MOTIFSIM - Motif Similarity Detection Tool Version 2.0 Total number of motifs: 21 Input files and motif counts File name Count of motifs Dataset # W-ChIPMotifs_DM230.txt 11 1 RSAT_peak-motifs_DM230.txt 10 2 Input Motifs Dataset #: 1 Motif ID: 1 Motif name: TFW1 0.000000 0.082495 0.917505 0.000000 0.074447 0.217304 0.197183 0.511066 0.000000 0.897384 0.102616 0.000000 0.050302 0.102616 0.847082 0.000000 0.000000 0.949698 0.050302 0.000000 0.000000 0.052314 0.947686 0.000000 Dataset #: 1 Motif ID: 2 Motif name: TFW2 0.005831 0.364431 0.416910 0.212828 0.081633 0.816327 0.099125 0.002915 0.002915 0.067055 0.921283 0.008746 0.005831 0.883382 0.107872 0.002915 0.000000 0.096210 0.860058 0.043732 0.002915 0.906706 0.078717 0.011662 0.043732 0.075802 0.825073 0.055394 0.000000 0.125364 0.871720 0.002915 Dataset #: 1 Motif ID: 3 Motif name: TFW3 0.020000 0.920000 0.050000 0.010000 0.000000 0.030000 0.960000 0.010000 0.000000 0.170000 0.830000 0.000000 0.000000 0.990000 0.000000 0.010000 0.000000 0.270000 0.210000 0.520000 0.030000 0.300000 0.370000 0.300000 0.000000 0.950000 0.050000 0.000000 0.020000 0.130000 0.800000 0.050000 0.000000 0.880000 0.120000 0.000000 0.010000 0.220000 0.760000 0.010000 Dataset #: 1 Motif ID: 4 Motif name: TFF1 0.180952 0.533333 0.142857 0.142857 0.019048 0.009524 0.952381 0.019048 0.019048 0.047619 0.914286 0.019048 0.400000 0.333333 0.219048 0.047619 0.028571 0.047619 0.885714 0.038095 0.038095 0.895238 0.009524 0.057143 0.133333 0.733333 0.066667 0.066667 0.038095 0.038095 0.876190 0.047619 0.123810 0.752381 0.114286 0.009524 0.314286 0.190476 0.390476 0.104762 0.123810 0.028571 0.771429 0.076190 0.057143 0.904762 0.028571 0.009524 Dataset #: 1 Motif ID: 5 Motif name: TFF11 0.076190 0.085714 0.819048 0.019048 0.076190 0.066667 0.780952 0.076190 0.438095 0.323810 0.180952 0.057143 0.123810 0.180952 0.657143 0.038095 0.095238 0.076190 0.790476 0.038095 0.371429 0.104762 0.485714 0.038095 0.019048 0.038095 0.914286 0.028571 0.019048 0.095238 0.885714 0.000000 0.057143 0.866667 0.066667 0.009524 0.009524 0.009524 0.980952 0.000000 0.047619 0.104762 0.838095 0.009524 0.333333 0.161905 0.409524 0.095238 0.019048 0.009524 0.952381 0.019048 0.114286 0.580952 0.266667 0.038095 Dataset #: 1 Motif ID: 6 Motif name: TFM2 0.404762 0.047619 0.547619 0.000000 0.238095 0.119048 0.642857 0.000000 0.607143 0.071429 0.321429 0.000000 0.190476 0.000000 0.797619 0.011905 0.226190 0.000000 0.738095 0.035714 0.738095 0.000000 0.238095 0.023810 0.261905 0.142857 0.595238 0.000000 0.345238 0.071429 0.583333 0.000000 0.547619 0.000000 0.452381 0.000000 0.011905 0.000000 0.988095 0.000000 0.011905 0.309524 0.678571 0.000000 0.357143 0.261905 0.190476 0.190476 0.309524 0.000000 0.690476 0.000000 0.250000 0.095238 0.654762 0.000000 0.309524 0.047619 0.392857 0.250000 0.035714 0.095238 0.857143 0.011905 Dataset #: 1 Motif ID: 7 Motif name: TFM1 0.384615 0.076923 0.000000 0.538462 0.256410 0.000000 0.000000 0.743590 0.076923 0.153846 0.333333 0.435897 0.230769 0.000000 0.000000 0.769231 0.000000 0.256410 0.000000 0.743590 0.000000 0.000000 0.076923 0.923077 0.025641 0.076923 0.256410 0.641026 0.000000 0.128205 0.230769 0.641026 0.333333 0.230769 0.205128 0.230769 0.282051 0.179487 0.000000 0.538462 0.051282 0.128205 0.000000 0.820513 0.128205 0.000000 0.000000 0.871795 0.256410 0.025641 0.179487 0.538462 0.102564 0.000000 0.000000 0.897436 0.128205 0.000000 0.102564 0.769231 0.128205 0.025641 0.205128 0.641026 0.102564 0.333333 0.256410 0.307692 0.256410 0.102564 0.000000 0.641026 Dataset #: 1 Motif ID: 8 Motif name: TFM3 0.454545 0.000000 0.000000 0.545455 0.500000 0.000000 0.000000 0.500000 0.318182 0.181818 0.090909 0.409091 0.000000 0.000000 0.136364 0.863636 0.318182 0.000000 0.000000 0.681818 0.045455 0.000000 0.272727 0.681818 0.272727 0.045455 0.090909 0.590909 0.272727 0.090909 0.000000 0.636364 0.045455 0.818182 0.000000 0.136364 0.727273 0.000000 0.000000 0.272727 0.090909 0.318182 0.227273 0.363636 0.863636 0.045455 0.000000 0.090909 0.818182 0.090909 0.090909 0.000000 0.500000 0.090909 0.090909 0.318182 0.136364 0.227273 0.000000 0.636364 0.227273 0.000000 0.000000 0.772727 0.363636 0.090909 0.000000 0.545455 0.772727 0.181818 0.045455 0.000000 Dataset #: 1 Motif ID: 9 Motif name: TFM12 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.190000 0.400000 0.000000 0.410000 0.000000 0.520000 0.190000 0.290000 0.110000 0.610000 0.100000 0.180000 0.180000 0.290000 0.330000 0.200000 0.000000 0.380000 0.350000 0.270000 0.000000 0.820000 0.000000 0.180000 0.180000 0.390000 0.000000 0.430000 0.000000 0.530000 0.000000 0.470000 0.000000 0.470000 0.150000 0.380000 0.000000 0.240000 0.240000 0.520000 0.000000 0.870000 0.000000 0.130000 0.050000 0.680000 0.000000 0.270000 0.180000 0.380000 0.100000 0.340000 0.000000 0.620000 0.220000 0.160000 0.000000 0.660000 0.090000 0.250000 0.200000 0.150000 0.130000 0.520000 0.040000 0.460000 0.160000 0.340000 0.060000 0.530000 0.030000 0.380000 0.050000 0.570000 0.040000 0.340000 Dataset #: 1 Motif ID: 10 Motif name: TFM13 0.666667 0.133333 0.000000 0.200000 0.066667 0.200000 0.000000 0.733333 0.200000 0.000000 0.333333 0.466667 0.666667 0.000000 0.000000 0.333333 0.666667 0.000000 0.000000 0.333333 0.600000 0.000000 0.000000 0.400000 0.333333 0.000000 0.000000 0.666667 0.000000 0.066667 0.000000 0.933333 0.133333 0.266667 0.000000 0.600000 0.266667 0.000000 0.000000 0.733333 0.466667 0.000000 0.466667 0.066667 0.600000 0.333333 0.000000 0.066667 0.800000 0.200000 0.000000 0.000000 0.666667 0.333333 0.000000 0.000000 0.133333 0.200000 0.200000 0.466667 0.800000 0.000000 0.200000 0.000000 0.466667 0.266667 0.066667 0.200000 0.400000 0.333333 0.000000 0.266667 0.200000 0.000000 0.000000 0.800000 0.600000 0.000000 0.000000 0.400000 Dataset #: 1 Motif ID: 11 Motif name: TFM11 0.294118 0.235294 0.117647 0.352941 0.382353 0.205882 0.205882 0.205882 0.529412 0.000000 0.117647 0.352941 0.235294 0.294118 0.323529 0.147059 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.941176 0.000000 0.000000 0.058824 0.764706 0.000000 0.029412 0.205882 0.382353 0.235294 0.176471 0.205882 0.735294 0.000000 0.058824 0.205882 0.735294 0.029412 0.117647 0.117647 0.676471 0.000000 0.088235 0.235294 0.529412 0.117647 0.205882 0.147059 0.705882 0.176471 0.117647 0.000000 0.441176 0.352941 0.147059 0.058824 0.941176 0.058824 0.000000 0.000000 0.852941 0.000000 0.147059 0.000000 0.676471 0.088235 0.000000 0.235294 0.529412 0.323529 0.117647 0.029412 0.470588 0.176471 0.000000 0.352941 0.411765 0.000000 0.147059 0.441176 0.500000 0.088235 0.147059 0.264706 0.294118 0.205882 0.088235 0.411765 0.205882 0.235294 0.264706 0.294118 0.470588 0.000000 0.117647 0.411765 0.617647 0.176471 0.205882 0.000000 Dataset #: 2 Motif ID: 12 Motif name: csGCCCCGCCCCsc 0.179104 0.492537 0.164179 0.164179 0.223881 0.402985 0.283582 0.089552 0.014925 0.014925 0.895522 0.074627 0.000000 0.895522 0.089552 0.014925 0.000000 0.925373 0.014925 0.059701 0.029851 0.970149 0.000000 0.000000 0.000000 0.970149 0.029851 0.000000 0.044776 0.000000 0.940299 0.014925 0.000000 0.955224 0.014925 0.029851 0.029851 0.955224 0.014925 0.000000 0.029851 0.925373 0.014925 0.029851 0.119403 0.820896 0.014925 0.044776 0.104478 0.328358 0.373134 0.194030 0.179104 0.358209 0.223881 0.238806 Dataset #: 2 Motif ID: 13 Motif name: tkAAATAATAtw 0.233333 0.200000 0.166667 0.400000 0.233333 0.133333 0.266667 0.366667 0.733333 0.033333 0.033333 0.200000 0.866667 0.033333 0.033333 0.066667 0.833333 0.000000 0.033333 0.133333 0.166667 0.000000 0.000000 0.833333 0.866667 0.066667 0.000000 0.066667 0.800000 0.033333 0.033333 0.133333 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.966667 0.033333 0.000000 0.000000 0.166667 0.200000 0.133333 0.500000 0.400000 0.100000 0.100000 0.400000 Dataset #: 2 Motif ID: 14 Motif name: cccGCCCCGCCCCsb 0.148936 0.425532 0.234043 0.191489 0.106383 0.553191 0.170213 0.170213 0.106383 0.659574 0.148936 0.085106 0.042553 0.000000 0.851064 0.106383 0.000000 0.936170 0.063830 0.000000 0.000000 0.872340 0.042553 0.085106 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.957447 0.042553 0.000000 0.021277 0.021277 0.957447 0.000000 0.000000 0.957447 0.021277 0.021277 0.042553 0.936170 0.021277 0.000000 0.021277 0.957447 0.021277 0.000000 0.063830 0.914894 0.021277 0.000000 0.063830 0.297872 0.404255 0.234043 0.148936 0.319149 0.255319 0.276596 Dataset #: 2 Motif ID: 15 Motif name: kCAGCCAATmr 0.235294 0.176471 0.294118 0.294118 0.117647 0.705882 0.176471 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.352941 0.352941 0.235294 0.058824 0.352941 0.176471 0.411765 0.058824 Dataset #: 2 Motif ID: 16 Motif name: kcACCTGCAgc 0.153846 0.230769 0.307692 0.307692 0.153846 0.538462 0.153846 0.153846 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.153846 0.230769 0.461538 0.153846 0.153846 0.615385 0.153846 0.076923 Dataset #: 2 Motif ID: 17 Motif name: wwAAATAATAtw 0.370370 0.166667 0.129630 0.333333 0.333333 0.166667 0.203704 0.296296 0.740741 0.018519 0.055556 0.185185 0.740741 0.055556 0.037037 0.166667 0.888889 0.018519 0.018519 0.074074 0.037037 0.000000 0.000000 0.962963 0.833333 0.037037 0.018519 0.111111 0.796296 0.018519 0.037037 0.148148 0.074074 0.055556 0.018519 0.851852 0.925926 0.055556 0.018519 0.000000 0.240741 0.166667 0.166667 0.425926 0.370370 0.129630 0.148148 0.351852 Dataset #: 2 Motif ID: 18 Motif name: sSGTCACGTGACSs 0.055556 0.388889 0.388889 0.166667 0.000000 0.277778 0.722222 0.000000 0.055556 0.111111 0.833333 0.000000 0.111111 0.000000 0.055556 0.833333 0.000000 0.888889 0.111111 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.944444 0.055556 0.000000 0.000000 0.055556 0.944444 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.111111 0.888889 0.000000 0.833333 0.055556 0.000000 0.111111 0.000000 0.833333 0.111111 0.055556 0.000000 0.722222 0.277778 0.000000 0.166667 0.388889 0.388889 0.055556 Dataset #: 2 Motif ID: 19 Motif name: wsTACwGTAsw 0.277778 0.222222 0.166667 0.333333 0.166667 0.444444 0.277778 0.111111 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.500000 0.000000 0.000000 0.500000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.111111 0.277778 0.444444 0.166667 0.333333 0.166667 0.222222 0.277778 Dataset #: 2 Motif ID: 20 Motif name: dhACATTCTkh 0.333333 0.000000 0.333333 0.333333 0.333333 0.333333 0.000000 0.333333 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.666667 0.333333 0.333333 0.333333 0.000000 0.333333 Dataset #: 2 Motif ID: 21 Motif name: wbgTAAATAww 0.285714 0.142857 0.178571 0.392857 0.214286 0.285714 0.250000 0.250000 0.142857 0.071429 0.678571 0.107143 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.928571 0.000000 0.035714 0.035714 0.821429 0.107143 0.035714 0.035714 0.821429 0.000000 0.178571 0.000000 0.000000 0.071429 0.000000 0.928571 0.928571 0.035714 0.035714 0.000000 0.285714 0.214286 0.142857 0.357143 0.392857 0.178571 0.178571 0.250000