.766115 0.094051 0.069763 0.070072 0.755621 0.088491 0.044802 0.111086 0.749083 0.135917 0.047510 0.067490 0.663231 0.176795 0.028134 0.131839 0.553358 0.277659 0.038655 0.130328 0.392578 0.314083 0.209844 0.083495 0.198462 0.237132 0.239466 0.324940 0.275121 0.210087 0.194779 0.320013 0.287748 0.277395 0.142704 0.292154 Consensus sequence: VBDDAAAAAAAAMVBHH Reverse complement motif 0.292154 0.277395 0.142704 0.287748 0.320013 0.210087 0.194779 0.275121 0.324940 0.237132 0.239466 0.198462 0.083495 0.314083 0.209844 0.392578 0.130328 0.277659 0.038655 0.553358 0.131839 0.176795 0.028134 0.663231 0.067490 0.135917 0.047510 0.749083 0.111086 0.088491 0.044802 0.755621 0.070072 0.094051 0.069763 0.766115 0.065510 0.141580 0.134033 0.658878 0.048296 0.113335 0.100401 0.737968 0.101962 0.077309 0.154466 0.666262 0.145107 0.102954 0.242569 0.509370 0.286491 0.180711 0.200027 0.332771 0.456618 0.083669 0.192498 0.267215 0.442657 0.200635 0.205316 0.151392 0.162968 0.440984 0.284828 0.111220 Consensus sequence: HHVBYTTTTTTTTDDVV Alignment: VBDDAAAAAAAAMVBHH --WWAADAARVHAAWW- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00061 Foxl1_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 3 14 0.027927 Species: Mus musculus Original motif 0.560226 0.121586 0.083231 0.234957 0.318077 0.149137 0.179955 0.352831 0.482497 0.118420 0.173594 0.225488 0.200166 0.160901 0.191493 0.447440 0.033691 0.569719 0.018901 0.377690 0.638020 0.166545 0.021254 0.174181 0.573953 0.105729 0.009308 0.311010 0.890518 0.053364 0.013424 0.042694 0.910758 0.028166 0.032648 0.028428 0.013358 0.738707 0.023981 0.223953 0.911783 0.018754 0.031898 0.037564 0.702891 0.068940 0.076823 0.151346 0.445507 0.320769 0.057216 0.176507 0.587798 0.129586 0.140592 0.142024 0.258981 0.330939 0.167334 0.242747 0.362022 0.333796 0.145861 0.158320 Consensus sequence: ADDDYAWAACAAMAHH Reverse complement motif 0.158320 0.333796 0.145861 0.362022 0.258981 0.167334 0.330939 0.242747 0.142024 0.129586 0.140592 0.587798 0.176507 0.320769 0.057216 0.445507 0.151346 0.068940 0.076823 0.702891 0.037564 0.018754 0.031898 0.911783 0.013358 0.023981 0.738707 0.223953 0.028428 0.028166 0.032648 0.910758 0.042694 0.053364 0.013424 0.890518 0.311010 0.105729 0.009308 0.573953 0.174181 0.166545 0.021254 0.638020 0.033691 0.018901 0.569719 0.377690 0.447440 0.160901 0.191493 0.200166 0.225488 0.118420 0.173594 0.482497 0.352831 0.149137 0.179955 0.318077 0.234957 0.121586 0.083231 0.560226 Consensus sequence: HDTYTTGTTWTKDDDT Alignment: HDTYTTGTTWTKDDDT WWTTHBKTTDTTWW-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00028 Tcfap2e_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 14 0.029427 Species: Mus musculus Original motif 0.248591 0.214386 0.166769 0.370254 0.416041 0.167262 0.218682 0.198015 0.195301 0.542527 0.153042 0.109129 0.240156 0.185228 0.255545 0.319071 0.195809 0.247688 0.280778 0.275725 0.271555 0.129776 0.497286 0.101382 0.738080 0.057879 0.078760 0.125281 0.728876 0.074205 0.092737 0.104182 0.694380 0.084957 0.159476 0.061186 0.665572 0.111592 0.131546 0.091289 0.782384 0.059680 0.047525 0.110411 0.769981 0.105692 0.056467 0.067860 0.402932 0.087712 0.172674 0.336682 0.409485 0.160886 0.229779 0.199850 Consensus sequence: HDCDBRAAAAAADD Reverse complement motif 0.199850 0.160886 0.229779 0.409485 0.336682 0.087712 0.172674 0.402932 0.067860 0.105692 0.056467 0.769981 0.110411 0.059680 0.047525 0.782384 0.091289 0.111592 0.131546 0.665572 0.061186 0.084957 0.159476 0.694380 0.104182 0.074205 0.092737 0.728876 0.125281 0.057879 0.078760 0.738080 0.271555 0.497286 0.129776 0.101382 0.195809 0.280778 0.247688 0.275725 0.319071 0.185228 0.255545 0.240156 0.195301 0.153042 0.542527 0.109129 0.198015 0.167262 0.218682 0.416041 0.370254 0.214386 0.166769 0.248591 Consensus sequence: DDTTTTTTMBDGDH Alignment: HDCDBRAAAAAADD WWAADAARVHAAWW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00014 Sox17_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 14 0.033114 Species: Mus musculus Original motif 0.384811 0.284700 0.175936 0.154553 0.309402 0.148547 0.182807 0.359244 0.481080 0.063522 0.236227 0.219171 0.767683 0.076339 0.078689 0.077290 0.721907 0.020423 0.021208 0.236461 0.015843 0.855728 0.037803 0.090627 0.946041 0.014076 0.006202 0.033681 0.968744 0.003602 0.010784 0.016871 0.019919 0.012714 0.005072 0.962296 0.184775 0.020594 0.079338 0.715293 0.391691 0.169606 0.345342 0.093361 0.686419 0.086126 0.077592 0.149862 0.416935 0.101839 0.062848 0.418379 0.272943 0.305787 0.124571 0.296700 0.388624 0.124150 0.177104 0.310122 Consensus sequence: VDDAACAATTVAWHD Reverse complement motif 0.310122 0.124150 0.177104 0.388624 0.272943 0.124571 0.305787 0.296700 0.418379 0.101839 0.062848 0.416935 0.149862 0.086126 0.077592 0.686419 0.093361 0.169606 0.345342 0.391691 0.715293 0.020594 0.079338 0.184775 0.962296 0.012714 0.005072 0.019919 0.016871 0.003602 0.010784 0.968744 0.033681 0.014076 0.006202 0.946041 0.015843 0.037803 0.855728 0.090627 0.236461 0.020423 0.021208 0.721907 0.077290 0.076339 0.078689 0.767683 0.219171 0.063522 0.236227 0.481080 0.359244 0.148547 0.182807 0.309402 0.154553 0.284700 0.175936 0.384811 Consensus sequence: DDWTBAATTGTTDDB Alignment: DDWTBAATTGTTDDB WWTTHBKTTDTTWW- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00037 Zfp105_primaryReverse Complement Reverse Complement Backward 1 14 0.033186 Species: Mus musculus Original motif 0.363104 0.182807 0.145232 0.308856 0.419707 0.133742 0.222546 0.224005 0.164481 0.418263 0.052397 0.364858 0.715575 0.117639 0.064914 0.101872 0.883836 0.026985 0.032584 0.056596 0.558797 0.151280 0.033120 0.256803 0.267037 0.403488 0.026746 0.302729 0.939762 0.013627 0.034579 0.012032 0.897072 0.009878 0.035642 0.057408 0.305904 0.516040 0.055311 0.122746 0.880940 0.027958 0.048350 0.042752 0.710082 0.052464 0.040250 0.197204 0.246712 0.125155 0.318627 0.309506 0.429749 0.181755 0.176892 0.211603 0.339643 0.097216 0.355250 0.207891 Consensus sequence: HDYAAAHAAMAADHD Reverse complement motif 0.339643 0.355250 0.097216 0.207891 0.211603 0.181755 0.176892 0.429749 0.246712 0.318627 0.125155 0.309506 0.197204 0.052464 0.040250 0.710082 0.042752 0.027958 0.048350 0.880940 0.305904 0.055311 0.516040 0.122746 0.057408 0.009878 0.035642 0.897072 0.012032 0.013627 0.034579 0.939762 0.267037 0.026746 0.403488 0.302729 0.256803 0.151280 0.033120 0.558797 0.056596 0.026985 0.032584 0.883836 0.101872 0.117639 0.064914 0.715575 0.164481 0.052397 0.418263 0.364858 0.224005 0.133742 0.222546 0.419707 0.308856 0.182807 0.145232 0.363104 Consensus sequence: HHHTTRTTDTTTKDH Alignment: HHHTTRTTDTTTKDH -WWTTHBKTTDTTWW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 132 Motif name: C132 Original motif 0.370000 0.070000 0.160000 0.400000 0.009901 0.801980 0.089109 0.099010 0.851485 0.009901 0.128713 0.009901 0.148515 0.079208 0.663366 0.108911 0.360000 0.170000 0.460000 0.010000 0.079208 0.079208 0.693069 0.148515 0.450000 0.090000 0.150000 0.310000 0.059406 0.128713 0.801980 0.009901 0.820000 0.010000 0.160000 0.010000 0.050000 0.050000 0.890000 0.010000 0.530000 0.030000 0.250000 0.190000 0.340000 0.120000 0.040000 0.500000 0.099010 0.742574 0.049505 0.108911 0.010000 0.400000 0.190000 0.400000 0.930000 0.010000 0.050000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.090000 0.150000 0.750000 0.010000 0.336634 0.128713 0.089109 0.445545 Consensus sequence: WCAGRGWGAGAWCYAGGW Reserve complement motif 0.445545 0.128713 0.089109 0.336634 0.090000 0.750000 0.150000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.050000 0.930000 0.010000 0.190000 0.400000 0.400000 0.099010 0.049505 0.742574 0.108911 0.500000 0.120000 0.040000 0.340000 0.190000 0.030000 0.250000 0.530000 0.050000 0.890000 0.050000 0.010000 0.010000 0.010000 0.160000 0.820000 0.059406 0.801980 0.128713 0.009901 0.310000 0.090000 0.150000 0.450000 0.079208 0.693069 0.079208 0.148515 0.360000 0.460000 0.170000 0.010000 0.148515 0.663366 0.079208 0.108911 0.009901 0.009901 0.128713 0.851485 0.009901 0.089109 0.801980 0.099010 0.400000 0.070000 0.160000 0.370000 Consensus sequence: WCCTKGWTCTCWCMCTGW ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 132 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 1 18 0.046481 Species: Mus musculus Original motif 0.067627 0.131333 0.654425 0.146615 0.156488 0.114442 0.145630 0.583441 0.206450 0.265630 0.358017 0.169903 0.090729 0.460713 0.274712 0.173847 0.285994 0.099998 0.154485 0.459523 0.635908 0.184787 0.072982 0.106323 0.748421 0.039204 0.092605 0.119769 0.081342 0.061327 0.044532 0.812799 0.143120 0.043879 0.024216 0.788785 0.247544 0.092102 0.621453 0.038901 0.295531 0.036295 0.027594 0.640580 0.194561 0.305468 0.339916 0.160055 0.175038 0.193568 0.101212 0.530182 0.145226 0.167488 0.559871 0.127415 0.271501 0.237429 0.206701 0.284369 0.216834 0.109191 0.569605 0.104370 0.182624 0.177160 0.300475 0.339742 0.331737 0.198645 0.265137 0.204482 0.230155 0.359365 0.183450 0.227029 0.056581 0.067297 0.463052 0.413070 0.198891 0.324626 0.304424 0.172059 0.181968 0.287547 0.202419 0.328066 Consensus sequence: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB Reverse complement motif 0.328066 0.287547 0.202419 0.181968 0.198891 0.304424 0.324626 0.172059 0.056581 0.463052 0.067297 0.413070 0.230155 0.183450 0.359365 0.227029 0.204482 0.198645 0.265137 0.331737 0.339742 0.177160 0.300475 0.182624 0.216834 0.569605 0.109191 0.104370 0.284369 0.237429 0.206701 0.271501 0.145226 0.559871 0.167488 0.127415 0.530182 0.193568 0.101212 0.175038 0.194561 0.339916 0.305468 0.160055 0.640580 0.036295 0.027594 0.295531 0.247544 0.621453 0.092102 0.038901 0.788785 0.043879 0.024216 0.143120 0.812799 0.061327 0.044532 0.081342 0.119769 0.039204 0.092605 0.748421 0.106323 0.184787 0.072982 0.635908 0.459523 0.099998 0.154485 0.285994 0.090729 0.274712 0.460713 0.173847 0.206450 0.358017 0.265630 0.169903 0.583441 0.114442 0.145630 0.156488 0.067627 0.654425 0.131333 0.146615 Consensus sequence: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC Alignment: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC WCCTKGWTCTCWCMCTGW---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v015681_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 2 18 0.049134 Species: Mus musculus Original motif 0.331499 0.188505 0.182841 0.297156 0.328961 0.213025 0.273530 0.184484 0.197213 0.129292 0.524914 0.148581 0.274491 0.226406 0.312118 0.186986 0.103231 0.393726 0.364988 0.138055 0.552594 0.166422 0.186262 0.094722 0.157618 0.064773 0.616497 0.161112 0.139166 0.176098 0.621185 0.063551 0.748420 0.062398 0.012447 0.176735 0.116584 0.009438 0.860326 0.013653 0.005030 0.003646 0.974877 0.016447 0.055257 0.007181 0.921760 0.015802 0.032748 0.058249 0.052709 0.856293 0.105606 0.872231 0.014370 0.007793 0.019480 0.497379 0.125899 0.357242 0.478582 0.269713 0.061464 0.190242 0.253985 0.287006 0.201320 0.257689 0.319384 0.210231 0.175842 0.294543 0.222123 0.287802 0.201294 0.288782 0.139951 0.376041 0.081133 0.402875 0.213450 0.343835 0.383676 0.059039 0.322294 0.355918 0.148062 0.173725 Consensus sequence: HVGVSAGGAGGGTCYHHHHYVH Reverse complement motif 0.322294 0.148062 0.355918 0.173725 0.213450 0.383676 0.343835 0.059039 0.402875 0.376041 0.081133 0.139951 0.288782 0.287802 0.201294 0.222123 0.294543 0.210231 0.175842 0.319384 0.253985 0.201320 0.287006 0.257689 0.190242 0.269713 0.061464 0.478582 0.019480 0.125899 0.497379 0.357242 0.105606 0.014370 0.872231 0.007793 0.856293 0.058249 0.052709 0.032748 0.055257 0.921760 0.007181 0.015802 0.005030 0.974877 0.003646 0.016447 0.116584 0.860326 0.009438 0.013653 0.176735 0.062398 0.012447 0.748420 0.139166 0.621185 0.176098 0.063551 0.157618 0.616497 0.064773 0.161112 0.094722 0.166422 0.186262 0.552594 0.103231 0.364988 0.393726 0.138055 0.274491 0.312118 0.226406 0.186986 0.197213 0.524914 0.129292 0.148581 0.184484 0.213025 0.273530 0.328961 0.297156 0.188505 0.182841 0.331499 Consensus sequence: DVMHHDHKGACCCTCCTSVCBH Alignment: HVGVSAGGAGGGTCYHHHHYVH -WCAGRGWGAGAWCYAGGW--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00528 Foxm1_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 1 18 0.051182 Species: Mus musculus Original motif 0.399785 0.446658 0.111435 0.042122 0.535175 0.103991 0.089706 0.271128 0.078171 0.387987 0.375083 0.158759 0.309001 0.519142 0.070618 0.101239 0.201844 0.255818 0.323149 0.219190 0.534101 0.109845 0.235026 0.121028 0.656038 0.037473 0.261484 0.045006 0.315713 0.164290 0.471815 0.048182 0.651960 0.009412 0.328237 0.010391 0.937365 0.017313 0.007516 0.037807 0.019983 0.044238 0.012387 0.923392 0.061195 0.021485 0.881645 0.035675 0.017521 0.952998 0.013139 0.016342 0.254160 0.029735 0.493023 0.223082 0.239200 0.593324 0.114503 0.052973 0.610822 0.071539 0.099169 0.218470 0.166610 0.389712 0.204400 0.239278 0.227752 0.361626 0.178497 0.232125 0.537030 0.182466 0.026035 0.254470 0.235902 0.151006 0.043788 0.569304 0.081851 0.250397 0.590059 0.077693 0.340417 0.189613 0.272075 0.197895 Consensus sequence: MWSMBAARRATGCDCABHATGD Reverse complement motif 0.197895 0.189613 0.272075 0.340417 0.081851 0.590059 0.250397 0.077693 0.569304 0.151006 0.043788 0.235902 0.254470 0.182466 0.026035 0.537030 0.227752 0.178497 0.361626 0.232125 0.166610 0.204400 0.389712 0.239278 0.218470 0.071539 0.099169 0.610822 0.239200 0.114503 0.593324 0.052973 0.254160 0.493023 0.029735 0.223082 0.017521 0.013139 0.952998 0.016342 0.061195 0.881645 0.021485 0.035675 0.923392 0.044238 0.012387 0.019983 0.037807 0.017313 0.007516 0.937365 0.010391 0.009412 0.328237 0.651960 0.315713 0.471815 0.164290 0.048182 0.045006 0.037473 0.261484 0.656038 0.121028 0.109845 0.235026 0.534101 0.201844 0.323149 0.255818 0.219190 0.309001 0.070618 0.519142 0.101239 0.078171 0.375083 0.387987 0.158759 0.271128 0.103991 0.089706 0.535175 0.399785 0.111435 0.446658 0.042122 Consensus sequence: DCATDBTGHGCATKMTTBRSWR Alignment: DCATDBTGHGCATKMTTBRSWR WCCTKGWTCTCWCMCTGW---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 4 18 0.052480 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB --WCAGRGWGAGAWCYAGGW--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v015681_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 2 18 0.052596 Species: Mus musculus Original motif 0.214165 0.143436 0.372522 0.269876 0.314445 0.406003 0.160351 0.119201 0.137147 0.092924 0.042921 0.727007 0.044121 0.072843 0.051741 0.831295 0.261292 0.324124 0.298498 0.116086 0.258125 0.323243 0.263362 0.155271 0.204557 0.589399 0.107153 0.098891 0.371021 0.244027 0.291102 0.093849 0.096327 0.572718 0.011797 0.319159 0.027282 0.046183 0.844519 0.082016 0.018921 0.012887 0.915917 0.052275 0.364793 0.166722 0.084229 0.384256 0.028216 0.011233 0.951056 0.009495 0.054974 0.004738 0.890377 0.049911 0.006802 0.312915 0.134247 0.546036 0.241289 0.628210 0.104788 0.025713 0.237863 0.302807 0.213018 0.246311 0.349399 0.203220 0.086635 0.360746 0.386634 0.144693 0.246895 0.221779 0.425101 0.354676 0.093374 0.126849 0.060272 0.391320 0.104905 0.443503 0.162090 0.190233 0.227433 0.420244 Consensus sequence: DVTTVVCVYGGHGGYCHHDMYB Reverse complement motif 0.420244 0.190233 0.227433 0.162090 0.443503 0.391320 0.104905 0.060272 0.126849 0.354676 0.093374 0.425101 0.221779 0.144693 0.246895 0.386634 0.360746 0.203220 0.086635 0.349399 0.237863 0.213018 0.302807 0.246311 0.241289 0.104788 0.628210 0.025713 0.546036 0.312915 0.134247 0.006802 0.054974 0.890377 0.004738 0.049911 0.028216 0.951056 0.011233 0.009495 0.384256 0.166722 0.084229 0.364793 0.018921 0.915917 0.012887 0.052275 0.027282 0.844519 0.046183 0.082016 0.096327 0.011797 0.572718 0.319159 0.093849 0.244027 0.291102 0.371021 0.204557 0.107153 0.589399 0.098891 0.258125 0.263362 0.323243 0.155271 0.261292 0.298498 0.324124 0.116086 0.831295 0.072843 0.051741 0.044121 0.727007 0.092924 0.042921 0.137147 0.314445 0.160351 0.406003 0.119201 0.214165 0.372522 0.143436 0.269876 Consensus sequence: VMYDHDGMCCHCCKBGVVAAVH Alignment: DVTTVVCVYGGHGGYCHHDMYB ---WCAGRGWGAGAWCYAGGW- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 133 Motif name: C133 Original motif 0.514851 0.069307 0.207921 0.207921 0.450000 0.010000 0.120000 0.420000 0.430000 0.550000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.495050 0.099010 0.009901 0.396040 0.252525 0.303030 0.050505 0.393939 0.500000 0.090000 0.250000 0.160000 0.510000 0.250000 0.010000 0.230000 0.009901 0.762376 0.108911 0.118812 0.831683 0.148515 0.009901 0.009901 0.069307 0.851485 0.039604 0.039604 0.207921 0.336634 0.069307 0.386139 0.430000 0.040000 0.330000 0.200000 0.620000 0.010000 0.040000 0.330000 0.495050 0.485149 0.009901 0.009901 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.520000 0.040000 0.040000 0.400000 Consensus sequence: AWMAWHDACACHRWMAW Reserve complement motif 0.400000 0.040000 0.040000 0.520000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.009901 0.485149 0.009901 0.495050 0.330000 0.010000 0.040000 0.620000 0.200000 0.040000 0.330000 0.430000 0.386139 0.336634 0.069307 0.207921 0.069307 0.039604 0.851485 0.039604 0.009901 0.148515 0.009901 0.831683 0.009901 0.108911 0.762376 0.118812 0.230000 0.250000 0.010000 0.510000 0.160000 0.090000 0.250000 0.500000 0.393939 0.303030 0.050505 0.252525 0.396040 0.099010 0.009901 0.495050 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.430000 0.010000 0.550000 0.010000 0.420000 0.010000 0.120000 0.450000 0.207921 0.069307 0.207921 0.514851 Consensus sequence: WTYWKHGTGTDHWTRWT ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 133 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 2 17 0.039607 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH -AWMAWHDACACHRWMAW----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 5 17 0.041254 Species: Mus musculus Original motif 0.360997 0.300272 0.115555 0.223177 0.309749 0.228429 0.166233 0.295589 0.149419 0.176868 0.240155 0.433558 0.379704 0.095791 0.276373 0.248133 0.394549 0.174184 0.130641 0.300626 0.443749 0.070776 0.211081 0.274393 0.364301 0.074356 0.370406 0.190936 0.791976 0.038475 0.093390 0.076159 0.963721 0.001826 0.002456 0.031997 0.004516 0.954596 0.008092 0.032796 0.981080 0.002062 0.002161 0.014697 0.986185 0.001846 0.006976 0.004992 0.059567 0.003649 0.002189 0.934595 0.495328 0.024257 0.240450 0.239965 0.305027 0.094878 0.526069 0.074025 0.418442 0.196237 0.158323 0.226998 0.336713 0.220452 0.191155 0.251680 0.192296 0.300342 0.169047 0.338315 0.240387 0.144634 0.128513 0.486465 0.290763 0.271259 0.116600 0.321377 0.224825 0.296233 0.229255 0.249687 0.493240 0.171285 0.075148 0.260326 Consensus sequence: HHBDHDDAACAATDRHHHHHBW Reverse complement motif 0.260326 0.171285 0.075148 0.493240 0.224825 0.229255 0.296233 0.249687 0.321377 0.271259 0.116600 0.290763 0.486465 0.144634 0.128513 0.240387 0.338315 0.300342 0.169047 0.192296 0.251680 0.220452 0.191155 0.336713 0.226998 0.196237 0.158323 0.418442 0.305027 0.526069 0.094878 0.074025 0.239965 0.024257 0.240450 0.495328 0.934595 0.003649 0.002189 0.059567 0.004992 0.001846 0.006976 0.986185 0.014697 0.002062 0.002161 0.981080 0.004516 0.008092 0.954596 0.032796 0.031997 0.001826 0.002456 0.963721 0.076159 0.038475 0.093390 0.791976 0.364301 0.370406 0.074356 0.190936 0.274393 0.070776 0.211081 0.443749 0.300626 0.174184 0.130641 0.394549 0.248133 0.095791 0.276373 0.379704 0.433558 0.176868 0.240155 0.149419 0.295589 0.228429 0.166233 0.309749 0.223177 0.300272 0.115555 0.360997 Consensus sequence: WBHHHHHMDATTGTTHDHDVHH Alignment: WBHHHHHMDATTGTTHDHDVHH ----WTYWKHGTGTDHWTRWT- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00039 Foxj3_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 1 17 0.044128 Species: Mus musculus Original motif 0.317700 0.247432 0.215783 0.219085 0.352303 0.162638 0.230006 0.255053 0.168554 0.301758 0.264712 0.264975 0.529943 0.098389 0.260344 0.111324 0.205868 0.388676 0.197345 0.208111 0.033261 0.853848 0.009029 0.103862 0.673657 0.279649 0.037915 0.008779 0.496326 0.243318 0.006446 0.253910 0.913038 0.037006 0.017077 0.032879 0.948910 0.014865 0.012562 0.023664 0.010919 0.862142 0.009524 0.117414 0.955604 0.012514 0.012289 0.019594 0.409400 0.131244 0.138666 0.320691 0.465036 0.133548 0.065727 0.335688 0.212413 0.103583 0.412294 0.271710 0.182538 0.310768 0.349143 0.157550 0.294233 0.219194 0.238798 0.247776 Consensus sequence: HDBAHCAWAACADWDVD Reverse complement motif 0.247776 0.219194 0.238798 0.294233 0.182538 0.349143 0.310768 0.157550 0.212413 0.412294 0.103583 0.271710 0.335688 0.133548 0.065727 0.465036 0.320691 0.131244 0.138666 0.409400 0.019594 0.012514 0.012289 0.955604 0.010919 0.009524 0.862142 0.117414 0.023664 0.014865 0.012562 0.948910 0.032879 0.037006 0.017077 0.913038 0.253910 0.243318 0.006446 0.496326 0.008779 0.279649 0.037915 0.673657 0.033261 0.009029 0.853848 0.103862 0.205868 0.197345 0.388676 0.208111 0.111324 0.098389 0.260344 0.529943 0.168554 0.264712 0.301758 0.264975 0.255053 0.162638 0.230006 0.352303 0.219085 0.247432 0.215783 0.317700 Consensus sequence: DVHWDTGTTWTGDTBDH Alignment: DVHWDTGTTWTGDTBDH WTYWKHGTGTDHWTRWT ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00119 Nkx2-9 Reverse Complement Original Motif Forward 1 17 0.044837 Species: Mus musculus Original motif 0.246057 0.081231 0.164694 0.508019 0.148670 0.199380 0.121257 0.530694 0.228864 0.152179 0.074714 0.544243 0.315761 0.097229 0.242200 0.344810 0.669183 0.002936 0.306075 0.021805 0.870957 0.008933 0.091276 0.028835 0.009834 0.028141 0.956928 0.005097 0.001783 0.219475 0.004428 0.774314 0.774314 0.004428 0.219475 0.001783 0.005097 0.956928 0.028141 0.009834 0.028835 0.091276 0.008933 0.870957 0.021805 0.306075 0.002936 0.669183 0.411282 0.172328 0.253633 0.162758 0.794622 0.018789 0.052643 0.133945 0.590680 0.124233 0.103686 0.181401 0.241272 0.115001 0.214390 0.429337 0.145724 0.359816 0.128911 0.365550 Consensus sequence: TTTDAAGTACTTVAADH Reverse complement motif 0.365550 0.359816 0.128911 0.145724 0.429337 0.115001 0.214390 0.241272 0.181401 0.124233 0.103686 0.590680 0.133945 0.018789 0.052643 0.794622 0.162758 0.172328 0.253633 0.411282 0.669183 0.306075 0.002936 0.021805 0.870957 0.091276 0.008933 0.028835 0.005097 0.028141 0.956928 0.009834 0.001783 0.004428 0.219475 0.774314 0.774314 0.219475 0.004428 0.001783 0.009834 0.956928 0.028141 0.005097 0.028835 0.008933 0.091276 0.870957 0.021805 0.002936 0.306075 0.669183 0.344810 0.097229 0.242200 0.315761 0.544243 0.152179 0.074714 0.228864 0.530694 0.199380 0.121257 0.148670 0.508019 0.081231 0.164694 0.246057 Consensus sequence: HDTTBAAGTACTTDAAA Alignment: TTTDAAGTACTTVAADH WTYWKHGTGTDHWTRWT ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 2 17 0.045476 Species: Mus musculus Original motif 0.067627 0.131333 0.654425 0.146615 0.156488 0.114442 0.145630 0.583441 0.206450 0.265630 0.358017 0.169903 0.090729 0.460713 0.274712 0.173847 0.285994 0.099998 0.154485 0.459523 0.635908 0.184787 0.072982 0.106323 0.748421 0.039204 0.092605 0.119769 0.081342 0.061327 0.044532 0.812799 0.143120 0.043879 0.024216 0.788785 0.247544 0.092102 0.621453 0.038901 0.295531 0.036295 0.027594 0.640580 0.194561 0.305468 0.339916 0.160055 0.175038 0.193568 0.101212 0.530182 0.145226 0.167488 0.559871 0.127415 0.271501 0.237429 0.206701 0.284369 0.216834 0.109191 0.569605 0.104370 0.182624 0.177160 0.300475 0.339742 0.331737 0.198645 0.265137 0.204482 0.230155 0.359365 0.183450 0.227029 0.056581 0.067297 0.463052 0.413070 0.198891 0.324626 0.304424 0.172059 0.181968 0.287547 0.202419 0.328066 Consensus sequence: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB Reverse complement motif 0.328066 0.287547 0.202419 0.181968 0.198891 0.304424 0.324626 0.172059 0.056581 0.463052 0.067297 0.413070 0.230155 0.183450 0.359365 0.227029 0.204482 0.198645 0.265137 0.331737 0.339742 0.177160 0.300475 0.182624 0.216834 0.569605 0.109191 0.104370 0.284369 0.237429 0.206701 0.271501 0.145226 0.559871 0.167488 0.127415 0.530182 0.193568 0.101212 0.175038 0.194561 0.339916 0.305468 0.160055 0.640580 0.036295 0.027594 0.295531 0.247544 0.621453 0.092102 0.038901 0.788785 0.043879 0.024216 0.143120 0.812799 0.061327 0.044532 0.081342 0.119769 0.039204 0.092605 0.748421 0.106323 0.184787 0.072982 0.635908 0.459523 0.099998 0.154485 0.285994 0.090729 0.274712 0.460713 0.173847 0.206450 0.358017 0.265630 0.169903 0.583441 0.114442 0.145630 0.156488 0.067627 0.654425 0.131333 0.146615 Consensus sequence: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC Alignment: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB -WTYWKHGTGTDHWTRWT---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 134 Motif name: C134 Original motif 0.277228 0.603960 0.009901 0.108911 0.220000 0.550000 0.010000 0.220000 0.148515 0.227723 0.415842 0.207921 0.009901 0.752475 0.019802 0.217822 0.009901 0.861386 0.009901 0.118812 0.230000 0.750000 0.010000 0.010000 0.130000 0.600000 0.010000 0.260000 0.099010 0.524752 0.336634 0.039604 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.141414 0.666667 0.161616 0.030303 Consensus sequence: CCBCCCCSCCC Reserve complement motif 0.141414 0.161616 0.666667 0.030303 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.099010 0.336634 0.524752 0.039604 0.130000 0.010000 0.600000 0.260000 0.230000 0.010000 0.750000 0.010000 0.009901 0.009901 0.861386 0.118812 0.009901 0.019802 0.752475 0.217822 0.148515 0.415842 0.227723 0.207921 0.220000 0.010000 0.550000 0.220000 0.277228 0.009901 0.603960 0.108911 Consensus sequence: GGGSGGGGBGG ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 134 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00021 Zfp281_primaryReverse Complement Reverse Complement Backward 1 11 0.004181 Species: Mus musculus Original motif 0.201535 0.165213 0.201324 0.431929 0.136153 0.443451 0.179132 0.241264 0.263149 0.555137 0.067983 0.113731 0.142183 0.737634 0.045722 0.074461 0.044982 0.884112 0.045356 0.025549 0.246434 0.590578 0.022655 0.140333 0.123049 0.591257 0.033072 0.252622 0.018153 0.944742 0.010254 0.026851 0.035459 0.953844 0.003988 0.006709 0.020000 0.954344 0.005966 0.019690 0.015299 0.964390 0.006755 0.013557 0.028565 0.936152 0.011660 0.023623 0.300127 0.517309 0.029700 0.152863 0.159063 0.513443 0.051834 0.275660 0.158172 0.647055 0.133256 0.061516 Consensus sequence: DBCCCCCCCCCCMYC Reverse complement motif 0.158172 0.133256 0.647055 0.061516 0.159063 0.051834 0.513443 0.275660 0.300127 0.029700 0.517309 0.152863 0.028565 0.011660 0.936152 0.023623 0.015299 0.006755 0.964390 0.013557 0.020000 0.005966 0.954344 0.019690 0.035459 0.003988 0.953844 0.006709 0.018153 0.010254 0.944742 0.026851 0.123049 0.033072 0.591257 0.252622 0.246434 0.022655 0.590578 0.140333 0.044982 0.045356 0.884112 0.025549 0.142183 0.045722 0.737634 0.074461 0.263149 0.067983 0.555137 0.113731 0.136153 0.179132 0.443451 0.241264 0.431929 0.165213 0.201324 0.201535 Consensus sequence: GKRGGGGGGGGGGBD Alignment: GKRGGGGGGGGGGBD ----GGGSGGGGBGG ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00022 Zfp740_primaryReverse Complement Reverse Complement Backward 1 11 0.005744 Species: Mus musculus Original motif 0.136946 0.396508 0.135309 0.331236 0.185528 0.417538 0.215409 0.181525 0.171276 0.341901 0.172832 0.313991 0.145641 0.590572 0.146376 0.117412 0.138035 0.660416 0.114016 0.087533 0.222728 0.750532 0.007528 0.019212 0.024633 0.963314 0.001894 0.010159 0.009557 0.979956 0.000642 0.009844 0.010416 0.977424 0.000541 0.011619 0.026401 0.956740 0.001544 0.015314 0.195502 0.755959 0.011060 0.037480 0.491291 0.364785 0.025613 0.118311 0.305153 0.398160 0.071680 0.225008 0.253497 0.232647 0.213246 0.300610 0.156964 0.297876 0.144683 0.400477 0.179549 0.292514 0.319462 0.208475 Consensus sequence: HVBCCCCCCCCMHHHB Reverse complement motif 0.179549 0.319462 0.292514 0.208475 0.400477 0.297876 0.144683 0.156964 0.300610 0.232647 0.213246 0.253497 0.305153 0.071680 0.398160 0.225008 0.118311 0.364785 0.025613 0.491291 0.195502 0.011060 0.755959 0.037480 0.026401 0.001544 0.956740 0.015314 0.010416 0.000541 0.977424 0.011619 0.009557 0.000642 0.979956 0.009844 0.024633 0.001894 0.963314 0.010159 0.222728 0.007528 0.750532 0.019212 0.138035 0.114016 0.660416 0.087533 0.145641 0.146376 0.590572 0.117412 0.171276 0.172832 0.341901 0.313991 0.185528 0.215409 0.417538 0.181525 0.136946 0.135309 0.396508 0.331236 Consensus sequence: BHHDYGGGGGGGGBVD Alignment: BHHDYGGGGGGGGBVD -----GGGSGGGGBGG ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00000 Smad3_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 2 11 0.014208 Species: Mus musculus Original motif 0.150668 0.131779 0.245665 0.471887 0.316817 0.287314 0.150829 0.245040 0.256473 0.409066 0.109700 0.224761 0.210646 0.220222 0.345010 0.224122 0.166679 0.508939 0.081676 0.242705 0.049351 0.759380 0.088489 0.102780 0.047598 0.785546 0.121957 0.044898 0.004606 0.944933 0.034696 0.015764 0.040252 0.050652 0.890382 0.018713 0.003038 0.913699 0.022449 0.060814 0.028672 0.941477 0.012276 0.017575 0.635243 0.139731 0.110495 0.114531 0.240016 0.385948 0.182848 0.191188 0.210430 0.274127 0.085171 0.430272 0.088118 0.454598 0.208989 0.248295 0.181269 0.265028 0.149023 0.404680 0.101070 0.252682 0.368542 0.277706 Consensus sequence: DHHBCCCCGCCAHHBHB Reverse complement motif 0.101070 0.368542 0.252682 0.277706 0.404680 0.265028 0.149023 0.181269 0.088118 0.208989 0.454598 0.248295 0.430272 0.274127 0.085171 0.210430 0.240016 0.182848 0.385948 0.191188 0.114531 0.139731 0.110495 0.635243 0.028672 0.012276 0.941477 0.017575 0.003038 0.022449 0.913699 0.060814 0.040252 0.890382 0.050652 0.018713 0.004606 0.034696 0.944933 0.015764 0.047598 0.121957 0.785546 0.044898 0.049351 0.088489 0.759380 0.102780 0.166679 0.081676 0.508939 0.242705 0.210646 0.345010 0.220222 0.224122 0.256473 0.109700 0.409066 0.224761 0.245040 0.287314 0.150829 0.316817 0.471887 0.131779 0.245665 0.150668 Consensus sequence: BHBHDTGGCGGGGBDHD Alignment: DHHBCCCCGCCAHHBHB -CCBCCCCSCCC----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00043 Bcl6b_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 1 11 0.018824 Species: Mus musculus Original motif 0.316572 0.278382 0.152556 0.252490 0.167141 0.257034 0.259894 0.315931 0.175523 0.325956 0.259996 0.238525 0.165052 0.385677 0.239449 0.209822 0.069489 0.782718 0.072454 0.075339 0.049943 0.800636 0.031988 0.117433 0.223382 0.060306 0.552691 0.163621 0.072944 0.818252 0.034406 0.074398 0.070535 0.845127 0.062712 0.021626 0.031035 0.859354 0.055424 0.054187 0.063668 0.798503 0.067274 0.070554 0.348488 0.030697 0.197179 0.423636 0.307220 0.256470 0.181009 0.255301 0.460933 0.285057 0.090258 0.163752 0.315798 0.228431 0.171135 0.284637 0.374527 0.268328 0.198810 0.158335 Consensus sequence: HBBBCCGCCCCWHHHV Reverse complement motif 0.158335 0.268328 0.198810 0.374527 0.284637 0.228431 0.171135 0.315798 0.163752 0.285057 0.090258 0.460933 0.255301 0.256470 0.181009 0.307220 0.423636 0.030697 0.197179 0.348488 0.063668 0.067274 0.798503 0.070554 0.031035 0.055424 0.859354 0.054187 0.070535 0.062712 0.845127 0.021626 0.072944 0.034406 0.818252 0.074398 0.223382 0.552691 0.060306 0.163621 0.049943 0.031988 0.800636 0.117433 0.069489 0.072454 0.782718 0.075339 0.165052 0.239449 0.385677 0.209822 0.175523 0.259996 0.325956 0.238525 0.315931 0.257034 0.259894 0.167141 0.252490 0.278382 0.152556 0.316572 Consensus sequence: BHHHWGGGGCGGBBVH Alignment: HBBBCCGCCCCWHHHV CCBCCCCSCCC----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00033 Zfp410_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 1 11 0.018912 Species: Mus musculus Original motif 0.162979 0.284781 0.237433 0.314807 0.182449 0.447584 0.069464 0.300502 0.298973 0.261014 0.213211 0.226802 0.136039 0.433062 0.144274 0.286625 0.180084 0.395933 0.158565 0.265418 0.069354 0.748510 0.068898 0.113238 0.060485 0.717828 0.075333 0.146354 0.023280 0.071762 0.645500 0.259457 0.166896 0.749762 0.062730 0.020612 0.050401 0.775248 0.089072 0.085279 0.103847 0.767557 0.068804 0.059791 0.064815 0.748318 0.114588 0.072280 0.340921 0.071942 0.242981 0.344157 0.301967 0.263512 0.165927 0.268594 0.479800 0.222955 0.118441 0.178803 0.229469 0.283621 0.143099 0.343811 0.261733 0.180191 0.169905 0.388170 Consensus sequence: BHHBHCCGCCCCDHHHH Reverse complement motif 0.388170 0.180191 0.169905 0.261733 0.343811 0.283621 0.143099 0.229469 0.178803 0.222955 0.118441 0.479800 0.268594 0.263512 0.165927 0.301967 0.344157 0.071942 0.242981 0.340921 0.064815 0.114588 0.748318 0.072280 0.103847 0.068804 0.767557 0.059791 0.050401 0.089072 0.775248 0.085279 0.166896 0.062730 0.749762 0.020612 0.023280 0.645500 0.071762 0.259457 0.060485 0.075333 0.717828 0.146354 0.069354 0.068898 0.748510 0.113238 0.180084 0.158565 0.395933 0.265418 0.136039 0.144274 0.433062 0.286625 0.226802 0.261014 0.213211 0.298973 0.182449 0.069464 0.447584 0.300502 0.314807 0.284781 0.237433 0.162979 Consensus sequence: HHHHDGGGGCGGDBHDV Alignment: HHHHDGGGGCGGDBHDV ------GGGSGGGGBGG ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 135 Motif name: C135 Original motif 0.040000 0.130000 0.420000 0.410000 0.069307 0.089109 0.366337 0.475248 0.118812 0.851485 0.019802 0.009901 0.202020 0.585859 0.010101 0.202020 0.070000 0.050000 0.480000 0.400000 0.534653 0.227723 0.118812 0.118812 0.030000 0.010000 0.950000 0.010000 0.590000 0.300000 0.100000 0.010000 0.620000 0.100000 0.270000 0.010000 0.010000 0.800000 0.180000 0.010000 0.118812 0.158416 0.247525 0.475248 0.485149 0.445545 0.009901 0.059406 0.821782 0.009901 0.079208 0.089109 0.059406 0.514851 0.415842 0.009901 0.455446 0.415842 0.019802 0.108911 0.380000 0.430000 0.110000 0.080000 Consensus sequence: KKCCKAGMACBMASMM Reserve complement motif 0.380000 0.110000 0.430000 0.080000 0.108911 0.415842 0.019802 0.455446 0.059406 0.415842 0.514851 0.009901 0.089109 0.009901 0.079208 0.821782 0.059406 0.445545 0.009901 0.485149 0.475248 0.158416 0.247525 0.118812 0.010000 0.180000 0.800000 0.010000 0.010000 0.100000 0.270000 0.620000 0.010000 0.300000 0.100000 0.590000 0.030000 0.950000 0.010000 0.010000 0.118812 0.227723 0.118812 0.534653 0.070000 0.480000 0.050000 0.400000 0.202020 0.010101 0.585859 0.202020 0.118812 0.019802 0.851485 0.009901 0.475248 0.089109 0.366337 0.069307 0.040000 0.420000 0.130000 0.410000 Consensus sequence: RYSTYVGTYCTYGGRY ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 135 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00390 Tcf1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 16 0.042858 Species: Mus musculus Original motif 0.162687 0.354579 0.139993 0.342741 0.101568 0.488153 0.262627 0.147652 0.039438 0.192375 0.351853 0.416335 0.204477 0.236464 0.207245 0.351815 0.362342 0.146750 0.361730 0.129178 0.079522 0.096055 0.737359 0.087065 0.085642 0.106305 0.007176 0.800876 0.020260 0.005019 0.002466 0.972256 0.969698 0.003428 0.003010 0.023864 0.967101 0.002595 0.014222 0.016082 0.019981 0.899634 0.055574 0.024811 0.052496 0.242078 0.031504 0.673922 0.539359 0.044536 0.229461 0.186643 0.668354 0.137998 0.106059 0.087589 0.447559 0.162706 0.171350 0.218385 0.444133 0.156784 0.227197 0.171885 0.111109 0.236252 0.290682 0.361957 Consensus sequence: HSKBVGTTAACTAADDB Reverse complement motif 0.361957 0.236252 0.290682 0.111109 0.171885 0.156784 0.227197 0.444133 0.218385 0.162706 0.171350 0.447559 0.087589 0.137998 0.106059 0.668354 0.186643 0.044536 0.229461 0.539359 0.673922 0.242078 0.031504 0.052496 0.019981 0.055574 0.899634 0.024811 0.016082 0.002595 0.014222 0.967101 0.023864 0.003428 0.003010 0.969698 0.972256 0.005019 0.002466 0.020260 0.800876 0.106305 0.007176 0.085642 0.079522 0.737359 0.096055 0.087065 0.129178 0.146750 0.361730 0.362342 0.351815 0.236464 0.207245 0.204477 0.416335 0.192375 0.351853 0.039438 0.101568 0.262627 0.488153 0.147652 0.162687 0.139993 0.354579 0.342741 Consensus sequence: VDDTTAGTTAACBVRSD Alignment: VDDTTAGTTAACBVRSD RYSTYVGTYCTYGGRY- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00389 Nkx3-1 Reverse Complement Reverse Complement Forward 2 16 0.043753 Species: Mus musculus Original motif 0.230343 0.129202 0.214468 0.425986 0.359358 0.121340 0.162570 0.356732 0.227575 0.345211 0.162386 0.264827 0.285383 0.076814 0.227804 0.409998 0.760754 0.004039 0.216886 0.018321 0.850903 0.006399 0.121474 0.021224 0.007291 0.042579 0.943324 0.006806 0.001583 0.137946 0.005502 0.854969 0.854969 0.005502 0.137946 0.001583 0.006806 0.943324 0.042579 0.007291 0.021224 0.121474 0.006399 0.850903 0.018321 0.216886 0.004039 0.760754 0.691606 0.099604 0.051045 0.157745 0.629431 0.051419 0.224807 0.094342 0.570121 0.143534 0.137491 0.148853 0.303064 0.084741 0.174009 0.438186 0.202801 0.252788 0.303231 0.241180 Consensus sequence: DDHDAAGTACTTAAADB Reverse complement motif 0.202801 0.303231 0.252788 0.241180 0.438186 0.084741 0.174009 0.303064 0.148853 0.143534 0.137491 0.570121 0.094342 0.051419 0.224807 0.629431 0.157745 0.099604 0.051045 0.691606 0.760754 0.216886 0.004039 0.018321 0.850903 0.121474 0.006399 0.021224 0.006806 0.042579 0.943324 0.007291 0.001583 0.005502 0.137946 0.854969 0.854969 0.137946 0.005502 0.001583 0.007291 0.943324 0.042579 0.006806 0.021224 0.006399 0.121474 0.850903 0.018321 0.004039 0.216886 0.760754 0.409998 0.076814 0.227804 0.285383 0.227575 0.162386 0.345211 0.264827 0.356732 0.121340 0.162570 0.359358 0.425986 0.129202 0.214468 0.230343 Consensus sequence: BDTTTAAGTACTTDDDD Alignment: BDTTTAAGTACTTDDDD -RYSTYVGTYCTYGGRY ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00100 Gata6_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 16 0.045664 Species: Mus musculus Original motif 0.096037 0.078720 0.658871 0.166372 0.099473 0.472200 0.272164 0.156163 0.148727 0.227078 0.409637 0.214558 0.280787 0.217654 0.322181 0.179378 0.108784 0.723506 0.080970 0.086739 0.058171 0.044102 0.818270 0.079457 0.681346 0.227586 0.064501 0.026567 0.026226 0.007471 0.070040 0.896263 0.896263 0.070040 0.007471 0.026226 0.026567 0.064501 0.227586 0.681346 0.079457 0.818270 0.044102 0.058171 0.086739 0.080970 0.723506 0.108784 0.081853 0.508631 0.267911 0.141606 0.438599 0.302967 0.195554 0.062881 0.091413 0.182315 0.581418 0.144854 0.142535 0.490840 0.073803 0.292822 0.254673 0.169951 0.289664 0.285713 Consensus sequence: GBBVCGATATCGSVGYD Reverse complement motif 0.254673 0.289664 0.169951 0.285713 0.142535 0.073803 0.490840 0.292822 0.091413 0.581418 0.182315 0.144854 0.062881 0.302967 0.195554 0.438599 0.081853 0.267911 0.508631 0.141606 0.086739 0.723506 0.080970 0.108784 0.079457 0.044102 0.818270 0.058171 0.681346 0.064501 0.227586 0.026567 0.026226 0.070040 0.007471 0.896263 0.896263 0.007471 0.070040 0.026226 0.026567 0.227586 0.064501 0.681346 0.058171 0.818270 0.044102 0.079457 0.108784 0.080970 0.723506 0.086739 0.280787 0.322181 0.217654 0.179378 0.148727 0.409637 0.227078 0.214558 0.099473 0.272164 0.472200 0.156163 0.096037 0.658871 0.078720 0.166372 Consensus sequence: HKCBSCGATATCGVBBC Alignment: GBBVCGATATCGSVGYD -KKCCKAGMACBMASMM ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00090 Elf3_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 2 16 0.045847 Species: Mus musculus Original motif 0.155083 0.152982 0.490906 0.201030 0.123195 0.312681 0.220770 0.343354 0.110252 0.131358 0.153983 0.604406 0.216489 0.490160 0.101348 0.192003 0.396130 0.292429 0.103252 0.208189 0.634770 0.070898 0.070668 0.223664 0.667102 0.099915 0.067576 0.165407 0.625495 0.095579 0.039353 0.239573 0.717478 0.093228 0.024737 0.164558 0.729965 0.048628 0.024557 0.196850 0.670909 0.118718 0.043692 0.166681 0.689441 0.050145 0.038829 0.221584 0.506735 0.159498 0.095635 0.238132 0.406093 0.298915 0.149902 0.145090 0.193913 0.282078 0.096706 0.427303 0.272324 0.154790 0.262469 0.310417 0.224484 0.458724 0.060144 0.256647 Consensus sequence: DBTHHAAAAAAAAVHDH Reverse complement motif 0.224484 0.060144 0.458724 0.256647 0.310417 0.154790 0.262469 0.272324 0.427303 0.282078 0.096706 0.193913 0.145090 0.298915 0.149902 0.406093 0.238132 0.159498 0.095635 0.506735 0.221584 0.050145 0.038829 0.689441 0.166681 0.118718 0.043692 0.670909 0.196850 0.048628 0.024557 0.729965 0.164558 0.093228 0.024737 0.717478 0.239573 0.095579 0.039353 0.625495 0.165407 0.099915 0.067576 0.667102 0.223664 0.070898 0.070668 0.634770 0.208189 0.292429 0.103252 0.396130 0.216489 0.101348 0.490160 0.192003 0.604406 0.131358 0.153983 0.110252 0.343354 0.312681 0.220770 0.123195 0.155083 0.490906 0.152982 0.201030 Consensus sequence: DDHBTTTTTTTTHDAVH Alignment: DDHBTTTTTTTTHDAVH -RYSTYVGTYCTYGGRY ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00053 Rxra_primary Original Motif Original Motif Backward 2 16 0.046396 Species: Mus musculus Original motif 0.235299 0.222264 0.237416 0.305021 0.144778 0.278902 0.341673 0.234648 0.261127 0.261904 0.191591 0.285378 0.119943 0.410774 0.218940 0.250343 0.222672 0.075554 0.365253 0.336521 0.001838 0.046904 0.002828 0.948430 0.030410 0.006359 0.960821 0.002410 0.987391 0.007562 0.002810 0.002237 0.105188 0.888650 0.001163 0.004998 0.006475 0.987074 0.001793 0.004659 0.001816 0.765138 0.003092 0.229953 0.010354 0.846496 0.029899 0.113251 0.328732 0.039382 0.265510 0.366377 0.209638 0.262628 0.145613 0.382121 0.385390 0.177695 0.299828 0.137087 0.403452 0.268924 0.096028 0.231595 0.203082 0.231812 0.213520 0.351585 Consensus sequence: DBHBDTGACCCCDHVHB Reverse complement motif 0.351585 0.231812 0.213520 0.203082 0.231595 0.268924 0.096028 0.403452 0.137087 0.177695 0.299828 0.385390 0.382121 0.262628 0.145613 0.209638 0.366377 0.039382 0.265510 0.328732 0.010354 0.029899 0.846496 0.113251 0.001816 0.003092 0.765138 0.229953 0.006475 0.001793 0.987074 0.004659 0.105188 0.001163 0.888650 0.004998 0.002237 0.007562 0.002810 0.987391 0.030410 0.960821 0.006359 0.002410 0.948430 0.046904 0.002828 0.001838 0.222672 0.365253 0.075554 0.336521 0.119943 0.218940 0.410774 0.250343 0.285378 0.261904 0.191591 0.261127 0.144778 0.341673 0.278902 0.234648 0.305021 0.222264 0.237416 0.235299 Consensus sequence: VHBHDGGGGTCAHBHBD Alignment: DBHBDTGACCCCDHVHB KKCCKAGMACBMASMM- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 136 Motif name: C136 Original motif 0.010000 0.200000 0.780000 0.010000 0.240000 0.010000 0.460000 0.290000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.262626 0.262626 0.282828 0.191919 0.080000 0.040000 0.510000 0.370000 0.020000 0.570000 0.350000 0.060000 0.320000 0.560000 0.010000 0.110000 0.168317 0.386139 0.128713 0.316832 0.060000 0.010000 0.920000 0.010000 0.118812 0.009901 0.861386 0.009901 0.079208 0.039604 0.871287 0.009901 0.440000 0.100000 0.440000 0.020000 0.514851 0.297030 0.059406 0.128713 0.010000 0.230000 0.200000 0.560000 Consensus sequence: GDGGVKSMHGGGRMT Reserve complement motif 0.560000 0.230000 0.200000 0.010000 0.128713 0.297030 0.059406 0.514851 0.020000 0.100000 0.440000 0.440000 0.079208 0.871287 0.039604 0.009901 0.118812 0.861386 0.009901 0.009901 0.060000 0.920000 0.010000 0.010000 0.168317 0.128713 0.386139 0.316832 0.320000 0.010000 0.560000 0.110000 0.020000 0.350000 0.570000 0.060000 0.080000 0.510000 0.040000 0.370000 0.262626 0.282828 0.262626 0.191919 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.240000 0.460000 0.010000 0.290000 0.010000 0.780000 0.200000 0.010000 Consensus sequence: AYKCCCDRSYVCCHC ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 136 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 8 15 0.029687 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH AYKCCCDRSYVCCHC------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00036 Myf6_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 1 15 0.032948 Species: Mus musculus Original motif 0.345146 0.261059 0.273931 0.119863 0.222137 0.272923 0.332024 0.172916 0.269602 0.278951 0.245221 0.206225 0.485406 0.144018 0.294421 0.076155 0.577731 0.270563 0.078955 0.072752 0.070027 0.750816 0.062819 0.116339 0.685018 0.105175 0.137110 0.072697 0.162574 0.071041 0.638464 0.127921 0.343240 0.389633 0.206226 0.060900 0.080169 0.790323 0.114211 0.015297 0.167035 0.201642 0.462780 0.168543 0.114383 0.664317 0.166143 0.055157 0.392143 0.114475 0.340085 0.153298 0.208147 0.577473 0.142694 0.071686 0.168632 0.563135 0.066181 0.202052 Consensus sequence: VVVRACAGVCBCDCC Reverse complement motif 0.168632 0.066181 0.563135 0.202052 0.208147 0.142694 0.577473 0.071686 0.153298 0.114475 0.340085 0.392143 0.114383 0.166143 0.664317 0.055157 0.167035 0.462780 0.201642 0.168543 0.080169 0.114211 0.790323 0.015297 0.343240 0.206226 0.389633 0.060900 0.162574 0.638464 0.071041 0.127921 0.072697 0.105175 0.137110 0.685018 0.070027 0.062819 0.750816 0.116339 0.072752 0.270563 0.078955 0.577731 0.076155 0.144018 0.294421 0.485406 0.269602 0.245221 0.278951 0.206225 0.222137 0.332024 0.272923 0.172916 0.119863 0.261059 0.273931 0.345146 Consensus sequence: GGDGBGVCTGTKVVB Alignment: VVVRACAGVCBCDCC GDGGVKSMHGGGRMT ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00021 Zfp281_primaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 1 15 0.036013 Species: Mus musculus Original motif 0.201535 0.165213 0.201324 0.431929 0.136153 0.443451 0.179132 0.241264 0.263149 0.555137 0.067983 0.113731 0.142183 0.737634 0.045722 0.074461 0.044982 0.884112 0.045356 0.025549 0.246434 0.590578 0.022655 0.140333 0.123049 0.591257 0.033072 0.252622 0.018153 0.944742 0.010254 0.026851 0.035459 0.953844 0.003988 0.006709 0.020000 0.954344 0.005966 0.019690 0.015299 0.964390 0.006755 0.013557 0.028565 0.936152 0.011660 0.023623 0.300127 0.517309 0.029700 0.152863 0.159063 0.513443 0.051834 0.275660 0.158172 0.647055 0.133256 0.061516 Consensus sequence: DBCCCCCCCCCCMYC Reverse complement motif 0.158172 0.133256 0.647055 0.061516 0.159063 0.051834 0.513443 0.275660 0.300127 0.029700 0.517309 0.152863 0.028565 0.011660 0.936152 0.023623 0.015299 0.006755 0.964390 0.013557 0.020000 0.005966 0.954344 0.019690 0.035459 0.003988 0.953844 0.006709 0.018153 0.010254 0.944742 0.026851 0.123049 0.033072 0.591257 0.252622 0.246434 0.022655 0.590578 0.140333 0.044982 0.045356 0.884112 0.025549 0.142183 0.045722 0.737634 0.074461 0.263149 0.067983 0.555137 0.113731 0.136153 0.179132 0.443451 0.241264 0.431929 0.165213 0.201324 0.201535 Consensus sequence: GKRGGGGGGGGGGBD Alignment: GKRGGGGGGGGGGBD GDGGVKSMHGGGRMT ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00082 Zfp187_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 1 15 0.038382 Species: Mus musculus Original motif 0.173063 0.169680 0.440836 0.216421 0.353277 0.179996 0.249403 0.217325 0.307337 0.038055 0.616380 0.038228 0.316636 0.564670 0.023732 0.094962 0.015484 0.923764 0.019439 0.041313 0.011243 0.956300 0.009443 0.023014 0.062273 0.107531 0.010739 0.819456 0.126670 0.201521 0.192005 0.479803 0.093090 0.045924 0.835792 0.025194 0.020165 0.015483 0.009567 0.954786 0.010873 0.672448 0.004559 0.312121 0.018002 0.846860 0.017605 0.117533 0.335703 0.408170 0.104095 0.152031 0.150308 0.362296 0.067408 0.419988 0.286490 0.242211 0.176532 0.294767 0.265022 0.249655 0.272219 0.213104 Consensus sequence: DDGMCCTBGTCCHYHV Reverse complement motif 0.265022 0.272219 0.249655 0.213104 0.294767 0.242211 0.176532 0.286490 0.419988 0.362296 0.067408 0.150308 0.335703 0.104095 0.408170 0.152031 0.018002 0.017605 0.846860 0.117533 0.010873 0.004559 0.672448 0.312121 0.954786 0.015483 0.009567 0.020165 0.093090 0.835792 0.045924 0.025194 0.479803 0.201521 0.192005 0.126670 0.819456 0.107531 0.010739 0.062273 0.011243 0.009443 0.956300 0.023014 0.015484 0.019439 0.923764 0.041313 0.316636 0.023732 0.564670 0.094962 0.307337 0.616380 0.038055 0.038228 0.217325 0.179996 0.249403 0.353277 0.173063 0.440836 0.169680 0.216421 Consensus sequence: VHMDGGACVAGGRCDH Alignment: DDGMCCTBGTCCHYHV AYKCCCDRSYVCCHC- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00096 Sox13_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 1 15 0.039125 Species: Mus musculus Original motif 0.262581 0.115233 0.405525 0.216661 0.246681 0.142854 0.145056 0.465409 0.341041 0.154355 0.306628 0.197976 0.242211 0.263918 0.113187 0.380684 0.119326 0.241913 0.117198 0.521563 0.054120 0.036135 0.784219 0.125525 0.076634 0.048399 0.788586 0.086381 0.215316 0.044119 0.663927 0.076638 0.248538 0.159141 0.015452 0.576869 0.047049 0.083570 0.788798 0.080583 0.071948 0.035098 0.768849 0.124105 0.123777 0.030383 0.713425 0.132415 0.294760 0.182119 0.181553 0.341567 0.516589 0.129377 0.116698 0.237336 0.350326 0.186505 0.112598 0.350571 0.311469 0.198085 0.147986 0.342460 0.185126 0.130721 0.242572 0.441582 Consensus sequence: DDDHTGGGTGGGHAHHD Reverse complement motif 0.441582 0.130721 0.242572 0.185126 0.342460 0.198085 0.147986 0.311469 0.350571 0.186505 0.112598 0.350326 0.237336 0.129377 0.116698 0.516589 0.341567 0.182119 0.181553 0.294760 0.123777 0.713425 0.030383 0.132415 0.071948 0.768849 0.035098 0.124105 0.047049 0.788798 0.083570 0.080583 0.576869 0.159141 0.015452 0.248538 0.215316 0.663927 0.044119 0.076638 0.076634 0.788586 0.048399 0.086381 0.054120 0.784219 0.036135 0.125525 0.521563 0.241913 0.117198 0.119326 0.380684 0.263918 0.113187 0.242211 0.197976 0.154355 0.306628 0.341041 0.465409 0.142854 0.145056 0.246681 0.262581 0.405525 0.115233 0.216661 Consensus sequence: DHHTHCCCACCCAHDDH Alignment: DDDHTGGGTGGGHAHHD GDGGVKSMHGGGRMT-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 137 Motif name: C137 Original motif 0.550000 0.070000 0.360000 0.020000 0.811881 0.118812 0.059406 0.009901 0.930000 0.010000 0.040000 0.020000 0.070000 0.500000 0.020000 0.410000 0.148515 0.049505 0.089109 0.712871 0.240000 0.610000 0.090000 0.060000 0.890000 0.010000 0.010000 0.090000 0.148515 0.009901 0.801980 0.039604 0.475248 0.029703 0.475248 0.019802 0.831683 0.009901 0.148515 0.009901 0.752475 0.099010 0.009901 0.138614 0.010000 0.410000 0.070000 0.510000 Consensus sequence: RAAYTCAGRAAY Reserve complement motif 0.510000 0.410000 0.070000 0.010000 0.138614 0.099010 0.009901 0.752475 0.009901 0.009901 0.148515 0.831683 0.019802 0.029703 0.475248 0.475248 0.148515 0.801980 0.009901 0.039604 0.090000 0.010000 0.010000 0.890000 0.240000 0.090000 0.610000 0.060000 0.712871 0.049505 0.089109 0.148515 0.070000 0.020000 0.500000 0.410000 0.020000 0.010000 0.040000 0.930000 0.009901 0.118812 0.059406 0.811881 0.020000 0.070000 0.360000 0.550000 Consensus sequence: MTTKCTGAKTTK ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 137 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00085 Sfpi1_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 2 12 0.009026 Species: Mus musculus Original motif 0.258850 0.404047 0.118755 0.218348 0.407411 0.209199 0.177959 0.205430 0.663761 0.052852 0.146297 0.137089 0.479949 0.060152 0.029036 0.430863 0.220887 0.085462 0.024186 0.669465 0.211993 0.111100 0.120358 0.556550 0.313150 0.360343 0.156354 0.170153 0.308131 0.323440 0.294899 0.073530 0.219945 0.060802 0.664830 0.054423 0.117625 0.080553 0.728331 0.073491 0.725502 0.039058 0.095272 0.140168 0.730077 0.107252 0.036034 0.126638 0.216907 0.541025 0.123234 0.118835 0.218267 0.479050 0.115849 0.186834 Consensus sequence: HHAWTTHVGGAACH Reverse complement motif 0.218267 0.115849 0.479050 0.186834 0.216907 0.123234 0.541025 0.118835 0.126638 0.107252 0.036034 0.730077 0.140168 0.039058 0.095272 0.725502 0.117625 0.728331 0.080553 0.073491 0.219945 0.664830 0.060802 0.054423 0.308131 0.294899 0.323440 0.073530 0.313150 0.156354 0.360343 0.170153 0.556550 0.111100 0.120358 0.211993 0.669465 0.085462 0.024186 0.220887 0.430863 0.060152 0.029036 0.479949 0.137089 0.052852 0.146297 0.663761 0.205430 0.209199 0.177959 0.407411 0.258850 0.118755 0.404047 0.218348 Consensus sequence: DGTTCCVDAAWTHD Alignment: HHAWTTHVGGAACH -RAAYTCAGRAAY- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00101 Sox12_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 5 12 0.017912 Species: Mus musculus Original motif 0.378898 0.318901 0.205859 0.096341 0.352524 0.321236 0.224504 0.101736 0.323551 0.182056 0.210897 0.283496 0.135539 0.325230 0.208031 0.331200 0.663106 0.055471 0.154459 0.126963 0.051748 0.292567 0.537307 0.118378 0.886489 0.042361 0.035742 0.035408 0.043647 0.688744 0.094358 0.173252 0.882052 0.039818 0.018899 0.059231 0.864171 0.036011 0.068363 0.031455 0.790158 0.046868 0.041594 0.121379 0.087447 0.143905 0.707798 0.060849 0.295919 0.132479 0.485703 0.085899 0.653156 0.133004 0.110012 0.103828 0.351764 0.131771 0.217730 0.298736 0.203977 0.196773 0.099958 0.499292 Consensus sequence: VVDBASACAAAGRADH Reverse complement motif 0.499292 0.196773 0.099958 0.203977 0.298736 0.131771 0.217730 0.351764 0.103828 0.133004 0.110012 0.653156 0.295919 0.485703 0.132479 0.085899 0.087447 0.707798 0.143905 0.060849 0.121379 0.046868 0.041594 0.790158 0.031455 0.036011 0.068363 0.864171 0.059231 0.039818 0.018899 0.882052 0.043647 0.094358 0.688744 0.173252 0.035408 0.042361 0.035742 0.886489 0.051748 0.537307 0.292567 0.118378 0.126963 0.055471 0.154459 0.663106 0.331200 0.325230 0.208031 0.135539 0.283496 0.182056 0.210897 0.323551 0.101736 0.321236 0.224504 0.352524 0.096341 0.318901 0.205859 0.378898 Consensus sequence: HDTMCTTTGTSTVDBB Alignment: VVDBASACAAAGRADH ----RAAYTCAGRAAY ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00185 Pbx1 Reverse Complement Reverse Complement Forward 6 12 0.017971 Species: Mus musculus Original motif 0.212132 0.278490 0.152736 0.356642 0.063933 0.492543 0.152064 0.291460 0.587031 0.034623 0.144307 0.234038 0.117053 0.398145 0.094881 0.389921 0.373322 0.389731 0.108286 0.128661 0.108687 0.734731 0.088065 0.068518 0.859559 0.019872 0.072249 0.048320 0.030137 0.010645 0.008436 0.950782 0.031271 0.947906 0.008587 0.012236 0.931443 0.030353 0.020847 0.017358 0.740694 0.063345 0.026296 0.169665 0.314246 0.050461 0.058593 0.576700 0.324258 0.320852 0.146988 0.207902 0.392891 0.139295 0.090383 0.377432 0.356442 0.139564 0.146747 0.357247 0.260742 0.286138 0.240467 0.212652 0.366956 0.354615 0.205968 0.072461 Consensus sequence: HYAYMCATCAAWHWDVV Reverse complement motif 0.072461 0.354615 0.205968 0.366956 0.260742 0.240467 0.286138 0.212652 0.357247 0.139564 0.146747 0.356442 0.377432 0.139295 0.090383 0.392891 0.207902 0.320852 0.146988 0.324258 0.576700 0.050461 0.058593 0.314246 0.169665 0.063345 0.026296 0.740694 0.017358 0.030353 0.020847 0.931443 0.031271 0.008587 0.947906 0.012236 0.950782 0.010645 0.008436 0.030137 0.048320 0.019872 0.072249 0.859559 0.108687 0.088065 0.734731 0.068518 0.373322 0.108286 0.389731 0.128661 0.117053 0.094881 0.398145 0.389921 0.234038 0.034623 0.144307 0.587031 0.063933 0.152064 0.492543 0.291460 0.356642 0.278490 0.152736 0.212132 Consensus sequence: BVDWHWTTGATGRKTKH Alignment: BVDWHWTTGATGRKTKH -----MTTKCTGAKTTK ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00062 Sox4_primary Original Motif Original Motif Forward 5 12 0.020913 Species: Mus musculus Original motif 0.427843 0.231210 0.119424 0.221523 0.196506 0.239531 0.304906 0.259057 0.302488 0.156922 0.290190 0.250401 0.433872 0.149126 0.196496 0.220506 0.258426 0.076511 0.475100 0.189963 0.841714 0.046453 0.099915 0.011918 0.983853 0.001612 0.001362 0.013174 0.003460 0.982032 0.005728 0.008780 0.989743 0.002253 0.002020 0.005984 0.990761 0.003397 0.002843 0.003000 0.770864 0.003540 0.001549 0.224048 0.235342 0.002598 0.757383 0.004677 0.371426 0.089574 0.529959 0.009040 0.480804 0.196949 0.240413 0.081833 0.187158 0.355102 0.216599 0.241142 0.248006 0.232182 0.157452 0.362360 0.403367 0.177684 0.164649 0.254300 Consensus sequence: HBDDDAACAAAGRVBHH Reverse complement motif 0.254300 0.177684 0.164649 0.403367 0.362360 0.232182 0.157452 0.248006 0.187158 0.216599 0.355102 0.241142 0.081833 0.196949 0.240413 0.480804 0.371426 0.529959 0.089574 0.009040 0.235342 0.757383 0.002598 0.004677 0.224048 0.003540 0.001549 0.770864 0.003000 0.003397 0.002843 0.990761 0.005984 0.002253 0.002020 0.989743 0.003460 0.005728 0.982032 0.008780 0.013174 0.001612 0.001362 0.983853 0.011918 0.046453 0.099915 0.841714 0.258426 0.475100 0.076511 0.189963 0.220506 0.149126 0.196496 0.433872 0.250401 0.156922 0.290190 0.302488 0.196506 0.304906 0.239531 0.259057 0.221523 0.231210 0.119424 0.427843 Consensus sequence: HHBBMCTTTGTTHDDBH Alignment: HBDDDAACAAAGRVBHH ----RAAYTCAGRAAY- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00030 Sox11_primary Original Motif Original Motif Forward 5 12 0.021207 Species: Mus musculus Original motif 0.351812 0.238467 0.143954 0.265768 0.195246 0.235838 0.281473 0.287443 0.349478 0.172616 0.210739 0.267167 0.484061 0.110438 0.173131 0.232370 0.276692 0.070713 0.479604 0.172991 0.859124 0.044167 0.083951 0.012758 0.975608 0.002029 0.002285 0.020079 0.006422 0.978485 0.007124 0.007969 0.987489 0.003025 0.002868 0.006617 0.987739 0.005463 0.002730 0.004067 0.693013 0.004067 0.002445 0.300475 0.189100 0.003677 0.801408 0.005814 0.352090 0.072517 0.567737 0.007656 0.542316 0.176545 0.192768 0.088371 0.196382 0.304176 0.205985 0.293457 0.289415 0.201358 0.182937 0.326290 0.385801 0.216362 0.152363 0.245475 Consensus sequence: HBDDRAACAAAGRABHH Reverse complement motif 0.245475 0.216362 0.152363 0.385801 0.326290 0.201358 0.182937 0.289415 0.196382 0.205985 0.304176 0.293457 0.088371 0.176545 0.192768 0.542316 0.352090 0.567737 0.072517 0.007656 0.189100 0.801408 0.003677 0.005814 0.300475 0.004067 0.002445 0.693013 0.004067 0.005463 0.002730 0.987739 0.006617 0.003025 0.002868 0.987489 0.006422 0.007124 0.978485 0.007969 0.020079 0.002029 0.002285 0.975608 0.012758 0.044167 0.083951 0.859124 0.276692 0.479604 0.070713 0.172991 0.232370 0.110438 0.173131 0.484061 0.267167 0.172616 0.210739 0.349478 0.287443 0.235838 0.281473 0.195246 0.265768 0.238467 0.143954 0.351812 Consensus sequence: HHBTMCTTTGTTMDDVH Alignment: HBDDRAACAAAGRABHH ----RAAYTCAGRAAY- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 138 Motif name: C138 Original motif 0.742574 0.009901 0.227723 0.019802 0.670000 0.040000 0.280000 0.010000 0.059406 0.207921 0.554455 0.178218 0.620000 0.110000 0.250000 0.020000 0.910000 0.070000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.610000 0.020000 0.310000 0.060000 0.170000 0.400000 0.420000 0.010000 0.610000 0.250000 0.130000 0.010000 0.960000 0.010000 0.020000 0.010000 0.060000 0.250000 0.530000 0.160000 Consensus sequence: AAGAAARSAAG Reserve complement motif 0.060000 0.530000 0.250000 0.160000 0.010000 0.010000 0.020000 0.960000 0.010000 0.250000 0.130000 0.610000 0.170000 0.420000 0.400000 0.010000 0.060000 0.020000 0.310000 0.610000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.070000 0.010000 0.910000 0.020000 0.110000 0.250000 0.620000 0.059406 0.554455 0.207921 0.178218 0.010000 0.040000 0.280000 0.670000 0.019802 0.009901 0.227723 0.742574 Consensus sequence: CTTSKTTTCTT ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 138 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00077 Srf_secondary Reverse Complement Reverse Complement Backward 5 11 0.033494 Species: Mus musculus Original motif 0.162968 0.284828 0.440984 0.111220 0.151392 0.200635 0.205316 0.442657 0.267215 0.083669 0.192498 0.456618 0.332771 0.180711 0.200027 0.286491 0.509370 0.102954 0.242569 0.145107 0.666262 0.077309 0.154466 0.101962 0.737968 0.113335 0.100401 0.048296 0.658878 0.141580 0.134033 0.065510 0.766115 0.094051 0.069763 0.070072 0.755621 0.088491 0.044802 0.111086 0.749083 0.135917 0.047510 0.067490 0.663231 0.176795 0.028134 0.131839 0.553358 0.277659 0.038655 0.130328 0.392578 0.314083 0.209844 0.083495 0.198462 0.237132 0.239466 0.324940 0.275121 0.210087 0.194779 0.320013 0.287748 0.277395 0.142704 0.292154 Consensus sequence: VBDDAAAAAAAAMVBHH Reverse complement motif 0.292154 0.277395 0.142704 0.287748 0.320013 0.210087 0.194779 0.275121 0.324940 0.237132 0.239466 0.198462 0.083495 0.314083 0.209844 0.392578 0.130328 0.277659 0.038655 0.553358 0.131839 0.176795 0.028134 0.663231 0.067490 0.135917 0.047510 0.749083 0.111086 0.088491 0.044802 0.755621 0.070072 0.094051 0.069763 0.766115 0.065510 0.141580 0.134033 0.658878 0.048296 0.113335 0.100401 0.737968 0.101962 0.077309 0.154466 0.666262 0.145107 0.102954 0.242569 0.509370 0.286491 0.180711 0.200027 0.332771 0.456618 0.083669 0.192498 0.267215 0.442657 0.200635 0.205316 0.151392 0.162968 0.440984 0.284828 0.111220 Consensus sequence: HHVBYTTTTTTTTDDVV Alignment: HHVBYTTTTTTTTDDVV --CTTSKTTTCTT---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00037 Zfp105_primaryReverse Complement Reverse Complement Backward 3 11 0.044128 Species: Mus musculus Original motif 0.363104 0.182807 0.145232 0.308856 0.419707 0.133742 0.222546 0.224005 0.164481 0.418263 0.052397 0.364858 0.715575 0.117639 0.064914 0.101872 0.883836 0.026985 0.032584 0.056596 0.558797 0.151280 0.033120 0.256803 0.267037 0.403488 0.026746 0.302729 0.939762 0.013627 0.034579 0.012032 0.897072 0.009878 0.035642 0.057408 0.305904 0.516040 0.055311 0.122746 0.880940 0.027958 0.048350 0.042752 0.710082 0.052464 0.040250 0.197204 0.246712 0.125155 0.318627 0.309506 0.429749 0.181755 0.176892 0.211603 0.339643 0.097216 0.355250 0.207891 Consensus sequence: HDYAAAHAAMAADHD Reverse complement motif 0.339643 0.355250 0.097216 0.207891 0.211603 0.181755 0.176892 0.429749 0.246712 0.318627 0.125155 0.309506 0.197204 0.052464 0.040250 0.710082 0.042752 0.027958 0.048350 0.880940 0.305904 0.055311 0.516040 0.122746 0.057408 0.009878 0.035642 0.897072 0.012032 0.013627 0.034579 0.939762 0.267037 0.026746 0.403488 0.302729 0.256803 0.151280 0.033120 0.558797 0.056596 0.026985 0.032584 0.883836 0.101872 0.117639 0.064914 0.715575 0.164481 0.052397 0.418263 0.364858 0.224005 0.133742 0.222546 0.419707 0.308856 0.182807 0.145232 0.363104 Consensus sequence: HHHTTRTTDTTTKDH Alignment: HHHTTRTTDTTTKDH --CTTSKTTTCTT-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00028 Tcfap2e_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 3 11 0.044912 Species: Mus musculus Original motif 0.248591 0.214386 0.166769 0.370254 0.416041 0.167262 0.218682 0.198015 0.195301 0.542527 0.153042 0.109129 0.240156 0.185228 0.255545 0.319071 0.195809 0.247688 0.280778 0.275725 0.271555 0.129776 0.497286 0.101382 0.738080 0.057879 0.078760 0.125281 0.728876 0.074205 0.092737 0.104182 0.694380 0.084957 0.159476 0.061186 0.665572 0.111592 0.131546 0.091289 0.782384 0.059680 0.047525 0.110411 0.769981 0.105692 0.056467 0.067860 0.402932 0.087712 0.172674 0.336682 0.409485 0.160886 0.229779 0.199850 Consensus sequence: HDCDBRAAAAAADD Reverse complement motif 0.199850 0.160886 0.229779 0.409485 0.336682 0.087712 0.172674 0.402932 0.067860 0.105692 0.056467 0.769981 0.110411 0.059680 0.047525 0.782384 0.091289 0.111592 0.131546 0.665572 0.061186 0.084957 0.159476 0.694380 0.104182 0.074205 0.092737 0.728876 0.125281 0.057879 0.078760 0.738080 0.271555 0.497286 0.129776 0.101382 0.195809 0.280778 0.247688 0.275725 0.319071 0.185228 0.255545 0.240156 0.195301 0.153042 0.542527 0.109129 0.198015 0.167262 0.218682 0.416041 0.370254 0.214386 0.166769 0.248591 Consensus sequence: DDTTTTTTMBDGDH Alignment: HDCDBRAAAAAADD --AAGAAARSAAG- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00171 Msx3 Reverse Complement Reverse Complement Backward 4 11 0.045203 Species: Mus musculus Original motif 0.317812 0.352438 0.231628 0.098123 0.601471 0.133830 0.164947 0.099752 0.399508 0.293187 0.098524 0.208781 0.754569 0.054130 0.133622 0.057678 0.770469 0.088090 0.086904 0.054537 0.038689 0.673100 0.189096 0.099115 0.004935 0.522968 0.000482 0.471615 0.986316 0.001484 0.009222 0.002978 0.991636 0.005079 0.001457 0.001828 0.009156 0.001857 0.001081 0.987906 0.013688 0.006588 0.000191 0.979532 0.987635 0.000354 0.005166 0.006845 0.701095 0.027828 0.154852 0.116224 0.181731 0.184800 0.303458 0.330011 0.224816 0.221032 0.182405 0.371747 0.310539 0.208307 0.099081 0.382073 Consensus sequence: VAHAACYAATTAABHH Reverse complement motif 0.382073 0.208307 0.099081 0.310539 0.371747 0.221032 0.182405 0.224816 0.330011 0.184800 0.303458 0.181731 0.116224 0.027828 0.154852 0.701095 0.006845 0.000354 0.005166 0.987635 0.979532 0.006588 0.000191 0.013688 0.987906 0.001857 0.001081 0.009156 0.001828 0.005079 0.001457 0.991636 0.002978 0.001484 0.009222 0.986316 0.004935 0.000482 0.522968 0.471615 0.038689 0.189096 0.673100 0.099115 0.054537 0.088090 0.086904 0.770469 0.057678 0.054130 0.133622 0.754569 0.208781 0.293187 0.098524 0.399508 0.099752 0.133830 0.164947 0.601471 0.317812 0.231628 0.352438 0.098123 Consensus sequence: HHVTTAATTKGTTHTV Alignment: HHVTTAATTKGTTHTV --CTTSKTTTCTT--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00025 Foxk1_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 4 11 0.045668 Species: Mus musculus Original motif 0.240753 0.425595 0.141281 0.192371 0.367715 0.247224 0.117353 0.267708 0.489169 0.220343 0.113844 0.176644 0.742256 0.042809 0.146704 0.068231 0.078936 0.546144 0.032328 0.342592 0.588419 0.293580 0.082117 0.035885 0.913924 0.026256 0.050778 0.009042 0.009007 0.565680 0.010683 0.414630 0.947562 0.020878 0.018821 0.012739 0.901384 0.021519 0.030204 0.046893 0.077157 0.797900 0.026432 0.098511 0.824314 0.040128 0.051910 0.083648 0.254436 0.342235 0.143789 0.259539 0.319400 0.338163 0.129746 0.212691 0.231014 0.260719 0.169042 0.339225 Consensus sequence: HHHAYAAYAACAHHH Reverse complement motif 0.339225 0.260719 0.169042 0.231014 0.319400 0.129746 0.338163 0.212691 0.254436 0.143789 0.342235 0.259539 0.083648 0.040128 0.051910 0.824314 0.077157 0.026432 0.797900 0.098511 0.046893 0.021519 0.030204 0.901384 0.012739 0.020878 0.018821 0.947562 0.009007 0.010683 0.565680 0.414630 0.009042 0.026256 0.050778 0.913924 0.035885 0.293580 0.082117 0.588419 0.078936 0.032328 0.546144 0.342592 0.068231 0.042809 0.146704 0.742256 0.176644 0.220343 0.113844 0.489169 0.267708 0.247224 0.117353 0.367715 0.240753 0.141281 0.425595 0.192371 Consensus sequence: HDDTGTTKTTKTHHD Alignment: HDDTGTTKTTKTHHD -CTTSKTTTCTT--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 139 Motif name: C139 Original motif 0.495050 0.009901 0.009901 0.485149 0.475248 0.009901 0.009901 0.504950 0.530000 0.290000 0.060000 0.120000 0.811881 0.099010 0.009901 0.079208 0.782178 0.118812 0.089109 0.009901 0.821782 0.079208 0.089109 0.009901 0.138614 0.346535 0.376238 0.138614 0.475248 0.069307 0.059406 0.396040 0.410000 0.080000 0.030000 0.480000 0.430000 0.010000 0.040000 0.520000 0.180000 0.350000 0.320000 0.150000 0.800000 0.180000 0.010000 0.010000 0.831683 0.148515 0.009901 0.009901 0.742574 0.158416 0.079208 0.019802 0.554455 0.247525 0.089109 0.108911 0.495050 0.079208 0.009901 0.415842 0.504950 0.009901 0.039604 0.445545 Consensus sequence: WWMAAABWWWVAAAAWW Reserve complement motif 0.445545 0.009901 0.039604 0.504950 0.415842 0.079208 0.009901 0.495050 0.108911 0.247525 0.089109 0.554455 0.019802 0.158416 0.079208 0.742574 0.009901 0.148515 0.009901 0.831683 0.010000 0.180000 0.010000 0.800000 0.180000 0.320000 0.350000 0.150000 0.520000 0.010000 0.040000 0.430000 0.480000 0.080000 0.030000 0.410000 0.396040 0.069307 0.059406 0.475248 0.138614 0.376238 0.346535 0.138614 0.009901 0.079208 0.089109 0.821782 0.009901 0.118812 0.089109 0.782178 0.079208 0.099010 0.009901 0.811881 0.120000 0.290000 0.060000 0.530000 0.504950 0.009901 0.009901 0.475248 0.485149 0.009901 0.009901 0.495050 Consensus sequence: WWTTTTVWWWBTTTYWW ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 139 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_primary Original Motif Original Motif Backward 3 17 0.048192 Species: Mus musculus Original motif 0.360997 0.300272 0.115555 0.223177 0.309749 0.228429 0.166233 0.295589 0.149419 0.176868 0.240155 0.433558 0.379704 0.095791 0.276373 0.248133 0.394549 0.174184 0.130641 0.300626 0.443749 0.070776 0.211081 0.274393 0.364301 0.074356 0.370406 0.190936 0.791976 0.038475 0.093390 0.076159 0.963721 0.001826 0.002456 0.031997 0.004516 0.954596 0.008092 0.032796 0.981080 0.002062 0.002161 0.014697 0.986185 0.001846 0.006976 0.004992 0.059567 0.003649 0.002189 0.934595 0.495328 0.024257 0.240450 0.239965 0.305027 0.094878 0.526069 0.074025 0.418442 0.196237 0.158323 0.226998 0.336713 0.220452 0.191155 0.251680 0.192296 0.300342 0.169047 0.338315 0.240387 0.144634 0.128513 0.486465 0.290763 0.271259 0.116600 0.321377 0.224825 0.296233 0.229255 0.249687 0.493240 0.171285 0.075148 0.260326 Consensus sequence: HHBDHDDAACAATDRHHHHHBW Reverse complement motif 0.260326 0.171285 0.075148 0.493240 0.224825 0.229255 0.296233 0.249687 0.321377 0.271259 0.116600 0.290763 0.486465 0.144634 0.128513 0.240387 0.338315 0.300342 0.169047 0.192296 0.251680 0.220452 0.191155 0.336713 0.226998 0.196237 0.158323 0.418442 0.305027 0.526069 0.094878 0.074025 0.239965 0.024257 0.240450 0.495328 0.934595 0.003649 0.002189 0.059567 0.004992 0.001846 0.006976 0.986185 0.014697 0.002062 0.002161 0.981080 0.004516 0.008092 0.954596 0.032796 0.031997 0.001826 0.002456 0.963721 0.076159 0.038475 0.093390 0.791976 0.364301 0.370406 0.074356 0.190936 0.274393 0.070776 0.211081 0.443749 0.300626 0.174184 0.130641 0.394549 0.248133 0.095791 0.276373 0.379704 0.433558 0.176868 0.240155 0.149419 0.295589 0.228429 0.166233 0.309749 0.223177 0.300272 0.115555 0.360997 Consensus sequence: WBHHHHHMDATTGTTHDHDVHH Alignment: HHBDHDDAACAATDRHHHHHBW ---WWMAAABWWWVAAAAWW-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00077 Srf_secondary Original Motif Original Motif Forward 1 17 0.049684 Species: Mus musculus Original motif 0.162968 0.284828 0.440984 0.111220 0.151392 0.200635 0.205316 0.442657 0.267215 0.083669 0.192498 0.456618 0.332771 0.180711 0.200027 0.286491 0.509370 0.102954 0.242569 0.145107 0.666262 0.077309 0.154466 0.101962 0.737968 0.113335 0.100401 0.048296 0.658878 0.141580 0.134033 0.065510 0.766115 0.094051 0.069763 0.070072 0.755621 0.088491 0.044802 0.111086 0.749083 0.135917 0.047510 0.067490 0.663231 0.176795 0.028134 0.131839 0.553358 0.277659 0.038655 0.130328 0.392578 0.314083 0.209844 0.083495 0.198462 0.237132 0.239466 0.324940 0.275121 0.210087 0.194779 0.320013 0.287748 0.277395 0.142704 0.292154 Consensus sequence: VBDDAAAAAAAAMVBHH Reverse complement motif 0.292154 0.277395 0.142704 0.287748 0.320013 0.210087 0.194779 0.275121 0.324940 0.237132 0.239466 0.198462 0.083495 0.314083 0.209844 0.392578 0.130328 0.277659 0.038655 0.553358 0.131839 0.176795 0.028134 0.663231 0.067490 0.135917 0.047510 0.749083 0.111086 0.088491 0.044802 0.755621 0.070072 0.094051 0.069763 0.766115 0.065510 0.141580 0.134033 0.658878 0.048296 0.113335 0.100401 0.737968 0.101962 0.077309 0.154466 0.666262 0.145107 0.102954 0.242569 0.509370 0.286491 0.180711 0.200027 0.332771 0.456618 0.083669 0.192498 0.267215 0.442657 0.200635 0.205316 0.151392 0.162968 0.440984 0.284828 0.111220 Consensus sequence: HHVBYTTTTTTTTDDVV Alignment: VBDDAAAAAAAAMVBHH WWMAAABWWWVAAAAWW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00255 Dbx1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 17 0.050958 Species: Mus musculus Original motif 0.193358 0.228955 0.160692 0.416995 0.611960 0.068099 0.048494 0.271446 0.459770 0.057385 0.307824 0.175021 0.226103 0.127408 0.101076 0.545413 0.241226 0.228640 0.067165 0.462969 0.621421 0.137382 0.078412 0.162785 0.737972 0.031899 0.051833 0.178295 0.110802 0.098497 0.073668 0.717033 0.129567 0.110629 0.036048 0.723756 0.729342 0.031636 0.088480 0.150541 0.540257 0.104927 0.048065 0.306750 0.195987 0.148698 0.098709 0.556606 0.587529 0.072583 0.170635 0.169252 0.497416 0.161804 0.219409 0.121371 0.278831 0.114362 0.139037 0.467771 0.297462 0.189119 0.187754 0.325665 0.397268 0.140582 0.287428 0.174722 Consensus sequence: HARTHAATTAWTAVDHD Reverse complement motif 0.174722 0.140582 0.287428 0.397268 0.325665 0.189119 0.187754 0.297462 0.467771 0.114362 0.139037 0.278831 0.121371 0.161804 0.219409 0.497416 0.169252 0.072583 0.170635 0.587529 0.556606 0.148698 0.098709 0.195987 0.306750 0.104927 0.048065 0.540257 0.150541 0.031636 0.088480 0.729342 0.723756 0.110629 0.036048 0.129567 0.717033 0.098497 0.073668 0.110802 0.178295 0.031899 0.051833 0.737972 0.162785 0.137382 0.078412 0.621421 0.462969 0.228640 0.067165 0.241226 0.545413 0.127408 0.101076 0.226103 0.175021 0.057385 0.307824 0.459770 0.271446 0.068099 0.048494 0.611960 0.416995 0.228955 0.160692 0.193358 Consensus sequence: DHDBTAWTAATTHAKTH Alignment: DHDBTAWTAATTHAKTH WWTTTTVWWWBTTTYWW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00090 Elf3_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 1 17 0.053282 Species: Mus musculus Original motif 0.155083 0.152982 0.490906 0.201030 0.123195 0.312681 0.220770 0.343354 0.110252 0.131358 0.153983 0.604406 0.216489 0.490160 0.101348 0.192003 0.396130 0.292429 0.103252 0.208189 0.634770 0.070898 0.070668 0.223664 0.667102 0.099915 0.067576 0.165407 0.625495 0.095579 0.039353 0.239573 0.717478 0.093228 0.024737 0.164558 0.729965 0.048628 0.024557 0.196850 0.670909 0.118718 0.043692 0.166681 0.689441 0.050145 0.038829 0.221584 0.506735 0.159498 0.095635 0.238132 0.406093 0.298915 0.149902 0.145090 0.193913 0.282078 0.096706 0.427303 0.272324 0.154790 0.262469 0.310417 0.224484 0.458724 0.060144 0.256647 Consensus sequence: DBTHHAAAAAAAAVHDH Reverse complement motif 0.224484 0.060144 0.458724 0.256647 0.310417 0.154790 0.262469 0.272324 0.427303 0.282078 0.096706 0.193913 0.145090 0.298915 0.149902 0.406093 0.238132 0.159498 0.095635 0.506735 0.221584 0.050145 0.038829 0.689441 0.166681 0.118718 0.043692 0.670909 0.196850 0.048628 0.024557 0.729965 0.164558 0.093228 0.024737 0.717478 0.239573 0.095579 0.039353 0.625495 0.165407 0.099915 0.067576 0.667102 0.223664 0.070898 0.070668 0.634770 0.208189 0.292429 0.103252 0.396130 0.216489 0.101348 0.490160 0.192003 0.604406 0.131358 0.153983 0.110252 0.343354 0.312681 0.220770 0.123195 0.155083 0.490906 0.152982 0.201030 Consensus sequence: DDHBTTTTTTTTHDAVH Alignment: DBTHHAAAAAAAAVHDH WWMAAABWWWVAAAAWW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00037 Zfp105_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 1 17 0.053560 Species: Mus musculus Original motif 0.266678 0.210793 0.270357 0.252172 0.060513 0.387388 0.139940 0.412159 0.129835 0.094669 0.581455 0.194041 0.222891 0.216518 0.374389 0.186202 0.051470 0.183173 0.261264 0.504093 0.033295 0.098623 0.075218 0.792864 0.159222 0.757734 0.066213 0.016831 0.909619 0.041577 0.030716 0.018087 0.790897 0.139370 0.044203 0.025531 0.016549 0.121838 0.111434 0.750178 0.747907 0.043147 0.179106 0.029840 0.696917 0.099750 0.098316 0.105017 0.132206 0.270741 0.232896 0.364158 0.140809 0.132229 0.164933 0.562029 0.054822 0.313780 0.179755 0.451644 0.144402 0.139143 0.255283 0.461171 0.263219 0.160957 0.382446 0.193379 Consensus sequence: DYGVKTCAATAABTYDD Reverse complement motif 0.263219 0.382446 0.160957 0.193379 0.461171 0.139143 0.255283 0.144402 0.451644 0.313780 0.179755 0.054822 0.562029 0.132229 0.164933 0.140809 0.364158 0.270741 0.232896 0.132206 0.105017 0.099750 0.098316 0.696917 0.029840 0.043147 0.179106 0.747907 0.750178 0.121838 0.111434 0.016549 0.025531 0.139370 0.044203 0.790897 0.018087 0.041577 0.030716 0.909619 0.159222 0.066213 0.757734 0.016831 0.792864 0.098623 0.075218 0.033295 0.504093 0.183173 0.261264 0.051470 0.222891 0.374389 0.216518 0.186202 0.129835 0.581455 0.094669 0.194041 0.412159 0.387388 0.139940 0.060513 0.266678 0.270357 0.210793 0.252172 Consensus sequence: HDMAVTTATTGARVCMH Alignment: HDMAVTTATTGARVCMH WWMAAABWWWVAAAAWW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 140 Motif name: C140 Original motif 0.010000 0.480000 0.240000 0.270000 0.010000 0.320000 0.450000 0.220000 0.010000 0.650000 0.220000 0.120000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.020000 0.390000 0.350000 0.240000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.252525 0.333333 0.313131 0.101010 0.010000 0.370000 0.600000 0.020000 0.010000 0.440000 0.510000 0.040000 0.020000 0.540000 0.340000 0.100000 0.090909 0.252525 0.404040 0.252525 0.010000 0.800000 0.180000 0.010000 0.010000 0.930000 0.050000 0.010000 0.180000 0.370000 0.060000 0.390000 0.270000 0.320000 0.180000 0.230000 0.240000 0.420000 0.280000 0.060000 0.250000 0.220000 0.520000 0.010000 Consensus sequence: BSCCBCVSSSBCCYHVG Reserve complement motif 0.250000 0.520000 0.220000 0.010000 0.240000 0.280000 0.420000 0.060000 0.270000 0.180000 0.320000 0.230000 0.390000 0.370000 0.060000 0.180000 0.010000 0.050000 0.930000 0.010000 0.010000 0.180000 0.800000 0.010000 0.090909 0.404040 0.252525 0.252525 0.020000 0.340000 0.540000 0.100000 0.010000 0.510000 0.440000 0.040000 0.010000 0.600000 0.370000 0.020000 0.252525 0.313131 0.333333 0.101010 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.020000 0.350000 0.390000 0.240000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.220000 0.650000 0.120000 0.010000 0.450000 0.320000 0.220000 0.010000 0.240000 0.480000 0.270000 Consensus sequence: CVDMGGBSSSVGBGGSB ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 140 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 1 17 0.051010 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH BSCCBCVSSSBCCYHVG----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00400 Zif268 Reverse Complement Reverse Complement Backward 5 17 0.052062 Species: Mus musculus Original motif 0.104824 0.412716 0.254506 0.227955 0.644922 0.065476 0.140479 0.149122 0.201205 0.166164 0.347131 0.285501 0.360606 0.256316 0.150766 0.232313 0.199831 0.240681 0.279350 0.280137 0.234308 0.204076 0.321306 0.240310 0.274112 0.462435 0.111425 0.152028 0.067070 0.717501 0.073934 0.141496 0.106745 0.084442 0.658566 0.150247 0.025128 0.967053 0.003585 0.004234 0.006412 0.982989 0.003227 0.007371 0.009588 0.877620 0.002571 0.110221 0.621521 0.355443 0.015669 0.007366 0.002600 0.980275 0.004191 0.012934 0.118773 0.026658 0.783843 0.070725 0.022358 0.822101 0.024684 0.130857 0.713212 0.080912 0.128793 0.077084 0.166568 0.250955 0.107934 0.474544 0.225040 0.222494 0.163301 0.389166 0.268976 0.223206 0.265314 0.242504 0.137052 0.229058 0.148439 0.485451 0.135819 0.304550 0.141994 0.417637 0.272440 0.319501 0.230580 0.177478 Consensus sequence: BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV Reverse complement motif 0.272440 0.230580 0.319501 0.177478 0.417637 0.304550 0.141994 0.135819 0.485451 0.229058 0.148439 0.137052 0.242504 0.223206 0.265314 0.268976 0.389166 0.222494 0.163301 0.225040 0.474544 0.250955 0.107934 0.166568 0.077084 0.080912 0.128793 0.713212 0.022358 0.024684 0.822101 0.130857 0.118773 0.783843 0.026658 0.070725 0.002600 0.004191 0.980275 0.012934 0.007366 0.355443 0.015669 0.621521 0.009588 0.002571 0.877620 0.110221 0.006412 0.003227 0.982989 0.007371 0.025128 0.003585 0.967053 0.004234 0.106745 0.658566 0.084442 0.150247 0.067070 0.073934 0.717501 0.141496 0.274112 0.111425 0.462435 0.152028 0.234308 0.321306 0.204076 0.240310 0.280137 0.240681 0.279350 0.199831 0.232313 0.256316 0.150766 0.360606 0.201205 0.347131 0.166164 0.285501 0.149122 0.065476 0.140479 0.644922 0.104824 0.254506 0.412716 0.227955 Consensus sequence: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB Alignment: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB --CVDMGGBSSSVGBGGSB---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00033 Zfp410_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 17 0.052397 Species: Mus musculus Original motif 0.162979 0.284781 0.237433 0.314807 0.182449 0.447584 0.069464 0.300502 0.298973 0.261014 0.213211 0.226802 0.136039 0.433062 0.144274 0.286625 0.180084 0.395933 0.158565 0.265418 0.069354 0.748510 0.068898 0.113238 0.060485 0.717828 0.075333 0.146354 0.023280 0.071762 0.645500 0.259457 0.166896 0.749762 0.062730 0.020612 0.050401 0.775248 0.089072 0.085279 0.103847 0.767557 0.068804 0.059791 0.064815 0.748318 0.114588 0.072280 0.340921 0.071942 0.242981 0.344157 0.301967 0.263512 0.165927 0.268594 0.479800 0.222955 0.118441 0.178803 0.229469 0.283621 0.143099 0.343811 0.261733 0.180191 0.169905 0.388170 Consensus sequence: BHHBHCCGCCCCDHHHH Reverse complement motif 0.388170 0.180191 0.169905 0.261733 0.343811 0.283621 0.143099 0.229469 0.178803 0.222955 0.118441 0.479800 0.268594 0.263512 0.165927 0.301967 0.344157 0.071942 0.242981 0.340921 0.064815 0.114588 0.748318 0.072280 0.103847 0.068804 0.767557 0.059791 0.050401 0.089072 0.775248 0.085279 0.166896 0.062730 0.749762 0.020612 0.023280 0.645500 0.071762 0.259457 0.060485 0.075333 0.717828 0.146354 0.069354 0.068898 0.748510 0.113238 0.180084 0.158565 0.395933 0.265418 0.136039 0.144274 0.433062 0.286625 0.226802 0.261014 0.213211 0.298973 0.182449 0.069464 0.447584 0.300502 0.314807 0.284781 0.237433 0.162979 Consensus sequence: HHHHDGGGGCGGDBHDV Alignment: BHHBHCCGCCCCDHHHH BSCCBCVSSSBCCYHVG ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 7 17 0.054436 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH ------BSCCBCVSSSBCCYHVG ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 3 17 0.058526 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV --CVDMGGBSSSVGBGGSB---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 141 Motif name: C141 Original motif 0.110000 0.430000 0.040000 0.420000 0.425743 0.485149 0.039604 0.049505 0.594059 0.069307 0.118812 0.217822 0.108911 0.009901 0.128713 0.752475 0.009901 0.871287 0.009901 0.108911 0.009901 0.871287 0.009901 0.108911 0.029703 0.405941 0.049505 0.514851 0.455446 0.009901 0.455446 0.079208 0.030000 0.410000 0.460000 0.100000 0.040000 0.380000 0.060000 0.520000 0.495050 0.069307 0.425743 0.009901 0.010000 0.820000 0.010000 0.160000 0.010000 0.190000 0.010000 0.790000 0.010000 0.010000 0.220000 0.760000 0.010000 0.230000 0.750000 0.010000 0.030000 0.110000 0.470000 0.390000 0.470000 0.010000 0.450000 0.070000 Consensus sequence: YMATCCYRSYRCTTGKR Reserve complement motif 0.070000 0.010000 0.450000 0.470000 0.030000 0.470000 0.110000 0.390000 0.010000 0.750000 0.230000 0.010000 0.760000 0.010000 0.220000 0.010000 0.790000 0.190000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.820000 0.160000 0.009901 0.069307 0.425743 0.495050 0.520000 0.380000 0.060000 0.040000 0.030000 0.460000 0.410000 0.100000 0.079208 0.009901 0.455446 0.455446 0.514851 0.405941 0.049505 0.029703 0.009901 0.009901 0.871287 0.108911 0.009901 0.009901 0.871287 0.108911 0.752475 0.009901 0.128713 0.108911 0.217822 0.069307 0.118812 0.594059 0.425743 0.039604 0.485149 0.049505 0.110000 0.040000 0.430000 0.420000 Consensus sequence: KYCAAGKMSKMGGATRK ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 141 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00527 Foxn4_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 2 17 0.048695 Species: Mus musculus Original motif 0.298336 0.418632 0.208054 0.074978 0.289907 0.015608 0.457100 0.237385 0.273583 0.077889 0.107860 0.540668 0.184954 0.161611 0.384390 0.269045 0.521826 0.156340 0.089019 0.232815 0.356716 0.131104 0.394857 0.117323 0.266669 0.108765 0.505273 0.119293 0.020778 0.047199 0.919524 0.012500 0.948536 0.018775 0.008113 0.024576 0.010822 0.964042 0.014701 0.010434 0.007428 0.019505 0.966351 0.006717 0.010025 0.975678 0.008648 0.005649 0.043796 0.120935 0.742979 0.092289 0.008252 0.250704 0.541132 0.199913 0.474428 0.044681 0.134430 0.346461 0.146597 0.421317 0.143166 0.288920 0.020540 0.181479 0.553811 0.244170 0.129612 0.173360 0.535219 0.161808 0.506084 0.158156 0.130983 0.204776 0.054872 0.103043 0.545792 0.296293 0.389882 0.171037 0.164162 0.274918 0.225861 0.314031 0.288872 0.171237 Consensus sequence: VDWDARRGACGCGGWHGGAKHV Reverse complement motif 0.225861 0.288872 0.314031 0.171237 0.274918 0.171037 0.164162 0.389882 0.054872 0.545792 0.103043 0.296293 0.204776 0.158156 0.130983 0.506084 0.129612 0.535219 0.173360 0.161808 0.020540 0.553811 0.181479 0.244170 0.146597 0.143166 0.421317 0.288920 0.346461 0.044681 0.134430 0.474428 0.008252 0.541132 0.250704 0.199913 0.043796 0.742979 0.120935 0.092289 0.010025 0.008648 0.975678 0.005649 0.007428 0.966351 0.019505 0.006717 0.010822 0.014701 0.964042 0.010434 0.024576 0.018775 0.008113 0.948536 0.020778 0.919524 0.047199 0.012500 0.266669 0.505273 0.108765 0.119293 0.356716 0.394857 0.131104 0.117323 0.232815 0.156340 0.089019 0.521826 0.184954 0.384390 0.161611 0.269045 0.540668 0.077889 0.107860 0.273583 0.289907 0.457100 0.015608 0.237385 0.298336 0.208054 0.418632 0.074978 Consensus sequence: VHYTCCDWCCGCGTCMMTHWHV Alignment: VDWDARRGACGCGGWHGGAKHV -KYCAAGKMSKMGGATRK---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00526 Foxn1_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 3 17 0.053338 Species: Mus musculus Original motif 0.477863 0.106306 0.184102 0.231729 0.304951 0.149020 0.361418 0.184612 0.548996 0.056128 0.348902 0.045974 0.385727 0.477782 0.086218 0.050273 0.409556 0.232265 0.173851 0.184328 0.174550 0.312880 0.307123 0.205448 0.850398 0.047204 0.041665 0.060734 0.141234 0.548534 0.142230 0.168002 0.059462 0.026354 0.892948 0.021236 0.053714 0.870297 0.028935 0.047055 0.086273 0.069147 0.805284 0.039296 0.033781 0.573881 0.034115 0.358223 0.035191 0.079663 0.824970 0.060176 0.051830 0.862631 0.019359 0.066180 0.178685 0.015738 0.762485 0.043092 0.058988 0.042615 0.017608 0.880789 0.202382 0.173360 0.284095 0.340163 0.098493 0.234651 0.506524 0.160333 0.109087 0.336204 0.250510 0.304198 0.130945 0.250843 0.177122 0.441090 0.353830 0.138838 0.162784 0.344548 0.114290 0.417163 0.160662 0.307885 Consensus sequence: DDRMHBACGCGYGCGTDGBBDB Reverse complement motif 0.114290 0.160662 0.417163 0.307885 0.344548 0.138838 0.162784 0.353830 0.441090 0.250843 0.177122 0.130945 0.109087 0.250510 0.336204 0.304198 0.098493 0.506524 0.234651 0.160333 0.340163 0.173360 0.284095 0.202382 0.880789 0.042615 0.017608 0.058988 0.178685 0.762485 0.015738 0.043092 0.051830 0.019359 0.862631 0.066180 0.035191 0.824970 0.079663 0.060176 0.033781 0.034115 0.573881 0.358223 0.086273 0.805284 0.069147 0.039296 0.053714 0.028935 0.870297 0.047055 0.059462 0.892948 0.026354 0.021236 0.141234 0.142230 0.548534 0.168002 0.060734 0.047204 0.041665 0.850398 0.174550 0.307123 0.312880 0.205448 0.184328 0.232265 0.173851 0.409556 0.385727 0.086218 0.477782 0.050273 0.045974 0.056128 0.348902 0.548996 0.304951 0.361418 0.149020 0.184612 0.231729 0.106306 0.184102 0.477863 Consensus sequence: BDVBCDACGCKCGCGTBHRKHD Alignment: BDVBCDACGCKCGCGTBHRKHD ---KYCAAGKMSKMGGATRK-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00033 Zfp410_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 17 0.054067 Species: Mus musculus Original motif 0.162979 0.284781 0.237433 0.314807 0.182449 0.447584 0.069464 0.300502 0.298973 0.261014 0.213211 0.226802 0.136039 0.433062 0.144274 0.286625 0.180084 0.395933 0.158565 0.265418 0.069354 0.748510 0.068898 0.113238 0.060485 0.717828 0.075333 0.146354 0.023280 0.071762 0.645500 0.259457 0.166896 0.749762 0.062730 0.020612 0.050401 0.775248 0.089072 0.085279 0.103847 0.767557 0.068804 0.059791 0.064815 0.748318 0.114588 0.072280 0.340921 0.071942 0.242981 0.344157 0.301967 0.263512 0.165927 0.268594 0.479800 0.222955 0.118441 0.178803 0.229469 0.283621 0.143099 0.343811 0.261733 0.180191 0.169905 0.388170 Consensus sequence: BHHBHCCGCCCCDHHHH Reverse complement motif 0.388170 0.180191 0.169905 0.261733 0.343811 0.283621 0.143099 0.229469 0.178803 0.222955 0.118441 0.479800 0.268594 0.263512 0.165927 0.301967 0.344157 0.071942 0.242981 0.340921 0.064815 0.114588 0.748318 0.072280 0.103847 0.068804 0.767557 0.059791 0.050401 0.089072 0.775248 0.085279 0.166896 0.062730 0.749762 0.020612 0.023280 0.645500 0.071762 0.259457 0.060485 0.075333 0.717828 0.146354 0.069354 0.068898 0.748510 0.113238 0.180084 0.158565 0.395933 0.265418 0.136039 0.144274 0.433062 0.286625 0.226802 0.261014 0.213211 0.298973 0.182449 0.069464 0.447584 0.300502 0.314807 0.284781 0.237433 0.162979 Consensus sequence: HHHHDGGGGCGGDBHDV Alignment: BHHBHCCGCCCCDHHHH YMATCCYRSYRCTTGKR ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00526 Foxn1_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 17 0.055888 Species: Mus musculus Original motif 0.456612 0.057181 0.078281 0.407926 0.460529 0.185506 0.083106 0.270859 0.445717 0.179510 0.239355 0.135417 0.116339 0.145186 0.275331 0.463144 0.239398 0.142078 0.480004 0.138520 0.355157 0.217877 0.284296 0.142670 0.318602 0.444835 0.153321 0.083243 0.609569 0.055866 0.280349 0.054216 0.062297 0.769824 0.027844 0.140035 0.151868 0.019245 0.803188 0.025699 0.011842 0.952534 0.017959 0.017665 0.017665 0.017959 0.952534 0.011842 0.025699 0.803188 0.019245 0.151868 0.140035 0.027844 0.769824 0.062297 0.054216 0.280349 0.055866 0.609569 0.013084 0.624655 0.177956 0.184305 0.287647 0.183527 0.295753 0.233074 0.042309 0.345931 0.198458 0.413301 0.338138 0.266033 0.045367 0.350462 0.302850 0.155320 0.074662 0.467168 0.240926 0.068901 0.283055 0.407118 0.409954 0.183157 0.154186 0.252704 Consensus sequence: WHVBVVMACGCGCGTCDYHWDH Reverse complement motif 0.252704 0.183157 0.154186 0.409954 0.407118 0.068901 0.283055 0.240926 0.467168 0.155320 0.074662 0.302850 0.350462 0.266033 0.045367 0.338138 0.413301 0.345931 0.198458 0.042309 0.287647 0.295753 0.183527 0.233074 0.013084 0.177956 0.624655 0.184305 0.609569 0.280349 0.055866 0.054216 0.140035 0.769824 0.027844 0.062297 0.025699 0.019245 0.803188 0.151868 0.017665 0.952534 0.017959 0.011842 0.011842 0.017959 0.952534 0.017665 0.151868 0.803188 0.019245 0.025699 0.062297 0.027844 0.769824 0.140035 0.054216 0.055866 0.280349 0.609569 0.318602 0.153321 0.444835 0.083243 0.142670 0.217877 0.284296 0.355157 0.239398 0.480004 0.142078 0.138520 0.463144 0.145186 0.275331 0.116339 0.135417 0.179510 0.239355 0.445717 0.270859 0.185506 0.083106 0.460529 0.407926 0.057181 0.078281 0.456612 Consensus sequence: HDWHMHGACGCGCGTRBVVBHW Alignment: HDWHMHGACGCGCGTRBVVBHW KYCAAGKMSKMGGATRK----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00002 Sp4_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 17 0.056207 Species: Mus musculus Original motif 0.155386 0.223380 0.374454 0.246780 0.247106 0.159582 0.345111 0.248201 0.238889 0.258354 0.165304 0.337454 0.255612 0.489586 0.051621 0.203182 0.450100 0.545383 0.001071 0.003447 0.003704 0.991007 0.002456 0.002833 0.035504 0.001814 0.928129 0.034553 0.001494 0.991406 0.003414 0.003686 0.003045 0.990628 0.005182 0.001145 0.000990 0.963237 0.001215 0.034557 0.148016 0.838396 0.000666 0.012922 0.014261 0.905847 0.007200 0.072692 0.083394 0.270068 0.058368 0.588170 0.149141 0.286783 0.142802 0.421274 0.204851 0.347195 0.253356 0.194597 0.184442 0.299908 0.194408 0.321242 0.125793 0.380109 0.245318 0.248780 Consensus sequence: BDHHMCGCCCCCTHVBB Reverse complement motif 0.125793 0.245318 0.380109 0.248780 0.321242 0.299908 0.194408 0.184442 0.204851 0.253356 0.347195 0.194597 0.421274 0.286783 0.142802 0.149141 0.588170 0.270068 0.058368 0.083394 0.014261 0.007200 0.905847 0.072692 0.148016 0.000666 0.838396 0.012922 0.000990 0.001215 0.963237 0.034557 0.003045 0.005182 0.990628 0.001145 0.001494 0.003414 0.991406 0.003686 0.035504 0.928129 0.001814 0.034553 0.003704 0.002456 0.991007 0.002833 0.450100 0.001071 0.545383 0.003447 0.255612 0.051621 0.489586 0.203182 0.337454 0.258354 0.165304 0.238889 0.247106 0.345111 0.159582 0.248201 0.155386 0.374454 0.223380 0.246780 Consensus sequence: BVVHAGGGGGCGRDHHB Alignment: BVVHAGGGGGCGRDHHB KYCAAGKMSKMGGATRK ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 142 Motif name: C142 Original motif 0.400000 0.020000 0.100000 0.480000 0.400000 0.290000 0.050000 0.260000 0.732673 0.009901 0.138614 0.118812 0.693069 0.178218 0.118812 0.009901 0.881188 0.009901 0.099010 0.009901 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.540000 0.180000 0.010000 0.270000 0.356436 0.099010 0.049505 0.495050 0.280000 0.010000 0.020000 0.690000 0.650000 0.080000 0.260000 0.010000 0.700000 0.030000 0.260000 0.010000 0.620000 0.060000 0.310000 0.010000 0.650000 0.090000 0.250000 0.010000 0.297030 0.069307 0.108911 0.524752 0.356436 0.099010 0.069307 0.475248 Consensus sequence: WHAAAAAWTAAAAWW Reserve complement motif 0.475248 0.099010 0.069307 0.356436 0.524752 0.069307 0.108911 0.297030 0.010000 0.090000 0.250000 0.650000 0.010000 0.060000 0.310000 0.620000 0.010000 0.030000 0.260000 0.700000 0.010000 0.080000 0.260000 0.650000 0.690000 0.010000 0.020000 0.280000 0.495050 0.099010 0.049505 0.356436 0.270000 0.180000 0.010000 0.540000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.009901 0.009901 0.099010 0.881188 0.009901 0.178218 0.118812 0.693069 0.118812 0.009901 0.138614 0.732673 0.260000 0.290000 0.050000 0.400000 0.480000 0.020000 0.100000 0.400000 Consensus sequence: WWTTTTAWTTTTTHW ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 142 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00077 Srf_secondary Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 15 0.020994 Species: Mus musculus Original motif 0.162968 0.284828 0.440984 0.111220 0.151392 0.200635 0.205316 0.442657 0.267215 0.083669 0.192498 0.456618 0.332771 0.180711 0.200027 0.286491 0.509370 0.102954 0.242569 0.145107 0.666262 0.077309 0.154466 0.101962 0.737968 0.113335 0.100401 0.048296 0.658878 0.141580 0.134033 0.065510 0.766115 0.094051 0.069763 0.070072 0.755621 0.088491 0.044802 0.111086 0.749083 0.135917 0.047510 0.067490 0.663231 0.176795 0.028134 0.131839 0.553358 0.277659 0.038655 0.130328 0.392578 0.314083 0.209844 0.083495 0.198462 0.237132 0.239466 0.324940 0.275121 0.210087 0.194779 0.320013 0.287748 0.277395 0.142704 0.292154 Consensus sequence: VBDDAAAAAAAAMVBHH Reverse complement motif 0.292154 0.277395 0.142704 0.287748 0.320013 0.210087 0.194779 0.275121 0.324940 0.237132 0.239466 0.198462 0.083495 0.314083 0.209844 0.392578 0.130328 0.277659 0.038655 0.553358 0.131839 0.176795 0.028134 0.663231 0.067490 0.135917 0.047510 0.749083 0.111086 0.088491 0.044802 0.755621 0.070072 0.094051 0.069763 0.766115 0.065510 0.141580 0.134033 0.658878 0.048296 0.113335 0.100401 0.737968 0.101962 0.077309 0.154466 0.666262 0.145107 0.102954 0.242569 0.509370 0.286491 0.180711 0.200027 0.332771 0.456618 0.083669 0.192498 0.267215 0.442657 0.200635 0.205316 0.151392 0.162968 0.440984 0.284828 0.111220 Consensus sequence: HHVBYTTTTTTTTDDVV Alignment: HHVBYTTTTTTTTDDVV WWTTTTAWTTTTTHW-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00255 Dbx1 Original Motif Original Motif Backward 3 15 0.029649 Species: Mus musculus Original motif 0.193358 0.228955 0.160692 0.416995 0.611960 0.068099 0.048494 0.271446 0.459770 0.057385 0.307824 0.175021 0.226103 0.127408 0.101076 0.545413 0.241226 0.228640 0.067165 0.462969 0.621421 0.137382 0.078412 0.162785 0.737972 0.031899 0.051833 0.178295 0.110802 0.098497 0.073668 0.717033 0.129567 0.110629 0.036048 0.723756 0.729342 0.031636 0.088480 0.150541 0.540257 0.104927 0.048065 0.306750 0.195987 0.148698 0.098709 0.556606 0.587529 0.072583 0.170635 0.169252 0.497416 0.161804 0.219409 0.121371 0.278831 0.114362 0.139037 0.467771 0.297462 0.189119 0.187754 0.325665 0.397268 0.140582 0.287428 0.174722 Consensus sequence: HARTHAATTAWTAVDHD Reverse complement motif 0.174722 0.140582 0.287428 0.397268 0.325665 0.189119 0.187754 0.297462 0.467771 0.114362 0.139037 0.278831 0.121371 0.161804 0.219409 0.497416 0.169252 0.072583 0.170635 0.587529 0.556606 0.148698 0.098709 0.195987 0.306750 0.104927 0.048065 0.540257 0.150541 0.031636 0.088480 0.729342 0.723756 0.110629 0.036048 0.129567 0.717033 0.098497 0.073668 0.110802 0.178295 0.031899 0.051833 0.737972 0.162785 0.137382 0.078412 0.621421 0.462969 0.228640 0.067165 0.241226 0.545413 0.127408 0.101076 0.226103 0.175021 0.057385 0.307824 0.459770 0.271446 0.068099 0.048494 0.611960 0.416995 0.228955 0.160692 0.193358 Consensus sequence: DHDBTAWTAATTHAKTH Alignment: HARTHAATTAWTAVDHD WHAAAAAWTAAAAWW-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00044 Mafk_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 1 15 0.029813 Species: Mus musculus Original motif 0.289934 0.244974 0.342021 0.123071 0.317105 0.250774 0.206169 0.225952 0.589909 0.146264 0.176464 0.087364 0.805648 0.031025 0.116712 0.046614 0.859239 0.012630 0.068740 0.059391 0.877855 0.017270 0.013520 0.091354 0.822443 0.051458 0.029433 0.096666 0.175032 0.076822 0.256419 0.491726 0.028231 0.131221 0.031440 0.809107 0.050608 0.039418 0.847824 0.062150 0.041983 0.868232 0.042708 0.047077 0.757931 0.111841 0.090214 0.040013 0.451956 0.283644 0.033652 0.230747 0.058765 0.285975 0.414514 0.240747 0.391919 0.133805 0.407813 0.066464 Consensus sequence: VHAAAAADTGCAHBR Reverse complement motif 0.391919 0.407813 0.133805 0.066464 0.058765 0.414514 0.285975 0.240747 0.230747 0.283644 0.033652 0.451956 0.040013 0.111841 0.090214 0.757931 0.041983 0.042708 0.868232 0.047077 0.050608 0.847824 0.039418 0.062150 0.809107 0.131221 0.031440 0.028231 0.491726 0.076822 0.256419 0.175032 0.096666 0.051458 0.029433 0.822443 0.091354 0.017270 0.013520 0.877855 0.059391 0.012630 0.068740 0.859239 0.046614 0.031025 0.116712 0.805648 0.087364 0.146264 0.176464 0.589909 0.225952 0.250774 0.206169 0.317105 0.289934 0.342021 0.244974 0.123071 Consensus sequence: MBHTGCADTTTTTHV Alignment: MBHTGCADTTTTTHV WWTTTTAWTTTTTHW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00090 Elf3_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 2 15 0.029820 Species: Mus musculus Original motif 0.155083 0.152982 0.490906 0.201030 0.123195 0.312681 0.220770 0.343354 0.110252 0.131358 0.153983 0.604406 0.216489 0.490160 0.101348 0.192003 0.396130 0.292429 0.103252 0.208189 0.634770 0.070898 0.070668 0.223664 0.667102 0.099915 0.067576 0.165407 0.625495 0.095579 0.039353 0.239573 0.717478 0.093228 0.024737 0.164558 0.729965 0.048628 0.024557 0.196850 0.670909 0.118718 0.043692 0.166681 0.689441 0.050145 0.038829 0.221584 0.506735 0.159498 0.095635 0.238132 0.406093 0.298915 0.149902 0.145090 0.193913 0.282078 0.096706 0.427303 0.272324 0.154790 0.262469 0.310417 0.224484 0.458724 0.060144 0.256647 Consensus sequence: DBTHHAAAAAAAAVHDH Reverse complement motif 0.224484 0.060144 0.458724 0.256647 0.310417 0.154790 0.262469 0.272324 0.427303 0.282078 0.096706 0.193913 0.145090 0.298915 0.149902 0.406093 0.238132 0.159498 0.095635 0.506735 0.221584 0.050145 0.038829 0.689441 0.166681 0.118718 0.043692 0.670909 0.196850 0.048628 0.024557 0.729965 0.164558 0.093228 0.024737 0.717478 0.239573 0.095579 0.039353 0.625495 0.165407 0.099915 0.067576 0.667102 0.223664 0.070898 0.070668 0.634770 0.208189 0.292429 0.103252 0.396130 0.216489 0.101348 0.490160 0.192003 0.604406 0.131358 0.153983 0.110252 0.343354 0.312681 0.220770 0.123195 0.155083 0.490906 0.152982 0.201030 Consensus sequence: DDHBTTTTTTTTHDAVH Alignment: DDHBTTTTTTTTHDAVH -WWTTTTAWTTTTTHW- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00037 Zfp105_primaryReverse Complement Reverse Complement Forward 1 15 0.033690 Species: Mus musculus Original motif 0.363104 0.182807 0.145232 0.308856 0.419707 0.133742 0.222546 0.224005 0.164481 0.418263 0.052397 0.364858 0.715575 0.117639 0.064914 0.101872 0.883836 0.026985 0.032584 0.056596 0.558797 0.151280 0.033120 0.256803 0.267037 0.403488 0.026746 0.302729 0.939762 0.013627 0.034579 0.012032 0.897072 0.009878 0.035642 0.057408 0.305904 0.516040 0.055311 0.122746 0.880940 0.027958 0.048350 0.042752 0.710082 0.052464 0.040250 0.197204 0.246712 0.125155 0.318627 0.309506 0.429749 0.181755 0.176892 0.211603 0.339643 0.097216 0.355250 0.207891 Consensus sequence: HDYAAAHAAMAADHD Reverse complement motif 0.339643 0.355250 0.097216 0.207891 0.211603 0.181755 0.176892 0.429749 0.246712 0.318627 0.125155 0.309506 0.197204 0.052464 0.040250 0.710082 0.042752 0.027958 0.048350 0.880940 0.305904 0.055311 0.516040 0.122746 0.057408 0.009878 0.035642 0.897072 0.012032 0.013627 0.034579 0.939762 0.267037 0.026746 0.403488 0.302729 0.256803 0.151280 0.033120 0.558797 0.056596 0.026985 0.032584 0.883836 0.101872 0.117639 0.064914 0.715575 0.164481 0.052397 0.418263 0.364858 0.224005 0.133742 0.222546 0.419707 0.308856 0.182807 0.145232 0.363104 Consensus sequence: HHHTTRTTDTTTKDH Alignment: HHHTTRTTDTTTKDH WWTTTTAWTTTTTHW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 143 Motif name: C143 Original motif 0.514851 0.465347 0.009901 0.009901 0.019802 0.009901 0.445545 0.524752 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.810000 0.170000 0.020000 0.770000 0.010000 0.200000 0.040000 0.010000 0.010000 0.940000 0.079208 0.009901 0.415842 0.495050 0.010000 0.470000 0.470000 0.050000 0.079208 0.495050 0.396040 0.029703 0.455446 0.445545 0.009901 0.089109 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.039604 0.059406 0.009901 0.891089 0.732673 0.059406 0.128713 0.079208 0.650000 0.220000 0.060000 0.070000 0.460000 0.470000 0.020000 0.050000 0.010000 0.010000 0.450000 0.530000 Consensus sequence: MKTGCTKSSMTTAAMK Reserve complement motif 0.530000 0.010000 0.450000 0.010000 0.460000 0.020000 0.470000 0.050000 0.070000 0.220000 0.060000 0.650000 0.079208 0.059406 0.128713 0.732673 0.891089 0.059406 0.009901 0.039604 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.089109 0.445545 0.009901 0.455446 0.079208 0.396040 0.495050 0.029703 0.010000 0.470000 0.470000 0.050000 0.495050 0.009901 0.415842 0.079208 0.940000 0.010000 0.010000 0.040000 0.020000 0.010000 0.770000 0.200000 0.010000 0.810000 0.010000 0.170000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.524752 0.009901 0.445545 0.019802 0.009901 0.465347 0.009901 0.514851 Consensus sequence: RRTTAAYSSRAGCARY ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 143 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00032 Gata3_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 4 16 0.043815 Species: Mus musculus Original motif 0.177641 0.319872 0.115137 0.387350 0.136644 0.182137 0.205873 0.475347 0.254263 0.244280 0.165207 0.336250 0.240415 0.207557 0.237497 0.314530 0.271041 0.214702 0.364395 0.149863 0.095475 0.320104 0.191738 0.392682 0.500902 0.142722 0.026556 0.329820 0.051221 0.023698 0.897245 0.027836 0.922410 0.027509 0.024058 0.026023 0.030735 0.070903 0.024248 0.874114 0.242120 0.231992 0.225143 0.300745 0.106956 0.220471 0.283490 0.389083 0.152079 0.165830 0.135066 0.547025 0.839205 0.051581 0.060119 0.049095 0.041204 0.069147 0.070830 0.818819 0.051861 0.848177 0.027599 0.072363 0.383793 0.016807 0.397470 0.201931 0.381899 0.215846 0.255908 0.146347 0.094792 0.358651 0.280905 0.265652 0.296132 0.181545 0.178433 0.343890 0.301997 0.254722 0.108566 0.334714 0.349481 0.270693 0.137507 0.242319 Consensus sequence: HBHDVBWGATHBTATCRVBHHH Reverse complement motif 0.242319 0.270693 0.137507 0.349481 0.334714 0.254722 0.108566 0.301997 0.343890 0.181545 0.178433 0.296132 0.094792 0.280905 0.358651 0.265652 0.146347 0.215846 0.255908 0.381899 0.383793 0.397470 0.016807 0.201931 0.051861 0.027599 0.848177 0.072363 0.818819 0.069147 0.070830 0.041204 0.049095 0.051581 0.060119 0.839205 0.547025 0.165830 0.135066 0.152079 0.389083 0.220471 0.283490 0.106956 0.300745 0.231992 0.225143 0.242120 0.874114 0.070903 0.024248 0.030735 0.026023 0.027509 0.024058 0.922410 0.051221 0.897245 0.023698 0.027836 0.329820 0.142722 0.026556 0.500902 0.392682 0.320104 0.191738 0.095475 0.271041 0.364395 0.214702 0.149863 0.314530 0.207557 0.237497 0.240415 0.336250 0.244280 0.165207 0.254263 0.475347 0.182137 0.205873 0.136644 0.387350 0.319872 0.115137 0.177641 Consensus sequence: HHHBBMGATAVHATCWVVDHVH Alignment: HBHDVBWGATHBTATCRVBHHH ---RRTTAAYSSRAGCARY--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00098 Rfx3_primary Reverse Complement Original Motif Backward 8 16 0.046085 Species: Mus musculus Original motif 0.218345 0.231533 0.152528 0.397594 0.264604 0.126115 0.320860 0.288421 0.117304 0.186844 0.172946 0.522906 0.111929 0.277908 0.409084 0.201079 0.343319 0.311376 0.123612 0.221692 0.193354 0.374280 0.157338 0.275028 0.166348 0.578991 0.130872 0.123789 0.006937 0.931183 0.046809 0.015072 0.255581 0.289587 0.125513 0.329319 0.002582 0.012615 0.002782 0.982021 0.850584 0.007973 0.140639 0.000803 0.037792 0.002285 0.957277 0.002646 0.009414 0.921481 0.001636 0.067469 0.943403 0.000980 0.042401 0.013216 0.991166 0.002931 0.003540 0.002364 0.003651 0.987110 0.001106 0.008133 0.208873 0.369705 0.319129 0.102292 0.322535 0.186617 0.374187 0.116660 0.326738 0.179486 0.226374 0.267402 0.299697 0.185329 0.133025 0.381949 0.300824 0.266836 0.096437 0.335904 0.418443 0.191068 0.127183 0.263306 0.386727 0.204062 0.126050 0.283161 Consensus sequence: HDTBHHCCHTAGCAACVVDHHHH Reverse complement motif 0.283161 0.204062 0.126050 0.386727 0.263306 0.191068 0.127183 0.418443 0.335904 0.266836 0.096437 0.300824 0.381949 0.185329 0.133025 0.299697 0.267402 0.179486 0.226374 0.326738 0.322535 0.374187 0.186617 0.116660 0.208873 0.319129 0.369705 0.102292 0.003651 0.001106 0.987110 0.008133 0.002364 0.002931 0.003540 0.991166 0.013216 0.000980 0.042401 0.943403 0.009414 0.001636 0.921481 0.067469 0.037792 0.957277 0.002285 0.002646 0.000803 0.007973 0.140639 0.850584 0.982021 0.012615 0.002782 0.002582 0.329319 0.289587 0.125513 0.255581 0.006937 0.046809 0.931183 0.015072 0.166348 0.130872 0.578991 0.123789 0.193354 0.157338 0.374280 0.275028 0.221692 0.311376 0.123612 0.343319 0.111929 0.409084 0.277908 0.201079 0.522906 0.186844 0.172946 0.117304 0.264604 0.320860 0.126115 0.288421 0.397594 0.231533 0.152528 0.218345 Consensus sequence: HHHHDVVGTTGCTAHGGDHBAHH Alignment: HDTBHHCCHTAGCAACVVDHHHH RRTTAAYSSRAGCARY------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00190 Nkx2-3 Original Motif Reverse Complement Forward 1 16 0.048536 Species: Mus musculus Original motif 0.112665 0.429746 0.074033 0.383556 0.100414 0.366064 0.135644 0.397877 0.083598 0.139792 0.093637 0.682973 0.157091 0.151456 0.101963 0.589490 0.804069 0.003353 0.166845 0.025733 0.880173 0.006767 0.091214 0.021845 0.009561 0.018555 0.963617 0.008268 0.001409 0.250669 0.002497 0.745425 0.745425 0.002497 0.250669 0.001409 0.008268 0.963617 0.018555 0.009561 0.021845 0.091214 0.006767 0.880173 0.025733 0.166845 0.003353 0.804069 0.534325 0.173500 0.200024 0.092151 0.581546 0.078557 0.226846 0.113051 0.210085 0.208523 0.190951 0.390441 0.231700 0.168938 0.404360 0.195002 Consensus sequence: YYTTAAGTACTTAAHD Reverse complement motif 0.231700 0.404360 0.168938 0.195002 0.390441 0.208523 0.190951 0.210085 0.113051 0.078557 0.226846 0.581546 0.092151 0.173500 0.200024 0.534325 0.804069 0.166845 0.003353 0.025733 0.880173 0.091214 0.006767 0.021845 0.008268 0.018555 0.963617 0.009561 0.001409 0.002497 0.250669 0.745425 0.745425 0.250669 0.002497 0.001409 0.009561 0.963617 0.018555 0.008268 0.021845 0.006767 0.091214 0.880173 0.025733 0.003353 0.166845 0.804069 0.589490 0.151456 0.101963 0.157091 0.682973 0.139792 0.093637 0.083598 0.397877 0.366064 0.135644 0.100414 0.112665 0.074033 0.429746 0.383556 Consensus sequence: HHTTAAGTACTTAAMK Alignment: HHTTAAGTACTTAAMK MKTGCTKSSMTTAAMK ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00421 Etv1 Reverse Complement Original Motif Backward 2 16 0.051393 Species: Mus musculus Original motif 0.481848 0.274378 0.165047 0.078727 0.153123 0.322109 0.385794 0.138974 0.257711 0.198309 0.118559 0.425422 0.102329 0.255032 0.373097 0.269542 0.655995 0.027594 0.168796 0.147615 0.012836 0.906067 0.077134 0.003962 0.079806 0.917232 0.002438 0.000524 0.005217 0.001765 0.991859 0.001159 0.001691 0.002097 0.993588 0.002624 0.991087 0.001016 0.001937 0.005961 0.751484 0.005147 0.002324 0.241044 0.112494 0.076460 0.805095 0.005951 0.012019 0.198497 0.022413 0.767071 0.482843 0.140306 0.249898 0.126953 0.298792 0.191769 0.286874 0.222565 0.395216 0.302575 0.172247 0.129961 0.364642 0.219734 0.190320 0.225304 Consensus sequence: MVHBACCGGAAGTVDVH Reverse complement motif 0.225304 0.219734 0.190320 0.364642 0.129961 0.302575 0.172247 0.395216 0.222565 0.191769 0.286874 0.298792 0.126953 0.140306 0.249898 0.482843 0.767071 0.198497 0.022413 0.012019 0.112494 0.805095 0.076460 0.005951 0.241044 0.005147 0.002324 0.751484 0.005961 0.001016 0.001937 0.991087 0.001691 0.993588 0.002097 0.002624 0.005217 0.991859 0.001765 0.001159 0.079806 0.002438 0.917232 0.000524 0.012836 0.077134 0.906067 0.003962 0.147615 0.027594 0.168796 0.655995 0.102329 0.373097 0.255032 0.269542 0.425422 0.198309 0.118559 0.257711 0.153123 0.385794 0.322109 0.138974 0.078727 0.274378 0.165047 0.481848 Consensus sequence: HBDBACTTCCGGTBHVY Alignment: MVHBACCGGAAGTVDVH RRTTAAYSSRAGCARY- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00410 Elk1 Reverse Complement Original Motif Forward 1 16 0.051952 Species: Mus musculus Original motif 0.430685 0.247184 0.200279 0.121853 0.170474 0.344859 0.320328 0.164339 0.289040 0.209865 0.151683 0.349412 0.153609 0.191266 0.230615 0.424510 0.717152 0.035619 0.128912 0.118318 0.015844 0.931939 0.044019 0.008198 0.074710 0.923143 0.001579 0.000568 0.005662 0.001876 0.991367 0.001095 0.002915 0.001618 0.993221 0.002246 0.986317 0.000532 0.001970 0.011180 0.891841 0.003746 0.000912 0.103501 0.077493 0.231881 0.682573 0.008053 0.012287 0.247896 0.024535 0.715282 0.291287 0.134464 0.256360 0.317889 0.223530 0.285605 0.253558 0.237306 0.373509 0.307981 0.133817 0.184693 0.294043 0.208400 0.267829 0.229728 Consensus sequence: VVHBACCGGAAGTDBHD Reverse complement motif 0.229728 0.208400 0.267829 0.294043 0.184693 0.307981 0.133817 0.373509 0.223530 0.253558 0.285605 0.237306 0.317889 0.134464 0.256360 0.291287 0.715282 0.247896 0.024535 0.012287 0.077493 0.682573 0.231881 0.008053 0.103501 0.003746 0.000912 0.891841 0.011180 0.000532 0.001970 0.986317 0.002915 0.993221 0.001618 0.002246 0.005662 0.991367 0.001876 0.001095 0.074710 0.001579 0.923143 0.000568 0.015844 0.044019 0.931939 0.008198 0.118318 0.035619 0.128912 0.717152 0.424510 0.191266 0.230615 0.153609 0.349412 0.209865 0.151683 0.289040 0.170474 0.320328 0.344859 0.164339 0.121853 0.247184 0.200279 0.430685 Consensus sequence: DHBDACTTCCGGTVHVB Alignment: VVHBACCGGAAGTDBHD RRTTAAYSSRAGCARY- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 144 Motif name: C144 Original motif 0.128713 0.069307 0.782178 0.019802 0.831683 0.089109 0.039604 0.039604 0.009901 0.831683 0.108911 0.049505 0.010000 0.940000 0.010000 0.040000 0.653465 0.168317 0.138614 0.039604 0.040000 0.080000 0.870000 0.010000 0.550000 0.010000 0.430000 0.010000 0.019802 0.465347 0.485149 0.029703 0.010000 0.470000 0.060000 0.460000 0.485149 0.009901 0.485149 0.019802 0.029703 0.009901 0.861386 0.099010 0.040000 0.530000 0.070000 0.360000 0.009901 0.861386 0.009901 0.118812 0.039604 0.009901 0.089109 0.861386 0.010000 0.760000 0.050000 0.180000 Consensus sequence: GACCAGRSYRGYCTC Reserve complement motif 0.010000 0.050000 0.760000 0.180000 0.861386 0.009901 0.089109 0.039604 0.009901 0.009901 0.861386 0.118812 0.040000 0.070000 0.530000 0.360000 0.029703 0.861386 0.009901 0.099010 0.019802 0.009901 0.485149 0.485149 0.010000 0.060000 0.470000 0.460000 0.019802 0.485149 0.465347 0.029703 0.010000 0.010000 0.430000 0.550000 0.040000 0.870000 0.080000 0.010000 0.039604 0.168317 0.138614 0.653465 0.010000 0.010000 0.940000 0.040000 0.009901 0.108911 0.831683 0.049505 0.039604 0.089109 0.039604 0.831683 0.128713 0.782178 0.069307 0.019802 Consensus sequence: GAGKCKKSKCTGGTC ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 144 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v015681_primaryReverse Complement Reverse Complement Backward 9 15 0.036528 Species: Mus musculus Original motif 0.641428 0.180211 0.044767 0.133594 0.171696 0.262981 0.334148 0.231174 0.129726 0.322735 0.243462 0.304077 0.165713 0.175735 0.256108 0.402445 0.146090 0.171890 0.412753 0.269266 0.212837 0.439192 0.280990 0.066980 0.251088 0.275516 0.374380 0.099015 0.575438 0.079656 0.338201 0.006704 0.005634 0.003422 0.972597 0.018348 0.890447 0.077034 0.031851 0.000668 0.007128 0.986862 0.000496 0.005515 0.001445 0.991564 0.001925 0.005066 0.738761 0.190157 0.026399 0.044684 0.013384 0.983783 0.000896 0.001937 0.068077 0.929549 0.000773 0.001602 0.040830 0.933742 0.005283 0.020145 0.730274 0.029225 0.145689 0.094812 0.165032 0.572838 0.162001 0.100129 0.383584 0.129942 0.429497 0.056977 0.455959 0.071959 0.208204 0.263878 0.134271 0.262985 0.222626 0.380117 0.071193 0.346594 0.346081 0.236132 0.445661 0.405278 0.053901 0.095160 Consensus sequence: ABBBBVVRGACCACCCACRDBBM Reverse complement motif 0.095160 0.405278 0.053901 0.445661 0.071193 0.346081 0.346594 0.236132 0.380117 0.262985 0.222626 0.134271 0.263878 0.071959 0.208204 0.455959 0.383584 0.429497 0.129942 0.056977 0.165032 0.162001 0.572838 0.100129 0.094812 0.029225 0.145689 0.730274 0.040830 0.005283 0.933742 0.020145 0.068077 0.000773 0.929549 0.001602 0.013384 0.000896 0.983783 0.001937 0.044684 0.190157 0.026399 0.738761 0.001445 0.001925 0.991564 0.005066 0.007128 0.000496 0.986862 0.005515 0.000668 0.077034 0.031851 0.890447 0.005634 0.972597 0.003422 0.018348 0.006704 0.079656 0.338201 0.575438 0.251088 0.374380 0.275516 0.099015 0.212837 0.280990 0.439192 0.066980 0.146090 0.412753 0.171890 0.269266 0.402445 0.175735 0.256108 0.165713 0.129726 0.243462 0.322735 0.304077 0.171696 0.334148 0.262981 0.231174 0.133594 0.180211 0.044767 0.641428 Consensus sequence: YBVDMGTGGGTGGTCKVVBVBBT Alignment: YBVDMGTGGGTGGTCKVVBVBBT GAGKCKKSKCTGGTC-------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_primaryReverse Complement Reverse Complement Backward 8 15 0.036784 Species: Mus musculus Original motif 0.183797 0.268049 0.330111 0.218043 0.127599 0.330310 0.243614 0.298477 0.143199 0.188046 0.268593 0.400162 0.214690 0.205230 0.247090 0.332990 0.294688 0.299104 0.327152 0.079056 0.221909 0.193223 0.480155 0.104712 0.444072 0.068239 0.481838 0.005852 0.006182 0.015429 0.901278 0.077111 0.766535 0.111138 0.121632 0.000696 0.014848 0.973961 0.000298 0.010893 0.001807 0.992200 0.002669 0.003324 0.795344 0.140510 0.018576 0.045571 0.006990 0.988200 0.002510 0.002299 0.154898 0.842296 0.000998 0.001808 0.029577 0.919262 0.006935 0.044226 0.677987 0.032075 0.185065 0.104874 0.195132 0.364580 0.319321 0.120967 0.225412 0.115034 0.612849 0.046705 0.548628 0.058900 0.162857 0.229616 0.112531 0.340331 0.165910 0.381227 0.073029 0.303078 0.363896 0.259997 0.561485 0.260567 0.092979 0.084969 0.132283 0.457691 0.140159 0.269867 Consensus sequence: BBBDVVRGACCACCCAVGABBAB Reverse complement motif 0.132283 0.140159 0.457691 0.269867 0.084969 0.260567 0.092979 0.561485 0.073029 0.363896 0.303078 0.259997 0.381227 0.340331 0.165910 0.112531 0.229616 0.058900 0.162857 0.548628 0.225412 0.612849 0.115034 0.046705 0.195132 0.319321 0.364580 0.120967 0.104874 0.032075 0.185065 0.677987 0.029577 0.006935 0.919262 0.044226 0.154898 0.000998 0.842296 0.001808 0.006990 0.002510 0.988200 0.002299 0.045571 0.140510 0.018576 0.795344 0.001807 0.002669 0.992200 0.003324 0.014848 0.000298 0.973961 0.010893 0.000696 0.111138 0.121632 0.766535 0.006182 0.901278 0.015429 0.077111 0.444072 0.481838 0.068239 0.005852 0.221909 0.480155 0.193223 0.104712 0.294688 0.327152 0.299104 0.079056 0.332990 0.205230 0.247090 0.214690 0.400162 0.188046 0.268593 0.143199 0.127599 0.243614 0.330310 0.298477 0.183797 0.330111 0.268049 0.218043 Consensus sequence: BTBVTCVTGGGTGGTCMVVDVBB Alignment: BTBVTCVTGGGTGGTCMVVDVBB -GAGKCKKSKCTGGTC------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_primaryReverse Complement Reverse Complement Forward 2 15 0.037229 Species: Mus musculus Original motif 0.137831 0.118922 0.394177 0.349070 0.190108 0.163633 0.138507 0.507753 0.346002 0.332315 0.228621 0.093063 0.113254 0.287554 0.373285 0.225908 0.272578 0.125402 0.328963 0.273057 0.333973 0.115165 0.194267 0.356595 0.381054 0.086215 0.501679 0.031052 0.002232 0.007405 0.966087 0.024276 0.834741 0.112115 0.052053 0.001091 0.009034 0.983239 0.000766 0.006960 0.002054 0.988103 0.003138 0.006705 0.805772 0.171299 0.008415 0.014515 0.020076 0.976846 0.000894 0.002183 0.079914 0.917273 0.001179 0.001634 0.013983 0.950545 0.004205 0.031267 0.789407 0.039441 0.108645 0.062507 0.055453 0.161271 0.595249 0.188028 0.333424 0.128169 0.373270 0.165136 0.536103 0.109520 0.062980 0.291397 0.346477 0.090909 0.279533 0.283081 0.045892 0.190183 0.584314 0.179611 0.088294 0.406148 0.251647 0.253912 0.202467 0.447159 0.162802 0.187571 Consensus sequence: DTVBDDRGACCACCCAGDWDGBH Reverse complement motif 0.202467 0.162802 0.447159 0.187571 0.088294 0.251647 0.406148 0.253912 0.045892 0.584314 0.190183 0.179611 0.283081 0.090909 0.279533 0.346477 0.291397 0.109520 0.062980 0.536103 0.333424 0.373270 0.128169 0.165136 0.055453 0.595249 0.161271 0.188028 0.062507 0.039441 0.108645 0.789407 0.013983 0.004205 0.950545 0.031267 0.079914 0.001179 0.917273 0.001634 0.020076 0.000894 0.976846 0.002183 0.014515 0.171299 0.008415 0.805772 0.002054 0.003138 0.988103 0.006705 0.009034 0.000766 0.983239 0.006960 0.001091 0.112115 0.052053 0.834741 0.002232 0.966087 0.007405 0.024276 0.381054 0.501679 0.086215 0.031052 0.356595 0.115165 0.194267 0.333973 0.272578 0.328963 0.125402 0.273057 0.113254 0.373285 0.287554 0.225908 0.093063 0.332315 0.228621 0.346002 0.507753 0.163633 0.138507 0.190108 0.137831 0.394177 0.118922 0.349070 Consensus sequence: DBCDWHCTGGGTGGTCMDHBBAH Alignment: DBCDWHCTGGGTGGTCMDHBBAH -GAGKCKKSKCTGGTC------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v015681_primaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 7 15 0.037305 Species: Mus musculus Original motif 0.472795 0.179227 0.091251 0.256726 0.036521 0.159743 0.204840 0.598896 0.164582 0.312805 0.221324 0.301289 0.237069 0.249050 0.293048 0.220833 0.401949 0.225181 0.229401 0.143469 0.161422 0.494334 0.252207 0.092036 0.252940 0.177721 0.369400 0.199939 0.119630 0.024651 0.849920 0.005798 0.000962 0.002398 0.990616 0.006023 0.937852 0.027016 0.034535 0.000597 0.008963 0.987756 0.000629 0.002652 0.001584 0.992898 0.002349 0.003169 0.956822 0.027342 0.002484 0.013352 0.009873 0.987759 0.000988 0.001381 0.016397 0.980856 0.000369 0.002378 0.081761 0.758555 0.038572 0.121112 0.371713 0.091838 0.448027 0.088423 0.111617 0.121913 0.683885 0.082585 0.334562 0.102916 0.436488 0.126034 0.210362 0.101261 0.238339 0.450037 0.169041 0.271583 0.320799 0.238576 0.140316 0.049885 0.735236 0.074563 Consensus sequence: HTBVVVDGGACCACCCRGRDBG Reverse complement motif 0.140316 0.735236 0.049885 0.074563 0.169041 0.320799 0.271583 0.238576 0.450037 0.101261 0.238339 0.210362 0.334562 0.436488 0.102916 0.126034 0.111617 0.683885 0.121913 0.082585 0.371713 0.448027 0.091838 0.088423 0.081761 0.038572 0.758555 0.121112 0.016397 0.000369 0.980856 0.002378 0.009873 0.000988 0.987759 0.001381 0.013352 0.027342 0.002484 0.956822 0.001584 0.002349 0.992898 0.003169 0.008963 0.000629 0.987756 0.002652 0.000597 0.027016 0.034535 0.937852 0.000962 0.990616 0.002398 0.006023 0.119630 0.849920 0.024651 0.005798 0.252940 0.369400 0.177721 0.199939 0.161422 0.252207 0.494334 0.092036 0.143469 0.225181 0.229401 0.401949 0.237069 0.293048 0.249050 0.220833 0.164582 0.221324 0.312805 0.301289 0.598896 0.159743 0.204840 0.036521 0.256726 0.179227 0.091251 0.472795 Consensus sequence: CBDMCMGGGTGGTCCHVBVBAH Alignment: CBDMCMGGGTGGTCCHVBVBAH -GACCAGRSYRGYCTC------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 2 15 0.039572 Species: Mus musculus Original motif 0.404007 0.395873 0.173319 0.026801 0.305977 0.215534 0.215359 0.263130 0.370148 0.250957 0.113088 0.265808 0.324336 0.229498 0.174679 0.271487 0.263563 0.137896 0.079217 0.519324 0.265762 0.222582 0.082555 0.429102 0.206721 0.288405 0.017851 0.487023 0.164361 0.236500 0.061051 0.538088 0.593344 0.348446 0.050304 0.007906 0.031328 0.947050 0.007032 0.014590 0.010428 0.956605 0.029142 0.003825 0.459636 0.207616 0.155368 0.177380 0.014573 0.964608 0.012209 0.008610 0.066291 0.918196 0.008729 0.006784 0.019488 0.866774 0.018897 0.094841 0.767405 0.104198 0.029234 0.099164 0.052494 0.772531 0.039832 0.135142 0.296085 0.243498 0.350935 0.109482 0.518843 0.226659 0.124784 0.129714 0.647901 0.019721 0.159901 0.172477 0.113912 0.231511 0.214864 0.439713 0.223117 0.310596 0.293328 0.172959 0.185557 0.487662 0.136321 0.190459 Consensus sequence: MHHHWHYTMCCHCCCACVAABVH Reverse complement motif 0.185557 0.136321 0.487662 0.190459 0.223117 0.293328 0.310596 0.172959 0.439713 0.231511 0.214864 0.113912 0.172477 0.019721 0.159901 0.647901 0.129714 0.226659 0.124784 0.518843 0.296085 0.350935 0.243498 0.109482 0.052494 0.039832 0.772531 0.135142 0.099164 0.104198 0.029234 0.767405 0.019488 0.018897 0.866774 0.094841 0.066291 0.008729 0.918196 0.006784 0.014573 0.012209 0.964608 0.008610 0.177380 0.207616 0.155368 0.459636 0.010428 0.029142 0.956605 0.003825 0.031328 0.007032 0.947050 0.014590 0.007906 0.348446 0.050304 0.593344 0.538088 0.236500 0.061051 0.164361 0.487023 0.288405 0.017851 0.206721 0.429102 0.222582 0.082555 0.265762 0.519324 0.137896 0.079217 0.263563 0.271487 0.229498 0.174679 0.324336 0.265808 0.250957 0.113088 0.370148 0.263130 0.215534 0.215359 0.305977 0.026801 0.395873 0.173319 0.404007 Consensus sequence: DVVTTVGTGGGHGGYAMHWHHHY Alignment: DVVTTVGTGGGHGGYAMHWHHHY -GAGKCKKSKCTGGTC------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 145 Motif name: C145 Original motif 0.495050 0.148515 0.009901 0.346535 0.360000 0.140000 0.080000 0.420000 0.290000 0.690000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.400000 0.030000 0.230000 0.340000 0.128713 0.851485 0.009901 0.009901 0.851485 0.128713 0.009901 0.009901 0.470000 0.310000 0.190000 0.030000 0.010000 0.730000 0.250000 0.010000 0.414141 0.262626 0.040404 0.282828 0.891089 0.029703 0.069307 0.009901 0.370000 0.590000 0.030000 0.010000 0.520000 0.040000 0.150000 0.290000 0.420000 0.020000 0.120000 0.440000 Consensus sequence: WWCADCAMCHAMWW Reserve complement motif 0.440000 0.020000 0.120000 0.420000 0.290000 0.040000 0.150000 0.520000 0.370000 0.030000 0.590000 0.010000 0.009901 0.029703 0.069307 0.891089 0.282828 0.262626 0.040404 0.414141 0.010000 0.250000 0.730000 0.010000 0.030000 0.310000 0.190000 0.470000 0.009901 0.128713 0.009901 0.851485 0.128713 0.009901 0.851485 0.009901 0.340000 0.030000 0.230000 0.400000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.290000 0.010000 0.690000 0.010000 0.420000 0.140000 0.080000 0.360000 0.346535 0.148515 0.009901 0.495050 Consensus sequence: WWRTHGYTGDTGWW ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 145 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00037 Zfp105_primaryOriginal Motif Original Motif Forward 2 14 0.033590 Species: Mus musculus Original motif 0.363104 0.182807 0.145232 0.308856 0.419707 0.133742 0.222546 0.224005 0.164481 0.418263 0.052397 0.364858 0.715575 0.117639 0.064914 0.101872 0.883836 0.026985 0.032584 0.056596 0.558797 0.151280 0.033120 0.256803 0.267037 0.403488 0.026746 0.302729 0.939762 0.013627 0.034579 0.012032 0.897072 0.009878 0.035642 0.057408 0.305904 0.516040 0.055311 0.122746 0.880940 0.027958 0.048350 0.042752 0.710082 0.052464 0.040250 0.197204 0.246712 0.125155 0.318627 0.309506 0.429749 0.181755 0.176892 0.211603 0.339643 0.097216 0.355250 0.207891 Consensus sequence: HDYAAAHAAMAADHD Reverse complement motif 0.339643 0.355250 0.097216 0.207891 0.211603 0.181755 0.176892 0.429749 0.246712 0.318627 0.125155 0.309506 0.197204 0.052464 0.040250 0.710082 0.042752 0.027958 0.048350 0.880940 0.305904 0.055311 0.516040 0.122746 0.057408 0.009878 0.035642 0.897072 0.012032 0.013627 0.034579 0.939762 0.267037 0.026746 0.403488 0.302729 0.256803 0.151280 0.033120 0.558797 0.056596 0.026985 0.032584 0.883836 0.101872 0.117639 0.064914 0.715575 0.164481 0.052397 0.418263 0.364858 0.224005 0.133742 0.222546 0.419707 0.308856 0.182807 0.145232 0.363104 Consensus sequence: HHHTTRTTDTTTKDH Alignment: HDYAAAHAAMAADHD -WWCADCAMCHAMWW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00069 Sox1_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 2 14 0.037921 Species: Mus musculus Original motif 0.311195 0.320761 0.168207 0.199837 0.167435 0.254705 0.172347 0.405512 0.455008 0.141912 0.238795 0.164285 0.073716 0.141297 0.053296 0.731691 0.568590 0.149220 0.096523 0.185666 0.713176 0.043537 0.154070 0.089217 0.052174 0.056918 0.031611 0.859297 0.054048 0.062932 0.047885 0.835134 0.062609 0.086497 0.830338 0.020556 0.019412 0.026926 0.041178 0.912484 0.025514 0.121633 0.159655 0.693198 0.589206 0.202387 0.156463 0.051943 0.139529 0.144613 0.355594 0.360265 0.099136 0.393670 0.195997 0.311196 0.221257 0.260915 0.363263 0.154565 Consensus sequence: HBDTAATTGTTABBV Reverse complement motif 0.221257 0.363263 0.260915 0.154565 0.099136 0.195997 0.393670 0.311196 0.360265 0.144613 0.355594 0.139529 0.051943 0.202387 0.156463 0.589206 0.693198 0.121633 0.159655 0.025514 0.912484 0.026926 0.041178 0.019412 0.062609 0.830338 0.086497 0.020556 0.835134 0.062932 0.047885 0.054048 0.859297 0.056918 0.031611 0.052174 0.089217 0.043537 0.154070 0.713176 0.185666 0.149220 0.096523 0.568590 0.731691 0.141297 0.053296 0.073716 0.164285 0.141912 0.238795 0.455008 0.405512 0.254705 0.172347 0.167435 0.311195 0.168207 0.320761 0.199837 Consensus sequence: VBVTAACAATTADVD Alignment: HBDTAATTGTTABBV WWRTHGYTGDTGWW- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00185 Pbx1 Original Motif Original Motif Forward 4 14 0.039389 Species: Mus musculus Original motif 0.212132 0.278490 0.152736 0.356642 0.063933 0.492543 0.152064 0.291460 0.587031 0.034623 0.144307 0.234038 0.117053 0.398145 0.094881 0.389921 0.373322 0.389731 0.108286 0.128661 0.108687 0.734731 0.088065 0.068518 0.859559 0.019872 0.072249 0.048320 0.030137 0.010645 0.008436 0.950782 0.031271 0.947906 0.008587 0.012236 0.931443 0.030353 0.020847 0.017358 0.740694 0.063345 0.026296 0.169665 0.314246 0.050461 0.058593 0.576700 0.324258 0.320852 0.146988 0.207902 0.392891 0.139295 0.090383 0.377432 0.356442 0.139564 0.146747 0.357247 0.260742 0.286138 0.240467 0.212652 0.366956 0.354615 0.205968 0.072461 Consensus sequence: HYAYMCATCAAWHWDVV Reverse complement motif 0.072461 0.354615 0.205968 0.366956 0.260742 0.240467 0.286138 0.212652 0.357247 0.139564 0.146747 0.356442 0.377432 0.139295 0.090383 0.392891 0.207902 0.320852 0.146988 0.324258 0.576700 0.050461 0.058593 0.314246 0.169665 0.063345 0.026296 0.740694 0.017358 0.030353 0.020847 0.931443 0.031271 0.008587 0.947906 0.012236 0.950782 0.010645 0.008436 0.030137 0.048320 0.019872 0.072249 0.859559 0.108687 0.088065 0.734731 0.068518 0.373322 0.108286 0.389731 0.128661 0.117053 0.094881 0.398145 0.389921 0.234038 0.034623 0.144307 0.587031 0.063933 0.152064 0.492543 0.291460 0.356642 0.278490 0.152736 0.212132 Consensus sequence: BVDWHWTTGATGRKTKH Alignment: HYAYMCATCAAWHWDVV ---WWCADCAMCHAMWW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00091 Sox5_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 2 14 0.039671 Species: Mus musculus Original motif 0.246579 0.230352 0.241808 0.281260 0.352611 0.218685 0.156655 0.272048 0.249499 0.128873 0.215834 0.405794 0.007509 0.736577 0.087481 0.168432 0.566572 0.059259 0.191060 0.183109 0.149304 0.024062 0.164680 0.661954 0.540015 0.279108 0.133921 0.046956 0.755323 0.101222 0.038315 0.105140 0.170385 0.095406 0.092958 0.641252 0.097171 0.227591 0.065510 0.609729 0.348302 0.171087 0.180187 0.300424 0.602718 0.200284 0.114330 0.082668 0.142864 0.302784 0.453243 0.101109 0.252334 0.240815 0.258541 0.248309 0.285758 0.214950 0.251057 0.248235 Consensus sequence: DHDCATMATTDASDD Reverse complement motif 0.248235 0.214950 0.251057 0.285758 0.252334 0.258541 0.240815 0.248309 0.142864 0.453243 0.302784 0.101109 0.082668 0.200284 0.114330 0.602718 0.300424 0.171087 0.180187 0.348302 0.609729 0.227591 0.065510 0.097171 0.641252 0.095406 0.092958 0.170385 0.105140 0.101222 0.038315 0.755323 0.046956 0.279108 0.133921 0.540015 0.661954 0.024062 0.164680 0.149304 0.183109 0.059259 0.191060 0.566572 0.007509 0.087481 0.736577 0.168432 0.405794 0.128873 0.215834 0.249499 0.272048 0.218685 0.156655 0.352611 0.281260 0.230352 0.241808 0.246579 Consensus sequence: DHSTDAATYATGDHD Alignment: DHDCATMATTDASDD -WWCADCAMCHAMWW ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00067 Lef1_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 2 14 0.040683 Species: Mus musculus Original motif 0.225775 0.266368 0.393085 0.114772 0.435548 0.077011 0.232595 0.254846 0.416750 0.144725 0.322119 0.116406 0.172866 0.341069 0.390257 0.095807 0.809227 0.021474 0.010361 0.158938 0.039268 0.014676 0.010455 0.935601 0.015615 0.901755 0.039475 0.043155 0.944804 0.006853 0.008451 0.039892 0.934861 0.010096 0.037766 0.017277 0.026944 0.020363 0.046918 0.905775 0.108303 0.713885 0.010564 0.167248 0.679723 0.017661 0.275577 0.027039 0.239565 0.345553 0.186641 0.228241 0.088115 0.243857 0.204018 0.464010 0.331032 0.182800 0.110215 0.375953 0.337037 0.160373 0.185584 0.317006 Consensus sequence: VDVVATCAATCAHBHD Reverse complement motif 0.317006 0.160373 0.185584 0.337037 0.375953 0.182800 0.110215 0.331032 0.464010 0.243857 0.204018 0.088115 0.239565 0.186641 0.345553 0.228241 0.027039 0.017661 0.275577 0.679723 0.108303 0.010564 0.713885 0.167248 0.905775 0.020363 0.046918 0.026944 0.017277 0.010096 0.037766 0.934861 0.039892 0.006853 0.008451 0.944804 0.015615 0.039475 0.901755 0.043155 0.935601 0.014676 0.010455 0.039268 0.158938 0.021474 0.010361 0.809227 0.172866 0.390257 0.341069 0.095807 0.116406 0.144725 0.322119 0.416750 0.254846 0.077011 0.232595 0.435548 0.225775 0.393085 0.266368 0.114772 Consensus sequence: DHVDTGATTGATVBDV Alignment: VDVVATCAATCAHBHD -WWCADCAMCHAMWW- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 146 Motif name: C146 Original motif 0.019802 0.465347 0.069307 0.445545 0.630000 0.040000 0.320000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.069307 0.772277 0.148515 0.009901 0.039604 0.455446 0.415842 0.089109 0.690000 0.010000 0.010000 0.290000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.108911 0.009901 0.871287 0.009901 0.138614 0.009901 0.841584 0.009901 0.019802 0.465347 0.455446 0.059406 0.020000 0.180000 0.120000 0.680000 0.710000 0.100000 0.180000 0.010000 0.030000 0.390000 0.010000 0.570000 0.495050 0.039604 0.405941 0.059406 Consensus sequence: YRGCSAGGGSTAYR Reserve complement motif 0.059406 0.039604 0.405941 0.495050 0.570000 0.390000 0.010000 0.030000 0.010000 0.100000 0.180000 0.710000 0.680000 0.180000 0.120000 0.020000 0.019802 0.455446 0.465347 0.059406 0.138614 0.841584 0.009901 0.009901 0.108911 0.871287 0.009901 0.009901 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.290000 0.010000 0.010000 0.690000 0.039604 0.415842 0.455446 0.089109 0.069307 0.148515 0.772277 0.009901 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.040000 0.320000 0.630000 0.019802 0.069307 0.465347 0.445545 Consensus sequence: KMTASCCCTSGCKK ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 146 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00022 Zfp740_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 3 14 0.033088 Species: Mus musculus Original motif 0.398967 0.071604 0.323957 0.205472 0.457709 0.058192 0.267218 0.216881 0.393346 0.032365 0.329533 0.244756 0.119528 0.091191 0.190078 0.599202 0.273933 0.123548 0.073075 0.529444 0.068935 0.812883 0.015245 0.102937 0.029664 0.907790 0.024804 0.037742 0.020725 0.933422 0.016796 0.029057 0.015086 0.948448 0.018030 0.018436 0.015628 0.884941 0.061172 0.038259 0.067508 0.744063 0.107305 0.081125 0.108097 0.140614 0.650174 0.101115 0.065696 0.247239 0.506149 0.180916 0.395005 0.077185 0.345914 0.181895 0.527081 0.093650 0.281853 0.097416 0.289378 0.245159 0.348803 0.116660 0.147136 0.260117 0.145993 0.446754 Consensus sequence: DDDTWCCCCCCGGDRVH Reverse complement motif 0.446754 0.260117 0.145993 0.147136 0.289378 0.348803 0.245159 0.116660 0.097416 0.093650 0.281853 0.527081 0.181895 0.077185 0.345914 0.395005 0.065696 0.506149 0.247239 0.180916 0.108097 0.650174 0.140614 0.101115 0.067508 0.107305 0.744063 0.081125 0.015628 0.061172 0.884941 0.038259 0.015086 0.018030 0.948448 0.018436 0.020725 0.016796 0.933422 0.029057 0.029664 0.024804 0.907790 0.037742 0.068935 0.015245 0.812883 0.102937 0.529444 0.123548 0.073075 0.273933 0.599202 0.091191 0.190078 0.119528 0.244756 0.032365 0.329533 0.393346 0.216881 0.058192 0.267218 0.457709 0.205472 0.071604 0.323957 0.398967 Consensus sequence: HVKDCCGGGGGGWADDD Alignment: HVKDCCGGGGGGWADDD --YRGCSAGGGSTAYR- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00400 Zif268 Original Motif Reverse Complement Forward 6 14 0.034503 Species: Mus musculus Original motif 0.104824 0.412716 0.254506 0.227955 0.644922 0.065476 0.140479 0.149122 0.201205 0.166164 0.347131 0.285501 0.360606 0.256316 0.150766 0.232313 0.199831 0.240681 0.279350 0.280137 0.234308 0.204076 0.321306 0.240310 0.274112 0.462435 0.111425 0.152028 0.067070 0.717501 0.073934 0.141496 0.106745 0.084442 0.658566 0.150247 0.025128 0.967053 0.003585 0.004234 0.006412 0.982989 0.003227 0.007371 0.009588 0.877620 0.002571 0.110221 0.621521 0.355443 0.015669 0.007366 0.002600 0.980275 0.004191 0.012934 0.118773 0.026658 0.783843 0.070725 0.022358 0.822101 0.024684 0.130857 0.713212 0.080912 0.128793 0.077084 0.166568 0.250955 0.107934 0.474544 0.225040 0.222494 0.163301 0.389166 0.268976 0.223206 0.265314 0.242504 0.137052 0.229058 0.148439 0.485451 0.135819 0.304550 0.141994 0.417637 0.272440 0.319501 0.230580 0.177478 Consensus sequence: BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV Reverse complement motif 0.272440 0.230580 0.319501 0.177478 0.417637 0.304550 0.141994 0.135819 0.485451 0.229058 0.148439 0.137052 0.242504 0.223206 0.265314 0.268976 0.389166 0.222494 0.163301 0.225040 0.474544 0.250955 0.107934 0.166568 0.077084 0.080912 0.128793 0.713212 0.022358 0.024684 0.822101 0.130857 0.118773 0.783843 0.026658 0.070725 0.002600 0.004191 0.980275 0.012934 0.007366 0.355443 0.015669 0.621521 0.009588 0.002571 0.877620 0.110221 0.006412 0.003227 0.982989 0.007371 0.025128 0.003585 0.967053 0.004234 0.106745 0.658566 0.084442 0.150247 0.067070 0.073934 0.717501 0.141496 0.274112 0.111425 0.462435 0.152028 0.234308 0.321306 0.204076 0.240310 0.280137 0.240681 0.279350 0.199831 0.232313 0.256316 0.150766 0.360606 0.201205 0.347131 0.166164 0.285501 0.149122 0.065476 0.140479 0.644922 0.104824 0.254506 0.412716 0.227955 Consensus sequence: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB Alignment: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB -----YRGCSAGGGSTAYR---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00093 Klf7_primary Original Motif Reverse Complement Forward 3 14 0.036987 Species: Mus musculus Original motif 0.204514 0.198353 0.171218 0.425915 0.167188 0.296785 0.246082 0.289946 0.267330 0.148001 0.398674 0.185994 0.549386 0.060167 0.337100 0.053347 0.050746 0.900013 0.022169 0.027073 0.037905 0.920332 0.008360 0.033403 0.410356 0.566702 0.016267 0.006675 0.009526 0.982354 0.001060 0.007060 0.204292 0.001084 0.748567 0.046056 0.003955 0.988490 0.002821 0.004735 0.004264 0.988826 0.004311 0.002598 0.002758 0.929549 0.001244 0.066448 0.260332 0.421683 0.024720 0.293265 0.184798 0.247697 0.085237 0.482268 0.347537 0.197344 0.139961 0.315159 0.255281 0.166620 0.242297 0.335802 Consensus sequence: HBDRCCMCGCCCHHHD Reverse complement motif 0.335802 0.166620 0.242297 0.255281 0.315159 0.197344 0.139961 0.347537 0.482268 0.247697 0.085237 0.184798 0.260332 0.024720 0.421683 0.293265 0.002758 0.001244 0.929549 0.066448 0.004264 0.004311 0.988826 0.002598 0.003955 0.002821 0.988490 0.004735 0.204292 0.748567 0.001084 0.046056 0.009526 0.001060 0.982354 0.007060 0.410356 0.016267 0.566702 0.006675 0.037905 0.008360 0.920332 0.033403 0.050746 0.022169 0.900013 0.027073 0.053347 0.060167 0.337100 0.549386 0.267330 0.398674 0.148001 0.185994 0.167188 0.246082 0.296785 0.289946 0.425915 0.198353 0.171218 0.204514 Consensus sequence: DHHDGGGCGRGGKHBH Alignment: DHHDGGGCGRGGKHBH --YRGCSAGGGSTAYR ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 3 14 0.037409 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK --YRGCSAGGGSTAYR------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00096 Sox13_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 14 0.040016 Species: Mus musculus Original motif 0.262581 0.115233 0.405525 0.216661 0.246681 0.142854 0.145056 0.465409 0.341041 0.154355 0.306628 0.197976 0.242211 0.263918 0.113187 0.380684 0.119326 0.241913 0.117198 0.521563 0.054120 0.036135 0.784219 0.125525 0.076634 0.048399 0.788586 0.086381 0.215316 0.044119 0.663927 0.076638 0.248538 0.159141 0.015452 0.576869 0.047049 0.083570 0.788798 0.080583 0.071948 0.035098 0.768849 0.124105 0.123777 0.030383 0.713425 0.132415 0.294760 0.182119 0.181553 0.341567 0.516589 0.129377 0.116698 0.237336 0.350326 0.186505 0.112598 0.350571 0.311469 0.198085 0.147986 0.342460 0.185126 0.130721 0.242572 0.441582 Consensus sequence: DDDHTGGGTGGGHAHHD Reverse complement motif 0.441582 0.130721 0.242572 0.185126 0.342460 0.198085 0.147986 0.311469 0.350571 0.186505 0.112598 0.350326 0.237336 0.129377 0.116698 0.516589 0.341567 0.182119 0.181553 0.294760 0.123777 0.713425 0.030383 0.132415 0.071948 0.768849 0.035098 0.124105 0.047049 0.788798 0.083570 0.080583 0.576869 0.159141 0.015452 0.248538 0.215316 0.663927 0.044119 0.076638 0.076634 0.788586 0.048399 0.086381 0.054120 0.784219 0.036135 0.125525 0.521563 0.241913 0.117198 0.119326 0.380684 0.263918 0.113187 0.242211 0.197976 0.154355 0.306628 0.341041 0.465409 0.142854 0.145056 0.246681 0.262581 0.405525 0.115233 0.216661 Consensus sequence: DHHTHCCCACCCAHDDH Alignment: DDDHTGGGTGGGHAHHD ---YRGCSAGGGSTAYR ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 147 Motif name: C147 Original motif 0.069307 0.821782 0.009901 0.099010 0.019802 0.514851 0.009901 0.455446 0.380000 0.010000 0.010000 0.600000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.118812 0.049505 0.821782 0.009901 0.080000 0.010000 0.460000 0.450000 0.050000 0.920000 0.010000 0.020000 0.040000 0.020000 0.010000 0.930000 0.670000 0.010000 0.260000 0.060000 0.010101 0.585859 0.252525 0.151515 0.495050 0.445545 0.009901 0.049505 0.040000 0.780000 0.020000 0.160000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.495050 0.009901 0.435644 0.059406 0.138614 0.009901 0.831683 0.019802 Consensus sequence: CYWGGKCTACMCAGRG Reserve complement motif 0.138614 0.831683 0.009901 0.019802 0.059406 0.009901 0.435644 0.495050 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.040000 0.020000 0.780000 0.160000 0.049505 0.445545 0.009901 0.495050 0.010101 0.252525 0.585859 0.151515 0.060000 0.010000 0.260000 0.670000 0.930000 0.020000 0.010000 0.040000 0.050000 0.010000 0.920000 0.020000 0.080000 0.460000 0.010000 0.450000 0.118812 0.821782 0.049505 0.009901 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.600000 0.010000 0.010000 0.380000 0.019802 0.009901 0.514851 0.455446 0.069307 0.009901 0.821782 0.099010 Consensus sequence: CKCTGYGTAGYCCWKG ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 147 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v015681_primaryOriginal Motif Original Motif Forward 5 16 0.027031 Species: Mus musculus Original motif 0.472795 0.179227 0.091251 0.256726 0.036521 0.159743 0.204840 0.598896 0.164582 0.312805 0.221324 0.301289 0.237069 0.249050 0.293048 0.220833 0.401949 0.225181 0.229401 0.143469 0.161422 0.494334 0.252207 0.092036 0.252940 0.177721 0.369400 0.199939 0.119630 0.024651 0.849920 0.005798 0.000962 0.002398 0.990616 0.006023 0.937852 0.027016 0.034535 0.000597 0.008963 0.987756 0.000629 0.002652 0.001584 0.992898 0.002349 0.003169 0.956822 0.027342 0.002484 0.013352 0.009873 0.987759 0.000988 0.001381 0.016397 0.980856 0.000369 0.002378 0.081761 0.758555 0.038572 0.121112 0.371713 0.091838 0.448027 0.088423 0.111617 0.121913 0.683885 0.082585 0.334562 0.102916 0.436488 0.126034 0.210362 0.101261 0.238339 0.450037 0.169041 0.271583 0.320799 0.238576 0.140316 0.049885 0.735236 0.074563 Consensus sequence: HTBVVVDGGACCACCCRGRDBG Reverse complement motif 0.140316 0.735236 0.049885 0.074563 0.169041 0.320799 0.271583 0.238576 0.450037 0.101261 0.238339 0.210362 0.334562 0.436488 0.102916 0.126034 0.111617 0.683885 0.121913 0.082585 0.371713 0.448027 0.091838 0.088423 0.081761 0.038572 0.758555 0.121112 0.016397 0.000369 0.980856 0.002378 0.009873 0.000988 0.987759 0.001381 0.013352 0.027342 0.002484 0.956822 0.001584 0.002349 0.992898 0.003169 0.008963 0.000629 0.987756 0.002652 0.000597 0.027016 0.034535 0.937852 0.000962 0.990616 0.002398 0.006023 0.119630 0.849920 0.024651 0.005798 0.252940 0.369400 0.177721 0.199939 0.161422 0.252207 0.494334 0.092036 0.143469 0.225181 0.229401 0.401949 0.237069 0.293048 0.249050 0.220833 0.164582 0.221324 0.312805 0.301289 0.598896 0.159743 0.204840 0.036521 0.256726 0.179227 0.091251 0.472795 Consensus sequence: CBDMCMGGGTGGTCCHVBVBAH Alignment: HTBVVVDGGACCACCCRGRDBG ----CYWGGKCTACMCAGRG-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_primaryOriginal Motif Original Motif Forward 4 16 0.029263 Species: Mus musculus Original motif 0.137831 0.118922 0.394177 0.349070 0.190108 0.163633 0.138507 0.507753 0.346002 0.332315 0.228621 0.093063 0.113254 0.287554 0.373285 0.225908 0.272578 0.125402 0.328963 0.273057 0.333973 0.115165 0.194267 0.356595 0.381054 0.086215 0.501679 0.031052 0.002232 0.007405 0.966087 0.024276 0.834741 0.112115 0.052053 0.001091 0.009034 0.983239 0.000766 0.006960 0.002054 0.988103 0.003138 0.006705 0.805772 0.171299 0.008415 0.014515 0.020076 0.976846 0.000894 0.002183 0.079914 0.917273 0.001179 0.001634 0.013983 0.950545 0.004205 0.031267 0.789407 0.039441 0.108645 0.062507 0.055453 0.161271 0.595249 0.188028 0.333424 0.128169 0.373270 0.165136 0.536103 0.109520 0.062980 0.291397 0.346477 0.090909 0.279533 0.283081 0.045892 0.190183 0.584314 0.179611 0.088294 0.406148 0.251647 0.253912 0.202467 0.447159 0.162802 0.187571 Consensus sequence: DTVBDDRGACCACCCAGDWDGBH Reverse complement motif 0.202467 0.162802 0.447159 0.187571 0.088294 0.251647 0.406148 0.253912 0.045892 0.584314 0.190183 0.179611 0.283081 0.090909 0.279533 0.346477 0.291397 0.109520 0.062980 0.536103 0.333424 0.373270 0.128169 0.165136 0.055453 0.595249 0.161271 0.188028 0.062507 0.039441 0.108645 0.789407 0.013983 0.004205 0.950545 0.031267 0.079914 0.001179 0.917273 0.001634 0.020076 0.000894 0.976846 0.002183 0.014515 0.171299 0.008415 0.805772 0.002054 0.003138 0.988103 0.006705 0.009034 0.000766 0.983239 0.006960 0.001091 0.112115 0.052053 0.834741 0.002232 0.966087 0.007405 0.024276 0.381054 0.501679 0.086215 0.031052 0.356595 0.115165 0.194267 0.333973 0.272578 0.328963 0.125402 0.273057 0.113254 0.373285 0.287554 0.225908 0.093063 0.332315 0.228621 0.346002 0.507753 0.163633 0.138507 0.190108 0.137831 0.394177 0.118922 0.349070 Consensus sequence: DBCDWHCTGGGTGGTCMDHBBAH Alignment: DTVBDDRGACCACCCAGDWDGBH ---CYWGGKCTACMCAGRG---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_primaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 5 16 0.029697 Species: Mus musculus Original motif 0.204923 0.208846 0.365383 0.220848 0.294304 0.300143 0.167287 0.238266 0.109711 0.619514 0.117379 0.153396 0.178979 0.378580 0.230177 0.212264 0.159594 0.542602 0.118178 0.179627 0.125206 0.430074 0.151826 0.292894 0.097692 0.709845 0.116956 0.075506 0.148292 0.565912 0.037632 0.248164 0.077951 0.034190 0.855503 0.032356 0.001657 0.001061 0.971877 0.025405 0.001926 0.001084 0.991712 0.005278 0.033031 0.012001 0.057796 0.897171 0.002723 0.002647 0.993348 0.001281 0.003261 0.000963 0.987199 0.008577 0.000611 0.090925 0.074857 0.833608 0.015299 0.978878 0.004949 0.000874 0.013368 0.600902 0.033485 0.352245 0.231949 0.149575 0.118804 0.499672 0.267580 0.186002 0.371242 0.175176 0.264884 0.223483 0.110082 0.401551 0.221365 0.170121 0.179559 0.428955 0.112997 0.692930 0.139981 0.054092 0.460305 0.207883 0.155111 0.176702 Consensus sequence: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH Reverse complement motif 0.176702 0.207883 0.155111 0.460305 0.112997 0.139981 0.692930 0.054092 0.428955 0.170121 0.179559 0.221365 0.401551 0.223483 0.110082 0.264884 0.267580 0.371242 0.186002 0.175176 0.499672 0.149575 0.118804 0.231949 0.013368 0.033485 0.600902 0.352245 0.015299 0.004949 0.978878 0.000874 0.833608 0.090925 0.074857 0.000611 0.003261 0.987199 0.000963 0.008577 0.002723 0.993348 0.002647 0.001281 0.897171 0.012001 0.057796 0.033031 0.001926 0.991712 0.001084 0.005278 0.001657 0.971877 0.001061 0.025405 0.077951 0.855503 0.034190 0.032356 0.148292 0.037632 0.565912 0.248164 0.097692 0.116956 0.709845 0.075506 0.125206 0.151826 0.430074 0.292894 0.159594 0.118178 0.542602 0.179627 0.178979 0.230177 0.378580 0.212264 0.109711 0.117379 0.619514 0.153396 0.294304 0.167287 0.300143 0.238266 0.204923 0.365383 0.208846 0.220848 Consensus sequence: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB Alignment: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB ---CYWGGKCTACMCAGRG---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_primaryOriginal Motif Original Motif Backward 3 16 0.032216 Species: Mus musculus Original motif 0.180868 0.321661 0.134642 0.362829 0.232215 0.134289 0.315356 0.318141 0.065068 0.093681 0.569842 0.271408 0.370822 0.229680 0.154738 0.244759 0.323039 0.182873 0.173588 0.320500 0.175039 0.266898 0.276080 0.281984 0.412669 0.147730 0.146326 0.293275 0.325953 0.028805 0.629596 0.015646 0.003017 0.001766 0.979711 0.015507 0.888973 0.040666 0.069420 0.000941 0.017309 0.979155 0.000899 0.002637 0.001732 0.988816 0.004856 0.004596 0.889763 0.078125 0.010384 0.021729 0.007566 0.987081 0.001421 0.003932 0.027797 0.966593 0.000878 0.004731 0.025816 0.867003 0.065749 0.041433 0.220658 0.075256 0.582904 0.121182 0.088946 0.283695 0.565345 0.062015 0.328012 0.241332 0.305901 0.124755 0.307302 0.137589 0.375928 0.179181 0.298752 0.231470 0.315255 0.154524 0.094565 0.142901 0.705696 0.056838 Consensus sequence: HDGHHBHRGACCACCCGSVDVG Reverse complement motif 0.094565 0.705696 0.142901 0.056838 0.298752 0.315255 0.231470 0.154524 0.307302 0.375928 0.137589 0.179181 0.124755 0.241332 0.305901 0.328012 0.088946 0.565345 0.283695 0.062015 0.220658 0.582904 0.075256 0.121182 0.025816 0.065749 0.867003 0.041433 0.027797 0.000878 0.966593 0.004731 0.007566 0.001421 0.987081 0.003932 0.021729 0.078125 0.010384 0.889763 0.001732 0.004856 0.988816 0.004596 0.017309 0.000899 0.979155 0.002637 0.000941 0.040666 0.069420 0.888973 0.003017 0.979711 0.001766 0.015507 0.325953 0.629596 0.028805 0.015646 0.293275 0.147730 0.146326 0.412669 0.281984 0.266898 0.276080 0.175039 0.320500 0.182873 0.173588 0.323039 0.244759 0.229680 0.154738 0.370822 0.065068 0.569842 0.093681 0.271408 0.318141 0.134289 0.315356 0.232215 0.362829 0.321661 0.134642 0.180868 Consensus sequence: CVHBSCGGGTGGTCMHVHHCDH Alignment: HDGHHBHRGACCACCCGSVDVG ----CYWGGKCTACMCAGRG-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_primaryOriginal Motif Original Motif Forward 4 16 0.038699 Species: Mus musculus Original motif 0.183797 0.268049 0.330111 0.218043 0.127599 0.330310 0.243614 0.298477 0.143199 0.188046 0.268593 0.400162 0.214690 0.205230 0.247090 0.332990 0.294688 0.299104 0.327152 0.079056 0.221909 0.193223 0.480155 0.104712 0.444072 0.068239 0.481838 0.005852 0.006182 0.015429 0.901278 0.077111 0.766535 0.111138 0.121632 0.000696 0.014848 0.973961 0.000298 0.010893 0.001807 0.992200 0.002669 0.003324 0.795344 0.140510 0.018576 0.045571 0.006990 0.988200 0.002510 0.002299 0.154898 0.842296 0.000998 0.001808 0.029577 0.919262 0.006935 0.044226 0.677987 0.032075 0.185065 0.104874 0.195132 0.364580 0.319321 0.120967 0.225412 0.115034 0.612849 0.046705 0.548628 0.058900 0.162857 0.229616 0.112531 0.340331 0.165910 0.381227 0.073029 0.303078 0.363896 0.259997 0.561485 0.260567 0.092979 0.084969 0.132283 0.457691 0.140159 0.269867 Consensus sequence: BBBDVVRGACCACCCAVGABBAB Reverse complement motif 0.132283 0.140159 0.457691 0.269867 0.084969 0.260567 0.092979 0.561485 0.073029 0.363896 0.303078 0.259997 0.381227 0.340331 0.165910 0.112531 0.229616 0.058900 0.162857 0.548628 0.225412 0.612849 0.115034 0.046705 0.195132 0.319321 0.364580 0.120967 0.104874 0.032075 0.185065 0.677987 0.029577 0.006935 0.919262 0.044226 0.154898 0.000998 0.842296 0.001808 0.006990 0.002510 0.988200 0.002299 0.045571 0.140510 0.018576 0.795344 0.001807 0.002669 0.992200 0.003324 0.014848 0.000298 0.973961 0.010893 0.000696 0.111138 0.121632 0.766535 0.006182 0.901278 0.015429 0.077111 0.444072 0.481838 0.068239 0.005852 0.221909 0.480155 0.193223 0.104712 0.294688 0.327152 0.299104 0.079056 0.332990 0.205230 0.247090 0.214690 0.400162 0.188046 0.268593 0.143199 0.127599 0.243614 0.330310 0.298477 0.183797 0.330111 0.268049 0.218043 Consensus sequence: BTBVTCVTGGGTGGTCMVVDVBB Alignment: BBBDVVRGACCACCCAVGABBAB ---CYWGGKCTACMCAGRG---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 148 Motif name: C148 Original motif 0.070000 0.360000 0.560000 0.010000 0.010000 0.960000 0.020000 0.010000 0.620000 0.360000 0.010000 0.010000 0.030000 0.400000 0.460000 0.110000 0.070000 0.460000 0.250000 0.220000 0.178218 0.148515 0.603960 0.069307 0.960000 0.020000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.280000 0.600000 0.110000 0.010000 0.198020 0.475248 0.108911 0.217822 0.178218 0.158416 0.544554 0.118812 0.070000 0.450000 0.470000 0.010000 0.010000 0.910000 0.070000 0.010000 0.630000 0.220000 0.010000 0.140000 0.070000 0.310000 0.610000 0.010000 Consensus sequence: SCMSBGACACHGSCAS Reserve complement motif 0.070000 0.610000 0.310000 0.010000 0.140000 0.220000 0.010000 0.630000 0.010000 0.070000 0.910000 0.010000 0.070000 0.470000 0.450000 0.010000 0.178218 0.544554 0.158416 0.118812 0.198020 0.108911 0.475248 0.217822 0.280000 0.110000 0.600000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.020000 0.010000 0.960000 0.178218 0.603960 0.148515 0.069307 0.070000 0.250000 0.460000 0.220000 0.030000 0.460000 0.400000 0.110000 0.010000 0.360000 0.010000 0.620000 0.010000 0.020000 0.960000 0.010000 0.070000 0.560000 0.360000 0.010000 Consensus sequence: STGSCDGTGTCBSYGS ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 148 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00068 Eomes_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 1 16 0.024523 Species: Mus musculus Original motif 0.253642 0.252604 0.298295 0.195458 0.112892 0.341342 0.341061 0.204704 0.297430 0.215095 0.343350 0.144125 0.241098 0.129378 0.421448 0.208076 0.894201 0.007299 0.061032 0.037468 0.052259 0.054303 0.856609 0.036829 0.005074 0.015048 0.966734 0.013144 0.003258 0.061529 0.002368 0.932845 0.017531 0.005025 0.973155 0.004289 0.116022 0.030172 0.047139 0.806667 0.027749 0.602513 0.009946 0.359792 0.018763 0.048982 0.794648 0.137608 0.177116 0.459591 0.284833 0.078460 0.121483 0.491485 0.148745 0.238287 0.152590 0.245835 0.214717 0.386857 0.221040 0.320773 0.249918 0.208270 Consensus sequence: VBVDAGGTGTYGVBBV Reverse complement motif 0.221040 0.249918 0.320773 0.208270 0.386857 0.245835 0.214717 0.152590 0.121483 0.148745 0.491485 0.238287 0.177116 0.284833 0.459591 0.078460 0.018763 0.794648 0.048982 0.137608 0.027749 0.009946 0.602513 0.359792 0.806667 0.030172 0.047139 0.116022 0.017531 0.973155 0.005025 0.004289 0.932845 0.061529 0.002368 0.003258 0.005074 0.966734 0.015048 0.013144 0.052259 0.856609 0.054303 0.036829 0.037468 0.007299 0.061032 0.894201 0.241098 0.421448 0.129378 0.208076 0.297430 0.343350 0.215095 0.144125 0.112892 0.341061 0.341342 0.204704 0.253642 0.298295 0.252604 0.195458 Consensus sequence: VVBVCKACACCTHVBV Alignment: VBVDAGGTGTYGVBBV STGSCDGTGTCBSYGS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00100 Gata6_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 2 16 0.032594 Species: Mus musculus Original motif 0.096037 0.078720 0.658871 0.166372 0.099473 0.472200 0.272164 0.156163 0.148727 0.227078 0.409637 0.214558 0.280787 0.217654 0.322181 0.179378 0.108784 0.723506 0.080970 0.086739 0.058171 0.044102 0.818270 0.079457 0.681346 0.227586 0.064501 0.026567 0.026226 0.007471 0.070040 0.896263 0.896263 0.070040 0.007471 0.026226 0.026567 0.064501 0.227586 0.681346 0.079457 0.818270 0.044102 0.058171 0.086739 0.080970 0.723506 0.108784 0.081853 0.508631 0.267911 0.141606 0.438599 0.302967 0.195554 0.062881 0.091413 0.182315 0.581418 0.144854 0.142535 0.490840 0.073803 0.292822 0.254673 0.169951 0.289664 0.285713 Consensus sequence: GBBVCGATATCGSVGYD Reverse complement motif 0.254673 0.289664 0.169951 0.285713 0.142535 0.073803 0.490840 0.292822 0.091413 0.581418 0.182315 0.144854 0.062881 0.302967 0.195554 0.438599 0.081853 0.267911 0.508631 0.141606 0.086739 0.723506 0.080970 0.108784 0.079457 0.044102 0.818270 0.058171 0.681346 0.064501 0.227586 0.026567 0.026226 0.070040 0.007471 0.896263 0.896263 0.007471 0.070040 0.026226 0.026567 0.227586 0.064501 0.681346 0.058171 0.818270 0.044102 0.079457 0.108784 0.080970 0.723506 0.086739 0.280787 0.322181 0.217654 0.179378 0.148727 0.409637 0.227078 0.214558 0.099473 0.272164 0.472200 0.156163 0.096037 0.658871 0.078720 0.166372 Consensus sequence: HKCBSCGATATCGVBBC Alignment: HKCBSCGATATCGVBBC -STGSCDGTGTCBSYGS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00042 Gm397_second Original Motif Original Motif Forward 1 16 0.036992 Species: Mus musculus Original motif 0.360404 0.193218 0.248888 0.197490 0.286498 0.224597 0.426555 0.062349 0.347032 0.440548 0.033161 0.179259 0.337062 0.193658 0.385751 0.083529 0.108793 0.005723 0.878300 0.007184 0.015151 0.973406 0.009324 0.002118 0.972117 0.003915 0.019783 0.004185 0.010144 0.980912 0.003106 0.005839 0.974864 0.007532 0.015914 0.001691 0.012441 0.939195 0.029256 0.019108 0.759620 0.106164 0.073819 0.060397 0.157234 0.818234 0.007449 0.017083 0.050076 0.063608 0.505171 0.381144 0.131903 0.538163 0.124608 0.205325 0.367623 0.286526 0.240931 0.104919 0.357798 0.317606 0.097711 0.226885 Consensus sequence: DVMVGCACACACKCVH Reverse complement motif 0.226885 0.317606 0.097711 0.357798 0.104919 0.286526 0.240931 0.367623 0.131903 0.124608 0.538163 0.205325 0.050076 0.505171 0.063608 0.381144 0.157234 0.007449 0.818234 0.017083 0.060397 0.106164 0.073819 0.759620 0.012441 0.029256 0.939195 0.019108 0.001691 0.007532 0.015914 0.974864 0.010144 0.003106 0.980912 0.005839 0.004185 0.003915 0.019783 0.972117 0.015151 0.009324 0.973406 0.002118 0.108793 0.878300 0.005723 0.007184 0.337062 0.385751 0.193658 0.083529 0.347032 0.033161 0.440548 0.179259 0.286498 0.426555 0.224597 0.062349 0.197490 0.193218 0.248888 0.360404 Consensus sequence: HBGYGTGTGTGCVRVD Alignment: DVMVGCACACACKCVH SCMSBGACACHGSCAS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00016 Sry_secondary Original Motif Original Motif Backward 1 16 0.037210 Species: Mus musculus Original motif 0.219740 0.291283 0.118755 0.370223 0.242432 0.282700 0.205912 0.268956 0.327415 0.133992 0.255532 0.283060 0.263415 0.304333 0.213668 0.218583 0.259356 0.177510 0.294274 0.268860 0.315458 0.184947 0.444440 0.055155 0.572256 0.199521 0.180616 0.047606 0.881847 0.020818 0.032731 0.064603 0.028134 0.863210 0.052977 0.055679 0.921133 0.023179 0.036360 0.019328 0.913642 0.029557 0.028830 0.027972 0.131537 0.035078 0.033568 0.799817 0.412204 0.069669 0.279439 0.238689 0.247458 0.179342 0.390493 0.182707 0.282951 0.233824 0.324889 0.158336 0.176058 0.325159 0.163416 0.335366 0.172201 0.210000 0.453746 0.164053 Consensus sequence: HHDHDRAACAATDDVHV Reverse complement motif 0.172201 0.453746 0.210000 0.164053 0.335366 0.325159 0.163416 0.176058 0.282951 0.324889 0.233824 0.158336 0.247458 0.390493 0.179342 0.182707 0.238689 0.069669 0.279439 0.412204 0.799817 0.035078 0.033568 0.131537 0.027972 0.029557 0.028830 0.913642 0.019328 0.023179 0.036360 0.921133 0.028134 0.052977 0.863210 0.055679 0.064603 0.020818 0.032731 0.881847 0.047606 0.199521 0.180616 0.572256 0.315458 0.444440 0.184947 0.055155 0.259356 0.294274 0.177510 0.268860 0.263415 0.213668 0.304333 0.218583 0.283060 0.133992 0.255532 0.327415 0.242432 0.205912 0.282700 0.268956 0.370223 0.291283 0.118755 0.219740 Consensus sequence: VHVHDATTGTTMHDDDH Alignment: HHDHDRAACAATDDVHV -SCMSBGACACHGSCAS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00101 Sox12_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 16 0.037346 Species: Mus musculus Original motif 0.378898 0.318901 0.205859 0.096341 0.352524 0.321236 0.224504 0.101736 0.323551 0.182056 0.210897 0.283496 0.135539 0.325230 0.208031 0.331200 0.663106 0.055471 0.154459 0.126963 0.051748 0.292567 0.537307 0.118378 0.886489 0.042361 0.035742 0.035408 0.043647 0.688744 0.094358 0.173252 0.882052 0.039818 0.018899 0.059231 0.864171 0.036011 0.068363 0.031455 0.790158 0.046868 0.041594 0.121379 0.087447 0.143905 0.707798 0.060849 0.295919 0.132479 0.485703 0.085899 0.653156 0.133004 0.110012 0.103828 0.351764 0.131771 0.217730 0.298736 0.203977 0.196773 0.099958 0.499292 Consensus sequence: VVDBASACAAAGRADH Reverse complement motif 0.499292 0.196773 0.099958 0.203977 0.298736 0.131771 0.217730 0.351764 0.103828 0.133004 0.110012 0.653156 0.295919 0.485703 0.132479 0.085899 0.087447 0.707798 0.143905 0.060849 0.121379 0.046868 0.041594 0.790158 0.031455 0.036011 0.068363 0.864171 0.059231 0.039818 0.018899 0.882052 0.043647 0.094358 0.688744 0.173252 0.035408 0.042361 0.035742 0.886489 0.051748 0.537307 0.292567 0.118378 0.126963 0.055471 0.154459 0.663106 0.331200 0.325230 0.208031 0.135539 0.283496 0.182056 0.210897 0.323551 0.101736 0.321236 0.224504 0.352524 0.096341 0.318901 0.205859 0.378898 Consensus sequence: HDTMCTTTGTSTVDBB Alignment: VVDBASACAAAGRADH SCMSBGACACHGSCAS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 149 Motif name: C149 Original motif 0.050000 0.290000 0.010000 0.650000 0.108911 0.108911 0.405941 0.376238 0.861386 0.009901 0.118812 0.009901 0.740000 0.010000 0.210000 0.040000 0.029703 0.762376 0.138614 0.069307 0.009901 0.138614 0.009901 0.841584 0.020000 0.960000 0.010000 0.010000 0.890000 0.010000 0.010000 0.090000 0.178218 0.069307 0.742574 0.009901 0.540000 0.050000 0.290000 0.120000 0.405941 0.396040 0.128713 0.069307 0.520000 0.090000 0.370000 0.020000 Consensus sequence: TKAACTCAGRMR Reserve complement motif 0.020000 0.090000 0.370000 0.520000 0.069307 0.396040 0.128713 0.405941 0.120000 0.050000 0.290000 0.540000 0.178218 0.742574 0.069307 0.009901 0.090000 0.010000 0.010000 0.890000 0.020000 0.010000 0.960000 0.010000 0.841584 0.138614 0.009901 0.009901 0.029703 0.138614 0.762376 0.069307 0.040000 0.010000 0.210000 0.740000 0.009901 0.009901 0.118812 0.861386 0.108911 0.405941 0.108911 0.376238 0.650000 0.290000 0.010000 0.050000 Consensus sequence: KYKCTGAGTTYA ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 149 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00148 Hdx Reverse Complement Reverse Complement Backward 5 12 0.019723 Species: Mus musculus Original motif 0.311640 0.203273 0.213311 0.271776 0.341055 0.177799 0.257310 0.223836 0.047573 0.089551 0.516163 0.346713 0.195776 0.119326 0.352322 0.332576 0.295379 0.306027 0.157574 0.241020 0.213770 0.018770 0.724927 0.042533 0.702123 0.228608 0.050137 0.019133 0.826735 0.011735 0.061646 0.099884 0.920071 0.005458 0.026253 0.048218 0.018655 0.024240 0.028915 0.928190 0.029929 0.896758 0.043300 0.030013 0.864548 0.044943 0.013744 0.076766 0.177175 0.216931 0.155519 0.450375 0.228403 0.325164 0.203649 0.242785 0.140135 0.298665 0.306153 0.255047 0.338324 0.345500 0.057864 0.258313 0.402538 0.228867 0.191777 0.176818 Consensus sequence: DDKDHGAAATCAHHBHV Reverse complement motif 0.176818 0.228867 0.191777 0.402538 0.338324 0.057864 0.345500 0.258313 0.140135 0.306153 0.298665 0.255047 0.228403 0.203649 0.325164 0.242785 0.450375 0.216931 0.155519 0.177175 0.076766 0.044943 0.013744 0.864548 0.029929 0.043300 0.896758 0.030013 0.928190 0.024240 0.028915 0.018655 0.048218 0.005458 0.026253 0.920071 0.099884 0.011735 0.061646 0.826735 0.019133 0.228608 0.050137 0.702123 0.213770 0.724927 0.018770 0.042533 0.295379 0.157574 0.306027 0.241020 0.195776 0.352322 0.119326 0.332576 0.047573 0.516163 0.089551 0.346713 0.223836 0.177799 0.257310 0.341055 0.271776 0.203273 0.213311 0.311640 Consensus sequence: BDBDHTGATTTCDHYDD Alignment: BDBDHTGATTTCDHYDD -KYKCTGAGTTYA---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00020 Atf1_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 12 0.026713 Species: Mus musculus Original motif 0.381335 0.135129 0.244887 0.238648 0.139538 0.419619 0.195665 0.245178 0.158070 0.098493 0.409974 0.333462 0.472756 0.096594 0.388246 0.042403 0.008868 0.028811 0.005332 0.956990 0.014102 0.014269 0.863476 0.108153 0.962594 0.004653 0.011816 0.020937 0.003091 0.949099 0.003165 0.044646 0.044646 0.003165 0.949099 0.003091 0.020937 0.011816 0.004653 0.962594 0.108153 0.863476 0.014269 0.014102 0.956990 0.005332 0.028811 0.008868 0.049761 0.357863 0.144826 0.447550 0.225769 0.448432 0.142340 0.183460 0.264766 0.097627 0.493031 0.144576 0.352319 0.180279 0.236767 0.230635 Consensus sequence: DBDRTGACGTCAYHRD Reverse complement motif 0.230635 0.180279 0.236767 0.352319 0.264766 0.493031 0.097627 0.144576 0.225769 0.142340 0.448432 0.183460 0.447550 0.357863 0.144826 0.049761 0.008868 0.005332 0.028811 0.956990 0.108153 0.014269 0.863476 0.014102 0.962594 0.011816 0.004653 0.020937 0.044646 0.949099 0.003165 0.003091 0.003091 0.003165 0.949099 0.044646 0.020937 0.004653 0.011816 0.962594 0.014102 0.863476 0.014269 0.108153 0.956990 0.028811 0.005332 0.008868 0.042403 0.096594 0.388246 0.472756 0.158070 0.409974 0.098493 0.333462 0.139538 0.195665 0.419619 0.245178 0.238648 0.135129 0.244887 0.381335 Consensus sequence: DMDMTGACGTCAKHBD Alignment: DMDMTGACGTCAKHBD KYKCTGAGTTYA---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00014 Sox17_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 4 12 0.027086 Species: Mus musculus Original motif 0.216056 0.230834 0.399857 0.153253 0.321065 0.233860 0.135741 0.309334 0.166479 0.321423 0.209463 0.302635 0.185647 0.499038 0.152355 0.162961 0.416451 0.221510 0.168645 0.193395 0.070777 0.581761 0.126392 0.221070 0.764583 0.085635 0.031993 0.117789 0.035294 0.112638 0.038664 0.813404 0.153178 0.046321 0.056161 0.744340 0.076540 0.825062 0.055409 0.042989 0.764357 0.060365 0.119861 0.055417 0.130143 0.178946 0.153266 0.537644 0.402684 0.154010 0.357674 0.085632 0.189784 0.349553 0.176965 0.283698 0.475181 0.145276 0.256449 0.123094 0.472286 0.151639 0.172736 0.203339 0.215278 0.186804 0.213020 0.384898 Consensus sequence: VHBHHCATTCATRHVDD Reverse complement motif 0.384898 0.186804 0.213020 0.215278 0.203339 0.151639 0.172736 0.472286 0.123094 0.145276 0.256449 0.475181 0.189784 0.176965 0.349553 0.283698 0.085632 0.154010 0.357674 0.402684 0.537644 0.178946 0.153266 0.130143 0.055417 0.060365 0.119861 0.764357 0.076540 0.055409 0.825062 0.042989 0.744340 0.046321 0.056161 0.153178 0.813404 0.112638 0.038664 0.035294 0.117789 0.085635 0.031993 0.764583 0.070777 0.126392 0.581761 0.221070 0.193395 0.221510 0.168645 0.416451 0.185647 0.152355 0.499038 0.162961 0.166479 0.209463 0.321423 0.302635 0.309334 0.233860 0.135741 0.321065 0.216056 0.399857 0.230834 0.153253 Consensus sequence: DDBDKATGAATGHDBHV Alignment: DDBDKATGAATGHDBHV --KYKCTGAGTTYA--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00064 Sox18_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 1 12 0.027120 Species: Mus musculus Original motif 0.233450 0.135591 0.449351 0.181608 0.164159 0.195257 0.355715 0.284869 0.366008 0.174902 0.291705 0.167384 0.111204 0.386494 0.313802 0.188500 0.037772 0.262983 0.150189 0.549056 0.361570 0.040331 0.452937 0.145162 0.644867 0.179214 0.074070 0.101849 0.847543 0.023693 0.066894 0.061870 0.061870 0.066894 0.023693 0.847543 0.101849 0.074070 0.179214 0.644867 0.145162 0.452937 0.040331 0.361570 0.549056 0.150189 0.262983 0.037772 0.256653 0.170745 0.197091 0.375512 0.288178 0.121185 0.335592 0.255044 0.284270 0.341602 0.127009 0.247119 0.288580 0.309961 0.222765 0.178693 Consensus sequence: DBVBTRAATTYADDHV Reverse complement motif 0.288580 0.222765 0.309961 0.178693 0.284270 0.127009 0.341602 0.247119 0.288178 0.335592 0.121185 0.255044 0.375512 0.170745 0.197091 0.256653 0.037772 0.150189 0.262983 0.549056 0.145162 0.040331 0.452937 0.361570 0.644867 0.074070 0.179214 0.101849 0.847543 0.066894 0.023693 0.061870 0.061870 0.023693 0.066894 0.847543 0.101849 0.179214 0.074070 0.644867 0.361570 0.452937 0.040331 0.145162 0.549056 0.262983 0.150189 0.037772 0.111204 0.313802 0.386494 0.188500 0.167384 0.174902 0.291705 0.366008 0.164159 0.355715 0.195257 0.284869 0.233450 0.449351 0.135591 0.181608 Consensus sequence: VDHDTKAATTMABBBH Alignment: DBVBTRAATTYADDHV KYKCTGAGTTYA---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00045 Mafb_primary Original Motif Reverse Complement Backward 5 12 0.030199 Species: Mus musculus Original motif 0.420301 0.182299 0.161481 0.235919 0.593201 0.055751 0.202477 0.148571 0.653364 0.017008 0.054630 0.274998 0.339176 0.102943 0.050258 0.507622 0.171557 0.078698 0.267471 0.482273 0.044703 0.033212 0.003920 0.918165 0.010333 0.004451 0.972441 0.012775 0.034026 0.949298 0.004788 0.011889 0.016078 0.008878 0.004007 0.971037 0.020331 0.004077 0.929676 0.045916 0.975739 0.007450 0.005991 0.010819 0.012733 0.887375 0.018700 0.081192 0.259981 0.111885 0.243051 0.385083 0.327677 0.149969 0.094895 0.427459 0.541721 0.105923 0.242224 0.110132 0.258689 0.068305 0.493226 0.179779 0.306041 0.306854 0.168308 0.218798 Consensus sequence: HAAWDTGCTGACDWARH Reverse complement motif 0.306041 0.168308 0.306854 0.218798 0.258689 0.493226 0.068305 0.179779 0.110132 0.105923 0.242224 0.541721 0.427459 0.149969 0.094895 0.327677 0.385083 0.111885 0.243051 0.259981 0.012733 0.018700 0.887375 0.081192 0.010819 0.007450 0.005991 0.975739 0.020331 0.929676 0.004077 0.045916 0.971037 0.008878 0.004007 0.016078 0.034026 0.004788 0.949298 0.011889 0.010333 0.972441 0.004451 0.012775 0.918165 0.033212 0.003920 0.044703 0.482273 0.078698 0.267471 0.171557 0.507622 0.102943 0.050258 0.339176 0.274998 0.017008 0.054630 0.653364 0.148571 0.055751 0.202477 0.593201 0.235919 0.182299 0.161481 0.420301 Consensus sequence: DMTWDGTCAGCADWTTH Alignment: DMTWDGTCAGCADWTTH -TKAACTCAGRMR---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 150 Motif name: C150 Original motif 0.019802 0.455446 0.009901 0.514851 0.009901 0.415842 0.049505 0.524752 0.099010 0.881188 0.009901 0.009901 0.465347 0.504950 0.009901 0.019802 0.560000 0.020000 0.410000 0.010000 0.080000 0.450000 0.430000 0.040000 0.050000 0.340000 0.580000 0.030000 0.790000 0.180000 0.020000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.821782 0.158416 0.009901 0.009901 0.060000 0.470000 0.460000 0.010000 0.070000 0.460000 0.030000 0.440000 0.010000 0.960000 0.020000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.470000 0.030000 0.450000 0.050000 0.514851 0.009901 0.415842 0.059406 Consensus sequence: YYCMRSSACASYCARR Reserve complement motif 0.059406 0.009901 0.415842 0.514851 0.050000 0.030000 0.450000 0.470000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.020000 0.960000 0.010000 0.070000 0.030000 0.460000 0.440000 0.060000 0.460000 0.470000 0.010000 0.009901 0.158416 0.009901 0.821782 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.180000 0.020000 0.790000 0.050000 0.580000 0.340000 0.030000 0.080000 0.430000 0.450000 0.040000 0.010000 0.020000 0.410000 0.560000 0.465347 0.009901 0.504950 0.019802 0.099010 0.009901 0.881188 0.009901 0.524752 0.415842 0.049505 0.009901 0.514851 0.455446 0.009901 0.019802 Consensus sequence: KKTGKSTGTSSKRGMM ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 150 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v015681_primaryOriginal Motif Original Motif Forward 4 16 0.022327 Species: Mus musculus Original motif 0.641428 0.180211 0.044767 0.133594 0.171696 0.262981 0.334148 0.231174 0.129726 0.322735 0.243462 0.304077 0.165713 0.175735 0.256108 0.402445 0.146090 0.171890 0.412753 0.269266 0.212837 0.439192 0.280990 0.066980 0.251088 0.275516 0.374380 0.099015 0.575438 0.079656 0.338201 0.006704 0.005634 0.003422 0.972597 0.018348 0.890447 0.077034 0.031851 0.000668 0.007128 0.986862 0.000496 0.005515 0.001445 0.991564 0.001925 0.005066 0.738761 0.190157 0.026399 0.044684 0.013384 0.983783 0.000896 0.001937 0.068077 0.929549 0.000773 0.001602 0.040830 0.933742 0.005283 0.020145 0.730274 0.029225 0.145689 0.094812 0.165032 0.572838 0.162001 0.100129 0.383584 0.129942 0.429497 0.056977 0.455959 0.071959 0.208204 0.263878 0.134271 0.262985 0.222626 0.380117 0.071193 0.346594 0.346081 0.236132 0.445661 0.405278 0.053901 0.095160 Consensus sequence: ABBBBVVRGACCACCCACRDBBM Reverse complement motif 0.095160 0.405278 0.053901 0.445661 0.071193 0.346081 0.346594 0.236132 0.380117 0.262985 0.222626 0.134271 0.263878 0.071959 0.208204 0.455959 0.383584 0.429497 0.129942 0.056977 0.165032 0.162001 0.572838 0.100129 0.094812 0.029225 0.145689 0.730274 0.040830 0.005283 0.933742 0.020145 0.068077 0.000773 0.929549 0.001602 0.013384 0.000896 0.983783 0.001937 0.044684 0.190157 0.026399 0.738761 0.001445 0.001925 0.991564 0.005066 0.007128 0.000496 0.986862 0.005515 0.000668 0.077034 0.031851 0.890447 0.005634 0.972597 0.003422 0.018348 0.006704 0.079656 0.338201 0.575438 0.251088 0.374380 0.275516 0.099015 0.212837 0.280990 0.439192 0.066980 0.146090 0.412753 0.171890 0.269266 0.402445 0.175735 0.256108 0.165713 0.129726 0.243462 0.322735 0.304077 0.171696 0.334148 0.262981 0.231174 0.133594 0.180211 0.044767 0.641428 Consensus sequence: YBVDMGTGGGTGGTCKVVBVBBT Alignment: ABBBBVVRGACCACCCACRDBBM ---YYCMRSSACASYCARR---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_primaryOriginal Motif Original Motif Forward 3 16 0.022788 Species: Mus musculus Original motif 0.183797 0.268049 0.330111 0.218043 0.127599 0.330310 0.243614 0.298477 0.143199 0.188046 0.268593 0.400162 0.214690 0.205230 0.247090 0.332990 0.294688 0.299104 0.327152 0.079056 0.221909 0.193223 0.480155 0.104712 0.444072 0.068239 0.481838 0.005852 0.006182 0.015429 0.901278 0.077111 0.766535 0.111138 0.121632 0.000696 0.014848 0.973961 0.000298 0.010893 0.001807 0.992200 0.002669 0.003324 0.795344 0.140510 0.018576 0.045571 0.006990 0.988200 0.002510 0.002299 0.154898 0.842296 0.000998 0.001808 0.029577 0.919262 0.006935 0.044226 0.677987 0.032075 0.185065 0.104874 0.195132 0.364580 0.319321 0.120967 0.225412 0.115034 0.612849 0.046705 0.548628 0.058900 0.162857 0.229616 0.112531 0.340331 0.165910 0.381227 0.073029 0.303078 0.363896 0.259997 0.561485 0.260567 0.092979 0.084969 0.132283 0.457691 0.140159 0.269867 Consensus sequence: BBBDVVRGACCACCCAVGABBAB Reverse complement motif 0.132283 0.140159 0.457691 0.269867 0.084969 0.260567 0.092979 0.561485 0.073029 0.363896 0.303078 0.259997 0.381227 0.340331 0.165910 0.112531 0.229616 0.058900 0.162857 0.548628 0.225412 0.612849 0.115034 0.046705 0.195132 0.319321 0.364580 0.120967 0.104874 0.032075 0.185065 0.677987 0.029577 0.006935 0.919262 0.044226 0.154898 0.000998 0.842296 0.001808 0.006990 0.002510 0.988200 0.002299 0.045571 0.140510 0.018576 0.795344 0.001807 0.002669 0.992200 0.003324 0.014848 0.000298 0.973961 0.010893 0.000696 0.111138 0.121632 0.766535 0.006182 0.901278 0.015429 0.077111 0.444072 0.481838 0.068239 0.005852 0.221909 0.480155 0.193223 0.104712 0.294688 0.327152 0.299104 0.079056 0.332990 0.205230 0.247090 0.214690 0.400162 0.188046 0.268593 0.143199 0.127599 0.243614 0.330310 0.298477 0.183797 0.330111 0.268049 0.218043 Consensus sequence: BTBVTCVTGGGTGGTCMVVDVBB Alignment: BBBDVVRGACCACCCAVGABBAB --YYCMRSSACASYCARR----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 2 16 0.023584 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH -YYCMRSSACASYCARR------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 7 16 0.025027 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH -YYCMRSSACASYCARR------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_primaryOriginal Motif Original Motif Backward 6 16 0.026522 Species: Mus musculus Original motif 0.137831 0.118922 0.394177 0.349070 0.190108 0.163633 0.138507 0.507753 0.346002 0.332315 0.228621 0.093063 0.113254 0.287554 0.373285 0.225908 0.272578 0.125402 0.328963 0.273057 0.333973 0.115165 0.194267 0.356595 0.381054 0.086215 0.501679 0.031052 0.002232 0.007405 0.966087 0.024276 0.834741 0.112115 0.052053 0.001091 0.009034 0.983239 0.000766 0.006960 0.002054 0.988103 0.003138 0.006705 0.805772 0.171299 0.008415 0.014515 0.020076 0.976846 0.000894 0.002183 0.079914 0.917273 0.001179 0.001634 0.013983 0.950545 0.004205 0.031267 0.789407 0.039441 0.108645 0.062507 0.055453 0.161271 0.595249 0.188028 0.333424 0.128169 0.373270 0.165136 0.536103 0.109520 0.062980 0.291397 0.346477 0.090909 0.279533 0.283081 0.045892 0.190183 0.584314 0.179611 0.088294 0.406148 0.251647 0.253912 0.202467 0.447159 0.162802 0.187571 Consensus sequence: DTVBDDRGACCACCCAGDWDGBH Reverse complement motif 0.202467 0.162802 0.447159 0.187571 0.088294 0.251647 0.406148 0.253912 0.045892 0.584314 0.190183 0.179611 0.283081 0.090909 0.279533 0.346477 0.291397 0.109520 0.062980 0.536103 0.333424 0.373270 0.128169 0.165136 0.055453 0.595249 0.161271 0.188028 0.062507 0.039441 0.108645 0.789407 0.013983 0.004205 0.950545 0.031267 0.079914 0.001179 0.917273 0.001634 0.020076 0.000894 0.976846 0.002183 0.014515 0.171299 0.008415 0.805772 0.002054 0.003138 0.988103 0.006705 0.009034 0.000766 0.983239 0.006960 0.001091 0.112115 0.052053 0.834741 0.002232 0.966087 0.007405 0.024276 0.381054 0.501679 0.086215 0.031052 0.356595 0.115165 0.194267 0.333973 0.272578 0.328963 0.125402 0.273057 0.113254 0.373285 0.287554 0.225908 0.093063 0.332315 0.228621 0.346002 0.507753 0.163633 0.138507 0.190108 0.137831 0.394177 0.118922 0.349070 Consensus sequence: DBCDWHCTGGGTGGTCMDHBBAH Alignment: DTVBDDRGACCACCCAGDWDGBH --YYCMRSSACASYCARR----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 151 Motif name: C151 Original motif 0.009901 0.455446 0.495050 0.039604 0.425743 0.108911 0.019802 0.445545 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.070000 0.260000 0.660000 0.010000 0.210000 0.560000 0.210000 0.020000 0.534653 0.029703 0.009901 0.425743 0.250000 0.010000 0.730000 0.010000 0.090000 0.080000 0.460000 0.370000 0.110000 0.580000 0.250000 0.060000 0.168317 0.514851 0.188119 0.128713 0.475248 0.009901 0.099010 0.415842 0.020000 0.240000 0.560000 0.180000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.430000 0.250000 0.310000 0.010000 0.460000 0.030000 0.090000 0.420000 0.010000 0.540000 0.400000 0.050000 Consensus sequence: SWGGCWGKCCWGGVWS Reserve complement motif 0.010000 0.400000 0.540000 0.050000 0.420000 0.030000 0.090000 0.460000 0.010000 0.250000 0.310000 0.430000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.020000 0.560000 0.240000 0.180000 0.415842 0.009901 0.099010 0.475248 0.168317 0.188119 0.514851 0.128713 0.110000 0.250000 0.580000 0.060000 0.090000 0.460000 0.080000 0.370000 0.250000 0.730000 0.010000 0.010000 0.425743 0.029703 0.009901 0.534653 0.210000 0.210000 0.560000 0.020000 0.070000 0.660000 0.260000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.445545 0.108911 0.019802 0.425743 0.009901 0.495050 0.455446 0.039604 Consensus sequence: SWBCCWGGYCWGCCWS ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 151 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 8 16 0.027408 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB -------SWGGCWGKCCWGGVWS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 1 16 0.028856 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH SWBCCWGGYCWGCCWS------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 8 16 0.036828 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH SWBCCWGGYCWGCCWS------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_primaryReverse Complement Original Motif Backward 7 16 0.042467 Species: Mus musculus Original motif 0.183797 0.268049 0.330111 0.218043 0.127599 0.330310 0.243614 0.298477 0.143199 0.188046 0.268593 0.400162 0.214690 0.205230 0.247090 0.332990 0.294688 0.299104 0.327152 0.079056 0.221909 0.193223 0.480155 0.104712 0.444072 0.068239 0.481838 0.005852 0.006182 0.015429 0.901278 0.077111 0.766535 0.111138 0.121632 0.000696 0.014848 0.973961 0.000298 0.010893 0.001807 0.992200 0.002669 0.003324 0.795344 0.140510 0.018576 0.045571 0.006990 0.988200 0.002510 0.002299 0.154898 0.842296 0.000998 0.001808 0.029577 0.919262 0.006935 0.044226 0.677987 0.032075 0.185065 0.104874 0.195132 0.364580 0.319321 0.120967 0.225412 0.115034 0.612849 0.046705 0.548628 0.058900 0.162857 0.229616 0.112531 0.340331 0.165910 0.381227 0.073029 0.303078 0.363896 0.259997 0.561485 0.260567 0.092979 0.084969 0.132283 0.457691 0.140159 0.269867 Consensus sequence: BBBDVVRGACCACCCAVGABBAB Reverse complement motif 0.132283 0.140159 0.457691 0.269867 0.084969 0.260567 0.092979 0.561485 0.073029 0.363896 0.303078 0.259997 0.381227 0.340331 0.165910 0.112531 0.229616 0.058900 0.162857 0.548628 0.225412 0.612849 0.115034 0.046705 0.195132 0.319321 0.364580 0.120967 0.104874 0.032075 0.185065 0.677987 0.029577 0.006935 0.919262 0.044226 0.154898 0.000998 0.842296 0.001808 0.006990 0.002510 0.988200 0.002299 0.045571 0.140510 0.018576 0.795344 0.001807 0.002669 0.992200 0.003324 0.014848 0.000298 0.973961 0.010893 0.000696 0.111138 0.121632 0.766535 0.006182 0.901278 0.015429 0.077111 0.444072 0.481838 0.068239 0.005852 0.221909 0.480155 0.193223 0.104712 0.294688 0.327152 0.299104 0.079056 0.332990 0.205230 0.247090 0.214690 0.400162 0.188046 0.268593 0.143199 0.127599 0.243614 0.330310 0.298477 0.183797 0.330111 0.268049 0.218043 Consensus sequence: BTBVTCVTGGGTGGTCMVVDVBB Alignment: BBBDVVRGACCACCCAVGABBAB -SWBCCWGGYCWGCCWS------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v015681_primaryReverse Complement Original Motif Forward 3 16 0.042980 Species: Mus musculus Original motif 0.641428 0.180211 0.044767 0.133594 0.171696 0.262981 0.334148 0.231174 0.129726 0.322735 0.243462 0.304077 0.165713 0.175735 0.256108 0.402445 0.146090 0.171890 0.412753 0.269266 0.212837 0.439192 0.280990 0.066980 0.251088 0.275516 0.374380 0.099015 0.575438 0.079656 0.338201 0.006704 0.005634 0.003422 0.972597 0.018348 0.890447 0.077034 0.031851 0.000668 0.007128 0.986862 0.000496 0.005515 0.001445 0.991564 0.001925 0.005066 0.738761 0.190157 0.026399 0.044684 0.013384 0.983783 0.000896 0.001937 0.068077 0.929549 0.000773 0.001602 0.040830 0.933742 0.005283 0.020145 0.730274 0.029225 0.145689 0.094812 0.165032 0.572838 0.162001 0.100129 0.383584 0.129942 0.429497 0.056977 0.455959 0.071959 0.208204 0.263878 0.134271 0.262985 0.222626 0.380117 0.071193 0.346594 0.346081 0.236132 0.445661 0.405278 0.053901 0.095160 Consensus sequence: ABBBBVVRGACCACCCACRDBBM Reverse complement motif 0.095160 0.405278 0.053901 0.445661 0.071193 0.346081 0.346594 0.236132 0.380117 0.262985 0.222626 0.134271 0.263878 0.071959 0.208204 0.455959 0.383584 0.429497 0.129942 0.056977 0.165032 0.162001 0.572838 0.100129 0.094812 0.029225 0.145689 0.730274 0.040830 0.005283 0.933742 0.020145 0.068077 0.000773 0.929549 0.001602 0.013384 0.000896 0.983783 0.001937 0.044684 0.190157 0.026399 0.738761 0.001445 0.001925 0.991564 0.005066 0.007128 0.000496 0.986862 0.005515 0.000668 0.077034 0.031851 0.890447 0.005634 0.972597 0.003422 0.018348 0.006704 0.079656 0.338201 0.575438 0.251088 0.374380 0.275516 0.099015 0.212837 0.280990 0.439192 0.066980 0.146090 0.412753 0.171890 0.269266 0.402445 0.175735 0.256108 0.165713 0.129726 0.243462 0.322735 0.304077 0.171696 0.334148 0.262981 0.231174 0.133594 0.180211 0.044767 0.641428 Consensus sequence: YBVDMGTGGGTGGTCKVVBVBBT Alignment: ABBBBVVRGACCACCCACRDBBM --SWBCCWGGYCWGCCWS----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 152 Motif name: C152 Original motif 0.160000 0.010000 0.370000 0.460000 0.530000 0.050000 0.030000 0.390000 0.580000 0.010000 0.340000 0.070000 0.640000 0.010000 0.340000 0.010000 0.059406 0.009901 0.475248 0.455446 0.520000 0.010000 0.070000 0.400000 0.570000 0.130000 0.290000 0.010000 0.742574 0.009901 0.207921 0.039604 0.610000 0.070000 0.310000 0.010000 0.770000 0.010000 0.210000 0.010000 0.510000 0.030000 0.070000 0.390000 0.620000 0.350000 0.010000 0.020000 0.470000 0.070000 0.430000 0.030000 0.821782 0.029703 0.089109 0.059406 0.480000 0.050000 0.070000 0.400000 0.510000 0.330000 0.060000 0.100000 Consensus sequence: KWRRKWRARAWMRAWM Reserve complement motif 0.100000 0.330000 0.060000 0.510000 0.400000 0.050000 0.070000 0.480000 0.059406 0.029703 0.089109 0.821782 0.030000 0.070000 0.430000 0.470000 0.020000 0.350000 0.010000 0.620000 0.390000 0.030000 0.070000 0.510000 0.010000 0.010000 0.210000 0.770000 0.010000 0.070000 0.310000 0.610000 0.039604 0.009901 0.207921 0.742574 0.010000 0.130000 0.290000 0.570000 0.400000 0.010000 0.070000 0.520000 0.059406 0.475248 0.009901 0.455446 0.010000 0.010000 0.340000 0.640000 0.070000 0.010000 0.340000 0.580000 0.390000 0.050000 0.030000 0.530000 0.460000 0.010000 0.370000 0.160000 Consensus sequence: YWTKYWTKTKWYKKWR ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 152 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00077 Srf_secondary Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 16 0.021845 Species: Mus musculus Original motif 0.162968 0.284828 0.440984 0.111220 0.151392 0.200635 0.205316 0.442657 0.267215 0.083669 0.192498 0.456618 0.332771 0.180711 0.200027 0.286491 0.509370 0.102954 0.242569 0.145107 0.666262 0.077309 0.154466 0.101962 0.737968 0.113335 0.100401 0.048296 0.658878 0.141580 0.134033 0.065510 0.766115 0.094051 0.069763 0.070072 0.755621 0.088491 0.044802 0.111086 0.749083 0.135917 0.047510 0.067490 0.663231 0.176795 0.028134 0.131839 0.553358 0.277659 0.038655 0.130328 0.392578 0.314083 0.209844 0.083495 0.198462 0.237132 0.239466 0.324940 0.275121 0.210087 0.194779 0.320013 0.287748 0.277395 0.142704 0.292154 Consensus sequence: VBDDAAAAAAAAMVBHH Reverse complement motif 0.292154 0.277395 0.142704 0.287748 0.320013 0.210087 0.194779 0.275121 0.324940 0.237132 0.239466 0.198462 0.083495 0.314083 0.209844 0.392578 0.130328 0.277659 0.038655 0.553358 0.131839 0.176795 0.028134 0.663231 0.067490 0.135917 0.047510 0.749083 0.111086 0.088491 0.044802 0.755621 0.070072 0.094051 0.069763 0.766115 0.065510 0.141580 0.134033 0.658878 0.048296 0.113335 0.100401 0.737968 0.101962 0.077309 0.154466 0.666262 0.145107 0.102954 0.242569 0.509370 0.286491 0.180711 0.200027 0.332771 0.456618 0.083669 0.192498 0.267215 0.442657 0.200635 0.205316 0.151392 0.162968 0.440984 0.284828 0.111220 Consensus sequence: HHVBYTTTTTTTTDDVV Alignment: HHVBYTTTTTTTTDDVV YWTKYWTKTKWYKKWR- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00090 Elf3_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 1 16 0.038475 Species: Mus musculus Original motif 0.155083 0.152982 0.490906 0.201030 0.123195 0.312681 0.220770 0.343354 0.110252 0.131358 0.153983 0.604406 0.216489 0.490160 0.101348 0.192003 0.396130 0.292429 0.103252 0.208189 0.634770 0.070898 0.070668 0.223664 0.667102 0.099915 0.067576 0.165407 0.625495 0.095579 0.039353 0.239573 0.717478 0.093228 0.024737 0.164558 0.729965 0.048628 0.024557 0.196850 0.670909 0.118718 0.043692 0.166681 0.689441 0.050145 0.038829 0.221584 0.506735 0.159498 0.095635 0.238132 0.406093 0.298915 0.149902 0.145090 0.193913 0.282078 0.096706 0.427303 0.272324 0.154790 0.262469 0.310417 0.224484 0.458724 0.060144 0.256647 Consensus sequence: DBTHHAAAAAAAAVHDH Reverse complement motif 0.224484 0.060144 0.458724 0.256647 0.310417 0.154790 0.262469 0.272324 0.427303 0.282078 0.096706 0.193913 0.145090 0.298915 0.149902 0.406093 0.238132 0.159498 0.095635 0.506735 0.221584 0.050145 0.038829 0.689441 0.166681 0.118718 0.043692 0.670909 0.196850 0.048628 0.024557 0.729965 0.164558 0.093228 0.024737 0.717478 0.239573 0.095579 0.039353 0.625495 0.165407 0.099915 0.067576 0.667102 0.223664 0.070898 0.070668 0.634770 0.208189 0.292429 0.103252 0.396130 0.216489 0.101348 0.490160 0.192003 0.604406 0.131358 0.153983 0.110252 0.343354 0.312681 0.220770 0.123195 0.155083 0.490906 0.152982 0.201030 Consensus sequence: DDHBTTTTTTTTHDAVH Alignment: DDHBTTTTTTTTHDAVH -YWTKYWTKTKWYKKWR ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00051 Sox8_primary Reverse Complement Original Motif Forward 2 16 0.039270 Species: Mus musculus Original motif 0.244952 0.197659 0.278014 0.279374 0.244434 0.136006 0.278446 0.341114 0.512025 0.129954 0.139069 0.218951 0.190001 0.086232 0.125500 0.598267 0.154692 0.325860 0.193904 0.325544 0.384624 0.130540 0.035110 0.449726 0.945021 0.006713 0.011975 0.036291 0.008386 0.026630 0.004166 0.960817 0.020908 0.005554 0.009294 0.964244 0.149285 0.038995 0.806085 0.005635 0.110990 0.007155 0.007797 0.874058 0.087283 0.099671 0.059611 0.753435 0.250662 0.432576 0.082152 0.234610 0.251277 0.174578 0.147771 0.426374 0.205121 0.137656 0.296366 0.360857 0.316796 0.152457 0.164403 0.366344 0.475864 0.128717 0.153551 0.241867 Consensus sequence: DDATBWATTGTTHHDDD Reverse complement motif 0.241867 0.128717 0.153551 0.475864 0.366344 0.152457 0.164403 0.316796 0.360857 0.137656 0.296366 0.205121 0.426374 0.174578 0.147771 0.251277 0.250662 0.082152 0.432576 0.234610 0.753435 0.099671 0.059611 0.087283 0.874058 0.007155 0.007797 0.110990 0.149285 0.806085 0.038995 0.005635 0.964244 0.005554 0.009294 0.020908 0.960817 0.026630 0.004166 0.008386 0.036291 0.006713 0.011975 0.945021 0.449726 0.130540 0.035110 0.384624 0.154692 0.193904 0.325860 0.325544 0.598267 0.086232 0.125500 0.190001 0.218951 0.129954 0.139069 0.512025 0.341114 0.136006 0.278446 0.244434 0.279374 0.197659 0.278014 0.244952 Consensus sequence: DDDHDAACAATWBATDD Alignment: DDATBWATTGTTHHDDD -YWTKYWTKTKWYKKWR ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00061 Foxl1_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 1 16 0.040156 Species: Mus musculus Original motif 0.560226 0.121586 0.083231 0.234957 0.318077 0.149137 0.179955 0.352831 0.482497 0.118420 0.173594 0.225488 0.200166 0.160901 0.191493 0.447440 0.033691 0.569719 0.018901 0.377690 0.638020 0.166545 0.021254 0.174181 0.573953 0.105729 0.009308 0.311010 0.890518 0.053364 0.013424 0.042694 0.910758 0.028166 0.032648 0.028428 0.013358 0.738707 0.023981 0.223953 0.911783 0.018754 0.031898 0.037564 0.702891 0.068940 0.076823 0.151346 0.445507 0.320769 0.057216 0.176507 0.587798 0.129586 0.140592 0.142024 0.258981 0.330939 0.167334 0.242747 0.362022 0.333796 0.145861 0.158320 Consensus sequence: ADDDYAWAACAAMAHH Reverse complement motif 0.158320 0.333796 0.145861 0.362022 0.258981 0.167334 0.330939 0.242747 0.142024 0.129586 0.140592 0.587798 0.176507 0.320769 0.057216 0.445507 0.151346 0.068940 0.076823 0.702891 0.037564 0.018754 0.031898 0.911783 0.013358 0.023981 0.738707 0.223953 0.028428 0.028166 0.032648 0.910758 0.042694 0.053364 0.013424 0.890518 0.311010 0.105729 0.009308 0.573953 0.174181 0.166545 0.021254 0.638020 0.033691 0.018901 0.569719 0.377690 0.447440 0.160901 0.191493 0.200166 0.225488 0.118420 0.173594 0.482497 0.352831 0.149137 0.179955 0.318077 0.234957 0.121586 0.083231 0.560226 Consensus sequence: HDTYTTGTTWTKDDDT Alignment: HDTYTTGTTWTKDDDT YWTKYWTKTKWYKKWR ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00255 Dbx1 Original Motif Original Motif Forward 1 16 0.041038 Species: Mus musculus Original motif 0.193358 0.228955 0.160692 0.416995 0.611960 0.068099 0.048494 0.271446 0.459770 0.057385 0.307824 0.175021 0.226103 0.127408 0.101076 0.545413 0.241226 0.228640 0.067165 0.462969 0.621421 0.137382 0.078412 0.162785 0.737972 0.031899 0.051833 0.178295 0.110802 0.098497 0.073668 0.717033 0.129567 0.110629 0.036048 0.723756 0.729342 0.031636 0.088480 0.150541 0.540257 0.104927 0.048065 0.306750 0.195987 0.148698 0.098709 0.556606 0.587529 0.072583 0.170635 0.169252 0.497416 0.161804 0.219409 0.121371 0.278831 0.114362 0.139037 0.467771 0.297462 0.189119 0.187754 0.325665 0.397268 0.140582 0.287428 0.174722 Consensus sequence: HARTHAATTAWTAVDHD Reverse complement motif 0.174722 0.140582 0.287428 0.397268 0.325665 0.189119 0.187754 0.297462 0.467771 0.114362 0.139037 0.278831 0.121371 0.161804 0.219409 0.497416 0.169252 0.072583 0.170635 0.587529 0.556606 0.148698 0.098709 0.195987 0.306750 0.104927 0.048065 0.540257 0.150541 0.031636 0.088480 0.729342 0.723756 0.110629 0.036048 0.129567 0.717033 0.098497 0.073668 0.110802 0.178295 0.031899 0.051833 0.737972 0.162785 0.137382 0.078412 0.621421 0.462969 0.228640 0.067165 0.241226 0.545413 0.127408 0.101076 0.226103 0.175021 0.057385 0.307824 0.459770 0.271446 0.068099 0.048494 0.611960 0.416995 0.228955 0.160692 0.193358 Consensus sequence: DHDBTAWTAATTHAKTH Alignment: HARTHAATTAWTAVDHD KWRRKWRARAWMRAWM- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 153 Motif name: C153 Original motif 0.080000 0.390000 0.100000 0.430000 0.009901 0.455446 0.118812 0.415842 0.613861 0.009901 0.247525 0.128713 0.099010 0.138614 0.752475 0.009901 0.445545 0.089109 0.455446 0.009901 0.210000 0.310000 0.400000 0.080000 0.148515 0.009901 0.009901 0.831683 0.059406 0.009901 0.831683 0.099010 0.210000 0.010000 0.770000 0.010000 0.130000 0.620000 0.240000 0.010000 0.020000 0.410000 0.320000 0.250000 0.010000 0.350000 0.190000 0.450000 0.059406 0.178218 0.108911 0.653465 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.380000 0.090000 0.480000 0.050000 Consensus sequence: YYAGRVTGGCBYTGR Reserve complement motif 0.380000 0.480000 0.090000 0.050000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.653465 0.178218 0.108911 0.059406 0.450000 0.350000 0.190000 0.010000 0.020000 0.320000 0.410000 0.250000 0.130000 0.240000 0.620000 0.010000 0.210000 0.770000 0.010000 0.010000 0.059406 0.831683 0.009901 0.099010 0.831683 0.009901 0.009901 0.148515 0.210000 0.400000 0.310000 0.080000 0.445545 0.455446 0.089109 0.009901 0.099010 0.752475 0.138614 0.009901 0.128713 0.009901 0.247525 0.613861 0.009901 0.118812 0.455446 0.415842 0.430000 0.390000 0.100000 0.080000 Consensus sequence: MCAMBGCCAVMCTKM ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 153 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 7 15 0.039827 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB ------YYAGRVTGGCBYTGR-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 3 15 0.041077 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH --MCAMBGCCAVMCTKM------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00035 Hic1_primary Reverse Complement Original Motif Forward 1 15 0.044934 Species: Mus musculus Original motif 0.275207 0.211375 0.250277 0.263141 0.135064 0.327571 0.217556 0.319808 0.145659 0.242586 0.267179 0.344576 0.656519 0.009712 0.315174 0.018595 0.002265 0.004755 0.001656 0.991325 0.041873 0.001128 0.955340 0.001659 0.001306 0.974834 0.022215 0.001645 0.001978 0.992066 0.002638 0.003317 0.921032 0.072388 0.001237 0.005344 0.582027 0.211694 0.115736 0.090542 0.005990 0.927450 0.028306 0.038254 0.027374 0.799879 0.053667 0.119080 0.203510 0.191263 0.168997 0.436229 0.402253 0.154087 0.291346 0.152314 0.201201 0.414412 0.145330 0.239056 0.241094 0.332661 0.143464 0.282781 Consensus sequence: DBBATGCCAACCHVHH Reverse complement motif 0.241094 0.143464 0.332661 0.282781 0.201201 0.145330 0.414412 0.239056 0.152314 0.154087 0.291346 0.402253 0.436229 0.191263 0.168997 0.203510 0.027374 0.053667 0.799879 0.119080 0.005990 0.028306 0.927450 0.038254 0.090542 0.211694 0.115736 0.582027 0.005344 0.072388 0.001237 0.921032 0.001978 0.002638 0.992066 0.003317 0.001306 0.022215 0.974834 0.001645 0.041873 0.955340 0.001128 0.001659 0.991325 0.004755 0.001656 0.002265 0.018595 0.009712 0.315174 0.656519 0.344576 0.242586 0.267179 0.145659 0.135064 0.217556 0.327571 0.319808 0.263141 0.211375 0.250277 0.275207 Consensus sequence: DDBHGGTTGGCATVBD Alignment: DDBHGGTTGGCATVBD MCAMBGCCAVMCTKM- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00007 Egr1_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 15 0.046050 Species: Mus musculus Original motif 0.182057 0.230014 0.276532 0.311397 0.122004 0.156883 0.366166 0.354947 0.209446 0.335433 0.185677 0.269444 0.140035 0.276547 0.302466 0.280952 0.124879 0.019371 0.809895 0.045854 0.647807 0.117014 0.183956 0.051224 0.021434 0.011745 0.954633 0.012188 0.017853 0.009441 0.315429 0.657277 0.166123 0.008326 0.807215 0.018337 0.022775 0.008972 0.947283 0.020970 0.038795 0.033592 0.781209 0.146405 0.728916 0.032888 0.088836 0.149360 0.197826 0.427858 0.055755 0.318561 0.264938 0.196184 0.092516 0.446362 0.267969 0.195624 0.318766 0.217641 0.225006 0.250404 0.267265 0.257324 Consensus sequence: BBHBGAGTGGGAHHDB Reverse complement motif 0.225006 0.267265 0.250404 0.257324 0.267969 0.318766 0.195624 0.217641 0.446362 0.196184 0.092516 0.264938 0.197826 0.055755 0.427858 0.318561 0.149360 0.032888 0.088836 0.728916 0.038795 0.781209 0.033592 0.146405 0.022775 0.947283 0.008972 0.020970 0.166123 0.807215 0.008326 0.018337 0.657277 0.009441 0.315429 0.017853 0.021434 0.954633 0.011745 0.012188 0.051224 0.117014 0.183956 0.647807 0.124879 0.809895 0.019371 0.045854 0.140035 0.302466 0.276547 0.280952 0.209446 0.185677 0.335433 0.269444 0.122004 0.366166 0.156883 0.354947 0.311397 0.230014 0.276532 0.182057 Consensus sequence: BHHDTCCCACTCBDBV Alignment: BBHBGAGTGGGAHHDB -YYAGRVTGGCBYTGR ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v015681_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 2 15 0.046130 Species: Mus musculus Original motif 0.214165 0.143436 0.372522 0.269876 0.314445 0.406003 0.160351 0.119201 0.137147 0.092924 0.042921 0.727007 0.044121 0.072843 0.051741 0.831295 0.261292 0.324124 0.298498 0.116086 0.258125 0.323243 0.263362 0.155271 0.204557 0.589399 0.107153 0.098891 0.371021 0.244027 0.291102 0.093849 0.096327 0.572718 0.011797 0.319159 0.027282 0.046183 0.844519 0.082016 0.018921 0.012887 0.915917 0.052275 0.364793 0.166722 0.084229 0.384256 0.028216 0.011233 0.951056 0.009495 0.054974 0.004738 0.890377 0.049911 0.006802 0.312915 0.134247 0.546036 0.241289 0.628210 0.104788 0.025713 0.237863 0.302807 0.213018 0.246311 0.349399 0.203220 0.086635 0.360746 0.386634 0.144693 0.246895 0.221779 0.425101 0.354676 0.093374 0.126849 0.060272 0.391320 0.104905 0.443503 0.162090 0.190233 0.227433 0.420244 Consensus sequence: DVTTVVCVYGGHGGYCHHDMYB Reverse complement motif 0.420244 0.190233 0.227433 0.162090 0.443503 0.391320 0.104905 0.060272 0.126849 0.354676 0.093374 0.425101 0.221779 0.144693 0.246895 0.386634 0.360746 0.203220 0.086635 0.349399 0.237863 0.213018 0.302807 0.246311 0.241289 0.104788 0.628210 0.025713 0.546036 0.312915 0.134247 0.006802 0.054974 0.890377 0.004738 0.049911 0.028216 0.951056 0.011233 0.009495 0.384256 0.166722 0.084229 0.364793 0.018921 0.915917 0.012887 0.052275 0.027282 0.844519 0.046183 0.082016 0.096327 0.011797 0.572718 0.319159 0.093849 0.244027 0.291102 0.371021 0.204557 0.107153 0.589399 0.098891 0.258125 0.263362 0.323243 0.155271 0.261292 0.298498 0.324124 0.116086 0.831295 0.072843 0.051741 0.044121 0.727007 0.092924 0.042921 0.137147 0.314445 0.160351 0.406003 0.119201 0.214165 0.372522 0.143436 0.269876 Consensus sequence: VMYDHDGMCCHCCKBGVVAAVH Alignment: VMYDHDGMCCHCCKBGVVAAVH -MCAMBGCCAVMCTKM------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Results created by MOTIFSIM on 11-19-2016 22:04:18 Runtime: 1193.594502 seconds MOTIFSIM is written by Ngoc Tam L. Tran