**************************************************************************************************************************************************************************************************** MOTIFSIM - Motif Similarity Detection Tool Version 2.1 **************************************************************************************************************************************************************************************************** INPUT **************************************************************************************************************************************************************************************************** Input Parameters Number of files: 2 Number of top significant motifs: 10 Number of best matches: 10 Similarity cutoff: >= 0.75 Matching motif database: UniProbe Mus Musculus Phylogenetic tree: Yes Combined similar motifs: Yes Output file type: All Output file format: All Input files and motif counts File name Count of motifs Dataset # MEME-ChIP_DM721.txt 11 1 PScanChIP_DM721.txt 37 2 **************************************************************************************************************************************************************************************************** RESULTS **************************************************************************************************************************************************************************************************** ********************************************************************** Best Matches in Database for Each Motif (Highest to Lowest) ***************************************************************** Dataset #: 1 Motif ID: 1 Motif name: Motif 1 Original motif 0.577889 0.000000 0.422111 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.419095 0.000000 0.580905 0.000000 Consensus sequence: RGGAAR Reserve complement motif 0.419095 0.580905 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.422111 0.577889 Consensus sequence: MTTCCK ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 1 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00090 Elf3_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 5 6 0.000000 Species: Mus musculus Original motif 0.338918 0.138284 0.180304 0.342493 0.614328 0.046536 0.066645 0.272492 0.248636 0.405469 0.125813 0.220081 0.389942 0.368832 0.198252 0.042975 0.473107 0.443315 0.064884 0.018693 0.032285 0.005365 0.952727 0.009624 0.021365 0.006895 0.955827 0.015913 0.976258 0.006536 0.010998 0.006209 0.892027 0.007456 0.003678 0.096839 0.433755 0.037682 0.520487 0.008076 0.098931 0.159997 0.023691 0.717381 0.423164 0.077419 0.201004 0.298413 0.572262 0.158763 0.164963 0.104012 Consensus sequence: DAHMMGGAARTDA Reverse complement motif 0.104012 0.158763 0.164963 0.572262 0.298413 0.077419 0.201004 0.423164 0.717381 0.159997 0.023691 0.098931 0.433755 0.520487 0.037682 0.008076 0.096839 0.007456 0.003678 0.892027 0.006209 0.006536 0.010998 0.976258 0.021365 0.955827 0.006895 0.015913 0.032285 0.952727 0.005365 0.009624 0.018693 0.443315 0.064884 0.473107 0.042975 0.368832 0.198252 0.389942 0.248636 0.125813 0.405469 0.220081 0.272492 0.046536 0.066645 0.614328 0.342493 0.138284 0.180304 0.338918 Consensus sequence: TDAMTTCCYYDTD Alignment: TDAMTTCCYYDTD ---MTTCCK---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00085 Sfpi1_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 6 6 0.003517 Species: Mus musculus Original motif 0.211586 0.273653 0.234763 0.279998 0.298032 0.104818 0.290385 0.306764 0.593467 0.048056 0.154602 0.203875 0.459746 0.052697 0.169949 0.317608 0.188623 0.155357 0.591543 0.064477 0.402746 0.286227 0.290285 0.020742 0.048569 0.001240 0.946397 0.003793 0.004354 0.001387 0.990819 0.003441 0.974272 0.001416 0.001466 0.022847 0.938748 0.003090 0.000833 0.057329 0.045831 0.270321 0.674644 0.009204 0.055664 0.092552 0.026061 0.825722 0.301235 0.122653 0.267039 0.309073 0.278680 0.276099 0.219159 0.226061 Consensus sequence: BDAWGVGGAAGTDH Reverse complement motif 0.226061 0.276099 0.219159 0.278680 0.309073 0.122653 0.267039 0.301235 0.825722 0.092552 0.026061 0.055664 0.045831 0.674644 0.270321 0.009204 0.057329 0.003090 0.000833 0.938748 0.022847 0.001416 0.001466 0.974272 0.004354 0.990819 0.001387 0.003441 0.048569 0.946397 0.001240 0.003793 0.020742 0.286227 0.290285 0.402746 0.188623 0.591543 0.155357 0.064477 0.317608 0.052697 0.169949 0.459746 0.203875 0.048056 0.154602 0.593467 0.306764 0.104818 0.290385 0.298032 0.279998 0.273653 0.234763 0.211586 Consensus sequence: HDACTTCCBCWTDV Alignment: HDACTTCCBCWTDV ---MTTCCK----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00414 Ets1 Reverse Complement Reverse Complement Forward 5 6 0.003562 Species: Mus musculus Original motif 0.185517 0.352264 0.234781 0.227438 0.267475 0.153636 0.374632 0.204257 0.209599 0.165342 0.278644 0.346414 0.223668 0.129204 0.369628 0.277501 0.215373 0.320617 0.160255 0.303754 0.836593 0.030586 0.105229 0.027592 0.018622 0.916166 0.063271 0.001942 0.137490 0.857089 0.004870 0.000551 0.002748 0.001698 0.993222 0.002332 0.003309 0.001651 0.993223 0.001817 0.990419 0.000878 0.002565 0.006138 0.815068 0.016317 0.001274 0.167342 0.373416 0.011725 0.613373 0.001487 0.124276 0.194676 0.025016 0.656033 0.359192 0.227478 0.212937 0.200393 0.314691 0.211253 0.233074 0.240981 0.285894 0.131047 0.225562 0.357496 Consensus sequence: BDDDHACCGGAARTVDD Reverse complement motif 0.357496 0.131047 0.225562 0.285894 0.240981 0.211253 0.233074 0.314691 0.200393 0.227478 0.212937 0.359192 0.656033 0.194676 0.025016 0.124276 0.373416 0.613373 0.011725 0.001487 0.167342 0.016317 0.001274 0.815068 0.006138 0.000878 0.002565 0.990419 0.003309 0.993223 0.001651 0.001817 0.002748 0.993222 0.001698 0.002332 0.137490 0.004870 0.857089 0.000551 0.018622 0.063271 0.916166 0.001942 0.027592 0.030586 0.105229 0.836593 0.215373 0.160255 0.320617 0.303754 0.223668 0.369628 0.129204 0.277501 0.346414 0.165342 0.278644 0.209599 0.267475 0.374632 0.153636 0.204257 0.185517 0.234781 0.352264 0.227438 Consensus sequence: DDBAMTTCCGGTDHDHB Alignment: DDBAMTTCCGGTDHDHB ----MTTCCK------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00409 Elf5 Original Motif Original Motif Backward 4 6 0.004400 Species: Mus musculus Original motif 0.179167 0.229135 0.279326 0.312372 0.421239 0.102900 0.145609 0.330252 0.791978 0.009721 0.028951 0.169350 0.237609 0.375543 0.161526 0.225321 0.145845 0.325411 0.516045 0.012699 0.431007 0.516333 0.051679 0.000982 0.005750 0.001408 0.990928 0.001915 0.002025 0.001886 0.992021 0.004068 0.986405 0.001705 0.001039 0.010851 0.950652 0.003619 0.000482 0.045248 0.165221 0.013897 0.819076 0.001805 0.032042 0.049374 0.014632 0.903953 0.285325 0.108010 0.127373 0.479292 0.366131 0.141246 0.290661 0.201963 Consensus sequence: BWAHSMGGAAGTWD Reverse complement motif 0.201963 0.141246 0.290661 0.366131 0.479292 0.108010 0.127373 0.285325 0.903953 0.049374 0.014632 0.032042 0.165221 0.819076 0.013897 0.001805 0.045248 0.003619 0.000482 0.950652 0.010851 0.001705 0.001039 0.986405 0.002025 0.992021 0.001886 0.004068 0.005750 0.990928 0.001408 0.001915 0.431007 0.051679 0.516333 0.000982 0.145845 0.516045 0.325411 0.012699 0.237609 0.161526 0.375543 0.225321 0.169350 0.009721 0.028951 0.791978 0.330252 0.102900 0.145609 0.421239 0.312372 0.229135 0.279326 0.179167 Consensus sequence: DWACTTCCRSDTWV Alignment: BWAHSMGGAAGTWD -----RGGAAR--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00015 Ehf_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 4 6 0.006556 Species: Mus musculus Original motif 0.327238 0.304037 0.232174 0.136551 0.198306 0.222758 0.316421 0.262515 0.252373 0.217079 0.267210 0.263337 0.633781 0.039800 0.036914 0.289504 0.160405 0.384709 0.220671 0.234215 0.134205 0.590541 0.266074 0.009179 0.210933 0.755978 0.030378 0.002710 0.011856 0.001472 0.984138 0.002533 0.003235 0.001605 0.989465 0.005695 0.984189 0.002418 0.002842 0.010551 0.884492 0.002651 0.002095 0.110762 0.249047 0.054607 0.690939 0.005407 0.124602 0.154669 0.047597 0.673132 0.375217 0.110561 0.230374 0.283848 0.402951 0.186789 0.219551 0.190710 Consensus sequence: VBDABCCGGAAGTDD Reverse complement motif 0.190710 0.186789 0.219551 0.402951 0.283848 0.110561 0.230374 0.375217 0.673132 0.154669 0.047597 0.124602 0.249047 0.690939 0.054607 0.005407 0.110762 0.002651 0.002095 0.884492 0.010551 0.002418 0.002842 0.984189 0.003235 0.989465 0.001605 0.005695 0.011856 0.984138 0.001472 0.002533 0.210933 0.030378 0.755978 0.002710 0.134205 0.266074 0.590541 0.009179 0.160405 0.220671 0.384709 0.234215 0.289504 0.039800 0.036914 0.633781 0.252373 0.267210 0.217079 0.263337 0.198306 0.316421 0.222758 0.262515 0.136551 0.304037 0.232174 0.327238 Consensus sequence: DDACTTCCGGBTHBB Alignment: DDACTTCCGGBTHBB ---MTTCCK------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00013 Gabpa_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 6 6 0.006637 Species: Mus musculus Original motif 0.347579 0.362501 0.122567 0.167353 0.291516 0.289483 0.243331 0.175670 0.444682 0.202283 0.117720 0.235315 0.286823 0.160493 0.154998 0.397686 0.777207 0.031168 0.138668 0.052958 0.020187 0.935458 0.041166 0.003190 0.044954 0.947416 0.006517 0.001112 0.004962 0.002315 0.991007 0.001716 0.002572 0.002766 0.992355 0.002307 0.989037 0.001723 0.001769 0.007471 0.898665 0.004213 0.001115 0.096007 0.219936 0.020606 0.754552 0.004906 0.021686 0.134459 0.014432 0.829423 0.197325 0.176901 0.362465 0.263309 0.245978 0.264865 0.197336 0.291821 0.323340 0.203013 0.195793 0.277854 0.279355 0.250354 0.250472 0.219819 Consensus sequence: HVHHACCGGAAGTDHHV Reverse complement motif 0.219819 0.250354 0.250472 0.279355 0.277854 0.203013 0.195793 0.323340 0.291821 0.264865 0.197336 0.245978 0.197325 0.362465 0.176901 0.263309 0.829423 0.134459 0.014432 0.021686 0.219936 0.754552 0.020606 0.004906 0.096007 0.004213 0.001115 0.898665 0.007471 0.001723 0.001769 0.989037 0.002572 0.992355 0.002766 0.002307 0.004962 0.991007 0.002315 0.001716 0.044954 0.006517 0.947416 0.001112 0.020187 0.041166 0.935458 0.003190 0.052958 0.031168 0.138668 0.777207 0.397686 0.160493 0.154998 0.286823 0.235315 0.202283 0.117720 0.444682 0.175670 0.289483 0.243331 0.291516 0.347579 0.122567 0.362501 0.167353 Consensus sequence: BHHHACTTCCGGTHHBD Alignment: BHHHACTTCCGGTHHBD -----MTTCCK------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00413 Elf4 Reverse Complement Original Motif Forward 6 6 0.008964 Species: Mus musculus Original motif 0.349744 0.139466 0.209326 0.301464 0.080478 0.359482 0.307083 0.252956 0.145756 0.213763 0.350557 0.289924 0.317307 0.199359 0.096089 0.387245 0.868576 0.009724 0.088821 0.032878 0.001975 0.827004 0.014159 0.156862 0.045494 0.000985 0.001907 0.951615 0.011012 0.001203 0.002186 0.985599 0.002743 0.992908 0.002226 0.002123 0.001498 0.990840 0.001556 0.006106 0.000951 0.005138 0.880591 0.113319 0.003127 0.107962 0.867980 0.020930 0.156602 0.055355 0.396563 0.391480 0.421246 0.049379 0.084495 0.444880 0.223879 0.068063 0.203809 0.504249 0.144100 0.323579 0.131544 0.400777 Consensus sequence: DBBHACTTCCGGKWTH Reverse complement motif 0.400777 0.323579 0.131544 0.144100 0.504249 0.068063 0.203809 0.223879 0.444880 0.049379 0.084495 0.421246 0.156602 0.396563 0.055355 0.391480 0.003127 0.867980 0.107962 0.020930 0.000951 0.880591 0.005138 0.113319 0.001498 0.001556 0.990840 0.006106 0.002743 0.002226 0.992908 0.002123 0.985599 0.001203 0.002186 0.011012 0.951615 0.000985 0.001907 0.045494 0.001975 0.014159 0.827004 0.156862 0.032878 0.009724 0.088821 0.868576 0.387245 0.199359 0.096089 0.317307 0.145756 0.350557 0.213763 0.289924 0.080478 0.307083 0.359482 0.252956 0.301464 0.139466 0.209326 0.349744 Consensus sequence: HAWYCCGGAAGTHBBD Alignment: DBBHACTTCCGGKWTH -----MTTCCK----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00419 Spic Original Motif Original Motif Backward 4 6 0.009755 Species: Mus musculus Original motif 0.372554 0.181557 0.296001 0.149888 0.734552 0.057250 0.044752 0.163446 0.707604 0.045049 0.110341 0.137006 0.637848 0.057252 0.071934 0.232966 0.125449 0.108933 0.689441 0.076176 0.266215 0.517339 0.207018 0.009428 0.015016 0.002582 0.979670 0.002732 0.004303 0.002322 0.989973 0.003401 0.982327 0.003552 0.003393 0.010727 0.974155 0.001662 0.003294 0.020889 0.040023 0.128522 0.821560 0.009894 0.027635 0.045828 0.016297 0.910239 0.317500 0.045635 0.172234 0.464631 0.342838 0.107812 0.284775 0.264576 Consensus sequence: VAAAGMGGAAGTWD Reverse complement motif 0.264576 0.107812 0.284775 0.342838 0.464631 0.045635 0.172234 0.317500 0.910239 0.045828 0.016297 0.027635 0.040023 0.821560 0.128522 0.009894 0.020889 0.001662 0.003294 0.974155 0.010727 0.003552 0.003393 0.982327 0.004303 0.989973 0.002322 0.003401 0.015016 0.979670 0.002582 0.002732 0.266215 0.207018 0.517339 0.009428 0.125449 0.689441 0.108933 0.076176 0.232966 0.057252 0.071934 0.637848 0.137006 0.045049 0.110341 0.707604 0.163446 0.057250 0.044752 0.734552 0.149888 0.181557 0.296001 0.372554 Consensus sequence: DWACTTCCRCTTTB Alignment: VAAAGMGGAAGTWD -----RGGAAR--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00418 Etv6 Reverse Complement Original Motif Forward 7 6 0.010345 Species: Mus musculus Original motif 0.354972 0.069107 0.299350 0.276571 0.209701 0.408003 0.227382 0.154914 0.284336 0.375266 0.162604 0.177794 0.176569 0.181438 0.342172 0.299820 0.106551 0.204378 0.060299 0.628772 0.884088 0.003252 0.103113 0.009546 0.001110 0.704391 0.006294 0.288205 0.014992 0.000892 0.001401 0.982714 0.004842 0.001887 0.002470 0.990801 0.002724 0.992864 0.002206 0.002206 0.001792 0.991200 0.001615 0.005393 0.005151 0.010157 0.940259 0.044433 0.017780 0.199839 0.761921 0.020459 0.230834 0.269936 0.119652 0.379577 0.233019 0.093692 0.034743 0.638546 0.194739 0.181763 0.175340 0.448159 0.145452 0.293709 0.335917 0.224922 Consensus sequence: DVHBTACTTCCGGHTHB Reverse complement motif 0.145452 0.335917 0.293709 0.224922 0.448159 0.181763 0.175340 0.194739 0.638546 0.093692 0.034743 0.233019 0.379577 0.269936 0.119652 0.230834 0.017780 0.761921 0.199839 0.020459 0.005151 0.940259 0.010157 0.044433 0.001792 0.001615 0.991200 0.005393 0.002724 0.002206 0.992864 0.002206 0.990801 0.001887 0.002470 0.004842 0.982714 0.000892 0.001401 0.014992 0.001110 0.006294 0.704391 0.288205 0.009546 0.003252 0.103113 0.884088 0.628772 0.204378 0.060299 0.106551 0.176569 0.342172 0.181438 0.299820 0.284336 0.162604 0.375266 0.177794 0.209701 0.227382 0.408003 0.154914 0.276571 0.069107 0.299350 0.354972 Consensus sequence: BHAHCCGGAAGTABDVD Alignment: DVHBTACTTCCGGHTHB ------MTTCCK----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00404 Elf2 Reverse Complement Original Motif Backward 6 6 0.010491 Species: Mus musculus Original motif 0.381592 0.198656 0.201326 0.218426 0.091509 0.331644 0.302830 0.274017 0.165404 0.272650 0.352528 0.209418 0.322145 0.255685 0.129399 0.292771 0.853490 0.012857 0.078563 0.055090 0.002655 0.792907 0.026436 0.178002 0.058923 0.001063 0.002976 0.937038 0.014944 0.001369 0.002865 0.980822 0.003786 0.992305 0.002102 0.001807 0.001365 0.988969 0.001554 0.008111 0.001527 0.009592 0.891056 0.097824 0.003671 0.143708 0.836117 0.016503 0.242982 0.061527 0.305342 0.390148 0.426709 0.117673 0.096260 0.359357 0.202520 0.113885 0.262005 0.421589 0.137957 0.359367 0.163919 0.338758 Consensus sequence: DBBHACTTCCGGDWDB Reverse complement motif 0.137957 0.163919 0.359367 0.338758 0.421589 0.113885 0.262005 0.202520 0.359357 0.117673 0.096260 0.426709 0.390148 0.061527 0.305342 0.242982 0.003671 0.836117 0.143708 0.016503 0.001527 0.891056 0.009592 0.097824 0.001365 0.001554 0.988969 0.008111 0.003786 0.002102 0.992305 0.001807 0.980822 0.001369 0.002865 0.014944 0.937038 0.001063 0.002976 0.058923 0.002655 0.026436 0.792907 0.178002 0.055090 0.012857 0.078563 0.853490 0.292771 0.255685 0.129399 0.322145 0.165404 0.352528 0.272650 0.209418 0.091509 0.302830 0.331644 0.274017 0.218426 0.198656 0.201326 0.381592 Consensus sequence: BDWDCCGGAAGTHBBD Alignment: DBBHACTTCCGGDWDB -----MTTCCK----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 2 Motif name: Motif 2 Original motif 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.483355 0.516645 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.832898 0.000000 0.167102 0.000000 Consensus sequence: AMACA Reserve complement motif 0.000000 0.000000 0.167102 0.832898 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.483355 0.000000 0.516645 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 Consensus sequence: TGTRT ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 2 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00042 Gm397_second Original Motif Original Motif Forward 7 5 0.000000 Species: Mus musculus Original motif 0.360404 0.193218 0.248888 0.197490 0.286498 0.224597 0.426555 0.062349 0.347032 0.440548 0.033161 0.179259 0.337062 0.193658 0.385751 0.083529 0.108793 0.005723 0.878300 0.007184 0.015151 0.973406 0.009324 0.002118 0.972117 0.003915 0.019783 0.004185 0.010144 0.980912 0.003106 0.005839 0.974864 0.007532 0.015914 0.001691 0.012441 0.939195 0.029256 0.019108 0.759620 0.106164 0.073819 0.060397 0.157234 0.818234 0.007449 0.017083 0.050076 0.063608 0.505171 0.381144 0.131903 0.538163 0.124608 0.205325 0.367623 0.286526 0.240931 0.104919 0.357798 0.317606 0.097711 0.226885 Consensus sequence: DVMVGCACACACKCVH Reverse complement motif 0.226885 0.317606 0.097711 0.357798 0.104919 0.286526 0.240931 0.367623 0.131903 0.124608 0.538163 0.205325 0.050076 0.505171 0.063608 0.381144 0.157234 0.007449 0.818234 0.017083 0.060397 0.106164 0.073819 0.759620 0.012441 0.029256 0.939195 0.019108 0.001691 0.007532 0.015914 0.974864 0.010144 0.003106 0.980912 0.005839 0.004185 0.003915 0.019783 0.972117 0.015151 0.009324 0.973406 0.002118 0.108793 0.878300 0.005723 0.007184 0.337062 0.385751 0.193658 0.083529 0.347032 0.033161 0.440548 0.179259 0.286498 0.426555 0.224597 0.062349 0.197490 0.193218 0.248888 0.360404 Consensus sequence: HBGYGTGTGTGCVRVD Alignment: DVMVGCACACACKCVH ------AMACA----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00025 Foxk1_primary Original Motif Original Motif Backward 6 5 0.006054 Species: Mus musculus Original motif 0.338172 0.192194 0.207817 0.261817 0.407924 0.117261 0.278236 0.196580 0.595570 0.070480 0.119221 0.214729 0.710845 0.038748 0.052600 0.197807 0.124647 0.116138 0.178053 0.581162 0.201602 0.005514 0.792110 0.000774 0.024590 0.004193 0.001331 0.969886 0.919465 0.077871 0.000760 0.001904 0.972342 0.010395 0.000580 0.016683 0.991045 0.001495 0.003585 0.003875 0.001358 0.885197 0.000980 0.112465 0.990318 0.001846 0.002968 0.004867 0.804563 0.063147 0.023496 0.108795 0.564824 0.087976 0.102865 0.244336 0.269947 0.300278 0.285008 0.144767 0.337905 0.220102 0.253694 0.188299 0.153781 0.274135 0.318343 0.253741 Consensus sequence: DDAATGTAAACAAAVVB Reverse complement motif 0.153781 0.318343 0.274135 0.253741 0.188299 0.220102 0.253694 0.337905 0.269947 0.285008 0.300278 0.144767 0.244336 0.087976 0.102865 0.564824 0.108795 0.063147 0.023496 0.804563 0.004867 0.001846 0.002968 0.990318 0.001358 0.000980 0.885197 0.112465 0.003875 0.001495 0.003585 0.991045 0.016683 0.010395 0.000580 0.972342 0.001904 0.077871 0.000760 0.919465 0.969886 0.004193 0.001331 0.024590 0.201602 0.792110 0.005514 0.000774 0.581162 0.116138 0.178053 0.124647 0.197807 0.038748 0.052600 0.710845 0.214729 0.070480 0.119221 0.595570 0.196580 0.117261 0.278236 0.407924 0.261817 0.192194 0.207817 0.338172 Consensus sequence: BBVTTTGTTTACATTDD Alignment: DDAATGTAAACAAAVVB -------AMACA----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00041 Foxj1_primary Original Motif Original Motif Forward 6 5 0.007533 Species: Mus musculus Original motif 0.446042 0.209997 0.124191 0.219770 0.271534 0.218131 0.245258 0.265077 0.368646 0.184693 0.168482 0.278180 0.348384 0.034204 0.583335 0.034077 0.040365 0.085618 0.013162 0.860855 0.824790 0.156631 0.004063 0.014515 0.835134 0.069381 0.003505 0.091980 0.967572 0.009280 0.006259 0.016890 0.009507 0.909577 0.004492 0.076424 0.947956 0.006994 0.008177 0.036873 0.599204 0.170666 0.065622 0.164508 0.708795 0.035865 0.070557 0.184782 0.303191 0.287145 0.184748 0.224917 0.285550 0.184167 0.248662 0.281621 0.235315 0.210836 0.254428 0.299421 0.220038 0.158539 0.286552 0.334871 Consensus sequence: HDHRTAAACAAAHDDD Reverse complement motif 0.334871 0.158539 0.286552 0.220038 0.299421 0.210836 0.254428 0.235315 0.281621 0.184167 0.248662 0.285550 0.224917 0.287145 0.184748 0.303191 0.184782 0.035865 0.070557 0.708795 0.164508 0.170666 0.065622 0.599204 0.036873 0.006994 0.008177 0.947956 0.009507 0.004492 0.909577 0.076424 0.016890 0.009280 0.006259 0.967572 0.091980 0.069381 0.003505 0.835134 0.014515 0.156631 0.004063 0.824790 0.860855 0.085618 0.013162 0.040365 0.348384 0.583335 0.034204 0.034077 0.278180 0.184693 0.168482 0.368646 0.265077 0.218131 0.245258 0.271534 0.219770 0.209997 0.124191 0.446042 Consensus sequence: DDDHTTTGTTTAMHDH Alignment: HDHRTAAACAAAHDDD -----AMACA------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00039 Foxj3_primary Original Motif Original Motif Backward 6 5 0.009656 Species: Mus musculus Original motif 0.273456 0.257473 0.208488 0.260583 0.338566 0.133379 0.306363 0.221693 0.475488 0.192852 0.156858 0.174803 0.506619 0.132646 0.170373 0.190362 0.349042 0.127275 0.325924 0.197759 0.303850 0.013619 0.678034 0.004497 0.014136 0.015691 0.003073 0.967100 0.913373 0.082928 0.001910 0.001789 0.956294 0.017745 0.000584 0.025378 0.987796 0.001685 0.004159 0.006360 0.002288 0.814764 0.001427 0.181521 0.986707 0.002688 0.003346 0.007259 0.787378 0.065481 0.057961 0.089180 0.572982 0.089910 0.066184 0.270924 0.224167 0.339979 0.258886 0.176968 0.268414 0.272007 0.239541 0.220038 0.241771 0.394748 0.174273 0.189208 Consensus sequence: HDHADGTAAACAAAVVH Reverse complement motif 0.241771 0.174273 0.394748 0.189208 0.268414 0.239541 0.272007 0.220038 0.224167 0.258886 0.339979 0.176968 0.270924 0.089910 0.066184 0.572982 0.089180 0.065481 0.057961 0.787378 0.007259 0.002688 0.003346 0.986707 0.002288 0.001427 0.814764 0.181521 0.006360 0.001685 0.004159 0.987796 0.025378 0.017745 0.000584 0.956294 0.001789 0.082928 0.001910 0.913373 0.967100 0.015691 0.003073 0.014136 0.303850 0.678034 0.013619 0.004497 0.197759 0.127275 0.325924 0.349042 0.190362 0.132646 0.170373 0.506619 0.174803 0.192852 0.156858 0.475488 0.221693 0.133379 0.306363 0.338566 0.260583 0.257473 0.208488 0.273456 Consensus sequence: DVVTTTGTTTACDTHDH Alignment: HDHADGTAAACAAAVVH -------AMACA----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00061 Foxl1_primary Original Motif Original Motif Backward 6 5 0.009895 Species: Mus musculus Original motif 0.323208 0.152915 0.185111 0.338766 0.428132 0.056109 0.099487 0.416272 0.659386 0.039965 0.035805 0.264843 0.647143 0.049206 0.078984 0.224667 0.208834 0.076592 0.071631 0.642943 0.341077 0.003865 0.649511 0.005547 0.016627 0.001866 0.001715 0.979792 0.952319 0.045294 0.000870 0.001516 0.988834 0.004620 0.000720 0.005826 0.989346 0.001005 0.006467 0.003182 0.001093 0.784230 0.001235 0.213442 0.991209 0.002017 0.001737 0.005037 0.801581 0.037084 0.023060 0.138274 0.528554 0.089350 0.107501 0.274595 0.208802 0.268646 0.368022 0.154530 0.280218 0.221367 0.340497 0.157918 0.146611 0.250725 0.293524 0.309140 Consensus sequence: DWAATRTAAACAAWVVB Reverse complement motif 0.309140 0.250725 0.293524 0.146611 0.280218 0.340497 0.221367 0.157918 0.208802 0.368022 0.268646 0.154530 0.274595 0.089350 0.107501 0.528554 0.138274 0.037084 0.023060 0.801581 0.005037 0.002017 0.001737 0.991209 0.001093 0.001235 0.784230 0.213442 0.003182 0.001005 0.006467 0.989346 0.005826 0.004620 0.000720 0.988834 0.001516 0.045294 0.000870 0.952319 0.979792 0.001866 0.001715 0.016627 0.341077 0.649511 0.003865 0.005547 0.642943 0.076592 0.071631 0.208834 0.224667 0.049206 0.078984 0.647143 0.264843 0.039965 0.035805 0.659386 0.416272 0.056109 0.099487 0.428132 0.338766 0.152915 0.185111 0.323208 Consensus sequence: VVVWTTGTTTAMATTWD Alignment: DWAATRTAAACAAWVVB -------AMACA----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00004 Sox14_secondary Reverse Complement Reverse Complement Backward 4 5 0.011645 Species: Mus musculus Original motif 0.191264 0.345487 0.212142 0.251106 0.105033 0.130838 0.338939 0.425191 0.126539 0.333031 0.233364 0.307066 0.641901 0.114039 0.195933 0.048127 0.153349 0.532437 0.272427 0.041786 0.934680 0.009395 0.019668 0.036257 0.013611 0.927298 0.037729 0.021361 0.964293 0.018416 0.006724 0.010568 0.962181 0.018004 0.014592 0.005223 0.229593 0.016301 0.007632 0.746474 0.268456 0.030092 0.519349 0.182102 0.201484 0.107350 0.588833 0.102334 0.253726 0.259057 0.242924 0.244293 0.168663 0.203061 0.347898 0.280378 0.175853 0.339716 0.301724 0.182707 Consensus sequence: BKBASACAATRGHBB Reverse complement motif 0.175853 0.301724 0.339716 0.182707 0.168663 0.347898 0.203061 0.280378 0.253726 0.242924 0.259057 0.244293 0.201484 0.588833 0.107350 0.102334 0.268456 0.519349 0.030092 0.182102 0.746474 0.016301 0.007632 0.229593 0.005223 0.018004 0.014592 0.962181 0.010568 0.018416 0.006724 0.964293 0.013611 0.037729 0.927298 0.021361 0.036257 0.009395 0.019668 0.934680 0.153349 0.272427 0.532437 0.041786 0.048127 0.114039 0.195933 0.641901 0.126539 0.233364 0.333031 0.307066 0.425191 0.130838 0.338939 0.105033 0.191264 0.212142 0.345487 0.251106 Consensus sequence: BBDCMATTGTSTBRB Alignment: BBDCMATTGTSTBRB -------TGTRT--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00073 Foxa2_primary Original Motif Original Motif Backward 6 5 0.014312 Species: Mus musculus Original motif 0.335487 0.205062 0.128957 0.330494 0.411635 0.179625 0.175701 0.233038 0.412976 0.128602 0.091890 0.366532 0.608396 0.079002 0.107142 0.205460 0.433474 0.035203 0.153143 0.378180 0.087552 0.005003 0.894586 0.012858 0.004459 0.038951 0.001109 0.955481 0.924470 0.068560 0.001165 0.005805 0.920483 0.070039 0.001674 0.007805 0.988335 0.001902 0.003155 0.006608 0.001527 0.656726 0.002699 0.339047 0.987505 0.001810 0.004336 0.006349 0.719584 0.065184 0.050384 0.164848 0.535389 0.099997 0.102849 0.261764 0.245215 0.272017 0.301499 0.181269 0.306107 0.209040 0.248687 0.236166 0.223744 0.278668 0.251931 0.245657 Consensus sequence: HHWAWGTAAAYAAAVDB Reverse complement motif 0.223744 0.251931 0.278668 0.245657 0.236166 0.209040 0.248687 0.306107 0.245215 0.301499 0.272017 0.181269 0.261764 0.099997 0.102849 0.535389 0.164848 0.065184 0.050384 0.719584 0.006349 0.001810 0.004336 0.987505 0.001527 0.002699 0.656726 0.339047 0.006608 0.001902 0.003155 0.988335 0.007805 0.070039 0.001674 0.920483 0.005805 0.068560 0.001165 0.924470 0.955481 0.038951 0.001109 0.004459 0.087552 0.894586 0.005003 0.012858 0.378180 0.035203 0.153143 0.433474 0.205460 0.079002 0.107142 0.608396 0.366532 0.128602 0.091890 0.412976 0.233038 0.179625 0.175701 0.411635 0.330494 0.205062 0.128957 0.335487 Consensus sequence: BDVTTTKTTTACWTWHH Alignment: HHWAWGTAAAYAAAVDB -------AMACA----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00026 Zscan4_secondary Reverse Complement Reverse Complement Forward 6 5 0.015323 Species: Mus musculus Original motif 0.275231 0.387763 0.112851 0.224155 0.269193 0.327669 0.360934 0.042204 0.439403 0.233641 0.022359 0.304596 0.409796 0.139856 0.390450 0.059899 0.038409 0.011231 0.936209 0.014150 0.067382 0.909014 0.021244 0.002359 0.962897 0.009563 0.009687 0.017854 0.043757 0.937596 0.007648 0.010999 0.970698 0.005379 0.016825 0.007098 0.066033 0.636556 0.043955 0.253456 0.797406 0.066726 0.011988 0.123879 0.774632 0.121694 0.017773 0.085901 0.324017 0.235408 0.213365 0.227210 0.365796 0.192247 0.134547 0.307410 0.299601 0.246867 0.098395 0.355137 0.328229 0.242048 0.251143 0.178579 Consensus sequence: HVHRGCACACAAHHHV Reverse complement motif 0.178579 0.242048 0.251143 0.328229 0.355137 0.246867 0.098395 0.299601 0.307410 0.192247 0.134547 0.365796 0.227210 0.235408 0.213365 0.324017 0.085901 0.121694 0.017773 0.774632 0.123879 0.066726 0.011988 0.797406 0.066033 0.043955 0.636556 0.253456 0.007098 0.005379 0.016825 0.970698 0.043757 0.007648 0.937596 0.010999 0.017854 0.009563 0.009687 0.962897 0.067382 0.021244 0.909014 0.002359 0.038409 0.936209 0.011231 0.014150 0.059899 0.139856 0.390450 0.409796 0.304596 0.233641 0.022359 0.439403 0.269193 0.360934 0.327669 0.042204 0.275231 0.112851 0.387763 0.224155 Consensus sequence: BHHHTTGTGTGCKHVD Alignment: BHHHTTGTGTGCKHVD -----TGTRT------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00011 Irf6_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 6 5 0.024195 Species: Mus musculus Original motif 0.256714 0.363080 0.149403 0.230804 0.312941 0.135162 0.190389 0.361507 0.255033 0.128823 0.354898 0.261246 0.667588 0.053933 0.205778 0.072701 0.199950 0.339707 0.114445 0.345899 0.029853 0.908514 0.006383 0.055250 0.019621 0.002231 0.976266 0.001882 0.983875 0.005320 0.008639 0.002166 0.698671 0.002741 0.006725 0.291864 0.990097 0.003609 0.003047 0.003247 0.008905 0.975208 0.011495 0.004392 0.022092 0.611448 0.018828 0.347632 0.538109 0.125313 0.241515 0.095063 0.456841 0.205124 0.177213 0.160822 0.372926 0.189134 0.195747 0.242193 0.217155 0.198027 0.300393 0.284425 0.277630 0.187849 0.237049 0.297472 Consensus sequence: HDDAHCGAAACYAVDDD Reverse complement motif 0.297472 0.187849 0.237049 0.277630 0.217155 0.300393 0.198027 0.284425 0.242193 0.189134 0.195747 0.372926 0.160822 0.205124 0.177213 0.456841 0.095063 0.125313 0.241515 0.538109 0.022092 0.018828 0.611448 0.347632 0.008905 0.011495 0.975208 0.004392 0.003247 0.003609 0.003047 0.990097 0.291864 0.002741 0.006725 0.698671 0.002166 0.005320 0.008639 0.983875 0.019621 0.976266 0.002231 0.001882 0.029853 0.006383 0.908514 0.055250 0.345899 0.339707 0.114445 0.199950 0.072701 0.053933 0.205778 0.667588 0.255033 0.354898 0.128823 0.261246 0.361507 0.135162 0.190389 0.312941 0.256714 0.149403 0.363080 0.230804 Consensus sequence: DHDBTKGTTTCGHTHDD Alignment: DHDBTKGTTTCGHTHDD -----TGTRT------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00000 Smad3_primary Original Motif Original Motif Forward 8 5 0.025597 Species: Mus musculus Original motif 0.282316 0.413385 0.114930 0.189369 0.341654 0.135011 0.267943 0.255392 0.399523 0.173081 0.168845 0.258551 0.365086 0.196360 0.211856 0.226699 0.243321 0.177839 0.224206 0.354635 0.029873 0.808479 0.036309 0.125339 0.004945 0.815465 0.040635 0.138955 0.934557 0.058944 0.005027 0.001471 0.005099 0.003998 0.986148 0.004755 0.969304 0.020594 0.001929 0.008173 0.008189 0.984816 0.004199 0.002795 0.669579 0.012182 0.282153 0.036085 0.130511 0.171241 0.334041 0.364207 0.198982 0.289660 0.252392 0.258966 0.423172 0.190978 0.164411 0.221440 0.213519 0.287388 0.294414 0.204679 0.371956 0.285061 0.150191 0.192792 Consensus sequence: HDHDDCCAGACABBHVH Reverse complement motif 0.192792 0.285061 0.150191 0.371956 0.213519 0.294414 0.287388 0.204679 0.221440 0.190978 0.164411 0.423172 0.198982 0.252392 0.289660 0.258966 0.364207 0.171241 0.334041 0.130511 0.036085 0.012182 0.282153 0.669579 0.008189 0.004199 0.984816 0.002795 0.008173 0.020594 0.001929 0.969304 0.005099 0.986148 0.003998 0.004755 0.001471 0.058944 0.005027 0.934557 0.004945 0.040635 0.815465 0.138955 0.029873 0.036309 0.808479 0.125339 0.354635 0.177839 0.224206 0.243321 0.226699 0.196360 0.211856 0.365086 0.258551 0.173081 0.168845 0.399523 0.255392 0.135011 0.267943 0.341654 0.282316 0.114930 0.413385 0.189369 Consensus sequence: HVHBVTGTCTGGDDHDD Alignment: HDHDDCCAGACABBHVH -------AMACA----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 3 Motif name: Motif 3 Original motif 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.472754 0.527246 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.496318 0.000000 0.000000 0.503682 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 Consensus sequence: AGSCWGG Reserve complement motif 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.503682 0.000000 0.000000 0.496318 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.527246 0.472754 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 Consensus sequence: CCWGSCT ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 3 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00035 Hic1_primary Original Motif Reverse Complement Backward 7 7 0.000000 Species: Mus musculus Original motif 0.275207 0.211375 0.250277 0.263141 0.135064 0.327571 0.217556 0.319808 0.145659 0.242586 0.267179 0.344576 0.656519 0.009712 0.315174 0.018595 0.002265 0.004755 0.001656 0.991325 0.041873 0.001128 0.955340 0.001659 0.001306 0.974834 0.022215 0.001645 0.001978 0.992066 0.002638 0.003317 0.921032 0.072388 0.001237 0.005344 0.582027 0.211694 0.115736 0.090542 0.005990 0.927450 0.028306 0.038254 0.027374 0.799879 0.053667 0.119080 0.203510 0.191263 0.168997 0.436229 0.402253 0.154087 0.291346 0.152314 0.201201 0.414412 0.145330 0.239056 0.241094 0.332661 0.143464 0.282781 Consensus sequence: DBBATGCCAACCHVHH Reverse complement motif 0.241094 0.143464 0.332661 0.282781 0.201201 0.145330 0.414412 0.239056 0.152314 0.154087 0.291346 0.402253 0.436229 0.191263 0.168997 0.203510 0.027374 0.053667 0.799879 0.119080 0.005990 0.028306 0.927450 0.038254 0.090542 0.211694 0.115736 0.582027 0.005344 0.072388 0.001237 0.921032 0.001978 0.002638 0.992066 0.003317 0.001306 0.022215 0.974834 0.001645 0.041873 0.955340 0.001128 0.001659 0.991325 0.004755 0.001656 0.002265 0.018595 0.009712 0.315174 0.656519 0.344576 0.242586 0.267179 0.145659 0.135064 0.217556 0.327571 0.319808 0.263141 0.211375 0.250277 0.275207 Consensus sequence: DDBHGGTTGGCATVBD Alignment: DDBHGGTTGGCATVBD ---AGSCWGG------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00070 Gcm1_primary Original Motif Reverse Complement Forward 5 7 0.005604 Species: Mus musculus Original motif 0.251681 0.208273 0.178525 0.361520 0.323865 0.334303 0.205542 0.136289 0.308084 0.277004 0.326203 0.088709 0.280609 0.171416 0.168918 0.379057 0.734441 0.031257 0.211473 0.022829 0.006187 0.990281 0.001052 0.002480 0.005819 0.990856 0.001498 0.001826 0.043838 0.936502 0.001550 0.018110 0.022607 0.058037 0.901005 0.018350 0.000424 0.787011 0.026547 0.186017 0.980774 0.002884 0.011288 0.005054 0.009100 0.110310 0.067399 0.813192 0.247510 0.310539 0.250093 0.191858 0.279511 0.211998 0.250717 0.257774 0.264451 0.270002 0.142606 0.322941 0.227607 0.212076 0.267214 0.293102 Consensus sequence: HVVHACCCGCATVDHD Reverse complement motif 0.293102 0.212076 0.267214 0.227607 0.322941 0.270002 0.142606 0.264451 0.257774 0.211998 0.250717 0.279511 0.247510 0.250093 0.310539 0.191858 0.813192 0.110310 0.067399 0.009100 0.005054 0.002884 0.011288 0.980774 0.000424 0.026547 0.787011 0.186017 0.022607 0.901005 0.058037 0.018350 0.043838 0.001550 0.936502 0.018110 0.005819 0.001498 0.990856 0.001826 0.006187 0.001052 0.990281 0.002480 0.022829 0.031257 0.211473 0.734441 0.379057 0.171416 0.168918 0.280609 0.308084 0.326203 0.277004 0.088709 0.323865 0.205542 0.334303 0.136289 0.361520 0.208273 0.178525 0.251681 Consensus sequence: DHDVATGCGGGTHVVH Alignment: DHDVATGCGGGTHVVH ----AGSCWGG----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00095 Zfp691_secondary Reverse Complement Original Motif Forward 3 7 0.010915 Species: Mus musculus Original motif 0.236868 0.155338 0.295091 0.312703 0.522782 0.133021 0.177386 0.166812 0.192915 0.374870 0.221406 0.210809 0.146546 0.199196 0.418035 0.236223 0.454326 0.095049 0.151770 0.298855 0.027956 0.023096 0.878335 0.070614 0.916030 0.020358 0.039894 0.023717 0.010595 0.938036 0.039415 0.011954 0.007271 0.014948 0.007990 0.969792 0.014291 0.964878 0.011126 0.009705 0.154586 0.759294 0.050151 0.035969 0.051021 0.268239 0.053410 0.627330 0.158293 0.386843 0.113152 0.341713 0.281766 0.184139 0.187916 0.346179 0.292444 0.267259 0.241323 0.198974 0.425732 0.262331 0.149076 0.162861 0.205385 0.384164 0.267912 0.142538 Consensus sequence: DABBWGACTCCTHDVHV Reverse complement motif 0.205385 0.267912 0.384164 0.142538 0.162861 0.262331 0.149076 0.425732 0.198974 0.267259 0.241323 0.292444 0.346179 0.184139 0.187916 0.281766 0.158293 0.113152 0.386843 0.341713 0.627330 0.268239 0.053410 0.051021 0.154586 0.050151 0.759294 0.035969 0.014291 0.011126 0.964878 0.009705 0.969792 0.014948 0.007990 0.007271 0.010595 0.039415 0.938036 0.011954 0.023717 0.020358 0.039894 0.916030 0.027956 0.878335 0.023096 0.070614 0.298855 0.095049 0.151770 0.454326 0.146546 0.418035 0.199196 0.236223 0.192915 0.221406 0.374870 0.210809 0.166812 0.133021 0.177386 0.522782 0.312703 0.155338 0.295091 0.236868 Consensus sequence: VHBDDAGGAGTCWBBTD Alignment: DABBWGACTCCTHDVHV --CCWGSCT-------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00006 Zic3_secondary Reverse Complement Reverse Complement Backward 7 7 0.010924 Species: Mus musculus Original motif 0.225537 0.223459 0.280507 0.270498 0.332396 0.181810 0.207290 0.278505 0.309873 0.017922 0.386135 0.286070 0.101947 0.871607 0.020267 0.006179 0.541366 0.089100 0.242170 0.127364 0.003307 0.969997 0.002414 0.024283 0.903286 0.021590 0.015872 0.059253 0.039887 0.009732 0.945083 0.005298 0.001704 0.827209 0.006276 0.164810 0.723052 0.003102 0.221051 0.052795 0.011758 0.024398 0.560633 0.403211 0.003656 0.012952 0.939586 0.043807 0.477846 0.270399 0.113113 0.138642 0.225706 0.298505 0.258523 0.217266 0.365251 0.191780 0.197411 0.245557 Consensus sequence: DDDCACAGCAKGHVD Reverse complement motif 0.245557 0.191780 0.197411 0.365251 0.225706 0.258523 0.298505 0.217266 0.138642 0.270399 0.113113 0.477846 0.003656 0.939586 0.012952 0.043807 0.011758 0.560633 0.024398 0.403211 0.052795 0.003102 0.221051 0.723052 0.001704 0.006276 0.827209 0.164810 0.039887 0.945083 0.009732 0.005298 0.059253 0.021590 0.015872 0.903286 0.003307 0.002414 0.969997 0.024283 0.127364 0.089100 0.242170 0.541366 0.101947 0.020267 0.871607 0.006179 0.309873 0.386135 0.017922 0.286070 0.278505 0.181810 0.207290 0.332396 0.225537 0.280507 0.223459 0.270498 Consensus sequence: DVHCYTGCTGTGHDH Alignment: DVHCYTGCTGTGHDH --CCWGSCT------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00000 Smad3_primary Reverse Complement Original Motif Forward 6 7 0.011450 Species: Mus musculus Original motif 0.282316 0.413385 0.114930 0.189369 0.341654 0.135011 0.267943 0.255392 0.399523 0.173081 0.168845 0.258551 0.365086 0.196360 0.211856 0.226699 0.243321 0.177839 0.224206 0.354635 0.029873 0.808479 0.036309 0.125339 0.004945 0.815465 0.040635 0.138955 0.934557 0.058944 0.005027 0.001471 0.005099 0.003998 0.986148 0.004755 0.969304 0.020594 0.001929 0.008173 0.008189 0.984816 0.004199 0.002795 0.669579 0.012182 0.282153 0.036085 0.130511 0.171241 0.334041 0.364207 0.198982 0.289660 0.252392 0.258966 0.423172 0.190978 0.164411 0.221440 0.213519 0.287388 0.294414 0.204679 0.371956 0.285061 0.150191 0.192792 Consensus sequence: HDHDDCCAGACABBHVH Reverse complement motif 0.192792 0.285061 0.150191 0.371956 0.213519 0.294414 0.287388 0.204679 0.221440 0.190978 0.164411 0.423172 0.198982 0.252392 0.289660 0.258966 0.364207 0.171241 0.334041 0.130511 0.036085 0.012182 0.282153 0.669579 0.008189 0.004199 0.984816 0.002795 0.008173 0.020594 0.001929 0.969304 0.005099 0.986148 0.003998 0.004755 0.001471 0.058944 0.005027 0.934557 0.004945 0.040635 0.815465 0.138955 0.029873 0.036309 0.808479 0.125339 0.354635 0.177839 0.224206 0.243321 0.226699 0.196360 0.211856 0.365086 0.258551 0.173081 0.168845 0.399523 0.255392 0.135011 0.267943 0.341654 0.282316 0.114930 0.413385 0.189369 Consensus sequence: HVHBVTGTCTGGDDHDD Alignment: HDHDDCCAGACABBHVH -----CCWGSCT----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v015681_primaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 6 7 0.011526 Species: Mus musculus Original motif 0.472795 0.179227 0.091251 0.256726 0.036521 0.159743 0.204840 0.598896 0.164582 0.312805 0.221324 0.301289 0.237069 0.249050 0.293048 0.220833 0.401949 0.225181 0.229401 0.143469 0.161422 0.494334 0.252207 0.092036 0.252940 0.177721 0.369400 0.199939 0.119630 0.024651 0.849920 0.005798 0.000962 0.002398 0.990616 0.006023 0.937852 0.027016 0.034535 0.000597 0.008963 0.987756 0.000629 0.002652 0.001584 0.992898 0.002349 0.003169 0.956822 0.027342 0.002484 0.013352 0.009873 0.987759 0.000988 0.001381 0.016397 0.980856 0.000369 0.002378 0.081761 0.758555 0.038572 0.121112 0.371713 0.091838 0.448027 0.088423 0.111617 0.121913 0.683885 0.082585 0.334562 0.102916 0.436488 0.126034 0.210362 0.101261 0.238339 0.450037 0.169041 0.271583 0.320799 0.238576 0.140316 0.049885 0.735236 0.074563 Consensus sequence: HTBVVVDGGACCACCCRGRDBG Reverse complement motif 0.140316 0.735236 0.049885 0.074563 0.169041 0.320799 0.271583 0.238576 0.450037 0.101261 0.238339 0.210362 0.334562 0.436488 0.102916 0.126034 0.111617 0.683885 0.121913 0.082585 0.371713 0.448027 0.091838 0.088423 0.081761 0.038572 0.758555 0.121112 0.016397 0.000369 0.980856 0.002378 0.009873 0.000988 0.987759 0.001381 0.013352 0.027342 0.002484 0.956822 0.001584 0.002349 0.992898 0.003169 0.008963 0.000629 0.987756 0.002652 0.000597 0.027016 0.034535 0.937852 0.000962 0.990616 0.002398 0.006023 0.119630 0.849920 0.024651 0.005798 0.252940 0.369400 0.177721 0.199939 0.161422 0.252207 0.494334 0.092036 0.143469 0.225181 0.229401 0.401949 0.237069 0.293048 0.249050 0.220833 0.164582 0.221324 0.312805 0.301289 0.598896 0.159743 0.204840 0.036521 0.256726 0.179227 0.091251 0.472795 Consensus sequence: CBDMCMGGGTGGTCCHVBVBAH Alignment: CBDMCMGGGTGGTCCHVBVBAH -----AGSCWGG---------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_primaryReverse Complement Reverse Complement Backward 8 7 0.011749 Species: Mus musculus Original motif 0.204923 0.208846 0.365383 0.220848 0.294304 0.300143 0.167287 0.238266 0.109711 0.619514 0.117379 0.153396 0.178979 0.378580 0.230177 0.212264 0.159594 0.542602 0.118178 0.179627 0.125206 0.430074 0.151826 0.292894 0.097692 0.709845 0.116956 0.075506 0.148292 0.565912 0.037632 0.248164 0.077951 0.034190 0.855503 0.032356 0.001657 0.001061 0.971877 0.025405 0.001926 0.001084 0.991712 0.005278 0.033031 0.012001 0.057796 0.897171 0.002723 0.002647 0.993348 0.001281 0.003261 0.000963 0.987199 0.008577 0.000611 0.090925 0.074857 0.833608 0.015299 0.978878 0.004949 0.000874 0.013368 0.600902 0.033485 0.352245 0.231949 0.149575 0.118804 0.499672 0.267580 0.186002 0.371242 0.175176 0.264884 0.223483 0.110082 0.401551 0.221365 0.170121 0.179559 0.428955 0.112997 0.692930 0.139981 0.054092 0.460305 0.207883 0.155111 0.176702 Consensus sequence: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH Reverse complement motif 0.176702 0.207883 0.155111 0.460305 0.112997 0.139981 0.692930 0.054092 0.428955 0.170121 0.179559 0.221365 0.401551 0.223483 0.110082 0.264884 0.267580 0.371242 0.186002 0.175176 0.499672 0.149575 0.118804 0.231949 0.013368 0.033485 0.600902 0.352245 0.015299 0.004949 0.978878 0.000874 0.833608 0.090925 0.074857 0.000611 0.003261 0.987199 0.000963 0.008577 0.002723 0.993348 0.002647 0.001281 0.897171 0.012001 0.057796 0.033031 0.001926 0.991712 0.001084 0.005278 0.001657 0.971877 0.001061 0.025405 0.077951 0.855503 0.034190 0.032356 0.148292 0.037632 0.565912 0.248164 0.097692 0.116956 0.709845 0.075506 0.125206 0.151826 0.430074 0.292894 0.159594 0.118178 0.542602 0.179627 0.178979 0.230177 0.378580 0.212264 0.109711 0.117379 0.619514 0.153396 0.294304 0.167287 0.300143 0.238266 0.204923 0.365383 0.208846 0.220848 Consensus sequence: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB Alignment: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB ---------CCWGSCT------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_primaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 6 7 0.013168 Species: Mus musculus Original motif 0.180868 0.321661 0.134642 0.362829 0.232215 0.134289 0.315356 0.318141 0.065068 0.093681 0.569842 0.271408 0.370822 0.229680 0.154738 0.244759 0.323039 0.182873 0.173588 0.320500 0.175039 0.266898 0.276080 0.281984 0.412669 0.147730 0.146326 0.293275 0.325953 0.028805 0.629596 0.015646 0.003017 0.001766 0.979711 0.015507 0.888973 0.040666 0.069420 0.000941 0.017309 0.979155 0.000899 0.002637 0.001732 0.988816 0.004856 0.004596 0.889763 0.078125 0.010384 0.021729 0.007566 0.987081 0.001421 0.003932 0.027797 0.966593 0.000878 0.004731 0.025816 0.867003 0.065749 0.041433 0.220658 0.075256 0.582904 0.121182 0.088946 0.283695 0.565345 0.062015 0.328012 0.241332 0.305901 0.124755 0.307302 0.137589 0.375928 0.179181 0.298752 0.231470 0.315255 0.154524 0.094565 0.142901 0.705696 0.056838 Consensus sequence: HDGHHBHRGACCACCCGSVDVG Reverse complement motif 0.094565 0.705696 0.142901 0.056838 0.298752 0.315255 0.231470 0.154524 0.307302 0.375928 0.137589 0.179181 0.124755 0.241332 0.305901 0.328012 0.088946 0.565345 0.283695 0.062015 0.220658 0.582904 0.075256 0.121182 0.025816 0.065749 0.867003 0.041433 0.027797 0.000878 0.966593 0.004731 0.007566 0.001421 0.987081 0.003932 0.021729 0.078125 0.010384 0.889763 0.001732 0.004856 0.988816 0.004596 0.017309 0.000899 0.979155 0.002637 0.000941 0.040666 0.069420 0.888973 0.003017 0.979711 0.001766 0.015507 0.325953 0.629596 0.028805 0.015646 0.293275 0.147730 0.146326 0.412669 0.281984 0.266898 0.276080 0.175039 0.320500 0.182873 0.173588 0.323039 0.244759 0.229680 0.154738 0.370822 0.065068 0.569842 0.093681 0.271408 0.318141 0.134289 0.315356 0.232215 0.362829 0.321661 0.134642 0.180868 Consensus sequence: CVHBSCGGGTGGTCMHVHHCDH Alignment: CVHBSCGGGTGGTCMHVHHCDH -----AGSCWGG---------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00081 Mybl1_secondary Original Motif Reverse Complement Forward 3 7 0.013603 Species: Mus musculus Original motif 0.205989 0.268359 0.263479 0.262174 0.149858 0.330201 0.339741 0.180201 0.440045 0.213697 0.179742 0.166516 0.055722 0.767204 0.049077 0.127997 0.060389 0.768239 0.011175 0.160197 0.980265 0.008906 0.004964 0.005865 0.976251 0.015501 0.004122 0.004126 0.006449 0.982888 0.005200 0.005463 0.025776 0.139679 0.048415 0.786131 0.009775 0.008352 0.975178 0.006695 0.187590 0.568007 0.036604 0.207799 0.108890 0.808175 0.017705 0.065231 0.242101 0.097932 0.555551 0.104417 0.281058 0.212523 0.104136 0.402283 0.150908 0.188201 0.411156 0.249734 Consensus sequence: BBVCCAACTGCCGHB Reverse complement motif 0.150908 0.411156 0.188201 0.249734 0.402283 0.212523 0.104136 0.281058 0.242101 0.555551 0.097932 0.104417 0.108890 0.017705 0.808175 0.065231 0.187590 0.036604 0.568007 0.207799 0.009775 0.975178 0.008352 0.006695 0.786131 0.139679 0.048415 0.025776 0.006449 0.005200 0.982888 0.005463 0.004126 0.015501 0.004122 0.976251 0.005865 0.008906 0.004964 0.980265 0.060389 0.011175 0.768239 0.160197 0.055722 0.049077 0.767204 0.127997 0.166516 0.213697 0.179742 0.440045 0.149858 0.339741 0.330201 0.180201 0.205989 0.263479 0.268359 0.262174 Consensus sequence: BHCGGCAGTTGGBBB Alignment: BHCGGCAGTTGGBBB --AGSCWGG------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00057 Zic2_secondary Reverse Complement Reverse Complement Backward 7 7 0.013956 Species: Mus musculus Original motif 0.201522 0.336845 0.183740 0.277892 0.238705 0.354378 0.165332 0.241585 0.350858 0.031427 0.308482 0.309233 0.104423 0.870794 0.018676 0.006107 0.313246 0.259944 0.277570 0.149241 0.003590 0.973377 0.002520 0.020513 0.899716 0.025489 0.015458 0.059336 0.049224 0.006415 0.938214 0.006147 0.002021 0.859631 0.007903 0.130445 0.772818 0.002659 0.187334 0.037190 0.008456 0.015170 0.594695 0.381679 0.004118 0.009188 0.961506 0.025188 0.367151 0.230955 0.204475 0.197419 0.267508 0.193660 0.430070 0.108762 0.444449 0.099127 0.212182 0.244241 Consensus sequence: HHDCVCAGCAKGVVD Reverse complement motif 0.244241 0.099127 0.212182 0.444449 0.267508 0.430070 0.193660 0.108762 0.197419 0.230955 0.204475 0.367151 0.004118 0.961506 0.009188 0.025188 0.008456 0.594695 0.015170 0.381679 0.037190 0.002659 0.187334 0.772818 0.002021 0.007903 0.859631 0.130445 0.049224 0.938214 0.006415 0.006147 0.059336 0.025489 0.015458 0.899716 0.003590 0.002520 0.973377 0.020513 0.149241 0.259944 0.277570 0.313246 0.104423 0.018676 0.870794 0.006107 0.309233 0.031427 0.308482 0.350858 0.238705 0.165332 0.354378 0.241585 0.201522 0.183740 0.336845 0.277892 Consensus sequence: DVBCYTGCTGBGDDD Alignment: DVBCYTGCTGBGDDD --CCWGSCT------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 4 Motif name: Motif 4 Original motif 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.265176 0.000000 0.734824 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.591054 0.000000 0.408946 Consensus sequence: CTCTGY Reserve complement motif 0.000000 0.000000 0.591054 0.408946 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.734824 0.265176 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 Consensus sequence: KCAGAG ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 4 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00031 Zbtb3_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 7 6 0.000000 Species: Mus musculus Original motif 0.401190 0.144405 0.268531 0.185874 0.430224 0.168519 0.221247 0.180011 0.172575 0.268499 0.274136 0.284789 0.150971 0.297110 0.290868 0.261051 0.133421 0.282842 0.434718 0.149019 0.042798 0.941105 0.001785 0.014312 0.890788 0.002551 0.103316 0.003345 0.001887 0.951368 0.043722 0.003023 0.011633 0.002218 0.002269 0.983880 0.003597 0.003728 0.984819 0.007856 0.002946 0.903520 0.072457 0.021077 0.908487 0.057072 0.018256 0.016185 0.076237 0.329864 0.228896 0.365003 0.144926 0.162981 0.177370 0.514722 0.124970 0.327876 0.295814 0.251341 0.144592 0.313887 0.301912 0.239609 0.108463 0.241747 0.350296 0.299494 Consensus sequence: DDBBBCACTGCABTBBB Reverse complement motif 0.108463 0.350296 0.241747 0.299494 0.144592 0.301912 0.313887 0.239609 0.124970 0.295814 0.327876 0.251341 0.514722 0.162981 0.177370 0.144926 0.365003 0.329864 0.228896 0.076237 0.016185 0.057072 0.018256 0.908487 0.002946 0.072457 0.903520 0.021077 0.003597 0.984819 0.003728 0.007856 0.983880 0.002218 0.002269 0.011633 0.001887 0.043722 0.951368 0.003023 0.003345 0.002551 0.103316 0.890788 0.042798 0.001785 0.941105 0.014312 0.133421 0.434718 0.282842 0.149019 0.150971 0.290868 0.297110 0.261051 0.284789 0.268499 0.274136 0.172575 0.180011 0.168519 0.221247 0.430224 0.185874 0.144405 0.268531 0.401190 Consensus sequence: BBBAVTGCAGTGBBVDD Alignment: BBBAVTGCAGTGBBVDD ------KCAGAG----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00018 Irf4_secondary Reverse Complement Reverse Complement Backward 7 6 0.006109 Species: Mus musculus Original motif 0.288101 0.247588 0.287461 0.176850 0.187625 0.276525 0.352820 0.183030 0.175230 0.300094 0.203295 0.321380 0.564519 0.107594 0.098018 0.229869 0.150412 0.310868 0.054960 0.483760 0.034907 0.015505 0.034843 0.914745 0.041776 0.885897 0.032309 0.040017 0.046210 0.168474 0.066613 0.718702 0.031764 0.913321 0.024478 0.030437 0.191755 0.029057 0.754998 0.024190 0.206291 0.097100 0.623727 0.072881 0.311511 0.037435 0.173101 0.477953 0.205101 0.316738 0.081628 0.396533 0.243888 0.196473 0.292453 0.267186 0.167980 0.404608 0.259107 0.168305 Consensus sequence: VVBAYTCTCGGWHDB Reverse complement motif 0.167980 0.259107 0.404608 0.168305 0.243888 0.292453 0.196473 0.267186 0.396533 0.316738 0.081628 0.205101 0.477953 0.037435 0.173101 0.311511 0.206291 0.623727 0.097100 0.072881 0.191755 0.754998 0.029057 0.024190 0.031764 0.024478 0.913321 0.030437 0.718702 0.168474 0.066613 0.046210 0.041776 0.032309 0.885897 0.040017 0.914745 0.015505 0.034843 0.034907 0.483760 0.310868 0.054960 0.150412 0.229869 0.107594 0.098018 0.564519 0.321380 0.300094 0.203295 0.175230 0.187625 0.352820 0.276525 0.183030 0.176850 0.247588 0.287461 0.288101 Consensus sequence: BHHWCCGAGAMTVVB Alignment: BHHWCCGAGAMTVVB ---KCAGAG------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00095 Zfp691_secondary Reverse Complement Reverse Complement Forward 5 6 0.006482 Species: Mus musculus Original motif 0.236868 0.155338 0.295091 0.312703 0.522782 0.133021 0.177386 0.166812 0.192915 0.374870 0.221406 0.210809 0.146546 0.199196 0.418035 0.236223 0.454326 0.095049 0.151770 0.298855 0.027956 0.023096 0.878335 0.070614 0.916030 0.020358 0.039894 0.023717 0.010595 0.938036 0.039415 0.011954 0.007271 0.014948 0.007990 0.969792 0.014291 0.964878 0.011126 0.009705 0.154586 0.759294 0.050151 0.035969 0.051021 0.268239 0.053410 0.627330 0.158293 0.386843 0.113152 0.341713 0.281766 0.184139 0.187916 0.346179 0.292444 0.267259 0.241323 0.198974 0.425732 0.262331 0.149076 0.162861 0.205385 0.384164 0.267912 0.142538 Consensus sequence: DABBWGACTCCTHDVHV Reverse complement motif 0.205385 0.267912 0.384164 0.142538 0.162861 0.262331 0.149076 0.425732 0.198974 0.267259 0.241323 0.292444 0.346179 0.184139 0.187916 0.281766 0.158293 0.113152 0.386843 0.341713 0.627330 0.268239 0.053410 0.051021 0.154586 0.050151 0.759294 0.035969 0.014291 0.011126 0.964878 0.009705 0.969792 0.014948 0.007990 0.007271 0.010595 0.039415 0.938036 0.011954 0.023717 0.020358 0.039894 0.916030 0.027956 0.878335 0.023096 0.070614 0.298855 0.095049 0.151770 0.454326 0.146546 0.418035 0.199196 0.236223 0.192915 0.221406 0.374870 0.210809 0.166812 0.133021 0.177386 0.522782 0.312703 0.155338 0.295091 0.236868 Consensus sequence: VHBDDAGGAGTCWBBTD Alignment: VHBDDAGGAGTCWBBTD ----KCAGAG------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00006 Zic3_secondary Reverse Complement Original Motif Backward 8 6 0.008531 Species: Mus musculus Original motif 0.225537 0.223459 0.280507 0.270498 0.332396 0.181810 0.207290 0.278505 0.309873 0.017922 0.386135 0.286070 0.101947 0.871607 0.020267 0.006179 0.541366 0.089100 0.242170 0.127364 0.003307 0.969997 0.002414 0.024283 0.903286 0.021590 0.015872 0.059253 0.039887 0.009732 0.945083 0.005298 0.001704 0.827209 0.006276 0.164810 0.723052 0.003102 0.221051 0.052795 0.011758 0.024398 0.560633 0.403211 0.003656 0.012952 0.939586 0.043807 0.477846 0.270399 0.113113 0.138642 0.225706 0.298505 0.258523 0.217266 0.365251 0.191780 0.197411 0.245557 Consensus sequence: DDDCACAGCAKGHVD Reverse complement motif 0.245557 0.191780 0.197411 0.365251 0.225706 0.258523 0.298505 0.217266 0.138642 0.270399 0.113113 0.477846 0.003656 0.939586 0.012952 0.043807 0.011758 0.560633 0.024398 0.403211 0.052795 0.003102 0.221051 0.723052 0.001704 0.006276 0.827209 0.164810 0.039887 0.945083 0.009732 0.005298 0.059253 0.021590 0.015872 0.903286 0.003307 0.002414 0.969997 0.024283 0.127364 0.089100 0.242170 0.541366 0.101947 0.020267 0.871607 0.006179 0.309873 0.386135 0.017922 0.286070 0.278505 0.181810 0.207290 0.332396 0.225537 0.280507 0.223459 0.270498 Consensus sequence: DVHCYTGCTGTGHDH Alignment: DDDCACAGCAKGHVD --KCAGAG------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00007 Egr1_secondary Original Motif Reverse Complement Forward 10 6 0.008950 Species: Mus musculus Original motif 0.182057 0.230014 0.276532 0.311397 0.122004 0.156883 0.366166 0.354947 0.209446 0.335433 0.185677 0.269444 0.140035 0.276547 0.302466 0.280952 0.124879 0.019371 0.809895 0.045854 0.647807 0.117014 0.183956 0.051224 0.021434 0.011745 0.954633 0.012188 0.017853 0.009441 0.315429 0.657277 0.166123 0.008326 0.807215 0.018337 0.022775 0.008972 0.947283 0.020970 0.038795 0.033592 0.781209 0.146405 0.728916 0.032888 0.088836 0.149360 0.197826 0.427858 0.055755 0.318561 0.264938 0.196184 0.092516 0.446362 0.267969 0.195624 0.318766 0.217641 0.225006 0.250404 0.267265 0.257324 Consensus sequence: BBHBGAGTGGGAHHDB Reverse complement motif 0.225006 0.267265 0.250404 0.257324 0.267969 0.318766 0.195624 0.217641 0.446362 0.196184 0.092516 0.264938 0.197826 0.055755 0.427858 0.318561 0.149360 0.032888 0.088836 0.728916 0.038795 0.781209 0.033592 0.146405 0.022775 0.947283 0.008972 0.020970 0.166123 0.807215 0.008326 0.018337 0.657277 0.009441 0.315429 0.017853 0.021434 0.954633 0.011745 0.012188 0.051224 0.117014 0.183956 0.647807 0.124879 0.809895 0.019371 0.045854 0.140035 0.302466 0.276547 0.280952 0.209446 0.185677 0.335433 0.269444 0.122004 0.366166 0.156883 0.354947 0.311397 0.230014 0.276532 0.182057 Consensus sequence: BHHDTCCCACTCBDBV Alignment: BHHDTCCCACTCBDBV ---------CTCTGY- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00095 Zfp691_primary Original Motif Reverse Complement Forward 9 6 0.009559 Species: Mus musculus Original motif 0.099567 0.441928 0.195388 0.263117 0.246130 0.144776 0.333677 0.275418 0.313398 0.260626 0.161738 0.264239 0.441985 0.199975 0.211839 0.146201 0.122299 0.673789 0.078912 0.125000 0.938960 0.009295 0.048527 0.003217 0.003807 0.001797 0.985916 0.008480 0.006543 0.001803 0.001788 0.989866 0.014213 0.000681 0.981108 0.003998 0.005018 0.989568 0.000804 0.004610 0.001371 0.007539 0.002430 0.988659 0.001686 0.992039 0.002898 0.003378 0.516097 0.399155 0.057953 0.026795 0.118858 0.390408 0.146017 0.344717 0.306387 0.166100 0.132122 0.395391 0.388407 0.129054 0.288224 0.194315 0.308085 0.152185 0.160807 0.378924 Consensus sequence: BDHVCAGTGCTCMBHDD Reverse complement motif 0.378924 0.152185 0.160807 0.308085 0.194315 0.129054 0.288224 0.388407 0.395391 0.166100 0.132122 0.306387 0.118858 0.146017 0.390408 0.344717 0.026795 0.399155 0.057953 0.516097 0.001686 0.002898 0.992039 0.003378 0.988659 0.007539 0.002430 0.001371 0.005018 0.000804 0.989568 0.004610 0.014213 0.981108 0.000681 0.003998 0.989866 0.001803 0.001788 0.006543 0.003807 0.985916 0.001797 0.008480 0.003217 0.009295 0.048527 0.938960 0.122299 0.078912 0.673789 0.125000 0.146201 0.199975 0.211839 0.441985 0.264239 0.260626 0.161738 0.313398 0.246130 0.333677 0.144776 0.275418 0.099567 0.195388 0.441928 0.263117 Consensus sequence: DDHBYGAGCACTGBHHB Alignment: DDHBYGAGCACTGBHHB --------CTCTGY--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00067 Lef1_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 6 6 0.010618 Species: Mus musculus Original motif 0.281920 0.214207 0.278077 0.225796 0.325566 0.151435 0.298797 0.224202 0.290253 0.145824 0.243443 0.320480 0.069286 0.404645 0.141614 0.384454 0.070044 0.621448 0.142647 0.165862 0.007295 0.907657 0.038110 0.046938 0.015587 0.018273 0.000658 0.965482 0.005527 0.005886 0.001905 0.986682 0.024512 0.001189 0.001344 0.972955 0.007384 0.025221 0.952270 0.015125 0.966438 0.000630 0.002693 0.030239 0.082252 0.001173 0.001495 0.915080 0.030255 0.677155 0.275323 0.017267 0.199467 0.118815 0.056814 0.624905 0.345445 0.169597 0.216831 0.268127 0.278106 0.150864 0.173693 0.397336 0.251834 0.339733 0.219703 0.188730 Consensus sequence: DDDYCCTTTGATCTDDV Reverse complement motif 0.251834 0.219703 0.339733 0.188730 0.397336 0.150864 0.173693 0.278106 0.268127 0.169597 0.216831 0.345445 0.624905 0.118815 0.056814 0.199467 0.030255 0.275323 0.677155 0.017267 0.915080 0.001173 0.001495 0.082252 0.030239 0.000630 0.002693 0.966438 0.007384 0.952270 0.025221 0.015125 0.972955 0.001189 0.001344 0.024512 0.986682 0.005886 0.001905 0.005527 0.965482 0.018273 0.000658 0.015587 0.007295 0.038110 0.907657 0.046938 0.070044 0.142647 0.621448 0.165862 0.069286 0.141614 0.404645 0.384454 0.320480 0.145824 0.243443 0.290253 0.224202 0.151435 0.298797 0.325566 0.225796 0.214207 0.278077 0.281920 Consensus sequence: VDDAGATCAAAGGKDDD Alignment: VDDAGATCAAAGGKDDD ------KCAGAG----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00102 Zic1_secondary Reverse Complement Original Motif Backward 8 6 0.012263 Species: Mus musculus Original motif 0.161683 0.405114 0.171743 0.261460 0.259478 0.357988 0.146793 0.235741 0.371334 0.026439 0.283598 0.318630 0.092229 0.883389 0.018758 0.005623 0.419591 0.169874 0.253266 0.157270 0.002985 0.976375 0.002722 0.017918 0.909381 0.021357 0.013299 0.055963 0.039418 0.007014 0.948302 0.005266 0.001711 0.845894 0.005756 0.146640 0.803792 0.003049 0.148687 0.044472 0.015314 0.017153 0.680239 0.287294 0.003793 0.011414 0.937403 0.047390 0.431916 0.266291 0.144154 0.157638 0.269331 0.239338 0.366817 0.124513 0.395873 0.103980 0.214796 0.285351 Consensus sequence: BHDCVCAGCAGGHVD Reverse complement motif 0.285351 0.103980 0.214796 0.395873 0.269331 0.366817 0.239338 0.124513 0.157638 0.266291 0.144154 0.431916 0.003793 0.937403 0.011414 0.047390 0.015314 0.680239 0.017153 0.287294 0.044472 0.003049 0.148687 0.803792 0.001711 0.005756 0.845894 0.146640 0.039418 0.948302 0.007014 0.005266 0.055963 0.021357 0.013299 0.909381 0.002985 0.002722 0.976375 0.017918 0.157270 0.169874 0.253266 0.419591 0.092229 0.018758 0.883389 0.005623 0.318630 0.026439 0.283598 0.371334 0.259478 0.146793 0.357988 0.235741 0.161683 0.171743 0.405114 0.261460 Consensus sequence: DVHCCTGCTGBGDDB Alignment: BHDCVCAGCAGGHVD --KCAGAG------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00083 Tcf7l2_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 6 6 0.013124 Species: Mus musculus Original motif 0.285725 0.187143 0.254855 0.272277 0.276264 0.157893 0.258178 0.307665 0.238788 0.161120 0.254018 0.346074 0.076041 0.333901 0.150903 0.439156 0.093376 0.526578 0.180529 0.199517 0.010827 0.880320 0.034150 0.074703 0.016546 0.023834 0.000940 0.958680 0.007166 0.008215 0.001941 0.982678 0.029634 0.001363 0.001379 0.967625 0.010872 0.031751 0.926186 0.031190 0.949407 0.000760 0.002581 0.047253 0.109203 0.001362 0.002094 0.887341 0.044198 0.567994 0.353059 0.034749 0.222623 0.142360 0.041281 0.593736 0.358872 0.167597 0.220534 0.252997 0.233072 0.141480 0.230985 0.394463 0.350703 0.243129 0.233961 0.172207 Consensus sequence: DDDYCCTTTGATSTDDV Reverse complement motif 0.172207 0.243129 0.233961 0.350703 0.394463 0.141480 0.230985 0.233072 0.252997 0.167597 0.220534 0.358872 0.593736 0.142360 0.041281 0.222623 0.044198 0.353059 0.567994 0.034749 0.887341 0.001362 0.002094 0.109203 0.047253 0.000760 0.002581 0.949407 0.010872 0.926186 0.031751 0.031190 0.967625 0.001363 0.001379 0.029634 0.982678 0.008215 0.001941 0.007166 0.958680 0.023834 0.000940 0.016546 0.010827 0.034150 0.880320 0.074703 0.093376 0.180529 0.526578 0.199517 0.439156 0.333901 0.150903 0.076041 0.346074 0.161120 0.254018 0.238788 0.307665 0.157893 0.258178 0.276264 0.272277 0.187143 0.254855 0.285725 Consensus sequence: BDDASATCAAAGGMDDD Alignment: BDDASATCAAAGGMDDD ------KCAGAG----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00057 Zic2_secondary Reverse Complement Original Motif Forward 3 6 0.013653 Species: Mus musculus Original motif 0.201522 0.336845 0.183740 0.277892 0.238705 0.354378 0.165332 0.241585 0.350858 0.031427 0.308482 0.309233 0.104423 0.870794 0.018676 0.006107 0.313246 0.259944 0.277570 0.149241 0.003590 0.973377 0.002520 0.020513 0.899716 0.025489 0.015458 0.059336 0.049224 0.006415 0.938214 0.006147 0.002021 0.859631 0.007903 0.130445 0.772818 0.002659 0.187334 0.037190 0.008456 0.015170 0.594695 0.381679 0.004118 0.009188 0.961506 0.025188 0.367151 0.230955 0.204475 0.197419 0.267508 0.193660 0.430070 0.108762 0.444449 0.099127 0.212182 0.244241 Consensus sequence: HHDCVCAGCAKGVVD Reverse complement motif 0.244241 0.099127 0.212182 0.444449 0.267508 0.430070 0.193660 0.108762 0.197419 0.230955 0.204475 0.367151 0.004118 0.961506 0.009188 0.025188 0.008456 0.594695 0.015170 0.381679 0.037190 0.002659 0.187334 0.772818 0.002021 0.007903 0.859631 0.130445 0.049224 0.938214 0.006415 0.006147 0.059336 0.025489 0.015458 0.899716 0.003590 0.002520 0.973377 0.020513 0.149241 0.259944 0.277570 0.313246 0.104423 0.018676 0.870794 0.006107 0.309233 0.031427 0.308482 0.350858 0.238705 0.165332 0.354378 0.241585 0.201522 0.183740 0.336845 0.277892 Consensus sequence: DVBCYTGCTGBGDDD Alignment: HHDCVCAGCAKGVVD --KCAGAG------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 5 Motif name: Motif 5 Original motif 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.165712 0.000000 0.397480 0.436808 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.436426 0.563574 0.000000 0.000000 Consensus sequence: ATKTM Reserve complement motif 0.436426 0.000000 0.563574 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.436808 0.000000 0.397480 0.165712 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 Consensus sequence: RARAT ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 5 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00080 Gata5_secondary Reverse Complement Original Motif Backward 9 5 0.000000 Species: Mus musculus Original motif 0.296956 0.225759 0.366964 0.110320 0.363955 0.287909 0.178199 0.169937 0.167366 0.353513 0.235266 0.243855 0.362045 0.255289 0.159993 0.222674 0.280070 0.083717 0.491243 0.144971 0.856104 0.068327 0.034504 0.041065 0.063256 0.017187 0.849623 0.069934 0.916053 0.035900 0.039485 0.008562 0.025896 0.011964 0.054314 0.907826 0.827706 0.129092 0.013351 0.029850 0.048301 0.029514 0.118868 0.803318 0.069245 0.824881 0.022797 0.083077 0.508319 0.034384 0.109239 0.348058 0.228736 0.146771 0.436716 0.187777 0.183599 0.289339 0.157455 0.369607 0.174967 0.268426 0.275078 0.281528 0.136843 0.155950 0.346111 0.361096 Consensus sequence: VVBHRAGATATCWDHBB Reverse complement motif 0.361096 0.155950 0.346111 0.136843 0.281528 0.268426 0.275078 0.174967 0.369607 0.289339 0.157455 0.183599 0.228736 0.436716 0.146771 0.187777 0.348058 0.034384 0.109239 0.508319 0.069245 0.022797 0.824881 0.083077 0.803318 0.029514 0.118868 0.048301 0.029850 0.129092 0.013351 0.827706 0.907826 0.011964 0.054314 0.025896 0.008562 0.035900 0.039485 0.916053 0.063256 0.849623 0.017187 0.069934 0.041065 0.068327 0.034504 0.856104 0.280070 0.491243 0.083717 0.144971 0.222674 0.255289 0.159993 0.362045 0.167366 0.235266 0.353513 0.243855 0.169937 0.287909 0.178199 0.363955 0.296956 0.366964 0.225759 0.110320 Consensus sequence: VVHHWGATATCTMHBBV Alignment: VVBHRAGATATCWDHBB ----RARAT-------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00148 Hdx Reverse Complement Original Motif Backward 8 5 0.002795 Species: Mus musculus Original motif 0.311640 0.203273 0.213311 0.271776 0.341055 0.177799 0.257310 0.223836 0.047573 0.089551 0.516163 0.346713 0.195776 0.119326 0.352322 0.332576 0.295379 0.306027 0.157574 0.241020 0.213770 0.018770 0.724927 0.042533 0.702123 0.228608 0.050137 0.019133 0.826735 0.011735 0.061646 0.099884 0.920071 0.005458 0.026253 0.048218 0.018655 0.024240 0.028915 0.928190 0.029929 0.896758 0.043300 0.030013 0.864548 0.044943 0.013744 0.076766 0.177175 0.216931 0.155519 0.450375 0.228403 0.325164 0.203649 0.242785 0.140135 0.298665 0.306153 0.255047 0.338324 0.345500 0.057864 0.258313 0.402538 0.228867 0.191777 0.176818 Consensus sequence: DDKDHGAAATCAHHBHV Reverse complement motif 0.176818 0.228867 0.191777 0.402538 0.338324 0.057864 0.345500 0.258313 0.140135 0.306153 0.298665 0.255047 0.228403 0.203649 0.325164 0.242785 0.450375 0.216931 0.155519 0.177175 0.076766 0.044943 0.013744 0.864548 0.029929 0.043300 0.896758 0.030013 0.928190 0.024240 0.028915 0.018655 0.048218 0.005458 0.026253 0.920071 0.099884 0.011735 0.061646 0.826735 0.019133 0.228608 0.050137 0.702123 0.213770 0.724927 0.018770 0.042533 0.295379 0.157574 0.306027 0.241020 0.195776 0.352322 0.119326 0.332576 0.047573 0.516163 0.089551 0.346713 0.223836 0.177799 0.257310 0.341055 0.271776 0.203273 0.213311 0.311640 Consensus sequence: BDBDHTGATTTCDHYDD Alignment: DDKDHGAAATCAHHBHV -----RARAT------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00032 Gata3_primary Reverse Complement Original Motif Forward 7 5 0.009677 Species: Mus musculus Original motif 0.151572 0.262753 0.258275 0.327401 0.221834 0.113385 0.275380 0.389400 0.297769 0.136928 0.134678 0.430625 0.270099 0.110415 0.271106 0.348380 0.265471 0.090253 0.223340 0.420936 0.616582 0.090091 0.171960 0.121367 0.197318 0.107541 0.406904 0.288237 0.798258 0.046950 0.001406 0.153385 0.003195 0.002516 0.989707 0.004582 0.991503 0.002748 0.002617 0.003132 0.005015 0.002764 0.003026 0.989195 0.948394 0.008932 0.001344 0.041330 0.973109 0.004100 0.004081 0.018710 0.040365 0.113905 0.828185 0.017545 0.736608 0.130524 0.113464 0.019404 0.415921 0.106101 0.316613 0.161365 0.376582 0.170927 0.155572 0.296919 0.137731 0.197151 0.211055 0.454064 0.324853 0.122747 0.246107 0.306293 0.462490 0.207311 0.159392 0.170807 0.380420 0.188972 0.311990 0.118618 0.222178 0.157873 0.380486 0.239463 Consensus sequence: BDHDDADAGATAAGADHBDHVD Reverse complement motif 0.222178 0.380486 0.157873 0.239463 0.118618 0.188972 0.311990 0.380420 0.170807 0.207311 0.159392 0.462490 0.306293 0.122747 0.246107 0.324853 0.454064 0.197151 0.211055 0.137731 0.296919 0.170927 0.155572 0.376582 0.161365 0.106101 0.316613 0.415921 0.019404 0.130524 0.113464 0.736608 0.040365 0.828185 0.113905 0.017545 0.018710 0.004100 0.004081 0.973109 0.041330 0.008932 0.001344 0.948394 0.989195 0.002764 0.003026 0.005015 0.003132 0.002748 0.002617 0.991503 0.003195 0.989707 0.002516 0.004582 0.153385 0.046950 0.001406 0.798258 0.197318 0.406904 0.107541 0.288237 0.121367 0.090091 0.171960 0.616582 0.420936 0.090253 0.223340 0.265471 0.348380 0.110415 0.271106 0.270099 0.430625 0.136928 0.134678 0.297769 0.389400 0.113385 0.275380 0.221834 0.327401 0.262753 0.258275 0.151572 Consensus sequence: HBHDVHDTCTTATCTHTDDHDV Alignment: BDHDDADAGATAAGADHBDHVD ------RARAT----------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00250 Irx5 Original Motif Original Motif Backward 6 5 0.011657 Species: Mus musculus Original motif 0.367463 0.110357 0.154650 0.367530 0.435675 0.104106 0.185653 0.274566 0.309411 0.166534 0.199426 0.324629 0.330171 0.218393 0.207727 0.243708 0.326575 0.006155 0.067531 0.599738 0.934344 0.018417 0.011430 0.035810 0.004941 0.961788 0.005465 0.027806 0.940152 0.001107 0.011177 0.047564 0.047564 0.011177 0.001107 0.940152 0.027806 0.005465 0.961788 0.004941 0.035810 0.011430 0.018417 0.934344 0.599738 0.067531 0.006155 0.326575 0.348557 0.239288 0.195868 0.216288 0.376605 0.112652 0.210787 0.299957 0.540552 0.074408 0.115847 0.269192 0.210439 0.212707 0.245294 0.331559 0.303891 0.113735 0.133741 0.448633 Consensus sequence: DDDHWACATGTWHDABW Reverse complement motif 0.448633 0.113735 0.133741 0.303891 0.331559 0.212707 0.245294 0.210439 0.269192 0.074408 0.115847 0.540552 0.299957 0.112652 0.210787 0.376605 0.216288 0.239288 0.195868 0.348557 0.326575 0.067531 0.006155 0.599738 0.934344 0.011430 0.018417 0.035810 0.027806 0.961788 0.005465 0.004941 0.940152 0.011177 0.001107 0.047564 0.047564 0.001107 0.011177 0.940152 0.004941 0.005465 0.961788 0.027806 0.035810 0.018417 0.011430 0.934344 0.599738 0.006155 0.067531 0.326575 0.243708 0.218393 0.207727 0.330171 0.324629 0.166534 0.199426 0.309411 0.274566 0.104106 0.185653 0.435675 0.367530 0.110357 0.154650 0.367463 Consensus sequence: WVTDHWACATGTWHDDD Alignment: DDDHWACATGTWHDABW -------ATKTM----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00236 Irx2 Original Motif Original Motif Backward 6 5 0.012020 Species: Mus musculus Original motif 0.394106 0.081399 0.100827 0.423668 0.466343 0.126236 0.130788 0.276633 0.319347 0.127772 0.257087 0.295794 0.406891 0.139766 0.252855 0.200488 0.219982 0.007245 0.029337 0.743436 0.947280 0.014984 0.012651 0.025086 0.003955 0.974386 0.007466 0.014192 0.956452 0.001229 0.011361 0.030959 0.030959 0.011361 0.001229 0.956452 0.014192 0.007466 0.974386 0.003955 0.025086 0.012651 0.014984 0.947280 0.743436 0.029337 0.007245 0.219982 0.404816 0.174236 0.206626 0.214322 0.295979 0.194049 0.285864 0.224108 0.399608 0.106063 0.123706 0.370623 0.176973 0.196462 0.269004 0.357560 0.339978 0.107593 0.083682 0.468747 Consensus sequence: WDDDTACATGTADDWBW Reverse complement motif 0.468747 0.107593 0.083682 0.339978 0.357560 0.196462 0.269004 0.176973 0.370623 0.106063 0.123706 0.399608 0.224108 0.194049 0.285864 0.295979 0.214322 0.174236 0.206626 0.404816 0.219982 0.029337 0.007245 0.743436 0.947280 0.012651 0.014984 0.025086 0.014192 0.974386 0.007466 0.003955 0.956452 0.011361 0.001229 0.030959 0.030959 0.001229 0.011361 0.956452 0.003955 0.007466 0.974386 0.014192 0.025086 0.014984 0.012651 0.947280 0.743436 0.007245 0.029337 0.219982 0.200488 0.139766 0.252855 0.406891 0.295794 0.127772 0.257087 0.319347 0.276633 0.126236 0.130788 0.466343 0.423668 0.081399 0.100827 0.394106 Consensus sequence: WVWDDTACATGTADDDW Alignment: WDDDTACATGTADDWBW -------ATKTM----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00150 Irx6 Original Motif Original Motif Forward 8 5 0.012060 Species: Mus musculus Original motif 0.356323 0.182245 0.120162 0.341271 0.540549 0.133347 0.119342 0.206762 0.401575 0.161837 0.116292 0.320296 0.311151 0.164568 0.283941 0.240340 0.198376 0.006596 0.030801 0.764227 0.947120 0.014182 0.010382 0.028316 0.006934 0.957983 0.007710 0.027373 0.947314 0.001874 0.016190 0.034622 0.034622 0.016190 0.001874 0.947314 0.027373 0.007710 0.957983 0.006934 0.028316 0.010382 0.014182 0.947120 0.764227 0.030801 0.006596 0.198376 0.372950 0.265937 0.182203 0.178910 0.399793 0.101871 0.214477 0.283859 0.478414 0.110202 0.114534 0.296850 0.317990 0.215498 0.212041 0.254471 0.131398 0.063397 0.070049 0.735156 Consensus sequence: HAHDTACATGTAVDWHT Reverse complement motif 0.735156 0.063397 0.070049 0.131398 0.254471 0.215498 0.212041 0.317990 0.296850 0.110202 0.114534 0.478414 0.283859 0.101871 0.214477 0.399793 0.178910 0.265937 0.182203 0.372950 0.198376 0.030801 0.006596 0.764227 0.947120 0.010382 0.014182 0.028316 0.027373 0.957983 0.007710 0.006934 0.947314 0.016190 0.001874 0.034622 0.034622 0.001874 0.016190 0.947314 0.006934 0.007710 0.957983 0.027373 0.028316 0.014182 0.010382 0.947120 0.764227 0.006596 0.030801 0.198376 0.240340 0.164568 0.283941 0.311151 0.320296 0.161837 0.116292 0.401575 0.206762 0.133347 0.119342 0.540549 0.341271 0.182245 0.120162 0.356323 Consensus sequence: AHWDBTACATGTADHTH Alignment: HAHDTACATGTAVDWHT -------ATKTM----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00223 Irx3_2226.1 Original Motif Original Motif Forward 8 5 0.012488 Species: Mus musculus Original motif 0.402654 0.107068 0.157939 0.332339 0.381229 0.129621 0.243277 0.245872 0.271699 0.148903 0.261472 0.317925 0.278393 0.239730 0.235045 0.246831 0.223980 0.006073 0.031227 0.738720 0.952925 0.013731 0.008900 0.024444 0.005380 0.972117 0.004335 0.018169 0.945295 0.001062 0.011429 0.042214 0.042214 0.011429 0.001062 0.945295 0.018169 0.004335 0.972117 0.005380 0.024444 0.008900 0.013731 0.952925 0.738720 0.031227 0.006073 0.223980 0.449438 0.199271 0.196335 0.154956 0.266542 0.085070 0.155050 0.493338 0.412619 0.114771 0.151818 0.320792 0.175351 0.270485 0.162372 0.391791 0.355721 0.130415 0.156633 0.357231 Consensus sequence: DDDHTACATGTAVWDHD Reverse complement motif 0.357231 0.130415 0.156633 0.355721 0.391791 0.270485 0.162372 0.175351 0.320792 0.114771 0.151818 0.412619 0.493338 0.085070 0.155050 0.266542 0.154956 0.199271 0.196335 0.449438 0.223980 0.031227 0.006073 0.738720 0.952925 0.008900 0.013731 0.024444 0.018169 0.972117 0.004335 0.005380 0.945295 0.011429 0.001062 0.042214 0.042214 0.001062 0.011429 0.945295 0.005380 0.004335 0.972117 0.018169 0.024444 0.013731 0.008900 0.952925 0.738720 0.006073 0.031227 0.223980 0.246831 0.239730 0.235045 0.278393 0.317925 0.148903 0.261472 0.271699 0.245872 0.129621 0.243277 0.381229 0.332339 0.107068 0.157939 0.402654 Consensus sequence: DHDWBTACATGTAHDDD Alignment: DDDHTACATGTAVWDHD -------ATKTM----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00033 Zfp410_primary Original Motif Original Motif Forward 10 5 0.015004 Species: Mus musculus Original motif 0.302837 0.133017 0.249940 0.314205 0.378542 0.186425 0.250700 0.184332 0.184780 0.144329 0.262766 0.408125 0.308569 0.039689 0.235695 0.416047 0.817738 0.108938 0.033419 0.039905 0.018996 0.007718 0.013175 0.960112 0.009278 0.002422 0.973921 0.014379 0.005587 0.002693 0.985088 0.006633 0.005874 0.004232 0.976927 0.012967 0.951309 0.011835 0.023187 0.013669 0.005927 0.004521 0.005701 0.983851 0.146443 0.003009 0.840720 0.009829 0.002553 0.044504 0.542059 0.410884 0.406299 0.375782 0.133922 0.083997 0.256884 0.160184 0.271190 0.311742 0.388381 0.141811 0.214600 0.255208 0.340877 0.274387 0.205585 0.179151 Consensus sequence: DVDDATGGGATGKMDDV Reverse complement motif 0.179151 0.274387 0.205585 0.340877 0.255208 0.141811 0.214600 0.388381 0.311742 0.160184 0.271190 0.256884 0.083997 0.375782 0.133922 0.406299 0.002553 0.542059 0.044504 0.410884 0.146443 0.840720 0.003009 0.009829 0.983851 0.004521 0.005701 0.005927 0.013669 0.011835 0.023187 0.951309 0.005874 0.976927 0.004232 0.012967 0.005587 0.985088 0.002693 0.006633 0.009278 0.973921 0.002422 0.014379 0.960112 0.007718 0.013175 0.018996 0.039905 0.108938 0.033419 0.817738 0.416047 0.039689 0.235695 0.308569 0.408125 0.144329 0.262766 0.184780 0.184332 0.186425 0.250700 0.378542 0.314205 0.133017 0.249940 0.302837 Consensus sequence: BDDYYCATCCCATDDBD Alignment: DVDDATGGGATGKMDDV ---------ATKTM--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00223 Irx3_0920.1 Original Motif Original Motif Backward 6 5 0.015019 Species: Mus musculus Original motif 0.369314 0.086226 0.205101 0.339359 0.332302 0.160101 0.284255 0.223343 0.291107 0.190306 0.229518 0.289068 0.295366 0.218346 0.264868 0.221420 0.224029 0.007037 0.047157 0.721777 0.935123 0.014036 0.014073 0.036768 0.004474 0.977496 0.005620 0.012411 0.924256 0.001181 0.015903 0.058661 0.058661 0.015903 0.001181 0.924256 0.012411 0.005620 0.977496 0.004474 0.036768 0.014073 0.014036 0.935123 0.721777 0.047157 0.007037 0.224029 0.449320 0.226936 0.166094 0.157650 0.313283 0.070145 0.179424 0.437148 0.522855 0.074913 0.105873 0.296358 0.185897 0.387406 0.129138 0.297559 0.276853 0.127952 0.189255 0.405940 Consensus sequence: DDDDTACATGTAVWWHD Reverse complement motif 0.405940 0.127952 0.189255 0.276853 0.185897 0.129138 0.387406 0.297559 0.296358 0.074913 0.105873 0.522855 0.437148 0.070145 0.179424 0.313283 0.157650 0.226936 0.166094 0.449320 0.224029 0.047157 0.007037 0.721777 0.935123 0.014073 0.014036 0.036768 0.012411 0.977496 0.005620 0.004474 0.924256 0.015903 0.001181 0.058661 0.058661 0.001181 0.015903 0.924256 0.004474 0.005620 0.977496 0.012411 0.036768 0.014036 0.014073 0.935123 0.721777 0.007037 0.047157 0.224029 0.221420 0.218346 0.264868 0.295366 0.289068 0.190306 0.229518 0.291107 0.223343 0.160101 0.284255 0.332302 0.339359 0.086226 0.205101 0.369314 Consensus sequence: DDWWBTACATGTADDDD Alignment: DDDDTACATGTAVWWHD -------ATKTM----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00528 Foxm1_secondary Reverse Complement Original Motif Backward 12 5 0.016608 Species: Mus musculus Original motif 0.399785 0.446658 0.111435 0.042122 0.535175 0.103991 0.089706 0.271128 0.078171 0.387987 0.375083 0.158759 0.309001 0.519142 0.070618 0.101239 0.201844 0.255818 0.323149 0.219190 0.534101 0.109845 0.235026 0.121028 0.656038 0.037473 0.261484 0.045006 0.315713 0.164290 0.471815 0.048182 0.651960 0.009412 0.328237 0.010391 0.937365 0.017313 0.007516 0.037807 0.019983 0.044238 0.012387 0.923392 0.061195 0.021485 0.881645 0.035675 0.017521 0.952998 0.013139 0.016342 0.254160 0.029735 0.493023 0.223082 0.239200 0.593324 0.114503 0.052973 0.610822 0.071539 0.099169 0.218470 0.166610 0.389712 0.204400 0.239278 0.227752 0.361626 0.178497 0.232125 0.537030 0.182466 0.026035 0.254470 0.235902 0.151006 0.043788 0.569304 0.081851 0.250397 0.590059 0.077693 0.340417 0.189613 0.272075 0.197895 Consensus sequence: MWSMBAARRATGCDCABHATGD Reverse complement motif 0.197895 0.189613 0.272075 0.340417 0.081851 0.590059 0.250397 0.077693 0.569304 0.151006 0.043788 0.235902 0.254470 0.182466 0.026035 0.537030 0.227752 0.178497 0.361626 0.232125 0.166610 0.204400 0.389712 0.239278 0.218470 0.071539 0.099169 0.610822 0.239200 0.114503 0.593324 0.052973 0.254160 0.493023 0.029735 0.223082 0.017521 0.013139 0.952998 0.016342 0.061195 0.881645 0.021485 0.035675 0.923392 0.044238 0.012387 0.019983 0.037807 0.017313 0.007516 0.937365 0.010391 0.009412 0.328237 0.651960 0.315713 0.471815 0.164290 0.048182 0.045006 0.037473 0.261484 0.656038 0.121028 0.109845 0.235026 0.534101 0.201844 0.323149 0.255818 0.219190 0.309001 0.070618 0.519142 0.101239 0.078171 0.375083 0.387987 0.158759 0.271128 0.103991 0.089706 0.535175 0.399785 0.111435 0.446658 0.042122 Consensus sequence: DCATDBTGHGCATKMTTBRSWR Alignment: MWSMBAARRATGCDCABHATGD ------RARAT----------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 6 Motif name: Motif 6 Original motif 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.594366 0.405634 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.636620 0.000000 0.363380 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 Consensus sequence: CMGCRGC Reserve complement motif 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.363380 0.636620 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.405634 0.000000 0.594366 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 Consensus sequence: GCKGCYG ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 6 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00052 Osr2_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 5 7 0.000000 Species: Mus musculus Original motif 0.295210 0.230759 0.178832 0.295199 0.286163 0.186772 0.186150 0.340915 0.287577 0.235045 0.329453 0.147924 0.263264 0.191325 0.081978 0.463433 0.839420 0.118123 0.018788 0.023669 0.005488 0.984397 0.000830 0.009284 0.660134 0.001532 0.336574 0.001760 0.003020 0.001773 0.993144 0.002063 0.039664 0.001060 0.005054 0.954222 0.980339 0.000636 0.016776 0.002249 0.003849 0.001418 0.992166 0.002568 0.000858 0.950172 0.007228 0.041743 0.342840 0.230712 0.133570 0.292878 0.342486 0.316980 0.167294 0.173240 0.362426 0.178913 0.146709 0.311952 0.266586 0.140406 0.435643 0.157365 Consensus sequence: HHVHACRGTAGCHHHD Reverse complement motif 0.266586 0.435643 0.140406 0.157365 0.311952 0.178913 0.146709 0.362426 0.173240 0.316980 0.167294 0.342486 0.292878 0.230712 0.133570 0.342840 0.000858 0.007228 0.950172 0.041743 0.003849 0.992166 0.001418 0.002568 0.002249 0.000636 0.016776 0.980339 0.954222 0.001060 0.005054 0.039664 0.003020 0.993144 0.001773 0.002063 0.001760 0.001532 0.336574 0.660134 0.005488 0.000830 0.984397 0.009284 0.023669 0.118123 0.018788 0.839420 0.463433 0.191325 0.081978 0.263264 0.287577 0.329453 0.235045 0.147924 0.340915 0.186772 0.186150 0.286163 0.295199 0.230759 0.178832 0.295210 Consensus sequence: HHHHGCTACKGTHVHH Alignment: HHHHGCTACKGTHVHH ----GCKGCYG----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00027 Osr1_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 5 7 0.001081 Species: Mus musculus Original motif 0.260366 0.252887 0.224273 0.262474 0.239931 0.233883 0.190643 0.335543 0.257637 0.188706 0.242480 0.311177 0.323833 0.165978 0.161144 0.349046 0.824983 0.119267 0.027014 0.028736 0.009055 0.974108 0.000889 0.015947 0.659219 0.001516 0.337361 0.001905 0.002965 0.001643 0.993070 0.002321 0.047380 0.001758 0.009593 0.941269 0.974073 0.000741 0.023187 0.001999 0.006256 0.001341 0.990114 0.002290 0.001372 0.921382 0.010719 0.066527 0.449788 0.160658 0.105504 0.284050 0.392727 0.304490 0.187448 0.115335 0.361758 0.209213 0.175805 0.253224 0.420972 0.108912 0.289406 0.180710 Consensus sequence: HHDHACRGTAGCHVHD Reverse complement motif 0.180710 0.108912 0.289406 0.420972 0.253224 0.209213 0.175805 0.361758 0.115335 0.304490 0.187448 0.392727 0.284050 0.160658 0.105504 0.449788 0.001372 0.010719 0.921382 0.066527 0.006256 0.990114 0.001341 0.002290 0.001999 0.000741 0.023187 0.974073 0.941269 0.001758 0.009593 0.047380 0.002965 0.993070 0.001643 0.002321 0.001905 0.001516 0.337361 0.659219 0.009055 0.000889 0.974108 0.015947 0.028736 0.119267 0.027014 0.824983 0.349046 0.165978 0.161144 0.323833 0.311177 0.188706 0.242480 0.257637 0.335543 0.233883 0.190643 0.239931 0.262474 0.252887 0.224273 0.260366 Consensus sequence: DHBHGCTACKGTHDHH Alignment: DHBHGCTACKGTHDHH ----GCKGCYG----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00099 Ascl2_primary Reverse Complement Original Motif Forward 8 7 0.009055 Species: Mus musculus Original motif 0.168852 0.325948 0.188604 0.316596 0.150343 0.193286 0.241301 0.415069 0.091518 0.482905 0.122928 0.302648 0.472493 0.198776 0.225796 0.102935 0.294513 0.179919 0.447250 0.078318 0.014660 0.972080 0.005591 0.007668 0.954848 0.008107 0.008474 0.028571 0.006076 0.178912 0.760021 0.054991 0.052082 0.817415 0.124797 0.005707 0.019342 0.010406 0.008905 0.961347 0.005455 0.008073 0.977684 0.008788 0.042946 0.715551 0.087020 0.154483 0.116888 0.241739 0.170073 0.471300 0.315931 0.324343 0.291451 0.068274 0.199164 0.366921 0.163690 0.270226 0.218561 0.211076 0.187732 0.382631 0.145317 0.139808 0.389262 0.325614 Consensus sequence: BBYVVCAGCTGCBVHHD Reverse complement motif 0.145317 0.389262 0.139808 0.325614 0.382631 0.211076 0.187732 0.218561 0.199164 0.163690 0.366921 0.270226 0.315931 0.291451 0.324343 0.068274 0.471300 0.241739 0.170073 0.116888 0.042946 0.087020 0.715551 0.154483 0.005455 0.977684 0.008073 0.008788 0.961347 0.010406 0.008905 0.019342 0.052082 0.124797 0.817415 0.005707 0.006076 0.760021 0.178912 0.054991 0.028571 0.008107 0.008474 0.954848 0.014660 0.005591 0.972080 0.007668 0.294513 0.447250 0.179919 0.078318 0.102935 0.198776 0.225796 0.472493 0.091518 0.122928 0.482905 0.302648 0.415069 0.193286 0.241301 0.150343 0.168852 0.188604 0.325948 0.316596 Consensus sequence: HHDVVGCAGCTGVBKVB Alignment: BBYVVCAGCTGCBVHHD -------GCKGCYG--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00102 Zic1_secondary Original Motif Original Motif Backward 4 7 0.011106 Species: Mus musculus Original motif 0.161683 0.405114 0.171743 0.261460 0.259478 0.357988 0.146793 0.235741 0.371334 0.026439 0.283598 0.318630 0.092229 0.883389 0.018758 0.005623 0.419591 0.169874 0.253266 0.157270 0.002985 0.976375 0.002722 0.017918 0.909381 0.021357 0.013299 0.055963 0.039418 0.007014 0.948302 0.005266 0.001711 0.845894 0.005756 0.146640 0.803792 0.003049 0.148687 0.044472 0.015314 0.017153 0.680239 0.287294 0.003793 0.011414 0.937403 0.047390 0.431916 0.266291 0.144154 0.157638 0.269331 0.239338 0.366817 0.124513 0.395873 0.103980 0.214796 0.285351 Consensus sequence: BHDCVCAGCAGGHVD Reverse complement motif 0.285351 0.103980 0.214796 0.395873 0.269331 0.366817 0.239338 0.124513 0.157638 0.266291 0.144154 0.431916 0.003793 0.937403 0.011414 0.047390 0.015314 0.680239 0.017153 0.287294 0.044472 0.003049 0.148687 0.803792 0.001711 0.005756 0.845894 0.146640 0.039418 0.948302 0.007014 0.005266 0.055963 0.021357 0.013299 0.909381 0.002985 0.002722 0.976375 0.017918 0.157270 0.169874 0.253266 0.419591 0.092229 0.018758 0.883389 0.005623 0.318630 0.026439 0.283598 0.371334 0.259478 0.146793 0.357988 0.235741 0.161683 0.171743 0.405114 0.261460 Consensus sequence: DVHCCTGCTGBGDDB Alignment: BHDCVCAGCAGGHVD -----CMGCRGC--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00057 Zic2_secondary Original Motif Original Motif Forward 6 7 0.012690 Species: Mus musculus Original motif 0.201522 0.336845 0.183740 0.277892 0.238705 0.354378 0.165332 0.241585 0.350858 0.031427 0.308482 0.309233 0.104423 0.870794 0.018676 0.006107 0.313246 0.259944 0.277570 0.149241 0.003590 0.973377 0.002520 0.020513 0.899716 0.025489 0.015458 0.059336 0.049224 0.006415 0.938214 0.006147 0.002021 0.859631 0.007903 0.130445 0.772818 0.002659 0.187334 0.037190 0.008456 0.015170 0.594695 0.381679 0.004118 0.009188 0.961506 0.025188 0.367151 0.230955 0.204475 0.197419 0.267508 0.193660 0.430070 0.108762 0.444449 0.099127 0.212182 0.244241 Consensus sequence: HHDCVCAGCAKGVVD Reverse complement motif 0.244241 0.099127 0.212182 0.444449 0.267508 0.430070 0.193660 0.108762 0.197419 0.230955 0.204475 0.367151 0.004118 0.961506 0.009188 0.025188 0.008456 0.594695 0.015170 0.381679 0.037190 0.002659 0.187334 0.772818 0.002021 0.007903 0.859631 0.130445 0.049224 0.938214 0.006415 0.006147 0.059336 0.025489 0.015458 0.899716 0.003590 0.002520 0.973377 0.020513 0.149241 0.259944 0.277570 0.313246 0.104423 0.018676 0.870794 0.006107 0.309233 0.031427 0.308482 0.350858 0.238705 0.165332 0.354378 0.241585 0.201522 0.183740 0.336845 0.277892 Consensus sequence: DVBCYTGCTGBGDDD Alignment: HHDCVCAGCAKGVVD -----CMGCRGC--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00006 Zic3_secondary Reverse Complement Reverse Complement Backward 6 7 0.013740 Species: Mus musculus Original motif 0.225537 0.223459 0.280507 0.270498 0.332396 0.181810 0.207290 0.278505 0.309873 0.017922 0.386135 0.286070 0.101947 0.871607 0.020267 0.006179 0.541366 0.089100 0.242170 0.127364 0.003307 0.969997 0.002414 0.024283 0.903286 0.021590 0.015872 0.059253 0.039887 0.009732 0.945083 0.005298 0.001704 0.827209 0.006276 0.164810 0.723052 0.003102 0.221051 0.052795 0.011758 0.024398 0.560633 0.403211 0.003656 0.012952 0.939586 0.043807 0.477846 0.270399 0.113113 0.138642 0.225706 0.298505 0.258523 0.217266 0.365251 0.191780 0.197411 0.245557 Consensus sequence: DDDCACAGCAKGHVD Reverse complement motif 0.245557 0.191780 0.197411 0.365251 0.225706 0.258523 0.298505 0.217266 0.138642 0.270399 0.113113 0.477846 0.003656 0.939586 0.012952 0.043807 0.011758 0.560633 0.024398 0.403211 0.052795 0.003102 0.221051 0.723052 0.001704 0.006276 0.827209 0.164810 0.039887 0.945083 0.009732 0.005298 0.059253 0.021590 0.015872 0.903286 0.003307 0.002414 0.969997 0.024283 0.127364 0.089100 0.242170 0.541366 0.101947 0.020267 0.871607 0.006179 0.309873 0.386135 0.017922 0.286070 0.278505 0.181810 0.207290 0.332396 0.225537 0.280507 0.223459 0.270498 Consensus sequence: DVHCYTGCTGTGHDH Alignment: DVHCYTGCTGTGHDH ---GCKGCYG----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00045 Mafb_primary Original Motif Reverse Complement Backward 4 7 0.025308 Species: Mus musculus Original motif 0.420301 0.182299 0.161481 0.235919 0.593201 0.055751 0.202477 0.148571 0.653364 0.017008 0.054630 0.274998 0.339176 0.102943 0.050258 0.507622 0.171557 0.078698 0.267471 0.482273 0.044703 0.033212 0.003920 0.918165 0.010333 0.004451 0.972441 0.012775 0.034026 0.949298 0.004788 0.011889 0.016078 0.008878 0.004007 0.971037 0.020331 0.004077 0.929676 0.045916 0.975739 0.007450 0.005991 0.010819 0.012733 0.887375 0.018700 0.081192 0.259981 0.111885 0.243051 0.385083 0.327677 0.149969 0.094895 0.427459 0.541721 0.105923 0.242224 0.110132 0.258689 0.068305 0.493226 0.179779 0.306041 0.306854 0.168308 0.218798 Consensus sequence: HAAWDTGCTGACDWARH Reverse complement motif 0.306041 0.168308 0.306854 0.218798 0.258689 0.493226 0.068305 0.179779 0.110132 0.105923 0.242224 0.541721 0.427459 0.149969 0.094895 0.327677 0.385083 0.111885 0.243051 0.259981 0.012733 0.018700 0.887375 0.081192 0.010819 0.007450 0.005991 0.975739 0.020331 0.929676 0.004077 0.045916 0.971037 0.008878 0.004007 0.016078 0.034026 0.004788 0.949298 0.011889 0.010333 0.972441 0.004451 0.012775 0.918165 0.033212 0.003920 0.044703 0.482273 0.078698 0.267471 0.171557 0.507622 0.102943 0.050258 0.339176 0.274998 0.017008 0.054630 0.653364 0.148571 0.055751 0.202477 0.593201 0.235919 0.182299 0.161481 0.420301 Consensus sequence: DMTWDGTCAGCADWTTH Alignment: DMTWDGTCAGCADWTTH -------CMGCRGC--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00193 Rhox11_1765.2 Original Motif Reverse Complement Forward 9 7 0.029267 Species: Mus musculus Original motif 0.538735 0.129821 0.147336 0.184107 0.331267 0.275123 0.227609 0.166001 0.174654 0.113319 0.383610 0.328417 0.296734 0.281670 0.230068 0.191527 0.128222 0.561296 0.062928 0.247554 0.027028 0.014676 0.949335 0.008962 0.087209 0.761581 0.147964 0.003246 0.006796 0.000741 0.006037 0.986427 0.039496 0.000533 0.943453 0.016517 0.005541 0.005164 0.002805 0.986489 0.561957 0.002761 0.004207 0.431075 0.780197 0.037155 0.031222 0.151425 0.518642 0.104220 0.012670 0.364468 0.314451 0.111366 0.333508 0.240676 0.236936 0.357992 0.280813 0.124259 0.314846 0.163774 0.426195 0.095185 0.408340 0.134111 0.102987 0.354562 Consensus sequence: AVDVCGCTGTWAWDVVW Reverse complement motif 0.354562 0.134111 0.102987 0.408340 0.314846 0.426195 0.163774 0.095185 0.236936 0.280813 0.357992 0.124259 0.314451 0.333508 0.111366 0.240676 0.364468 0.104220 0.012670 0.518642 0.151425 0.037155 0.031222 0.780197 0.431075 0.002761 0.004207 0.561957 0.986489 0.005164 0.002805 0.005541 0.039496 0.943453 0.000533 0.016517 0.986427 0.000741 0.006037 0.006796 0.087209 0.147964 0.761581 0.003246 0.027028 0.949335 0.014676 0.008962 0.128222 0.062928 0.561296 0.247554 0.191527 0.281670 0.230068 0.296734 0.174654 0.383610 0.113319 0.328417 0.166001 0.275123 0.227609 0.331267 0.184107 0.129821 0.147336 0.538735 Consensus sequence: WVVHWTWACAGCGBHBT Alignment: WVVHWTWACAGCGBHBT --------CMGCRGC-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00193 Rhox11_2205.1 Original Motif Reverse Complement Backward 3 7 0.029808 Species: Mus musculus Original motif 0.504898 0.140204 0.135418 0.219480 0.282348 0.244881 0.300572 0.172199 0.183939 0.100670 0.384783 0.330608 0.326709 0.269523 0.194043 0.209724 0.142989 0.557393 0.066826 0.232792 0.038356 0.014052 0.932450 0.015142 0.092102 0.778844 0.125082 0.003972 0.010254 0.001252 0.005231 0.983263 0.033486 0.000891 0.947486 0.018137 0.005360 0.007407 0.003729 0.983504 0.603485 0.007179 0.003482 0.385853 0.798026 0.029788 0.032370 0.139816 0.529622 0.100632 0.016507 0.353238 0.243581 0.126094 0.401402 0.228923 0.207484 0.285456 0.353715 0.153346 0.282413 0.188410 0.441463 0.087715 0.422774 0.152965 0.094106 0.330155 Consensus sequence: AVDHCGCTGTWAWDVVW Reverse complement motif 0.330155 0.152965 0.094106 0.422774 0.282413 0.441463 0.188410 0.087715 0.207484 0.353715 0.285456 0.153346 0.243581 0.401402 0.126094 0.228923 0.353238 0.100632 0.016507 0.529622 0.139816 0.029788 0.032370 0.798026 0.385853 0.007179 0.003482 0.603485 0.983504 0.007407 0.003729 0.005360 0.033486 0.947486 0.000891 0.018137 0.983263 0.001252 0.005231 0.010254 0.092102 0.125082 0.778844 0.003972 0.038356 0.932450 0.014052 0.015142 0.142989 0.066826 0.557393 0.232792 0.209724 0.269523 0.194043 0.326709 0.183939 0.384783 0.100670 0.330608 0.282348 0.300572 0.244881 0.172199 0.219480 0.140204 0.135418 0.504898 Consensus sequence: WVVHWTWACAGCGHHVT Alignment: WVVHWTWACAGCGHHVT --------CMGCRGC-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00122 Tgif1 Original Motif Original Motif Backward 3 7 0.033298 Species: Mus musculus Original motif 0.272977 0.158875 0.284742 0.283406 0.550609 0.124110 0.169608 0.155673 0.114568 0.207160 0.282464 0.395807 0.560868 0.052907 0.053508 0.332716 0.336500 0.068048 0.114050 0.481403 0.007736 0.003722 0.000495 0.988048 0.004489 0.000729 0.992211 0.002571 0.956618 0.000414 0.000890 0.042078 0.004381 0.990925 0.000538 0.004156 0.982797 0.000366 0.015539 0.001298 0.016760 0.002980 0.969991 0.010269 0.036013 0.725983 0.200022 0.037982 0.064755 0.104386 0.133891 0.696968 0.199404 0.263520 0.410228 0.126848 0.222648 0.351390 0.272575 0.153387 0.087778 0.206043 0.395671 0.310507 0.319643 0.144216 0.196041 0.340100 Consensus sequence: DABWWTGACAGCTVVBD Reverse complement motif 0.340100 0.144216 0.196041 0.319643 0.087778 0.395671 0.206043 0.310507 0.222648 0.272575 0.351390 0.153387 0.199404 0.410228 0.263520 0.126848 0.696968 0.104386 0.133891 0.064755 0.036013 0.200022 0.725983 0.037982 0.016760 0.969991 0.002980 0.010269 0.001298 0.000366 0.015539 0.982797 0.004381 0.000538 0.990925 0.004156 0.042078 0.000414 0.000890 0.956618 0.004489 0.992211 0.000729 0.002571 0.988048 0.003722 0.000495 0.007736 0.481403 0.068048 0.114050 0.336500 0.332716 0.052907 0.053508 0.560868 0.395807 0.207160 0.282464 0.114568 0.155673 0.124110 0.169608 0.550609 0.272977 0.284742 0.158875 0.283406 Consensus sequence: DBVVAGCTGTCAWWVTH Alignment: DABWWTGACAGCTVVBD --------CMGCRGC-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 7 Motif name: Motif 7 Original motif 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.474359 0.000000 0.525641 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 Consensus sequence: CCCRCCCC Reserve complement motif 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.474359 0.525641 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 Consensus sequence: GGGGMGGG ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 7 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00093 Klf7_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 4 8 0.000000 Species: Mus musculus Original motif 0.204514 0.198353 0.171218 0.425915 0.167188 0.296785 0.246082 0.289946 0.267330 0.148001 0.398674 0.185994 0.549386 0.060167 0.337100 0.053347 0.050746 0.900013 0.022169 0.027073 0.037905 0.920332 0.008360 0.033403 0.410356 0.566702 0.016267 0.006675 0.009526 0.982354 0.001060 0.007060 0.204292 0.001084 0.748567 0.046056 0.003955 0.988490 0.002821 0.004735 0.004264 0.988826 0.004311 0.002598 0.002758 0.929549 0.001244 0.066448 0.260332 0.421683 0.024720 0.293265 0.184798 0.247697 0.085237 0.482268 0.347537 0.197344 0.139961 0.315159 0.255281 0.166620 0.242297 0.335802 Consensus sequence: HBDRCCMCGCCCHHHD Reverse complement motif 0.335802 0.166620 0.242297 0.255281 0.315159 0.197344 0.139961 0.347537 0.482268 0.247697 0.085237 0.184798 0.260332 0.024720 0.421683 0.293265 0.002758 0.001244 0.929549 0.066448 0.004264 0.004311 0.988826 0.002598 0.003955 0.002821 0.988490 0.004735 0.204292 0.748567 0.001084 0.046056 0.009526 0.001060 0.982354 0.007060 0.410356 0.016267 0.566702 0.006675 0.037905 0.008360 0.920332 0.033403 0.050746 0.022169 0.900013 0.027073 0.053347 0.060167 0.337100 0.549386 0.267330 0.398674 0.148001 0.185994 0.167188 0.246082 0.296785 0.289946 0.425915 0.198353 0.171218 0.204514 Consensus sequence: DHHDGGGCGRGGKHBH Alignment: DHHDGGGCGRGGKHBH ---GGGGMGGG----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00002 Sp4_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 7 8 0.004909 Species: Mus musculus Original motif 0.155386 0.223380 0.374454 0.246780 0.247106 0.159582 0.345111 0.248201 0.238889 0.258354 0.165304 0.337454 0.255612 0.489586 0.051621 0.203182 0.450100 0.545383 0.001071 0.003447 0.003704 0.991007 0.002456 0.002833 0.035504 0.001814 0.928129 0.034553 0.001494 0.991406 0.003414 0.003686 0.003045 0.990628 0.005182 0.001145 0.000990 0.963237 0.001215 0.034557 0.148016 0.838396 0.000666 0.012922 0.014261 0.905847 0.007200 0.072692 0.083394 0.270068 0.058368 0.588170 0.149141 0.286783 0.142802 0.421274 0.204851 0.347195 0.253356 0.194597 0.184442 0.299908 0.194408 0.321242 0.125793 0.380109 0.245318 0.248780 Consensus sequence: BDHHMCGCCCCCTHVBB Reverse complement motif 0.125793 0.245318 0.380109 0.248780 0.321242 0.299908 0.194408 0.184442 0.204851 0.253356 0.347195 0.194597 0.421274 0.286783 0.142802 0.149141 0.588170 0.270068 0.058368 0.083394 0.014261 0.007200 0.905847 0.072692 0.148016 0.000666 0.838396 0.012922 0.000990 0.001215 0.963237 0.034557 0.003045 0.005182 0.990628 0.001145 0.001494 0.003414 0.991406 0.003686 0.035504 0.928129 0.001814 0.034553 0.003704 0.002456 0.991007 0.002833 0.450100 0.001071 0.545383 0.003447 0.255612 0.051621 0.489586 0.203182 0.337454 0.258354 0.165304 0.238889 0.247106 0.345111 0.159582 0.248201 0.155386 0.374454 0.223380 0.246780 Consensus sequence: BVVHAGGGGGCGRDHHB Alignment: BVVHAGGGGGCGRDHHB ------GGGGMGGG--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00007 Egr1_primary Original Motif Original Motif Forward 1 8 0.010144 Species: Mus musculus Original motif 0.211547 0.282708 0.203472 0.302273 0.141988 0.722437 0.054854 0.080721 0.032605 0.877172 0.012432 0.077792 0.115126 0.070606 0.781290 0.032979 0.003516 0.990021 0.002265 0.004198 0.004715 0.982482 0.009897 0.002906 0.001627 0.975937 0.001662 0.020774 0.262352 0.731732 0.002730 0.003187 0.005890 0.985756 0.002081 0.006273 0.022893 0.090460 0.649322 0.237324 0.023038 0.859949 0.037913 0.079101 0.567633 0.057394 0.166792 0.208181 0.176597 0.331265 0.125308 0.366830 0.183049 0.183774 0.226793 0.406384 Consensus sequence: HCCGCCCCCGCAHB Reverse complement motif 0.406384 0.183774 0.226793 0.183049 0.366830 0.331265 0.125308 0.176597 0.208181 0.057394 0.166792 0.567633 0.023038 0.037913 0.859949 0.079101 0.022893 0.649322 0.090460 0.237324 0.005890 0.002081 0.985756 0.006273 0.262352 0.002730 0.731732 0.003187 0.001627 0.001662 0.975937 0.020774 0.004715 0.009897 0.982482 0.002906 0.003516 0.002265 0.990021 0.004198 0.115126 0.781290 0.070606 0.032979 0.032605 0.012432 0.877172 0.077792 0.141988 0.054854 0.722437 0.080721 0.302273 0.282708 0.203472 0.211547 Consensus sequence: VHTGCGGGGGCGGH Alignment: HCCGCCCCCGCAHB CCCRCCCC------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00021 Zfp281_primary Original Motif Original Motif Forward 4 8 0.010691 Species: Mus musculus Original motif 0.201535 0.165213 0.201324 0.431929 0.136153 0.443451 0.179132 0.241264 0.263149 0.555137 0.067983 0.113731 0.142183 0.737634 0.045722 0.074461 0.044982 0.884112 0.045356 0.025549 0.246434 0.590578 0.022655 0.140333 0.123049 0.591257 0.033072 0.252622 0.018153 0.944742 0.010254 0.026851 0.035459 0.953844 0.003988 0.006709 0.020000 0.954344 0.005966 0.019690 0.015299 0.964390 0.006755 0.013557 0.028565 0.936152 0.011660 0.023623 0.300127 0.517309 0.029700 0.152863 0.159063 0.513443 0.051834 0.275660 0.158172 0.647055 0.133256 0.061516 Consensus sequence: DBCCCCCCCCCCMYC Reverse complement motif 0.158172 0.133256 0.647055 0.061516 0.159063 0.051834 0.513443 0.275660 0.300127 0.029700 0.517309 0.152863 0.028565 0.011660 0.936152 0.023623 0.015299 0.006755 0.964390 0.013557 0.020000 0.005966 0.954344 0.019690 0.035459 0.003988 0.953844 0.006709 0.018153 0.010254 0.944742 0.026851 0.123049 0.033072 0.591257 0.252622 0.246434 0.022655 0.590578 0.140333 0.044982 0.045356 0.884112 0.025549 0.142183 0.045722 0.737634 0.074461 0.263149 0.067983 0.555137 0.113731 0.136153 0.179132 0.443451 0.241264 0.431929 0.165213 0.201324 0.201535 Consensus sequence: GKRGGGGGGGGGGBD Alignment: DBCCCCCCCCCCMYC ---CCCRCCCC---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00043 Bcl6b_secondary Original Motif Original Motif Forward 4 8 0.015268 Species: Mus musculus Original motif 0.316572 0.278382 0.152556 0.252490 0.167141 0.257034 0.259894 0.315931 0.175523 0.325956 0.259996 0.238525 0.165052 0.385677 0.239449 0.209822 0.069489 0.782718 0.072454 0.075339 0.049943 0.800636 0.031988 0.117433 0.223382 0.060306 0.552691 0.163621 0.072944 0.818252 0.034406 0.074398 0.070535 0.845127 0.062712 0.021626 0.031035 0.859354 0.055424 0.054187 0.063668 0.798503 0.067274 0.070554 0.348488 0.030697 0.197179 0.423636 0.307220 0.256470 0.181009 0.255301 0.460933 0.285057 0.090258 0.163752 0.315798 0.228431 0.171135 0.284637 0.374527 0.268328 0.198810 0.158335 Consensus sequence: HBBBCCGCCCCWHHHV Reverse complement motif 0.158335 0.268328 0.198810 0.374527 0.284637 0.228431 0.171135 0.315798 0.163752 0.285057 0.090258 0.460933 0.255301 0.256470 0.181009 0.307220 0.423636 0.030697 0.197179 0.348488 0.063668 0.067274 0.798503 0.070554 0.031035 0.055424 0.859354 0.054187 0.070535 0.062712 0.845127 0.021626 0.072944 0.034406 0.818252 0.074398 0.223382 0.552691 0.060306 0.163621 0.049943 0.031988 0.800636 0.117433 0.069489 0.072454 0.782718 0.075339 0.165052 0.239449 0.385677 0.209822 0.175523 0.259996 0.325956 0.238525 0.315931 0.257034 0.259894 0.167141 0.252490 0.278382 0.152556 0.316572 Consensus sequence: BHHHWGGGGCGGBBVH Alignment: HBBBCCGCCCCWHHHV ---CCCRCCCC----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 9 8 0.025218 Species: Mus musculus Original motif 0.404007 0.395873 0.173319 0.026801 0.305977 0.215534 0.215359 0.263130 0.370148 0.250957 0.113088 0.265808 0.324336 0.229498 0.174679 0.271487 0.263563 0.137896 0.079217 0.519324 0.265762 0.222582 0.082555 0.429102 0.206721 0.288405 0.017851 0.487023 0.164361 0.236500 0.061051 0.538088 0.593344 0.348446 0.050304 0.007906 0.031328 0.947050 0.007032 0.014590 0.010428 0.956605 0.029142 0.003825 0.459636 0.207616 0.155368 0.177380 0.014573 0.964608 0.012209 0.008610 0.066291 0.918196 0.008729 0.006784 0.019488 0.866774 0.018897 0.094841 0.767405 0.104198 0.029234 0.099164 0.052494 0.772531 0.039832 0.135142 0.296085 0.243498 0.350935 0.109482 0.518843 0.226659 0.124784 0.129714 0.647901 0.019721 0.159901 0.172477 0.113912 0.231511 0.214864 0.439713 0.223117 0.310596 0.293328 0.172959 0.185557 0.487662 0.136321 0.190459 Consensus sequence: MHHHWHYTMCCHCCCACVAABVH Reverse complement motif 0.185557 0.136321 0.487662 0.190459 0.223117 0.293328 0.310596 0.172959 0.439713 0.231511 0.214864 0.113912 0.172477 0.019721 0.159901 0.647901 0.129714 0.226659 0.124784 0.518843 0.296085 0.350935 0.243498 0.109482 0.052494 0.039832 0.772531 0.135142 0.099164 0.104198 0.029234 0.767405 0.019488 0.018897 0.866774 0.094841 0.066291 0.008729 0.918196 0.006784 0.014573 0.012209 0.964608 0.008610 0.177380 0.207616 0.155368 0.459636 0.010428 0.029142 0.956605 0.003825 0.031328 0.007032 0.947050 0.014590 0.007906 0.348446 0.050304 0.593344 0.538088 0.236500 0.061051 0.164361 0.487023 0.288405 0.017851 0.206721 0.429102 0.222582 0.082555 0.265762 0.519324 0.137896 0.079217 0.263563 0.271487 0.229498 0.174679 0.324336 0.265808 0.250957 0.113088 0.370148 0.263130 0.215534 0.215359 0.305977 0.026801 0.395873 0.173319 0.404007 Consensus sequence: DVVTTVGTGGGHGGYAMHWHHHY Alignment: MHHHWHYTMCCHCCCACVAABVH --------CCCRCCCC------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00022 Zfp740_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 7 8 0.025853 Species: Mus musculus Original motif 0.136946 0.396508 0.135309 0.331236 0.185528 0.417538 0.215409 0.181525 0.171276 0.341901 0.172832 0.313991 0.145641 0.590572 0.146376 0.117412 0.138035 0.660416 0.114016 0.087533 0.222728 0.750532 0.007528 0.019212 0.024633 0.963314 0.001894 0.010159 0.009557 0.979956 0.000642 0.009844 0.010416 0.977424 0.000541 0.011619 0.026401 0.956740 0.001544 0.015314 0.195502 0.755959 0.011060 0.037480 0.491291 0.364785 0.025613 0.118311 0.305153 0.398160 0.071680 0.225008 0.253497 0.232647 0.213246 0.300610 0.156964 0.297876 0.144683 0.400477 0.179549 0.292514 0.319462 0.208475 Consensus sequence: HVBCCCCCCCCMHHHB Reverse complement motif 0.179549 0.319462 0.292514 0.208475 0.400477 0.297876 0.144683 0.156964 0.300610 0.232647 0.213246 0.253497 0.305153 0.071680 0.398160 0.225008 0.118311 0.364785 0.025613 0.491291 0.195502 0.011060 0.755959 0.037480 0.026401 0.001544 0.956740 0.015314 0.010416 0.000541 0.977424 0.011619 0.009557 0.000642 0.979956 0.009844 0.024633 0.001894 0.963314 0.010159 0.222728 0.007528 0.750532 0.019212 0.138035 0.114016 0.660416 0.087533 0.145641 0.146376 0.590572 0.117412 0.171276 0.172832 0.341901 0.313991 0.185528 0.215409 0.417538 0.181525 0.136946 0.135309 0.396508 0.331236 Consensus sequence: BHHDYGGGGGGGGBVD Alignment: BHHDYGGGGGGGGBVD ------GGGGMGGG-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00007 Egr1_secondary Original Motif Reverse Complement Forward 6 8 0.031824 Species: Mus musculus Original motif 0.182057 0.230014 0.276532 0.311397 0.122004 0.156883 0.366166 0.354947 0.209446 0.335433 0.185677 0.269444 0.140035 0.276547 0.302466 0.280952 0.124879 0.019371 0.809895 0.045854 0.647807 0.117014 0.183956 0.051224 0.021434 0.011745 0.954633 0.012188 0.017853 0.009441 0.315429 0.657277 0.166123 0.008326 0.807215 0.018337 0.022775 0.008972 0.947283 0.020970 0.038795 0.033592 0.781209 0.146405 0.728916 0.032888 0.088836 0.149360 0.197826 0.427858 0.055755 0.318561 0.264938 0.196184 0.092516 0.446362 0.267969 0.195624 0.318766 0.217641 0.225006 0.250404 0.267265 0.257324 Consensus sequence: BBHBGAGTGGGAHHDB Reverse complement motif 0.225006 0.267265 0.250404 0.257324 0.267969 0.318766 0.195624 0.217641 0.446362 0.196184 0.092516 0.264938 0.197826 0.055755 0.427858 0.318561 0.149360 0.032888 0.088836 0.728916 0.038795 0.781209 0.033592 0.146405 0.022775 0.947283 0.008972 0.020970 0.166123 0.807215 0.008326 0.018337 0.657277 0.009441 0.315429 0.017853 0.021434 0.954633 0.011745 0.012188 0.051224 0.117014 0.183956 0.647807 0.124879 0.809895 0.019371 0.045854 0.140035 0.302466 0.276547 0.280952 0.209446 0.185677 0.335433 0.269444 0.122004 0.366166 0.156883 0.354947 0.311397 0.230014 0.276532 0.182057 Consensus sequence: BHHDTCCCACTCBDBV Alignment: BHHDTCCCACTCBDBV -----CCCRCCCC--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_primaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 8 8 0.033360 Species: Mus musculus Original motif 0.204923 0.208846 0.365383 0.220848 0.294304 0.300143 0.167287 0.238266 0.109711 0.619514 0.117379 0.153396 0.178979 0.378580 0.230177 0.212264 0.159594 0.542602 0.118178 0.179627 0.125206 0.430074 0.151826 0.292894 0.097692 0.709845 0.116956 0.075506 0.148292 0.565912 0.037632 0.248164 0.077951 0.034190 0.855503 0.032356 0.001657 0.001061 0.971877 0.025405 0.001926 0.001084 0.991712 0.005278 0.033031 0.012001 0.057796 0.897171 0.002723 0.002647 0.993348 0.001281 0.003261 0.000963 0.987199 0.008577 0.000611 0.090925 0.074857 0.833608 0.015299 0.978878 0.004949 0.000874 0.013368 0.600902 0.033485 0.352245 0.231949 0.149575 0.118804 0.499672 0.267580 0.186002 0.371242 0.175176 0.264884 0.223483 0.110082 0.401551 0.221365 0.170121 0.179559 0.428955 0.112997 0.692930 0.139981 0.054092 0.460305 0.207883 0.155111 0.176702 Consensus sequence: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH Reverse complement motif 0.176702 0.207883 0.155111 0.460305 0.112997 0.139981 0.692930 0.054092 0.428955 0.170121 0.179559 0.221365 0.401551 0.223483 0.110082 0.264884 0.267580 0.371242 0.186002 0.175176 0.499672 0.149575 0.118804 0.231949 0.013368 0.033485 0.600902 0.352245 0.015299 0.004949 0.978878 0.000874 0.833608 0.090925 0.074857 0.000611 0.003261 0.987199 0.000963 0.008577 0.002723 0.993348 0.002647 0.001281 0.897171 0.012001 0.057796 0.033031 0.001926 0.991712 0.001084 0.005278 0.001657 0.971877 0.001061 0.025405 0.077951 0.855503 0.034190 0.032356 0.148292 0.037632 0.565912 0.248164 0.097692 0.116956 0.709845 0.075506 0.125206 0.151826 0.430074 0.292894 0.159594 0.118178 0.542602 0.179627 0.178979 0.230177 0.378580 0.212264 0.109711 0.117379 0.619514 0.153396 0.294304 0.167287 0.300143 0.238266 0.204923 0.365383 0.208846 0.220848 Consensus sequence: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB Alignment: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB --------CCCRCCCC------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00033 Zfp410_secondary Reverse Complement Reverse Complement Forward 6 8 0.033618 Species: Mus musculus Original motif 0.162979 0.284781 0.237433 0.314807 0.182449 0.447584 0.069464 0.300502 0.298973 0.261014 0.213211 0.226802 0.136039 0.433062 0.144274 0.286625 0.180084 0.395933 0.158565 0.265418 0.069354 0.748510 0.068898 0.113238 0.060485 0.717828 0.075333 0.146354 0.023280 0.071762 0.645500 0.259457 0.166896 0.749762 0.062730 0.020612 0.050401 0.775248 0.089072 0.085279 0.103847 0.767557 0.068804 0.059791 0.064815 0.748318 0.114588 0.072280 0.340921 0.071942 0.242981 0.344157 0.301967 0.263512 0.165927 0.268594 0.479800 0.222955 0.118441 0.178803 0.229469 0.283621 0.143099 0.343811 0.261733 0.180191 0.169905 0.388170 Consensus sequence: BHHBHCCGCCCCDHHHH Reverse complement motif 0.388170 0.180191 0.169905 0.261733 0.343811 0.283621 0.143099 0.229469 0.178803 0.222955 0.118441 0.479800 0.268594 0.263512 0.165927 0.301967 0.344157 0.071942 0.242981 0.340921 0.064815 0.114588 0.748318 0.072280 0.103847 0.068804 0.767557 0.059791 0.050401 0.089072 0.775248 0.085279 0.166896 0.062730 0.749762 0.020612 0.023280 0.645500 0.071762 0.259457 0.060485 0.075333 0.717828 0.146354 0.069354 0.068898 0.748510 0.113238 0.180084 0.158565 0.395933 0.265418 0.136039 0.144274 0.433062 0.286625 0.226802 0.261014 0.213211 0.298973 0.182449 0.069464 0.447584 0.300502 0.314807 0.284781 0.237433 0.162979 Consensus sequence: HHHHDGGGGCGGDBHDV Alignment: HHHHDGGGGCGGDBHDV -----GGGGMGGG---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 8 Motif name: Motif 8 Original motif 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.306358 0.000000 0.693642 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 Consensus sequence: CTGGGA Reserve complement motif 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.693642 0.306358 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 Consensus sequence: TCCCAG ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 8 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00033 Zfp410_primary Original Motif Original Motif Backward 8 6 0.000000 Species: Mus musculus Original motif 0.302837 0.133017 0.249940 0.314205 0.378542 0.186425 0.250700 0.184332 0.184780 0.144329 0.262766 0.408125 0.308569 0.039689 0.235695 0.416047 0.817738 0.108938 0.033419 0.039905 0.018996 0.007718 0.013175 0.960112 0.009278 0.002422 0.973921 0.014379 0.005587 0.002693 0.985088 0.006633 0.005874 0.004232 0.976927 0.012967 0.951309 0.011835 0.023187 0.013669 0.005927 0.004521 0.005701 0.983851 0.146443 0.003009 0.840720 0.009829 0.002553 0.044504 0.542059 0.410884 0.406299 0.375782 0.133922 0.083997 0.256884 0.160184 0.271190 0.311742 0.388381 0.141811 0.214600 0.255208 0.340877 0.274387 0.205585 0.179151 Consensus sequence: DVDDATGGGATGKMDDV Reverse complement motif 0.179151 0.274387 0.205585 0.340877 0.255208 0.141811 0.214600 0.388381 0.311742 0.160184 0.271190 0.256884 0.083997 0.375782 0.133922 0.406299 0.002553 0.542059 0.044504 0.410884 0.146443 0.840720 0.003009 0.009829 0.983851 0.004521 0.005701 0.005927 0.013669 0.011835 0.023187 0.951309 0.005874 0.976927 0.004232 0.012967 0.005587 0.985088 0.002693 0.006633 0.009278 0.973921 0.002422 0.014379 0.960112 0.007718 0.013175 0.018996 0.039905 0.108938 0.033419 0.817738 0.416047 0.039689 0.235695 0.308569 0.408125 0.144329 0.262766 0.184780 0.184332 0.186425 0.250700 0.378542 0.314205 0.133017 0.249940 0.302837 Consensus sequence: BDDYYCATCCCATDDBD Alignment: DVDDATGGGATGKMDDV ----CTGGGA------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00216 Obox1 Reverse Complement Reverse Complement Forward 9 6 0.000601 Species: Mus musculus Original motif 0.239477 0.131084 0.243507 0.385932 0.217543 0.106254 0.206114 0.470089 0.647326 0.113122 0.157767 0.081785 0.447787 0.111541 0.372093 0.068580 0.248541 0.017787 0.686924 0.046748 0.088770 0.008796 0.883034 0.019400 0.049663 0.003287 0.945325 0.001725 0.003569 0.000420 0.960584 0.035426 0.967192 0.029883 0.000248 0.002677 0.001721 0.005927 0.001063 0.991288 0.008389 0.011678 0.000280 0.979653 0.946957 0.000663 0.002329 0.050052 0.711018 0.017942 0.052601 0.218440 0.234125 0.619719 0.073871 0.072285 0.255026 0.148239 0.159856 0.436879 0.448611 0.200869 0.092123 0.258397 0.182337 0.333505 0.182092 0.302066 Consensus sequence: DDARGGGGATTAACDHH Reverse complement motif 0.182337 0.182092 0.333505 0.302066 0.258397 0.200869 0.092123 0.448611 0.436879 0.148239 0.159856 0.255026 0.234125 0.073871 0.619719 0.072285 0.218440 0.017942 0.052601 0.711018 0.050052 0.000663 0.002329 0.946957 0.979653 0.011678 0.000280 0.008389 0.991288 0.005927 0.001063 0.001721 0.002677 0.029883 0.000248 0.967192 0.003569 0.960584 0.000420 0.035426 0.049663 0.945325 0.003287 0.001725 0.088770 0.883034 0.008796 0.019400 0.248541 0.686924 0.017787 0.046748 0.068580 0.111541 0.372093 0.447787 0.081785 0.113122 0.157767 0.647326 0.470089 0.106254 0.206114 0.217543 0.385932 0.131084 0.243507 0.239477 Consensus sequence: DHDGTTAATCCCCKTDD Alignment: DHDGTTAATCCCCKTDD --------TCCCAG--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00229 Otx1 Reverse Complement Reverse Complement Forward 10 6 0.014078 Species: Mus musculus Original motif 0.300610 0.149999 0.303810 0.245581 0.194444 0.095366 0.487289 0.222901 0.366838 0.110418 0.162922 0.359822 0.426793 0.049280 0.474292 0.049636 0.176031 0.195172 0.608443 0.020354 0.077179 0.003862 0.916244 0.002715 0.006954 0.001526 0.985903 0.005616 0.953016 0.043074 0.000504 0.003406 0.001743 0.004547 0.001783 0.991927 0.012882 0.003454 0.000402 0.983262 0.939084 0.000404 0.001874 0.058638 0.687439 0.025328 0.143515 0.143718 0.117461 0.128987 0.097084 0.656468 0.291905 0.125407 0.094129 0.488559 0.241296 0.237850 0.201291 0.319563 0.317041 0.222787 0.160309 0.299862 0.187481 0.261819 0.240698 0.310001 Consensus sequence: DDDRGGGATTAATWHHB Reverse complement motif 0.310001 0.261819 0.240698 0.187481 0.299862 0.222787 0.160309 0.317041 0.319563 0.237850 0.201291 0.241296 0.488559 0.125407 0.094129 0.291905 0.656468 0.128987 0.097084 0.117461 0.143718 0.025328 0.143515 0.687439 0.058638 0.000404 0.001874 0.939084 0.983262 0.003454 0.000402 0.012882 0.991927 0.004547 0.001783 0.001743 0.003406 0.043074 0.000504 0.953016 0.006954 0.985903 0.001526 0.005616 0.077179 0.916244 0.003862 0.002715 0.176031 0.608443 0.195172 0.020354 0.426793 0.474292 0.049280 0.049636 0.359822 0.110418 0.162922 0.366838 0.194444 0.487289 0.095366 0.222901 0.300610 0.303810 0.149999 0.245581 Consensus sequence: VHHWATTAATCCCMDHH Alignment: VHHWATTAATCCCMDHH ---------TCCCAG-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00160 Obox3 Reverse Complement Reverse Complement Backward 4 6 0.014219 Species: Mus musculus Original motif 0.265987 0.173377 0.153926 0.406710 0.129561 0.268972 0.350646 0.250821 0.342885 0.208848 0.334291 0.113975 0.153240 0.164565 0.582521 0.099674 0.258413 0.031726 0.629457 0.080404 0.111288 0.035159 0.768619 0.084935 0.083021 0.004060 0.905853 0.007066 0.012108 0.002693 0.970145 0.015055 0.982328 0.009671 0.001699 0.006303 0.003572 0.002819 0.006020 0.987589 0.012066 0.006455 0.003574 0.977906 0.954560 0.001995 0.009190 0.034255 0.716184 0.015547 0.126758 0.141512 0.137277 0.673851 0.087215 0.101657 0.282699 0.056894 0.162378 0.498029 0.432159 0.290288 0.109507 0.168046 0.260601 0.267351 0.069676 0.402372 Consensus sequence: HBVGGGGGATTAACWHH Reverse complement motif 0.402372 0.267351 0.069676 0.260601 0.168046 0.290288 0.109507 0.432159 0.498029 0.056894 0.162378 0.282699 0.137277 0.087215 0.673851 0.101657 0.141512 0.015547 0.126758 0.716184 0.034255 0.001995 0.009190 0.954560 0.977906 0.006455 0.003574 0.012066 0.987589 0.002819 0.006020 0.003572 0.006303 0.009671 0.001699 0.982328 0.012108 0.970145 0.002693 0.015055 0.083021 0.905853 0.004060 0.007066 0.111288 0.768619 0.035159 0.084935 0.258413 0.629457 0.031726 0.080404 0.153240 0.582521 0.164565 0.099674 0.113975 0.208848 0.334291 0.342885 0.129561 0.350646 0.268972 0.250821 0.406710 0.173377 0.153926 0.265987 Consensus sequence: HHWGTTAATCCCCCBBH Alignment: HHWGTTAATCCCCCBBH --------TCCCAG--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00239 Obox2 Reverse Complement Reverse Complement Backward 4 6 0.018459 Species: Mus musculus Original motif 0.293849 0.125144 0.142440 0.438568 0.122280 0.144634 0.408124 0.324963 0.448856 0.147837 0.312347 0.090959 0.152801 0.059872 0.649129 0.138198 0.187720 0.040843 0.725481 0.045956 0.070379 0.021109 0.864530 0.043982 0.063765 0.006819 0.915928 0.013488 0.018370 0.002669 0.948065 0.030896 0.972042 0.020308 0.001317 0.006333 0.009162 0.002535 0.005655 0.982649 0.024250 0.007414 0.002871 0.965464 0.934913 0.002383 0.012220 0.050484 0.694401 0.019404 0.079194 0.207001 0.290944 0.524953 0.061736 0.122367 0.258089 0.064339 0.154268 0.523303 0.510991 0.233652 0.092796 0.162561 0.221195 0.238061 0.076237 0.464507 Consensus sequence: DBRGGGGGATTAAMTAH Reverse complement motif 0.464507 0.238061 0.076237 0.221195 0.162561 0.233652 0.092796 0.510991 0.523303 0.064339 0.154268 0.258089 0.290944 0.061736 0.524953 0.122367 0.207001 0.019404 0.079194 0.694401 0.050484 0.002383 0.012220 0.934913 0.965464 0.007414 0.002871 0.024250 0.982649 0.002535 0.005655 0.009162 0.006333 0.020308 0.001317 0.972042 0.018370 0.948065 0.002669 0.030896 0.063765 0.915928 0.006819 0.013488 0.070379 0.864530 0.021109 0.043982 0.187720 0.725481 0.040843 0.045956 0.152801 0.649129 0.059872 0.138198 0.090959 0.147837 0.312347 0.448856 0.122280 0.408124 0.144634 0.324963 0.438568 0.125144 0.142440 0.293849 Consensus sequence: HTARTTAATCCCCCKBD Alignment: HTARTTAATCCCCCKBD --------TCCCAG--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00416 Fli1 Original Motif Reverse Complement Backward 7 6 0.018604 Species: Mus musculus Original motif 0.306248 0.320757 0.227284 0.145711 0.154859 0.254523 0.255295 0.335323 0.131261 0.300255 0.356247 0.212237 0.349545 0.222549 0.254062 0.173844 0.736280 0.006475 0.242691 0.014555 0.001696 0.522360 0.010544 0.465399 0.082657 0.000819 0.004666 0.911858 0.007818 0.001869 0.001302 0.989011 0.002303 0.992768 0.002361 0.002568 0.002417 0.992259 0.003375 0.001949 0.000360 0.004820 0.907484 0.087336 0.004749 0.022225 0.959164 0.013862 0.197948 0.147167 0.034749 0.620136 0.340568 0.182434 0.187068 0.289930 0.240105 0.146975 0.344334 0.268587 0.189372 0.384338 0.143385 0.282906 Consensus sequence: VBBVAYTTCCGGTDDH Reverse complement motif 0.189372 0.143385 0.384338 0.282906 0.240105 0.344334 0.146975 0.268587 0.289930 0.182434 0.187068 0.340568 0.620136 0.147167 0.034749 0.197948 0.004749 0.959164 0.022225 0.013862 0.000360 0.907484 0.004820 0.087336 0.002417 0.003375 0.992259 0.001949 0.002303 0.002361 0.992768 0.002568 0.989011 0.001869 0.001302 0.007818 0.911858 0.000819 0.004666 0.082657 0.001696 0.010544 0.522360 0.465399 0.014555 0.006475 0.242691 0.736280 0.173844 0.222549 0.254062 0.349545 0.131261 0.356247 0.300255 0.212237 0.335323 0.254523 0.255295 0.154859 0.306248 0.227284 0.320757 0.145711 Consensus sequence: DHDACCGGAAKTBBVV Alignment: DHDACCGGAAKTBBVV ----CTGGGA------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00411 Erg Original Motif Reverse Complement Forward 5 6 0.019643 Species: Mus musculus Original motif 0.301267 0.284764 0.255705 0.158264 0.122975 0.233756 0.238767 0.404502 0.154943 0.290275 0.345790 0.208992 0.321204 0.330726 0.177808 0.170262 0.780210 0.006861 0.200535 0.012393 0.001550 0.582732 0.011633 0.404085 0.105245 0.000870 0.004910 0.888976 0.009093 0.001705 0.001205 0.987996 0.002195 0.992811 0.002476 0.002518 0.003021 0.992233 0.002469 0.002278 0.000332 0.004293 0.893671 0.101704 0.005607 0.034448 0.942814 0.017131 0.185818 0.115556 0.035998 0.662628 0.300053 0.198903 0.221728 0.279316 0.186224 0.170560 0.307002 0.336213 0.157640 0.407799 0.198527 0.236034 Consensus sequence: VBBVAYTTCCGGTDDB Reverse complement motif 0.157640 0.198527 0.407799 0.236034 0.336213 0.170560 0.307002 0.186224 0.279316 0.198903 0.221728 0.300053 0.662628 0.115556 0.035998 0.185818 0.005607 0.942814 0.034448 0.017131 0.000332 0.893671 0.004293 0.101704 0.003021 0.002469 0.992233 0.002278 0.002195 0.002476 0.992811 0.002518 0.987996 0.001705 0.001205 0.009093 0.888976 0.000870 0.004910 0.105245 0.001550 0.011633 0.582732 0.404085 0.012393 0.006861 0.200535 0.780210 0.321204 0.177808 0.330726 0.170262 0.154943 0.345790 0.290275 0.208992 0.404502 0.233756 0.238767 0.122975 0.158264 0.284764 0.255705 0.301267 Consensus sequence: BDDACCGGAAKTVBVB Alignment: BDDACCGGAAKTVBVB ----CTGGGA------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00413 Elf4 Original Motif Reverse Complement Forward 5 6 0.019681 Species: Mus musculus Original motif 0.349744 0.139466 0.209326 0.301464 0.080478 0.359482 0.307083 0.252956 0.145756 0.213763 0.350557 0.289924 0.317307 0.199359 0.096089 0.387245 0.868576 0.009724 0.088821 0.032878 0.001975 0.827004 0.014159 0.156862 0.045494 0.000985 0.001907 0.951615 0.011012 0.001203 0.002186 0.985599 0.002743 0.992908 0.002226 0.002123 0.001498 0.990840 0.001556 0.006106 0.000951 0.005138 0.880591 0.113319 0.003127 0.107962 0.867980 0.020930 0.156602 0.055355 0.396563 0.391480 0.421246 0.049379 0.084495 0.444880 0.223879 0.068063 0.203809 0.504249 0.144100 0.323579 0.131544 0.400777 Consensus sequence: DBBHACTTCCGGKWTH Reverse complement motif 0.400777 0.323579 0.131544 0.144100 0.504249 0.068063 0.203809 0.223879 0.444880 0.049379 0.084495 0.421246 0.156602 0.396563 0.055355 0.391480 0.003127 0.867980 0.107962 0.020930 0.000951 0.880591 0.005138 0.113319 0.001498 0.001556 0.990840 0.006106 0.002743 0.002226 0.992908 0.002123 0.985599 0.001203 0.002186 0.011012 0.951615 0.000985 0.001907 0.045494 0.001975 0.014159 0.827004 0.156862 0.032878 0.009724 0.088821 0.868576 0.387245 0.199359 0.096089 0.317307 0.145756 0.350557 0.213763 0.289924 0.080478 0.307083 0.359482 0.252956 0.301464 0.139466 0.209326 0.349744 Consensus sequence: HAWYCCGGAAGTHBBD Alignment: HAWYCCGGAAGTHBBD ----CTGGGA------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00143 Dobox5 Original Motif Original Motif Backward 10 6 0.019963 Species: Mus musculus Original motif 0.318006 0.161296 0.325541 0.195157 0.313601 0.083023 0.377870 0.225506 0.298208 0.282086 0.190012 0.229693 0.484557 0.174619 0.249175 0.091650 0.178941 0.025979 0.771418 0.023662 0.048080 0.001644 0.948807 0.001469 0.008069 0.000908 0.985703 0.005321 0.964141 0.032554 0.000312 0.002993 0.003637 0.002849 0.001283 0.992231 0.006297 0.007784 0.000276 0.985643 0.930090 0.000696 0.000899 0.068314 0.815261 0.006992 0.154272 0.023474 0.057969 0.177555 0.096246 0.668231 0.236979 0.285921 0.057746 0.419354 0.347812 0.200757 0.249827 0.201604 0.239503 0.153155 0.096118 0.511224 0.234875 0.401818 0.136916 0.226391 Consensus sequence: DDHVGGGATTAATHDTH Reverse complement motif 0.234875 0.136916 0.401818 0.226391 0.511224 0.153155 0.096118 0.239503 0.201604 0.200757 0.249827 0.347812 0.419354 0.285921 0.057746 0.236979 0.668231 0.177555 0.096246 0.057969 0.023474 0.006992 0.154272 0.815261 0.068314 0.000696 0.000899 0.930090 0.985643 0.007784 0.000276 0.006297 0.992231 0.002849 0.001283 0.003637 0.002993 0.032554 0.000312 0.964141 0.008069 0.985703 0.000908 0.005321 0.048080 0.948807 0.001644 0.001469 0.178941 0.771418 0.025979 0.023662 0.091650 0.174619 0.249175 0.484557 0.229693 0.282086 0.190012 0.298208 0.313601 0.377870 0.083023 0.225506 0.318006 0.325541 0.161296 0.195157 Consensus sequence: DADHATTAATCCCBHHH Alignment: DDHVGGGATTAATHDTH --CTGGGA--------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00265 Pitx3 Reverse Complement Reverse Complement Forward 10 6 0.021062 Species: Mus musculus Original motif 0.376317 0.228810 0.324927 0.069946 0.194464 0.131695 0.538949 0.134892 0.066391 0.226063 0.645457 0.062089 0.174103 0.030838 0.758315 0.036743 0.018838 0.001515 0.979039 0.000608 0.002099 0.002488 0.992192 0.003220 0.958051 0.040431 0.000340 0.001178 0.002126 0.007833 0.000559 0.989482 0.009085 0.005231 0.000358 0.985326 0.975248 0.000371 0.001696 0.022685 0.177679 0.041353 0.541741 0.239227 0.054770 0.772535 0.116688 0.056007 0.157041 0.155159 0.224874 0.462926 0.343501 0.137361 0.357922 0.161216 0.153495 0.344871 0.332684 0.168951 0.125949 0.548089 0.196494 0.129468 Consensus sequence: VGGGGGATTAGCDDBC Reverse complement motif 0.125949 0.196494 0.548089 0.129468 0.153495 0.332684 0.344871 0.168951 0.343501 0.357922 0.137361 0.161216 0.462926 0.155159 0.224874 0.157041 0.054770 0.116688 0.772535 0.056007 0.177679 0.541741 0.041353 0.239227 0.022685 0.000371 0.001696 0.975248 0.985326 0.005231 0.000358 0.009085 0.989482 0.007833 0.000559 0.002126 0.001178 0.040431 0.000340 0.958051 0.002099 0.992192 0.002488 0.003220 0.018838 0.979039 0.001515 0.000608 0.174103 0.758315 0.030838 0.036743 0.066391 0.645457 0.226063 0.062089 0.194464 0.538949 0.131695 0.134892 0.069946 0.228810 0.324927 0.376317 Consensus sequence: GBHDGCTAATCCCCCB Alignment: GBHDGCTAATCCCCCB ---------TCCCAG- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 9 Motif name: Motif 9 Original motif 0.034483 0.931034 0.034483 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.827586 0.172414 0.000000 0.862069 0.000000 0.000000 0.137931 0.103448 0.862069 0.000000 0.034483 0.793103 0.034483 0.103448 0.068966 0.241379 0.413793 0.275862 0.068966 0.655172 0.000000 0.344828 0.000000 0.000000 0.827586 0.172414 0.000000 0.965517 0.000000 0.034483 0.000000 0.000000 0.965517 0.034483 0.000000 0.931034 0.000000 0.000000 0.068966 0.068966 0.931034 0.000000 0.000000 0.965517 0.034483 0.000000 0.000000 Consensus sequence: CACACAVRCACACA Reserve complement motif 0.000000 0.034483 0.000000 0.965517 0.068966 0.000000 0.931034 0.000000 0.068966 0.000000 0.000000 0.931034 0.000000 0.034483 0.965517 0.000000 0.000000 0.000000 0.034483 0.965517 0.000000 0.172414 0.827586 0.000000 0.000000 0.000000 0.344828 0.655172 0.241379 0.275862 0.413793 0.068966 0.068966 0.034483 0.103448 0.793103 0.103448 0.000000 0.862069 0.034483 0.137931 0.000000 0.000000 0.862069 0.000000 0.172414 0.827586 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.034483 0.034483 0.931034 0.000000 Consensus sequence: TGTGTGKVTGTGTG ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 9 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 2 14 0.048759 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH -CACACAVRCACACA-------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00042 Gm397_second Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 14 0.049697 Species: Mus musculus Original motif 0.360404 0.193218 0.248888 0.197490 0.286498 0.224597 0.426555 0.062349 0.347032 0.440548 0.033161 0.179259 0.337062 0.193658 0.385751 0.083529 0.108793 0.005723 0.878300 0.007184 0.015151 0.973406 0.009324 0.002118 0.972117 0.003915 0.019783 0.004185 0.010144 0.980912 0.003106 0.005839 0.974864 0.007532 0.015914 0.001691 0.012441 0.939195 0.029256 0.019108 0.759620 0.106164 0.073819 0.060397 0.157234 0.818234 0.007449 0.017083 0.050076 0.063608 0.505171 0.381144 0.131903 0.538163 0.124608 0.205325 0.367623 0.286526 0.240931 0.104919 0.357798 0.317606 0.097711 0.226885 Consensus sequence: DVMVGCACACACKCVH Reverse complement motif 0.226885 0.317606 0.097711 0.357798 0.104919 0.286526 0.240931 0.367623 0.131903 0.124608 0.538163 0.205325 0.050076 0.505171 0.063608 0.381144 0.157234 0.007449 0.818234 0.017083 0.060397 0.106164 0.073819 0.759620 0.012441 0.029256 0.939195 0.019108 0.001691 0.007532 0.015914 0.974864 0.010144 0.003106 0.980912 0.005839 0.004185 0.003915 0.019783 0.972117 0.015151 0.009324 0.973406 0.002118 0.108793 0.878300 0.005723 0.007184 0.337062 0.385751 0.193658 0.083529 0.347032 0.033161 0.440548 0.179259 0.286498 0.426555 0.224597 0.062349 0.197490 0.193218 0.248888 0.360404 Consensus sequence: HBGYGTGTGTGCVRVD Alignment: HBGYGTGTGTGCVRVD -TGTGTGKVTGTGTG- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 10 14 0.050339 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB TGTGTGKVTGTGTG--------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00025 Foxk1_secondary Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 14 0.050679 Species: Mus musculus Original motif 0.240753 0.425595 0.141281 0.192371 0.367715 0.247224 0.117353 0.267708 0.489169 0.220343 0.113844 0.176644 0.742256 0.042809 0.146704 0.068231 0.078936 0.546144 0.032328 0.342592 0.588419 0.293580 0.082117 0.035885 0.913924 0.026256 0.050778 0.009042 0.009007 0.565680 0.010683 0.414630 0.947562 0.020878 0.018821 0.012739 0.901384 0.021519 0.030204 0.046893 0.077157 0.797900 0.026432 0.098511 0.824314 0.040128 0.051910 0.083648 0.254436 0.342235 0.143789 0.259539 0.319400 0.338163 0.129746 0.212691 0.231014 0.260719 0.169042 0.339225 Consensus sequence: HHHAYAAYAACAHHH Reverse complement motif 0.339225 0.260719 0.169042 0.231014 0.319400 0.129746 0.338163 0.212691 0.254436 0.143789 0.342235 0.259539 0.083648 0.040128 0.051910 0.824314 0.077157 0.026432 0.797900 0.098511 0.046893 0.021519 0.030204 0.901384 0.012739 0.020878 0.018821 0.947562 0.009007 0.010683 0.565680 0.414630 0.009042 0.026256 0.050778 0.913924 0.035885 0.293580 0.082117 0.588419 0.078936 0.032328 0.546144 0.342592 0.068231 0.042809 0.146704 0.742256 0.176644 0.220343 0.113844 0.489169 0.267708 0.247224 0.117353 0.367715 0.240753 0.141281 0.425595 0.192371 Consensus sequence: HDDTGTTKTTKTHHD Alignment: HDDTGTTKTTKTHHD -TGTGTGKVTGTGTG ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00036 Myf6_secondary Original Motif Original Motif Forward 2 14 0.051611 Species: Mus musculus Original motif 0.345146 0.261059 0.273931 0.119863 0.222137 0.272923 0.332024 0.172916 0.269602 0.278951 0.245221 0.206225 0.485406 0.144018 0.294421 0.076155 0.577731 0.270563 0.078955 0.072752 0.070027 0.750816 0.062819 0.116339 0.685018 0.105175 0.137110 0.072697 0.162574 0.071041 0.638464 0.127921 0.343240 0.389633 0.206226 0.060900 0.080169 0.790323 0.114211 0.015297 0.167035 0.201642 0.462780 0.168543 0.114383 0.664317 0.166143 0.055157 0.392143 0.114475 0.340085 0.153298 0.208147 0.577473 0.142694 0.071686 0.168632 0.563135 0.066181 0.202052 Consensus sequence: VVVRACAGVCBCDCC Reverse complement motif 0.168632 0.066181 0.563135 0.202052 0.208147 0.142694 0.577473 0.071686 0.153298 0.114475 0.340085 0.392143 0.114383 0.166143 0.664317 0.055157 0.167035 0.462780 0.201642 0.168543 0.080169 0.114211 0.790323 0.015297 0.343240 0.206226 0.389633 0.060900 0.162574 0.638464 0.071041 0.127921 0.072697 0.105175 0.137110 0.685018 0.070027 0.062819 0.750816 0.116339 0.072752 0.270563 0.078955 0.577731 0.076155 0.144018 0.294421 0.485406 0.269602 0.245221 0.278951 0.206225 0.222137 0.332024 0.272923 0.172916 0.119863 0.261059 0.273931 0.345146 Consensus sequence: GGDGBGVCTGTKVVB Alignment: VVVRACAGVCBCDCC -CACACAVRCACACA ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_secondary Original Motif Reverse Complement Forward 1 14 0.052370 Species: Mus musculus Original motif 0.067627 0.131333 0.654425 0.146615 0.156488 0.114442 0.145630 0.583441 0.206450 0.265630 0.358017 0.169903 0.090729 0.460713 0.274712 0.173847 0.285994 0.099998 0.154485 0.459523 0.635908 0.184787 0.072982 0.106323 0.748421 0.039204 0.092605 0.119769 0.081342 0.061327 0.044532 0.812799 0.143120 0.043879 0.024216 0.788785 0.247544 0.092102 0.621453 0.038901 0.295531 0.036295 0.027594 0.640580 0.194561 0.305468 0.339916 0.160055 0.175038 0.193568 0.101212 0.530182 0.145226 0.167488 0.559871 0.127415 0.271501 0.237429 0.206701 0.284369 0.216834 0.109191 0.569605 0.104370 0.182624 0.177160 0.300475 0.339742 0.331737 0.198645 0.265137 0.204482 0.230155 0.359365 0.183450 0.227029 0.056581 0.067297 0.463052 0.413070 0.198891 0.324626 0.304424 0.172059 0.181968 0.287547 0.202419 0.328066 Consensus sequence: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB Reverse complement motif 0.328066 0.287547 0.202419 0.181968 0.198891 0.304424 0.324626 0.172059 0.056581 0.463052 0.067297 0.413070 0.230155 0.183450 0.359365 0.227029 0.204482 0.198645 0.265137 0.331737 0.339742 0.177160 0.300475 0.182624 0.216834 0.569605 0.109191 0.104370 0.284369 0.237429 0.206701 0.271501 0.145226 0.559871 0.167488 0.127415 0.530182 0.193568 0.101212 0.175038 0.194561 0.339916 0.305468 0.160055 0.640580 0.036295 0.027594 0.295531 0.247544 0.621453 0.092102 0.038901 0.788785 0.043879 0.024216 0.143120 0.812799 0.061327 0.044532 0.081342 0.119769 0.039204 0.092605 0.748421 0.106323 0.184787 0.072982 0.635908 0.459523 0.099998 0.154485 0.285994 0.090729 0.274712 0.460713 0.173847 0.206450 0.358017 0.265630 0.169903 0.583441 0.114442 0.145630 0.156488 0.067627 0.654425 0.131333 0.146615 Consensus sequence: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC Alignment: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB CACACAVRCACACA-------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00026 Zscan4_primary Original Motif Original Motif Forward 1 14 0.055735 Species: Mus musculus Original motif 0.203927 0.157260 0.307071 0.331743 0.360341 0.265216 0.147327 0.227115 0.251195 0.298806 0.241051 0.208949 0.487186 0.122472 0.214362 0.175980 0.122838 0.051062 0.055773 0.770327 0.020467 0.009992 0.965816 0.003725 0.005887 0.026663 0.006808 0.960643 0.030656 0.002167 0.965099 0.002078 0.002078 0.965099 0.002167 0.030656 0.960643 0.006808 0.026663 0.005887 0.003725 0.965816 0.009992 0.020467 0.770327 0.055773 0.051062 0.122838 0.044808 0.382307 0.042920 0.529965 0.751320 0.047417 0.044482 0.156781 0.362742 0.228898 0.085373 0.322987 0.436635 0.111479 0.217284 0.234601 0.303930 0.285374 0.195872 0.214824 Consensus sequence: DHVDTGTGCACAYAHDH Reverse complement motif 0.214824 0.285374 0.195872 0.303930 0.234601 0.111479 0.217284 0.436635 0.322987 0.228898 0.085373 0.362742 0.156781 0.047417 0.044482 0.751320 0.529965 0.382307 0.042920 0.044808 0.122838 0.055773 0.051062 0.770327 0.003725 0.009992 0.965816 0.020467 0.005887 0.006808 0.026663 0.960643 0.002078 0.002167 0.965099 0.030656 0.030656 0.965099 0.002167 0.002078 0.960643 0.026663 0.006808 0.005887 0.020467 0.965816 0.009992 0.003725 0.770327 0.051062 0.055773 0.122838 0.175980 0.122472 0.214362 0.487186 0.251195 0.241051 0.298806 0.208949 0.227115 0.265216 0.147327 0.360341 0.331743 0.157260 0.307071 0.203927 Consensus sequence: HDHTMTGTGCACADVHD Alignment: DHVDTGTGCACAYAHDH CACACAVRCACACA--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00526 Foxn1_secondary Original Motif Original Motif Backward 8 14 0.057857 Species: Mus musculus Original motif 0.477863 0.106306 0.184102 0.231729 0.304951 0.149020 0.361418 0.184612 0.548996 0.056128 0.348902 0.045974 0.385727 0.477782 0.086218 0.050273 0.409556 0.232265 0.173851 0.184328 0.174550 0.312880 0.307123 0.205448 0.850398 0.047204 0.041665 0.060734 0.141234 0.548534 0.142230 0.168002 0.059462 0.026354 0.892948 0.021236 0.053714 0.870297 0.028935 0.047055 0.086273 0.069147 0.805284 0.039296 0.033781 0.573881 0.034115 0.358223 0.035191 0.079663 0.824970 0.060176 0.051830 0.862631 0.019359 0.066180 0.178685 0.015738 0.762485 0.043092 0.058988 0.042615 0.017608 0.880789 0.202382 0.173360 0.284095 0.340163 0.098493 0.234651 0.506524 0.160333 0.109087 0.336204 0.250510 0.304198 0.130945 0.250843 0.177122 0.441090 0.353830 0.138838 0.162784 0.344548 0.114290 0.417163 0.160662 0.307885 Consensus sequence: DDRMHBACGCGYGCGTDGBBDB Reverse complement motif 0.114290 0.160662 0.417163 0.307885 0.344548 0.138838 0.162784 0.353830 0.441090 0.250843 0.177122 0.130945 0.109087 0.250510 0.336204 0.304198 0.098493 0.506524 0.234651 0.160333 0.340163 0.173360 0.284095 0.202382 0.880789 0.042615 0.017608 0.058988 0.178685 0.762485 0.015738 0.043092 0.051830 0.019359 0.862631 0.066180 0.035191 0.824970 0.079663 0.060176 0.033781 0.034115 0.573881 0.358223 0.086273 0.805284 0.069147 0.039296 0.053714 0.028935 0.870297 0.047055 0.059462 0.892948 0.026354 0.021236 0.141234 0.142230 0.548534 0.168002 0.060734 0.047204 0.041665 0.850398 0.174550 0.307123 0.312880 0.205448 0.184328 0.232265 0.173851 0.409556 0.385727 0.086218 0.477782 0.050273 0.045974 0.056128 0.348902 0.548996 0.304951 0.361418 0.149020 0.184612 0.231729 0.106306 0.184102 0.477863 Consensus sequence: BDVBCDACGCKCGCGTBHRKHD Alignment: DDRMHBACGCGYGCGTDGBBDB -CACACAVRCACACA------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00400 Zif268 Reverse Complement Reverse Complement Backward 4 14 0.058005 Species: Mus musculus Original motif 0.104824 0.412716 0.254506 0.227955 0.644922 0.065476 0.140479 0.149122 0.201205 0.166164 0.347131 0.285501 0.360606 0.256316 0.150766 0.232313 0.199831 0.240681 0.279350 0.280137 0.234308 0.204076 0.321306 0.240310 0.274112 0.462435 0.111425 0.152028 0.067070 0.717501 0.073934 0.141496 0.106745 0.084442 0.658566 0.150247 0.025128 0.967053 0.003585 0.004234 0.006412 0.982989 0.003227 0.007371 0.009588 0.877620 0.002571 0.110221 0.621521 0.355443 0.015669 0.007366 0.002600 0.980275 0.004191 0.012934 0.118773 0.026658 0.783843 0.070725 0.022358 0.822101 0.024684 0.130857 0.713212 0.080912 0.128793 0.077084 0.166568 0.250955 0.107934 0.474544 0.225040 0.222494 0.163301 0.389166 0.268976 0.223206 0.265314 0.242504 0.137052 0.229058 0.148439 0.485451 0.135819 0.304550 0.141994 0.417637 0.272440 0.319501 0.230580 0.177478 Consensus sequence: BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV Reverse complement motif 0.272440 0.230580 0.319501 0.177478 0.417637 0.304550 0.141994 0.135819 0.485451 0.229058 0.148439 0.137052 0.242504 0.223206 0.265314 0.268976 0.389166 0.222494 0.163301 0.225040 0.474544 0.250955 0.107934 0.166568 0.077084 0.080912 0.128793 0.713212 0.022358 0.024684 0.822101 0.130857 0.118773 0.783843 0.026658 0.070725 0.002600 0.004191 0.980275 0.012934 0.007366 0.355443 0.015669 0.621521 0.009588 0.002571 0.877620 0.110221 0.006412 0.003227 0.982989 0.007371 0.025128 0.003585 0.967053 0.004234 0.106745 0.658566 0.084442 0.150247 0.067070 0.073934 0.717501 0.141496 0.274112 0.111425 0.462435 0.152028 0.234308 0.321306 0.204076 0.240310 0.280137 0.240681 0.279350 0.199831 0.232313 0.256316 0.150766 0.360606 0.201205 0.347131 0.166164 0.285501 0.149122 0.065476 0.140479 0.644922 0.104824 0.254506 0.412716 0.227955 Consensus sequence: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB Alignment: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB ------TGTGTGKVTGTGTG--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00014 Sox17_secondary Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 14 0.058124 Species: Mus musculus Original motif 0.216056 0.230834 0.399857 0.153253 0.321065 0.233860 0.135741 0.309334 0.166479 0.321423 0.209463 0.302635 0.185647 0.499038 0.152355 0.162961 0.416451 0.221510 0.168645 0.193395 0.070777 0.581761 0.126392 0.221070 0.764583 0.085635 0.031993 0.117789 0.035294 0.112638 0.038664 0.813404 0.153178 0.046321 0.056161 0.744340 0.076540 0.825062 0.055409 0.042989 0.764357 0.060365 0.119861 0.055417 0.130143 0.178946 0.153266 0.537644 0.402684 0.154010 0.357674 0.085632 0.189784 0.349553 0.176965 0.283698 0.475181 0.145276 0.256449 0.123094 0.472286 0.151639 0.172736 0.203339 0.215278 0.186804 0.213020 0.384898 Consensus sequence: VHBHHCATTCATRHVDD Reverse complement motif 0.384898 0.186804 0.213020 0.215278 0.203339 0.151639 0.172736 0.472286 0.123094 0.145276 0.256449 0.475181 0.189784 0.176965 0.349553 0.283698 0.085632 0.154010 0.357674 0.402684 0.537644 0.178946 0.153266 0.130143 0.055417 0.060365 0.119861 0.764357 0.076540 0.055409 0.825062 0.042989 0.744340 0.046321 0.056161 0.153178 0.813404 0.112638 0.038664 0.035294 0.117789 0.085635 0.031993 0.764583 0.070777 0.126392 0.581761 0.221070 0.193395 0.221510 0.168645 0.416451 0.185647 0.152355 0.499038 0.162961 0.166479 0.209463 0.321423 0.302635 0.309334 0.233860 0.135741 0.321065 0.216056 0.399857 0.230834 0.153253 Consensus sequence: DDBDKATGAATGHDBHV Alignment: DDBDKATGAATGHDBHV --TGTGTGKVTGTGTG- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 10 Motif name: Motif 10 Original motif 0.169492 0.000000 0.000000 0.830508 0.169492 0.033898 0.372881 0.423729 0.152542 0.000000 0.305085 0.542373 0.203390 0.000000 0.000000 0.796610 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.203390 0.576271 0.220339 0.271186 0.135593 0.050847 0.542374 0.016949 0.152542 0.033898 0.796611 0.016949 0.000000 0.101695 0.881356 0.084746 0.000000 0.135593 0.779661 0.050847 0.000000 0.067797 0.881356 0.000000 0.169492 0.152542 0.677966 0.000000 0.000000 0.169492 0.830508 Consensus sequence: TKKTTTGTTTTTTT Reserve complement motif 0.830508 0.000000 0.169492 0.000000 0.677966 0.169492 0.152542 0.000000 0.881356 0.000000 0.067797 0.050847 0.779661 0.000000 0.135593 0.084746 0.881356 0.000000 0.101695 0.016949 0.796611 0.152542 0.033898 0.016949 0.542374 0.135593 0.050847 0.271186 0.000000 0.576271 0.203390 0.220339 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.796610 0.000000 0.000000 0.203390 0.542373 0.000000 0.305085 0.152542 0.423729 0.033898 0.372881 0.169492 0.830508 0.000000 0.000000 0.169492 Consensus sequence: AAAAAAACAAARRA ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 10 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00061 Foxl1_secondary Original Motif Reverse Complement Backward 3 14 0.031934 Species: Mus musculus Original motif 0.560226 0.121586 0.083231 0.234957 0.318077 0.149137 0.179955 0.352831 0.482497 0.118420 0.173594 0.225488 0.200166 0.160901 0.191493 0.447440 0.033691 0.569719 0.018901 0.377690 0.638020 0.166545 0.021254 0.174181 0.573953 0.105729 0.009308 0.311010 0.890518 0.053364 0.013424 0.042694 0.910758 0.028166 0.032648 0.028428 0.013358 0.738707 0.023981 0.223953 0.911783 0.018754 0.031898 0.037564 0.702891 0.068940 0.076823 0.151346 0.445507 0.320769 0.057216 0.176507 0.587798 0.129586 0.140592 0.142024 0.258981 0.330939 0.167334 0.242747 0.362022 0.333796 0.145861 0.158320 Consensus sequence: ADDDYAWAACAAMAHH Reverse complement motif 0.158320 0.333796 0.145861 0.362022 0.258981 0.167334 0.330939 0.242747 0.142024 0.129586 0.140592 0.587798 0.176507 0.320769 0.057216 0.445507 0.151346 0.068940 0.076823 0.702891 0.037564 0.018754 0.031898 0.911783 0.013358 0.023981 0.738707 0.223953 0.028428 0.028166 0.032648 0.910758 0.042694 0.053364 0.013424 0.890518 0.311010 0.105729 0.009308 0.573953 0.174181 0.166545 0.021254 0.638020 0.033691 0.018901 0.569719 0.377690 0.447440 0.160901 0.191493 0.200166 0.225488 0.118420 0.173594 0.482497 0.352831 0.149137 0.179955 0.318077 0.234957 0.121586 0.083231 0.560226 Consensus sequence: HDTYTTGTTWTKDDDT Alignment: HDTYTTGTTWTKDDDT TKKTTTGTTTTTTT-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00062 Sox4_primary Reverse Complement Original Motif Backward 4 14 0.036836 Species: Mus musculus Original motif 0.427843 0.231210 0.119424 0.221523 0.196506 0.239531 0.304906 0.259057 0.302488 0.156922 0.290190 0.250401 0.433872 0.149126 0.196496 0.220506 0.258426 0.076511 0.475100 0.189963 0.841714 0.046453 0.099915 0.011918 0.983853 0.001612 0.001362 0.013174 0.003460 0.982032 0.005728 0.008780 0.989743 0.002253 0.002020 0.005984 0.990761 0.003397 0.002843 0.003000 0.770864 0.003540 0.001549 0.224048 0.235342 0.002598 0.757383 0.004677 0.371426 0.089574 0.529959 0.009040 0.480804 0.196949 0.240413 0.081833 0.187158 0.355102 0.216599 0.241142 0.248006 0.232182 0.157452 0.362360 0.403367 0.177684 0.164649 0.254300 Consensus sequence: HBDDDAACAAAGRVBHH Reverse complement motif 0.254300 0.177684 0.164649 0.403367 0.362360 0.232182 0.157452 0.248006 0.187158 0.216599 0.355102 0.241142 0.081833 0.196949 0.240413 0.480804 0.371426 0.529959 0.089574 0.009040 0.235342 0.757383 0.002598 0.004677 0.224048 0.003540 0.001549 0.770864 0.003000 0.003397 0.002843 0.990761 0.005984 0.002253 0.002020 0.989743 0.003460 0.005728 0.982032 0.008780 0.013174 0.001612 0.001362 0.983853 0.011918 0.046453 0.099915 0.841714 0.258426 0.475100 0.076511 0.189963 0.220506 0.149126 0.196496 0.433872 0.250401 0.156922 0.290190 0.302488 0.196506 0.304906 0.239531 0.259057 0.221523 0.231210 0.119424 0.427843 Consensus sequence: HHBBMCTTTGTTHDDBH Alignment: HBDDDAACAAAGRVBHH AAAAAAACAAARRA--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00030 Sox11_primary Reverse Complement Original Motif Forward 1 14 0.037030 Species: Mus musculus Original motif 0.351812 0.238467 0.143954 0.265768 0.195246 0.235838 0.281473 0.287443 0.349478 0.172616 0.210739 0.267167 0.484061 0.110438 0.173131 0.232370 0.276692 0.070713 0.479604 0.172991 0.859124 0.044167 0.083951 0.012758 0.975608 0.002029 0.002285 0.020079 0.006422 0.978485 0.007124 0.007969 0.987489 0.003025 0.002868 0.006617 0.987739 0.005463 0.002730 0.004067 0.693013 0.004067 0.002445 0.300475 0.189100 0.003677 0.801408 0.005814 0.352090 0.072517 0.567737 0.007656 0.542316 0.176545 0.192768 0.088371 0.196382 0.304176 0.205985 0.293457 0.289415 0.201358 0.182937 0.326290 0.385801 0.216362 0.152363 0.245475 Consensus sequence: HBDDRAACAAAGRABHH Reverse complement motif 0.245475 0.216362 0.152363 0.385801 0.326290 0.201358 0.182937 0.289415 0.196382 0.205985 0.304176 0.293457 0.088371 0.176545 0.192768 0.542316 0.352090 0.567737 0.072517 0.007656 0.189100 0.801408 0.003677 0.005814 0.300475 0.004067 0.002445 0.693013 0.004067 0.005463 0.002730 0.987739 0.006617 0.003025 0.002868 0.987489 0.006422 0.007124 0.978485 0.007969 0.020079 0.002029 0.002285 0.975608 0.012758 0.044167 0.083951 0.859124 0.276692 0.479604 0.070713 0.172991 0.232370 0.110438 0.173131 0.484061 0.267167 0.172616 0.210739 0.349478 0.287443 0.235838 0.281473 0.195246 0.265768 0.238467 0.143954 0.351812 Consensus sequence: HHBTMCTTTGTTMDDVH Alignment: HBDDRAACAAAGRABHH AAAAAAACAAARRA--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00077 Srf_secondary Original Motif Reverse Complement Backward 3 14 0.038882 Species: Mus musculus Original motif 0.162968 0.284828 0.440984 0.111220 0.151392 0.200635 0.205316 0.442657 0.267215 0.083669 0.192498 0.456618 0.332771 0.180711 0.200027 0.286491 0.509370 0.102954 0.242569 0.145107 0.666262 0.077309 0.154466 0.101962 0.737968 0.113335 0.100401 0.048296 0.658878 0.141580 0.134033 0.065510 0.766115 0.094051 0.069763 0.070072 0.755621 0.088491 0.044802 0.111086 0.749083 0.135917 0.047510 0.067490 0.663231 0.176795 0.028134 0.131839 0.553358 0.277659 0.038655 0.130328 0.392578 0.314083 0.209844 0.083495 0.198462 0.237132 0.239466 0.324940 0.275121 0.210087 0.194779 0.320013 0.287748 0.277395 0.142704 0.292154 Consensus sequence: VBDDAAAAAAAAMVBHH Reverse complement motif 0.292154 0.277395 0.142704 0.287748 0.320013 0.210087 0.194779 0.275121 0.324940 0.237132 0.239466 0.198462 0.083495 0.314083 0.209844 0.392578 0.130328 0.277659 0.038655 0.553358 0.131839 0.176795 0.028134 0.663231 0.067490 0.135917 0.047510 0.749083 0.111086 0.088491 0.044802 0.755621 0.070072 0.094051 0.069763 0.766115 0.065510 0.141580 0.134033 0.658878 0.048296 0.113335 0.100401 0.737968 0.101962 0.077309 0.154466 0.666262 0.145107 0.102954 0.242569 0.509370 0.286491 0.180711 0.200027 0.332771 0.456618 0.083669 0.192498 0.267215 0.442657 0.200635 0.205316 0.151392 0.162968 0.440984 0.284828 0.111220 Consensus sequence: HHVBYTTTTTTTTDDVV Alignment: HHVBYTTTTTTTTDDVV -TKKTTTGTTTTTTT-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00101 Sox12_secondary Reverse Complement Original Motif Forward 1 14 0.040260 Species: Mus musculus Original motif 0.378898 0.318901 0.205859 0.096341 0.352524 0.321236 0.224504 0.101736 0.323551 0.182056 0.210897 0.283496 0.135539 0.325230 0.208031 0.331200 0.663106 0.055471 0.154459 0.126963 0.051748 0.292567 0.537307 0.118378 0.886489 0.042361 0.035742 0.035408 0.043647 0.688744 0.094358 0.173252 0.882052 0.039818 0.018899 0.059231 0.864171 0.036011 0.068363 0.031455 0.790158 0.046868 0.041594 0.121379 0.087447 0.143905 0.707798 0.060849 0.295919 0.132479 0.485703 0.085899 0.653156 0.133004 0.110012 0.103828 0.351764 0.131771 0.217730 0.298736 0.203977 0.196773 0.099958 0.499292 Consensus sequence: VVDBASACAAAGRADH Reverse complement motif 0.499292 0.196773 0.099958 0.203977 0.298736 0.131771 0.217730 0.351764 0.103828 0.133004 0.110012 0.653156 0.295919 0.485703 0.132479 0.085899 0.087447 0.707798 0.143905 0.060849 0.121379 0.046868 0.041594 0.790158 0.031455 0.036011 0.068363 0.864171 0.059231 0.039818 0.018899 0.882052 0.043647 0.094358 0.688744 0.173252 0.035408 0.042361 0.035742 0.886489 0.051748 0.537307 0.292567 0.118378 0.126963 0.055471 0.154459 0.663106 0.331200 0.325230 0.208031 0.135539 0.283496 0.182056 0.210897 0.323551 0.101736 0.321236 0.224504 0.352524 0.096341 0.318901 0.205859 0.378898 Consensus sequence: HDTMCTTTGTSTVDBB Alignment: HDTMCTTTGTSTVDBB AAAAAAACAAARRA-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00073 Foxa2_secondary Reverse Complement Original Motif Forward 2 14 0.040284 Species: Mus musculus Original motif 0.337264 0.231140 0.283651 0.147945 0.347118 0.236817 0.257338 0.158726 0.431380 0.126811 0.187071 0.254738 0.585753 0.089587 0.164350 0.160310 0.590169 0.225841 0.088487 0.095503 0.091374 0.098551 0.099596 0.710479 0.790999 0.060485 0.081771 0.066745 0.738945 0.032660 0.093144 0.135251 0.071350 0.719067 0.064337 0.145246 0.820757 0.079130 0.029431 0.070682 0.603611 0.145951 0.097449 0.152989 0.530021 0.143634 0.190469 0.135877 0.231297 0.288099 0.276056 0.204548 0.202920 0.232513 0.431635 0.132933 0.198379 0.292889 0.308599 0.200133 Consensus sequence: VVDAATAACAAAVVB Reverse complement motif 0.198379 0.308599 0.292889 0.200133 0.202920 0.431635 0.232513 0.132933 0.231297 0.276056 0.288099 0.204548 0.135877 0.143634 0.190469 0.530021 0.152989 0.145951 0.097449 0.603611 0.070682 0.079130 0.029431 0.820757 0.071350 0.064337 0.719067 0.145246 0.135251 0.032660 0.093144 0.738945 0.066745 0.060485 0.081771 0.790999 0.710479 0.098551 0.099596 0.091374 0.095503 0.225841 0.088487 0.590169 0.160310 0.089587 0.164350 0.585753 0.254738 0.126811 0.187071 0.431380 0.158726 0.236817 0.257338 0.347118 0.147945 0.231140 0.283651 0.337264 Consensus sequence: BVVTTTGTTATTDBB Alignment: VVDAATAACAAAVVB -AAAAAAACAAARRA ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_primary Reverse Complement Original Motif Backward 7 14 0.040935 Species: Mus musculus Original motif 0.360997 0.300272 0.115555 0.223177 0.309749 0.228429 0.166233 0.295589 0.149419 0.176868 0.240155 0.433558 0.379704 0.095791 0.276373 0.248133 0.394549 0.174184 0.130641 0.300626 0.443749 0.070776 0.211081 0.274393 0.364301 0.074356 0.370406 0.190936 0.791976 0.038475 0.093390 0.076159 0.963721 0.001826 0.002456 0.031997 0.004516 0.954596 0.008092 0.032796 0.981080 0.002062 0.002161 0.014697 0.986185 0.001846 0.006976 0.004992 0.059567 0.003649 0.002189 0.934595 0.495328 0.024257 0.240450 0.239965 0.305027 0.094878 0.526069 0.074025 0.418442 0.196237 0.158323 0.226998 0.336713 0.220452 0.191155 0.251680 0.192296 0.300342 0.169047 0.338315 0.240387 0.144634 0.128513 0.486465 0.290763 0.271259 0.116600 0.321377 0.224825 0.296233 0.229255 0.249687 0.493240 0.171285 0.075148 0.260326 Consensus sequence: HHBDHDDAACAATDRHHHHHBW Reverse complement motif 0.260326 0.171285 0.075148 0.493240 0.224825 0.229255 0.296233 0.249687 0.321377 0.271259 0.116600 0.290763 0.486465 0.144634 0.128513 0.240387 0.338315 0.300342 0.169047 0.192296 0.251680 0.220452 0.191155 0.336713 0.226998 0.196237 0.158323 0.418442 0.305027 0.526069 0.094878 0.074025 0.239965 0.024257 0.240450 0.495328 0.934595 0.003649 0.002189 0.059567 0.004992 0.001846 0.006976 0.986185 0.014697 0.002062 0.002161 0.981080 0.004516 0.008092 0.954596 0.032796 0.031997 0.001826 0.002456 0.963721 0.076159 0.038475 0.093390 0.791976 0.364301 0.370406 0.074356 0.190936 0.274393 0.070776 0.211081 0.443749 0.300626 0.174184 0.130641 0.394549 0.248133 0.095791 0.276373 0.379704 0.433558 0.176868 0.240155 0.149419 0.295589 0.228429 0.166233 0.309749 0.223177 0.300272 0.115555 0.360997 Consensus sequence: WBHHHHHMDATTGTTHDHDVHH Alignment: HHBDHDDAACAATDRHHHHHBW --AAAAAAACAAARRA------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00025 Foxk1_secondary Original Motif Reverse Complement Backward 1 14 0.041617 Species: Mus musculus Original motif 0.240753 0.425595 0.141281 0.192371 0.367715 0.247224 0.117353 0.267708 0.489169 0.220343 0.113844 0.176644 0.742256 0.042809 0.146704 0.068231 0.078936 0.546144 0.032328 0.342592 0.588419 0.293580 0.082117 0.035885 0.913924 0.026256 0.050778 0.009042 0.009007 0.565680 0.010683 0.414630 0.947562 0.020878 0.018821 0.012739 0.901384 0.021519 0.030204 0.046893 0.077157 0.797900 0.026432 0.098511 0.824314 0.040128 0.051910 0.083648 0.254436 0.342235 0.143789 0.259539 0.319400 0.338163 0.129746 0.212691 0.231014 0.260719 0.169042 0.339225 Consensus sequence: HHHAYAAYAACAHHH Reverse complement motif 0.339225 0.260719 0.169042 0.231014 0.319400 0.129746 0.338163 0.212691 0.254436 0.143789 0.342235 0.259539 0.083648 0.040128 0.051910 0.824314 0.077157 0.026432 0.797900 0.098511 0.046893 0.021519 0.030204 0.901384 0.012739 0.020878 0.018821 0.947562 0.009007 0.010683 0.565680 0.414630 0.009042 0.026256 0.050778 0.913924 0.035885 0.293580 0.082117 0.588419 0.078936 0.032328 0.546144 0.342592 0.068231 0.042809 0.146704 0.742256 0.176644 0.220343 0.113844 0.489169 0.267708 0.247224 0.117353 0.367715 0.240753 0.141281 0.425595 0.192371 Consensus sequence: HDDTGTTKTTKTHHD Alignment: HHHAYAAYAACAHHH -TKKTTTGTTTTTTT ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00039 Foxj3_primary Reverse Complement Original Motif Backward 1 14 0.041902 Species: Mus musculus Original motif 0.273456 0.257473 0.208488 0.260583 0.338566 0.133379 0.306363 0.221693 0.475488 0.192852 0.156858 0.174803 0.506619 0.132646 0.170373 0.190362 0.349042 0.127275 0.325924 0.197759 0.303850 0.013619 0.678034 0.004497 0.014136 0.015691 0.003073 0.967100 0.913373 0.082928 0.001910 0.001789 0.956294 0.017745 0.000584 0.025378 0.987796 0.001685 0.004159 0.006360 0.002288 0.814764 0.001427 0.181521 0.986707 0.002688 0.003346 0.007259 0.787378 0.065481 0.057961 0.089180 0.572982 0.089910 0.066184 0.270924 0.224167 0.339979 0.258886 0.176968 0.268414 0.272007 0.239541 0.220038 0.241771 0.394748 0.174273 0.189208 Consensus sequence: HDHADGTAAACAAAVVH Reverse complement motif 0.241771 0.174273 0.394748 0.189208 0.268414 0.239541 0.272007 0.220038 0.224167 0.258886 0.339979 0.176968 0.270924 0.089910 0.066184 0.572982 0.089180 0.065481 0.057961 0.787378 0.007259 0.002688 0.003346 0.986707 0.002288 0.001427 0.814764 0.181521 0.006360 0.001685 0.004159 0.987796 0.025378 0.017745 0.000584 0.956294 0.001789 0.082928 0.001910 0.913373 0.967100 0.015691 0.003073 0.014136 0.303850 0.678034 0.013619 0.004497 0.197759 0.127275 0.325924 0.349042 0.190362 0.132646 0.170373 0.506619 0.174803 0.192852 0.156858 0.475488 0.221693 0.133379 0.306363 0.338566 0.260583 0.257473 0.208488 0.273456 Consensus sequence: DVVTTTGTTTACDTHDH Alignment: HDHADGTAAACAAAVVH ---AAAAAAACAAARRA ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00073 Foxa2_primary Reverse Complement Original Motif Backward 1 14 0.043917 Species: Mus musculus Original motif 0.335487 0.205062 0.128957 0.330494 0.411635 0.179625 0.175701 0.233038 0.412976 0.128602 0.091890 0.366532 0.608396 0.079002 0.107142 0.205460 0.433474 0.035203 0.153143 0.378180 0.087552 0.005003 0.894586 0.012858 0.004459 0.038951 0.001109 0.955481 0.924470 0.068560 0.001165 0.005805 0.920483 0.070039 0.001674 0.007805 0.988335 0.001902 0.003155 0.006608 0.001527 0.656726 0.002699 0.339047 0.987505 0.001810 0.004336 0.006349 0.719584 0.065184 0.050384 0.164848 0.535389 0.099997 0.102849 0.261764 0.245215 0.272017 0.301499 0.181269 0.306107 0.209040 0.248687 0.236166 0.223744 0.278668 0.251931 0.245657 Consensus sequence: HHWAWGTAAAYAAAVDB Reverse complement motif 0.223744 0.251931 0.278668 0.245657 0.236166 0.209040 0.248687 0.306107 0.245215 0.301499 0.272017 0.181269 0.261764 0.099997 0.102849 0.535389 0.164848 0.065184 0.050384 0.719584 0.006349 0.001810 0.004336 0.987505 0.001527 0.002699 0.656726 0.339047 0.006608 0.001902 0.003155 0.988335 0.007805 0.070039 0.001674 0.920483 0.005805 0.068560 0.001165 0.924470 0.955481 0.038951 0.001109 0.004459 0.087552 0.894586 0.005003 0.012858 0.378180 0.035203 0.153143 0.433474 0.205460 0.079002 0.107142 0.608396 0.366532 0.128602 0.091890 0.412976 0.233038 0.179625 0.175701 0.411635 0.330494 0.205062 0.128957 0.335487 Consensus sequence: BDVTTTKTTTACWTWHH Alignment: HHWAWGTAAAYAAAVDB ---AAAAAAACAAARRA ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 1 Motif ID: 11 Motif name: Motif 11 Original motif 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.636364 0.000000 0.363636 0.727273 0.000000 0.272727 0.000000 0.181818 0.818182 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.909091 0.000000 0.090909 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.909091 0.000000 0.090909 0.909091 0.000000 0.000000 0.090909 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.818182 0.000000 0.000000 0.181818 0.000000 0.909091 0.000000 0.090909 0.909091 0.000000 0.000000 0.090909 Consensus sequence: CAYACACACACACA Reserve complement motif 0.090909 0.000000 0.000000 0.909091 0.000000 0.000000 0.909091 0.090909 0.181818 0.000000 0.000000 0.818182 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.090909 0.000000 0.000000 0.909091 0.000000 0.000000 0.909091 0.090909 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.909091 0.090909 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.181818 0.000000 0.818182 0.000000 0.000000 0.000000 0.272727 0.727273 0.000000 0.000000 0.636364 0.363636 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 Consensus sequence: TGTGTGTGTGTKTG ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 11 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00042 Gm397_second Original Motif Original Motif Backward 2 14 0.023504 Species: Mus musculus Original motif 0.360404 0.193218 0.248888 0.197490 0.286498 0.224597 0.426555 0.062349 0.347032 0.440548 0.033161 0.179259 0.337062 0.193658 0.385751 0.083529 0.108793 0.005723 0.878300 0.007184 0.015151 0.973406 0.009324 0.002118 0.972117 0.003915 0.019783 0.004185 0.010144 0.980912 0.003106 0.005839 0.974864 0.007532 0.015914 0.001691 0.012441 0.939195 0.029256 0.019108 0.759620 0.106164 0.073819 0.060397 0.157234 0.818234 0.007449 0.017083 0.050076 0.063608 0.505171 0.381144 0.131903 0.538163 0.124608 0.205325 0.367623 0.286526 0.240931 0.104919 0.357798 0.317606 0.097711 0.226885 Consensus sequence: DVMVGCACACACKCVH Reverse complement motif 0.226885 0.317606 0.097711 0.357798 0.104919 0.286526 0.240931 0.367623 0.131903 0.124608 0.538163 0.205325 0.050076 0.505171 0.063608 0.381144 0.157234 0.007449 0.818234 0.017083 0.060397 0.106164 0.073819 0.759620 0.012441 0.029256 0.939195 0.019108 0.001691 0.007532 0.015914 0.974864 0.010144 0.003106 0.980912 0.005839 0.004185 0.003915 0.019783 0.972117 0.015151 0.009324 0.973406 0.002118 0.108793 0.878300 0.005723 0.007184 0.337062 0.385751 0.193658 0.083529 0.347032 0.033161 0.440548 0.179259 0.286498 0.426555 0.224597 0.062349 0.197490 0.193218 0.248888 0.360404 Consensus sequence: HBGYGTGTGTGCVRVD Alignment: DVMVGCACACACKCVH -CAYACACACACACA- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00026 Zscan4_secondary Reverse Complement Reverse Complement Forward 2 14 0.037261 Species: Mus musculus Original motif 0.275231 0.387763 0.112851 0.224155 0.269193 0.327669 0.360934 0.042204 0.439403 0.233641 0.022359 0.304596 0.409796 0.139856 0.390450 0.059899 0.038409 0.011231 0.936209 0.014150 0.067382 0.909014 0.021244 0.002359 0.962897 0.009563 0.009687 0.017854 0.043757 0.937596 0.007648 0.010999 0.970698 0.005379 0.016825 0.007098 0.066033 0.636556 0.043955 0.253456 0.797406 0.066726 0.011988 0.123879 0.774632 0.121694 0.017773 0.085901 0.324017 0.235408 0.213365 0.227210 0.365796 0.192247 0.134547 0.307410 0.299601 0.246867 0.098395 0.355137 0.328229 0.242048 0.251143 0.178579 Consensus sequence: HVHRGCACACAAHHHV Reverse complement motif 0.178579 0.242048 0.251143 0.328229 0.355137 0.246867 0.098395 0.299601 0.307410 0.192247 0.134547 0.365796 0.227210 0.235408 0.213365 0.324017 0.085901 0.121694 0.017773 0.774632 0.123879 0.066726 0.011988 0.797406 0.066033 0.043955 0.636556 0.253456 0.007098 0.005379 0.016825 0.970698 0.043757 0.007648 0.937596 0.010999 0.017854 0.009563 0.009687 0.962897 0.067382 0.021244 0.909014 0.002359 0.038409 0.936209 0.011231 0.014150 0.059899 0.139856 0.390450 0.409796 0.304596 0.233641 0.022359 0.439403 0.269193 0.360934 0.327669 0.042204 0.275231 0.112851 0.387763 0.224155 Consensus sequence: BHHHTTGTGTGCKHVD Alignment: BHHHTTGTGTGCKHVD -TGTGTGTGTGTKTG- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00000 Smad3_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 4 14 0.044637 Species: Mus musculus Original motif 0.282316 0.413385 0.114930 0.189369 0.341654 0.135011 0.267943 0.255392 0.399523 0.173081 0.168845 0.258551 0.365086 0.196360 0.211856 0.226699 0.243321 0.177839 0.224206 0.354635 0.029873 0.808479 0.036309 0.125339 0.004945 0.815465 0.040635 0.138955 0.934557 0.058944 0.005027 0.001471 0.005099 0.003998 0.986148 0.004755 0.969304 0.020594 0.001929 0.008173 0.008189 0.984816 0.004199 0.002795 0.669579 0.012182 0.282153 0.036085 0.130511 0.171241 0.334041 0.364207 0.198982 0.289660 0.252392 0.258966 0.423172 0.190978 0.164411 0.221440 0.213519 0.287388 0.294414 0.204679 0.371956 0.285061 0.150191 0.192792 Consensus sequence: HDHDDCCAGACABBHVH Reverse complement motif 0.192792 0.285061 0.150191 0.371956 0.213519 0.294414 0.287388 0.204679 0.221440 0.190978 0.164411 0.423172 0.198982 0.252392 0.289660 0.258966 0.364207 0.171241 0.334041 0.130511 0.036085 0.012182 0.282153 0.669579 0.008189 0.004199 0.984816 0.002795 0.008173 0.020594 0.001929 0.969304 0.005099 0.986148 0.003998 0.004755 0.001471 0.058944 0.005027 0.934557 0.004945 0.040635 0.815465 0.138955 0.029873 0.036309 0.808479 0.125339 0.354635 0.177839 0.224206 0.243321 0.226699 0.196360 0.211856 0.365086 0.258551 0.173081 0.168845 0.399523 0.255392 0.135011 0.267943 0.341654 0.282316 0.114930 0.413385 0.189369 Consensus sequence: HVHBVTGTCTGGDDHDD Alignment: HVHBVTGTCTGGDDHDD ---TGTGTGTGTGTKTG ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00400 Zif268 Original Motif Original Motif Forward 4 14 0.045717 Species: Mus musculus Original motif 0.104824 0.412716 0.254506 0.227955 0.644922 0.065476 0.140479 0.149122 0.201205 0.166164 0.347131 0.285501 0.360606 0.256316 0.150766 0.232313 0.199831 0.240681 0.279350 0.280137 0.234308 0.204076 0.321306 0.240310 0.274112 0.462435 0.111425 0.152028 0.067070 0.717501 0.073934 0.141496 0.106745 0.084442 0.658566 0.150247 0.025128 0.967053 0.003585 0.004234 0.006412 0.982989 0.003227 0.007371 0.009588 0.877620 0.002571 0.110221 0.621521 0.355443 0.015669 0.007366 0.002600 0.980275 0.004191 0.012934 0.118773 0.026658 0.783843 0.070725 0.022358 0.822101 0.024684 0.130857 0.713212 0.080912 0.128793 0.077084 0.166568 0.250955 0.107934 0.474544 0.225040 0.222494 0.163301 0.389166 0.268976 0.223206 0.265314 0.242504 0.137052 0.229058 0.148439 0.485451 0.135819 0.304550 0.141994 0.417637 0.272440 0.319501 0.230580 0.177478 Consensus sequence: BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV Reverse complement motif 0.272440 0.230580 0.319501 0.177478 0.417637 0.304550 0.141994 0.135819 0.485451 0.229058 0.148439 0.137052 0.242504 0.223206 0.265314 0.268976 0.389166 0.222494 0.163301 0.225040 0.474544 0.250955 0.107934 0.166568 0.077084 0.080912 0.128793 0.713212 0.022358 0.024684 0.822101 0.130857 0.118773 0.783843 0.026658 0.070725 0.002600 0.004191 0.980275 0.012934 0.007366 0.355443 0.015669 0.621521 0.009588 0.002571 0.877620 0.110221 0.006412 0.003227 0.982989 0.007371 0.025128 0.003585 0.967053 0.004234 0.106745 0.658566 0.084442 0.150247 0.067070 0.073934 0.717501 0.141496 0.274112 0.111425 0.462435 0.152028 0.234308 0.321306 0.204076 0.240310 0.280137 0.240681 0.279350 0.199831 0.232313 0.256316 0.150766 0.360606 0.201205 0.347131 0.166164 0.285501 0.149122 0.065476 0.140479 0.644922 0.104824 0.254506 0.412716 0.227955 Consensus sequence: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB Alignment: BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV ---CAYACACACACACA------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_secondary Original Motif Reverse Complement Forward 1 14 0.047722 Species: Mus musculus Original motif 0.067627 0.131333 0.654425 0.146615 0.156488 0.114442 0.145630 0.583441 0.206450 0.265630 0.358017 0.169903 0.090729 0.460713 0.274712 0.173847 0.285994 0.099998 0.154485 0.459523 0.635908 0.184787 0.072982 0.106323 0.748421 0.039204 0.092605 0.119769 0.081342 0.061327 0.044532 0.812799 0.143120 0.043879 0.024216 0.788785 0.247544 0.092102 0.621453 0.038901 0.295531 0.036295 0.027594 0.640580 0.194561 0.305468 0.339916 0.160055 0.175038 0.193568 0.101212 0.530182 0.145226 0.167488 0.559871 0.127415 0.271501 0.237429 0.206701 0.284369 0.216834 0.109191 0.569605 0.104370 0.182624 0.177160 0.300475 0.339742 0.331737 0.198645 0.265137 0.204482 0.230155 0.359365 0.183450 0.227029 0.056581 0.067297 0.463052 0.413070 0.198891 0.324626 0.304424 0.172059 0.181968 0.287547 0.202419 0.328066 Consensus sequence: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB Reverse complement motif 0.328066 0.287547 0.202419 0.181968 0.198891 0.304424 0.324626 0.172059 0.056581 0.463052 0.067297 0.413070 0.230155 0.183450 0.359365 0.227029 0.204482 0.198645 0.265137 0.331737 0.339742 0.177160 0.300475 0.182624 0.216834 0.569605 0.109191 0.104370 0.284369 0.237429 0.206701 0.271501 0.145226 0.559871 0.167488 0.127415 0.530182 0.193568 0.101212 0.175038 0.194561 0.339916 0.305468 0.160055 0.640580 0.036295 0.027594 0.295531 0.247544 0.621453 0.092102 0.038901 0.788785 0.043879 0.024216 0.143120 0.812799 0.061327 0.044532 0.081342 0.119769 0.039204 0.092605 0.748421 0.106323 0.184787 0.072982 0.635908 0.459523 0.099998 0.154485 0.285994 0.090729 0.274712 0.460713 0.173847 0.206450 0.358017 0.265630 0.169903 0.583441 0.114442 0.145630 0.156488 0.067627 0.654425 0.131333 0.146615 Consensus sequence: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC Alignment: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB CAYACACACACACA-------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00025 Foxk1_secondary Reverse Complement Reverse Complement Forward 2 14 0.048548 Species: Mus musculus Original motif 0.240753 0.425595 0.141281 0.192371 0.367715 0.247224 0.117353 0.267708 0.489169 0.220343 0.113844 0.176644 0.742256 0.042809 0.146704 0.068231 0.078936 0.546144 0.032328 0.342592 0.588419 0.293580 0.082117 0.035885 0.913924 0.026256 0.050778 0.009042 0.009007 0.565680 0.010683 0.414630 0.947562 0.020878 0.018821 0.012739 0.901384 0.021519 0.030204 0.046893 0.077157 0.797900 0.026432 0.098511 0.824314 0.040128 0.051910 0.083648 0.254436 0.342235 0.143789 0.259539 0.319400 0.338163 0.129746 0.212691 0.231014 0.260719 0.169042 0.339225 Consensus sequence: HHHAYAAYAACAHHH Reverse complement motif 0.339225 0.260719 0.169042 0.231014 0.319400 0.129746 0.338163 0.212691 0.254436 0.143789 0.342235 0.259539 0.083648 0.040128 0.051910 0.824314 0.077157 0.026432 0.797900 0.098511 0.046893 0.021519 0.030204 0.901384 0.012739 0.020878 0.018821 0.947562 0.009007 0.010683 0.565680 0.414630 0.009042 0.026256 0.050778 0.913924 0.035885 0.293580 0.082117 0.588419 0.078936 0.032328 0.546144 0.342592 0.068231 0.042809 0.146704 0.742256 0.176644 0.220343 0.113844 0.489169 0.267708 0.247224 0.117353 0.367715 0.240753 0.141281 0.425595 0.192371 Consensus sequence: HDDTGTTKTTKTHHD Alignment: HDDTGTTKTTKTHHD -TGTGTGTGTGTKTG ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00041 Foxj1_primary Original Motif Original Motif Backward 3 14 0.048863 Species: Mus musculus Original motif 0.446042 0.209997 0.124191 0.219770 0.271534 0.218131 0.245258 0.265077 0.368646 0.184693 0.168482 0.278180 0.348384 0.034204 0.583335 0.034077 0.040365 0.085618 0.013162 0.860855 0.824790 0.156631 0.004063 0.014515 0.835134 0.069381 0.003505 0.091980 0.967572 0.009280 0.006259 0.016890 0.009507 0.909577 0.004492 0.076424 0.947956 0.006994 0.008177 0.036873 0.599204 0.170666 0.065622 0.164508 0.708795 0.035865 0.070557 0.184782 0.303191 0.287145 0.184748 0.224917 0.285550 0.184167 0.248662 0.281621 0.235315 0.210836 0.254428 0.299421 0.220038 0.158539 0.286552 0.334871 Consensus sequence: HDHRTAAACAAAHDDD Reverse complement motif 0.334871 0.158539 0.286552 0.220038 0.299421 0.210836 0.254428 0.235315 0.281621 0.184167 0.248662 0.285550 0.224917 0.287145 0.184748 0.303191 0.184782 0.035865 0.070557 0.708795 0.164508 0.170666 0.065622 0.599204 0.036873 0.006994 0.008177 0.947956 0.009507 0.004492 0.909577 0.076424 0.016890 0.009280 0.006259 0.967572 0.091980 0.069381 0.003505 0.835134 0.014515 0.156631 0.004063 0.824790 0.860855 0.085618 0.013162 0.040365 0.348384 0.583335 0.034204 0.034077 0.278180 0.184693 0.168482 0.368646 0.265077 0.218131 0.245258 0.271534 0.219770 0.209997 0.124191 0.446042 Consensus sequence: DDDHTTTGTTTAMHDH Alignment: HDHRTAAACAAAHDDD CAYACACACACACA-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00026 Zscan4_primary Original Motif Original Motif Backward 2 14 0.048960 Species: Mus musculus Original motif 0.203927 0.157260 0.307071 0.331743 0.360341 0.265216 0.147327 0.227115 0.251195 0.298806 0.241051 0.208949 0.487186 0.122472 0.214362 0.175980 0.122838 0.051062 0.055773 0.770327 0.020467 0.009992 0.965816 0.003725 0.005887 0.026663 0.006808 0.960643 0.030656 0.002167 0.965099 0.002078 0.002078 0.965099 0.002167 0.030656 0.960643 0.006808 0.026663 0.005887 0.003725 0.965816 0.009992 0.020467 0.770327 0.055773 0.051062 0.122838 0.044808 0.382307 0.042920 0.529965 0.751320 0.047417 0.044482 0.156781 0.362742 0.228898 0.085373 0.322987 0.436635 0.111479 0.217284 0.234601 0.303930 0.285374 0.195872 0.214824 Consensus sequence: DHVDTGTGCACAYAHDH Reverse complement motif 0.214824 0.285374 0.195872 0.303930 0.234601 0.111479 0.217284 0.436635 0.322987 0.228898 0.085373 0.362742 0.156781 0.047417 0.044482 0.751320 0.529965 0.382307 0.042920 0.044808 0.122838 0.055773 0.051062 0.770327 0.003725 0.009992 0.965816 0.020467 0.005887 0.006808 0.026663 0.960643 0.002078 0.002167 0.965099 0.030656 0.030656 0.965099 0.002167 0.002078 0.960643 0.026663 0.006808 0.005887 0.020467 0.965816 0.009992 0.003725 0.770327 0.051062 0.055773 0.122838 0.175980 0.122472 0.214362 0.487186 0.251195 0.241051 0.298806 0.208949 0.227115 0.265216 0.147327 0.360341 0.331743 0.157260 0.307071 0.203927 Consensus sequence: HDHTMTGTGCACADVHD Alignment: DHVDTGTGCACAYAHDH --CAYACACACACACA- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 10 14 0.050113 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB TGTGTGTGTGTKTG--------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00025 Foxk1_primary Original Motif Original Motif Backward 2 14 0.051895 Species: Mus musculus Original motif 0.338172 0.192194 0.207817 0.261817 0.407924 0.117261 0.278236 0.196580 0.595570 0.070480 0.119221 0.214729 0.710845 0.038748 0.052600 0.197807 0.124647 0.116138 0.178053 0.581162 0.201602 0.005514 0.792110 0.000774 0.024590 0.004193 0.001331 0.969886 0.919465 0.077871 0.000760 0.001904 0.972342 0.010395 0.000580 0.016683 0.991045 0.001495 0.003585 0.003875 0.001358 0.885197 0.000980 0.112465 0.990318 0.001846 0.002968 0.004867 0.804563 0.063147 0.023496 0.108795 0.564824 0.087976 0.102865 0.244336 0.269947 0.300278 0.285008 0.144767 0.337905 0.220102 0.253694 0.188299 0.153781 0.274135 0.318343 0.253741 Consensus sequence: DDAATGTAAACAAAVVB Reverse complement motif 0.153781 0.318343 0.274135 0.253741 0.188299 0.220102 0.253694 0.337905 0.269947 0.285008 0.300278 0.144767 0.244336 0.087976 0.102865 0.564824 0.108795 0.063147 0.023496 0.804563 0.004867 0.001846 0.002968 0.990318 0.001358 0.000980 0.885197 0.112465 0.003875 0.001495 0.003585 0.991045 0.016683 0.010395 0.000580 0.972342 0.001904 0.077871 0.000760 0.919465 0.969886 0.004193 0.001331 0.024590 0.201602 0.792110 0.005514 0.000774 0.581162 0.116138 0.178053 0.124647 0.197807 0.038748 0.052600 0.710845 0.214729 0.070480 0.119221 0.595570 0.196580 0.117261 0.278236 0.407924 0.261817 0.192194 0.207817 0.338172 Consensus sequence: BBVTTTGTTTACATTDD Alignment: DDAATGTAAACAAAVVB --CAYACACACACACA- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 12 Motif name: Zfx Original motif 0.105042 0.371849 0.376050 0.147059 0.125786 0.356394 0.360587 0.157233 0.190377 0.315900 0.416318 0.077406 0.150313 0.102296 0.622129 0.125261 0.020790 0.617464 0.299376 0.062370 0.012474 0.752599 0.004158 0.230769 0.062370 0.259875 0.378378 0.299376 0.397089 0.320166 0.251559 0.031185 0.018711 0.004158 0.975052 0.002079 0.000000 0.006237 0.991684 0.002079 0.002079 0.997921 0.000000 0.000000 0.000000 0.997921 0.000000 0.002079 0.000000 0.004158 0.000000 0.995842 0.174636 0.253638 0.455301 0.116424 Consensus sequence: BBVGCCBVGGCCTV Reserve complement motif 0.174636 0.455301 0.253638 0.116424 0.995842 0.004158 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.997921 0.002079 0.002079 0.000000 0.997921 0.000000 0.000000 0.991684 0.006237 0.002079 0.018711 0.975052 0.004158 0.002079 0.031185 0.320166 0.251559 0.397089 0.062370 0.378378 0.259875 0.299376 0.012474 0.004158 0.752599 0.230769 0.020790 0.299376 0.617464 0.062370 0.150313 0.622129 0.102296 0.125261 0.190377 0.416318 0.315900 0.077406 0.125786 0.360587 0.356394 0.157233 0.105042 0.376050 0.371849 0.147059 Consensus sequence: VAGGCCBBGGCVBB ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 12 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00005 Tcfap2a_secondary Original Motif Original Motif Forward 1 14 0.059614 Species: Mus musculus Original motif 0.198427 0.243196 0.159241 0.399136 0.267754 0.388187 0.116811 0.227248 0.448284 0.056403 0.414623 0.080691 0.031469 0.826323 0.055436 0.086772 0.035527 0.756642 0.022985 0.184845 0.127338 0.316078 0.155806 0.400778 0.135021 0.313650 0.287760 0.263570 0.418892 0.082297 0.068352 0.430460 0.201062 0.044735 0.711358 0.042845 0.038934 0.022320 0.903763 0.034982 0.201790 0.065554 0.460526 0.272130 0.006890 0.786923 0.061853 0.144334 0.460666 0.103658 0.196452 0.239224 0.092272 0.204611 0.390375 0.312742 Consensus sequence: HHRCCBBWGGDCDB Reverse complement motif 0.092272 0.390375 0.204611 0.312742 0.239224 0.103658 0.196452 0.460666 0.006890 0.061853 0.786923 0.144334 0.201790 0.460526 0.065554 0.272130 0.038934 0.903763 0.022320 0.034982 0.201062 0.711358 0.044735 0.042845 0.430460 0.082297 0.068352 0.418892 0.135021 0.287760 0.313650 0.263570 0.400778 0.316078 0.155806 0.127338 0.035527 0.022985 0.756642 0.184845 0.031469 0.055436 0.826323 0.086772 0.080691 0.056403 0.414623 0.448284 0.267754 0.116811 0.388187 0.227248 0.399136 0.243196 0.159241 0.198427 Consensus sequence: BDGHCCWBVGGKDH Alignment: HHRCCBBWGGDCDB BBVGCCBVGGCCTV ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v015681_primaryOriginal Motif Original Motif Forward 1 14 0.060352 Species: Mus musculus Original motif 0.641428 0.180211 0.044767 0.133594 0.171696 0.262981 0.334148 0.231174 0.129726 0.322735 0.243462 0.304077 0.165713 0.175735 0.256108 0.402445 0.146090 0.171890 0.412753 0.269266 0.212837 0.439192 0.280990 0.066980 0.251088 0.275516 0.374380 0.099015 0.575438 0.079656 0.338201 0.006704 0.005634 0.003422 0.972597 0.018348 0.890447 0.077034 0.031851 0.000668 0.007128 0.986862 0.000496 0.005515 0.001445 0.991564 0.001925 0.005066 0.738761 0.190157 0.026399 0.044684 0.013384 0.983783 0.000896 0.001937 0.068077 0.929549 0.000773 0.001602 0.040830 0.933742 0.005283 0.020145 0.730274 0.029225 0.145689 0.094812 0.165032 0.572838 0.162001 0.100129 0.383584 0.129942 0.429497 0.056977 0.455959 0.071959 0.208204 0.263878 0.134271 0.262985 0.222626 0.380117 0.071193 0.346594 0.346081 0.236132 0.445661 0.405278 0.053901 0.095160 Consensus sequence: ABBBBVVRGACCACCCACRDBBM Reverse complement motif 0.095160 0.405278 0.053901 0.445661 0.071193 0.346081 0.346594 0.236132 0.380117 0.262985 0.222626 0.134271 0.263878 0.071959 0.208204 0.455959 0.383584 0.429497 0.129942 0.056977 0.165032 0.162001 0.572838 0.100129 0.094812 0.029225 0.145689 0.730274 0.040830 0.005283 0.933742 0.020145 0.068077 0.000773 0.929549 0.001602 0.013384 0.000896 0.983783 0.001937 0.044684 0.190157 0.026399 0.738761 0.001445 0.001925 0.991564 0.005066 0.007128 0.000496 0.986862 0.005515 0.000668 0.077034 0.031851 0.890447 0.005634 0.972597 0.003422 0.018348 0.006704 0.079656 0.338201 0.575438 0.251088 0.374380 0.275516 0.099015 0.212837 0.280990 0.439192 0.066980 0.146090 0.412753 0.171890 0.269266 0.402445 0.175735 0.256108 0.165713 0.129726 0.243462 0.322735 0.304077 0.171696 0.334148 0.262981 0.231174 0.133594 0.180211 0.044767 0.641428 Consensus sequence: YBVDMGTGGGTGGTCKVVBVBBT Alignment: ABBBBVVRGACCACCCACRDBBM BBVGCCBVGGCCTV--------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00002 Sp4_primary Reverse Complement Original Motif Forward 4 14 0.060469 Species: Mus musculus Original motif 0.155386 0.223380 0.374454 0.246780 0.247106 0.159582 0.345111 0.248201 0.238889 0.258354 0.165304 0.337454 0.255612 0.489586 0.051621 0.203182 0.450100 0.545383 0.001071 0.003447 0.003704 0.991007 0.002456 0.002833 0.035504 0.001814 0.928129 0.034553 0.001494 0.991406 0.003414 0.003686 0.003045 0.990628 0.005182 0.001145 0.000990 0.963237 0.001215 0.034557 0.148016 0.838396 0.000666 0.012922 0.014261 0.905847 0.007200 0.072692 0.083394 0.270068 0.058368 0.588170 0.149141 0.286783 0.142802 0.421274 0.204851 0.347195 0.253356 0.194597 0.184442 0.299908 0.194408 0.321242 0.125793 0.380109 0.245318 0.248780 Consensus sequence: BDHHMCGCCCCCTHVBB Reverse complement motif 0.125793 0.245318 0.380109 0.248780 0.321242 0.299908 0.194408 0.184442 0.204851 0.253356 0.347195 0.194597 0.421274 0.286783 0.142802 0.149141 0.588170 0.270068 0.058368 0.083394 0.014261 0.007200 0.905847 0.072692 0.148016 0.000666 0.838396 0.012922 0.000990 0.001215 0.963237 0.034557 0.003045 0.005182 0.990628 0.001145 0.001494 0.003414 0.991406 0.003686 0.035504 0.928129 0.001814 0.034553 0.003704 0.002456 0.991007 0.002833 0.450100 0.001071 0.545383 0.003447 0.255612 0.051621 0.489586 0.203182 0.337454 0.258354 0.165304 0.238889 0.247106 0.345111 0.159582 0.248201 0.155386 0.374454 0.223380 0.246780 Consensus sequence: BVVHAGGGGGCGRDHHB Alignment: BDHHMCGCCCCCTHVBB ---VAGGCCBBGGCVBB ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00093 Klf7_primary Original Motif Original Motif Backward 3 14 0.060607 Species: Mus musculus Original motif 0.204514 0.198353 0.171218 0.425915 0.167188 0.296785 0.246082 0.289946 0.267330 0.148001 0.398674 0.185994 0.549386 0.060167 0.337100 0.053347 0.050746 0.900013 0.022169 0.027073 0.037905 0.920332 0.008360 0.033403 0.410356 0.566702 0.016267 0.006675 0.009526 0.982354 0.001060 0.007060 0.204292 0.001084 0.748567 0.046056 0.003955 0.988490 0.002821 0.004735 0.004264 0.988826 0.004311 0.002598 0.002758 0.929549 0.001244 0.066448 0.260332 0.421683 0.024720 0.293265 0.184798 0.247697 0.085237 0.482268 0.347537 0.197344 0.139961 0.315159 0.255281 0.166620 0.242297 0.335802 Consensus sequence: HBDRCCMCGCCCHHHD Reverse complement motif 0.335802 0.166620 0.242297 0.255281 0.315159 0.197344 0.139961 0.347537 0.482268 0.247697 0.085237 0.184798 0.260332 0.024720 0.421683 0.293265 0.002758 0.001244 0.929549 0.066448 0.004264 0.004311 0.988826 0.002598 0.003955 0.002821 0.988490 0.004735 0.204292 0.748567 0.001084 0.046056 0.009526 0.001060 0.982354 0.007060 0.410356 0.016267 0.566702 0.006675 0.037905 0.008360 0.920332 0.033403 0.050746 0.022169 0.900013 0.027073 0.053347 0.060167 0.337100 0.549386 0.267330 0.398674 0.148001 0.185994 0.167188 0.246082 0.296785 0.289946 0.425915 0.198353 0.171218 0.204514 Consensus sequence: DHHDGGGCGRGGKHBH Alignment: HBDRCCMCGCCCHHHD BBVGCCBVGGCCTV-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v015681_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 9 14 0.060688 Species: Mus musculus Original motif 0.331499 0.188505 0.182841 0.297156 0.328961 0.213025 0.273530 0.184484 0.197213 0.129292 0.524914 0.148581 0.274491 0.226406 0.312118 0.186986 0.103231 0.393726 0.364988 0.138055 0.552594 0.166422 0.186262 0.094722 0.157618 0.064773 0.616497 0.161112 0.139166 0.176098 0.621185 0.063551 0.748420 0.062398 0.012447 0.176735 0.116584 0.009438 0.860326 0.013653 0.005030 0.003646 0.974877 0.016447 0.055257 0.007181 0.921760 0.015802 0.032748 0.058249 0.052709 0.856293 0.105606 0.872231 0.014370 0.007793 0.019480 0.497379 0.125899 0.357242 0.478582 0.269713 0.061464 0.190242 0.253985 0.287006 0.201320 0.257689 0.319384 0.210231 0.175842 0.294543 0.222123 0.287802 0.201294 0.288782 0.139951 0.376041 0.081133 0.402875 0.213450 0.343835 0.383676 0.059039 0.322294 0.355918 0.148062 0.173725 Consensus sequence: HVGVSAGGAGGGTCYHHHHYVH Reverse complement motif 0.322294 0.148062 0.355918 0.173725 0.213450 0.383676 0.343835 0.059039 0.402875 0.376041 0.081133 0.139951 0.288782 0.287802 0.201294 0.222123 0.294543 0.210231 0.175842 0.319384 0.253985 0.201320 0.287006 0.257689 0.190242 0.269713 0.061464 0.478582 0.019480 0.125899 0.497379 0.357242 0.105606 0.014370 0.872231 0.007793 0.856293 0.058249 0.052709 0.032748 0.055257 0.921760 0.007181 0.015802 0.005030 0.974877 0.003646 0.016447 0.116584 0.860326 0.009438 0.013653 0.176735 0.062398 0.012447 0.748420 0.139166 0.621185 0.176098 0.063551 0.157618 0.616497 0.064773 0.161112 0.094722 0.166422 0.186262 0.552594 0.103231 0.364988 0.393726 0.138055 0.274491 0.312118 0.226406 0.186986 0.197213 0.524914 0.129292 0.148581 0.184484 0.213025 0.273530 0.328961 0.297156 0.188505 0.182841 0.331499 Consensus sequence: DVMHHDHKGACCCTCCTSVCBH Alignment: HVGVSAGGAGGGTCYHHHHYVH --------VAGGCCBBGGCVBB ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00087 Tcfap2c_secondary Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 14 0.060806 Species: Mus musculus Original motif 0.203043 0.348071 0.227399 0.221487 0.179291 0.396392 0.144383 0.279934 0.093421 0.033540 0.859005 0.014034 0.181373 0.693724 0.031481 0.093422 0.019065 0.840720 0.011622 0.128593 0.197421 0.501100 0.087606 0.213873 0.457286 0.063305 0.239499 0.239911 0.508984 0.143325 0.116228 0.231463 0.213873 0.087606 0.501100 0.197421 0.128593 0.011622 0.840720 0.019065 0.093422 0.031481 0.693724 0.181373 0.014034 0.859005 0.033540 0.093421 0.477741 0.059425 0.165356 0.297478 0.278658 0.136011 0.311291 0.274039 Consensus sequence: BHGCCCDAGGGCWD Reverse complement motif 0.278658 0.311291 0.136011 0.274039 0.297478 0.059425 0.165356 0.477741 0.014034 0.033540 0.859005 0.093421 0.093422 0.693724 0.031481 0.181373 0.128593 0.840720 0.011622 0.019065 0.213873 0.501100 0.087606 0.197421 0.231463 0.143325 0.116228 0.508984 0.239911 0.063305 0.239499 0.457286 0.197421 0.087606 0.501100 0.213873 0.019065 0.011622 0.840720 0.128593 0.181373 0.031481 0.693724 0.093422 0.093421 0.859005 0.033540 0.014034 0.179291 0.144383 0.396392 0.279934 0.203043 0.227399 0.348071 0.221487 Consensus sequence: HWGCCCTDGGGCDB Alignment: HWGCCCTDGGGCDB VAGGCCBBGGCVBB ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v015681_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 5 14 0.061500 Species: Mus musculus Original motif 0.214165 0.143436 0.372522 0.269876 0.314445 0.406003 0.160351 0.119201 0.137147 0.092924 0.042921 0.727007 0.044121 0.072843 0.051741 0.831295 0.261292 0.324124 0.298498 0.116086 0.258125 0.323243 0.263362 0.155271 0.204557 0.589399 0.107153 0.098891 0.371021 0.244027 0.291102 0.093849 0.096327 0.572718 0.011797 0.319159 0.027282 0.046183 0.844519 0.082016 0.018921 0.012887 0.915917 0.052275 0.364793 0.166722 0.084229 0.384256 0.028216 0.011233 0.951056 0.009495 0.054974 0.004738 0.890377 0.049911 0.006802 0.312915 0.134247 0.546036 0.241289 0.628210 0.104788 0.025713 0.237863 0.302807 0.213018 0.246311 0.349399 0.203220 0.086635 0.360746 0.386634 0.144693 0.246895 0.221779 0.425101 0.354676 0.093374 0.126849 0.060272 0.391320 0.104905 0.443503 0.162090 0.190233 0.227433 0.420244 Consensus sequence: DVTTVVCVYGGHGGYCHHDMYB Reverse complement motif 0.420244 0.190233 0.227433 0.162090 0.443503 0.391320 0.104905 0.060272 0.126849 0.354676 0.093374 0.425101 0.221779 0.144693 0.246895 0.386634 0.360746 0.203220 0.086635 0.349399 0.237863 0.213018 0.302807 0.246311 0.241289 0.104788 0.628210 0.025713 0.546036 0.312915 0.134247 0.006802 0.054974 0.890377 0.004738 0.049911 0.028216 0.951056 0.011233 0.009495 0.384256 0.166722 0.084229 0.364793 0.018921 0.915917 0.012887 0.052275 0.027282 0.844519 0.046183 0.082016 0.096327 0.011797 0.572718 0.319159 0.093849 0.244027 0.291102 0.371021 0.204557 0.107153 0.589399 0.098891 0.258125 0.263362 0.323243 0.155271 0.261292 0.298498 0.324124 0.116086 0.831295 0.072843 0.051741 0.044121 0.727007 0.092924 0.042921 0.137147 0.314445 0.160351 0.406003 0.119201 0.214165 0.372522 0.143436 0.269876 Consensus sequence: VMYDHDGMCCHCCKBGVVAAVH Alignment: DVTTVVCVYGGHGGYCHHDMYB ----BBVGCCBVGGCCTV---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00010 Tcfap2b_secondary Original Motif Reverse Complement Forward 2 14 0.062429 Species: Mus musculus Original motif 0.325895 0.099601 0.286848 0.287657 0.177095 0.035123 0.260876 0.526906 0.344850 0.211117 0.015725 0.428308 0.128363 0.059965 0.777560 0.034112 0.048072 0.881624 0.024842 0.045462 0.072628 0.872650 0.011271 0.043451 0.057165 0.162157 0.347719 0.432959 0.015437 0.448405 0.428425 0.107733 0.446877 0.336374 0.099940 0.116809 0.090955 0.023004 0.848240 0.037801 0.040151 0.015072 0.901303 0.043473 0.087378 0.817019 0.027876 0.067727 0.532482 0.021469 0.266773 0.179276 0.325017 0.271661 0.138860 0.264463 0.203625 0.179490 0.143885 0.473001 Consensus sequence: DTWGCCKSMGGCRHH Reverse complement motif 0.473001 0.179490 0.143885 0.203625 0.264463 0.271661 0.138860 0.325017 0.179276 0.021469 0.266773 0.532482 0.087378 0.027876 0.817019 0.067727 0.040151 0.901303 0.015072 0.043473 0.090955 0.848240 0.023004 0.037801 0.116809 0.336374 0.099940 0.446877 0.015437 0.428425 0.448405 0.107733 0.432959 0.162157 0.347719 0.057165 0.072628 0.011271 0.872650 0.043451 0.048072 0.024842 0.881624 0.045462 0.128363 0.777560 0.059965 0.034112 0.428308 0.211117 0.015725 0.344850 0.526906 0.035123 0.260876 0.177095 0.287657 0.099601 0.286848 0.325895 Consensus sequence: HHKGCCYSRGGCWAD Alignment: HHKGCCYSRGGCWAD -BBVGCCBVGGCCTV ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00082 Zfp187_secondary Reverse Complement Original Motif Forward 1 14 0.062766 Species: Mus musculus Original motif 0.173063 0.169680 0.440836 0.216421 0.353277 0.179996 0.249403 0.217325 0.307337 0.038055 0.616380 0.038228 0.316636 0.564670 0.023732 0.094962 0.015484 0.923764 0.019439 0.041313 0.011243 0.956300 0.009443 0.023014 0.062273 0.107531 0.010739 0.819456 0.126670 0.201521 0.192005 0.479803 0.093090 0.045924 0.835792 0.025194 0.020165 0.015483 0.009567 0.954786 0.010873 0.672448 0.004559 0.312121 0.018002 0.846860 0.017605 0.117533 0.335703 0.408170 0.104095 0.152031 0.150308 0.362296 0.067408 0.419988 0.286490 0.242211 0.176532 0.294767 0.265022 0.249655 0.272219 0.213104 Consensus sequence: DDGMCCTBGTCCHYHV Reverse complement motif 0.265022 0.272219 0.249655 0.213104 0.294767 0.242211 0.176532 0.286490 0.419988 0.362296 0.067408 0.150308 0.335703 0.104095 0.408170 0.152031 0.018002 0.017605 0.846860 0.117533 0.010873 0.004559 0.672448 0.312121 0.954786 0.015483 0.009567 0.020165 0.093090 0.835792 0.045924 0.025194 0.479803 0.201521 0.192005 0.126670 0.819456 0.107531 0.010739 0.062273 0.011243 0.009443 0.956300 0.023014 0.015484 0.019439 0.923764 0.041313 0.316636 0.023732 0.564670 0.094962 0.307337 0.616380 0.038055 0.038228 0.217325 0.179996 0.249403 0.353277 0.173063 0.440836 0.169680 0.216421 Consensus sequence: VHMDGGACVAGGRCDH Alignment: VHMDGGACVAGGRCDH VAGGCCBBGGCVBB-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00009 Nr2f2_secondary Reverse Complement Reverse Complement Forward 3 14 0.063653 Species: Mus musculus Original motif 0.195749 0.435700 0.196915 0.171636 0.131070 0.131912 0.417834 0.319184 0.238959 0.441529 0.174973 0.144539 0.187749 0.189727 0.405849 0.216675 0.006751 0.541370 0.182092 0.269787 0.005388 0.590608 0.339869 0.064135 0.088153 0.004666 0.902351 0.004830 0.002459 0.004278 0.982637 0.010626 0.003618 0.002504 0.985275 0.008602 0.003325 0.004017 0.009244 0.983414 0.002547 0.972864 0.005345 0.019244 0.940260 0.002927 0.053632 0.003181 0.222459 0.390569 0.251497 0.135475 0.151824 0.258444 0.332866 0.256865 0.175811 0.290583 0.232086 0.301520 0.356690 0.198973 0.136050 0.308287 Consensus sequence: VBVBCSGGGTCAVBBH Reverse complement motif 0.308287 0.198973 0.136050 0.356690 0.301520 0.290583 0.232086 0.175811 0.151824 0.332866 0.258444 0.256865 0.222459 0.251497 0.390569 0.135475 0.003181 0.002927 0.053632 0.940260 0.002547 0.005345 0.972864 0.019244 0.983414 0.004017 0.009244 0.003325 0.003618 0.985275 0.002504 0.008602 0.002459 0.982637 0.004278 0.010626 0.088153 0.902351 0.004666 0.004830 0.005388 0.339869 0.590608 0.064135 0.006751 0.182092 0.541370 0.269787 0.187749 0.405849 0.189727 0.216675 0.238959 0.174973 0.441529 0.144539 0.131070 0.417834 0.131912 0.319184 0.195749 0.196915 0.435700 0.171636 Consensus sequence: HVBVTGACCCSGBVBV Alignment: HVBVTGACCCSGBVBV --VAGGCCBBGGCVBB ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 13 Motif name: Zfp423 Original motif 0.212121 0.121212 0.666667 0.000000 0.000000 0.484848 0.515152 0.000000 0.484848 0.515152 0.000000 0.000000 0.515152 0.484848 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.030303 0.515152 0.000000 0.454545 0.727273 0.000000 0.000000 0.272727 0.393939 0.000000 0.484848 0.121212 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.515152 0.484848 0.000000 0.000000 0.484848 0.515152 0.000000 0.242424 0.484848 0.272727 0.333333 0.666667 0.000000 0.000000 Consensus sequence: GSMMCCYARGGKKKC Reserve complement motif 0.333333 0.000000 0.666667 0.000000 0.000000 0.484848 0.242424 0.272727 0.515152 0.000000 0.484848 0.000000 0.000000 0.515152 0.000000 0.484848 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.393939 0.484848 0.000000 0.121212 0.272727 0.000000 0.000000 0.727273 0.030303 0.000000 0.515152 0.454545 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.484848 0.000000 0.515152 0.484848 0.000000 0.515152 0.000000 0.000000 0.515152 0.484848 0.000000 0.212121 0.666667 0.121212 0.000000 Consensus sequence: GYRYCCMTKGGYRSC ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 13 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00057 Zic2_primary Original Motif Original Motif Backward 1 15 0.017808 Species: Mus musculus Original motif 0.171475 0.300729 0.275648 0.252148 0.274948 0.494479 0.090926 0.139646 0.136266 0.716563 0.033328 0.113843 0.116272 0.772964 0.046083 0.064680 0.103529 0.835329 0.032215 0.028927 0.057023 0.813129 0.071277 0.058571 0.057483 0.766273 0.157290 0.018955 0.071535 0.110226 0.631760 0.186479 0.058571 0.071277 0.813129 0.057023 0.028927 0.032215 0.835329 0.103529 0.064680 0.046083 0.772964 0.116272 0.113843 0.033328 0.716563 0.136266 0.119744 0.068294 0.609218 0.202743 0.065793 0.215443 0.562951 0.155813 0.178819 0.196535 0.205955 0.418691 Consensus sequence: BMCCCCCGGGGGGGB Reverse complement motif 0.418691 0.196535 0.205955 0.178819 0.065793 0.562951 0.215443 0.155813 0.119744 0.609218 0.068294 0.202743 0.113843 0.716563 0.033328 0.136266 0.064680 0.772964 0.046083 0.116272 0.028927 0.835329 0.032215 0.103529 0.058571 0.813129 0.071277 0.057023 0.071535 0.631760 0.110226 0.186479 0.057483 0.157290 0.766273 0.018955 0.057023 0.071277 0.813129 0.058571 0.103529 0.032215 0.835329 0.028927 0.116272 0.046083 0.772964 0.064680 0.136266 0.033328 0.716563 0.113843 0.274948 0.090926 0.494479 0.139646 0.171475 0.275648 0.300729 0.252148 Consensus sequence: VCCCCCCCGGGGGRB Alignment: BMCCCCCGGGGGGGB GSMMCCYARGGKKKC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00006 Zic3_primary Original Motif Original Motif Backward 1 15 0.021395 Species: Mus musculus Original motif 0.133123 0.374622 0.252864 0.239392 0.305344 0.451195 0.093638 0.149822 0.125347 0.723516 0.027695 0.123442 0.129457 0.754873 0.045215 0.070455 0.117681 0.809987 0.036742 0.035590 0.046565 0.817263 0.077300 0.058872 0.047132 0.790594 0.143506 0.018768 0.059681 0.087688 0.665195 0.187436 0.058872 0.077300 0.817263 0.046565 0.035590 0.036742 0.809987 0.117681 0.070455 0.045215 0.754873 0.129457 0.123442 0.027695 0.723516 0.125347 0.104029 0.069439 0.636026 0.190506 0.070968 0.197801 0.581172 0.150060 0.147077 0.235294 0.230097 0.387531 Consensus sequence: BMCCCCCGGGGGGGB Reverse complement motif 0.387531 0.235294 0.230097 0.147077 0.070968 0.581172 0.197801 0.150060 0.104029 0.636026 0.069439 0.190506 0.123442 0.723516 0.027695 0.125347 0.070455 0.754873 0.045215 0.129457 0.035590 0.809987 0.036742 0.117681 0.058872 0.817263 0.077300 0.046565 0.059681 0.665195 0.087688 0.187436 0.047132 0.143506 0.790594 0.018768 0.046565 0.077300 0.817263 0.058872 0.117681 0.036742 0.809987 0.035590 0.129457 0.045215 0.754873 0.070455 0.125347 0.027695 0.723516 0.123442 0.305344 0.093638 0.451195 0.149822 0.133123 0.252864 0.374622 0.239392 Consensus sequence: VCCCCCCCGGGGGRB Alignment: BMCCCCCGGGGGGGB GSMMCCYARGGKKKC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 2 15 0.025524 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH -------GSMMCCYARGGKKKC- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00087 Tcfap2c_primary Original Motif Original Motif Forward 1 15 0.026140 Species: Mus musculus Original motif 0.453894 0.104785 0.095366 0.345954 0.232091 0.189298 0.180541 0.398071 0.233238 0.261214 0.065556 0.439992 0.012319 0.459636 0.511133 0.016912 0.008159 0.984661 0.002866 0.004314 0.001420 0.885962 0.001808 0.110810 0.005689 0.345363 0.111901 0.537046 0.035614 0.353586 0.534122 0.076679 0.537046 0.111901 0.345363 0.005689 0.110810 0.001808 0.885962 0.001420 0.004314 0.002866 0.984661 0.008159 0.016912 0.511133 0.459636 0.012319 0.313235 0.097541 0.435018 0.154206 0.570019 0.140594 0.123600 0.165788 0.326417 0.176576 0.220289 0.276718 Consensus sequence: WHHSCCYSRGGSDAD Reverse complement motif 0.276718 0.176576 0.220289 0.326417 0.165788 0.140594 0.123600 0.570019 0.313235 0.435018 0.097541 0.154206 0.016912 0.459636 0.511133 0.012319 0.004314 0.984661 0.002866 0.008159 0.110810 0.885962 0.001808 0.001420 0.005689 0.111901 0.345363 0.537046 0.035614 0.534122 0.353586 0.076679 0.537046 0.345363 0.111901 0.005689 0.001420 0.001808 0.885962 0.110810 0.008159 0.002866 0.984661 0.004314 0.012319 0.511133 0.459636 0.016912 0.439992 0.261214 0.065556 0.233238 0.398071 0.189298 0.180541 0.232091 0.345954 0.104785 0.095366 0.453894 Consensus sequence: DTHSCCKSMGGSHHW Alignment: WHHSCCYSRGGSDAD GSMMCCYARGGKKKC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00005 Tcfap2a_primary Original Motif Original Motif Forward 1 15 0.026620 Species: Mus musculus Original motif 0.422613 0.103833 0.119614 0.353939 0.249412 0.169205 0.202313 0.379071 0.229443 0.231233 0.068690 0.470634 0.013814 0.501744 0.463635 0.020806 0.006744 0.985507 0.003252 0.004497 0.001758 0.859562 0.001396 0.137285 0.005460 0.315890 0.186790 0.491861 0.040326 0.375312 0.497433 0.086929 0.491861 0.186790 0.315890 0.005460 0.137285 0.001396 0.859562 0.001758 0.004497 0.003252 0.985507 0.006744 0.020806 0.463635 0.501744 0.013814 0.348377 0.094358 0.419593 0.137673 0.559411 0.134625 0.133295 0.172668 0.331903 0.197670 0.240404 0.230023 Consensus sequence: WDHSCCYSRGGSRAD Reverse complement motif 0.230023 0.197670 0.240404 0.331903 0.172668 0.134625 0.133295 0.559411 0.348377 0.419593 0.094358 0.137673 0.020806 0.501744 0.463635 0.013814 0.004497 0.985507 0.003252 0.006744 0.137285 0.859562 0.001396 0.001758 0.005460 0.186790 0.315890 0.491861 0.040326 0.497433 0.375312 0.086929 0.491861 0.315890 0.186790 0.005460 0.001758 0.001396 0.859562 0.137285 0.006744 0.003252 0.985507 0.004497 0.013814 0.463635 0.501744 0.020806 0.470634 0.231233 0.068690 0.229443 0.379071 0.169205 0.202313 0.249412 0.353939 0.103833 0.119614 0.422613 Consensus sequence: DTMSCCKSMGGSHDW Alignment: WDHSCCYSRGGSRAD GSMMCCYARGGKKKC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 8 15 0.027503 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH -------GSMMCCYARGGKKKC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00220 Nkx1-1 Reverse Complement Original Motif Backward 2 15 0.027694 Species: Mus musculus Original motif 0.353447 0.068118 0.120462 0.457973 0.169987 0.245776 0.546030 0.038207 0.262042 0.483886 0.125630 0.128442 0.354878 0.202410 0.397957 0.044755 0.047984 0.627223 0.134949 0.189844 0.007630 0.416328 0.000687 0.575355 0.884176 0.112464 0.001228 0.002132 0.953912 0.001377 0.001269 0.043443 0.043443 0.001269 0.001377 0.953912 0.002132 0.001228 0.112464 0.884176 0.575355 0.000687 0.416328 0.007630 0.189844 0.134949 0.627223 0.047984 0.014022 0.455684 0.058677 0.471617 0.112401 0.095488 0.677137 0.114973 0.101198 0.313778 0.492626 0.092398 0.160044 0.156084 0.492477 0.191395 0.358939 0.198163 0.262649 0.180248 Consensus sequence: WGHRCYAATTRGYGSDV Reverse complement motif 0.180248 0.198163 0.262649 0.358939 0.160044 0.492477 0.156084 0.191395 0.101198 0.492626 0.313778 0.092398 0.112401 0.677137 0.095488 0.114973 0.471617 0.455684 0.058677 0.014022 0.189844 0.627223 0.134949 0.047984 0.007630 0.000687 0.416328 0.575355 0.884176 0.001228 0.112464 0.002132 0.953912 0.001269 0.001377 0.043443 0.043443 0.001377 0.001269 0.953912 0.002132 0.112464 0.001228 0.884176 0.575355 0.416328 0.000687 0.007630 0.047984 0.134949 0.627223 0.189844 0.354878 0.397957 0.202410 0.044755 0.262042 0.125630 0.483886 0.128442 0.169987 0.546030 0.245776 0.038207 0.457973 0.068118 0.120462 0.353447 Consensus sequence: BHSCMCKAATTMGMDCW Alignment: WGHRCYAATTRGYGSDV -GYRYCCMTKGGYRSC- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_primaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 15 0.028048 Species: Mus musculus Original motif 0.137831 0.118922 0.394177 0.349070 0.190108 0.163633 0.138507 0.507753 0.346002 0.332315 0.228621 0.093063 0.113254 0.287554 0.373285 0.225908 0.272578 0.125402 0.328963 0.273057 0.333973 0.115165 0.194267 0.356595 0.381054 0.086215 0.501679 0.031052 0.002232 0.007405 0.966087 0.024276 0.834741 0.112115 0.052053 0.001091 0.009034 0.983239 0.000766 0.006960 0.002054 0.988103 0.003138 0.006705 0.805772 0.171299 0.008415 0.014515 0.020076 0.976846 0.000894 0.002183 0.079914 0.917273 0.001179 0.001634 0.013983 0.950545 0.004205 0.031267 0.789407 0.039441 0.108645 0.062507 0.055453 0.161271 0.595249 0.188028 0.333424 0.128169 0.373270 0.165136 0.536103 0.109520 0.062980 0.291397 0.346477 0.090909 0.279533 0.283081 0.045892 0.190183 0.584314 0.179611 0.088294 0.406148 0.251647 0.253912 0.202467 0.447159 0.162802 0.187571 Consensus sequence: DTVBDDRGACCACCCAGDWDGBH Reverse complement motif 0.202467 0.162802 0.447159 0.187571 0.088294 0.251647 0.406148 0.253912 0.045892 0.584314 0.190183 0.179611 0.283081 0.090909 0.279533 0.346477 0.291397 0.109520 0.062980 0.536103 0.333424 0.373270 0.128169 0.165136 0.055453 0.595249 0.161271 0.188028 0.062507 0.039441 0.108645 0.789407 0.013983 0.004205 0.950545 0.031267 0.079914 0.001179 0.917273 0.001634 0.020076 0.000894 0.976846 0.002183 0.014515 0.171299 0.008415 0.805772 0.002054 0.003138 0.988103 0.006705 0.009034 0.000766 0.983239 0.006960 0.001091 0.112115 0.052053 0.834741 0.002232 0.966087 0.007405 0.024276 0.381054 0.501679 0.086215 0.031052 0.356595 0.115165 0.194267 0.333973 0.272578 0.328963 0.125402 0.273057 0.113254 0.373285 0.287554 0.225908 0.093063 0.332315 0.228621 0.346002 0.507753 0.163633 0.138507 0.190108 0.137831 0.394177 0.118922 0.349070 Consensus sequence: DBCDWHCTGGGTGGTCMDHBBAH Alignment: DTVBDDRGACCACCCAGDWDGBH --------GSMMCCYARGGKKKC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_primaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 9 15 0.028880 Species: Mus musculus Original motif 0.204923 0.208846 0.365383 0.220848 0.294304 0.300143 0.167287 0.238266 0.109711 0.619514 0.117379 0.153396 0.178979 0.378580 0.230177 0.212264 0.159594 0.542602 0.118178 0.179627 0.125206 0.430074 0.151826 0.292894 0.097692 0.709845 0.116956 0.075506 0.148292 0.565912 0.037632 0.248164 0.077951 0.034190 0.855503 0.032356 0.001657 0.001061 0.971877 0.025405 0.001926 0.001084 0.991712 0.005278 0.033031 0.012001 0.057796 0.897171 0.002723 0.002647 0.993348 0.001281 0.003261 0.000963 0.987199 0.008577 0.000611 0.090925 0.074857 0.833608 0.015299 0.978878 0.004949 0.000874 0.013368 0.600902 0.033485 0.352245 0.231949 0.149575 0.118804 0.499672 0.267580 0.186002 0.371242 0.175176 0.264884 0.223483 0.110082 0.401551 0.221365 0.170121 0.179559 0.428955 0.112997 0.692930 0.139981 0.054092 0.460305 0.207883 0.155111 0.176702 Consensus sequence: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH Reverse complement motif 0.176702 0.207883 0.155111 0.460305 0.112997 0.139981 0.692930 0.054092 0.428955 0.170121 0.179559 0.221365 0.401551 0.223483 0.110082 0.264884 0.267580 0.371242 0.186002 0.175176 0.499672 0.149575 0.118804 0.231949 0.013368 0.033485 0.600902 0.352245 0.015299 0.004949 0.978878 0.000874 0.833608 0.090925 0.074857 0.000611 0.003261 0.987199 0.000963 0.008577 0.002723 0.993348 0.002647 0.001281 0.897171 0.012001 0.057796 0.033031 0.001926 0.991712 0.001084 0.005278 0.001657 0.971877 0.001061 0.025405 0.077951 0.855503 0.034190 0.032356 0.148292 0.037632 0.565912 0.248164 0.097692 0.116956 0.709845 0.075506 0.125206 0.151826 0.430074 0.292894 0.159594 0.118178 0.542602 0.179627 0.178979 0.230177 0.378580 0.212264 0.109711 0.117379 0.619514 0.153396 0.294304 0.167287 0.300143 0.238266 0.204923 0.365383 0.208846 0.220848 Consensus sequence: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB Alignment: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB --------GSMMCCYARGGKKKC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00028 Tcfap2e_primary Original Motif Original Motif Forward 1 15 0.029693 Species: Mus musculus Original motif 0.369517 0.172742 0.163174 0.294567 0.260541 0.211816 0.194359 0.333284 0.292862 0.281323 0.073013 0.352801 0.011777 0.272676 0.697188 0.018359 0.005160 0.983588 0.005917 0.005335 0.002256 0.960488 0.005733 0.031524 0.003735 0.283214 0.123762 0.589290 0.024383 0.379981 0.542999 0.052638 0.589290 0.123762 0.283214 0.003735 0.031524 0.005733 0.960488 0.002256 0.005335 0.005917 0.983588 0.005160 0.018359 0.697188 0.272676 0.011777 0.328286 0.093173 0.334133 0.244408 0.563777 0.145250 0.140240 0.150733 0.263206 0.222321 0.242153 0.272320 Consensus sequence: HHHGCCTSAGGCDAD Reverse complement motif 0.272320 0.222321 0.242153 0.263206 0.150733 0.145250 0.140240 0.563777 0.328286 0.334133 0.093173 0.244408 0.018359 0.272676 0.697188 0.011777 0.005335 0.983588 0.005917 0.005160 0.031524 0.960488 0.005733 0.002256 0.003735 0.123762 0.283214 0.589290 0.024383 0.542999 0.379981 0.052638 0.589290 0.283214 0.123762 0.003735 0.002256 0.005733 0.960488 0.031524 0.005160 0.005917 0.983588 0.005335 0.011777 0.697188 0.272676 0.018359 0.352801 0.281323 0.073013 0.292862 0.333284 0.211816 0.194359 0.260541 0.294567 0.172742 0.163174 0.369517 Consensus sequence: DTHGCCTSAGGCHHH Alignment: HHHGCCTSAGGCDAD GSMMCCYARGGKKKC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 14 Motif name: ZEB1 Original motif 0.024390 0.829268 0.024390 0.121951 0.926829 0.000000 0.048780 0.024390 0.000000 0.975610 0.024390 0.000000 0.000000 0.926829 0.073171 0.000000 0.000000 0.024390 0.000000 0.975610 0.243902 0.024390 0.390244 0.341463 Consensus sequence: CACCTD Reserve complement motif 0.243902 0.390244 0.024390 0.341463 0.975610 0.024390 0.000000 0.000000 0.000000 0.073171 0.926829 0.000000 0.000000 0.024390 0.975610 0.000000 0.024390 0.000000 0.048780 0.926829 0.024390 0.024390 0.829268 0.121951 Consensus sequence: HAGGTG ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 14 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00068 Eomes_secondary Original Motif Reverse Complement Backward 4 6 0.000000 Species: Mus musculus Original motif 0.253642 0.252604 0.298295 0.195458 0.112892 0.341342 0.341061 0.204704 0.297430 0.215095 0.343350 0.144125 0.241098 0.129378 0.421448 0.208076 0.894201 0.007299 0.061032 0.037468 0.052259 0.054303 0.856609 0.036829 0.005074 0.015048 0.966734 0.013144 0.003258 0.061529 0.002368 0.932845 0.017531 0.005025 0.973155 0.004289 0.116022 0.030172 0.047139 0.806667 0.027749 0.602513 0.009946 0.359792 0.018763 0.048982 0.794648 0.137608 0.177116 0.459591 0.284833 0.078460 0.121483 0.491485 0.148745 0.238287 0.152590 0.245835 0.214717 0.386857 0.221040 0.320773 0.249918 0.208270 Consensus sequence: VBVDAGGTGTYGVBBV Reverse complement motif 0.221040 0.249918 0.320773 0.208270 0.386857 0.245835 0.214717 0.152590 0.121483 0.148745 0.491485 0.238287 0.177116 0.284833 0.459591 0.078460 0.018763 0.794648 0.048982 0.137608 0.027749 0.009946 0.602513 0.359792 0.806667 0.030172 0.047139 0.116022 0.017531 0.973155 0.005025 0.004289 0.932845 0.061529 0.002368 0.003258 0.005074 0.966734 0.015048 0.013144 0.052259 0.856609 0.054303 0.036829 0.037468 0.007299 0.061032 0.894201 0.241098 0.421448 0.129378 0.208076 0.297430 0.343350 0.215095 0.144125 0.112892 0.341061 0.341342 0.204704 0.253642 0.298295 0.252604 0.195458 Consensus sequence: VVBVCKACACCTHVBV Alignment: VVBVCKACACCTHVBV -------CACCTD--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00199 Six4 Reverse Complement Reverse Complement Forward 4 6 0.004331 Species: Mus musculus Original motif 0.523054 0.168817 0.140331 0.167798 0.187385 0.177009 0.246164 0.389442 0.414492 0.118547 0.308876 0.158085 0.345234 0.289795 0.130249 0.234723 0.611522 0.116948 0.098944 0.172586 0.016342 0.029436 0.015062 0.939161 0.014351 0.004796 0.962435 0.018418 0.987454 0.005228 0.002590 0.004727 0.007431 0.812214 0.005849 0.174506 0.969354 0.025386 0.002362 0.002898 0.005123 0.989068 0.003362 0.002447 0.001424 0.969981 0.012011 0.016585 0.209729 0.227411 0.210523 0.352337 0.341679 0.297940 0.104590 0.255792 0.126190 0.288862 0.245018 0.339930 0.173008 0.295896 0.252422 0.278674 0.409639 0.210750 0.296197 0.083415 Consensus sequence: ADDHATGACACCBHBBV Reverse complement motif 0.083415 0.210750 0.296197 0.409639 0.173008 0.252422 0.295896 0.278674 0.339930 0.288862 0.245018 0.126190 0.255792 0.297940 0.104590 0.341679 0.352337 0.227411 0.210523 0.209729 0.001424 0.012011 0.969981 0.016585 0.005123 0.003362 0.989068 0.002447 0.002898 0.025386 0.002362 0.969354 0.007431 0.005849 0.812214 0.174506 0.004727 0.005228 0.002590 0.987454 0.014351 0.962435 0.004796 0.018418 0.939161 0.029436 0.015062 0.016342 0.172586 0.116948 0.098944 0.611522 0.234723 0.289795 0.130249 0.345234 0.158085 0.118547 0.308876 0.414492 0.389442 0.177009 0.246164 0.187385 0.167798 0.168817 0.140331 0.523054 Consensus sequence: BBVHVGGTGTCATHDDT Alignment: BBVHVGGTGTCATHDDT ---HAGGTG-------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00068 Eomes_primary Original Motif Reverse Complement Forward 9 6 0.005241 Species: Mus musculus Original motif 0.186316 0.215541 0.297644 0.300499 0.300381 0.234276 0.266283 0.199061 0.317841 0.211418 0.183235 0.287507 0.482598 0.095323 0.245062 0.177017 0.654197 0.008988 0.261951 0.074864 0.095656 0.022883 0.843364 0.038097 0.002655 0.008355 0.976390 0.012600 0.003287 0.080755 0.001057 0.914900 0.006753 0.001517 0.989917 0.001813 0.039940 0.098800 0.003305 0.857955 0.009015 0.039036 0.844029 0.107921 0.984070 0.002369 0.008852 0.004709 0.789505 0.101528 0.029294 0.079672 0.649685 0.139882 0.090466 0.119966 0.421759 0.205595 0.073074 0.299573 0.214779 0.290522 0.134050 0.360649 0.202141 0.270323 0.176798 0.350738 Consensus sequence: BVHDAGGTGTGAAAHHH Reverse complement motif 0.350738 0.270323 0.176798 0.202141 0.360649 0.290522 0.134050 0.214779 0.299573 0.205595 0.073074 0.421759 0.119966 0.139882 0.090466 0.649685 0.079672 0.101528 0.029294 0.789505 0.004709 0.002369 0.008852 0.984070 0.009015 0.844029 0.039036 0.107921 0.857955 0.098800 0.003305 0.039940 0.006753 0.989917 0.001517 0.001813 0.914900 0.080755 0.001057 0.003287 0.002655 0.976390 0.008355 0.012600 0.095656 0.843364 0.022883 0.038097 0.074864 0.008988 0.261951 0.654197 0.177017 0.095323 0.245062 0.482598 0.287507 0.211418 0.183235 0.317841 0.199061 0.234276 0.266283 0.300381 0.300499 0.215541 0.297644 0.186316 Consensus sequence: HHHTTTCACACCTDHBV Alignment: HHHTTTCACACCTDHBV --------CACCTD--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00046 Tcfe2a_primary Reverse Complement Original Motif Forward 6 6 0.009113 Species: Mus musculus Original motif 0.306209 0.232705 0.244475 0.216611 0.165668 0.171480 0.222584 0.440269 0.213008 0.429038 0.156385 0.201569 0.283226 0.329518 0.160795 0.226461 0.439156 0.283517 0.251270 0.026056 0.014994 0.980987 0.000714 0.003304 0.975741 0.020182 0.002909 0.001168 0.000926 0.191353 0.801648 0.006073 0.015382 0.090853 0.893043 0.000721 0.001549 0.005912 0.001713 0.990826 0.004000 0.000857 0.989667 0.005475 0.016957 0.663726 0.148127 0.171190 0.299047 0.091156 0.448649 0.161148 0.354701 0.214677 0.236757 0.193865 0.399446 0.174508 0.200036 0.226009 0.303545 0.277435 0.200094 0.218926 0.380242 0.148876 0.163367 0.307514 Consensus sequence: VBHHVCAGGTGCDVDHD Reverse complement motif 0.307514 0.148876 0.163367 0.380242 0.218926 0.277435 0.200094 0.303545 0.226009 0.174508 0.200036 0.399446 0.193865 0.214677 0.236757 0.354701 0.299047 0.448649 0.091156 0.161148 0.016957 0.148127 0.663726 0.171190 0.004000 0.989667 0.000857 0.005475 0.990826 0.005912 0.001713 0.001549 0.015382 0.893043 0.090853 0.000721 0.000926 0.801648 0.191353 0.006073 0.001168 0.020182 0.002909 0.975741 0.014994 0.000714 0.980987 0.003304 0.026056 0.283517 0.251270 0.439156 0.283226 0.160795 0.329518 0.226461 0.213008 0.156385 0.429038 0.201569 0.440269 0.171480 0.222584 0.165668 0.216611 0.232705 0.244475 0.306209 Consensus sequence: DHDBHGCACCTGBDDVB Alignment: VBHHVCAGGTGCDVDHD -----HAGGTG------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00047 Zbtb7b_secondary Original Motif Original Motif Backward 4 6 0.023356 Species: Mus musculus Original motif 0.203365 0.307129 0.203712 0.285795 0.306328 0.182359 0.203143 0.308170 0.220878 0.174035 0.265341 0.339746 0.475421 0.085294 0.281054 0.158231 0.395971 0.330114 0.260810 0.013104 0.001970 0.006366 0.962058 0.029606 0.907785 0.081900 0.001279 0.009036 0.008745 0.981422 0.002970 0.006863 0.006791 0.966163 0.017605 0.009441 0.894233 0.081139 0.004949 0.019679 0.007553 0.970771 0.004892 0.016783 0.016719 0.797465 0.011842 0.173974 0.415678 0.189952 0.165207 0.229163 0.092707 0.182206 0.346121 0.378967 0.175722 0.130498 0.215118 0.478662 0.365762 0.163282 0.315788 0.155168 0.214734 0.272805 0.243194 0.269267 Consensus sequence: BDDRVGACCACCHBDVB Reverse complement motif 0.214734 0.243194 0.272805 0.269267 0.155168 0.163282 0.315788 0.365762 0.478662 0.130498 0.215118 0.175722 0.378967 0.182206 0.346121 0.092707 0.229163 0.189952 0.165207 0.415678 0.016719 0.011842 0.797465 0.173974 0.007553 0.004892 0.970771 0.016783 0.019679 0.081139 0.004949 0.894233 0.006791 0.017605 0.966163 0.009441 0.008745 0.002970 0.981422 0.006863 0.009036 0.081900 0.001279 0.907785 0.001970 0.962058 0.006366 0.029606 0.013104 0.330114 0.260810 0.395971 0.158231 0.085294 0.281054 0.475421 0.339746 0.174035 0.265341 0.220878 0.308170 0.182359 0.203143 0.306328 0.203365 0.203712 0.307129 0.285795 Consensus sequence: BBDVHGGTGGTCBKDDB Alignment: BDDRVGACCACCHBDVB --------CACCTD--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_primaryReverse Complement Original Motif Backward 11 6 0.023393 Species: Mus musculus Original motif 0.204923 0.208846 0.365383 0.220848 0.294304 0.300143 0.167287 0.238266 0.109711 0.619514 0.117379 0.153396 0.178979 0.378580 0.230177 0.212264 0.159594 0.542602 0.118178 0.179627 0.125206 0.430074 0.151826 0.292894 0.097692 0.709845 0.116956 0.075506 0.148292 0.565912 0.037632 0.248164 0.077951 0.034190 0.855503 0.032356 0.001657 0.001061 0.971877 0.025405 0.001926 0.001084 0.991712 0.005278 0.033031 0.012001 0.057796 0.897171 0.002723 0.002647 0.993348 0.001281 0.003261 0.000963 0.987199 0.008577 0.000611 0.090925 0.074857 0.833608 0.015299 0.978878 0.004949 0.000874 0.013368 0.600902 0.033485 0.352245 0.231949 0.149575 0.118804 0.499672 0.267580 0.186002 0.371242 0.175176 0.264884 0.223483 0.110082 0.401551 0.221365 0.170121 0.179559 0.428955 0.112997 0.692930 0.139981 0.054092 0.460305 0.207883 0.155111 0.176702 Consensus sequence: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH Reverse complement motif 0.176702 0.207883 0.155111 0.460305 0.112997 0.139981 0.692930 0.054092 0.428955 0.170121 0.179559 0.221365 0.401551 0.223483 0.110082 0.264884 0.267580 0.371242 0.186002 0.175176 0.499672 0.149575 0.118804 0.231949 0.013368 0.033485 0.600902 0.352245 0.015299 0.004949 0.978878 0.000874 0.833608 0.090925 0.074857 0.000611 0.003261 0.987199 0.000963 0.008577 0.002723 0.993348 0.002647 0.001281 0.897171 0.012001 0.057796 0.033031 0.001926 0.991712 0.001084 0.005278 0.001657 0.971877 0.001061 0.025405 0.077951 0.855503 0.034190 0.032356 0.148292 0.037632 0.565912 0.248164 0.097692 0.116956 0.709845 0.075506 0.125206 0.151826 0.430074 0.292894 0.159594 0.118178 0.542602 0.179627 0.178979 0.230177 0.378580 0.212264 0.109711 0.117379 0.619514 0.153396 0.294304 0.167287 0.300143 0.238266 0.204923 0.365383 0.208846 0.220848 Consensus sequence: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB Alignment: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH -------HAGGTG---------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v015681_primaryOriginal Motif Original Motif Backward 6 6 0.025434 Species: Mus musculus Original motif 0.472795 0.179227 0.091251 0.256726 0.036521 0.159743 0.204840 0.598896 0.164582 0.312805 0.221324 0.301289 0.237069 0.249050 0.293048 0.220833 0.401949 0.225181 0.229401 0.143469 0.161422 0.494334 0.252207 0.092036 0.252940 0.177721 0.369400 0.199939 0.119630 0.024651 0.849920 0.005798 0.000962 0.002398 0.990616 0.006023 0.937852 0.027016 0.034535 0.000597 0.008963 0.987756 0.000629 0.002652 0.001584 0.992898 0.002349 0.003169 0.956822 0.027342 0.002484 0.013352 0.009873 0.987759 0.000988 0.001381 0.016397 0.980856 0.000369 0.002378 0.081761 0.758555 0.038572 0.121112 0.371713 0.091838 0.448027 0.088423 0.111617 0.121913 0.683885 0.082585 0.334562 0.102916 0.436488 0.126034 0.210362 0.101261 0.238339 0.450037 0.169041 0.271583 0.320799 0.238576 0.140316 0.049885 0.735236 0.074563 Consensus sequence: HTBVVVDGGACCACCCRGRDBG Reverse complement motif 0.140316 0.735236 0.049885 0.074563 0.169041 0.320799 0.271583 0.238576 0.450037 0.101261 0.238339 0.210362 0.334562 0.436488 0.102916 0.126034 0.111617 0.683885 0.121913 0.082585 0.371713 0.448027 0.091838 0.088423 0.081761 0.038572 0.758555 0.121112 0.016397 0.000369 0.980856 0.002378 0.009873 0.000988 0.987759 0.001381 0.013352 0.027342 0.002484 0.956822 0.001584 0.002349 0.992898 0.003169 0.008963 0.000629 0.987756 0.002652 0.000597 0.027016 0.034535 0.937852 0.000962 0.990616 0.002398 0.006023 0.119630 0.849920 0.024651 0.005798 0.252940 0.369400 0.177721 0.199939 0.161422 0.252207 0.494334 0.092036 0.143469 0.225181 0.229401 0.401949 0.237069 0.293048 0.249050 0.220833 0.164582 0.221324 0.312805 0.301289 0.598896 0.159743 0.204840 0.036521 0.256726 0.179227 0.091251 0.472795 Consensus sequence: CBDMCMGGGTGGTCCHVBVBAH Alignment: HTBVVVDGGACCACCCRGRDBG -----------CACCTD----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_primaryOriginal Motif Original Motif Backward 6 6 0.029014 Species: Mus musculus Original motif 0.180868 0.321661 0.134642 0.362829 0.232215 0.134289 0.315356 0.318141 0.065068 0.093681 0.569842 0.271408 0.370822 0.229680 0.154738 0.244759 0.323039 0.182873 0.173588 0.320500 0.175039 0.266898 0.276080 0.281984 0.412669 0.147730 0.146326 0.293275 0.325953 0.028805 0.629596 0.015646 0.003017 0.001766 0.979711 0.015507 0.888973 0.040666 0.069420 0.000941 0.017309 0.979155 0.000899 0.002637 0.001732 0.988816 0.004856 0.004596 0.889763 0.078125 0.010384 0.021729 0.007566 0.987081 0.001421 0.003932 0.027797 0.966593 0.000878 0.004731 0.025816 0.867003 0.065749 0.041433 0.220658 0.075256 0.582904 0.121182 0.088946 0.283695 0.565345 0.062015 0.328012 0.241332 0.305901 0.124755 0.307302 0.137589 0.375928 0.179181 0.298752 0.231470 0.315255 0.154524 0.094565 0.142901 0.705696 0.056838 Consensus sequence: HDGHHBHRGACCACCCGSVDVG Reverse complement motif 0.094565 0.705696 0.142901 0.056838 0.298752 0.315255 0.231470 0.154524 0.307302 0.375928 0.137589 0.179181 0.124755 0.241332 0.305901 0.328012 0.088946 0.565345 0.283695 0.062015 0.220658 0.582904 0.075256 0.121182 0.025816 0.065749 0.867003 0.041433 0.027797 0.000878 0.966593 0.004731 0.007566 0.001421 0.987081 0.003932 0.021729 0.078125 0.010384 0.889763 0.001732 0.004856 0.988816 0.004596 0.017309 0.000899 0.979155 0.002637 0.000941 0.040666 0.069420 0.888973 0.003017 0.979711 0.001766 0.015507 0.325953 0.629596 0.028805 0.015646 0.293275 0.147730 0.146326 0.412669 0.281984 0.266898 0.276080 0.175039 0.320500 0.182873 0.173588 0.323039 0.244759 0.229680 0.154738 0.370822 0.065068 0.569842 0.093681 0.271408 0.318141 0.134289 0.315356 0.232215 0.362829 0.321661 0.134642 0.180868 Consensus sequence: CVHBSCGGGTGGTCMHVHHCDH Alignment: HDGHHBHRGACCACCCGSVDVG -----------CACCTD----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00036 Myf6_primary Reverse Complement Original Motif Backward 5 6 0.030967 Species: Mus musculus Original motif 0.249543 0.203739 0.394131 0.152587 0.349361 0.204136 0.321767 0.124736 0.386930 0.174655 0.250284 0.188131 0.173937 0.233501 0.412360 0.180201 0.663624 0.037653 0.264216 0.034507 0.717265 0.040761 0.206656 0.035318 0.004176 0.985948 0.003219 0.006657 0.967612 0.005543 0.008604 0.018241 0.080781 0.089857 0.746009 0.083354 0.019831 0.270961 0.409808 0.299401 0.019877 0.026996 0.014022 0.939105 0.005169 0.007980 0.978334 0.008518 0.115710 0.200514 0.226485 0.457291 0.032392 0.527196 0.128372 0.312041 0.202049 0.384912 0.106488 0.306551 0.181994 0.192975 0.425582 0.199448 Consensus sequence: VVDBAACAGBTGBYHB Reverse complement motif 0.181994 0.425582 0.192975 0.199448 0.202049 0.106488 0.384912 0.306551 0.032392 0.128372 0.527196 0.312041 0.457291 0.200514 0.226485 0.115710 0.005169 0.978334 0.007980 0.008518 0.939105 0.026996 0.014022 0.019877 0.019831 0.409808 0.270961 0.299401 0.080781 0.746009 0.089857 0.083354 0.018241 0.005543 0.008604 0.967612 0.004176 0.003219 0.985948 0.006657 0.035318 0.040761 0.206656 0.717265 0.034507 0.037653 0.264216 0.663624 0.173937 0.412360 0.233501 0.180201 0.188131 0.174655 0.250284 0.386930 0.124736 0.204136 0.321767 0.349361 0.249543 0.394131 0.203739 0.152587 Consensus sequence: BDKVCABCTGTTBDBV Alignment: VVDBAACAGBTGBYHB ------HAGGTG---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00249 Nkx2-5 Original Motif Original Motif Forward 6 6 0.031502 Species: Mus musculus Original motif 0.284346 0.280937 0.138180 0.296538 0.399663 0.110464 0.327481 0.162392 0.637560 0.029806 0.218321 0.114314 0.184898 0.144379 0.370828 0.299895 0.017459 0.862111 0.118223 0.002207 0.001004 0.958164 0.000888 0.039945 0.947796 0.011499 0.000413 0.040291 0.024268 0.973476 0.000709 0.001546 0.002616 0.001901 0.003337 0.992147 0.006742 0.071290 0.000276 0.921691 0.393078 0.093424 0.490620 0.022879 0.870162 0.007294 0.051952 0.070591 0.632449 0.156278 0.172644 0.038628 0.362798 0.126579 0.085796 0.424828 0.132810 0.206405 0.025084 0.635702 0.094708 0.272324 0.087702 0.545267 Consensus sequence: HDADCCACTTRAAWTT Reverse complement motif 0.545267 0.272324 0.087702 0.094708 0.635702 0.206405 0.025084 0.132810 0.424828 0.126579 0.085796 0.362798 0.038628 0.156278 0.172644 0.632449 0.070591 0.007294 0.051952 0.870162 0.393078 0.490620 0.093424 0.022879 0.921691 0.071290 0.000276 0.006742 0.992147 0.001901 0.003337 0.002616 0.024268 0.000709 0.973476 0.001546 0.040291 0.011499 0.000413 0.947796 0.001004 0.000888 0.958164 0.039945 0.017459 0.118223 0.862111 0.002207 0.184898 0.370828 0.144379 0.299895 0.114314 0.029806 0.218321 0.637560 0.162392 0.110464 0.327481 0.399663 0.296538 0.280937 0.138180 0.284346 Consensus sequence: AAWTTMAAGTGGHTDH Alignment: HDADCCACTTRAAWTT -----CACCTD----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 15 Motif name: TFAP2A Original motif 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.118919 0.383784 0.248649 0.248649 0.102703 0.308108 0.329730 0.259459 0.297297 0.237838 0.362162 0.102703 0.286486 0.162162 0.491892 0.059459 0.102703 0.086486 0.740541 0.070270 0.048649 0.421622 0.427027 0.102703 Consensus sequence: GCCBBVRGS Reserve complement motif 0.048649 0.427027 0.421622 0.102703 0.102703 0.740541 0.086486 0.070270 0.286486 0.491892 0.162162 0.059459 0.297297 0.362162 0.237838 0.102703 0.102703 0.329730 0.308108 0.259459 0.118919 0.248649 0.383784 0.248649 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 Consensus sequence: SCMVBBGGC ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 15 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00010 Tcfap2b_secondary Original Motif Reverse Complement Forward 4 9 0.011555 Species: Mus musculus Original motif 0.325895 0.099601 0.286848 0.287657 0.177095 0.035123 0.260876 0.526906 0.344850 0.211117 0.015725 0.428308 0.128363 0.059965 0.777560 0.034112 0.048072 0.881624 0.024842 0.045462 0.072628 0.872650 0.011271 0.043451 0.057165 0.162157 0.347719 0.432959 0.015437 0.448405 0.428425 0.107733 0.446877 0.336374 0.099940 0.116809 0.090955 0.023004 0.848240 0.037801 0.040151 0.015072 0.901303 0.043473 0.087378 0.817019 0.027876 0.067727 0.532482 0.021469 0.266773 0.179276 0.325017 0.271661 0.138860 0.264463 0.203625 0.179490 0.143885 0.473001 Consensus sequence: DTWGCCKSMGGCRHH Reverse complement motif 0.473001 0.179490 0.143885 0.203625 0.264463 0.271661 0.138860 0.325017 0.179276 0.021469 0.266773 0.532482 0.087378 0.027876 0.817019 0.067727 0.040151 0.901303 0.015072 0.043473 0.090955 0.848240 0.023004 0.037801 0.116809 0.336374 0.099940 0.446877 0.015437 0.428425 0.448405 0.107733 0.432959 0.162157 0.347719 0.057165 0.072628 0.011271 0.872650 0.043451 0.048072 0.024842 0.881624 0.045462 0.128363 0.777560 0.059965 0.034112 0.428308 0.211117 0.015725 0.344850 0.526906 0.035123 0.260876 0.177095 0.287657 0.099601 0.286848 0.325895 Consensus sequence: HHKGCCYSRGGCWAD Alignment: HHKGCCYSRGGCWAD ---GCCBBVRGS--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00010 Tcfap2b_primary Original Motif Original Motif Forward 3 9 0.015045 Species: Mus musculus Original motif 0.241622 0.134036 0.195946 0.428396 0.170161 0.349277 0.064019 0.416543 0.037533 0.228173 0.717601 0.016693 0.007604 0.927737 0.058613 0.006046 0.002996 0.965706 0.002874 0.028425 0.004745 0.626301 0.026069 0.342885 0.022194 0.291409 0.272335 0.414062 0.589759 0.136946 0.247468 0.025828 0.342885 0.026069 0.626301 0.004745 0.028425 0.002874 0.965706 0.002996 0.006046 0.058613 0.927737 0.007604 0.016693 0.717601 0.228173 0.037533 0.664950 0.075306 0.151047 0.108696 0.315138 0.174615 0.172322 0.337924 Consensus sequence: DYGCCYBARGGCAH Reverse complement motif 0.337924 0.174615 0.172322 0.315138 0.108696 0.075306 0.151047 0.664950 0.016693 0.228173 0.717601 0.037533 0.006046 0.927737 0.058613 0.007604 0.028425 0.965706 0.002874 0.002996 0.342885 0.626301 0.026069 0.004745 0.025828 0.136946 0.247468 0.589759 0.414062 0.291409 0.272335 0.022194 0.004745 0.026069 0.626301 0.342885 0.002996 0.002874 0.965706 0.028425 0.007604 0.058613 0.927737 0.006046 0.037533 0.717601 0.228173 0.016693 0.416543 0.349277 0.064019 0.170161 0.428396 0.134036 0.195946 0.241622 Consensus sequence: HTGCCMTVKGGCMD Alignment: DYGCCYBARGGCAH --GCCBBVRGS--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00005 Tcfap2a_primary Original Motif Original Motif Forward 4 9 0.015153 Species: Mus musculus Original motif 0.422613 0.103833 0.119614 0.353939 0.249412 0.169205 0.202313 0.379071 0.229443 0.231233 0.068690 0.470634 0.013814 0.501744 0.463635 0.020806 0.006744 0.985507 0.003252 0.004497 0.001758 0.859562 0.001396 0.137285 0.005460 0.315890 0.186790 0.491861 0.040326 0.375312 0.497433 0.086929 0.491861 0.186790 0.315890 0.005460 0.137285 0.001396 0.859562 0.001758 0.004497 0.003252 0.985507 0.006744 0.020806 0.463635 0.501744 0.013814 0.348377 0.094358 0.419593 0.137673 0.559411 0.134625 0.133295 0.172668 0.331903 0.197670 0.240404 0.230023 Consensus sequence: WDHSCCYSRGGSRAD Reverse complement motif 0.230023 0.197670 0.240404 0.331903 0.172668 0.134625 0.133295 0.559411 0.348377 0.419593 0.094358 0.137673 0.020806 0.501744 0.463635 0.013814 0.004497 0.985507 0.003252 0.006744 0.137285 0.859562 0.001396 0.001758 0.005460 0.186790 0.315890 0.491861 0.040326 0.497433 0.375312 0.086929 0.491861 0.315890 0.186790 0.005460 0.001758 0.001396 0.859562 0.137285 0.006744 0.003252 0.985507 0.004497 0.013814 0.463635 0.501744 0.020806 0.470634 0.231233 0.068690 0.229443 0.379071 0.169205 0.202313 0.249412 0.353939 0.103833 0.119614 0.422613 Consensus sequence: DTMSCCKSMGGSHDW Alignment: WDHSCCYSRGGSRAD ---GCCBBVRGS--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00087 Tcfap2c_primary Original Motif Original Motif Backward 4 9 0.016909 Species: Mus musculus Original motif 0.453894 0.104785 0.095366 0.345954 0.232091 0.189298 0.180541 0.398071 0.233238 0.261214 0.065556 0.439992 0.012319 0.459636 0.511133 0.016912 0.008159 0.984661 0.002866 0.004314 0.001420 0.885962 0.001808 0.110810 0.005689 0.345363 0.111901 0.537046 0.035614 0.353586 0.534122 0.076679 0.537046 0.111901 0.345363 0.005689 0.110810 0.001808 0.885962 0.001420 0.004314 0.002866 0.984661 0.008159 0.016912 0.511133 0.459636 0.012319 0.313235 0.097541 0.435018 0.154206 0.570019 0.140594 0.123600 0.165788 0.326417 0.176576 0.220289 0.276718 Consensus sequence: WHHSCCYSRGGSDAD Reverse complement motif 0.276718 0.176576 0.220289 0.326417 0.165788 0.140594 0.123600 0.570019 0.313235 0.435018 0.097541 0.154206 0.016912 0.459636 0.511133 0.012319 0.004314 0.984661 0.002866 0.008159 0.110810 0.885962 0.001808 0.001420 0.005689 0.111901 0.345363 0.537046 0.035614 0.534122 0.353586 0.076679 0.537046 0.345363 0.111901 0.005689 0.001420 0.001808 0.885962 0.110810 0.008159 0.002866 0.984661 0.004314 0.012319 0.511133 0.459636 0.016912 0.439992 0.261214 0.065556 0.233238 0.398071 0.189298 0.180541 0.232091 0.345954 0.104785 0.095366 0.453894 Consensus sequence: DTHSCCKSMGGSHHW Alignment: WHHSCCYSRGGSDAD ---GCCBBVRGS--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00087 Tcfap2c_secondary Original Motif Original Motif Forward 3 9 0.017026 Species: Mus musculus Original motif 0.203043 0.348071 0.227399 0.221487 0.179291 0.396392 0.144383 0.279934 0.093421 0.033540 0.859005 0.014034 0.181373 0.693724 0.031481 0.093422 0.019065 0.840720 0.011622 0.128593 0.197421 0.501100 0.087606 0.213873 0.457286 0.063305 0.239499 0.239911 0.508984 0.143325 0.116228 0.231463 0.213873 0.087606 0.501100 0.197421 0.128593 0.011622 0.840720 0.019065 0.093422 0.031481 0.693724 0.181373 0.014034 0.859005 0.033540 0.093421 0.477741 0.059425 0.165356 0.297478 0.278658 0.136011 0.311291 0.274039 Consensus sequence: BHGCCCDAGGGCWD Reverse complement motif 0.278658 0.311291 0.136011 0.274039 0.297478 0.059425 0.165356 0.477741 0.014034 0.033540 0.859005 0.093421 0.093422 0.693724 0.031481 0.181373 0.128593 0.840720 0.011622 0.019065 0.213873 0.501100 0.087606 0.197421 0.231463 0.143325 0.116228 0.508984 0.239911 0.063305 0.239499 0.457286 0.197421 0.087606 0.501100 0.213873 0.019065 0.011622 0.840720 0.128593 0.181373 0.031481 0.693724 0.093422 0.093421 0.859005 0.033540 0.014034 0.179291 0.144383 0.396392 0.279934 0.203043 0.227399 0.348071 0.221487 Consensus sequence: HWGCCCTDGGGCDB Alignment: BHGCCCDAGGGCWD --GCCBBVRGS--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00028 Tcfap2e_primary Original Motif Original Motif Forward 4 9 0.019885 Species: Mus musculus Original motif 0.369517 0.172742 0.163174 0.294567 0.260541 0.211816 0.194359 0.333284 0.292862 0.281323 0.073013 0.352801 0.011777 0.272676 0.697188 0.018359 0.005160 0.983588 0.005917 0.005335 0.002256 0.960488 0.005733 0.031524 0.003735 0.283214 0.123762 0.589290 0.024383 0.379981 0.542999 0.052638 0.589290 0.123762 0.283214 0.003735 0.031524 0.005733 0.960488 0.002256 0.005335 0.005917 0.983588 0.005160 0.018359 0.697188 0.272676 0.011777 0.328286 0.093173 0.334133 0.244408 0.563777 0.145250 0.140240 0.150733 0.263206 0.222321 0.242153 0.272320 Consensus sequence: HHHGCCTSAGGCDAD Reverse complement motif 0.272320 0.222321 0.242153 0.263206 0.150733 0.145250 0.140240 0.563777 0.328286 0.334133 0.093173 0.244408 0.018359 0.272676 0.697188 0.011777 0.005335 0.983588 0.005917 0.005160 0.031524 0.960488 0.005733 0.002256 0.003735 0.123762 0.283214 0.589290 0.024383 0.542999 0.379981 0.052638 0.589290 0.283214 0.123762 0.003735 0.002256 0.005733 0.960488 0.031524 0.005160 0.005917 0.983588 0.005335 0.011777 0.697188 0.272676 0.018359 0.352801 0.281323 0.073013 0.292862 0.333284 0.211816 0.194359 0.260541 0.294567 0.172742 0.163174 0.369517 Consensus sequence: DTHGCCTSAGGCHHH Alignment: HHHGCCTSAGGCDAD ---GCCBBVRGS--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00000 Smad3_secondary Reverse Complement Reverse Complement Backward 9 9 0.020368 Species: Mus musculus Original motif 0.150668 0.131779 0.245665 0.471887 0.316817 0.287314 0.150829 0.245040 0.256473 0.409066 0.109700 0.224761 0.210646 0.220222 0.345010 0.224122 0.166679 0.508939 0.081676 0.242705 0.049351 0.759380 0.088489 0.102780 0.047598 0.785546 0.121957 0.044898 0.004606 0.944933 0.034696 0.015764 0.040252 0.050652 0.890382 0.018713 0.003038 0.913699 0.022449 0.060814 0.028672 0.941477 0.012276 0.017575 0.635243 0.139731 0.110495 0.114531 0.240016 0.385948 0.182848 0.191188 0.210430 0.274127 0.085171 0.430272 0.088118 0.454598 0.208989 0.248295 0.181269 0.265028 0.149023 0.404680 0.101070 0.252682 0.368542 0.277706 Consensus sequence: DHHBCCCCGCCAHHBHB Reverse complement motif 0.101070 0.368542 0.252682 0.277706 0.404680 0.265028 0.149023 0.181269 0.088118 0.208989 0.454598 0.248295 0.430272 0.274127 0.085171 0.210430 0.240016 0.182848 0.385948 0.191188 0.114531 0.139731 0.110495 0.635243 0.028672 0.012276 0.941477 0.017575 0.003038 0.022449 0.913699 0.060814 0.040252 0.890382 0.050652 0.018713 0.004606 0.034696 0.944933 0.015764 0.047598 0.121957 0.785546 0.044898 0.049351 0.088489 0.759380 0.102780 0.166679 0.081676 0.508939 0.242705 0.210646 0.345010 0.220222 0.224122 0.256473 0.109700 0.409066 0.224761 0.245040 0.287314 0.150829 0.316817 0.471887 0.131779 0.245665 0.150668 Consensus sequence: BHBHDTGGCGGGGBDHD Alignment: BHBHDTGGCGGGGBDHD SCMVBBGGC-------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00003 E2F3_secondary Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 9 0.021706 Species: Mus musculus Original motif 0.265095 0.268267 0.222997 0.243641 0.200676 0.255224 0.341788 0.202312 0.178293 0.362068 0.104617 0.355022 0.351308 0.049870 0.101991 0.496832 0.114543 0.445994 0.008584 0.430879 0.113589 0.020854 0.846807 0.018750 0.004661 0.132010 0.859240 0.004088 0.030896 0.962007 0.004017 0.003080 0.006194 0.002090 0.965564 0.026152 0.008009 0.911831 0.077009 0.003151 0.029519 0.830096 0.011333 0.129053 0.764710 0.016406 0.088627 0.130257 0.530327 0.265186 0.100721 0.103765 0.331689 0.153148 0.308482 0.206682 0.332536 0.311591 0.232118 0.123755 0.175189 0.233372 0.375563 0.215876 0.183884 0.334856 0.283993 0.197267 Consensus sequence: HBHWYGGCGCCAMDVBB Reverse complement motif 0.183884 0.283993 0.334856 0.197267 0.175189 0.375563 0.233372 0.215876 0.123755 0.311591 0.232118 0.332536 0.206682 0.153148 0.308482 0.331689 0.103765 0.265186 0.100721 0.530327 0.130257 0.016406 0.088627 0.764710 0.029519 0.011333 0.830096 0.129053 0.008009 0.077009 0.911831 0.003151 0.006194 0.965564 0.002090 0.026152 0.030896 0.004017 0.962007 0.003080 0.004661 0.859240 0.132010 0.004088 0.113589 0.846807 0.020854 0.018750 0.114543 0.008584 0.445994 0.430879 0.496832 0.049870 0.101991 0.351308 0.178293 0.104617 0.362068 0.355022 0.200676 0.341788 0.255224 0.202312 0.265095 0.222997 0.268267 0.243641 Consensus sequence: BBBDYTGGCGCCKWDBD Alignment: BBBDYTGGCGCCKWDBD SCMVBBGGC-------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00005 Tcfap2a_secondary Original Motif Original Motif Forward 3 9 0.023478 Species: Mus musculus Original motif 0.198427 0.243196 0.159241 0.399136 0.267754 0.388187 0.116811 0.227248 0.448284 0.056403 0.414623 0.080691 0.031469 0.826323 0.055436 0.086772 0.035527 0.756642 0.022985 0.184845 0.127338 0.316078 0.155806 0.400778 0.135021 0.313650 0.287760 0.263570 0.418892 0.082297 0.068352 0.430460 0.201062 0.044735 0.711358 0.042845 0.038934 0.022320 0.903763 0.034982 0.201790 0.065554 0.460526 0.272130 0.006890 0.786923 0.061853 0.144334 0.460666 0.103658 0.196452 0.239224 0.092272 0.204611 0.390375 0.312742 Consensus sequence: HHRCCBBWGGDCDB Reverse complement motif 0.092272 0.390375 0.204611 0.312742 0.239224 0.103658 0.196452 0.460666 0.006890 0.061853 0.786923 0.144334 0.201790 0.460526 0.065554 0.272130 0.038934 0.903763 0.022320 0.034982 0.201062 0.711358 0.044735 0.042845 0.430460 0.082297 0.068352 0.418892 0.135021 0.287760 0.313650 0.263570 0.400778 0.316078 0.155806 0.127338 0.035527 0.022985 0.756642 0.184845 0.031469 0.055436 0.826323 0.086772 0.080691 0.056403 0.414623 0.448284 0.267754 0.116811 0.388187 0.227248 0.399136 0.243196 0.159241 0.198427 Consensus sequence: BDGHCCWBVGGKDH Alignment: HHRCCBBWGGDCDB --GCCBBVRGS--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00093 Klf7_secondary Original Motif Original Motif Backward 1 9 0.026642 Species: Mus musculus Original motif 0.386646 0.259902 0.253791 0.099661 0.421388 0.207885 0.231243 0.139483 0.257377 0.193145 0.314893 0.234586 0.061783 0.371675 0.214607 0.351935 0.610889 0.007047 0.106287 0.275777 0.181496 0.007153 0.071824 0.739527 0.759998 0.222078 0.005710 0.012214 0.003816 0.977244 0.004175 0.014765 0.037124 0.002582 0.946042 0.014252 0.009124 0.982167 0.005065 0.003644 0.007023 0.980091 0.008044 0.004842 0.005328 0.930742 0.002828 0.061102 0.389804 0.299794 0.050877 0.259525 0.507764 0.121280 0.163196 0.207759 0.296269 0.307462 0.196230 0.200039 0.301339 0.231088 0.150226 0.317347 0.185149 0.176068 0.292944 0.345838 Consensus sequence: VVDBATACGCCCHAHHD Reverse complement motif 0.345838 0.176068 0.292944 0.185149 0.317347 0.231088 0.150226 0.301339 0.296269 0.196230 0.307462 0.200039 0.207759 0.121280 0.163196 0.507764 0.259525 0.299794 0.050877 0.389804 0.005328 0.002828 0.930742 0.061102 0.007023 0.008044 0.980091 0.004842 0.009124 0.005065 0.982167 0.003644 0.037124 0.946042 0.002582 0.014252 0.003816 0.004175 0.977244 0.014765 0.012214 0.222078 0.005710 0.759998 0.739527 0.007153 0.071824 0.181496 0.275777 0.007047 0.106287 0.610889 0.061783 0.214607 0.371675 0.351935 0.257377 0.314893 0.193145 0.234586 0.139483 0.207885 0.231243 0.421388 0.099661 0.259902 0.253791 0.386646 Consensus sequence: DHDTHGGGCGTATBHBB Alignment: VVDBATACGCCCHAHHD --------GCCBBVRGS ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 16 Motif name: SP1 Original motif 0.000000 0.914286 0.028571 0.057143 0.000000 0.857143 0.028571 0.114286 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.114286 0.771429 0.000000 0.114286 0.057143 0.142857 0.428571 0.371429 0.000000 0.800000 0.028571 0.171429 0.028571 0.885714 0.000000 0.085714 0.000000 0.685714 0.085714 0.228571 0.171429 0.714286 0.000000 0.114286 0.085714 0.742857 0.085714 0.085714 Consensus sequence: CCCCKCCCCC Reserve complement motif 0.085714 0.085714 0.742857 0.085714 0.171429 0.000000 0.714286 0.114286 0.000000 0.085714 0.685714 0.228571 0.028571 0.000000 0.885714 0.085714 0.000000 0.028571 0.800000 0.171429 0.057143 0.428571 0.142857 0.371429 0.114286 0.000000 0.771429 0.114286 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.028571 0.857143 0.114286 0.000000 0.028571 0.914286 0.057143 Consensus sequence: GGGGGYGGGG ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 16 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00021 Zfp281_primary Original Motif Original Motif Backward 4 10 0.023102 Species: Mus musculus Original motif 0.201535 0.165213 0.201324 0.431929 0.136153 0.443451 0.179132 0.241264 0.263149 0.555137 0.067983 0.113731 0.142183 0.737634 0.045722 0.074461 0.044982 0.884112 0.045356 0.025549 0.246434 0.590578 0.022655 0.140333 0.123049 0.591257 0.033072 0.252622 0.018153 0.944742 0.010254 0.026851 0.035459 0.953844 0.003988 0.006709 0.020000 0.954344 0.005966 0.019690 0.015299 0.964390 0.006755 0.013557 0.028565 0.936152 0.011660 0.023623 0.300127 0.517309 0.029700 0.152863 0.159063 0.513443 0.051834 0.275660 0.158172 0.647055 0.133256 0.061516 Consensus sequence: DBCCCCCCCCCCMYC Reverse complement motif 0.158172 0.133256 0.647055 0.061516 0.159063 0.051834 0.513443 0.275660 0.300127 0.029700 0.517309 0.152863 0.028565 0.011660 0.936152 0.023623 0.015299 0.006755 0.964390 0.013557 0.020000 0.005966 0.954344 0.019690 0.035459 0.003988 0.953844 0.006709 0.018153 0.010254 0.944742 0.026851 0.123049 0.033072 0.591257 0.252622 0.246434 0.022655 0.590578 0.140333 0.044982 0.045356 0.884112 0.025549 0.142183 0.045722 0.737634 0.074461 0.263149 0.067983 0.555137 0.113731 0.136153 0.179132 0.443451 0.241264 0.431929 0.165213 0.201324 0.201535 Consensus sequence: GKRGGGGGGGGGGBD Alignment: DBCCCCCCCCCCMYC --CCCCKCCCCC--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00093 Klf7_primary Original Motif Original Motif Backward 3 10 0.030321 Species: Mus musculus Original motif 0.204514 0.198353 0.171218 0.425915 0.167188 0.296785 0.246082 0.289946 0.267330 0.148001 0.398674 0.185994 0.549386 0.060167 0.337100 0.053347 0.050746 0.900013 0.022169 0.027073 0.037905 0.920332 0.008360 0.033403 0.410356 0.566702 0.016267 0.006675 0.009526 0.982354 0.001060 0.007060 0.204292 0.001084 0.748567 0.046056 0.003955 0.988490 0.002821 0.004735 0.004264 0.988826 0.004311 0.002598 0.002758 0.929549 0.001244 0.066448 0.260332 0.421683 0.024720 0.293265 0.184798 0.247697 0.085237 0.482268 0.347537 0.197344 0.139961 0.315159 0.255281 0.166620 0.242297 0.335802 Consensus sequence: HBDRCCMCGCCCHHHD Reverse complement motif 0.335802 0.166620 0.242297 0.255281 0.315159 0.197344 0.139961 0.347537 0.482268 0.247697 0.085237 0.184798 0.260332 0.024720 0.421683 0.293265 0.002758 0.001244 0.929549 0.066448 0.004264 0.004311 0.988826 0.002598 0.003955 0.002821 0.988490 0.004735 0.204292 0.748567 0.001084 0.046056 0.009526 0.001060 0.982354 0.007060 0.410356 0.016267 0.566702 0.006675 0.037905 0.008360 0.920332 0.033403 0.050746 0.022169 0.900013 0.027073 0.053347 0.060167 0.337100 0.549386 0.267330 0.398674 0.148001 0.185994 0.167188 0.246082 0.296785 0.289946 0.425915 0.198353 0.171218 0.204514 Consensus sequence: DHHDGGGCGRGGKHBH Alignment: HBDRCCMCGCCCHHHD ----CCCCKCCCCC-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00033 Zfp410_secondary Reverse Complement Reverse Complement Forward 5 10 0.032301 Species: Mus musculus Original motif 0.162979 0.284781 0.237433 0.314807 0.182449 0.447584 0.069464 0.300502 0.298973 0.261014 0.213211 0.226802 0.136039 0.433062 0.144274 0.286625 0.180084 0.395933 0.158565 0.265418 0.069354 0.748510 0.068898 0.113238 0.060485 0.717828 0.075333 0.146354 0.023280 0.071762 0.645500 0.259457 0.166896 0.749762 0.062730 0.020612 0.050401 0.775248 0.089072 0.085279 0.103847 0.767557 0.068804 0.059791 0.064815 0.748318 0.114588 0.072280 0.340921 0.071942 0.242981 0.344157 0.301967 0.263512 0.165927 0.268594 0.479800 0.222955 0.118441 0.178803 0.229469 0.283621 0.143099 0.343811 0.261733 0.180191 0.169905 0.388170 Consensus sequence: BHHBHCCGCCCCDHHHH Reverse complement motif 0.388170 0.180191 0.169905 0.261733 0.343811 0.283621 0.143099 0.229469 0.178803 0.222955 0.118441 0.479800 0.268594 0.263512 0.165927 0.301967 0.344157 0.071942 0.242981 0.340921 0.064815 0.114588 0.748318 0.072280 0.103847 0.068804 0.767557 0.059791 0.050401 0.089072 0.775248 0.085279 0.166896 0.062730 0.749762 0.020612 0.023280 0.645500 0.071762 0.259457 0.060485 0.075333 0.717828 0.146354 0.069354 0.068898 0.748510 0.113238 0.180084 0.158565 0.395933 0.265418 0.136039 0.144274 0.433062 0.286625 0.226802 0.261014 0.213211 0.298973 0.182449 0.069464 0.447584 0.300502 0.314807 0.284781 0.237433 0.162979 Consensus sequence: HHHHDGGGGCGGDBHDV Alignment: HHHHDGGGGCGGDBHDV ----GGGGGYGGGG--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00099 Ascl2_secondary Reverse Complement Reverse Complement Forward 3 10 0.034097 Species: Mus musculus Original motif 0.114462 0.345602 0.289353 0.250583 0.192593 0.250844 0.116250 0.440313 0.338838 0.304929 0.195843 0.160390 0.312051 0.115094 0.162465 0.410390 0.143975 0.600492 0.123348 0.132185 0.078751 0.715072 0.135182 0.070995 0.146191 0.685571 0.069799 0.098439 0.137287 0.646078 0.126428 0.090207 0.335099 0.092260 0.371510 0.201131 0.033090 0.631176 0.074278 0.261456 0.117516 0.619336 0.100946 0.162202 0.114769 0.627362 0.089839 0.168031 0.195787 0.252057 0.220803 0.331353 0.415355 0.120731 0.281372 0.182542 0.111178 0.217079 0.245769 0.425974 0.191517 0.296952 0.153370 0.358162 Consensus sequence: BHVDCCCCDCCCBDBH Reverse complement motif 0.358162 0.296952 0.153370 0.191517 0.425974 0.217079 0.245769 0.111178 0.182542 0.120731 0.281372 0.415355 0.331353 0.252057 0.220803 0.195787 0.114769 0.089839 0.627362 0.168031 0.117516 0.100946 0.619336 0.162202 0.033090 0.074278 0.631176 0.261456 0.335099 0.371510 0.092260 0.201131 0.137287 0.126428 0.646078 0.090207 0.146191 0.069799 0.685571 0.098439 0.078751 0.135182 0.715072 0.070995 0.143975 0.123348 0.600492 0.132185 0.410390 0.115094 0.162465 0.312051 0.160390 0.304929 0.195843 0.338838 0.440313 0.250844 0.116250 0.192593 0.114462 0.289353 0.345602 0.250583 Consensus sequence: HVDVGGGHGGGGDBHB Alignment: HVDVGGGHGGGGDBHB --GGGGGYGGGG---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00043 Bcl6b_secondary Reverse Complement Reverse Complement Forward 5 10 0.035105 Species: Mus musculus Original motif 0.316572 0.278382 0.152556 0.252490 0.167141 0.257034 0.259894 0.315931 0.175523 0.325956 0.259996 0.238525 0.165052 0.385677 0.239449 0.209822 0.069489 0.782718 0.072454 0.075339 0.049943 0.800636 0.031988 0.117433 0.223382 0.060306 0.552691 0.163621 0.072944 0.818252 0.034406 0.074398 0.070535 0.845127 0.062712 0.021626 0.031035 0.859354 0.055424 0.054187 0.063668 0.798503 0.067274 0.070554 0.348488 0.030697 0.197179 0.423636 0.307220 0.256470 0.181009 0.255301 0.460933 0.285057 0.090258 0.163752 0.315798 0.228431 0.171135 0.284637 0.374527 0.268328 0.198810 0.158335 Consensus sequence: HBBBCCGCCCCWHHHV Reverse complement motif 0.158335 0.268328 0.198810 0.374527 0.284637 0.228431 0.171135 0.315798 0.163752 0.285057 0.090258 0.460933 0.255301 0.256470 0.181009 0.307220 0.423636 0.030697 0.197179 0.348488 0.063668 0.067274 0.798503 0.070554 0.031035 0.055424 0.859354 0.054187 0.070535 0.062712 0.845127 0.021626 0.072944 0.034406 0.818252 0.074398 0.223382 0.552691 0.060306 0.163621 0.049943 0.031988 0.800636 0.117433 0.069489 0.072454 0.782718 0.075339 0.165052 0.239449 0.385677 0.209822 0.175523 0.259996 0.325956 0.238525 0.315931 0.257034 0.259894 0.167141 0.252490 0.278382 0.152556 0.316572 Consensus sequence: BHHHWGGGGCGGBBVH Alignment: BHHHWGGGGCGGBBVH ----GGGGGYGGGG-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 7 10 0.039044 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK ------GGGGGYGGGG------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 7 10 0.039336 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV -------GGGGGYGGGG------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00000 Smad3_secondary Original Motif Original Motif Backward 4 10 0.041386 Species: Mus musculus Original motif 0.150668 0.131779 0.245665 0.471887 0.316817 0.287314 0.150829 0.245040 0.256473 0.409066 0.109700 0.224761 0.210646 0.220222 0.345010 0.224122 0.166679 0.508939 0.081676 0.242705 0.049351 0.759380 0.088489 0.102780 0.047598 0.785546 0.121957 0.044898 0.004606 0.944933 0.034696 0.015764 0.040252 0.050652 0.890382 0.018713 0.003038 0.913699 0.022449 0.060814 0.028672 0.941477 0.012276 0.017575 0.635243 0.139731 0.110495 0.114531 0.240016 0.385948 0.182848 0.191188 0.210430 0.274127 0.085171 0.430272 0.088118 0.454598 0.208989 0.248295 0.181269 0.265028 0.149023 0.404680 0.101070 0.252682 0.368542 0.277706 Consensus sequence: DHHBCCCCGCCAHHBHB Reverse complement motif 0.101070 0.368542 0.252682 0.277706 0.404680 0.265028 0.149023 0.181269 0.088118 0.208989 0.454598 0.248295 0.430272 0.274127 0.085171 0.210430 0.240016 0.182848 0.385948 0.191188 0.114531 0.139731 0.110495 0.635243 0.028672 0.012276 0.941477 0.017575 0.003038 0.022449 0.913699 0.060814 0.040252 0.890382 0.050652 0.018713 0.004606 0.034696 0.944933 0.015764 0.047598 0.121957 0.785546 0.044898 0.049351 0.088489 0.759380 0.102780 0.166679 0.081676 0.508939 0.242705 0.210646 0.345010 0.220222 0.224122 0.256473 0.109700 0.409066 0.224761 0.245040 0.287314 0.150829 0.316817 0.471887 0.131779 0.245665 0.150668 Consensus sequence: BHBHDTGGCGGGGBDHD Alignment: DHHBCCCCGCCAHHBHB ----CCCCKCCCCC--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00022 Zfp740_primary Original Motif Original Motif Forward 4 10 0.041895 Species: Mus musculus Original motif 0.136946 0.396508 0.135309 0.331236 0.185528 0.417538 0.215409 0.181525 0.171276 0.341901 0.172832 0.313991 0.145641 0.590572 0.146376 0.117412 0.138035 0.660416 0.114016 0.087533 0.222728 0.750532 0.007528 0.019212 0.024633 0.963314 0.001894 0.010159 0.009557 0.979956 0.000642 0.009844 0.010416 0.977424 0.000541 0.011619 0.026401 0.956740 0.001544 0.015314 0.195502 0.755959 0.011060 0.037480 0.491291 0.364785 0.025613 0.118311 0.305153 0.398160 0.071680 0.225008 0.253497 0.232647 0.213246 0.300610 0.156964 0.297876 0.144683 0.400477 0.179549 0.292514 0.319462 0.208475 Consensus sequence: HVBCCCCCCCCMHHHB Reverse complement motif 0.179549 0.319462 0.292514 0.208475 0.400477 0.297876 0.144683 0.156964 0.300610 0.232647 0.213246 0.253497 0.305153 0.071680 0.398160 0.225008 0.118311 0.364785 0.025613 0.491291 0.195502 0.011060 0.755959 0.037480 0.026401 0.001544 0.956740 0.015314 0.010416 0.000541 0.977424 0.011619 0.009557 0.000642 0.979956 0.009844 0.024633 0.001894 0.963314 0.010159 0.222728 0.007528 0.750532 0.019212 0.138035 0.114016 0.660416 0.087533 0.145641 0.146376 0.590572 0.117412 0.171276 0.172832 0.341901 0.313991 0.185528 0.215409 0.417538 0.181525 0.136946 0.135309 0.396508 0.331236 Consensus sequence: BHHDYGGGGGGGGBVD Alignment: HVBCCCCCCCCMHHHB ---CCCCKCCCCC--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00002 Sp4_primary Original Motif Original Motif Backward 6 10 0.042071 Species: Mus musculus Original motif 0.155386 0.223380 0.374454 0.246780 0.247106 0.159582 0.345111 0.248201 0.238889 0.258354 0.165304 0.337454 0.255612 0.489586 0.051621 0.203182 0.450100 0.545383 0.001071 0.003447 0.003704 0.991007 0.002456 0.002833 0.035504 0.001814 0.928129 0.034553 0.001494 0.991406 0.003414 0.003686 0.003045 0.990628 0.005182 0.001145 0.000990 0.963237 0.001215 0.034557 0.148016 0.838396 0.000666 0.012922 0.014261 0.905847 0.007200 0.072692 0.083394 0.270068 0.058368 0.588170 0.149141 0.286783 0.142802 0.421274 0.204851 0.347195 0.253356 0.194597 0.184442 0.299908 0.194408 0.321242 0.125793 0.380109 0.245318 0.248780 Consensus sequence: BDHHMCGCCCCCTHVBB Reverse complement motif 0.125793 0.245318 0.380109 0.248780 0.321242 0.299908 0.194408 0.184442 0.204851 0.253356 0.347195 0.194597 0.421274 0.286783 0.142802 0.149141 0.588170 0.270068 0.058368 0.083394 0.014261 0.007200 0.905847 0.072692 0.148016 0.000666 0.838396 0.012922 0.000990 0.001215 0.963237 0.034557 0.003045 0.005182 0.990628 0.001145 0.001494 0.003414 0.991406 0.003686 0.035504 0.928129 0.001814 0.034553 0.003704 0.002456 0.991007 0.002833 0.450100 0.001071 0.545383 0.003447 0.255612 0.051621 0.489586 0.203182 0.337454 0.258354 0.165304 0.238889 0.247106 0.345111 0.159582 0.248201 0.155386 0.374454 0.223380 0.246780 Consensus sequence: BVVHAGGGGGCGRDHHB Alignment: BDHHMCGCCCCCTHVBB --CCCCKCCCCC----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 17 Motif name: RXRAVDR Original motif 0.300000 0.000000 0.700000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.900000 0.100000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.900000 0.000000 0.100000 0.900000 0.000000 0.100000 0.000000 0.400000 0.200000 0.000000 0.400000 0.200000 0.400000 0.200000 0.200000 0.200000 0.000000 0.800000 0.000000 0.500000 0.000000 0.500000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.100000 0.000000 0.000000 0.900000 0.000000 0.900000 0.000000 0.100000 0.700000 0.100000 0.200000 0.000000 Consensus sequence: GGGTCAWBGRGTTCA Reserve complement motif 0.000000 0.100000 0.200000 0.700000 0.000000 0.000000 0.900000 0.100000 0.900000 0.000000 0.000000 0.100000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.500000 0.500000 0.200000 0.800000 0.000000 0.000000 0.200000 0.200000 0.400000 0.200000 0.400000 0.200000 0.000000 0.400000 0.000000 0.000000 0.100000 0.900000 0.000000 0.000000 0.900000 0.100000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.900000 0.000000 0.100000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.300000 0.700000 0.000000 0.000000 Consensus sequence: TGAACKCBWTGACCC ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 17 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00037 Zfp105_secondary Original Motif Original Motif Backward 1 15 0.063164 Species: Mus musculus Original motif 0.266678 0.210793 0.270357 0.252172 0.060513 0.387388 0.139940 0.412159 0.129835 0.094669 0.581455 0.194041 0.222891 0.216518 0.374389 0.186202 0.051470 0.183173 0.261264 0.504093 0.033295 0.098623 0.075218 0.792864 0.159222 0.757734 0.066213 0.016831 0.909619 0.041577 0.030716 0.018087 0.790897 0.139370 0.044203 0.025531 0.016549 0.121838 0.111434 0.750178 0.747907 0.043147 0.179106 0.029840 0.696917 0.099750 0.098316 0.105017 0.132206 0.270741 0.232896 0.364158 0.140809 0.132229 0.164933 0.562029 0.054822 0.313780 0.179755 0.451644 0.144402 0.139143 0.255283 0.461171 0.263219 0.160957 0.382446 0.193379 Consensus sequence: DYGVKTCAATAABTYDD Reverse complement motif 0.263219 0.382446 0.160957 0.193379 0.461171 0.139143 0.255283 0.144402 0.451644 0.313780 0.179755 0.054822 0.562029 0.132229 0.164933 0.140809 0.364158 0.270741 0.232896 0.132206 0.105017 0.099750 0.098316 0.696917 0.029840 0.043147 0.179106 0.747907 0.750178 0.121838 0.111434 0.016549 0.025531 0.139370 0.044203 0.790897 0.018087 0.041577 0.030716 0.909619 0.159222 0.066213 0.757734 0.016831 0.792864 0.098623 0.075218 0.033295 0.504093 0.183173 0.261264 0.051470 0.222891 0.374389 0.216518 0.186202 0.129835 0.581455 0.094669 0.194041 0.412159 0.387388 0.139940 0.060513 0.266678 0.270357 0.210793 0.252172 Consensus sequence: HDMAVTTATTGARVCMH Alignment: DYGVKTCAATAABTYDD --GGGTCAWBGRGTTCA ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00044 Mafk_primary Reverse Complement Original Motif Backward 1 15 0.063967 Species: Mus musculus Original motif 0.245931 0.193118 0.199428 0.361523 0.489106 0.078574 0.157014 0.275306 0.744659 0.025715 0.102440 0.127186 0.677561 0.030532 0.064134 0.227772 0.621949 0.037389 0.034818 0.305844 0.394828 0.100590 0.123295 0.381287 0.040491 0.082155 0.007425 0.869929 0.023425 0.010118 0.934562 0.031895 0.108761 0.847231 0.005930 0.038078 0.049587 0.025925 0.010216 0.914271 0.048851 0.008289 0.821725 0.121135 0.919694 0.018019 0.017253 0.045033 0.013536 0.716811 0.037362 0.232291 0.148097 0.100721 0.092846 0.658336 0.185674 0.220883 0.168608 0.424835 Consensus sequence: DWAAAWTGCTGACTH Reverse complement motif 0.424835 0.220883 0.168608 0.185674 0.658336 0.100721 0.092846 0.148097 0.013536 0.037362 0.716811 0.232291 0.045033 0.018019 0.017253 0.919694 0.048851 0.821725 0.008289 0.121135 0.914271 0.025925 0.010216 0.049587 0.108761 0.005930 0.847231 0.038078 0.023425 0.934562 0.010118 0.031895 0.869929 0.082155 0.007425 0.040491 0.381287 0.100590 0.123295 0.394828 0.305844 0.037389 0.034818 0.621949 0.227772 0.030532 0.064134 0.677561 0.127186 0.025715 0.102440 0.744659 0.275306 0.078574 0.157014 0.489106 0.361523 0.193118 0.199428 0.245931 Consensus sequence: HAGTCAGCAWTTTWD Alignment: HAGTCAGCAWTTTWD TGAACKCBWTGACCC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_primaryOriginal Motif Original Motif Forward 9 15 0.068282 Species: Mus musculus Original motif 0.204923 0.208846 0.365383 0.220848 0.294304 0.300143 0.167287 0.238266 0.109711 0.619514 0.117379 0.153396 0.178979 0.378580 0.230177 0.212264 0.159594 0.542602 0.118178 0.179627 0.125206 0.430074 0.151826 0.292894 0.097692 0.709845 0.116956 0.075506 0.148292 0.565912 0.037632 0.248164 0.077951 0.034190 0.855503 0.032356 0.001657 0.001061 0.971877 0.025405 0.001926 0.001084 0.991712 0.005278 0.033031 0.012001 0.057796 0.897171 0.002723 0.002647 0.993348 0.001281 0.003261 0.000963 0.987199 0.008577 0.000611 0.090925 0.074857 0.833608 0.015299 0.978878 0.004949 0.000874 0.013368 0.600902 0.033485 0.352245 0.231949 0.149575 0.118804 0.499672 0.267580 0.186002 0.371242 0.175176 0.264884 0.223483 0.110082 0.401551 0.221365 0.170121 0.179559 0.428955 0.112997 0.692930 0.139981 0.054092 0.460305 0.207883 0.155111 0.176702 Consensus sequence: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH Reverse complement motif 0.176702 0.207883 0.155111 0.460305 0.112997 0.139981 0.692930 0.054092 0.428955 0.170121 0.179559 0.221365 0.401551 0.223483 0.110082 0.264884 0.267580 0.371242 0.186002 0.175176 0.499672 0.149575 0.118804 0.231949 0.013368 0.033485 0.600902 0.352245 0.015299 0.004949 0.978878 0.000874 0.833608 0.090925 0.074857 0.000611 0.003261 0.987199 0.000963 0.008577 0.002723 0.993348 0.002647 0.001281 0.897171 0.012001 0.057796 0.033031 0.001926 0.991712 0.001084 0.005278 0.001657 0.971877 0.001061 0.025405 0.077951 0.855503 0.034190 0.032356 0.148292 0.037632 0.565912 0.248164 0.097692 0.116956 0.709845 0.075506 0.125206 0.151826 0.430074 0.292894 0.159594 0.118178 0.542602 0.179627 0.178979 0.230177 0.378580 0.212264 0.109711 0.117379 0.619514 0.153396 0.294304 0.167287 0.300143 0.238266 0.204923 0.365383 0.208846 0.220848 Consensus sequence: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB Alignment: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH --------GGGTCAWBGRGTTCA ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v015681_primaryReverse Complement Original Motif Forward 2 15 0.069950 Species: Mus musculus Original motif 0.472795 0.179227 0.091251 0.256726 0.036521 0.159743 0.204840 0.598896 0.164582 0.312805 0.221324 0.301289 0.237069 0.249050 0.293048 0.220833 0.401949 0.225181 0.229401 0.143469 0.161422 0.494334 0.252207 0.092036 0.252940 0.177721 0.369400 0.199939 0.119630 0.024651 0.849920 0.005798 0.000962 0.002398 0.990616 0.006023 0.937852 0.027016 0.034535 0.000597 0.008963 0.987756 0.000629 0.002652 0.001584 0.992898 0.002349 0.003169 0.956822 0.027342 0.002484 0.013352 0.009873 0.987759 0.000988 0.001381 0.016397 0.980856 0.000369 0.002378 0.081761 0.758555 0.038572 0.121112 0.371713 0.091838 0.448027 0.088423 0.111617 0.121913 0.683885 0.082585 0.334562 0.102916 0.436488 0.126034 0.210362 0.101261 0.238339 0.450037 0.169041 0.271583 0.320799 0.238576 0.140316 0.049885 0.735236 0.074563 Consensus sequence: HTBVVVDGGACCACCCRGRDBG Reverse complement motif 0.140316 0.735236 0.049885 0.074563 0.169041 0.320799 0.271583 0.238576 0.450037 0.101261 0.238339 0.210362 0.334562 0.436488 0.102916 0.126034 0.111617 0.683885 0.121913 0.082585 0.371713 0.448027 0.091838 0.088423 0.081761 0.038572 0.758555 0.121112 0.016397 0.000369 0.980856 0.002378 0.009873 0.000988 0.987759 0.001381 0.013352 0.027342 0.002484 0.956822 0.001584 0.002349 0.992898 0.003169 0.008963 0.000629 0.987756 0.002652 0.000597 0.027016 0.034535 0.937852 0.000962 0.990616 0.002398 0.006023 0.119630 0.849920 0.024651 0.005798 0.252940 0.369400 0.177721 0.199939 0.161422 0.252207 0.494334 0.092036 0.143469 0.225181 0.229401 0.401949 0.237069 0.293048 0.249050 0.220833 0.164582 0.221324 0.312805 0.301289 0.598896 0.159743 0.204840 0.036521 0.256726 0.179227 0.091251 0.472795 Consensus sequence: CBDMCMGGGTGGTCCHVBVBAH Alignment: HTBVVVDGGACCACCCRGRDBG -TGAACKCBWTGACCC------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v015681_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 1 15 0.071170 Species: Mus musculus Original motif 0.331499 0.188505 0.182841 0.297156 0.328961 0.213025 0.273530 0.184484 0.197213 0.129292 0.524914 0.148581 0.274491 0.226406 0.312118 0.186986 0.103231 0.393726 0.364988 0.138055 0.552594 0.166422 0.186262 0.094722 0.157618 0.064773 0.616497 0.161112 0.139166 0.176098 0.621185 0.063551 0.748420 0.062398 0.012447 0.176735 0.116584 0.009438 0.860326 0.013653 0.005030 0.003646 0.974877 0.016447 0.055257 0.007181 0.921760 0.015802 0.032748 0.058249 0.052709 0.856293 0.105606 0.872231 0.014370 0.007793 0.019480 0.497379 0.125899 0.357242 0.478582 0.269713 0.061464 0.190242 0.253985 0.287006 0.201320 0.257689 0.319384 0.210231 0.175842 0.294543 0.222123 0.287802 0.201294 0.288782 0.139951 0.376041 0.081133 0.402875 0.213450 0.343835 0.383676 0.059039 0.322294 0.355918 0.148062 0.173725 Consensus sequence: HVGVSAGGAGGGTCYHHHHYVH Reverse complement motif 0.322294 0.148062 0.355918 0.173725 0.213450 0.383676 0.343835 0.059039 0.402875 0.376041 0.081133 0.139951 0.288782 0.287802 0.201294 0.222123 0.294543 0.210231 0.175842 0.319384 0.253985 0.201320 0.287006 0.257689 0.190242 0.269713 0.061464 0.478582 0.019480 0.125899 0.497379 0.357242 0.105606 0.014370 0.872231 0.007793 0.856293 0.058249 0.052709 0.032748 0.055257 0.921760 0.007181 0.015802 0.005030 0.974877 0.003646 0.016447 0.116584 0.860326 0.009438 0.013653 0.176735 0.062398 0.012447 0.748420 0.139166 0.621185 0.176098 0.063551 0.157618 0.616497 0.064773 0.161112 0.094722 0.166422 0.186262 0.552594 0.103231 0.364988 0.393726 0.138055 0.274491 0.312118 0.226406 0.186986 0.197213 0.524914 0.129292 0.148581 0.184484 0.213025 0.273530 0.328961 0.297156 0.188505 0.182841 0.331499 Consensus sequence: DVMHHDHKGACCCTCCTSVCBH Alignment: DVMHHDHKGACCCTCCTSVCBH -------TGAACKCBWTGACCC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_primaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 2 15 0.072162 Species: Mus musculus Original motif 0.180868 0.321661 0.134642 0.362829 0.232215 0.134289 0.315356 0.318141 0.065068 0.093681 0.569842 0.271408 0.370822 0.229680 0.154738 0.244759 0.323039 0.182873 0.173588 0.320500 0.175039 0.266898 0.276080 0.281984 0.412669 0.147730 0.146326 0.293275 0.325953 0.028805 0.629596 0.015646 0.003017 0.001766 0.979711 0.015507 0.888973 0.040666 0.069420 0.000941 0.017309 0.979155 0.000899 0.002637 0.001732 0.988816 0.004856 0.004596 0.889763 0.078125 0.010384 0.021729 0.007566 0.987081 0.001421 0.003932 0.027797 0.966593 0.000878 0.004731 0.025816 0.867003 0.065749 0.041433 0.220658 0.075256 0.582904 0.121182 0.088946 0.283695 0.565345 0.062015 0.328012 0.241332 0.305901 0.124755 0.307302 0.137589 0.375928 0.179181 0.298752 0.231470 0.315255 0.154524 0.094565 0.142901 0.705696 0.056838 Consensus sequence: HDGHHBHRGACCACCCGSVDVG Reverse complement motif 0.094565 0.705696 0.142901 0.056838 0.298752 0.315255 0.231470 0.154524 0.307302 0.375928 0.137589 0.179181 0.124755 0.241332 0.305901 0.328012 0.088946 0.565345 0.283695 0.062015 0.220658 0.582904 0.075256 0.121182 0.025816 0.065749 0.867003 0.041433 0.027797 0.000878 0.966593 0.004731 0.007566 0.001421 0.987081 0.003932 0.021729 0.078125 0.010384 0.889763 0.001732 0.004856 0.988816 0.004596 0.017309 0.000899 0.979155 0.002637 0.000941 0.040666 0.069420 0.888973 0.003017 0.979711 0.001766 0.015507 0.325953 0.629596 0.028805 0.015646 0.293275 0.147730 0.146326 0.412669 0.281984 0.266898 0.276080 0.175039 0.320500 0.182873 0.173588 0.323039 0.244759 0.229680 0.154738 0.370822 0.065068 0.569842 0.093681 0.271408 0.318141 0.134289 0.315356 0.232215 0.362829 0.321661 0.134642 0.180868 Consensus sequence: CVHBSCGGGTGGTCMHVHHCDH Alignment: CVHBSCGGGTGGTCMHVHHCDH ------GGGTCAWBGRGTTCA- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00045 Mafb_primary Reverse Complement Original Motif Forward 2 14 0.562034 Species: Mus musculus Original motif 0.420301 0.182299 0.161481 0.235919 0.593201 0.055751 0.202477 0.148571 0.653364 0.017008 0.054630 0.274998 0.339176 0.102943 0.050258 0.507622 0.171557 0.078698 0.267471 0.482273 0.044703 0.033212 0.003920 0.918165 0.010333 0.004451 0.972441 0.012775 0.034026 0.949298 0.004788 0.011889 0.016078 0.008878 0.004007 0.971037 0.020331 0.004077 0.929676 0.045916 0.975739 0.007450 0.005991 0.010819 0.012733 0.887375 0.018700 0.081192 0.259981 0.111885 0.243051 0.385083 0.327677 0.149969 0.094895 0.427459 0.541721 0.105923 0.242224 0.110132 0.258689 0.068305 0.493226 0.179779 0.306041 0.306854 0.168308 0.218798 Consensus sequence: HAAWDTGCTGACDWARH Reverse complement motif 0.306041 0.168308 0.306854 0.218798 0.258689 0.493226 0.068305 0.179779 0.110132 0.105923 0.242224 0.541721 0.427459 0.149969 0.094895 0.327677 0.385083 0.111885 0.243051 0.259981 0.012733 0.018700 0.887375 0.081192 0.010819 0.007450 0.005991 0.975739 0.020331 0.929676 0.004077 0.045916 0.971037 0.008878 0.004007 0.016078 0.034026 0.004788 0.949298 0.011889 0.010333 0.972441 0.004451 0.012775 0.918165 0.033212 0.003920 0.044703 0.482273 0.078698 0.267471 0.171557 0.507622 0.102943 0.050258 0.339176 0.274998 0.017008 0.054630 0.653364 0.148571 0.055751 0.202477 0.593201 0.235919 0.182299 0.161481 0.420301 Consensus sequence: DMTWDGTCAGCADWTTH Alignment: DMTWDGTCAGCADWTTH- -TGAACKCBWTGACCC-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00012 Bbx_primary Original Motif Reverse Complement Forward 2 14 0.562788 Species: Mus musculus Original motif 0.243561 0.194936 0.123150 0.438353 0.606538 0.159878 0.056476 0.177109 0.460256 0.141315 0.215237 0.183192 0.134434 0.033508 0.053304 0.778753 0.091333 0.019966 0.020704 0.867997 0.136284 0.753571 0.062560 0.047585 0.917109 0.031475 0.015472 0.035944 0.452244 0.084890 0.121698 0.341168 0.035944 0.015472 0.031475 0.917109 0.047585 0.062560 0.753571 0.136284 0.867997 0.020704 0.019966 0.091333 0.778753 0.053304 0.033508 0.134434 0.123705 0.284125 0.353361 0.238808 0.291282 0.126574 0.120737 0.461406 0.330626 0.062565 0.348868 0.257941 Consensus sequence: HADTTCAWTGAABWD Reverse complement motif 0.330626 0.348868 0.062565 0.257941 0.461406 0.126574 0.120737 0.291282 0.123705 0.353361 0.284125 0.238808 0.134434 0.053304 0.033508 0.778753 0.091333 0.020704 0.019966 0.867997 0.047585 0.753571 0.062560 0.136284 0.917109 0.015472 0.031475 0.035944 0.341168 0.084890 0.121698 0.452244 0.035944 0.031475 0.015472 0.917109 0.136284 0.062560 0.753571 0.047585 0.867997 0.019966 0.020704 0.091333 0.778753 0.033508 0.053304 0.134434 0.183192 0.141315 0.215237 0.460256 0.177109 0.159878 0.056476 0.606538 0.438353 0.194936 0.123150 0.243561 Consensus sequence: HWBTTCAWTGAADTH Alignment: HWBTTCAWTGAADTH- -GGGTCAWBGRGTTCA ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00005 Tcfap2a_secondary Original Motif Reverse Complement Forward 1 14 0.565490 Species: Mus musculus Original motif 0.198427 0.243196 0.159241 0.399136 0.267754 0.388187 0.116811 0.227248 0.448284 0.056403 0.414623 0.080691 0.031469 0.826323 0.055436 0.086772 0.035527 0.756642 0.022985 0.184845 0.127338 0.316078 0.155806 0.400778 0.135021 0.313650 0.287760 0.263570 0.418892 0.082297 0.068352 0.430460 0.201062 0.044735 0.711358 0.042845 0.038934 0.022320 0.903763 0.034982 0.201790 0.065554 0.460526 0.272130 0.006890 0.786923 0.061853 0.144334 0.460666 0.103658 0.196452 0.239224 0.092272 0.204611 0.390375 0.312742 Consensus sequence: HHRCCBBWGGDCDB Reverse complement motif 0.092272 0.390375 0.204611 0.312742 0.239224 0.103658 0.196452 0.460666 0.006890 0.061853 0.786923 0.144334 0.201790 0.460526 0.065554 0.272130 0.038934 0.903763 0.022320 0.034982 0.201062 0.711358 0.044735 0.042845 0.430460 0.082297 0.068352 0.418892 0.135021 0.287760 0.313650 0.263570 0.400778 0.316078 0.155806 0.127338 0.035527 0.022985 0.756642 0.184845 0.031469 0.055436 0.826323 0.086772 0.080691 0.056403 0.414623 0.448284 0.267754 0.116811 0.388187 0.227248 0.399136 0.243196 0.159241 0.198427 Consensus sequence: BDGHCCWBVGGKDH Alignment: BDGHCCWBVGGKDH- GGGTCAWBGRGTTCA ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00067 Lef1_primary Original Motif Reverse Complement Forward 4 14 0.565777 Species: Mus musculus Original motif 0.281920 0.214207 0.278077 0.225796 0.325566 0.151435 0.298797 0.224202 0.290253 0.145824 0.243443 0.320480 0.069286 0.404645 0.141614 0.384454 0.070044 0.621448 0.142647 0.165862 0.007295 0.907657 0.038110 0.046938 0.015587 0.018273 0.000658 0.965482 0.005527 0.005886 0.001905 0.986682 0.024512 0.001189 0.001344 0.972955 0.007384 0.025221 0.952270 0.015125 0.966438 0.000630 0.002693 0.030239 0.082252 0.001173 0.001495 0.915080 0.030255 0.677155 0.275323 0.017267 0.199467 0.118815 0.056814 0.624905 0.345445 0.169597 0.216831 0.268127 0.278106 0.150864 0.173693 0.397336 0.251834 0.339733 0.219703 0.188730 Consensus sequence: DDDYCCTTTGATCTDDV Reverse complement motif 0.251834 0.219703 0.339733 0.188730 0.397336 0.150864 0.173693 0.278106 0.268127 0.169597 0.216831 0.345445 0.624905 0.118815 0.056814 0.199467 0.030255 0.275323 0.677155 0.017267 0.915080 0.001173 0.001495 0.082252 0.030239 0.000630 0.002693 0.966438 0.007384 0.952270 0.025221 0.015125 0.972955 0.001189 0.001344 0.024512 0.986682 0.005886 0.001905 0.005527 0.965482 0.018273 0.000658 0.015587 0.007295 0.038110 0.907657 0.046938 0.070044 0.142647 0.621448 0.165862 0.069286 0.141614 0.404645 0.384454 0.320480 0.145824 0.243443 0.290253 0.224202 0.151435 0.298797 0.325566 0.225796 0.214207 0.278077 0.281920 Consensus sequence: VDDAGATCAAAGGKDDD Alignment: VDDAGATCAAAGGKDDD- ---GGGTCAWBGRGTTCA ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 18 Motif name: RREB1 Original motif 0.272727 0.727273 0.000000 0.000000 0.090909 0.909091 0.000000 0.000000 0.272727 0.727273 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.636364 0.363636 0.000000 0.000000 0.818182 0.181818 0.000000 0.000000 0.727273 0.272727 0.000000 0.000000 0.363636 0.545455 0.000000 0.090909 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.363636 0.636364 0.000000 0.000000 0.090909 0.909091 0.000000 0.000000 0.272727 0.727273 0.000000 0.000000 0.363636 0.545455 0.090909 0.000000 0.181818 0.818182 0.000000 0.000000 0.363636 0.454545 0.000000 0.181818 0.363636 0.454545 0.090909 0.090909 0.363636 0.545455 0.000000 0.090909 0.090909 0.636364 0.272727 0.000000 0.363636 0.363636 0.181818 0.090909 Consensus sequence: CCCCMAAMCAMCCMCMMMCV Reserve complement motif 0.090909 0.363636 0.181818 0.363636 0.090909 0.272727 0.636364 0.000000 0.363636 0.000000 0.545455 0.090909 0.363636 0.090909 0.454545 0.090909 0.363636 0.000000 0.454545 0.181818 0.181818 0.000000 0.818182 0.000000 0.363636 0.090909 0.545455 0.000000 0.272727 0.000000 0.727273 0.000000 0.090909 0.000000 0.909091 0.000000 0.363636 0.000000 0.636364 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.363636 0.000000 0.545455 0.090909 0.000000 0.272727 0.000000 0.727273 0.000000 0.181818 0.000000 0.818182 0.000000 0.363636 0.000000 0.636364 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.272727 0.000000 0.727273 0.000000 0.090909 0.000000 0.909091 0.000000 0.272727 0.000000 0.727273 0.000000 Consensus sequence: BGRRRGRGGRTGRTTYGGGG ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 18 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v015681_primaryReverse Complement Reverse Complement Backward 4 20 0.044337 Species: Mus musculus Original motif 0.641428 0.180211 0.044767 0.133594 0.171696 0.262981 0.334148 0.231174 0.129726 0.322735 0.243462 0.304077 0.165713 0.175735 0.256108 0.402445 0.146090 0.171890 0.412753 0.269266 0.212837 0.439192 0.280990 0.066980 0.251088 0.275516 0.374380 0.099015 0.575438 0.079656 0.338201 0.006704 0.005634 0.003422 0.972597 0.018348 0.890447 0.077034 0.031851 0.000668 0.007128 0.986862 0.000496 0.005515 0.001445 0.991564 0.001925 0.005066 0.738761 0.190157 0.026399 0.044684 0.013384 0.983783 0.000896 0.001937 0.068077 0.929549 0.000773 0.001602 0.040830 0.933742 0.005283 0.020145 0.730274 0.029225 0.145689 0.094812 0.165032 0.572838 0.162001 0.100129 0.383584 0.129942 0.429497 0.056977 0.455959 0.071959 0.208204 0.263878 0.134271 0.262985 0.222626 0.380117 0.071193 0.346594 0.346081 0.236132 0.445661 0.405278 0.053901 0.095160 Consensus sequence: ABBBBVVRGACCACCCACRDBBM Reverse complement motif 0.095160 0.405278 0.053901 0.445661 0.071193 0.346081 0.346594 0.236132 0.380117 0.262985 0.222626 0.134271 0.263878 0.071959 0.208204 0.455959 0.383584 0.429497 0.129942 0.056977 0.165032 0.162001 0.572838 0.100129 0.094812 0.029225 0.145689 0.730274 0.040830 0.005283 0.933742 0.020145 0.068077 0.000773 0.929549 0.001602 0.013384 0.000896 0.983783 0.001937 0.044684 0.190157 0.026399 0.738761 0.001445 0.001925 0.991564 0.005066 0.007128 0.000496 0.986862 0.005515 0.000668 0.077034 0.031851 0.890447 0.005634 0.972597 0.003422 0.018348 0.006704 0.079656 0.338201 0.575438 0.251088 0.374380 0.275516 0.099015 0.212837 0.280990 0.439192 0.066980 0.146090 0.412753 0.171890 0.269266 0.402445 0.175735 0.256108 0.165713 0.129726 0.243462 0.322735 0.304077 0.171696 0.334148 0.262981 0.231174 0.133594 0.180211 0.044767 0.641428 Consensus sequence: YBVDMGTGGGTGGTCKVVBVBBT Alignment: YBVDMGTGGGTGGTCKVVBVBBT BGRRRGRGGRTGRTTYGGGG--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 2 20 0.049057 Species: Mus musculus Original motif 0.404007 0.395873 0.173319 0.026801 0.305977 0.215534 0.215359 0.263130 0.370148 0.250957 0.113088 0.265808 0.324336 0.229498 0.174679 0.271487 0.263563 0.137896 0.079217 0.519324 0.265762 0.222582 0.082555 0.429102 0.206721 0.288405 0.017851 0.487023 0.164361 0.236500 0.061051 0.538088 0.593344 0.348446 0.050304 0.007906 0.031328 0.947050 0.007032 0.014590 0.010428 0.956605 0.029142 0.003825 0.459636 0.207616 0.155368 0.177380 0.014573 0.964608 0.012209 0.008610 0.066291 0.918196 0.008729 0.006784 0.019488 0.866774 0.018897 0.094841 0.767405 0.104198 0.029234 0.099164 0.052494 0.772531 0.039832 0.135142 0.296085 0.243498 0.350935 0.109482 0.518843 0.226659 0.124784 0.129714 0.647901 0.019721 0.159901 0.172477 0.113912 0.231511 0.214864 0.439713 0.223117 0.310596 0.293328 0.172959 0.185557 0.487662 0.136321 0.190459 Consensus sequence: MHHHWHYTMCCHCCCACVAABVH Reverse complement motif 0.185557 0.136321 0.487662 0.190459 0.223117 0.293328 0.310596 0.172959 0.439713 0.231511 0.214864 0.113912 0.172477 0.019721 0.159901 0.647901 0.129714 0.226659 0.124784 0.518843 0.296085 0.350935 0.243498 0.109482 0.052494 0.039832 0.772531 0.135142 0.099164 0.104198 0.029234 0.767405 0.019488 0.018897 0.866774 0.094841 0.066291 0.008729 0.918196 0.006784 0.014573 0.012209 0.964608 0.008610 0.177380 0.207616 0.155368 0.459636 0.010428 0.029142 0.956605 0.003825 0.031328 0.007032 0.947050 0.014590 0.007906 0.348446 0.050304 0.593344 0.538088 0.236500 0.061051 0.164361 0.487023 0.288405 0.017851 0.206721 0.429102 0.222582 0.082555 0.265762 0.519324 0.137896 0.079217 0.263563 0.271487 0.229498 0.174679 0.324336 0.265808 0.250957 0.113088 0.370148 0.263130 0.215534 0.215359 0.305977 0.026801 0.395873 0.173319 0.404007 Consensus sequence: DVVTTVGTGGGHGGYAMHWHHHY Alignment: MHHHWHYTMCCHCCCACVAABVH --CCCCMAAMCAMCCMCMMMCV- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_primaryReverse Complement Reverse Complement Forward 2 20 0.054617 Species: Mus musculus Original motif 0.183797 0.268049 0.330111 0.218043 0.127599 0.330310 0.243614 0.298477 0.143199 0.188046 0.268593 0.400162 0.214690 0.205230 0.247090 0.332990 0.294688 0.299104 0.327152 0.079056 0.221909 0.193223 0.480155 0.104712 0.444072 0.068239 0.481838 0.005852 0.006182 0.015429 0.901278 0.077111 0.766535 0.111138 0.121632 0.000696 0.014848 0.973961 0.000298 0.010893 0.001807 0.992200 0.002669 0.003324 0.795344 0.140510 0.018576 0.045571 0.006990 0.988200 0.002510 0.002299 0.154898 0.842296 0.000998 0.001808 0.029577 0.919262 0.006935 0.044226 0.677987 0.032075 0.185065 0.104874 0.195132 0.364580 0.319321 0.120967 0.225412 0.115034 0.612849 0.046705 0.548628 0.058900 0.162857 0.229616 0.112531 0.340331 0.165910 0.381227 0.073029 0.303078 0.363896 0.259997 0.561485 0.260567 0.092979 0.084969 0.132283 0.457691 0.140159 0.269867 Consensus sequence: BBBDVVRGACCACCCAVGABBAB Reverse complement motif 0.132283 0.140159 0.457691 0.269867 0.084969 0.260567 0.092979 0.561485 0.073029 0.363896 0.303078 0.259997 0.381227 0.340331 0.165910 0.112531 0.229616 0.058900 0.162857 0.548628 0.225412 0.612849 0.115034 0.046705 0.195132 0.319321 0.364580 0.120967 0.104874 0.032075 0.185065 0.677987 0.029577 0.006935 0.919262 0.044226 0.154898 0.000998 0.842296 0.001808 0.006990 0.002510 0.988200 0.002299 0.045571 0.140510 0.018576 0.795344 0.001807 0.002669 0.992200 0.003324 0.014848 0.000298 0.973961 0.010893 0.000696 0.111138 0.121632 0.766535 0.006182 0.901278 0.015429 0.077111 0.444072 0.481838 0.068239 0.005852 0.221909 0.480155 0.193223 0.104712 0.294688 0.327152 0.299104 0.079056 0.332990 0.205230 0.247090 0.214690 0.400162 0.188046 0.268593 0.143199 0.127599 0.243614 0.330310 0.298477 0.183797 0.330111 0.268049 0.218043 Consensus sequence: BTBVTCVTGGGTGGTCMVVDVBB Alignment: BTBVTCVTGGGTGGTCMVVDVBB -BGRRRGRGGRTGRTTYGGGG-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 3 20 0.055783 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH -CCCCMAAMCAMCCMCMMMCV-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 3 20 0.057969 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB --BGRRRGRGGRTGRTTYGGGG- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_primaryOriginal Motif Original Motif Backward 2 20 0.059510 Species: Mus musculus Original motif 0.137831 0.118922 0.394177 0.349070 0.190108 0.163633 0.138507 0.507753 0.346002 0.332315 0.228621 0.093063 0.113254 0.287554 0.373285 0.225908 0.272578 0.125402 0.328963 0.273057 0.333973 0.115165 0.194267 0.356595 0.381054 0.086215 0.501679 0.031052 0.002232 0.007405 0.966087 0.024276 0.834741 0.112115 0.052053 0.001091 0.009034 0.983239 0.000766 0.006960 0.002054 0.988103 0.003138 0.006705 0.805772 0.171299 0.008415 0.014515 0.020076 0.976846 0.000894 0.002183 0.079914 0.917273 0.001179 0.001634 0.013983 0.950545 0.004205 0.031267 0.789407 0.039441 0.108645 0.062507 0.055453 0.161271 0.595249 0.188028 0.333424 0.128169 0.373270 0.165136 0.536103 0.109520 0.062980 0.291397 0.346477 0.090909 0.279533 0.283081 0.045892 0.190183 0.584314 0.179611 0.088294 0.406148 0.251647 0.253912 0.202467 0.447159 0.162802 0.187571 Consensus sequence: DTVBDDRGACCACCCAGDWDGBH Reverse complement motif 0.202467 0.162802 0.447159 0.187571 0.088294 0.251647 0.406148 0.253912 0.045892 0.584314 0.190183 0.179611 0.283081 0.090909 0.279533 0.346477 0.291397 0.109520 0.062980 0.536103 0.333424 0.373270 0.128169 0.165136 0.055453 0.595249 0.161271 0.188028 0.062507 0.039441 0.108645 0.789407 0.013983 0.004205 0.950545 0.031267 0.079914 0.001179 0.917273 0.001634 0.020076 0.000894 0.976846 0.002183 0.014515 0.171299 0.008415 0.805772 0.002054 0.003138 0.988103 0.006705 0.009034 0.000766 0.983239 0.006960 0.001091 0.112115 0.052053 0.834741 0.002232 0.966087 0.007405 0.024276 0.381054 0.501679 0.086215 0.031052 0.356595 0.115165 0.194267 0.333973 0.272578 0.328963 0.125402 0.273057 0.113254 0.373285 0.287554 0.225908 0.093063 0.332315 0.228621 0.346002 0.507753 0.163633 0.138507 0.190108 0.137831 0.394177 0.118922 0.349070 Consensus sequence: DBCDWHCTGGGTGGTCMDHBBAH Alignment: DTVBDDRGACCACCCAGDWDGBH --CCCCMAAMCAMCCMCMMMCV- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_primaryReverse Complement Original Motif Forward 2 20 0.062200 Species: Mus musculus Original motif 0.204923 0.208846 0.365383 0.220848 0.294304 0.300143 0.167287 0.238266 0.109711 0.619514 0.117379 0.153396 0.178979 0.378580 0.230177 0.212264 0.159594 0.542602 0.118178 0.179627 0.125206 0.430074 0.151826 0.292894 0.097692 0.709845 0.116956 0.075506 0.148292 0.565912 0.037632 0.248164 0.077951 0.034190 0.855503 0.032356 0.001657 0.001061 0.971877 0.025405 0.001926 0.001084 0.991712 0.005278 0.033031 0.012001 0.057796 0.897171 0.002723 0.002647 0.993348 0.001281 0.003261 0.000963 0.987199 0.008577 0.000611 0.090925 0.074857 0.833608 0.015299 0.978878 0.004949 0.000874 0.013368 0.600902 0.033485 0.352245 0.231949 0.149575 0.118804 0.499672 0.267580 0.186002 0.371242 0.175176 0.264884 0.223483 0.110082 0.401551 0.221365 0.170121 0.179559 0.428955 0.112997 0.692930 0.139981 0.054092 0.460305 0.207883 0.155111 0.176702 Consensus sequence: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH Reverse complement motif 0.176702 0.207883 0.155111 0.460305 0.112997 0.139981 0.692930 0.054092 0.428955 0.170121 0.179559 0.221365 0.401551 0.223483 0.110082 0.264884 0.267580 0.371242 0.186002 0.175176 0.499672 0.149575 0.118804 0.231949 0.013368 0.033485 0.600902 0.352245 0.015299 0.004949 0.978878 0.000874 0.833608 0.090925 0.074857 0.000611 0.003261 0.987199 0.000963 0.008577 0.002723 0.993348 0.002647 0.001281 0.897171 0.012001 0.057796 0.033031 0.001926 0.991712 0.001084 0.005278 0.001657 0.971877 0.001061 0.025405 0.077951 0.855503 0.034190 0.032356 0.148292 0.037632 0.565912 0.248164 0.097692 0.116956 0.709845 0.075506 0.125206 0.151826 0.430074 0.292894 0.159594 0.118178 0.542602 0.179627 0.178979 0.230177 0.378580 0.212264 0.109711 0.117379 0.619514 0.153396 0.294304 0.167287 0.300143 0.238266 0.204923 0.365383 0.208846 0.220848 Consensus sequence: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB Alignment: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH -BGRRRGRGGRTGRTTYGGGG-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 2 20 0.062695 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH -CCCCMAAMCAMCCMCMMMCV- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v015681_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 3 20 0.063190 Species: Mus musculus Original motif 0.331499 0.188505 0.182841 0.297156 0.328961 0.213025 0.273530 0.184484 0.197213 0.129292 0.524914 0.148581 0.274491 0.226406 0.312118 0.186986 0.103231 0.393726 0.364988 0.138055 0.552594 0.166422 0.186262 0.094722 0.157618 0.064773 0.616497 0.161112 0.139166 0.176098 0.621185 0.063551 0.748420 0.062398 0.012447 0.176735 0.116584 0.009438 0.860326 0.013653 0.005030 0.003646 0.974877 0.016447 0.055257 0.007181 0.921760 0.015802 0.032748 0.058249 0.052709 0.856293 0.105606 0.872231 0.014370 0.007793 0.019480 0.497379 0.125899 0.357242 0.478582 0.269713 0.061464 0.190242 0.253985 0.287006 0.201320 0.257689 0.319384 0.210231 0.175842 0.294543 0.222123 0.287802 0.201294 0.288782 0.139951 0.376041 0.081133 0.402875 0.213450 0.343835 0.383676 0.059039 0.322294 0.355918 0.148062 0.173725 Consensus sequence: HVGVSAGGAGGGTCYHHHHYVH Reverse complement motif 0.322294 0.148062 0.355918 0.173725 0.213450 0.383676 0.343835 0.059039 0.402875 0.376041 0.081133 0.139951 0.288782 0.287802 0.201294 0.222123 0.294543 0.210231 0.175842 0.319384 0.253985 0.201320 0.287006 0.257689 0.190242 0.269713 0.061464 0.478582 0.019480 0.125899 0.497379 0.357242 0.105606 0.014370 0.872231 0.007793 0.856293 0.058249 0.052709 0.032748 0.055257 0.921760 0.007181 0.015802 0.005030 0.974877 0.003646 0.016447 0.116584 0.860326 0.009438 0.013653 0.176735 0.062398 0.012447 0.748420 0.139166 0.621185 0.176098 0.063551 0.157618 0.616497 0.064773 0.161112 0.094722 0.166422 0.186262 0.552594 0.103231 0.364988 0.393726 0.138055 0.274491 0.312118 0.226406 0.186986 0.197213 0.524914 0.129292 0.148581 0.184484 0.213025 0.273530 0.328961 0.297156 0.188505 0.182841 0.331499 Consensus sequence: DVMHHDHKGACCCTCCTSVCBH Alignment: DVMHHDHKGACCCTCCTSVCBH CCCCMAAMCAMCCMCMMMCV-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00528 Foxm1_secondary Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 20 0.067385 Species: Mus musculus Original motif 0.399785 0.446658 0.111435 0.042122 0.535175 0.103991 0.089706 0.271128 0.078171 0.387987 0.375083 0.158759 0.309001 0.519142 0.070618 0.101239 0.201844 0.255818 0.323149 0.219190 0.534101 0.109845 0.235026 0.121028 0.656038 0.037473 0.261484 0.045006 0.315713 0.164290 0.471815 0.048182 0.651960 0.009412 0.328237 0.010391 0.937365 0.017313 0.007516 0.037807 0.019983 0.044238 0.012387 0.923392 0.061195 0.021485 0.881645 0.035675 0.017521 0.952998 0.013139 0.016342 0.254160 0.029735 0.493023 0.223082 0.239200 0.593324 0.114503 0.052973 0.610822 0.071539 0.099169 0.218470 0.166610 0.389712 0.204400 0.239278 0.227752 0.361626 0.178497 0.232125 0.537030 0.182466 0.026035 0.254470 0.235902 0.151006 0.043788 0.569304 0.081851 0.250397 0.590059 0.077693 0.340417 0.189613 0.272075 0.197895 Consensus sequence: MWSMBAARRATGCDCABHATGD Reverse complement motif 0.197895 0.189613 0.272075 0.340417 0.081851 0.590059 0.250397 0.077693 0.569304 0.151006 0.043788 0.235902 0.254470 0.182466 0.026035 0.537030 0.227752 0.178497 0.361626 0.232125 0.166610 0.204400 0.389712 0.239278 0.218470 0.071539 0.099169 0.610822 0.239200 0.114503 0.593324 0.052973 0.254160 0.493023 0.029735 0.223082 0.017521 0.013139 0.952998 0.016342 0.061195 0.881645 0.021485 0.035675 0.923392 0.044238 0.012387 0.019983 0.037807 0.017313 0.007516 0.937365 0.010391 0.009412 0.328237 0.651960 0.315713 0.471815 0.164290 0.048182 0.045006 0.037473 0.261484 0.656038 0.121028 0.109845 0.235026 0.534101 0.201844 0.323149 0.255818 0.219190 0.309001 0.070618 0.519142 0.101239 0.078171 0.375083 0.387987 0.158759 0.271128 0.103991 0.089706 0.535175 0.399785 0.111435 0.446658 0.042122 Consensus sequence: DCATDBTGHGCATKMTTBRSWR Alignment: DCATDBTGHGCATKMTTBRSWR --BGRRRGRGGRTGRTTYGGGG ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 19 Motif name: REST Original motif 0.132621 0.109365 0.230044 0.527970 0.036318 0.168441 0.091421 0.703820 0.047589 0.855354 0.031309 0.065748 0.906367 0.018727 0.058677 0.016230 0.021197 0.027431 0.945137 0.006234 0.076012 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.004359 0.007472 0.007472 0.001868 0.987547 0.007472 0.003113 0.021793 0.922167 0.012453 0.043587 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.077307 0.552369 0.024314 0.004364 0.966958 0.004364 0.012469 0.003117 0.983167 0.001247 0.877105 0.069869 0.021210 0.031815 0.008125 0.800000 0.145625 0.046250 0.983750 0.005625 0.004375 0.006250 0.026349 0.008156 0.959849 0.005646 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.019472 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.078616 0.112579 0.700629 0.023270 0.163522 Consensus sequence: TTCAGCACCATGGACAGCKCC Reserve complement motif 0.112579 0.023270 0.700629 0.163522 0.133962 0.200629 0.586792 0.078616 0.229899 0.432161 0.019472 0.318467 0.128688 0.114878 0.632141 0.124294 0.026349 0.959849 0.008156 0.005646 0.006250 0.005625 0.004375 0.983750 0.008125 0.145625 0.800000 0.046250 0.031815 0.069869 0.021210 0.877105 0.012469 0.983167 0.003117 0.001247 0.024314 0.966958 0.004364 0.004364 0.552369 0.233791 0.077307 0.136534 0.204984 0.125234 0.100935 0.568847 0.021793 0.012453 0.922167 0.043587 0.001868 0.007472 0.987547 0.003113 0.007472 0.004359 0.007472 0.980697 0.076012 0.201246 0.609346 0.113396 0.021197 0.945137 0.027431 0.006234 0.016230 0.018727 0.058677 0.906367 0.047589 0.031309 0.855354 0.065748 0.703820 0.168441 0.091421 0.036318 0.527970 0.109365 0.230044 0.132621 Consensus sequence: GGYGCTGTCCATGGTGCTGAA ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 19 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_primaryOriginal Motif Original Motif Forward 3 21 0.069918 Species: Mus musculus Original motif 0.183797 0.268049 0.330111 0.218043 0.127599 0.330310 0.243614 0.298477 0.143199 0.188046 0.268593 0.400162 0.214690 0.205230 0.247090 0.332990 0.294688 0.299104 0.327152 0.079056 0.221909 0.193223 0.480155 0.104712 0.444072 0.068239 0.481838 0.005852 0.006182 0.015429 0.901278 0.077111 0.766535 0.111138 0.121632 0.000696 0.014848 0.973961 0.000298 0.010893 0.001807 0.992200 0.002669 0.003324 0.795344 0.140510 0.018576 0.045571 0.006990 0.988200 0.002510 0.002299 0.154898 0.842296 0.000998 0.001808 0.029577 0.919262 0.006935 0.044226 0.677987 0.032075 0.185065 0.104874 0.195132 0.364580 0.319321 0.120967 0.225412 0.115034 0.612849 0.046705 0.548628 0.058900 0.162857 0.229616 0.112531 0.340331 0.165910 0.381227 0.073029 0.303078 0.363896 0.259997 0.561485 0.260567 0.092979 0.084969 0.132283 0.457691 0.140159 0.269867 Consensus sequence: BBBDVVRGACCACCCAVGABBAB Reverse complement motif 0.132283 0.140159 0.457691 0.269867 0.084969 0.260567 0.092979 0.561485 0.073029 0.363896 0.303078 0.259997 0.381227 0.340331 0.165910 0.112531 0.229616 0.058900 0.162857 0.548628 0.225412 0.612849 0.115034 0.046705 0.195132 0.319321 0.364580 0.120967 0.104874 0.032075 0.185065 0.677987 0.029577 0.006935 0.919262 0.044226 0.154898 0.000998 0.842296 0.001808 0.006990 0.002510 0.988200 0.002299 0.045571 0.140510 0.018576 0.795344 0.001807 0.002669 0.992200 0.003324 0.014848 0.000298 0.973961 0.010893 0.000696 0.111138 0.121632 0.766535 0.006182 0.901278 0.015429 0.077111 0.444072 0.481838 0.068239 0.005852 0.221909 0.480155 0.193223 0.104712 0.294688 0.327152 0.299104 0.079056 0.332990 0.205230 0.247090 0.214690 0.400162 0.188046 0.268593 0.143199 0.127599 0.243614 0.330310 0.298477 0.183797 0.330111 0.268049 0.218043 Consensus sequence: BTBVTCVTGGGTGGTCMVVDVBB Alignment: BBBDVVRGACCACCCAVGABBAB --TTCAGCACCATGGACAGCKCC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v015681_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 1 21 0.073468 Species: Mus musculus Original motif 0.214165 0.143436 0.372522 0.269876 0.314445 0.406003 0.160351 0.119201 0.137147 0.092924 0.042921 0.727007 0.044121 0.072843 0.051741 0.831295 0.261292 0.324124 0.298498 0.116086 0.258125 0.323243 0.263362 0.155271 0.204557 0.589399 0.107153 0.098891 0.371021 0.244027 0.291102 0.093849 0.096327 0.572718 0.011797 0.319159 0.027282 0.046183 0.844519 0.082016 0.018921 0.012887 0.915917 0.052275 0.364793 0.166722 0.084229 0.384256 0.028216 0.011233 0.951056 0.009495 0.054974 0.004738 0.890377 0.049911 0.006802 0.312915 0.134247 0.546036 0.241289 0.628210 0.104788 0.025713 0.237863 0.302807 0.213018 0.246311 0.349399 0.203220 0.086635 0.360746 0.386634 0.144693 0.246895 0.221779 0.425101 0.354676 0.093374 0.126849 0.060272 0.391320 0.104905 0.443503 0.162090 0.190233 0.227433 0.420244 Consensus sequence: DVTTVVCVYGGHGGYCHHDMYB Reverse complement motif 0.420244 0.190233 0.227433 0.162090 0.443503 0.391320 0.104905 0.060272 0.126849 0.354676 0.093374 0.425101 0.221779 0.144693 0.246895 0.386634 0.360746 0.203220 0.086635 0.349399 0.237863 0.213018 0.302807 0.246311 0.241289 0.104788 0.628210 0.025713 0.546036 0.312915 0.134247 0.006802 0.054974 0.890377 0.004738 0.049911 0.028216 0.951056 0.011233 0.009495 0.384256 0.166722 0.084229 0.364793 0.018921 0.915917 0.012887 0.052275 0.027282 0.844519 0.046183 0.082016 0.096327 0.011797 0.572718 0.319159 0.093849 0.244027 0.291102 0.371021 0.204557 0.107153 0.589399 0.098891 0.258125 0.263362 0.323243 0.155271 0.261292 0.298498 0.324124 0.116086 0.831295 0.072843 0.051741 0.044121 0.727007 0.092924 0.042921 0.137147 0.314445 0.160351 0.406003 0.119201 0.214165 0.372522 0.143436 0.269876 Consensus sequence: VMYDHDGMCCHCCKBGVVAAVH Alignment: VMYDHDGMCCHCCKBGVVAAVH GGYGCTGTCCATGGTGCTGAA- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 2 21 0.074065 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH -TTCAGCACCATGGACAGCKCC- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 21 0.075015 Species: Mus musculus Original motif 0.404007 0.395873 0.173319 0.026801 0.305977 0.215534 0.215359 0.263130 0.370148 0.250957 0.113088 0.265808 0.324336 0.229498 0.174679 0.271487 0.263563 0.137896 0.079217 0.519324 0.265762 0.222582 0.082555 0.429102 0.206721 0.288405 0.017851 0.487023 0.164361 0.236500 0.061051 0.538088 0.593344 0.348446 0.050304 0.007906 0.031328 0.947050 0.007032 0.014590 0.010428 0.956605 0.029142 0.003825 0.459636 0.207616 0.155368 0.177380 0.014573 0.964608 0.012209 0.008610 0.066291 0.918196 0.008729 0.006784 0.019488 0.866774 0.018897 0.094841 0.767405 0.104198 0.029234 0.099164 0.052494 0.772531 0.039832 0.135142 0.296085 0.243498 0.350935 0.109482 0.518843 0.226659 0.124784 0.129714 0.647901 0.019721 0.159901 0.172477 0.113912 0.231511 0.214864 0.439713 0.223117 0.310596 0.293328 0.172959 0.185557 0.487662 0.136321 0.190459 Consensus sequence: MHHHWHYTMCCHCCCACVAABVH Reverse complement motif 0.185557 0.136321 0.487662 0.190459 0.223117 0.293328 0.310596 0.172959 0.439713 0.231511 0.214864 0.113912 0.172477 0.019721 0.159901 0.647901 0.129714 0.226659 0.124784 0.518843 0.296085 0.350935 0.243498 0.109482 0.052494 0.039832 0.772531 0.135142 0.099164 0.104198 0.029234 0.767405 0.019488 0.018897 0.866774 0.094841 0.066291 0.008729 0.918196 0.006784 0.014573 0.012209 0.964608 0.008610 0.177380 0.207616 0.155368 0.459636 0.010428 0.029142 0.956605 0.003825 0.031328 0.007032 0.947050 0.014590 0.007906 0.348446 0.050304 0.593344 0.538088 0.236500 0.061051 0.164361 0.487023 0.288405 0.017851 0.206721 0.429102 0.222582 0.082555 0.265762 0.519324 0.137896 0.079217 0.263563 0.271487 0.229498 0.174679 0.324336 0.265808 0.250957 0.113088 0.370148 0.263130 0.215534 0.215359 0.305977 0.026801 0.395873 0.173319 0.404007 Consensus sequence: DVVTTVGTGGGHGGYAMHWHHHY Alignment: MHHHWHYTMCCHCCCACVAABVH --TTCAGCACCATGGACAGCKCC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_primaryReverse Complement Original Motif Backward 3 21 0.075145 Species: Mus musculus Original motif 0.204923 0.208846 0.365383 0.220848 0.294304 0.300143 0.167287 0.238266 0.109711 0.619514 0.117379 0.153396 0.178979 0.378580 0.230177 0.212264 0.159594 0.542602 0.118178 0.179627 0.125206 0.430074 0.151826 0.292894 0.097692 0.709845 0.116956 0.075506 0.148292 0.565912 0.037632 0.248164 0.077951 0.034190 0.855503 0.032356 0.001657 0.001061 0.971877 0.025405 0.001926 0.001084 0.991712 0.005278 0.033031 0.012001 0.057796 0.897171 0.002723 0.002647 0.993348 0.001281 0.003261 0.000963 0.987199 0.008577 0.000611 0.090925 0.074857 0.833608 0.015299 0.978878 0.004949 0.000874 0.013368 0.600902 0.033485 0.352245 0.231949 0.149575 0.118804 0.499672 0.267580 0.186002 0.371242 0.175176 0.264884 0.223483 0.110082 0.401551 0.221365 0.170121 0.179559 0.428955 0.112997 0.692930 0.139981 0.054092 0.460305 0.207883 0.155111 0.176702 Consensus sequence: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH Reverse complement motif 0.176702 0.207883 0.155111 0.460305 0.112997 0.139981 0.692930 0.054092 0.428955 0.170121 0.179559 0.221365 0.401551 0.223483 0.110082 0.264884 0.267580 0.371242 0.186002 0.175176 0.499672 0.149575 0.118804 0.231949 0.013368 0.033485 0.600902 0.352245 0.015299 0.004949 0.978878 0.000874 0.833608 0.090925 0.074857 0.000611 0.003261 0.987199 0.000963 0.008577 0.002723 0.993348 0.002647 0.001281 0.897171 0.012001 0.057796 0.033031 0.001926 0.991712 0.001084 0.005278 0.001657 0.971877 0.001061 0.025405 0.077951 0.855503 0.034190 0.032356 0.148292 0.037632 0.565912 0.248164 0.097692 0.116956 0.709845 0.075506 0.125206 0.151826 0.430074 0.292894 0.159594 0.118178 0.542602 0.179627 0.178979 0.230177 0.378580 0.212264 0.109711 0.117379 0.619514 0.153396 0.294304 0.167287 0.300143 0.238266 0.204923 0.365383 0.208846 0.220848 Consensus sequence: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB Alignment: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH GGYGCTGTCCATGGTGCTGAA-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 2 21 0.075832 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH -TTCAGCACCATGGACAGCKCC- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_primaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 21 0.077345 Species: Mus musculus Original motif 0.137831 0.118922 0.394177 0.349070 0.190108 0.163633 0.138507 0.507753 0.346002 0.332315 0.228621 0.093063 0.113254 0.287554 0.373285 0.225908 0.272578 0.125402 0.328963 0.273057 0.333973 0.115165 0.194267 0.356595 0.381054 0.086215 0.501679 0.031052 0.002232 0.007405 0.966087 0.024276 0.834741 0.112115 0.052053 0.001091 0.009034 0.983239 0.000766 0.006960 0.002054 0.988103 0.003138 0.006705 0.805772 0.171299 0.008415 0.014515 0.020076 0.976846 0.000894 0.002183 0.079914 0.917273 0.001179 0.001634 0.013983 0.950545 0.004205 0.031267 0.789407 0.039441 0.108645 0.062507 0.055453 0.161271 0.595249 0.188028 0.333424 0.128169 0.373270 0.165136 0.536103 0.109520 0.062980 0.291397 0.346477 0.090909 0.279533 0.283081 0.045892 0.190183 0.584314 0.179611 0.088294 0.406148 0.251647 0.253912 0.202467 0.447159 0.162802 0.187571 Consensus sequence: DTVBDDRGACCACCCAGDWDGBH Reverse complement motif 0.202467 0.162802 0.447159 0.187571 0.088294 0.251647 0.406148 0.253912 0.045892 0.584314 0.190183 0.179611 0.283081 0.090909 0.279533 0.346477 0.291397 0.109520 0.062980 0.536103 0.333424 0.373270 0.128169 0.165136 0.055453 0.595249 0.161271 0.188028 0.062507 0.039441 0.108645 0.789407 0.013983 0.004205 0.950545 0.031267 0.079914 0.001179 0.917273 0.001634 0.020076 0.000894 0.976846 0.002183 0.014515 0.171299 0.008415 0.805772 0.002054 0.003138 0.988103 0.006705 0.009034 0.000766 0.983239 0.006960 0.001091 0.112115 0.052053 0.834741 0.002232 0.966087 0.007405 0.024276 0.381054 0.501679 0.086215 0.031052 0.356595 0.115165 0.194267 0.333973 0.272578 0.328963 0.125402 0.273057 0.113254 0.373285 0.287554 0.225908 0.093063 0.332315 0.228621 0.346002 0.507753 0.163633 0.138507 0.190108 0.137831 0.394177 0.118922 0.349070 Consensus sequence: DBCDWHCTGGGTGGTCMDHBBAH Alignment: DTVBDDRGACCACCCAGDWDGBH --TTCAGCACCATGGACAGCKCC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00050 Bhlhb2_secondary Original Motif Original Motif Forward 3 21 0.077537 Species: Mus musculus Original motif 0.120938 0.344851 0.124072 0.410138 0.220931 0.169844 0.422396 0.186829 0.127752 0.260812 0.103811 0.507625 0.140641 0.405473 0.287668 0.166218 0.296957 0.155579 0.301094 0.246370 0.219647 0.287193 0.154072 0.339087 0.049294 0.026059 0.121789 0.802859 0.520042 0.289284 0.173423 0.017251 0.049190 0.943472 0.004308 0.003030 0.902609 0.006767 0.074770 0.015854 0.003221 0.971329 0.005512 0.019937 0.019937 0.005512 0.971329 0.003221 0.015854 0.074770 0.006767 0.902609 0.003030 0.004308 0.943472 0.049190 0.003497 0.088920 0.685942 0.221641 0.802859 0.121789 0.026059 0.049294 0.334544 0.155170 0.275193 0.235092 0.275957 0.132104 0.454982 0.136957 0.134097 0.254352 0.422940 0.188611 0.396163 0.432784 0.051281 0.119772 0.276474 0.115627 0.419844 0.188056 0.160759 0.088061 0.649863 0.101318 0.203314 0.166595 0.106821 0.523270 Consensus sequence: YDYBDHTMCACGTGGADDBMDGT Reverse complement motif 0.523270 0.166595 0.106821 0.203314 0.160759 0.649863 0.088061 0.101318 0.276474 0.419844 0.115627 0.188056 0.396163 0.051281 0.432784 0.119772 0.134097 0.422940 0.254352 0.188611 0.275957 0.454982 0.132104 0.136957 0.235092 0.155170 0.275193 0.334544 0.049294 0.121789 0.026059 0.802859 0.003497 0.685942 0.088920 0.221641 0.003030 0.943472 0.004308 0.049190 0.902609 0.074770 0.006767 0.015854 0.019937 0.971329 0.005512 0.003221 0.003221 0.005512 0.971329 0.019937 0.015854 0.006767 0.074770 0.902609 0.049190 0.004308 0.943472 0.003030 0.017251 0.289284 0.173423 0.520042 0.802859 0.026059 0.121789 0.049294 0.339087 0.287193 0.154072 0.219647 0.296957 0.301094 0.155579 0.246370 0.140641 0.287668 0.405473 0.166218 0.507625 0.260812 0.103811 0.127752 0.220931 0.422396 0.169844 0.186829 0.410138 0.344851 0.124072 0.120938 Consensus sequence: ACHRBHDTCCACGTGYAHHBMHM Alignment: YDYBDHTMCACGTGGADDBMDGT --TTCAGCACCATGGACAGCKCC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00528 Foxm1_secondary Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 21 0.077977 Species: Mus musculus Original motif 0.399785 0.446658 0.111435 0.042122 0.535175 0.103991 0.089706 0.271128 0.078171 0.387987 0.375083 0.158759 0.309001 0.519142 0.070618 0.101239 0.201844 0.255818 0.323149 0.219190 0.534101 0.109845 0.235026 0.121028 0.656038 0.037473 0.261484 0.045006 0.315713 0.164290 0.471815 0.048182 0.651960 0.009412 0.328237 0.010391 0.937365 0.017313 0.007516 0.037807 0.019983 0.044238 0.012387 0.923392 0.061195 0.021485 0.881645 0.035675 0.017521 0.952998 0.013139 0.016342 0.254160 0.029735 0.493023 0.223082 0.239200 0.593324 0.114503 0.052973 0.610822 0.071539 0.099169 0.218470 0.166610 0.389712 0.204400 0.239278 0.227752 0.361626 0.178497 0.232125 0.537030 0.182466 0.026035 0.254470 0.235902 0.151006 0.043788 0.569304 0.081851 0.250397 0.590059 0.077693 0.340417 0.189613 0.272075 0.197895 Consensus sequence: MWSMBAARRATGCDCABHATGD Reverse complement motif 0.197895 0.189613 0.272075 0.340417 0.081851 0.590059 0.250397 0.077693 0.569304 0.151006 0.043788 0.235902 0.254470 0.182466 0.026035 0.537030 0.227752 0.178497 0.361626 0.232125 0.166610 0.204400 0.389712 0.239278 0.218470 0.071539 0.099169 0.610822 0.239200 0.114503 0.593324 0.052973 0.254160 0.493023 0.029735 0.223082 0.017521 0.013139 0.952998 0.016342 0.061195 0.881645 0.021485 0.035675 0.923392 0.044238 0.012387 0.019983 0.037807 0.017313 0.007516 0.937365 0.010391 0.009412 0.328237 0.651960 0.315713 0.471815 0.164290 0.048182 0.045006 0.037473 0.261484 0.656038 0.121028 0.109845 0.235026 0.534101 0.201844 0.323149 0.255818 0.219190 0.309001 0.070618 0.519142 0.101239 0.078171 0.375083 0.387987 0.158759 0.271128 0.103991 0.089706 0.535175 0.399785 0.111435 0.446658 0.042122 Consensus sequence: DCATDBTGHGCATKMTTBRSWR Alignment: DCATDBTGHGCATKMTTBRSWR -GGYGCTGTCCATGGTGCTGAA ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00400 Zif268 Reverse Complement Original Motif Backward 1 21 0.078597 Species: Mus musculus Original motif 0.104824 0.412716 0.254506 0.227955 0.644922 0.065476 0.140479 0.149122 0.201205 0.166164 0.347131 0.285501 0.360606 0.256316 0.150766 0.232313 0.199831 0.240681 0.279350 0.280137 0.234308 0.204076 0.321306 0.240310 0.274112 0.462435 0.111425 0.152028 0.067070 0.717501 0.073934 0.141496 0.106745 0.084442 0.658566 0.150247 0.025128 0.967053 0.003585 0.004234 0.006412 0.982989 0.003227 0.007371 0.009588 0.877620 0.002571 0.110221 0.621521 0.355443 0.015669 0.007366 0.002600 0.980275 0.004191 0.012934 0.118773 0.026658 0.783843 0.070725 0.022358 0.822101 0.024684 0.130857 0.713212 0.080912 0.128793 0.077084 0.166568 0.250955 0.107934 0.474544 0.225040 0.222494 0.163301 0.389166 0.268976 0.223206 0.265314 0.242504 0.137052 0.229058 0.148439 0.485451 0.135819 0.304550 0.141994 0.417637 0.272440 0.319501 0.230580 0.177478 Consensus sequence: BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV Reverse complement motif 0.272440 0.230580 0.319501 0.177478 0.417637 0.304550 0.141994 0.135819 0.485451 0.229058 0.148439 0.137052 0.242504 0.223206 0.265314 0.268976 0.389166 0.222494 0.163301 0.225040 0.474544 0.250955 0.107934 0.166568 0.077084 0.080912 0.128793 0.713212 0.022358 0.024684 0.822101 0.130857 0.118773 0.783843 0.026658 0.070725 0.002600 0.004191 0.980275 0.012934 0.007366 0.355443 0.015669 0.621521 0.009588 0.002571 0.877620 0.110221 0.006412 0.003227 0.982989 0.007371 0.025128 0.003585 0.967053 0.004234 0.106745 0.658566 0.084442 0.150247 0.067070 0.073934 0.717501 0.141496 0.274112 0.111425 0.462435 0.152028 0.234308 0.321306 0.204076 0.240310 0.280137 0.240681 0.279350 0.199831 0.232313 0.256316 0.150766 0.360606 0.201205 0.347131 0.166164 0.285501 0.149122 0.065476 0.140479 0.644922 0.104824 0.254506 0.412716 0.227955 Consensus sequence: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB Alignment: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB --GGYGCTGTCCATGGTGCTGAA ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 20 Motif name: PPARGRXRA Original motif 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.026744 0.427907 0.091860 0.116144 0.003484 0.779326 0.101045 0.161253 0.017401 0.781903 0.039443 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.082271 0.633835 0.207416 0.076477 0.949015 0.024334 0.017381 0.009270 0.604867 0.055620 0.312862 0.026651 0.825231 0.005787 0.158565 0.010417 0.095017 0.002317 0.888760 0.013905 0.047509 0.010429 0.803013 0.139050 0.025492 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.126450 0.784223 0.067285 0.054524 0.093968 Consensus sequence: BTRGGDCARAGGKCA Reserve complement motif 0.093968 0.067285 0.054524 0.784223 0.062645 0.167053 0.643852 0.126450 0.555041 0.114716 0.304751 0.025492 0.047509 0.803013 0.010429 0.139050 0.095017 0.888760 0.002317 0.013905 0.010417 0.005787 0.158565 0.825231 0.026651 0.055620 0.312862 0.604867 0.009270 0.024334 0.017381 0.949015 0.082271 0.207416 0.633835 0.076477 0.168213 0.458237 0.149652 0.223898 0.161253 0.781903 0.017401 0.039443 0.116144 0.779326 0.003484 0.101045 0.091860 0.026744 0.427907 0.453488 0.540793 0.193473 0.148019 0.117716 0.109685 0.373396 0.369895 0.147025 Consensus sequence: TGRCCTKTGHCCKAB ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 20 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00067 Lef1_primary Original Motif Reverse Complement Backward 2 15 0.030495 Species: Mus musculus Original motif 0.281920 0.214207 0.278077 0.225796 0.325566 0.151435 0.298797 0.224202 0.290253 0.145824 0.243443 0.320480 0.069286 0.404645 0.141614 0.384454 0.070044 0.621448 0.142647 0.165862 0.007295 0.907657 0.038110 0.046938 0.015587 0.018273 0.000658 0.965482 0.005527 0.005886 0.001905 0.986682 0.024512 0.001189 0.001344 0.972955 0.007384 0.025221 0.952270 0.015125 0.966438 0.000630 0.002693 0.030239 0.082252 0.001173 0.001495 0.915080 0.030255 0.677155 0.275323 0.017267 0.199467 0.118815 0.056814 0.624905 0.345445 0.169597 0.216831 0.268127 0.278106 0.150864 0.173693 0.397336 0.251834 0.339733 0.219703 0.188730 Consensus sequence: DDDYCCTTTGATCTDDV Reverse complement motif 0.251834 0.219703 0.339733 0.188730 0.397336 0.150864 0.173693 0.278106 0.268127 0.169597 0.216831 0.345445 0.624905 0.118815 0.056814 0.199467 0.030255 0.275323 0.677155 0.017267 0.915080 0.001173 0.001495 0.082252 0.030239 0.000630 0.002693 0.966438 0.007384 0.952270 0.025221 0.015125 0.972955 0.001189 0.001344 0.024512 0.986682 0.005886 0.001905 0.005527 0.965482 0.018273 0.000658 0.015587 0.007295 0.038110 0.907657 0.046938 0.070044 0.142647 0.621448 0.165862 0.069286 0.141614 0.404645 0.384454 0.320480 0.145824 0.243443 0.290253 0.224202 0.151435 0.298797 0.325566 0.225796 0.214207 0.278077 0.281920 Consensus sequence: VDDAGATCAAAGGKDDD Alignment: VDDAGATCAAAGGKDDD -BTRGGDCARAGGKCA- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00058 Tcf3_primary Original Motif Original Motif Forward 2 15 0.031947 Species: Mus musculus Original motif 0.185864 0.201179 0.183663 0.429294 0.371100 0.233868 0.122934 0.272098 0.249563 0.171285 0.128851 0.450301 0.582940 0.043382 0.129099 0.244578 0.041400 0.395349 0.497087 0.066163 0.759123 0.009670 0.005936 0.225270 0.056579 0.008662 0.003986 0.930772 0.043968 0.865783 0.056001 0.034249 0.962748 0.003731 0.003265 0.030256 0.971318 0.003542 0.012299 0.012841 0.937558 0.003991 0.020195 0.038256 0.125931 0.057976 0.798081 0.018012 0.209401 0.172342 0.483980 0.134277 0.485703 0.129227 0.309936 0.075134 0.397027 0.195902 0.152395 0.254676 0.311636 0.231510 0.157732 0.299122 0.320965 0.206031 0.164299 0.308705 Consensus sequence: HHHASATCAAAGVRHHH Reverse complement motif 0.308705 0.206031 0.164299 0.320965 0.299122 0.231510 0.157732 0.311636 0.254676 0.195902 0.152395 0.397027 0.075134 0.129227 0.309936 0.485703 0.209401 0.483980 0.172342 0.134277 0.125931 0.798081 0.057976 0.018012 0.038256 0.003991 0.020195 0.937558 0.012841 0.003542 0.012299 0.971318 0.030256 0.003731 0.003265 0.962748 0.043968 0.056001 0.865783 0.034249 0.930772 0.008662 0.003986 0.056579 0.225270 0.009670 0.005936 0.759123 0.041400 0.497087 0.395349 0.066163 0.244578 0.043382 0.129099 0.582940 0.450301 0.171285 0.128851 0.249563 0.272098 0.233868 0.122934 0.371100 0.429294 0.201179 0.183663 0.185864 Consensus sequence: HHHKVCTTTGATSTHHH Alignment: HHHASATCAAAGVRHHH -BTRGGDCARAGGKCA- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00054 Tcf7_primary Original Motif Original Motif Backward 2 15 0.032779 Species: Mus musculus Original motif 0.170811 0.196976 0.220503 0.411710 0.337231 0.228482 0.140137 0.294150 0.299312 0.173780 0.143426 0.383481 0.603957 0.053557 0.128214 0.214271 0.036338 0.377925 0.534647 0.051091 0.725865 0.010314 0.008501 0.255320 0.067855 0.007849 0.004559 0.919737 0.049387 0.815496 0.098330 0.036787 0.960514 0.005036 0.005137 0.029313 0.960631 0.004550 0.018815 0.016004 0.935245 0.005169 0.023866 0.035720 0.159760 0.060340 0.761341 0.018559 0.228534 0.153897 0.523052 0.094517 0.557984 0.123512 0.254154 0.064350 0.490252 0.211976 0.124557 0.173215 0.310463 0.250279 0.132612 0.306646 0.332720 0.248937 0.120633 0.297711 Consensus sequence: BHHASATCAAAGGAHHH Reverse complement motif 0.297711 0.248937 0.120633 0.332720 0.306646 0.250279 0.132612 0.310463 0.173215 0.211976 0.124557 0.490252 0.064350 0.123512 0.254154 0.557984 0.228534 0.523052 0.153897 0.094517 0.159760 0.761341 0.060340 0.018559 0.035720 0.005169 0.023866 0.935245 0.016004 0.004550 0.018815 0.960631 0.029313 0.005036 0.005137 0.960514 0.049387 0.098330 0.815496 0.036787 0.919737 0.007849 0.004559 0.067855 0.255320 0.010314 0.008501 0.725865 0.036338 0.534647 0.377925 0.051091 0.214271 0.053557 0.128214 0.603957 0.383481 0.173780 0.143426 0.299312 0.294150 0.228482 0.140137 0.337231 0.411710 0.196976 0.220503 0.170811 Consensus sequence: HHHTCCTTTGATSTHHV Alignment: BHHASATCAAAGGAHHH -BTRGGDCARAGGKCA- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00082 Zfp187_secondary Original Motif Reverse Complement Backward 2 15 0.033418 Species: Mus musculus Original motif 0.173063 0.169680 0.440836 0.216421 0.353277 0.179996 0.249403 0.217325 0.307337 0.038055 0.616380 0.038228 0.316636 0.564670 0.023732 0.094962 0.015484 0.923764 0.019439 0.041313 0.011243 0.956300 0.009443 0.023014 0.062273 0.107531 0.010739 0.819456 0.126670 0.201521 0.192005 0.479803 0.093090 0.045924 0.835792 0.025194 0.020165 0.015483 0.009567 0.954786 0.010873 0.672448 0.004559 0.312121 0.018002 0.846860 0.017605 0.117533 0.335703 0.408170 0.104095 0.152031 0.150308 0.362296 0.067408 0.419988 0.286490 0.242211 0.176532 0.294767 0.265022 0.249655 0.272219 0.213104 Consensus sequence: DDGMCCTBGTCCHYHV Reverse complement motif 0.265022 0.272219 0.249655 0.213104 0.294767 0.242211 0.176532 0.286490 0.419988 0.362296 0.067408 0.150308 0.335703 0.104095 0.408170 0.152031 0.018002 0.017605 0.846860 0.117533 0.010873 0.004559 0.672448 0.312121 0.954786 0.015483 0.009567 0.020165 0.093090 0.835792 0.045924 0.025194 0.479803 0.201521 0.192005 0.126670 0.819456 0.107531 0.010739 0.062273 0.011243 0.009443 0.956300 0.023014 0.015484 0.019439 0.923764 0.041313 0.316636 0.023732 0.564670 0.094962 0.307337 0.616380 0.038055 0.038228 0.217325 0.179996 0.249403 0.353277 0.173063 0.440836 0.169680 0.216421 Consensus sequence: VHMDGGACVAGGRCDH Alignment: VHMDGGACVAGGRCDH BTRGGDCARAGGKCA- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00062 Sox4_primary Original Motif Original Motif Backward 2 15 0.035254 Species: Mus musculus Original motif 0.427843 0.231210 0.119424 0.221523 0.196506 0.239531 0.304906 0.259057 0.302488 0.156922 0.290190 0.250401 0.433872 0.149126 0.196496 0.220506 0.258426 0.076511 0.475100 0.189963 0.841714 0.046453 0.099915 0.011918 0.983853 0.001612 0.001362 0.013174 0.003460 0.982032 0.005728 0.008780 0.989743 0.002253 0.002020 0.005984 0.990761 0.003397 0.002843 0.003000 0.770864 0.003540 0.001549 0.224048 0.235342 0.002598 0.757383 0.004677 0.371426 0.089574 0.529959 0.009040 0.480804 0.196949 0.240413 0.081833 0.187158 0.355102 0.216599 0.241142 0.248006 0.232182 0.157452 0.362360 0.403367 0.177684 0.164649 0.254300 Consensus sequence: HBDDDAACAAAGRVBHH Reverse complement motif 0.254300 0.177684 0.164649 0.403367 0.362360 0.232182 0.157452 0.248006 0.187158 0.216599 0.355102 0.241142 0.081833 0.196949 0.240413 0.480804 0.371426 0.529959 0.089574 0.009040 0.235342 0.757383 0.002598 0.004677 0.224048 0.003540 0.001549 0.770864 0.003000 0.003397 0.002843 0.990761 0.005984 0.002253 0.002020 0.989743 0.003460 0.005728 0.982032 0.008780 0.013174 0.001612 0.001362 0.983853 0.011918 0.046453 0.099915 0.841714 0.258426 0.475100 0.076511 0.189963 0.220506 0.149126 0.196496 0.433872 0.250401 0.156922 0.290190 0.302488 0.196506 0.304906 0.239531 0.259057 0.221523 0.231210 0.119424 0.427843 Consensus sequence: HHBBMCTTTGTTHDDBH Alignment: HBDDDAACAAAGRVBHH -BTRGGDCARAGGKCA- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00030 Sox11_primary Original Motif Original Motif Backward 2 15 0.035878 Species: Mus musculus Original motif 0.351812 0.238467 0.143954 0.265768 0.195246 0.235838 0.281473 0.287443 0.349478 0.172616 0.210739 0.267167 0.484061 0.110438 0.173131 0.232370 0.276692 0.070713 0.479604 0.172991 0.859124 0.044167 0.083951 0.012758 0.975608 0.002029 0.002285 0.020079 0.006422 0.978485 0.007124 0.007969 0.987489 0.003025 0.002868 0.006617 0.987739 0.005463 0.002730 0.004067 0.693013 0.004067 0.002445 0.300475 0.189100 0.003677 0.801408 0.005814 0.352090 0.072517 0.567737 0.007656 0.542316 0.176545 0.192768 0.088371 0.196382 0.304176 0.205985 0.293457 0.289415 0.201358 0.182937 0.326290 0.385801 0.216362 0.152363 0.245475 Consensus sequence: HBDDRAACAAAGRABHH Reverse complement motif 0.245475 0.216362 0.152363 0.385801 0.326290 0.201358 0.182937 0.289415 0.196382 0.205985 0.304176 0.293457 0.088371 0.176545 0.192768 0.542316 0.352090 0.567737 0.072517 0.007656 0.189100 0.801408 0.003677 0.005814 0.300475 0.004067 0.002445 0.693013 0.004067 0.005463 0.002730 0.987739 0.006617 0.003025 0.002868 0.987489 0.006422 0.007124 0.978485 0.007969 0.020079 0.002029 0.002285 0.975608 0.012758 0.044167 0.083951 0.859124 0.276692 0.479604 0.070713 0.172991 0.232370 0.110438 0.173131 0.484061 0.267167 0.172616 0.210739 0.349478 0.287443 0.235838 0.281473 0.195246 0.265768 0.238467 0.143954 0.351812 Consensus sequence: HHBTMCTTTGTTMDDVH Alignment: HBDDRAACAAAGRABHH -BTRGGDCARAGGKCA- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00101 Sox12_secondary Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 15 0.037473 Species: Mus musculus Original motif 0.378898 0.318901 0.205859 0.096341 0.352524 0.321236 0.224504 0.101736 0.323551 0.182056 0.210897 0.283496 0.135539 0.325230 0.208031 0.331200 0.663106 0.055471 0.154459 0.126963 0.051748 0.292567 0.537307 0.118378 0.886489 0.042361 0.035742 0.035408 0.043647 0.688744 0.094358 0.173252 0.882052 0.039818 0.018899 0.059231 0.864171 0.036011 0.068363 0.031455 0.790158 0.046868 0.041594 0.121379 0.087447 0.143905 0.707798 0.060849 0.295919 0.132479 0.485703 0.085899 0.653156 0.133004 0.110012 0.103828 0.351764 0.131771 0.217730 0.298736 0.203977 0.196773 0.099958 0.499292 Consensus sequence: VVDBASACAAAGRADH Reverse complement motif 0.499292 0.196773 0.099958 0.203977 0.298736 0.131771 0.217730 0.351764 0.103828 0.133004 0.110012 0.653156 0.295919 0.485703 0.132479 0.085899 0.087447 0.707798 0.143905 0.060849 0.121379 0.046868 0.041594 0.790158 0.031455 0.036011 0.068363 0.864171 0.059231 0.039818 0.018899 0.882052 0.043647 0.094358 0.688744 0.173252 0.035408 0.042361 0.035742 0.886489 0.051748 0.537307 0.292567 0.118378 0.126963 0.055471 0.154459 0.663106 0.331200 0.325230 0.208031 0.135539 0.283496 0.182056 0.210897 0.323551 0.101736 0.321236 0.224504 0.352524 0.096341 0.318901 0.205859 0.378898 Consensus sequence: HDTMCTTTGTSTVDBB Alignment: HDTMCTTTGTSTVDBB TGRCCTKTGHCCKAB- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00083 Tcf7l2_primary Original Motif Reverse Complement Backward 2 15 0.037976 Species: Mus musculus Original motif 0.285725 0.187143 0.254855 0.272277 0.276264 0.157893 0.258178 0.307665 0.238788 0.161120 0.254018 0.346074 0.076041 0.333901 0.150903 0.439156 0.093376 0.526578 0.180529 0.199517 0.010827 0.880320 0.034150 0.074703 0.016546 0.023834 0.000940 0.958680 0.007166 0.008215 0.001941 0.982678 0.029634 0.001363 0.001379 0.967625 0.010872 0.031751 0.926186 0.031190 0.949407 0.000760 0.002581 0.047253 0.109203 0.001362 0.002094 0.887341 0.044198 0.567994 0.353059 0.034749 0.222623 0.142360 0.041281 0.593736 0.358872 0.167597 0.220534 0.252997 0.233072 0.141480 0.230985 0.394463 0.350703 0.243129 0.233961 0.172207 Consensus sequence: DDDYCCTTTGATSTDDV Reverse complement motif 0.172207 0.243129 0.233961 0.350703 0.394463 0.141480 0.230985 0.233072 0.252997 0.167597 0.220534 0.358872 0.593736 0.142360 0.041281 0.222623 0.044198 0.353059 0.567994 0.034749 0.887341 0.001362 0.002094 0.109203 0.047253 0.000760 0.002581 0.949407 0.010872 0.926186 0.031751 0.031190 0.967625 0.001363 0.001379 0.029634 0.982678 0.008215 0.001941 0.007166 0.958680 0.023834 0.000940 0.016546 0.010827 0.034150 0.880320 0.074703 0.093376 0.180529 0.526578 0.199517 0.439156 0.333901 0.150903 0.076041 0.346074 0.161120 0.254018 0.238788 0.307665 0.157893 0.258178 0.276264 0.272277 0.187143 0.254855 0.285725 Consensus sequence: BDDASATCAAAGGMDDD Alignment: BDDASATCAAAGGMDDD -BTRGGDCARAGGKCA- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00093 Klf7_primary Original Motif Reverse Complement Backward 2 15 0.038273 Species: Mus musculus Original motif 0.204514 0.198353 0.171218 0.425915 0.167188 0.296785 0.246082 0.289946 0.267330 0.148001 0.398674 0.185994 0.549386 0.060167 0.337100 0.053347 0.050746 0.900013 0.022169 0.027073 0.037905 0.920332 0.008360 0.033403 0.410356 0.566702 0.016267 0.006675 0.009526 0.982354 0.001060 0.007060 0.204292 0.001084 0.748567 0.046056 0.003955 0.988490 0.002821 0.004735 0.004264 0.988826 0.004311 0.002598 0.002758 0.929549 0.001244 0.066448 0.260332 0.421683 0.024720 0.293265 0.184798 0.247697 0.085237 0.482268 0.347537 0.197344 0.139961 0.315159 0.255281 0.166620 0.242297 0.335802 Consensus sequence: HBDRCCMCGCCCHHHD Reverse complement motif 0.335802 0.166620 0.242297 0.255281 0.315159 0.197344 0.139961 0.347537 0.482268 0.247697 0.085237 0.184798 0.260332 0.024720 0.421683 0.293265 0.002758 0.001244 0.929549 0.066448 0.004264 0.004311 0.988826 0.002598 0.003955 0.002821 0.988490 0.004735 0.204292 0.748567 0.001084 0.046056 0.009526 0.001060 0.982354 0.007060 0.410356 0.016267 0.566702 0.006675 0.037905 0.008360 0.920332 0.033403 0.050746 0.022169 0.900013 0.027073 0.053347 0.060167 0.337100 0.549386 0.267330 0.398674 0.148001 0.185994 0.167188 0.246082 0.296785 0.289946 0.425915 0.198353 0.171218 0.204514 Consensus sequence: DHHDGGGCGRGGKHBH Alignment: DHHDGGGCGRGGKHBH BTRGGDCARAGGKCA- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00055 Hbp1_secondary Original Motif Reverse Complement Backward 3 15 0.039717 Species: Mus musculus Original motif 0.313621 0.149049 0.200899 0.336432 0.262644 0.147616 0.334882 0.254859 0.175848 0.137857 0.292272 0.394023 0.045910 0.364107 0.180535 0.409448 0.093235 0.718630 0.093516 0.094619 0.095552 0.724866 0.044589 0.134993 0.058227 0.785149 0.029814 0.126810 0.897368 0.023735 0.019064 0.059832 0.043826 0.041750 0.020731 0.893692 0.044268 0.013557 0.014689 0.927487 0.102208 0.026005 0.709573 0.162214 0.058404 0.046118 0.135257 0.760221 0.303689 0.280676 0.320259 0.095375 0.258633 0.262177 0.197029 0.282161 0.564761 0.122466 0.194691 0.118082 0.104738 0.358061 0.310533 0.226668 0.267450 0.230099 0.197859 0.304593 Consensus sequence: DDDYCCCATTGTVHABH Reverse complement motif 0.304593 0.230099 0.197859 0.267450 0.104738 0.310533 0.358061 0.226668 0.118082 0.122466 0.194691 0.564761 0.282161 0.262177 0.197029 0.258633 0.303689 0.320259 0.280676 0.095375 0.760221 0.046118 0.135257 0.058404 0.102208 0.709573 0.026005 0.162214 0.927487 0.013557 0.014689 0.044268 0.893692 0.041750 0.020731 0.043826 0.059832 0.023735 0.019064 0.897368 0.058227 0.029814 0.785149 0.126810 0.095552 0.044589 0.724866 0.134993 0.093235 0.093516 0.718630 0.094619 0.409448 0.364107 0.180535 0.045910 0.394023 0.137857 0.292272 0.175848 0.262644 0.334882 0.147616 0.254859 0.336432 0.149049 0.200899 0.313621 Consensus sequence: HBTHVACAATGGGMDHD Alignment: HBTHVACAATGGGMDHD BTRGGDCARAGGKCA-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 21 Motif name: PLAG1 Original motif 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.166667 0.000000 0.777778 0.055556 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.944444 0.055556 0.000000 0.777778 0.222222 0.000000 0.000000 0.833333 0.055556 0.111111 0.222222 0.555556 0.055556 0.166667 0.666667 0.000000 0.000000 0.333333 0.611111 0.277778 0.111111 0.000000 0.111111 0.000000 0.777778 0.111111 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.888889 0.111111 0.111111 0.000000 0.888889 0.000000 Consensus sequence: GGGGCCCAAGGGGG Reserve complement motif 0.111111 0.888889 0.000000 0.000000 0.000000 0.888889 0.000000 0.111111 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.111111 0.777778 0.000000 0.111111 0.000000 0.277778 0.111111 0.611111 0.333333 0.000000 0.000000 0.666667 0.222222 0.055556 0.555556 0.166667 0.000000 0.055556 0.833333 0.111111 0.000000 0.222222 0.777778 0.000000 0.000000 0.944444 0.000000 0.055556 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.166667 0.777778 0.000000 0.055556 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 Consensus sequence: CCCCCTTGGGCCCC ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 21 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00102 Zic1_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 14 0.049953 Species: Mus musculus Original motif 0.174040 0.367918 0.270176 0.187866 0.359560 0.309872 0.111047 0.219520 0.094468 0.790352 0.026034 0.089145 0.114860 0.779490 0.050895 0.054755 0.105195 0.837712 0.031857 0.025237 0.045234 0.825039 0.073990 0.055737 0.145555 0.592986 0.228415 0.033044 0.045273 0.175001 0.607615 0.172111 0.055737 0.073990 0.825039 0.045234 0.025237 0.031857 0.837712 0.105195 0.054755 0.050895 0.779490 0.114860 0.089145 0.026034 0.790352 0.094468 0.060833 0.067787 0.717352 0.154028 0.097742 0.194545 0.591608 0.116104 Consensus sequence: BHCCCCCGGGGGGG Reverse complement motif 0.097742 0.591608 0.194545 0.116104 0.060833 0.717352 0.067787 0.154028 0.089145 0.790352 0.026034 0.094468 0.054755 0.779490 0.050895 0.114860 0.025237 0.837712 0.031857 0.105195 0.055737 0.825039 0.073990 0.045234 0.045273 0.607615 0.175001 0.172111 0.145555 0.228415 0.592986 0.033044 0.045234 0.073990 0.825039 0.055737 0.105195 0.031857 0.837712 0.025237 0.114860 0.050895 0.779490 0.054755 0.094468 0.026034 0.790352 0.089145 0.219520 0.309872 0.111047 0.359560 0.174040 0.270176 0.367918 0.187866 Consensus sequence: CCCCCCCGGGGGHB Alignment: CCCCCCCGGGGGHB CCCCCTTGGGCCCC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_primaryReverse Complement Original Motif Backward 1 14 0.054061 Species: Mus musculus Original motif 0.183797 0.268049 0.330111 0.218043 0.127599 0.330310 0.243614 0.298477 0.143199 0.188046 0.268593 0.400162 0.214690 0.205230 0.247090 0.332990 0.294688 0.299104 0.327152 0.079056 0.221909 0.193223 0.480155 0.104712 0.444072 0.068239 0.481838 0.005852 0.006182 0.015429 0.901278 0.077111 0.766535 0.111138 0.121632 0.000696 0.014848 0.973961 0.000298 0.010893 0.001807 0.992200 0.002669 0.003324 0.795344 0.140510 0.018576 0.045571 0.006990 0.988200 0.002510 0.002299 0.154898 0.842296 0.000998 0.001808 0.029577 0.919262 0.006935 0.044226 0.677987 0.032075 0.185065 0.104874 0.195132 0.364580 0.319321 0.120967 0.225412 0.115034 0.612849 0.046705 0.548628 0.058900 0.162857 0.229616 0.112531 0.340331 0.165910 0.381227 0.073029 0.303078 0.363896 0.259997 0.561485 0.260567 0.092979 0.084969 0.132283 0.457691 0.140159 0.269867 Consensus sequence: BBBDVVRGACCACCCAVGABBAB Reverse complement motif 0.132283 0.140159 0.457691 0.269867 0.084969 0.260567 0.092979 0.561485 0.073029 0.363896 0.303078 0.259997 0.381227 0.340331 0.165910 0.112531 0.229616 0.058900 0.162857 0.548628 0.225412 0.612849 0.115034 0.046705 0.195132 0.319321 0.364580 0.120967 0.104874 0.032075 0.185065 0.677987 0.029577 0.006935 0.919262 0.044226 0.154898 0.000998 0.842296 0.001808 0.006990 0.002510 0.988200 0.002299 0.045571 0.140510 0.018576 0.795344 0.001807 0.002669 0.992200 0.003324 0.014848 0.000298 0.973961 0.010893 0.000696 0.111138 0.121632 0.766535 0.006182 0.901278 0.015429 0.077111 0.444072 0.481838 0.068239 0.005852 0.221909 0.480155 0.193223 0.104712 0.294688 0.327152 0.299104 0.079056 0.332990 0.205230 0.247090 0.214690 0.400162 0.188046 0.268593 0.143199 0.127599 0.243614 0.330310 0.298477 0.183797 0.330111 0.268049 0.218043 Consensus sequence: BTBVTCVTGGGTGGTCMVVDVBB Alignment: BBBDVVRGACCACCCAVGABBAB ---------CCCCCTTGGGCCCC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00057 Zic2_primary Reverse Complement Original Motif Backward 1 14 0.054841 Species: Mus musculus Original motif 0.171475 0.300729 0.275648 0.252148 0.274948 0.494479 0.090926 0.139646 0.136266 0.716563 0.033328 0.113843 0.116272 0.772964 0.046083 0.064680 0.103529 0.835329 0.032215 0.028927 0.057023 0.813129 0.071277 0.058571 0.057483 0.766273 0.157290 0.018955 0.071535 0.110226 0.631760 0.186479 0.058571 0.071277 0.813129 0.057023 0.028927 0.032215 0.835329 0.103529 0.064680 0.046083 0.772964 0.116272 0.113843 0.033328 0.716563 0.136266 0.119744 0.068294 0.609218 0.202743 0.065793 0.215443 0.562951 0.155813 0.178819 0.196535 0.205955 0.418691 Consensus sequence: BMCCCCCGGGGGGGB Reverse complement motif 0.418691 0.196535 0.205955 0.178819 0.065793 0.562951 0.215443 0.155813 0.119744 0.609218 0.068294 0.202743 0.113843 0.716563 0.033328 0.136266 0.064680 0.772964 0.046083 0.116272 0.028927 0.835329 0.032215 0.103529 0.058571 0.813129 0.071277 0.057023 0.071535 0.631760 0.110226 0.186479 0.057483 0.157290 0.766273 0.018955 0.057023 0.071277 0.813129 0.058571 0.103529 0.032215 0.835329 0.028927 0.116272 0.046083 0.772964 0.064680 0.136266 0.033328 0.716563 0.113843 0.274948 0.090926 0.494479 0.139646 0.171475 0.275648 0.300729 0.252148 Consensus sequence: VCCCCCCCGGGGGRB Alignment: BMCCCCCGGGGGGGB -CCCCCTTGGGCCCC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00005 Tcfap2a_secondary Original Motif Reverse Complement Backward 1 14 0.055678 Species: Mus musculus Original motif 0.198427 0.243196 0.159241 0.399136 0.267754 0.388187 0.116811 0.227248 0.448284 0.056403 0.414623 0.080691 0.031469 0.826323 0.055436 0.086772 0.035527 0.756642 0.022985 0.184845 0.127338 0.316078 0.155806 0.400778 0.135021 0.313650 0.287760 0.263570 0.418892 0.082297 0.068352 0.430460 0.201062 0.044735 0.711358 0.042845 0.038934 0.022320 0.903763 0.034982 0.201790 0.065554 0.460526 0.272130 0.006890 0.786923 0.061853 0.144334 0.460666 0.103658 0.196452 0.239224 0.092272 0.204611 0.390375 0.312742 Consensus sequence: HHRCCBBWGGDCDB Reverse complement motif 0.092272 0.390375 0.204611 0.312742 0.239224 0.103658 0.196452 0.460666 0.006890 0.061853 0.786923 0.144334 0.201790 0.460526 0.065554 0.272130 0.038934 0.903763 0.022320 0.034982 0.201062 0.711358 0.044735 0.042845 0.430460 0.082297 0.068352 0.418892 0.135021 0.287760 0.313650 0.263570 0.400778 0.316078 0.155806 0.127338 0.035527 0.022985 0.756642 0.184845 0.031469 0.055436 0.826323 0.086772 0.080691 0.056403 0.414623 0.448284 0.267754 0.116811 0.388187 0.227248 0.399136 0.243196 0.159241 0.198427 Consensus sequence: BDGHCCWBVGGKDH Alignment: BDGHCCWBVGGKDH GGGGCCCAAGGGGG ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00006 Zic3_primary Reverse Complement Original Motif Backward 1 14 0.056976 Species: Mus musculus Original motif 0.133123 0.374622 0.252864 0.239392 0.305344 0.451195 0.093638 0.149822 0.125347 0.723516 0.027695 0.123442 0.129457 0.754873 0.045215 0.070455 0.117681 0.809987 0.036742 0.035590 0.046565 0.817263 0.077300 0.058872 0.047132 0.790594 0.143506 0.018768 0.059681 0.087688 0.665195 0.187436 0.058872 0.077300 0.817263 0.046565 0.035590 0.036742 0.809987 0.117681 0.070455 0.045215 0.754873 0.129457 0.123442 0.027695 0.723516 0.125347 0.104029 0.069439 0.636026 0.190506 0.070968 0.197801 0.581172 0.150060 0.147077 0.235294 0.230097 0.387531 Consensus sequence: BMCCCCCGGGGGGGB Reverse complement motif 0.387531 0.235294 0.230097 0.147077 0.070968 0.581172 0.197801 0.150060 0.104029 0.636026 0.069439 0.190506 0.123442 0.723516 0.027695 0.125347 0.070455 0.754873 0.045215 0.129457 0.035590 0.809987 0.036742 0.117681 0.058872 0.817263 0.077300 0.046565 0.059681 0.665195 0.087688 0.187436 0.047132 0.143506 0.790594 0.018768 0.046565 0.077300 0.817263 0.058872 0.117681 0.036742 0.809987 0.035590 0.129457 0.045215 0.754873 0.070455 0.125347 0.027695 0.723516 0.123442 0.305344 0.093638 0.451195 0.149822 0.133123 0.252864 0.374622 0.239392 Consensus sequence: VCCCCCCCGGGGGRB Alignment: BMCCCCCGGGGGGGB -CCCCCTTGGGCCCC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_primaryReverse Complement Original Motif Backward 9 14 0.057350 Species: Mus musculus Original motif 0.180868 0.321661 0.134642 0.362829 0.232215 0.134289 0.315356 0.318141 0.065068 0.093681 0.569842 0.271408 0.370822 0.229680 0.154738 0.244759 0.323039 0.182873 0.173588 0.320500 0.175039 0.266898 0.276080 0.281984 0.412669 0.147730 0.146326 0.293275 0.325953 0.028805 0.629596 0.015646 0.003017 0.001766 0.979711 0.015507 0.888973 0.040666 0.069420 0.000941 0.017309 0.979155 0.000899 0.002637 0.001732 0.988816 0.004856 0.004596 0.889763 0.078125 0.010384 0.021729 0.007566 0.987081 0.001421 0.003932 0.027797 0.966593 0.000878 0.004731 0.025816 0.867003 0.065749 0.041433 0.220658 0.075256 0.582904 0.121182 0.088946 0.283695 0.565345 0.062015 0.328012 0.241332 0.305901 0.124755 0.307302 0.137589 0.375928 0.179181 0.298752 0.231470 0.315255 0.154524 0.094565 0.142901 0.705696 0.056838 Consensus sequence: HDGHHBHRGACCACCCGSVDVG Reverse complement motif 0.094565 0.705696 0.142901 0.056838 0.298752 0.315255 0.231470 0.154524 0.307302 0.375928 0.137589 0.179181 0.124755 0.241332 0.305901 0.328012 0.088946 0.565345 0.283695 0.062015 0.220658 0.582904 0.075256 0.121182 0.025816 0.065749 0.867003 0.041433 0.027797 0.000878 0.966593 0.004731 0.007566 0.001421 0.987081 0.003932 0.021729 0.078125 0.010384 0.889763 0.001732 0.004856 0.988816 0.004596 0.017309 0.000899 0.979155 0.002637 0.000941 0.040666 0.069420 0.888973 0.003017 0.979711 0.001766 0.015507 0.325953 0.629596 0.028805 0.015646 0.293275 0.147730 0.146326 0.412669 0.281984 0.266898 0.276080 0.175039 0.320500 0.182873 0.173588 0.323039 0.244759 0.229680 0.154738 0.370822 0.065068 0.569842 0.093681 0.271408 0.318141 0.134289 0.315356 0.232215 0.362829 0.321661 0.134642 0.180868 Consensus sequence: CVHBSCGGGTGGTCMHVHHCDH Alignment: HDGHHBHRGACCACCCGSVDVG CCCCCTTGGGCCCC-------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v015681_secondaryReverse Complement Reverse Complement Forward 9 14 0.057902 Species: Mus musculus Original motif 0.214165 0.143436 0.372522 0.269876 0.314445 0.406003 0.160351 0.119201 0.137147 0.092924 0.042921 0.727007 0.044121 0.072843 0.051741 0.831295 0.261292 0.324124 0.298498 0.116086 0.258125 0.323243 0.263362 0.155271 0.204557 0.589399 0.107153 0.098891 0.371021 0.244027 0.291102 0.093849 0.096327 0.572718 0.011797 0.319159 0.027282 0.046183 0.844519 0.082016 0.018921 0.012887 0.915917 0.052275 0.364793 0.166722 0.084229 0.384256 0.028216 0.011233 0.951056 0.009495 0.054974 0.004738 0.890377 0.049911 0.006802 0.312915 0.134247 0.546036 0.241289 0.628210 0.104788 0.025713 0.237863 0.302807 0.213018 0.246311 0.349399 0.203220 0.086635 0.360746 0.386634 0.144693 0.246895 0.221779 0.425101 0.354676 0.093374 0.126849 0.060272 0.391320 0.104905 0.443503 0.162090 0.190233 0.227433 0.420244 Consensus sequence: DVTTVVCVYGGHGGYCHHDMYB Reverse complement motif 0.420244 0.190233 0.227433 0.162090 0.443503 0.391320 0.104905 0.060272 0.126849 0.354676 0.093374 0.425101 0.221779 0.144693 0.246895 0.386634 0.360746 0.203220 0.086635 0.349399 0.237863 0.213018 0.302807 0.246311 0.241289 0.104788 0.628210 0.025713 0.546036 0.312915 0.134247 0.006802 0.054974 0.890377 0.004738 0.049911 0.028216 0.951056 0.011233 0.009495 0.384256 0.166722 0.084229 0.364793 0.018921 0.915917 0.012887 0.052275 0.027282 0.844519 0.046183 0.082016 0.096327 0.011797 0.572718 0.319159 0.093849 0.244027 0.291102 0.371021 0.204557 0.107153 0.589399 0.098891 0.258125 0.263362 0.323243 0.155271 0.261292 0.298498 0.324124 0.116086 0.831295 0.072843 0.051741 0.044121 0.727007 0.092924 0.042921 0.137147 0.314445 0.160351 0.406003 0.119201 0.214165 0.372522 0.143436 0.269876 Consensus sequence: VMYDHDGMCCHCCKBGVVAAVH Alignment: VMYDHDGMCCHCCKBGVVAAVH --------CCCCCTTGGGCCCC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v015681_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 9 14 0.058066 Species: Mus musculus Original motif 0.331499 0.188505 0.182841 0.297156 0.328961 0.213025 0.273530 0.184484 0.197213 0.129292 0.524914 0.148581 0.274491 0.226406 0.312118 0.186986 0.103231 0.393726 0.364988 0.138055 0.552594 0.166422 0.186262 0.094722 0.157618 0.064773 0.616497 0.161112 0.139166 0.176098 0.621185 0.063551 0.748420 0.062398 0.012447 0.176735 0.116584 0.009438 0.860326 0.013653 0.005030 0.003646 0.974877 0.016447 0.055257 0.007181 0.921760 0.015802 0.032748 0.058249 0.052709 0.856293 0.105606 0.872231 0.014370 0.007793 0.019480 0.497379 0.125899 0.357242 0.478582 0.269713 0.061464 0.190242 0.253985 0.287006 0.201320 0.257689 0.319384 0.210231 0.175842 0.294543 0.222123 0.287802 0.201294 0.288782 0.139951 0.376041 0.081133 0.402875 0.213450 0.343835 0.383676 0.059039 0.322294 0.355918 0.148062 0.173725 Consensus sequence: HVGVSAGGAGGGTCYHHHHYVH Reverse complement motif 0.322294 0.148062 0.355918 0.173725 0.213450 0.383676 0.343835 0.059039 0.402875 0.376041 0.081133 0.139951 0.288782 0.287802 0.201294 0.222123 0.294543 0.210231 0.175842 0.319384 0.253985 0.201320 0.287006 0.257689 0.190242 0.269713 0.061464 0.478582 0.019480 0.125899 0.497379 0.357242 0.105606 0.014370 0.872231 0.007793 0.856293 0.058249 0.052709 0.032748 0.055257 0.921760 0.007181 0.015802 0.005030 0.974877 0.003646 0.016447 0.116584 0.860326 0.009438 0.013653 0.176735 0.062398 0.012447 0.748420 0.139166 0.621185 0.176098 0.063551 0.157618 0.616497 0.064773 0.161112 0.094722 0.166422 0.186262 0.552594 0.103231 0.364988 0.393726 0.138055 0.274491 0.312118 0.226406 0.186986 0.197213 0.524914 0.129292 0.148581 0.184484 0.213025 0.273530 0.328961 0.297156 0.188505 0.182841 0.331499 Consensus sequence: DVMHHDHKGACCCTCCTSVCBH Alignment: DVMHHDHKGACCCTCCTSVCBH CCCCCTTGGGCCCC-------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_primaryReverse Complement Reverse Complement Backward 1 14 0.059745 Species: Mus musculus Original motif 0.204923 0.208846 0.365383 0.220848 0.294304 0.300143 0.167287 0.238266 0.109711 0.619514 0.117379 0.153396 0.178979 0.378580 0.230177 0.212264 0.159594 0.542602 0.118178 0.179627 0.125206 0.430074 0.151826 0.292894 0.097692 0.709845 0.116956 0.075506 0.148292 0.565912 0.037632 0.248164 0.077951 0.034190 0.855503 0.032356 0.001657 0.001061 0.971877 0.025405 0.001926 0.001084 0.991712 0.005278 0.033031 0.012001 0.057796 0.897171 0.002723 0.002647 0.993348 0.001281 0.003261 0.000963 0.987199 0.008577 0.000611 0.090925 0.074857 0.833608 0.015299 0.978878 0.004949 0.000874 0.013368 0.600902 0.033485 0.352245 0.231949 0.149575 0.118804 0.499672 0.267580 0.186002 0.371242 0.175176 0.264884 0.223483 0.110082 0.401551 0.221365 0.170121 0.179559 0.428955 0.112997 0.692930 0.139981 0.054092 0.460305 0.207883 0.155111 0.176702 Consensus sequence: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH Reverse complement motif 0.176702 0.207883 0.155111 0.460305 0.112997 0.139981 0.692930 0.054092 0.428955 0.170121 0.179559 0.221365 0.401551 0.223483 0.110082 0.264884 0.267580 0.371242 0.186002 0.175176 0.499672 0.149575 0.118804 0.231949 0.013368 0.033485 0.600902 0.352245 0.015299 0.004949 0.978878 0.000874 0.833608 0.090925 0.074857 0.000611 0.003261 0.987199 0.000963 0.008577 0.002723 0.993348 0.002647 0.001281 0.897171 0.012001 0.057796 0.033031 0.001926 0.991712 0.001084 0.005278 0.001657 0.971877 0.001061 0.025405 0.077951 0.855503 0.034190 0.032356 0.148292 0.037632 0.565912 0.248164 0.097692 0.116956 0.709845 0.075506 0.125206 0.151826 0.430074 0.292894 0.159594 0.118178 0.542602 0.179627 0.178979 0.230177 0.378580 0.212264 0.109711 0.117379 0.619514 0.153396 0.294304 0.167287 0.300143 0.238266 0.204923 0.365383 0.208846 0.220848 Consensus sequence: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB Alignment: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB ---------CCCCCTTGGGCCCC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00021 Zfp281_primary Reverse Complement Original Motif Backward 1 14 0.059809 Species: Mus musculus Original motif 0.201535 0.165213 0.201324 0.431929 0.136153 0.443451 0.179132 0.241264 0.263149 0.555137 0.067983 0.113731 0.142183 0.737634 0.045722 0.074461 0.044982 0.884112 0.045356 0.025549 0.246434 0.590578 0.022655 0.140333 0.123049 0.591257 0.033072 0.252622 0.018153 0.944742 0.010254 0.026851 0.035459 0.953844 0.003988 0.006709 0.020000 0.954344 0.005966 0.019690 0.015299 0.964390 0.006755 0.013557 0.028565 0.936152 0.011660 0.023623 0.300127 0.517309 0.029700 0.152863 0.159063 0.513443 0.051834 0.275660 0.158172 0.647055 0.133256 0.061516 Consensus sequence: DBCCCCCCCCCCMYC Reverse complement motif 0.158172 0.133256 0.647055 0.061516 0.159063 0.051834 0.513443 0.275660 0.300127 0.029700 0.517309 0.152863 0.028565 0.011660 0.936152 0.023623 0.015299 0.006755 0.964390 0.013557 0.020000 0.005966 0.954344 0.019690 0.035459 0.003988 0.953844 0.006709 0.018153 0.010254 0.944742 0.026851 0.123049 0.033072 0.591257 0.252622 0.246434 0.022655 0.590578 0.140333 0.044982 0.045356 0.884112 0.025549 0.142183 0.045722 0.737634 0.074461 0.263149 0.067983 0.555137 0.113731 0.136153 0.179132 0.443451 0.241264 0.431929 0.165213 0.201324 0.201535 Consensus sequence: GKRGGGGGGGGGGBD Alignment: GKRGGGGGGGGGGBD -CCCCCTTGGGCCCC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 22 Motif name: NR2F1 Original motif 0.000000 0.000000 0.153846 0.846154 0.076923 0.000000 0.923077 0.000000 0.923077 0.000000 0.076923 0.000000 0.461538 0.538462 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.230769 0.000000 0.769231 0.000000 0.153846 0.000000 0.846154 0.076923 0.000000 0.000000 0.923077 0.153846 0.000000 0.846154 0.000000 0.461538 0.307692 0.230769 0.000000 0.461538 0.384615 0.076923 0.076923 0.076923 0.769231 0.076923 0.076923 0.230769 0.461538 0.000000 0.307692 0.000000 0.230769 0.230769 0.538462 Consensus sequence: TGAMCTTTGMMCYT Reserve complement motif 0.538462 0.230769 0.230769 0.000000 0.230769 0.000000 0.461538 0.307692 0.076923 0.076923 0.769231 0.076923 0.076923 0.384615 0.076923 0.461538 0.000000 0.307692 0.230769 0.461538 0.153846 0.846154 0.000000 0.000000 0.923077 0.000000 0.000000 0.076923 0.846154 0.153846 0.000000 0.000000 0.769231 0.230769 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.461538 0.000000 0.538462 0.000000 0.000000 0.000000 0.076923 0.923077 0.076923 0.923077 0.000000 0.000000 0.846154 0.000000 0.153846 0.000000 Consensus sequence: AKGYYCAAAGRTCA ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 22 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00083 Tcf7l2_primary Original Motif Original Motif Backward 3 14 0.045236 Species: Mus musculus Original motif 0.285725 0.187143 0.254855 0.272277 0.276264 0.157893 0.258178 0.307665 0.238788 0.161120 0.254018 0.346074 0.076041 0.333901 0.150903 0.439156 0.093376 0.526578 0.180529 0.199517 0.010827 0.880320 0.034150 0.074703 0.016546 0.023834 0.000940 0.958680 0.007166 0.008215 0.001941 0.982678 0.029634 0.001363 0.001379 0.967625 0.010872 0.031751 0.926186 0.031190 0.949407 0.000760 0.002581 0.047253 0.109203 0.001362 0.002094 0.887341 0.044198 0.567994 0.353059 0.034749 0.222623 0.142360 0.041281 0.593736 0.358872 0.167597 0.220534 0.252997 0.233072 0.141480 0.230985 0.394463 0.350703 0.243129 0.233961 0.172207 Consensus sequence: DDDYCCTTTGATSTDDV Reverse complement motif 0.172207 0.243129 0.233961 0.350703 0.394463 0.141480 0.230985 0.233072 0.252997 0.167597 0.220534 0.358872 0.593736 0.142360 0.041281 0.222623 0.044198 0.353059 0.567994 0.034749 0.887341 0.001362 0.002094 0.109203 0.047253 0.000760 0.002581 0.949407 0.010872 0.926186 0.031751 0.031190 0.967625 0.001363 0.001379 0.029634 0.982678 0.008215 0.001941 0.007166 0.958680 0.023834 0.000940 0.016546 0.010827 0.034150 0.880320 0.074703 0.093376 0.180529 0.526578 0.199517 0.439156 0.333901 0.150903 0.076041 0.346074 0.161120 0.254018 0.238788 0.307665 0.157893 0.258178 0.276264 0.272277 0.187143 0.254855 0.285725 Consensus sequence: BDDASATCAAAGGMDDD Alignment: DDDYCCTTTGATSTDDV -TGAMCTTTGMMCYT-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00067 Lef1_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 14 0.045345 Species: Mus musculus Original motif 0.281920 0.214207 0.278077 0.225796 0.325566 0.151435 0.298797 0.224202 0.290253 0.145824 0.243443 0.320480 0.069286 0.404645 0.141614 0.384454 0.070044 0.621448 0.142647 0.165862 0.007295 0.907657 0.038110 0.046938 0.015587 0.018273 0.000658 0.965482 0.005527 0.005886 0.001905 0.986682 0.024512 0.001189 0.001344 0.972955 0.007384 0.025221 0.952270 0.015125 0.966438 0.000630 0.002693 0.030239 0.082252 0.001173 0.001495 0.915080 0.030255 0.677155 0.275323 0.017267 0.199467 0.118815 0.056814 0.624905 0.345445 0.169597 0.216831 0.268127 0.278106 0.150864 0.173693 0.397336 0.251834 0.339733 0.219703 0.188730 Consensus sequence: DDDYCCTTTGATCTDDV Reverse complement motif 0.251834 0.219703 0.339733 0.188730 0.397336 0.150864 0.173693 0.278106 0.268127 0.169597 0.216831 0.345445 0.624905 0.118815 0.056814 0.199467 0.030255 0.275323 0.677155 0.017267 0.915080 0.001173 0.001495 0.082252 0.030239 0.000630 0.002693 0.966438 0.007384 0.952270 0.025221 0.015125 0.972955 0.001189 0.001344 0.024512 0.986682 0.005886 0.001905 0.005527 0.965482 0.018273 0.000658 0.015587 0.007295 0.038110 0.907657 0.046938 0.070044 0.142647 0.621448 0.165862 0.069286 0.141614 0.404645 0.384454 0.320480 0.145824 0.243443 0.290253 0.224202 0.151435 0.298797 0.325566 0.225796 0.214207 0.278077 0.281920 Consensus sequence: VDDAGATCAAAGGKDDD Alignment: VDDAGATCAAAGGKDDD --AKGYYCAAAGRTCA- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v015681_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 2 14 0.046136 Species: Mus musculus Original motif 0.331499 0.188505 0.182841 0.297156 0.328961 0.213025 0.273530 0.184484 0.197213 0.129292 0.524914 0.148581 0.274491 0.226406 0.312118 0.186986 0.103231 0.393726 0.364988 0.138055 0.552594 0.166422 0.186262 0.094722 0.157618 0.064773 0.616497 0.161112 0.139166 0.176098 0.621185 0.063551 0.748420 0.062398 0.012447 0.176735 0.116584 0.009438 0.860326 0.013653 0.005030 0.003646 0.974877 0.016447 0.055257 0.007181 0.921760 0.015802 0.032748 0.058249 0.052709 0.856293 0.105606 0.872231 0.014370 0.007793 0.019480 0.497379 0.125899 0.357242 0.478582 0.269713 0.061464 0.190242 0.253985 0.287006 0.201320 0.257689 0.319384 0.210231 0.175842 0.294543 0.222123 0.287802 0.201294 0.288782 0.139951 0.376041 0.081133 0.402875 0.213450 0.343835 0.383676 0.059039 0.322294 0.355918 0.148062 0.173725 Consensus sequence: HVGVSAGGAGGGTCYHHHHYVH Reverse complement motif 0.322294 0.148062 0.355918 0.173725 0.213450 0.383676 0.343835 0.059039 0.402875 0.376041 0.081133 0.139951 0.288782 0.287802 0.201294 0.222123 0.294543 0.210231 0.175842 0.319384 0.253985 0.201320 0.287006 0.257689 0.190242 0.269713 0.061464 0.478582 0.019480 0.125899 0.497379 0.357242 0.105606 0.014370 0.872231 0.007793 0.856293 0.058249 0.052709 0.032748 0.055257 0.921760 0.007181 0.015802 0.005030 0.974877 0.003646 0.016447 0.116584 0.860326 0.009438 0.013653 0.176735 0.062398 0.012447 0.748420 0.139166 0.621185 0.176098 0.063551 0.157618 0.616497 0.064773 0.161112 0.094722 0.166422 0.186262 0.552594 0.103231 0.364988 0.393726 0.138055 0.274491 0.312118 0.226406 0.186986 0.197213 0.524914 0.129292 0.148581 0.184484 0.213025 0.273530 0.328961 0.297156 0.188505 0.182841 0.331499 Consensus sequence: DVMHHDHKGACCCTCCTSVCBH Alignment: DVMHHDHKGACCCTCCTSVCBH -------TGAMCTTTGMMCYT- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00054 Tcf7_primary Reverse Complement Original Motif Backward 2 14 0.046177 Species: Mus musculus Original motif 0.170811 0.196976 0.220503 0.411710 0.337231 0.228482 0.140137 0.294150 0.299312 0.173780 0.143426 0.383481 0.603957 0.053557 0.128214 0.214271 0.036338 0.377925 0.534647 0.051091 0.725865 0.010314 0.008501 0.255320 0.067855 0.007849 0.004559 0.919737 0.049387 0.815496 0.098330 0.036787 0.960514 0.005036 0.005137 0.029313 0.960631 0.004550 0.018815 0.016004 0.935245 0.005169 0.023866 0.035720 0.159760 0.060340 0.761341 0.018559 0.228534 0.153897 0.523052 0.094517 0.557984 0.123512 0.254154 0.064350 0.490252 0.211976 0.124557 0.173215 0.310463 0.250279 0.132612 0.306646 0.332720 0.248937 0.120633 0.297711 Consensus sequence: BHHASATCAAAGGAHHH Reverse complement motif 0.297711 0.248937 0.120633 0.332720 0.306646 0.250279 0.132612 0.310463 0.173215 0.211976 0.124557 0.490252 0.064350 0.123512 0.254154 0.557984 0.228534 0.523052 0.153897 0.094517 0.159760 0.761341 0.060340 0.018559 0.035720 0.005169 0.023866 0.935245 0.016004 0.004550 0.018815 0.960631 0.029313 0.005036 0.005137 0.960514 0.049387 0.098330 0.815496 0.036787 0.919737 0.007849 0.004559 0.067855 0.255320 0.010314 0.008501 0.725865 0.036338 0.534647 0.377925 0.051091 0.214271 0.053557 0.128214 0.603957 0.383481 0.173780 0.143426 0.299312 0.294150 0.228482 0.140137 0.337231 0.411710 0.196976 0.220503 0.170811 Consensus sequence: HHHTCCTTTGATSTHHV Alignment: BHHASATCAAAGGAHHH --AKGYYCAAAGRTCA- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00058 Tcf3_primary Reverse Complement Original Motif Backward 2 14 0.047363 Species: Mus musculus Original motif 0.185864 0.201179 0.183663 0.429294 0.371100 0.233868 0.122934 0.272098 0.249563 0.171285 0.128851 0.450301 0.582940 0.043382 0.129099 0.244578 0.041400 0.395349 0.497087 0.066163 0.759123 0.009670 0.005936 0.225270 0.056579 0.008662 0.003986 0.930772 0.043968 0.865783 0.056001 0.034249 0.962748 0.003731 0.003265 0.030256 0.971318 0.003542 0.012299 0.012841 0.937558 0.003991 0.020195 0.038256 0.125931 0.057976 0.798081 0.018012 0.209401 0.172342 0.483980 0.134277 0.485703 0.129227 0.309936 0.075134 0.397027 0.195902 0.152395 0.254676 0.311636 0.231510 0.157732 0.299122 0.320965 0.206031 0.164299 0.308705 Consensus sequence: HHHASATCAAAGVRHHH Reverse complement motif 0.308705 0.206031 0.164299 0.320965 0.299122 0.231510 0.157732 0.311636 0.254676 0.195902 0.152395 0.397027 0.075134 0.129227 0.309936 0.485703 0.209401 0.483980 0.172342 0.134277 0.125931 0.798081 0.057976 0.018012 0.038256 0.003991 0.020195 0.937558 0.012841 0.003542 0.012299 0.971318 0.030256 0.003731 0.003265 0.962748 0.043968 0.056001 0.865783 0.034249 0.930772 0.008662 0.003986 0.056579 0.225270 0.009670 0.005936 0.759123 0.041400 0.497087 0.395349 0.066163 0.244578 0.043382 0.129099 0.582940 0.450301 0.171285 0.128851 0.249563 0.272098 0.233868 0.122934 0.371100 0.429294 0.201179 0.183663 0.185864 Consensus sequence: HHHKVCTTTGATSTHHH Alignment: HHHASATCAAAGVRHHH --AKGYYCAAAGRTCA- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00082 Zfp187_secondary Original Motif Original Motif Forward 1 14 0.048019 Species: Mus musculus Original motif 0.173063 0.169680 0.440836 0.216421 0.353277 0.179996 0.249403 0.217325 0.307337 0.038055 0.616380 0.038228 0.316636 0.564670 0.023732 0.094962 0.015484 0.923764 0.019439 0.041313 0.011243 0.956300 0.009443 0.023014 0.062273 0.107531 0.010739 0.819456 0.126670 0.201521 0.192005 0.479803 0.093090 0.045924 0.835792 0.025194 0.020165 0.015483 0.009567 0.954786 0.010873 0.672448 0.004559 0.312121 0.018002 0.846860 0.017605 0.117533 0.335703 0.408170 0.104095 0.152031 0.150308 0.362296 0.067408 0.419988 0.286490 0.242211 0.176532 0.294767 0.265022 0.249655 0.272219 0.213104 Consensus sequence: DDGMCCTBGTCCHYHV Reverse complement motif 0.265022 0.272219 0.249655 0.213104 0.294767 0.242211 0.176532 0.286490 0.419988 0.362296 0.067408 0.150308 0.335703 0.104095 0.408170 0.152031 0.018002 0.017605 0.846860 0.117533 0.010873 0.004559 0.672448 0.312121 0.954786 0.015483 0.009567 0.020165 0.093090 0.835792 0.045924 0.025194 0.479803 0.201521 0.192005 0.126670 0.819456 0.107531 0.010739 0.062273 0.011243 0.009443 0.956300 0.023014 0.015484 0.019439 0.923764 0.041313 0.316636 0.023732 0.564670 0.094962 0.307337 0.616380 0.038055 0.038228 0.217325 0.179996 0.249403 0.353277 0.173063 0.440836 0.169680 0.216421 Consensus sequence: VHMDGGACVAGGRCDH Alignment: DDGMCCTBGTCCHYHV TGAMCTTTGMMCYT-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00062 Sox4_primary Original Motif Reverse Complement Forward 2 14 0.049545 Species: Mus musculus Original motif 0.427843 0.231210 0.119424 0.221523 0.196506 0.239531 0.304906 0.259057 0.302488 0.156922 0.290190 0.250401 0.433872 0.149126 0.196496 0.220506 0.258426 0.076511 0.475100 0.189963 0.841714 0.046453 0.099915 0.011918 0.983853 0.001612 0.001362 0.013174 0.003460 0.982032 0.005728 0.008780 0.989743 0.002253 0.002020 0.005984 0.990761 0.003397 0.002843 0.003000 0.770864 0.003540 0.001549 0.224048 0.235342 0.002598 0.757383 0.004677 0.371426 0.089574 0.529959 0.009040 0.480804 0.196949 0.240413 0.081833 0.187158 0.355102 0.216599 0.241142 0.248006 0.232182 0.157452 0.362360 0.403367 0.177684 0.164649 0.254300 Consensus sequence: HBDDDAACAAAGRVBHH Reverse complement motif 0.254300 0.177684 0.164649 0.403367 0.362360 0.232182 0.157452 0.248006 0.187158 0.216599 0.355102 0.241142 0.081833 0.196949 0.240413 0.480804 0.371426 0.529959 0.089574 0.009040 0.235342 0.757383 0.002598 0.004677 0.224048 0.003540 0.001549 0.770864 0.003000 0.003397 0.002843 0.990761 0.005984 0.002253 0.002020 0.989743 0.003460 0.005728 0.982032 0.008780 0.013174 0.001612 0.001362 0.983853 0.011918 0.046453 0.099915 0.841714 0.258426 0.475100 0.076511 0.189963 0.220506 0.149126 0.196496 0.433872 0.250401 0.156922 0.290190 0.302488 0.196506 0.304906 0.239531 0.259057 0.221523 0.231210 0.119424 0.427843 Consensus sequence: HHBBMCTTTGTTHDDBH Alignment: HHBBMCTTTGTTHDDBH -TGAMCTTTGMMCYT-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00030 Sox11_primary Original Motif Reverse Complement Backward 3 14 0.049903 Species: Mus musculus Original motif 0.351812 0.238467 0.143954 0.265768 0.195246 0.235838 0.281473 0.287443 0.349478 0.172616 0.210739 0.267167 0.484061 0.110438 0.173131 0.232370 0.276692 0.070713 0.479604 0.172991 0.859124 0.044167 0.083951 0.012758 0.975608 0.002029 0.002285 0.020079 0.006422 0.978485 0.007124 0.007969 0.987489 0.003025 0.002868 0.006617 0.987739 0.005463 0.002730 0.004067 0.693013 0.004067 0.002445 0.300475 0.189100 0.003677 0.801408 0.005814 0.352090 0.072517 0.567737 0.007656 0.542316 0.176545 0.192768 0.088371 0.196382 0.304176 0.205985 0.293457 0.289415 0.201358 0.182937 0.326290 0.385801 0.216362 0.152363 0.245475 Consensus sequence: HBDDRAACAAAGRABHH Reverse complement motif 0.245475 0.216362 0.152363 0.385801 0.326290 0.201358 0.182937 0.289415 0.196382 0.205985 0.304176 0.293457 0.088371 0.176545 0.192768 0.542316 0.352090 0.567737 0.072517 0.007656 0.189100 0.801408 0.003677 0.005814 0.300475 0.004067 0.002445 0.693013 0.004067 0.005463 0.002730 0.987739 0.006617 0.003025 0.002868 0.987489 0.006422 0.007124 0.978485 0.007969 0.020079 0.002029 0.002285 0.975608 0.012758 0.044167 0.083951 0.859124 0.276692 0.479604 0.070713 0.172991 0.232370 0.110438 0.173131 0.484061 0.267167 0.172616 0.210739 0.349478 0.287443 0.235838 0.281473 0.195246 0.265768 0.238467 0.143954 0.351812 Consensus sequence: HHBTMCTTTGTTMDDVH Alignment: HHBTMCTTTGTTMDDVH -TGAMCTTTGMMCYT-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00023 Sox30_primary Original Motif Original Motif Backward 1 14 0.051153 Species: Mus musculus Original motif 0.372432 0.102933 0.322145 0.202491 0.328072 0.182071 0.157347 0.332510 0.289417 0.084511 0.292873 0.333198 0.157571 0.227851 0.441662 0.172917 0.716832 0.049010 0.201411 0.032747 0.957368 0.003162 0.004402 0.035068 0.003907 0.862678 0.009407 0.124008 0.977231 0.007658 0.004263 0.010847 0.976481 0.004510 0.015225 0.003784 0.067568 0.004353 0.005071 0.923008 0.158205 0.108442 0.467023 0.266330 0.334549 0.091557 0.510241 0.063654 0.456431 0.182602 0.150234 0.210732 0.387485 0.241062 0.151504 0.219950 0.188387 0.269857 0.176514 0.365242 0.175680 0.243984 0.165833 0.414502 Consensus sequence: DHDBAACAATDRHHHH Reverse complement motif 0.414502 0.243984 0.165833 0.175680 0.365242 0.269857 0.176514 0.188387 0.219950 0.241062 0.151504 0.387485 0.210732 0.182602 0.150234 0.456431 0.334549 0.510241 0.091557 0.063654 0.158205 0.467023 0.108442 0.266330 0.923008 0.004353 0.005071 0.067568 0.003784 0.004510 0.015225 0.976481 0.010847 0.007658 0.004263 0.977231 0.003907 0.009407 0.862678 0.124008 0.035068 0.003162 0.004402 0.957368 0.032747 0.049010 0.201411 0.716832 0.157571 0.441662 0.227851 0.172917 0.333198 0.084511 0.292873 0.289417 0.332510 0.182071 0.157347 0.328072 0.202491 0.102933 0.322145 0.372432 Consensus sequence: HHHHMHATTGTTBDHD Alignment: DHDBAACAATDRHHHH --TGAMCTTTGMMCYT ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00005 Tcfap2a_secondary Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 14 0.051697 Species: Mus musculus Original motif 0.198427 0.243196 0.159241 0.399136 0.267754 0.388187 0.116811 0.227248 0.448284 0.056403 0.414623 0.080691 0.031469 0.826323 0.055436 0.086772 0.035527 0.756642 0.022985 0.184845 0.127338 0.316078 0.155806 0.400778 0.135021 0.313650 0.287760 0.263570 0.418892 0.082297 0.068352 0.430460 0.201062 0.044735 0.711358 0.042845 0.038934 0.022320 0.903763 0.034982 0.201790 0.065554 0.460526 0.272130 0.006890 0.786923 0.061853 0.144334 0.460666 0.103658 0.196452 0.239224 0.092272 0.204611 0.390375 0.312742 Consensus sequence: HHRCCBBWGGDCDB Reverse complement motif 0.092272 0.390375 0.204611 0.312742 0.239224 0.103658 0.196452 0.460666 0.006890 0.061853 0.786923 0.144334 0.201790 0.460526 0.065554 0.272130 0.038934 0.903763 0.022320 0.034982 0.201062 0.711358 0.044735 0.042845 0.430460 0.082297 0.068352 0.418892 0.135021 0.287760 0.313650 0.263570 0.400778 0.316078 0.155806 0.127338 0.035527 0.022985 0.756642 0.184845 0.031469 0.055436 0.826323 0.086772 0.080691 0.056403 0.414623 0.448284 0.267754 0.116811 0.388187 0.227248 0.399136 0.243196 0.159241 0.198427 Consensus sequence: BDGHCCWBVGGKDH Alignment: BDGHCCWBVGGKDH AKGYYCAAAGRTCA ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 23 Motif name: MZF1_1-4 Original motif 0.150000 0.250000 0.200000 0.400000 0.000000 0.000000 0.950000 0.050000 0.100000 0.000000 0.900000 0.000000 0.000000 0.000000 0.950000 0.050000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.900000 0.000000 0.100000 0.000000 Consensus sequence: BGGGGA Reserve complement motif 0.000000 0.000000 0.100000 0.900000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.950000 0.000000 0.050000 0.100000 0.900000 0.000000 0.000000 0.000000 0.950000 0.000000 0.050000 0.400000 0.250000 0.200000 0.150000 Consensus sequence: TCCCCV ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 23 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00176 Crx Original Motif Original Motif Forward 4 6 0.000000 Species: Mus musculus Original motif 0.090571 0.470784 0.132533 0.306112 0.097553 0.215274 0.380528 0.306645 0.329642 0.096126 0.139164 0.435068 0.256197 0.120190 0.173105 0.450508 0.092558 0.110352 0.731426 0.065664 0.091713 0.267719 0.595502 0.045066 0.043905 0.002927 0.952004 0.001165 0.003160 0.002104 0.990877 0.003859 0.959206 0.038974 0.000375 0.001444 0.003080 0.004243 0.000706 0.991971 0.015557 0.002685 0.000597 0.981161 0.979685 0.000442 0.002645 0.017227 0.372459 0.028457 0.403587 0.195497 0.092995 0.682203 0.100835 0.123967 0.103130 0.522168 0.231711 0.142992 0.194271 0.158404 0.247437 0.399888 Consensus sequence: YBWDGGGGATTARCCD Reverse complement motif 0.399888 0.158404 0.247437 0.194271 0.103130 0.231711 0.522168 0.142992 0.092995 0.100835 0.682203 0.123967 0.372459 0.403587 0.028457 0.195497 0.017227 0.000442 0.002645 0.979685 0.981161 0.002685 0.000597 0.015557 0.991971 0.004243 0.000706 0.003080 0.001444 0.038974 0.000375 0.959206 0.003160 0.990877 0.002104 0.003859 0.043905 0.952004 0.002927 0.001165 0.091713 0.595502 0.267719 0.045066 0.092558 0.731426 0.110352 0.065664 0.450508 0.120190 0.173105 0.256197 0.435068 0.096126 0.139164 0.329642 0.097553 0.380528 0.215274 0.306645 0.090571 0.132533 0.470784 0.306112 Consensus sequence: DGGMTAATCCCCDWBK Alignment: YBWDGGGGATTARCCD ---BGGGGA------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00265 Pitx3 Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 6 0.001933 Species: Mus musculus Original motif 0.376317 0.228810 0.324927 0.069946 0.194464 0.131695 0.538949 0.134892 0.066391 0.226063 0.645457 0.062089 0.174103 0.030838 0.758315 0.036743 0.018838 0.001515 0.979039 0.000608 0.002099 0.002488 0.992192 0.003220 0.958051 0.040431 0.000340 0.001178 0.002126 0.007833 0.000559 0.989482 0.009085 0.005231 0.000358 0.985326 0.975248 0.000371 0.001696 0.022685 0.177679 0.041353 0.541741 0.239227 0.054770 0.772535 0.116688 0.056007 0.157041 0.155159 0.224874 0.462926 0.343501 0.137361 0.357922 0.161216 0.153495 0.344871 0.332684 0.168951 0.125949 0.548089 0.196494 0.129468 Consensus sequence: VGGGGGATTAGCDDBC Reverse complement motif 0.125949 0.196494 0.548089 0.129468 0.153495 0.332684 0.344871 0.168951 0.343501 0.357922 0.137361 0.161216 0.462926 0.155159 0.224874 0.157041 0.054770 0.116688 0.772535 0.056007 0.177679 0.541741 0.041353 0.239227 0.022685 0.000371 0.001696 0.975248 0.985326 0.005231 0.000358 0.009085 0.989482 0.007833 0.000559 0.002126 0.001178 0.040431 0.000340 0.958051 0.002099 0.992192 0.002488 0.003220 0.018838 0.979039 0.001515 0.000608 0.174103 0.758315 0.030838 0.036743 0.066391 0.645457 0.226063 0.062089 0.194464 0.538949 0.131695 0.134892 0.069946 0.228810 0.324927 0.376317 Consensus sequence: GBHDGCTAATCCCCCB Alignment: GBHDGCTAATCCCCCB ---------TCCCCV- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00239 Obox2 Reverse Complement Reverse Complement Forward 9 6 0.002847 Species: Mus musculus Original motif 0.293849 0.125144 0.142440 0.438568 0.122280 0.144634 0.408124 0.324963 0.448856 0.147837 0.312347 0.090959 0.152801 0.059872 0.649129 0.138198 0.187720 0.040843 0.725481 0.045956 0.070379 0.021109 0.864530 0.043982 0.063765 0.006819 0.915928 0.013488 0.018370 0.002669 0.948065 0.030896 0.972042 0.020308 0.001317 0.006333 0.009162 0.002535 0.005655 0.982649 0.024250 0.007414 0.002871 0.965464 0.934913 0.002383 0.012220 0.050484 0.694401 0.019404 0.079194 0.207001 0.290944 0.524953 0.061736 0.122367 0.258089 0.064339 0.154268 0.523303 0.510991 0.233652 0.092796 0.162561 0.221195 0.238061 0.076237 0.464507 Consensus sequence: DBRGGGGGATTAAMTAH Reverse complement motif 0.464507 0.238061 0.076237 0.221195 0.162561 0.233652 0.092796 0.510991 0.523303 0.064339 0.154268 0.258089 0.290944 0.061736 0.524953 0.122367 0.207001 0.019404 0.079194 0.694401 0.050484 0.002383 0.012220 0.934913 0.965464 0.007414 0.002871 0.024250 0.982649 0.002535 0.005655 0.009162 0.006333 0.020308 0.001317 0.972042 0.018370 0.948065 0.002669 0.030896 0.063765 0.915928 0.006819 0.013488 0.070379 0.864530 0.021109 0.043982 0.187720 0.725481 0.040843 0.045956 0.152801 0.649129 0.059872 0.138198 0.090959 0.147837 0.312347 0.448856 0.122280 0.408124 0.144634 0.324963 0.438568 0.125144 0.142440 0.293849 Consensus sequence: HTARTTAATCCCCCKBD Alignment: HTARTTAATCCCCCKBD --------TCCCCV--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00216 Obox1 Original Motif Original Motif Backward 9 6 0.004620 Species: Mus musculus Original motif 0.239477 0.131084 0.243507 0.385932 0.217543 0.106254 0.206114 0.470089 0.647326 0.113122 0.157767 0.081785 0.447787 0.111541 0.372093 0.068580 0.248541 0.017787 0.686924 0.046748 0.088770 0.008796 0.883034 0.019400 0.049663 0.003287 0.945325 0.001725 0.003569 0.000420 0.960584 0.035426 0.967192 0.029883 0.000248 0.002677 0.001721 0.005927 0.001063 0.991288 0.008389 0.011678 0.000280 0.979653 0.946957 0.000663 0.002329 0.050052 0.711018 0.017942 0.052601 0.218440 0.234125 0.619719 0.073871 0.072285 0.255026 0.148239 0.159856 0.436879 0.448611 0.200869 0.092123 0.258397 0.182337 0.333505 0.182092 0.302066 Consensus sequence: DDARGGGGATTAACDHH Reverse complement motif 0.182337 0.182092 0.333505 0.302066 0.258397 0.200869 0.092123 0.448611 0.436879 0.148239 0.159856 0.255026 0.234125 0.073871 0.619719 0.072285 0.218440 0.017942 0.052601 0.711018 0.050052 0.000663 0.002329 0.946957 0.979653 0.011678 0.000280 0.008389 0.991288 0.005927 0.001063 0.001721 0.002677 0.029883 0.000248 0.967192 0.003569 0.960584 0.000420 0.035426 0.049663 0.945325 0.003287 0.001725 0.088770 0.883034 0.008796 0.019400 0.248541 0.686924 0.017787 0.046748 0.068580 0.111541 0.372093 0.447787 0.081785 0.113122 0.157767 0.647326 0.470089 0.106254 0.206114 0.217543 0.385932 0.131084 0.243507 0.239477 Consensus sequence: DHDGTTAATCCCCKTDD Alignment: DDARGGGGATTAACDHH ---BGGGGA-------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00160 Obox3 Reverse Complement Reverse Complement Forward 9 6 0.006418 Species: Mus musculus Original motif 0.265987 0.173377 0.153926 0.406710 0.129561 0.268972 0.350646 0.250821 0.342885 0.208848 0.334291 0.113975 0.153240 0.164565 0.582521 0.099674 0.258413 0.031726 0.629457 0.080404 0.111288 0.035159 0.768619 0.084935 0.083021 0.004060 0.905853 0.007066 0.012108 0.002693 0.970145 0.015055 0.982328 0.009671 0.001699 0.006303 0.003572 0.002819 0.006020 0.987589 0.012066 0.006455 0.003574 0.977906 0.954560 0.001995 0.009190 0.034255 0.716184 0.015547 0.126758 0.141512 0.137277 0.673851 0.087215 0.101657 0.282699 0.056894 0.162378 0.498029 0.432159 0.290288 0.109507 0.168046 0.260601 0.267351 0.069676 0.402372 Consensus sequence: HBVGGGGGATTAACWHH Reverse complement motif 0.402372 0.267351 0.069676 0.260601 0.168046 0.290288 0.109507 0.432159 0.498029 0.056894 0.162378 0.282699 0.137277 0.087215 0.673851 0.101657 0.141512 0.015547 0.126758 0.716184 0.034255 0.001995 0.009190 0.954560 0.977906 0.006455 0.003574 0.012066 0.987589 0.002819 0.006020 0.003572 0.006303 0.009671 0.001699 0.982328 0.012108 0.970145 0.002693 0.015055 0.083021 0.905853 0.004060 0.007066 0.111288 0.768619 0.035159 0.084935 0.258413 0.629457 0.031726 0.080404 0.153240 0.582521 0.164565 0.099674 0.113975 0.208848 0.334291 0.342885 0.129561 0.350646 0.268972 0.250821 0.406710 0.173377 0.153926 0.265987 Consensus sequence: HHWGTTAATCCCCCBBH Alignment: HHWGTTAATCCCCCBBH --------TCCCCV--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00208 Obox5_2284.1 Original Motif Original Motif Forward 3 6 0.011026 Species: Mus musculus Original motif 0.281264 0.188968 0.136609 0.393160 0.344028 0.038266 0.328422 0.289284 0.266627 0.234290 0.328022 0.171062 0.393172 0.142839 0.379282 0.084706 0.110940 0.063210 0.811347 0.014502 0.089051 0.002920 0.905749 0.002280 0.008411 0.000554 0.984833 0.006202 0.987567 0.004995 0.000896 0.006542 0.003972 0.001261 0.003058 0.991709 0.007568 0.004773 0.000491 0.987168 0.974587 0.000828 0.001598 0.022987 0.799844 0.004926 0.020978 0.174252 0.383707 0.178162 0.082155 0.355976 0.074343 0.081369 0.030820 0.813467 0.182973 0.309007 0.180900 0.327119 0.274045 0.191530 0.121366 0.413060 0.286677 0.377630 0.141803 0.193890 Consensus sequence: HDVRGGGATTAAHTHHH Reverse complement motif 0.286677 0.141803 0.377630 0.193890 0.413060 0.191530 0.121366 0.274045 0.327119 0.309007 0.180900 0.182973 0.813467 0.081369 0.030820 0.074343 0.355976 0.178162 0.082155 0.383707 0.174252 0.004926 0.020978 0.799844 0.022987 0.000828 0.001598 0.974587 0.987168 0.004773 0.000491 0.007568 0.991709 0.001261 0.003058 0.003972 0.006542 0.004995 0.000896 0.987567 0.008411 0.984833 0.000554 0.006202 0.089051 0.905749 0.002920 0.002280 0.110940 0.811347 0.063210 0.014502 0.084706 0.142839 0.379282 0.393172 0.266627 0.328022 0.234290 0.171062 0.289284 0.038266 0.328422 0.344028 0.393160 0.188968 0.136609 0.281264 Consensus sequence: DHHAHTTAATCCCKVDH Alignment: HDVRGGGATTAAHTHHH --BGGGGA--------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00143 Dobox5 Original Motif Original Motif Backward 10 6 0.013657 Species: Mus musculus Original motif 0.318006 0.161296 0.325541 0.195157 0.313601 0.083023 0.377870 0.225506 0.298208 0.282086 0.190012 0.229693 0.484557 0.174619 0.249175 0.091650 0.178941 0.025979 0.771418 0.023662 0.048080 0.001644 0.948807 0.001469 0.008069 0.000908 0.985703 0.005321 0.964141 0.032554 0.000312 0.002993 0.003637 0.002849 0.001283 0.992231 0.006297 0.007784 0.000276 0.985643 0.930090 0.000696 0.000899 0.068314 0.815261 0.006992 0.154272 0.023474 0.057969 0.177555 0.096246 0.668231 0.236979 0.285921 0.057746 0.419354 0.347812 0.200757 0.249827 0.201604 0.239503 0.153155 0.096118 0.511224 0.234875 0.401818 0.136916 0.226391 Consensus sequence: DDHVGGGATTAATHDTH Reverse complement motif 0.234875 0.136916 0.401818 0.226391 0.511224 0.153155 0.096118 0.239503 0.201604 0.200757 0.249827 0.347812 0.419354 0.285921 0.057746 0.236979 0.668231 0.177555 0.096246 0.057969 0.023474 0.006992 0.154272 0.815261 0.068314 0.000696 0.000899 0.930090 0.985643 0.007784 0.000276 0.006297 0.992231 0.002849 0.001283 0.003637 0.002993 0.032554 0.000312 0.964141 0.008069 0.985703 0.000908 0.005321 0.048080 0.948807 0.001644 0.001469 0.178941 0.771418 0.025979 0.023662 0.091650 0.174619 0.249175 0.484557 0.229693 0.282086 0.190012 0.298208 0.313601 0.377870 0.083023 0.225506 0.318006 0.325541 0.161296 0.195157 Consensus sequence: DADHATTAATCCCBHHH Alignment: DDHVGGGATTAATHDTH --BGGGGA--------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00229 Otx1 Original Motif Original Motif Backward 10 6 0.013894 Species: Mus musculus Original motif 0.300610 0.149999 0.303810 0.245581 0.194444 0.095366 0.487289 0.222901 0.366838 0.110418 0.162922 0.359822 0.426793 0.049280 0.474292 0.049636 0.176031 0.195172 0.608443 0.020354 0.077179 0.003862 0.916244 0.002715 0.006954 0.001526 0.985903 0.005616 0.953016 0.043074 0.000504 0.003406 0.001743 0.004547 0.001783 0.991927 0.012882 0.003454 0.000402 0.983262 0.939084 0.000404 0.001874 0.058638 0.687439 0.025328 0.143515 0.143718 0.117461 0.128987 0.097084 0.656468 0.291905 0.125407 0.094129 0.488559 0.241296 0.237850 0.201291 0.319563 0.317041 0.222787 0.160309 0.299862 0.187481 0.261819 0.240698 0.310001 Consensus sequence: DDDRGGGATTAATWHHB Reverse complement motif 0.310001 0.261819 0.240698 0.187481 0.299862 0.222787 0.160309 0.317041 0.319563 0.237850 0.201291 0.241296 0.488559 0.125407 0.094129 0.291905 0.656468 0.128987 0.097084 0.117461 0.143718 0.025328 0.143515 0.687439 0.058638 0.000404 0.001874 0.939084 0.983262 0.003454 0.000402 0.012882 0.991927 0.004547 0.001783 0.001743 0.003406 0.043074 0.000504 0.953016 0.006954 0.985903 0.001526 0.005616 0.077179 0.916244 0.003862 0.002715 0.176031 0.608443 0.195172 0.020354 0.426793 0.474292 0.049280 0.049636 0.359822 0.110418 0.162922 0.366838 0.194444 0.487289 0.095366 0.222901 0.300610 0.303810 0.149999 0.245581 Consensus sequence: VHHWATTAATCCCMDHH Alignment: DDDRGGGATTAATWHHB --BGGGGA--------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00267 Otx2 Original Motif Original Motif Backward 10 6 0.016387 Species: Mus musculus Original motif 0.228258 0.209722 0.271345 0.290675 0.291157 0.069361 0.377485 0.261996 0.287153 0.152094 0.222957 0.337796 0.483727 0.152072 0.310290 0.053911 0.204144 0.113048 0.667872 0.014936 0.075520 0.006026 0.914157 0.004298 0.014517 0.001438 0.974113 0.009931 0.947371 0.046288 0.000447 0.005895 0.005062 0.002217 0.001684 0.991037 0.012926 0.004277 0.000429 0.982368 0.924965 0.000604 0.001421 0.073010 0.746193 0.020984 0.124464 0.108360 0.111140 0.150400 0.115855 0.622606 0.195298 0.342901 0.084437 0.377364 0.295892 0.125170 0.317047 0.261892 0.189707 0.172624 0.206879 0.430790 0.206004 0.451765 0.136227 0.206004 Consensus sequence: DDDRGGGATTAATHDDH Reverse complement motif 0.206004 0.136227 0.451765 0.206004 0.430790 0.172624 0.206879 0.189707 0.295892 0.317047 0.125170 0.261892 0.377364 0.342901 0.084437 0.195298 0.622606 0.150400 0.115855 0.111140 0.108360 0.020984 0.124464 0.746193 0.073010 0.000604 0.001421 0.924965 0.982368 0.004277 0.000429 0.012926 0.991037 0.002217 0.001684 0.005062 0.005895 0.046288 0.000447 0.947371 0.014517 0.974113 0.001438 0.009931 0.075520 0.914157 0.006026 0.004298 0.204144 0.667872 0.113048 0.014936 0.053911 0.152072 0.310290 0.483727 0.337796 0.152094 0.222957 0.287153 0.291157 0.377485 0.069361 0.261996 0.290675 0.209722 0.271345 0.228258 Consensus sequence: DDHHATTAATCCCKDHD Alignment: DDDRGGGATTAATHDDH --BGGGGA--------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00153 Pitx1 Original Motif Original Motif Backward 9 6 0.016495 Species: Mus musculus Original motif 0.207371 0.246323 0.166934 0.379372 0.115831 0.171040 0.352289 0.360841 0.435857 0.190325 0.290547 0.083272 0.281154 0.147141 0.422767 0.148938 0.453996 0.050465 0.389240 0.106298 0.187631 0.043211 0.734974 0.034185 0.042788 0.001867 0.954016 0.001329 0.006032 0.001055 0.986493 0.006420 0.955163 0.042114 0.000355 0.002368 0.003755 0.004760 0.000754 0.990731 0.005515 0.009073 0.000267 0.985144 0.913280 0.000712 0.001035 0.084973 0.721584 0.024188 0.198396 0.055833 0.334868 0.490003 0.058252 0.116877 0.457303 0.071620 0.241947 0.229130 0.478355 0.207860 0.143752 0.170032 0.256961 0.248882 0.203598 0.290559 Consensus sequence: HBVDRGGGATTAAMDHH Reverse complement motif 0.290559 0.248882 0.203598 0.256961 0.170032 0.207860 0.143752 0.478355 0.229130 0.071620 0.241947 0.457303 0.334868 0.058252 0.490003 0.116877 0.055833 0.024188 0.198396 0.721584 0.084973 0.000712 0.001035 0.913280 0.985144 0.009073 0.000267 0.005515 0.990731 0.004760 0.000754 0.003755 0.002368 0.042114 0.000355 0.955163 0.006032 0.986493 0.001055 0.006420 0.042788 0.954016 0.001867 0.001329 0.187631 0.734974 0.043211 0.034185 0.106298 0.050465 0.389240 0.453996 0.281154 0.422767 0.147141 0.148938 0.083272 0.190325 0.290547 0.435857 0.360841 0.171040 0.352289 0.115831 0.379372 0.246323 0.166934 0.207371 Consensus sequence: HHDRTTAATCCCKHBVH Alignment: HBVDRGGGATTAAMDHH ---BGGGGA-------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 24 Motif name: Ar Original motif 0.375000 0.291667 0.083333 0.250000 0.375000 0.083333 0.125000 0.416667 0.458333 0.125000 0.125000 0.291667 0.666667 0.041667 0.291667 0.000000 0.000000 0.000000 0.916667 0.083333 0.500000 0.250000 0.041667 0.208333 0.875000 0.083333 0.000000 0.041667 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.625000 0.000000 0.333333 0.041667 0.166667 0.375000 0.083333 0.375000 0.208333 0.458333 0.083333 0.250000 0.250000 0.375000 0.375000 0.000000 0.125000 0.208333 0.041667 0.625000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.166667 0.000000 0.000000 0.833333 0.458333 0.208333 0.041667 0.291667 0.041667 0.916667 0.041667 0.000000 0.125000 0.666667 0.041667 0.166667 0.250000 0.291667 0.208333 0.250000 0.250000 0.208333 0.375000 0.166667 0.416667 0.458333 0.000000 0.125000 0.208333 0.458333 0.250000 0.083333 Consensus sequence: HWDAGHACRHHVTGTHCCHVMV Reserve complement motif 0.208333 0.250000 0.458333 0.083333 0.416667 0.000000 0.458333 0.125000 0.250000 0.375000 0.208333 0.166667 0.250000 0.208333 0.291667 0.250000 0.125000 0.041667 0.666667 0.166667 0.041667 0.041667 0.916667 0.000000 0.291667 0.208333 0.041667 0.458333 0.833333 0.000000 0.000000 0.166667 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.625000 0.208333 0.041667 0.125000 0.250000 0.375000 0.375000 0.000000 0.208333 0.083333 0.458333 0.250000 0.166667 0.083333 0.375000 0.375000 0.041667 0.000000 0.333333 0.625000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.041667 0.083333 0.000000 0.875000 0.208333 0.250000 0.041667 0.500000 0.000000 0.916667 0.000000 0.083333 0.000000 0.041667 0.291667 0.666667 0.291667 0.125000 0.125000 0.458333 0.416667 0.083333 0.125000 0.375000 0.250000 0.291667 0.083333 0.375000 Consensus sequence: VRVDGGHACAVDDKGTHCTDWH ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 24 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00032 Gata3_secondary Original Motif Original Motif Backward 1 22 0.067699 Species: Mus musculus Original motif 0.177641 0.319872 0.115137 0.387350 0.136644 0.182137 0.205873 0.475347 0.254263 0.244280 0.165207 0.336250 0.240415 0.207557 0.237497 0.314530 0.271041 0.214702 0.364395 0.149863 0.095475 0.320104 0.191738 0.392682 0.500902 0.142722 0.026556 0.329820 0.051221 0.023698 0.897245 0.027836 0.922410 0.027509 0.024058 0.026023 0.030735 0.070903 0.024248 0.874114 0.242120 0.231992 0.225143 0.300745 0.106956 0.220471 0.283490 0.389083 0.152079 0.165830 0.135066 0.547025 0.839205 0.051581 0.060119 0.049095 0.041204 0.069147 0.070830 0.818819 0.051861 0.848177 0.027599 0.072363 0.383793 0.016807 0.397470 0.201931 0.381899 0.215846 0.255908 0.146347 0.094792 0.358651 0.280905 0.265652 0.296132 0.181545 0.178433 0.343890 0.301997 0.254722 0.108566 0.334714 0.349481 0.270693 0.137507 0.242319 Consensus sequence: HBHDVBWGATHBTATCRVBHHH Reverse complement motif 0.242319 0.270693 0.137507 0.349481 0.334714 0.254722 0.108566 0.301997 0.343890 0.181545 0.178433 0.296132 0.094792 0.280905 0.358651 0.265652 0.146347 0.215846 0.255908 0.381899 0.383793 0.397470 0.016807 0.201931 0.051861 0.027599 0.848177 0.072363 0.818819 0.069147 0.070830 0.041204 0.049095 0.051581 0.060119 0.839205 0.547025 0.165830 0.135066 0.152079 0.389083 0.220471 0.283490 0.106956 0.300745 0.231992 0.225143 0.242120 0.874114 0.070903 0.024248 0.030735 0.026023 0.027509 0.024058 0.922410 0.051221 0.897245 0.023698 0.027836 0.329820 0.142722 0.026556 0.500902 0.392682 0.320104 0.191738 0.095475 0.271041 0.364395 0.214702 0.149863 0.314530 0.207557 0.237497 0.240415 0.336250 0.244280 0.165207 0.254263 0.475347 0.182137 0.205873 0.136644 0.387350 0.319872 0.115137 0.177641 Consensus sequence: HHHBBMGATAVHATCWVVDHVH Alignment: HBHDVBWGATHBTATCRVBHHH HWDAGHACRHHVTGTHCCHVMV ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_secondary Reverse Complement Reverse Complement Backward 1 22 0.069215 Species: Mus musculus Original motif 0.067627 0.131333 0.654425 0.146615 0.156488 0.114442 0.145630 0.583441 0.206450 0.265630 0.358017 0.169903 0.090729 0.460713 0.274712 0.173847 0.285994 0.099998 0.154485 0.459523 0.635908 0.184787 0.072982 0.106323 0.748421 0.039204 0.092605 0.119769 0.081342 0.061327 0.044532 0.812799 0.143120 0.043879 0.024216 0.788785 0.247544 0.092102 0.621453 0.038901 0.295531 0.036295 0.027594 0.640580 0.194561 0.305468 0.339916 0.160055 0.175038 0.193568 0.101212 0.530182 0.145226 0.167488 0.559871 0.127415 0.271501 0.237429 0.206701 0.284369 0.216834 0.109191 0.569605 0.104370 0.182624 0.177160 0.300475 0.339742 0.331737 0.198645 0.265137 0.204482 0.230155 0.359365 0.183450 0.227029 0.056581 0.067297 0.463052 0.413070 0.198891 0.324626 0.304424 0.172059 0.181968 0.287547 0.202419 0.328066 Consensus sequence: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB Reverse complement motif 0.328066 0.287547 0.202419 0.181968 0.198891 0.304424 0.324626 0.172059 0.056581 0.463052 0.067297 0.413070 0.230155 0.183450 0.359365 0.227029 0.204482 0.198645 0.265137 0.331737 0.339742 0.177160 0.300475 0.182624 0.216834 0.569605 0.109191 0.104370 0.284369 0.237429 0.206701 0.271501 0.145226 0.559871 0.167488 0.127415 0.530182 0.193568 0.101212 0.175038 0.194561 0.339916 0.305468 0.160055 0.640580 0.036295 0.027594 0.295531 0.247544 0.621453 0.092102 0.038901 0.788785 0.043879 0.024216 0.143120 0.812799 0.061327 0.044532 0.081342 0.119769 0.039204 0.092605 0.748421 0.106323 0.184787 0.072982 0.635908 0.459523 0.099998 0.154485 0.285994 0.090729 0.274712 0.460713 0.173847 0.206450 0.358017 0.265630 0.169903 0.583441 0.114442 0.145630 0.156488 0.067627 0.654425 0.131333 0.146615 Consensus sequence: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC Alignment: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC VRVDGGHACAVDDKGTHCTDWH ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00050 Bhlhb2_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 22 0.069561 Species: Mus musculus Original motif 0.347837 0.112349 0.403713 0.136102 0.298329 0.175329 0.324534 0.201809 0.421791 0.222553 0.113615 0.242041 0.387506 0.130670 0.161435 0.320389 0.197183 0.244864 0.304611 0.253342 0.345884 0.188786 0.278290 0.187041 0.228203 0.142148 0.408269 0.221381 0.037126 0.006772 0.231775 0.724328 0.055214 0.942800 0.001192 0.000794 0.974119 0.004466 0.015535 0.005880 0.000300 0.958145 0.007498 0.034056 0.034056 0.007498 0.958145 0.000300 0.005880 0.015535 0.004466 0.974119 0.000794 0.001192 0.942800 0.055214 0.724328 0.231775 0.006772 0.037126 0.015720 0.466476 0.315208 0.202596 0.173670 0.355170 0.210710 0.260449 0.407419 0.261539 0.134430 0.196612 0.351478 0.209698 0.262426 0.176399 0.207869 0.284582 0.198951 0.308598 0.434482 0.113724 0.184408 0.267386 0.211144 0.363745 0.173978 0.251133 Consensus sequence: RDHDBVDTCACGTGASBHVHDH Reverse complement motif 0.211144 0.173978 0.363745 0.251133 0.267386 0.113724 0.184408 0.434482 0.308598 0.284582 0.198951 0.207869 0.176399 0.209698 0.262426 0.351478 0.196612 0.261539 0.134430 0.407419 0.173670 0.210710 0.355170 0.260449 0.015720 0.315208 0.466476 0.202596 0.037126 0.231775 0.006772 0.724328 0.000794 0.942800 0.001192 0.055214 0.974119 0.015535 0.004466 0.005880 0.034056 0.958145 0.007498 0.000300 0.000300 0.007498 0.958145 0.034056 0.005880 0.004466 0.015535 0.974119 0.055214 0.001192 0.942800 0.000794 0.724328 0.006772 0.231775 0.037126 0.228203 0.408269 0.142148 0.221381 0.187041 0.188786 0.278290 0.345884 0.197183 0.304611 0.244864 0.253342 0.320389 0.130670 0.161435 0.387506 0.242041 0.222553 0.113615 0.421791 0.298329 0.324534 0.175329 0.201809 0.347837 0.403713 0.112349 0.136102 Consensus sequence: DDHBHBSTCACGTGAHBBDHHM Alignment: DDHBHBSTCACGTGAHBBDHHM VRVDGGHACAVDDKGTHCTDWH ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00050 Bhlhb2_secondary Original Motif Reverse Complement Forward 2 22 0.077135 Species: Mus musculus Original motif 0.120938 0.344851 0.124072 0.410138 0.220931 0.169844 0.422396 0.186829 0.127752 0.260812 0.103811 0.507625 0.140641 0.405473 0.287668 0.166218 0.296957 0.155579 0.301094 0.246370 0.219647 0.287193 0.154072 0.339087 0.049294 0.026059 0.121789 0.802859 0.520042 0.289284 0.173423 0.017251 0.049190 0.943472 0.004308 0.003030 0.902609 0.006767 0.074770 0.015854 0.003221 0.971329 0.005512 0.019937 0.019937 0.005512 0.971329 0.003221 0.015854 0.074770 0.006767 0.902609 0.003030 0.004308 0.943472 0.049190 0.003497 0.088920 0.685942 0.221641 0.802859 0.121789 0.026059 0.049294 0.334544 0.155170 0.275193 0.235092 0.275957 0.132104 0.454982 0.136957 0.134097 0.254352 0.422940 0.188611 0.396163 0.432784 0.051281 0.119772 0.276474 0.115627 0.419844 0.188056 0.160759 0.088061 0.649863 0.101318 0.203314 0.166595 0.106821 0.523270 Consensus sequence: YDYBDHTMCACGTGGADDBMDGT Reverse complement motif 0.523270 0.166595 0.106821 0.203314 0.160759 0.649863 0.088061 0.101318 0.276474 0.419844 0.115627 0.188056 0.396163 0.051281 0.432784 0.119772 0.134097 0.422940 0.254352 0.188611 0.275957 0.454982 0.132104 0.136957 0.235092 0.155170 0.275193 0.334544 0.049294 0.121789 0.026059 0.802859 0.003497 0.685942 0.088920 0.221641 0.003030 0.943472 0.004308 0.049190 0.902609 0.074770 0.006767 0.015854 0.019937 0.971329 0.005512 0.003221 0.003221 0.005512 0.971329 0.019937 0.015854 0.006767 0.074770 0.902609 0.049190 0.004308 0.943472 0.003030 0.017251 0.289284 0.173423 0.520042 0.802859 0.026059 0.121789 0.049294 0.339087 0.287193 0.154072 0.219647 0.296957 0.301094 0.155579 0.246370 0.140641 0.287668 0.405473 0.166218 0.507625 0.260812 0.103811 0.127752 0.220931 0.422396 0.169844 0.186829 0.410138 0.344851 0.124072 0.120938 Consensus sequence: ACHRBHDTCCACGTGYAHHBMHM Alignment: ACHRBHDTCCACGTGYAHHBMHM -HWDAGHACRHHVTGTHCCHVMV ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00526 Foxn1_primary Reverse Complement Original Motif Forward 1 22 0.077205 Species: Mus musculus Original motif 0.456612 0.057181 0.078281 0.407926 0.460529 0.185506 0.083106 0.270859 0.445717 0.179510 0.239355 0.135417 0.116339 0.145186 0.275331 0.463144 0.239398 0.142078 0.480004 0.138520 0.355157 0.217877 0.284296 0.142670 0.318602 0.444835 0.153321 0.083243 0.609569 0.055866 0.280349 0.054216 0.062297 0.769824 0.027844 0.140035 0.151868 0.019245 0.803188 0.025699 0.011842 0.952534 0.017959 0.017665 0.017665 0.017959 0.952534 0.011842 0.025699 0.803188 0.019245 0.151868 0.140035 0.027844 0.769824 0.062297 0.054216 0.280349 0.055866 0.609569 0.013084 0.624655 0.177956 0.184305 0.287647 0.183527 0.295753 0.233074 0.042309 0.345931 0.198458 0.413301 0.338138 0.266033 0.045367 0.350462 0.302850 0.155320 0.074662 0.467168 0.240926 0.068901 0.283055 0.407118 0.409954 0.183157 0.154186 0.252704 Consensus sequence: WHVBVVMACGCGCGTCDYHWDH Reverse complement motif 0.252704 0.183157 0.154186 0.409954 0.407118 0.068901 0.283055 0.240926 0.467168 0.155320 0.074662 0.302850 0.350462 0.266033 0.045367 0.338138 0.413301 0.345931 0.198458 0.042309 0.287647 0.295753 0.183527 0.233074 0.013084 0.177956 0.624655 0.184305 0.609569 0.280349 0.055866 0.054216 0.140035 0.769824 0.027844 0.062297 0.025699 0.019245 0.803188 0.151868 0.017665 0.952534 0.017959 0.011842 0.011842 0.017959 0.952534 0.017665 0.151868 0.803188 0.019245 0.025699 0.062297 0.027844 0.769824 0.140035 0.054216 0.055866 0.280349 0.609569 0.318602 0.153321 0.444835 0.083243 0.142670 0.217877 0.284296 0.355157 0.239398 0.480004 0.142078 0.138520 0.463144 0.145186 0.275331 0.116339 0.135417 0.179510 0.239355 0.445717 0.270859 0.185506 0.083106 0.460529 0.407926 0.057181 0.078281 0.456612 Consensus sequence: HDWHMHGACGCGCGTRBVVBHW Alignment: WHVBVVMACGCGCGTCDYHWDH VRVDGGHACAVDDKGTHCTDWH ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00526 Foxn1_secondary Reverse Complement Original Motif Forward 1 22 0.077433 Species: Mus musculus Original motif 0.477863 0.106306 0.184102 0.231729 0.304951 0.149020 0.361418 0.184612 0.548996 0.056128 0.348902 0.045974 0.385727 0.477782 0.086218 0.050273 0.409556 0.232265 0.173851 0.184328 0.174550 0.312880 0.307123 0.205448 0.850398 0.047204 0.041665 0.060734 0.141234 0.548534 0.142230 0.168002 0.059462 0.026354 0.892948 0.021236 0.053714 0.870297 0.028935 0.047055 0.086273 0.069147 0.805284 0.039296 0.033781 0.573881 0.034115 0.358223 0.035191 0.079663 0.824970 0.060176 0.051830 0.862631 0.019359 0.066180 0.178685 0.015738 0.762485 0.043092 0.058988 0.042615 0.017608 0.880789 0.202382 0.173360 0.284095 0.340163 0.098493 0.234651 0.506524 0.160333 0.109087 0.336204 0.250510 0.304198 0.130945 0.250843 0.177122 0.441090 0.353830 0.138838 0.162784 0.344548 0.114290 0.417163 0.160662 0.307885 Consensus sequence: DDRMHBACGCGYGCGTDGBBDB Reverse complement motif 0.114290 0.160662 0.417163 0.307885 0.344548 0.138838 0.162784 0.353830 0.441090 0.250843 0.177122 0.130945 0.109087 0.250510 0.336204 0.304198 0.098493 0.506524 0.234651 0.160333 0.340163 0.173360 0.284095 0.202382 0.880789 0.042615 0.017608 0.058988 0.178685 0.762485 0.015738 0.043092 0.051830 0.019359 0.862631 0.066180 0.035191 0.824970 0.079663 0.060176 0.033781 0.034115 0.573881 0.358223 0.086273 0.805284 0.069147 0.039296 0.053714 0.028935 0.870297 0.047055 0.059462 0.892948 0.026354 0.021236 0.141234 0.142230 0.548534 0.168002 0.060734 0.047204 0.041665 0.850398 0.174550 0.307123 0.312880 0.205448 0.184328 0.232265 0.173851 0.409556 0.385727 0.086218 0.477782 0.050273 0.045974 0.056128 0.348902 0.548996 0.304951 0.361418 0.149020 0.184612 0.231729 0.106306 0.184102 0.477863 Consensus sequence: BDVBCDACGCKCGCGTBHRKHD Alignment: BDVBCDACGCKCGCGTBHRKHD VRVDGGHACAVDDKGTHCTDWH ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 22 0.077690 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH -HWDAGHACRHHVTGTHCCHVMV ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00528 Foxm1_secondary Original Motif Original Motif Forward 1 22 0.078798 Species: Mus musculus Original motif 0.399785 0.446658 0.111435 0.042122 0.535175 0.103991 0.089706 0.271128 0.078171 0.387987 0.375083 0.158759 0.309001 0.519142 0.070618 0.101239 0.201844 0.255818 0.323149 0.219190 0.534101 0.109845 0.235026 0.121028 0.656038 0.037473 0.261484 0.045006 0.315713 0.164290 0.471815 0.048182 0.651960 0.009412 0.328237 0.010391 0.937365 0.017313 0.007516 0.037807 0.019983 0.044238 0.012387 0.923392 0.061195 0.021485 0.881645 0.035675 0.017521 0.952998 0.013139 0.016342 0.254160 0.029735 0.493023 0.223082 0.239200 0.593324 0.114503 0.052973 0.610822 0.071539 0.099169 0.218470 0.166610 0.389712 0.204400 0.239278 0.227752 0.361626 0.178497 0.232125 0.537030 0.182466 0.026035 0.254470 0.235902 0.151006 0.043788 0.569304 0.081851 0.250397 0.590059 0.077693 0.340417 0.189613 0.272075 0.197895 Consensus sequence: MWSMBAARRATGCDCABHATGD Reverse complement motif 0.197895 0.189613 0.272075 0.340417 0.081851 0.590059 0.250397 0.077693 0.569304 0.151006 0.043788 0.235902 0.254470 0.182466 0.026035 0.537030 0.227752 0.178497 0.361626 0.232125 0.166610 0.204400 0.389712 0.239278 0.218470 0.071539 0.099169 0.610822 0.239200 0.114503 0.593324 0.052973 0.254160 0.493023 0.029735 0.223082 0.017521 0.013139 0.952998 0.016342 0.061195 0.881645 0.021485 0.035675 0.923392 0.044238 0.012387 0.019983 0.037807 0.017313 0.007516 0.937365 0.010391 0.009412 0.328237 0.651960 0.315713 0.471815 0.164290 0.048182 0.045006 0.037473 0.261484 0.656038 0.121028 0.109845 0.235026 0.534101 0.201844 0.323149 0.255818 0.219190 0.309001 0.070618 0.519142 0.101239 0.078171 0.375083 0.387987 0.158759 0.271128 0.103991 0.089706 0.535175 0.399785 0.111435 0.446658 0.042122 Consensus sequence: DCATDBTGHGCATKMTTBRSWR Alignment: MWSMBAARRATGCDCABHATGD HWDAGHACRHHVTGTHCCHVMV ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_primary Original Motif Original Motif Backward 1 22 0.079272 Species: Mus musculus Original motif 0.360997 0.300272 0.115555 0.223177 0.309749 0.228429 0.166233 0.295589 0.149419 0.176868 0.240155 0.433558 0.379704 0.095791 0.276373 0.248133 0.394549 0.174184 0.130641 0.300626 0.443749 0.070776 0.211081 0.274393 0.364301 0.074356 0.370406 0.190936 0.791976 0.038475 0.093390 0.076159 0.963721 0.001826 0.002456 0.031997 0.004516 0.954596 0.008092 0.032796 0.981080 0.002062 0.002161 0.014697 0.986185 0.001846 0.006976 0.004992 0.059567 0.003649 0.002189 0.934595 0.495328 0.024257 0.240450 0.239965 0.305027 0.094878 0.526069 0.074025 0.418442 0.196237 0.158323 0.226998 0.336713 0.220452 0.191155 0.251680 0.192296 0.300342 0.169047 0.338315 0.240387 0.144634 0.128513 0.486465 0.290763 0.271259 0.116600 0.321377 0.224825 0.296233 0.229255 0.249687 0.493240 0.171285 0.075148 0.260326 Consensus sequence: HHBDHDDAACAATDRHHHHHBW Reverse complement motif 0.260326 0.171285 0.075148 0.493240 0.224825 0.229255 0.296233 0.249687 0.321377 0.271259 0.116600 0.290763 0.486465 0.144634 0.128513 0.240387 0.338315 0.300342 0.169047 0.192296 0.251680 0.220452 0.191155 0.336713 0.226998 0.196237 0.158323 0.418442 0.305027 0.526069 0.094878 0.074025 0.239965 0.024257 0.240450 0.495328 0.934595 0.003649 0.002189 0.059567 0.004992 0.001846 0.006976 0.986185 0.014697 0.002062 0.002161 0.981080 0.004516 0.008092 0.954596 0.032796 0.031997 0.001826 0.002456 0.963721 0.076159 0.038475 0.093390 0.791976 0.364301 0.370406 0.074356 0.190936 0.274393 0.070776 0.211081 0.443749 0.300626 0.174184 0.130641 0.394549 0.248133 0.095791 0.276373 0.379704 0.433558 0.176868 0.240155 0.149419 0.295589 0.228429 0.166233 0.309749 0.223177 0.300272 0.115555 0.360997 Consensus sequence: WBHHHHHMDATTGTTHDHDVHH Alignment: HHBDHDDAACAATDRHHHHHBW HWDAGHACRHHVTGTHCCHVMV ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v015681_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 22 0.079931 Species: Mus musculus Original motif 0.331499 0.188505 0.182841 0.297156 0.328961 0.213025 0.273530 0.184484 0.197213 0.129292 0.524914 0.148581 0.274491 0.226406 0.312118 0.186986 0.103231 0.393726 0.364988 0.138055 0.552594 0.166422 0.186262 0.094722 0.157618 0.064773 0.616497 0.161112 0.139166 0.176098 0.621185 0.063551 0.748420 0.062398 0.012447 0.176735 0.116584 0.009438 0.860326 0.013653 0.005030 0.003646 0.974877 0.016447 0.055257 0.007181 0.921760 0.015802 0.032748 0.058249 0.052709 0.856293 0.105606 0.872231 0.014370 0.007793 0.019480 0.497379 0.125899 0.357242 0.478582 0.269713 0.061464 0.190242 0.253985 0.287006 0.201320 0.257689 0.319384 0.210231 0.175842 0.294543 0.222123 0.287802 0.201294 0.288782 0.139951 0.376041 0.081133 0.402875 0.213450 0.343835 0.383676 0.059039 0.322294 0.355918 0.148062 0.173725 Consensus sequence: HVGVSAGGAGGGTCYHHHHYVH Reverse complement motif 0.322294 0.148062 0.355918 0.173725 0.213450 0.383676 0.343835 0.059039 0.402875 0.376041 0.081133 0.139951 0.288782 0.287802 0.201294 0.222123 0.294543 0.210231 0.175842 0.319384 0.253985 0.201320 0.287006 0.257689 0.190242 0.269713 0.061464 0.478582 0.019480 0.125899 0.497379 0.357242 0.105606 0.014370 0.872231 0.007793 0.856293 0.058249 0.052709 0.032748 0.055257 0.921760 0.007181 0.015802 0.005030 0.974877 0.003646 0.016447 0.116584 0.860326 0.009438 0.013653 0.176735 0.062398 0.012447 0.748420 0.139166 0.621185 0.176098 0.063551 0.157618 0.616497 0.064773 0.161112 0.094722 0.166422 0.186262 0.552594 0.103231 0.364988 0.393726 0.138055 0.274491 0.312118 0.226406 0.186986 0.197213 0.524914 0.129292 0.148581 0.184484 0.213025 0.273530 0.328961 0.297156 0.188505 0.182841 0.331499 Consensus sequence: DVMHHDHKGACCCTCCTSVCBH Alignment: HVGVSAGGAGGGTCYHHHHYVH HWDAGHACRHHVTGTHCCHVMV ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 25 Motif name: Arnt Original motif 0.200000 0.800000 0.000000 0.000000 0.950000 0.000000 0.050000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 Consensus sequence: CACGTG Reserve complement motif 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.050000 0.950000 0.200000 0.000000 0.800000 0.000000 Consensus sequence: CACGTG ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 25 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00050 Bhlhb2_primary Original Motif Original Motif Forward 9 6 0.000000 Species: Mus musculus Original motif 0.347837 0.112349 0.403713 0.136102 0.298329 0.175329 0.324534 0.201809 0.421791 0.222553 0.113615 0.242041 0.387506 0.130670 0.161435 0.320389 0.197183 0.244864 0.304611 0.253342 0.345884 0.188786 0.278290 0.187041 0.228203 0.142148 0.408269 0.221381 0.037126 0.006772 0.231775 0.724328 0.055214 0.942800 0.001192 0.000794 0.974119 0.004466 0.015535 0.005880 0.000300 0.958145 0.007498 0.034056 0.034056 0.007498 0.958145 0.000300 0.005880 0.015535 0.004466 0.974119 0.000794 0.001192 0.942800 0.055214 0.724328 0.231775 0.006772 0.037126 0.015720 0.466476 0.315208 0.202596 0.173670 0.355170 0.210710 0.260449 0.407419 0.261539 0.134430 0.196612 0.351478 0.209698 0.262426 0.176399 0.207869 0.284582 0.198951 0.308598 0.434482 0.113724 0.184408 0.267386 0.211144 0.363745 0.173978 0.251133 Consensus sequence: RDHDBVDTCACGTGASBHVHDH Reverse complement motif 0.211144 0.173978 0.363745 0.251133 0.267386 0.113724 0.184408 0.434482 0.308598 0.284582 0.198951 0.207869 0.176399 0.209698 0.262426 0.351478 0.196612 0.261539 0.134430 0.407419 0.173670 0.210710 0.355170 0.260449 0.015720 0.315208 0.466476 0.202596 0.037126 0.231775 0.006772 0.724328 0.000794 0.942800 0.001192 0.055214 0.974119 0.015535 0.004466 0.005880 0.034056 0.958145 0.007498 0.000300 0.000300 0.007498 0.958145 0.034056 0.005880 0.004466 0.015535 0.974119 0.055214 0.001192 0.942800 0.000794 0.724328 0.006772 0.231775 0.037126 0.228203 0.408269 0.142148 0.221381 0.187041 0.188786 0.278290 0.345884 0.197183 0.304611 0.244864 0.253342 0.320389 0.130670 0.161435 0.387506 0.242041 0.222553 0.113615 0.421791 0.298329 0.324534 0.175329 0.201809 0.347837 0.403713 0.112349 0.136102 Consensus sequence: DDHBHBSTCACGTGAHBBDHHM Alignment: RDHDBVDTCACGTGASBHVHDH --------CACGTG-------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00050 Bhlhb2_secondary Reverse Complement Reverse Complement Backward 9 6 0.002642 Species: Mus musculus Original motif 0.120938 0.344851 0.124072 0.410138 0.220931 0.169844 0.422396 0.186829 0.127752 0.260812 0.103811 0.507625 0.140641 0.405473 0.287668 0.166218 0.296957 0.155579 0.301094 0.246370 0.219647 0.287193 0.154072 0.339087 0.049294 0.026059 0.121789 0.802859 0.520042 0.289284 0.173423 0.017251 0.049190 0.943472 0.004308 0.003030 0.902609 0.006767 0.074770 0.015854 0.003221 0.971329 0.005512 0.019937 0.019937 0.005512 0.971329 0.003221 0.015854 0.074770 0.006767 0.902609 0.003030 0.004308 0.943472 0.049190 0.003497 0.088920 0.685942 0.221641 0.802859 0.121789 0.026059 0.049294 0.334544 0.155170 0.275193 0.235092 0.275957 0.132104 0.454982 0.136957 0.134097 0.254352 0.422940 0.188611 0.396163 0.432784 0.051281 0.119772 0.276474 0.115627 0.419844 0.188056 0.160759 0.088061 0.649863 0.101318 0.203314 0.166595 0.106821 0.523270 Consensus sequence: YDYBDHTMCACGTGGADDBMDGT Reverse complement motif 0.523270 0.166595 0.106821 0.203314 0.160759 0.649863 0.088061 0.101318 0.276474 0.419844 0.115627 0.188056 0.396163 0.051281 0.432784 0.119772 0.134097 0.422940 0.254352 0.188611 0.275957 0.454982 0.132104 0.136957 0.235092 0.155170 0.275193 0.334544 0.049294 0.121789 0.026059 0.802859 0.003497 0.685942 0.088920 0.221641 0.003030 0.943472 0.004308 0.049190 0.902609 0.074770 0.006767 0.015854 0.019937 0.971329 0.005512 0.003221 0.003221 0.005512 0.971329 0.019937 0.015854 0.006767 0.074770 0.902609 0.049190 0.004308 0.943472 0.003030 0.017251 0.289284 0.173423 0.520042 0.802859 0.026059 0.121789 0.049294 0.339087 0.287193 0.154072 0.219647 0.296957 0.301094 0.155579 0.246370 0.140641 0.287668 0.405473 0.166218 0.507625 0.260812 0.103811 0.127752 0.220931 0.422396 0.169844 0.186829 0.410138 0.344851 0.124072 0.120938 Consensus sequence: ACHRBHDTCCACGTGYAHHBMHM Alignment: ACHRBHDTCCACGTGYAHHBMHM ---------CACGTG-------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00060 Max_primary Original Motif Original Motif Forward 5 6 0.004442 Species: Mus musculus Original motif 0.234855 0.152539 0.301720 0.310886 0.199226 0.147959 0.439250 0.213565 0.582926 0.274768 0.075866 0.066440 0.138829 0.475428 0.305884 0.079859 0.024979 0.969691 0.001811 0.003520 0.966345 0.003728 0.022320 0.007607 0.000598 0.907006 0.008160 0.084236 0.084236 0.008160 0.907006 0.000598 0.007607 0.022320 0.003728 0.966345 0.003520 0.001811 0.969691 0.024979 0.149140 0.241218 0.389598 0.220044 0.066440 0.075866 0.274768 0.582926 0.186990 0.346199 0.250066 0.216745 0.273437 0.225889 0.300738 0.199936 0.160893 0.111177 0.477963 0.249968 0.171790 0.101256 0.424580 0.302375 Consensus sequence: DDASCACGTGBTBVDD Reverse complement motif 0.171790 0.424580 0.101256 0.302375 0.160893 0.477963 0.111177 0.249968 0.273437 0.300738 0.225889 0.199936 0.186990 0.250066 0.346199 0.216745 0.582926 0.075866 0.274768 0.066440 0.149140 0.389598 0.241218 0.220044 0.003520 0.969691 0.001811 0.024979 0.966345 0.022320 0.003728 0.007607 0.084236 0.907006 0.008160 0.000598 0.000598 0.008160 0.907006 0.084236 0.007607 0.003728 0.022320 0.966345 0.024979 0.001811 0.969691 0.003520 0.138829 0.305884 0.475428 0.079859 0.066440 0.274768 0.075866 0.582926 0.199226 0.439250 0.147959 0.213565 0.310886 0.152539 0.301720 0.234855 Consensus sequence: HHVBABCACGTGSTHD Alignment: DDASCACGTGBTBVDD ----CACGTG------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00046 Tcfe2a_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 7 6 0.034215 Species: Mus musculus Original motif 0.306209 0.232705 0.244475 0.216611 0.165668 0.171480 0.222584 0.440269 0.213008 0.429038 0.156385 0.201569 0.283226 0.329518 0.160795 0.226461 0.439156 0.283517 0.251270 0.026056 0.014994 0.980987 0.000714 0.003304 0.975741 0.020182 0.002909 0.001168 0.000926 0.191353 0.801648 0.006073 0.015382 0.090853 0.893043 0.000721 0.001549 0.005912 0.001713 0.990826 0.004000 0.000857 0.989667 0.005475 0.016957 0.663726 0.148127 0.171190 0.299047 0.091156 0.448649 0.161148 0.354701 0.214677 0.236757 0.193865 0.399446 0.174508 0.200036 0.226009 0.303545 0.277435 0.200094 0.218926 0.380242 0.148876 0.163367 0.307514 Consensus sequence: VBHHVCAGGTGCDVDHD Reverse complement motif 0.307514 0.148876 0.163367 0.380242 0.218926 0.277435 0.200094 0.303545 0.226009 0.174508 0.200036 0.399446 0.193865 0.214677 0.236757 0.354701 0.299047 0.448649 0.091156 0.161148 0.016957 0.148127 0.663726 0.171190 0.004000 0.989667 0.000857 0.005475 0.990826 0.005912 0.001713 0.001549 0.015382 0.893043 0.090853 0.000721 0.000926 0.801648 0.191353 0.006073 0.001168 0.020182 0.002909 0.975741 0.014994 0.000714 0.980987 0.003304 0.026056 0.283517 0.251270 0.439156 0.283226 0.160795 0.329518 0.226461 0.213008 0.156385 0.429038 0.201569 0.440269 0.171480 0.222584 0.165668 0.216611 0.232705 0.244475 0.306209 Consensus sequence: DHDBHGCACCTGBDDVB Alignment: DHDBHGCACCTGBDDVB ------CACGTG----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00097 Mtf1_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 9 6 0.047193 Species: Mus musculus Original motif 0.220880 0.102939 0.418146 0.258035 0.154303 0.210788 0.420671 0.214238 0.229141 0.160788 0.412818 0.197253 0.167193 0.404248 0.092489 0.336070 0.025978 0.931335 0.023830 0.018857 0.009150 0.002023 0.977342 0.011485 0.044768 0.024113 0.039091 0.892028 0.007577 0.008370 0.973767 0.010286 0.005251 0.264996 0.004018 0.725735 0.009165 0.002428 0.980566 0.007841 0.021296 0.956027 0.008893 0.013784 0.982532 0.003341 0.005773 0.008353 0.500983 0.226027 0.143944 0.129045 0.544466 0.285936 0.044719 0.124879 0.321158 0.168428 0.261827 0.248587 0.271460 0.263221 0.199083 0.266236 Consensus sequence: DBDHCGTGTGCAAMDH Reverse complement motif 0.266236 0.263221 0.199083 0.271460 0.248587 0.168428 0.261827 0.321158 0.124879 0.285936 0.044719 0.544466 0.129045 0.226027 0.143944 0.500983 0.008353 0.003341 0.005773 0.982532 0.021296 0.008893 0.956027 0.013784 0.009165 0.980566 0.002428 0.007841 0.725735 0.264996 0.004018 0.005251 0.007577 0.973767 0.008370 0.010286 0.892028 0.024113 0.039091 0.044768 0.009150 0.977342 0.002023 0.011485 0.025978 0.023830 0.931335 0.018857 0.167193 0.092489 0.404248 0.336070 0.229141 0.412818 0.160788 0.197253 0.154303 0.420671 0.210788 0.214238 0.220880 0.418146 0.102939 0.258035 Consensus sequence: HDYTTGCACACGDHBH Alignment: HDYTTGCACACGDHBH --------CACGTG-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00249 Nkx2-5 Reverse Complement Original Motif Forward 6 6 0.048275 Species: Mus musculus Original motif 0.284346 0.280937 0.138180 0.296538 0.399663 0.110464 0.327481 0.162392 0.637560 0.029806 0.218321 0.114314 0.184898 0.144379 0.370828 0.299895 0.017459 0.862111 0.118223 0.002207 0.001004 0.958164 0.000888 0.039945 0.947796 0.011499 0.000413 0.040291 0.024268 0.973476 0.000709 0.001546 0.002616 0.001901 0.003337 0.992147 0.006742 0.071290 0.000276 0.921691 0.393078 0.093424 0.490620 0.022879 0.870162 0.007294 0.051952 0.070591 0.632449 0.156278 0.172644 0.038628 0.362798 0.126579 0.085796 0.424828 0.132810 0.206405 0.025084 0.635702 0.094708 0.272324 0.087702 0.545267 Consensus sequence: HDADCCACTTRAAWTT Reverse complement motif 0.545267 0.272324 0.087702 0.094708 0.635702 0.206405 0.025084 0.132810 0.424828 0.126579 0.085796 0.362798 0.038628 0.156278 0.172644 0.632449 0.070591 0.007294 0.051952 0.870162 0.393078 0.490620 0.093424 0.022879 0.921691 0.071290 0.000276 0.006742 0.992147 0.001901 0.003337 0.002616 0.024268 0.000709 0.973476 0.001546 0.040291 0.011499 0.000413 0.947796 0.001004 0.000888 0.958164 0.039945 0.017459 0.118223 0.862111 0.002207 0.184898 0.370828 0.144379 0.299895 0.114314 0.029806 0.218321 0.637560 0.162392 0.110464 0.327481 0.399663 0.296538 0.280937 0.138180 0.284346 Consensus sequence: AAWTTMAAGTGGHTDH Alignment: HDADCCACTTRAAWTT -----CACGTG----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00060 Max_secondary Reverse Complement Original Motif Backward 5 6 0.048544 Species: Mus musculus Original motif 0.127991 0.202889 0.399822 0.269298 0.156940 0.244015 0.182364 0.416681 0.046494 0.050598 0.744311 0.158596 0.196142 0.365183 0.183389 0.255286 0.019306 0.946805 0.015210 0.018680 0.924839 0.022113 0.027620 0.025428 0.007478 0.672138 0.027789 0.292595 0.046702 0.026044 0.906146 0.021107 0.117335 0.610863 0.025132 0.246670 0.044431 0.053581 0.722748 0.179240 0.543713 0.149809 0.190030 0.116447 0.241148 0.722386 0.022547 0.013919 0.265412 0.113032 0.270602 0.350954 0.226186 0.143504 0.332746 0.297564 Consensus sequence: BBGHCACGCGACDD Reverse complement motif 0.226186 0.332746 0.143504 0.297564 0.350954 0.113032 0.270602 0.265412 0.241148 0.022547 0.722386 0.013919 0.116447 0.149809 0.190030 0.543713 0.044431 0.722748 0.053581 0.179240 0.117335 0.025132 0.610863 0.246670 0.046702 0.906146 0.026044 0.021107 0.007478 0.027789 0.672138 0.292595 0.025428 0.022113 0.027620 0.924839 0.019306 0.015210 0.946805 0.018680 0.196142 0.183389 0.365183 0.255286 0.046494 0.744311 0.050598 0.158596 0.416681 0.244015 0.182364 0.156940 0.127991 0.399822 0.202889 0.269298 Consensus sequence: HDGTCGCGTGDCVB Alignment: BBGHCACGCGACDD ----CACGTG---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00231 Nkx2-2 Original Motif Reverse Complement Forward 7 6 0.049723 Species: Mus musculus Original motif 0.299323 0.258429 0.141957 0.300291 0.267631 0.143882 0.146933 0.441554 0.482614 0.212022 0.233631 0.071733 0.430836 0.073912 0.334439 0.160813 0.124944 0.704331 0.166815 0.003910 0.001941 0.876479 0.000828 0.120752 0.920202 0.005985 0.000456 0.073357 0.023544 0.974093 0.000859 0.001505 0.005010 0.003098 0.001328 0.990564 0.003250 0.198149 0.000490 0.798110 0.134659 0.104976 0.753464 0.006901 0.932490 0.000724 0.006140 0.060646 0.504530 0.106203 0.360995 0.028271 0.673257 0.074893 0.106536 0.145314 0.356324 0.097610 0.230142 0.315924 0.129483 0.188353 0.203623 0.478542 0.289071 0.157675 0.231909 0.321345 Consensus sequence: HDVRCCACTTGARADBD Reverse complement motif 0.321345 0.157675 0.231909 0.289071 0.478542 0.188353 0.203623 0.129483 0.315924 0.097610 0.230142 0.356324 0.145314 0.074893 0.106536 0.673257 0.028271 0.106203 0.360995 0.504530 0.060646 0.000724 0.006140 0.932490 0.134659 0.753464 0.104976 0.006901 0.798110 0.198149 0.000490 0.003250 0.990564 0.003098 0.001328 0.005010 0.023544 0.000859 0.974093 0.001505 0.073357 0.005985 0.000456 0.920202 0.001941 0.000828 0.876479 0.120752 0.124944 0.166815 0.704331 0.003910 0.160813 0.073912 0.334439 0.430836 0.071733 0.212022 0.233631 0.482614 0.441554 0.143882 0.146933 0.267631 0.300291 0.258429 0.141957 0.299323 Consensus sequence: DVDTKTCAAGTGGKBDH Alignment: DVDTKTCAAGTGGKBDH ------CACGTG----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00165 Titf1 Original Motif Reverse Complement Backward 6 6 0.049892 Species: Mus musculus Original motif 0.142834 0.324493 0.147276 0.385397 0.404842 0.233186 0.227659 0.134313 0.677580 0.044952 0.178774 0.098695 0.137761 0.202622 0.469728 0.189889 0.069301 0.825888 0.093549 0.011262 0.003882 0.876858 0.000966 0.118295 0.904355 0.015154 0.001043 0.079449 0.018912 0.977464 0.001207 0.002417 0.003517 0.004393 0.002428 0.989662 0.007151 0.162279 0.000584 0.829986 0.192074 0.120883 0.670840 0.016203 0.881358 0.002039 0.013253 0.103349 0.450016 0.333144 0.184121 0.032719 0.342018 0.321148 0.066945 0.269889 0.209486 0.122118 0.046367 0.622029 0.174564 0.145894 0.048004 0.631539 Consensus sequence: BVABCCACTTGAMHTT Reverse complement motif 0.631539 0.145894 0.048004 0.174564 0.622029 0.122118 0.046367 0.209486 0.269889 0.321148 0.066945 0.342018 0.032719 0.333144 0.184121 0.450016 0.103349 0.002039 0.013253 0.881358 0.192074 0.670840 0.120883 0.016203 0.829986 0.162279 0.000584 0.007151 0.989662 0.004393 0.002428 0.003517 0.018912 0.001207 0.977464 0.002417 0.079449 0.015154 0.001043 0.904355 0.003882 0.000966 0.876858 0.118295 0.069301 0.093549 0.825888 0.011262 0.137761 0.469728 0.202622 0.189889 0.098695 0.044952 0.178774 0.677580 0.134313 0.233186 0.227659 0.404842 0.385397 0.324493 0.147276 0.142834 Consensus sequence: AAHYTCAAGTGGBTBV Alignment: AAHYTCAAGTGGBTBV -----CACGTG----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00147 Nkx2-6 Reverse Complement Original Motif Forward 6 6 0.054460 Species: Mus musculus Original motif 0.217416 0.196318 0.223786 0.362479 0.398508 0.155537 0.270546 0.175410 0.791392 0.022106 0.126944 0.059558 0.211671 0.145452 0.349401 0.293476 0.023830 0.847357 0.127125 0.001688 0.001426 0.942475 0.000495 0.055604 0.969354 0.001012 0.000987 0.028646 0.017358 0.980969 0.000778 0.000894 0.001816 0.004181 0.001573 0.992430 0.000925 0.059099 0.000431 0.939544 0.670672 0.011130 0.312570 0.005628 0.757147 0.010903 0.032137 0.199813 0.335600 0.359053 0.277277 0.028070 0.440449 0.199116 0.111993 0.248442 0.126577 0.210049 0.039661 0.623714 0.088481 0.233166 0.032706 0.645647 Consensus sequence: DDADCCACTTAAVHTT Reverse complement motif 0.645647 0.233166 0.032706 0.088481 0.623714 0.210049 0.039661 0.126577 0.248442 0.199116 0.111993 0.440449 0.335600 0.277277 0.359053 0.028070 0.199813 0.010903 0.032137 0.757147 0.005628 0.011130 0.312570 0.670672 0.939544 0.059099 0.000431 0.000925 0.992430 0.004181 0.001573 0.001816 0.017358 0.000778 0.980969 0.000894 0.028646 0.001012 0.000987 0.969354 0.001426 0.000495 0.942475 0.055604 0.023830 0.127125 0.847357 0.001688 0.211671 0.349401 0.145452 0.293476 0.059558 0.022106 0.126944 0.791392 0.175410 0.155537 0.270546 0.398508 0.362479 0.196318 0.223786 0.217416 Consensus sequence: AAHVTTAAGTGGHTDD Alignment: DDADCCACTTAAVHTT -----CACGTG----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 26 Motif name: ArntAhr Original motif 0.125000 0.333333 0.083333 0.458333 0.000000 0.000000 0.958333 0.041667 0.000000 0.958333 0.000000 0.041667 0.000000 0.000000 0.958333 0.041667 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 Consensus sequence: YGCGTG Reserve complement motif 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.958333 0.000000 0.041667 0.000000 0.000000 0.958333 0.041667 0.000000 0.958333 0.000000 0.041667 0.458333 0.333333 0.083333 0.125000 Consensus sequence: CACGCM ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 26 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00400 Zif268 Original Motif Reverse Complement Forward 7 6 0.000000 Species: Mus musculus Original motif 0.104824 0.412716 0.254506 0.227955 0.644922 0.065476 0.140479 0.149122 0.201205 0.166164 0.347131 0.285501 0.360606 0.256316 0.150766 0.232313 0.199831 0.240681 0.279350 0.280137 0.234308 0.204076 0.321306 0.240310 0.274112 0.462435 0.111425 0.152028 0.067070 0.717501 0.073934 0.141496 0.106745 0.084442 0.658566 0.150247 0.025128 0.967053 0.003585 0.004234 0.006412 0.982989 0.003227 0.007371 0.009588 0.877620 0.002571 0.110221 0.621521 0.355443 0.015669 0.007366 0.002600 0.980275 0.004191 0.012934 0.118773 0.026658 0.783843 0.070725 0.022358 0.822101 0.024684 0.130857 0.713212 0.080912 0.128793 0.077084 0.166568 0.250955 0.107934 0.474544 0.225040 0.222494 0.163301 0.389166 0.268976 0.223206 0.265314 0.242504 0.137052 0.229058 0.148439 0.485451 0.135819 0.304550 0.141994 0.417637 0.272440 0.319501 0.230580 0.177478 Consensus sequence: BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV Reverse complement motif 0.272440 0.230580 0.319501 0.177478 0.417637 0.304550 0.141994 0.135819 0.485451 0.229058 0.148439 0.137052 0.242504 0.223206 0.265314 0.268976 0.389166 0.222494 0.163301 0.225040 0.474544 0.250955 0.107934 0.166568 0.077084 0.080912 0.128793 0.713212 0.022358 0.024684 0.822101 0.130857 0.118773 0.783843 0.026658 0.070725 0.002600 0.004191 0.980275 0.012934 0.007366 0.355443 0.015669 0.621521 0.009588 0.002571 0.877620 0.110221 0.006412 0.003227 0.982989 0.007371 0.025128 0.003585 0.967053 0.004234 0.106745 0.658566 0.084442 0.150247 0.067070 0.073934 0.717501 0.141496 0.274112 0.111425 0.462435 0.152028 0.234308 0.321306 0.204076 0.240310 0.280137 0.240681 0.279350 0.199831 0.232313 0.256316 0.150766 0.360606 0.201205 0.347131 0.166164 0.285501 0.149122 0.065476 0.140479 0.644922 0.104824 0.254506 0.412716 0.227955 Consensus sequence: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB Alignment: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB ------YGCGTG----------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00002 Sp4_secondary Reverse Complement Reverse Complement Backward 5 6 0.001836 Species: Mus musculus Original motif 0.146334 0.312326 0.244281 0.297060 0.493155 0.092609 0.162506 0.251729 0.503593 0.059863 0.077561 0.358984 0.763321 0.015264 0.213114 0.008301 0.012415 0.025932 0.945502 0.016151 0.006713 0.015221 0.950098 0.027968 0.062415 0.834303 0.054500 0.048782 0.011010 0.020677 0.928821 0.039493 0.012785 0.024162 0.145822 0.817231 0.133595 0.033962 0.787876 0.044567 0.140697 0.180481 0.428253 0.250570 0.036281 0.806412 0.033510 0.123797 0.157910 0.408607 0.122427 0.311055 0.292185 0.260017 0.197515 0.250283 0.251107 0.124480 0.359447 0.264967 Consensus sequence: BDWAGGCGTGBCHHD Reverse complement motif 0.251107 0.359447 0.124480 0.264967 0.250283 0.260017 0.197515 0.292185 0.157910 0.122427 0.408607 0.311055 0.036281 0.033510 0.806412 0.123797 0.140697 0.428253 0.180481 0.250570 0.133595 0.787876 0.033962 0.044567 0.817231 0.024162 0.145822 0.012785 0.011010 0.928821 0.020677 0.039493 0.062415 0.054500 0.834303 0.048782 0.006713 0.950098 0.015221 0.027968 0.012415 0.945502 0.025932 0.016151 0.008301 0.015264 0.213114 0.763321 0.358984 0.059863 0.077561 0.503593 0.251729 0.092609 0.162506 0.493155 0.146334 0.244281 0.312326 0.297060 Consensus sequence: HHDGBCACGCCTWDB Alignment: HHDGBCACGCCTWDB -----CACGCM---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00060 Max_secondary Original Motif Reverse Complement Backward 5 6 0.003480 Species: Mus musculus Original motif 0.127991 0.202889 0.399822 0.269298 0.156940 0.244015 0.182364 0.416681 0.046494 0.050598 0.744311 0.158596 0.196142 0.365183 0.183389 0.255286 0.019306 0.946805 0.015210 0.018680 0.924839 0.022113 0.027620 0.025428 0.007478 0.672138 0.027789 0.292595 0.046702 0.026044 0.906146 0.021107 0.117335 0.610863 0.025132 0.246670 0.044431 0.053581 0.722748 0.179240 0.543713 0.149809 0.190030 0.116447 0.241148 0.722386 0.022547 0.013919 0.265412 0.113032 0.270602 0.350954 0.226186 0.143504 0.332746 0.297564 Consensus sequence: BBGHCACGCGACDD Reverse complement motif 0.226186 0.332746 0.143504 0.297564 0.350954 0.113032 0.270602 0.265412 0.241148 0.022547 0.722386 0.013919 0.116447 0.149809 0.190030 0.543713 0.044431 0.722748 0.053581 0.179240 0.117335 0.025132 0.610863 0.246670 0.046702 0.906146 0.026044 0.021107 0.007478 0.027789 0.672138 0.292595 0.025428 0.022113 0.027620 0.924839 0.019306 0.015210 0.946805 0.018680 0.196142 0.183389 0.365183 0.255286 0.046494 0.744311 0.050598 0.158596 0.416681 0.244015 0.182364 0.156940 0.127991 0.399822 0.202889 0.269298 Consensus sequence: HDGTCGCGTGDCVB Alignment: HDGTCGCGTGDCVB ----YGCGTG---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00527 Foxn4_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 8 6 0.005262 Species: Mus musculus Original motif 0.397468 0.109792 0.196359 0.296381 0.102928 0.480888 0.250249 0.165936 0.141925 0.173586 0.377365 0.307124 0.337385 0.368225 0.188518 0.105872 0.354789 0.067393 0.345343 0.232475 0.299392 0.109745 0.215552 0.375311 0.242937 0.170264 0.189245 0.397554 0.461680 0.013180 0.358677 0.166463 0.067089 0.063048 0.008045 0.861819 0.431756 0.128671 0.436022 0.003551 0.006559 0.001814 0.988272 0.003355 0.012929 0.983600 0.001468 0.002003 0.018768 0.000766 0.976433 0.004033 0.003776 0.005554 0.002991 0.987679 0.002737 0.981589 0.009028 0.006646 0.126509 0.273800 0.413161 0.186530 0.100613 0.337225 0.212034 0.350128 0.123741 0.284683 0.060914 0.530661 0.204454 0.143533 0.100462 0.551551 0.202290 0.482197 0.148368 0.167145 0.191625 0.101330 0.607860 0.099185 0.507546 0.086532 0.219554 0.186368 Consensus sequence: DBBVDDDRTRGCGTCBBYTHGA Reverse complement motif 0.186368 0.086532 0.219554 0.507546 0.191625 0.607860 0.101330 0.099185 0.202290 0.148368 0.482197 0.167145 0.551551 0.143533 0.100462 0.204454 0.530661 0.284683 0.060914 0.123741 0.350128 0.337225 0.212034 0.100613 0.126509 0.413161 0.273800 0.186530 0.002737 0.009028 0.981589 0.006646 0.987679 0.005554 0.002991 0.003776 0.018768 0.976433 0.000766 0.004033 0.012929 0.001468 0.983600 0.002003 0.006559 0.988272 0.001814 0.003355 0.431756 0.436022 0.128671 0.003551 0.861819 0.063048 0.008045 0.067089 0.166463 0.013180 0.358677 0.461680 0.397554 0.170264 0.189245 0.242937 0.375311 0.109745 0.215552 0.299392 0.232475 0.067393 0.345343 0.354789 0.337385 0.188518 0.368225 0.105872 0.141925 0.377365 0.173586 0.307124 0.102928 0.250249 0.480888 0.165936 0.296381 0.109792 0.196359 0.397468 Consensus sequence: TCDAMVBGACGCMAKDDDVBBD Alignment: TCDAMVBGACGCMAKDDDVBBD -------CACGCM--------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00042 Gm397_second Original Motif Reverse Complement Backward 8 6 0.005582 Species: Mus musculus Original motif 0.360404 0.193218 0.248888 0.197490 0.286498 0.224597 0.426555 0.062349 0.347032 0.440548 0.033161 0.179259 0.337062 0.193658 0.385751 0.083529 0.108793 0.005723 0.878300 0.007184 0.015151 0.973406 0.009324 0.002118 0.972117 0.003915 0.019783 0.004185 0.010144 0.980912 0.003106 0.005839 0.974864 0.007532 0.015914 0.001691 0.012441 0.939195 0.029256 0.019108 0.759620 0.106164 0.073819 0.060397 0.157234 0.818234 0.007449 0.017083 0.050076 0.063608 0.505171 0.381144 0.131903 0.538163 0.124608 0.205325 0.367623 0.286526 0.240931 0.104919 0.357798 0.317606 0.097711 0.226885 Consensus sequence: DVMVGCACACACKCVH Reverse complement motif 0.226885 0.317606 0.097711 0.357798 0.104919 0.286526 0.240931 0.367623 0.131903 0.124608 0.538163 0.205325 0.050076 0.505171 0.063608 0.381144 0.157234 0.007449 0.818234 0.017083 0.060397 0.106164 0.073819 0.759620 0.012441 0.029256 0.939195 0.019108 0.001691 0.007532 0.015914 0.974864 0.010144 0.003106 0.980912 0.005839 0.004185 0.003915 0.019783 0.972117 0.015151 0.009324 0.973406 0.002118 0.108793 0.878300 0.005723 0.007184 0.337062 0.385751 0.193658 0.083529 0.347032 0.033161 0.440548 0.179259 0.286498 0.426555 0.224597 0.062349 0.197490 0.193218 0.248888 0.360404 Consensus sequence: HBGYGTGTGTGCVRVD Alignment: HBGYGTGTGTGCVRVD ---YGCGTG------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00097 Mtf1_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 9 6 0.007024 Species: Mus musculus Original motif 0.220880 0.102939 0.418146 0.258035 0.154303 0.210788 0.420671 0.214238 0.229141 0.160788 0.412818 0.197253 0.167193 0.404248 0.092489 0.336070 0.025978 0.931335 0.023830 0.018857 0.009150 0.002023 0.977342 0.011485 0.044768 0.024113 0.039091 0.892028 0.007577 0.008370 0.973767 0.010286 0.005251 0.264996 0.004018 0.725735 0.009165 0.002428 0.980566 0.007841 0.021296 0.956027 0.008893 0.013784 0.982532 0.003341 0.005773 0.008353 0.500983 0.226027 0.143944 0.129045 0.544466 0.285936 0.044719 0.124879 0.321158 0.168428 0.261827 0.248587 0.271460 0.263221 0.199083 0.266236 Consensus sequence: DBDHCGTGTGCAAMDH Reverse complement motif 0.266236 0.263221 0.199083 0.271460 0.248587 0.168428 0.261827 0.321158 0.124879 0.285936 0.044719 0.544466 0.129045 0.226027 0.143944 0.500983 0.008353 0.003341 0.005773 0.982532 0.021296 0.008893 0.956027 0.013784 0.009165 0.980566 0.002428 0.007841 0.725735 0.264996 0.004018 0.005251 0.007577 0.973767 0.008370 0.010286 0.892028 0.024113 0.039091 0.044768 0.009150 0.977342 0.002023 0.011485 0.025978 0.023830 0.931335 0.018857 0.167193 0.092489 0.404248 0.336070 0.229141 0.412818 0.160788 0.197253 0.154303 0.420671 0.210788 0.214238 0.220880 0.418146 0.102939 0.258035 Consensus sequence: HDYTTGCACACGDHBH Alignment: HDYTTGCACACGDHBH --------CACGCM-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00526 Foxn1_secondary Original Motif Original Motif Forward 8 6 0.012323 Species: Mus musculus Original motif 0.477863 0.106306 0.184102 0.231729 0.304951 0.149020 0.361418 0.184612 0.548996 0.056128 0.348902 0.045974 0.385727 0.477782 0.086218 0.050273 0.409556 0.232265 0.173851 0.184328 0.174550 0.312880 0.307123 0.205448 0.850398 0.047204 0.041665 0.060734 0.141234 0.548534 0.142230 0.168002 0.059462 0.026354 0.892948 0.021236 0.053714 0.870297 0.028935 0.047055 0.086273 0.069147 0.805284 0.039296 0.033781 0.573881 0.034115 0.358223 0.035191 0.079663 0.824970 0.060176 0.051830 0.862631 0.019359 0.066180 0.178685 0.015738 0.762485 0.043092 0.058988 0.042615 0.017608 0.880789 0.202382 0.173360 0.284095 0.340163 0.098493 0.234651 0.506524 0.160333 0.109087 0.336204 0.250510 0.304198 0.130945 0.250843 0.177122 0.441090 0.353830 0.138838 0.162784 0.344548 0.114290 0.417163 0.160662 0.307885 Consensus sequence: DDRMHBACGCGYGCGTDGBBDB Reverse complement motif 0.114290 0.160662 0.417163 0.307885 0.344548 0.138838 0.162784 0.353830 0.441090 0.250843 0.177122 0.130945 0.109087 0.250510 0.336204 0.304198 0.098493 0.506524 0.234651 0.160333 0.340163 0.173360 0.284095 0.202382 0.880789 0.042615 0.017608 0.058988 0.178685 0.762485 0.015738 0.043092 0.051830 0.019359 0.862631 0.066180 0.035191 0.824970 0.079663 0.060176 0.033781 0.034115 0.573881 0.358223 0.086273 0.805284 0.069147 0.039296 0.053714 0.028935 0.870297 0.047055 0.059462 0.892948 0.026354 0.021236 0.141234 0.142230 0.548534 0.168002 0.060734 0.047204 0.041665 0.850398 0.174550 0.307123 0.312880 0.205448 0.184328 0.232265 0.173851 0.409556 0.385727 0.086218 0.477782 0.050273 0.045974 0.056128 0.348902 0.548996 0.304951 0.361418 0.149020 0.184612 0.231729 0.106306 0.184102 0.477863 Consensus sequence: BDVBCDACGCKCGCGTBHRKHD Alignment: DDRMHBACGCGYGCGTDGBBDB -------YGCGTG--------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00007 Egr1_primary Reverse Complement Original Motif Backward 3 6 0.014158 Species: Mus musculus Original motif 0.211547 0.282708 0.203472 0.302273 0.141988 0.722437 0.054854 0.080721 0.032605 0.877172 0.012432 0.077792 0.115126 0.070606 0.781290 0.032979 0.003516 0.990021 0.002265 0.004198 0.004715 0.982482 0.009897 0.002906 0.001627 0.975937 0.001662 0.020774 0.262352 0.731732 0.002730 0.003187 0.005890 0.985756 0.002081 0.006273 0.022893 0.090460 0.649322 0.237324 0.023038 0.859949 0.037913 0.079101 0.567633 0.057394 0.166792 0.208181 0.176597 0.331265 0.125308 0.366830 0.183049 0.183774 0.226793 0.406384 Consensus sequence: HCCGCCCCCGCAHB Reverse complement motif 0.406384 0.183774 0.226793 0.183049 0.366830 0.331265 0.125308 0.176597 0.208181 0.057394 0.166792 0.567633 0.023038 0.037913 0.859949 0.079101 0.022893 0.649322 0.090460 0.237324 0.005890 0.002081 0.985756 0.006273 0.262352 0.002730 0.731732 0.003187 0.001627 0.001662 0.975937 0.020774 0.004715 0.009897 0.982482 0.002906 0.003516 0.002265 0.990021 0.004198 0.115126 0.781290 0.070606 0.032979 0.032605 0.012432 0.877172 0.077792 0.141988 0.054854 0.722437 0.080721 0.302273 0.282708 0.203472 0.211547 Consensus sequence: VHTGCGGGGGCGGH Alignment: HCCGCCCCCGCAHB ------CACGCM-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_primaryOriginal Motif Original Motif Backward 11 6 0.014448 Species: Mus musculus Original motif 0.204923 0.208846 0.365383 0.220848 0.294304 0.300143 0.167287 0.238266 0.109711 0.619514 0.117379 0.153396 0.178979 0.378580 0.230177 0.212264 0.159594 0.542602 0.118178 0.179627 0.125206 0.430074 0.151826 0.292894 0.097692 0.709845 0.116956 0.075506 0.148292 0.565912 0.037632 0.248164 0.077951 0.034190 0.855503 0.032356 0.001657 0.001061 0.971877 0.025405 0.001926 0.001084 0.991712 0.005278 0.033031 0.012001 0.057796 0.897171 0.002723 0.002647 0.993348 0.001281 0.003261 0.000963 0.987199 0.008577 0.000611 0.090925 0.074857 0.833608 0.015299 0.978878 0.004949 0.000874 0.013368 0.600902 0.033485 0.352245 0.231949 0.149575 0.118804 0.499672 0.267580 0.186002 0.371242 0.175176 0.264884 0.223483 0.110082 0.401551 0.221365 0.170121 0.179559 0.428955 0.112997 0.692930 0.139981 0.054092 0.460305 0.207883 0.155111 0.176702 Consensus sequence: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH Reverse complement motif 0.176702 0.207883 0.155111 0.460305 0.112997 0.139981 0.692930 0.054092 0.428955 0.170121 0.179559 0.221365 0.401551 0.223483 0.110082 0.264884 0.267580 0.371242 0.186002 0.175176 0.499672 0.149575 0.118804 0.231949 0.013368 0.033485 0.600902 0.352245 0.015299 0.004949 0.978878 0.000874 0.833608 0.090925 0.074857 0.000611 0.003261 0.987199 0.000963 0.008577 0.002723 0.993348 0.002647 0.001281 0.897171 0.012001 0.057796 0.033031 0.001926 0.991712 0.001084 0.005278 0.001657 0.971877 0.001061 0.025405 0.077951 0.855503 0.034190 0.032356 0.148292 0.037632 0.565912 0.248164 0.097692 0.116956 0.709845 0.075506 0.125206 0.151826 0.430074 0.292894 0.159594 0.118178 0.542602 0.179627 0.178979 0.230177 0.378580 0.212264 0.109711 0.117379 0.619514 0.153396 0.294304 0.167287 0.300143 0.238266 0.204923 0.365383 0.208846 0.220848 Consensus sequence: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB Alignment: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH -------YGCGTG---------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00527 Foxn4_secondary Original Motif Reverse Complement Forward 10 6 0.017211 Species: Mus musculus Original motif 0.298336 0.418632 0.208054 0.074978 0.289907 0.015608 0.457100 0.237385 0.273583 0.077889 0.107860 0.540668 0.184954 0.161611 0.384390 0.269045 0.521826 0.156340 0.089019 0.232815 0.356716 0.131104 0.394857 0.117323 0.266669 0.108765 0.505273 0.119293 0.020778 0.047199 0.919524 0.012500 0.948536 0.018775 0.008113 0.024576 0.010822 0.964042 0.014701 0.010434 0.007428 0.019505 0.966351 0.006717 0.010025 0.975678 0.008648 0.005649 0.043796 0.120935 0.742979 0.092289 0.008252 0.250704 0.541132 0.199913 0.474428 0.044681 0.134430 0.346461 0.146597 0.421317 0.143166 0.288920 0.020540 0.181479 0.553811 0.244170 0.129612 0.173360 0.535219 0.161808 0.506084 0.158156 0.130983 0.204776 0.054872 0.103043 0.545792 0.296293 0.389882 0.171037 0.164162 0.274918 0.225861 0.314031 0.288872 0.171237 Consensus sequence: VDWDARRGACGCGGWHGGAKHV Reverse complement motif 0.225861 0.288872 0.314031 0.171237 0.274918 0.171037 0.164162 0.389882 0.054872 0.545792 0.103043 0.296293 0.204776 0.158156 0.130983 0.506084 0.129612 0.535219 0.173360 0.161808 0.020540 0.553811 0.181479 0.244170 0.146597 0.143166 0.421317 0.288920 0.346461 0.044681 0.134430 0.474428 0.008252 0.541132 0.250704 0.199913 0.043796 0.742979 0.120935 0.092289 0.010025 0.008648 0.975678 0.005649 0.007428 0.966351 0.019505 0.006717 0.010822 0.014701 0.964042 0.010434 0.024576 0.018775 0.008113 0.948536 0.020778 0.919524 0.047199 0.012500 0.266669 0.505273 0.108765 0.119293 0.356716 0.394857 0.131104 0.117323 0.232815 0.156340 0.089019 0.521826 0.184954 0.384390 0.161611 0.269045 0.540668 0.077889 0.107860 0.273583 0.289907 0.457100 0.015608 0.237385 0.298336 0.208054 0.418632 0.074978 Consensus sequence: VHYTCCDWCCGCGTCMMTHWHV Alignment: VHYTCCDWCCGCGTCMMTHWHV ---------YGCGTG------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 27 Motif name: E2F1 Original motif 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.400000 0.600000 0.000000 0.000000 0.200000 0.800000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.900000 0.100000 0.000000 Consensus sequence: TTTSGCGC Reserve complement motif 0.000000 0.100000 0.900000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.800000 0.200000 0.000000 0.000000 0.600000 0.400000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 Consensus sequence: GCGCSAAA ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 27 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00001 E2F2_secondary Original Motif Reverse Complement Backward 7 8 0.000000 Species: Mus musculus Original motif 0.270440 0.280855 0.182254 0.266451 0.232294 0.286577 0.287022 0.194107 0.182719 0.289524 0.187726 0.340031 0.321668 0.055383 0.129604 0.493345 0.105971 0.476989 0.007580 0.409460 0.150172 0.013701 0.803513 0.032614 0.004559 0.194378 0.794741 0.006322 0.047843 0.942269 0.005918 0.003970 0.010089 0.002584 0.946109 0.041218 0.012276 0.865373 0.117935 0.004415 0.045912 0.779220 0.006935 0.167933 0.781965 0.011623 0.113119 0.093293 0.612968 0.172164 0.096061 0.118806 0.357204 0.206997 0.222456 0.213343 0.292059 0.261101 0.279674 0.167166 0.164667 0.173227 0.371882 0.290223 0.157765 0.278892 0.333119 0.230224 Consensus sequence: HVBWYGGCGCCAADVBB Reverse complement motif 0.157765 0.333119 0.278892 0.230224 0.164667 0.371882 0.173227 0.290223 0.167166 0.261101 0.279674 0.292059 0.213343 0.206997 0.222456 0.357204 0.118806 0.172164 0.096061 0.612968 0.093293 0.011623 0.113119 0.781965 0.045912 0.006935 0.779220 0.167933 0.012276 0.117935 0.865373 0.004415 0.010089 0.946109 0.002584 0.041218 0.047843 0.005918 0.942269 0.003970 0.004559 0.794741 0.194378 0.006322 0.150172 0.803513 0.013701 0.032614 0.105971 0.007580 0.476989 0.409460 0.493345 0.055383 0.129604 0.321668 0.340031 0.289524 0.187726 0.182719 0.232294 0.287022 0.286577 0.194107 0.270440 0.182254 0.280855 0.266451 Consensus sequence: BBBDTTGGCGCCKWVVD Alignment: BBBDTTGGCGCCKWVVD ---TTTSGCGC------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00003 E2F3_secondary Original Motif Reverse Complement Forward 4 8 0.001820 Species: Mus musculus Original motif 0.265095 0.268267 0.222997 0.243641 0.200676 0.255224 0.341788 0.202312 0.178293 0.362068 0.104617 0.355022 0.351308 0.049870 0.101991 0.496832 0.114543 0.445994 0.008584 0.430879 0.113589 0.020854 0.846807 0.018750 0.004661 0.132010 0.859240 0.004088 0.030896 0.962007 0.004017 0.003080 0.006194 0.002090 0.965564 0.026152 0.008009 0.911831 0.077009 0.003151 0.029519 0.830096 0.011333 0.129053 0.764710 0.016406 0.088627 0.130257 0.530327 0.265186 0.100721 0.103765 0.331689 0.153148 0.308482 0.206682 0.332536 0.311591 0.232118 0.123755 0.175189 0.233372 0.375563 0.215876 0.183884 0.334856 0.283993 0.197267 Consensus sequence: HBHWYGGCGCCAMDVBB Reverse complement motif 0.183884 0.283993 0.334856 0.197267 0.175189 0.375563 0.233372 0.215876 0.123755 0.311591 0.232118 0.332536 0.206682 0.153148 0.308482 0.331689 0.103765 0.265186 0.100721 0.530327 0.130257 0.016406 0.088627 0.764710 0.029519 0.011333 0.830096 0.129053 0.008009 0.077009 0.911831 0.003151 0.006194 0.965564 0.002090 0.026152 0.030896 0.004017 0.962007 0.003080 0.004661 0.859240 0.132010 0.004088 0.113589 0.846807 0.020854 0.018750 0.114543 0.008584 0.445994 0.430879 0.496832 0.049870 0.101991 0.351308 0.178293 0.104617 0.362068 0.355022 0.200676 0.341788 0.255224 0.202312 0.265095 0.222997 0.268267 0.243641 Consensus sequence: BBBDYTGGCGCCKWDBD Alignment: BBBDYTGGCGCCKWDBD ---TTTSGCGC------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00072 IRC900814_primary Original Motif Reverse Complement Backward 5 8 0.023764 Species: Mus musculus Original motif 0.365594 0.139520 0.170474 0.324412 0.273874 0.192800 0.250453 0.282872 0.161547 0.330332 0.098428 0.409694 0.084003 0.205596 0.098191 0.612210 0.953705 0.016367 0.006314 0.023614 0.003494 0.989648 0.003278 0.003580 0.004722 0.003156 0.988805 0.003317 0.939828 0.001925 0.052151 0.006096 0.183998 0.760396 0.030845 0.024762 0.917564 0.003661 0.065438 0.013337 0.965452 0.006559 0.005183 0.022807 0.730611 0.054369 0.006576 0.208444 0.266519 0.133801 0.067418 0.532262 0.329952 0.210903 0.220319 0.238826 0.250220 0.197954 0.314202 0.237625 0.172311 0.401218 0.189340 0.237131 Consensus sequence: DDHTACGACAAAWDDB Reverse complement motif 0.172311 0.189340 0.401218 0.237131 0.250220 0.314202 0.197954 0.237625 0.238826 0.210903 0.220319 0.329952 0.532262 0.133801 0.067418 0.266519 0.208444 0.054369 0.006576 0.730611 0.022807 0.006559 0.005183 0.965452 0.013337 0.003661 0.065438 0.917564 0.183998 0.030845 0.760396 0.024762 0.006096 0.001925 0.052151 0.939828 0.004722 0.988805 0.003156 0.003317 0.003494 0.003278 0.989648 0.003580 0.023614 0.016367 0.006314 0.953705 0.612210 0.205596 0.098191 0.084003 0.409694 0.330332 0.098428 0.161547 0.282872 0.192800 0.250453 0.273874 0.324412 0.139520 0.170474 0.365594 Consensus sequence: BHDWTTTGTCGTAHDD Alignment: BHDWTTTGTCGTAHDD ----TTTSGCGC---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00003 E2F3_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 3 8 0.027564 Species: Mus musculus Original motif 0.358868 0.212371 0.263565 0.165196 0.303014 0.253580 0.111217 0.332189 0.420933 0.110957 0.210958 0.257152 0.769724 0.062662 0.032155 0.135459 0.311973 0.051319 0.408669 0.228039 0.097916 0.141153 0.719697 0.041234 0.009980 0.014044 0.971955 0.004021 0.014425 0.974798 0.008373 0.002404 0.000891 0.013228 0.983966 0.001915 0.000827 0.938560 0.059548 0.001065 0.007071 0.102005 0.872378 0.018546 0.020099 0.897653 0.014151 0.068097 0.114080 0.346724 0.409037 0.130159 0.331439 0.279041 0.085030 0.304491 0.319846 0.136792 0.043641 0.499722 Consensus sequence: VHDADGGCGCGCSHW Reverse complement motif 0.499722 0.136792 0.043641 0.319846 0.304491 0.279041 0.085030 0.331439 0.114080 0.409037 0.346724 0.130159 0.020099 0.014151 0.897653 0.068097 0.007071 0.872378 0.102005 0.018546 0.000827 0.059548 0.938560 0.001065 0.000891 0.983966 0.013228 0.001915 0.014425 0.008373 0.974798 0.002404 0.009980 0.971955 0.014044 0.004021 0.097916 0.719697 0.141153 0.041234 0.311973 0.408669 0.051319 0.228039 0.135459 0.062662 0.032155 0.769724 0.257152 0.110957 0.210958 0.420933 0.332189 0.253580 0.111217 0.303014 0.165196 0.212371 0.263565 0.358868 Consensus sequence: WHSGCGCGCCHTDHB Alignment: WHSGCGCGCCHTDHB -----GCGCSAAA-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00065 Zfp161_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 9 8 0.028109 Species: Mus musculus Original motif 0.142624 0.111294 0.283688 0.462394 0.221170 0.081404 0.499138 0.198288 0.290070 0.042114 0.604904 0.062912 0.109755 0.559510 0.215454 0.115281 0.111745 0.022727 0.850580 0.014948 0.015907 0.942291 0.005561 0.036241 0.088509 0.003729 0.902805 0.004957 0.004957 0.902805 0.003729 0.088509 0.036241 0.005561 0.942291 0.015907 0.014948 0.850580 0.022727 0.111745 0.325358 0.049424 0.519652 0.105566 0.062912 0.604904 0.042114 0.290070 0.214335 0.388248 0.125912 0.271505 0.128984 0.372787 0.092390 0.405839 0.269058 0.098422 0.484016 0.148504 0.362176 0.156050 0.188642 0.293132 Consensus sequence: DDGCGCGCGCRCHYRD Reverse complement motif 0.293132 0.156050 0.188642 0.362176 0.269058 0.484016 0.098422 0.148504 0.405839 0.372787 0.092390 0.128984 0.214335 0.125912 0.388248 0.271505 0.062912 0.042114 0.604904 0.290070 0.325358 0.519652 0.049424 0.105566 0.014948 0.022727 0.850580 0.111745 0.036241 0.942291 0.005561 0.015907 0.004957 0.003729 0.902805 0.088509 0.088509 0.902805 0.003729 0.004957 0.015907 0.005561 0.942291 0.036241 0.111745 0.850580 0.022727 0.014948 0.109755 0.215454 0.559510 0.115281 0.290070 0.604904 0.042114 0.062912 0.221170 0.499138 0.081404 0.198288 0.462394 0.111294 0.283688 0.142624 Consensus sequence: DMMDGMGCGCGCGCHD Alignment: DMMDGMGCGCGCGCHD --------GCGCSAAA ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00001 E2F2_primary Original Motif Original Motif Backward 6 8 0.029630 Species: Mus musculus Original motif 0.305970 0.214348 0.269312 0.210370 0.279551 0.218276 0.140576 0.361597 0.391304 0.162239 0.193916 0.252541 0.701667 0.102206 0.041580 0.154547 0.427655 0.068368 0.324706 0.179271 0.144368 0.191048 0.609772 0.054812 0.014295 0.020613 0.958397 0.006695 0.019783 0.962982 0.013403 0.003831 0.001189 0.023882 0.973231 0.001697 0.001343 0.919840 0.077728 0.001089 0.011293 0.097945 0.865194 0.025568 0.039106 0.864604 0.025189 0.071100 0.147663 0.328105 0.407118 0.117115 0.462769 0.203531 0.107986 0.225714 0.293396 0.229650 0.082819 0.394135 Consensus sequence: VHDARGGCGCGCVHH Reverse complement motif 0.394135 0.229650 0.082819 0.293396 0.225714 0.203531 0.107986 0.462769 0.147663 0.407118 0.328105 0.117115 0.039106 0.025189 0.864604 0.071100 0.011293 0.865194 0.097945 0.025568 0.001343 0.077728 0.919840 0.001089 0.001189 0.973231 0.023882 0.001697 0.019783 0.013403 0.962982 0.003831 0.014295 0.958397 0.020613 0.006695 0.144368 0.609772 0.191048 0.054812 0.179271 0.068368 0.324706 0.427655 0.154547 0.102206 0.041580 0.701667 0.252541 0.162239 0.193916 0.391304 0.361597 0.218276 0.140576 0.279551 0.210370 0.214348 0.269312 0.305970 Consensus sequence: HHVGCGCGCCKTDHB Alignment: VHDARGGCGCGCVHH --TTTSGCGC----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00068 Eomes_primary Reverse Complement Original Motif Forward 7 8 0.034897 Species: Mus musculus Original motif 0.186316 0.215541 0.297644 0.300499 0.300381 0.234276 0.266283 0.199061 0.317841 0.211418 0.183235 0.287507 0.482598 0.095323 0.245062 0.177017 0.654197 0.008988 0.261951 0.074864 0.095656 0.022883 0.843364 0.038097 0.002655 0.008355 0.976390 0.012600 0.003287 0.080755 0.001057 0.914900 0.006753 0.001517 0.989917 0.001813 0.039940 0.098800 0.003305 0.857955 0.009015 0.039036 0.844029 0.107921 0.984070 0.002369 0.008852 0.004709 0.789505 0.101528 0.029294 0.079672 0.649685 0.139882 0.090466 0.119966 0.421759 0.205595 0.073074 0.299573 0.214779 0.290522 0.134050 0.360649 0.202141 0.270323 0.176798 0.350738 Consensus sequence: BVHDAGGTGTGAAAHHH Reverse complement motif 0.350738 0.270323 0.176798 0.202141 0.360649 0.290522 0.134050 0.214779 0.299573 0.205595 0.073074 0.421759 0.119966 0.139882 0.090466 0.649685 0.079672 0.101528 0.029294 0.789505 0.004709 0.002369 0.008852 0.984070 0.009015 0.844029 0.039036 0.107921 0.857955 0.098800 0.003305 0.039940 0.006753 0.989917 0.001517 0.001813 0.914900 0.080755 0.001057 0.003287 0.002655 0.976390 0.008355 0.012600 0.095656 0.843364 0.022883 0.038097 0.074864 0.008988 0.261951 0.654197 0.177017 0.095323 0.245062 0.482598 0.287507 0.211418 0.183235 0.317841 0.199061 0.234276 0.266283 0.300381 0.300499 0.215541 0.297644 0.186316 Consensus sequence: HHHTTTCACACCTDHBV Alignment: BVHDAGGTGTGAAAHHH ------GCGCSAAA--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00011 Irf6_primary Original Motif Reverse Complement Forward 8 8 0.036828 Species: Mus musculus Original motif 0.256714 0.363080 0.149403 0.230804 0.312941 0.135162 0.190389 0.361507 0.255033 0.128823 0.354898 0.261246 0.667588 0.053933 0.205778 0.072701 0.199950 0.339707 0.114445 0.345899 0.029853 0.908514 0.006383 0.055250 0.019621 0.002231 0.976266 0.001882 0.983875 0.005320 0.008639 0.002166 0.698671 0.002741 0.006725 0.291864 0.990097 0.003609 0.003047 0.003247 0.008905 0.975208 0.011495 0.004392 0.022092 0.611448 0.018828 0.347632 0.538109 0.125313 0.241515 0.095063 0.456841 0.205124 0.177213 0.160822 0.372926 0.189134 0.195747 0.242193 0.217155 0.198027 0.300393 0.284425 0.277630 0.187849 0.237049 0.297472 Consensus sequence: HDDAHCGAAACYAVDDD Reverse complement motif 0.297472 0.187849 0.237049 0.277630 0.217155 0.300393 0.198027 0.284425 0.242193 0.189134 0.195747 0.372926 0.160822 0.205124 0.177213 0.456841 0.095063 0.125313 0.241515 0.538109 0.022092 0.018828 0.611448 0.347632 0.008905 0.011495 0.975208 0.004392 0.003247 0.003609 0.003047 0.990097 0.291864 0.002741 0.006725 0.698671 0.002166 0.005320 0.008639 0.983875 0.019621 0.976266 0.002231 0.001882 0.029853 0.006383 0.908514 0.055250 0.345899 0.339707 0.114445 0.199950 0.072701 0.053933 0.205778 0.667588 0.255033 0.354898 0.128823 0.261246 0.361507 0.135162 0.190389 0.312941 0.256714 0.149403 0.363080 0.230804 Consensus sequence: DHDBTKGTTTCGHTHDD Alignment: DHDBTKGTTTCGHTHDD -------TTTSGCGC-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00049 Sp100_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 8 0.038381 Species: Mus musculus Original motif 0.398739 0.130867 0.338756 0.131639 0.320699 0.027975 0.063466 0.587860 0.157015 0.031583 0.041611 0.769790 0.271347 0.151934 0.038804 0.537915 0.221418 0.241703 0.174145 0.362734 0.312757 0.303980 0.166494 0.216770 0.002826 0.987021 0.007115 0.003038 0.002112 0.121645 0.874129 0.002114 0.089781 0.088890 0.590613 0.230716 0.777902 0.081494 0.061090 0.079515 0.872234 0.012434 0.025044 0.090287 0.707481 0.047782 0.028697 0.216041 0.488552 0.135946 0.098790 0.276712 0.187811 0.111904 0.208223 0.492061 Consensus sequence: DWTWHHCGGAAAWD Reverse complement motif 0.492061 0.111904 0.208223 0.187811 0.276712 0.135946 0.098790 0.488552 0.216041 0.047782 0.028697 0.707481 0.090287 0.012434 0.025044 0.872234 0.079515 0.081494 0.061090 0.777902 0.089781 0.590613 0.088890 0.230716 0.002112 0.874129 0.121645 0.002114 0.002826 0.007115 0.987021 0.003038 0.216770 0.303980 0.166494 0.312757 0.362734 0.241703 0.174145 0.221418 0.537915 0.151934 0.038804 0.271347 0.769790 0.031583 0.041611 0.157015 0.587860 0.027975 0.063466 0.320699 0.131639 0.130867 0.338756 0.398739 Consensus sequence: DWTTTCCGHHWAWD Alignment: DWTTTCCGHHWAWD -----GCGCSAAA- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00527 Foxn4_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 9 8 0.040600 Species: Mus musculus Original motif 0.397468 0.109792 0.196359 0.296381 0.102928 0.480888 0.250249 0.165936 0.141925 0.173586 0.377365 0.307124 0.337385 0.368225 0.188518 0.105872 0.354789 0.067393 0.345343 0.232475 0.299392 0.109745 0.215552 0.375311 0.242937 0.170264 0.189245 0.397554 0.461680 0.013180 0.358677 0.166463 0.067089 0.063048 0.008045 0.861819 0.431756 0.128671 0.436022 0.003551 0.006559 0.001814 0.988272 0.003355 0.012929 0.983600 0.001468 0.002003 0.018768 0.000766 0.976433 0.004033 0.003776 0.005554 0.002991 0.987679 0.002737 0.981589 0.009028 0.006646 0.126509 0.273800 0.413161 0.186530 0.100613 0.337225 0.212034 0.350128 0.123741 0.284683 0.060914 0.530661 0.204454 0.143533 0.100462 0.551551 0.202290 0.482197 0.148368 0.167145 0.191625 0.101330 0.607860 0.099185 0.507546 0.086532 0.219554 0.186368 Consensus sequence: DBBVDDDRTRGCGTCBBYTHGA Reverse complement motif 0.186368 0.086532 0.219554 0.507546 0.191625 0.607860 0.101330 0.099185 0.202290 0.148368 0.482197 0.167145 0.551551 0.143533 0.100462 0.204454 0.530661 0.284683 0.060914 0.123741 0.350128 0.337225 0.212034 0.100613 0.126509 0.413161 0.273800 0.186530 0.002737 0.009028 0.981589 0.006646 0.987679 0.005554 0.002991 0.003776 0.018768 0.976433 0.000766 0.004033 0.012929 0.001468 0.983600 0.002003 0.006559 0.988272 0.001814 0.003355 0.431756 0.436022 0.128671 0.003551 0.861819 0.063048 0.008045 0.067089 0.166463 0.013180 0.358677 0.461680 0.397554 0.170264 0.189245 0.242937 0.375311 0.109745 0.215552 0.299392 0.232475 0.067393 0.345343 0.354789 0.337385 0.188518 0.368225 0.105872 0.141925 0.377365 0.173586 0.307124 0.102928 0.250249 0.480888 0.165936 0.296381 0.109792 0.196359 0.397468 Consensus sequence: TCDAMVBGACGCMAKDDDVBBD Alignment: TCDAMVBGACGCMAKDDDVBBD --------GCGCSAAA------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 28 Motif name: Egr1 Original motif 0.200000 0.266667 0.066667 0.466667 0.133333 0.066667 0.800000 0.000000 0.000000 0.866667 0.000000 0.133333 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.200000 0.800000 0.200000 0.000000 0.800000 0.000000 0.066667 0.000000 0.933333 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.133333 0.666667 0.000000 0.200000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.066667 0.000000 0.466667 0.466667 Consensus sequence: HGCGTGGGCGK Reserve complement motif 0.066667 0.466667 0.000000 0.466667 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.133333 0.000000 0.666667 0.200000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.066667 0.933333 0.000000 0.000000 0.200000 0.800000 0.000000 0.000000 0.800000 0.000000 0.200000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.866667 0.133333 0.133333 0.800000 0.066667 0.000000 0.466667 0.266667 0.066667 0.200000 Consensus sequence: YCGCCCACGCH ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 28 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00400 Zif268 Original Motif Reverse Complement Backward 7 11 0.000000 Species: Mus musculus Original motif 0.104824 0.412716 0.254506 0.227955 0.644922 0.065476 0.140479 0.149122 0.201205 0.166164 0.347131 0.285501 0.360606 0.256316 0.150766 0.232313 0.199831 0.240681 0.279350 0.280137 0.234308 0.204076 0.321306 0.240310 0.274112 0.462435 0.111425 0.152028 0.067070 0.717501 0.073934 0.141496 0.106745 0.084442 0.658566 0.150247 0.025128 0.967053 0.003585 0.004234 0.006412 0.982989 0.003227 0.007371 0.009588 0.877620 0.002571 0.110221 0.621521 0.355443 0.015669 0.007366 0.002600 0.980275 0.004191 0.012934 0.118773 0.026658 0.783843 0.070725 0.022358 0.822101 0.024684 0.130857 0.713212 0.080912 0.128793 0.077084 0.166568 0.250955 0.107934 0.474544 0.225040 0.222494 0.163301 0.389166 0.268976 0.223206 0.265314 0.242504 0.137052 0.229058 0.148439 0.485451 0.135819 0.304550 0.141994 0.417637 0.272440 0.319501 0.230580 0.177478 Consensus sequence: BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV Reverse complement motif 0.272440 0.230580 0.319501 0.177478 0.417637 0.304550 0.141994 0.135819 0.485451 0.229058 0.148439 0.137052 0.242504 0.223206 0.265314 0.268976 0.389166 0.222494 0.163301 0.225040 0.474544 0.250955 0.107934 0.166568 0.077084 0.080912 0.128793 0.713212 0.022358 0.024684 0.822101 0.130857 0.118773 0.783843 0.026658 0.070725 0.002600 0.004191 0.980275 0.012934 0.007366 0.355443 0.015669 0.621521 0.009588 0.002571 0.877620 0.110221 0.006412 0.003227 0.982989 0.007371 0.025128 0.003585 0.967053 0.004234 0.106745 0.658566 0.084442 0.150247 0.067070 0.073934 0.717501 0.141496 0.274112 0.111425 0.462435 0.152028 0.234308 0.321306 0.204076 0.240310 0.280137 0.240681 0.279350 0.199831 0.232313 0.256316 0.150766 0.360606 0.201205 0.347131 0.166164 0.285501 0.149122 0.065476 0.140479 0.644922 0.104824 0.254506 0.412716 0.227955 Consensus sequence: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB Alignment: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB ------HGCGTGGGCGK------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00007 Egr1_primary Reverse Complement Original Motif Backward 3 11 0.007275 Species: Mus musculus Original motif 0.211547 0.282708 0.203472 0.302273 0.141988 0.722437 0.054854 0.080721 0.032605 0.877172 0.012432 0.077792 0.115126 0.070606 0.781290 0.032979 0.003516 0.990021 0.002265 0.004198 0.004715 0.982482 0.009897 0.002906 0.001627 0.975937 0.001662 0.020774 0.262352 0.731732 0.002730 0.003187 0.005890 0.985756 0.002081 0.006273 0.022893 0.090460 0.649322 0.237324 0.023038 0.859949 0.037913 0.079101 0.567633 0.057394 0.166792 0.208181 0.176597 0.331265 0.125308 0.366830 0.183049 0.183774 0.226793 0.406384 Consensus sequence: HCCGCCCCCGCAHB Reverse complement motif 0.406384 0.183774 0.226793 0.183049 0.366830 0.331265 0.125308 0.176597 0.208181 0.057394 0.166792 0.567633 0.023038 0.037913 0.859949 0.079101 0.022893 0.649322 0.090460 0.237324 0.005890 0.002081 0.985756 0.006273 0.262352 0.002730 0.731732 0.003187 0.001627 0.001662 0.975937 0.020774 0.004715 0.009897 0.982482 0.002906 0.003516 0.002265 0.990021 0.004198 0.115126 0.781290 0.070606 0.032979 0.032605 0.012432 0.877172 0.077792 0.141988 0.054854 0.722437 0.080721 0.302273 0.282708 0.203472 0.211547 Consensus sequence: VHTGCGGGGGCGGH Alignment: HCCGCCCCCGCAHB -YCGCCCACGCH-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 4 11 0.026258 Species: Mus musculus Original motif 0.404007 0.395873 0.173319 0.026801 0.305977 0.215534 0.215359 0.263130 0.370148 0.250957 0.113088 0.265808 0.324336 0.229498 0.174679 0.271487 0.263563 0.137896 0.079217 0.519324 0.265762 0.222582 0.082555 0.429102 0.206721 0.288405 0.017851 0.487023 0.164361 0.236500 0.061051 0.538088 0.593344 0.348446 0.050304 0.007906 0.031328 0.947050 0.007032 0.014590 0.010428 0.956605 0.029142 0.003825 0.459636 0.207616 0.155368 0.177380 0.014573 0.964608 0.012209 0.008610 0.066291 0.918196 0.008729 0.006784 0.019488 0.866774 0.018897 0.094841 0.767405 0.104198 0.029234 0.099164 0.052494 0.772531 0.039832 0.135142 0.296085 0.243498 0.350935 0.109482 0.518843 0.226659 0.124784 0.129714 0.647901 0.019721 0.159901 0.172477 0.113912 0.231511 0.214864 0.439713 0.223117 0.310596 0.293328 0.172959 0.185557 0.487662 0.136321 0.190459 Consensus sequence: MHHHWHYTMCCHCCCACVAABVH Reverse complement motif 0.185557 0.136321 0.487662 0.190459 0.223117 0.293328 0.310596 0.172959 0.439713 0.231511 0.214864 0.113912 0.172477 0.019721 0.159901 0.647901 0.129714 0.226659 0.124784 0.518843 0.296085 0.350935 0.243498 0.109482 0.052494 0.039832 0.772531 0.135142 0.099164 0.104198 0.029234 0.767405 0.019488 0.018897 0.866774 0.094841 0.066291 0.008729 0.918196 0.006784 0.014573 0.012209 0.964608 0.008610 0.177380 0.207616 0.155368 0.459636 0.010428 0.029142 0.956605 0.003825 0.031328 0.007032 0.947050 0.014590 0.007906 0.348446 0.050304 0.593344 0.538088 0.236500 0.061051 0.164361 0.487023 0.288405 0.017851 0.206721 0.429102 0.222582 0.082555 0.265762 0.519324 0.137896 0.079217 0.263563 0.271487 0.229498 0.174679 0.324336 0.265808 0.250957 0.113088 0.370148 0.263130 0.215534 0.215359 0.305977 0.026801 0.395873 0.173319 0.404007 Consensus sequence: DVVTTVGTGGGHGGYAMHWHHHY Alignment: MHHHWHYTMCCHCCCACVAABVH ---------YCGCCCACGCH--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v015681_primaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 3 11 0.029705 Species: Mus musculus Original motif 0.641428 0.180211 0.044767 0.133594 0.171696 0.262981 0.334148 0.231174 0.129726 0.322735 0.243462 0.304077 0.165713 0.175735 0.256108 0.402445 0.146090 0.171890 0.412753 0.269266 0.212837 0.439192 0.280990 0.066980 0.251088 0.275516 0.374380 0.099015 0.575438 0.079656 0.338201 0.006704 0.005634 0.003422 0.972597 0.018348 0.890447 0.077034 0.031851 0.000668 0.007128 0.986862 0.000496 0.005515 0.001445 0.991564 0.001925 0.005066 0.738761 0.190157 0.026399 0.044684 0.013384 0.983783 0.000896 0.001937 0.068077 0.929549 0.000773 0.001602 0.040830 0.933742 0.005283 0.020145 0.730274 0.029225 0.145689 0.094812 0.165032 0.572838 0.162001 0.100129 0.383584 0.129942 0.429497 0.056977 0.455959 0.071959 0.208204 0.263878 0.134271 0.262985 0.222626 0.380117 0.071193 0.346594 0.346081 0.236132 0.445661 0.405278 0.053901 0.095160 Consensus sequence: ABBBBVVRGACCACCCACRDBBM Reverse complement motif 0.095160 0.405278 0.053901 0.445661 0.071193 0.346081 0.346594 0.236132 0.380117 0.262985 0.222626 0.134271 0.263878 0.071959 0.208204 0.455959 0.383584 0.429497 0.129942 0.056977 0.165032 0.162001 0.572838 0.100129 0.094812 0.029225 0.145689 0.730274 0.040830 0.005283 0.933742 0.020145 0.068077 0.000773 0.929549 0.001602 0.013384 0.000896 0.983783 0.001937 0.044684 0.190157 0.026399 0.738761 0.001445 0.001925 0.991564 0.005066 0.007128 0.000496 0.986862 0.005515 0.000668 0.077034 0.031851 0.890447 0.005634 0.972597 0.003422 0.018348 0.006704 0.079656 0.338201 0.575438 0.251088 0.374380 0.275516 0.099015 0.212837 0.280990 0.439192 0.066980 0.146090 0.412753 0.171890 0.269266 0.402445 0.175735 0.256108 0.165713 0.129726 0.243462 0.322735 0.304077 0.171696 0.334148 0.262981 0.231174 0.133594 0.180211 0.044767 0.641428 Consensus sequence: YBVDMGTGGGTGGTCKVVBVBBT Alignment: YBVDMGTGGGTGGTCKVVBVBBT --HGCGTGGGCGK---------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 5 11 0.031814 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB ----HGCGTGGGCGK-------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00002 Sp4_primary Original Motif Reverse Complement Forward 3 11 0.034501 Species: Mus musculus Original motif 0.155386 0.223380 0.374454 0.246780 0.247106 0.159582 0.345111 0.248201 0.238889 0.258354 0.165304 0.337454 0.255612 0.489586 0.051621 0.203182 0.450100 0.545383 0.001071 0.003447 0.003704 0.991007 0.002456 0.002833 0.035504 0.001814 0.928129 0.034553 0.001494 0.991406 0.003414 0.003686 0.003045 0.990628 0.005182 0.001145 0.000990 0.963237 0.001215 0.034557 0.148016 0.838396 0.000666 0.012922 0.014261 0.905847 0.007200 0.072692 0.083394 0.270068 0.058368 0.588170 0.149141 0.286783 0.142802 0.421274 0.204851 0.347195 0.253356 0.194597 0.184442 0.299908 0.194408 0.321242 0.125793 0.380109 0.245318 0.248780 Consensus sequence: BDHHMCGCCCCCTHVBB Reverse complement motif 0.125793 0.245318 0.380109 0.248780 0.321242 0.299908 0.194408 0.184442 0.204851 0.253356 0.347195 0.194597 0.421274 0.286783 0.142802 0.149141 0.588170 0.270068 0.058368 0.083394 0.014261 0.007200 0.905847 0.072692 0.148016 0.000666 0.838396 0.012922 0.000990 0.001215 0.963237 0.034557 0.003045 0.005182 0.990628 0.001145 0.001494 0.003414 0.991406 0.003686 0.035504 0.928129 0.001814 0.034553 0.003704 0.002456 0.991007 0.002833 0.450100 0.001071 0.545383 0.003447 0.255612 0.051621 0.489586 0.203182 0.337454 0.258354 0.165304 0.238889 0.247106 0.345111 0.159582 0.248201 0.155386 0.374454 0.223380 0.246780 Consensus sequence: BVVHAGGGGGCGRDHHB Alignment: BVVHAGGGGGCGRDHHB --HGCGTGGGCGK---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_primaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 4 11 0.035350 Species: Mus musculus Original motif 0.183797 0.268049 0.330111 0.218043 0.127599 0.330310 0.243614 0.298477 0.143199 0.188046 0.268593 0.400162 0.214690 0.205230 0.247090 0.332990 0.294688 0.299104 0.327152 0.079056 0.221909 0.193223 0.480155 0.104712 0.444072 0.068239 0.481838 0.005852 0.006182 0.015429 0.901278 0.077111 0.766535 0.111138 0.121632 0.000696 0.014848 0.973961 0.000298 0.010893 0.001807 0.992200 0.002669 0.003324 0.795344 0.140510 0.018576 0.045571 0.006990 0.988200 0.002510 0.002299 0.154898 0.842296 0.000998 0.001808 0.029577 0.919262 0.006935 0.044226 0.677987 0.032075 0.185065 0.104874 0.195132 0.364580 0.319321 0.120967 0.225412 0.115034 0.612849 0.046705 0.548628 0.058900 0.162857 0.229616 0.112531 0.340331 0.165910 0.381227 0.073029 0.303078 0.363896 0.259997 0.561485 0.260567 0.092979 0.084969 0.132283 0.457691 0.140159 0.269867 Consensus sequence: BBBDVVRGACCACCCAVGABBAB Reverse complement motif 0.132283 0.140159 0.457691 0.269867 0.084969 0.260567 0.092979 0.561485 0.073029 0.363896 0.303078 0.259997 0.381227 0.340331 0.165910 0.112531 0.229616 0.058900 0.162857 0.548628 0.225412 0.612849 0.115034 0.046705 0.195132 0.319321 0.364580 0.120967 0.104874 0.032075 0.185065 0.677987 0.029577 0.006935 0.919262 0.044226 0.154898 0.000998 0.842296 0.001808 0.006990 0.002510 0.988200 0.002299 0.045571 0.140510 0.018576 0.795344 0.001807 0.002669 0.992200 0.003324 0.014848 0.000298 0.973961 0.010893 0.000696 0.111138 0.121632 0.766535 0.006182 0.901278 0.015429 0.077111 0.444072 0.481838 0.068239 0.005852 0.221909 0.480155 0.193223 0.104712 0.294688 0.327152 0.299104 0.079056 0.332990 0.205230 0.247090 0.214690 0.400162 0.188046 0.268593 0.143199 0.127599 0.243614 0.330310 0.298477 0.183797 0.330111 0.268049 0.218043 Consensus sequence: BTBVTCVTGGGTGGTCMVVDVBB Alignment: BTBVTCVTGGGTGGTCMVVDVBB ---HGCGTGGGCGK--------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00007 Egr1_secondary Reverse Complement Reverse Complement Forward 3 11 0.036023 Species: Mus musculus Original motif 0.182057 0.230014 0.276532 0.311397 0.122004 0.156883 0.366166 0.354947 0.209446 0.335433 0.185677 0.269444 0.140035 0.276547 0.302466 0.280952 0.124879 0.019371 0.809895 0.045854 0.647807 0.117014 0.183956 0.051224 0.021434 0.011745 0.954633 0.012188 0.017853 0.009441 0.315429 0.657277 0.166123 0.008326 0.807215 0.018337 0.022775 0.008972 0.947283 0.020970 0.038795 0.033592 0.781209 0.146405 0.728916 0.032888 0.088836 0.149360 0.197826 0.427858 0.055755 0.318561 0.264938 0.196184 0.092516 0.446362 0.267969 0.195624 0.318766 0.217641 0.225006 0.250404 0.267265 0.257324 Consensus sequence: BBHBGAGTGGGAHHDB Reverse complement motif 0.225006 0.267265 0.250404 0.257324 0.267969 0.318766 0.195624 0.217641 0.446362 0.196184 0.092516 0.264938 0.197826 0.055755 0.427858 0.318561 0.149360 0.032888 0.088836 0.728916 0.038795 0.781209 0.033592 0.146405 0.022775 0.947283 0.008972 0.020970 0.166123 0.807215 0.008326 0.018337 0.657277 0.009441 0.315429 0.017853 0.021434 0.954633 0.011745 0.012188 0.051224 0.117014 0.183956 0.647807 0.124879 0.809895 0.019371 0.045854 0.140035 0.302466 0.276547 0.280952 0.209446 0.185677 0.335433 0.269444 0.122004 0.366166 0.156883 0.354947 0.311397 0.230014 0.276532 0.182057 Consensus sequence: BHHDTCCCACTCBDBV Alignment: BHHDTCCCACTCBDBV --YCGCCCACGCH--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 9 11 0.036274 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH --------YCGCCCACGCH---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00097 Mtf1_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 3 11 0.038694 Species: Mus musculus Original motif 0.220880 0.102939 0.418146 0.258035 0.154303 0.210788 0.420671 0.214238 0.229141 0.160788 0.412818 0.197253 0.167193 0.404248 0.092489 0.336070 0.025978 0.931335 0.023830 0.018857 0.009150 0.002023 0.977342 0.011485 0.044768 0.024113 0.039091 0.892028 0.007577 0.008370 0.973767 0.010286 0.005251 0.264996 0.004018 0.725735 0.009165 0.002428 0.980566 0.007841 0.021296 0.956027 0.008893 0.013784 0.982532 0.003341 0.005773 0.008353 0.500983 0.226027 0.143944 0.129045 0.544466 0.285936 0.044719 0.124879 0.321158 0.168428 0.261827 0.248587 0.271460 0.263221 0.199083 0.266236 Consensus sequence: DBDHCGTGTGCAAMDH Reverse complement motif 0.266236 0.263221 0.199083 0.271460 0.248587 0.168428 0.261827 0.321158 0.124879 0.285936 0.044719 0.544466 0.129045 0.226027 0.143944 0.500983 0.008353 0.003341 0.005773 0.982532 0.021296 0.008893 0.956027 0.013784 0.009165 0.980566 0.002428 0.007841 0.725735 0.264996 0.004018 0.005251 0.007577 0.973767 0.008370 0.010286 0.892028 0.024113 0.039091 0.044768 0.009150 0.977342 0.002023 0.011485 0.025978 0.023830 0.931335 0.018857 0.167193 0.092489 0.404248 0.336070 0.229141 0.412818 0.160788 0.197253 0.154303 0.420671 0.210788 0.214238 0.220880 0.418146 0.102939 0.258035 Consensus sequence: HDYTTGCACACGDHBH Alignment: HDYTTGCACACGDHBH ---YCGCCCACGCH-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 29 Motif name: ESR1 Original motif 0.261242 0.256959 0.329764 0.152034 0.228632 0.170940 0.350427 0.250000 0.136752 0.369658 0.318376 0.175214 0.176596 0.487234 0.138298 0.197872 0.285106 0.493617 0.100000 0.121277 0.651163 0.059197 0.188161 0.101480 0.075949 0.016878 0.816456 0.090717 0.040000 0.037895 0.884211 0.037895 0.069474 0.086316 0.191579 0.652632 0.008421 0.829474 0.111579 0.050526 0.837895 0.027368 0.056842 0.077895 0.122105 0.526316 0.225263 0.126316 0.132632 0.581053 0.111579 0.174737 0.134737 0.543158 0.204211 0.117895 0.067368 0.040000 0.016842 0.875789 0.044211 0.046316 0.896842 0.012632 0.642105 0.223158 0.065263 0.069474 0.021053 0.917895 0.025263 0.035789 0.124211 0.743158 0.004211 0.128421 0.054737 0.347368 0.046316 0.551579 Consensus sequence: VDBHMAGGTCACCCTGACCY Reserve complement motif 0.551579 0.347368 0.046316 0.054737 0.124211 0.004211 0.743158 0.128421 0.021053 0.025263 0.917895 0.035789 0.069474 0.223158 0.065263 0.642105 0.044211 0.896842 0.046316 0.012632 0.875789 0.040000 0.016842 0.067368 0.134737 0.204211 0.543158 0.117895 0.132632 0.111579 0.581053 0.174737 0.122105 0.225263 0.526316 0.126316 0.077895 0.027368 0.056842 0.837895 0.008421 0.111579 0.829474 0.050526 0.652632 0.086316 0.191579 0.069474 0.040000 0.884211 0.037895 0.037895 0.075949 0.816456 0.016878 0.090717 0.101480 0.059197 0.188161 0.651163 0.285106 0.100000 0.493617 0.121277 0.176596 0.138298 0.487234 0.197872 0.136752 0.318376 0.369658 0.175214 0.228632 0.350427 0.170940 0.250000 0.261242 0.329764 0.256959 0.152034 Consensus sequence: MGGTCAGGGTGACCTRDBHV ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 29 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 4 20 0.065841 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH VDBHMAGGTCACCCTGACCY--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00098 Rfx3_secondary Original Motif Reverse Complement Backward 4 20 0.068975 Species: Mus musculus Original motif 0.314514 0.275352 0.257617 0.152518 0.126939 0.598294 0.130576 0.144192 0.102265 0.155334 0.177957 0.564445 0.129288 0.282678 0.326990 0.261044 0.318166 0.227823 0.175681 0.278330 0.109019 0.380838 0.278328 0.231815 0.226145 0.289206 0.291300 0.193348 0.035863 0.844339 0.072582 0.047216 0.223793 0.187244 0.088092 0.500871 0.039800 0.029681 0.026201 0.904317 0.298298 0.032147 0.654746 0.014809 0.014729 0.022023 0.944826 0.018422 0.485114 0.004925 0.013785 0.496176 0.035708 0.020381 0.240804 0.703108 0.951152 0.012738 0.017886 0.018224 0.023713 0.944394 0.009538 0.022355 0.291067 0.385205 0.232388 0.091339 0.340334 0.199588 0.311526 0.148552 0.198713 0.472138 0.178319 0.150830 0.321155 0.269932 0.311301 0.097612 0.412646 0.195252 0.231950 0.160152 0.297134 0.180928 0.250400 0.271538 0.151169 0.305386 0.358574 0.184871 Consensus sequence: VCTBHBVCTTGGWTACVVVVVDB Reverse complement motif 0.151169 0.358574 0.305386 0.184871 0.271538 0.180928 0.250400 0.297134 0.160152 0.195252 0.231950 0.412646 0.097612 0.269932 0.311301 0.321155 0.198713 0.178319 0.472138 0.150830 0.148552 0.199588 0.311526 0.340334 0.291067 0.232388 0.385205 0.091339 0.023713 0.009538 0.944394 0.022355 0.018224 0.012738 0.017886 0.951152 0.703108 0.020381 0.240804 0.035708 0.496176 0.004925 0.013785 0.485114 0.014729 0.944826 0.022023 0.018422 0.298298 0.654746 0.032147 0.014809 0.904317 0.029681 0.026201 0.039800 0.500871 0.187244 0.088092 0.223793 0.035863 0.072582 0.844339 0.047216 0.226145 0.291300 0.289206 0.193348 0.109019 0.278328 0.380838 0.231815 0.278330 0.227823 0.175681 0.318166 0.129288 0.326990 0.282678 0.261044 0.564445 0.155334 0.177957 0.102265 0.126939 0.130576 0.598294 0.144192 0.152518 0.275352 0.257617 0.314514 Consensus sequence: BDBBVBVGTAWCCAAGVBHBAGB Alignment: BDBBVBVGTAWCCAAGVBHBAGB VDBHMAGGTCACCCTGACCY--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v015681_primaryReverse Complement Reverse Complement Backward 3 20 0.070125 Species: Mus musculus Original motif 0.472795 0.179227 0.091251 0.256726 0.036521 0.159743 0.204840 0.598896 0.164582 0.312805 0.221324 0.301289 0.237069 0.249050 0.293048 0.220833 0.401949 0.225181 0.229401 0.143469 0.161422 0.494334 0.252207 0.092036 0.252940 0.177721 0.369400 0.199939 0.119630 0.024651 0.849920 0.005798 0.000962 0.002398 0.990616 0.006023 0.937852 0.027016 0.034535 0.000597 0.008963 0.987756 0.000629 0.002652 0.001584 0.992898 0.002349 0.003169 0.956822 0.027342 0.002484 0.013352 0.009873 0.987759 0.000988 0.001381 0.016397 0.980856 0.000369 0.002378 0.081761 0.758555 0.038572 0.121112 0.371713 0.091838 0.448027 0.088423 0.111617 0.121913 0.683885 0.082585 0.334562 0.102916 0.436488 0.126034 0.210362 0.101261 0.238339 0.450037 0.169041 0.271583 0.320799 0.238576 0.140316 0.049885 0.735236 0.074563 Consensus sequence: HTBVVVDGGACCACCCRGRDBG Reverse complement motif 0.140316 0.735236 0.049885 0.074563 0.169041 0.320799 0.271583 0.238576 0.450037 0.101261 0.238339 0.210362 0.334562 0.436488 0.102916 0.126034 0.111617 0.683885 0.121913 0.082585 0.371713 0.448027 0.091838 0.088423 0.081761 0.038572 0.758555 0.121112 0.016397 0.000369 0.980856 0.002378 0.009873 0.000988 0.987759 0.001381 0.013352 0.027342 0.002484 0.956822 0.001584 0.002349 0.992898 0.003169 0.008963 0.000629 0.987756 0.002652 0.000597 0.027016 0.034535 0.937852 0.000962 0.990616 0.002398 0.006023 0.119630 0.849920 0.024651 0.005798 0.252940 0.369400 0.177721 0.199939 0.161422 0.252207 0.494334 0.092036 0.143469 0.225181 0.229401 0.401949 0.237069 0.293048 0.249050 0.220833 0.164582 0.221324 0.312805 0.301289 0.598896 0.159743 0.204840 0.036521 0.256726 0.179227 0.091251 0.472795 Consensus sequence: CBDMCMGGGTGGTCCHVBVBAH Alignment: CBDMCMGGGTGGTCCHVBVBAH MGGTCAGGGTGACCTRDBHV-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v015681_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 3 20 0.071127 Species: Mus musculus Original motif 0.331499 0.188505 0.182841 0.297156 0.328961 0.213025 0.273530 0.184484 0.197213 0.129292 0.524914 0.148581 0.274491 0.226406 0.312118 0.186986 0.103231 0.393726 0.364988 0.138055 0.552594 0.166422 0.186262 0.094722 0.157618 0.064773 0.616497 0.161112 0.139166 0.176098 0.621185 0.063551 0.748420 0.062398 0.012447 0.176735 0.116584 0.009438 0.860326 0.013653 0.005030 0.003646 0.974877 0.016447 0.055257 0.007181 0.921760 0.015802 0.032748 0.058249 0.052709 0.856293 0.105606 0.872231 0.014370 0.007793 0.019480 0.497379 0.125899 0.357242 0.478582 0.269713 0.061464 0.190242 0.253985 0.287006 0.201320 0.257689 0.319384 0.210231 0.175842 0.294543 0.222123 0.287802 0.201294 0.288782 0.139951 0.376041 0.081133 0.402875 0.213450 0.343835 0.383676 0.059039 0.322294 0.355918 0.148062 0.173725 Consensus sequence: HVGVSAGGAGGGTCYHHHHYVH Reverse complement motif 0.322294 0.148062 0.355918 0.173725 0.213450 0.383676 0.343835 0.059039 0.402875 0.376041 0.081133 0.139951 0.288782 0.287802 0.201294 0.222123 0.294543 0.210231 0.175842 0.319384 0.253985 0.201320 0.287006 0.257689 0.190242 0.269713 0.061464 0.478582 0.019480 0.125899 0.497379 0.357242 0.105606 0.014370 0.872231 0.007793 0.856293 0.058249 0.052709 0.032748 0.055257 0.921760 0.007181 0.015802 0.005030 0.974877 0.003646 0.016447 0.116584 0.860326 0.009438 0.013653 0.176735 0.062398 0.012447 0.748420 0.139166 0.621185 0.176098 0.063551 0.157618 0.616497 0.064773 0.161112 0.094722 0.166422 0.186262 0.552594 0.103231 0.364988 0.393726 0.138055 0.274491 0.312118 0.226406 0.186986 0.197213 0.524914 0.129292 0.148581 0.184484 0.213025 0.273530 0.328961 0.297156 0.188505 0.182841 0.331499 Consensus sequence: DVMHHDHKGACCCTCCTSVCBH Alignment: HVGVSAGGAGGGTCYHHHHYVH MGGTCAGGGTGACCTRDBHV-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_primaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 2 20 0.074243 Species: Mus musculus Original motif 0.180868 0.321661 0.134642 0.362829 0.232215 0.134289 0.315356 0.318141 0.065068 0.093681 0.569842 0.271408 0.370822 0.229680 0.154738 0.244759 0.323039 0.182873 0.173588 0.320500 0.175039 0.266898 0.276080 0.281984 0.412669 0.147730 0.146326 0.293275 0.325953 0.028805 0.629596 0.015646 0.003017 0.001766 0.979711 0.015507 0.888973 0.040666 0.069420 0.000941 0.017309 0.979155 0.000899 0.002637 0.001732 0.988816 0.004856 0.004596 0.889763 0.078125 0.010384 0.021729 0.007566 0.987081 0.001421 0.003932 0.027797 0.966593 0.000878 0.004731 0.025816 0.867003 0.065749 0.041433 0.220658 0.075256 0.582904 0.121182 0.088946 0.283695 0.565345 0.062015 0.328012 0.241332 0.305901 0.124755 0.307302 0.137589 0.375928 0.179181 0.298752 0.231470 0.315255 0.154524 0.094565 0.142901 0.705696 0.056838 Consensus sequence: HDGHHBHRGACCACCCGSVDVG Reverse complement motif 0.094565 0.705696 0.142901 0.056838 0.298752 0.315255 0.231470 0.154524 0.307302 0.375928 0.137589 0.179181 0.124755 0.241332 0.305901 0.328012 0.088946 0.565345 0.283695 0.062015 0.220658 0.582904 0.075256 0.121182 0.025816 0.065749 0.867003 0.041433 0.027797 0.000878 0.966593 0.004731 0.007566 0.001421 0.987081 0.003932 0.021729 0.078125 0.010384 0.889763 0.001732 0.004856 0.988816 0.004596 0.017309 0.000899 0.979155 0.002637 0.000941 0.040666 0.069420 0.888973 0.003017 0.979711 0.001766 0.015507 0.325953 0.629596 0.028805 0.015646 0.293275 0.147730 0.146326 0.412669 0.281984 0.266898 0.276080 0.175039 0.320500 0.182873 0.173588 0.323039 0.244759 0.229680 0.154738 0.370822 0.065068 0.569842 0.093681 0.271408 0.318141 0.134289 0.315356 0.232215 0.362829 0.321661 0.134642 0.180868 Consensus sequence: CVHBSCGGGTGGTCMHVHHCDH Alignment: CVHBSCGGGTGGTCMHVHHCDH -VDBHMAGGTCACCCTGACCY- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v015681_primaryOriginal Motif Original Motif Backward 2 20 0.074705 Species: Mus musculus Original motif 0.641428 0.180211 0.044767 0.133594 0.171696 0.262981 0.334148 0.231174 0.129726 0.322735 0.243462 0.304077 0.165713 0.175735 0.256108 0.402445 0.146090 0.171890 0.412753 0.269266 0.212837 0.439192 0.280990 0.066980 0.251088 0.275516 0.374380 0.099015 0.575438 0.079656 0.338201 0.006704 0.005634 0.003422 0.972597 0.018348 0.890447 0.077034 0.031851 0.000668 0.007128 0.986862 0.000496 0.005515 0.001445 0.991564 0.001925 0.005066 0.738761 0.190157 0.026399 0.044684 0.013384 0.983783 0.000896 0.001937 0.068077 0.929549 0.000773 0.001602 0.040830 0.933742 0.005283 0.020145 0.730274 0.029225 0.145689 0.094812 0.165032 0.572838 0.162001 0.100129 0.383584 0.129942 0.429497 0.056977 0.455959 0.071959 0.208204 0.263878 0.134271 0.262985 0.222626 0.380117 0.071193 0.346594 0.346081 0.236132 0.445661 0.405278 0.053901 0.095160 Consensus sequence: ABBBBVVRGACCACCCACRDBBM Reverse complement motif 0.095160 0.405278 0.053901 0.445661 0.071193 0.346081 0.346594 0.236132 0.380117 0.262985 0.222626 0.134271 0.263878 0.071959 0.208204 0.455959 0.383584 0.429497 0.129942 0.056977 0.165032 0.162001 0.572838 0.100129 0.094812 0.029225 0.145689 0.730274 0.040830 0.005283 0.933742 0.020145 0.068077 0.000773 0.929549 0.001602 0.013384 0.000896 0.983783 0.001937 0.044684 0.190157 0.026399 0.738761 0.001445 0.001925 0.991564 0.005066 0.007128 0.000496 0.986862 0.005515 0.000668 0.077034 0.031851 0.890447 0.005634 0.972597 0.003422 0.018348 0.006704 0.079656 0.338201 0.575438 0.251088 0.374380 0.275516 0.099015 0.212837 0.280990 0.439192 0.066980 0.146090 0.412753 0.171890 0.269266 0.402445 0.175735 0.256108 0.165713 0.129726 0.243462 0.322735 0.304077 0.171696 0.334148 0.262981 0.231174 0.133594 0.180211 0.044767 0.641428 Consensus sequence: YBVDMGTGGGTGGTCKVVBVBBT Alignment: ABBBBVVRGACCACCCACRDBBM --VDBHMAGGTCACCCTGACCY- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_primaryOriginal Motif Original Motif Forward 4 20 0.074917 Species: Mus musculus Original motif 0.204923 0.208846 0.365383 0.220848 0.294304 0.300143 0.167287 0.238266 0.109711 0.619514 0.117379 0.153396 0.178979 0.378580 0.230177 0.212264 0.159594 0.542602 0.118178 0.179627 0.125206 0.430074 0.151826 0.292894 0.097692 0.709845 0.116956 0.075506 0.148292 0.565912 0.037632 0.248164 0.077951 0.034190 0.855503 0.032356 0.001657 0.001061 0.971877 0.025405 0.001926 0.001084 0.991712 0.005278 0.033031 0.012001 0.057796 0.897171 0.002723 0.002647 0.993348 0.001281 0.003261 0.000963 0.987199 0.008577 0.000611 0.090925 0.074857 0.833608 0.015299 0.978878 0.004949 0.000874 0.013368 0.600902 0.033485 0.352245 0.231949 0.149575 0.118804 0.499672 0.267580 0.186002 0.371242 0.175176 0.264884 0.223483 0.110082 0.401551 0.221365 0.170121 0.179559 0.428955 0.112997 0.692930 0.139981 0.054092 0.460305 0.207883 0.155111 0.176702 Consensus sequence: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH Reverse complement motif 0.176702 0.207883 0.155111 0.460305 0.112997 0.139981 0.692930 0.054092 0.428955 0.170121 0.179559 0.221365 0.401551 0.223483 0.110082 0.264884 0.267580 0.371242 0.186002 0.175176 0.499672 0.149575 0.118804 0.231949 0.013368 0.033485 0.600902 0.352245 0.015299 0.004949 0.978878 0.000874 0.833608 0.090925 0.074857 0.000611 0.003261 0.987199 0.000963 0.008577 0.002723 0.993348 0.002647 0.001281 0.897171 0.012001 0.057796 0.033031 0.001926 0.991712 0.001084 0.005278 0.001657 0.971877 0.001061 0.025405 0.077951 0.855503 0.034190 0.032356 0.148292 0.037632 0.565912 0.248164 0.097692 0.116956 0.709845 0.075506 0.125206 0.151826 0.430074 0.292894 0.159594 0.118178 0.542602 0.179627 0.178979 0.230177 0.378580 0.212264 0.109711 0.117379 0.619514 0.153396 0.294304 0.167287 0.300143 0.238266 0.204923 0.365383 0.208846 0.220848 Consensus sequence: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB Alignment: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH ---VDBHMAGGTCACCCTGACCY ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_primaryOriginal Motif Original Motif Forward 2 20 0.075931 Species: Mus musculus Original motif 0.183797 0.268049 0.330111 0.218043 0.127599 0.330310 0.243614 0.298477 0.143199 0.188046 0.268593 0.400162 0.214690 0.205230 0.247090 0.332990 0.294688 0.299104 0.327152 0.079056 0.221909 0.193223 0.480155 0.104712 0.444072 0.068239 0.481838 0.005852 0.006182 0.015429 0.901278 0.077111 0.766535 0.111138 0.121632 0.000696 0.014848 0.973961 0.000298 0.010893 0.001807 0.992200 0.002669 0.003324 0.795344 0.140510 0.018576 0.045571 0.006990 0.988200 0.002510 0.002299 0.154898 0.842296 0.000998 0.001808 0.029577 0.919262 0.006935 0.044226 0.677987 0.032075 0.185065 0.104874 0.195132 0.364580 0.319321 0.120967 0.225412 0.115034 0.612849 0.046705 0.548628 0.058900 0.162857 0.229616 0.112531 0.340331 0.165910 0.381227 0.073029 0.303078 0.363896 0.259997 0.561485 0.260567 0.092979 0.084969 0.132283 0.457691 0.140159 0.269867 Consensus sequence: BBBDVVRGACCACCCAVGABBAB Reverse complement motif 0.132283 0.140159 0.457691 0.269867 0.084969 0.260567 0.092979 0.561485 0.073029 0.363896 0.303078 0.259997 0.381227 0.340331 0.165910 0.112531 0.229616 0.058900 0.162857 0.548628 0.225412 0.612849 0.115034 0.046705 0.195132 0.319321 0.364580 0.120967 0.104874 0.032075 0.185065 0.677987 0.029577 0.006935 0.919262 0.044226 0.154898 0.000998 0.842296 0.001808 0.006990 0.002510 0.988200 0.002299 0.045571 0.140510 0.018576 0.795344 0.001807 0.002669 0.992200 0.003324 0.014848 0.000298 0.973961 0.010893 0.000696 0.111138 0.121632 0.766535 0.006182 0.901278 0.015429 0.077111 0.444072 0.481838 0.068239 0.005852 0.221909 0.480155 0.193223 0.104712 0.294688 0.327152 0.299104 0.079056 0.332990 0.205230 0.247090 0.214690 0.400162 0.188046 0.268593 0.143199 0.127599 0.243614 0.330310 0.298477 0.183797 0.330111 0.268049 0.218043 Consensus sequence: BTBVTCVTGGGTGGTCMVVDVBB Alignment: BBBDVVRGACCACCCAVGABBAB -VDBHMAGGTCACCCTGACCY-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00400 Zif268 Reverse Complement Reverse Complement Backward 3 20 0.076269 Species: Mus musculus Original motif 0.104824 0.412716 0.254506 0.227955 0.644922 0.065476 0.140479 0.149122 0.201205 0.166164 0.347131 0.285501 0.360606 0.256316 0.150766 0.232313 0.199831 0.240681 0.279350 0.280137 0.234308 0.204076 0.321306 0.240310 0.274112 0.462435 0.111425 0.152028 0.067070 0.717501 0.073934 0.141496 0.106745 0.084442 0.658566 0.150247 0.025128 0.967053 0.003585 0.004234 0.006412 0.982989 0.003227 0.007371 0.009588 0.877620 0.002571 0.110221 0.621521 0.355443 0.015669 0.007366 0.002600 0.980275 0.004191 0.012934 0.118773 0.026658 0.783843 0.070725 0.022358 0.822101 0.024684 0.130857 0.713212 0.080912 0.128793 0.077084 0.166568 0.250955 0.107934 0.474544 0.225040 0.222494 0.163301 0.389166 0.268976 0.223206 0.265314 0.242504 0.137052 0.229058 0.148439 0.485451 0.135819 0.304550 0.141994 0.417637 0.272440 0.319501 0.230580 0.177478 Consensus sequence: BADHBDHCGCCCMCGCAHHDBBV Reverse complement motif 0.272440 0.230580 0.319501 0.177478 0.417637 0.304550 0.141994 0.135819 0.485451 0.229058 0.148439 0.137052 0.242504 0.223206 0.265314 0.268976 0.389166 0.222494 0.163301 0.225040 0.474544 0.250955 0.107934 0.166568 0.077084 0.080912 0.128793 0.713212 0.022358 0.024684 0.822101 0.130857 0.118773 0.783843 0.026658 0.070725 0.002600 0.004191 0.980275 0.012934 0.007366 0.355443 0.015669 0.621521 0.009588 0.002571 0.877620 0.110221 0.006412 0.003227 0.982989 0.007371 0.025128 0.003585 0.967053 0.004234 0.106745 0.658566 0.084442 0.150247 0.067070 0.073934 0.717501 0.141496 0.274112 0.111425 0.462435 0.152028 0.234308 0.321306 0.204076 0.240310 0.280137 0.240681 0.279350 0.199831 0.232313 0.256316 0.150766 0.360606 0.201205 0.347131 0.166164 0.285501 0.149122 0.065476 0.140479 0.644922 0.104824 0.254506 0.412716 0.227955 Consensus sequence: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB Alignment: VVVDHHTGCGYGGGCGDHVHHTB -MGGTCAGGGTGACCTRDBHV-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_secondary Original Motif Original Motif Forward 1 20 0.078011 Species: Mus musculus Original motif 0.067627 0.131333 0.654425 0.146615 0.156488 0.114442 0.145630 0.583441 0.206450 0.265630 0.358017 0.169903 0.090729 0.460713 0.274712 0.173847 0.285994 0.099998 0.154485 0.459523 0.635908 0.184787 0.072982 0.106323 0.748421 0.039204 0.092605 0.119769 0.081342 0.061327 0.044532 0.812799 0.143120 0.043879 0.024216 0.788785 0.247544 0.092102 0.621453 0.038901 0.295531 0.036295 0.027594 0.640580 0.194561 0.305468 0.339916 0.160055 0.175038 0.193568 0.101212 0.530182 0.145226 0.167488 0.559871 0.127415 0.271501 0.237429 0.206701 0.284369 0.216834 0.109191 0.569605 0.104370 0.182624 0.177160 0.300475 0.339742 0.331737 0.198645 0.265137 0.204482 0.230155 0.359365 0.183450 0.227029 0.056581 0.067297 0.463052 0.413070 0.198891 0.324626 0.304424 0.172059 0.181968 0.287547 0.202419 0.328066 Consensus sequence: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB Reverse complement motif 0.328066 0.287547 0.202419 0.181968 0.198891 0.304424 0.324626 0.172059 0.056581 0.463052 0.067297 0.413070 0.230155 0.183450 0.359365 0.227029 0.204482 0.198645 0.265137 0.331737 0.339742 0.177160 0.300475 0.182624 0.216834 0.569605 0.109191 0.104370 0.284369 0.237429 0.206701 0.271501 0.145226 0.559871 0.167488 0.127415 0.530182 0.193568 0.101212 0.175038 0.194561 0.339916 0.305468 0.160055 0.640580 0.036295 0.027594 0.295531 0.247544 0.621453 0.092102 0.038901 0.788785 0.043879 0.024216 0.143120 0.812799 0.061327 0.044532 0.081342 0.119769 0.039204 0.092605 0.748421 0.106323 0.184787 0.072982 0.635908 0.459523 0.099998 0.154485 0.285994 0.090729 0.274712 0.460713 0.173847 0.206450 0.358017 0.265630 0.169903 0.583441 0.114442 0.145630 0.156488 0.067627 0.654425 0.131333 0.146615 Consensus sequence: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC Alignment: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB VDBHMAGGTCACCCTGACCY-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 30 Motif name: ESR2 Original motif 0.218487 0.450980 0.176471 0.154062 0.442577 0.142857 0.114846 0.299720 0.521008 0.042017 0.431373 0.005602 0.075630 0.000000 0.770308 0.154062 0.050420 0.056022 0.893557 0.000000 0.036415 0.053221 0.092437 0.817927 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.943978 0.002801 0.000000 0.053221 0.137255 0.344538 0.316527 0.201681 0.179272 0.176471 0.417367 0.226891 0.145658 0.170868 0.411765 0.271709 0.058824 0.092437 0.067227 0.781513 0.176471 0.070028 0.742297 0.011204 0.498599 0.277311 0.053221 0.170868 0.095238 0.750700 0.005602 0.148459 0.128852 0.809524 0.000000 0.061625 0.075630 0.252101 0.000000 0.672269 0.168067 0.263305 0.380952 0.187675 Consensus sequence: VHRGGTCABDBTGMCCTB Reserve complement motif 0.168067 0.380952 0.263305 0.187675 0.672269 0.252101 0.000000 0.075630 0.128852 0.000000 0.809524 0.061625 0.095238 0.005602 0.750700 0.148459 0.170868 0.277311 0.053221 0.498599 0.176471 0.742297 0.070028 0.011204 0.781513 0.092437 0.067227 0.058824 0.145658 0.411765 0.170868 0.271709 0.179272 0.417367 0.176471 0.226891 0.137255 0.316527 0.344538 0.201681 0.053221 0.002801 0.000000 0.943978 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.817927 0.053221 0.092437 0.036415 0.050420 0.893557 0.056022 0.000000 0.075630 0.770308 0.000000 0.154062 0.005602 0.042017 0.431373 0.521008 0.299720 0.142857 0.114846 0.442577 0.218487 0.176471 0.450980 0.154062 Consensus sequence: BAGGYCABHBTGACCKHV ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 30 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_secondary Original Motif Original Motif Forward 4 18 0.044389 Species: Mus musculus Original motif 0.067627 0.131333 0.654425 0.146615 0.156488 0.114442 0.145630 0.583441 0.206450 0.265630 0.358017 0.169903 0.090729 0.460713 0.274712 0.173847 0.285994 0.099998 0.154485 0.459523 0.635908 0.184787 0.072982 0.106323 0.748421 0.039204 0.092605 0.119769 0.081342 0.061327 0.044532 0.812799 0.143120 0.043879 0.024216 0.788785 0.247544 0.092102 0.621453 0.038901 0.295531 0.036295 0.027594 0.640580 0.194561 0.305468 0.339916 0.160055 0.175038 0.193568 0.101212 0.530182 0.145226 0.167488 0.559871 0.127415 0.271501 0.237429 0.206701 0.284369 0.216834 0.109191 0.569605 0.104370 0.182624 0.177160 0.300475 0.339742 0.331737 0.198645 0.265137 0.204482 0.230155 0.359365 0.183450 0.227029 0.056581 0.067297 0.463052 0.413070 0.198891 0.324626 0.304424 0.172059 0.181968 0.287547 0.202419 0.328066 Consensus sequence: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB Reverse complement motif 0.328066 0.287547 0.202419 0.181968 0.198891 0.304424 0.324626 0.172059 0.056581 0.463052 0.067297 0.413070 0.230155 0.183450 0.359365 0.227029 0.204482 0.198645 0.265137 0.331737 0.339742 0.177160 0.300475 0.182624 0.216834 0.569605 0.109191 0.104370 0.284369 0.237429 0.206701 0.271501 0.145226 0.559871 0.167488 0.127415 0.530182 0.193568 0.101212 0.175038 0.194561 0.339916 0.305468 0.160055 0.640580 0.036295 0.027594 0.295531 0.247544 0.621453 0.092102 0.038901 0.788785 0.043879 0.024216 0.143120 0.812799 0.061327 0.044532 0.081342 0.119769 0.039204 0.092605 0.748421 0.106323 0.184787 0.072982 0.635908 0.459523 0.099998 0.154485 0.285994 0.090729 0.274712 0.460713 0.173847 0.206450 0.358017 0.265630 0.169903 0.583441 0.114442 0.145630 0.156488 0.067627 0.654425 0.131333 0.146615 Consensus sequence: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC Alignment: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB ---VHRGGTCABDBTGMCCTB- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 4 18 0.049219 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH ---VHRGGTCABDBTGMCCTB-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00050 Bhlhb2_primary Original Motif Reverse Complement Backward 3 18 0.050918 Species: Mus musculus Original motif 0.347837 0.112349 0.403713 0.136102 0.298329 0.175329 0.324534 0.201809 0.421791 0.222553 0.113615 0.242041 0.387506 0.130670 0.161435 0.320389 0.197183 0.244864 0.304611 0.253342 0.345884 0.188786 0.278290 0.187041 0.228203 0.142148 0.408269 0.221381 0.037126 0.006772 0.231775 0.724328 0.055214 0.942800 0.001192 0.000794 0.974119 0.004466 0.015535 0.005880 0.000300 0.958145 0.007498 0.034056 0.034056 0.007498 0.958145 0.000300 0.005880 0.015535 0.004466 0.974119 0.000794 0.001192 0.942800 0.055214 0.724328 0.231775 0.006772 0.037126 0.015720 0.466476 0.315208 0.202596 0.173670 0.355170 0.210710 0.260449 0.407419 0.261539 0.134430 0.196612 0.351478 0.209698 0.262426 0.176399 0.207869 0.284582 0.198951 0.308598 0.434482 0.113724 0.184408 0.267386 0.211144 0.363745 0.173978 0.251133 Consensus sequence: RDHDBVDTCACGTGASBHVHDH Reverse complement motif 0.211144 0.173978 0.363745 0.251133 0.267386 0.113724 0.184408 0.434482 0.308598 0.284582 0.198951 0.207869 0.176399 0.209698 0.262426 0.351478 0.196612 0.261539 0.134430 0.407419 0.173670 0.210710 0.355170 0.260449 0.015720 0.315208 0.466476 0.202596 0.037126 0.231775 0.006772 0.724328 0.000794 0.942800 0.001192 0.055214 0.974119 0.015535 0.004466 0.005880 0.034056 0.958145 0.007498 0.000300 0.000300 0.007498 0.958145 0.034056 0.005880 0.004466 0.015535 0.974119 0.055214 0.001192 0.942800 0.000794 0.724328 0.006772 0.231775 0.037126 0.228203 0.408269 0.142148 0.221381 0.187041 0.188786 0.278290 0.345884 0.197183 0.304611 0.244864 0.253342 0.320389 0.130670 0.161435 0.387506 0.242041 0.222553 0.113615 0.421791 0.298329 0.324534 0.175329 0.201809 0.347837 0.403713 0.112349 0.136102 Consensus sequence: DDHBHBSTCACGTGAHBBDHHM Alignment: DDHBHBSTCACGTGAHBBDHHM --VHRGGTCABDBTGMCCTB-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v015681_secondaryReverse Complement Original Motif Forward 2 18 0.052708 Species: Mus musculus Original motif 0.214165 0.143436 0.372522 0.269876 0.314445 0.406003 0.160351 0.119201 0.137147 0.092924 0.042921 0.727007 0.044121 0.072843 0.051741 0.831295 0.261292 0.324124 0.298498 0.116086 0.258125 0.323243 0.263362 0.155271 0.204557 0.589399 0.107153 0.098891 0.371021 0.244027 0.291102 0.093849 0.096327 0.572718 0.011797 0.319159 0.027282 0.046183 0.844519 0.082016 0.018921 0.012887 0.915917 0.052275 0.364793 0.166722 0.084229 0.384256 0.028216 0.011233 0.951056 0.009495 0.054974 0.004738 0.890377 0.049911 0.006802 0.312915 0.134247 0.546036 0.241289 0.628210 0.104788 0.025713 0.237863 0.302807 0.213018 0.246311 0.349399 0.203220 0.086635 0.360746 0.386634 0.144693 0.246895 0.221779 0.425101 0.354676 0.093374 0.126849 0.060272 0.391320 0.104905 0.443503 0.162090 0.190233 0.227433 0.420244 Consensus sequence: DVTTVVCVYGGHGGYCHHDMYB Reverse complement motif 0.420244 0.190233 0.227433 0.162090 0.443503 0.391320 0.104905 0.060272 0.126849 0.354676 0.093374 0.425101 0.221779 0.144693 0.246895 0.386634 0.360746 0.203220 0.086635 0.349399 0.237863 0.213018 0.302807 0.246311 0.241289 0.104788 0.628210 0.025713 0.546036 0.312915 0.134247 0.006802 0.054974 0.890377 0.004738 0.049911 0.028216 0.951056 0.011233 0.009495 0.384256 0.166722 0.084229 0.364793 0.018921 0.915917 0.012887 0.052275 0.027282 0.844519 0.046183 0.082016 0.096327 0.011797 0.572718 0.319159 0.093849 0.244027 0.291102 0.371021 0.204557 0.107153 0.589399 0.098891 0.258125 0.263362 0.323243 0.155271 0.261292 0.298498 0.324124 0.116086 0.831295 0.072843 0.051741 0.044121 0.727007 0.092924 0.042921 0.137147 0.314445 0.160351 0.406003 0.119201 0.214165 0.372522 0.143436 0.269876 Consensus sequence: VMYDHDGMCCHCCKBGVVAAVH Alignment: DVTTVVCVYGGHGGYCHHDMYB -BAGGYCABHBTGACCKHV--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 4 18 0.054104 Species: Mus musculus Original motif 0.360997 0.300272 0.115555 0.223177 0.309749 0.228429 0.166233 0.295589 0.149419 0.176868 0.240155 0.433558 0.379704 0.095791 0.276373 0.248133 0.394549 0.174184 0.130641 0.300626 0.443749 0.070776 0.211081 0.274393 0.364301 0.074356 0.370406 0.190936 0.791976 0.038475 0.093390 0.076159 0.963721 0.001826 0.002456 0.031997 0.004516 0.954596 0.008092 0.032796 0.981080 0.002062 0.002161 0.014697 0.986185 0.001846 0.006976 0.004992 0.059567 0.003649 0.002189 0.934595 0.495328 0.024257 0.240450 0.239965 0.305027 0.094878 0.526069 0.074025 0.418442 0.196237 0.158323 0.226998 0.336713 0.220452 0.191155 0.251680 0.192296 0.300342 0.169047 0.338315 0.240387 0.144634 0.128513 0.486465 0.290763 0.271259 0.116600 0.321377 0.224825 0.296233 0.229255 0.249687 0.493240 0.171285 0.075148 0.260326 Consensus sequence: HHBDHDDAACAATDRHHHHHBW Reverse complement motif 0.260326 0.171285 0.075148 0.493240 0.224825 0.229255 0.296233 0.249687 0.321377 0.271259 0.116600 0.290763 0.486465 0.144634 0.128513 0.240387 0.338315 0.300342 0.169047 0.192296 0.251680 0.220452 0.191155 0.336713 0.226998 0.196237 0.158323 0.418442 0.305027 0.526069 0.094878 0.074025 0.239965 0.024257 0.240450 0.495328 0.934595 0.003649 0.002189 0.059567 0.004992 0.001846 0.006976 0.986185 0.014697 0.002062 0.002161 0.981080 0.004516 0.008092 0.954596 0.032796 0.031997 0.001826 0.002456 0.963721 0.076159 0.038475 0.093390 0.791976 0.364301 0.370406 0.074356 0.190936 0.274393 0.070776 0.211081 0.443749 0.300626 0.174184 0.130641 0.394549 0.248133 0.095791 0.276373 0.379704 0.433558 0.176868 0.240155 0.149419 0.295589 0.228429 0.166233 0.309749 0.223177 0.300272 0.115555 0.360997 Consensus sequence: WBHHHHHMDATTGTTHDHDVHH Alignment: WBHHHHHMDATTGTTHDHDVHH -BAGGYCABHBTGACCKHV--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00098 Rfx3_secondary Reverse Complement Original Motif Forward 3 18 0.054111 Species: Mus musculus Original motif 0.314514 0.275352 0.257617 0.152518 0.126939 0.598294 0.130576 0.144192 0.102265 0.155334 0.177957 0.564445 0.129288 0.282678 0.326990 0.261044 0.318166 0.227823 0.175681 0.278330 0.109019 0.380838 0.278328 0.231815 0.226145 0.289206 0.291300 0.193348 0.035863 0.844339 0.072582 0.047216 0.223793 0.187244 0.088092 0.500871 0.039800 0.029681 0.026201 0.904317 0.298298 0.032147 0.654746 0.014809 0.014729 0.022023 0.944826 0.018422 0.485114 0.004925 0.013785 0.496176 0.035708 0.020381 0.240804 0.703108 0.951152 0.012738 0.017886 0.018224 0.023713 0.944394 0.009538 0.022355 0.291067 0.385205 0.232388 0.091339 0.340334 0.199588 0.311526 0.148552 0.198713 0.472138 0.178319 0.150830 0.321155 0.269932 0.311301 0.097612 0.412646 0.195252 0.231950 0.160152 0.297134 0.180928 0.250400 0.271538 0.151169 0.305386 0.358574 0.184871 Consensus sequence: VCTBHBVCTTGGWTACVVVVVDB Reverse complement motif 0.151169 0.358574 0.305386 0.184871 0.271538 0.180928 0.250400 0.297134 0.160152 0.195252 0.231950 0.412646 0.097612 0.269932 0.311301 0.321155 0.198713 0.178319 0.472138 0.150830 0.148552 0.199588 0.311526 0.340334 0.291067 0.232388 0.385205 0.091339 0.023713 0.009538 0.944394 0.022355 0.018224 0.012738 0.017886 0.951152 0.703108 0.020381 0.240804 0.035708 0.496176 0.004925 0.013785 0.485114 0.014729 0.944826 0.022023 0.018422 0.298298 0.654746 0.032147 0.014809 0.904317 0.029681 0.026201 0.039800 0.500871 0.187244 0.088092 0.223793 0.035863 0.072582 0.844339 0.047216 0.226145 0.291300 0.289206 0.193348 0.109019 0.278328 0.380838 0.231815 0.278330 0.227823 0.175681 0.318166 0.129288 0.326990 0.282678 0.261044 0.564445 0.155334 0.177957 0.102265 0.126939 0.130576 0.598294 0.144192 0.152518 0.275352 0.257617 0.314514 Consensus sequence: BDBBVBVGTAWCCAAGVBHBAGB Alignment: VCTBHBVCTTGGWTACVVVVVDB --BAGGYCABHBTGACCKHV--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00527 Foxn4_secondary Original Motif Original Motif Backward 2 18 0.054373 Species: Mus musculus Original motif 0.298336 0.418632 0.208054 0.074978 0.289907 0.015608 0.457100 0.237385 0.273583 0.077889 0.107860 0.540668 0.184954 0.161611 0.384390 0.269045 0.521826 0.156340 0.089019 0.232815 0.356716 0.131104 0.394857 0.117323 0.266669 0.108765 0.505273 0.119293 0.020778 0.047199 0.919524 0.012500 0.948536 0.018775 0.008113 0.024576 0.010822 0.964042 0.014701 0.010434 0.007428 0.019505 0.966351 0.006717 0.010025 0.975678 0.008648 0.005649 0.043796 0.120935 0.742979 0.092289 0.008252 0.250704 0.541132 0.199913 0.474428 0.044681 0.134430 0.346461 0.146597 0.421317 0.143166 0.288920 0.020540 0.181479 0.553811 0.244170 0.129612 0.173360 0.535219 0.161808 0.506084 0.158156 0.130983 0.204776 0.054872 0.103043 0.545792 0.296293 0.389882 0.171037 0.164162 0.274918 0.225861 0.314031 0.288872 0.171237 Consensus sequence: VDWDARRGACGCGGWHGGAKHV Reverse complement motif 0.225861 0.288872 0.314031 0.171237 0.274918 0.171037 0.164162 0.389882 0.054872 0.545792 0.103043 0.296293 0.204776 0.158156 0.130983 0.506084 0.129612 0.535219 0.173360 0.161808 0.020540 0.553811 0.181479 0.244170 0.146597 0.143166 0.421317 0.288920 0.346461 0.044681 0.134430 0.474428 0.008252 0.541132 0.250704 0.199913 0.043796 0.742979 0.120935 0.092289 0.010025 0.008648 0.975678 0.005649 0.007428 0.966351 0.019505 0.006717 0.010822 0.014701 0.964042 0.010434 0.024576 0.018775 0.008113 0.948536 0.020778 0.919524 0.047199 0.012500 0.266669 0.505273 0.108765 0.119293 0.356716 0.394857 0.131104 0.117323 0.232815 0.156340 0.089019 0.521826 0.184954 0.384390 0.161611 0.269045 0.540668 0.077889 0.107860 0.273583 0.289907 0.457100 0.015608 0.237385 0.298336 0.208054 0.418632 0.074978 Consensus sequence: VHYTCCDWCCGCGTCMMTHWHV Alignment: VDWDARRGACGCGGWHGGAKHV ---VHRGGTCABDBTGMCCTB- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_primaryReverse Complement Original Motif Backward 5 18 0.054809 Species: Mus musculus Original motif 0.204923 0.208846 0.365383 0.220848 0.294304 0.300143 0.167287 0.238266 0.109711 0.619514 0.117379 0.153396 0.178979 0.378580 0.230177 0.212264 0.159594 0.542602 0.118178 0.179627 0.125206 0.430074 0.151826 0.292894 0.097692 0.709845 0.116956 0.075506 0.148292 0.565912 0.037632 0.248164 0.077951 0.034190 0.855503 0.032356 0.001657 0.001061 0.971877 0.025405 0.001926 0.001084 0.991712 0.005278 0.033031 0.012001 0.057796 0.897171 0.002723 0.002647 0.993348 0.001281 0.003261 0.000963 0.987199 0.008577 0.000611 0.090925 0.074857 0.833608 0.015299 0.978878 0.004949 0.000874 0.013368 0.600902 0.033485 0.352245 0.231949 0.149575 0.118804 0.499672 0.267580 0.186002 0.371242 0.175176 0.264884 0.223483 0.110082 0.401551 0.221365 0.170121 0.179559 0.428955 0.112997 0.692930 0.139981 0.054092 0.460305 0.207883 0.155111 0.176702 Consensus sequence: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH Reverse complement motif 0.176702 0.207883 0.155111 0.460305 0.112997 0.139981 0.692930 0.054092 0.428955 0.170121 0.179559 0.221365 0.401551 0.223483 0.110082 0.264884 0.267580 0.371242 0.186002 0.175176 0.499672 0.149575 0.118804 0.231949 0.013368 0.033485 0.600902 0.352245 0.015299 0.004949 0.978878 0.000874 0.833608 0.090925 0.074857 0.000611 0.003261 0.987199 0.000963 0.008577 0.002723 0.993348 0.002647 0.001281 0.897171 0.012001 0.057796 0.033031 0.001926 0.991712 0.001084 0.005278 0.001657 0.971877 0.001061 0.025405 0.077951 0.855503 0.034190 0.032356 0.148292 0.037632 0.565912 0.248164 0.097692 0.116956 0.709845 0.075506 0.125206 0.151826 0.430074 0.292894 0.159594 0.118178 0.542602 0.179627 0.178979 0.230177 0.378580 0.212264 0.109711 0.117379 0.619514 0.153396 0.294304 0.167287 0.300143 0.238266 0.204923 0.365383 0.208846 0.220848 Consensus sequence: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB Alignment: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH -BAGGYCABHBTGACCKHV---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00528 Foxm1_secondary Original Motif Reverse Complement Forward 5 18 0.055453 Species: Mus musculus Original motif 0.399785 0.446658 0.111435 0.042122 0.535175 0.103991 0.089706 0.271128 0.078171 0.387987 0.375083 0.158759 0.309001 0.519142 0.070618 0.101239 0.201844 0.255818 0.323149 0.219190 0.534101 0.109845 0.235026 0.121028 0.656038 0.037473 0.261484 0.045006 0.315713 0.164290 0.471815 0.048182 0.651960 0.009412 0.328237 0.010391 0.937365 0.017313 0.007516 0.037807 0.019983 0.044238 0.012387 0.923392 0.061195 0.021485 0.881645 0.035675 0.017521 0.952998 0.013139 0.016342 0.254160 0.029735 0.493023 0.223082 0.239200 0.593324 0.114503 0.052973 0.610822 0.071539 0.099169 0.218470 0.166610 0.389712 0.204400 0.239278 0.227752 0.361626 0.178497 0.232125 0.537030 0.182466 0.026035 0.254470 0.235902 0.151006 0.043788 0.569304 0.081851 0.250397 0.590059 0.077693 0.340417 0.189613 0.272075 0.197895 Consensus sequence: MWSMBAARRATGCDCABHATGD Reverse complement motif 0.197895 0.189613 0.272075 0.340417 0.081851 0.590059 0.250397 0.077693 0.569304 0.151006 0.043788 0.235902 0.254470 0.182466 0.026035 0.537030 0.227752 0.178497 0.361626 0.232125 0.166610 0.204400 0.389712 0.239278 0.218470 0.071539 0.099169 0.610822 0.239200 0.114503 0.593324 0.052973 0.254160 0.493023 0.029735 0.223082 0.017521 0.013139 0.952998 0.016342 0.061195 0.881645 0.021485 0.035675 0.923392 0.044238 0.012387 0.019983 0.037807 0.017313 0.007516 0.937365 0.010391 0.009412 0.328237 0.651960 0.315713 0.471815 0.164290 0.048182 0.045006 0.037473 0.261484 0.656038 0.121028 0.109845 0.235026 0.534101 0.201844 0.323149 0.255818 0.219190 0.309001 0.070618 0.519142 0.101239 0.078171 0.375083 0.387987 0.158759 0.271128 0.103991 0.089706 0.535175 0.399785 0.111435 0.446658 0.042122 Consensus sequence: DCATDBTGHGCATKMTTBRSWR Alignment: DCATDBTGHGCATKMTTBRSWR ----VHRGGTCABDBTGMCCTB ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00032 Gata3_secondary Original Motif Original Motif Backward 4 18 0.056643 Species: Mus musculus Original motif 0.177641 0.319872 0.115137 0.387350 0.136644 0.182137 0.205873 0.475347 0.254263 0.244280 0.165207 0.336250 0.240415 0.207557 0.237497 0.314530 0.271041 0.214702 0.364395 0.149863 0.095475 0.320104 0.191738 0.392682 0.500902 0.142722 0.026556 0.329820 0.051221 0.023698 0.897245 0.027836 0.922410 0.027509 0.024058 0.026023 0.030735 0.070903 0.024248 0.874114 0.242120 0.231992 0.225143 0.300745 0.106956 0.220471 0.283490 0.389083 0.152079 0.165830 0.135066 0.547025 0.839205 0.051581 0.060119 0.049095 0.041204 0.069147 0.070830 0.818819 0.051861 0.848177 0.027599 0.072363 0.383793 0.016807 0.397470 0.201931 0.381899 0.215846 0.255908 0.146347 0.094792 0.358651 0.280905 0.265652 0.296132 0.181545 0.178433 0.343890 0.301997 0.254722 0.108566 0.334714 0.349481 0.270693 0.137507 0.242319 Consensus sequence: HBHDVBWGATHBTATCRVBHHH Reverse complement motif 0.242319 0.270693 0.137507 0.349481 0.334714 0.254722 0.108566 0.301997 0.343890 0.181545 0.178433 0.296132 0.094792 0.280905 0.358651 0.265652 0.146347 0.215846 0.255908 0.381899 0.383793 0.397470 0.016807 0.201931 0.051861 0.027599 0.848177 0.072363 0.818819 0.069147 0.070830 0.041204 0.049095 0.051581 0.060119 0.839205 0.547025 0.165830 0.135066 0.152079 0.389083 0.220471 0.283490 0.106956 0.300745 0.231992 0.225143 0.242120 0.874114 0.070903 0.024248 0.030735 0.026023 0.027509 0.024058 0.922410 0.051221 0.897245 0.023698 0.027836 0.329820 0.142722 0.026556 0.500902 0.392682 0.320104 0.191738 0.095475 0.271041 0.364395 0.214702 0.149863 0.314530 0.207557 0.237497 0.240415 0.336250 0.244280 0.165207 0.254263 0.475347 0.182137 0.205873 0.136644 0.387350 0.319872 0.115137 0.177641 Consensus sequence: HHHBBMGATAVHATCWVVDHVH Alignment: HBHDVBWGATHBTATCRVBHHH -VHRGGTCABDBTGMCCTB--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 31 Motif name: Esrrb Original motif 0.200000 0.800000 0.000000 0.000000 0.950000 0.000000 0.050000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 Consensus sequence: CACGTG Reserve complement motif 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.050000 0.950000 0.200000 0.000000 0.800000 0.000000 Consensus sequence: CACGTG ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 31 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00050 Bhlhb2_primary Original Motif Original Motif Backward 9 6 0.000000 Species: Mus musculus Original motif 0.347837 0.112349 0.403713 0.136102 0.298329 0.175329 0.324534 0.201809 0.421791 0.222553 0.113615 0.242041 0.387506 0.130670 0.161435 0.320389 0.197183 0.244864 0.304611 0.253342 0.345884 0.188786 0.278290 0.187041 0.228203 0.142148 0.408269 0.221381 0.037126 0.006772 0.231775 0.724328 0.055214 0.942800 0.001192 0.000794 0.974119 0.004466 0.015535 0.005880 0.000300 0.958145 0.007498 0.034056 0.034056 0.007498 0.958145 0.000300 0.005880 0.015535 0.004466 0.974119 0.000794 0.001192 0.942800 0.055214 0.724328 0.231775 0.006772 0.037126 0.015720 0.466476 0.315208 0.202596 0.173670 0.355170 0.210710 0.260449 0.407419 0.261539 0.134430 0.196612 0.351478 0.209698 0.262426 0.176399 0.207869 0.284582 0.198951 0.308598 0.434482 0.113724 0.184408 0.267386 0.211144 0.363745 0.173978 0.251133 Consensus sequence: RDHDBVDTCACGTGASBHVHDH Reverse complement motif 0.211144 0.173978 0.363745 0.251133 0.267386 0.113724 0.184408 0.434482 0.308598 0.284582 0.198951 0.207869 0.176399 0.209698 0.262426 0.351478 0.196612 0.261539 0.134430 0.407419 0.173670 0.210710 0.355170 0.260449 0.015720 0.315208 0.466476 0.202596 0.037126 0.231775 0.006772 0.724328 0.000794 0.942800 0.001192 0.055214 0.974119 0.015535 0.004466 0.005880 0.034056 0.958145 0.007498 0.000300 0.000300 0.007498 0.958145 0.034056 0.005880 0.004466 0.015535 0.974119 0.055214 0.001192 0.942800 0.000794 0.724328 0.006772 0.231775 0.037126 0.228203 0.408269 0.142148 0.221381 0.187041 0.188786 0.278290 0.345884 0.197183 0.304611 0.244864 0.253342 0.320389 0.130670 0.161435 0.387506 0.242041 0.222553 0.113615 0.421791 0.298329 0.324534 0.175329 0.201809 0.347837 0.403713 0.112349 0.136102 Consensus sequence: DDHBHBSTCACGTGAHBBDHHM Alignment: RDHDBVDTCACGTGASBHVHDH --------CACGTG-------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00050 Bhlhb2_secondary Reverse Complement Reverse Complement Backward 9 6 0.002642 Species: Mus musculus Original motif 0.120938 0.344851 0.124072 0.410138 0.220931 0.169844 0.422396 0.186829 0.127752 0.260812 0.103811 0.507625 0.140641 0.405473 0.287668 0.166218 0.296957 0.155579 0.301094 0.246370 0.219647 0.287193 0.154072 0.339087 0.049294 0.026059 0.121789 0.802859 0.520042 0.289284 0.173423 0.017251 0.049190 0.943472 0.004308 0.003030 0.902609 0.006767 0.074770 0.015854 0.003221 0.971329 0.005512 0.019937 0.019937 0.005512 0.971329 0.003221 0.015854 0.074770 0.006767 0.902609 0.003030 0.004308 0.943472 0.049190 0.003497 0.088920 0.685942 0.221641 0.802859 0.121789 0.026059 0.049294 0.334544 0.155170 0.275193 0.235092 0.275957 0.132104 0.454982 0.136957 0.134097 0.254352 0.422940 0.188611 0.396163 0.432784 0.051281 0.119772 0.276474 0.115627 0.419844 0.188056 0.160759 0.088061 0.649863 0.101318 0.203314 0.166595 0.106821 0.523270 Consensus sequence: YDYBDHTMCACGTGGADDBMDGT Reverse complement motif 0.523270 0.166595 0.106821 0.203314 0.160759 0.649863 0.088061 0.101318 0.276474 0.419844 0.115627 0.188056 0.396163 0.051281 0.432784 0.119772 0.134097 0.422940 0.254352 0.188611 0.275957 0.454982 0.132104 0.136957 0.235092 0.155170 0.275193 0.334544 0.049294 0.121789 0.026059 0.802859 0.003497 0.685942 0.088920 0.221641 0.003030 0.943472 0.004308 0.049190 0.902609 0.074770 0.006767 0.015854 0.019937 0.971329 0.005512 0.003221 0.003221 0.005512 0.971329 0.019937 0.015854 0.006767 0.074770 0.902609 0.049190 0.004308 0.943472 0.003030 0.017251 0.289284 0.173423 0.520042 0.802859 0.026059 0.121789 0.049294 0.339087 0.287193 0.154072 0.219647 0.296957 0.301094 0.155579 0.246370 0.140641 0.287668 0.405473 0.166218 0.507625 0.260812 0.103811 0.127752 0.220931 0.422396 0.169844 0.186829 0.410138 0.344851 0.124072 0.120938 Consensus sequence: ACHRBHDTCCACGTGYAHHBMHM Alignment: ACHRBHDTCCACGTGYAHHBMHM ---------CACGTG-------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00060 Max_primary Original Motif Original Motif Forward 5 6 0.004442 Species: Mus musculus Original motif 0.234855 0.152539 0.301720 0.310886 0.199226 0.147959 0.439250 0.213565 0.582926 0.274768 0.075866 0.066440 0.138829 0.475428 0.305884 0.079859 0.024979 0.969691 0.001811 0.003520 0.966345 0.003728 0.022320 0.007607 0.000598 0.907006 0.008160 0.084236 0.084236 0.008160 0.907006 0.000598 0.007607 0.022320 0.003728 0.966345 0.003520 0.001811 0.969691 0.024979 0.149140 0.241218 0.389598 0.220044 0.066440 0.075866 0.274768 0.582926 0.186990 0.346199 0.250066 0.216745 0.273437 0.225889 0.300738 0.199936 0.160893 0.111177 0.477963 0.249968 0.171790 0.101256 0.424580 0.302375 Consensus sequence: DDASCACGTGBTBVDD Reverse complement motif 0.171790 0.424580 0.101256 0.302375 0.160893 0.477963 0.111177 0.249968 0.273437 0.300738 0.225889 0.199936 0.186990 0.250066 0.346199 0.216745 0.582926 0.075866 0.274768 0.066440 0.149140 0.389598 0.241218 0.220044 0.003520 0.969691 0.001811 0.024979 0.966345 0.022320 0.003728 0.007607 0.084236 0.907006 0.008160 0.000598 0.000598 0.008160 0.907006 0.084236 0.007607 0.003728 0.022320 0.966345 0.024979 0.001811 0.969691 0.003520 0.138829 0.305884 0.475428 0.079859 0.066440 0.274768 0.075866 0.582926 0.199226 0.439250 0.147959 0.213565 0.310886 0.152539 0.301720 0.234855 Consensus sequence: HHVBABCACGTGSTHD Alignment: DDASCACGTGBTBVDD ----CACGTG------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00046 Tcfe2a_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 7 6 0.034215 Species: Mus musculus Original motif 0.306209 0.232705 0.244475 0.216611 0.165668 0.171480 0.222584 0.440269 0.213008 0.429038 0.156385 0.201569 0.283226 0.329518 0.160795 0.226461 0.439156 0.283517 0.251270 0.026056 0.014994 0.980987 0.000714 0.003304 0.975741 0.020182 0.002909 0.001168 0.000926 0.191353 0.801648 0.006073 0.015382 0.090853 0.893043 0.000721 0.001549 0.005912 0.001713 0.990826 0.004000 0.000857 0.989667 0.005475 0.016957 0.663726 0.148127 0.171190 0.299047 0.091156 0.448649 0.161148 0.354701 0.214677 0.236757 0.193865 0.399446 0.174508 0.200036 0.226009 0.303545 0.277435 0.200094 0.218926 0.380242 0.148876 0.163367 0.307514 Consensus sequence: VBHHVCAGGTGCDVDHD Reverse complement motif 0.307514 0.148876 0.163367 0.380242 0.218926 0.277435 0.200094 0.303545 0.226009 0.174508 0.200036 0.399446 0.193865 0.214677 0.236757 0.354701 0.299047 0.448649 0.091156 0.161148 0.016957 0.148127 0.663726 0.171190 0.004000 0.989667 0.000857 0.005475 0.990826 0.005912 0.001713 0.001549 0.015382 0.893043 0.090853 0.000721 0.000926 0.801648 0.191353 0.006073 0.001168 0.020182 0.002909 0.975741 0.014994 0.000714 0.980987 0.003304 0.026056 0.283517 0.251270 0.439156 0.283226 0.160795 0.329518 0.226461 0.213008 0.156385 0.429038 0.201569 0.440269 0.171480 0.222584 0.165668 0.216611 0.232705 0.244475 0.306209 Consensus sequence: DHDBHGCACCTGBDDVB Alignment: DHDBHGCACCTGBDDVB ------CACGTG----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00097 Mtf1_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 9 6 0.047193 Species: Mus musculus Original motif 0.220880 0.102939 0.418146 0.258035 0.154303 0.210788 0.420671 0.214238 0.229141 0.160788 0.412818 0.197253 0.167193 0.404248 0.092489 0.336070 0.025978 0.931335 0.023830 0.018857 0.009150 0.002023 0.977342 0.011485 0.044768 0.024113 0.039091 0.892028 0.007577 0.008370 0.973767 0.010286 0.005251 0.264996 0.004018 0.725735 0.009165 0.002428 0.980566 0.007841 0.021296 0.956027 0.008893 0.013784 0.982532 0.003341 0.005773 0.008353 0.500983 0.226027 0.143944 0.129045 0.544466 0.285936 0.044719 0.124879 0.321158 0.168428 0.261827 0.248587 0.271460 0.263221 0.199083 0.266236 Consensus sequence: DBDHCGTGTGCAAMDH Reverse complement motif 0.266236 0.263221 0.199083 0.271460 0.248587 0.168428 0.261827 0.321158 0.124879 0.285936 0.044719 0.544466 0.129045 0.226027 0.143944 0.500983 0.008353 0.003341 0.005773 0.982532 0.021296 0.008893 0.956027 0.013784 0.009165 0.980566 0.002428 0.007841 0.725735 0.264996 0.004018 0.005251 0.007577 0.973767 0.008370 0.010286 0.892028 0.024113 0.039091 0.044768 0.009150 0.977342 0.002023 0.011485 0.025978 0.023830 0.931335 0.018857 0.167193 0.092489 0.404248 0.336070 0.229141 0.412818 0.160788 0.197253 0.154303 0.420671 0.210788 0.214238 0.220880 0.418146 0.102939 0.258035 Consensus sequence: HDYTTGCACACGDHBH Alignment: HDYTTGCACACGDHBH --------CACGTG-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00249 Nkx2-5 Reverse Complement Original Motif Backward 6 6 0.048275 Species: Mus musculus Original motif 0.284346 0.280937 0.138180 0.296538 0.399663 0.110464 0.327481 0.162392 0.637560 0.029806 0.218321 0.114314 0.184898 0.144379 0.370828 0.299895 0.017459 0.862111 0.118223 0.002207 0.001004 0.958164 0.000888 0.039945 0.947796 0.011499 0.000413 0.040291 0.024268 0.973476 0.000709 0.001546 0.002616 0.001901 0.003337 0.992147 0.006742 0.071290 0.000276 0.921691 0.393078 0.093424 0.490620 0.022879 0.870162 0.007294 0.051952 0.070591 0.632449 0.156278 0.172644 0.038628 0.362798 0.126579 0.085796 0.424828 0.132810 0.206405 0.025084 0.635702 0.094708 0.272324 0.087702 0.545267 Consensus sequence: HDADCCACTTRAAWTT Reverse complement motif 0.545267 0.272324 0.087702 0.094708 0.635702 0.206405 0.025084 0.132810 0.424828 0.126579 0.085796 0.362798 0.038628 0.156278 0.172644 0.632449 0.070591 0.007294 0.051952 0.870162 0.393078 0.490620 0.093424 0.022879 0.921691 0.071290 0.000276 0.006742 0.992147 0.001901 0.003337 0.002616 0.024268 0.000709 0.973476 0.001546 0.040291 0.011499 0.000413 0.947796 0.001004 0.000888 0.958164 0.039945 0.017459 0.118223 0.862111 0.002207 0.184898 0.370828 0.144379 0.299895 0.114314 0.029806 0.218321 0.637560 0.162392 0.110464 0.327481 0.399663 0.296538 0.280937 0.138180 0.284346 Consensus sequence: AAWTTMAAGTGGHTDH Alignment: HDADCCACTTRAAWTT -----CACGTG----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00060 Max_secondary Reverse Complement Original Motif Backward 5 6 0.048544 Species: Mus musculus Original motif 0.127991 0.202889 0.399822 0.269298 0.156940 0.244015 0.182364 0.416681 0.046494 0.050598 0.744311 0.158596 0.196142 0.365183 0.183389 0.255286 0.019306 0.946805 0.015210 0.018680 0.924839 0.022113 0.027620 0.025428 0.007478 0.672138 0.027789 0.292595 0.046702 0.026044 0.906146 0.021107 0.117335 0.610863 0.025132 0.246670 0.044431 0.053581 0.722748 0.179240 0.543713 0.149809 0.190030 0.116447 0.241148 0.722386 0.022547 0.013919 0.265412 0.113032 0.270602 0.350954 0.226186 0.143504 0.332746 0.297564 Consensus sequence: BBGHCACGCGACDD Reverse complement motif 0.226186 0.332746 0.143504 0.297564 0.350954 0.113032 0.270602 0.265412 0.241148 0.022547 0.722386 0.013919 0.116447 0.149809 0.190030 0.543713 0.044431 0.722748 0.053581 0.179240 0.117335 0.025132 0.610863 0.246670 0.046702 0.906146 0.026044 0.021107 0.007478 0.027789 0.672138 0.292595 0.025428 0.022113 0.027620 0.924839 0.019306 0.015210 0.946805 0.018680 0.196142 0.183389 0.365183 0.255286 0.046494 0.744311 0.050598 0.158596 0.416681 0.244015 0.182364 0.156940 0.127991 0.399822 0.202889 0.269298 Consensus sequence: HDGTCGCGTGDCVB Alignment: BBGHCACGCGACDD ----CACGTG---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00231 Nkx2-2 Original Motif Reverse Complement Forward 7 6 0.049723 Species: Mus musculus Original motif 0.299323 0.258429 0.141957 0.300291 0.267631 0.143882 0.146933 0.441554 0.482614 0.212022 0.233631 0.071733 0.430836 0.073912 0.334439 0.160813 0.124944 0.704331 0.166815 0.003910 0.001941 0.876479 0.000828 0.120752 0.920202 0.005985 0.000456 0.073357 0.023544 0.974093 0.000859 0.001505 0.005010 0.003098 0.001328 0.990564 0.003250 0.198149 0.000490 0.798110 0.134659 0.104976 0.753464 0.006901 0.932490 0.000724 0.006140 0.060646 0.504530 0.106203 0.360995 0.028271 0.673257 0.074893 0.106536 0.145314 0.356324 0.097610 0.230142 0.315924 0.129483 0.188353 0.203623 0.478542 0.289071 0.157675 0.231909 0.321345 Consensus sequence: HDVRCCACTTGARADBD Reverse complement motif 0.321345 0.157675 0.231909 0.289071 0.478542 0.188353 0.203623 0.129483 0.315924 0.097610 0.230142 0.356324 0.145314 0.074893 0.106536 0.673257 0.028271 0.106203 0.360995 0.504530 0.060646 0.000724 0.006140 0.932490 0.134659 0.753464 0.104976 0.006901 0.798110 0.198149 0.000490 0.003250 0.990564 0.003098 0.001328 0.005010 0.023544 0.000859 0.974093 0.001505 0.073357 0.005985 0.000456 0.920202 0.001941 0.000828 0.876479 0.120752 0.124944 0.166815 0.704331 0.003910 0.160813 0.073912 0.334439 0.430836 0.071733 0.212022 0.233631 0.482614 0.441554 0.143882 0.146933 0.267631 0.300291 0.258429 0.141957 0.299323 Consensus sequence: DVDTKTCAAGTGGKBDH Alignment: DVDTKTCAAGTGGKBDH ------CACGTG----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00165 Titf1 Original Motif Reverse Complement Backward 6 6 0.049892 Species: Mus musculus Original motif 0.142834 0.324493 0.147276 0.385397 0.404842 0.233186 0.227659 0.134313 0.677580 0.044952 0.178774 0.098695 0.137761 0.202622 0.469728 0.189889 0.069301 0.825888 0.093549 0.011262 0.003882 0.876858 0.000966 0.118295 0.904355 0.015154 0.001043 0.079449 0.018912 0.977464 0.001207 0.002417 0.003517 0.004393 0.002428 0.989662 0.007151 0.162279 0.000584 0.829986 0.192074 0.120883 0.670840 0.016203 0.881358 0.002039 0.013253 0.103349 0.450016 0.333144 0.184121 0.032719 0.342018 0.321148 0.066945 0.269889 0.209486 0.122118 0.046367 0.622029 0.174564 0.145894 0.048004 0.631539 Consensus sequence: BVABCCACTTGAMHTT Reverse complement motif 0.631539 0.145894 0.048004 0.174564 0.622029 0.122118 0.046367 0.209486 0.269889 0.321148 0.066945 0.342018 0.032719 0.333144 0.184121 0.450016 0.103349 0.002039 0.013253 0.881358 0.192074 0.670840 0.120883 0.016203 0.829986 0.162279 0.000584 0.007151 0.989662 0.004393 0.002428 0.003517 0.018912 0.001207 0.977464 0.002417 0.079449 0.015154 0.001043 0.904355 0.003882 0.000966 0.876858 0.118295 0.069301 0.093549 0.825888 0.011262 0.137761 0.469728 0.202622 0.189889 0.098695 0.044952 0.178774 0.677580 0.134313 0.233186 0.227659 0.404842 0.385397 0.324493 0.147276 0.142834 Consensus sequence: AAHYTCAAGTGGBTBV Alignment: AAHYTCAAGTGGBTBV -----CACGTG----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00147 Nkx2-6 Reverse Complement Original Motif Forward 6 6 0.054460 Species: Mus musculus Original motif 0.217416 0.196318 0.223786 0.362479 0.398508 0.155537 0.270546 0.175410 0.791392 0.022106 0.126944 0.059558 0.211671 0.145452 0.349401 0.293476 0.023830 0.847357 0.127125 0.001688 0.001426 0.942475 0.000495 0.055604 0.969354 0.001012 0.000987 0.028646 0.017358 0.980969 0.000778 0.000894 0.001816 0.004181 0.001573 0.992430 0.000925 0.059099 0.000431 0.939544 0.670672 0.011130 0.312570 0.005628 0.757147 0.010903 0.032137 0.199813 0.335600 0.359053 0.277277 0.028070 0.440449 0.199116 0.111993 0.248442 0.126577 0.210049 0.039661 0.623714 0.088481 0.233166 0.032706 0.645647 Consensus sequence: DDADCCACTTAAVHTT Reverse complement motif 0.645647 0.233166 0.032706 0.088481 0.623714 0.210049 0.039661 0.126577 0.248442 0.199116 0.111993 0.440449 0.335600 0.277277 0.359053 0.028070 0.199813 0.010903 0.032137 0.757147 0.005628 0.011130 0.312570 0.670672 0.939544 0.059099 0.000431 0.000925 0.992430 0.004181 0.001573 0.001816 0.017358 0.000778 0.980969 0.000894 0.028646 0.001012 0.000987 0.969354 0.001426 0.000495 0.942475 0.055604 0.023830 0.127125 0.847357 0.001688 0.211671 0.349401 0.145452 0.293476 0.059558 0.022106 0.126944 0.791392 0.175410 0.155537 0.270546 0.398508 0.362479 0.196318 0.223786 0.217416 Consensus sequence: AAHVTTAAGTGGHTDD Alignment: DDADCCACTTAAVHTT -----CACGTG----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 32 Motif name: EWSR1-FLI1 Original motif 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.019048 0.000000 0.980952 0.000000 0.990476 0.000000 0.009524 0.000000 0.990476 0.000000 0.009524 0.000000 0.009524 0.000000 0.990476 0.000000 0.019048 0.000000 0.971429 0.009524 0.980952 0.000000 0.019048 0.000000 0.971429 0.000000 0.028571 0.000000 0.000000 0.000000 0.990476 0.009524 0.000000 0.019048 0.980952 0.000000 0.942857 0.038095 0.019048 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.019048 0.980952 0.000000 0.952381 0.028571 0.000000 0.019048 0.971429 0.000000 0.019048 0.009524 0.047619 0.000000 0.923810 0.028571 0.028571 0.028571 0.923810 0.019048 Consensus sequence: GGAAGGAAGGAAGGAAGG Reserve complement motif 0.028571 0.923810 0.028571 0.019048 0.047619 0.923810 0.000000 0.028571 0.009524 0.000000 0.019048 0.971429 0.019048 0.028571 0.000000 0.952381 0.000000 0.980952 0.019048 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.038095 0.019048 0.942857 0.000000 0.980952 0.019048 0.000000 0.000000 0.990476 0.000000 0.009524 0.000000 0.000000 0.028571 0.971429 0.000000 0.000000 0.019048 0.980952 0.019048 0.971429 0.000000 0.009524 0.009524 0.990476 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.009524 0.990476 0.000000 0.000000 0.009524 0.990476 0.019048 0.980952 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 Consensus sequence: CCTTCCTTCCTTCCTTCC ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 32 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00419 Spic Original Motif Original Motif Backward 3 14 0.044283 Species: Mus musculus Original motif 0.372554 0.181557 0.296001 0.149888 0.734552 0.057250 0.044752 0.163446 0.707604 0.045049 0.110341 0.137006 0.637848 0.057252 0.071934 0.232966 0.125449 0.108933 0.689441 0.076176 0.266215 0.517339 0.207018 0.009428 0.015016 0.002582 0.979670 0.002732 0.004303 0.002322 0.989973 0.003401 0.982327 0.003552 0.003393 0.010727 0.974155 0.001662 0.003294 0.020889 0.040023 0.128522 0.821560 0.009894 0.027635 0.045828 0.016297 0.910239 0.317500 0.045635 0.172234 0.464631 0.342838 0.107812 0.284775 0.264576 Consensus sequence: VAAAGMGGAAGTWD Reverse complement motif 0.264576 0.107812 0.284775 0.342838 0.464631 0.045635 0.172234 0.317500 0.910239 0.045828 0.016297 0.027635 0.040023 0.821560 0.128522 0.009894 0.020889 0.001662 0.003294 0.974155 0.010727 0.003552 0.003393 0.982327 0.004303 0.989973 0.002322 0.003401 0.015016 0.979670 0.002582 0.002732 0.266215 0.207018 0.517339 0.009428 0.125449 0.689441 0.108933 0.076176 0.232966 0.057252 0.071934 0.637848 0.137006 0.045049 0.110341 0.707604 0.163446 0.057250 0.044752 0.734552 0.149888 0.181557 0.296001 0.372554 Consensus sequence: DWACTTCCRCTTTB Alignment: ----VAAAGMGGAAGTWD GGAAGGAAGGAAGGAAGG-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00055 Hbp1_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 5 14 0.046623 Species: Mus musculus Original motif 0.348694 0.177225 0.158977 0.315104 0.241477 0.301470 0.225252 0.231801 0.299530 0.177310 0.188699 0.334462 0.413829 0.141414 0.102784 0.341973 0.032644 0.017968 0.004577 0.944811 0.021091 0.330699 0.642563 0.005647 0.969224 0.001914 0.005956 0.022906 0.969063 0.003485 0.003398 0.024054 0.013104 0.003523 0.002842 0.980532 0.005485 0.020244 0.932599 0.041672 0.757494 0.002617 0.231695 0.008193 0.865658 0.039206 0.073039 0.022097 0.110535 0.114879 0.043620 0.730965 0.186322 0.154540 0.442471 0.216667 0.366490 0.152622 0.256688 0.224200 0.216146 0.261309 0.238703 0.283842 Consensus sequence: HHDWTSAATGAATDDB Reverse complement motif 0.283842 0.261309 0.238703 0.216146 0.224200 0.152622 0.256688 0.366490 0.186322 0.442471 0.154540 0.216667 0.730965 0.114879 0.043620 0.110535 0.022097 0.039206 0.073039 0.865658 0.008193 0.002617 0.231695 0.757494 0.005485 0.932599 0.020244 0.041672 0.980532 0.003523 0.002842 0.013104 0.024054 0.003485 0.003398 0.969063 0.022906 0.001914 0.005956 0.969224 0.021091 0.642563 0.330699 0.005647 0.944811 0.017968 0.004577 0.032644 0.341973 0.141414 0.102784 0.413829 0.334462 0.177310 0.188699 0.299530 0.241477 0.225252 0.301470 0.231801 0.315104 0.177225 0.158977 0.348694 Consensus sequence: VDHATTCATTSAWDDH Alignment: ----VDHATTCATTSAWDDH CCTTCCTTCCTTCCTTCC---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00035 Hic1_primary Original Motif Reverse Complement Backward 3 14 0.047846 Species: Mus musculus Original motif 0.275207 0.211375 0.250277 0.263141 0.135064 0.327571 0.217556 0.319808 0.145659 0.242586 0.267179 0.344576 0.656519 0.009712 0.315174 0.018595 0.002265 0.004755 0.001656 0.991325 0.041873 0.001128 0.955340 0.001659 0.001306 0.974834 0.022215 0.001645 0.001978 0.992066 0.002638 0.003317 0.921032 0.072388 0.001237 0.005344 0.582027 0.211694 0.115736 0.090542 0.005990 0.927450 0.028306 0.038254 0.027374 0.799879 0.053667 0.119080 0.203510 0.191263 0.168997 0.436229 0.402253 0.154087 0.291346 0.152314 0.201201 0.414412 0.145330 0.239056 0.241094 0.332661 0.143464 0.282781 Consensus sequence: DBBATGCCAACCHVHH Reverse complement motif 0.241094 0.143464 0.332661 0.282781 0.201201 0.145330 0.414412 0.239056 0.152314 0.154087 0.291346 0.402253 0.436229 0.191263 0.168997 0.203510 0.027374 0.053667 0.799879 0.119080 0.005990 0.028306 0.927450 0.038254 0.090542 0.211694 0.115736 0.582027 0.005344 0.072388 0.001237 0.921032 0.001978 0.002638 0.992066 0.003317 0.001306 0.022215 0.974834 0.001645 0.041873 0.955340 0.001128 0.001659 0.991325 0.004755 0.001656 0.002265 0.018595 0.009712 0.315174 0.656519 0.344576 0.242586 0.267179 0.145659 0.135064 0.217556 0.327571 0.319808 0.263141 0.211375 0.250277 0.275207 Consensus sequence: DDBHGGTTGGCATVBD Alignment: ----DDBHGGTTGGCATVBD GGAAGGAAGGAAGGAAGG-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00090 Elf3_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 3 13 0.539121 Species: Mus musculus Original motif 0.338918 0.138284 0.180304 0.342493 0.614328 0.046536 0.066645 0.272492 0.248636 0.405469 0.125813 0.220081 0.389942 0.368832 0.198252 0.042975 0.473107 0.443315 0.064884 0.018693 0.032285 0.005365 0.952727 0.009624 0.021365 0.006895 0.955827 0.015913 0.976258 0.006536 0.010998 0.006209 0.892027 0.007456 0.003678 0.096839 0.433755 0.037682 0.520487 0.008076 0.098931 0.159997 0.023691 0.717381 0.423164 0.077419 0.201004 0.298413 0.572262 0.158763 0.164963 0.104012 Consensus sequence: DAHMMGGAARTDA Reverse complement motif 0.104012 0.158763 0.164963 0.572262 0.298413 0.077419 0.201004 0.423164 0.717381 0.159997 0.023691 0.098931 0.433755 0.520487 0.037682 0.008076 0.096839 0.007456 0.003678 0.892027 0.006209 0.006536 0.010998 0.976258 0.021365 0.955827 0.006895 0.015913 0.032285 0.952727 0.005365 0.009624 0.018693 0.443315 0.064884 0.473107 0.042975 0.368832 0.198252 0.389942 0.248636 0.125813 0.405469 0.220081 0.272492 0.046536 0.066645 0.614328 0.342493 0.138284 0.180304 0.338918 Consensus sequence: TDAMTTCCYYDTD Alignment: TDAMTTCCYYDTD----- --CCTTCCTTCCTTCCTTCC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00062 Sox4_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 5 13 0.547912 Species: Mus musculus Original motif 0.427843 0.231210 0.119424 0.221523 0.196506 0.239531 0.304906 0.259057 0.302488 0.156922 0.290190 0.250401 0.433872 0.149126 0.196496 0.220506 0.258426 0.076511 0.475100 0.189963 0.841714 0.046453 0.099915 0.011918 0.983853 0.001612 0.001362 0.013174 0.003460 0.982032 0.005728 0.008780 0.989743 0.002253 0.002020 0.005984 0.990761 0.003397 0.002843 0.003000 0.770864 0.003540 0.001549 0.224048 0.235342 0.002598 0.757383 0.004677 0.371426 0.089574 0.529959 0.009040 0.480804 0.196949 0.240413 0.081833 0.187158 0.355102 0.216599 0.241142 0.248006 0.232182 0.157452 0.362360 0.403367 0.177684 0.164649 0.254300 Consensus sequence: HBDDDAACAAAGRVBHH Reverse complement motif 0.254300 0.177684 0.164649 0.403367 0.362360 0.232182 0.157452 0.248006 0.187158 0.216599 0.355102 0.241142 0.081833 0.196949 0.240413 0.480804 0.371426 0.529959 0.089574 0.009040 0.235342 0.757383 0.002598 0.004677 0.224048 0.003540 0.001549 0.770864 0.003000 0.003397 0.002843 0.990761 0.005984 0.002253 0.002020 0.989743 0.003460 0.005728 0.982032 0.008780 0.013174 0.001612 0.001362 0.983853 0.011918 0.046453 0.099915 0.841714 0.258426 0.475100 0.076511 0.189963 0.220506 0.149126 0.196496 0.433872 0.250401 0.156922 0.290190 0.302488 0.196506 0.304906 0.239531 0.259057 0.221523 0.231210 0.119424 0.427843 Consensus sequence: HHBBMCTTTGTTHDDBH Alignment: HHBBMCTTTGTTHDDBH----- ----CCTTCCTTCCTTCCTTCC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00021 Zfp281_primary Original Motif Reverse Complement Backward 3 13 0.548284 Species: Mus musculus Original motif 0.201535 0.165213 0.201324 0.431929 0.136153 0.443451 0.179132 0.241264 0.263149 0.555137 0.067983 0.113731 0.142183 0.737634 0.045722 0.074461 0.044982 0.884112 0.045356 0.025549 0.246434 0.590578 0.022655 0.140333 0.123049 0.591257 0.033072 0.252622 0.018153 0.944742 0.010254 0.026851 0.035459 0.953844 0.003988 0.006709 0.020000 0.954344 0.005966 0.019690 0.015299 0.964390 0.006755 0.013557 0.028565 0.936152 0.011660 0.023623 0.300127 0.517309 0.029700 0.152863 0.159063 0.513443 0.051834 0.275660 0.158172 0.647055 0.133256 0.061516 Consensus sequence: DBCCCCCCCCCCMYC Reverse complement motif 0.158172 0.133256 0.647055 0.061516 0.159063 0.051834 0.513443 0.275660 0.300127 0.029700 0.517309 0.152863 0.028565 0.011660 0.936152 0.023623 0.015299 0.006755 0.964390 0.013557 0.020000 0.005966 0.954344 0.019690 0.035459 0.003988 0.953844 0.006709 0.018153 0.010254 0.944742 0.026851 0.123049 0.033072 0.591257 0.252622 0.246434 0.022655 0.590578 0.140333 0.044982 0.045356 0.884112 0.025549 0.142183 0.045722 0.737634 0.074461 0.263149 0.067983 0.555137 0.113731 0.136153 0.179132 0.443451 0.241264 0.431929 0.165213 0.201324 0.201535 Consensus sequence: GKRGGGGGGGGGGBD Alignment: -----GKRGGGGGGGGGGBD GGAAGGAAGGAAGGAAGG-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00030 Sox11_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 5 13 0.548370 Species: Mus musculus Original motif 0.351812 0.238467 0.143954 0.265768 0.195246 0.235838 0.281473 0.287443 0.349478 0.172616 0.210739 0.267167 0.484061 0.110438 0.173131 0.232370 0.276692 0.070713 0.479604 0.172991 0.859124 0.044167 0.083951 0.012758 0.975608 0.002029 0.002285 0.020079 0.006422 0.978485 0.007124 0.007969 0.987489 0.003025 0.002868 0.006617 0.987739 0.005463 0.002730 0.004067 0.693013 0.004067 0.002445 0.300475 0.189100 0.003677 0.801408 0.005814 0.352090 0.072517 0.567737 0.007656 0.542316 0.176545 0.192768 0.088371 0.196382 0.304176 0.205985 0.293457 0.289415 0.201358 0.182937 0.326290 0.385801 0.216362 0.152363 0.245475 Consensus sequence: HBDDRAACAAAGRABHH Reverse complement motif 0.245475 0.216362 0.152363 0.385801 0.326290 0.201358 0.182937 0.289415 0.196382 0.205985 0.304176 0.293457 0.088371 0.176545 0.192768 0.542316 0.352090 0.567737 0.072517 0.007656 0.189100 0.801408 0.003677 0.005814 0.300475 0.004067 0.002445 0.693013 0.004067 0.005463 0.002730 0.987739 0.006617 0.003025 0.002868 0.987489 0.006422 0.007124 0.978485 0.007969 0.020079 0.002029 0.002285 0.975608 0.012758 0.044167 0.083951 0.859124 0.276692 0.479604 0.070713 0.172991 0.232370 0.110438 0.173131 0.484061 0.267167 0.172616 0.210739 0.349478 0.287443 0.235838 0.281473 0.195246 0.265768 0.238467 0.143954 0.351812 Consensus sequence: HHBTMCTTTGTTMDDVH Alignment: HHBTMCTTTGTTMDDVH----- ----CCTTCCTTCCTTCCTTCC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v015681_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 11 12 1.040685 Species: Mus musculus Original motif 0.331499 0.188505 0.182841 0.297156 0.328961 0.213025 0.273530 0.184484 0.197213 0.129292 0.524914 0.148581 0.274491 0.226406 0.312118 0.186986 0.103231 0.393726 0.364988 0.138055 0.552594 0.166422 0.186262 0.094722 0.157618 0.064773 0.616497 0.161112 0.139166 0.176098 0.621185 0.063551 0.748420 0.062398 0.012447 0.176735 0.116584 0.009438 0.860326 0.013653 0.005030 0.003646 0.974877 0.016447 0.055257 0.007181 0.921760 0.015802 0.032748 0.058249 0.052709 0.856293 0.105606 0.872231 0.014370 0.007793 0.019480 0.497379 0.125899 0.357242 0.478582 0.269713 0.061464 0.190242 0.253985 0.287006 0.201320 0.257689 0.319384 0.210231 0.175842 0.294543 0.222123 0.287802 0.201294 0.288782 0.139951 0.376041 0.081133 0.402875 0.213450 0.343835 0.383676 0.059039 0.322294 0.355918 0.148062 0.173725 Consensus sequence: HVGVSAGGAGGGTCYHHHHYVH Reverse complement motif 0.322294 0.148062 0.355918 0.173725 0.213450 0.383676 0.343835 0.059039 0.402875 0.376041 0.081133 0.139951 0.288782 0.287802 0.201294 0.222123 0.294543 0.210231 0.175842 0.319384 0.253985 0.201320 0.287006 0.257689 0.190242 0.269713 0.061464 0.478582 0.019480 0.125899 0.497379 0.357242 0.105606 0.014370 0.872231 0.007793 0.856293 0.058249 0.052709 0.032748 0.055257 0.921760 0.007181 0.015802 0.005030 0.974877 0.003646 0.016447 0.116584 0.860326 0.009438 0.013653 0.176735 0.062398 0.012447 0.748420 0.139166 0.621185 0.176098 0.063551 0.157618 0.616497 0.064773 0.161112 0.094722 0.166422 0.186262 0.552594 0.103231 0.364988 0.393726 0.138055 0.274491 0.312118 0.226406 0.186986 0.197213 0.524914 0.129292 0.148581 0.184484 0.213025 0.273530 0.328961 0.297156 0.188505 0.182841 0.331499 Consensus sequence: DVMHHDHKGACCCTCCTSVCBH Alignment: ------HVGVSAGGAGGGTCYHHHHYVH GGAAGGAAGGAAGGAAGG---------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00409 Elf5 Original Motif Original Motif Backward 3 12 1.041590 Species: Mus musculus Original motif 0.179167 0.229135 0.279326 0.312372 0.421239 0.102900 0.145609 0.330252 0.791978 0.009721 0.028951 0.169350 0.237609 0.375543 0.161526 0.225321 0.145845 0.325411 0.516045 0.012699 0.431007 0.516333 0.051679 0.000982 0.005750 0.001408 0.990928 0.001915 0.002025 0.001886 0.992021 0.004068 0.986405 0.001705 0.001039 0.010851 0.950652 0.003619 0.000482 0.045248 0.165221 0.013897 0.819076 0.001805 0.032042 0.049374 0.014632 0.903953 0.285325 0.108010 0.127373 0.479292 0.366131 0.141246 0.290661 0.201963 Consensus sequence: BWAHSMGGAAGTWD Reverse complement motif 0.201963 0.141246 0.290661 0.366131 0.479292 0.108010 0.127373 0.285325 0.903953 0.049374 0.014632 0.032042 0.165221 0.819076 0.013897 0.001805 0.045248 0.003619 0.000482 0.950652 0.010851 0.001705 0.001039 0.986405 0.002025 0.992021 0.001886 0.004068 0.005750 0.990928 0.001408 0.001915 0.431007 0.051679 0.516333 0.000982 0.145845 0.516045 0.325411 0.012699 0.237609 0.161526 0.375543 0.225321 0.169350 0.009721 0.028951 0.791978 0.330252 0.102900 0.145609 0.421239 0.312372 0.229135 0.279326 0.179167 Consensus sequence: DWACTTCCRSDTWV Alignment: ------BWAHSMGGAAGTWD GGAAGGAAGGAAGGAAGG-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00056 Rfx4_secondary Original Motif Reverse Complement Backward 7 12 1.043492 Species: Mus musculus Original motif 0.241055 0.181590 0.146782 0.430573 0.334692 0.284570 0.183858 0.196880 0.149993 0.369289 0.267268 0.213450 0.022041 0.923939 0.029272 0.024748 0.270991 0.387582 0.133916 0.207510 0.064065 0.026889 0.060947 0.848098 0.502352 0.014409 0.481032 0.002206 0.004704 0.003480 0.984761 0.007055 0.362619 0.002225 0.004187 0.630969 0.008959 0.011532 0.043287 0.936222 0.952238 0.009996 0.017571 0.020195 0.008741 0.976874 0.006479 0.007906 0.219429 0.353879 0.330699 0.095994 0.234527 0.265601 0.292784 0.207089 0.296592 0.268334 0.216930 0.218144 Consensus sequence: HHBCHTRGWTACVVH Reverse complement motif 0.218144 0.268334 0.216930 0.296592 0.234527 0.292784 0.265601 0.207089 0.219429 0.330699 0.353879 0.095994 0.008741 0.006479 0.976874 0.007906 0.020195 0.009996 0.017571 0.952238 0.936222 0.011532 0.043287 0.008959 0.630969 0.002225 0.004187 0.362619 0.004704 0.984761 0.003480 0.007055 0.002206 0.014409 0.481032 0.502352 0.848098 0.026889 0.060947 0.064065 0.270991 0.133916 0.387582 0.207510 0.022041 0.029272 0.923939 0.024748 0.149993 0.267268 0.369289 0.213450 0.196880 0.284570 0.183858 0.334692 0.430573 0.181590 0.146782 0.241055 Consensus sequence: HVVGTAWCKADGBHH Alignment: ------HHBCHTRGWTACVVH GGAAGGAAGGAAGGAAGG------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 33 Motif name: HIF1AARNT Original motif 0.259615 0.269231 0.471154 0.000000 0.096154 0.278846 0.326923 0.298077 0.750000 0.019231 0.221154 0.009615 0.000000 0.990385 0.000000 0.009615 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.173077 0.490385 0.192308 0.144231 Consensus sequence: VBACGTGV Reserve complement motif 0.173077 0.192308 0.490385 0.144231 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.990385 0.009615 0.009615 0.019231 0.221154 0.750000 0.096154 0.326923 0.278846 0.298077 0.259615 0.471154 0.269231 0.000000 Consensus sequence: VCACGTBV ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 33 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00097 Mtf1_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 8 0.000000 Species: Mus musculus Original motif 0.220880 0.102939 0.418146 0.258035 0.154303 0.210788 0.420671 0.214238 0.229141 0.160788 0.412818 0.197253 0.167193 0.404248 0.092489 0.336070 0.025978 0.931335 0.023830 0.018857 0.009150 0.002023 0.977342 0.011485 0.044768 0.024113 0.039091 0.892028 0.007577 0.008370 0.973767 0.010286 0.005251 0.264996 0.004018 0.725735 0.009165 0.002428 0.980566 0.007841 0.021296 0.956027 0.008893 0.013784 0.982532 0.003341 0.005773 0.008353 0.500983 0.226027 0.143944 0.129045 0.544466 0.285936 0.044719 0.124879 0.321158 0.168428 0.261827 0.248587 0.271460 0.263221 0.199083 0.266236 Consensus sequence: DBDHCGTGTGCAAMDH Reverse complement motif 0.266236 0.263221 0.199083 0.271460 0.248587 0.168428 0.261827 0.321158 0.124879 0.285936 0.044719 0.544466 0.129045 0.226027 0.143944 0.500983 0.008353 0.003341 0.005773 0.982532 0.021296 0.008893 0.956027 0.013784 0.009165 0.980566 0.002428 0.007841 0.725735 0.264996 0.004018 0.005251 0.007577 0.973767 0.008370 0.010286 0.892028 0.024113 0.039091 0.044768 0.009150 0.977342 0.002023 0.011485 0.025978 0.023830 0.931335 0.018857 0.167193 0.092489 0.404248 0.336070 0.229141 0.412818 0.160788 0.197253 0.154303 0.420671 0.210788 0.214238 0.220880 0.418146 0.102939 0.258035 Consensus sequence: HDYTTGCACACGDHBH Alignment: HDYTTGCACACGDHBH -------VCACGTBV- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00060 Max_primary Original Motif Original Motif Forward 4 8 0.000574 Species: Mus musculus Original motif 0.234855 0.152539 0.301720 0.310886 0.199226 0.147959 0.439250 0.213565 0.582926 0.274768 0.075866 0.066440 0.138829 0.475428 0.305884 0.079859 0.024979 0.969691 0.001811 0.003520 0.966345 0.003728 0.022320 0.007607 0.000598 0.907006 0.008160 0.084236 0.084236 0.008160 0.907006 0.000598 0.007607 0.022320 0.003728 0.966345 0.003520 0.001811 0.969691 0.024979 0.149140 0.241218 0.389598 0.220044 0.066440 0.075866 0.274768 0.582926 0.186990 0.346199 0.250066 0.216745 0.273437 0.225889 0.300738 0.199936 0.160893 0.111177 0.477963 0.249968 0.171790 0.101256 0.424580 0.302375 Consensus sequence: DDASCACGTGBTBVDD Reverse complement motif 0.171790 0.424580 0.101256 0.302375 0.160893 0.477963 0.111177 0.249968 0.273437 0.300738 0.225889 0.199936 0.186990 0.250066 0.346199 0.216745 0.582926 0.075866 0.274768 0.066440 0.149140 0.389598 0.241218 0.220044 0.003520 0.969691 0.001811 0.024979 0.966345 0.022320 0.003728 0.007607 0.084236 0.907006 0.008160 0.000598 0.000598 0.008160 0.907006 0.084236 0.007607 0.003728 0.022320 0.966345 0.024979 0.001811 0.969691 0.003520 0.138829 0.305884 0.475428 0.079859 0.066440 0.274768 0.075866 0.582926 0.199226 0.439250 0.147959 0.213565 0.310886 0.152539 0.301720 0.234855 Consensus sequence: HHVBABCACGTGSTHD Alignment: DDASCACGTGBTBVDD ---VBACGTGV----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00050 Bhlhb2_secondary Original Motif Original Motif Backward 9 8 0.006425 Species: Mus musculus Original motif 0.120938 0.344851 0.124072 0.410138 0.220931 0.169844 0.422396 0.186829 0.127752 0.260812 0.103811 0.507625 0.140641 0.405473 0.287668 0.166218 0.296957 0.155579 0.301094 0.246370 0.219647 0.287193 0.154072 0.339087 0.049294 0.026059 0.121789 0.802859 0.520042 0.289284 0.173423 0.017251 0.049190 0.943472 0.004308 0.003030 0.902609 0.006767 0.074770 0.015854 0.003221 0.971329 0.005512 0.019937 0.019937 0.005512 0.971329 0.003221 0.015854 0.074770 0.006767 0.902609 0.003030 0.004308 0.943472 0.049190 0.003497 0.088920 0.685942 0.221641 0.802859 0.121789 0.026059 0.049294 0.334544 0.155170 0.275193 0.235092 0.275957 0.132104 0.454982 0.136957 0.134097 0.254352 0.422940 0.188611 0.396163 0.432784 0.051281 0.119772 0.276474 0.115627 0.419844 0.188056 0.160759 0.088061 0.649863 0.101318 0.203314 0.166595 0.106821 0.523270 Consensus sequence: YDYBDHTMCACGTGGADDBMDGT Reverse complement motif 0.523270 0.166595 0.106821 0.203314 0.160759 0.649863 0.088061 0.101318 0.276474 0.419844 0.115627 0.188056 0.396163 0.051281 0.432784 0.119772 0.134097 0.422940 0.254352 0.188611 0.275957 0.454982 0.132104 0.136957 0.235092 0.155170 0.275193 0.334544 0.049294 0.121789 0.026059 0.802859 0.003497 0.685942 0.088920 0.221641 0.003030 0.943472 0.004308 0.049190 0.902609 0.074770 0.006767 0.015854 0.019937 0.971329 0.005512 0.003221 0.003221 0.005512 0.971329 0.019937 0.015854 0.006767 0.074770 0.902609 0.049190 0.004308 0.943472 0.003030 0.017251 0.289284 0.173423 0.520042 0.802859 0.026059 0.121789 0.049294 0.339087 0.287193 0.154072 0.219647 0.296957 0.301094 0.155579 0.246370 0.140641 0.287668 0.405473 0.166218 0.507625 0.260812 0.103811 0.127752 0.220931 0.422396 0.169844 0.186829 0.410138 0.344851 0.124072 0.120938 Consensus sequence: ACHRBHDTCCACGTGYAHHBMHM Alignment: YDYBDHTMCACGTGGADDBMDGT -------VBACGTGV-------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00084 Gmeb1_primary Original Motif Reverse Complement Backward 5 8 0.013117 Species: Mus musculus Original motif 0.166569 0.264627 0.345569 0.223235 0.335599 0.314451 0.153336 0.196615 0.105350 0.231839 0.348018 0.314793 0.131274 0.215623 0.291288 0.361815 0.125570 0.072341 0.404848 0.397242 0.049879 0.039110 0.325167 0.585844 0.705098 0.009202 0.284757 0.000943 0.003535 0.986983 0.004275 0.005207 0.005207 0.004275 0.986983 0.003535 0.000943 0.284757 0.009202 0.705098 0.585844 0.325167 0.039110 0.049879 0.397242 0.404848 0.072341 0.125570 0.206857 0.234555 0.371731 0.186857 0.435957 0.145115 0.181033 0.237896 0.176104 0.260127 0.230770 0.333000 0.272102 0.213365 0.312032 0.202501 0.237402 0.250982 0.266977 0.244639 Consensus sequence: BHBBKKACGTMMVDBVB Reverse complement motif 0.237402 0.266977 0.250982 0.244639 0.272102 0.312032 0.213365 0.202501 0.333000 0.260127 0.230770 0.176104 0.237896 0.145115 0.181033 0.435957 0.206857 0.371731 0.234555 0.186857 0.397242 0.072341 0.404848 0.125570 0.049879 0.325167 0.039110 0.585844 0.705098 0.284757 0.009202 0.000943 0.005207 0.986983 0.004275 0.003535 0.003535 0.004275 0.986983 0.005207 0.000943 0.009202 0.284757 0.705098 0.585844 0.039110 0.325167 0.049879 0.125570 0.404848 0.072341 0.397242 0.361815 0.215623 0.291288 0.131274 0.105350 0.348018 0.231839 0.314793 0.196615 0.314451 0.153336 0.335599 0.166569 0.345569 0.264627 0.223235 Consensus sequence: BVVDVRYACGTRYVBHB Alignment: BVVDVRYACGTRYVBHB -----VBACGTGV---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00050 Bhlhb2_primary Reverse Complement Original Motif Backward 8 8 0.014006 Species: Mus musculus Original motif 0.347837 0.112349 0.403713 0.136102 0.298329 0.175329 0.324534 0.201809 0.421791 0.222553 0.113615 0.242041 0.387506 0.130670 0.161435 0.320389 0.197183 0.244864 0.304611 0.253342 0.345884 0.188786 0.278290 0.187041 0.228203 0.142148 0.408269 0.221381 0.037126 0.006772 0.231775 0.724328 0.055214 0.942800 0.001192 0.000794 0.974119 0.004466 0.015535 0.005880 0.000300 0.958145 0.007498 0.034056 0.034056 0.007498 0.958145 0.000300 0.005880 0.015535 0.004466 0.974119 0.000794 0.001192 0.942800 0.055214 0.724328 0.231775 0.006772 0.037126 0.015720 0.466476 0.315208 0.202596 0.173670 0.355170 0.210710 0.260449 0.407419 0.261539 0.134430 0.196612 0.351478 0.209698 0.262426 0.176399 0.207869 0.284582 0.198951 0.308598 0.434482 0.113724 0.184408 0.267386 0.211144 0.363745 0.173978 0.251133 Consensus sequence: RDHDBVDTCACGTGASBHVHDH Reverse complement motif 0.211144 0.173978 0.363745 0.251133 0.267386 0.113724 0.184408 0.434482 0.308598 0.284582 0.198951 0.207869 0.176399 0.209698 0.262426 0.351478 0.196612 0.261539 0.134430 0.407419 0.173670 0.210710 0.355170 0.260449 0.015720 0.315208 0.466476 0.202596 0.037126 0.231775 0.006772 0.724328 0.000794 0.942800 0.001192 0.055214 0.974119 0.015535 0.004466 0.005880 0.034056 0.958145 0.007498 0.000300 0.000300 0.007498 0.958145 0.034056 0.005880 0.004466 0.015535 0.974119 0.055214 0.001192 0.942800 0.000794 0.724328 0.006772 0.231775 0.037126 0.228203 0.408269 0.142148 0.221381 0.187041 0.188786 0.278290 0.345884 0.197183 0.304611 0.244864 0.253342 0.320389 0.130670 0.161435 0.387506 0.242041 0.222553 0.113615 0.421791 0.298329 0.324534 0.175329 0.201809 0.347837 0.403713 0.112349 0.136102 Consensus sequence: DDHBHBSTCACGTGAHBBDHHM Alignment: RDHDBVDTCACGTGASBHVHDH -------VCACGTBV------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00046 Tcfe2a_primary Original Motif Original Motif Forward 5 8 0.018430 Species: Mus musculus Original motif 0.306209 0.232705 0.244475 0.216611 0.165668 0.171480 0.222584 0.440269 0.213008 0.429038 0.156385 0.201569 0.283226 0.329518 0.160795 0.226461 0.439156 0.283517 0.251270 0.026056 0.014994 0.980987 0.000714 0.003304 0.975741 0.020182 0.002909 0.001168 0.000926 0.191353 0.801648 0.006073 0.015382 0.090853 0.893043 0.000721 0.001549 0.005912 0.001713 0.990826 0.004000 0.000857 0.989667 0.005475 0.016957 0.663726 0.148127 0.171190 0.299047 0.091156 0.448649 0.161148 0.354701 0.214677 0.236757 0.193865 0.399446 0.174508 0.200036 0.226009 0.303545 0.277435 0.200094 0.218926 0.380242 0.148876 0.163367 0.307514 Consensus sequence: VBHHVCAGGTGCDVDHD Reverse complement motif 0.307514 0.148876 0.163367 0.380242 0.218926 0.277435 0.200094 0.303545 0.226009 0.174508 0.200036 0.399446 0.193865 0.214677 0.236757 0.354701 0.299047 0.448649 0.091156 0.161148 0.016957 0.148127 0.663726 0.171190 0.004000 0.989667 0.000857 0.005475 0.990826 0.005912 0.001713 0.001549 0.015382 0.893043 0.090853 0.000721 0.000926 0.801648 0.191353 0.006073 0.001168 0.020182 0.002909 0.975741 0.014994 0.000714 0.980987 0.003304 0.026056 0.283517 0.251270 0.439156 0.283226 0.160795 0.329518 0.226461 0.213008 0.156385 0.429038 0.201569 0.440269 0.171480 0.222584 0.165668 0.216611 0.232705 0.244475 0.306209 Consensus sequence: DHDBHGCACCTGBDDVB Alignment: VBHHVCAGGTGCDVDHD ----VBACGTGV----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00068 Eomes_secondary Reverse Complement Reverse Complement Backward 3 8 0.018815 Species: Mus musculus Original motif 0.253642 0.252604 0.298295 0.195458 0.112892 0.341342 0.341061 0.204704 0.297430 0.215095 0.343350 0.144125 0.241098 0.129378 0.421448 0.208076 0.894201 0.007299 0.061032 0.037468 0.052259 0.054303 0.856609 0.036829 0.005074 0.015048 0.966734 0.013144 0.003258 0.061529 0.002368 0.932845 0.017531 0.005025 0.973155 0.004289 0.116022 0.030172 0.047139 0.806667 0.027749 0.602513 0.009946 0.359792 0.018763 0.048982 0.794648 0.137608 0.177116 0.459591 0.284833 0.078460 0.121483 0.491485 0.148745 0.238287 0.152590 0.245835 0.214717 0.386857 0.221040 0.320773 0.249918 0.208270 Consensus sequence: VBVDAGGTGTYGVBBV Reverse complement motif 0.221040 0.249918 0.320773 0.208270 0.386857 0.245835 0.214717 0.152590 0.121483 0.148745 0.491485 0.238287 0.177116 0.284833 0.459591 0.078460 0.018763 0.794648 0.048982 0.137608 0.027749 0.009946 0.602513 0.359792 0.806667 0.030172 0.047139 0.116022 0.017531 0.973155 0.005025 0.004289 0.932845 0.061529 0.002368 0.003258 0.005074 0.966734 0.015048 0.013144 0.052259 0.856609 0.054303 0.036829 0.037468 0.007299 0.061032 0.894201 0.241098 0.421448 0.129378 0.208076 0.297430 0.343350 0.215095 0.144125 0.112892 0.341061 0.341342 0.204704 0.253642 0.298295 0.252604 0.195458 Consensus sequence: VVBVCKACACCTHVBV Alignment: VVBVCKACACCTHVBV ------VCACGTBV-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00026 Zscan4_primary Original Motif Original Motif Backward 9 8 0.018957 Species: Mus musculus Original motif 0.203927 0.157260 0.307071 0.331743 0.360341 0.265216 0.147327 0.227115 0.251195 0.298806 0.241051 0.208949 0.487186 0.122472 0.214362 0.175980 0.122838 0.051062 0.055773 0.770327 0.020467 0.009992 0.965816 0.003725 0.005887 0.026663 0.006808 0.960643 0.030656 0.002167 0.965099 0.002078 0.002078 0.965099 0.002167 0.030656 0.960643 0.006808 0.026663 0.005887 0.003725 0.965816 0.009992 0.020467 0.770327 0.055773 0.051062 0.122838 0.044808 0.382307 0.042920 0.529965 0.751320 0.047417 0.044482 0.156781 0.362742 0.228898 0.085373 0.322987 0.436635 0.111479 0.217284 0.234601 0.303930 0.285374 0.195872 0.214824 Consensus sequence: DHVDTGTGCACAYAHDH Reverse complement motif 0.214824 0.285374 0.195872 0.303930 0.234601 0.111479 0.217284 0.436635 0.322987 0.228898 0.085373 0.362742 0.156781 0.047417 0.044482 0.751320 0.529965 0.382307 0.042920 0.044808 0.122838 0.055773 0.051062 0.770327 0.003725 0.009992 0.965816 0.020467 0.005887 0.006808 0.026663 0.960643 0.002078 0.002167 0.965099 0.030656 0.030656 0.965099 0.002167 0.002078 0.960643 0.026663 0.006808 0.005887 0.020467 0.965816 0.009992 0.003725 0.770327 0.051062 0.055773 0.122838 0.175980 0.122472 0.214362 0.487186 0.251195 0.241051 0.298806 0.208949 0.227115 0.265216 0.147327 0.360341 0.331743 0.157260 0.307071 0.203927 Consensus sequence: HDHTMTGTGCACADVHD Alignment: DHVDTGTGCACAYAHDH -VBACGTGV-------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00042 Gm397_primary Original Motif Reverse Complement Backward 8 8 0.019899 Species: Mus musculus Original motif 0.248614 0.321010 0.201723 0.228654 0.332381 0.190810 0.184854 0.291955 0.253802 0.119338 0.331394 0.295466 0.577827 0.100884 0.130066 0.191223 0.180374 0.011174 0.042942 0.765510 0.009131 0.024996 0.962422 0.003450 0.003308 0.034731 0.002930 0.959032 0.063907 0.001099 0.933714 0.001280 0.001280 0.933714 0.001099 0.063907 0.959032 0.002930 0.034731 0.003308 0.003450 0.962422 0.024996 0.009131 0.765510 0.042942 0.011174 0.180374 0.026456 0.256356 0.130672 0.586516 0.589555 0.285548 0.036864 0.088034 0.265828 0.529813 0.031915 0.172445 0.209015 0.104817 0.374275 0.311892 0.224283 0.292805 0.144270 0.338642 Consensus sequence: HHDATGTGCACATAMDH Reverse complement motif 0.338642 0.292805 0.144270 0.224283 0.209015 0.374275 0.104817 0.311892 0.265828 0.031915 0.529813 0.172445 0.088034 0.285548 0.036864 0.589555 0.586516 0.256356 0.130672 0.026456 0.180374 0.042942 0.011174 0.765510 0.003450 0.024996 0.962422 0.009131 0.003308 0.002930 0.034731 0.959032 0.001280 0.001099 0.933714 0.063907 0.063907 0.933714 0.001099 0.001280 0.959032 0.034731 0.002930 0.003308 0.009131 0.962422 0.024996 0.003450 0.765510 0.011174 0.042942 0.180374 0.191223 0.100884 0.130066 0.577827 0.253802 0.331394 0.119338 0.295466 0.291955 0.190810 0.184854 0.332381 0.248614 0.201723 0.321010 0.228654 Consensus sequence: HHRTATGTGCACATHHD Alignment: HHRTATGTGCACATHHD --VBACGTGV------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00060 Max_secondary Reverse Complement Original Motif Backward 4 8 0.021967 Species: Mus musculus Original motif 0.127991 0.202889 0.399822 0.269298 0.156940 0.244015 0.182364 0.416681 0.046494 0.050598 0.744311 0.158596 0.196142 0.365183 0.183389 0.255286 0.019306 0.946805 0.015210 0.018680 0.924839 0.022113 0.027620 0.025428 0.007478 0.672138 0.027789 0.292595 0.046702 0.026044 0.906146 0.021107 0.117335 0.610863 0.025132 0.246670 0.044431 0.053581 0.722748 0.179240 0.543713 0.149809 0.190030 0.116447 0.241148 0.722386 0.022547 0.013919 0.265412 0.113032 0.270602 0.350954 0.226186 0.143504 0.332746 0.297564 Consensus sequence: BBGHCACGCGACDD Reverse complement motif 0.226186 0.332746 0.143504 0.297564 0.350954 0.113032 0.270602 0.265412 0.241148 0.022547 0.722386 0.013919 0.116447 0.149809 0.190030 0.543713 0.044431 0.722748 0.053581 0.179240 0.117335 0.025132 0.610863 0.246670 0.046702 0.906146 0.026044 0.021107 0.007478 0.027789 0.672138 0.292595 0.025428 0.022113 0.027620 0.924839 0.019306 0.015210 0.946805 0.018680 0.196142 0.183389 0.365183 0.255286 0.046494 0.744311 0.050598 0.158596 0.416681 0.244015 0.182364 0.156940 0.127991 0.399822 0.202889 0.269298 Consensus sequence: HDGTCGCGTGDCVB Alignment: BBGHCACGCGACDD ---VCACGTBV--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 34 Motif name: HNF4A Original motif 0.417910 0.104478 0.402985 0.074627 0.029851 0.029851 0.835821 0.104478 0.179104 0.059701 0.522388 0.238806 0.074627 0.343284 0.298507 0.283582 0.044776 0.761194 0.059701 0.134328 0.880597 0.014925 0.044776 0.059701 0.791045 0.029851 0.149254 0.029851 0.835821 0.014925 0.119403 0.029851 0.059701 0.059701 0.865672 0.014925 0.089552 0.029851 0.492537 0.388060 0.044776 0.328358 0.164179 0.462687 0.059701 0.731343 0.074627 0.134328 0.626866 0.104478 0.149254 0.119403 Consensus sequence: RGGBCAAAGKYCA Reserve complement motif 0.119403 0.104478 0.149254 0.626866 0.059701 0.074627 0.731343 0.134328 0.462687 0.328358 0.164179 0.044776 0.089552 0.492537 0.029851 0.388060 0.059701 0.865672 0.059701 0.014925 0.029851 0.014925 0.119403 0.835821 0.029851 0.029851 0.149254 0.791045 0.059701 0.014925 0.044776 0.880597 0.044776 0.059701 0.761194 0.134328 0.074627 0.298507 0.343284 0.283582 0.179104 0.522388 0.059701 0.238806 0.029851 0.835821 0.029851 0.104478 0.074627 0.104478 0.402985 0.417910 Consensus sequence: TGMYCTTTGBCCK ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 34 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00058 Tcf3_primary Original Motif Original Motif Backward 2 13 0.035778 Species: Mus musculus Original motif 0.185864 0.201179 0.183663 0.429294 0.371100 0.233868 0.122934 0.272098 0.249563 0.171285 0.128851 0.450301 0.582940 0.043382 0.129099 0.244578 0.041400 0.395349 0.497087 0.066163 0.759123 0.009670 0.005936 0.225270 0.056579 0.008662 0.003986 0.930772 0.043968 0.865783 0.056001 0.034249 0.962748 0.003731 0.003265 0.030256 0.971318 0.003542 0.012299 0.012841 0.937558 0.003991 0.020195 0.038256 0.125931 0.057976 0.798081 0.018012 0.209401 0.172342 0.483980 0.134277 0.485703 0.129227 0.309936 0.075134 0.397027 0.195902 0.152395 0.254676 0.311636 0.231510 0.157732 0.299122 0.320965 0.206031 0.164299 0.308705 Consensus sequence: HHHASATCAAAGVRHHH Reverse complement motif 0.308705 0.206031 0.164299 0.320965 0.299122 0.231510 0.157732 0.311636 0.254676 0.195902 0.152395 0.397027 0.075134 0.129227 0.309936 0.485703 0.209401 0.483980 0.172342 0.134277 0.125931 0.798081 0.057976 0.018012 0.038256 0.003991 0.020195 0.937558 0.012841 0.003542 0.012299 0.971318 0.030256 0.003731 0.003265 0.962748 0.043968 0.056001 0.865783 0.034249 0.930772 0.008662 0.003986 0.056579 0.225270 0.009670 0.005936 0.759123 0.041400 0.497087 0.395349 0.066163 0.244578 0.043382 0.129099 0.582940 0.450301 0.171285 0.128851 0.249563 0.272098 0.233868 0.122934 0.371100 0.429294 0.201179 0.183663 0.185864 Consensus sequence: HHHKVCTTTGATSTHHH Alignment: HHHASATCAAAGVRHHH ---RGGBCAAAGKYCA- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00054 Tcf7_primary Original Motif Original Motif Backward 2 13 0.035779 Species: Mus musculus Original motif 0.170811 0.196976 0.220503 0.411710 0.337231 0.228482 0.140137 0.294150 0.299312 0.173780 0.143426 0.383481 0.603957 0.053557 0.128214 0.214271 0.036338 0.377925 0.534647 0.051091 0.725865 0.010314 0.008501 0.255320 0.067855 0.007849 0.004559 0.919737 0.049387 0.815496 0.098330 0.036787 0.960514 0.005036 0.005137 0.029313 0.960631 0.004550 0.018815 0.016004 0.935245 0.005169 0.023866 0.035720 0.159760 0.060340 0.761341 0.018559 0.228534 0.153897 0.523052 0.094517 0.557984 0.123512 0.254154 0.064350 0.490252 0.211976 0.124557 0.173215 0.310463 0.250279 0.132612 0.306646 0.332720 0.248937 0.120633 0.297711 Consensus sequence: BHHASATCAAAGGAHHH Reverse complement motif 0.297711 0.248937 0.120633 0.332720 0.306646 0.250279 0.132612 0.310463 0.173215 0.211976 0.124557 0.490252 0.064350 0.123512 0.254154 0.557984 0.228534 0.523052 0.153897 0.094517 0.159760 0.761341 0.060340 0.018559 0.035720 0.005169 0.023866 0.935245 0.016004 0.004550 0.018815 0.960631 0.029313 0.005036 0.005137 0.960514 0.049387 0.098330 0.815496 0.036787 0.919737 0.007849 0.004559 0.067855 0.255320 0.010314 0.008501 0.725865 0.036338 0.534647 0.377925 0.051091 0.214271 0.053557 0.128214 0.603957 0.383481 0.173780 0.143426 0.299312 0.294150 0.228482 0.140137 0.337231 0.411710 0.196976 0.220503 0.170811 Consensus sequence: HHHTCCTTTGATSTHHV Alignment: BHHASATCAAAGGAHHH ---RGGBCAAAGKYCA- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00067 Lef1_primary Original Motif Reverse Complement Forward 4 13 0.035901 Species: Mus musculus Original motif 0.281920 0.214207 0.278077 0.225796 0.325566 0.151435 0.298797 0.224202 0.290253 0.145824 0.243443 0.320480 0.069286 0.404645 0.141614 0.384454 0.070044 0.621448 0.142647 0.165862 0.007295 0.907657 0.038110 0.046938 0.015587 0.018273 0.000658 0.965482 0.005527 0.005886 0.001905 0.986682 0.024512 0.001189 0.001344 0.972955 0.007384 0.025221 0.952270 0.015125 0.966438 0.000630 0.002693 0.030239 0.082252 0.001173 0.001495 0.915080 0.030255 0.677155 0.275323 0.017267 0.199467 0.118815 0.056814 0.624905 0.345445 0.169597 0.216831 0.268127 0.278106 0.150864 0.173693 0.397336 0.251834 0.339733 0.219703 0.188730 Consensus sequence: DDDYCCTTTGATCTDDV Reverse complement motif 0.251834 0.219703 0.339733 0.188730 0.397336 0.150864 0.173693 0.278106 0.268127 0.169597 0.216831 0.345445 0.624905 0.118815 0.056814 0.199467 0.030255 0.275323 0.677155 0.017267 0.915080 0.001173 0.001495 0.082252 0.030239 0.000630 0.002693 0.966438 0.007384 0.952270 0.025221 0.015125 0.972955 0.001189 0.001344 0.024512 0.986682 0.005886 0.001905 0.005527 0.965482 0.018273 0.000658 0.015587 0.007295 0.038110 0.907657 0.046938 0.070044 0.142647 0.621448 0.165862 0.069286 0.141614 0.404645 0.384454 0.320480 0.145824 0.243443 0.290253 0.224202 0.151435 0.298797 0.325566 0.225796 0.214207 0.278077 0.281920 Consensus sequence: VDDAGATCAAAGGKDDD Alignment: VDDAGATCAAAGGKDDD ---RGGBCAAAGKYCA- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00083 Tcf7l2_primary Original Motif Reverse Complement Backward 2 13 0.036079 Species: Mus musculus Original motif 0.285725 0.187143 0.254855 0.272277 0.276264 0.157893 0.258178 0.307665 0.238788 0.161120 0.254018 0.346074 0.076041 0.333901 0.150903 0.439156 0.093376 0.526578 0.180529 0.199517 0.010827 0.880320 0.034150 0.074703 0.016546 0.023834 0.000940 0.958680 0.007166 0.008215 0.001941 0.982678 0.029634 0.001363 0.001379 0.967625 0.010872 0.031751 0.926186 0.031190 0.949407 0.000760 0.002581 0.047253 0.109203 0.001362 0.002094 0.887341 0.044198 0.567994 0.353059 0.034749 0.222623 0.142360 0.041281 0.593736 0.358872 0.167597 0.220534 0.252997 0.233072 0.141480 0.230985 0.394463 0.350703 0.243129 0.233961 0.172207 Consensus sequence: DDDYCCTTTGATSTDDV Reverse complement motif 0.172207 0.243129 0.233961 0.350703 0.394463 0.141480 0.230985 0.233072 0.252997 0.167597 0.220534 0.358872 0.593736 0.142360 0.041281 0.222623 0.044198 0.353059 0.567994 0.034749 0.887341 0.001362 0.002094 0.109203 0.047253 0.000760 0.002581 0.949407 0.010872 0.926186 0.031751 0.031190 0.967625 0.001363 0.001379 0.029634 0.982678 0.008215 0.001941 0.007166 0.958680 0.023834 0.000940 0.016546 0.010827 0.034150 0.880320 0.074703 0.093376 0.180529 0.526578 0.199517 0.439156 0.333901 0.150903 0.076041 0.346074 0.161120 0.254018 0.238788 0.307665 0.157893 0.258178 0.276264 0.272277 0.187143 0.254855 0.285725 Consensus sequence: BDDASATCAAAGGMDDD Alignment: BDDASATCAAAGGMDDD ---RGGBCAAAGKYCA- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00046 Tcfe2a_secondary Original Motif Original Motif Backward 4 13 0.040576 Species: Mus musculus Original motif 0.296417 0.247522 0.206749 0.249312 0.410113 0.201959 0.303149 0.084779 0.267313 0.132645 0.452057 0.147985 0.187929 0.136827 0.427628 0.247616 0.198671 0.425254 0.234160 0.141915 0.029244 0.953929 0.004092 0.012734 0.954570 0.014314 0.018695 0.012421 0.010025 0.055055 0.845504 0.089415 0.874802 0.040849 0.069178 0.015172 0.015084 0.010551 0.008736 0.965628 0.012981 0.007192 0.965036 0.014791 0.037724 0.016891 0.495632 0.449753 0.021685 0.438927 0.056118 0.483270 0.209872 0.365671 0.139706 0.284751 0.151815 0.336912 0.289382 0.221891 0.152995 0.262354 0.416434 0.168217 0.227567 0.187603 0.447892 0.136938 Consensus sequence: HVDDVCAGATGKYHBBV Reverse complement motif 0.227567 0.447892 0.187603 0.136938 0.152995 0.416434 0.262354 0.168217 0.151815 0.289382 0.336912 0.221891 0.209872 0.139706 0.365671 0.284751 0.483270 0.438927 0.056118 0.021685 0.037724 0.495632 0.016891 0.449753 0.012981 0.965036 0.007192 0.014791 0.965628 0.010551 0.008736 0.015084 0.015172 0.040849 0.069178 0.874802 0.010025 0.845504 0.055055 0.089415 0.012421 0.014314 0.018695 0.954570 0.029244 0.004092 0.953929 0.012734 0.198671 0.234160 0.425254 0.141915 0.187929 0.427628 0.136827 0.247616 0.267313 0.452057 0.132645 0.147985 0.084779 0.201959 0.303149 0.410113 0.249312 0.247522 0.206749 0.296417 Consensus sequence: VBBDMYCATCTGVHHBH Alignment: HVDDVCAGATGKYHBBV -RGGBCAAAGKYCA--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00062 Sox4_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 2 13 0.040991 Species: Mus musculus Original motif 0.427843 0.231210 0.119424 0.221523 0.196506 0.239531 0.304906 0.259057 0.302488 0.156922 0.290190 0.250401 0.433872 0.149126 0.196496 0.220506 0.258426 0.076511 0.475100 0.189963 0.841714 0.046453 0.099915 0.011918 0.983853 0.001612 0.001362 0.013174 0.003460 0.982032 0.005728 0.008780 0.989743 0.002253 0.002020 0.005984 0.990761 0.003397 0.002843 0.003000 0.770864 0.003540 0.001549 0.224048 0.235342 0.002598 0.757383 0.004677 0.371426 0.089574 0.529959 0.009040 0.480804 0.196949 0.240413 0.081833 0.187158 0.355102 0.216599 0.241142 0.248006 0.232182 0.157452 0.362360 0.403367 0.177684 0.164649 0.254300 Consensus sequence: HBDDDAACAAAGRVBHH Reverse complement motif 0.254300 0.177684 0.164649 0.403367 0.362360 0.232182 0.157452 0.248006 0.187158 0.216599 0.355102 0.241142 0.081833 0.196949 0.240413 0.480804 0.371426 0.529959 0.089574 0.009040 0.235342 0.757383 0.002598 0.004677 0.224048 0.003540 0.001549 0.770864 0.003000 0.003397 0.002843 0.990761 0.005984 0.002253 0.002020 0.989743 0.003460 0.005728 0.982032 0.008780 0.013174 0.001612 0.001362 0.983853 0.011918 0.046453 0.099915 0.841714 0.258426 0.475100 0.076511 0.189963 0.220506 0.149126 0.196496 0.433872 0.250401 0.156922 0.290190 0.302488 0.196506 0.304906 0.239531 0.259057 0.221523 0.231210 0.119424 0.427843 Consensus sequence: HHBBMCTTTGTTHDDBH Alignment: HHBBMCTTTGTTHDDBH -TGMYCTTTGBCCK--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00101 Sox12_secondary Reverse Complement Reverse Complement Forward 1 13 0.041322 Species: Mus musculus Original motif 0.378898 0.318901 0.205859 0.096341 0.352524 0.321236 0.224504 0.101736 0.323551 0.182056 0.210897 0.283496 0.135539 0.325230 0.208031 0.331200 0.663106 0.055471 0.154459 0.126963 0.051748 0.292567 0.537307 0.118378 0.886489 0.042361 0.035742 0.035408 0.043647 0.688744 0.094358 0.173252 0.882052 0.039818 0.018899 0.059231 0.864171 0.036011 0.068363 0.031455 0.790158 0.046868 0.041594 0.121379 0.087447 0.143905 0.707798 0.060849 0.295919 0.132479 0.485703 0.085899 0.653156 0.133004 0.110012 0.103828 0.351764 0.131771 0.217730 0.298736 0.203977 0.196773 0.099958 0.499292 Consensus sequence: VVDBASACAAAGRADH Reverse complement motif 0.499292 0.196773 0.099958 0.203977 0.298736 0.131771 0.217730 0.351764 0.103828 0.133004 0.110012 0.653156 0.295919 0.485703 0.132479 0.085899 0.087447 0.707798 0.143905 0.060849 0.121379 0.046868 0.041594 0.790158 0.031455 0.036011 0.068363 0.864171 0.059231 0.039818 0.018899 0.882052 0.043647 0.094358 0.688744 0.173252 0.035408 0.042361 0.035742 0.886489 0.051748 0.537307 0.292567 0.118378 0.126963 0.055471 0.154459 0.663106 0.331200 0.325230 0.208031 0.135539 0.283496 0.182056 0.210897 0.323551 0.101736 0.321236 0.224504 0.352524 0.096341 0.318901 0.205859 0.378898 Consensus sequence: HDTMCTTTGTSTVDBB Alignment: HDTMCTTTGTSTVDBB TGMYCTTTGBCCK--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00030 Sox11_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 2 13 0.042110 Species: Mus musculus Original motif 0.351812 0.238467 0.143954 0.265768 0.195246 0.235838 0.281473 0.287443 0.349478 0.172616 0.210739 0.267167 0.484061 0.110438 0.173131 0.232370 0.276692 0.070713 0.479604 0.172991 0.859124 0.044167 0.083951 0.012758 0.975608 0.002029 0.002285 0.020079 0.006422 0.978485 0.007124 0.007969 0.987489 0.003025 0.002868 0.006617 0.987739 0.005463 0.002730 0.004067 0.693013 0.004067 0.002445 0.300475 0.189100 0.003677 0.801408 0.005814 0.352090 0.072517 0.567737 0.007656 0.542316 0.176545 0.192768 0.088371 0.196382 0.304176 0.205985 0.293457 0.289415 0.201358 0.182937 0.326290 0.385801 0.216362 0.152363 0.245475 Consensus sequence: HBDDRAACAAAGRABHH Reverse complement motif 0.245475 0.216362 0.152363 0.385801 0.326290 0.201358 0.182937 0.289415 0.196382 0.205985 0.304176 0.293457 0.088371 0.176545 0.192768 0.542316 0.352090 0.567737 0.072517 0.007656 0.189100 0.801408 0.003677 0.005814 0.300475 0.004067 0.002445 0.693013 0.004067 0.005463 0.002730 0.987739 0.006617 0.003025 0.002868 0.987489 0.006422 0.007124 0.978485 0.007969 0.020079 0.002029 0.002285 0.975608 0.012758 0.044167 0.083951 0.859124 0.276692 0.479604 0.070713 0.172991 0.232370 0.110438 0.173131 0.484061 0.267167 0.172616 0.210739 0.349478 0.287443 0.235838 0.281473 0.195246 0.265768 0.238467 0.143954 0.351812 Consensus sequence: HHBTMCTTTGTTMDDVH Alignment: HHBTMCTTTGTTMDDVH -TGMYCTTTGBCCK--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00086 Irf3_secondary Original Motif Original Motif Forward 1 13 0.044200 Species: Mus musculus Original motif 0.236565 0.149020 0.414811 0.199604 0.197737 0.139048 0.436764 0.226451 0.598309 0.089963 0.124245 0.187483 0.212136 0.055296 0.648272 0.084296 0.747144 0.027184 0.047789 0.177884 0.766825 0.051238 0.039008 0.142929 0.479462 0.085743 0.175517 0.259279 0.064625 0.107366 0.753079 0.074929 0.058034 0.074096 0.820937 0.046934 0.270072 0.088714 0.217158 0.424057 0.063867 0.384543 0.418514 0.133076 0.047352 0.597210 0.167770 0.187669 0.266737 0.150063 0.382264 0.200936 0.381079 0.204427 0.218492 0.196003 Consensus sequence: DDAGAADGGDSCDV Reverse complement motif 0.196003 0.204427 0.218492 0.381079 0.266737 0.382264 0.150063 0.200936 0.047352 0.167770 0.597210 0.187669 0.063867 0.418514 0.384543 0.133076 0.424057 0.088714 0.217158 0.270072 0.058034 0.820937 0.074096 0.046934 0.064625 0.753079 0.107366 0.074929 0.259279 0.085743 0.175517 0.479462 0.142929 0.051238 0.039008 0.766825 0.177884 0.027184 0.047789 0.747144 0.212136 0.648272 0.055296 0.084296 0.187483 0.089963 0.124245 0.598309 0.197737 0.436764 0.139048 0.226451 0.236565 0.414811 0.149020 0.199604 Consensus sequence: BHGSDCCDTTCTHH Alignment: DDAGAADGGDSCDV RGGBCAAAGKYCA- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00082 Zfp187_secondary Original Motif Reverse Complement Backward 1 13 0.044688 Species: Mus musculus Original motif 0.173063 0.169680 0.440836 0.216421 0.353277 0.179996 0.249403 0.217325 0.307337 0.038055 0.616380 0.038228 0.316636 0.564670 0.023732 0.094962 0.015484 0.923764 0.019439 0.041313 0.011243 0.956300 0.009443 0.023014 0.062273 0.107531 0.010739 0.819456 0.126670 0.201521 0.192005 0.479803 0.093090 0.045924 0.835792 0.025194 0.020165 0.015483 0.009567 0.954786 0.010873 0.672448 0.004559 0.312121 0.018002 0.846860 0.017605 0.117533 0.335703 0.408170 0.104095 0.152031 0.150308 0.362296 0.067408 0.419988 0.286490 0.242211 0.176532 0.294767 0.265022 0.249655 0.272219 0.213104 Consensus sequence: DDGMCCTBGTCCHYHV Reverse complement motif 0.265022 0.272219 0.249655 0.213104 0.294767 0.242211 0.176532 0.286490 0.419988 0.362296 0.067408 0.150308 0.335703 0.104095 0.408170 0.152031 0.018002 0.017605 0.846860 0.117533 0.010873 0.004559 0.672448 0.312121 0.954786 0.015483 0.009567 0.020165 0.093090 0.835792 0.045924 0.025194 0.479803 0.201521 0.192005 0.126670 0.819456 0.107531 0.010739 0.062273 0.011243 0.009443 0.956300 0.023014 0.015484 0.019439 0.923764 0.041313 0.316636 0.023732 0.564670 0.094962 0.307337 0.616380 0.038055 0.038228 0.217325 0.179996 0.249403 0.353277 0.173063 0.440836 0.169680 0.216421 Consensus sequence: VHMDGGACVAGGRCDH Alignment: VHMDGGACVAGGRCDH ---RGGBCAAAGKYCA ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 35 Motif name: INSM1 Original motif 0.041667 0.000000 0.166667 0.791667 0.000000 0.000000 0.833333 0.166667 0.000000 0.333333 0.125000 0.541667 0.250000 0.625000 0.000000 0.125000 0.666667 0.000000 0.000000 0.333333 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.041667 0.958333 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.083333 0.666667 0.250000 0.125000 0.666667 0.000000 0.208333 0.416667 0.000000 0.500000 0.083333 Consensus sequence: TGYCAGGGGGCR Reserve complement motif 0.416667 0.500000 0.000000 0.083333 0.125000 0.000000 0.666667 0.208333 0.000000 0.666667 0.083333 0.250000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.958333 0.041667 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.333333 0.000000 0.000000 0.666667 0.250000 0.000000 0.625000 0.125000 0.541667 0.333333 0.125000 0.000000 0.000000 0.833333 0.000000 0.166667 0.791667 0.000000 0.166667 0.041667 Consensus sequence: MGCCCCCTGMCA ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 35 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00022 Zfp740_secondary Original Motif Reverse Complement Forward 3 12 0.000851 Species: Mus musculus Original motif 0.398967 0.071604 0.323957 0.205472 0.457709 0.058192 0.267218 0.216881 0.393346 0.032365 0.329533 0.244756 0.119528 0.091191 0.190078 0.599202 0.273933 0.123548 0.073075 0.529444 0.068935 0.812883 0.015245 0.102937 0.029664 0.907790 0.024804 0.037742 0.020725 0.933422 0.016796 0.029057 0.015086 0.948448 0.018030 0.018436 0.015628 0.884941 0.061172 0.038259 0.067508 0.744063 0.107305 0.081125 0.108097 0.140614 0.650174 0.101115 0.065696 0.247239 0.506149 0.180916 0.395005 0.077185 0.345914 0.181895 0.527081 0.093650 0.281853 0.097416 0.289378 0.245159 0.348803 0.116660 0.147136 0.260117 0.145993 0.446754 Consensus sequence: DDDTWCCCCCCGGDRVH Reverse complement motif 0.446754 0.260117 0.145993 0.147136 0.289378 0.348803 0.245159 0.116660 0.097416 0.093650 0.281853 0.527081 0.181895 0.077185 0.345914 0.395005 0.065696 0.506149 0.247239 0.180916 0.108097 0.650174 0.140614 0.101115 0.067508 0.107305 0.744063 0.081125 0.015628 0.061172 0.884941 0.038259 0.015086 0.018030 0.948448 0.018436 0.020725 0.016796 0.933422 0.029057 0.029664 0.024804 0.907790 0.037742 0.068935 0.015245 0.812883 0.102937 0.529444 0.123548 0.073075 0.273933 0.599202 0.091191 0.190078 0.119528 0.244756 0.032365 0.329533 0.393346 0.216881 0.058192 0.267218 0.457709 0.205472 0.071604 0.323957 0.398967 Consensus sequence: HVKDCCGGGGGGWADDD Alignment: HVKDCCGGGGGGWADDD --TGYCAGGGGGCR--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00002 Sp4_primary Original Motif Reverse Complement Backward 6 12 0.004064 Species: Mus musculus Original motif 0.155386 0.223380 0.374454 0.246780 0.247106 0.159582 0.345111 0.248201 0.238889 0.258354 0.165304 0.337454 0.255612 0.489586 0.051621 0.203182 0.450100 0.545383 0.001071 0.003447 0.003704 0.991007 0.002456 0.002833 0.035504 0.001814 0.928129 0.034553 0.001494 0.991406 0.003414 0.003686 0.003045 0.990628 0.005182 0.001145 0.000990 0.963237 0.001215 0.034557 0.148016 0.838396 0.000666 0.012922 0.014261 0.905847 0.007200 0.072692 0.083394 0.270068 0.058368 0.588170 0.149141 0.286783 0.142802 0.421274 0.204851 0.347195 0.253356 0.194597 0.184442 0.299908 0.194408 0.321242 0.125793 0.380109 0.245318 0.248780 Consensus sequence: BDHHMCGCCCCCTHVBB Reverse complement motif 0.125793 0.245318 0.380109 0.248780 0.321242 0.299908 0.194408 0.184442 0.204851 0.253356 0.347195 0.194597 0.421274 0.286783 0.142802 0.149141 0.588170 0.270068 0.058368 0.083394 0.014261 0.007200 0.905847 0.072692 0.148016 0.000666 0.838396 0.012922 0.000990 0.001215 0.963237 0.034557 0.003045 0.005182 0.990628 0.001145 0.001494 0.003414 0.991406 0.003686 0.035504 0.928129 0.001814 0.034553 0.003704 0.002456 0.991007 0.002833 0.450100 0.001071 0.545383 0.003447 0.255612 0.051621 0.489586 0.203182 0.337454 0.258354 0.165304 0.238889 0.247106 0.345111 0.159582 0.248201 0.155386 0.374454 0.223380 0.246780 Consensus sequence: BVVHAGGGGGCGRDHHB Alignment: BVVHAGGGGGCGRDHHB TGYCAGGGGGCR----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00047 Zbtb7b_primary Original Motif Reverse Complement Forward 3 12 0.004869 Species: Mus musculus Original motif 0.346946 0.168959 0.284689 0.199406 0.368623 0.144282 0.255122 0.231973 0.231438 0.167540 0.443911 0.157110 0.048139 0.713513 0.224736 0.013612 0.005943 0.982494 0.009265 0.002298 0.005729 0.990328 0.002017 0.001925 0.012634 0.982154 0.001044 0.004167 0.003906 0.974044 0.002213 0.019837 0.092161 0.786818 0.026401 0.094621 0.372382 0.157921 0.109317 0.360380 0.615307 0.152879 0.040223 0.191591 0.669723 0.112856 0.072817 0.144604 0.433088 0.064050 0.180057 0.322805 0.487027 0.216787 0.092562 0.203624 0.140487 0.242560 0.157093 0.459860 Consensus sequence: DDVCCCCCCHAAWHB Reverse complement motif 0.459860 0.242560 0.157093 0.140487 0.203624 0.216787 0.092562 0.487027 0.322805 0.064050 0.180057 0.433088 0.144604 0.112856 0.072817 0.669723 0.191591 0.152879 0.040223 0.615307 0.360380 0.157921 0.109317 0.372382 0.092161 0.026401 0.786818 0.094621 0.003906 0.002213 0.974044 0.019837 0.012634 0.001044 0.982154 0.004167 0.005729 0.002017 0.990328 0.001925 0.005943 0.009265 0.982494 0.002298 0.048139 0.224736 0.713513 0.013612 0.231438 0.443911 0.167540 0.157110 0.231973 0.144282 0.255122 0.368623 0.199406 0.168959 0.284689 0.346946 Consensus sequence: VHWTTHGGGGGGVDD Alignment: VHWTTHGGGGGGVDD --TGYCAGGGGGCR- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00079 Esrra_secondary Original Motif Original Motif Backward 6 12 0.008626 Species: Mus musculus Original motif 0.252126 0.268706 0.351590 0.127578 0.158171 0.083434 0.389646 0.368749 0.180010 0.290882 0.279192 0.249916 0.206905 0.249360 0.275438 0.268296 0.756588 0.046202 0.023921 0.173289 0.018262 0.022596 0.949143 0.010000 0.206468 0.046491 0.745475 0.001566 0.005511 0.001141 0.983152 0.010196 0.004791 0.001893 0.985951 0.007365 0.027643 0.001133 0.008565 0.962659 0.002459 0.970934 0.007826 0.018780 0.924387 0.003164 0.071225 0.001224 0.419387 0.230189 0.111588 0.238836 0.290954 0.163823 0.341233 0.203991 0.196768 0.281307 0.313868 0.208056 0.128428 0.260428 0.378607 0.232537 0.269305 0.378895 0.123480 0.228320 Consensus sequence: VKBBAGGGGTCAHDBBH Reverse complement motif 0.269305 0.123480 0.378895 0.228320 0.128428 0.378607 0.260428 0.232537 0.196768 0.313868 0.281307 0.208056 0.290954 0.341233 0.163823 0.203991 0.238836 0.230189 0.111588 0.419387 0.001224 0.003164 0.071225 0.924387 0.002459 0.007826 0.970934 0.018780 0.962659 0.001133 0.008565 0.027643 0.004791 0.985951 0.001893 0.007365 0.005511 0.983152 0.001141 0.010196 0.206468 0.745475 0.046491 0.001566 0.018262 0.949143 0.022596 0.010000 0.173289 0.046202 0.023921 0.756588 0.206905 0.275438 0.249360 0.268296 0.180010 0.279192 0.290882 0.249916 0.158171 0.389646 0.083434 0.368749 0.252126 0.351590 0.268706 0.127578 Consensus sequence: DBBHHTGACCCCTBBYV Alignment: VKBBAGGGGTCAHDBBH TGYCAGGGGGCR----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00024 Glis2_primary Original Motif Reverse Complement Forward 2 12 0.009363 Species: Mus musculus Original motif 0.135895 0.314811 0.129804 0.419490 0.379294 0.148356 0.125349 0.347001 0.331058 0.171563 0.156431 0.340948 0.238325 0.268940 0.259195 0.233540 0.014812 0.072844 0.774496 0.137848 0.826050 0.107559 0.058965 0.007426 0.013657 0.965452 0.008273 0.012618 0.011951 0.975704 0.007210 0.005135 0.015560 0.961676 0.004028 0.018736 0.010295 0.971668 0.003618 0.014418 0.087168 0.805495 0.002118 0.105220 0.098937 0.760880 0.010017 0.130166 0.492579 0.177017 0.171719 0.158685 0.160142 0.327745 0.192170 0.319943 0.484858 0.086830 0.273852 0.154461 0.266100 0.086868 0.363661 0.283371 Consensus sequence: HHHVGACCCCCCVBRD Reverse complement motif 0.266100 0.363661 0.086868 0.283371 0.154461 0.086830 0.273852 0.484858 0.160142 0.192170 0.327745 0.319943 0.158685 0.177017 0.171719 0.492579 0.098937 0.010017 0.760880 0.130166 0.087168 0.002118 0.805495 0.105220 0.010295 0.003618 0.971668 0.014418 0.015560 0.004028 0.961676 0.018736 0.011951 0.007210 0.975704 0.005135 0.013657 0.008273 0.965452 0.012618 0.007426 0.107559 0.058965 0.826050 0.014812 0.774496 0.072844 0.137848 0.238325 0.259195 0.268940 0.233540 0.340948 0.171563 0.156431 0.331058 0.347001 0.148356 0.125349 0.379294 0.419490 0.314811 0.129804 0.135895 Consensus sequence: HKBBGGGGGGTCVHHH Alignment: HKBBGGGGGGTCVHHH -TGYCAGGGGGCR--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00066 Hnf4a_primary Original Motif Original Motif Forward 1 12 0.012359 Species: Mus musculus Original motif 0.223704 0.280688 0.251889 0.243719 0.198683 0.190981 0.267970 0.342366 0.150012 0.319579 0.206063 0.324347 0.274896 0.302572 0.238597 0.183935 0.438853 0.331148 0.021186 0.208812 0.133937 0.027342 0.832490 0.006231 0.141462 0.002336 0.854359 0.001843 0.003464 0.000753 0.987433 0.008349 0.004388 0.000692 0.884494 0.110426 0.003808 0.001605 0.016793 0.977794 0.001992 0.976605 0.003739 0.017664 0.881237 0.089981 0.026017 0.002764 0.735041 0.106592 0.083260 0.075107 0.164419 0.315518 0.181031 0.339032 0.228285 0.176364 0.157583 0.437768 0.233407 0.193567 0.327076 0.245951 0.320479 0.312566 0.195701 0.171254 Consensus sequence: BDBVMGGGGTCAABHDV Reverse complement motif 0.171254 0.312566 0.195701 0.320479 0.233407 0.327076 0.193567 0.245951 0.437768 0.176364 0.157583 0.228285 0.339032 0.315518 0.181031 0.164419 0.075107 0.106592 0.083260 0.735041 0.002764 0.089981 0.026017 0.881237 0.001992 0.003739 0.976605 0.017664 0.977794 0.001605 0.016793 0.003808 0.004388 0.884494 0.000692 0.110426 0.003464 0.987433 0.000753 0.008349 0.141462 0.854359 0.002336 0.001843 0.133937 0.832490 0.027342 0.006231 0.208812 0.331148 0.021186 0.438853 0.274896 0.238597 0.302572 0.183935 0.324347 0.319579 0.206063 0.150012 0.342366 0.190981 0.267970 0.198683 0.223704 0.251889 0.280688 0.243719 Consensus sequence: BHHVTTGACCCCYVVDB Alignment: BDBVMGGGGTCAABHDV TGYCAGGGGGCR----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00007 Egr1_primary Reverse Complement Original Motif Forward 3 12 0.015517 Species: Mus musculus Original motif 0.211547 0.282708 0.203472 0.302273 0.141988 0.722437 0.054854 0.080721 0.032605 0.877172 0.012432 0.077792 0.115126 0.070606 0.781290 0.032979 0.003516 0.990021 0.002265 0.004198 0.004715 0.982482 0.009897 0.002906 0.001627 0.975937 0.001662 0.020774 0.262352 0.731732 0.002730 0.003187 0.005890 0.985756 0.002081 0.006273 0.022893 0.090460 0.649322 0.237324 0.023038 0.859949 0.037913 0.079101 0.567633 0.057394 0.166792 0.208181 0.176597 0.331265 0.125308 0.366830 0.183049 0.183774 0.226793 0.406384 Consensus sequence: HCCGCCCCCGCAHB Reverse complement motif 0.406384 0.183774 0.226793 0.183049 0.366830 0.331265 0.125308 0.176597 0.208181 0.057394 0.166792 0.567633 0.023038 0.037913 0.859949 0.079101 0.022893 0.649322 0.090460 0.237324 0.005890 0.002081 0.985756 0.006273 0.262352 0.002730 0.731732 0.003187 0.001627 0.001662 0.975937 0.020774 0.004715 0.009897 0.982482 0.002906 0.003516 0.002265 0.990021 0.004198 0.115126 0.781290 0.070606 0.032979 0.032605 0.012432 0.877172 0.077792 0.141988 0.054854 0.722437 0.080721 0.302273 0.282708 0.203472 0.211547 Consensus sequence: VHTGCGGGGGCGGH Alignment: HCCGCCCCCGCAHB --MGCCCCCTGMCA ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00022 Zfp740_primary Reverse Complement Original Motif Backward 2 12 0.017664 Species: Mus musculus Original motif 0.136946 0.396508 0.135309 0.331236 0.185528 0.417538 0.215409 0.181525 0.171276 0.341901 0.172832 0.313991 0.145641 0.590572 0.146376 0.117412 0.138035 0.660416 0.114016 0.087533 0.222728 0.750532 0.007528 0.019212 0.024633 0.963314 0.001894 0.010159 0.009557 0.979956 0.000642 0.009844 0.010416 0.977424 0.000541 0.011619 0.026401 0.956740 0.001544 0.015314 0.195502 0.755959 0.011060 0.037480 0.491291 0.364785 0.025613 0.118311 0.305153 0.398160 0.071680 0.225008 0.253497 0.232647 0.213246 0.300610 0.156964 0.297876 0.144683 0.400477 0.179549 0.292514 0.319462 0.208475 Consensus sequence: HVBCCCCCCCCMHHHB Reverse complement motif 0.179549 0.319462 0.292514 0.208475 0.400477 0.297876 0.144683 0.156964 0.300610 0.232647 0.213246 0.253497 0.305153 0.071680 0.398160 0.225008 0.118311 0.364785 0.025613 0.491291 0.195502 0.011060 0.755959 0.037480 0.026401 0.001544 0.956740 0.015314 0.010416 0.000541 0.977424 0.011619 0.009557 0.000642 0.979956 0.009844 0.024633 0.001894 0.963314 0.010159 0.222728 0.007528 0.750532 0.019212 0.138035 0.114016 0.660416 0.087533 0.145641 0.146376 0.590572 0.117412 0.171276 0.172832 0.341901 0.313991 0.185528 0.215409 0.417538 0.181525 0.136946 0.135309 0.396508 0.331236 Consensus sequence: BHHDYGGGGGGGGBVD Alignment: HVBCCCCCCCCMHHHB ---MGCCCCCTGMCA- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00043 Bcl6b_secondary Original Motif Reverse Complement Backward 5 12 0.018243 Species: Mus musculus Original motif 0.316572 0.278382 0.152556 0.252490 0.167141 0.257034 0.259894 0.315931 0.175523 0.325956 0.259996 0.238525 0.165052 0.385677 0.239449 0.209822 0.069489 0.782718 0.072454 0.075339 0.049943 0.800636 0.031988 0.117433 0.223382 0.060306 0.552691 0.163621 0.072944 0.818252 0.034406 0.074398 0.070535 0.845127 0.062712 0.021626 0.031035 0.859354 0.055424 0.054187 0.063668 0.798503 0.067274 0.070554 0.348488 0.030697 0.197179 0.423636 0.307220 0.256470 0.181009 0.255301 0.460933 0.285057 0.090258 0.163752 0.315798 0.228431 0.171135 0.284637 0.374527 0.268328 0.198810 0.158335 Consensus sequence: HBBBCCGCCCCWHHHV Reverse complement motif 0.158335 0.268328 0.198810 0.374527 0.284637 0.228431 0.171135 0.315798 0.163752 0.285057 0.090258 0.460933 0.255301 0.256470 0.181009 0.307220 0.423636 0.030697 0.197179 0.348488 0.063668 0.067274 0.798503 0.070554 0.031035 0.055424 0.859354 0.054187 0.070535 0.062712 0.845127 0.021626 0.072944 0.034406 0.818252 0.074398 0.223382 0.552691 0.060306 0.163621 0.049943 0.031988 0.800636 0.117433 0.069489 0.072454 0.782718 0.075339 0.165052 0.239449 0.385677 0.209822 0.175523 0.259996 0.325956 0.238525 0.315931 0.257034 0.259894 0.167141 0.252490 0.278382 0.152556 0.316572 Consensus sequence: BHHHWGGGGCGGBBVH Alignment: BHHHWGGGGCGGBBVH TGYCAGGGGGCR---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00070 Gcm1_secondary Reverse Complement Reverse Complement Forward 3 12 0.020059 Species: Mus musculus Original motif 0.298360 0.124865 0.240783 0.335992 0.184300 0.174617 0.373392 0.267691 0.150632 0.435099 0.254062 0.160207 0.212569 0.220347 0.370971 0.196113 0.258171 0.316689 0.186896 0.238243 0.872371 0.051703 0.070791 0.005135 0.011560 0.017672 0.009746 0.961022 0.888546 0.042964 0.061758 0.006732 0.071365 0.009982 0.801505 0.117148 0.010657 0.014961 0.949286 0.025096 0.004496 0.009941 0.978381 0.007182 0.005645 0.010294 0.972682 0.011378 0.499895 0.152322 0.335875 0.011908 0.109410 0.346384 0.380529 0.163677 0.371764 0.096182 0.457999 0.074056 0.450207 0.392208 0.065686 0.091898 0.104224 0.228467 0.391473 0.275836 Consensus sequence: DDBVHATAGGGGRBRMB Reverse complement motif 0.104224 0.391473 0.228467 0.275836 0.091898 0.392208 0.065686 0.450207 0.371764 0.457999 0.096182 0.074056 0.109410 0.380529 0.346384 0.163677 0.011908 0.152322 0.335875 0.499895 0.005645 0.972682 0.010294 0.011378 0.004496 0.978381 0.009941 0.007182 0.010657 0.949286 0.014961 0.025096 0.071365 0.801505 0.009982 0.117148 0.006732 0.042964 0.061758 0.888546 0.961022 0.017672 0.009746 0.011560 0.005135 0.051703 0.070791 0.872371 0.258171 0.186896 0.316689 0.238243 0.212569 0.370971 0.220347 0.196113 0.150632 0.254062 0.435099 0.160207 0.184300 0.373392 0.174617 0.267691 0.335992 0.124865 0.240783 0.298360 Consensus sequence: BYMBKCCCCTATDVBHD Alignment: BYMBKCCCCTATDVBHD --MGCCCCCTGMCA--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 36 Motif name: Klf4 Original motif 0.338561 0.018681 0.235701 0.407057 0.020276 0.002074 0.976267 0.001382 0.003223 0.002993 0.990792 0.002993 0.003221 0.008282 0.984817 0.003681 0.063693 0.441941 0.002529 0.491837 0.005064 0.003453 0.983656 0.007827 0.009671 0.018420 0.501727 0.470182 0.060872 0.010606 0.899700 0.028822 0.028400 0.030016 0.874856 0.066728 0.058742 0.660962 0.064755 0.215541 Consensus sequence: DGGGYGKGGC Reserve complement motif 0.058742 0.064755 0.660962 0.215541 0.028400 0.874856 0.030016 0.066728 0.060872 0.899700 0.010606 0.028822 0.009671 0.501727 0.018420 0.470182 0.005064 0.983656 0.003453 0.007827 0.491837 0.441941 0.002529 0.063693 0.003221 0.984817 0.008282 0.003681 0.003223 0.990792 0.002993 0.002993 0.020276 0.976267 0.002074 0.001382 0.407057 0.018681 0.235701 0.338561 Consensus sequence: GCCYCMCCCD ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 36 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00093 Klf7_primary Original Motif Reverse Complement Forward 4 10 0.000000 Species: Mus musculus Original motif 0.204514 0.198353 0.171218 0.425915 0.167188 0.296785 0.246082 0.289946 0.267330 0.148001 0.398674 0.185994 0.549386 0.060167 0.337100 0.053347 0.050746 0.900013 0.022169 0.027073 0.037905 0.920332 0.008360 0.033403 0.410356 0.566702 0.016267 0.006675 0.009526 0.982354 0.001060 0.007060 0.204292 0.001084 0.748567 0.046056 0.003955 0.988490 0.002821 0.004735 0.004264 0.988826 0.004311 0.002598 0.002758 0.929549 0.001244 0.066448 0.260332 0.421683 0.024720 0.293265 0.184798 0.247697 0.085237 0.482268 0.347537 0.197344 0.139961 0.315159 0.255281 0.166620 0.242297 0.335802 Consensus sequence: HBDRCCMCGCCCHHHD Reverse complement motif 0.335802 0.166620 0.242297 0.255281 0.315159 0.197344 0.139961 0.347537 0.482268 0.247697 0.085237 0.184798 0.260332 0.024720 0.421683 0.293265 0.002758 0.001244 0.929549 0.066448 0.004264 0.004311 0.988826 0.002598 0.003955 0.002821 0.988490 0.004735 0.204292 0.748567 0.001084 0.046056 0.009526 0.001060 0.982354 0.007060 0.410356 0.016267 0.566702 0.006675 0.037905 0.008360 0.920332 0.033403 0.050746 0.022169 0.900013 0.027073 0.053347 0.060167 0.337100 0.549386 0.267330 0.398674 0.148001 0.185994 0.167188 0.246082 0.296785 0.289946 0.425915 0.198353 0.171218 0.204514 Consensus sequence: DHHDGGGCGRGGKHBH Alignment: DHHDGGGCGRGGKHBH ---DGGGYGKGGC--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00021 Zfp281_primary Reverse Complement Original Motif Forward 4 10 0.015331 Species: Mus musculus Original motif 0.201535 0.165213 0.201324 0.431929 0.136153 0.443451 0.179132 0.241264 0.263149 0.555137 0.067983 0.113731 0.142183 0.737634 0.045722 0.074461 0.044982 0.884112 0.045356 0.025549 0.246434 0.590578 0.022655 0.140333 0.123049 0.591257 0.033072 0.252622 0.018153 0.944742 0.010254 0.026851 0.035459 0.953844 0.003988 0.006709 0.020000 0.954344 0.005966 0.019690 0.015299 0.964390 0.006755 0.013557 0.028565 0.936152 0.011660 0.023623 0.300127 0.517309 0.029700 0.152863 0.159063 0.513443 0.051834 0.275660 0.158172 0.647055 0.133256 0.061516 Consensus sequence: DBCCCCCCCCCCMYC Reverse complement motif 0.158172 0.133256 0.647055 0.061516 0.159063 0.051834 0.513443 0.275660 0.300127 0.029700 0.517309 0.152863 0.028565 0.011660 0.936152 0.023623 0.015299 0.006755 0.964390 0.013557 0.020000 0.005966 0.954344 0.019690 0.035459 0.003988 0.953844 0.006709 0.018153 0.010254 0.944742 0.026851 0.123049 0.033072 0.591257 0.252622 0.246434 0.022655 0.590578 0.140333 0.044982 0.045356 0.884112 0.025549 0.142183 0.045722 0.737634 0.074461 0.263149 0.067983 0.555137 0.113731 0.136153 0.179132 0.443451 0.241264 0.431929 0.165213 0.201324 0.201535 Consensus sequence: GKRGGGGGGGGGGBD Alignment: DBCCCCCCCCCCMYC ---GCCYCMCCCD-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00002 Sp4_secondary Original Motif Original Motif Forward 3 10 0.018679 Species: Mus musculus Original motif 0.146334 0.312326 0.244281 0.297060 0.493155 0.092609 0.162506 0.251729 0.503593 0.059863 0.077561 0.358984 0.763321 0.015264 0.213114 0.008301 0.012415 0.025932 0.945502 0.016151 0.006713 0.015221 0.950098 0.027968 0.062415 0.834303 0.054500 0.048782 0.011010 0.020677 0.928821 0.039493 0.012785 0.024162 0.145822 0.817231 0.133595 0.033962 0.787876 0.044567 0.140697 0.180481 0.428253 0.250570 0.036281 0.806412 0.033510 0.123797 0.157910 0.408607 0.122427 0.311055 0.292185 0.260017 0.197515 0.250283 0.251107 0.124480 0.359447 0.264967 Consensus sequence: BDWAGGCGTGBCHHD Reverse complement motif 0.251107 0.359447 0.124480 0.264967 0.250283 0.260017 0.197515 0.292185 0.157910 0.122427 0.408607 0.311055 0.036281 0.033510 0.806412 0.123797 0.140697 0.428253 0.180481 0.250570 0.133595 0.787876 0.033962 0.044567 0.817231 0.024162 0.145822 0.012785 0.011010 0.928821 0.020677 0.039493 0.062415 0.054500 0.834303 0.048782 0.006713 0.950098 0.015221 0.027968 0.012415 0.945502 0.025932 0.016151 0.008301 0.015264 0.213114 0.763321 0.358984 0.059863 0.077561 0.503593 0.251729 0.092609 0.162506 0.493155 0.146334 0.244281 0.312326 0.297060 Consensus sequence: HHDGBCACGCCTWDB Alignment: BDWAGGCGTGBCHHD --DGGGYGKGGC--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00022 Zfp740_primary Reverse Complement Original Motif Forward 3 10 0.021840 Species: Mus musculus Original motif 0.136946 0.396508 0.135309 0.331236 0.185528 0.417538 0.215409 0.181525 0.171276 0.341901 0.172832 0.313991 0.145641 0.590572 0.146376 0.117412 0.138035 0.660416 0.114016 0.087533 0.222728 0.750532 0.007528 0.019212 0.024633 0.963314 0.001894 0.010159 0.009557 0.979956 0.000642 0.009844 0.010416 0.977424 0.000541 0.011619 0.026401 0.956740 0.001544 0.015314 0.195502 0.755959 0.011060 0.037480 0.491291 0.364785 0.025613 0.118311 0.305153 0.398160 0.071680 0.225008 0.253497 0.232647 0.213246 0.300610 0.156964 0.297876 0.144683 0.400477 0.179549 0.292514 0.319462 0.208475 Consensus sequence: HVBCCCCCCCCMHHHB Reverse complement motif 0.179549 0.319462 0.292514 0.208475 0.400477 0.297876 0.144683 0.156964 0.300610 0.232647 0.213246 0.253497 0.305153 0.071680 0.398160 0.225008 0.118311 0.364785 0.025613 0.491291 0.195502 0.011060 0.755959 0.037480 0.026401 0.001544 0.956740 0.015314 0.010416 0.000541 0.977424 0.011619 0.009557 0.000642 0.979956 0.009844 0.024633 0.001894 0.963314 0.010159 0.222728 0.007528 0.750532 0.019212 0.138035 0.114016 0.660416 0.087533 0.145641 0.146376 0.590572 0.117412 0.171276 0.172832 0.341901 0.313991 0.185528 0.215409 0.417538 0.181525 0.136946 0.135309 0.396508 0.331236 Consensus sequence: BHHDYGGGGGGGGBVD Alignment: HVBCCCCCCCCMHHHB --GCCYCMCCCD---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00007 Egr1_primary Reverse Complement Original Motif Backward 5 10 0.024959 Species: Mus musculus Original motif 0.211547 0.282708 0.203472 0.302273 0.141988 0.722437 0.054854 0.080721 0.032605 0.877172 0.012432 0.077792 0.115126 0.070606 0.781290 0.032979 0.003516 0.990021 0.002265 0.004198 0.004715 0.982482 0.009897 0.002906 0.001627 0.975937 0.001662 0.020774 0.262352 0.731732 0.002730 0.003187 0.005890 0.985756 0.002081 0.006273 0.022893 0.090460 0.649322 0.237324 0.023038 0.859949 0.037913 0.079101 0.567633 0.057394 0.166792 0.208181 0.176597 0.331265 0.125308 0.366830 0.183049 0.183774 0.226793 0.406384 Consensus sequence: HCCGCCCCCGCAHB Reverse complement motif 0.406384 0.183774 0.226793 0.183049 0.366830 0.331265 0.125308 0.176597 0.208181 0.057394 0.166792 0.567633 0.023038 0.037913 0.859949 0.079101 0.022893 0.649322 0.090460 0.237324 0.005890 0.002081 0.985756 0.006273 0.262352 0.002730 0.731732 0.003187 0.001627 0.001662 0.975937 0.020774 0.004715 0.009897 0.982482 0.002906 0.003516 0.002265 0.990021 0.004198 0.115126 0.781290 0.070606 0.032979 0.032605 0.012432 0.877172 0.077792 0.141988 0.054854 0.722437 0.080721 0.302273 0.282708 0.203472 0.211547 Consensus sequence: VHTGCGGGGGCGGH Alignment: HCCGCCCCCGCAHB GCCYCMCCCD---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00002 Sp4_primary Original Motif Reverse Complement Forward 7 10 0.029916 Species: Mus musculus Original motif 0.155386 0.223380 0.374454 0.246780 0.247106 0.159582 0.345111 0.248201 0.238889 0.258354 0.165304 0.337454 0.255612 0.489586 0.051621 0.203182 0.450100 0.545383 0.001071 0.003447 0.003704 0.991007 0.002456 0.002833 0.035504 0.001814 0.928129 0.034553 0.001494 0.991406 0.003414 0.003686 0.003045 0.990628 0.005182 0.001145 0.000990 0.963237 0.001215 0.034557 0.148016 0.838396 0.000666 0.012922 0.014261 0.905847 0.007200 0.072692 0.083394 0.270068 0.058368 0.588170 0.149141 0.286783 0.142802 0.421274 0.204851 0.347195 0.253356 0.194597 0.184442 0.299908 0.194408 0.321242 0.125793 0.380109 0.245318 0.248780 Consensus sequence: BDHHMCGCCCCCTHVBB Reverse complement motif 0.125793 0.245318 0.380109 0.248780 0.321242 0.299908 0.194408 0.184442 0.204851 0.253356 0.347195 0.194597 0.421274 0.286783 0.142802 0.149141 0.588170 0.270068 0.058368 0.083394 0.014261 0.007200 0.905847 0.072692 0.148016 0.000666 0.838396 0.012922 0.000990 0.001215 0.963237 0.034557 0.003045 0.005182 0.990628 0.001145 0.001494 0.003414 0.991406 0.003686 0.035504 0.928129 0.001814 0.034553 0.003704 0.002456 0.991007 0.002833 0.450100 0.001071 0.545383 0.003447 0.255612 0.051621 0.489586 0.203182 0.337454 0.258354 0.165304 0.238889 0.247106 0.345111 0.159582 0.248201 0.155386 0.374454 0.223380 0.246780 Consensus sequence: BVVHAGGGGGCGRDHHB Alignment: BVVHAGGGGGCGRDHHB ------DGGGYGKGGC- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00000 Smad3_secondary Original Motif Reverse Complement Forward 5 10 0.030859 Species: Mus musculus Original motif 0.150668 0.131779 0.245665 0.471887 0.316817 0.287314 0.150829 0.245040 0.256473 0.409066 0.109700 0.224761 0.210646 0.220222 0.345010 0.224122 0.166679 0.508939 0.081676 0.242705 0.049351 0.759380 0.088489 0.102780 0.047598 0.785546 0.121957 0.044898 0.004606 0.944933 0.034696 0.015764 0.040252 0.050652 0.890382 0.018713 0.003038 0.913699 0.022449 0.060814 0.028672 0.941477 0.012276 0.017575 0.635243 0.139731 0.110495 0.114531 0.240016 0.385948 0.182848 0.191188 0.210430 0.274127 0.085171 0.430272 0.088118 0.454598 0.208989 0.248295 0.181269 0.265028 0.149023 0.404680 0.101070 0.252682 0.368542 0.277706 Consensus sequence: DHHBCCCCGCCAHHBHB Reverse complement motif 0.101070 0.368542 0.252682 0.277706 0.404680 0.265028 0.149023 0.181269 0.088118 0.208989 0.454598 0.248295 0.430272 0.274127 0.085171 0.210430 0.240016 0.182848 0.385948 0.191188 0.114531 0.139731 0.110495 0.635243 0.028672 0.012276 0.941477 0.017575 0.003038 0.022449 0.913699 0.060814 0.040252 0.890382 0.050652 0.018713 0.004606 0.034696 0.944933 0.015764 0.047598 0.121957 0.785546 0.044898 0.049351 0.088489 0.759380 0.102780 0.166679 0.081676 0.508939 0.242705 0.210646 0.345010 0.220222 0.224122 0.256473 0.109700 0.409066 0.224761 0.245040 0.287314 0.150829 0.316817 0.471887 0.131779 0.245665 0.150668 Consensus sequence: BHBHDTGGCGGGGBDHD Alignment: BHBHDTGGCGGGGBDHD ----DGGGYGKGGC--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00047 Zbtb7b_primary Reverse Complement Original Motif Forward 1 10 0.034589 Species: Mus musculus Original motif 0.346946 0.168959 0.284689 0.199406 0.368623 0.144282 0.255122 0.231973 0.231438 0.167540 0.443911 0.157110 0.048139 0.713513 0.224736 0.013612 0.005943 0.982494 0.009265 0.002298 0.005729 0.990328 0.002017 0.001925 0.012634 0.982154 0.001044 0.004167 0.003906 0.974044 0.002213 0.019837 0.092161 0.786818 0.026401 0.094621 0.372382 0.157921 0.109317 0.360380 0.615307 0.152879 0.040223 0.191591 0.669723 0.112856 0.072817 0.144604 0.433088 0.064050 0.180057 0.322805 0.487027 0.216787 0.092562 0.203624 0.140487 0.242560 0.157093 0.459860 Consensus sequence: DDVCCCCCCHAAWHB Reverse complement motif 0.459860 0.242560 0.157093 0.140487 0.203624 0.216787 0.092562 0.487027 0.322805 0.064050 0.180057 0.433088 0.144604 0.112856 0.072817 0.669723 0.191591 0.152879 0.040223 0.615307 0.360380 0.157921 0.109317 0.372382 0.092161 0.026401 0.786818 0.094621 0.003906 0.002213 0.974044 0.019837 0.012634 0.001044 0.982154 0.004167 0.005729 0.002017 0.990328 0.001925 0.005943 0.009265 0.982494 0.002298 0.048139 0.224736 0.713513 0.013612 0.231438 0.443911 0.167540 0.157110 0.231973 0.144282 0.255122 0.368623 0.199406 0.168959 0.284689 0.346946 Consensus sequence: VHWTTHGGGGGGVDD Alignment: VHWTTHGGGGGGVDD GCCYCMCCCD----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00043 Bcl6b_secondary Reverse Complement Original Motif Forward 3 10 0.034674 Species: Mus musculus Original motif 0.316572 0.278382 0.152556 0.252490 0.167141 0.257034 0.259894 0.315931 0.175523 0.325956 0.259996 0.238525 0.165052 0.385677 0.239449 0.209822 0.069489 0.782718 0.072454 0.075339 0.049943 0.800636 0.031988 0.117433 0.223382 0.060306 0.552691 0.163621 0.072944 0.818252 0.034406 0.074398 0.070535 0.845127 0.062712 0.021626 0.031035 0.859354 0.055424 0.054187 0.063668 0.798503 0.067274 0.070554 0.348488 0.030697 0.197179 0.423636 0.307220 0.256470 0.181009 0.255301 0.460933 0.285057 0.090258 0.163752 0.315798 0.228431 0.171135 0.284637 0.374527 0.268328 0.198810 0.158335 Consensus sequence: HBBBCCGCCCCWHHHV Reverse complement motif 0.158335 0.268328 0.198810 0.374527 0.284637 0.228431 0.171135 0.315798 0.163752 0.285057 0.090258 0.460933 0.255301 0.256470 0.181009 0.307220 0.423636 0.030697 0.197179 0.348488 0.063668 0.067274 0.798503 0.070554 0.031035 0.055424 0.859354 0.054187 0.070535 0.062712 0.845127 0.021626 0.072944 0.034406 0.818252 0.074398 0.223382 0.552691 0.060306 0.163621 0.049943 0.031988 0.800636 0.117433 0.069489 0.072454 0.782718 0.075339 0.165052 0.239449 0.385677 0.209822 0.175523 0.259996 0.325956 0.238525 0.315931 0.257034 0.259894 0.167141 0.252490 0.278382 0.152556 0.316572 Consensus sequence: BHHHWGGGGCGGBBVH Alignment: HBBBCCGCCCCWHHHV --GCCYCMCCCD---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 8 10 0.035150 Species: Mus musculus Original motif 0.404007 0.395873 0.173319 0.026801 0.305977 0.215534 0.215359 0.263130 0.370148 0.250957 0.113088 0.265808 0.324336 0.229498 0.174679 0.271487 0.263563 0.137896 0.079217 0.519324 0.265762 0.222582 0.082555 0.429102 0.206721 0.288405 0.017851 0.487023 0.164361 0.236500 0.061051 0.538088 0.593344 0.348446 0.050304 0.007906 0.031328 0.947050 0.007032 0.014590 0.010428 0.956605 0.029142 0.003825 0.459636 0.207616 0.155368 0.177380 0.014573 0.964608 0.012209 0.008610 0.066291 0.918196 0.008729 0.006784 0.019488 0.866774 0.018897 0.094841 0.767405 0.104198 0.029234 0.099164 0.052494 0.772531 0.039832 0.135142 0.296085 0.243498 0.350935 0.109482 0.518843 0.226659 0.124784 0.129714 0.647901 0.019721 0.159901 0.172477 0.113912 0.231511 0.214864 0.439713 0.223117 0.310596 0.293328 0.172959 0.185557 0.487662 0.136321 0.190459 Consensus sequence: MHHHWHYTMCCHCCCACVAABVH Reverse complement motif 0.185557 0.136321 0.487662 0.190459 0.223117 0.293328 0.310596 0.172959 0.439713 0.231511 0.214864 0.113912 0.172477 0.019721 0.159901 0.647901 0.129714 0.226659 0.124784 0.518843 0.296085 0.350935 0.243498 0.109482 0.052494 0.039832 0.772531 0.135142 0.099164 0.104198 0.029234 0.767405 0.019488 0.018897 0.866774 0.094841 0.066291 0.008729 0.918196 0.006784 0.014573 0.012209 0.964608 0.008610 0.177380 0.207616 0.155368 0.459636 0.010428 0.029142 0.956605 0.003825 0.031328 0.007032 0.947050 0.014590 0.007906 0.348446 0.050304 0.593344 0.538088 0.236500 0.061051 0.164361 0.487023 0.288405 0.017851 0.206721 0.429102 0.222582 0.082555 0.265762 0.519324 0.137896 0.079217 0.263563 0.271487 0.229498 0.174679 0.324336 0.265808 0.250957 0.113088 0.370148 0.263130 0.215534 0.215359 0.305977 0.026801 0.395873 0.173319 0.404007 Consensus sequence: DVVTTVGTGGGHGGYAMHWHHHY Alignment: MHHHWHYTMCCHCCCACVAABVH ------GCCYCMCCCD------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 37 Motif name: MIZF Original motif 0.100000 0.300000 0.250000 0.350000 0.650000 0.050000 0.000000 0.300000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.100000 0.850000 0.050000 0.000000 0.000000 0.000000 0.950000 0.050000 0.000000 0.050000 0.000000 0.950000 0.000000 0.950000 0.000000 0.050000 0.000000 0.900000 0.100000 0.000000 0.000000 0.000000 0.950000 0.050000 0.100000 0.650000 0.050000 0.200000 Consensus sequence: BAACGTCCGC Reserve complement motif 0.100000 0.050000 0.650000 0.200000 0.000000 0.950000 0.000000 0.050000 0.000000 0.100000 0.900000 0.000000 0.000000 0.000000 0.950000 0.050000 0.950000 0.050000 0.000000 0.000000 0.000000 0.950000 0.000000 0.050000 0.100000 0.050000 0.850000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.300000 0.050000 0.000000 0.650000 0.350000 0.300000 0.250000 0.100000 Consensus sequence: GCGGACGTTV ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 37 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00419 Spic Original Motif Reverse Complement Forward 1 10 0.000000 Species: Mus musculus Original motif 0.372554 0.181557 0.296001 0.149888 0.734552 0.057250 0.044752 0.163446 0.707604 0.045049 0.110341 0.137006 0.637848 0.057252 0.071934 0.232966 0.125449 0.108933 0.689441 0.076176 0.266215 0.517339 0.207018 0.009428 0.015016 0.002582 0.979670 0.002732 0.004303 0.002322 0.989973 0.003401 0.982327 0.003552 0.003393 0.010727 0.974155 0.001662 0.003294 0.020889 0.040023 0.128522 0.821560 0.009894 0.027635 0.045828 0.016297 0.910239 0.317500 0.045635 0.172234 0.464631 0.342838 0.107812 0.284775 0.264576 Consensus sequence: VAAAGMGGAAGTWD Reverse complement motif 0.264576 0.107812 0.284775 0.342838 0.464631 0.045635 0.172234 0.317500 0.910239 0.045828 0.016297 0.027635 0.040023 0.821560 0.128522 0.009894 0.020889 0.001662 0.003294 0.974155 0.010727 0.003552 0.003393 0.982327 0.004303 0.989973 0.002322 0.003401 0.015016 0.979670 0.002582 0.002732 0.266215 0.207018 0.517339 0.009428 0.125449 0.689441 0.108933 0.076176 0.232966 0.057252 0.071934 0.637848 0.137006 0.045049 0.110341 0.707604 0.163446 0.057250 0.044752 0.734552 0.149888 0.181557 0.296001 0.372554 Consensus sequence: DWACTTCCRCTTTB Alignment: DWACTTCCRCTTTB BAACGTCCGC---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00409 Elf5 Original Motif Reverse Complement Forward 1 10 0.003800 Species: Mus musculus Original motif 0.179167 0.229135 0.279326 0.312372 0.421239 0.102900 0.145609 0.330252 0.791978 0.009721 0.028951 0.169350 0.237609 0.375543 0.161526 0.225321 0.145845 0.325411 0.516045 0.012699 0.431007 0.516333 0.051679 0.000982 0.005750 0.001408 0.990928 0.001915 0.002025 0.001886 0.992021 0.004068 0.986405 0.001705 0.001039 0.010851 0.950652 0.003619 0.000482 0.045248 0.165221 0.013897 0.819076 0.001805 0.032042 0.049374 0.014632 0.903953 0.285325 0.108010 0.127373 0.479292 0.366131 0.141246 0.290661 0.201963 Consensus sequence: BWAHSMGGAAGTWD Reverse complement motif 0.201963 0.141246 0.290661 0.366131 0.479292 0.108010 0.127373 0.285325 0.903953 0.049374 0.014632 0.032042 0.165221 0.819076 0.013897 0.001805 0.045248 0.003619 0.000482 0.950652 0.010851 0.001705 0.001039 0.986405 0.002025 0.992021 0.001886 0.004068 0.005750 0.990928 0.001408 0.001915 0.431007 0.051679 0.516333 0.000982 0.145845 0.516045 0.325411 0.012699 0.237609 0.161526 0.375543 0.225321 0.169350 0.009721 0.028951 0.791978 0.330252 0.102900 0.145609 0.421239 0.312372 0.229135 0.279326 0.179167 Consensus sequence: DWACTTCCRSDTWV Alignment: DWACTTCCRSDTWV BAACGTCCGC---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00413 Elf4 Original Motif Original Motif Backward 5 10 0.012410 Species: Mus musculus Original motif 0.349744 0.139466 0.209326 0.301464 0.080478 0.359482 0.307083 0.252956 0.145756 0.213763 0.350557 0.289924 0.317307 0.199359 0.096089 0.387245 0.868576 0.009724 0.088821 0.032878 0.001975 0.827004 0.014159 0.156862 0.045494 0.000985 0.001907 0.951615 0.011012 0.001203 0.002186 0.985599 0.002743 0.992908 0.002226 0.002123 0.001498 0.990840 0.001556 0.006106 0.000951 0.005138 0.880591 0.113319 0.003127 0.107962 0.867980 0.020930 0.156602 0.055355 0.396563 0.391480 0.421246 0.049379 0.084495 0.444880 0.223879 0.068063 0.203809 0.504249 0.144100 0.323579 0.131544 0.400777 Consensus sequence: DBBHACTTCCGGKWTH Reverse complement motif 0.400777 0.323579 0.131544 0.144100 0.504249 0.068063 0.203809 0.223879 0.444880 0.049379 0.084495 0.421246 0.156602 0.396563 0.055355 0.391480 0.003127 0.867980 0.107962 0.020930 0.000951 0.880591 0.005138 0.113319 0.001498 0.001556 0.990840 0.006106 0.002743 0.002226 0.992908 0.002123 0.985599 0.001203 0.002186 0.011012 0.951615 0.000985 0.001907 0.045494 0.001975 0.014159 0.827004 0.156862 0.032878 0.009724 0.088821 0.868576 0.387245 0.199359 0.096089 0.317307 0.145756 0.350557 0.213763 0.289924 0.080478 0.307083 0.359482 0.252956 0.301464 0.139466 0.209326 0.349744 Consensus sequence: HAWYCCGGAAGTHBBD Alignment: DBBHACTTCCGGKWTH --BAACGTCCGC---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00404 Elf2 Original Motif Original Motif Forward 3 10 0.012835 Species: Mus musculus Original motif 0.381592 0.198656 0.201326 0.218426 0.091509 0.331644 0.302830 0.274017 0.165404 0.272650 0.352528 0.209418 0.322145 0.255685 0.129399 0.292771 0.853490 0.012857 0.078563 0.055090 0.002655 0.792907 0.026436 0.178002 0.058923 0.001063 0.002976 0.937038 0.014944 0.001369 0.002865 0.980822 0.003786 0.992305 0.002102 0.001807 0.001365 0.988969 0.001554 0.008111 0.001527 0.009592 0.891056 0.097824 0.003671 0.143708 0.836117 0.016503 0.242982 0.061527 0.305342 0.390148 0.426709 0.117673 0.096260 0.359357 0.202520 0.113885 0.262005 0.421589 0.137957 0.359367 0.163919 0.338758 Consensus sequence: DBBHACTTCCGGDWDB Reverse complement motif 0.137957 0.163919 0.359367 0.338758 0.421589 0.113885 0.262005 0.202520 0.359357 0.117673 0.096260 0.426709 0.390148 0.061527 0.305342 0.242982 0.003671 0.836117 0.143708 0.016503 0.001527 0.891056 0.009592 0.097824 0.001365 0.001554 0.988969 0.008111 0.003786 0.002102 0.992305 0.001807 0.980822 0.001369 0.002865 0.014944 0.937038 0.001063 0.002976 0.058923 0.002655 0.026436 0.792907 0.178002 0.055090 0.012857 0.078563 0.853490 0.292771 0.255685 0.129399 0.322145 0.165404 0.352528 0.272650 0.209418 0.091509 0.302830 0.331644 0.274017 0.218426 0.198656 0.201326 0.381592 Consensus sequence: BDWDCCGGAAGTHBBD Alignment: DBBHACTTCCGGDWDB --BAACGTCCGC---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00085 Sfpi1_primary Original Motif Reverse Complement Forward 1 10 0.014152 Species: Mus musculus Original motif 0.211586 0.273653 0.234763 0.279998 0.298032 0.104818 0.290385 0.306764 0.593467 0.048056 0.154602 0.203875 0.459746 0.052697 0.169949 0.317608 0.188623 0.155357 0.591543 0.064477 0.402746 0.286227 0.290285 0.020742 0.048569 0.001240 0.946397 0.003793 0.004354 0.001387 0.990819 0.003441 0.974272 0.001416 0.001466 0.022847 0.938748 0.003090 0.000833 0.057329 0.045831 0.270321 0.674644 0.009204 0.055664 0.092552 0.026061 0.825722 0.301235 0.122653 0.267039 0.309073 0.278680 0.276099 0.219159 0.226061 Consensus sequence: BDAWGVGGAAGTDH Reverse complement motif 0.226061 0.276099 0.219159 0.278680 0.309073 0.122653 0.267039 0.301235 0.825722 0.092552 0.026061 0.055664 0.045831 0.674644 0.270321 0.009204 0.057329 0.003090 0.000833 0.938748 0.022847 0.001416 0.001466 0.974272 0.004354 0.990819 0.001387 0.003441 0.048569 0.946397 0.001240 0.003793 0.020742 0.286227 0.290285 0.402746 0.188623 0.591543 0.155357 0.064477 0.317608 0.052697 0.169949 0.459746 0.203875 0.048056 0.154602 0.593467 0.306764 0.104818 0.290385 0.298032 0.279998 0.273653 0.234763 0.211586 Consensus sequence: HDACTTCCBCWTDV Alignment: HDACTTCCBCWTDV BAACGTCCGC---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00423 Gm5454 Reverse Complement Reverse Complement Backward 3 10 0.014467 Species: Mus musculus Original motif 0.189373 0.396200 0.238705 0.175722 0.271321 0.176458 0.265627 0.286594 0.266229 0.324575 0.201073 0.208123 0.468162 0.220280 0.143160 0.168399 0.828556 0.009006 0.155963 0.006475 0.000965 0.820477 0.022769 0.155789 0.259255 0.001186 0.002221 0.737339 0.006364 0.001548 0.002346 0.989741 0.002267 0.993010 0.002221 0.002502 0.002365 0.993176 0.001987 0.002473 0.000528 0.001790 0.953300 0.044382 0.002238 0.032836 0.958384 0.006542 0.230236 0.143256 0.029199 0.597309 0.285226 0.282789 0.207699 0.224286 0.271642 0.251065 0.289590 0.187703 0.219881 0.390525 0.157704 0.231890 Consensus sequence: VDHHACTTCCGGTHVH Reverse complement motif 0.219881 0.157704 0.390525 0.231890 0.271642 0.289590 0.251065 0.187703 0.224286 0.282789 0.207699 0.285226 0.597309 0.143256 0.029199 0.230236 0.002238 0.958384 0.032836 0.006542 0.000528 0.953300 0.001790 0.044382 0.002365 0.001987 0.993176 0.002473 0.002267 0.002221 0.993010 0.002502 0.989741 0.001548 0.002346 0.006364 0.737339 0.001186 0.002221 0.259255 0.000965 0.022769 0.820477 0.155789 0.006475 0.009006 0.155963 0.828556 0.168399 0.220280 0.143160 0.468162 0.266229 0.201073 0.324575 0.208123 0.286594 0.176458 0.265627 0.271321 0.189373 0.238705 0.396200 0.175722 Consensus sequence: DVHACCGGAAGTHDDV Alignment: DVHACCGGAAGTHDDV ----GCGGACGTTV-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00412 Etv5 Reverse Complement Reverse Complement Backward 3 10 0.015583 Species: Mus musculus Original motif 0.163863 0.478739 0.234818 0.122579 0.298203 0.128058 0.250907 0.322832 0.304907 0.352627 0.141386 0.201081 0.505689 0.209260 0.108917 0.176133 0.755659 0.019470 0.214957 0.009914 0.001392 0.808267 0.034638 0.155703 0.341720 0.002244 0.003969 0.652068 0.011512 0.000955 0.002369 0.985163 0.003522 0.992404 0.002813 0.001261 0.002303 0.993216 0.002157 0.002324 0.000502 0.002139 0.938005 0.059354 0.004246 0.041666 0.947484 0.006604 0.177758 0.143265 0.023436 0.655542 0.278473 0.235398 0.218872 0.267257 0.225212 0.275898 0.211908 0.286982 0.193184 0.385135 0.190634 0.231048 Consensus sequence: VDHAACWTCCGGTHHH Reverse complement motif 0.193184 0.190634 0.385135 0.231048 0.286982 0.275898 0.211908 0.225212 0.267257 0.235398 0.218872 0.278473 0.655542 0.143265 0.023436 0.177758 0.004246 0.947484 0.041666 0.006604 0.000502 0.938005 0.002139 0.059354 0.002303 0.002157 0.993216 0.002324 0.003522 0.002813 0.992404 0.001261 0.985163 0.000955 0.002369 0.011512 0.652068 0.002244 0.003969 0.341720 0.001392 0.034638 0.808267 0.155703 0.009914 0.019470 0.214957 0.755659 0.176133 0.209260 0.108917 0.505689 0.304907 0.141386 0.352627 0.201081 0.322832 0.128058 0.250907 0.298203 0.163863 0.234818 0.478739 0.122579 Consensus sequence: DHHACCGGAWGTTDDV Alignment: DHHACCGGAWGTTDDV ----GCGGACGTTV-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00015 Ehf_primary Reverse Complement Original Motif Forward 6 10 0.016202 Species: Mus musculus Original motif 0.327238 0.304037 0.232174 0.136551 0.198306 0.222758 0.316421 0.262515 0.252373 0.217079 0.267210 0.263337 0.633781 0.039800 0.036914 0.289504 0.160405 0.384709 0.220671 0.234215 0.134205 0.590541 0.266074 0.009179 0.210933 0.755978 0.030378 0.002710 0.011856 0.001472 0.984138 0.002533 0.003235 0.001605 0.989465 0.005695 0.984189 0.002418 0.002842 0.010551 0.884492 0.002651 0.002095 0.110762 0.249047 0.054607 0.690939 0.005407 0.124602 0.154669 0.047597 0.673132 0.375217 0.110561 0.230374 0.283848 0.402951 0.186789 0.219551 0.190710 Consensus sequence: VBDABCCGGAAGTDD Reverse complement motif 0.190710 0.186789 0.219551 0.402951 0.283848 0.110561 0.230374 0.375217 0.673132 0.154669 0.047597 0.124602 0.249047 0.690939 0.054607 0.005407 0.110762 0.002651 0.002095 0.884492 0.010551 0.002418 0.002842 0.984189 0.003235 0.989465 0.001605 0.005695 0.011856 0.984138 0.001472 0.002533 0.210933 0.030378 0.755978 0.002710 0.134205 0.266074 0.590541 0.009179 0.160405 0.220671 0.384709 0.234215 0.289504 0.039800 0.036914 0.633781 0.252373 0.267210 0.217079 0.263337 0.198306 0.316421 0.222758 0.262515 0.136551 0.304037 0.232174 0.327238 Consensus sequence: DDACTTCCGGBTHBB Alignment: VBDABCCGGAAGTDD -----GCGGACGTTV ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00418 Etv6 Original Motif Original Motif Forward 4 10 0.017123 Species: Mus musculus Original motif 0.354972 0.069107 0.299350 0.276571 0.209701 0.408003 0.227382 0.154914 0.284336 0.375266 0.162604 0.177794 0.176569 0.181438 0.342172 0.299820 0.106551 0.204378 0.060299 0.628772 0.884088 0.003252 0.103113 0.009546 0.001110 0.704391 0.006294 0.288205 0.014992 0.000892 0.001401 0.982714 0.004842 0.001887 0.002470 0.990801 0.002724 0.992864 0.002206 0.002206 0.001792 0.991200 0.001615 0.005393 0.005151 0.010157 0.940259 0.044433 0.017780 0.199839 0.761921 0.020459 0.230834 0.269936 0.119652 0.379577 0.233019 0.093692 0.034743 0.638546 0.194739 0.181763 0.175340 0.448159 0.145452 0.293709 0.335917 0.224922 Consensus sequence: DVHBTACTTCCGGHTHB Reverse complement motif 0.145452 0.335917 0.293709 0.224922 0.448159 0.181763 0.175340 0.194739 0.638546 0.093692 0.034743 0.233019 0.379577 0.269936 0.119652 0.230834 0.017780 0.761921 0.199839 0.020459 0.005151 0.940259 0.010157 0.044433 0.001792 0.001615 0.991200 0.005393 0.002724 0.002206 0.992864 0.002206 0.990801 0.001887 0.002470 0.004842 0.982714 0.000892 0.001401 0.014992 0.001110 0.006294 0.704391 0.288205 0.009546 0.003252 0.103113 0.884088 0.628772 0.204378 0.060299 0.106551 0.176569 0.342172 0.181438 0.299820 0.284336 0.162604 0.375266 0.177794 0.209701 0.227382 0.408003 0.154914 0.276571 0.069107 0.299350 0.354972 Consensus sequence: BHAHCCGGAAGTABDVD Alignment: DVHBTACTTCCGGHTHB ---BAACGTCCGC---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00421 Etv1 Reverse Complement Original Motif Forward 6 10 0.018415 Species: Mus musculus Original motif 0.481848 0.274378 0.165047 0.078727 0.153123 0.322109 0.385794 0.138974 0.257711 0.198309 0.118559 0.425422 0.102329 0.255032 0.373097 0.269542 0.655995 0.027594 0.168796 0.147615 0.012836 0.906067 0.077134 0.003962 0.079806 0.917232 0.002438 0.000524 0.005217 0.001765 0.991859 0.001159 0.001691 0.002097 0.993588 0.002624 0.991087 0.001016 0.001937 0.005961 0.751484 0.005147 0.002324 0.241044 0.112494 0.076460 0.805095 0.005951 0.012019 0.198497 0.022413 0.767071 0.482843 0.140306 0.249898 0.126953 0.298792 0.191769 0.286874 0.222565 0.395216 0.302575 0.172247 0.129961 0.364642 0.219734 0.190320 0.225304 Consensus sequence: MVHBACCGGAAGTVDVH Reverse complement motif 0.225304 0.219734 0.190320 0.364642 0.129961 0.302575 0.172247 0.395216 0.222565 0.191769 0.286874 0.298792 0.126953 0.140306 0.249898 0.482843 0.767071 0.198497 0.022413 0.012019 0.112494 0.805095 0.076460 0.005951 0.241044 0.005147 0.002324 0.751484 0.005961 0.001016 0.001937 0.991087 0.001691 0.993588 0.002097 0.002624 0.005217 0.991859 0.001765 0.001159 0.079806 0.002438 0.917232 0.000524 0.012836 0.077134 0.906067 0.003962 0.147615 0.027594 0.168796 0.655995 0.102329 0.373097 0.255032 0.269542 0.425422 0.198309 0.118559 0.257711 0.153123 0.385794 0.322109 0.138974 0.078727 0.274378 0.165047 0.481848 Consensus sequence: HBDBACTTCCGGTBHVY Alignment: MVHBACCGGAAGTVDVH -----GCGGACGTTV-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 38 Motif name: Myc Original motif 0.295154 0.422907 0.158590 0.123348 0.149780 0.233480 0.572687 0.044053 0.035242 0.964758 0.000000 0.000000 0.955947 0.017621 0.022026 0.004405 0.000000 0.933921 0.013216 0.052863 0.083700 0.008811 0.898678 0.008811 0.039648 0.193833 0.000000 0.766520 0.000000 0.008811 0.951542 0.039648 0.000000 0.074890 0.806167 0.118943 0.198238 0.471366 0.105727 0.224670 Consensus sequence: VGCACGTGGH Reserve complement motif 0.198238 0.105727 0.471366 0.224670 0.000000 0.806167 0.074890 0.118943 0.000000 0.951542 0.008811 0.039648 0.766520 0.193833 0.000000 0.039648 0.083700 0.898678 0.008811 0.008811 0.000000 0.013216 0.933921 0.052863 0.004405 0.017621 0.022026 0.955947 0.035242 0.000000 0.964758 0.000000 0.149780 0.572687 0.233480 0.044053 0.295154 0.158590 0.422907 0.123348 Consensus sequence: DCCACGTGCV ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 38 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00060 Max_primary Original Motif Original Motif Forward 3 10 0.000000 Species: Mus musculus Original motif 0.234855 0.152539 0.301720 0.310886 0.199226 0.147959 0.439250 0.213565 0.582926 0.274768 0.075866 0.066440 0.138829 0.475428 0.305884 0.079859 0.024979 0.969691 0.001811 0.003520 0.966345 0.003728 0.022320 0.007607 0.000598 0.907006 0.008160 0.084236 0.084236 0.008160 0.907006 0.000598 0.007607 0.022320 0.003728 0.966345 0.003520 0.001811 0.969691 0.024979 0.149140 0.241218 0.389598 0.220044 0.066440 0.075866 0.274768 0.582926 0.186990 0.346199 0.250066 0.216745 0.273437 0.225889 0.300738 0.199936 0.160893 0.111177 0.477963 0.249968 0.171790 0.101256 0.424580 0.302375 Consensus sequence: DDASCACGTGBTBVDD Reverse complement motif 0.171790 0.424580 0.101256 0.302375 0.160893 0.477963 0.111177 0.249968 0.273437 0.300738 0.225889 0.199936 0.186990 0.250066 0.346199 0.216745 0.582926 0.075866 0.274768 0.066440 0.149140 0.389598 0.241218 0.220044 0.003520 0.969691 0.001811 0.024979 0.966345 0.022320 0.003728 0.007607 0.084236 0.907006 0.008160 0.000598 0.000598 0.008160 0.907006 0.084236 0.007607 0.003728 0.022320 0.966345 0.024979 0.001811 0.969691 0.003520 0.138829 0.305884 0.475428 0.079859 0.066440 0.274768 0.075866 0.582926 0.199226 0.439250 0.147959 0.213565 0.310886 0.152539 0.301720 0.234855 Consensus sequence: HHVBABCACGTGSTHD Alignment: DDASCACGTGBTBVDD --VGCACGTGGH---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00050 Bhlhb2_secondary Reverse Complement Reverse Complement Forward 8 10 0.006319 Species: Mus musculus Original motif 0.120938 0.344851 0.124072 0.410138 0.220931 0.169844 0.422396 0.186829 0.127752 0.260812 0.103811 0.507625 0.140641 0.405473 0.287668 0.166218 0.296957 0.155579 0.301094 0.246370 0.219647 0.287193 0.154072 0.339087 0.049294 0.026059 0.121789 0.802859 0.520042 0.289284 0.173423 0.017251 0.049190 0.943472 0.004308 0.003030 0.902609 0.006767 0.074770 0.015854 0.003221 0.971329 0.005512 0.019937 0.019937 0.005512 0.971329 0.003221 0.015854 0.074770 0.006767 0.902609 0.003030 0.004308 0.943472 0.049190 0.003497 0.088920 0.685942 0.221641 0.802859 0.121789 0.026059 0.049294 0.334544 0.155170 0.275193 0.235092 0.275957 0.132104 0.454982 0.136957 0.134097 0.254352 0.422940 0.188611 0.396163 0.432784 0.051281 0.119772 0.276474 0.115627 0.419844 0.188056 0.160759 0.088061 0.649863 0.101318 0.203314 0.166595 0.106821 0.523270 Consensus sequence: YDYBDHTMCACGTGGADDBMDGT Reverse complement motif 0.523270 0.166595 0.106821 0.203314 0.160759 0.649863 0.088061 0.101318 0.276474 0.419844 0.115627 0.188056 0.396163 0.051281 0.432784 0.119772 0.134097 0.422940 0.254352 0.188611 0.275957 0.454982 0.132104 0.136957 0.235092 0.155170 0.275193 0.334544 0.049294 0.121789 0.026059 0.802859 0.003497 0.685942 0.088920 0.221641 0.003030 0.943472 0.004308 0.049190 0.902609 0.074770 0.006767 0.015854 0.019937 0.971329 0.005512 0.003221 0.003221 0.005512 0.971329 0.019937 0.015854 0.006767 0.074770 0.902609 0.049190 0.004308 0.943472 0.003030 0.017251 0.289284 0.173423 0.520042 0.802859 0.026059 0.121789 0.049294 0.339087 0.287193 0.154072 0.219647 0.296957 0.301094 0.155579 0.246370 0.140641 0.287668 0.405473 0.166218 0.507625 0.260812 0.103811 0.127752 0.220931 0.422396 0.169844 0.186829 0.410138 0.344851 0.124072 0.120938 Consensus sequence: ACHRBHDTCCACGTGYAHHBMHM Alignment: ACHRBHDTCCACGTGYAHHBMHM -------DCCACGTGCV------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00050 Bhlhb2_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 7 10 0.008217 Species: Mus musculus Original motif 0.347837 0.112349 0.403713 0.136102 0.298329 0.175329 0.324534 0.201809 0.421791 0.222553 0.113615 0.242041 0.387506 0.130670 0.161435 0.320389 0.197183 0.244864 0.304611 0.253342 0.345884 0.188786 0.278290 0.187041 0.228203 0.142148 0.408269 0.221381 0.037126 0.006772 0.231775 0.724328 0.055214 0.942800 0.001192 0.000794 0.974119 0.004466 0.015535 0.005880 0.000300 0.958145 0.007498 0.034056 0.034056 0.007498 0.958145 0.000300 0.005880 0.015535 0.004466 0.974119 0.000794 0.001192 0.942800 0.055214 0.724328 0.231775 0.006772 0.037126 0.015720 0.466476 0.315208 0.202596 0.173670 0.355170 0.210710 0.260449 0.407419 0.261539 0.134430 0.196612 0.351478 0.209698 0.262426 0.176399 0.207869 0.284582 0.198951 0.308598 0.434482 0.113724 0.184408 0.267386 0.211144 0.363745 0.173978 0.251133 Consensus sequence: RDHDBVDTCACGTGASBHVHDH Reverse complement motif 0.211144 0.173978 0.363745 0.251133 0.267386 0.113724 0.184408 0.434482 0.308598 0.284582 0.198951 0.207869 0.176399 0.209698 0.262426 0.351478 0.196612 0.261539 0.134430 0.407419 0.173670 0.210710 0.355170 0.260449 0.015720 0.315208 0.466476 0.202596 0.037126 0.231775 0.006772 0.724328 0.000794 0.942800 0.001192 0.055214 0.974119 0.015535 0.004466 0.005880 0.034056 0.958145 0.007498 0.000300 0.000300 0.007498 0.958145 0.034056 0.005880 0.004466 0.015535 0.974119 0.055214 0.001192 0.942800 0.000794 0.724328 0.006772 0.231775 0.037126 0.228203 0.408269 0.142148 0.221381 0.187041 0.188786 0.278290 0.345884 0.197183 0.304611 0.244864 0.253342 0.320389 0.130670 0.161435 0.387506 0.242041 0.222553 0.113615 0.421791 0.298329 0.324534 0.175329 0.201809 0.347837 0.403713 0.112349 0.136102 Consensus sequence: DDHBHBSTCACGTGAHBBDHHM Alignment: DDHBHBSTCACGTGAHBBDHHM ------DCCACGTGCV------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00046 Tcfe2a_primary Original Motif Reverse Complement Backward 4 10 0.014001 Species: Mus musculus Original motif 0.306209 0.232705 0.244475 0.216611 0.165668 0.171480 0.222584 0.440269 0.213008 0.429038 0.156385 0.201569 0.283226 0.329518 0.160795 0.226461 0.439156 0.283517 0.251270 0.026056 0.014994 0.980987 0.000714 0.003304 0.975741 0.020182 0.002909 0.001168 0.000926 0.191353 0.801648 0.006073 0.015382 0.090853 0.893043 0.000721 0.001549 0.005912 0.001713 0.990826 0.004000 0.000857 0.989667 0.005475 0.016957 0.663726 0.148127 0.171190 0.299047 0.091156 0.448649 0.161148 0.354701 0.214677 0.236757 0.193865 0.399446 0.174508 0.200036 0.226009 0.303545 0.277435 0.200094 0.218926 0.380242 0.148876 0.163367 0.307514 Consensus sequence: VBHHVCAGGTGCDVDHD Reverse complement motif 0.307514 0.148876 0.163367 0.380242 0.218926 0.277435 0.200094 0.303545 0.226009 0.174508 0.200036 0.399446 0.193865 0.214677 0.236757 0.354701 0.299047 0.448649 0.091156 0.161148 0.016957 0.148127 0.663726 0.171190 0.004000 0.989667 0.000857 0.005475 0.990826 0.005912 0.001713 0.001549 0.015382 0.893043 0.090853 0.000721 0.000926 0.801648 0.191353 0.006073 0.001168 0.020182 0.002909 0.975741 0.014994 0.000714 0.980987 0.003304 0.026056 0.283517 0.251270 0.439156 0.283226 0.160795 0.329518 0.226461 0.213008 0.156385 0.429038 0.201569 0.440269 0.171480 0.222584 0.165668 0.216611 0.232705 0.244475 0.306209 Consensus sequence: DHDBHGCACCTGBDDVB Alignment: DHDBHGCACCTGBDDVB ----VGCACGTGGH--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00060 Max_secondary Original Motif Original Motif Backward 3 10 0.030891 Species: Mus musculus Original motif 0.127991 0.202889 0.399822 0.269298 0.156940 0.244015 0.182364 0.416681 0.046494 0.050598 0.744311 0.158596 0.196142 0.365183 0.183389 0.255286 0.019306 0.946805 0.015210 0.018680 0.924839 0.022113 0.027620 0.025428 0.007478 0.672138 0.027789 0.292595 0.046702 0.026044 0.906146 0.021107 0.117335 0.610863 0.025132 0.246670 0.044431 0.053581 0.722748 0.179240 0.543713 0.149809 0.190030 0.116447 0.241148 0.722386 0.022547 0.013919 0.265412 0.113032 0.270602 0.350954 0.226186 0.143504 0.332746 0.297564 Consensus sequence: BBGHCACGCGACDD Reverse complement motif 0.226186 0.332746 0.143504 0.297564 0.350954 0.113032 0.270602 0.265412 0.241148 0.022547 0.722386 0.013919 0.116447 0.149809 0.190030 0.543713 0.044431 0.722748 0.053581 0.179240 0.117335 0.025132 0.610863 0.246670 0.046702 0.906146 0.026044 0.021107 0.007478 0.027789 0.672138 0.292595 0.025428 0.022113 0.027620 0.924839 0.019306 0.015210 0.946805 0.018680 0.196142 0.183389 0.365183 0.255286 0.046494 0.744311 0.050598 0.158596 0.416681 0.244015 0.182364 0.156940 0.127991 0.399822 0.202889 0.269298 Consensus sequence: HDGTCGCGTGDCVB Alignment: BBGHCACGCGACDD --VGCACGTGGH-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00165 Titf1 Reverse Complement Original Motif Forward 4 10 0.031172 Species: Mus musculus Original motif 0.142834 0.324493 0.147276 0.385397 0.404842 0.233186 0.227659 0.134313 0.677580 0.044952 0.178774 0.098695 0.137761 0.202622 0.469728 0.189889 0.069301 0.825888 0.093549 0.011262 0.003882 0.876858 0.000966 0.118295 0.904355 0.015154 0.001043 0.079449 0.018912 0.977464 0.001207 0.002417 0.003517 0.004393 0.002428 0.989662 0.007151 0.162279 0.000584 0.829986 0.192074 0.120883 0.670840 0.016203 0.881358 0.002039 0.013253 0.103349 0.450016 0.333144 0.184121 0.032719 0.342018 0.321148 0.066945 0.269889 0.209486 0.122118 0.046367 0.622029 0.174564 0.145894 0.048004 0.631539 Consensus sequence: BVABCCACTTGAMHTT Reverse complement motif 0.631539 0.145894 0.048004 0.174564 0.622029 0.122118 0.046367 0.209486 0.269889 0.321148 0.066945 0.342018 0.032719 0.333144 0.184121 0.450016 0.103349 0.002039 0.013253 0.881358 0.192074 0.670840 0.120883 0.016203 0.829986 0.162279 0.000584 0.007151 0.989662 0.004393 0.002428 0.003517 0.018912 0.001207 0.977464 0.002417 0.079449 0.015154 0.001043 0.904355 0.003882 0.000966 0.876858 0.118295 0.069301 0.093549 0.825888 0.011262 0.137761 0.469728 0.202622 0.189889 0.098695 0.044952 0.178774 0.677580 0.134313 0.233186 0.227659 0.404842 0.385397 0.324493 0.147276 0.142834 Consensus sequence: AAHYTCAAGTGGBTBV Alignment: BVABCCACTTGAMHTT ---DCCACGTGCV--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00249 Nkx2-5 Reverse Complement Original Motif Backward 4 10 0.031308 Species: Mus musculus Original motif 0.284346 0.280937 0.138180 0.296538 0.399663 0.110464 0.327481 0.162392 0.637560 0.029806 0.218321 0.114314 0.184898 0.144379 0.370828 0.299895 0.017459 0.862111 0.118223 0.002207 0.001004 0.958164 0.000888 0.039945 0.947796 0.011499 0.000413 0.040291 0.024268 0.973476 0.000709 0.001546 0.002616 0.001901 0.003337 0.992147 0.006742 0.071290 0.000276 0.921691 0.393078 0.093424 0.490620 0.022879 0.870162 0.007294 0.051952 0.070591 0.632449 0.156278 0.172644 0.038628 0.362798 0.126579 0.085796 0.424828 0.132810 0.206405 0.025084 0.635702 0.094708 0.272324 0.087702 0.545267 Consensus sequence: HDADCCACTTRAAWTT Reverse complement motif 0.545267 0.272324 0.087702 0.094708 0.635702 0.206405 0.025084 0.132810 0.424828 0.126579 0.085796 0.362798 0.038628 0.156278 0.172644 0.632449 0.070591 0.007294 0.051952 0.870162 0.393078 0.490620 0.093424 0.022879 0.921691 0.071290 0.000276 0.006742 0.992147 0.001901 0.003337 0.002616 0.024268 0.000709 0.973476 0.001546 0.040291 0.011499 0.000413 0.947796 0.001004 0.000888 0.958164 0.039945 0.017459 0.118223 0.862111 0.002207 0.184898 0.370828 0.144379 0.299895 0.114314 0.029806 0.218321 0.637560 0.162392 0.110464 0.327481 0.399663 0.296538 0.280937 0.138180 0.284346 Consensus sequence: AAWTTMAAGTGGHTDH Alignment: HDADCCACTTRAAWTT ---DCCACGTGCV--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00231 Nkx2-2 Reverse Complement Original Motif Forward 4 10 0.033485 Species: Mus musculus Original motif 0.299323 0.258429 0.141957 0.300291 0.267631 0.143882 0.146933 0.441554 0.482614 0.212022 0.233631 0.071733 0.430836 0.073912 0.334439 0.160813 0.124944 0.704331 0.166815 0.003910 0.001941 0.876479 0.000828 0.120752 0.920202 0.005985 0.000456 0.073357 0.023544 0.974093 0.000859 0.001505 0.005010 0.003098 0.001328 0.990564 0.003250 0.198149 0.000490 0.798110 0.134659 0.104976 0.753464 0.006901 0.932490 0.000724 0.006140 0.060646 0.504530 0.106203 0.360995 0.028271 0.673257 0.074893 0.106536 0.145314 0.356324 0.097610 0.230142 0.315924 0.129483 0.188353 0.203623 0.478542 0.289071 0.157675 0.231909 0.321345 Consensus sequence: HDVRCCACTTGARADBD Reverse complement motif 0.321345 0.157675 0.231909 0.289071 0.478542 0.188353 0.203623 0.129483 0.315924 0.097610 0.230142 0.356324 0.145314 0.074893 0.106536 0.673257 0.028271 0.106203 0.360995 0.504530 0.060646 0.000724 0.006140 0.932490 0.134659 0.753464 0.104976 0.006901 0.798110 0.198149 0.000490 0.003250 0.990564 0.003098 0.001328 0.005010 0.023544 0.000859 0.974093 0.001505 0.073357 0.005985 0.000456 0.920202 0.001941 0.000828 0.876479 0.120752 0.124944 0.166815 0.704331 0.003910 0.160813 0.073912 0.334439 0.430836 0.071733 0.212022 0.233631 0.482614 0.441554 0.143882 0.146933 0.267631 0.300291 0.258429 0.141957 0.299323 Consensus sequence: DVDTKTCAAGTGGKBDH Alignment: HDVRCCACTTGARADBD ---DCCACGTGCV---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00147 Nkx2-6 Reverse Complement Original Motif Backward 4 10 0.034555 Species: Mus musculus Original motif 0.217416 0.196318 0.223786 0.362479 0.398508 0.155537 0.270546 0.175410 0.791392 0.022106 0.126944 0.059558 0.211671 0.145452 0.349401 0.293476 0.023830 0.847357 0.127125 0.001688 0.001426 0.942475 0.000495 0.055604 0.969354 0.001012 0.000987 0.028646 0.017358 0.980969 0.000778 0.000894 0.001816 0.004181 0.001573 0.992430 0.000925 0.059099 0.000431 0.939544 0.670672 0.011130 0.312570 0.005628 0.757147 0.010903 0.032137 0.199813 0.335600 0.359053 0.277277 0.028070 0.440449 0.199116 0.111993 0.248442 0.126577 0.210049 0.039661 0.623714 0.088481 0.233166 0.032706 0.645647 Consensus sequence: DDADCCACTTAAVHTT Reverse complement motif 0.645647 0.233166 0.032706 0.088481 0.623714 0.210049 0.039661 0.126577 0.248442 0.199116 0.111993 0.440449 0.335600 0.277277 0.359053 0.028070 0.199813 0.010903 0.032137 0.757147 0.005628 0.011130 0.312570 0.670672 0.939544 0.059099 0.000431 0.000925 0.992430 0.004181 0.001573 0.001816 0.017358 0.000778 0.980969 0.000894 0.028646 0.001012 0.000987 0.969354 0.001426 0.000495 0.942475 0.055604 0.023830 0.127125 0.847357 0.001688 0.211671 0.349401 0.145452 0.293476 0.059558 0.022106 0.126944 0.791392 0.175410 0.155537 0.270546 0.398508 0.362479 0.196318 0.223786 0.217416 Consensus sequence: AAHVTTAAGTGGHTDD Alignment: DDADCCACTTAAVHTT ---DCCACGTGCV--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00527 Foxn4_secondary Original Motif Original Motif Forward 6 10 0.036382 Species: Mus musculus Original motif 0.298336 0.418632 0.208054 0.074978 0.289907 0.015608 0.457100 0.237385 0.273583 0.077889 0.107860 0.540668 0.184954 0.161611 0.384390 0.269045 0.521826 0.156340 0.089019 0.232815 0.356716 0.131104 0.394857 0.117323 0.266669 0.108765 0.505273 0.119293 0.020778 0.047199 0.919524 0.012500 0.948536 0.018775 0.008113 0.024576 0.010822 0.964042 0.014701 0.010434 0.007428 0.019505 0.966351 0.006717 0.010025 0.975678 0.008648 0.005649 0.043796 0.120935 0.742979 0.092289 0.008252 0.250704 0.541132 0.199913 0.474428 0.044681 0.134430 0.346461 0.146597 0.421317 0.143166 0.288920 0.020540 0.181479 0.553811 0.244170 0.129612 0.173360 0.535219 0.161808 0.506084 0.158156 0.130983 0.204776 0.054872 0.103043 0.545792 0.296293 0.389882 0.171037 0.164162 0.274918 0.225861 0.314031 0.288872 0.171237 Consensus sequence: VDWDARRGACGCGGWHGGAKHV Reverse complement motif 0.225861 0.288872 0.314031 0.171237 0.274918 0.171037 0.164162 0.389882 0.054872 0.545792 0.103043 0.296293 0.204776 0.158156 0.130983 0.506084 0.129612 0.535219 0.173360 0.161808 0.020540 0.553811 0.181479 0.244170 0.146597 0.143166 0.421317 0.288920 0.346461 0.044681 0.134430 0.474428 0.008252 0.541132 0.250704 0.199913 0.043796 0.742979 0.120935 0.092289 0.010025 0.008648 0.975678 0.005649 0.007428 0.966351 0.019505 0.006717 0.010822 0.014701 0.964042 0.010434 0.024576 0.018775 0.008113 0.948536 0.020778 0.919524 0.047199 0.012500 0.266669 0.505273 0.108765 0.119293 0.356716 0.394857 0.131104 0.117323 0.232815 0.156340 0.089019 0.521826 0.184954 0.384390 0.161611 0.269045 0.540668 0.077889 0.107860 0.273583 0.289907 0.457100 0.015608 0.237385 0.298336 0.208054 0.418632 0.074978 Consensus sequence: VHYTCCDWCCGCGTCMMTHWHV Alignment: VDWDARRGACGCGGWHGGAKHV -----VGCACGTGGH------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 39 Motif name: MYCMAX Original motif 0.333333 0.047619 0.428571 0.190476 0.714286 0.047619 0.190476 0.047619 0.095238 0.428571 0.428571 0.047619 0.047619 0.952381 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.952381 0.000000 0.047619 0.047619 0.000000 0.952381 0.000000 0.000000 0.047619 0.000000 0.952381 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.047619 0.047619 0.857143 0.047619 0.142857 0.238095 0.000000 0.619048 Consensus sequence: RASCACGTGGT Reserve complement motif 0.619048 0.238095 0.000000 0.142857 0.047619 0.857143 0.047619 0.047619 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.952381 0.047619 0.000000 0.000000 0.047619 0.952381 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.952381 0.047619 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.047619 0.000000 0.952381 0.000000 0.095238 0.428571 0.428571 0.047619 0.047619 0.047619 0.190476 0.714286 0.333333 0.428571 0.047619 0.190476 Consensus sequence: ACCACGTGSTM ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 39 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00060 Max_primary Original Motif Reverse Complement Backward 3 11 0.000000 Species: Mus musculus Original motif 0.234855 0.152539 0.301720 0.310886 0.199226 0.147959 0.439250 0.213565 0.582926 0.274768 0.075866 0.066440 0.138829 0.475428 0.305884 0.079859 0.024979 0.969691 0.001811 0.003520 0.966345 0.003728 0.022320 0.007607 0.000598 0.907006 0.008160 0.084236 0.084236 0.008160 0.907006 0.000598 0.007607 0.022320 0.003728 0.966345 0.003520 0.001811 0.969691 0.024979 0.149140 0.241218 0.389598 0.220044 0.066440 0.075866 0.274768 0.582926 0.186990 0.346199 0.250066 0.216745 0.273437 0.225889 0.300738 0.199936 0.160893 0.111177 0.477963 0.249968 0.171790 0.101256 0.424580 0.302375 Consensus sequence: DDASCACGTGBTBVDD Reverse complement motif 0.171790 0.424580 0.101256 0.302375 0.160893 0.477963 0.111177 0.249968 0.273437 0.300738 0.225889 0.199936 0.186990 0.250066 0.346199 0.216745 0.582926 0.075866 0.274768 0.066440 0.149140 0.389598 0.241218 0.220044 0.003520 0.969691 0.001811 0.024979 0.966345 0.022320 0.003728 0.007607 0.084236 0.907006 0.008160 0.000598 0.000598 0.008160 0.907006 0.084236 0.007607 0.003728 0.022320 0.966345 0.024979 0.001811 0.969691 0.003520 0.138829 0.305884 0.475428 0.079859 0.066440 0.274768 0.075866 0.582926 0.199226 0.439250 0.147959 0.213565 0.310886 0.152539 0.301720 0.234855 Consensus sequence: HHVBABCACGTGSTHD Alignment: HHVBABCACGTGSTHD ---RASCACGTGGT-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00050 Bhlhb2_secondary Reverse Complement Reverse Complement Forward 8 11 0.025477 Species: Mus musculus Original motif 0.120938 0.344851 0.124072 0.410138 0.220931 0.169844 0.422396 0.186829 0.127752 0.260812 0.103811 0.507625 0.140641 0.405473 0.287668 0.166218 0.296957 0.155579 0.301094 0.246370 0.219647 0.287193 0.154072 0.339087 0.049294 0.026059 0.121789 0.802859 0.520042 0.289284 0.173423 0.017251 0.049190 0.943472 0.004308 0.003030 0.902609 0.006767 0.074770 0.015854 0.003221 0.971329 0.005512 0.019937 0.019937 0.005512 0.971329 0.003221 0.015854 0.074770 0.006767 0.902609 0.003030 0.004308 0.943472 0.049190 0.003497 0.088920 0.685942 0.221641 0.802859 0.121789 0.026059 0.049294 0.334544 0.155170 0.275193 0.235092 0.275957 0.132104 0.454982 0.136957 0.134097 0.254352 0.422940 0.188611 0.396163 0.432784 0.051281 0.119772 0.276474 0.115627 0.419844 0.188056 0.160759 0.088061 0.649863 0.101318 0.203314 0.166595 0.106821 0.523270 Consensus sequence: YDYBDHTMCACGTGGADDBMDGT Reverse complement motif 0.523270 0.166595 0.106821 0.203314 0.160759 0.649863 0.088061 0.101318 0.276474 0.419844 0.115627 0.188056 0.396163 0.051281 0.432784 0.119772 0.134097 0.422940 0.254352 0.188611 0.275957 0.454982 0.132104 0.136957 0.235092 0.155170 0.275193 0.334544 0.049294 0.121789 0.026059 0.802859 0.003497 0.685942 0.088920 0.221641 0.003030 0.943472 0.004308 0.049190 0.902609 0.074770 0.006767 0.015854 0.019937 0.971329 0.005512 0.003221 0.003221 0.005512 0.971329 0.019937 0.015854 0.006767 0.074770 0.902609 0.049190 0.004308 0.943472 0.003030 0.017251 0.289284 0.173423 0.520042 0.802859 0.026059 0.121789 0.049294 0.339087 0.287193 0.154072 0.219647 0.296957 0.301094 0.155579 0.246370 0.140641 0.287668 0.405473 0.166218 0.507625 0.260812 0.103811 0.127752 0.220931 0.422396 0.169844 0.186829 0.410138 0.344851 0.124072 0.120938 Consensus sequence: ACHRBHDTCCACGTGYAHHBMHM Alignment: ACHRBHDTCCACGTGYAHHBMHM -------ACCACGTGSTM----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00050 Bhlhb2_primary Original Motif Original Motif Forward 6 11 0.033078 Species: Mus musculus Original motif 0.347837 0.112349 0.403713 0.136102 0.298329 0.175329 0.324534 0.201809 0.421791 0.222553 0.113615 0.242041 0.387506 0.130670 0.161435 0.320389 0.197183 0.244864 0.304611 0.253342 0.345884 0.188786 0.278290 0.187041 0.228203 0.142148 0.408269 0.221381 0.037126 0.006772 0.231775 0.724328 0.055214 0.942800 0.001192 0.000794 0.974119 0.004466 0.015535 0.005880 0.000300 0.958145 0.007498 0.034056 0.034056 0.007498 0.958145 0.000300 0.005880 0.015535 0.004466 0.974119 0.000794 0.001192 0.942800 0.055214 0.724328 0.231775 0.006772 0.037126 0.015720 0.466476 0.315208 0.202596 0.173670 0.355170 0.210710 0.260449 0.407419 0.261539 0.134430 0.196612 0.351478 0.209698 0.262426 0.176399 0.207869 0.284582 0.198951 0.308598 0.434482 0.113724 0.184408 0.267386 0.211144 0.363745 0.173978 0.251133 Consensus sequence: RDHDBVDTCACGTGASBHVHDH Reverse complement motif 0.211144 0.173978 0.363745 0.251133 0.267386 0.113724 0.184408 0.434482 0.308598 0.284582 0.198951 0.207869 0.176399 0.209698 0.262426 0.351478 0.196612 0.261539 0.134430 0.407419 0.173670 0.210710 0.355170 0.260449 0.015720 0.315208 0.466476 0.202596 0.037126 0.231775 0.006772 0.724328 0.000794 0.942800 0.001192 0.055214 0.974119 0.015535 0.004466 0.005880 0.034056 0.958145 0.007498 0.000300 0.000300 0.007498 0.958145 0.034056 0.005880 0.004466 0.015535 0.974119 0.055214 0.001192 0.942800 0.000794 0.724328 0.006772 0.231775 0.037126 0.228203 0.408269 0.142148 0.221381 0.187041 0.188786 0.278290 0.345884 0.197183 0.304611 0.244864 0.253342 0.320389 0.130670 0.161435 0.387506 0.242041 0.222553 0.113615 0.421791 0.298329 0.324534 0.175329 0.201809 0.347837 0.403713 0.112349 0.136102 Consensus sequence: DDHBHBSTCACGTGAHBBDHHM Alignment: RDHDBVDTCACGTGASBHVHDH -----RASCACGTGGT------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00046 Tcfe2a_primary Reverse Complement Original Motif Backward 4 11 0.037558 Species: Mus musculus Original motif 0.306209 0.232705 0.244475 0.216611 0.165668 0.171480 0.222584 0.440269 0.213008 0.429038 0.156385 0.201569 0.283226 0.329518 0.160795 0.226461 0.439156 0.283517 0.251270 0.026056 0.014994 0.980987 0.000714 0.003304 0.975741 0.020182 0.002909 0.001168 0.000926 0.191353 0.801648 0.006073 0.015382 0.090853 0.893043 0.000721 0.001549 0.005912 0.001713 0.990826 0.004000 0.000857 0.989667 0.005475 0.016957 0.663726 0.148127 0.171190 0.299047 0.091156 0.448649 0.161148 0.354701 0.214677 0.236757 0.193865 0.399446 0.174508 0.200036 0.226009 0.303545 0.277435 0.200094 0.218926 0.380242 0.148876 0.163367 0.307514 Consensus sequence: VBHHVCAGGTGCDVDHD Reverse complement motif 0.307514 0.148876 0.163367 0.380242 0.218926 0.277435 0.200094 0.303545 0.226009 0.174508 0.200036 0.399446 0.193865 0.214677 0.236757 0.354701 0.299047 0.448649 0.091156 0.161148 0.016957 0.148127 0.663726 0.171190 0.004000 0.989667 0.000857 0.005475 0.990826 0.005912 0.001713 0.001549 0.015382 0.893043 0.090853 0.000721 0.000926 0.801648 0.191353 0.006073 0.001168 0.020182 0.002909 0.975741 0.014994 0.000714 0.980987 0.003304 0.026056 0.283517 0.251270 0.439156 0.283226 0.160795 0.329518 0.226461 0.213008 0.156385 0.429038 0.201569 0.440269 0.171480 0.222584 0.165668 0.216611 0.232705 0.244475 0.306209 Consensus sequence: DHDBHGCACCTGBDDVB Alignment: VBHHVCAGGTGCDVDHD ---ACCACGTGSTM--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00046 Tcfe2a_secondary Original Motif Original Motif Forward 3 11 0.045242 Species: Mus musculus Original motif 0.296417 0.247522 0.206749 0.249312 0.410113 0.201959 0.303149 0.084779 0.267313 0.132645 0.452057 0.147985 0.187929 0.136827 0.427628 0.247616 0.198671 0.425254 0.234160 0.141915 0.029244 0.953929 0.004092 0.012734 0.954570 0.014314 0.018695 0.012421 0.010025 0.055055 0.845504 0.089415 0.874802 0.040849 0.069178 0.015172 0.015084 0.010551 0.008736 0.965628 0.012981 0.007192 0.965036 0.014791 0.037724 0.016891 0.495632 0.449753 0.021685 0.438927 0.056118 0.483270 0.209872 0.365671 0.139706 0.284751 0.151815 0.336912 0.289382 0.221891 0.152995 0.262354 0.416434 0.168217 0.227567 0.187603 0.447892 0.136938 Consensus sequence: HVDDVCAGATGKYHBBV Reverse complement motif 0.227567 0.447892 0.187603 0.136938 0.152995 0.416434 0.262354 0.168217 0.151815 0.289382 0.336912 0.221891 0.209872 0.139706 0.365671 0.284751 0.483270 0.438927 0.056118 0.021685 0.037724 0.495632 0.016891 0.449753 0.012981 0.965036 0.007192 0.014791 0.965628 0.010551 0.008736 0.015084 0.015172 0.040849 0.069178 0.874802 0.010025 0.845504 0.055055 0.089415 0.012421 0.014314 0.018695 0.954570 0.029244 0.004092 0.953929 0.012734 0.198671 0.234160 0.425254 0.141915 0.187929 0.427628 0.136827 0.247616 0.267313 0.452057 0.132645 0.147985 0.084779 0.201959 0.303149 0.410113 0.249312 0.247522 0.206749 0.296417 Consensus sequence: VBBDMYCATCTGVHHBH Alignment: HVDDVCAGATGKYHBBV --RASCACGTGGT---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00036 Myf6_primary Original Motif Original Motif Forward 4 11 0.047197 Species: Mus musculus Original motif 0.249543 0.203739 0.394131 0.152587 0.349361 0.204136 0.321767 0.124736 0.386930 0.174655 0.250284 0.188131 0.173937 0.233501 0.412360 0.180201 0.663624 0.037653 0.264216 0.034507 0.717265 0.040761 0.206656 0.035318 0.004176 0.985948 0.003219 0.006657 0.967612 0.005543 0.008604 0.018241 0.080781 0.089857 0.746009 0.083354 0.019831 0.270961 0.409808 0.299401 0.019877 0.026996 0.014022 0.939105 0.005169 0.007980 0.978334 0.008518 0.115710 0.200514 0.226485 0.457291 0.032392 0.527196 0.128372 0.312041 0.202049 0.384912 0.106488 0.306551 0.181994 0.192975 0.425582 0.199448 Consensus sequence: VVDBAACAGBTGBYHB Reverse complement motif 0.181994 0.425582 0.192975 0.199448 0.202049 0.106488 0.384912 0.306551 0.032392 0.128372 0.527196 0.312041 0.457291 0.200514 0.226485 0.115710 0.005169 0.978334 0.007980 0.008518 0.939105 0.026996 0.014022 0.019877 0.019831 0.409808 0.270961 0.299401 0.080781 0.746009 0.089857 0.083354 0.018241 0.005543 0.008604 0.967612 0.004176 0.003219 0.985948 0.006657 0.035318 0.040761 0.206656 0.717265 0.034507 0.037653 0.264216 0.663624 0.173937 0.412360 0.233501 0.180201 0.188131 0.174655 0.250284 0.386930 0.124736 0.204136 0.321767 0.349361 0.249543 0.394131 0.203739 0.152587 Consensus sequence: BDKVCABCTGTTBDBV Alignment: VVDBAACAGBTGBYHB ---RASCACGTGGT-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00099 Ascl2_primary Original Motif Reverse Complement Forward 4 11 0.050442 Species: Mus musculus Original motif 0.168852 0.325948 0.188604 0.316596 0.150343 0.193286 0.241301 0.415069 0.091518 0.482905 0.122928 0.302648 0.472493 0.198776 0.225796 0.102935 0.294513 0.179919 0.447250 0.078318 0.014660 0.972080 0.005591 0.007668 0.954848 0.008107 0.008474 0.028571 0.006076 0.178912 0.760021 0.054991 0.052082 0.817415 0.124797 0.005707 0.019342 0.010406 0.008905 0.961347 0.005455 0.008073 0.977684 0.008788 0.042946 0.715551 0.087020 0.154483 0.116888 0.241739 0.170073 0.471300 0.315931 0.324343 0.291451 0.068274 0.199164 0.366921 0.163690 0.270226 0.218561 0.211076 0.187732 0.382631 0.145317 0.139808 0.389262 0.325614 Consensus sequence: BBYVVCAGCTGCBVHHD Reverse complement motif 0.145317 0.389262 0.139808 0.325614 0.382631 0.211076 0.187732 0.218561 0.199164 0.163690 0.366921 0.270226 0.315931 0.291451 0.324343 0.068274 0.471300 0.241739 0.170073 0.116888 0.042946 0.087020 0.715551 0.154483 0.005455 0.977684 0.008073 0.008788 0.961347 0.010406 0.008905 0.019342 0.052082 0.124797 0.817415 0.005707 0.006076 0.760021 0.178912 0.054991 0.028571 0.008107 0.008474 0.954848 0.014660 0.005591 0.972080 0.007668 0.294513 0.447250 0.179919 0.078318 0.102935 0.198776 0.225796 0.472493 0.091518 0.122928 0.482905 0.302648 0.415069 0.193286 0.241301 0.150343 0.168852 0.188604 0.325948 0.316596 Consensus sequence: HHDVVGCAGCTGVBKVB Alignment: HHDVVGCAGCTGVBKVB ---RASCACGTGGT--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00084 Gmeb1_secondary Reverse Complement Reverse Complement Backward 3 11 0.052204 Species: Mus musculus Original motif 0.171801 0.139045 0.265726 0.423428 0.146597 0.118316 0.577770 0.157317 0.247220 0.191958 0.432935 0.127887 0.119277 0.232191 0.394786 0.253747 0.227546 0.664338 0.016991 0.091125 0.271290 0.146819 0.518707 0.063184 0.693351 0.120942 0.066863 0.118844 0.041459 0.895990 0.042253 0.020298 0.020298 0.042253 0.895990 0.041459 0.118844 0.066863 0.120942 0.693351 0.063184 0.518707 0.146819 0.271290 0.091125 0.016991 0.664338 0.227546 0.122589 0.186959 0.078274 0.612178 0.103039 0.274719 0.113320 0.508922 0.375945 0.289040 0.127861 0.207153 0.429989 0.189120 0.110127 0.270765 Consensus sequence: DGVBCRACGTYGTYHH Reverse complement motif 0.270765 0.189120 0.110127 0.429989 0.207153 0.289040 0.127861 0.375945 0.508922 0.274719 0.113320 0.103039 0.612178 0.186959 0.078274 0.122589 0.091125 0.664338 0.016991 0.227546 0.063184 0.146819 0.518707 0.271290 0.693351 0.066863 0.120942 0.118844 0.020298 0.895990 0.042253 0.041459 0.041459 0.042253 0.895990 0.020298 0.118844 0.120942 0.066863 0.693351 0.271290 0.518707 0.146819 0.063184 0.227546 0.016991 0.664338 0.091125 0.119277 0.394786 0.232191 0.253747 0.247220 0.432935 0.191958 0.127887 0.146597 0.577770 0.118316 0.157317 0.423428 0.139045 0.265726 0.171801 Consensus sequence: HHMACKACGTMGBVCD Alignment: HHMACKACGTMGBVCD ---ACCACGTGSTM-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00165 Titf1 Reverse Complement Original Motif Forward 4 11 0.055409 Species: Mus musculus Original motif 0.142834 0.324493 0.147276 0.385397 0.404842 0.233186 0.227659 0.134313 0.677580 0.044952 0.178774 0.098695 0.137761 0.202622 0.469728 0.189889 0.069301 0.825888 0.093549 0.011262 0.003882 0.876858 0.000966 0.118295 0.904355 0.015154 0.001043 0.079449 0.018912 0.977464 0.001207 0.002417 0.003517 0.004393 0.002428 0.989662 0.007151 0.162279 0.000584 0.829986 0.192074 0.120883 0.670840 0.016203 0.881358 0.002039 0.013253 0.103349 0.450016 0.333144 0.184121 0.032719 0.342018 0.321148 0.066945 0.269889 0.209486 0.122118 0.046367 0.622029 0.174564 0.145894 0.048004 0.631539 Consensus sequence: BVABCCACTTGAMHTT Reverse complement motif 0.631539 0.145894 0.048004 0.174564 0.622029 0.122118 0.046367 0.209486 0.269889 0.321148 0.066945 0.342018 0.032719 0.333144 0.184121 0.450016 0.103349 0.002039 0.013253 0.881358 0.192074 0.670840 0.120883 0.016203 0.829986 0.162279 0.000584 0.007151 0.989662 0.004393 0.002428 0.003517 0.018912 0.001207 0.977464 0.002417 0.079449 0.015154 0.001043 0.904355 0.003882 0.000966 0.876858 0.118295 0.069301 0.093549 0.825888 0.011262 0.137761 0.469728 0.202622 0.189889 0.098695 0.044952 0.178774 0.677580 0.134313 0.233186 0.227659 0.404842 0.385397 0.324493 0.147276 0.142834 Consensus sequence: AAHYTCAAGTGGBTBV Alignment: BVABCCACTTGAMHTT ---ACCACGTGSTM-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00060 Max_secondary Original Motif Reverse Complement Forward 2 11 0.055759 Species: Mus musculus Original motif 0.127991 0.202889 0.399822 0.269298 0.156940 0.244015 0.182364 0.416681 0.046494 0.050598 0.744311 0.158596 0.196142 0.365183 0.183389 0.255286 0.019306 0.946805 0.015210 0.018680 0.924839 0.022113 0.027620 0.025428 0.007478 0.672138 0.027789 0.292595 0.046702 0.026044 0.906146 0.021107 0.117335 0.610863 0.025132 0.246670 0.044431 0.053581 0.722748 0.179240 0.543713 0.149809 0.190030 0.116447 0.241148 0.722386 0.022547 0.013919 0.265412 0.113032 0.270602 0.350954 0.226186 0.143504 0.332746 0.297564 Consensus sequence: BBGHCACGCGACDD Reverse complement motif 0.226186 0.332746 0.143504 0.297564 0.350954 0.113032 0.270602 0.265412 0.241148 0.022547 0.722386 0.013919 0.116447 0.149809 0.190030 0.543713 0.044431 0.722748 0.053581 0.179240 0.117335 0.025132 0.610863 0.246670 0.046702 0.906146 0.026044 0.021107 0.007478 0.027789 0.672138 0.292595 0.025428 0.022113 0.027620 0.924839 0.019306 0.015210 0.946805 0.018680 0.196142 0.183389 0.365183 0.255286 0.046494 0.744311 0.050598 0.158596 0.416681 0.244015 0.182364 0.156940 0.127991 0.399822 0.202889 0.269298 Consensus sequence: HDGTCGCGTGDCVB Alignment: HDGTCGCGTGDCVB -RASCACGTGGT-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 40 Motif name: Mycn Original motif 0.349315 0.363014 0.143836 0.143836 0.089041 0.388128 0.447489 0.075342 0.015982 0.984018 0.000000 0.000000 0.945205 0.000000 0.041096 0.013699 0.000000 0.961187 0.018265 0.020548 0.070776 0.002283 0.924658 0.002283 0.054795 0.221461 0.004566 0.719178 0.000000 0.000000 0.938356 0.061644 0.061644 0.111872 0.739726 0.086758 0.139269 0.605023 0.091324 0.164384 Consensus sequence: HSCACGTGGC Reserve complement motif 0.139269 0.091324 0.605023 0.164384 0.061644 0.739726 0.111872 0.086758 0.000000 0.938356 0.000000 0.061644 0.719178 0.221461 0.004566 0.054795 0.070776 0.924658 0.002283 0.002283 0.000000 0.018265 0.961187 0.020548 0.013699 0.000000 0.041096 0.945205 0.015982 0.000000 0.984018 0.000000 0.089041 0.447489 0.388128 0.075342 0.349315 0.143836 0.363014 0.143836 Consensus sequence: GCCACGTGSD ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 40 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00060 Max_primary Original Motif Original Motif Forward 3 10 0.000000 Species: Mus musculus Original motif 0.234855 0.152539 0.301720 0.310886 0.199226 0.147959 0.439250 0.213565 0.582926 0.274768 0.075866 0.066440 0.138829 0.475428 0.305884 0.079859 0.024979 0.969691 0.001811 0.003520 0.966345 0.003728 0.022320 0.007607 0.000598 0.907006 0.008160 0.084236 0.084236 0.008160 0.907006 0.000598 0.007607 0.022320 0.003728 0.966345 0.003520 0.001811 0.969691 0.024979 0.149140 0.241218 0.389598 0.220044 0.066440 0.075866 0.274768 0.582926 0.186990 0.346199 0.250066 0.216745 0.273437 0.225889 0.300738 0.199936 0.160893 0.111177 0.477963 0.249968 0.171790 0.101256 0.424580 0.302375 Consensus sequence: DDASCACGTGBTBVDD Reverse complement motif 0.171790 0.424580 0.101256 0.302375 0.160893 0.477963 0.111177 0.249968 0.273437 0.300738 0.225889 0.199936 0.186990 0.250066 0.346199 0.216745 0.582926 0.075866 0.274768 0.066440 0.149140 0.389598 0.241218 0.220044 0.003520 0.969691 0.001811 0.024979 0.966345 0.022320 0.003728 0.007607 0.084236 0.907006 0.008160 0.000598 0.000598 0.008160 0.907006 0.084236 0.007607 0.003728 0.022320 0.966345 0.024979 0.001811 0.969691 0.003520 0.138829 0.305884 0.475428 0.079859 0.066440 0.274768 0.075866 0.582926 0.199226 0.439250 0.147959 0.213565 0.310886 0.152539 0.301720 0.234855 Consensus sequence: HHVBABCACGTGSTHD Alignment: DDASCACGTGBTBVDD --HSCACGTGGC---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00050 Bhlhb2_secondary Reverse Complement Reverse Complement Backward 7 10 0.007838 Species: Mus musculus Original motif 0.120938 0.344851 0.124072 0.410138 0.220931 0.169844 0.422396 0.186829 0.127752 0.260812 0.103811 0.507625 0.140641 0.405473 0.287668 0.166218 0.296957 0.155579 0.301094 0.246370 0.219647 0.287193 0.154072 0.339087 0.049294 0.026059 0.121789 0.802859 0.520042 0.289284 0.173423 0.017251 0.049190 0.943472 0.004308 0.003030 0.902609 0.006767 0.074770 0.015854 0.003221 0.971329 0.005512 0.019937 0.019937 0.005512 0.971329 0.003221 0.015854 0.074770 0.006767 0.902609 0.003030 0.004308 0.943472 0.049190 0.003497 0.088920 0.685942 0.221641 0.802859 0.121789 0.026059 0.049294 0.334544 0.155170 0.275193 0.235092 0.275957 0.132104 0.454982 0.136957 0.134097 0.254352 0.422940 0.188611 0.396163 0.432784 0.051281 0.119772 0.276474 0.115627 0.419844 0.188056 0.160759 0.088061 0.649863 0.101318 0.203314 0.166595 0.106821 0.523270 Consensus sequence: YDYBDHTMCACGTGGADDBMDGT Reverse complement motif 0.523270 0.166595 0.106821 0.203314 0.160759 0.649863 0.088061 0.101318 0.276474 0.419844 0.115627 0.188056 0.396163 0.051281 0.432784 0.119772 0.134097 0.422940 0.254352 0.188611 0.275957 0.454982 0.132104 0.136957 0.235092 0.155170 0.275193 0.334544 0.049294 0.121789 0.026059 0.802859 0.003497 0.685942 0.088920 0.221641 0.003030 0.943472 0.004308 0.049190 0.902609 0.074770 0.006767 0.015854 0.019937 0.971329 0.005512 0.003221 0.003221 0.005512 0.971329 0.019937 0.015854 0.006767 0.074770 0.902609 0.049190 0.004308 0.943472 0.003030 0.017251 0.289284 0.173423 0.520042 0.802859 0.026059 0.121789 0.049294 0.339087 0.287193 0.154072 0.219647 0.296957 0.301094 0.155579 0.246370 0.140641 0.287668 0.405473 0.166218 0.507625 0.260812 0.103811 0.127752 0.220931 0.422396 0.169844 0.186829 0.410138 0.344851 0.124072 0.120938 Consensus sequence: ACHRBHDTCCACGTGYAHHBMHM Alignment: ACHRBHDTCCACGTGYAHHBMHM -------GCCACGTGSD------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00050 Bhlhb2_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 7 10 0.013286 Species: Mus musculus Original motif 0.347837 0.112349 0.403713 0.136102 0.298329 0.175329 0.324534 0.201809 0.421791 0.222553 0.113615 0.242041 0.387506 0.130670 0.161435 0.320389 0.197183 0.244864 0.304611 0.253342 0.345884 0.188786 0.278290 0.187041 0.228203 0.142148 0.408269 0.221381 0.037126 0.006772 0.231775 0.724328 0.055214 0.942800 0.001192 0.000794 0.974119 0.004466 0.015535 0.005880 0.000300 0.958145 0.007498 0.034056 0.034056 0.007498 0.958145 0.000300 0.005880 0.015535 0.004466 0.974119 0.000794 0.001192 0.942800 0.055214 0.724328 0.231775 0.006772 0.037126 0.015720 0.466476 0.315208 0.202596 0.173670 0.355170 0.210710 0.260449 0.407419 0.261539 0.134430 0.196612 0.351478 0.209698 0.262426 0.176399 0.207869 0.284582 0.198951 0.308598 0.434482 0.113724 0.184408 0.267386 0.211144 0.363745 0.173978 0.251133 Consensus sequence: RDHDBVDTCACGTGASBHVHDH Reverse complement motif 0.211144 0.173978 0.363745 0.251133 0.267386 0.113724 0.184408 0.434482 0.308598 0.284582 0.198951 0.207869 0.176399 0.209698 0.262426 0.351478 0.196612 0.261539 0.134430 0.407419 0.173670 0.210710 0.355170 0.260449 0.015720 0.315208 0.466476 0.202596 0.037126 0.231775 0.006772 0.724328 0.000794 0.942800 0.001192 0.055214 0.974119 0.015535 0.004466 0.005880 0.034056 0.958145 0.007498 0.000300 0.000300 0.007498 0.958145 0.034056 0.005880 0.004466 0.015535 0.974119 0.055214 0.001192 0.942800 0.000794 0.724328 0.006772 0.231775 0.037126 0.228203 0.408269 0.142148 0.221381 0.187041 0.188786 0.278290 0.345884 0.197183 0.304611 0.244864 0.253342 0.320389 0.130670 0.161435 0.387506 0.242041 0.222553 0.113615 0.421791 0.298329 0.324534 0.175329 0.201809 0.347837 0.403713 0.112349 0.136102 Consensus sequence: DDHBHBSTCACGTGAHBBDHHM Alignment: DDHBHBSTCACGTGAHBBDHHM ------GCCACGTGSD------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00046 Tcfe2a_primary Reverse Complement Original Motif Forward 4 10 0.022793 Species: Mus musculus Original motif 0.306209 0.232705 0.244475 0.216611 0.165668 0.171480 0.222584 0.440269 0.213008 0.429038 0.156385 0.201569 0.283226 0.329518 0.160795 0.226461 0.439156 0.283517 0.251270 0.026056 0.014994 0.980987 0.000714 0.003304 0.975741 0.020182 0.002909 0.001168 0.000926 0.191353 0.801648 0.006073 0.015382 0.090853 0.893043 0.000721 0.001549 0.005912 0.001713 0.990826 0.004000 0.000857 0.989667 0.005475 0.016957 0.663726 0.148127 0.171190 0.299047 0.091156 0.448649 0.161148 0.354701 0.214677 0.236757 0.193865 0.399446 0.174508 0.200036 0.226009 0.303545 0.277435 0.200094 0.218926 0.380242 0.148876 0.163367 0.307514 Consensus sequence: VBHHVCAGGTGCDVDHD Reverse complement motif 0.307514 0.148876 0.163367 0.380242 0.218926 0.277435 0.200094 0.303545 0.226009 0.174508 0.200036 0.399446 0.193865 0.214677 0.236757 0.354701 0.299047 0.448649 0.091156 0.161148 0.016957 0.148127 0.663726 0.171190 0.004000 0.989667 0.000857 0.005475 0.990826 0.005912 0.001713 0.001549 0.015382 0.893043 0.090853 0.000721 0.000926 0.801648 0.191353 0.006073 0.001168 0.020182 0.002909 0.975741 0.014994 0.000714 0.980987 0.003304 0.026056 0.283517 0.251270 0.439156 0.283226 0.160795 0.329518 0.226461 0.213008 0.156385 0.429038 0.201569 0.440269 0.171480 0.222584 0.165668 0.216611 0.232705 0.244475 0.306209 Consensus sequence: DHDBHGCACCTGBDDVB Alignment: VBHHVCAGGTGCDVDHD ---GCCACGTGSD---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00060 Max_secondary Original Motif Original Motif Forward 3 10 0.025701 Species: Mus musculus Original motif 0.127991 0.202889 0.399822 0.269298 0.156940 0.244015 0.182364 0.416681 0.046494 0.050598 0.744311 0.158596 0.196142 0.365183 0.183389 0.255286 0.019306 0.946805 0.015210 0.018680 0.924839 0.022113 0.027620 0.025428 0.007478 0.672138 0.027789 0.292595 0.046702 0.026044 0.906146 0.021107 0.117335 0.610863 0.025132 0.246670 0.044431 0.053581 0.722748 0.179240 0.543713 0.149809 0.190030 0.116447 0.241148 0.722386 0.022547 0.013919 0.265412 0.113032 0.270602 0.350954 0.226186 0.143504 0.332746 0.297564 Consensus sequence: BBGHCACGCGACDD Reverse complement motif 0.226186 0.332746 0.143504 0.297564 0.350954 0.113032 0.270602 0.265412 0.241148 0.022547 0.722386 0.013919 0.116447 0.149809 0.190030 0.543713 0.044431 0.722748 0.053581 0.179240 0.117335 0.025132 0.610863 0.246670 0.046702 0.906146 0.026044 0.021107 0.007478 0.027789 0.672138 0.292595 0.025428 0.022113 0.027620 0.924839 0.019306 0.015210 0.946805 0.018680 0.196142 0.183389 0.365183 0.255286 0.046494 0.744311 0.050598 0.158596 0.416681 0.244015 0.182364 0.156940 0.127991 0.399822 0.202889 0.269298 Consensus sequence: HDGTCGCGTGDCVB Alignment: BBGHCACGCGACDD --HSCACGTGGC-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00165 Titf1 Reverse Complement Original Motif Backward 4 10 0.034483 Species: Mus musculus Original motif 0.142834 0.324493 0.147276 0.385397 0.404842 0.233186 0.227659 0.134313 0.677580 0.044952 0.178774 0.098695 0.137761 0.202622 0.469728 0.189889 0.069301 0.825888 0.093549 0.011262 0.003882 0.876858 0.000966 0.118295 0.904355 0.015154 0.001043 0.079449 0.018912 0.977464 0.001207 0.002417 0.003517 0.004393 0.002428 0.989662 0.007151 0.162279 0.000584 0.829986 0.192074 0.120883 0.670840 0.016203 0.881358 0.002039 0.013253 0.103349 0.450016 0.333144 0.184121 0.032719 0.342018 0.321148 0.066945 0.269889 0.209486 0.122118 0.046367 0.622029 0.174564 0.145894 0.048004 0.631539 Consensus sequence: BVABCCACTTGAMHTT Reverse complement motif 0.631539 0.145894 0.048004 0.174564 0.622029 0.122118 0.046367 0.209486 0.269889 0.321148 0.066945 0.342018 0.032719 0.333144 0.184121 0.450016 0.103349 0.002039 0.013253 0.881358 0.192074 0.670840 0.120883 0.016203 0.829986 0.162279 0.000584 0.007151 0.989662 0.004393 0.002428 0.003517 0.018912 0.001207 0.977464 0.002417 0.079449 0.015154 0.001043 0.904355 0.003882 0.000966 0.876858 0.118295 0.069301 0.093549 0.825888 0.011262 0.137761 0.469728 0.202622 0.189889 0.098695 0.044952 0.178774 0.677580 0.134313 0.233186 0.227659 0.404842 0.385397 0.324493 0.147276 0.142834 Consensus sequence: AAHYTCAAGTGGBTBV Alignment: BVABCCACTTGAMHTT ---GCCACGTGSD--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00231 Nkx2-2 Reverse Complement Original Motif Backward 5 10 0.035228 Species: Mus musculus Original motif 0.299323 0.258429 0.141957 0.300291 0.267631 0.143882 0.146933 0.441554 0.482614 0.212022 0.233631 0.071733 0.430836 0.073912 0.334439 0.160813 0.124944 0.704331 0.166815 0.003910 0.001941 0.876479 0.000828 0.120752 0.920202 0.005985 0.000456 0.073357 0.023544 0.974093 0.000859 0.001505 0.005010 0.003098 0.001328 0.990564 0.003250 0.198149 0.000490 0.798110 0.134659 0.104976 0.753464 0.006901 0.932490 0.000724 0.006140 0.060646 0.504530 0.106203 0.360995 0.028271 0.673257 0.074893 0.106536 0.145314 0.356324 0.097610 0.230142 0.315924 0.129483 0.188353 0.203623 0.478542 0.289071 0.157675 0.231909 0.321345 Consensus sequence: HDVRCCACTTGARADBD Reverse complement motif 0.321345 0.157675 0.231909 0.289071 0.478542 0.188353 0.203623 0.129483 0.315924 0.097610 0.230142 0.356324 0.145314 0.074893 0.106536 0.673257 0.028271 0.106203 0.360995 0.504530 0.060646 0.000724 0.006140 0.932490 0.134659 0.753464 0.104976 0.006901 0.798110 0.198149 0.000490 0.003250 0.990564 0.003098 0.001328 0.005010 0.023544 0.000859 0.974093 0.001505 0.073357 0.005985 0.000456 0.920202 0.001941 0.000828 0.876479 0.120752 0.124944 0.166815 0.704331 0.003910 0.160813 0.073912 0.334439 0.430836 0.071733 0.212022 0.233631 0.482614 0.441554 0.143882 0.146933 0.267631 0.300291 0.258429 0.141957 0.299323 Consensus sequence: DVDTKTCAAGTGGKBDH Alignment: HDVRCCACTTGARADBD ---GCCACGTGSD---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00084 Gmeb1_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 4 10 0.035858 Species: Mus musculus Original motif 0.166569 0.264627 0.345569 0.223235 0.335599 0.314451 0.153336 0.196615 0.105350 0.231839 0.348018 0.314793 0.131274 0.215623 0.291288 0.361815 0.125570 0.072341 0.404848 0.397242 0.049879 0.039110 0.325167 0.585844 0.705098 0.009202 0.284757 0.000943 0.003535 0.986983 0.004275 0.005207 0.005207 0.004275 0.986983 0.003535 0.000943 0.284757 0.009202 0.705098 0.585844 0.325167 0.039110 0.049879 0.397242 0.404848 0.072341 0.125570 0.206857 0.234555 0.371731 0.186857 0.435957 0.145115 0.181033 0.237896 0.176104 0.260127 0.230770 0.333000 0.272102 0.213365 0.312032 0.202501 0.237402 0.250982 0.266977 0.244639 Consensus sequence: BHBBKKACGTMMVDBVB Reverse complement motif 0.237402 0.266977 0.250982 0.244639 0.272102 0.312032 0.213365 0.202501 0.333000 0.260127 0.230770 0.176104 0.237896 0.145115 0.181033 0.435957 0.206857 0.371731 0.234555 0.186857 0.397242 0.072341 0.404848 0.125570 0.049879 0.325167 0.039110 0.585844 0.705098 0.284757 0.009202 0.000943 0.005207 0.986983 0.004275 0.003535 0.003535 0.004275 0.986983 0.005207 0.000943 0.009202 0.284757 0.705098 0.585844 0.039110 0.325167 0.049879 0.125570 0.404848 0.072341 0.397242 0.361815 0.215623 0.291288 0.131274 0.105350 0.348018 0.231839 0.314793 0.196615 0.314451 0.153336 0.335599 0.166569 0.345569 0.264627 0.223235 Consensus sequence: BVVDVRYACGTRYVBHB Alignment: BVVDVRYACGTRYVBHB ----GCCACGTGSD--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00084 Gmeb1_secondary Original Motif Reverse Complement Forward 4 10 0.037250 Species: Mus musculus Original motif 0.171801 0.139045 0.265726 0.423428 0.146597 0.118316 0.577770 0.157317 0.247220 0.191958 0.432935 0.127887 0.119277 0.232191 0.394786 0.253747 0.227546 0.664338 0.016991 0.091125 0.271290 0.146819 0.518707 0.063184 0.693351 0.120942 0.066863 0.118844 0.041459 0.895990 0.042253 0.020298 0.020298 0.042253 0.895990 0.041459 0.118844 0.066863 0.120942 0.693351 0.063184 0.518707 0.146819 0.271290 0.091125 0.016991 0.664338 0.227546 0.122589 0.186959 0.078274 0.612178 0.103039 0.274719 0.113320 0.508922 0.375945 0.289040 0.127861 0.207153 0.429989 0.189120 0.110127 0.270765 Consensus sequence: DGVBCRACGTYGTYHH Reverse complement motif 0.270765 0.189120 0.110127 0.429989 0.207153 0.289040 0.127861 0.375945 0.508922 0.274719 0.113320 0.103039 0.612178 0.186959 0.078274 0.122589 0.091125 0.664338 0.016991 0.227546 0.063184 0.146819 0.518707 0.271290 0.693351 0.066863 0.120942 0.118844 0.020298 0.895990 0.042253 0.041459 0.041459 0.042253 0.895990 0.020298 0.118844 0.120942 0.066863 0.693351 0.271290 0.518707 0.146819 0.063184 0.227546 0.016991 0.664338 0.091125 0.119277 0.394786 0.232191 0.253747 0.247220 0.432935 0.191958 0.127887 0.146597 0.577770 0.118316 0.157317 0.423428 0.139045 0.265726 0.171801 Consensus sequence: HHMACKACGTMGBVCD Alignment: HHMACKACGTMGBVCD ---HSCACGTGGC--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00526 Foxn1_primary Original Motif Original Motif Forward 7 10 0.038319 Species: Mus musculus Original motif 0.456612 0.057181 0.078281 0.407926 0.460529 0.185506 0.083106 0.270859 0.445717 0.179510 0.239355 0.135417 0.116339 0.145186 0.275331 0.463144 0.239398 0.142078 0.480004 0.138520 0.355157 0.217877 0.284296 0.142670 0.318602 0.444835 0.153321 0.083243 0.609569 0.055866 0.280349 0.054216 0.062297 0.769824 0.027844 0.140035 0.151868 0.019245 0.803188 0.025699 0.011842 0.952534 0.017959 0.017665 0.017665 0.017959 0.952534 0.011842 0.025699 0.803188 0.019245 0.151868 0.140035 0.027844 0.769824 0.062297 0.054216 0.280349 0.055866 0.609569 0.013084 0.624655 0.177956 0.184305 0.287647 0.183527 0.295753 0.233074 0.042309 0.345931 0.198458 0.413301 0.338138 0.266033 0.045367 0.350462 0.302850 0.155320 0.074662 0.467168 0.240926 0.068901 0.283055 0.407118 0.409954 0.183157 0.154186 0.252704 Consensus sequence: WHVBVVMACGCGCGTCDYHWDH Reverse complement motif 0.252704 0.183157 0.154186 0.409954 0.407118 0.068901 0.283055 0.240926 0.467168 0.155320 0.074662 0.302850 0.350462 0.266033 0.045367 0.338138 0.413301 0.345931 0.198458 0.042309 0.287647 0.295753 0.183527 0.233074 0.013084 0.177956 0.624655 0.184305 0.609569 0.280349 0.055866 0.054216 0.140035 0.769824 0.027844 0.062297 0.025699 0.019245 0.803188 0.151868 0.017665 0.952534 0.017959 0.011842 0.011842 0.017959 0.952534 0.017665 0.151868 0.803188 0.019245 0.025699 0.062297 0.027844 0.769824 0.140035 0.054216 0.055866 0.280349 0.609569 0.318602 0.153321 0.444835 0.083243 0.142670 0.217877 0.284296 0.355157 0.239398 0.480004 0.142078 0.138520 0.463144 0.145186 0.275331 0.116339 0.135417 0.179510 0.239355 0.445717 0.270859 0.185506 0.083106 0.460529 0.407926 0.057181 0.078281 0.456612 Consensus sequence: HDWHMHGACGCGCGTRBVVBHW Alignment: WHVBVVMACGCGCGTCDYHWDH ------HSCACGTGGC------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 41 Motif name: MZF1_5-13 Original motif 0.062500 0.250000 0.437500 0.250000 0.125000 0.000000 0.437500 0.437500 0.937500 0.062500 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.687500 0.312500 0.000000 0.000000 0.937500 0.062500 0.000000 0.125000 0.875000 0.000000 0.000000 0.000000 0.875000 0.125000 0.187500 0.062500 0.500000 0.250000 0.625000 0.000000 0.250000 0.125000 0.500000 0.125000 0.250000 0.125000 Consensus sequence: BKAGGGGDAD Reserve complement motif 0.125000 0.125000 0.250000 0.500000 0.125000 0.000000 0.250000 0.625000 0.187500 0.500000 0.062500 0.250000 0.000000 0.875000 0.000000 0.125000 0.000000 0.875000 0.125000 0.000000 0.000000 0.937500 0.000000 0.062500 0.000000 0.687500 0.000000 0.312500 0.000000 0.062500 0.000000 0.937500 0.125000 0.437500 0.000000 0.437500 0.062500 0.437500 0.250000 0.250000 Consensus sequence: BTHCCCCTYB ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 41 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00022 Zfp740_secondary Reverse Complement Original Motif Forward 4 10 0.009053 Species: Mus musculus Original motif 0.398967 0.071604 0.323957 0.205472 0.457709 0.058192 0.267218 0.216881 0.393346 0.032365 0.329533 0.244756 0.119528 0.091191 0.190078 0.599202 0.273933 0.123548 0.073075 0.529444 0.068935 0.812883 0.015245 0.102937 0.029664 0.907790 0.024804 0.037742 0.020725 0.933422 0.016796 0.029057 0.015086 0.948448 0.018030 0.018436 0.015628 0.884941 0.061172 0.038259 0.067508 0.744063 0.107305 0.081125 0.108097 0.140614 0.650174 0.101115 0.065696 0.247239 0.506149 0.180916 0.395005 0.077185 0.345914 0.181895 0.527081 0.093650 0.281853 0.097416 0.289378 0.245159 0.348803 0.116660 0.147136 0.260117 0.145993 0.446754 Consensus sequence: DDDTWCCCCCCGGDRVH Reverse complement motif 0.446754 0.260117 0.145993 0.147136 0.289378 0.348803 0.245159 0.116660 0.097416 0.093650 0.281853 0.527081 0.181895 0.077185 0.345914 0.395005 0.065696 0.506149 0.247239 0.180916 0.108097 0.650174 0.140614 0.101115 0.067508 0.107305 0.744063 0.081125 0.015628 0.061172 0.884941 0.038259 0.015086 0.018030 0.948448 0.018436 0.020725 0.016796 0.933422 0.029057 0.029664 0.024804 0.907790 0.037742 0.068935 0.015245 0.812883 0.102937 0.529444 0.123548 0.073075 0.273933 0.599202 0.091191 0.190078 0.119528 0.244756 0.032365 0.329533 0.393346 0.216881 0.058192 0.267218 0.457709 0.205472 0.071604 0.323957 0.398967 Consensus sequence: HVKDCCGGGGGGWADDD Alignment: DDDTWCCCCCCGGDRVH ---BTHCCCCTYB---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00007 Egr1_secondary Original Motif Original Motif Backward 4 10 0.009102 Species: Mus musculus Original motif 0.182057 0.230014 0.276532 0.311397 0.122004 0.156883 0.366166 0.354947 0.209446 0.335433 0.185677 0.269444 0.140035 0.276547 0.302466 0.280952 0.124879 0.019371 0.809895 0.045854 0.647807 0.117014 0.183956 0.051224 0.021434 0.011745 0.954633 0.012188 0.017853 0.009441 0.315429 0.657277 0.166123 0.008326 0.807215 0.018337 0.022775 0.008972 0.947283 0.020970 0.038795 0.033592 0.781209 0.146405 0.728916 0.032888 0.088836 0.149360 0.197826 0.427858 0.055755 0.318561 0.264938 0.196184 0.092516 0.446362 0.267969 0.195624 0.318766 0.217641 0.225006 0.250404 0.267265 0.257324 Consensus sequence: BBHBGAGTGGGAHHDB Reverse complement motif 0.225006 0.267265 0.250404 0.257324 0.267969 0.318766 0.195624 0.217641 0.446362 0.196184 0.092516 0.264938 0.197826 0.055755 0.427858 0.318561 0.149360 0.032888 0.088836 0.728916 0.038795 0.781209 0.033592 0.146405 0.022775 0.947283 0.008972 0.020970 0.166123 0.807215 0.008326 0.018337 0.657277 0.009441 0.315429 0.017853 0.021434 0.954633 0.011745 0.012188 0.051224 0.117014 0.183956 0.647807 0.124879 0.809895 0.019371 0.045854 0.140035 0.302466 0.276547 0.280952 0.209446 0.185677 0.335433 0.269444 0.122004 0.366166 0.156883 0.354947 0.311397 0.230014 0.276532 0.182057 Consensus sequence: BHHDTCCCACTCBDBV Alignment: BBHBGAGTGGGAHHDB ---BKAGGGGDAD--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00070 Gcm1_secondary Original Motif Original Motif Backward 3 10 0.010118 Species: Mus musculus Original motif 0.298360 0.124865 0.240783 0.335992 0.184300 0.174617 0.373392 0.267691 0.150632 0.435099 0.254062 0.160207 0.212569 0.220347 0.370971 0.196113 0.258171 0.316689 0.186896 0.238243 0.872371 0.051703 0.070791 0.005135 0.011560 0.017672 0.009746 0.961022 0.888546 0.042964 0.061758 0.006732 0.071365 0.009982 0.801505 0.117148 0.010657 0.014961 0.949286 0.025096 0.004496 0.009941 0.978381 0.007182 0.005645 0.010294 0.972682 0.011378 0.499895 0.152322 0.335875 0.011908 0.109410 0.346384 0.380529 0.163677 0.371764 0.096182 0.457999 0.074056 0.450207 0.392208 0.065686 0.091898 0.104224 0.228467 0.391473 0.275836 Consensus sequence: DDBVHATAGGGGRBRMB Reverse complement motif 0.104224 0.391473 0.228467 0.275836 0.091898 0.392208 0.065686 0.450207 0.371764 0.457999 0.096182 0.074056 0.109410 0.380529 0.346384 0.163677 0.011908 0.152322 0.335875 0.499895 0.005645 0.972682 0.010294 0.011378 0.004496 0.978381 0.009941 0.007182 0.010657 0.949286 0.014961 0.025096 0.071365 0.801505 0.009982 0.117148 0.006732 0.042964 0.061758 0.888546 0.961022 0.017672 0.009746 0.011560 0.005135 0.051703 0.070791 0.872371 0.258171 0.186896 0.316689 0.238243 0.212569 0.370971 0.220347 0.196113 0.150632 0.254062 0.435099 0.160207 0.184300 0.373392 0.174617 0.267691 0.335992 0.124865 0.240783 0.298360 Consensus sequence: BYMBKCCCCTATDVBHD Alignment: DDBVHATAGGGGRBRMB -----BKAGGGGDAD-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00021 Zfp281_primary Original Motif Reverse Complement Backward 6 10 0.010323 Species: Mus musculus Original motif 0.201535 0.165213 0.201324 0.431929 0.136153 0.443451 0.179132 0.241264 0.263149 0.555137 0.067983 0.113731 0.142183 0.737634 0.045722 0.074461 0.044982 0.884112 0.045356 0.025549 0.246434 0.590578 0.022655 0.140333 0.123049 0.591257 0.033072 0.252622 0.018153 0.944742 0.010254 0.026851 0.035459 0.953844 0.003988 0.006709 0.020000 0.954344 0.005966 0.019690 0.015299 0.964390 0.006755 0.013557 0.028565 0.936152 0.011660 0.023623 0.300127 0.517309 0.029700 0.152863 0.159063 0.513443 0.051834 0.275660 0.158172 0.647055 0.133256 0.061516 Consensus sequence: DBCCCCCCCCCCMYC Reverse complement motif 0.158172 0.133256 0.647055 0.061516 0.159063 0.051834 0.513443 0.275660 0.300127 0.029700 0.517309 0.152863 0.028565 0.011660 0.936152 0.023623 0.015299 0.006755 0.964390 0.013557 0.020000 0.005966 0.954344 0.019690 0.035459 0.003988 0.953844 0.006709 0.018153 0.010254 0.944742 0.026851 0.123049 0.033072 0.591257 0.252622 0.246434 0.022655 0.590578 0.140333 0.044982 0.045356 0.884112 0.025549 0.142183 0.045722 0.737634 0.074461 0.263149 0.067983 0.555137 0.113731 0.136153 0.179132 0.443451 0.241264 0.431929 0.165213 0.201324 0.201535 Consensus sequence: GKRGGGGGGGGGGBD Alignment: GKRGGGGGGGGGGBD BKAGGGGDAD----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00099 Ascl2_secondary Original Motif Reverse Complement Forward 6 10 0.012623 Species: Mus musculus Original motif 0.114462 0.345602 0.289353 0.250583 0.192593 0.250844 0.116250 0.440313 0.338838 0.304929 0.195843 0.160390 0.312051 0.115094 0.162465 0.410390 0.143975 0.600492 0.123348 0.132185 0.078751 0.715072 0.135182 0.070995 0.146191 0.685571 0.069799 0.098439 0.137287 0.646078 0.126428 0.090207 0.335099 0.092260 0.371510 0.201131 0.033090 0.631176 0.074278 0.261456 0.117516 0.619336 0.100946 0.162202 0.114769 0.627362 0.089839 0.168031 0.195787 0.252057 0.220803 0.331353 0.415355 0.120731 0.281372 0.182542 0.111178 0.217079 0.245769 0.425974 0.191517 0.296952 0.153370 0.358162 Consensus sequence: BHVDCCCCDCCCBDBH Reverse complement motif 0.358162 0.296952 0.153370 0.191517 0.425974 0.217079 0.245769 0.111178 0.182542 0.120731 0.281372 0.415355 0.331353 0.252057 0.220803 0.195787 0.114769 0.089839 0.627362 0.168031 0.117516 0.100946 0.619336 0.162202 0.033090 0.074278 0.631176 0.261456 0.335099 0.371510 0.092260 0.201131 0.137287 0.126428 0.646078 0.090207 0.146191 0.069799 0.685571 0.098439 0.078751 0.135182 0.715072 0.070995 0.143975 0.123348 0.600492 0.132185 0.410390 0.115094 0.162465 0.312051 0.160390 0.304929 0.195843 0.338838 0.440313 0.250844 0.116250 0.192593 0.114462 0.289353 0.345602 0.250583 Consensus sequence: HVDVGGGHGGGGDBHB Alignment: HVDVGGGHGGGGDBHB -----BKAGGGGDAD- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00013 Gabpa_secondary Original Motif Reverse Complement Forward 2 10 0.013531 Species: Mus musculus Original motif 0.233133 0.551828 0.139009 0.076030 0.100085 0.525562 0.101688 0.272665 0.252996 0.198121 0.299171 0.249711 0.141471 0.195290 0.234560 0.428679 0.160993 0.442765 0.082653 0.313590 0.307890 0.127950 0.071713 0.492448 0.093453 0.148935 0.080288 0.677324 0.083535 0.634212 0.074652 0.207601 0.098119 0.639328 0.099957 0.162596 0.067430 0.451776 0.357188 0.123606 0.286259 0.466975 0.063013 0.183753 0.203211 0.422637 0.133368 0.240783 0.111206 0.315595 0.192833 0.380366 0.199462 0.324652 0.305491 0.170395 0.347919 0.292387 0.230724 0.128970 0.254648 0.294196 0.194942 0.256214 Consensus sequence: CYDBYWTCCSMHBVVH Reverse complement motif 0.254648 0.194942 0.294196 0.256214 0.128970 0.292387 0.230724 0.347919 0.199462 0.305491 0.324652 0.170395 0.380366 0.315595 0.192833 0.111206 0.203211 0.133368 0.422637 0.240783 0.286259 0.063013 0.466975 0.183753 0.067430 0.357188 0.451776 0.123606 0.098119 0.099957 0.639328 0.162596 0.083535 0.074652 0.634212 0.207601 0.677324 0.148935 0.080288 0.093453 0.492448 0.127950 0.071713 0.307890 0.160993 0.082653 0.442765 0.313590 0.428679 0.195290 0.234560 0.141471 0.252996 0.299171 0.198121 0.249711 0.100085 0.101688 0.525562 0.272665 0.233133 0.139009 0.551828 0.076030 Consensus sequence: DBVVDRSGGAWKVHKG Alignment: DBVVDRSGGAWKVHKG -BKAGGGGDAD----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00022 Zfp740_primary Original Motif Reverse Complement Backward 4 10 0.015300 Species: Mus musculus Original motif 0.136946 0.396508 0.135309 0.331236 0.185528 0.417538 0.215409 0.181525 0.171276 0.341901 0.172832 0.313991 0.145641 0.590572 0.146376 0.117412 0.138035 0.660416 0.114016 0.087533 0.222728 0.750532 0.007528 0.019212 0.024633 0.963314 0.001894 0.010159 0.009557 0.979956 0.000642 0.009844 0.010416 0.977424 0.000541 0.011619 0.026401 0.956740 0.001544 0.015314 0.195502 0.755959 0.011060 0.037480 0.491291 0.364785 0.025613 0.118311 0.305153 0.398160 0.071680 0.225008 0.253497 0.232647 0.213246 0.300610 0.156964 0.297876 0.144683 0.400477 0.179549 0.292514 0.319462 0.208475 Consensus sequence: HVBCCCCCCCCMHHHB Reverse complement motif 0.179549 0.319462 0.292514 0.208475 0.400477 0.297876 0.144683 0.156964 0.300610 0.232647 0.213246 0.253497 0.305153 0.071680 0.398160 0.225008 0.118311 0.364785 0.025613 0.491291 0.195502 0.011060 0.755959 0.037480 0.026401 0.001544 0.956740 0.015314 0.010416 0.000541 0.977424 0.011619 0.009557 0.000642 0.979956 0.009844 0.024633 0.001894 0.963314 0.010159 0.222728 0.007528 0.750532 0.019212 0.138035 0.114016 0.660416 0.087533 0.145641 0.146376 0.590572 0.117412 0.171276 0.172832 0.341901 0.313991 0.185528 0.215409 0.417538 0.181525 0.136946 0.135309 0.396508 0.331236 Consensus sequence: BHHDYGGGGGGGGBVD Alignment: BHHDYGGGGGGGGBVD ---BKAGGGGDAD--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00055 Hbp1_secondary Reverse Complement Original Motif Backward 7 10 0.017653 Species: Mus musculus Original motif 0.313621 0.149049 0.200899 0.336432 0.262644 0.147616 0.334882 0.254859 0.175848 0.137857 0.292272 0.394023 0.045910 0.364107 0.180535 0.409448 0.093235 0.718630 0.093516 0.094619 0.095552 0.724866 0.044589 0.134993 0.058227 0.785149 0.029814 0.126810 0.897368 0.023735 0.019064 0.059832 0.043826 0.041750 0.020731 0.893692 0.044268 0.013557 0.014689 0.927487 0.102208 0.026005 0.709573 0.162214 0.058404 0.046118 0.135257 0.760221 0.303689 0.280676 0.320259 0.095375 0.258633 0.262177 0.197029 0.282161 0.564761 0.122466 0.194691 0.118082 0.104738 0.358061 0.310533 0.226668 0.267450 0.230099 0.197859 0.304593 Consensus sequence: DDDYCCCATTGTVHABH Reverse complement motif 0.304593 0.230099 0.197859 0.267450 0.104738 0.310533 0.358061 0.226668 0.118082 0.122466 0.194691 0.564761 0.282161 0.262177 0.197029 0.258633 0.303689 0.320259 0.280676 0.095375 0.760221 0.046118 0.135257 0.058404 0.102208 0.709573 0.026005 0.162214 0.927487 0.013557 0.014689 0.044268 0.893692 0.041750 0.020731 0.043826 0.059832 0.023735 0.019064 0.897368 0.058227 0.029814 0.785149 0.126810 0.095552 0.044589 0.724866 0.134993 0.093235 0.093516 0.718630 0.094619 0.409448 0.364107 0.180535 0.045910 0.394023 0.137857 0.292272 0.175848 0.262644 0.334882 0.147616 0.254859 0.336432 0.149049 0.200899 0.313621 Consensus sequence: HBTHVACAATGGGMDHD Alignment: DDDYCCCATTGTVHABH -BTHCCCCTYB------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00002 Sp4_primary Reverse Complement Original Motif Forward 6 10 0.018334 Species: Mus musculus Original motif 0.155386 0.223380 0.374454 0.246780 0.247106 0.159582 0.345111 0.248201 0.238889 0.258354 0.165304 0.337454 0.255612 0.489586 0.051621 0.203182 0.450100 0.545383 0.001071 0.003447 0.003704 0.991007 0.002456 0.002833 0.035504 0.001814 0.928129 0.034553 0.001494 0.991406 0.003414 0.003686 0.003045 0.990628 0.005182 0.001145 0.000990 0.963237 0.001215 0.034557 0.148016 0.838396 0.000666 0.012922 0.014261 0.905847 0.007200 0.072692 0.083394 0.270068 0.058368 0.588170 0.149141 0.286783 0.142802 0.421274 0.204851 0.347195 0.253356 0.194597 0.184442 0.299908 0.194408 0.321242 0.125793 0.380109 0.245318 0.248780 Consensus sequence: BDHHMCGCCCCCTHVBB Reverse complement motif 0.125793 0.245318 0.380109 0.248780 0.321242 0.299908 0.194408 0.184442 0.204851 0.253356 0.347195 0.194597 0.421274 0.286783 0.142802 0.149141 0.588170 0.270068 0.058368 0.083394 0.014261 0.007200 0.905847 0.072692 0.148016 0.000666 0.838396 0.012922 0.000990 0.001215 0.963237 0.034557 0.003045 0.005182 0.990628 0.001145 0.001494 0.003414 0.991406 0.003686 0.035504 0.928129 0.001814 0.034553 0.003704 0.002456 0.991007 0.002833 0.450100 0.001071 0.545383 0.003447 0.255612 0.051621 0.489586 0.203182 0.337454 0.258354 0.165304 0.238889 0.247106 0.345111 0.159582 0.248201 0.155386 0.374454 0.223380 0.246780 Consensus sequence: BVVHAGGGGGCGRDHHB Alignment: BDHHMCGCCCCCTHVBB -----BTHCCCCTYB-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00239 Obox2 Original Motif Original Motif Forward 1 10 0.019782 Species: Mus musculus Original motif 0.293849 0.125144 0.142440 0.438568 0.122280 0.144634 0.408124 0.324963 0.448856 0.147837 0.312347 0.090959 0.152801 0.059872 0.649129 0.138198 0.187720 0.040843 0.725481 0.045956 0.070379 0.021109 0.864530 0.043982 0.063765 0.006819 0.915928 0.013488 0.018370 0.002669 0.948065 0.030896 0.972042 0.020308 0.001317 0.006333 0.009162 0.002535 0.005655 0.982649 0.024250 0.007414 0.002871 0.965464 0.934913 0.002383 0.012220 0.050484 0.694401 0.019404 0.079194 0.207001 0.290944 0.524953 0.061736 0.122367 0.258089 0.064339 0.154268 0.523303 0.510991 0.233652 0.092796 0.162561 0.221195 0.238061 0.076237 0.464507 Consensus sequence: DBRGGGGGATTAAMTAH Reverse complement motif 0.464507 0.238061 0.076237 0.221195 0.162561 0.233652 0.092796 0.510991 0.523303 0.064339 0.154268 0.258089 0.290944 0.061736 0.524953 0.122367 0.207001 0.019404 0.079194 0.694401 0.050484 0.002383 0.012220 0.934913 0.965464 0.007414 0.002871 0.024250 0.982649 0.002535 0.005655 0.009162 0.006333 0.020308 0.001317 0.972042 0.018370 0.948065 0.002669 0.030896 0.063765 0.915928 0.006819 0.013488 0.070379 0.864530 0.021109 0.043982 0.187720 0.725481 0.040843 0.045956 0.152801 0.649129 0.059872 0.138198 0.090959 0.147837 0.312347 0.448856 0.122280 0.408124 0.144634 0.324963 0.438568 0.125144 0.142440 0.293849 Consensus sequence: HTARTTAATCCCCCKBD Alignment: DBRGGGGGATTAAMTAH BKAGGGGDAD------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 42 Motif name: NFKB1 Original motif 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.111111 0.000000 0.888889 0.000000 0.611111 0.055556 0.333333 0.000000 0.277778 0.000000 0.111111 0.611111 0.000000 0.277778 0.111111 0.611111 0.000000 0.722222 0.000000 0.277778 0.000000 0.944444 0.000000 0.055556 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.055556 0.833333 0.055556 0.055556 Consensus sequence: GGGGRTTCCCC Reserve complement motif 0.055556 0.055556 0.833333 0.055556 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.944444 0.055556 0.000000 0.000000 0.722222 0.277778 0.611111 0.277778 0.111111 0.000000 0.611111 0.000000 0.111111 0.277778 0.000000 0.055556 0.333333 0.611111 0.111111 0.888889 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 Consensus sequence: GGGGAAKCCCC ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 42 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00021 Zfp281_secondary Original Motif Reverse Complement Backward 1 11 0.037179 Species: Mus musculus Original motif 0.463582 0.061604 0.232850 0.241964 0.128956 0.062321 0.481130 0.327593 0.217730 0.020690 0.453776 0.307803 0.535427 0.042857 0.149994 0.271722 0.222391 0.125415 0.375419 0.276775 0.640877 0.065373 0.223489 0.070261 0.021896 0.962922 0.010999 0.004183 0.033993 0.953699 0.002967 0.009341 0.009096 0.979346 0.006614 0.004944 0.010148 0.971252 0.010228 0.008373 0.019605 0.958973 0.012496 0.008926 0.752208 0.080178 0.046020 0.121594 0.466313 0.149124 0.107403 0.277160 0.177748 0.055516 0.159170 0.607566 0.314879 0.170636 0.187525 0.326960 0.322202 0.105206 0.230803 0.341789 0.284925 0.228846 0.320951 0.165278 Consensus sequence: DKKWDACCCCCAHTDDV Reverse complement motif 0.284925 0.320951 0.228846 0.165278 0.341789 0.105206 0.230803 0.322202 0.326960 0.170636 0.187525 0.314879 0.607566 0.055516 0.159170 0.177748 0.277160 0.149124 0.107403 0.466313 0.121594 0.080178 0.046020 0.752208 0.019605 0.012496 0.958973 0.008926 0.010148 0.010228 0.971252 0.008373 0.009096 0.006614 0.979346 0.004944 0.033993 0.002967 0.953699 0.009341 0.021896 0.010999 0.962922 0.004183 0.070261 0.065373 0.223489 0.640877 0.222391 0.375419 0.125415 0.276775 0.271722 0.042857 0.149994 0.535427 0.217730 0.453776 0.020690 0.307803 0.128956 0.481130 0.062321 0.327593 0.241964 0.061604 0.232850 0.463582 Consensus sequence: VDDAHTGGGGGTHWYYD Alignment: DKKWDACCCCCAHTDDV ------GGGGRTTCCCC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00088 Plagl1_secondary Original Motif Original Motif Backward 3 11 0.040790 Species: Mus musculus Original motif 0.289171 0.173201 0.327701 0.209927 0.214498 0.351146 0.216580 0.217776 0.195842 0.158571 0.147255 0.498332 0.193177 0.050535 0.597112 0.159176 0.090067 0.011082 0.813242 0.085609 0.009711 0.005858 0.976345 0.008085 0.028320 0.003003 0.964413 0.004264 0.004384 0.005577 0.976902 0.013137 0.005407 0.010480 0.969224 0.014889 0.013126 0.014728 0.008018 0.964128 0.878962 0.009528 0.080106 0.031404 0.050698 0.888663 0.014145 0.046494 0.220252 0.630703 0.057244 0.091801 0.229911 0.340631 0.212450 0.217008 0.241118 0.325264 0.145213 0.288405 0.200246 0.235974 0.190380 0.373401 0.271001 0.126532 0.246343 0.356123 Consensus sequence: DBHGGGGGGTACCHHHD Reverse complement motif 0.356123 0.126532 0.246343 0.271001 0.373401 0.235974 0.190380 0.200246 0.241118 0.145213 0.325264 0.288405 0.229911 0.212450 0.340631 0.217008 0.220252 0.057244 0.630703 0.091801 0.050698 0.014145 0.888663 0.046494 0.031404 0.009528 0.080106 0.878962 0.964128 0.014728 0.008018 0.013126 0.005407 0.969224 0.010480 0.014889 0.004384 0.976902 0.005577 0.013137 0.028320 0.964413 0.003003 0.004264 0.009711 0.976345 0.005858 0.008085 0.090067 0.813242 0.011082 0.085609 0.193177 0.597112 0.050535 0.159176 0.498332 0.158571 0.147255 0.195842 0.214498 0.216580 0.351146 0.217776 0.289171 0.327701 0.173201 0.209927 Consensus sequence: DHDDGGTACCCCCCHBH Alignment: DBHGGGGGGTACCHHHD ----GGGGRTTCCCC-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00088 Plagl1_primary Original Motif Original Motif Forward 3 11 0.045970 Species: Mus musculus Original motif 0.119709 0.241933 0.299696 0.338662 0.236295 0.277376 0.191945 0.294383 0.203722 0.152043 0.467305 0.176931 0.187661 0.114330 0.513662 0.184347 0.047306 0.041411 0.838415 0.072868 0.131945 0.003749 0.848921 0.015385 0.003800 0.006713 0.960656 0.028832 0.002515 0.652482 0.343047 0.001955 0.001955 0.343047 0.652482 0.002515 0.028832 0.960656 0.006713 0.003800 0.015385 0.848921 0.003749 0.131945 0.072868 0.838415 0.041411 0.047306 0.193804 0.543600 0.063385 0.199211 0.210649 0.233823 0.258755 0.296773 0.376439 0.191612 0.261004 0.170945 0.230078 0.256519 0.299785 0.213618 Consensus sequence: BHDGGGGSSCCCCBVV Reverse complement motif 0.230078 0.299785 0.256519 0.213618 0.170945 0.191612 0.261004 0.376439 0.296773 0.233823 0.258755 0.210649 0.193804 0.063385 0.543600 0.199211 0.072868 0.041411 0.838415 0.047306 0.015385 0.003749 0.848921 0.131945 0.028832 0.006713 0.960656 0.003800 0.001955 0.652482 0.343047 0.002515 0.002515 0.343047 0.652482 0.001955 0.003800 0.960656 0.006713 0.028832 0.131945 0.848921 0.003749 0.015385 0.047306 0.838415 0.041411 0.072868 0.187661 0.513662 0.114330 0.184347 0.203722 0.467305 0.152043 0.176931 0.294383 0.277376 0.191945 0.236295 0.338662 0.241933 0.299696 0.119709 Consensus sequence: VBVGGGGSSCCCCHHV Alignment: BHDGGGGSSCCCCBVV --GGGGRTTCCCC--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00176 Crx Reverse Complement Reverse Complement Forward 2 11 0.046497 Species: Mus musculus Original motif 0.090571 0.470784 0.132533 0.306112 0.097553 0.215274 0.380528 0.306645 0.329642 0.096126 0.139164 0.435068 0.256197 0.120190 0.173105 0.450508 0.092558 0.110352 0.731426 0.065664 0.091713 0.267719 0.595502 0.045066 0.043905 0.002927 0.952004 0.001165 0.003160 0.002104 0.990877 0.003859 0.959206 0.038974 0.000375 0.001444 0.003080 0.004243 0.000706 0.991971 0.015557 0.002685 0.000597 0.981161 0.979685 0.000442 0.002645 0.017227 0.372459 0.028457 0.403587 0.195497 0.092995 0.682203 0.100835 0.123967 0.103130 0.522168 0.231711 0.142992 0.194271 0.158404 0.247437 0.399888 Consensus sequence: YBWDGGGGATTARCCD Reverse complement motif 0.399888 0.158404 0.247437 0.194271 0.103130 0.231711 0.522168 0.142992 0.092995 0.100835 0.682203 0.123967 0.372459 0.403587 0.028457 0.195497 0.017227 0.000442 0.002645 0.979685 0.981161 0.002685 0.000597 0.015557 0.991971 0.004243 0.000706 0.003080 0.001444 0.038974 0.000375 0.959206 0.003160 0.990877 0.002104 0.003859 0.043905 0.952004 0.002927 0.001165 0.091713 0.595502 0.267719 0.045066 0.092558 0.731426 0.110352 0.065664 0.450508 0.120190 0.173105 0.256197 0.435068 0.096126 0.139164 0.329642 0.097553 0.380528 0.215274 0.306645 0.090571 0.132533 0.470784 0.306112 Consensus sequence: DGGMTAATCCCCDWBK Alignment: DGGMTAATCCCCDWBK -GGGGAAKCCCC---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00265 Pitx3 Reverse Complement Reverse Complement Backward 3 11 0.048533 Species: Mus musculus Original motif 0.376317 0.228810 0.324927 0.069946 0.194464 0.131695 0.538949 0.134892 0.066391 0.226063 0.645457 0.062089 0.174103 0.030838 0.758315 0.036743 0.018838 0.001515 0.979039 0.000608 0.002099 0.002488 0.992192 0.003220 0.958051 0.040431 0.000340 0.001178 0.002126 0.007833 0.000559 0.989482 0.009085 0.005231 0.000358 0.985326 0.975248 0.000371 0.001696 0.022685 0.177679 0.041353 0.541741 0.239227 0.054770 0.772535 0.116688 0.056007 0.157041 0.155159 0.224874 0.462926 0.343501 0.137361 0.357922 0.161216 0.153495 0.344871 0.332684 0.168951 0.125949 0.548089 0.196494 0.129468 Consensus sequence: VGGGGGATTAGCDDBC Reverse complement motif 0.125949 0.196494 0.548089 0.129468 0.153495 0.332684 0.344871 0.168951 0.343501 0.357922 0.137361 0.161216 0.462926 0.155159 0.224874 0.157041 0.054770 0.116688 0.772535 0.056007 0.177679 0.541741 0.041353 0.239227 0.022685 0.000371 0.001696 0.975248 0.985326 0.005231 0.000358 0.009085 0.989482 0.007833 0.000559 0.002126 0.001178 0.040431 0.000340 0.958051 0.002099 0.992192 0.002488 0.003220 0.018838 0.979039 0.001515 0.000608 0.174103 0.758315 0.030838 0.036743 0.066391 0.645457 0.226063 0.062089 0.194464 0.538949 0.131695 0.134892 0.069946 0.228810 0.324927 0.376317 Consensus sequence: GBHDGCTAATCCCCCB Alignment: GBHDGCTAATCCCCCB ---GGGGAAKCCCC-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00216 Obox1 Reverse Complement Reverse Complement Backward 5 11 0.050264 Species: Mus musculus Original motif 0.239477 0.131084 0.243507 0.385932 0.217543 0.106254 0.206114 0.470089 0.647326 0.113122 0.157767 0.081785 0.447787 0.111541 0.372093 0.068580 0.248541 0.017787 0.686924 0.046748 0.088770 0.008796 0.883034 0.019400 0.049663 0.003287 0.945325 0.001725 0.003569 0.000420 0.960584 0.035426 0.967192 0.029883 0.000248 0.002677 0.001721 0.005927 0.001063 0.991288 0.008389 0.011678 0.000280 0.979653 0.946957 0.000663 0.002329 0.050052 0.711018 0.017942 0.052601 0.218440 0.234125 0.619719 0.073871 0.072285 0.255026 0.148239 0.159856 0.436879 0.448611 0.200869 0.092123 0.258397 0.182337 0.333505 0.182092 0.302066 Consensus sequence: DDARGGGGATTAACDHH Reverse complement motif 0.182337 0.182092 0.333505 0.302066 0.258397 0.200869 0.092123 0.448611 0.436879 0.148239 0.159856 0.255026 0.234125 0.073871 0.619719 0.072285 0.218440 0.017942 0.052601 0.711018 0.050052 0.000663 0.002329 0.946957 0.979653 0.011678 0.000280 0.008389 0.991288 0.005927 0.001063 0.001721 0.002677 0.029883 0.000248 0.967192 0.003569 0.960584 0.000420 0.035426 0.049663 0.945325 0.003287 0.001725 0.088770 0.883034 0.008796 0.019400 0.248541 0.686924 0.017787 0.046748 0.068580 0.111541 0.372093 0.447787 0.081785 0.113122 0.157767 0.647326 0.470089 0.106254 0.206114 0.217543 0.385932 0.131084 0.243507 0.239477 Consensus sequence: DHDGTTAATCCCCKTDD Alignment: DHDGTTAATCCCCKTDD --GGGGAAKCCCC---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00239 Obox2 Reverse Complement Reverse Complement Backward 5 11 0.051550 Species: Mus musculus Original motif 0.293849 0.125144 0.142440 0.438568 0.122280 0.144634 0.408124 0.324963 0.448856 0.147837 0.312347 0.090959 0.152801 0.059872 0.649129 0.138198 0.187720 0.040843 0.725481 0.045956 0.070379 0.021109 0.864530 0.043982 0.063765 0.006819 0.915928 0.013488 0.018370 0.002669 0.948065 0.030896 0.972042 0.020308 0.001317 0.006333 0.009162 0.002535 0.005655 0.982649 0.024250 0.007414 0.002871 0.965464 0.934913 0.002383 0.012220 0.050484 0.694401 0.019404 0.079194 0.207001 0.290944 0.524953 0.061736 0.122367 0.258089 0.064339 0.154268 0.523303 0.510991 0.233652 0.092796 0.162561 0.221195 0.238061 0.076237 0.464507 Consensus sequence: DBRGGGGGATTAAMTAH Reverse complement motif 0.464507 0.238061 0.076237 0.221195 0.162561 0.233652 0.092796 0.510991 0.523303 0.064339 0.154268 0.258089 0.290944 0.061736 0.524953 0.122367 0.207001 0.019404 0.079194 0.694401 0.050484 0.002383 0.012220 0.934913 0.965464 0.007414 0.002871 0.024250 0.982649 0.002535 0.005655 0.009162 0.006333 0.020308 0.001317 0.972042 0.018370 0.948065 0.002669 0.030896 0.063765 0.915928 0.006819 0.013488 0.070379 0.864530 0.021109 0.043982 0.187720 0.725481 0.040843 0.045956 0.152801 0.649129 0.059872 0.138198 0.090959 0.147837 0.312347 0.448856 0.122280 0.408124 0.144634 0.324963 0.438568 0.125144 0.142440 0.293849 Consensus sequence: HTARTTAATCCCCCKBD Alignment: HTARTTAATCCCCCKBD --GGGGAAKCCCC---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00160 Obox3 Reverse Complement Reverse Complement Forward 3 11 0.052060 Species: Mus musculus Original motif 0.265987 0.173377 0.153926 0.406710 0.129561 0.268972 0.350646 0.250821 0.342885 0.208848 0.334291 0.113975 0.153240 0.164565 0.582521 0.099674 0.258413 0.031726 0.629457 0.080404 0.111288 0.035159 0.768619 0.084935 0.083021 0.004060 0.905853 0.007066 0.012108 0.002693 0.970145 0.015055 0.982328 0.009671 0.001699 0.006303 0.003572 0.002819 0.006020 0.987589 0.012066 0.006455 0.003574 0.977906 0.954560 0.001995 0.009190 0.034255 0.716184 0.015547 0.126758 0.141512 0.137277 0.673851 0.087215 0.101657 0.282699 0.056894 0.162378 0.498029 0.432159 0.290288 0.109507 0.168046 0.260601 0.267351 0.069676 0.402372 Consensus sequence: HBVGGGGGATTAACWHH Reverse complement motif 0.402372 0.267351 0.069676 0.260601 0.168046 0.290288 0.109507 0.432159 0.498029 0.056894 0.162378 0.282699 0.137277 0.087215 0.673851 0.101657 0.141512 0.015547 0.126758 0.716184 0.034255 0.001995 0.009190 0.954560 0.977906 0.006455 0.003574 0.012066 0.987589 0.002819 0.006020 0.003572 0.006303 0.009671 0.001699 0.982328 0.012108 0.970145 0.002693 0.015055 0.083021 0.905853 0.004060 0.007066 0.111288 0.768619 0.035159 0.084935 0.258413 0.629457 0.031726 0.080404 0.153240 0.582521 0.164565 0.099674 0.113975 0.208848 0.334291 0.342885 0.129561 0.350646 0.268972 0.250821 0.406710 0.173377 0.153926 0.265987 Consensus sequence: HHWGTTAATCCCCCBBH Alignment: HHWGTTAATCCCCCBBH --GGGGAAKCCCC---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00024 Glis2_primary Original Motif Reverse Complement Backward 1 11 0.052761 Species: Mus musculus Original motif 0.135895 0.314811 0.129804 0.419490 0.379294 0.148356 0.125349 0.347001 0.331058 0.171563 0.156431 0.340948 0.238325 0.268940 0.259195 0.233540 0.014812 0.072844 0.774496 0.137848 0.826050 0.107559 0.058965 0.007426 0.013657 0.965452 0.008273 0.012618 0.011951 0.975704 0.007210 0.005135 0.015560 0.961676 0.004028 0.018736 0.010295 0.971668 0.003618 0.014418 0.087168 0.805495 0.002118 0.105220 0.098937 0.760880 0.010017 0.130166 0.492579 0.177017 0.171719 0.158685 0.160142 0.327745 0.192170 0.319943 0.484858 0.086830 0.273852 0.154461 0.266100 0.086868 0.363661 0.283371 Consensus sequence: HHHVGACCCCCCVBRD Reverse complement motif 0.266100 0.363661 0.086868 0.283371 0.154461 0.086830 0.273852 0.484858 0.160142 0.192170 0.327745 0.319943 0.158685 0.177017 0.171719 0.492579 0.098937 0.010017 0.760880 0.130166 0.087168 0.002118 0.805495 0.105220 0.010295 0.003618 0.971668 0.014418 0.015560 0.004028 0.961676 0.018736 0.011951 0.007210 0.975704 0.005135 0.013657 0.008273 0.965452 0.012618 0.007426 0.107559 0.058965 0.826050 0.014812 0.774496 0.072844 0.137848 0.238325 0.259195 0.268940 0.233540 0.340948 0.171563 0.156431 0.331058 0.347001 0.148356 0.125349 0.379294 0.419490 0.314811 0.129804 0.135895 Consensus sequence: HKBBGGGGGGTCVHHH Alignment: HKBBGGGGGGTCVHHH -----GGGGRTTCCCC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v015681_primaryReverse Complement Reverse Complement Forward 7 11 0.055570 Species: Mus musculus Original motif 0.472795 0.179227 0.091251 0.256726 0.036521 0.159743 0.204840 0.598896 0.164582 0.312805 0.221324 0.301289 0.237069 0.249050 0.293048 0.220833 0.401949 0.225181 0.229401 0.143469 0.161422 0.494334 0.252207 0.092036 0.252940 0.177721 0.369400 0.199939 0.119630 0.024651 0.849920 0.005798 0.000962 0.002398 0.990616 0.006023 0.937852 0.027016 0.034535 0.000597 0.008963 0.987756 0.000629 0.002652 0.001584 0.992898 0.002349 0.003169 0.956822 0.027342 0.002484 0.013352 0.009873 0.987759 0.000988 0.001381 0.016397 0.980856 0.000369 0.002378 0.081761 0.758555 0.038572 0.121112 0.371713 0.091838 0.448027 0.088423 0.111617 0.121913 0.683885 0.082585 0.334562 0.102916 0.436488 0.126034 0.210362 0.101261 0.238339 0.450037 0.169041 0.271583 0.320799 0.238576 0.140316 0.049885 0.735236 0.074563 Consensus sequence: HTBVVVDGGACCACCCRGRDBG Reverse complement motif 0.140316 0.735236 0.049885 0.074563 0.169041 0.320799 0.271583 0.238576 0.450037 0.101261 0.238339 0.210362 0.334562 0.436488 0.102916 0.126034 0.111617 0.683885 0.121913 0.082585 0.371713 0.448027 0.091838 0.088423 0.081761 0.038572 0.758555 0.121112 0.016397 0.000369 0.980856 0.002378 0.009873 0.000988 0.987759 0.001381 0.013352 0.027342 0.002484 0.956822 0.001584 0.002349 0.992898 0.003169 0.008963 0.000629 0.987756 0.002652 0.000597 0.027016 0.034535 0.937852 0.000962 0.990616 0.002398 0.006023 0.119630 0.849920 0.024651 0.005798 0.252940 0.369400 0.177721 0.199939 0.161422 0.252207 0.494334 0.092036 0.143469 0.225181 0.229401 0.401949 0.237069 0.293048 0.249050 0.220833 0.164582 0.221324 0.312805 0.301289 0.598896 0.159743 0.204840 0.036521 0.256726 0.179227 0.091251 0.472795 Consensus sequence: CBDMCMGGGTGGTCCHVBVBAH Alignment: CBDMCMGGGTGGTCCHVBVBAH ------GGGGAAKCCCC----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 43 Motif name: NR1H2RXRA Original motif 0.680000 0.200000 0.000000 0.120000 0.680000 0.040000 0.200000 0.080000 0.800000 0.000000 0.200000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.960000 0.040000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.960000 0.000000 0.000000 0.040000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.800000 0.040000 0.080000 0.080000 0.000000 0.600000 0.240000 0.160000 Consensus sequence: AAAGGTCAAAGGTCAAC Reserve complement motif 0.000000 0.240000 0.600000 0.160000 0.080000 0.040000 0.080000 0.800000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.040000 0.000000 0.000000 0.960000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.960000 0.000000 0.040000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.200000 0.800000 0.080000 0.040000 0.200000 0.680000 0.120000 0.200000 0.000000 0.680000 Consensus sequence: GTTGACCTTTGACCTTT ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 43 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v015681_secondaryReverse Complement Reverse Complement Backward 1 17 0.053845 Species: Mus musculus Original motif 0.331499 0.188505 0.182841 0.297156 0.328961 0.213025 0.273530 0.184484 0.197213 0.129292 0.524914 0.148581 0.274491 0.226406 0.312118 0.186986 0.103231 0.393726 0.364988 0.138055 0.552594 0.166422 0.186262 0.094722 0.157618 0.064773 0.616497 0.161112 0.139166 0.176098 0.621185 0.063551 0.748420 0.062398 0.012447 0.176735 0.116584 0.009438 0.860326 0.013653 0.005030 0.003646 0.974877 0.016447 0.055257 0.007181 0.921760 0.015802 0.032748 0.058249 0.052709 0.856293 0.105606 0.872231 0.014370 0.007793 0.019480 0.497379 0.125899 0.357242 0.478582 0.269713 0.061464 0.190242 0.253985 0.287006 0.201320 0.257689 0.319384 0.210231 0.175842 0.294543 0.222123 0.287802 0.201294 0.288782 0.139951 0.376041 0.081133 0.402875 0.213450 0.343835 0.383676 0.059039 0.322294 0.355918 0.148062 0.173725 Consensus sequence: HVGVSAGGAGGGTCYHHHHYVH Reverse complement motif 0.322294 0.148062 0.355918 0.173725 0.213450 0.383676 0.343835 0.059039 0.402875 0.376041 0.081133 0.139951 0.288782 0.287802 0.201294 0.222123 0.294543 0.210231 0.175842 0.319384 0.253985 0.201320 0.287006 0.257689 0.190242 0.269713 0.061464 0.478582 0.019480 0.125899 0.497379 0.357242 0.105606 0.014370 0.872231 0.007793 0.856293 0.058249 0.052709 0.032748 0.055257 0.921760 0.007181 0.015802 0.005030 0.974877 0.003646 0.016447 0.116584 0.860326 0.009438 0.013653 0.176735 0.062398 0.012447 0.748420 0.139166 0.621185 0.176098 0.063551 0.157618 0.616497 0.064773 0.161112 0.094722 0.166422 0.186262 0.552594 0.103231 0.364988 0.393726 0.138055 0.274491 0.312118 0.226406 0.186986 0.197213 0.524914 0.129292 0.148581 0.184484 0.213025 0.273530 0.328961 0.297156 0.188505 0.182841 0.331499 Consensus sequence: DVMHHDHKGACCCTCCTSVCBH Alignment: DVMHHDHKGACCCTCCTSVCBH -----GTTGACCTTTGACCTTT ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00032 Gata3_primary Original Motif Original Motif Backward 1 17 0.054510 Species: Mus musculus Original motif 0.151572 0.262753 0.258275 0.327401 0.221834 0.113385 0.275380 0.389400 0.297769 0.136928 0.134678 0.430625 0.270099 0.110415 0.271106 0.348380 0.265471 0.090253 0.223340 0.420936 0.616582 0.090091 0.171960 0.121367 0.197318 0.107541 0.406904 0.288237 0.798258 0.046950 0.001406 0.153385 0.003195 0.002516 0.989707 0.004582 0.991503 0.002748 0.002617 0.003132 0.005015 0.002764 0.003026 0.989195 0.948394 0.008932 0.001344 0.041330 0.973109 0.004100 0.004081 0.018710 0.040365 0.113905 0.828185 0.017545 0.736608 0.130524 0.113464 0.019404 0.415921 0.106101 0.316613 0.161365 0.376582 0.170927 0.155572 0.296919 0.137731 0.197151 0.211055 0.454064 0.324853 0.122747 0.246107 0.306293 0.462490 0.207311 0.159392 0.170807 0.380420 0.188972 0.311990 0.118618 0.222178 0.157873 0.380486 0.239463 Consensus sequence: BDHDDADAGATAAGADHBDHVD Reverse complement motif 0.222178 0.380486 0.157873 0.239463 0.118618 0.188972 0.311990 0.380420 0.170807 0.207311 0.159392 0.462490 0.306293 0.122747 0.246107 0.324853 0.454064 0.197151 0.211055 0.137731 0.296919 0.170927 0.155572 0.376582 0.161365 0.106101 0.316613 0.415921 0.019404 0.130524 0.113464 0.736608 0.040365 0.828185 0.113905 0.017545 0.018710 0.004100 0.004081 0.973109 0.041330 0.008932 0.001344 0.948394 0.989195 0.002764 0.003026 0.005015 0.003132 0.002748 0.002617 0.991503 0.003195 0.989707 0.002516 0.004582 0.153385 0.046950 0.001406 0.798258 0.197318 0.406904 0.107541 0.288237 0.121367 0.090091 0.171960 0.616582 0.420936 0.090253 0.223340 0.265471 0.348380 0.110415 0.271106 0.270099 0.430625 0.136928 0.134678 0.297769 0.389400 0.113385 0.275380 0.221834 0.327401 0.262753 0.258275 0.151572 Consensus sequence: HBHDVHDTCTTATCTHTDDHDV Alignment: BDHDDADAGATAAGADHBDHVD -----AAAGGTCAAAGGTCAAC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00067 Lef1_primary Original Motif Reverse Complement Forward 2 16 0.521114 Species: Mus musculus Original motif 0.281920 0.214207 0.278077 0.225796 0.325566 0.151435 0.298797 0.224202 0.290253 0.145824 0.243443 0.320480 0.069286 0.404645 0.141614 0.384454 0.070044 0.621448 0.142647 0.165862 0.007295 0.907657 0.038110 0.046938 0.015587 0.018273 0.000658 0.965482 0.005527 0.005886 0.001905 0.986682 0.024512 0.001189 0.001344 0.972955 0.007384 0.025221 0.952270 0.015125 0.966438 0.000630 0.002693 0.030239 0.082252 0.001173 0.001495 0.915080 0.030255 0.677155 0.275323 0.017267 0.199467 0.118815 0.056814 0.624905 0.345445 0.169597 0.216831 0.268127 0.278106 0.150864 0.173693 0.397336 0.251834 0.339733 0.219703 0.188730 Consensus sequence: DDDYCCTTTGATCTDDV Reverse complement motif 0.251834 0.219703 0.339733 0.188730 0.397336 0.150864 0.173693 0.278106 0.268127 0.169597 0.216831 0.345445 0.624905 0.118815 0.056814 0.199467 0.030255 0.275323 0.677155 0.017267 0.915080 0.001173 0.001495 0.082252 0.030239 0.000630 0.002693 0.966438 0.007384 0.952270 0.025221 0.015125 0.972955 0.001189 0.001344 0.024512 0.986682 0.005886 0.001905 0.005527 0.965482 0.018273 0.000658 0.015587 0.007295 0.038110 0.907657 0.046938 0.070044 0.142647 0.621448 0.165862 0.069286 0.141614 0.404645 0.384454 0.320480 0.145824 0.243443 0.290253 0.224202 0.151435 0.298797 0.325566 0.225796 0.214207 0.278077 0.281920 Consensus sequence: VDDAGATCAAAGGKDDD Alignment: VDDAGATCAAAGGKDDD- -AAAGGTCAAAGGTCAAC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00083 Tcf7l2_primary Reverse Complement Original Motif Backward 2 16 0.527825 Species: Mus musculus Original motif 0.285725 0.187143 0.254855 0.272277 0.276264 0.157893 0.258178 0.307665 0.238788 0.161120 0.254018 0.346074 0.076041 0.333901 0.150903 0.439156 0.093376 0.526578 0.180529 0.199517 0.010827 0.880320 0.034150 0.074703 0.016546 0.023834 0.000940 0.958680 0.007166 0.008215 0.001941 0.982678 0.029634 0.001363 0.001379 0.967625 0.010872 0.031751 0.926186 0.031190 0.949407 0.000760 0.002581 0.047253 0.109203 0.001362 0.002094 0.887341 0.044198 0.567994 0.353059 0.034749 0.222623 0.142360 0.041281 0.593736 0.358872 0.167597 0.220534 0.252997 0.233072 0.141480 0.230985 0.394463 0.350703 0.243129 0.233961 0.172207 Consensus sequence: DDDYCCTTTGATSTDDV Reverse complement motif 0.172207 0.243129 0.233961 0.350703 0.394463 0.141480 0.230985 0.233072 0.252997 0.167597 0.220534 0.358872 0.593736 0.142360 0.041281 0.222623 0.044198 0.353059 0.567994 0.034749 0.887341 0.001362 0.002094 0.109203 0.047253 0.000760 0.002581 0.949407 0.010872 0.926186 0.031751 0.031190 0.967625 0.001363 0.001379 0.029634 0.982678 0.008215 0.001941 0.007166 0.958680 0.023834 0.000940 0.016546 0.010827 0.034150 0.880320 0.074703 0.093376 0.180529 0.526578 0.199517 0.439156 0.333901 0.150903 0.076041 0.346074 0.161120 0.254018 0.238788 0.307665 0.157893 0.258178 0.276264 0.272277 0.187143 0.254855 0.285725 Consensus sequence: BDDASATCAAAGGMDDD Alignment: -DDDYCCTTTGATSTDDV GTTGACCTTTGACCTTT- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00054 Tcf7_primary Original Motif Original Motif Forward 2 16 0.531154 Species: Mus musculus Original motif 0.170811 0.196976 0.220503 0.411710 0.337231 0.228482 0.140137 0.294150 0.299312 0.173780 0.143426 0.383481 0.603957 0.053557 0.128214 0.214271 0.036338 0.377925 0.534647 0.051091 0.725865 0.010314 0.008501 0.255320 0.067855 0.007849 0.004559 0.919737 0.049387 0.815496 0.098330 0.036787 0.960514 0.005036 0.005137 0.029313 0.960631 0.004550 0.018815 0.016004 0.935245 0.005169 0.023866 0.035720 0.159760 0.060340 0.761341 0.018559 0.228534 0.153897 0.523052 0.094517 0.557984 0.123512 0.254154 0.064350 0.490252 0.211976 0.124557 0.173215 0.310463 0.250279 0.132612 0.306646 0.332720 0.248937 0.120633 0.297711 Consensus sequence: BHHASATCAAAGGAHHH Reverse complement motif 0.297711 0.248937 0.120633 0.332720 0.306646 0.250279 0.132612 0.310463 0.173215 0.211976 0.124557 0.490252 0.064350 0.123512 0.254154 0.557984 0.228534 0.523052 0.153897 0.094517 0.159760 0.761341 0.060340 0.018559 0.035720 0.005169 0.023866 0.935245 0.016004 0.004550 0.018815 0.960631 0.029313 0.005036 0.005137 0.960514 0.049387 0.098330 0.815496 0.036787 0.919737 0.007849 0.004559 0.067855 0.255320 0.010314 0.008501 0.725865 0.036338 0.534647 0.377925 0.051091 0.214271 0.053557 0.128214 0.603957 0.383481 0.173780 0.143426 0.299312 0.294150 0.228482 0.140137 0.337231 0.411710 0.196976 0.220503 0.170811 Consensus sequence: HHHTCCTTTGATSTHHV Alignment: BHHASATCAAAGGAHHH- -AAAGGTCAAAGGTCAAC ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00058 Tcf3_primary Original Motif Original Motif Backward 2 16 0.531876 Species: Mus musculus Original motif 0.185864 0.201179 0.183663 0.429294 0.371100 0.233868 0.122934 0.272098 0.249563 0.171285 0.128851 0.450301 0.582940 0.043382 0.129099 0.244578 0.041400 0.395349 0.497087 0.066163 0.759123 0.009670 0.005936 0.225270 0.056579 0.008662 0.003986 0.930772 0.043968 0.865783 0.056001 0.034249 0.962748 0.003731 0.003265 0.030256 0.971318 0.003542 0.012299 0.012841 0.937558 0.003991 0.020195 0.038256 0.125931 0.057976 0.798081 0.018012 0.209401 0.172342 0.483980 0.134277 0.485703 0.129227 0.309936 0.075134 0.397027 0.195902 0.152395 0.254676 0.311636 0.231510 0.157732 0.299122 0.320965 0.206031 0.164299 0.308705 Consensus sequence: HHHASATCAAAGVRHHH Reverse complement motif 0.308705 0.206031 0.164299 0.320965 0.299122 0.231510 0.157732 0.311636 0.254676 0.195902 0.152395 0.397027 0.075134 0.129227 0.309936 0.485703 0.209401 0.483980 0.172342 0.134277 0.125931 0.798081 0.057976 0.018012 0.038256 0.003991 0.020195 0.937558 0.012841 0.003542 0.012299 0.971318 0.030256 0.003731 0.003265 0.962748 0.043968 0.056001 0.865783 0.034249 0.930772 0.008662 0.003986 0.056579 0.225270 0.009670 0.005936 0.759123 0.041400 0.497087 0.395349 0.066163 0.244578 0.043382 0.129099 0.582940 0.450301 0.171285 0.128851 0.249563 0.272098 0.233868 0.122934 0.371100 0.429294 0.201179 0.183663 0.185864 Consensus sequence: HHHKVCTTTGATSTHHH Alignment: -HHHASATCAAAGVRHHH AAAGGTCAAAGGTCAAC- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00030 Sox11_primary Original Motif Original Motif Backward 2 16 0.544403 Species: Mus musculus Original motif 0.351812 0.238467 0.143954 0.265768 0.195246 0.235838 0.281473 0.287443 0.349478 0.172616 0.210739 0.267167 0.484061 0.110438 0.173131 0.232370 0.276692 0.070713 0.479604 0.172991 0.859124 0.044167 0.083951 0.012758 0.975608 0.002029 0.002285 0.020079 0.006422 0.978485 0.007124 0.007969 0.987489 0.003025 0.002868 0.006617 0.987739 0.005463 0.002730 0.004067 0.693013 0.004067 0.002445 0.300475 0.189100 0.003677 0.801408 0.005814 0.352090 0.072517 0.567737 0.007656 0.542316 0.176545 0.192768 0.088371 0.196382 0.304176 0.205985 0.293457 0.289415 0.201358 0.182937 0.326290 0.385801 0.216362 0.152363 0.245475 Consensus sequence: HBDDRAACAAAGRABHH Reverse complement motif 0.245475 0.216362 0.152363 0.385801 0.326290 0.201358 0.182937 0.289415 0.196382 0.205985 0.304176 0.293457 0.088371 0.176545 0.192768 0.542316 0.352090 0.567737 0.072517 0.007656 0.189100 0.801408 0.003677 0.005814 0.300475 0.004067 0.002445 0.693013 0.004067 0.005463 0.002730 0.987739 0.006617 0.003025 0.002868 0.987489 0.006422 0.007124 0.978485 0.007969 0.020079 0.002029 0.002285 0.975608 0.012758 0.044167 0.083951 0.859124 0.276692 0.479604 0.070713 0.172991 0.232370 0.110438 0.173131 0.484061 0.267167 0.172616 0.210739 0.349478 0.287443 0.235838 0.281473 0.195246 0.265768 0.238467 0.143954 0.351812 Consensus sequence: HHBTMCTTTGTTMDDVH Alignment: -HBDDRAACAAAGRABHH AAAGGTCAAAGGTCAAC- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00062 Sox4_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 16 0.544565 Species: Mus musculus Original motif 0.427843 0.231210 0.119424 0.221523 0.196506 0.239531 0.304906 0.259057 0.302488 0.156922 0.290190 0.250401 0.433872 0.149126 0.196496 0.220506 0.258426 0.076511 0.475100 0.189963 0.841714 0.046453 0.099915 0.011918 0.983853 0.001612 0.001362 0.013174 0.003460 0.982032 0.005728 0.008780 0.989743 0.002253 0.002020 0.005984 0.990761 0.003397 0.002843 0.003000 0.770864 0.003540 0.001549 0.224048 0.235342 0.002598 0.757383 0.004677 0.371426 0.089574 0.529959 0.009040 0.480804 0.196949 0.240413 0.081833 0.187158 0.355102 0.216599 0.241142 0.248006 0.232182 0.157452 0.362360 0.403367 0.177684 0.164649 0.254300 Consensus sequence: HBDDDAACAAAGRVBHH Reverse complement motif 0.254300 0.177684 0.164649 0.403367 0.362360 0.232182 0.157452 0.248006 0.187158 0.216599 0.355102 0.241142 0.081833 0.196949 0.240413 0.480804 0.371426 0.529959 0.089574 0.009040 0.235342 0.757383 0.002598 0.004677 0.224048 0.003540 0.001549 0.770864 0.003000 0.003397 0.002843 0.990761 0.005984 0.002253 0.002020 0.989743 0.003460 0.005728 0.982032 0.008780 0.013174 0.001612 0.001362 0.983853 0.011918 0.046453 0.099915 0.841714 0.258426 0.475100 0.076511 0.189963 0.220506 0.149126 0.196496 0.433872 0.250401 0.156922 0.290190 0.302488 0.196506 0.304906 0.239531 0.259057 0.221523 0.231210 0.119424 0.427843 Consensus sequence: HHBBMCTTTGTTHDDBH Alignment: -HHBBMCTTTGTTHDDBH GTTGACCTTTGACCTTT- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00019 Zbtb12_primary Reverse Complement Reverse Complement Backward 2 16 0.550511 Species: Mus musculus Original motif 0.163348 0.349811 0.273573 0.213268 0.212612 0.211975 0.220400 0.355012 0.325879 0.220972 0.186720 0.266430 0.510632 0.041115 0.419323 0.028930 0.067550 0.203499 0.411224 0.317727 0.023546 0.002038 0.972278 0.002138 0.017818 0.006841 0.006478 0.968864 0.019791 0.001443 0.009338 0.969428 0.003084 0.992130 0.002654 0.002131 0.001031 0.039768 0.003588 0.955613 0.980811 0.006260 0.008964 0.003965 0.013624 0.002796 0.979716 0.003863 0.841198 0.016422 0.129217 0.013163 0.169265 0.145424 0.085753 0.599558 0.068235 0.584950 0.065758 0.281057 0.378189 0.252218 0.209355 0.160238 0.167389 0.305726 0.229730 0.297156 Consensus sequence: BDHRBGTTCTAGATCVB Reverse complement motif 0.167389 0.229730 0.305726 0.297156 0.160238 0.252218 0.209355 0.378189 0.068235 0.065758 0.584950 0.281057 0.599558 0.145424 0.085753 0.169265 0.013163 0.016422 0.129217 0.841198 0.013624 0.979716 0.002796 0.003863 0.003965 0.006260 0.008964 0.980811 0.955613 0.039768 0.003588 0.001031 0.003084 0.002654 0.992130 0.002131 0.969428 0.001443 0.009338 0.019791 0.968864 0.006841 0.006478 0.017818 0.023546 0.972278 0.002038 0.002138 0.067550 0.411224 0.203499 0.317727 0.028930 0.041115 0.419323 0.510632 0.266430 0.220972 0.186720 0.325879 0.355012 0.211975 0.220400 0.212612 0.163348 0.273573 0.349811 0.213268 Consensus sequence: BBGATCTAGAACBKHDB Alignment: -BBGATCTAGAACBKHDB GTTGACCTTTGACCTTT- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00046 Tcfe2a_secondary Original Motif Original Motif Backward 2 16 0.552064 Species: Mus musculus Original motif 0.296417 0.247522 0.206749 0.249312 0.410113 0.201959 0.303149 0.084779 0.267313 0.132645 0.452057 0.147985 0.187929 0.136827 0.427628 0.247616 0.198671 0.425254 0.234160 0.141915 0.029244 0.953929 0.004092 0.012734 0.954570 0.014314 0.018695 0.012421 0.010025 0.055055 0.845504 0.089415 0.874802 0.040849 0.069178 0.015172 0.015084 0.010551 0.008736 0.965628 0.012981 0.007192 0.965036 0.014791 0.037724 0.016891 0.495632 0.449753 0.021685 0.438927 0.056118 0.483270 0.209872 0.365671 0.139706 0.284751 0.151815 0.336912 0.289382 0.221891 0.152995 0.262354 0.416434 0.168217 0.227567 0.187603 0.447892 0.136938 Consensus sequence: HVDDVCAGATGKYHBBV Reverse complement motif 0.227567 0.447892 0.187603 0.136938 0.152995 0.416434 0.262354 0.168217 0.151815 0.289382 0.336912 0.221891 0.209872 0.139706 0.365671 0.284751 0.483270 0.438927 0.056118 0.021685 0.037724 0.495632 0.016891 0.449753 0.012981 0.965036 0.007192 0.014791 0.965628 0.010551 0.008736 0.015084 0.015172 0.040849 0.069178 0.874802 0.010025 0.845504 0.055055 0.089415 0.012421 0.014314 0.018695 0.954570 0.029244 0.004092 0.953929 0.012734 0.198671 0.234160 0.425254 0.141915 0.187929 0.427628 0.136827 0.247616 0.267313 0.452057 0.132645 0.147985 0.084779 0.201959 0.303149 0.410113 0.249312 0.247522 0.206749 0.296417 Consensus sequence: VBBDMYCATCTGVHHBH Alignment: -HVDDVCAGATGKYHBBV AAAGGTCAAAGGTCAAC- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 44 Motif name: NR4A2 Original motif 0.615385 0.076923 0.230769 0.076923 0.928571 0.000000 0.071429 0.000000 0.000000 0.000000 0.928571 0.071429 0.214286 0.000000 0.785714 0.000000 0.142857 0.142857 0.000000 0.714286 0.000000 0.928571 0.000000 0.071429 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.230769 0.615385 0.153846 0.000000 Consensus sequence: AAGGTCAC Reserve complement motif 0.230769 0.153846 0.615385 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.928571 0.071429 0.714286 0.142857 0.000000 0.142857 0.214286 0.785714 0.000000 0.000000 0.000000 0.928571 0.000000 0.071429 0.000000 0.000000 0.071429 0.928571 0.076923 0.076923 0.230769 0.615385 Consensus sequence: GTGACCTT ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 44 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00048 Rara Original Motif Original Motif Backward 4 8 0.000000 Species: Mus musculus Original motif 0.222478 0.177331 0.266395 0.333797 0.276222 0.360097 0.118354 0.245327 0.106047 0.268455 0.234217 0.391281 0.244163 0.407141 0.146864 0.201832 0.852083 0.050643 0.039941 0.057332 0.814108 0.012894 0.165984 0.007015 0.905198 0.005648 0.088378 0.000776 0.002783 0.000555 0.988205 0.008457 0.001289 0.000626 0.898209 0.099877 0.002878 0.001631 0.008910 0.986582 0.000499 0.975550 0.005264 0.018687 0.963627 0.000883 0.034432 0.001058 0.181490 0.517766 0.077094 0.223650 0.183789 0.384790 0.308350 0.123071 0.229801 0.228801 0.224468 0.316930 0.218244 0.170273 0.366746 0.244736 Consensus sequence: DHBHAAAGGTCACVHD Reverse complement motif 0.218244 0.366746 0.170273 0.244736 0.316930 0.228801 0.224468 0.229801 0.183789 0.308350 0.384790 0.123071 0.181490 0.077094 0.517766 0.223650 0.001058 0.000883 0.034432 0.963627 0.000499 0.005264 0.975550 0.018687 0.986582 0.001631 0.008910 0.002878 0.001289 0.898209 0.000626 0.099877 0.002783 0.988205 0.000555 0.008457 0.000776 0.005648 0.088378 0.905198 0.007015 0.012894 0.165984 0.814108 0.057332 0.050643 0.039941 0.852083 0.244163 0.146864 0.407141 0.201832 0.391281 0.268455 0.234217 0.106047 0.276222 0.118354 0.360097 0.245327 0.333797 0.177331 0.266395 0.222478 Consensus sequence: HHVGTGACCTTTDVDD Alignment: DHBHAAAGGTCACVHD -----AAGGTCAC--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00009 Nr2f2_primary Original Motif Original Motif Backward 4 8 0.007453 Species: Mus musculus Original motif 0.253408 0.181904 0.273186 0.291502 0.262827 0.381870 0.153734 0.201569 0.143383 0.243233 0.242562 0.370823 0.247498 0.336892 0.176114 0.239496 0.856654 0.037068 0.049492 0.056786 0.797369 0.012935 0.176463 0.013233 0.808222 0.001309 0.189796 0.000674 0.002583 0.000536 0.989167 0.007714 0.002421 0.000283 0.972777 0.024519 0.000270 0.003650 0.019038 0.977041 0.000184 0.956654 0.005329 0.037833 0.925587 0.000706 0.072434 0.001273 0.307028 0.327297 0.079126 0.286549 0.238576 0.245847 0.384025 0.131552 0.281599 0.234987 0.226211 0.257204 0.211511 0.212695 0.363980 0.211815 Consensus sequence: DHBHAAAGGTCAHVHB Reverse complement motif 0.211511 0.363980 0.212695 0.211815 0.257204 0.234987 0.226211 0.281599 0.238576 0.384025 0.245847 0.131552 0.307028 0.079126 0.327297 0.286549 0.001273 0.000706 0.072434 0.925587 0.000184 0.005329 0.956654 0.037833 0.977041 0.003650 0.019038 0.000270 0.002421 0.972777 0.000283 0.024519 0.002583 0.989167 0.000536 0.007714 0.000674 0.001309 0.189796 0.808222 0.013233 0.012935 0.176463 0.797369 0.056786 0.037068 0.049492 0.856654 0.247498 0.176114 0.336892 0.239496 0.370823 0.243233 0.242562 0.143383 0.262827 0.153734 0.381870 0.201569 0.291502 0.181904 0.273186 0.253408 Consensus sequence: BHVDTGACCTTTDVDD Alignment: DHBHAAAGGTCAHVHB -----AAGGTCAC--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00079 Esrra_primary Original Motif Original Motif Backward 5 8 0.015420 Species: Mus musculus Original motif 0.212524 0.177958 0.293723 0.315796 0.420838 0.283140 0.144938 0.151084 0.198119 0.196347 0.260353 0.345181 0.117752 0.282184 0.137207 0.462857 0.070125 0.781439 0.138093 0.010344 0.965989 0.000956 0.023828 0.009227 0.977263 0.003066 0.019255 0.000416 0.007404 0.000267 0.938934 0.053395 0.007147 0.000287 0.983377 0.009190 0.039608 0.000730 0.040682 0.918981 0.000685 0.905345 0.021930 0.072040 0.800961 0.001126 0.195791 0.002121 0.245039 0.241263 0.038084 0.475614 0.265397 0.238316 0.304963 0.191325 0.203742 0.286208 0.231002 0.279048 0.194132 0.188854 0.346693 0.270322 0.310711 0.263840 0.184317 0.241132 Consensus sequence: DHDBCAAGGTCAHVBDH Reverse complement motif 0.241132 0.263840 0.184317 0.310711 0.194132 0.346693 0.188854 0.270322 0.203742 0.231002 0.286208 0.279048 0.265397 0.304963 0.238316 0.191325 0.475614 0.241263 0.038084 0.245039 0.002121 0.001126 0.195791 0.800961 0.000685 0.021930 0.905345 0.072040 0.918981 0.000730 0.040682 0.039608 0.007147 0.983377 0.000287 0.009190 0.007404 0.938934 0.000267 0.053395 0.000416 0.003066 0.019255 0.977263 0.009227 0.000956 0.023828 0.965989 0.070125 0.138093 0.781439 0.010344 0.462857 0.282184 0.137207 0.117752 0.345181 0.196347 0.260353 0.198119 0.151084 0.283140 0.144938 0.420838 0.315796 0.177958 0.293723 0.212524 Consensus sequence: HHBVHTGACCTTGVDHD Alignment: DHDBCAAGGTCAHVBDH -----AAGGTCAC---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00009 Nr2f2_secondary Original Motif Original Motif Backward 4 8 0.039564 Species: Mus musculus Original motif 0.195749 0.435700 0.196915 0.171636 0.131070 0.131912 0.417834 0.319184 0.238959 0.441529 0.174973 0.144539 0.187749 0.189727 0.405849 0.216675 0.006751 0.541370 0.182092 0.269787 0.005388 0.590608 0.339869 0.064135 0.088153 0.004666 0.902351 0.004830 0.002459 0.004278 0.982637 0.010626 0.003618 0.002504 0.985275 0.008602 0.003325 0.004017 0.009244 0.983414 0.002547 0.972864 0.005345 0.019244 0.940260 0.002927 0.053632 0.003181 0.222459 0.390569 0.251497 0.135475 0.151824 0.258444 0.332866 0.256865 0.175811 0.290583 0.232086 0.301520 0.356690 0.198973 0.136050 0.308287 Consensus sequence: VBVBCSGGGTCAVBBH Reverse complement motif 0.308287 0.198973 0.136050 0.356690 0.301520 0.290583 0.232086 0.175811 0.151824 0.332866 0.258444 0.256865 0.222459 0.251497 0.390569 0.135475 0.003181 0.002927 0.053632 0.940260 0.002547 0.005345 0.972864 0.019244 0.983414 0.004017 0.009244 0.003325 0.003618 0.985275 0.002504 0.008602 0.002459 0.982637 0.004278 0.010626 0.088153 0.902351 0.004666 0.004830 0.005388 0.339869 0.590608 0.064135 0.006751 0.182092 0.541370 0.269787 0.187749 0.405849 0.189727 0.216675 0.238959 0.174973 0.441529 0.144539 0.131070 0.417834 0.131912 0.319184 0.195749 0.196915 0.435700 0.171636 Consensus sequence: HVBVTGACCCSGBVBV Alignment: VBVBCSGGGTCAVBBH -----AAGGTCAC--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00082 Zfp187_secondary Reverse Complement Original Motif Forward 1 8 0.040787 Species: Mus musculus Original motif 0.173063 0.169680 0.440836 0.216421 0.353277 0.179996 0.249403 0.217325 0.307337 0.038055 0.616380 0.038228 0.316636 0.564670 0.023732 0.094962 0.015484 0.923764 0.019439 0.041313 0.011243 0.956300 0.009443 0.023014 0.062273 0.107531 0.010739 0.819456 0.126670 0.201521 0.192005 0.479803 0.093090 0.045924 0.835792 0.025194 0.020165 0.015483 0.009567 0.954786 0.010873 0.672448 0.004559 0.312121 0.018002 0.846860 0.017605 0.117533 0.335703 0.408170 0.104095 0.152031 0.150308 0.362296 0.067408 0.419988 0.286490 0.242211 0.176532 0.294767 0.265022 0.249655 0.272219 0.213104 Consensus sequence: DDGMCCTBGTCCHYHV Reverse complement motif 0.265022 0.272219 0.249655 0.213104 0.294767 0.242211 0.176532 0.286490 0.419988 0.362296 0.067408 0.150308 0.335703 0.104095 0.408170 0.152031 0.018002 0.017605 0.846860 0.117533 0.010873 0.004559 0.672448 0.312121 0.954786 0.015483 0.009567 0.020165 0.093090 0.835792 0.045924 0.025194 0.479803 0.201521 0.192005 0.126670 0.819456 0.107531 0.010739 0.062273 0.011243 0.009443 0.956300 0.023014 0.015484 0.019439 0.923764 0.041313 0.316636 0.023732 0.564670 0.094962 0.307337 0.616380 0.038055 0.038228 0.217325 0.179996 0.249403 0.353277 0.173063 0.440836 0.169680 0.216421 Consensus sequence: VHMDGGACVAGGRCDH Alignment: VHMDGGACVAGGRCDH GTGACCTT-------- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00053 Rxra_primary Reverse Complement Original Motif Forward 5 8 0.042293 Species: Mus musculus Original motif 0.235299 0.222264 0.237416 0.305021 0.144778 0.278902 0.341673 0.234648 0.261127 0.261904 0.191591 0.285378 0.119943 0.410774 0.218940 0.250343 0.222672 0.075554 0.365253 0.336521 0.001838 0.046904 0.002828 0.948430 0.030410 0.006359 0.960821 0.002410 0.987391 0.007562 0.002810 0.002237 0.105188 0.888650 0.001163 0.004998 0.006475 0.987074 0.001793 0.004659 0.001816 0.765138 0.003092 0.229953 0.010354 0.846496 0.029899 0.113251 0.328732 0.039382 0.265510 0.366377 0.209638 0.262628 0.145613 0.382121 0.385390 0.177695 0.299828 0.137087 0.403452 0.268924 0.096028 0.231595 0.203082 0.231812 0.213520 0.351585 Consensus sequence: DBHBDTGACCCCDHVHB Reverse complement motif 0.351585 0.231812 0.213520 0.203082 0.231595 0.268924 0.096028 0.403452 0.137087 0.177695 0.299828 0.385390 0.382121 0.262628 0.145613 0.209638 0.366377 0.039382 0.265510 0.328732 0.010354 0.029899 0.846496 0.113251 0.001816 0.003092 0.765138 0.229953 0.006475 0.001793 0.987074 0.004659 0.105188 0.001163 0.888650 0.004998 0.002237 0.007562 0.002810 0.987391 0.030410 0.960821 0.006359 0.002410 0.948430 0.046904 0.002828 0.001838 0.222672 0.365253 0.075554 0.336521 0.119943 0.218940 0.410774 0.250343 0.285378 0.261904 0.191591 0.261127 0.144778 0.341673 0.278902 0.234648 0.305021 0.222264 0.237416 0.235299 Consensus sequence: VHBHDGGGGTCAHBHBD Alignment: DBHBDTGACCCCDHVHB ----GTGACCTT----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00079 Esrra_secondary Original Motif Original Motif Backward 5 8 0.044744 Species: Mus musculus Original motif 0.252126 0.268706 0.351590 0.127578 0.158171 0.083434 0.389646 0.368749 0.180010 0.290882 0.279192 0.249916 0.206905 0.249360 0.275438 0.268296 0.756588 0.046202 0.023921 0.173289 0.018262 0.022596 0.949143 0.010000 0.206468 0.046491 0.745475 0.001566 0.005511 0.001141 0.983152 0.010196 0.004791 0.001893 0.985951 0.007365 0.027643 0.001133 0.008565 0.962659 0.002459 0.970934 0.007826 0.018780 0.924387 0.003164 0.071225 0.001224 0.419387 0.230189 0.111588 0.238836 0.290954 0.163823 0.341233 0.203991 0.196768 0.281307 0.313868 0.208056 0.128428 0.260428 0.378607 0.232537 0.269305 0.378895 0.123480 0.228320 Consensus sequence: VKBBAGGGGTCAHDBBH Reverse complement motif 0.269305 0.123480 0.378895 0.228320 0.128428 0.378607 0.260428 0.232537 0.196768 0.313868 0.281307 0.208056 0.290954 0.341233 0.163823 0.203991 0.238836 0.230189 0.111588 0.419387 0.001224 0.003164 0.071225 0.924387 0.002459 0.007826 0.970934 0.018780 0.962659 0.001133 0.008565 0.027643 0.004791 0.985951 0.001893 0.007365 0.005511 0.983152 0.001141 0.010196 0.206468 0.745475 0.046491 0.001566 0.018262 0.949143 0.022596 0.010000 0.173289 0.046202 0.023921 0.756588 0.206905 0.275438 0.249360 0.268296 0.180010 0.279192 0.290882 0.249916 0.158171 0.389646 0.083434 0.368749 0.252126 0.351590 0.268706 0.127578 Consensus sequence: DBBHHTGACCCCTBBYV Alignment: VKBBAGGGGTCAHDBBH -----AAGGTCAC---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00066 Hnf4a_secondary Original Motif Original Motif Forward 6 8 0.048142 Species: Mus musculus Original motif 0.131680 0.169949 0.346277 0.352094 0.109910 0.144258 0.373681 0.372151 0.196671 0.411335 0.159689 0.232305 0.311086 0.307077 0.122332 0.259505 0.895155 0.013238 0.038874 0.052733 0.779629 0.018399 0.171269 0.030703 0.950546 0.002649 0.041825 0.004980 0.004769 0.002646 0.985847 0.006739 0.004458 0.002117 0.012011 0.981414 0.016789 0.969626 0.003890 0.009695 0.002468 0.982852 0.004754 0.009926 0.891448 0.003193 0.097548 0.007811 0.513330 0.308971 0.070467 0.107232 0.179371 0.115514 0.130898 0.574217 0.285826 0.277536 0.166982 0.269655 0.319407 0.227783 0.129020 0.323790 Consensus sequence: BBHHAAAGTCCAMTHH Reverse complement motif 0.323790 0.227783 0.129020 0.319407 0.269655 0.277536 0.166982 0.285826 0.574217 0.115514 0.130898 0.179371 0.107232 0.308971 0.070467 0.513330 0.007811 0.003193 0.097548 0.891448 0.002468 0.004754 0.982852 0.009926 0.016789 0.003890 0.969626 0.009695 0.981414 0.002117 0.012011 0.004458 0.004769 0.985847 0.002646 0.006739 0.004980 0.002649 0.041825 0.950546 0.030703 0.018399 0.171269 0.779629 0.052733 0.013238 0.038874 0.895155 0.259505 0.307077 0.122332 0.311086 0.196671 0.159689 0.411335 0.232305 0.109910 0.373681 0.144258 0.372151 0.352094 0.169949 0.346277 0.131680 Consensus sequence: HHAYTGGACTTTHDBV Alignment: BBHHAAAGTCCAMTHH -----AAGGTCAC--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00197 Hoxc9 Reverse Complement Reverse Complement Forward 8 8 0.049768 Species: Mus musculus Original motif 0.279588 0.205946 0.337877 0.176588 0.212819 0.121136 0.376165 0.289881 0.371836 0.224291 0.240111 0.163762 0.200999 0.056254 0.589311 0.153436 0.141203 0.048864 0.796449 0.013484 0.026376 0.197045 0.009146 0.767433 0.286968 0.688278 0.011985 0.012769 0.890619 0.006181 0.098071 0.005129 0.019680 0.011114 0.002539 0.966668 0.287238 0.007432 0.002166 0.703164 0.975510 0.006204 0.005667 0.012620 0.949137 0.017111 0.006224 0.027528 0.241729 0.296577 0.052768 0.408926 0.212400 0.269675 0.090007 0.427918 0.333376 0.091783 0.259582 0.315259 0.182024 0.203528 0.245531 0.368917 Consensus sequence: VDVGGTCATTAAHHDB Reverse complement motif 0.368917 0.203528 0.245531 0.182024 0.315259 0.091783 0.259582 0.333376 0.427918 0.269675 0.090007 0.212400 0.408926 0.296577 0.052768 0.241729 0.027528 0.017111 0.006224 0.949137 0.012620 0.006204 0.005667 0.975510 0.703164 0.007432 0.002166 0.287238 0.966668 0.011114 0.002539 0.019680 0.005129 0.006181 0.098071 0.890619 0.286968 0.011985 0.688278 0.012769 0.767433 0.197045 0.009146 0.026376 0.141203 0.796449 0.048864 0.013484 0.200999 0.589311 0.056254 0.153436 0.163762 0.224291 0.240111 0.371836 0.212819 0.376165 0.121136 0.289881 0.279588 0.337877 0.205946 0.176588 Consensus sequence: VDHHTTAATGACCBHV Alignment: VDHHTTAATGACCBHV -------GTGACCTT- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00035 Hic1_secondary Reverse Complement Original Motif Forward 5 8 0.050006 Species: Mus musculus Original motif 0.204898 0.149951 0.363373 0.281778 0.112946 0.243700 0.437938 0.205417 0.205232 0.182319 0.383143 0.229305 0.242063 0.152491 0.296426 0.309020 0.312922 0.028523 0.585026 0.073529 0.006754 0.011178 0.005346 0.976723 0.127589 0.005562 0.859436 0.007414 0.010046 0.974694 0.007001 0.008259 0.010262 0.974769 0.006069 0.008899 0.015122 0.966101 0.007970 0.010807 0.556511 0.167389 0.114635 0.161465 0.586459 0.044786 0.073450 0.295305 0.297710 0.194666 0.223655 0.283969 0.303202 0.250809 0.206475 0.239514 0.279338 0.160655 0.314457 0.245550 0.266477 0.266890 0.299970 0.166662 Consensus sequence: DBDDRTGCCCAWDHDV Reverse complement motif 0.266477 0.299970 0.266890 0.166662 0.279338 0.314457 0.160655 0.245550 0.239514 0.250809 0.206475 0.303202 0.283969 0.194666 0.223655 0.297710 0.295305 0.044786 0.073450 0.586459 0.161465 0.167389 0.114635 0.556511 0.015122 0.007970 0.966101 0.010807 0.010262 0.006069 0.974769 0.008899 0.010046 0.007001 0.974694 0.008259 0.127589 0.859436 0.005562 0.007414 0.976723 0.011178 0.005346 0.006754 0.312922 0.585026 0.028523 0.073529 0.309020 0.152491 0.296426 0.242063 0.205232 0.383143 0.182319 0.229305 0.112946 0.437938 0.243700 0.205417 0.204898 0.363373 0.149951 0.281778 Consensus sequence: VHHDWTGGGCAMDHBH Alignment: DBDDRTGCCCAWDHDV ----GTGACCTT---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 45 Motif name: Pax5 Original motif 0.333333 0.083333 0.333333 0.250000 0.333333 0.000000 0.666667 0.000000 0.333333 0.250000 0.250000 0.166667 0.083333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.083333 0.166667 0.583333 0.166667 0.083333 0.166667 0.166667 0.416667 0.250000 0.166667 0.000000 0.250000 0.166667 0.583333 0.083333 0.166667 0.666667 0.083333 0.500000 0.083333 0.250000 0.166667 0.500000 0.000000 0.166667 0.333333 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.166667 0.666667 0.083333 0.083333 0.250000 0.000000 0.750000 0.000000 0.083333 0.000000 0.333333 0.583333 0.500000 0.083333 0.416667 0.000000 0.416667 0.083333 0.416667 0.083333 0.166667 0.833333 0.000000 0.000000 0.166667 0.416667 0.416667 0.000000 0.416667 0.000000 0.500000 0.083333 Consensus sequence: DGVBCABTGDWGCGKRRCSR Reserve complement motif 0.416667 0.500000 0.000000 0.083333 0.166667 0.416667 0.416667 0.000000 0.166667 0.000000 0.833333 0.000000 0.083333 0.083333 0.416667 0.416667 0.000000 0.083333 0.416667 0.500000 0.583333 0.000000 0.333333 0.083333 0.250000 0.750000 0.000000 0.000000 0.166667 0.083333 0.666667 0.083333 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.333333 0.000000 0.166667 0.500000 0.166667 0.083333 0.250000 0.500000 0.083333 0.666667 0.166667 0.083333 0.583333 0.250000 0.166667 0.000000 0.166667 0.250000 0.416667 0.166667 0.166667 0.166667 0.083333 0.583333 0.166667 0.083333 0.583333 0.166667 0.083333 0.416667 0.166667 0.333333 0.166667 0.250000 0.250000 0.333333 0.333333 0.666667 0.000000 0.000000 0.250000 0.083333 0.333333 0.333333 Consensus sequence: MSGKKRCGCWDCABTGBBCD ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 45 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00526 Foxn1_secondary Original Motif Original Motif Backward 2 20 0.049954 Species: Mus musculus Original motif 0.477863 0.106306 0.184102 0.231729 0.304951 0.149020 0.361418 0.184612 0.548996 0.056128 0.348902 0.045974 0.385727 0.477782 0.086218 0.050273 0.409556 0.232265 0.173851 0.184328 0.174550 0.312880 0.307123 0.205448 0.850398 0.047204 0.041665 0.060734 0.141234 0.548534 0.142230 0.168002 0.059462 0.026354 0.892948 0.021236 0.053714 0.870297 0.028935 0.047055 0.086273 0.069147 0.805284 0.039296 0.033781 0.573881 0.034115 0.358223 0.035191 0.079663 0.824970 0.060176 0.051830 0.862631 0.019359 0.066180 0.178685 0.015738 0.762485 0.043092 0.058988 0.042615 0.017608 0.880789 0.202382 0.173360 0.284095 0.340163 0.098493 0.234651 0.506524 0.160333 0.109087 0.336204 0.250510 0.304198 0.130945 0.250843 0.177122 0.441090 0.353830 0.138838 0.162784 0.344548 0.114290 0.417163 0.160662 0.307885 Consensus sequence: DDRMHBACGCGYGCGTDGBBDB Reverse complement motif 0.114290 0.160662 0.417163 0.307885 0.344548 0.138838 0.162784 0.353830 0.441090 0.250843 0.177122 0.130945 0.109087 0.250510 0.336204 0.304198 0.098493 0.506524 0.234651 0.160333 0.340163 0.173360 0.284095 0.202382 0.880789 0.042615 0.017608 0.058988 0.178685 0.762485 0.015738 0.043092 0.051830 0.019359 0.862631 0.066180 0.035191 0.824970 0.079663 0.060176 0.033781 0.034115 0.573881 0.358223 0.086273 0.805284 0.069147 0.039296 0.053714 0.028935 0.870297 0.047055 0.059462 0.892948 0.026354 0.021236 0.141234 0.142230 0.548534 0.168002 0.060734 0.047204 0.041665 0.850398 0.174550 0.307123 0.312880 0.205448 0.184328 0.232265 0.173851 0.409556 0.385727 0.086218 0.477782 0.050273 0.045974 0.056128 0.348902 0.548996 0.304951 0.361418 0.149020 0.184612 0.231729 0.106306 0.184102 0.477863 Consensus sequence: BDVBCDACGCKCGCGTBHRKHD Alignment: DDRMHBACGCGYGCGTDGBBDB -DGVBCABTGDWGCGKRRCSR- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00526 Foxn1_primary Original Motif Reverse Complement Forward 1 20 0.052020 Species: Mus musculus Original motif 0.456612 0.057181 0.078281 0.407926 0.460529 0.185506 0.083106 0.270859 0.445717 0.179510 0.239355 0.135417 0.116339 0.145186 0.275331 0.463144 0.239398 0.142078 0.480004 0.138520 0.355157 0.217877 0.284296 0.142670 0.318602 0.444835 0.153321 0.083243 0.609569 0.055866 0.280349 0.054216 0.062297 0.769824 0.027844 0.140035 0.151868 0.019245 0.803188 0.025699 0.011842 0.952534 0.017959 0.017665 0.017665 0.017959 0.952534 0.011842 0.025699 0.803188 0.019245 0.151868 0.140035 0.027844 0.769824 0.062297 0.054216 0.280349 0.055866 0.609569 0.013084 0.624655 0.177956 0.184305 0.287647 0.183527 0.295753 0.233074 0.042309 0.345931 0.198458 0.413301 0.338138 0.266033 0.045367 0.350462 0.302850 0.155320 0.074662 0.467168 0.240926 0.068901 0.283055 0.407118 0.409954 0.183157 0.154186 0.252704 Consensus sequence: WHVBVVMACGCGCGTCDYHWDH Reverse complement motif 0.252704 0.183157 0.154186 0.409954 0.407118 0.068901 0.283055 0.240926 0.467168 0.155320 0.074662 0.302850 0.350462 0.266033 0.045367 0.338138 0.413301 0.345931 0.198458 0.042309 0.287647 0.295753 0.183527 0.233074 0.013084 0.177956 0.624655 0.184305 0.609569 0.280349 0.055866 0.054216 0.140035 0.769824 0.027844 0.062297 0.025699 0.019245 0.803188 0.151868 0.017665 0.952534 0.017959 0.011842 0.011842 0.017959 0.952534 0.017665 0.151868 0.803188 0.019245 0.025699 0.062297 0.027844 0.769824 0.140035 0.054216 0.055866 0.280349 0.609569 0.318602 0.153321 0.444835 0.083243 0.142670 0.217877 0.284296 0.355157 0.239398 0.480004 0.142078 0.138520 0.463144 0.145186 0.275331 0.116339 0.135417 0.179510 0.239355 0.445717 0.270859 0.185506 0.083106 0.460529 0.407926 0.057181 0.078281 0.456612 Consensus sequence: HDWHMHGACGCGCGTRBVVBHW Alignment: WHVBVVMACGCGCGTCDYHWDH DGVBCABTGDWGCGKRRCSR-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Backward 2 20 0.054276 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK -DGVBCABTGDWGCGKRRCSR- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00528 Foxm1_secondary Reverse Complement Reverse Complement Forward 3 20 0.056064 Species: Mus musculus Original motif 0.399785 0.446658 0.111435 0.042122 0.535175 0.103991 0.089706 0.271128 0.078171 0.387987 0.375083 0.158759 0.309001 0.519142 0.070618 0.101239 0.201844 0.255818 0.323149 0.219190 0.534101 0.109845 0.235026 0.121028 0.656038 0.037473 0.261484 0.045006 0.315713 0.164290 0.471815 0.048182 0.651960 0.009412 0.328237 0.010391 0.937365 0.017313 0.007516 0.037807 0.019983 0.044238 0.012387 0.923392 0.061195 0.021485 0.881645 0.035675 0.017521 0.952998 0.013139 0.016342 0.254160 0.029735 0.493023 0.223082 0.239200 0.593324 0.114503 0.052973 0.610822 0.071539 0.099169 0.218470 0.166610 0.389712 0.204400 0.239278 0.227752 0.361626 0.178497 0.232125 0.537030 0.182466 0.026035 0.254470 0.235902 0.151006 0.043788 0.569304 0.081851 0.250397 0.590059 0.077693 0.340417 0.189613 0.272075 0.197895 Consensus sequence: MWSMBAARRATGCDCABHATGD Reverse complement motif 0.197895 0.189613 0.272075 0.340417 0.081851 0.590059 0.250397 0.077693 0.569304 0.151006 0.043788 0.235902 0.254470 0.182466 0.026035 0.537030 0.227752 0.178497 0.361626 0.232125 0.166610 0.204400 0.389712 0.239278 0.218470 0.071539 0.099169 0.610822 0.239200 0.114503 0.593324 0.052973 0.254160 0.493023 0.029735 0.223082 0.017521 0.013139 0.952998 0.016342 0.061195 0.881645 0.021485 0.035675 0.923392 0.044238 0.012387 0.019983 0.037807 0.017313 0.007516 0.937365 0.010391 0.009412 0.328237 0.651960 0.315713 0.471815 0.164290 0.048182 0.045006 0.037473 0.261484 0.656038 0.121028 0.109845 0.235026 0.534101 0.201844 0.323149 0.255818 0.219190 0.309001 0.070618 0.519142 0.101239 0.078171 0.375083 0.387987 0.158759 0.271128 0.103991 0.089706 0.535175 0.399785 0.111435 0.446658 0.042122 Consensus sequence: DCATDBTGHGCATKMTTBRSWR Alignment: DCATDBTGHGCATKMTTBRSWR --MSGKKRCGCWDCABTGBBCD ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 1 20 0.059567 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH DGVBCABTGDWGCGKRRCSR--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00528 Foxm1_primary Original Motif Original Motif Forward 1 20 0.060256 Species: Mus musculus Original motif 0.402634 0.249702 0.143705 0.203959 0.709619 0.108953 0.130781 0.050647 0.334232 0.077498 0.228818 0.359452 0.131721 0.094794 0.234481 0.539005 0.170102 0.237609 0.252464 0.339824 0.244961 0.347304 0.228129 0.179606 0.612141 0.132244 0.180110 0.075504 0.472236 0.042388 0.234419 0.250957 0.125213 0.007413 0.849788 0.017587 0.702068 0.064216 0.141992 0.091724 0.008657 0.038238 0.002959 0.950145 0.007170 0.002244 0.986824 0.003763 0.002862 0.979956 0.000711 0.016471 0.971196 0.001954 0.011441 0.015409 0.105575 0.031482 0.022836 0.840107 0.031534 0.736742 0.032785 0.198939 0.479153 0.347558 0.031799 0.141490 0.056405 0.123140 0.023989 0.796466 0.111194 0.195344 0.501360 0.192102 0.376359 0.416820 0.072818 0.134004 0.225111 0.249460 0.306563 0.218866 0.405251 0.168478 0.108618 0.317653 0.165386 0.191749 0.268604 0.374261 Consensus sequence: HADTBVADGATGCATCMTGMVHB Reverse complement motif 0.374261 0.191749 0.268604 0.165386 0.317653 0.168478 0.108618 0.405251 0.225111 0.306563 0.249460 0.218866 0.376359 0.072818 0.416820 0.134004 0.111194 0.501360 0.195344 0.192102 0.796466 0.123140 0.023989 0.056405 0.141490 0.347558 0.031799 0.479153 0.031534 0.032785 0.736742 0.198939 0.840107 0.031482 0.022836 0.105575 0.015409 0.001954 0.011441 0.971196 0.002862 0.000711 0.979956 0.016471 0.007170 0.986824 0.002244 0.003763 0.950145 0.038238 0.002959 0.008657 0.091724 0.064216 0.141992 0.702068 0.125213 0.849788 0.007413 0.017587 0.250957 0.042388 0.234419 0.472236 0.075504 0.132244 0.180110 0.612141 0.244961 0.228129 0.347304 0.179606 0.339824 0.237609 0.252464 0.170102 0.539005 0.094794 0.234481 0.131721 0.359452 0.077498 0.228818 0.334232 0.050647 0.108953 0.130781 0.709619 0.203959 0.249702 0.143705 0.402634 Consensus sequence: VHVRCAYGATGCATCDTVVADTH Alignment: HADTBVADGATGCATCMTGMVHB DGVBCABTGDWGCGKRRCSR--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 4 20 0.060751 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB DGVBCABTGDWGCGKRRCSR--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00098 Rfx3_secondary Reverse Complement Reverse Complement Backward 4 20 0.061123 Species: Mus musculus Original motif 0.314514 0.275352 0.257617 0.152518 0.126939 0.598294 0.130576 0.144192 0.102265 0.155334 0.177957 0.564445 0.129288 0.282678 0.326990 0.261044 0.318166 0.227823 0.175681 0.278330 0.109019 0.380838 0.278328 0.231815 0.226145 0.289206 0.291300 0.193348 0.035863 0.844339 0.072582 0.047216 0.223793 0.187244 0.088092 0.500871 0.039800 0.029681 0.026201 0.904317 0.298298 0.032147 0.654746 0.014809 0.014729 0.022023 0.944826 0.018422 0.485114 0.004925 0.013785 0.496176 0.035708 0.020381 0.240804 0.703108 0.951152 0.012738 0.017886 0.018224 0.023713 0.944394 0.009538 0.022355 0.291067 0.385205 0.232388 0.091339 0.340334 0.199588 0.311526 0.148552 0.198713 0.472138 0.178319 0.150830 0.321155 0.269932 0.311301 0.097612 0.412646 0.195252 0.231950 0.160152 0.297134 0.180928 0.250400 0.271538 0.151169 0.305386 0.358574 0.184871 Consensus sequence: VCTBHBVCTTGGWTACVVVVVDB Reverse complement motif 0.151169 0.358574 0.305386 0.184871 0.271538 0.180928 0.250400 0.297134 0.160152 0.195252 0.231950 0.412646 0.097612 0.269932 0.311301 0.321155 0.198713 0.178319 0.472138 0.150830 0.148552 0.199588 0.311526 0.340334 0.291067 0.232388 0.385205 0.091339 0.023713 0.009538 0.944394 0.022355 0.018224 0.012738 0.017886 0.951152 0.703108 0.020381 0.240804 0.035708 0.496176 0.004925 0.013785 0.485114 0.014729 0.944826 0.022023 0.018422 0.298298 0.654746 0.032147 0.014809 0.904317 0.029681 0.026201 0.039800 0.500871 0.187244 0.088092 0.223793 0.035863 0.072582 0.844339 0.047216 0.226145 0.291300 0.289206 0.193348 0.109019 0.278328 0.380838 0.231815 0.278330 0.227823 0.175681 0.318166 0.129288 0.326990 0.282678 0.261044 0.564445 0.155334 0.177957 0.102265 0.126939 0.130576 0.598294 0.144192 0.152518 0.275352 0.257617 0.314514 Consensus sequence: BDBBVBVGTAWCCAAGVBHBAGB Alignment: BDBBVBVGTAWCCAAGVBHBAGB MSGKKRCGCWDCABTGBBCD--- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00050 Bhlhb2_primary Reverse Complement Original Motif Forward 3 20 0.061136 Species: Mus musculus Original motif 0.347837 0.112349 0.403713 0.136102 0.298329 0.175329 0.324534 0.201809 0.421791 0.222553 0.113615 0.242041 0.387506 0.130670 0.161435 0.320389 0.197183 0.244864 0.304611 0.253342 0.345884 0.188786 0.278290 0.187041 0.228203 0.142148 0.408269 0.221381 0.037126 0.006772 0.231775 0.724328 0.055214 0.942800 0.001192 0.000794 0.974119 0.004466 0.015535 0.005880 0.000300 0.958145 0.007498 0.034056 0.034056 0.007498 0.958145 0.000300 0.005880 0.015535 0.004466 0.974119 0.000794 0.001192 0.942800 0.055214 0.724328 0.231775 0.006772 0.037126 0.015720 0.466476 0.315208 0.202596 0.173670 0.355170 0.210710 0.260449 0.407419 0.261539 0.134430 0.196612 0.351478 0.209698 0.262426 0.176399 0.207869 0.284582 0.198951 0.308598 0.434482 0.113724 0.184408 0.267386 0.211144 0.363745 0.173978 0.251133 Consensus sequence: RDHDBVDTCACGTGASBHVHDH Reverse complement motif 0.211144 0.173978 0.363745 0.251133 0.267386 0.113724 0.184408 0.434482 0.308598 0.284582 0.198951 0.207869 0.176399 0.209698 0.262426 0.351478 0.196612 0.261539 0.134430 0.407419 0.173670 0.210710 0.355170 0.260449 0.015720 0.315208 0.466476 0.202596 0.037126 0.231775 0.006772 0.724328 0.000794 0.942800 0.001192 0.055214 0.974119 0.015535 0.004466 0.005880 0.034056 0.958145 0.007498 0.000300 0.000300 0.007498 0.958145 0.034056 0.005880 0.004466 0.015535 0.974119 0.055214 0.001192 0.942800 0.000794 0.724328 0.006772 0.231775 0.037126 0.228203 0.408269 0.142148 0.221381 0.187041 0.188786 0.278290 0.345884 0.197183 0.304611 0.244864 0.253342 0.320389 0.130670 0.161435 0.387506 0.242041 0.222553 0.113615 0.421791 0.298329 0.324534 0.175329 0.201809 0.347837 0.403713 0.112349 0.136102 Consensus sequence: DDHBHBSTCACGTGAHBBDHHM Alignment: RDHDBVDTCACGTGASBHVHDH --MSGKKRCGCWDCABTGBBCD ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_secondary Original Motif Original Motif Forward 1 20 0.061403 Species: Mus musculus Original motif 0.067627 0.131333 0.654425 0.146615 0.156488 0.114442 0.145630 0.583441 0.206450 0.265630 0.358017 0.169903 0.090729 0.460713 0.274712 0.173847 0.285994 0.099998 0.154485 0.459523 0.635908 0.184787 0.072982 0.106323 0.748421 0.039204 0.092605 0.119769 0.081342 0.061327 0.044532 0.812799 0.143120 0.043879 0.024216 0.788785 0.247544 0.092102 0.621453 0.038901 0.295531 0.036295 0.027594 0.640580 0.194561 0.305468 0.339916 0.160055 0.175038 0.193568 0.101212 0.530182 0.145226 0.167488 0.559871 0.127415 0.271501 0.237429 0.206701 0.284369 0.216834 0.109191 0.569605 0.104370 0.182624 0.177160 0.300475 0.339742 0.331737 0.198645 0.265137 0.204482 0.230155 0.359365 0.183450 0.227029 0.056581 0.067297 0.463052 0.413070 0.198891 0.324626 0.304424 0.172059 0.181968 0.287547 0.202419 0.328066 Consensus sequence: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB Reverse complement motif 0.328066 0.287547 0.202419 0.181968 0.198891 0.304424 0.324626 0.172059 0.056581 0.463052 0.067297 0.413070 0.230155 0.183450 0.359365 0.227029 0.204482 0.198645 0.265137 0.331737 0.339742 0.177160 0.300475 0.182624 0.216834 0.569605 0.109191 0.104370 0.284369 0.237429 0.206701 0.271501 0.145226 0.559871 0.167488 0.127415 0.530182 0.193568 0.101212 0.175038 0.194561 0.339916 0.305468 0.160055 0.640580 0.036295 0.027594 0.295531 0.247544 0.621453 0.092102 0.038901 0.788785 0.043879 0.024216 0.143120 0.812799 0.061327 0.044532 0.081342 0.119769 0.039204 0.092605 0.748421 0.106323 0.184787 0.072982 0.635908 0.459523 0.099998 0.154485 0.285994 0.090729 0.274712 0.460713 0.173847 0.206450 0.358017 0.265630 0.169903 0.583441 0.114442 0.145630 0.156488 0.067627 0.654425 0.131333 0.146615 Consensus sequence: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC Alignment: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB DGVBCABTGDWGCGKRRCSR-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 46 Motif name: RORA_1 Original motif 0.600000 0.040000 0.080000 0.280000 0.360000 0.040000 0.000000 0.600000 0.240000 0.480000 0.160000 0.120000 0.440000 0.080000 0.200000 0.280000 0.840000 0.000000 0.160000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 Consensus sequence: AWVDAGGTCA Reserve complement motif 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.160000 0.840000 0.280000 0.080000 0.200000 0.440000 0.240000 0.160000 0.480000 0.120000 0.600000 0.040000 0.000000 0.360000 0.280000 0.040000 0.080000 0.600000 Consensus sequence: TGACCTDVWT ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 46 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00009 Nr2f2_primary Original Motif Original Motif Backward 5 10 0.015475 Species: Mus musculus Original motif 0.253408 0.181904 0.273186 0.291502 0.262827 0.381870 0.153734 0.201569 0.143383 0.243233 0.242562 0.370823 0.247498 0.336892 0.176114 0.239496 0.856654 0.037068 0.049492 0.056786 0.797369 0.012935 0.176463 0.013233 0.808222 0.001309 0.189796 0.000674 0.002583 0.000536 0.989167 0.007714 0.002421 0.000283 0.972777 0.024519 0.000270 0.003650 0.019038 0.977041 0.000184 0.956654 0.005329 0.037833 0.925587 0.000706 0.072434 0.001273 0.307028 0.327297 0.079126 0.286549 0.238576 0.245847 0.384025 0.131552 0.281599 0.234987 0.226211 0.257204 0.211511 0.212695 0.363980 0.211815 Consensus sequence: DHBHAAAGGTCAHVHB Reverse complement motif 0.211511 0.363980 0.212695 0.211815 0.257204 0.234987 0.226211 0.281599 0.238576 0.384025 0.245847 0.131552 0.307028 0.079126 0.327297 0.286549 0.001273 0.000706 0.072434 0.925587 0.000184 0.005329 0.956654 0.037833 0.977041 0.003650 0.019038 0.000270 0.002421 0.972777 0.000283 0.024519 0.002583 0.989167 0.000536 0.007714 0.000674 0.001309 0.189796 0.808222 0.013233 0.012935 0.176463 0.797369 0.056786 0.037068 0.049492 0.856654 0.247498 0.176114 0.336892 0.239496 0.370823 0.243233 0.242562 0.143383 0.262827 0.153734 0.381870 0.201569 0.291502 0.181904 0.273186 0.253408 Consensus sequence: BHVDTGACCTTTDVDD Alignment: DHBHAAAGGTCAHVHB --AWVDAGGTCA---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00079 Esrra_primary Reverse Complement Reverse Complement Forward 6 10 0.017666 Species: Mus musculus Original motif 0.212524 0.177958 0.293723 0.315796 0.420838 0.283140 0.144938 0.151084 0.198119 0.196347 0.260353 0.345181 0.117752 0.282184 0.137207 0.462857 0.070125 0.781439 0.138093 0.010344 0.965989 0.000956 0.023828 0.009227 0.977263 0.003066 0.019255 0.000416 0.007404 0.000267 0.938934 0.053395 0.007147 0.000287 0.983377 0.009190 0.039608 0.000730 0.040682 0.918981 0.000685 0.905345 0.021930 0.072040 0.800961 0.001126 0.195791 0.002121 0.245039 0.241263 0.038084 0.475614 0.265397 0.238316 0.304963 0.191325 0.203742 0.286208 0.231002 0.279048 0.194132 0.188854 0.346693 0.270322 0.310711 0.263840 0.184317 0.241132 Consensus sequence: DHDBCAAGGTCAHVBDH Reverse complement motif 0.241132 0.263840 0.184317 0.310711 0.194132 0.346693 0.188854 0.270322 0.203742 0.231002 0.286208 0.279048 0.265397 0.304963 0.238316 0.191325 0.475614 0.241263 0.038084 0.245039 0.002121 0.001126 0.195791 0.800961 0.000685 0.021930 0.905345 0.072040 0.918981 0.000730 0.040682 0.039608 0.007147 0.983377 0.000287 0.009190 0.007404 0.938934 0.000267 0.053395 0.000416 0.003066 0.019255 0.977263 0.009227 0.000956 0.023828 0.965989 0.070125 0.138093 0.781439 0.010344 0.462857 0.282184 0.137207 0.117752 0.345181 0.196347 0.260353 0.198119 0.151084 0.283140 0.144938 0.420838 0.315796 0.177958 0.293723 0.212524 Consensus sequence: HHBVHTGACCTTGVDHD Alignment: HHBVHTGACCTTGVDHD -----TGACCTDVWT-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00048 Rara Original Motif Original Motif Backward 5 10 0.018960 Species: Mus musculus Original motif 0.222478 0.177331 0.266395 0.333797 0.276222 0.360097 0.118354 0.245327 0.106047 0.268455 0.234217 0.391281 0.244163 0.407141 0.146864 0.201832 0.852083 0.050643 0.039941 0.057332 0.814108 0.012894 0.165984 0.007015 0.905198 0.005648 0.088378 0.000776 0.002783 0.000555 0.988205 0.008457 0.001289 0.000626 0.898209 0.099877 0.002878 0.001631 0.008910 0.986582 0.000499 0.975550 0.005264 0.018687 0.963627 0.000883 0.034432 0.001058 0.181490 0.517766 0.077094 0.223650 0.183789 0.384790 0.308350 0.123071 0.229801 0.228801 0.224468 0.316930 0.218244 0.170273 0.366746 0.244736 Consensus sequence: DHBHAAAGGTCACVHD Reverse complement motif 0.218244 0.366746 0.170273 0.244736 0.316930 0.228801 0.224468 0.229801 0.183789 0.308350 0.384790 0.123071 0.181490 0.077094 0.517766 0.223650 0.001058 0.000883 0.034432 0.963627 0.000499 0.005264 0.975550 0.018687 0.986582 0.001631 0.008910 0.002878 0.001289 0.898209 0.000626 0.099877 0.002783 0.988205 0.000555 0.008457 0.000776 0.005648 0.088378 0.905198 0.007015 0.012894 0.165984 0.814108 0.057332 0.050643 0.039941 0.852083 0.244163 0.146864 0.407141 0.201832 0.391281 0.268455 0.234217 0.106047 0.276222 0.118354 0.360097 0.245327 0.333797 0.177331 0.266395 0.222478 Consensus sequence: HHVGTGACCTTTDVDD Alignment: DHBHAAAGGTCACVHD --AWVDAGGTCA---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00009 Nr2f2_secondary Original Motif Original Motif Backward 5 10 0.033200 Species: Mus musculus Original motif 0.195749 0.435700 0.196915 0.171636 0.131070 0.131912 0.417834 0.319184 0.238959 0.441529 0.174973 0.144539 0.187749 0.189727 0.405849 0.216675 0.006751 0.541370 0.182092 0.269787 0.005388 0.590608 0.339869 0.064135 0.088153 0.004666 0.902351 0.004830 0.002459 0.004278 0.982637 0.010626 0.003618 0.002504 0.985275 0.008602 0.003325 0.004017 0.009244 0.983414 0.002547 0.972864 0.005345 0.019244 0.940260 0.002927 0.053632 0.003181 0.222459 0.390569 0.251497 0.135475 0.151824 0.258444 0.332866 0.256865 0.175811 0.290583 0.232086 0.301520 0.356690 0.198973 0.136050 0.308287 Consensus sequence: VBVBCSGGGTCAVBBH Reverse complement motif 0.308287 0.198973 0.136050 0.356690 0.301520 0.290583 0.232086 0.175811 0.151824 0.332866 0.258444 0.256865 0.222459 0.251497 0.390569 0.135475 0.003181 0.002927 0.053632 0.940260 0.002547 0.005345 0.972864 0.019244 0.983414 0.004017 0.009244 0.003325 0.003618 0.985275 0.002504 0.008602 0.002459 0.982637 0.004278 0.010626 0.088153 0.902351 0.004666 0.004830 0.005388 0.339869 0.590608 0.064135 0.006751 0.182092 0.541370 0.269787 0.187749 0.405849 0.189727 0.216675 0.238959 0.174973 0.441529 0.144539 0.131070 0.417834 0.131912 0.319184 0.195749 0.196915 0.435700 0.171636 Consensus sequence: HVBVTGACCCSGBVBV Alignment: VBVBCSGGGTCAVBBH --AWVDAGGTCA---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00066 Hnf4a_primary Original Motif Original Motif Forward 3 10 0.034177 Species: Mus musculus Original motif 0.223704 0.280688 0.251889 0.243719 0.198683 0.190981 0.267970 0.342366 0.150012 0.319579 0.206063 0.324347 0.274896 0.302572 0.238597 0.183935 0.438853 0.331148 0.021186 0.208812 0.133937 0.027342 0.832490 0.006231 0.141462 0.002336 0.854359 0.001843 0.003464 0.000753 0.987433 0.008349 0.004388 0.000692 0.884494 0.110426 0.003808 0.001605 0.016793 0.977794 0.001992 0.976605 0.003739 0.017664 0.881237 0.089981 0.026017 0.002764 0.735041 0.106592 0.083260 0.075107 0.164419 0.315518 0.181031 0.339032 0.228285 0.176364 0.157583 0.437768 0.233407 0.193567 0.327076 0.245951 0.320479 0.312566 0.195701 0.171254 Consensus sequence: BDBVMGGGGTCAABHDV Reverse complement motif 0.171254 0.312566 0.195701 0.320479 0.233407 0.327076 0.193567 0.245951 0.437768 0.176364 0.157583 0.228285 0.339032 0.315518 0.181031 0.164419 0.075107 0.106592 0.083260 0.735041 0.002764 0.089981 0.026017 0.881237 0.001992 0.003739 0.976605 0.017664 0.977794 0.001605 0.016793 0.003808 0.004388 0.884494 0.000692 0.110426 0.003464 0.987433 0.000753 0.008349 0.141462 0.854359 0.002336 0.001843 0.133937 0.832490 0.027342 0.006231 0.208812 0.331148 0.021186 0.438853 0.274896 0.238597 0.302572 0.183935 0.324347 0.319579 0.206063 0.150012 0.342366 0.190981 0.267970 0.198683 0.223704 0.251889 0.280688 0.243719 Consensus sequence: BHHVTTGACCCCYVVDB Alignment: BDBVMGGGGTCAABHDV --AWVDAGGTCA----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00053 Rxra_primary Reverse Complement Original Motif Forward 6 10 0.036357 Species: Mus musculus Original motif 0.235299 0.222264 0.237416 0.305021 0.144778 0.278902 0.341673 0.234648 0.261127 0.261904 0.191591 0.285378 0.119943 0.410774 0.218940 0.250343 0.222672 0.075554 0.365253 0.336521 0.001838 0.046904 0.002828 0.948430 0.030410 0.006359 0.960821 0.002410 0.987391 0.007562 0.002810 0.002237 0.105188 0.888650 0.001163 0.004998 0.006475 0.987074 0.001793 0.004659 0.001816 0.765138 0.003092 0.229953 0.010354 0.846496 0.029899 0.113251 0.328732 0.039382 0.265510 0.366377 0.209638 0.262628 0.145613 0.382121 0.385390 0.177695 0.299828 0.137087 0.403452 0.268924 0.096028 0.231595 0.203082 0.231812 0.213520 0.351585 Consensus sequence: DBHBDTGACCCCDHVHB Reverse complement motif 0.351585 0.231812 0.213520 0.203082 0.231595 0.268924 0.096028 0.403452 0.137087 0.177695 0.299828 0.385390 0.382121 0.262628 0.145613 0.209638 0.366377 0.039382 0.265510 0.328732 0.010354 0.029899 0.846496 0.113251 0.001816 0.003092 0.765138 0.229953 0.006475 0.001793 0.987074 0.004659 0.105188 0.001163 0.888650 0.004998 0.002237 0.007562 0.002810 0.987391 0.030410 0.960821 0.006359 0.002410 0.948430 0.046904 0.002828 0.001838 0.222672 0.365253 0.075554 0.336521 0.119943 0.218940 0.410774 0.250343 0.285378 0.261904 0.191591 0.261127 0.144778 0.341673 0.278902 0.234648 0.305021 0.222264 0.237416 0.235299 Consensus sequence: VHBHDGGGGTCAHBHBD Alignment: DBHBDTGACCCCDHVHB -----TGACCTDVWT-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00079 Esrra_secondary Original Motif Original Motif Backward 6 10 0.039128 Species: Mus musculus Original motif 0.252126 0.268706 0.351590 0.127578 0.158171 0.083434 0.389646 0.368749 0.180010 0.290882 0.279192 0.249916 0.206905 0.249360 0.275438 0.268296 0.756588 0.046202 0.023921 0.173289 0.018262 0.022596 0.949143 0.010000 0.206468 0.046491 0.745475 0.001566 0.005511 0.001141 0.983152 0.010196 0.004791 0.001893 0.985951 0.007365 0.027643 0.001133 0.008565 0.962659 0.002459 0.970934 0.007826 0.018780 0.924387 0.003164 0.071225 0.001224 0.419387 0.230189 0.111588 0.238836 0.290954 0.163823 0.341233 0.203991 0.196768 0.281307 0.313868 0.208056 0.128428 0.260428 0.378607 0.232537 0.269305 0.378895 0.123480 0.228320 Consensus sequence: VKBBAGGGGTCAHDBBH Reverse complement motif 0.269305 0.123480 0.378895 0.228320 0.128428 0.378607 0.260428 0.232537 0.196768 0.313868 0.281307 0.208056 0.290954 0.341233 0.163823 0.203991 0.238836 0.230189 0.111588 0.419387 0.001224 0.003164 0.071225 0.924387 0.002459 0.007826 0.970934 0.018780 0.962659 0.001133 0.008565 0.027643 0.004791 0.985951 0.001893 0.007365 0.005511 0.983152 0.001141 0.010196 0.206468 0.745475 0.046491 0.001566 0.018262 0.949143 0.022596 0.010000 0.173289 0.046202 0.023921 0.756588 0.206905 0.275438 0.249360 0.268296 0.180010 0.279192 0.290882 0.249916 0.158171 0.389646 0.083434 0.368749 0.252126 0.351590 0.268706 0.127578 Consensus sequence: DBBHHTGACCCCTBBYV Alignment: VKBBAGGGGTCAHDBBH --AWVDAGGTCA----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00035 Hic1_secondary Reverse Complement Original Motif Backward 2 10 0.044421 Species: Mus musculus Original motif 0.204898 0.149951 0.363373 0.281778 0.112946 0.243700 0.437938 0.205417 0.205232 0.182319 0.383143 0.229305 0.242063 0.152491 0.296426 0.309020 0.312922 0.028523 0.585026 0.073529 0.006754 0.011178 0.005346 0.976723 0.127589 0.005562 0.859436 0.007414 0.010046 0.974694 0.007001 0.008259 0.010262 0.974769 0.006069 0.008899 0.015122 0.966101 0.007970 0.010807 0.556511 0.167389 0.114635 0.161465 0.586459 0.044786 0.073450 0.295305 0.297710 0.194666 0.223655 0.283969 0.303202 0.250809 0.206475 0.239514 0.279338 0.160655 0.314457 0.245550 0.266477 0.266890 0.299970 0.166662 Consensus sequence: DBDDRTGCCCAWDHDV Reverse complement motif 0.266477 0.299970 0.266890 0.166662 0.279338 0.314457 0.160655 0.245550 0.239514 0.250809 0.206475 0.303202 0.283969 0.194666 0.223655 0.297710 0.295305 0.044786 0.073450 0.586459 0.161465 0.167389 0.114635 0.556511 0.015122 0.007970 0.966101 0.010807 0.010262 0.006069 0.974769 0.008899 0.010046 0.007001 0.974694 0.008259 0.127589 0.859436 0.005562 0.007414 0.976723 0.011178 0.005346 0.006754 0.312922 0.585026 0.028523 0.073529 0.309020 0.152491 0.296426 0.242063 0.205232 0.383143 0.182319 0.229305 0.112946 0.437938 0.243700 0.205417 0.204898 0.363373 0.149951 0.281778 Consensus sequence: VHHDWTGGGCAMDHBH Alignment: DBDDRTGCCCAWDHDV -----TGACCTDVWT- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00050 Bhlhb2_primary Original Motif Reverse Complement Forward 1 10 0.046143 Species: Mus musculus Original motif 0.347837 0.112349 0.403713 0.136102 0.298329 0.175329 0.324534 0.201809 0.421791 0.222553 0.113615 0.242041 0.387506 0.130670 0.161435 0.320389 0.197183 0.244864 0.304611 0.253342 0.345884 0.188786 0.278290 0.187041 0.228203 0.142148 0.408269 0.221381 0.037126 0.006772 0.231775 0.724328 0.055214 0.942800 0.001192 0.000794 0.974119 0.004466 0.015535 0.005880 0.000300 0.958145 0.007498 0.034056 0.034056 0.007498 0.958145 0.000300 0.005880 0.015535 0.004466 0.974119 0.000794 0.001192 0.942800 0.055214 0.724328 0.231775 0.006772 0.037126 0.015720 0.466476 0.315208 0.202596 0.173670 0.355170 0.210710 0.260449 0.407419 0.261539 0.134430 0.196612 0.351478 0.209698 0.262426 0.176399 0.207869 0.284582 0.198951 0.308598 0.434482 0.113724 0.184408 0.267386 0.211144 0.363745 0.173978 0.251133 Consensus sequence: RDHDBVDTCACGTGASBHVHDH Reverse complement motif 0.211144 0.173978 0.363745 0.251133 0.267386 0.113724 0.184408 0.434482 0.308598 0.284582 0.198951 0.207869 0.176399 0.209698 0.262426 0.351478 0.196612 0.261539 0.134430 0.407419 0.173670 0.210710 0.355170 0.260449 0.015720 0.315208 0.466476 0.202596 0.037126 0.231775 0.006772 0.724328 0.000794 0.942800 0.001192 0.055214 0.974119 0.015535 0.004466 0.005880 0.034056 0.958145 0.007498 0.000300 0.000300 0.007498 0.958145 0.034056 0.005880 0.004466 0.015535 0.974119 0.055214 0.001192 0.942800 0.000794 0.724328 0.006772 0.231775 0.037126 0.228203 0.408269 0.142148 0.221381 0.187041 0.188786 0.278290 0.345884 0.197183 0.304611 0.244864 0.253342 0.320389 0.130670 0.161435 0.387506 0.242041 0.222553 0.113615 0.421791 0.298329 0.324534 0.175329 0.201809 0.347837 0.403713 0.112349 0.136102 Consensus sequence: DDHBHBSTCACGTGAHBBDHHM Alignment: DDHBHBSTCACGTGAHBBDHHM AWVDAGGTCA------------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_primaryReverse Complement Original Motif Backward 3 10 0.048957 Species: Mus musculus Original motif 0.204923 0.208846 0.365383 0.220848 0.294304 0.300143 0.167287 0.238266 0.109711 0.619514 0.117379 0.153396 0.178979 0.378580 0.230177 0.212264 0.159594 0.542602 0.118178 0.179627 0.125206 0.430074 0.151826 0.292894 0.097692 0.709845 0.116956 0.075506 0.148292 0.565912 0.037632 0.248164 0.077951 0.034190 0.855503 0.032356 0.001657 0.001061 0.971877 0.025405 0.001926 0.001084 0.991712 0.005278 0.033031 0.012001 0.057796 0.897171 0.002723 0.002647 0.993348 0.001281 0.003261 0.000963 0.987199 0.008577 0.000611 0.090925 0.074857 0.833608 0.015299 0.978878 0.004949 0.000874 0.013368 0.600902 0.033485 0.352245 0.231949 0.149575 0.118804 0.499672 0.267580 0.186002 0.371242 0.175176 0.264884 0.223483 0.110082 0.401551 0.221365 0.170121 0.179559 0.428955 0.112997 0.692930 0.139981 0.054092 0.460305 0.207883 0.155111 0.176702 Consensus sequence: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH Reverse complement motif 0.176702 0.207883 0.155111 0.460305 0.112997 0.139981 0.692930 0.054092 0.428955 0.170121 0.179559 0.221365 0.401551 0.223483 0.110082 0.264884 0.267580 0.371242 0.186002 0.175176 0.499672 0.149575 0.118804 0.231949 0.013368 0.033485 0.600902 0.352245 0.015299 0.004949 0.978878 0.000874 0.833608 0.090925 0.074857 0.000611 0.003261 0.987199 0.000963 0.008577 0.002723 0.993348 0.002647 0.001281 0.897171 0.012001 0.057796 0.033031 0.001926 0.991712 0.001084 0.005278 0.001657 0.971877 0.001061 0.025405 0.077951 0.855503 0.034190 0.032356 0.148292 0.037632 0.565912 0.248164 0.097692 0.116956 0.709845 0.075506 0.125206 0.151826 0.430074 0.292894 0.159594 0.118178 0.542602 0.179627 0.178979 0.230177 0.378580 0.212264 0.109711 0.117379 0.619514 0.153396 0.294304 0.167287 0.300143 0.238266 0.204923 0.365383 0.208846 0.220848 Consensus sequence: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB Alignment: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH -----------TGACCTDVWT-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 47 Motif name: RXRRAR_DR5 Original motif 0.521739 0.000000 0.478261 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.043478 0.000000 0.565217 0.391304 0.000000 0.000000 0.043478 0.956522 0.000000 0.782609 0.130435 0.086957 0.956522 0.000000 0.043478 0.000000 0.173913 0.304348 0.217391 0.304348 0.217391 0.347826 0.391304 0.043478 0.217391 0.173913 0.478261 0.130435 0.565217 0.043478 0.304348 0.086957 0.217391 0.260870 0.521739 0.000000 0.739130 0.130435 0.130435 0.000000 0.043478 0.043478 0.869565 0.043478 0.000000 0.043478 0.695652 0.260870 0.086957 0.043478 0.130435 0.739130 0.043478 0.739130 0.130435 0.086957 0.913043 0.000000 0.043478 0.043478 Consensus sequence: RGKTCABVVRGAGGTCA Reserve complement motif 0.043478 0.000000 0.043478 0.913043 0.043478 0.130435 0.739130 0.086957 0.739130 0.043478 0.130435 0.086957 0.000000 0.695652 0.043478 0.260870 0.043478 0.869565 0.043478 0.043478 0.000000 0.130435 0.130435 0.739130 0.217391 0.521739 0.260870 0.000000 0.086957 0.043478 0.304348 0.565217 0.217391 0.478261 0.173913 0.130435 0.217391 0.391304 0.347826 0.043478 0.173913 0.217391 0.304348 0.304348 0.000000 0.000000 0.043478 0.956522 0.000000 0.130435 0.782609 0.086957 0.956522 0.000000 0.043478 0.000000 0.043478 0.565217 0.000000 0.391304 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.478261 0.521739 Consensus sequence: TGACCTCKVVBTGAYCK ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 47 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v015681_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 1 17 0.058509 Species: Mus musculus Original motif 0.214165 0.143436 0.372522 0.269876 0.314445 0.406003 0.160351 0.119201 0.137147 0.092924 0.042921 0.727007 0.044121 0.072843 0.051741 0.831295 0.261292 0.324124 0.298498 0.116086 0.258125 0.323243 0.263362 0.155271 0.204557 0.589399 0.107153 0.098891 0.371021 0.244027 0.291102 0.093849 0.096327 0.572718 0.011797 0.319159 0.027282 0.046183 0.844519 0.082016 0.018921 0.012887 0.915917 0.052275 0.364793 0.166722 0.084229 0.384256 0.028216 0.011233 0.951056 0.009495 0.054974 0.004738 0.890377 0.049911 0.006802 0.312915 0.134247 0.546036 0.241289 0.628210 0.104788 0.025713 0.237863 0.302807 0.213018 0.246311 0.349399 0.203220 0.086635 0.360746 0.386634 0.144693 0.246895 0.221779 0.425101 0.354676 0.093374 0.126849 0.060272 0.391320 0.104905 0.443503 0.162090 0.190233 0.227433 0.420244 Consensus sequence: DVTTVVCVYGGHGGYCHHDMYB Reverse complement motif 0.420244 0.190233 0.227433 0.162090 0.443503 0.391320 0.104905 0.060272 0.126849 0.354676 0.093374 0.425101 0.221779 0.144693 0.246895 0.386634 0.360746 0.203220 0.086635 0.349399 0.237863 0.213018 0.302807 0.246311 0.241289 0.104788 0.628210 0.025713 0.546036 0.312915 0.134247 0.006802 0.054974 0.890377 0.004738 0.049911 0.028216 0.951056 0.011233 0.009495 0.384256 0.166722 0.084229 0.364793 0.018921 0.915917 0.012887 0.052275 0.027282 0.844519 0.046183 0.082016 0.096327 0.011797 0.572718 0.319159 0.093849 0.244027 0.291102 0.371021 0.204557 0.107153 0.589399 0.098891 0.258125 0.263362 0.323243 0.155271 0.261292 0.298498 0.324124 0.116086 0.831295 0.072843 0.051741 0.044121 0.727007 0.092924 0.042921 0.137147 0.314445 0.160351 0.406003 0.119201 0.214165 0.372522 0.143436 0.269876 Consensus sequence: VMYDHDGMCCHCCKBGVVAAVH Alignment: DVTTVVCVYGGHGGYCHHDMYB RGKTCABVVRGAGGTCA----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_secondary Original Motif Original Motif Backward 1 17 0.070996 Species: Mus musculus Original motif 0.067627 0.131333 0.654425 0.146615 0.156488 0.114442 0.145630 0.583441 0.206450 0.265630 0.358017 0.169903 0.090729 0.460713 0.274712 0.173847 0.285994 0.099998 0.154485 0.459523 0.635908 0.184787 0.072982 0.106323 0.748421 0.039204 0.092605 0.119769 0.081342 0.061327 0.044532 0.812799 0.143120 0.043879 0.024216 0.788785 0.247544 0.092102 0.621453 0.038901 0.295531 0.036295 0.027594 0.640580 0.194561 0.305468 0.339916 0.160055 0.175038 0.193568 0.101212 0.530182 0.145226 0.167488 0.559871 0.127415 0.271501 0.237429 0.206701 0.284369 0.216834 0.109191 0.569605 0.104370 0.182624 0.177160 0.300475 0.339742 0.331737 0.198645 0.265137 0.204482 0.230155 0.359365 0.183450 0.227029 0.056581 0.067297 0.463052 0.413070 0.198891 0.324626 0.304424 0.172059 0.181968 0.287547 0.202419 0.328066 Consensus sequence: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB Reverse complement motif 0.328066 0.287547 0.202419 0.181968 0.198891 0.304424 0.324626 0.172059 0.056581 0.463052 0.067297 0.413070 0.230155 0.183450 0.359365 0.227029 0.204482 0.198645 0.265137 0.331737 0.339742 0.177160 0.300475 0.182624 0.216834 0.569605 0.109191 0.104370 0.284369 0.237429 0.206701 0.271501 0.145226 0.559871 0.167488 0.127415 0.530182 0.193568 0.101212 0.175038 0.194561 0.339916 0.305468 0.160055 0.640580 0.036295 0.027594 0.295531 0.247544 0.621453 0.092102 0.038901 0.788785 0.043879 0.024216 0.143120 0.812799 0.061327 0.044532 0.081342 0.119769 0.039204 0.092605 0.748421 0.106323 0.184787 0.072982 0.635908 0.459523 0.099998 0.154485 0.285994 0.090729 0.274712 0.460713 0.173847 0.206450 0.358017 0.265630 0.169903 0.583441 0.114442 0.145630 0.156488 0.067627 0.654425 0.131333 0.146615 Consensus sequence: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC Alignment: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB -----RGKTCABVVRGAGGTCA ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 1 17 0.075055 Species: Mus musculus Original motif 0.404007 0.395873 0.173319 0.026801 0.305977 0.215534 0.215359 0.263130 0.370148 0.250957 0.113088 0.265808 0.324336 0.229498 0.174679 0.271487 0.263563 0.137896 0.079217 0.519324 0.265762 0.222582 0.082555 0.429102 0.206721 0.288405 0.017851 0.487023 0.164361 0.236500 0.061051 0.538088 0.593344 0.348446 0.050304 0.007906 0.031328 0.947050 0.007032 0.014590 0.010428 0.956605 0.029142 0.003825 0.459636 0.207616 0.155368 0.177380 0.014573 0.964608 0.012209 0.008610 0.066291 0.918196 0.008729 0.006784 0.019488 0.866774 0.018897 0.094841 0.767405 0.104198 0.029234 0.099164 0.052494 0.772531 0.039832 0.135142 0.296085 0.243498 0.350935 0.109482 0.518843 0.226659 0.124784 0.129714 0.647901 0.019721 0.159901 0.172477 0.113912 0.231511 0.214864 0.439713 0.223117 0.310596 0.293328 0.172959 0.185557 0.487662 0.136321 0.190459 Consensus sequence: MHHHWHYTMCCHCCCACVAABVH Reverse complement motif 0.185557 0.136321 0.487662 0.190459 0.223117 0.293328 0.310596 0.172959 0.439713 0.231511 0.214864 0.113912 0.172477 0.019721 0.159901 0.647901 0.129714 0.226659 0.124784 0.518843 0.296085 0.350935 0.243498 0.109482 0.052494 0.039832 0.772531 0.135142 0.099164 0.104198 0.029234 0.767405 0.019488 0.018897 0.866774 0.094841 0.066291 0.008729 0.918196 0.006784 0.014573 0.012209 0.964608 0.008610 0.177380 0.207616 0.155368 0.459636 0.010428 0.029142 0.956605 0.003825 0.031328 0.007032 0.947050 0.014590 0.007906 0.348446 0.050304 0.593344 0.538088 0.236500 0.061051 0.164361 0.487023 0.288405 0.017851 0.206721 0.429102 0.222582 0.082555 0.265762 0.519324 0.137896 0.079217 0.263563 0.271487 0.229498 0.174679 0.324336 0.265808 0.250957 0.113088 0.370148 0.263130 0.215534 0.215359 0.305977 0.026801 0.395873 0.173319 0.404007 Consensus sequence: DVVTTVGTGGGHGGYAMHWHHHY Alignment: DVVTTVGTGGGHGGYAMHWHHHY RGKTCABVVRGAGGTCA------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_primaryOriginal Motif Original Motif Forward 7 17 0.075882 Species: Mus musculus Original motif 0.183797 0.268049 0.330111 0.218043 0.127599 0.330310 0.243614 0.298477 0.143199 0.188046 0.268593 0.400162 0.214690 0.205230 0.247090 0.332990 0.294688 0.299104 0.327152 0.079056 0.221909 0.193223 0.480155 0.104712 0.444072 0.068239 0.481838 0.005852 0.006182 0.015429 0.901278 0.077111 0.766535 0.111138 0.121632 0.000696 0.014848 0.973961 0.000298 0.010893 0.001807 0.992200 0.002669 0.003324 0.795344 0.140510 0.018576 0.045571 0.006990 0.988200 0.002510 0.002299 0.154898 0.842296 0.000998 0.001808 0.029577 0.919262 0.006935 0.044226 0.677987 0.032075 0.185065 0.104874 0.195132 0.364580 0.319321 0.120967 0.225412 0.115034 0.612849 0.046705 0.548628 0.058900 0.162857 0.229616 0.112531 0.340331 0.165910 0.381227 0.073029 0.303078 0.363896 0.259997 0.561485 0.260567 0.092979 0.084969 0.132283 0.457691 0.140159 0.269867 Consensus sequence: BBBDVVRGACCACCCAVGABBAB Reverse complement motif 0.132283 0.140159 0.457691 0.269867 0.084969 0.260567 0.092979 0.561485 0.073029 0.363896 0.303078 0.259997 0.381227 0.340331 0.165910 0.112531 0.229616 0.058900 0.162857 0.548628 0.225412 0.612849 0.115034 0.046705 0.195132 0.319321 0.364580 0.120967 0.104874 0.032075 0.185065 0.677987 0.029577 0.006935 0.919262 0.044226 0.154898 0.000998 0.842296 0.001808 0.006990 0.002510 0.988200 0.002299 0.045571 0.140510 0.018576 0.795344 0.001807 0.002669 0.992200 0.003324 0.014848 0.000298 0.973961 0.010893 0.000696 0.111138 0.121632 0.766535 0.006182 0.901278 0.015429 0.077111 0.444072 0.481838 0.068239 0.005852 0.221909 0.480155 0.193223 0.104712 0.294688 0.327152 0.299104 0.079056 0.332990 0.205230 0.247090 0.214690 0.400162 0.188046 0.268593 0.143199 0.127599 0.243614 0.330310 0.298477 0.183797 0.330111 0.268049 0.218043 Consensus sequence: BTBVTCVTGGGTGGTCMVVDVBB Alignment: BBBDVVRGACCACCCAVGABBAB ------RGKTCABVVRGAGGTCA ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00032 Gata3_secondary Reverse Complement Original Motif Backward 6 17 0.075995 Species: Mus musculus Original motif 0.177641 0.319872 0.115137 0.387350 0.136644 0.182137 0.205873 0.475347 0.254263 0.244280 0.165207 0.336250 0.240415 0.207557 0.237497 0.314530 0.271041 0.214702 0.364395 0.149863 0.095475 0.320104 0.191738 0.392682 0.500902 0.142722 0.026556 0.329820 0.051221 0.023698 0.897245 0.027836 0.922410 0.027509 0.024058 0.026023 0.030735 0.070903 0.024248 0.874114 0.242120 0.231992 0.225143 0.300745 0.106956 0.220471 0.283490 0.389083 0.152079 0.165830 0.135066 0.547025 0.839205 0.051581 0.060119 0.049095 0.041204 0.069147 0.070830 0.818819 0.051861 0.848177 0.027599 0.072363 0.383793 0.016807 0.397470 0.201931 0.381899 0.215846 0.255908 0.146347 0.094792 0.358651 0.280905 0.265652 0.296132 0.181545 0.178433 0.343890 0.301997 0.254722 0.108566 0.334714 0.349481 0.270693 0.137507 0.242319 Consensus sequence: HBHDVBWGATHBTATCRVBHHH Reverse complement motif 0.242319 0.270693 0.137507 0.349481 0.334714 0.254722 0.108566 0.301997 0.343890 0.181545 0.178433 0.296132 0.094792 0.280905 0.358651 0.265652 0.146347 0.215846 0.255908 0.381899 0.383793 0.397470 0.016807 0.201931 0.051861 0.027599 0.848177 0.072363 0.818819 0.069147 0.070830 0.041204 0.049095 0.051581 0.060119 0.839205 0.547025 0.165830 0.135066 0.152079 0.389083 0.220471 0.283490 0.106956 0.300745 0.231992 0.225143 0.242120 0.874114 0.070903 0.024248 0.030735 0.026023 0.027509 0.024058 0.922410 0.051221 0.897245 0.023698 0.027836 0.329820 0.142722 0.026556 0.500902 0.392682 0.320104 0.191738 0.095475 0.271041 0.364395 0.214702 0.149863 0.314530 0.207557 0.237497 0.240415 0.336250 0.244280 0.165207 0.254263 0.475347 0.182137 0.205873 0.136644 0.387350 0.319872 0.115137 0.177641 Consensus sequence: HHHBBMGATAVHATCWVVDHVH Alignment: HBHDVBWGATHBTATCRVBHHH TGACCTCKVVBTGAYCK----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_primaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 17 0.076021 Species: Mus musculus Original motif 0.137831 0.118922 0.394177 0.349070 0.190108 0.163633 0.138507 0.507753 0.346002 0.332315 0.228621 0.093063 0.113254 0.287554 0.373285 0.225908 0.272578 0.125402 0.328963 0.273057 0.333973 0.115165 0.194267 0.356595 0.381054 0.086215 0.501679 0.031052 0.002232 0.007405 0.966087 0.024276 0.834741 0.112115 0.052053 0.001091 0.009034 0.983239 0.000766 0.006960 0.002054 0.988103 0.003138 0.006705 0.805772 0.171299 0.008415 0.014515 0.020076 0.976846 0.000894 0.002183 0.079914 0.917273 0.001179 0.001634 0.013983 0.950545 0.004205 0.031267 0.789407 0.039441 0.108645 0.062507 0.055453 0.161271 0.595249 0.188028 0.333424 0.128169 0.373270 0.165136 0.536103 0.109520 0.062980 0.291397 0.346477 0.090909 0.279533 0.283081 0.045892 0.190183 0.584314 0.179611 0.088294 0.406148 0.251647 0.253912 0.202467 0.447159 0.162802 0.187571 Consensus sequence: DTVBDDRGACCACCCAGDWDGBH Reverse complement motif 0.202467 0.162802 0.447159 0.187571 0.088294 0.251647 0.406148 0.253912 0.045892 0.584314 0.190183 0.179611 0.283081 0.090909 0.279533 0.346477 0.291397 0.109520 0.062980 0.536103 0.333424 0.373270 0.128169 0.165136 0.055453 0.595249 0.161271 0.188028 0.062507 0.039441 0.108645 0.789407 0.013983 0.004205 0.950545 0.031267 0.079914 0.001179 0.917273 0.001634 0.020076 0.000894 0.976846 0.002183 0.014515 0.171299 0.008415 0.805772 0.002054 0.003138 0.988103 0.006705 0.009034 0.000766 0.983239 0.006960 0.001091 0.112115 0.052053 0.834741 0.002232 0.966087 0.007405 0.024276 0.381054 0.501679 0.086215 0.031052 0.356595 0.115165 0.194267 0.333973 0.272578 0.328963 0.125402 0.273057 0.113254 0.373285 0.287554 0.225908 0.093063 0.332315 0.228621 0.346002 0.507753 0.163633 0.138507 0.190108 0.137831 0.394177 0.118922 0.349070 Consensus sequence: DBCDWHCTGGGTGGTCMDHBBAH Alignment: DTVBDDRGACCACCCAGDWDGBH ------RGKTCABVVRGAGGTCA ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_primaryReverse Complement Original Motif Backward 7 17 0.076340 Species: Mus musculus Original motif 0.204923 0.208846 0.365383 0.220848 0.294304 0.300143 0.167287 0.238266 0.109711 0.619514 0.117379 0.153396 0.178979 0.378580 0.230177 0.212264 0.159594 0.542602 0.118178 0.179627 0.125206 0.430074 0.151826 0.292894 0.097692 0.709845 0.116956 0.075506 0.148292 0.565912 0.037632 0.248164 0.077951 0.034190 0.855503 0.032356 0.001657 0.001061 0.971877 0.025405 0.001926 0.001084 0.991712 0.005278 0.033031 0.012001 0.057796 0.897171 0.002723 0.002647 0.993348 0.001281 0.003261 0.000963 0.987199 0.008577 0.000611 0.090925 0.074857 0.833608 0.015299 0.978878 0.004949 0.000874 0.013368 0.600902 0.033485 0.352245 0.231949 0.149575 0.118804 0.499672 0.267580 0.186002 0.371242 0.175176 0.264884 0.223483 0.110082 0.401551 0.221365 0.170121 0.179559 0.428955 0.112997 0.692930 0.139981 0.054092 0.460305 0.207883 0.155111 0.176702 Consensus sequence: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH Reverse complement motif 0.176702 0.207883 0.155111 0.460305 0.112997 0.139981 0.692930 0.054092 0.428955 0.170121 0.179559 0.221365 0.401551 0.223483 0.110082 0.264884 0.267580 0.371242 0.186002 0.175176 0.499672 0.149575 0.118804 0.231949 0.013368 0.033485 0.600902 0.352245 0.015299 0.004949 0.978878 0.000874 0.833608 0.090925 0.074857 0.000611 0.003261 0.987199 0.000963 0.008577 0.002723 0.993348 0.002647 0.001281 0.897171 0.012001 0.057796 0.033031 0.001926 0.991712 0.001084 0.005278 0.001657 0.971877 0.001061 0.025405 0.077951 0.855503 0.034190 0.032356 0.148292 0.037632 0.565912 0.248164 0.097692 0.116956 0.709845 0.075506 0.125206 0.151826 0.430074 0.292894 0.159594 0.118178 0.542602 0.179627 0.178979 0.230177 0.378580 0.212264 0.109711 0.117379 0.619514 0.153396 0.294304 0.167287 0.300143 0.238266 0.204923 0.365383 0.208846 0.220848 Consensus sequence: HGDHVHKGACCACCCGGBGBGDB Alignment: BHCBCBCCGGGTGGTCYHVHDCH TGACCTCKVVBTGAYCK------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Reverse Complement Forward 1 17 0.076866 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK RGKTCABVVRGAGGTCA----- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00050 Bhlhb2_primary Original Motif Reverse Complement Forward 5 17 0.078407 Species: Mus musculus Original motif 0.347837 0.112349 0.403713 0.136102 0.298329 0.175329 0.324534 0.201809 0.421791 0.222553 0.113615 0.242041 0.387506 0.130670 0.161435 0.320389 0.197183 0.244864 0.304611 0.253342 0.345884 0.188786 0.278290 0.187041 0.228203 0.142148 0.408269 0.221381 0.037126 0.006772 0.231775 0.724328 0.055214 0.942800 0.001192 0.000794 0.974119 0.004466 0.015535 0.005880 0.000300 0.958145 0.007498 0.034056 0.034056 0.007498 0.958145 0.000300 0.005880 0.015535 0.004466 0.974119 0.000794 0.001192 0.942800 0.055214 0.724328 0.231775 0.006772 0.037126 0.015720 0.466476 0.315208 0.202596 0.173670 0.355170 0.210710 0.260449 0.407419 0.261539 0.134430 0.196612 0.351478 0.209698 0.262426 0.176399 0.207869 0.284582 0.198951 0.308598 0.434482 0.113724 0.184408 0.267386 0.211144 0.363745 0.173978 0.251133 Consensus sequence: RDHDBVDTCACGTGASBHVHDH Reverse complement motif 0.211144 0.173978 0.363745 0.251133 0.267386 0.113724 0.184408 0.434482 0.308598 0.284582 0.198951 0.207869 0.176399 0.209698 0.262426 0.351478 0.196612 0.261539 0.134430 0.407419 0.173670 0.210710 0.355170 0.260449 0.015720 0.315208 0.466476 0.202596 0.037126 0.231775 0.006772 0.724328 0.000794 0.942800 0.001192 0.055214 0.974119 0.015535 0.004466 0.005880 0.034056 0.958145 0.007498 0.000300 0.000300 0.007498 0.958145 0.034056 0.005880 0.004466 0.015535 0.974119 0.055214 0.001192 0.942800 0.000794 0.724328 0.006772 0.231775 0.037126 0.228203 0.408269 0.142148 0.221381 0.187041 0.188786 0.278290 0.345884 0.197183 0.304611 0.244864 0.253342 0.320389 0.130670 0.161435 0.387506 0.242041 0.222553 0.113615 0.421791 0.298329 0.324534 0.175329 0.201809 0.347837 0.403713 0.112349 0.136102 Consensus sequence: DDHBHBSTCACGTGAHBBDHHM Alignment: DDHBHBSTCACGTGAHBBDHHM ----RGKTCABVVRGAGGTCA- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 1 17 0.079467 Species: Mus musculus Original motif 0.319838 0.171199 0.138099 0.370865 0.269358 0.196600 0.346909 0.187133 0.176807 0.338888 0.193903 0.290402 0.230268 0.119645 0.310500 0.339587 0.517372 0.257658 0.111673 0.113296 0.159477 0.126524 0.561119 0.152879 0.117072 0.553013 0.130919 0.198996 0.073372 0.163548 0.525014 0.238066 0.143608 0.186896 0.170528 0.498967 0.054943 0.079034 0.722992 0.143031 0.048852 0.015134 0.852458 0.083556 0.029001 0.023938 0.918900 0.028160 0.036727 0.092645 0.090591 0.780037 0.017757 0.057598 0.895222 0.029423 0.026113 0.048113 0.879744 0.046030 0.023041 0.787043 0.123490 0.066426 0.579766 0.004868 0.296873 0.118493 0.303862 0.042931 0.290151 0.363055 0.099672 0.237431 0.262301 0.400597 0.217788 0.163908 0.367628 0.250676 0.450783 0.141108 0.226137 0.181972 0.485086 0.102553 0.242662 0.169700 0.109057 0.454222 0.145665 0.291056 Consensus sequence: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB Reverse complement motif 0.109057 0.145665 0.454222 0.291056 0.169700 0.102553 0.242662 0.485086 0.181972 0.141108 0.226137 0.450783 0.217788 0.367628 0.163908 0.250676 0.400597 0.237431 0.262301 0.099672 0.363055 0.042931 0.290151 0.303862 0.118493 0.004868 0.296873 0.579766 0.023041 0.123490 0.787043 0.066426 0.026113 0.879744 0.048113 0.046030 0.017757 0.895222 0.057598 0.029423 0.780037 0.092645 0.090591 0.036727 0.029001 0.918900 0.023938 0.028160 0.048852 0.852458 0.015134 0.083556 0.054943 0.722992 0.079034 0.143031 0.498967 0.186896 0.170528 0.143608 0.073372 0.525014 0.163548 0.238066 0.117072 0.130919 0.553013 0.198996 0.159477 0.561119 0.126524 0.152879 0.113296 0.257658 0.111673 0.517372 0.339587 0.119645 0.310500 0.230268 0.176807 0.193903 0.338888 0.290402 0.269358 0.346909 0.196600 0.187133 0.370865 0.171199 0.138099 0.319838 Consensus sequence: BDDHVDKGCCACCCVCGCTDBVH Alignment: HVBDAGCGBGGGTGGCRDBDDDB RGKTCABVVRGAGGTCA------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Dataset #: 2 Motif ID: 48 Motif name: Tcfcp2l1 Original motif 0.001968 0.925480 0.062715 0.009838 0.069973 0.807513 0.005401 0.117113 0.594508 0.005148 0.275803 0.124540 0.005884 0.023780 0.967149 0.003187 0.175477 0.336270 0.025698 0.462555 0.098385 0.289280 0.062163 0.550171 0.173924 0.397260 0.151174 0.277642 0.357213 0.224939 0.252323 0.165526 0.631540 0.069682 0.190954 0.107824 0.394421 0.051382 0.310497 0.243700 0.003669 0.933219 0.054795 0.008317 0.061719 0.812148 0.002939 0.123194 0.536555 0.007360 0.305937 0.150147 0.012039 0.028993 0.954791 0.004177 Consensus sequence: CCAGYYHVADCCRG Reserve complement motif 0.012039 0.954791 0.028993 0.004177 0.150147 0.007360 0.305937 0.536555 0.061719 0.002939 0.812148 0.123194 0.003669 0.054795 0.933219 0.008317 0.243700 0.051382 0.310497 0.394421 0.107824 0.069682 0.190954 0.631540 0.165526 0.224939 0.252323 0.357213 0.173924 0.151174 0.397260 0.277642 0.550171 0.289280 0.062163 0.098385 0.462555 0.336270 0.025698 0.175477 0.005884 0.967149 0.023780 0.003187 0.124540 0.005148 0.275803 0.594508 0.069973 0.005401 0.807513 0.117113 0.001968 0.062715 0.925480 0.009838 Consensus sequence: CKGGDTBDMMCTGG ************************************************************************ Best Matches for Motif ID 48 (Highest to Lowest) ************************************************************************ Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00032 Gata3_secondary Original Motif Original Motif Backward 5 14 0.052725 Species: Mus musculus Original motif 0.177641 0.319872 0.115137 0.387350 0.136644 0.182137 0.205873 0.475347 0.254263 0.244280 0.165207 0.336250 0.240415 0.207557 0.237497 0.314530 0.271041 0.214702 0.364395 0.149863 0.095475 0.320104 0.191738 0.392682 0.500902 0.142722 0.026556 0.329820 0.051221 0.023698 0.897245 0.027836 0.922410 0.027509 0.024058 0.026023 0.030735 0.070903 0.024248 0.874114 0.242120 0.231992 0.225143 0.300745 0.106956 0.220471 0.283490 0.389083 0.152079 0.165830 0.135066 0.547025 0.839205 0.051581 0.060119 0.049095 0.041204 0.069147 0.070830 0.818819 0.051861 0.848177 0.027599 0.072363 0.383793 0.016807 0.397470 0.201931 0.381899 0.215846 0.255908 0.146347 0.094792 0.358651 0.280905 0.265652 0.296132 0.181545 0.178433 0.343890 0.301997 0.254722 0.108566 0.334714 0.349481 0.270693 0.137507 0.242319 Consensus sequence: HBHDVBWGATHBTATCRVBHHH Reverse complement motif 0.242319 0.270693 0.137507 0.349481 0.334714 0.254722 0.108566 0.301997 0.343890 0.181545 0.178433 0.296132 0.094792 0.280905 0.358651 0.265652 0.146347 0.215846 0.255908 0.381899 0.383793 0.397470 0.016807 0.201931 0.051861 0.027599 0.848177 0.072363 0.818819 0.069147 0.070830 0.041204 0.049095 0.051581 0.060119 0.839205 0.547025 0.165830 0.135066 0.152079 0.389083 0.220471 0.283490 0.106956 0.300745 0.231992 0.225143 0.242120 0.874114 0.070903 0.024248 0.030735 0.026023 0.027509 0.024058 0.922410 0.051221 0.897245 0.023698 0.027836 0.329820 0.142722 0.026556 0.500902 0.392682 0.320104 0.191738 0.095475 0.271041 0.364395 0.214702 0.149863 0.314530 0.207557 0.237497 0.240415 0.336250 0.244280 0.165207 0.254263 0.475347 0.182137 0.205873 0.136644 0.387350 0.319872 0.115137 0.177641 Consensus sequence: HHHBBMGATAVHATCWVVDHVH Alignment: HBHDVBWGATHBTATCRVBHHH ----CCAGYYHVADCCRG---- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Backward 1 14 0.055169 Species: Mus musculus Original motif 0.533199 0.080715 0.330435 0.055650 0.152031 0.212841 0.110234 0.524893 0.223934 0.264217 0.087037 0.424811 0.115097 0.339994 0.343861 0.201048 0.124993 0.418259 0.365642 0.091106 0.158365 0.292428 0.088361 0.460847 0.165479 0.561778 0.022254 0.250489 0.136873 0.259822 0.579763 0.023543 0.109570 0.747495 0.055128 0.087807 0.061912 0.792986 0.109031 0.036071 0.508703 0.267806 0.169766 0.053725 0.040912 0.838888 0.057470 0.062730 0.330554 0.606077 0.016192 0.047177 0.068079 0.563969 0.029742 0.338209 0.388799 0.291667 0.191284 0.128249 0.183283 0.578079 0.171100 0.067538 0.165163 0.097206 0.631377 0.106253 0.128564 0.435496 0.253275 0.182665 0.103395 0.088222 0.234758 0.573625 0.432879 0.276641 0.155895 0.134585 0.339199 0.148928 0.311036 0.200836 0.211958 0.298526 0.158443 0.331072 Consensus sequence: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH Reverse complement motif 0.331072 0.298526 0.158443 0.211958 0.200836 0.148928 0.311036 0.339199 0.134585 0.276641 0.155895 0.432879 0.573625 0.088222 0.234758 0.103395 0.128564 0.253275 0.435496 0.182665 0.165163 0.631377 0.097206 0.106253 0.183283 0.171100 0.578079 0.067538 0.128249 0.291667 0.191284 0.388799 0.068079 0.029742 0.563969 0.338209 0.330554 0.016192 0.606077 0.047177 0.040912 0.057470 0.838888 0.062730 0.053725 0.267806 0.169766 0.508703 0.061912 0.109031 0.792986 0.036071 0.109570 0.055128 0.747495 0.087807 0.136873 0.579763 0.259822 0.023543 0.165479 0.022254 0.561778 0.250489 0.460847 0.292428 0.088361 0.158365 0.124993 0.365642 0.418259 0.091106 0.115097 0.343861 0.339994 0.201048 0.424811 0.264217 0.087037 0.223934 0.524893 0.212841 0.110234 0.152031 0.055650 0.080715 0.330435 0.533199 Consensus sequence: HDBABCGBKRGYGGCGMSBHAK Alignment: RTHBSYCGCCMCMYVCGBTVDH --------CCAGYYHVADCCRG ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00005 Tcfap2a_secondary Original Motif Original Motif Backward 1 14 0.056098 Species: Mus musculus Original motif 0.198427 0.243196 0.159241 0.399136 0.267754 0.388187 0.116811 0.227248 0.448284 0.056403 0.414623 0.080691 0.031469 0.826323 0.055436 0.086772 0.035527 0.756642 0.022985 0.184845 0.127338 0.316078 0.155806 0.400778 0.135021 0.313650 0.287760 0.263570 0.418892 0.082297 0.068352 0.430460 0.201062 0.044735 0.711358 0.042845 0.038934 0.022320 0.903763 0.034982 0.201790 0.065554 0.460526 0.272130 0.006890 0.786923 0.061853 0.144334 0.460666 0.103658 0.196452 0.239224 0.092272 0.204611 0.390375 0.312742 Consensus sequence: HHRCCBBWGGDCDB Reverse complement motif 0.092272 0.390375 0.204611 0.312742 0.239224 0.103658 0.196452 0.460666 0.006890 0.061853 0.786923 0.144334 0.201790 0.460526 0.065554 0.272130 0.038934 0.903763 0.022320 0.034982 0.201062 0.711358 0.044735 0.042845 0.430460 0.082297 0.068352 0.418892 0.135021 0.287760 0.313650 0.263570 0.400778 0.316078 0.155806 0.127338 0.035527 0.022985 0.756642 0.184845 0.031469 0.055436 0.826323 0.086772 0.080691 0.056403 0.414623 0.448284 0.267754 0.116811 0.388187 0.227248 0.399136 0.243196 0.159241 0.198427 Consensus sequence: BDGHCCWBVGGKDH Alignment: HHRCCBBWGGDCDB CCAGYYHVADCCRG ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00013 Gabpa_secondary Original Motif Original Motif Backward 3 14 0.056647 Species: Mus musculus Original motif 0.233133 0.551828 0.139009 0.076030 0.100085 0.525562 0.101688 0.272665 0.252996 0.198121 0.299171 0.249711 0.141471 0.195290 0.234560 0.428679 0.160993 0.442765 0.082653 0.313590 0.307890 0.127950 0.071713 0.492448 0.093453 0.148935 0.080288 0.677324 0.083535 0.634212 0.074652 0.207601 0.098119 0.639328 0.099957 0.162596 0.067430 0.451776 0.357188 0.123606 0.286259 0.466975 0.063013 0.183753 0.203211 0.422637 0.133368 0.240783 0.111206 0.315595 0.192833 0.380366 0.199462 0.324652 0.305491 0.170395 0.347919 0.292387 0.230724 0.128970 0.254648 0.294196 0.194942 0.256214 Consensus sequence: CYDBYWTCCSMHBVVH Reverse complement motif 0.254648 0.194942 0.294196 0.256214 0.128970 0.292387 0.230724 0.347919 0.199462 0.305491 0.324652 0.170395 0.380366 0.315595 0.192833 0.111206 0.203211 0.133368 0.422637 0.240783 0.286259 0.063013 0.466975 0.183753 0.067430 0.357188 0.451776 0.123606 0.098119 0.099957 0.639328 0.162596 0.083535 0.074652 0.634212 0.207601 0.677324 0.148935 0.080288 0.093453 0.492448 0.127950 0.071713 0.307890 0.160993 0.082653 0.442765 0.313590 0.428679 0.195290 0.234560 0.141471 0.252996 0.299171 0.198121 0.249711 0.100085 0.101688 0.525562 0.272665 0.233133 0.139009 0.551828 0.076030 Consensus sequence: DBVVDRSGGAWKVHKG Alignment: CYDBYWTCCSMHBVVH CCAGYYHVADCCRG-- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00075 Sox15_secondary Original Motif Reverse Complement Backward 1 14 0.057764 Species: Mus musculus Original motif 0.110714 0.252497 0.291511 0.345278 0.164622 0.184062 0.190197 0.461119 0.287350 0.199874 0.330362 0.182414 0.616693 0.089218 0.166132 0.127957 0.525717 0.258234 0.059744 0.156305 0.083274 0.096411 0.076805 0.743510 0.049512 0.096815 0.691840 0.161833 0.410479 0.121470 0.156168 0.311883 0.522715 0.308171 0.070073 0.099041 0.708200 0.050818 0.138346 0.102635 0.095092 0.056144 0.158664 0.690100 0.126419 0.145616 0.080224 0.647741 0.167179 0.424187 0.154592 0.254042 0.222121 0.318065 0.377920 0.081893 0.532720 0.168320 0.257188 0.041771 Consensus sequence: BBVAATGDMATTHVA Reverse complement motif 0.041771 0.168320 0.257188 0.532720 0.222121 0.377920 0.318065 0.081893 0.167179 0.154592 0.424187 0.254042 0.647741 0.145616 0.080224 0.126419 0.690100 0.056144 0.158664 0.095092 0.102635 0.050818 0.138346 0.708200 0.099041 0.308171 0.070073 0.522715 0.311883 0.121470 0.156168 0.410479 0.049512 0.691840 0.096815 0.161833 0.743510 0.096411 0.076805 0.083274 0.156305 0.258234 0.059744 0.525717 0.127957 0.089218 0.166132 0.616693 0.287350 0.330362 0.199874 0.182414 0.461119 0.184062 0.190197 0.164622 0.345278 0.252497 0.291511 0.110714 Consensus sequence: TVDAATYDCATTVVV Alignment: BBVAATGDMATTHVA -CCAGYYHVADCCRG ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00096 Sox13_secondary Reverse Complement Original Motif Forward 4 14 0.058789 Species: Mus musculus Original motif 0.262581 0.115233 0.405525 0.216661 0.246681 0.142854 0.145056 0.465409 0.341041 0.154355 0.306628 0.197976 0.242211 0.263918 0.113187 0.380684 0.119326 0.241913 0.117198 0.521563 0.054120 0.036135 0.784219 0.125525 0.076634 0.048399 0.788586 0.086381 0.215316 0.044119 0.663927 0.076638 0.248538 0.159141 0.015452 0.576869 0.047049 0.083570 0.788798 0.080583 0.071948 0.035098 0.768849 0.124105 0.123777 0.030383 0.713425 0.132415 0.294760 0.182119 0.181553 0.341567 0.516589 0.129377 0.116698 0.237336 0.350326 0.186505 0.112598 0.350571 0.311469 0.198085 0.147986 0.342460 0.185126 0.130721 0.242572 0.441582 Consensus sequence: DDDHTGGGTGGGHAHHD Reverse complement motif 0.441582 0.130721 0.242572 0.185126 0.342460 0.198085 0.147986 0.311469 0.350571 0.186505 0.112598 0.350326 0.237336 0.129377 0.116698 0.516589 0.341567 0.182119 0.181553 0.294760 0.123777 0.713425 0.030383 0.132415 0.071948 0.768849 0.035098 0.124105 0.047049 0.788798 0.083570 0.080583 0.576869 0.159141 0.015452 0.248538 0.215316 0.663927 0.044119 0.076638 0.076634 0.788586 0.048399 0.086381 0.054120 0.784219 0.036135 0.125525 0.521563 0.241913 0.117198 0.119326 0.380684 0.263918 0.113187 0.242211 0.197976 0.154355 0.306628 0.341041 0.465409 0.142854 0.145056 0.246681 0.262581 0.405525 0.115233 0.216661 Consensus sequence: DHHTHCCCACCCAHDDH Alignment: DDDHTGGGTGGGHAHHD ---CKGGDTBDMMCTGG ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00034 Sox7_secondary Original Motif Reverse Complement Forward 3 14 0.059024 Species: Mus musculus Original motif 0.067627 0.131333 0.654425 0.146615 0.156488 0.114442 0.145630 0.583441 0.206450 0.265630 0.358017 0.169903 0.090729 0.460713 0.274712 0.173847 0.285994 0.099998 0.154485 0.459523 0.635908 0.184787 0.072982 0.106323 0.748421 0.039204 0.092605 0.119769 0.081342 0.061327 0.044532 0.812799 0.143120 0.043879 0.024216 0.788785 0.247544 0.092102 0.621453 0.038901 0.295531 0.036295 0.027594 0.640580 0.194561 0.305468 0.339916 0.160055 0.175038 0.193568 0.101212 0.530182 0.145226 0.167488 0.559871 0.127415 0.271501 0.237429 0.206701 0.284369 0.216834 0.109191 0.569605 0.104370 0.182624 0.177160 0.300475 0.339742 0.331737 0.198645 0.265137 0.204482 0.230155 0.359365 0.183450 0.227029 0.056581 0.067297 0.463052 0.413070 0.198891 0.324626 0.304424 0.172059 0.181968 0.287547 0.202419 0.328066 Consensus sequence: GTVBDAATTGTVTGHGDDHKVB Reverse complement motif 0.328066 0.287547 0.202419 0.181968 0.198891 0.304424 0.324626 0.172059 0.056581 0.463052 0.067297 0.413070 0.230155 0.183450 0.359365 0.227029 0.204482 0.198645 0.265137 0.331737 0.339742 0.177160 0.300475 0.182624 0.216834 0.569605 0.109191 0.104370 0.284369 0.237429 0.206701 0.271501 0.145226 0.559871 0.167488 0.127415 0.530182 0.193568 0.101212 0.175038 0.194561 0.339916 0.305468 0.160055 0.640580 0.036295 0.027594 0.295531 0.247544 0.621453 0.092102 0.038901 0.788785 0.043879 0.024216 0.143120 0.812799 0.061327 0.044532 0.081342 0.119769 0.039204 0.092605 0.748421 0.106323 0.184787 0.072982 0.635908 0.459523 0.099998 0.154485 0.285994 0.090729 0.274712 0.460713 0.173847 0.206450 0.358017 0.265630 0.169903 0.583441 0.114442 0.145630 0.156488 0.067627 0.654425 0.131333 0.146615 Consensus sequence: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC Alignment: VVYDDDCHCAVACAATTDBVAC --CCAGYYHVADCCRG------ ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00540 Gli3_v016060_secondaryOriginal Motif Original Motif Forward 9 14 0.059690 Species: Mus musculus Original motif 0.168550 0.345968 0.396524 0.088958 0.038113 0.360882 0.114042 0.486963 0.349356 0.180599 0.051416 0.418629 0.258773 0.332518 0.244932 0.163778 0.371663 0.208591 0.263136 0.156609 0.225440 0.321741 0.175932 0.276887 0.100827 0.656850 0.018644 0.223679 0.494140 0.155427 0.327424 0.023009 0.105642 0.805846 0.027712 0.060800 0.065110 0.845072 0.058046 0.031772 0.649343 0.110180 0.180680 0.059797 0.064269 0.853604 0.066860 0.015268 0.437421 0.533797 0.016833 0.011948 0.121694 0.787708 0.016177 0.074421 0.625382 0.066925 0.266070 0.041623 0.117819 0.608153 0.165139 0.108889 0.145639 0.102001 0.604926 0.147434 0.521188 0.184986 0.064607 0.229219 0.180371 0.274237 0.096591 0.448801 0.071055 0.455813 0.332817 0.140315 0.084503 0.199982 0.448293 0.267222 0.389451 0.169545 0.155507 0.285497 0.424314 0.227621 0.101210 0.246855 Consensus sequence: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH Reverse complement motif 0.246855 0.227621 0.101210 0.424314 0.285497 0.169545 0.155507 0.389451 0.084503 0.448293 0.199982 0.267222 0.071055 0.332817 0.455813 0.140315 0.448801 0.274237 0.096591 0.180371 0.229219 0.184986 0.064607 0.521188 0.145639 0.604926 0.102001 0.147434 0.117819 0.165139 0.608153 0.108889 0.041623 0.066925 0.266070 0.625382 0.121694 0.016177 0.787708 0.074421 0.437421 0.016833 0.533797 0.011948 0.064269 0.066860 0.853604 0.015268 0.059797 0.110180 0.180680 0.649343 0.065110 0.058046 0.845072 0.031772 0.105642 0.027712 0.805846 0.060800 0.023009 0.155427 0.327424 0.494140 0.100827 0.018644 0.656850 0.223679 0.225440 0.175932 0.321741 0.276887 0.156609 0.208591 0.263136 0.371663 0.258773 0.244932 0.332518 0.163778 0.418629 0.180599 0.051416 0.349356 0.486963 0.360882 0.114042 0.038113 0.168550 0.396524 0.345968 0.088958 Consensus sequence: HHBSHTCGTGRGTGGKGDBVWMV Alignment: VYWVVHCRCCACMCACGAHSBHH --------CCAGYYHVADCCRG- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00538 Gli1_v015681_primaryOriginal Motif Original Motif Forward 10 14 0.059769 Species: Mus musculus Original motif 0.183797 0.268049 0.330111 0.218043 0.127599 0.330310 0.243614 0.298477 0.143199 0.188046 0.268593 0.400162 0.214690 0.205230 0.247090 0.332990 0.294688 0.299104 0.327152 0.079056 0.221909 0.193223 0.480155 0.104712 0.444072 0.068239 0.481838 0.005852 0.006182 0.015429 0.901278 0.077111 0.766535 0.111138 0.121632 0.000696 0.014848 0.973961 0.000298 0.010893 0.001807 0.992200 0.002669 0.003324 0.795344 0.140510 0.018576 0.045571 0.006990 0.988200 0.002510 0.002299 0.154898 0.842296 0.000998 0.001808 0.029577 0.919262 0.006935 0.044226 0.677987 0.032075 0.185065 0.104874 0.195132 0.364580 0.319321 0.120967 0.225412 0.115034 0.612849 0.046705 0.548628 0.058900 0.162857 0.229616 0.112531 0.340331 0.165910 0.381227 0.073029 0.303078 0.363896 0.259997 0.561485 0.260567 0.092979 0.084969 0.132283 0.457691 0.140159 0.269867 Consensus sequence: BBBDVVRGACCACCCAVGABBAB Reverse complement motif 0.132283 0.140159 0.457691 0.269867 0.084969 0.260567 0.092979 0.561485 0.073029 0.363896 0.303078 0.259997 0.381227 0.340331 0.165910 0.112531 0.229616 0.058900 0.162857 0.548628 0.225412 0.612849 0.115034 0.046705 0.195132 0.319321 0.364580 0.120967 0.104874 0.032075 0.185065 0.677987 0.029577 0.006935 0.919262 0.044226 0.154898 0.000998 0.842296 0.001808 0.006990 0.002510 0.988200 0.002299 0.045571 0.140510 0.018576 0.795344 0.001807 0.002669 0.992200 0.003324 0.014848 0.000298 0.973961 0.010893 0.000696 0.111138 0.121632 0.766535 0.006182 0.901278 0.015429 0.077111 0.444072 0.481838 0.068239 0.005852 0.221909 0.480155 0.193223 0.104712 0.294688 0.327152 0.299104 0.079056 0.332990 0.205230 0.247090 0.214690 0.400162 0.188046 0.268593 0.143199 0.127599 0.243614 0.330310 0.298477 0.183797 0.330111 0.268049 0.218043 Consensus sequence: BTBVTCVTGGGTGGTCMVVDVBB Alignment: BBBDVVRGACCACCCAVGABBAB ---------CCAGYYHVADCCRG ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Motif ID Motif name Matching format of first motif Matching format of second motif Direction Position # # of overlap Similarity score UP00539 Gli2_v015681_secondaryReverse Complement Original Motif Backward 2 14 0.059836 Species: Mus musculus Original motif 0.331499 0.188505 0.182841 0.297156 0.328961 0.213025 0.273530 0.184484 0.197213 0.129292 0.524914 0.148581 0.274491 0.226406 0.312118 0.186986 0.103231 0.393726 0.364988 0.138055 0.552594 0.166422 0.186262 0.094722 0.157618 0.064773 0.616497 0.161112 0.139166 0.176098 0.621185 0.063551 0.748420 0.062398 0.012447 0.176735 0.116584 0.009438 0.860326 0.013653 0.005030 0.003646 0.974877 0.016447 0.055257 0.007181 0.921760 0.015802 0.032748 0.058249 0.052709 0.856293 0.105606 0.872231 0.014370 0.007793 0.019480 0.497379 0.125899 0.357242 0.478582 0.269713 0.061464 0.190242 0.253985 0.287006 0.201320 0.257689 0.319384 0.210231 0.175842 0.294543 0.222123 0.287802 0.201294 0.288782 0.139951 0.376041 0.081133 0.402875 0.213450 0.343835 0.383676 0.059039 0.322294 0.355918 0.148062 0.173725 Consensus sequence: HVGVSAGGAGGGTCYHHHHYVH Reverse complement motif 0.322294 0.148062 0.355918 0.173725 0.213450 0.383676 0.343835 0.059039 0.402875 0.376041 0.081133 0.139951 0.288782 0.287802 0.201294 0.222123 0.294543 0.210231 0.175842 0.319384 0.253985 0.201320 0.287006 0.257689 0.190242 0.269713 0.061464 0.478582 0.019480 0.125899 0.497379 0.357242 0.105606 0.014370 0.872231 0.007793 0.856293 0.058249 0.052709 0.032748 0.055257 0.921760 0.007181 0.015802 0.005030 0.974877 0.003646 0.016447 0.116584 0.860326 0.009438 0.013653 0.176735 0.062398 0.012447 0.748420 0.139166 0.621185 0.176098 0.063551 0.157618 0.616497 0.064773 0.161112 0.094722 0.166422 0.186262 0.552594 0.103231 0.364988 0.393726 0.138055 0.274491 0.312118 0.226406 0.186986 0.197213 0.524914 0.129292 0.148581 0.184484 0.213025 0.273530 0.328961 0.297156 0.188505 0.182841 0.331499 Consensus sequence: DVMHHDHKGACCCTCCTSVCBH Alignment: HVGVSAGGAGGGTCYHHHHYVH -------CKGGDTBDMMCTGG- ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Results created by MOTIFSIM on 11-20-2016 13:44:02 Runtime: 673.484985 seconds MOTIFSIM is written by Ngoc Tam L. Tran